View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5878-Insertion-6 (Length: 345)

Name: NF5878-Insertion-6
Description: NF5878
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5878-Insertion-6
NF5878-Insertion-6
[»] chr5 (31 HSPs)
chr5 (9-342)||(38598466-38598800)
chr5 (157-345)||(1165614-1165802)
chr5 (154-342)||(9008073-9008261)
chr5 (154-345)||(16069357-16069548)
chr5 (154-343)||(33991144-33991333)
chr5 (154-345)||(1579040-1579231)
chr5 (154-345)||(1605584-1605775)
chr5 (154-345)||(8374352-8374542)
chr5 (154-345)||(33491209-33491400)
chr5 (153-345)||(24105684-24105876)
chr5 (154-345)||(27679182-27679373)
chr5 (151-345)||(3386499-3386693)
chr5 (155-345)||(16737460-16737650)
chr5 (154-343)||(27420862-27421051)
chr5 (154-345)||(4120941-4121132)
chr5 (154-342)||(5202976-5203164)
chr5 (153-345)||(31883147-31883339)
chr5 (154-345)||(19358530-19358721)
chr5 (154-345)||(3921585-3921776)
chr5 (154-341)||(20992163-20992350)
chr5 (154-343)||(35782659-35782848)
chr5 (155-345)||(31410481-31410671)
chr5 (184-343)||(26602957-26603116)
chr5 (199-345)||(27025005-27025151)
chr5 (156-285)||(20992354-20992487)
chr5 (152-291)||(33284642-33284781)
chr5 (10-111)||(38867750-38867851)
chr5 (162-286)||(31638157-31638281)
chr5 (154-302)||(25634586-25634732)
chr5 (300-345)||(35420437-35420482)
chr5 (216-269)||(41818552-41818605)
[»] chr3 (41 HSPs)
chr3 (154-345)||(29445486-29445677)
chr3 (154-342)||(25999386-25999574)
chr3 (154-345)||(8042605-8042796)
chr3 (154-345)||(32244118-32244309)
chr3 (154-345)||(25494284-25494475)
chr3 (154-345)||(37698142-37698333)
chr3 (154-343)||(38856091-38856280)
chr3 (154-343)||(42307906-42308095)
chr3 (154-345)||(54870173-54870364)
chr3 (154-343)||(15520143-15520332)
chr3 (156-345)||(21581042-21581231)
chr3 (154-345)||(20842347-20842538)
chr3 (154-345)||(22174989-22175180)
chr3 (154-345)||(15520634-15520825)
chr3 (154-345)||(50528927-50529118)
chr3 (156-345)||(35226447-35226636)
chr3 (154-345)||(32359257-32359448)
chr3 (156-343)||(44609334-44609521)
chr3 (154-345)||(46452161-46452352)
chr3 (154-345)||(20699147-20699338)
chr3 (154-345)||(38933944-38934134)
chr3 (154-345)||(24835698-24835889)
chr3 (154-345)||(34700339-34700530)
chr3 (154-345)||(54534327-54534516)
chr3 (154-343)||(12117659-12117848)
chr3 (160-345)||(42104970-42105155)
chr3 (156-340)||(26122814-26122998)
chr3 (157-345)||(2895186-2895378)
chr3 (154-306)||(35643215-35643367)
chr3 (177-345)||(44688782-44688949)
chr3 (156-345)||(48925002-48925189)
chr3 (177-345)||(16354367-16354535)
chr3 (156-345)||(53028225-53028406)
chr3 (156-290)||(50529827-50529961)
chr3 (198-341)||(12915948-12916091)
chr3 (154-284)||(49128047-49128177)
chr3 (270-345)||(24366143-24366218)
chr3 (277-345)||(13696914-13696982)
chr3 (157-206)||(24366093-24366142)
chr3 (310-343)||(50528883-50528916)
chr3 (154-183)||(40240486-40240515)
[»] chr4 (65 HSPs)
chr4 (154-345)||(53717465-53717656)
chr4 (154-345)||(54189546-54189737)
chr4 (154-344)||(38055158-38055348)
chr4 (156-345)||(28032713-28032902)
chr4 (154-342)||(23776463-23776651)
chr4 (154-345)||(19913631-19913822)
chr4 (154-345)||(30423566-30423756)
chr4 (154-345)||(50055102-50055293)
chr4 (154-345)||(50353802-50353993)
chr4 (155-345)||(15241029-15241219)
chr4 (154-343)||(1756767-1756956)
chr4 (154-345)||(6611361-6611552)
chr4 (154-345)||(8591093-8591284)
chr4 (154-345)||(20877048-20877239)
chr4 (154-345)||(40428721-40428912)
chr4 (154-345)||(45424535-45424726)
chr4 (154-345)||(52139204-52139395)
chr4 (156-345)||(48909849-48910038)
chr4 (154-345)||(1617085-1617276)
chr4 (156-343)||(23704212-23704399)
chr4 (154-345)||(27488649-27488840)
chr4 (162-345)||(33703850-33704033)
chr4 (157-343)||(40680041-40680227)
chr4 (154-343)||(11639581-11639770)
chr4 (156-345)||(44379188-44379377)
chr4 (154-345)||(6688628-6688813)
chr4 (153-345)||(16700781-16700973)
chr4 (153-345)||(43289961-43290153)
chr4 (154-345)||(2481409-2481600)
chr4 (154-345)||(14987793-14987984)
chr4 (154-345)||(31969682-31969873)
chr4 (154-345)||(44784918-44785109)
chr4 (154-345)||(54412629-54412820)
chr4 (149-345)||(19164974-19165169)
chr4 (146-341)||(35490778-35490974)
chr4 (154-345)||(8932179-8932370)
chr4 (154-345)||(15669184-15669375)
chr4 (168-345)||(37968758-37968935)
chr4 (154-345)||(47632035-47632227)
chr4 (153-345)||(53875657-53875849)
chr4 (154-345)||(30171581-30171772)
chr4 (154-345)||(37464722-37464913)
chr4 (154-345)||(55344826-55345017)
chr4 (157-345)||(27583633-27583821)
chr4 (154-345)||(27536105-27536292)
chr4 (156-324)||(28360433-28360602)
chr4 (154-345)||(53353056-53353255)
chr4 (162-342)||(38071327-38071504)
chr4 (155-341)||(16703827-16704009)
chr4 (154-345)||(44375846-44376037)
chr4 (139-302)||(50053428-50053592)
chr4 (230-345)||(23269047-23269162)
chr4 (167-302)||(44548185-44548320)
chr4 (271-345)||(53408137-53408212)
chr4 (154-238)||(23265865-23265949)
chr4 (219-301)||(51780763-51780845)
chr4 (160-302)||(17493340-17493482)
chr4 (295-345)||(23261887-23261937)
chr4 (240-297)||(55344724-55344781)
chr4 (162-286)||(46257269-46257393)
chr4 (308-345)||(9595903-9595940)
chr4 (309-345)||(50055301-50055337)
chr4 (292-345)||(48748197-48748250)
chr4 (255-291)||(9595946-9595982)
chr4 (148-204)||(34615823-34615879)
[»] chr7 (44 HSPs)
chr7 (157-345)||(12101181-12101369)
chr7 (154-345)||(3511325-3511516)
chr7 (154-345)||(33359093-33359284)
chr7 (154-345)||(43067976-43068167)
chr7 (154-345)||(24792335-24792526)
chr7 (154-345)||(25748489-25748680)
chr7 (154-341)||(30181031-30181218)
chr7 (154-343)||(7164186-7164375)
chr7 (157-345)||(42964999-42965187)
chr7 (154-345)||(5280862-5281053)
chr7 (154-345)||(9452592-9452783)
chr7 (154-345)||(20346490-20346681)
chr7 (155-345)||(1803029-1803219)
chr7 (155-345)||(38866547-38866737)
chr7 (156-345)||(933289-933478)
chr7 (154-343)||(22649699-22649888)
chr7 (154-345)||(36890833-36891023)
chr7 (153-345)||(4477324-4477516)
chr7 (154-345)||(42204156-42204348)
chr7 (157-345)||(43156718-43156906)
chr7 (154-343)||(46134309-46134498)
chr7 (157-345)||(12097593-12097781)
chr7 (154-342)||(32041544-32041732)
chr7 (154-341)||(4347275-4347462)
chr7 (154-345)||(15655914-15656105)
chr7 (154-345)||(33846532-33846718)
chr7 (153-345)||(42673466-42673654)
chr7 (154-345)||(6394753-6394944)
chr7 (154-339)||(8630668-8630853)
chr7 (154-345)||(17753602-17753793)
chr7 (184-345)||(48865662-48865826)
chr7 (154-345)||(46891342-46891534)
chr7 (184-345)||(16894510-16894671)
chr7 (154-297)||(19828272-19828415)
chr7 (157-345)||(43021583-43021767)
chr7 (153-302)||(37005857-37006006)
chr7 (154-247)||(37704982-37705075)
chr7 (154-302)||(43405022-43405170)
chr7 (154-295)||(36849590-36849731)
chr7 (154-302)||(30075277-30075422)
chr7 (157-286)||(20163824-20163953)
chr7 (155-302)||(15655458-15655605)
chr7 (168-241)||(27691433-27691506)
chr7 (154-182)||(48865642-48865670)
[»] chr6 (23 HSPs)
chr6 (153-345)||(34887305-34887497)
chr6 (154-345)||(3347536-3347727)
chr6 (154-345)||(9459566-9459757)
chr6 (154-345)||(21893458-21893649)
chr6 (154-345)||(26946889-26947080)
chr6 (154-342)||(3955782-3955970)
chr6 (154-345)||(2837548-2837739)
chr6 (154-345)||(6086612-6086803)
chr6 (155-345)||(30691855-30692045)
chr6 (154-345)||(26704352-26704543)
chr6 (154-345)||(17261086-17261277)
chr6 (154-345)||(18613541-18613732)
chr6 (154-343)||(16307023-16307212)
chr6 (154-345)||(11167243-11167434)
chr6 (148-345)||(1153590-1153787)
chr6 (154-345)||(20726794-20726981)
chr6 (154-345)||(28199521-28199713)
chr6 (155-345)||(30698942-30699132)
chr6 (154-337)||(35198287-35198469)
chr6 (154-306)||(52839-52991)
chr6 (221-345)||(33464399-33464523)
chr6 (244-345)||(53001-53102)
chr6 (154-229)||(33463704-33463779)
[»] chr2 (29 HSPs)
chr2 (149-345)||(4016035-4016231)
chr2 (156-345)||(33906060-33906249)
chr2 (153-345)||(42937719-42937912)
chr2 (154-345)||(18806897-18807088)
chr2 (154-345)||(31517228-31517419)
chr2 (155-343)||(3873259-3873447)
chr2 (154-345)||(28329852-28330041)
chr2 (154-343)||(4232157-4232346)
chr2 (154-343)||(26323201-26323390)
chr2 (154-345)||(30270692-30270883)
chr2 (154-343)||(19901153-19901341)
chr2 (154-338)||(1108281-1108464)
chr2 (154-345)||(6174841-6175032)
chr2 (166-345)||(19383948-19384127)
chr2 (154-345)||(39635453-39635644)
chr2 (153-345)||(1482916-1483107)
chr2 (168-345)||(5733414-5733591)
chr2 (154-345)||(2178782-2178973)
chr2 (153-344)||(16588790-16588981)
chr2 (157-345)||(16066307-16066495)
chr2 (154-302)||(30420223-30420371)
chr2 (154-345)||(850998-851189)
chr2 (153-343)||(429816-430006)
chr2 (157-345)||(44947562-44947743)
chr2 (20-108)||(39953697-39953790)
chr2 (154-302)||(42446625-42446773)
chr2 (187-295)||(22101210-22101318)
chr2 (153-302)||(3585290-3585439)
chr2 (156-286)||(12517256-12517385)
[»] chr8 (40 HSPs)
chr8 (154-345)||(14422706-14422897)
chr8 (154-345)||(18594540-18594731)
chr8 (154-345)||(39206589-39206780)
chr8 (154-343)||(35118046-35118235)
chr8 (153-345)||(144396-144588)
chr8 (154-345)||(13110407-13110598)
chr8 (154-345)||(22260643-22260834)
chr8 (154-345)||(24113179-24113370)
chr8 (154-345)||(29938064-29938255)
chr8 (155-345)||(2042537-2042727)
chr8 (155-343)||(10836770-10836958)
chr8 (154-345)||(6144286-6144477)
chr8 (154-345)||(7791414-7791605)
chr8 (154-345)||(33278403-33278594)
chr8 (155-345)||(7774768-7774958)
chr8 (154-343)||(7811998-7812187)
chr8 (156-345)||(34679470-34679659)
chr8 (154-345)||(34842378-34842569)
chr8 (154-345)||(34998909-34999100)
chr8 (154-345)||(39218780-39218971)
chr8 (153-343)||(41575515-41575705)
chr8 (157-345)||(44804957-44805145)
chr8 (154-345)||(4035850-4036041)
chr8 (156-345)||(38167168-38167357)
chr8 (155-343)||(42571598-42571783)
chr8 (154-345)||(5320567-5320758)
chr8 (157-343)||(36491163-36491349)
chr8 (154-306)||(33287077-33287229)
chr8 (154-306)||(40117904-40118056)
chr8 (154-345)||(28639281-28639474)
chr8 (154-342)||(8021722-8021902)
chr8 (155-290)||(26783801-26783936)
chr8 (153-345)||(66192-66385)
chr8 (230-345)||(9807339-9807454)
chr8 (154-302)||(2322068-2322216)
chr8 (154-302)||(39220259-39220407)
chr8 (148-279)||(5005162-5005294)
chr8 (154-238)||(9806876-9806960)
chr8 (155-286)||(18683714-18683844)
chr8 (155-286)||(18729276-18729406)
[»] chr1 (48 HSPs)
chr1 (154-345)||(25897375-25897566)
chr1 (154-345)||(26663259-26663450)
chr1 (156-344)||(38829072-38829260)
chr1 (154-345)||(16052097-16052288)
chr1 (154-345)||(42370808-42370999)
chr1 (154-345)||(46760967-46761158)
chr1 (156-345)||(29078519-29078708)
chr1 (154-345)||(1168504-1168695)
chr1 (154-345)||(1940760-1940951)
chr1 (154-341)||(32671580-32671767)
chr1 (154-345)||(33510485-33510676)
chr1 (154-345)||(39260359-39260550)
chr1 (154-345)||(29288150-29288339)
chr1 (154-345)||(1170457-1170648)
chr1 (154-345)||(20089472-20089663)
chr1 (154-345)||(26580283-26580474)
chr1 (154-345)||(52753160-52753351)
chr1 (156-342)||(40092494-40092680)
chr1 (154-342)||(15203113-15203301)
chr1 (154-345)||(5215386-5215577)
chr1 (154-345)||(19715174-19715365)
chr1 (154-345)||(52696792-52696983)
chr1 (154-345)||(970537-970730)
chr1 (156-345)||(12682823-12683012)
chr1 (153-345)||(43905654-43905846)
chr1 (154-345)||(8079722-8079913)
chr1 (153-345)||(46409435-46409629)
chr1 (154-345)||(7145208-7145399)
chr1 (154-342)||(41928511-41928699)
chr1 (153-345)||(8120869-8121061)
chr1 (154-345)||(17591692-17591880)
chr1 (154-345)||(6765460-6765651)
chr1 (156-343)||(13996738-13996925)
chr1 (155-345)||(15717787-15717976)
chr1 (154-345)||(2347657-2347849)
chr1 (169-345)||(17587518-17587694)
chr1 (153-340)||(49146172-49146359)
chr1 (154-345)||(51359230-51359420)
chr1 (144-345)||(2473712-2473914)
chr1 (156-343)||(23498463-23498650)
chr1 (184-345)||(40149494-40149655)
chr1 (154-345)||(15554165-15554348)
chr1 (156-319)||(29695678-29695842)
chr1 (156-282)||(52086270-52086396)
chr1 (153-345)||(38171832-38172011)
chr1 (167-301)||(23322897-23323031)
chr1 (155-302)||(5217840-5217986)
chr1 (154-224)||(5675106-5675176)
[»] scaffold0167 (1 HSPs)
scaffold0167 (154-345)||(22964-23155)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (154-345)||(145258-145449)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (154-345)||(36706-36897)
[»] scaffold0172 (1 HSPs)
scaffold0172 (154-345)||(10239-10430)
[»] scaffold0482 (1 HSPs)
scaffold0482 (154-345)||(308-499)
[»] scaffold0920 (1 HSPs)
scaffold0920 (154-343)||(3711-3900)
[»] scaffold1777 (1 HSPs)
scaffold1777 (154-345)||(19-210)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (154-345)||(19-211)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 283; Significance: 1e-158; HSPs: 31)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 9 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 38598800 - 38598466
Alignment:
Q  9 actcaatagtgctatacttttcttttgccaattgtcattaaagaactgaaaagtgaaataatactccatattgctagattgaaaggggttgaatgagtgt 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38598800 actcaatagtgctatacttttcttttgccaattgtcattaaagaactgaaaagtgaaataatactccatattgttagattgaaaggggttgaatgagtgt 38598701  T
Q  109 tatgtgggcttataacattgtcatgtcacattttaacacttaggtccg-tttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcc 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||    
T  38598700 tatgtgggcttataacattgtcatgtcacattttaacacttaggcccggtttggattggcttactttgaacttatgtgagcttatctactctcataagcc 38598601  T
Q  208 tttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctt 307  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38598600 tttttaaatgtgtttgggtaaataagtaaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctt 38598501  T
Q  308 cggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacct 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38598500 cggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacct 38598466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 157 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 1165802 - 1165614
Alignment:
Q  157 tttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttc 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1165802 tttggattgacttattttgagcttatgtgagcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttc 1165703  T
Q  257 ataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1165702 ataagttgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 1165614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 154 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 9008261 - 9008073
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9008261 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 9008162  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacct 342  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9008161 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacct 9008073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Original strand, 16069357 - 16069548
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16069357 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtaggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagcttatcatagt 16069456  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16069457 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 16069548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 154 - 343
Target Start/End: Original strand, 33991144 - 33991333
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33991144 ccgtttgaattgacttattttgagtttatgtggacttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 33991243  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 343  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33991244 ttcataagttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 33991333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Original strand, 1579040 - 1579231
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1579040 ccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagt 1579139  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1579140 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 1579231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 1605775 - 1605584
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1605775 ccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagt 1605676  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1605675 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 1605584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 8374542 - 8374352
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8374542 ccgtttggattgccttattttaagcttatgtgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagt 8374443  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8374442 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatg-atttatgtaacctcct 8374352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 33491400 - 33491209
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33491400 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 33491301  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33491300 ttcataagctgcttttgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 33491209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 153 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 24105876 - 24105684
Alignment:
Q  153 tccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 252  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24105876 tccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 24105777  T
Q  253 tttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24105776 tttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattatcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 24105684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 27679373 - 27679182
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27679373 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 27679274  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27679273 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaatctcct 27679182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 151 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 3386693 - 3386499
Alignment:
Q  151 ggtccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 250  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3386693 ggtctgtttggattggcttattttgagcttatgtggacttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 3386594  T
Q  251 agtttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3386593 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcctatgaatttatgtaacctcct 3386499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 155 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 16737650 - 16737460
Alignment:
Q  155 cgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 254  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||| || | ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16737650 cgtttgaattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataaacctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 16737551  T
Q  255 tcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16737550 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 16737460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 154 - 343
Target Start/End: Original strand, 27420862 - 27421051
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27420862 ccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagtttatcatagt 27420961  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 343  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27420962 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 27421051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Original strand, 4120941 - 4121132
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  4120941 ccgtttggaatggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataagcccttttaaaggtgtttgggtaaataagtaaaaataatttatcatagt 4121040  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4121041 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 4121132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 154 - 342
Target Start/End: Original strand, 5202976 - 5203164
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5202976 ccgtttggattgacttattttgagtttatgttggtttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagt 5203075  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacct 342  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5203076 ttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtcacct 5203164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 153 - 345
Target Start/End: Original strand, 31883147 - 31883339
Alignment:
Q  153 tccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31883147 tccgtttggattgacttattttgagcttatgtggacttatctactctcataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatag 31883246  T
Q  253 tttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31883247 tttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaatttttagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 31883339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Original strand, 19358530 - 19358721
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19358530 ccgtttggattgccttattttgagcttatgtgagcttatctactcctataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 19358629  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19358630 ttcataagctgcttatgccatattttagtaagcctaaattttcagcttaccctccaacttaacaaggagcttatgaatttatgtaatctcct 19358721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Original strand, 3921585 - 3921776
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||| || | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3921585 ccgtttggattgatttattttgagtttatatgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagt 3921684  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3921685 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaaaaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 3921776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 154 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 20992350 - 20992163
