View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5907_low_79 (Length: 228)

Name: NF5907_low_79
Description: NF5907
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5907_low_79
NF5907_low_79
[»] chr8 (20 HSPs)
chr8 (1-228)||(36021564-36021791)
chr8 (1-228)||(6464341-6464568)
chr8 (1-228)||(7311579-7311806)
chr8 (1-228)||(36076197-36076424)
chr8 (1-228)||(8013085-8013312)
chr8 (1-228)||(16710433-16710660)
chr8 (1-228)||(36005247-36005474)
chr8 (1-228)||(1238444-1238671)
chr8 (1-228)||(11357958-11358185)
chr8 (1-228)||(36425495-36425722)
chr8 (1-228)||(45068181-45068408)
chr8 (1-228)||(26250356-26250583)
chr8 (2-228)||(15012619-15012845)
chr8 (1-91)||(41242018-41242108)
chr8 (2-83)||(31017617-31017698)
chr8 (1-228)||(24220037-24220263)
chr8 (1-64)||(12768974-12769037)
chr8 (69-228)||(7933690-7933850)
chr8 (164-228)||(14394091-14394155)
chr8 (164-213)||(29336842-29336893)
[»] chr6 (27 HSPs)
chr6 (1-228)||(32328258-32328485)
chr6 (1-228)||(1428188-1428415)
chr6 (1-228)||(34711322-34711549)
chr6 (1-228)||(31548125-31548352)
chr6 (1-228)||(7062281-7062508)
chr6 (1-228)||(4738088-4738315)
chr6 (1-228)||(34649030-34649257)
chr6 (1-228)||(34655481-34655708)
chr6 (1-228)||(4020000-4020227)
chr6 (1-228)||(4026426-4026653)
chr6 (1-228)||(7069467-7069694)
chr6 (1-228)||(9864525-9864752)
chr6 (1-228)||(4186915-4187142)
chr6 (1-228)||(13671582-13671809)
chr6 (1-228)||(27670324-27670551)
chr6 (1-228)||(29907089-29907316)
chr6 (1-228)||(30117064-30117291)
chr6 (1-228)||(21262339-21262566)
chr6 (2-228)||(1167244-1167471)
chr6 (1-91)||(11058052-11058142)
chr6 (1-228)||(10081326-10081554)
chr6 (54-228)||(9846804-9846978)
chr6 (54-213)||(22870523-22870682)
chr6 (127-228)||(11016444-11016545)
chr6 (75-202)||(18765994-18766120)
chr6 (195-228)||(31129055-31129088)
chr6 (54-94)||(11015492-11015532)
[»] chr2 (27 HSPs)
chr2 (1-228)||(43268089-43268316)
chr2 (1-228)||(2157842-2158069)
chr2 (1-228)||(2164258-2164485)
chr2 (1-227)||(36781950-36782176)
chr2 (1-228)||(12951026-12951253)
chr2 (1-228)||(34834577-34834804)
chr2 (1-228)||(34841021-34841248)
chr2 (1-228)||(42931137-42931364)
chr2 (1-228)||(15852780-15853007)
chr2 (1-228)||(16817095-16817322)
chr2 (1-228)||(16856252-16856479)
chr2 (1-228)||(13901721-13901949)
chr2 (1-228)||(2021213-2021440)
chr2 (1-228)||(45012213-45012440)
chr2 (1-228)||(21067722-21067950)
chr2 (1-228)||(21331759-21331986)
chr2 (53-228)||(29485177-29485352)
chr2 (36-228)||(21341691-21341883)
chr2 (1-228)||(13163049-13163276)
chr2 (1-228)||(36842018-36842245)
chr2 (54-228)||(11909715-11909889)
chr2 (76-228)||(37439298-37439450)
chr2 (2-213)||(17788871-17789082)
chr2 (53-228)||(41455888-41456064)
chr2 (54-207)||(28144771-28144924)
chr2 (61-213)||(24852806-24852958)
chr2 (165-213)||(34745070-34745119)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (1-228)||(4770-4997)
[»] chr7 (36 HSPs)
chr7 (1-228)||(1379177-1379404)
chr7 (1-228)||(2446876-2447103)
chr7 (1-228)||(5049677-5049904)
chr7 (1-228)||(6795668-6795895)
chr7 (1-228)||(15914868-15915095)
chr7 (1-227)||(9642682-9642908)
chr7 (1-228)||(3923858-3924085)
chr7 (1-228)||(6020629-6020856)
chr7 (1-228)||(14287945-14288172)
chr7 (1-228)||(15949389-15949616)
chr7 (1-228)||(26602142-26602369)
chr7 (1-228)||(1948398-1948625)
chr7 (1-228)||(14299130-14299357)
chr7 (1-228)||(8142210-8142438)
chr7 (1-224)||(19090038-19090261)
chr7 (1-228)||(23612619-23612846)
chr7 (1-228)||(8185157-8185384)
chr7 (1-228)||(8192717-8192944)
chr7 (1-228)||(21642748-21642975)
chr7 (1-228)||(48346861-48347088)
chr7 (1-228)||(48353245-48353472)
chr7 (1-224)||(36875775-36875998)
chr7 (1-228)||(33850408-33850635)
chr7 (1-228)||(39433137-39433364)
chr7 (1-228)||(45433816-45434043)
chr7 (140-228)||(22853971-22854059)
chr7 (1-64)||(13774059-13774122)
chr7 (1-50)||(5056250-5056299)
chr7 (1-228)||(21900952-21901180)
chr7 (2-213)||(7412697-7412907)
chr7 (164-228)||(8881163-8881227)
chr7 (1-49)||(37026278-37026326)
chr7 (127-228)||(10830889-10830991)
chr7 (127-228)||(11024681-11024783)
chr7 (63-202)||(9702033-9702171)
chr7 (87-202)||(43364566-43364680)
[»] chr5 (26 HSPs)
chr5 (1-228)||(29980689-29980916)
chr5 (1-228)||(30041009-30041236)
chr5 (1-228)||(34357053-34357280)
chr5 (1-228)||(34358844-34359071)
chr5 (1-228)||(22360194-22360421)
chr5 (1-228)||(42151049-42151276)
chr5 (1-228)||(22314060-22314287)
chr5 (1-228)||(29414434-29414661)
chr5 (1-228)||(40958382-40958609)
chr5 (1-228)||(5876448-5876675)
chr5 (1-228)||(25894414-25894641)
chr5 (1-228)||(2958089-2958316)
chr5 (1-228)||(2966558-2966785)
chr5 (1-228)||(4973793-4974020)
chr5 (1-228)||(12505530-12505757)
chr5 (1-228)||(2439030-2439258)
chr5 (56-209)||(30579974-30580127)
chr5 (1-228)||(3413055-3413282)
chr5 (53-228)||(12918715-12918890)
chr5 (53-228)||(19853293-19853467)
chr5 (69-228)||(9843647-9843807)
chr5 (61-228)||(34738430-34738597)
chr5 (53-228)||(2155884-2156060)
chr5 (55-213)||(42747370-42747527)
chr5 (75-220)||(9334920-9335064)
chr5 (1-109)||(33794322-33794430)
[»] chr1 (39 HSPs)
chr1 (1-228)||(43686859-43687086)
chr1 (1-228)||(45016011-45016238)
chr1 (1-228)||(6238885-6239112)
chr1 (1-228)||(41297747-41297974)
chr1 (1-228)||(42092126-42092353)
chr1 (1-227)||(29001961-29002187)
chr1 (1-228)||(1174836-1175063)
chr1 (1-228)||(23762101-23762328)
chr1 (1-228)||(39053103-39053330)
chr1 (1-228)||(39059475-39059702)
chr1 (1-228)||(9869335-9869562)
chr1 (1-228)||(26621700-26621927)
chr1 (1-228)||(1115747-1115974)
chr1 (1-228)||(44241587-44241814)
chr1 (1-228)||(44916568-44916795)
chr1 (1-228)||(4599759-4599986)
chr1 (1-227)||(41305285-41305506)
chr1 (1-228)||(32797953-32798181)
chr1 (1-228)||(11913027-11913254)
chr1 (1-228)||(35085239-35085463)
chr1 (24-228)||(31072571-31072775)
chr1 (127-227)||(28996371-28996471)
chr1 (1-137)||(41299044-41299180)
chr1 (31-228)||(23251612-23251809)
chr1 (61-228)||(47646960-47647128)
chr1 (1-228)||(5357512-5357739)
chr1 (1-228)||(45619909-45620136)
chr1 (1-228)||(38672541-38672769)
chr1 (54-228)||(13432132-13432306)
chr1 (61-213)||(13249008-13249158)
chr1 (69-213)||(31473557-31473701)
chr1 (1-228)||(28413437-28413665)
chr1 (53-228)||(39806339-39806515)
chr1 (69-228)||(2824584-2824744)
chr1 (76-202)||(21815125-21815250)
chr1 (61-94)||(6847847-6847880)
chr1 (164-213)||(30660234-30660283)
chr1 (69-97)||(6244575-6244603)
chr1 (146-202)||(9316337-9316392)
[»] scaffold0510 (2 HSPs)
scaffold0510 (1-228)||(8646-8873)
scaffold0510 (1-227)||(2326-2552)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (1-228)||(49920-50147)
[»] chr4 (22 HSPs)
chr4 (1-228)||(41373217-41373444)
chr4 (1-228)||(37368080-37368307)
chr4 (1-228)||(13594338-13594565)
chr4 (1-228)||(55462537-55462764)
chr4 (1-228)||(27590535-27590762)
chr4 (1-228)||(8104112-8104338)
chr4 (1-228)||(17457085-17457312)
chr4 (1-228)||(16838124-16838351)
chr4 (1-228)||(36754556-36754783)
chr4 (1-228)||(16405576-16405803)
chr4 (1-228)||(30211301-30211528)
chr4 (1-228)||(5660314-5660541)
chr4 (106-228)||(37356114-37356236)
chr4 (1-91)||(30238490-30238580)
chr4 (124-228)||(30238582-30238686)
chr4 (61-228)||(52182932-52183099)
chr4 (1-64)||(7780637-7780700)
chr4 (54-228)||(49359080-49359254)
chr4 (182-228)||(7780737-7780783)
chr4 (69-228)||(2948143-2948303)
chr4 (1-228)||(13003571-13003798)
chr4 (63-202)||(13568272-13568410)
[»] chr3 (27 HSPs)
chr3 (1-228)||(4311251-4311478)
chr3 (1-228)||(23068694-23068921)
chr3 (1-228)||(6036496-6036723)
chr3 (1-228)||(32746600-32746827)
chr3 (1-228)||(24179304-24179531)
chr3 (1-228)||(27501732-27501959)
chr3 (1-228)||(43931807-43932034)
chr3 (1-228)||(10941069-10941296)
chr3 (1-228)||(43995308-43995534)
chr3 (9-228)||(9570312-9570532)
chr3 (9-228)||(9576814-9577034)
chr3 (1-160)||(25893466-25893625)
chr3 (1-228)||(20650890-20651117)
chr3 (62-228)||(47441092-47441258)
chr3 (1-120)||(13015216-13015335)
chr3 (1-221)||(9330910-9331130)
chr3 (163-228)||(41354078-41354143)
chr3 (61-228)||(24705101-24705268)
chr3 (61-228)||(25692267-25692438)
chr3 (1-228)||(20952519-20952746)
chr3 (61-228)||(17735634-17735801)
chr3 (61-228)||(19036903-19037070)
chr3 (1-213)||(2785935-2786148)
chr3 (150-228)||(461194-461272)
chr3 (69-228)||(4591093-4591253)
chr3 (21-202)||(27900781-27900960)
chr3 (164-228)||(4644227-4644291)
[»] scaffold0343 (1 HSPs)
scaffold0343 (1-228)||(2875-3102)
[»] scaffold0936 (1 HSPs)
scaffold0936 (1-228)||(3029-3256)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (1-228)||(15401-15628)
[»] scaffold0513 (1 HSPs)
scaffold0513 (1-165)||(12163-12327)
[»] scaffold0173 (1 HSPs)
scaffold0173 (1-110)||(24148-24257)
[»] scaffold0291 (1 HSPs)
scaffold0291 (75-202)||(1498-1624)
[»] scaffold0265 (1 HSPs)
scaffold0265 (76-202)||(17559-17684)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 228; Significance: 1e-126; HSPs: 20)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 36021791 - 36021564
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36021791 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 36021692  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36021691 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 36021592  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36021591 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 36021564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 6464568 - 6464341
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6464568 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 6464469  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6464468 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaaactatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 6464369  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6464368 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 6464341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 7311579 - 7311806
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7311579 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 7311678  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7311679 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaaactatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 7311778  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7311779 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 7311806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 36076197 - 36076424
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36076197 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 36076296  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36076297 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaaactatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 36076396  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36076397 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 36076424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 216; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 8013312 - 8013085
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8013312 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 8013213  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8013212 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaaactatgttttgacagatggttattctaaacctagattcaaa 8013113  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8013112 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 8013085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 216; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16710660 - 16710433
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16710660 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 16710561  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16710560 gaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 16710461  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16710460 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 16710433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 36005474 - 36005247
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36005474 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 36005375  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36005374 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaaactatgttttgatagatggttattctaaaccaagattcaaa 36005275  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36005274 agtatttttcaatcacaattaaatcaaa 36005247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 1238444 - 1238671
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1238444 atcaattgtatcattcaatagtcgatgtcacaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatagatgatttctcaatctattgaatgataa 1238543  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1238544 gaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 1238643  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1238644 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 1238671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 11358185 - 11357958
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  11358185 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcgatctattgaatgataa 11358086  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11358085 gaaagctttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 11357986  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11357985 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 11357958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 36425722 - 36425495
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||| |||| |||    
T  36425722 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgtccaatcgatgatttcttgatctattgaatgctaa 36425623  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36425622 gaaagctttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 36425523  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36425522 agtatttctcaatcacaattaaaccaaa 36425495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 45068408 - 45068181
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45068408 atcaattgtaccattcaatagtcgatgtttcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 45068309  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45068308 gaaagctttaagtttggatacaaaaggtgattatcaaaacatcaattcaatgtctagaacttatgttttgatagatgattattctaaacctagattcaaa 45068209  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45068208 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 45068181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 26250583 - 26250356
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  26250583 atcaattgtatcattcaatcgttgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttttcaatctattgaatgataa 26250484  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    |||||||||  ||||||||||  ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26250483 gaaagcttttagtttggatacaaaaggtgattattaaaacatcaattccatgtctagaacttatgttttgatagatgattattctaaacctagattcaaa 26250384  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26250383 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 26250356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 2 - 228
Target Start/End: Original strand, 15012619 - 15012845
Alignment:
Q  2 tcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataag 101  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||||||||| |||||||| |||||||||    
T  15012619 tcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaattgatgatttcttaatctattgaatgataag 15012718  T
Q  102 aaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaaa 201  Q
    ||||||||| ||||||||||  || |||||||||||| |||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15012719 aaagctttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtttagaacttatgttttgatagatgattattctaaacctagattcaaaa 15012818  T
Q  202 gtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  15012819 gtatttctcaatcacaattaaatcaaa 15012845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 41242108 - 41242018
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctatt 91  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41242108 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctatt 41242018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 2 - 83
Target Start/End: Original strand, 31017617 - 31017698
Alignment:
Q  2 tcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctc 83  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  31017617 tcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctc 31017698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 24220263 - 24220037
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    |||||||||||  || ||| || ||| || ||||||||| ||  || ||| |||||||  ||||||| |||||| |||||||| |||||||||| |||      
T  24220263 atcaattgtattgttgaatcgttgatttcccaaactattaaacaatccaatagtcgattgtatcgtttaatcgaggatttctccatctattaaacgatct 24220164  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    |||||||||| ||   |||| |   | ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  24220163 gaaagctttaagtcccgatatttgtg-tgattatcaaaacattgatttcatgtctagaaccattgttttgatagatgaatattctaaacatagattcaaa 24220065  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    |||| || | ||| ||||||||||||||    
T  24220064 agtacttttaaataacaattaaatcaaa 24220037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Original strand, 12768974 - 12769037
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatc 64  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12768974 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatc 12769037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 69 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 7933850 - 7933690
Alignment:
Q  69 aatcgatgatttctcaatctattaaatgataagaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttt 168  Q
    |||||| |||||||||||||||| || |||  |||||||||| ||   |||||     |||||||||||| |||| || | ||||||||||    |||||    
T  7933850 aatcgacgatttctcaatctattcaacgatccgaaagctttatgtaccgataccttgtgtgattatcaaaacatcaatcctatgtctagaattattgttt 7933751  T
Q  169 tgatagatggtt-attctaaacctagattcaaaagtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  7933750 tgatagataatttattctaaacctagattcaaaagtacttttcaataacaattaaatcaaa 7933690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 228
