View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5907_low_2 (Length: 858)

Name: NF5907_low_2
Description: NF5907
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5907_low_2
NF5907_low_2
[»] chr4 (7 HSPs)
chr4 (18-846)||(26191861-26192689)
chr4 (68-835)||(26179595-26180361)
chr4 (83-835)||(26161798-26162548)
chr4 (49-304)||(26176214-26176469)
chr4 (300-522)||(26175213-26175435)
chr4 (109-683)||(25928965-25929539)
chr4 (86-754)||(25648361-25649029)
[»] chr6 (1 HSPs)
chr6 (115-674)||(32189237-32189799)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 752; Significance: 0; HSPs: 7)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 752; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 846
Target Start/End: Complemental strand, 26192689 - 26191861
Alignment:
Q  18 aatatgtcattgatccaaaaggcctcccatctaccaactccgtagaagatctcccaattcctaatttggatcatacagaagctttcaagacaggatattt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26192689 aatatgtcattgatccaaaaggcctcccatctaccaactccgtagaagatctcccaattcctaacttggatcatacagaagctttcaagacaggatattt 26192590  T
Q  118 cagtttggatgatcttcacattggaaatgtaatgaccctccaatttccggtccaagaagtttctccttacctctcnnnnnnngaggccgactccattcct 217  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||       ||||||||||||||||||    
T  26192589 cagttttgatgatcttcacgttggaaatgtaatgaccctccaatttccggtccaagaagtttctccatacctctcaaaaaaagaggccgactccattcct 26192490  T
Q  218 ttctcgatgtcacaactcccaagtattcttcaactcttttcaatccctgaagcatctcctcaagccaaatccatgagaggagcacttgaagagtgcgaag 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26192489 ttctcgatgtcacaactcccaagtattcttcaactcttttcaatccctgaagaatctcctcaagccaaatccatgagaggagcacttgaagagtgcgaag 26192390  T
Q  318 gggaaaccgttacaggggagacaaaaatctgtgccaattctctagagtccatgctcgaatttgttgacacaattattggttcaaacgtcaaatatagtat 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26192389 gggaaaccgttacaggggagacaaaaatctgtgccaattctctagagtccatgctcgaatttgttgacacaattattggttcaaacgtcaaatatagtat 26192290  T
Q  418 tctaaccacgagcaacccctcacccagaactacccctctacaaaagtacaccgttttagaagtatcacatgatattgatgttcccaaatgggtagcttgt 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26192289 tctaaccacgagcaacccctcacccagaactacccctctacaaaagtacactgttttagaagtatcacatgatattgatgttcccaaatgggtagcttgt 26192190  T
Q  518 catcccctcccatatccatatgccatttactattgccattacattgccacaaagattaaagtgttcaaagtctcacttgttagtgatcagaatggagata 617  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26192189 catccccttccatatccatatgccatttactattgccattacattgccacaaagactaaagtgttcaaggtctcacttgttagtgatgagaatggagata 26192090  T
Q  618 aaatagaagctcttggagtttgccattttgatacatctgaatggaaccctaatcatattatattcaaacaacttgggattaaggctgggaggaattctcc 717  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26192089 aaatggaagctcttggagtttgccattttgatacatctgaatggaaccctaatcatattatattcaaacaacttgggattaaggctgggaagaattctcc 26191990  T
Q  718 agtgtgtcactttttccctgtgaaccatcttatgtggatcccaatgtagccatcccaaagccactatgtgaaatgagtttgtctatctagatttgtataa 817  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26191989 agtgtgtcactttttccctgtgaaccatcttatgtggattccaatctagccatcccaaagccactatgtgaaatgagtttgtctatctagatttgtataa 26191890  T
Q  818 taaaggttttatcaatcttaccaatgatg 846  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26191889 taaaggttttatcaatcttaccaatgatg 26191861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 68 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 26180361 - 26179595
Alignment:
Q  68 ctcccaat-tcctaatttggatcatacagaagctttcaagacaggatatttcagtttggatgatcttcacattggaaatgtaatgaccctccaatttccg 166  Q
