View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5900-Insertion-2 (Length: 1060)

Name: NF5900-Insertion-2
Description: NF5900
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5900-Insertion-2
NF5900-Insertion-2
[»] chr1 (59 HSPs)
chr1 (407-1060)||(1974796-1975448)
chr1 (407-1057)||(1982159-1982814)
chr1 (409-1057)||(1989577-1990230)
chr1 (465-1057)||(41207892-41208503)
chr1 (749-1060)||(52955380-52955689)
chr1 (407-555)||(34822355-34822503)
chr1 (409-573)||(1186980-1187144)
chr1 (409-573)||(22960214-22960378)
chr1 (407-573)||(42033524-42033690)
chr1 (407-535)||(21457869-21457997)
chr1 (406-573)||(16154214-16154381)
chr1 (409-571)||(21782030-21782192)
chr1 (408-573)||(2370969-2371134)
chr1 (409-573)||(22406830-22406994)
chr1 (408-573)||(12418170-12418336)
chr1 (408-573)||(2115333-2115499)
chr1 (408-573)||(20328954-20329120)
chr1 (408-530)||(25018802-25018924)
chr1 (407-573)||(20311619-20311786)
chr1 (409-572)||(21822023-21822186)
chr1 (409-573)||(20308142-20308307)
chr1 (409-510)||(26194078-26194179)
chr1 (409-573)||(27065408-27065573)
chr1 (406-535)||(37011343-37011472)
chr1 (409-573)||(18097508-18097672)
chr1 (411-534)||(41544723-41544846)
chr1 (409-535)||(8539585-8539711)
chr1 (409-535)||(8604824-8604950)
chr1 (409-510)||(4950355-4950456)
chr1 (409-573)||(25867587-25867752)
chr1 (406-573)||(13964228-13964395)
chr1 (411-534)||(50940496-50940618)
chr1 (409-534)||(30550206-30550332)
chr1 (409-534)||(1968679-1968804)
chr1 (696-873)||(13403943-13404121)
chr1 (752-970)||(34822706-34822915)
chr1 (409-525)||(30209518-30209634)
chr1 (406-488)||(20585210-20585292)
chr1 (803-981)||(1186580-1186750)
chr1 (408-496)||(18381418-18381506)
chr1 (409-534)||(2653074-2653200)
chr1 (803-981)||(21458358-21458529)
chr1 (809-979)||(22956292-22956454)
chr1 (408-525)||(2371533-2371650)
chr1 (803-981)||(16154613-16154784)
chr1 (803-981)||(25019198-25019369)
chr1 (890-981)||(2115810-2115901)
chr1 (890-981)||(21886123-21886214)
chr1 (464-510)||(21885703-21885749)
chr1 (904-981)||(8540075-8540152)
chr1 (904-981)||(18383185-18383262)
chr1 (904-981)||(41544270-41544347)
chr1 (890-981)||(30549765-30549856)
chr1 (904-981)||(18062380-18062457)
chr1 (752-926)||(30210492-30210665)
chr1 (752-839)||(18062516-18062600)
chr1 (696-879)||(19868880-19869065)
chr1 (912-981)||(8605322-8605391)
chr1 (752-839)||(21782371-21782455)
[»] chr4 (74 HSPs)
chr4 (408-1060)||(522309-522960)
chr4 (409-1060)||(17421413-17422062)
chr4 (409-1060)||(26457675-26458325)
chr4 (544-1059)||(30651025-30651537)
chr4 (544-1059)||(16057689-16058220)
chr4 (407-573)||(6406391-6406557)
chr4 (409-573)||(7847339-7847504)
chr4 (408-573)||(18106077-18106242)
chr4 (408-573)||(44888075-44888240)
chr4 (407-573)||(1292685-1292851)
chr4 (407-573)||(3488495-3488662)
chr4 (407-573)||(5294003-5294170)
chr4 (407-573)||(21854722-21854889)
chr4 (407-573)||(21910585-21910752)
chr4 (407-573)||(27681665-27681832)
chr4 (407-573)||(27691276-27691443)
chr4 (409-573)||(11476422-11476587)
chr4 (407-573)||(17985435-17985601)
chr4 (408-573)||(21845294-21845460)
chr4 (408-573)||(21901157-21901323)
chr4 (409-573)||(5303617-5303782)
chr4 (409-573)||(16471979-16472143)
chr4 (407-573)||(17829142-17829309)
chr4 (409-573)||(40921027-40921191)
chr4 (408-573)||(17838533-17838699)
chr4 (408-573)||(2828879-2829045)
chr4 (408-573)||(16248385-16248551)
chr4 (407-553)||(26330558-26330704)
chr4 (409-573)||(3497762-3497927)
chr4 (409-573)||(12865667-12865832)
chr4 (408-573)||(52498464-52498629)
chr4 (407-573)||(6691315-6691482)
chr4 (407-573)||(6701721-6701888)
chr4 (409-573)||(16252746-16252911)
chr4 (409-573)||(16628840-16629006)
chr4 (972-1059)||(41525986-41526072)
chr4 (409-573)||(3606608-3606773)
chr4 (432-573)||(9836609-9836750)
chr4 (409-510)||(14601327-14601428)
chr4 (409-573)||(17160573-17160737)
chr4 (407-534)||(15668520-15668647)
chr4 (753-968)||(41525532-41525745)
chr4 (405-573)||(4417024-4417199)
chr4 (409-510)||(13403648-13403751)
chr4 (804-981)||(9836227-9836397)
chr4 (904-981)||(6405991-6406068)
chr4 (803-981)||(6691948-6692119)
chr4 (803-981)||(6702354-6702525)
chr4 (803-981)||(21845833-21846004)
chr4 (803-981)||(21855425-21855596)
chr4 (803-981)||(21901696-21901867)
chr4 (803-981)||(21911288-21911459)
chr4 (803-981)||(40921573-40921744)
chr4 (803-981)||(5293256-5293427)
chr4 (803-981)||(5302915-5303086)
chr4 (803-981)||(16249176-16249347)
chr4 (803-981)||(16253142-16253313)
chr4 (803-981)||(27680919-27681090)
chr4 (803-981)||(27690574-27690745)
chr4 (890-981)||(3487790-3487881)
chr4 (890-981)||(3497113-3497204)
chr4 (904-979)||(13793229-13793304)
chr4 (890-981)||(15668997-15669088)
chr4 (890-981)||(16241871-16241962)
chr4 (890-981)||(17985032-17985123)
chr4 (890-981)||(18105583-18105674)
chr4 (413-523)||(40883821-40883931)
chr4 (904-981)||(13403204-13403281)
chr4 (904-981)||(26331049-26331126)
chr4 (895-981)||(17161053-17161139)
chr4 (904-966)||(52498955-52499017)
chr4 (895-969)||(19917980-19918054)
chr4 (904-981)||(11476745-11476822)
chr4 (409-473)||(16241630-16241695)
[»] scaffold0764 (1 HSPs)
scaffold0764 (407-1060)||(891-1543)
[»] scaffold0313 (2 HSPs)
scaffold0313 (407-1060)||(5066-5718)
scaffold0313 (407-1060)||(19223-19875)
[»] chr6 (55 HSPs)
chr6 (408-1060)||(34764655-34765306)
chr6 (409-1054)||(8563338-8563965)
chr6 (544-1049)||(22223693-22224198)
chr6 (544-1049)||(22249528-22250033)
chr6 (417-917)||(24370554-24371033)
chr6 (411-589)||(24692168-24692346)
chr6 (913-1060)||(24361785-24361931)
chr6 (696-964)||(9761632-9761901)
chr6 (408-573)||(27788129-27788294)
chr6 (408-573)||(12454295-12454460)
chr6 (409-573)||(20911635-20911799)
chr6 (409-573)||(23777803-23777967)
chr6 (409-573)||(24931599-24931763)
chr6 (407-573)||(1595762-1595929)
chr6 (408-535)||(14790936-14791063)
chr6 (407-573)||(24922563-24922729)
chr6 (408-573)||(26021763-26021929)
chr6 (409-573)||(18159061-18159225)
chr6 (409-573)||(26425888-26426052)
chr6 (407-535)||(31366529-31366657)
chr6 (407-573)||(16897006-16897173)
chr6 (407-573)||(16907659-16907826)
chr6 (407-532)||(18168877-18169002)
chr6 (407-535)||(3285178-3285306)
chr6 (409-573)||(20926083-20926247)
chr6 (411-535)||(31356805-31356929)
chr6 (409-573)||(12991135-12991301)
chr6 (407-553)||(18200604-18200750)
chr6 (409-573)||(24505987-24506152)
chr6 (421-646)||(9761968-9762193)
chr6 (408-510)||(18712831-18712933)
chr6 (408-568)||(7756021-7756182)
chr6 (409-510)||(17823419-17823520)
chr6 (409-573)||(29539792-29539956)
chr6 (407-573)||(30658722-30658888)
chr6 (752-981)||(27787728-27787948)
chr6 (409-510)||(16320618-16320719)
chr6 (409-557)||(16922896-16923045)
chr6 (406-507)||(26161229-26161325)
chr6 (803-981)||(12454783-12454954)
chr6 (895-981)||(16897761-16897847)
chr6 (895-981)||(16908414-16908500)
chr6 (803-981)||(20912012-20912183)
chr6 (864-981)||(24922160-24922277)
chr6 (864-981)||(24931196-24931313)
chr6 (890-981)||(3285655-3285746)
chr6 (972-1059)||(19360878-19360964)
chr6 (864-981)||(18159845-18159962)
chr6 (864-981)||(18169657-18169774)
chr6 (904-981)||(29540281-29540358)
chr6 (803-981)||(31357290-31357461)
chr6 (803-981)||(31367018-31367189)
chr6 (890-966)||(14791413-14791489)
chr6 (339-410)||(32013018-32013089)
chr6 (893-930)||(28092396-28092433)
[»] chr7 (74 HSPs)
chr7 (408-1060)||(31824048-31824699)
chr7 (409-1060)||(5615587-5616237)
chr7 (411-1060)||(13285875-13286518)
chr7 (409-1059)||(41026870-41027520)
chr7 (408-1060)||(42594681-42595334)
chr7 (409-1059)||(12827451-12828098)
chr7 (769-1060)||(25441775-25442065)
chr7 (562-1059)||(15988761-15989258)
chr7 (407-703)||(25441478-25441774)
chr7 (406-967)||(33090509-33091079)
chr7 (696-968)||(40701540-40701813)
chr7 (411-573)||(14114646-14114808)
chr7 (411-573)||(14424296-14424458)
chr7 (407-573)||(32097712-32097878)
chr7 (409-573)||(9546087-9546251)
chr7 (407-573)||(9535804-9535970)
chr7 (407-573)||(2992478-2992644)
chr7 (407-573)||(32108149-32108315)
chr7 (408-573)||(43982434-43982600)
chr7 (407-573)||(46506836-46507002)
chr7 (408-573)||(46496225-46496390)
chr7 (407-573)||(5382552-5382719)
chr7 (407-573)||(8510534-8510701)
chr7 (407-573)||(11627202-11627369)
chr7 (408-535)||(10414788-10414915)
chr7 (409-573)||(5392206-5392371)
chr7 (409-573)||(8500066-8500231)
chr7 (407-573)||(16132625-16132791)
chr7 (409-573)||(26363953-26364118)
chr7 (409-573)||(16143189-16143353)
chr7 (407-573)||(26348933-26349100)
chr7 (407-573)||(44906855-44907022)
chr7 (407-573)||(6543964-6544131)
chr7 (408-570)||(14249106-14249268)
chr7 (408-510)||(24541521-24541623)
chr7 (409-573)||(27987822-27987988)
chr7 (409-573)||(44896506-44896671)
chr7 (409-573)||(5926016-5926181)
chr7 (409-510)||(45552530-45552631)
chr7 (409-573)||(6533667-6533832)
chr7 (409-535)||(19585084-19585211)
chr7 (409-535)||(19799035-19799162)
chr7 (408-573)||(42620512-42620678)
chr7 (407-523)||(40701274-40701391)
chr7 (408-510)||(14943644-14943746)
chr7 (408-510)||(15371237-15371339)
chr7 (803-981)||(5381976-5382147)
chr7 (803-981)||(5391614-5391785)
chr7 (803-981)||(5926865-5927036)
chr7 (803-981)||(6544535-6544706)
chr7 (803-981)||(8500779-8500950)
chr7 (803-981)||(8511249-8511420)
chr7 (406-510)||(12769446-12769551)
chr7 (803-981)||(46496844-46497015)
chr7 (803-981)||(46507456-46507627)
chr7 (864-981)||(6534290-6534407)
chr7 (803-981)||(11626525-11626696)
chr7 (803-981)||(26348310-26348481)
chr7 (803-981)||(43983207-43983378)
chr7 (864-981)||(44897101-44897218)
chr7 (864-981)||(44907504-44907621)
chr7 (890-981)||(9535401-9535492)
chr7 (890-981)||(9545684-9545775)
chr7 (890-981)||(16132075-16132166)
chr7 (890-981)||(16142624-16142715)
chr7 (890-981)||(42620989-42621080)
chr7 (752-966)||(9006586-9006791)
chr7 (464-510)||(22964879-22964925)
chr7 (803-966)||(26363360-26363516)
chr7 (904-981)||(2992076-2992153)
chr7 (904-981)||(14944131-14944208)
chr7 (904-981)||(15371724-15371801)
chr7 (803-981)||(32098110-32098281)
chr7 (803-981)||(32108547-32108718)
[»] chr5 (59 HSPs)
chr5 (407-1057)||(20957507-20958156)
chr5 (409-1057)||(20947120-20947767)
chr5 (409-1059)||(19548561-19549212)
chr5 (547-1060)||(36315826-36316339)
chr5 (407-573)||(33948806-33948972)
chr5 (409-573)||(33938408-33938572)
chr5 (407-573)||(26192773-26192939)
chr5 (409-573)||(22174084-22174249)
chr5 (408-573)||(32069773-32069938)
chr5 (409-573)||(26203333-26203497)
chr5 (407-573)||(21761796-21761963)
chr5 (411-573)||(23379149-23379311)
chr5 (409-571)||(20896260-20896422)
chr5 (408-573)||(21680846-21681012)
chr5 (408-573)||(37816886-37817052)
chr5 (409-573)||(4038762-4038927)
chr5 (409-573)||(21752375-21752540)
chr5 (409-573)||(27274963-27275128)
chr5 (407-573)||(18389404-18389571)
chr5 (409-572)||(20905318-20905481)
chr5 (409-553)||(22240346-22240490)
chr5 (409-573)||(27411482-27411646)
chr5 (407-573)||(30944628-30944795)
chr5 (407-573)||(8766279-8766446)
chr5 (405-532)||(11411775-11411902)
chr5 (407-573)||(18210657-18210824)
chr5 (407-573)||(31916118-31916285)
chr5 (409-573)||(18360406-18360571)
chr5 (408-510)||(20763667-20763769)
chr5 (409-573)||(30954050-30954215)
chr5 (409-573)||(13572494-13572659)
chr5 (409-573)||(37549403-37549568)
chr5 (409-573)||(37652201-37652366)
chr5 (409-573)||(18220007-18220172)
chr5 (409-573)||(19889124-19889289)
chr5 (409-509)||(42091369-42091469)
chr5 (409-573)||(37299613-37299778)
chr5 (408-510)||(34131293-34131395)
chr5 (803-981)||(18361007-18361178)
chr5 (803-981)||(21753173-21753344)
chr5 (803-981)||(21762460-21762631)
chr5 (803-981)||(26192161-26192332)
chr5 (803-981)||(26202765-26202936)
chr5 (904-981)||(31105236-31105313)
chr5 (803-981)||(33939047-33939218)
chr5 (803-981)||(33949447-33949618)
chr5 (864-981)||(8765525-8765642)
chr5 (864-981)||(11411269-11411386)
chr5 (803-981)||(18389964-18390135)
chr5 (803-981)||(27411878-27412049)
chr5 (803-981)||(32070170-32070341)
chr5 (408-476)||(15240546-15240614)
chr5 (473-573)||(206261-206362)
chr5 (904-981)||(22244538-22244615)
chr5 (904-981)||(23378743-23378820)
chr5 (408-476)||(15240685-15240753)
chr5 (906-981)||(21484194-21484269)
chr5 (409-460)||(35985567-35985619)
chr5 (696-837)||(31105036-31105175)
[»] chr2 (61 HSPs)
chr2 (407-1057)||(27160026-27160675)
chr2 (407-1057)||(27170395-27171044)
chr2 (407-1059)||(22908876-22909529)
chr2 (411-1059)||(22901414-22902060)
chr2 (409-1059)||(19341624-19342259)
chr2 (407-1059)||(23721266-23721889)
chr2 (418-968)||(40409214-40409761)
chr2 (409-628)||(15479268-15479487)
chr2 (441-745)||(16135532-16135833)
chr2 (408-573)||(44639478-44639643)
chr2 (409-573)||(24697065-24697229)
chr2 (407-573)||(4456154-4456321)
chr2 (409-570)||(15940024-15940186)
chr2 (409-571)||(38958301-38958463)
chr2 (408-573)||(2999269-2999434)
chr2 (409-573)||(17488024-17488188)
chr2 (409-573)||(45014066-45014230)
chr2 (407-573)||(4457218-4457385)
chr2 (407-573)||(4466843-4467010)
chr2 (407-573)||(5337948-5338115)
chr2 (408-573)||(5347844-5348010)
chr2 (408-573)||(16934860-16935026)
chr2 (408-573)||(17005520-17005686)
chr2 (409-573)||(32937982-32938147)
chr2 (709-820)||(15475617-15475729)
chr2 (407-573)||(18662419-18662586)
chr2 (409-573)||(29131552-29131716)
chr2 (408-573)||(9503567-9503733)
chr2 (408-573)||(9514933-9515099)
chr2 (406-484)||(18495833-18495911)
chr2 (407-573)||(45024141-45024307)
chr2 (408-573)||(38930963-38931128)
chr2 (407-573)||(18660678-18660845)
chr2 (407-573)||(22688254-22688421)
chr2 (409-510)||(45190096-45190197)
chr2 (434-573)||(24239713-24239852)
chr2 (409-510)||(573568-573669)
chr2 (409-573)||(3606493-3606657)
chr2 (406-573)||(12569890-12570058)
chr2 (409-573)||(18650351-18650516)
chr2 (652-713)||(15479203-15479264)
chr2 (803-981)||(18650948-18651119)
chr2 (803-981)||(18663066-18663237)
chr2 (890-981)||(24696663-24696754)
chr2 (803-981)||(2998775-2998946)
chr2 (803-981)||(4457925-4458096)
chr2 (803-981)||(4467550-4467721)
chr2 (803-981)||(5337213-5337384)
chr2 (803-981)||(5347066-5347237)
chr2 (864-981)||(9502839-9502956)
chr2 (864-981)||(9514205-9514322)
chr2 (803-981)||(17488420-17488591)
chr2 (803-981)||(45014462-45014633)
chr2 (803-981)||(45024539-45024710)
chr2 (407-480)||(18618827-18618901)
chr2 (904-981)||(29423189-29423266)
chr2 (904-968)||(72307-72371)
chr2 (432-508)||(28460989-28461065)
chr2 (907-981)||(38930560-38930634)
chr2 (895-981)||(38957896-38957982)
chr2 (346-405)||(40001878-40001938)
[»] chr8 (42 HSPs)
chr8 (409-1059)||(14436701-14437351)
chr8 (409-1057)||(26362454-26363082)
chr8 (411-923)||(12841725-12842235)
chr8 (409-604)||(37295289-37295484)
chr8 (660-964)||(18536171-18536475)
chr8 (756-967)||(37295552-37295763)
chr8 (408-573)||(5867956-5868121)
chr8 (408-573)||(2690856-2691022)
chr8 (752-968)||(5867563-5867770)
chr8 (408-573)||(20098148-20098313)
chr8 (409-573)||(17268176-17268340)
chr8 (411-573)||(5758713-5758876)
chr8 (408-573)||(14894695-14894861)
chr8 (408-534)||(21446763-21446889)
chr8 (407-573)||(21988580-21988746)
chr8 (409-573)||(32008382-32008547)
chr8 (409-573)||(25034631-25034795)
chr8 (407-573)||(9325824-9325991)
chr8 (407-573)||(14882329-14882496)
chr8 (407-573)||(21203657-21203824)
chr8 (407-573)||(21333275-21333442)
chr8 (409-573)||(13673490-13673655)
chr8 (408-573)||(20531905-20532071)
chr8 (409-573)||(21214073-21214238)
chr8 (409-573)||(21998098-21998262)
chr8 (409-535)||(3967328-3967455)
chr8 (407-573)||(31992014-31992181)
chr8 (408-573)||(25506809-25506974)
chr8 (409-573)||(791070-791235)
chr8 (409-573)||(33774705-33774870)
chr8 (408-502)||(20707481-20707576)
chr8 (803-981)||(9325194-9325365)
chr8 (803-981)||(21202972-21203143)
chr8 (803-981)||(21213388-21213559)
chr8 (803-981)||(21334028-21334199)
chr8 (803-981)||(2690450-2690620)
chr8 (410-573)||(7757106-7757262)
chr8 (904-981)||(17268665-17268742)
chr8 (803-981)||(21997632-21997803)
chr8 (890-981)||(791546-791637)
chr8 (890-968)||(37816670-37816748)
chr8 (803-981)||(21988098-21988269)
[»] chr3 (61 HSPs)
chr3 (409-1060)||(49387465-49388096)
chr3 (408-1057)||(24873351-24874001)
chr3 (408-1059)||(24792776-24793428)
chr3 (745-1059)||(17733773-17734088)
chr3 (745-1059)||(19035042-19035357)
chr3 (409-600)||(17732229-17732420)
chr3 (409-600)||(19033460-19033651)
chr3 (669-984)||(21542446-21542760)
chr3 (407-573)||(6421634-6421800)
chr3 (407-573)||(8982655-8982821)
chr3 (631-732)||(17732413-17732514)
chr3 (631-732)||(19033644-19033745)
chr3 (408-573)||(1685884-1686049)
chr3 (409-573)||(8972074-8972238)
chr3 (409-573)||(12804856-12805020)
chr3 (407-573)||(6432074-6432240)
chr3 (409-573)||(2490168-2490333)
chr3 (407-571)||(4380083-4380248)
chr3 (409-573)||(4783589-4783754)
chr3 (409-573)||(10012796-10012960)
chr3 (407-573)||(9536234-9536401)
chr3 (407-573)||(9546656-9546823)
chr3 (409-573)||(16336011-16336175)
chr3 (409-571)||(4370339-4370502)
chr3 (407-573)||(19828852-19829019)
chr3 (409-573)||(5656460-5656625)
chr3 (408-573)||(51979339-51979503)
chr3 (408-573)||(25432193-25432358)
chr3 (407-573)||(12556-12723)
chr3 (409-573)||(18560251-18560417)
chr3 (409-573)||(13120547-13120712)
chr3 (409-573)||(20745641-20745806)
chr3 (406-534)||(4024999-4025127)
chr3 (409-573)||(20491389-20491553)
chr3 (409-535)||(20292463-20292590)
chr3 (407-573)||(55478612-55478782)
chr3 (407-510)||(13113483-13113586)
chr3 (409-502)||(24762868-24762961)
chr3 (450-534)||(11459422-11459505)
chr3 (803-981)||(1685418-1685589)
chr3 (803-981)||(5655793-5655964)
chr3 (803-981)||(8972576-8972747)
chr3 (803-981)||(8983131-8983302)
chr3 (803-981)||(9536865-9537036)
chr3 (803-981)||(9547191-9547362)
chr3 (832-968)||(29709466-29709602)
chr3 (890-981)||(4371187-4371278)
chr3 (890-981)||(4380906-4380997)
chr3 (409-523)||(11044809-11044924)
chr3 (890-981)||(16335608-16335699)
chr3 (410-608)||(21542800-21542998)
chr3 (895-981)||(12154-12240)
chr3 (864-966)||(6422086-6422188)
chr3 (405-483)||(12375920-12375998)
chr3 (904-981)||(55478210-55478287)
chr3 (904-979)||(6432566-6432641)
chr3 (890-981)||(25432669-25432760)
chr3 (803-981)||(10012394-10012565)
chr3 (831-881)||(8435868-8435918)
chr3 (831-881)||(8439413-8439463)
chr3 (904-981)||(20491878-20491955)
[»] scaffold0194 (1 HSPs)
scaffold0194 (8-408)||(5748-6144)
[»] scaffold0059 (1 HSPs)
scaffold0059 (407-1059)||(40684-41336)
[»] scaffold0535 (1 HSPs)
scaffold0535 (578-1054)||(1017-1494)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (412-829)||(267239-267655)
[»] scaffold0434 (1 HSPs)
scaffold0434 (411-713)||(13870-14173)
[»] scaffold0811 (1 HSPs)
scaffold0811 (562-1059)||(3626-4120)
[»] scaffold0262 (1 HSPs)
scaffold0262 (538-884)||(1072-1399)
[»] scaffold0014 (6 HSPs)
scaffold0014 (407-610)||(167450-167653)
scaffold0014 (407-573)||(234979-235146)
scaffold0014 (409-573)||(115095-115260)
scaffold0014 (406-534)||(146031-146162)
scaffold0014 (407-499)||(154163-154255)
scaffold0014 (803-981)||(234156-234327)
[»] scaffold0142 (2 HSPs)
scaffold0142 (407-573)||(29333-29499)
scaffold0142 (754-829)||(29072-29145)
[»] scaffold0057 (2 HSPs)
scaffold0057 (409-568)||(65023-65182)
scaffold0057 (755-984)||(65370-65590)
[»] scaffold0004 (3 HSPs)
scaffold0004 (744-968)||(241865-242089)
scaffold0004 (409-535)||(132327-132453)
scaffold0004 (419-525)||(242298-242404)
[»] scaffold0048 (1 HSPs)
scaffold0048 (406-535)||(87296-87425)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (407-573)||(112363-112530)
scaffold0031 (407-510)||(103171-103274)
[»] scaffold0016 (2 HSPs)
scaffold0016 (411-573)||(13154-13316)
scaffold0016 (904-981)||(13645-13722)
[»] scaffold0277 (2 HSPs)
scaffold0277 (407-573)||(19946-20111)
scaffold0277 (864-981)||(19543-19660)
[»] scaffold0015 (2 HSPs)
scaffold0015 (409-573)||(199250-199415)
scaffold0015 (809-968)||(198873-199024)
[»] scaffold0553 (1 HSPs)
scaffold0553 (407-573)||(1438-1606)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (409-573)||(52300-52464)
[»] scaffold0590 (1 HSPs)
scaffold0590 (408-573)||(9604-9770)
[»] scaffold0047 (2 HSPs)
scaffold0047 (408-573)||(75287-75453)
scaffold0047 (895-966)||(74900-74971)
[»] scaffold0005 (3 HSPs)
scaffold0005 (407-573)||(310589-310754)
scaffold0005 (409-510)||(215950-216051)
scaffold0005 (890-981)||(310186-310277)
[»] scaffold0065 (2 HSPs)
scaffold0065 (409-534)||(15183-15308)
scaffold0065 (890-981)||(15658-15749)
[»] scaffold0058 (4 HSPs)
scaffold0058 (409-573)||(57746-57911)
scaffold0058 (409-573)||(58864-59029)
scaffold0058 (409-573)||(67107-67272)
scaffold0058 (407-510)||(24437-24540)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (409-573)||(12709-12873)
[»] scaffold0291 (1 HSPs)
scaffold0291 (408-535)||(22117-22245)
[»] scaffold0265 (1 HSPs)
scaffold0265 (409-572)||(10623-10786)
[»] scaffold0254 (2 HSPs)
scaffold0254 (407-573)||(8647-8814)
scaffold0254 (803-981)||(8010-8181)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (408-573)||(33439-33605)
[»] scaffold0690 (1 HSPs)
scaffold0690 (407-573)||(4780-4947)
[»] scaffold0611 (2 HSPs)
scaffold0611 (407-573)||(7702-7869)
scaffold0611 (890-981)||(8180-8271)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (409-509)||(18069-18169)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (409-509)||(396616-396716)
[»] scaffold0043 (2 HSPs)
scaffold0043 (407-573)||(93422-93589)
scaffold0043 (890-981)||(93020-93111)
[»] scaffold0809 (1 HSPs)
scaffold0809 (411-535)||(291-416)
[»] scaffold0303 (1 HSPs)
scaffold0303 (409-573)||(12456-12621)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (411-573)||(53957-54120)
scaffold0018 (411-573)||(57909-58072)
[»] scaffold0234 (2 HSPs)
scaffold0234 (413-535)||(22919-23041)
scaffold0234 (890-981)||(21323-21414)
[»] scaffold1411 (1 HSPs)
scaffold1411 (407-510)||(273-376)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (409-535)||(22694-22822)
[»] scaffold1705 (1 HSPs)
scaffold1705 (439-573)||(1-136)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (407-481)||(13951-14025)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (904-981)||(17454-17531)
[»] scaffold0756 (1 HSPs)
scaffold0756 (408-449)||(4014-4055)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (803-900)||(28630-28727)
[»] scaffold0406 (1 HSPs)
scaffold0406 (752-839)||(15062-15146)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 586; Significance: 0; HSPs: 59)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 586; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 407 - 1060
Target Start/End: Complemental strand, 1975448 - 1974796
Alignment:
Q  407 attgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgct 506  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1975448 attgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgatgattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgct 1975349  T
Q  507 cttgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacataaagacttaagaactcagtcagagttcagaaag 606  Q
    |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1975348 cttgagtggttaactaagacaggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacataaagacttaagaactcagtcagagttcagaaag 1975249  T
Q  607 ttaaaaagagttcagaaggttgggcagagtttagaaggttgttcgtgatgaacatcaagaaccaagcccagaaattcatgaactaaatgaagaacatgca 706  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1975248 ttaaaaagagttcagaaggttggacagagttcagaaggttgttcatgatgaacatcaagaaccaagcccagaaattcatgaactaaatgaagaacatgca 1975149  T
Q  707 aggttcacgtgacttaaatgaaagcctagaaaagtacatgactaagatcaatcaaggaataaaagcatttatttgattaaagtcaaaaagggcatcttca 806  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1975148 aggttcacgtgacttaaatgaaagcccagaaaagtacatgactgagatcaatcaaggaataaaagcatttatttgattaaagtcaaaaagggcatcttca 1975049  T
Q  807 atgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaagaatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcataaatgt 906  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1975048 atgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacattaggaatattccattaagaatatcatcctagatgttttccatgctgcacttcataaatgt 1974949  T
Q  907 ttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctgaagtcccctgagttcagaaagttcaa 1006  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  1974948 ttcactattaggatttgattacattaattacaagtcttacaaatcatcctaagtgaaacaaaagaaacattctgaagtcccctgagttcagaatgttcga 1974849  T
Q  1007 tcctgctccatgcttttttctgacgtgaacagtacagtggttggaaagcaaaag 1060  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1974848 tcctgctccatgct-ttttctgacgtgaacagtacagtggttggaaagcaaaag 1974796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 548; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 407 - 1057
Target Start/End: Complemental strand, 1982814 - 1982159
Alignment:
Q  407 attgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgct 506  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1982814 attgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgatgattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgtt 1982715  T
Q  507 cttgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacataaagacttaagaactcagtcagagttcagaaag 606  Q
    |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1982714 cttgagtggttaactaagacaggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacataaagacttaagaactcagtcagagttcagaaag 1982615  T
Q  607 ttaaaaagagttcagaaggttgggcagagtttagaaggttgttcgtgatgaacatcaagaaccaagcccagaaattcatgaactaaatgaagaacatgca 706  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1982614 ttaaaaagagttcagaaggttggacaaagttcagaaggttgttcatgatgaacatcaagaaccaagcccagaaattcatgaactaaatgaagaacatgca 1982515  T
Q  707 aggttcacgtgacttaaatgaaagcctagaaaagtacatgactaagatcaatcaaggaataaaagcatttatttgattaaagtcaaaaagggcatcttca 806  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1982514 aggttcacgtgacttaaatgaaagcccagaaaagtacatgactaagatcaatcaaggaataaaagcatttatttgattaaagtcaaaaagggcatcttca 1982415  T
Q  807 atgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaagaatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcataaatgt 906  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  1982414 atgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacattaggaatattccattaagaatatcatcctagatgttttccatgctgcacttcataaatgc 1982315  T
Q  907 ttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctgaagtcccctgagttcagaaagttcaa 1006  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||      
T  1982314 ttcactattaggatttgattacatcaaatacaagtcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattatgaagtcccctgagttcagaatgttcgt 1982215  T
Q  1007 tcctgctccatgc-----ttttttctgacgtgaacagtacagtggttggaaagcaa 1057  Q
    |||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  1982214 tcctgctccatgcttcttttttttctgacgtgaacagtacagcagttggaaagcaa 1982159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 538; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 409 - 1057
Target Start/End: Complemental strand, 1990230 - 1989577
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1990230 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgatgattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgttct 1990131  T
Q  509 tgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacataaagacttaagaactcagtcagagttcagaaagtt 608  Q
    || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1990130 tgagtggttaactaagacaggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacataaagacttaagaactcagtcagagttcagaaagtt 1990031  T
Q  609 aaaaagagttcagaaggttgggcagagtttagaaggttgttcgtgatgaacatcaagaaccaagcccagaaattcatgaactaaatgaagaacatgcaag 708  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1990030 aaaaagagttcagaaggttggacaaagttcagaaggttgttcatgatgaacatcaagaaccaagccctgaaattcatgaactaaatgaagaacatgcaag 1989931  T
Q  709 gttcacgtgacttaaatgaaagcctagaaaagtacatgactaagatcaatcaaggaataaaagcatttatttgattaaagtcaaaaagggcatcttcaat 808  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1989930 gttcacgtgacttaaatgaaagcccagaaaagtacatgactaagatcaatcaaggaataaaagcatttatttgattaaagtcaaaaagggcatcttcaat 1989831  T
Q  809 gttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaagaatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcataaatgttt 908  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1989830 gttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacattaggaatattccattaagaatatcatcctagatgttttccatgctgcacttcataaatgctt 1989731  T
Q  909 cactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctgaagtcccctgagttcagaaagttcaatc 1008  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||    
T  1989730 cactattaggatttgattacatcaaatacaagtcttacaaatcatcctaagtgaaacaaaagaaacattatgaagtcccctgagttcagaatgttcgttc 1989631  T
Q  1009 ctgctccatgctt-----ttttctgacgtgaacagtacagtggttggaaagcaa 1057  Q
    |||||||||||||     ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  1989630 ctgctccatgctttttttttttctgacgtgaacagtacagcagttggaaagcaa 1989577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 415; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 465 - 1057
Target Start/End: Original strand, 41207892 - 41208503
Alignment:
Q  465 attaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctcttgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatc 564  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  41207892 attaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctcttgagtggttaactaagacagaaacaagtttcaattcataccaagatacaaagaatc 41207991  T
Q  565 aaaggacataaagacttaagaactcagtcagagttcagaaagttaaaaagagttcagaaggttgggcagagtttagaaggttgt---------------- 648  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||                     
T  41207992 aaaggacataaagacttaagaactcagtcagagttcagaaagttaaaaagagttcagaaggttggacagagttcagaaggttggacaaagttcagaaggt 41208091  T
Q  649 ---tcgtgatgaacatcaagaaccaagcccagaaattcatgaactaaatgaagaacatgcaaggttcacgtgacttaaatgaaagcctagaaaagtacat 745  Q
       || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| || |||||||||    
T  41208092 tggtcatgatgaacatcaagaaccaagcccagaaattcatgaactaaatgaagaacatgcaaggttcatatgacttaaataaaagcccagtaaagtacat 41208191  T
Q  746 -gactaagatcaatcaaggaataaaagcatttatttgattaaagtcaaaaagggcatcttcaatgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaac 844  Q
     ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41208192 tgactaagatcaatcaagaaataaaggcatttatttaattaaagtcaaaaagggcatcttcaatgttcattcaagactatgaacatttgaagtacaaaac 41208291  T
Q  845 gttaggaatattccattaagaatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcataaatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatctt 944  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  41208292 attaggaatattccattaagaatatcatcctagatgttttccatgctgcacttcataaatgtttcactattaggatttgattacataaattacaagtctt 41208391  T
Q  945 acaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctgaagtcccctgagttcagaaagttcaatcctgctccatgcttttttctgacgtgaacagtacagt 1044  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  41208392 acaaatcatcctaagtgaaacaaaagaaacattctgaagtcccctgagttcagaatgttcgttcctgctccatgc-tttttctgacgtgaacagtacagc 41208490  T
Q  1045 ggttggaaagcaa 1057  Q
     ||||||||||||    
T  41208491 agttggaaagcaa 41208503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 749 - 1060
Target Start/End: Complemental strand, 52955689 - 52955380
Alignment:
Q  749 taagatcaatcaaggaataaaagcatttatttgattaaagtcaaaaagggcatcttcaatgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgtta 848  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||    
T  52955689 taagatcaatcaag-aataaaggcatttatttgattaaagtcaaaaagggtatatttaatgttcattcaagactatgaatatttgaagtacaaaacatta 52955591  T
Q  849 ggaatattccattaagaatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcataaatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaa 948  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||  | ||||||||    
T  52955590 ggaatattccattaagaatatcatcctagatgttttccacgctgcacttcataaatgtttcactattagaatttgattacatcaaataagagtcttacaa 52955491  T
Q  949 atcattctaagtgaaacaaaagaaacattctgaagtcccctgagttcagaaagttcaatcctgctccatgcttttttctgacgtgaacagtacagtggtt 1048  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  52955490 atcatcctaagtgaaacaaaagaaacattctgaagtcccctgagttcagaaagttcgatcctgctccatgct-ttttctgacatgaacagtacactggtt 52955392  T
Q  1049 ggaaagcaaaag 1060  Q
    |||||| |||||    
T  52955391 ggaaagtaaaag 52955380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 407 - 555
Target Start/End: Original strand, 34822355 - 34822503
Alignment:
Q  407 attgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgct 506  Q
    |||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34822355 attgttgaagcaaaattcctaattagttttaaagataataaaccttgatgattaaagaattaatggactttgattaatttattggtatttaacttgtgct 34822454  T
Q  507 cttgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagata 555  Q
    |||| ||| |||||||||| ||||||||   | ||||||||||||||||    
T  34822455 cttgagtgtttaactaagacaggaacaatgtttaattcataccaagata 34822503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 409 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 1187144 - 1186980
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    ||||||||||||||  ||||||  |||||||||||| ||||||  || |||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1187144 tgttgaggcaaaatttctaattagttttaaagataataaacctcaatgattaagaaattgatggactttgattaatttcttggtatttaacttgtgctct 1187045  T
Q  509 tgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    || ||| |||||||||| || ||||||  | || ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  1187044 tgagtgtttaactaagacagaaacaaggtttaaatcataccaagatacaagaaatcaaaggacat 1186980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 409 - 573
Target Start/End: Original strand, 22960214 - 22960378
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | |||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  22960214 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatgaactttgattaattccttgatatttaacttgtgctct 22960313  T
Q  509 tgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    || ||| || ||||||| |||||||||  | || ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  22960314 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagatacaagaaatcaaaggacat 22960378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 407 - 573
Target Start/End: Original strand, 42033524 - 42033690
Alignment:
Q  407 attgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgct 506  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||   || ||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  42033524 attgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaaccaatatgattagagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgct 42033623  T
Q  507 cttgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    |||| ||| || |||||||||||||||||  | || ||||||||| |  |||  |||||||||||||    
T  42033624 cttgagtgttttactaagataggaacaaggtttaaatcataccaaaaatcaagaaatcaaaggacat 42033690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 407 - 535
Target Start/End: Original strand, 21457869 - 21457997
Alignment:
Q  407 attgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgct 506  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  21457869 attgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaaccaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgct 21457968  T
Q  507 cttgcgtgattaactaagataggaacaag 535  Q
    |||| ||| || ||||||| |||||||||    
T  21457969 cttgagtgttttactaagacaggaacaag 21457997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 406 - 573
Target Start/End: Original strand, 16154214 - 16154381
Alignment:
Q  406 aattgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgc 505  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  16154214 aattgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaaccaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgc 16154313  T
Q  506 tcttgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    ||||| ||| || ||||||| | |||||||  | |  |||||||||||  |||  |||||||||||||    
T  16154314 tcttgagtgttttactaagacatgaacaaggtttagatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacat 16154381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 409 - 571
Target Start/End: Original strand, 21782030 - 21782192
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  21782030 tgttgaggaaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggactaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 21782129  T
Q  509 tgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggac 571  Q
    || ||| || ||||||| |||||||||  | || ||| ||||||||| ||  |||||||||||    
T  21782130 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcagaccaagatagaagaaatcaaaggac 21782192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 408 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 2371134 - 2370969
Alignment:
Q  408 ttgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctc 507  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||    
T  2371134 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaacctttatgattaaagaattaatggactctgattaattccttggtatttaacttgtactc 2371035  T
Q  508 ttgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    ||| ||| || | ||||| | |||||||  | || |||||||||||| |||  ||||||| |||||    
T  2371034 ttgagtgttttagtaagacatgaacaaggtttaaatcataccaagattcaagaaatcaaaagacat 2370969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 409 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 22406994 - 22406830
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||   || ||||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  22406994 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaaccaatatgattaaagaattaatggactttgattaactccttggtatttaacttgtgctct 22406895  T
Q  509 tgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    |  ||| || ||||||| |||||||||  | || |||||||||||  |||  |||||||||||||    
T  22406894 taagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacat 22406830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 408 - 573
Target Start/End: Original strand, 12418170 - 12418336
Alignment:
Q  408 ttgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctc 507  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12418170 ttgttgaggcaaaattcctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaatttcttggtatttaacttgtgctc 12418269  T
Q  508 ttgcgtg-attaactaagatagg-aacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    ||| |||  |||||||||| ||| || |||| | || |||||||||||| || | |||||||||||||    
T  12418270 ttgagtgttttaactaagacaggaaaaaagtatgaa-tcataccaagatgcataaaatcaaaggacat 12418336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 408 - 573
Target Start/End: Original strand, 2115333 - 2115499
Alignment:
Q  408 ttgttgaggcaaaatccct-aatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgct 506  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||    || ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  2115333 ttgttgaggcaaaatcccttaattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgct 2115432  T
Q  507 cttgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    |||| ||| || ||||||| |||||||||  | || |||||||||||  |||  |||||||||||||    
T  2115433 cttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacat 2115499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 408 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 20329120 - 20328954
Alignment:
Q  408 ttgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctc 507  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  20329120 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttcgtatttaacttgtgctc 20329021  T
Q  508 ttgcgtg-attaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    ||| |||  || ||||||| |||||||||  |  | |||||||||||| || | |||||||||||||    
T  20329020 ttgagtgttttcactaagacaggaacaaggcttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggacat 20328954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 408 - 530
Target Start/End: Original strand, 25018802 - 25018924
Alignment:
Q  408 ttgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctc 507  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  25018802 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaaccaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 25018901  T
Q  508 ttgcgtgattaactaagatagga 530  Q
    ||| ||| || ||||||| ||||    
T  25018902 ttgagtgttttactaagacagga 25018924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 407 - 573
Target Start/End: Original strand, 20311619 - 20311786
Alignment:
Q  407 attgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgct 506  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  20311619 attgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaaatccttggtatttaacttgtgct 20311718  T
Q  507 cttgcgtg-attaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    |||| |||  || ||||||| |||||||||  |  | |||||||||||| || | ||||||| |||||    
T  20311719 cttgagtgttttcactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaagacat 20311786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 409 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 21822186 - 21822023
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  | || |||||||| | |||||  |||||||||||    |||||||||||||||||||    
T  21822186 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactataatgattaaggactaaatgggttttgattaattccccggtatttaacttgtgctct 21822087  T
Q  509 tgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggaca 572  Q
    || ||| || ||||||| |||||||||  | || ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  21822086 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagatacaagaaatcaaaggaca 21822023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 409 - 573
Target Start/End: Original strand, 20308142 - 20308307
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  20308142 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaaatcattggtatttaacttgtgctct 20308241  T
Q  509 tgcgtg-attaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    || |||  || ||||||| | |||||||  |  | |||||||||||| || | |||||||||||||    
T  20308242 tgagtgttttcactaagacatgaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggacat 20308307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 409 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 26194179 - 26194078
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  26194179 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 26194080  T
Q  509 tg 510  Q
    ||    
T  26194079 tg 26194078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 409 - 573
Target Start/End: Original strand, 27065408 - 27065573
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  27065408 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattcattccttggtatttaacttgtgctct 27065507  T
Q  509 tgcgtg-attaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    || |||  || ||||||| |||||||||  |  | |||||||||||| || | ||||||| |||||    
T  27065508 tgagtgttttcactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaagacat 27065573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 406 - 535
Target Start/End: Original strand, 37011343 - 37011472
Alignment:
Q  406 aattgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgc 505  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  37011343 aattgttgaggcaaaatccatgattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgc 37011442  T
Q  506 tcttgcgtgattaactaagataggaacaag 535  Q
    ||||| ||| || ||||||| | |||||||    
T  37011443 tcttgagtgttttactaagacatgaacaag 37011472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 409 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 18097672 - 18097508
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| |||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||    
T  18097672 tgttgaggtaaaatccctaattaattttaaggataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattcctttgtatttaacttgtgttct 18097573  T
Q  509 tgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    || ||| || ||||||| |||||||||  | || | ||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  18097572 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaataataccaagatacaagaaatcaaagaacat 18097508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 411 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 41544846 - 41544723
Alignment:
Q  411 ttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctcttg 510  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||    || ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  41544846 ttgaggtaaaatccctaattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattacttggtatttaacttgtgctcttg 41544747  T
Q  511 cgtgattaactaagataggaacaa 534  Q
     ||| || ||||||| ||||||||    
T  41544746 agtgttttactaagacaggaacaa 41544723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 63; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 409 - 535
Target Start/End: Original strand, 8539585 - 8539711
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||    || ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  8539585 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaggataataaacgaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 8539684  T
Q  509 tgcgtgattaactaagataggaacaag 535  Q
    || ||| || ||||||| |||| ||||    
T  8539685 tgagtgtttcactaagacaggagcaag 8539711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 63; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 409 - 535
Target Start/End: Original strand, 8604824 - 8604950
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||    || ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  8604824 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaggataataaacgaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 8604923  T
Q  509 tgcgtgattaactaagataggaacaag 535  Q
    || ||| || ||||||| |||| ||||    
T  8604924 tgagtgtttcactaagacaggagcaag 8604950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 409 - 510
Target Start/End: Original strand, 4950355 - 4950456
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  4950355 tgttgagacaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattctttggtatttaacttgtgctct 4950454  T
Q  509 tg 510  Q
    ||    
T  4950455 tg 4950456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 409 - 573
Target Start/End: Original strand, 25867587 - 25867752
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || ||||| || | ||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  25867587 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaagattaaattgactttgattaattccttggtatttaaattgtgctct 25867686  T
Q  509 tgcgtg-attaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    || |||  || ||||||| |||||||||  |  | |||||||||||| || | |||||||||||||    
T  25867687 tgagtgttttcactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggacat 25867752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 406 - 573
Target Start/End: Original strand, 13964228 - 13964395
Alignment:
Q  406 aattgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgc 505  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||    
T  13964228 aattgttgaggcaaaatctctaattaattttaaagataataaaccaatatgattaaagaattaatggactttgattaattcattggtatttaacttctgc 13964327  T
Q  506 tcttgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    || || ||  || |||||||  ||||||||  | || |||||||| ||  |||  |||||||||||||    
T  13964328 tcgtgagtattttactaagactggaacaaggtttaaatcataccatgaatcaagaaatcaaaggacat 13964395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 411 - 534
Target Start/End: Original strand, 50940496 - 50940618
Alignment:
Q  411 ttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctcttg 510  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||   |||||||||    
T  50940496 ttgaggcaaaatccttaaataattttaaagataacaaactttgatgattaaagaattaatggactttgattagtttcttggt-tttaatacgtgctcttg 50940594  T
Q  511 cgtgattaactaagataggaacaa 534  Q
     |||||||||||||| | ||||||    
T  50940595 agtgattaactaagacaagaacaa 50940618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 409 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 30550332 - 30550206
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccct-aatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctc 507  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||    || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  30550332 tgttgaggcaaaatcccttaattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 30550233  T
Q  508 ttgcgtgattaactaagataggaacaa 534  Q
    ||| ||| || ||||||| | ||||||    
T  30550232 ttgagtgttttactaagacatgaacaa 30550206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 409 - 534
Target Start/End: Original strand, 1968679 - 1968804
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || ||||| || | ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  1968679 tgttgaagcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaagattaaatggactttgattaattccttgatatttaacttgtgctct 1968778  T
Q  509 tgcgtgattaactaagataggaacaa 534  Q
    || ||| || ||||||| || |||||    
T  1968779 tgagtgttttactaagacagaaacaa 1968804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 696 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 13404121 - 13403943
Alignment:
Q  696 aagaacatgcaaggttcacgtgacttaaatgaaagcctagaaaagtacatgacta-agatcaatcaaggaataaaagcatttatttg-attaaagtcaaa 793  Q
    |||||||| ||||| |||| |||| ||||| |||| | |||||||   ||||||  |||||||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||||    
T  13404121 aagaacattcaaggctcacatgacataaataaaagtccagaaaagactatgactttagatcaatcaaggattaaaggcatttatttggataaaagtcaaa 13404022  T
Q  794 aagggcatcttcaatgttcatttaagact-atgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaagaatgtcatc 873  Q
    |  || || |||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||| |||||    
T  13404021 a--ggaatattcattgttcattaaagacttatgaacaattgaagtacaaaacattaggaatactcctataagaatatcatc 13403943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 752 - 970
Target Start/End: Original strand, 34822706 - 34822915
Alignment:
Q  752 gatcaatcaaggaataaaagcatttatttgattaaagtcaaaaagggcatcttcaatgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttagga 851  Q
    ||||||||||| |||||| | |||||   |||||| |||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||       |||||    
T  34822706 gatcaatcaagcaataaaggaatttacaagattaatgtcaaaaaag--atcttcattgttcatttaagactatgaacatttgaagtac-------tagga 34822796  T
Q  852 atattccattaagaatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcataaatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatc 951  Q
    |||||| |   ||||| |||| |||||||||    |  |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| || |   | |||||||||||    
T  34822797 atattctaaagagaatatcatactagatgttacaaacactgcacttcattgttgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatc 34822896  T
Q  952 attctaagtgaaacaaaag 970  Q
    || ||||||||||||||||    
T  34822897 atcctaagtgaaacaaaag 34822915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 409 - 525
Target Start/End: Original strand, 30209518 - 30209634
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    ||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||| |||||||| ||| || ||||||||| |||| |||    
T  30209518 tgttgaggcaaaatctctaaatagttttaaagataacaaactttgatgattaaaggattaatggattttgattagttttttagtatttaacatgtgttct 30209617  T
Q  509 tgcgtgattaactaaga 525  Q
    || || |||||||||||    
T  30209618 tgagttattaactaaga 30209634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 406 - 488
Target Start/End: Original strand, 20585210 - 20585292
Alignment:
Q  406 aattgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgt 488  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | |||||||||||||| ||||||    
T  20585210 aattgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattnatttgt 20585292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 803 - 981
Target Start/End: Complemental strand, 1186750 - 1186580
Alignment:
Q  803 ttcaatgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaagaatgtcatcctagatgttttccatg-ctgcacttcata 901  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||       ||| |||||||||   ||||| ||||||||||||||  | ||  |||| ||||||     
T  1186750 ttcaatgttcatttaagactatgaaca-ttgaagtac-------tagaaatattccaaagagaatatcatcctagatgtta-caatctctgctcttcatt 1186660  T
Q  902 aatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
      ||||||||||||||||||||||||||| || |  || |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  1186659 gttgtttcactattaggatttgattacatcaaatggaagtcttacaaatcatcataagtgaaacaaaaggaacattctga 1186580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 408 - 496
Target Start/End: Original strand, 18381418 - 18381506
Alignment:
Q  408 ttgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtattt 496  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | || |||||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  18381418 ttgttgaagcaaaatccctaattaattttaaagataataaaccattattattaaataattaatggactttgattaattccttggtattt 18381506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 409 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 2653200 - 2653074
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataa-caaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctc 507  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||| ||| |||||   ||||||| | |||||||||||| |||||||||||  ||||  |    
T  2653200 tgttgaggcaaaatccctaaaatattttaaagataaacaaccctcgatgattaaaagattaatgaagtttgattaatttcttggtatttaatatgtgtgc 2653101  T
Q  508 ttgcgtgattaactaagataggaacaa 534  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  2653100 ttgagtgattaaataagagaggaacaa 2653074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 803 - 981
Target Start/End: Original strand, 21458358 - 21458529
Alignment:
Q  803 ttcaatgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaag-aatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcata 901  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||       |||||||||| ||  ||| ||| |||||||||||||| ||    |||| ||||||     
T  21458358 ttcaatgttcatttaagactatgaaca-ttgatgtac-------taggaatatttcacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcatt 21458449  T
Q  902 aatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||    
T  21458450 attgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctga 21458529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 809 - 979
Target Start/End: Original strand, 22956292 - 22956454
Alignment:
Q  809 gttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaagaatgtcatcctagatgttttccatg-ctgcacttcataaatgtt 907  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||       |||||||||| ||||||| ||||||||||||||  | ||  ||||||||||   |||||    
T  22956292 gttcatttaagactatgaaca-ttgaagtactaa-------gaatattccaataagaatatcatcctagatgttg-caatcactgcacttcagttatgtt 22956382  T
Q  908 t-cactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattct 979  Q
    | ||||||||||||| | |||||| || ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  22956383 ttcactattaggatt-gtttacatcaaatacaagtcttacaaatcatcctaagtgaaacaaatggaacattct 22956454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 408 - 525
Target Start/End: Original strand, 2371533 - 2371650
Alignment:
Q  408 ttgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctc 507  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| || |||| || ||||||||||||| | ||| |||||||||  |||||||||| ||||  |||    
T  2371533 ttgttgaggcaaaatccttaattatttttaaaaataataaccctttatgattaaggaattaaggaactctgattaattccttggtatttaccttgaactc 2371632  T
Q  508 ttgcgtgattaactaaga 525  Q
    | | ||| ||||||||||    
T  2371633 tagagtgtttaactaaga 2371650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 803 - 981
Target Start/End: Original strand, 16154613 - 16154784
Alignment:
Q  803 ttcaatgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaag-aatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcata 901  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||       |||||||||| ||  ||| ||| |||||||||||||| |     |||| ||||||     
T  16154613 ttcaatgttcatttaagactatgaaca-ttgatgtac-------taggaatatttcacaaaggaatatcatcctagatgttattatcactgctcttcatt 16154704  T
Q  902 aatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||    
T  16154705 attgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctga 16154784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 803 - 981
Target Start/End: Original strand, 25019198 - 25019369
Alignment:
Q  803 ttcaatgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaag-aatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcata 901  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||       |||||||||| ||  | | ||| |||||||||||||| |     |||| ||||||     
T  25019198 ttcaatgttcatttaagactatgaaca-ttgaagtac-------taggaatatttcacaagggaatatcatcctagatgttattatcactgctcttcatc 25019289  T
Q  902 aatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||    
T  25019290 attgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctga 25019369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 890 - 981
Target Start/End: Original strand, 2115810 - 2115901
Alignment:
Q  890 ctgcacttcataaatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    |||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||    
T  2115810 ctgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctga 2115901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 890 - 981
Target Start/End: Original strand, 21886123 - 21886214
Alignment:
Q  890 ctgcacttcataaatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    |||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||    
T  21886123 ctgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctga 21886214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 464 - 510
Target Start/End: Original strand, 21885703 - 21885749
Alignment:
Q  464 aattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctcttg 510  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  21885703 aattaatggactttgattaattctttggtatttaacttgtgctcttg 21885749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 904 - 981
Target Start/End: Original strand, 8540075 - 8540152
Alignment:
Q  904 tgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||    
T  8540075 tgtttcactattaggatttgattacatcaaatggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctga 8540152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 904 - 981
Target Start/End: Original strand, 18383185 - 18383262
Alignment:
Q  904 tgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| || |   | ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||    
T  18383185 tgtttcactattaggatttaattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcctaagtgaaacaaaaggaacgttctga 18383262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 904 - 981
Target Start/End: Complemental strand, 41544347 - 41544270
Alignment:
Q  904 tgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||    
T  41544347 tgtttcactattaggatttgattacatcaaatggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctga 41544270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 890 - 981
Target Start/End: Complemental strand, 30549856 - 30549765
Alignment:
Q  890 ctgcacttcataaatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    |||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |   | |||||||||||||  ||||||||||| | | ||||||||||    
T  30549856 ctgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatggtagtcttacaaatcatcttaagtgaaacagatggaacattctga 30549765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 904 - 981
Target Start/End: Complemental strand, 18062457 - 18062380
Alignment:
Q  904 tgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    |||| |||| |||| |||||||||||| || |   | |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  18062457 tgttccactgttagaatttgattacatcaaatggtagtcttacaaataatcctaagtgaaacaaaagaaacattctga 18062380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 752 - 926
Target Start/End: Original strand, 30210492 - 30210665
Alignment:
Q  752 gatcaatcaaggaataaaagcatttattt-gattaaagtcaaaaagggcatcttcaatgttcatttaagac-tatgaacaattgaagtacaaaacgttag 849  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||| ||| ||||||||||   |||| |||| |||||||| ||||| || |||||| |||||||| |||| ||||    
T  30210492 gatcaatcaaggattaaagacatttatttggataaaagtcaaaa--tgcatattcattgttcattaaagacttacgaacaaatgaagtac-aaacattag 30210588  T
Q  850 gaatattccattaagaatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcataaatgtttcactattaggatttgatt 926  Q
    |||||||||   ||||||||  |||||||| || | |||  ||  ||||||  ||| |||||||||| |||||||||    
T  30210589 gaatattcctccaagaatgttttcctagatattatacatattgtgcttcattgatggttcactattatgatttgatt 30210665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 752 - 839
Target Start/End: Complemental strand, 18062600 - 18062516
Alignment:
Q  752 gatcaatcaaggaataaaagcatttatttgattaaagtcaaaaagggcatcttcaatgttcatttaagactatgaacaattgaagtac 839  Q
    ||||||| ||| ||||||  |||||||  | |||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18062600 gatcaatgaagcaataaagacatttataaggttaatgtcaaaaagg--atattcaatgttcatttaagactatgaac-attgaagtac 18062516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 696 - 879
Target Start/End: Complemental strand, 19869065 - 19868880
Alignment:
Q  696 aagaacatgcaaggttcacgtgacttaaatgaaagcctagaaaagtac-atgacta-agatcaatcaaggaataaaagcatttatttg-attaaagtcaa 792  Q
    |||||||| ||||| |||| |||  ||||| |||| | |||||||||| |||| |  |||||||||||||| ||||  || ||||||| || ||||||||    
T  19869065 aagaacattcaaggctcacatgatataaataaaagtccagaaaagtactatgattttagatcaatcaaggattaaagacacttatttggataaaagtcaa 19868966  T
Q  793 aaagggcatcttcaatgttcatttaagact-atgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaagaatgtcatcctagat 879  Q
    |||   ||| |||| |||||||| |||||| |||||||| |||| |||||| |  ||||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  19868965 aaaaa-catattcattgttcattaaagacttatgaacaaatgaattacaaa-caataggaatattcctctaagaatatcatcctagat 19868880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 912 - 981
Target Start/End: Original strand, 8605322 - 8605391
Alignment:
Q  912 tattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    ||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||    
T  8605322 tattaggatttgattacatcaaatggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctga 8605391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 752 - 839
Target Start/End: Original strand, 21782371 - 21782455
Alignment:
Q  752 gatcaatcaaggaataaaagcatttatttgattaaagtcaaaaagggcatcttcaatgttcatttaagactatgaacaattgaagtac 839  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||   || ||| ||||||||||   ||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  21782371 gatcaatcaagcaataaaggcatttacaagaataatgtcaaaaagg---tcttcaaggttcattcaagactataaacacttgaagtac 21782455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 581; Significance: 0; HSPs: 74)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 581; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 408 - 1060
Target Start/End: Complemental strand, 522960 - 522309
Alignment:
Q  408 ttgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctc 507  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  522960 ttgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgatgattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctc 522861  T
Q  508 ttgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacataaagacttaagaactcagtcagagttcagaaagt 607  Q
    ||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  522860 ttgagtggttaactaagacaggaacaagtgtaaatttataccaagatacaaagaatcaaaggacataaagacttaagaactcagtcagagttcagaaagt 522761  T
Q  608 taaaaagagttcagaaggttgggcagagtttagaaggttgttcgtgatgaacatcaagaaccaagcccagaaattcatgaactaaatgaagaacatgcaa 707  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  522760 taaaaagagttcagaaggttggacagagttcagaaggttgttcatgatgaacatcaagaaccaagcccagaaattcatgaactaaatgaagaacatgcaa 522661  T
Q  708 ggttcacgtgacttaaatgaaagcctagaaaagtacatgactaagatcaatcaaggaataaaagcatttatttgattaaagtcaaaaagggcatcttcaa 807  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  522660 ggttcacgtgacttaaatgaaagcccagaaaagtacatgactgagatcaatcaaggaataaaagcatttatttgattaaagtcaaaaagggcatcttcaa 522561  T
Q  808 tgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaagaatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcataaatgtt 907  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  522560 tgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacattaggaatattccattaagaatatcatcctagatgttttccatgctgcacttcataaatgtt 522461  T
Q  908 tcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctgaagtcccctgagttcagaaagttcaat 1007  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  522460 tcactattaggatttgattacattaattacaagtcttacaaatcatcctaagtgaaacaaaagaaacattctgaagtcccctgagttcagaatgttcgat 522361  T
Q  1008 cctgctccatgcttttttctgacgtgaacagtacagtggttggaaagcaaaag 1060  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  522360 cctgctccatgct-ttttctgacgtgaacagtacagtggttggaaagcaaaag 522309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 536; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 409 - 1060
Target Start/End: Complemental strand, 17422062 - 17421413
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17422062 tgttgaggcaaaatctttaatttattttaaagataacaaactttgatgattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 17421963  T
Q  509 tgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacataaagacttaagaactcagtcagagttcagaaagtt 608  Q
    || |||||||||||||| || ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17421962 tgagtgattaactaagacag-aacaagtttcaattcatatcaagatacaaagaatcaaaggacataaagacttaagaactcagttagagttcagaaagtt 17421864  T
Q  609 aaaaagagttcagaaggttgggcagagtttagaaggttgttcgtgatgaacatcaagaaccaagcccagaaattcatgaactaaatgaagaacatgcaag 708  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17421863 aaaaagagttcagaaggttggacagagttcagaaggttgttcatgatgaacatcaagaaccaagtccagaaattcatgaactaaatgaagaacatgcaag 17421764  T
Q  709 gttcacgtgacttaaatgaaagcctagaaaagtacatgactaagatcaatcaaggaataaaagcatttatttgattaaagtcaaaaagggcatcttcaat 808  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17421763 gttcacgtgacttaaatgaaagcctagaaaagtacatgactaagatcaatcaaggaataaaaccatttatttgattaaagtcaaaaaggacatcttcaat 17421664  T
Q  809 gttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaagaatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcataaatgttt 908  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17421663 gttcattcaagactatgaacatttgaagtacaaaacattaggaatattccattaagaatatcatcctagatgttttccatgctgcacttcataaatgttt 17421564  T
Q  909 cactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctgaagtcccctgagttcagaaagttcaatc 1008  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17421563 cactattaggaattgattacatcaattacaagtcttacaaatcatcctaagtgaaacaaaagaaacattctgaagtcccctgagttcagaaagttcaatc 17421464  T
Q  1009 ctgctccatgcttttttctgacgtgaacagtacagtggttggaaagcaaaag 1060  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17421463 ctgctccatgct-ttttctgacgtgaacagtacaatggttggaaagcaaaag 17421413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 457; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 409 - 1060
Target Start/End: Original strand, 26457675 - 26458325
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26457675 tgttgaggcaaattccctaattaattttaaagataacaaaccttgatgattaaagaattaatagacttcgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 26457774  T
Q  509 tgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacataaagacttaa-gaactcagtcagagttcagaaagt 607  Q
    || ||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  26457775 tgggtggttaactaagacaggaacaagtttcaattcatacccagatacaaagaatcaaaggacataaagacttaaagaactcagtctgagtttagaaagt 26457874  T
Q  608 taaaaagagttcagaaggttgggcagagtttagaaggttgttcgtgatgaacatcaagaaccaagcccagaaattcatgaactaaatgaagaacatgcaa 707  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26457875 taaaaagagttcagaagattggacagagttcagaaggttgttcatgatgaacatcaagaaccaagcccagaaattcatgaac-aaatgaagaacatgcaa 26457973  T
Q  708 ggttcacgtgacttaaatgaaagcctagaaaagtacatgactaagatcaatcaaggaataaaagcatttatttgattaaagtcaaaaagggcatcttcaa 807  Q
    |||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  26457974 ggttcacgtgacttaaataaaagctcataaaagtacatgactaagatcaattaaggaataaaggcatttatttgattaaatttaaaaagagcatcttcaa 26458073  T
Q  808 tgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaagaatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcataaatgtt 907  Q
    |||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26458074 tgttcatccaagactatgaacatttgaagtacaaaacattaggaatattccattaagaatatcatcctagatgttttccatgcagcacttcataaatgtt 26458173  T
Q  908 tcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctgaagtcccctgagttcagaaagttcaat 1007  Q
    |||||||||||| |||||||||| || ||  | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  26458174 tcactattaggagttgattacatcaaataagagtcttacaaatcatcctaagtgaaacaaaagaaacattctgaagtcccctgagtttagaaagttcgat 26458273  T
Q  1008 cctgctccatgcttttttctgacgtgaacagtacagtggttggaaagcaaaag 1060  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26458274 cctgctccatg-ttttttctgacgtgaacaatacagtggttggaaagcaaaag 26458325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 544 - 1059
Target Start/End: Original strand, 30651025 - 30651537
Alignment:
Q  544 cataccaagatacaaagaatcaaaggacataaagacttaagaactcagtcagagttcagaaagttaaaaagagttcagaaggttgggcagagtttagaag 643  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  30651025 cataccaagatacaaagaattaaaggacataaagacttaagaactcagttagagttcagaaagttaaaaagagttcagaaggttggacagagttcagaag 30651124  T
Q  644 gttgttcgtgatgaacatcaagaaccaagcccagaaattcatgaactaaatgaagaacatgcaaggttcacgtgacttaaatgaaagcctagaaaagtac 743  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||    
T  30651125 gttgtttatgatgaacatcaagaaccaaacccagaaattcatgaaccaaatgaataacatacaaggttcacgtgacttaaataaaagcccagtaaagtac 30651224  T
Q  744 a-tgactaagatcaatcaaggaataaaagcatttatttgattaaagtcaaaaagggcatcttcaatgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaa 842  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  30651225 attgactaagatcaatcaaggaataaacgcatttatttgattaaagtcaaaaagggcatcttcaatgttcattcaagactatgaacatttgaagtacaaa 30651324  T
Q  843 acgttaggaatattccattaagaatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcataaatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatc 942  Q
    || || ||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| |||||||||||| || ||  | ||    
T  30651325 acattggg---attccattaagaatatcatcctagatgttttccatgctgcacttcatcaatgttcctctattagaatttgattacatcaaataagagtc 30651421  T
Q  943 ttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctgaagtcccctgagttcagaaagttcaatcctgctccatgcttttttctgacgtgaacagtaca 1042  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  30651422 ttacaaatcatcctaagtgaaacaaaaagaacattctgaagtcccctgagttcaaaaagttcgatcctgctccatgc-tttttctgtcatgaacagtaca 30651520  T
Q  1043 gtggttggaaagcaaaa 1059  Q
    || | ||||||| ||||    
T  30651521 gttggtggaaagtaaaa 30651537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 292; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 544 - 1059
Target Start/End: Original strand, 16057689 - 16058220
Alignment:
Q  544 cataccaagatacaaagaatcaaaggacataaagacttaagaactcagtcagagttcagaaagttaaaaagagttcagaaggttgggcagagtttagaag 643  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  16057689 cataccaagatacaaagaatcaaaggacataaagacttaagaactcagttagagttcagaaagttaaaaagagttcagaaggttggacagagttcagaag 16057788  T
Q  644 gttgttcgtgatgaacatcaagaaccaagcccagaaattcatgaactaaatgaagaacatgcaaggttcacgtgacttaaatgaaagcctagaaaagtac 743  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||    
T  16057789 gttgttcatgatgaacatcaagaaccaaacccagaaattcatgaaccaaatgaaggacatacaaggttcatgtgacttaaataaaagcccagtaaagtac 16057888  T
Q  744 a-tgactaagatcaatcaaggaataaaagcatttatttgattaaagtcaaaaagggcatcttca----------------atgttcatttaagactatga 826  Q
    | |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||                ||||||||| ||||||||||    
T  16057889 attgactaggatcaatcaaggaataaaggcatttatttgattaaagtcaaaaagggcatcttcaatgttcattcaagactatgttcattcaagactatga 16057988  T
Q  827 acaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaagaatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcataaatgtttcactattaggatttgatt 926  Q
    ||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  16057989 acatttgaagtacaaaatattgggaatattccattaagaatatcatcctagatgttttccatgctgtttttcatcaatgttccactattaggatttgatt 16058088  T
Q  927 acattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctgaagtcccctgagttcagaaagttcaatcctgctccatgcttttttc 1026  Q
    |||| || ||  ||||||||||||||| |||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  16058089 acatcaaataagaatcttacaaatcatcctaattgaaataaaaagaacattctgaagtcccctgtgtttagaaagttcgatcctgctccatgc-tttttc 16058187  T
Q  1027 tgacgtgaacagtacagtggttggaaagcaaaa 1059  Q
    || | |||| |||||||| | ||||||| ||||    
T  16058188 tgtcatgaatagtacagttggtggaaaggaaaa 16058220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 407 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 6406557 - 6406391
Alignment:
Q  407 attgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgct 506  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6406557 attgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaaccttgatgataaaggaattaatgggctttgattaatttcttggtatttaacttgtgct 6406458  T
Q  507 cttgcgtgattaactaagataggaacaa-gtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    |||| ||| |||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  6406457 cttgagtgtttaactaagacaggaacaatgtttaaa-tcataccaagatacaagaaatcaaaggacat 6406391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 82; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 409 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 7847504 - 7847339
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  7847504 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 7847405  T
Q  509 tgcgtgatta-actaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    || ||| ||| ||||||| |||||||||  | || |||||||||||| || | |||||||||||||    
T  7847404 tgagtgtttatactaagacaggaacaaggattaaatcataccaagatgcataaaatcaaaggacat 7847339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 408 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 18106242 - 18106077
Alignment:
Q  408 ttgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctc 507  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  18106242 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaaccaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 18106143  T
Q  508 ttgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    ||| ||| || ||||||| |||||||||  |  | |||||||||||  |||  |||||||||||||    
T  18106142 ttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacat 18106077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 408 - 573
Target Start/End: Original strand, 44888075 - 44888240
Alignment:
Q  408 ttgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctc 507  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  44888075 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 44888174  T
Q  508 ttgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    ||| ||| || ||||||| |||||||||  |  | | |||||||||||||   |||||||||||||    
T  44888175 ttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttgaataataccaagatacatgaaatcaaaggacat 44888240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 407 - 573
Target Start/End: Original strand, 1292685 - 1292851
Alignment:
Q  407 attgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgct 506  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |    
T  1292685 attgttgaggaaaaatccctaattaattttaaagataataaaccttgatgattaaggaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgat 1292784  T
Q  507 cttgcgtgattaactaagataggaacaa-gtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
     ||| ||| || | ||||| | |||||| || |||||| |||||||||| |||  ||||||| |||||    
T  1292785 attgagtgttttattaagacatgaacaaggtttaaatt-ataccaagattcaagaaatcaaatgacat 1292851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 407 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 3488662 - 3488495
Alignment:
Q  407 attgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgct 506  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  3488662 attgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgct 3488563  T
Q  507 cttgcgtg-attaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    |||| |||  || ||||||| |||||||||  |  | |||||||||||| || | |||||||||||||    
T  3488562 cttgagtgtttttactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggacat 3488495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 407 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 5294170 - 5294003
Alignment:
Q  407 attgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgct 506  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  5294170 attgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgct 5294071  T
Q  507 cttgcgtg-attaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    |||| |||  || ||||||| |||||||||  |  | |||||||||||| || | |||||||||||||    
T  5294070 cttgagtgttttcactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggacat 5294003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 407 - 573
Target Start/End: Original strand, 21854722 - 21854889
Alignment:
Q  407 attgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgct 506  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  21854722 attgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgct 21854821  T
Q  507 cttgcgtg-attaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    |||| |||  || ||||||| |||||||||  |  | |||||||||||| || | |||||||||||||    
T  21854822 cttgagtgttttcactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggacat 21854889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 407 - 573
Target Start/End: Original strand, 21910585 - 21910752
Alignment:
Q  407 attgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgct 506  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  21910585 attgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgct 21910684  T
Q  507 cttgcgtg-attaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    |||| |||  || ||||||| |||||||||  |  | |||||||||||| || | |||||||||||||    
T  21910685 cttgagtgttttcactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggacat 21910752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 407 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 27681832 - 27681665
Alignment:
Q  407 attgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgct 506  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  27681832 attgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgct 27681733  T
Q  507 cttgcgtg-attaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    |||| |||  || ||||||| |||||||||  |  | |||||||||||| || | |||||||||||||    
T  27681732 cttgagtgttttcactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggacat 27681665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 407 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 27691443 - 27691276
Alignment:
Q  407 attgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgct 506  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  27691443 attgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgct 27691344  T
Q  507 cttgcgtg-attaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    |||| |||  || ||||||| |||||||||  |  | |||||||||||| || | |||||||||||||    
T  27691343 cttgagtgttttcactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggacat 27691276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 409 - 573
Target Start/End: Original strand, 11476422 - 11476587
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaa-ccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctc 507  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || | || ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||    
T  11476422 tgttgaggcaaaatccttaatttattttaatgataataaaacccttatgattaaagaattaatggactttgatgaatttcttggtatttaacttgcactc 11476521  T
Q  508 ttgcgtgattaactaagataggaacaa-gtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    ||| ||| || |||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  11476522 ttgagtgttttactaagataggaacaaggtataaatt-ataccaagatacaagaaatcaaaggacat 11476587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 407 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 17985601 - 17985435
Alignment:
Q  407 attgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgct 506  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  17985601 attgttgagacaaaatccctaattaattttaaagataataaaccaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgct 17985502  T
Q  507 cttgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    |||| ||| || ||||||| |||||||||  | |  |||||||||||  |||  |||||||||||||    
T  17985501 cttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttagatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacat 17985435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 408 - 573
Target Start/End: Original strand, 21845294 - 21845460
Alignment:
Q  408 ttgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctc 507  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  21845294 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 21845393  T
Q  508 ttgcgtg-attaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    ||| |||  || ||||||| |||||||||  |  | |||||||||||| || | |||||||||||||    
T  21845394 ttgagtgttttcactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggacat 21845460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 408 - 573
Target Start/End: Original strand, 21901157 - 21901323
Alignment:
Q  408 ttgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctc 507  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  21901157 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 21901256  T
Q  508 ttgcgtg-attaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    ||| |||  || ||||||| |||||||||  |  | |||||||||||| || | |||||||||||||    
T  21901257 ttgagtgttttcactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggacat 21901323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 409 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 5303782 - 5303617
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  5303782 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 5303683  T
Q  509 tgcgtg-attaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    || |||  || ||||||| |||||||||  |  | |||||||||||| || | |||||||||||||    
T  5303682 tgagtgttttcactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggacat 5303617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 409 - 573
Target Start/End: Original strand, 16471979 - 16472143
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  16471979 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 16472078  T
Q  509 tgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    |  ||  || ||||||| |||||||||  | || | ||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  16472079 taagtattttactaagacaggaacaaggtttaaataataccaagacacaagaaatcaaaggacat 16472143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 407 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 17829309 - 17829142
Alignment:
Q  407 attgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgct 506  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  17829309 attgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgct 17829210  T
Q  507 cttgcgtg-attaactaagataggaacaa-gtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    |||| |||  || ||||||| |||||||| || | || |||||||||||| || | |||||||||||||    
T  17829209 cttgagtgttttcactaagacaggaacaaggtctgaa-tcataccaagatgcataaaatcaaaggacat 17829142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 409 - 573
Target Start/End: Original strand, 40921027 - 40921191
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    || ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  40921027 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 40921126  T
Q  509 tgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    || ||| || ||||||| |||||||||  |  | |||||||||||  |||  |||||||||||||    
T  40921127 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacat 40921191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 408 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 17838699 - 17838533
Alignment:
Q  408 ttgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctc 507  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  17838699 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 17838600  T
Q  508 ttgcgtg-attaactaagataggaacaa-gtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    ||| |||  || ||||||| |||||||| || | || |||||||||||| || | |||||||||||||    
T  17838599 ttgagtgttttcactaagacaggaacaaggtctgaa-tcataccaagatgcataaaatcaaaggacat 17838533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 408 - 573
Target Start/End: Original strand, 2828879 - 2829045
Alignment:
Q  408 ttgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctc 507  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  2828879 ttgttgaggcaaaatctctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttgatatttaacttgtgctc 2828978  T
Q  508 ttgcgtg-attaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    ||| |||  || ||||||| |||||||||  | || |||||||||||||||   |||||||||||||    
T  2828979 ttgagtgtttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagatacatgaaatcaaaggacat 2829045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 408 - 573
Target Start/End: Original strand, 16248385 - 16248551
Alignment:
Q  408 ttgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctc 507  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  16248385 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 16248484  T
Q  508 ttgcgtg-attaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    ||| |||  || ||||||| |||||||||  |  | |||||||||||| || | |||||||||||||    
T  16248485 ttgagtgttttcactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggacat 16248551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 407 - 553
Target Start/End: Original strand, 26330558 - 26330704
Alignment:
Q  407 attgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgct 506  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||   || ||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |    
T  26330558 attgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaaccaatatgattagagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgat 26330657  T
Q  507 cttgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaaga 553  Q
    |||||||| || ||||||| | |||||||  | || |||||||||||    
T  26330658 cttgcgtgttttactaagacatgaacaaggtttaaatcataccaaga 26330704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 409 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 3497927 - 3497762
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  3497927 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 3497828  T
Q  509 tgcgtg-attaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    || |||  || ||||||| |||||||||  |  | ||||| |||||| || | |||||||||||||    
T  3497827 tgagtgtttttactaagacaggaacaaggtttgaatcataacaagatgcataaaatcaaaggacat 3497762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 409 - 573
Target Start/End: Original strand, 12865667 - 12865832
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  12865667 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 12865766  T
Q  509 tgcgtg-attaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    || |||  || ||||||| ||||||||   |  | |||||||||||| || | |||||||||||||    
T  12865767 tgagtgttttcactaagacaggaacaaaatttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggacat 12865832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 408 - 573
Target Start/End: Original strand, 52498464 - 52498629
Alignment:
Q  408 ttgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctc 507  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||   || ||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  52498464 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataatgaaccaatattattaaagaattaatgaactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 52498563  T
Q  508 ttgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    ||| ||| || ||||||| |||||||||  | ||  ||||||||||  |||  |||||||||||||    
T  52498564 ttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaaacataccaagaatcaagaaatcaaaggacat 52498629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 407 - 573
Target Start/End: Original strand, 6691315 - 6691482
Alignment:
Q  407 attgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgct 506  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||   || ||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  6691315 attgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaaccaatatgattaaagaattaatggactttgattaatcccttggtatttaacttgtgct 6691414  T
Q  507 cttgcgtg-attaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    |||| |||  || ||||||| |||| ||||  |  | |||||||||||| || | |||||||||||||    
T  6691415 cttgagtgttttcactaagacaggatcaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggacat 6691482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 407 - 573
Target Start/End: Original strand, 6701721 - 6701888
Alignment:
Q  407 attgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgct 506  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||   || ||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  6701721 attgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaaccaatatgattaaagaattaatggactttgattaatcccttggtatttaacttgtgct 6701820  T
Q  507 cttgcgtg-attaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    |||| |||  || ||||||| |||| ||||  |  | |||||||||||| || | |||||||||||||    
T  6701821 cttgagtgttttcactaagacaggatcaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggacat 6701888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 409 - 573
Target Start/End: Original strand, 16252746 - 16252911
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaattta-ttttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctc 507  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  16252746 tgttgaggcaaaatccctaaattaattttaaagataataaaccaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 16252845  T
Q  508 ttgcgtgattaactaagataggaacaa-gtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    ||| ||| || | ||||| |||||||| || |||| |||||||||||  |||  |||||||||||||    
T  16252846 ttgagtgttttaataagacaggaacaatgtttaaa-tcataccaagaatcaagaaatcaaaggacat 16252911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 409 - 573
Target Start/End: Original strand, 16628840 - 16629006
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  16628840 tgttgaggcaaaatccctaagtaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 16628939  T
Q  509 tgcgtg-attaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagataca-aagaatcaaaggacat 573  Q
    || |||  || ||||||| |||||||||  |  | |||||||||||| || || |||||||||||||    
T  16628940 tgagtgttttcactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaaatcaaaggacat 16629006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 972 - 1059
Target Start/End: Original strand, 41525986 - 41526072
Alignment:
Q  972 aacattctgaagtcccctgagttcagaaagttcaatcctgctccatgcttttttctgacgtgaacagtacagtggttggaaagcaaaa 1059  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41525986 aacattctgaagtctcctgagttcagaaagttcgatcctgctccatgc-tttttctgacatgaacagtacagtggttggaaagtaaaa 41526072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 409 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 3606773 - 3606608
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  3606773 tgttgaggcaaaatccctgattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttaattaattccttggtatttaacttgtgctct 3606674  T
Q  509 tgcgtg-attaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    || |||  |||||||||| || || |||  |  | |||||||||||| || | |||||||||||||    
T  3606673 tgagtgttttaactaagacagaaaaaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggacat 3606608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 432 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 9836750 - 9836609
Alignment:
Q  432 attttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctcttgcgtgattaactaagataggaa 531  Q
    ||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| | | |||    
T  9836750 attttaaagataataaacctttatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctcttgagtgttttactaaaacaagaa 9836651  T
Q  532 caagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    ||||  |  | |||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  9836650 caaggttttaatcataccaagattcaagaaatcaaaggacat 9836609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 409 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 14601428 - 14601327
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  14601428 tgttgaggcaaaattcctaattaattttaaagataatacaccttaatgattaaggaattaatgaactttgattaattcctaggtatttaacttgtgctct 14601329  T
Q  509 tg 510  Q
    ||    
T  14601328 tg 14601327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 409 - 573
Target Start/End: Original strand, 17160573 - 17160737
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  17160573 tgttaaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaaccaatatgattaaagaattaatggactttgattaattcattggtatttaacttgcgctct 17160672  T
Q  509 tgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    || ||  || ||||||| | |||||||  |  | |||||||||||  |||  |||||||||||||    
T  17160673 tgagtatttcactaagacatgaacaaggtttcaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacat 17160737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 407 - 534
Target Start/End: Original strand, 15668520 - 15668647
Alignment:
Q  407 attgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgct 506  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||   || ||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  15668520 attgttgaggctaaatccctaattaattttaaagataataaaccaatatgattatagaattaatggactttgattaattccttggtatgtaacttgtgct 15668619  T
Q  507 cttgcgtgattaactaagataggaacaa 534  Q
    |||| ||| || || |||| ||||||||    
T  15668620 cttgagtgttttaccaagacaggaacaa 15668647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 753 - 968
Target Start/End: Original strand, 41525532 - 41525745
Alignment:
Q  753 atcaatcaaggaataaaagcatttatttg-attaaagtcaaaaagggcatcttcaatgttcatttaagact-atgaacaattgaagtacaaaacgttagg 850  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||| || ||||||||||   |||| |||| ||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||||   |||||    
T  41525532 atcaatcaaggattaaagacatttatttggataaaagtcaaaa---gcatattcattgtacattaaagacttatgaacaattgaattacaaata-ttagg 41525627  T
Q  851 aatattccattaagaatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcataaatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaat 950  Q
    ||||||||  ||||||| ||||| || ||||| | |||| ||||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||| || |  |  ||||||||||    
T  41525628 aatattcctataagaatatcatcttaaatgttatacatgatgcacttcatttatgttttactattaggatttaattacatcaaatggatgtcttacaaat 41525727  T
Q  951 cattctaagtgaaacaaa 968  Q
    ||| |||||| |||||||    
T  41525728 catcctaagtaaaacaaa 41525745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 405 - 573
Target Start/End: Original strand, 4417024 - 4417199
Alignment:
Q  405 gaattgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaat-------ttgttggtattta 497  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||  |       || || |||||||    
T  4417024 gaattgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttgatgattaaggaattaatagattttgattttttattttattttttgtattta 4417123  T
Q  498 acttgtgctcttgcgtgattaactaagataggaac-aagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    | |||| |||||| ||| |||||||||| |  ||| |||| || | ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4417124 aattgtactcttgagtgtttaactaagacaataacaaagtttaca-tcataccaagatacaaaaaatcaaaggacat 4417199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 409 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 13403751 - 13403648
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttga-taattaa-ggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgct 506  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  || | | ||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  13403751 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaattttaaatgattaaaggaattaatcgactttgattaattccttggtatttaacttgtgct 13403652  T
Q  507 cttg 510  Q
    ||||    
T  13403651 cttg 13403648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 804 - 981
Target Start/End: Complemental strand, 9836397 - 9836227
Alignment:
Q  804 tcaatgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaag-aatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcataa 902  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||       |||||||||||||  | | ||| ||||||||||||||||     |||| ||||||      
T  9836397 tcaatgttcatttaagactatgaaca-ttgaagtac-------taggaatattccaaaagggaatatcatcctagatgttttaatcactgctcttcattg 9836306  T
Q  903 atgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |   | ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  9836305 ttgtttcactattaggatttgattatatcaaatggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaacaaaaggaacattctga 9836227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 904 - 981
Target Start/End: Complemental strand, 6406068 - 6405991
Alignment:
Q  904 tgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| || || || |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  6406068 tgtttcactattagaatttgattacatcaaatagaagtcttacaaatcatcataagtgaaacaaaaggaacattctga 6405991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 803 - 981
Target Start/End: Original strand, 6691948 - 6692119
Alignment:
Q  803 ttcaatgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaag-aatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcata 901  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||       |||||||||| ||  ||| ||| |||||||||||||| ||    |||| ||||||     
T  6691948 ttcaatgttcatttaagactatgaaca-ttgatgtac-------taggaatatttcacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcatt 6692039  T
Q  902 aatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||    
T  6692040 attgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctga 6692119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 803 - 981
Target Start/End: Original strand, 6702354 - 6702525
Alignment:
Q  803 ttcaatgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaag-aatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcata 901  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||       |||||||||| ||  ||| ||| |||||||||||||| ||    |||| ||||||     
T  6702354 ttcaatgttcatttaagactatgaaca-ttgatgtac-------taggaatatttcacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcatt 6702445  T
Q  902 aatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||    
T  6702446 attgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctga 6702525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 803 - 981
Target Start/End: Original strand, 21845833 - 21846004
Alignment:
Q  803 ttcaatgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaag-aatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcata 901  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||       |||||||||| ||  ||| ||| |||||||||||||| ||    |||| ||||||     
T  21845833 ttcaatgttcatttaagactatgaaca-ttgatgtac-------taggaatatttcacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcatt 21845924  T
Q  902 aatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||    
T  21845925 attgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctga 21846004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 803 - 981
Target Start/End: Original strand, 21855425 - 21855596
Alignment:
Q  803 ttcaatgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaag-aatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcata 901  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||       |||||||||| ||  ||| ||| |||||||||||||| ||    |||| ||||||     
T  21855425 ttcaatgttcatttaagactatgaaca-ttgatgtac-------taggaatatttcacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcatt 21855516  T
Q  902 aatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||    
T  21855517 attgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctga 21855596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 803 - 981
Target Start/End: Original strand, 21901696 - 21901867
Alignment:
Q  803 ttcaatgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaag-aatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcata 901  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||       |||||||||| ||  ||| ||| |||||||||||||| ||    |||| ||||||     
T  21901696 ttcaatgttcatttaagactatgaaca-ttgatgtac-------taggaatatttcacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcatt 21901787  T
Q  902 aatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||    
T  21901788 attgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctga 21901867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 803 - 981
Target Start/End: Original strand, 21911288 - 21911459
Alignment:
Q  803 ttcaatgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaag-aatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcata 901  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||       |||||||||| ||  ||| ||| |||||||||||||| ||    |||| ||||||     
T  21911288 ttcaatgttcatttaagactatgaaca-ttgatgtac-------taggaatatttcacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcatt 21911379  T
Q  902 aatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||    
T  21911380 attgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctga 21911459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 803 - 981
Target Start/End: Original strand, 40921573 - 40921744
Alignment:
Q  803 ttcaatgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaag-aatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcata 901  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||       |||||||||| ||  ||| ||| |||||||||||||| ||    |||| ||||||     
T  40921573 ttcaatgttcatttaagactatgaaca-ttgatgtac-------taggaatatttcacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcatt 40921664  T
Q  902 aatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||    
T  40921665 attgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctga 40921744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 803 - 981
Target Start/End: Complemental strand, 5293427 - 5293256
Alignment:
Q  803 ttcaatgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaag-aatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcata 901  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||       |||||||||| ||  ||| ||| |||||||||||||| |     |||| ||||||     
T  5293427 ttcaatgttcatttaagactatgaaca-ttgatgtac-------taggaatatttcacaaaggaatatcatcctagatgttattatcactgctcttcatt 5293336  T
Q  902 aatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||    
T  5293335 attgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctga 5293256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 803 - 981
Target Start/End: Complemental strand, 5303086 - 5302915
Alignment:
Q  803 ttcaatgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaag-aatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcata 901  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||       |||||||||| ||  ||| ||| |||||||||||||| |     |||| ||||||     
T  5303086 ttcaatgttcatttaagactatgaaca-ttgatgtac-------taggaatatttcacaaaggaatatcatcctagatgttattatcactgctcttcatt 5302995  T
Q  902 aatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||    
T  5302994 attgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctga 5302915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 803 - 981
Target Start/End: Original strand, 16249176 - 16249347
Alignment:
Q  803 ttcaatgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaag-aatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcata 901  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||       |||||||||| ||  ||| ||| |||||||||||||| |     |||| ||||||     
T  16249176 ttcaatgttcatttaagactatgaaca-ttgatgtac-------taggaatatttcacaaaggaatatcatcctagatgttattatcactgctcttcatt 16249267  T
Q  902 aatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||    
T  16249268 attgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctga 16249347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 803 - 981
Target Start/End: Original strand, 16253142 - 16253313
Alignment:
Q  803 ttcaatgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaag-aatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcata 901  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||       |||||||||||||  | | ||| ||||||||||||||     | |||| ||||||     
T  16253142 ttcaatgttcatttaagactatgaaca-ttgatgtac-------taggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaaaattactgctcttcatt 16253233  T
Q  902 aatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||    
T  16253234 attgtttcactattaggatttgattacatcaaatggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctga 16253313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 803 - 981
Target Start/End: Complemental strand, 27681090 - 27680919
Alignment:
Q  803 ttcaatgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaag-aatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcata 901  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||       |||||||||| ||  ||| ||| |||||||||||||| |     |||| ||||||     
T  27681090 ttcaatgttcatttaagactatgaaca-ttgatgtac-------taggaatatttcacaaaggaatatcatcctagatgttattatcactgctcttcatt 27680999  T
Q  902 aatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||    
T  27680998 attgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctga 27680919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 803 - 981
Target Start/End: Complemental strand, 27690745 - 27690574
Alignment:
Q  803 ttcaatgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaag-aatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcata 901  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||       |||||||||| ||  ||| ||| |||||||||||||| |     |||| ||||||     
T  27690745 ttcaatgttcatttaagactatgaaca-ttgatgtac-------taggaatatttcacaaaggaatatcatcctagatgttattatcactgctcttcatt 27690654  T
Q  902 aatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||    
T  27690653 attgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctga 27690574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 890 - 981
Target Start/End: Complemental strand, 3487881 - 3487790
Alignment:
Q  890 ctgcacttcataaatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    |||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||    
T  3487881 ctgctcttcatcattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctga 3487790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 890 - 981
Target Start/End: Complemental strand, 3497204 - 3497113
Alignment:
Q  890 ctgcacttcataaatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    |||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||    
T  3497204 ctgctcttcatcattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctga 3497113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 904 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 13793304 - 13793229
Alignment:
Q  904 tgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattct 979  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||    
T  13793304 tgtttcactattaggatttgattacatcaaatggtagtcttacaaatcatcctaaatgaaacaaaaggaacattct 13793229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 890 - 981
Target Start/End: Original strand, 15668997 - 15669088
Alignment:
Q  890 ctgcacttcataaatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    |||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||| | |||||||||||| | ||||||||||    
T  15668997 ctgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatggtagtcttacaaatcatccaaagtgaaacaaatggaacattctga 15669088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 890 - 981
Target Start/End: Original strand, 16241871 - 16241962
Alignment:
Q  890 ctgcacttcataaatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    |||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||    
T  16241871 ctgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctga 16241962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 890 - 981
Target Start/End: Complemental strand, 17985123 - 17985032
Alignment:
Q  890 ctgcacttcataaatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    |||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||    
T  17985123 ctgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctga 17985032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 890 - 981
Target Start/End: Complemental strand, 18105674 - 18105583
Alignment:
Q  890 ctgcacttcataaatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    |||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||    
T  18105674 ctgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctga 18105583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 413 - 523
Target Start/End: Original strand, 40883821 - 40883931
Alignment:
Q  413 gaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctcttgcg 512  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| || ||  ||||| | |||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||| | ||| |    
T  40883821 gaggcaaaattcctaattaattttaaagataataaatctcgacgattaaaggattaatagacttttatcaattttttggtatttaatttgtgtttttgag 40883920  T
Q  513 tgattaactaa 523  Q
    || ||||||||    
T  40883921 tgtttaactaa 40883931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 904 - 981
Target Start/End: Complemental strand, 13403281 - 13403204
Alignment:
Q  904 tgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||    
T  13403281 tgtttcactattaggatttgattacatcaaatggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctga 13403204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 904 - 981
Target Start/End: Original strand, 26331049 - 26331126
Alignment:
Q  904 tgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||    
T  26331049 tgtttcactattaggatttgattacatcaaatggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctga 26331126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 895 - 981
Target Start/End: Original strand, 17161053 - 17161139
Alignment:
Q  895 cttcataaatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||| ||||||| |||||||||||| | | ||||||||||    
T  17161053 cttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatggtagtcttataaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctga 17161139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 904 - 966
Target Start/End: Original strand, 52498955 - 52499017
Alignment:
Q  904 tgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaaca 966  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||| ||||||||||||    
T  52498955 tgtttcactattaggatttgattacatcaaatggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaaca 52499017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 895 - 969
Target Start/End: Original strand, 19917980 - 19918054
Alignment:
Q  895 cttcataaatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaa 969  Q
    |||||| | |||||||||||||||| |||||||||| || |  |  |||| |||||||| |||||||||||||||    
T  19917980 cttcattattgtttcactattaggaattgattacatcaaatggatgtcttgcaaatcatcctaagtgaaacaaaa 19918054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 904 - 981
Target Start/End: Original strand, 11476745 - 11476822
Alignment:
Q  904 tgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| || |   | ||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  11476745 tgtttcactattagaattttattacatcaaatggtattcttacagattatcctaagtgaaacaaaaggaacattctga 11476822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 409 - 473
Target Start/End: Original strand, 16241630 - 16241695
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccct-aatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatgga 473  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||   || ||||| |||||||||||    
T  16241630 tgttgaggcaaaatccctaaattaattttaaagataataaaccaatatgattaaagaattaatgga 16241695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0764 (Bit Score: 578; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0764
Description:

