View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5878_high_4 (Length: 367)

Name: NF5878_high_4
Description: NF5878
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5878_high_4
NF5878_high_4
[»] chr5 (32 HSPs)
chr5 (18-367)||(38598450-38598800)
chr5 (163-367)||(9008057-9008261)
chr5 (163-367)||(16069357-16069561)
chr5 (166-364)||(1165604-1165802)
chr5 (163-367)||(8374339-8374542)
chr5 (163-367)||(33491196-33491400)
chr5 (163-367)||(33991144-33991348)
chr5 (163-364)||(1579040-1579241)
chr5 (163-364)||(1605574-1605775)
chr5 (162-367)||(24105671-24105876)
chr5 (163-367)||(27679169-27679373)
chr5 (164-367)||(16737447-16737650)
chr5 (160-367)||(3386486-3386693)
chr5 (162-367)||(31883147-31883352)
chr5 (163-367)||(4120941-4121145)
chr5 (163-367)||(19358530-19358734)
chr5 (163-363)||(27420862-27421062)
chr5 (163-366)||(5202976-5203179)
chr5 (163-367)||(3921585-3921789)
chr5 (163-367)||(20992146-20992350)
chr5 (163-367)||(35782644-35782848)
chr5 (164-364)||(31410481-31410681)
chr5 (208-367)||(27025005-27025164)
chr5 (193-367)||(26602942-26603116)
chr5 (165-294)||(20992354-20992487)
chr5 (161-300)||(33284642-33284781)
chr5 (19-120)||(38867750-38867851)
chr5 (309-367)||(35420424-35420482)
chr5 (171-295)||(31638157-31638281)
chr5 (163-311)||(25634586-25634732)
chr5 (225-278)||(41818552-41818605)
chr5 (329-360)||(27024822-27024853)
[»] chr4 (66 HSPs)
chr4 (163-367)||(53717452-53717656)
chr4 (163-367)||(54189546-54189750)
chr4 (163-367)||(19913618-19913822)
chr4 (163-367)||(38055158-38055362)
chr4 (164-367)||(15241016-15241219)
chr4 (163-365)||(23776449-23776651)
chr4 (165-367)||(28032700-28032902)
chr4 (163-364)||(30423556-30423756)
chr4 (163-367)||(1756752-1756956)
chr4 (163-367)||(6611348-6611552)
chr4 (163-367)||(40428708-40428912)
chr4 (163-367)||(50353802-50354006)
chr4 (163-364)||(52139204-52139405)
chr4 (163-367)||(1617085-1617289)
chr4 (163-367)||(8591080-8591284)
chr4 (163-367)||(27488636-27488840)
chr4 (171-367)||(33703850-33704046)
chr4 (163-367)||(45424522-45424726)
chr4 (165-365)||(48909849-48910049)
chr4 (163-366)||(20877048-20877251)
chr4 (163-358)||(50055098-50055293)
chr4 (165-367)||(44379175-44379377)
chr4 (163-367)||(6688615-6688813)
chr4 (162-367)||(16700781-16700986)
chr4 (166-367)||(40680026-40680227)
chr4 (163-367)||(2481396-2481600)
chr4 (163-367)||(31969682-31969886)
chr4 (163-367)||(44784905-44785109)
chr4 (163-367)||(54412629-54412833)
chr4 (162-364)||(43289951-43290153)
chr4 (155-367)||(35490761-35490974)
chr4 (163-367)||(8932166-8932370)
chr4 (163-367)||(11639566-11639770)
chr4 (163-367)||(14987793-14987997)
chr4 (165-364)||(23704200-23704399)
chr4 (177-366)||(37968746-37968935)
chr4 (162-367)||(53875657-53875862)
chr4 (163-367)||(15669184-15669388)
chr4 (163-367)||(30171581-30171785)
chr4 (163-367)||(37464722-37464926)
chr4 (158-367)||(19164961-19165169)
chr4 (163-367)||(47632035-47632240)
chr4 (163-367)||(55344813-55345017)
chr4 (163-367)||(27536092-27536292)
chr4 (166-367)||(27583620-27583821)
chr4 (163-366)||(53353056-53353267)
chr4 (164-364)||(16703827-16704023)
chr4 (165-333)||(28360433-28360602)
chr4 (171-367)||(38071314-38071504)
chr4 (163-358)||(44375846-44376041)
chr4 (239-367)||(23269034-23269162)
chr4 (148-311)||(50053428-50053592)
chr4 (280-367)||(53408137-53408225)
chr4 (176-311)||(44548185-44548320)
chr4 (163-247)||(23265865-23265949)
chr4 (304-367)||(23261874-23261937)
chr4 (228-310)||(51780763-51780845)
chr4 (317-367)||(9595890-9595940)
chr4 (318-367)||(50055301-50055350)
chr4 (169-311)||(17493340-17493482)
chr4 (301-367)||(48748197-48748263)
chr4 (249-306)||(55344724-55344781)
chr4 (171-295)||(46257269-46257393)
chr4 (333-367)||(55344681-55344715)
chr4 (264-300)||(9595946-9595982)
chr4 (157-213)||(34615823-34615879)
[»] chr7 (44 HSPs)
chr7 (166-367)||(12101168-12101369)
chr7 (163-365)||(3511325-3511527)
chr7 (163-367)||(33359080-33359284)
chr7 (163-367)||(43067963-43068167)
chr7 (163-367)||(24792322-24792526)
chr7 (163-367)||(30181014-30181218)
chr7 (166-367)||(42964986-42965187)
chr7 (163-367)||(5280862-5281066)
chr7 (163-367)||(9452592-9452796)
chr7 (163-367)||(20346490-20346694)
chr7 (163-367)||(25748489-25748693)
chr7 (164-367)||(1803029-1803232)
chr7 (163-367)||(7164186-7164390)
chr7 (163-366)||(36890821-36891023)
chr7 (164-367)||(38866547-38866750)
chr7 (165-367)||(933289-933491)
chr7 (162-367)||(4477311-4477516)
chr7 (163-367)||(42204156-42204361)
chr7 (163-367)||(22649684-22649888)
chr7 (166-365)||(43156718-43156917)
chr7 (166-367)||(12097580-12097781)
chr7 (163-367)||(15655914-15656118)
chr7 (163-367)||(33846519-33846718)
chr7 (162-367)||(42673466-42673667)
chr7 (163-367)||(46134294-46134498)
chr7 (163-367)||(6394753-6394957)
chr7 (163-367)||(32041544-32041748)
chr7 (163-367)||(4347275-4347478)
chr7 (163-367)||(8630668-8630872)
chr7 (163-367)||(17753602-17753806)
chr7 (193-365)||(48865662-48865837)
chr7 (163-367)||(46891329-46891534)
chr7 (193-367)||(16894497-16894671)
chr7 (166-367)||(43021570-43021767)
chr7 (163-306)||(19828272-19828415)
chr7 (162-311)||(37005857-37006006)
chr7 (163-256)||(37704982-37705075)
chr7 (163-363)||(43405022-43405223)
chr7 (163-304)||(36849590-36849731)
chr7 (163-311)||(30075277-30075422)
chr7 (166-295)||(20163824-20163953)
chr7 (164-311)||(15655458-15655605)
chr7 (177-250)||(27691433-27691506)
chr7 (163-191)||(48865642-48865670)
[»] chr6 (23 HSPs)
chr6 (162-367)||(34887292-34887497)
chr6 (163-367)||(3347523-3347727)
chr6 (163-367)||(9459566-9459770)
chr6 (163-367)||(21893458-21893662)
chr6 (163-367)||(26946876-26947080)
chr6 (163-367)||(2837548-2837752)
chr6 (163-367)||(6086599-6086803)
chr6 (164-367)||(30691855-30692058)
chr6 (163-367)||(26704339-26704543)
chr6 (163-367)||(17261073-17261277)
chr6 (163-367)||(18613541-18613745)
chr6 (163-367)||(3955769-3955970)
chr6 (163-367)||(11167243-11167447)
chr6 (163-367)||(20726794-20726994)
chr6 (163-367)||(28199508-28199713)
chr6 (157-367)||(1153590-1153800)
chr6 (163-360)||(16307015-16307212)
chr6 (164-362)||(30698934-30699132)
chr6 (163-366)||(35198287-35198489)
chr6 (230-367)||(33464399-33464536)
chr6 (163-315)||(52839-52991)
chr6 (253-367)||(53001-53115)
chr6 (163-238)||(33463704-33463779)
[»] chr2 (29 HSPs)
chr2 (158-367)||(4016035-4016244)
chr2 (162-367)||(42937719-42937925)
chr2 (165-367)||(33906047-33906249)
chr2 (163-367)||(18806884-18807088)
chr2 (163-367)||(31517215-31517419)
chr2 (164-367)||(3873244-3873447)
chr2 (163-367)||(28329839-28330041)
chr2 (163-367)||(26323186-26323390)
chr2 (163-367)||(4232142-4232346)
chr2 (163-367)||(6174828-6175032)
chr2 (163-367)||(30270679-30270883)
chr2 (163-366)||(39635453-39635656)
chr2 (162-367)||(1482903-1483107)
chr2 (175-364)||(19383938-19384127)
chr2 (163-362)||(19901143-19901341)
chr2 (177-367)||(5733414-5733604)
chr2 (163-367)||(2178769-2178973)
chr2 (163-347)||(1108281-1108464)
chr2 (162-367)||(16588776-16588981)
chr2 (163-367)||(850998-851202)
chr2 (166-359)||(16066302-16066495)
chr2 (163-365)||(30420181-30420371)
chr2 (162-363)||(429816-430017)
chr2 (166-367)||(44947549-44947743)
chr2 (29-117)||(39953697-39953790)
chr2 (163-311)||(42446625-42446773)
chr2 (196-304)||(22101210-22101318)
chr2 (162-311)||(3585290-3585439)
chr2 (165-295)||(12517256-12517385)
[»] chr8 (40 HSPs)
chr8 (163-367)||(14422706-14422910)
chr8 (163-367)||(18594540-18594744)
chr8 (163-367)||(39206589-39206793)
chr8 (162-367)||(144396-144601)
chr8 (163-367)||(13110407-13110611)
chr8 (163-367)||(22260630-22260834)
chr8 (163-367)||(24113166-24113370)
chr8 (163-367)||(29938064-29938268)
chr8 (163-367)||(35118031-35118235)
chr8 (164-365)||(2042526-2042727)
chr8 (163-367)||(6144273-6144477)
chr8 (163-367)||(7791414-7791618)
chr8 (164-367)||(10836755-10836958)
chr8 (163-367)||(33278403-33278607)
chr8 (164-367)||(7774768-7774971)
chr8 (163-367)||(7811998-7812202)
chr8 (163-367)||(34842365-34842569)
chr8 (163-367)||(34998896-34999100)
chr8 (163-366)||(39218780-39218983)
chr8 (165-367)||(34679457-34679659)
chr8 (162-366)||(41575515-41575719)
chr8 (166-366)||(44804945-44805145)
chr8 (163-366)||(4035850-4036053)
chr8 (164-367)||(42571598-42571798)
chr8 (165-363)||(38167159-38167357)
chr8 (163-367)||(5320567-5320771)
chr8 (166-367)||(36491163-36491364)
chr8 (163-364)||(33287040-33287229)
chr8 (163-364)||(28639281-28639484)
chr8 (163-315)||(40117904-40118056)
chr8 (163-367)||(8021722-8021918)
chr8 (162-366)||(66180-66385)
chr8 (164-299)||(26783801-26783936)
chr8 (239-364)||(9807339-9807464)
chr8 (163-311)||(2322068-2322216)
chr8 (163-311)||(39220259-39220407)
chr8 (157-288)||(5005162-5005294)
chr8 (163-247)||(9806876-9806960)
chr8 (164-295)||(18683714-18683844)
chr8 (164-295)||(18729276-18729406)
[»] chr3 (41 HSPs)
chr3 (163-367)||(8042605-8042809)
chr3 (163-367)||(25999386-25999590)
chr3 (163-367)||(29445486-29445690)
chr3 (163-367)||(25494271-25494475)
chr3 (163-367)||(37698129-37698333)
chr3 (163-362)||(32244118-32244317)
chr3 (163-366)||(42307892-42308095)
chr3 (165-367)||(21581042-21581244)
chr3 (163-367)||(15520128-15520332)
chr3 (163-367)||(20842334-20842538)
chr3 (163-367)||(22174976-22175180)
chr3 (163-367)||(38856091-38856295)
chr3 (163-367)||(54870160-54870364)
chr3 (163-367)||(50528927-50529131)
chr3 (163-366)||(15520634-15520837)
chr3 (165-367)||(35226447-35226649)
chr3 (163-367)||(32359257-32359461)
chr3 (163-366)||(46452149-46452352)
chr3 (165-367)||(44609319-44609521)
chr3 (163-367)||(38933944-38934147)
chr3 (163-366)||(20699147-20699350)
chr3 (163-367)||(54534314-54534516)
chr3 (166-367)||(2895186-2895391)
chr3 (163-367)||(12117644-12117848)
chr3 (163-366)||(24835686-24835889)
chr3 (169-367)||(42104957-42105155)
chr3 (165-366)||(26122814-26123015)
chr3 (163-367)||(34700339-34700543)
chr3 (186-366)||(44688782-44688961)
chr3 (165-367)||(48924989-48925189)
chr3 (165-367)||(53028225-53028419)
chr3 (163-315)||(35643215-35643367)
chr3 (186-367)||(16354367-16354548)
chr3 (165-299)||(50529827-50529961)
chr3 (207-364)||(12915948-12916105)
chr3 (279-366)||(24366143-24366230)
chr3 (163-293)||(49128047-49128177)
chr3 (286-367)||(13696914-13696995)
chr3 (319-367)||(50528868-50528916)
chr3 (166-215)||(24366093-24366142)
chr3 (163-192)||(40240486-40240515)
[»] chr1 (48 HSPs)
chr1 (163-367)||(25897375-25897579)
chr1 (163-367)||(26663259-26663463)
chr1 (163-367)||(42370795-42370999)
chr1 (163-366)||(16052097-16052300)
chr1 (163-366)||(46760967-46761170)
chr1 (165-367)||(38829072-38829274)
chr1 (165-366)||(29078519-29078720)
chr1 (163-367)||(32671580-32671784)
chr1 (163-367)||(33510485-33510689)
chr1 (163-367)||(39260346-39260550)
chr1 (163-367)||(29288150-29288352)
chr1 (163-367)||(1168504-1168708)
chr1 (163-367)||(1940747-1940951)
chr1 (163-367)||(20089472-20089676)
chr1 (163-367)||(52753147-52753351)
chr1 (163-364)||(1170447-1170648)
chr1 (163-367)||(15203113-15203317)
chr1 (163-367)||(19715161-19715365)
chr1 (163-367)||(26580270-26580474)
chr1 (163-367)||(970524-970730)
chr1 (165-367)||(12682823-12683025)
chr1 (163-367)||(5215386-5215590)
chr1 (162-367)||(46409435-46409642)
chr1 (163-367)||(52696792-52696996)
chr1 (165-367)||(40092494-40092696)
chr1 (163-367)||(7145208-7145412)
chr1 (162-367)||(43905654-43905859)
chr1 (163-367)||(41928495-41928699)
chr1 (163-366)||(8079710-8079913)
chr1 (162-367)||(8120869-8121074)
chr1 (163-367)||(17591692-17591893)
chr1 (165-367)||(13996723-13996925)
chr1 (163-367)||(2347657-2347862)
chr1 (163-367)||(51359217-51359420)
chr1 (163-362)||(6765460-6765659)
chr1 (178-367)||(17587505-17587694)
chr1 (162-367)||(49146172-49146377)
chr1 (164-364)||(15717787-15717986)
chr1 (165-367)||(23498463-23498665)
chr1 (153-364)||(2473712-2473924)
chr1 (193-367)||(40149494-40149668)
chr1 (163-367)||(15554152-15554348)
chr1 (165-328)||(29695678-29695842)
chr1 (162-366)||(38171832-38172023)
chr1 (165-291)||(52086270-52086396)
chr1 (176-310)||(23322897-23323031)
chr1 (164-311)||(5217840-5217986)
chr1 (163-233)||(5675106-5675176)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (163-367)||(36706-36910)
[»] scaffold0167 (1 HSPs)
scaffold0167 (163-362)||(22956-23155)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (163-366)||(145246-145449)
[»] scaffold0172 (1 HSPs)
scaffold0172 (163-367)||(10239-10443)
[»] scaffold0482 (1 HSPs)
scaffold0482 (163-367)||(295-499)
[»] scaffold1777 (1 HSPs)
scaffold1777 (163-367)||(6-210)
[»] scaffold0920 (1 HSPs)
scaffold0920 (163-367)||(3711-3915)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (163-367)||(6-211)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 295; Significance: 1e-166; HSPs: 32)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 295; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 18 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 38598800 - 38598450
Alignment:
Q  18 actcaatagtgctatacttttcttttgccaattgtcattaaagaactgaaaagtgaaataatactccatattgctagattgaaaggggttgaatgagtgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38598800 actcaatagtgctatacttttcttttgccaattgtcattaaagaactgaaaagtgaaataatactccatattgttagattgaaaggggttgaatgagtgt 38598701  T
Q  118 tatgtgggcttataacattgtcatgtcacattttaacacttaggtccg-tttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcc 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||    
T  38598700 tatgtgggcttataacattgtcatgtcacattttaacacttaggcccggtttggattggcttactttgaacttatgtgagcttatctactctcataagcc 38598601  T
Q  217 tttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctt 316  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38598600 tttttaaatgtgtttgggtaaataagtaaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctt 38598501  T
Q  317 cggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38598500 cggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctctg 38598450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 9008261 - 9008057
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9008261 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 9008162  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9008161 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattct 9008062  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  9008061 ctctg 9008057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Original strand, 16069357 - 16069561
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16069357 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtaggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagcttatcatagt 16069456  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16069457 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 16069556  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  16069557 ctctg 16069561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 166 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 1165802 - 1165604
Alignment:
Q  166 tttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttc 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1165802 tttggattgacttattttgagcttatgtgagcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttc 1165703  T
Q  266 ataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 364  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1165702 ataagttgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 1165604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 8374542 - 8374339
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8374542 ccgtttggattgccttattttaagcttatgtgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagt 8374443  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8374442 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatg-atttatgtaacctccttcgattct 8374344  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  8374343 ctctg 8374339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 33491400 - 33491196
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33491400 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 33491301  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33491300 ttcataagctgcttttgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 33491201  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  33491200 ctctg 33491196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Original strand, 33991144 - 33991348
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33991144 ccgtttgaattgacttattttgagtttatgtggacttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 33991243  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33991244 ttcataagttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcattcgattct 33991343  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  33991344 ctctg 33991348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 163 - 364
Target Start/End: Original strand, 1579040 - 1579241
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1579040 ccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagt 1579139  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1579140 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 1579239  T
Q  363 ct 364  Q
    ||    
T  1579240 ct 1579241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 163 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 1605775 - 1605574
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1605775 ccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagt 1605676  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1605675 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 1605576  T
Q  363 ct 364  Q
    ||    
T  1605575 ct 1605574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 162 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 24105876 - 24105671
Alignment:
Q  162 tccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 261  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24105876 tccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 24105777  T
Q  262 tttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 361  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24105776 tttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattatcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 24105677  T
Q  362 tctctg 367  Q
    ||||||    
T  24105676 tctctg 24105671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 27679373 - 27679169
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27679373 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 27679274  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27679273 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaatctccttcgattct 27679174  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  27679173 ctctg 27679169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 164 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 16737650 - 16737447
Alignment:
Q  164 cgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 263  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||| || | ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16737650 cgtttgaattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataaacctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 16737551  T
Q  264 tcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctc 363  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16737550 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctc 16737451  T
Q  364 tctg 367  Q
    ||||    
T  16737450 tctg 16737447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 160 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 3386693 - 3386486
Alignment:
Q  160 ggtccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 259  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3386693 ggtctgtttggattggcttattttgagcttatgtggacttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 3386594  T
Q  260 agtttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgat 359  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3386593 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcctatgaatttatgtaacctccttcgat 3386494  T
Q  360 tctctctg 367  Q
    | ||||||    
T  3386493 tatctctg 3386486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 162 - 367
Target Start/End: Original strand, 31883147 - 31883352
Alignment:
Q  162 tccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31883147 tccgtttggattgacttattttgagcttatgtggacttatctactctcataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatag 31883246  T
Q  262 tttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 361  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31883247 tttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaatttttagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 31883346  T
Q  362 tctctg 367  Q
    ||||||    
T  31883347 tctctg 31883352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Original strand, 4120941 - 4121145
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  4120941 ccgtttggaatggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataagcccttttaaaggtgtttgggtaaataagtaaaaataatttatcatagt 4121040  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4121041 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctttgattct 4121140  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  4121141 ctctg 4121145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Original strand, 19358530 - 19358734
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19358530 ccgtttggattgccttattttgagcttatgtgagcttatctactcctataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 19358629  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19358630 ttcataagctgcttatgccatattttagtaagcctaaattttcagcttaccctccaacttaacaaggagcttatgaatttatgtaatctccttcgattct 19358729  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  19358730 ctctg 19358734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 163 - 363
Target Start/End: Original strand, 27420862 - 27421062
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27420862 ccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagtttatcatagt 27420961  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27420962 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcattcgattct 27421061  T
Q  363 c 363  Q
    |    
T  27421062 c 27421062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 163 - 366
Target Start/End: Original strand, 5202976 - 5203179
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5202976 ccgtttggattgacttattttgagtttatgttggtttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagt 5203075  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  5203076 ttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtcaccttcttcgattct 5203175  T
Q  363 ctct 366  Q
    ||||    
T  5203176 ctct 5203179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Original strand, 3921585 - 3921789
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||| || | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3921585 ccgtttggattgatttattttgagtttatatgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagt 3921684  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3921685 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaaaaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 3921784  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  3921785 ctctg 3921789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 20992350 - 20992146
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||   ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20992350 ccgtttgaattggcttattttgagcttatgtggtcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcatatcatagt 20992251  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20992250 ttcataagctgattatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacccccttcgattct 20992151  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  20992150 ctctg 20992146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 35782848 - 35782644
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35782848 ccgtttggattgccttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 35782749  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcg-gcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 361  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35782748 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcttaaattttcagcctaccctccgtgctt-acaaggagcttatgaatttatgtaacctcattcgattc 35782650  T
Q  362 tctctg 367  Q
    ||||||    
T  35782649 tctctg 35782644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 164 - 364
Target Start/End: Original strand, 31410481 - 31410681
Alignment:
Q  164 cgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 263  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||| || ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31410481 cgtttggattgatttattttgagtttatatgggtttatctacccccataagtctttttaaaggtgtttgagtaaacaaataaaaatagcttatcatagtt 31410580  T