    |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||     
T  26180361 ctcccaatctcctaacttggatcgtacagaagctttcaaggtaggatttttcaatttggatgatctttatgttggaaatgtaatgacccttcaatttccc 26180262  T
Q  167 gtccaagaagtttctccttacctctcnnnnnnngaggccgactccattcctttctcgatgtcacaactcccaagtattcttcaactcttttcaatccctg 266  Q
    |||||||  ||||||||||  |||||       ||||| |||||||||||| |  | ||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  26180261 gtccaagtggtttctccttttctctcaaaaaaagaggctgactccattcctcttgcaatgtcacaacttccaagtgttcttcaactcttatcaatccctg 26180162  T
Q  267 aagcatctcctcaagccaaatccatgagaggagcacttgaagagtgcgaaggggaaaccgttacaggggagacaaaaatctgtgccaattctctagagtc 366  Q
    |||  ||||||||||| |||||||||| |    |||||| |||||| |||  ||||||| |||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||    
T  26180161 aagattctcctcaagctaaatccatgataaattcacttggagagtgtgaatcggaaaccattacaggggagacaaagacttgtgccaactctctagagtc 26180062  T
Q  367 catgctcgaatttgttgacacaattattggttcaaacgtcaaatatagtattctaaccacgagcaacccctcacccagaactacccctctacaaaagtac 466  Q
    |||||||||||||||| |||| ||  |||||||| | | ||||  ||||||||||||||| | ||| |||||||| | | ||  |||| |||| ||||||    
T  26180061 catgctcgaatttgttaacacgatctttggttcagatgccaaaattagtattctaaccaccaacaaaccctcaccgacagctgtccctttacagaagtac 26179962  T
Q  467 accgttttagaagtatcacatgatattgatgttcccaaatgggtagcttgtcatcccctcccatatccatatgccatttactattgccattacattgcca 566  Q
    ||| |||| |||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |    
T  26179961 accattttggaagtatcccatgatattgatgctccaaaatgggtagcttgtcatcccctctcatatccatatgccatttacttttgtcattacatagcta 26179862  T
Q  567 caaagattaaagtgttcaaagtctcacttgttagtgatcagaatggagataaaatagaagctcttggagtttgccattttgatacatctgaatggaaccc 666  Q
    ||  || || ||||||||| ||||| |||||  ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  26179861 cagggactagagtgttcaaggtctcgcttgtcggtgatgagaatggagataaaatggaagctgttggaatttgccatttggacacatctgattggaaccc 26179762  T
Q  667 taatcatattatattcaaacaacttgggattaaggctgggaggaattctccagtgtgtcactttttccctgtgaaccatcttatgtggatcccaatgtag 766  Q
      ||||||| ||||| |  || ||| | |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| | |||||| |     
T  26179761 agatcatataatatttaggcagcttagcattaaggccgggaagaactctccagtgtgtcacttcttacctgtgaaccatcttctgtgggttccaatgcaa 26179662  T
Q  767 ccatcccaaagccactatgtgaaatgagtttgtctatctagatttgtataataaaggttttatcaatct 835  Q
    || | | |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  26179661 cc-ttcaaaagccaccatgtgaagtgagttggtctatctagacttgtataataaagg-tttatcaatct 26179595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 83 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 26162548 - 26161798
Alignment:
Q  83 ttggatcatacagaagctttcaagacaggatatttcagtttggatgatcttcacattggaaatgtaatgaccctccaatttccggtccaagaagtttctc 182  Q
    |||||||  |||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||  |||| |    
T  26162548 ttggatcgcacagaagctttcaaggtaggatttttcaatttggatgatctttatgttggaaatgtaatgacccttcaatttcccatccaagagatttcac 26162449  T
Q  183 cttacctctcnnnnnnngaggccgactccattcctttctcgatgtcacaactcccaagtattcttcaactcttttcaatccctgaagcatctcctcaagc 282  Q
     || ||||||       ||||| ||||| |||||| || | |||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||  |||||||||||    
T  26162448 gtttcctctcaaaaaaagaggctgactcaattcctctcgcaatgtcacaactcccaagtgtttttcaacttttctcaatccctgaagattctcctcaagc 26162349  T
Q  283 caaatccatgagaggagcacttgaagagtgcgaaggggaaaccgttacaggggagacaaaaatctgtgccaattctctagagtccatgctcgaatttgtt 382  Q
     |||||||||  |||| |||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||| |  ||||  || || ||||||||||||||||||||||||    
