View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5907_low_68 (Length: 245)

Name: NF5907_low_68
Description: NF5907
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5907_low_68
NF5907_low_68
[»] chr6 (35 HSPs)
chr6 (1-230)||(31128838-31129066)
chr6 (1-226)||(34711108-34711333)
chr6 (1-217)||(4187131-4187347)
chr6 (1-229)||(13671363-13671593)
chr6 (1-218)||(4019795-4020011)
chr6 (1-218)||(4026221-4026437)
chr6 (1-218)||(7062076-7062292)
chr6 (1-218)||(7069262-7069478)
chr6 (1-218)||(34655697-34655913)
chr6 (1-217)||(21262135-21262350)
chr6 (1-218)||(31548341-31548557)
chr6 (1-218)||(34649246-34649462)
chr6 (1-218)||(32328053-32328269)
chr6 (1-218)||(1427984-1428199)
chr6 (1-185)||(9864353-9864536)
chr6 (1-217)||(29907305-29907520)
chr6 (1-217)||(1167040-1167255)
chr6 (1-148)||(27670540-27670686)
chr6 (71-218)||(4718101-4718246)
chr6 (83-217)||(30121098-30121231)
chr6 (1-70)||(4738030-4738099)
chr6 (127-218)||(4737939-4738030)
chr6 (27-139)||(11016559-11016670)
chr6 (103-155)||(22870786-22870838)
chr6 (29-154)||(9846995-9847119)
chr6 (103-166)||(14759219-14759282)
chr6 (116-166)||(20382818-20382868)
chr6 (190-229)||(27670683-27670722)
chr6 (1-44)||(30117032-30117075)
chr6 (28-92)||(3539215-3539280)
chr6 (28-92)||(9932734-9932799)
chr6 (28-92)||(26515357-26515422)
chr6 (29-92)||(5988932-5988996)
chr6 (28-92)||(21596457-21596521)
chr6 (29-92)||(34006670-34006734)
[»] chr4 (25 HSPs)
chr4 (1-230)||(37367863-37368091)
chr4 (1-217)||(7780772-7780988)
chr4 (1-229)||(16405792-16406019)
chr4 (1-218)||(13594554-13594770)
chr4 (1-218)||(17457301-17457517)
chr4 (1-218)||(27590751-27590967)
chr4 (1-218)||(8104327-8104543)
chr4 (1-218)||(37355909-37356125)
chr4 (1-217)||(30238675-30238889)
chr4 (1-217)||(55462334-55462548)
chr4 (1-218)||(41373433-41373648)
chr4 (5-217)||(30211096-30211308)
chr4 (1-217)||(36754352-36754567)
chr4 (1-217)||(5660110-5660325)
chr4 (22-155)||(49358939-49359069)
chr4 (1-77)||(16838059-16838135)
chr4 (1-154)||(52182792-52182943)
chr4 (27-154)||(13003431-13003557)
chr4 (27-92)||(21677595-21677661)
chr4 (28-92)||(323606-323671)
chr4 (28-92)||(4839065-4839130)
chr4 (27-92)||(19247756-19247821)
chr4 (27-92)||(52618671-52618736)
chr4 (28-92)||(26069896-26069960)
chr4 (28-92)||(26373559-26373623)
[»] chr7 (38 HSPs)
chr7 (1-230)||(21642964-21643192)
chr7 (1-230)||(14288161-14288389)
chr7 (1-230)||(14299346-14299574)
chr7 (1-230)||(9642464-9642692)
chr7 (1-225)||(22853759-22853982)
chr7 (1-218)||(8142005-8142221)
chr7 (1-217)||(23612835-23613049)
chr7 (1-229)||(39433353-39433580)
chr7 (1-218)||(8184952-8185168)
chr7 (1-218)||(8192512-8192728)
chr7 (1-218)||(48353040-48353256)
chr7 (1-218)||(6020424-6020640)
chr7 (1-217)||(19090254-19090470)
chr7 (1-218)||(48346656-48346872)
chr7 (1-217)||(26602358-26602572)
chr7 (1-217)||(33850204-33850419)
chr7 (1-218)||(1379393-1379608)
chr7 (1-218)||(5049473-5049688)
chr7 (1-218)||(6795884-6796099)
chr7 (1-217)||(3923655-3923869)
chr7 (1-218)||(2447092-2447307)
chr7 (1-217)||(1948195-1948409)
chr7 (1-217)||(15949605-15949818)
chr7 (1-217)||(36875991-36876205)
chr7 (1-217)||(15915084-15915297)
chr7 (1-217)||(45434032-45434246)
chr7 (150-229)||(37026324-37026403)
chr7 (27-154)||(8881037-8881162)
chr7 (1-154)||(10830750-10830900)
chr7 (1-154)||(11024542-11024692)
chr7 (1-154)||(21900814-21900963)
chr7 (28-92)||(10346234-10346299)
chr7 (27-92)||(31878768-31878833)
chr7 (28-92)||(6172684-6172748)
chr7 (29-92)||(8107818-8107882)
chr7 (28-92)||(19472119-19472183)
chr7 (29-125)||(20403700-20403795)
chr7 (28-92)||(31664424-31664488)
[»] chr3 (33 HSPs)
chr3 (1-230)||(6036712-6036940)
chr3 (1-218)||(27501527-27501743)
chr3 (5-217)||(10940865-10941076)
chr3 (1-217)||(23068910-23069124)
chr3 (1-217)||(32746816-32747030)
chr3 (1-218)||(24179520-24179736)
chr3 (1-216)||(43932023-43932237)
chr3 (1-218)||(9570108-9570323)
chr3 (1-218)||(9576610-9576825)
chr3 (1-217)||(4311048-4311262)
chr3 (1-217)||(43995523-43995737)
chr3 (1-217)||(47441247-47441462)
chr3 (4-217)||(20650686-20650898)
chr3 (58-218)||(25893729-25893888)
chr3 (1-128)||(41353963-41354089)
chr3 (22-181)||(2786171-2786328)
chr3 (30-154)||(17735818-17735940)
chr3 (30-154)||(19037087-19037209)
chr3 (1-137)||(4644104-4644238)
chr3 (29-154)||(461055-461178)
chr3 (1-154)||(4591242-4591392)
chr3 (103-166)||(6817173-6817236)
chr3 (28-92)||(9989564-9989628)
chr3 (27-154)||(25692452-25692578)
chr3 (76-154)||(20949814-20949890)
chr3 (56-129)||(24705311-24705382)
chr3 (22-92)||(36469359-36469429)
chr3 (28-92)||(3588568-3588633)
chr3 (28-92)||(8615671-8615736)
chr3 (28-92)||(4742931-4742994)
chr3 (29-92)||(7653152-7653216)
chr3 (28-92)||(37471616-37471680)
chr3 (20-92)||(45527815-45527887)
[»] chr1 (41 HSPs)
chr1 (1-230)||(43687075-43687303)
chr1 (1-229)||(4599975-4600202)
chr1 (1-229)||(9869551-9869778)
chr1 (1-217)||(26621916-26622131)
chr1 (1-218)||(6239101-6239317)
chr1 (1-229)||(44241803-44242028)
chr1 (1-229)||(35085452-35085679)
chr1 (1-217)||(1115543-1115758)
chr1 (41-230)||(29002211-29002399)
chr1 (1-218)||(39052899-39053114)
chr1 (1-218)||(39059271-39059486)
chr1 (2-218)||(45022982-45023197)
chr1 (1-217)||(1175052-1175266)
chr1 (1-217)||(32798170-32798385)
chr1 (1-230)||(28996461-28996683)
chr1 (5-217)||(31072768-31072980)
chr1 (1-217)||(23761898-23762112)
chr1 (1-218)||(45016227-45016442)
chr1 (1-218)||(42092342-42092557)
chr1 (1-217)||(11912823-11913038)
chr1 (1-217)||(44916784-44916999)
chr1 (20-214)||(41305084-41305277)
chr1 (1-83)||(41297963-41298045)
chr1 (27-155)||(31473731-31473857)
chr1 (27-155)||(47647142-47647267)
chr1 (27-154)||(30660312-30660437)
chr1 (29-167)||(13249190-13249325)
chr1 (1-154)||(2824445-2824595)
chr1 (1-154)||(5357372-5357523)
chr1 (3-154)||(13432297-13432447)
chr1 (1-154)||(23251798-23251949)
chr1 (27-154)||(38672402-38672527)
chr1 (1-154)||(28413298-28413448)
chr1 (1-154)||(39806504-39806654)
chr1 (28-92)||(432270-432334)
chr1 (28-92)||(9667625-9667689)
chr1 (28-92)||(12168145-12168210)
chr1 (28-92)||(38121861-38121926)
chr1 (28-92)||(39001110-39001175)
chr1 (29-92)||(33492128-33492192)
chr1 (28-92)||(41000033-41000097)
[»] chr2 (32 HSPs)
chr2 (1-230)||(36781732-36781960)
chr2 (1-218)||(43268305-43268521)
chr2 (1-218)||(34834372-34834588)
chr2 (1-218)||(34840816-34841032)
chr2 (1-218)||(15852996-15853212)
chr2 (1-218)||(45012429-45012645)
chr2 (1-218)||(29485341-29485557)
chr2 (1-218)||(13901516-13901732)
chr2 (1-217)||(2021010-2021224)
chr2 (1-217)||(21067518-21067733)
chr2 (1-185)||(42930965-42931148)
chr2 (1-218)||(2158058-2158273)
chr2 (1-218)||(2164474-2164689)
chr2 (1-218)||(12951242-12951457)
chr2 (1-218)||(21341487-21341702)
chr2 (1-217)||(16816892-16817106)
chr2 (1-217)||(16856049-16856263)
chr2 (1-178)||(21331594-21331770)
chr2 (1-217)||(13163265-13163478)
chr2 (1-155)||(11909575-11909726)
chr2 (1-154)||(37439159-37439309)
chr2 (26-154)||(17863954-17864080)
chr2 (5-155)||(34744913-34745061)
chr2 (1-154)||(36842234-36842385)
chr2 (1-154)||(41456053-41456203)
chr2 (27-134)||(24852672-24852777)
chr2 (28-92)||(29223882-29223947)
chr2 (28-92)||(29337181-29337246)
chr2 (28-92)||(13230271-13230335)
chr2 (134-166)||(22197701-22197733)
chr2 (28-92)||(36040192-36040256)
chr2 (28-92)||(36667798-36667862)
[»] chr5 (40 HSPs)
chr5 (1-229)||(4974009-4974236)
chr5 (1-218)||(2958305-2958521)
chr5 (1-218)||(2966774-2966990)
chr5 (1-218)||(25894209-25894425)
chr5 (1-217)||(40958179-40958393)
chr5 (1-217)||(29414230-29414445)
chr5 (1-218)||(29980905-29981120)
chr5 (1-218)||(34356849-34357064)
chr5 (1-218)||(34358640-34358855)
chr5 (1-217)||(42151265-42151479)
chr5 (1-217)||(22360410-22360624)
chr5 (1-217)||(5876664-5876878)
chr5 (1-217)||(22314276-22314490)
chr5 (1-216)||(2439247-2439461)
chr5 (2-217)||(12505326-12505540)
chr5 (1-117)||(30040905-30041020)
chr5 (112-218)||(29974514-29974619)
chr5 (112-218)||(30022023-30022128)
chr5 (28-155)||(42747558-42747683)
chr5 (27-154)||(34738611-34738736)
chr5 (1-154)||(3412915-3413066)
chr5 (3-154)||(19853153-19853302)
chr5 (103-166)||(37335694-37335757)
chr5 (1-154)||(12918575-12918726)
chr5 (1-154)||(2155745-2155895)
chr5 (117-166)||(17346799-17346848)
chr5 (28-92)||(11766923-11766987)
chr5 (28-92)||(31846148-31846212)
chr5 (28-92)||(33434771-33434835)
chr5 (4-138)||(30579830-30579963)
chr5 (117-165)||(40153906-40153954)
chr5 (28-92)||(11723205-11723270)
chr5 (28-92)||(16904538-16904603)
chr5 (28-92)||(24835903-24835968)
chr5 (27-92)||(27167026-27167091)
chr5 (29-92)||(7315133-7315197)
chr5 (29-92)||(7315372-7315436)
chr5 (29-92)||(9404592-9404656)
chr5 (29-92)||(30607006-30607070)
chr5 (29-92)||(34456465-34456529)
[»] chr8 (27 HSPs)
chr8 (1-218)||(36021359-36021575)
chr8 (1-218)||(36425290-36425506)
chr8 (1-217)||(1238660-1238875)
chr8 (1-218)||(11357753-11357969)
chr8 (1-217)||(16710229-16710444)
chr8 (1-217)||(45067977-45068192)
chr8 (1-218)||(6464137-6464352)
chr8 (1-218)||(7311795-7312010)
chr8 (1-218)||(8012881-8013096)
chr8 (1-218)||(36005043-36005258)
chr8 (1-218)||(36076413-36076628)
chr8 (1-217)||(15012834-15013049)
chr8 (1-184)||(26250186-26250367)
chr8 (27-154)||(29336687-29336812)
chr8 (1-154)||(14394144-14394295)
chr8 (1-139)||(24219912-24220048)
chr8 (1-154)||(7933551-7933701)
chr8 (28-92)||(3298970-3299034)
chr8 (28-92)||(9068096-9068161)
chr8 (28-92)||(11308916-11308981)
chr8 (28-92)||(16580253-16580318)
chr8 (28-92)||(28370261-28370326)
chr8 (28-92)||(4861880-4861944)
chr8 (29-92)||(8743213-8743277)
chr8 (28-92)||(22180770-22180834)
chr8 (28-92)||(34006701-34006765)
chr8 (29-92)||(41577261-41577325)
[»] scaffold0343 (1 HSPs)
scaffold0343 (1-229)||(3091-3318)
[»] scaffold0510 (1 HSPs)
scaffold0510 (1-214)||(8445-8657)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (1-218)||(50136-50351)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (1-218)||(4566-4781)
[»] scaffold0936 (1 HSPs)
scaffold0936 (1-217)||(2823-3040)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (5-217)||(15621-15832)
[»] scaffold0513 (1 HSPs)
scaffold0513 (33-217)||(11694-11877)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (28-92)||(8910-8975)
[»] scaffold0298 (2 HSPs)
scaffold0298 (27-92)||(12132-12197)
scaffold0298 (27-92)||(15902-15967)
[»] scaffold0159 (1 HSPs)
scaffold0159 (28-92)||(28828-28893)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (28-92)||(25579-25644)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 35)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 31129066 - 31128838
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31129066 aattaaatcaaagataaagattaa-gtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttataaatcaaaagattacatgtttaagc 31128968  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacact 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31128967 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacact 31128868  T
Q  201 cgtgatctctcaacaaagtgatgtagaatt 230  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31128867 tgtgatctctcaacaaagtgatgtagaatt 31128838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 34711333 - 34711108
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34711333 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 34711234  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacact 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34711233 tatgatcaaatacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccatgacacact 34711134  T
Q  201 cgtgatctctcaacaaagtgatgtag 226  Q
     |||||||||||||||||||||||||    
T  34711133 tgtgatctctcaacaaagtgatgtag 34711108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 4187131 - 4187347
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  4187131 aattaaatcaaagataaacattgaagtgcaagaataacatcaataccaaatcaaatgctagaaccatatatttataaatcaaaggattacatgtttaagc 4187230  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacact 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4187231 tatgatcaagtacctctaattccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacact 4187330  T
Q  201 cgtgatctctcaacaaa 217  Q
     || || ||||||||||    
T  4187331 tgtaatttctcaacaaa 4187347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 13671593 - 13671363
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13671593 aattaaatcaaacataagcattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtt-aagc 13671495  T
Q  101 tatgatcaagta---cctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacac 197  Q
    || |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13671494 taagatcaagtagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaagaatgaattgagagagaaagatccattacac 13671395  T
Q  198 actcgtgatctctcaacaaagtgatgtagaat 229  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  13671394 acttgtgatctctcaacaaaatgatgtagaat 13671363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 4020011 - 4019795
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4020011 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatg-ttaagc 4019913  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatcca-ttacacac 199  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||| ||    
T  4019912 taagatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaagaatgaattgaaggagaaagattcatttaca-ac 4019814  T
Q  200 tcgtgatctctcaacaaag 218  Q
    | ||||| |||||||||||    
T  4019813 ttgtgatttctcaacaaag 4019795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 4026437 - 4026221
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4026437 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatg-ttaagc 4026339  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatcca-ttacacac 199  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||| ||    
T  4026338 taagatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaagaatgaattgaaggagaaagattcatttaca-ac 4026240  T
Q  200 tcgtgatctctcaacaaag 218  Q
    | ||||| |||||||||||    
T  4026239 ttgtgatttctcaacaaag 4026221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 7062292 - 7062076
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7062292 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatg-ttaagc 7062194  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatcca-ttacacac 199  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||| ||    
T  7062193 taagatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaagaatgaattgaaggagaaagattcatttaca-ac 7062095  T
Q  200 tcgtgatctctcaacaaag 218  Q
    | ||||| |||||||||||    
T  7062094 ttgtgatttctcaacaaag 7062076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 7069478 - 7069262
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7069478 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatg-ttaagc 7069380  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatcca-ttacacac 199  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||| ||    
T  7069379 taagatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaagaatgaattgaaggagaaagattcatttaca-ac 7069281  T
Q  200 tcgtgatctctcaacaaag 218  Q
    | ||||| |||||||||||    
T  7069280 ttgtgatttctcaacaaag 7069262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 34655697 - 34655913
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34655697 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatg-ttaagc 34655795  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatcca-ttacacac 199  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||| ||    
T  34655796 taagatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaagaatgaattgaaggagaaagattcatttaca-ac 34655894  T
Q  200 tcgtgatctctcaacaaag 218  Q
    | ||||| |||||||||||    
T  34655895 ttgtgatttctcaacaaag 34655913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 21262350 - 21262135
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21262350 aattaaatcaaagataaacattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 21262251  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacact 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||| |||    
T  21262250 taagatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattttcatggaaaccttgcaagaatgaattgaagaagaaagattcattaca-act 21262152  T
Q  201 cgtgatctctcaacaaa 217  Q
     ||||| ||||||||||    
T  21262151 tgtgatttctcaacaaa 21262135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 31548341 - 31548557
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  31548341 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttataaatcaaaagattacatg-ttaagc 31548439  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatcca-ttacacac 199  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||| ||    
T  31548440 taagatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaagaatgaattgaaggagaaagattcatttaca-ac 31548538  T
Q  200 tcgtgatctctcaacaaag 218  Q
    | ||||| |||||||||||    
T  31548539 ttgtgatttctcaacaaag 31548557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 34649246 - 34649462
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34649246 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatg-ttaagc 34649344  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatcca-ttacacac 199  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||| ||    
T  34649345 taagatcaagtacctctaatcctaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaagaatgaattgaaggagaaagattcatttaca-ac 34649443  T
Q  200 tcgtgatctctcaacaaag 218  Q
    | ||||| |||||||||||    
T  34649444 ttgtgatttctcaacaaag 34649462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 32328269 - 32328053
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  32328269 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaaaaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttataaatcaaaggattacatgtttaagc 32328170  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacact 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||| ||||||| |||    
T  32328169 tatgatcaagtacctctaatcccaacataggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaagaatgaattgaagaagcaagattcattaca-act 32328071  T
Q  201 cgtgatctctcaacaaag 218  Q
     ||||| |||||||||||    
T  32328070 tgtgatgtctcaacaaag 32328053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 1428199 - 1427984
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |    
T  1428199 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacctcaatatcaattcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaacgattacatg-ttaaac 1428101  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacact 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||| ||||||| |||    
T  1428100 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaagaatgaattgaagaagcaagattcattaca-act 1428002  T
Q  201 cgtgatctctcaacaaag 218  Q
     ||||| |||||||||||    
T  1428001 tgtgatgtctcaacaaag 1427984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 9864536 - 9864353
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9864536 aattaaatcaaacataagcattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatg-ttaagc 9864438  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaa 185  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  9864437 taagatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttatctactcattgtcatggaagccttgcaagaatgaattgaaggagaaa 9864353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 29907305 - 29907520
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29907305 aattaaatcaaacataagcattaaagtgcaagaataacatcaatttcaaatcaaatgctagaatcatatatttatagatcaaaagattacatg-ttaagc 29907403  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacact 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||  || |||||   |||    
T  29907404 taggatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttaactactcattgtcatggaagccttgcaagaaataattgaaagagaagaatgcattaataact 29907503  T
Q  201 cgtgatctctcaacaaa 217  Q
     ||||||||||||||||    
T  29907504 tgtgatctctcaacaaa 29907520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 1167255 - 1167040
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  1167255 aattaaatcaaacataaacaataaagtgcaagaatagtctcaatatcaaaccaaatgctagaaccatacatttaaagatcaaaagattacatgttta-gc 1167157  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacact 200  Q
    || |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||   |    
T  1167156 taagatcaaatacctctaatcccagcaatggagatttagctactcattgtcatggaagctttgcaagaatgaattgaaagagaaggattcattacaactt 1167057  T
Q  201 cgtgatctctcaacaaa 217  Q
     ||||||||||||||||    
T  1167056 tgtgatctctcaacaaa 1167040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Original strand, 27670540 - 27670686