Target Start/End: Original strand, 14394091 - 14394155
Alignment:
Q  164 tgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaaagtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  14394091 tgttttgatagatgaatattctacacctagattcaaaagtacttttcaataacaattaaatcaaa 14394155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 164 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 29336893 - 29336842
Alignment:
Q  164 tgttttgatagatggttattctaaa--cctagattcaaaagtatttctcaat 213  Q
    |||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||    
T  29336893 tgttttgatagatgattattctagattcctagattcaaaagtatttttcaat 29336842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 27)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 32328485 - 32328258
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32328485 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 32328386  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32328385 gaaaggtttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 32328286  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32328285 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 32328258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 1428415 - 1428188
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1428415 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 1428316  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1428315 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaaactatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 1428216  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1428215 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 1428188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 34711549 - 34711322
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  34711549 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcaatgatttctcaatccattgaatgataa 34711450  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34711449 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaatctatgctttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 34711350  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34711349 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 34711322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 31548125 - 31548352
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  31548125 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctatagaatgataa 31548224  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31548225 gaaagctttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 31548324  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31548325 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 31548352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 7062508 - 7062281
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  7062508 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgtccaatcgatgatttctcgatctattgaatgataa 7062409  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7062408 gaaagctttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 7062309  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7062308 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 7062281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 4738315 - 4738088
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  4738315 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgtccaatcgatgatttcttgatctattgaatgataa 4738216  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4738215 gaaagctttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 4738116  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4738115 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 4738088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 34649030 - 34649257
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||    
T  34649030 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgtccaatcgatgatttctcgatctattgaatgctaa 34649129  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34649130 gaaagctttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 34649229  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34649230 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 34649257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 34655481 - 34655708
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||    
T  34655481 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgtccaatcgatgatttctcgatctattgaatgctaa 34655580  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34655581 gaaagctttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 34655680  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34655681 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 34655708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 4020227 - 4020000
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||    
T  4020227 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgtccaatcgatgatttctcgatctattgaatgctaa 4020128  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4020127 gaaagctttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggtttttctaaacctagattcaaa 4020028  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4020027 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 4020000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 4026653 - 4026426
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||    
T  4026653 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgtccaatcgatgatttctcgatctattgaatgctaa 4026554  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4026553 gaaagctttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggtttttctaaacctagattcaaa 4026454  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4026453 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 4026426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 7069694 - 7069467
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  7069694 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaacagtcgatcttatcgtccaatcgatgatttctcgatctattgaatgataa 7069595  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  7069594 gaaagctttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaag 7069495  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7069494 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 7069467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 9864752 - 9864525
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  9864752 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctgttgaatgataa 9864653  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  9864652 gaaagctttaagtttggatacaaaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgagatatgattattctaaacctagattcaaa 9864553  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9864552 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 9864525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 4186915 - 4187142
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4186915 atcaattgtatcattcaatcgttgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 4187014  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4187015 gaaagctttaagtttggatacaaaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaatctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 4187114  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4187115 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 4187142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 13671809 - 13671582
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13671809 atcaactgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 13671710  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    |||||||||| ||||||||||  || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13671709 gaaagctttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattcaaa 13671610  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13671609 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 13671582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 27670324 - 27670551
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  27670324 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatcaattgaatgataa 27670423  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  27670424 gaaagctttaagtttggatacaaaaggtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacccatgttttgatagatgattattctaaacttagattcaaa 27670523  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27670524 agtatttatcaatcacaattaaatcaaa 27670551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 29907089 - 29907316
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||    
T  29907089 atcaattgtattatttaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcgttcaataaatgatttctcaatctattgaatgataa 29907188  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  29907189 gaaagctttaagtttggatacaaaaggtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacttatgttttgatagatgattattctaaacagagattcaaa 29907288  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29907289 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 29907316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 30117291 - 30117064
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||    
T  30117291 atcaattgtattatttaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcgttcaataaatgatttctcaatctattgaatgataa 30117192  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  30117191 gaaagctttaagtttggatacaaaaggtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacttatgttttgatagatgattattctaaacagagattcaaa 30117092  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30117091 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 30117064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 21262566 - 21262339
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  21262566 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaacttttgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatggatgatttctcaatctatagaatgataa 21262467  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
     | ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21262466 aagagctttaagtttggatacaaaaggtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 21262367  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||    
T  21262366 tgtatttctcaattacaattaaatcaaa 21262339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 2 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 1167471 - 1167244
Alignment:
Q  2 tcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaa-tgataa 100  Q
    ||||||||||| ||  || || |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  1167471 tcaattgtatcgttttatcgttgatgtctcaaactattaaacgatccaagagtcgatcttatgatttaatcgacgatttctcaatctattaaaatgataa 1167372  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    |||||||||| ||||||||||  |  |||||||||||| |||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||     
T  1167371 gaaagctttaagtttggatacaaagagtgattatcaaaacatcaattccatatctagaatttatgttttgatagactattattctaaacctagaatcaag 1167272  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  1167271 aatatttttcaatcacaattaaatcaaa 1167244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 11058142 - 11058052
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctatt 91  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11058142 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctatt 11058052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 10081554 - 10081326
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    |||||||||||  |||||| || ||| || ||||||||| ||  || |||  ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||| || |||      
T  10081554 atcaattgtattgttcaatagttgatttcccaaactattaaaaaatccaattgtcgatcgtatcgtttaatcgacgatttctcaatatattcaacgatcc 10081455  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatgg-ttattctaaacctagattcaa 199  Q
     ||||||||| || | |||||     |||||||||||| |||| || | |||||||||| |  ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  10081454 aaaagctttacgtatcgataccttgtgtgattatcaaaacatcaatcctatgtctagaatcattgttttgatagatgaattattctaaacctagattcaa 10081355  T
Q  200 aagtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  10081354 aagtacttttcaataacaattaaatcaaa 10081326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 54 - 228
Target Start/End: Original strand, 9846804 - 9846978
Alignment:
Q  54 tcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataagaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgt 153  Q
    |||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||  ||||||    |||||||||||| |||| || | ||||    
T  9846804 tcgatcgtatcgtttaatccacgatttctcaatctattaaacgatctgaaagctttaagttctgatactttgtgtgattatcaaaacatcaatcctatgt 9846903  T
Q  154 ctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaaagtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
      |||| |  |||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  9846904 taagaatcattgttttgatagataaatattttaaacctagattcaaaagtatttctcaatagcatttaaatcaaa 9846978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 54 - 213
Target Start/End: Original strand, 22870523 - 22870682
Alignment:
Q  54 tcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataagaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgt 153  Q
    |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||  || |||   || |||||| ||||||||||||||| ||   || | ||||    
T  22870523 tcgatcgtatcgtttaatcgacgatttctcaatctattaaacgatatgatggcattaaccttcgatacttaaggtgattatcaaaacactaatcctatgt 22870622  T
Q  154 ctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaaagtatttctcaat 213  Q
    ||||||    |||||||||||||| |||||||||  ||| | |||||||||||| |||||    
T  22870623 ctagaattcttgttttgatagatgattattctaacactaaactcaaaagtatttttcaat 22870682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 127 - 228
Target Start/End: Original strand, 11016444 - 11016545
Alignment:
Q  127 gtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaaagtatttctcaatcacaattaaatca 226  Q
    |||||||||||| |||| |  | ||||||| || |  ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||    
T  11016444 gtgattatcaaaacatcaaccctatgtctaaaatcattgttttgatagatgaaaattctaaacctagattcaaaagtattttttaataacatttaaatca 11016543  T
Q  227 aa 228  Q
    ||    
T  11016544 aa 11016545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 202
Target Start/End: Original strand, 18765994 - 18766120
Alignment:
Q  75 tgatttctcaatctattaaatgataagaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatag 174  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| |||   ||| |||| |||||||||||| | |  ||||||||||||||||  | | ||||||||    
T  18765994 tgatttcccaaactattaaatgatacaaaagctttaagttccaatattcaaagtgattatcaaaacctaaattccatgtctagaacaaaagctttgatag 18766093  T
Q  175 atggttattctaaacctagattcaaaag 202  Q
    | | ||||||| |||| |||||||||||    
T  18766094 aagattattct-aaccaagattcaaaag 18766120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 195 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 31129088 - 31129055
Alignment:
Q  195 ttcaaaagtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31129088 ttcaaaagtatttctcaatcacaattaaatcaaa 31129055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 94
Target Start/End: Original strand, 11015492 - 11015532
Alignment:
Q  54 tcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaa 94  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  11015492 tcgatcgtatcgtttaatcgacgatttctcaatctattaaa 11015532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 27)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 43268089 - 43268316
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43268089 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttttcaatctattaaatgataa 43268188  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43268189 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 43268288  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43268289 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 43268316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 2157842 - 2158069
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2157842 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 2157941  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2157942 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaaactatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 2158041  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2158042 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 2158069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 2164258 - 2164485
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2164258 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 2164357  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2164358 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaaactatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 2164457  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2164458 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 2164485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 36782176 - 36781950
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36782176 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 36782077  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36782076 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 36781977  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaa 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  36781976 agtatttctcaatcacaattaaatcaa 36781950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 216; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 12951026 - 12951253
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12951026 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 12951125  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12951126 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaaactatgttttgacagatggttattctaaacctagattcaaa 12951225  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12951226 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 12951253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 216; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 34834804 - 34834577