T  26162348 taaatccatgttaggatcacttgaacagtgtgaagcggaaaccattacaggggagacaaagacttgtgtaaactccctagagtccatgctcgaatttgtt 26162249  T
Q  383 gacacaattattggttcaaacgtcaaatatagtattctaaccacgagcaacccctcacccagaactacccctctacaaaagtacaccgttttagaagtat 482  Q
    ||||| || ||||||||| |||  ||| ||| |||||| || || | ||| |||||| | | | | | |||| |||| || |||||| |||| |||||||    
T  26162248 gacacgatcattggttcatacgcgaaacataatattctcactaccaccaaaccctcatcgacagccatccctttacagaattacaccattttggaagtat 26162149  T
Q  483 cacatgatattgatgttcccaaatgggtagcttgtcatcccctcccatatccatatgccatttactattgccattacattgccacaaagattaaagtgtt 582  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||  || || ||||||    
T  26162148 cacatgatattgatgctcccaaatgggtagcttgtcatcccctctcatatccatatgccatttacttttgtcattacatagctacagggactagagtgtt 26162049  T
Q  583 caaagtctcacttgttagtgatcagaatggagataaaatagaagctcttggagtttgccattttgatacatctgaatggaaccctaatcatattatattc 682  Q
    ||| |||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||| | ||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||||  |||||||| ||||     
T  26162048 caaggtctcacttgttggtgatgcgaatggagataaaatggaagttgttggaatttgtcatttggacacatctgattggaacccagatcatattgtattt 26161949  T
Q  683 aaacaacttgggattaaggctgggaggaattctccagtgtgtcactttttccctgtgaaccatcttatgtggatcccaatgtagccatcccaaagccact 782  Q
    |  || ||| || |||  ||||||| ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||| |||| | | ||||||||     
T  26161948 aggcagcttagggttaccgctgggaagaactctccaatgtgtcacttcttacctgtgaaccatcttatgtgggttccaatgcagcc-ttcaaaagccacc 26161850  T
Q  783 atgtgaaatgagtttgtctatctagatttgtataataaaggttttatcaatct 835  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||    
T  26161849 atgtgaagtgagttggtctatctaaacttgtataataaagg-tttatcaatct 26161798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 49 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 26176469 - 26176214
Alignment:
Q  49 taccaactccgtagaagatctcccaattcctaatttggatcatacagaagctttcaagacaggatatttcagtttggatgatcttcacattggaaatgta 148  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26176469 taccaactccgcagaagatctcccaattcctaacttggatcatacagaagctttcaagacaggatattttagtttggatgatcttcacgttggaaatgta 26176370  T
Q  149 atgaccctccaatttccggtccaagaagtttctccttacctctcnnnnnnngaggccgactccattcctttctcgatgtcacaactcccaagtattcttc 248  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26176369 atgaccttccaatttccggtccaagaagtttctccttacctctcaaaaaaagaggccaactccattcctttctcgatgtcacaactcccaagtattcttc 26176270  T
Q  249 aactcttttcaatccctgaagcatctcctcaagccaaatccatgagaggagcactt 304  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  26176269 aactcttttcaatccctaaagaatctcttcaaaccaaatccatgagaggagcactt 26176214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 300 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 26175435 - 26175213
Alignment:
Q  300 cacttgaagagtgcgaaggggaaaccgttacaggggagacaaaaatctgtgccaattctctagagtccatgctcgaatttgttgacacaattattggttc 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||     
T  26175435 cacttgaagagtgcgaaggggaaaccgttacaggggagacaaagatctgtgccaattcttaagagcccatgcttgaatttgttgacacaattattagttt 26175336  T
Q  400 aaacgtcaaatatagtattctaaccacgagcaacccctcacccagaactacccctctacaaaagtacaccgttttagaagtatcacatgatattgatgtt 499  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26175335 aaacgtcaaatatagtattctgaccaccagcaacccctcaaccagaactatccctctacaaaagtacaccattttagaagtatcacatgatattgatgtt 26175236  T
