View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5887-Insertion-5 (Length: 465)

Name: NF5887-Insertion-5
Description: NF5887
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5887-Insertion-5
NF5887-Insertion-5
[»] chr5 (18 HSPs)
chr5 (183-375)||(41334571-41334763)
chr5 (183-369)||(2614563-2614749)
chr5 (181-375)||(18033980-18034174)
chr5 (179-377)||(7617129-7617327)
chr5 (180-376)||(5256992-5257188)
chr5 (183-350)||(22512305-22512472)
chr5 (181-376)||(33801467-33801662)
chr5 (181-369)||(38470577-38470765)
chr5 (185-377)||(25914902-25915085)
chr5 (182-350)||(39122366-39122533)
chr5 (270-377)||(39122262-39122369)
chr5 (183-282)||(32473395-32473494)
chr5 (183-258)||(33855068-33855143)
chr5 (177-375)||(30622627-30622824)
chr5 (182-282)||(17208073-17208173)
chr5 (303-374)||(32473303-32473374)
chr5 (286-349)||(6679724-6679788)
chr5 (286-349)||(28177801-28177865)
[»] chr8 (34 HSPs)
chr8 (176-376)||(36743390-36743590)
chr8 (183-369)||(11582766-11582952)
chr8 (177-369)||(29705356-29705548)
chr8 (182-374)||(42197344-42197536)
chr8 (178-377)||(30660648-30660847)
chr8 (185-377)||(30912468-30912660)
chr8 (184-376)||(45397317-45397508)
chr8 (185-371)||(29800862-29801048)
chr8 (182-375)||(2546995-2547188)
chr8 (185-374)||(26125637-26125825)
chr8 (185-377)||(20148762-20148954)
chr8 (183-369)||(2165877-2166063)
chr8 (177-375)||(31384658-31384856)
chr8 (179-375)||(42295191-42295386)
chr8 (225-375)||(9241594-9241744)
chr8 (180-352)||(5754900-5755072)
chr8 (183-377)||(1375542-1375736)
chr8 (179-375)||(3743767-3743963)
chr8 (182-375)||(40528542-40528736)
chr8 (185-279)||(42699259-42699353)
chr8 (180-282)||(35181513-35181615)
chr8 (181-377)||(34304786-34304981)
chr8 (177-282)||(33629994-33630099)
chr8 (182-282)||(18066719-18066819)
chr8 (182-276)||(16603633-16603727)
chr8 (177-227)||(19386626-19386676)
chr8 (303-375)||(10678060-10678132)
chr8 (179-277)||(16358839-16358938)
chr8 (177-222)||(10678201-10678246)
chr8 (303-376)||(35181636-35181709)
chr8 (303-375)||(33629901-33629973)
chr8 (183-218)||(28977146-28977181)
chr8 (185-285)||(32328815-32328908)
chr8 (303-375)||(19386473-19386545)
[»] chr3 (36 HSPs)
chr3 (174-377)||(36150121-36150324)
chr3 (180-375)||(24688310-24688505)
chr3 (184-375)||(54237097-54237288)
chr3 (184-377)||(42394325-42394518)
chr3 (181-375)||(40808863-40809057)
chr3 (178-377)||(54246054-54246253)
chr3 (178-376)||(46941048-46941246)
chr3 (184-375)||(40480750-40480941)
chr3 (182-376)||(25413680-25413874)
chr3 (185-375)||(53581766-53581956)
chr3 (183-375)||(45126836-45127028)
chr3 (181-377)||(47190932-47191127)
chr3 (183-367)||(42100688-42100872)
chr3 (185-375)||(27748565-27748746)
chr3 (225-376)||(52629870-52630021)
chr3 (185-377)||(1078229-1078412)
chr3 (181-377)||(53273599-53273786)
chr3 (198-327)||(51249323-51249452)
chr3 (178-282)||(4190266-4190370)
chr3 (179-377)||(11064628-11064824)
chr3 (179-375)||(9434120-9434316)
chr3 (285-377)||(29556865-29556956)
chr3 (174-285)||(29558232-29558343)
chr3 (181-282)||(10457893-10457994)
chr3 (182-271)||(25996267-25996356)
chr3 (297-377)||(19148882-19148962)
chr3 (177-282)||(34791823-34791928)
chr3 (181-282)||(52627978-52628079)
chr3 (183-282)||(51757593-51757692)
chr3 (303-375)||(51757713-51757784)
chr3 (303-377)||(4190171-4190245)
chr3 (313-375)||(54429173-54429235)
chr3 (226-277)||(19148822-19148873)
chr3 (287-349)||(26141543-26141606)
chr3 (303-377)||(10457798-10457872)
chr3 (179-211)||(47532019-47532051)
[»] chr6 (21 HSPs)
chr6 (179-371)||(7292743-7292935)
chr6 (182-369)||(9698247-9698434)
chr6 (178-377)||(26669915-26670114)
chr6 (183-374)||(13743130-13743321)
chr6 (183-374)||(13748630-13748821)
chr6 (179-377)||(26466795-26466993)
chr6 (180-377)||(3213397-3213594)
chr6 (180-369)||(7367546-7367735)
chr6 (182-377)||(21279928-21280123)
chr6 (180-377)||(7273241-7273438)
chr6 (185-375)||(24203895-24204085)
chr6 (185-375)||(30735984-30736174)
chr6 (183-374)||(30014343-30014534)
chr6 (182-376)||(21293584-21293778)
chr6 (185-282)||(27441544-27441641)
chr6 (181-375)||(33242401-33242595)
chr6 (182-282)||(31109223-31109323)
chr6 (183-282)||(33253913-33254012)
chr6 (303-377)||(27441662-27441736)
chr6 (303-376)||(33254034-33254107)
chr6 (303-377)||(31109128-31109202)
[»] chr1 (37 HSPs)
chr1 (179-375)||(5489772-5489968)
chr1 (183-375)||(43570994-43571186)
chr1 (181-375)||(48498870-48499064)
chr1 (177-374)||(37814772-37814969)
chr1 (180-375)||(23989431-23989627)
chr1 (180-377)||(24769405-24769602)
chr1 (183-376)||(50448167-50448360)
chr1 (185-377)||(7447828-7448019)
chr1 (182-377)||(750211-750406)
chr1 (185-376)||(4401329-4401521)
chr1 (185-376)||(2497469-2497660)
chr1 (233-376)||(4888093-4888235)
chr1 (181-282)||(44112675-44112776)
chr1 (183-282)||(48119628-48119727)
chr1 (183-282)||(35003294-35003393)
chr1 (182-282)||(41065152-41065252)
chr1 (183-282)||(38335918-38336017)
chr1 (183-282)||(46168383-46168482)
chr1 (182-282)||(45427746-45427846)
chr1 (182-276)||(38113202-38113296)
chr1 (181-282)||(45639733-45639834)
chr1 (303-375)||(35000021-35000093)
chr1 (303-377)||(35003414-35003488)
chr1 (303-377)||(44112797-44112871)
chr1 (182-282)||(45705824-45705924)
chr1 (303-375)||(45705945-45706017)
chr1 (183-282)||(35000114-35000213)
chr1 (181-230)||(14427345-14427394)
chr1 (303-372)||(48119748-48119817)
chr1 (303-375)||(45639640-45639712)
chr1 (303-377)||(26585582-26585656)
chr1 (303-377)||(38113101-38113175)
chr1 (306-376)||(45427652-45427722)
chr1 (181-282)||(26585460-26585561)
chr1 (303-376)||(41065271-41065344)
chr1 (286-349)||(45044570-45044634)
chr1 (303-355)||(46168503-46168555)
[»] chr7 (36 HSPs)
chr7 (183-369)||(24000926-24001112)
chr7 (183-369)||(42538345-42538531)
chr7 (181-375)||(41861672-41861868)
chr7 (183-377)||(5810830-5811024)
chr7 (177-371)||(5015389-5015583)
chr7 (185-377)||(44326180-44326372)
chr7 (183-369)||(42972852-42973038)
chr7 (186-375)||(26898310-26898499)
chr7 (185-376)||(44416841-44417032)
chr7 (185-375)||(43343532-43343722)
chr7 (192-369)||(32029731-32029908)
chr7 (185-377)||(16180263-16180454)
chr7 (185-376)||(4638106-4638297)
chr7 (183-377)||(45326020-45326214)
chr7 (182-377)||(35069720-35069915)
chr7 (199-369)||(27393174-27393344)
chr7 (185-375)||(10573751-10573941)
chr7 (177-375)||(43317437-43317635)
chr7 (182-369)||(9216301-9216487)
chr7 (206-357)||(38160505-38160656)
chr7 (182-375)||(5194139-5194332)
chr7 (182-324)||(24280555-24280697)
chr7 (180-376)||(40236916-40237112)
chr7 (183-282)||(31513287-31513386)
chr7 (263-377)||(47279630-47279744)
chr7 (184-282)||(31408634-31408732)
chr7 (180-282)||(27535232-27535334)
chr7 (179-282)||(33384866-33384970)
chr7 (183-250)||(39998408-39998475)
chr7 (303-377)||(31408539-31408613)
chr7 (303-377)||(33384991-33385065)
chr7 (303-377)||(27535137-27535211)
chr7 (303-377)||(31513407-31513481)
chr7 (182-236)||(47279744-47279798)
chr7 (305-349)||(35522902-35522947)
chr7 (182-211)||(38160666-38160695)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (184-377)||(112656-112849)
[»] chr2 (42 HSPs)
chr2 (184-377)||(19047158-19047351)
chr2 (182-377)||(30838631-30838826)
chr2 (177-375)||(1750408-1750606)
chr2 (185-377)||(43490307-43490499)
chr2 (180-369)||(12302167-12302356)
chr2 (176-376)||(4764633-4764833)
chr2 (183-375)||(16096747-16096940)
chr2 (181-375)||(43335671-43335865)
chr2 (183-374)||(42849768-42849946)
chr2 (184-377)||(34817682-34817875)
chr2 (173-342)||(13780676-13780846)
chr2 (182-369)||(42026766-42026955)
chr2 (185-325)||(8896541-8896681)
chr2 (225-376)||(39149201-39149350)
chr2 (180-282)||(43114554-43114656)
chr2 (185-375)||(11825562-11825752)
chr2 (181-282)||(16803966-16804067)
chr2 (181-282)||(16843248-16843349)
chr2 (185-282)||(41281975-41282072)
chr2 (183-282)||(12415461-12415560)
chr2 (183-282)||(12427521-12427620)
chr2 (185-277)||(33229303-33229396)
chr2 (180-377)||(34895647-34895844)
chr2 (182-276)||(18491704-18491798)
chr2 (181-282)||(966835-966936)
chr2 (185-268)||(6518484-6518566)
chr2 (182-265)||(14285675-14285758)
chr2 (303-377)||(6518400-6518474)
chr2 (303-377)||(18491825-18491899)
chr2 (303-377)||(41281880-41281954)
chr2 (303-375)||(966742-966814)
chr2 (303-375)||(43114677-43114749)
chr2 (185-268)||(4299435-4299518)
chr2 (185-272)||(7070418-7070505)
chr2 (225-282)||(4451951-4452008)
chr2 (311-375)||(12415368-12415432)
chr2 (311-375)||(12427428-12427492)
chr2 (303-375)||(16804088-16804160)
chr2 (303-375)||(16843370-16843442)
chr2 (303-377)||(12531569-12531643)
chr2 (303-375)||(4299328-4299400)
chr2 (287-349)||(40613913-40613976)
[»] scaffold0119 (1 HSPs)
scaffold0119 (178-377)||(680-879)
[»] chr4 (52 HSPs)
chr4 (183-377)||(27550309-27550503)
chr4 (181-377)||(1771172-1771368)
chr4 (177-376)||(23035974-23036173)
chr4 (181-375)||(25051691-25051885)
chr4 (181-377)||(28982728-28982924)
chr4 (180-377)||(55966252-55966449)
chr4 (185-375)||(27893750-27893940)
chr4 (181-375)||(33703139-33703333)
chr4 (180-377)||(27864561-27864758)
chr4 (183-375)||(35017733-35017924)
chr4 (185-375)||(43514594-43514784)
chr4 (7-182)||(48187288-48187464)
chr4 (186-375)||(23204686-23204875)
chr4 (185-375)||(43949709-43949900)
chr4 (185-376)||(31680904-31681095)
chr4 (180-377)||(28988470-28988666)
chr4 (185-377)||(43735744-43735936)
chr4 (183-369)||(12496956-12497142)
chr4 (183-376)||(27316619-27316813)
chr4 (182-372)||(48463361-48463551)
chr4 (177-371)||(45490225-45490419)
chr4 (182-377)||(21687005-21687200)
chr4 (184-377)||(41878407-41878593)
chr4 (225-375)||(51512173-51512323)
chr4 (185-357)||(39631102-39631275)
chr4 (177-370)||(41847965-41848158)
chr4 (185-348)||(41327478-41327641)
chr4 (224-376)||(56215805-56215956)
chr4 (181-282)||(711958-712059)
chr4 (236-363)||(46412389-46412516)
chr4 (183-282)||(17619153-17619252)
chr4 (183-375)||(55272284-55272476)
chr4 (181-263)||(960890-960972)
chr4 (185-277)||(3756252-3756344)
chr4 (182-282)||(32728356-32728456)
chr4 (179-271)||(35037001-35037093)
chr4 (182-282)||(48435580-48435680)
chr4 (390-465)||(48187484-48187561)
chr4 (303-376)||(19880074-19880147)
chr4 (180-268)||(46827721-46827809)
chr4 (303-374)||(35037125-35037195)
chr4 (303-377)||(17619058-17619132)
chr4 (303-371)||(712080-712148)
chr4 (303-375)||(48435487-48435559)
chr4 (303-377)||(46827612-46827686)
chr4 (182-263)||(49229684-49229765)
chr4 (337-377)||(32728511-32728551)
chr4 (183-222)||(36004165-36004204)
chr4 (327-373)||(960753-960799)
chr4 (177-231)||(30189267-30189321)
chr4 (303-376)||(3756159-3756232)
chr4 (185-282)||(38851515-38851612)
[»] scaffold0187 (2 HSPs)
scaffold0187 (182-375)||(14097-14289)
scaffold0187 (182-375)||(24425-24617)
[»] scaffold0385 (1 HSPs)
scaffold0385 (181-375)||(11249-11443)
[»] scaffold0157 (1 HSPs)
scaffold0157 (183-369)||(23335-23521)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (185-282)||(45720-45817)
scaffold0003 (303-377)||(45625-45699)
[»] scaffold0100 (2 HSPs)
scaffold0100 (183-282)||(35457-35556)
scaffold0100 (318-369)||(35370-35421)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 18)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 183 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 41334763 - 41334571
Alignment:
Q  183 ggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatctt 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41334763 ggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacacctcattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatctt 41334664  T
Q  283 ctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactc 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41334663 ctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaagggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactc 41334571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 183 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 2614749 - 2614563
Alignment:
Q  183 ggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatctt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2614749 ggaaaatgttacatgaacaccctttattcctacatcccattgtacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatctt 2614650  T
Q  283 ctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatca 369  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2614649 ctatttgtgtggggtccagattgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaagggtgtattgccacatgaggtggtacatgtatca 2614563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 181 - 375
Target Start/End: Original strand, 18033980 - 18034174
Alignment:
Q  181 aaggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatc 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18033980 aaggaaaatgttacatgaacaccctttattcctacactccattgtacaccctatgtattagggatatttttgtaagttcatctcacaaccacactttatc 18034079  T
Q  281 ttctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactc 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  18034080 ttctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttatatgggtgtaaagggtgtattgccatatggggtggtacatgtatcatcactc 18034174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 179 - 377
Target Start/End: Original strand, 7617129 - 7617327
Alignment:
Q  179 aaaaggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacacttta 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7617129 aaaaggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacactccattatacaccccatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacacttta 7617228  T
Q  279 tcttctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactctt 377  Q
    |||||||||| |||||| || | |||| ||| |||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  7617229 tcttctatttatgtgggatctaagttgtcacatgtcagaattttgtgttggtgtaaaaggtgtattgccacatggggtgatacatgtatcatcactctt 7617327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 180 - 376
Target Start/End: Original strand, 5256992 - 5257188
Alignment:
Q  180 aaaggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttat 279  Q
    |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5256992 aaagaaaaatgttacataaacaccatttattcatacatcccattgtacaccccatgtattagggatattttggtaatttcatctcacaaccacactttat 5257091  T
Q  280 cttctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactct 376  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||||||| |||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5257092 cttctatttatgtggggtcaagattgccacatgtcagaattttatgtgggtgtaaagggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactct 5257188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 183 - 350
Target Start/End: Original strand, 22512305 - 22512472
Alignment:
Q  183 ggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatctt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22512305 ggaaaatgttacatgaacaccctttattcctacactccattgtacactccatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatctt 22512404  T
Q  283 ctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccaca 350  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||    
T  22512405 ctatttgtgtggggtccaagttgccacgtgtcagaattttgtgtggatgtaaagggtgtattgccaca 22512472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 181 - 376
Target Start/End: Original strand, 33801467 - 33801662
Alignment:
Q  181 aaggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatc 280  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33801467 aaggaaaatgttacatgaacatcctttatttctacaccccattgtacactccatgtattagggatattttagtaagttcatctcacaaccacactttatc 33801566  T
Q  281 ttctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactct 376  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||    
T  33801567 ttctatttgtgtgggatccaagttgccacgtgtcagaattttgtgtgggtgtaaagagtgtattgccacatgggaaggtacatatatcatcactct 33801662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 181 - 369
Target Start/End: Original strand, 38470577 - 38470765
Alignment:
Q  181 aaggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatc 280  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  38470577 aaggaaaatgttacataaacaccctttattcatacattccattgtacaccccatgtattaaggatattttggtaaattcatttcacaatcacactttatc 38470676  T
Q  281 ttctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatca 369  Q
    |||||||| |||||||||||| || |||||| |||||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  38470677 ttctatttatgtggggtccagattaccacgtatcagaattttatgtgggtgtaaagggtgtattgccatatgaggtggtacatgtatca 38470765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 185 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 25915085 - 25914902
Alignment:
Q  185 aaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttct 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||| |||||||||| ||        ||||||||    
T  25915085 aaaatgttacatgaacaccctttattcctacacctcattgtacacccaatgtattaga-atatttttgtaggttcatctcataa--------tatcttct 25914995  T
Q  285 atttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactctt 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  25914994 atttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtgtgggtgtaaatggtgtattgccacatgaggtggtacatgtatcatcactctt 25914902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 182 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 39122533 - 39122366
Alignment:
Q  182 aggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatct 281  Q
    |||||| | ||||||||||||| |||||||||||| |  |||| |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  39122533 aggaaactattacatgaacaccttttattcatacatctaattagacaccc-atgtattaggaatattttggtaaattcatctcacaactacactttatct 39122435  T
Q  282 tctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccaca 350  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||| | ||||| ||||    
T  39122434 tctatttgtgtggggtttaggttgccacatgtcagaatcttgtgtggatgtaaatgatatattgtcaca 39122366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 270 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 39122369 - 39122262
Alignment:
Q  270 cacactttatcttctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatca 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39122369 cacactttatcttctatttgtgtggggtttaggttgccacatgtcagaatcttgtgtggatgtaaatgatatattgtcacatggggtggtacatgtatca 39122270  T
Q  370 ccactctt 377  Q
    ||||||||    
T  39122269 ccactctt 39122262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 183 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 32473494 - 32473395
Alignment:
Q  183 ggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatctt 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  32473494 ggaaaatgttacatgaacaccctttaatcatacaccttattgtacaccacatgcattagggatattttggtaatttcatctcacaaccatactttctctt 32473395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 183 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 33855143 - 33855068
Alignment:
Q  183 ggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagtt 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| | |||||||||||||    
T  33855143 ggaaaatgttacatgaacaccctttattcctacaccccattgtacaccccatgtattaggaacattttggtaagtt 33855068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 177 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 30622824 - 30622627
Alignment:
Q  177 aaaaaaggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactt 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| || | || ||| |||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||    
T  30622824 aaaaaaggaaaatgttacatgaacatcctttaatcatacaccctattgta-agcccatgcattaaggatattttggtaaatttatctcacaaccatactt 30622726  T
Q  277 tatcttctat---ttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccac 373  Q
    | ||||  ||    | | |    |||   ||||||| ||||| |||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  30622725 tctctttcatctcctctctcttttcc---ttgccacatgtcaaaattttgtgtgggtgtaagaggtgtattgccacatgggggtgtacatgtatcaccac 30622629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 182 - 282
Target Start/End: Original strand, 17208073 - 17208173
Alignment:
Q  182 aggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatct 281  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||   ||| ||||||| ||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||    
T  17208073 aggaaaatgttacgtgaacaccctttaatcatacactttattgtacaccccatgcattaaggacattttggtaaattcatctcacaaccatactttctct 17208172  T
Q  282 t 282  Q
    |    
T  17208173 t 17208173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 303 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 32473374 - 32473303
Alignment:
Q  303 ttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccact 374  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  32473374 ttgccacatgtcagaattttgtgtgggtgtaagaggtgtattgccacatggaggtgtacatgtatcaccact 32473303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 286 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 6679788 - 6679724
Alignment:
Q  286 tttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgt-aaatggtgtattgccac 349  Q
    |||||| |||||||| ||  |||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  6679788 tttgtgcggggtccatgtgaccacgtgtcagatttttgtgtgggtgtcaaaaggtgtattgccac 6679724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 286 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 28177865 - 28177801
Alignment:
Q  286 tttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgt-aaatggtgtattgccac 349  Q