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34834804 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaacgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 34834705  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34834704 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaaactatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 34834605  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34834604 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 34834577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 216; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 34841248 - 34841021
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34841248 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaacgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 34841149  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34841148 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaaactatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 34841049  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34841048 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 34841021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 42931364 - 42931137
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42931364 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 42931265  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42931264 gaaagctttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 42931165  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42931164 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 42931137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 15852780 - 15853007
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  15852780 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctatagaatgataa 15852879  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15852880 gaaagctttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 15852979  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15852980 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 15853007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16817322 - 16817095
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16817322 atcaattgtatcattcaattgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 16817223  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16817222 gaaagctttaggtttggatgcacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaaccaatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 16817123  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16817122 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 16817095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16856479 - 16856252
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16856479 atcaattgtatcattcaattgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 16856380  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16856379 gaaagctttaggtttggatgcacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaaccaatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 16856280  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16856279 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 16856252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 13901949 - 13901721
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctatt-aaatgata 99  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13901949 atcaattgtatcattcaatggttgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaattgatgatttctcaatctatttaaatgata 13901850  T
Q  100 agaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13901849 agaaagctttaggtttggatacctaaggtgattatcaaaacgtcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaa 13901750  T
Q  200 aagtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13901749 aagtatttctcaatcacaattaaatcaaa 13901721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 2021440 - 2021213
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2021440 atcaattgtatcattcaattgtcaatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 2021341  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2021340 gaaagttttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgatttcatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacttagattcaaa 2021241  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2021240 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 2021213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 45012213 - 45012440
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||    
T  45012213 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgtccaatcgatgatttctcgatctattgaatgctaa 45012312  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45012313 gaaagctttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 45012412  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45012413 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 45012440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 21067950 - 21067722
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21067950 atcaattgtatcattcaattgttgatgtctcaaactattgaatgattcaagagacgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 21067851  T
Q  101 gaaa-gctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaa 199  Q
     ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21067850 aaaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatcgatggttattctaaacctagattcaa 21067751  T
Q  200 aagtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21067750 aagtatttctcaatcacaattaaatcaaa 21067722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 21331986 - 21331759
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21331986 atcaattgtgtcattcaatcgttgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 21331887  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21331886 gaaagctttaagtttggatacaaaaggtgattatcagaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattcaaa 21331787  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21331786 agtatttctcaatcataattaaatcaaa 21331759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 53 - 228
Target Start/End: Original strand, 29485177 - 29485352
Alignment:
Q  53 gtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataagaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatg 152  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  29485177 gtcgatcttatcgtccaatcgatgatttctcgatctattgaatgctaagaaagctttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaacatcgattccatg 29485276  T
Q  153 tctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaaagtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29485277 tctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaaagtatttctcaatcacaattaaatcaaa 29485352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 36 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 21341883 - 21341691
Alignment:
Q  36 tattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataagaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatc 135  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  21341883 tattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataagaaagctttaagtttggatacaaaaggtgattatc 21341784  T
Q  136 aaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaaagtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    | | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21341783 agaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattcaaaagtatttctcaatcataattaaatcaaa 21341691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 13163049 - 13163276
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    |||||||||||| || ||| || ||| || ||||||||| || ||| ||| | |||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| |||      
T  13163049 atcaattgtatcgtttaatcgttgatttcccaaactattaaacgatccaacattcgatcgtatcgtttaatcgacgatttctcactctattaaacgatct 13163148  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    |||| | | | | || |||||||||||||||||||||| | |  || ||||||||||||    |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  13163149 gaaaccatgaagcttagatactcaaggtgattatcaaaacgtaaatcccatgtctagaattcctgttttgataaatgattattctagacctagattcaaa 13163248  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||| |||||  |||||||||||||    
T  13163249 agtatttttcaatagcaattaaatcaaa 13163276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 36842018 - 36842245
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||| |||||  |||||| || ||| || ||||||||| ||  || ||| | |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| || |||      
T  36842018 atcaactgtattgttcaatagttgatttcccaaactattaaacaatccaataatcgatcgtatcgtttaatcgacgatttctcaatctattcaacgatct 36842117  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    ||||||| || |||  |||||     |||||||||||| |||| || | |||||||||| |  ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  36842118 gaaagctctacgttccgataccttgtgtgattatcaaaacatcaatcctatgtctagaatcattgttttgatagatgaatattctaaacctagattcaaa 36842217  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    |||| || ||||| ||||||||||||||    
T  36842218 agtacttttcaataacaattaaatcaaa 36842245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 54 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 11909889 - 11909715
Alignment:
Q  54 tcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataagaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgt 153  Q
    |||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| |||   ||||| | | |||| |||||   | |||||||||||| |||| |||| ||||    
T  11909889 tcgatcgtatcgtttaatcgacgatttctcagtctattaaacgattcaaaagcatgaagtttagatacaagaagtgattatcaaaacatcaattctatgt 11909790  T
Q  154 ctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaaagtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||| ||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||    
T  11909789 ctaaaattcatgttttgatagatgattattctaaacctagattcaagagtacttttcaataacaattaaatcaaa 11909715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 76 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 37439450 - 37439298
Alignment:
Q  76 gatttctcaatctattaaatgataagaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgataga 175  Q
    ||||||||||||||||||| |||  |||||||||| | |  ||||||  | |||||||||||| |||| || | |||||||||| |  ||||||||||||    
T  37439450 gatttctcaatctattaaacgatctgaaagctttaagatccgatactttatgtgattatcaaaacatcaatcctatgtctagaatcattgttttgataga 37439351  T
Q  176 tggttattctaaacctagattcaaaagtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    |   ||||||||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  37439350 taaatattctaaaactagattcaaaagtatttttcaatagcaattaaatcaaa 37439298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 2 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 17789082 - 17788871
Alignment:
Q  2 tcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataag 101  Q
    ||||||||||  || ||| || ||| |||||||||||| |   || ||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||  |    
T  17789082 tcaattgtattgtttaattgttgatttctcaaactattaagcaatccaatagtcgatcgtatcgtttaatcgacgatttctcaatctatcaaacgatccg 17788983  T
Q  102 aaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaaa 201  Q
    ||||||||| |||  || | |    |||||||||||| |||| || | |||||||||| |  | |||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  17788982 aaagctttaagttctgacaatttgtgtgattatcaaaacatcaatcctatgtctagaatcatttttttgatagataaatattctaaacctagattcaaaa 17788883  T
Q  202 gtatttctcaat 213  Q
    ||||||||||||    
T  17788882 gtatttctcaat 17788871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 53 - 228
Target Start/End: Original strand, 41455888 - 41456064
Alignment:
Q  53 gtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataagaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatg 152  Q
    |||||||  |||||| |||||| |||||||||||||||| || |||  |||||||||| ||   |||||     |||||||||||| |||| || | |||    
T  41455888 gtcgatcggatcgtttaatcgacgatttctcaatctattcaacgatccgaaagctttatgtactgataccttgtgtgattatcaaaacatcaatcctatg 41455987  T
Q  153 tctagaacctatgttttgatagatggt-tattctaaacctagattcaaaagtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    |||||||    |||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  41455988 tctagaattattgttttgatagataaactattctaaacctagattcaaaagtacttttcaataacaattaaatcaaa 41456064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 28144924 - 28144771
Alignment:
Q  54 tcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataagaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgt 153  Q
    |||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||  ||||||    ||||||| |||| || | ||   ||||    
T  28144924 tcgatcgtatcgtttaattgacgatttctcaatctattaaacgatctgaaagctttaagttccgatactttgtgtgattaccaaaacaccaatcttatgt 28144825  T
Q  154 ctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaaagtattt 207  Q
    |||||| |  ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  28144824 ctagaatcattgttttgatagatgaatattctaaacttagattcaaaagcattt 28144771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 24852958 - 24852806
Alignment:
Q  61 tatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataagaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaac 160  Q
    ||||||| ||||||  |||||||||||||||||| |||  || |||  || |||  ||||||    ||||||||| || || | || | ||||||||||     
T  24852958 tatcgtttaatcgacaatttctcaatctattaaacgatctgatagcaatacgttctgatactttgtgtgattatctaaacaccaatcctatgtctagaat 24852859  T
Q  161 ctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaaagtatttctcaat 213  Q
    |  |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  24852858 ccttgttttgatagatgattattctaaccctagattcaaaagtatttttcaat 24852806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 165 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 34745119 - 34745070
Alignment:
Q  165 gttttgatagatggttattctaaacctagattc-aaaagtatttctcaat 213  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  34745119 gttttgatagatgattattataaacctagattcaaaaagtatttttcaat 34745070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 4997 - 4770
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4997 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 4898  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4897 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaaactatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 4798  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4797 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 4770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 36)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 1379177 - 1379404
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1379177 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 1379276  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1379277 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaaactatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 1379376  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1379377 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 1379404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 2446876 - 2447103
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2446876 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 2446975  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2446976 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaaactatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 2447075  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2447076 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 2447103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 5049904 - 5049677
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5049904 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 5049805  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5049804 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaaactatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 5049705  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5049704 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 5049677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 6795668 - 6795895
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6795668 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 6795767  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6795768 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaaactatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 6795867  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6795868 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 6795895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 15914868 - 15915095
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15914868 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 15914967  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15914968 caaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 15915067  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15915068 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 15915095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 9642908 - 9642682
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9642908 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcattcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 9642809  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9642808 ggaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 9642709  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaa 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  9642708 agtatttctcaatcacaattaaatcaa 9642682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 3924085 - 3923858
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3924085 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 3923986  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3923985 gaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 3923886  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3923885 agtgtttctcaatcacaattaaatcaaa 3923858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 6020856 - 6020629