Q  500 cccaaatgggtagcttgtcatcc 522  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  26175235 ccctaatgggtagcttgtcatcc 26175213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 109 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 25929539 - 25928965
Alignment:
Q  109 aggatatttcagtttggatgatcttcacattggaaatgtaatgaccctccaatttccggtccaagaagtttctccttacctctcnnnnnnngaggccgac 208  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||  || ||| ||       ||||| |||    
T  25929539 aggatttttcaatttggatgatcttcatgttggaaatgtaatgaccctccaatttccaatccaagagatttctaatttcctttcgagaaaagaggctgac 25929440  T
Q  209 tccattcctttctcgatgtcacaactcccaagtattcttcaactcttttcaatccctgaagcatctcctcaagccaaatccatgagaggagcacttgaag 308  Q
    || |||||| |||| || ||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||| ||||  ||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||      
T  25929439 tcaattcctctctcaatttcacaactcccaagtgttctcgaactcctttcaatccccgaagactctcctcaagcaaaatcaatgagagaaacacttgagc 25929340  T
Q  309 agtgcgaaggggaaaccgttacaggggagacaaaaatctgtgccaattctctagagtccatgctcgaatttgttgacacaattattggttcaaacgtcaa 408  Q
    | ||  |||  ||| |||| ||||||||| | || | ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||  ||  |||    
T  25929339 aatgtcaagcagaacccgtcacaggggagtccaagacctgtgccaactctatagagtccatgcttgaatttgttgacaaaataattggttccgactccaa 25929240  T
Q  409 atatagtattctaaccacgagcaacccctcacccagaactacccctctacaaaagtacaccgttttagaagtatcacatgatattgatgttcccaaatgg 508  Q
      ||| | |||| || || | | |||||||||||    ||| |||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||| ||| |||  |||||||||||||    
T  25929239 gcataatgttcttactaccacccacccctcaccctcggctatccctctccaaaaatacaccattttaaaagtatcacgtgacattagtgttcccaaatgg 25929140  T
Q  509 gtagcttgtcatcccctcccatatccatatgccatttactattgccattacattgccacaaagattaaagtgttcaaagtctcacttgttagtgatcaga 608  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||   | ||  |||||||| |||||| | ||| |||||  ||    
T  25929139 gtatcttgccatcccctcccatatccatatgccatttactattgtcattacatagctacaggaactagggtgttcaaggtctcattggttggtgatgtga 25929040  T
Q  609 atggagataaaatagaagctcttggagtttgccattttgatacatctgaatggaaccctaatcatattatattca 683  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| | |||||||| ||||||||||| ||||| ||  ||||||| |||||||    
T  25929039 atggagataaaatagaagctgtaggaatgtgccatttggatacatctgattggaatccagatcatataatattca 25928965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 86 - 754
Target Start/End: Original strand, 25648361 - 25649029
Alignment:
Q  86 gatcatacagaagctttcaagacaggatatttcagtttggatgatcttcacattggaaatgtaatgaccctccaatttccggtccaagaagtttctcctt 185  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||| | |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||  |    
T  25648361 gatcacacagaagctttcaagttaggctttttcggtttggatgatcttcatgttggaaatgtaatggccctccaatttccggtccaaaaagttcctcaat 25648460  T
Q  186 acctctcnnnnnnngaggccgactccattcctttctcgatgtcacaactcccaagtattcttcaactcttttcaatccctgaagcatctcctcaagccaa 285  Q
     ||| ||       |||||  |||| |||||||||||  | ||| ||||| ||||  |||| || ||||| ||||||||| |||  ||||| ||||||||    
T  25648461 tcctttcgaaaaaggaggctaactcaattcctttctcactctcataactcacaagggttctacatctcttgtcaatccctcaagattctccacaagccaa 25648560  T
Q  286 atccatgagaggagcacttgaagagtgcgaaggggaaaccgttacaggggagacaaaaatctgtgccaattctctagagtccatgctcgaatttgttgac 385  Q
    ||| ||||||  | |||||||| | || ||||  || |  || | ||||||||| |  || |||| ||| ||  ||||||| |||||  |||||||||||    
T  25648561 atctatgagaaaaacacttgaacattgtgaagctgacagagtcagaggggagaccaggatgtgtgtcaactccgtagagtctatgcttaaatttgttgac 25648660  T
Q  386 acaattattggttcaaacgtcaaatatagtattctaaccacgagcaacccctcacccagaactacccctctacaaaagtacaccgttttagaagtatcac 485  Q