Q  264 tcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctc 363  Q
    | |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31410581 ttataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaggagtttatgaatttatgtgacctccttcgattctc 31410680  T
Q  364 t 364  Q
    |    
T  31410681 t 31410681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 208 - 367
Target Start/End: Original strand, 27025005 - 27025164
Alignment:
Q  208 ccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcag 307  Q
    ||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27025005 ccataagactttttaaagatgttcgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccattttttaataagcctaaattttcag 27025104  T
Q  308 cttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 367  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27025105 cttaccctccggcttaacaaggagtttataaatttatgtaacctccttcgattctctctg 27025164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 193 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 26603116 - 26602942
Alignment:
Q  193 tgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgtttatgccatattttaata 292  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  26603116 tgagcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataaactgcttatgccatattttaata 26603017  T
Q  293 agcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 367  Q
    ||| ||| ||||||| |||| ||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26603016 agcataatttttcagtttactctctggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctctttcgattctctctg 26602942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 165 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 20992487 - 20992354
Alignment:
Q  165 gtttggattgacttattttgagcttatgt----gagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 260  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||    | | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20992487 gtttggattggcttattttgagcttatgtacatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcatatcata 20992388  T
Q  261 gtttcataagctgtttatgccatattttaataag 294  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20992387 gtttcataagctgcttatgccatattttaataag 20992354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 161 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 33284781 - 33284642
Alignment:
Q  161 gtccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 260  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  33284781 gtccgcttggattgacttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttaagtaaataaataaaaatagcttatcata 33284682  T
Q  261 gtttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaa 300  Q
    |||| |||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||    
T  33284681 gttttataaactgcttataccatatttcaataagcctaaa 33284642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 19 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 38867851 - 38867750
Alignment:
Q  19 ctcaatagtgctatacttttcttttgccaattgtcattaaagaactgaaaagtgaaataatactccatattgctagattgaaaggggttgaatgagtgtt 118  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38867851 ctcaatagtgctattctttccttttgccaattgtaattaaaaaactgaaaagtaaaatgatactccatatttctagattgaaaggggttgaatgagtgtt 38867752  T
Q  119 at 120  Q
    ||    
T  38867751 at 38867750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 309 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 35420482 - 35420424
Alignment:
Q  309 ttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 367  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35420482 ttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 35420424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 171 - 295
Target Start/End: Original strand, 31638157 - 31638281
Alignment:
Q  171 attgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataag 270  Q
    |||||||||||||  | ||||||||| ||| |||||  ||||||||||| |||| |||||||| |||||  ||||||||| ||||||| | ||| |||||    
T  31638157 attgacttattttatgtttatgtgagcttacctactaacataagcctttgtaaaagtgtttggataaatcgataaaaataacttatcacaattttataag 31638256  T
Q  271 ctgtttatgccatattttaataagc 295  Q
    ||  ||||| |||||||||||||||    
T  31638257 cttcttatgtcatattttaataagc 31638281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 163 - 311
Target Start/End: Original strand, 25634586 - 25634732
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||  ||| |||   ||||||||||||||   |||||||||||| | | |    
T  25634586 ccgtttagattggcttattttaagcttatgagagtttatctactaacataagctctttcaaatacgtttgggtaaataa--taaaatagcttataacaat 25634683  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagctta 311  Q
    ||||||||| | |||| |||||||||||||| ||  |||||| ||||||    
T  25634684 ttcataagccgcttataccatattttaataaaccataattttgagctta 25634732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 225 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 41818605 - 41818552
Alignment:
Q  225 ggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgtttat 278  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||    
T  41818605 ggtgtttaggtaaattaataaaaatagcttatcatatttttataagctgcttat 41818552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 329 - 360
Target Start/End: Original strand, 27024822 - 27024853
Alignment:
Q  329 gagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27024822 gagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 27024853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 181; Significance: 1e-97; HSPs: 66)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 53717656 - 53717452
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53717656 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagtttatctactcccataagcctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 53717557  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53717556 ttcataagctgcttatgccctattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 53717457  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  53717456 ctctg 53717452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Original strand, 54189546 - 54189750
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54189546 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactaacataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 54189645  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54189646 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 54189745  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  54189746 ctctg 54189750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 19913822 - 19913618
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  19913822 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaattaaaacagcttatcatagt 19913723  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19913722 ttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 19913623  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  19913622 ctctg 19913618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Original strand, 38055158 - 38055362
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  38055158 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatagt 38055257  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38055258 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttactctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccatcgattct 38055357  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  38055358 ctctg 38055362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 164 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 15241219 - 15241016
Alignment:
Q  164 cgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 263  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  15241219 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagtttatcatagtt 15241120  T
Q  264 tcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctc 363  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15241119 tcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctc 15241020  T
Q  364 tctg 367  Q
    ||||    
T  15241019 tctg 15241016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 163 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 23776651 - 23776449
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23776651 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 23776552  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23776551 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggatcttatgaatttatgtaaccttcttcgattct 23776452  T
Q  363 ctc 365  Q
    |||    
T  23776451 ctc 23776449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 165 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 28032902 - 28032700
Alignment:
Q  165 gtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 264  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28032902 gtttagattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtat 28032803  T
Q  265 cataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 364  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28032802 cataagctgcttatgccatattttaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattatct 28032703  T
Q  365 ctg 367  Q
    |||    
T  28032702 ctg 28032700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 163 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 30423756 - 30423556
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30423756 ccgtttggattggcttattttgagtttatgtgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 30423657  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30423656 ttcataagctgcttatgccatatttcaataagcataaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagctta-gaatttatgtaacctccttcgattct 30423558  T
Q  363 ct 364  Q
    ||    
T  30423557 ct 30423556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 1756956 - 1756752
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1756956 ccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatcatagt 1756857  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1756856 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctctttcgattct 1756757  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  1756756 ctctg 1756752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 6611552 - 6611348
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6611552 ccgtttggattggtttattttgagcttatgtggacttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 6611453  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6611452 ttcataagctgtttatgtcatattttgataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 6611353  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  6611352 ctctg 6611348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 40428912 - 40428708
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40428912 ccgtttgaattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 40428813  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40428812 ttcataagctgcttataccatattttgataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 40428713  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  40428712 ctctg 40428708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Original strand, 50353802 - 50354006
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  50353802 ccgtttggattggcttattttgagcttctgtgagcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatgatagt 50353901  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  50353902 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaatttttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattat 50354001  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  50354002 ctctg 50354006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 163 - 364
Target Start/End: Original strand, 52139204 - 52139405
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52139204 ccgtttggattggcttattttgaacttatgtgggtttatctatttctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 52139303  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52139304 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccatccggcttaacaagaagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 52139403  T
Q  363 ct 364  Q
    ||    
T  52139404 ct 52139405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Original strand, 1617085 - 1617289
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1617085 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatctattctcataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaataacttatcatagt 1617184  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1617185 ttcataagctgcttgtgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 1617284  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  1617285 ctctg 1617289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 8591284 - 8591080
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||  ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8591284 ccgtttgacttggcttattttgagtttatgtgggtttatctacttctataagcctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 8591185  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8591184 ttcataagctgcttatgccatatgttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcggttct 8591085  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  8591084 ctctg 8591080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 27488840 - 27488636
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27488840 ccgtttggattggcttaagttgagcttatctgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 27488741  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27488740 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcttaaattttcagcttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 27488641  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  27488640 ctctg 27488636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 171 - 367
Target Start/End: Original strand, 33703850 - 33704046
Alignment:
Q  171 attgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataag 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  33703850 attgacttattttgagcttatgtgagtttatctactcggataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacaacttatcatagtttcataag 33703949  T
Q  271 ctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 367  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33703950 ctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 33704046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 45424726 - 45424522
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45424726 ccgtttggattgacttattttgagcttatgttggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagt 45424627  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45424626 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 45424527  T
Q  363 ctctg 367  Q
     ||||    
T  45424526 ttctg 45424522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 165 - 365
Target Start/End: Original strand, 48909849 - 48910049
Alignment:
Q  165 gtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 264  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48909849 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataaacctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagttt 48909948  T
Q  265 cataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 364  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  48909949 cataagctgcttatgccatattttaacaaacctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaatctccttcgattctct 48910048  T
Q  365 c 365  Q
    |    
T  48910049 c 48910049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 163 - 366
Target Start/End: Original strand, 20877048 - 20877251
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20877048 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagt 20877147  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  20877148 ttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatggatttacgtaacctccttagattct 20877247  T
Q  363 ctct 366  Q
    ||||    
T  20877248 ctct 20877251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 163 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 50055293 - 50055098
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  50055293 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaatgaaaatagcttatcatggt 50055194  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 358  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50055193 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 50055098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 165 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 44379377 - 44379175
Alignment:
Q  165 gtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 264  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |  | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44379377 gtttggattgacttattttgagtttatataggcttatctacttccataaacctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagttt 44379278  T
Q  265 cataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 364  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44379277 cataagttgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgcaacctccttcgattctct 44379178  T
Q  365 ctg 367  Q
    |||    
T  44379177 ctg 44379175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 6688813 - 6688615
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6688813 ccgtttggattgacttattttgagtttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 6688714  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    |||      || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6688713 ttc------tgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 6688620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 162 - 367
Target Start/End: Original strand, 16700781 - 16700986
Alignment:
Q  162 tccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 261  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16700781 tccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataaacctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcatag 16700880  T
Q  262 tttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 361  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16700881 tttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctagcttaacaaggagcttataaatttatgtaacctccttcgattc 16700980  T
Q  362 tctctg 367  Q
    ||||||    
T  16700981 tctctg 16700986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 166 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 40680227 - 40680026
Alignment:
Q  166 tttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttc 265  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40680227 tttggattgacttattttgaatttatgtgagcttatctacttccataagtctttttaaaggtatttggataaataaataaaaatagcttatcatagtttc 40680128  T
Q  266 ataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctc 365  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40680127 ataagctgcttatgccatattttcataagcctaaatttttagcttacccttcggcttaacaagaagcttatgaatttatgtaacctcattcgattctctc 40680028  T
Q  366 tg 367  Q
    ||    
T  40680027 tg 40680026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 2481600 - 2481396
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  2481600 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttatcatagt 2481501  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2481500 ttcataagctgcttatgccatattttaataagccaaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 2481401  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  2481400 ctctg 2481396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Original strand, 31969682 - 31969886
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31969682 ccgtttgaattgatttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagt 31969781  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31969782 ttcataagctgcttatgctatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 31969881  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  31969882 ctctg 31969886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 44785109 - 44784905
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44785109 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttgtaaaagtgtttgggtaaacaaataaaaatagcttatcatagt 44785010  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44785009 ttcataagttgcttatgccatattttaataagcctaaactttcagcttaccctccggcttaacaatgagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 44784910  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  44784909 ctctg 44784905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Original strand, 54412629 - 54412833
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  54412629 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagt 54412728  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  54412729 ttcataagctgcttatgtcatattctaataagtctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcatatgaatttatgtaacctccttcgattct 54412828  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  54412829 ctctg 54412833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 162 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 43290153 - 43289951
Alignment:
Q  162 tccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 261  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| | || | |||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43290153 tccgtttggattggcttattttgagcttttatgtgcttatctactcacataagcctttttaaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagcttatcatag 43290054  T
Q  262 tttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 361  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43290053 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaataaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 43289954  T
Q  362 tct 364  Q
    |||    
T  43289953 tct 43289951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 155 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 35490974 - 35490761
Alignment:
Q  155 acttaggtcc-gtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagct 253  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| || | ||||| |||  ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35490974 acttaggtcccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatccactctcataagcttttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagct 35490875  T
Q  254 tatcatagtttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcc 353  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  35490874 tatcatagtttcataagttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaaccacc 35490775  T
Q  354 ttcgattctctctg 367  Q
    ||||||||||||||    
T  35490774 ttcgattctctctg 35490761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 8932370 - 8932166
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| | | ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||    
T  8932370 ccgtttggattggcttattttgagcttatgcgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagcttaacgtagt 8932271  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8932270 ttcataagctgcttatgccatattttaataaacctaaattttcagcttacccttcagcttaacaaggaacttatgaatttatgtaacctccttcgattct 8932171  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  8932170 ctctg 8932166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 11639770 - 11639566
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||| | |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11639770 ccgtttggattggtttattttgaacttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 11639671  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  11639670 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcttttgattct 11639571  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  11639570 ctctg 11639566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Original strand, 14987793 - 14987997
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14987793 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatatactcccataagccattttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 14987892  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14987893 ttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctcttgcttaacaatgagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 14987992  T
Q  363 ctctg 367  Q
     ||||    
T  14987993 ttctg 14987997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 165 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 23704399 - 23704200
Alignment:
Q  165 gtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 264  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23704399 gtttggattggcttattttgagcttatatgagcttatctactcacataagccttttgaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagttt 23704300  T