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6020856 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctataaaatgataa 6020757  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6020756 gaaagctttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 6020657  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6020656 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 6020629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 14287945 - 14288172
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14287945 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 14288044  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14288045 gaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagatttaaa 14288144  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14288145 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 14288172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 15949389 - 15949616
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15949389 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 15949488  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15949489 gaaagctttaggtttggatacacaaggtggttatccaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 15949588  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15949589 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 15949616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 26602142 - 26602369
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26602142 atcaattgtatcattcaattgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 26602241  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26602242 gaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattttaaacctagattcaaa 26602341  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26602342 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 26602369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 1948625 - 1948398
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1948625 atcaattgtatcattcaattgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 1948526  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1948525 gaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattcaaa 1948426  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1948425 agtatttctcaatcacaattatatcaaa 1948398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 14299130 - 14299357
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14299130 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 14299229  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14299230 gaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagatttaaa 14299329  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14299330 agtatttcttaatcacaattaaatcaaa 14299357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 8142438 - 8142210
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctatt-aaatgata 99  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8142438 atcaattgtatcattcaatggttgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaattgatgatttctcaatctatttaaatgata 8142339  T
Q  100 agaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8142338 agaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaaacgtcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctaaattcaa 8142239  T
Q  200 aagtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8142238 aagtatttctcaatcacaattaaatcaaa 8142210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 19090038 - 19090261
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19090038 atcaattgtatcactcaattgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 19090137  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19090138 gaaaactttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 19090237  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaat 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  19090238 agtatttctcaatcacaattaaat 19090261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 23612619 - 23612846
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23612619 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtatcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 23612718  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23612719 gaaagctttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 23612818  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23612819 agtatttcttaatcacaattaaatcaaa 23612846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 8185384 - 8185157
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||    
T  8185384 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgtccaatcgatgatttctcgatctattgaatgctaa 8185285  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8185284 gaaagctttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattcaaa 8185185  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8185184 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 8185157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 8192944 - 8192717
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||    
T  8192944 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgtccaatcgatgatttctcgatctattgaatgctaa 8192845  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8192844 gaaagctttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattcaaa 8192745  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8192744 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 8192717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 21642748 - 21642975
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  21642748 atcaattatatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgtacaatcgatgatttctaaatctattgaatgataa 21642847  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21642848 gaaagctttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgtttcgatagatggttattctaaacctagattcaaa 21642947  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21642948 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 21642975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 48347088 - 48346861
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||    
T  48347088 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgtccaatcgatgatttctcgatctattgaatgctaa 48346989  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  48346988 gaaagctttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattcaaa 48346889  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  48346888 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 48346861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 48353472 - 48353245
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||    
T  48353472 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgtccaatcgatgatttctcgatctattgaatgctaa 48353373  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  48353372 gaaagctttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattcaaa 48353273  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  48353272 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 48353245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 36875775 - 36875998
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36875775 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttattgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 36875874  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  36875875 gaaagctttaagtttggatacaaaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaatctatgttttgatagatggttattctaaacctagatttaaa 36875974  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaat 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  36875975 agtatttctcaatcacaattaaat 36875998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 33850635 - 33850408
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33850635 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 33850536  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  33850535 gaaagctttaagtttggatacaaaaggtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacttatgttttgatagatgattattataaacctagattcaaa 33850436  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33850435 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 33850408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 39433137 - 39433364
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39433137 atcaattgtatctgtcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttttcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 39433236  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    |||||||||| ||||||||||  || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39433237 gaaagctttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattcaaa 39433336  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39433337 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 39433364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 45433816 - 45434043
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||| |||| ||||||||    
T  45433816 atcaattgtaccattcaatagtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcaatgatttctcaatttattgaatgataa 45433915  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45433916 gaaagctttaagtttggatacaaaaggtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacttatgttttgatagatgattattctaaacctagattcaaa 45434015  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45434016 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 45434043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 140 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22854059 - 22853971
Alignment:
Q  140 catcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaaagtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22854059 catcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattcaaaagtatttctcaatcacaattaaatcaaa 22853971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 13774122 - 13774059
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatc 64  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13774122 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatc 13774059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 5056299 - 5056250
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaa 50  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5056299 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaa 5056250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 21901180 - 21900952
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    |||||||||||  |||||| || ||| || ||||||||| ||  || |||  |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||      
T  21901180 atcaattgtattgttcaatagttgatttcccaaactattaaacaatccaattgtcgatcgaatcgtttaatcgatgatttctcaatctattcaacgatcc 21901081  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatgg-ttattctaaacctagattcaa 199  Q
    |||||||||| ||   |||||     |||||||||||| |||| || | ||||||| ||    |||||||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  21901080 gaaagctttatgtaccgataccttgtgtgattatcaaaacatcaatcctatgtctaaaattattgttttgatagataaattattctaaacctagattcaa 21900981  T
Q  200 aagtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||| | || ||||| ||||||||||||||    
T  21900980 aagcacttttcaataacaattaaatcaaa 21900952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 2 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 7412907 - 7412697
Alignment:
Q  2 tcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataag 101  Q
    ||||| ||||| || ||| || ||| |||||||||||| ||  || ||| | |||||| ||| ||| ||| || ||||||||| |||| |||| |||  |    
T  7412907 tcaatcgtatcttttaatcgttgatttctcaaactattaaacaatccaatattcgatcgtattgtttaattgacgatttctcagtctactaaacgatccg 7412808  T
Q  102 aaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaaa 201  Q
    ||||| | | | || ||||||||| |||||||||||| |||  || ||||||||| |  |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  7412807 aaagcatgaagcttagatactcaaagtgattatcaaaacataaatcccatgtctaaattcc-tgttttgatagatgattattctaaacctagattcaaga 7412709  T
Q  202 gtatttctcaat 213  Q
    |||||| |||||    
T  7412708 gtatttttcaat 7412697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 164 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 8881227 - 8881163
Alignment:
Q  164 tgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaaagtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  8881227 tgttttgatagatgaatattctaaacctagtttcaaaagtatttctcaataacatttaaatcaaa 8881163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Original strand, 37026278 - 37026326
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattca 49  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37026278 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattca 37026326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 127 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 10830991 - 10830889
Alignment:
Q  127 gtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatgg-ttattctaaacctagattcaaaagtatttctcaatcacaattaaatc 225  Q
    |||||||||||| |||| || | ||||||||||    |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  10830991 gtgattatcaaaacatcaatcctatgtctagaattattgttttgatagataaattattctaaacctagattcaaaagtacttttcaataacaattaaatc 10830892  T
Q  226 aaa 228  Q
    |||    
T  10830891 aaa 10830889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 127 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 11024783 - 11024681
Alignment:
Q  127 gtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatgg-ttattctaaacctagattcaaaagtatttctcaatcacaattaaatc 225  Q
    |||||||||||| |||| || | ||||||||||    |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  11024783 gtgattatcaaaacatcaatcctatgtctagaattattgttttgatagataaattattctaaacctagattcaaaagtacttttcaataacaattaaatc 11024684  T
Q  226 aaa 228  Q
    |||    
T  11024683 aaa 11024681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 63 - 202
Target Start/End: Original strand, 9702033 - 9702171
Alignment:
Q  63 tcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataagaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacct 162  Q
    ||||| |||||  |||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| |||   ||| |||| |||||||||||| | |  |||||||||||| |||      
T  9702033 tcgtttaatcgtcgatttcccaaactattaaatgatacaaaagctttaagttccaatattcaaagtgattatcaaaacctaaattccatgtctaaaacaa 9702132  T
Q  163 atgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaaag 202  Q
    | | ||||||||| | ||||||| |||||||| |||||||    
T  9702133 aagctttgatagaagattattct-aacctagaatcaaaag 9702171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 87 - 202
Target Start/End: Original strand, 43364566 - 43364680
Alignment:
Q  87 ctattaaatgataagaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattcta 186  Q
    ||||| |||||||  ||||||||| |||   ||| |||| |||||||||||| | |  ||||||||||||||||  | | ||||||||| | |||||||     
T  43364566 ctattgaatgatacaaaagctttaagttccaatattcaaagtgattatcaaaacctaaattccatgtctagaacaaaagctttgatagaagattattct- 43364664  T
Q  187 aacctagattcaaaag 202  Q
    ||||||||||||||||    
T  43364665 aacctagattcaaaag 43364680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 26)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 29980689 - 29980916
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29980689 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 29980788  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29980789 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaaactatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 29980888  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29980889 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 29980916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 30041236 - 30041009
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30041236 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 30041137  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30041136 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaaactatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 30041037  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30041036 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 30041009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 34357280 - 34357053
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34357280 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 34357181  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34357180 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaaactatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 34357081  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34357080 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 34357053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 34359071 - 34358844
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34359071 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 34358972  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34358971 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaaactatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 34358872  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34358871 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 34358844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 22360194 - 22360421
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22360194 atcaattgtatcattcaattgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 22360293  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22360294 gaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctacacctagattcaaa 22360393  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22360394 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 22360421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 42151049 - 42151276
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  42151049 atcaattgtatcattcaattgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatggtaa 42151148  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42151149 gaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 42151248  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42151249 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 42151276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 22314060 - 22314287
