View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5915-Insertion-3 (Length: 1075)

Name: NF5915-Insertion-3
Description: NF5915
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5915-Insertion-3
NF5915-Insertion-3
[»] chr1 (90 HSPs)
chr1 (147-862)||(15030807-15031521)
chr1 (145-667)||(15031145-15031667)
chr1 (145-651)||(15023820-15024326)
chr1 (434-862)||(15009709-15010136)
chr1 (272-656)||(15023959-15024343)
chr1 (272-656)||(15031300-15031684)
chr1 (146-523)||(15031001-15031378)
chr1 (651-938)||(15023893-15024180)
chr1 (651-938)||(15031234-15031521)
chr1 (14-363)||(15009703-15010052)
chr1 (14-363)||(15030801-15031150)
chr1 (56-379)||(15009903-15010226)
chr1 (272-532)||(14533631-14533891)
chr1 (370-667)||(14533585-14533882)
chr1 (560-876)||(15009910-15010226)
chr1 (416-662)||(15024097-15024343)
chr1 (416-662)||(15031438-15031684)
chr1 (172-388)||(14533675-14533891)
chr1 (650-934)||(15031094-15031378)
chr1 (290-507)||(15009703-15009920)
chr1 (290-507)||(15030801-15031018)
chr1 (434-651)||(15009703-15009920)
chr1 (290-523)||(15009903-15010136)
chr1 (434-651)||(15030801-15031018)
chr1 (284-507)||(15001100-15001321)
chr1 (428-651)||(15001100-15001321)
chr1 (175-363)||(15001100-15001288)
chr1 (676-933)||(14533675-14533932)
chr1 (272-457)||(15036061-15036246)
chr1 (679-862)||(15001106-15001288)
chr1 (416-594)||(15036068-15036246)
chr1 (794-938)||(15009776-15009920)
chr1 (794-938)||(15030874-15031018)
chr1 (788-938)||(15001173-15001321)
chr1 (650-862)||(15023826-15024037)
chr1 (650-876)||(15031008-15031234)
chr1 (17-152)||(15023959-15024094)
chr1 (17-152)||(15031300-15031435)
chr1 (649-930)||(15024045-15024326)
chr1 (649-930)||(15031386-15031667)
chr1 (43-163)||(15031145-15031265)
chr1 (53-158)||(15024097-15024202)
chr1 (53-158)||(15031438-15031543)
chr1 (146-313)||(15036061-15036228)
chr1 (22-163)||(14533597-14533738)
chr1 (14-163)||(14533733-14533882)
chr1 (650-802)||(15036076-15036228)
chr1 (776-934)||(15036088-15036246)
chr1 (56-163)||(15036139-15036246)
chr1 (16-150)||(14523470-14523604)
chr1 (730-927)||(14533585-14533782)
chr1 (361-510)||(14523455-14523604)
chr1 (68-163)||(15001228-15001321)
chr1 (560-667)||(15036139-15036246)
chr1 (217-366)||(14523455-14523604)
chr1 (505-654)||(14523455-14523604)
chr1 (572-667)||(15001228-15001321)
chr1 (275-501)||(15016112-15016338)
chr1 (560-667)||(15024236-15024343)
chr1 (56-163)||(15024236-15024343)
chr1 (560-667)||(15031577-15031684)
chr1 (56-163)||(15031577-15031684)
chr1 (419-645)||(15016112-15016338)
chr1 (14-147)||(15001100-15001233)
chr1 (794-934)||(15009996-15010136)
chr1 (172-357)||(15016112-15016297)
chr1 (43-147)||(15023820-15023924)
chr1 (721-864)||(14523455-14523597)
chr1 (776-930)||(15024189-15024343)
chr1 (776-930)||(15031530-15031684)
chr1 (416-523)||(15010119-15010226)
chr1 (676-862)||(15016112-15016297)
chr1 (419-501)||(14481558-14481640)
chr1 (275-357)||(14481558-14481640)
chr1 (563-645)||(14481558-14481640)
chr1 (59-141)||(14481558-14481640)
chr1 (880-934)||(14523470-14523524)
chr1 (22-164)||(15016233-15016375)
chr1 (56-141)||(15016112-15016197)
chr1 (779-938)||(15016179-15016338)
chr1 (14-90)||(15036068-15036144)
chr1 (779-862)||(14481558-14481640)
chr1 (561-656)||(15039879-15039974)
chr1 (462-512)||(15039879-15039929)
chr1 (318-368)||(15039879-15039929)
chr1 (563-668)||(15016233-15016338)
chr1 (57-152)||(15039879-15039974)
chr1 (678-728)||(15039879-15039929)
chr1 (174-224)||(15039879-15039929)
chr1 (650-723)||(15023820-15023893)
[»] scaffold0400 (9 HSPs)
scaffold0400 (181-594)||(11539-11952)
scaffold0400 (272-667)||(11610-12005)
scaffold0400 (685-938)||(11699-11952)
scaffold0400 (685-892)||(11601-11808)
scaffold0400 (685-752)||(11597-11664)
scaffold0400 (56-163)||(11898-12005)
scaffold0400 (72-163)||(11754-11845)
scaffold0400 (776-892)||(11889-12005)
scaffold0400 (109-163)||(11610-11664)
[»] scaffold0365 (9 HSPs)
scaffold0365 (181-594)||(12182-12595)
scaffold0365 (272-667)||(12253-12648)
scaffold0365 (685-938)||(12342-12595)
scaffold0365 (685-892)||(12244-12451)
scaffold0365 (685-752)||(12240-12307)
scaffold0365 (56-163)||(12541-12648)
scaffold0365 (72-163)||(12397-12488)
scaffold0365 (776-892)||(12532-12648)
scaffold0365 (109-163)||(12253-12307)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 333; Significance: 0; HSPs: 90)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 147 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 15031521 - 15030807
Alignment:
Q  147 gaatttgtccagtgagatgattccttgaaaggtaaatagtatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttgtccagtgagagcatttgagca 246  Q
    ||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |    
T  15031521 gaattggtccagagagatgattttttgaaaggtaaatagtatccaaatttatcaaatttcctatggaaggtggaatttgtccagcaagagcatttgagaa 15031422  T
Q  247 aaatgataatctacttgctttcgttaaatttccgatggtggaaggaattggtcctgagagattatttattgaaaggtaaataatatccaaattgatcaag 346  Q
    ||  |||||| |||    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||||    
T  15031421 aagagataatgtaccgagttttgttaaatttccgatggtggaaggaattggtccagagagatgatttcttgataggtgaataagatccaaattgatcaag 15031322  T
Q  347 ttacctatggaaggtggaatttgtccagtgagagcatttgagaaaaatgataatctacttgctttcgttaaatttccgatggtggaaggaattggtcctg 446  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||  ||||  | |||  ||||  ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| |    
T  15031321 ttacctatggaaggtggaatttctccggagagagcatttgaataaaaatacaattcacttagtttggttaaatttccgatagtgaaaggaattggtccag 15031222  T
Q  447 agagattatttattgaaaggtaaataatatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttgtccagtgagagcatttgagaaaaatgataatct 546  Q
    |||||||||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||  |||||| |    
T  15031221 agagattattttgtgaaaggtcaatantatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttgtccagtgagagcatttaaataaagagataatgt 15031122  T
Q  547 acttgctttcgttaaatttccgatggtggaaggaattggtcctgagagatgatttattgaaaggtaaataatatccaaattgatcaagttacctatggaa 646  Q
    |||   ||| || |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||| |||    ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  15031121 actgagttttgtcaaatttccaatagtggaaggaattggtccagagagattattttgtgaaagggaaaagtaatccaaattaatcaaattacctatggaa 15031022  T
Q  647 ggtggaatttgtccagtgagatgattacttgaaaggtaaatagtatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttgtccagtgagagcatttg 746  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15031021 ggtggaattggtccagagagatgatttcttgaaaggtcaataatatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttgtccagtgagagcatttg 15030922  T
Q  747 agaaaaatgataatctacttgctttcgttaaatttccgatggtggaaggaattggttcctgagagattatttattgaaaggtaaataatatccaaattga 846  Q
    |  ||||  | |||  ||||   ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||| |||||  |||||||| |||| |||| ||||| |    
T  15030921 aataaaaatacaattcacttagcttcgttaaatttccgatagtgaaaggaattgg-tccagagagagtattttgtgaaaggtcaatagtatctaaattaa 15030823  T
Q  847 tcaagttacctatgga 862  Q
    |||| |||||||||||    
T  15030822 tcaaattacctatgga 15030807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 145 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 15031667 - 15031145
Alignment:
Q  145 tggaatttgtccagtgagatgattccttgaaaggtaaatagtatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttgtccagtgagagcatttgag 244  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||   ||||||| ||||   ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |    
T  15031667 tggaattggtccagagagattattttgtgaaagggaaatgtaatccaaattaatcaaattacctatggaaggtggaatttgtccggtgagagcatttacg 15031568  T
Q  245 caaaatgataatctacttgctttcgttaaatttccgatggtggaaggaattggtcctgagagattatttattgaaaggtaaataatatccaaattgatca 344  Q
    | ||  | |||| ||||   ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  15031567 ccaagagttaatttactcaattttgttaaatttccgatgatggaaagaattggtccagagagatgattttttgaaaggtaaatagtatccaaatttatca 15031468  T
Q  345 agttacctatggaaggtggaatttgtccagtgagagcatttgagaaaaatgataatctacttgctttcgttaaatttccgatggtggaaggaattggtcc 444  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||| |||    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15031467 aatttcctatggaaggtggaatttgtccagcaagagcatttgagaaaagagataatgtaccgagttttgttaaatttccgatggtggaaggaattggtcc 15031368  T
Q  445 tgagagattatttattgaaaggtaaataatatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttgtccagtgagagcatttgagaaaaatgataat 544  Q
     ||||||| |||| |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||  ||||  | |||    
T  15031367 agagagatgatttcttgataggtgaataagatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttctccggagagagcatttgaataaaaatacaat 15031268  T
Q  545 ctacttgctttcgttaaatttccgatggtggaaggaattggtcctgagagatgatttattgaaaggtaaataatatccaaattgatcaagttacctatgg 644  Q
      ||||  ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15031267 tcacttagtttggttaaatttccgatagtgaaaggaattggtccagagagattattttgtgaaaggtcaatantatccaaattgatcaagttacctatgg 15031168  T
Q  645 aaggtggaatttgtccagtgaga 667  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  15031167 aaggtggaatttgtccagtgaga 15031145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 145 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 15024326 - 15023820
Alignment:
Q  145 tggaatttgtccagtgagatgattccttgaaaggtaaatagtatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttgtccagtgagagcatttgag 244  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||   ||||||| ||||   ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |    
T  15024326 tggaattggtccagagagattattttgtgaaagggaaatgtaatccaaattaatcaaattacctatggaaggtggaatttgtccggtgagagcatttacg 15024227  T
Q  245 caaaatgataatctacttgctttcgttaaatttccgatggtggaaggaattggtcctgagagattatttattgaaaggtaaataatatccaaattgatca 344  Q
    | ||  | |||| ||||   ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  15024226 ccaagagttaatttactcaattttgttaaatttccgatgatggaaagaattggtccagagagatgattttttgaaaggtaaatagtatccaaatttatca 15024127  T
Q  345 agttacctatggaaggtggaatttgtccagtgagagcatttgagaaaaatgataatctacttgctttcgttaaatttccgatggtggaaggaattggtcc 444  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||| |||    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15024126 aatttcctatggaaggtggaatttgtccagcaagagcatttgagaaaagagataatgtaccgagttttgttaaatttccgatggtggaaggaattggtcc 15024027  T
Q  445 tgagagattatttattgaaaggtaaataatatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttgtccagtgagagcatttgagaaaaatgataat 544  Q
     ||||||| |||| |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||  ||||  | |||    
T  15024026 agagagatgatttcttgataggtgaataagatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttctccggagagagcatttgaataaaaatacaat 15023927  T
Q  545 ctacttgctttcgttaaatttccgatggtggaaggaattggtcctgagagatgatttattgaaaggtaaataatatccaaattgatcaagttacctatgg 644  Q
      ||||  ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  15023926 tcacttagtttggttaaatttccgatagtgaaaggaattggtccagagagattattttgtgaaaggtcaatactatccaaattaatcaaattacctatgg 15023827  T
Q  645 aaggtgg 651  Q
    | |||||    
T  15023826 atggtgg 15023820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 434 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 15010136 - 15009709
Alignment:
Q  434 ggaattggtcctgagagattatttattgaaaggtaaataatatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttgtccagtgagagcatttgaga 533  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |      
T  15010136 ggaattggtccagagagatgatttcttgaaagggaaatattatccaaattgatcaagttacctacggaaggtggaatttgtccagtgagagcatttaaat 15010037  T
Q  534 aaaatgataatctacttgctttcgttaaatttccgatggtggaaggaattggtcctgagagatgatttattgaaaggtaaataatatccaaattgatcaa 633  Q