    |||||| |||||||| ||  |||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  28177865 tttgtgcggggtccatgtgaccacgtgtcagatttttgtgtgggtgtcaaagggtgtattgccac 28177801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 181; Significance: 1e-97; HSPs: 34)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 176 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 36743590 - 36743390
Alignment:
Q  176 taaaaaaggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacact 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36743590 taaaaaaggaaaatgttacatgaacaccctttattcctacatcccattgtacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacact 36743491  T
Q  276 ttatcttctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactc 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36743490 ttatcttctatttgtgtggggtccagattgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcatcactc 36743391  T
Q  376 t 376  Q
    |    
T  36743390 t 36743390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 183 - 369
Target Start/End: Original strand, 11582766 - 11582952
Alignment:
Q  183 ggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatctt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11582766 ggaaaatgttacatgaacaccctttattcctacatcccattgtacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatctt 11582865  T
Q  283 ctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatca 369  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11582866 ctatttgtgtggggtccagattgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaagggtgtattgccacatgaggtggtacatgtatca 11582952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 177 - 369
Target Start/End: Original strand, 29705356 - 29705548
Alignment:
Q  177 aaaaaaggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactt 276  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29705356 aaaaatggaaaatgttacatgaacaccctttatttctacaccccattgtacaccccatgtattagggatattttgataagttcatctcacaaccacactt 29705455  T
Q  277 tatcttctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatca 369  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29705456 tatcttctatttgtgcggggtccaagttgccacgtgtcagaattttgtgtgggtgtaaagggtgtattgccacatggggtggtacatgtatca 29705548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 182 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 42197536 - 42197344
Alignment:
Q  182 aggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatct 281  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42197536 aggaaaatgttacatgaacaccatttattcctacaccccattgcacacactatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatct 42197437  T
Q  282 tctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccact 374  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42197436 tctatttgtgtggggtccagattgccacgtgtcaaaattttgtgtgggtgtaaagggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcatcact 42197344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 178 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 30660847 - 30660648
Alignment:
Q  178 aaaaaggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacacttt 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30660847 aaaaaggaaaatgttacatgaacaccctttatttctacatcccattgtacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatcttacaaccacacttt 30660748  T
Q  278 atcttctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactctt 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||    
T  30660747 atcttctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttatgtggatgtaaagggtgtattgccacataggatgatacatgtatcatcactctt 30660648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 185 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 30912660 - 30912468
Alignment:
Q  185 aaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttct 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  30912660 aaaatgttacatgaacaccctttattcctacaccccattgtacacttcatgtattaggggtattttggtaagttcatctcacaaccgcaccttatcttct 30912561  T
Q  285 atttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactctt 377  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30912560 atttgtgtggggtctaggttgccacgtgtcagaattttgtgtgggtgtaaagagtgtattgccacatggggtggtacatgtatcatcactctt 30912468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 184 - 376
Target Start/End: Original strand, 45397317 - 45397508
Alignment:
Q  184 gaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttc 283  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45397317 gaaaatgttacgtgaacaccctttattcctacaccccattctacaccctatgtattagggatatttttgtaagttcatctcacaaccacaatttatcttc 45397416  T
Q  284 tatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactct 376  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  45397417 tatttgtgtgggctccagattgccacgtgtcagaattttgtgtgggtgtaaagggtgtgttgccacat-gggtggtacatgtatcatcactct 45397508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 185 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 29801048 - 29800862
Alignment:
Q  185 aaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttct 284  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29801048 aaaatgttacataaacaccatttattcatacatcccattgtacaccccatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttct 29800949  T
Q  285 atttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcacc 371  Q
    |||| ||||||||| || ||||||| |||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29800948 atttatgtggggtcaagattgccacatgtcagaattttatgtgggtgtaaagggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcacc 29800862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 182 - 375
Target Start/End: Original strand, 2546995 - 2547188
Alignment:
Q  182 aggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatct 281  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2546995 aggaaaatgttacatgaacactctttatttctacactccattgtacacctcatgtattagggatattttagtaagttcatctcacaaccacactttatct 2547094  T
Q  282 tctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactc 375  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  2547095 tctatttgtgtgggatccaagttgccacgtgtcagaattttgtgtgggtgtaaagggtgtattgccacatagggtggtacatgtatcatcactc 2547188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 185 - 374
Target Start/End: Original strand, 26125637 - 26125825
Alignment:
Q  185 aaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttct 284  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26125637 aaaatgttacataaacaccctttattcatacattccattgtacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttct 26125736  T
Q  285 atttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccact 374  Q
    |||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26125737 atttatgt-gggtccagattgccacgtgtcagaattttatgcgggtgtaaagggtgtattgccacatggggtggtacatatatcaccact 26125825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 185 - 377
Target Start/End: Original strand, 20148762 - 20148954
Alignment:
Q  185 aaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttct 284  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20148762 aaaatgttacataaacaccctttattcatacatcccattgtacacctcatatattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcatct 20148861  T
Q  285 atttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactctt 377  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20148862 atttatgtgggatccagattgccacgtgtcagaattttatgtgggtgtaaagggtgtattgccacatggtgtggtacatgtatcaccactctt 20148954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 183 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 2166063 - 2165877
Alignment:
Q  183 ggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatctt 282  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2166063 ggaaaatattacatgaacaccatttattcctacaccccattgtataccccatgtattagagatattttggtaagttcatctcataaccacactttatctt 2165964  T
Q  283 ctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatca 369  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  2165963 ctatttgtgtggggttcaggttgccacgtgtcagaattttgtgtgggtgtaaagggtgtattgtcacatgggatggtacatgtatca 2165877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 177 - 375
Target Start/End: Original strand, 31384658 - 31384856
Alignment:
Q  177 aaaaaaggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactt 276  Q
    |||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||  | ||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31384658 aaaataggaaagtattacatgaacaccctttattcttacattctattgtacaccccatgtattaggaatattttggtaagttcatctcacaaccacactt 31384757  T
Q  277 tatcttctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactc 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  31384758 tatcttctatttgtgtggggtccaggttgctacgtgtcagaattttatgtggatgtaaagggtatattgccacatggggtggtacatatatcatcactc 31384856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 179 - 375
Target Start/End: Original strand, 42295191 - 42295386
Alignment:
Q  179 aaaaggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacacttta 278  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42295191 aaaagaaaaatgttacatgaacaccctttattcctacacctcattgtacactccatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacacttta 42295290  T
Q  279 tcttctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactc 375  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||    
T  42295291 tcttctatttatgt-gggtccaagttgccacatgtcagaattttgtgtggatgtaaagggtatattgccacataggatggtacatttatcatcactc 42295386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 225 - 375
Target Start/End: Original strand, 9241594 - 9241744
Alignment:
Q  225 tacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgt 324  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9241594 tacaccctatatattagggatatttttgtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatttatgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgt 9241693  T
Q  325 atgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactc 375  Q
     |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9241694 gtgggtgcaaagggtgtgttgccacatggggtggtacatgtatcatcactc 9241744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 180 - 352
Target Start/End: Original strand, 5754900 - 5755072
Alignment:
Q  180 aaaggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttat 279  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5754900 aaaggaaaatgttacatgaacaccttttattcctacatcccattgtacatcccatatattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttat 5754999  T
Q  280 cttctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatg 352  Q
    ||||||||| |||||| |||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  5755000 cttctatttatgtgggatccaagttgccacgtgttagaattttgtgtgggtgtaaagggtgtattgccccatg 5755072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 183 - 377
Target Start/End: Original strand, 1375542 - 1375736
Alignment:
Q  183 ggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatctt 282  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||    
T  1375542 ggaaaattttacatgaacaccttttattcatacacccaattgtacaccccatatattagggatattttggtaaatttatctcacaactacactttatctt 1375641  T
Q  283 ctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactctt 377  Q
    |||||||||||| || ||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||   ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1375642 ctatttgtgtggagttcagattgccacgtgttagaatcttgtgtgggtgtaaagaatgtattgtcacatagggtggtacatgtatcaccactctt 1375736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 179 - 375
Target Start/End: Original strand, 3743767 - 3743963
Alignment:
Q  179 aaaaggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacacttta 278  Q
    ||||| |||||||| |||  ||||||||||||||| |  |||||||||||||| || ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3743767 aaaagaaaaatgttccatatacaccctttattcatccctcccattatacaccccatatattaagtatattttgataagttcatctcacaaccacacttta 3743866  T
Q  279 tcttctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactc 375  Q
    |||||||||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  3743867 tcttctatttatgtagggttcagattgccacgtgtcagaattttatgtgggtgtaaagggtgtattgctacatggggtggtacatatatcatcactc 3743963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 182 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 40528736 - 40528542
Alignment:
Q  182 aggaaaatgttacatgaacacccttt-attcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatc 280  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||| || ||||||||| |||||| ||| || |||||||||||||||||| ||    
T  40528736 aggaaaataatacatgaacacccttttattcacaaaccccattgtacaccccatatattagggacattttgataaatttatctcacaaccacactttctc 40528637  T
Q  281 ttctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactc 375  Q
    ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||| |||||||| ||| |||||||| | ||||| |||||| ||  | ||||||||||||||||    
T  40528636 ttctatttgtgtggggttcaagttgtcacatgtcataattttgtgtggatgtaaatgatatattgtcacatgagggtgcacatgtatcaccactc 40528542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 185 - 279
Target Start/End: Original strand, 42699259 - 42699353
Alignment:
Q  185 aaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttat 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42699259 aaaatgttacatgaacaccctttattcctacaccccattgtacaccttatgtattatggatatttttgtaagttcatctcacaaccacactttat 42699353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 180 - 282
Target Start/End: Original strand, 35181513 - 35181615
Alignment:
Q  180 aaaggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttat 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| |    
T  35181513 aaaggaaaatgttacatgaacaccctttaatcatacaccctattgtacaccccatgcattagggacattttggtaatttcatctcacaaccatactttct 35181612  T
Q  280 ctt 282  Q
    |||    
T  35181613 ctt 35181615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 181 - 377
Target Start/End: Original strand, 34304786 - 34304981
Alignment:
Q  181 aaggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatc 280  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||    
T  34304786 aaggaaaatgttacatgaacatcctttaatcatacaccctattgtacaccccatgcattagggacattttggtaatttcatctcacaaccatactttctc 34304885  T
Q  281 ttctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactctt 377  Q
    ||  || |        |     ||||||| |||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34304886 tttcatctcctctcacttttccttgccacatgtcaggattttgtttgggtgtaagaggtgtattgccacatggggt-gtacatgtatcaccactctt 34304981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 177 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 33630099 - 33629994
Alignment:
Q  177 aaaaaaggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactt 276  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||||| | ||||    
T  33630099 aaaaaagaaaaatgttacacgaacaccctttaatcatacacctcattgtacaccctatgcattagggacattttagtaatttcatctcacaactatactt 33630000  T
Q  277 tatctt 282  Q
    | ||||    
T  33629999 tctctt 33629994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 182 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 18066819 - 18066719
Alignment:
Q  182 aggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatct 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | ||| |||| || |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||    
T  18066819 aggaaaatgttacatgaacaccctttaatcatacattctattgtacatcccatgtattagggatattttagtaatttcatctcacaaccatactttctct 18066720  T
Q  282 t 282  Q
    |    
T  18066719 t 18066719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 182 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 16603727 - 16603633
Alignment:
Q  182 aggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactt 276  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||| ||||  || |||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  16603727 aggaaaatgttacatgcacaccctttaatcatacaccttattatacaccccatgcattaaagacattttggtaaattcatctcacaaccatactt 16603633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 19386676 - 19386626
Alignment:
Q  177 aaaaaaggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatac 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  19386676 aaaaaaggaaaatgttacatgaacaccctttaatcatacaccctattatac 19386626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 303 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 10678132 - 10678060
Alignment:
Q  303 ttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactc 375  Q
    ||||||| |||||| ||||||| |||||||||  | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  10678132 ttgccacatgtcaggattttgtgtgggtgtaagagatgtattgccacatgggggtgtacatgtatcaccactc 10678060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 16358938 - 16358839
Alignment:
Q  179 aaaaggaaaatgttacat-gaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacacttt 277  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||| ||| |||| || ||| |||| | |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||    
T  16358938 aaaaagaaaatgttacattgaagaccctttaatcatacaccctattgtacatcccatgcattaagaatattttgataaattcatctcacaaccatacttt 16358839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 10678246 - 10678201
Alignment:
Q  177 aaaaaaggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  10678246 aaaaaaggaaaatgttacatgaataccctttaatcatacaccccat 10678201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 303 - 376
Target Start/End: Original strand, 35181636 - 35181709
Alignment:
Q  303 ttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactct 376  Q
    ||||||| |||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||    
T  35181636 ttgccacatgtcaggattttgtgtgggtgtaagaggtgtattgccacatgaaggtgtacatgtatcaccactct 35181709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 303 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 33629973 - 33629901
Alignment:
Q  303 ttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactc 375  Q
    ||||||| ||||| |||||||| | |||||||  |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  33629973 ttgccacatgtcaaaattttgtgtaggtgtaagaggtgtattgccacatgggggtgtacatatatcaccactc 33629901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 183 - 218
Target Start/End: Original strand, 28977146 - 28977181
Alignment:
Q  183 ggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacacc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28977146 ggaaaatgttacatgaacaccctttattcctacacc 28977181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 185 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 32328908 - 32328815
Alignment:
Q  185 aaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttct 284  Q
    |||||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||       | |||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||| | ||||| ||||||    
T  32328908 aaaatgttacgtgaacaccattttttcatacaccgcat-------cttatgcattaggaatattttggtaagtttatctcacaactatactttctcttct 32328816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 303 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 19386545 - 19386473
Alignment:
Q  303 ttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactc 375  Q
    ||||||| |||||| ||||||| ||||||||   |||| ||| |||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  19386545 ttgccacatgtcaggattttgtgtgggtgtatgaggtgcattaccacatggagatgtacatgtatcaccactc 19386473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 172; Significance: 3e-92; HSPs: 36)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 174 - 377
Target Start/End: Original strand, 36150121 - 36150324
Alignment:
Q  174 tttaaaaaaggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccaca 273  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36150121 tttaaaagtggaaaatgttacatgaataccctttattcatacaccccattatacaccctatgtatcagggatattttggtaagttcatctcacaaccaca 36150220  T
Q  274 ctttatcttctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccac 373  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36150221 ctttatcttctatttgtgtggagtccaggttgccacgtgtcagaattttgtgtggatgtaaagggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccac 36150320  T
Q  374 tctt 377  Q
    ||||    
T  36150321 tctt 36150324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 180 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 24688505 - 24688310
Alignment:
Q  180 aaaggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttat 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24688505 aaaggaaaatgttacatgaacaccctttatttctacactccattgtacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttat 24688406  T
Q  280 cttctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactc 375  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24688405 cttctatttatgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtgtgggggtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcatcactc 24688310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 184 - 375
Target Start/End: Original strand, 54237097 - 54237288
Alignment:
Q  184 gaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttc 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54237097 gaaaatgttacatgaacaccctttattcctacatcccattgtacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttc 54237196  T
Q  284 tatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactc 375  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  54237197 tatttgtgtggggtccagattgccacgtgtcagaatattgtatgggtgtaaagggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcatcactc 54237288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 184 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 42394518 - 42394325