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27670540 aattaaatcaaacataagtattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaattaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatg-ttaagc 27670638  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcatt 148  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27670639 taagatcaagtacctctaatccgaacaaaggagatttagctactcatt 27670686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 71 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 4718246 - 4718101
Alignment:
Q  71 tttatagatcaaaagattacatgtttaagctatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggat 170  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4718246 tttatagatcaaacgattacatgttaaa-ctatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaagaat 4718148  T
Q  171 gaattgaaagagaaagatccattacacactcgtgatctctcaacaaag 218  Q
    ||||||||  || ||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  4718147 gaattgaagaagcaagattcattaca-acttgtgatgtctcaacaaag 4718101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 83 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 30121231 - 30121098
Alignment:
Q  83 aagattacatgtttaagctatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagag 182  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  30121231 aagattacatgtt-aagctaagatcaagtacctctaatcttaacaaaggagattcaactactcattatcatggaagccttgcaagaaagaattgaaagag 30121133  T
Q  183 aaagatccattacacactcgtgatctctcaacaaa 217  Q
    ||  || ||||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  30121132 aacaattcattacaaacttgtgatttctcaacaaa 30121098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 4738099 - 4738030
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatata 70  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4738099 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatata 4738030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 127 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 4738030 - 4737939
Alignment:
Q  127 aaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatcca-ttacacactcgtgatctctcaacaaag 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  4738030 aaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaagaatgaattgaaggagaaagattcatttaca-acttgtgatttctcaacaaag 4737939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 139
Target Start/End: Original strand, 11016559 - 11016670
Alignment:
Q  27 tgcaagaataa-catcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagctatgatcaagtacctctaatcccaa 125  Q
    ||||||||||| | |||||||||  | || |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  11016559 tgcaagaataaacttcaatatcatgtaaattgctagaatcatatattgaaagatcaaaagattacat-tctaagct-tgatcaaatacctctaatcccaa 11016656  T
Q  126 caaaggagatttag 139  Q
    ||||||||||||||    
T  11016657 caaaggagatttag 11016670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 103 - 155
Target Start/End: Original strand, 22870786 - 22870838
Alignment:
Q  103 tgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatgg 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  22870786 tgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctaatcattctcatgg 22870838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 29 - 154
Target Start/End: Original strand, 9846995 - 9847119
Alignment:
Q  29 caagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttata-gatcaaaagattacatgtttaagctatgatcaagtacctctaatcccaaca 127  Q
    |||||||| |||||||||||  | || |||||||| |||||||||  | ||||||||||||||||  | ||  ||  ||||||||||||||||||||||     
T  9846995 caagaatatcatcaatatcatgtaaattgctagaatcatatatttgcaagatcaaaagattacattctgaactta--atcaagtacctctaatcccaact 9847092  T
Q  128 aaggagatttagctactcattgtcatg 154  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||    
T  9847093 aaggagatttagttcatcattgtcatg 9847119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 103 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 14759282 - 14759219
Alignment:
Q  103 tgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaa 166  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  14759282 tgatcaaatacctttaatcccaacaaatgagatttaactactcattatcatggtagccttgcaa 14759219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 20382868 - 20382818
Alignment:
Q  116 ctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaa 166  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  20382868 ctaatcccaacaaatgagatttagctactcattatcatggtagccttgcaa 20382818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 190 - 229
Target Start/End: Original strand, 27670683 - 27670722
Alignment:
Q  190 cattacacactcgtgatctctcaacaaagtgatgtagaat 229  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  27670683 cattacacacttgtgatctctcaacaaaatgatgtagaat 27670722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 30117075 - 30117032
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaat 44  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  30117075 aattaaatcaaacataagcattaaagtgcaagaataacatcaat 30117032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 28 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 3539280 - 3539215
Alignment:
Q  28 gcaagaataacatcaatatcaaatcaa-atgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacat 92  Q
    |||||||||||| ||||||  ||| || | |||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  3539280 gcaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacat 3539215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 28 - 92
Target Start/End: Original strand, 9932734 - 9932799
Alignment:
Q  28 gcaagaataacatcaatatcaaatcaa-atgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacat 92  Q
    |||||||||||| ||||||  ||| || | |||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  9932734 gcaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacat 9932799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 28 - 92
Target Start/End: Original strand, 26515357 - 26515422
Alignment:
Q  28 gcaagaataacatcaatatcaaatcaa-atgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacat 92  Q
    |||||||||||| ||||||  ||| || | |||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  26515357 gcaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacat 26515422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 92
Target Start/End: Original strand, 5988932 - 5988996
Alignment:
Q  29 caagaataacatcaatatcaaatcaa-atgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacat 92  Q
    ||||||||||| ||||||  ||| || | |||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  5988932 caagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacat 5988996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 92
Target Start/End: Original strand, 21596457 - 21596521
Alignment:
Q  28 gcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacat 92  Q
    |||||||||||| ||||||  ||| ||  |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  21596457 gcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacat 21596521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 34006734 - 34006670
Alignment:
Q  29 caagaataacatcaatatcaaatcaa-atgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacat 92  Q
    ||||||||||| ||||||  ||| || | |||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  34006734 caagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacat 34006670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 25)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 37368091 - 37367863
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37368091 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtt-aagc 37367993  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacact 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37367992 taagatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacact 37367893  T
Q  201 cgtgatctctcaacaaagtgatgtagaatt 230  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37367892 tgtgatctctcaacaaagtgatgtagaatt 37367863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 7780772 - 7780988
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7780772 aattaaatcaaagataaacattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 7780871  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacact 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||| |||    
T  7780872 taagatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaagaatgaattgaagaagaaagattcattacaaact 7780971  T
Q  201 cgtgatctctcaacaaa 217  Q
     ||||| ||||||||||    
T  7780972 tgtgatttctcaacaaa 7780988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 16405792 - 16406019
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  16405792 aattaaatcaaacataagcattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgataaaaccatatatttatagattaaaagattacatgtt-aagc 16405890  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacact 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  16405891 taagatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaagaatgaattgaaagagaatgattcattacacact 16405990  T
Q  201 cgtgatctctcaacaaagtgatgtagaat 229  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||    
T  16405991 tgtgatctctcaacaaaatgatgtagaat 16406019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 13594554 - 13594770
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13594554 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatg-ttaagc 13594652  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatcca-ttacacac 199  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||| ||    
T  13594653 taagatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaagaatgaattgaaggagaaagattcatttaca-ac 13594751  T
Q  200 tcgtgatctctcaacaaag 218  Q
    | ||||| |||||||||||    
T  13594752 ttgtgatttctcaacaaag 13594770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 17457301 - 17457517
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17457301 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatg-ttaagc 17457399  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatcca-ttacacac 199  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||| ||    
T  17457400 taagatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaagaatgaattgaaggagaaagattcatttaca-ac 17457498  T
Q  200 tcgtgatctctcaacaaag 218  Q
    | ||||| |||||||||||    
T  17457499 ttgtgatttctcaacaaag 17457517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 27590751 - 27590967
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27590751 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatg-ttaagc 27590849  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatcca-ttacacac 199  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||| ||    
T  27590850 taagatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaagaatgaattgaaggagaaagattcatttaca-ac 27590948  T
Q  200 tcgtgatctctcaacaaag 218  Q
    | ||||| |||||||||||    
T  27590949 ttgtgatttctcaacaaag 27590967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 8104327 - 8104543
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8104327 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacattaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatg-ttaagc 8104425  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatcca-ttacacac 199  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||| ||    
T  8104426 taagatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaagaatgaattgaaggagaaagattcatttaca-ac 8104524  T
Q  200 tcgtgatctctcaacaaag 218  Q
    | ||||| |||||||||||    
T  8104525 ttgtgatttctcaacaaag 8104543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 37356125 - 37355909
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37356125 aattaaatcaaagataaagatcaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatg-ttaagc 37356027  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatcca-ttacacac 199  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||| ||    
T  37356026 taagatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaagaatgaattgaaggagaaagattcatttaca-ac 37355928  T
Q  200 tcgtgatctctcaacaaag 218  Q
    | ||||| |||||||||||    
T  37355927 ttgtgatttctcaacaaag 37355909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 30238675 - 30238889
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30238675 aattaaatcaaagataaagattaaattgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatg-ttaagc 30238773  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacact 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||| |||    
T  30238774 taagatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaggccttgcaagaatgaattgaagaagaaagattcattaca-act 30238872  T
Q  201 cgtgatctctcaacaaa 217  Q
     ||||| ||||||||||    
T  30238873 tgtgatttctcaacaaa 30238889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 55462548 - 55462334
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  55462548 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacattaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatg-ttaagc 55462450  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacact 200  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||| |||    
T  55462449 taagatcaggtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaagaatgaattgaagaagaaagattcattaca-act 55462351  T
Q  201 cgtgatctctcaacaaa 217  Q
      |||| ||||||||||    
T  55462350 tttgatttctcaacaaa 55462334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 41373433 - 41373648
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |    
T  41373433 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacctcaatatcaattcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaacgattacatg-ttaaac 41373531  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacact 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||| ||||||| |||    
T  41373532 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaagaatgaattgaagaagcaagattcattaca-act 41373630  T
Q  201 cgtgatctctcaacaaag 218  Q
     ||||| |||||||||||    
T  41373631 tgtgatgtctcaacaaag 41373648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 5 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 30211308 - 30211096
Alignment:
Q  5 aaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagctatg 104  Q
    |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  30211308 aaatcaaacataagcattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatg-ttaagctaag 30211210  T
Q  105 atcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattg-aaagagaaagatccattacacactcgt 203  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||| ||| ||    
T  30211209 atcaagtacctctaatccaaacaaaggagatttagctacttattgtcatggaagccttgcaagaatgaattgaaaagagaaggattcattacaaacttgt 30211110  T
Q  204 gatctctcaacaaa 217  Q
    ||||||||||||||    
T  30211109 gatctctcaacaaa 30211096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 36754567 - 36754352
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    ||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  36754567 aattacatcaaacataagcattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagaatacatgttta-gc 36754469  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacact 200  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||   |    
T  36754468 taagttcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttaactactcattgtcatggaagccttgcaagaatgaattgaaagagaaggattcattacaactt 36754369  T
Q  201 cgtgatctctcaacaaa 217  Q
     ||||||||||||||||    
T  36754368 tgtgatctctcaacaaa 36754352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 5660325 - 5660110
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5660325 aattaaatcaaacataaacaataaagtgcaagaataatctcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgttt-agc 5660227  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacact 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| | |||||   |    
T  5660226 taagatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttaactactcattgtcatggaagctttgcaagaatgaattgaaagagaaggattccttacaactt 5660127  T
Q  201 cgtgatctctcaacaaa 217  Q
     ||||||||||||||||    
T  5660126 tgtgatctctcaacaaa 5660110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 22 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 49359069 - 49358939
Alignment:
Q  22 taaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagctatgatcaagtacctctaatc 121  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  49359069 taaattgcaagaataatatcaatatcaaatcaaatgctagaatcatatattaa-agatcaaaagattacatgttta-gct-tgatcaagtacctctaatc 49358973  T
Q  122 ccaacaaaggagatttagctactcattgtcatgg 155  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  49358972 ccaacaatggagatttagctactcattttcatgg 49358939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 16838135 - 16838059
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatag 77  Q
    |||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16838135 aattaaatcaaacataagcattaaaatgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatag 16838059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 52182943 - 52182792
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    |||||||||||||||||  || ||| |||||||||||  | |||||||  | || | |||||| |||||||| |  |||||||||||||||| | |||||    
T  52182943 aattaaatcaaagataagaatgaaa-tgcaagaataaacttaatatcatctaaattactagaatcatatattcaaggatcaaaagattacat-tctaagc 52182846  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatg 154  Q
      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  52182845 cttaatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagttgatcattgtcatg 52182792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 27 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 13003557 - 13003431
Alignment:
Q  27 tgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatc-aaaagattacatgtttaagctatgatcaagtacctctaatcccaa 125  Q
    |||||||||||| |||||||||  | || |||||||| ||||||||   ||||  |||||||||||| | ||||||   |||||||||||||||||||||    
T  13003557 tgcaagaataacttcaatatcatgtaaattgctagaatcatatattacaagatttaaaagattacat-tctaagctca-atcaagtacctctaatcccaa 13003460  T
Q  126 caaaggagatttagctactcattgtcatg 154  Q
    | |||||||||||| |  |||||||||||    
T  13003459 ctaaggagatttagttcatcattgtcatg 13003431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 92
Target Start/End: Original strand, 21677595 - 21677661
Alignment:
Q  27 tgcaagaataacatcaatatcaaatcaa-atgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacat 92  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||| || | |||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  21677595 tgcaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacat 21677661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 28 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 323671 - 323606
Alignment:
Q  28 gcaagaataacatcaatatcaaatcaa-atgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacat 92  Q
    |||||||||||| ||||||  ||| || | |||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  323671 gcaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacat 323606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 28 - 92
Target Start/End: Original strand, 4839065 - 4839130
Alignment:
Q  28 gcaagaataacatcaatatcaaatcaa-atgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacat 92  Q
    |||||||||||| ||||||  ||| || | |||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  4839065 gcaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacat 4839130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 27 - 92
Target Start/End: Original strand, 19247756 - 19247821
Alignment:
Q  27 tgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacat 92  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||| ||  |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  19247756 tgcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacat 19247821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 27 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 52618736 - 52618671
Alignment:
Q  27 tgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacat 92  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||| ||  |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  52618736 tgcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacat 52618671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 26069960 - 26069896
Alignment:
Q  28 gcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacat 92  Q
    |||||||||||| ||||||  ||| ||  |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  26069960 gcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacat 26069896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 92
Target Start/End: Original strand, 26373559 - 26373623
Alignment:
Q  28 gcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacat 92  Q