    |||  |||||| ||||   ||| || |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||| |||    ||||||||| |||||    
T  15010036 aaagagataatgtactgagttttgtcaaatttccaatagtggaaggaattggtccagagagattattttgtgaaagggaaaagtaatccaaattaatcaa 15009937  T
Q  634 gttacctatggaaggtggaatttgtccagtgagatgattacttgaaaggtaaatagtatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttgtcca 733  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15009936 attacctatggaaggtggaattggtccagagagatgatttcttgaaaggtcaataatatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttgtcca 15009837  T
Q  734 gtgagagcatttgagaaaaatgataatctacttgctttcgttaaatttccgatggtggaaggaattggttcctgagagattatttattgaaaggtaaata 833  Q
    ||||||||||||||  ||||  | |||  ||||   ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||| |||||  |||||||| ||||    
T  15009836 gtgagagcatttgaataaaaatacaattcacttagcttcgttaaatttccgatagtgaaaggaattgg-tccagagagagtattttgtgaaaggtcaata 15009738  T
Q  834 atatccaaattgatcaagttacctatgga 862  Q
     |||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  15009737 gtatctaaattaatcaaattacctatgga 15009709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 272 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 15024343 - 15023959
Alignment:
Q  272 aaatttccgatggtggaaggaattggtcctgagagattatttattgaaaggtaaataatatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttgtc 371  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||   ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15024343 aaatttccgatagtggatggaattggtccagagagattattttgtgaaagggaaatgtaatccaaattaatcaaattacctatggaaggtggaatttgtc 15024244  T
Q  372 cagtgagagcatttgagaaaaatgataatctacttgctttcgttaaatttccgatggtggaaggaattggtcctgagagattatttattgaaaggtaaat 471  Q
    | ||||||||||||  |  ||  | |||| ||||   ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||    
T  15024243 cggtgagagcatttacgccaagagttaatttactcaattttgttaaatttccgatgatggaaagaattggtccagagagatgattttttgaaaggtaaat 15024144  T
Q  472 aatatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttgtccagtgagagcatttgagaaaaatgataatctacttgctttcgttaaatttccgatg 571  Q
    | |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||| |||    ||| |||||||||||||||    
T  15024143 agtatccaaatttatcaaatttcctatggaaggtggaatttgtccagcaagagcatttgagaaaagagataatgtaccgagttttgttaaatttccgatg 15024044  T
Q  572 gtggaaggaattggtcctgagagatgatttattgaaaggtaaataatatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaattt 656  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15024043 gtggaaggaattggtccagagagatgatttcttgataggtgaataagatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaattt 15023959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 272 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 15031684 - 15031300
Alignment:
Q  272 aaatttccgatggtggaaggaattggtcctgagagattatttattgaaaggtaaataatatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttgtc 371  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||   ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15031684 aaatttccgatagtggatggaattggtccagagagattattttgtgaaagggaaatgtaatccaaattaatcaaattacctatggaaggtggaatttgtc 15031585  T
Q  372 cagtgagagcatttgagaaaaatgataatctacttgctttcgttaaatttccgatggtggaaggaattggtcctgagagattatttattgaaaggtaaat 471  Q
    | ||||||||||||  |  ||  | |||| ||||   ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||    
T  15031584 cggtgagagcatttacgccaagagttaatttactcaattttgttaaatttccgatgatggaaagaattggtccagagagatgattttttgaaaggtaaat 15031485  T
Q  472 aatatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttgtccagtgagagcatttgagaaaaatgataatctacttgctttcgttaaatttccgatg 571  Q
    | |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||| |||    ||| |||||||||||||||    
T  15031484 agtatccaaatttatcaaatttcctatggaaggtggaatttgtccagcaagagcatttgagaaaagagataatgtaccgagttttgttaaatttccgatg 15031385  T
Q  572 gtggaaggaattggtcctgagagatgatttattgaaaggtaaataatatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaattt 656  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15031384 gtggaaggaattggtccagagagatgatttcttgataggtgaataagatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaattt 15031300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 171; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 146 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 15031378 - 15031001
Alignment:
Q  146 ggaatttgtccagtgagatgattccttgaaaggtaaatagtatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttgtccagtgagagcatttgagc 245  Q
    |||||| |||||| ||||||||| ||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||      
T  15031378 ggaattggtccagagagatgatttcttgataggtgaataagatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttctccggagagagcatttgaat 15031279  T
Q  246 aaaatgataatctacttgctttcgttaaatttccgatggtggaaggaattggtcctgagagattatttattgaaaggtaaataatatccaaattgatcaa 345  Q
    ||||  | |||  ||||  ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  15031278 aaaaatacaattcacttagtttggttaaatttccgatagtgaaaggaattggtccagagagattattttgtgaaaggtcaatantatccaaattgatcaa 15031179  T
Q  346 gttacctatggaaggtggaatttgtccagtgagagcatttgagaaaaatgataatctacttgctttcgttaaatttccgatggtggaaggaattggtcct 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||  |||||| ||||   ||| || |||||||| || |||||||||||||||||     
T  15031178 gttacctatggaaggtggaatttgtccagtgagagcatttaaataaagagataatgtactgagttttgtcaaatttccaatagtggaaggaattggtcca 15031079  T
Q  446 gagagattatttattgaaaggtaaataatatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttgtccagtgaga 523  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  15031078 gagagattattttgtgaaagggaaaagtaatccaaattaatcaaattacctatggaaggtggaattggtccagagaga 15031001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 651 - 938
Target Start/End: Complemental strand, 15024180 - 15023893
Alignment:
Q  651 gaatttgtccagtgagatgattacttgaaaggtaaatagtatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttgtccagtgagagcatttgagaa 750  Q
    ||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  15024180 gaattggtccagagagatgattttttgaaaggtaaatagtatccaaatttatcaaatttcctatggaaggtggaatttgtccagcaagagcatttgagaa 15024081  T
Q  751 aaatgataatctacttgctttcgttaaatttccgatggtggaaggaattggttcctgagagattatttattgaaaggtaaataatatccaaattgatcaa 850  Q
    ||  |||||| |||    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||| |||| ||||| |||||||||||||||    
T  15024080 aagagataatgtaccgagttttgttaaatttccgatggtggaaggaattgg-tccagagagatgatttcttgataggtgaataagatccaaattgatcaa 15023982  T
Q  851 gttacctatggaa-gtggaatttgtcctgtgagagcatttgagtcaaaatataattcacttagtttcgttaaatttccgatagtgaaag 938  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15023981 gttacctatggaaggtggaatttctccggagagagcatttgaataaaaatacaattcacttagtttggttaaatttccgatagtgaaag 15023893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 153; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 651 - 938
Target Start/End: Complemental strand, 15031521 - 15031234
Alignment:
Q  651 gaatttgtccagtgagatgattacttgaaaggtaaatagtatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttgtccagtgagagcatttgagaa 750  Q
    ||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  15031521 gaattggtccagagagatgattttttgaaaggtaaatagtatccaaatttatcaaatttcctatggaaggtggaatttgtccagcaagagcatttgagaa 15031422  T
Q  751 aaatgataatctacttgctttcgttaaatttccgatggtggaaggaattggttcctgagagattatttattgaaaggtaaataatatccaaattgatcaa 850  Q
    ||  |||||| |||    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||| |||| ||||| |||||||||||||||    
T  15031421 aagagataatgtaccgagttttgttaaatttccgatggtggaaggaattgg-tccagagagatgatttcttgataggtgaataagatccaaattgatcaa 15031323  T
Q  851 gttacctatggaa-gtggaatttgtcctgtgagagcatttgagtcaaaatataattcacttagtttcgttaaatttccgatagtgaaag 938  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15031322 gttacctatggaaggtggaatttctccggagagagcatttgaataaaaatacaattcacttagtttggttaaatttccgatagtgaaag 15031234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 15010052 - 15009703
Alignment:
Q  14 gtgagagcatttgagaaaaatgataatctacttactttcgttaaatttccgatggtggaaggaattggtcctgagagatgatttattgaaaggtaaatag 113  Q
    |||||||||||| |  |||  |||||| |||| | ||| || |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||| ||| ||    
T  15010052 gtgagagcatttaaataaagagataatgtactgagttttgtcaaatttccaatagtggaaggaattggtccagagagattattttgtgaaagggaaa-ag 15009954  T
Q  114 ta-tccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttgtccagtgagatgattccttgaaaggtaaatagtatccaaattgatcaagttacctatgg 212  Q
    || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15009953 taatccaaattaatcaaattacctatggaaggtggaattggtccagagagatgatttcttgaaaggtcaataatatccaaattgatcaagttacctatgg 15009854  T
Q  213 aaggtggaatttgtccagtgagagcatttgagcaaaatgataatctacttgctttcgttaaatttccgatggtggaaggaattggtcctgagagattatt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  | |||  ||||   ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  15009853 aaggtggaatttgtccagtgagagcatttgaataaaaatacaattcacttagcttcgttaaatttccgatagtgaaaggaattggtccagagagagtatt 15009754  T
Q  313 tattgaaaggtaaataatatccaaattgatcaagttacctatggaaggtgg 363  Q
    |  |||||||| |||| |||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  15009753 ttgtgaaaggtcaatagtatctaaattaatcaaattacctatggatggtgg 15009703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 15031150 - 15030801
Alignment:
Q  14 gtgagagcatttgagaaaaatgataatctacttactttcgttaaatttccgatggtggaaggaattggtcctgagagatgatttattgaaaggtaaatag 113  Q
    |||||||||||| |  |||  |||||| |||| | ||| || |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||| ||| ||    
T  15031150 gtgagagcatttaaataaagagataatgtactgagttttgtcaaatttccaatagtggaaggaattggtccagagagattattttgtgaaagggaaa-ag 15031052  T
Q  114 ta-tccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttgtccagtgagatgattccttgaaaggtaaatagtatccaaattgatcaagttacctatgg 212  Q
    || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15031051 taatccaaattaatcaaattacctatggaaggtggaattggtccagagagatgatttcttgaaaggtcaataatatccaaattgatcaagttacctatgg 15030952  T
Q  213 aaggtggaatttgtccagtgagagcatttgagcaaaatgataatctacttgctttcgttaaatttccgatggtggaaggaattggtcctgagagattatt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  | |||  ||||   ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  15030951 aaggtggaatttgtccagtgagagcatttgaataaaaatacaattcacttagcttcgttaaatttccgatagtgaaaggaattggtccagagagagtatt 15030852  T
Q  313 tattgaaaggtaaataatatccaaattgatcaagttacctatggaaggtgg 363  Q
    |  |||||||| |||| |||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  15030851 ttgtgaaaggtcaatagtatctaaattaatcaaattacctatggatggtgg 15030801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 145; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 56 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 15010226 - 15009903
Alignment:
Q  56 aaatttccgatggtggaaggaattggtcctgagagatgatttattgaaaggtaaatagta-tccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttgt 154  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||| ||| |||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  15010226 aaatttccaatagtggaaggaattggtccagagagattattttgtgaaagggaaa-agtaatccaaattagtcaaattacctatggaaggtggaattggt 15010128  T
Q  155 ccagtgagatgattccttgaaaggtaaatagtatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttgtccagtgagagcatttgagcaaaatgata 254  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||  ||||    
T  15010127 ccagagagatgatttcttgaaagggaaatattatccaaattgatcaagttacctacggaaggtggaatttgtccagtgagagcatttaaataaagagata 15010028  T
Q  255 atctacttgctttcgttaaatttccgatggtggaaggaattggtcctgagagattatttattgaaaggtaaataatatccaaattgatcaagttacctat 354  Q
    || ||||   ||| || |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||    ||||||||| ||||| ||||||||    