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||   ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20992350 ccgtttgaattggcttattttgagcttatgtggtcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcatatcatagt 20992251  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 341  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20992250 ttcataagctgattatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 20992163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 154 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 35782848 - 35782659
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35782848 ccgtttggattgccttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 35782749  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcg-gcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 343  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35782748 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcttaaattttcagcctaccctccgtgctt-acaaggagcttatgaatttatgtaacctc 35782659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 155 - 345
Target Start/End: Original strand, 31410481 - 31410671
Alignment:
Q  155 cgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 254  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||| || ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31410481 cgtttggattgatttattttgagtttatatgggtttatctacccccataagtctttttaaaggtgtttgagtaaacaaataaaaatagcttatcatagtt 31410580  T
Q  255 tcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    | |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  31410581 ttataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaggagtttatgaatttatgtgacctcct 31410671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 184 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 26603116 - 26602957
Alignment:
Q  184 tgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgtttatgccatattttaata 283  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  26603116 tgagcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataaactgcttatgccatattttaata 26603017  T
Q  284 agcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 343  Q
    ||| ||| ||||||| |||| ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26603016 agcataatttttcagtttactctctggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 26602957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 199 - 345
Target Start/End: Original strand, 27025005 - 27025151
Alignment:
Q  199 ccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcag 298  Q
    ||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27025005 ccataagactttttaaagatgttcgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccattttttaataagcctaaattttcag 27025104  T
Q  299 cttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  27025105 cttaccctccggcttaacaaggagtttataaatttatgtaacctcct 27025151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 156 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 20992487 - 20992354
Alignment:
Q  156 gtttggattgacttattttgagcttatgt----gagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 251  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||    | | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20992487 gtttggattggcttattttgagcttatgtacatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcatatcata 20992388  T
Q  252 gtttcataagctgtttatgccatattttaataag 285  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20992387 gtttcataagctgcttatgccatattttaataag 20992354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 152 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 33284781 - 33284642
Alignment:
Q  152 gtccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 251  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  33284781 gtccgcttggattgacttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttaagtaaataaataaaaatagcttatcata 33284682  T
Q  252 gtttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaa 291  Q
    |||| |||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||    
T  33284681 gttttataaactgcttataccatatttcaataagcctaaa 33284642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 38867851 - 38867750
Alignment:
Q  10 ctcaatagtgctatacttttcttttgccaattgtcattaaagaactgaaaagtgaaataatactccatattgctagattgaaaggggttgaatgagtgtt 109  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38867851 ctcaatagtgctattctttccttttgccaattgtaattaaaaaactgaaaagtaaaatgatactccatatttctagattgaaaggggttgaatgagtgtt 38867752  T
Q  110 at 111  Q
    ||    
T  38867751 at 38867750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 162 - 286
Target Start/End: Original strand, 31638157 - 31638281
Alignment:
Q  162 attgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataag 261  Q
    |||||||||||||  | ||||||||| ||| |||||  ||||||||||| |||| |||||||| |||||  ||||||||| ||||||| | ||| |||||    
T  31638157 attgacttattttatgtttatgtgagcttacctactaacataagcctttgtaaaagtgtttggataaatcgataaaaataacttatcacaattttataag 31638256  T
Q  262 ctgtttatgccatattttaataagc 286  Q
    ||  ||||| |||||||||||||||    
T  31638257 cttcttatgtcatattttaataagc 31638281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 154 - 302
Target Start/End: Original strand, 25634586 - 25634732
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||  ||| |||   ||||||||||||||   |||||||||||| | | |    
T  25634586 ccgtttagattggcttattttaagcttatgagagtttatctactaacataagctctttcaaatacgtttgggtaaataa--taaaatagcttataacaat 25634683  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagctta 302  Q
    ||||||||| | |||| |||||||||||||| ||  |||||| ||||||    
T  25634684 ttcataagccgcttataccatattttaataaaccataattttgagctta 25634732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 300 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 35420482 - 35420437
Alignment:
Q  300 ttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  35420482 ttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacctcct 35420437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 216 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 41818605 - 41818552
Alignment:
Q  216 ggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgtttat 269  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||    
T  41818605 ggtgtttaggtaaattaataaaaatagcttatcatatttttataagctgcttat 41818552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 41)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Original strand, 29445486 - 29445677
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29445486 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagtttatctactcccataagcctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 29445585  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29445586 ttcataagctgtttatgccctattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 29445677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 154 - 342
Target Start/End: Original strand, 25999386 - 25999574
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25999386 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 25999485  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacct 342  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25999486 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacct 25999574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Original strand, 8042605 - 8042796
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  8042605 ccgtttggatgggcttattttgagcttatgtgagcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataagtaaaaatagtttatcatagt 8042704  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8042705 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 8042796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Original strand, 32244118 - 32244309
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32244118 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtggatttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagt 32244217  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32244218 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcttaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 32244309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 25494475 - 25494284
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25494475 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggtttatctattcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 25494376  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25494375 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctcctgcttaacaaggagcttatgaatttatgcaacctcct 25494284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 37698333 - 37698142
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37698333 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 37698234  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37698233 ttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 37698142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 154 - 343
Target Start/End: Original strand, 38856091 - 38856280
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38856091 ccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 38856190  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 343  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38856191 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 38856280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 154 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 42308095 - 42307906
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42308095 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggcgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 42307996  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 343  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42307995 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 42307906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 54870364 - 54870173
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  54870364 ccgtttggattggcttattttgagtttatgtgggtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatcgt 54870265  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54870264 ttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaatttttagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 54870173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 154 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 15520332 - 15520143
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  15520332 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaataacttatcatcgt 15520233  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 343  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15520232 ttcataaactgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 15520143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 156 - 345
Target Start/End: Original strand, 21581042 - 21581231
Alignment:
Q  156 gtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21581042 gtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaataacttatcatagttt 21581141  T
Q  256 cataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21581142 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccatctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacatcct 21581231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 20842538 - 20842347
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  20842538 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatctactcgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacaacttatcatagt 20842439  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20842438 ttcataagctgcttatatcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 20842347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 22175180 - 22174989
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22175180 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcatagt 22175081  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22175080 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 22174989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Original strand, 15520634 - 15520825
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  15520634 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttatcatagt 15520733  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15520734 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttttgtaacctcct 15520825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Original strand, 50528927 - 50529118
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  50528927 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcatagt 50529026  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  50529027 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagtttatgaatttatgtaacctcct 50529118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 156 - 345
Target Start/End: Original strand, 35226447 - 35226636
Alignment:
Q  156 gtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 255  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  35226447 gtttggattggcctattttgagcttatgtgggcttatctatttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaatcagcttatcatagttt 35226546  T
Q  256 cataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35226547 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcctaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 35226636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Original strand, 32359257 - 32359448
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32359257 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtggatttatctatttccataagcttttataaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagtttatcatagt 32359356  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32359357 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacctcct 32359448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 156 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 44609521 - 44609334
Alignment:
Q  156 gtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 255  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44609521 gtttggattggcttattttgagcttatgtggacttatctacttgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcatagttt 44609422  T
Q  256 cataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 343  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44609421 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagtttatgaatttatgtaacctc 44609334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 46452352 - 46452161
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  46452352 ccgtttggattggcttaagttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagt 46452253  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46452252 ttcataagttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagctcaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 46452161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Original strand, 20699147 - 20699338
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  20699147 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttatcatagt 20699246  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  20699247 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttaggaatttttgtaacctcct 20699338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Original strand, 38933944 - 38934134
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38933944 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtg-gcttatctactcccataagccttttcaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcatagt 38934042  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38934043 ttcataagctgcttatgtcatattttaataagtctaaatttccagtttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 38934134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 24835889 - 24835698
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  24835889 ccgtttggattgatttattttgagcttatatagacttatcaactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttattatagt 24835790  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24835789 ttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaaactcct 24835698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Original strand, 34700339 - 34700530
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34700339 ccgtttagattggtttattttgagcttatgtgggtttatttacttccataagcctttttaaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagcttatcatagt 34700438  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  34700439 ttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaatttttagtttaccctccggcttaagaagaagcttatgaatttatataacctcct 34700530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 54534516 - 54534327
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  54534516 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatggt 54534417  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    || |||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  54534416 tt-ataagctgcttatgccata-ttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcct 54534327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 154 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 12117848 - 12117659
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| | ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12117848 ccgtttgaattggcttattttgagcttatgtgggcttatctattcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagtttatcatagt 12117749  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 343  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12117748 ttcataagttgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccatctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 12117659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 160 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 42105155 - 42104970
Alignment:
Q  160 ggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcata 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42105155 ggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataaacatttttaaaggtgtttggataaaaaaataaaaatagtttatcatagtttcata 42105056  T
Q  260 agctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42105055 agctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctcatgcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 42104970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 156 - 340
Target Start/End: Original strand, 26122814 - 26122998
Alignment:
Q  156 gtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 255  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26122814 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctattcccatgagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagttt 26122913  T
Q  256 cataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaac 340  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  26122914 cataagctgcttatgtcatatttcaataagcctaaattttcagcttatcctccggcttaacaagtagcttatgaatttacgtaac 26122998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 157 - 345
Target Start/End: Original strand, 2895186 - 2895378
Alignment:
Q  157 tttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttc 256  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  2895186 tttgaattgacttattttgagcttatgtgggtttatctactcgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaaaaaattatcatagtttc 2895285  T
Q  257 ataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagct----tatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    ||||||||||| |||||||||    
T  2895286 ataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatatatgaatttatataacctcct 2895378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 154 - 306
Target Start/End: Original strand, 35643215 - 35643367
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35643215 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgaacttatctacttccataagcctttttaaaggtgcttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 35643314  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccct 306  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35643315 ttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttgagcttaccct 35643367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 177 - 345
Target Start/End: Original strand, 44688782 - 44688949
Alignment:
Q  177 gcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgtttatgccatat 276  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  44688782 gcttatgtgggtttatctacttccataagcctttttaaagatgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatg-catat 44688880  T
Q  277 tttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  44688881 tttaataagcttaaattttcagcttaccctccggcttaacaatgagcttatgaatttatgcaacctcct 44688949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 156 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 48925189 - 48925002
Alignment:
Q  156 gtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 255  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  48925189 gtttggattggcttatttagagtttatatgggtttatctacttccataagcttttttaaaagt--ttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagttt 48925092  T
Q  256 cataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48925091 cataagctgtttatgtcatattttaataagtctaaatttttagcttatcctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 48925002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 177 - 345
Target Start/End: Original strand, 16354367 - 16354535
Alignment:
Q  177 gcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgtttatgccatat 276  Q
    |||||| |||| ||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| |    
T  16354367 gcttatatgagattatctacactcataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaataacttatcatagtttcataagctgctaatgccatgt 16354466  T
Q  277 tttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16354467 tttaataagcctaaattttcagcttatcctcctgcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 16354535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 156 - 345
Target Start/End: Original strand, 53028225 - 53028406
Alignment:
Q  156 gtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| ||||||| ||||        ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  53028225 gtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctattcccataagtctttttagaggt--------aaataaataaaaatagcttatcatatttt 53028316  T
