View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5892_low_10 (Length: 492)

Name: NF5892_low_10
Description: NF5892
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5892_low_10
NF5892_low_10
[»] chr3 (144 HSPs)
chr3 (9-463)||(46822687-46823141)
chr3 (48-468)||(41124360-41124780)
chr3 (44-468)||(20629509-20629933)
chr3 (48-468)||(38961158-38961579)
chr3 (44-468)||(55318621-55319045)
chr3 (48-468)||(16282079-16282499)
chr3 (48-468)||(17444084-17444505)
chr3 (48-463)||(13937295-13937709)
chr3 (9-395)||(10379628-10380019)
chr3 (44-391)||(24513981-24514328)
chr3 (139-465)||(8499944-8500270)
chr3 (139-468)||(27165673-27166002)
chr3 (142-468)||(53300919-53301245)
chr3 (165-463)||(10557334-10557633)
chr3 (47-395)||(12119185-12119515)
chr3 (48-303)||(8899418-8899664)
chr3 (273-468)||(14567431-14567626)
chr3 (293-468)||(16358234-16358409)
chr3 (244-415)||(55319014-55319185)
chr3 (237-412)||(15465438-15465613)
chr3 (282-468)||(36528383-36528569)
chr3 (239-395)||(54521123-54521279)
chr3 (237-412)||(5223667-5223842)
chr3 (237-395)||(20629895-20630053)
chr3 (237-412)||(26054968-26055143)
chr3 (237-395)||(17463478-17463636)
chr3 (237-395)||(34159626-34159784)
chr3 (239-395)||(29544547-29544703)
chr3 (237-395)||(38961541-38961700)
chr3 (244-395)||(46822562-46822713)
chr3 (237-395)||(15977833-15977991)
chr3 (237-395)||(28848325-28848483)
chr3 (237-395)||(41124240-41124398)
chr3 (237-395)||(53301207-53301365)
chr3 (337-465)||(15007923-15008054)
chr3 (237-395)||(10247427-10247585)
chr3 (237-395)||(16282461-16282619)
chr3 (237-395)||(17444467-17444625)
chr3 (237-395)||(45606610-45606768)
chr3 (237-393)||(12567862-12568018)
chr3 (237-393)||(13153959-13154115)
chr3 (237-393)||(13544327-13544482)
chr3 (244-395)||(13436600-13436751)
chr3 (244-395)||(15412732-15412883)
chr3 (244-395)||(27165553-27165704)
chr3 (237-395)||(6468838-6468996)
chr3 (237-395)||(7781050-7781208)
chr3 (237-395)||(10557209-10557367)
chr3 (237-395)||(55476791-55476949)
chr3 (9-152)||(6468310-6468454)
chr3 (237-393)||(13151494-13151650)
chr3 (364-468)||(17463598-17463702)
chr3 (364-468)||(34159746-34159850)
chr3 (237-395)||(16453984-16454143)
chr3 (237-395)||(8499821-8499979)
chr3 (237-395)||(25237144-25237302)
chr3 (364-468)||(6468772-6468876)
chr3 (296-458)||(3264323-3264485)
chr3 (364-468)||(13153893-13153997)
chr3 (364-468)||(55476911-55477015)
chr3 (47-165)||(37428549-37428667)
chr3 (367-468)||(10247364-10247465)
chr3 (47-175)||(17463998-17464126)
chr3 (47-175)||(34160146-34160274)
chr3 (364-468)||(13151428-13151532)
chr3 (364-468)||(45606544-45606648)
chr3 (9-148)||(325030-325168)
chr3 (160-267)||(45220313-45220420)
chr3 (223-427)||(17393176-17393382)
chr3 (237-383)||(25229569-25229715)
chr3 (47-175)||(10246936-10247064)
chr3 (364-465)||(15412855-15412955)
chr3 (47-175)||(15978355-15978483)
chr3 (47-175)||(55477312-55477440)
chr3 (47-158)||(7780559-7780671)
chr3 (47-175)||(45577655-45577783)
chr3 (48-128)||(13938301-13938381)
chr3 (47-158)||(16453489-16453601)
chr3 (47-175)||(15413251-15413379)
chr3 (47-158)||(1864367-1864479)
chr3 (47-158)||(13151002-13151114)
chr3 (47-158)||(13153470-13153582)
chr3 (48-175)||(14671706-14671832)
chr3 (47-160)||(28847833-28847947)
chr3 (400-468)||(7781020-7781088)
chr3 (400-468)||(12305543-12305611)
chr3 (14-162)||(14604801-14604947)
chr3 (400-468)||(15977953-15978021)
chr3 (403-468)||(16453957-16454022)
chr3 (400-468)||(5223804-5223872)
chr3 (400-468)||(15465575-15465643)
chr3 (400-464)||(28848295-28848359)
chr3 (400-468)||(29544515-29544583)
chr3 (44-165)||(9578480-9578600)
chr3 (9-153)||(46752053-46752196)
chr3 (400-468)||(54521243-54521311)
chr3 (401-468)||(25229677-25229744)
chr3 (401-468)||(25237264-25237331)
chr3 (325-395)||(12305446-12305516)
chr3 (46-148)||(12386280-12386382)
chr3 (363-465)||(26054901-26055003)
chr3 (400-465)||(13436723-13436788)
chr3 (47-173)||(16828281-16828405)
chr3 (236-321)||(36528337-36528422)
chr3 (48-160)||(22758835-22758947)
chr3 (47-148)||(44495488-44495588)
chr3 (237-324)||(16358371-16358458)
chr3 (47-165)||(32402182-32402300)
chr3 (237-327)||(15007868-15007961)
chr3 (90-160)||(43888799-43888868)
chr3 (48-160)||(18699431-18699543)
chr3 (314-395)||(25058286-25058367)
chr3 (47-148)||(43927957-43928058)
chr3 (44-116)||(24152383-24152455)
chr3 (44-115)||(11202205-11202276)
chr3 (47-114)||(22146768-22146834)
chr3 (47-114)||(37641504-37641570)
chr3 (46-148)||(49968858-49968960)
chr3 (313-383)||(51158683-51158753)
chr3 (314-383)||(16934851-16934920)
chr3 (314-383)||(49231768-49231837)
chr3 (46-117)||(26054434-26054505)
chr3 (47-95)||(45606140-45606188)
chr3 (46-97)||(5224324-5224375)
chr3 (47-114)||(8927555-8927621)
chr3 (425-468)||(12567980-12568023)
chr3 (425-468)||(13544444-13544487)
chr3 (239-321)||(3264459-3264541)
chr3 (90-160)||(12470783-12470852)
chr3 (47-113)||(13522202-13522267)
chr3 (46-128)||(50243782-50243864)
chr3 (239-288)||(12305530-12305579)
chr3 (296-396)||(21026083-21026183)
chr3 (46-113)||(6804891-6804957)
chr3 (58-117)||(45530613-45530672)
chr3 (314-381)||(54039167-54039234)
chr3 (50-153)||(11885560-11885663)
chr3 (125-175)||(45606198-45606247)
chr3 (46-98)||(5842875-5842927)
chr3 (351-383)||(14263640-14263672)
chr3 (46-74)||(16644985-16645013)
chr3 (44-96)||(21838376-21838428)
chr3 (47-99)||(50350816-50350868)
chr3 (47-142)||(52988858-52988952)
[»] chr2 (132 HSPs)
chr2 (9-465)||(32214212-32214669)
chr2 (47-468)||(22105886-22106307)
chr2 (48-465)||(6726471-6726888)
chr2 (44-465)||(23931884-23932305)
chr2 (47-468)||(24918561-24918982)
chr2 (48-468)||(24368247-24368668)
chr2 (48-468)||(41523202-41523621)
chr2 (44-468)||(23706343-23706766)
chr2 (47-468)||(45027220-45027646)
chr2 (46-465)||(24528866-24529285)
chr2 (48-460)||(21154136-21154548)
chr2 (48-468)||(24671446-24671866)
chr2 (44-468)||(24681865-24682281)
chr2 (237-468)||(21154518-21154749)
chr2 (238-468)||(41523584-41523814)
chr2 (237-468)||(23706728-23706958)
chr2 (244-465)||(23709050-23709271)
chr2 (239-395)||(20261520-20261676)
chr2 (237-395)||(22105766-22105924)
chr2 (239-391)||(10684468-10684620)
chr2 (237-395)||(18809243-18809401)
chr2 (237-395)||(23706920-23707078)
chr2 (237-395)||(23711717-23711875)
chr2 (237-395)||(24368127-24368285)
chr2 (237-395)||(28577399-28577557)
chr2 (237-395)||(41523776-41523934)
chr2 (237-395)||(571698-571856)
chr2 (237-395)||(6726348-6726506)
chr2 (237-395)||(24671326-24671484)
chr2 (237-395)||(32214634-32214792)
chr2 (237-395)||(39682614-39682772)
chr2 (237-395)||(45027608-45027766)
chr2 (239-395)||(24681745-24681901)
chr2 (244-395)||(23131163-23131314)
chr2 (244-395)||(23133630-23133781)
chr2 (244-395)||(34402232-34402383)
chr2 (237-395)||(21154711-21154869)
chr2 (237-395)||(24642452-24642610)
chr2 (237-395)||(24918441-24918599)
chr2 (336-468)||(24642358-24642490)
chr2 (237-393)||(24897899-24898055)
chr2 (237-393)||(24900382-24900538)
chr2 (237-393)||(24902859-24903015)
chr2 (237-393)||(24905336-24905492)
chr2 (237-395)||(23135880-23136038)
chr2 (237-395)||(26505679-26505837)
chr2 (237-395)||(26508157-26508315)
chr2 (364-468)||(18809363-18809467)
chr2 (364-468)||(23711651-23711755)
chr2 (237-381)||(23931775-23931919)
chr2 (49-160)||(24897411-24897523)
chr2 (49-160)||(24899894-24900006)
chr2 (49-160)||(24902371-24902483)
chr2 (49-160)||(24904848-24904960)
chr2 (49-160)||(24907323-24907435)
chr2 (237-393)||(24907811-24907967)
chr2 (364-468)||(28577519-28577623)
chr2 (237-395)||(23709236-23709394)
chr2 (364-468)||(26505799-26505903)
chr2 (364-468)||(26508277-26508381)
chr2 (364-468)||(39682734-39682838)
chr2 (296-395)||(25616482-25616581)
chr2 (364-463)||(32039136-32039235)
chr2 (238-388)||(38967787-38967937)
chr2 (237-395)||(32039202-32039360)
chr2 (364-465)||(571821-571922)
chr2 (47-175)||(18809763-18809891)
chr2 (364-465)||(23131286-23131386)
chr2 (47-175)||(23711227-23711355)
chr2 (246-395)||(24529259-24529408)
chr2 (47-175)||(32038711-32038839)
chr2 (364-465)||(34402160-34402260)
chr2 (47-175)||(39683136-39683264)
chr2 (47-175)||(23131682-23131810)
chr2 (364-465)||(23133753-23133853)
chr2 (47-175)||(23134149-23134277)
chr2 (367-468)||(23708980-23709081)
chr2 (47-175)||(34401736-34401864)
chr2 (46-160)||(38968314-38968426)
chr2 (47-160)||(28577939-28578053)
chr2 (47-175)||(22695155-22695283)
chr2 (47-175)||(26508677-26508805)
chr2 (48-175)||(9785463-9785589)
chr2 (47-175)||(26506199-26506327)
chr2 (47-175)||(27919978-27920106)
chr2 (47-160)||(572232-572347)
chr2 (47-160)||(23136402-23136516)
chr2 (401-468)||(31345600-31345667)
chr2 (400-465)||(23136003-23136068)
chr2 (44-165)||(39827192-39827312)
chr2 (400-468)||(20261640-20261708)
chr2 (64-175)||(22690559-22690670)
chr2 (400-465)||(24897869-24897934)
chr2 (400-465)||(24900352-24900417)
chr2 (400-465)||(24902829-24902894)
chr2 (400-465)||(24905306-24905371)
chr2 (400-465)||(24907781-24907846)
chr2 (339-412)||(31345480-31345553)
chr2 (48-165)||(34137799-34137915)
chr2 (400-465)||(38967903-38967968)
chr2 (400-468)||(10684436-10684504)
chr2 (48-104)||(25616572-25616628)
chr2 (46-165)||(27845492-27845610)
chr2 (47-152)||(18388190-18388295)
chr2 (42-159)||(43946513-43946629)
chr2 (46-158)||(26393264-26393375)
chr2 (19-153)||(24792731-24792864)
chr2 (237-305)||(31345570-31345638)
chr2 (46-165)||(18546142-18546260)
chr2 (364-415)||(27920402-27920453)
chr2 (46-128)||(7187395-7187477)
chr2 (47-117)||(19358873-19358943)
chr2 (90-160)||(23068451-23068520)
chr2 (314-395)||(16900803-16900884)
chr2 (314-395)||(16994194-16994275)
chr2 (19-153)||(24833995-24834128)
chr2 (46-128)||(22172978-22173060)
chr2 (314-383)||(34823750-34823819)
chr2 (47-148)||(3539787-3539889)
chr2 (47-97)||(34858192-34858242)
chr2 (47-97)||(34873254-34873304)
chr2 (290-383)||(67339-67432)
chr2 (314-383)||(12727711-12727780)
chr2 (44-96)||(23079871-23079923)
chr2 (44-142)||(27473414-27473511)
chr2 (273-383)||(19887274-19887384)
chr2 (291-329)||(24788042-24788080)
chr2 (47-99)||(12626427-12626479)
chr2 (47-99)||(20005971-20006023)
chr2 (315-383)||(22274022-22274090)
chr2 (46-117)||(31346101-31346172)
chr2 (47-99)||(45535925-45535977)
[»] chr8 (122 HSPs)
chr8 (47-468)||(32122149-32122570)
chr8 (47-465)||(27471737-27472155)
chr8 (9-465)||(16412597-16413054)
chr8 (48-468)||(20403700-20404120)
chr8 (44-468)||(38549130-38549553)
chr8 (47-465)||(24049034-24049452)
chr8 (47-468)||(15202306-15202727)
chr8 (47-465)||(19896938-19897356)
chr8 (46-395)||(1326444-1326793)
chr8 (139-465)||(15070984-15071310)
chr8 (44-381)||(11361024-11361362)
chr8 (46-468)||(19936239-19936649)
chr8 (47-329)||(32810263-32810536)
chr8 (47-267)||(37609722-37609941)
chr8 (237-468)||(19896742-19896973)
chr8 (47-213)||(20457354-20457520)
chr8 (237-468)||(15202689-15202920)
chr8 (239-465)||(16401437-16401663)
chr8 (237-468)||(38549515-38549746)
chr8 (237-464)||(16401243-16401469)
chr8 (237-412)||(14397444-14397619)
chr8 (244-395)||(27472127-27472278)
chr8 (237-395)||(1484702-1484860)
chr8 (237-395)||(14409148-14409306)
chr8 (237-395)||(14824075-14824233)
chr8 (237-395)||(5852996-5853154)
chr8 (237-395)||(19936611-19936769)
chr8 (237-395)||(20403580-20403738)
chr8 (237-395)||(24048912-24049069)
chr8 (237-395)||(24485747-24485905)
chr8 (237-395)||(15202882-15203040)
chr8 (237-395)||(16198195-16198353)
chr8 (237-391)||(16413019-16413173)
chr8 (237-395)||(18677768-18677926)
chr8 (237-395)||(32122029-32122187)
chr8 (47-175)||(5852507-5852634)
chr8 (237-393)||(22002055-22002211)
chr8 (244-395)||(4483581-4483732)
chr8 (237-395)||(15070861-15071019)
chr8 (237-395)||(38549708-38549866)
chr8 (237-394)||(4542077-4542234)
chr8 (364-468)||(1484822-1484926)
chr8 (364-468)||(5852930-5853034)
chr8 (364-468)||(14409082-14409186)
chr8 (237-395)||(20045899-20046057)
chr8 (238-375)||(45290252-45290389)
chr8 (364-468)||(20045833-20045937)
chr8 (237-395)||(16401628-16401786)
chr8 (237-395)||(19896622-19896780)
chr8 (47-160)||(24485254-24485368)
chr8 (277-391)||(45290385-45290499)
chr8 (364-468)||(14824195-14824299)
chr8 (46-160)||(45289760-45289875)
chr8 (273-395)||(25657892-25658014)
chr8 (47-175)||(1485222-1485350)
chr8 (47-175)||(4484100-4484228)
chr8 (47-175)||(14408658-14408786)
chr8 (47-175)||(14824596-14824724)
chr8 (47-175)||(18677276-18677404)
chr8 (47-175)||(20045409-20045537)
chr8 (48-175)||(23914804-23914931)
chr8 (47-165)||(22252315-22252432)
chr8 (364-465)||(4483704-4483804)
chr8 (19-162)||(13660826-13660969)
chr8 (19-162)||(13719469-13719612)
chr8 (47-158)||(22002591-22002703)
chr8 (373-468)||(16401186-16401281)
chr8 (47-158)||(22245237-22245347)
chr8 (47-175)||(4541584-4541712)
chr8 (400-468)||(4542047-4542115)
chr8 (400-468)||(22002173-22002241)
chr8 (400-468)||(24485717-24485785)
chr8 (47-165)||(22385077-22385193)
chr8 (48-148)||(25733821-25733921)
chr8 (365-465)||(45290186-45290286)
chr8 (405-468)||(14397419-14397482)
chr8 (400-465)||(18677738-18677803)
chr8 (27-165)||(28398423-28398560)
chr8 (46-159)||(37516548-37516660)
chr8 (363-468)||(16198315-16198420)
chr8 (47-136)||(19928758-19928847)
chr8 (44-165)||(20501227-20501347)
chr8 (44-148)||(19154009-19154113)
chr8 (9-74)||(39834578-39834643)
chr8 (47-153)||(21330771-21330876)
chr8 (48-152)||(42265510-42265614)
chr8 (44-148)||(17438661-17438765)
chr8 (44-115)||(17460205-17460276)
chr8 (47-160)||(21999438-21999550)
chr8 (47-117)||(3273872-3273942)
chr8 (313-383)||(15320028-15320098)
chr8 (313-383)||(15500397-15500467)
chr8 (47-164)||(21966701-21966809)
chr8 (314-383)||(13663129-13663198)
chr8 (314-383)||(22007126-22007195)
chr8 (46-117)||(14396910-14396981)
chr8 (46-102)||(20457989-20458045)
chr8 (46-102)||(20463192-20463248)
chr8 (47-111)||(22317911-22317975)
chr8 (291-383)||(24717728-24717820)
chr8 (373-427)||(3844554-3844609)
chr8 (54-165)||(17085077-17085187)
chr8 (54-165)||(17085311-17085421)
chr8 (47-114)||(22005077-22005143)
chr8 (376-422)||(11360951-11360997)
chr8 (47-128)||(23661266-23661347)
chr8 (314-383)||(29759429-29759498)
chr8 (431-471)||(16412827-16412867)
chr8 (46-117)||(25483441-25483512)
chr8 (47-159)||(40492028-40492139)
chr8 (46-97)||(19807393-19807444)
chr8 (47-160)||(21979467-21979579)
chr8 (47-160)||(21982952-21983064)
chr8 (47-98)||(44522179-44522230)
chr8 (430-468)||(1326635-1326673)
chr8 (333-383)||(18611952-18612002)
chr8 (313-383)||(22089412-22089482)
chr8 (47-148)||(24353916-24354016)
chr8 (131-159)||(2418084-2418112)
chr8 (49-129)||(22984533-22984612)
chr8 (46-114)||(22996696-22996764)
chr8 (46-98)||(44474701-44474753)
[»] scaffold0322 (1 HSPs)
scaffold0322 (44-468)||(18358-18782)
[»] chr4 (115 HSPs)
chr4 (46-468)||(14970026-14970448)
chr4 (47-468)||(18214524-18214945)
chr4 (47-468)||(362794-363215)
chr4 (47-465)||(3515431-3515849)
chr4 (44-465)||(52872399-52872811)
chr4 (48-468)||(52313175-52313595)
chr4 (46-467)||(19617394-19617807)
chr4 (52-395)||(11773-12116)
chr4 (165-465)||(19858002-19858302)
chr4 (44-311)||(12778193-12778460)
chr4 (44-288)||(15489466-15489710)
chr4 (237-468)||(14746022-14746253)
chr4 (44-282)||(14745697-14745931)
chr4 (237-465)||(362604-362832)
chr4 (273-468)||(15495720-15495915)
chr4 (237-468)||(52312982-52313213)
chr4 (47-267)||(15354846-15355058)
chr4 (293-468)||(14185556-14185731)
chr4 (239-395)||(15534482-15534638)
chr4 (333-468)||(14745925-14746060)
chr4 (239-395)||(362481-362637)
chr4 (239-395)||(49547479-49547635)
chr4 (44-174)||(19858327-19858458)
chr4 (237-395)||(14970410-14970568)
chr4 (237-395)||(52872776-52872934)
chr4 (239-395)||(36038171-36038327)
chr4 (237-395)||(15118056-15118214)
chr4 (237-395)||(19243001-19243159)
chr4 (237-395)||(3515308-3515466)
chr4 (237-395)||(44772787-44772945)
chr4 (239-395)||(19617772-19617928)
chr4 (245-395)||(19857879-19858029)
chr4 (237-395)||(29267654-29267812)
chr4 (237-395)||(1837223-1837381)
chr4 (237-395)||(14746215-14746373)
chr4 (237-395)||(50222043-50222201)
chr4 (237-395)||(52312863-52313020)
chr4 (364-468)||(15117990-15118094)
chr4 (314-468)||(22725313-22725466)
chr4 (47-175)||(7640400-7640528)
chr4 (47-175)||(1836734-1836860)
chr4 (364-468)||(7640824-7640928)
chr4 (247-395)||(15495887-15496035)
chr4 (237-395)||(7640890-7641048)
chr4 (237-395)||(44615589-44615747)
chr4 (47-160)||(44616125-44616239)
chr4 (47-175)||(19243523-19243651)
chr4 (46-160)||(3485803-3485918)
chr4 (47-175)||(15117566-15117694)
chr4 (364-468)||(1837157-1837261)
chr4 (239-395)||(14048878-14049034)
chr4 (47-165)||(16043892-16044010)
chr4 (47-158)||(50221552-50221664)
chr4 (366-468)||(44772723-44772825)
chr4 (47-175)||(18238826-18238954)
chr4 (47-175)||(44772297-44772425)
chr4 (47-158)||(12032985-12033097)
chr4 (46-160)||(25031099-25031215)
chr4 (47-158)||(29268192-29268304)
chr4 (48-175)||(18022934-18023060)
chr4 (47-160)||(14873299-14873413)
chr4 (400-468)||(29267774-29267842)
chr4 (400-468)||(50222013-50222081)
chr4 (46-165)||(15792629-15792747)
chr4 (42-148)||(14651575-14651681)
chr4 (44-165)||(32306149-32306269)
chr4 (400-468)||(15534602-15534670)
chr4 (400-468)||(19243121-19243189)
chr4 (400-468)||(36038291-36038359)
chr4 (47-137)||(14717934-14718025)
chr4 (42-165)||(26049615-26049737)
chr4 (237-395)||(30147216-30147374)
chr4 (400-465)||(44615712-44615777)
chr4 (400-468)||(49547447-49547515)
chr4 (400-465)||(14049001-14049066)
chr4 (47-159)||(26014225-26014336)
chr4 (400-465)||(30147339-30147404)
chr4 (400-464)||(12033447-12033511)
chr4 (44-148)||(12841516-12841619)
chr4 (9-162)||(27996729-27996881)
chr4 (46-159)||(13591068-13591180)
chr4 (236-306)||(14185525-14185595)
chr4 (90-160)||(15011514-15011583)
chr4 (42-140)||(26790215-26790312)
chr4 (9-74)||(15191208-15191273)
chr4 (44-128)||(12611880-12611964)
chr4 (9-67)||(44928094-44928152)
chr4 (44-165)||(14852021-14852141)
chr4 (314-383)||(14995644-14995713)
chr4 (47-128)||(23802406-23802487)
chr4 (237-288)||(18214907-18214958)
chr4 (47-114)||(22354654-22354720)
chr4 (357-395)||(18214992-18215030)
chr4 (291-395)||(9198544-9198648)
chr4 (291-383)||(14951270-14951362)
chr4 (9-162)||(19739676-19739828)
chr4 (315-383)||(25120076-25120144)
chr4 (90-173)||(50161014-50161096)
chr4 (48-128)||(51463031-51463111)
chr4 (321-383)||(18293703-18293765)
chr4 (282-383)||(43281694-43281795)
chr4 (47-142)||(10057619-10057713)
chr4 (313-381)||(55377225-55377293)
chr4 (333-383)||(5683415-5683465)
chr4 (430-468)||(12778386-12778424)
chr4 (273-383)||(18247739-18247849)
chr4 (333-383)||(19698032-19698082)
chr4 (333-383)||(19708617-19708667)
chr4 (430-468)||(19858192-19858230)
chr4 (320-381)||(15287905-15287966)
chr4 (320-381)||(15295015-15295076)
chr4 (314-383)||(17146320-17146389)
chr4 (314-383)||(18168293-18168362)
chr4 (314-383)||(22355100-22355169)
chr4 (46-98)||(42596476-42596528)
[»] scaffold0716 (2 HSPs)
scaffold0716 (9-465)||(5118-5574)
scaffold0716 (237-395)||(4995-5153)
[»] scaffold0023 (6 HSPs)
scaffold0023 (9-468)||(16722-17181)
scaffold0023 (237-395)||(94711-94869)
scaffold0023 (237-395)||(17143-17301)
scaffold0023 (364-468)||(94831-94935)
scaffold0023 (47-175)||(95231-95359)
scaffold0023 (314-383)||(154892-154961)
[»] scaffold0574 (2 HSPs)
scaffold0574 (47-468)||(6872-7293)
scaffold0574 (237-395)||(6752-6910)
[»] chr5 (93 HSPs)
chr5 (46-468)||(2153951-2154373)
chr5 (44-468)||(17516287-17516712)
chr5 (48-468)||(32028446-32028866)
chr5 (48-468)||(20917168-20917588)
chr5 (44-468)||(29330403-29330818)
chr5 (47-468)||(295603-296016)
chr5 (179-468)||(20901373-20901662)
chr5 (246-468)||(17516683-17516905)
chr5 (237-468)||(32028059-32028291)
chr5 (237-458)||(32028263-32028484)
chr5 (237-468)||(32027866-32028097)
chr5 (44-171)||(24473792-24473919)
chr5 (237-395)||(295978-296136)
chr5 (239-395)||(17516869-17517025)
chr5 (244-395)||(20901631-20901782)
chr5 (237-395)||(2154335-2154493)
chr5 (237-395)||(20909312-20909470)
chr5 (245-395)||(20917558-20917708)
chr5 (237-395)||(32027746-32027904)
chr5 (237-395)||(264472-264630)
chr5 (237-395)||(29346280-29346438)
chr5 (237-393)||(29330285-29330441)
chr5 (244-395)||(37804613-37804764)
chr5 (244-395)||(39363685-39363836)
chr5 (237-391)||(10732644-10732798)
chr5 (237-395)||(29348753-29348911)
chr5 (237-395)||(29351226-29351384)
chr5 (237-395)||(42245069-42245227)
chr5 (244-395)||(38619737-38619888)
chr5 (237-395)||(23064814-23064972)
chr5 (237-395)||(39245436-39245594)
chr5 (364-465)||(20909435-20909536)
chr5 (364-468)||(264406-264510)
chr5 (364-465)||(39245559-39245660)
chr5 (364-468)||(23064934-23065038)
chr5 (364-468)||(29346400-29346504)
chr5 (364-468)||(29348873-29348977)
chr5 (364-468)||(29351346-29351450)
chr5 (47-175)||(38620256-38620384)
chr5 (364-465)||(39363808-39363908)
chr5 (47-175)||(39245956-39246084)
chr5 (47-175)||(39364204-39364332)
chr5 (47-158)||(29346817-29346929)
chr5 (47-158)||(29349290-29349402)
chr5 (47-158)||(29351763-29351875)
chr5 (47-158)||(42244576-42244688)
chr5 (47-158)||(20909850-20909963)
chr5 (47-158)||(263982-264094)
chr5 (47-152)||(23065358-23065464)
chr5 (364-465)||(38619860-38619960)
chr5 (365-468)||(42245004-42245107)
chr5 (273-395)||(9776659-9776781)
chr5 (400-465)||(10732614-10732679)
chr5 (47-158)||(10732151-10732263)
chr5 (47-148)||(41094818-41094919)
chr5 (45-159)||(15797281-15797395)
chr5 (42-165)||(23476337-23476461)
chr5 (47-148)||(14048939-14049040)
chr5 (46-98)||(20901325-20901377)
chr5 (42-165)||(23470626-23470749)
chr5 (46-152)||(40723459-40723566)
chr5 (51-165)||(25573581-25573694)
chr5 (47-148)||(41860581-41860682)
chr5 (52-165)||(25576010-25576122)
chr5 (46-159)||(26739796-26739908)
chr5 (400-465)||(37804576-37804641)
chr5 (19-118)||(21914464-21914563)
chr5 (52-159)||(26731989-26732095)
chr5 (46-128)||(22413056-22413138)
chr5 (52-165)||(25574817-25574929)
chr5 (47-114)||(10774664-10774731)
chr5 (47-114)||(40726666-40726732)
chr5 (47-117)||(21405628-21405698)
chr5 (273-383)||(22883903-22884013)
chr5 (314-383)||(1220384-1220453)
chr5 (314-383)||(10778832-10778901)
chr5 (46-148)||(31251891-31251992)
chr5 (313-383)||(27183208-27183278)
chr5 (273-383)||(43444008-43444118)
chr5 (51-111)||(17876191-17876251)
chr5 (47-154)||(36315390-36315496)
chr5 (273-383)||(11903-12013)
chr5 (47-97)||(18419453-18419503)
chr5 (273-383)||(25426177-25426287)
chr5 (47-148)||(31062195-31062293)
chr5 (320-381)||(7424879-7424940)
chr5 (314-383)||(11212734-11212803)
chr5 (44-129)||(20572731-20572815)
chr5 (314-383)||(21074249-21074318)
chr5 (315-383)||(11342190-11342258)
chr5 (315-383)||(23511127-23511195)
chr5 (47-118)||(25249828-25249900)
chr5 (47-118)||(25313612-25313684)
[»] chr7 (149 HSPs)
chr7 (44-468)||(14269081-14269505)
chr7 (54-468)||(15081169-15081583)
chr7 (44-465)||(8940899-8941319)
chr7 (47-468)||(16214105-16214526)
chr7 (48-467)||(21188926-21189336)
chr7 (47-409)||(38897549-38897910)
chr7 (44-395)||(8469036-8469387)
chr7 (48-395)||(11972849-11973196)
chr7 (47-465)||(14156392-14156817)
chr7 (44-266)||(45846762-45846984)
chr7 (237-465)||(8940707-8940934)
chr7 (237-468)||(14269467-14269698)
chr7 (46-207)||(23461632-23461793)
chr7 (47-220)||(14317516-14317688)
chr7 (47-186)||(5294432-5294571)
chr7 (47-186)||(5295605-5295744)
chr7 (47-186)||(5296778-5296917)
chr7 (314-465)||(45847242-45847393)
chr7 (47-178)||(9945010-9945141)
chr7 (47-370)||(10500735-10501064)
chr7 (237-427)||(10501097-10501288)
chr7 (237-412)||(25926833-25927008)
chr7 (237-412)||(1856933-1857107)
chr7 (237-395)||(16213985-16214143)
chr7 (237-395)||(15376417-15376575)
chr7 (237-395)||(16410359-16410517)
chr7 (237-395)||(20384827-20384985)
chr7 (239-395)||(11303548-11303704)
chr7 (237-412)||(13918106-13918282)
chr7 (239-395)||(23664658-23664814)
chr7 (239-391)||(29796915-29797067)
chr7 (239-391)||(29800734-29800886)
chr7 (237-427)||(14156782-14156969)
chr7 (237-395)||(14948826-14948984)
chr7 (237-403)||(15081545-15081711)
chr7 (237-395)||(24702529-24702687)
chr7 (237-395)||(24704976-24705134)
chr7 (237-395)||(27217161-27217319)
chr7 (47-175)||(26355194-26355321)
chr7 (47-175)||(26357646-26357773)
chr7 (237-395)||(456622-456780)
chr7 (237-395)||(14269660-14269818)
chr7 (237-395)||(26355685-26355843)
chr7 (237-395)||(26358137-26358295)
chr7 (237-395)||(32125791-32125949)
chr7 (239-395)||(16108394-16108550)
chr7 (244-395)||(13869649-13869800)
chr7 (237-395)||(16232821-16232979)
chr7 (237-395)||(41523218-41523376)
chr7 (237-395)||(41525680-41525838)
chr7 (237-395)||(8940580-8940742)
chr7 (47-175)||(11392516-11392642)
chr7 (364-468)||(15376351-15376455)
chr7 (364-468)||(16410479-16410583)
chr7 (364-468)||(20384761-20384865)
chr7 (244-395)||(21189306-21189457)
chr7 (237-391)||(18431016-18431170)
chr7 (237-395)||(18627866-18628024)
chr7 (237-395)||(18640572-18640730)
chr7 (364-468)||(18627986-18628090)
chr7 (364-468)||(18640692-18640796)
chr7 (364-468)||(26355619-26355723)
chr7 (364-468)||(26358071-26358175)
chr7 (364-468)||(27217281-27217385)
chr7 (47-175)||(27217682-27217809)
chr7 (246-427)||(17985097-17985279)
chr7 (47-175)||(457143-457271)
chr7 (47-175)||(15375927-15376055)
chr7 (47-175)||(20384337-20384465)
chr7 (364-468)||(456742-456846)
chr7 (364-468)||(16232941-16233045)
chr7 (320-450)||(11310193-11310323)
chr7 (364-465)||(13869772-13869872)
chr7 (47-175)||(13870166-13870294)
chr7 (47-175)||(16410880-16411008)
chr7 (47-175)||(18431533-18431661)
chr7 (364-467)||(11392937-11393040)
chr7 (47-175)||(16233342-16233471)
chr7 (237-395)||(45847358-45847516)
chr7 (47-175)||(18628386-18628514)
chr7 (48-175)||(16460036-16460163)
chr7 (47-158)||(41523756-41523868)
chr7 (47-160)||(32126325-32126439)
chr7 (47-175)||(18641092-18641220)
chr7 (50-158)||(41526218-41526327)
chr7 (291-395)||(11393044-11393148)
chr7 (47-158)||(14948333-14948445)
chr7 (48-175)||(16580541-16580668)
chr7 (400-471)||(18431129-18431200)
chr7 (400-468)||(13918076-13918144)
chr7 (400-468)||(25926803-25926871)
chr7 (400-468)||(32125911-32125979)
chr7 (400-468)||(41523338-41523406)
chr7 (400-468)||(41525800-41525868)
chr7 (400-468)||(14948796-14948864)
chr7 (400-468)||(24702649-24702717)
chr7 (400-468)||(24705096-24705164)
chr7 (304-395)||(13841355-13841446)
chr7 (56-175)||(20484900-20485018)
chr7 (47-137)||(24703081-24703172)
chr7 (47-137)||(24705528-24705619)
chr7 (50-165)||(38519616-38519732)
chr7 (400-465)||(11303671-11303736)
chr7 (400-465)||(16108362-16108427)
chr7 (44-165)||(16997027-16997147)
chr7 (48-153)||(20488282-20488387)
chr7 (44-159)||(14980667-14980781)
chr7 (44-159)||(15410143-15410257)
chr7 (400-468)||(23664626-23664694)
chr7 (400-468)||(29797031-29797099)
chr7 (400-468)||(29800850-29800918)
chr7 (42-165)||(129938-130059)
chr7 (400-467)||(10501067-10501134)
chr7 (47-165)||(42462806-42462923)
chr7 (400-464)||(1856903-1856967)
chr7 (48-160)||(14259334-14259445)
chr7 (46-159)||(9724801-9724913)
chr7 (47-173)||(13893374-13893498)
chr7 (9-162)||(15203116-15203268)
chr7 (44-128)||(18455587-18455671)
chr7 (48-162)||(32302163-32302278)
chr7 (44-159)||(9176832-9176946)
chr7 (47-148)||(15095637-15095738)
chr7 (48-160)||(14928290-14928402)
chr7 (48-160)||(15351756-15351868)
chr7 (47-114)||(19485973-19486039)
chr7 (47-148)||(8135238-8135338)
chr7 (46-132)||(11768089-11768174)
chr7 (233-306)||(23461791-23461864)
chr7 (47-117)||(1856401-1856471)
chr7 (47-118)||(11054694-11054765)
chr7 (44-142)||(11085478-11085575)
chr7 (47-117)||(13648263-13648333)
chr7 (47-117)||(13917573-13917643)
chr7 (47-153)||(15140159-15140265)
chr7 (47-97)||(42374305-42374355)
chr7 (236-321)||(11310130-11310214)
chr7 (48-97)||(25926301-25926350)
chr7 (315-383)||(32495092-32495160)
chr7 (44-128)||(37793389-37793473)
chr7 (61-140)||(9032530-9032608)
chr7 (47-157)||(15623961-15624070)
chr7 (320-383)||(15951640-15951703)
chr7 (313-383)||(11286976-11287046)
chr7 (314-383)||(125965-126034)
chr7 (314-383)||(15760779-15760848)
chr7 (315-383)||(1937828-1937896)
chr7 (46-74)||(17052761-17052789)
chr7 (47-95)||(33060442-33060490)
[»] chr6 (140 HSPs)
chr6 (47-468)||(31629861-31630282)
chr6 (9-387)||(34963682-34964060)
chr6 (46-465)||(30676038-30676448)
chr6 (9-395)||(23992723-23993109)
chr6 (46-465)||(19005575-19005991)
chr6 (48-465)||(1598673-1599082)
chr6 (44-465)||(18914549-18914969)
chr6 (44-395)||(25535708-25536060)
chr6 (123-465)||(19847368-19847710)
chr6 (44-253)||(17027861-17028070)
chr6 (244-468)||(8834-9058)
chr6 (237-468)||(1598477-1598708)
chr6 (237-468)||(26924151-26924382)
chr6 (244-437)||(1875-2068)
chr6 (44-202)||(25689320-25689478)
chr6 (237-464)||(25688927-25689154)
chr6 (47-201)||(16198293-16198447)
chr6 (237-465)||(18914356-18914584)
chr6 (273-465)||(25689119-25689311)
chr6 (44-185)||(25721009-25721150)
chr6 (291-468)||(25737063-25737240)
chr6 (308-468)||(22981321-22981481)
chr6 (308-468)||(23806927-23807087)
chr6 (246-439)||(85-278)
chr6 (9-152)||(25753385-25753528)
chr6 (9-152)||(25755555-25755698)
chr6 (237-395)||(1598357-1598515)
chr6 (237-395)||(23415265-23415423)
chr6 (239-395)||(28289042-28289198)
chr6 (237-412)||(27557006-27557181)
chr6 (237-395)||(18334296-18334454)
chr6 (237-395)||(24422847-24423005)
chr6 (237-395)||(26924344-26924502)
chr6 (237-395)||(33862094-33862252)
chr6 (237-395)||(33864578-33864736)
chr6 (237-395)||(19005452-19005610)
chr6 (237-395)||(30676413-30676571)
chr6 (47-175)||(8055851-8055978)
chr6 (237-395)||(1540615-1540773)
chr6 (237-395)||(2290884-2291042)
chr6 (237-395)||(12742618-12742776)
chr6 (47-175)||(22783048-22783176)
chr6 (237-395)||(8055330-8055488)
chr6 (237-395)||(18914233-18914391)
chr6 (237-395)||(31630244-31630402)
chr6 (47-160)||(17882710-17882823)
chr6 (364-468)||(18334230-18334334)
chr6 (364-468)||(24422967-24423071)
chr6 (237-393)||(25688805-25688961)
chr6 (364-468)||(33864698-33864802)
chr6 (262-395)||(17377576-17377709)
chr6 (237-395)||(19847675-19847829)
chr6 (364-468)||(2290818-2290922)
chr6 (364-468)||(26924085-26924189)
chr6 (237-395)||(19858626-19858781)
chr6 (237-395)||(22782527-22782685)
chr6 (47-175)||(18333806-18333934)
chr6 (47-175)||(19858136-19858264)
chr6 (47-175)||(24423367-24423495)
chr6 (47-175)||(26923659-26923787)
chr6 (47-175)||(33865098-33865226)
chr6 (364-468)||(8055450-8055554)
chr6 (364-468)||(22782647-22782751)
chr6 (47-175)||(2290392-2290520)
chr6 (47-158)||(33862633-33862745)
chr6 (47-152)||(18343033-18343139)
chr6 (47-158)||(12743156-12743268)
chr6 (239-395)||(12942502-12942646)
chr6 (237-356)||(15892112-15892231)
chr6 (47-165)||(17229064-17229181)
chr6 (48-175)||(2077125-2077251)
chr6 (47-160)||(1540125-1540239)
chr6 (239-337)||(17883203-17883301)
chr6 (47-160)||(18454067-18454179)
chr6 (400-468)||(23415385-23415453)
chr6 (400-468)||(33862214-33862282)
chr6 (400-465)||(19858596-19858661)
chr6 (400-465)||(27557146-27557211)
chr6 (400-468)||(12742738-12742806)
chr6 (400-468)||(17883171-17883239)
chr6 (47-162)||(20137513-20137626)
chr6 (47-162)||(22195243-22195356)
chr6 (400-465)||(12942613-12942678)
chr6 (404-465)||(15892086-15892147)
chr6 (400-468)||(1540585-1540653)
chr6 (44-160)||(23527297-23527413)
chr6 (46-148)||(13612330-13612432)
chr6 (46-108)||(19003468-19003530)
chr6 (9-159)||(22375762-22375911)
chr6 (47-173)||(25739249-25739373)
chr6 (400-465)||(28289010-28289075)
chr6 (44-148)||(18697382-18697485)
chr6 (46-165)||(19363301-19363416)
chr6 (48-160)||(19772667-19772779)
chr6 (237-310)||(25737028-25737101)
chr6 (44-148)||(18707133-18707236)
chr6 (44-148)||(23077574-23077678)
chr6 (46-148)||(19401045-19401147)
chr6 (46-159)||(18895485-18895594)
chr6 (46-128)||(14978542-14978624)
chr6 (46-128)||(25618899-25618981)
chr6 (48-160)||(22806678-22806790)
chr6 (31-142)||(16246176-16246286)
chr6 (47-114)||(8226740-8226806)
chr6 (47-162)||(20183657-20183772)
chr6 (47-162)||(22152219-22152334)
chr6 (47-114)||(23531896-23531962)
chr6 (237-302)||(9020-9085)
chr6 (44-137)||(35012023-35012116)
chr6 (9-65)||(23658123-23658178)
chr6 (360-395)||(15875702-15875737)
chr6 (313-383)||(16240296-16240366)
chr6 (313-383)||(16556984-16557054)
chr6 (313-383)||(16633540-16633610)
chr6 (313-383)||(16650214-16650284)
chr6 (47-97)||(17201080-17201130)
chr6 (19-117)||(18259146-18259243)
chr6 (46-128)||(20556033-20556115)
chr6 (44-94)||(23415906-23415956)
chr6 (430-468)||(34963794-34963832)
chr6 (313-383)||(35016043-35016113)
chr6 (48-160)||(15704565-15704677)
chr6 (315-383)||(19984160-19984228)
chr6 (313-383)||(22226608-22226679)
chr6 (237-280)||(22981443-22981486)
chr6 (46-137)||(23539792-23539883)
chr6 (237-280)||(23806922-23806965)
chr6 (313-383)||(25904474-25904545)
chr6 (47-97)||(20733244-20733294)
chr6 (430-468)||(25535828-25535866)
chr6 (273-383)||(27654596-27654706)
chr6 (314-383)||(1555527-1555596)
chr6 (314-383)||(16826408-16826477)
chr6 (314-383)||(21776136-21776205)
chr6 (314-383)||(33315116-33315185)
chr6 (433-465)||(1871-1903)
chr6 (433-465)||(8830-8862)
chr6 (47-99)||(18459306-18459358)
chr6 (46-117)||(27557644-27557715)
chr6 (46-98)||(28709568-28709620)
[»] scaffold0001 (6 HSPs)
scaffold0001 (47-468)||(501485-501906)
scaffold0001 (238-395)||(501366-501522)
scaffold0001 (46-165)||(447348-447466)
scaffold0001 (47-165)||(498258-498375)
scaffold0001 (9-162)||(498996-499148)
scaffold0001 (47-114)||(152111-152177)
[»] chr1 (88 HSPs)
chr1 (47-465)||(29298665-29299083)
chr1 (44-465)||(16274570-16274994)
chr1 (57-468)||(22122344-22122756)
chr1 (47-395)||(22050350-22050698)
chr1 (47-395)||(9044518-9044866)
chr1 (48-468)||(31612979-31613389)
chr1 (46-468)||(15859316-15859750)
chr1 (48-393)||(40129387-40129732)
chr1 (44-328)||(43543269-43543548)
chr1 (165-465)||(29777164-29777465)
chr1 (160-465)||(16401345-16401651)
chr1 (48-213)||(41230941-41231106)
chr1 (239-464)||(31612790-31613015)
chr1 (273-465)||(27161133-27161325)
chr1 (48-191)||(22122168-22122311)
chr1 (237-403)||(31612658-31612824)
chr1 (239-395)||(27161292-27161448)
chr1 (237-395)||(29777041-29777199)
chr1 (237-395)||(13989166-13989324)
chr1 (237-395)||(13227164-13227322)
chr1 (237-395)||(21922995-21923153)
chr1 (237-393)||(21841069-21841225)
chr1 (160-288)||(43630215-43630343)
chr1 (245-395)||(16274967-16275118)
chr1 (237-395)||(15859712-15859870)
chr1 (237-395)||(22122718-22122876)
chr1 (237-395)||(29535352-29535510)
chr1 (237-395)||(16362219-16362377)
chr1 (237-395)||(21474790-21474948)
chr1 (238-387)||(29298550-29298699)
chr1 (364-468)||(13989286-13989390)
chr1 (46-137)||(46560040-46560131)
chr1 (333-464)||(10812612-10812743)
chr1 (244-395)||(23593444-23593595)
chr1 (46-160)||(51083112-51083227)
chr1 (46-175)||(14237654-14237783)
chr1 (47-175)||(13989686-13989814)
chr1 (364-468)||(21474724-21474828)
chr1 (47-175)||(21474298-21474426)
chr1 (47-152)||(41373316-41373422)
chr1 (47-175)||(16362740-16362868)
chr1 (47-158)||(21922503-21922615)
chr1 (47-158)||(23592944-23593056)
chr1 (47-158)||(21841607-21841719)
chr1 (47-165)||(21042505-21042622)
chr1 (47-148)||(48444341-48444443)
chr1 (400-468)||(13227284-13227352)
chr1 (400-468)||(16362339-16362407)
chr1 (400-468)||(21841187-21841255)
chr1 (400-468)||(21922965-21923033)
chr1 (42-165)||(22125133-22125255)
chr1 (400-465)||(29535475-29535540)
chr1 (42-165)||(20958963-20959086)
chr1 (47-152)||(22350663-22350768)
chr1 (46-159)||(48521353-48521464)
chr1 (400-464)||(41372896-41372960)
chr1 (46-165)||(47191436-47191554)
chr1 (44-94)||(42314748-42314798)
chr1 (365-462)||(23593372-23593469)
chr1 (45-153)||(16381981-16382089)
chr1 (46-152)||(20453635-20453742)
chr1 (47-117)||(51476975-51477045)
chr1 (44-165)||(52940024-52940144)
chr1 (46-118)||(21708130-21708202)
chr1 (46-118)||(21712673-21712745)
chr1 (14-74)||(28193622-28193682)
chr1 (42-129)||(14801360-14801447)
chr1 (42-129)||(14810234-14810321)
chr1 (46-128)||(13880537-13880619)
chr1 (44-86)||(34770621-34770663)
chr1 (46-151)||(11946388-11946493)
chr1 (9-65)||(38056635-38056690)
chr1 (46-153)||(21342938-21343044)
chr1 (46-153)||(21347803-21347909)
chr1 (46-137)||(21683858-21683949)
chr1 (46-97)||(22130025-22130076)
chr1 (9-67)||(20846394-20846452)
chr1 (313-383)||(21858592-21858662)
chr1 (430-468)||(43543322-43543360)
chr1 (46-111)||(44822020-44822085)
chr1 (47-142)||(21995664-21995758)
chr1 (315-383)||(44035860-44035928)
chr1 (47-118)||(7320594-7320665)
chr1 (47-154)||(14294728-14294834)
chr1 (47-94)||(45574020-45574067)
chr1 (86-148)||(45755470-45755532)
chr1 (47-154)||(51131402-51131508)
chr1 (237-306)||(10812709-10812778)
[»] scaffold0317 (2 HSPs)
scaffold0317 (44-468)||(6254-6677)
scaffold0317 (237-395)||(6639-6797)
[»] scaffold0040 (7 HSPs)
scaffold0040 (57-465)||(43163-43570)
scaffold0040 (44-231)||(20502-20689)
scaffold0040 (237-395)||(43040-43198)
scaffold0040 (47-175)||(13033-13161)
scaffold0040 (291-395)||(13384-13488)
scaffold0040 (47-159)||(23059-23168)
scaffold0040 (52-139)||(14221-14307)
[»] scaffold1792 (3 HSPs)
scaffold1792 (44-465)||(791-1203)
scaffold1792 (320-460)||(636-776)
scaffold1792 (244-395)||(508-659)
[»] scaffold0278 (3 HSPs)
scaffold0278 (47-471)||(8350-8774)
scaffold0278 (237-468)||(8160-8391)
scaffold0278 (239-395)||(8040-8196)
[»] scaffold1296 (2 HSPs)
scaffold1296 (44-465)||(1678-2099)
scaffold1296 (237-316)||(1634-1713)
[»] scaffold0306 (4 HSPs)
scaffold0306 (44-468)||(10657-11081)
scaffold0306 (157-450)||(15351-15643)
scaffold0306 (237-395)||(11043-11201)
scaffold0306 (276-395)||(15223-15342)
[»] scaffold0230 (8 HSPs)
scaffold0230 (44-465)||(22697-23109)
scaffold0230 (44-287)||(20521-20764)
scaffold0230 (320-460)||(23124-23264)
scaffold0230 (244-395)||(23241-23392)
scaffold0230 (237-395)||(14248-14406)
scaffold0230 (47-158)||(14786-14898)
scaffold0230 (400-465)||(14371-14436)
scaffold0230 (430-468)||(20714-20752)
[»] scaffold0494 (2 HSPs)
scaffold0494 (12-395)||(1-385)
scaffold0494 (430-465)||(227-262)
[»] scaffold0043 (5 HSPs)
scaffold0043 (44-465)||(10408-10829)
scaffold0043 (246-466)||(10214-10434)
scaffold0043 (239-395)||(10092-10248)
scaffold0043 (46-160)||(27916-28030)
scaffold0043 (46-160)||(42774-42888)
[»] scaffold0149 (3 HSPs)
scaffold0149 (126-468)||(30440-30782)
scaffold0149 (46-231)||(34154-34339)
scaffold0149 (244-395)||(30320-30471)
[»] scaffold0747 (3 HSPs)
scaffold0747 (44-373)||(1225-1553)
scaffold0747 (254-466)||(1012-1224)
scaffold0747 (237-395)||(890-1048)
[»] scaffold0021 (1 HSPs)
scaffold0021 (44-317)||(398-671)
[»] scaffold0035 (4 HSPs)
scaffold0035 (47-253)||(107111-107317)
scaffold0035 (47-134)||(115731-115818)
scaffold0035 (315-383)||(110106-110174)
scaffold0035 (315-383)||(118607-118675)
[»] scaffold0535 (1 HSPs)
scaffold0535 (46-254)||(7419-7627)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (48-250)||(60575-60777)
[»] scaffold0042 (3 HSPs)
scaffold0042 (48-238)||(43169-43359)
scaffold0042 (237-318)||(75608-75689)
scaffold0042 (427-465)||(75605-75643)
[»] scaffold0711 (4 HSPs)
scaffold0711 (44-229)||(6894-7079)
scaffold0711 (238-465)||(7395-7621)
scaffold0711 (237-468)||(7201-7431)
scaffold0711 (308-468)||(7079-7239)
[»] scaffold0741 (4 HSPs)
scaffold0741 (237-468)||(3813-4044)
scaffold0741 (237-468)||(3620-3851)
scaffold0741 (237-395)||(4006-4164)
scaffold0741 (351-468)||(3541-3658)
[»] scaffold0074 (3 HSPs)
scaffold0074 (139-384)||(38261-38506)
scaffold0074 (47-162)||(9044-9159)
scaffold0074 (47-142)||(1896-1990)
[»] scaffold0151 (4 HSPs)
scaffold0151 (277-461)||(36749-36933)
scaffold0151 (291-445)||(36956-37110)
scaffold0151 (44-188)||(36596-36740)
scaffold0151 (47-153)||(31055-31160)
[»] scaffold0191 (1 HSPs)
scaffold0191 (46-185)||(3524-3663)
[»] scaffold0016 (3 HSPs)
scaffold0016 (48-180)||(184978-185110)
scaffold0016 (44-148)||(118752-118854)
scaffold0016 (47-114)||(172109-172175)
[»] scaffold0138 (2 HSPs)
scaffold0138 (239-395)||(33472-33628)
scaffold0138 (400-468)||(33592-33660)
[»] scaffold0051 (3 HSPs)
scaffold0051 (237-412)||(31487-31662)
scaffold0051 (400-468)||(31624-31692)
scaffold0051 (46-117)||(32124-32195)
[»] scaffold0200 (3 HSPs)
scaffold0200 (239-412)||(17937-18110)
scaffold0200 (400-468)||(18074-18142)
scaffold0200 (46-117)||(18575-18646)
[»] scaffold0695 (3 HSPs)
scaffold0695 (237-395)||(6247-6405)
scaffold0695 (47-175)||(6765-6893)
scaffold0695 (400-468)||(6367-6435)
[»] scaffold0422 (2 HSPs)
scaffold0422 (239-395)||(3324-3480)
scaffold0422 (400-465)||(3447-3512)
[»] scaffold0019 (3 HSPs)
scaffold0019 (44-163)||(21898-22017)
scaffold0019 (47-158)||(158621-158733)
scaffold0019 (48-160)||(30010-30122)
[»] scaffold0444 (3 HSPs)
scaffold0444 (237-395)||(13693-13851)
scaffold0444 (363-468)||(13813-13918)
scaffold0444 (47-158)||(14230-14342)
[»] scaffold0319 (1 HSPs)
scaffold0319 (46-164)||(6046-6164)
[»] scaffold0134 (3 HSPs)
scaffold0134 (237-395)||(38122-38280)
scaffold0134 (364-468)||(38242-38346)
scaffold0134 (47-175)||(38642-38770)
[»] scaffold0117 (4 HSPs)
scaffold0117 (237-395)||(39633-39791)
scaffold0117 (404-468)||(39753-39817)
scaffold0117 (46-114)||(40218-40285)
scaffold0117 (46-117)||(42653-42724)
[»] scaffold0363 (3 HSPs)
scaffold0363 (237-393)||(9544-9700)
scaffold0363 (47-158)||(10082-10194)
scaffold0363 (400-468)||(9662-9730)
[»] scaffold0293 (3 HSPs)
scaffold0293 (237-412)||(19792-19967)
scaffold0293 (400-468)||(19762-19830)
scaffold0293 (48-117)||(19301-19370)
[»] scaffold0044 (4 HSPs)
scaffold0044 (237-395)||(40700-40858)
scaffold0044 (363-468)||(40820-40925)
scaffold0044 (47-158)||(41236-41348)
scaffold0044 (313-395)||(37848-37929)
[»] scaffold0254 (4 HSPs)
scaffold0254 (237-395)||(21048-21207)
scaffold0254 (47-160)||(21585-21699)
scaffold0254 (47-151)||(19116-19221)
scaffold0254 (400-468)||(21168-21237)
[»] scaffold0064 (2 HSPs)
scaffold0064 (237-395)||(68262-68420)
scaffold0064 (400-465)||(68385-68450)
[»] scaffold0436 (2 HSPs)
scaffold0436 (237-410)||(8304-8477)
scaffold0436 (400-468)||(8439-8507)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (47-175)||(2918-3044)
[»] scaffold0029 (3 HSPs)
scaffold0029 (239-395)||(11590-11746)
scaffold0029 (47-175)||(12110-12238)
scaffold0029 (400-465)||(11713-11778)
[»] scaffold0028 (16 HSPs)
scaffold0028 (237-395)||(134511-134669)
scaffold0028 (47-160)||(135047-135161)
scaffold0028 (237-395)||(136980-137138)
scaffold0028 (47-160)||(137516-137630)
scaffold0028 (237-395)||(139449-139607)
scaffold0028 (47-160)||(139985-140099)
scaffold0028 (237-395)||(141918-142076)
scaffold0028 (47-160)||(142454-142568)
scaffold0028 (237-395)||(144387-144545)
scaffold0028 (47-160)||(144923-145037)
scaffold0028 (400-465)||(134634-134699)
scaffold0028 (400-465)||(137103-137168)
scaffold0028 (400-465)||(139572-139637)
scaffold0028 (400-465)||(142041-142106)
scaffold0028 (400-465)||(144510-144575)
scaffold0028 (48-152)||(3053-3157)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (47-158)||(56220-56332)
[»] scaffold1427 (1 HSPs)
scaffold1427 (293-395)||(1729-1831)
[»] scaffold0063 (1 HSPs)
scaffold0063 (47-175)||(38952-39080)
[»] scaffold0022 (2 HSPs)
scaffold0022 (274-395)||(53612-53733)
scaffold0022 (122-159)||(128172-128209)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (160-427)||(113284-113550)
[»] scaffold0146 (1 HSPs)
scaffold0146 (46-175)||(22909-23039)
[»] scaffold0546 (1 HSPs)
scaffold0546 (46-160)||(7871-7986)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (46-160)||(5321-5436)
scaffold0109 (46-160)||(18-133)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (42-165)||(191793-191915)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (47-148)||(16284-16385)
[»] scaffold0454 (3 HSPs)
scaffold0454 (47-158)||(419-531)
scaffold0454 (400-464)||(1-65)
scaffold0454 (326-393)||(11075-11142)
[»] scaffold0323 (1 HSPs)
scaffold0323 (48-135)||(11828-11915)
[»] scaffold0500 (1 HSPs)
scaffold0500 (42-148)||(8346-8452)
[»] scaffold0232 (1 HSPs)
scaffold0232 (54-175)||(4150-4270)
[»] scaffold0480 (1 HSPs)
scaffold0480 (47-162)||(10273-10387)
[»] scaffold0780 (1 HSPs)
scaffold0780 (46-159)||(2470-2583)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (44-165)||(220331-220449)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (42-148)||(165611-165717)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (48-165)||(7144-7260)
scaffold0010 (42-165)||(1492-1614)
[»] scaffold0357 (1 HSPs)
scaffold0357 (44-148)||(4816-4920)
[»] scaffold0059 (2 HSPs)
scaffold0059 (312-395)||(57782-57865)
scaffold0059 (47-99)||(49729-49781)
[»] scaffold0145 (1 HSPs)
scaffold0145 (47-140)||(8127-8221)
[»] scaffold0686 (2 HSPs)
scaffold0686 (44-148)||(2131-2235)
scaffold0686 (314-383)||(6970-7039)
[»] scaffold0481 (1 HSPs)
scaffold0481 (47-123)||(2-78)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (44-148)||(97898-98002)
scaffold0006 (44-148)||(107176-107280)
[»] scaffold1835 (1 HSPs)
scaffold1835 (44-165)||(142-262)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (27-159)||(12095-12227)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (47-157)||(17335-17444)
[»] scaffold0180 (3 HSPs)
scaffold0180 (46-148)||(33668-33770)
scaffold0180 (46-152)||(28328-28434)
scaffold0180 (46-111)||(31369-31434)
[»] scaffold0091 (1 HSPs)
scaffold0091 (59-165)||(31648-31752)
[»] scaffold0007 (3 HSPs)
scaffold0007 (47-152)||(158822-158927)
scaffold0007 (47-116)||(160278-160347)
scaffold0007 (47-148)||(163557-163656)
[»] scaffold0169 (1 HSPs)
scaffold0169 (44-165)||(28693-28812)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (48-160)||(120893-121005)
scaffold0034 (313-383)||(79003-79073)
[»] scaffold1419 (1 HSPs)
scaffold1419 (45-153)||(903-1010)
[»] scaffold0379 (2 HSPs)
scaffold0379 (9-159)||(3855-4006)
scaffold0379 (9-159)||(13849-14000)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (47-123)||(33837-33913)
[»] scaffold0054 (1 HSPs)
scaffold0054 (46-158)||(75024-75134)
[»] scaffold0417 (1 HSPs)
scaffold0417 (42-165)||(464-586)
[»] scaffold0394 (2 HSPs)
scaffold0394 (46-128)||(13019-13101)
scaffold0394 (47-99)||(7514-7566)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (9-67)||(23640-23698)
[»] scaffold0083 (1 HSPs)
scaffold0083 (46-128)||(42266-42348)
[»] scaffold0046 (2 HSPs)
scaffold0046 (47-165)||(16085-16203)
scaffold0046 (47-165)||(25272-25390)
[»] scaffold0290 (1 HSPs)
scaffold0290 (44-129)||(1042-1127)
[»] scaffold0065 (1 HSPs)
scaffold0065 (9-153)||(55888-56031)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (32-114)||(5351-5433)
[»] scaffold0452 (1 HSPs)
scaffold0452 (90-160)||(12666-12735)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (273-383)||(725-835)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (51-153)||(18857-18958)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (90-160)||(22037-22106)
[»] scaffold0292 (1 HSPs)
scaffold0292 (48-148)||(7506-7606)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (48-160)||(30593-30705)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (44-129)||(1048-1133)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (48-160)||(21634-21746)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (47-111)||(476-540)
[»] scaffold0914 (1 HSPs)
scaffold0914 (46-129)||(2614-2697)
[»] scaffold0439 (1 HSPs)
scaffold0439 (47-148)||(12345-12446)
[»] scaffold0338 (2 HSPs)
scaffold0338 (19-153)||(10734-10867)
scaffold0338 (313-383)||(8566-8636)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (47-118)||(8623-8694)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (46-129)||(23123-23206)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (46-129)||(72399-72482)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (47-153)||(333183-333289)
[»] scaffold1128 (1 HSPs)
scaffold1128 (46-151)||(445-550)
[»] scaffold0347 (1 HSPs)
scaffold0347 (46-153)||(9747-9854)
[»] scaffold0308 (1 HSPs)
scaffold0308 (47-153)||(13386-13492)
[»] scaffold0107 (3 HSPs)
scaffold0107 (313-383)||(30470-30540)
scaffold0107 (47-85)||(51328-51366)
scaffold0107 (46-74)||(13551-13579)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (19-97)||(68299-68377)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (47-164)||(209804-209912)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (46-132)||(37282-37367)
scaffold0011 (90-153)||(126737-126799)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (47-152)||(135504-135609)
[»] scaffold0877 (1 HSPs)
scaffold0877 (46-115)||(2027-2096)
[»] scaffold0848 (1 HSPs)
scaffold0848 (9-148)||(1982-2122)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (44-165)||(54809-54929)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (47-128)||(82967-83048)
scaffold0037 (44-148)||(81518-81622)
[»] scaffold0114 (1 HSPs)
scaffold0114 (351-395)||(28142-28186)
[»] scaffold0959 (1 HSPs)
scaffold0959 (308-395)||(1219-1306)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (31-173)||(4093-4233)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (46-159)||(58677-58786)
[»] scaffold1404 (1 HSPs)
scaffold1404 (314-412)||(1347-1444)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (313-383)||(6235-6305)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (47-152)||(35464-35569)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (47-128)||(1045-1126)
[»] scaffold0577 (1 HSPs)
scaffold0577 (47-151)||(9008-9111)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (9-65)||(13983-14038)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (315-383)||(32148-32216)
[»] scaffold0153 (2 HSPs)
scaffold0153 (47-142)||(5255-5349)
scaffold0153 (47-142)||(12275-12369)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (315-383)||(40628-40696)
[»] scaffold0457 (1 HSPs)
scaffold0457 (47-98)||(10898-10949)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (312-383)||(12519-12590)
[»] scaffold0251 (1 HSPs)
scaffold0251 (47-118)||(20086-20157)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (46-113)||(22163-22229)
scaffold0026 (46-96)||(10103-10153)
[»] scaffold0301 (2 HSPs)
scaffold0301 (47-97)||(11322-11372)
scaffold0301 (47-97)||(15722-15772)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (321-383)||(28469-28531)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (47-117)||(4012-4082)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (313-383)||(19939-20009)
[»] scaffold0853 (1 HSPs)
scaffold0853 (104-165)||(9-68)
[»] scaffold0750 (1 HSPs)
scaffold0750 (46-159)||(4479-4590)
[»] scaffold0315 (1 HSPs)
scaffold0315 (314-383)||(18205-18274)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (46-99)||(32048-32101)
[»] scaffold0081 (1 HSPs)
scaffold0081 (44-157)||(4001-4111)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (19-148)||(22471-22599)
[»] scaffold1800 (1 HSPs)
scaffold1800 (47-99)||(607-659)
[»] scaffold1102 (1 HSPs)
scaffold1102 (47-99)||(1951-2003)
[»] scaffold0679 (1 HSPs)
scaffold0679 (46-98)||(1583-1635)
[»] scaffold0269 (1 HSPs)
scaffold0269 (321-381)||(15780-15840)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 367; Significance: 0; HSPs: 144)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 367; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 46823141 - 46822687
Alignment:
Q  9 gagatgaaccaagaggaaaggttgccgatcgttaatcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtattta 108  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  46823141 gagaagaaccaagaggaaaggctgccgatcgttaatcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaatcgtattta 46823042  T
Q  109 acatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaattagggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgct 208  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46823041 acatgttgtaggtttagtttttgagaatttgagaattagggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgct 46822942  T
Q  209 ttttctaatttttcttttcatctctgccccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggt 308  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  46822941 ttttctgatttttcttttcatctgtgccccgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacataattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggt 46822842  T
Q  309 atggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaattttta 408  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  46822841 atggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttataaaacttgagttatcgtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaattttta 46822742  T
Q  409 tgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggta 463  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  46822741 tgaatttcagcacaactttgtccgattttgaaatgaaaagtggtattgattggta 46822687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 48 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 41124780 - 41124360
Alignment:
Q  48 aaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaattag 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41124780 aaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaggtttagtttttgagaatttgagaattag 41124681  T
Q  148 ggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctaatttttcttttcatctctgccccgaatctgaa 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  41124680 ggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgtttttttttatttttctttttatctctgccccgaatttgaa 41124581  T
Q  248 atgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaa 347  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41124580 atgaaaactggtattgattggtaaagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaa 41124481  T
Q  348 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaa 447  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41124480 aacgatttatagaacttgagttatgatcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatgtgaaatgaaaa 41124381  T
Q  448 ctgatattgattggtacagaa 468  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  41124380 ctggtattgattggtacagaa 41124360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 44 - 468
Target Start/End: Original strand, 20629509 - 20629933
Alignment:
Q  44 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaa 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20629509 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatattgtaggtttagtttttgagaatttgagaa 20629608  T
Q  144 ttagggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctaatttttcttttcatctctgccccgaatc 243  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  20629609 ttagggttatgagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatt 20629708  T
Q  244 tgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacg 343  Q
    |||||||||| ||||||||||| | | | ||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  20629709 tgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttataggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgaca 20629808  T
Q  344 tcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatg 443  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20629809 ttaaagcgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatg 20629908  T
Q  444 aaaactgatattgattggtacagaa 468  Q
    ||||||  |||||||||||||||||    
T  20629909 aaaacttgtattgattggtacagaa 20629933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 48 - 468
Target Start/End: Original strand, 38961158 - 38961579
Alignment:
Q  48 aaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagttttt-gagaatttgagaatta 146  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38961158 aaggtaagggtgagactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaggtttagttttttgagaatttgagaatta 38961257  T
Q  147 gggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctaatttttcttttcatctctgccccgaatctga 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  38961258 gggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatatatgttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttga 38961357  T
Q  247 aatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtca 346  Q
    |||||||  |||||||||| | |   ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  38961358 aatgaaatatggtattgataggtcaagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtca 38961457  T
Q  347 aaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38961458 aaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattgctgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaa 38961557  T
Q  447 actgatattgattggtacagaa 468  Q
    |||| ||||||||| |||||||    
T  38961558 actggtattgattgatacagaa 38961579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 44 - 468
Target Start/End: Original strand, 55318621 - 55319045
Alignment:
Q  44 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaa 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55318621 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaa 55318720  T
Q  144 ttagggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctaatttttcttttcatctctgccccgaatc 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||     
T  55318721 ttagggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttattttttctgatttttcttttcatctctgccccaaatt 55318820  T
Q  244 tgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacg 343  Q
    |||||||||| ||||||||||| | | | ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||     
T  55318821 tgaaatgaaatctggtattgataggtccagaactggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatggtagctttctaatgccgttggtatgaca 55318920  T
Q  344 tcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatg 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  55318921 tcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcgcagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccaaatttgaaatg 55319020  T
Q  444 aaaactgatattgattggtacagaa 468  Q
    |||| || |||||||||||||||||    
T  55319021 aaaattggtattgattggtacagaa 55319045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 48 - 468
Target Start/End: Original strand, 16282079 - 16282499
Alignment:
Q  48 aaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaattag 147  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16282079 aaggtaagggtgagactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaatatgttgtaggtttagtttttgagaatttgagaattag 16282178  T
Q  148 ggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctaatttttcttttcatctctgccccgaatctgaa 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  16282179 ggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttaaa 16282278  T
Q  248 atgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaa 347  Q
    |||||| ||||||||||| | |   ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| |||||| |||||    
T  16282279 atgaaatctggtattgataggtcaagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatagatgttatctttttaatgttgttagtctgatgtcaa 16282378  T
Q  348 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaa 447  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16282379 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaa 16282478  T
Q  448 ctgatattgattggtacagaa 468  Q
    ||  |||||||||||||||||    
T  16282479 ctagtattgattggtacagaa 16282499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 48 - 468
Target Start/End: Original strand, 17444084 - 17444505
Alignment:
Q  48 aaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaattag 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17444084 aaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaatatgttgtaggtttagtttttgagaatttaagaattag 17444183  T
Q  148 ggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttcta-atttttcttttcatctctgccccgaatctga 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17444184 ggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatatgggttgctttttttttatttttcttttcatctctgccccgaatttga 17444283  T
Q  247 aatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtca 346  Q
    ||||||| ||||||||||| | | | ||||||||||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17444284 aatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacaggaaagttgtaagtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctaacgtca 17444383  T
Q  347 aaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaa 446  Q
    |||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17444384 aaacaatttatacaacttgagctatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaa 17444483  T
Q  447 actgatattgattggtacagaa 468  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  17444484 actggtattgattggtacagaa 17444505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 48 - 463
Target Start/End: Original strand, 13937295 - 13937709
Alignment:
Q  48 aaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaattag 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13937295 aaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaggtttagtttttgagaatttgagaattag 13937394  T
Q  148 ggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctaatttttcttttcatctctgccccgaatctgaa 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  13937395 ggttaagagtgatgattgtgatgattttggatgaaagtgaagttgaataatataggttgc-ttttctgatttttcttttcatctttgccctgaatttgaa 13937493  T
Q  248 atgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaa 347  Q
    |||||| ||||||||||| |     ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13937494 atgaaatctggtattgataggacaagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaa 13937593  T
Q  348 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaa 447  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13937594 aacgatttatagaacttgtgttatggtcaaattactgcacgtaggccacggtgaatttttatgaattttagcacaactttgtccgaatttgaaataaaaa 13937693  T
Q  448 ctgatattgattggta 463  Q
    ||| ||||||||||||    
T  13937694 ctggtattgattggta 13937709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 9 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 10380019 - 10379628
Alignment:
Q  9 gagatgaaccaagaggaaaggttgccgatcgttaatcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtattta 108  Q
    |||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10380019 gagaagaaccaagaggaaaggctgtcgatcgttaatcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtattta 10379920  T
Q  109 acatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaattagggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgct 208  Q
    | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  10379919 atatgttgtagatttagtttttgagaatttgagaattagggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttttt 10379820  T
Q  209 tt-----ttctaatttttcttttcatctctgccccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttg 303  Q
    ||     |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  10379819 ttttttcttctgatttttcttttcatctctgccccgaatatgaaataaaaactggtattgattgatacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttg 10379720  T
Q  304 taggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10379719 taggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 10379628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 44 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 24514328 - 24513981
Alignment:
Q  44 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaa 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  24514328 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaggtttagtttttgagaatttgataa 24514229  T
Q  144 ttagggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctaatttttcttttcatctctgccccgaatc 243  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  24514228 ttaggattaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataagttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatt 24514129  T
Q  244 tgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacg 343  Q
    |||||||||| ||||||||||| | | | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24514128 tgaaatgaaatctggtattgatagctccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacg 24514029  T
Q  344 tcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtag 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24514028 tcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtag 24513981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 139 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 8500270 - 8499944
Alignment:
Q  139 gagaattagggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctaatttttcttttcatctctgcccc 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  8500270 gagaattagggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctcttcccc 8500171  T
Q  239 gaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtc 338  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  8500170 gaatttgaaataaaaactggtattgatcgatatagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatagatgttagctttctaatgccgttggtc 8500071  T
Q  339 tgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttg 438  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8500070 tgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaagttactgcacgtaggtcacagtgtatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttg 8499971  T
Q  439 aaatgaaaactgatattgattggtaca 465  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||    
T  8499970 aaatgaaaactggtattgattggtaca 8499944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 139 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 27166002 - 27165673
Alignment:
Q  139 gagaattagggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctaatttttcttttcatctctgcccc 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27166002 gagaattagggttaagagtgatgattgtgatgattttgaataaaagtgaagttgaatagtatagattgctttttctaatttttcttttcatctctgcccc 27165903  T
Q  239 gaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtc 338  Q
    |||| |||||| |||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||    
T  27165902 gaatttgaaataaaaactagtattgatcggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgtatgttagctttctaatgccgttggtc 27165803  T
Q  339 tgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttg 438  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  27165802 tgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcaacacaactttgtccgattttg 27165703  T
Q  439 aaatgaaaactgatattgattggtacagaa 468  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27165702 aaatgaaaactggtattgattggtacagaa 27165673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 142 - 468
Target Start/End: Original strand, 53300919 - 53301245
Alignment:
Q  142 aattagggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctaatttttcttttcatctctgccccgaa 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  53300919 aattagggttaagagtgatgattgtgatgattttgaataaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctttgccccgaa 53301018  T
Q  242 tctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctga 341  Q
    | |||||| |||||  |||||||| | |||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  53301019 tttgaaataaaaacaagtattgatcggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgtatgttagctttctaatgtcgttggtctga 53301118  T
Q  342 cgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaa 441  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  53301119 cgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacataggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgaccgaatttgaaa 53301218  T
Q  442 tgaaaactgatattgattggtacagaa 468  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||    
T  53301219 taaaaactggtattgattggtacagaa 53301245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 165 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 10557633 - 10557334
Alignment:
Q  165 gtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctaattttt-cttttcatctctgccccgaatctgaaatgaaaactggtattg 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||    
T  10557633 gtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttcttattttttcttttcatctctgccccgaatttgaaacgaaatatggtattg 10557534  T
Q  264 attgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaact 363  Q
    |||| ||| ||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10557533 attggtacagaattggtcttagttgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtcggacgtcaaaacgatttatagaact 10557434  T
Q  364 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggta 463  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10557433 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagaacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 10557334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 47 - 395
Target Start/End: Original strand, 12119185 - 12119515
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatta 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12119185 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaggtttagtttttgagaatttgagaatta 12119284  T
Q  147 gggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctaatttttcttttcatctctgccccgaatctga 246  Q
    |||||||||||||||||| |||         ||||||         |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12119285 gggttaagagtgatgattctga---------atgaaa---------aataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttga 12119366  T
Q  247 aatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtca 346  Q
    ||| |||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| |||| |||    
T  12119367 aataaaaactggtattgatcagtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttca 12119466  T
Q  347 aaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12119467 aaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtca 12119515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 48 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 8899664 - 8899418
Alignment:
Q  48 aaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaattag 147  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8899664 aaggtaagggtgagactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatataatatgttgtaggtttagtttttgagaatttgagaattag 8899565  T
Q  148 ggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctaatttttcttttcatctctgccccgaatctgaa 247  Q
    |||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8899564 ggttaagagtgatgatt---------ttgaatgaaagtgaagttgaataatatgggttgctttttctaatttttcttttcatctctgccccgaatttgaa 8899474  T
Q  248 atgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttg 303  Q
    |||||| ||||||||||| | | | ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  8899473 atgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttg 8899418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 273 - 468
Target Start/End: Original strand, 14567431 - 14567626
Alignment:
Q  273 gaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatg 372  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||     
T  14567431 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtctaacatcaaaaggatttatagaacttgagttata 14567530  T
Q  373 gtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaa 468  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  14567531 gtcaaattactacacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaacttttcccgaatttgaaatgaaaactggtattggtaggtacagaa 14567626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 293 - 468
Target Start/End: Original strand, 16358234 - 16358409
Alignment:
Q  293 cacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtagg 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  16358234 cacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaacggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcgcatagg 16358333  T
Q  393 tcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaa 468  Q
    ||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16358334 tcacattgaatttttatgaatttcagcacaattttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaa 16358409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 244 - 415
Target Start/End: Original strand, 55319014 - 55319185
Alignment:
Q  244 tgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacg 343  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  55319014 tgaaatgaaaattggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacg 55319113  T
Q  344 tcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaattt 415  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  55319114 tcaaaacgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaagtcacagtgaatttttatgaattt 55319185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 237 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 15465613 - 15465438
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | ||||    
T  15465613 ccgaatttgaaatgaaaattggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccattgg 15465514  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaa 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||||||    
T  15465513 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaaatcttatgaa 15465438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 282 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 36528569 - 36528383
Alignment:
Q  282 ttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaatta 381  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36528569 ttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacgtctaaatgaattatagaacttgagttatggtcaaatta 36528470  T
Q  382 ctgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaa 468  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  36528469 ctgcacgtaggtcatagtgaatatttatgaatttcagcacaacctttcccgaatttgaaatgaaaactggtattgataagtacagaa 36528383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 239 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 54521279 - 54521123
Alignment:
Q  239 gaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtc 338  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||     
T  54521279 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtgggtatggatgttagctttctaatgccgttggtt 54521180  T
Q  339 tgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54521179 tgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 54521123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 237 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 5223842 - 5223667
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | ||||    
T  5223842 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattcgtcttaggtgtaaacacgaaagttataggtatggatgttagctttctaatgccattgg 5223743  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaa 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||| | |||||||    
T  5223742 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgatcaaattactccacgtaggtcacagtgaaatcttatgaa 5223667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Original strand, 20629895 - 20630053
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  20629895 ccgaatttgaaatgaaaacttgtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 20629994  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20629995 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 20630053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 237 - 412
Target Start/End: Original strand, 26054968 - 26055143
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||    
T  26054968 ccgaatttgaaaggaaaattggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgcctttgg 26055067  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaa 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||| | |||||||    
T  26055068 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtaaaattactgcacgtaggtcacagtgaaatcttatgaa 26055143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 17463636 - 17463478
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||    
T  17463636 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 17463537  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17463536 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtca 17463478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 34159784 - 34159626
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||    
T  34159784 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 34159685  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34159684 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtca 34159626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 239 - 395
Target Start/End: Original strand, 29544547 - 29544703
Alignment:
Q  239 gaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtc 338  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||     
T  29544547 gaatttgaaatgaaaactgttattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtt 29544646  T
Q  339 tgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    |||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29544647 tgatttcaaaagaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 29544703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Original strand, 38961541 - 38961700
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaat-gtcgttg 335  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| | |||||    
T  38961541 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattgatacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagccttctaatggccgttg 38961640  T
Q  336 gtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38961641 gtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtca 38961700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 244 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 46822713 - 46822562
Alignment:
Q  244 tgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacg 343  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||   |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||     
T  46822713 tgaaatgaaaagtggtattgattggtaaacaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgact 46822614  T
Q  344 tcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46822613 tcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 46822562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 15977991 - 15977833
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||    
T  15977991 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 15977892  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| ||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15977891 tttgacttcaaaagaatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtca 15977833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Original strand, 28848325 - 28848483
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||    
T  28848325 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtactgaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 28848424  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28848425 tttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtca 28848483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 41124398 - 41124240
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||     
T  41124398 ccgaatgtgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttga 41124299  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  41124298 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattattgcacgtaggtca 41124240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Original strand, 53301207 - 53301365
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  53301207 ccgaatttgaaataaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatattagctttctaatgccgttgg 53301306  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  53301307 tttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtca 53301365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 337 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 15008054 - 15007923
Alignment:
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatt 436  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15008054 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatt 15007955  T
Q  437 tgaaatgaaa---actgatattgattggtaca 465  Q
    ||||||||||   |||| ||||||||||||||    
T  15007954 tgaaatgaaaagtactggtattgattggtaca 15007923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Original strand, 10247427 - 10247585
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||    
T  10247427 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 10247526  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| |||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  10247527 tttgacttcaaaatgatttatagaacttgatttatactcaaattactgcacgtaggtca 10247585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Original strand, 16282461 - 16282619
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| | ||||    
T  16282461 ccgaatttgaaatgaaaactagtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagatttctaatgccattgg 16282560  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16282561 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtca 16282619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Original strand, 17444467 - 17444625
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  17444467 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaagtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttgg 17444566  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  17444567 tttgacttcaaaaggatttattgaacttgagttatagtcaaatttttgcacgtaggtca 17444625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Original strand, 45606610 - 45606768
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||    
T  45606610 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 45606709  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  45606710 tttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaatgtaggtca 45606768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 237 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 12568018 - 12567862
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  12568018 ccgaatttgaaatgaaaactagtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttgg 12567919  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggt 393  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  12567918 tttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatagtcaaattacttcatgtaggt 12567862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 237 - 393
Target Start/End: Original strand, 13153959 - 13154115
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||  |||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| |||| |    
T  13153959 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcataggtgtaaacacgaaagttttaggtatgaatgttagctttctaatgccgttag 13154058  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggt 393  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13154059 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggt 13154115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 237 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 13544482 - 13544327
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  13544482 ccgaatttgaaatgaaaactagtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttgg 13544383  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggt 393  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  13544382 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaa-tactgcacgtaggt 13544327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 244 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 13436751 - 13436600
Alignment:
Q  244 tgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacg 343  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||     
T  13436751 tgaaatgaaaacttgtattgattggtacataattggtcttaggtataaatacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgact 13436652  T
Q  344 tcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13436651 tcaaaaggatttatagaacttgagttatggtccaattactgcacgtaggtca 13436600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 244 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 15412883 - 15412732
Alignment:
Q  244 tgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacg 343  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||||     
T  15412883 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgact 15412784  T
Q  344 tcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15412783 tcaaaaggatttatagaacttgatttatggtcaaattactgaacgtaggtca 15412732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 244 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 27165704 - 27165553
Alignment:
Q  244 tgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacg 343  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| || ||||     
T  27165704 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggggtaaacacgaaagttgtaggtatggatcttagctttctaatgccgttagtttgact 27165605  T
Q  344 tcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  27165604 tcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattactgaacgtaggtca 27165553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Original strand, 6468838 - 6468996
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||| ||||||    
T  6468838 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagctgtaaacacgaaagttggaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 6468937  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| ||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6468938 tttgacttcaaaagaatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtca 6468996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Original strand, 7781050 - 7781208
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  | |||| |||||||||| ||||||    
T  7781050 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtataaacgttagctttctaatgccgttgg 7781149  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  7781150 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacataggtca 7781208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 10557367 - 10557209
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |    
T  10557367 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtaaataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttag 10557268  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | | || |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  10557267 ttttacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcagattactgcacataggtca 10557209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 55476949 - 55476791
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||    
T  55476949 ccgaatttgaaattaaaactggtattgactggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 55476850  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  55476849 tttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtca 55476791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 9 - 152
Target Start/End: Original strand, 6468310 - 6468454
Alignment:
Q  9 gagatgaaccaagaggaaaggttgccgatcgttaatcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtattta 108  Q
    |||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||  |||||    
T  6468310 gagaagaaccaagaggaaatgttgtcgatcgttaatcttaaggtaagggtgggagtaacattcaataatcttaagtcattgattctgaaaattagattta 6468409  T
Q  109 acatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaattagggtta 152  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6468410 acatgttgtaggttttagtttttgagaatttgggaattagggtta 6468454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 237 - 393
Target Start/End: Original strand, 13151494 - 13151650
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||||||  |||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| |||| |    
T  13151494 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggaacagaattggtcataggtgtaaacacgaaagttttaggtatgaatgttagctttctaatgccgttag 13151593  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggt 393  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13151594 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggt 13151650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 364 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 17463702 - 17463598
Alignment:
Q  364 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggta 463  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17463702 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 17463603  T
Q  464 cagaa 468  Q
    |||||    
T  17463602 cagaa 17463598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 364 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 34159850 - 34159746
Alignment:
Q  364 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggta 463  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34159850 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 34159751  T
Q  464 cagaa 468  Q
    |||||    
T  34159750 cagaa 34159746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Original strand, 16453984 - 16454143
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||    
T  16453984 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 16454083  T
Q  337 tctgacgtcaaaa-cgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| ||||||  |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16454084 tttgacttcaaaatggatttatagaactatagttatagtcaaattactgcacgtaggtca 16454143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 8499979 - 8499821
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  8499979 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtagatatggaagttagctttctaatgccgttgg 8499880  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||    
T  8499879 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtgaaattacggaacataggtca 8499821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 25237302 - 25237144
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||| |||  |    
T  25237302 ccgaatttgaaatgaaaattggtattgattgatacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgttggtatgaatgttaggtttctaatgccgtgtg 25237203  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | | || |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25237202 tttaacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtca 25237144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 364 - 468
Target Start/End: Original strand, 6468772 - 6468876
Alignment:
Q  364 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggta 463  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6468772 tgagttatggtcaaattactgcacgtatgtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 6468871  T
Q  464 cagaa 468  Q
    |||||    
T  6468872 cagaa 6468876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 296 - 458
Target Start/End: Original strand, 3264323 - 3264485
Alignment:
Q  296 gaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||||| | ||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3264323 gaaagttgtaggtatggatgttagatttctaaggccgttgatttgacgtctaaatgaattatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtca 3264422  T
Q  396 aagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgat 458  Q
     || |||| |||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||| || |||||||    
T  3264423 cagtgaatatttatgaatttcagcacaacctttcctgaatttgaaatgaaaattggtattgat 3264485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 364 - 468
Target Start/End: Original strand, 13153893 - 13153997
Alignment:
Q  364 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggta 463  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13153893 tgagttaaggtcaaattactgcacataggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 13153992  T
Q  464 cagaa 468  Q
    |||||    
T  13153993 cagaa 13153997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 364 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 55477015 - 55476911
Alignment:
Q  364 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggta 463  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  55477015 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaattaaaactggtattgactggta 55476916  T
Q  464 cagaa 468  Q
    |||||    
T  55476915 cagaa 55476911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 47 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 37428667 - 37428549
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatta 146  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37428667 taaggtaagggtgggactaatattcaataatcctaagtcattgattctgaatattgtattcaacatgttgtaggtttagtttttgagaatttgagaatta 37428568  T
Q  147 gggttaagagtgatgattg 165  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  37428567 gggttaagagtgataattg 37428549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 367 - 468
Target Start/End: Original strand, 10247364 - 10247465
Alignment:
Q  367 gttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacag 466  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10247364 gttatggtcaaattactgcacggaggtcttagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacag 10247463  T
Q  467 aa 468  Q
    ||    
T  10247464 aa 10247465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 47 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 17464126 - 17463998
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  17464126 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttaagtcattgattctgaaaattggatttaacatgttgtaggttttagtttttgagaatttgggaatt 17464027  T
Q  146 agggttaagagtgatgattgtgatgatttt 175  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  17464026 agggttaaaagtgattatt-tgatgatttt 17463998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 47 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 34160274 - 34160146
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  34160274 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttaagtcattgattctgaaaattggatttaacatgttgtaggttttagtttttgagaatttgggaatt 34160175  T
Q  146 agggttaagagtgatgattgtgatgatttt 175  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  34160174 agggttaaaagtgattatt-tgatgatttt 34160146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 364 - 468
Target Start/End: Original strand, 13151428 - 13151532
Alignment:
Q  364 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggta 463  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  13151428 tgagttaaggtcaaattactgcacataggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggaa 13151527  T
Q  464 cagaa 468  Q
    |||||    
T  13151528 cagaa 13151532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 364 - 468
Target Start/End: Original strand, 45606544 - 45606648
Alignment:
Q  364 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggta 463  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45606544 tgagttaaggtcaaattactgcacataggtcaccgtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 45606643  T
Q  464 cagaa 468  Q
    |||||    
T  45606644 cagaa 45606648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 9 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 325168 - 325030
Alignment:
Q  9 gagatgaaccaagaggaaaggttgccgatcgttaatcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtattta 108  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| || |||||||||||| ||||  |||||    
T  325168 gagaagaaccaagaggaaaggctgccgatcgttaatcttaaggtaagggtgggactagcattcaatcttcttaagcctatgattctgataattagattta 325069  T
Q  109 acatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaattagg 148  Q
    |||||||| | |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  325068 acatgttggaggtttag-ttttgagaattggagaattagg 325030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 160 - 267
Target Start/End: Original strand, 45220313 - 45220420
Alignment:
Q  160 tgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctaatttttcttttcatctctgccccgaatctgaaatgaaaactggt 259  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||    
T  45220313 tgattatgatgattttgaatgaaagtgaagttaaataatataggttgctttttcttatttttcttttcatctctgcccagaatttgaaatgaaatatggt 45220412  T
Q  260 attgattg 267  Q
    ||||||||    
T  45220413 attgattg 45220420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 223 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 17393382 - 17393176
Alignment:
Q  223 ttttcatctctgcccc-gaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatct 321  Q
    |||||||||||||||| |||| | |||||||  ||  ||||||| | ||| ||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  17393382 ttttcatctctgcccccgaatttcaaatgaactcttctattgatcggtacagaattggtcttagatgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttacct 17393283  T
Q  322 ttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatg-aatttcagca 420  Q
    ||| |||| ||||||| ||||  ||||| ||||| |||||| | |||||| ||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  17393282 ttccaatggcgttggtttgactccaaaatgatttttagaacattagttatagtcaaattactacacataggtcatagtgaatttttatgaaatttcagca 17393183  T
Q  421 caacttt 427  Q
    |||||||    
T  17393182 caacttt 17393176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 237 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 25229715 - 25229569
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||| |||  |    
T  25229715 ccgaatttgaaatgaaaattggtattgattgatacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgttggtatgaatgttaggtttctaatgccgtgtg 25229616  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 383  Q
    | | || |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25229615 tttaacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattact 25229569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 47 - 175
Target Start/End: Original strand, 10246936 - 10247064
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||  ||||    
T  10246936 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttaagtcattgattctgaaaattggatttaacatgttgtaggttttagtttttgagaatttggaaatt 10247035  T
Q  146 agggttaagagtgatgattgtgatgatttt 175  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  10247036 agggttaaaagtgattatt-tgatgatttt 10247064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 364 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 15412955 - 15412855
Alignment:
Q  364 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggta 463  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15412955 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaa-ttgaaatgaaaactggtattgattggta 15412857  T
Q  464 ca 465  Q
    ||    
T  15412856 ca 15412855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 47 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 15978483 - 15978355
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||    
T  15978483 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttaagtcattgattctgaaaattggatttaacatgttgtaggttttcgtttttgagaatttgggaatt 15978384  T
Q  146 agggttaagagtgatgattgtgatgatttt 175  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  15978383 agggttaaaagtgattatt-tgatgatttt 15978355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 47 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 55477440 - 55477312
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  55477440 taaggtaagggtgagactaacattcaataatcttaagtcattgattctgaaaattggatttaacatgttgtaggttttagtttttgagaatttgggaatt 55477341  T
Q  146 agggttaagagtgatgattgtgatgatttt 175  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  55477340 agggttaaaagtgattatt-tgatgatttt 55477312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 47 - 158
Target Start/End: Original strand, 7780559 - 7780671
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||    
T  7780559 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttaagtcattgattctgaaaattggatttaacatgttgtaggttttcgtttttgagaatttgagaatt 7780658  T
Q  146 agggttaagagtg 158  Q
    |||||||| ||||    
T  7780659 agggttaaaagtg 7780671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 47 - 175
Target Start/End: Original strand, 45577655 - 45577783
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  45577655 taaggtaagggtgagactaacattcaataatcttaagtaattgattctgaaaattggatttaacatgttgtaggttttagtttttgagaatttgggaatt 45577754  T
Q  146 agggttaagagtgatgattgtgatgatttt 175  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  45577755 agggttaaaagtgattatt-tgatgatttt 45577783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 48 - 128
Target Start/End: Original strand, 13938301 - 13938381
Alignment:
Q  48 aaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagttt 128  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13938301 aaggtaagggtgggaataacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaggtttagttt 13938381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 47 - 158
Target Start/End: Original strand, 16453489 - 16453601
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||    
T  16453489 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttaagtcattgattctgaaaattggatttaatatgttgtaggttttcgtttttgagaatttgagaatt 16453588  T
Q  146 agggttaagagtg 158  Q
    |||||||| ||||    
T  16453589 agggttaaaagtg 16453601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 15413379 - 15413251
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  15413379 taaggtaagggtgggattaacattcaataatcttaagtcattgattctaaaaattggatttaacatgtggtaggttttagtttttgagaatttgggaatt 15413280  T
Q  146 agggttaagagtgatgattgtgatgatttt 175  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  15413279 agggttaaaagtgattatt-tgatgatttt 15413251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 158
Target Start/End: Original strand, 1864367 - 1864479
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  1864367 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttaagtcatcgattctggaaattggatttaacatgttgtaggttttagtttttgagaatttgggaatt 1864466  T
Q  146 agggttaagagtg 158  Q
    |||||||| ||||    
T  1864467 agggttaaaagtg 1864479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 158
Target Start/End: Original strand, 13151002 - 13151114
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  13151002 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttaagtcatcgattctgaaaattggatttaacatgttgtaggttttagtttttgagaatttgggaatt 13151101  T
Q  146 agggttaagagtg 158  Q
    | |||||| ||||    
T  13151102 aaggttaaaagtg 13151114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 158
Target Start/End: Original strand, 13153470 - 13153582
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  13153470 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttaagtcatcgattctgaaaattggatttaacatgttgtaggttttagtttttgagaatttgggaatt 13153569  T
Q  146 agggttaagagtg 158  Q
    | |||||| ||||    
T  13153570 aaggttaaaagtg 13153582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 48 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 14671832 - 14671706
Alignment:
Q  48 aaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaattag 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||| || |||||||||||||   ||||||||||||| |||||||    
T  14671832 aaggtaagggtgggactaacattcaataatcttaagtcattgattctgaaaattggattgaatatgttgtaagttttagttttgagaatttgggaattag 14671733  T
Q  148 ggttaagagtgatgattgtgatgatttt 175  Q
    |||||| | |||| ||| ||||||||||    
T  14671732 ggttaaaattgattatt-tgatgatttt 14671706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 47 - 160
Target Start/End: Original strand, 28847833 - 28847947
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||   |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||    
T  28847833 taaggtaagggtgggactaatattcaataatcttaagtcatcgattctgaaaattggatttaacatgttgtaggttttcgtttttgagaatttgggaatt 28847932  T
Q  146 agggttaagagtgat 160  Q
    |||||||| ||||||    
T  28847933 agggttaaaagtgat 28847947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 400 - 468
Target Start/End: Original strand, 7781020 - 7781088
Alignment:
Q  400 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaa 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7781020 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaa 7781088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 400 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 12305611 - 12305543
Alignment:
Q  400 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaa 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12305611 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtcagaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaa 12305543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 14604947 - 14604801
Alignment:
Q  14 gaaccaagaggaaaggttgccgatcgttaatcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatg 113  Q
    |||||||||| | ||| |||| |||  ||||  |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| ||    
T  14604947 gaaccaagagaataggctgccaatcaataattctaaggtaagggtgggactaatattcaattatcttaagtcattgattctgaaaattgtatttaacttg 14604848  T
Q  114 ttgtaagtttagtttttgagaatttgagaattagggttaagagtgatga 162  Q
    |||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  14604847 ttgtagctttag-ttttgagaatttg-gaattagggttaaaagtgatga 14604801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 400 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 15978021 - 15977953
Alignment:
Q  400 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaa 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15978021 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaa 15977953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 403 - 468
Target Start/End: Original strand, 16453957 - 16454022
Alignment:
Q  403 tttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaa 468  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16453957 tttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaa 16454022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 400 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 5223872 - 5223804
Alignment:
Q  400 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaa 468  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5223872 gaatttttatgaatttcagaacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaa 5223804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 400 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 15465643 - 15465575
Alignment:
Q  400 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaa 468  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  15465643 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaattggtattgattggtacagaa 15465575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 400 - 464
Target Start/End: Original strand, 28848295 - 28848359
Alignment:
Q  400 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtac 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28848295 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtac 28848359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 400 - 468
Target Start/End: Original strand, 29544515 - 29544583
Alignment:
Q  400 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaa 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29544515 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtcagaatttgaaatgaaaactgttattgattggtacagaa 29544583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 44 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 9578600 - 9578480
Alignment:
Q  44 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||  |||  ||||||||||||||| | ||||||||| |||||| || ||    
T  9578600 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaatcttcttaagcctatgattctgatgattagatttaacatgttgtagggttagttttttagaattgga-aa 9578502  T
Q  144 ttagggttaagagtgatgattg 165  Q
    |||||||| |||||||| ||||    
T  9578501 ttagggtttagagtgataattg 9578480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 46752196 - 46752053
Alignment:
Q  9 gagatgaaccaagaggaaaggttgccgatcgttaatcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtattta 108  Q
    |||| ||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| | |||||||| |||||| |||||    
T  46752196 gagaagaaccaagaagagaggctgccgatcgttaatcctaaggtaagggtgggactaaccttcaataattctgagtatgtgattctg-aaattgaattta 46752098  T
Q  109 acat-gttgtaagtttagtttttgagaatttgagaattagggttaa 153  Q
    |||| |||||| ||| |  |||| || |||||||||||||||||||    
T  46752097 acatggttgtaggttaaagtttt-aggatttgagaattagggttaa 46752053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 400 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 54521311 - 54521243
Alignment:
Q  400 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaa 468  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  54521311 gaatttttatggatttcagcacaactttgtcagaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaa 54521243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 401 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 25229744 - 25229677
Alignment:
Q  401 aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaa 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||    
T  25229744 aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaattggtattgattgatacagaa 25229677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 401 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 25237331 - 25237264
Alignment:
Q  401 aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaa 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||    
T  25237331 aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaattggtattgattgatacagaa 25237264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 325 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 12305516 - 12305446
Alignment:
Q  325 taatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    ||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12305516 taatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 12305446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 46 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 12386382 - 12386280
Alignment:
Q  46 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||| |||   |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  12386382 ttaaggtaagggtgggactagcattcaattctattaagtctatgattttgatggttgtatttaacacgttgtaggattagtttttgagaatttgagaatt 12386283  T
Q  146 agg 148  Q
    |||    
T  12386282 agg 12386280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 363 - 465
Target Start/End: Original strand, 26054901 - 26055003
Alignment:
Q  363 ttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggt 462  Q
    |||||||||| | ||| |||| || | |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  26054901 ttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaaggaaaattggtattgattggt 26055000  T
Q  463 aca 465  Q
    |||    
T  26055001 aca 26055003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 400 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 13436788 - 13436723
Alignment:
Q  400 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtaca 465  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  13436788 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgagtttgaaatgaaaacttgtattgattggtaca 13436723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 47 - 173
Target Start/End: Original strand, 16828281 - 16828405
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagttttt-gagaatttgagaat 144  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||  || | |||||||||| ||||||||||||||    
T  16828281 taaggtaagggtgggactatcattcagtgatcttaagtctatgattctg-aaattggatttaacatgt--taggttttagtttttggagaatttgagaat 16828377  T
Q  145 tagggttaagagtgatgattgtgatgatt 173  Q
    ||||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  16828378 tagggttaaaagtgataatt-tgatgatt 16828405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 236 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 36528422 - 36528337
Alignment:
Q  236 cccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatct 321  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36528422 cccgaatttgaaatgaaaactggtattgataagtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttatct 36528337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 48 - 160
Target Start/End: Original strand, 22758835 - 22758947
Alignment:
Q  48 aaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatga-ttctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatta 146  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||  | ||| | | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  22758835 aaggtaagggtgagactaaccttcaataattctaagtgttttaattctgaaaattgtatttaacatgttgtaggtttag-ttttgaggatttgggaatta 22758933  T
Q  147 gggttaagagtgat 160  Q
    ||||||| ||||||    
T  22758934 gggttaaaagtgat 22758947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 47 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 44495588 - 44495488
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatta 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||| ||||  ||||||||| ||| | |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  44495588 taaggtaagggtgggactaacattcaatcttcttaagtctatgattatgataattagatttaacatattggaggtttag-ttttgagaattggagaatta 44495490  T
Q  147 gg 148  Q
    ||    
T  44495489 gg 44495488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 237 - 324
Target Start/End: Original strand, 16358371 - 16358458
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttc 324  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||| ||||||| ||| ||| ||||||| |||||    
T  16358371 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacatgaaagttttagatatagatgttagctttc 16358458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 47 - 165
Target Start/End: Original strand, 32402182 - 32402300
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatta 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||  | | |||||||  |||  ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||  ||||||    
T  32402182 taaggtaagggtgggactaacattcaattctcttaagcttgtaattctgatgattagatttaacatgtcgtaggtttagtttttgaggattttggaatta 32402281  T
Q  147 gggttaagagtgatgattg 165  Q
    || ||||||||||| ||||    
T  32402282 ggcttaagagtgataattg 32402300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 237 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 15007961 - 15007868
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaa---ctggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaa 327  Q
    |||||| |||||||||||   ||||||||||||| |||  ||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  15007961 ccgaatttgaaatgaaaagtactggtattgattggtacaaaattggttttaggtgtaaacacgaaagttataggtatggatgttagctttctaa 15007868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 90 - 160
Target Start/End: Original strand, 43888799 - 43888868
Alignment:
Q  90 attctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaattagggttaagagtgat 160  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  43888799 attctgaaaatggtatttaacatgttgtaggtttag-ttttgaggatttgggaattagggttaaaagtgat 43888868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 48 - 160
Target Start/End: Original strand, 18699431 - 18699543
Alignment:
Q  48 aaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatga-ttctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatta 146  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||  | ||| | | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||  |||||    
T  18699431 aaggtaagggtgggactagccttcaataattctaagtgttttaattctgaaaattgtatttaacatgttgtaggtttagttttaaag-atttggaaatta 18699529  T
Q  147 gggttaagagtgat 160  Q
    ||||||| ||||||    
T  18699530 gggttaaaagtgat 18699543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 314 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 25058367 - 25058286
Alignment:
Q  314 tgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| ||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||    
T  25058367 tgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattactacacataggtca 25058286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 43928058 - 43927957
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatta 146  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||  | || ||||| | |||||||   |||||||||||| |||||| | |||||| ||||||||||||||||||    
T  43928058 taaggtaagggtgagactagcattcaatcttattaagtctgtaattctgatggttgtatttaacaagttgtaggattagttattgagaatttgagaatta 43927959  T
Q  147 gg 148  Q
    ||    
T  43927958 gg 43927957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 44 - 116
Target Start/End: Original strand, 24152383 - 24152455
Alignment:
Q  44 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || | || |||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  24152383 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaatcttcctaagcctatgattctgataattagatttaacatgttg 24152455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 11202276 - 11202205
Alignment:
Q  44 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgtt 115  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  11202276 tcttaaggtaagggtgagactagcattcaatcttcttaagtctatgattctgataattagatttaacatgtt 11202205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 114
Target Start/End: Original strand, 22146768 - 22146834
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  22146768 taaggtaagggtgggactaacattcaatcttcttaagcctatgattctg-aaattggatttaacatgt 22146834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 114
Target Start/End: Original strand, 37641504 - 37641570
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  37641504 taaggtaagggtgggactaacattcaatcttcttaagcctatgattctg-aaattggatttaacatgt 37641570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 148
Target Start/End: Original strand, 49968858 - 49968960
Alignment:
Q  46 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtt-tagtttttgagaatttgagaat 144  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||| ||||  | ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||  || ||| ||||||||||||| ||||    
T  49968858 ttaaggtaagagtgggactaaccttcactaattctaagtgtatgattctgaaaattgaatttaacaggttgtagcttgtag-ttttgagaatttgggaat 49968956  T
Q  145 tagg 148  Q
    ||||    
T  49968957 tagg 49968960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 313 - 383
Target Start/End: Original strand, 51158683 - 51158753
Alignment:
Q  313 atgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 383  Q
    |||||| |||||||||| | ||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  51158683 atgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 51158753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 314 - 383
Target Start/End: Original strand, 16934851 - 16934920
Alignment:
Q  314 tgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 383  Q
    ||||| |||||||||| | ||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  16934851 tgttagctttctaatggccttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 16934920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 314 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 49231837 - 49231768
Alignment:
Q  314 tgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 383  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| ||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  49231837 tgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 49231768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 117
Target Start/End: Original strand, 26054434 - 26054505
Alignment:
Q  46 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgt-atttaacatgttgt 117  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || ||||||||||| || |||| ||||||||||||||    
T  26054434 ttaaggtaagggtgagactaacattcaatattcttaagcctatgattctg-aatttgtgatttaacatgttgt 26054505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 95
Target Start/End: Original strand, 45606140 - 45606188
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  45606140 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttaagtcattgattctg 45606188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 46 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 5224375 - 5224324
Alignment:
Q  46 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaa 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||    
T  5224375 ttaaggtaagggtgggactaacattcaatcttcttaagcctatgattctgaa 5224324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 47 - 114
Target Start/End: Original strand, 8927555 - 8927621
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgt 114  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  8927555 taaggtaagggtgggactatcattcagtaatcttaagtttataattctg-aaattggatttaacatgt 8927621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 425 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 12568023 - 12567980
Alignment:
Q  425 tttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaa 468  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  12568023 tttgtccgaatttgaaatgaaaactagtattgattggtacagaa 12567980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 425 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 13544487 - 13544444
Alignment:
Q  425 tttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaa 468  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  13544487 tttgtccgaatttgaaatgaaaactagtattgattggtacagaa 13544444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 239 - 321
Target Start/End: Original strand, 3264459 - 3264541
Alignment:
Q  239 gaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatct 321  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||   ||  |||||| |||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3264459 gaatttgaaatgaaaattggtattgataagtatagaattgatcttaggtgtcttcacgaaagttgtaggtatggatgttatct 3264541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 90 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 12470852 - 12470783
Alignment:
Q  90 attctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaattagggttaagagtgat 160  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || |||||| ||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  12470852 attctgaaaattgtatttaccatgttttaggtttag-ttttgaagatttgggaattagggttaaaagtgat 12470783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 113
Target Start/End: Original strand, 13522202 - 13522267
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatg 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  |||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  13522202 taaggtaagggtgggactagcattcaatcttcttaagcctatgattctg-aaattgaatttaacatg 13522267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 50243864 - 50243782
Alignment:
Q  46 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagttt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||| || || ||||||| | ||||  ||||||||||||| | |||||||||    
T  50243864 ttaaggtaagggtgagactaacattcaatcttcttaagcctgtgattctcataattagatttaacatgttggaggtttagttt 50243782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 239 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 12305579 - 12305530
Alignment:
Q  239 gaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtg 288  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  12305579 gaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaattggtcttaggtg 12305530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 296 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 21026183 - 21026083
Alignment:
Q  296 gaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||| | ||| |||| || ||| |  ||| ||||||||||| ||||| |||||||| | |||||    
T  21026183 gaaagttgtaggtatggatgttagatttctaatggctttgttttgaagtcataatgatgttcagatcttgagttatgatcaaaatactgcacatgggtca 21026084  T
Q  396 a 396  Q
    |    
T  21026083 a 21026083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 113
Target Start/End: Original strand, 6804891 - 6804957
Alignment:
Q  46 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatg 113  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||| | |||||||| |||||| ||||||||||    
T  6804891 ttaaggtaagggtgagactaaccttcaataattctgagtatgtgattctg-aaattgaatttaacatg 6804957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 58 - 117
Target Start/End: Original strand, 45530613 - 45530672
Alignment:
Q  58 tgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgt 117  Q
    ||||||||||||| ||||||  | ||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  45530613 tgggactaacatttaataattctaagtatatgattctgaaaattgaatttaacaggttgt 45530672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 314 - 381
Target Start/End: Original strand, 54039167 - 54039234
Alignment:
Q  314 tgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaatta 381  Q
    ||||| |||||||||| | ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||    
T  54039167 tgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgatcaaatta 54039234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 50 - 153
Target Start/End: Original strand, 11885560 - 11885663
Alignment:
Q  50 ggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtct-atgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtt-tagtttttgagaatttgagaattag 147  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||  | ||| | || ||||||||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||  | |||||||||||||||    
T  11885560 ggtaagggtgggactaactttctctaattctaagtgttataattctgaaaattggatttaacaagttgtaggttgtagttt--gggaatttgagaattag 11885657  T
Q  148 ggttaa 153  Q
    ||||||    
T  11885658 ggttaa 11885663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 125 - 175
Target Start/End: Original strand, 45606198 - 45606247
Alignment:
Q  125 gtttttgagaatttgagaattagggttaagagtgatgattgtgatgatttt 175  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  45606198 gtttttgagaatttgggaattagggttaaaagtgattatt-tgatgatttt 45606247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 46 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 5842927 - 5842875
Alignment:
Q  46 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaa 98  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| | ||||| |||||||||    
T  5842927 ttaaggtaagggtgagactatcattcaatgatcttaaatctataattctgaaa 5842875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 351 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 14263672 - 14263640
Alignment:
Q  351 gatttatagaacttgagttatggtcaaattact 383  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14263672 gatttctagaacttgagttatggtcaaattact 14263640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 46 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 16645013 - 16644985
Alignment:
Q  46 ttaaggtaagggtgggactaacattcaat 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16645013 ttaaggtaagggtgggactaacattcaat 16644985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 44 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 21838428 - 21838376
Alignment:
Q  44 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctga 96  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| | |||||||    
T  21838428 tcttaaggtaagggtgagactagcattcaattatattgagtctgtaattctga 21838376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 47 - 99
Target Start/End: Original strand, 50350816 - 50350868
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  50350816 taaggtaagggtgggactaaccttctttaatcatgagtatataattctgaaaa 50350868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 47 - 142
Target Start/End: Original strand, 52988858 - 52988952
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacat-gttgtaagtttagtttttgagaatttgaga 142  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||| | |||||||||| | || ||||||||| |||||| ||| || |||| |||||||||||    
T  52988858 taaggtaagggtgagactaaccttcaataattctgagtatgtgattctgaaga-tgaatttaacatggttgtaggttgaggtttt-agaatttgaga 52988952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 366; Significance: 0; HSPs: 132)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 465
Target Start/End: Original strand, 32214212 - 32214669
Alignment:
Q  9 gagatgaaccaagaggaaaggttgccgatcgttaatcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtattta 108  Q
    |||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32214212 gagaagaaccaagaggaaaggctgccaatcgttaatcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtattta 32214311  T
Q  109 acatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaattagggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgct 208  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32214312 acatgttgtaggtttagtttttgagaatttgagaattagggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatatagattgct 32214411  T
Q  209 ttttctaatttttcttttcatctctgccccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggt 308  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32214412 ttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttaaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggt 32214511  T
Q  309 atggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcga-attttt 407  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| || ||  |||||    
T  32214512 atggatgttagctttctaatgccgttgctctgacgtcaaaacaatttatagaacttaagttatggtcaaattacagcacgtaggtcacagtgattttttt 32214611  T
Q  408 atgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtaca 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32214612 atgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtaca 32214669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 47 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 22106307 - 22105886
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatta 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22106307 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaggtttagtttttgagaatttgagaatta 22106208  T
Q  147 gggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctaatttttcttttcatctctgccccgaatctga 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  22106207 gggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttattttcatctctgccccgaatttga 22106108  T
Q  247 aatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtca 346  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  22106107 aatgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgatgtca 22106008  T
Q  347 aaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaa 446  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22106007 aaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaa 22105908  T
Q  447 actgatattgattggtacagaa 468  Q
    |||| ||||||||||| |||||    
T  22105907 actggtattgattggtgcagaa 22105886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 48 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 6726888 - 6726471
Alignment:
Q  48 aaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaattag 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6726888 aaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaggtttagtttttgagaatttgagaattag 6726789  T
Q  148 ggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctaatttttcttttcatctctgccccgaatctgaa 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6726788 ggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaattgaagttgaaaaatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaa 6726689  T
Q  248 atgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaa 347  Q
    |||||| ||  ||||||| | |   ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  6726688 atgaaatctcatattgataggtcaagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaa 6726589  T
Q  348 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaa 447  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6726588 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaa 6726489  T
Q  448 ctgatattgattggtaca 465  Q
    ||| ||||||||| ||||    
T  6726488 ctggtattgattgataca 6726471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 44 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 23932305 - 23931884
Alignment:
Q  44 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaa 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23932305 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaggtttagtttttgagaatttgagaa 23932206  T
Q  144 ttagggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctaatttttcttttcatctctgccccgaatc 243  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||     
T  23932205 ttagggttaatagtgatgattttgatgagtttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccctgaatt 23932106  T
Q  244 tgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacg 343  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  23932105 tgaaatgaaagctggtattgattggtatagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatttcgttggtctgacg 23932006  T
Q  344 tcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatg 443  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23932005 tcaaaacgatttatagaactttagttatggtcaatttacttcacttaggtcacagtgtatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatg 23931906  T
Q  444 aaaactgatattgattggtaca 465  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  23931905 aaaactggtattgattggtaca 23931884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 47 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 24918982 - 24918561
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatta 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24918982 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattctatttaccatgttgtaggtttagtttttgagaatttgagaatta 24918883  T
Q  147 gggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctaatttttcttttcatctctgccccgaatctga 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  24918882 gggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataagttgccttttcggatttttcttttcatctctgccctgaatttga 24918783  T
Q  247 aatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtca 346  Q
    ||||||| ||||||||||| | |   ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  24918782 aatgaaatctggtattgataggtcaagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaataccgttggtctgacgtca 24918683  T
Q  347 aaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaa 446  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24918682 aaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaa 24918583  T
Q  447 actgatattgattggtacagaa 468  Q
    ||||||||||||||||| ||||    
T  24918582 actgatattgattggtagagaa 24918561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 48 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 24368668 - 24368247
Alignment:
Q  48 aaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagttttt-gagaatttgagaatta 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  24368668 aaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaggtatagttttttgagaatttgagaatta 24368569  T
Q  147 gggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctaatttttcttttcatctctgccccgaatctga 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24368568 gggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataagttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttga 24368469  T
Q  247 aatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtca 346  Q
    ||||||| ||||||||||| | |    | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  24368468 aatgaaatctggtattgataggtcaatagttggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgatgtca 24368369  T
Q  347 aaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaa 446  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24368368 aaacgatttatagaacttaagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcaacacaactttgtccgaatttgaaatgaaa 24368269  T
Q  447 actgatattgattggtacagaa 468  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  24368268 actggtattgattggtacagaa 24368247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 48 - 468
Target Start/End: Original strand, 41523202 - 41523621
Alignment:
Q  48 aaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaattag 147  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41523202 aaggtaagggtgaggctaacattcaataatcttgagtctatgat-ctgaaaattgtatttaatatgttgtaggtttagtttttgagaatttgagaattag 41523300  T
Q  148 ggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctaatttttcttttcatctctgccccgaatctgaa 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  41523301 ggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgattttttttttcatctctgccccgaatttgaa 41523400  T
Q  248 atgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaa 347  Q
    |||||| ||||||||||| | | |  ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41523401 atgaaatctggtattgataggtccataattggtcttacgtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaa 41523500  T
Q  348 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaa 447  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  41523501 aaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtaaatttttatgaatttcagcacaactttgtacgaatttgaaataaaaa 41523600  T
Q  448 ctgatattgattggtacagaa 468  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  41523601 ctggtattgattggtacagaa 41523621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 44 - 468
Target Start/End: Original strand, 23706343 - 23706766
Alignment:
Q  44 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaa 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  23706343 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtatgtttagtttttgataatttgagaa 23706442  T
Q  144 ttagggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctaatttttcttttcatctctgccccgaatc 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||     
T  23706443 ttagggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttaaataatctaggttgctttttctgatttttcttttcatctctggcccgaatt 23706542  T
Q  244 tgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacg 343  Q
    |||||||||| ||||||||||| | | | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||   | |    
T  23706543 tgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatggtgttggttctatg 23706642  T
Q  344 tcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatg 443  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23706643 tcaaaacaatttatagaacttgagttatggtcaagttactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaacttt-tccgaatttgaaatg 23706741  T
Q  444 aaaactgatattgattggtacagaa 468  Q
    ||||| | |||||||||||||||||    
T  23706742 aaaacggctattgattggtacagaa 23706766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 47 - 468
Target Start/End: Original strand, 45027220 - 45027646
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatta 146  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  45027220 taaggtaagggtgagactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaggtttagtttttgagaatttgagaatta 45027319  T
Q  147 gggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctaa-----tttttcttttcatctctgccccgaa 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |     |||||||||||||||||||||| ||    
T  45027320 gggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataagttgctttttctgattttttttttcttttcatctctgccccaaa 45027419  T
Q  242 tctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctga 341  Q
    | ||||||| || ||||| ||||| | | | ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  45027420 tttgaaatggaatctggtgttgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagatttcgaatgtcgttggtctga 45027519  T
Q  342 cgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaa 441  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45027520 cgtcaaaacgatttatagaactttagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgattttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaa 45027619  T
Q  442 tgaaaactgatattgattggtacagaa 468  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  45027620 tgaaaactggtattgattggtacagaa 45027646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 46 - 465
Target Start/End: Original strand, 24528866 - 24529285
Alignment:
Q  46 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  24528866 ttaaggtaagggtgagactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtaattaacatattgtaggtttactttttgagaatttgagaatt 24528965  T
Q  146 agggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctaatttttcttttcatctctgccccgaatctg 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  24528966 agggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttaaataatatagattgctttttctgatttttcttttcatctttgccccgaatttg 24529065  T
Q  246 aaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtc 345  Q
    |||||||| ||||||||||| | | |  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||    
T  24529066 aaatgaaatctggtattgataggtccttaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtatgacgtc 24529165  T
Q  346 aaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaa 445  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  24529166 aaaatgatttatagaacttgagttatggtcatattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccaaatttaaaatgaa 24529265  T
Q  446 aactgatattgattggtaca 465  Q
    ||||  ||||||||||||||    
T  24529266 aacttgtattgattggtaca 24529285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 48 - 460
Target Start/End: Original strand, 21154136 - 21154548
Alignment:
Q  48 aaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaattag 147  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21154136 aaggtaagagtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaatatgttgtaggtttagtttttgagaatttgagaattag 21154235  T
Q  148 ggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctaatttttcttttcatctctgccccgaatctgaa 247  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21154236 ggttaagagcgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatatgggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaa 21154335  T
Q  248 atgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaa 347  Q
    |||||| || |||||||| | |   ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||    
T  21154336 atgaaatctagtattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgatgtcaa 21154435  T
Q  348 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaa 447  Q
    || |||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21154436 aatgatttatagaacttgacttttagtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcagaactttgtccgaatttgaaatgaaaa 21154535  T
Q  448 ctgatattgattg 460  Q
    ||| |||||||||    
T  21154536 ctggtattgattg 21154548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 48 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 24671866 - 24671446
Alignment:
Q  48 aaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaattag 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24671866 aaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctaaaaattgtatttaatatgttgtaggtttagtttttgagaatttgagaattag 24671767  T
Q  148 ggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctaatttttcttttcatctctgccccgaatctgaa 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  24671766 ggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgga 24671667  T
Q  248 atgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaa 347  Q
    |||||| |||||||||||   | | ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||| | ||  | |||| ||||    
T  24671666 atgaaatctggtattgatatgtccagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtgtggatgttagctttctaatgccatttatttgacatcaa 24671567  T
Q  348 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaa 447  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24671566 aaatatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttaagaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgcaaa 24671467  T
Q  448 ctgatattgattggtacagaa 468  Q
    ||| |||| ||||||||||||    
T  24671466 ctggtatttattggtacagaa 24671446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 44 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 24682281 - 24681865
Alignment:
Q  44 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaa 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||          
T  24682281 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttaagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaggtttagtttttgagaatt------ 24682188  T
Q  144 ttagggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctaatttttcttttcatctctgccccgaatc 243  Q
      |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||     
T  24682187 --agggttaagagtgatgattgtgataattttgaataaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctcccccgaatt 24682090  T
Q  244 tgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacg 343  Q
    |||||||||| ||||||||||| | | | ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||| |||||||     
T  24682089 tgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtgtggatgttagcattctaatgccgttagtctgaca 24681990  T
Q  344 tcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatg 443  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24681989 tcaaaaagatttatagagcttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtctgaatttgaaatg 24681890  T
Q  444 aaaactgatattgattggtacagaa 468  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||    
T  24681889 aaaactggtattggttggtacagaa 24681865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 237 - 468
Target Start/End: Original strand, 21154518 - 21154749
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  21154518 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattgttatagaattggtcctaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 21154617  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatt 436  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21154618 tctgacgtcaaaacgatttatagaatttgagttacggtcaaattactgcacgtagatcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatt 21154717  T
Q  437 tgaaatgaaaactgatattgattggtacagaa 468  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21154718 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaa 21154749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 238 - 468
Target Start/End: Original strand, 41523584 - 41523814
Alignment:
Q  238 cgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggt 337  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||    
T  41523584 cgaatttgaaataaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaggttgtaggtatggatgttatctttataatgcccttggt 41523683  T
Q  338 ctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaattt 437  Q
     |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41523684 ttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaattt 41523783  T
Q  438 gaaatgaaaactgatattgattggtacagaa 468  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41523784 gaaatgaaaactggtattgattggtacagaa 41523814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 237 - 468
Target Start/End: Original strand, 23706728 - 23706958
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||    
T  23706728 ccgaatttgaaatgaaaacggctattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttatagttatggatgttacctttctaatgccgtagg 23706827  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatt 436  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23706828 tctgacgtcaaaacgaattatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaagtcacagctaatatttatgaatttcagcacaacttt-tccgaatt 23706926  T
Q  437 tgaaatgaaaactgatattgattggtacagaa 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23706927 tgaaatgaaaactgatattgattggtacagaa 23706958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 244 - 465
Target Start/End: Original strand, 23709050 - 23709271
Alignment:
Q  244 tgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacg 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  23709050 tgaaatgaaaactggtattgattggcacagaattcgtcctaggtgtaaacacgtaagttgtaggtatggatgttagatttctaatgccgttggtctgacg 23709149  T
Q  344 tcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatg 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23709150 tcaaaacgatttatagaacttgagttatggtctaattactgcacataggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaata 23709249  T
Q  444 aaaactgatattgattggtaca 465  Q
    || |||| ||||||||||||||    
T  23709250 aatactggtattgattggtaca 23709271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 239 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 20261676 - 20261520
Alignment:
Q  239 gaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtc 338  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||     
T  20261676 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtt 20261577  T
Q  339 tgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20261576 tgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 20261520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 22105924 - 22105766
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  22105924 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtgcagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 22105825  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22105824 tttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtca 22105766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 239 - 391
Target Start/End: Original strand, 10684468 - 10684620
Alignment:
Q  239 gaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtc 338  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||     
T  10684468 gaatttgaaatgaaaactggtattgattgatacagaattggtcttaggtgtaagcacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtt 10684567  T
Q  339 tgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtag 391  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10684568 tgacttcaaaaggatttatagaacttgagctatggtcaaattactgcacgtag 10684620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 18809401 - 18809243
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||    
T  18809401 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 18809302  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18809301 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtca 18809243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Original strand, 23706920 - 23707078
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||    
T  23706920 ccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttgg 23707019  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23707020 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 23707078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Original strand, 23711717 - 23711875
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||    
T  23711717 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 23711816  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23711817 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtca 23711875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 24368285 - 24368127
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  24368285 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttgg 24368186  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  24368185 tttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatagttaaattactgcacgtaggtca 24368127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 28577557 - 28577399
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  28577557 ccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttgg 28577458  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28577457 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtca 28577399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Original strand, 41523776 - 41523934
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  41523776 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattagtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaacgtcgttgg 41523875  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41523876 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtca 41523934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 571856 - 571698
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  571856 ccgaatttgaaataaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttgg 571757  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  571756 tttgacgtcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtca 571698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 6726506 - 6726348
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  6726506 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattgatacataagtggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttgg 6726407  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| |||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  6726406 tttgacttcaaaaggatttatagaacttaagttatagtcaaattactgcacataggtca 6726348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 24671484 - 24671326
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  24671484 ccgaatttgaaatgcaaactggtatttattggtacagaattggtcttaggtgtaaaaacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgttgttgg 24671385  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24671384 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtca 24671326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Original strand, 32214634 - 32214792
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||    
T  32214634 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattgttcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattgg 32214733  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32214734 tttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 32214792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 39682772 - 39682614
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||    
T  39682772 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 39682673  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39682672 tttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtca 39682614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Original strand, 45027608 - 45027766
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | ||||    
T  45027608 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccattgg 45027707  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  45027708 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgaattatagtcaaattactgcacgtaggtca 45027766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 239 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 24681901 - 24681745
Alignment:
Q  239 gaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtc 338  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  24681901 gaatttgaaatgaaaactggtattggttggtacagaattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtt 24681802  T
Q  339 tgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
     | | || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24681801 gggcttccaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 24681745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 244 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 23131314 - 23131163
Alignment:
Q  244 tgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacg 343  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||||     
T  23131314 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgact 23131215  T
Q  344 tcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23131214 tcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtca 23131163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 244 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 23133781 - 23133630
Alignment:
Q  244 tgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacg 343  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||||     
T  23133781 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgact 23133682  T
Q  344 tcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23133681 tcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtca 23133630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 244 - 395
Target Start/End: Original strand, 34402232 - 34402383
Alignment:
Q  244 tgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacg 343  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||||     
T  34402232 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgact 34402331  T
Q  344 tcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34402332 tcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtca 34402383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Original strand, 21154711 - 21154869
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  21154711 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaatttgtcttaggggtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttgg 21154810  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  21154811 tttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacataggtca 21154869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Original strand, 24642452 - 24642610
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24642452 ccgaatttgaaaagaaaactggtattgattggtacagaattgctcttaggtgtaaacccaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 24642551  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24642552 tttgacttcaaaaggatttatagaacttaagttatggtcaaattactgcatgtaggtca 24642610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 24918599 - 24918441
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||    
T  24918599 ccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtagagaattggtcttaagtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttgg 24918500  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24918499 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 24918441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 336 - 468
Target Start/End: Original strand, 24642358 - 24642490
Alignment:
Q  336 gtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaat 435  Q
    ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24642358 gtctgacgtaaacgcgatttatagaacttgagttatggtcaaataactacacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaat 24642457  T
Q  436 ttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaa 468  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  24642458 ttgaaaagaaaactggtattgattggtacagaa 24642490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 237 - 393
Target Start/End: Original strand, 24897899 - 24898055
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| |    
T  24897899 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcataggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttag 24897998  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggt 393  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24897999 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggt 24898055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 237 - 393
Target Start/End: Original strand, 24900382 - 24900538
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| |    
T  24900382 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcataggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttag 24900481  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggt 393  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24900482 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggt 24900538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 237 - 393
Target Start/End: Original strand, 24902859 - 24903015
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| |    
T  24902859 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcataggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttag 24902958  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggt 393  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24902959 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggt 24903015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 237 - 393
Target Start/End: Original strand, 24905336 - 24905492
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| |    
T  24905336 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcataggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttag 24905435  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggt 393  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24905436 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggt 24905492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 23136038 - 23135880
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||  ||||||    
T  23136038 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatcccgttgg 23135939  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23135938 tttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtca 23135880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 26505837 - 26505679
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||    
T  26505837 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattgatcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 26505738  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| ||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26505737 tttgacttcaaaagaatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtca 26505679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 26508315 - 26508157
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||| |    
T  26508315 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttag 26508216  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| ||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26508215 tttgacttcaaaagaatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtca 26508157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 364 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 18809467 - 18809363
Alignment:
Q  364 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggta 463  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18809467 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 18809368  T
Q  464 cagaa 468  Q
    |||||    
T  18809367 cagaa 18809363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 364 - 468
Target Start/End: Original strand, 23711651 - 23711755
Alignment:
Q  364 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggta 463  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23711651 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 23711750  T
Q  464 cagaa 468  Q
    |||||    
T  23711751 cagaa 23711755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 237 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 23931919 - 23931775
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||    
T  23931919 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacactaaagttgtaggtattgatgttagctttctaatgccgttgg 23931820  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaatta 381  Q
    | |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23931819 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaatta 23931775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 49 - 160
Target Start/End: Original strand, 24897411 - 24897523
Alignment:
Q  49 aggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaattag 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||    
T  24897411 aggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaggttttagtttttgagaatttgggaattag 24897510  T
Q  148 ggttaagagtgat 160  Q
    |||||| ||||||    
T  24897511 ggttaaaagtgat 24897523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 49 - 160
Target Start/End: Original strand, 24899894 - 24900006
Alignment:
Q  49 aggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaattag 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||    
T  24899894 aggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaggttttagtttttgagaatttgggaattag 24899993  T
Q  148 ggttaagagtgat 160  Q
    |||||| ||||||    
T  24899994 ggttaaaagtgat 24900006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 49 - 160
Target Start/End: Original strand, 24902371 - 24902483
Alignment:
Q  49 aggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaattag 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||    
T  24902371 aggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaggttttagtttttgagaatttgggaattag 24902470  T
Q  148 ggttaagagtgat 160  Q
    |||||| ||||||    
T  24902471 ggttaaaagtgat 24902483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 49 - 160
Target Start/End: Original strand, 24904848 - 24904960
Alignment:
Q  49 aggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaattag 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||    
T  24904848 aggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaggttttagtttttgagaatttgggaattag 24904947  T
Q  148 ggttaagagtgat 160  Q
    |||||| ||||||    
T  24904948 ggttaaaagtgat 24904960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 49 - 160
Target Start/End: Original strand, 24907323 - 24907435
Alignment:
Q  49 aggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaattag 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||    
T  24907323 aggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaggttttagtttttgagaatttgggaattag 24907422  T
Q  148 ggttaagagtgat 160  Q
    |||||| ||||||    
T  24907423 ggttaaaagtgat 24907435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 237 - 393
Target Start/End: Original strand, 24907811 - 24907967
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| |    
T  24907811 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcataggtgtaaacatgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttag 24907910  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggt 393  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24907911 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggt 24907967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 364 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 28577623 - 28577519
Alignment:
Q  364 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggta 463  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28577623 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggta 28577524  T
Q  464 cagaa 468  Q
    |||||    
T  28577523 cagaa 28577519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Original strand, 23709236 - 23709394
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||| || |||||||||||||| |||  |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||    
T  23709236 ccgaatttgaaataaatactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgcagttgg 23709335  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23709336 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtca 23709394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 364 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 26505903 - 26505799
Alignment:
Q  364 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggta 463  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26505903 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaaccttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 26505804  T
Q  464 cagaa 468  Q
    |||||    
T  26505803 cagaa 26505799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 364 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 26508381 - 26508277
Alignment:
Q  364 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggta 463  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26508381 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaaccttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 26508282  T
Q  464 cagaa 468  Q
    |||||    
T  26508281 cagaa 26508277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 364 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 39682838 - 39682734
Alignment:
Q  364 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggta 463  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39682838 tgagttaaggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 39682739  T
Q  464 cagaa 468  Q
    |||||    
T  39682738 cagaa 39682734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 296 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 25616581 - 25616482
Alignment:
Q  296 gaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  25616581 gaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatcgtcaaattacttcacgtaggtca 25616482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 364 - 463
Target Start/End: Original strand, 32039136 - 32039235
Alignment:
Q  364 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggta 463  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32039136 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 32039235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 238 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 38967937 - 38967787
Alignment:
Q  238 cgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggt 337  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  38967937 cgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaatacgaaagttgtagatatggatgttaggtttctaatgtcgttggt 38967838  T
Q  338 ctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacg 388  Q
     |||| ||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  38967837 ttgacttcaaaagtatttatagaacttgagttatagtgaaattactgcacg 38967787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Original strand, 32039202 - 32039360
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  || ||| ||||||| || ||||||    
T  32039202 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtaaaggattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaattttagctttctattgccgttgg 32039301  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32039302 tttgacttcaaaaggatttatagaatttaagttatggtcaaattactgaacgtaggtca 32039360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 364 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 571922 - 571821
Alignment:
Q  364 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggta 463  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  571922 tgagttaaggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaataaaaactggtattgattggta 571823  T
Q  464 ca 465  Q
    ||    
T  571822 ca 571821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 47 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 18809891 - 18809763
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  18809891 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttaagtcattgattctgaaaattggatttaacatgttgtaggttttagtttttgagaatttgggaatt 18809792  T
Q  146 agggttaagagtgatgattgtgatgatttt 175  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  18809791 agggttaaaagtgattatt-tgatgatttt 18809763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 364 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 23131386 - 23131286
Alignment:
Q  364 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggta 463  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23131386 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaa-ttgaaatgaaaactggtattgattggta 23131288  T
Q  464 ca 465  Q
    ||    
T  23131287 ca 23131286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 47 - 175
Target Start/End: Original strand, 23711227 - 23711355
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  23711227 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttaagtcattgattctgaaaattggatttaacatgttgtaggttttagtttttgagaatttgggaatt 23711326  T
Q  146 agggttaagagtgatgattgtgatgatttt 175  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  23711327 agggttaaaagtgattatt-tgatgatttt 23711355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 246 - 395
Target Start/End: Original strand, 24529259 - 24529408
Alignment:
Q  246 aaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtc 345  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| ||    
T  24529259 aaatgaaaacttgtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttacctttctaatgccgttggtttgacttc 24529358  T
Q  346 aaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    |||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||    
T  24529359 aaaaggatttatagcacttgagatatggtgaaattactaaacgtaggtca 24529408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 47 - 175
Target Start/End: Original strand, 32038711 - 32038839
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  32038711 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttaagtcattgattctgaaaattggatttaacatgttgtaggttttagtttttgagaatttgggaatt 32038810  T
Q  146 agggttaagagtgatgattgtgatgatttt 175  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  32038811 agggttaaaagtgattatt-tgatgatttt 32038839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 364 - 465
Target Start/End: Original strand, 34402160 - 34402260
Alignment:
Q  364 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggta 463  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34402160 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaa-ttgaaatgaaaactggtattgattggta 34402258  T
Q  464 ca 465  Q
    ||    
T  34402259 ca 34402260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 47 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 39683264 - 39683136
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  39683264 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttaagtcattgattctgaaaattgaatttaacatgttgtaggttttagtttttgagaatttgggaatt 39683165  T
Q  146 agggttaagagtgatgattgtgatgatttt 175  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  39683164 agggttaaaagtgattatt-tgatgatttt 39683136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 47 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 23131810 - 23131682
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||  ||||    
T  23131810 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttaagtcattgattctgaaaattggatttaacatgttgtaggttttagtttttgagaatttggaaatt 23131711  T
Q  146 agggttaagagtgatgattgtgatgatttt 175  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  23131710 agggttaaaagtgattatt-tgatgatttt 23131682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 364 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 23133853 - 23133753
Alignment:
Q  364 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggta 463  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23133853 tgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaa-ttgaaatgaaaactggtattgattggta 23133755  T
Q  464 ca 465  Q
    ||    
T  23133754 ca 23133753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 47 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 23134277 - 23134149
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||  ||||    
T  23134277 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttaagtcattgattctgaaaattggatttaacatgttgtaggttttagtttttgagaatttggaaatt 23134178  T
Q  146 agggttaagagtgatgattgtgatgatttt 175  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  23134177 agggttaaaagtgattatt-tgatgatttt 23134149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 367 - 468
Target Start/End: Original strand, 23708980 - 23709081
Alignment:
Q  367 gttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacag 466  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  23708980 gttatggtcaaattactgcacttaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgattttgaaatgaaaactggtattgattggcacag 23709079  T
Q  467 aa 468  Q
    ||    
T  23709080 aa 23709081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 47 - 175
Target Start/End: Original strand, 34401736 - 34401864
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||  ||||    
T  34401736 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttaagtcattgattctgaaaattggatttaacatgttgtaggttttagtttttgagaatttggaaatt 34401835  T
Q  146 agggttaagagtgatgattgtgatgatttt 175  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  34401836 agggttaaaagtgattatt-tgatgatttt 34401864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 46 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 38968426 - 38968314
Alignment:
Q  46 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |    |||||||||||||||||||||||||    
T  38968426 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttaagtctatgattctaaaaattggatttaacatgtag--gttttagtttttgagaatttgagaatt 38968329  T
Q  146 agggttaagagtgat 160  Q
    |||||||| ||||||    
T  38968328 agggttaaaagtgat 38968314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 28578053 - 28577939
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  28578053 taaggtaagggtaggactaacattcaataatcttaagtcattgattctgaaaattggatttaacatgttgtaggttttagtttttgagaatttgggaatt 28577954  T
Q  146 agggttaagagtgat 160  Q
    |||||||| ||||||    
T  28577953 agggttaaaagtgat 28577939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 47 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 22695283 - 22695155
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  22695283 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttaagtcattgattctgaaaatttgatttaacatgttgtaggttttagtttttgagaatttgggaatt 22695184  T
Q  146 agggttaagagtgatgattgtgatgatttt 175  Q
    |||||||| | |||| ||| ||||||||||    
T  22695183 agggttaaaaatgattatt-tgatgatttt 22695155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 47 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 26508805 - 26508677
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  26508805 taaggtaagggtgagactaacattcaataatcttaagtcattgattctggaaattggatttaacatgttgtaggttttagtttttgagaatttgggaatt 26508706  T
Q  146 agggttaagagtgatgattgtgatgatttt 175  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  26508705 agggttaaaagtgattatt-tgatgatttt 26508677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 48 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 9785589 - 9785463
Alignment:
Q  48 aaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaattag 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||   ||||||||||||| |||||||    
T  9785589 aaggtaagggtgggactaacattcaataatcttaagtcattgattctgaaaattggatttaatatgttgtaagttttagttttgagaatttgggaattag 9785490  T
Q  148 ggttaagagtgatgattgtgatgatttt 175  Q
    |||||| | |||| ||| ||||||||||    
T  9785489 ggttaaaattgattatt-tgatgatttt 9785463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 26506327 - 26506199
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  | |||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  26506327 taaggtaagggtgagactaacattcaataatcttaagtcattaattctggaaattggatttaacatgttgtaggttttagtttttgagaatttgggaatt 26506228  T
Q  146 agggttaagagtgatgattgtgatgatttt 175  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  26506227 agggttaaaagtgattatt-tgatgatttt 26506199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 175
Target Start/End: Original strand, 27919978 - 27920106
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  | |||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  27919978 taaggtaagggtgagactaacattcaataatcttaagtcattaattctggaaattggatttaacatgttgtaggttttagtttttgagaatttgggaatt 27920077  T
Q  146 agggttaagagtgatgattgtgatgatttt 175  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  27920078 agggttaaaagtgattatt-tgatgatttt 27920106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 47 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 572347 - 572232
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctg-aaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaat 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  572347 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttaagtcatcgattctgaaaaattggatttaacatgttgtaggttttagtttttgagaatttgggaat 572248  T
Q  145 tagggttaagagtgat 160  Q
    ||||||||| ||||||    
T  572247 tagggttaaaagtgat 572232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 47 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 23136516 - 23136402
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||   |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||    
T  23136516 taaggtaagggtgggactaatattcaataatcttaagtcatcgattctgaaaattggatttaacatgttgtaggttttcgtttttgagaatttgggaatt 23136417  T
Q  146 agggttaagagtgat 160  Q
    |||||||| ||||||    
T  23136416 agggttaaaagtgat 23136402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 401 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 31345667 - 31345600
Alignment:
Q  401 aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaa 468  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31345667 aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaa 31345600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 400 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 23136068 - 23136003
Alignment:
Q  400 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtaca 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23136068 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtaca 23136003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 44 - 165
Target Start/End: Original strand, 39827192 - 39827312
Alignment:
Q  44 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaa 143  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| || ||||||||||||  |||  ||||||||||||||| | |||||||||||||||| || ||    
T  39827192 tcttaaggtaagggtgggactaagattcaatcttcttaagcctatgattctgatgattagatttaacatgttgtagggttagtttttgagaattgga-aa 39827290  T
Q  144 ttagggttaagagtgatgattg 165  Q
    ||||||||||||||||| ||||    
T  39827291 ttagggttaagagtgataattg 39827312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 400 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 20261708 - 20261640
Alignment:
Q  400 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaa 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20261708 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtcagaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaa 20261640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 64 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 22690670 - 22690559
Alignment:
Q  64 taacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaattagggttaagagtgatga 162  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |    
T  22690670 taacattcaataatcttaagtcattgattctgaaaattggatttaacatgttgtaggttttagtttttgagaatttgggaattagggttaaaaatgatta 22690571  T
Q  163 ttgtgatgatttt 175  Q
    || ||||||||||    
T  22690570 tt-tgatgatttt 22690559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 400 - 465
Target Start/End: Original strand, 24897869 - 24897934
Alignment:
Q  400 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtaca 465  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24897869 gaatttttatgaatttcagcacaactttatccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtaca 24897934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 400 - 465
Target Start/End: Original strand, 24900352 - 24900417
Alignment:
Q  400 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtaca 465  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24900352 gaatttttatgaatttcagcacaactttatccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtaca 24900417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 400 - 465
Target Start/End: Original strand, 24902829 - 24902894
Alignment:
Q  400 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtaca 465  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24902829 gaatttttatgaatttcagcacaactttatccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtaca 24902894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 400 - 465
Target Start/End: Original strand, 24905306 - 24905371
Alignment:
Q  400 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtaca 465  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24905306 gaatttttatgaatttcagcacaactttatccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtaca 24905371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 400 - 465
Target Start/End: Original strand, 24907781 - 24907846
Alignment:
Q  400 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtaca 465  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24907781 gaatttttatgaatttcagcacaactttatccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtaca 24907846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 339 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 31345553 - 31345480
Alignment:
Q  339 tgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaa 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||||||    
T  31345553 tgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaaatcttatgaa 31345480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 48 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 34137915 - 34137799
Alignment:
Q  48 aaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaattag 147  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  |||| || ||||||||||||  |||  ||||||||||||||| | |||||||||||||||| || ||||||    
T  34137915 aaggtaagggtggaactaacattcaatcttcttaagcctatgattctgatgattagatttaacatgttgtagggttagtttttgagaattgga-aattag 34137817  T
Q  148 ggttaagagtgatgattg 165  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  34137816 ggttaagagtgataattg 34137799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 400 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 38967968 - 38967903
Alignment:
Q  400 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtaca 465  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38967968 gaatttttatgaatttcagcacaactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtaca 38967903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 400 - 468
Target Start/End: Original strand, 10684436 - 10684504
Alignment:
Q  400 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaa 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  10684436 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtcagaatttgaaatgaaaactggtattgattgatacagaa 10684504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 48 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 25616628 - 25616572
Alignment:
Q  48 aaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgta 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25616628 aaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaagttgta 25616572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 46 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 27845610 - 27845492
Alignment:
Q  46 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||| |||||||  |||  |||||||| |||||| | |||||||||||||||| || ||||    
T  27845610 ttaaggtaagggtgagactaacattcaattttcttaagtctataattctgatgattagatttaacaagttgtaggattagtttttgagaattgga-aatt 27845512  T
Q  146 agggttaagagtgatgattg 165  Q
    |||||||| |||||| ||||    
T  27845511 agggttaaaagtgataattg 27845492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 47 - 152
Target Start/End: Original strand, 18388190 - 18388295
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtt-tagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| ||| ||||| ||||||| |||||    
T  18388190 taaggtaagggtgagactaaccttcaataatcctgagtatatgattctgaaaattggatttaacaagttgtaggttgtag-ttttgggaatttgggaatt 18388288  T
Q  146 agggtta 152  Q
    | |||||    
T  18388289 atggtta 18388295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 42 - 159
Target Start/End: Original strand, 43946513 - 43946629
Alignment:
Q  42 aatcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgag 141  Q
    |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||  |||| || |||||||||||| ||||  ||||||||||||||| | |||||||| ||||||| ||     
T  43946513 aatcataaggtaagggtaagacaaacattcaattttcttaagcctatgattctgataattagatttaacatgttgtaggattagttttggagaattgga- 43946611  T
Q  142 aattagggttaagagtga 159  Q
    ||||||||||||||||||    
T  43946612 aattagggttaagagtga 43946629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 46 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 26393375 - 26393264
Alignment:
Q  46 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||| | |||||||  |||  |||||||| |||||| |||||| ||||||||||| || ||||    
T  26393375 ttaaggtaagggtgagactaacattcaattctcttaagtctgtaattctgatgattaaatttaacaagttgtaggtttag-ttttgagaattggaaaatt 26393277  T
Q  146 agggttaagagtg 158  Q
    |||||||||||||    
T  26393276 agggttaagagtg 26393264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 153
Target Start/End: Original strand, 24792731 - 24792864
Alignment:
Q  19 aagaggaaaggttgccgatcgttaatcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacat-gttgt 117  Q
    ||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| | |||||||| ||| || ||||||||| |||||    
T  24792731 aagaggagaggttgcaaatcgttaatcctaaggtaagggtgggactaaccttcaataattctgagtatgtgattctg-aaactgaatttaacatggttgt 24792829  T
Q  118 aagtt-tagtttttgagaatttgagaattagggttaa 153  Q
    | |||  ||| ||  ||||||||||||||||||||||    
T  24792830 aggttggagtctt--agaatttgagaattagggttaa 24792864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 237 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 31345638 - 31345570
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgta 305  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  31345638 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattgatcttaggtgtaaacacgaaagttgta 31345570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 46 - 165
Target Start/End: Original strand, 18546142 - 18546260
Alignment:
Q  46 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||  |||| ||||||| |||||||  |||  ||||| || |||||| | ||||||||||| || |||| ||||    
T  18546142 ttaaggtaagggtgagactaacgttcaattttcttaagtctataattctgatgattagatttagcaagttgtaggattagtttttga-aagttgaaaatt 18546240  T
Q  146 agggttaagagtgatgattg 165  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  18546241 agggttaagagtgataattg 18546260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 364 - 415
Target Start/End: Original strand, 27920402 - 27920453
Alignment:
Q  364 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaattt 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  27920402 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaattt 27920453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 46 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 7187477 - 7187395
Alignment:
Q  46 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagttt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||| || |||||||||||| ||||  ||||||||||||| | |||||||||    
T  7187477 ttaaggtaagggtgagactaacattcaatcttcttaagcctatgattctgataattagatttaacatgttggaggtttagttt 7187395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 19358943 - 19358873
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  19358943 taaggtaagggtgggactaacctttaataattctgagtatatgattctgaaaattgaatttaacaagttgt 19358873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 90 - 160
Target Start/End: Original strand, 23068451 - 23068520
Alignment:
Q  90 attctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaattagggttaagagtgat 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  23068451 attctgaaaattgtatttaacatgttgtaggtttag-ttttgaggatttgggaattcgggttaaaagtgat 23068520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #114
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 314 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 16900884 - 16900803
Alignment:
Q  314 tgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    ||||| |||||||||| | ||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  16900884 tgttagctttctaatgactttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattactacacgtgggtca 16900803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #115
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 314 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 16994275 - 16994194
Alignment:
Q  314 tgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    ||||| |||||||||| | ||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  16994275 tgttagctttctaatgactttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattactacacgtgggtca 16994194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #116
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 153
Target Start/End: Original strand, 24833995 - 24834128
Alignment:
Q  19 aagaggaaaggttgccgatcgttaatcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacat-gttgt 117  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||| | |||||| | |||||| ||||||||| |||||    
T  24833995 aagaggagaggataccgatcgttaatcctaaggtaagggtgggactaaccatcaataattctgagtatgtgattccg-aaattgaatttaacatggttgt 24834093  T
Q  118 aagtt-tagtttttgagaatttgagaattagggttaa 153  Q
    | |||  ||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  24834094 aggttggagtttt--agaatttgataattagggttaa 24834128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #117
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 46 - 128
Target Start/End: Original strand, 22172978 - 22173060
Alignment:
Q  46 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagttt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||| || |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| | |||||||||    
T  22172978 ttaaggtaagggtgagactaacattcaatcttcttaagcctatgattatgataattagatttaacatgttggaggtttagttt 22173060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #118
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 314 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 34823819 - 34823750
Alignment:
Q  314 tgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 383  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| ||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  34823819 tgttagctttctaatgacgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 34823750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #119
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 47 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 3539889 - 3539787
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagt-ctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtt-tagtttttgagaatttgagaat 144  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  |||| || |||  ||| ||||||||||| | |||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  3539889 taaggtaagggtgggactaactttctctaattttaagtggtataattctgaaaatcgaatttaacaagttgtaggttgtagtttttg-gaatttgagaat 3539791  T
Q  145 tagg 148  Q
    ||||    
T  3539790 tagg 3539787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #120
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 97
Target Start/End: Original strand, 34858192 - 34858242
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaa 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  34858192 taaggtaagggtgggactaaccttcaataattttgagtatgtgattctgaa 34858242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #121
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 97
Target Start/End: Original strand, 34873254 - 34873304
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaa 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  34873254 taaggtaagggtgggactaaccttcaataattttgagtatgtgattctgaa 34873304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #122
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 67432 - 67339
Alignment:
Q  290 taacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 383  Q
    ||||| |||| ||||||||   |||||||  ||||||||| | ||||| |||| || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  67432 taacatgaaaattgtaggttaagatgttagatttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 67339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #123
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 314 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 12727780 - 12727711
Alignment:
Q  314 tgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 383  Q
    ||||| |||||||||| | ||||  ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  12727780 tgttagctttctaatggccttgggttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 12727711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #124
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 96
Target Start/End: Original strand, 23079871 - 23079923
Alignment:
Q  44 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctga 96  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || | ||||||||||    
T  23079871 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaattttcttaagccgatgattctga 23079923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #125
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 27473511 - 27473414
Alignment:
Q  44 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacat-gttgtaagtttagtttttgagaatttgaga 142  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||| | |||||||||| | || ||||||||| |||||| ||| || |||| |||||||||||    
T  27473511 tcttaagttaagggtgggactaaccttcaataattatgagtatgtgattctgaaga-tgaatttaacatggttgtaggttgaggtttt-agaatttgaga 27473414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #126
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 273 - 383
Target Start/End: Original strand, 19887274 - 19887384
Alignment:
Q  273 gaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatg 372  Q
    ||||||| ||| ||||  |||| ||||||||||| ||    ||||| |||||||||| | ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  19887274 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 19887373  T
Q  373 gtcaaattact 383  Q
     | ||||||||    
T  19887374 attaaattact 19887384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #127
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 291 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 24788080 - 24788042
Alignment:
Q  291 aacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatg 329  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24788080 aacatgaaagttgtaggtatggatgttatctttccaatg 24788042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #128
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 47 - 99
Target Start/End: Original strand, 12626427 - 12626479
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||| ||| ||||||||||    
T  12626427 taaggtaagggtgggactaaccttcattaatcataagtgtataattctgaaaa 12626479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #129
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 47 - 99
Target Start/End: Original strand, 20005971 - 20006023
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaa 99  Q
    ||||||||||||||||||| | |||  ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  20005971 taaggtaagggtgggactagccttctttaatcatgagtctataattctgaaaa 20006023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #130