Alignment:
Q  184 gaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttc 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42394518 gaaaatgttacatgaacaccctttattcctacattccattgtacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttc 42394419  T
Q  284 tatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactctt 377  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42394418 tatttgtgtggggtccagattgccacgtgtcaaaattttgtatgggtgtaaagggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcatcactctt 42394325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 181 - 375
Target Start/End: Original strand, 40808863 - 40809057
Alignment:
Q  181 aaggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatc 280  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40808863 aaggaaaatgttacatcaacaccatttattcctacaccccattgtacaccccatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatc 40808962  T
Q  281 ttctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactc 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40808963 ttctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtgtggatgtaaaaggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcatcactc 40809057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 178 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 54246253 - 54246054
Alignment:
Q  178 aaaaaggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacacttt 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  54246253 aaaaaggaaaatgttacatgaacaccctttattcctacaccccattgtacaccctatgtattagagatatttttgtaagttcatctcacaaccacacttt 54246154  T
Q  278 atcttctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactctt 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  54246153 atcttctatttgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatgtgggtgtaaagaatgtattgccacatggggtggtacatgtatcatcactctt 54246054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 178 - 376
Target Start/End: Original strand, 46941048 - 46941246
Alignment:
Q  178 aaaaaggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacacttt 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46941048 aaaaaggaaaatgttacatgaacaccctttattcctacatctcattgtacaccccatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacacttt 46941147  T
Q  278 atcttctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactct 376  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  46941148 atcttctatttgtgtggggtccaagttgccacgtgtcagaattttatgtgggtgtaaagagtgtattgccacatggggtggtacatgtatcatcactct 46941246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 184 - 375
Target Start/End: Original strand, 40480750 - 40480941
Alignment:
Q  184 gaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttc 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40480750 gaaaatgttacatgaacaccctttattcatatgccccattgtacatcctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttc 40480849  T
Q  284 tatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactc 375  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  40480850 tatttgtgtagggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtgtgggtgtaaagggtgtattgccgcatggggtgatacatgtatcatcactc 40480941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 182 - 376
Target Start/End: Original strand, 25413680 - 25413874
Alignment:
Q  182 aggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatct 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25413680 aggaaaatgttacatgaacaccctttattcctacaccccattgtacaccttatgtattagggatatttttgtaagttcatctcacaaccacactttatct 25413779  T
Q  282 tctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactct 376  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  25413780 tctatttgtgtggggtccaggttaccacgtgtcagagttttgtgtgggtgtaaagggtgtattgtcatatggggtggtacatgtatcatcactct 25413874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 185 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 53581956 - 53581766
Alignment:
Q  185 aaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttct 284  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53581956 aaaatgttacatgaacactctttattcatacactccattgtacatcctatgtattagggatattttgataagttcatctcacaaccacactttatcttct 53581857  T
Q  285 atttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactc 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  53581856 atttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtgtgggtgtaaagggtgtattgccacatagggtggtacaggtatcatcactc 53581766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 183 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 45127028 - 45126836
Alignment:
Q  183 ggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatctt 282  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  45127028 ggaaaatgttacataaacaccctttattcatacatcccattgtacaccccatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatttt 45126929  T
Q  283 ctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactc 375  Q
    |||||| |||||||||||| || |||| || ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45126928 ctatttatgtggggtccagattaccacatgccagaattttatgtgggtgtaaagggtgtattgccacatggagtggtacatgtatcaccactc 45126836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 181 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 47191127 - 47190932
Alignment:
Q  181 aaggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatc 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47191127 aaggaaaatgttacatgaacaccctttattcctacacctcattgtacaccc-atgtattagagatattttgataagttcatctcacaaccacactttatc 47191029  T
Q  281 ttctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactctt 377  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  47191028 ttctatttgtgtggggtccaagttaccacatgtcagaattttgtgtgggtgtaaagggtgtattgccacatggaatggtacatgtatcatcactctt 47190932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 183 - 367
Target Start/End: Original strand, 42100688 - 42100872
Alignment:
Q  183 ggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatctt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42100688 ggaaaatgttacatgaacaccctttattcctacacctcattgtacaccccatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacattttatctt 42100787  T
Q  283 ctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtat 367  Q
     ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  42100788 ttatttgtgtggagttcaggttgccacgtgtcagaattttatgtgggtgtaaagggtgcattgccacatgaggtggtacatgtat 42100872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 185 - 375
Target Start/End: Original strand, 27748565 - 27748746
Alignment:
Q  185 aaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttct 284  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  27748565 aaaatgttacatgaacaccttttattcatacacctcattatacaccttatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaacaatactttatcttct 27748664  T
Q  285 atttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactc 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27748665 atttgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttgtgt---------cggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactc 27748746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 225 - 376
Target Start/End: Original strand, 52629870 - 52630021
Alignment:
Q  225 tacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgt 324  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  52629870 tacaccctatgtattaaggatatttttgtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatttatgtagggtccaggttgctacgtgtcagaattttgt 52629969  T
Q  325 atgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactct 376  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  52629970 gtgggtgtaaagggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcatcactct 52630021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 185 - 377
Target Start/End: Original strand, 1078229 - 1078412
Alignment:
Q  185 aaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttct 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||  |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||        ||||||||    
T  1078229 aaaatgttacatgaacaccctttattcctgcacctcattgtacacctaatgtattagg-atatttttgtaggttcatctcacaa--------tatcttct 1078319  T
Q  285 atttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactctt 377  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  1078320 atttgtgtggagttcaggttgccacgtgtcagaattttgtgtggatgtaaagggtgtattgccacatgaggtggtacatgtatcatcactctt 1078412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 181 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 53273786 - 53273599
Alignment:
Q  181 aaggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatc 280  Q
    ||||||||||||| ||||||| | ||||||| || ||| |||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  53273786 aaggaaaatgttatatgaacatcatttattcctatacctcattgtacatcccatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccatactttatc 53273687  T
Q  281 ttctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactctt 377  Q
    || ||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||      |||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  53273686 ttttatttatgtgggatccaggttaccacgtatcagaatttt------gtgta---ggtgtattgccacatgggatggtacatgtatcatcactctt 53273599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 198 - 327
Target Start/End: Original strand, 51249323 - 51249452
Alignment:
Q  198 aacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatttgtgtggggt 297  Q
    |||||||||||||||  || |||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  51249323 aacaccctttattcacccaacccattatacacctcatgcattaaggatattttggtaaattcatctcacaaccacactttctcttctatttgtgtgggat 51249422  T
Q  298 ccaggttgccacgtgtcagaattttgtatg 327  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  51249423 ccagattgccacatgtcagaattttgtatg 51249452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 178 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 4190370 - 4190266
Alignment:
Q  178 aaaaaggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacacttt 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  4190370 aaaaaggaaaatgttacatgaacaccctttaatcatacaccctattgtacaccttatgtattagagatattttggtaaattcatctcacaaccatacttt 4190271  T
Q  278 atctt 282  Q
     ||||    
T  4190270 ctctt 4190266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 179 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 11064824 - 11064628
Alignment:
Q  179 aaaaggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacacttta 278  Q
    |||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||| |||| |||||||||||  |||| ||||||||| | | ||||||||| || |||||||      
T  11064824 aaaaggaaaatgtta--tgaacatcatttattcatacacctcattgtacaccctatgctttagagatattttgattaattcatctcataatcacacttac 11064727  T
Q  279 tcttctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactctt 377  Q
    |||||||||||||||||||| || || |||| ||||| |||||||| |||||||||  ||||||||| ||||   |   ||||||||||||||||||||    
T  11064726 tcttctatttgtgtggggtctagattaccacatgtcaaaattttgtgtgggtgtaaggggtgtattgtcacacaagagtgtacatgtatcaccactctt 11064628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 179 - 375
Target Start/End: Original strand, 9434120 - 9434316
Alignment:
Q  179 aaaaggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacacttta 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||     
T  9434120 aaaaggaaaatgttacatgaacaccctttaatcatacactctattgtacaccccatgcattagggacattttggtaatttcatctcacaaccatactttc 9434219  T
Q  279 tcttctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactc 375  Q
    ||||  || |        |     ||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  9434220 tctttcatctcctctcacttttccttgccacatgtcagaattttgtgtgggtgtaagaggtgtattgccacatgggagtgtacatgtatcaccactc 9434316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 285 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 29556956 - 29556865
Alignment:
Q  285 atttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactctt 377  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  29556956 atttgtgtggggttcaggttgccacatgtcaga-ttttatatgggtgtaaattgtgtattgccacatgtagtggtacatgtatcaccactctt 29556865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 174 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 29558343 - 29558232
Alignment:
Q  174 tttaaaaaaggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccaca 273  Q
    |||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  29558343 tttataaaaggacaatgttatatgaacaccctttattcatacatctcattgtacaccctatatattaggaatatattggtaaattcatctcacaatcaca 29558244  T
Q  274 ctttatcttcta 285  Q
     ||||| |||||    
T  29558243 ttttattttcta 29558232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 181 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 10457994 - 10457893
Alignment:
Q  181 aaggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatc 280  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||    
T  10457994 aaggaaaatgttacatgaacaccttttaatcatacaccctattgtacaccccatgcattaaggatattttggtaaatttatctcacaaccatactttctc 10457895  T
Q  281 tt 282  Q
    ||    
T  10457894 tt 10457893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 182 - 271
Target Start/End: Original strand, 25996267 - 25996356
Alignment:
Q  182 aggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaacca 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||| ||||||| || ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  25996267 aggaaaatgttacatgaacaccctttaatcatacatcttattgtacaccccatatattaaggacattttggtaaattcatctcacaacca 25996356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 297 - 377
Target Start/End: Original strand, 19148882 - 19148962
Alignment:
Q  297 tccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactctt 377  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| ||||    
T  19148882 tccaggttgccatatgtcagaattttgtgtgggtgtaagtggtgtattgccacatgggggtgtacatgtgtcaccattctt 19148962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 177 - 282
Target Start/End: Original strand, 34791823 - 34791928
Alignment:
Q  177 aaaaaaggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactt 276  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| || |||  ||| |||||||| |||||  ||| ||||||||||||||| ||||    
T  34791823 aaaaatggaaaatgttacatgaacaccctttaatcatacaccatattgtaaacctcatgcattagggacattttaataatttcatctcacaaccatactt 34791922  T
Q  277 tatctt 282  Q
    | ||||    
T  34791923 tctctt 34791928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 181 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 52628079 - 52627978
Alignment:
Q  181 aaggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatc 280  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||  ||| |||| | |||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||    
T  52628079 aaggaaaatgttacgtgaacaccctttaatcatacatcctattgtacacctcatgcattaagtatattttggtaaattcatctcacaatcatactttctc 52627980  T
Q  281 tt 282  Q
    ||    
T  52627979 tt 52627978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 183 - 282
Target Start/End: Original strand, 51757593 - 51757692
Alignment:
Q  183 ggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatctt 282  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||  ||| |||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  51757593 ggaaaatattacataaacaccctttaatcatacaccctattgtacacctcatgcattatggacattttagtaatttcatctcacaaccatactttctctt 51757692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 303 - 375
Target Start/End: Original strand, 51757713 - 51757784
Alignment:
Q  303 ttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactc 375  Q
    ||||||| |||||| ||| ||| |||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  51757713 ttgccacatgtcaggattgtgtgtgggtgtaagaggtatattgccacatggggt-gtacatgtatcaccactc 51757784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 303 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 4190245 - 4190171
Alignment:
Q  303 ttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactctt 377  Q
    ||||||| |||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||  ||   |||||||||||||||||||    
T  4190245 ttgccacatgtcaggattttgtgtgggtgtaagaggtgtattgccacataagggtatacatgtatcaccactctt 4190171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 313 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 54429235 - 54429173
Alignment:
Q  313 tcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactc 375  Q
    |||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||    
T  54429235 tcagaattttgtgtgggtgtaagaggtgtattgccatatgggggtgtacatgtatcgccactc 54429173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 277
Target Start/End: Original strand, 19148822 - 19148873
Alignment:
Q  226 acaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacacttt 277  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||| || ||||||||| ||||||||    
T  19148822 acaccctatgtattagggacattttagtaaatttatctcacaatcacacttt 19148873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 349
Target Start/End: Original strand, 26141543 - 26141606
Alignment:
Q  287 ttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtg-taaatggtgtattgccac 349  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||    
T  26141543 ttgtgtggggtccatgtgaccacgtgtcagatttttgtgtgggtgttaaagggtgtattgccac 26141606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 303 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 10457872 - 10457798
Alignment:
Q  303 ttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactctt 377  Q
    ||||||| |||||| ||||||| ||| |||||  |||||||||||||||| ||   ||||||||||| |||||||    
T  10457872 ttgccacatgtcaggattttgtgtggatgtaagaggtgtattgccacatgagggtatacatgtatcaacactctt 10457798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 179 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 47532051 - 47532019
Alignment:
Q  179 aaaaggaaaatgttacatgaacaccctttattc 211  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  47532051 aaaaggaaaatgttacataaacaccctttattc 47532019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 169; Significance: 2e-90; HSPs: 21)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 179 - 371
Target Start/End: Original strand, 7292743 - 7292935
Alignment:
Q  179 aaaaggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacacttta 278  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7292743 aaaaggaaaatgttacaagaacaccatttattcatacacctcattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacacttta 7292842  T
Q  279 tcttctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcacc 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7292843 tcttctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtttgtgtgtaaagggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcacc 7292935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 182 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 9698434 - 9698247
Alignment:
Q  182 aggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatct 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9698434 aggaaaatgttacatgaacaccctttattcctacatcccattgtacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatct 9698335  T
Q  282 tctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatca 369  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9698334 tctatttgtgtggggtccagattgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaagggtgtattgccacatgaggtggtacatgtatca 9698247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 178 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 26670114 - 26669915
Alignment:
Q  178 aaaaaggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacacttt 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26670114 aaaaaggaaaatgttacatgaacaccctttattcctacacctcattgtacacctcatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacacttt 26670015  T
Q  278 atcttctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactctt 377  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||    
T  26670014 atcttctatttgtgtggagtccaggttgccacgtgtcagaattttgtgtgggtgtaaagggtgtattgccacatgaggtggtacatatatcaccgctctt 26669915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 183 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 13743321 - 13743130
Alignment:
Q  183 ggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatctt 282  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13743321 ggaaaatgttacatgaacaccttttattcatacatccaattgtacaccccatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatctt 13743222  T
Q  283 ctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccact 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13743221 ctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaatcttgtgtgggtgtaaaggatatattgccacatagggtggtacatgtatcaccact 13743130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 183 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 13748821 - 13748630
Alignment:
Q  183 ggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatctt 282  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13748821 ggaaaatgttacatgaacaccttttattcatacatccaattgtacaccccatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatctt 13748722  T