    |||||||||||| ||||||  ||| ||  |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  26373559 gcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacat 26373623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 38)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 21642964 - 21643192
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21642964 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtt-aagc 21643062  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacact 200  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21643063 taagatcaagtacctctaatgccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaagtgaaagagaaagatccattacacact 21643162  T
Q  201 cgtgatctctcaacaaagtgatgtagaatt 230  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||    
T  21643163 tgttatctctcaacaaagtgatgtagaatt 21643192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 14288161 - 14288389
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    ||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  14288161 aattaaatcaaagatgaacaataaagtgcaagaataacatcaatatcaattcaaatgctagaatcatatatttatagatcaaaggattacatgtt-aagc 14288259  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacact 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14288260 taagatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaaggtccattacacact 14288359  T
Q  201 cgtgatctctcaacaaagtgatgtagaatt 230  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14288360 tgtgatctctcaacaaagtgatgtagaatt 14288389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 14299346 - 14299574
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    ||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  14299346 aattaaatcaaagatgaacaataaagtgcaagaataacatcaatatcaattcaaatgctagaatcatatatttatagatcaaaggattacatgtt-aagc 14299444  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacact 200  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14299445 taagatcaagtacctctaatcctaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacact 14299544  T
Q  201 cgtgatctctcaacaaagtgatgtagaatt 230  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14299545 tgtgatctctcaacaaagtgatgtagaatt 14299574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 9642692 - 9642464
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    |||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |    
T  9642692 aattaaatcaagcataagcattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatataattatagatcaaaagattacatgttaaa-c 9642594  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacact 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9642593 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagctttgcaagaatgaattgaaagagaaagatccattacacact 9642494  T
Q  201 cgtgatctctcaacaaagtgatgtagaatt 230  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9642493 tgtgatcactcaacaaagtgatgtagaatt 9642464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22853982 - 22853759
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22853982 aattaaatcaaacataagcattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtt-aagc 22853884  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacact 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  22853883 taagatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaagaatgaattgaaagggaaggatccattacacact 22853784  T
Q  201 cgtgatctctcaacaaagtgatgta 225  Q
     |||||||||||||||| |||||||    
T  22853783 tgtgatctctcaacaaaatgatgta 22853759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 8142221 - 8142005
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8142221 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaggattacatgtttaagc 8142122  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacact 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||| ||||||| |||    
T  8142121 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaagaatgaattgaagaagcaagattcattaca-act 8142023  T
Q  201 cgtgatctctcaacaaag 218  Q
     ||||| |||||||||||    
T  8142022 tgtgatgtctcaacaaag 8142005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 23612835 - 23613049
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23612835 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatg-ttaagc 23612933  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacact 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||| |||    
T  23612934 taagatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaagaatgaattgaagaagaaagattcattaca-act 23613032  T
Q  201 cgtgatctctcaacaaa 217  Q
     ||||| ||||||||||    
T  23613033 tgtgatttctcaacaaa 23613049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 39433353 - 39433580
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39433353 aattaaatcaaacataagcattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccagatatttatagatcaaaagattacatgtt-aagc 39433451  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacact 200  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  39433452 taagatcaagtacctctaatcctaacaaaagagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaagaatgaattgaaagagaaggatccattgcacact 39433551  T
Q  201 cgtgatctctcaacaaagtgatgtagaat 229  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||    
T  39433552 tgtgatctctcaacaaaatgatgtagaat 39433580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 8185168 - 8184952
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8185168 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatg-ttaagc 8185070  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatcca-ttacacac 199  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||| ||    
T  8185069 taagatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaagaatgaattgaaggagaaagattcatttaca-ac 8184971  T
Q  200 tcgtgatctctcaacaaag 218  Q
    | ||||| |||||||||||    
T  8184970 ttgtgatttctcaacaaag 8184952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 8192728 - 8192512
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8192728 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatg-ttaagc 8192630  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatcca-ttacacac 199  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||| ||    
T  8192629 taagatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaagaatgaattgaaggagaaagattcatttaca-ac 8192531  T
Q  200 tcgtgatctctcaacaaag 218  Q
    | ||||| |||||||||||    
T  8192530 ttgtgatttctcaacaaag 8192512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 48353256 - 48353040
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  48353256 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatg-ttaagc 48353158  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatcca-ttacacac 199  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||| ||    
T  48353157 taagatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaagaatgaattgaaggagaaagattcatttaca-ac 48353059  T
Q  200 tcgtgatctctcaacaaag 218  Q
    | ||||| |||||||||||    
T  48353058 ttgtgatttctcaacaaag 48353040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 6020640 - 6020424
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6020640 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatg-ttaagc 6020542  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacact 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||    |||    
T  6020541 taagatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaagaatgaattgaaggagaaagattcatttacgact 6020442  T
Q  201 cgtgatctctcaacaaag 218  Q
     ||||| |||||||||||    
T  6020441 tgtgatttctcaacaaag 6020424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 19090254 - 19090470
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19090254 aattaaattaaagataaacattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 19090353  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaag-agaaagatccattacacac 199  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||    
T  19090354 taagatcaagtacctctaatcccaacaaaagagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaagaatgaattgaaagaagaaagattcattaca-ac 19090452  T
Q  200 tcgtgatctctcaacaaa 217  Q
    | ||||| ||||||||||    
T  19090453 ttgtgatttctcaacaaa 19090470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 48346872 - 48346656
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  48346872 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatg-ttaagc 48346774  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatcca-ttacacac 199  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||| ||    
T  48346773 taagatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattatcatggaagccttgcaagaatgaattgaaggagaaagattcatttaca-ac 48346675  T
Q  200 tcgtgatctctcaacaaag 218  Q
    | ||||| |||||||||||    
T  48346674 ttgtgatttctcaacaaag 48346656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 26602358 - 26602572
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26602358 aattaaatcaaagataaacattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatg-ttaagc 26602456  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacact 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||| ||||||| |||    
T  26602457 taagatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaagaatgaattgaagaagcaagattcattaca-act 26602555  T
Q  201 cgtgatctctcaacaaa 217  Q
     ||||| ||||||||||    
T  26602556 tgtgatttctcaacaaa 26602572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 33850419 - 33850204
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  33850419 aattaaatcaaacataagcattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttctagatcaaaagattacatgtt-aagc 33850321  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacact 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| |||    
T  33850320 taagatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttatctactcattgtcatggaagccttgcaagaatgaattgaaagagaaggattcattacaaact 33850221  T
Q  201 cgtgatctctcaacaaa 217  Q
     ||||||||||||||||    
T  33850220 tgtgatctctcaacaaa 33850204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 1379393 - 1379608
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |    
T  1379393 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacctcaatatcaattcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaacgattacatg-ttaaac 1379491  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacact 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||| ||||||| |||    
T  1379492 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaagaatgaattgaagaagcaagattcattaca-act 1379590  T
Q  201 cgtgatctctcaacaaag 218  Q
     ||||| |||||||||||    
T  1379591 tgtgatgtctcaacaaag 1379608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 5049688 - 5049473
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |    
T  5049688 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacctcaatatcaattcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaacgattacatg-ttaaac 5049590  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacact 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||| ||||||| |||    
T  5049589 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaagaatgaattgaagaagcaagattcattaca-act 5049491  T
Q  201 cgtgatctctcaacaaag 218  Q
     ||||| |||||||||||    
T  5049490 tgtgatgtctcaacaaag 5049473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 6795884 - 6796099
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |    
T  6795884 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacctcaatatcaattcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaacgattacatg-ttaaac 6795982  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacact 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||| ||||||| |||    
T  6795983 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaagaatgaattgaagaagcaagattcattaca-act 6796081  T
Q  201 cgtgatctctcaacaaag 218  Q
     ||||| |||||||||||    
T  6796082 tgtgatgtctcaacaaag 6796099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 3923869 - 3923655
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  3923869 aattaaatcaaagataaacattaaagtgcaagaataacatcaatatcaattcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaggattacatg-ttaagc 3923771  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacact 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||| |||    
T  3923770 taagatcaagtacctctaatcccaacaaaggtgatttagctactcattgtcatggaagccttgcaagaatgaattgaagaagaaagattcattaca-act 3923672  T
Q  201 cgtgatctctcaacaaa 217  Q
     ||||| ||||||||||    
T  3923671 tgtgatttctcaacaaa 3923655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 2447092 - 2447307
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |    
T  2447092 aattaaatcaaagataaagattaaagcgcaagaataacctcaatatcaattcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaacgattacatg-ttaaac 2447190  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacact 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||| ||||||| |||    
T  2447191 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaagaatgaattgaagaagcaagattcattaca-act 2447289  T
Q  201 cgtgatctctcaacaaag 218  Q
     ||||| |||||||||||    
T  2447290 tgtgatgtctcaacaaag 2447307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 1948409 - 1948195
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1948409 aattatatcaaagataaacattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatg-ttaagc 1948311  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacact 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||| ||||||| |||    
T  1948310 taagatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgccatggaagccttgcaagaatgaattgaagaagcaagattcattaca-act 1948212  T
Q  201 cgtgatctctcaacaaa 217  Q
      |||| ||||||||||    
T  1948211 tatgatttctcaacaaa 1948195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 15949605 - 15949818
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15949605 aattaaatcaaagataac-attaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatg-ttaagc 15949702  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacact 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||| ||||||| |||    
T  15949703 taagatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatctagctactcattgtcatggaagccttgcaagaatgaattgaagaagcaagattcattaca-act 15949801  T
Q  201 cgtgatctctcaacaaa 217  Q
     ||||| ||||||||||    
T  15949802 tgtgatttctcaacaaa 15949818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 36875991 - 36876205
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    |||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36875991 aattaaattaagcataaacattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatg-ttaagc 36876089  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacact 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||| ||||||| |||    
T  36876090 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaagagatttagctactcattgtcatggaagccttgaaagaatgaattgaagaagaaagattcattaca-act 36876188  T
Q  201 cgtgatctctcaacaaa 217  Q
     ||||| ||||||||||    
T  36876189 tgtgatttctcaacaaa 36876205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 15915084 - 15915297
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15915084 aattaaatcaaagataac-attaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatg-ttaagc 15915181  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacact 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||| || |||| |||    
T  15915182 taagatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatctagctactcattgtcatggaagccttgcaagaatgaattgaagaagcaagattcaataca-act 15915280  T
Q  201 cgtgatctctcaacaaa 217  Q
     ||||| ||||||||||    
T  15915281 tgtgatttctcaacaaa 15915297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 45434032 - 45434246
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    |||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  45434032 aattaaatcaaacataagcaataaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaattgctagaaccatat-tttatagatcaaaatattacatgttta-gc 45434129  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacact 200  Q
    ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||| |||    
T  45434130 taaaatcgagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgccatggaagccttgcaagaatgaattgaaaaagaaggattcattacaaact 45434229  T
Q  201 cgtgatctctcaacaaa 217  Q
      |||||||| ||||||    
T  45434230 tatgatctctaaacaaa 45434246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 150 - 229
Target Start/End: Original strand, 37026324 - 37026403
Alignment:
Q  150 tcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacactcgtgatctctcaacaaagtgatgtagaat 229  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  37026324 tcatggaagccttgcaagaatgaattgaaagagaatgatccattacacacttgtgatctctcaacaaaatgatgtagaat 37026403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 27 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 8881162 - 8881037
Alignment:
Q  27 tgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttata-gatcaaaagattacatgtttaagctatgatcaagtacctctaatcccaa 125  Q
    |||||||||||  ||||||||| || ||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8881162 tgcaagaataaactcaatatcacataaaatgctagaatcatttatttaaaagatcaaaagattacat--ttaagct-tgatcaagtacctctaatcccaa 8881066  T
Q  126 caaaggagatttagctactcattgtcatg 154  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||||    
T  8881065 caaaggagatttagttgatcattgtcatg 8881037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 10830900 - 10830750
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    |||||||||||||||| | || ||  ||||||||||||||||||||||  | || ||||||||  |||||||   |||| |||||||||||| | |||||    
T  10830900 aattaaatcaaagatagaaatgaat-tgcaagaataacatcaatatcatgtaaattgctagaataatatattacaagattaaaagattacat-tctaagc 10830803  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatg 154  Q
    |   |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||    
T  10830802 tca-atcaagtacctctaatcccaactaaggagatttagttcatcattgtcatg 10830750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 11024692 - 11024542
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    |||||||||||||||| | || ||  ||||||||||||||||||||||  | || ||||||||  |||||||   |||| |||||||||||| | |||||    
T  11024692 aattaaatcaaagatagaaatgaat-tgcaagaataacatcaatatcatgtaaattgctagaataatatattacaagattaaaagattacat-tctaagc 11024595  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatg 154  Q
    |   |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||    
T  11024594 tca-atcaagtacctctaatcccaactaaggagatttagttcatcattgtcatg 11024542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 21900963 - 21900814
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    |||||||||||||||||| || ||  |||||||||||| |||||||||  | || |||||||| ||||||||   |||| ||||||| |||| | |||||    
T  21900963 aattaaatcaaagataaaaatgaat-tgcaagaataacttcaatatcatgtaaattgctagaatcatatattacaagattaaaagat-acat-tctaagc 21900867  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatg 154  Q
    |   |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||    
T  21900866 tca-atcaagtacctctaatcccaactaaggagatttagttcatcattgtcatg 21900814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 28 - 92
Target Start/End: Original strand, 10346234 - 10346299
Alignment:
Q  28 gcaagaataacatcaatatcaaatcaa-atgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacat 92  Q
    |||||||||||| ||||||  ||| || | |||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  10346234 gcaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacat 10346299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 27 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 31878833 - 31878768
Alignment:
Q  27 tgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacat 92  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||| ||  |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  31878833 tgcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacat 31878768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 6172748 - 6172684
Alignment:
Q  28 gcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacat 92  Q
    |||||||||||| ||||||  ||| ||  |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  6172748 gcaagaataacagcaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacat 6172684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 92
Target Start/End: Original strand, 8107818 - 8107882
Alignment:
Q  29 caagaataacatcaatatcaaatcaa-atgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacat 92  Q
    ||||||||||| ||||||  ||| || | |||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  8107818 caagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacat 8107882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 92