Q  265 cataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 364  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  23704299 cataagctgcttatgctatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcatttgattctct 23704200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 177 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 37968935 - 37968746
Alignment:
Q  177 ttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgttt 276  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37968935 ttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgctt 37968836  T
Q  277 atgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctct 366  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37968835 atgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattctctct 37968746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 162 - 367
Target Start/End: Original strand, 53875657 - 53875862
Alignment:
Q  162 tccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 261  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||| | |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53875657 tccgtttggattggcttattttaagcttatgtgggcttatatactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 53875756  T
Q  262 tttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 361  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  53875757 ttttataagctgcttatgtcatatttcaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgcaacctccttcgattc 53875856  T
Q  362 tctctg 367  Q
    ||||||    
T  53875857 tctctg 53875862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Original strand, 15669184 - 15669388
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15669184 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatctaatcacataagactttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcatagt 15669283  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15669284 ttcataagctgcttatgtcatactttaataagcctaaattttcagcttaccgtccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacctccttccattct 15669383  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  15669384 ctctg 15669388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Original strand, 30171581 - 30171785
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30171581 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatcttattccataagcttttttaaaggtgtttggataaataaatgaaaatagcttatcatagt 30171680  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30171681 ttcataagctgcttataccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccttccggtttaacaaggagcttatgaatttatttaacctccttcgattct 30171780  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  30171781 ctctg 30171785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Original strand, 37464722 - 37464926
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| | ||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  37464722 ccgtttgaattggcttattttgagcttatgtgggcttatctattcgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagtttatcatagt 37464821  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37464822 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagtttaccctccggtttaacaaagagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 37464921  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  37464922 ctctg 37464926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 158 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 19165169 - 19164961
Alignment:
Q  158 taggtccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagccttttt-aaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttat 256  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19165169 taggaccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttat 19165070  T
Q  257 catagtttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 356  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19165069 catagtttcataagctgcttatgccata-tttaataagcctaaattttcagcttaccc-tcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 19164972  T
Q  357 gattctctctg 367  Q
    | || ||||||    
T  19164971 gtttttctctg 19164961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Original strand, 47632035 - 47632240
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaa-ggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 261  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||   |||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  47632035 ccgtttggattggcttattttgagtttatgtggacttatctactctcataaacctttttaaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttctcatag 47632134  T
Q  262 tttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 361  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  47632135 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcttaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcaattc 47632234  T
Q  362 tctctg 367  Q
    ||||||    
T  47632235 tctctg 47632240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 55345017 - 55344813
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  55345017 ccgtttgaattgacttattttgagcttatgtgggtttatctactctcataagcctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatatt 55344918  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    | ||| || ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  55344917 tgcatgagttgtttataccatattttaataagccaaaattttcagcttaccatccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctttgattct 55344818  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  55344817 ctctg 55344813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 27536292 - 27536092
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||  | | |||    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27536292 ccgtttggattggcttattttgagcttatacgggctta----ctcccataagccttcttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagt 27536197  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27536196 ttcataaactgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 27536097  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  27536096 ctctg 27536092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 166 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 27583821 - 27583620
Alignment:
Q  166 tttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttc 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  27583821 tttggattgacttattttgagcttatgtaggcttatctactcccataagcttttttaaagatgtttggataaataaataaaaataacttatcatagttgc 27583722  T
Q  266 ataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctc 365  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  27583721 ataagctgcttatgccatattttcataagcctaaatttttagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaatctccttcaattctctc 27583622  T
Q  366 tg 367  Q
    ||    
T  27583621 tg 27583620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 163 - 366
Target Start/End: Original strand, 53353056 - 53353267
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagctta----tgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 258  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||    | || | ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53353056 ccgtttggattggcttattttgagcttaattatatgggcttatctactcccatatgtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 53353155  T
Q  259 tagtttcataagctgtttatgccatatttta----ataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 354  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  53353156 tagtttcataagctgcttatgccatattttaatatataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatggatttatgtaacctcct 53353255  T
Q  355 tcgattctctct 366  Q
    ||||||||||||    
T  53353256 tcgattctctct 53353267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 164 - 364
Target Start/End: Original strand, 16703827 - 16704023
Alignment:
Q  164 cgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 263  Q
    ||||||||||||||||    ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16703827 cgtttggattgactta----gagcttatgtgaacttatctacttccataagcttttttaaagttgtttgaataaataaataaaaatagtttatcatagtt 16703922  T
Q  264 tcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctc 363  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  16703923 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagtttatcctccggcttaacaaggagcctataaatttatgtaacccccttcgattctc 16704022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 165 - 333
Target Start/End: Original strand, 28360433 - 28360602
Alignment:
Q  165 gtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28360433 gtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttttctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagttt 28360532  T
Q  265 cataagctgtttatgcca-tattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagct 333  Q
     |||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28360533 tataagctgcttatgccattatttttataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagct 28360602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 171 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 38071504 - 38071314
Alignment:
Q  171 attgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataag 270  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38071504 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataatcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataag 38071405  T
Q  271 ctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 367  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||     |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  38071404 ctgcttatgccatattttaataagcctgaattttcagtttac---ggggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa---ccttcgattctctctg 38071314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 163 - 358
Target Start/End: Original strand, 44375846 - 44376041
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcc-tttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 261  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||| | ||||||| |||||  |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44375846 ccgtttggattggcttattttaagcttatgtgggcttatcta-ttccaatagccatttttataggtgttcgggtaaataaataaaaatagtttatcatag 44375944  T
Q  262 tttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 358  Q
    |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44375945 tttcataaactgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaaaaaagagcttatgaatttatgtaacctccttcga 44376041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 239 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 23269162 - 23269034
Alignment:
Q  239 taaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatga 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23269162 taaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgctatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatga 23269063  T
Q  339 atttatgtaacctccttcgattctctctg 367  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23269062 atttatgtaatctccttcgattctctctg 23269034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 148 - 311
Target Start/End: Original strand, 50053428 - 50053592
Alignment:
Q  148 ttttaacacttaggtcc-gtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaa 246  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||| ||   ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  50053428 ttttaacacttaggccccgtttggattggcttattttgagcttatatggacttatctactcccataagcctttttaaatgtgtttgggcaaataaataaa 50053527  T
Q  247 aatagcttatcatagtttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagctta 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  50053528 aatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagtctaaattttcatctta 50053592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 280 - 367
Target Start/End: Original strand, 53408137 - 53408225
Alignment:
Q  280 ccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttc-ggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 367  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53408137 ccatattttattaagcctaaattttcagcttacccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 53408225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 176 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 44548320 - 44548185
Alignment:
Q  176 cttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgtt 275  Q
    ||||||| ||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||||||| | ||| ||||| ||||    
T  44548320 cttatttggagcttatgtgggcttatctactaacataagcctttttaaaggtgtttggataaatcaataaaaacatcttatcacaattttataagttgtt 44548221  T
Q  276 tatgccatattttaataagcctaaattttcagctta 311  Q
    |||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  44548220 tatgccctattttattaagcccaaattttaagctta 44548185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 163 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 23265949 - 23265865
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaa 247  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23265949 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcggataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaa 23265865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 304 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 23261937 - 23261874
Alignment:
Q  304 tcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 367  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23261937 tcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 23261874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 228 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 51780845 - 51780763
Alignment:
Q  228 gtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagctt 310  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  51780845 gtttggataaatcaataaaaatagcttatcataatttcataagctgcttatgccatattttaataagcccaaattttaagctt 51780763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 317 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 9595940 - 9595890
Alignment:
Q  317 cggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9595940 cggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 9595890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 318 - 367
Target Start/End: Original strand, 50055301 - 50055350
Alignment:
Q  318 ggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50055301 ggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 50055350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 169 - 311
Target Start/End: Original strand, 17493340 - 17493482
Alignment:
Q  169 ggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcata 268  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||   |||||||| | |||||| ||||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||  || ||| |||    
T  17493340 ggattgacttattttgaatttatatgaacatatctactcctataagcatttttaagggcgtttgagtaaatcaataaaaatatcttattctaattttata 17493439  T
Q  269 agctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagctta 311  Q
    ||||| |||| |||| |||||||||||  ||||||| ||||||    
T  17493440 agctgcttataccatgttttaataagctcaaattttgagctta 17493482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 301 - 367
Target Start/End: Original strand, 48748197 - 48748263
Alignment:
Q  301 ttttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 367  Q
    |||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  48748197 ttttcagcataccctccgtcttaataaggagcttatgaatttatgtaatctccttcaattctctctg 48748263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 249 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 55344781 - 55344724
Alignment:
Q  249 tagcttatcatagtttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttca 306  Q
    |||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  55344781 tagcttatcatattttcatgagttgtttatgccatattttaataagccaaaattttca 55344724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 46257393 - 46257269
Alignment:
Q  171 attgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataag 270  Q
    |||| |||||||| || |||||| ||||||||||||  ||||||| |||  |||  ||||||||||||| |||  ||| || |||||| | |||||||||    
T  46257393 attggcttattttaagtttatgtaagtttatctactgacataagcatttacaaaattgtttgggtaaatcaattgaaagagtttatcacaatttcataag 46257294  T
Q  271 ctgtttatgccatattttaataagc 295  Q
    |||||||| | ||| ||||||||||    
T  46257293 ctgtttattctatagtttaataagc 46257269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 333 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 55344715 - 55344681
Alignment:
Q  333 ttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55344715 ttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 55344681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 9595982 - 9595946
Alignment:
Q  264 tcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaa 300  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  9595982 tcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaa 9595946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 157 - 213
Target Start/End: Original strand, 34615823 - 34615879
Alignment:
Q  157 ttaggtccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataa 213  Q
    ||||| ||||||| |||| |||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||    
T  34615823 ttaggcccgtttgaattggcttattttgaacttacgtaggtttatctacttccataa 34615879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 178; Significance: 6e-96; HSPs: 44)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 166 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 12101369 - 12101168
Alignment:
Q  166 tttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttc 265  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12101369 tttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttc 12101270  T
Q  266 ataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctc 365  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12101269 ataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctatggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctc 12101170  T
Q  366 tg 367  Q
    ||    
T  12101169 tg 12101168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 163 - 365
Target Start/End: Original strand, 3511325 - 3511527
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3511325 ccgtttggattgtcttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaatagataaaaatagcttatcatagt 3511424  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3511425 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaatttttagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 3511524  T
Q  363 ctc 365  Q
    |||    
T  3511525 ctc 3511527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 33359284 - 33359080
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33359284 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 33359185  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33359184 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 33359085  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  33359084 ctctg 33359080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 43068167 - 43067963
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43068167 ccgtttggattgacttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 43068068  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43068067 ttcataagcttcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 43067968  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  43067967 ctctg 43067963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 24792526 - 24792322
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24792526 ccgtttggattggcttaagttgagcttatctgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 24792427  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24792426 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 24792327  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  24792326 ctctg 24792322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 30181218 - 30181014
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30181218 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 30181119  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30181118 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggaacttatgaatttatgtaacccccttcgattct 30181019  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  30181018 ctctg 30181014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 166 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 42965187 - 42964986
Alignment:
Q  166 tttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttc 265  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42965187 tttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttc 42965088  T
Q  266 ataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctc 365  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42965087 ataagctgcttatgccatattttaataagcctaaatttttagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctc 42964988  T
Q  366 tg 367  Q
    ||    
T  42964987 tg 42964986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Original strand, 5280862 - 5281066
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5280862 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatctattcacataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagt 5280961  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5280962 ttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 5281061  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  5281062 ctctg 5281066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Original strand, 9452592 - 9452796
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  9452592 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgaacttatctattctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataagtaaaaatagtttatcatagt 9452691  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9452692 ttcataagctgtctatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacactccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 9452791  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  9452792 ctctg 9452796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Original strand, 20346490 - 20346694
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20346490 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatcatagt 20346589  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20346590 ttcataagctgcttatgccatattttaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgaaacctccttcgattct 20346689  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  20346690 ctctg 20346694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Original strand, 25748489 - 25748693
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25748489 ccgtttggattggcttaagttgagcttatattagtttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 25748588  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25748589 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattat 25748688  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  25748689 ctctg 25748693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 164 - 367
Target Start/End: Original strand, 1803029 - 1803232
Alignment:
Q  164 cgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1803029 cgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 1803128  T
Q  264 tcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctc 363  Q
    |||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1803129 tcataagctgcttatacgatattttattaagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaagaagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctc 1803228  T
Q  364 tctg 367  Q
    ||||    
T  1803229 tctg 1803232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Original strand, 7164186 - 7164390
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7164186 ccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagtttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 7164285  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7164286 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctctttcgattct 7164385  T
Q  363 ctctg 367  Q
     ||||    
T  7164386 atctg 7164390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 163 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 36891023 - 36890821
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36891023 ccgtttggattgacttattt-gagcttatgtaggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 36890925  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36890924 ttcataagttgcttatgccatatttcaataagcctaagttttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 36890825  T
Q  363 ctct 366  Q
    ||||    
T  36890824 ctct 36890821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 164 - 367
Target Start/End: Original strand, 38866547 - 38866750
Alignment:
Q  164 cgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 263  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38866547 cgtttggatcgacttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataattttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtt 38866646  T