T  15010027 atgtactgagttttgtcaaatttccaatagtggaaggaattggtccagagagattattttgtgaaagggaaaagtaatccaaattaatcaaattacctat 15009928  T
Q  355 ggaaggtggaatttgtccagtgaga 379  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||    
T  15009927 ggaaggtggaattggtccagagaga 15009903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 137; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 272 - 532
Target Start/End: Original strand, 14533631 - 14533891
Alignment:
Q  272 aaatttccgatggtggaaggaattggtcctgagagattatttattgaaaggtaaataatatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttgtc 371  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||| | || |||||||||||||||||||| |||||    
T  14533631 aaatttccgatagtggaaggaattggtccagagagtttattttctgaaaggtaaatagtatccaaattaaccatgttacctatggaaggtggaagttgtc 14533730  T
Q  372 cagtgagagcatttgagaaaaatgataatctacttgctttcgttaaatttccgatggtggaaggaattggtcctgagagattatttattgaaaggtaaat 471  Q
    ||||||||||||||||   ||  |||||| ||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||  ||||| ||||||  |||||||| |||    
T  14533731 cagtgagagcatttgaatgaagagataatatacttactttcgttaaatttccaacagtggaaggaattggtctagagagtttattttctgaaaggtcaat 14533830  T
Q  472 aatatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttgtccagtgagagcatttgag 532  Q
    | |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14533831 agtatccaaattaaccaggttacctatggaaggtggaatttgtccggtgagagcatttgag 14533891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 370 - 667
Target Start/End: Original strand, 14533585 - 14533882
Alignment:
Q  370 tccagtgagagcatttgagaaaaatgataatctacttgctttcgttaaatttccgatggtggaaggaattggtcctgagagattatttattgaaaggtaa 469  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |||||||  | |   ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||    
T  14533585 tccagtgagggaatttgagaaaagtgataatgaattaagttttgtcaaatttccgatagtggaaggaattggtccagagagtttattttctgaaaggtaa 14533684  T
Q  470 ataatatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttgtccagtgagagcatttgagaaaaatgataatctacttgctttcgttaaatttccga 569  Q
    ||| |||||||||| | || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||  |||||| ||||| |||||||||||||||| |    
T  14533685 atagtatccaaattaaccatgttacctatggaaggtggaagttgtccagtgagagcatttgaatgaagagataatatacttactttcgttaaatttccaa 14533784  T
Q  570 tggtggaaggaattggtcctgagagatgatttattgaaaggtaaataatatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttgtccagtgaga 667  Q
      ||||||||||||||||  ||||| | ||||  |||||||| |||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14533785 cagtggaaggaattggtctagagagtttattttctgaaaggtcaatagtatccaaattaaccaggttacctatggaaggtggaatttgtccggtgaga 14533882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 560 - 876
Target Start/End: Complemental strand, 15010226 - 15009910
Alignment:
Q  560 aaatttccgatggtggaaggaattggtcctgagagatgatttattgaaaggtaaataatatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttgtc 659  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||| |||    |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  15010226 aaatttccaatagtggaaggaattggtccagagagattattttgtgaaagggaaaagtaatccaaattagtcaaattacctatggaaggtggaattggtc 15010127  T
Q  660 cagtgagatgattacttgaaaggtaaatagtatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttgtccagtgagagcatttgagaaaaatgataa 759  Q
    ||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||  |||||    
T  15010126 cagagagatgatttcttgaaagggaaatattatccaaattgatcaagttacctacggaaggtggaatttgtccagtgagagcatttaaataaagagataa 15010027  T
Q  760 tctacttgctttcgttaaatttccgatggtggaaggaattggttcctgagagattatttattgaaaggtaaataatatccaaattgatcaagttacctat 859  Q
    | ||||   ||| || |||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||| |||    ||||||||| ||||| ||||||||    
T  15010026 tgtactgagttttgtcaaatttccaatagtggaaggaattgg-tccagagagattattttgtgaaagggaaaagtaatccaaattaatcaaattacctat 15009928  T
Q  860 ggaa-gtggaatttgtcc 876  Q
    |||| |||||||| ||||    
T  15009927 ggaaggtggaattggtcc 15009910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 416 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 15024343 - 15024097
Alignment:
Q  416 aaatttccgatggtggaaggaattggtcctgagagattatttattgaaaggtaaataatatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttgtc 515  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||   ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15024343 aaatttccgatagtggatggaattggtccagagagattattttgtgaaagggaaatgtaatccaaattaatcaaattacctatggaaggtggaatttgtc 15024244  T
Q  516 cagtgagagcatttgagaaaaatgataatctacttgctttcgttaaatttccgatggtggaaggaattggtcctgagagatgatttattgaaaggtaaat 615  Q
    | ||||||||||||  |  ||  | |||| ||||   ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  15024243 cggtgagagcatttacgccaagagttaatttactcaattttgttaaatttccgatgatggaaagaattggtccagagagatgattttttgaaaggtaaat 15024144  T
Q  616 aatatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttgtccag 662  Q
    | |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  15024143 agtatccaaatttatcaaatttcctatggaaggtggaatttgtccag 15024097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 416 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 15031684 - 15031438
Alignment:
Q  416 aaatttccgatggtggaaggaattggtcctgagagattatttattgaaaggtaaataatatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttgtc 515  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||   ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15031684 aaatttccgatagtggatggaattggtccagagagattattttgtgaaagggaaatgtaatccaaattaatcaaattacctatggaaggtggaatttgtc 15031585  T
Q  516 cagtgagagcatttgagaaaaatgataatctacttgctttcgttaaatttccgatggtggaaggaattggtcctgagagatgatttattgaaaggtaaat 615  Q
    | ||||||||||||  |  ||  | |||| ||||   ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  15031584 cggtgagagcatttacgccaagagttaatttactcaattttgttaaatttccgatgatggaaagaattggtccagagagatgattttttgaaaggtaaat 15031485  T
Q  616 aatatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttgtccag 662  Q
    | |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  15031484 agtatccaaatttatcaaatttcctatggaaggtggaatttgtccag 15031438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 117; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 172 - 388
Target Start/End: Original strand, 14533675 - 14533891
Alignment:
Q  172 tgaaaggtaaatagtatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttgtccagtgagagcatttgagcaaaatgataatctacttgctttcgtt 271  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||  |||||| ||||| ||||||||    
T  14533675 tgaaaggtaaatagtatccaaattaaccatgttacctatggaaggtggaagttgtccagtgagagcatttgaatgaagagataatatacttactttcgtt 14533774  T
Q  272 aaatttccgatggtggaaggaattggtcctgagagattatttattgaaaggtaaataatatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttgtc 371  Q
    |||||||| |  ||||||||||||||||  ||||| ||||||  |||||||| |||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||    
T  14533775 aaatttccaacagtggaaggaattggtctagagagtttattttctgaaaggtcaatagtatccaaattaaccaggttacctatggaaggtggaatttgtc 14533874  T
Q  372 cagtgagagcatttgag 388  Q
    | |||||||||||||||    
T  14533875 cggtgagagcatttgag 14533891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 115; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 650 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 15031378 - 15031094
Alignment:
Q  650 ggaatttgtccagtgagatgattacttgaaaggtaaatagtatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttgtccagtgagagcatttgaga 749  Q
    |||||| |||||| ||||||||| ||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||      
T  15031378 ggaattggtccagagagatgatttcttgataggtgaataagatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttctccggagagagcatttgaat 15031279  T
Q  750 aaaatgataatctacttgctttcgttaaatttccgatggtggaaggaattggttcctgagagattatttattgaaaggtaaataatatccaaattgatca 849  Q
    ||||  | |||  ||||  ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||||||||    
T  15031278 aaaaatacaattcacttagtttggttaaatttccgatagtgaaaggaattggt-ccagagagattattttgtgaaaggtcaatantatccaaattgatca 15031180  T
Q  850 agttacctatggaa-gtggaatttgtcctgtgagagcatttgagtcaaaatataattcacttagtttcgttaaatttccgatagtg 934  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | | || | |||||  ||| ||||| || |||||||| ||||||    
T  15031179 agttacctatggaaggtggaatttgtccagtgagagcatttaaataaagagataatgtactgagttttgtcaaatttccaatagtg 15031094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 290 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 15009920 - 15009703
Alignment:
Q  290 ggaattggtcctgagagattatttattgaaaggtaaataatatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttgtccagtgagagcatttgaga 389  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  15009920 ggaattggtccagagagatgatttcttgaaaggtcaataatatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttgtccagtgagagcatttgaat 15009821  T
Q  390 aaaatgataatctacttgctttcgttaaatttccgatggtggaaggaattggtcctgagagattatttattgaaaggtaaataatatccaaattgatcaa 489  Q
    ||||  | |||  ||||   ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| |||||  |||||||| |||| |||| ||||| |||||    
T  15009820 aaaaatacaattcacttagcttcgttaaatttccgatagtgaaaggaattggtccagagagagtattttgtgaaaggtcaatagtatctaaattaatcaa 15009721  T
Q  490 gttacctatggaaggtgg 507  Q
     ||||||||||| |||||    
T  15009720 attacctatggatggtgg 15009703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 290 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 15031018 - 15030801
Alignment:
Q  290 ggaattggtcctgagagattatttattgaaaggtaaataatatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttgtccagtgagagcatttgaga 389  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  15031018 ggaattggtccagagagatgatttcttgaaaggtcaataatatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttgtccagtgagagcatttgaat 15030919  T
Q  390 aaaatgataatctacttgctttcgttaaatttccgatggtggaaggaattggtcctgagagattatttattgaaaggtaaataatatccaaattgatcaa 489  Q
    ||||  | |||  ||||   ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| |||||  |||||||| |||| |||| ||||| |||||    
T  15030918 aaaaatacaattcacttagcttcgttaaatttccgatagtgaaaggaattggtccagagagagtattttgtgaaaggtcaatagtatctaaattaatcaa 15030819  T
Q  490 gttacctatggaaggtgg 507  Q
     ||||||||||| |||||    
T  15030818 attacctatggatggtgg 15030801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 110; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 434 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 15009920 - 15009703
Alignment:
Q  434 ggaattggtcctgagagattatttattgaaaggtaaataatatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttgtccagtgagagcatttgaga 533  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  15009920 ggaattggtccagagagatgatttcttgaaaggtcaataatatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttgtccagtgagagcatttgaat 15009821  T
Q  534 aaaatgataatctacttgctttcgttaaatttccgatggtggaaggaattggtcctgagagatgatttattgaaaggtaaataatatccaaattgatcaa 633  Q
    ||||  | |||  ||||   ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||  ||||  |||||||| |||| |||| ||||| |||||    
T  15009820 aaaaatacaattcacttagcttcgttaaatttccgatagtgaaaggaattggtccagagagagtattttgtgaaaggtcaatagtatctaaattaatcaa 15009721  T
Q  634 gttacctatggaaggtgg 651  Q
     ||||||||||| |||||    
T  15009720 attacctatggatggtgg 15009703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 110; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 290 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 15010136 - 15009903
Alignment:
Q  290 ggaattggtcctgagagattatttattgaaaggtaaataatatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttgtccagtgagagcatttgaga 389  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |      