Target Start/End: Original strand, 19472119 - 19472183
Alignment:
Q  28 gcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacat 92  Q
    |||||||||||| ||||||  ||| ||  |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  19472119 gcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacat 19472183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 20403795 - 20403700
Alignment:
Q  29 caagaataacatcaatatcaaatcaaa--tgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagctatgatcaagtacctctaatcccaa 125  Q
    ||||||||| ||||| ||||| | |||  |||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  20403795 caagaataaaatcaacatcaagtaaaaattgctagaaccatatatttaaggataaaaagaatacatatt--agct-tgatcaagtacctctaaacccaa 20403700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 92
Target Start/End: Original strand, 31664424 - 31664488
Alignment:
Q  28 gcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacat 92  Q
    |||||||||||| ||||||  ||| ||  |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  31664424 gcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacat 31664488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 33)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 6036712 - 6036940
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6036712 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtt-aagc 6036810  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacact 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6036811 taagatcaagtacctctaatcccaacagaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaagaatgaattgaaagagaaagatcaattacacact 6036910  T
Q  201 cgtgatctctcaacaaagtgatgtagaatt 230  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6036911 tgtgatctctcaacaaagtgatgtagaatt 6036940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 27501743 - 27501527
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27501743 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatg-ttaagc 27501645  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatcca-ttacacac 199  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||| ||    
T  27501644 taagatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaagaatgaattgaaggagaaagattcatttaca-ac 27501546  T
Q  200 tcgtgatctctcaacaaag 218  Q
    | ||||| |||||||||||    
T  27501545 ttgtgatttctcaacaaag 27501527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 5 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 10941076 - 10940865
Alignment:
Q  5 aaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagctatg 104  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  10941076 aaatcaaacataaacattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtt-aagctaag 10940978  T
Q  105 atcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacactcgtg 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||    
T  10940977 atcaagtacctctaatcccaacaaatgagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaagaatgaattgaaagagaaggattcattacaaacttgtg 10940878  T
Q  205 atctctcaacaaa 217  Q
    |||||||||||||    
T  10940877 atctctcaacaaa 10940865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 23068910 - 23069124
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23068910 aattaaatcaaagataagcattaaagtgcaagaataacatcaatatcaattcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtt-aagc 23069008  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  23069009 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttatctactcattgtcatggaagccttgcaagaatgaattgaaagagaaagattcattaca-act 23069107  T
Q  201 cgtgatctctcaacaaa 217  Q
     ||||| ||||||||||    
T  23069108 tgtgatttctcaacaaa 23069124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 32746816 - 32747030
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32746816 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatg-ttaagc 32746914  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacact 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||| |||    
T  32746915 taagatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttaactactcattgtcatggaagccttgcaagaatgaattgaagaagaaagattcattaca-act 32747013  T
Q  201 cgtgatctctcaacaaa 217  Q
     ||||| ||||||||||    
T  32747014 tgtgatttctcaacaaa 32747030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 24179520 - 24179736
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24179520 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatg-ttaagc 24179618  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatcca-ttacacac 199  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||| ||    
T  24179619 taagatcaagtacccctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaagaatgaattgaaggagaaagattcatttaca-ac 24179717  T
Q  200 tcgtgatctctcaacaaag 218  Q
    | ||||| |||||||||||    
T  24179718 ttgtgatttctcaacaaag 24179736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 43932023 - 43932237
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43932023 aattaaatcaaacataagcattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtt-aagc 43932121  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacact 200  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| |||    
T  43932122 taagattaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaagaatgaattgaaagagaaggattcattacaaact 43932221  T
Q  201 cgtgatctctcaacaa 216  Q
     ||||| |||||||||    
T  43932222 tgtgatttctcaacaa 43932237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 9570323 - 9570108
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  9570323 aattaaatcaaagataaagattaa-gtgcaagaataacctcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttataaatcaaaggattacatgtttaagc 9570225  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacact 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||| ||||||| |||    
T  9570224 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaagaatgaattgaagaagcaagattcattaca-act 9570126  T
Q  201 cgtgatctctcaacaaag 218  Q
     ||||| |||||||||||    
T  9570125 tgtgatgtctcaacaaag 9570108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 9576825 - 9576610
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  9576825 aattaaatcaaagataaagattaa-gtgcaagaataacctcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttataaatcaaaggattacatgtttaagc 9576727  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacact 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||| ||||||| |||    
T  9576726 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaagaatgaattgaagaagcaagattcattaca-act 9576628  T
Q  201 cgtgatctctcaacaaag 218  Q
     ||||| |||||||||||    
T  9576627 tgtgatgtctcaacaaag 9576610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 4311262 - 4311048
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4311262 aattaaatcaaagataaacattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatg-ttaagc 4311164  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacact 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  || | ||| ||||||| |||    
T  4311163 taggatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaagaatgaattaaagaagcaggattcattaca-act 4311065  T
Q  201 cgtgatctctcaacaaa 217  Q
     ||||| ||||||||||    
T  4311064 tgtgatttctcaacaaa 4311048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 43995523 - 43995737
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  43995523 aattaaatcaaacataagcattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtt--agc 43995620  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacact 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||| |||    
T  43995621 taagatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttacaagaatgaattgaaagagaaggattcattaca-act 43995719  T
Q  201 -cgtgatctctcaacaaa 217  Q
      ||||||||||||||||    
T  43995720 atgtgatctctcaacaaa 43995737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 47441247 - 47441462
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||    
T  47441247 aattaaatcaaacataagcattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaacaaattacatgttt-agc 47441345  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacact 200  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||   |    
T  47441346 taagatcaagtaactctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagctttgcaagagtgaattgaaagaggaagattcattacaactt 47441445  T
Q  201 cgtgatctctcaacaaa 217  Q
     ||||||||||||||||    
T  47441446 tgtgatctctcaacaaa 47441462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 4 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 20650898 - 20650686
Alignment:
Q  4 taaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagctat 103  Q
    ||||||||| ||||| | |||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  20650898 taaatcaaacataaacaataaagttcaagaataatctcaatatcaaatcaaatgctagaatcatatatttatagatcaaaagattacatgttt-agctaa 20650800  T
Q  104 gatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacactcgt 203  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||  || |||||||   | ||    
T  20650799 gatcaagtacctctaatcctaacaaaggagatttagctacttgttgtcatggaagctttgcaagaatgaagtgaaagagaagaattcattacaactttgt 20650700  T
Q  204 gatctctcaacaaa 217  Q
    |||||||| |||||    
T  20650699 gatctctccacaaa 20650686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 58 - 218
Target Start/End: Original strand, 25893729 - 25893888
Alignment:
Q  58 ctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagctatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaa 157  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25893729 ctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtt-aagctaagatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaa 25893827  T
Q  158 gccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatcca-ttacacactcgtgatctctcaacaaag 218  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  25893828 gccttgcaagaatgaattgaaggagaaagattcatttaca-acttgtgatttctcaacaaag 25893888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 41354089 - 41353963
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41354089 aattaaatcaaagataaacattaaggtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatg-ttaagc 41353991  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaa 128  Q
    || ||||||| | ||||||||| |||||    
T  41353990 taagatcaaggaactctaatcctaacaa 41353963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 22 - 181
Target Start/End: Original strand, 2786171 - 2786328
Alignment:
Q  22 taaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagctatgatcaagtacctctaatc 121  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  2786171 taaaatgcaagaataacctcaatatcaaatcaaatgctagaatcatatattaag-gattaaaagattacatgttta-gcttagatcaagtacctctaatc 2786268  T
Q  122 ccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaaga 181  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||  | | |||||||  ||||||||||||    
T  2786269 ccaacaatggaaatttagctactcattgtcatgataactttgcaagattgaattgaaaga 2786328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 30 - 154
Target Start/End: Original strand, 17735818 - 17735940
Alignment:
Q  30 aagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatattt-atagatcaaaagattacatgtttaagctatgatcaagtacctctaatcccaacaa 128  Q
    ||||||||  ||||||||| || || |||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17735818 aagaataaactcaatatcacataaattgctagaatcatatatttgagatatcaaaagattacatct--aagct-tgatcaagtacctctaatcccaacaa 17735914  T
Q  129 aggagatttagctactcattgtcatg 154  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||    
T  17735915 aggagatttagttgatcattgtcatg 17735940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 30 - 154
Target Start/End: Original strand, 19037087 - 19037209
Alignment:
Q  30 aagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatattt-atagatcaaaagattacatgtttaagctatgatcaagtacctctaatcccaacaa 128  Q
    ||||||||  ||||||||| || || |||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19037087 aagaataaactcaatatcacataaattgctagaatcatatatttgagatatcaaaagattacatct--aagct-tgatcaagtacctctaatcccaacaa 19037183  T
Q  129 aggagatttagctactcattgtcatg 154  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||    
T  19037184 aggagatttagttgatcattgtcatg 19037209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 4644238 - 4644104
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    ||||||||||||||||   | | || |||||||||||| |||||||||  | || |||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||  | ||      
T  4644238 aattaaatcaaagataggaaatgaattgcaagaataacttcaatatcatgtaaattgctagaatcatatattgaaagatcaaaagtttacattatcaact 4644139  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagattt 137  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4644138 ta--atcaagtacctctaatcccaacaaaggagattt 4644104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 29 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 461178 - 461055
Alignment:
Q  29 caagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatattt-atagatcaaaagattacatgtttaagctatgatcaagtacctctaatcccaaca 127  Q
    |||||||||  ||||||||| || ||||||||||| | | ||||| | ||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  461178 caagaataaactcaatatcacataaaatgctagaatcgtctatttcaaagatcaaaagattacatct--aagct-tgatcaagtacctctaatcccagca 461082  T
Q  128 aaggagatttagctactcattgtcatg 154  Q
    ||| |||||||| |  |||||||||||    
T  461081 aagaagatttagttgatcattgtcatg 461055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Original strand, 4591242 - 4591392
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    |||||||||||||||| | || ||  |||||||||||| |||||||||  | || |||||||| ||||||||   |||| |||||||||||| | |||||    
T  4591242 aattaaatcaaagatagaaatgaat-tgcaagaataacttcaatatcatgtaaattgctagaatcatatattacaagattaaaagattacat-tctaagc 4591339  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatg 154  Q
    |   |||||||||||||||||||||| || ||||||||| |  |||||||||||    
T  4591340 tca-atcaagtacctctaatcccaactaaagagatttagttcatcattgtcatg 4591392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 103 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 6817236 - 6817173
Alignment:
Q  103 tgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaa 166  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6817236 tgatcaattacatctaatcccaaaaagtgagatttagctactcattgtcatggtagccttgcaa 6817173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 28 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 9989628 - 9989564
Alignment:
Q  28 gcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacat 92  Q
    |||||||||||| ||||||  ||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  9989628 gcaagaataacaacaatattgaataaattgctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacat 9989564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 27 - 154
Target Start/End: Original strand, 25692452 - 25692578
Alignment:
Q  27 tgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttata-gatcaaaagattacatgtttaagctatgatcaagtacctctaatcccaa 125  Q
    |||||||||||  ||||||||   | || |||||||| |||||||| | | |||||||||||||||| | |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  25692452 tgcaagaataaactcaatatcttgtaaattgctagaatcatatattcaaaagatcaaaagattacat-tctaagtt-tgatcaagtacctctaatcccaa 25692549  T
Q  126 caaaggagatttagctactcattgtcatg 154  Q
    | ||| |||||||| |  |||||||||||    
T  25692550 ctaagaagatttagttgatcattgtcatg 25692578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 76 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 20949890 - 20949814
Alignment:
Q  76 agatcaaaagattacatgtttaagctatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatg 154  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||    
T  20949890 agatcaaaagattacat-tctaagctca-atcaagtacctctaatcccaactaaggagatttagttcatcattgtcatg 20949814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 129
Target Start/End: Original strand, 24705311 - 24705382
Alignment:
Q  56 tgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagctatgatcaagtacctctaatcccaacaaa 129  Q
    |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| | |||||| | ||||||||||| |||||||||||||    
T  24705311 tgctagaatcatatattcaaagatcaaaagattacat-tctaagct-taatcaagtacctataatcccaacaaa 24705382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 92
Target Start/End: Original strand, 36469359 - 36469429
Alignment:
Q  22 taaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacat 92  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||  ||| || |||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||    
T  36469359 taaaatgcaagaataacaacaatattgaataaattgctagaaccatgtattaaaagatctaaagattacat 36469429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 28 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 3588633 - 3588568
Alignment:
Q  28 gcaagaataacatcaatatcaaatcaa-atgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacat 92  Q
    |||||||||||| ||||||  ||| || | |||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  3588633 gcaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacat 3588568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 28 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 8615736 - 8615671
Alignment:
Q  28 gcaagaataacatcaatatcaaatcaa-atgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacat 92  Q
    |||||||||||| ||||||  ||| || | |||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  8615736 gcaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacat 8615671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 92
Target Start/End: Original strand, 4742931 - 4742994
Alignment:
Q  28 gcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacat 92  Q
    |||||||||||| ||||||  ||| ||  |||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  4742931 gcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaat-gatcaaaagattacat 4742994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 92
Target Start/End: Original strand, 7653152 - 7653216
Alignment:
Q  29 caagaataacatcaatatcaaatcaa-atgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacat 92  Q
    ||||||||||| ||||||  ||| || | |||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  7653152 caagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacat 7653216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 92
Target Start/End: Original strand, 37471616 - 37471680
Alignment:
Q  28 gcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacat 92  Q
    |||||||||||| ||||||  ||| ||  |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  37471616 gcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacat 37471680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 45527887 - 45527815
Alignment:
Q  20 attaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacat 92  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||  ||| ||  ||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  45527887 attaaaatgcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatgtattaaatgatcaaaagattacat 45527815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 41)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 43687075 - 43687303
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  43687075 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgttaaa-c 43687173  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacact 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43687174 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatctagctactcattgtcatggaagccttgcaagaatgaattgaaagagaaagatctattacacact 43687273  T
Q  201 cgtgatctctcaacaaagtgatgtagaatt 230  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43687274 tgtgatctctcaacaaagtgatgtagaatt 43687303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 4599975 - 4600202
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4599975 aattaaatcaaacataagcattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtt-aagc 4600073  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacact 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  4600074 taagatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaagaatgaattgaaagagaaggatccattatacact 4600173  T
Q  201 cgtgatctctcaacaaagtgatgtagaat 229  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||    
T  4600174 tgtgatctctcaacaaaatgatgtagaat 4600202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 9869551 - 9869778
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9869551 aattaaatcaaacataagcattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtt-aagc 9869649  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacact 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9869650 taagatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttaactactcattgtcatggaagccttgcaagaatgaattgaaagagaaggatccattacacact 9869749  T