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 315 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 22274090 - 22274022
Alignment:
Q  315 gttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 383  Q
    |||| |||||||||| | ||||| ||| ||| ||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||    
T  22274090 gttagctttctaatggccttggtttgatgtctaaatgatttttaaaacttgagttatgatcaaattact 22274022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #131
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 46 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 31346172 - 31346101
Alignment:
Q  46 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgt-atttaacatgttgt 117  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||| || |||||||| || || |||| ||||||||||||||    
T  31346172 ttaaggtaagggtgagactaacattcaatcttcttaagcctatgattttg-aatttgtgatttaacatgttgt 31346101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #132
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 47 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 45535977 - 45535925
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  |||||  |||||||| ||||||||||    
T  45535977 taaggtaagggtgggactaaccttctttaatcacgagtctataattctgaaaa 45535925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 362; Significance: 0; HSPs: 122)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 362; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 47 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 32122570 - 32122149
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatta 146  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32122570 taaggtaagggtggaactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaggtttagtttttgagaatttgagaatta 32122471  T
Q  147 gggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctaatttttcttttcatctctgccccgaatctga 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  32122470 gggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttga 32122371  T
Q  247 aatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtca 346  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  32122370 aatgaaaactggtattgattggtatagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgatgtca 32122271  T
Q  347 aaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  32122270 aaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgtaa 32122171  T
Q  447 actgatattgattggtacagaa 468  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  32122170 actgatattgattggtacagaa 32122149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 47 - 465
Target Start/End: Original strand, 27471737 - 27472155
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatta 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27471737 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattttgaaaattgtatttaacatgttgtaggtttagtttttgagaatttgagaatta 27471836  T
Q  147 gggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctaatttttcttttcatctctgccccgaatctga 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27471837 gggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttga 27471936  T
Q  247 aatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtca 346  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27471937 aatgaaaactgatattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtca 27472036  T
Q  347 aaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27472037 aaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgagtttgaaatgaaa 27472136  T
Q  447 actgatattgattggtaca 465  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  27472137 actggtattgattggtaca 27472155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 465
Target Start/End: Original strand, 16412597 - 16413054
Alignment:
Q  9 gagatgaaccaagaggaaaggttgccgatcgttaatcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtattta 108  Q
    |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16412597 gagaagaaccatgaggaaaggctgccgatcgttaatcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtattta 16412696  T
Q  109 acatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaattagggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgc- 207  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16412697 acatgttgtaggtttagtttttgagaatttgagaattagggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgct 16412796  T
Q  208 tttttctaatttttcttttcatctctgccccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtagg 307  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  16412797 tttttctgatttttcttttcatctctgccgcgaatttgaaatgaaaattggtattgattggtacagaactggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtagg 16412896  T
Q  308 tatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaattttt 407  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| || ||||||||    
T  16412897 tatggatgttagctttctaattccgttggtctgatgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactatacgtaggtcacagtgaattttt 16412996  T
Q  408 atgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtaca 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16412997 atgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtaca 16413054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 48 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 20404120 - 20403700
Alignment:
Q  48 aaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaattag 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20404120 aaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgataattgtatttaacatgttgtaggtttagtttttgagaattttagaattag 20404021  T
Q  148 ggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctaatttttcttttcatctctgccccgaatctgaa 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20404020 ggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatatagattgctttttcttatttttcttttcatctctgccccgaatttgaa 20403921  T
Q  248 atgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaa 347  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  20403920 atgaaaactggtattgattgctacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaa 20403821  T
Q  348 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaa 447  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20403820 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatgtttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaa 20403721  T
Q  448 ctgatattgattggtacagaa 468  Q
    ||| ||||||||| |||||||    
T  20403720 ctggtattgattgatacagaa 20403700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 44 - 468
Target Start/End: Original strand, 38549130 - 38549553
Alignment:
Q  44 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaa 143  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  38549130 tcttaaggtaagggttggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtgggtttagtttttgagaatttgagaa 38549229  T
Q  144 ttagggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctaatttttcttttcatctctgccccgaatc 243  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||     
T  38549230 ttaggcttaaaagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctcccccgaatt 38549329  T
Q  244 tgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacg 343  Q
    |||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  38549330 tgaaatgaaatctggtattgataggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtatgtatggatgttagctttctaatgtcgttggtatgacg 38549429  T
Q  344 tcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatg 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38549430 tcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtagg-cacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttaaaatg 38549528  T
Q  444 aaaactgatattgattggtacagaa 468  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  38549529 aaaactggtattgattggtacagaa 38549553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 47 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 24049452 - 24049034
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatta 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24049452 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattatatttaacatgttgtaggtttagtttttgagaatttgagaatta 24049353  T
Q  147 gggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctaatttttcttttcatctctgccccgaatctga 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24049352 gggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgttttttatgatttttcttttcatctctgccccgaatttga 24049253  T
Q  247 aatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtca 346  Q
    |||||||  |||||||||| | | | ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24049252 aatgaaatatggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttataggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtca 24049153  T
Q  347 aaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaa 446  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24049152 aaacgatttataaaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaaataaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaataaaa 24049053  T
Q  447 actgatattgattggtaca 465  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  24049052 actggtattgattggtaca 24049034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 47 - 468
Target Start/End: Original strand, 15202306 - 15202727
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatta 146  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15202306 taaggtaagggtgagactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaatatgttgtaggtttagtttttgagaatttgagaatta 15202405  T
Q  147 gggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctaatttttcttttcatctctgccccgaatctga 246  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  15202406 gggttaagagtgatgattgtgattatttagaatgaaagtgaagttgaataatatgggttgctttttctgatttttcttttcatctctaccccgaatttga 15202505  T
Q  247 aatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtca 346  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  15202506 aatgaaatctggtattgatagatccagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaataccgttggtctgacgtca 15202605  T
Q  347 aaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaa 446  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15202606 aaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcacaacgttgtccgaatttgaaatgaaa 15202705  T
Q  447 actgatattgattggtacagaa 468  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  15202706 actgatattgattggtacagaa 15202727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 47 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 19897356 - 19896938
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatta 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19897356 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaggtttagtttttgagaatttgagaatta 19897257  T
Q  147 gggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctaatttttcttttcatctctgccccgaatctga 246  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19897256 gagttaagagtgatgattgttatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttga 19897157  T
Q  247 aatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtca 346  Q
    ||||||| ||||||||||| | | |  |||||||||||| ||  || || ||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  19897156 aatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttagctgtaaatacaaaagttgtaggtatgaatgttagatttctaatgccgttggtctgacgtca 19897057  T
Q  347 aaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaa 446  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19897056 aaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaattttaaatgaaa 19896957  T
Q  447 actgatattgattggtaca 465  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  19896956 actggtattgattggtaca 19896938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 46 - 395
Target Start/End: Original strand, 1326444 - 1326793
Alignment:
Q  46 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1326444 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaggtttagtttttgagaatttgagaatt 1326543  T
Q  146 agggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctaatttttcttttcatctctgccccgaatctg 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  1326544 agggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtaaaattgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctttgccccgaatttg 1326643  T
Q  246 aaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtc 345  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||  || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1326644 aaatgaaatctggtattgattggtacagaattggtcttaagtgtaaaaacgaaagttgtaggtatgaatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtc 1326743  T
Q  346 aaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1326744 aaaacgatttataaaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 1326793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 139 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 15071310 - 15070984
Alignment:
Q  139 gagaattagggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctaatttttcttttcatctctgcccc 238  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15071310 gagaattagagataagagtgatgattgtgatgattttgaataaaagtgaagttgaataatataagttgctttttctgatttttcttttcatctctgcccc 15071211  T
Q  239 gaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtc 338  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||| | ||  |||||| ||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  15071210 gaatttgaaataaaaactggtattgatcggtaaagaattgatcttaggggtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtc 15071111  T
Q  339 tgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttg 438  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15071110 tgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttg 15071011  T
Q  439 aaatgaaaactgatattgattggtaca 465  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||    
T  15071010 aaatgaaaactggtattgattggtaca 15070984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 44 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 11361362 - 11361024
Alignment:
Q  44 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaa 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11361362 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctaaaaattgtatttaacatgttgtaggtttagtttttgagaatttgagaa 11361263  T
Q  144 ttagggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctaatttttctttt-catctctgccccgaat 242  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  11361262 ttaaggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgattttttttttccatctctgccccgaat 11361163  T
Q  243 ctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgac 342  Q
     |||||||||| || |||||||| | | |  |||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||    
T  11361162 ttgaaatgaaatctagtattgataggtgcataattggtcttaggtgtaaacacaaaacttgtaggtatggatgttagctttctaatactgttggtctgac 11361063  T
Q  343 gtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaatta 381  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||    
T  11361062 gtcaaaacgatttatagaacttaagttatagttaaatta 11361024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 46 - 468
Target Start/End: Original strand, 19936239 - 19936649
Alignment:
Q  46 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||  | || ||||| | |||||||  |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19936239 ttaaggtaagggtgagactagcattcaattctattaagtctgtaattctgatgatt--atttaacatgttgtaggtttagtttttgagaatttgagaatt 19936336  T
Q  146 agggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctaatttttcttttcatctctgccccgaatctg 245  Q
    |||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||    
T  19936337 agggttaagagtgatgatt---------ttgaatgaaagtgaagttgaataatataagttgctttttctgatttttcttttta-ctctgccccgaatttg 19936426  T
Q  246 aaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtc 345  Q
    |||||||| ||||||||||| | | | ||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||  |||||||||| |||     
T  19936427 aaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtagctatggatattagctttctaattccgttggtctggcgtt 19936526  T
Q  346 aaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaa 445  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19936527 aaaacgatttatagaacttgagttatgctcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaa 19936626  T
Q  446 aactgatattgattggtacagaa 468  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  19936627 aactggtattgattggtacagaa 19936649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 47 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 32810536 - 32810263
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatta 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32810536 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaggtttagtttttgagaatttgagaatta 32810437  T
Q  147 gggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctaatttttcttttcatctctgccccgaatctga 246  Q
    ||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  32810436 gggttaagagtgat---------gattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttga 32810346  T
Q  247 aatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatg 329  Q
    ||||||| ||  ||||||| | | | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  32810345 aatgaaatctaatattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttgtaatg 32810263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 47 - 267
Target Start/End: Original strand, 37609722 - 37609941
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatta 146  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37609722 taaggtaagggtgagactaacattcaataatcttgagtctatgattctaaaaattgtatttaacatgttgtaggtttagtttttgagaatttgagaatta 37609821  T
Q  147 gggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctaatttttcttttcatctctgccccgaatctga 246  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  37609822 gggttaagggtgatgattgtgatgattttgaataagagtgaagttgaataatataggttgctttttcttatttttcttttcatctctg-cccgaatttga 37609920  T
Q  247 aatgaaaactggtattgattg 267  Q
    ||||||| |||||||| ||||    
T  37609921 aatgaaatctggtatttattg 37609941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 237 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 19896973 - 19896742
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  19896973 ccgaattttaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 19896874  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatt 436  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19896873 tttgacttcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcaagtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatt 19896774  T
Q  437 tgaaatgaaaactgatattgattggtacagaa 468  Q
    | |||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  19896773 ttaaatgaaaactggtattgattggtagagaa 19896742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 47 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 20457520 - 20457354
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatta 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20457520 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgatcctgaaaattgtatttaacatgttgtaggtttagtttttgagaatttgagaatta 20457421  T
Q  147 gggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttc 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20457420 gggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttc 20457354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 237 - 468
Target Start/End: Original strand, 15202689 - 15202920
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||    
T  15202689 ccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgctattgg 15202788  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatt 436  Q
    | |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15202789 tttgacttcaaaagaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatatttatgaatttcagcacaactttgtccgaatt 15202888  T
Q  437 tgaaatgaaaactgatattgattggtacagaa 468  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  15202889 tgaaacgaaaactggtattgattggtacagaa 15202920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 239 - 465
Target Start/End: Original strand, 16401437 - 16401663
Alignment:
Q  239 gaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtc 338  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||     
T  16401437 gaatttgaaatgcaaactggtattgattggtacgtaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttccaacgccgttggtt 16401536  T
Q  339 tgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttg 438  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16401537 tgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattacagcacgtatgccacaatgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttg 16401636  T
Q  439 aaatgaaaactgatattgattggtaca 465  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||    
T  16401637 aaatgaaaactgatattgattgataca 16401663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 237 - 468
Target Start/End: Original strand, 38549515 - 38549746
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||    
T  38549515 ccgaatttaaaatgaaaactggtattgattggtacagaattgatcttaggtataaacacggaagttgtaggtatggatgttagctttttaattccgttgg 38549614  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatt 436  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38549615 tttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcatcacaactttgtccgaatt 38549714  T
Q  437 tgaaatgaaaactgatattgattggtacagaa 468  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  38549715 tgaaatgaaatctggtattgattggtaaagaa 38549746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 237 - 464
Target Start/End: Original strand, 16401243 - 16401469
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| | | | |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  16401243 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggt-ttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 16401341  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatt 436  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  16401342 tttgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattacagcacgtaggtcacagtgaatgtttatgaatttcaatacaactttgtcagaatt 16401441  T
Q  437 tgaaatgaaaactgatattgattggtac 464  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  16401442 tgaaatgcaaactggtattgattggtac 16401469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 237 - 412
Target Start/End: Original strand, 14397444 - 14397619
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  14397444 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagctgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttgg 14397543  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaa 412  Q
    | |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||||||    
T  14397544 tttgacttcaaaatgatttgtagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaaatcttatgaa 14397619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 244 - 395
Target Start/End: Original strand, 27472127 - 27472278
Alignment:
Q  244 tgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacg 343  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||     
T  27472127 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagatttctaatgtcgttggtttgact 27472226  T
Q  344 tcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27472227 tcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 27472278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 1484860 - 1484702
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||    
T  1484860 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 1484761  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1484760 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtca 1484702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Original strand, 14409148 - 14409306
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||    
T  14409148 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 14409247  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14409248 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtca 14409306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 14824233 - 14824075
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  14824233 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtatagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttgg 14824134  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14824133 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtca 14824075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Original strand, 5852996 - 5853154
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||    
T  5852996 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 5853095  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5853096 tttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtca 5853154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Original strand, 19936611 - 19936769
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||    
T  19936611 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagatttctaatgtcattgg 19936710  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  19936711 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgaggtatagtcaaattactgcacgtaggtca 19936769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 20403738 - 20403580
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  20403738 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattgatacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtattaatgttagctttctaatgtcgttgg 20403639  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  20403638 tttgacttgaaaaggatttatagaacttgagttattgtcatattactgcgcgtaggtca 20403580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 24049069 - 24048912
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24049069 ccgaatttgaaataaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 24048970  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24048969 tttgacttcaaaacaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgca-gtaggtca 24048912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Original strand, 24485747 - 24485905
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  24485747 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttgggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttgg 24485846  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24485847 tttgacttcaaaatgatttataaaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtca 24485905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Original strand, 15202882 - 15203040
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  15202882 ccgaatttgaaacgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttgg 15202981  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| ||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15202982 tttgacttcaaaagaatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtca 15203040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 16198353 - 16198195
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  16198353 ccgaatttgaaataaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatattagctttctaatgccgttgg 16198254  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| | ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16198253 tttgactttaaaaatatttatagaacttgagttatggtccaattactgcacgtaggtca 16198195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 237 - 391
Target Start/End: Original strand, 16413019 - 16413173
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||    
T  16413019 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgacagttgtaggtatggatgttagcttgctaatgccgttgg 16413118  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtag 391  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16413119 tttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattacttcacgtag 16413173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Original strand, 18677768 - 18677926
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  18677768 ccgaattttaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttgg 18677867  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18677868 tttgacttcaaaagaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 18677926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 32122187 - 32122029
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |    
T  32122187 ccgaatttgaaatgtaaactgatattgattggtacagaattgttcttaggtgtaaacacgaatgttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttag 32122088  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32122087 tttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 32122029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 47 - 175
Target Start/End: Original strand, 5852507 - 5852634
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatta 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  5852507 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaatcgtatttaacatgttgtaggtttagtttttgagaatttgggaatta 5852606  T
Q  147 gggttaagagtgatgattgtgatgatttt 175  Q
    ||||||  |||||| ||| ||||||||||    
T  5852607 gggttacaagtgattatt-tgatgatttt 5852634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 237 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 22002211 - 22002055
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  22002211 ccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttgg 22002112  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggt 393  Q
    | |||| ||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22002111 tttgacttcaaaagaatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggt 22002055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 244 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 4483732 - 4483581
Alignment:
Q  244 tgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacg 343  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||||     
T  4483732 tgaaatgaaaactggtatttattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgact 4483633  T
Q  344 tcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4483632 tcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtca 4483581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 15071019 - 15070861
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  15071019 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttgg 15070920  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| | |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15070919 tttgacttaaaaatgatttatacaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtca 15070861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Original strand, 38549708 - 38549866
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  38549708 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgattggtaaagaattggtcttaggtataaacacaaaagttgtaggtatggatgttagttttctaatgtcgttgg 38549807  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  38549808 tttgacttcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaaatactgcacgtatgtca 38549866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 237 - 394
Target Start/End: Original strand, 4542077 - 4542234
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||| |    
T  4542077 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttcg 4542176  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtc 394  Q
      |||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4542177 cttgacttcaaaatgatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtc 4542234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 364 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 1484926 - 1484822
Alignment:
Q  364 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggta 463  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1484926 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 1484827  T
Q  464 cagaa 468  Q
    |||||    
T  1484826 cagaa 1484822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 364 - 468
Target Start/End: Original strand, 5852930 - 5853034
Alignment:
Q  364 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggta 463  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5852930 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 5853029  T
Q  464 cagaa 468  Q
    |||||    
T  5853030 cagaa 5853034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 364 - 468
Target Start/End: Original strand, 14409082 - 14409186
Alignment:
Q  364 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggta 463  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14409082 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 14409181  T
Q  464 cagaa 468  Q
    |||||    
T  14409182 cagaa 14409186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Original strand, 20045899 - 20046057
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||| ||||||    
T  20045899 ccgaatttgaaataaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagatttctaatgccgttgg 20045998  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | | || |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  20045999 tttcacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcatgtaggtca 20046057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 238 - 375
Target Start/End: Original strand, 45290252 - 45290389
Alignment:
Q  238 cgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggt 337  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  45290252 cgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggt 45290351  T
Q  338 ctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtc 375  Q
     |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45290352 ttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtc 45290389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 364 - 468
Target Start/End: Original strand, 20045833 - 20045937
Alignment:
Q  364 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggta 463  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  20045833 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaataaaaactggtattgattggta 20045932  T
Q  464 cagaa 468  Q
    |||||    
T  20045933 cagaa 20045937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Original strand, 16401628 - 16401786
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||    
T  16401628 ccgaatttgaaatgaaaactgatattgattgatacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtattgatgttagatttctaatgccgttgg 16401727  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||    
T  16401728 tttgacttcaaaaggatttataaaacttgagttatagtcagattacagcaggtaggtca 16401786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 19896780 - 19896622
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||  | ||||||    
T  19896780 ccgaattttaaatgaaaactggtattgattggtagagaattggtcttaggtgtaaacacgaaaattgtaggtatgaattttaactttctagcgccgttgg 19896681  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19896680 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtca 19896622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 47 - 160
Target Start/End: Original strand, 24485254 - 24485368
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||    
T  24485254 taaggtaagggtgggactaacatttaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaggttttagtttttgagaatttaggaatt 24485353  T
Q  146 agggttaagagtgat 160  Q
    |||||||| ||||||    
T  24485354 agggttaaaagtgat 24485368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 277 - 391
Target Start/End: Original strand, 45290385 - 45290499
Alignment:
Q  277 tggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtca 376  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  45290385 tggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtca 45290484  T
Q  377 aattactgcacgtag 391  Q
    |||||||||||||||    
T  45290485 aattactgcacgtag 45290499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 364 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 14824299 - 14824195
Alignment:
Q  364 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggta 463  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14824299 tgagttatggtcaaattattgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 14824200  T
Q  464 cagaa 468  Q
     ||||    
T  14824199 tagaa 14824195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 46 - 160
Target Start/End: Original strand, 45289760 - 45289875
Alignment:
Q  46 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgta-agtttagtttttgagaatttgagaat 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  45289760 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttaagtctatgattctaaaaattggatttaacatgttgtagggtttagtttttgagaatttgggaat 45289859  T
Q  145 tagggttaagagtgat 160  Q
    ||||||||| ||||||    
T  45289860 tagggttaaaagtgat 45289875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 273 - 395
Target Start/End: Original strand, 25657892 - 25658014
Alignment:
Q  273 gaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatg 372  Q
    ||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || |||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25657892 gaattggtctttggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgtttgtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 25657991  T
Q  373 gtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  25657992 gtcaaattactgcacgtaggtca 25658014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 47 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 1485350 - 1485222
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  1485350 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttaagtcattgattctgaaaattggatttaacatgttgtaggttttagtttttgagaatttgggaatt 1485251  T
Q  146 agggttaagagtgatgattgtgatgatttt 175  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  1485250 agggttaaaagtgattatt-tgatgatttt 1485222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 47 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 4484228 - 4484100
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  4484228 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttaagtcattgattctgaaaattggatttaacatgttgtaggttttagtttttgagaatttgggaatt 4484129  T
Q  146 agggttaagagtgatgattgtgatgatttt 175  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  4484128 agggttaaaagtgatcatt-tgatgatttt 4484100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 47 - 175
Target Start/End: Original strand, 14408658 - 14408786
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  14408658 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttaagtcattgattctgaaaattggatttaacatgttgtaggttttagtttttgagaatttgggaatt 14408757  T
Q  146 agggttaagagtgatgattgtgatgatttt 175  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  14408758 agggttaaaagtgattatt-tgatgatttt 14408786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 47 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 14824724 - 14824596
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  14824724 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttaagtcattgattctgaaaattggatttaacatgttgtaggttttagtttttgagaatttgggaatt 14824625  T
Q  146 agggttaagagtgatgattgtgatgatttt 175  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  14824624 agggttaaaagtgattatt-tgatgatttt 14824596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 47 - 175
Target Start/End: Original strand, 18677276 - 18677404
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||    
T  18677276 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttaagtcattgattctgaaaattggatttaacatgttgtaggttttcgtttttgagaatttgggaatt 18677375  T
Q  146 agggttaagagtgatgattgtgatgatttt 175  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  18677376 agggttaaaagtgattatt-tgatgatttt 18677404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 47 - 175
Target Start/End: Original strand, 20045409 - 20045537
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||    
T  20045409 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttaagtcattgattctgaaaattggatttaacatgttgtaggttttagtttttgaaaatttgggaatt 20045508  T
Q  146 agggttaagagtgatgattgtgatgatttt 175  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  20045509 agggttaaaagtgattatt-tgatgatttt 20045537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 48 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 23914931 - 23914804
Alignment:
Q  48 aaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaatta 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23914931 aaggtaagggtgggactaacattcaaaaatcttaagtcattgattctgaaaattggatttaatatgttgtaagttttagtttttgagaatttgagaatta 23914832  T
Q  147 gggttaagagtgatgattgtgatgatttt 175  Q
    ||||||| | |||| ||| ||||||||||    
T  23914831 gggttaaaattgattatt-tgatgatttt 23914804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 165
Target Start/End: Original strand, 22252315 - 22252432
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatta 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  22252315 taaggtaagggtgggactaacattcaatcttcttaagcctatgattctgataattagatttaacatgttgtaggtttagtttttgagaatttga-aatta 22252413  T
Q  147 gggttaagagtgatgattg 165  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  22252414 gggttaagagtgataattg 22252432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 364 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 4483804 - 4483704
Alignment:
Q  364 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggta 463  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||    
T  4483804 tgagttatggtcaaattactgcatgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaa-ttgaaatgaaaactggtatttattggta 4483706  T
Q  464 ca 465  Q
    ||    
T  4483705 ca 4483704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Original strand, 13660826 - 13660969
Alignment:
Q  19 aagaggaaaggttgccgatcgttaatcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacat-gttgt 117  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| | ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  13660826 aagaggaaaggttgccgattgttaatcataaggtaagggtgggactaaccttcaataattctgagtatgtgattctgaaaattgaatttaacatggttgt 13660925  T
Q  118 aagtttagtttttgagaatttgagaattagggttaagagtgatga 162  Q
    | ||| |  |||| |||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  13660926 aggttgaagtttt-agaatttgagaattagggttcaaagtgatga 13660969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Original strand, 13719469 - 13719612
Alignment:
Q  19 aagaggaaaggttgccgatcgttaatcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacat-gttgt 117  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| | ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  13719469 aagaggaaaggttgccgattgttaatcataaggtaagggtgggactaaccttcaataattctgagtatgtgattctgaaaattgaatttaacatggttgt 13719568  T
Q  118 aagtttagtttttgagaatttgagaattagggttaagagtgatga 162  Q
    | ||| |  |||| |||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  13719569 aggttgaagtttt-agaatttgagaattagggttcaaagtgatga 13719612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 47 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 22002703 - 22002591
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||    
T  22002703 taaggtaagggtgagactaacattcaataatcttaagtcattgattctgaaaattggatttaacatgttgtaggttttcgtttttgagaatttgagaatt 22002604  T
Q  146 agggttaagagtg 158  Q
    |||||||| ||||    
T  22002603 agggttaaaagtg 22002591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 373 - 468
Target Start/End: Original strand, 16401186 - 16401281
Alignment:
Q  373 gtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaa 468  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||    
T  16401186 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaa 16401281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 47 - 158
Target Start/End: Original strand, 22245237 - 22245347
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatta 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  22245237 taaggtaagggtgggactaacattcaatcttcttaagcctatgattctgataattagatttaacatgttgtaggtttagtttttgagaatttga-aatta 22245335  T
Q  147 gggttaagagtg 158  Q
    ||||||||||||    
T  22245336 gggttaagagtg 22245347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 47 - 175
Target Start/End: Original strand, 4541584 - 4541712
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| || ||    
T  4541584 taaggtaagggtgggactaatattcaataatcttaagtcattgattctgaaaattggatttaacatgttgtaggttttagtttttgataatttgggattt 4541683  T
Q  146 agggttaagagtgatgattgtgatgatttt 175  Q
    |||||||| ||| || ||| ||||||||||    
T  4541684 agggttaaaagttattatt-tgatgatttt 4541712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 400 - 468
Target Start/End: Original strand, 4542047 - 4542115
Alignment:
Q  400 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaa 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4542047 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaa 4542115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 400 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 22002241 - 22002173
Alignment:
Q  400 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaa 468  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22002241 gaatttgtatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaa 22002173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 400 - 468
Target Start/End: Original strand, 24485717 - 24485785
Alignment:
Q  400 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaa 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24485717 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaa 24485785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 47 - 165
Target Start/End: Original strand, 22385077 - 22385193
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatta 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  22385077 taaggtaatggtgggactaacattcaatcttcttaagcctatgattctgataattagatttaacatgttgtaggtttag-ttttgagaatttga-aatta 22385174  T
Q  147 gggttaagagtgatgattg 165  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  22385175 gggttaagagtgataattg 22385193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 48 - 148
Target Start/End: Original strand, 25733821 - 25733921
Alignment:
Q  48 aaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaattag 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||   ||||||||||||| |||||||    
T  25733821 aaggtaagggtgggactaacattcaataatcttatgtcattgattctgaaaattggatttaatatgttgtaagttttagttttgagaatttgggaattag 25733920  T
Q  148 g 148  Q
    |    
T  25733921 g 25733921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 365 - 465
Target Start/End: Original strand, 45290186 - 45290286
Alignment:
Q  365 gagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtac 464  Q
    |||||||| | ||| ||||  |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45290186 gagttatgatgaaaatactcaacgtaggtcacagttaatttttatgaatttcagcacaactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtac 45290285  T
Q  465 a 465  Q
    |    
T  45290286 a 45290286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 405 - 468
Target Start/End: Original strand, 14397419 - 14397482
Alignment:
Q  405 tttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaa 468  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14397419 tttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaa 14397482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 400 - 465
Target Start/End: Original strand, 18677738 - 18677803
Alignment:
Q  400 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtaca 465  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  18677738 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaattttaaatgaaaactggtattgattggtaca 18677803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 27 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 28398560 - 28398423
Alignment:
Q  27 aggttgccgatcgttaatcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagt 126  Q
    |||||||||||  | |||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |||| || ||||||||||||  |||  | ||||||||||||| | |||||    
T  28398560 aggttgccgattttgaatcataaggtaagggtgagactaacattcaattttcttaagcctatgattctgatgattagaattaacatgttgtaggattagt 28398461  T
Q  127 ttttgagaatttgagaattagggttaagagtgatgattg 165  Q
    ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  28398460 tttggagaa-ttgaaaattagggttaagagtgataattg 28398423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 46 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 37516660 - 37516548
Alignment:
Q  46 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatg-ttgtaagtttagtttttgagaatttgagaat 144  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||| | | ||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  37516660 ttaaggtaagggtgggactaaccttcaataatcttgagtatgtgattctg-aaattgaatttaaaacgattgtaggttgagttttt-agaatttgagaat 37516563  T
Q  145 tagggttaagagtga 159  Q
    ||||||||| |||||    
T  37516562 tagggttaaaagtga 37516548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 363 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 16198420 - 16198315
Alignment:
Q  363 ttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggt 462  Q
    ||||| |||| | ||| |||| |||| |||||  || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  16198420 ttgagatatgattaaaatactccacggaggtcttagtgaaattttatgaatttcaccacaactttgtccgaatttgaaataaaaactggtattgattggt 16198321  T
Q  463 acagaa 468  Q
    ||||||    
T  16198320 acagaa 16198315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 47 - 136
Target Start/End: Original strand, 19928758 - 19928847
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaat 136  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  19928758 taaggtaagggtgagactaacattcattaatcttaagcctttgattctgaaaattgcatttaacatgttataggtttagttttttagaat 19928847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 44 - 165
Target Start/End: Original strand, 20501227 - 20501347
Alignment:
Q  44 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||  |||  |||||||||||| || | ||| |||||||||||| ||| |    
T  20501227 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaatcttcttaagcctatgattctgatgattagatttaacatgttttagggttactttttgagaattggag-a 20501325  T
Q  144 ttagggttaagagtgatgattg 165  Q
    ||| ||||||||||||| ||||    
T  20501326 ttaaggttaagagtgataattg 20501347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 44 - 148
Target Start/End: Original strand, 19154009 - 19154113
Alignment:
Q  44 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaa 143  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||  | || ||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| ||    
T  19154009 tcttaaggtaacggtgggactagcattcaattctattaagtttatgattctgatagttgtatttaacaggttgtaggattagtttttgagaatttgaaaa 19154108  T
Q  144 ttagg 148  Q
    |||||    
T  19154109 ttagg 19154113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 39834643 - 39834578
Alignment:
Q  9 gagatgaaccaagaggaaaggttgccgatcgttaatcttaaggtaagggtgggactaacattcaat 74  Q
    |||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39834643 gagaagaaccaagaggaaaagctgccgatcgttaatcttaaggtaagggtgagactaacattcaat 39834578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 47 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 21330876 - 21330771
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagttttt-gagaatttgagaatt 145  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||||    ||||||||||| |||||||||||||||    
T  21330876 taaggtaagggtgggactatcattcagtgatcttaagtctatgattttg-aaattggatttaacatgtt-agggtttagtttttggagaatttgagaatt 21330779  T
Q  146 agggttaa 153  Q
    ||||||||    
T  21330778 agggttaa 21330771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 48 - 152
Target Start/End: Original strand, 42265510 - 42265614
Alignment:
Q  48 aaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtt-tagtttttgagaatttgagaatta 146  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||   ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| ||| ||||| ||||||| ||||||    
T  42265510 aaggtaagggtgggactaacctttaataagtctgagtatatgattctgaaaattgaatttaacaagttgtaggttgtag-ttttgggaatttgggaatta 42265608  T
Q  147 gggtta 152  Q
    ||||||    
T  42265609 gggtta 42265614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 44 - 148
Target Start/End: Original strand, 17438661 - 17438765
Alignment:
Q  44 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaa 143  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||||  | || |||||||||||||||   | |||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  17438661 tcttaaggtaaggttgagactagcattcaattctattaagtctatgattctgatggtcgtatttaacaagttgtaggattagtttgtgagaatttgagaa 17438760  T
Q  144 ttagg 148  Q
    |||||    
T  17438761 ttagg 17438765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 44 - 115
Target Start/End: Original strand, 17460205 - 17460276
Alignment:
Q  44 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgtt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  17460205 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaatcttcttaagcctatgattctgataattagatttaacatgtt 17460276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 160
Target Start/End: Original strand, 21999438 - 21999550
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtt-tagtt--tttgagaatttgagaa 143  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||| |||||| |||||| ||||||||   |||||||| |  ||  ||||||||||||||||    
T  21999438 taaggtaagggtgggactatcattcagtgatcttaagtctataattctg-aaattggatttaaca---tgtaagttgttcttgatttgagaatttgagaa 21999533  T
Q  144 ttagggttaagagtgat 160  Q
    |||||||||| ||||||    
T  21999534 ttagggttaaaagtgat 21999550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 47 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 3273942 - 3273872
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||  || || ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  3273942 taaggtaagggtgggactaacctttaataattatgtgtatatgattctgaaaattgaatttaacaggttgt 3273872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 313 - 383
Target Start/End: Original strand, 15320028 - 15320098
Alignment:
Q  313 atgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 383  Q
    |||||| |||||||||| | ||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  15320028 atgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 15320098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 313 - 383
Target Start/End: Original strand, 15500397 - 15500467
Alignment:
Q  313 atgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 383  Q
    |||||| |||||||||| | ||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  15500397 atgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 15500467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 47 - 164
Target Start/End: Original strand, 21966701 - 21966809
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatta 146  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||| |||||| |||||| ||||||||   ||||||||  ||| |||   ||||||||||||    
T  21966701 taaggtaagggtgggactatcattcagtgatcttaagtctataattctg-aaattggatttaaca---tgtaagtt--gttcttg---atttgagaatta 21966791  T
Q  147 gggttaagagtgatgatt 164  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  21966792 gggttaaaagtgatgatt 21966809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 314 - 383
Target Start/End: Original strand, 13663129 - 13663198
Alignment:
Q  314 tgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 383  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| ||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  13663129 tgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 13663198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 314 - 383
Target Start/End: Original strand, 22007126 - 22007195
Alignment:
Q  314 tgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 383  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| ||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  22007126 tgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 22007195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 117
Target Start/End: Original strand, 14396910 - 14396981
Alignment:
Q  46 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgt-atttaacatgttgt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||| || |||| ||||||||||||||    
T  14396910 ttaaggtaagggtgggactaacattcaatcttcttaagcctatgattctg-aatttgtgatttaacatgttgt 14396981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 20458045 - 20457989
Alignment:
Q  46 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattg 102  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  20458045 ttaaggtaagggtgagactaaccttcaataattttgagtatatgattttgaaaattg 20457989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 20463248 - 20463192
Alignment:
Q  46 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattg 102  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  20463248 ttaaggtaagggtgagactaaccttcaataattctgagtatatgattctgaaaattg 20463192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 111
Target Start/End: Original strand, 22317911 - 22317975
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaaca 111  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||  | ||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  22317911 taaggtaagggtgggactaaccttcactaattctaagtgtatgattctgaaaattgaatttaaca 22317975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 291 - 383
Target Start/End: Original strand, 24717728 - 24717820
Alignment:
Q  291 aacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 383  Q
    |||| ||||||| ||||||   ||||||  ||||||||| | ||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  24717728 aacatgaaagttttaggtaattatgttagatttctaatgcctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 24717820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 373 - 427
Target Start/End: Original strand, 3844554 - 3844609
Alignment:
Q  373 gtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatg-aatttcagcacaacttt 427  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3844554 gtcaaattactacacgtaggtcatagtgaatttttatgaaatttcagcacaacttt 3844609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 165
Target Start/End: Original strand, 17085077 - 17085187
Alignment:
Q  54 agggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaattagggttaa 153  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| || || | ||| |||  |||  |||||||| |||||| | |||||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  17085077 agggtgggactaacattcaatcttcttaagcctttaattatgatgattagatttaacaagttgtagggttagtttttg-gaaattgaaaattagggttaa 17085175  T
Q  154 gagtgatgattg 165  Q
    ||||||| ||||    
T  17085176 gagtgataattg 17085187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 165
Target Start/End: Original strand, 17085311 - 17085421
Alignment:
Q  54 agggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaattagggttaa 153  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| || || | ||| |||  |||  |||||||| |||||| | |||||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  17085311 agggtgggactaacattcaatcttcttaagcctttaattatgatgattagatttaacaagttgtagggttagtttttg-gaaattgaaaattagggttaa 17085409  T
Q  154 gagtgatgattg 165  Q
    ||||||| ||||    
T  17085410 gagtgataattg 17085421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 47 - 114
Target Start/End: Original strand, 22005077 - 22005143
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgt 114  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  22005077 taaggtaagggtgggactatcattcagtgatcttcagtctataattctg-aaattggatttaacatgt 22005143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 376 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 11360997 - 11360951
Alignment:
Q  376 aaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcaca 422  Q
    |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  11360997 aaattactgcacgtagatcatagtgaatttttatgaatttcagcaca 11360951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 47 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 23661347 - 23661266
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagttt 128  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||  || | || |||||||||||| ||||  ||||||||||||| | |||||||||    
T  23661347 taaggtaagggtgggactggcattcaatcttcataagcctatgattctgataattagatttaacatgttggaggtttagttt 23661266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 314 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 29759498 - 29759429
Alignment:
Q  314 tgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 383  Q
    ||||| |||||||||| | ||||| |||| || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  29759498 tgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 29759429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 431 - 471
Target Start/End: Original strand, 16412827 - 16412867
Alignment:
Q  431 cgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaactg 471  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  16412827 cgaatttgaaatgaaaattggtattgattggtacagaactg 16412867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 46 - 117
Target Start/End: Original strand, 25483441 - 25483512
Alignment:
Q  46 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgt-atttaacatgttgt 117  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||| || |||| ||||||||||||||    
T  25483441 ttaagttaagggtgggactaacattcaatcttcttaagcctatgattctg-aatttgtgatttaacatgttgt 25483512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 159
Target Start/End: Original strand, 40492028 - 40492139
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatta 146  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||  | || ||||| | ||| |||  |||  |||||||| || ||| | ||| |||| ||||||||||||||||    
T  40492028 taaggtaagggtgagactagcattcaatcttattaagtctgtaattttgatgattaaatttaacaagt-gtaggattaattttagagaatttgagaatta 40492126  T
Q  147 gggttaagagtga 159  Q
    |||||||||||||    
T  40492127 gggttaagagtga 40492139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 97
Target Start/End: Original strand, 19807393 - 19807444
Alignment:
Q  46 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaa 97  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| | ||||||||||    
T  19807393 ttaaggtaagggtgggactaaccttcaataattctgagtatgtgattctgaa 19807444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #112
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 160
Target Start/End: Original strand, 21979467 - 21979579
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtt-tagtt--tttgagaatttgagaa 143  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| | ||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||   ||||| |  ||  ||||||||||||||||    
T  21979467 taaggtaaaggtgggactatcattcagtgatcttaagtctataattctgaaa-ttggatttatcatgt---aagttgttcttgatttgagaatttgagaa 21979562  T
Q  144 ttagggttaagagtgat 160  Q
    |||||||||| ||||||    
T  21979563 ttagggttaaaagtgat 21979579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #113
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 160
Target Start/End: Original strand, 21982952 - 21983064
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtt-tagtt--tttgagaatttgagaa 143  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||| |||||| |||||| ||||||||    ||||||| |  ||  ||||||||||||||||    
T  21982952 taagctaagggtgggactatcattcagtgatcttaagtctataattctg-aaattggatttaaca---agtaagttgttcttgatttgagaatttgagaa 21983047  T
Q  144 ttagggttaagagtgat 160  Q
    |||||||||| ||||||    
T  21983048 ttagggttaaaagtgat 21983064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #114
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 98
Target Start/End: Original strand, 44522179 - 44522230
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaa 98  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||| |||||||||    
T  44522179 taaggtaagggtgggactatcattcagtaatcttaagtttataattctgaaa 44522230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #115
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 430 - 468
Target Start/End: Original strand, 1326635 - 1326673
Alignment:
Q  430 ccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaa 468  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  1326635 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgattggtacagaa 1326673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #116
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 333 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 18612002 - 18611952
Alignment:
Q  333 ttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 383  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  18612002 ttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 18611952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #117
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 313 - 383
Target Start/End: Original strand, 22089412 - 22089482
Alignment:
Q  313 atgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 383  Q
    |||||| |||||||||| | ||||| ||||||| ||| ||| |  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  22089412 atgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatattaagaacttgagttatgatcaaattact 22089482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #118
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 24354016 - 24353916
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatta 146  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||  | || ||||| | |||||||  |||  |||||||| || ||| | |||||||| ||||||||||||||||    
T  24354016 taaggtaagggtgagactagcattcaatcttattaagtctgtaattctgatgattaaatttaacaagt-gtatggttagttttagagaatttgagaatta 24353918  T
Q  147 gg 148  Q
    ||    
T  24353917 gg 24353916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #119
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 131 - 159
Target Start/End: Original strand, 2418084 - 2418112
Alignment:
Q  131 gagaatttgagaattagggttaagagtga 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2418084 gagaatttgagaattagggttaagagtga 2418112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #120
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 49 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 22984612 - 22984533
Alignment:
Q  49 aggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttt 129  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  |||| || || |||||||||  |||  |||||||||| |||| ||||||||||    
T  22984612 aggtaagggtgagactaacattcaatcttcttaagcctttgattctgatgattagatttaacatg-tgtaggtttagtttt 22984533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #121
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 46 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 22996764 - 22996696
Alignment:
Q  46 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgt 114  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||| || |||||||| |||  |||  |||||||||||    
T  22996764 ttaaggtaagggtgagactaacattcaatcttcttaagcctatgattttgatgattagatttaacatgt 22996696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #122
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 46 - 98
Target Start/End: Original strand, 44474701 - 44474753
Alignment:
Q  46 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaa 98  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| | ||||| ||||||| |||||||||    
T  44474701 ttaaggtaagggtgagactatcattcagtgatcttaagtctataattctgaaa 44474753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 361; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 44 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 18782 - 18358
Alignment:
Q  44 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaa 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  18782 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaggtttagtttttgagaatctgagaa 18683  T
Q  144 ttagggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctaatttttcttttcatctctgccccgaatc 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  18682 ttagggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatt 18583  T
Q  244 tgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacg 343  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  18582 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcattggtctgacg 18483  T
Q  344 tcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatg 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18482 tcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatg 18383  T
Q  444 aaaactgatattgattggtacagaa 468  Q
    |||||||  ||||||||||||||||    
T  18382 aaaactggcattgattggtacagaa 18358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 355; Significance: 0; HSPs: 115)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 46 - 468
Target Start/End: Original strand, 14970026 - 14970448
Alignment:
Q  46 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  14970026 ttaaggtaagggtgagactaacattcaataatcttgagtctgtgattctgaaaattgtatttaacatgttataggtttagtttttgagaatttgagaatt 14970125  T
Q  146 agggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctaatttttcttttcatctctgccccgaatctg 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14970126 agggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttg 14970225  T
Q  246 aaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtc 345  Q
    |||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  14970226 aaatgaaaactggtattgatttgtacacaattggtcttaggtgataacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtc 14970325  T
Q  346 aaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaa 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14970326 aaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaa 14970425  T
Q  446 aactgatattgattggtacagaa 468  Q
    ||||| |||||||||||| ||||    
T  14970426 aactggtattgattggtatagaa 14970448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 47 - 468
Target Start/End: Original strand, 18214524 - 18214945
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatta 146  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18214524 taaggtaagcgtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgcaaattgtatttaacatgttgtaggtttagtttttgagaatttgagaatta 18214623  T
Q  147 gggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctaatttttcttttcatctctgccccgaatctga 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  18214624 gggttaagagtgatgattgtgatgattttgaaggaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccaaatttga 18214723  T
Q  247 aatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtca 346  Q
    ||||||| ||||||||||| | | | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  18214724 aatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtca 18214823  T
Q  347 aaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18214824 aaacgatttatagaacttgagttatggtcatattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaa 18214923  T
Q  447 actgatattgattggtacagaa 468  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  18214924 actggtattgattggtacagaa 18214945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 47 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 363215 - 362794
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatta 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  363215 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaggtttagtttttgagaatttgagaatta 363116  T
Q  147 gggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctaatttttcttttcatctctgccccgaatctga 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  363115 gggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatatatgttgctttttatgatttttcttttcatctctgccccgaatttga 363016  T
Q  247 aatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtca 346  Q
    |||||||  |||||||||||  ||  ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  363015 aatgaaatgtggtattgatttgtatagaattggtcttaggtgtaaacccgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtca 362916  T
Q  347 aaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaa 446  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  362915 aaaagatttatagaatttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatatcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaa 362816  T
Q  447 actgatattgattggtacagaa 468  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  362815 actggtattgattggtacagaa 362794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 47 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 3515849 - 3515431
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatta 146  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  3515849 taaggtaagggtgagactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaggtttagtttttgataatttgagaatta 3515750  T
Q  147 gggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctaatttttcttttcatctctgccccgaatctga 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||    
T  3515749 gggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgttttttctgatttttcttttcatctctaccctgaatttga 3515650  T
Q  247 aatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtca 346  Q
    ||||||| ||||||||||| | | | |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||    
T  3515649 aatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggcgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctcacgtca 3515550  T
Q  347 aaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3515549 aaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaattttagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaa 3515450  T
Q  447 actgatattgattggtaca 465  Q
    |||| ||||||| ||||||    
T  3515449 actggtattgatcggtaca 3515431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 44 - 465
Target Start/End: Original strand, 52872399 - 52872811
Alignment:
Q  44 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaa 143  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  52872399 tcttaaggtaagggtgggattaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaggtttagtttttgagaatttgagaa 52872498  T
Q  144 ttagggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctaatttttcttttcatctctgccccgaatc 243  Q
    ||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  52872499 ttagggttaagagtga---------tgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatt 52872589  T
Q  244 tgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacg 343  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||    
T  52872590 tgaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattctgttggtctgacg 52872689  T
Q  344 tcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatg 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52872690 tcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatgtttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatg 52872789  T
Q  444 aaaactgatattgattggtaca 465  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  52872790 aaaactggtattgattggtaca 52872811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 48 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 52313595 - 52313175
Alignment:
Q  48 aaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaattag 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||     
T  52313595 aaggtaagggtgggactaacattcaataatcttaagtctatgattctgaaaattgtatttaatatgttgtaggtttagtttttgagaattagagaattaa 52313496  T
Q  148 ggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctaatttttcttttcatctctgccccgaatctgaa 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  52313495 ggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttaaataatatggggtgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaa 52313396  T
Q  248 atgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaa 347  Q
    |||||| ||||||||||| | |   |||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  52313395 atgaaatctggtattgataggtcaagaattgatcttaggtgtaaacacgaaagttataggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaa 52313296  T
Q  348 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaa 447  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  52313295 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaat 52313196  T
Q  448 ctgatattgattggtacagaa 468  Q
    ||| ||||||| ||| |||||    
T  52313195 ctggtattgataggtccagaa 52313175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 46 - 467
Target Start/End: Original strand, 19617394 - 19617807
Alignment:
Q  46 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||          
T  19617394 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaggtttagtttttgagaatttg------ 19617487  T
Q  146 agggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctaatttttcttttcatctctgccccgaatctg 245  Q
      ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19617488 --ggttaagagtgatgattttgatgatttcgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttctatgatttttcttttcatctctgccccgaatttg 19617585  T
Q  246 aaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtc 345  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| |    
T  19617586 aaatgaaatctggtattgattggtacataattggtcttaggtgtagacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctaacgcc 19617685  T
Q  346 aaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaa 445  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19617686 aaaatgatttattgaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtctgaatttgaaatgaa 19617785  T
Q  446 aactgatattgattggtacaga 467  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  19617786 aactggtattgattggtacaga 19617807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 52 - 395
Target Start/End: Original strand, 11773 - 12116
Alignment:
Q  52 taagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaattagggtt 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11773 taagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaatatgttgtaggtttagtttttgagaatttgagaattagggtt 11872  T
Q  152 aagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctaatttttcttttcatctctgccccgaatctgaaatga 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  11873 aagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatatgggttgctttttctgatttttctttttatctctgccccgaatttgaaatga 11972  T
Q  252 aaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacg 351  Q
    || ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| |    
T  11973 aatctggtattgataggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatcaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaagg 12072  T
Q  352 atttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12073 atttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtca 12116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 165 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 19858302 - 19858002
Alignment:
Q  165 gtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctaatttttcttttcatctctgccccgaatctgaaatgaaaactggtattga 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  19858302 gtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctaatttttcttttcatctctaccccgaatttgaaatgaaaaatggtattga 19858203  T
Q  265 ttgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaactt 364  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19858202 ttggtacagaattggtcttaggtgcaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaactt 19858103  T
Q  365 gagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtac 464  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  19858102 gagttatggtcaaattattgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatgagaaatgaaaactggtattgattggtac 19858003  T
Q  465 a 465  Q
    |    
T  19858002 a 19858002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 44 - 311
Target Start/End: Original strand, 12778193 - 12778460
Alignment:
Q  44 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaa-ttgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgaga 142  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12778193 tcttaaggcaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaaattgtatttaacatgttgtaggtttagtttttgagaatttgaga 12778292  T
Q  143 attagggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctaatttttcttttcatctctgccccgaat 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  12778293 attagggttaagagtgatgattgtgataattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctga-ttttcttttcatctctgccccgaat 12778391  T
Q  243 ctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatg 311  Q
     |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  12778392 ttgaaatgaaatctggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatg 12778460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 44 - 288
Target Start/End: Original strand, 15489466 - 15489710
Alignment:
Q  44 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaa 143  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15489466 tcttaaggtaagggtgggaataacattcaataatcttgagtctataattctgaaaattgtatttaacatgttgtaggtttagtttttgagaatttgagaa 15489565  T
Q  144 ttagggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctaatttttcttttcatctctgccccgaatc 243  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  15489566 ttagggttaaaagtgatgattgtgaagattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatt 15489665  T
Q  244 tgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtg 288  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15489666 tgaaatgaagtctggtattgattgatacagaattggtcttaggtg 15489710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 237 - 468
Target Start/End: Original strand, 14746022 - 14746253
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14746022 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacaagaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 14746121  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatt 436  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14746122 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtagatcatagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatt 14746221  T
Q  437 tgaaatgaaaactgatattgattggtacagaa 468  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14746222 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaa 14746253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 44 - 282
Target Start/End: Original strand, 14745697 - 14745931
Alignment:
Q  44 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  14745697 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaa----tatttaacatgttgtaggtttagtttttgagaatatgagaa 14745792  T
Q  144 ttagggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctaatttttcttttcatctctgccccgaatc 243  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14745793 ttaaggttaagagtaatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctaatttttcttttcatctctgccccgaatt 14745892  T
Q  244 tgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtct 282  Q
    ||||||||||  |||||||||| | | | ||||||||||    
T  14745893 tgaaatgaaatttggtattgataggtccagaattggtct 14745931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 237 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 362832 - 362604
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  362832 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacactaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 362733  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatt 436  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  362732 tctgacatcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgattttttatgaatttcagcacaactttgtctgaatt 362633  T
Q  437 tgaaatgaaaactgatattgattggtaca 465  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  362632 tgaaatgaaaactggtattgattgataca 362604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 273 - 468
Target Start/End: Original strand, 15495720 - 15495915
Alignment:
Q  273 gaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatg 372  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15495720 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacaatttatagaacttgagttatg 15495819  T
Q  373 gtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaa 468  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15495820 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtcctaatttggaatgaaaactggtattgattggtacagaa 15495915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 237 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 52313213 - 52312982
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| | | | |||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||    
T  52313213 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattgatcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagatttctaatgcctttgg 52313114  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatt 436  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  52313113 tatgacgtcaaaacgatttatagaacttgatttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaagtttgtccgaatt 52313014  T
Q  437 tgaaatgaaaactgatattgattggtacagaa 468  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  52313013 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaa 52312982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 47 - 267
Target Start/End: Original strand, 15354846 - 15355058
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtattt-aacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15354846 taaggtaagggtggaactaacattcaataatcttgagtctatgattctgataattttattttaacatgttgtaggtttagtttttgagaatttgagaatt 15354945  T
Q  146 agggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctaatttttcttttcatctctgccccgaatctg 245  Q
    ||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  15354946 agggttaaga---------gtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataacataggttgctttttctgatttttctttccatctctgccccgaatttg 15355036  T
Q  246 aaatgaaaactggtattgattg 267  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  15355037 aaatgaaaactggtatcgattg 15355058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 293 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 14185731 - 14185556
Alignment:
Q  293 cacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtagg 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  14185731 cacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacgtcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattattgaacgtagg 14185632  T
Q  393 tcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaa 468  Q
    ||| || |||| |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  14185631 tcacagtgaatctttaggaatttcagcacaacttttcccgaatttgaaataaaaactggtattgattggtacagaa 14185556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 239 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 15534638 - 15534482
Alignment:
Q  239 gaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtc 338  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||     
T  15534638 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtt 15534539  T
Q  339 tgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15534538 tgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 15534482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 333 - 468
Target Start/End: Original strand, 14745925 - 14746060
Alignment:
Q  333 ttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccg 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14745925 ttggtctgacgtcaaaacgatttatagcacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtaaatttttatgaatttcagcacaactttgtccg 14746024  T
Q  433 aatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaa 468  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14746025 aatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaa 14746060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 239 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 362637 - 362481
Alignment:
Q  239 gaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtc 338  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||     
T  362637 gaatttgaaatgaaaactggtattgattgatacaaaattagtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttagtt 362538  T
Q  339 tgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  362537 tgacttcaaaacgatttatagaacttgatttatggtcaaattactgcacgtaggtca 362481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 239 - 395
Target Start/End: Original strand, 49547479 - 49547635
Alignment:
Q  239 gaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtc 338  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||     
T  49547479 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaatttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtt 49547578  T
Q  339 tgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49547579 tgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 49547635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 44 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 19858458 - 19858327
Alignment:
Q  44 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaa-ttgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgaga 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |    
T  19858458 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaaattgtatttaacatgttgtaggtttactttttgagaatttgata 19858359  T
Q  143 attagggttaagagtgatgattgtgatgattt 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19858358 attagggttaagagtgatgattgtgatgattt 19858327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Original strand, 14970410 - 14970568
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  14970410 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtatagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 14970509  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14970510 tttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacataggtca 14970568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Original strand, 52872776 - 52872934
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  52872776 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgctagctttctaatgccgttgg 52872875  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52872876 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 52872934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 239 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 36038327 - 36038171
Alignment:
Q  239 gaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtc 338  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||     
T  36038327 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggccttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaataccgttggtt 36038228  T
Q  339 tgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36038227 tgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 36038171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Original strand, 15118056 - 15118214
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||    
T  15118056 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 15118155  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15118156 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtca 15118214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 19243159 - 19243001
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||   |||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  19243159 ccgaatttgaaacgaaaactggtattgattggtacagaattagtcttaggtataaacaagaaagttgtaggtatgtatgttagctttctaatgtcgttgg 19243060  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  19243059 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggttaaattactgaacgtaggtca 19243001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 3515466 - 3515308
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  3515466 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgatcggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 3515367  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3515366 tttgacttcaaaatgatttatagaacttgagctatggtcaaattactgcacgtaggtca 3515308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Original strand, 44772787 - 44772945
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  44772787 ccgaattttaaatgaaaactggtatttattggtagagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttgg 44772886  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44772887 tttgacttcaaaaagatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtca 44772945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 239 - 395
Target Start/End: Original strand, 19617772 - 19617928
Alignment:
Q  239 gaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtc 338  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||     
T  19617772 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagagttggtcttaggtgttaacacaaaagttataggtatggatgttagctttctaatgctgttggtg 19617871  T
Q  339 tgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19617872 tgacttcaaaaggatttatagaagttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 19617928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 245 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 19858029 - 19857879
Alignment:
Q  245 gaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgt 344  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| |||| |    
T  19858029 gaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgtatgttagctttctaatgccgttggtttgactt 19857930  T
Q  345 caaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19857929 caaaataatttatagaacttgatttatggtcaaattactgcacgtaggtca 19857879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 29267812 - 29267654
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| || ||||||    
T  29267812 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctattgccgttgg 29267713  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29267712 tttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtca 29267654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Original strand, 1837223 - 1837381
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||    
T  1837223 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 1837322  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| | |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1837323 tttgacttaaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtca 1837381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Original strand, 14746215 - 14746373
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||  |  |||||||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||||    
T  14746215 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttcggtgtaaggacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaattccgttgg 14746314  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14746315 tttgactttaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 14746373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Original strand, 50222043 - 50222201
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||||  |||||| |||||||||| ||||||    
T  50222043 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagatgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 50222142  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  50222143 tttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtca 50222201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 52313020 - 52312863
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  52313020 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttgg 52312921  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | | || |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  52312920 ttttacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtc-aattactgcacgcaggtca 52312863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 364 - 468
Target Start/End: Original strand, 15117990 - 15118094
Alignment:
Q  364 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggta 463  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15117990 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 15118089  T
Q  464 cagaa 468  Q
    |||||    
T  15118090 cagaa 15118094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 314 - 468
Target Start/End: Original strand, 22725313 - 22725466
Alignment:
Q  314 tgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaat 413  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||    
T  22725313 tgttagctttctaatc-cgttggtttgacatcaaaatgatttataggacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacactgaatctttatgaat 22725411  T
Q  414 ttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaa 468  Q
    ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22725412 ttcagcacaacttttcccaaatttgaaatgaaaactgatattgataggtacagaa 22725466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 47 - 175
Target Start/End: Original strand, 7640400 - 7640528
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  7640400 taaggtaagggtgagactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaggttttagtttttgagaatttgggaatt 7640499  T
Q  146 agggttaagagtgatgattgtgatgatttt 175  Q
    | |||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  7640500 aaggttaaaagtgattatt-tgatgatttt 7640528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 47 - 175
Target Start/End: Original strand, 1836734 - 1836860
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatta 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||    
T  1836734 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatcattctgaaaattgtatttaaca-gttgtaggtatagtttttgagaatttgggaatta 1836832  T
Q  147 gggttaagagtgatgattgtgatgatttt 175  Q
    ||||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  1836833 gggttaaaagtgattatt-tgatgatttt 1836860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 364 - 468
Target Start/End: Original strand, 7640824 - 7640928
Alignment:
Q  364 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggta 463  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7640824 tgagttatggttaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 7640923  T
Q  464 cagaa 468  Q
    |||||    
T  7640924 cagaa 7640928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 247 - 395
Target Start/End: Original strand, 15495887 - 15496035
Alignment:
Q  247 aatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtca 346  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | |  ||     
T  15495887 aatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttaaattcg 15495986  T
Q  347 aaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15495987 aaaggttttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaagtca 15496035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Original strand, 7640890 - 7641048
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| | ||||    
T  7640890 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccattgg 7640989  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | | || |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||    
T  7640990 tttcacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagttaaattactgcctgtaggtca 7641048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 44615747 - 44615589
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||    
T  44615747 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattagtacataattggtcttaagtgtaaacacgaaatttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 44615648  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44615647 tttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtca 44615589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 47 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 44616239 - 44616125
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  44616239 taaggtaagggtgagactaacattcaataatcttgggtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaggttttagtttttgagaatttgggaatt 44616140  T
Q  146 agggttaagagtgat 160  Q
    |||||||| ||||||    
T  44616139 agggttaaaagtgat 44616125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 47 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 19243651 - 19243523
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  19243651 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttaagtcattgattctgaaaattggatttaacatgttgtaggttttagtttttgagaatttgagaatt 19243552  T
Q  146 agggttaagagtgatgattgtgatgatttt 175  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  19243551 agggttaaaagtgattatt-tgatgatttt 19243523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 46 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 3485918 - 3485803
Alignment:
Q  46 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaat 144  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  3485918 ttaatgtaagggtgagactaacattcaataatcttaagtctatgattctgaaaattggatttaacatgttgtaggttttagtttttgagaatttgagaat 3485819  T
Q  145 tagggttaagagtgat 160  Q
    ||||||||| ||||||    
T  3485818 tagggttaaaagtgat 3485803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 47 - 175
Target Start/End: Original strand, 15117566 - 15117694
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  15117566 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttaagtcattgattctgaaaattggatttaacatgttgtaggttttagtttttgagaatttgggaatt 15117665  T
Q  146 agggttaagagtgatgattgtgatgatttt 175  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  15117666 agggttaaaagtgattatt-tgatgatttt 15117694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 364 - 468
Target Start/End: Original strand, 1837157 - 1837261
Alignment:
Q  364 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggta 463  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1837157 tgagttaaggtcaaattactgcacataggtcaccgtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 1837256  T
Q  464 cagaa 468  Q
    |||||    
T  1837257 cagaa 1837261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 239 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 14049034 - 14048878
Alignment:
Q  239 gaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtc 338  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||| |||||||  |||| ||||||||| |||||| |||||| |||||||||| |||||||     
T  14049034 gaatttgaaatgaaaactagtattgattggtacataattggttttaggtgtaaacatgaaagttgtgggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtt 14048935  T
Q  339 tgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    |||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14048934 tgacttcaaaaggatttacagaacttgtgttatggtcaaattactacacgtaggtca 14048878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 47 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 16044010 - 16043892
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatta 146  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||    
T  16044010 taaggtaagggtgagactaacatgcagtaatcttaagtctatggttctgaaaattgtatttaacatgttataggattagtttttgaggatttgagaatta 16043911  T
Q  147 gggttaagagtgatgattg 165  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  16043910 gggttaagagtgataattg 16043892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 47 - 158
Target Start/End: Original strand, 50221552 - 50221664
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  50221552 taaggtaagggtgagactaacattcaataatcttaagtcattgattctgaaaattggatttaacatgttgtaggttttagtttttgagaatttgagaatt 50221651  T
Q  146 agggttaagagtg 158  Q
    |||||||| ||||    
T  50221652 agggttaaaagtg 50221664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 366 - 468
Target Start/End: Original strand, 44772723 - 44772825
Alignment:
Q  366 agttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtaca 465  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| |    
T  44772723 agttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaacattgtccgaattttaaatgaaaactggtatttattggtaga 44772822  T
Q  466 gaa 468  Q
    |||    
T  44772823 gaa 44772825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 47 - 175
Target Start/End: Original strand, 18238826 - 18238954
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  18238826 taaggtaagggtgagactaacattcaataatcttaagtcattgattctggaaattggatttaacatgttgtaggttttagtttttgagaatttgggaatt 18238925  T
Q  146 agggttaagagtgatgattgtgatgatttt 175  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  18238926 agggttaaaagtgattatt-tgatgatttt 18238954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 47 - 175
Target Start/End: Original strand, 44772297 - 44772425
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||    
T  44772297 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttaagtcattgattctgaaaattggattttacatgttgtaggttttagtttttcagaatttgagaatt 44772396  T
Q  146 agggttaagagtgatgattgtgatgatttt 175  Q
    || ||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  44772397 agagttaaaagtgattatt-tgatgatttt 44772425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 47 - 158
Target Start/End: Original strand, 12032985 - 12033097
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  12032985 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttaagtcattgattctgaaaattggatttaacatgttgtaggttttagtttttgagaatttgggaatt 12033084  T
Q  146 agggttaagagtg 158  Q
    | |||||| ||||    
T  12033085 aaggttaaaagtg 12033097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 46 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 25031215 - 25031099
Alignment:
Q  46 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctg-aaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaa 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  25031215 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttaagtcatcgattctgaaaaattggatttaacatgttgtaggttttagtttttgagaatttgagaa 25031116  T
Q  144 ttagggttaagagtgat 160  Q
    |||||||||| ||||||    
T  25031115 ttagggttaaaagtgat 25031099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 29268304 - 29268192
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||    
T  29268304 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttaagtcattgattctgaaaattggatttaacatgttgtaggttttagtttttgagtatttgggaatt 29268205  T
Q  146 agggttaagagtg 158  Q
    | |||||| ||||    
T  29268204 aaggttaaaagtg 29268192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 48 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 18023060 - 18022934
Alignment:
Q  48 aaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaattag 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||| || |||||||||||||   ||||||||||||| |||||||    
T  18023060 aaggtaagggtgggactaacattcaataatcttaagtcattgattctgaaaattggattgaatatgttgtaagttttagttttgagaatttgggaattag 18022961  T
Q  148 ggttaagagtgatgattgtgatgatttt 175  Q
    |||||| | |||| ||| ||||||||||    
T  18022960 ggttaaaattgattatt-tgatgatttt 18022934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 47 - 160
Target Start/End: Original strand, 14873299 - 14873413
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||   |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |||||    
T  14873299 taaggtaagggtgggactaaaattcaataatcttaagtcatagattctgaaaattggatttaacatgttgtaggttttaatttttgagaatttgggaatt 14873398  T
Q  146 agggttaagagtgat 160  Q
    |||||||| ||||||    
T  14873399 agggttaaaagtgat 14873413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 400 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 29267842 - 29267774
Alignment:
Q  400 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaa 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29267842 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaa 29267774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 400 - 468
Target Start/End: Original strand, 50222013 - 50222081
Alignment:
Q  400 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaa 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50222013 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaa 50222081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 46 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 15792747 - 15792629
Alignment:
Q  46 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||  |||  ||||||||||||||| | |||||||||||||||| || ||||    
T  15792747 ttaaggtaagggtgggactaacattcaattttcttaagcctatgattctgatgattagatttaacatgttgtaggattagtttttgagaattgga-aatt 15792649  T
Q  146 agggttaagagtgatgattg 165  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  15792648 agggttaagagtgataattg 15792629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 42 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 14651681 - 14651575
Alignment:
Q  42 aatcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgag 141  Q
    |||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |    
T  14651681 aatcctaacgtaagggtgggacttacattcattaatcttaagactattattctgaaaattgtctttaacatgttgtatgtttagttcttgagaatttggg 14651582  T
Q  142 aattagg 148  Q
    |||||||    
T  14651581 aattagg 14651575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 44 - 165
Target Start/End: Original strand, 32306149 - 32306269
Alignment:
Q  44 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || |||||||| |||  |||  ||||||||||||||| | |||||||||||||||| || ||    
T  32306149 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaatcttcttaagcctatgattttgatgattagatttaacatgttgtagggttagtttttgagaattgga-aa 32306247  T
Q  144 ttagggttaagagtgatgattg 165  Q
    ||||||||||||||||| ||||    
T  32306248 ttagggttaagagtgataattg 32306269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 400 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 15534670 - 15534602
Alignment:
Q  400 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaa 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15534670 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtcagaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaa 15534602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 400 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 19243189 - 19243121
Alignment:
Q  400 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaa 468  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  19243189 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaacgaaaactggtattgattggtacagaa 19243121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 400 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 36038359 - 36038291
Alignment:
Q  400 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaa 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36038359 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtcagaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaa 36038291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 47 - 137
Target Start/End: Original strand, 14717934 - 14718025
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatt 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||    
T  14717934 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttaagtcattgattctgaaaattggatttaacatgttgtaggttttcgtttttgagaatt 14718025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 42 - 165
Target Start/End: Original strand, 26049615 - 26049737
Alignment:
Q  42 aatcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgag 141  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| || |||||||| |||  |||  ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||     
T  26049615 aatcctaaggtaagggtgggactaacattcaatcttcttaagcctatgattatgatgattagatttaacatgttgtagggttagtttttgagaattgga- 26049713  T
Q  142 aattagggttaagagtgatgattg 165  Q
    ||||||||||||||||||| ||||    
T  26049714 aattagggttaagagtgataattg 26049737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 30147374 - 30147216
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||  |||||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||| | |  ||   |||| | ||||    
T  30147374 ccgaatttgaaatgaaaaatggaattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaagtatggatataaaattaaaaatgacattgg 30147275  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  30147274 tatgacaacaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactacacataggtca 30147216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 400 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 44615777 - 44615712
Alignment:
Q  400 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtaca 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  44615777 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattagtaca 44615712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 400 - 468
Target Start/End: Original strand, 49547447 - 49547515
Alignment:
Q  400 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaa 468  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  49547447 gaatttttatgaatttcagcacaaatttgtcagaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaa 49547515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 400 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 14049066 - 14049001
Alignment:
Q  400 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtaca 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  14049066 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtcagaatttgaaatgaaaactagtattgattggtaca 14049001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 47 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 26014336 - 26014225
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacat-gttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| || |||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||| || |||||||||||    
T  26014336 taaggtaagggtgggactaaccttcaataatcttgagtatgtgattttg-aaattgaatttaacatggttgtaggttgagttttt-aggatttgagaatt 26014239  T
Q  146 agggttaagagtga 159  Q
    |||||||| |||||    
T  26014238 agggttaaaagtga 26014225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 400 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 30147404 - 30147339
Alignment:
Q  400 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtaca 465  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  30147404 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaaatggaattgattggtaca 30147339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 400 - 464
Target Start/End: Original strand, 12033447 - 12033511
Alignment:
Q  400 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtac 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  12033447 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtaaagattggtac 12033511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 44 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 12841619 - 12841516
Alignment:
Q  44 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || | |||||||||| ||||  ||||||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||    
T  12841619 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaatcttcttaagcccatgattctgataattagatttaacatgttggaggtttag-ttttgagaattggagaa 12841521  T
Q  144 ttagg 148  Q
    |||||    
T  12841520 ttagg 12841516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 27996881 - 27996729
Alignment:
Q  9 gagatgaaccaagaggaaaggttgccgatcgttaatcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtattta 108  Q
    |||| ||||||||| || ||| |||| |||| | ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| | |||||||||||| || |||||    
T  27996881 gagaagaaccaagaagagaggctgccaatcgattatcctaaggtaagggtgggactaaccttcaataattctgagtatgtgattctgaaaa-tgaattta 27996783  T
Q  109 acat-gttgta-agtttagtttttgagaatttgagaattagggttaagagtgatga 162  Q
    |||| |||||| | | |||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  27996782 acatggttgtagattgtagtttt--agaatttgggaattagggttaaaagtgatga 27996729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 46 - 159
Target Start/End: Original strand, 13591068 - 13591180
Alignment:
Q  46 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacat-gttgtaagtttagtttttgagaatttgagaat 144  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| | ||| |||| | |||| ||||||||| |||||| ||| || |||| |||||||||||||    
T  13591068 ttaaggtaagggtgggactaaccttaaataatcttgagtatgtgaatctg-atattgaatttaacatggttgtatgttgaggtttt-agaatttgagaat 13591165  T
Q  145 tagggttaagagtga 159  Q
    ||||||||| |||||    
T  13591166 tagggttaaaagtga 13591180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 236 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 14185595 - 14185525
Alignment:
Q  236 cccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtag 306  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  14185595 cccgaatttgaaataaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgttaacatgaaagttgtag 14185525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 90 - 160
Target Start/End: Original strand, 15011514 - 15011583
Alignment:
Q  90 attctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaattagggttaagagtgat 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  15011514 attctgaaaattgtatttaacatgttgtaggtttag-ttttgaggatttgggaattagggttaaaagtgat 15011583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 42 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 26790312 - 26790215
Alignment:
Q  42 aatcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttga 140  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||  |||  |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  26790312 aatcataaggtaagggtgagactaacattcaattttcttaagtctatgattttgatgattagatttaacatg-tgtaggtttagtttttgagaatttga 26790215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 9 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 15191273 - 15191208
Alignment:
Q  9 gagatgaaccaagaggaaaggttgccgatcgttaatcttaaggtaagggtgggactaacattcaat 74  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  15191273 gagaagaaccaagaggaaaggctgccgatcgttaatcttaaggtaagggtaagactagcattcaat 15191208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 44 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 12611964 - 12611880
Alignment:
Q  44 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagttt 128  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| || |||||||||||| ||||  ||||||||||||| | |||||||||    
T  12611964 tcttaaggtaagggtgagactaacattcaatcttcttaagcctatgattctgataattagatttaacatgttggaggtttagttt 12611880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 67
Target Start/End: Original strand, 44928094 - 44928152
Alignment:
Q  9 gagatgaaccaagaggaaaggttgccgatcgttaatcttaaggtaagggtgggactaac 67  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  44928094 gagaagaaccaagaggaaaggttgtcgatcgttaatcttaaggtaagggggagactaac 44928152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 165
Target Start/End: Original strand, 14852021 - 14852141
Alignment:
Q  44 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaa 143  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| || || | |||||||  |||  |||||||| |||||| | ||||||||| |||||| || ||    
T  14852021 tcttaaggtaagggttggactaacattcaatcttcttaagcctttaattctgatgattagatttaacaagttgtagggttagttttttagaattgga-aa 14852119  T
Q  144 ttagggttaagagtgatgattg 165  Q
    ||||| ||||||||||| ||||    
T  14852120 ttaggattaagagtgataattg 14852141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 314 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 14995713 - 14995644
Alignment:
Q  314 tgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 383  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  14995713 tgttagctttctaatgtcgttggtttgaggtctaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 14995644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 128
Target Start/End: Original strand, 23802406 - 23802487
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagttt 128  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  |||| || |||||||||||| ||||  ||||||||||||| | |||||||||    
T  23802406 taaggtaagggtgagactaacattcaatcttcttaagcctatgattctgataattagatttaacatgttggaggtttagttt 23802487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 288
Target Start/End: Original strand, 18214907 - 18214958
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtg 288  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  18214907 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtg 18214958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 22354720 - 22354654
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  22354720 taaggtaagggtgggactaacattcaatcttcttaagcctatgattctg-aaattggatttaacatgt 22354654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 357 - 395
Target Start/End: Original strand, 18214992 - 18215030
Alignment:
Q  357 tagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18214992 tagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 18215030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 291 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 9198648 - 9198544
Alignment:
Q  291 aacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgta 390  Q
    |||| ||||||| ||  |||||||||||| |||||||||   ||||||| || |||||| ||||| || ||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  9198648 aacatgaaagttttatatatggatgttatatttctaatggatttggtcttacttcaaaatgatttctacaacttgatttatggtcaaattaatacacgta 9198549  T
Q  391 ggtca 395  Q
     ||||    
T  9198548 tgtca 9198544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 291 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 14951362 - 14951270
Alignment:
Q  291 aacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 383  Q
    |||| ||||||||||| ||   |||||| |||||||||| | ||||| |||| || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  14951362 aacatgaaagttgtagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 14951270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 19739828 - 19739676
Alignment:
Q  9 gagatgaaccaagaggaaaggttgccgatcgttaatcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtattta 108  Q
    |||| ||||||||| || ||| |||| |||| | ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||| | ||||| |||| | || |||||    
T  19739828 gagaagaaccaagaagagaggctgccaatcgattatcctaaggtaagggtgagactaaccttcaataattctgagtatgtgattatgaata-tgaattta 19739730  T
Q  109 aca-tgttgtaagtt-tagtttttgagaatttgagaattagggttaagagtgatga 162  Q
    |||  |||||| ||| |||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  19739729 acacggttgtaggttgtagtttt--agaatttgggaattagggttaaaagtgatga 19739676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 315 - 383
Target Start/End: Original strand, 25120076 - 25120144
Alignment:
Q  315 gttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 383  Q
    |||| |||||||||| | ||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  25120076 gttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 25120144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 50161096 - 50161014
Alignment:
Q  90 attctgaaaattgtatttaacatg-ttgtaagtttagtttttgagaatttgagaattagggttaagagtgatgattgtgatgatt 173  Q
    ||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  50161096 attctgaaaattgaattttacatggttgtaggttgagttttt-agaatttgagaattagggttaaaagtgaggatt-tgatgatt 50161014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 48 - 128
Target Start/End: Original strand, 51463031 - 51463111
Alignment:
Q  48 aaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagttt 128  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  |||| || |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| | |||||||||    
T  51463031 aaggtaagggtgagactaacattcaatcttcttaagcctatgattttgataattagatttaacatgttggaggtttagttt 51463111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 321 - 383
Target Start/End: Original strand, 18293703 - 18293765
Alignment:
Q  321 tttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 383  Q
    ||||||||| | ||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  18293703 tttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 18293765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 282 - 383
Target Start/End: Original strand, 43281694 - 43281795
Alignment:
Q  282 ttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaatta 381  Q
    ||||||| ||||| |||| ||||||||   ||||||| |||||||||| |  |||| | || || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  43281694 ttaggtgttaacatgaaaattgtaggttaagatgttagctttctaatggctatggttttacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaatta 43281793  T
Q  382 ct 383  Q
    ||    
T  43281794 ct 43281795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 10057713 - 10057619
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacat-gttgtaagtttagtttttgagaatttgaga 142  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| | |||||||||| | || ||||||||| |||||| ||| || |||| |||||||||||    
T  10057713 taaggtaagggtgggactaaccttcaataattctgagtatgtgattctgaaga-tgaatttaacatggttgtaggttgaggtttt-agaatttgaga 10057619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 313 - 381
Target Start/End: Original strand, 55377225 - 55377293
Alignment:
Q  313 atgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaatta 381  Q
    |||||| |||||||||| | ||||| |||| || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  55377225 atgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaatta 55377293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 333 - 383
Target Start/End: Original strand, 5683415 - 5683465
Alignment:
Q  333 ttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 383  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  5683415 ttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 5683465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 430 - 468
Target Start/End: Original strand, 12778386 - 12778424
Alignment:
Q  430 ccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaa 468  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  12778386 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgattggtacagaa 12778424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 273 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 18247849 - 18247739
Alignment:
Q  273 gaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatg 372  Q
    ||||||| ||| ||||  |||| ||||||||||| ||    ||||| |||||||||| | ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  18247849 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 18247750  T
Q  373 gtcaaattact 383  Q
     | ||||||||    
T  18247749 attaaattact 18247739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 333 - 383
Target Start/End: Original strand, 19698032 - 19698082
Alignment:
Q  333 ttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 383  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  19698032 ttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 19698082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 333 - 383
Target Start/End: Original strand, 19708617 - 19708667
Alignment:
Q  333 ttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 383  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  19708617 ttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 19708667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 430 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 19858230 - 19858192
Alignment:
Q  430 ccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaa 468  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  19858230 ccgaatttgaaatgaaaaatggtattgattggtacagaa 19858192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 320 - 381
Target Start/End: Original strand, 15287905 - 15287966
Alignment:
Q  320 ctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaatta 381  Q
    |||||||||| | ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||    
T  15287905 ctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgatcaaatta 15287966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 320 - 381
Target Start/End: Original strand, 15295015 - 15295076
Alignment:
Q  320 ctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaatta 381  Q
    |||||||||| | ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||    
T  15295015 ctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgatcaaatta 15295076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 383
Target Start/End: Original strand, 17146320 - 17146389
Alignment:
Q  314 tgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 383  Q
    ||||| |||||||||| | ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  17146320 tgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 17146389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 18168362 - 18168293
Alignment:
Q  314 tgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 383  Q
    ||||| |||||||||| ||||| | ||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||| | ||||||||    
T  18168362 tgttagctttctaatggcgttgatttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgattaaattact 18168293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 383
Target Start/End: Original strand, 22355100 - 22355169
Alignment:
Q  314 tgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 383  Q
    ||||| |||||||||| | ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  22355100 tgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 22355169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 46 - 98
Target Start/End: Original strand, 42596476 - 42596528
Alignment:
Q  46 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaa 98  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| | ||||| ||||||| |||||||||    
T  42596476 ttaaggtaagggtgagactatcattcagtgatcttaagtctataattctgaaa 42596528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 353; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 5574 - 5118
Alignment:
Q  9 gagatgaaccaagaggaaaggttgccgatcgttaatcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtattta 108  Q
    |||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5574 gagaagaatcaagaggaaaggctgtcgatcgttaatcttaaggtaagggtgggaataacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtattta 5475  T
Q  109 acatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaattagggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgct 208  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5474 acatgttgtaggtttagtttttgagaatttgagaattagggttaagactgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgct 5375  T
Q  209 ttttctaatttttcttttcatctctgccccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggt 308  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  5374 ttttctgatttttctattcatctctgccccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggt 5275  T
Q  309 atggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaattttta 408  Q
    ||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  5274 atggatgttagttttcttatgccgttggtctgacgtcaaaacgatatatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaattttta 5175  T
Q  409 tgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtaca 465  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5174 tgaatttcagcacaactttggccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtaca 5118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 5153 - 4995
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |  |||    
T  5153 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccaatgg 5054  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  5053 tttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatagtcaaattacagcacgtaggtca 4995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 352; Significance: 0; HSPs: 6)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 468
Target Start/End: Original strand, 16722 - 17181
Alignment:
Q  9 gagatgaaccaagaggaaaggttgccgatcgttaatcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtattta 108  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16722 gagaagaaccaagaggaaaggatgccgatcgttgatcttaaggtaagggtgagactaacattcaataatcttgagtctatgattctaaaaattgtattta 16821  T
Q  109 acatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaattagggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgct 208  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16822 acatgttgtaggttgagtttttgagaatttgagaattagggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgct 16921  T
Q  209 ttttctaatttttcttttcatctctgccccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggt 308  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  16922 ttttctgatttttcttttcatctctgccccaaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaatttgtgttaggggataacacgaaagttgtaggt 17021  T
Q  309 atggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaattttta 408  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||||||    
T  17022 atggatgttagctttctaatgtcgttggtctgatatcaaaaaggtttatagaacttgagttatgatcaaattaatgcacgtaggtcatagtgaattttta 17121  T
Q  409 tgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaa 468  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  17122 tgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaacttgtattgattggtatagaa 17181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 94869 - 94711
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  94869 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttgg 94770  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  94769 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtca 94711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Original strand, 17143 - 17301
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||| ||||||    
T  17143 ccgaatttgaaatgaaaacttgtattgattggtatagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatttttgttagctttctaatgccgttgg 17242  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17243 tttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 17301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 364 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 94935 - 94831
Alignment:
Q  364 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggta 463  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  94935 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 94836  T
Q  464 cagaa 468  Q
    |||||    
T  94835 cagaa 94831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 47 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 95359 - 95231
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  95359 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttaagtcattgattctgaaaattggatttaacatgttgtaggttttagtttttgagaatttgggaatt 95260  T
Q  146 agggttaagagtgatgattgtgatgatttt 175  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  95259 agggttaaaagtgattatt-tgatgatttt 95231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 383
Target Start/End: Original strand, 154892 - 154961
Alignment:
Q  314 tgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 383  Q
    ||||| |||| ||||| ||||||| ||| ||| |||  |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  154892 tgttagctttataatgacgttggtttgaggtccaaatcatttttagaacttgagttatgatcaaattact 154961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 346; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 47 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 7293 - 6872
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatta 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7293 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaggtttagtttttgagaatttgagaatta 7194  T
Q  147 gggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctaatttttcttttcatctctgccccgaatctga 246  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  7193 gggttaagagtgatatttgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgtcccgaatatga 7094  T
Q  247 aatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtca 346  Q
    |||||||| || ||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  7093 aatgaaaattgctattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtatgacgtca 6994  T
Q  347 aaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaa 446  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6993 aaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaa 6894  T
Q  447 actgatattgattggtacagaa 468  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  6893 actggtattgattggtacagaa 6872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 6910 - 6752
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  6910 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 6811  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6810 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 6752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 343; Significance: 0; HSPs: 93)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 46 - 468
Target Start/End: Original strand, 2153951 - 2154373
Alignment:
Q  46 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2153951 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaggtttagtttttgagaatttgagaatt 2154050  T
Q  146 agggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctaatttttcttttcatctctgccccgaatctg 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  2154051 agggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccaaatttg 2154150  T
Q  246 aaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtc 345  Q
    |||||||| ||||||||||| | | | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  2154151 aaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttttaatgtcgttggtctgacgtc 2154250  T
Q  346 aaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaa 445  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2154251 aaaacgatttatagaacttaagttatagtcaaattactgcacgtatgtcacggtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaa 2154350  T
Q  446 aactgatattgattggtacagaa 468  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  2154351 aactggtattgattggtacagaa 2154373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 44 - 468
Target Start/End: Original strand, 17516287 - 17516712
Alignment:
Q  44 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaa 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  17516287 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaggtttattttttgagaatttgagaa 17516386  T
Q  144 ttagggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttc-taatttttcttttcatctctgccccgaat 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  17516387 ttagggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttcctgatttttcttttcatctctgccccgaat 17516486  T
Q  243 ctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgac 342  Q
     |||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||     
T  17516487 ttgaaatgaaaaccggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgat 17516586  T
Q  343 gtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaat 442  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  17516587 gtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattacttcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgatttttaaat 17516686  T
Q  443 gaaaactgatattgattggtacagaa 468  Q
    ||||| || |||||||||| ||||||    
T  17516687 gaaaaatggtattgattggcacagaa 17516712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 48 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 32028866 - 32028446
Alignment:
Q  48 aaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaattag 147  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  32028866 aaggtaaggatgagactaacattcaataatcttgagtttatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtagttttagtttttgagaatttgagaattag 32028767  T
Q  148 ggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctaatttttcttttcatctctgccccgaatctgaa 247  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  32028766 ggttaagagtggtgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccctgaatttgaa 32028667  T
Q  248 atgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaa 347  Q
    |||||| ||||||||||| | |    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  32028666 atgaaatctggtattgataggtcaaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatatcgttggtctgacatcaa 32028567  T
Q  348 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaa 447  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32028566 aacgatttatagagcttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaa 32028467  T
Q  448 ctgatattgattggtacagaa 468  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  32028466 ctggtattgattggtacagaa 32028446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 48 - 468
Target Start/End: Original strand, 20917168 - 20917588
Alignment:
Q  48 aaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaattag 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20917168 aaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaatatgttgtaggtttagtttttgagaatttgagaattag 20917267  T
Q  148 ggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctaatttttcttttcatctctgccccgaatctgaa 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20917268 ggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatatgggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaa 20917367  T
Q  248 atgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaa 347  Q
    |||||| | ||||||||| | | |  ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  20917368 atgaaatcaggtattgataggtccataattgatcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgctggtctgacgtcaa 20917467  T
Q  348 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaa 447  Q
    ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20917468 aatcatttataaaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaattcgaaatgaaaa 20917567  T
Q  448 ctgatattgattggtacagaa 468  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  20917568 ctggtattgattggtacagaa 20917588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 44 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 29330818 - 29330403
Alignment:
Q  44 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaa 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29330818 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaggtttagtttttgagaatttgagaa 29330719  T
Q  144 ttagggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctaatttttcttttcatctctgccccgaatc 243  Q
    |||||||| ||||||||||||         |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  29330718 ttagggttcagagtgatgatt---------ttgaatgaaagtaaagttgaataatataggttactttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatt 29330628  T
Q  244 tgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacg 343  Q
    |||||||||| ||||||||||| | |   ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||    
T  29330627 tgaaatgaaatctggtattgataggtcaagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaaggccgttggtctgacg 29330528  T
Q  344 tcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatg 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  29330527 tcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattaatgcacgtatgtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaata 29330428  T
Q  444 aaaactgatattgattggtacagaa 468  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  29330427 aaaactggtattgattggtacagaa 29330403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 47 - 468
Target Start/End: Original strand, 295603 - 296016
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatta 146  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||        |||||||    
T  295603 taaggtaagagtgagactaacattcaataatctttagtctatgattctgaaaattgtatttaatatgttgtaggtttagtttttg--------agaatta 295694  T
Q  147 gggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctaatttttcttttcatctctgccccgaatctga 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  295695 gggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataagttgctttttctgatttttcttttcatctctgtcccgaatttga 295794  T
Q  247 aatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtca 346  Q
    ||||||| |||||||||||   | |||||| |||||||||||  | || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| |||    
T  295795 aatgaaatctggtattgataagtccggaataggtcttaggtgtaaccatgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttgatctgacatca 295894  T
Q  347 aaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  295895 aaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaa 295994  T
Q  447 actgatattgattggtacagaa 468  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  295995 actgatattgattggtacagaa 296016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 179 - 468
Target Start/End: Original strand, 20901373 - 20901662
Alignment:
Q  179 tgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctaatttttcttttcatctctgccccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattg 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  20901373 tgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattg 20901472  T
Q  279 gtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaa 378  Q
    ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20901473 gtcttaggtgtaaacacgaacgttgtaggtatggatgtcagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaactttagttatggtcaaa 20901572  T
Q  379 ttactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaa 468  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20901573 ttactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcaacacaactttgtccgattttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaa 20901662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 246 - 468
Target Start/End: Original strand, 17516683 - 17516905
Alignment:
Q  246 aaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtc 345  Q
    ||||||||| ||||||||||||  || ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17516683 aaatgaaaaatggtattgattggcacagaattggtcctaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtc 17516782  T
Q  346 aaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaa 445  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17516783 aaaaagatttatagaacttgagttatcgtcgaattactgcacataggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtctgaatttgaaatgaa 17516882  T
Q  446 aactgatattgattggtacagaa 468  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  17516883 aactggtattgattggtacagaa 17516905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 237 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 32028291 - 32028059
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| | |   ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  32028291 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtcaagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 32028192  T
Q  337 tct-gacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaat 435  Q
    | | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32028191 ttttgacgtcaaaacgatttatagagcttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaat 32028092  T
Q  436 ttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaa 468  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  32028091 ttgaaatgaaaattgttattgattggtacagaa 32028059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 237 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 32028484 - 32028263
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||  |||||    
T  32028484 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggttttaggtgaaaacacgaaagttgtaggtatatatgttagctttctagtgctgttgg 32028385  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatt 436  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32028384 tctgacgtcaaaacaatttatagagcttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatt 32028285  T
Q  437 tgaaatgaaaactgatattgat 458  Q
    |||||||||| ||| |||||||    
T  32028284 tgaaatgaaatctggtattgat 32028263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 237 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 32028097 - 32027866
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||| ||| |||||  ||||||||||| |||||||||| | ||||    
T  32028097 ccgaatttgaaatgaaaattgttattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaaattgtatttatggatgttagctttctaatgccattgg 32027998  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatt 436  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32027997 tcggacgtcaaaacgatttatagagcttgagttatggtcaaattactgcacgtaagtcacaatgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatt 32027898  T
Q  437 tgaaatgaaaactgatattgattggtacagaa 468  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32027897 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaa 32027866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 44 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 24473919 - 24473792
Alignment:
Q  44 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaa 143  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24473919 tcttaaggtaagggtgagactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaggtttagtttttgagaatttgagaa 24473820  T
Q  144 ttagggttaagagtgatgattgtgatga 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24473819 ttagggttaagagtgatgattgtgatga 24473792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Original strand, 295978 - 296136
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  295978 ccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaattggtcttaggtgtatacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 296077  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  296078 tctgacgtcaaaacaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 296136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 239 - 395
Target Start/End: Original strand, 17516869 - 17517025
Alignment:
Q  239 gaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtc 338  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||     
T  17516869 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtt 17516968  T
Q  339 tgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17516969 tgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatcgtcaaattactgcacgtaggtca 17517025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 244 - 395
Target Start/End: Original strand, 20901631 - 20901782
Alignment:
Q  244 tgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacg 343  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||     
T  20901631 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagatttctaatgccgttggtttgact 20901730  T
Q  344 tcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20901731 tcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 20901782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Original strand, 2154335 - 2154493
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || ||| |||||||||| ||||||    
T  2154335 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacactaaagttgtaggtatgaatattagctttctaatgccgttgg 2154434  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2154435 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 2154493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 20909470 - 20909312
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||    
T  20909470 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 20909371  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20909370 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtca 20909312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 245 - 395
Target Start/End: Original strand, 20917558 - 20917708
Alignment:
Q  245 gaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgt 344  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| |||| |    
T  20917558 gaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgactt 20917657  T
Q  345 caaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  20917658 caaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaagtca 20917708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 32027904 - 32027746
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||    
T  32027904 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacaagaaagttgtaggtatgaatgttagatttctaatgccgttgg 32027805  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32027804 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtca 32027746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Original strand, 264472 - 264630
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  ||||||  ||||||||| ||||||    
T  264472 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtataaatgttagatttctaatgccgttgg 264571  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  264572 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtca 264630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 29346438 - 29346280
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||    
T  29346438 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 29346339  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| |||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  29346338 tttgacttcaaaatgatttatagaacttgatttatactcaaattactgcacgtaggtca 29346280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 237 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 29330441 - 29330285
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||    
T  29330441 ccgaatttgaaataaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgctgttgg 29330342  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggt 393  Q
    | |||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29330341 tttgatttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggt 29330285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 244 - 395
Target Start/End: Original strand, 37804613 - 37804764
Alignment:
Q  244 tgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacg 343  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||     
T  37804613 tgaaatgaaaactggcattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgact 37804712  T
Q  344 tcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37804713 tcaaaaggatttataaaacttgagttatggtcaaattaatgcacgtaggtca 37804764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 244 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 39363836 - 39363685
Alignment:
Q  244 tgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacg 343  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| | ||||     
T  39363836 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttgatttgact 39363737  T
Q  344 tcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39363736 tcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtca 39363685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 237 - 391
Target Start/End: Original strand, 10732644 - 10732798
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||    
T  10732644 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 10732743  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtag 391  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  10732744 tttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtag 10732798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 29348911 - 29348753
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||| ||||||    
T  29348911 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcaaatgccgttgg 29348812  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| |||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  29348811 tttgacttcaaaatgatttatagaacttgatttatactcaaattactgcacgtaggtca 29348753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 29351384 - 29351226
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||| ||||||    
T  29351384 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcaaatgccgttgg 29351285  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| |||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  29351284 tttgacttcaaaatgatttatagaacttgatttatactcaaattactgcacgtaggtca 29351226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Original strand, 42245069 - 42245227
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||| ||||||    
T  42245069 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattgatacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagatttctaatgccgttgg 42245168  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| |||||  |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42245169 tttgacttcaaatggatttatagaactatagttatagtcaaattactgcacgtaggtca 42245227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 244 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 38619888 - 38619737
Alignment:
Q  244 tgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacg 343  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||||| ||||     
T  38619888 tgaaataaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagatttctagtgccgttggtttgact 38619789  T
Q  344 tcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38619788 tcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtca 38619737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 23064972 - 23064814
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| || |||| |    
T  23064972 ccgaatttgaaattaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatataaacacgaaagttgtaggtatggatgtcagctttctagtgccgttcg 23064873  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23064872 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtca 23064814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 39245594 - 39245436
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||    
T  39245594 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttatgtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 39245495  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| |||||| |||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  39245494 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgatttatagttaaattactgcacgtaggtca 39245436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 364 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 20909536 - 20909435
Alignment:
Q  364 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggta 463  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20909536 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 20909437  T
Q  464 ca 465  Q
    ||    
T  20909436 ca 20909435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 364 - 468
Target Start/End: Original strand, 264406 - 264510
Alignment:
Q  364 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggta 463  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  264406 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaaccttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 264505  T
Q  464 cagaa 468  Q
    |||||    
T  264506 cagaa 264510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 364 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 39245660 - 39245559
Alignment:
Q  364 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggta 463  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39245660 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttgagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 39245561  T
Q  464 ca 465  Q
    ||    
T  39245560 ca 39245559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 364 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 23065038 - 23064934
Alignment:
Q  364 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggta 463  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  23065038 tgagttatggtccaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaattaaaactggtattgattggta 23064939  T
Q  464 cagaa 468  Q
    |||||    
T  23064938 cagaa 23064934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 364 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 29346504 - 29346400
Alignment:
Q  364 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggta 463  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29346504 tgagttatggtcaaattactgcacggaggtcttagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 29346405  T
Q  464 cagaa 468  Q
    |||||    
T  29346404 cagaa 29346400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 364 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 29348977 - 29348873
Alignment:
Q  364 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggta 463  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29348977 tgagttatggtcaaattactgcacggaggtcttagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 29348878  T
Q  464 cagaa 468  Q
    |||||    
T  29348877 cagaa 29348873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 364 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 29351450 - 29351346
Alignment:
Q  364 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggta 463  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29351450 tgagttatggtcaaattactgcacggaggtcttagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 29351351  T
Q  464 cagaa 468  Q
    |||||    
T  29351350 cagaa 29351346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 47 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 38620384 - 38620256
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  38620384 taaggtaagggtgagactaacattcaataatcttaagtcattgattctgaaaattggatttaacatgttgtaggttttagtttttgagaatttgagaatt 38620285  T
Q  146 agggttaagagtgatgattgtgatgatttt 175  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  38620284 agggttaaaagtgattatt-tgatgatttt 38620256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 364 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 39363908 - 39363808
Alignment:
Q  364 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggta 463  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39363908 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaa-ttgaaatgaaaactggtattgattggta 39363810  T
Q  464 ca 465  Q
    ||    
T  39363809 ca 39363808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 47 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 39246084 - 39245956
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  39246084 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttaagtcattgattctgaaaattggatttaacatgttgtaggttttagtttttgagaatttgggaatt 39245985  T
Q  146 agggttaagagtgatgattgtgatgatttt 175  Q
    ||||| || |||||| ||| ||||||||||    
T  39245984 agggtcaaaagtgattatt-tgatgatttt 39245956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 47 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 39364332 - 39364204
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||  ||||    
T  39364332 taaggtaagggtgggactaacattcaataaccttaagtcattgattctgaaaattggatttaacatgttgtaggttttagtttttgagaatttggaaatt 39364233  T
Q  146 agggttaagagtgatgattgtgatgatttt 175  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  39364232 agggttaaaagtgattatt-tgatgatttt 39364204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 47 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 29346929 - 29346817
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||    
T  29346929 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttaagtcattgattctgaaaattggatttaacatgttgtaggttttcgtttttgagaatttgggaatt 29346830  T
Q  146 agggttaagagtg 158  Q
    |||||||| ||||    
T  29346829 agggttaaaagtg 29346817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 47 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 29349402 - 29349290
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||    
T  29349402 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttaagtcattgattctgaaaattggatttaacatgttgtaggttttcgtttttgagaatttgggaatt 29349303  T
Q  146 agggttaagagtg 158  Q
    |||||||| ||||    
T  29349302 agggttaaaagtg 29349290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 47 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 29351875 - 29351763
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||    
T  29351875 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttaagtcattgattctgaaaattggatttaacatgttgtaggttttcgtttttgagaatttgggaatt 29351776  T
Q  146 agggttaagagtg 158  Q
    |||||||| ||||    
T  29351775 agggttaaaagtg 29351763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 47 - 158
Target Start/End: Original strand, 42244576 - 42244688
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||    
T  42244576 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttaagtcattgattctgaaaattggatttaatatgttgtaggttttcgtttttgagaatttgagaatt 42244675  T
Q  146 agggttaagagtg 158  Q
    |||||||| ||||    
T  42244676 agggttaaaagtg 42244688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 47 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 20909963 - 20909850
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagttt--agtttttgagaatttgagaat 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    |||||||||||||||||||    
T  20909963 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttaagtcattgattctgaaaattggatttaacatgttgtaggttttcgttttttgagaatttgagaat 20909864  T
Q  145 tagggttaagagtg 158  Q
    ||||||||| ||||    
T  20909863 tagggttaaaagtg 20909850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 158
Target Start/End: Original strand, 263982 - 264094
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||    
T  263982 taaggtaagggtgagactaacattcaataatcttaagtcattgattctgaaaattggatttaacatgttgtaggttttcgtttttgaaaatttgagaatt 264081  T
Q  146 agggttaagagtg 158  Q
    |||||||| ||||    
T  264082 agggttaaaagtg 264094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 47 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 23065464 - 23065358
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||  ||||    
T  23065464 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttaagtcattgattctgaaaattggatttaacatgttgtaggttttagtttttgagaaattggaaatt 23065365  T
Q  146 agggtta 152  Q
    |||||||    
T  23065364 agggtta 23065358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 364 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 38619960 - 38619860
Alignment:
Q  364 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggta 463  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  38619960 tgagttatggtccaattactgcacgtaggtcacaatgaaattttatgaatttcagcacaactttgtccgaa-ttgaaataaaaactggtattgattggta 38619862  T
Q  464 ca 465  Q
    ||    
T  38619861 ca 38619860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 365 - 468
Target Start/End: Original strand, 42245004 - 42245107
Alignment:
Q  365 gagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtac 464  Q
    |||||||| | ||| |||| || |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  42245004 gagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattgatac 42245103  T
Q  465 agaa 468  Q
    ||||    
T  42245104 agaa 42245107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 273 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 9776781 - 9776659
Alignment:
Q  273 gaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatg 372  Q
    ||||||||||| ||||  |||| ||||||||||| ||   |||||| |||||||||  ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  9776781 gaattggtctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattatgttagctttctaataccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagctatg 9776682  T
Q  373 gtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  9776681 gtcaaattactgcacgtaggtca 9776659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 400 - 465
Target Start/End: Original strand, 10732614 - 10732679
Alignment:
Q  400 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtaca 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10732614 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtaca 10732679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 47 - 158
Target Start/End: Original strand, 10732151 - 10732263
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||  ||||| ||||||||  ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||    
T  10732151 taaggtaagggtgagactaacattcaataatcctaagtcattgattatgaaaattagatttaacatgttgtaggttttcgtttttgagaatttgagaatt 10732250  T
Q  146 agggttaagagtg 158  Q
    |||||||| ||||    
T  10732251 agggttaaaagtg 10732263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 47 - 148
Target Start/End: Original strand, 41094818 - 41094919
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatta 146  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||  |||| || || | ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  41094818 taaggtaagggtgagactaacaatcaattctcttaagcctgtaattctgataattgtatttaacatgttgtaggtttagtttttgagaattggagaatta 41094917  T
Q  147 gg 148  Q
    ||    
T  41094918 gg 41094919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 45 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 15797395 - 15797281
Alignment:
Q  45 cttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaat 144  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||  |||| || || | ||||||| | ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||    
T  15797395 cttaaggtaagggtgggactagcactcaattttcttaagcctctaattctgatagttgtatttaacatgttgtaggactagtttttgagaatttaagaat 15797296  T
Q  145 tagggttaagagtga 159  Q
    | |||||||||||||    
T  15797295 tcgggttaagagtga 15797281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 42 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 23476461 - 23476337
Alignment:
Q  42 aatcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagttttt--gagaatttg 139  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||| |  |||  ||||||||||||||| | |||||||||  |||||||||    
T  23476461 aatcctaaggtaagggtgggactaacattcaatcttcttaagcctatgattctaatgattagatttaacatgttgtagggttagttttttggagaatttg 23476362  T
Q  140 agaattagggttaagagtgatgattg 165  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||    
T  23476361 a-aattagggttaagagtgataattg 23476337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 47 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 14049040 - 14048939
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatta 146  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||  |||| || || | ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||    
T  14049040 taaggtaagggtgggattaacaatcaattctcttaagcctgtaattctgataattgtatttaacatgttgtaggtttagtttttgaaaattggagaatta 14048941  T
Q  147 gg 148  Q
    ||    
T  14048940 gg 14048939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 46 - 98
Target Start/End: Original strand, 20901325 - 20901377
Alignment:
Q  46 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20901325 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaa 20901377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 42 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 23470749 - 23470626
Alignment:
Q  42 aatcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagttttt-gagaatttga 140  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||||||  |||  ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||    
T  23470749 aatcctaaggtaagggtgggaataacattcaatcttcttaagcctatgattctgatgattagatttaacatgttgtagggttagtttttggagaattgga 23470650  T
Q  141 gaattagggttaagagtgatgattg 165  Q
     ||||||||||||||||||| ||||    
T  23470649 -aattagggttaagagtgataattg 23470626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 46 - 152
Target Start/End: Original strand, 40723459 - 40723566
Alignment:
Q  46 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtt-tagtttttgagaatttgagaat 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||| || |||||||| ||| ||||  ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  40723459 ttaaggtaagggtgggactaacattcaatcttcttaagcctatgattttgataattaaatttaacatgttgttggttatagtttttgagaatttgggaat 40723558  T
Q  145 tagggtta 152  Q
    ||| ||||    
T  40723559 tagagtta 40723566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 165
Target Start/End: Original strand, 25573581 - 25573694
Alignment:
Q  51 gtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaattagggt 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| |  ||||||||||||  |||  ||||||||||||||| | |||||||||||||||| || ||||||||     
T  25573581 gtaagggtgggactaacattcaatcttcttaatcctatgattctgatgattagatttaacatgttgtagggttagtttttgagaattgga-aattagggc 25573679  T
Q  151 taagagtgatgattg 165  Q
    |||||||||| ||||    
T  25573680 taagagtgatcattg 25573694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 47 - 148
Target Start/End: Original strand, 41860581 - 41860682
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtt-tagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||| || |||||||| ||| ||||  |||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  41860581 taaggtaagggtgggactaacattcaatcttcttaagcctatgattttgataattagatttaa-atgttgtaggttatagtttttgagaatttgagaatt 41860679  T
Q  146 agg 148  Q
    |||    
T  41860680 agg 41860682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 52 - 165
Target Start/End: Original strand, 25576010 - 25576122
Alignment:
Q  52 taagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaattagggtt 151  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||  | |  ||||||||||||||| | |||||||||||||||| || |||||||| |    
T  25576010 taagggtgggactaacattcaatcttcttaagcctatgattctgatgaatagatttaacatgttgtagggttagtttttgagaattgga-aattagggct 25576108  T
Q  152 aagagtgatgattg 165  Q
    ||||||||| ||||    
T  25576109 aagagtgatcattg 25576122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 46 - 159
Target Start/End: Original strand, 26739796 - 26739908
Alignment:
Q  46 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||| | |||||||  |||  |||||||| |||||| |||||| ||||||||||| || ||||    
T  26739796 ttaaggtaagggtgagactaacattcaattctcttaagtctgtaattctgatgattaaatttaacaagttgtaggtttag-ttttgagaattggaaaatt 26739894  T
Q  146 agggttaagagtga 159  Q
    ||||||||||||||    
T  26739895 agggttaagagtga 26739908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 400 - 465
Target Start/End: Original strand, 37804576 - 37804641
Alignment:
Q  400 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtaca 465  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  37804576 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtcataatttgaaatgaaaactggcattgattggtaca 37804641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 118
Target Start/End: Original strand, 21914464 - 21914563
Alignment:
Q  19 aagaggaaaggttgccgatcgttaatcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgta 118  Q
    ||||||| ||| ||||||||| | | | ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| | | ||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  21914464 aagaggagaggctgccgatcgattaacctaaggtaagggtgggactaaccttcaataattctgagtatgtaattctgaaaattggatttaacaagttgta 21914563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 52 - 159
Target Start/End: Original strand, 26731989 - 26732095
Alignment:
Q  52 taagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaattagggtt 151  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||| ||||| | |||||||  |||  |||||||| |||||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  26731989 taagggtgagactaacattcaattctcttaagtctgtaattctgatgattaaatttaacaagttgtaggtttag-ttttgagaattggaaaattagggtt 26732087  T
Q  152 aagagtga 159  Q
    ||||||||    
T  26732088 aagagtga 26732095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 46 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 22413138 - 22413056
Alignment:
Q  46 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagttt 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  | || || |||||||||||| ||||  ||||||||||||| | |||||||||    
T  22413138 ttaaggtaagggtgggactaacattcaatctttttaagcctatgattctgataattagatttaacatgttggaggtttagttt 22413056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 165
Target Start/End: Original strand, 25574817 - 25574929
Alignment:
Q  52 taagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaattagggtt 151  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| || ||||| ||||||  | |  ||||||||||||||| | |||||||||||||||| || |||||| | |    
T  25574817 taagggtgggactaacattcaatcttcttaagcctatggttctgatgaatagatttaacatgttgtagggttagtttttgagaattgga-aattagagct 25574915  T
Q  152 aagagtgatgattg 165  Q
    ||||||||| ||||    
T  25574916 aagagtgatcattg 25574929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 114
Target Start/End: Original strand, 10774664 - 10774731
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgt 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||  | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10774664 taaggtaagggtgggactaaccttcactaattctaagtgtatgattctgaaaattgaatttaacatgt 10774731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 40726732 - 40726666
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  40726732 taaggtaagggtgggactaacattcaatcttcttaagcctatgattctg-aaattggatttaacatgt 40726666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 47 - 117
Target Start/End: Original strand, 21405628 - 21405698
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgt 117  Q
    ||||||||||||| ||||||| || ||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  21405628 taaggtaagggtgagactaacctttaataattctgagtatatgattctgaaaattgaatttaacaggttgt 21405698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 273 - 383
Target Start/End: Original strand, 22883903 - 22884013
Alignment:
Q  273 gaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatg 372  Q
    ||||||| ||| ||||  |||| ||||||| ||||||   |||||| |||||||||| | ||||| ||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  22883903 gaattggccttgggtgtaaacatgaaagttttaggtaattatgttagctttctaatggctttggtttgacgttcaaatgatttttagaacttgagttatg 22884002  T
Q  373 gtcaaattact 383  Q
     ||||||||||    
T  22884003 atcaaattact 22884013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 314 - 383
Target Start/End: Original strand, 1220384 - 1220453
Alignment:
Q  314 tgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 383  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| ||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  1220384 tgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 1220453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 314 - 383
Target Start/End: Original strand, 10778832 - 10778901
Alignment:
Q  314 tgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 383  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| ||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  10778832 tgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 10778901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 46 - 148
Target Start/End: Original strand, 31251891 - 31251992
Alignment:
Q  46 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtt-tagtttttgagaatttgagaat 144  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| | ||||| ||||||| |||||| |||||| |||||||| ||| || ||| ||||||| | ||||||||||||    
T  31251891 ttaaggtaagggtgagactatcattcagtgatcttaagtctataattctg-aaattggatttaacaggttataggttgtagttttag-gaatttgagaat 31251988  T
Q  145 tagg 148  Q
    ||||    
T  31251989 tagg 31251992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 313 - 383
Target Start/End: Original strand, 27183208 - 27183278
Alignment:
Q  313 atgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 383  Q
    |||||| |||||||||| | ||||| |||| || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  27183208 atgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 27183278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 273 - 383
Target Start/End: Original strand, 43444008 - 43444118
Alignment:
Q  273 gaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatg 372  Q
    ||||||| ||| ||||  |||| ||||||||||| ||    ||||| |||||||||| | ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  43444008 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataactttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatg 43444107  T
Q  373 gtcaaattact 383  Q
     | ||||||||    
T  43444108 attaaattact 43444118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 51 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 17876251 - 17876191
Alignment:
Q  51 gtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaaca 111  Q
    |||||||||  |||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  17876251 gtaagggtgaaactaaccttcaataattctgagtatatgattctgaaaattggatttaaca 17876191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 36315496 - 36315390
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatta 146  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||  | || ||||| | |||||||  |||  |||||||| || ||| | || ||||| ||||||||||||||||    
T  36315496 taaggtaagggtgagactagcattcaattctattaagtctgtaattctgatgattaaatttaacaagt-gtaggattggttttagagaatttgagaatta 36315398  T
Q  147 gggttaag 154  Q
    ||||||||    
T  36315397 gggttaag 36315390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 273 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 12013 - 11903
Alignment:
Q  273 gaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatg 372  Q
    ||||||| ||| ||||  |||| ||||||||||| ||    ||||| |||||||||| | ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  12013 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggcattggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 11914  T
Q  373 gtcaaattact 383  Q
     | ||||||||    
T  11913 attaaattact 11903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 47 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 18419503 - 18419453
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaa 97  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||    
T  18419503 taaggtaaaggtgggactaacattcaatcttcttaagcctatgattctgaa 18419453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 273 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 25426287 - 25426177
Alignment:
Q  273 gaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatg 372  Q
    ||||||| ||| ||||  |||| ||||||||||| ||    ||||| |||||||||| | ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  25426287 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggcattggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 25426188  T
Q  373 gtcaaattact 383  Q
     | ||||||||    
T  25426187 attaaattact 25426177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 47 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 31062293 - 31062195
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatta 146  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||  |||| || |||||||||||| ||||  ||||||||||||| |  ||||| |||||||||||  |||||||    
T  31062293 taaggtaagggtgag--taacattcaatcttcttaagcctatgattctgataattagatttaacatgttggagatttag-ttttgagaattgaagaatta 31062197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 320 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 7424940 - 7424879
Alignment:
Q  320 ctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaatta 381  Q
    |||||||||| | ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||    
T  7424940 ctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgatcaaatta 7424879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 383
Target Start/End: Original strand, 11212734 - 11212803
Alignment:
Q  314 tgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 383  Q
    ||||| |||||| ||| | ||||| | ||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  11212734 tgttagctttcttatggctttggtttaacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 11212803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 20572815 - 20572731
Alignment:
Q  44 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttt 129  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||  |  | || ||||||||||||  |||  |||||||||| |||| ||||||||||    
T  20572815 tcttaaggtaagggtgagactaacattcaattttggtaagcctatgattctgatgattagatttaacatg-tgtaggtttagtttt 20572731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 383
Target Start/End: Original strand, 21074249 - 21074318
Alignment:
Q  314 tgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 383  Q
    ||||| |||||||||| | ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  21074249 tgttagctttctaatggcattggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 21074318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 315 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 11342258 - 11342190
Alignment:
Q  315 gttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 383  Q
    |||| |||||||||| | ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  11342258 gttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 11342190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 315 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 23511195 - 23511127
Alignment:
Q  315 gttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 383  Q
    |||| |||| ||||| | ||||| |||| || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  23511195 gttagctttttaatggctttggtttgacatccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 23511127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 47 - 118
Target Start/End: Original strand, 25249828 - 25249900
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtc-tatgattctgaaaattgtatttaacatgttgta 118  Q
    |||||||||||| |||||||| |||  |||| || |||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25249828 taaggtaagggtaggactaaccttctttaattttaagttatataattctgaaaattggatttaacatgttgta 25249900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 47 - 118
Target Start/End: Original strand, 25313612 - 25313684
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtc-tatgattctgaaaattgtatttaacatgttgta 118  Q
    |||||||||||| |||||||| |||  |||| || |||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25313612 taaggtaagggtaggactaaccttctttaattttaagttatataattctgaaaattggatttaacatgttgta 25313684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 337; Significance: 0; HSPs: 149)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 44 - 468
Target Start/End: Original strand, 14269081 - 14269505
Alignment:
Q  44 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14269081 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgctgtaggtttagtttttgagaatttgagaa 14269180  T
Q  144 ttagggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctaatttttcttttcatctctgccccgaatc 243  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||     
T  14269181 ttagggttaagggtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatatagggtgctttttctgatttttcttttcatctctgccctgaatt 14269280  T
Q  244 tgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacg 343  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||| |    
T  14269281 tgaaatgaaatctggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttggtttgatg 14269380  T
Q  344 tcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatg 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14269381 tcaaaacgatttatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatg 14269480  T
Q  444 aaaactgatattgattggtacagaa 468  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  14269481 aaaactggtattgattggtacagaa 14269505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 54 - 468
Target Start/End: Original strand, 15081169 - 15081583
Alignment:
Q  54 agggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaattagggttaa 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15081169 agggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattcttaaaattgtatttaacatgttgtaggtttagtttttgagaatttgagaattagggttaa 15081268  T
Q  154 gagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctaatttttcttttcatctctgccccgaatctgaaatgaaa 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  15081269 gagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctatgccccgaatttgaaatgaaa 15081368  T
Q  254 actggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgat 353  Q
      |||||||||| | | |  ||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15081369 tatggtattgataggtccataattggtcttagaagtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgat 15081468  T
Q  354 ttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgata 453  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15081469 ttatagaacttgagttatggttaaattactgcacgtaggtcacaattaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgata 15081568  T
Q  454 ttgattggtacagaa 468  Q
    |||||||||||||||    
T  15081569 ttgattggtacagaa 15081583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 44 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 8941319 - 8940899
Alignment:
Q  44 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaa 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8941319 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaggtttagtttttgagaatttgagaa 8941220  T
Q  144 ttagggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctaatttttcttttcatctctgccccgaatc 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  8941219 ttagggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgc--tttctgatttttcttttcatctctgccccgaatt 8941122  T
Q  244 tgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacg 343  Q
    |||||||||| ||||||||||| | | | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |    
T  8941121 tgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgaag 8941022  T
Q  344 tcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaa-tttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaat 442  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8941021 tcaaaatgatttatagaacttgagttatgctcaaactactgcacataggtcgcagtgaattttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaat 8940922  T
Q  443 gaaaactgatattgattggtaca 465  Q
    |||||||| ||||||||| ||||    
T  8940921 gaaaactggtattgattgataca 8940899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 47 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 16214526 - 16214105
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatta 146  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  16214526 taaggtaagggtgggattaatattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatcttgtaggtttagtttttgagaatttgagaatca 16214427  T
Q  147 gggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctaatttttcttttcatctctgccccgaatctga 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16214426 gggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgatgttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttga 16214327  T
Q  247 aatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtca 346  Q
    |||||||  |||||||||| | | | ||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  16214326 aatgaaatttggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacaaaggttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtatgacgtca 16214227  T
Q  347 aaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaa 446  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16214226 aaaagatttatagaacttgagttatggtcatattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaa 16214127  T
Q  447 actgatattgattggtacagaa 468  Q
    |||| ||||||||| |||||||    
T  16214126 actggtattgattgatacagaa 16214105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 48 - 467
Target Start/End: Original strand, 21188926 - 21189336
Alignment:
Q  48 aaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaattag 147  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21188926 aaggtaagggtgggactaacatttaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaggtttagttttttagaatttgagaattag 21189025  T
Q  148 ggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctaatttttcttttcatctctgccccgaatctgaa 247  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21189026 ggttaagattgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgc---------tttttcttttcatctctgccccgaatttgaa 21189116  T
Q  248 atgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaa 347  Q
    |||||| ||||||||||| | |    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  21189117 atgaaatctggtattgataggtcaacaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatattagctttttaatgccgttggtctgacgtcaa 21189216  T
Q  348 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaa 447  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21189217 aacaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcagagtgaatttttatgaatttccgcacaactttgtccaaatttgaaatgaaaa 21189316  T
Q  448 ctgatattgattggtacaga 467  Q
    ||| |||| |||||||||||    
T  21189317 ctggtatttattggtacaga 21189336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 47 - 409
Target Start/End: Original strand, 38897549 - 38897910
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatta 146  Q
    ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  38897549 taaggtaggggtgagactaacatt-aataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacaagttgtaggtttagtttttgagaatttcagaatta 38897647  T
Q  147 gggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctaatttttcttttcatctctgccccgaatctga 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  38897648 gggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccaaatttga 38897747  T
Q  247 aatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtca 346  Q
    ||||||| ||||||||||| | | | ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  38897748 aatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaactcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacgtca 38897847  T
Q  347 aaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttat 409  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  38897848 aaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttat 38897910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 44 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 8469387 - 8469036
Alignment:
Q  44 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8469387 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataattttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaggtttagtttttgagaatttgagaa 8469288  T
Q  144 ttagggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctaatttttcttttcatctctgccccgaatc 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  8469287 ttagggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataagttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatt 8469188  T
Q  244 tgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacg 343  Q
    |||||||||| ||||||||||| | | | ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||| ||||     
T  8469187 tgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatagatgttagttttctaatgacgttggtttgact 8469088  T
Q  344 tcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  8469087 tcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattactgcatgtaggtca 8469036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 48 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 11973196 - 11972849
Alignment:
Q  48 aaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaattag 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11973196 aaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaggtttagtttttgagaatttgagaattag 11973097  T
Q  148 ggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctaatttttcttttcatctctgccccgaatctgaa 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  11973096 ggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaacttaaa 11972997  T
Q  248 atgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaa 347  Q
    |||||| ||||||||||| | | | ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  11972996 atgaaatctggtattgataggtccagaatttgtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 11972897  T
Q  348 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    || ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  11972896 aaggatctatagaacttgagttatagtcaaattactgtacgtaggtca 11972849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 47 - 465
Target Start/End: Original strand, 14156392 - 14156817
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatta 146  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  14156392 taaggtaagggtgggactatcattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattttatttgacatgttgtaggtttagtctttgagaattggagaatta 14156491  T
Q  147 gggttaagagtgatgattgt--gatgat-----tttgaatgaaa--gtgaagtt-gaataatataggttgctttttctaatttttcttttcatctctgcc 236  Q
    |||||||||||||| ||||   ||| ||     ||||     ||  |||||||| |||||||||| |||| |||| || |||||||||   || |||| |    
T  14156492 gggttaagagtgataattgatggattatgttactttgttgtcaattgtgaagtttgaataatataagttgtttttcctgatttttctt---atttctgtc 14156588  T
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
     | ||| |||||  ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  14156589 tcaaatttgaaacaaaaactggtattgatcggtacagaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 14156688  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatt 436  Q
    | |||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14156689 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgacttatgatcaaattaccgcatgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaaccttgtccgaatt 14156788  T
Q  437 tgaaatgaaaactgatattgattggtaca 465  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14156789 tgaaatgaaaactggtattgattggtaca 14156817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 44 - 266
Target Start/End: Original strand, 45846762 - 45846984
Alignment:
Q  44 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaa 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45846762 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctctgattttgaaaattgtatttaacatgttgtaggtttagtttttgagaatttgagaa 45846861  T
Q  144 ttagggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctaatttttcttttcatctctgccccgaatc 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  45846862 ttagggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatt 45846961  T