T  15010136 ggaattggtccagagagatgatttcttgaaagggaaatattatccaaattgatcaagttacctacggaaggtggaatttgtccagtgagagcatttaaat 15010037  T
Q  390 aaaatgataatctacttgctttcgttaaatttccgatggtggaaggaattggtcctgagagattatttattgaaaggtaaataatatccaaattgatcaa 489  Q
    |||  |||||| ||||   ||| || |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||    ||||||||| |||||    
T  15010036 aaagagataatgtactgagttttgtcaaatttccaatagtggaaggaattggtccagagagattattttgtgaaagggaaaagtaatccaaattaatcaa 15009937  T
Q  490 gttacctatggaaggtggaatttgtccagtgaga 523  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  15009936 attacctatggaaggtggaattggtccagagaga 15009903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 110; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 434 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 15031018 - 15030801
Alignment:
Q  434 ggaattggtcctgagagattatttattgaaaggtaaataatatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttgtccagtgagagcatttgaga 533  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  15031018 ggaattggtccagagagatgatttcttgaaaggtcaataatatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttgtccagtgagagcatttgaat 15030919  T
Q  534 aaaatgataatctacttgctttcgttaaatttccgatggtggaaggaattggtcctgagagatgatttattgaaaggtaaataatatccaaattgatcaa 633  Q
    ||||  | |||  ||||   ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||  ||||  |||||||| |||| |||| ||||| |||||    
T  15030918 aaaaatacaattcacttagcttcgttaaatttccgatagtgaaaggaattggtccagagagagtattttgtgaaaggtcaatagtatctaaattaatcaa 15030819  T
Q  634 gttacctatggaaggtgg 651  Q
     ||||||||||| |||||    
T  15030818 attacctatggatggtgg 15030801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 109; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 284 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 15001321 - 15001100
Alignment:
Q  284 gtggaaggaattggtcctgagagattatttattgaaaggtaaataatatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttgtccagtgagagcat 383  Q
    ||||||||||||||||| |||||| | || |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15001321 gtggaaggaattggtccagagagacttttcatt--aaggtaaatagtatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttgtccagtgagagcat 15001224  T
Q  384 ttgagaaaaatgataatctacttgctttcgttaaatttccgatggtggaaggaattggtcctgagagattatttattgaaaggtaaataatatccaaatt 483  Q
    ||||  ||||  | |||  ||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| |||||  |||||||| |||| |||| |||||    
T  15001223 ttgaataaaaatacaattcacttagtttcgttaaatttccgatagtgaaaggaattggtccagagagagtattttgtgaaaggtcaatagtatctaaatt 15001124  T
Q  484 gatcaagttacctatggaaggtgg 507  Q
     ||||| ||||||||||| |||||    
T  15001123 aatcaaattacctatggatggtgg 15001100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 105; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 428 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 15001321 - 15001100
Alignment:
Q  428 gtggaaggaattggtcctgagagattatttattgaaaggtaaataatatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttgtccagtgagagcat 527  Q
    ||||||||||||||||| |||||| | || |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15001321 gtggaaggaattggtccagagagacttttcatt--aaggtaaatagtatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttgtccagtgagagcat 15001224  T
Q  528 ttgagaaaaatgataatctacttgctttcgttaaatttccgatggtggaaggaattggtcctgagagatgatttattgaaaggtaaataatatccaaatt 627  Q
    ||||  ||||  | |||  ||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||  ||||  |||||||| |||| |||| |||||    
T  15001223 ttgaataaaaatacaattcacttagtttcgttaaatttccgatagtgaaaggaattggtccagagagagtattttgtgaaaggtcaatagtatctaaatt 15001124  T
Q  628 gatcaagttacctatggaaggtgg 651  Q
     ||||| ||||||||||| |||||    
T  15001123 aatcaaattacctatggatggtgg 15001100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 105; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 175 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 15001288 - 15001100
Alignment:
Q  175 aaggtaaatagtatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttgtccagtgagagcatttgagcaaaatgataatctacttgctttcgttaaa 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  | |||  ||||  ||||||||||    
T  15001288 aaggtaaatagtatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttgtccagtgagagcatttgaataaaaatacaattcacttagtttcgttaaa 15001189  T
Q  275 tttccgatggtggaaggaattggtcctgagagattatttattgaaaggtaaataatatccaaattgatcaagttacctatggaaggtgg 363  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| |||||| |||||  |||||||| |||| |||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  15001188 tttccgatagtgaaaggaattggtccagagagagtattttgtgaaaggtcaatagtatctaaattaatcaaattacctatggatggtgg 15001100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 103; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 676 - 933
Target Start/End: Original strand, 14533675 - 14533932
Alignment:
Q  676 tgaaaggtaaatagtatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttgtccagtgagagcatttgagaaaaatgataatctacttgctttcgtt 775  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||  |||||| ||||| ||||||||    
T  14533675 tgaaaggtaaatagtatccaaattaaccatgttacctatggaaggtggaagttgtccagtgagagcatttgaatgaagagataatatacttactttcgtt 14533774  T
Q  776 aaatttccgatggtggaaggaattggttcctgagagattatttattgaaaggtaaataatatccaaattgatcaagttacctatggaa-gtggaatttgt 874  Q
    |||||||| |  |||||||||||||| ||  ||||| ||||||  |||||||| |||| |||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||||    
T  14533775 aaatttccaacagtggaaggaattgg-tctagagagtttattttctgaaaggtcaatagtatccaaattaaccaggttacctatggaaggtggaatttgt 14533873  T
Q  875 cctgtgagagcatttgagtcaaaatataattcacttagtttcgttaaatttccgatagt 933  Q
    || |||||||||||||||  || ||||||  |  | ||||| || ||||||||||||||    
T  14533874 ccggtgagagcatttgaggaaagatataacactgtgagttttgtcaaatttccgatagt 14533932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 98; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 272 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 15036246 - 15036061
Alignment:
Q  272 aaatttccgatggtggaaggaattggtcctgagagattatttattgaaaggtaaataatatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttgtc 371  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  15036246 aaattttcgatagtggaaggaattggtccagagagattatttagtgaaaggtgaatagaatccaaattaatcaaattacctatggaaggtggaatttttc 15036147  T
Q  372 cagtgagagcatttgagaaaaatgataatctacttgctttcgttaaatttccgatggtggaaggaattggtcctgagagattattt 457  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |||||  |||  |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  15036146 cagtgagagcatttgagtaaattaataattcactcactttggttaaatttccaatagtggaaggaattggtccagagagtttattt 15036061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 96; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 679 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 15001288 - 15001106
Alignment:
Q  679 aaggtaaatagtatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttgtccagtgagagcatttgagaaaaatgataatctacttgctttcgttaaa 778  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  | |||  ||||  ||||||||||    
T  15001288 aaggtaaatagtatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttgtccagtgagagcatttgaataaaaatacaattcacttagtttcgttaaa 15001189  T
Q  779 tttccgatggtggaaggaattggttcctgagagattatttattgaaaggtaaataatatccaaattgatcaagttacctatgga 862  Q
    |||||||| ||| |||||||||| ||| |||||| |||||  |||||||| |||| |||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  15001188 tttccgatagtgaaaggaattgg-tccagagagagtattttgtgaaaggtcaatagtatctaaattaatcaaattacctatgga 15001106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 95; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 416 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 15036246 - 15036068
Alignment:
Q  416 aaatttccgatggtggaaggaattggtcctgagagattatttattgaaaggtaaataatatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttgtc 515  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  15036246 aaattttcgatagtggaaggaattggtccagagagattatttagtgaaaggtgaatagaatccaaattaatcaaattacctatggaaggtggaatttttc 15036147  T
Q  516 cagtgagagcatttgagaaaaatgataatctacttgctttcgttaaatttccgatggtggaaggaattggtcctgagag 594  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |||||  |||  |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  15036146 cagtgagagcatttgagtaaattaataattcactcactttggttaaatttccaatagtggaaggaattggtccagagag 15036068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 794 - 938
Target Start/End: Complemental strand, 15009920 - 15009776
Alignment:
Q  794 ggaattggttcctgagagattatttattgaaaggtaaataatatccaaattgatcaagttacctatggaag-tggaatttgtcctgtgagagcatttgag 892  Q
    ||||||||| || ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||     
T  15009920 ggaattggt-ccagagagatgatttcttgaaaggtcaataatatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttgtccagtgagagcatttgaa 15009822  T
Q  893 tcaaaatataattcacttagtttcgttaaatttccgatagtgaaag 938  Q
    | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15009821 taaaaatacaattcacttagcttcgttaaatttccgatagtgaaag 15009776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 794 - 938
Target Start/End: Complemental strand, 15031018 - 15030874
Alignment:
Q  794 ggaattggttcctgagagattatttattgaaaggtaaataatatccaaattgatcaagttacctatggaag-tggaatttgtcctgtgagagcatttgag 892  Q
    ||||||||| || ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||     
T  15031018 ggaattggt-ccagagagatgatttcttgaaaggtcaataatatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttgtccagtgagagcatttgaa 15030920  T
Q  893 tcaaaatataattcacttagtttcgttaaatttccgatagtgaaag 938  Q
    | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15030919 taaaaatacaattcacttagcttcgttaaatttccgatagtgaaag 15030874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 788 - 938
Target Start/End: Complemental strand, 15001321 - 15001173
Alignment:
Q  788 gtggaaggaattggttcctgagagattatttattgaaaggtaaataatatccaaattgatcaagttacctatggaag-tggaatttgtcctgtgagagca 886  Q
    ||||||||||||||| || |||||| | || |||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  15001321 gtggaaggaattggt-ccagagagacttttcatt--aaggtaaatagtatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttgtccagtgagagca 15001225  T
Q  887 tttgagtcaaaatataattcacttagtttcgttaaatttccgatagtgaaag 938  Q
    ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15001224 tttgaataaaaatacaattcacttagtttcgttaaatttccgatagtgaaag 15001173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 650 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 15024037 - 15023826
Alignment:
Q  650 ggaatttgtccagtgagatgattacttgaaaggtaaatagtatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttgtccagtgagagcatttgaga 749  Q
    |||||| |||||| ||||||||| ||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||      
T  15024037 ggaattggtccagagagatgatttcttgataggtgaataagatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttctccggagagagcatttgaat 15023938  T
Q  750 aaaatgataatctacttgctttcgttaaatttccgatggtggaaggaattggttcctgagagattatttattgaaaggtaaataatatccaaattgatca 849  Q
    ||||  | |||  ||||  ||| |||||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  15023937 aaaaatacaattcacttagtttggttaaatttccgatagtgaaaggaattgg-tccagagagattattttgtgaaaggtcaatactatccaaattaatca 15023839  T
Q  850 agttacctatgga 862  Q
    | |||||||||||    
T  15023838 aattacctatgga 15023826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 85; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 650 - 876
Target Start/End: Complemental strand, 15031234 - 15031008
Alignment:
Q  650 ggaatttgtccagtgagatgattacttgaaaggtaaatagtatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttgtccagtgagagcatttgaga 749  Q
    |||||| |||||| ||||| |||   |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |      