Q  256 cataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53028317 cataaactgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 53028406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 156 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 50529961 - 50529827
Alignment:
Q  156 gtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 255  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50529961 gtttggattgacttattttgagtttatgtggacttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 50529862  T
Q  256 cataagctgtttatgccatattttaataagcctaa 290  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  50529861 cataagctgcttatgccatattttaatgagcctaa 50529827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 198 - 341
Target Start/End: Original strand, 12915948 - 12916091
Alignment:
Q  198 tccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttca 297  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||    
T  12915948 tccataaatctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagtttatcataatttcataaactgcttatgtcatatttaaataagcttaagttttca 12916047  T
Q  298 gcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 341  Q
    ||||||||| ||| |||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  12916048 gcttaccctccggtttaagaaagagtttatgaatttatgtaacc 12916091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 154 - 284
Target Start/End: Original strand, 49128047 - 49128177
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| || |    
T  49128047 ccgtttggattgacttattttaaacttatgtgggcttatctactcctataagtctttttaaagatgtttgggtaaatcaataaaaataacttatcgtaat 49128146  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataa 284  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  49128147 ttcataagctgcttatgctatattttaataa 49128177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 270 - 345
Target Start/End: Original strand, 24366143 - 24366218
Alignment:
Q  270 gccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24366143 gccatattttaataagcataaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 24366218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 277 - 345
Target Start/End: Original strand, 13696914 - 13696982
Alignment:
Q  277 tttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13696914 tttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttgtgtaacctcct 13696982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 206
Target Start/End: Original strand, 24366093 - 24366142
Alignment:
Q  157 tttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagc 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  24366093 tttggattgacttattttgagcttatgtgggtttatctactcgcataagc 24366142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 310 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 50528916 - 50528883
Alignment:
Q  310 gcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50528916 gcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 50528883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 183
Target Start/End: Original strand, 40240486 - 40240515
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatg 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40240486 ccgtttggattgacttattttgagcttatg 40240515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 168; Significance: 5e-90; HSPs: 65)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 53717656 - 53717465
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53717656 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagtttatctactcccataagcctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 53717557  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53717556 ttcataagctgcttatgccctattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 53717465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Original strand, 54189546 - 54189737
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54189546 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactaacataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 54189645  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54189646 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 54189737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 154 - 344
Target Start/End: Original strand, 38055158 - 38055348
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  38055158 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatagt 38055257  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcc 344  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38055258 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttactctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcc 38055348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 156 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 28032902 - 28032713
Alignment:
Q  156 gtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 255  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28032902 gtttagattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtat 28032803  T
Q  256 cataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28032802 cataagctgcttatgccatattttaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 28032713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 154 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 23776651 - 23776463
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23776651 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 23776552  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacct 342  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23776551 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggatcttatgaatttatgtaacct 23776463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 19913822 - 19913631
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  19913822 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaattaaaacagcttatcatagt 19913723  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19913722 ttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 19913631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 30423756 - 30423566
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30423756 ccgtttggattggcttattttgagtttatgtgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 30423657  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30423656 ttcataagctgcttatgccatatttcaataagcataaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagctta-gaatttatgtaacctcct 30423566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 50055293 - 50055102
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  50055293 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaatgaaaatagcttatcatggt 50055194  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50055193 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 50055102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Original strand, 50353802 - 50353993
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  50353802 ccgtttggattggcttattttgagcttctgtgagcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatgatagt 50353901  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50353902 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaatttttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 50353993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 155 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 15241219 - 15241029
Alignment:
Q  155 cgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 254  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  15241219 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagtttatcatagtt 15241120  T
Q  255 tcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15241119 tcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 15241029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 154 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 1756956 - 1756767
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1756956 ccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatcatagt 1756857  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 343  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1756856 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 1756767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 6611552 - 6611361
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6611552 ccgtttggattggtttattttgagcttatgtggacttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 6611453  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6611452 ttcataagctgtttatgtcatattttgataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacctcct 6611361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 8591284 - 8591093
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||  ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8591284 ccgtttgacttggcttattttgagtttatgtgggtttatctacttctataagcctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 8591185  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8591184 ttcataagctgcttatgccatatgttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 8591093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Original strand, 20877048 - 20877239
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20877048 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagt 20877147  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  20877148 ttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatggatttacgtaacctcct 20877239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 40428912 - 40428721
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40428912 ccgtttgaattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 40428813  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40428812 ttcataagctgcttataccatattttgataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 40428721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 45424726 - 45424535
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45424726 ccgtttggattgacttattttgagcttatgttggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagt 45424627  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45424626 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 45424535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Original strand, 52139204 - 52139395
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52139204 ccgtttggattggcttattttgaacttatgtgggtttatctatttctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 52139303  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  52139304 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccatccggcttaacaagaagcttatgaatttatgtaacctcct 52139395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 156 - 345
Target Start/End: Original strand, 48909849 - 48910038
Alignment:
Q  156 gtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 255  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48909849 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataaacctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagttt 48909948  T
Q  256 cataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  48909949 cataagctgcttatgccatattttaacaaacctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaatctcct 48910038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Original strand, 1617085 - 1617276
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1617085 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatctattctcataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaataacttatcatagt 1617184  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1617185 ttcataagctgcttgtgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 1617276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 156 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 23704399 - 23704212
Alignment:
Q  156 gtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 255  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23704399 gtttggattggcttattttgagcttatatgagcttatctactcacataagccttttgaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagttt 23704300  T
Q  256 cataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 343  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23704299 cataagctgcttatgctatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 23704212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 27488840 - 27488649
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27488840 ccgtttggattggcttaagttgagcttatctgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 27488741  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27488740 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcttaaattttcagcttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacctcct 27488649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 162 - 345
Target Start/End: Original strand, 33703850 - 33704033
Alignment:
Q  162 attgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataag 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  33703850 attgacttattttgagcttatgtgagtttatctactcggataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacaacttatcatagtttcataag 33703949  T
Q  262 ctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33703950 ctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 33704033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 157 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 40680227 - 40680041
Alignment:
Q  157 tttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttc 256  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40680227 tttggattgacttattttgaatttatgtgagcttatctacttccataagtctttttaaaggtatttggataaataaataaaaatagcttatcatagtttc 40680128  T
Q  257 ataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 343  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40680127 ataagctgcttatgccatattttcataagcctaaatttttagcttacccttcggcttaacaagaagcttatgaatttatgtaacctc 40680041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 154 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 11639770 - 11639581
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||| | |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11639770 ccgtttggattggtttattttgaacttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 11639671  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 343  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11639670 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 11639581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 156 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 44379377 - 44379188
Alignment:
Q  156 gtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 255  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |  | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44379377 gtttggattgacttattttgagtttatataggcttatctacttccataaacctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagttt 44379278  T
Q  256 cataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44379277 cataagttgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgcaacctcct 44379188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 6688813 - 6688628
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6688813 ccgtttggattgacttattttgagtttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 6688714  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6688713 tt------ctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 6688628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 153 - 345
Target Start/End: Original strand, 16700781 - 16700973
Alignment:
Q  153 tccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 252  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16700781 tccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataaacctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcatag 16700880  T
Q  253 tttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16700881 tttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctagcttaacaaggagcttataaatttatgtaacctcct 16700973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 153 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 43290153 - 43289961
Alignment:
Q  153 tccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 252  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| | || | |||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43290153 tccgtttggattggcttattttgagcttttatgtgcttatctactcacataagcctttttaaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagcttatcatag 43290054  T
Q  253 tttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43290053 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaataaggagcttatgaatttatgtaacctcct 43289961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 2481600 - 2481409
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  2481600 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttatcatagt 2481501  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2481500 ttcataagctgcttatgccatattttaataagccaaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 2481409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Original strand, 14987793 - 14987984
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14987793 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatatactcccataagccattttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 14987892  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14987893 ttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctcttgcttaacaatgagcttatgaatttatgtaacctcct 14987984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Original strand, 31969682 - 31969873
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31969682 ccgtttgaattgatttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagt 31969781  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31969782 ttcataagctgcttatgctatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 31969873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 44785109 - 44784918
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44785109 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttgtaaaagtgtttgggtaaacaaataaaaatagcttatcatagt 44785010  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44785009 ttcataagttgcttatgccatattttaataagcctaaactttcagcttaccctccggcttaacaatgagcttatgaatttatgtaacctcct 44784918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Original strand, 54412629 - 54412820
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  54412629 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagt 54412728  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  54412729 ttcataagctgcttatgtcatattctaataagtctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcatatgaatttatgtaacctcct 54412820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 149 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 19165169 - 19164974
Alignment:
Q  149 taggtccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagccttttt-aaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttat 247  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19165169 taggaccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttat 19165070  T
Q  248 catagtttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19165069 catagtttcataagctgcttatgccata-tttaataagcctaaattttcagcttaccc-tcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 19164974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 146 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 35490974 - 35490778
Alignment:
Q  146 acttaggtcc-gtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagct 244  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| || | ||||| |||  ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35490974 acttaggtcccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatccactctcataagcttttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagct 35490875  T
Q  245 tatcatagtttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 341  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35490874 tatcatagtttcataagttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 35490778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 8932370 - 8932179
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| | | ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||    
T  8932370 ccgtttggattggcttattttgagcttatgcgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagcttaacgtagt 8932271  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8932270 ttcataagctgcttatgccatattttaataaacctaaattttcagcttacccttcagcttaacaaggaacttatgaatttatgtaacctcct 8932179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Original strand, 15669184 - 15669375
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15669184 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatctaatcacataagactttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcatagt 15669283  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15669284 ttcataagctgcttatgtcatactttaataagcctaaattttcagcttaccgtccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacctcct 15669375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 168 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 37968935 - 37968758
Alignment:
Q  168 ttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgttt 267  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37968935 ttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgctt 37968836  T
Q  268 atgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37968835 atgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcct 37968758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Original strand, 47632035 - 47632227
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaa-ggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 252  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||   |||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  47632035 ccgtttggattggcttattttgagtttatgtggacttatctactctcataaacctttttaaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttctcatag 47632134  T
Q  253 tttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47632135 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcttaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 47632227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 153 - 345