Q  264 tcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctc 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  38866647 tcataagctgtttatgccatattttaataagcataaattttcagcttaccctccggcttaagaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattatc 38866746  T
Q  364 tctg 367  Q
    ||||    
T  38866747 tctg 38866750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 165 - 367
Target Start/End: Original strand, 933289 - 933491
Alignment:
Q  165 gtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 264  Q
    ||||| |||| ||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  933289 gtttgaattggcttattttgagctcatgtggacttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagttt 933388  T
Q  265 cataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 364  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  933389 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgaatctct 933488  T
Q  365 ctg 367  Q
    |||    
T  933489 ctg 933491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 162 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 4477516 - 4477311
Alignment:
Q  162 tccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 261  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4477516 tccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtcttttcaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatgg 4477417  T
Q  262 tttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 361  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4477416 tttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattc 4477317  T
Q  362 tctctg 367  Q
    ||||||    
T  4477316 tctctg 4477311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Original strand, 42204156 - 42204361
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttt-taaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 261  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42204156 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagtcttttttaaaggtgtttgggtaaataagtaaaaatagcttatcatag 42204255  T
Q  262 tttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 361  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42204256 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgcaacctccttcgattc 42204355  T
Q  362 tctctg 367  Q
    ||||||    
T  42204356 tctctg 42204361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 22649888 - 22649684
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  22649888 ccgtttgaattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcataat 22649789  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  22649788 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcattcgatttt 22649689  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  22649688 ctctg 22649684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 166 - 365
Target Start/End: Original strand, 43156718 - 43156917
Alignment:
Q  166 tttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttc 265  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43156718 tttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctattcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttc 43156817  T
Q  266 ataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctc 365  Q
    |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43156818 ataagctgtttatggcaaatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaagaacttatgaatttatgtaacctccttcgattctctc 43156917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 166 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 12097781 - 12097580
Alignment:
Q  166 tttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttc 265  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12097781 tttggattggcttaagttgagcttatatgagcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatcatagtttc 12097682  T
Q  266 ataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctc 365  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12097681 ataagctacttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctc 12097582  T
Q  366 tg 367  Q
    ||    
T  12097581 tg 12097580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Original strand, 15655914 - 15656118
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  15655914 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctgctcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttatcatagt 15656013  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15656014 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaagaagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 15656113  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  15656114 ctctg 15656118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 33846718 - 33846519
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33846718 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 33846619  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33846618 ttcataaactgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagctta-----gggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 33846524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 162 - 367
Target Start/End: Original strand, 42673466 - 42673667
Alignment:
Q  162 tccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 261  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    || ||||||||||||    
T  42673466 tccgtttggattgacttatttggagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaa----aacagcttatcatag 42673561  T
Q  262 tttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 361  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42673562 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 42673661  T
Q  362 tctctg 367  Q
    ||||||    
T  42673662 tctctg 42673667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 46134498 - 46134294
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  46134498 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctactcctataactctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaatagtttattatagt 46134399  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  46134398 ttcataagctgtttacgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttattaatttatgtaacctcattcgattct 46134299  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  46134298 ctctg 46134294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Original strand, 6394753 - 6394957
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  6394753 ccgtttagattggcttattttgagcttatgtgggcttatctattcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagtttatcatggt 6394852  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6394853 ttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagtttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattct 6394952  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  6394953 ctctg 6394957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Original strand, 32041544 - 32041748
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32041544 ccgtttggattggcttattttgtgcttatgtgggcttatctacttccataagtctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 32041643  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  32041644 ttcataagctgcttatgtcatattttcataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttataaatttatgtaaccttattcgattct 32041743  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  32041744 ctctg 32041748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Original strand, 4347275 - 4347478
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4347275 ccgtttggattgacttattttaagcttatgtgggcttatctactcccataaacttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttaccatagt 4347374  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  4347375 ttcataagctgcttatgccatattttaacaagcctaaattttcagcttaccctcgagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc-ccttctattct 4347473  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  4347474 ctctg 4347478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Original strand, 8630668 - 8630872
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||   |||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8630668 ccgtttggatttgtttattttgaggttatgtgggttgatctactcccataagcctttttaaaggtgttcgggtaaataaataaaaatagtttatcatagt 8630767  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  8630768 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaatccccttcgattct 8630867  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  8630868 ctctg 8630872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Original strand, 17753602 - 17753806
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||   || ||||||||| | |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17753602 ccgtttggattagcttattttgagcttatacaagcttatctactcctataagccttttagaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttaacatagt 17753701  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17753702 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaatttttagcttacccttcaacttaacaaggagcttatgaatttatgtaatctccttcgattct 17753801  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  17753802 ctctg 17753806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 193 - 365
Target Start/End: Original strand, 48865662 - 48865837
Alignment:
Q  193 tgagtttatctacttccataagcctttt---taaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgtttatgccatatttta 289  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  48865662 tgagcttatctacttccataagccttttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgccatatttta 48865761  T
Q  290 ataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctc 365  Q
    |||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48865762 ataagcctaaattttcagcttaacatcaggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctc 48865837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 46891534 - 46891329
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagccttttt-aaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 261  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |  | ||||||||| | |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  46891534 ccgtttggattggcttattttgagcttatataggcttatctactcctataaaccttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttgtcatag 46891435  T
Q  262 tttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 361  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  46891434 ttttataagctgcttatgtcatattttaattagcctaaattttcagcttacccttcagcttaacaaggagcttatgagtttatgtaacctccttcgattg 46891335  T
Q  362 tctctg 367  Q
    ||||||    
T  46891334 tctctg 46891329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 193 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 16894671 - 16894497
Alignment:
Q  193 tgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgtttatgccatattttaata 292  Q
    |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16894671 tgagcttatctactcccataagcttttttaaaggtatttgggtaaacaaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 16894572  T
Q  293 agcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  16894571 agcctaaattttcagcttacccttcaacttaacagggagcttatgaatttatgtaacatccttcgattctttctg 16894497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 166 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 43021767 - 43021570
Alignment:
Q  166 tttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttc 265  Q
    ||||||||| |||||||| || |||||||   ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  43021767 tttggattggcttattttaagtttatgtggacttatctacttcaataagtctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaataacttattatagtttc 43021668  T
Q  266 ataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctc 365  Q
    |||||||| ||||| ||||||    |  | ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43021667 ataagctgcttatggcatatt----tcggtctaaattttcagcttactctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctc 43021572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 163 - 306
Target Start/End: Original strand, 19828272 - 19828415
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| ||||||  | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19828272 ccgtttgaattggcttattttgagtttatgttggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggctaaataaataaaaatagcttatcatagt 19828371  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttca 306  Q
    |||||||  || |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19828372 ttcataaattgcttatgccatattttaataagccaaaattttca 19828415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 162 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 37006006 - 37005857
Alignment:
Q  162 tccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 261  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| ||     
T  37006006 tccgtttggattggcttattttaagcttatgtgagtttatctacttctataagtttttttaaaggcgtttgggtaaatcagtaaaaatagcttatcgtaa 37005907  T
Q  262 tttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagctta 311  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||    
T  37005906 tttcataagctgcttatgctatattttaataaggctaattttttagctta 37005857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 163 - 256
Target Start/End: Original strand, 37704982 - 37705075
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttat 256  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37704982 ccgtttgggttgacttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttat 37705075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 163 - 363
Target Start/End: Original strand, 43405022 - 43405223
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||  | ||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || |    
T  43405022 ccgtttgaattgacttattttaagcttatgttggcttatctactcctataagtctttttaaaggcgtttgggtaaatcaataaaaatagcttatcgtaat 43405121  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttat-gaatttatgtaacctccttcgattc 361  Q
    |||||||| ||||| | | ||||||||||||||| || |||| |||||| |    |||||| || ||||||||| ||||| | |  ||||||||||||||    
T  43405122 ttcataagttgtttctactatattttaataagcccaattttttagcttaacacaaggcttatcacggagcttatggaattcaagggacctccttcgattc 43405221  T
Q  362 tc 363  Q
    ||    
T  43405222 tc 43405223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 163 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 36849731 - 36849590
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||| |||| ||||||  |||| |  ||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||| | |    
T  36849731 ccgtttggattgacttattcgaagcttatgtgggtttgtctactaacatatgtttttttaaaggtgtttggataaatcaataaaatcagcttatcacaat 36849632  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaatttt 304  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  36849631 ttcataaactgtttatgtcatattttaataagctcaaatttt 36849590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 163 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 30075422 - 30075277
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| | |   |||||||||||| |||||||||||||||| ||| |    
T  30075422 ccgtttggattgacttattttaagcttatgtgagtttatctactaacataagccctttcagatacgtttgggtaaat-aataaaaatagcttat-ata-t 30075326  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagctta 311  Q
    ||||||| | | |||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  30075325 ttcataaaccgcttataccatattttaataagccataattttgagctta 30075277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 166 - 295
Target Start/End: Original strand, 20163824 - 20163953
Alignment:
Q  166 tttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttc 265  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| |||   ||||| ||||| | || | |||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||    
T  20163824 tttggattgacttattttgggcttatatgagcttatttaccaacataatcctttgtgaatgcgtttgggtgaattaattaaaatagcttatcacagtttc 20163923  T
Q  266 ataagctgtttatgccatattttaataagc 295  Q
    |||||||| ||||  |||||||||| ||||    
T  20163924 ataagctgcttatagcatattttaacaagc 20163953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 164 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 15655605 - 15655458
Alignment:
Q  164 cgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 263  Q
    ||||||||||| |||||| | | |||||||||| || ||||||  |||||| |||||||||  | ||||| ||||| ||||||||||||||| || | ||    
T  15655605 cgtttggattggcttattctaaacttatgtgagcttgtctactaacataagtctttttaaaactatttggataaatcaataaaaatagcttaccacaatt 15655506  T
Q  264 tcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagctta 311  Q
    | |||| ||| |||| ||| ||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  15655505 ttataaactgcttataccaaattttaataagctcaaattttgagctta 15655458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 27691506 - 27691433
Alignment:
Q  177 ttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaata 250  Q
    |||||||||  |||| || | ||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27691506 ttattttgaatttatatgggcttatctactcccataaatctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaata 27691433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 163 - 191
Target Start/End: Original strand, 48865642 - 48865670
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttat 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  48865642 ccgtttggattgacttattttgagcttat 48865670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 178; Significance: 6e-96; HSPs: 23)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 162 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 34887497 - 34887292
Alignment:
Q  162 tccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34887497 tccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggtttatctcctcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 34887398  T
Q  262 tttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  34887397 tttcataagctgtttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagctaatgaatttatgtgacctccttcgattc 34887298  T
Q  362 tctctg 367  Q
    ||||||    
T  34887297 tctctg 34887292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 3347727 - 3347523
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  3347727 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaacagcttatcatagt 3347628  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3347627 ttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 3347528  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  3347527 ctctg 3347523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Original strand, 9459566 - 9459770
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9459566 ccgtttggattggcttattttgagtttatgtgagcttatctatttccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 9459665  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9459666 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtatcctccttcgattct 9459765  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  9459766 ctctg 9459770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Original strand, 21893458 - 21893662
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21893458 ccgtttggatcgatttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaatatataaaaatagcttatcatagt 21893557  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21893558 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaatttttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 21893657  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  21893658 ctctg 21893662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 26947080 - 26946876
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26947080 ccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 26946981  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26946980 ttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 26946881  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  26946880 ctctg 26946876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Original strand, 2837548 - 2837752
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2837548 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 2837647  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2837648 ttcatgagctgctcatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 2837747  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  2837748 ctctg 2837752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 6086803 - 6086599
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6086803 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 6086704  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6086703 ttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 6086604  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  6086603 ctctg 6086599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 164 - 367
Target Start/End: Original strand, 30691855 - 30692058
Alignment:
Q  164 cgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 263  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30691855 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 30691954  T
Q  264 tcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctc 363  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30691955 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccatctgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctc 30692054  T
Q  364 tctg 367  Q
    ||||    
T  30692055 tctg 30692058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 26704543 - 26704339
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||| ||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26704543 ccgtttggattggtttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 26704444  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26704443 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 26704344  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  26704343 ctctg 26704339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 17261277 - 17261073
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  17261277 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttctaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttataatatt 17261178  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17261177 ttcataagctgcttatgctatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggaacttatgaatttatgtaacctccttcgattct 17261078  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  17261077 ctctg 17261073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Original strand, 18613541 - 18613745
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18613541 ccgtttggattgacttattttgagcttatgcggacttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcatagt 18613640  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18613641 tccataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 18613740  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  18613741 ctctg 18613745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 3955970 - 3955769
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3955970 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 3955871  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  3955870 ttcataaactgcttatgctatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa---ccttcgattct 3955774  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  3955773 ctctg 3955769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Original strand, 11167243 - 11167447
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| || || ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11167243 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgtgcttatttattttcataagtttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 11167342  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11167343 ttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttacccaccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 11167442  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  11167443 ctctg 11167447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Original strand, 20726794 - 20726994
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||| |||||||||||    
T  20726794 ccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaa----taaaaataacttatcatagt 20726889  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20726890 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaatttttagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 20726989  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  20726990 ctctg 20726994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 28199713 - 28199508
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctact--tccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28199713 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtggacttatcatctactccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 28199614  T