T  15031234 ggaattggtccagagagattattttgtgaaaggtcaatantatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttgtccagtgagagcatttaaat 15031135  T
Q  750 aaaatgataatctacttgctttcgttaaatttccgatggtggaaggaattggttcctgagagattatttattgaaaggtaaataatatccaaattgatca 849  Q
    |||  |||||| ||||   ||| || |||||||| || ||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||| |||    ||||||||| ||||    
T  15031134 aaagagataatgtactgagttttgtcaaatttccaatagtggaaggaattggt-ccagagagattattttgtgaaagggaaaagtaatccaaattaatca 15031036  T
Q  850 agttacctatggaa-gtggaatttgtcc 876  Q
    | |||||||||||| |||||||| ||||    
T  15031035 aattacctatggaaggtggaattggtcc 15031008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 15024094 - 15023959
Alignment:
Q  17 agagcatttgagaaaaatgataatctacttactttcgttaaatttccgatggtggaaggaattggtcctgagagatgatttattgaaaggtaaatagtat 116  Q
    ||||||||||||||||  |||||| |||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| ||||  ||    
T  15024094 agagcatttgagaaaagagataatgtaccgagttttgttaaatttccgatggtggaaggaattggtccagagagatgatttcttgataggtgaataagat 15023995  T
Q  117 ccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaattt 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15023994 ccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaattt 15023959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 15031435 - 15031300
Alignment:
Q  17 agagcatttgagaaaaatgataatctacttactttcgttaaatttccgatggtggaaggaattggtcctgagagatgatttattgaaaggtaaatagtat 116  Q
    ||||||||||||||||  |||||| |||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| ||||  ||    
T  15031435 agagcatttgagaaaagagataatgtaccgagttttgttaaatttccgatggtggaaggaattggtccagagagatgatttcttgataggtgaataagat 15031336  T
Q  117 ccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaattt 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15031335 ccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaattt 15031300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 83; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 649 - 930
Target Start/End: Complemental strand, 15024326 - 15024045
Alignment:
Q  649 tggaatttgtccagtgagatgattacttgaaaggtaaatagtatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttgtccagtgagagcatttgag 748  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||   ||||||| ||||   ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |    
T  15024326 tggaattggtccagagagattattttgtgaaagggaaatgtaatccaaattaatcaaattacctatggaaggtggaatttgtccggtgagagcatttacg 15024227  T
Q  749 aaaaatgataatctacttgctttcgttaaatttccgatggtggaaggaattggttcctgagagattatttattgaaaggtaaataatatccaaattgatc 848  Q
      ||  | |||| ||||   ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| |||    
T  15024226 ccaagagttaatttactcaattttgttaaatttccgatgatggaaagaattgg-tccagagagatgattttttgaaaggtaaatagtatccaaatttatc 15024128  T
Q  849 aagttacctatggaa-gtggaatttgtcctgtgagagcatttgagtcaaaatataattcacttagtttcgttaaatttccgat 930  Q
    || || ||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||  || | |||||  ||  ||||| ||||||||||||||    
T  15024127 aaatttcctatggaaggtggaatttgtccagcaagagcatttgagaaaagagataatgtaccgagttttgttaaatttccgat 15024045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 83; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 649 - 930
Target Start/End: Complemental strand, 15031667 - 15031386
Alignment:
Q  649 tggaatttgtccagtgagatgattacttgaaaggtaaatagtatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttgtccagtgagagcatttgag 748  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||   ||||||| ||||   ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |    
T  15031667 tggaattggtccagagagattattttgtgaaagggaaatgtaatccaaattaatcaaattacctatggaaggtggaatttgtccggtgagagcatttacg 15031568  T
Q  749 aaaaatgataatctacttgctttcgttaaatttccgatggtggaaggaattggttcctgagagattatttattgaaaggtaaataatatccaaattgatc 848  Q
      ||  | |||| ||||   ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| |||    
T  15031567 ccaagagttaatttactcaattttgttaaatttccgatgatggaaagaattgg-tccagagagatgattttttgaaaggtaaatagtatccaaatttatc 15031469  T
Q  849 aagttacctatggaa-gtggaatttgtcctgtgagagcatttgagtcaaaatataattcacttagtttcgttaaatttccgat 930  Q
    || || ||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||  || | |||||  ||  ||||| ||||||||||||||    
T  15031468 aaatttcctatggaaggtggaatttgtccagcaagagcatttgagaaaagagataatgtaccgagttttgttaaatttccgat 15031386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 82; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 43 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 15031265 - 15031145
Alignment:
Q  43 acttactttcgttaaatttccgatggtggaaggaattggtcctgagagatgatttattgaaaggtaaatagtatccaaattgatcaagttacctatggaa 142  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15031265 acttagtttggttaaatttccgatagtgaaaggaattggtccagagagattattttgtgaaaggtcaatantatccaaattgatcaagttacctatggaa 15031166  T
Q  143 ggtggaatttgtccagtgaga 163  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  15031165 ggtggaatttgtccagtgaga 15031145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 78; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 53 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 15024202 - 15024097
Alignment:
Q  53 gttaaatttccgatggtggaaggaattggtcctgagagatgatttattgaaaggtaaatagtatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaattt 152  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||    
T  15024202 gttaaatttccgatgatggaaagaattggtccagagagatgattttttgaaaggtaaatagtatccaaatttatcaaatttcctatggaaggtggaattt 15024103  T
Q  153 gtccag 158  Q
    ||||||    
T  15024102 gtccag 15024097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 78; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 53 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 15031543 - 15031438
Alignment:
Q  53 gttaaatttccgatggtggaaggaattggtcctgagagatgatttattgaaaggtaaatagtatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaattt 152  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||    
T  15031543 gttaaatttccgatgatggaaagaattggtccagagagatgattttttgaaaggtaaatagtatccaaatttatcaaatttcctatggaaggtggaattt 15031444  T
Q  153 gtccag 158  Q
    ||||||    
T  15031443 gtccag 15031438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 146 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 15036228 - 15036061
Alignment:
Q  146 ggaatttgtccagtgagatgattccttgaaaggtaaatagtatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttgtccagtgagagcatttgagc 245  Q
    |||||| |||||| ||||| |||   |||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  15036228 ggaattggtccagagagattatttagtgaaaggtgaatagaatccaaattaatcaaattacctatggaaggtggaatttttccagtgagagcatttgagt 15036129  T
Q  246 aaaatgataatctacttgctttcgttaaatttccgatggtggaaggaattggtcctgagagattattt 313  Q
    ||| | |||||  |||  |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  15036128 aaattaataattcactcactttggttaaatttccaatagtggaaggaattggtccagagagtttattt 15036061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 22 - 163
Target Start/End: Original strand, 14533597 - 14533738
Alignment:
Q  22 atttgagaaaaatgataatctacttactttcgttaaatttccgatggtggaaggaattggtcctgagagatgatttattgaaaggtaaatagtatccaaa 121  Q
    ||||||||||| |||||||  | | | ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  14533597 atttgagaaaagtgataatgaattaagttttgtcaaatttccgatagtggaaggaattggtccagagagtttattttctgaaaggtaaatagtatccaaa 14533696  T
Q  122 ttgatcaagttacctatggaaggtggaatttgtccagtgaga 163  Q
    || | || |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14533697 ttaaccatgttacctatggaaggtggaagttgtccagtgaga 14533738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 163
Target Start/End: Original strand, 14533733 - 14533882
Alignment:
Q  14 gtgagagcatttgagaaaaatgataatctacttactttcgttaaatttccgatggtggaaggaattggtcctgagagatgatttattgaaaggtaaatag 113  Q
    ||||||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||  ||||| | ||||  |||||||| |||||    
T  14533733 gtgagagcatttgaatgaagagataatatacttactttcgttaaatttccaacagtggaaggaattggtctagagagtttattttctgaaaggtcaatag 14533832  T
Q  114 tatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttgtccagtgaga 163  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14533833 tatccaaattaaccaggttacctatggaaggtggaatttgtccggtgaga 14533882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 650 - 802
Target Start/End: Complemental strand, 15036228 - 15036076
Alignment:
Q  650 ggaatttgtccagtgagatgattacttgaaaggtaaatagtatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttgtccagtgagagcatttgaga 749  Q
    |||||| |||||| ||||| |||   |||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  15036228 ggaattggtccagagagattatttagtgaaaggtgaatagaatccaaattaatcaaattacctatggaaggtggaatttttccagtgagagcatttgagt 15036129  T
Q  750 aaaatgataatctacttgctttcgttaaatttccgatggtggaaggaattggt 802  Q
    ||| | |||||  |||  |||| ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  15036128 aaattaataattcactcactttggttaaatttccaatagtggaaggaattggt 15036076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 68; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 776 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 15036246 - 15036088
Alignment:
Q  776 aaatttccgatggtggaaggaattggttcctgagagattatttattgaaaggtaaataatatccaaattgatcaagttacctatggaa-gtggaatttgt 874  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| |    
T  15036246 aaattttcgatagtggaaggaattggt-ccagagagattatttagtgaaaggtgaatagaatccaaattaatcaaattacctatggaaggtggaattttt 15036148  T
Q  875 cctgtgagagcatttgagtcaaaatataattcacttagtttcgttaaatttccgatagtg 934  Q
    || |||||||||||||||| ||   |||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||    
T  15036147 ccagtgagagcatttgagtaaattaataattcactcactttggttaaatttccaatagtg 15036088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 68; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 56 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 15036246 - 15036139
Alignment:
Q  56 aaatttccgatggtggaaggaattggtcctgagagatgatttattgaaaggtaaatagtatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttgtc 155  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  15036246 aaattttcgatagtggaaggaattggtccagagagattatttagtgaaaggtgaatagaatccaaattaatcaaattacctatggaaggtggaatttttc 15036147  T
Q  156 cagtgaga 163  Q
    ||||||||    
T  15036146 cagtgaga 15036139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 150
Target Start/End: Original strand, 14523470 - 14523604
Alignment:
Q  16 gagagcatttgagaaaaatgataatctacttactttcgttaaatttccgatggtggaaggaattggtcctgagagatgatttattgaaaggtaaatagta 115  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| | ||||  ||||| || |||||||    
T  14523470 gagagcatttgagagaaaagataattcacttactttcgttaaatttccgatagtggaaggaagtggtccagagagtttattttgtgaaaagtcaatagta 14523569  T
Q  116 tccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaat 150  Q
    ||||||||||  | ||||||||| |||||||||||    
T  14523570 tccaaattgacaaggttacctatagaaggtggaat 14523604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 730 - 927
Target Start/End: Original strand, 14533585 - 14533782
Alignment:
Q  730 tccagtgagagcatttgagaaaaatgataatctacttgctttcgttaaatttccgatggtggaaggaattggttcctgagagattatttattgaaaggta 829  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |||||||  | |   ||| || ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||  |||||||||    
T  14533585 tccagtgagggaatttgagaaaagtgataatgaattaagttttgtcaaatttccgatagtggaaggaattggt-ccagagagtttattttctgaaaggta 14533683  T
Q  830 aataatatccaaattgatcaagttacctatggaa-gtggaatttgtcctgtgagagcatttgagtcaaaatataattcacttagtttcgttaaatttcc 927  Q
    |||| |||||||||| | || ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || | |||||  ||||| |||||||||||||||    