Q  283 ctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccact 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13748721 ctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaatcttgtgtgggtgtaaaggatatattgccacatagggtggtacatgtatcaccact 13748630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 179 - 377
Target Start/End: Original strand, 26466795 - 26466993
Alignment:
Q  179 aaaaggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacacttta 278  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26466795 aaaaggaaaatgttacataaacaccctttattcctacaccccattgtacactccatgtattagggttattttggtaagttcatctcacaaccacacttta 26466894  T
Q  279 tcttctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactctt 377  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  26466895 tcttctatttgtttggggttcaggttgccacgtatcaggattttgtatgggtgtaaaaggtgtattgccacatagggtggtaaatgtatcatcactctt 26466993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 180 - 377
Target Start/End: Original strand, 3213397 - 3213594
Alignment:
Q  180 aaaggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttat 279  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  3213397 aaaggaaaatgttacataaacaccctttattcatacatctcattgtacaccccatgtattaaggatattttggtaaattcatttcacaaccatactttat 3213496  T
Q  280 cttctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactctt 377  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3213497 cttctatttatgtggggtccagattgccacgtgtcagaattttatgtgggtgtaaagggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactctt 3213594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 180 - 369
Target Start/End: Original strand, 7367546 - 7367735
Alignment:
Q  180 aaaggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttat 279  Q
    |||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7367546 aaaggaaaatgttatatgaacatcatttattcatacacctcattgtacatcccatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttat 7367645  T
Q  280 cttctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatca 369  Q
     |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7367646 tttctatttatgtgggatccaggttgccacgtgtcagaattttgtgtgggtgtaaagggtgtattgccacatggggtggtacatgtatca 7367735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 182 - 377
Target Start/End: Original strand, 21279928 - 21280123
Alignment:
Q  182 aggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatct 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21279928 aggaaaatgttacatgaacaccctttatttctacattccattgcacatcccatgtattagggatattttggtaaattcatctcacaaccacactttatct 21280027  T
Q  282 tctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactctt 377  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21280028 tctatttgtgtggggtccaagttgccacgtgtcagaattttgtgtgggtgtaaagggtatattgccacatggggtggtacatgtatcatcactctt 21280123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 180 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 7273438 - 7273241
Alignment:
Q  180 aaaggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttat 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7273438 aaaggaaaatgttacatgaacaccctttattcctacaccttattgtacaccccatgtattagagatattttggtaagttcatctcacaatcacactttat 7273339  T
Q  280 cttctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactctt 377  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  7273338 cttctatttatgtggggtccaagttgccacgtgtcagaattttgtgtgggtgtaaagagtgtattaccacatggggtggtacatgcatcatcactctt 7273241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 185 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 24204085 - 24203895
Alignment:
Q  185 aaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttct 284  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24204085 aaaatgttacatgaacaccatttattcctacaccctattgtacactccatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatattct 24203986  T
Q  285 atttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactc 375  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  24203985 atttgtgtggggtccaagttgccacgtgtcagaattttgtgtggatgtaaagggtgtattgtcacatggagtggtacatgtatcatcactc 24203895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 185 - 375
Target Start/End: Original strand, 30735984 - 30736174
Alignment:
Q  185 aaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttct 284  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30735984 aaaatgttacatgaacactttttattcctacaccccattgtacacctcatgtattagtgatattttggtaagttcatctcacaatcacactttatcttct 30736083  T
Q  285 atttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactc 375  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  30736084 atttatgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtgtggatgtaaagggtgtattgccacatgggatggtacatgtatcatcactc 30736174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 183 - 374
Target Start/End: Original strand, 30014343 - 30014534
Alignment:
Q  183 ggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatctt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30014343 ggaaaatgttacatgaacaccctttattcctacatcccattatacatcccatgtattaggcatattttggtaagttcatctcacaaccatactttatctt 30014442  T
Q  283 ctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccact 374  Q
    |||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  30014443 ctatttatatggggtccaagttaccacgtgtcagaattttgtgtggatgtaaagggtgtattgccacatggggtgatacatgtatcatcact 30014534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 182 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 21293778 - 21293584
Alignment:
Q  182 aggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatct 281  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||   || | ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  21293778 aggaaaatgttacataaacaccctttattcatacatttcactgtacaccccatgtattaaggatattttggtaaattcatttcacaaccacactttatct 21293679  T
Q  282 tctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactct 376  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21293678 tctatttatgtggggtccagattgccacgtgtcagaattttatgtgggtgtaaagggtgtattgccacatgaggtggtacatgtatcaccactct 21293584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 185 - 282
Target Start/End: Original strand, 27441544 - 27441641
Alignment:
Q  185 aaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatctt 282  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  27441544 aaaatgttacatgaacaccctttaatcatacaccctattgtacatcctatgtattaaggatattttggtaaattcatctcacaaccatactttctctt 27441641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 181 - 375
Target Start/End: Original strand, 33242401 - 33242595
Alignment:
Q  181 aaggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatc 280  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| || ||||| ||    
T  33242401 aaggaaaatgttacatgaacaccatttaatcatacaccttattgtacaccccatgtattaaggacattttggtaaattcatctcacaaacatactttctc 33242500  T
Q  281 ttctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactc 375  Q
    ||  || |        |     ||||||| |||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  33242501 tttcatctcctctcccttttccttgccacatgtcaggattttgtgtgggtgtaagaggtgtattgccacatgggggtgtacatgtatcaccactc 33242595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 182 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 31109323 - 31109223
Alignment:
Q  182 aggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatct 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||| |||| || || |||||| ||| |||    
T  31109323 aggaaaatgttacatgaacaccctttaatcatacatcccattatacaccccatgcactagggatattttgataaattcaacttacgaccacattttctct 31109224  T
Q  282 t 282  Q
    |    
T  31109223 t 31109223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 183 - 282
Target Start/End: Original strand, 33253913 - 33254012
Alignment:
Q  183 ggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatctt 282  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||| ||| ||||||| ||| |||||||| || ||||||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  33253913 ggaaaatgttacatgaacaccatttaatcacacaccctattgtacaccccatgcattagggacatattggtaaattcatctcacaatcatactttatctt 33254012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 303 - 377
Target Start/End: Original strand, 27441662 - 27441736
Alignment:
Q  303 ttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactctt 377  Q
    ||||||| |||||| ||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  27441662 ttgccacatgtcaggattttatgtgggtgtaagaggtgtattgccacatgggtgtgtacatgtatcaccactctt 27441736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 303 - 376
Target Start/End: Original strand, 33254034 - 33254107
Alignment:
Q  303 ttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactct 376  Q
    ||||||| |||| | ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  33254034 ttgccacatgtccggattttgtgtgggtataaaaggtgtattgccacatggaggtgtacatgtatcaccactct 33254107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 303 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 31109202 - 31109128
Alignment:
Q  303 ttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactctt 377  Q
    ||||||| |||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||  | |||||| ||| |||||||    
T  31109202 ttgccacatgtcaggattttgtgtgggtgtaagaggtgtattgccacataggggtgcacatgtgtcaacactctt 31109128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 165; Significance: 4e-88; HSPs: 37)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 179 - 375
Target Start/End: Original strand, 5489772 - 5489968
Alignment:
Q  179 aaaaggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacacttta 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5489772 aaaaggaaaatgttacatgaacaccctttattcctacatcccattgtacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacacttta 5489871  T
Q  279 tcttctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactc 375  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5489872 tcttctatttgtgtggggtccaagttgccacgtgtcagaattttatgtgggtgtaaagggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcatcactc 5489968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 183 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 43571186 - 43570994
Alignment:
Q  183 ggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatctt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43571186 ggaaaatgttacatgaacaccctttattcctacacctcattgtacaccccatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatctt 43571087  T
Q  283 ctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactc 375  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  43571086 ctatttgtgtggggtccaagttgccacgtgtcagaattttatgtgggtgtaaagggtgtattgccacatggggtggtacatatatcatcactc 43570994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 181 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 48499064 - 48498870
Alignment:
Q  181 aaggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatc 280  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48499064 aaggaaaatgttacatgaacactctttatttctacactccattgtacacctcatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatc 48498965  T
Q  281 ttctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactc 375  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  48498964 ttctatttgtgtggggtccaagttgccacgtgtcagaattttatgtgggtgtaaagggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcatcactc 48498870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 177 - 374
Target Start/End: Original strand, 37814772 - 37814969
Alignment:
Q  177 aaaaaaggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactt 276  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  37814772 aaaaagggaaaatgttacataaacaccctttattcatacatctcattgtacaccccatgtattaaggatattttggtaaattcatttcacaaccacactt 37814871  T
Q  277 tatcttctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccact 374  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37814872 tatcttctatttatgtggggtccagattgccacgtgtcagaattttatatggatgtaaagggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccact 37814969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 180 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 23989627 - 23989431
Alignment:
Q  180 aaaggaaaatgttacatgaacacccttt-attcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacacttta 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| || |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  23989627 aaaggaaaatgttacatgaacacccttttattcatacactcaattgtataccctatgtattagggatattttggtaaatttatctcacaaccacacttta 23989528  T
Q  279 tcttctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactc 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  23989527 tcttctatttgtgtggggtccaggttgccacatgtcagaatcttgtgtgggtgtaaagggtgtattgccatatagggtggtacatgtatcaccactc 23989431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 180 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 24769602 - 24769405
Alignment:
Q  180 aaaggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttat 279  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  24769602 aaaggaaaatgtttcatgaacaccttttatttctacactccattgtacaccccatgtattagggatattttggtaagttcttatcacaaccacactttat 24769503  T
Q  280 cttctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactctt 377  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24769502 cttctatttgtgtggggtccaagttgccacgtgtcagaattttgtgtggatgtaaagagtgtattgccacatggggtggtacatgtatcatcactctt 24769405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 183 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 50448360 - 50448167
Alignment:
Q  183 ggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatctt 282  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  50448360 ggaaaatgttacatgaacactctttatttctacactccattgtacaccttatgtattagggatatttttgtaagttcatcttacaaccacattttatctt 50448261  T
Q  283 ctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactct 376  Q
    |||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  50448260 ctatttttgtgggttccatgttgccacgtgtcagaattttgtgtgggtgtaaagggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcatcactct 50448167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 185 - 377
Target Start/End: Original strand, 7447828 - 7448019
Alignment:
Q  185 aaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttct 284  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7447828 aaaatgttacatgaacatcctttattcctacatcccattgtacaccc-atgtattacagatattttgataagttcatctcacaaccacactttatcttct 7447926  T
Q  285 atttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactctt 377  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  7447927 atttgtgtggggtccaagttgccacgtgtcagaattttgtgtgggtgtaaagggtgtattgccacatggaatggtacatgtatcatcactctt 7448019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 182 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 750406 - 750211
Alignment:
Q  182 aggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatct 281  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  750406 aggaaaatgttacgtgaacacccttatttcctacaccccattgtacaccccatgtatcagggatattttgataaattcatctcaaaaccacactttatct 750307  T
Q  282 tctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactctt 377  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  750306 tctatttgtgtggggtccatgttaccacgtgtcagaattttgtgtgggtgtaaagggtgtattgccacatgggatggtacatgtatcatcactctt 750211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 185 - 376
Target Start/End: Original strand, 4401329 - 4401521
Alignment:
Q  185 aaaatgttacatgaacacccttt-attcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttc 283  Q
    |||||| ||||||||||| |||| |||| |||||  |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4401329 aaaatgatacatgaacactcttttattcctacacttcattgtacaccccatgtattagagatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttc 4401428  T
Q  284 tatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactct 376  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  4401429 tatttgtgtggggtccaatatgccacgtgtcagaattttgtgtgggtgtaaagggtgtattgccacatagggtggtacatgtatcatcactct 4401521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 185 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 2497660 - 2497469
Alignment:
Q  185 aaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttct 284  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2497660 aaaatgttacataaacaccatttattcatacattccattgtacaccccatatattaaggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcatct 2497561  T
Q  285 atttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactct 376  Q
    |||| |||||| ||||| ||| |||||||||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2497560 atttatgtgggatccagattgtcacgtgtcagaattttatgtgggtataaagggtgtattgccacatggtgtggtacatgtatcaccactct 2497469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 233 - 376
Target Start/End: Original strand, 4888093 - 4888235
Alignment:
Q  233 atgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgt 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||| || |||||||||||| ||| |||    
T  4888093 atgtattagggatattttggtaagtttatctcacaaccacactttattttctatttgtgtggtgtccaaattgccatgtatcagaattttgtgtggatgt 4888192  T
Q  333 aaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactct 376  Q
    ||| | | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  4888193 aaaggatatattgccacat-gggtggtacatgtatcatcactct 4888235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 181 - 282
Target Start/End: Original strand, 44112675 - 44112776
Alignment:
Q  181 aaggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatc 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||    
T  44112675 aaggaaaatgttacatgaacaccctttaatcatacaccctattgtacaccccatgcattagggacattttggtaatttcatctcacaaccatactttctc 44112774  T
Q  281 tt 282  Q
    ||    
T  44112775 tt 44112776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 183 - 282
Target Start/End: Original strand, 48119628 - 48119727
Alignment:
Q  183 ggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatctt 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  48119628 ggaaaatgttacatgaacaccctttaatcatacaccctattgtacaccccatgcattaaggatattttggtaaattcatctcacaaccatactttctctt 48119727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 183 - 282
Target Start/End: Original strand, 35003294 - 35003393
Alignment:
Q  183 ggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatctt 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||  |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  35003294 ggaaaatgttacatgaacaccctttaatcatacaccctattgtacaccccatacattaaggatattttggtaaattcatctcacaaccatactttctctt 35003393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 182 - 282
Target Start/End: Original strand, 41065152 - 41065252
Alignment:
Q  182 aggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatct 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||| ||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||    
T  41065152 aggaaaatgttacatgaacaccctttaatcatacaccctgttgtacaccccatgcattaggggcattttggtaatttcatctcacaaccatactttctct 41065251  T
Q  282 t 282  Q
    |    
T  41065252 t 41065252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 183 - 282
Target Start/End: Original strand, 38335918 - 38336017
Alignment:
Q  183 ggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatctt 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||| || ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  38335918 ggaaaatgttacatgaacaccctttaatcatacaccttattgtacatcccatgcattaaggatattttggtaaattcatctcacaaccatactttctctt 38336017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 183 - 282
Target Start/End: Original strand, 46168383 - 46168482
Alignment:
Q  183 ggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatctt 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  46168383 ggaaaatgttacatgaacaccctttaatcatatatcctattgtacacccaatgcattaaggatattttggtaaattcatctcacaaccatactttctctt 46168482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 182 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 45427846 - 45427746
Alignment:
Q  182 aggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatct 281  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||| ||||| | ||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||    
T  45427846 aggaaaatgttacatgaataccttttaatcatacaccctattgtacactccatgcattagggacattttggtaatttcatctcacaaccatactttctct 45427747  T
Q  282 t 282  Q
    |    
T  45427746 t 45427746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 182 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 38113296 - 38113202
Alignment:
Q  182 aggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactt 276  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||| ||||  || |||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  38113296 aggaaaatgttatatgaacaccctttaatcatacaccctattgtacaccccatgcattaatgacattttggtaaattcatctcacaaccatactt 38113202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 181 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 45639834 - 45639733
Alignment:
Q  181 aaggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatc 280  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||| ||||||| ||  |||| |||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||    
T  45639834 aaggaaaatgttacatgaacactctttaatcatacatcctattgtacaccccatacattaaggatattttggtaaattcatctcacaatcatactttctc 45639735  T
Q  281 tt 282  Q
    ||    