Q  201 cgtgatctctcaacaaagtgatgtagaat 229  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||    
T  9869750 tgtgatctctcaacaaattgatgtagaat 9869778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 26621916 - 26622131
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26621916 aattaaatcaaagataaacattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 26622015  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacact 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||| |||    
T  26622016 taagatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaagaatgaattgaagaagaaagattcattaca-act 26622114  T
Q  201 cgtgatctctcaacaaa 217  Q
     ||||| ||||||||||    
T  26622115 tgtgatttctcaacaaa 26622131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 6239101 - 6239317
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6239101 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaggattacatgtttaagc 6239200  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacact 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||| ||||||| |||    
T  6239201 tatgatcaagtacctctagtcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaagaatgaattgaagaagcaagattcattaca-act 6239299  T
Q  201 cgtgatctctcaacaaag 218  Q
     ||||| |||||||||||    
T  6239300 tgtgatgtctcaacaaag 6239317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 44241803 - 44242028
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44241803 aattaaatcaaacataagcattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaat--aatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtt-aagc 44241899  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacact 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44241900 taagatcaagtacctctaatcccaacaatggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaagaatgaattgaaagagaatgatccattacacact 44241999  T
Q  201 cgtgatctctcaacaaagtgatgtagaat 229  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||    
T  44242000 tgtgatctctcaacaaaatgatgtagaat 44242028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 35085452 - 35085679
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35085452 aattaaatcaaacataagcattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctataaccatatatttatagatcaaaagattacatgtt-aagc 35085550  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacact 200  Q
    || |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35085551 taagatcaagtacctttaatcctaacaaaggagatttaggtactcattgtcatggaagccttgcaagaatgaattgaaagagaaatatccattacacact 35085650  T
Q  201 cgtgatctctcaacaaagtgatgtagaat 229  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||    
T  35085651 tgtgatctctcaacaaaatgatgtagaat 35085679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 1115758 - 1115543
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  1115758 aattaaatcaaacataagcattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttctagatcaaaagattacatgtt-aagc 1115660  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacact 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| |||    
T  1115659 taagatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaagaatgaattgaaagagaaggattcattacaaact 1115560  T
Q  201 cgtgatctctcaacaaa 217  Q
     ||||||||||||||||    
T  1115559 tgtgatctctcaacaaa 1115543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 41 - 230
Target Start/End: Original strand, 29002211 - 29002399
Alignment:
Q  41 caatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagctatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagc 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29002211 caatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtt-aagctaagatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagc 29002309  T
Q  141 tactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacactcgtgatctctcaacaaagtgatgtagaatt 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29002310 tactcattgtcatggaagccttgcaagaatgaattgaaagagaaagatccattacacatttgtgatctctcaacaaagtgatgtagaatt 29002399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 39053114 - 39052899
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |    
T  39053114 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaggattacatg-ttaaac 39053016  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacact 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||| ||||||| |||    
T  39053015 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaagaatgaattgaagaagcaagattcattaca-act 39052917  T
Q  201 cgtgatctctcaacaaag 218  Q
     ||||| |||||||||||    
T  39052916 tgtgatgtctcaacaaag 39052899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 39059486 - 39059271
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |    
T  39059486 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaggattacatg-ttaaac 39059388  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacact 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||| ||||||| |||    
T  39059387 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaagaatgaattgaagaagcaagattcattaca-act 39059289  T
Q  201 cgtgatctctcaacaaag 218  Q
     ||||| |||||||||||    
T  39059288 tgtgatgtctcaacaaag 39059271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 2 - 218
Target Start/End: Original strand, 45022982 - 45023197
Alignment:
Q  2 attaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagct 101  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45022982 attaattcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatg-ttaagct 45023080  T
Q  102 atgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatcca-ttacacact 200  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||| |||    
T  45023081 aagatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaagaatgaattgaaggagaaagattcatttaca-act 45023179  T
Q  201 cgtgatctctcaacaaag 218  Q
     ||||| |||||||||||    
T  45023180 tgtgatttctcaacaaag 45023197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 1175052 - 1175266
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1175052 aattaaatcaaagataaacattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatg-ttaagc 1175150  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacact 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||| ||||||| |||    
T  1175151 taagatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaagaatgaattgaagaagcaagattcattaca-act 1175249  T
Q  201 cgtgatctctcaacaaa 217  Q
     ||||| ||||||||||    
T  1175250 tgtgatttctcaacaaa 1175266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 32798170 - 32798385
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  32798170 aattaaatcaaacataagcattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttctacatcaaaagattacatgtt-aagc 32798268  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacact 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| |||    
T  32798269 taagatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaagaatgaattgaaagagaaggattcattacaaact 32798368  T
Q  201 cgtgatctctcaacaaa 217  Q
     ||||||||||||||||    
T  32798369 tgtgatctctcaacaaa 32798385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 28996461 - 28996683
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    |||||||||||  ||||  |||||| |||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28996461 aattaaatcaagcataagcattaaaatgcaagaataacatcaa------atcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtt-aagc 28996553  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacact 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28996554 taagatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaagaatgaattgaaagagaaagatccattacacatt 28996653  T
Q  201 cgtgatctctcaacaaagtgatgtagaatt 230  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28996654 tgtgatctctcaacaaagtgatgtagaatt 28996683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 5 - 217
Target Start/End: Original strand, 31072768 - 31072980
Alignment:
Q  5 aaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagctatg 104  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  31072768 aaatcaaacataaacattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatg-ttaagctaag 31072866  T
Q  105 atcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaaga-tccattacacactcgt 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||| ||| ||    
T  31072867 atcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcgttgtcatggaagccttgcaagaatgaattgaaagagaaggatttcattacaaacttgt 31072966  T
Q  204 gatctctcaacaaa 217  Q
    ||||||||||||||    
T  31072967 gatctctcaacaaa 31072980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 23762112 - 23761898
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  23762112 aattaaatcaaagataaacattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagattaaaagattacatg-ttaagc 23762014  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacact 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||| ||||||| |||    
T  23762013 taggatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaagaatgaattgaagaagtaagattcattaca-act 23761915  T
Q  201 cgtgatctctcaacaaa 217  Q
     ||||| ||||||||||    
T  23761914 tgtgatttctcaacaaa 23761898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 45016227 - 45016442
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |    
T  45016227 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacctcaatatcaattcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaacgattacatg-ttaaac 45016325  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacact 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||| ||||||| |||    
T  45016326 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaagaatgaattgaagaagcaagattcattaca-act 45016424  T
Q  201 cgtgatctctcaacaaag 218  Q
     ||||| |||||||||||    
T  45016425 tgtgatgtctcaacaaag 45016442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 42092342 - 42092557
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |    
T  42092342 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacctcaatatcaattcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaacgattacatg-ttaaac 42092440  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||| ||||||| |||    
T  42092441 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggaaatttagctactcattgtcatggaagccttgcaagaatgaattgaagaagcaagattcattaca-act 42092539  T
Q  201 cgtgatctctcaacaaag 218  Q
     ||||| |||||||||||    
T  42092540 tgtgatgtctcaacaaag 42092557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 11913038 - 11912823
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  11913038 aattaaatcaaacataagcattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaatcatatatttataaatcaaaagattacatgttta-gc 11912940  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacact 200  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||   |    
T  11912939 taagatcaagtacctctaatctcaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaaaatgaattgaaagagaaggattcattacaactt 11912840  T
Q  201 cgtgatctctcaacaaa 217  Q
     ||||||||||||||||    
T  11912839 tgtgatctctcaacaaa 11912823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 44916784 - 44916999
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  44916784 aattaaatcaaacataagcattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgttagaaccatatatttatagatcaaaatattacatgttta-gc 44916882  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacact 200  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||   |    
T  44916883 taagatcaagtatctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcattgaagccttgcaagaatgaattgaaagagaatgattcattacaactt 44916982  T
Q  201 cgtgatctctcaacaaa 217  Q
     ||||||||||||||||    
T  44916983 tgtgatctctcaacaaa 44916999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 20 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 41305277 - 41305084
Alignment:
Q  20 attaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagctatgatcaagtacctctaa 119  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41305277 attaaaatgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagctaagatcaagtacctctaa 41305178  T
Q  120 tcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacactcgtgatctctcaac 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||| ||||||| ||| ||||| |||||||    
T  41305177 tcccaacaaaggagatttagctactcattatcatggaagccttgcaagaatgaattgaagaagcaagattcattaca-acttgtgatttctcaac 41305084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 83
Target Start/End: Original strand, 41297963 - 41298045
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaa 83  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41297963 aattaaatcaaagataaacattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaa 41298045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 155
Target Start/End: Original strand, 31473731 - 31473857
Alignment:
Q  27 tgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagctatgatcaagtacctctaatcccaac 126  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31473731 tgcaagaataatctcaatatcaaataaaaagctagaatcatatatttaaggatcaaaagattacatgct-aggct-tgatcaagtacctctaatcccaac 31473828  T
Q  127 aaaggagatttagctactcattgtcatgg 155  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  31473829 aaagtagatttagctactcattatcatgg 31473857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 27 - 155
Target Start/End: Original strand, 47647142 - 47647267
Alignment:
Q  27 tgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagctatgatcaagtacctctaatcccaac 126  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||| |   |||| ||| |||| |||||| |||    
T  47647142 tgcaagaataatctcaatatcaaatcaaatgctagaatcatata-ttaaatatcaaaagattacatgtttagg--ttgataaagcacctataatcctaac 47647238  T
Q  127 aaaggagatttagctactcattgtcatgg 155  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||    
T  47647239 aatggagatttagctactcattgtcatgg 47647267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 27 - 154
Target Start/End: Original strand, 30660312 - 30660437
Alignment:
Q  27 tgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagctatgatcaagtacctctaatcccaac 126  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||  ||||||| |||||||| |  |||||||||||||||   | | ||| |||||||||| || ||||||||||    
T  30660312 tgcaagaataatctcaatatcaaataaagagctagaatcatatattaaaggatcaaaagattacacaat-aggct-tgatcaagtatctttaatcccaac 30660409  T
Q  127 aaaggagatttagctactcattgtcatg 154  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||    
T  30660410 aaaggagatttagctactcattctcatg 30660437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 167
Target Start/End: Original strand, 13249190 - 13249325
Alignment:
Q  29 caagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagctatgatcaagtacctctaatcccaacaa 128  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||  ||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||  | | ||| |||||||||||||||||||  |||||    
T  13249190 caagaataatctcaatatcaaataaagagctagaatcatatattaaaagaacaaaagattacatact-aggct-tgatcaagtacctctaatct-aacaa 13249286  T
Q  129 aggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaag 167  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||  | |||||||||    
T  13249287 aggagatttagttactcattatcatgataaccttgcaag 13249325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 2824595 - 2824445
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    |||||||||||||||||| || ||  |||||||||||| |||||||||  | || |||||||| ||||||||   |||| |||||||||||| | |||||    
T  2824595 aattaaatcaaagataaaaatgaat-tgcaagaataacttcaatatcatgtaaattgctagaatcatatattacaagattaaaagattacat-tctaagc 2824498  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatg 154  Q
    |   ||||||| |||||||||||| | |||||||||||| |  |||||||||||    
T  2824497 t-caatcaagtgcctctaatcccagctaaggagatttagttcatcattgtcatg 2824445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 5357523 - 5357372
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    |||||||||||||||||  | | || |||||||||||| |||||||||  | || |||||||| ||||||||   |||||||| |||||||| | |||||    
T  5357523 aattaaatcaaagataagaaatgaattgcaagaataacttcaatatcatgtaaattgctagaatcatatattacaagatcaaaggattacat-tctaagc 5357425  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatg 154  Q
    | | | ||||||||||||| |||||| ||||||| |||| |  |||||||||||    
T  5357424 t-taaacaagtacctctaaccccaactaaggagaattagttcatcattgtcatg 5357372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 3 - 154
Target Start/End: Original strand, 13432297 - 13432447
Alignment:
Q  3 ttaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatattt-atagatcaaaagattacatgtttaagct 101  Q
    ||||||||||||||| || | || | ||||| || |||||||||||  | || |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||  | ||  |    
T  13432297 ttaaatcaaagataaggaatgaaatacaagagtatcatcaatatcatgtaaattgctagaatcatatatttgaaagatcaaaagattacattatcaactt 13432396  T
Q  102 atgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatg 154  Q
    |  ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||    
T  13432397 a--atcaagtacctgtaatcccaactaaggagatttagttcatcattgtcatg 13432447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Original strand, 23251798 - 23251949
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    |||||||||||||||||  | | || |||||||||||| |||||||||  | || | |||||| |||||| |   ||||||||||||||||| | |||||    
T  23251798 aattaaatcaaagataagaaatgaattgcaagaataacttcaatatcatgtaaattactagaatcatataatacaagatcaaaagattacat-tctaagc 23251896  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatg 154  Q
    |   | |||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||    
T  23251897 tcaaa-caagtacctctaatcccaactaaggagatttagttcatcattgtcatg 23251949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 27 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 38672527 - 38672402
Alignment:
Q  27 tgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagctatgatcaagtacctctaatcccaac 126  Q
    |||||||||||| |||||||||  | || |||||||| ||||||||   |||| |||||||||||| | ||||||   ||||||||||||||||| ||||    
T  38672527 tgcaagaataacttcaatatcatgtaaattgctagaatcatatattataagattaaaagattacat-tctaagctca-atcaagtacctctaatctcaac 38672430  T
Q  127 aaaggagatttagctactcattgtcatg 154  Q
     |||||||||||| |  |||||||||||    
T  38672429 taaggagatttagttcatcattgtcatg 38672402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 28413448 - 28413298
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    |||||||||||||||| | || ||  |||||||||||| |||||||||  | || | |||||| ||||||||   |||| |||||||||||| | ||| |    
T  28413448 aattaaatcaaagatagaaatgaat-tgcaagaataacttcaatatcatgtaaattactagaatcatatattacaagattaaaagattacat-tctaatc 28413351  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatg 154  Q
    |   |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||    
T  28413350 tca-atcaagtacctctaatcccaactaaggagatttagttcatcattgtcatg 28413298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Original strand, 39806504 - 39806654
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    ||||||||||||||| || || ||  |||||||||||| | |||||||  | || || ||||| ||||||||   |||| |||||||||||| | |||||    
T  39806504 aattaaatcaaagatgaaaatgaat-tgcaagaataactttaatatcatgtaaattggtagaatcatatattacaagattaaaagattacat-tctaagc 39806601  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatg 154  Q
    |   |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||    
T  39806602 tca-atcaagtacctctaatcccaactaaggagatttagttcatcattgtcatg 39806654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 92
Target Start/End: Original strand, 432270 - 432334
Alignment:
Q  28 gcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacat 92  Q
    |||||||||||| ||||||  ||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  432270 gcaagaataacaacaatattgaataaattgctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacat 432334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 92
Target Start/End: Original strand, 9667625 - 9667689
Alignment:
Q  28 gcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacat 92  Q
    |||||||||||| ||||||  ||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  9667625 gcaagaataacaacaatattgaataaattgctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacat 9667689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 28 - 92
Target Start/End: Original strand, 12168145 - 12168210
Alignment:
Q  28 gcaagaataacatcaatatcaaatcaa-atgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacat 92  Q