T  14533684 aatagtatccaaattaaccatgttacctatggaaggtggaagttgtccagtgagagcatttgaatgaagagataatatacttactttcgttaaatttcc 14533782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 361 - 510
Target Start/End: Original strand, 14523455 - 14523604
Alignment:
Q  361 tggaatttgtccagtgagagcatttgagaaaaatgataatctacttgctttcgttaaatttccgatggtggaaggaattggtcctgagagattatttatt 460  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||||| ||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||  |    
T  14523455 tggaatatttccagagagagcatttgagagaaaagataattcacttactttcgttaaatttccgatagtggaaggaagtggtccagagagtttattttgt 14523554  T
Q  461 gaaaggtaaataatatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaat 510  Q
    |||| || |||| ||||||||||||  | ||||||||| |||||||||||    
T  14523555 gaaaagtcaatagtatccaaattgacaaggttacctatagaaggtggaat 14523604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 68 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 15001321 - 15001228
Alignment:
Q  68 gtggaaggaattggtcctgagagatgatttattgaaaggtaaatagtatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttgtccagtgaga 163  Q
    ||||||||||||||||| ||||||   || |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15001321 gtggaaggaattggtccagagagacttttcatt--aaggtaaatagtatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttgtccagtgaga 15001228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 560 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 15036246 - 15036139
Alignment:
Q  560 aaatttccgatggtggaaggaattggtcctgagagatgatttattgaaaggtaaataatatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttgtc 659  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  15036246 aaattttcgatagtggaaggaattggtccagagagattatttagtgaaaggtgaatagaatccaaattaatcaaattacctatggaaggtggaatttttc 15036147  T
Q  660 cagtgaga 667  Q
    ||||||||    
T  15036146 cagtgaga 15036139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 217 - 366
Target Start/End: Original strand, 14523455 - 14523604
Alignment:
Q  217 tggaatttgtccagtgagagcatttgagcaaaatgataatctacttgctttcgttaaatttccgatggtggaaggaattggtcctgagagattatttatt 316  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||||  ||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||  |    
T  14523455 tggaatatttccagagagagcatttgagagaaaagataattcacttactttcgttaaatttccgatagtggaaggaagtggtccagagagtttattttgt 14523554  T
Q  317 gaaaggtaaataatatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaat 366  Q
    |||| || |||| ||||||||||||  | ||||||||| |||||||||||    
T  14523555 gaaaagtcaatagtatccaaattgacaaggttacctatagaaggtggaat 14523604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 505 - 654
Target Start/End: Original strand, 14523455 - 14523604
Alignment:
Q  505 tggaatttgtccagtgagagcatttgagaaaaatgataatctacttgctttcgttaaatttccgatggtggaaggaattggtcctgagagatgatttatt 604  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||||| ||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| | ||||  |    
T  14523455 tggaatatttccagagagagcatttgagagaaaagataattcacttactttcgttaaatttccgatagtggaaggaagtggtccagagagtttattttgt 14523554  T
Q  605 gaaaggtaaataatatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaat 654  Q
    |||| || |||| ||||||||||||  | ||||||||| |||||||||||    
T  14523555 gaaaagtcaatagtatccaaattgacaaggttacctatagaaggtggaat 14523604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 572 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 15001321 - 15001228
Alignment:
Q  572 gtggaaggaattggtcctgagagatgatttattgaaaggtaaataatatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttgtccagtgaga 667  Q
    ||||||||||||||||| ||||||   || |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15001321 gtggaaggaattggtccagagagacttttcatt--aaggtaaatagtatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttgtccagtgaga 15001228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 275 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 15016338 - 15016112
Alignment:
Q  275 tttccgatggtggaaggaattggtcctgagagattatttattgaaaggtaaataatatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttgtccag 374  Q
    ||||| || ||| ||||||||||| | |||||||||||   ||||||||||| | ||| |||||| || || ||| ||||| |||||||||||||||| |    
T  15016338 tttccaatagtgaaaggaattggttcagagagattattgtatgaaaggtaaagagtatgcaaattaattaaattatctatgaaaggtggaatttgtccgg 15016239  T
Q  375 tgagagcatttgagaaaaatgataatctacttgctttcgttaaatttccgatggtggaaggaattggtcctgagagattatttattgaaaggtaaataat 474  Q
    ||||| |||||||| |||   ||| | || |   ||| || |||||||| || ||| |||||| |||||| |||| |||||||  |||||||| |||| |    
T  15016238 tgagatcatttgagtaaagatatagtatattgagttttgtcaaatttcctatagtgaaaggaagtggtccagagatattattttctgaaaggttaatagt 15016139  T
Q  475 atccaaattgatcaagttacctatgga 501  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  15016138 atccaaattaatcaaattacctatgga 15016112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 560 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 15024343 - 15024236
Alignment:
Q  560 aaatttccgatggtggaaggaattggtcctgagagatgatttattgaaaggtaaataatatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttgtc 659  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||  ||||||| ||||   ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15024343 aaatttccgatagtggatggaattggtccagagagattattttgtgaaagggaaatgtaatccaaattaatcaaattacctatggaaggtggaatttgtc 15024244  T
Q  660 cagtgaga 667  Q
    | ||||||    
T  15024243 cggtgaga 15024236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 56 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 15024343 - 15024236
Alignment:
Q  56 aaatttccgatggtggaaggaattggtcctgagagatgatttattgaaaggtaaatagtatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttgtc 155  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||  ||||||| ||||   ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15024343 aaatttccgatagtggatggaattggtccagagagattattttgtgaaagggaaatgtaatccaaattaatcaaattacctatggaaggtggaatttgtc 15024244  T
Q  156 cagtgaga 163  Q
    | ||||||    
T  15024243 cggtgaga 15024236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 560 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 15031684 - 15031577
Alignment:
Q  560 aaatttccgatggtggaaggaattggtcctgagagatgatttattgaaaggtaaataatatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttgtc 659  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||  ||||||| ||||   ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15031684 aaatttccgatagtggatggaattggtccagagagattattttgtgaaagggaaatgtaatccaaattaatcaaattacctatggaaggtggaatttgtc 15031585  T
Q  660 cagtgaga 667  Q
    | ||||||    
T  15031584 cggtgaga 15031577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 56 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 15031684 - 15031577
Alignment:
Q  56 aaatttccgatggtggaaggaattggtcctgagagatgatttattgaaaggtaaatagtatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttgtc 155  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||  ||||||| ||||   ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15031684 aaatttccgatagtggatggaattggtccagagagattattttgtgaaagggaaatgtaatccaaattaatcaaattacctatggaaggtggaatttgtc 15031585  T
Q  156 cagtgaga 163  Q
    | ||||||    
T  15031584 cggtgaga 15031577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 55; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 419 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 15016338 - 15016112
Alignment:
Q  419 tttccgatggtggaaggaattggtcctgagagattatttattgaaaggtaaataatatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttgtccag 518  Q
    ||||| || ||| ||||||||||| | |||||||||||   ||||||||||| | ||| |||||| || || ||| ||||| |||||||||||||||| |    
T  15016338 tttccaatagtgaaaggaattggttcagagagattattgtatgaaaggtaaagagtatgcaaattaattaaattatctatgaaaggtggaatttgtccgg 15016239  T
Q  519 tgagagcatttgagaaaaatgataatctacttgctttcgttaaatttccgatggtggaaggaattggtcctgagagatgatttattgaaaggtaaataat 618  Q
    ||||| |||||||| |||   ||| | || |   ||| || |||||||| || ||| |||||| |||||| |||| || ||||  |||||||| |||| |    
T  15016238 tgagatcatttgagtaaagatatagtatattgagttttgtcaaatttcctatagtgaaaggaagtggtccagagatattattttctgaaaggttaatagt 15016139  T
Q  619 atccaaattgatcaagttacctatgga 645  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  15016138 atccaaattaatcaaattacctatgga 15016112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 15001233 - 15001100
Alignment:
Q  14 gtgagagcatttgagaaaaatgataatctacttactttcgttaaatttccgatggtggaaggaattggtcctgagagatgatttattgaaaggtaaatag 113  Q
    ||||||||||||||  ||||  | |||  ||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||  ||||  |||||||| |||||    
T  15001233 gtgagagcatttgaataaaaatacaattcacttagtttcgttaaatttccgatagtgaaaggaattggtccagagagagtattttgtgaaaggtcaatag 15001134  T
Q  114 tatccaaattgatcaagttacctatggaaggtgg 147  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  15001133 tatctaaattaatcaaattacctatggatggtgg 15001100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 794 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 15010136 - 15009996
Alignment:
Q  794 ggaattggttcctgagagattatttattgaaaggtaaataatatccaaattgatcaagttacctatggaag-tggaatttgtcctgtgagagcatttgag 892  Q
    ||||||||| || ||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||| |     
T  15010136 ggaattggt-ccagagagatgatttcttgaaagggaaatattatccaaattgatcaagttacctacggaaggtggaatttgtccagtgagagcatttaaa 15010038  T
Q  893 tcaaaatataattcacttagtttcgttaaatttccgatagtg 934  Q
    | || | |||||  ||| ||||| || |||||||| ||||||    
T  15010037 taaagagataatgtactgagttttgtcaaatttccaatagtg 15009996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 172 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 15016297 - 15016112
Alignment:
Q  172 tgaaaggtaaatagtatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttgtccagtgagagcatttgagcaaaatgataatctacttgctttcgtt 271  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| || || ||| ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| |||   ||| | || |   ||| ||     
T  15016297 tgaaaggtaaagagtatgcaaattaattaaattatctatgaaaggtggaatttgtccggtgagatcatttgagtaaagatatagtatattgagttttgtc 15016198  T
Q  272 aaatttccgatggtggaaggaattggtcctgagagattatttattgaaaggtaaataatatccaaattgatcaagttacctatgga 357  Q
    |||||||| || ||| |||||| |||||| |||| |||||||  |||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||||    
T  15016197 aaatttcctatagtgaaaggaagtggtccagagatattattttctgaaaggttaatagtatccaaattaatcaaattacctatgga 15016112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 43 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 15023924 - 15023820
Alignment:
Q  43 acttactttcgttaaatttccgatggtggaaggaattggtcctgagagatgatttattgaaaggtaaatagtatccaaattgatcaagttacctatggaa 142  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||||     
T  15023924 acttagtttggttaaatttccgatagtgaaaggaattggtccagagagattattttgtgaaaggtcaatactatccaaattaatcaaattacctatggat 15023825  T
Q  143 ggtgg 147  Q
    |||||    
T  15023824 ggtgg 15023820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 721 - 864
Target Start/End: Original strand, 14523455 - 14523597
Alignment:
Q  721 tggaatttgtccagtgagagcatttgagaaaaatgataatctacttgctttcgttaaatttccgatggtggaaggaattggttcctgagagattatttat 820  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||||| ||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||| ||||||      
T  14523455 tggaatatttccagagagagcatttgagagaaaagataattcacttactttcgttaaatttccgatagtggaaggaagtgg-tccagagagtttattttg 14523553  T
Q  821 tgaaaggtaaataatatccaaattgatcaagttacctatggaag 864  Q
    ||||| || |||| ||||||||||||  | ||||||||| ||||    
T  14523554 tgaaaagtcaatagtatccaaattgacaaggttacctatagaag 14523597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 776 - 930