T  45639734 tt 45639733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 303 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 35000093 - 35000021
Alignment:
Q  303 ttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactc 375  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  35000093 ttgccacatgtcaggattttgtatgggtgtaagagatgtattgccacatgggggtgtacatgtatcaccactc 35000021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 303 - 377
Target Start/End: Original strand, 35003414 - 35003488
Alignment:
Q  303 ttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactctt 377  Q
    ||||||| |||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  35003414 ttgccacatgtcaggattttgtgtgggtgtaagaggtgtattgccacatgggggtgtgcatgtatcaccactctt 35003488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 303 - 377
Target Start/End: Original strand, 44112797 - 44112871
Alignment:
Q  303 ttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactctt 377  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||    
T  44112797 ttgccacatgtcagaattttgtgtgggtgtaagaggtgtattgccacatgaaggtgtacatgtatcaccactctt 44112871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 182 - 282
Target Start/End: Original strand, 45705824 - 45705924
Alignment:
Q  182 aggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatct 281  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||  | ||| ||||| | ||| |||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||    
T  45705824 aggaaaatgttatatgaacaccctttaatcatacattctattgtacactccatgcattatggacattttgataaattcatctcacaaccatactttctct 45705923  T
Q  282 t 282  Q
    |    
T  45705924 t 45705924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 303 - 375
Target Start/End: Original strand, 45705945 - 45706017
Alignment:
Q  303 ttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactc 375  Q
    ||||||| |||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  45705945 ttgccacatgtcaggattttgtgtgggtgtaagaggtgtattgccacatggaggtgtacatgtatcaccactc 45706017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 35000213 - 35000114
Alignment:
Q  183 ggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatctt 282  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | ||| || ||   |||||||||||| |||||| ||| || |||||||||||| ||||| ||||    
T  35000213 ggaaaatgttacatgaacaccttttaatcatacactctattgtatacttcatgtattagggacattttgataaatttatctcacaaccatactttctctt 35000114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 230
Target Start/End: Original strand, 14427345 - 14427394
Alignment:
Q  181 aaggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacacc 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  14427345 aaggaaaatgttacatgaacaccctttaatcatacaccctattgtacacc 14427394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 303 - 372
Target Start/End: Original strand, 48119748 - 48119817
Alignment:
Q  303 ttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcacca 372  Q
    ||||||| |||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  48119748 ttgccacatgtcaggattttgtgtgggtgtaagaggtgtattgccacgtgggggtgtacatgtatcacca 48119817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 303 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 45639712 - 45639640
Alignment:
Q  303 ttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactc 375  Q
    ||||||| ||| || ||||||| |||||||||  |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  45639712 ttgccacatgttaggattttgtgtgggtgtaagaggtgtattgccacaagggggtgtacatgtatcaccactc 45639640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 303 - 377
Target Start/End: Original strand, 26585582 - 26585656
Alignment:
Q  303 ttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactctt 377  Q
    ||||||| |||||| ||||||| ||| |||||  | ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  26585582 ttgccacatgtcaggattttgtgtggatgtaagagatgtattgccgcatgggggtgtacatgtatcaccactctt 26585656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 303 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 38113175 - 38113101
Alignment:
Q  303 ttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactctt 377  Q
    ||||||| |||||| ||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||| |  ||||||| ||||||||||||    
T  38113175 ttgccacatgtcaggattttgtgtgggtgtaagaggtgtattgtcacatggaggtgtacatgaatcaccactctt 38113101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 306 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 45427722 - 45427652
Alignment:
Q  306 ccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactct 376  Q
    |||| |||||| ||||||| ||| || ||  |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  45427722 ccacatgtcaggattttgtgtggatggaagaggtgtattgccacatggggatgtacatgtatcaccactct 45427652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 181 - 282
Target Start/End: Original strand, 26585460 - 26585561
Alignment:
Q  181 aaggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatc 280  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||   ||| ||||||| ||| |||| ||||||||| |||| |||||||| ||| || ||||| ||    
T  26585460 aaggaaaatgttagatgaacattctttaatcatacactatattgtacaccccatgcattaaggatattttagtaaattcatctcgcaatcatactttctc 26585559  T
Q  281 tt 282  Q
    ||    
T  26585560 tt 26585561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 303 - 376
Target Start/End: Original strand, 41065271 - 41065344
Alignment:
Q  303 ttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactct 376  Q
    ||||||| |||||| |||||||  || |||||  |||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||    
T  41065271 ttgccacatgtcaggattttgtgcggatgtaagaggtgtattgccacatgggggtgtacatatatcaccactct 41065344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 286 - 349
Target Start/End: Original strand, 45044570 - 45044634
Alignment:
Q  286 tttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgt-aaatggtgtattgccac 349  Q
    |||||| |||||||| || || || ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45044570 tttgtgcggggtccatgtggctacatgtcagatttttgtatgggtgtcaaatggtgtattgccac 45044634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 303 - 355
Target Start/End: Original strand, 46168503 - 46168555
Alignment:
Q  303 ttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatgggg 355  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||||||  | |||||||||||||||||    
T  46168503 ttgccacatgtcataattttgtgtgggtgtaagagatgtattgccacatgggg 46168555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 163; Significance: 7e-87; HSPs: 36)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 183 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 24001112 - 24000926
Alignment:
Q  183 ggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatctt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24001112 ggaaaatgttacatgaacaccctttattcctacatcccattgtacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatctt 24001013  T
Q  283 ctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatca 369  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24001012 ctatttgtgtggggtccagattgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaagggtgtattgccacatgaggtggtacatgtatca 24000926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 183 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 42538531 - 42538345
Alignment:
Q  183 ggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatctt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42538531 ggaaaatgttacatgaacaccctttattcctacatcccattgtacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatctt 42538432  T
Q  283 ctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatca 369  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42538431 ctatttgtgtggggtccagattgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaagggtgtattgccacatgaggtggtacatgtatca 42538345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 181 - 375
Target Start/End: Original strand, 41861672 - 41861868
Alignment:
Q  181 aaggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtatta--gggatattttggtaagttcatctcacaaccacacttta 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41861672 aaggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacacccaattatacaccctatgtattatagagatattttggtaagtttatctcacaaccacacttta 41861771  T
Q  279 tcttctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactc 375  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41861772 tcttctatttgtatggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaagggtgtattgccacatggagtggtacatgtatcaccactc 41861868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 183 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 5811024 - 5810830
Alignment:
Q  183 ggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatctt 282  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5811024 ggaaaatgttacatgaccaccctttattcctacaccccattgtacaccctatatattagggatattttgataagttcatctcacaaccacactttatctt 5810925  T
Q  283 ctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactctt 377  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5810924 ctatttgtgtggggtccaagttgccacatgtcaaaattttgtatgggtgtaaagggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcatcactctt 5810830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 177 - 371
Target Start/End: Original strand, 5015389 - 5015583
Alignment:
Q  177 aaaaaaggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactt 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5015389 aaaaaaggaaaatgttacatgaacactctttatttctacactccattgtacacctcatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactt 5015488  T
Q  277 tatcttctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcacc 371  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5015489 tatcttctatttgtgtggggtccaagttgccacgtgtcagaattttgtgtgagtgtaaaaggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcacc 5015583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 185 - 377
Target Start/End: Original strand, 44326180 - 44326372
Alignment:
Q  185 aaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttct 284  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  44326180 aaaatgttacataaacaccctttattcatacatcccattgtacacctcatatattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcatct 44326279  T
Q  285 atttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactctt 377  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44326280 atttatgtgggatccagattgccacgtgtcagaattttatgtgggtgtaaagggtgtattgccacatggtgtggtacatgtatcaccactctt 44326372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 183 - 369
Target Start/End: Original strand, 42972852 - 42973038
Alignment:
Q  183 ggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatctt 282  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42972852 ggaaaatgttacctgaacatcctttattcctacactccattgtacacctcatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacattttatctt 42972951  T
Q  283 ctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatca 369  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||    
T  42972952 ctatttgtgtggggtccaagttgccacgtgtcagaattttgtgtgggtgtaaatggtgtattgccacataggatagtacatgtatca 42973038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 186 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 26898499 - 26898310
Alignment:
Q  186 aaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttcta 285  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  26898499 aaatgttacatgaacaccttttattcatacacccaattgtacattccatgtattagggatattttggtaagttcatcttacaaccacactttatattcta 26898400  T
Q  286 tttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactc 375  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  26898399 tttgtgtggggtccaggttaccacgtgtcagaattttatgtgggtgtaaaaggtgtattgccacataggatggtacatgtatcaccactc 26898310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 185 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 44417032 - 44416841
Alignment:
Q  185 aaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttct 284  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||  ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44417032 aaaatgttacatgaacatcatttatttctacaccctattgtacaccccatgtattagggatattttgataagttcatctcacaaccacactttatcttct 44416933  T
Q  285 atttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactct 376  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  44416932 atttgtgtggggtccaagttgccacgtgtcagaaatttgtgtggatgtaaaaggtgtattgccacatgaggtggtacatgtatcatcactct 44416841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 185 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 43343722 - 43343532
Alignment:
Q  185 aaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttct 284  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||  ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43343722 aaaatgttacatgaacatcatttatttctacaccctattgtacaccccatgtattagggatattttgataagttcatctcacaaccacactttatcttct 43343623  T
Q  285 atttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactc 375  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  43343622 atttgtgtggggtccaagttgccacgtgtcagaaatttgtgtggatgtaaaaggtgtattgccacatgaggtggtacatgtatcatcactc 43343532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 192 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 32029908 - 32029731
Alignment:
Q  192 tacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatttgtg 291  Q
    ||||| |||||  ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  32029908 tacataaacactttttattcctacaccccattgtacaccccatgtattagggatattttggtaaattcatctaacaaccacactttatcttctatttatg 32029809  T
Q  292 tggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatca 369  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32029808 tggggtccaagttgccacgtgtcagaattttgtgtgggtgtaaagggtgtattgccacatggggtggtacatgtatca 32029731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 185 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 16180454 - 16180263
Alignment:
Q  185 aaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttct 284  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||| | ||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16180454 aaaatgttacatcaacaccatttattcctacaccc-attgtacaccccacgtattataaatattttggtaaattcatctcacaaccacactttatcttct 16180356  T
Q  285 atttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactctt 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16180355 atttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtgtggatgtaaaaggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcatcactctt 16180263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 185 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 4638297 - 4638106
Alignment:
Q  185 aaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttct 284  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4638297 aaaatgttacatgaacaccttttattcatacactcaattgtacaccccatatattatggatattttggtaagttcatctcacaaccatactttatcttct 4638198  T
Q  285 atttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactct 376  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  4638197 atttgtgtggggtctaggttaccacgtgtcagaatcttgtatggatgtaaagggtgtattgtcacgtagggtggtacatgtatcaccactct 4638106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 183 - 377
Target Start/End: Original strand, 45326020 - 45326214
Alignment:
Q  183 ggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatctt 282  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||||||||| | |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45326020 ggaaagtgttacataaacaccttttattcatacatcacattgtacaccccatatattagggatattttggtaagttcatctcacaatcacactttatctt 45326119  T
Q  283 ctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactctt 377  Q
    |||||| ||||||||||||  | |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45326120 ctatttatgtggggtccagactaccacctgtcagaattttatgtgggtgtaaatggtgtattgtcacatggggtggtacatgtatcaccactctt 45326214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 182 - 377
Target Start/End: Original strand, 35069720 - 35069915
Alignment:
Q  182 aggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatct 281  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35069720 aggaaaatgttacatgaacactctttattcctacacctcattgtacacctcatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatct 35069819  T
Q  282 tctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactctt 377  Q
    ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||||| | | ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||    
T  35069820 tctatttatgtgaggtccaagttgccacgtgtcagaattttgtgtagatgtaaaggatatattgccacataggatggtacatgtatcatcactctt 35069915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 199 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 27393344 - 27393174
Alignment:
Q  199 acaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatttgtgtggggtc 298  Q
    ||||||||||||| |||| || ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27393344 acaccctttattcctacatcctattgtacactctatgtattagggatatttttgtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatttatgtggggtc 27393245  T
Q  299 caggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatca 369  Q
    ||||||||| | |||||||||||| | |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27393244 caggttgcctcatgtcagaattttatgtgggtgtaaaggatgtattgccacatggggtggtacatgtatca 27393174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 185 - 375
Target Start/End: Original strand, 10573751 - 10573941
Alignment:
Q  185 aaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttct 284  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10573751 aaaatgttacataaacaccctttattcatacatcctattgtacaccccatgtattaggaatattttggtaaattcatctcacaaccacactttatcttct 10573850  T
Q  285 atttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactc 375  Q
    |||| ||||||||| || ||||||| | |||||||||| | |||||||||| | | ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10573851 atttatgtggggtcaagattgccacatatcagaattttatgtgggtgtaaaggatatattgtcacatgcggtggtacatgtatcaccactc 10573941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 177 - 375
Target Start/End: Original strand, 43317437 - 43317635
Alignment:
Q  177 aaaaaaggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactt 276  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||  |||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  43317437 aaaataggaaaatgttacatgaacaccatttattcatacacctcattgtacatcctatgctttagggatattttgataaattcatctcacaatcacactt 43317536  T
Q  277 tatcttctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactc 375  Q
      |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||   ||  ||||||||||||||||||    
T  43317537 actcttctatttgtgtggggtctagattgccacatgtcagaattttgtgtgggtgtaaggggtgtattgccacacaagggtgtacatgtatcaccactc 43317635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 182 - 369
Target Start/End: Original strand, 9216301 - 9216487
Alignment:
Q  182 aggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatct 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || | || ||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9216301 aggaaaatgttacatgaacaccctttattcctatatcctattgtacaccc-atgcattagagatattttggtaagttcatctcacaaccacattttatct 9216399  T
Q  282 tctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatca 369  Q
    ||||||||||||||||  | |||||| | |||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  9216400 tctatttgtgtggggtttaagttgccgcatgtcagaattttgtgtggatgtaaaaggtgtattgtcacatggggtggtatatatatca 9216487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 206 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 38160656 - 38160505
Alignment:
Q  206 ttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatttgtgtggggtccaggttg 305  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  38160656 ttattcttacactccattgtacaccccatgtattagggatattttagtaacttcatctcacaactacactttatcttctatttatgtggggtccaagttg 38160557  T
Q  306 ccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtg 357  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  38160556 ccacgtgtcagaattttgtgtgggtgtaaggggtgtattgccacatggggtg 38160505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 182 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 5194332 - 5194139
Alignment:
Q  182 aggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatct 281  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||  |||    
T  5194332 aggaaaatgttacatgaacaccatttattcatacacctcattgtacaccctatgttttaaggatattttgataaattcatctcacaatcacacttactct 5194233  T
Q  282 tctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactc 375  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||| |||||||||  | ||||||||||||   ||  ||||||||||||| ||||    
T  5194232 tctatttgtgtggggtctagattgccacatgtcaaaattttgtgtgggtgtaagggttgtattgccacacaagggtgtacatgtatcactactc 5194139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 182 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 24280697 - 24280555
Alignment:
Q  182 aggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatct 281  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||| | |||  |||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||    
T  24280697 aggaaaatgttacgtgaacaccctttattcatacaccctattctacatcccatgcactagaaatattttggtaaattcatctcacaatcacactttctct 24280598  T
Q  282 tctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgt 324  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||    