Q  261 gtttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 360  Q
    |||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28199613 gtttcatatgctgcttatgccat-tttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 28199515  T
Q  361 ctctctg 367  Q
    |||||||    
T  28199514 ctctctg 28199508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 157 - 367
Target Start/End: Original strand, 1153590 - 1153800
Alignment:
Q  157 ttaggtccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttat 256  Q
    ||||| || ||| ||||| |||||||| |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  1153590 ttaggcccttttagattggcttattttaagcttatgttggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataagtaaaaatagattat 1153689  T
Q  257 catagtttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 356  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  1153690 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggtgcttatgtatttatgtaacctccttc 1153789  T
Q  357 gattctctctg 367  Q
    | |||||||||    
T  1153790 gtttctctctg 1153800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 163 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 16307212 - 16307015
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  16307212 ccgtttggattgacttattttgagcttatgttggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttggataaataaataaaaacagcttatcatagt 16307113  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 360  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16307112 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcataaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcattcgatt 16307015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 164 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 30699132 - 30698934
Alignment:
Q  164 cgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 263  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30699132 cgtttggattgacttattatgagtttatgtgagcttatttatttctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 30699033  T
Q  264 tcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30699032 ttattagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaatgagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 30698934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 163 - 366
Target Start/End: Original strand, 35198287 - 35198489
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    ||||||| |||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35198287 ccgtttgaattggcttattttgaacttatgtgggcttatctacttccataagc-tttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 35198385  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  35198386 ttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagtttactctccggcttaacaaggaacttatgaatttatgtgatctcattcgattct 35198485  T
Q  363 ctct 366  Q
    ||||    
T  35198486 ctct 35198489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 230 - 367
Target Start/End: Original strand, 33464399 - 33464536
Alignment:
Q  230 ttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaagg 329  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33464399 ttgggtaaataagtaaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaagg 33464498  T
Q  330 agcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33464499 agcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 33464536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 163 - 315
Target Start/End: Original strand, 52839 - 52991
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52839 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactaacataagcatttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 52938  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccct 315  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52939 ttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccct 52991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 253 - 367
Target Start/End: Original strand, 53001 - 53115
Alignment:
Q  253 ttatcatagtttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 352  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53001 ttatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 53100  T
Q  353 cttcgattctctctg 367  Q
    |||||||||||||||    
T  53101 cttcgattctctctg 53115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 163 - 238
Target Start/End: Original strand, 33463704 - 33463779
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaa 238  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33463704 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaa 33463779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 178; Significance: 6e-96; HSPs: 29)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 158 - 367
Target Start/End: Original strand, 4016035 - 4016244
Alignment:
Q  158 taggtccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 257  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||    
T  4016035 taggcccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagtttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtgaataaataaaaataacgtatc 4016134  T
Q  258 atagtttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 357  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4016135 atagtttcataagctgcttatgccatattttaacaagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 4016234  T
Q  358 attctctctg 367  Q
    ||||||||||    
T  4016235 attctctctg 4016244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 162 - 367
Target Start/End: Original strand, 42937719 - 42937925
Alignment:
Q  162 tccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 261  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  42937719 tccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagtttatctatttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatag 42937818  T
Q  262 tttcataagctgtttatgccatattttaat-aagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 360  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42937819 tttcataagctgcttatgccatattttaataaagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 42937918  T
Q  361 ctctctg 367  Q
    |||||||    
T  42937919 ctctctg 42937925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 165 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 33906249 - 33906047
Alignment:
Q  165 gtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 264  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33906249 gtttggattgacttattttgaacttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 33906150  T
Q  265 cataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 364  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33906149 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaagaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattatct 33906050  T
Q  365 ctg 367  Q
    |||    
T  33906049 ctg 33906047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 18807088 - 18806884
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18807088 ccgtttggattggcttattttgagcttatatgagcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 18806989  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18806988 ttcataagctgcttatgctatattttaataagcctaaatttttagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 18806889  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  18806888 ctctg 18806884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 31517419 - 31517215
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31517419 ccgtttggattggcttattttgagcttatttgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 31517320  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31517319 ttcataaactgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaataaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 31517220  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  31517219 ctctg 31517215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 164 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 3873447 - 3873244
Alignment:
Q  164 cgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 263  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3873447 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaatatagcttatcatagtt 3873348  T
Q  264 tcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctc 363  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  3873347 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatataacctcattcgattctc 3873248  T
Q  364 tctg 367  Q
    ||||    
T  3873247 tctg 3873244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 28330041 - 28329839
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28330041 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctacacccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 28329942  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28329941 ttcataaactgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccct--agcttaacaaggagcatatgaatttatgtaacctccttcgattct 28329844  T
Q  363 ctctg 367  Q
     ||||    
T  28329843 ttctg 28329839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 26323390 - 26323186
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26323390 ccgtttggattggtttattttgagcttatgtggacttatctactcccataagtctttttaaagatgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagt 26323291  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26323290 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcattcgattct 26323191  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  26323190 ctctg 26323186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 4232346 - 4232142
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4232346 ccgtttggattggcttattttgtgcttatgtgggcttatctacttccataagtctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 4232247  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  4232246 ttcataagctgcttatgccatattttcacaagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacctcattcgattat 4232147  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  4232146 ctctg 4232142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 6175032 - 6174828
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  6175032 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatatactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatagt 6174933  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  6174932 ttcataagctgcttatgtcatatttcattaagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttacgtgacctccttcgattct 6174833  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  6174832 ctctg 6174828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 30270883 - 30270679
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  30270883 ccgtttggattggcttattttaagcttatatgagtttatctactcccataagcctttttaaaagtgtttggataaataaaataaaatagtttatcatagt 30270784  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  30270783 ttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaatctccttcgattat 30270684  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  30270683 ctctg 30270679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 163 - 366
Target Start/End: Original strand, 39635453 - 39635656
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39635453 ccgtttggattagcttattttgagcttatgtggacttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaatatagcttatcatagt 39635552  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39635553 ttcataagctgcttatgtcatattttattaagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaacgagcttatcaatttatgtaacctccttcgattct 39635652  T
Q  363 ctct 366  Q
    ||||    
T  39635653 ctct 39635656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 162 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 1483107 - 1482903
Alignment:
Q  162 tccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 261  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  1483107 tccgttttgattggcttattttgagcttatgtgggcttatctact-ccataagcttttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattattg 1483009  T
Q  262 tttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 361  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1483008 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagtttacccttcgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacatccttcgattc 1482909  T
Q  362 tctctg 367  Q
    ||||||    
T  1482908 tctctg 1482903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 175 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 19384127 - 19383938
Alignment:
Q  175 acttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgt 274  Q
    |||||||||||| |||| |||| ||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  19384127 acttattttgagtttatatgagcttatctattctcataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagttgt 19384028  T
Q  275 ttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19384027 ttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 19383938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 163 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 19901341 - 19901143
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19901341 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttctctacttccataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataa-taaaaatagcttatcatagt 19901243  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19901242 ttcataaactgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcccacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctctttcgattct 19901143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 177 - 367
Target Start/End: Original strand, 5733414 - 5733604
Alignment:
Q  177 ttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgttt 276  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||    
T  5733414 ttattttgagcttatgtgggcttatctactcccatcagcctttttaaaggtgtttgggtgaataaataaaaacaacttatcatagtttcataagctgctt 5733513  T
Q  277 atgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 367  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5733514 atgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgcaacctccttcgattctctctg 5733604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 2178973 - 2178769
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    ||||||||||||| ||||||| || |||||||   ||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2178973 ccgtttggattgatttattttaagtttatgtggacttatctattcgcataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcatagt 2178874  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2178873 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 2178774  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  2178773 ctctg 2178769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 163 - 347
Target Start/End: Original strand, 1108281 - 1108464
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1108281 ccgtttggatgg-cttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagt 1108379  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgta 347  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1108380 ttcataagttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgta 1108464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 162 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 16588981 - 16588776
Alignment:
Q  162 tccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 261  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | ||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16588981 tccgtttggattggcttattttgtgtttatgtgggcttatctactttcataagtctttttaaagaagtttgggtaaataaataaaaatagcttattatag 16588882  T
Q  262 tttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 361  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||     
T  16588881 tttcataagctgcttatgccatattttcataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaataaggagcttatgaattaatgtaacctccgtcgatta 16588782  T
Q  362 tctctg 367  Q
    ||||||    
T  16588781 tctctg 16588776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Original strand, 850998 - 851202
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||  |||||||| |||||||||  | |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |    
T  850998 ccgtttggatttgcttattttaagcttatgtaggcttatctactctcataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaatagagcttatcataat 851097  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  851098 tttataagctgcttatgccatattttaataagcttaaatttttagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 851197  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  851198 ctctg 851202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 166 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 16066495 - 16066302
Alignment:
Q  166 tttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttc 265  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16066495 tttgaattggcttattttgagcttatgtgggcttatctgctttcataagtcttttttaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttc 16066396  T
Q  266 ataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgat 359  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16066395 ataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctgatttaataaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgat 16066302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 163 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 30420371 - 30420181
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  30420371 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagg 30420272  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30420271 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcag------------cttaacaaggagcttatgaatttatgtaacccccttcgattct 30420184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 162 - 363
Target Start/End: Original strand, 429816 - 430017
Alignment:
Q  162 tccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 261  Q
    |||||||| |||  ||||||||||  |||||||  ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  429816 tccgtttgaattcccttattttgaatttatgtggatttatctactctcataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcataa 429915  T
Q  262 tttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 361  Q
    ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  429916 tttcataagttgcttatgcgatattttaataagcctaaattttcaacttacaattcgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctctttcgattc 430015  T
Q  362 tc 363  Q
    ||    
T  430016 tc 430017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 166 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 44947743 - 44947549
Alignment:
Q  166 tttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttc 265  Q
    |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44947743 tttgtattggcttattttgatcttatgtgagtttatctagtgccataagcatttttaaaagtgtttggataaataaataaaaatagtttatcatagtttc 44947644  T
Q  266 ataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctc 365  Q
    |||||||| |||||||||||||        |||||||||||| ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44947643 ataagctgcttatgccatattt-------gctaaattttcagtttaccctccggcttaacaagaagtttatgaatttatgtaacctccttcgattctctc 44947551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 29 - 117
Target Start/End: Original strand, 39953697 - 39953790
Alignment:
Q  29 ctatacttttcttttgccaattgtcatta-----aagaactgaaaagtgaaataatactccatattgctagattgaaaggggttgaatgagtgt 117  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39953697 ctatacttttcttttgtcaattgtcattaaattaaagaactgaaaagtgaaataatactccatattgctagattgaaaggggttgaatgagtgt 39953790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 163 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 42446773 - 42446625
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||| ||||||  ||| ||||| ||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | ||||||| | |    
T  42446773 ccgtttggattggcttattcggagtttatgcgaacttatctactaacataagcctttttaaaggtgtttaggtaaatcaataaaaacaacttatcacaat 42446674  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagctta 311  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||    
T  42446673 ttcataagctgcttatgccatattttaataagatcaaattttaagctta 42446625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 196 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 22101318 - 22101210
Alignment:
Q  196 gtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgtttatgccatattttaataagc 295  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||| | ||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  22101318 gtttatctactaacataagcctttttaaaggtatttgtataaatcaataaaaacaacttatcacaatttcataagctgcttatgtcatattttaataagc 22101219  T
Q  296 ctaaatttt 304  Q
    | |||||||    
T  22101218 ccaaatttt 22101210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 162 - 311
Target Start/End: Original strand, 3585290 - 3585439
Alignment:
Q  162 tccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 261  Q
    ||||||||||| | ||||||   ||||||||||  |||||| |||  ||||| |||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| |  |||||| |     
T  3585290 tccgtttggatcggcttattcaaagcttatgtggatttatccactaacataaaccttattaaatgtgttttggtaaattaataaaaacaatttatcacaa 3585389  T
Q  262 tttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagctta 311  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||    
T  3585390 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctgaattatgagctta 3585439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 12517385 - 12517256
Alignment:
Q  165 gtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 264  Q
    |||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||   |||||| ||  |||| |||||||| ||  | ||| |||| |||||||| || |||    
T  12517385 gtttggattggcttattta-agcttatgtgagcttatctactaaaataagctttcctaaaagtgtttggataccttaattaaaagagcttatcctaattt 12517287  T
Q  265 cataagctgtttatgccatattttaataagc 295  Q
    ||||||| | ||| || ||||||||| ||||    
T  12517286 cataagcagcttaagcaatattttaacaagc 12517256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 40)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Original strand, 14422706 - 14422910
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14422706 ccgtttggattggtttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 14422805  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14422806 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 14422905  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  14422906 ctctg 14422910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Original strand, 18594540 - 18594744
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18594540 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 18594639  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18594640 ttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 18594739  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  18594740 ctctg 18594744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Original strand, 39206589 - 39206793
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39206589 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 39206688  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39206689 ttcataagctgcttatgccatattttaataagtctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 39206788  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  39206789 ctctg 39206793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 162 - 367
Target Start/End: Original strand, 144396 - 144601
Alignment:
Q  162 tccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  144396 tccgtttggattgacttattttgagcatatgtggacttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaagtaaataaaaatagtttatcatag 144495  T
Q  262 tttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 361  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  144496 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 144595  T
Q  362 tctctg 367  Q
    ||||||    
T  144596 tctctg 144601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Original strand, 13110407 - 13110611
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13110407 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccatatgcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 13110506  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13110507 ttaataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgagtttatgtaacctccttcgattct 13110606  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  13110607 ctctg 13110611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 22260834 - 22260630