Target: scaffold0764; HSP #1
Raw Score: 578; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 407 - 1060
Target Start/End: Complemental strand, 1543 - 891
Alignment:
Q  407 attgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgct 506  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1543 attgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgatgattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgct 1444  T
Q  507 cttgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacataaagacttaagaactcagtcagagttcagaaag 606  Q
    |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1443 cttgagtggttaactaagacaggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacataaagacttaagaactcagttagagttcagaaag 1344  T
Q  607 ttaaaaagagttcagaaggttgggcagagtttagaaggttgttcgtgatgaacatcaagaaccaagcccagaaattcatgaactaaatgaagaacatgca 706  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1343 ttaaaaagagttcagaaggttggacagagttcagaaggttgttcatgatgaacatcaagaaccaagcccagaaattcatgaactaaatgaagaacatgca 1244  T
Q  707 aggttcacgtgacttaaatgaaagcctagaaaagtacatgactaagatcaatcaaggaataaaagcatttatttgattaaagtcaaaaagggcatcttca 806  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1243 aggttcacgtgacttaaatgaaagcccagaaaagtacatgactgagatcaatcaaggaataaaaacatttatttgattaaagtcaaaaagggcatcttca 1144  T
Q  807 atgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaagaatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcataaatgt 906  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1143 atgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacattaggaatattccattaagaatatcatcctagatgttttccatgctgcacttcataaatgt 1044  T
Q  907 ttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctgaagtcccctgagttcagaaagttcaa 1006  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  1043 ttcactattaggatttgattacattaattacaagtcttacaaatcatcctaagtgaaacaaaagaaacattctgaagtcccctgagttcagaatgttcga 944  T
Q  1007 tcctgctccatgcttttttctgacgtgaacagtacagtggttggaaagcaaaag 1060  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  943 tcctgctccatgct-ttttctgacgtgaacagtacagtggttggaaagcaaaag 891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0313 (Bit Score: 578; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0313
Description:

Target: scaffold0313; HSP #1
Raw Score: 578; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 407 - 1060
Target Start/End: Original strand, 5066 - 5718
Alignment:
Q  407 attgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgct 506  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5066 attgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgatgattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgct 5165  T
Q  507 cttgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacataaagacttaagaactcagtcagagttcagaaag 606  Q
    |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5166 cttgagtggttaactaagacaggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacataaagacttaagaactcagttagagttcagaaag 5265  T
Q  607 ttaaaaagagttcagaaggttgggcagagtttagaaggttgttcgtgatgaacatcaagaaccaagcccagaaattcatgaactaaatgaagaacatgca 706  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5266 ttaaaaagagttcagaaggttggacagagttcagaaggttgttcatgatgaacatcaagaaccaagcccagaaattcatgaactaaatgaagaacatgca 5365  T
Q  707 aggttcacgtgacttaaatgaaagcctagaaaagtacatgactaagatcaatcaaggaataaaagcatttatttgattaaagtcaaaaagggcatcttca 806  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5366 aggttcacgtgacttaaatgaaagcccagaaaagtacatgactgagatcaatcaaggaataaaaacatttatttgattaaagtcaaaaagggcatcttca 5465  T
Q  807 atgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaagaatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcataaatgt 906  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5466 atgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacattaggaatattccattaagaatatcatcctagatgttttccatgctgcacttcataaatgt 5565  T
Q  907 ttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctgaagtcccctgagttcagaaagttcaa 1006  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  5566 ttcactattaggatttgattacattaattacaagtcttacaaatcatcctaagtgaaacaaaagaaacattctgaagtcccctgagttcagaatgttcga 5665  T
Q  1007 tcctgctccatgcttttttctgacgtgaacagtacagtggttggaaagcaaaag 1060  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5666 tcctgctccatgc-tttttctgacgtgaacagtacagtggttggaaagcaaaag 5718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0313; HSP #2
Raw Score: 578; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 407 - 1060
Target Start/End: Original strand, 19223 - 19875
Alignment:
Q  407 attgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgct 506  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19223 attgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgatgattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgct 19322  T
Q  507 cttgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacataaagacttaagaactcagtcagagttcagaaag 606  Q
    |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19323 cttgagtggttaactaagacaggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacataaagacttaagaactcagttagagttcagaaag 19422  T
Q  607 ttaaaaagagttcagaaggttgggcagagtttagaaggttgttcgtgatgaacatcaagaaccaagcccagaaattcatgaactaaatgaagaacatgca 706  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19423 ttaaaaagagttcagaaggttggacagagttcagaaggttgttcatgatgaacatcaagaaccaagcccagaaattcatgaactaaatgaagaacatgca 19522  T
Q  707 aggttcacgtgacttaaatgaaagcctagaaaagtacatgactaagatcaatcaaggaataaaagcatttatttgattaaagtcaaaaagggcatcttca 806  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19523 aggttcacgtgacttaaatgaaagcccagaaaagtacatgactgagatcaatcaaggaataaaaacatttatttgattaaagtcaaaaagggcatcttca 19622  T
Q  807 atgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaagaatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcataaatgt 906  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19623 atgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacattaggaatattccattaagaatatcatcctagatgttttccatgctgcacttcataaatgt 19722  T
Q  907 ttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctgaagtcccctgagttcagaaagttcaa 1006  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  19723 ttcactattaggatttgattacattaattacaagtcttacaaatcatcctaagtgaaacaaaagaaacattctgaagtcccctgagttcagaatgttcga 19822  T
Q  1007 tcctgctccatgcttttttctgacgtgaacagtacagtggttggaaagcaaaag 1060  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19823 tcctgctccatgc-tttttctgacgtgaacagtacagtggttggaaagcaaaag 19875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 573; Significance: 0; HSPs: 55)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 573; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 408 - 1060
Target Start/End: Original strand, 34764655 - 34765306
Alignment:
Q  408 ttgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctc 507  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34764655 ttgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgatgattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctc 34764754  T
Q  508 ttgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacataaagacttaagaactcagtcagagttcagaaagt 607  Q
    ||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34764755 ttgagtggttaactaagacaggaacaagtgtaaattcatacgaagatacaaagaatcaaaggacataaagacttaagaactcagttagagttcagaaagt 34764854  T
Q  608 taaaaagagttcagaaggttgggcagagtttagaaggttgttcgtgatgaacatcaagaaccaagcccagaaattcatgaactaaatgaagaacatgcaa 707  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34764855 taaaaagagttcagaaggttggacagagttcagaaggttgttcatgatgaacatcaagaaccaagcccagaaattcatgaactaaatgaagaacatgcaa 34764954  T
Q  708 ggttcacgtgacttaaatgaaagcctagaaaagtacatgactaagatcaatcaaggaataaaagcatttatttgattaaagtcaaaaagggcatcttcaa 807  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34764955 ggttcacgtgacttaaatgaaagcccagaaaagtacatgactgagatcaatcaaggaataaaaacatttatttgattaaagtcaaaaagggcatcttcaa 34765054  T
Q  808 tgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaagaatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcataaatgtt 907  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34765055 tgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacattaggaatattccattaagaatatcatcctagatgttttccatgctgcacttcataaatgtt 34765154  T
Q  908 tcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctgaagtcccctgagttcagaaagttcaat 1007  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  34765155 tcactattaggatttgattacattaattacaagtcttacaaatcatcctaagtgaaacaaaagaaacattctgaagtcccctgagttcagaatgttcgat 34765254  T
Q  1008 cctgctccatgcttttttctgacgtgaacagtacagtggttggaaagcaaaag 1060  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34765255 cctgctccatgc-tttttctgacgtgaacagtacagtggttggaaagcaaaag 34765306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 410; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 409 - 1054
Target Start/End: Complemental strand, 8563965 - 8563338
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8563965 tgttgaggccaaatccctaattaattttaaagttaacaaaccttgatgattaaggaagtaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 8563866  T
Q  509 tgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacataaagacttaa-gaactcagtcagagttcagaaagt 607  Q
    || ||| |||||||||| ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8563865 tgagtggttaactaagacaggaaaaagtttcaatttataccaagatacaaagaatcaaaggacataaagacttaaagaactcagtcagagttcagaaagt 8563766  T
Q  608 taaaaagagttcagaaggttgggcagagtttagaaggttgttcgtgatgaacatcaagaaccaagcccagaaattcatgaactaaatgaagaacatgcaa 707  Q
    |||| |||||||||||                   |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8563765 taaagagagttcagaa-------------------ggttgttcatgatgaacatcaagagtcaagcccagaaattcatgaaccaaatgaagaacatgcaa 8563685  T
Q  708 ggttcacgtgacttaaatgaaagcctagaaaagtacat-gactaagatcaatcaaggaataaaagcatttatttgattaaagtcaaaaagggcatcttca 806  Q
    |||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8563684 ggttcacgtgacttaaataaaagcccagtaaagtacattgactaagatcaatcaaggaataaaggcatttatttgattaaagtcaaaaaggacatcttca 8563585  T
Q  807 atgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaagaatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcataaatgt 906  Q
    |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8563584 atgttcattctagactatgaacatttgaagtacaaaacattaggaatattccattaagaatatcatcctagatgttttccatgctgcacttcataaatgt 8563485  T
Q  907 ttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctgaagtcccctgagttcagaaagttcaa 1006  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  8563484 ttcaatattaggatttgattacatcaattaagagtcttacaaatcatcctaagtgaaacaaaaggaacattctgaagtcccctaagttcagaaagttcga 8563385  T
Q  1007 tcctgctccatgcttttttctgacgtgaacagtacagtggttggaaag 1054  Q
    || ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8563384 tcttgctccatgct-ttttctgacatgaacagtacagtggttggaaag 8563338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 367; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 544 - 1049
Target Start/End: Complemental strand, 22224198 - 22223693
Alignment:
Q  544 cataccaagatacaaagaatcaaaggacataaagacttaagaactcagtcagagttcagaaagttaaaaagagttcagaaggttgggcagagtttagaag 643  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||    
T  22224198 catatcaagatacaaagaatcaaaggacataaagacctaagaactcagtaagagttcagaaagttaaaaagagttcagaaggttggacatagttcagaag 22224099  T
Q  644 gttgttcgtgatgaacatcaagaaccaagcccagaaattcatgaactaaatgaagaacatgcaaggttcacgtgacttaaatgaaagcctagaaaagtac 743  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||    
T  22224098 gttgttcatgatgaacatcaagaaccaagcccagaaattcatgaaccaaatgaagaacatgcaaggttcacgtgacttaaataaaagcccagtaaagtac 22223999  T
Q  744 at-gactaagatcaatcaaggaataaaagcatttatttgattaaagtcaaaaagggcatcttcaatgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaa 842  Q
    || ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  22223998 attgactaagatcaattaaggaataaaggcatttatttgattaaagtcaaaaaggacatcttcaatgttcattcaagactatgaacatttgaagtacaaa 22223899  T
Q  843 acgttaggaatattccattaagaatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcataaatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatc 942  Q
    |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  22223898 aaattaggaatattccattaagaatatcatcctagatgttttccatgctgcacttcataaatgtttcactattaggatttgattacatcaattaaaagtc 22223799  T
Q  943 ttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctgaagtcccctgagttcagaaagttcaatcctgctccatgcttttttctgacgtgaacagtaca 1042  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||  |||||||||||||| |||||| || |||||||||||    
T  22223798 ttacaaatcatcctaagtgaaacaaaagaaacattctgaagtcccatgagttgagaatgttcgttcctgctccatgct-ttttctaacatgaacagtaca 22223700  T
Q  1043 gtggttg 1049  Q
    || ||||    
T  22223699 gtagttg 22223693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 367; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 544 - 1049
Target Start/End: Complemental strand, 22250033 - 22249528
Alignment:
Q  544 cataccaagatacaaagaatcaaaggacataaagacttaagaactcagtcagagttcagaaagttaaaaagagttcagaaggttgggcagagtttagaag 643  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||    
T  22250033 catatcaagatacaaagaatcaaaggacataaagacctaagaactcagtaagagttcagaaagttaaaaagagttcagaaggttggacatagttcagaag 22249934  T
Q  644 gttgttcgtgatgaacatcaagaaccaagcccagaaattcatgaactaaatgaagaacatgcaaggttcacgtgacttaaatgaaagcctagaaaagtac 743  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||    
T  22249933 gttgttcatgatgaacatcaagaaccaagcccagaaattcatgaaccaaatgaagaacatgcaaggttcacgtgacttaaataaaagcccagtaaagtac 22249834  T
Q  744 at-gactaagatcaatcaaggaataaaagcatttatttgattaaagtcaaaaagggcatcttcaatgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaa 842  Q
    || ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  22249833 attgactaagatcaattaaggaataaaggcatttatttgattaaagtcaaaaaggacatcttcaatgttcattcaagactatgaacatttgaagtacaaa 22249734  T
Q  843 acgttaggaatattccattaagaatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcataaatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatc 942  Q
    |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  22249733 aaattaggaatattccattaagaatatcatcctagatgttttccatgctgcacttcataaatgtttcactattaggatttgattacatcaattaaaagtc 22249634  T
Q  943 ttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctgaagtcccctgagttcagaaagttcaatcctgctccatgcttttttctgacgtgaacagtaca 1042  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||  |||||||||||||| |||||| || |||||||||||    
T  22249633 ttacaaatcatcctaagtgaaacaaaagaaacattctgaagtcccatgagttgagaatgttcgttcctgctccatgct-ttttctaacatgaacagtaca 22249535  T
Q  1043 gtggttg 1049  Q
    || ||||    
T  22249534 gtagttg 22249528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 417 - 917
Target Start/End: Complemental strand, 24371033 - 24370554
Alignment:
Q  417 caaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctcttgcgtgat 516  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  24371033 caaaatccctaattaattttaaaaataacaaaccttgatgattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctcttgagtggt 24370934  T
Q  517 taactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacataaagacttaagaactcagtcagagttcagaaagttaaaaagag 616  Q
    ||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  24370933 taactaagacaggaacaagtttcaattcataccaagatacaaagaatcaa-ggacataaagacttaagaactcagtcaaagttcaaaaagttaaaaagag 24370835  T
Q  617 ttcagaaggttgggcagagtttagaaggttgttcgtgatgaacatcaagaaccaagcccagaaattcatgaactaaatgaagaacatgcaaggttcacgt 716  Q
    |||||||                   |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24370834 ttcagaa-------------------ggttgttcatgatgaacattaagaaccaagcccagaaattcatgaac-aaatgaagaacatgcaaggttcacgt 24370755  T
Q  717 gacttaaatgaaagcctagaaaagtacatgactaagatcaatcaaggaataaaagcatttatttgattaaagtcaaaaagggcatcttcaatgttcattt 816  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24370754 gacttaaataaaagcccagaaaagtacatgactaagatcaatcaaggaataaagacatttatttgattaaagtcaaaaagggcatcttcaatgttcattc 24370655  T
Q  817 aagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaagaatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcataaatgtttcactatta 916  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24370654 aagactatgaacatttgaagtacaaaacattaggaatattccattaagaatatcatcctagatgttttccatgttgcacttcataaatgtttcactatta 24370555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 411 - 589
Target Start/End: Original strand, 24692168 - 24692346
Alignment:
Q  411 ttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctcttg 510  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24692168 ttgaggcaaaattcctaattaattttaaagataacaaaccttaatgattaaggaattaacgaaatttgattaatttgttggtatttaacttgtgctcttg 24692267  T
Q  511 cgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacataaagacttaagaactc 589  Q
     ||| |||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24692268 agtggttaactaagacatgaacaagtttcaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacataaagacttaaaaactc 24692346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 96; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 913 - 1060
Target Start/End: Complemental strand, 24361931 - 24361785
Alignment:
Q  913 attaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctgaagtcccctgagttcagaaagttcaatcctgc 1012  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  24361931 attaggatttgattacatcaattaaaagtcttacaaatcatcctaagtgaaacaaaagaaacattctgaagtctcttgagttcagaaagttcgatcctgc 24361832  T
Q  1013 tccatgcttttttctgacgtgaacagtacagtggttggaaagcaaaag 1060  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| | |||||||||||||| |||||    
T  24361831 tccatgct-ttttctgacatgaacaatgcagtggttggaaagtaaaag 24361785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 696 - 964
Target Start/End: Complemental strand, 9761901 - 9761632
Alignment:
Q  696 aagaacatgcaaggttcacgtgacttaaatgaaagcctagaaaagtac-atgactaagatcaatcaaggaataaaagcatttattt-gattaaagtcaaa 793  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||| | | |||| ||  || ||| |||||||||||||  ||||  ||| ||||| ||| |||||||||    
T  9761901 aagaacattcaaggctcacgtgacataaataaaagtccaaaaaattattataacttagatcaatcaagggttaaagacatctattttgataaaagtcaaa 9761802  T
Q  794 aagggcatcttcaatgttcatttaagact-atgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaagaatgtcatcctagatgttttccatgctg 892  Q
    |  ||||| |||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| | ||  |||    
T  9761801 a--ggcatattcattgttcattaaagacttatgaacaattgaagtacaaaacattaggaatattcctctaagaatatcatcctagatgttatacacactg 9761704  T
Q  893 cacttcataaatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaa 964  Q
    ||||||||  |||||| ||| ||| ||||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  9761703 cacttcattgatgttttactgttaagatttgattacatcaaatagaaatcttacaaatcatcctaagtgaaa 9761632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 87; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 408 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 27788294 - 27788129
Alignment:
Q  408 ttgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctc 507  Q
    ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27788294 ttgttgaggtaaaatccctaaataattttaaagataataaacctttatgattaaagaattaatggattttgattaatttcttggtatttaacttgtgctc 27788195  T
Q  508 ttgcgtgattaactaagataggaacaa-gtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    ||| ||| |||||||||| | |||||| || |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  27788194 ttgagtgtttaactaagacatgaacaatgtttaaa-tcataccaagatacaagaaatcaaaggacat 27788129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 78; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 408 - 573
Target Start/End: Original strand, 12454295 - 12454460
Alignment:
Q  408 ttgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctc 507  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  12454295 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaaccaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 12454394  T
Q  508 ttgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    ||| ||| || ||||||| |||||||||  |  | |||||||||||  |||  |||||||||||||    
T  12454395 ttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacat 12454460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 409 - 573
Target Start/End: Original strand, 20911635 - 20911799
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  20911635 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaaccaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 20911734  T
Q  509 tgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    || ||| || ||||||| |||||||||  | |  |||||||||||  |||  |||||||||||||    
T  20911735 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttagatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacat 20911799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 409 - 573
Target Start/End: Original strand, 23777803 - 23777967
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    || ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  23777803 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 23777902  T
Q  509 tgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    || ||| || ||||||| |||||||||| |  | |||||||||||  |||  |||||||||||||    
T  23777903 tgagtgttttactaagacaggaacaagttttgaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacat 23777967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 409 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 24931763 - 24931599
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    || ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  24931763 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 24931664  T
Q  509 tgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    || ||| || ||||||| |||||||||  | || |||||||||||  |||  |||||||||||||    
T  24931663 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacat 24931599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 407 - 573
Target Start/End: Original strand, 1595762 - 1595929
Alignment:
Q  407 attgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgct 506  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  1595762 attgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgct 1595861  T
Q  507 cttgcgtg-attaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    |||| |||  || ||||||| |||||||||  |  | |||||||||||| || | |||||||||||||    
T  1595862 cttgagtgtttttactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggacat 1595929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 408 - 535
Target Start/End: Original strand, 14790936 - 14791063
Alignment:
Q  408 ttgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctc 507  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  14790936 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaaccaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 14791035  T
Q  508 ttgcgtgattaactaagataggaacaag 535  Q
    ||| ||| || ||||||| |||||||||    
T  14791036 ttgagtgttttactaagacaggaacaag 14791063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 407 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 24922729 - 24922563
Alignment:
Q  407 attgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgct 506  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||    || ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  24922729 attgttgagacaaaatccctaattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgct 24922630  T
Q  507 cttgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    |||| ||| || ||||||| |||||||||  | || |||||||||||  |||  |||||||||||||    
T  24922629 cttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacat 24922563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 408 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 26021929 - 26021763
Alignment:
Q  408 ttgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctc 507  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  26021929 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattcattccttggtatttaacttgtgctc 26021830  T
Q  508 ttgcgtg-attaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    ||| |||  || |||||||||||||||||  |  | |||||||||||| || | |||||||||||||    
T  26021829 ttgagtgttttcactaagataggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggacat 26021763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 409 - 573
Target Start/End: Original strand, 18159061 - 18159225
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    || ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  18159061 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattacttggtatttaacttgtgctct 18159160  T
Q  509 tgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    || ||| || ||||||| |||||||||  |  | |||||||||||  |||  |||||||||||||    
T  18159161 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacat 18159225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 409 - 573
Target Start/End: Original strand, 26425888 - 26426052
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    || ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  26425888 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 26425987  T
Q  509 tgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    || ||| || ||||||| |||||||||  |  | |||||||||||  |||  |||||||||||||    
T  26425988 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacat 26426052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 407 - 535
Target Start/End: Original strand, 31366529 - 31366657
Alignment:
Q  407 attgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgct 506  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  31366529 attgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaaccaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgct 31366628  T
Q  507 cttgcgtgattaactaagataggaacaag 535  Q
     ||| ||| || ||||||| |||||||||    
T  31366629 attgagtgttttactaagacaggaacaag 31366657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 407 - 573
Target Start/End: Original strand, 16897006 - 16897173
Alignment:
Q  407 attgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgct 506  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    || ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  16897006 attgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattcattggtatttaacttgtgct 16897105  T
Q  507 cttgcgtg-attaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    |||| |||  || ||||||| |||||||||  |  | |||||||||||| || | |||||||||||||    
T  16897106 cttgagtgttttcactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggacat 16897173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 407 - 573
Target Start/End: Original strand, 16907659 - 16907826
Alignment:
Q  407 attgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgct 506  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    || ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  16907659 attgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgct 16907758  T
Q  507 cttgcgtg-attaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    |||| |||  || ||||||| |||||||||  |  | |||||||||||| || | |||||||||||||    
T  16907759 cttgagtgttttcactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggacat 16907826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 407 - 532
Target Start/End: Original strand, 18168877 - 18169002
Alignment:
Q  407 attgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgct 506  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    || ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  18168877 attgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattacttggtatttaacttgtgct 18168976  T
Q  507 cttgcgtgattaactaagataggaac 532  Q
    |||| ||| || ||||||| ||||||    
T  18168977 cttgagtgttttactaagacaggaac 18169002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 407 - 535
Target Start/End: Original strand, 3285178 - 3285306
Alignment:
Q  407 attgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgct 506  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||   || ||||| ||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||    
T  3285178 attgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaaccaatatgattaaagaattaatggactttgattaactccttgttatttaacttgtgct 3285277  T
Q  507 cttgcgtgattaactaagataggaacaag 535  Q
    |||| ||| || ||||||| |||||||||    
T  3285278 cttgagtgttttactaagacaggaacaag 3285306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 409 - 573
Target Start/End: Original strand, 20926083 - 20926247
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||   || ||||| ||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  20926083 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaaccaatatgattaaagaattaatggaatttgattaatacattggtatttaacttgtgctct 20926182  T
Q  509 tgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    || ||| || ||||||| |||||||||  | |  |||||||||||  |||  |||||||||||||    
T  20926183 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttagatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacat 20926247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 411 - 535
Target Start/End: Original strand, 31356805 - 31356929
Alignment:
Q  411 ttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctcttg 510  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||    
T  31356805 ttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaaccaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctattg 31356904  T
Q  511 cgtgattaactaagataggaacaag 535  Q
     ||| || ||||||| |||||||||    
T  31356905 agtgttttactaagacaggaacaag 31356929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 409 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 12991301 - 12991135
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttga-taattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctc 507  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || | | |||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  12991301 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 12991202  T
Q  508 ttgcgtg-attaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    ||| |||  || ||||||| |||||||||  |  | |||||||||||| || | |||||||||||||    
T  12991201 ttgagtgttttcactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggacat 12991135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 407 - 553
Target Start/End: Original strand, 18200604 - 18200750
Alignment:
Q  407 attgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgct 506  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||   || ||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |    
T  18200604 attgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaaccaatatgattagagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgtt 18200703  T
Q  507 cttgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaaga 553  Q
     ||| ||| || ||||||| |||||||||  | || |||||||||||    
T  18200704 attgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaaga 18200750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 409 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 24506152 - 24505987
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  24506152 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttgatatttaacttgtgctct 24506053  T
Q  509 tgcgtg-attaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    || |||  || |||| || |||||||||  |  | |||||| |||||||| | |||||||||||||    
T  24506052 tgagtgttttcactatgacaggaacaaggtttgaatcatactaagatacataaaatcaaaggacat 24505987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 63; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 421 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 9762193 - 9761968
Alignment:
Q  421 atccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctcttgcgtgattaac 520  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| |||||   |||||||||||||||||| ||| |||||||||||  |||| |||||  ||||||||    
T  9762193 atccctgattgattttaaagataacaaactttgatgattaaaagattaatggactttgattagtttattggtatttaatatgtgttcttgattgattaac 9762094  T
Q  521 taagataggaaca-agtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacataaagacttaagaactcagtcagagttcagaaagttaaaaagagttc 619  Q
    ||||| || |||| ||| |||| ||| |||||||  |||  |||||||| |||| |||||||| ||||  ||| | |||||| || ||| || |||||||    
T  9762093 taagacagaaacatagtataaa-tcaaaccaagaagcaagcaatcaaagaacattaagacttatgaaccaagttaaagttcataaggttgaacagagttc 9761995  T
Q  620 agaaggttgggcagagtttagaaggtt 646  Q
    | |||||||| || |||| ||||||||    
T  9761994 aaaaggttggacatagttcagaaggtt 9761968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 63; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 408 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 18712933 - 18712831
Alignment:
Q  408 ttgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctc 507  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  18712933 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaattattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaagttgtgctc 18712834  T
Q  508 ttg 510  Q
    |||    
T  18712833 ttg 18712831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 408 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 7756182 - 7756021
Alignment:
Q  408 ttgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctc 507  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || ||| | || | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  7756182 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattgaagattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 7756083  T
Q  508 ttgcgtg-attaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaag 568  Q
    ||| |||  || ||||||| |||||||||  |  | |||||||||||| || | ||||||||    
T  7756082 ttgagtgttttcactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaag 7756021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 409 - 510
Target Start/End: Original strand, 17823419 - 17823520
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  17823419 tgttgaggcaaaacccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 17823518  T
Q  509 tg 510  Q
    ||    
T  17823519 tg 17823520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 409 - 573
Target Start/End: Original strand, 29539792 - 29539956
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |   || ||||| |||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  29539792 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaatcaatatgattaaagaattaatgagctttgattaattacttggtatttaacttgtgctct 29539891  T
Q  509 tgcgtgattaactaagataggaac-aagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    || ||| |  ||||||| |||||| |||| |||| |||||||||||  |||  |||||||||||||    
T  29539892 tgagtgttatactaagacaggaacaaagtttaaa-tcataccaagaatcaagaaatcaaaggacat 29539956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 407 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 30658888 - 30658722
Alignment:
Q  407 attgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgct 506  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||  || || |||||||| | || |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  30658888 attgttgaggcaaaattcctaattaattttaaagataataaaatttaatgattaaggattaaagggactttgattaattccttggtatttaatttgtgct 30658789  T
Q  507 cttgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    |||| ||| || ||||||| || ||||||  |  | | |||||||||||||   |||||||||||||    
T  30658788 cttgagtgttttactaagacagaaacaaggtttgaataataccaagatacatgaaatcaaaggacat 30658722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 752 - 981
Target Start/End: Complemental strand, 27787948 - 27787728
Alignment:
Q  752 gatcaatcaaggaataaaagcatttatttgattaaagtcaaaaagggcatcttcaatgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttagga 851  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||   | |||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||       |||||    
T  27787948 gatcaatcaagcaataaaggcatttacaaggttaatgtcaaaaagg--atattcaatgttcatttaagactatgaaca-ttgaagtac-------tagga 27787859  T
Q  852 atattccattaag-aatgtcatcctagatgttttccatg-ctgcacttcataaatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaa 949  Q
    ||||||||  | | ||| ||||||||||||||  | ||  |||| ||||||   ||||||||||||||||| ||||||||| || |   | |||||||||    
T  27787858 atattccaaaagggaatatcatcctagatgtta-caatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatatgattacatcaaatggtagtcttacaaa 27787760  T
Q  950 tcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  27787759 tcatcctaagtgaaacaaaaggaacattctga 27787728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 409 - 510
Target Start/End: Original strand, 16320618 - 16320719
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | || || |||||||| | ||||||||||||||||||  || ||||||| || |||||||    
T  16320618 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataacctttaatgattaaggattaaatggactttgattaattcctttgtatttagctggtgctct 16320717  T
Q  509 tg 510  Q
    ||    
T  16320718 tg 16320719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 409 - 557
Target Start/End: Original strand, 16922896 - 16923045
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||  || || |||||||| | |||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||    
T  16922896 tgttgaggcaacatccctaattaattttaaagataataaattttaatgattaaggattaaatggactttgattaagtccttagtatttaacttgtgctct 16922995  T
Q  509 tgcg-tgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagataca 557  Q
    |  | |  || |||||||||| ||||||  | || |||||||||||||||    
T  16922996 taagtttttttactaagatagaaacaaggtttaaatcataccaagataca 16923045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 406 - 507
Target Start/End: Original strand, 26161229 - 26161325
Alignment:
Q  406 aattgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgc 505  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || ||||||||     || |||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  26161229 aattgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaagga-----tgaactttgattaattccttggtatttaacttgtgc 26161323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 803 - 981
Target Start/End: Original strand, 12454783 - 12454954
Alignment:
Q  803 ttcaatgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaag-aatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcata 901  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||       |||||||||| ||  ||| ||| |||||||||||||| ||    |||| ||||||     
T  12454783 ttcaatgttcatttaagactatgaaca-ttgatgtac-------taggaatatttcacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcatt 12454874  T
Q  902 aatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||    
T  12454875 attgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctga 12454954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 895 - 981
Target Start/End: Original strand, 16897761 - 16897847
Alignment:
Q  895 cttcataaatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |   | |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||    
T  16897761 cttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcattctaagtgaaacagatggaacattctga 16897847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 895 - 981
Target Start/End: Original strand, 16908414 - 16908500
Alignment:
Q  895 cttcataaatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |   | |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||    
T  16908414 cttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcattctaagtgaaacagatggaacattctga 16908500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 803 - 981
Target Start/End: Original strand, 20912012 - 20912183
Alignment:
Q  803 ttcaatgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaag-aatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcata 901  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||       |||||||||| ||  ||| ||| |||||||||||||| |     |||| ||||||     
T  20912012 ttcaatgttcatttaagactatgaaca-ttgatgtac-------taggaatatttcacaaaggaatatcatcctagatgttattatcactgctcttcatt 20912103  T
Q  902 aatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||    
T  20912104 attgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctga 20912183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 864 - 981
Target Start/End: Complemental strand, 24922277 - 24922160
Alignment:
Q  864 gaatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcataaatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaa 963  Q
    |||| |||||||||||||| |   | |||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||| |||||||||    
T  24922277 gaatatcatcctagatgttattattactgctcttcatcattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcctaagtgaa 24922178  T
Q  964 acaaaagaaacattctga 981  Q
    ||| | | ||||||||||    
T  24922177 acagatggaacattctga 24922160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 864 - 981
Target Start/End: Complemental strand, 24931313 - 24931196
Alignment:
Q  864 gaatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcataaatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaa 963  Q
    |||| |||||||||||||| |   | |||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||| |||||||||    
T  24931313 gaatatcatcctagatgttattattactgctcttcatcattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcctaagtgaa 24931214  T
Q  964 acaaaagaaacattctga 981  Q
    ||| | | ||||||||||    
T  24931213 acagatggaacattctga 24931196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 890 - 981
Target Start/End: Original strand, 3285655 - 3285746
Alignment:
Q  890 ctgcacttcataaatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    |||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||    
T  3285655 ctgctcttcatcattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctga 3285746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 972 - 1059
Target Start/End: Original strand, 19360878 - 19360964
Alignment:
Q  972 aacattctgaagtcccctgagttcagaaagttcaatcctgctccatgcttttttctgacgtgaacagtacagtggttggaaagcaaaa 1059  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||| | |||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  19360878 aacattatgaagtctcctgagttcataaagtttgatcctgctccatac-tttttctgacatgaatagtacactggttggaaagtaaaa 19360964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 864 - 981
Target Start/End: Original strand, 18159845 - 18159962
Alignment:
Q  864 gaatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcataaatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaa 963  Q
    |||| |||||||||||||| ||    |||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||  |||||||||    
T  18159845 gaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcagcctaagtgaa 18159944  T
Q  964 acaaaagaaacattctga 981  Q
    ||| | | ||||||||||    
T  18159945 acagatggaacattctga 18159962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 864 - 981
Target Start/End: Original strand, 18169657 - 18169774
Alignment:
Q  864 gaatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcataaatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaa 963  Q
    |||| |||||||||||||| ||    |||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||  |||||||||    
T  18169657 gaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcagcctaagtgaa 18169756  T
Q  964 acaaaagaaacattctga 981  Q
    ||| | | ||||||||||    
T  18169757 acagatggaacattctga 18169774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 904 - 981
Target Start/End: Original strand, 29540281 - 29540358
Alignment:
Q  904 tgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| || |   | ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||    
T  29540281 tgtttcactattagaatttgattacatcaaatggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaacaaatggaacattctga 29540358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 803 - 981
Target Start/End: Original strand, 31357290 - 31357461
Alignment:
Q  803 ttcaatgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaag-aatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcata 901  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||       |||||||||| ||  ||| ||| |||||||||||||| |     |||| ||||||     
T  31357290 ttcaatgttcatttaagactatgaaca-ttgatgtac-------taggaatatttcacaaaggaatatcatcctagatgttattatcactgctcttcatt 31357381  T
Q  902 aatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||  |||||||||||| | | ||||||||||    
T  31357382 attgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcagcctaagtgaaacagatggaacattctga 31357461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 803 - 981
Target Start/End: Original strand, 31367018 - 31367189
Alignment:
Q  803 ttcaatgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaag-aatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcata 901  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||       |||||||||| ||  ||| ||| |||||||||||||| |     |||| ||||||     
T  31367018 ttcaatgttcatttaagactatgaaca-ttgatgtac-------taggaatatttcacaaaggaatatcatcctagatgttattatcactgctcttcatt 31367109  T
Q  902 aatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||  |||||||||||| | | ||||||||||    
T  31367110 attgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcagcctaagtgaaacagatggaacattctga 31367189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 890 - 966
Target Start/End: Original strand, 14791413 - 14791489
Alignment:
Q  890 ctgcacttcataaatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaaca 966  Q
    |||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||| ||||||||||||    
T  14791413 ctgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaaca 14791489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 339 - 410
Target Start/End: Original strand, 32013018 - 32013089
Alignment:
Q  339 ttacttgatgtaacatttggataattttagtt-ttaatttatgtttggaattattgatgtaatatttgaattg 410  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  32013018 ttacttgatgtaac-tttagataatttttgttcttaatttatgtttggaattgttgatgtaacttttgaattg 32013089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 893 - 930
Target Start/End: Original strand, 28092396 - 28092433
Alignment:
Q  893 cacttcataaatgtttcactattaggatttgattacat 930  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28092396 cacttcattgatgtttcactattaggatttgattacat 28092433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 569; Significance: 0; HSPs: 74)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 569; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 408 - 1060
Target Start/End: Original strand, 31824048 - 31824699
Alignment:
Q  408 ttgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctc 507  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31824048 ttgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgatgattaaggaattaatagactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctc 31824147  T
Q  508 ttgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacataaagacttaagaactcagtcagagttcagaaagt 607  Q
    ||| ||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31824148 ttgagtggttaactaagacaggaacaagtttcaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacataaagacttaagaacttagtcagagttcagaaagt 31824247  T
Q  608 taaaaagagttcagaaggttgggcagagtttagaaggttgttcgtgatgaacatcaagaaccaagcccagaaattcatgaactaaatgaagaacatgcaa 707  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31824248 taaaaagagttcagaaggttggacagagttcagaaggttgttcatgatgaacatcaagaaccaagcccataaattcatgaactaaatgaagaacatgcaa 31824347  T
Q  708 ggttcacgtgacttaaatgaaagcctagaaaagtacatgactaagatcaatcaaggaataaaagcatttatttgattaaagtcaaaaagggcatcttcaa 807  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31824348 ggttcacgtgacttaaatgaaagcccagaaaagtacatgactaagatcaatcaaggaataaaagcatttatttgattaaagtcaaaaagggcatcttcaa 31824447  T
Q  808 tgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaagaatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcataaatgtt 907  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31824448 tgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacattaggaatattccattaagaatatcatcctagatgttttccatgctgcacttcataaatgtt 31824547  T
Q  908 tcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctgaagtcccctgagttcagaaagttcaat 1007  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31824548 tcactattaggatttgattacatcaattacaagtcttacaaatcatcctaagtgaaacaaaagaaacattctaaagtcccctgagttcagaaagttcaat 31824647  T
Q  1008 cctgctccatgcttttttctgacgtgaacagtacagtggttggaaagcaaaag 1060  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31824648 cctgctccatgc-tttttctgacgtgaacagtacagtggttggaaagcaaaag 31824699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 564; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 409 - 1060
Target Start/End: Complemental strand, 5616237 - 5615587
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5616237 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgatgattaaggaattaatggaatttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 5616138  T
Q  509 tgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacataaagacttaagaactcagtcagagttcagaaagtt 608  Q
    || ||| |||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5616137 tgagtggttaactaagacaggaacaagtataaattaataccaagatacaaagaatcaaaggacataaaaacttaagaactaagtcagagttcagaaagtt 5616038  T
Q  609 aaaaagagttcagaaggttgggcagagtttagaaggttgttcgtgatgaacatcaagaaccaagcccagaaattcatgaactaaatgaagaacatgcaag 708  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5616037 aaaaagagttcagaaggttggacagagttcagaaggttgttcatgatgaacatcaagaaccaagcccagaaattcatgaactaaatgaagaacatgcaag 5615938  T
Q  709 gttcacgtgacttaaatgaaagcctagaaaagtacatgactaagatcaatcaaggaataaaagcatttatttgattaaagtcaaaaagggcatcttcaat 808  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5615937 gttcacgtgacttaaatgaaagccaagaaaagtacatgactaagatcaatcaaggaataaaagcatttatttgattaaagtcaaaaagggcatcttcaat 5615838  T
Q  809 gttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaagaatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcataaatgttt 908  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5615837 gttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacattaggaatattccattaagaatatcatcctagatgttttccatgctgcacttcataaatgttt 5615738  T
Q  909 cactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctgaagtcccctgagttcagaaagttcaatc 1008  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  5615737 cactattaggatttgattacattaattacaagtcttacaaatcatcctaagtgaaacaaaagaaacattctgaagtcccctgagttcagaaagttagatc 5615638  T
Q  1009 ctgctccatgcttttttctgacgtgaacagtacagtggttggaaagcaaaag 1060  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5615637 ctactccatgct-ttttctgacgtgaacagtacagtggttggaaagcaaaag 5615587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 465; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 411 - 1060
Target Start/End: Complemental strand, 13286518 - 13285875
Alignment:
Q  411 ttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctcttg 510  Q
    |||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13286518 ttgaggcaaaatccctaattt----taaagataacaaaccttgatgattaaggaattaatgaactttgattaatttcttggtatttaacttgtgctcttg 13286423  T
Q  511 cgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacataaagacttaagaactcagtcagagttcagaaagttaa 610  Q
     ||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13286422 agtggttaactaagacaggaacaagtttcaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacataaagacttaagaactcagtcagaggtcagaaagttaa 13286323  T
Q  611 aaagagttcagaaggttgggcagagtttagaaggttgttcgtgatgaacatcaagaaccaagcccagaaattcatgaactaaatgaagaacatgcaaggt 710  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  13286322 aaa-agttcagaaggttggacagagttcagaaggttgttcatgatgaacatcaagaaccaagcccagaaattcatgaac-aattgaagaacatgcaaggt 13286225  T
Q  711 tcacgtgacttaaatgaaagcctagaaaagtacatgactaagatcaatcaaggaataaaagcatttatttgattaaagtcaaaaagggcatcttcaatgt 810  Q
    ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13286224 tcacgtggcttaaataaaagcccagaaaagtacatgactaagatcaatcaaggaataaaggcatttatttgattaaagtcaaaaggggcatcttcaatgt 13286125  T
Q  811 tcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaagaatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcataaatgtttca 910  Q
    ||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13286124 tcattcaatactatgaacatttgaagtacaaaacattaggaatattccattaagaatatcatcctagatgttttccatgctgcacttcataaatgtttca 13286025  T
Q  911 ctattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctgaagtcccctgagttcagaaagttcaatcct 1010  Q
    |||||||||||||||||||| || ||  | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  13286024 ctattaggatttgattacatcaaataagagtcttacaaatcatcctaagtgaaacaaaagaaacattctgaagtcccctgagttcagaaagtttgatcct 13285925  T
Q  1011 gctccatgcttttttctgacgtgaacagtacagtggttggaaagcaaaag 1060  Q
    | ||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||| |||||    
T  13285924 gttccatacttttttctgacatgaacaagacaatggttggaaagtaaaag 13285875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 452; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 409 - 1059
Target Start/End: Original strand, 41026870 - 41027520
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41026870 tgttgaggcaaaatccctgattaattttaaagataacaaaccttgatgattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 41026969  T
Q  509 tgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacataaagacttaagaactcagtcagagttcagaaagtt 608  Q
    || ||| || ||| ||| ||||| |||| | | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  41026970 tgagtggttcactgagacaggaaaaagtttcacttcataccaagacacaaagaatcaaaggacataaagacttaagaactcaattagagttcagaaagtt 41027069  T
Q  609 aaaaagagttcagaaggttgggcagagtttagaaggttgttcgtgatgaacatcaagaaccaagcccagaaattcatgaactaaatgaagaacatgcaag 708  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  41027070 aaaaagagttcagaaggttggacaaagttcagaaggttgttcatgatgaacatcaagaaccaagcccagaaattcatgaaccaaatgaagagcatgcaag 41027169  T
Q  709 gttcacgtgacttaaatgaaagcctagaaaagtaca-tgactaagatcaatcaaggaataaaagcatttatttgattaaagtcaaaaagggcatcttcaa 807  Q
    |||||||||| |||||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41027170 gttcacgtgatttaaataaaagcccagtaaagtacattgactaagatcaatcaaggaataaagacatttatttgattaaagtcaaaaggggcatcttcaa 41027269  T
Q  808 tgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaagaatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcataaatgtt 907  Q
    |||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  41027270 tgttcattcaaaactatgaacatttgaagtacaaaacattaggaatattccattaagaatatcatcctagatgttttccatgctgcacttcataaatatt 41027369  T
Q  908 tcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctgaagtcccctgagttcagaaagttcaat 1007  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||  | ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41027370 tcactattaggatttgattacatcaaataagagtcttacaaatcatcctaagtgaaacaaatggaacattctgaagtcctctgagttcagaaagttcaat 41027469  T
Q  1008 cctgctccatgcttttttctgacgtgaacagtacagtggttggaaagcaaaa 1059  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41027470 cctgctctatg-ttttttctgacatgaacagtacagtggttggaaagtaaaa 41027520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 451; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 408 - 1060
Target Start/End: Original strand, 42594681 - 42595334
Alignment:
Q  408 ttgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctc 507  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42594681 ttgttgatgcaaaatccctaattaattttaaagataacaaaacttgatgattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgttc 42594780  T
Q  508 ttgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacataaagacttaa-gaactcagtcagagttcagaaag 606  Q
    ||| ||| |||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42594781 ttgagtggttaactaagaaaggaacaagtttcaatttataccaagatacaaagaatcaaaggacataaagacttaaagaactcagtcagagttcagaaag 42594880  T
Q  607 ttaaaaagagttcagaaggttgggcagagtttagaaggttgttcgtgatgaacatcaagaaccaagcccagaaattcatgaactaaatgaagaacatgca 706  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42594881 ttaaaaagagttcaaaaggttggacagagttcagaaggttgttcatgatgaacatcaagaatcaagcccagaaattcatgaaccaaatgaagaacatgca 42594980  T
Q  707 aggttcacgtgacttaaatgaaagcctagaaaagtacat-gactaagatcaatcaaggaataaaagcatttatttgattaaagtcaaaaagggcatcttc 805  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42594981 aggttcacgtgacttaaataaaagcccagtaaagtgcattgactaagatcagtcaaggaataaaggcatttatttgattaaagtcaaaaaggacatcttc 42595080  T
Q  806 aatgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaagaatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcataaatg 905  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42595081 aatgttcattcaagactatgaacatttgaagtacaaaaaattaagaatattccattaagaatatcatcctagatgttttccatactgcacttcataaatg 42595180  T
Q  906 tttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctgaagtcccctgagttcagaaagttca 1005  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  42595181 tttcactattaggatttgattacatcaattaagagtcttacaaatcatcctaagtgaaacaaaaggaacattctgaagtcccatgagttcagaaagttcg 42595280  T
Q  1006 atcctgctccatgcttttttctgacgtgaacagtacagtggttggaaagcaaaag 1060  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  42595281 atcatgctccatg-ttttttctgacatgaacagtacaatgggaggaaagtaaaag 42595334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 426; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 409 - 1059
Target Start/End: Complemental strand, 12828098 - 12827451
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12828098 tgttgaggcaaaatccctta---attttaaagataacaaaccttgatgatgaaagaattaatgcactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 12828002  T
Q  509 tgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacataaagacttaagaactcagtcagagttcagaaagtt 608  Q
    || ||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12828001 tgagtggttaactaagacaggaacaagtttcaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacataaagacttaagaactcagttagagttcagaaagtt 12827902  T
Q  609 aaaaagagttcagaaggttgggcagagtttagaaggttgttcgtgatgaacatcaagaaccaagcccagaaattcatgaactaaatgaagaacatgcaag 708  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12827901 aaaaagagttcagaaggttggacatagttcagaaggttgtttatgatgaacatcaagaaccaatcatagaaattcatgaaccaaatgaagaacatgcaag 12827802  T
Q  709 gttcacgtgacttaaatgaaagcctagaaaagtaca-tgactaagatcaatcaaggaataaaagcatttatttgattaaagtcaaaaagggcatcttcaa 807  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12827801 gttcacgtgacttaaataaaagcctagtaaagtacattgaataagatcaatcaagcaataaatgcatttatttgattaaagtcaaaaagggcatcttcaa 12827702  T
Q  808 tgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaagaatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcataaatgtt 907  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  12827701 tgttcattcaagactatgaacatttgaagtacaaaacattaggaatattccattaagaatatcatcctagatgttttccatgttgcacttcatcaatgtt 12827602  T
Q  908 tcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctgaagtcccctgagttcagaaagttcaat 1007  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||  | ||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||  ||    
T  12827601 tcactattaggatttgattacatcaaataagagtcttacaaatcatcctaagtgaaacaaaatgaatattctgaagtcccttgagttcagaaagtttgat 12827502  T
Q  1008 cctgctccatgcttttttctgacgtgaacagtacagtggttggaaagcaaaa 1059  Q
    | ||||||||| |||||||| || ||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  12827501 catgctccatg-ttttttctcacatgaacagtacaatagttggaaagtaaaa 12827451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 252; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 769 - 1060
Target Start/End: Original strand, 25441775 - 25442065
Alignment:
Q  769 aagcatttatttgattaaagtcaaaaagggcatcttcaatgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaagaatg 868  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||     
T  25441775 aagcatttatttgattaaagtcaaaaagggcatcttcaatgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaagacattaggaatattccattaagaata 25441874  T
Q  869 tcatcctagatgttttccatgctgcacttcataaatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaa 968  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25441875 tcatcctagatgttttccatgttgcacttcataaatgtttcactattaggatttgattatattaattacaagtcttacaaatcatcctaagtgaaacaaa 25441974  T
Q  969 agaaacattctgaagtcccctgagttcagaaagttcaatcctgctccatgcttttttctgacgtgaacagtacagtggttggaaagcaaaag 1060  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25441975 agaaacattctgaagtcccctgagttcagaaagttcaatcctgctccatgc-tttttctgacgtgaacagtacagtggttgaaaagcaaaag 25442065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 562 - 1059
Target Start/End: Complemental strand, 15989258 - 15988761
Alignment:
Q  562 atcaaaggacataaagacttaagaactcagtcagagttcagaaagttaaaaagagttcagaaggttgggc-agagtttagaaggttgttcgtgatgaaca 660  Q
    ||||||| |||| ||  |||| ||||||||||||||||| ||| ||||   ||||||||||||||| |   | |||| |||| ||||||| | | |   |    
T  15989258 atcaaagaacattaaagcttatgaactcagtcagagttcggaaggttagtcagagttcagaaggtttgaagatagttcagaaagttgttcttaaggttta 15989159  T
Q  661 tcaagaaccaagcccagaaattcatgaactaaatgaagaacatgcaaggttcacgtgacttaaatgaaagcctagaaaagtacat-gactaagatcaatc 759  Q
    |||||||| |||| |||||||  ||||||   || || ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| || |||||| || ||||||||||||||    
T  15989158 tcaagaac-aagctcagaaatatatgaacattataaaaaacattcaaggtttacgtgacttaaataaaagcccagtaaagtatattgactaagatcaatc 15989060  T
Q  760 aaggaataaaagcatttatttgattaaagtcaaaaagggcatcttcaatgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattcca 859  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15989059 aaggaataaaggcatttatttgattaaagtcaaaaggggcatcttcaatattcattcaagactatgaatatttgaagtacaaaacattaggaatattcca 15988960  T
Q  860 ttaagaatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcataaatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaag 959  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||  | ||||||||||||| |||||    
T  15988959 tcaagaatatcatcctagatgttttccatgctgcacttcatcaatgtttcactattaggatttgattacatcaaataacagtcttacaaatcatcctaag 15988860  T
Q  960 tgaaacaaaagaaacattctgaagtcccctgagttcagaaagttcaatcctgctccatgcttttttctgacgtgaacagtacagtggttggaaagcaaaa 1059  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  15988859 tgaaacaaaaggaacattctgaagtcccctgagttcagaaagttcgatcctgctccatgctttttt-tgacatgaacagtatagtggttggaaagtaaaa 15988761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 407 - 703
Target Start/End: Original strand, 25441478 - 25441774
Alignment:
Q  407 attgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgct 506  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25441478 attgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataacaaaccttgatgattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgct 25441577  T
Q  507 cttgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacataaagacttaagaactcagtcagagttcagaaag 606  Q
    |||| ||| |||||||||| |||||||||| | |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25441578 cttgagtggttaactaagacaggaacaagtttcaattcatatcatgatacaaagaatcaaagaacataaagacttaagaactcagttagagttcagaaag 25441677  T
Q  607 ttaaaaagagttcagaaggttgggcagagtttagaaggttgttcgtgatgaacatcaagaaccaagcccagaaattcatgaactaaatgaagaacat 703  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25441678 ttaaaaagagctcagaaggttggacagagttcagaaggttgttcatgatgaacattaagaaccaagcccagaaattcatgaattaaatgaagaacat 25441774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 406 - 967
Target Start/End: Original strand, 33090509 - 33091079
Alignment:
Q  406 aattgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgc 505  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||| | ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||     
T  33090509 aattgttgaggcaaaattcctaattaattttgaagataataaacgtcgatgattaaggaattgatgaactttgattaatttattggtatttaatttgtgt 33090608  T
Q  506 tcttgcgtgattaactaagataggaacaa-gtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacataaagacttaagaactcagtcagagttcagaa 604  Q
    | |||  || ||| |||||  | |||||| || ||||| ||||| |||||| ||  |||||||| |||||| ||||||  |||  |||||||||||| ||    
T  33090609 tattgaatgttta-ctaagtcaagaacaacgtttaaat-catacaaagataaaagaaatcaaagaacataatgacttataaacctagtcagagttcataa 33090706  T
Q  605 agttaaaaagagttcagaaggttgggcagagtttagaaggttgttcgtgatgaacatcaagaac-----------caagcccagaaattcatgaactaaa 693  Q
    |||||||  ||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||| | |||   |||||||||           ||| |  ||||||||||||||        
T  33090707 agttaaattgagttca-aaggttggatagagttcagaaggttgttctt-atggctatcaagaacaagcataagaacaaccttagaaattcatgaacattg 33090804  T
Q  694 tgaagaacatgcaaggttcacgtgacttaaatgaaagcctagaaaagtacat--gactaagatcaatcaaggaataaaagcatttatttga-ttaaagtc 790  Q
    | || |||||   ||| ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||  ||||  || |||||||| ||||||  |||||| || | || |  ||    
T  33090805 tcaaaaacatttgaggctcacgtgacataaataaaagcccagaaaagtacatttgactt-gaacaatcaagcaataaagacatttaattaaatttatttc 33090903  T
Q  791 aaaaagggcatcttcaatgttcatttaagacta-tgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaagaatgtcatcctagatgttttccatg 889  Q
    ||||  |||||||| | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||  ||||||| || |||||| ||||||||||||||    ||     
T  33090904 aaaa--ggcatctttattgttcatttaagactaatgaacatttgaagtacaaaacattataaatattctatcaagaatatcatcctagatgttacatata 33091001  T
Q  890 ctgcacttcataaatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaa 967  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||| |||||||||||||    
T  33091002 ctgcacttcatcaatgtttcactattaggatttgattacatcaaatgagagtcttacaaatcatcctaagtgaaacaa 33091079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 696 - 968
Target Start/End: Original strand, 40701540 - 40701813
Alignment:
Q  696 aagaacatgcaaggttcacgtgacttaaatgaaagcctagaaaagtacat-gactaagatcaatcaaggaataaaagcatttatttgattaaagtcaaaa 794  Q
    |||||||||||||  |  |||||| ||||| ||| |  || ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40701540 aagaacatgcaagacttgcgtgacataaataaaaactcagtaaagtacattgacttagatcaatcaaggaataaaagcatttatttgattaaagtcaaaa 40701639  T
Q  795 agggcatcttcaatgttcatttaaga-ctatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaagaatgtcatcctagatgttttccatgctgc 893  Q
    | | |||||||| |||||||| ||||  ||||||| | |||||| |||||  ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| | ||  ||||    
T  40701640 a-gacatcttcagtgttcattcaagatttatgaacgaatgaagtgcaaaatattaggaatattccatcaagaatatcattctagatgttatacacactgc 40701738  T
Q  894 acttcataaatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaa 968  Q
    ||||||   |||||||| ||||||||||||||||||| || |   | |||||||||| || ||||||||||||||    
T  40701739 acttcaatgatgtttcattattaggatttgattacatcaaatggtagtcttacaaattatcctaagtgaaacaaa 40701813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 411 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 14114808 - 14114646
Alignment:
Q  411 ttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctcttg 510  Q
    |||||||||||||  ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14114808 ttgaggcaaaatcgttaattaactttaaagataacaaaccttgatgattaacgaattaatggactttgattaatttcttggtatttaacttgtgctcttg 14114709  T
Q  511 cgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
     ||| |||||||||| |||| |||   | || ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  14114708 agtgtttaactaagacaggagcaaagtttaagtcataccaagatacaaaaattcaaaggacat 14114646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 411 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 14424458 - 14424296
Alignment:
Q  411 ttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctcttg 510  Q
    |||||||||||||  ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14424458 ttgaggcaaaatcgttaattaactttaaagataacaaaccttgatgattaacgaattaatggactttgattaatttcttggtatttaacttgtgctcttg 14424359  T
Q  511 cgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
     ||| |||||||||| |||| |||   | || ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  14424358 agtgtttaactaagacaggagcaaagtttaagtcataccaagatacaaaaattcaaaggacat 14424296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 83; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 407 - 573
Target Start/End: Original strand, 32097712 - 32097878
Alignment:
Q  407 attgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgct 506  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  32097712 attgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaaccaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgct 32097811  T
Q  507 cttgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    |||| ||| || ||||||| |||||||||  | || |||||||||||  |||  |||||||||||||    
T  32097812 cttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacat 32097878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 409 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 9546251 - 9546087
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  9546251 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaaccaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 9546152  T
Q  509 tgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    || ||| || ||||||| |||||||||  | || |||||||||||  |||  |||||||||||||    
T  9546151 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacat 9546087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 407 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 9535970 - 9535804
Alignment:
Q  407 attgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgct 506  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  9535970 attgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaaccaatatgattaaagaattaatggactttgattaattctttggtatttaacttgtgct 9535871  T
Q  507 cttgcgtgattaactaagataggaacaa-gtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    |||| ||| || ||||||| |||||||| || |||| |||||||||||  |||  |||||||||||||    
T  9535870 cttgagtgttttactaagacaggaacaatgtttaaa-tcataccaagaatcaagaaatcaaaggacat 9535804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 407 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 2992644 - 2992478
Alignment:
Q  407 attgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgct 506  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||    
T  2992644 attgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacctttatgattaaagaattaatggactttgattaatttcttggtagttaacttgttct 2992545  T
Q  507 cttgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    |||| | | |||||||||| || |||| || | || ||||| |||||| |||  |||||||||||||    
T  2992544 cttgagggtttaactaagacagaaacatgtttcaaatcatatcaagattcaagaaatcaaaggacat 2992478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 407 - 573
Target Start/End: Original strand, 32108149 - 32108315
Alignment:
Q  407 attgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgct 506  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  32108149 attgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaaccaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgct 32108248  T
Q  507 cttgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    |||| ||| || ||||||| || ||||||  | || |||||||||||  |||  |||||||||||||    
T  32108249 cttgagtgttttactaagacagaaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacat 32108315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 408 - 573
Target Start/End: Original strand, 43982434 - 43982600
Alignment:
Q  408 ttgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctc 507  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  43982434 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 43982533  T
Q  508 ttgcgtg-attaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    ||| |||  || ||||||| |||||||||  |  | |||||||||||| || | |||||||||||||    
T  43982534 ttgagtgttttcactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggacat 43982600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 407 - 573
Target Start/End: Original strand, 46506836 - 46507002
Alignment:
Q  407 attgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgct 506  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    || ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  46506836 attgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgct 46506935  T
Q  507 cttgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    |||| ||| || ||||||| |||||||||  |  | |||||||||||  |||  |||||||||||||    
T  46506936 cttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacat 46507002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 408 - 573
Target Start/End: Original strand, 46496225 - 46496390
Alignment:
Q  408 ttgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctc 507  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  46496225 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 46496324  T
Q  508 ttgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    ||| ||| || ||||||| |||||||||  |  | |||||||||||  |||  |||||||||||||    
T  46496325 ttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacat 46496390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 407 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 5382719 - 5382552
Alignment:
Q  407 attgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgct 506  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  5382719 attgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgct 5382620  T
Q  507 cttgcgtg-attaactaagataggaacaa-gtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    |||| |||  || ||||||| |||||||| || | || |||||||||||| || | |||||||||||||    
T  5382619 cttgagtgttttcactaagacaggaacaaggtctgaa-tcataccaagatgcataaaatcaaaggacat 5382552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 407 - 573
Target Start/End: Original strand, 8510534 - 8510701
Alignment:
Q  407 attgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgct 506  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  8510534 attgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgct 8510633  T
Q  507 cttgcgtg-attaactaagataggaacaa-gtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    |||| |||  || ||||||| |||||||| || | || |||||||||||| || | |||||||||||||    
T  8510634 cttgagtgttttcactaagacaggaacaaggtctgaa-tcataccaagatgcataaaatcaaaggacat 8510701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 407 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 11627369 - 11627202
Alignment:
Q  407 attgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgct 506  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  11627369 attgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgct 11627270  T
Q  507 cttgcgtg-attaactaagataggaacaa-gtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    |||| |||  || ||||||| |||||||| || | || |||||||||||| || | |||||||||||||    
T  11627269 cttgagtgttttcactaagacaggaacaaggtctgaa-tcataccaagatgcataaaatcaaaggacat 11627202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 408 - 535
Target Start/End: Original strand, 10414788 - 10414915
Alignment:
Q  408 ttgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctc 507  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  10414788 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattatttttttggtatttaacttgtgctc 10414887  T
Q  508 ttgcgtgattaactaagataggaacaag 535  Q
    ||| ||| || |||||||| | ||||||    
T  10414888 ttgagtgttttactaagatcgaaacaag 10414915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 409 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 5392371 - 5392206
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  5392371 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 5392272  T
Q  509 tgcgtg-attaactaagataggaacaa-gtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    || |||  || ||||||| |||||||| || | || |||||||||||| || | |||||||||||||    
T  5392271 tgagtgttttcactaagacaggaacaaggtctgaa-tcataccaagatgcataaaatcaaaggacat 5392206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 409 - 573
Target Start/End: Original strand, 8500066 - 8500231
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  8500066 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 8500165  T
Q  509 tgcgtg-attaactaagataggaacaa-gtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    || |||  || ||||||| |||||||| || | || |||||||||||| || | |||||||||||||    
T  8500166 tgagtgttttcactaagacaggaacaaggtctgaa-tcataccaagatgcataaaatcaaaggacat 8500231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 407 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 16132791 - 16132625
Alignment:
Q  407 attgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgct 506  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    || ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  16132791 attgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgct 16132692  T
Q  507 cttgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    |||| ||| || | ||||| |||||||||  |  | |||||||||||  |||  |||||||||||||    
T  16132691 cttgagtgttttattaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacat 16132625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 409 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 26364118 - 26363953
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  26364118 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 26364019  T
Q  509 tgcgtg-attaactaagataggaacaa-gtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    || |||  || ||||||| |||||||| || | || |||||||||||| || | |||||||||||||    
T  26364018 tgagtgttttcactaagacaggaacaaggtctgaa-tcataccaagatgcataaaatcaaaggacat 26363953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 409 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 16143353 - 16143189
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    || ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  16143353 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 16143254  T
Q  509 tgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    || ||| || | ||||| |||||||||  |  | |||||||||||  |||  |||||||||||||    
T  16143253 tgagtgttttattaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacat 16143189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 407 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 26349100 - 26348933
Alignment:
Q  407 attgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgct 506  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  26349100 attgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgct 26349001  T
Q  507 cttgcgtg-attaactaagataggaacaa-gtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    |||| |||  || ||||||| || ||||| || | || |||||||||||| || | |||||||||||||    
T  26349000 cttgagtgttttcactaagacagaaacaaggtctgaa-tcataccaagatgcataaaatcaaaggacat 26348933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 407 - 573
Target Start/End: Original strand, 44906855 - 44907022
Alignment:
Q  407 attgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgct 506  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |    
T  44906855 attgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgtt 44906954  T
Q  507 cttgcgtg-attaactaagataggaacaa-gtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    |||| |||  || ||||||| |||||||| || | || |||||||||||| || | |||||||||||||    
T  44906955 cttgagtgttttcactaagacaggaacaaggtctgaa-tcataccaagatgcataaaatcaaaggacat 44907022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 407 - 573
Target Start/End: Original strand, 6543964 - 6544131
Alignment:
Q  407 attgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgct 506  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  6543964 attgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttgatatttaacttgtgct 6544063  T
Q  507 cttgcgtg-attaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    |||| |||  || ||||||| |||||||||  |  | |||||||||||| || | |||||||||||||    
T  6544064 cttgagtgttttcactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggacat 6544131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 408 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 14249268 - 14249106
Alignment:
Q  408 ttgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctc 507  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||| ||  |||| ||||||||| ||| |||||||| | | ||||||||||||||||||    
T  14249268 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttgaagataatgaacctttatgcttaaagaattaatgaactatgattaatgtctcggtatttaacttgtgctc 14249169  T
Q  508 ttgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaagga 570  Q
    ||| ||| |||||||||| ||||||||   | || |||| |||||||||||  ||||||||||    
T  14249168 ttgagtgtttaactaagaaaggaacaaagattaaatcattccaagatacaagaaatcaaagga 14249106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 408 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 24541623 - 24541521
Alignment:
Q  408 ttgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctc 507  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  24541623 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 24541524  T
Q  508 ttg 510  Q
    |||    
T  24541523 ttg 24541521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 409 - 573
Target Start/End: Original strand, 27987822 - 27987988
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttga-taattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctc 507  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| || | | |||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  27987822 tgttgaggaaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 27987921  T
Q  508 ttgcgtg-attaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    ||| |||  || |||||||||||||||||  |  | |||||||||||| || | |||||||||||||    
T  27987922 ttgagtgtttttactaagataggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggacat 27987988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 409 - 573
Target Start/End: Original strand, 44896506 - 44896671
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||    
T  44896506 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgttct 44896605  T
Q  509 tgcgtg-attaactaagataggaacaa-gtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    || |||  || ||||||| |||||||| || | || |||||||||||| || | |||||||||||||    
T  44896606 tgagtgttttcactaagacaggaacaaggtctgaa-tcataccaagatgcataaaatcaaaggacat 44896671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 409 - 573
Target Start/End: Original strand, 5926016 - 5926181
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    || ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  5926016 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 5926115  T
Q  509 tgcgtg-attaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    || |||  || ||||||| |||||||||  |  | |||||| ||||| || | |||||||||||||    
T  5926116 tgagtgttttcactaagacaggaacaaggtttgaatcatacaaagatgcataaaatcaaaggacat 5926181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 409 - 510
Target Start/End: Original strand, 45552530 - 45552631
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  45552530 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 45552629  T
Q  509 tg 510  Q
    ||    
T  45552630 tg 45552631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 409 - 573
Target Start/End: Original strand, 6533667 - 6533832
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  6533667 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttgatatttaacttgtgctct 6533766  T
Q  509 tgcgtg-attaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    || |||  || ||||||| |||||||||  |  | |||||| ||||| || | |||||||||||||    
T  6533767 tgagtgttttcactaagacaggaacaaggtttgaatcatacaaagatgcataaaatcaaaggacat 6533832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 409 - 535
Target Start/End: Original strand, 19585084 - 19585211
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | |||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  19585084 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggattttgattaattccttagtatttaacttgtgctct 19585183  T
Q  509 tgcgtg-attaactaagataggaacaag 535  Q
    || |||  || ||||||| |||||||||    
T  19585184 tgagtgttttcactaagacaggaacaag 19585211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 409 - 535
Target Start/End: Original strand, 19799035 - 19799162
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    || ||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  19799035 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaacaaaaatgattaaagaataaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 19799134  T
Q  509 tgcgtg-attaactaagataggaacaag 535  Q
    || |||  || ||||||| |||||||||    
T  19799135 tgagtgttttcactaagacaggaacaag 19799162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 408 - 573
Target Start/End: Original strand, 42620512 - 42620678
Alignment:
Q  408 ttgttgaggcaaaatccct-aatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgct 506  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||    || ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||    
T  42620512 ttgttgaggcaaaatcccttaattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattctttggtatttaatctgtgct 42620611  T
Q  507 cttgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    |||  ||| || ||||||| |||||||||  | || |||||||||||  |||  |||||||||||||    
T  42620612 cttaagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacat 42620678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 407 - 523
Target Start/End: Original strand, 40701274 - 40701391
Alignment:
Q  407 attgttgaggcaaaatccctaatttattttaaa-gataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgc 505  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||     
T  40701274 attgttgaggcaaaattcctaattaattttaaaagataacgaaccttgatgattaaagaattaataaactttgattaattttttggtatttaaattgtgt 40701373  T
Q  506 tcttgcgtgattaactaa 523  Q
    ||||  ||| ||||||||    
T  40701374 tctttagtgtttaactaa 40701391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 408 - 510
Target Start/End: Original strand, 14943644 - 14943746
Alignment:
Q  408 ttgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctc 507  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||   || ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||||||||||||||||    
T  14943644 ttgttgaggcaaaatcgctaattaattttaaagataatagaccgatatgattaaagaattaatggactttgattatttcctttgtatttaacttgtgctc 14943743  T
Q  508 ttg 510  Q
    |||    
T  14943744 ttg 14943746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 408 - 510
Target Start/End: Original strand, 15371237 - 15371339
Alignment:
Q  408 ttgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctc 507  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||   || ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||||||||||||||||    
T  15371237 ttgttgaggcaaaatcgctaattaattttaaagataatagaccgatatgattaaagaattaatggactttgattatttcctttgtatttaacttgtgctc 15371336  T
Q  508 ttg 510  Q
    |||    
T  15371337 ttg 15371339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 803 - 981
Target Start/End: Complemental strand, 5382147 - 5381976
Alignment:
Q  803 ttcaatgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaag-aatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcata 901  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||       |||||||||| ||  ||| ||| |||||||||||||| ||    |||| ||||||     
T  5382147 ttcaatgttcatttaagactatgaaca-ttgatgtac-------taggaatatttcacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcatt 5382056  T
Q  902 aatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||    
T  5382055 attgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctga 5381976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 803 - 981
Target Start/End: Complemental strand, 5391785 - 5391614
Alignment:
Q  803 ttcaatgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaag-aatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcata 901  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||       |||||||||| ||  ||| ||| |||||||||||||| ||    |||| ||||||     
T  5391785 ttcaatgttcatttaagactatgaaca-ttgatgtac-------taggaatatttcacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcatt 5391694  T
Q  902 aatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||    
T  5391693 attgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctga 5391614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 803 - 981
Target Start/End: Original strand, 5926865 - 5927036
Alignment:
Q  803 ttcaatgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaag-aatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcata 901  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||       |||||||||| ||  ||| ||| |||||||||||||| ||    |||| ||||||     
T  5926865 ttcaatgttcatttaagactatgaaca-ttgatgtac-------taggaatatttcacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcatt 5926956  T
Q  902 aatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||    
T  5926957 attgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctga 5927036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 803 - 981
Target Start/End: Original strand, 6544535 - 6544706
Alignment:
Q  803 ttcaatgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaag-aatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcata 901  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||       |||||||||| ||  ||| ||| |||||||||||||| ||    |||| ||||||     
T  6544535 ttcaatgttcatttaagactatgaaca-ttgatgtac-------taggaatatttcacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcatt 6544626  T
Q  902 aatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||    
T  6544627 attgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctga 6544706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 803 - 981
Target Start/End: Original strand, 8500779 - 8500950
Alignment:
Q  803 ttcaatgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaag-aatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcata 901  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||       |||||||||| ||  ||| ||| |||||||||||||| ||    |||| ||||||     
T  8500779 ttcaatgttcatttaagactatgaaca-ttgatgtac-------taggaatatttcacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcatt 8500870  T
Q  902 aatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||    
T  8500871 attgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctga 8500950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 803 - 981
Target Start/End: Original strand, 8511249 - 8511420
Alignment:
Q  803 ttcaatgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaag-aatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcata 901  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||       |||||||||| ||  ||| ||| |||||||||||||| ||    |||| ||||||     
T  8511249 ttcaatgttcatttaagactatgaaca-ttgatgtac-------taggaatatttcacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcatt 8511340  T
Q  902 aatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||    
T  8511341 attgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctga 8511420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 406 - 510
Target Start/End: Original strand, 12769446 - 12769551
Alignment:
Q  406 aattgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttga-taattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtg 504  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| |||| || | | |||||||| |||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||     
T  12769446 aattgttgaggcaaaattcctaattaattttagagataataaactttaaattattaaggatttaatggactttaattgttttcttggtatttaacttgta 12769545  T
Q  505 ctcttg 510  Q
    ||||||    
T  12769546 ctcttg 12769551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 803 - 981
Target Start/End: Original strand, 46496844 - 46497015
Alignment:
Q  803 ttcaatgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaag-aatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcata 901  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||       |||||||||| ||  ||| ||| |||||||||||||| ||    |||| ||||||     
T  46496844 ttcaatgttcatttaagactatgaaca-ttgatgtac-------taggaatatttcacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcatt 46496935  T
Q  902 aatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||    
T  46496936 attgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctga 46497015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 803 - 981
Target Start/End: Original strand, 46507456 - 46507627
Alignment:
Q  803 ttcaatgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaag-aatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcata 901  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||       |||||||||| ||  ||| ||| |||||||||||||| ||    |||| ||||||     
T  46507456 ttcaatgttcatttaagactatgaaca-ttgatgtac-------taggaatatttcacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcatt 46507547  T
Q  902 aatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||    
T  46507548 attgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctga 46507627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 864 - 981
Target Start/End: Original strand, 6534290 - 6534407
Alignment:
Q  864 gaatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcataaatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaa 963  Q
    |||| |||||||||||||| ||    |||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||| |||||||||    
T  6534290 gaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcctaagtgaa 6534389  T
Q  964 acaaaagaaacattctga 981  Q
    ||| | | ||||||||||    
T  6534390 acagatggaacattctga 6534407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 803 - 981
Target Start/End: Complemental strand, 11626696 - 11626525
Alignment:
Q  803 ttcaatgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaag-aatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcata 901  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||       |||||||||| ||  ||| ||| |||||||||||||| ||    |||| ||||||     
T  11626696 ttcaatgttcatttaagactatgaaca-ttgatgtac-------taggaatatttcacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcatt 11626605  T
Q  902 aatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||| || |   | ||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||    
T  11626604 attgtttcactattaggatttgattgcatcaaatgatagtcttacaaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctga 11626525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 803 - 981
Target Start/End: Complemental strand, 26348481 - 26348310
Alignment:
Q  803 ttcaatgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaag-aatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcata 901  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||       |||||||||| ||  ||| ||| |||||||||||||| |     |||| ||||||     
T  26348481 ttcaatgttcatttaagactatgaaca-ttgatgtac-------taggaatatttcacaaaggaatatcatcctagatgttattatcactgctcttcatt 26348390  T
Q  902 aatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||    
T  26348389 attgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctga 26348310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 803 - 981
Target Start/End: Original strand, 43983207 - 43983378
Alignment:
Q  803 ttcaatgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaag-aatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcata 901  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||       |||||||||| ||  ||| ||| |||||||||||||| ||    |||| ||||||     
T  43983207 ttcaatgttcatttaagactatgaaca-ttgatgtac-------taggaatatttcacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcatt 43983298  T
Q  902 aatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||  |||||||||||| | | ||||||||||    
T  43983299 attgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcagcctaagtgaaacagatggaacattctga 43983378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 864 - 981
Target Start/End: Original strand, 44897101 - 44897218
Alignment:
Q  864 gaatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcataaatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaa 963  Q
    |||| |||||||||||||| ||    |||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||| |||||||||    
T  44897101 gaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcctaagtgaa 44897200  T
Q  964 acaaaagaaacattctga 981  Q
    ||| | | ||||||||||    
T  44897201 acagatggaacattctga 44897218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 864 - 981
Target Start/End: Original strand, 44907504 - 44907621
Alignment:
Q  864 gaatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcataaatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaa 963  Q
    |||| |||||||||||||| ||    |||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||| |||||||||    
T  44907504 gaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcctaagtgaa 44907603  T
Q  964 acaaaagaaacattctga 981  Q
    ||| | | ||||||||||    
T  44907604 acagatggaacattctga 44907621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 890 - 981
Target Start/End: Complemental strand, 9535492 - 9535401
Alignment:
Q  890 ctgcacttcataaatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    |||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||    
T  9535492 ctgctcttcatcattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctga 9535401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 890 - 981
Target Start/End: Complemental strand, 9545775 - 9545684
Alignment:
Q  890 ctgcacttcataaatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    |||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||    
T  9545775 ctgctcttcatcattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctga 9545684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 890 - 981
Target Start/End: Complemental strand, 16132166 - 16132075
Alignment:
Q  890 ctgcacttcataaatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    |||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||    
T  16132166 ctgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctga 16132075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 890 - 981
Target Start/End: Complemental strand, 16142715 - 16142624
Alignment:
Q  890 ctgcacttcataaatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    |||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||    
T  16142715 ctgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctga 16142624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 890 - 981
Target Start/End: Original strand, 42620989 - 42621080
Alignment:
Q  890 ctgcacttcataaatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    |||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||    
T  42620989 ctgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctga 42621080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 752 - 966
Target Start/End: Original strand, 9006586 - 9006791
Alignment:
Q  752 gatcaatcaaggaataaaagcatttatttgattaaagtcaaaaagggcatcttcaatgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttagga 851  Q
    ||||||||||| |||||| | |||||   |||||| ||||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||       ||| |    
T  9006586 gatcaatcaagcaataaaggtatttacaagattaatgtcaaaaagg--atattcaatgttcattcaagactatgaacacttgaaatac-------tagaa 9006676  T
Q  852 atattccattaagaatgtcatcctagatgttttccatg-ctgcacttcataaatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaat 950  Q
    ||||||||   ||||| ||||||||||||||  | ||  || | ||||||   ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||    
T  9006677 atattccaaagagaatatcatcctagatgttg-caatcacttctcttcattgttgtttcactattaggatttgattacatcaaatggtagtcttacaaat 9006775  T
Q  951 cattctaagtgaaaca 966  Q
    | ||||||||||||||    
T  9006776 ccttctaagtgaaaca 9006791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 464 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 22964925 - 22964879
Alignment:
Q  464 aattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctcttg 510  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  22964925 aattaatggactttgattaattctttggtatttaacttgtgctcttg 22964879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 803 - 966
Target Start/End: Complemental strand, 26363516 - 26363360
Alignment:
Q  803 ttcaatgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaag-aatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcata 901  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||       |||||||||| ||  ||| ||| |||||||||||||| |     |||| ||||||     
T  26363516 ttcaatgttcatttaagactatgaaca-ttgatgtac-------taggaatatttcacaaaggaatatcatcctagatgttattatcactgctcttcatt 26363425  T
Q  902 aatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaaca 966  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||| ||||||||||||    
T  26363424 attgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcctaagtgaaaca 26363360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 904 - 981
Target Start/End: Complemental strand, 2992153 - 2992076
Alignment:
Q  904 tgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  2992153 tgtttcactattaggatttgattacatcaaatggtagtcttagaaatcatcctaaatgaaacaaaaggaacattctga 2992076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 904 - 981
Target Start/End: Original strand, 14944131 - 14944208
Alignment:
Q  904 tgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||    
T  14944131 tgtttcactattaggatttgattacatcaaatggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctga 14944208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 904 - 981
Target Start/End: Original strand, 15371724 - 15371801
Alignment:
Q  904 tgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||    
T  15371724 tgtttcactattaggatttgattacatcaaatggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctga 15371801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 803 - 981
Target Start/End: Original strand, 32098110 - 32098281
Alignment:
Q  803 ttcaatgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaag-aatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcata 901  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||       |||||||||| ||  ||| ||| |||||||||||||| |     |||| ||||||     
T  32098110 ttcaatgttcatttaagactatgaaca-ttgatgtac-------taggaatatttcacaaaggaatatcatcctagatgttattatcactgctcttcatt 32098201  T
Q  902 aatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||| || |   | ||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||    
T  32098202 attgtttcactattaggatttgattgcatcaaatgatagtcttacaaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctga 32098281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 803 - 981
Target Start/End: Original strand, 32108547 - 32108718
Alignment:
Q  803 ttcaatgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaag-aatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcata 901  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||       |||||||||| ||  ||| ||| |||||||||||||| |     |||| ||||||     
T  32108547 ttcaatgttcatttaagactatgaaca-ttgatgtac-------taggaatatttcacaaaggaatatcatcctagatgttattatcactgctcttcatt 32108638  T
Q  902 aatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||| || |   | ||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||    
T  32108639 attgtttcactattaggatttgattgcatcaaatgatagtcttacaaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctga 32108718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 567; Significance: 0; HSPs: 59)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 567; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 407 - 1057
Target Start/End: Original strand, 20957507 - 20958156
Alignment:
Q  407 attgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgct 506  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20957507 attgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgatgattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgct 20957606  T
Q  507 cttgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacataaagacttaagaactcagtcagagttcagaaag 606  Q
    |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20957607 cttgagtggttaactaagacaggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacataaagacttaagaactcagttagagttcagaaag 20957706  T
Q  607 ttaaaaagagttcagaaggttgggcagagtttagaaggttgttcgtgatgaacatcaagaaccaagcccagaaattcatgaactaaatgaagaacatgca 706  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20957707 ttaaaaagagttcagaaggttggacagagttcagaaggttgttcatgatgaacatcaagaaccaagcccagaaattcatgaactaaatgaagaacatgca 20957806  T
Q  707 aggttcacgtgacttaaatgaaagcctagaaaagtacatgactaagatcaatcaaggaataaaagcatttatttgattaaagtcaaaaagggcatcttca 806  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20957807 aggttcacgtgacttaaatgaaggcctagaaaagtacatgactgagatcaatcaaggaataaaagcatttatttgattaaagtcaaaaagggcatcttca 20957906  T
Q  807 atgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaagaatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcataaatgt 906  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20957907 atgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacattaggaatattccattaagaatatcatcctagatgttttccatgctgcacttcataaatgt 20958006  T
Q  907 ttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctgaagtcccctgagttcagaaagttcaa 1006  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      
T  20958007 ttcactattaggatttgattacattaattacaagtcttacaaatcatcctaagtgaaacaaaagaaacattctgaagtcccctgagttcagaatgttcgt 20958106  T
Q  1007 tcctgctccatgcttttttctgacgtgaacagtacagtggttggaaagcaa 1057  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  20958107 tcctgctccatgc-tttttctgacgtgaacagtacagcagttggaaagcaa 20958156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 561; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 409 - 1057
Target Start/End: Original strand, 20947120 - 20947767
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20947120 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgatgattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 20947219  T
Q  509 tgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacataaagacttaagaactcagtcagagttcagaaagtt 608  Q
    || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20947220 tgagtggttaactaagacaggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacataaagacttaagaactcagttagagttcagaaagtt 20947319  T
Q  609 aaaaagagttcagaaggttgggcagagtttagaaggttgttcgtgatgaacatcaagaaccaagcccagaaattcatgaactaaatgaagaacatgcaag 708  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20947320 aaaaagagttcagaaggttggacagagttcagaaggttgttcatgatgaacatcaagaaccaaacccagaaattcatgaactaaatgaagaacatgcaag 20947419  T
Q  709 gttcacgtgacttaaatgaaagcctagaaaagtacatgactaagatcaatcaaggaataaaagcatttatttgattaaagtcaaaaagggcatcttcaat 808  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20947420 gttcacgtgacttaaatgaaggcctagaaaagtacatgactgagatcaatcaaggaataaaagcatttatttgattaaagtcaaaaagggcatcttcaat 20947519  T
Q  809 gttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaagaatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcataaatgttt 908  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20947520 gttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacattaggaatattccattaagaatatcatcctagatgttttccatgctgcacttcataaatgttt 20947619  T
Q  909 cactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctgaagtcccctgagttcagaaagttcaatc 1008  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||    
T  20947620 cactattaggatttgattacattaattacaagtcttacaaatcatcctaagtgaaacaaaagaaacattctgaagtcccctgagttcagaatgttcgttc 20947719  T
Q  1009 ctgctccatgcttttttctgacgtgaacagtacagtggttggaaagcaa 1057  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  20947720 ctgctccatgc-tttttctgacgtgaacagtacagcagttggaaagcaa 20947767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 465; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 409 - 1059
Target Start/End: Complemental strand, 19549212 - 19548561
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19549212 tgttgagggaaaatccctaattaattttaaagataacaaaccttgttgattaagaaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacctgtgctct 19549113  T
Q  509 tgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagata-caaagaatcaaaggacataaagacttaagaactcagtcagagttcagaaagt 607  Q
    || ||| |||||||| | |||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19549112 tgagtggttaactaaaacaggaacaagtttcaattcataccaagataacaaagaatcaaaggacataaagacttaagaactcagttagagttcagaaagt 19549013  T
Q  608 taaaaagagttcagaaggttgggcagagtttagaaggttgttcgtgatgaacatcaagaaccaagcccagaaattcatgaactaaatgaagaacatgcaa 707  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19549012 taaaaagagttcagaaggttggacagagttcagaaggttgttcatgatgaacatcaagaaccaaacccagaaattcatgaaccaaatgaagaacatgcaa 19548913  T
Q  708 ggttcacgtgacttaaatgaaagcctagaaaagtacat-gactaagatcaatcaaggaataaaagcatttatttgattaaagtcaaaaagggcatcttca 806  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19548912 ggttcacgtgacttaaataaaagcccagaaaagtatattgactaagatcaatcaaggaataaagacatttatttgatttaagtcaaaaagggcatcttca 19548813  T
Q  807 atgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaagaatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcataaatgt 906  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  19548812 atgttcatttaagactatgaacatttgaagtacaaaacattaggaatattccattaagaatatcatcctagatgtttttcatgttgcacttcataaatgt 19548713  T
Q  907 ttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctgaagtcccctgagttcagaaagttcaa 1006  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19548712 ttcactattaggatttgattacatcaaataagagtcttacaaatcatcctaagtgaaacaaaagaaacattatgaagtcccctgagttcagaaagttcaa 19548613  T
Q  1007 tcctgctccatgcttttttctgacgtgaacagtacagtggttggaaagcaaaa 1059  Q
    || ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  19548612 tcatgctccatgct-ttttctgtcatgaacagtacagttggtggaaagcaaaa 19548561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 547 - 1060
Target Start/End: Original strand, 36315826 - 36316339
Alignment:
Q  547 accaagatacaaagaatcaaaggacataaagacttaagaactcagtcagagttcagaaagttaaaaagagttcagaaggttgggcagagtttagaaggtt 646  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  36315826 accaagatacaaagaatcaaaggacataaagacttaagaactcagttagagttcaaaaagttaaaaagagttcagaaggttggacagagttcagaaggtt 36315925  T
Q  647 gttcgtgatgaacatcaagaaccaagcccagaaattcatgaactaaatgaagaacatgcaaggttcacgtgacttaaatgaaagcctagaaaagtacat- 745  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||||||| ||| || || |||||||||     
T  36315926 gttcatgatgaacatcaagaaccaaacccaaaaattcatgaaccaaataaagaacatacaaggttcacatgacttaaataaaatcccagtaaagtacatt 36316025  T
Q  746 gactaagatcaatcaaggaataaaagcatttatttgattaaagtcaaaaagggcatcttcaatgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacg 845  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||     
T  36316026 gactaagatcaatcaaggaataaagacatttatttgattaaagtcaaaaagggcatcttcaatgttcattcaagactatgaacatttgaagtacaaaaca 36316125  T
Q  846 ttaggaatattccattaagaatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcataaatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatctta 945  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| || ||  | |||||    
T  36316126 tttggaatattccattaagaatatcatcctagatgttttccatgctgcacttcatcgatgttccactattaggatttgattacatcaaataagagtctta 36316225  T
Q  946 caaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctgaagtcccctgagttcagaaagttcaatcctgctccatgcttttttctgacgtgaacagtacagtg 1045  Q
    |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  36316226 caaatcatcctaagtgaaacaaaaacaacattctgaagtcccttgagttcagaaagttcgatcctgctccatgc-tttttctgtcatgaacagtacagtg 36316324  T
Q  1046 gttggaaagcaaaag 1060  Q
    |||||||||||||||    
T  36316325 gttggaaagcaaaag 36316339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 83; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 407 - 573
Target Start/End: Original strand, 33948806 - 33948972
Alignment:
Q  407 attgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgct 506  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  33948806 attgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaaccaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgct 33948905  T
Q  507 cttgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    |||| ||| || ||||||| |||||||||  |  | |||||||||||| || | |||||||||||||    
T  33948906 cttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggacat 33948972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 409 - 573
Target Start/End: Original strand, 33938408 - 33938572
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  33938408 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaaccaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 33938507  T
Q  509 tgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    || ||| || ||||||| |||||||||  |  | |||||||||||| || | |||||||||||||    
T  33938508 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggacat 33938572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 407 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 26192939 - 26192773
Alignment:
Q  407 attgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgct 506  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  26192939 attgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaaccaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgct 26192840  T
Q  507 cttgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    |||| ||| || ||||||| |||||||||  |  | |||||||||||  |||  |||||||||||||    
T  26192839 cttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacat 26192773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 409 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 22174249 - 22174084
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  22174249 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 22174150  T
Q  509 tgcgtg-attaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    || |||  || ||||||| |||||||||  |  | ||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  22174149 tgagtgttttcactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatacataaaatcaaaggacat 22174084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 408 - 573
Target Start/End: Original strand, 32069773 - 32069938
Alignment:
Q  408 ttgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctc 507  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  32069773 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaaccaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 32069872  T
Q  508 ttgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    ||| ||| || ||||||| |||||||||  | |  |||||||||||  |||  |||||||||||||    
T  32069873 ttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttagatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacat 32069938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 409 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 26203497 - 26203333
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  26203497 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaaccaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 26203398  T
Q  509 tgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    || ||| || ||||||| |||||||||  |  | |||||||||||  |||  |||||||||||||    
T  26203397 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacat 26203333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 407 - 573
Target Start/End: Original strand, 21761796 - 21761963
Alignment:
Q  407 attgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgct 506  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  21761796 attgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgct 21761895  T
Q  507 cttgcgtg-attaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    |||| |||  || ||||||| |||||||||  |  | |||||||||||| || | |||||||||||||    
T  21761896 cttgagtgttttcactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggacat 21761963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 411 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 23379311 - 23379149
Alignment:
Q  411 ttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctcttg 510  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23379311 ttgaggcaaaatccttaattaattttaaagataataaaacttgatgattaaggaatcaatggactttgattaatttcttggtatttaacttgtgctcttg 23379212  T
Q  511 cgtgattaactaagataggaacaa-gtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
      || || ||||||| | ||| || || |||| |||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  23379211 aatgttttactaagacatgaaaaatgtttaaa-tcattccaagatacaagaaatcaaaggacat 23379149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 409 - 571
Target Start/End: Original strand, 20896260 - 20896422
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  20896260 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggactaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 20896359  T
Q  509 tgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggac 571  Q
    || ||| || || || ||| |||||||  | || ||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  20896360 tgagtgttttacaaatataagaacaaggtttaagtcataccaagatagaagaaatcaaaggac 20896422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 408 - 573
Target Start/End: Original strand, 21680846 - 21681012
Alignment:
Q  408 ttgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctc 507  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  21680846 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 21680945  T
Q  508 ttgcgtg-attaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    ||| |||  || ||||||| |||||||||  |  | |||||||||||| || | |||||||||||||    
T  21680946 ttgagtgttttcactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggacat 21681012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 408 - 573
Target Start/End: Original strand, 37816886 - 37817052
Alignment:
Q  408 ttgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctc 507  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  37816886 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 37816985  T
Q  508 ttgcgtg-attaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    ||| |||  || ||||||| |||||||||  |  | |||||||||||| || | |||||||||||||    
T  37816986 ttgagtgttttcactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggacat 37817052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 409 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 4038927 - 4038762
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  4038927 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 4038828  T
Q  509 tgcgtg-attaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    || |||  || ||||||| |||||||||  |  | |||||||||||| || | |||||||||||||    
T  4038827 tgagtgctttcactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcatataatcaaaggacat 4038762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 409 - 573
Target Start/End: Original strand, 21752375 - 21752540
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  21752375 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 21752474  T
Q  509 tgcgtg-attaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    || |||  || ||||||| |||||||||  |  | |||||||||||| || | |||||||||||||    
T  21752475 tgagtgttttcactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggacat 21752540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 409 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 27275128 - 27274963
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  27275128 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 27275029  T
Q  509 tgcgtg-attaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    || |||  || ||||||| |||||||||  |  | |||||||||||| || | |||||||||||||    
T  27275028 tgagtgttttcactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggacat 27274963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 407 - 573
Target Start/End: Original strand, 18389404 - 18389571
Alignment:
Q  407 attgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgct 506  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  18389404 attgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgct 18389503  T
Q  507 cttgcgtg-attaactaagataggaacaa-gtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    |||| |||  || ||||||| |||||||| || | || |||||||||||| || | |||||||||||||    
T  18389504 cttgagtgttttcactaagacaggaacaaggtctgaa-tcataccaagatgcataaaatcaaaggacat 18389571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 409 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 20905481 - 20905318
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  | || |||||||| | ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  20905481 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactataatgattaaggactaaatggactttgattaattccttgatatttaacttgtgctct 20905382  T
Q  509 tgcgtgattaactaagataggaacaa-gtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggaca 572  Q
    || ||| || |||||||  ||||||| || |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  20905381 tgagtgttttactaagacgggaacaatgtttaaa-tcataccaagatacaagaaatcaaaggaca 20905318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 409 - 553
Target Start/End: Original strand, 22240346 - 22240490
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  22240346 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaaccaatatgattaacgaattaatggactttgattaattccttgatatttaacttgtgctct 22240445  T
Q  509 tgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaaga 553  Q
    || ||| || ||||||||| |||||||  | || |||||||||||    
T  22240446 tgagtgttttactaagataagaacaaggtttaaatcataccaaga 22240490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 409 - 573
Target Start/End: Original strand, 27411482 - 27411646
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |    
T  27411482 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaaccaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctat 27411581  T
Q  509 tgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    || ||| || ||||||| |||||||||  | |  |||||||||||  |||  |||||||||||||    
T  27411582 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttagatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacat 27411646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 407 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 30944795 - 30944628
Alignment:
Q  407 attgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgct 506  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  30944795 attgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgct 30944696  T
Q  507 cttgcgtg-attaactaagataggaacaa-gtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    |||| |||  || ||||||| |||||||| || | || |||||||||||| || | |||||||||||||    
T  30944695 cttgagtgttttcactaagacaggaacaaggtctgaa-tcataccaagatgcataaaatcaaaggacat 30944628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 407 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 8766446 - 8766279
Alignment:
Q  407 attgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgct 506  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    || ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  8766446 attgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgct 8766347  T
Q  507 cttgcgtg-attaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    |||| |||  || ||||||| |||||||||  |  | |||||||||||| || | |||||||||||||    
T  8766346 cttgagtgttttcactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggacat 8766279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 405 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 11411902 - 11411775
Alignment:
Q  405 gaattgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtg 504  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  11411902 gaattgttgaggcaaaatctctaattaattttaaagataataaaccaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtg 11411803  T
Q  505 ctcttgcgtgattaactaagataggaac 532  Q
    |||||| ||| || ||||||| ||||||    
T  11411802 ctcttgagtgttttactaagacaggaac 11411775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 407 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 18210824 - 18210657
Alignment:
Q  407 attgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgct 506  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  || || |||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  18210824 attgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaagtttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgct 18210725  T
Q  507 cttgcgtg-attaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    |||| |||  || ||||||| |||||||||  |  | |||||||||||| || | |||||||||||||    
T  18210724 cttgagtgttttcactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggacat 18210657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 407 - 573
Target Start/End: Original strand, 31916118 - 31916285
Alignment:
Q  407 attgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgct 506  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |    
T  31916118 attgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaacattaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgtt 31916217  T
Q  507 cttgcgtg-attaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    |||| |||  || ||||||| |||||||||  |  | |||||||||||| || | |||||||||||||    
T  31916218 cttgagtgtttttactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggacat 31916285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 409 - 573
Target Start/End: Original strand, 18360406 - 18360571
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  18360406 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 18360505  T
Q  509 tgcgtg-attaactaagataggaacaa-gtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    || |||  || ||||||| |||||||| || | || |||||||||||| || | |||||||||||||    
T  18360506 tgagtgttttcactaagacaggaacaaggtctgaa-tcataccaagatgcataaaatcaaaggacat 18360571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 408 - 510
Target Start/End: Original strand, 20763667 - 20763769
Alignment:
Q  408 ttgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctc 507  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20763667 ttgttaaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggaataaatggactttgattaatttcttggtatttaacttgtgctc 20763766  T
Q  508 ttg 510  Q
    |||    
T  20763767 ttg 20763769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 409 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 30954215 - 30954050
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  30954215 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 30954116  T
Q  509 tgcgtg-attaactaagataggaacaa-gtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    || |||  || ||||||| |||||||| || | || |||||||||||| || | |||||||||||||    
T  30954115 tgagtgttttcactaagacaggaacaaggtctgaa-tcataccaagatgcataaaatcaaaggacat 30954050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 409 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 13572659 - 13572494
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  13572659 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattgattccttggtatttaacttgtgctct 13572560  T
Q  509 tgcgtg-attaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    || |||  || ||||||| |||||||||  |  | |||||||||||| || | |||||||||||||    
T  13572559 tgagtgttttcactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggacat 13572494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 409 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 37549568 - 37549403
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  37549568 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 37549469  T
Q  509 tgcgtg-attaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    || |||  || ||||||| | |||||||  |  | |||||||||||| || | |||||||||||||    
T  37549468 tgagtgttttcactaagacaagaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggacat 37549403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 409 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 37652366 - 37652201
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  37652366 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 37652267  T
Q  509 tgcgtg-attaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    || |||  || ||||||| | |||||||  |  | |||||||||||| || | |||||||||||||    
T  37652266 tgagtgttttcactaagacaagaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggacat 37652201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 409 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 18220172 - 18220007
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  || || |||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  18220172 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaagtttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 18220073  T
Q  509 tgcgtg-attaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    || |||  || ||||||| | |||||||  |  | |||||||||||| || | |||||||||||||    
T  18220072 tgagtgttttcactaagacaagaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggacat 18220007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 409 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 19889289 - 19889124
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  19889289 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttaattaattccttggtatttaacttgtgctct 19889190  T
Q  509 tgcgtg-attaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    || |||  || ||||||| ||||| |||  |  | |||||||||||| || | |||||||||||||    
T  19889189 tgagtgtttttactaagacaggaataaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggacat 19889124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 409 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 42091469 - 42091369
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  42091469 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 42091370  T
Q  509 t 509  Q
    |    
T  42091369 t 42091369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 409 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 37299778 - 37299613
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  37299778 tgttgaggcaaaatacctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacatgtgctct 37299679  T
Q  509 tgcgtg-attaactaagataggaac-aagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    || |||  || ||||||| |||||| |||| | || |||||||||||| || | |||||||||||||    
T  37299678 tgagtgttttcactaagacaggaacaaagtttgaa-tcataccaagatgcataaaatcaaaggacat 37299613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 408 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 34131395 - 34131293
Alignment:
Q  408 ttgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctc 507  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | |||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  34131395 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatgaactttgattaattccttgatatttaacttgtgctc 34131296  T
Q  508 ttg 510  Q
    |||    
T  34131295 ttg 34131293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 803 - 981
Target Start/End: Original strand, 18361007 - 18361178
Alignment:
Q  803 ttcaatgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaag-aatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcata 901  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||       |||||||||| ||  ||| ||| |||||||||||||| ||    |||| ||||||     
T  18361007 ttcaatgttcatttaagactatgaaca-ttgatgtac-------taggaatatttcacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcatt 18361098  T
Q  902 aatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||    
T  18361099 attgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctga 18361178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 803 - 981
Target Start/End: Original strand, 21753173 - 21753344
Alignment:
Q  803 ttcaatgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaag-aatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcata 901  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||       |||||||||| ||  ||| ||| |||||||||||||| ||    |||| ||||||     
T  21753173 ttcaatgttcatttaagactatgaaca-ttgatgtac-------taggaatatttcacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcatt 21753264  T
Q  902 aatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||    
T  21753265 attgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctga 21753344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 803 - 981
Target Start/End: Original strand, 21762460 - 21762631
Alignment:
Q  803 ttcaatgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaag-aatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcata 901  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||       |||||||||| ||  ||| ||| |||||||||||||| ||    |||| ||||||     
T  21762460 ttcaatgttcatttaagactatgaaca-ttgatgtac-------taggaatatttcacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcatt 21762551  T