T  24280597 tctatttgtgtggggtccaagttgccatatatcagaattttgt 24280555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 180 - 376
Target Start/End: Original strand, 40236916 - 40237112
Alignment:
Q  180 aaaggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttat 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | ||| |    
T  40236916 aaaggaaaatgttacatgaacaccctttaatcatacatcctattgtacaccccatgcattagggacattttggtaatttcatctcacaaccatattttct 40237015  T
Q  280 cttctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactct 376  Q
    |||  || |        |     ||||||| |||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  40237016 ctttcatctcctctcacttttccttgccacatgtcaggattttgtgtgggtgtaagaggtgtattgccacatgggggtgtacatgtatcaccactct 40237112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 183 - 282
Target Start/End: Original strand, 31513287 - 31513386
Alignment:
Q  183 ggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatctt 282  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| || |||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  31513287 ggaaaatgttacatgaacactctttaatcatacaccctattgtataccccatgcattaaggatattttggtaaattcatctcacaaccatactttctctt 31513386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 263 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 47279744 - 47279630
Alignment:
Q  263 tcacaaccacactttatcttctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtaca 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | || ||||| || |||| | |||||||||| | ||||| |||| ||||||||| || ||||| |||||||    
T  47279744 tcacaaccacactttatcttctatttatataggatccagattaccacatatcagaattttatgtgggtataaagggtgtattgtcagatgggatggtaca 47279645  T
Q  363 tgtatcaccactctt 377  Q
    |||||||||||||||    
T  47279644 tgtatcaccactctt 47279630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 184 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 31408732 - 31408634
Alignment:
Q  184 gaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatctt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||| || ||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  31408732 gaaaatgttacatgaacaccctttaatcatacactctattgtacatcccatgcattaaggatattttggtaaattcatttcacaaccatactttctctt 31408634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 180 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 27535334 - 27535232
Alignment:
Q  180 aaaggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttat 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||| | |||| |||  || |||||||||| ||||||||||||| | ||||| |    
T  27535334 aaaggaaaatgttacatgaacaccctttaatcatacactctattgtacactccatgtgttaaagacattttggtaatttcatctcacaactatactttct 27535235  T
Q  280 ctt 282  Q
    |||    
T  27535234 ctt 27535232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 179 - 282
Target Start/End: Original strand, 33384866 - 33384970
Alignment:
Q  179 aaaaggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacacccc-attatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacacttt 277  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| ||| || || | ||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| || |||||    
T  33384866 aaaaggaaaatgttacatgaacatcatttaatcatacacccctattgtatactccatgcattagggacattttggtaaattcatctcacaaacatacttt 33384965  T
Q  278 atctt 282  Q
     ||||    
T  33384966 ctctt 33384970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 250
Target Start/End: Original strand, 39998408 - 39998475
Alignment:
Q  183 ggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatatttt 250  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| ||||||| || ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  39998408 ggaaaatgttacatgaacacattttaatcatacatcctattgtacaccccatgtattagggatatttt 39998475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 303 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 31408613 - 31408539
Alignment:
Q  303 ttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactctt 377  Q
    ||||||| |||||| ||||| | |||||||||  ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  31408613 ttgccacatgtcaggattttatgtgggtgtaagaggtgtattgtcacatgggggtgtacatgtatcaccactctt 31408539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 303 - 377
Target Start/End: Original strand, 33384991 - 33385065
Alignment:
Q  303 ttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactctt 377  Q
    ||||||| | |||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||    
T  33384991 ttgccacatatcaggattttgtatgggtgtaagaggtgtattgtcacatgggggtttacatgtatcaccactctt 33385065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 303 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 27535211 - 27535137
Alignment:
Q  303 ttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactctt 377  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| |||||  | ||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||    
T  27535211 ttgccacatgtcagaattttgtgtggatgtaagagatgtattgccacatggaggaatacatgtatcaccactctt 27535137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 303 - 377
Target Start/End: Original strand, 31513407 - 31513481
Alignment:
Q  303 ttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactctt 377  Q
    ||||||| |||||| ||||||| | | |||||  |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||    
T  31513407 ttgccacatgtcaggattttgtgtagatgtaagaggtgtattgccacataagggtgtacatgtatcaccactctt 31513481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 182 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 47279798 - 47279744
Alignment:
Q  182 aggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgt 236  Q
    |||||||| |||||| || |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||    
T  47279798 aggaaaatattacataaataccctttattcatacatcccattgtacaccccatgt 47279744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 305 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 35522947 - 35522902
Alignment:
Q  305 gccacgtgtcagaattttgtatgggtg-taaatggtgtattgccac 349  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  35522947 gccacgtgtcagatttttgtgtgggtgttaaatggtgtattgccac 35522902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 182 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 38160695 - 38160666
Alignment:
Q  182 aggaaaatgttacatgaacaccctttattc 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38160695 aggaaaatgttacatgaacaccctttattc 38160666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 162; Significance: 3e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 184 - 377
Target Start/End: Original strand, 112656 - 112849
Alignment:
Q  184 gaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttc 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  112656 gaaaatgttacatgaacaccctttattcctacattccattgtacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttc 112755  T
Q  284 tatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactctt 377  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  112756 tatttgtgtggggtccagattgccacgtgtcaaaattttgtatgggtgtaaagggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcatcactctt 112849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 162; Significance: 3e-86; HSPs: 42)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 184 - 377
Target Start/End: Original strand, 19047158 - 19047351
Alignment:
Q  184 gaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttc 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19047158 gaaaatgttacatgaacaccctttattcctacattccattgtacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttc 19047257  T
Q  284 tatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactctt 377  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19047258 tatttgtgtggggtccagattgccacgtgtcaaaattttgtatgggtgtaaagggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcatcactctt 19047351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 182 - 377
Target Start/End: Original strand, 30838631 - 30838826
Alignment:
Q  182 aggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatct 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30838631 aggaaaatgttacatgaacaccctttatttctacatcttattgtacaccccatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatct 30838730  T
Q  282 tctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactctt 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30838731 tctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtgtaggtgtaaaaggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcatcactctt 30838826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 177 - 375
Target Start/End: Original strand, 1750408 - 1750606
Alignment:
Q  177 aaaaaaggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactt 276  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1750408 aaaaatggaaaatgttacatgaacaccctttattcctacaccccattgtacaccctatgtattagggatatttttgtaagttcatctcacaaccacactt 1750507  T
Q  277 tatcttctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactc 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  1750508 tatcttctatttgtgtggggtccagattgccacgtgtcagaattttgtgtgagtgtaaagggtgtgttgccacatggggtggtacaaatatcatcactc 1750606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 185 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 43490499 - 43490307
Alignment:
Q  185 aaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttct 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43490499 aaaatgttacatgaacaccctttattcctacatcccattgtacactctatgtattagggatattttggtaagttcatctcataaccacactttatcttct 43490400  T
Q  285 atttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactctt 377  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  43490399 atttatgtggggtccagattgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaagggtgtattgccacatgaggtggtacatgtagcatcactctt 43490307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 180 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 12302356 - 12302167
Alignment:
Q  180 aaaggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttat 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12302356 aaaggaaaatgttacatgaacaccctttatttctacaccccattgtacaccctatgtattagggatatttttgtaagttcatctcacaaccacactttat 12302257  T
Q  280 cttctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatca 369  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12302256 cttctatttatgtggggtccaggttaccatgtgtcagaattttgtgtggatgtaaaggatgtattgccacatggggtgatacatgtatca 12302167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 176 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 4764833 - 4764633
Alignment:
Q  176 taaaaaaggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacact 275  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4764833 taaaaaaggaaaatgttacatcaacaccatttattcctacaccctattgtacaccccatgtattataaatattttggtaaattcatctcacaaccacact 4764734  T
Q  276 ttatcttctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactc 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  4764733 ttatcttctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtgtggatgtaaaaggtgtattgccacatgaggtggtacatgtatcatcactc 4764634  T
Q  376 t 376  Q
    |    
T  4764633 t 4764633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 183 - 375
Target Start/End: Original strand, 16096747 - 16096940
Alignment:
Q  183 ggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatctt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  16096747 ggaaaatgttacatgaacaccctttattcctacaccccattatacaccccatgtattagggatattttggtgagttaatctcacaaccacactttatctt 16096846  T
Q  283 ctatttgtgt-ggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactc 375  Q
    ||| || ||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  16096847 ctacttatgtgggggtctaagttgccacgtgtcagaattttgtgtgggtgtaaagggtgtattgccacatgatgtggtacatgtatcatcactc 16096940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 181 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 43335865 - 43335671
Alignment:
Q  181 aaggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatc 280  Q
    ||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||||| |||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43335865 aaggaaaatgttatatgaacatcatttattcctacacctcattgtacatcccatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaactacactttatc 43335766  T
Q  281 ttctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactc 375  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43335765 ttctatttatgtgggatccaggttgccacgtgtcagaattttgtgtggatgtaaaaggtatattgccacatggggtggtacatgtatcatcactc 43335671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 183 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 42849946 - 42849768
Alignment:
Q  183 ggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatctt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||            ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42849946 ggaaaatgttacatgaacaccctttattcctacaccccat------------gtattagggatattttgataagttcatctcacaaccacactttat-tt 42849860  T
Q  283 ctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccact 374  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42849859 ctatttgtgtggggtccaagttgccacgtgtcagaattttgtgtgggtgtaaagggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcatcact 42849768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 184 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 34817875 - 34817682
Alignment:
Q  184 gaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttc 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||| | || | | |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  34817875 gaaaatgttacatgaacaccctttattcacacacctcattgtacaccccatgcactacgcacattttggtaaattcatctcacaaccacactttctcttc 34817776  T
Q  284 tatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactctt 377  Q
    |||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||    
T  34817775 tatttgtacgggatccaggttgccacatgtcagaattttgtatgggtgtaaggggagcattgccacatgggggtgtacatgtatcatcactctt 34817682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 173 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 13780846 - 13780676
Alignment:
Q  173 ctttaaaaaa-ggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaacca 271  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||| ||||| |||| ||||||| ||  ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  13780846 ctttaaaaaatggaaaatgttacatcaacacattttattcacacacctcattgtacaccccatacattagggatattttgataaattcatctcacaacca 13780747  T
Q  272 cactttatcttctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgta 342  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  13780746 cactttctcttctatttatgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttgtataggtgtaaagggtgta 13780676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 182 - 369
Target Start/End: Original strand, 42026766 - 42026955
Alignment:
Q  182 aggaaaatgttacatgaacaccc--tttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttat 279  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||| |||| ||   | |||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| |    
T  42026766 aggaaaatgttacatgaacacccaatttattcatacattccattgtacatcccgcgcattagggatattttggcaaattcatctcacaactacactttct 42026865  T
Q  280 cttctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatca 369  Q
     |||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  42026866 tttctatttgtgtggggtctaggttgcaagatgtcagaattttgtgtgggtgtaaggggtgtattgccacatggaggtgtacatgtatca 42026955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 185 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 8896681 - 8896541
Alignment:
Q  185 aaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttct 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||  | |||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||    
T  8896681 aaaatgttacatgaacaccctttattcacacattccattgtacaccctatacaataggaatattttggtaaattcatctcacaatcacactttcttttct 8896582  T
Q  285 atttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgta 325  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  8896581 atttgtgtgaggttcaggttgccacatgtcagaattttgta 8896541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 225 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 39149350 - 39149201
Alignment:
Q  225 tacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgt 324  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |  || |||||| ||| ||||||||    
T  39149350 tacatcctatgtattagagatattttggtaagttcatcccacaactacactttatcttttatttgtgt-gggtctaaattaccacgtctcataattttgt 39149252  T
Q  325 atgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactct 376  Q
     |||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  39149251 gtgggtgtaaaaggtgtattaccacat-gggtggtacatgtatcatcactct 39149201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 180 - 282
Target Start/End: Original strand, 43114554 - 43114656
Alignment:
Q  180 aaaggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttat 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| |    
T  43114554 aaaggaaaatgttacatgaacaccctttaatcatacaccctattgtacaccccatgcattagggacattttggtaatttcatctcacaaccatactttct 43114653  T
Q  280 ctt 282  Q
    |||    
T  43114654 ctt 43114656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 185 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 11825752 - 11825562
Alignment:
Q  185 aaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttct 284  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||      
T  11825752 aaaatgttacatgaacaccctttaatcatacaccctattgtacaccccatgcattagggacattttggtaatttcatctcacaatcatactttctctttc 11825653  T
Q  285 atttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactc 375  Q
    || |        |     ||||||| |||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  11825652 atctcctctcccttttccttgccacatgtcaggattttgtgtgggtgtaagaggtgtattgccacatggggatgtacatgtatcaccactc 11825562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 181 - 282
Target Start/End: Original strand, 16803966 - 16804067
Alignment:
Q  181 aaggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatc 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| || ||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||    
T  16803966 aaggaaaatgttacatgaacaccctttaatcatacaccctattgtacatcccatgcattagggacattttgataatttcatctcacaaccatactttctc 16804065  T
Q  281 tt 282  Q
    ||    
T  16804066 tt 16804067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 181 - 282
Target Start/End: Original strand, 16843248 - 16843349
Alignment:
Q  181 aaggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatc 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| || ||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||    
T  16843248 aaggaaaatgttacatgaacaccctttaatcatacaccctattgtacatcccatgcattagggacattttgataatttcatctcacaaccatactttctc 16843347  T
Q  281 tt 282  Q
    ||    
T  16843348 tt 16843349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 185 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 41282072 - 41281975
Alignment:
Q  185 aaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatctt 282  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  41282072 aaaatgttacatgaacaccctttaatcatacaccctattgtacaccccatgcattagggacattttgataatttcatctcacaaccatactttctctt 41281975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 183 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 12415560 - 12415461
Alignment:
Q  183 ggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatctt 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||    
T  12415560 ggaaaatgttacatgaacaccctttaatcatacaccttattgtacaccccatgcattagggacattttggtaattttatctcacaaccatactttctctt 12415461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 183 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 12427620 - 12427521
Alignment:
Q  183 ggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatctt 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||    
T  12427620 ggaaaatgttacatgaacaccctttaatcatacaccttattgtacaccccatgcattagggacattttggtaattttatctcacaaccatactttctctt 12427521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 185 - 277
Target Start/End: Original strand, 33229303 - 33229396
Alignment:
Q  185 aaaatgttacatgaacacccttt-attcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacacttt 277  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  33229303 aaaatgatacatgaacacccttttattcctacacctcattgtacaccccatgtattagggatattttggtaagttcatcatacaatcacacttt 33229396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 180 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 34895844 - 34895647
Alignment:
Q  180 aaaggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttat 279  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||| ||| ||||||| ||| |||||||| || ||||||| |||||||||||| || |||||||    
T  34895844 aaaggaaagtgttacatgaacaccatttaatcacacaccctattgtacaccccatgcattagggacatattggtaaattcatctcacaatcatactttat 34895745  T
Q  280 cttctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactctt 377  Q
    |||  || |        |     ||||||| |||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  34895744 ctttcatctcctctcccttttccttgccacatgtcaggattttgtgtgggtgtaagaggtgtattgccacatgggggtgtacatgtatcaccactctt 34895647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 182 - 276