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  22260834 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatctactcccataagtctttttaaaggcgtttgggtaaatcaataaaaatagcttatcctagt 22260735  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22260734 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 22260635  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  22260634 ctctg 22260630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 24113370 - 24113166
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  24113370 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataaccctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagattatcatagt 24113271  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24113270 ttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 24113171  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  24113170 ctctg 24113166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Original strand, 29938064 - 29938268
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29938064 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatatactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataagtaaaaatagcttatcatagt 29938163  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29938164 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 29938263  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  29938264 ctctg 29938268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 35118235 - 35118031
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35118235 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagccttttgaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 35118136  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35118135 ttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaagaagcttatgaatttatgtaacctcattcgattct 35118036  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  35118035 ctctg 35118031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 164 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 2042727 - 2042526
Alignment:
Q  164 cgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 263  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2042727 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcatagtt 2042628  T
Q  264 tcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctc 363  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2042627 tcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctc 2042528  T
Q  364 tc 365  Q
    ||    
T  2042527 tc 2042526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 6144477 - 6144273
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6144477 ccgtttggattgacttattttgagcttatatgggcttatctactcccatatgcctttttaacagtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 6144378  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6144377 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcataaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 6144278  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  6144277 ctctg 6144273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Original strand, 7791414 - 7791618
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7791414 ccgtttggattggcttattttgagtttatgtgagtttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatcatagt 7791513  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7791514 ttcataagctgcttatgtcatatttcaataagcttaaactttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 7791613  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  7791614 ctctg 7791618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 164 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 10836958 - 10836755
Alignment:
Q  164 cgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 263  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10836958 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtt 10836859  T
Q  264 tcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctc 363  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  10836858 tcataaactgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctctttcgattatc 10836759  T
Q  364 tctg 367  Q
    ||||    
T  10836758 tctg 10836755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Original strand, 33278403 - 33278607
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||| ||   |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33278403 ccgtttggattggcttattttgagtttatatggacttatctactttcataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagtttatcatagt 33278502  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33278503 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 33278602  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  33278603 ctctg 33278607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 164 - 367
Target Start/End: Original strand, 7774768 - 7774971
Alignment:
Q  164 cgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 263  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7774768 cgtttagattggcttattttgagcttatgcgggtttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatcatagtt 7774867  T
Q  264 tcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctc 363  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7774868 tcataagctgcttatgtcatattttattaagcttaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctc 7774967  T
Q  364 tctg 367  Q
    ||||    
T  7774968 tctg 7774971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Original strand, 7811998 - 7812202
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7811998 ccgttttgattggcttattttgagtttatgtgagtttatctacttccattagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatcatagt 7812097  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7812098 ttcataagctgcttatgtcatatttcaataagcttaaattttcagcttactctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcattcgattct 7812197  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  7812198 ctctg 7812202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 34842569 - 34842365
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34842569 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagt 34842470  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  34842469 ttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaatttccagcttacccaccgtcttaacaaggagcttattaatttatgtgacctccttcgattct 34842370  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  34842369 ctctg 34842365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 34999100 - 34998896
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34999100 ccgtatggattggcttattttgagcttatacgggtttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcttagt 34999001  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  34999000 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttgccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatttaatctccttcgattct 34998901  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  34998900 ctctg 34998896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 163 - 366
Target Start/End: Original strand, 39218780 - 39218983
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||     
T  39218780 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatggtttatcatagc 39218879  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  39218880 ttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagctgatgaatttatgtgacctccttcgattct 39218979  T
Q  363 ctct 366  Q
    ||||    
T  39218980 ctct 39218983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 165 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 34679659 - 34679457
Alignment:
Q  165 gtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 264  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34679659 gtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgaataaataaataaaaatagtttatcatagttt 34679560  T
Q  265 cataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 364  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34679559 cataagctgcttataccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaatgagcttatgaatttatgtaacctccttcgattcttt 34679460  T
Q  365 ctg 367  Q
    |||    
T  34679459 ctg 34679457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 162 - 366
Target Start/End: Original strand, 41575515 - 41575719
Alignment:
Q  162 tccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 261  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  41575515 tccgtttggattggcttattttgagcttatgtagacttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaattgcttatcatag 41575614  T
Q  262 tttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 361  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41575615 tttcataagctgcttatgtcatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcattcgattc 41575714  T
Q  362 tctct 366  Q
    |||||    
T  41575715 tctct 41575719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 166 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 44805145 - 44804945
Alignment:
Q  166 tttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttc 265  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44805145 tttgaattggcttattttgagcttatgtaggtttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttagataaataaataaaaatagcttatcatagtttc 44805046  T
Q  266 ataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctc 365  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44805045 ataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctc 44804946  T
Q  366 t 366  Q
    |    
T  44804945 t 44804945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 163 - 366
Target Start/End: Original strand, 4035850 - 4036053
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||||| || | ||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4035850 ccgtttggattggtttatttttagcttatatgggcttatctactcccataagttttattaaaggtgtttgggtaaacaaataaaaatagcttatcatagt 4035949  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4035950 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 4036049  T
Q  363 ctct 366  Q
    ||||    
T  4036050 ctct 4036053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 164 - 367
Target Start/End: Original strand, 42571598 - 42571798
Alignment:
Q  164 cgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 263  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42571598 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctacttccataagcctttttaaaagtgtttgggtaaat-aataaaaatagcttatcatagtt 42571696  T
Q  264 tcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctc 363  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  42571697 tcataagctgcttatgtcatatttcaat--gcctaaatttttagcttacccttcggcttaacaaggaacttatgaatttatgcaacctctttcgattctc 42571794  T
Q  364 tctg 367  Q
    ||||    
T  42571795 tctg 42571798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 165 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 38167357 - 38167159
Alignment:
Q  165 gtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 264  Q
    |||||||||| | ||||||||| ||||||| | ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  38167357 gtttggattggcctattttgagtttatgtgggcttatctattcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaactagtttatcatagttt 38167258  T
Q  265 cataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctc 363  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38167257 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggcttaacaagaagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctc 38167159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Original strand, 5320567 - 5320771
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  5320567 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagtttatctactcccataagcctttttaaagttgttttggtaaataaataaaaataatttatcatagt 5320666  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    |||||||| || ||||| ||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5320667 ttcataagttgcttatgtcatgtttcaataagcctaaattttcaacttaccatctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattct 5320766  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  5320767 ctctg 5320771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 166 - 367
Target Start/End: Original strand, 36491163 - 36491364
Alignment:
Q  166 tttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttc 265  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||| | ||||||| |  |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36491163 tttggattggcttattttaagcttatgtgggattatctaatcgcataagtctttttgaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcatagtttc 36491262  T
Q  266 ataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctc 365  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36491263 ataacttgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaagaagcttatgaatttatgtaacctctttcgattctctc 36491362  T
Q  366 tg 367  Q
    ||    
T  36491363 tg 36491364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 163 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 33287229 - 33287040
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33287229 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggtttatctactcccatatgcttttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagtttatcatagt 33287130  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||        |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33287129 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccct----ct--------agcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 33287042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 163 - 364
Target Start/End: Original strand, 28639281 - 28639484
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccat----aagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 258  Q
    ||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| | ||    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  28639281 ccgtttgaattggcttattttaagcttatgtgagcttatctactcctatatacaagcttttttaaaggtgttttggtaaataaataaaaatagtttatca 28639380  T
Q  259 tagtttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 358  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  28639381 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacatagagcttatga--ttatgtaacctccttcga 28639478  T
Q  359 ttctct 364  Q
    ||||||    
T  28639479 ttctct 28639484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 163 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 40118056 - 40117904
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40118056 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 40117957  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccct 315  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40117956 ttcataagctgcttatgtcatattttaataagcttaaattttcagcttaccct 40117904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Original strand, 8021722 - 8021918
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8021722 ccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagt 8021821  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||        | |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  8021822 ttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttca--------tccggcttaacaaggagcttatgagtttatataacctacttcgattct 8021913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 162 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 66385 - 66180
Alignment:
Q  162 tccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 261  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| || |||  | ||||||| | ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  66385 tccgtttagattggcttattttgagtttctgtaggcttatctattcccatatgtctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaataacttataatag 66286  T
Q  262 tttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccc-ttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 360  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  66285 tttcataagctgcttatgccatatttcaataagtttaaattttcagcttaccctttcggcttaacaaggagcttatgaatttacgtgacctccttcgatt 66186  T
Q  361 ctctct 366  Q
    ||||||    
T  66185 ctctct 66180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 164 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 26783936 - 26783801
Alignment:
Q  164 cgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 263  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26783936 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaatatagcttatcatagtt 26783837  T
Q  264 tcataagctgtttatgccatattttaataagcctaa 299  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26783836 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaa 26783801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 239 - 364
Target Start/End: Original strand, 9807339 - 9807464
Alignment:
Q  239 taaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatga 338  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9807339 taaataaaaatagcttatcatagcttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaggagcttatga 9807438  T
Q  339 atttatgtaacctccttcgattctct 364  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  9807439 atttatgaaacctccttcgtttctct 9807464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 163 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 2322216 - 2322068
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||| ||||||  |||||||| ||  ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |    
T  2322216 ccgtttggattggcttattcggagcttatatggatttatctactaacataagcttttttaaaggtgtttgggtaaatcaataaaaacagcttatcacaat 2322117  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagctta 311  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  2322116 ttcataagctgcttatatcatattttgataagcctaaattttaagctta 2322068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 163 - 311
Target Start/End: Original strand, 39220259 - 39220407
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||  |||||||| |||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||   | |    
T  39220259 ccgtttgaattgacttattttgagcttatatgaacttatctacatccatatgtctttttaaaggtgtttgagtaaatcaataaaaatagcttattccaat 39220358  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagctta 311  Q
    ||||||||||| | || | ||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  39220359 ttcataagctgctcatactatattttaataagctcaaattttgagctta 39220407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 157 - 288
Target Start/End: Original strand, 5005162 - 5005294
Alignment:
Q  157 ttaggtcc-gtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 255  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  5005162 ttaggtcctgtttggattggcttatcttaagcttatgtgggcttatctacttccataagcttttttaaaggcgtttgggtaaatcaataaaaatagctta 5005261  T
Q  256 tcatagtttcataagctgtttatgccatatttt 288  Q
    |  || | |||||| ||| |||||| |||||||    
T  5005262 tgctactctcataaactgcttatgctatatttt 5005294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 163 - 247
Target Start/End: Original strand, 9806876 - 9806960
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaa 247  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| || | ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9806876 ccgtttggattgacttattttgagtttatatgtgcttatctactcccatatgcctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaa 9806960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 164 - 295
Target Start/End: Original strand, 18683714 - 18683844
Alignment:
Q  164 cgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 263  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||  ||| |||||||||  |||||||  ||| |||   |||||||||||| ||||||||||| ||||   | ||    
T  18683714 cgtttggactgacttattttaagcttattggagcttatctactaacataagctctttcaaatacgtttgggtaaat-aataaaaatagtttataccaatt 18683812  T
Q  264 tcataagctgtttatgccatattttaataagc 295  Q
    | |||||| | |||| ||||||||| ||||||    
T  18683813 ttataagccgcttataccatattttcataagc 18683844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 164 - 295
Target Start/End: Original strand, 18729276 - 18729406
Alignment:
Q  164 cgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 263  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||  ||| |||||||||  |||||||  ||| |||   |||||||||||| ||||||||||| ||||   | ||    
T  18729276 cgtttggactgacttattttaagcttattggagcttatctactaacataagctctttcaaatacgtttgggtaaat-aataaaaatagtttataccaatt 18729374  T
Q  264 tcataagctgtttatgccatattttaataagc 295  Q
    | |||||| | |||| ||||||||| ||||||    
T  18729375 ttataagccgcttataccatattttcataagc 18729406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 41)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Original strand, 8042605 - 8042809
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  8042605 ccgtttggatgggcttattttgagcttatgtgagcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataagtaaaaatagtttatcatagt 8042704  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8042705 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 8042804  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  8042805 ctctg 8042809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Original strand, 25999386 - 25999590
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25999386 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 25999485  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25999486 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattct 25999585  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  25999586 ctctg 25999590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Original strand, 29445486 - 29445690
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29445486 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagtttatctactcccataagcctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 29445585  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29445586 ttcataagctgtttatgccctattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttccattct 29445685  T
Q  363 ctctg 367  Q
     ||||    
T  29445686 atctg 29445690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 25494475 - 25494271
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25494475 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggtttatctattcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 25494376  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25494375 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctcctgcttaacaaggagcttatgaatttatgcaacctccttcgattct 25494276  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  25494275 ctctg 25494271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 37698333 - 37698129
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37698333 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 37698234  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37698233 ttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 37698134  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  37698133 ctctg 37698129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 163 - 362
Target Start/End: Original strand, 32244118 - 32244317
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32244118 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtggatttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagt 32244217  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32244218 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcttaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 32244317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 163 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 42308095 - 42307892
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42308095 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggcgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 42307996  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  42307995 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctctttcgattct 42307896  T
Q  363 ctct 366  Q
    ||||    
T  42307895 ctct 42307892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 165 - 367
Target Start/End: Original strand, 21581042 - 21581244
Alignment:
Q  165 gtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21581042 gtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaataacttatcatagttt 21581141  T
Q  265 cataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 364  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21581142 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccatctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacatccttcgattctct 21581241  T
Q  365 ctg 367  Q
    |||    
T  21581242 ctg 21581244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 15520332 - 15520128
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  15520332 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaataacttatcatcgt 15520233  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15520232 ttcataaactgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcattcgattct 15520133  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  15520132 ctctg 15520128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 20842538 - 20842334