Target Start/End: Complemental strand, 15024343 - 15024189
Alignment:
Q  776 aaatttccgatggtggaaggaattggttcctgagagattatttattgaaaggtaaataatatccaaattgatcaagttacctatggaa-gtggaatttgt 874  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||||||  ||||||| ||||   ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  15024343 aaatttccgatagtggatggaattggt-ccagagagattattttgtgaaagggaaatgtaatccaaattaatcaaattacctatggaaggtggaatttgt 15024245  T
Q  875 cctgtgagagcatttgagtcaaaatataattcacttagtttcgttaaatttccgat 930  Q
    || ||||||||||||  | ||| |  ||||| ||| | ||| ||||||||||||||    
T  15024244 ccggtgagagcatttacgccaagagttaatttactcaattttgttaaatttccgat 15024189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 776 - 930
Target Start/End: Complemental strand, 15031684 - 15031530
Alignment:
Q  776 aaatttccgatggtggaaggaattggttcctgagagattatttattgaaaggtaaataatatccaaattgatcaagttacctatggaa-gtggaatttgt 874  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||||||  ||||||| ||||   ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  15031684 aaatttccgatagtggatggaattggt-ccagagagattattttgtgaaagggaaatgtaatccaaattaatcaaattacctatggaaggtggaatttgt 15031586  T
Q  875 cctgtgagagcatttgagtcaaaatataattcacttagtttcgttaaatttccgat 930  Q
    || ||||||||||||  | ||| |  ||||| ||| | ||| ||||||||||||||    
T  15031585 ccggtgagagcatttacgccaagagttaatttactcaattttgttaaatttccgat 15031530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 416 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 15010226 - 15010119
Alignment:
Q  416 aaatttccgatggtggaaggaattggtcctgagagattatttattgaaaggtaaataatatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttgtc 515  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||    |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  15010226 aaatttccaatagtggaaggaattggtccagagagattattttgtgaaagggaaaagtaatccaaattagtcaaattacctatggaaggtggaattggtc 15010127  T
Q  516 cagtgaga 523  Q
    ||| ||||    
T  15010126 cagagaga 15010119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 676 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 15016297 - 15016112
Alignment:
Q  676 tgaaaggtaaatagtatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttgtccagtgagagcatttgagaaaaatgataatctacttgctttcgtt 775  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| || || ||| ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| |||   ||| | || |   ||| ||     
T  15016297 tgaaaggtaaagagtatgcaaattaattaaattatctatgaaaggtggaatttgtccggtgagatcatttgagtaaagatatagtatattgagttttgtc 15016198  T
Q  776 aaatttccgatggtggaaggaattggttcctgagagattatttattgaaaggtaaataatatccaaattgatcaagttacctatgga 862  Q
    |||||||| || ||| |||||| ||| ||| |||| |||||||  |||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||||    
T  15016197 aaatttcctatagtgaaaggaagtgg-tccagagatattattttctgaaaggttaatagtatccaaattaatcaaattacctatgga 15016112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 419 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 14481640 - 14481558
Alignment:
Q  419 tttccgatggtggaaggaattggtcctgagagattatttattgaaaggtaaataatatccaaattgatcaagttacctatgga 501  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||  |||| |||||||||||| ||||||||| |||||    
T  14481640 tttccgatagtggaaggaattggtccagagagattgtttatttgaaggagaatattatccaaattgaccaagttaccaatgga 14481558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 275 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 14481640 - 14481558
Alignment:
Q  275 tttccgatggtggaaggaattggtcctgagagattatttattgaaaggtaaataatatccaaattgatcaagttacctatgga 357  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||  |||| |||||||||||| ||||||||| |||||    
T  14481640 tttccgatagtggaaggaattggtccagagagattgtttatttgaaggagaatattatccaaattgaccaagttaccaatgga 14481558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 563 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 14481640 - 14481558
Alignment:
Q  563 tttccgatggtggaaggaattggtcctgagagatgatttattgaaaggtaaataatatccaaattgatcaagttacctatgga 645  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||  ||||  |||| |||||||||||| ||||||||| |||||    
T  14481640 tttccgatagtggaaggaattggtccagagagattgtttatttgaaggagaatattatccaaattgaccaagttaccaatgga 14481558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 14481640 - 14481558
Alignment:
Q  59 tttccgatggtggaaggaattggtcctgagagatgatttattgaaaggtaaatagtatccaaattgatcaagttacctatgga 141  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||  ||||  |||| |||||||||||| ||||||||| |||||    
T  14481640 tttccgatagtggaaggaattggtccagagagattgtttatttgaaggagaatattatccaaattgaccaagttaccaatgga 14481558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 880 - 934
Target Start/End: Original strand, 14523470 - 14523524
Alignment:
Q  880 gagagcatttgagtcaaaatataattcacttagtttcgttaaatttccgatagtg 934  Q
    |||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14523470 gagagcatttgagagaaaagataattcacttactttcgttaaatttccgatagtg 14523524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 15016375 - 15016233
Alignment:
Q  22 atttgagaaaaatgataatctacttactttcgttaaatttccgatggtggaaggaattggtcctgagagatgatttattgaaaggtaaatagtatccaaa 121  Q
    |||||||||||  ||||||||| | | ||| || |  ||||| || ||| ||||||||||| | ||||||| |||   ||||||||||| ||||| ||||    
T  15016375 atttgagaaaagagataatctaatgagttttgtcatgtttccaatagtgaaaggaattggttcagagagattattgtatgaaaggtaaagagtatgcaaa 15016276  T
Q  122 ttgatcaagttacctatggaaggtggaatttgtccagtgagat 164  Q
    || || || ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  15016275 ttaattaaattatctatgaaaggtggaatttgtccggtgagat 15016233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 56 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 15016197 - 15016112
Alignment:
Q  56 aaatttccgatggtggaaggaattggtcctgagagatgatttattgaaaggtaaatagtatccaaattgatcaagttacctatgga 141  Q
    |||||||| || ||| |||||| |||||| |||| || ||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  15016197 aaatttcctatagtgaaaggaagtggtccagagatattattttctgaaaggttaatagtatccaaattaatcaaattacctatgga 15016112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 779 - 938
Target Start/End: Complemental strand, 15016338 - 15016179
Alignment:
Q  779 tttccgatggtggaaggaattggttcctgagagattatttattgaaaggtaaataatatccaaattgatcaagttacctatggaag-tggaatttgtcct 877  Q
    ||||| || ||| |||||||||||||  |||||||||||   ||||||||||| | ||| |||||| || || ||| ||||| ||| ||||||||||||     
T  15016338 tttccaatagtgaaaggaattggttca-gagagattattgtatgaaaggtaaagagtatgcaaattaattaaattatctatgaaaggtggaatttgtccg 15016240  T
Q  878 gtgagagcatttgagtcaaaatataattcacttagtttcgttaaatttccgatagtgaaag 938  Q
    |||||| ||||||||| || ||||| |  | | ||||| || |||||||| ||||||||||    
T  15016239 gtgagatcatttgagtaaagatatagtatattgagttttgtcaaatttcctatagtgaaag 15016179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 15036144 - 15036068
Alignment:
Q  14 gtgagagcatttgagaaaaatgataatctacttactttcgttaaatttccgatggtggaaggaattggtcctgagag 90  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||  ||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  15036144 gtgagagcatttgagtaaattaataattcactcactttggttaaatttccaatagtggaaggaattggtccagagag 15036068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 779 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 14481640 - 14481558
Alignment:
Q  779 tttccgatggtggaaggaattggttcctgagagattatttattgaaaggtaaataatatccaaattgatcaagttacctatgga 862  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||||  ||||  |||| |||||||||||| ||||||||| |||||    
T  14481640 tttccgatagtggaaggaattggt-ccagagagattgtttatttgaaggagaatattatccaaattgaccaagttaccaatgga 14481558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 561 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 15039974 - 15039879
Alignment:
Q  561 aatttccgatggtggaaggaattggtcctgagagatgatttattgaaaggtaaataatatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaattt 656  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||  | || |||||     |||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  15039974 aatttccgatagtggaaggaattgttccataaagttgattaccataaaggtcaataatatccaaattgatcaggttaccaattgaaggtggaattt 15039879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 462 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 15039929 - 15039879
Alignment:
Q  462 aaaggtaaataatatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaattt 512  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  15039929 aaaggtcaataatatccaaattgatcaggttaccaattgaaggtggaattt 15039879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 318 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 15039929 - 15039879
Alignment:
Q  318 aaaggtaaataatatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaattt 368  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  15039929 aaaggtcaataatatccaaattgatcaggttaccaattgaaggtggaattt 15039879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 563 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 15016338 - 15016233
Alignment:
Q  563 tttccgatggtggaaggaattggtcctgagagatgatttattgaaaggtaaataatatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttgtccag 662  Q
    ||||| || ||| ||||||||||| | ||||||| |||   ||||||||||| | ||| |||||| || || ||| ||||| |||||||||||||||| |    
T  15016338 tttccaatagtgaaaggaattggttcagagagattattgtatgaaaggtaaagagtatgcaaattaattaaattatctatgaaaggtggaatttgtccgg 15016239  T
Q  663 tgagat 668  Q
    ||||||    
T  15016238 tgagat 15016233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 15039974 - 15039879
Alignment:
Q  57 aatttccgatggtggaaggaattggtcctgagagatgatttattgaaaggtaaatagtatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaattt 152  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||  | || |||||     |||||| |||| ||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  15039974 aatttccgatagtggaaggaattgttccataaagttgattaccataaaggtcaataatatccaaattgatcaggttaccaattgaaggtggaattt 15039879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 678 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 15039929 - 15039879
Alignment:
Q  678 aaaggtaaatagtatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaattt 728  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  15039929 aaaggtcaataatatccaaattgatcaggttaccaattgaaggtggaattt 15039879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 15039929 - 15039879
Alignment:
Q  174 aaaggtaaatagtatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaattt 224  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  15039929 aaaggtcaataatatccaaattgatcaggttaccaattgaaggtggaattt 15039879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 650 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 15023893 - 15023820
Alignment:
Q  650 ggaatttgtccagtgagatgattacttgaaaggtaaatagtatccaaattgatcaagttacctatggaaggtgg 723  Q
    |||||| |||||| ||||| |||   |||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  15023893 ggaattggtccagagagattattttgtgaaaggtcaatactatccaaattaatcaaattacctatggatggtgg 15023820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0400 (Bit Score: 94; Significance: 2e-45; HSPs: 9)
Name: scaffold0400
Description:

Target: scaffold0400; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 181 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 11952 - 11539
Alignment:
Q  181 aatagtatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttgtccagtgagagcatttgagcaaaatgataatctacttgctttcgttaaatttccg 280  Q
    ||||| |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||     |   ||| || ||||||       
T  11952 aatagaatccaagttgaccaagttaccaatggaaggtggaatttgtccggtgagagcatttgagaaaagagataacactgtgagttttgtcaaatttttt 11853  T