Target Start/End: Original strand, 18491704 - 18491798
Alignment:
Q  182 aggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactt 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||  ||| |||| | | |||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  18491704 aggaaaatgttacatgaacaccctttaatcatacaccctattgtacacctcatgcattaagaacattttggtaaattcatctcacaaccatactt 18491798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 181 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 966936 - 966835
Alignment:
Q  181 aaggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatc 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||| |||| | |  ||||||||| |||||||||||| || ||||| ||    
T  966936 aaggaaaatgttacatgaacaccctttaatcatacaccctattgtacaccccatgcattaagaacgttttggtaaattcatctcacaaacatactttctc 966837  T
Q  281 tt 282  Q
    ||    
T  966836 tt 966835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 185 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 6518566 - 6518484
Alignment:
Q  185 aaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaa 268  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||| | ||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  6518566 aaaatgttacatgaacacc-tttaatcatacactctattgtacaccccatgcattagggacattttggtaatttcatctcacaa 6518484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 182 - 265
Target Start/End: Original strand, 14285675 - 14285758
Alignment:
Q  182 aggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctca 265  Q
    |||||||| |||||  ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  14285675 aggaaaatattacacaaacaccctttaatcatacaccctattgtacaccctatatattaaagatattttggtaaattcatctca 14285758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 303 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 6518474 - 6518400
Alignment:
Q  303 ttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactctt 377  Q
    ||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  6518474 ttgccacatgtcaggattttgtgtgggtgtaaaaggtgtattgacacatggaggtgtacatgtatcaccactctt 6518400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 303 - 377
Target Start/End: Original strand, 18491825 - 18491899
Alignment:
Q  303 ttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactctt 377  Q
    ||||||| ||| || ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  18491825 ttgccacatgttaggattttgtgtgggtgtaagaggtgtattgccacatgggggtgtacatgtatcaccactctt 18491899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 303 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 41281954 - 41281880
Alignment:
Q  303 ttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactctt 377  Q
    ||||||| |||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  41281954 ttgccacatgtcaggattttgtgtgggtgtaagaggtgtattgccatatgggggtgtacatgtatcaccactctt 41281880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 303 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 966814 - 966742
Alignment:
Q  303 ttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactc 375  Q
    ||||||| |||||| ||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  966814 ttgccacatgtcaggattttgtgtgggtgtaagaggtgtatttccacatggggatgtacatgtatcaccactc 966742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 303 - 375
Target Start/End: Original strand, 43114677 - 43114749
Alignment:
Q  303 ttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactc 375  Q
    ||||||| |||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  43114677 ttgccacttgtcaggattttgtgtgggtgtaagaggtgtattgccacatgagggtgtacatgtatcaccactc 43114749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 4299518 - 4299435
Alignment:
Q  185 aaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaa 268  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| | ||| ||||  || |||||||||| ||||||||||||    
T  4299518 aaaatgttatatgaacaccctttaatcatacaccctattgtacactccatgcattaatgacattttggtaaattcatctcacaa 4299435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 272
Target Start/End: Original strand, 7070418 - 7070505
Alignment:
Q  185 aaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccac 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  | | || |||| |||| |||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  7070418 aaaatgttacatgaacaccctttattcatacatcccattgtaacctccatttattggggacattttgataaattcatcttacaaccac 7070505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 4452008 - 4451951
Alignment:
Q  225 tacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatctt 282  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  4452008 tacaccatatgcattagggatattttggtaaattcatctcacaaccatactttctctt 4451951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 311 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 12415432 - 12415368
Alignment:
Q  311 tgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactc 375  Q
    |||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  12415432 tgtcagaattttgtgtggatgtaagaggtgtattgccacatgggagtgtacatgtatcaccactc 12415368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 311 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 12427492 - 12427428
Alignment:
Q  311 tgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactc 375  Q
    |||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  12427492 tgtcagaattttgtgtggatgtaagaggtgtattgccacatgggagtgtacatgtatcaccactc 12427428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 303 - 375
Target Start/End: Original strand, 16804088 - 16804160
Alignment:
Q  303 ttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactc 375  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||||||| || || |||  ||||||||||||||||||    
T  16804088 ttgccacatgtcagaattttgtgtgggtgtaagaggtgtattgtcatataggggtgtacatgtatcaccactc 16804160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 303 - 375
Target Start/End: Original strand, 16843370 - 16843442
Alignment:
Q  303 ttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactc 375  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||||||| || || |||  ||||||||||||||||||    
T  16843370 ttgccacatgtcagaattttgtgtgggtgtaagaggtgtattgtcatataggggtgtacatgtatcaccactc 16843442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 303 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 12531643 - 12531569
Alignment:
Q  303 ttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactctt 377  Q
    ||||||| |||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||| |||| |  |||||||||||| |||||||    
T  12531643 ttgccacatgtcaggattttgtgtgggtgtaagaggtgtattgccatatggaggtgtacatgtatcatcactctt 12531569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 303 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 4299400 - 4299328
Alignment:
Q  303 ttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactc 375  Q
    ||||||| |||||| ||||||| |||||||||  | ||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||    
T  4299400 ttgccacatgtcaggattttgtgtgggtgtaagagatgtattgccacatgaaggtgtacatgtatcaccactc 4299328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 349
Target Start/End: Original strand, 40613913 - 40613976
Alignment:
Q  287 ttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgt-aaatggtgtattgccac 349  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  40613913 ttgtgcggggtccatgtggccacgtgtcagatttttgtgtgggtgtcaaagggtgtattgccac 40613976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0119 (Bit Score: 156; Significance: 1e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0119
Description:

Target: scaffold0119; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 178 - 377
Target Start/End: Original strand, 680 - 879
Alignment:
Q  178 aaaaaggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacacttt 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  680 aaaaaggaaaatgttacatgaacaccctttattcctacacctcattgtacacctcatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacacttt 779  T
Q  278 atcttctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactctt 377  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||    
T  780 atcttctatttgtgtggagtccaggttgccacgtgtcagaattttgtgtgggtgtaaagggtgtattgccacatgaggtggtacatatatcaccgctctt 879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 155; Significance: 4e-82; HSPs: 52)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 183 - 377
Target Start/End: Original strand, 27550309 - 27550503
Alignment:
Q  183 ggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatctt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27550309 ggaaaatgttacatgaacaccctttatttctacactccattgtacacctcatgtattagggatattttggtaagttcatcttacaaccacactttatctt 27550408  T
Q  283 ctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactctt 377  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27550409 ctatttatgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaagggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcatcactctt 27550503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 181 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 1771368 - 1771172
Alignment:
Q  181 aaggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatc 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1771368 aaggaaaatgttacatgaacaccctttattcctacaccccattgtacaccccatgtattagagatattttgataagttcatctcacaaccacattttatc 1771269  T
Q  281 ttctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactctt 377  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1771268 ttctatttatgtggggtccaagttgccacgtctcagaattttgtgtgggtgtaaagggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcatcactctt 1771172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 177 - 376
Target Start/End: Original strand, 23035974 - 23036173
Alignment:
Q  177 aaaaaaggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactt 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23035974 aaaaaaggaaaatgttacatgaacctcctttattcctacaccctattgtacaccctatatattagggatatttttgtaagttcatctcacaaccacactt 23036073  T
Q  277 tatcttctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactct 376  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23036074 tatcttctatttatgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtgtgggtgtaaaggatgtgttgccacatggggtggtacatgtatcatcactct 23036173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 181 - 375
Target Start/End: Original strand, 25051691 - 25051885
Alignment:
Q  181 aaggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatc 280  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25051691 aaggaaaatgtcacatgaacacactttattcctacaccccattgtacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaatcacactttatc 25051790  T
Q  281 ttctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactc 375  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  25051791 ttctatttatgtggggtccaagttgccacgtgtcagaattttgtgtggatgtaaatgatgtattgccacgtggggtggtacatgtatcatcactc 25051885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 181 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 28982924 - 28982728
Alignment:
Q  181 aaggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatc 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28982924 aaggaaaatgttacatgaacaccctttatttctacaccctattgtacatcccatatattagggatattttggtaagttcatctcacaaccgcactttatc 28982825  T
Q  281 ttctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactctt 377  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28982824 ttctatttgtgtggggtccaagttgccacgtgtcagaattttgtgtggatgtaaaaggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcatcactctt 28982728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 180 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 55966449 - 55966252
Alignment:
Q  180 aaaggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttat 279  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  55966449 aaaggaaaatgttacataaacaccctttattcatacatcccattgtacatcccatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacaatttat 55966350  T
Q  280 cttctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactctt 377  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||||||| |||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  55966349 cttctatttatgtggggtctagattgccacctgtcagaattttatgtgggtgtaaagggtgtattgccacatggagtggtacatgtatcaccactctt 55966252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 185 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 27893940 - 27893750
Alignment:
Q  185 aaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttct 284  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27893940 aaaatgttacataaacaccatttattcatacatcccattgtacaccccatgtattagggatattttggtaatttcatctcacaaccacactttatcttct 27893841  T
Q  285 atttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactc 375  Q
    |||| ||||||||| || ||||||| |||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27893840 atttatgtggggtcaagattgccacatgtcagaattttatgtgggtgtaaagggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactc 27893750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 181 - 375
Target Start/End: Original strand, 33703139 - 33703333
Alignment:
Q  181 aaggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatc 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33703139 aaggaaaatgttacatgaacaccctttatttctacatcttattgtacaccccatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatc 33703238  T
Q  281 ttctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactc 375  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  33703239 ttctatttgtgcgggatccaagttgccacgtgtcagaattttgtgtgggtgtaaagggtgtattgccatatggggtggtacatgtatcatcactc 33703333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 180 - 377
Target Start/End: Original strand, 27864561 - 27864758
Alignment:
Q  180 aaaggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttat 279  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27864561 aaaggaaaatgttacataaacaccatttattcatacatcccattgtacaccccatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttat 27864660  T
Q  280 cttctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactctt 377  Q
     |||||||| |||||||| ||| || |||| |||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27864661 tttctatttatgtggggttcagattaccacatgtcagaattttatgtggatgtaaagggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactctt 27864758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 183 - 375
Target Start/End: Original strand, 35017733 - 35017924
Alignment:
Q  183 ggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatctt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || | | |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35017733 ggaaaatgttacatgaacaccctttattcctatatctcattgtacaccccatgtat-agggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatctt 35017831  T
Q  283 ctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactc 375  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35017832 ctatttgtgtggggtccaagttgccacgtgtcagaattttgtgtggatgtaaaagatgtattgccacatggggtggtacatgtatcatcactc 35017924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 185 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 43514784 - 43514594
Alignment:
Q  185 aaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttct 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43514784 aaaatgttacatgaacaccctttattcctacactccattgtacacttcatgtattagggttattttggtaagttcatctcacaaccacaccttatcttct 43514685  T
Q  285 atttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactc 375  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43514684 atttgtgtggggtctaggttgccacgtgtcagaattttttgtggatgtaaagagtgtattgccacatggggtggtacatgtatcatcactc 43514594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 7 - 182
Target Start/End: Original strand, 48187288 - 48187464
Alignment:
Q  7 caaacatgtgggttgataaattgtgtaggggacctagcatgagaaagggagtgtcatgaacaatttaaaaattcagcaataatactattaagaaccaaat 106  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48187288 caaacatgtggtttgataaattgtgtaggggacctagcatgagaaagggagtgtcatgaactgtttaaaaattcagcaataatactattaagaaccaaat 48187387  T
Q  107 attagac-nnnnnnnnnctgtatccaacatttgaaatataaaataataaaggatgcatttgttttagctttaaaaaa 182  Q
    |||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  48187388 attagacttttttttttctgtatccaacatttgaaatataaaataataaaggatgcatttgttttaactttaaaaaa 48187464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 186 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 23204875 - 23204686
Alignment:
Q  186 aaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttcta 285  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23204875 aaatgttacatgaacactctttattcctacatcccattgtacatcctatgtattagggatatttttgtaagttcatgtcacaaccacactttatcttcta 23204776  T
Q  286 tttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactc 375  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||| | | |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  23204775 tttatgtggggtccaggttgccacatgtcagaattttatgtgggtgtaaaggatatattgccacatgggatggtacgtgtatcatcactc 23204686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 185 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 43949900 - 43949709
Alignment:
Q  185 aaaatgttacatgaacacccttt-attcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttc 283  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||| | |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43949900 aaaatgatacatgaacacccttttattcctgcacctcattgtacaccccatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttc 43949801  T
Q  284 tatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactc 375  Q
    |||||||| ||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  43949800 tatttgtgcgggatccaatatgccacgtgtcagaattttgtatgggtataaagggtgtattgccaaatagggtggtacatgtatcatcactc 43949709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 185 - 376
Target Start/End: Original strand, 31680904 - 31681095
Alignment:
Q  185 aaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttct 284  Q
    |||||||||| | |||||| ||||||||||||  ||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31680904 aaaatgttacgtaaacaccatttattcatacattccattgtacaccccgtatattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttct 31681003  T
Q  285 atttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactct 376  Q
    |||| ||||||||  || |||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  31681004 atttatgtggggtttagattgccacgtgtcagaattttatgtaggtgtaaagggtgtattgccacatgggatgctacatgtatcaccactct 31681095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 180 - 377
Target Start/End: Original strand, 28988470 - 28988666
Alignment:
Q  180 aaaggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttat 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| | |||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||||| |    
T  28988470 aaaggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacacctcattgtacaccccatgcactagggacattttgataaattcatctcataaccacactttct 28988569  T
Q  280 cttctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactctt 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||  ||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  28988570 cttctatttgtgtggggtccaggttgccatatgtcagaattttgtatgag-gtaaggggtgtattgtcacatgagggtgtacatgtatcaccactctt 28988666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 185 - 377
Target Start/End: Original strand, 43735744 - 43735936
Alignment:
Q  185 aaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttct 284  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||  | ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43735744 aaaatattacatgaacatcctttattcctacatctcattatacattccatgtattagagatattttgataagttcatctcacaatcacactttatcttct 43735843  T
Q  285 atttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactctt 377  Q
    ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  43735844 atttgtgtgggatccaagttgtcacgtgtcagaattttatgtggatgtaaagggtgtattgccacgtggggtggtacatgtatcatcactctt 43735936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 183 - 369
Target Start/End: Original strand, 12496956 - 12497142
Alignment:
Q  183 ggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatctt 282  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  12496956 ggaaaatgttatatgaacaccctttattcctacactccattgtacatcccatgtattagagatattttggtaagttcatcttacaatcacactttatctt 12497055  T
Q  283 ctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatca 369  Q
    ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  12497056 ctatttgtgtgaggttcaatttgccacgtgttagaattttgtgtgggtgtaaaacgtgtattgtcacatggggtggtgcatgtatca 12497142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 183 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 27316813 - 27316619
Alignment:
Q  183 ggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatctt 282  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27316813 ggaaaatgttaaacgaacaccctttattcctacacctcattatacaccccatgtattaaggatattttggtaagttcatctcataaccacactttatctt 27316714  T
Q  283 ctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaa-ttttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactct 376  Q
    |||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||| || || |||||||| ||||||    
T  27316713 ctatttatttggagtccaagttgccacgtgtcagaatttttgtgtggatgtaaagggtgtattgtcacatgggatgataaatgtatcatcactct 27316619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 182 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 48463551 - 48463361