    |||||||||||| ||||||  ||| || | |||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  12168145 gcaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacat 12168210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 28 - 92
Target Start/End: Original strand, 38121861 - 38121926
Alignment:
Q  28 gcaagaataacatcaatatcaaatcaa-atgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacat 92  Q
    |||||||||||| ||||||  ||| || | |||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  38121861 gcaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacat 38121926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 28 - 92
Target Start/End: Original strand, 39001110 - 39001175
Alignment:
Q  28 gcaagaataacatcaatatcaaatcaa-atgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacat 92  Q
    |||||||||||| ||||||  ||| || | |||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  39001110 gcaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacat 39001175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 92
Target Start/End: Original strand, 33492128 - 33492192
Alignment:
Q  29 caagaataacatcaatatcaaatcaa-atgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacat 92  Q
    ||||||||||| ||||||  ||| || | |||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  33492128 caagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacat 33492192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 92
Target Start/End: Original strand, 41000033 - 41000097
Alignment:
Q  28 gcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacat 92  Q
    |||||||||||| ||||||  ||| ||  |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  41000033 gcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacat 41000097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 32)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 36781960 - 36781732
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    |||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  36781960 aattaaatcaagcataagcattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgttaaa-c 36781862  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacact 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36781861 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaagaatgaattgaaagagaaagatccattacacact 36781762  T
Q  201 cgtgatctctcaacaaagtgatgtagaatt 230  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36781761 tgtgatctctcaacaaagtgatgtagaatt 36781732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 43268305 - 43268521
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43268305 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 43268404  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacact 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||| ||||||| |||    
T  43268405 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaagaatgaattgaagaagcaagattcattaca-act 43268503  T
Q  201 cgtgatctctcaacaaag 218  Q
     ||||| |||||||||||    
T  43268504 tgtgatgtctcaacaaag 43268521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 34834588 - 34834372
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34834588 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaggattacatgtttaagc 34834489  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacact 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||| ||||||| |||    
T  34834488 tatgatcaagtacctctagtcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaagaatgaattgaagaagcaagattcattaca-act 34834390  T
Q  201 cgtgatctctcaacaaag 218  Q
     ||||| |||||||||||    
T  34834389 tgtgatgtctcaacaaag 34834372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 34841032 - 34840816
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34841032 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaggattacatgtttaagc 34840933  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacact 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||| ||||||| |||    
T  34840932 tatgatcaagtacctctagtcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaagaatgaattgaagaagcaagattcattaca-act 34840834  T
Q  201 cgtgatctctcaacaaag 218  Q
     ||||| |||||||||||    
T  34840833 tgtgatgtctcaacaaag 34840816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 15852996 - 15853212
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15852996 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatg-ttaagc 15853094  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatcca-ttacacac 199  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||| ||    
T  15853095 taagatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaagaatgaattgaaggagaaagattcatttaca-ac 15853193  T
Q  200 tcgtgatctctcaacaaag 218  Q
    | ||||| |||||||||||    
T  15853194 ttgtgatttctcaacaaag 15853212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 45012429 - 45012645
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45012429 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatg-ttaagc 45012527  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatcca-ttacacac 199  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||| ||    
T  45012528 taagatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaagaatgaattgaaggagaaagattcatttaca-ac 45012626  T
Q  200 tcgtgatctctcaacaaag 218  Q
    | ||||| |||||||||||    
T  45012627 ttgtgatttctcaacaaag 45012645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 29485341 - 29485557
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29485341 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatg-ttaagc 29485439  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatcca-ttacacac 199  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| || ||||| ||    
T  29485440 taagatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaagaatgaatttaaggagaaagattcatttaca-ac 29485538  T
Q  200 tcgtgatctctcaacaaag 218  Q
    | ||||| |||||||||||    
T  29485539 ttgtgatttctcaacaaag 29485557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 13901732 - 13901516
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13901732 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacattaatatcaaatcaaatgatagaaccatatatttatagatcaaaggattacatgtttaagc 13901633  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacact 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  || ||||| ||||||| |||    
T  13901632 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaagaatgaatcgaagaagcaagattcattaca-act 13901534  T
Q  201 cgtgatctctcaacaaag 218  Q
     ||||| |||||||||||    
T  13901533 tgtgatgtctcaacaaag 13901516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 2021224 - 2021010
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2021224 aattaaatcaaagataaatattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctataaccatatatttatagatcaaaagattacatg-ttaagc 2021126  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacact 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||| |||    
T  2021125 taagatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaagaatgaattgaagaagaaagattcattaca-act 2021027  T
Q  201 cgtgatctctcaacaaa 217  Q
     ||||| ||||||||||    
T  2021026 tgtgatttctcaacaaa 2021010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 21067733 - 21067518
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21067733 aattaaatcaaatataaacattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaatattacatgtttaagc 21067634  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacact 200  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||| |||    
T  21067633 taagatcaaatacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaagaatgaattgaagaagaaagattcattaca-act 21067535  T
Q  201 cgtgatctctcaacaaa 217  Q
     ||||| ||||||||||    
T  21067534 tgtgatttctcaacaaa 21067518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 42931148 - 42930965
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42931148 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatg-ttaagc 42931050  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaa 185  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  42931049 taagatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaagaatgaattgaaggagaaa 42930965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 2158058 - 2158273
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |    
T  2158058 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacctcaatatcaattcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaacgattacatg-ttaaac 2158156  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacact 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||| ||||||| |||    
T  2158157 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaagaatgaattgaagaagcaagattcattaca-act 2158255  T
Q  201 cgtgatctctcaacaaag 218  Q
     ||||| |||||||||||    
T  2158256 tgtgatgtctcaacaaag 2158273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 2164474 - 2164689
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |    
T  2164474 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacctcaatatcaattcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaacgattacatg-ttaaac 2164572  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacact 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||| ||||||| |||    
T  2164573 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaagaatgaattgaagaagcaagattcattaca-act 2164671  T
Q  201 cgtgatctctcaacaaag 218  Q
     ||||| |||||||||||    
T  2164672 tgtgatgtctcaacaaag 2164689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 12951242 - 12951457
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |    
T  12951242 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacctcaatatcaattcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaacgattacatg-ttaaac 12951340  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacact 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||| ||||||| |||    
T  12951341 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaagaatgaattgaagaagcaagattcattaca-act 12951439  T
Q  201 cgtgatctctcaacaaag 218  Q
     ||||| |||||||||||    
T  12951440 tgtgatgtctcaacaaag 12951457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 21341702 - 21341487
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21341702 aattaaatcaaacataagcattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatg-ttaagc 21341604  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacact 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||| |||    
T  21341603 taagatcaagtacctctaatcccaacaaaggatatttagctactcattgtcatggaagccttgcaagaatgaattgaagaagaaagattcattaca-act 21341505  T
Q  201 cgtgatctctcaacaaag 218  Q
     ||||| |||||||||||    
T  21341504 tgtgatttctcaacaaag 21341487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 16817106 - 16816892
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  16817106 aattaaatcaaagataaacattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaaagttacatg-ttaagc 16817008  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacact 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||| ||||||| |||    
T  16817007 taagatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaagaatgaattgaagaagcaagattcattaca-act 16816909  T
Q  201 cgtgatctctcaacaaa 217  Q
     ||||| ||||||||||    
T  16816908 tgtgatttctcaacaaa 16816892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 16856263 - 16856049
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  16856263 aattaaatcaaagataaacattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaaagttacatg-ttaagc 16856165  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacact 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||| ||||||| |||    
T  16856164 taagatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaagaatgaattgaagaagcaagattcattaca-act 16856066  T
Q  201 cgtgatctctcaacaaa 217  Q
     ||||| ||||||||||    
T  16856065 tgtgatttctcaacaaa 16856049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 21331770 - 21331594
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21331770 aattaaatcaaacataagcattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatg-ttaagc 21331672  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaa 178  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21331671 taagatcaagtacctctaatcccaacaaaggatatttagctactcattgtcatggaagccttgcaagaatgaattgaa 21331594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 13163265 - 13163478
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    |||||||||||| ||||  || ||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||    
T  13163265 aattaaatcaaacataagcat-aaattgcaagaataatctcaatatcaaatcaaatgctacaatcatatatt-atagatcaaaagattacatgtttt-gc 13163361  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccat-tacacac 199  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||  |||| | |||||  ||||| ||| |||| ||    
T  13163362 t-tgatcaagtacctctaatcccaacaatggagatttagctactcattgtcatggtaactttgcaagattgaagtaaaagatgaagattcatatacaaac 13163460  T
Q  200 tcgtgatctctcaacaaa 217  Q
    | ||||| ||||||||||    
T  13163461 ttgtgatttctcaacaaa 13163478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 11909726 - 11909575
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    |||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||| |||||| |||    
T  11909726 aattaaatcaaacataagcaataaagtgcaagaataacctcaatatcaaatcaaatgctagaatcatata-ttaaagattaaaagattaaatgttt-agc 11909629  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatgg 155  Q
    || |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11909628 ta-gatcaagtacctccgatcccaacaatggagatttagctactcattgtcatgg 11909575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 37439309 - 37439159
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    |||||||||||||||||| || ||| |||||||||||  |||||||||  | || |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| | |||||    
T  37439309 aattaaatcaaagataaaaatgaaa-tgcaagaataaactcaatatcatgtaaattgctagaatcatatattcaaagatcaaaagattacat-tctaagc 37439212  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatg 154  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  37439211 t-tgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagttgatcattgtcatg 37439159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 26 - 154
Target Start/End: Original strand, 17863954 - 17864080
Alignment:
Q  26 gtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagctatgatcaagtacctctaatcccaa 125  Q
    ||||||||||||  ||||||||| || || |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| | |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  17863954 gtgcaagaataaactcaatatcacataaattgctagaatcatatatttaaagaacaaaagattacat-tctaagct-taatcaagtacctctaatcccaa 17864051  T
Q  126 caaaggagatttagctactcattgtcatg 154  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  17864052 caaaggagatttagctgatcattgtcatg 17864080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 5 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 34745061 - 34744913
Alignment:
Q  5 aaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagat-tacatgtttaagctat 103  Q
    |||||||| ||||| || ||| |||||| |||| ||||||||||| | |||  |||||| ||||||||||  ||||||||||  |||||  | | ||| |    
T  34745061 aaatcaaacataaacatgaaa-tgcaaggataatatcaatatcaagtaaaagactagaatcatatatttaaggatcaaaagaaatacatact-atgct-t 34744965  T
Q  104 gatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatgg 155  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34744964 gatcaagtacatctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatgg 34744913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Original strand, 36842234 - 36842385
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    ||||||||||||||||   | | || |||||||||||| | |||||||  | || |||||||| |||||| |   ||||||||||||||||| |||||||    
T  36842234 aattaaatcaaagataggaaatgaattgcaagaataactttaatatcatgtaaattgctagaatcatataatacaagatcaaaagattacat-tttaagc 36842332  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatg 154  Q
    |   |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||    
T  36842333 tca-atcaagtacctctaatcccaactaaggagatttagttcatcattgtcatg 36842385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Original strand, 41456053 - 41456203
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    |||||||||||||||||| || ||  |||||||||||  |||||||||  | || ||||||||  |||||||   |||| |||||||||||| | |||||    
T  41456053 aattaaatcaaagataaaaatgaat-tgcaagaataatttcaatatcatgtaaattgctagaattatatattacaagattaaaagattacat-tctaagc 41456150  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatg 154  Q
    |   |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||    
T  41456151 tca-atcaagtacctctaatcccaacgaaggagatttagttcatcattgtcatg 41456203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 24852777 - 24852672
Alignment:
Q  27 tgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttata-gatcaaaagattacatgtttaagctatgatcaagtacctctaatcccaa 125  Q
    |||||||||||  ||||||||| || ||  ||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||| |||| ||||    
T  24852777 tgcaagaataaactcaatatcacataaatagctagaatcatatatttaaaagatcaaaagattacatct--aagct-tgatcaagtacctgtaattccaa 24852681  T
Q  126 caaaggaga 134  Q
    |||||||||    
T  24852680 caaaggaga 24852672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 28 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 29223947 - 29223882
Alignment:
Q  28 gcaagaataacatcaatatcaaatcaa-atgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacat 92  Q
    |||||||||||| ||||||  ||| || | |||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  29223947 gcaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacat 29223882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 28 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 29337246 - 29337181
Alignment:
Q  28 gcaagaataacatcaatatcaaatcaa-atgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacat 92  Q
    |||||||||||| ||||||  ||| || | |||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  29337246 gcaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacat 29337181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 92
Target Start/End: Original strand, 13230271 - 13230335
Alignment:
Q  28 gcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacat 92  Q
    |||||||||||| ||||||  ||| ||  |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  13230271 gcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacat 13230335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 22197733 - 22197701
Alignment:
Q  134 atttagctactcattgtcatggaagccttgcaa 166  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22197733 atttagctactcattgtcatggaaaccttgcaa 22197701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 92
Target Start/End: Original strand, 36040192 - 36040256
Alignment:
Q  28 gcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacat 92  Q
    |||||||||||| ||||||  ||| ||  |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  36040192 gcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacat 36040256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 92
Target Start/End: Original strand, 36667798 - 36667862
Alignment:
Q  28 gcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacat 92  Q
    |||||||||||| ||||||  ||| ||  |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  36667798 gcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacat 36667862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 40)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 4974009 - 4974236
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  4974009 aattaaatcaaacataagcattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttgtagatcaaaagattacatgtt-aagc 4974107  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacact 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4974108 taagatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaagaatgaattgaaagaggaagatccattacacact 4974207  T
Q  201 cgtgatctctcaacaaagtgatgtagaat 229  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||    
T  4974208 tgtgatctctcaacaaaatgatgtagaat 4974236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 2958305 - 2958521
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2958305 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatg-ttaagc 2958403  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatcca-ttacacac 199  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||| ||    
T  2958404 taagatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaagaatgaattgaaggagaaagattcatttaca-ac 2958502  T
Q  200 tcgtgatctctcaacaaag 218  Q
    | ||||| |||||||||||    
T  2958503 ttgtgatttctcaacaaag 2958521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 2966774 - 2966990