Q  902 aatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||    
T  21762552 attgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctga 21762631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 803 - 981
Target Start/End: Complemental strand, 26192332 - 26192161
Alignment:
Q  803 ttcaatgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaag-aatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcata 901  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||       |||||||||| ||  ||| ||| |||||||||||||| ||    |||| ||||||     
T  26192332 ttcaatgttcatttaagactatgaaca-ttgatgtac-------taggaatatttcacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcatt 26192241  T
Q  902 aatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||    
T  26192240 attgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctga 26192161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 803 - 981
Target Start/End: Complemental strand, 26202936 - 26202765
Alignment:
Q  803 ttcaatgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaag-aatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcata 901  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||       |||||||||| ||  ||| ||| |||||||||||||| ||    |||| ||||||     
T  26202936 ttcaatgttcatttaagactatgaaca-ttgatgtac-------taggaatatttcacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcatt 26202845  T
Q  902 aatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||    
T  26202844 attgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctga 26202765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 904 - 981
Target Start/End: Original strand, 31105236 - 31105313
Alignment:
Q  904 tgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  31105236 tgtttcactattaggatttgattacatcaaatggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaacaaaaggaacattctga 31105313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 803 - 981
Target Start/End: Original strand, 33939047 - 33939218
Alignment:
Q  803 ttcaatgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaag-aatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcata 901  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||       |||||||||| ||  ||| ||| |||||||||||||| ||    |||| ||||||     
T  33939047 ttcaatgttcatttaagactatgaaca-ttgatgtac-------taggaatatttcacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcatt 33939138  T
Q  902 aatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||    
T  33939139 attgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctga 33939218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 803 - 981
Target Start/End: Original strand, 33949447 - 33949618
Alignment:
Q  803 ttcaatgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaag-aatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcata 901  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||       |||||||||| ||  ||| ||| |||||||||||||| ||    |||| ||||||     
T  33949447 ttcaatgttcatttaagactatgaaca-ttgatgtac-------taggaatatttcacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcatt 33949538  T
Q  902 aatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||    
T  33949539 attgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctga 33949618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 864 - 981
Target Start/End: Complemental strand, 8765642 - 8765525
Alignment:
Q  864 gaatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcataaatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaa 963  Q
    |||| |||||||||||||| ||    |||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||| |||||||||    
T  8765642 gaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcctaagtgaa 8765543  T
Q  964 acaaaagaaacattctga 981  Q
    ||| | | ||||||||||    
T  8765542 acagatggaacattctga 8765525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 864 - 981
Target Start/End: Complemental strand, 11411386 - 11411269
Alignment:
Q  864 gaatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcataaatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaa 963  Q
    |||| |||||||||||||| ||    |||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||| |||||||||    
T  11411386 gaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcctaagtgaa 11411287  T
Q  964 acaaaagaaacattctga 981  Q
    ||| | | ||||||||||    
T  11411286 acagatggaacattctga 11411269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 803 - 981
Target Start/End: Original strand, 18389964 - 18390135
Alignment:
Q  803 ttcaatgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaag-aatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcata 901  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||       |||||||||| ||  ||| ||| |||||||||||||| ||    |||| ||||||     
T  18389964 ttcaatgttcatttaagactatgaaca-ttgatgtac-------taggaatatttcacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcatt 18390055  T
Q  902 aatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||| ||||||| |||||||||||| | | ||||||||||    
T  18390056 attgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttagaaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctga 18390135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 803 - 981
Target Start/End: Original strand, 27411878 - 27412049
Alignment:
Q  803 ttcaatgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaag-aatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcata 901  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||       |||||||||| ||  ||| ||| |||||||||||||| |     |||| ||||||     
T  27411878 ttcaatgttcatttaagactatgaaca-ttgatgtac-------taggaatatttcacaaaggaatatcatcctagatgttattatcactgctcttcatt 27411969  T
Q  902 aatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||    
T  27411970 attgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctga 27412049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 803 - 981
Target Start/End: Original strand, 32070170 - 32070341
Alignment:
Q  803 ttcaatgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaag-aatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcata 901  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||       |||||||||| ||  ||| ||| |||||||||||||| |     |||| ||||||     
T  32070170 ttcaatgttcatttaagactatgaaca-ttgatgtac-------taggaatatttcacaaaggaatatcatcctagatgttattatcactgctcttcatt 32070261  T
Q  902 aatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||    
T  32070262 attgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctga 32070341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 408 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 15240614 - 15240546
Alignment:
Q  408 ttgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactt 476  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||| |||| | ||||||||||||    
T  15240614 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagatgataaaccatgatagttaaaggattaatggactt 15240546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 473 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 206362 - 206261
Alignment:
Q  473 actttgattaatttgttggtatttaacttgtgctcttgcgtg-attaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggac 571  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||  || ||||||| ||||| |||  | || |||||||||||||||   |||||||||||    
T  206362 actttgattaattccttggtatttaacttgtgctcttgagtgtttttactaagacaggaataaggtttaaatcataccaagatacatgaaatcaaaggac 206263  T
Q  572 at 573  Q
    ||    
T  206262 at 206261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 904 - 981
Target Start/End: Original strand, 22244538 - 22244615
Alignment:
Q  904 tgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||    
T  22244538 tgtttcactattaggatttgattacatcaaatggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctga 22244615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 904 - 981
Target Start/End: Complemental strand, 23378820 - 23378743
Alignment:
Q  904 tgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| || |  || ||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||    
T  23378820 tgtttcactattacgatttgattacatcaaatggaagtcttacaaatcatcctaagagaaacaaaaggaccattctga 23378743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 408 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 15240753 - 15240685
Alignment:
Q  408 ttgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactt 476  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||| | || |||||||||    
T  15240753 ttgttgaggcaaaatcccaaattaattttaaagataataaaccatgatagttaaaggatcaatggactt 15240685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 906 - 981
Target Start/End: Complemental strand, 21484269 - 21484194
Alignment:
Q  906 tttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtg-aaacaaaagaaacattctga 981  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||| | ||||||||||    
T  21484269 tttcactattaggatt-gattacatcaaatacaagtcttacaaatcatcctaggtgaaaacaaatggaacattctga 21484194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 409 - 460
Target Start/End: Original strand, 35985567 - 35985619
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagat-aacaaaccttgataatta 460  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  35985567 tgttgaggcaaaatccctaaaatattttaaagataaacaaaccttgatgatta 35985619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 696 - 837
Target Start/End: Original strand, 31105036 - 31105175
Alignment:
Q  696 aagaacatgcaaggttcacgtgacttaaatgaaagcctagaaaagtacatgactaag-atcaatcaaggaataaaagcatttatttgattaaagtcaaaa 794  Q
    ||||||||||||||| |||||||| | ||| || | | || |||||||||   || | |||||||||| ||||||  ||||||   |||||| | |||||    
T  31105036 aagaacatgcaaggtacacgtgacatgaataaatgtccagtaaagtacattggtatggatcaatcaagcaataaagtcatttacaagattaatgccaaaa 31105135  T
Q  795 agggcatcttcaatgttcatttaagactatgaacaattgaagt 837  Q
    |||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31105136 agg--atattcaatgttcatttaagactatgaac-attgaagt 31105175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 551; Significance: 0; HSPs: 61)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 551; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 407 - 1057
Target Start/End: Complemental strand, 27160675 - 27160026
Alignment:
Q  407 attgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgct 506  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27160675 attgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgatgattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgct 27160576  T
Q  507 cttgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacataaagacttaagaactcagtcagagttcagaaag 606  Q
    |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27160575 cttgagtggttaactaagacaggaacaagtgtaaatttataccaagatacaaagaatcaaaagacataaagacttaagaactcagtcagagttcagaaag 27160476  T
Q  607 ttaaaaagagttcagaaggttgggcagagtttagaaggttgttcgtgatgaacatcaagaaccaagcccagaaattcatgaactaaatgaagaacatgca 706  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27160475 ttaaaaagagttcagaaggttggacagagttcagaaggttgttcatgatgaacatcaagaaccaagcccagaaactcatgaactaaatgaagaacatgca 27160376  T
Q  707 aggttcacgtgacttaaatgaaagcctagaaaagtacatgactaagatcaatcaaggaataaaagcatttatttgattaaagtcaaaaagggcatcttca 806  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27160375 aggttcacgtgacttaaatgaaagcccagaaaagtacatgactgagatcaatcaaggaataaaagcatttatttgattaaagtcaaaaagggcatcttca 27160276  T
Q  807 atgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaagaatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcataaatgt 906  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27160275 atgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacattaggaatattccattaagaatatcatcctagatgttttccatgctgcacttcatagatgt 27160176  T
Q  907 ttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctgaagtcccctgagttcagaaagttcaa 1006  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      
T  27160175 ttcactattaggatttgattacattaattacaagtcttacaaatcatcctaagtaaaacaaaagaaacattctgaagtcccctgagttcagaatgttcgt 27160076  T
Q  1007 tcctgctccatgcttttttctgacgtgaacagtacagtggttggaaagcaa 1057  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  27160075 tcctgctccatgct-ttttctgacgtgaacagtacagcagttggaaagcaa 27160026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 551; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 407 - 1057
Target Start/End: Complemental strand, 27171044 - 27170395
Alignment:
Q  407 attgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgct 506  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27171044 attgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgatgattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgct 27170945  T
Q  507 cttgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacataaagacttaagaactcagtcagagttcagaaag 606  Q
    |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27170944 cttgagtggttaactaagacaggaacaagtgtaaatttataccaagatacaaagaatcaaaagacataaagacttaagaactcagtcagagttcagaaag 27170845  T
Q  607 ttaaaaagagttcagaaggttgggcagagtttagaaggttgttcgtgatgaacatcaagaaccaagcccagaaattcatgaactaaatgaagaacatgca 706  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27170844 ttaaaaagagttcagaaggttggacagagttcagaaggttgttcatgatgaacatcaagaaccaagcccagaaactcatgaactaaatgaagaacatgca 27170745  T
Q  707 aggttcacgtgacttaaatgaaagcctagaaaagtacatgactaagatcaatcaaggaataaaagcatttatttgattaaagtcaaaaagggcatcttca 806  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27170744 aggttcacgtgacttaaatgaaagcccagaaaagtacatgactgagatcaatcaaggaataaaagcatttatttgattaaagtcaaaaagggcatcttca 27170645  T
Q  807 atgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaagaatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcataaatgt 906  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27170644 atgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacattaggaatattccattaagaatatcatcctagatgttttccatgctgcacttcatagatgt 27170545  T
Q  907 ttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctgaagtcccctgagttcagaaagttcaa 1006  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      
T  27170544 ttcactattaggatttgattacattaattacaagtcttacaaatcatcctaagtaaaacaaaagaaacattctgaagtcccctgagttcagaatgttcgt 27170445  T
Q  1007 tcctgctccatgcttttttctgacgtgaacagtacagtggttggaaagcaa 1057  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  27170444 tcctgctccatgct-ttttctgacgtgaacagtacagcagttggaaagcaa 27170395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 455; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 407 - 1059
Target Start/End: Complemental strand, 22909529 - 22908876
Alignment:
Q  407 attgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgct 506  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22909529 attgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataacaaaccttgatgattaaggaattaatggactatgattaatttgttggtatttaacttgtgct 22909430  T
Q  507 cttgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacataaagacttaa-gaactcagtcagagttcagaaa 605  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  22909429 cttgagtggttaactgagataggaacaagtttcaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacataaagacttaaagaactcagtcagagttcataaa 22909330  T
Q  606 gttaaaaagagttcagaaggttgggcagagtttagaaggttgttcgtgatgaacatcaagaaccaagcccagaaattcatgaactaaatgaagaacatgc 705  Q
    ||||||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  22909329 gttaaaaagagtttagaaagttggacaaagttcagaaggttgttcatgatgaacatcaagaaccaagcccagaaattcatgaatcaaatgaagaacatgc 22909230  T
Q  706 aaggttcacgtgacttaaatgaaagcctagaaaagtacat-gactaagatcaatcaaggaataaaagcatttatttgattaaagtcaaaaagggcatctt 804  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  22909229 aaggttcacgtgacttaaataaaagccaactaaagtacattgactaagatcaatcaaggaataaaggcatttatttgattaaagacaaaaatggcatctt 22909130  T
Q  805 caatgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaagaatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcataaat 904  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22909129 caatgttcattcaagactatgaacatttgaagtataaaaaattaggaatattccattaagaatatcatcctagatgttttccatgctccacttcataaat 22909030  T
Q  905 gtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctgaagtcccctgagttcagaaagttc 1004  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| || ||  | ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  22909029 gtttcattattaggatttgattacatcaaataagagtcttacaaatcatcctaagtgaaacaaaaggaacattccgaagtcccctgagtttagaaagttc 22908930  T
Q  1005 aatcctgctccatgcttttttctgacgtgaacagtacagtggttggaaagcaaaa 1059  Q
     ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22908929 gatcctgctccatg-ttttttctgacatgaacagtacagtggttggaaagtaaaa 22908876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 431; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 411 - 1059
Target Start/End: Original strand, 22901414 - 22902060
Alignment:
Q  411 ttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctcttg 510  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22901414 ttgagacaaaatccctaattaattttaaagataacaaaccttgatgattaaagaattaatggactatgattaatttattggtatttaacttgtgctcttg 22901513  T
Q  511 cgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacataaagacttaagaactcagtcagagttcagaaagttaa 610  Q
     ||| |||||||||| || | ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22901514 agtggttaactaagacagaatcaagtttcaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacataaagacttaagaactcagtcagagtttagaaagttaa 22901613  T
Q  611 aaagagttcagaaggttgggcagagtttagaaggttgttcgtgatgaacatcaagaaccaagcccagaaattcatgaactaaatgaagaacatgcaaggt 710  Q
    |||||||||||||| |||| || |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22901614 aaagagttcagaagattggacaaagttcagaaggttgttaatgatgaacatcaagaaccagacccataaattcatgaaccaaatgaagaacatgcaaggt 22901713  T
Q  711 tcacgtgacttaaatgaaagcctagaaaagtaca-tgactaagatcaatcaaggaataaaagcatttatttgattaaagtcaaaaagggcatcttcaatg 809  Q
    ||||||||||||||| |||||  || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22901714 tcacgtgacttaaataaaagctcagtaaagtacattgactaagatcaatcaaggaataaatgaatttatttgattaaagtcaaaaagggcatcttcaatg 22901813  T
Q  810 ttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaagaatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcataaatgtttc 909  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22901814 ttcatttaagattatgaacatttgaagtacaaaacattaggaatattccattaagaatatcatcctagatgttttccatgttgcacttcataaatgtttc 22901913  T
Q  910 actattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctgaagtcccctgagttcagaaagttcaatcc 1009  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||  | ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||    
T  22901914 actattaggatttgattacatcaaataagagtcttacaaatcatcctaactgaaacaaaaggaacattctgaagtccc--gagctcagaaagttcgatcc 22902011  T
Q  1010 tgctccatgcttttttctgacgtgaacagtacagtggttggaaagcaaaa 1059  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  22902012 tgctccatgc-tttttctgacatgaacagtacaatggttggaaagtaaaa 22902060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 389; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 409 - 1059
Target Start/End: Original strand, 19341624 - 19342259
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  19341624 tgttgaggcaaaatatctaattaattttaaagataacaaaccttgatgattaaggaattaatggactttgattaatttgttggt---taacttgtgctct 19341720  T
Q  509 tgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacataaagacttaagaactcagtcagagttcagaaagtt 608  Q
    || ||| |||| ||||| ||||| |||| |  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19341721 tgagtggttaattaagacaggaataagtttcgattcatagcaagatacaaacaatcaaaggacataaagacttaagaactcagtcagagttcaaaaagtt 19341820  T
Q  609 aaaaagagttcagaaggttgggcagagtttagaaggttgttcgtgatgaacatcaagaaccaagcccagaaattcatgaactaaatgaagaacatgcaag 708  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  19341821 aaaaagagttcagaaggttggacagagttcagaatgttattcatgatgaacatcaagaaccaagcccagaaattcatgaaccaaatgaagaaaatgcaag 19341920  T
Q  709 gttcacgtgacttaaatgaaagcctagaaaagtaca-tgactaagatcaatcaaggaataaaagcatttatttgattaaagtcaaaaagggcatcttcaa 807  Q
    | ||||||||||||||| |||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19341921 ggtcacgtgacttaaataaaagcccagtaaagtacattgactgagatcaatcaaggaataaaggcatttatttgattaaagtcaaaaaggtcatcttcaa 19342020  T
Q  808 tgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaagaatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcataaatgtt 907  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||            |||||| |||||||||| ||||||    
T  19342021 tgttcattcaagactatgaacatttgaagtacaaaacattaggaatattctattaagaatatca------------tccatgttgcacttcatcaatgtt 19342108  T
Q  908 tcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctgaagtcccctgagttcagaaagttcaat 1007  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||  | ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19342109 tcactattaggatttgattacatcaaataagagtcttacaaatcatcctaagtgaaacaaaaggaacattctgaagtcccctgagttcagaaagttcgat 19342208  T
Q  1008 cctgctccatgcttttttctgacgtgaacagtacagtggttggaaagcaaaa 1059  Q
    | | |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19342209 catactccatgc-tttttctgacatgaacagtacagtggttggaaagtaaaa 19342259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 407 - 1059
Target Start/End: Original strand, 23721266 - 23721889
Alignment:
Q  407 attgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgct 506  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23721266 attgttaaggcaaaatccctaattaattttaaagataacaaaccttgatgattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgct 23721365  T
Q  507 cttgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacataaagacttaagaactcagtcagagttcagaaag 606  Q
    |||| ||| |||||  ||| |||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23721366 cttgggtggttaaccgagacaggaacaaatttcaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacataaagacttaagaactcagtcagagttcaaaaag 23721465  T
Q  607 ttaaaaagagttcagaaggttgggcagagtttagaaggttgttcgtgatgaacatcaagaaccaagcccagaaattcatgaactaaatgaagaacatgca 706  Q
    ||  |||||||||||                   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23721466 tt--aaagagttcag-------------------aaggttgttcatgatgaacatcaagaaccaagcccagaaattcatgaaccaaatgaagaacatgca 23721544  T
Q  707 aggttcacgtgacttaaatgaaagcctagaaaagtaca-tgactaagatcaatcaaggaataaaagcatttatttgattaaagtcaaaaagggcatcttc 805  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||    
T  23721545 aggttcacgtgactttaataaaagccccgtaaagtacattgactaagatcaatcaaggaataaaggcatttatttgactaaagtccaaaggagcatcttc 23721644  T
Q  806 aatgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaagaatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcataaatg 905  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||       |||   ||||||||| |||||||||||||||    
T  23721645 aatgttcattcaagactatgaacatttgaagtacaaaacattaggaatattccattaataat-------tag-gattttccatgttgcacttcataaatg 23721736  T
Q  906 tttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctgaagtcccctgagttcagaaagttca 1005  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||  | ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  23721737 tttcactattaggatttgattacatcaaataagagtcttacaaatcatcctaagtgaaacaaaaggaacattatgaagtcctctgagttcagaaagttcg 23721836  T
Q  1006 atcctgctccatgcttttttctgacgtgaacagtacagtggttggaaagcaaaa 1059  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23721837 atcctgctccatgctttttt-tgacatgaacagtacagtggttggaaagtaaaa 23721889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 145; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 418 - 968
Target Start/End: Complemental strand, 40409761 - 40409214
Alignment:
Q  418 aaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctcttgcgtgatt 517  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || ||||| | |||||||||| |||| || ||| ||||||||||| || || ||||| ||| ||    
T  40409761 aaaatccctaattaattttaaatataacaaaccttaatgattaaaggattaatggacattgaatagtttcttggtatttaattt-tgttcttgagtgttt 40409663  T
Q  518 aactaagataggaacaa-gtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacataaagacttaagaactcagtcagagttcagaaagttaaaaagag 616  Q
    |||||||| | |||||| |  |||||  || ||||||  |||  ||||||||||||| |||||||  ||||  |||||||||||| ||||||| | | ||    
T  40409662 aactaagacaagaacaaagaataaatcaat-ccaagaagcaagcaatcaaaggacattaagacttttgaaccgagtcagagttcataaagttagacatag 40409564  T
Q  617 ttcagaaggttgggcagagtttagaaggttgttcgtgatgaacatcaagaaccaagcccagaaattcatgaactaaatgaagaacatgcaaggttcacgt 716  Q
    ||||||| |||  ||| |||| |||||||||||| | |||   ||||||||| |||||||||||||||||| |   || |||||||||||||| |||| |    
T  40409563 ttcagaatgttcagcatagttcagaaggttgttctt-atggttatcaagaac-aagcccagaaattcatgaccattatcaagaacatgcaaggctcacat 40409466  T
Q  717 gacttaaatgaaagcctagaaaagtacat-gactaagatcaatcaaggaataaaagcatttatttgattaaagtcaaaaagggcatcttcaatgttcatt 815  Q
     |  ||||| |||||  || ||||||| | || | |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  40409465 aatataaataaaagctcagtaaagtactttgaattagatcaatcaaggaataaagccatttatttgattaaagtcaaaaaga-catctttaatgttcatt 40409367  T
Q  816 taagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaagaatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcataaatgtttcactatt 915  Q
     ||||| |||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||   ||| || ||||||||  |||||||||||||    
T  40409366 caagaccatgaacaattcaagtaggaaacattaggaatattccatcaagaatatcatcctagatgttacacatactacacttcattgatgtttcactatt 40409267  T
Q  916 aggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaa 968  Q
    ||  ||||||||||| || |   | ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  40409266 agagtttgattacatcaaatgagagtcttacaaatcttcctaagtgaaacaaa 40409214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 140; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 409 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 15479487 - 15479268
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15479487 tgttgaggcaaaatccctaattaatttgaaagataacaaaccttgatgattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 15479388  T
Q  509 tgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacataaagacttaagaactcagtcagagttcagaaagtt 608  Q
    || ||| |||||||||| ||||||||   | ||||| |||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||    
T  15479387 tgagtgtttaactaagacaggaacaaagtttaattcgtaccaagaaacaagaaataaaaggacataaagacttatgaactcagttagagttcaaaaagtt 15479288  T
Q  609 aaaaagagttcagaaggttg 628  Q
    || | |||||||||||||||    
T  15479287 aagatgagttcagaaggttg 15479268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 95; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 441 - 745
Target Start/End: Complemental strand, 16135833 - 16135532
Alignment:
Q  441 ataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctcttgcgtgattaactaagataggaacaa-gtgta 539  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||||||| || ||||||| |||  |||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||| |  || || || ||    
T  16135833 ataacaaaccttgatgattaatggattaatgaacattgattagtttcatggtatttaatttgtgttcttgagtgtttaactaagacaataaaaaagttta 16135734  T
Q  540 aattcataccaagatacaaagaatcaaaggacataaagacttaagaactcagtcagagttcagaaagttaaaaagagttcagaaggttgggcagagttta 639  Q
    ||| ||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| || |    
T  16135733 aat-cataccaagataccagaaattaaaggacataaagacttatgaacccagtcagagttcagaaagttaaactgagttcagaaggttggacagatttca 16135635  T
Q  640 gaaggttgttcgtgatgaacatcaagaaccaagcccagaaattcatgaactaaatgaagaacatgcaaggttcacgtgacttaaatgaaagcctagaaaa 739  Q
    |||| ||| || | |||   |||||||||  | |||||||||||||||||   || |||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  16135634 gaagattgctc-ttatggctatcaagaac--aacccagaaattcatgaacattatcaagaacattcaaggttcatgtgacataaataaaagcccagaaaa 16135538  T
Q  740 gtacat 745  Q
    ||||||    
T  16135537 gtacat 16135532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 408 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 44639643 - 44639478
Alignment:
Q  408 ttgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctc 507  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  44639643 ttgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataataaaccattatgattaaagaattaatggactttgattaattctttggtatttaatttgtgctc 44639544  T
Q  508 ttgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    ||| ||| || ||||||| |||||||||  | || |||||||||||  |||  |||||||||||||    
T  44639543 ttgagtgttttactaagacaggaacaagatttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacat 44639478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 409 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 24697229 - 24697065
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  24697229 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaaccaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 24697130  T
Q  509 tgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    || ||| || |||||||||||||||||  | |  |||||||||||  |||  |||||||||||||    
T  24697129 tgagtgttttactaagataggaacaaggtttagatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacat 24697065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 80; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 407 - 573
Target Start/End: Original strand, 4456154 - 4456321
Alignment:
Q  407 attgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgct 506  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  4456154 attgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgct 4456253  T
Q  507 cttgcgtg-attaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    |||| |||  || |||||||||||||||||  |  | |||||||||||| || | |||||||||||||    
T  4456254 cttgagtgttttcactaagataggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggacat 4456321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 409 - 570
Target Start/End: Original strand, 15940024 - 15940186
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaa-tccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctc 507  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  15940024 tgttgaggcaaaaattcctaattaattttaaagataataaactttgatgattaaggaattaatggactttgattattttcttggtatttaaattgtgctc 15940123  T
Q  508 ttgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaagga 570  Q
    ||| ||| || ||||||| |||||||||  | |||| |||||||||| |||  ||||||||||    
T  15940124 ttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaatttataccaagattcaagaaatcaaagga 15940186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 409 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 38958463 - 38958301
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  38958463 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaaccaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 38958364  T
Q  509 tgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggac 571  Q
    || ||| || ||||||| |||||||||  | || |||||||||||  |||  |||||||||||    
T  38958363 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaataaatcaaaggac 38958301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 408 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 2999434 - 2999269
Alignment:
Q  408 ttgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctc 507  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  2999434 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaaccaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 2999335  T
Q  508 ttgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    ||| ||| || ||||||| |||||||||  |  | |||||||||||  |||  |||||||||||||    
T  2999334 ttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacat 2999269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 409 - 573
Target Start/End: Original strand, 17488024 - 17488188
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||   || ||||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  17488024 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaaccaatatgattaaagaattaatggactttgattaactccttggtatttaacttgtgctct 17488123  T
Q  509 tgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    || ||| || ||||||| |||||||||  | || |||||||||||  |||  |||||||||||||    
T  17488124 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacat 17488188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 409 - 573
Target Start/End: Original strand, 45014066 - 45014230
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  45014066 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaaccaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 45014165  T
Q  509 tgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    || ||| || ||||||| |||||||||  | |  |||||||||||  |||  |||||||||||||    
T  45014166 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttagatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacat 45014230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 407 - 573
Target Start/End: Original strand, 4457218 - 4457385
Alignment:
Q  407 attgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgct 506  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  4457218 attgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgct 4457317  T
Q  507 cttgcgtg-attaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    |||| |||  || ||||||| |||||||||  |  | |||||||||||| || | |||||||||||||    
T  4457318 cttgagtgttttcactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggacat 4457385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 407 - 573
Target Start/End: Original strand, 4466843 - 4467010
Alignment:
Q  407 attgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgct 506  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  4466843 attgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgct 4466942  T
Q  507 cttgcgtg-attaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    |||| |||  || ||||||| |||||||||  |  | |||||||||||| || | |||||||||||||    
T  4466943 cttgagtgttttcactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggacat 4467010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 407 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 5338115 - 5337948
Alignment:
Q  407 attgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgct 506  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  5338115 attgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgct 5338016  T
Q  507 cttgcgtg-attaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    |||| |||  || ||||||| |||||||||  |  | |||||||||||| || | |||||||||||||    
T  5338015 cttgagtgttttcactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggacat 5337948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 408 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 5348010 - 5347844
Alignment:
Q  408 ttgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctc 507  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  5348010 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 5347911  T
Q  508 ttgcgtg-attaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    ||| |||  || ||||||| |||||||||  |  | |||||||||||| || | |||||||||||||    
T  5347910 ttgagtgttttcactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggacat 5347844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 408 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 16935026 - 16934860
Alignment:
Q  408 ttgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctc 507  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  16935026 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 16934927  T
Q  508 ttgcgtg-attaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    ||| |||  || ||||||| |||||||||  |  | |||||||||||| || | |||||||||||||    
T  16934926 ttgagtgtttttactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggacat 16934860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 408 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 17005686 - 17005520
Alignment:
Q  408 ttgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctc 507  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  17005686 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 17005587  T
Q  508 ttgcgtg-attaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    ||| |||  || ||||||| |||||||||  |  | |||||||||||| || | |||||||||||||    
T  17005586 ttgagtgtttttactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggacat 17005520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 409 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 32938147 - 32937982
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  32938147 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 32938048  T
Q  509 tgcgtg-attaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    || |||  || ||||||| |||||||||  |  | |||||||||||| || | |||||||||||||    
T  32938047 tgagtgttttcactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggacat 32937982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 709 - 820
Target Start/End: Complemental strand, 15475729 - 15475617
Alignment:
Q  709 gttcacgtgacttaaatgaaagcctagaaaagtacat-gactaagatcaatcaaggaataaaagcatttatttgattaaagtcaaaaagggcatcttcaa 807  Q
    ||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  15475729 gttcacgtgacataaataaaagtccagaaaagtacattgactaagatcaatcaaggaataaaggcatttatttgattaaagtcaaaatgagcatcttcaa 15475630  T
Q  808 tgttcatttaaga 820  Q
    |||||||| ||||    
T  15475629 tgttcattcaaga 15475617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 407 - 573
Target Start/End: Original strand, 18662419 - 18662586
Alignment:
Q  407 attgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgct 506  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  18662419 attgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgct 18662518  T
Q  507 cttgcgtg-attaactaagataggaacaa-gtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    |||| |||  || ||||||| |||||||| || | || |||||||||||| || | |||||||||||||    
T  18662519 cttgagtgttttcactaagacaggaacaaggtctgaa-tcataccaagatgcataaaatcaaaggacat 18662586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 409 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 29131716 - 29131552
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  29131716 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaatttcttggtatttatcttgtgctct 29131617  T
Q  509 tgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    || ||| || ||||||| |||||||||  |  | |||||||||||  |||  |||||||||||||    
T  29131616 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacat 29131552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 408 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 9503733 - 9503567
Alignment:
Q  408 ttgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctc 507  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  9503733 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 9503634  T
Q  508 ttgcgtg-attaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    ||| |||  || ||||||| |||||||||  |  | |||||||||||| || | |||||||||||||    
T  9503633 ttgagtgttttcactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggacat 9503567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 408 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 9515099 - 9514933
Alignment:
Q  408 ttgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctc 507  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  9515099 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 9515000  T
Q  508 ttgcgtg-attaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    ||| |||  || ||||||| |||||||||  |  | |||||||||||| || | |||||||||||||    
T  9514999 ttgagtgttttcactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggacat 9514933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 406 - 484
Target Start/End: Original strand, 18495833 - 18495911
Alignment:
Q  406 aattgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaat 484  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18495833 aattgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataacaaaccttaataattaaggaattaatggactttgattaat 18495911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 407 - 573
Target Start/End: Original strand, 45024141 - 45024307
Alignment:
Q  407 attgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgct 506  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  45024141 attgttgatgcaaaatccctaattaattttaaagataataaaccaatatgattaaagaattaatggactttgattaattcattggtatttaacttgtgct 45024240  T
Q  507 cttgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    |||| ||| || ||||||| | |||||||  | |  |||||||||||  |||  |||||||||||||    
T  45024241 cttgagtgttttactaagacaagaacaaggtttagatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacat 45024307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 408 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 38931128 - 38930963
Alignment:
Q  408 ttgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctc 507  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  38931128 ttgttgaggcaaaatccctaatgagttttaaagataataaaccaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 38931029  T
Q  508 ttgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    ||| ||| || ||||||| |||||||||  | || ||| |||||||  |||  |||||||||||||    
T  38931028 ttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcacaccaagaatcaataaatcaaaggacat 38930963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 407 - 573
Target Start/End: Original strand, 18660678 - 18660845
Alignment:
Q  407 attgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgct 506  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  18660678 attgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgct 18660777  T
Q  507 cttgcgtg-attaactaagataggaacaa-gtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    |||| |||  || ||||||| || ||||| || | || |||||||||||| || | |||||||||||||    
T  18660778 cttgagtgttttcactaagacagaaacaaggtctgaa-tcataccaagatgcataaaatcaaaggacat 18660845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 407 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 22688421 - 22688254
Alignment:
Q  407 attgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgct 506  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  22688421 attgttgaggcaaaatacctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgct 22688322  T
Q  507 cttgcgtg-attaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    |||| |||  || ||||||| |||||||||  |  | |||||||||||| ||   |||||||||||||    
T  22688321 cttgagtgtttttactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcatgaaatcaaaggacat 22688254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 409 - 510
Target Start/End: Original strand, 45190096 - 45190197
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  45190096 tgttgaggcaaaatccttaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 45190195  T
Q  509 tg 510  Q
    ||    
T  45190196 tg 45190197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 434 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 24239852 - 24239713
Alignment:
Q  434 tttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctcttgcgtgattaactaagataggaaca 533  Q
    ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||| | ||| |    
T  24239852 tttaaagataataaactttgatgattaaggaattaatggactttgattattttcttggtatttaacttgtgctcttaagtgttttactaagacatgaata 24239753  T
Q  534 a-gtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    | || |||||| |||||||||| |||  |||||||||||||    
T  24239752 aggtttaaatt-ataccaagattcaagaaatcaaaggacat 24239713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 409 - 510
Target Start/End: Original strand, 573568 - 573669
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  573568 tgttgaggcaaaatccctaaataattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttgatatttaacttgtgctct 573667  T
Q  509 tg 510  Q
    ||    
T  573668 tg 573669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 409 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 3606657 - 3606493
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || ||||| || | |||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  3606657 tgttgaggaaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaatgattaaatgaactttgattaattctttgttatttaacttgtgctct 3606558  T
Q  509 tgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    || ||| || ||||||| | |||||||  |  | | |||||||||||||   |||||||||||||    
T  3606557 tgagtgttttactaagacatgaacaaggtttgaataataccaagatacatgaaatcaaaggacat 3606493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 406 - 573
Target Start/End: Original strand, 12569890 - 12570058
Alignment:
Q  406 aattgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgc 505  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || || || ||| |||| | |||| |||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  12569890 aattgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataatatactttaatgattgaggattaaatgaactttgattaattccttagtatttaacttgtgc 12569989  T
Q  506 tcttgcgtg-attaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    ||||| |||  || ||||||| |||||||||  |  | |||||||||||| ||   |||||||||||||    
T  12569990 tcttgagtgtttttactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcatgaaatcaaaggacat 12570058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 409 - 573
Target Start/End: Original strand, 18650351 - 18650516
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | |||||||||||||| |||  || |||||||| ||||| |||    
T  18650351 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgatttattcctttgtatttaatttgtgttct 18650450  T
Q  509 tgcgtg-attaactaagataggaacaa-gtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    || |||  || ||||||| |||||||| || | || |||||||||||| || | |||||||||||||    
T  18650451 tgagtgttttcactaagacaggaacaaggtctgaa-tcataccaagatgcataaaatcaaaggacat 18650516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 652 - 713
Target Start/End: Complemental strand, 15479264 - 15479203
Alignment:
Q  652 tgatgaacatcaagaaccaagcccagaaattcatgaactaaatgaagaacatgcaaggttca 713  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15479264 tgatgaacatcaaaaaccaagttcagaaattcatgaaccaaatgaagaacatgcaaggttca 15479203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 803 - 981
Target Start/End: Original strand, 18650948 - 18651119
Alignment:
Q  803 ttcaatgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaag-aatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcata 901  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||       |||||||||| ||  ||| ||| |||||||||||||| ||    |||| ||||||     
T  18650948 ttcaatgttcatttaagactatgaaca-ttgatgtac-------taggaatatttcacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcatt 18651039  T
Q  902 aatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||    
T  18651040 attgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctga 18651119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 803 - 981
Target Start/End: Original strand, 18663066 - 18663237
Alignment:
Q  803 ttcaatgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaag-aatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcata 901  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||       |||||||||| ||  ||| ||| |||||||||||||| ||    |||| ||||||     
T  18663066 ttcaatgttcatttaagactatgaaca-ttgatgtac-------taggaatatttcacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcatt 18663157  T
Q  902 aatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||    
T  18663158 attgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctga 18663237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 890 - 981
Target Start/End: Complemental strand, 24696754 - 24696663
Alignment:
Q  890 ctgcacttcataaatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    |||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  24696754 ctgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaacagaaggaacattctga 24696663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 803 - 981
Target Start/End: Complemental strand, 2998946 - 2998775
Alignment:
Q  803 ttcaatgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaag-aatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcata 901  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||       |||||||||| ||  ||| ||| |||||||||||||| |     |||| ||||||     
T  2998946 ttcaatgttcatttaagactatgaaca-ttgatgtac-------taggaatatttcacaaaggaatatcatcctagatgttattatcactgctcttcatt 2998855  T
Q  902 aatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||    
T  2998854 attgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctga 2998775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 803 - 981
Target Start/End: Original strand, 4457925 - 4458096
Alignment:
Q  803 ttcaatgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaag-aatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcata 901  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||       |||||||||| ||  ||| ||| |||||||||||||| |     |||| ||||||     
T  4457925 ttcaatgttcatttaagactatgaaca-ttgatgtac-------taggaatatttcacaaaggaatatcatcctagatgttattatcactgctcttcatt 4458016  T
Q  902 aatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||    
T  4458017 attgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctga 4458096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 803 - 981
Target Start/End: Original strand, 4467550 - 4467721
Alignment:
Q  803 ttcaatgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaag-aatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcata 901  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||       |||||||||| ||  ||| ||| |||||||||||||| |     |||| ||||||     
T  4467550 ttcaatgttcatttaagactatgaaca-ttgatgtac-------taggaatatttcacaaaggaatatcatcctagatgttattatcactgctcttcatt 4467641  T
Q  902 aatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||    
T  4467642 attgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctga 4467721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 803 - 981
Target Start/End: Complemental strand, 5337384 - 5337213
Alignment:
Q  803 ttcaatgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaag-aatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcata 901  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||       |||||||||| ||  ||| ||| |||||||||||||| ||    |||| ||||||     
T  5337384 ttcaatgttcatttaagactatgaaca-ttgatgtac-------taggaatatttcacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcatt 5337293  T
Q  902 aatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||  |||||||||||| | | ||||||||||    
T  5337292 attgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcagcctaagtgaaacagatggaacattctga 5337213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 803 - 981
Target Start/End: Complemental strand, 5347237 - 5347066
Alignment:
Q  803 ttcaatgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaag-aatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcata 901  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||       |||||||||| ||  ||| ||| |||||||||||||| ||    |||| ||||||     
T  5347237 ttcaatgttcatttaagactatgaaca-ttgatgtac-------taggaatatttcacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcatt 5347146  T
Q  902 aatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||  |||||||||||| | | ||||||||||    
T  5347145 attgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcagcctaagtgaaacagatggaacattctga 5347066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 864 - 981
Target Start/End: Complemental strand, 9502956 - 9502839
Alignment:
Q  864 gaatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcataaatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaa 963  Q
    |||| |||||||||||||| ||    |||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||| |||||||||    
T  9502956 gaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcctaagtgaa 9502857  T
Q  964 acaaaagaaacattctga 981  Q
    ||| | | ||||||||||    
T  9502856 acagatggaacattctga 9502839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 864 - 981
Target Start/End: Complemental strand, 9514322 - 9514205
Alignment:
Q  864 gaatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcataaatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaa 963  Q
    |||| |||||||||||||| ||    |||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||| |||||||||    
T  9514322 gaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcctaagtgaa 9514223  T
Q  964 acaaaagaaacattctga 981  Q
    ||| | | ||||||||||    
T  9514222 acagatggaacattctga 9514205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 803 - 981
Target Start/End: Original strand, 17488420 - 17488591
Alignment:
Q  803 ttcaatgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaagaa-tgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcata 901  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||       |||||||||| ||  ||||| | |||||||||||||| |     |||| ||||||     
T  17488420 ttcaatgttcatttaagactatgaaca-ttgatgtac-------taggaatatttcacaaagaaatatcatcctagatgttattatcactgctcttcatt 17488511  T
Q  902 aatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||    
T  17488512 attgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctga 17488591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 803 - 981
Target Start/End: Original strand, 45014462 - 45014633
Alignment:
Q  803 ttcaatgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaag-aatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcata 901  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||       |||||||||| ||  ||| ||| |||||||||||||| |     |||| ||||||     
T  45014462 ttcaatgttcatttaagactatgaaca-ttgatgtac-------taggaatatttcacaaaggaatatcatcctagatgttattatcactgctcttcatt 45014553  T
Q  902 aatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||    
T  45014554 attgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctga 45014633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 803 - 981
Target Start/End: Original strand, 45024539 - 45024710
Alignment:
Q  803 ttcaatgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaag-aatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcata 901  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||       |||||||||| ||  ||| ||| |||||||||||||| |     |||| ||||||     
T  45024539 ttcaatgttcatttaagactatgaaca-ttgatgtac-------taggaatatttcacaaaggaatatcatcctagatgttattatcactgctcttcatt 45024630  T
Q  902 aatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||    
T  45024631 attgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctga 45024710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 407 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 18618901 - 18618827
Alignment:
Q  407 attgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagat-aacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgat 480  Q
    ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||    
T  18618901 attgttgaggcaaaatctctaaaatattttaaagataaacaaaccttgatgaataaagaattattggactttgat 18618827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 904 - 981
Target Start/End: Original strand, 29423189 - 29423266
Alignment:
Q  904 tgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||    
T  29423189 tgtttcactattaggatttgattacatcaaatggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctga 29423266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 904 - 968
Target Start/End: Complemental strand, 72371 - 72307
Alignment:
Q  904 tgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaa 968  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| || |   | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  72371 tgtttcactattaggatttaattacatcaaatggtagtcttacaaatcattctaagtgaaacaaa 72307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 432 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 28461065 - 28460989
Alignment:
Q  432 attttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    ||||||||||||| |||||   || ||||  ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  28461065 attttaaagataataaaccaatatgattagagaattaatgaactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 28460989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 907 - 981
Target Start/End: Complemental strand, 38930634 - 38930560
Alignment:
Q  907 ttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||    
T  38930634 ttcactattaggatttgattacatcaaatggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctga 38930560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 895 - 981
Target Start/End: Complemental strand, 38957982 - 38957896
Alignment:
Q  895 cttcataaatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||| || || |   | ||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||    
T  38957982 cttcattattgtttcactattaggatttgattatatcaaatggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctga 38957896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 346 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 40001938 - 40001878
Alignment:
Q  346 atgtaacatttggataattttagttttaa-tttatgtttggaattattgatgtaatatttg 405  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | || |||||||||||||||    
T  40001938 atgtgacatttggataatttaagttttaactttatgtttgaatttgttgatgtaatatttg 40001878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 520; Significance: 0; HSPs: 42)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 520; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 409 - 1059
Target Start/End: Original strand, 14436701 - 14437351
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14436701 tgttaaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaacattgatgattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 14436800  T
Q  509 tgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacataaagacttaagaactcagtcagagttcagaaagtt 608  Q
    || |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14436801 tgagtgattaactaagacaagaacaagtgtaaaatcataccaagatacaaagaatcaaagaacataaagacttaagaactcagtcagagttcagaaagtt 14436900  T
Q  609 aaaaagagttcagaaggttgggcagagtttagaaggttgttcgtgatgaacatcaagaaccaagcccagaaattcatgaactaaa-tgaagaacatgcaa 707  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  14436901 aaaaaaagttcagaaggttggacagagttcagaaggttgttcatgatgaacatcaagaaccaagcccagaaattcatgaactaaaatgaagaacatacaa 14437000  T
Q  708 ggttcacgtgacttaaatgaaagcctagaaaagtacatgactaagatcaatcaaggaataaaagcatttatttgattaaagtcaaaaagggcatcttcaa 807  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14437001 ggttcacgtgacttaaatgaaagcccagaaaagtacatgactaagatcaatcaaagaataaaagcatttatttgattaaagtcaaaaagggcatcttcaa 14437100  T
Q  808 tgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaagaatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcataaatgtt 907  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14437101 tgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacattaggaatattccatcaagaatatcatcctagatgtttttcatgctgcacttcataaatgtt 14437200  T
Q  908 tcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctgaagtcccctgagttcagaaagttcaat 1007  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  14437201 tcactattaggatttgattacatcaattacaagtcttacaaatcatcctaagtgaaacaaaagaaacattctgaagtcccatgagttcagaaagttcaac 14437300  T
Q  1008 cctgctccatgcttttttctgacgtgaacagtacagtggttggaaagcaaaa 1059  Q
    | |||||||||||||||| |||  ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  14437301 cttgctccatgctttttt-tgatatgaacagtacagcagttggaaagcaaaa 14437351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 447; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 409 - 1057
Target Start/End: Complemental strand, 26363082 - 26362454
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26363082 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataacaaaccttgatgattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 26362983  T
Q  509 tgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacataaagacttaagaactcagtcagagttcagaaagtt 608  Q
    || ||| |||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            
T  26362982 tgagtggttaactaagacaggaacaagttttaatttataccaagatacaaagaatcaaaggacataaagacttaagaactcagtcagagttc-------- 26362891  T
Q  609 aaaaagagttcagaaggttgggcagagtttagaaggttgttcgtgatgaacatcaagaaccaagcccagaaattcatgaactaaatgaagaacatgcaag 708  Q
               |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  26362890 -----------agaaggttggacagagttcagaaggttgttcatgatgaacatcaagaaccaagcccagatactcatgtactaaataaagaacatgcaag 26362802  T
Q  709 gttcacgtgacttaaatgaaagcctagaaaagtacatgactaagatcaatcaaggaataaaagcatttatttgattaaagtcaaaaagggcatcttcaat 808  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26362801 gttcacgtgacttaaatgaaagcccagaaaagtacaagactaagataaatcaaagaataagagcatttattttattaaagtcaaaaagggcatcttcaat 26362702  T
Q  809 gttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaagaatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcataaatgttt 908  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26362701 gttcatttaagactatgaacatttgaagtacaaaacattaggaatattccattaagaatatcatcctagatgttttccatgctgcacttcataaatgctt 26362602  T
Q  909 cactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctgaagtcccctgagttcagaaagttcaatc 1008  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||    
T  26362601 cactattaggatttgattacatcaattacaagtcttacaaatcatcctaagtgaaacaaaagaaacattctgaagtcccctgagttcagaatgttcgttc 26362502  T
Q  1009 ctgctccatgcttttttctgacgtgaacagtacagtggttggaaagcaa 1057  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  26362501 ctgctccatgct-ttttctgacgtgaacagtacagcagttggaaagcaa 26362454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 227; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 411 - 923
Target Start/End: Complemental strand, 12842235 - 12841725
Alignment:
Q  411 ttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctcttg 510  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12842235 ttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataacaaactttgatgattaaggaattaatagaatttgattaatttgttggtatttaatttgtgctcttg 12842136  T
Q  511 cgtgattaactaagataggaac-aagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacataaagacttaagaactcagtcagagttcagaaagtta 609  Q
     ||  |||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  12842135 agtatttaactaagacaggaacaaagtttaaa-tcataccaagatacaaa-aatcaaaggacattaaggcttatgaacccagtcagggttcagaaagtta 12842038  T
Q  610 aaaagagttcagaaggttgggcagagtttagaaggttgttcgtgatgaacatcaagaaccaagcccagaaattcatgaactaaatgaagaacatgcaagg 709  Q
    ||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || | ||| | || ||||| |||||||||||||| |||||| | ||||||||||| || ||    
T  12842037 aactgagtttagaaggttggacagagtttagaaggttgctc-ttatggatataaagaa-caagcccagaaatttatgaacaatatgaagaacatacaggg 12841940  T
Q  710 ttcacgtgacttaaatgaaagcctagaaaagtaca-tgactaagatcaatcaaggaataaaagcatttatttgattaaagtcaaaaagggcatcttcaat 808  Q
     ||||||||| ||||| || ||| || |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||  ||| |||||||||||| |||    
T  12841939 ctcacgtgacataaataaaggcccagtaaagtacattgacttagatcaatcaagaaataaagacatttattagattaagttcataaagggcatcttgaat 12841840  T
Q  809 gttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaagaatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcataaatgttt 908  Q
    |||| || ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| || |||| |||||||||    || ||||||||||| |||||||    
T  12841839 gttccttcaagactatgaacatttgaagtacaaaacattaggaatattccatcaaggatatcatgctagatgttacatatactgcacttcatcaatgttt 12841740  T
Q  909 cactattaggatttg 923  Q
    |||||||||| ||||    
T  12841739 cactattaggctttg 12841725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 409 - 604
Target Start/End: Original strand, 37295289 - 37295484
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  37295289 tgttgagacaaaatccctaattaattttaaaaataacaaatcttgatgattaaggaattaatggacctcgattaatttcttggtatttaatttgtactct 37295388  T
Q  509 tgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacataaagacttaagaactcagtcagagttcagaa 604  Q
    || ||| |||||||||| | |||||| | | || ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| || ||||| |||||||    
T  37295389 tgagtgtttaactaagacatgaacaaattttaaatcataccaagatacaaaaaatcaaatgacataaagacttaggaacccaatcagaattcagaa 37295484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 99; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 660 - 964
Target Start/End: Original strand, 18536171 - 18536475
Alignment:
Q  660 atcaagaaccaagcccagaaattcatgaactaaatgaagaacatgcaaggttcacgtgacttaaatgaaagcctagaaaagtacat-gactaagatcaat 758  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||  || || ||||| ||||| ||||||| | ||||| |||| | || ||| || || || | ||||||||    
T  18536171 atcaagaac-aagcccaaaaattcatgaactttatcaataacattcaaggatcacgtggcataaataaaagtcgagtaaactatattgaattagatcaat 18536269  T
Q  759 caaggaataaaagcatttatttgattaaagtcaaaaagggcatcttcaatgttcatttaagact-atgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattc 857  Q
    ||| |||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  18536270 caaagaataaacacatttatttgattaaagttaaaaagg-catcttcaatgatcattcaagacttatgaacaattgaagtacaaaatattatgaatattc 18536368  T
Q  858 cattaagaatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcataaatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattcta 957  Q
    ||| |||||| ||||||||||| || | |||  ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| || |   | | ||||||||||| |||    
T  18536369 catcaagaatatcatcctagatcttatacatagtgcacttcattgatgtttcactattagaatttgattacatcaaatgagagttttacaaatcatccta 18536468  T
Q  958 agtgaaa 964  Q
    |||||||    
T  18536469 agtgaaa 18536475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 92; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 756 - 967
Target Start/End: Original strand, 37295552 - 37295763
Alignment:
Q  756 aatcaaggaataaaagcatttatttgattaaagtcaaaaagggcatcttcaatgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatat 855  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  37295552 aatcaaggaataaatgcatttatttgagtaagttcaaaaatgacatcttcaatgttcattcaagactatggacatttgaagtacaaaacattaggaatat 37295651  T
Q  856 tccattaagaatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcataaatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattc 955  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||    |  | |||||| || || ||||||||||||||||||||||| || || |   | ||||||||||||| |    
T  37295652 ttcattaagaatatcatcctagatgttacatacaccgcactttatcaacgtttcactattaggatttgattatatcaaatggtagtcttacaaatcatcc 37295751  T
Q  956 taagtgaaacaa 967  Q
    ||||||||||||    
T  37295752 taagtgaaacaa 37295763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 87; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 408 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 5868121 - 5867956
Alignment:
Q  408 ttgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctc 507  Q
    |||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5868121 ttgttgaggataaatccttaattaattttaaagataacaaaccttgattattaaggaattaatggactttgattaatttcttggtatttaacttgtgctc 5868022  T
Q  508 ttgcgtgattaactaagataggaac-aagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    ||  ||| ||||||||||  ||||| |||| |||| |||||||||  |||||  |||||||||||||    
T  5868021 ttaagtgtttaactaagaccggaacaaagtttaaa-tcataccaatttacaagaaatcaaaggacat 5867956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 408 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 2691022 - 2690856
Alignment:
Q  408 ttgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctc 507  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| || |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2691022 ttgttgaggcaaaatccttaattaattttaaagacaataaactttgatgattaaggaattaatggactttgattaatttcttggtatttaacttgtgctc 2690923  T
Q  508 ttgcgtg-attaactaagataggaac-aagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    ||| |||  || ||||||| |||||| |||| |||||| |||||||||| |||  |||||||||||||    
T  2690922 ttgagtgtttttactaagacaggaacaaagtttaaatt-ataccaagattcaagaaatcaaaggacat 2690856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 80; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 752 - 968
Target Start/End: Complemental strand, 5867770 - 5867563
Alignment:
Q  752 gatcaatcaaggaataaaagcatttatttgattaaagtcaaaaagggcatcttcaatgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttagga 851  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||       |||||    
T  5867770 gatcaatcaaggaataaaggcatttttaggattaaagtcaaaaagg--atcttcaatgttcatttaagactatgaacatttgaagtac-------tagga 5867680  T
Q  852 atattccattaagaatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcataaatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatc 951  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||| |||    |   ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |   | |||||||||||    
T  5867679 atattccaataagaatatcatcctagacgttacaaacattgcccttcatcgatgtttcactattaggatttgattacattaaatgagagtcttacaaatc 5867580  T
Q  952 attctaagtgaaacaaa 968  Q
    || |||||||| |||||    
T  5867579 atcctaagtgatacaaa 5867563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 78; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 408 - 573
Target Start/End: Original strand, 20098148 - 20098313
Alignment:
Q  408 ttgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctc 507  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  20098148 ttgttgaggcaaaatctctaattaattttaaggataataaaccttgatggttaaggaattaatggactttgattaatttcttagtttttaacttgtgctc 20098247  T
Q  508 ttgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    ||| ||| |||||||| | | |||||||  | || |||||||||||| |||  |||||| ||||||    
T  20098248 ttgagtgtttaactaaaacaagaacaaggtttaaatcataccaagattcaagaaatcaatggacat 20098313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 409 - 573
Target Start/End: Original strand, 17268176 - 17268340
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | || ||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||    
T  17268176 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaaccattatgattaaagaattaatggactttgatttattcattggtatttaacttgttctct 17268275  T
Q  509 tgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    || ||| || ||||||| |||||||||  | || |||||| ||||| |||  |||||||||||||    
T  17268276 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcatactaagattcaagaaatcaaaggacat 17268340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 411 - 573
Target Start/End: Original strand, 5758713 - 5758876
Alignment:
Q  411 ttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctcttg 510  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  5758713 ttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattctttggtatttaacttgtgctcttg 5758812  T
Q  511 cgtg-attaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
     |||  || ||||||| |||||||||  | || |||||||||||||||   |||||||||||||    
T  5758813 agtgtttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagatacatgaaatcaaaggacat 5758876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 408 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 14894861 - 14894695
Alignment:
Q  408 ttgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctc 507  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  14894861 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 14894762  T
Q  508 ttgcgtg-attaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    ||| |||  || ||||||| |||||||||  |  | |||||||||||| || | |||||||||||||    
T  14894761 ttgagtgttttcactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggacat 14894695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 408 - 534
Target Start/End: Original strand, 21446763 - 21446889
Alignment:
Q  408 ttgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctc 507  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  21446763 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaaccaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 21446862  T
Q  508 ttgcgtgattaactaagataggaacaa 534  Q
    ||| ||| || ||||||| ||||||||    
T  21446863 ttgagtgttttactaagacaggaacaa 21446889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 407 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 21988746 - 21988580
Alignment:
Q  407 attgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgct 506  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    || | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21988746 attgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaacaaatatgaataaagaattaatggactttgattaatttcttggtatttaacttgtgct 21988647  T
Q  507 cttgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    |||| ||| || ||||||| |||||||||  |  | |||||||||||  |||  |||||||||||||    
T  21988646 cttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacat 21988580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 409 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 32008547 - 32008382
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  32008547 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 32008448  T
Q  509 tgcgtg-attaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    || |||  || ||||||| |||||||||  |  | |||||||||||| || | |||||||||||||    
T  32008447 tgagtgttttcactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggacat 32008382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 409 - 573
Target Start/End: Original strand, 25034631 - 25034795
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| |||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  25034631 tgttgagacaaaattcctaattaattttaaagataataaaccaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 25034730  T
Q  509 tgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    || ||| || | ||||| |||||||||| | || |||||||||||  |||  |||||||||||||    
T  25034731 tgagtgttttagtaagacaggaacaagttttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacat 25034795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 407 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 9325991 - 9325824
Alignment:
Q  407 attgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgct 506  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    || ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  9325991 attgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgct 9325892  T
Q  507 cttgcgtg-attaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    |||| |||  || ||||||| |||||||||  |  | |||||||||||| || | |||||||||||||    
T  9325891 cttgagtgttttcactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggacat 9325824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 407 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 14882496 - 14882329
Alignment:
Q  407 attgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgct 506  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  14882496 attgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgct 14882397  T
Q  507 cttgcgtg-attaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    |||| |||  || ||||||| || ||||||  |  | |||||||||||| || | |||||||||||||    
T  14882396 cttgagtgttttcactaagacagaaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggacat 14882329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 407 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 21203824 - 21203657
Alignment:
Q  407 attgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgct 506  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    || ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  21203824 attgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgct 21203725  T
Q  507 cttgcgtg-attaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    |||| |||  || ||||||| |||||||||  |  | |||||||||||| || | |||||||||||||    
T  21203724 cttgagtgttttcactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggacat 21203657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 407 - 573
Target Start/End: Original strand, 21333275 - 21333442
Alignment:
Q  407 attgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgct 506  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    || ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  21333275 attgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgct 21333374  T
Q  507 cttgcgtg-attaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    |||| |||  || ||||||| |||||||||  |  | |||||||||||| || | |||||||||||||    
T  21333375 cttgagtgctttcactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggacat 21333442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 409 - 573
Target Start/End: Original strand, 13673490 - 13673655
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  13673490 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 13673589  T
Q  509 tgcgtg-attaactaagataggaacaa-gtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    || |||  || ||||||| |||||||| || | || |||||||||||| || | |||||||||||||    
T  13673590 tgagtgttttcactaagacaggaacaaggtctgaa-tcataccaagatgcataaaatcaaaggacat 13673655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 408 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 20532071 - 20531905
Alignment:
Q  408 ttgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctc 507  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  20532071 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 20531972  T
Q  508 ttgcgtg-attaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    ||| |||  || ||||||| |||||||||  |  | |||||||||||| ||   |||||||||||||    
T  20531971 ttgagtgtttttactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcatgaaatcaaaggacat 20531905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 409 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 21214238 - 21214073
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    || ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  21214238 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 21214139  T
Q  509 tgcgtg-attaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    || |||  || ||||||| |||||||||  |  | |||||||||||| || | |||||||||||||    
T  21214138 tgagtgttttcactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggacat 21214073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 409 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 21998262 - 21998098
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||    || | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21998262 tgttgaggtaaaatccctaattaattttaaagataataaacaaatatgaataaagaattaatggactttgattaatttcttggtatttaacttgtgctct 21998163  T
Q  509 tgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    || ||| || ||||||| |||||||||  |  | |||||||||||  |||  |||||||||||||    
T  21998162 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacat 21998098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 68; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 409 - 535
Target Start/End: Original strand, 3967328 - 3967455
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  3967328 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 3967427  T
Q  509 tgcgtg-attaactaagataggaacaag 535  Q
    || |||  || ||||||| |||||||||    
T  3967428 tgagtgttttcactaagacaggaacaag 3967455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 407 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 31992181 - 31992014
Alignment:
Q  407 attgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgct 506  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  31992181 attgttgaggaaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgct 31992082  T
Q  507 cttgcgtg-attaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    |||| |||  || |||||||  ||||||||  |  | |||||||||||| || | |||||||||||||    
T  31992081 cttgagtgttttcactaagactggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggacat 31992014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 408 - 573
Target Start/End: Original strand, 25506809 - 25506974
Alignment:
Q  408 ttgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctc 507  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  25506809 ttgttgaggcaaa-tccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 25506907  T
Q  508 ttgcgtg-attaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    ||| |||  || ||||||| |||||||||  |  | |||||||||||| || | |||||||||||||    
T  25506908 ttgagtgttttcactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggacat 25506974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 409 - 573
Target Start/End: Original strand, 791070 - 791235
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaattta-ttttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctc 507  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||   || ||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  791070 tgttgaggcaaaatccctaaattaattttaaagataataaaccaatatgattagagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 791169  T
Q  508 ttgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    ||| ||| || ||||||| |||||||||  | || |||||| ||||  |||  |||||||||||||    
T  791170 ttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcatactaagaatcaagaaatcaaaggacat 791235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 63; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 409 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 33774870 - 33774705
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || ||||||||   ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  33774870 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggatcaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 33774771  T
Q  509 tgcgtg-attaactaagataggaac-aagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    || |||  || ||||||| | |||| |||| | || |||||||||||| || | |||||||||||||    
T  33774770 tgagtgttttcactaagacatgaacaaagtttgaa-tcataccaagatgcataaaatcaaaggacat 33774705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 408 - 502
Target Start/End: Original strand, 20707481 - 20707576
Alignment:
Q  408 ttgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaacctt-gataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttg 502  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||  || |||||||| |||||  |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  20707481 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaaatgattaaggacttaattaactttgattattttcttggtatttaacttg 20707576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 803 - 981
Target Start/End: Complemental strand, 9325365 - 9325194
Alignment:
Q  803 ttcaatgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaag-aatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcata 901  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||       |||||||||| ||  ||| ||| |||||||||||||| ||    |||| ||||||     
T  9325365 ttcaatgttcatttaagactatgaaca-ttgatgtac-------taggaatatttcacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcatt 9325274  T
Q  902 aatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||    
T  9325273 attgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctga 9325194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 803 - 981
Target Start/End: Complemental strand, 21203143 - 21202972
Alignment:
Q  803 ttcaatgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaag-aatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcata 901  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||       |||||||||| ||  ||| ||| |||||||||||||| ||    |||| ||||||     
T  21203143 ttcaatgttcatttaagactatgaaca-ttgatgtac-------taggaatatttcacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcatt 21203052  T
Q  902 aatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||    
T  21203051 attgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctga 21202972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 803 - 981
Target Start/End: Complemental strand, 21213559 - 21213388
Alignment:
Q  803 ttcaatgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaag-aatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcata 901  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||       |||||||||| ||  ||| ||| |||||||||||||| ||    |||| ||||||     
T  21213559 ttcaatgttcatttaagactatgaaca-ttgatgtac-------taggaatatttcacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcatt 21213468  T
Q  902 aatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||    
T  21213467 attgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctga 21213388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 803 - 981
Target Start/End: Original strand, 21334028 - 21334199
Alignment:
Q  803 ttcaatgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaag-aatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcata 901  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||       |||||||||| ||  ||| ||| |||||||||||||| ||    |||| ||||||     
T  21334028 ttcaatgttcatttaagactatgaaca-ttgatgtac-------taggaatatttcacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcatt 21334119  T
Q  902 aatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||    
T  21334120 attgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctga 21334199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 803 - 981
Target Start/End: Complemental strand, 2690620 - 2690450
Alignment:
Q  803 ttcaatgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaagaatgtcatcctagatgttttccatg-ctgcacttca-- 899  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||       ||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||  | ||  ||||||||||      
T  2690620 ttcaatgttcattttagactatgaaca-ttgaagtac-------taggaatattccaatgagaatatcatcctagatatta-caatcactgcacttcagt 2690530  T
Q  900 taaatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    || || |||||||||||||||| |||||||  || ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  2690529 tatat-tttcactattaggatt-gattacaccaaatacaagtcttacaaatcatcctaagtgaaacaaatgaaacattctga 2690450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 410 - 573
Target Start/End: Original strand, 7757106 - 7757262
Alignment:
Q  410 gttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctctt 509  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||       |  || ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  7757106 gttgaagcaaaatccctaattaattttaaagataataaaccattat-------gcctttatgaactttgattaattccttggtatttaacttgtgctctt 7757198  T
Q  510 gcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    | ||| || ||||||| | |||||||  | || |||||||||||  |||  |||||||||||||    
T  7757199 gagtgttttactaagacatgaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacat 7757262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 904 - 981
Target Start/End: Original strand, 17268665 - 17268742
Alignment:
Q  904 tgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  17268665 tgtttcattattaggatttgattacatcaaatggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaacaaaaggaacattctga 17268742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 803 - 981
Target Start/End: Complemental strand, 21997803 - 21997632
Alignment:
Q  803 ttcaatgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaag-aatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcata 901  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||       |||||||||| ||  ||| ||| |||||||||||||| |     |||| ||||||     
T  21997803 ttcaatgttcatttaagactatgaaca-ttgatgtac-------taggaatatttcacaaaggaatatcatcctagatgttattatcactgctcttcatt 21997712  T
Q  902 aatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||    
T  21997711 actgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctga 21997632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 890 - 981
Target Start/End: Original strand, 791546 - 791637
Alignment:
Q  890 ctgcacttcataaatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    |||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||    
T  791546 ctgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctga 791637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 890 - 968
Target Start/End: Original strand, 37816670 - 37816748
Alignment:
Q  890 ctgcacttcataaatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaa 968  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| || |   | ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37816670 ctgcacttcattgatgtttcactattagaatttgattacatcaaatgagagtcttacaaatcatcctaagtgaaacaaa 37816748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 803 - 981
Target Start/End: Complemental strand, 21988269 - 21988098
Alignment:
Q  803 ttcaatgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaag-aatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcata 901  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||       |||||||||| ||  ||| ||| |||||||||||||| |     |||| ||||||     
T  21988269 ttcaatgttcatttaagactatgaaca-ttgatgtac-------taggaatatttcacaaaggaatatcatcctagatgttattatcactgctcttcatt 21988178  T
Q  902 aatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||| ||| |||||||| | | ||||||||||    
T  21988177 actgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcctatgtgaaacagatggaacattctga 21988098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 518; Significance: 0; HSPs: 61)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 518; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 409 - 1060
Target Start/End: Complemental strand, 49388096 - 49387465
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49388096 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgatgattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 49387997  T
Q  509 tgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacataaagacttaagaactcagtcagagttcagaaagtt 608  Q
    || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49387996 tgagtggttaactaagacaggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacataaaaacttaagaactcagtcagagttcagaaagtt 49387897  T
Q  609 aaaaagagttcagaaggttgggcagagtttagaaggttgttcgtgatgaacatcaagaaccaagcccagaaattcatgaactaaatgaagaacatgcaag 708  Q
    |||||||||||||||                   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49387896 aaaaagagttcagaa-------------------ggttgttcatgatgaacatcaagaaccaagcccagaaattcatgaactaaatgaagaacatgcaag 49387816  T
Q  709 gttcacgtgacttaaatgaaagcctagaaaagtacatgactaagatcaatcaaggaataaaagcatttatttgattaaagtcaaaaagggcatcttcaat 808  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  49387815 gttcacgtgacttaaatgaaagcccaaaaaagtacatgactaagatcaatcaaggaataaaggcatttatttgattaaagtcaaaaaggacatcttcaat 49387716  T
Q  809 gttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaagaatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcataaatgttt 908  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49387715 gttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacattaggaatattccattaagaatatcatcctagatgttttccatgctgcacttcataaatgttt 49387616  T
Q  909 cactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctgaagtcccctgagttcagaaagttcaatc 1008  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  49387615 cactattaggatttgattacattaattacaagtcttacaaatcatcctaagtgaaacaaaagaaacattctgaagtcccctgagttcagaaagtttgatc 49387516  T
Q  1009 ctgctccatgcttttttctgacgtgaacagtacagtggttggaaagcaaaag 1060  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49387515 ctgctccatgct-ttttctgacgtgaacagtacagtggttggaaagcaaaag 49387465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 487; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 408 - 1057
Target Start/End: Complemental strand, 24874001 - 24873351
Alignment:
Q  408 ttgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctc 507  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24874001 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataacaaacctttattaatagggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctc 24873902  T
Q  508 ttgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacataaagacttaagaactcagtcagagttcagaaagt 607  Q
    ||| ||| |||||||||| |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24873901 ttgagtggttaactaagacaggaacaagtttcaatttataccaagatacaaagaatcaaaggacataaagacttaagaactcagtcagagttcagaaagt 24873802  T
Q  608 taaaaagagttcagaaggttgggcagagtttagaaggttgttcgtgatgaacatcaagaaccaagcccagaaattcatgaactaaatgaagaacatgcaa 707  Q
    |||||||| || |||| ||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || || |||||||    
T  24873801 taaaaagaatttagaaagttgaacagagttcagaaggttgttcatgatgaacatcaagaaccaagcccagatactcatgaactaaaagacgatcatgcaa 24873702  T
Q  708 ggttcacgtgacttaaatgaaagcctagaaaagtacat-gactaagatcaatcaaggaataaaagcatttatttgattaaagtcaaaaagggcatcttca 806  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  24873701 ggttcatgtgacttaaataaaagcccagtaaagtacattgactaagatcaatcaaggaataaaggcatttatttgataaaagtcaaagaggacatcttca 24873602  T
Q  807 atgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaagaatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcataaatgt 906  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24873601 atgttcatttaagactatgaacatttgaagtacaaaacattaggaatattccattaagaatatcatcctagatgttttccatgctgcacttcataaatgt 24873502  T
Q  907 ttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctgaagtcccctgagttcagaaagttcaa 1006  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24873501 atcactattaggatttgattacataaattacaagtcttacaaatcatcctaagtgaaacaaaagaaacattctgaagtcccctgagttcagaaagttcga 24873402  T
Q  1007 tcctgctccatgcttttttctgacgtgaacagtacagtggttggaaagcaa 1057  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24873401 tcctgctccatgcttttttctgacgtgaacagtacagtggttggaaagcaa 24873351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 461; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 408 - 1059
Target Start/End: Original strand, 24792776 - 24793428
Alignment:
Q  408 ttgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctc 507  Q
    ||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24792776 ttgttgatgcgaaatccctaattaattttaaagataacaaacattgatgattaaggaattaatgaaatttgattaatttgttggtatttaacttgtgctc 24792875  T
Q  508 ttgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacataaagacttaagaactcagtcagagttcagaaagt 607  Q
    ||| ||| |||||||||| || ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  24792876 ttgagtggttaactaagacagaaacaagtttcaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacataaagacttaagaactcgctcagagttcagaaagt 24792975  T
Q  608 taaaaagagttcagaaggttgggcagagtttagaaggttgttcgtgatgaacatcaagaaccaagcccagaaattcatgaactaaatgaagaacatgcaa 707  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24792976 taaaaagagttcagaaggttggacaaagttcagaaggttgttcatgatgaacatcaagaaccaagcccagaaattcatgaaccaaatgaagaacatgcaa 24793075  T
Q  708 ggttcacgtgacttaaatgaaagcctagaaaagtacat-gactaagatcaatcaaggaataaaagcatttatttgattaaagtcaaaaagggcatcttca 806  Q
    ||||||| |||||||||| ||| || || ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24793076 ggttcacatgacttaaataaaaacccagtaaaatacattgactaagatcaatcaaggaataaaggcatttatttgattaaagtcaaaaaggacatcttca 24793175  T
Q  807 atgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaagaatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcataaatgt 906  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24793176 atgttcattcaagactatgaacatttgaagtacaaaacattaggaatattccattaagaatatcatcctagatgttttctatgctgcacttcataaatgt 24793275  T
Q  907 ttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctgaagtcccctgagttcagaaagttcaa 1006  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||  | |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24793276 ttcactattaggatttgattacatcaaataagagtcttgcaaatcatcctaagtgaaacaaaaggaacattctgaagtcccctgagttcagaaagttcga 24793375  T
Q  1007 tcctgctccatgcttttttctgacgtgaacagtacagtggttggaaagcaaaa 1059  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  24793376 tcttgctccatgcttttttctgacatgaacagtacaatggttggaaagtaaaa 24793428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 745 - 1059
Target Start/End: Original strand, 17733773 - 17734088
Alignment:
Q  745 tgactaagatcaatcaaggaataaaagcatttatttgattaaagtcaaaa--agggcatcttcaatgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaa 842  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||    
T  17733773 tgactaagatcaatcaaggaataaagacatttatttggttaaagtcaaaaaaagggcatcttcaatgtttattcaagattatgaacatttgaagtacaaa 17733872  T
Q  843 acgttaggaatattccattaagaatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcataaatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatc 942  Q
    || |||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||  | ||    
T  17733873 acattaggaatattccattaagaatatgatcctagatgctttccatgctacacttcataaatgtttcactattatgatttgattacatcaaataagagtc 17733972  T
Q  943 ttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctgaagtcccctgagttcagaaagttcaatcctgctccatgcttttttctgacgtgaacagtaca 1042  Q
    |||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| |    
T  17733973 ttacaaattatcctaagtgaaacaaaaggaacattctgaagtcccctgagttcagaaagttcaatcctgctccatac-tttttctgacatgaacagtaga 17734071  T
Q  1043 gtggttggaaagcaaaa 1059  Q
    || ||||||||| ||||    
T  17734072 gtagttggaaagtaaaa 17734088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 745 - 1059
Target Start/End: Original strand, 19035042 - 19035357
Alignment:
Q  745 tgactaagatcaatcaaggaataaaagcatttatttgattaaagtcaaaa--agggcatcttcaatgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaa 842  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||    
T  19035042 tgactaagatcaatcaaggaataaagacatttatttggttaaagtcaaaaaaagggcatcttcaatgtttattcaagattatgaacatttgaagtacaaa 19035141  T
Q  843 acgttaggaatattccattaagaatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcataaatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatc 942  Q
    || |||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||  | ||    
T  19035142 acattaggaatattccattaagaatatgatcctagatgctttccatgctacacttcataaatgtttcactattatgatttgattacatcaaataagagtc 19035241  T
Q  943 ttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctgaagtcccctgagttcagaaagttcaatcctgctccatgcttttttctgacgtgaacagtaca 1042  Q
    |||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| |    
T  19035242 ttacaaattatcctaagtgaaacaaaaggaacattctgaagtcccctgagttcagaaagttcaatcctgctccatac-tttttctgacatgaacagtaga 19035340  T
Q  1043 gtggttggaaagcaaaa 1059  Q
    || ||||||||| ||||    
T  19035341 gtagttggaaagtaaaa 19035357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 132; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 409 - 600
Target Start/End: Original strand, 17732229 - 17732420
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17732229 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataacaaatattgatgattaaggaattaatggactttgtttaatttgttggtatttaacttgtgctct 17732328  T
Q  509 tgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacataaagacttaagaactcagtcagagttc 600  Q
    || ||| |||||||||| |||||||||  | |||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17732329 tgagtgtttaactaagacaggaacaaggtttaattcataccaagaaataagaaatcaaaggacataaagacttaagaactcagtcagagttc 17732420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 409 - 600
Target Start/End: Original strand, 19033460 - 19033651
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19033460 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataacaaatattgatgattaaggaattaatggactttgtttaatttgttggtatttaacttgtgctct 19033559  T
Q  509 tgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacataaagacttaagaactcagtcagagttc 600  Q
    || ||| |||||||||| |||||||||  | |||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19033560 tgagtgtttaactaagacaggaacaaggtttaattcataccaagaaataagaaatcaaaggacataaagacttaagaactcagtcagagttc 19033651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 669 - 984
Target Start/End: Complemental strand, 21542760 - 21542446
Alignment:
Q  669 caagcccagaaattcatgaactaaatgaagaacatgcaaggttcacgtgacttaaatgaaagcctagaaaagtaca-tgactaagatcaatcaaggaata 767  Q
    |||||||||||||||||||||   || |||||||||||||| |||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  21542760 caagcccagaaattcatgaaccttatcaagaacatgcaaggctcacatgacataaataaaagcctagaaaagtacattgacttagatcaataaaggaata 21542661  T
Q  768 aaagcatttattt-gattaaagtcaaaaagggcatcttcaatgttcatttaagac-tatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaaga 865  Q
    || |||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||  |||||||||||| || | ||    
T  21542660 aaggcatttatttggattaaagtcaaa---ggcatcttcaatgttcatttaagacttttgaacatttaaagtacaaaatattaggaatattcgatcatga 21542564  T
Q  866 atgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcataaatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaac 965  Q
    || ||||||||||||||   ||| || || |||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |   | |||||||||| || |||||||||||    
T  21542563 atatcatcctagatgttacacatactacatttcattgatgttacactactaggatttgattacattaaatgagagtcttacaaataatcctaagtgaaac 21542464  T
Q  966 aaaagaaacattctgaagt 984  Q
     |||| |||||||||||||    
T  21542463 -aaaggaacattctgaagt 21542446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 83; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 407 - 573
Target Start/End: Original strand, 6421634 - 6421800
Alignment:
Q  407 attgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgct 506  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    || ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  6421634 attgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgct 6421733  T
Q  507 cttgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    |||| ||| || |||||||||||||||||  | || |||||||||||  |||  |||||||||||||    
T  6421734 cttgagtgttttactaagataggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacat 6421800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 83; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 407 - 573
Target Start/End: Original strand, 8982655 - 8982821
Alignment:
Q  407 attgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgct 506  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  8982655 attgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaaccaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgct 8982754  T
Q  507 cttgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    |||| ||| || ||||||| |||||||||  | || |||||||||||  |||  |||||||||||||    
T  8982755 cttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacat 8982821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 82; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 631 - 732
Target Start/End: Original strand, 17732413 - 17732514
Alignment:
Q  631 cagagtttagaaggttgttcgtgatgaacatcaagaaccaagcccagaaattcatgaactaaatgaagaacatgcaaggttcacgtgacttaaatgaaag 730  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17732413 cagagttcggaaggttgttcatgatgaacatcaagaagcaagcccagaaattcatgaactaaatgaagaacatgcaaggttcacgtgacttaaataaaag 17732512  T
Q  731 cc 732  Q
    ||    
T  17732513 cc 17732514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 631 - 732
Target Start/End: Original strand, 19033644 - 19033745
Alignment:
Q  631 cagagtttagaaggttgttcgtgatgaacatcaagaaccaagcccagaaattcatgaactaaatgaagaacatgcaaggttcacgtgacttaaatgaaag 730  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19033644 cagagttcggaaggttgttcatgatgaacatcaagaagcaagcccagaaattcatgaactaaatgaagaacatgcaaggttcacgtgacttaaataaaag 19033743  T
Q  731 cc 732  Q
    ||    
T  19033744 cc 19033745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 78; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 408 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 1686049 - 1685884
Alignment:
Q  408 ttgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctc 507  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  1686049 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaaccaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 1685950  T
Q  508 ttgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    ||| ||| || ||||||| |||||||||  |  | |||||||||||  |||  |||||||||||||    
T  1685949 ttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacat 1685884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 409 - 573
Target Start/End: Original strand, 8972074 - 8972238
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  8972074 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaaccaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 8972173  T
Q  509 tgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    || ||| || ||||||| |||||||||  |  | |||||||||||  |||  |||||||||||||    
T  8972174 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacat 8972238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 409 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 12805020 - 12804856
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  12805020 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaaccaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 12804921  T
Q  509 tgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    || ||| || ||||||| |||||||||  |  | |||||||||||  |||  |||||||||||||    
T  12804920 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacat 12804856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 407 - 573
Target Start/End: Original strand, 6432074 - 6432240
Alignment:
Q  407 attgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgct 506  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||    
T  6432074 attgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaatttcttggtattcagcttgtgct 6432173  T
Q  507 cttgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    |||| ||| || ||||||| |||||||||  | || |||||||||||  |||  |||||||||||||    
T  6432174 cttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacat 6432240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 409 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 2490333 - 2490168
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  2490333 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 2490234  T
Q  509 tgcgtg-attaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    || |||  || ||||||| |||||||||  |  | |||||||||||| || | |||||||||||||    
T  2490233 tgagtgttttcactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggacat 2490168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 407 - 571
Target Start/End: Original strand, 4380083 - 4380248
Alignment:
Q  407 attgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgct 506  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  4380083 attgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgct 4380182  T
Q  507 cttgcgtg-attaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggac 571  Q
    |||| |||  || ||||||| |||||||||  |  | |||||||||||| || | |||||||||||    
T  4380183 cttgagtgttttcactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggac 4380248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 409 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 4783754 - 4783589
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  4783754 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 4783655  T
Q  509 tgcgtg-attaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    || |||  || ||||||| |||||||||  |  | |||||||||||| || | |||||||||||||    
T  4783654 tgagtgttttcactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggacat 4783589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 409 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 10012960 - 10012796
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  10012960 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaaccaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtactct 10012861  T
Q  509 tgcgtgattaactaagataggaacaa-gtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    || ||| || ||||||| |||||||| || |||| |||||||||||  |||  |||||||||||||    
T  10012860 tgagtgttttactaagacaggaacaatgtttaaa-tcataccaagaatcaagaaatcaaaggacat 10012796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 407 - 573
Target Start/End: Original strand, 9536234 - 9536401
Alignment:
Q  407 attgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgct 506  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  9536234 attgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgct 9536333  T
Q  507 cttgcgtg-attaactaagataggaacaa-gtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    |||| |||  || ||||||| |||||||| || | || |||||||||||| || | |||||||||||||    
T  9536334 cttgagtgttttcactaagacaggaacaaggtctgaa-tcataccaagatgcataaaatcaaaggacat 9536401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 407 - 573
Target Start/End: Original strand, 9546656 - 9546823
Alignment:
Q  407 attgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgct 506  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  9546656 attgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgct 9546755  T
Q  507 cttgcgtg-attaactaagataggaacaa-gtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    |||| |||  || ||||||| |||||||| || | || |||||||||||| || | |||||||||||||    
T  9546756 cttgagtgttttcactaagacaggaacaaggtctgaa-tcataccaagatgcataaaatcaaaggacat 9546823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 409 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 16336175 - 16336011
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |    
T  16336175 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctat 16336076  T
Q  509 tgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    || ||| || ||||||| |||||||||  | || |||||||||||  |||  |||||||||||||    
T  16336075 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacat 16336011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 409 - 571
Target Start/End: Original strand, 4370339 - 4370502
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  4370339 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 4370438  T
Q  509 tgcgtg-attaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggac 571  Q
    || |||  || ||||||| |||||||||  |  | |||||||||||| || | |||||||||||    
T  4370439 tgagtgttttcactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggac 4370502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 407 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 19829019 - 19828852
Alignment:
Q  407 attgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgct 506  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  19829019 attgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgct 19828920  T
Q  507 cttgcgtg-attaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    |||  |||  || ||||||| |||||||||  |  | |||||||||||| || | |||||||||||||    
T  19828919 cttaagtgttttcactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggacat 19828852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 409 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 5656625 - 5656460
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  5656625 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 5656526  T
Q  509 tgcgtg-attaactaagataggaacaa-gtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    || |||  || ||||||| |||||||| || | || |||||||||||| || | |||||||||||||    
T  5656525 tgagtgttttcactaagacaggaacaaggtctgaa-tcataccaagatgcataaaatcaaaggacat 5656460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 408 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 51979503 - 51979339
Alignment:
Q  408 ttgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctc 507  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  51979503 ttgttgatgcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttgatatttaacttgtgctc 51979404  T
Q  508 ttgcgtgattaactaagataggaacaa-gtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    |||  || || ||||||| |||||||| || |||| | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51979403 ttgaatgttttactaagacaggaacaatgtttaaa-taataccaagatac-aagaatcaaaggacat 51979339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 408 - 573
Target Start/End: Original strand, 25432193 - 25432358
Alignment:
Q  408 ttgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctc 507  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||    || ||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  25432193 ttgttgaggcaaaatcccaaattaattttaaagataataaacaaatatgattatagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 25432292  T
Q  508 ttgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    ||| ||| || ||||||| |||||||||  | || |||||||||||  |||  |||||||||||||    
T  25432293 ttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacat 25432358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 68; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 407 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 12723 - 12556
Alignment:
Q  407 attgttgaggcaaaatccct-aatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgc 505  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||    || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  12723 attgttgaggcaaaatcccttaattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgc 12624  T
Q  506 tcttgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    ||||| ||| || ||||||| |||||||||  | || ||||||||| |  |||  |||||||||||||    
T  12623 tcttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaaaaatcaagaaatcaaaggacat 12556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 409 - 573
Target Start/End: Original strand, 18560251 - 18560417
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgatt-aatttgttggtatttaacttgtgctc 507  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  18560251 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaaattccttggtatttaacttgtgctc 18560350  T
Q  508 ttgcgtg-attaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    ||| |||  || ||||||| |||||||||  |  | |||||||||||| || | |||||||||||||    
T  18560351 ttgagtgttttcactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggacat 18560417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 409 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 13120712 - 13120547
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | |||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  13120712 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggattttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 13120613  T
Q  509 tgcgtg-attaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    || |||  || ||||||| | |||||||  |  | |||||||||||| || | |||||||||||||    
T  13120612 tgagtgtttttactaagacaagaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggacat 13120547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 409 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 20745806 - 20745641
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||    
T  20745806 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttcattaattccttggtatttaacttgtgatct 20745707  T
Q  509 tgcgtg-attaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    || |||  || ||||||| |||||||||  |  | |||||||||||| || | |||||||||||||    
T  20745706 tgagtgttttcactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggacat 20745641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 406 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 4025127 - 4024999
Alignment:
Q  406 aattgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgc 505  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||    
T  4025127 aattgttgaggcaatatccctaattaattttaaagataataaaccaatatgattaaagaattaatggactttgattaattcattggtatttaacttctgc 4025028  T
Q  506 tcttgcgtgattaactaagataggaacaa 534  Q
    ||||| ||| || |||||||  |||||||    
T  4025027 tcttgagtgttttactaagactggaacaa 4024999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 409 - 573
Target Start/End: Original strand, 20491389 - 20491553
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||  ||||   || ||||| |||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  20491389 tgttgagacaaaatccgtaattaattttaaagataatgaaccaatatgattaaagaattaatgggctttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 20491488  T
Q  509 tgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    || ||| || ||||||| |||||||||  | || |||||||||||  |||  |||||||||||||    
T  20491489 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaataaatcaaaggacat 20491553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 409 - 535
Target Start/End: Original strand, 20292463 - 20292590
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  20292463 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatagactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 20292562  T
Q  509 tgcgtg-attaactaagataggaacaag 535  Q
    || |||  || ||||||| |||||||||    
T  20292563 tgagtgtttttactaagacaggaacaag 20292590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 407 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 55478782 - 55478612
Alignment:
Q  407 attgttgaggcaaaatccctaatttatt----ttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttg 502  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||    |||||||||| |||||   || ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  55478782 attgttgaggcaaaatctctaattaattaattttaaagataataaaccaatatgattagagaattaatggactttgattaatttcttggtatttaacttg 55478683  T
Q  503 tgctcttgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    |||| ||| ||| || |||||||  ||||||||  | || |||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  55478682 tgctattgagtgttttactaagacgggaacaaggtttaaatcataccaagattcaagaaatcaaaggacat 55478612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 407 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 13113586 - 13113483
Alignment:
Q  407 attgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgct 506  Q
    ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | |||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  13113586 attgttgaggataaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggattttgattaattccttggtatttaacttgtgct 13113487  T
Q  507 cttg 510  Q
    ||||    
T  13113486 cttg 13113483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 409 - 502
Target Start/End: Original strand, 24762868 - 24762961
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttg 502  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | |||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  24762868 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatgaactttgattaattctttggtatttaacttg 24762961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 450 - 534
Target Start/End: Original strand, 11459422 - 11459505
Alignment:
Q  450 cttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctcttgcgtgattaactaagataggaacaa 534  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||| ||||||||    
T  11459422 cttgatgattaaggaattaatggactttgattaatttcttgatatttaacttgtgct-ttgagtgtttaagtaagagaggaacaa 11459505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 803 - 981
Target Start/End: Complemental strand, 1685589 - 1685418
Alignment:
Q  803 ttcaatgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaag-aatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcata 901  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||       |||||||||| ||  ||| ||| |||||||||||||| ||    |||| ||||||     
T  1685589 ttcaatgttcatttaagactatgaaca-ttgatgtac-------taggaatatttcacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcatt 1685498  T
Q  902 aatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||    
T  1685497 attgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctga 1685418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 803 - 981
Target Start/End: Complemental strand, 5655964 - 5655793
Alignment:
Q  803 ttcaatgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaag-aatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcata 901  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||       |||||||||| ||  ||| ||| |||||||||||||| ||    |||| ||||||     
T  5655964 ttcaatgttcatttaagactatgaaca-ttgatgtac-------taggaatatttcacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcatt 5655873  T
Q  902 aatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||    
T  5655872 attgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctga 5655793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 803 - 981
Target Start/End: Original strand, 8972576 - 8972747
Alignment:
Q  803 ttcaatgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaag-aatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcata 901  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||       |||||||||| ||  ||| ||| |||||||||||||| ||    |||| ||||||     
T  8972576 ttcaatgttcatttaagactatgaaca-ttgatgtac-------taggaatatttcacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcatt 8972667  T
Q  902 aatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||    
T  8972668 attgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctga 8972747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 803 - 981
Target Start/End: Original strand, 8983131 - 8983302
Alignment:
Q  803 ttcaatgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaag-aatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcata 901  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||       |||||||||| ||  ||| ||| |||||||||||||| ||    |||| ||||||     
T  8983131 ttcaatgttcatttaagactatgaaca-ttgatgtac-------taggaatatttcacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcatt 8983222  T
Q  902 aatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||    
T  8983223 attgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctga 8983302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 803 - 981
Target Start/End: Original strand, 9536865 - 9537036
Alignment:
Q  803 ttcaatgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaag-aatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcata 901  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||       |||||||||| ||  ||| ||| |||||||||||||| ||    |||| ||||||     
T  9536865 ttcaatgttcatttaagactatgaaca-ttgatgtac-------taggaatatttcacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcatt 9536956  T
Q  902 aatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||    
T  9536957 attgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctga 9537036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 803 - 981
Target Start/End: Original strand, 9547191 - 9547362
Alignment:
Q  803 ttcaatgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaag-aatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcata 901  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||       |||||||||| ||  ||| ||| |||||||||||||| ||    |||| ||||||     
T  9547191 ttcaatgttcatttaagactatgaaca-ttgatgtac-------taggaatatttcacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcatt 9547282  T
Q  902 aatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||    
T  9547283 attgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctga 9547362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 832 - 968
Target Start/End: Complemental strand, 29709602 - 29709466
Alignment:
Q  832 tgaagtacaaaacgttaggaatattccattaagaatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcataaatgtttcactattaggatttgattacatt 931  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||  | | ||| |||||||||||||| | |||  |||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||     
T  29709602 tgaagtacaaaacattaagaatattcctctcacaatatcatcctagatgttatacatattgcacttcattaacgttttactattaggatttaattacatc 29709503  T
Q  932 aattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaa 968  Q
    || |  || ||||| |||  ||||||||| |||||||    
T  29709502 aaatggaagtcttataaaagattctaagttaaacaaa 29709466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 890 - 981
Target Start/End: Original strand, 4371187 - 4371278
Alignment:
Q  890 ctgcacttcataaatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    |||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||    
T  4371187 ctgctcttcatcattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctga 4371278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 890 - 981
Target Start/End: Original strand, 4380906 - 4380997
Alignment:
Q  890 ctgcacttcataaatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    |||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||    
T  4380906 ctgctcttcatcattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctga 4380997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 409 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 11044924 - 11044809
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataatt-aaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctc 507  Q
    |||||||||||||| ||| ||  ||||||| |||||||||| ||||| ||| || ||||||||| | |||||||| ||| ||||||| ||| ||||| ||    
T  11044924 tgttgaggcaaaattcctgatgaattttaaggataacaaacattgatgattaaaagaattaatgaattttgattagtttcttggtatctaatttgtgttc 11044825  T
Q  508 ttgcgtgattaactaa 523  Q
    ||| ||| ||||||||    
T  11044824 ttgagtgtttaactaa 11044809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 890 - 981
Target Start/End: Complemental strand, 16335699 - 16335608
Alignment:
Q  890 ctgcacttcataaatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    |||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||    
T  16335699 ctgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctga 16335608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 410 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 21542998 - 21542800
Alignment:
Q  410 gttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctctt 509  Q
    ||||||||||||||  |||||  |||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||| |||| |||    |||||||| ||||  ||||    
T  21542998 gttgaggcaaaatcattaattactttttaagataacaaaccttgatgattaaaggattaatgaactttaattagtttcactgtatttaatttgtattctt 21542899  T
Q  510 gcgtgattaactaagataggaac-aagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacataaagacttaagaactcagtcagagttcagaaagtt 608  Q
    | ||| |||||||||| |  ||| |||| |||| |||| ||||||  |||  ||| |||||| || |||||||| |||| |||||| |||||| ||||||    
T  21542898 gagtgtttaactaagacataaacaaagtataaa-tcattccaagaagcaagcaattaaaggagattaagacttatgaacccagtcatagttcataaagtt 21542800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 895 - 981
Target Start/End: Complemental strand, 12240 - 12154
Alignment:
Q  895 cttcataaatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||    
T  12240 cttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctga 12154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 864 - 966
Target Start/End: Original strand, 6422086 - 6422188
Alignment:
Q  864 gaatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcataaatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaa 963  Q
    |||| |||||||||||||| |   | |||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||| |||||||||    
T  6422086 gaatatcatcctagatgttattattactgctcttcatcattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcctaagtgaa 6422185  T
Q  964 aca 966  Q
    |||    
T  6422186 aca 6422188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 405 - 483
Target Start/End: Original strand, 12375920 - 12375998
Alignment:
Q  405 gaattgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaa 483  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  || || |||| ||| | ||||||||||||||||    
T  12375920 gaatttttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaattttaatgattacggattaaatggactttgattaa 12375998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 904 - 981
Target Start/End: Complemental strand, 55478287 - 55478210
Alignment:
Q  904 tgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||    
T  55478287 tgtttcactattaggatttgattacatcaaatggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctga 55478210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 904 - 979
Target Start/End: Original strand, 6432566 - 6432641
Alignment:
Q  904 tgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattct 979  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||    
T  6432566 tgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcctaagtgaaacagatggaacattct 6432641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 890 - 981
Target Start/End: Original strand, 25432669 - 25432760
Alignment:
Q  890 ctgcacttcataaatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    |||| |||||| | |||||||||| |||||||||||||||| || |   | ||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||    
T  25432669 ctgctcttcattattgtttcactaataggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctga 25432760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 803 - 981
Target Start/End: Complemental strand, 10012565 - 10012394
Alignment:
Q  803 ttcaatgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccatta-agaatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcata 901  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||       |||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||       |||| ||||||     
T  10012565 ttcaatgttcatttaagactatgaaca-ttgatgtac-------taggaatattccacaagagaatatcatcctagatgttaaaatcactgctcttcatt 10012474  T
Q  902 aatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||| || |   | ||||||||||| | |||||||||||| | | ||||||||||    
T  10012473 attgtttcaccattaggatttgattacatcaaatggtagtcttacaaatcgtcctaagtgaaacagatggaacattctga 10012394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 831 - 881
Target Start/End: Complemental strand, 8435918 - 8435868
Alignment:
Q  831 ttgaagtacaaaacgttaggaatattccattaagaatgtcatcctagatgt 881  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  8435918 ttgaagtacaatacattaggaatattcctctaagaatatcatcctagatgt 8435868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 831 - 881
Target Start/End: Complemental strand, 8439463 - 8439413
Alignment:
Q  831 ttgaagtacaaaacgttaggaatattccattaagaatgtcatcctagatgt 881  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  8439463 ttgaagtacaatacattaggaatattcctataagaatatcatcctagatgt 8439413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 904 - 981
Target Start/End: Original strand, 20491878 - 20491955
Alignment:
Q  904 tgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| || |   | ||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||    
T  20491878 tgttttactatttggatttgattacatcaaatggtagtcttacaaatcatgctaagtgaaacagatggaacattctga 20491955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0194 (Bit Score: 327; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0194
Description:

Target: scaffold0194; HSP #1
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 408
Target Start/End: Original strand, 5748 - 6144
Alignment:
Q  8 tcaagttgttgtgactggtgtagagacgacaactggacacataagatggtattttaccattacacgtctatacaacatacctgcatcggagaatgtagag 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5748 tcaagttgttgtgactggtgtagagacgacaactggacacataagatcgtattttaccattacacatctatacaacatacctgcatcggagaatgtacag 5847  T
Q  108 gctccaaggccaccggaaaaggagatccttaaggagctatacattagcttatagctaggacgtattagagattatgtctgagggatcatgagaggtggtc 207  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5848 gctccaaggccactggaaaatgagattcttaaggagctatacatgagcttatagctaggacgtattagagatcatgtctgagggatcatgagaggtggtc 5947  T
Q  208 tgctggaaaggagcagtctggctaggctgaatttggagcagatcctgcatgacatttagggagggatgatttatagtcggaggcgtaagggtgataggag 307  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||| | |   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5948 cgctggaaaggagcactctggctaggctgaatctag---agatcctgcatgagatttagggagggatgatttat-gtcggaggcgtaagggtgataggag 6043  T
Q  308 tggcgttgctacccaatagttttttattttcttacttgatgtaacatttggataattttagttttaatttatgtttggaattattgatgtaatatttgaa 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6044 tggcgttgctacccaatagttttttattttcttacttgatgtaacatttggataattttagttttaatttatgtttggaattattgatgtaatatttgaa 6143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059 (Bit Score: 308; Significance: 1e-173; HSPs: 1)
Name: scaffold0059
Description:

Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 407 - 1059
Target Start/End: Complemental strand, 41336 - 40684
Alignment:
Q  407 attgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgct 506  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41336 attgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataacaaaccttgatgattaaggaattaatggactttgattaattttttggtatttaacttgtgct 41237  T
Q  507 cttgcgtgattaact-aagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacataaagacttaa-gaactcagtcagagttcagaa 604  Q
     ||| ||| |||| | |||||| ||||||   | |||||||||  |||| |||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||    
T  41236 tttgagtgtttaaattaagatatgaacaaagtttaattcatacgtagatgcaagaaatcaaaggacttaaagacttaaagaactcagtcatagttcaaaa 41137  T
Q  605 agttaaaaagagttcagaaggttgggcagagtttagaaggttgttcgtgatgaacatcaagaaccaagcccagaaattcatgaactaaatgaagaacatg 704  Q
    | |||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||  || ||||||| ||||| |||||| | | ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41136 aattaaaa-gagttcagaaggttggacagagttcagaaggtttctc-tgatgaaaatcaaaaaccaaactcggaaattcatgaaccaaatgaagaacatg 41039  T
Q  705 caaggttcacgtgacttaaatgaaagcctagaaaagtacat-gactaagatcaatcaaggaataaaagcatttatttgattaaagtcaaaaagggcatct 803  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| |  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41038 caaggttcacgtgacataaataaaagcccaataaagtacattgactaagagcaatcaaggaataaaagcatttatttgattaaagtcaaaaaaggcatct 40939  T
Q  804 tcaatgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaagaatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcataaa 903  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || | |||| | |||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||||  |    
T  40938 tcaatgttcattcaagactatgaacatttgaagtacaaaaccttcgcaatagttcattaagaatatcatcctagatgtttttcatattgcacttcattga 40839  T
Q  904 tgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctgaagtcccctgagttcagaaagtt 1003  Q
    | ||||| ||| | |||||  |||||| || |   | ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  40838 tatttcattatgaagatttccttacatcaaatgggagtctcacaaatcatcctaagtgaaacaaaaggaacattatgaagtccattgagttcagaaagtt 40739  T
Q  1004 caatcctgctccatgcttttttctgacgtgaacagtacagtggttggaaagcaaaa 1059  Q
      ||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40738 tgatcctgctttatgc-tttttctgacatgaacagtacagtggttggaaagtaaaa 40684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0535 (Bit Score: 275; Significance: 1e-153; HSPs: 1)
Name: scaffold0535
Description:

Target: scaffold0535; HSP #1
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 578 - 1054
Target Start/End: Complemental strand, 1494 - 1017
Alignment:
Q  578 acttaagaactcagtcagagttcagaaagttaaaaagagttcagaaggttgggc-agagtttagaaggttgttcgtgatgaacatcaagaaccaagccca 676  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||| |   | |||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  1494 acttatgaactcagtcagagttcagaaggttagttagagttcagaaggttcgaagatagttcagaaggtttttcattatgaacatcaagaaccaagccca 1395  T
Q  677 gaaattcatgaactaaatgaagaacatgcaaggttcacgtgacttaaatgaaagcctagaaaagtacat-gactaagatcaatcaaggaataaaagcatt 775  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  1394 gaaattcatgaactaaatgaagaatatgcaaggttcacgtgacttaaataaaagcccagtaaagtacattgactaagataaatcaaggaataaaggcatt 1295  T
Q  776 tatttgattaaagtcaaaaagggcatcttcaatgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaagaatgtcatcct 875  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1294 tatttgattaaagtcaaaaagggcatcttcaatgttcattcatgactatgaacatttgaagtacaaaacattaggaatattccattaagaatatcatcct 1195  T
Q  876 agatgttttccatgctgcacttcataaatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaaca 975  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |  ||||||| || ||  | ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||    
T  1194 agatgttttccatgctgcacttcatcaatgtttcactattaagactcaattacatcaaataagagtcttacaaatcatcctaagtgaaccaaaaggaaca 1095  T
Q  976 ttctgaagtcccctgagttcagaaagttcaatcctgctccatgcttttttctgacgtgaacagtacagtggttggaaag 1054  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||| || |||||| |||| |||||||||||    
T  1094 ttcgtaagtcccctgagttcagaaagttcgatcctgctccatgc-tctttctaacatgaacaatacaatggttggaaag 1017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 243; Significance: 1e-134; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 412 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 267655 - 267239
Alignment:
Q  412 tgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctcttgc 511  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||     
T  267655 tgaggtaaaatccctaattaattttaaagataacaaacattgatgattaaggaattaatggactttgattaattttttggtatttaacttgtcctcttga 267556  T
Q  512 gtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacataaagacttaagaactcagtcagagttcagaaagttaaa 611  Q
    ||| |||||||||| || |||||   | || ||||||||||| |||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  267555 gtgtttaactaagacagaaacaaagtttaactcataccaagaaacaggaaatcaaaagacataaagacttaagaactcagtcaaagttcagaaagttaaa 267456  T
Q  612 aagagttcagaaggttgggcagagtttagaaggttgttcgtgatgaacatcaagaaccaagcccagaaattcatgaactaaatgaagaacatgcaaggtt 711  Q
    | |||||||||||||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  267455 atgagttcagaaggttggacaaagttcagaaggttgttc-tgatgaacatcaagaaccaagcccataaactcatgaaccaaatgaagaacatgcaaggtt 267357  T
Q  712 cacgtgacttaaatgaaagcctagaaaagtac-atgactaagatcaatcaaggaataaaagcatttatttgattaaagtcaaaaagggcatcttcaatgt 810  Q
    ||||| || ||||| |||||| ||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  267356 cacgtaacataaataaaagcccagtgaagtacgttgactaagatcaatcaaggaataaaggtatttatttgattaaagtcaaaaagggcatcttcaatgt 267257  T
Q  811 tcatttaagactatgaaca 829  Q
    ||| | |||||||||||||    
T  267256 tca-taaagactatgaaca 267239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0434 (Bit Score: 220; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold0434
Description:

Target: scaffold0434; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 411 - 713
Target Start/End: Original strand, 13870 - 14173
Alignment:
Q  411 ttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctcttg 510  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13870 ttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataacaaaccttgatgattaaggaattaatggattttgattaatttgttggtatttaacttgtgctcttg 13969  T
Q  511 cgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacataaagactt-aagaactcagtcagagttcagaaagtta 609  Q
     ||| | |||||||| |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13970 agtggtcaactaagacaggaacaagtttcaatttataccaagatacaaagaatcaaagaaaataaagacttaaagaactcagttagagttcagaaagtta 14069  T
Q  610 aaaagagttcagaaggttgggcagagtttagaaggttgttcgtgatgaacatcaagaaccaagcccagaaattcatgaactaaatgaagaacatgcaagg 709  Q
    |||||| ||||||||||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14070 aaaagatttcagaaggttggacaaagttcagaaggttgttcatgatgaacatcaagaaccaagcccagaaattcatgaaccaaatgaagaacatgcaagg 14169  T
Q  710 ttca 713  Q
    ||||    
T  14170 ttca 14173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0811 (Bit Score: 218; Significance: 1e-119; HSPs: 1)
Name: scaffold0811
Description:

Target: scaffold0811; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 562 - 1059
Target Start/End: Complemental strand, 4120 - 3626
Alignment:
Q  562 atcaaaggacataaagacttaagaactcagtcagagttcagaaagttaaaaagagttcagaaggttgggcag-agtttagaaggttgttcgtgatgaaca 660  Q
    ||||||| |||| ||  |||| ||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||| |  |  |||| |||| |||||||   | |   |    
T  4120 atcaaagaacattaaagcttatgaactcagtcagagttctgaaggttagtaagagttcagaaggttcgaaaatagttcagaaagttgttctaaaggttta 4021  T
Q  661 tcaagaaccaagcccagaaattcatgaactaaatgaagaacatgcaaggttcacgtgacttaaatgaaagcctagaaaagtacat-gactaagatcaatc 759  Q
    |||||||| |||| |||||||  ||||||   || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| ||||||||||||||    
T  4020 tcaagaac-aagcgcagaaatatatgaacattatcaagaacattcaaggttcacgtgacttaaataaaagctcagtaaagtacattgactaagatcaatc 3922  T
Q  760 aaggaataaaagcatttatttgattaaagtcaaaaagggcatcttcaatgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattcca 859  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| |||| |    
T  3921 aaggaataaaggcatttatttgattaaagtcaaaaagggcatcttcaatattcattcaagactatgaatatttgaagtacaaaacattaggaacattcga 3822  T
Q  860 ttaagaatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcataaatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaag 959  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| | ||  | ||||||||||||| |||||    
T  3821 tcaagaatatcatcctagatgttttccatgatgcacttcatcattgtttcactattacgatttgattacatttaataagagtcttacaaatcatactaag 3722  T
Q  960 tgaaacaaaagaaacattctgaagtcccctgagttcagaaagttcaatcctgctccatgcttttttctgacgtgaacagtacagtggttggaaagcaaaa 1059  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  3721 tgaaacaaaaggaacattctgaagtccc--gagttcagaaagttcaatcctgctccatgc--ttttccgacatgaacagtatagtggttggaaagtaaaa 3626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0262 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0262
Description:

Target: scaffold0262; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 538 - 884
Target Start/End: Original strand, 1072 - 1399
Alignment:
Q  538 taaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacataaagacttaagaactcagtcagagttcagaaagttaaaaagagttcagaaggttgggcagagtt 637  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||                  
T  1072 taaattcatacctagatacaaagaatcaaaggacataaagacttaagaactcagccagagttcagaaagttaaaaaaagttcagaa-------------- 1157  T
Q  638 tagaaggttgttcgtgatgaacatcaagaaccaagcccagaaattcatgaactaaatgaagaacatgcaaggttcacgtgacttaaatgaaagcctagaa 737  Q
         |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||    
T  1158 -----ggttgttcatgatgaacatcaagaaccaagcccagaaattcatgaaccaaatgaagaacatgcaaggttcacgtgacttaaataaaagcgcagaa 1252  T
Q  738 aagtacatgactaagatcaatcaaggaataaaagcatttatttgattaaagtcaaaaagggcatcttcaatgttcatttaagactatgaacaattgaagt 837  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  1253 aagtacataactaagatcaatcagtgaataaagacatttatttgattcaagtcaaaaagggcatcttcaatgttcattcaagactatgaacatttgaagt 1352  T
Q  838 acaaaacgttaggaatattccattaagaatgtcatcctagatgtttt 884  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  1353 acaaaacattaggaatattccatcaagaatatcatcctagatgtttt 1399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 100; Significance: 6e-49; HSPs: 6)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 407 - 610
Target Start/End: Original strand, 167450 - 167653
Alignment:
Q  407 attgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgct 506  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  167450 attgttgaggcaaaattcctaattaattttaaagataatagaccttgatgattaaggaattaatggacttggattaatttcttggtatttaacttgtgct 167549  T
Q  507 cttgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacataaagacttaagaactcagtcagagttcagaaag 606  Q
    |||| ||| ||| |||||| |||||||| ||| || ||||||  ||||||||  |||||||||||||   || ||| ||||| | || ||||||||||||    
T  167550 cttgtgtgtttatctaagacaggaacaaatgttaaatcatacatagatacaagaaatcaaaggacatttggatttatgaactaactctgagttcagaaag 167649  T
Q  607 ttaa 610  Q
    ||||    
T  167650 ttaa 167653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 407 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 235146 - 234979
Alignment:
Q  407 attgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgct 506  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  235146 attgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgct 235047  T
Q  507 cttgcgtg-attaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    |||| |||  || ||||||| |||||||||  |  | |||||||||||| || | |||||||||||||    
T  235046 cttgagtgttttcactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggacat 234979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #3
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 409 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 115260 - 115095
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||    
T  115260 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaactcgtgttct 115161  T
Q  509 tgcgtg-attaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    || |||  || ||||||| | |||||||  | || |||||||||||| ||   |||||||||||||    
T  115160 tgagtgtttttactaagacatgaacaaggattaaatcataccaagatgcatgaaatcaaaggacat 115095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #4
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 406 - 534
Target Start/End: Original strand, 146031 - 146162
Alignment:
Q  406 aattgttgaggcaaaatccctaatttattttaaaga--taacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgt 503  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||| |||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  146031 aattgttgaggaaaaatccctaattaattttaaagagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgt 146130  T
Q  504 gctcttgcgtg-attaactaagataggaacaa 534  Q
    ||||||| |||  || ||||||| ||||||||    
T  146131 gctcttgagtgtttttactaagacaggaacaa 146162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #5
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 407 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 154255 - 154163
Alignment:
Q  407 attgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaac 499  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | |||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  154255 attgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttaattaattccttggtatttaac 154163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #6
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 803 - 981
Target Start/End: Complemental strand, 234327 - 234156
Alignment:
Q  803 ttcaatgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaag-aatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcata 901  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||       |||||||||| ||  ||| ||| |||||||||||||| ||    |||| ||||||     
T  234327 ttcaatgttcatttaagactatgaaca-ttgatgtac-------taggaatatttcacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcatt 234236  T
Q  902 aatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||    
T  234235 attgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctga 234156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 84; Significance: 2e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 407 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 29499 - 29333
Alignment:
Q  407 attgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgct 506  Q
    |||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29499 attgttgaggtaaaatccctaattagttttaaagataataaaccttaatgattaaggaattaatagactttgattaatttcttggtatttaacttgtgct 29400  T
Q  507 cttgcgtgattaactaagataggaacaag-tgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    |||| ||| || ||||||| | ||||||| | |||||| |||||||||| |||  |||||||||||||    
T  29399 cttgagtgttttactaagacatgaacaaggtttaaatt-ataccaagattcaagtaatcaaaggacat 29333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 754 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 29145 - 29072
Alignment:
Q  754 tcaatcaaggaataaaagcatttatttgattaaagtcaaaaagggcatcttcaatgttcatttaagactatgaaca 829  Q
    ||||||||| |||||| |||||||   | |||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||    
T  29145 tcaatcaagcaataaatgcatttacaaggttaatgtcaaaaagg--atattcaatgttcatttaagactatgaaca 29072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 84; Significance: 2e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 409 - 568
Target Start/End: Original strand, 65023 - 65182
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||||||||| |||||| | || ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  65023 tgttgaggcagaatccccatttcattttaaagataataaaccttgatgattaaggaattaatagactttgattaatttcttgatatttaacttgtgctct 65122  T
Q  509 tgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaag 568  Q
    || ||| |||||||||| | |||||||  | || ||||||||||||||||  ||||||||    
T  65123 tgagtgtttaactaagacaagaacaaggtttaaatcataccaagatacaagaaatcaaag 65182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 755 - 984
Target Start/End: Original strand, 65370 - 65590
Alignment:
Q  755 caatcaaggaataaaagcatttatttgattaaagtcaaaaagggcatcttcaatgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaata 854  Q
    |||||||| ||||||  ||||||   |||||| |||||||| |  ||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||       ||||||||    
T  65370 caatcaagcaataaatacatttacaagattaatgtcaaaaaag--atcttcagtgttcattcaagactatgaacatttgaagtac-------taggaata 65460  T
Q  855 ttccattaagaatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcataaatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcatt 954  Q
    ||| |  |||||| ||||||||||||||    |   | |||||| |  ||||||||||||||  |||||||||||| || |  |||||||||| |||||     
T  65461 ttcgaacaagaatatcatcctagatgttacaaacattccacttctttgatgtttcactattaatatttgattacatgaaatggaaatcttacatatcatc 65560  T
Q  955 ctaagtgaaacaaaagaaacattctgaagt 984  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  65561 ctaagtgaaacaaaaggaacattatgaagt 65590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 84; Significance: 2e-39; HSPs: 3)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 744 - 968
Target Start/End: Complemental strand, 242089 - 241865
Alignment:
Q  744 atgactaagatcaatcaaggaataaaagcatttatttg-attaaagtcaaaaagggcatcttcaatgttcatttaagact-atgaacaattgaagtacaa 841  Q
    |||||| |||| ||||||||  ||||  |||||||||| || ||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  242089 atgacttagattaatcaaggtttaaacacatttatttggataaaagtgaaaa--ggcatattcaatgttcatttaagacttatgaacaattgaagtacaa 241992  T
Q  842 aacgttaggaatattccattaagaatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcataaatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaat 941  Q
    ||| ||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||| | ||  || ||||||||  |||| | ||||||||||| ||||||||| || || || |    
T  241991 aacattaggaatatttctctaagaatatcatcctagatgttatacacactacacttcattgatgtattactattaggatctgattacatcaaatagaagt 241892  T
Q  942 cttacaaatcattctaagtgaaacaaa 968  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||    
T  241891 cttacaaatcatcctaagtgaaacaaa 241865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 409 - 535
Target Start/End: Original strand, 132327 - 132453
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    || ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  132327 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 132426  T
Q  509 tgcgtgattaactaagataggaacaag 535  Q
    || ||| || ||||||| |||||||||    
T  132427 tgagtgttttactaagacaggaacaag 132453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 419 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 242404 - 242298
Alignment:
Q  419 aaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctcttgcgtgatta 518  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||| ||| | ||||||||| ||||| ||||| ||| |||    
T  242404 aaatccctaattaattttaaggataacaaaccttgataattaaaggattattgggctttgattagtttctaggtatttaatttgtgttcttgggtgttta 242305  T
Q  519 actaaga 525  Q
    |||||||    
T  242304 actaaga 242298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0048 (Bit Score: 78; Significance: 9e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0048
Description:

Target: scaffold0048; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 406 - 535
Target Start/End: Original strand, 87296 - 87425
Alignment:
Q  406 aattgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgc 505  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  87296 aattgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaaccaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgc 87395  T
Q  506 tcttgcgtgattaactaagataggaacaag 535  Q
    ||||| ||| || ||||||| |||||||||    
T  87396 tcttgagtgttttactaagacaggaacaag 87425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 76; Significance: 1e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 407 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 112530 - 112363
Alignment:
Q  407 attgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgct 506  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  112530 attgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgct 112431  T
Q  507 cttgcgtg-attaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    |||| |||  || ||||||| |||||||||  |  | |||||||||||| || | |||||||||||||    
T  112430 cttgagtgttttcactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggacat 112363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 407 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 103274 - 103171
Alignment:
Q  407 attgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgct 506  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  103274 attgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgct 103175  T
Q  507 cttg 510  Q
    ||||    
T  103174 cttg 103171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 76; Significance: 1e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 411 - 573
Target Start/End: Original strand, 13154 - 13316
Alignment:
Q  411 ttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctcttg 510  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13154 ttgaggcaaaatccttaattaattttaaagataataaaacttgatgattaaggaatcaatggactttgattaatttcttggtatttaacttgtgctcttg 13253  T
Q  511 cgtgattaactaagataggaacaa-gtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
      || || ||||||| | ||| || || |||| |||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  13254 aatgttttactaagacatgaaaaatgtttaaa-tcattccaagatacaagaaatcaaaggacat 13316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 904 - 981
Target Start/End: Original strand, 13645 - 13722
Alignment:
Q  904 tgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| || |  || ||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||    
T  13645 tgtttcactattacgatttgattacatcaaatggaagtcttacaaatcatcctaagagaaacaaaaggaccattctga 13722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277 (Bit Score: 75; Significance: 5e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0277
Description:

Target: scaffold0277; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 407 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 20111 - 19946
Alignment:
Q  407 attgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgct 506  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    || ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||    
T  20111 attgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacctgtgct 20012  T
Q  507 cttgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    |||| |||||| ||||||| |||||||||  | |||| |||||||||  |||  |||||||||||||    
T  20011 cttgagtgatttactaagacaggaacaaggtttaatt-ataccaagaatcaagaaatcaaaggacat 19946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 864 - 981
Target Start/End: Complemental strand, 19660 - 19543
Alignment:
Q  864 gaatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcataaatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaa 963  Q
    |||| |||||||||||||| |   | |||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||| |||||||||    
T  19660 gaatatcatcctagatgttattattactgctcttcatcattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcctaagtgaa 19561  T
Q  964 acaaaagaaacattctga 981  Q
    ||| | | ||||||||||    
T  19560 acagatggaacattctga 19543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 74; Significance: 2e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 409 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 199415 - 199250
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  199415 tgttgaagcaaagtcccaaatttattttaaagataataaaccttaatgataaagaaattaatggactttgattaatgtcttggtatttaacttgttctct 199316  T
Q  509 tgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcatacc-aagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    || ||| |||||||||| |||||||||  |||| |  |||| |||||||||  |||||||||||||    
T  199315 tgagtgtttaactaagacaggaacaaggttaaaatattaccaaagatacaagaaatcaaaggacat 199250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 809 - 968
Target Start/End: Complemental strand, 199024 - 198873
Alignment:
Q  809 gttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaagaatgtcatcctagatgttttccatg-ctgcacttcataaatgtt 907  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||       || |||||||||| ||||||| ||||||||||||||  | ||  ||||||||||   |||||    
T  199024 gttcatttaagactatgaaca-ttgaagtac-------tatgaatattccaataagaatatcatcctagatgttg-caatcactgcacttcagttatgtt 198934  T
Q  908 t-cactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaa 968  Q
    | ||||||||||||| | |||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  198933 ttcactattaggatt-gtttacatcaaatacaagtcttacaaatcatcctaagtgaaacaaa 198873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0553 (Bit Score: 73; Significance: 8e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0553
Description:

Target: scaffold0553; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 407 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 1606 - 1438
Alignment:
Q  407 attgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgct 506  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  1606 attgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgct 1507  T
Q  507 cttgcgtg-attaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagataca-aagaatcaaaggacat 573  Q
    |||| |||  || ||||||| |||||||||  |  | |||||||||||| || || |||||||||||||    
T  1506 cttgagtgttttcactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaaatcaaaggacat 1438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 73; Significance: 8e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 409 - 573
Target Start/End: Original strand, 52300 - 52464
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    || ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  52300 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 52399  T
Q  509 tgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    || ||| || ||||||| |||||||||  |  | |||||||||||  |||  |||||||||||||    
T  52400 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacat 52464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0590 (Bit Score: 71; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0590
Description:

Target: scaffold0590; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 408 - 573
Target Start/End: Original strand, 9604 - 9770
Alignment:
Q  408 ttgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctc 507  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  9604 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattcattggtatttaacttgtgctc 9703  T
Q  508 ttgcgtg-attaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    ||| |||  || ||||||| || ||||||  |  | |||||||||||| || | |||||||||||||    
T  9704 ttgagtgttttcactaagacagaaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggacat 9770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 71; Significance: 1e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 408 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 75453 - 75287
Alignment:
Q  408 ttgttgaggcaaaatccctaattta-ttttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgct 506  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||    || ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  75453 ttgttgaggcaaaatccctaaattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgct 75354  T
Q  507 cttgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    |||| ||| || ||||||| |||||||||  | || |||||||||||  |||  |||||||||||||    
T  75353 cttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacat 75287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 895 - 966
Target Start/End: Complemental strand, 74971 - 74900
Alignment:
Q  895 cttcataaatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaaca 966  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||| ||||||||||||    
T  74971 cttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaaca 74900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 71; Significance: 1e-31; HSPs: 3)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 407 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 310754 - 310589
Alignment:
Q  407 attgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgct 506  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  310754 attgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaaccaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgct 310655  T
Q  507 cttgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    |||| ||| || ||||| | |||||||||  |  | |||||||||||  |||  |||||||||||||    
T  310654 cttgagtgttttactaa-acaggaacaaggtttgaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacat 310589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 409 - 510
Target Start/End: Original strand, 215950 - 216051
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  215950 tgttgaggcaaaattcctaattaattttaaagataatacaccttaatgattaaggaattaatgaactttgattaattcctaggtatttaacttgtgctct 216049  T
Q  509 tg 510  Q
    ||    
T  216050 tg 216051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 890 - 981
Target Start/End: Complemental strand, 310277 - 310186
Alignment:
Q  890 ctgcacttcataaatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    |||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||    
T  310277 ctgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctga 310186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065 (Bit Score: 70; Significance: 5e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0065
Description:

Target: scaffold0065; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 409 - 534
Target Start/End: Original strand, 15183 - 15308
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||   || ||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  15183 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaaccaatatgattaaagaattaatagactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 15282  T
Q  509 tgcgtgattaactaagataggaacaa 534  Q
    || ||| || ||||||| ||||||||    
T  15283 tgagtgttttactaagacaggaacaa 15308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 890 - 981
Target Start/End: Original strand, 15658 - 15749
Alignment:
Q  890 ctgcacttcataaatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    |||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||    
T  15658 ctgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaacaaatggaacattctga 15749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 70; Significance: 5e-31; HSPs: 4)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 409 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 57911 - 57746
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  57911 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattcattggtatttaacttgtgctct 57812  T
Q  509 tgcgtg-attaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    |  |||  || |||||||||||||||||  |  | |||||||||||| || | || ||||||||||    
T  57811 taagtgtttttactaagataggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaagcaaaggacat 57746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 409 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 59029 - 58864
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  59029 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattcattggtatttaacttgtgctct 58930  T
Q  509 tgcgtg-attaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    || |||  || ||||||| || ||||||  |  | |||||||||||| || | |||||||||||||    
T  58929 tgagtgtttttactaagacagaaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggacat 58864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #3
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 409 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 67272 - 67107
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  67272 tgttgatgcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 67173  T
Q  509 tgcgtg-attaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    || |||  || ||||||| | |||||||  |  | |||||||||||| || | |||||||||||||    
T  67172 tgagtgttttcactaagacatgaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggacat 67107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #4
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 407 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 24540 - 24437
Alignment:
Q  407 attgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgct 506  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |    
T  24540 attgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtggt 24441  T
Q  507 cttg 510  Q
    ||||    
T  24440 cttg 24437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 69; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 409 - 573
Target Start/End: Original strand, 12709 - 12873
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||   || ||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||    
T  12709 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaaccaatatgattaaagaattaatggactttgattaaatcattggtatttaaattgtgctct 12808  T
Q  509 tgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    || ||| || ||||||| |||||||||  |  | |||||||||||  |||  |||||||||||||    
T  12809 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacat 12873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0291 (Bit Score: 69; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0291
Description:

Target: scaffold0291; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 408 - 535
Target Start/End: Original strand, 22117 - 22245
Alignment:
Q  408 ttgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctc 507  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  22117 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaaccaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 22216  T
Q  508 ttgcgtg-attaactaagataggaacaag 535  Q
    ||| |||  || ||||||| |||||||||    
T  22217 ttgagtgttttcactaagacaggaacaag 22245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0265 (Bit Score: 68; Significance: 8e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0265
Description:

Target: scaffold0265; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 409 - 572
Target Start/End: Original strand, 10623 - 10786
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  | || |||||||| | |||||  |||||||||||    |||||||||||||||||||    
T  10623 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactataatgattaaggactaaatgggttttgattaattccccggtatttaacttgtgctct 10722  T
Q  509 tgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggaca 572  Q
    || ||| || ||||||| |||||||||  | || ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  10723 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagatacaagaaatcaaaggaca 10786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 68; Significance: 8e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 407 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 8814 - 8647
Alignment:
Q  407 attgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgct 506  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||   || ||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  8814 attgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaaccaatatgattaaagaattaatggactttgattaatcccttggtatttaacttgtgct 8715  T
Q  507 cttgcgtg-attaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    |||| |||  || ||||||| |||| ||||  |  | |||||||||||| || | |||||||||||||    
T  8714 cttgagtgttttcactaagacaggatcaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggacat 8647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 803 - 981
Target Start/End: Complemental strand, 8181 - 8010
Alignment:
Q  803 ttcaatgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaag-aatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcata 901  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||       |||||||||| ||  ||| ||| |||||||||||||| ||    |||| ||||||     
T  8181 ttcaatgttcatttaagactatgaaca-ttgatgtac-------taggaatatttcacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcatt 8090  T
Q  902 aatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||    
T  8089 attgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctga 8010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 67; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 408 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 33605 - 33439
Alignment:
Q  408 ttgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctc 507  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||   || || |||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  33605 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataatttttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 33506  T
Q  508 ttgcgtg-attaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    ||| |||  || ||||||| |||||||||  |  | |||||||||||| || | |||||||||||||    
T  33505 ttgagtgttttcactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggacat 33439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0690 (Bit Score: 65; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0690
Description:

Target: scaffold0690; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 407 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 4947 - 4780
Alignment:
Q  407 attgttgaggcaaaatccctaattta-ttttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgc 505  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||   || ||||  ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  4947 attgttgaggcaaaatccctaaattaattttaaagataataaaccaatatgattagagaattaatggattttgattaattccttggtatttaacttgtgc 4848  T
Q  506 tcttgcgtgattaactaagataggaac-aagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    ||||| ||| || ||||||| |||||| |||| |||| |||||||||||  |||  |||||||||||||    
T  4847 tcttgagtgttttactaagacaggaacaaagtttaaa-tcataccaagaatcaagaaatcaaaggacat 4780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0611 (Bit Score: 65; Significance: 5e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0611
Description:

Target: scaffold0611; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 407 - 573
Target Start/End: Original strand, 7702 - 7869
Alignment:
Q  407 attgttgaggcaaaatccctaatttat-tttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgc 505  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  7702 attgttgaggcaaaatccctaaattaaatttaaagataataaaccaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgc 7801  T
Q  506 tcttgcgtgattaactaagataggaac-aagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    ||||| ||| || | ||||| |||||| |||| |||| |||||||||||  |||  |||||||||||||    
T  7802 tcttgagtgttttaataagacaggaacaaagtttaaa-tcataccaagaatcaagaaatcaaaggacat 7869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0611; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 890 - 981
Target Start/End: Original strand, 8180 - 8271
Alignment:
Q  890 ctgcacttcataaatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||    
T  8180 ctgctcttcataattgtttcactattaggatttgattacatcaaatggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctga 8271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 65; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 409 - 509
Target Start/End: Original strand, 18069 - 18169
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  18069 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattcattggtatttaacttgtgctct 18168  T
Q  509 t 509  Q
    |    
T  18169 t 18169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 65; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 409 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 396716 - 396616
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  396716 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 396617  T
Q  509 t 509  Q
    |    
T  396616 t 396616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 64; Significance: 2e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 407 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 93589 - 93422
Alignment:
Q  407 attgttgaggcaaaatccctaattt-attttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgc 505  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||   || ||||  |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  93589 attgttgaggcaaaatccctaaattcattttaaagataataaaccaatatgattagagaattaatggacttcgattaattccttggtatttaacttgtgc 93490  T
Q  506 tcttgcgtgattaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    ||||| ||| || ||||| | |||||||||  | || |||||||||||  |||  |||||||||||||    
T  93489 tcttgagtgttttactaaaacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacat 93422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 890 - 981
Target Start/End: Complemental strand, 93111 - 93020
Alignment:
Q  890 ctgcacttcataaatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    |||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || ||  | ||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||    
T  93111 ctgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatagtagtcttacaaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctga 93020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0809 (Bit Score: 62; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0809
Description:

Target: scaffold0809; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 411 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 416 - 291
Alignment:
Q  411 ttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctcttg 510  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  416 ttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaatttgtgctcttg 317  T
Q  511 cgtg-attaactaagataggaacaag 535  Q
     |||  || ||||||| |||||||||    
T  316 agtgttttcactaagacaggaacaag 291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0303 (Bit Score: 62; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0303
Description:

Target: scaffold0303; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 409 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 12621 - 12456
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 508  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  12621 tgttgaggcaaaatccctaattaattttgaatataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 12522  T
Q  509 tgcgtg-attaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    || |||  || ||||||| |||||||||  |  | ||||||||||||  | | |||||||||||||    
T  12521 tgagtgttttgactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatggataaaatcaaaggacat 12456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 60; Significance: 5e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 411 - 573
Target Start/End: Original strand, 53957 - 54120
Alignment:
Q  411 ttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctcttg 510  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| |  || |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||    
T  53957 ttgaggcaaaatcactaattaattttaaagataataaacttaaatgattaaggacttaatggactttgattattttcttggtatttaacttgtactattg 54056  T
Q  511 cgtg-attaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
     |||  || ||||||| |||||||||  | || ||  ||||||||||||  |||||||||||||    
T  54057 agtgtttttactaagacaggaacaaggtttaaatctcaccaagatacaagaaatcaaaggacat 54120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 411 - 573
Target Start/End: Original strand, 57909 - 58072
Alignment:
Q  411 ttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctcttg 510  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| |  || |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||    
T  57909 ttgaggcaaaatcactaattaattttaaagataataaacttaaatgattaaggacttaatggactttgattattttcttggtatttaacttgtactattg 58008  T
Q  511 cgtg-attaactaagataggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
     |||  || ||||||| |||||||||  | || ||  ||||||||||||  |||||||||||||    
T  58009 agtgtttttactaagacaggaacaaggtttaaatctcaccaagatacaagaaatcaaaggacat 58072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 59; Significance: 2e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 413 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 23041 - 22919
Alignment:
Q  413 gaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctcttgcg 512  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |   || ||||  |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |    
T  23041 gaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaaacaatatgattatagaattaatggacattgattaattccttggtatttaacttgtgctcttgag 22942  T
Q  513 tgattaactaagataggaacaag 535  Q
    || || ||||||| |||||||||    
T  22941 tgttttactaagacaggaacaag 22919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 890 - 981
Target Start/End: Complemental strand, 21414 - 21323
Alignment:
Q  890 ctgcacttcataaatgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    |||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||   | ||||||||||||| | || ||||||| | | ||||||||||    
T  21414 ctgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaattggtattcttacaaatcatcccaaatgaaacagatggaacattctga 21323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1411 (Bit Score: 56; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold1411
Description:

Target: scaffold1411; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 407 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 376 - 273
Alignment:
Q  407 attgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgct 506  Q
    ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | |||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  376 attgttgaggttaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggattttgattaattccttggtatttaacttgtgct 277  T
Q  507 cttg 510  Q
    ||||    
T  276 cttg 273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 53; Significance: 7e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 409 - 535
Target Start/End: Original strand, 22694 - 22822
Alignment:
Q  409 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttga-taattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctc 507  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| || | | |||||| | | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  22694 tgttgaggcaaaattcctaattaattttaaagataataaactttaaatgattaagcattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 22793  T
Q  508 ttgcgtg-attaactaagataggaacaag 535  Q
    ||| |||  || ||||||| |||||||||    
T  22794 ttgagtgtttttactaagacaggaacaag 22822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1705 (Bit Score: 48; Significance: 7e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold1705
Description:

Target: scaffold1705; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 439 - 573
Target Start/End: Original strand, 1 - 136
Alignment:
Q  439 agataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctcttgcgtg-attaactaagataggaacaagtg 537  Q
    |||||| |||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||  || ||||||| |||||||||      
T  1 agataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctcttgagtgctttcactaagacaggaacaaggt 100  T
Q  538 taaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 573  Q
    |  | |||||||||||| || | |||||||||||||    
T  101 ttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggacat 136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 47; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 407 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 14025 - 13951
Alignment:
Q  407 attgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgataattaaggaattaatggactttgatt 481  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| | ||||||||||||||    
T  14025 attgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgatt 13951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 904 - 981
Target Start/End: Complemental strand, 17531 - 17454
Alignment:
Q  904 tgtttcactattaggatttgattacattaattacaaatcttacaaatcattctaagtgaaacaaaagaaacattctga 981  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |   | ||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||    
T  17531 tgtttcactattaggatttgattacattaaatggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctga 17454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0756 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0756
Description:

Target: scaffold0756; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 408 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 4055 - 4014
Alignment:
Q  408 ttgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaac 449  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  4055 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaac 4014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 31; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 803 - 900
Target Start/End: Complemental strand, 28727 - 28630
Alignment:
Q  803 ttcaatgttcatttaagact-atgaacaattgaagtacaaaacgttaggaatattccattaagaatgtcatcctagatgttttccatgctgcacttcat 900  Q
    |||| |||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||||||||    |||||| |||| ||||||||| | |||| ||||||||||    
T  28727 ttcattgttcattaaagacttatgaacaaatgaagtac-aaacattaggaatattcatcaaagaatttcattctagatgttatacatgttgcacttcat 28630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0406 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0406
Description:

Target: scaffold0406; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 752 - 839
Target Start/End: Original strand, 15062 - 15146
Alignment:
Q  752 gatcaatcaaggaataaaagcatttatttgattaaagtcaaaaagggcatcttcaatgttcatttaagactatgaacaattgaagtac 839  Q
    ||||||||||| ||||||  ||||||   || ||| |||||||||   |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  15062 gatcaatcaagaaataaagacatttacaagactaatgtcaaaaag---atcttcaaggttcattcaagactatgaacacttgaagtac 15146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University