Q  244 tgaaatgaaaactggtattgatt 266  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  45846962 tgaaatgaaatctggtattgatt 45846984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 237 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 8940934 - 8940707
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  8940934 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattgatacataattggtcttaggtgtaaacaa-aaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 8940836  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatt 436  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8940835 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttaagcacaactttgtccgaatt 8940736  T
Q  437 tgaaatgaaaactgatattgattggtaca 465  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8940735 tgaaatgaaaactgctattgattggtaca 8940707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 237 - 468
Target Start/End: Original strand, 14269467 - 14269698
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||    
T  14269467 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgcctttgg 14269566  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatt 436  Q
    | |||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14269567 tatgacgtcaaaaaaatttatagaacttgagttatcatcaaattattgcacgcaggtcagagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatt 14269666  T
Q  437 tgaaatgaaaactgatattgattggtacagaa 468  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14269667 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaa 14269698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 46 - 207
Target Start/End: Original strand, 23461632 - 23461793
Alignment:
Q  46 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23461632 ttaaggtaagggtgagactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaggtttagtttttgagaatttgagaatt 23461731  T
Q  146 agggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgc 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23461732 agggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgc 23461793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 47 - 220
Target Start/End: Original strand, 14317516 - 14317688
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatta 146  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  14317516 taaggtaagggtgagactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaggtttattttttgagaatttgagaatta 14317615  T
Q  147 gggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctaatttt 220  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  14317616 -ggttaagagtgacgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgttttttctgatttt 14317688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 47 - 186
Target Start/End: Original strand, 5294432 - 5294571
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatta 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5294432 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaggtttagtttttgagaatttgagaatta 5294531  T
Q  147 gggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtg 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5294532 gggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtg 5294571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 47 - 186
Target Start/End: Original strand, 5295605 - 5295744
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatta 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5295605 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtaattaacatgttgtaggtttagtttttgagaatttgagaatta 5295704  T
Q  147 gggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtg 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5295705 gggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtg 5295744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 47 - 186
Target Start/End: Original strand, 5296778 - 5296917
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatta 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5296778 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtaattaacatgttgtaggtttagtttttgagaatttgagaatta 5296877  T
Q  147 gggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtg 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5296878 gggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtg 5296917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 314 - 465
Target Start/End: Original strand, 45847242 - 45847393
Alignment:
Q  314 tgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaat 413  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  45847242 tgttaactttctaatgtcgttggtatgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaat 45847341  T
Q  414 ttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtaca 465  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  45847342 ttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaaataatattgattggtaca 45847393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 47 - 178
Target Start/End: Original strand, 9945010 - 9945141
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatta 146  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9945010 taaggtaagggtgagactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaggtttagtttttgagaatttgagaatta 9945109  T
Q  147 gggttaagagtgatgattgtgatgattttgaa 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9945110 gggttaagagtgatgattgtgatgattttgaa 9945141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 47 - 370
Target Start/End: Original strand, 10500735 - 10501064
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatta 146  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| || ||||||||||||||||||  |||||||    
T  10500735 taaggtaagggtgggactatcattcaataatcttgagtctatgattctgaaaatttcatttgacatgtt-taggtttagtttttgagaattgaagaatta 10500833  T
Q  147 gggttaagagtgatgattgt--gatgat-----tttgaatgaaa--gtgaagtt-gaataatataggttgctttttctaatttttcttttcatctctgcc 236  Q
    |||||||||||||| ||||   ||| ||     ||||     ||  |||||||| |||||||||| |||| |||| || |||||||||   || |||| |    
T  10500834 gggttaagagtgataattgatggattatgttactttgttgtcaattgtgaagtttgaataatataagttgtttttcctgatttttctt---atttctgtc 10500930  T
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
     | ||| |||||  ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  10500931 tctaatttgaaacaaaaactggtattgatcggtacagaattggtcttaggtgataacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 10501030  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagtta 370  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  10501031 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtta 10501064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 237 - 427
Target Start/End: Original strand, 10501097 - 10501288
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  10501097 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattgatacagagttggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagatttctaatgtcgttgg 10501196  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttat-gaatttcagcacaacttt 427  Q
    | |||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||| || |||||| ||||||||    
T  10501197 tttgacttcaaatggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgaaggtcatagtgaatttttatggactttcagtacaacttt 10501288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 237 - 412
Target Start/End: Original strand, 25926833 - 25927008
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||    
T  25926833 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatattagctttctaatgccattgg 25926932  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaa 412  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||||||    
T  25926933 tctgacgtcaaaaagagttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaaatcttatgaa 25927008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 237 - 412
Target Start/End: Original strand, 1856933 - 1857107
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  1856933 ccgaatttgaaataaaaactggtattgattggtaccgaattggtcttaggtgtaaacacgaa-gttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcattgg 1857031  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaa 412  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||||||    
T  1857032 tctgacgtcaaaacgatttatataacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaaatcttatgaa 1857107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 16214143 - 16213985
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  16214143 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattgatacagaattggtcttacgtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 16214044  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16214043 tttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaatgactgcacgtaggtca 16213985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Original strand, 15376417 - 15376575
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||    
T  15376417 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 15376516  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15376517 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtca 15376575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 16410517 - 16410359
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||    
T  16410517 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 16410418  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16410417 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtca 16410359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Original strand, 20384827 - 20384985
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||    
T  20384827 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 20384926  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20384927 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtca 20384985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 239 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 11303704 - 11303548
Alignment:
Q  239 gaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtc 338  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||     
T  11303704 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtt 11303605  T
Q  339 tgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11303604 tgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 11303548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 237 - 412
Target Start/End: Original strand, 13918106 - 13918282
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtctt-aggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttg 335  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||  |||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||  | |||    
T  13918106 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtctttaggtgtaaacacgaaaactgtaggtatgaatgttagctttctaattccattg 13918205  T
Q  336 gtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaa 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||||||    
T  13918206 gtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaaatcttatgaa 13918282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 239 - 395
Target Start/End: Original strand, 23664658 - 23664814
Alignment:
Q  239 gaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtc 338  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||     
T  23664658 gaatttgaaatgaaaaatggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtt 23664757  T
Q  339 tgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  23664758 tgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattattgcatgtaggtca 23664814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 239 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 29797067 - 29796915
Alignment:
Q  239 gaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtc 338  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||     
T  29797067 gaatttgaaatgaaaactggtattgattgatacagaattggtcttaggtgtaagcacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtt 29796968  T
Q  339 tgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtag 391  Q
    |||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29796967 tgacttcaaaagaatttatagaacttgagctatggtcaaattactgcacgtag 29796915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 239 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 29800886 - 29800734
Alignment:
Q  239 gaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtc 338  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||     
T  29800886 gaatttgaaatgaaaactggtattgattgatacagaattggtcttaggtgtaagcacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtt 29800787  T
Q  339 tgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtag 391  Q
    |||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29800786 tgacttcaaaagaatttatagaacttgagctatggtcaaattactgcacgtag 29800734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 237 - 427
Target Start/End: Original strand, 14156782 - 14156969
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||    |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  14156782 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggt----acactaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttgg 14156877  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttat-gaatttcagcacaacttt 427  Q
    | |||| |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||| || |||||| ||||||||    
T  14156878 tttgacttcaaaaggatttatagaacgtgagttatgttcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatggactttcagtacaacttt 14156969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Original strand, 14948826 - 14948984
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||    
T  14948826 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 14948925  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14948926 tttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtca 14948984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 237 - 403
Target Start/End: Original strand, 15081545 - 15081711
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  15081545 ccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttgg 15081644  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaat 403  Q
    | |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  15081645 tttgacttcaaaagaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtctaagtgaat 15081711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 24702687 - 24702529
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||    
T  24702687 ccgaatttgaaatgaaaactggtattggttggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaggttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 24702588  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24702587 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 24702529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 24705134 - 24704976
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||    
T  24705134 ccgaatttgaaatgaaaactggtattggttggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaggttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 24705035  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24705034 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 24704976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 27217319 - 27217161
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||    
T  27217319 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 27217220  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27217219 tttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtca 27217161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 47 - 175
Target Start/End: Original strand, 26355194 - 26355321
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatta 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  26355194 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattccgaaaattgtatttaacatgttgtaggtttagtttttgagaatttgggaatta 26355293  T
Q  147 gggttaagagtgatgattgtgatgatttt 175  Q
    ||||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  26355294 gggttaaaagtgattatt-tgatgatttt 26355321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 47 - 175
Target Start/End: Original strand, 26357646 - 26357773
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatta 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  26357646 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattccgaaaattgtatttaacatgttgtaggtttagtttttgagaatttgggaatta 26357745  T
Q  147 gggttaagagtgatgattgtgatgatttt 175  Q
    ||||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  26357746 gggttaaaagtgattatt-tgatgatttt 26357773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 456780 - 456622
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||    
T  456780 ccgaatttgaaatgaaaaccggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 456681  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  456680 tttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtca 456622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Original strand, 14269660 - 14269818
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||    
T  14269660 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttgg 14269759  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    |  ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  14269760 ttcgacttcaaaaggatttatagaaattgagttatggtcaaatttttgcacgtaggtca 14269818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Original strand, 26355685 - 26355843
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||||    
T  26355685 ccgaatttgaaataaaaactggtattgattggtacagaattggtcttatgtgttaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaattccgttgg 26355784  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  26355785 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactacacgtaggtca 26355843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Original strand, 26358137 - 26358295
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||||    
T  26358137 ccgaatttgaaataaaaactggtattgattggtacagaattggtcttatgtgttaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaattccgttgg 26358236  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  26358237 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactacacgtaggtca 26358295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 32125949 - 32125791
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||  ||||||    
T  32125949 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaataccgttgg 32125850  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32125849 tttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtca 32125791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 239 - 395
Target Start/End: Original strand, 16108394 - 16108550
Alignment:
Q  239 gaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtc 338  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||     
T  16108394 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagttttctaatgctgttggtt 16108493  T
Q  339 tgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  16108494 tgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtacgtca 16108550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 244 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 13869800 - 13869649
Alignment:
Q  244 tgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacg 343  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||||     
T  13869800 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgact 13869701  T
Q  344 tcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  13869700 tcaaaaggatttatagaacttgagttatggttaaattactgaacgtaggtca 13869649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 16232979 - 16232821
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||    
T  16232979 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 16232880  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||  |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  16232879 tttgaattcaaaaggatttatagaatttgagttattgtcaaattactgaacgtaggtca 16232821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 41523376 - 41523218
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||    
T  41523376 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacataaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 41523277  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41523276 tttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtca 41523218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 41525838 - 41525680
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||    
T  41525838 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacataaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 41525739  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41525738 tttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtca 41525680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 8940742 - 8940580
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgata----acacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcg 332  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||||  |    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||    
T  8940742 ccgaatttgaaatgaaaactgctattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccg 8940643  T
Q  333 ttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8940642 ttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 8940580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 47 - 175
Target Start/End: Original strand, 11392516 - 11392642
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatta 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||    
T  11392516 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaaca-gttgtaggtatagtttttgagaatttgggaatta 11392614  T
Q  147 gggttaagagtgatgattgtgatgatttt 175  Q
    ||||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  11392615 gggttaaaagtgattatt-tgatgatttt 11392642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 364 - 468
Target Start/End: Original strand, 15376351 - 15376455
Alignment:
Q  364 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggta 463  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15376351 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 15376450  T
Q  464 cagaa 468  Q
    |||||    
T  15376451 cagaa 15376455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 364 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 16410583 - 16410479
Alignment:
Q  364 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggta 463  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16410583 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 16410484  T
Q  464 cagaa 468  Q
    |||||    
T  16410483 cagaa 16410479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 364 - 468
Target Start/End: Original strand, 20384761 - 20384865
Alignment:
Q  364 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggta 463  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20384761 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 20384860  T
Q  464 cagaa 468  Q
    |||||    
T  20384861 cagaa 20384865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 244 - 395
Target Start/End: Original strand, 21189306 - 21189457
Alignment:
Q  244 tgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacg 343  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||||||||||  |||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||| ||||     
T  21189306 tgaaatgaaaactggtatttattggtacagagttggtcttaggtgtaaacaagaaagttgtaggtatgaatgttagctttttaatgccgttggtttgact 21189405  T
Q  344 tcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21189406 tcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtca 21189457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 237 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 18431170 - 18431016
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||  ||||||||| ||||||    
T  18431170 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaactggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatcttaggtttctaatgccgttgg 18431071  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtag 391  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  18431070 tttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtag 18431016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 18628024 - 18627866
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| | |||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||    
T  18628024 ccgaatttaaaatgaaaactgatattgattggcacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 18627925  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  18627924 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgatttatagtcaaattactgcacgtaggtca 18627866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 18640730 - 18640572
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||| ||||||    
T  18640730 ccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggcacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttataatgccgttgg 18640631  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  18640630 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgatttatagtcaaattactgcacgtaggtca 18640572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 364 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 18628090 - 18627986
Alignment:
Q  364 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggta 463  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  18628090 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttaaaatgaaaactgatattgattggca 18627991  T
Q  464 cagaa 468  Q
    |||||    
T  18627990 cagaa 18627986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 364 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 18640796 - 18640692
Alignment:
Q  364 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggta 463  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18640796 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttaagaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggca 18640697  T
Q  464 cagaa 468  Q
    |||||    
T  18640696 cagaa 18640692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 364 - 468
Target Start/End: Original strand, 26355619 - 26355723
Alignment:
Q  364 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggta 463  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  26355619 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaataaaaactggtattgattggta 26355718  T
Q  464 cagaa 468  Q
    |||||    
T  26355719 cagaa 26355723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 364 - 468
Target Start/End: Original strand, 26358071 - 26358175
Alignment:
Q  364 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggta 463  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  26358071 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaataaaaactggtattgattggta 26358170  T
Q  464 cagaa 468  Q
    |||||    
T  26358171 cagaa 26358175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 364 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 27217385 - 27217281
Alignment:
Q  364 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggta 463  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27217385 tgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 27217286  T
Q  464 cagaa 468  Q
    |||||    
T  27217285 cagaa 27217281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 47 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 27217809 - 27217682
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatta 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  27217809 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttaagtcattgattctgaaaattggatttaacatgttgtaggtttagtttttgagaatttgggaatta 27217710  T
Q  147 gggttaagagtgatgattgtgatgatttt 175  Q
    ||||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  27217709 gggttaaaagtgattatt-tgatgatttt 27217682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 246 - 427
Target Start/End: Original strand, 17985097 - 17985279
Alignment:
Q  246 aaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtc 345  Q
    |||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||||  |||||| |||   |    
T  17985097 aaatgaaatctggtattgatcggtacagaattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtaaggatgttaaatttctaatggagttggtttgattcc 17985196  T
Q  346 aaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatg-aatttcagcacaacttt 427  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17985197 aaaatgatatttagaacttgagttatagtcaaattactacacgtaggtcatagtgaatttttatgaaatttcagcacaacttt 17985279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 47 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 457271 - 457143
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  457271 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttaagtcattgattctgaaaattggatttaacatgttgtaggttttagtttttgagaatttgggaatt 457172  T
Q  146 agggttaagagtgatgattgtgatgatttt 175  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  457171 agggttaaaagtgattatt-tgatgatttt 457143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 47 - 175
Target Start/End: Original strand, 15375927 - 15376055
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  15375927 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttaagtcattgattctgaaaattggatttaacatgttgtaggttttagtttttgagaatttgggaatt 15376026  T
Q  146 agggttaagagtgatgattgtgatgatttt 175  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  15376027 agggttaaaagtgattatt-tgatgatttt 15376055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 47 - 175
Target Start/End: Original strand, 20384337 - 20384465
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  20384337 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttaagtcattgattctgaaaattggatttaacatgttgtaggttttagtttttgagaatttgggaatt 20384436  T
Q  146 agggttaagagtgatgattgtgatgatttt 175  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  20384437 agggttaaaagtgattatt-tgatgatttt 20384465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 364 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 456846 - 456742
Alignment:
Q  364 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggta 463  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  456846 tgagttaaggtcaaattactgcacgtaggtcacattgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaaccggtattgattggta 456747  T
Q  464 cagaa 468  Q
    |||||    
T  456746 cagaa 456742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 364 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 16233045 - 16232941
Alignment:
Q  364 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggta 463  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16233045 tgagttaaggtcaaattactgcacataggtcaccgtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 16232946  T
Q  464 cagaa 468  Q
    |||||    
T  16232945 cagaa 16232941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 320 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 11310323 - 11310193
Alignment:
Q  320 ctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagc 419  Q
    |||||||||| | ||||| ||||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||    
T  11310323 ctttctaatgccattggtttgacgtctaaatgaattatataacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcagagtgaatatttatgaatttcagc 11310224  T
Q  420 acaactttgtccgaatttgaaatgaaaactg 450  Q
    ||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  11310223 acaacctttcccgaatttgaaatgaaaactg 11310193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 364 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 13869872 - 13869772
Alignment:
Q  364 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggta 463  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13869872 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaa-ttgaaatgaaaactggtattgattggta 13869774  T
Q  464 ca 465  Q
    ||    
T  13869773 ca 13869772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 47 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 13870294 - 13870166
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  13870294 taaggtaagggtgggactagcattcaataatcttaagtcattgattctgaaaattggatttaacatgttgtaggttttagtttttgagaatttgggaatt 13870195  T
Q  146 agggttaagagtgatgattgtgatgatttt 175  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  13870194 agggttaaaagtgattatt-tgatgatttt 13870166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 47 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 16411008 - 16410880
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||    
T  16411008 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttaagtcattgattctgaaaattggatttaacatgttgtaggttttagtttttgagaattttggaatt 16410909  T
Q  146 agggttaagagtgatgattgtgatgatttt 175  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  16410908 agggttaaaagtgattatt-tgatgatttt 16410880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 47 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 18431661 - 18431533
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  18431661 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttaagtcattgattctgaaaattggattttacatgttgtaggttttagtttttgagaatttgagaatt 18431562  T
Q  146 agggttaagagtgatgattgtgatgatttt 175  Q
    || ||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  18431561 agagttaaaagtgattatt-tgatgatttt 18431533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 364 - 467
Target Start/End: Original strand, 11392937 - 11393040
Alignment:
Q  364 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggta 463  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11392937 tgagttaaggtcaaattactgcacataggtcaccgtgaatttttatgaatttcagcataactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 11393036  T
Q  464 caga 467  Q
    ||||    
T  11393037 caga 11393040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 16233471 - 16233342
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctg-aaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaat 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  16233471 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttaagtcattgattctgaaaaattggatttaacatgttgtaggttttagtttttgagaatttgggaat 16233372  T
Q  145 tagggttaagagtgatgattgtgatgatttt 175  Q
    ||||||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  16233371 tagggttaaaagtgattatt-tgatgatttt 16233342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Original strand, 45847358 - 45847516
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| ||||||||||| |  ||||||||| |||  ||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    ||| |    
T  45847358 ccgaatttgaaatgaaaaataatattgattggtacaaaattggtcttaggtataaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaactctgttag 45847457  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45847458 tttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattattgcacgtaggtca 45847516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 47 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 18628514 - 18628386
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  18628514 taaggtaagggtgggaataacattcaataatcttaagtcattgattctgaaaattggatttaacatgttgtaggttttagtttttgagaatttgggaatt 18628415  T
Q  146 agggttaagagtgatgattgtgatgatttt 175  Q
    |||||||| | |||| ||| ||||||||||    
T  18628414 agggttaaaaatgattatt-tgatgatttt 18628386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 48 - 175
Target Start/End: Original strand, 16460036 - 16460163
Alignment:
Q  48 aaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaatta 146  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||    
T  16460036 aaggtaagggttggactaacattcaacaatcttaagtcattgattctgaaaattggatttaacatgttgtaggttttagtttttgagaatttgggaatta 16460135  T
Q  147 gggttaagagtgatgattgtgatgatttt 175  Q
    ||||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  16460136 gggttaaaagtgattatt-tgatgatttt 16460163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 47 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 41523868 - 41523756
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  41523868 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttaagtcatcgattctgaaaattggatttaacatgttgtaggttttagtttttgagaatttgggaatt 41523769  T
Q  146 agggttaagagtg 158  Q
    |||||||| ||||    
T  41523768 agggttaaaagtg 41523756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 47 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 32126439 - 32126325
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  32126439 taaggtaagggtgggacaaacattcaataatcttaagtcattgattctaaaaattggatttaacatgttgtaggttttagtttttgagaatttgggaatt 32126340  T
Q  146 agggttaagagtgat 160  Q
    |||||||| ||||||    
T  32126339 agggttaaaagtgat 32126325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 18641220 - 18641092
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  18641220 taaggtaagggtgggaataacattcaataatcttaagtcattgattctgaaaattggatttaatatgttgtaggttttagtttttgagaatttgggaatt 18641121  T
Q  146 agggttaagagtgatgattgtgatgatttt 175  Q
    |||||||| | |||| ||| ||||||||||    
T  18641120 agggttaaaaatgattatt-tgatgatttt 18641092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 50 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 41526327 - 41526218
Alignment:
Q  50 ggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaattagg 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41526327 ggtaagggtgggactaacattcaataatcttaagtcatcgattctgaaaattggatttaacatgttgtaggttttagtttttgagaatttgggaattagg 41526228  T
Q  149 gttaagagtg 158  Q
    ||||| ||||    
T  41526227 gttaaaagtg 41526218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 291 - 395
Target Start/End: Original strand, 11393044 - 11393148
Alignment:
Q  291 aacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgta 390  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  11393044 aacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgta 11393143  T
Q  391 ggtca 395  Q
    |||||    
T  11393144 ggtca 11393148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 158
Target Start/End: Original strand, 14948333 - 14948445
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgta-agtttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||    
T  14948333 taaggtaagggtgggactaacattcaataatattaagtcattgattctgaaaattggatttaacatgttgtagcttttcgtttttgagaatttgagaatt 14948432  T
Q  146 agggttaagagtg 158  Q
    |||||||| ||||    
T  14948433 agggttaaaagtg 14948445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 48 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 16580668 - 16580541
Alignment:
Q  48 aaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaatta 146  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||  |||||    
T  16580668 aaggtaagggttggactaacattcaataatcttaagtcattgattctgaaaattggatttaacatgttgtaggttttagtttttgagaatttggaaatta 16580569  T
Q  147 gggttaagagtgatgattgtgatgatttt 175  Q
    | ||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  16580568 gagttaaaagtgattatt-tgatgatttt 16580541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 400 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 18431200 - 18431129
Alignment:
Q  400 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaactg 471  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18431200 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaactg 18431129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 400 - 468
Target Start/End: Original strand, 13918076 - 13918144
Alignment:
Q  400 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaa 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13918076 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaa 13918144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 400 - 468
Target Start/End: Original strand, 25926803 - 25926871
Alignment:
Q  400 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaa 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25926803 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaa 25926871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 400 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 32125979 - 32125911
Alignment:
Q  400 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaa 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32125979 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaa 32125911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 400 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 41523406 - 41523338
Alignment:
Q  400 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaa 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41523406 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaa 41523338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 400 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 41525868 - 41525800
Alignment:
Q  400 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaa 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41525868 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaa 41525800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 400 - 468
Target Start/End: Original strand, 14948796 - 14948864
Alignment:
Q  400 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaa 468  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14948796 gaatttttatgaattttagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaa 14948864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 400 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 24702717 - 24702649
Alignment:
Q  400 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaa 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  24702717 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattggttggtacagaa 24702649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 400 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 24705164 - 24705096
Alignment:
Q  400 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaa 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  24705164 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattggttggtacagaa 24705096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 304 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 13841446 - 13841355
Alignment:
Q  304 taggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    |||||||| |||||| |||||||||  ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13841446 taggtatgaatgttagctttctaattccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtca 13841355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 56 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 20485018 - 20484900
Alignment:
Q  56 ggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaattagggttaaga 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||   ||||||||||||| || |||||||||| |    
T  20485018 ggtgggactaacattcaataatcttaagtcattgattctgaaaattgaatttaatatgttgtaagttttagttttgagaatttgggatttagggttaaaa 20484919  T
Q  156 gtgatgattgtgatgatttt 175  Q
     |||| ||| ||||||||||    
T  20484918 ttgattatt-tgatgatttt 20484900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 47 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 24703172 - 24703081
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatt 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||    
T  24703172 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttaagtcattgattctgaaaattggatttaacatgttgtaggttttcgtttttgagaatt 24703081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 47 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 24705619 - 24705528
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatt 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||    
T  24705619 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttaagtcattgattctgaaaattggatttaacatgttgtaggttttcgtttttgagaatt 24705528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 50 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 38519732 - 38519616
Alignment:
Q  50 ggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagt--ttttgagaatttgagaattag 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||| ||||  ||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  38519732 ggtaagggtgggactaacattcaatcttcttaagcctatgattctgataattagatttagcatgttgtaggtttagtttttttgagaatttga-aattag 38519634  T
Q  148 ggttaagagtgatgattg 165  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  38519633 ggttaagagtgataattg 38519616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 400 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 11303736 - 11303671
Alignment:
Q  400 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtaca 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11303736 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtcagaatttgaaatgaaaactggtattgattggtaca 11303671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 400 - 465
Target Start/End: Original strand, 16108362 - 16108427
Alignment:
Q  400 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtaca 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16108362 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtcagaatttgaaatgaaaactggtattgattggtaca 16108427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 44 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 16997147 - 16997027
Alignment:
Q  44 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||  |||  ||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||  ||    
T  16997147 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaatcttcttaagcctatgattctgatgattagatttaacatgttgtagggttagttttttagaa-ttgtaaa 16997049  T
Q  144 ttagggttaagagtgatgattg 165  Q
    ||||||||||||||||| ||||    
T  16997048 ttagggttaagagtgataattg 16997027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 48 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 20488387 - 20488282
Alignment:
Q  48 aaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaattag 147  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||   |||||||||||||  ||||||    
T  20488387 aaggtaagggtgagactaacattcaataatcttaagtcattgattctgaaaattggatttaatatgttgtaagttttagttttgagaatttggaaattag 20488288  T
Q  148 ggttaa 153  Q
    | ||||    
T  20488287 gattaa 20488282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 44 - 159
Target Start/End: Original strand, 14980667 - 14980781
Alignment:
Q  44 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacat-gttgtaagtttagtttttgagaatttgaga 142  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||| || |||| |||    
T  14980667 tcttaaggtaagggtgggactaaccttcaataatcttgagtatgtgattctg-aaattgaatttaacatggttgtaggttgagttttt-aggattttaga 14980764  T
Q  143 attagggttaagagtga 159  Q
    ||||||||||| |||||    
T  14980765 attagggttaaaagtga 14980781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 44 - 159
Target Start/End: Original strand, 15410143 - 15410257
Alignment:
Q  44 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacat-gttgtaagtttagtttttgagaatttgaga 142  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||| || |||| |||    
T  15410143 tcttaaggtaagggtgggactaaccttcaataatcttgagtatgtgattctg-aaattgaatttaacatggttgtaggttgagttttt-aggattttaga 15410240  T
Q  143 attagggttaagagtga 159  Q
    ||||||||||| |||||    
T  15410241 attagggttaaaagtga 15410257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 400 - 468
Target Start/End: Original strand, 23664626 - 23664694
Alignment:
Q  400 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaa 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  23664626 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtcagaatttgaaatgaaaaatggtattgattggtacagaa 23664694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 400 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 29797099 - 29797031
Alignment:
Q  400 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaa 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  29797099 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtcagaatttgaaatgaaaactggtattgattgatacagaa 29797031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 400 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 29800918 - 29800850
Alignment:
Q  400 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaa 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  29800918 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtcagaatttgaaatgaaaactggtattgattgatacagaa 29800850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 42 - 165
Target Start/End: Original strand, 129938 - 130059
Alignment:
Q  42 aatcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgag 141  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||  |||||||||||  |||  ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||     
T  129938 aatcctaaggtaagggtgggactaacattcaat-ctcttaagcttatgattctgatgattagatttaacatgttgtatggttagtttttgagaattgga- 130035  T
Q  142 aattagggttaagagtgatgattg 165  Q
    ||||||||||||||||||| ||||    
T  130036 aattagggttaagagtgataattg 130059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 400 - 467
Target Start/End: Original strand, 10501067 - 10501134
Alignment:
Q  400 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacaga 467  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  10501067 gaatttttatgaatttcagcacaaccttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattgatacaga 10501134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 47 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 42462923 - 42462806
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatta 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||  |||  ||||||||||||||| | ||||||||| |||||| || |||||    
T  42462923 taaggtaagggtgggactaacattcaatcttcttaagcctatgattctgatgattagatttaacatgttgtagggttagttttttagaattgga-aatta 42462825  T
Q  147 gggttaagagtgatgattg 165  Q
     ||||||||||||| ||||    
T  42462824 aggttaagagtgataattg 42462806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 400 - 464
Target Start/End: Original strand, 1856903 - 1856967
Alignment:
Q  400 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtac 464  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  1856903 gaatttttatgaatttcagaacaactttgtccgaatttgaaataaaaactggtattgattggtac 1856967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 48 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 14259445 - 14259334
Alignment:
Q  48 aaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatga-ttctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatta 146  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||  | ||| | | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  14259445 aaggtaagggtgggactagccttcaataattctaagtgttttaattctgaaaattgtatttaacatgttgt-agtttag-ttttgagaatttgggaatta 14259348  T
Q  147 gggttaagagtgat 160  Q
    ||||||| ||||||    
T  14259347 gggttaaaagtgat 14259334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 46 - 159
Target Start/End: Original strand, 9724801 - 9724913
Alignment:
Q  46 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacat-gttgtaagtttagtttttgagaatttgagaat 144  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| | ||| |||| | |||| ||||||||| |||||| ||| || |||| |||||||||||||    
T  9724801 ttaaggtaagggtgggactaaccttaaataatcttgagtatgtgaatctg-atattgaatttaacatggttgtatgttgaggtttt-agaatttgagaat 9724898  T
Q  145 tagggttaagagtga 159  Q
    ||||||||| |||||    
T  9724899 tagggttaaaagtga 9724913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 47 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 13893498 - 13893374
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagttttt-gagaatttgagaat 144  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||  || | |||||||||| ||||||||||||||    
T  13893498 taaggtaagggtgggactatcattcagtgatcttaagtctatgattctg-aaattggatttaacatgt--taggttttagtttttggagaatttgagaat 13893402  T
Q  145 tagggttaagagtgatgattgtgatgatt 173  Q
    | ||||| | |||||| ||| ||||||||    
T  13893401 ttgggttgaaagtgataatt-tgatgatt 13893374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 15203268 - 15203116
Alignment:
Q  9 gagatgaaccaagaggaaaggttgccgatcgttaatcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtattta 108  Q
    |||| ||||||||| || ||| | || |||| | ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| | |||||||||||| || |||||    
T  15203268 gagaagaaccaagaagagaggctaccaatcgattatcctaaggtaagggtgggactaaccttcaataattatgagtatgtgattctgaaaa-tgaattta 15203170  T
Q  109 acat-gttgtaagtt-tagtttttgagaatttgagaattagggttaagagtgatga 162  Q
    |||| |||||| ||| |||||||  |||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  15203169 acatggttgtaggttgtagtttt--agaatttgggaattacggttaaaagtgatga 15203116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 44 - 128
Target Start/End: Original strand, 18455587 - 18455671
Alignment:
Q  44 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagttt 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||  ||||||||||| ||||  ||||||||||||| | |||||||||    
T  18455587 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaatcttcttaagcatatgattctgataattagatttaacatgttggaggtttagttt 18455671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 48 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 32302278 - 32302163
Alignment:
Q  48 aaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatga-ttctgaaaa-ttgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||  | ||| | | | ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||    
T  32302278 aaggtaagggtgggactagccttcaataattctaagtgttttaattctgaaaaattgtatttaacatgttgtaggtttag-ttttgaggatttgggaatt 32302180  T
Q  146 agggttaagagtgatga 162  Q
    |||||||| ||||||||    
T  32302179 agggttaaaagtgatga 32302163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 44 - 159
Target Start/End: Original strand, 9176832 - 9176946
Alignment:
Q  44 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaa 143  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||  | || ||||| | ||||||| ||||  |||||||| || ||| | |||||||| ||||||||||| |    
T  9176832 tcttaaggtaagggtgagactagcattcaattttattaagtctgtaattctgataattaaatttaacaagt-gtaggattagttttagagaatttgagga 9176930  T
Q  144 ttagggttaagagtga 159  Q
    ||||||||||||||||    
T  9176931 ttagggttaagagtga 9176946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 148
Target Start/End: Original strand, 15095637 - 15095738
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtt-tagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||  | ||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| ||| ||||| ||||||| |||||    
T  15095637 taaggtaagggtgggactaaccttcactaattctaagtgtatgattctgaaaattgaatttaacaggttgtaggttgtag-ttttgggaatttgggaatt 15095735  T
Q  146 agg 148  Q
    |||    
T  15095736 agg 15095738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 48 - 160
Target Start/End: Original strand, 14928290 - 14928402
Alignment:
Q  48 aaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagt-ctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatta 146  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||  | ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||  ||||| ||||||    
T  14928290 aaggtaagggtgggactaaccttcagtaattctaagttctttaattctgaaaattgtatttaacatgttgtagatttag-ttttgacgatttgggaatta 14928388  T
Q  147 gggttaagagtgat 160  Q
    | ||||| ||||||    
T  14928389 gagttaaaagtgat 14928402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 48 - 160
Target Start/End: Original strand, 15351756 - 15351868
Alignment:
Q  48 aaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagt-ctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatta 146  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||  | ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||  ||||| ||||||    
T  15351756 aaggtaagggtgggactaaccttcagtaattctaagttctttaattctgaaaattgtatttaacatgttgtagatttag-ttttgacgatttgggaatta 15351854  T
Q  147 gggttaagagtgat 160  Q
    | ||||| ||||||    
T  15351855 gagttaaaagtgat 15351868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 114
Target Start/End: Original strand, 19485973 - 19486039
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  19485973 taaggtaagggtgggactaacattcaatcttcttaagcctatgattctg-aaattggatttaacatgt 19486039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 47 - 148
Target Start/End: Original strand, 8135238 - 8135338
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtt-tagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| ||||| | ||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| ||||||| | |||||||||||||    
T  8135238 taaggtaagggtgagactaaccttcactaatcctaagtgtatgattctg-aaattgaatttaacaggttgtaggttgtagttttag-gaatttgagaatt 8135335  T
Q  146 agg 148  Q
    |||    
T  8135336 agg 8135338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 46 - 132
Target Start/End: Original strand, 11768089 - 11768174
Alignment:
Q  46 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttga 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||| || |||| |||||||  |||  |||||||||| |||| |||||||||||||    
T  11768089 ttaaggtaagggtgggactaacattcaatcttcttaagcctataattctgatgattagatttaacatg-tgtaggtttagtttttga 11768174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 233 - 306
Target Start/End: Original strand, 23461791 - 23461864
Alignment:
Q  233 tgccccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtag 306  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||||||||| | | | ||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  23461791 tgccccgaatttgaaatgaagtctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtag 23461864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 47 - 117
Target Start/End: Original strand, 1856401 - 1856471
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgt-atttaacatgttgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||| || |||| ||||||||||||||    
T  1856401 taaggtaagggtgggactaacattcaatcttcttaagcctatgattctg-aatttgtgatttaacatgttgt 1856471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 47 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 11054765 - 11054694
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgta 118  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||  | ||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  11054765 taaggtaagggtgggactaaccttcaatgattctaagtgtttgattctgaaaattgaatttaacaggttgta 11054694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 44 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 11085575 - 11085478
Alignment:
Q  44 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacat-gttgtaagtttagtttttgagaatttgaga 142  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| | |||||||||| | || ||||||||| |||||| ||| || |||| |||||||||||    
T  11085575 tcttaaggtaagggtgggactaaccttcaataattctgagtatgtgattctgaaga-tgaatttaacatggttgtaggttgaggtttt-agaatttgaga 11085478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 47 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 13648333 - 13648263
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgt-atttaacatgttgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||| || |||| ||||||||||||||    
T  13648333 taaggtaagggtgggactaacattcaatcttcttaagcctatgattctg-aatttgtgatttaacatgttgt 13648263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 47 - 117
Target Start/End: Original strand, 13917573 - 13917643
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgt-atttaacatgttgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||| || |||| ||||||||||||||    
T  13917573 taaggtaagggtgggactaacattcaatcttcttaagcctatgattctg-aatttgtgatttaacatgttgt 13917643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 47 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 15140265 - 15140159
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtt-tagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    ||||||| ||||| ||||||| |||| ||||  | ||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| ||| ||||| ||||||| |||||    
T  15140265 taaggtatgggtgagactaaccttcactaattctaagtgtatgattctgaaaattgaatttaacaggttgtaggttgtag-ttttgggaatttgggaatt 15140167  T
Q  146 agggttaa 153  Q
    ||| ||||    
T  15140166 aggtttaa 15140159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 97
Target Start/End: Original strand, 42374305 - 42374355
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaa 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||    
T  42374305 taaggtaagggtgggactaacattcaatcttcttaagcctatgattctgaa 42374355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 236 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 11310214 - 11310130
Alignment:
Q  236 cccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatct 321  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||   |||  ||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  11310214 cccgaatttgaaatgaaaactg-tattgataagtacataattggtcttaggtgttttcacaaaagttgtaggtatagatgttatct 11310130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 48 - 97
Target Start/End: Original strand, 25926301 - 25926350
Alignment:
Q  48 aaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaa 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||    
T  25926301 aaggtaagggtgggactaacattcaatcttcttaagcctatgattctgaa 25926350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #139
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 315 - 383
Target Start/End: Original strand, 32495092 - 32495160
Alignment:
Q  315 gttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 383  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||    
T  32495092 gttatctttctaatggctttggtttgatgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcatattact 32495160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #140
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 128
Target Start/End: Original strand, 37793389 - 37793473
Alignment:
Q  44 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagttt 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || |  | |||||||  |||  |||||||| |||||| |||||||||    
T  37793389 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaatcttcttaagccgttaattctgatgattagatttaacaagttgtaggtttagttt 37793473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #141
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 140
Target Start/End: Original strand, 9032530 - 9032608
Alignment:
Q  61 gactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttga 140  Q
    ||||||||||||||  |||| || ||||||||||||  |||  |||||||||| | || |||||||||||||||||||||    
T  9032530 gactaacattcaattttcttaagcctatgattctgattattagatttaacatg-tctaggtttagtttttgagaatttga 9032608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #142
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 15624070 - 15623961
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtt-tagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||  | ||| |||||||||| |||||| |||||| | ||||||  || ||| ||||| |||||||||||||    
T  15624070 taaggtaagggtgagactaaccttcaataattctaagtgtatgattctg-aaattgaatttaataggttgtagtttgtag-ttttgggaatttgagaatt 15623973  T
Q  146 agggttaagagt 157  Q
    ||| ||| ||||    
T  15623972 aggtttaggagt 15623961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #143
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 320 - 383
Target Start/End: Original strand, 15951640 - 15951703
Alignment:
Q  320 ctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 383  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||| | ||||||||    
T  15951640 ctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgattaaattact 15951703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #144
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 313 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 11287046 - 11286976
Alignment:
Q  313 atgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 383  Q
    |||||| |||||||||| | ||||| || | || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  11287046 atgttagctttctaatggctttggtttgtcttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 11286976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #145
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 126034 - 125965
Alignment:
Q  314 tgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 383  Q
    ||||| |||||||||| | ||||| |||| || ||| || || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  126034 tgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgagttttagaacttgagttatgatcaaattact 125965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #146
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 383
Target Start/End: Original strand, 15760779 - 15760848
Alignment:
Q  314 tgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 383  Q
    ||||| |||||||||| | ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  15760779 tgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 15760848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #147
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 315 - 383
Target Start/End: Original strand, 1937828 - 1937896
Alignment:
Q  315 gttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 383  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||| || || ||||| || ||||||| ||||||||||    
T  1937828 gttatctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgaattttagaattttagttatgatcaaattact 1937896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #148
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 46 - 74
Target Start/End: Original strand, 17052761 - 17052789
Alignment:
Q  46 ttaaggtaagggtgggactaacattcaat 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17052761 ttaaggtaagggtgggactaacattcaat 17052789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #149
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 47 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 33060490 - 33060442
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctg 95  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||| ||||||    
T  33060490 taaggtaagggtgggactaaccttctttaatcatgagtctataattctg 33060442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 334; Significance: 0; HSPs: 140)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 47 - 468
Target Start/End: Original strand, 31629861 - 31630282
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatta 146  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31629861 taaggtaagggtgagactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaggtttagtttttgagaatttgagaatta 31629960  T
Q  147 gggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctaatttttcttttcatctctgccccgaatctga 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  31629961 gggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttaa 31630060  T
Q  247 aatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtca 346  Q
    ||||||| |||||||||||   |||  | |||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31630061 aatgaaatctggtattgataagtacatagttggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtagttatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtca 31630160  T
Q  347 aaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31630161 aaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactacatgtatgtcacagcgaatttttatgaatttcagcacaattttgtccgaatttgaaatgaaa 31630260  T
Q  447 actgatattgattggtacagaa 468  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  31630261 actggtattgattggtacagaa 31630282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 9 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 34964060 - 34963682
Alignment:
Q  9 gagatgaaccaagaggaaaggttgccgatcgttaatcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtattta 108  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34964060 gagaagaaccaagaggaaaggctgccgatcgttaatcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtattta 34963961  T
Q  109 acatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaattagggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgct 208  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34963960 acatgttgtaggtttagtttttgagaatttgagaattagggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatatatgttgct 34963861  T
Q  209 ttttctaatttttcttttcatctctgccccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggt 308  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  34963860 ttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggt 34963761  T
Q  309 atggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcac 387  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34963760 atggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcac 34963682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 46 - 465
Target Start/End: Original strand, 30676038 - 30676448
Alignment:
Q  46 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30676038 ttaaggtaagggtgagactaacatgcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaggtttagtttttgagaatttgagaatt 30676137  T
Q  146 agggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctaatttttcttttcatctctgccccgaatctg 245  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||| ||    
T  30676138 agagttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttt---------tcttttcatctctgccccgaatttg 30676228  T
Q  246 aaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtc 345  Q
    ||||||||||||||||||| || |||  ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||    
T  30676229 aaatgaaaactggtattgaatggtacataattggtcttaggtgataagactaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttgctctgacgtc 30676328  T
Q  346 aaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaa 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30676329 aaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaa 30676428  T
Q  446 aactgatattgattggtaca 465  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  30676429 aactggtattgattggtaca 30676448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 9 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 23993109 - 23992723
Alignment:
Q  9 gagatgaaccaagaggaaaggttgccgatcgttaatcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtattta 108  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23993109 gagaagaaccaagaggaaaggctgccgatcgttaatcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctataattctgaaaattgtattta 23993010  T
Q  109 acatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaattagggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgct 208  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23993009 acatgttgtaggtttagtttttgagaatttgagaattagggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaatagtataggttgct 23992910  T
Q  209 ttttctaatttttcttttcatctctgccccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggt 308  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| | | | ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  23992909 ttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatccggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggt 23992810  T
Q  309 atggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    |||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23992809 atggatgtcagctttctaatgttgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaatttactgcacgtaggtca 23992723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 46 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 19005991 - 19005575
Alignment:
Q  46 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtt-tagtttttgagaatttgagaat 144  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||| |||  ||  |||||||||    
T  19005991 ttaaggtaagggtgagactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttat--gttataggttt--agtttttgagaat 19005896  T
Q  145 tagggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctaatttttcttttcatctctgccccgaatct 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19005895 tagggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttatgatttttcttttcatctctgccccgaattt 19005796  T
Q  245 gaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgt 344  Q
    |||||||||  |||||||||||  ||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  19005795 gaaatgaaatttggtattgattagtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgactt 19005696  T
Q  345 caaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatga 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19005695 caaaacgatttatagaacttgagttatgttcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacatctttgtccgaatttgaaatga 19005596  T
Q  445 aaactgatattgattggtaca 465  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  19005595 aaactggtattgattggtaca 19005575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 48 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 1599082 - 1598673
Alignment:
Q  48 aaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaattag 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||        |     
T  1599082 aaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtagatttagtttttgagaatt--------at 1598991  T
Q  148 ggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctaatttttcttttcatctctgccccgaatctgaa 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  1598990 ggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctaccccgaatttgaa 1598891  T
Q  248 atgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaa 347  Q
    |||||||||||||||||| | | | ||||||||| || |||  ||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| ||    
T  1598890 atgaaaactggtattgataggtccagaattggtcataagtgtaaacattaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttggtctgacgttaa 1598791  T
Q  348 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaa 447  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1598790 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaa 1598691  T
Q  448 ctgatattgattggtaca 465  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  1598690 ctggtattgattggtaca 1598673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 44 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 18914969 - 18914549
Alignment:
Q  44 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaa 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18914969 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttga-tctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaggtttagtttttgagaatttgagaa 18914871  T
Q  144 ttagggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctaatttttcttttcatctctgccccgaatc 243  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  18914870 taagggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatt 18914771  T
Q  244 tgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacg 343  Q
    |||||||||| |||||||||||   | | ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||     
T  18914770 tgaaatgaaatctggtattgataagtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagatttctaatgtcgttggtctgaca 18914671  T
Q  344 tcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatg 443  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || |||||||||||| |||||||||| | |||||||| ||||     
T  18914670 tcaaaaaaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtaaacttttatgaattttagcacaacttagaccgaattttaaatt 18914571  T
Q  444 aaaactgatattgattggtaca 465  Q
    || |||| ||||||||||||||    
T  18914570 aatactggtattgattggtaca 18914549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 44 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 25536060 - 25535708
Alignment:
Q  44 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaa 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25536060 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaggtttagtttttgagaatttgagaa 25535961  T
Q  144 ttagggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgct-ttttctaatttttcttttcatctctgccccgaat 242  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  25535960 ttatggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgcttttttctgatttttcttttcatctttgccccgaat 25535861  T
Q  243 ctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgac 342  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  25535860 ttgaaatgaaaactggtattgattggtagagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgac 25535761  T
Q  343 gtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25535760 ttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcatgtaggtca 25535708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 123 - 465
Target Start/End: Original strand, 19847368 - 19847710
Alignment:
Q  123 tagtttttgagaatttgagaattagggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctaatttttc 222  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19847368 tagtttttgagcatttgagaattagggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttc 19847467  T
Q  223 ttttcatctctgccccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctt 322  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19847468 ttttcatctctgccccaaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcctaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctt 19847567  T
Q  323 tctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcaca 422  Q
    ||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  19847568 tctaatgccattagtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatcgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcaca 19847667  T
Q  423 actttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtaca 465  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19847668 actttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtaca 19847710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 44 - 253
Target Start/End: Original strand, 17027861 - 17028070
Alignment:
Q  44 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaa 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  17027861 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaggtttagtttttgagaatctgagaa 17027960  T
Q  144 ttagggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctaatttttcttttcatctctgccccgaatc 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  17027961 ttagggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatt 17028060  T
Q  244 tgaaatgaaa 253  Q
    ||||||||||    
T  17028061 tgaaatgaaa 17028070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 244 - 468
Target Start/End: Original strand, 8834 - 9058
Alignment:
Q  244 tgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacg 343  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8834 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtacacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacg 8933  T
Q  344 tcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatg 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8934 tcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaattttaaatg 9033  T
Q  444 aaaactgatattgattggtacagaa 468  Q
    ||||||| || ||||||||||||||    
T  9034 aaaactggtaatgattggtacagaa 9058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 237 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 1598708 - 1598477
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  1598708 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataaatggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 1598609  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatt 436  Q
    | |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1598608 tatgacatcaaaacaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatt 1598509  T
Q  437 tgaaatgaaaactgatattgattggtacagaa 468  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1598508 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaa 1598477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 237 - 468
Target Start/End: Original strand, 26924151 - 26924382
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||| ||||  |||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  26924151 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttgg 26924250  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatt 436  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26924251 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagttaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatt 26924350  T
Q  437 tgaaatgaaaactgatattgattggtacagaa 468  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  26924351 tgaaatgaaaactagtattgattggtacagaa 26924382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 244 - 437
Target Start/End: Original strand, 1875 - 2068
Alignment:
Q  244 tgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacg 343  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1875 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtacacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacg 1974  T
Q  344 tcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaattt 437  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1975 tcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaattt 2068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 44 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 25689478 - 25689320
Alignment:
Q  44 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaa 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25689478 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaggtttagtttttgagaatttgagaa 25689379  T
Q  144 ttagggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatatag 202  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25689378 ttagagttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatatag 25689320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 237 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 25689154 - 25688927
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  25689154 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 25689055  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatt 436  Q
    || ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25689054 tcggacgtcaaaaaaatttatagaacttgcgttatggtcatattactgcacgtaggtcatagtgaatttttatgaatttcagcacaactttatccgaatt 25688955  T
Q  437 tgaaatgaaaactgatattgattggtac 464  Q
    |||||| ||||||| |||| ||||||||    
T  25688954 tgaaatcaaaactggtatttattggtac 25688927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 47 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 16198447 - 16198293
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatta 146  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16198447 taaggtaagggtgtgactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaggtttagtttttgagaatttgagaatta 16198348  T
Q  147 gggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatata 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16198347 gggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatata 16198293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 237 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 18914584 - 18914356
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| | |||| || |||||||||||||| |||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||    
T  18914584 ccgaattttaaattaatactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggaagttagctttctaataccgttgg 18914485  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatt 436  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18914484 tctgaagtcaaaacgattgatagaacttgagttatggtcaaagtactgcacgtaggtcacagtcaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatt 18914385  T
Q  437 tgaaatgaaaactgatattgattggtaca 465  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||    
T  18914384 tgaaatgaaaactggtatttattggtaca 18914356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 273 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 25689311 - 25689119
Alignment:
Q  273 gaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatg 372  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| | | |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25689311 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtgtggatgtcagcattctaatgacgttggtctgacatcaaaacaatttatagaacttgagttatg 25689212  T
Q  373 gtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtaca 465  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25689211 gtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaatttttatgaatatcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtaca 25689119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 44 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 25721150 - 25721009
Alignment:
Q  44 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaa 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25721150 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaggtttagtttttgagaatttgagaa 25721051  T
Q  144 ttagggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagt 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25721050 ttagggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagt 25721009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 291 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 25737240 - 25737063
Alignment:
Q  291 aacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgta 390  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||    
T  25737240 aacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacaatttatagaacatgagttatggtcatattactgcatgta 25737141  T
Q  391 ggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaa 468  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25737140 ggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttatccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaa 25737063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 308 - 468
Target Start/End: Original strand, 22981321 - 22981481
Alignment:
Q  308 tatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaattttt 407  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  22981321 tatggatgttagctttctaatgccgttggtcgggcgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggttaaattactgcacgtaggtcacagtgaattttt 22981420  T
Q  408 atgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaa 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22981421 atgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaa 22981481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 308 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 23807087 - 23806927
Alignment:
Q  308 tatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaattttt 407  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  23807087 tatggatgttagctttctaatgccgttggtcgggcgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggttaaattactgcacgtaggtcacagtgaattttt 23806988  T
Q  408 atgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaa 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23806987 atgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaa 23806927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 246 - 439
Target Start/End: Original strand, 85 - 278
Alignment:
Q  246 aaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtc 345  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||  |||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  85 aaatgaaaactggtattgagttgtacaaaattggtcttaggtgtatacacgaaagttgaaggtatggatgttagttttctaatgtcgttggtctgacgtc 184  T
Q  346 aaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttga 439  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  185 aaaacgatttatataacttgagttatggtcaaagtactgcacgtaggtcatagtgaatttttgtgaatttcagcacaactttgttcgaatttga 278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 9 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 25753528 - 25753385
Alignment:
Q  9 gagatgaaccaagaggaaaggttgccgatcgttaatcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtattta 108  Q
    |||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25753528 gagaagaaccaagaggaaaggcttccgatcattaatcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtattta 25753429  T
Q  109 acatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaattagggtta 152  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25753428 acatgttgtaggtttagtttttgagaatttgagaattagggtta 25753385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 9 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 25755698 - 25755555
Alignment:
Q  9 gagatgaaccaagaggaaaggttgccgatcgttaatcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtattta 108  Q
    |||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25755698 gagaagaaccaagaggaaaggcttccgatcattaatcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtattta 25755599  T
Q  109 acatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaattagggtta 152  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25755598 acatgttgtaggtttagtttttgagaatttgagaattagggtta 25755555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 1598515 - 1598357
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  1598515 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 1598416  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| |||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  1598415 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtcatagtcaaattactgcacgtaggtca 1598357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 23415423 - 23415265
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||    
T  23415423 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaatttgtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagttttctaatgccattgg 23415324  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23415323 tctgacgtcaaaacaatttatagaacttgagttatggtcaagttactgcacgtaggtca 23415265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 239 - 395
Target Start/End: Original strand, 28289042 - 28289198
Alignment:
Q  239 gaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtc 338  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  28289042 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtctcaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtt 28289141  T
Q  339 tgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28289142 tgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 28289198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 237 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 27557181 - 27557006
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||    
T  27557181 ccgaatttgaaatgaaaactgctattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattgg 27557082  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaa 412  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||||||    
T  27557081 tctgacgttaaaacaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaaatcttatgaa 27557006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Original strand, 18334296 - 18334454
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||    
T  18334296 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 18334395  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18334396 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtca 18334454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 24423005 - 24422847
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||    
T  24423005 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 24422906  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24422905 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtca 24422847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Original strand, 26924344 - 26924502
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  26924344 ccgaatttgaaatgaaaactagtattgattggtacagaattgttcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 26924443  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26924444 tttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtacgtca 26924502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 33862252 - 33862094
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||    
T  33862252 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 33862153  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33862152 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtca 33862094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 33864736 - 33864578
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||    
T  33864736 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 33864637  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33864636 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtca 33864578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 19005610 - 19005452
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19005610 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattagtcttaggtgtaaacacaaaaattgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 19005511  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19005510 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcatgtaggtca 19005452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Original strand, 30676413 - 30676571
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  30676413 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 30676512  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  30676513 tttgacttcaaaataatttatagaacttgagttatggtaaaattacttcacgtaggtca 30676571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 47 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 8055978 - 8055851
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatta 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  8055978 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattccgaaaattgtatttaacatgttgtaggtttagtttttgagaatttgggaatta 8055879  T
Q  147 gggttaagagtgatgattgtgatgatttt 175  Q
    ||||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  8055878 gggttaaaagtgattatt-tgatgatttt 8055851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Original strand, 1540615 - 1540773
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||    
T  1540615 ccgaatttgaaatgcaaactggtattgattggtatagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 1540714  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1540715 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtca 1540773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Original strand, 2290884 - 2291042
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||  |||||| |||||||||| ||||||    
T  2290884 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtagatataaatgttagctttctaatgccgttgg 2290983  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2290984 tttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtca 2291042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 12742776 - 12742618
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||    
T  12742776 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtatagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 12742677  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  12742676 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcaagtaggtca 12742618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 47 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 22783176 - 22783048
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  22783176 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaggttttagtttttgagaatttgggaatt 22783077  T
Q  146 agggttaagagtgatgattgtgatgatttt 175  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  22783076 agggttaaaagtgattatt-tgatgatttt 22783048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 8055488 - 8055330
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| || ||||||    
T  8055488 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctattgccgttgg 8055389  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  8055388 tttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaatgtaggtca 8055330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 18914391 - 18914233
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||    
T  18914391 ccgaatttgaaatgaaaactggtatttattggtacataattggtcttaggggtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttaactttctaatgctgttgg 18914292  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | | || |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18914291 tttaacttcaaaaggatgtatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 18914233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Original strand, 31630244 - 31630402
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| || |||| |||||||||| |||| |    
T  31630244 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaatttgtaggtatagacgttagctttctaatgccgttag 31630343  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  31630344 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattattgcacgtatgtca 31630402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 47 - 160
Target Start/End: Original strand, 17882710 - 17882823
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatta 146  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  17882710 taaggtaagggtgagactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgcatttaacatgttgtaggtttagtttttgagaatttgggaatta 17882809  T
Q  147 gggttaagagtgat 160  Q
    ||||||| ||||||    
T  17882810 gggttaaaagtgat 17882823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 364 - 468
Target Start/End: Original strand, 18334230 - 18334334
Alignment:
Q  364 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggta 463  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18334230 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 18334329  T
Q  464 cagaa 468  Q
    |||||    
T  18334330 cagaa 18334334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 364 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 24423071 - 24422967
Alignment:
Q  364 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggta 463  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24423071 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 24422972  T
Q  464 cagaa 468  Q
    |||||    
T  24422971 cagaa 24422967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 237 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 25688961 - 25688805
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||| |||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||    
T  25688961 ccgaatttgaaatcaaaactggtatttattggtaccgaattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttgtaatgccgttgg 25688862  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggt 393  Q
    | |||| |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25688861 tttgacttcaaaaggatttataaaaattgagttatggtcaaattactgcacgtaggt 25688805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 364 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 33864802 - 33864698
Alignment:
Q  364 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggta 463  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33864802 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 33864703  T
Q  464 cagaa 468  Q
    |||||    
T  33864702 cagaa 33864698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 262 - 395
Target Start/End: Original strand, 17377576 - 17377709
Alignment:
Q  262 tgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaa 361  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| |||| ||||||  ||||||||||    
T  17377576 tgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaagtatttatagaa 17377675  T
Q  362 cttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17377676 cttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 17377709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Original strand, 19847675 - 19847829
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||     ||  ||||||||| ||||||    
T  19847675 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgc----tagatttctaatgccgttgg 19847770  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19847771 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 19847829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 364 - 468
Target Start/End: Original strand, 2290818 - 2290922
Alignment:
Q  364 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggta 463  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2290818 tgagttaaggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 2290917  T
Q  464 cagaa 468  Q
    |||||    
T  2290918 cagaa 2290922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 364 - 468
Target Start/End: Original strand, 26924085 - 26924189
Alignment:
Q  364 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggta 463  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26924085 tgagttatggtcaaattactgcatgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 26924184  T
Q  464 cagaa 468  Q
    |||||    
T  26924185 cagaa 26924189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Original strand, 19858626 - 19858781
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||   |||||||||| ||||||    
T  19858626 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattgatcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgt---ctttctaatgccgttgg 19858722  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  19858723 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacataggtca 19858781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 22782685 - 22782527
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||  |  | |||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  22782685 ccgaatttgaaatgaaaaatggtattaattggtacagaattggtcttaggtgtaagtaggaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttgg 22782586  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22782585 tttgacttcaaaagaatttatagaatttgagttatggtcaaattactgcacataggtca 22782527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 47 - 175
Target Start/End: Original strand, 18333806 - 18333934
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  18333806 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttaagtcattgattctgaaaattggatttaacatgttgtaggttttagtttttgagaatttgggaatt 18333905  T
Q  146 agggttaagagtgatgattgtgatgatttt 175  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  18333906 agggttaaaagtgattatt-tgatgatttt 18333934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 47 - 175
Target Start/End: Original strand, 19858136 - 19858264
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  19858136 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttaagtcattgattctgaaaattggatttaagatgttgtaggttttagtttttgagaatttgagaatt 19858235  T
Q  146 agggttaagagtgatgattgtgatgatttt 175  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  19858236 agggttaaaagtgattatt-tgatgatttt 19858264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 47 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 24423495 - 24423367
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  24423495 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttaagtcattgattctgaaaattggatttaacatgttgtaggttttagtttttgagaatttgggaatt 24423396  T
Q  146 agggttaagagtgatgattgtgatgatttt 175  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  24423395 agggttaaaagtgattatt-tgatgatttt 24423367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 47 - 175
Target Start/End: Original strand, 26923659 - 26923787
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  26923659 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttaagtcattgattctgaaaattgaatttaacatgttgtaggttttagtttttgagaatttgggaatt 26923758  T
Q  146 agggttaagagtgatgattgtgatgatttt 175  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  26923759 agggttaaaagtgattatt-tgatgatttt 26923787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 47 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 33865226 - 33865098
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  33865226 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttaagtcattgattctgaaaattggatttaacatgttgtaggttttagtttttgagaatttgggaatt 33865127  T
Q  146 agggttaagagtgatgattgtgatgatttt 175  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  33865126 agggttaaaagtgattatt-tgatgatttt 33865098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 364 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 8055554 - 8055450
Alignment:
Q  364 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggta 463  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8055554 tgagttaaggtcaaattactgcacataggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttatccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 8055455  T
Q  464 cagaa 468  Q
    |||||    
T  8055454 cagaa 8055450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 364 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 22782751 - 22782647
Alignment:
Q  364 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggta 463  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||    
T  22782751 tgagttatggtcaaattactgcatgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaaatggtattaattggta 22782652  T
Q  464 cagaa 468  Q
    |||||    
T  22782651 cagaa 22782647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 47 - 175
Target Start/End: Original strand, 2290392 - 2290520
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgta-agtttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  2290392 taaggtaaaggtgggactaacattcaataatcttaagtcattgattctgaaaattgaatttaacatgttgtagggtttagtttttgagaatttgggaatt 2290491  T
Q  146 agggttaagagtgatgattgtgatgatttt 175  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  2290492 agggttaaaagtgattatt-tgatgatttt 2290520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 47 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 33862745 - 33862633
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||    
T  33862745 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttaagtcattgattctgaaaattggatttaacatgttgtaggttttcgtttttgagaatttgagaatt 33862646  T
Q  146 agggttaagagtg 158  Q
    |||||||| ||||    
T  33862645 agggttaaaagtg 33862633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 18343139 - 18343033
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  18343139 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttaagtcattgattctgaaaattggatttaacatgttgtaggttttagtttttgagaatttgggaatt 18343040  T
Q  146 agggtta 152  Q
    |||||||    
T  18343039 agggtta 18343033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 47 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 12743268 - 12743156
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  12743268 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttaagtcattgattctgaaaattggatttaacatgttgtaggttttagtttttgagaatttgggaatt 12743169  T
Q  146 agggttaagagtg 158  Q
    | |||||| ||||    
T  12743168 aaggttaaaagtg 12743156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 239 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 12942646 - 12942502
Alignment:
Q  239 gaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtc 338  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||  ||||||||||||||| |            ||||||||||||||||||     
T  12942646 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaag------------ctttctaatgtcgttggtt 12942559  T
Q  339 tgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12942558 tgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcgaattactgcacgtaggtca 12942502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 237 - 356
Target Start/End: Original strand, 15892112 - 15892231
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  15892112 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgctagctttctaatgccgttgg 15892211  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgattta 356  Q
    | |||| |||||| ||||||    
T  15892212 tttgacttcaaaaggattta 15892231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 47 - 165
Target Start/End: Original strand, 17229064 - 17229181
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatta 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||| | ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  17229064 taaggtaagggtgggactaacattcaatcttcttaagcctatgattctaataattagatttaacatgttgtaggtttagtttttgagaatttga-aatta 17229162  T
Q  147 gggttaagagtgatgattg 165  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  17229163 gggttaagagtgataattg 17229181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 48 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 2077251 - 2077125
Alignment:
Q  48 aaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaattag 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||   ||||||||||||| |||||||    
T  2077251 aaggtaagggtgggactaacattcaataatcttaagtcattgattctgaaaattggatttaatatgctgtaagttttagttttgagaatttgggaattag 2077152  T
Q  148 ggttaagagtgatgattgtgatgatttt 175  Q
    |||||| | |||| ||| ||||||||||    
T  2077151 ggttaaaattgattatt-tgatgatttt 2077125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 47 - 160
Target Start/End: Original strand, 1540125 - 1540239
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  1540125 taaggtaagggtgagacaaacattcaataatcttaagtcattgattctaaaaattggatttaacatgttgtaggttttagtttttgagaatttgggaatt 1540224  T
Q  146 agggttaagagtgat 160  Q
    |||||||| ||||||    
T  1540225 agggttaaaagtgat 1540239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 239 - 337
Target Start/End: Original strand, 17883203 - 17883301
Alignment:
Q  239 gaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggt 337  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  17883203 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtctttggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagcattctaatgtcgttggt 17883301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 47 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 18454179 - 18454067
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatta 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||  ||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||    
T  18454179 taaggtaagggtgggactaacattcaatcttcttaagcatatgattctgataattagatttaacatgttgtaggtttaatttttgagaatttga-aatta 18454081  T
Q  147 gggttaagagtgat 160  Q
    ||||||||||||||    
T  18454080 gggttaagagtgat 18454067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 400 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 23415453 - 23415385
Alignment:
Q  400 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaa 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23415453 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaa 23415385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 400 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 33862282 - 33862214
Alignment:
Q  400 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaa 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33862282 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaa 33862214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 400 - 465
Target Start/End: Original strand, 19858596 - 19858661
Alignment:
Q  400 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtaca 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19858596 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtaca 19858661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 400 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 27557211 - 27557146
Alignment:
Q  400 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtaca 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27557211 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgctattgattggtaca 27557146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 400 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 12742806 - 12742738
Alignment:
Q  400 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaa 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  12742806 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtatagaa 12742738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 400 - 468
Target Start/End: Original strand, 17883171 - 17883239
Alignment:
Q  400 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaa 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17883171 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtctgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaa 17883239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 47 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 20137626 - 20137513
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatta 146  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  20137626 taaggaaagggtgggactaacattcaatcttcttaagcctatgattctgataattagatttaacatgttgtaggtttag-ttttgagaatttg-gaatta 20137529  T
Q  147 gggttaagagtgatga 162  Q
    ||||||| ||||||||    
T  20137528 gggttaaaagtgatga 20137513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 47 - 162
Target Start/End: Original strand, 22195243 - 22195356
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatta 146  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  22195243 taaggaaagggtgggactaacattcaatcttcttaagcctatgattctgataattagatttaacatgttgtaggtttag-ttttgagaatttg-gaatta 22195340  T
Q  147 gggttaagagtgatga 162  Q
    ||||||| ||||||||    
T  22195341 gggttaaaagtgatga 22195356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 400 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 12942678 - 12942613
Alignment:
Q  400 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtaca 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12942678 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtcagaatttgaaatgaaaactggtattgattggtaca 12942613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 404 - 465
Target Start/End: Original strand, 15892086 - 15892147
Alignment:
Q  404 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtaca 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15892086 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtaca 15892147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 400 - 468
Target Start/End: Original strand, 1540585 - 1540653
Alignment:
Q  400 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaa 468  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  1540585 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgcaaactggtattgattggtatagaa 1540653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 44 - 160
Target Start/End: Original strand, 23527297 - 23527413
Alignment:
Q  44 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| || || | |||||||  |||  |||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||    
T  23527297 tcttaaggtaagggtgggactagcattcaattttcttaagcctgtaattctgatgattagatttaacatgttataggattagtttttgaggatttgagaa 23527396  T
Q  144 ttagggttaagagtgat 160  Q
    |||||||||||||||||    
T  23527397 ttagggttaagagtgat 23527413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 46 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 13612432 - 13612330
Alignment:
Q  46 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||  || | ||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||    
T  13612432 ttaatgtaagggtgggactaacaatcaattctcctaagtctgtaattctgataattgtatttaacatgttgtaggtttagtttttgataattggagaatt 13612333  T
Q  146 agg 148  Q
    |||    
T  13612332 agg 13612330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 46 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 19003530 - 19003468
Alignment:
Q  46 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtattta 108  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19003530 ttaaggtaagggtgaaactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtattta 19003468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 159
Target Start/End: Original strand, 22375762 - 22375911
Alignment:
Q  9 gagatgaaccaagaggaaaggttgccgatcgttaatcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtattta 108  Q
    |||| ||||||||| || ||  || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| | |||||||| |||||| |||||    
T  22375762 gagaagaaccaagaagagagtctgtcgatcgttaatcctaaggtaagggtgggactaaccttcaataattctgagtatgtgattctg-aaattgaattta 22375860  T
Q  109 acat-gttgtaagtt-tagtttttgagaatttgagaattagggttaagagtga 159  Q
    |||| |||||| |||  ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  22375861 acatggttgtaggttggagtttt--agaatttgagaattagggttaaaagtga 22375911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 47 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 25739373 - 25739249
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagttttt-gagaatttgagaat 144  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||  || | |||||||||| ||||||||||||||    
T  25739373 taaggtaagggtgggactatcattcagtgatcttaagtctatgattctg-aaattggatttaacatgt--taggttttagtttttggagaatttgagaat 25739277  T
Q  145 tagggttaagagtgatgattgtgatgatt 173  Q
    ||||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  25739276 tagggttaaaagtgataatt-tgatgatt 25739249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 400 - 465
Target Start/End: Original strand, 28289010 - 28289075
Alignment:
Q  400 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtaca 465  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28289010 gaatttttatgaattttagcacaactttgtcagaatttgaaatgaaaactggtattgattggtaca 28289075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 44 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 18697485 - 18697382
Alignment:
Q  44 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| || |||||||||||| ||||  ||||||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||    
T  18697485 tcttaaggtaagggtgggactagcattcaatcttcttaagcctatgattctgataattagatttaacatgttggaggtttag-ttttgagaattggagaa 18697387  T
Q  144 ttagg 148  Q
    |||||    
T  18697386 ttagg 18697382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 46 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 19363416 - 19363301
Alignment:
Q  46 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||| || |||||||||||   |||  ||||||||||||||| | |||||||| ||||||| || ||||    
T  19363416 ttaaggtaagggtgagactaacattcaattttcttaagcctatgattctg---attagatttaacatgttgtaggattagttttggagaattgga-aatt 19363321  T
Q  146 agggttaagagtgatgattg 165  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  19363320 agggttaagagtgaggattg 19363301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 48 - 160
Target Start/End: Original strand, 19772667 - 19772779
Alignment:
Q  48 aaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatga-ttctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatta 146  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||  | ||| | | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  19772667 aaggtaagggtgggactagccttcaataattctaagtgttttaattctgaaaattgtatttaacatgttgtaggtttag-ttttgaggatttgggaatta 19772765  T
Q  147 gggttaagagtgat 160  Q
    ||||||| ||||||    
T  19772766 gggttaaaagtgat 19772779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 237 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 25737101 - 25737028
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtat 310  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  25737101 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattcgtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 25737028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 44 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 18707236 - 18707133
Alignment:
Q  44 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| || | |||||||||| ||||  ||||||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||    
T  18707236 tcttaaggtaagggtgggactagcattcaatcttcttaagcccatgattctgataattagatttaacatgttggaggtttag-ttttgagaattggagaa 18707138  T
Q  144 ttagg 148  Q
    |||||    
T  18707137 ttagg 18707133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 44 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 23077678 - 23077574
Alignment:
Q  44 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaa 143  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||  | || ||||| ||||||| |   ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||    
T  23077678 tcttaaggtaagagtgggactagcattcaattctattaagtctgtgattctaatggttgtatttaacatgttgtaggattagtttttgagaatttgataa 23077579  T
Q  144 ttagg 148  Q
    |||||    
T  23077578 ttagg 23077574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 46 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 19401147 - 19401045
Alignment:
Q  46 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtt-tagtttttgagaatttgagaat 144  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||  | ||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||    
T  19401147 ttaaggtaagggtgggactaaccttcactaattctaagtgtatgattctgaaaattgaatttaacaggttgtaggttgtag-ttttgggaatttgagaat 19401049  T
Q  145 tagg 148  Q
    ||||    
T  19401048 tagg 19401045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 46 - 159
Target Start/End: Original strand, 18895485 - 18895594
Alignment:
Q  46 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||| || |||||||| ||   |||  |||||||| |||||| | |||||||||||||||| || ||||    
T  18895485 ttaaggtaagggtgagactaacattcaattttcttaagcctatgattttg---attagatttaacaagttgtaggattagtttttgagaattgga-aatt 18895580  T
Q  146 agggttaagagtga 159  Q
    ||||||||||||||    
T  18895581 agggttaagagtga 18895594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 46 - 128
Target Start/End: Original strand, 14978542 - 14978624
Alignment:
Q  46 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagttt 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||| || || ||||||||| ||||  ||||||||||||| | |||||||||    
T  14978542 ttaaggtaagggtgggactaacattcaatcttcttaagcctgtgattctgataattagatttaacatgttggaggtttagttt 14978624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 46 - 128
Target Start/End: Original strand, 25618899 - 25618981
Alignment:
Q  46 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagttt 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||| || || ||||||||| ||||  ||||||||||||| | |||||||||    
T  25618899 ttaaggtaagggtgggactaacattcaatcttcttaagcctgtgattctgataattagatttaacatgttggaggtttagttt 25618981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 48 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 22806790 - 22806678
Alignment:
Q  48 aaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatga-ttctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatta 146  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||  | ||| | | | ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||| |    
T  22806790 aaggtaagggtgggactagccttcaataattctaagtgttttaattctgaaaattatatttaacatgttgtaggtttag-ttttgaggatttgggaataa 22806692  T
Q  147 gggttaagagtgat 160  Q
    ||||||| ||||||    
T  22806691 gggttaaaagtgat 22806678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 16246286 - 16246176
Alignment:
Q  31 tgccgatcgttaatcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacat-gttgtaagtttagtttt 129  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| | | ||||| ||||||| ||||||||| ||||||  || ||||||    
T  16246286 tgccgatcgtgaatcctaaggtaagggtgggactaaccttcaataattatgagtttctaattct-aaaattgaatttaacatggttgtagattgagtttt 16246188  T
Q  130 tgagaatttgaga 142  Q
    | |||||||||||    
T  16246187 t-agaatttgaga 16246176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 114
Target Start/End: Original strand, 8226740 - 8226806
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  8226740 taaggtaagggtgggactaacattcaatcttcttaagcctatgattctg-aaattggatttaacatgt 8226806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 20183772 - 20183657
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatga-ttctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagttttt-gagaatttgagaa 143  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||  || | |||||||||| ||| ||||||| |    
T  20183772 taaggtaagggtgggactatcattcagtactcttaagtctatgatttctg-aaattggatttaacatgt--taggttttagtttttcgaggatttgagga 20183676  T
Q  144 ttagggttaagagtgatga 162  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  20183675 ttagggttaaaagtgatga 20183657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 162
Target Start/End: Original strand, 22152219 - 22152334
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatga-ttctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagttttt-gagaatttgagaa 143  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||  || | |||||||||| ||| ||||||| |    
T  22152219 taaggtaagggtgggactatcattcagtactcttaagtctatgatttctg-aaattggatttaacatgt--taggttttagtttttcgaggatttgagga 22152315  T
Q  144 ttagggttaagagtgatga 162  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  22152316 ttagggttaaaagtgatga 22152334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #107
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 114
Target Start/End: Original strand, 23531896 - 23531962
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  23531896 taaggtaagggtgggactaacattcaatcttcttaagcctatgattctg-aaattggatttaacatgt 23531962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #108
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 237 - 302
Target Start/End: Original strand, 9020 - 9085
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagtt 302  Q
    |||||| | ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  9020 ccgaattttaaatgaaaactggtaatgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagtt 9085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #109
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 35012116 - 35012023
Alignment:
Q  44 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatt 137  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||||||  | || |||||| ||||||||   |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  35012116 tcttaaggtaagggtggggctagaattcaattctattaagtctacgattctgatggttgtatttaacaggttgtaggattagtttttgagaatt 35012023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #110
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 23658178 - 23658123
Alignment:
Q  9 gagatgaaccaagaggaaaggttgccgatcgttaatcttaaggtaagggtgggacta 65  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23658178 gagaagaaccaagaagagaggttgccgatcgttaatc-taaggtaagggtgggacta 23658123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #111
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 360 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 15875737 - 15875702
Alignment:
Q  360 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15875737 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 15875702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #112
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 313 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 16240366 - 16240296
Alignment:
Q  313 atgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 383  Q
    |||||| |||||||||| | ||||| ||||||| ||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||    
T  16240366 atgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttaggacttgagttatgatcaaattact 16240296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #113
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 313 - 383
Target Start/End: Original strand, 16556984 - 16557054
Alignment:
Q  313 atgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 383  Q
    |||||| |||||||||| | ||||| | ||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  16556984 atgttagctttctaatggctttggtttaacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 16557054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #114
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 313 - 383
Target Start/End: Original strand, 16633540 - 16633610
Alignment:
Q  313 atgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 383  Q
    |||||| |||||||||| | ||||| | ||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  16633540 atgttagctttctaatggctttggtttaacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 16633610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #115
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 313 - 383
Target Start/End: Original strand, 16650214 - 16650284
Alignment:
Q  313 atgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 383  Q
    |||||| |||||||||| | ||||| ||||||| ||| || || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  16650214 atgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgaattttagaacttgagttatgatcaaattact 16650284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #116
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 97
Target Start/End: Original strand, 17201080 - 17201130
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaa 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||    
T  17201080 taaggtaagggtgggactaacattcaatcttcttaagcctatgattctgaa 17201130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #117
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 117
Target Start/End: Original strand, 18259146 - 18259243
Alignment:
Q  19 aagaggaaaggttgccgatcgttaatcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgt 117  Q
    ||||||| ||| |||| |||| | ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| |  |||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  18259146 aagaggagaggctgccaatcgattatcctaaggtaagggtgggactaaccttcaataattctgag-cattgattctgaaaattgagtttaacatattgt 18259243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #118
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 128
Target Start/End: Original strand, 20556033 - 20556115
Alignment:
Q  46 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagttt 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||    ||||||||||||  |||  ||||||||||||| | |||||||||    
T  20556033 ttaaggtaagggtgggactaacattcaattttcttacacctatgattctgatgattagatttaacatgttggatgtttagttt 20556115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #119
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 23415956 - 23415906
Alignment:
Q  44 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattct 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||    
T  23415956 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaatcttcttaagcctatgattct 23415906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #120
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 430 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 34963832 - 34963794
Alignment:
Q  430 ccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaa 468  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34963832 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaa 34963794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #121
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 313 - 383
Target Start/End: Original strand, 35016043 - 35016113
Alignment:
Q  313 atgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 383  Q
    |||||| |||||||||| | ||| | ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  35016043 atgttagctttctaatggctttgctttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 35016113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #122
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 48 - 160
Target Start/End: Original strand, 15704565 - 15704677
Alignment:
Q  48 aaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatg-attctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatta 146  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||  | ||| | |  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||   |||||| |||||  |||||    
T  15704565 aaggtaagggtgggactagccttcaataattctaagtgttttcattccgaaaattgtatttaacatgttgtaggttta-aatttgaggatttggaaatta 15704663  T
Q  147 gggttaagagtgat 160  Q
    ||||||| ||||||    
T  15704664 gggttaaaagtgat 15704677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #123
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 315 - 383
Target Start/End: Original strand, 19984160 - 19984228
Alignment:
Q  315 gttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 383  Q
    |||| |||||||||| | ||||| |||| || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  19984160 gttagctttctaatgactttggtttgacctccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 19984228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #124
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 313 - 383
Target Start/End: Original strand, 22226608 - 22226679
Alignment:
Q  313 atgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttat-agaacttgagttatggtcaaattact 383  Q
    |||||| |||||||||| | ||||| ||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  22226608 atgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgattttttagaacttgagttatgatcaaattact 22226679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #125
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 237 - 280
Target Start/End: Original strand, 22981443 - 22981486
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggt 280  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  22981443 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 22981486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #126
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 23539883 - 23539792
Alignment:
Q  46 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatt 137  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||  | || ||| ||| |||||||   ||||||||||||  ||||| | ||||||||||||||||    
T  23539883 ttaaggtaagggtgggactagcattcgattctattaagtgtataattctgatggttgtatttaacagattgtaggattagtttttgagaatt 23539792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #127
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 237 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 23806965 - 23806922
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggt 280  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  23806965 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 23806922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #128
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 313 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 25904545 - 25904474
Alignment:
Q  313 atgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttat-agaacttgagttatggtcaaattact 383  Q
    |||||| |||||||||| | ||||| ||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  25904545 atgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgattttttagaacttgagttatgatcaaattact 25904474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #129
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 47 - 97
Target Start/End: Original strand, 20733244 - 20733294
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaa 97  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  20733244 taaggtaagggtgagactaaccttcaataattttgagtatgtgattctgaa 20733294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #130
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 430 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 25535866 - 25535828
Alignment:
Q  430 ccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaa 468  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  25535866 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtagagaa 25535828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #131
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 273 - 383
Target Start/End: Original strand, 27654596 - 27654706
Alignment:
Q  273 gaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatg 372  Q
    ||||||| ||| ||||  |||| ||||||||||| ||    ||||| |||||||||| | ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  27654596 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggcattggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 27654695  T
Q  373 gtcaaattact 383  Q
     | ||||||||    
T  27654696 attaaattact 27654706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #132
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 1555596 - 1555527
Alignment:
Q  314 tgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 383  Q
    ||||| |||||||||| | ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  1555596 tgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 1555527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #133
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 383
Target Start/End: Original strand, 16826408 - 16826477
Alignment:
Q  314 tgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 383  Q
    ||||| |||||||||| | ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  16826408 tgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 16826477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #134
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 383
Target Start/End: Original strand, 21776136 - 21776205
Alignment:
Q  314 tgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 383  Q
    ||||| |||||||||| | ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  21776136 tgttagctttctaatggctttggtttgacgccaaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 21776205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #135
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 383
Target Start/End: Original strand, 33315116 - 33315185
Alignment:
Q  314 tgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 383  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| | | ||| ||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||    
T  33315116 tgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttaaaacttgagttatgatcaaattact 33315185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #136
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 433 - 465
Target Start/End: Original strand, 1871 - 1903
Alignment:
Q  433 aatttgaaatgaaaactgatattgattggtaca 465  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1871 aatttgaaatgaaaactggtattgattggtaca 1903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #137
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 433 - 465
Target Start/End: Original strand, 8830 - 8862
Alignment:
Q  433 aatttgaaatgaaaactgatattgattggtaca 465  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8830 aatttgaaatgaaaactggtattgattggtaca 8862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #138
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 47 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 18459358 - 18459306
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||| | |  ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  18459358 taaggtaagggtgggactaacctactttaatcatgagtatatgattctgaaaa 18459306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #139
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 46 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 27557715 - 27557644
Alignment:
Q  46 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgt-atttaacatgttgt 117  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||  |||| || ||||||||||| || |||| ||||||||||||||    
T  27557715 ttaagctaagggtgagactaacattcaatcttcttaagcctatgattctg-aatttgtgatttaacatgttgt 27557644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #140
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 46 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 28709620 - 28709568
Alignment:
Q  46 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaa 98  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| | ||||| |||||||||    
T  28709620 ttaaggtaagggtgagactatcattcaatgatcttaaatctataattctgaaa 28709568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 330; Significance: 0; HSPs: 6)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 47 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 501906 - 501485
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatta 146  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  501906 taaggtaagtgtggtactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaggtttagtttttgagaatttgagaatta 501807  T
Q  147 gggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctaatttttcttttcatctctgccccgaatctga 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  501806 gggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttga 501707  T
Q  247 aatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtca 346  Q
    ||||||| ||||||||||| | |   ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  501706 aatgaaatctggtattgataggtcaagaactggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgatgtca 501607  T
Q  347 aaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  501606 aaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaacattgtgcgaatttgaaatgaaa 501507  T
Q  447 actgatattgattggtacagaa 468  Q
    | |||||||||||| |||||||    
T  501506 agtgatattgattgttacagaa 501485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 238 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 501522 - 501366
Alignment:
Q  238 cgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggt 337  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||||    
T  501522 cgaatttgaaatgaaaagtgatattgattgttacagaattggtcttatgtgtaaacacgaaagttgtagg-atagatgttagctttctaatgccgttggt 501424  T
Q  338 ctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
     |||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  501423 ttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatgatcaaattactgcacgtaggtca 501366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 46 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 447466 - 447348
Alignment:
Q  46 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||  |||  ||||||||||||||| | |||||||||||||||| || ||||    
T  447466 ttaaggtaagggtgggactaacattcaatcttcttaagcctatgattctgatgattagatttaacatgttgtagggttagtttttgagaattgga-aatt 447368  T
Q  146 agggttaagagtgatgattg 165  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  447367 agggttaagagtgataattg 447348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 47 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 498375 - 498258
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatta 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||  |||  ||||||||||||||| | |||||||||||||||| || |||||    
T  498375 taaggtaatggtgggactaacattcaatcttcttaagcctatgattctgatgattagatttaacatgttgtagggttagtttttgagaattgga-aatta 498277  T
Q  147 gggttaagagtgatgattg 165  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  498276 gggttaagagtgataattg 498258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #5
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 499148 - 498996
Alignment:
Q  9 gagatgaaccaagaggaaaggttgccgatcgttaatcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtattta 108  Q
    |||| ||||||||| || ||| |||| |||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||||||||| || |||||    
T  499148 gagaagaaccaagaagagaggctgccaatcgattatcctaaggtaagggtgggactaaccttcaataattttgagtatgtgattctgaaaa-tgaattta 499050  T
Q  109 acat-gttgtaagtt-tagtttttgagaatttgagaattagggttaagagtgatga 162  Q
    |||| |||||| ||| |||||||  |||||||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  499049 acatggttgtaggttgtagtttt--agaatttgggaattagggttaaaagtaatga 498996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #6
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 47 - 114
Target Start/End: Original strand, 152111 - 152177
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgt 114  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  152111 taaggtaagggtgggactatcattcagtaatcttaagtttataattctg-aaattgaatttaacatgt 152177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 323; Significance: 0; HSPs: 88)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 47 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 29299083 - 29298665
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatta 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29299083 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgaatctatgattctgaaaattgtatttaatatgttgtaggtttagtttttgagaatttgagaatta 29298984  T
Q  147 gggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctaatttttcttttcatctctgccccgaatctga 246  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  29298983 tggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatatgggttgctttttatgatttttcttttcatctctgcaccgaatttga 29298884  T
Q  247 aatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtca 346  Q
    ||||||| ||||||||||| | | | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  29298883 aatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgttctgacgtca 29298784  T
Q  347 aaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaa 446  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29298783 aaacgatttataaaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgttcgaatttgaaatgaaa 29298684  T
Q  447 actgatattgattggtaca 465  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  29298683 actggtattgattggtaca 29298665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 44 - 465
Target Start/End: Original strand, 16274570 - 16274994
Alignment:
Q  44 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaa 143  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16274570 tcttaaggtaagggtgagactaacattcaataatcttgagtctatgattttgaaaattgtatttaacatgttgtaggtttagtttttgagaatttgagaa 16274669  T
Q  144 ttagggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctaatttt---tcttttcatctctgccccga 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||    
T  16274670 ttagggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgattttttttcttttcatctctgccccga 16274769  T
Q  241 atctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctg 340  Q
    || ||||||| || ||||| ||||| | | | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  16274770 atttgaaatggaatctggtgttgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatatcattggtctg 16274869  T
Q  341 acgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaa 440  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  16274870 acgtcaaaactatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaatgtttatgaattttagcacaactctgtccgaattggaa 16274969  T
Q  441 atgaaaactgatattgattggtaca 465  Q
    |||||||||| ||||||||||||||    
T  16274970 atgaaaactggtattgattggtaca 16274994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 57 - 468
Target Start/End: Original strand, 22122344 - 22122756
Alignment:
Q  57 gtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaattagggttaagag 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22122344 gtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaatatgttgtaggtttagtttttgagaatttgagaattagggttaagag 22122443  T
Q  157 tgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctaatttttcttttcatctctgccccgaatctgaaatgaaaact 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  22122444 tgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatatgggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatct 22122543  T
Q  257 ggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacac-gaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgattt 355  Q
    ||||||||| | | | ||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | || ||||||||||||    
T  22122544 ggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacactaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggttttacttcaaaacgattt 22122643  T
Q  356 atagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatatt 455  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22122644 gtagaacttgagttatggtcaaattactgcacatagatcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtatt 22122743  T
Q  456 gattggtacagaa 468  Q
    ||| ||| |||||    
T  22122744 gataggtccagaa 22122756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 47 - 395
Target Start/End: Original strand, 22050350 - 22050698
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatta 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22050350 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaatatgttgtaggtttagtttttgagaatttgagaatta 22050449  T
Q  147 gggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctaatttttcttttcatctctgccccgaatctga 246  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  22050450 gggttaagagcgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccaaatttga 22050549  T
Q  247 aatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtca 346  Q
    ||||||| ||||||||||| | | | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||    
T  22050550 aatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcaatggtctaatgtca 22050649  T
Q  347 aaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22050650 aaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 22050698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 47 - 395
Target Start/End: Original strand, 9044518 - 9044866
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatta 146  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9044518 taaggtaagggtgagactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtacttaacatgttgtaggtttagtttttgagaatttgagaatta 9044617  T
Q  147 gggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctaatttttcttttcatctctgccccgaatctga 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  9044618 gggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgttttttcttttcatctctgccccaaatttga 9044717  T
Q  247 aatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtca 346  Q
    ||| ||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||    
T  9044718 aataaaaactggtattgatcggtacagaattagtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgtatgttagttttctaatgccgttggtctaacgtca 9044817  T
Q  347 aaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9044818 aaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 9044866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 48 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 31613389 - 31612979
Alignment:
Q  48 aaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaattag 147  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  31613389 aaggtaatggtgggactaacattcaataatcttgagtttgtgattgtgaaaattgtatttaatatgttgtaggtttagttttcgagaatttgagaattag 31613290  T
Q  148 ggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctaatttttcttttcatctctgccccgaatctgaa 247  Q
    ||| |||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31613289 ggt-aagagtgatgatt---------ttgaatgaaagtgaagttgaataatatgggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaa 31613200  T
Q  248 atgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaa 347  Q
    ||||||  |||||||||| | | |  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||    
T  31613199 atgaaatatggtattgataggttcataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttaggtttctaataccgttggtctgacgtcaa 31613100  T
Q  348 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaa 447  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  31613099 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcacaactttgtctgaatttgaactgaaaa 31613000  T
Q  448 ctgatattgattggtacagaa 468  Q
    ||| |||||||||||| ||||    
T  31612999 ctggtattgattggtatagaa 31612979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 46 - 468
Target Start/End: Original strand, 15859316 - 15859750
Alignment:
Q  46 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| |||  | || ||||| | |||||||  |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15859316 ttaaggtaagggtgagactagcatttaattctattaagtctgtaattctgatgatt--atttaacatgttgtaggtttagtttttgagaatttgagaatt 15859413  T
Q  146 agggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctaatttt-tcttttcatctctgccccgaatct 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||| |    
T  15859414 agggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgattttttcttttcatctctatcccgaattt 15859513  T
Q  245 gaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgt 344  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  15859514 gaaataaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtatacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtctgacct 15859613  T
Q  345 caaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtag-------------gtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtcc 431  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||             |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15859614 caaaactatttatagaacttgagttatgatcaaattactgcacgtaggtcacagtgaattgtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtcc 15859713  T
Q  432 gaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaa 468  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15859714 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaa 15859750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 48 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 40129732 - 40129387
Alignment:
Q  48 aaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaattag 147  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  40129732 aaggtaagggtgagactaacattcaataattttgagtctatgattctgaaaattgtatttaatatgttgtaggtttagtttttgagaattagagaattag 40129633  T
Q  148 ggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctaatttttcttttcatctctgccccgaatctgaa 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40129632 ggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatatgggttgctttttatgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaa 40129533  T
Q  248 atgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaa 347  Q
    ||||||  |||||||||| | | | |||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| | ||||    
T  40129532 atgaaatatggtattgataggtccagaattgatcttaggtgtaaacactaaagttgtaggtatgaatgttagatttctaatgtcgttggtctggcatcaa 40129433  T
Q  348 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggt 393  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40129432 aacgatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggt 40129387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 44 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 43543548 - 43543269
Alignment:
Q  44 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaat---tgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttga 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  43543548 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaataattgtatttaacatgttgtaggtttagtttttgagaatttg- 43543450  T
Q  141 gaattagggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctaatttttcttttcatctctgccccga 240  Q
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43543449 -------ggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataagttgatttttctgatttttcttttcatctctgccccga 43543357  T
Q  241 atctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaat 328  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43543356 atttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaat 43543269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 165 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 29777465 - 29777164
Alignment:
Q  165 gtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgcttttt-ctaatttttcttttcatctctgccccgaatctgaaatgaaaactggtattg 263  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||    
T  29777465 gtgatgattttgaataaaagtgaagtggaataatataggttccttttttctgatttttcttttcatctctgccctgaatttgaaataaaaactggtattg 29777366  T
Q  264 attgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaact 363  Q
    || | ||| ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29777365 atcggtacagaattagtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgtatgttagctttctaatgccgttggtctgacgttaaaacgatttatagaact 29777266  T
Q  364 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggta 463  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29777265 tgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 29777166  T
Q  464 ca 465  Q
    ||    
T  29777165 ca 29777164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 160 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 16401651 - 16401345
Alignment:
Q  160 tgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttcta-atttttcttttcatctctgccccgaatctgaaatgaaaactgg 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  16401651 tgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatatagattgctttttcccgatttttcttttcatctctgctccgaatttgaaataaaaactgg 16401552  T
Q  259 tattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttata 358  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |  | ||||||| ||||  ||| ||||||||    
T  16401551 tattgatcggtacagaattggtcttaggtgtagacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctatttccattggtctaacgtggaaaggatttata 16401452  T
Q  359 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgat 458  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  16401451 taacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaacttttcccgaatttgaaatgaaaactggtattggt 16401352  T
Q  459 tggtaca 465  Q
     ||||||    
T  16401351 cggtaca 16401345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 48 - 213
Target Start/End: Original strand, 41230941 - 41231106
Alignment:
Q  48 aaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaattag 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41230941 aaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaattag 41231040  T
Q  148 ggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttc 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41231041 ggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttc 41231106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 239 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 31613015 - 31612790
Alignment:
Q  239 gaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtc 338  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||| | | |||||||||| |||||||     
T  31613015 gaatttgaactgaaaactggtattgattggtatagaattggtcttaggtgtaaacactaaagttataggtatggatttaagctttctaatgccgttggtt 31612916  T
Q  339 tgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttg 438  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31612915 tgacttcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttg 31612816  T
Q  439 aaatgaaaactgatattgattggtac 464  Q
    |||||||||||| |||||||||||||    
T  31612815 aaatgaaaactggtattgattggtac 31612790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 273 - 465
Target Start/End: Original strand, 27161133 - 27161325
Alignment:
Q  273 gaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatg 372  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27161133 gaattggtcttaggtgtaaacaggaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatactgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgaattatg 27161232  T
Q  373 gtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtaca 465  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  27161233 gtcaaattactgcatgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtcagaatttgaaatgaaaacaggtattgattggtaca 27161325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 48 - 191
Target Start/End: Original strand, 22122168 - 22122311
Alignment:
Q  48 aaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaattag 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22122168 aaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaatatgttgtaggtttagtttttgagaatttgagaattag 22122267  T
Q  148 ggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagtt 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22122268 ggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagtt 22122311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 237 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 31612824 - 31612658
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  31612824 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtaccgaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttcaaatgtcgttgg 31612725  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaat 403  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31612724 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcaaagtgaat 31612658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 239 - 395
Target Start/End: Original strand, 27161292 - 27161448
Alignment:
Q  239 gaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtc 338  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  27161292 gaatttgaaatgaaaacaggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtt 27161391  T
Q  339 tgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27161392 tgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 27161448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 29777199 - 29777041
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29777199 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaatcacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 29777100  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
      |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29777099 gttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 29777041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 13989324 - 13989166
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||    
T  13989324 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 13989225  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13989224 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtca 13989166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 13227322 - 13227164
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  13227322 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttttatgtatggatgttagctttctagtgccgttgg 13227223  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13227222 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtca 13227164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Original strand, 21922995 - 21923153
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||    
T  21922995 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 21923094  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21923095 tttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtca 21923153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 237 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 21841225 - 21841069
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  21841225 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttgg 21841126  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggt 393  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  21841125 tttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatagtcaaattacttcatgtaggt 21841069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 160 - 288
Target Start/End: Original strand, 43630215 - 43630343
Alignment:
Q  160 tgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctaatttttcttttcatctctgccccgaatctgaaatgaaaactggt 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||    
T  43630215 tgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatatggt 43630314  T
Q  260 attgattgatacggaattggtcttaggtg 288  Q
    |||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  43630315 attgattggtacagaattggtctcaggtg 43630343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 245 - 395
Target Start/End: Original strand, 16274967 - 16275118
Alignment:
Q  245 gaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttct-aatgtcgttggtctgacg 343  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| | ||     
T  16274967 gaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaaatgtcattggtttcact 16275066  T
Q  344 tcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16275067 tcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 16275118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Original strand, 15859712 - 15859870
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  15859712 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaagcacgaaagttgtaggtatggatgttagttttctaatgccgttgg 15859811  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15859812 tttgacttcaaaagaatttatacaacttgagttatggtcaaataactgcacgtaggtca 15859870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Original strand, 22122718 - 22122876
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| | | | ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  22122718 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgctagctttctaatgccgttgg 22122817  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22122818 tttgacttcaaaacgatttatagaacttgggttatagtcaaattactgcacgtaggtca 22122876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 29535510 - 29535352
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  29535510 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtatgtatggatgttagctttctagtgtcgttgg 29535411  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29535410 tttgacttcaaaagaatttatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtca 29535352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 16362377 - 16362219
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||    
T  16362377 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttgggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggaagttagctttctaatgcggttgg 16362278  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16362277 tttgacttcaaaaggatttatagaatttaagttatggtcaaattactgaacgtaggtca 16362219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Original strand, 21474790 - 21474948
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||    
T  21474790 ccgaatatgaaatgaaaaccggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 21474889  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  21474890 tttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactaaacgtaggtca 21474948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 238 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 29298699 - 29298550
Alignment:
Q  238 cgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggt 337  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | |||||    
T  29298699 cgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccattggt 29298600  T
Q  338 ctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcac 387  Q
     |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29298599 ttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcac 29298550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 364 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 13989390 - 13989286
Alignment:
Q  364 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggta 463  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13989390 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 13989291  T
Q  464 cagaa 468  Q
    |||||    
T  13989290 cagaa 13989286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 46 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 46560131 - 46560040
Alignment:
Q  46 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatt 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  46560131 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaggtttagtttttgagaatt 46560040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 333 - 464
Target Start/End: Original strand, 10812612 - 10812743
Alignment:
Q  333 ttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccg 432  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  10812612 ttggtttgacttcaaaatgatttataaaacttgagctatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttctatgaatttcagcacaactttctccg 10812711  T
Q  433 aatttgaaatgaaaactgatattgattggtac 464  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||| |||||    
T  10812712 aatttgaaattaaaactggtattgatcggtac 10812743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 244 - 395
Target Start/End: Original strand, 23593444 - 23593595
Alignment:
Q  244 tgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacg 343  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |  |||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  23593444 tgaaatgaaaactggtattgattggtgcataattagtcttaggtgtaaacaagaaagttgtaggtatgtatgttagctttctaatgccgttggtctgacg 23593543  T
Q  344 tcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    ||||||  |||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  23593544 tcaaaataatttatagaacttgcgttatagttaaattactgaacgtaggtca 23593595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 46 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 51083227 - 51083112
Alignment:
Q  46 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaat 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  51083227 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttaagtctatgattttgaaaattggatttaacatgttgtaggttttagtttttgagaatttgggaat 51083128  T
Q  145 tagggttaagagtgat 160  Q
    ||||||||| ||||||    
T  51083127 tagggttaaaagtgat 51083112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 46 - 175
Target Start/End: Original strand, 14237654 - 14237783
Alignment:
Q  46 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaat 144  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  14237654 ttaaggtaagggtgggactaatattcaataatcttaagtctatgattctgaaaattggatttaacatgttgtaggttttagtttttgagaatttgggaat 14237753  T
Q  145 tagggttaagagtgatgattgtgatgatttt 175  Q
    ||||||||| ||| || ||| ||||||||||    
T  14237754 tagggttaaaagtaattatt-tgatgatttt 14237783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 47 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 13989814 - 13989686
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  13989814 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttaagtcattgattctgaaaattggatttaacatgttgtaggttttagtttttgagaatttgggaatt 13989715  T
Q  146 agggttaagagtgatgattgtgatgatttt 175  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  13989714 agggttaaaagtgattatt-tgatgatttt 13989686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 364 - 468
Target Start/End: Original strand, 21474724 - 21474828
Alignment:
Q  364 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggta 463  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||    
T  21474724 tgagttaaggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatatgaaatgaaaaccggtattgattggta 21474823  T
Q  464 cagaa 468  Q
    |||||    
T  21474824 cagaa 21474828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 47 - 175
Target Start/End: Original strand, 21474298 - 21474426
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  21474298 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttaagtcatcgattctgaaaattggatttaacatgttgtaggttttagtttttgagaatttgggaatt 21474397  T
Q  146 agggttaagagtgatgattgtgatgatttt 175  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  21474398 agggttaaaagtgattatt-tgatgatttt 21474426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 41373422 - 41373316
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  41373422 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttaagtcattgattctgaaaattggatttaacatgttgtaggttttagtttttgagaatttgggaatt 41373323  T
Q  146 agggtta 152  Q
    |||||||    
T  41373322 agggtta 41373316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 47 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 16362868 - 16362740
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||  |||     
T  16362868 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttaagtcattgattctgaaaattggatttaacatgttgtaggttttagtttttgagaatttggaaata 16362769  T
Q  146 agggttaagagtgatgattgtgatgatttt 175  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  16362768 agggttaaaagtgattatt-tgatgatttt 16362740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 47 - 158
Target Start/End: Original strand, 21922503 - 21922615
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||    
T  21922503 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttaagtcattgattctgaaaattggatttaacatgttgtaggttttcgtttttgagaatttgggaatt 21922602  T
Q  146 agggttaagagtg 158  Q
    |||||||| ||||    
T  21922603 agggttaaaagtg 21922615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 47 - 158
Target Start/End: Original strand, 23592944 - 23593056
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  23592944 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttaagtcatcgattctgaaaattggatttaacatgttgtaggttttagtttttgagaatttgggaatt 23593043  T
Q  146 agggttaagagtg 158  Q
    |||||||| ||||    
T  23593044 agggttaaaagtg 23593056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 21841719 - 21841607
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||    
T  21841719 taaggtaagggtgagactaacattcaataatcttaagtcattgattctgaaaattggatttaacatgttgtaggttttcgtttttgagaatttcagaatt 21841620  T
Q  146 agggttaagagtg 158  Q
    |||||||| ||||    
T  21841619 agggttaaaagtg 21841607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 47 - 165
Target Start/End: Original strand, 21042505 - 21042622
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatta 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||| || |||||||| ||| ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||    
T  21042505 taaggtaagggtgggactaacattcaatcttcttaagcctatgattatgataattagatttaacatgttgtaggtttagtttttgagaaattga-aatta 21042603  T
Q  147 gggttaagagtgatgattg 165  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  21042604 gggttaagagtgataattg 21042622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 47 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 48444443 - 48444341
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||  ||||    
T  48444443 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttaagtcattgattctgaaaattggatttaacatgttgtaggttttagtttttgagaatttggaaatt 48444344  T
Q  146 agg 148  Q
    |||    
T  48444343 agg 48444341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 400 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 13227352 - 13227284
Alignment:
Q  400 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaa 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13227352 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaa 13227284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 400 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 16362407 - 16362339
Alignment:
Q  400 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaa 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16362407 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaa 16362339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 400 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 21841255 - 21841187
Alignment:
Q  400 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaa 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21841255 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaa 21841187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 400 - 468
Target Start/End: Original strand, 21922965 - 21923033
Alignment:
Q  400 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaa 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21922965 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaa 21923033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 42 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 22125255 - 22125133
Alignment:
Q  42 aatcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgag 141  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||||||  |||  ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||     
T  22125255 aatcctaaggtaagggtgggagtaacattcaatcttcttaagcctatgattctgatgattagatttaacatgttgtagggttagtttttgagaattgga- 22125157  T
Q  142 aattagggttaagagtgatgattg 165  Q
    ||||||||||||||||||| ||||    
T  22125156 aattagggttaagagtgataattg 22125133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 400 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 29535540 - 29535475
Alignment:
Q  400 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtaca 465  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29535540 gaatttttatgaatttcaacacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtaca 29535475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 42 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 20959086 - 20958963
Alignment:
Q  42 aatcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagt-ttttgagaatttga 140  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||  |||  ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |    
T  20959086 aatcgtaaggtaagggtgggactaacattcaatcttcttaagcctatgattctgatgattagatttaacatgttgaaggtttagttttttgagaattt-a 20958988  T
Q  141 gaattagggttaagagtgatgattg 165  Q
     ||||||||||||||||||| ||||    
T  20958987 aaattagggttaagagtgataattg 20958963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 47 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 22350768 - 22350663
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtt-tagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| ||| ||||| ||||||| |||||    
T  22350768 taaggtaagggtgggactaaccttcaataattctgagtatatgattctgaaaattgaatttaacaagttgtaggttgtag-ttttgggaatttgggaatt 22350670  T
Q  146 agggtta 152  Q
    |||||||    
T  22350669 agggtta 22350663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 46 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 48521464 - 48521353
Alignment:
Q  46 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||| || || ||||||||| ||||  ||||||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||    
T  48521464 ttaaggtaagggtgggactaacattcaatcttcttaagcctgtgattctgataattagatttaacatgttggaggtttag-ttttgagaattggagaatt 48521366  T
Q  146 agggttaagagtga 159  Q
    | ||||||||||||    
T  48521365 a-ggttaagagtga 48521353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 400 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 41372960 - 41372896
Alignment:
Q  400 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtac 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  41372960 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtaaagattggtac 41372896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 46 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 47191554 - 47191436
Alignment:
Q  46 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||| || ||||||||||||  |||  ||||||||||||||| | |||||||| ||||||| || |||     
T  47191554 ttaaggtaagggtgggactaacattcagttttcttaagcctatgattctgatgattagatttaacatgttgtaggattagttttggagaattgga-aatc 47191456  T
Q  146 agggttaagagtgatgattg 165  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  47191455 agggttaagagtgataattg 47191436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 44 - 94
Target Start/End: Original strand, 42314748 - 42314798
Alignment:
Q  44 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattct 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42314748 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattct 42314798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 365 - 462
Target Start/End: Original strand, 23593372 - 23593469
Alignment:
Q  365 gagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggt 462  Q
    |||||||| | |||||||| || | |||||  || ||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  23593372 gagttatgatgaaattactccaaggaggtcttagtgaattttcacgaatttcagcacaactttgtccgagtttgaaatgaaaactggtattgattggt 23593469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 45 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 16382089 - 16381981
Alignment:
Q  45 cttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaat 144  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  | || ||||| | ||||  |   ||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  16382089 cttaaggtaagggtgggactagcattcaattctattaagtctgtaattcatatggttgtatttaacatgttgtaggattagtttttgaggatttgagaat 16381990  T
Q  145 tagggttaa 153  Q
    |||||||||    
T  16381989 tagggttaa 16381981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 46 - 152
Target Start/End: Original strand, 20453635 - 20453742
Alignment:
Q  46 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtt-tagtttttgagaatttgagaat 144  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||| || |||||||| ||| ||||  |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  20453635 ttaaggtaagggtgagactaacattcaatcttcttaagcctatgattttgataattagatttaacatgctgtaggttatagtttttgagaatttgggaat 20453734  T
Q  145 tagggtta 152  Q
    || |||||    
T  20453735 tacggtta 20453742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 47 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 51477045 - 51476975
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  51477045 taaggtaagggtgggactaacctttaataattttgagtatatgattctgaaaattgaatttaacaggttgt 51476975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 44 - 165
Target Start/End: Original strand, 52940024 - 52940144
Alignment:
Q  44 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaa 143  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||| || || | |||||||  |||  ||||||||||||||| | ||||||||||| |||| || ||    
T  52940024 tcttaaggtaagagtgagactaacattcaatcttcttaagcctttaattctgatgattagatttaacatgttgtagggttagtttttgataattgga-aa 52940122  T
Q  144 ttagggttaagagtgatgattg 165  Q
    ||||||||||||||||| ||||    
T  52940123 ttagggttaagagtgataattg 52940144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 46 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 21708202 - 21708130
Alignment:
Q  46 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgta 118  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| | | ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21708202 ttaaggtaagggtgggactaaccttcaataattctgagtatgtaattctgaaaattggatttaacatgttgta 21708130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 46 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 21712745 - 21712673
Alignment:
Q  46 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgta 118  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| | | ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21712745 ttaaggtaagggtgggactaaccttcaataattctgagtatgtaattctgaaaattggatttaacatgttgta 21712673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 74
Target Start/End: Original strand, 28193622 - 28193682
Alignment:
Q  14 gaaccaagaggaaaggttgccgatcgttaatcttaaggtaagggtgggactaacattcaat 74  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||    
T  28193622 gaaccaagaggaaaggctgccgatcgttaatcttaaggtaagggtgagactagtattcaat 28193682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 42 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 14801447 - 14801360
Alignment:
Q  42 aatcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttt 129  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||| || || ||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  14801447 aatcataaggtaaaggtgggactaacattcaatcttcttaagcctgtgattctgataattgcatttagcatgttgtaggtttagtttt 14801360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 42 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 14810321 - 14810234
Alignment:
Q  42 aatcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttt 129  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||| || || ||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  14810321 aatcataaggtaaaggtgggactaacattcaatcttcttaagcctgtgattctgataattgcatttagcatgttgtaggtttagtttt 14810234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 46 - 128
Target Start/End: Original strand, 13880537 - 13880619
Alignment:
Q  46 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagttt 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||| || || ||||||||| ||||  ||||||||||||| | |||||||||    
T  13880537 ttaaggtaagggtgggactaacattcaatcttcttaagcctgtgattctgataattagatttaacatgttggaggtttagttt 13880619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 34770663 - 34770621
Alignment:
Q  44 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtct 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34770663 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtct 34770621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 46 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 11946493 - 11946388
Alignment:
Q  46 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtt-tagtttttgagaatttgagaat 144  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| | ||||| ||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||   || |||| ||||    
T  11946493 ttaaggtaagggtgagactatcattcagtgatcttaagtctataattctg-aaattggatttaacatgttgtaggttatagttttgaggattttgggaat 11946395  T
Q  145 tagggtt 151  Q
    |||||||    
T  11946394 tagggtt 11946388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 65
Target Start/End: Original strand, 38056635 - 38056690
Alignment:
Q  9 gagatgaaccaagaggaaaggttgccgatcgttaatcttaaggtaagggtgggacta 65  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38056635 gagaagaaccaagaagagaggttgccgatcgttaatc-taaggtaagggtgggacta 38056690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 46 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 21343044 - 21342938
Alignment:
Q  46 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | || ||||| | |||||||  |||  |||||||| || ||| | || ||||| |||||||||||||||    
T  21343044 ttaaggtaagggtgggactagcattcaattctattaagtctgtaattctgatgattaaatttaacaagt-gtaggattggttttagagaatttgagaatt 21342946  T
Q  146 agggttaa 153  Q
    ||||||||    
T  21342945 agggttaa 21342938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 46 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 21347909 - 21347803
Alignment:
Q  46 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | || ||||| | |||||||  |||  |||||||| || ||| | || ||||| |||||||||||||||    
T  21347909 ttaaggtaagggtgggactagcattcaattctattaagtctgtaattctgatgattaaatttaacaagt-gtaggattggttttagagaatttgagaatt 21347811  T
Q  146 agggttaa 153  Q
    ||||||||    
T  21347810 agggttaa 21347803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 46 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 21683949 - 21683858
Alignment:
Q  46 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatt 137  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||| |||||||   ||  ||||||||  ||||| | ||||||||||||||||    
T  21683949 ttaaggtaagggtgagactaacattcaattttcttaagtctataattctgatggttagatttaacaacttgtagggttagtttttgagaatt 21683858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 46 - 97
Target Start/End: Original strand, 22130025 - 22130076
Alignment:
Q  46 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaa 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||    
T  22130025 ttaaggtaagggtgggactaacattcaatcttcttaagcctatgattctgaa 22130076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 67
Target Start/End: Original strand, 20846394 - 20846452
Alignment:
Q  9 gagatgaaccaagaggaaaggttgccgatcgttaatcttaaggtaagggtgggactaac 67  Q
    |||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||| |||||||    
T  20846394 gagaagaaccaagaggaaaggctgtcgatcggtaatcttaaggtaaaggtgagactaac 20846452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 313 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 21858662 - 21858592
Alignment:
Q  313 atgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 383  Q
    |||||| |||||||| | | ||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  21858662 atgttagctttctaacggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 21858592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 430 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 43543360 - 43543322
Alignment:
Q  430 ccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaa 468  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43543360 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaa 43543322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 46 - 111
Target Start/End: Original strand, 44822020 - 44822085
Alignment:
Q  46 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaaca 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||| | ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  44822020 ttaaggtaagagtgggactaaccttcaataattctgattatatgattatgaaaattggatttaaca 44822085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 142
Target Start/End: Original strand, 21995664 - 21995758
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacat-gttgtaagtttagtttttgagaatttgaga 142  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||||||| | || ||||||||| |||||| ||| || |||| |||||||||||    
T  21995664 taagataagggtgggactaaccttcaataattttgagtatgtgattctgaaga-tgaatttaacatggttgtaggttgaggtttt-agaatttgaga 21995758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 315 - 383
Target Start/End: Original strand, 44035860 - 44035928
Alignment:
Q  315 gttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 383  Q
    |||| |||||||||| | ||||| ||||||| ||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||    
T  44035860 gttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttataacttgagttatgatcaaattact 44035928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 118
Target Start/End: Original strand, 7320594 - 7320665
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgta 118  Q
    ||||||||||||||||||||| | || ||||  | ||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  7320594 taaggtaagggtgggactaacctacactaattctaagtgtattattctgaaaattgaatttaacaggttgta 7320665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 154
Target Start/End: Original strand, 14294728 - 14294834
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatta 146  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||  | || ||||| | |||||||  |||  |||||||| || ||| | || ||||| ||||||||||||||||    
T  14294728 taaggtaagggtgagactagcattcaattctattaagtctgtaattctgatgattaaatttaacaagt-gtaggattggttttagagaatttgagaatta 14294826  T
Q  147 gggttaag 154  Q
    ||||||||    
T  14294827 gggttaag 14294834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 94
Target Start/End: Original strand, 45574020 - 45574067
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattct 94  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||    
T  45574020 taaggtaagggtgggactaacattcaatcttcttaagcctatgattct 45574067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 45755532 - 45755470
Alignment:
Q  86 tatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtt-tagtttttgagaatttgagaattagg 148  Q
    |||||||||||||| || |||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  45755532 tatgattctgaaaagtggatttaacaagttgtaggttgtagtttt-gagaatttgagaattagg 45755470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 51131508 - 51131402
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatta 146  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||  | || ||||| | |||||||  |||  |||||||| || ||| | || ||||| ||||||||||||||||    
T  51131508 taaggtaagggtgagactagcattcaattctattaagtctgtaattctgatgattaaatttaacaagt-gtaggattggttttagagaatttgagaatta 51131410  T
Q  147 gggttaag 154  Q
    ||||||||    
T  51131409 gggttaag 51131402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 306
Target Start/End: Original strand, 10812709 - 10812778
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtag 306  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||  |||| |||||| ||||    
T  10812709 ccgaatttgaaattaaaactggtattgatcggtactgaattgatcttaggtgtaaacatgaaagtcgtag 10812778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 313; Significance: 1e-176; HSPs: 2)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 44 - 468
Target Start/End: Original strand, 6254 - 6677
Alignment:
Q  44 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaa 143  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  6254 tcttaaggaaagggtgagactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtagatttagtttttgagaatttgagaa 6353  T
Q  144 ttagggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctaatttttcttttcatctctgccccgaatc 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||     
T  6354 ttagggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgaatttt-ttttcatctccgccccgaatt 6452  T
Q  244 tgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacg 343  Q
    ||||||||||  |||||||||| | | | ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  6453 tgaaatgaaatgtggtattgataggtccagaattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagttttctaatgccgttggtctgacg 6552  T
Q  344 tcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatg 443  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6553 tcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaattttaatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatg 6652  T
Q  444 aaaactgatattgattggtacagaa 468  Q
    |||| || |||||||||||||||||    
T  6653 aaaattggtattgattggtacagaa 6677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Original strand, 6639 - 6797
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||    
T  6639 ccgaatttgaaatgaaaattggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagatttccaatgccgttgg 6738  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6739 tccgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtca 6797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 313; Significance: 1e-176; HSPs: 7)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 57 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 43570 - 43163
Alignment:
Q  57 gtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaattagggttaagag 156  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43570 gtgggactaacattcaataatcttaagtatatgattctgaaaattgtatttaatatgttgtaggtttagtttttgagaatttgagaattagggttaagag 43471  T
Q  157 tgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctaatttttcttttcatctctgccccgaatctgaaatgaaaact 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  43470 tgatgattgtgatgattttgaatgaaagtggagttgaataatatgggttgcttttt-tgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatct 43372  T
Q  257 ggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgattta 356  Q
    ||||||||| | |   ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43371 ggtattgataggtcaagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgattta 43272  T
Q  357 tagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattg 456  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43271 tagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattg 43172  T
Q  457 attggtaca 465  Q
    |||||||||    
T  43171 attggtaca 43163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 44 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 20689 - 20502
Alignment:
Q  44 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaa 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20689 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaggtttagtttttgagaatttgagaa 20590  T
Q  144 ttagggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctaatttttcttttcatct 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20589 ttagggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatct 20502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #3
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 43198 - 43040
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  43198 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacatttttggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttgg 43099  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  43098 tttgacttcaaaagggtttatagaacttgagttatagtcaaattagtgcacgtaggtca 43040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #4
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 47 - 175
Target Start/End: Original strand, 13033 - 13161
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||  ||||    
T  13033 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttaagtcattgattctgaaaattggatttaacatgttgtaggttttagtttttgagaatttggaaatt 13132  T
Q  146 agggttaagagtgatgattgtgatgatttt 175  Q
    ||| |||| |||||| ||| ||||||||||    
T  13133 aggattaaaagtgattatt-tgatgatttt 13161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #5
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 291 - 395
Target Start/End: Original strand, 13384 - 13488
Alignment:
Q  291 aacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgta 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13384 aacacgaaagttgtaggtatggatgttagcttactagtgccgttggtttgacttcaaaaggatttataaaacttgagttatggtcaaattactgaacgta 13483  T
Q  391 ggtca 395  Q
    |||||    
T  13484 ggtca 13488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #6
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 47 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 23168 - 23059
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatta 146  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  |||| |  |||||||||||| ||||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||    
T  23168 taaggtaagggtgg-actaacattcaatcttcttaatcctatgattctgataattagatttaacatgttgt-aggttagtttttgagaatttg-gaatta 23072  T
Q  147 gggttaagagtga 159  Q
    ||||||| |||||    
T  23071 gggttaaaagtga 23059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #7
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 52 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 14307 - 14221
Alignment:
Q  52 taagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttg 139  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||| ||||  |||||| ||||||| || ||||||||||||||||||    
T  14307 taagggtgggactaacattcaatcttcttaagcctatgattctgataattagatttaatatgttgt-aggttagtttttgagaatttg 14221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1792 (Bit Score: 306; Significance: 1e-172; HSPs: 3)
Name: scaffold1792
Description:

Target: scaffold1792; HSP #1
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 44 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 1203 - 791
Alignment:
Q  44 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaa 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  1203 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaggttgagtttttgagaatttgagaa 1104  T
Q  144 ttagggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctaatttttcttttcatctctgccccgaatc 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||     
T  1103 ttagggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgcataatataggttt---------atttttcttttcatctctgccccgaatt 1013  T
Q  244 tgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacg 343  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  1012 tgaaatgaaatctggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtagatatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacg 913  T
Q  344 tcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatg 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  912 tcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcatattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttttccgaatttgaaatg 813  T
Q  444 aaaactgatattgattggtaca 465  Q
    ||| ||| ||||||||||||||    
T  812 aaatctggtattgattggtaca 791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1792; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 320 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 776 - 636
Alignment:
Q  320 ctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagc 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||||||    
T  776 ctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcatgtaggtcacagtgaatttgtatgaatttcagc 677  T
Q  420 acaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattg 460  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  676 acaactttgtccaaatttgaaatgaaaactggtatttattg 636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1792; HSP #3
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 244 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 659 - 508
Alignment:
Q  244 tgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacg 343  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||| |||||  ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||     
T  659 tgaaatgaaaactggtatttattgatatagaattagtctaaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatagatgttagctttctaatgccgttggtttgact 560  T
Q  344 tcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  559 tcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 305; Significance: 1e-171; HSPs: 3)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 47 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 8774 - 8350
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatta 146  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8774 taagttaagggtggaactaacattcaataatcttgagtgtatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaggtttagtttttgagaatttgagaatta 8675  T
Q  147 gggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctaatttttcttttcatctctgccccgaatctga 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8674 gggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaatgtgaagttgaataatataggttgctttttctaatttttcttttcatctctgccccgaatttga 8575  T
Q  247 aatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtca 346  Q
    |||| |||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||  ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||  | ||||| ||||||||    
T  8574 aatggaaactggtattgattggtacataattggtcttacgtgtaaacacaaaagttgtagatatggatgttagctttctaattccattggtatgacgtca 8475  T
Q  347 aaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaa 446  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8474 aaaagatttatacaacttgagttatggtgaaattactgcacgtaggtcacagtgcatttttatgattttcagcacaactttgtccgaatgtgaaatgaaa 8375  T
Q  447 actgatattgattggtacagaactg 471  Q
    |||| |||||||||||||| |||||    
T  8374 actggtattgattggtacataactg 8350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 237 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 8391 - 8160
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||  | ||||    
T  8391 ccgaatgtgaaatgaaaactggtattgattggtacataactggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtagatatggatgttagctttctaatccccttgg 8292  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatt 436  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8291 tttgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtctgaatt 8192  T
Q  437 tgaaatgaaaactgatattgattggtacagaa 468  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  8191 tgaaatgaaaactggtattgattagtacagaa 8160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #3
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 239 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 8196 - 8040
Alignment:
Q  239 gaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtc 338  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||     
T  8196 gaatttgaaatgaaaactggtattgattagtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttggtt 8097  T
Q  339 tgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    |||| |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8096 tgacttcaaaaggatttatagaatttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtca 8040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1296 (Bit Score: 303; Significance: 1e-170; HSPs: 2)
Name: scaffold1296
Description:

Target: scaffold1296; HSP #1
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 44 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 2099 - 1678
Alignment:
Q  44 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaa 143  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  2099 tcttaaggtaagggtgagactaacattcaataatcttaagtctatgattctgaaaattgtatttaatatgttataggtttagtttttgagaatttgagaa 2000  T
Q  144 ttagggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaa-gttgaataatataggttgctttttctaatttttcttttcatctctgccccgaat 242  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||    
T  1999 tcagggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaaagttgaataatataggttgctttt-ctgatttttcttttcatctctgccctgaat 1901  T
Q  243 ctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgac 342  Q
     |||||||||| ||||||||||| | | | ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  1900 ttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacaagaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgac 1801  T
Q  343 gtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaat 442  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1800 ttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaat 1701  T
Q  443 gaaaactgatattgattggtaca 465  Q
    ||||| || ||||||||||||||    
T  1700 gaaaattggtattgattggtaca 1678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1296; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 237 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 1713 - 1634
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgt 316  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  1713 ccgaatttgaaatgaaaattggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgt 1634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306 (Bit Score: 302; Significance: 1e-170; HSPs: 4)
Name: scaffold0306
Description:

Target: scaffold0306; HSP #1
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 44 - 468
Target Start/End: Original strand, 10657 - 11081
Alignment:
Q  44 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaa 143  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  10657 tcttaaggtaagggtgagactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtagattttgtttttgagaatttgagaa 10756  T
Q  144 ttagggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctaatttttcttttcatctctgcccc-gaat 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| ||||| ||||    
T  10757 ttagggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgaatttt-ttttcatctccgccccggaat 10855  T
Q  243 ctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgac 342  Q
     ||||||||||  |||||||||| | | | ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  10856 ttgaaatgaaatgtggtattgataggtccagaattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagttttctaatgccgttggtctgac 10955  T
Q  343 gtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaat 442  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10956 gtcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaattttcctgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaat 11055  T
Q  443 gaaaactgatattgattggtacagaa 468  Q
    ||||| || |||||||||||||||||    
T  11056 gaaaattggtattgattggtacagaa 11081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306; HSP #2
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 157 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 15643 - 15351
Alignment:
Q  157 tgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctaatttttcttttcatctctgccccgaatctgaaatgaaaact 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  15643 tgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatct 15544  T
Q  257 ggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgattta 356  Q
    |||||| || | | | ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  15543 ggtattaataggtccagaattggtcttag-tgtaaacacgaaagttgtaggtatggacgttagctttctaatgtcgttggtctgacatcaaaacaattta 15445  T
Q  357 tagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactg 450  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15444 tagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatgtttatgaatttcagcacaactttgttcgaatttgaaatgaaaactg 15351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Original strand, 11043 - 11201
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||    
T  11043 ccgaatttgaaatgaaaattggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagatttccaatgccgttgg 11142  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11143 tccgacgtcaaaacgatttatagtacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtca 11201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306; HSP #4
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 276 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 15342 - 15223
Alignment:
Q  276 ttggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtc 375  Q
    |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15342 ttggtcttaggtgtaaccacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgctggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtc 15243  T
Q  376 aaattactgcacgtaggtca 395  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  15242 aaattactgcacgtaggtca 15223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 302; Significance: 1e-170; HSPs: 8)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 44 - 465
Target Start/End: Original strand, 22697 - 23109
Alignment:
Q  44 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaa 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  22697 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaggttgagtttttgagaatttgagaa 22796  T
Q  144 ttagggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctaatttttcttttcatctctgccccgaatc 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||     
T  22797 ttagggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgcataatataggttt---------atttttcttttcatctctgccccgaatt 22887  T
Q  244 tgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacg 343  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  22888 tgaaatgaaatctggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtagatatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacg 22987  T
Q  344 tcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatg 443  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22988 tcaaaacgatttatagaacatgagttatggtcatattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttttccgaatttgaaatg 23087  T
Q  444 aaaactgatattgattggtaca 465  Q
    ||| ||| ||||||||||||||    
T  23088 aaatctggtattgattggtaca 23109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 44 - 287
Target Start/End: Original strand, 20521 - 20764
Alignment:
Q  44 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaa 143  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  20521 tcttagggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaggttcagtttttgagaattttagaa 20620  T
Q  144 ttagggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctaatttttcttttcatctctgccccgaatc 243  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  20621 ttaaggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatcaaagtgaagttgaataatataggttgttttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatt 20720  T
Q  244 tgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggt 287  Q
     ||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  20721 ggaaatgaaatctgatattgattggtacagaattggtcttaggt 20764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 320 - 460
Target Start/End: Original strand, 23124 - 23264
Alignment:
Q  320 ctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagc 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||||||    
T  23124 ctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcatgtaggtcacagtgaatttgtatgaatttcagc 23223  T
Q  420 acaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattg 460  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  23224 acaactttgtccaaatttgaaatgaaaactggtatttattg 23264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #4
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 244 - 395
Target Start/End: Original strand, 23241 - 23392
Alignment:
Q  244 tgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacg 343  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||| |||||  ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||     
T  23241 tgaaatgaaaactggtatttattgatatagaattagtctaaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatagatgttagctttctaatgccgttggtttgact 23340  T
Q  344 tcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23341 tcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 23392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #5
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 14406 - 14248
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||  |||||||| |||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||    
T  14406 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaacgttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 14307  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14306 tttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtca 14248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #6
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 47 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 14898 - 14786
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  14898 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttaagtcattgattctgaaaattggatttaacatgttgtaggttttagtttttgagaatttgggaatt 14799  T
Q  146 agggttaagagtg 158  Q
    | |||||| ||||    
T  14798 aaggttaaaagtg 14786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #7
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 400 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 14436 - 14371
Alignment:
Q  400 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtaca 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14436 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtaca 14371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #8
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 430 - 468
Target Start/End: Original strand, 20714 - 20752
Alignment:
Q  430 ccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaa 468  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20714 ccgaattggaaatgaaatctgatattgattggtacagaa 20752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 293; Significance: 1e-164; HSPs: 2)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 12 - 395
Target Start/End: Original strand, 1 - 385
Alignment:
Q  12 atgaaccaagaggaaaggttgccgatcgttaatcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaaca 111  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1 atgaaccaagaggaaaggctgttgatcgttaaccttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctgtgattctgaaaattgtatttaaca 100  T
Q  112 tgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaattagggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttt 211  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  101 tgttgtaggtttagtttttgaaaatttgagaattagggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttt 200  T
Q  212 tctaa-tttttcttttcatctctgccccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtat 310  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||||  |||| ||||||| |||||||    
T  201 tctaattttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataaatggtcttaggtgtaaacaagaaagttataggtat 300  T
Q  311 ggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  301 ggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 430 - 465
Target Start/End: Original strand, 227 - 262
Alignment:
Q  430 ccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtaca 465  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  227 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtaca 262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 286; Significance: 1e-160; HSPs: 5)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 44 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 10829 - 10408
Alignment:
Q  44 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaa 143  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10829 tcttaaggtaagggtgagactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatattgtaggtttagtttttgagaatttgagaa 10730  T
Q  144 ttagggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctaatttttcttttcatctctgccccgaatc 243  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||| |||     
T  10729 ttaggcttaagagtgacgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgttttttcttatttttcttttcatgtttgccccaaatt 10630  T
Q  244 tgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacg 343  Q
    |||| ||||| ||||||||||| | | |  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  10629 tgaactgaaatctggtattgataggtccataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaataccgttggtctgacg 10530  T
Q  344 tcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatg 443  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  10529 tcaaaaagatttatagaacttgcgttatggtcaaattactgcatgtaggtcacaatgaatttttgtgaatttcagcacaactttatctgaatttaaaatg 10430  T
Q  444 aaaactgatattgattggtaca 465  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  10429 aaaactggtattgattggtaca 10408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 246 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 10434 - 10214
Alignment:
Q  246 aaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtc 345  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||    
T  10434 aaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttatgtgtcaacacgaaagttgtaggtatggatgttagatttctaatgccgttggtctgacatc 10335  T
Q  346 aaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaa 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  10334 aaaacgatttatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgactgaatttgaaatgaa 10235  T
Q  446 aactgatattgattggtacag 466  Q
    ||||  |||||||||||||||    
T  10234 aactagtattgattggtacag 10214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #3
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 239 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 10248 - 10092
Alignment:
Q  239 gaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtc 338  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||| ||| |  |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||     
T  10248 gaatttgaaatgaaaactagtattgattggtacagtgttggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctattgccgttggtt 10149  T
Q  339 tgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||    
T  10148 tgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattatttcatgtaggtca 10092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #4
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 46 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 28030 - 27916
Alignment:
Q  46 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatga-ttctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaat 144  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||  | ||| | | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  28030 ttaaggtaagggtgggactagccttcaataattctaagtgttttaattctgaaaattgtatttaacatgttgtaggtttag-ttttgaggatttggaaat 27932  T
Q  145 tagggttaagagtgat 160  Q
    ||||||||| ||||||    
T  27931 tagggttaaaagtgat 27916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #5
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 46 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 42888 - 42774
Alignment:
Q  46 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatga-ttctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaat 144  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||  | ||| | | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  42888 ttaaggtaagggtgggactagccttcaataattctaagtgttttaattctgaaaattgtatttaacatgttgtaggtttag-ttttgaggatttgttaat 42790  T
Q  145 tagggttaagagtgat 160  Q
    | ||||||| ||||||    
T  42789 ttgggttaaaagtgat 42774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 3)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 126 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 30782 - 30440
Alignment:
Q  126 tttttgagaatttgagaattagggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctaatttttcttt 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  30782 tttttgagaatttgagaattagggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttcatatttttcttt 30683  T
Q  226 tcatctctgccccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttct 325  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  30682 tcatctctgctccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttcc 30583  T
Q  326 aatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaact 425  Q
    |||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||    
T  30582 aatgccattggtgtgacgtcaaaacgatttataaaactttagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcaacacaact 30483  T
Q  426 ttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaa 468  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30482 ttgtccgattttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaa 30440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 46 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 34339 - 34154
Alignment:
Q  46 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34339 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaggtttagtttttgagaatttgagaatt 34240  T
Q  146 agggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctaatttttcttttcatct 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34239 agggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatct 34154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #3
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 244 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 30471 - 30320
Alignment:
Q  244 tgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacg 343  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||  ||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| | ||     
T  30471 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttcggtgtaaacattaaagttgtaggtatggatgttagctttctaataccgttggtttcact 30372  T
Q  344 tcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30371 tcaaaaggatttgtagtacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 30320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 3)
Name: scaffold0747
Description:

Target: scaffold0747; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 44 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 1553 - 1225
Alignment:
Q  44 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaa 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  1553 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattttgaaaattgtatttaacatgttgtaggtttagttattgagaatttgagaa 1454  T
Q  144 ttagggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctaatttttcttttcatctctgccccgaatc 243  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||     
T  1453 ttatggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatatatgttgctttttctgatttttcatttcatctctgccccgaatt 1354  T
Q  244 tgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacg 343  Q
    |||||||||| ||  ||||||| | | | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||    
T  1353 tgaaatgaaatctcatattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttct-atgccgttggtctgacg 1255  T
Q  344 tcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 373  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||    
T  1254 tctaaacgatttatagaacttgagttatgg 1225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 254 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 1224 - 1012
Alignment:
Q  254 actggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgat 353  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||| |||    
T  1224 actggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttggtctgatgtcaaaaagat 1125  T
Q  354 ttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgata 453  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  1124 ttatagaacttgagttatggtcaaattactacacgcaggtcatagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaataaaaactggta 1025  T
Q  454 ttgattggtacag 466  Q
    |||||||||||||    
T  1024 ttgattggtacag 1012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747; HSP #3
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 1048 - 890
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  1048 ccgaatttgaaataaaaactggtattgattggtacagcattcgtcttaggagtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 949  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  948 tttgacttcaaaattatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 198; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 44 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 671 - 398
Alignment:
Q  44 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaa 143  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  671 tcttaaggtaagggtgagactaacattcaataatctcgactctatgattctgaaaattgtatttaatatgttgtaggtttagtttttgagaatttgagaa 572  T
Q  144 ttagggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctaatttttcttttcatctctgccccgaatc 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||     
T  571 ttagggttaagagtgatgattgtgattattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctcatttttcttttcatctatgccccgaatt 472  T
Q  244 tgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgtt 317  Q
    |||||| ||| ||||||||||| | | | ||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  471 tgaaataaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagtcgtacgtatggatgtt 398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 4)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 47 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 107317 - 107111
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatta 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  107317 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaggtttagtttttgagaatttgagaatta 107218  T
Q  147 gggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctaatttttcttttcatctctgccccgaatctga 246  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  107217 gggttaagagtgatgattgtggtgattttgaatgaaagtgaaattgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttga 107118  T
Q  247 aatgaaa 253  Q
    |||||||    
T  107117 aatgaaa 107111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 47 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 115818 - 115731
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgaga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  115818 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaggtttagtttttgaga 115731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 315 - 383
Target Start/End: Original strand, 110106 - 110174
Alignment:
Q  315 gttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 383  Q
    |||| |||||||||| | ||| | |||| || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  110106 gttagctttctaatggctttgatttgacatccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 110174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 315 - 383
Target Start/End: Original strand, 118607 - 118675
Alignment:
Q  315 gttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 383  Q
    |||| |||||||||| | ||| | |||| || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  118607 gttagctttctaatggctttgatttgacatccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 118675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0535 (Bit Score: 181; Significance: 1e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0535
Description:

Target: scaffold0535; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 46 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 7627 - 7419
Alignment:
Q  46 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7627 ttaaggtaagggtgagactaacattcaataatcttgagtctatgattctgagaattgtatttaacatgttgtaggtttagtttttgagaatttgagaatt 7528  T
Q  146 agggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctaatttttcttttcatctctgccccgaatctg 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7527 agggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgagtaatataggttgctatttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttg 7428  T
Q  246 aaatgaaaa 254  Q
    |||||||||    
T  7427 aaatgaaaa 7419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 179; Significance: 2e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 48 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 60777 - 60575
Alignment:
Q  48 aaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaattag 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  60777 aaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgtttctgaaaattttatttaatatgttgtaggtttagtttttgagaatttgagaattag 60678  T
Q  148 ggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctaatttttcttttcatctctgccccgaatctgaa 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  60677 ggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaa 60578  T
Q  248 atg 250  Q
    |||    
T  60577 atg 60575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 175; Significance: 5e-94; HSPs: 3)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 48 - 238
Target Start/End: Original strand, 43169 - 43359
Alignment:
Q  48 aaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaattag 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43169 aaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaatattgtacttaacatgttgtaggtttagtttttgagaatttgagaattag 43268  T
Q  148 ggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctaatttttcttttcatctctgcccc 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43269 ggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgcccc 43359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 237 - 318
Target Start/End: Original strand, 75608 - 75689
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgtta 318  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  75608 ccgaatttgaaatgaaaactagtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtta 75689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 427 - 465
Target Start/End: Original strand, 75605 - 75643
Alignment:
Q  427 tgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtaca 465  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  75605 tgtccgaatttgaaatgaaaactagtattgattggtaca 75643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0711 (Bit Score: 170; Significance: 5e-91; HSPs: 4)
Name: scaffold0711
Description:

Target: scaffold0711; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 44 - 229
Target Start/End: Original strand, 6894 - 7079
Alignment:
Q  44 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaa 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6894 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaggtttagtttttgagaatttgagaa 6993  T
Q  144 ttagggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctaatttttcttttcat 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6994 ttagggttaagagtgatgattgtgatgattttgaataaaagtgaaattgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcat 7079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0711; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 238 - 465
Target Start/End: Original strand, 7395 - 7621
Alignment:
Q  238 cgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggt 337  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||    
T  7395 cgaatttgaaatgaaa-ctggtattgattggtacagaattggtcttgggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaataccgttggt 7493  T
Q  338 ctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaattt 437  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7494 ctgacatcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaaattttatgaatttcagcacaactttgtccgaattt 7593  T
Q  438 gaaatgaaaactgatattgattggtaca 465  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7594 gaaatgaaaactggtattgattggtaca 7621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0711; HSP #3
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 237 - 468
Target Start/End: Original strand, 7201 - 7431
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| ||||||| || ||||||||||||| ||  ||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  7201 ccgaatttgaaatgcaatctggtattgattggtaaagaatatgtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttatccttctaatgtcgttgg 7300  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatt 436  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  7301 tctgacgtcaaaacaatttataaaacttgagttatggtcaaattattgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaacattgttcgaatt 7400  T
Q  437 tgaaatgaaaactgatattgattggtacagaa 468  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  7401 tgaaatg-aaactggtattgattggtacagaa 7431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0711; HSP #4
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 308 - 468
Target Start/End: Original strand, 7079 - 7239
Alignment:
Q  308 tatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaattttt 407  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||    
T  7079 tatggatgttagctttctaatgccgttgctctgccgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacataggtcacagtgacttttt 7178  T
Q  408 atgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaa 468  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||| ||||    
T  7179 atgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgcaatctggtattgattggtaaagaa 7239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741 (Bit Score: 168; Significance: 8e-90; HSPs: 4)
Name: scaffold0741
Description:

Target: scaffold0741; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 237 - 468
Target Start/End: Original strand, 3813 - 4044
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||    
T  3813 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtggaaacacgaaagttgtaggtattgatgttagctttctaattccgttgg 3912  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatt 436  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3913 tctgatgtcaaaacgatttatgaaacttgagttatgatcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatt 4012  T
Q  437 tgaaatgaaaactgatattgattggtacagaa 468  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4013 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaa 4044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 237 - 468
Target Start/End: Original strand, 3620 - 3851
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  3620 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagctgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 3719  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatt 436  Q
    | ||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3720 tatgaggtcaaaacgatttatgtaacttgagttatgctcaaattactgaacgtaggtcacagttaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatt 3819  T
Q  437 tgaaatgaaaactgatattgattggtacagaa 468  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3820 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaa 3851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Original strand, 4006 - 4164
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4006 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcataggtgtaaacatgaaaggtgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 4105  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4106 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtgggtca 4164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741; HSP #4
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 351 - 468
Target Start/End: Original strand, 3541 - 3658
Alignment:
Q  351 gatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactg 450  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3541 gatttatagaacttgagttatggtcaaaatactgcacgtaggtcactgtgaatttttatgaatttcaacacaagtttgtccgaatttgaaatgaaaactg 3640  T
Q  451 atattgattggtacagaa 468  Q
     |||||||||||||||||    
T  3641 gtattgattggtacagaa 3658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 154; Significance: 2e-81; HSPs: 3)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 139 - 384
Target Start/End: Original strand, 38261 - 38506
Alignment:
Q  139 gagaattagggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctaatttttcttttcatctctgcccc 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  38261 gagaattagggttaagagtgatgattgtgatgattttgaataaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttctcttttcatctctgcccc 38360  T
Q  239 gaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtc 338  Q
    |||| |||||| |||| | ||||||||   ||  |||||| |||||||    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  38361 gaatttgaaataaaaattagtattgatccgtaaagaattgatcttagggctaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtt 38460  T
Q  339 tgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactg 384  Q
    |||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  38461 tgacttcaaaatgatttatagaatttgagttatgttcaaattactg 38506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 47 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 9159 - 9044
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatta 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||  ||||||||| | ||||  ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  9159 taaggtaagggtgggactaacattcaatcttcttaagcgtatgattctaataattccatttagcatgttgtaggtttaatttttgagaatttgggaatta 9060  T
Q  147 gggttaagagtgatga 162  Q
    ||||||| ||||||||    
T  9059 gggttaaaagtgatga 9044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 47 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 1990 - 1896
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacat-gttgtaagtttagtttttgagaatttgaga 142  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| | ||||| |||| | || ||||||||| |||||| ||| || |||| |||||||||||    
T  1990 taaggtaagggtgggactaaccttcaataattctgagtatgtgattatgaaga-tgaatttaacatggttgtaggttgaggtttt-agaatttgaga 1896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 141; Significance: 1e-73; HSPs: 4)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 277 - 461
Target Start/End: Original strand, 36749 - 36933
Alignment:
Q  277 tggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtca 376  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36749 tggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttaactttctaatgttgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtca 36848  T
Q  377 aattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattgg 461  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36849 aattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttatcaaaatttgaaatgaaaactaatattgattgg 36933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 291 - 445
Target Start/End: Original strand, 36956 - 37110
Alignment:
Q  291 aacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgta 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36956 aacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgta 37055  T
Q  391 ggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaa 445  Q
    | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37056 gatcatagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaa 37110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151; HSP #3
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 44 - 188
Target Start/End: Original strand, 36596 - 36740
Alignment:
Q  44 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaa 143  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||    
T  36596 tcttaaggtaagtgtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaggtttagtttttaaaaatttgagaa 36695  T
Q  144 ttagggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaa 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36696 ttagggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaa 36740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151; HSP #4
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 47 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 31160 - 31055
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtt-tagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| | | ||||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||  |||| ||||||| |||||    
T  31160 taaggtaagggtgggactaaccttcaataattctgagtatgtaattctgaaaattggatttaacaagttgtaggttgtag--tttgggaatttgggaatt 31063  T
Q  146 agggttaa 153  Q
    ||||||||    
T  31062 agggttaa 31055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0191 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0191
Description:

Target: scaffold0191; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 46 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 3663 - 3524
Alignment:
Q  46 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3663 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaatatgttgtaggtttagtttttgagaatttgagaatt 3564  T
Q  146 agggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagt 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3563 agggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatgaaagt 3524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 3)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 48 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 185110 - 184978
Alignment:
Q  48 aaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaattag 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  185110 aaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaggtttagtttttgagaatttgagaattag 185011  T
Q  148 ggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatg 180  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  185010 ggttaagagtgatgattgtgatgattttgaatg 184978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 44 - 148
Target Start/End: Original strand, 118752 - 118854
Alignment:
Q  44 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| |||| |||||  ||||||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||    
T  118752 tcttaaggtaagggtgggactaaccttcaataatcttgagtatgtgaatctg-aaattagatttaacatgttggaggtttag-ttttgagaattggagaa 118849  T
Q  144 ttagg 148  Q
     ||||    
T  118850 ctagg 118854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 47 - 114
Target Start/End: Original strand, 172109 - 172175
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgt 114  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  172109 taaggtaagggtgggactatcattcagtgatcttaagtctataattctg-aaattggatttaacatgt 172175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 121; Significance: 9e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 239 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 33628 - 33472
Alignment:
Q  239 gaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtc 338  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  33628 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagatttctaatgtcgttggtc 33529  T
Q  339 tgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33528 tgacgtaaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 33472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 400 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 33660 - 33592
Alignment:
Q  400 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaa 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33660 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtctgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaa 33592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 116; Significance: 8e-59; HSPs: 3)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 237 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 31662 - 31487
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| | ||||    
T  31662 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtattaatgttagctttctaatgccattgg 31563  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaa 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||| | |||||||    
T  31562 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggttaaattactgcacgtaggtcacagtgaaatcttatgaa 31487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 400 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 31692 - 31624
Alignment:
Q  400 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaa 468  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31692 gaatttttatgaatttcatcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaa 31624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 46 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 32195 - 32124
Alignment:
Q  46 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgt-atttaacatgttgt 117  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||| || ||||||||||| || |||| ||||||||||||||    
T  32195 ttaaggtaagggtgagactaacattcaatcttcttaagcctatgattctg-aatttgtgatttaacatgttgt 32124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200 (Bit Score: 110; Significance: 3e-55; HSPs: 3)
Name: scaffold0200
Description:

Target: scaffold0200; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 239 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 18110 - 17937
Alignment:
Q  239 gaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtc 338  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  | ||||||    
T  18110 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaataccattggtc 18011  T
Q  339 tgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaa 412  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| | |||||||    
T  18010 tgacgtcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacataggtcacagtgaaatcttatgaa 17937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 400 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 18142 - 18074
Alignment:
Q  400 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaa 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18142 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtcagaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaa 18074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 18646 - 18575
Alignment:
Q  46 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgt-atttaacatgttgt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||| || |||| ||||||||||||||    
T  18646 ttaaggtaagggtgggactaacattcaatcttcttaagcctatgattctg-aatttgtgatttaacatgttgt 18575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0695 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 3)
Name: scaffold0695
Description:

Target: scaffold0695; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 6405 - 6247
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  6405 ccgaatttgaaatgaaaactggtattcattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttgg 6306  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6305 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtca 6247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0695; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 47 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 6893 - 6765
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  | ||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  6893 taaggtaagggtgagactaacattcaataatcttaagtcattaattctgaaaattggatttaacatgttgtaggttttagtttttgagaatttgagaatt 6794  T
Q  146 agggttaagagtgatgattgtgatgatttt 175  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  6793 agggttaaaagtgattatt-tgatgatttt 6765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0695; HSP #3
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 400 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 6435 - 6367
Alignment:
Q  400 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaa 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  6435 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattcattggtacagaa 6367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422 (Bit Score: 105; Significance: 3e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0422
Description:

Target: scaffold0422; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 239 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 3480 - 3324
Alignment:
Q  239 gaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtc 338  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||     
T  3480 gaatttgaaatgaaaactggtattgattgttacataattgttcttagttgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtt 3381  T
Q  339 tgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3380 tgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 3324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 400 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 3512 - 3447
Alignment:
Q  400 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtaca 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  3512 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtcagaatttgaaatgaaaactggtattgattgttaca 3447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 3)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 44 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 22017 - 21898
Alignment:
Q  44 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaa 143  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22017 tcttaaggtaagggtgagactaacattcaataatcttgagtctatgattgtgaaaattgtatttaacatgttgtaggtttagtttttgagaatttgagaa 21918  T
Q  144 ttagggttaagagtgatgat 163  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  21917 ttagggttaacagtgatgat 21898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 47 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 158733 - 158621
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  158733 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttaagtcattgattctgaaaattggatttaacatgttgtaggttttagtttttgagaatttgggaatt 158634  T
Q  146 agggttaagagtg 158  Q
    |||||||| ||||    
T  158633 agggttaaaagtg 158621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 48 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 30122 - 30010
Alignment:
Q  48 aaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatga-ttctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatta 146  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||   | ||| | | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  30122 aaggtaagggtgggactaaccttcaataaatctaagtgttttaattctgaaaattgtatttaacatgttgtaggtttag-ttttgaggatttgggaatta 30024  T
Q  147 gggttaagagtgat 160  Q
    | ||||| ||||||    
T  30023 gagttaaaagtgat 30010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 103; Significance: 5e-51; HSPs: 3)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 13851 - 13693
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  13851 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtataaatgttatctttctaatgccgttgg 13752  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13751 tttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtca 13693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 363 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 13918 - 13813
Alignment:
Q  363 ttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggt 462  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13918 ttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggt 13819  T
Q  463 acagaa 468  Q
    ||||||    
T  13818 acagaa 13813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444; HSP #3
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 47 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 14342 - 14230
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||    
T  14342 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttaagtcattgattctcaaaattggatttaacatgttgtaggttttcgtttttgagaatttgagaatt 14243  T
Q  146 agggttaagagtg 158  Q
    |||||||| ||||    
T  14242 agggttaaaagtg 14230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0319 (Bit Score: 103; Significance: 5e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0319
Description:

Target: scaffold0319; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 46 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 6164 - 6046
Alignment:
Q  46 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6164 ttaaggtaaaggtgagactaacattcaataattttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaggtttagtttttgagaatttgagaatt 6065  T
Q  146 agggttaagagtgatgatt 164  Q
    |||||||||||||||||||    
T  6064 agggttaagagtgatgatt 6046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 103; Significance: 5e-51; HSPs: 3)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 38280 - 38122
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||    
T  38280 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 38181  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38180 tttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtca 38122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 364 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 38346 - 38242
Alignment:
Q  364 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggta 463  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38346 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 38247  T
Q  464 cagaa 468  Q
    |||||    
T  38246 cagaa 38242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134; HSP #3
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 47 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 38770 - 38642
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  38770 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttaagtcattgattctgaaaattggatttaacatgttgtaggttttagtttttgagaatttgggaatt 38671  T
Q  146 agggttaagagtgatgattgtgatgatttt 175  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  38670 agggttaaaagtgattatt-tgatgatttt 38642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 103; Significance: 5e-51; HSPs: 4)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 39791 - 39633
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||    
T  39791 ccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtagttatggatgttagctttctaatgccattgg 39692  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  39691 tctaacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattattacacgtaggtca 39633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 39817 - 39753
Alignment:
Q  404 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaa 468  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39817 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaa 39753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 114
Target Start/End: Original strand, 40218 - 40285
Alignment:
Q  46 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgt 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||| || |||||||| || |||||| |||||||||||    
T  40218 ttaaggtaagggtgggactaacattcaatcttcttaagcctatgattttg-aaattggatttaacatgt 40285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 42724 - 42653
Alignment:
Q  46 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgt-atttaacatgttgt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||| || |||| ||||||||||||||    
T  42724 ttaaggtaagggtgggactaacattcaatcttcttaagcctatgattctg-aatttgtgatttaacatgttgt 42653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 101; Significance: 7e-50; HSPs: 3)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 237 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 9700 - 9544
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| ||||||    
T  9700 ccgaatttgaaatgaaaactggtatttattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctctctaatgccgttgg 9601  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggt 393  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9600 tttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggt 9544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 47 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 10194 - 10082
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||    
T  10194 taaggtaagggtgagactaacattcaataatcttaagtcattgattctgaaaattggatttaacatgttgtaggttttcgtttttgagaatttgagaatt 10095  T
Q  146 agggttaagagtg 158  Q
    |||||||||||||    
T  10094 agggttaagagtg 10082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363; HSP #3
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 400 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 9730 - 9662
Alignment:
Q  400 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaa 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  9730 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtatttattggtacagaa 9662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 100; Significance: 3e-49; HSPs: 3)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 237 - 412
Target Start/End: Original strand, 19792 - 19967
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||    
T  19792 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtatagaattggtcttaggtgtaaacgcaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattgg 19891  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaa 412  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||| | |||||||    
T  19892 tctgacgtcaaaacgaattatataacttgagttatcgtcaaattactacacgtaggtcatagtgaaatcttatgaa 19967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 400 - 468
Target Start/End: Original strand, 19762 - 19830
Alignment:
Q  400 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaa 468  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  19762 gaatttttatgaatttcagcaaaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtatagaa 19830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 48 - 117
Target Start/End: Original strand, 19301 - 19370
Alignment:
Q  48 aaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgt-atttaacatgttgt 117  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  |||| || ||||||||||| || |||| ||||||||||||||    
T  19301 aaggtaagggtgagactaacattcaatcttcttaagcctatgattctg-aatttgtgatttaacatgttgt 19370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 4)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 40858 - 40700
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||  |||||| |||||||||| ||||||    
T  40858 ccgaatttgaaattaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtagatataaatgttagctttctaatgccgttgg 40759  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40758 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtca 40700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 363 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 40925 - 40820
Alignment:
Q  363 ttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggt 462  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  40925 ttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaattaaaactggtattgattggt 40826  T
Q  463 acagaa 468  Q
    ||||||    
T  40825 acagaa 40820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 41348 - 41236
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||    
T  41348 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttaagtcattgattctgaaaattggatttaacatgttgtaggttttcgtttttgagaatttgggaatt 41249  T
Q  146 agggttaagagtg 158  Q
    | |||||| ||||    
T  41248 aaggttaaaagtg 41236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 313 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 37929 - 37848
Alignment:
Q  313 atgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    |||||| ||||| |||| | ||||| |||| || ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||    
T  37929 atgttagctttcaaatggctttggtttgacttccaaatgattt-tagaacttgagttatgatcaaattactacacataggtca 37848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 96; Significance: 7e-47; HSPs: 4)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 21207 - 21048
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaat-gaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttg 335  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||    
T  21207 ccgaatttgaaatagaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacaagaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttg 21108  T
Q  336 gtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    || |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21107 gtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtca 21048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 47 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 21699 - 21585
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  21699 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttaagtcattgattctgaaaattggatttaacatgttgtaggttttagtttttgagaatttgagaatt 21600  T
Q  146 agggttaagagtgat 160  Q
    |||||||| ||||||    
T  21599 agggttaaaagtgat 21585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254; HSP #3
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 19221 - 19116
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  19221 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttaagtcattgattctgaaaattagatttaacatgttgtaggttttagtttttgagaatttgggaatt 19122  T
Q  146 agggtt 151  Q
    ||||||    
T  19121 agggtt 19116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254; HSP #4
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 400 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 21237 - 21168
Alignment:
Q  400 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaat-gaaaactgatattgattggtacagaa 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  21237 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatagaaaactggtattgattggtacagaa 21168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 95; Significance: 3e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 68420 - 68262
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || | ||||    
T  68420 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttatgtgtaaacacgaaagttgtatgtatggatgttagctttctagtgccattgg 68321  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  68320 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtca 68262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 400 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 68450 - 68385
Alignment:
Q  400 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtaca 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  68450 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtaca 68385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0436 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0436
Description:

Target: scaffold0436; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 237 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 8477 - 8304
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||  |||||| |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||    
T  8477 ccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtatagaattgctcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgctattgg 8378  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatg 410  Q
    | |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  8377 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtaaaattactgcacgttggtcacagtgaatttttatg 8304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0436; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 400 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 8507 - 8439
Alignment:
Q  400 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaa 468  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8507 gaatttttatgaatttcagcacagctttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtatagaa 8439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 93; Significance: 4e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 47 - 175
Target Start/End: Original strand, 2918 - 3044
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatta 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||    
T  2918 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaaca-gttgtaggtatagtttttgagaatttgggaatta 3016  T
Q  147 gggttaagagtgatgattgtgatgatttt 175  Q
    ||||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  3017 gggttaaaagtgattatt-tgatgatttt 3044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 93; Significance: 4e-45; HSPs: 3)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 239 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 11746 - 11590
Alignment:
Q  239 gaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtc 338  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||      
T  11746 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgatacttgtaggtatggatgttagctttctattgccgttgggt 11647  T
Q  339 tgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11646 tgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtca 11590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 47 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 12238 - 12110
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||    
T  12238 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttaagtcattgattctgaaaattggatttaacatgttgtaggttttcgtttttgagaatttgagaatt 12139  T
Q  146 agggttaagagtgatgattgtgatgatttt 175  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  12138 agggttaaaagtgattatt-tgatgatttt 12110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 400 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 11778 - 11713
Alignment:
Q  400 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtaca 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11778 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtcggaatttgaaatgaaaactggtattgattggtaca 11713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 91; Significance: 7e-44; HSPs: 16)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 134669 - 134511
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||    
T  134669 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattagtacataattggtcttaagtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 134570  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  134569 tttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtca 134511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 47 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 135161 - 135047
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  135161 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgggtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaggttttagtttttgagaatttgggaatt 135062  T
Q  146 agggttaagagtgat 160  Q
    |||||||| ||||||    
T  135061 agggttaaaagtgat 135047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 137138 - 136980
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||    
T  137138 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattagtacataattggtcttaagtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 137039  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  137038 tttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtca 136980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 47 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 137630 - 137516
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  137630 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgggtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaggttttagtttttgagaatttgggaatt 137531  T
Q  146 agggttaagagtgat 160  Q
    |||||||| ||||||    
T  137530 agggttaaaagtgat 137516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 139607 - 139449
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||    
T  139607 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattagtacataattggtcttaagtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 139508  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  139507 tttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtca 139449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 47 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 140099 - 139985
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  140099 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgggtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaggttttagtttttgagaatttgggaatt 140000  T
Q  146 agggttaagagtgat 160  Q
    |||||||| ||||||    
T  139999 agggttaaaagtgat 139985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 142076 - 141918
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||    
T  142076 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattagtacataattggtcttaagtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 141977  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  141976 tttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtca 141918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #8
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 47 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 142568 - 142454
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  142568 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgggtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaggttttagtttttgagaatttgggaatt 142469  T
Q  146 agggttaagagtgat 160  Q
    |||||||| ||||||    
T  142468 agggttaaaagtgat 142454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 144545 - 144387
Alignment:
Q  237 ccgaatctgaaatgaaaactggtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||    
T  144545 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattagtacataattggtcttaagtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 144446  T
Q  337 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  144445 tttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtca 144387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #10
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 47 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 145037 - 144923
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  145037 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgggtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaggttttagtttttgagaatttgggaatt 144938  T
Q  146 agggttaagagtgat 160  Q
    |||||||| ||||||    
T  144937 agggttaaaagtgat 144923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #11
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 400 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 134699 - 134634
Alignment:
Q  400 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtaca 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  134699 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattagtaca 134634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #12
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 400 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 137168 - 137103
Alignment:
Q  400 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtaca 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  137168 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattagtaca 137103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #13
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 400 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 139637 - 139572
Alignment:
Q  400 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtaca 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  139637 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattagtaca 139572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #14
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 400 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 142106 - 142041
Alignment:
Q  400 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtaca 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  142106 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattagtaca 142041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #15
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 400 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 144575 - 144510
Alignment:
Q  400 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtaca 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  144575 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattagtaca 144510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #16
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 48 - 152
Target Start/End: Original strand, 3053 - 3157
Alignment:
Q  48 aaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtt-tagtttttgagaatttgagaatta 146  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  | ||| ||| ||||||||||||| |||||||| |||||| ||| ||| ||||| ||||||  ||||||    
T  3053 aaggtaagggtgggactaaccttcaataattctaagtgtattattctgaaaattgaatttaacaagttgtaggttgtag-ttttgggaatttaggaatta 3151  T
Q  147 gggtta 152  Q
    ||||||    
T  3152 gggtta 3157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 47 - 158
Target Start/End: Original strand, 56220 - 56332
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  56220 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgggtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaggttttagtttttgagaatttgggaatt 56319  T
Q  146 agggttaagagtg 158  Q
    |||||||| ||||    
T  56320 agggttaaaagtg 56332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1427 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold1427
Description:

Target: scaffold1427; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 293 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 1831 - 1729
Alignment:
Q  293 cacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtagg 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1831 cacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtagg 1732  T
Q  393 tca 395  Q
    |||    
T  1731 tca 1729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 47 - 175
Target Start/End: Original strand, 38952 - 39080
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||    
T  38952 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttaagtcattgattctgaaaattggatttaacatgttgtaggttttagttttttagaatttgagaatt 39051  T
Q  146 agggttaagagtgatgattgtgatgatttt 175  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  39052 agggttaaaagtgattatt-tgatgatttt 39080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 274 - 395
Target Start/End: Original strand, 53612 - 53733
Alignment:
Q  274 aattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 373  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  53612 aattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacgtcaaagggatttatagaacttgagatatgg 53711  T
Q  374 tcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  53712 tcaaattactgcacgtaggtca 53733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 159
Target Start/End: Original strand, 128172 - 128209
Alignment:
Q  122 ttagtttttgagaatttgagaattagggttaagagtga 159  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  128172 ttagttttagagaatttgagaattagagttaagagtga 128209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 160 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 113550 - 113284
Alignment:
Q  160 tgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagtt-gaataatataggttgctttttctaatttttcttttcatctctgcccc-gaatctgaaatgaaaactg 257  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  || |||||||||| | | ||||    |||||||| |||| |||| |||||| |||||||    
T  113550 tgattgtgatgattttgaatgaatgtgaagtttgaataagttaagttgctttttttgactttt----tcatctctacccccgaatttgaaataaaaactg 113455  T
Q  258 gtattgattgatacggaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttat 357  Q
    |||||||| | | |||| |||| ||| | ||  |||| | |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||  ||||| || || |    
T  113454 gtattgatcggtgcggatttggcctttgatgtaaacatggaagttgtaggtatggatgttacatttctaatgacgttggtttgactccaaaatgagtttt 113355  T
Q  358 agaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttat-gaatttcagcacaacttt 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||  || ||||||  |||||||||||||||||    
T  113354 agaacttgagttatggtcaaattactaaacgtaggtcatagtaaagttttataaaatttcagcacaacttt 113284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 80; Significance: 3e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 46 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 23039 - 22909
Alignment:
Q  46 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatc-ttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtt-tagtttttgagaatttgagaa 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||    
T  23039 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatctttaagtctatgattctaaaaattggatttaacatgttgtaggttatagtttttgagaatttgggaa 22940  T
Q  144 ttagggttaagagtgatgattgtgatgatttt 175  Q
    |||||||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  22939 ttagggttaaaagtgattatt-tgatgatttt 22909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 76; Significance: 6e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 46 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 7986 - 7871
Alignment:
Q  46 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaat 144  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  7986 ttaaagtaagggtgggactaacattcaataatcttaagtctatgattctaaaaattggatttaacatgttgtaggttttagtttttgagaatttgggaat 7887  T
Q  145 tagggttaagagtgat 160  Q
    || |||||| ||||||    
T  7886 taaggttaaaagtgat 7871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 76; Significance: 6e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 46 - 160
Target Start/End: Original strand, 5321 - 5436
Alignment:
Q  46 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaat 144  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  5321 ttaaagtaagggtgggactaacattcaataatcttaagtctatgattctaaaaattggatttaacatgttgtaggttttagtttttgagaatttgggaat 5420  T
Q  145 tagggttaagagtgat 160  Q
    || |||||| ||||||    
T  5421 taaggttaaaagtgat 5436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 46 - 160
Target Start/End: Original strand, 18 - 133
Alignment:
Q  46 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaat 144  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  18 ttaaggtaagggtgagactaatattcaataatcttaagtctatgattctaaaaattggatttaacatgttgtaggttttagtttttgagaatttgggaat 117  T
Q  145 tagggttaagagtgat 160  Q
     |||||||| ||||||    
T  118 gagggttaaaagtgat 133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 76; Significance: 6e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 42 - 165
Target Start/End: Original strand, 191793 - 191915
Alignment:
Q  42 aatcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgag 141  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  191793 aatcctaaggtaagggtgggactaacattcaatcttcttaagcctatgattctgataattagatttaacatgttgtaggtttagtttttgagaatttga- 191891  T
Q  142 aattagggttaagagtgatgattg 165  Q
    ||||||||||||||||||| ||||    
T  191892 aattagggttaagagtgataattg 191915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 47 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 16385 - 16284
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatta 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  16385 taaggtaagggtgggactaacattcattaatcttaagtctattattctgaaaattgcctttaacatgttgtaggtttagtttttgagaatttgggaatta 16286  T
Q  147 gg 148  Q
    ||    
T  16285 gg 16284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 69; Significance: 9e-31; HSPs: 3)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 531 - 419
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||    
T  531 taaggtaagggtgagactaacattcaataatcttaagtcattgattctgaaaattggatttaacatgttgtaggttttcgtttttgagaatttcagaatt 432  T
Q  146 agggttaagagtg 158  Q
    |||||||| ||||    
T  431 agggttaaaagtg 419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 400 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 65 - 1
Alignment:
Q  400 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtac 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  65 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtac 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 326 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 11142 - 11075
Alignment:
Q  326 aatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggt 393  Q
    |||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  11142 aatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatagtcaaattacttcatgtaggt 11075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0323 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0323
Description:

Target: scaffold0323; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 48 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 11915 - 11828
Alignment:
Q  48 aaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaa 135  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  11915 aaggtacgggtgagactaacattcaataatcttgagtctatgattttgaaaattgtatttaatatgttgtaggtttagtttttgagaa 11828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0500 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0500
Description:

Target: scaffold0500; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 42 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 8452 - 8346
Alignment:
Q  42 aatcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgag 141  Q
    |||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  8452 aatcctaagataagggtggaactaacattcattaatcttaagtccattattctgaaaattgtctttaacatgttgaaggtttagtttttgagaatttgag 8353  T
Q  142 aattagg 148  Q
    |||||||    
T  8352 aattagg 8346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0232 (Bit Score: 66; Significance: 6e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0232
Description:

Target: scaffold0232; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 54 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 4270 - 4150
Alignment:
Q  54 agggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaattagggttaa 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||    
T  4270 agggtgggactaacattcaataatcttaagtcattgattctgaaaattggatttaatatgttgtaagttttagttttgagaatttgggaattagggttaa 4171  T
Q  154 gagtgatgattgtgatgatttt 175  Q
     | |||| ||| ||||||||||    
T  4170 aattgattatt-tgatgatttt 4150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480 (Bit Score: 64; Significance: 9e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0480
Description:

Target: scaffold0480; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 47 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 10387 - 10273
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatta 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  10387 taaggtaagggtgggactaacattcaatcttcttaagcctatgattctgataattgcatttagcatgttgttggtttag-ttttgagaatttgggaatta 10289  T
Q  147 gggttaagagtgatga 162  Q
    ||||||| ||||||||    
T  10288 gggttaaaagtgatga 10273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0780 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0780
Description:

Target: scaffold0780; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 46 - 159
Target Start/End: Original strand, 2470 - 2583
Alignment:
Q  46 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacat-gttgtaagtttagtttttgagaatttgagaat 144  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| |||| |||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  2470 ttaaggtaagggtgggactaaccttcaataatcttgagtatgtgaatctg-aaattgaatttaacatggttgtaggttaagttttttagaatttgagaat 2568  T
Q  145 tagggttaagagtga 159  Q
    ||||||||| |||||    
T  2569 tagggttaaaagtga 2583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 44 - 165
Target Start/End: Original strand, 220331 - 220449
Alignment:
Q  44 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||  |||  ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  220331 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaatcttcttaagcctatgattctgatgattagatttaacatg--gtaggtttagtttttgagaatttga-aa 220427  T
Q  144 ttagggttaagagtgatgattg 165  Q
    ||||||||||||||||| ||||    
T  220428 ttagggttaagagtgataattg 220449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 42 - 148
Target Start/End: Original strand, 165611 - 165717
Alignment:
Q  42 aatcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgag 141  Q
    |||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |    
T  165611 aatcctaacgtaagggtgggacttacattcattaatcttaagactattattctgaaaattgtctttaacatgttgtatgtttagttcttgagaatttggg 165710  T
Q  142 aattagg 148  Q
    |||||||    
T  165711 aattagg 165717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 48 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 7260 - 7144
Alignment:
Q  48 aaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaattag 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||  ||||||    
T  7260 aaggtaagggtgggactaacattcaatcttcttaagcctatgattctgatgattatatttaacatgttgtaggtttagtttgtgag-atttggaaattag 7162  T
Q  148 ggttaagagtgatgattg 165  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  7161 ggttaagagtgataattg 7144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 42 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 1614 - 1492
Alignment:
Q  42 aatcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgag 141  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||  |||  ||||||||||||||| ||||||||| | |||||| ||     
T  1614 aatcctaaggcaaaggtgggactaacattcaatattcttaagcctatgattctgatgattagatttaacatgttgtaggtttagtttattagaattgga- 1516  T
Q  142 aattagggttaagagtgatgattg 165  Q
    ||||||||||||||||||| ||||    
T  1515 aattagggttaagagtgataattg 1492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 44 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 4920 - 4816
Alignment:
Q  44 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  | || |||||||||||||||   |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  4920 tcttaaggtaagggtgggactagcattcaattctattaagtctatgattctgatggttgtatttaacaggttgtaggattagtttttgagaatttgagaa 4821  T
Q  144 ttagg 148  Q
    |||||    
T  4820 ttagg 4816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0059
Description:

Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 312 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 57865 - 57782
Alignment:
Q  312 gatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  57865 gatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttataaaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 57782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 47 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 49781 - 49729
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||| || ||||||||||    
T  49781 taaggtaagggtgggactaaccttctttaatcatgagtccataattctgaaaa 49729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 59; Significance: 9e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 47 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 8221 - 8127
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaag-tttagtttttgagaatttga 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||    
T  8221 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttaagtcattgattctgaaaattggatttaacatgttgtaggttttggttttagagaatttga 8127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0686
Description:

Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 44 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 2235 - 2131
Alignment:
Q  44 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||| |   |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  2235 tcttaaggtaagggtgggactagcattcaattctattaagtctatgattctaatggttgtatttaacaggttgtaggattagtttttgagaatttgagaa 2136  T
Q  144 ttagg 148  Q
    |||||    
T  2135 ttagg 2131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 314 - 383
Target Start/End: Original strand, 6970 - 7039
Alignment:
Q  314 tgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 383  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| ||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  6970 tgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 7039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0481 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0481
Description:

Target: scaffold0481; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 47 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 78 - 2
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagttt 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  78 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttaagtcattgattctgaaaattggatttaacatgttgtaggttt 2  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 44 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 98002 - 97898
Alignment:
Q  44 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaa 143  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||  | || |||||||||||||||   |||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  98002 tcttaaggtaagggtggaactaacattcaattctattaagtctatgattctgatggttgtatttaacaggttgtaggattaatttttgagaatttgagaa 97903  T
Q  144 ttagg 148  Q
    |||||    
T  97902 ttagg 97898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 44 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 107280 - 107176
Alignment:
Q  44 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaa 143  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||  | || |||||||||||||||   |||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  107280 tcttaaggtaagggtggaactaacattcaattctattaagtctatgattctgatggttgtatttaacaggttgtaggattaatttttgagaatttgagaa 107181  T
Q  144 ttagg 148  Q
    |||||    
T  107180 ttagg 107176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1835 (Bit Score: 54; Significance: 8e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold1835
Description:

Target: scaffold1835; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 44 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 262 - 142
Alignment:
Q  44 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaa 143  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| || || | |||||||  |||  ||||||||||||||| | |||||||||||||||| || ||    
T  262 tcttaaggtaagggtgcgactaacattcaatcttcttaagcctttaattctgatgattagatttaacatgttgtagggttagtttttgagaattgga-aa 164  T
Q  144 ttagggttaagagtgatgattg 165  Q
    ||||||||||||||||| ||||    
T  163 ttagggttaagagtgataattg 142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 27 - 159
Target Start/End: Original strand, 12095 - 12227
Alignment:
Q  27 aggttgccgatcgttaatcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacat-gttgtaagtttag 125  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| | |||||||| |||| | ||||||||| |||||| ||| |     
T  12095 aggttgccgatcgttaatcctaaggtaagggtgggactaaccttcaataattctgagtatgtgattctg-aaatcgaatttaacatggttgtaggttgaa 12193  T
Q  126 tttttgagaatttgaga-attagggttaagagtga 159  Q
     |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  12194 gtttt-agaatttgagagattagggttaaaagtga 12227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 47 - 157
Target Start/End: Original strand, 17335 - 17444
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatta 146  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |  |||| ||  ||||||||||| ||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  17335 taaggtaaggttgggactaacattcagtcttcttaagcatatgattctgataattagatttaacattttgtaggtttagtttttgagaatttga-aatta 17433  T
Q  147 gggttaagagt 157  Q
    | |||||||||    
T  17434 gtgttaagagt 17444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 3)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 46 - 148
Target Start/End: Original strand, 33668 - 33770
Alignment:
Q  46 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||  | || |||||||||||| ||   |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  33668 ttaaggtaaggctgggactagcattcaattctattaagtctatgattccgatggttgtatttaacaggttgtaggattagtttttgagaatttgagaatt 33767  T
Q  146 agg 148  Q
    |||    
T  33768 agg 33770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 46 - 152
Target Start/End: Original strand, 28328 - 28434
Alignment:
Q  46 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtt-tagtttttgagaatttgagaat 144  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| ||| ||||| |||||||  |||    
T  28328 ttaaggtaagggtgggactacccttcaataattctgagtatatgattctgaaaattggatttaacaagttgtaggttgtag-ttttgggaatttggaaat 28426  T
Q  145 tagggtta 152  Q
    ||||||||    
T  28427 tagggtta 28434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 46 - 111
Target Start/End: Original strand, 31369 - 31434
Alignment:
Q  46 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaaca 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | || |||||||||||||||   ||||||||||||    
T  31369 ttaaggtaagggtgggactagcattcaattctattaagtctatgattctgatggttgtatttaaca 31434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 59 - 165
Target Start/End: Original strand, 31648 - 31752
Alignment:
Q  59 gggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaattagggttaagagtg 158  Q
    ||||||||||||||||  |||| || |||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  31648 gggactaacattcaatcttcttaagcctatgattctgataattagatttaacatgttgtaggttta-tttttgagaatttga-aattagggttaagaggg 31745  T
Q  159 atgattg 165  Q
    || ||||    
T  31746 ataattg 31752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 3)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 47 - 152
Target Start/End: Original strand, 158822 - 158927
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtt-tagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||||| ||| ||| ||||| ||||||| |||||    
T  158822 taaggtaagggtgggactaaccttcaataattctgagtatatgattctaaaaattggatttaacaagttgtaggttgtag-ttttgggaatttgggaatt 158920  T
Q  146 agggtta 152  Q
    |||||||    
T  158921 agggtta 158927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 116
Target Start/End: Original strand, 160278 - 160347
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttg 116  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |  |||| || |||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  160278 taaggtaagggtaagactaacattcactcttcttaagcctatgattctgataattagatttaacatgttg 160347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 148
Target Start/End: Original strand, 163557 - 163656
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatta 146  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||  |||| || |||||||||||| ||||  |||||| |||||| |  ||||| |||||||||||  |||||||    
T  163557 taaggtaacggtgagactaacattcaatcttcttaagcctatgattctgataattaaatttaa-atgttggagatttag-ttttgagaattgaagaatta 163654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0169 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0169
Description:

Target: scaffold0169; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 44 - 165
Target Start/End: Original strand, 28693 - 28812
Alignment:
Q  44 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || || | |||||||  |||  |||||||| |||||| |||||| ||||||||||| || ||    
T  28693 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaatcttcttaagcctttaattctgatgattagatttaacaagttgtaggtttag-ttttgagaattgga-aa 28790  T
Q  144 ttagggttaagagtgatgattg 165  Q
    ||||||||||||||||| ||||    
T  28791 ttagggttaagagtgataattg 28812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 48 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 121005 - 120893
Alignment:
Q  48 aaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatga-ttctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatta 146  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||  | ||| | | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  121005 aaggtaagggtgggactagccttcaataattctaagtgttttaattctgaaaattgtatttaacatgttgtaggtttag-ttttgaggatttgtgaatta 120907  T
Q  147 gggttaagagtgat 160  Q
    ||||||| ||||||    
T  120906 gggttaaaagtgat 120893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 313 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 79073 - 79003
Alignment:
Q  313 atgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 383  Q
    |||||| |||||||||  | ||||| |||| || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  79073 atgttagctttctaattgctttggtttgacatccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 79003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1419 (Bit Score: 49; Significance: 8e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold1419
Description:

Target: scaffold1419; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 45 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 1010 - 903
Alignment:
Q  45 cttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaat 144  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||  |||| ||||||| ||| |||  |||  ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  1010 cttaaggtaaggctgggactagcattcaattttcttaagtctataattatgatgattagatttaacatgt-gtaggtttagtttttgaggatttgagaat 912  T
Q  145 tagggttaa 153  Q
    |||||||||    
T  911 tagggttaa 903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 49; Significance: 8e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 159
Target Start/End: Original strand, 3855 - 4006
Alignment:
Q  9 gagatgaaccaagaggaaaggttgccgatcgttaatcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtattta 108  Q
    |||| ||||||||| || ||| |||| |||| | ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||||| | | ||||||||||||| |||||    
T  3855 gagaagaaccaagaagagaggctgccaatcgattatcctaaggtaagggagggactaaccttcaataattatgagtatgtaattctgaaaattgaattta 3954  T
Q  109 acat-gttgtaagtttagtttttgagaatttgaga-attagggttaagagtga 159  Q
    |||| |||||| ||| || |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  3955 acatggttgtaggttgaggtttt-agaatttgagagattagggttaaaagtga 4006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 159
Target Start/End: Original strand, 13849 - 14000
Alignment:
Q  9 gagatgaaccaagaggaaaggttgccgatcgttaatcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtattta 108  Q
    |||| ||||||||| || ||| |||| |||| | ||  ||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||| | | ||||| ||||||| |||||    
T  13849 gagaagaaccaagaagagaggctgccaatcgattattctaaggtaagggtgggaccaaccttcaataattgtgagtatgtaattctaaaaattgaattta 13948  T
Q  109 acat-gttgtaagtttagtttttgagaatttgaga-attagggttaagagtga 159  Q
    |||| |||||| ||| || |||| | ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  13949 acatggttgtaggttgaggtttt-aaaatttgagagattagggttaaaagtga 14000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 49; Significance: 8e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 47 - 123
Target Start/End: Original strand, 33837 - 33913
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagttt 123  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  33837 taaggtaagggtgagactaacattcaataatcttaagtcattgattttgaaaattggatttaacatgttgtaggttt 33913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 49; Significance: 8e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 46 - 158
Target Start/End: Original strand, 75024 - 75134
Alignment:
Q  46 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||  ||| ||||| | ||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||    
T  75024 ttaaggtaagggtgggactaacattcaatcttcttaagcatattattcttataattagatttaacatgttgtaggtttag-ttttgagaatttg-gaatt 75121  T
Q  146 agggttaagagtg 158  Q
    |||||||| ||||    
T  75122 agggttaaaagtg 75134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0417 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0417
Description:

Target: scaffold0417; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 42 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 586 - 464
Alignment:
Q  42 aatcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgag 141  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |||| |  || ||||| |||  |||  ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||     
T  586 aatcataaggtaagggtgagactaacattcaatcttcttcaacctttgattatgatcattagatttaacatgttgtagggttagtttttgagaattgga- 488  T
Q  142 aattagggttaagagtgatgattg 165  Q
    ||||||||||||||||||| ||||    
T  487 aattagggttaagagtgataattg 464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 46 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 13101 - 13019
Alignment:
Q  46 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagttt 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||| ||||  ||||||||||||| | |||||||||    
T  13101 ttaaggtaagggtgggactaacattcaatcttcttaagcctatgattctgataattagatttaacatgttggaggtttagttt 13019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 47 - 99
Target Start/End: Original strand, 7514 - 7566
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  ||||  ||||| ||||||||||||||    
T  7514 taaggtaagggtgggactaaccttctttaattatgagtatatgattctgaaaa 7566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 9 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 23698 - 23640
Alignment:
Q  9 gagatgaaccaagaggaaaggttgccgatcgttaatcttaaggtaagggtgggactaac 67  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23698 gagaagaaccaagaggaaaggctgccgatcgttaatcttaaggtaagggtgagactaac 23640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 46 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 42348 - 42266
Alignment:
Q  46 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagttt 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||| ||||  ||||||||||||| | |||||||||    
T  42348 ttaaggtaagggtgggactaacattcaatcttcttaagcctatgattctgataattagatttaacatgttggacgtttagttt 42266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 47 - 165
Target Start/End: Original strand, 16085 - 16203
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatta 146  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||| |||| ||  |||  ||||| || |||||| | ||||||||||| | || ||||||||    
T  16085 taaggtaagggtgagactaacattcaattttcttaagtctataattcggatgattagatttagcaagttgtaggattagtttttgaaagttggagaatta 16184  T
Q  147 gggttaagagtgatgattg 165  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  16185 gggttaagagtgataattg 16203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 47 - 165
Target Start/End: Original strand, 25272 - 25390
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatta 146  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  |||| |||| || |||||||  |||  ||||| || |||||| | ||||||||||| | || ||||||||    
T  25272 taaggtaagggtgagactaacattcaattttcttaagtcgataattctgatgattagatttagcaagttgtaggattagtttttgaaagttggagaatta 25371  T
Q  147 gggttaagagtgatgattg 165  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  25372 gggttaagagtgataattg 25390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0290 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0290
Description:

Target: scaffold0290; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 44 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 1127 - 1042
Alignment:
Q  44 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttt 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||| ||||  ||||||||||||| | ||||| ||||    
T  1127 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaatcttcttaagcctatgattctgataattagatttaacatgttggaggtttaatttt 1042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0065
Description:

Target: scaffold0065; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 9 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 56031 - 55888
Alignment:
Q  9 gagatgaaccaagaggaaaggttgccgatcgttaatcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtattta 108  Q
    |||| ||||||||| || ||| |||| |||| | ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||| | |||||||| |||||| |||||    
T  56031 gagaagaaccaagaagagaggctgccaatcgattatcctaaggtaagggtgagactaaccttcaataattctgagtatgtgattctg-aaattgaattta 55933  T
Q  109 acat-gttgtaagtttagtttttgagaatttgagaattagggttaa 153  Q
    |||| |||||| ||| |  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  55932 acatggttgtaggttaaagtttt-agaatttgagaattagggttaa 55888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 5433 - 5351
Alignment:
Q  32 gccgatcgttaatcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgt 114  Q
    ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||||  | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5433 gccgatcattaattctaaggtaagggtgggactaaccttcactaattctaagtgtatgattctgaaaattgaatttaacatgt 5351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0452 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0452
Description:

Target: scaffold0452; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 90 - 160
Target Start/End: Original strand, 12666 - 12735
Alignment:
Q  90 attctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaattagggttaagagtgat 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||    
T  12666 attctgaaaattgtatttaacatgttgtaggtttag-ttttgaggatttggggattagggttaaaagtgat 12735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 273 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 835 - 725
Alignment:
Q  273 gaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatg 372  Q
    ||||||| ||| ||||  |||| ||||||||||| ||   | |||| |||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  835 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattacgttagctttctaatggctttggtctgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatg 736  T
Q  373 gtcaaattact 383  Q
     ||||||||||    
T  735 atcaaattact 725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 51 - 153
Target Start/End: Original strand, 18857 - 18958
Alignment:
Q  51 gtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaattagggt 150  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||| |||||||  |||  |||||||| |||||| | |||||||||||||||| || |||||||||    
T  18857 gtaagggtgagactaacattcaattttcttaagtctataattctgatgattagatttaacaagttgtaggattagtttttgagaattgga-aattagggt 18955  T
Q  151 taa 153  Q
    |||    
T  18956 taa 18958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 90 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 22106 - 22037
Alignment:
Q  90 attctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaattagggttaagagtgat 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  22106 attctgaaaattgtatttaacatgttgtaggtttag-ttttgaggatttgggaattagagttaaaagtgat 22037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 48 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 7606 - 7506
Alignment:
Q  48 aaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatga-ttctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatta 146  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||  | ||| | | | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  7606 aaggtaagggtgggactagccttcaataattctaagtgttttaattctgaaaaatgtatttaacatgttgtaagtttag-ttttgaggatttgggaatta 7508  T
Q  147 gg 148  Q
    ||    
T  7507 gg 7506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 48 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 30705 - 30593
Alignment:
Q  48 aaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatga-ttctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatta 146  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||  | ||| | | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||    
T  30705 aaggtaagggtgagactaaccttcaataattctaagtgttttaattctgaaaattgtatttaacatgttgtaggtttag-ttttgagaatttggaaatta 30607  T
Q  147 gggttaagagtgat 160  Q
      ||||| ||||||    
T  30606 tagttaaaagtgat 30593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 129
Target Start/End: Original strand, 1048 - 1133
Alignment:
Q  44 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttt 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||  |||  ||||||||||||| | ||||| ||||    
T  1048 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaatcttcttaagcctatgattctgattattagatttaacatgttggaggtttaatttt 1133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 48 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 21746 - 21634
Alignment:
Q  48 aaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatga-ttctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatta 146  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||  | ||| | | | || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||    
T  21746 aaggtaagggtgggactagccttcaataattctaagtgttttaattttgaaaattgtatttaacatgttgtaggtttagttttt-aggatttgggaatta 21648  T
Q  147 gggttaagagtgat 160  Q
     |||||| ||||||    
T  21647 aggttaaaagtgat 21634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 47 - 111
Target Start/End: Original strand, 476 - 540
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaaca 111  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  476 taaggtaagggtgagacgaacattcaatcttcttaagcctatgattctgaaaattgtatttaaca 540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0914 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0914
Description:

Target: scaffold0914; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 2697 - 2614
Alignment:
Q  46 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttt 129  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||| |||||||  |||  |||||||| || ||||||||||||||    
T  2697 ttaaggtaagggtgagactaacattcaatcttcttaagtctataattctgatgattagatttaacaagtcgtaagtttagtttt 2614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0439
Description:

Target: scaffold0439; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 12446 - 12345
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacat-gttgtaagtt-tagtttttgagaatttgagaat 144  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||  |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||| || |||||||||||    
T  12446 taaggtaagggtgagactagcattcaatcttcttaagtctatgattctg-aaattgaatttaacatggttgtaggttgtagttttgga-aatttgagaat 12349  T
Q  145 tagg 148  Q
    ||||    
T  12348 tagg 12345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 153
Target Start/End: Original strand, 10734 - 10867
Alignment:
Q  19 aagaggaaaggttgccgatcgttaatcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacat-gttgt 117  Q
    ||||||| |||  |||||||| | ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| | |||||||| |||||| ||||||||| |||||    
T  10734 aagaggagaggccgccgatcgattatcctaaggtaagggtgggactaaccttcaataattatgagtatgtgattctg-aaattgaatttaacatggttgt 10832  T
Q  118 aagtttagtttttgagaatttgagaattagggttaa 153  Q
    | ||| |  |||| | |||||| |||||||||||||    
T  10833 aggttgaagtttt-ataatttgggaattagggttaa 10867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 313 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 8636 - 8566
Alignment:
Q  313 atgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 383  Q
    |||||| |||||||||| | ||||| |||| || | | ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  8636 atgttagctttctaatggctttggtttgacttctagatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 8566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 8694 - 8623
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgta 118  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||  | ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  8694 taaggtaagggtgggactaaccttcactaattctaagtgtatgattctgaaaattgaatttaacaggttgta 8623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 129
Target Start/End: Original strand, 23123 - 23206
Alignment:
Q  46 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttt 129  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||| || |||||||||||| ||||  ||||||||||||| | ||||| ||||    
T  23123 ttaaggtaagggtgtgactaacattcaatcttcttaagcctatgattctgataattagatttaacatgttggaggtttaatttt 23206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 72482 - 72399
Alignment:
Q  46 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttt 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||| |||||||| ||||   |||||||||||| | ||||||||||    
T  72482 ttaaggtaagggtgggactaacattcaatcttcttaagcctacgattctgataattaggtttaacatgttggaggtttagtttt 72399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 333289 - 333183
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttag-tttttgagaatttgagaatt 145  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||| |||||||  |||  |||||||| |||||| | |||| |||||||||||| || ||||    
T  333289 taaggtaagggtgagactaacattcaattttcttaagtctataattctgatgattagatttaacaagttgtaggattagttttttgagaattgga-aatt 333191  T
Q  146 agggttaa 153  Q
    ||||||||    
T  333190 agggttaa 333183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1128 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold1128
Description:

Target: scaffold1128; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 46 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 550 - 445
Alignment:
Q  46 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtt-tagtttttgagaatttgagaat 144  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| | ||||| ||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||   || |||| ||||    
T  550 ttaaggtaagggtgagactatcattcagtgatcttaagtctataattctg-aaattggatttaacatgttgtaggttatagttttgaggattttgggaat 452  T
Q  145 tagggtt 151  Q
    |||||||    
T  451 tagggtt 445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0347 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0347
Description:

Target: scaffold0347; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 46 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 9854 - 9747
Alignment:
Q  46 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagttttt--gagaatttgagaa 143  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||| || ||||||||||||  |||  |||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||| ||    
T  9854 ttaaggtaagggtgagactaacattcaatcttcttaagcctatgattctgatgattagatttaacatg-tgtaggtttagttttttggagaatttga-aa 9757  T
Q  144 ttagggttaa 153  Q
    ||||| ||||    
T  9756 ttaggtttaa 9747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0308 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0308
Description:

Target: scaffold0308; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 47 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 13492 - 13386
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatta 146  Q
    |||||||||| || ||||||| || ||| ||  | ||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| |  ||||| ||||||| ||||||    
T  13492 taaggtaaggatgtgactaacctttaatcattctcagtatatgattctgaaaattgaatttaacaagttgtaggttgaagttttgggaatttgggaatta 13393  T
Q  147 gggttaa 153  Q
    |||||||    
T  13392 gggttaa 13386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000007; HSPs: 3)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 313 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 30540 - 30470
Alignment:
Q  313 atgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 383  Q
    |||||| |||||||||| | ||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  30540 atgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 30470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 85
Target Start/End: Original strand, 51328 - 51366
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtc 85  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  51328 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttaagtc 51366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 46 - 74
Target Start/End: Original strand, 13551 - 13579
Alignment:
Q  46 ttaaggtaagggtgggactaacattcaat 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13551 ttaaggtaagggtgggactaacattcaat 13579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 19 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 68377 - 68299
Alignment:
Q  19 aagaggaaaggttgccgatcgttaatcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaa 97  Q
    |||||||| || || |||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| | ||||||||||    
T  68377 aagaggaagggctgtcgatcgattatcttaaggtaagggtgggactaaccttcaataattctgagtatgtgattctgaa 68299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 47 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 209912 - 209804
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatta 146  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||| |||||| |||||| ||||||||   ||||||||  ||| |||   ||||||||||||    
T  209912 taaggtaagggtgggactatcattcagtgatcttaagtctataattctg-aaattggatttaaca---tgtaagtt--gttcttg---atttgagaatta 209822  T
Q  147 gggttaagagtgatgatt 164  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  209821 gggttaaaagtgatgatt 209804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 46 - 132
Target Start/End: Original strand, 37282 - 37367
Alignment:
Q  46 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttga 132  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||| || ||||||||||||  |||  |||||||||| |||| |||||||||||||    
T  37282 ttaaggtaagggtgagactaacattcaatcttcttaagcctatgattctgatgattagatttaacatg-tgtaggtttagtttttga 37367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 90 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 126799 - 126737
Alignment:
Q  90 attctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaattagggttaa 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| | ||| |||||||||||||    
T  126799 attctgaaaattgtatttaacatgttgcaggtttag-ttttgaggacttgggaattagggttaa 126737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 47 - 152
Target Start/End: Original strand, 135504 - 135609
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtt-tagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||  | ||| ||| ||||||||||||| |||||||| |||||| ||| ||| ||||| ||||||| |||||    
T  135504 taaggtaagggtgggactaaccttcactaattctaagtgtataattctgaaaattgaatttaacaggttgtaggttgtag-ttttgggaatttgggaatt 135602  T
Q  146 agggtta 152  Q
    || ||||    
T  135603 agagtta 135609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0877 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0877
Description:

Target: scaffold0877; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 46 - 115
Target Start/End: Original strand, 2027 - 2096
Alignment:
Q  46 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgtt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||  ||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  2027 ttaaggtaagggtgggactaacattcaatcttcttaagcttatgattctgataattagatttaacatgtt 2096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0848 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0848
Description:

Target: scaffold0848; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 148
Target Start/End: Original strand, 1982 - 2122
Alignment:
Q  9 gagatgaaccaagaggaaaggttgccgatcgttaatc-ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtattt 107  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| ||||| |  |  ||||| ||||||||||| |||| |||| ||||  | ||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  1982 gagaagaaccaagaggaaaggctgctgatcgattttgattaagctaagggtgggattaaccttcactaattctaagtgtatgattttgaaaattgaattt 2081  T
Q  108 aacatgttgtaagtt-tagtttttgagaatttgagaattagg 148  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| || |||||| ||||||||    
T  2082 aacatgttgtaggttgtagttttgga-aatttgggaattagg 2122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 165
Target Start/End: Original strand, 54809 - 54929
Alignment:
Q  44 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaa 143  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||    || | ||| |||  |||  |||||||| |||||| | |||||||||||||||| || ||    
T  54809 tcttaaggtaagagtgggactaacattcaatcttcttatacctttaattatgatgattagatttaacaagttgtagggttagtttttgagaattgga-aa 54907  T
Q  144 ttagggttaagagtgatgattg 165  Q
    ||||||||||||||||| ||||    
T  54908 ttagggttaagagtgataattg 54929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 83048 - 82967
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagttt 128  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  |||| || |||||||||| | ||||  ||||||||||||| | |||||||||    
T  83048 taaggtaagggtgggattaacattcaatcttcttaagcctatgattctaataattagatttaacatgttggaggtttagttt 82967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 44 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 81622 - 81518
Alignment:
Q  44 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtt-tagtttttgagaatttgaga 142  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||  | | |  |||||||| ||||||| |||||||| |||||| ||| ||| ||||| ||||||| ||    
T  81622 tcttaaggtaagggtgggactaaccttcactaattctaaatggatgattctaaaaattgaatttaacaggttgtaggttgtag-ttttgggaatttggga 81524  T
Q  143 attagg 148  Q
    ||||||    
T  81523 attagg 81518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 351 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 28186 - 28142
Alignment:
Q  351 gatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  28186 gatttatagaacttgagttatagtcaaattacttcacgtaggtca 28142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0959 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0959
Description:

Target: scaffold0959; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 308 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 1306 - 1219
Alignment:
Q  308 tatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 395  Q
    |||||||||||| |||||||||   ||||||| || |||||| | ||| || ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||    
T  1306 tatggatgttatatttctaatggatttggtctcacttcaaaatgttttctaaaacttgatttatggtcaaattactacacataggtca 1219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 4233 - 4093
Alignment:
Q  31 tgccgatcgttaatcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatg-ttgtaagtttagtttt 129  Q
    |||||||||| |||| |||||||| |||| ||||||| ||||||| |  | ||| | ||||||||||| ||  |||||||||| ||||| ||| | ||||    
T  4233 tgccgatcgtgaatcctaaggtaaaggtgagactaaccttcaatacttctaagtatgtgattctgaaa-ttcaatttaacatggttgtaggttgaatttt 4135  T
Q  130 tgagaatttgagaattagggttaagagtgatgattgtgatgatt 173  Q
    | || ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  4134 t-aggatttgagaattagggttaaaagtgaggatt-tgatgatt 4093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 46 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 58786 - 58677
Alignment:
Q  46 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  | || ||||||||||||||   |||  |||||||| |||| | | |||||||| ||||||| || | ||    
T  58786 ttaaggtaagggtgagactaacattcaattttattaagtctatgattctg---attagatttaacaagttgaaggattagttttggagaattgga-attt 58691  T
Q  146 agggttaagagtga 159  Q
    ||||||||||||||    
T  58690 agggttaagagtga 58677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1404 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1404
Description:

Target: scaffold1404; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 1444 - 1347
Alignment:
Q  314 tgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaagcgaatttttatgaa 412  Q
    ||||| |||||||||| | ||||| ||||||| ||| || || |||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| |  |||||||||||||    
T  1444 tgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgagttttagaacttgagttatgatcaaattactacacatgggtcata-tgaatttttatgaa 1347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 313 - 383
Target Start/End: Original strand, 6235 - 6305
Alignment:
Q  313 atgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 383  Q
    |||||| |||||||||| | ||||| |||| || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  6235 atgttagctttctaatggctttggtttgacttctaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 6305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 152
Target Start/End: Original strand, 35464 - 35569
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtt-tagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    |||||||||| |||||||||| || | ||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||| ||| ||||| ||||||| |||||    
T  35464 taaggtaaggatgggactaacctttattaattctgagtatatgattctgaaaattgaatttaacaacttgtaggttgtag-ttttgggaatttgggaatt 35562  T
Q  146 agggtta 152  Q
    | |||||    
T  35563 aaggtta 35569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 47 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 1126 - 1045
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagttt 128  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  |||| || |||||||||| | ||||  ||||||||||||  | |||||||||    
T  1126 taaggtaagggtgagactaacattcaatcttcttaagcctatgattctaataattagatttaacatgttagaggtttagttt 1045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0577 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0577
Description:

Target: scaffold0577; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 47 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 9111 - 9008
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtt-tagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||| | | |||||| ||| || |||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  9111 taaggtaagggtgggactaaccttcagtaattctgagtatgtaattctg-aaactggatttaacaggttgtaggttgtagtttttg-gaatttgggaatt 9014  T
Q  146 agggtt 151  Q
    ||||||    
T  9013 agggtt 9008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 14038 - 13983
Alignment:
Q  9 gagatgaaccaagaggaaaggttgccgatcgttaatcttaaggtaagggtgggacta 65  Q
    |||| ||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14038 gagaagaaccaagaagagaggctgccgatcgttaatc-taaggtaagggtgggacta 13983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 315 - 383
Target Start/End: Original strand, 32148 - 32216
Alignment:
Q  315 gttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 383  Q
    |||| |||||||||| | ||||| | ||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  32148 gttagctttctaatggctttggtttaacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 32216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0153 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0153
Description:

Target: scaffold0153; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 5349 - 5255
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacat-gttgtaagtttagtttttgagaatttgaga 142  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| | |||||||||| | || ||||||||| |||||| ||| || |||| |||||||||||    
T  5349 taaggtaagggtgggactaaccttcaataattatgagtatgtgattctgaaga-tgaatttaacatggttgtaggttgaggtttt-agaatttgaga 5255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0153; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 12369 - 12275
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacat-gttgtaagtttagtttttgagaatttgaga 142  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| | |||||||||| | || ||||||||| |||||| ||| || |||| |||||||||||    
T  12369 taaggtaagggtgggactaaccttcaataattatgagtatgtgattctgaaga-tgaatttaacatggttgtaggttgaggtttt-agaatttgaga 12275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 315 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 40696 - 40628
Alignment:
Q  315 gttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 383  Q
    |||| |||||||||| | ||||| | ||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  40696 gttagctttctaatggctttggtttaacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 40628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0457 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0457
Description:

Target: scaffold0457; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 98
Target Start/End: Original strand, 10898 - 10949
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaa 98  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||| |||||||||    
T  10898 taaggtaagggtgggactatcattcagtgatcttaagtctataattctgaaa 10949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 383
Target Start/End: Original strand, 12519 - 12590
Alignment:
Q  312 gatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 383  Q
    ||||||| |||||||||| | ||||  |||| || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  12519 gatgttagctttctaatggctttgggttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 12590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 118
Target Start/End: Original strand, 20086 - 20157
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgta 118  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| ||||  | ||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  20086 taaggtaagggcgggactaaccttcactaattctaagtgtataattctgaaaattgaatttaacaggttgta 20157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 22229 - 22163
Alignment:
Q  46 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatg 113  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||| | |||||||| |||||| ||||||||||    
T  22229 ttaaggtaagggtgagactaaccttcaataattctgagtatgtgattctg-aaattgaatttaacatg 22163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 46 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 10153 - 10103
Alignment:
Q  46 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctga 96  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| | |||||||||    
T  10153 ttaaggtaagggtgagactaaccttcaataattttgagtatgtgattctga 10103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0301 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0301
Description:

Target: scaffold0301; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 47 - 97
Target Start/End: Original strand, 11322 - 11372
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaa 97  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||| ||||||||    
T  11322 taaggtaagggtgggactatcattcagtgatcttaagtctataattctgaa 11372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0301; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 47 - 97
Target Start/End: Original strand, 15722 - 15772
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaa 97  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||| ||||||||    
T  15722 taaggtaagggtgggactatcattcagtgatcttaagtctataattctgaa 15772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 321 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 28531 - 28469
Alignment:
Q  321 tttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 383  Q
    ||||||||| | ||||| ||||||| ||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||    
T  28531 tttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttataacttgagttatgatcaaattact 28469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 47 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 4082 - 4012
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgt 117  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||  |||| || |||||||| ||| ||||  ||||||||||||||    
T  4082 taaggtaagggtgagactaacatttaatcttcttaagcctatgattatgataattagatttaacatgttgt 4012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 313 - 383
Target Start/End: Original strand, 19939 - 20009
Alignment:
Q  313 atgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 383  Q
    |||||| ||||| |||| | ||||| ||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  19939 atgttagctttccaatggctttggtttgaagtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 20009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0853 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0853
Description:

Target: scaffold0853; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 165
Target Start/End: Original strand, 9 - 68
Alignment:
Q  104 atttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaattagggttaagagtgatgattg 165  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| ||||    
T  9 atttaacaagttgtaggtttagtttt-gagaattgga-aattagggttaagagtgataattg 68  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0750 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0750
Description:

Target: scaffold0750; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 4590 - 4479
Alignment:
Q  46 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaatt 145  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||  |||| ||  ||| |||||||  |||  |||||||| |||||| |||| | ||||||||||| || ||||    
T  4590 ttaaggtaagggtcagactaacattcaattttcttaagcttataattctgatgattagatttaacaagttgtaggttttg-ttttgagaattgga-aatt 4493  T
Q  146 agggttaagagtga 159  Q
    || |||||||||||    
T  4492 agtgttaagagtga 4479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0315
Description:

Target: scaffold0315; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 18274 - 18205
Alignment:
Q  314 tgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 383  Q
    ||||| |||||||||| | ||||| ||| ||| ||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||    
T  18274 tgttagctttctaatggctttggtttgaggtccaaatgatttttataacttgagttatgatcaaattact 18205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 32101 - 32048
Alignment:
Q  46 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaa 99  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||  ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  32101 ttaaggtaagggtggggctaaccttctttaatcatgagtatatgattctgaaaa 32048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 157
Target Start/End: Original strand, 4001 - 4111
Alignment:
Q  44 tcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgtaagtttagtttttgagaatttgagaa 143  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||   ||||||||||   || ||||||||||| ||| || |||| |||| |||||| || ||    
T  4001 tcttaaggtaagggtgagactaacattcaattctcttaagctgatgattctgatggttatatttaacatg-tgt-aggttag-ttttaagaattggaaaa 4097  T
Q  144 ttagggttaagagt 157  Q
    ||||||||||||||    
T  4098 ttagggttaagagt 4111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 148
Target Start/End: Original strand, 22471 - 22599
Alignment:
Q  19 aagaggaaaggttgccgatcgttaatcttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaattgtatttaacatgttgta 118  Q
    |||||||| || ||||||||| | ||  ||||||||||||| ||||| ||| ||||  | || ||||| | |||||||   || ||||||||| || |||    
T  22471 aagaggaagggctgccgatcgattattctaaggtaagggtgagactagcatgcaatcctattaagtctgtaattctgatggttttatttaacaagt-gta 22569  T
Q  119 agtttagtttttgagaatttgagaattagg 148  Q
     | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  22570 gggttagttttagagaatttgagaattagg 22599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1800 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold1800
Description:

Target: scaffold1800; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 47 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 659 - 607
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  659 taaggtaagggtgggactaaccttctttaatcatgagtctataattcttaaaa 607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1102 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold1102
Description:

Target: scaffold1102; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 47 - 99
Target Start/End: Original strand, 1951 - 2003
Alignment:
Q  47 taaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaaa 99  Q
    |||||||| |||||||||||| |||  ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  1951 taaggtaacggtgggactaaccttctttaatcatgagtctataattctgaaaa 2003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0679 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0679
Description:

Target: scaffold0679; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 46 - 98
Target Start/End: Original strand, 1583 - 1635
Alignment:
Q  46 ttaaggtaagggtgggactaacattcaataatcttgagtctatgattctgaaa 98  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| | ||||| |||||||||    
T  1583 ttaaggtaagggtgagactatcattcaatgatcttaaatctataattctgaaa 1635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 321 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 15840 - 15780
Alignment:
Q  321 tttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaatta 381  Q
    ||||||||| | ||||| |||| || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  15840 tttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaatta 15780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University