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2966774 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatg-ttaagc 2966872  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatcca-ttacacac 199  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||| ||    
T  2966873 taagatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaagaatgaattgaaggagaaagattcatttaca-ac 2966971  T
Q  200 tcgtgatctctcaacaaag 218  Q
    | ||||| |||||||||||    
T  2966972 ttgtgatttctcaacaaag 2966990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 25894425 - 25894209
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25894425 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatg-ttaagc 25894327  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatcca-ttacacac 199  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||| ||    
T  25894326 taagatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaagaatgaattgaaggagaaagattcatttaca-ac 25894228  T
Q  200 tcgtgatctctcaacaaag 218  Q
    | ||||| |||||||||||    
T  25894227 ttgtgatttctcaacaaag 25894209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 40958393 - 40958179
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40958393 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatg-ttaagc 40958295  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacact 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||| |||    
T  40958294 taagatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcactgtcatggaagccttgcaagaatgaattgaagaagaaagattcattaca-act 40958196  T
Q  201 cgtgatctctcaacaaa 217  Q
     ||||| ||||||||||    
T  40958195 tgtgatttctcaacaaa 40958179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 29414445 - 29414230
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29414445 aattaaatcaaagataaacattaaagtgaaagaataacatcaatatcaaatcaaatgttagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 29414346  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacact 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||| |||    
T  29414345 taagatcaagtacctctaatcccaacaaaggaaatttagctactcattgtcatggaagccttgcaagaatgaattgaagaagaaagattcattaca-act 29414247  T
Q  201 cgtgatctctcaacaaa 217  Q
     ||||| ||||||||||    
T  29414246 tgtgatttctcaacaaa 29414230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 29980905 - 29981120
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |    
T  29980905 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacctcaatatcaattcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaacgattacatg-ttaaac 29981003  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacact 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||| ||||||| |||    
T  29981004 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaagaatgaattgaagaagcaagattcattaca-act 29981102  T
Q  201 cgtgatctctcaacaaag 218  Q
     ||||| |||||||||||    
T  29981103 tgtgatgtctcaacaaag 29981120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 34357064 - 34356849
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |    
T  34357064 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacctcaatatcaattcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaacgattacatg-ttaaac 34356966  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacact 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||| ||||||| |||    
T  34356965 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaagaatgaattgaagaagcaagattcattaca-act 34356867  T
Q  201 cgtgatctctcaacaaag 218  Q
     ||||| |||||||||||    
T  34356866 tgtgatgtctcaacaaag 34356849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 34358855 - 34358640
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |    
T  34358855 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacctcaatatcaattcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaatgattacatg-ttaaac 34358757  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacact 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||| ||||||| |||    
T  34358756 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaagaatgaattgaagaagcaagattcattaca-act 34358658  T
Q  201 cgtgatctctcaacaaag 218  Q
     ||||| |||||||||||    
T  34358657 tgtgatgtctcaacaaag 34358640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 42151265 - 42151479
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42151265 aattaaatcaaagataaacattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatg-ttaagc 42151363  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacact 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||| ||||||| |||    
T  42151364 taagatcaagtacctctaatcccaatgaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaagaatgaattgaagaagcaagattcattaca-act 42151462  T
Q  201 cgtgatctctcaacaaa 217  Q
     ||||| ||||||||||    
T  42151463 tgtgatttctcaacaaa 42151479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 22360410 - 22360624
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  22360410 aattaaatcaaagataaacattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctataaccatatatttatagatcaaaagattacatg-ttaagt 22360508  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacact 200  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||| ||||||| |||    
T  22360509 taaggtcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaagaatgaattgaagaagcaagattcattaca-act 22360607  T
Q  201 cgtgatctctcaacaaa 217  Q
     ||||| ||||||||||    
T  22360608 tgtgatttctcaacaaa 22360624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 5876664 - 5876878
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  5876664 aattaaatcaaagataaacattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagtttacatg-ttaagc 5876762  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacact 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||  || ||||| ||||||| |||    
T  5876763 taggatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattatcatggaagctttgcaaaaatgaattgaagaagcaagattcattaca-act 5876861  T
Q  201 cgtgatctctcaacaaa 217  Q
     ||||| ||||||||||    
T  5876862 tgtgatttctcaacaaa 5876878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 22314276 - 22314490
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  22314276 aattaaatcaaagataaacattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctataaccatatatttatagatcaaaagattacaag-ttaagc 22314374  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacact 200  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||| ||||||| |||    
T  22314375 taaggtcaagtacctctaatcccaacaaaggaggtttagctactcattgtcatggaagccttgcaagaatgaattgaagaagcaagattcattaca-act 22314473  T
Q  201 cgtgatctctcaacaaa 217  Q
     ||||| ||||||||||    
T  22314474 tgtgatttctcaacaaa 22314490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 2439247 - 2439461
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    |||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  2439247 aattaaatcaaacaaaagcattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgttagaaccatatatttatagattaaaagattacatgtt-aagc 2439345  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacact 200  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| |||    
T  2439346 taagatcaagtacctctaatccgaacaaaggagatttagctactcaatgtcatggaagctttgcaagaatgaattgaaagagaatgattcattacaaact 2439445  T
Q  201 cgtgatctctcaacaa 216  Q
     ||||| |||||||||    
T  2439446 tgtgatttctcaacaa 2439461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 2 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 12505540 - 12505326
Alignment:
Q  2 attaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagct 101  Q
    ||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  12505540 attaaatcaaacataagcaataaagtgcaagaataatctcaatatcaaaggaaatgctagaaccatatattaatagatcaaaagattacatgttta-gct 12505442  T
Q  102 atgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacactc 201  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||   |     
T  12505441 aagatcaagtacctctaatcccaacaatggagatttagctactcattgtcatggaagctttgcaagaatgaattgaaagagaacgattcattacaacttt 12505342  T
Q  202 gtgatctctcaacaaa 217  Q
    ||||||||||||||||    
T  12505341 gtgatctctcaacaaa 12505326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 30041020 - 30040905
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |    
T  30041020 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacctcaatatcaattcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaacgattacatg-ttaaac 30040922  T
Q  101 tatgatcaagtacctct 117  Q
    |||||||||||||||||    
T  30040921 tatgatcaagtacctct 30040905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 112 - 218
Target Start/End: Original strand, 29974514 - 29974619
Alignment:
Q  112 acctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacactcgtgatctctc 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||| ||||||| ||| ||||| ||||    
T  29974514 acctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaagaatgaattgaagaagcaagattcattaca-acttgtgatgtctc 29974612  T
Q  212 aacaaag 218  Q
    |||||||    
T  29974613 aacaaag 29974619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 112 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 30022128 - 30022023
Alignment:
Q  112 acctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacactcgtgatctctc 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||| ||||||| ||| ||||| ||||    
T  30022128 acctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaagaatgaattgaagaagcaagattcattaca-acttgtgatgtctc 30022030  T
Q  212 aacaaag 218  Q
    |||||||    
T  30022029 aacaaag 30022023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 28 - 155
Target Start/End: Original strand, 42747558 - 42747683
Alignment:
Q  28 gcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagctatgatcaagtacctctaatcccaaca 127  Q
    ||||||||||  |||||||||||| ||  ||||||| |||||||| | |||||||||||||||||  | | ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  42747558 gcaagaataatctcaatatcaaataaagagctagaatcatatattcaaagatcaaaagattacatact-aggct-tgatcaagtacgtctaatcccaaca 42747655  T
Q  128 aaggagatttagctactcattgtcatgg 155  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42747656 aaggagatttagctactcattctcatgg 42747683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 27 - 154
Target Start/End: Original strand, 34738611 - 34738736
Alignment:
Q  27 tgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatattt-atagatcaaaagattacatgtttaagctatgatcaagtacctctaatcccaa 125  Q
    |||||||||||  | ||||||| || || |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34738611 tgcaagaataaacttaatatcacataaattgctagaatcatatatttgaaagatcaaaagattacatct--aagct-tgatcaagtacctctaatcccaa 34738707  T
Q  126 caaaggagatttagctactcattgtcatg 154  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||||    
T  34738708 caaaggagatttagttgatcattgtcatg 34738736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 3413066 - 3412915
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    ||||||||||||||||   | | || |||||||||||| |||||||||  | || |||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||  | ||      
T  3413066 aattaaatcaaagataggaaatgaattgcaagaataacttcaatatcatgtaaattgctagaatcatatattgaaagatcaaaagtttacattatcaact 3412967  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatg 154  Q
    ||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||    
T  3412966 ta--atcaagtacctctaatcccaactaaggagatttagttcatcattgtcatg 3412915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 3 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 19853302 - 19853153
Alignment:
Q  3 ttaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagcta 102  Q
    ||||||||||||||| |  | || |||||||||||| |||||| ||  | || ||||||||  |||||||   ||||||||||||||||| | ||||||     
T  19853302 ttaaatcaaagataagggatgaattgcaagaataacttcaataccatgtaaattgctagaataatatattacaagatcaaaagattacat-tctaagct- 19853205  T
Q  103 tgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatg 154  Q
    | |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||    
T  19853204 taatcaagtatctctaatcccaactaaggagatttagttcatcattgtcatg 19853153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 103 - 166
Target Start/End: Original strand, 37335694 - 37335757
Alignment:
Q  103 tgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaa 166  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  37335694 tgatcaagtacatctaatcccaacaaatgagatttagctactcattgtcattgtagctttgcaa 37335757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 12918726 - 12918575
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    ||||||||||||||||   | | || |||||||||||| |||||||||  | || || ||||| |||||||| | |||||||||| ||||||  | ||      
T  12918726 aattaaatcaaagataggaaatgaattgcaagaataacttcaatatcatgtaaattgttagaatcatatattgaaagatcaaaagtttacattatcaact 12918627  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatg 154  Q
    ||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||    
T  12918626 ta--atcaagtacctctaatcccaactaaggagatttagttcatcattgtcatg 12918575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 2155895 - 2155745
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    |||||||||||||||||| || ||  |||||||||||| | |||||||  | || |||||||| ||||||||   |||| |||| ||||||| | |||||    
T  2155895 aattaaatcaaagataaaaatgaat-tgcaagaataactttaatatcatgtaaattgctagaatcatatattacaagattaaaatattacat-tctaagc 2155798  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatg 154  Q
    |   |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||    
T  2155797 tca-atcaagtacctctaatcccaactaaggagatttagttcatcattgtcatg 2155745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 117 - 166
Target Start/End: Original strand, 17346799 - 17346848
Alignment:
Q  117 taatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaa 166  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17346799 taatcccaacaaatgagatttagctactcattgtcatggtagccttgcaa 17346848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 28 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 11766987 - 11766923
Alignment:
Q  28 gcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacat 92  Q
    |||||||||||| ||||||  ||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  11766987 gcaagaataacaacaatattgaataaattgctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacat 11766923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 28 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 31846212 - 31846148
Alignment:
Q  28 gcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacat 92  Q
    |||||||||||| ||||||  ||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  31846212 gcaagaataacaacaatattgaataaattgctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacat 31846148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 28 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 33434835 - 33434771
Alignment:
Q  28 gcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacat 92  Q
    |||||||||||| ||||||  ||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  33434835 gcaagaataacaacaatattgaataaattgctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacat 33434771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 30579963 - 30579830
Alignment:
Q  4 taaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatattt-atagatcaaaagattacatgtttaagcta 102  Q
    |||||||||||||| || | || | |||||||| |||||||||||  | || |||||||| |||||||||   |||||||||||||||||  | ||  ||    
T  30579963 taaatcaaagataaggaatgaaatacaagaatatcatcaatatcatgtaaattgctagaatcatatatttgcaagatcaaaagattacattatcaactta 30579864  T
Q  103 tgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagattta 138  Q
      || ||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  30579863 --ataaagtacctctaatccaaactaaggagattta 30579830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 117 - 165
Target Start/End: Original strand, 40153906 - 40153954
Alignment:
Q  117 taatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgca 165  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||||    
T  40153906 taatcccaacaaatgagatttaactactcattgtcatggtaaccttgca 40153954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 28 - 92
Target Start/End: Original strand, 11723205 - 11723270
Alignment:
Q  28 gcaagaataacatcaatatcaaatcaa-atgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacat 92  Q
    |||||||||||| ||||||  ||| || | |||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  11723205 gcaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacat 11723270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 28 - 92
Target Start/End: Original strand, 16904538 - 16904603
Alignment:
Q  28 gcaagaataacatcaatatcaaatcaa-atgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacat 92  Q
    |||||||||||| ||||||  ||| || | |||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  16904538 gcaagaataacaacaatattgaataaataggctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacat 16904603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 28 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 24835968 - 24835903
Alignment:
Q  28 gcaagaataacatcaatatcaaatcaa-atgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacat 92  Q
    |||||||||||| ||||||  ||| || | |||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  24835968 gcaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacat 24835903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 27 - 92
Target Start/End: Original strand, 27167026 - 27167091
Alignment:
Q  27 tgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacat 92  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||| ||  |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  27167026 tgcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacat 27167091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 7315197 - 7315133
Alignment:
Q  29 caagaataacatcaatatcaaatcaa-atgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacat 92  Q
    ||||||||||| ||||||  ||| || | |||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  7315197 caagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacat 7315133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 7315436 - 7315372
Alignment:
Q  29 caagaataacatcaatatcaaatcaa-atgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacat 92  Q
    ||||||||||| ||||||  ||| || | |||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  7315436 caagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacat 7315372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 9404656 - 9404592
Alignment:
Q  29 caagaataacatcaatatcaaatcaa-atgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacat 92  Q
    ||||||||||| ||||||  ||| || | |||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  9404656 caagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacat 9404592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 92
Target Start/End: Original strand, 30607006 - 30607070
Alignment:
Q  29 caagaataacatcaatatcaaatcaa-atgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacat 92  Q
    ||||||||||| ||||||  ||| || | |||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  30607006 caagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacat 30607070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 34456529 - 34456465
Alignment:
Q  29 caagaataacatcaatatcaaatcaa-atgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacat 92  Q
    ||||||||||| ||||||  ||| || | |||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  34456529 caagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacat 34456465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 27)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 36021575 - 36021359
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  36021575 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttataaatcaaaggattacatgtttaagc 36021476  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacact 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||| ||||||| |||    
T  36021475 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaagaatgaattgaagaagcaagattcattaca-act 36021377  T
Q  201 cgtgatctctcaacaaag 218  Q
     ||||| |||||||||||    
T  36021376 tgtgatgtctcaacaaag 36021359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 36425506 - 36425290
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36425506 aattaaaccaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatg-ttaagc 36425408  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatcca-ttacacac 199  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||| ||    