Target Start/End: Original strand, 53875657 - 53875849
Alignment:
Q  153 tccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 252  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||| | |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53875657 tccgtttggattggcttattttaagcttatgtgggcttatatactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 53875756  T
Q  253 tttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  53875757 ttttataagctgcttatgtcatatttcaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgcaacctcct 53875849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Original strand, 30171581 - 30171772
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30171581 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatcttattccataagcttttttaaaggtgtttggataaataaatgaaaatagcttatcatagt 30171680  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30171681 ttcataagctgcttataccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccttccggtttaacaaggagcttatgaatttatttaacctcct 30171772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Original strand, 37464722 - 37464913
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| | ||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  37464722 ccgtttgaattggcttattttgagcttatgtgggcttatctattcgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagtttatcatagt 37464821  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37464822 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagtttaccctccggtttaacaaagagcttatgaatttatgtaacctcct 37464913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 55345017 - 55344826
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  55345017 ccgtttgaattgacttattttgagcttatgtgggtttatctactctcataagcctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatatt 55344918  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    | ||| || ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55344917 tgcatgagttgtttataccatattttaataagccaaaattttcagcttaccatccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 55344826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 157 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 27583821 - 27583633
Alignment:
Q  157 tttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttc 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  27583821 tttggattgacttattttgagcttatgtaggcttatctactcccataagcttttttaaagatgtttggataaataaataaaaataacttatcatagttgc 27583722  T
Q  257 ataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27583721 ataagctgcttatgccatattttcataagcctaaatttttagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaatctcct 27583633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 27536292 - 27536105
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||  | | |||    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27536292 ccgtttggattggcttattttgagcttatacgggctta----ctcccataagccttcttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagt 27536197  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27536196 ttcataaactgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 27536105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 156 - 324
Target Start/End: Original strand, 28360433 - 28360602
Alignment:
Q  156 gtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28360433 gtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttttctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagttt 28360532  T
Q  256 cataagctgtttatgcca-tattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagct 324  Q
     |||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28360533 tataagctgcttatgccattatttttataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagct 28360602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Original strand, 53353056 - 53353255
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagctta----tgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 249  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||    | || | ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53353056 ccgtttggattggcttattttgagcttaattatatgggcttatctactcccatatgtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 53353155  T
Q  250 tagtttcataagctgtttatgccatatttta----ataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  53353156 tagtttcataagctgcttatgccatattttaatatataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatggatttatgtaacctcct 53353255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 162 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 38071504 - 38071327
Alignment:
Q  162 attgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataag 261  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38071504 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataatcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataag 38071405  T
Q  262 ctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacct 342  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38071404 ctgcttatgccatattttaataagcctgaattttcagtttac---ggggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacct 38071327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 155 - 341
Target Start/End: Original strand, 16703827 - 16704009
Alignment:
Q  155 cgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 254  Q
    ||||||||||||||||    ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16703827 cgtttggattgactta----gagcttatgtgaacttatctacttccataagcttttttaaagttgtttgaataaataaataaaaatagtttatcatagtt 16703922  T
Q  255 tcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 341  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  16703923 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagtttatcctccggcttaacaaggagcctataaatttatgtaacc 16704009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Original strand, 44375846 - 44376037
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcc-tttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 252  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||| | ||||||| |||||  |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44375846 ccgtttggattggcttattttaagcttatgtgggcttatcta-ttccaatagccatttttataggtgttcgggtaaataaataaaaatagtttatcatag 44375944  T
Q  253 tttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  44375945 tttcataaactgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaaaaaagagcttatgaatttatgtaacctcct 44376037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 139 - 302
Target Start/End: Original strand, 50053428 - 50053592
Alignment:
Q  139 ttttaacacttaggtcc-gtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaa 237  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||| ||   ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  50053428 ttttaacacttaggccccgtttggattggcttattttgagcttatatggacttatctactcccataagcctttttaaatgtgtttgggcaaataaataaa 50053527  T
Q  238 aatagcttatcatagtttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagctta 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  50053528 aatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagtctaaattttcatctta 50053592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 230 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 23269162 - 23269047
Alignment:
Q  230 taaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatga 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23269162 taaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgctatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatga 23269063  T
Q  330 atttatgtaacctcct 345  Q
    |||||||||| |||||    
T  23269062 atttatgtaatctcct 23269047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 167 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 44548320 - 44548185
Alignment:
Q  167 cttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgtt 266  Q
    ||||||| ||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||||||| | ||| ||||| ||||    
T  44548320 cttatttggagcttatgtgggcttatctactaacataagcctttttaaaggtgtttggataaatcaataaaaacatcttatcacaattttataagttgtt 44548221  T
Q  267 tatgccatattttaataagcctaaattttcagctta 302  Q
    |||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  44548220 tatgccctattttattaagcccaaattttaagctta 44548185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 271 - 345
Target Start/End: Original strand, 53408137 - 53408212
Alignment:
Q  271 ccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttc-ggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53408137 ccatattttattaagcctaaattttcagcttacccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 53408212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 154 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 23265949 - 23265865
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaa 238  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23265949 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcggataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaa 23265865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 219 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 51780845 - 51780763
Alignment:
Q  219 gtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagctt 301  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  51780845 gtttggataaatcaataaaaatagcttatcataatttcataagctgcttatgccatattttaataagcccaaattttaagctt 51780763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 160 - 302
Target Start/End: Original strand, 17493340 - 17493482
Alignment:
Q  160 ggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcata 259  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||   |||||||| | |||||| ||||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||  || ||| |||    
T  17493340 ggattgacttattttgaatttatatgaacatatctactcctataagcatttttaagggcgtttgagtaaatcaataaaaatatcttattctaattttata 17493439  T
Q  260 agctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagctta 302  Q
    ||||| |||| |||| |||||||||||  ||||||| ||||||    
T  17493440 agctgcttataccatgttttaataagctcaaattttgagctta 17493482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 295 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 23261937 - 23261887
Alignment:
Q  295 tcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23261937 tcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 23261887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 240 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 55344781 - 55344724
Alignment:
Q  240 tagcttatcatagtttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttca 297  Q
    |||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  55344781 tagcttatcatattttcatgagttgtttatgccatattttaataagccaaaattttca 55344724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 162 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 46257393 - 46257269
Alignment:
Q  162 attgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataag 261  Q
    |||| |||||||| || |||||| ||||||||||||  ||||||| |||  |||  ||||||||||||| |||  ||| || |||||| | |||||||||    
T  46257393 attggcttattttaagtttatgtaagtttatctactgacataagcatttacaaaattgtttgggtaaatcaattgaaagagtttatcacaatttcataag 46257294  T
Q  262 ctgtttatgccatattttaataagc 286  Q
    |||||||| | ||| ||||||||||    
T  46257293 ctgtttattctatagtttaataagc 46257269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 308 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 9595940 - 9595903
Alignment:
Q  308 cggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9595940 cggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 9595903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 309 - 345
Target Start/End: Original strand, 50055301 - 50055337
Alignment:
Q  309 ggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50055301 ggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 50055337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 292 - 345
Target Start/End: Original strand, 48748197 - 48748250
Alignment:
Q  292 ttttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    |||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  48748197 ttttcagcataccctccgtcttaataaggagcttatgaatttatgtaatctcct 48748250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 255 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 9595982 - 9595946
Alignment:
Q  255 tcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaa 291  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  9595982 tcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaa 9595946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Original strand, 34615823 - 34615879
Alignment:
Q  148 ttaggtccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataa 204  Q
    ||||| ||||||| |||| |||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||    
T  34615823 ttaggcccgtttgaattggcttattttgaacttacgtaggtttatctacttccataa 34615879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 165; Significance: 3e-88; HSPs: 44)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 157 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 12101369 - 12101181
Alignment:
Q  157 tttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttc 256  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12101369 tttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttc 12101270  T
Q  257 ataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12101269 ataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctatggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 12101181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Original strand, 3511325 - 3511516
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3511325 ccgtttggattgtcttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaatagataaaaatagcttatcatagt 3511424  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3511425 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaatttttagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 3511516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 33359284 - 33359093
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33359284 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 33359185  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33359184 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 33359093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 43068167 - 43067976
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43068167 ccgtttggattgacttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 43068068  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43068067 ttcataagcttcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 43067976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 24792526 - 24792335
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24792526 ccgtttggattggcttaagttgagcttatctgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 24792427  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24792426 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 24792335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Original strand, 25748489 - 25748680
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25748489 ccgtttggattggcttaagttgagcttatattagtttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 25748588  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25748589 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 25748680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 154 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 30181218 - 30181031
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30181218 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 30181119  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 341  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30181118 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggaacttatgaatttatgtaacc 30181031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 154 - 343
Target Start/End: Original strand, 7164186 - 7164375
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7164186 ccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagtttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 7164285  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 343  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7164286 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 7164375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 157 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 42965187 - 42964999
Alignment:
Q  157 tttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttc 256  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42965187 tttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttc 42965088  T
Q  257 ataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42965087 ataagctgcttatgccatattttaataagcctaaatttttagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 42964999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Original strand, 5280862 - 5281053
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5280862 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatctattcacataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagt 5280961  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5280962 ttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 5281053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Original strand, 9452592 - 9452783
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  9452592 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgaacttatctattctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataagtaaaaatagtttatcatagt 9452691  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9452692 ttcataagctgtctatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacactccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 9452783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Original strand, 20346490 - 20346681
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20346490 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatcatagt 20346589  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20346590 ttcataagctgcttatgccatattttaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgaaacctcct 20346681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 155 - 345
Target Start/End: Original strand, 1803029 - 1803219
Alignment:
Q  155 cgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1803029 cgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 1803128  T
Q  255 tcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    |||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1803129 tcataagctgcttatacgatattttattaagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaagaagcttatgaatttatgtaacctcct 1803219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 155 - 345
Target Start/End: Original strand, 38866547 - 38866737
Alignment:
Q  155 cgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 254  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38866547 cgtttggatcgacttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataattttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtt 38866646  T
Q  255 tcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38866647 tcataagctgtttatgccatattttaataagcataaattttcagcttaccctccggcttaagaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 38866737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 156 - 345
Target Start/End: Original strand, 933289 - 933478
Alignment:
Q  156 gtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 255  Q
    ||||| |||| ||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  933289 gtttgaattggcttattttgagctcatgtggacttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagttt 933388  T
Q  256 cataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  933389 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 933478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 154 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 22649888 - 22649699
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  22649888 ccgtttgaattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcataat 22649789  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 343  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22649788 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 22649699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 36891023 - 36890833
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36891023 ccgtttggattgacttattt-gagcttatgtaggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 36890925  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36890924 ttcataagttgcttatgccatatttcaataagcctaagttttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 36890833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 153 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 4477516 - 4477324
Alignment:
Q  153 tccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 252  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4477516 tccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtcttttcaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatgg 4477417  T
Q  253 tttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4477416 tttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcct 4477324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Original strand, 42204156 - 42204348
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttt-taaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 252  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42204156 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagtcttttttaaaggtgtttgggtaaataagtaaaaatagcttatcatag 42204255  T
Q  253 tttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42204256 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgcaacctcct 42204348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 157 - 345
Target Start/End: Original strand, 43156718 - 43156906
Alignment:
Q  157 tttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttc 256  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43156718 tttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctattcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttc 43156817  T