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  22314060 atcaattgtatcattcaattgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgataatttctcaatctattgaatgataa 22314159  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22314160 gaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctaaaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 22314259  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22314260 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 22314287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 29414661 - 29414434
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29414661 atcaattgtatcattcaattatcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 29414562  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29414561 gaaagctttagggttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 29414462  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29414461 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 29414434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 40958609 - 40958382
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40958609 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaaccattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 40958510  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40958509 gaaagctttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 40958410  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40958409 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 40958382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 5876448 - 5876675
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5876448 atcaattgtatcattcaattgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 5876547  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5876548 gaaaactttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaacatcgattccatgtctataacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 5876647  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5876648 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 5876675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 25894641 - 25894414
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||    
T  25894641 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgtccaatcgatgatttctcgatctattgaatgctaa 25894542  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25894541 gaaagctttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 25894442  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25894441 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 25894414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 2958089 - 2958316
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||    
T  2958089 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgtccaatcgatgatttctcgatctattgaatgctaa 2958188  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2958189 gaaagctttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattcaaa 2958288  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2958289 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 2958316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 2966558 - 2966785
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||    
T  2966558 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgtccaatcgatgatttctcgatctattgaatgctaa 2966657  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2966658 gaaagctttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattcaaa 2966757  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2966758 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 2966785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 4973793 - 4974020
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4973793 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatctaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 4973892  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4973893 gaaagctttaagtttggatacaaaaggtgattattaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattcaaa 4973992  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4973993 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 4974020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 12505757 - 12505530
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12505757 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaaatattgaatggtccaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 12505658  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12505657 gaaagctttaagtttggatacaaaaggtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaatctatgttttgatagatgattattctaaacctagattcaaa 12505558  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  12505557 agtatttttcaatcactattaaatcaaa 12505530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 2439030 - 2439258
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  2439030 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagccggtcttatcatttaatcgatgatttttcaatctattgaatgataa 2439129  T
Q  101 gaaagctttaggtttggat-actcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaa 199  Q
    |||||||||| |||||||| |   ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  2439130 gaaagctttaagtttggataaaaaaaggtgattatcaagacatcaattccatgtctagaacttatgttatgatagatgattattttaaaactagattcaa 2439229  T
Q  200 aagtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2439230 aagtatttctcaatcacaattaaatcaaa 2439258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 56 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 30580127 - 30579974
Alignment:
Q  56 gatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataagaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtct 155  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||    |||||||||||| |||| || | ||||||    
T  30580127 gatcgtatcgtttaatcgatgatttctcaatctattaaatgatatgaaagctttaagtttcgatactttgtgtgattatcaaaacatcaatcctatgtct 30580028  T
Q  156 agaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaaagtatttct 209  Q
    |||| |  |||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30580027 agaatcattgttttgatagataaatattctaaacccagattcaaaagtatttct 30579974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 3413282 - 3413055
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    |||||||||||  |||||| || ||| || ||||||||| ||  || ||| || ||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||||| |||      
T  3413282 atcaattgtattgttcaatcgttgatttcccaaactattaaacaatccaatagccgatcgtatcgtttaatcgacgatttctccatctattaaacgatcc 3413183  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    |||||||||| ||   ||||||    ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||    
T  3413182 gaaagctttaagtcctgatactttgtgtgattaccaaaacattgattccatgtctagaaccattgttttgatagatgaatattttaaacatagattcaaa 3413083  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    |||| || ||||| ||||||||||||||    
T  3413082 agtacttttcaataacaattaaatcaaa 3413055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 53 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 12918890 - 12918715
Alignment:
Q  53 gtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataagaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatg 152  Q
    ||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||  |||||||||| || | ||||||    |||| ||||||| ||| |||||||||    
T  12918890 gtcgatcgtatcgtttaatcgacgatttctccatctattgaatgatccgaaagctttaagtcttgatactttgtgtgactatcaaaacattgattccatg 12918791  T
Q  153 tctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaaagtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    |||||||||  ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||    
T  12918790 tctagaaccattgttttgatagatgaatattctaaacatagattcaaaagtactttttaataacaattaaatcaaa 12918715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 53 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 19853467 - 19853293
Alignment:
Q  53 gtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataagaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatg 152  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||  |||| ||||| | |  ||||||    |||||||||||| |||| || | |||    
T  19853467 gtcgatcgtatcgtttaatcgatgatttctcaatcaattaaacgatccgaaaactttaagatatgatactttgcgtgattatcaaaacatcaatcctatg 19853368  T
Q  153 tctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaaagtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    |||||| | | ||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||    
T  19853367 tctagatcat-tgtttagatagatgaatattctaaagctagattcaaaagtatttgtcaatagcatttaaatcaaa 19853293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 69 - 228
Target Start/End: Original strand, 9843647 - 9843807
Alignment:
Q  69 aatcgatgatttctcaatctattaaatgataagaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttt 168  Q
    |||||| |||||||||||||||| || |||  |||||||||| ||   |||||     |||||||||||| |||| || | ||||||||||    |||||    
T  9843647 aatcgacgatttctcaatctattcaacgatccgaaagctttatgtaccgataccttgtgtgattatcaaaacatcaatcctatgtctagaattattgttt 9843746  T
Q  169 tgatagatggtt-attctaaacctagattcaaaagtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  9843747 tgatagataatttattctaaacctagattcaaaagtacttttcaataacaattaaatcaaa 9843807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 61 - 228
Target Start/End: Original strand, 34738430 - 34738597
Alignment:
Q  61 tatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataagaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaac 160  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||   | ||| ||| |||  ||||||  | |||| | ||||| || | || | ||||||||||     
T  34738430 tatcgtttaatcgacgatttctcaatctattaaacgatccaatagcgttaagttccgatactttatgtgaatgtcaaaacaccaatcctatgtctagaat 34738529  T
Q  161 ctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaaagtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    |  | ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  34738530 catttttttgatagatgaatattctaaccctagattcaaaagtatttctcaatagcatttaaatcaaa 34738597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 53 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 2156060 - 2155884
Alignment:
Q  53 gtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataagaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatg 152  Q
    |||||||  |||||| ||||||  ||||||||||||||| || |||  |||||||||| ||   |||||     |||||||||||| |||| || | |||    
T  2156060 gtcgatcggatcgtttaatcgacaatttctcaatctattcaacgatctgaaagctttatgtaccgataccttgtgtgattatcaaaacatcaatcctatg 2155961  T
Q  153 tctagaacctatgttttgatagatgg-ttattctaaacctagattcaaaagtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    |||||||    |||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  2155960 tctagaattattgttttgatagataaattatcctaaacctagattcaaaagtacttttcaataacaattaaatcaaa 2155884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 55 - 213
Target Start/End: Original strand, 42747370 - 42747527
Alignment:
Q  55 cgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataagaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtc 154  Q
    ||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||  || | | ||| |||| |||||| ||   |||||||||| ||   |  | |||||    
T  42747370 cgatcgtattgtttaatcgacgatttctcaatctattaaatgatccgataacattaagtttcgatacttaaaa-gattatcaaaacacaaaccctatgtc 42747468  T
Q  155 tagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaaagtatttctcaat 213  Q
    |||||   | ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  42747469 tagaattcaagttttgatagatgattattctaaccctagattcaaaagtatttttcaat 42747527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 9335064 - 9334920
Alignment:
Q  75 tgatttctcaatctattaaatgataagaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatag 174  Q
    ||||||| ||| ||||| |||||||  ||||||||| |||   ||| |||| ||||||||||| || |   |||||||||||||||||| |  || ||||    
T  9335064 tgatttcccaaactattcaatgatacaaaagctttaagttccaatattcaaagtgattatcaa-gcttaagttccatgtctagaacctaagcattaatag 9334966  T
Q  175 atggttattctaaacctagattcaaaa-gtatttctcaatcacaatt 220  Q
    | | |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| ||||||    
T  9334965 aagattattctaaa-ctagattcaaaaggtatttttcaataacaatt 9334920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Original strand, 33794322 - 33794430
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    |||||||||||  |||||| || ||| || ||||||||| ||  || |||  ||||||| ||||||| ||| || |||||||||||||||| || |||      
T  33794322 atcaattgtattgttcaatagttgatttcccaaactattaaacaatccaattgtcgatcgtatcgtttaattgacgatttctcaatctattcaacgatcc 33794421  T
Q  101 gaaagcttt 109  Q
    |||||||||    
T  33794422 gaaagcttt 33794430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 39)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 43686859 - 43687086
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43686859 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 43686958  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43686959 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 43687058  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43687059 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 43687086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 45016011 - 45016238
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45016011 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 45016110  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45016111 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaaactatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 45016210  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45016211 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 45016238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 216; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 6238885 - 6239112
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6238885 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaacgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 6238984  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6238985 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaaactatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 6239084  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6239085 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 6239112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 216; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 41297747 - 41297974
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41297747 atcaattctatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 41297846  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41297847 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 41297946  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41297947 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 41297974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 216; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 42092126 - 42092353
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42092126 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 42092225  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42092226 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaaactatgttttgacagatggttattctaaacctagattcaaa 42092325  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42092326 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 42092353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 29001961 - 29002187
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  29001961 atcaattgtatcattcaattgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaataataa 29002060  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29002061 gaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 29002160  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaa 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  29002161 agtatttctcaatcacaattaaatcaa 29002187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 1174836 - 1175063
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1174836 atcaattgtatcattcaattgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcgctcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 1174935  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1174936 gaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaatcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 1175035  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1175036 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 1175063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 23762328 - 23762101
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23762328 atcaattgtatcattcaattgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 23762229  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23762228 gaaagctttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaaaatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 23762129  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23762128 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 23762101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 39053330 - 39053103
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||    
T  39053330 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgtccaatcgatgatttctcgatctattgaatgctaa 39053231  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39053230 gaaagctttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 39053131  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39053130 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 39053103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 39059702 - 39059475
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||    
T  39059702 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgtccaatcgatgatttctcgatctattgaatgctaa 39059603  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39059602 gaaagctttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 39059503  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39059502 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 39059475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 9869335 - 9869562