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  20842538 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatctactcgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacaacttatcatagt 20842439  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20842438 ttcataagctgcttatatcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 20842339  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  20842338 ctctg 20842334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 22175180 - 22174976
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22175180 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcatagt 22175081  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22175080 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 22174981  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  22174980 ctctg 22174976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Original strand, 38856091 - 38856295
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38856091 ccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 38856190  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  38856191 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctctttcgattat 38856290  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  38856291 ctctg 38856295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 54870364 - 54870160
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  54870364 ccgtttggattggcttattttgagtttatgtgggtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatcgt 54870265  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54870264 ttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaatttttagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 54870165  T
Q  363 ctctg 367  Q
     ||||    
T  54870164 ttctg 54870160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Original strand, 50528927 - 50529131
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  50528927 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcatagt 50529026  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50529027 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagtttatgaatttatgtaacctccttcgattct 50529126  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  50529127 ctctg 50529131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 163 - 366
Target Start/End: Original strand, 15520634 - 15520837
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  15520634 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttatcatagt 15520733  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15520734 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttttgtaacctccttcgattct 15520833  T
Q  363 ctct 366  Q
    ||||    
T  15520834 ctct 15520837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 165 - 367
Target Start/End: Original strand, 35226447 - 35226649
Alignment:
Q  165 gtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 264  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  35226447 gtttggattggcctattttgagcttatgtgggcttatctatttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaatcagcttatcatagttt 35226546  T
Q  265 cataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 364  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35226547 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcctaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 35226646  T
Q  365 ctg 367  Q
    |||    
T  35226647 ctg 35226649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Original strand, 32359257 - 32359461
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32359257 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtggatttatctatttccataagcttttataaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagtttatcatagt 32359356  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32359357 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 32359456  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  32359457 ctctg 32359461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 163 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 46452352 - 46452149
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  46452352 ccgtttggattggcttaagttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagt 46452253  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46452252 ttcataagttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagctcaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 46452153  T
Q  363 ctct 366  Q
    ||||    
T  46452152 ctct 46452149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 165 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 44609521 - 44609319
Alignment:
Q  165 gtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 264  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44609521 gtttggattggcttattttgagcttatgtggacttatctacttgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcatagttt 44609422  T
Q  265 cataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 364  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  44609421 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagtttatgaatttatgtaacctctttcgattctct 44609322  T
Q  365 ctg 367  Q
    |||    
T  44609321 ctg 44609319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Original strand, 38933944 - 38934147
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38933944 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtg-gcttatctactcccataagccttttcaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcatagt 38934042  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38934043 ttcataagctgcttatgtcatattttaataagtctaaatttccagtttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 38934142  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  38934143 ctctg 38934147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 163 - 366
Target Start/End: Original strand, 20699147 - 20699350
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  20699147 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttatcatagt 20699246  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  20699247 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttaggaatttttgtaacctccttcgattct 20699346  T
Q  363 ctct 366  Q
    ||||    
T  20699347 ctct 20699350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 54534516 - 54534314
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  54534516 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatggt 54534417  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    || |||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  54534416 tt-ataagctgcttatgccata-ttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattct 54534319  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  54534318 ctctg 54534314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 166 - 367
Target Start/End: Original strand, 2895186 - 2895391
Alignment:
Q  166 tttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttc 265  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  2895186 tttgaattgacttattttgagcttatgtgggtttatctactcgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaaaaaattatcatagtttc 2895285  T
Q  266 ataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagct----tatgaatttatgtaacctccttcgattc 361  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2895286 ataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatatatgaatttatataacctccttcgattc 2895385  T
Q  362 tctctg 367  Q
    ||||||    
T  2895386 tctctg 2895391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 12117848 - 12117644
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| | ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12117848 ccgtttgaattggcttattttgagcttatgtgggcttatctattcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagtttatcatagt 12117749  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12117748 ttcataagttgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccatctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcattcgattct 12117649  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  12117648 ctctg 12117644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 163 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 24835889 - 24835686
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  24835889 ccgtttggattgatttattttgagcttatatagacttatcaactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttattatagt 24835790  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  24835789 ttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaaactccttcgattat 24835690  T
Q  363 ctct 366  Q
    ||||    
T  24835689 ctct 24835686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 169 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 42105155 - 42104957
Alignment:
Q  169 ggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcata 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42105155 ggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataaacatttttaaaggtgtttggataaaaaaataaaaatagtttatcatagtttcata 42105056  T
Q  269 agctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 367  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42105055 agctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctcatgcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattccctctg 42104957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 165 - 366
Target Start/End: Original strand, 26122814 - 26123015
Alignment:
Q  165 gtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 264  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26122814 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctattcccatgagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagttt 26122913  T
Q  265 cataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 364  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  26122914 cataagctgcttatgtcatatttcaataagcctaaattttcagcttatcctccggcttaacaagtagcttatgaatttacgtaacattcttcgattctct 26123013  T
Q  365 ct 366  Q
    ||    
T  26123014 ct 26123015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Original strand, 34700339 - 34700543
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34700339 ccgtttagattggtttattttgagcttatgtgggtttatttacttccataagcctttttaaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagcttatcatagt 34700438  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| |    
T  34700439 ttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaatttttagtttaccctccggcttaagaagaagcttatgaatttatataacctcctttgattat 34700538  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  34700539 ctctg 34700543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 186 - 366
Target Start/End: Original strand, 44688782 - 44688961
Alignment:
Q  186 gcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgtttatgccatat 285  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  44688782 gcttatgtgggtttatctacttccataagcctttttaaagatgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatg-catat 44688880  T
Q  286 tttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctct 366  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44688881 tttaataagcttaaattttcagcttaccctccggcttaacaatgagcttatgaatttatgcaacctccttcgattctctct 44688961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 165 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 48925189 - 48924989
Alignment:
Q  165 gtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 264  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  48925189 gtttggattggcttatttagagtttatatgggtttatctacttccataagcttttttaaaagt--ttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagttt 48925092  T
Q  265 cataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 364  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48925091 cataagctgtttatgtcatattttaataagtctaaatttttagcttatcctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 48924992  T
Q  365 ctg 367  Q
    |||    
T  48924991 ctg 48924989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 165 - 367
Target Start/End: Original strand, 53028225 - 53028419
Alignment:
Q  165 gtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| ||||||| ||||        ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  53028225 gtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctattcccataagtctttttagaggt--------aaataaataaaaatagcttatcatatttt 53028316  T
Q  265 cataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 364  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53028317 cataaactgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 53028416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 163 - 315
Target Start/End: Original strand, 35643215 - 35643367
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35643215 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgaacttatctacttccataagcctttttaaaggtgcttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 35643314  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccct 315  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35643315 ttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttgagcttaccct 35643367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 186 - 367
Target Start/End: Original strand, 16354367 - 16354548
Alignment:
Q  186 gcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgtttatgccatat 285  Q
    |||||| |||| ||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| |    
T  16354367 gcttatatgagattatctacactcataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaataacttatcatagtttcataagctgctaatgccatgt 16354466  T
Q  286 tttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  16354467 tttaataagcctaaattttcagcttatcctcctgcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctgcgattatctctg 16354548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 165 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 50529961 - 50529827
Alignment:
Q  165 gtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 264  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50529961 gtttggattgacttattttgagtttatgtggacttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 50529862  T
Q  265 cataagctgtttatgccatattttaataagcctaa 299  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  50529861 cataagctgcttatgccatattttaatgagcctaa 50529827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 207 - 364
Target Start/End: Original strand, 12915948 - 12916105
Alignment:
Q  207 tccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttca 306  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||    
T  12915948 tccataaatctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagtttatcataatttcataaactgcttatgtcatatttaaataagcttaagttttca 12916047  T
Q  307 gcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 364  Q
    ||||||||| ||| |||| || ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12916048 gcttaccctccggtttaagaaagagtttatgaatttatgtaacccccttcgattctct 12916105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 279 - 366
Target Start/End: Original strand, 24366143 - 24366230
Alignment:
Q  279 gccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctct 366  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24366143 gccatattttaataagcataaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttagattctctct 24366230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 163 - 293
Target Start/End: Original strand, 49128047 - 49128177
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| || |    
T  49128047 ccgtttggattgacttattttaaacttatgtgggcttatctactcctataagtctttttaaagatgtttgggtaaatcaataaaaataacttatcgtaat 49128146  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataa 293  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  49128147 ttcataagctgcttatgctatattttaataa 49128177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 286 - 367
Target Start/End: Original strand, 13696914 - 13696995
Alignment:
Q  286 tttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  13696914 tttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttgtgtaacctcctttgattctctctg 13696995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 319 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 50528916 - 50528868
Alignment:
Q  319 gcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  50528916 gcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcattcgattctatctg 50528868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 166 - 215
Target Start/End: Original strand, 24366093 - 24366142
Alignment:
Q  166 tttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagc 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  24366093 tttggattgacttattttgagcttatgtgggtttatctactcgcataagc 24366142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 192
Target Start/End: Original strand, 40240486 - 40240515
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatg 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40240486 ccgtttggattgacttattttgagcttatg 40240515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 48)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Original strand, 25897375 - 25897579
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25897375 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcatatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 25897474  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25897475 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 25897574  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  25897575 ctctg 25897579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Original strand, 26663259 - 26663463
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26663259 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagt 26663358  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26663359 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 26663458  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  26663459 ctctg 26663463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 42370999 - 42370795
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  42370999 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaaaaacttatcatagt 42370900  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42370899 ttcataagctgcttgtgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 42370800  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  42370799 ctctg 42370795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 163 - 366
Target Start/End: Original strand, 16052097 - 16052300
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16052097 ccgtttggattggcttattttgagtttatgtgggcttatctacttccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 16052196  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16052197 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctgaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 16052296  T
Q  363 ctct 366  Q
    ||||    
T  16052297 ctct 16052300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 163 - 366
Target Start/End: Original strand, 46760967 - 46761170
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46760967 ccgtttggattgacttattttgaacttatatgagcttatctacttgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 46761066  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  46761067 ttcataaactgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacttccttcgattct 46761166  T
Q  363 ctct 366  Q
    ||||    
T  46761167 ctct 46761170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 165 - 367
Target Start/End: Original strand, 38829072 - 38829274
Alignment:
Q  165 gtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 264  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38829072 gtttggattggcttattttgagcttatgtcggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 38829171  T
Q  265 cataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 364  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38829172 cataagctgcttgtgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccatcgattctct 38829271  T
Q  365 ctg 367  Q
    |||    
T  38829272 ctg 38829274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 165 - 366
Target Start/End: Original strand, 29078519 - 29078720
Alignment:
Q  165 gtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 264  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29078519 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 29078618  T
Q  265 cataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 364  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29078619 cataagctgcttatgccatattttaataaacctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 29078718  T
Q  365 ct 366  Q
    ||    
T  29078719 ct 29078720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Original strand, 32671580 - 32671784
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32671580 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtggatttatctactcccataagcctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 32671679  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32671680 ttcataagctacttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacccccttcgattct 32671779  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  32671780 ctctg 32671784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Original strand, 33510485 - 33510689
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33510485 ccgtttggattggcttattttgagcttatatgagcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagtttatcatagt 33510584  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33510585 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 33510684  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  33510685 ctctg 33510689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 39260550 - 39260346
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39260550 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 39260451  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39260450 ttcataagttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 39260351  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  39260350 ctctg 39260346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Original strand, 29288150 - 29288352
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29288150 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagt 29288249  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  29288250 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaa--tatgtaacctccttcgattct 29288347  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  29288348 ctctg 29288352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Original strand, 1168504 - 1168708
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1168504 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 1168603  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  1168604 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagtttatgaatttatgtaatctcctttgattct 1168703  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  1168704 ctctg 1168708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 1940951 - 1940747
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1940951 ccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 1940852  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1940851 ttcataagttgtttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcaattct 1940752  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  1940751 ctctg 1940747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Original strand, 20089472 - 20089676
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20089472 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 20089571  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20089572 ttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 20089671  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  20089672 ctctg 20089676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 52753351 - 52753147
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52753351 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 52753252  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52753251 ttcataagctacttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccatctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 52753152  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  52753151 ctctg 52753147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 163 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 1170648 - 1170447