    ||||| ||||||||| | | |||||||  |||||| || || | |||||| ||||||  | | | ||||||  | || |||||| | || |||||||||     
T  25648661 acaataattggttcagaagccaaatatgatattctcacaaccaacaacccatcaccctcagccatccctctctagaaatacaccatcttggaagtatcag 25648760  T
Q  486 atgatattgatgttcccaaatgggtagcttgtcatcccctcccatatccatatgccatttactattgccattacattgccacaaagattaaagtgttcaa 585  Q
    | |||||| |||   | ||||||||| |||| |||||| | ||||||||||||||  |||||  ||| ||| |||| || |||  || ||||||||||||    
T  25648761 acgatattaatgcatctaaatgggtatcttgccatcccatgccatatccatatgctgtttacggttgtcatcacatagctacagggagtaaagtgttcaa 25648860  T
Q  586 agtctcacttgttagtgatcagaatggagataaaatagaagctcttggagtttgccattttgatacatctgaatggaaccctaatcatattatattcaaa 685  Q
     || ||  | ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | || || || ||||||||||| ||||||||| |||||    |||||||     
T  25648861 ggtatctttggttggtgatgagaatggagataaaatggaagctcttggaatgtgtcacttggatacatctgactggaaccctgatcatgagttattcaag 25648960  T
Q  686 caacttgggattaaggctgggaggaattctccagtgtgtcactttttccctgtgaaccatcttatgtgg 754  Q
      |||  | || ||| |||||| ||||||| ||| ||||||||| || ||||| ||||||||| |||||    
T  25648961 acactaagaatcaagcctgggaagaattcttcagcgtgtcacttctttcctgtaaaccatcttttgtgg 25649029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 116; Significance: 1e-58; HSPs: 1)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 115 - 674
Target Start/End: Original strand, 32189237 - 32189799
Alignment:
Q  115 tttcagtttggatgatcttcacattggaaatgtaatgaccctccaatttccggtccaagaagtttctccttacctctcnnnnnnngaggccgactccatt 214  Q
    ||||| |||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || || ||| || ||| ||       ||||||||||| ||     
T  32189237 tttcaatttgaatgatcttcgtgttggaaatgtaatgaccctccaatttccggttcaaaaaattcctcatttcctttcaaaaaaggaggccgactcaatg 32189336  T
Q  215 cctttctcgatgtcacaactcccaagtattcttcaactcttttcaatccctgaagcatctcctcaagccaaatccatgagaggagcacttgaagagtgcg 314  Q
    ||| ||||  | ||||||||| ||||  |||| || ||||| ||||||||| |||  ||||| ||||||||||  ||||||  | |||||||| |||| |    
T  32189337 cctctctcactctcacaactcacaagagttctacatctcttgtcaatccctcaagattctccacaagccaaatatatgagaaaaacacttgaacagtgtg 32189436  T
Q  315 aaggggaaacc---gttacaggggagacaaaaatctgtgccaattctctagagtccatgctcgaatttgttgacacaattattggttcaaacgtcaaata 411  Q
    ||   |  | |   || | ||||||||| |  || |||| ||| ||| ||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||| | | ||||||    
T  32189437 aaaaagccatcatagtcaaaggggagaccaggatgtgtgtcaactctttagagtccatgcttgaattcgttggcacaataattggttcagaagccaaata 32189536  T
Q  412 tagtattctaaccacgagcaacccctcacccagaactacccctctacaaaagtacaccgttttagaagtatcacatgatattgatgttcccaaatgggta 511  Q
    |  |||||| || || |||||||| ||||||| ||| |||||||| || || |||||| |||| |||||||||| ||| ||| ||| ||| ||||||||     
T  32189537 tgatattctcacaaccagcaacccatcacccacaaccacccctctccagaaatacaccattttggaagtatcacctgacattaatgctccaaaatgggtt 32189636  T
Q  512 gcttgtcatcccctcccatatccatatgccatttactattgccattacattgccacaaagattaaagtgttcaaagtctcacttgttagtgatcagaatg 611  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||| || |||  || |||||||||||| || ||  | ||| || || ||||||    
T  32189637 gcttgccatcccatcccatatccatatgccatttacggttgtcatcacatagctacagggagtaaagtgttcaaggtatctttggttggtaatgagaatg 32189736  T
Q  612 gagataaaatagaagctcttggagtttgccattttgatacatctgaatggaaccctaatcata 674  Q
    |||||||||| |||||||||||| | || ||||| ||||||||||  |||||||| |||||||    
T  32189737 gagataaaatggaagctcttggaatgtgtcatttggatacatctggttggaacccaaatcata 32189799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University