T  36425407 taagatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaagaatgaattgaaggagaaagattcatttaca-ac 36425309  T
Q  200 tcgtgatctctcaacaaag 218  Q
    | ||||| |||||||||||    
T  36425308 ttgtgatttctcaacaaag 36425290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 1238660 - 1238875
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1238660 aattaaatcaaagataaacattaaagtgcaagaataacatcaataacaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 1238759  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacact 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||| |||    
T  1238760 taagatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttaactactcattgtcatagaagccttgcaagaatgaattgaagaagaaagattcattaca-act 1238858  T
Q  201 cgtgatctctcaacaaa 217  Q
     ||||| ||||||||||    
T  1238859 tgtgatttctcaacaaa 1238875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 11357969 - 11357753
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11357969 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatg-ttaagc 11357871  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatcca-ttacacac 199  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||| || || ||||| ||    
T  11357870 taagatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtgatggaagccttgcaagaatgaattgaaggagaaaaattcatttaca-ac 11357772  T
Q  200 tcgtgatctctcaacaaag 218  Q
    | ||||| |||||||||||    
T  11357771 ttgtgatttctcaacaaag 11357753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 16710444 - 16710229
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16710444 aattaaatcaaagataaacattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaggattacatgtttaagc 16710345  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacact 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  || ||||| ||||||| |||    
T  16710344 tatgatcaagtatctctaatcccaacaagggagatttagctactcattgtcatggaagtcttgcaagaatgaattgaagaagcaagattcattaca-act 16710246  T
Q  201 cgtgatctctcaacaaa 217  Q
     ||||| ||||||||||    
T  16710245 tgtgatttctcaacaaa 16710229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 45068192 - 45067977
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  45068192 aattaaatcaaacataagcattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgttt-agc 45068094  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacact 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||| |||    
T  45068093 taagatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactccttgtcattgaagccttgcaaaaatgaattgaaagagaatgattcattacaaact 45067994  T
Q  201 cgtgatctctcaacaaa 217  Q
     ||||||||||||||||    
T  45067993 tgtgatctctcaacaaa 45067977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 6464352 - 6464137
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |    
T  6464352 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacctcaatatcaattcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaacgattacatg-ttaaac 6464254  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacact 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||| ||||||| |||    
T  6464253 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaagaatgaattgaagaagcaagattcattaca-act 6464155  T
Q  201 cgtgatctctcaacaaag 218  Q
     ||||| |||||||||||    
T  6464154 tgtgatgtctcaacaaag 6464137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 7311795 - 7312010
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |    
T  7311795 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacctcaatatcaattcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaacgattacatg-ttaaac 7311893  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacact 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||| ||||||| |||    
T  7311894 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaagaatgaattgaagaagcaagattcattaca-act 7311992  T
Q  201 cgtgatctctcaacaaag 218  Q
     ||||| |||||||||||    
T  7311993 tgtgatgtctcaacaaag 7312010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 8013096 - 8012881
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |    
T  8013096 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacctcaatatcaattcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaacgattacatg-ttaaac 8012998  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacact 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||| ||||||| |||    
T  8012997 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaagaatgaattgaagaagcaagattcattaca-act 8012899  T
Q  201 cgtgatctctcaacaaag 218  Q
     ||||| |||||||||||    
T  8012898 tgtgatgtctcaacaaag 8012881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 36005258 - 36005043
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |    
T  36005258 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacctcaatatcaattcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaacgattacatg-ttaaac 36005160  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacact 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||| ||||||| |||    
T  36005159 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaagaatgaattgaagaagcaagattcattaca-act 36005061  T
Q  201 cgtgatctctcaacaaag 218  Q
     ||||| |||||||||||    
T  36005060 tgtgatgtctcaacaaag 36005043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 36076413 - 36076628
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |    
T  36076413 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacctcaatatcaattcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaacgattacatg-ttaaac 36076511  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacact 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||| ||||||| |||    
T  36076512 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaagaatgaattgaagaagcaagattcattaca-act 36076610  T
Q  201 cgtgatctctcaacaaag 218  Q
     ||||| |||||||||||    
T  36076611 tgtgatgtctcaacaaag 36076628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 15012834 - 15013049
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || |    
T  15012834 aattaaatcaaacataagcattaaagtgcaagaataacatcaatattaaatcaaatgctagaaccatatatttctatatcaaaagattacatgttaaa-c 15012932  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacact 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| |||    
T  15012933 taagatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaagaatgaattgaaagagaaggattcattacaaact 15013032  T
Q  201 cgtgatctctcaacaaa 217  Q
     ||||||||||||||||    
T  15013033 tgtgatctctcaacaaa 15013049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 26250367 - 26250186
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26250367 aattaaatcaaacataagcattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaa-tgttagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgttta-gc 26250270  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaa 184  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26250269 taagatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaagaatgaattgaaagagaa 26250186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 27 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 29336812 - 29336687
Alignment:
Q  27 tgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagctatgatcaagtacctctaatcccaac 126  Q
    |||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29336812 tgcaagaataatctcaatatcaagtaaaatgctagaaccatatatttgaagatcaaaagattacatact-aagct-tgatcaagtacctctaatcccaac 29336715  T
Q  127 aaaggagatttagctactcattgtcatg 154  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||    
T  29336714 aaaggagaattagttactcattgtcatg 29336687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Original strand, 14394144 - 14394295
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    |||||||||||||||||  | | || |||||||||||| |||||||||  | || |||||||| |||||||||  |||||||| |||||||| | |||||    
T  14394144 aattaaatcaaagataagaaatgaattgcaagaataacttcaatatcatttaaattgctagaatcatatatttcaagatcaaaggattacat-tctaagc 14394242  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatg 154  Q
    | | | ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |  |||||||||||    
T  14394243 t-taaacaagtacctctaatctcaactaaggagatttagttcatcattgtcatg 14394295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 24220048 - 24219912
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    ||||||||||||||||   | | || |||||||||||| |||||||||  | || |||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||  | ||      
T  24220048 aattaaatcaaagataggaaatgaattgcaagaataacttcaatatcatgtaaattgctagaatcatatattgaaagatcaaaagtttacattatcaact 24219949  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttag 139  Q
    ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24219948 ta--atcaagtacctctaatcccaactaaggagatttag 24219912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 7933701 - 7933551
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    |||||||||||||||| | || ||  |||||||||||| |||||||||  | || |||||||| ||||||||   |||| |||||||||||| | |||||    
T  7933701 aattaaatcaaagatagaaatgaat-tgcaagaataacttcaatatcatgtaaattgctagaatcatatattacaagattaaaagattacat-tctaagc 7933604  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatg 154  Q
    |   |||||||||||||||||||||| || ||||||||| |  |||||||||||    
T  7933603 tca-atcaagtacctctaatcccaactaaagagatttagttcatcattgtcatg 7933551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 28 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 3299034 - 3298970
Alignment:
Q  28 gcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacat 92  Q
    |||||||||||| ||||||  ||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  3299034 gcaagaataacaacaatattgaataaattgctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacat 3298970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 28 - 92
Target Start/End: Original strand, 9068096 - 9068161
Alignment:
Q  28 gcaagaataacatcaatatcaaatcaa-atgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacat 92  Q
    |||||||||||| ||||||  ||| || | |||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  9068096 gcaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacat 9068161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 28 - 92
Target Start/End: Original strand, 11308916 - 11308981
Alignment:
Q  28 gcaagaataacatcaatatcaaatcaa-atgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacat 92  Q
    |||||||||||| ||||||  ||| || | |||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  11308916 gcaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacat 11308981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 28 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 16580318 - 16580253
Alignment:
Q  28 gcaagaataacatcaatatcaaatcaa-atgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacat 92  Q
    |||||||||||| ||||||  ||| || | |||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  16580318 gcaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacat 16580253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 28 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 28370326 - 28370261
Alignment:
Q  28 gcaagaataacatcaatatcaaatcaa-atgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacat 92  Q
    |||||||||||| ||||||  ||| || | |||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  28370326 gcaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacat 28370261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 92
Target Start/End: Original strand, 4861880 - 4861944
Alignment:
Q  28 gcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacat 92  Q
    |||||||||||| ||||||  ||| ||  |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  4861880 gcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacat 4861944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 92
Target Start/End: Original strand, 8743213 - 8743277
Alignment:
Q  29 caagaataacatcaatatcaaatcaa-atgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacat 92  Q
    ||||||||||| ||||||  ||| || | |||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  8743213 caagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacat 8743277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 22180834 - 22180770
Alignment:
Q  28 gcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacat 92  Q
    |||||||||||| ||||||  ||| ||  |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  22180834 gcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacat 22180770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 92
Target Start/End: Original strand, 34006701 - 34006765
Alignment:
Q  28 gcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacat 92  Q
    |||||||||||| ||||||  ||| ||  |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  34006701 gcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacat 34006765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 92
Target Start/End: Original strand, 41577261 - 41577325
Alignment:
Q  29 caagaataacatcaatatcaaatcaa-atgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacat 92  Q
    ||||||||||| ||||||  ||| || | |||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  41577261 caagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacat 41577325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0343 (Bit Score: 173; Significance: 4e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0343
Description:

Target: scaffold0343; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 3091 - 3318
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  3091 aattaaatcaaacataagcattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatactagaaccatatatttttagatcaaaagattacatgtt-aagc 3189  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacact 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3190 taagatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttaactactcattgtcatggaagccttgcaagaatgaattgaaagagaaggatccattacacact 3289  T
Q  201 cgtgatctctcaacaaagtgatgtagaat 229  Q
     ||||||||| |||||| |||||||||||    
T  3290 tgtgatctcttaacaaaatgatgtagaat 3318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0510 (Bit Score: 170; Significance: 2e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0510
Description:

Target: scaffold0510; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 8657 - 8445
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8657 aattaaatcaaagataaacattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaggattacatgtttaagc 8558  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacact 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||| ||||||| |||    
T  8557 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaagaatgaattgaagaagcaagattcattaca-act 8459  T
Q  201 cgtgatctctcaac 214  Q
     ||||| |||||||    
T  8458 tgtgatttctcaac 8445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 158; Significance: 3e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 50136 - 50351
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |    
T  50136 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacctcaatatcaattcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaacgattacatg-ttaaac 50234  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacact 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||| ||||||| |||    
T  50235 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaagaatgaattgaagaagcaagattcattaca-act 50333  T
Q  201 cgtgatctctcaacaaag 218  Q
     ||||| |||||||||||    
T  50334 tgtgatgtctcaacaaag 50351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 158; Significance: 3e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 4781 - 4566
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |    
T  4781 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacctcaatatcaattcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaacgattacatg-ttaaac 4683  T
Q  101 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacact 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||| ||||||| |||    
T  4682 tatgatcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaagaatgaattgaagaagcaagattcattaca-act 4584  T
Q  201 cgtgatctctcaacaaag 218  Q
     ||||| |||||||||||    
T  4583 tgtgatgtctcaacaaag 4566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0936 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0936
Description:

Target: scaffold0936; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 3040 - 2823
Alignment:
Q  1 aattaaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagc 100  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3040 aattaaatcaaacataagcattaaagtgcaagaatgacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtt-aagc 2942  T
Q  101 tatgatca--agtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacaca 198  Q
    || |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| |    
T  2941 taagatcataagtacctctaatcacaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaagaatgaattgaaagagaaggattcattacaaa 2842  T
Q  199 ctcgtgatctctcaacaaa 217  Q
    || ||||| ||||||||||    
T  2841 cttgtgatttctcaacaaa 2823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 149; Significance: 8e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 5 - 217
Target Start/End: Original strand, 15621 - 15832
Alignment:
Q  5 aaatcaaagataaagattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagctatg 104  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  15621 aaatcaaacataaacattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctaaaaccatatatttatagatcaaaagaatacatgtt-aagctaag 15719  T
Q  105 atcaagtacctctaatcccaacaaaggagatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacactcgtg 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||     
T  15720 atcaagtacctttaatcccaacaaaggagatttatctactcattgtcatggaagcctttcaagaatgaattgaaagagaatgattcattacaaacttgta 15819  T
Q  205 atctctcaacaaa 217  Q
    |||||||||||||    
T  15820 atctctcaacaaa 15832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0513
Description:

Target: scaffold0513; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 33 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 11877 - 11694
Alignment:
Q  33 aataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagctatgatcaagtacctctaatcccaacaaagga 132  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11877 aataacatcaatatcaattcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacatgtttaagctaagatcaagtacctctaatcccaacaaagga 11778  T
Q  133 gatttagctactcattgtcatggaagccttgcaaggatgaattgaaagagaaagatccattacacactcgtgatctctcaacaaa 217  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||| |||| || ||| ||||| ||||||||||    
T  11777 gatttagctactcattgacatggaagccttgcaagaatgaattgaagaagcaagattcatttca-acttgtgatttctcaacaaa 11694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 28 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 8975 - 8910
Alignment:
Q  28 gcaagaataacatcaatatcaaatcaa-atgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacat 92  Q
    |||||||||||| ||||||  ||| || | |||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  8975 gcaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacat 8910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 27 - 92
Target Start/End: Original strand, 12132 - 12197
Alignment:
Q  27 tgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacat 92  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||| ||  ||||| |||||||||| | |||||||||||||||||    
T  12132 tgcaagaataacaacaatattgaataaatagctagtaccatatattaaaagatcaaaagattacat 12197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 27 - 92
Target Start/End: Original strand, 15902 - 15967
Alignment:
Q  27 tgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacat 92  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||| ||  ||||| |||||||||| | |||||||||||||||||    
T  15902 tgcaagaataacaacaatattgaataaatagctagtaccatatattaaaagatcaaaagattacat 15967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 28 - 92
Target Start/End: Original strand, 28828 - 28893
Alignment:
Q  28 gcaagaataacatcaatatcaaatcaa-atgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacat 92  Q
    |||||||||||| ||||||  ||| || | |||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  28828 gcaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacat 28893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 28 - 92
Target Start/End: Original strand, 25579 - 25644
Alignment:
Q  28 gcaagaataacatcaatatcaaatcaa-atgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacat 92  Q
    |||||||||||| ||||||  ||| || | |||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  25579 gcaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacat 25644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University