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9869335 atcaattgtatcattcaatcatcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaattgatgatttctcaatctattaaatgataa 9869434  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9869435 gaaagctttaggtttggatacaaaaggtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattcaaa 9869534  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9869535 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 9869562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 26621700 - 26621927
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26621700 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 26621799  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    |||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26621800 gaaaactttaagtttggatacaaaaggtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattcaaa 26621899  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26621900 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 26621927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 1115974 - 1115747
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1115974 atcaattgtatcattctatcgtcaatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 1115875  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
     ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1115874 taaagctttaagtttggatacaaaaggtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacttatgttttgatagatgattattctaaacctagattcaaa 1115775  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1115774 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 1115747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 44241587 - 44241814
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44241587 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtgtcaaactattgaatgattcaagagtcagtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 44241686  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    |||||||||| ||||||||||  || |||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44241687 gaaagctttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaatttcatgtctagaatctatgttttgatagatgattattctaaacctagattcaaa 44241786  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44241787 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 44241814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 44916568 - 44916795
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  44916568 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgatccaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaacgataa 44916667  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    |||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44916668 gaaaactttaagtttggatacaaaaggtgattatcaaaacatcaattccatatctagaacttatgttttgatagatgattattctaaacctagattcaaa 44916767  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44916768 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 44916795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 4599759 - 4599986
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| |||||||||||||||||| ||| ||||    
T  4599759 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcaatgatttctcaatctattgaatcataa 4599858  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    |||||||||| ||||||||||  || ||||||| |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  4599859 gaaagctttaagtttggatacaaaaagtgattaccaaaacatcaattccatgtctataacctatgttttgatagatgattattctaaaccttgattcaaa 4599958  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4599959 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 4599986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 41305506 - 41305285
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |     ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41305506 atcaattgtatcattcgaacgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcatct-----aatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 41305412  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41305411 gaaagctttaagtttggatacaaaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattcaaa 41305312  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaa 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  41305311 agtatttctcaatcacaattaaatcaa 41305285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 32797953 - 32798181
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  32797953 atcaattgtatcattcaatcgttgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctatcgaatgataa 32798052  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    |||| ||||| ||||||||||  || |||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32798053 gaaaactttaagtttggatacaaaatgtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacttatgttttgatagatgattattctaaacctagattcaaa 32798152  T
Q  201 agta-tttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32798153 agtattttctcaatcacaattaaatcaaa 32798181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 11913254 - 11913027
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||| || ||||||||| |||||| ||||||||    
T  11913254 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtttcaaactattgaatgatccaagagtcggtcttatcatttaattgaagatttctcagtctattgaatgataa 11913155  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    |||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  11913154 gaaagctttaagttttgatacaaaaggtgattatcaaaacataaattccatgtctagaacttatgttttgatagatgattattctaaacctaaattcaaa 11913055  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11913054 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 11913027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 35085239 - 35085463
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |   ||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  35085239 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcagt---atcatttaatcgatgatttctcaacctattgaatgataa 35085335  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    |||||||||| ||||||||||  || |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  35085336 gaaagctttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaatctatgttttgatagatgattattctaagcctagattcaaa 35085435  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
     |||||||||||||||||||||||||||    
T  35085436 ggtatttctcaatcacaattaaatcaaa 35085463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 24 - 228
Target Start/End: Original strand, 31072571 - 31072775
Alignment:
Q  24 gatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataagaaagctttaggtttggatactc 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||      
T  31072571 gatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcataaaatcaatgatttctcaatctattgaatgataagaaagctttaagtttggatacaa 31072670  T
Q  124 aaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaaagtatttctcaatcacaattaaa 223  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||    
T  31072671 aaggtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacttatgttttcatagatgattattctaaaccttgatttaaaagtatttctcaatcataatcaaa 31072770  T
Q  224 tcaaa 228  Q
    |||||    
T  31072771 tcaaa 31072775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 127 - 227
Target Start/End: Original strand, 28996371 - 28996471
Alignment:
Q  127 gtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaaagtatttctcaatcacaattaaatca 226  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28996371 gtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaaagtatttctcaatcacaattaaatca 28996470  T
Q  227 a 227  Q
    |    
T  28996471 a 28996471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 41299180 - 41299044
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  41299180 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatctaatcaatgatttctcaatctattgaatgataa 41299081  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaa 137  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  41299080 gaaagctttaagtttggatacaaaaggtgattatcaa 41299044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 31 - 228
Target Start/End: Original strand, 23251612 - 23251809
Alignment:
Q  31 caaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataagaaagctttaggtttggatactcaaggtga 130  Q
    ||||||||| ||  || ||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||  ||||||    ||||    
T  23251612 caaactattaaacaatccaatagtcgatcgtatcgtttaatcgacgatttctcaatctattcaatgatccgaaagctttaagttccgatactttgtgtga 23251711  T
Q  131 ttatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaaagtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    |||||||| |||| || | |||||||||| |  ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||    
T  23251712 ttatcaaaacatcaatcctatgtctagaatcattgttttgatagatgaatattctaaacctagattcaaaagtacttttcaatagcaattaaatcaaa 23251809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 61 - 228
Target Start/End: Original strand, 47646960 - 47647128
Alignment:
Q  61 tatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataagaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaac 160  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||| ||||||||| |||  |||||| | | | || ||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||||||     
T  47646960 tatcgtttaatcgacgatttttcagtctattaaacgatctgaaagcatgaagcttagatactcaaagtgattatcaaaacatcaatcccatgtctagaat 47647059  T
Q  161 ct-atgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaaagtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
     | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||  |||| | ||||||||||||    
T  47647060 ttcatgttttgatagatgattattctaaacctagattctagagtatttgccaataaaaattaaatcaaa 47647128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 5357739 - 5357512
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    |||||||||||  |||||| || ||| || ||||||||| ||  |||||| |||||| | ||||||| ||||||  ||||||||||||||| || |||      
T  5357739 atcaattgtattgttcaattgttgatttcccaaactattaaacaattcaatagtcgaccgtatcgtttaatcgacaatttctcaatctattcaacgatcc 5357640  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    |||||||||| |||   |||||    |||||||||||| |||| || | |||||||||| |  ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  5357639 gaaagctttaagttccaatactttgtgtgattatcaaaacatcaatcctatgtctagaatcattgttttgatagatgaatattctaaacctggattcaaa 5357540  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    | || || |||||  |||||||||||||    
T  5357539 attacttttcaatagcaattaaatcaaa 5357512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 45620136 - 45619909
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    |||||||||||  |||||| || ||| || || |||||| ||  || ||| |||| ||  ||||||| |||| | ||||||||||||||||||| |||      
T  45620136 atcaattgtattgttcaatcgttgatttcccagactattaaacaatccaatagtccattgtatcgtttaatcaacgatttctcaatctattaaacgatcc 45620037  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    |||||||||| |||  ||||||    |||||||||||| ||| ||| | |||||||||| |  ||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||    
T  45620036 gaaagctttaagttccgatactttgtgtgattatcaaaacattgatcctatgtctagaatcattgttttgatagatgaatattttaaacctatattcaaa 45619937  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    |||| || ||||| ||||||||||||||    
T  45619936 agtacttttcaataacaattaaatcaaa 45619909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 38672769 - 38672541
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    |||||||||||  |||||| || ||| || ||||||||| ||  || |||  ||||||| ||||||| ||| || |||||||||||||||| || |||      
T  38672769 atcaattgtattgttcaatagttgatttcccaaactattaaacaatccaattgtcgatcgtatcgtttaattgacgatttctcaatctattcaacgatcc 38672670  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatgg-ttattctaaacctagattcaa 199  Q
    |||||||||| ||   |||||     |||||||||||| |||| || | ||||||||||    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  38672669 gaaagctttatgtaccgataccttgtgtgattatcaaaacatcaatcctatgtctagaattattgttttgatagatgaattattctaaacctagattcaa 38672570  T
Q  200 aagtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  38672569 aagtacttttcaataacaattaaatcaaa 38672541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 54 - 228
Target Start/End: Original strand, 13432132 - 13432306
Alignment:
Q  54 tcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataagaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgt 153  Q
    |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||  ||||||    |||||||||||| |||   | | ||||    
T  13432132 tcgatcgtatcgtttaatcgacgatttctcaatctattaaacgatctgaaagctttaagttccgatactttgtgtgattatcaaaacattagtcctatgt 13432231  T
Q  154 ctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaaagtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    |||||| |  |||||| ||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  13432232 ctagaatcattgtttttatagataaatattcttaacctagattcaaaagtatttctcaatagcatttaaatcaaa 13432306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 61 - 213
Target Start/End: Original strand, 13249008 - 13249158
Alignment:
Q  61 tatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataagaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaac 160  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||   | ||| ||| | || |||||| ||||||||||||||| |||  || |  |||||||||     
T  13249008 tatcgtttaatcgacgatttctcaatctattaaacgatctaatagcattaagcttcgatacttaaggtgattatcaaaacattaatcc--tgtctagaat 13249105  T
Q  161 ctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaaagtatttctcaat 213  Q
       |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  13249106 tcttgttttgatagatgattattctaaccctagattcaaaagtatttttcaat 13249158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 69 - 213
Target Start/End: Original strand, 31473557 - 31473701
Alignment:
Q  69 aatcgatgatttctcaatctattaaatgataagaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttt 168  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||  || | | ||| | || |||||| ||||||||||||||| ||   || | ||||||||||    |||||    
T  31473557 aatcgacgatttctcaatctattaaacgatccgatatcattaagctttgatacttaaggtgattatcaaaacactaatcctatgtctagaattcttgttt 31473656  T
Q  169 tgatagatggttattctaaacctagattcaaaagtatttctcaat 213  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  31473657 tgatagatgattattctaaccctagattcaaaagtatttttcaat 31473701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 28413665 - 28413437
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    |||||||||||  |||||| || ||| || ||||||||| ||  || |||  ||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||||| || |||      
T  28413665 atcaattgtattgttcaatagttgatttcccaaactattaaacaatccaattgtcaatcagatcgtttaatcgacgatttctcaatctattcaacgatcc 28413566  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatgg-ttattctaaacctagattcaa 199  Q
    |||||||||| ||    ||||     |||||||||||| |||| || | ||||||||||    |||||||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  28413565 gaaagctttatgtaccaataccttgtgtgattatcaaaacatcaatcctatgtctagaattattgttttgatagataaattattctaaacctagattcaa 28413466  T
Q  200 aagtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  28413465 aagtacttttcaataacaattaaatcaaa 28413437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 53 - 228
Target Start/End: Original strand, 39806339 - 39806515
Alignment:
Q  53 gtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataagaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatg 152  Q
    ||||||| ||||||| ||| || |||||||||||| ||| || |||  |||||||||| ||   |||||     |||||||||||| ||||||| | |||    
T  39806339 gtcgatcatatcgtttaatagacgatttctcaatccattcaacgatccgaaagctttatgtactgataccttgtgtgattatcaaaacatcgatcctatg 39806438  T
Q  153 tctagaacctatgttttgatagatgg-ttattctaaacctagattcaaaagtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    |||||||    |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||    
T  39806439 tctagaattattgttttgatagataaattattctaaacctagattcaaaagtacttttcaataaaaattaaatcaaa 39806515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 2824744 - 2824584
Alignment:
Q  69 aatcgatgatttctcaatctattaaatgataagaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttt 168  Q
    |||||| |||||||||||||||| || |||  |||||||||| ||   |||||     |||||||||||| |||| || | ||||||||||    |||||    
T  2824744 aatcgacgatttctcaatctattcaacgatccgaaagctttatgtaccgataccttgtgtgattatcaaaacatcaatcctatgtctagaattattgttt 2824645  T
Q  169 tgatagatgg-ttattctaaacctagattcaaaagtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||   |||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  2824644 tgatagataaattatcctaaacctagattcaaaagtacttttcaataacaattaaatcaaa 2824584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 202
Target Start/End: Original strand, 21815125 - 21815250
Alignment:
Q  76 gatttctcaatctattaaatgataagaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgataga 175  Q
    |||||| ||| |||||||||||||  |||| |||| |||    || |||| |||||||||||| | |  ||||||||||||||||  | | |||||||||    
T  21815125 gatttcccaaactattaaatgatacaaaagttttaagttccactattcaaagtgattatcaaaacctaaattccatgtctagaacaaaagctttgataga 21815224  T
Q  176 tggttattctaaacctagattcaaaag 202  Q
     | ||||||| ||||||||||||||||    
T  21815225 agattattct-aacctagattcaaaag 21815250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 61 - 94
Target Start/End: Original strand, 6847847 - 6847880
Alignment:
Q  61 tatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaa 94  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6847847 tatcgtttaatcgatgatttctcaatctattaaa 6847880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 164 - 213
Target Start/End: Original strand, 30660234 - 30660283
Alignment:
Q  164 tgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaaagtatttctcaat 213  Q
    ||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  30660234 tgttttggttgatgattattctaaccctagattcaaaagtatttttcaat 30660283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 69 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 6244603 - 6244575