Q  257 ataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  43156818 ataagctgtttatggcaaatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaagaacttatgaatttatgtaacctcct 43156906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 154 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 46134498 - 46134309
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  46134498 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctactcctataactctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaatagtttattatagt 46134399  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 343  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  46134398 ttcataagctgtttacgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttattaatttatgtaacctc 46134309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 157 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 12097781 - 12097593
Alignment:
Q  157 tttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttc 256  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12097781 tttggattggcttaagttgagcttatatgagcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatcatagtttc 12097682  T
Q  257 ataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12097681 ataagctacttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 12097593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 154 - 342
Target Start/End: Original strand, 32041544 - 32041732
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32041544 ccgtttggattggcttattttgtgcttatgtgggcttatctacttccataagtctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 32041643  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacct 342  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32041644 ttcataagctgcttatgtcatattttcataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttataaatttatgtaacct 32041732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 154 - 341
Target Start/End: Original strand, 4347275 - 4347462
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4347275 ccgtttggattgacttattttaagcttatgtgggcttatctactcccataaacttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttaccatagt 4347374  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 341  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4347375 ttcataagctgcttatgccatattttaacaagcctaaattttcagcttaccctcgagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 4347462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Original strand, 15655914 - 15656105
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  15655914 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctgctcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttatcatagt 15656013  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15656014 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaagaagcttatgaatttatgtaacctcct 15656105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 33846718 - 33846532
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33846718 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 33846619  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33846618 ttcataaactgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagctta-----gggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 33846532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 153 - 345
Target Start/End: Original strand, 42673466 - 42673654
Alignment:
Q  153 tccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 252  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    || ||||||||||||    
T  42673466 tccgtttggattgacttatttggagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaa----aacagcttatcatag 42673561  T
Q  253 tttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42673562 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 42673654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Original strand, 6394753 - 6394944
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  6394753 ccgtttagattggcttattttgagcttatgtgggcttatctattcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagtttatcatggt 6394852  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6394853 ttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagtttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcct 6394944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 154 - 339
Target Start/End: Original strand, 8630668 - 8630853
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||   |||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8630668 ccgtttggatttgtttattttgaggttatgtgggttgatctactcccataagcctttttaaaggtgttcgggtaaataaataaaaatagtttatcatagt 8630767  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 339  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8630768 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaa 8630853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Original strand, 17753602 - 17753793
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||   || ||||||||| | |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17753602 ccgtttggattagcttattttgagcttatacaagcttatctactcctataagccttttagaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttaacatagt 17753701  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17753702 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaatttttagcttacccttcaacttaacaaggagcttatgaatttatgtaatctcct 17753793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 184 - 345
Target Start/End: Original strand, 48865662 - 48865826
Alignment:
Q  184 tgagtttatctacttccataagcctttt---taaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgtttatgccatatttta 280  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  48865662 tgagcttatctacttccataagccttttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgccatatttta 48865761  T
Q  281 ataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    |||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48865762 ataagcctaaattttcagcttaacatcaggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 48865826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 46891534 - 46891342
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagccttttt-aaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 252  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |  | ||||||||| | |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  46891534 ccgtttggattggcttattttgagcttatataggcttatctactcctataaaccttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttgtcatag 46891435  T
Q  253 tttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  46891434 ttttataagctgcttatgtcatattttaattagcctaaattttcagcttacccttcagcttaacaaggagcttatgagtttatgtaacctcct 46891342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 184 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 16894671 - 16894510
Alignment:
Q  184 tgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgtttatgccatattttaata 283  Q
    |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16894671 tgagcttatctactcccataagcttttttaaaggtatttgggtaaacaaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 16894572  T
Q  284 agcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  16894571 agcctaaattttcagcttacccttcaacttaacagggagcttatgaatttatgtaacatcct 16894510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 154 - 297
Target Start/End: Original strand, 19828272 - 19828415
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| ||||||  | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19828272 ccgtttgaattggcttattttgagtttatgttggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggctaaataaataaaaatagcttatcatagt 19828371  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttca 297  Q
    |||||||  || |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19828372 ttcataaattgcttatgccatattttaataagccaaaattttca 19828415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 157 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 43021767 - 43021583
Alignment:
Q  157 tttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttc 256  Q
    ||||||||| |||||||| || |||||||   ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  43021767 tttggattggcttattttaagtttatgtggacttatctacttcaataagtctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaataacttattatagtttc 43021668  T
Q  257 ataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    |||||||| ||||| ||||||    |  | ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43021667 ataagctgcttatggcatatt----tcggtctaaattttcagcttactctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 43021583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 153 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 37006006 - 37005857
Alignment:
Q  153 tccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 252  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| ||     
T  37006006 tccgtttggattggcttattttaagcttatgtgagtttatctacttctataagtttttttaaaggcgtttgggtaaatcagtaaaaatagcttatcgtaa 37005907  T
Q  253 tttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagctta 302  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||    
T  37005906 tttcataagctgcttatgctatattttaataaggctaattttttagctta 37005857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 154 - 247
Target Start/End: Original strand, 37704982 - 37705075
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttat 247  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37704982 ccgtttgggttgacttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttat 37705075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 154 - 302
Target Start/End: Original strand, 43405022 - 43405170
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||  | ||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || |    
T  43405022 ccgtttgaattgacttattttaagcttatgttggcttatctactcctataagtctttttaaaggcgtttgggtaaatcaataaaaatagcttatcgtaat 43405121  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagctta 302  Q
    |||||||| ||||| | | ||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  43405122 ttcataagttgtttctactatattttaataagcccaattttttagctta 43405170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 154 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 36849731 - 36849590
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||| |||| ||||||  |||| |  ||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||| | |    
T  36849731 ccgtttggattgacttattcgaagcttatgtgggtttgtctactaacatatgtttttttaaaggtgtttggataaatcaataaaatcagcttatcacaat 36849632  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaatttt 295  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  36849631 ttcataaactgtttatgtcatattttaataagctcaaatttt 36849590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 154 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 30075422 - 30075277
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| | |   |||||||||||| |||||||||||||||| ||| |    
T  30075422 ccgtttggattgacttattttaagcttatgtgagtttatctactaacataagccctttcagatacgtttgggtaaat-aataaaaatagcttat-ata-t 30075326  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagctta 302  Q
    ||||||| | | |||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  30075325 ttcataaaccgcttataccatattttaataagccataattttgagctta 30075277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 157 - 286
Target Start/End: Original strand, 20163824 - 20163953
Alignment:
Q  157 tttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttc 256  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| |||   ||||| ||||| | || | |||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||    
T  20163824 tttggattgacttattttgggcttatatgagcttatttaccaacataatcctttgtgaatgcgtttgggtgaattaattaaaatagcttatcacagtttc 20163923  T
Q  257 ataagctgtttatgccatattttaataagc 286  Q
    |||||||| ||||  |||||||||| ||||    
T  20163924 ataagctgcttatagcatattttaacaagc 20163953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 155 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 15655605 - 15655458
Alignment:
Q  155 cgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 254  Q
    ||||||||||| |||||| | | |||||||||| || ||||||  |||||| |||||||||  | ||||| ||||| ||||||||||||||| || | ||    
T  15655605 cgtttggattggcttattctaaacttatgtgagcttgtctactaacataagtctttttaaaactatttggataaatcaataaaaatagcttaccacaatt 15655506  T
Q  255 tcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagctta 302  Q
    | |||| ||| |||| ||| ||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  15655505 ttataaactgcttataccaaattttaataagctcaaattttgagctta 15655458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 27691506 - 27691433
Alignment:
Q  168 ttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaata 241  Q
    |||||||||  |||| || | ||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27691506 ttattttgaatttatatgggcttatctactcccataaatctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaata 27691433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 182
Target Start/End: Original strand, 48865642 - 48865670
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttat 182  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  48865642 ccgtttggattgacttattttgagcttat 48865670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 165; Significance: 3e-88; HSPs: 23)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 153 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 34887497 - 34887305
Alignment:
Q  153 tccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34887497 tccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggtttatctcctcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 34887398  T
Q  253 tttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  34887397 tttcataagctgtttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagctaatgaatttatgtgacctcct 34887305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 3347727 - 3347536
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  3347727 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaacagcttatcatagt 3347628  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3347627 ttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 3347536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Original strand, 9459566 - 9459757
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9459566 ccgtttggattggcttattttgagtttatgtgagcttatctatttccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 9459665  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9459666 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtatcctcct 9459757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Original strand, 21893458 - 21893649
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21893458 ccgtttggatcgatttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaatatataaaaatagcttatcatagt 21893557  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21893558 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaatttttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 21893649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 26947080 - 26946889
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26947080 ccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 26946981  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26946980 ttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 26946889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 154 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 3955970 - 3955782
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3955970 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 3955871  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacct 342  Q
    ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3955870 ttcataaactgcttatgctatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacct 3955782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Original strand, 2837548 - 2837739
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2837548 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 2837647  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2837648 ttcatgagctgctcatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 2837739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 6086803 - 6086612
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6086803 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 6086704  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6086703 ttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 6086612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 155 - 345
Target Start/End: Original strand, 30691855 - 30692045
Alignment:
Q  155 cgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 254  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30691855 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 30691954  T
Q  255 tcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30691955 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccatctgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 30692045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 26704543 - 26704352
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||| ||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26704543 ccgtttggattggtttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 26704444  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26704443 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 26704352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 17261277 - 17261086
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  17261277 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttctaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttataatatt 17261178  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17261177 ttcataagctgcttatgctatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggaacttatgaatttatgtaacctcct 17261086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Original strand, 18613541 - 18613732
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18613541 ccgtttggattgacttattttgagcttatgcggacttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcatagt 18613640  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18613641 tccataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 18613732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 154 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 16307212 - 16307023
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  16307212 ccgtttggattgacttattttgagcttatgttggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttggataaataaataaaaacagcttatcatagt 16307113  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 343  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16307112 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcataaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 16307023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Original strand, 11167243 - 11167434
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| || || ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11167243 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgtgcttatttattttcataagtttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 11167342  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11167343 ttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttacccaccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 11167434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 148 - 345
Target Start/End: Original strand, 1153590 - 1153787
Alignment:
Q  148 ttaggtccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttat 247  Q
    ||||| || ||| ||||| |||||||| |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  1153590 ttaggcccttttagattggcttattttaagcttatgttggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataagtaaaaatagattat 1153689  T
Q  248 catagtttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  1153690 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggtgcttatgtatttatgtaacctcct 1153787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Original strand, 20726794 - 20726981
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||| |||||||||||    
T  20726794 ccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaa----taaaaataacttatcatagt 20726889  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20726890 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaatttttagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 20726981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 28199713 - 28199521
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctact--tccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28199713 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtggacttatcatctactccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 28199614  T
Q  252 gtttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    |||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28199613 gtttcatatgctgcttatgccat-tttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 28199521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 155 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 30699132 - 30698942
Alignment:
Q  155 cgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 254  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30699132 cgtttggattgacttattatgagtttatgtgagcttatttatttctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 30699033  T
Q  255 tcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30699032 ttattagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaatgagcttatgaatttatgtaacctcct 30698942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 154 - 337
Target Start/End: Original strand, 35198287 - 35198469
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    ||||||| |||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35198287 ccgtttgaattggcttattttgaacttatgtgggcttatctacttccataagc-tttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 35198385  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgt 337  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35198386 ttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagtttactctccggcttaacaaggaacttatgaatttatgt 35198469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 154 - 306