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1170648 ccgtttggattggcttattttgagcttttgtgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcatagt 1170549  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1170548 ttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccatccggcttaacaaggagtttatgaatttatgtaacctccttcgattct 1170449  T
Q  363 ct 364  Q
    ||    
T  1170448 ct 1170447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Original strand, 15203113 - 15203317
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15203113 ccgtttgaattgacttattttaagcttttgtgggtttatctactcccataagcctttttaaaggtgttagggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 15203212  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15203213 ttcataagctgtttatgccatatttcaataagcctaaattttcagccaaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattct 15203312  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  15203313 ctctg 15203317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 19715365 - 19715161
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19715365 ccgtttggattggtttattttgagcttatgtgagcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcattgt 19715266  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19715265 ttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaatttttagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 19715166  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  19715165 ctctg 19715161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 26580474 - 26580270
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26580474 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctattcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaagtaaataaaaatagcttatcatagt 26580375  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26580374 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattat 26580275  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  26580274 ctctg 26580270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 970730 - 970524
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata-- 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||      
T  970730 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatcatata 970631  T
Q  261 gtttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 360  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  970630 gtttcataagctgcttatgccatattttaataaacctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaatctccttcgatt 970531  T
Q  361 ctctctg 367  Q
    |||||||    
T  970530 ctctctg 970524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 165 - 367
Target Start/End: Original strand, 12682823 - 12683025
Alignment:
Q  165 gtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 264  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12682823 gtttggattgacttattttgagtttatgtgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 12682922  T
Q  265 cataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 364  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12682923 cataagctgcttatgccatattttcataagcctaaatctttagcttaccctccggcttaacaagaagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 12683022  T
Q  365 ctg 367  Q
    |||    
T  12683023 ctg 12683025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Original strand, 5215386 - 5215590
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5215386 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactttcataagcctttttaaagatgtttgggtaaataagtaaaaatagcttatcatagt 5215485  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5215486 ttcataagttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaacttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattat 5215585  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  5215586 ctctg 5215590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 162 - 367
Target Start/End: Original strand, 46409435 - 46409642
Alignment:
Q  162 tccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46409435 tccgtttggattgacttattttgagcttatgtggacttatctaatctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 46409534  T
Q  262 tttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggc--ttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgat 359  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  46409535 tttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttacccttcgacaattaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgat 46409634  T
Q  360 tctctctg 367  Q
    ||||||||    
T  46409635 tctctctg 46409642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Original strand, 52696792 - 52696996
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  52696792 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttatcatagt 52696891  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  52696892 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattat 52696991  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  52696992 ctctg 52696996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 165 - 367
Target Start/End: Original strand, 40092494 - 40092696
Alignment:
Q  165 gtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40092494 gtttggattgacttattttgagcttatatgagcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatatcttatcatagttt 40092593  T
Q  265 cataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 364  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||    
T  40092594 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttatcttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctttttcgattttct 40092693  T
Q  365 ctg 367  Q
    |||    
T  40092694 ctg 40092696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Original strand, 7145208 - 7145412
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttatttt-gagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 261  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  7145208 ccgtttggattgacttatttttgagcttatgtgtatttatctactcccataagcctttttaaaagtgtt-gggtaaataaacaaaaatagtttatcatag 7145306  T
Q  262 tttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 361  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7145307 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 7145406  T
Q  362 tctctg 367  Q
    ||||||    
T  7145407 tctctg 7145412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 162 - 367
Target Start/End: Original strand, 43905654 - 43905859
Alignment:
Q  162 tccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 261  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43905654 tccgtttggattggcttattttgagcttatttgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 43905753  T
Q  262 tttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 361  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  43905754 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaatttttagtttaccctccggcttaagaaggagcttatgaatttacgtaacctccttcgattg 43905853  T
Q  362 tctctg 367  Q
    ||||||    
T  43905854 tctctg 43905859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 41928699 - 41928495
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||   ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41928699 ccgtttggattggcttattttgaacttatgtggacttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagt 41928600  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41928599 ttcataagctgcttatgccatattttaacaagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattct 41928500  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  41928499 ctctg 41928495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 163 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 8079913 - 8079710
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8079913 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 8079814  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  8079813 ttcataagctacttatgccatattttaataagcctaagttttcagcttaccctctggcttaacaaggagtttatgaatttatgtaatctcctttgattct 8079714  T
Q  363 ctct 366  Q
    ||||    
T  8079713 ctct 8079710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 162 - 367
Target Start/End: Original strand, 8120869 - 8121074
Alignment:
Q  162 tccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 261  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  8120869 tccgtttggattggcttattttgagcttatgtggacttatctactcgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagtttatcatag 8120968  T
Q  262 tttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 361  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8120969 tttcataagctgcttatgtcatattttaataagcttaaattttcagtttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 8121068  T
Q  362 tctctg 367  Q
    ||||||    
T  8121069 tctctg 8121074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Original strand, 17591692 - 17591893
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||| ||||||  ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17591692 ccgtttggattggcttatt--gagcttatgtg-gcttatctactcccataagccttttcaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcatagt 17591788  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17591789 ttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaatttccagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 17591888  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  17591889 ctctg 17591893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 165 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 13996925 - 13996723
Alignment:
Q  165 gtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 264  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||    
T  13996925 gtttggattggcttattttgaaattatgtgggtttatctactcccataagcctttttaaagatgtttggataaataaataaaaatagcttataatggttt 13996826  T
Q  265 cataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 364  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13996825 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaggagtttatgaatttatgtaacctcattcgattctct 13996726  T
Q  365 ctg 367  Q
    |||    
T  13996725 ctg 13996723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Original strand, 2347657 - 2347862
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||   |||||||||| ||||| | | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2347657 ccgtttggatttgtttattttgagtttatgcgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagt 2347756  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccata-ttttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 361  Q
    ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2347757 ttcataagctgcttatgtcatatttttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaatgagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 2347856  T
Q  362 tctctg 367  Q
    ||||||    
T  2347857 tctctg 2347862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 51359420 - 51359217
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  51359420 ccgtttggattggcttattttgagcttatgcgggcttatttactgccataagccttcttaaaggt-tttgggtaaataattaaaaatagcttatcatagt 51359322  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51359321 ttcataaggtgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagtttatgaatttatgtaacctccttcgattct 51359222  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  51359221 ctctg 51359217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 163 - 362
Target Start/End: Original strand, 6765460 - 6765659
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  6765460 ccgtttggattggcttattttgagtttatgtgaatttatctacttttataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatatt 6765559  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6765560 ttcatgagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagtttatgaatttatgtaatctccttcgattct 6765659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 178 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 17587694 - 17587505
Alignment:
Q  178 tattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgttta 277  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||    
T  17587694 tattttgagcttatgtgagcttatctattcgcataagcctttttaaaggtgtttggctaaataaataaaaacagcttatcatattttcataagctgctta 17587595  T
Q  278 tgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17587594 tgccatattttaataagcctaaattttcagcttacactctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctttctg 17587505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 162 - 367
Target Start/End: Original strand, 49146172 - 49146377
Alignment:
Q  162 tccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 261  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  49146172 tccgtttggattggtttattttgagcttatgtggatttatatactcccataagtttttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatag 49146271  T
Q  262 tttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 361  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  49146272 tttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcatcttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacgtcattcgattc 49146371  T
Q  362 tctctg 367  Q
    ||||||    
T  49146372 tctctg 49146377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 164 - 364
Target Start/End: Original strand, 15717787 - 15717986
Alignment:
Q  164 cgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 263  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  |  |||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15717787 cgtttggattgacttattttgagtttatgttggcctatctaatttcataagcctttttaaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagctt-tcatagtt 15717885  T
Q  264 tcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctc 363  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  15717886 tcataagctgcttatgccataatttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgattttatgtaacctccttcaattctc 15717985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 165 - 367
Target Start/End: Original strand, 23498463 - 23498665
Alignment:
Q  165 gtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 264  Q
    ||||| |||| |||||||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  23498463 gtttgaattggcttattttaagcttatgtgggcttatctacttccacaagcctttttcaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttcatcatagttt 23498562  T
Q  265 cataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 364  Q
    |||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23498563 cataagttgcttatatcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctctttcgattctct 23498662  T
Q  365 ctg 367  Q
    |||    
T  23498663 ctg 23498665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 153 - 364
Target Start/End: Original strand, 2473712 - 2473924
Alignment:
Q  153 acacttaggtcc-gtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatag 251  Q
    |||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2473712 acacttaggtcccgtttggatcggtttattttgagcttatgtgggcttatctacgcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatag 2473811  T
Q  252 cttatcatagtttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacct 351  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2473812 cttattatagtttcataagctgcttatgtcatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctcctacttaacaaggagcttatgaatttatgttacct 2473911  T
Q  352 ccttcgattctct 364  Q
    ||||||| |||||    
T  2473912 ccttcgagtctct 2473924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 193 - 367
Target Start/End: Original strand, 40149494 - 40149668
Alignment:
Q  193 tgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgtttatgccatattttaata 292  Q
    |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  40149494 tgagcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaataatttatcatagttttataagctgcttatgtcatattttaata 40149593  T
Q  293 agcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 367  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40149594 agcctaaattttcagtttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 40149668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 15554348 - 15554152
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |            
T  15554348 ccgtttggattggcttaagttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcat-------- 15554257  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15554256 ttcataaactgctgatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 15554157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 165 - 328
Target Start/End: Original strand, 29695678 - 29695842
Alignment:
Q  165 gtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataa-gcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 263  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  29695678 gtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcccataatttttttttaaaggtgtttggataaataaataaaaataatttatcatagtt 29695777  T
Q  264 tcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaag 328  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  29695778 tcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaag 29695842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 162 - 366
Target Start/End: Original strand, 38171832 - 38172023
Alignment:
Q  162 tccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 261  Q
    |||||||| |||||||||||||||  ||||||||  |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  38171832 tccgtttgcattgacttattttgaatttatgtgaacttatctactcacataaacctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaacagtttatcatag 38171931  T
Q  262 tttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 361  Q
    |||||||||||| |||||              |||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38171932 tttcataagctgcttatg-------------tgcctaaattttcagcttatcctccggcttaagaatgagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 38172018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 165 - 291
Target Start/End: Original strand, 52086270 - 52086396
Alignment:
Q  165 gtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 264  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| |||    
T  52086270 gtttggattgacttattttaagcttatgtgggtttatctgctcccataaacctttttaaaggtgtttgggtaaatcagtaaaaataacttatcataattt 52086369  T
Q  265 cataagctgtttatgccatattttaat 291  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  52086370 cataagctgcttatgccataatttaat 52086396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 176 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 23323031 - 23322897
Alignment:
Q  176 cttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgtt 275  Q
    |||||||||||||||| |  | ||||||||| |||||| | ||||| |||| |||||  ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |    
T  23323031 cttattttgagcttatataggcttatctactcccataaactttttttaaggcgtttgaataaatcaataaaaatagtttatcataatttcataagctgct 23322932  T
Q  276 tatgccatattttaataagcctaaattttcagctt 310  Q
    |||| |||| ||||||||||  ||||||| |||||    
T  23322931 tatgtcatactttaataagcgcaaattttaagctt 23322897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 164 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 5217986 - 5217840
Alignment:
Q  164 cgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 263  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||| ||| |||||||||  |||||||  ||| |||    ||||||||||| ||||||||||||||||   | ||    
T  5217986 cgtttggattggcttattttaagcttatgagagcttatctactaacataagctctttcaaatacatttgggtaaat-aataaaaatagcttataccaatt 5217888  T
Q  264 tcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagctta 311  Q
    |||||||| | |||| ||||||||| |||||||  |||||| ||||||    
T  5217887 tcataagccgcttataccatatttttataagccataattttgagctta 5217840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 233
Target Start/End: Original strand, 5675106 - 5675176
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgg 233  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||  ||||||| |||| |||| |||||||    
T  5675106 ccgtttggattggcttattttaagcttatgttagcttatctactaacataagctttttgaaagatgtttgg 5675176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Original strand, 36706 - 36910
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36706 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 36805  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36806 ttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 36905  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  36906 ctctg 36910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 168; Significance: 6e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 163 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 23155 - 22956
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| || | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23155 ccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 23056  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23055 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 22956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 168; Significance: 6e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 163 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 145449 - 145246
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  145449 ccgtttggattgacttattttgagtttatgtggacttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 145350  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  145349 ttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttataaatttatgtaacctccttcgattct 145250  T
Q  363 ctct 366  Q
    ||||    
T  145249 ctct 145246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0172 (Bit Score: 165; Significance: 4e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0172
Description:

Target: scaffold0172; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Original strand, 10239 - 10443
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10239 ccgtttggattgacttattttgagcttatatgggtttatctactctcataagccttcttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagt 10338  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10339 ttcataagctgcttataccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 10438  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  10439 ctctg 10443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0482 (Bit Score: 161; Significance: 9e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0482
Description:

Target: scaffold0482; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 499 - 295
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  499 ccgtttggattggcttattttgagtttatgtgagtttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatcatagt 400  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  399 ttcataagctgcttatgtcatatttcaataagcttaaactttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 300  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  299 ctctg 295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1777 (Bit Score: 153; Significance: 5e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold1777
Description:

Target: scaffold1777; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 210 - 6
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    ||||||| |||| ||||  ||||| |||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  210 ccgtttgtattggcttaagttgagtttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 111  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  110 ttcataagctgcttatgccatattttaataatcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 11  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  10 ctctg 6  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0920 (Bit Score: 153; Significance: 5e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0920
Description:

Target: scaffold0920; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Original strand, 3711 - 3915
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 262  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||| | |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3711 ccgtttggattggtttattttgaacttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 3810  T
Q  263 ttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 362  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  3811 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcttttgattct 3910  T
Q  363 ctctg 367  Q
    |||||    
T  3911 ctctg 3915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 211 - 6
Alignment:
Q  163 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctact--tccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  211 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtggacttatcatctactccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 112  T
Q  261 gtttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 360  Q
    |||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  111 gtttcatatgctgcttatgccat-tttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 13  T
Q  361 ctctctg 367  Q
    |||||||    
T  12 ctctctg 6  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University