Alignment:
Q  69 aatcgatgatttctcaatctattaaatga 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6244603 aatcgatgatttctcaatctattaaatga 6244575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 146 - 202
Target Start/End: Original strand, 9316337 - 9316392
Alignment:
Q  146 ttccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaaag 202  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||||| | |||||||||| |||||||||||||    
T  9316337 ttccatgtctagaaccaatgcattgatagaagattattctaaa-ctagattcaaaag 9316392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0510 (Bit Score: 216; Significance: 1e-119; HSPs: 2)
Name: scaffold0510
Description:

Target: scaffold0510; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 8873 - 8646
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8873 atcaattctatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 8774  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8773 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 8674  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8673 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 8646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0510; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 2552 - 2326
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  2552 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatctaatcaatgatttctcaatctattgaatgataa 2453  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2452 gaaagctttaagtttggatacaaaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtttagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattcaaa 2353  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaa 227  Q
    | |||||||||||||||||||||||||    
T  2352 aatatttctcaatcacaattaaatcaa 2326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 216; Significance: 1e-119; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 49920 - 50147
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  49920 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 50019  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50020 gaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 50119  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50120 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 50147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 216; Significance: 1e-119; HSPs: 22)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 41373217 - 41373444
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41373217 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 41373316  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41373317 gaaagctttaggcttggatactcaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaaactatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 41373416  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41373417 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 41373444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 37368307 - 37368080
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  37368307 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcgatctattgaatgataa 37368208  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37368207 gaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 37368108  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37368107 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 37368080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 13594338 - 13594565
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  13594338 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgtccaatcgatgatttctcgatctattgaatgataa 13594437  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13594438 gaaagctttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 13594537  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13594538 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 13594565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 55462764 - 55462537
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  55462764 atcaattgtatcattcaatcgttgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 55462665  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55462664 gaaagctttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 55462565  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  55462564 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 55462537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 27590535 - 27590762
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  27590535 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgtccaatcgatgatttctcgatctattgaatgataa 27590634  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27590635 gaaagctttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 27590734  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27590735 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 27590762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 8104112 - 8104338
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  8104112 atcaattgtatc-ttcaattgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctatagaatgataa 8104210  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8104211 gaaagctttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 8104310  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8104311 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 8104338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 17457085 - 17457312
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||    
T  17457085 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgtccaatcgatgatttctcgatctattgaatgctaa 17457184  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17457185 gaaagctttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattcaaa 17457284  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17457285 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 17457312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16838351 - 16838124
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16838351 atcaattgtatcatccaatcgtcgatgtctcagactattaaatgattcaagagtcggtcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 16838252  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    |||||||||| |||||||||   || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16838251 gaaagctttaagtttggataaaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 16838152  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16838151 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 16838124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 36754783 - 36754556
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36754783 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgatccaagagtcggtcttatcattcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 36754684  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36754683 gaaagctttaagtttggatacaaaaggtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacttatgttttgatagatgattattctaaacctagattcaaa 36754584  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36754583 agtatttctcaatcacaattacatcaaa 36754556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 16405576 - 16405803
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16405576 atcaattgtatcattcaattgtcaatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 16405675  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    |||||||||| ||||||||||  || |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16405676 gaaagctttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaatcatcaattccatgtctagaatctatgttttgatagatgattattctaaacctagattcaaa 16405775  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16405776 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 16405803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 30211528 - 30211301
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  30211528 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcggtgatttctcaatctattgaatgataa 30211429  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    |||||||||| ||||||||||  || |||||||||||| |||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30211428 gaaagctttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatccatttcatatctagaacttatgttttgatagatgattattctaaacctagattcaaa 30211329  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30211328 agtatttctcaatcacaatcaaatcaaa 30211301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 5660541 - 5660314
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5660541 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgatccaagagtcagtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattaaatgctaa 5660442  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    |||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||   ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||     
T  5660441 gaaagcgttaagtttggatacaaaaggtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaattcatgttgtgatagatgattattttaaacctagattcaag 5660342  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||    
T  5660341 agtatttttcgatcacaattaaatcaaa 5660314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 37356236 - 37356114
Alignment:
Q  106 ctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaaagtat 205  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37356236 ctttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaaagtat 37356137  T
Q  206 ttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  37356136 ttctcaatcacaattaaatcaaa 37356114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 30238490 - 30238580
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctatt 91  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30238490 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgttgatttctcaatctatt 30238580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 124 - 228
Target Start/End: Original strand, 30238582 - 30238686
Alignment:
Q  124 aaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaaagtatttctcaatcacaattaaa 223  Q
    ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30238582 aaggtgattatcaaaacattcattccatgtctagaatctctgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaaagtatttctcaatcaaaattaaa 30238681  T
Q  224 tcaaa 228  Q
    |||||    
T  30238682 tcaaa 30238686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 61 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 52183099 - 52182932
Alignment:
Q  61 tatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataagaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaac 160  Q
    ||||||| ||| || ||||||||||||||| | | |||  |||||||||| | || ||||||    |||||||||||| |||| |||  ||||||||||     
T  52183099 tatcgtttaattgacgatttctcaatctatcatacgatctgaaagctttaagatttgatactttgtgtgattatcaaaacatcaattttatgtctagaat 52183000  T
Q  161 ctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaaagtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    |  ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  52182999 cattgttttgatagatgaatattttaaacctagattcaaaagtatttgtcaatagcaattaaatcaaa 52182932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Original strand, 7780637 - 7780700
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatc 64  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  7780637 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcagtcttatc 7780700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 54 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 49359254 - 49359080
Alignment:
Q  54 tcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataagaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgt 153  Q
    |||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| |||   ||||| | | | ||  |||| ||| |||||||||||| |||  || | ||||    
T  49359254 tcgatcgtatcgtttaatcgacgatttctcagtctattaaacgatctaaaagcgtgaagcttatatacacaaagtgattatcaaaacataaatcctatgt 49359155  T
Q  154 ctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaaagtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    |||||     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||    
T  49359154 ctagatttcctgttttgatagatgattattctaaacctagattcaagagtatttttcaatagcaattaaatcaaa 49359080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 182 - 228
Target Start/End: Original strand, 7780737 - 7780783
Alignment:
Q  182 ttctaaacctagattcaaaagtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7780737 ttctaaacctagattcaaaagtatttctcaatcacaattaaatcaaa 7780783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 69 - 228
Target Start/End: Original strand, 2948143 - 2948303
Alignment:
Q  69 aatcgatgatttctcaatctattaaatgataagaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttt 168  Q
    |||||| |||||||||||||||| || |||  |||||||||| ||   |||||     |||||||||||| |||| || | ||||||||||    |||||    
T  2948143 aatcgacgatttctcaatctattcaacgatccgaaagctttatgtaccgataccttgtgtgattatcaaaacatcaatcctatgtctagaattattgttt 2948242  T
Q  169 tgatagatggtt-attctaaacctagattcaaaagtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  2948243 tgatagataatttattctaaacctagattcaaaagtacttttcaataacaattaaatcaaa 2948303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 13003798 - 13003571
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    |||||||||||  |||||| || ||| |||||||||||| ||  || |||  ||||||| ||||||| ||| || |||||||||||||||| || |||      
T  13003798 atcaattgtattgttcaatagttgatttctcaaactattaaacaatccaattgtcgatcgtatcgtttaattgacgatttctcaatctattcaacgatcc 13003699  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagat-ggttattctaaacctagattcaa 199  Q
    |||||||||| ||    || |     |||||||||||| |||| || | ||||||||||    |||||||||||||   ||||||| |||| ||||||||    
T  13003698 gaaagctttatgtacttattccttgtgtgattatcaaaacatcaatcctatgtctagaattattgttttgatagataaattattct-aacccagattcaa 13003600  T
Q  200 aagtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  13003599 aagtacttttcaataacaattaaatcaaa 13003571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 63 - 202
Target Start/End: Original strand, 13568272 - 13568410
Alignment:
Q  63 tcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataagaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacct 162  Q
    ||||| |||||  |||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| |||   ||| |||| |||||||||||| | |  |||||||||||| |||      
T  13568272 tcgtttaatcgtcgatttcccaaactattaaatgatacaaaagctttaagttccaatattcaaagtgattatcaaaacctaaattccatgtctaaaacaa 13568371  T
Q  163 atgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaaag 202  Q
    | | ||||||||| | ||||||| |||||||| |||||||    
T  13568372 aagctttgatagaagattattct-aacctagaatcaaaag 13568410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 216; Significance: 1e-119; HSPs: 27)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 4311478 - 4311251
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4311478 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 4311379  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4311378 gaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 4311279  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4311278 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 4311251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 216; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 23068694 - 23068921
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23068694 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 23068793  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23068794 gaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 23068893  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23068894 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 23068921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 6036496 - 6036723
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6036496 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 6036595  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6036596 gaaagctttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 6036695  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6036696 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 6036723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 32746600 - 32746827
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32746600 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 32746699  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32746700 gaaagctttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 32746799  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32746800 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 32746827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 24179304 - 24179531
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  24179304 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcgatctattgaatgataa 24179403  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24179404 gaaagctttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 24179503  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24179504 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 24179531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 27501959 - 27501732
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||    
T  27501959 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgtccaatcgatgatttctcgatctattgaatgctaa 27501860  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27501859 gaaagctttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattcaaa 27501760  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27501759 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 27501732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 43931807 - 43932034
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  43931807 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttgccaatctattgaatgataa 43931906  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43931907 gaaagctttaagtttggatacaaaaggtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacttatgttttgatagatgattattctaaacctagattcaaa 43932006  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