Target Start/End: Original strand, 52839 - 52991
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52839 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactaacataagcatttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 52938  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccct 306  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52939 ttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccct 52991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 221 - 345
Target Start/End: Original strand, 33464399 - 33464523
Alignment:
Q  221 ttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaagg 320  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33464399 ttgggtaaataagtaaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaagg 33464498  T
Q  321 agcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  33464499 agcttatgaatttatgtaacctcct 33464523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 244 - 345
Target Start/End: Original strand, 53001 - 53102
Alignment:
Q  244 ttatcatagtttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 343  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53001 ttatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 53100  T
Q  344 ct 345  Q
    ||    
T  53101 ct 53102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 154 - 229
Target Start/End: Original strand, 33463704 - 33463779
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaa 229  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33463704 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaa 33463779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 165; Significance: 3e-88; HSPs: 29)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 149 - 345
Target Start/End: Original strand, 4016035 - 4016231
Alignment:
Q  149 taggtccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 248  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||    
T  4016035 taggcccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagtttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtgaataaataaaaataacgtatc 4016134  T
Q  249 atagtttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4016135 atagtttcataagctgcttatgccatattttaacaagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 4016231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 156 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 33906249 - 33906060
Alignment:
Q  156 gtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 255  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33906249 gtttggattgacttattttgaacttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 33906150  T
Q  256 cataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33906149 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaagaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 33906060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 153 - 345
Target Start/End: Original strand, 42937719 - 42937912
Alignment:
Q  153 tccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 252  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  42937719 tccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagtttatctatttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatag 42937818  T
Q  253 tttcataagctgtttatgccatattttaat-aagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42937819 tttcataagctgcttatgccatattttaataaagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 42937912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 18807088 - 18806897
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18807088 ccgtttggattggcttattttgagcttatatgagcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 18806989  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18806988 ttcataagctgcttatgctatattttaataagcctaaatttttagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 18806897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 31517419 - 31517228
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31517419 ccgtttggattggcttattttgagcttatttgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 31517320  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31517319 ttcataaactgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaataaggagcttatgaatttatgtaacctcct 31517228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 155 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 3873447 - 3873259
Alignment:
Q  155 cgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 254  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3873447 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaatatagcttatcatagtt 3873348  T
Q  255 tcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 343  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3873347 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatataacctc 3873259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 28330041 - 28329852
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28330041 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctacacccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 28329942  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28329941 ttcataaactgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccct--agcttaacaaggagcatatgaatttatgtaacctcct 28329852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 154 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 4232346 - 4232157
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4232346 ccgtttggattggcttattttgtgcttatgtgggcttatctacttccataagtctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 4232247  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 343  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4232246 ttcataagctgcttatgccatattttcacaagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacctc 4232157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 154 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 26323390 - 26323201
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26323390 ccgtttggattggtttattttgagcttatgtggacttatctactcccataagtctttttaaagatgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagt 26323291  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 343  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26323290 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 26323201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 30270883 - 30270692
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  30270883 ccgtttggattggcttattttaagcttatatgagtttatctactcccataagcctttttaaaagtgtttggataaataaaataaaatagtttatcatagt 30270784  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30270783 ttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaatctcct 30270692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 154 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 19901341 - 19901153
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19901341 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttctctacttccataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataa-taaaaatagcttatcatagt 19901243  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 343  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19901242 ttcataaactgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcccacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 19901153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 154 - 338
Target Start/End: Original strand, 1108281 - 1108464
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1108281 ccgtttggatgg-cttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagt 1108379  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgta 338  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1108380 ttcataagttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgta 1108464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 6175032 - 6174841
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  6175032 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatatactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatagt 6174933  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  6174932 ttcataagctgcttatgtcatatttcattaagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttacgtgacctcct 6174841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 166 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 19384127 - 19383948
Alignment:
Q  166 acttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgt 265  Q
    |||||||||||| |||| |||| ||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  19384127 acttattttgagtttatatgagcttatctattctcataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagttgt 19384028  T
Q  266 ttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19384027 ttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 19383948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Original strand, 39635453 - 39635644
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39635453 ccgtttggattagcttattttgagcttatgtggacttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaatatagcttatcatagt 39635552  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  39635553 ttcataagctgcttatgtcatattttattaagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaacgagcttatcaatttatgtaacctcct 39635644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 153 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 1483107 - 1482916
Alignment:
Q  153 tccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 252  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  1483107 tccgttttgattggcttattttgagcttatgtgggcttatctact-ccataagcttttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattattg 1483009  T
Q  253 tttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1483008 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagtttacccttcgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacatcct 1482916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 168 - 345
Target Start/End: Original strand, 5733414 - 5733591
Alignment:
Q  168 ttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgttt 267  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||    
T  5733414 ttattttgagcttatgtgggcttatctactcccatcagcctttttaaaggtgtttgggtgaataaataaaaacaacttatcatagtttcataagctgctt 5733513  T
Q  268 atgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5733514 atgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgcaacctcct 5733591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 2178973 - 2178782
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    ||||||||||||| ||||||| || |||||||   ||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2178973 ccgtttggattgatttattttaagtttatgtggacttatctattcgcataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcatagt 2178874  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2178873 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 2178782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 153 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 16588981 - 16588790
Alignment:
Q  153 tccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 252  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | ||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16588981 tccgtttggattggcttattttgtgtttatgtgggcttatctactttcataagtctttttaaagaagtttgggtaaataaataaaaatagcttattatag 16588882  T
Q  253 tttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcc 344  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  16588881 tttcataagctgcttatgccatattttcataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaataaggagcttatgaattaatgtaacctcc 16588790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 157 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 16066495 - 16066307
Alignment:
Q  157 tttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttc 256  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16066495 tttgaattggcttattttgagcttatgtgggcttatctgctttcataagtcttttttaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttc 16066396  T
Q  257 ataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16066395 ataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctgatttaataaggagcttatgaatttatgtaacctcct 16066307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 154 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 30420371 - 30420223
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  30420371 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagg 30420272  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagctta 302  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30420271 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagctta 30420223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Original strand, 850998 - 851189
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||  |||||||| |||||||||  | |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |    
T  850998 ccgtttggatttgcttattttaagcttatgtaggcttatctactctcataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaatagagcttatcataat 851097  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  851098 tttataagctgcttatgccatattttaataagcttaaatttttagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 851189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 153 - 343
Target Start/End: Original strand, 429816 - 430006
Alignment:
Q  153 tccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 252  Q
    |||||||| |||  ||||||||||  |||||||  ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  429816 tccgtttgaattcccttattttgaatttatgtggatttatctactctcataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcataa 429915  T
Q  253 tttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 343  Q
    ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  429916 tttcataagttgcttatgcgatattttaataagcctaaattttcaacttacaattcgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 430006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 157 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 44947743 - 44947562
Alignment:
Q  157 tttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttc 256  Q
    |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44947743 tttgtattggcttattttgatcttatgtgagtttatctagtgccataagcatttttaaaagtgtttggataaataaataaaaatagtttatcatagtttc 44947644  T
Q  257 ataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    |||||||| |||||||||||||        |||||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  44947643 ataagctgcttatgccatattt-------gctaaattttcagtttaccctccggcttaacaagaagtttatgaatttatgtaacctcct 44947562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 108
Target Start/End: Original strand, 39953697 - 39953790
Alignment:
Q  20 ctatacttttcttttgccaattgtcatta-----aagaactgaaaagtgaaataatactccatattgctagattgaaaggggttgaatgagtgt 108  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39953697 ctatacttttcttttgtcaattgtcattaaattaaagaactgaaaagtgaaataatactccatattgctagattgaaaggggttgaatgagtgt 39953790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 154 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 42446773 - 42446625
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||| ||||||  ||| ||||| ||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | ||||||| | |    
T  42446773 ccgtttggattggcttattcggagtttatgcgaacttatctactaacataagcctttttaaaggtgtttaggtaaatcaataaaaacaacttatcacaat 42446674  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagctta 302  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||    
T  42446673 ttcataagctgcttatgccatattttaataagatcaaattttaagctta 42446625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 187 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 22101318 - 22101210
Alignment:
Q  187 gtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgtttatgccatattttaataagc 286  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||| | ||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  22101318 gtttatctactaacataagcctttttaaaggtatttgtataaatcaataaaaacaacttatcacaatttcataagctgcttatgtcatattttaataagc 22101219  T
Q  287 ctaaatttt 295  Q
    | |||||||    
T  22101218 ccaaatttt 22101210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 153 - 302
Target Start/End: Original strand, 3585290 - 3585439
Alignment:
Q  153 tccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 252  Q
    ||||||||||| | ||||||   ||||||||||  |||||| |||  ||||| |||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| |  |||||| |     
T  3585290 tccgtttggatcggcttattcaaagcttatgtggatttatccactaacataaaccttattaaatgtgttttggtaaattaataaaaacaatttatcacaa 3585389  T
Q  253 tttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagctta 302  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||    
T  3585390 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctgaattatgagctta 3585439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 12517385 - 12517256
Alignment:
Q  156 gtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 255  Q
    |||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||   |||||| ||  |||| |||||||| ||  | ||| |||| |||||||| || |||    
T  12517385 gtttggattggcttattta-agcttatgtgagcttatctactaaaataagctttcctaaaagtgtttggataccttaattaaaagagcttatcctaattt 12517287  T
Q  256 cataagctgtttatgccatattttaataagc 286  Q
    ||||||| | ||| || ||||||||| ||||    
T  12517286 cataagcagcttaagcaatattttaacaagc 12517256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 40)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Original strand, 14422706 - 14422897
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14422706 ccgtttggattggtttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 14422805  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14422806 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 14422897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Original strand, 18594540 - 18594731
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18594540 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 18594639  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18594640 ttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 18594731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Original strand, 39206589 - 39206780
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39206589 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 39206688  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39206689 ttcataagctgcttatgccatattttaataagtctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 39206780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 154 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 35118235 - 35118046
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35118235 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagccttttgaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 35118136  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 343  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35118135 ttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaagaagcttatgaatttatgtaacctc 35118046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 153 - 345
Target Start/End: Original strand, 144396 - 144588
Alignment:
Q  153 tccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  144396 tccgtttggattgacttattttgagcatatgtggacttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaagtaaataaaaatagtttatcatag 144495  T
Q  253 tttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  144496 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 144588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Original strand, 13110407 - 13110598
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13110407 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccatatgcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 13110506  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13110507 ttaataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgagtttatgtaacctcct 13110598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 22260834 - 22260643
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  22260834 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatctactcccataagtctttttaaaggcgtttgggtaaatcaataaaaatagcttatcctagt 22260735  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22260734 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 22260643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 24113370 - 24113179
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  24113370 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataaccctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagattatcatagt 24113271  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24113270 ttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 24113179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Original strand, 29938064 - 29938255
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29938064 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatatactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataagtaaaaatagcttatcatagt 29938163  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29938164 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 29938255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 155 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 2042727 - 2042537
Alignment:
Q  155 cgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 254  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2042727 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcatagtt 2042628  T
Q  255 tcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2042627 tcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 2042537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 155 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 10836958 - 10836770
Alignment:
Q  155 cgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 254  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10836958 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtt 10836859  T