Alignment:
Q  182 aggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatct 281  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||   |||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  48463551 aggaaaatgttacataaacaccatttattcatacatttcattgtacatcccatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccatactttattt 48463452  T
Q  282 tctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcacca 372  Q
    ||||||| |||||||| ||| || |||| |||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  48463451 tctatttatgtggggttcagattaccacatgtcagaattttatgtgggtgtaaagggtgtattgccacatagagtggtacatgtatcacca 48463361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 177 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 45490419 - 45490225
Alignment:
Q  177 aaaaaaggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactt 276  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||||| || ||| ||||||  |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  45490419 aaaaatggaaaatgttacatgaacacattttatttatacatccaattgtacacctcatgtattagggatactttagtaaattcatctcacaaccacactt 45490320  T
Q  277 tatcttctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcacc 371  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  45490319 tatcttctatttgtacgggatccaggttgccacgtgtcagaatcttgtgtgggtgtaaatgatatattgccacatagggtactacatgtatcacc 45490225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 182 - 377
Target Start/End: Original strand, 21687005 - 21687200
Alignment:
Q  182 aggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatct 281  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  21687005 aggaaaatgttacatgaacatcctttatttttacaccccattatacatcttatgtattagaaatattttagtaagttcatctcataaccatactttatct 21687104  T
Q  282 tctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactctt 377  Q
    ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||   ||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||    
T  21687105 tctatttgtctggagttcaggttgccacgtgtcagaattttgtgtgaatgtaaagaatgtattgccacataggttggtacatatatcatcactctt 21687200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 184 - 377
Target Start/End: Original strand, 41878407 - 41878593
Alignment:
Q  184 gaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttc 283  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || |||||    
T  41878407 gaaaatgttacatgaacactctttattcatacacctcattgtacaccctatccattagggatattttgataagttcatctcacaaccaaaccttctcttc 41878506  T
Q  284 tatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactctt 377  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||  ||     ||||||||||||||||||||||||    
T  41878507 tatttgtgtggggtccagattgtcacgtgtcagaattttgtgttggtgtaaagagtgtatt--ca-----ggtggtacatgtatcaccactctt 41878593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 225 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 51512323 - 51512173
Alignment:
Q  225 tacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgt 324  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51512323 tacaccccatgtattagagatattttggtaagttcatcttataaccacactttatcttttatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgt 51512224  T
Q  325 atgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactc 375  Q
     ||||| | || | ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  51512223 gtgggtattaaagatgtattgccacgtggggtggtacatgtatcatcactc 51512173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 185 - 357
Target Start/End: Original strand, 39631102 - 39631275
Alignment:
Q  185 aaaatgttacatgaacacccttt-attcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttc 283  Q
    |||||| ||||||||| |||||| |||| |||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39631102 aaaatgatacatgaacccccttttattcctacacctcattgtacacctcatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttc 39631201  T
Q  284 tatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtg 357  Q
    |||||||||||||| ||   || |||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| |||||||||||    
T  39631202 tatttgtgtggggttcaatatgtcacgtgtcagaattttgtgtgggtgtaaaggatgtattgtcacatggggtg 39631275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 177 - 370
Target Start/End: Original strand, 41847965 - 41848158
Alignment:
Q  177 aaaaaaggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactt 276  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||| |||| ||||||| ||| ||||| || ||||||| || |||||| |||||||||||||    
T  41847965 aaaaacggaaaatgttacaagaacatccttttttcacacacctcattgtacaccccatgcattagagacattttggcaaattcatcgcacaaccacactt 41848064  T
Q  277 tatcttctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcac 370  Q
    | ||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||  ||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  41848065 tctcttctatttgtgtggggttcagattgtcacatgtcagaattttgcgtggatgtaaggggtgtattgccacatgggggtgtacatgtatcac 41848158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 185 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 41327641 - 41327478
Alignment:
Q  185 aaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttct 284  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| | || ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||     
T  41327641 aaaatgttacatagacaccctttattcacacaccccattgtacaccttatgcactacggacattttggtaaattcatctcacatccacactttctcttca 41327542  T
Q  285 atttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgcca 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | || ||||||  ||||||||||||    
T  41327541 atttgtgtggggtccaggttgccacatgttagaattttttgtgagtgtaaggggtgtattgcca 41327478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 224 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 56215956 - 56215805
Alignment:
Q  224 atacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttg 323  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||    
T  56215956 atacatcctatgcattagcgatattttggaaaatttatctcacaaccacactttctct-ctatttgtgtggggtctaggttgctatatgtcagaattttg 56215858  T
Q  324 tatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactct 376  Q
    | |||||||||  ||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  56215857 tgtgggtgtaagaggtgtatggccacatggtggtgtacatgtatcaccactct 56215805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 181 - 282
Target Start/End: Original strand, 711958 - 712059
Alignment:
Q  181 aaggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatc 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||    
T  711958 aaggaaaatgttacatgaacaccctttaatcatacaccctattgtacaccctatgcattaaggatattttggtaaattcatctcacaaacatactttctc 712057  T
Q  281 tt 282  Q
    ||    
T  712058 tt 712059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 236 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 46412516 - 46412389
Alignment:
Q  236 tattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatcttctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaa 335  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |  |||||||||||||||||||||| | | ||||||    
T  46412516 tattagagatattttggtaagttcttctcacaaccacactttatcttctatttatgtggggtttaaattgccacgtgtcagaattttgtgtagatgtaaa 46412417  T
Q  336 tggtgtattgccacatggggtggtacat 363  Q
      || ||||| || || |||||||||||    
T  46412416 aagtatattgtcatatagggtggtacat 46412389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 183 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 17619252 - 17619153
Alignment:
Q  183 ggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatctt 282  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  17619252 ggaaaatgttacatgaacaccttttaatcatacaccctattgtacaccccatgcattaaggatattttggtaaattcatctcacaaccatactttctctt 17619153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 183 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 55272476 - 55272284
Alignment:
Q  183 ggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatctt 282  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  55272476 ggaaaatgttacatgaacatcctttaatcatacactctattgtacaccccatgcattaaggatattttggtaaattcatctcacaaccatactttctctt 55272377  T
Q  283 ctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactc 375  Q
      || |        |     ||||||| |||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  55272376 tcatctcctctcccttttccttgccacatgtcaggattttgtgtgggtgtaagaggtgtattgccacatgggggtgtacatgtatcaccactc 55272284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 181 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 960972 - 960890
Alignment:
Q  181 aaggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatct 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||||    
T  960972 aaggaaaatgttacatgaacaccctttaatcatacactctattgtacaccctatacattagggacattttggtaaattcatct 960890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 185 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 3756344 - 3756252
Alignment:
Q  185 aaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacacttt 277  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||| |||| ||||||||| |||| || ||||||||| || |||||    
T  3756344 aaaatgttacatgaacaccctttaatcatacaccctattgtacaccccatgcattaaggatattttagtaaatttatctcacaatcatacttt 3756252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 182 - 282
Target Start/End: Original strand, 32728356 - 32728456
Alignment:
Q  182 aggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatct 281  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||| ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||| || ||||| |||    
T  32728356 aggaaaatgttacatgaacatcctttaatcatacaccctattgtacaccccatgcattaaggacattttagtaaattcatctcacaatcatactttctct 32728455  T
Q  282 t 282  Q
    |    
T  32728456 t 32728456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 179 - 271
Target Start/End: Original strand, 35037001 - 35037093
Alignment:
Q  179 aaaaggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaacca 271  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||||| | ||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35037001 aaaagaaaaatgttacatgagcaccctttaaccatacactctattgtacaccccatgcattaaggatattttggtaaattcatctcacaacca 35037093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 182 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 48435680 - 48435580
Alignment:
Q  182 aggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatct 281  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||| ||| ||||||| ||| |||||||| || ||||||| |||||||||||| || |||||||||    
T  48435680 aggaaagtgttacatgaacaccatttaatcacacaccctattgtacaccccatgcattagggacatattggtaaattcatctcacaatcatactttatct 48435581  T
Q  282 t 282  Q
    |    
T  48435580 t 48435580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 390 - 465
Target Start/End: Original strand, 48187484 - 48187561
Alignment:
Q  390 cgttccgaacttagtccgttaag--cttgtgtttatttatggtaaaattgtatttgtacgactgactatttggtttac 465  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||||  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48187484 cgttccgaacttagtccgttaatatcttgcttgtgtttatggtaaaattgtatttgtacgactgactatttggtttac 48187561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 303 - 376
Target Start/End: Original strand, 19880074 - 19880147
Alignment:
Q  303 ttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactct 376  Q
    ||||||| |||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  19880074 ttgccacatgtcaggattttgtgtgggtgtaagaggtgtattgccacatgggggtgtacatgtatcaccactct 19880147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 180 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 46827809 - 46827721
Alignment:
Q  180 aaaggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaa 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||||| ||| |||| | |  ||||||||| || |||||||||    
T  46827809 aaaggaaaatgttacatgaacaccctttaatcatacactctattgtacacccaatgcattaagaacgttttggtaaatttatctcacaa 46827721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 303 - 374
Target Start/End: Original strand, 35037125 - 35037195
Alignment:
Q  303 ttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccact 374  Q
    ||||||| |||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  35037125 ttgccacatgtcaggattttgtgtgggtgtaagaggtgtattgccacatggagt-gtacatgtatcaccact 35037195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 303 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 17619132 - 17619058
Alignment:
Q  303 ttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactctt 377  Q
    ||||||| |||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||    
T  17619132 ttgccacatgtcaggattttgtgtgggtgtaagaggtgtattgccaggtggggatgtacatgtatcaccactctt 17619058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 303 - 371
Target Start/End: Original strand, 712080 - 712148
Alignment:
Q  303 ttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcacc 371  Q
    ||||||| |||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  712080 ttgccacatgtcaggattttgtgtgggtgtaagaggtgtattgccacatggaggtgtacatgtatcacc 712148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 303 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 48435559 - 48435487
Alignment:
Q  303 ttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactc 375  Q
    ||||||| |||||| ||||||| |||||||||  | ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  48435559 ttgccacatgtcaggattttgtgtgggtgtaagagatgtattgtcacatgggggtgtacatgtatcaccactc 48435487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 303 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 46827686 - 46827612
Alignment:
Q  303 ttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactctt 377  Q
    ||||||| |||||| ||||||| |||||||||  | |||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  46827686 ttgccacatgtcaggattttgtgtgggtgtaagagatgtatttccacatggaggtgtacatgtatcaccactctt 46827612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 182 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 49229765 - 49229684
Alignment:
Q  182 aggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatct 263  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||   ||| |||| ||||||| |||||| |||||||    
T  49229765 aggaaaatgttatatgaacatcctttaatcatacaccctattgtacacttcatgcattaaggatattctggtaaattcatct 49229684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 337 - 377
Target Start/End: Original strand, 32728511 - 32728551
Alignment:
Q  337 ggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactctt 377  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  32728511 ggtgtattgccacatgggggtgtacatgtatcaccactctt 32728551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 183 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 36004204 - 36004165
Alignment:
Q  183 ggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccat 222  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  36004204 ggaaaatgttacatgaataccctttaatcatacaccccat 36004165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 327 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 960799 - 960753
Alignment:
Q  327 gggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccac 373  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  960799 gggtgtaagaggtgtattgccacatgggggtgtacatgtatcaccac 960753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 177 - 231
Target Start/End: Original strand, 30189267 - 30189321
Alignment:
Q  177 aaaaaaggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccc 231  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||  |||||||    
T  30189267 aaaataggaaaatgttacatgaacaccatttattcacacactccatcgtacaccc 30189321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 303 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 3756232 - 3756159
Alignment:
Q  303 ttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactct 376  Q
    ||||||| |||||  ||||| | |||||||||  | ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  3756232 ttgccacatgtcatgattttatgtgggtgtaagagttgtattgccacatgggagtgtacatgtatcaccactct 3756159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 282
Target Start/End: Original strand, 38851515 - 38851612
Alignment:
Q  185 aaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatctt 282  Q
    ||||||||||||||| | |||||| ||||||| |  | | ||||| | ||| |||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  38851515 aaaatgttacatgaatatcctttaatcatacatcataatgtacactccatgcattatggacattttgataaattcatctcacaaccatactttctctt 38851612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0187 (Bit Score: 150; Significance: 4e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0187
Description:

Target: scaffold0187; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 182 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 14289 - 14097
Alignment:
Q  182 aggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatct 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14289 aggaaaatgttacatgaacaccctttatttctacaccccattgtacatcctatgtattagggatatttttgtaagttcatctcacaaccacactttatct 14190  T
Q  282 tctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactc 375  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14189 tctatttgtgt-gggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtgtggatgtaaagggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcatcactc 14097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0187; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 182 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 24617 - 24425
Alignment:
Q  182 aggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatct 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24617 aggaaaatgttacatgaacaccctttatttctacaccccattgtacatcctatgtattagggatatttttgtaagttcatctcacaaccacactttatct 24518  T
Q  282 tctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactc 375  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24517 tctatttgtgt-gggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtgtggatgtaaagggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcatcactc 24425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0385 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0385
Description:

Target: scaffold0385; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 181 - 375
Target Start/End: Original strand, 11249 - 11443
Alignment:
Q  181 aaggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatc 280  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11249 aaggaaaatgtcacatgaacacactttattcatacaccccattgtacaccccatatattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatc 11348  T
Q  281 ttctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactc 375  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  11349 ttctattgatgtggggtccaagttgctacgtgtcagaattttgtgtaggtgtaaatagtgtattgccacatgggatggtacatgtatcatcactc 11443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 111; Significance: 8e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 183 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 23521 - 23335
Alignment:
Q  183 ggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatctt 282  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  23521 ggaaaatgttatatgaacaccctttattcctacactccattgtacatcccatgtattagagatattttggtaagttcatcttacaatcacactttatctt 23422  T
Q  283 ctatttgtgtggggtccaggttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatca 369  Q
    ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  23421 ctatttgtgtgaggttcaatttgccacgtgttagaattttgtgtgggtgtaaaacgtgtattgtcacatggggtggtgcatgtatca 23335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 66; Significance: 5e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 185 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 45817 - 45720
Alignment:
Q  185 aaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatctt 282  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  45817 aaaatgttacatgaacaccctttaatcatacaccctattgtacatcctatgtattaaggatattttggtaaattcatctcacaaccatactttctctt 45720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 303 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 45699 - 45625
Alignment:
Q  303 ttgccacgtgtcagaattttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatcaccactctt 377  Q
    ||||||| |||||| ||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  45699 ttgccacatgtcaggattttatgtgggtgtaagaggtgtattgccacatgggtgtgtacatgtatcaccactctt 45625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 183 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 35556 - 35457
Alignment:
Q  183 ggaaaatgttacatgaacaccctttattcatacaccccattatacaccctatgtattagggatattttggtaagttcatctcacaaccacactttatctt 282  Q
    |||||||||||||| |||||| |||| |||||||||  ||| ||||||| ||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  35556 ggaaaatgttacataaacaccatttaatcatacaccatattgtacaccccatgcattagggacatattggtaaattcatctcacaaccatactttctctt 35457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 318 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 35421 - 35370
Alignment:
Q  318 attttgtatgggtgtaaatggtgtattgccacatggggtggtacatgtatca 369  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  35421 attttgtatgggtgtaagaggtgtattgccacatgggggtgtacatgtatca 35370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University