     |||||||||||||||||||||||||||    
T  43932007 cgtatttctcaatcacaattaaatcaaa 43932034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 10941296 - 10941069
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10941296 atcaattgtatcattcaatcgtcaatgtctcaaactattgaatatttcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 10941197  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10941196 gaaagctttaagtttggatacaaaaggtgattatcaaaacatcaattccatatctagaacttatgttttgatagatgattattctaaacctagattcaaa 10941097  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10941096 agtatttctcaatcacaatcaaatcaaa 10941069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 43995308 - 43995534
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43995308 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgatccaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 43995407  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||| |||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  43995408 gaaagctttaagtttggatacaaaaggt-attatcaaaacatcaatttcatgtccagaacttatgttttgatagatgattattctaaacatagattcaaa 43995506  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43995507 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 43995534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 9 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 9570532 - 9570312
Alignment:
Q  9 tatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataagaaagctt 108  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  9570532 tatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataagaaagcgt 9570433  T
Q  109 taggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacct-atgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaaagtattt 207  Q
    ||  |||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9570432 taaatttggatacaaaagatgattatcaaaacatcgattccatgtctagaatctcttgttttgatagatgattattctaaacctagattcaaaagtattt 9570333  T
Q  208 ctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  9570332 ctcaatcacaattaaatcaaa 9570312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 9 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 9577034 - 9576814
Alignment:
Q  9 tatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataagaaagctt 108  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  9577034 tatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataagaaagcgt 9576935  T
Q  109 taggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacct-atgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaaagtattt 207  Q
    ||  |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9576934 taaatttggatacaaaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaatctcttgttttgatagatgattattctaaaccaagattcaaaagtattt 9576835  T
Q  208 ctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  9576834 ctcaatcacaattaaatcaaa 9576814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 25893466 - 25893625
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25893466 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 25893565  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaac 160  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25893566 gaaagctttaagtttggatacaaaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaac 25893625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 20651117 - 20650890
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20651117 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgatccaagagtcggttttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 20651018  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    ||| || ||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||   ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||     
T  20651017 gaaggcgttaagtttggatacaaaaggtgattatcaaaacattaattccatgtctagaattcatgttgtgatagaggattattctaaacctagattcaag 20650918  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  20650917 agtatttttcaatcacaactaaatcaaa 20650890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 62 - 228
Target Start/End: Original strand, 47441092 - 47441258
Alignment:
Q  62 atcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataagaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacc 161  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||     
T  47441092 atcgtttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataagaaagttttaagtttggatacaaaaggtgattatcaaaacatcaatttcatgtctagaact 47441191  T
Q  162 tatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaaagtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47441192 tatgttttgatagaggattattctaaacctagattcaaaagtatttctcaatcacaattaaatcaaa 47441258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Original strand, 13015216 - 13015335
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13015216 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 13015315  T
Q  101 gaaagctttaggtttggata 120  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  13015316 gaaagctttaggtttagata 13015335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 9331130 - 9330910
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    |||||||||||  |||||| || ||| || ||||||||| |   || ||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||||| |||      
T  9331130 atcaattgtattgttcaatcgttgatttcccaaactattaagcaatccaatagtcgatcgtatcgtttaatcgacgatttctccatctattaaacgatct 9331031  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    |||||||||| ||   ||||||    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  9331030 gaaagctttaagtcccgatactttgtgtgattatcaaaacattgattccatgtctagaaccattgttttgatagatgaatattctaaacatagattcaaa 9330931  T
Q  201 agtatttctcaatcacaatta 221  Q
    |||| || ||||| |||||||    
T  9330930 agtacttttcaataacaatta 9330910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 163 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 41354143 - 41354078
Alignment:
Q  163 atgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaaagtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41354143 atgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaaagtatttctcaatcacaattaaatcaaa 41354078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 61 - 228
Target Start/End: Original strand, 24705101 - 24705268
Alignment:
Q  61 tatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataagaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaac 160  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||  ||||||    |||||||||||| |||| |    ||||||||||     
T  24705101 tatcgtttaatcgacgatttctcaatctattaaacgatctgaaagctttaagttccgatactttgtgtgattatcaaaacatcaaccttatgtctagaat 24705200  T
Q  161 ctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaaagtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    |  ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  24705201 cattgttttgatagatgaatattctaaacttagattcaaaagtatttttcaataacaattaaatcaaa 24705268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 61 - 228
Target Start/End: Original strand, 25692267 - 25692438
Alignment:
Q  61 tatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataagaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaac 160  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||| ||| |||||||    |||||||||||| |||| |  | ||||||||||     
T  25692267 tatcgtttaatcgatgatttctcaatcttttaaaagatctgaaagctttaagttcggatactttgtgtgattatcaaaacatcaaccctatgtctagaat 25692366  T
Q  161 cta----tgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaaagtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    |      ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  25692367 catgcattgttttgatagatgaatattctaaacctagattcaaaagtatttctcaatagcatttaaatcaaa 25692438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 20952746 - 20952519
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    |||||||||||  |||| | || ||| || ||||||||| ||  || ||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||| || |||      
T  20952746 atcaattgtattgttcagtcgttgatttcccaaactattaaacaatccaatagtcgatcgtatcgtttaatcgacgatttcttaatctattcaacgatcc 20952647  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    |||||||||| |||  ||||||    |||||||||||| |||| || | |||||||||| |  ||||||||||| |   |||||||||||||||||||||    
T  20952646 gaaagctttaagttccgatactttgtgtgattatcaaaacatcaatcctatgtctagaatcattgttttgataggtcaatattctaaacctagattcaaa 20952547  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
     ||| || |||||  |||||||||||||    
T  20952546 ggtacttttcaatagcaattaaatcaaa 20952519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 61 - 228
Target Start/End: Original strand, 17735634 - 17735801
Alignment:
Q  61 tatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataagaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaac 160  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||  || ||||||| ||   |||||     |||||||||||| |||| |  | ||||||||||     
T  17735634 tatcgtttaatcgacgatttctcaatctattaaacgatctgatagctttaagtactgataccttgtgtgattatcaaaacatcaacgctatgtctagaat 17735733  T
Q  161 ctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaaagtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    |  ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||    
T  17735734 cattgttttgatagatgaatattctaaacctagattcataagcatttctcaattacatttaaatcaaa 17735801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 61 - 228
Target Start/End: Original strand, 19036903 - 19037070
Alignment:
Q  61 tatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataagaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaac 160  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||  || ||||||| ||   |||||     |||||||||||| |||| |  | ||||||||||     
T  19036903 tatcgtttaatcgacgatttctcaatctattaaacgatctgatagctttaagtactgataccttgtgtgattatcaaaacatcaacgctatgtctagaat 19037002  T
Q  161 ctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaaagtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    |  ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||    
T  19037003 cattgttttgatagatgaatattctaaacctagattcataagcatttctcaattacatttaaatcaaa 19037070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 2785935 - 2786148
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    |||||||||||| || ||| || ||| |||||||||| | || ||| ||| | ||| || ||||||| |||||| |||||||| ||| |||||| |||      
T  2785935 atcaattgtatcgtttaatcgttgatttctcaaactactaaacgatccaatattcggtcgtatcgtttaatcgacgatttctccatcgattaaacgatcc 2786034  T
Q  101 gaaagctttagg-tttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaa 199  Q
    |||||| | | | |||| ||||  ||||||||||||| | |||| || | ||||| ||||   ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  2786035 gaaagcatgaagctttgaatacaaaaggtgattatcagaacatcaatcctatgtccagaattcatgttttgatagatgatgattctaaacctagattcaa 2786134  T
Q  200 aagtatttctcaat 213  Q
     ||||||| |||||    
T  2786135 gagtatttttcaat 2786148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 150 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 461272 - 461194
Alignment:
Q  150 atgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaaagtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    |||||||||| || | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  461272 atgtctagaatctttattttgatagatgattattctaaccctagattcaaaagtatttttcaataacatttaaatcaaa 461194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 69 - 228
Target Start/End: Original strand, 4591093 - 4591253
Alignment:
Q  69 aatcgatgatttctcaatctattaaatgataagaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttt 168  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||| || ||   |||||     ||||||||||||||||| || | ||||||||||    || ||    
T  4591093 aatcgatgatttctcaatctattcaacgatccgaaagctatatgtaccgataccttgtgtgattatcaaagcatcaatcctatgtctagaattattgctt 4591192  T
Q  169 tgatagat-ggttattctaaacctagattcaaaagtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||   |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  4591193 tgatagataatttattctaaacctagattcaaaagtacttttcaataacaattaaatcaaa 4591253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 202
Target Start/End: Original strand, 27900781 - 27900960
Alignment:
Q  21 gtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataagaaagctttaggtttggata 120  Q
    |||||| || ||||||||| || ||| ||| ||||||| ||||  ||  || | ||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| |||   |||    
T  27900781 gtcgatttcccaaactattaaacgatccaatagtcgattttattattgcatagttgatttcccaaactattaaatgatacaaaagctttaagttccaata 27900880  T
Q  121 ctcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaaag 202  Q
     |||| |||||||||||| | |  ||||||||||||||||  ||| ||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||    
T  27900881 ttcaaagtgattatcaaaacctaaattccatgtctagaacaaatgctttga-agaagattattct-aacctagattcaaaag 27900960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 164 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 4644291 - 4644227
Alignment:
Q  164 tgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaaagtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||    
T  4644291 tgttttgatagatgaatattctaaacatagattcaaaattacttttcaataacaattaaatcaaa 4644227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0343 (Bit Score: 180; Significance: 2e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0343
Description:

Target: scaffold0343; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 2875 - 3102
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2875 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcattaaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 2974  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    |||||||||| ||||||||||  || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2975 gaaagctttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatgttttgatagatgattattctaaacctagattcaaa 3074  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3075 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 3102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0936 (Bit Score: 176; Significance: 6e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0936
Description:

Target: scaffold0936; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 3256 - 3029
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  3256 atcaattgtatcattcaattgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttaccgttcaatcgatgatttctcaatctattgattgataa 3157  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3156 gaaagctttaagtttggatacacaagatgattatcaaaacatgaattccatgtctagaacttatgttttgatagatgattattctaaacctagattcaaa 3057  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3056 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 3029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 160; Significance: 2e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 15401 - 15628
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15401 atcaattgtatcattcaatcgttgatgtctcacactattgaatgattcaagaatcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 15500  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatagatggttattctaaacctagattcaaa 200  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15501 gaaagctttaagtttggatacaaaaggtgattatcaaaacatcaattcaatgtctagaacttatgttttgatagatgattattctaaacctagattcaaa 15600  T
Q  201 agtatttctcaatcacaattaaatcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15601 agtatttctcaatcacaatcaaatcaaa 15628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513 (Bit Score: 153; Significance: 3e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0513
Description:

Target: scaffold0513; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 12163 - 12327
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12163 atcaattctatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 12262  T
Q  101 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatg 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12263 gaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 12327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0173 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0173
Description:

Target: scaffold0173; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 24257 - 24148
Alignment:
Q  1 atcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataa 100  Q
    |||||||||||  |||||| || ||| |||||||||||| ||  || |||  ||||||| ||||||| ||| || |||||||||||||||| || |||      
T  24257 atcaattgtattgttcaatagttgatttctcaaactattaaacaatccaattgtcgatcgtatcgtttaattgacgatttctcaatctattcaacgatcc 24158  T
Q  101 gaaagcttta 110  Q
    ||||||||||    
T  24157 gaaagcttta 24148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0291 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0291
Description:

Target: scaffold0291; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 75 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 1624 - 1498
Alignment:
Q  75 tgatttctcaatctattaaatgataagaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgatag 174  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||  || |||||| |||   ||| |||| |||||||||||| | |  ||||||||||||||||  | | ||||||||    
T  1624 tgatttcccaaactattaaatgatacaaacgctttaagttccaatattcaaagtgattatcaaaacctaaattccatgtctagaacaaaagctttgatag 1525  T
Q  175 atggttattctaaacctagattcaaaag 202  Q
    | | ||||||| ||||||| ||||||||    
T  1524 aagattattct-aacctagtttcaaaag 1498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0265 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0265
Description:

Target: scaffold0265; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 17684 - 17559
Alignment:
Q  76 gatttctcaatctattaaatgataagaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatgttttgataga 175  Q
    |||||| ||| |||||||||||||  |||| |||| |||    || |||| |||||||||||| | |  ||||||||||||||||  | | |||||||||    
T  17684 gatttcccaaactattaaatgatacaaaagttttaagttccactattcaaagtgattatcaaaacctaaattccatgtctagaacaaaagctttgataga 17585  T
Q  176 tggttattctaaacctagattcaaaag 202  Q
     | ||||||| ||||||||||||||||    
T  17584 agattattct-aacctagattcaaaag 17559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University