Q  255 tcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 343  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10836858 tcataaactgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 10836770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 6144477 - 6144286
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6144477 ccgtttggattgacttattttgagcttatatgggcttatctactcccatatgcctttttaacagtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 6144378  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6144377 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcataaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 6144286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Original strand, 7791414 - 7791605
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7791414 ccgtttggattggcttattttgagtttatgtgagtttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatcatagt 7791513  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7791514 ttcataagctgcttatgtcatatttcaataagcttaaactttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 7791605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Original strand, 33278403 - 33278594
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||| ||   |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33278403 ccgtttggattggcttattttgagtttatatggacttatctactttcataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagtttatcatagt 33278502  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33278503 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 33278594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 155 - 345
Target Start/End: Original strand, 7774768 - 7774958
Alignment:
Q  155 cgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 254  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7774768 cgtttagattggcttattttgagcttatgcgggtttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatcatagtt 7774867  T
Q  255 tcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7774868 tcataagctgcttatgtcatattttattaagcttaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 7774958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 154 - 343
Target Start/End: Original strand, 7811998 - 7812187
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7811998 ccgttttgattggcttattttgagtttatgtgagtttatctacttccattagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatcatagt 7812097  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 343  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7812098 ttcataagctgcttatgtcatatttcaataagcttaaattttcagcttactctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 7812187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 156 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 34679659 - 34679470
Alignment:
Q  156 gtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 255  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34679659 gtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgaataaataaataaaaatagtttatcatagttt 34679560  T
Q  256 cataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34679559 cataagctgcttataccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaatgagcttatgaatttatgtaacctcct 34679470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 34842569 - 34842378
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34842569 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagt 34842470  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  34842469 ttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaatttccagcttacccaccgtcttaacaaggagcttattaatttatgtgacctcct 34842378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 34999100 - 34998909
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34999100 ccgtatggattggcttattttgagcttatacgggtttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcttagt 34999001  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  34999000 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttgccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatttaatctcct 34998909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Original strand, 39218780 - 39218971
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||     
T  39218780 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatggtttatcatagc 39218879  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  39218880 ttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagctgatgaatttatgtgacctcct 39218971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 153 - 343
Target Start/End: Original strand, 41575515 - 41575705
Alignment:
Q  153 tccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 252  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  41575515 tccgtttggattggcttattttgagcttatgtagacttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaattgcttatcatag 41575614  T
Q  253 tttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 343  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41575615 tttcataagctgcttatgtcatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 41575705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 157 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 44805145 - 44804957
Alignment:
Q  157 tttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttc 256  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44805145 tttgaattggcttattttgagcttatgtaggtttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttagataaataaataaaaatagcttatcatagtttc 44805046  T
Q  257 ataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44805045 ataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 44804957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Original strand, 4035850 - 4036041
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||||| || | ||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4035850 ccgtttggattggtttatttttagcttatatgggcttatctactcccataagttttattaaaggtgtttgggtaaacaaataaaaatagcttatcatagt 4035949  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4035950 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 4036041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 156 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 38167357 - 38167168
Alignment:
Q  156 gtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 255  Q
    |||||||||| | ||||||||| ||||||| | ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  38167357 gtttggattggcctattttgagtttatgtgggcttatctattcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaactagtttatcatagttt 38167258  T
Q  256 cataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38167257 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggcttaacaagaagcttatgaatttatgtaacctcct 38167168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 155 - 343
Target Start/End: Original strand, 42571598 - 42571783
Alignment:
Q  155 cgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 254  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42571598 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctacttccataagcctttttaaaagtgtttgggtaaat-aataaaaatagcttatcatagtt 42571696  T
Q  255 tcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 343  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  42571697 tcataagctgcttatgtcatatttcaat--gcctaaatttttagcttacccttcggcttaacaaggaacttatgaatttatgcaacctc 42571783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Original strand, 5320567 - 5320758
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  5320567 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagtttatctactcccataagcctttttaaagttgttttggtaaataaataaaaataatttatcatagt 5320666  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    |||||||| || ||||| ||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5320667 ttcataagttgcttatgtcatgtttcaataagcctaaattttcaacttaccatctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcct 5320758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 157 - 343
Target Start/End: Original strand, 36491163 - 36491349
Alignment:
Q  157 tttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttc 256  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||| | ||||||| |  |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36491163 tttggattggcttattttaagcttatgtgggattatctaatcgcataagtctttttgaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcatagtttc 36491262  T
Q  257 ataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 343  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36491263 ataacttgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaagaagcttatgaatttatgtaacctc 36491349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 154 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 33287229 - 33287077
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33287229 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggtttatctactcccatatgcttttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagtttatcatagt 33287130  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccct 306  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33287129 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccct 33287077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 154 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 40118056 - 40117904
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40118056 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 40117957  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccct 306  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40117956 ttcataagctgcttatgtcatattttaataagcttaaattttcagcttaccct 40117904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Original strand, 28639281 - 28639474
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccat----aagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 249  Q
    ||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| | ||    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  28639281 ccgtttgaattggcttattttaagcttatgtgagcttatctactcctatatacaagcttttttaaaggtgttttggtaaataaataaaaatagtttatca 28639380  T
Q  250 tagtttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||    
T  28639381 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacatagagcttatga--ttatgtaacctcct 28639474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 154 - 342
Target Start/End: Original strand, 8021722 - 8021902
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8021722 ccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagt 8021821  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacct 342  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||        | |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  8021822 ttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttca--------tccggcttaacaaggagcttatgagtttatataacct 8021902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 155 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 26783936 - 26783801
Alignment:
Q  155 cgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 254  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26783936 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaatatagcttatcatagtt 26783837  T
Q  255 tcataagctgtttatgccatattttaataagcctaa 290  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26783836 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaa 26783801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 153 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 66385 - 66192
Alignment:
Q  153 tccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 252  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| || |||  | ||||||| | ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  66385 tccgtttagattggcttattttgagtttctgtaggcttatctattcccatatgtctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaataacttataatag 66286  T
Q  253 tttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccc-ttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  66285 tttcataagctgcttatgccatatttcaataagtttaaattttcagcttaccctttcggcttaacaaggagcttatgaatttacgtgacctcct 66192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 230 - 345
Target Start/End: Original strand, 9807339 - 9807454
Alignment:
Q  230 taaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatga 329  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9807339 taaataaaaatagcttatcatagcttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaggagcttatga 9807438  T
Q  330 atttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||| ||||||||    
T  9807439 atttatgaaacctcct 9807454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 154 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 2322216 - 2322068
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||| ||||||  |||||||| ||  ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |    
T  2322216 ccgtttggattggcttattcggagcttatatggatttatctactaacataagcttttttaaaggtgtttgggtaaatcaataaaaacagcttatcacaat 2322117  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagctta 302  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  2322116 ttcataagctgcttatatcatattttgataagcctaaattttaagctta 2322068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 154 - 302
Target Start/End: Original strand, 39220259 - 39220407
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||  |||||||| |||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||   | |    
T  39220259 ccgtttgaattgacttattttgagcttatatgaacttatctacatccatatgtctttttaaaggtgtttgagtaaatcaataaaaatagcttattccaat 39220358  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagctta 302  Q
    ||||||||||| | || | ||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  39220359 ttcataagctgctcatactatattttaataagctcaaattttgagctta 39220407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 148 - 279
Target Start/End: Original strand, 5005162 - 5005294
Alignment:
Q  148 ttaggtcc-gtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 246  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  5005162 ttaggtcctgtttggattggcttatcttaagcttatgtgggcttatctacttccataagcttttttaaaggcgtttgggtaaatcaataaaaatagctta 5005261  T
Q  247 tcatagtttcataagctgtttatgccatatttt 279  Q
    |  || | |||||| ||| |||||| |||||||    
T  5005262 tgctactctcataaactgcttatgctatatttt 5005294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 154 - 238
Target Start/End: Original strand, 9806876 - 9806960
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaa 238  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| || | ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9806876 ccgtttggattgacttattttgagtttatatgtgcttatctactcccatatgcctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaa 9806960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 155 - 286
Target Start/End: Original strand, 18683714 - 18683844
Alignment:
Q  155 cgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 254  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||  ||| |||||||||  |||||||  ||| |||   |||||||||||| ||||||||||| ||||   | ||    
T  18683714 cgtttggactgacttattttaagcttattggagcttatctactaacataagctctttcaaatacgtttgggtaaat-aataaaaatagtttataccaatt 18683812  T
Q  255 tcataagctgtttatgccatattttaataagc 286  Q
    | |||||| | |||| ||||||||| ||||||    
T  18683813 ttataagccgcttataccatattttcataagc 18683844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 155 - 286
Target Start/End: Original strand, 18729276 - 18729406
Alignment:
Q  155 cgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 254  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||  ||| |||||||||  |||||||  ||| |||   |||||||||||| ||||||||||| ||||   | ||    
T  18729276 cgtttggactgacttattttaagcttattggagcttatctactaacataagctctttcaaatacgtttgggtaaat-aataaaaatagtttataccaatt 18729374  T
Q  255 tcataagctgtttatgccatattttaataagc 286  Q
    | |||||| | |||| ||||||||| ||||||    
T  18729375 ttataagccgcttataccatattttcataagc 18729406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 48)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Original strand, 25897375 - 25897566
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25897375 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcatatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 25897474  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25897475 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 25897566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Original strand, 26663259 - 26663450
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26663259 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagt 26663358  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26663359 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 26663450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 156 - 344
Target Start/End: Original strand, 38829072 - 38829260
Alignment:
Q  156 gtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 255  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38829072 gtttggattggcttattttgagcttatgtcggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 38829171  T
Q  256 cataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcc 344  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38829172 cataagctgcttgtgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcc 38829260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Original strand, 16052097 - 16052288
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16052097 ccgtttggattggcttattttgagtttatgtgggcttatctacttccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 16052196  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16052197 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctgaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 16052288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 42370999 - 42370808
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  42370999 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaaaaacttatcatagt 42370900  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42370899 ttcataagctgcttgtgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 42370808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Original strand, 46760967 - 46761158
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46760967 ccgtttggattgacttattttgaacttatatgagcttatctacttgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 46761066  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  46761067 ttcataaactgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacttcct 46761158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 156 - 345
Target Start/End: Original strand, 29078519 - 29078708
Alignment:
Q  156 gtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 255  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29078519 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 29078618  T
Q  256 cataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29078619 cataagctgcttatgccatattttaataaacctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 29078708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Original strand, 1168504 - 1168695
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1168504 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 1168603  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  1168604 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagtttatgaatttatgtaatctcct 1168695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 1940951 - 1940760
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1940951 ccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 1940852  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1940851 ttcataagttgtttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 1940760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 154 - 341
Target Start/End: Original strand, 32671580 - 32671767
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32671580 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtggatttatctactcccataagcctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 32671679  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 341  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32671680 ttcataagctacttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 32671767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Original strand, 33510485 - 33510676
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33510485 ccgtttggattggcttattttgagcttatatgagcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagtttatcatagt 33510584  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33510585 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 33510676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 39260550 - 39260359
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39260550 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 39260451  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39260450 ttcataagttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 39260359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Original strand, 29288150 - 29288339
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29288150 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagt 29288249  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  29288250 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaa--tatgtaacctcct 29288339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 1170648 - 1170457
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1170648 ccgtttggattggcttattttgagcttttgtgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcatagt 1170549  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1170548 ttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccatccggcttaacaaggagtttatgaatttatgtaacctcct 1170457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Original strand, 20089472 - 20089663
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20089472 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 20089571  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20089572 ttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 20089663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 26580474 - 26580283
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26580474 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctattcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaagtaaataaaaatagcttatcatagt 26580375  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26580374 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 26580283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 52753351 - 52753160
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52753351 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 52753252  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52753251 ttcataagctacttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccatctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 52753160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 156 - 342
Target Start/End: Original strand, 40092494 - 40092680
Alignment:
Q  156 gtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40092494 gtttggattgacttattttgagcttatatgagcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatatcttatcatagttt 40092593  T
Q  256 cataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacct 342  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40092594 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttatcttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacct 40092680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 154 - 342
Target Start/End: Original strand, 15203113 - 15203301
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15203113 ccgtttgaattgacttattttaagcttttgtgggtttatctactcccataagcctttttaaaggtgttagggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 15203212  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacct 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15203213 ttcataagctgtttatgccatatttcaataagcctaaattttcagccaaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacct 15203301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Original strand, 5215386 - 5215577
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5215386 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactttcataagcctttttaaagatgtttgggtaaataagtaaaaatagcttatcatagt 5215485  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5215486 ttcataagttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaacttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 5215577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 19715365 - 19715174
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19715365 ccgtttggattggtttattttgagcttatgtgagcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcattgt 19715266  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19715265 ttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaatttttagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 19715174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Original strand, 52696792 - 52696983
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  52696792 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttatcatagt 52696891  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52696892 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 52696983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 970730 - 970537
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc--ata 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||    
T  970730 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatcatata 970631  T
Q  252 gtttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  970630 gtttcataagctgcttatgccatattttaataaacctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaatctcct 970537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 156 - 345
Target Start/End: Original strand, 12682823 - 12683012
Alignment:
Q  156 gtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 255  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12682823 gtttggattgacttattttgagtttatgtgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 12682922  T
Q  256 cataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12682923 cataagctgcttatgccatattttcataagcctaaatctttagcttaccctccggcttaacaagaagcttatgaatttatgtaacctcct 12683012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 153 - 345
Target Start/End: Original strand, 43905654 - 43905846
Alignment:
Q  153 tccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 252  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43905654 tccgtttggattggcttattttgagcttatttgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 43905753  T
Q  253 tttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43905754 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaatttttagtttaccctccggcttaagaaggagcttatgaatttacgtaacctcct 43905846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 8079913 - 8079722
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8079913 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 8079814  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  8079813 ttcataagctacttatgccatattttaataagcctaagttttcagcttaccctctggcttaacaaggagtttatgaatttatgtaatctcct 8079722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 153 - 345
Target Start/End: Original strand, 46409435 - 46409629
Alignment:
Q  153 tccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46409435 tccgtttggattgacttattttgagcttatgtggacttatctaatctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 46409534  T
Q  253 tttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggc--ttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  46409535 tttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttacccttcgacaattaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcct 46409629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Original strand, 7145208 - 7145399
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttatttt-gagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 252  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  7145208 ccgtttggattgacttatttttgagcttatgtgtatttatctactcccataagcctttttaaaagtgtt-gggtaaataaacaaaaatagtttatcatag 7145306  T
Q  253 tttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7145307 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 7145399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 154 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 41928699 - 41928511
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||   ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41928699 ccgtttggattggcttattttgaacttatgtggacttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagt 41928600  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacct 342  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41928599 ttcataagctgcttatgccatattttaacaagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacct 41928511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 153 - 345
Target Start/End: Original strand, 8120869 - 8121061
Alignment:
Q  153 tccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 252  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  8120869 tccgtttggattggcttattttgagcttatgtggacttatctactcgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagtttatcatag 8120968  T
Q  253 tttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8120969 tttcataagctgcttatgtcatattttaataagcttaaattttcagtttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 8121061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Original strand, 17591692 - 17591880
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||| ||||||  ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17591692 ccgtttggattggcttatt--gagcttatgtg-gcttatctactcccataagccttttcaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcatagt 17591788  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17591789 ttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaatttccagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 17591880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Original strand, 6765460 - 6765651
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  6765460 ccgtttggattggcttattttgagtttatgtgaatttatctacttttataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatatt 6765559  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  6765560 ttcatgagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagtttatgaatttatgtaatctcct 6765651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 156 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 13996925 - 13996738
Alignment:
Q  156 gtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 255  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||    
T  13996925 gtttggattggcttattttgaaattatgtgggtttatctactcccataagcctttttaaagatgtttggataaataaataaaaatagcttataatggttt 13996826  T
Q  256 cataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 343  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13996825 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaggagtttatgaatttatgtaacctc 13996738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 155 - 345
Target Start/End: Original strand, 15717787 - 15717976
Alignment:
Q  155 cgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 254  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  |  |||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15717787 cgtttggattgacttattttgagtttatgttggcctatctaatttcataagcctttttaaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagctt-tcatagtt 15717885  T
Q  255 tcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15717886 tcataagctgcttatgccataatttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgattttatgtaacctcct 15717976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Original strand, 2347657 - 2347849
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||   |||||||||| ||||| | | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2347657 ccgtttggatttgtttattttgagtttatgcgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagt 2347756  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccata-ttttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2347757 ttcataagctgcttatgtcatatttttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaatgagcttatgaatttatgtaacctcct 2347849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 169 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 17587694 - 17587518
Alignment:
Q  169 tattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgttta 268  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||    
T  17587694 tattttgagcttatgtgagcttatctattcgcataagcctttttaaaggtgtttggctaaataaataaaaacagcttatcatattttcataagctgctta 17587595  T
Q  269 tgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17587594 tgccatattttaataagcctaaattttcagcttacactctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 17587518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 153 - 340
Target Start/End: Original strand, 49146172 - 49146359
Alignment:
Q  153 tccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 252  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  49146172 tccgtttggattggtttattttgagcttatgtggatttatatactcccataagtttttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatag 49146271  T
Q  253 tttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaac 340  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  49146272 tttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcatcttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaac 49146359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 51359420 - 51359230
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  51359420 ccgtttggattggcttattttgagcttatgcgggcttatttactgccataagccttcttaaaggt-tttgggtaaataattaaaaatagcttatcatagt 51359322  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  51359321 ttcataaggtgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagtttatgaatttatgtaacctcct 51359230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 144 - 345
Target Start/End: Original strand, 2473712 - 2473914
Alignment:
Q  144 acacttaggtcc-gtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatag 242  Q
    |||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2473712 acacttaggtcccgtttggatcggtttattttgagcttatgtgggcttatctacgcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatag 2473811  T
Q  243 cttatcatagtttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacct 342  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2473812 cttattatagtttcataagctgcttatgtcatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctcctacttaacaaggagcttatgaatttatgttacct 2473911  T
Q  343 cct 345  Q
    |||    
T  2473912 cct 2473914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 156 - 343
Target Start/End: Original strand, 23498463 - 23498650
Alignment:
Q  156 gtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 255  Q
    ||||| |||| |||||||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  23498463 gtttgaattggcttattttaagcttatgtgggcttatctacttccacaagcctttttcaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttcatcatagttt 23498562  T
Q  256 cataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 343  Q
    |||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23498563 cataagttgcttatatcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 23498650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 184 - 345
Target Start/End: Original strand, 40149494 - 40149655
Alignment:
Q  184 tgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgtttatgccatattttaata 283  Q
    |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  40149494 tgagcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaataatttatcatagttttataagctgcttatgtcatattttaata 40149593  T
Q  284 agcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40149594 agcctaaattttcagtttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 40149655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 15554348 - 15554165
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |            
T  15554348 ccgtttggattggcttaagttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcat-------- 15554257  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15554256 ttcataaactgctgatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 15554165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 156 - 319
Target Start/End: Original strand, 29695678 - 29695842
Alignment:
Q  156 gtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataa-gcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 254  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  29695678 gtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcccataatttttttttaaaggtgtttggataaataaataaaaataatttatcatagtt 29695777  T
Q  255 tcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaag 319  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  29695778 tcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaag 29695842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 156 - 282
Target Start/End: Original strand, 52086270 - 52086396
Alignment:
Q  156 gtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 255  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| |||    
T  52086270 gtttggattgacttattttaagcttatgtgggtttatctgctcccataaacctttttaaaggtgtttgggtaaatcagtaaaaataacttatcataattt 52086369  T
Q  256 cataagctgtttatgccatattttaat 282  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  52086370 cataagctgcttatgccataatttaat 52086396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 153 - 345
Target Start/End: Original strand, 38171832 - 38172011
Alignment:
Q  153 tccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 252  Q
    |||||||| |||||||||||||||  ||||||||  |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  38171832 tccgtttgcattgacttattttgaatttatgtgaacttatctactcacataaacctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaacagtttatcatag 38171931  T
Q  253 tttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    |||||||||||| |||||              |||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  38171932 tttcataagctgcttatg-------------tgcctaaattttcagcttatcctccggcttaagaatgagcttatgaatttatgtaacctcct 38172011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 167 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 23323031 - 23322897
Alignment:
Q  167 cttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgtt 266  Q
    |||||||||||||||| |  | ||||||||| |||||| | ||||| |||| |||||  ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |    
T  23323031 cttattttgagcttatataggcttatctactcccataaactttttttaaggcgtttgaataaatcaataaaaatagtttatcataatttcataagctgct 23322932  T
Q  267 tatgccatattttaataagcctaaattttcagctt 301  Q
    |||| |||| ||||||||||  ||||||| |||||    
T  23322931 tatgtcatactttaataagcgcaaattttaagctt 23322897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 155 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 5217986 - 5217840
Alignment:
Q  155 cgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 254  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||| ||| |||||||||  |||||||  ||| |||    ||||||||||| ||||||||||||||||   | ||    
T  5217986 cgtttggattggcttattttaagcttatgagagcttatctactaacataagctctttcaaatacatttgggtaaat-aataaaaatagcttataccaatt 5217888  T
Q  255 tcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagctta 302  Q
    |||||||| | |||| ||||||||| |||||||  |||||| ||||||    
T  5217887 tcataagccgcttataccatatttttataagccataattttgagctta 5217840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 224
Target Start/End: Original strand, 5675106 - 5675176
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgg 224  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||  ||||||| |||| |||| |||||||    
T  5675106 ccgtttggattggcttattttaagcttatgttagcttatctactaacataagctttttgaaagatgtttgg 5675176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 160; Significance: 3e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 23155 - 22964
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| || | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23155 ccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 23056  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23055 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 22964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 156; Significance: 8e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 145449 - 145258
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  145449 ccgtttggattgacttattttgagtttatgtggacttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 145350  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  145349 ttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttataaatttatgtaacctcct 145258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 156; Significance: 8e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Original strand, 36706 - 36897
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36706 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 36805  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36806 ttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 36897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0172 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0172
Description:

Target: scaffold0172; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Original strand, 10239 - 10430
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10239 ccgtttggattgacttattttgagcttatatgggtttatctactctcataagccttcttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagt 10338  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10339 ttcataagctgcttataccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 10430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0482 (Bit Score: 148; Significance: 5e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0482
Description:

Target: scaffold0482; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 499 - 308
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  499 ccgtttggattggcttattttgagtttatgtgagtttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatcatagt 400  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  399 ttcataagctgcttatgtcatatttcaataagcttaaactttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0920 (Bit Score: 146; Significance: 7e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0920
Description:

Target: scaffold0920; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 154 - 343
Target Start/End: Original strand, 3711 - 3900
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||| | |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3711 ccgtttggattggtttattttgaacttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 3810  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 343  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3811 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 3900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1777 (Bit Score: 140; Significance: 3e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold1777
Description:

Target: scaffold1777; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 210 - 19
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 253  Q
    ||||||| |||| ||||  ||||| |||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  210 ccgtttgtattggcttaagttgagtttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 111  T
Q  254 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  110 ttcataagctgcttatgccatattttaataatcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 19  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 211 - 19
Alignment:
Q  154 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctact--tccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  211 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtggacttatcatctactccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 112  T
Q  252 gtttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 345  Q
    |||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  111 gtttcatatgctgcttatgccat-tttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 19  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University