Q  281 atggtggaaggaattggtcctgagagattatttattgaaaggtaaataatatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttgtccagtgagag 380  Q
    || ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||   ||||  ||||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  11852 atagtgcaaggaattggtcccgagagtttatttatatgaaggataatagaatccaaattgaccaagttacctatggaatgtggaatttgtccggtgagag 11753  T
Q  381 catttgagaaaaatgataatctacttgctttcgttaaatttccgatggtggaaggaattggtcctgagagattatttattgaaaggtaaataatatccaa 480  Q
    ||||||||||||  | |||   | |   ||| || |||||||| || ||| ||||||| ||||| || ||  ||||| |   ||||  |||| |||||||    
T  11752 catttgagaaaagagttaactcagtgagttttgtcaaatttcctatagtgaaaggaataggtccagatagtgtatttgtatgaaggacaatagtatccaa 11653  T
Q  481 attgatcaagttacctatggaaggtggaatttgtccagtgagagcatttgagaaaaatgataatctacttgctttcgttaaatttccgatggtggaagga 580  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||  |  |   ||| || ||||||||||| |||| ||||    
T  11652 attgaccaagttatatatggaaggtggaatttgtccggtgagagcatttgagaaaagagataacattgtgagttttgtcaaatttccgatagtggtagga 11553  T
Q  581 attggtcctgagag 594  Q
    |||||||| |||||    
T  11552 attggtcccgagag 11539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0400; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 272 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 12005 - 11610
Alignment:
Q  272 aaatttccgatggtggaaggaattggtcctgagagattatttattgaaaggtaaataatatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttgtc 371  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||| ||| | |||||| |||||| |  ||||  |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12005 aaatttccgatagtgggaggaattggtccagagggtttatttgttgaaatggtaatagaatccaagttgaccaagttaccaatggaaggtggaatttgtc 11906  T
Q  372 cagtgagagcatttgagaaaaatgataatctacttgctttcgttaaatttccgatggtggaaggaattggtcctgagagattatttattgaaaggtaaat 471  Q
    | |||||||||||||||||||  |||||     |   ||| || ||||||   || ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||   ||||  |||    
T  11905 cggtgagagcatttgagaaaagagataacactgtgagttttgtcaaattttttatagtgcaaggaattggtcccgagagtttatttatatgaaggataat 11806  T
Q  472 aatatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttgtccagtgagagcatttgagaaaaatgataatctacttgctttcgttaaatttccgatg 571  Q
    |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  | |||   | |   ||| || |||||||| ||     
T  11805 agaatccaaattgaccaagttacctatggaatgtggaatttgtccggtgagagcatttgagaaaagagttaactcagtgagttttgtcaaatttcctata 11706  T
Q  572 gtggaaggaattggtcctgagagatgatttattgaaaggtaaataatatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttgtccagtgaga 667  Q
    ||| ||||||| ||||| || ||   |||| |   ||||  |||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11705 gtgaaaggaataggtccagatagtgtatttgtatgaaggacaatagtatccaaattgaccaagttatatatggaaggtggaatttgtccggtgaga 11610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0400; HSP #3
Raw Score: 63; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 685 - 938
Target Start/End: Complemental strand, 11952 - 11699
Alignment:
Q  685 aatagtatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttgtccagtgagagcatttgagaaaaatgataatctacttgctttcgttaaatttccg 784  Q
    ||||| |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||     |   ||| || ||||||       
T  11952 aatagaatccaagttgaccaagttaccaatggaaggtggaatttgtccggtgagagcatttgagaaaagagataacactgtgagttttgtcaaatttttt 11853  T
Q  785 atggtggaaggaattggttcctgagagattatttattgaaaggtaaataatatccaaattgatcaagttacctatggaa-gtggaatttgtcctgtgaga 883  Q
    || ||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||   ||||  ||||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  11852 atagtgcaaggaattgg-tcccgagagtttatttatatgaaggataatagaatccaaattgaccaagttacctatggaatgtggaatttgtccggtgaga 11754  T
Q  884 gcatttgagtcaaaatataattcacttagtttcgttaaatttccgatagtgaaag 938  Q
    |||||||||  || |  ||| ||| | ||||| || |||||||| ||||||||||    
T  11753 gcatttgagaaaagagttaactcagtgagttttgtcaaatttcctatagtgaaag 11699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0400; HSP #4
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 685 - 892
Target Start/End: Complemental strand, 11808 - 11601
Alignment:
Q  685 aatagtatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttgtccagtgagagcatttgagaaaaatgataatctacttgctttcgttaaatttccg 784  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  | |||   | |   ||| || ||||||||     
T  11808 aatagaatccaaattgaccaagttacctatggaatgtggaatttgtccggtgagagcatttgagaaaagagttaactcagtgagttttgtcaaatttcct 11709  T
Q  785 atggtggaaggaattggttcctgagagattatttattgaaaggtaaataatatccaaattgatcaagttacctatggaa-gtggaatttgtcctgtgaga 883  Q
    || ||| ||||||| || ||| || ||  ||||| |   ||||  |||| |||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  11708 atagtgaaaggaatagg-tccagatagtgtatttgtatgaaggacaatagtatccaaattgaccaagttatatatggaaggtggaatttgtccggtgaga 11610  T
Q  884 gcatttgag 892  Q
    |||||||||    
T  11609 gcatttgag 11601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0400; HSP #5
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 685 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 11664 - 11597
Alignment:
Q  685 aatagtatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttgtccagtgagagcatttgagaaaa 752  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11664 aatagtatccaaattgaccaagttatatatggaaggtggaatttgtccggtgagagcatttgagaaaa 11597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0400; HSP #6
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 56 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 12005 - 11898
Alignment:
Q  56 aaatttccgatggtggaaggaattggtcctgagagatgatttattgaaaggtaaatagtatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttgtc 155  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||| ||| | | |||| |||||| |  ||||| |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12005 aaatttccgatagtgggaggaattggtccagagggtttatttgttgaaatggtaatagaatccaagttgaccaagttaccaatggaaggtggaatttgtc 11906  T
Q  156 cagtgaga 163  Q
    | ||||||    
T  11905 cggtgaga 11898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0400; HSP #7
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 11845 - 11754
Alignment:
Q  72 aaggaattggtcctgagagatgatttattgaaaggtaaatagtatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttgtccagtgaga 163  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||||||   ||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  11845 aaggaattggtcccgagagtttatttatatgaaggataatagaatccaaattgaccaagttacctatggaatgtggaatttgtccggtgaga 11754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0400; HSP #8
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 776 - 892
Target Start/End: Complemental strand, 12005 - 11889
Alignment:
Q  776 aaatttccgatggtggaaggaattggttcctgagagattatttattgaaaggtaaataatatccaaattgatcaagttacctatggaag-tggaatttgt 874  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||| || ||| | |||||| |||||| |  ||||  |||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  12005 aaatttccgatagtgggaggaattggt-ccagagggtttatttgttgaaatggtaatagaatccaagttgaccaagttaccaatggaaggtggaatttgt 11907  T
Q  875 cctgtgagagcatttgag 892  Q
    || |||||||||||||||    
T  11906 ccggtgagagcatttgag 11889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0400; HSP #9
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 11664 - 11610
Alignment:
Q  109 aatagtatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttgtccagtgaga 163  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11664 aatagtatccaaattgaccaagttatatatggaaggtggaatttgtccggtgaga 11610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0365 (Bit Score: 94; Significance: 2e-45; HSPs: 9)
Name: scaffold0365
Description:

Target: scaffold0365; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 181 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 12595 - 12182
Alignment:
Q  181 aatagtatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttgtccagtgagagcatttgagcaaaatgataatctacttgctttcgttaaatttccg 280  Q
    ||||| |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||     |   ||| || ||||||       
T  12595 aatagaatccaagttgaccaagttaccaatggaaggtggaatttgtccggtgagagcatttgagaaaagagataacactgtgagttttgtcaaatttttt 12496  T
Q  281 atggtggaaggaattggtcctgagagattatttattgaaaggtaaataatatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttgtccagtgagag 380  Q
    || ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||   ||||  ||||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  12495 atagtgcaaggaattggtcccgagagtttatttatatgaaggataatagaatccaaattgaccaagttacctatggaatgtggaatttgtccggtgagag 12396  T
Q  381 catttgagaaaaatgataatctacttgctttcgttaaatttccgatggtggaaggaattggtcctgagagattatttattgaaaggtaaataatatccaa 480  Q
    ||||||||||||  | |||   | |   ||| || |||||||| || ||| ||||||| ||||| || ||  ||||| |   ||||  |||| |||||||    
T  12395 catttgagaaaagagttaactcagtgagttttgtcaaatttcctatagtgaaaggaataggtccagatagtgtatttgtatgaaggacaatagtatccaa 12296  T
Q  481 attgatcaagttacctatggaaggtggaatttgtccagtgagagcatttgagaaaaatgataatctacttgctttcgttaaatttccgatggtggaagga 580  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||  |  |   ||| || ||||||||||| |||| ||||    
T  12295 attgaccaagttatatatggaaggtggaatttgtccggtgagagcatttgagaaaagagataacattgtgagttttgtcaaatttccgatagtggtagga 12196  T
Q  581 attggtcctgagag 594  Q
    |||||||| |||||    
T  12195 attggtcccgagag 12182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0365; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 272 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 12648 - 12253
Alignment:
Q  272 aaatttccgatggtggaaggaattggtcctgagagattatttattgaaaggtaaataatatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttgtc 371  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||| ||| | |||||| |||||| |  ||||  |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12648 aaatttccgatagtgggaggaattggtccagagggtttatttgttgaaatggtaatagaatccaagttgaccaagttaccaatggaaggtggaatttgtc 12549  T
Q  372 cagtgagagcatttgagaaaaatgataatctacttgctttcgttaaatttccgatggtggaaggaattggtcctgagagattatttattgaaaggtaaat 471  Q
    | |||||||||||||||||||  |||||     |   ||| || ||||||   || ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||   ||||  |||    
T  12548 cggtgagagcatttgagaaaagagataacactgtgagttttgtcaaattttttatagtgcaaggaattggtcccgagagtttatttatatgaaggataat 12449  T
Q  472 aatatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttgtccagtgagagcatttgagaaaaatgataatctacttgctttcgttaaatttccgatg 571  Q
    |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  | |||   | |   ||| || |||||||| ||     
T  12448 agaatccaaattgaccaagttacctatggaatgtggaatttgtccggtgagagcatttgagaaaagagttaactcagtgagttttgtcaaatttcctata 12349  T
Q  572 gtggaaggaattggtcctgagagatgatttattgaaaggtaaataatatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttgtccagtgaga 667  Q
    ||| ||||||| ||||| || ||   |||| |   ||||  |||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12348 gtgaaaggaataggtccagatagtgtatttgtatgaaggacaatagtatccaaattgaccaagttatatatggaaggtggaatttgtccggtgaga 12253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0365; HSP #3
Raw Score: 63; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 685 - 938
Target Start/End: Complemental strand, 12595 - 12342
Alignment:
Q  685 aatagtatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttgtccagtgagagcatttgagaaaaatgataatctacttgctttcgttaaatttccg 784  Q
    ||||| |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||     |   ||| || ||||||       
T  12595 aatagaatccaagttgaccaagttaccaatggaaggtggaatttgtccggtgagagcatttgagaaaagagataacactgtgagttttgtcaaatttttt 12496  T
Q  785 atggtggaaggaattggttcctgagagattatttattgaaaggtaaataatatccaaattgatcaagttacctatggaa-gtggaatttgtcctgtgaga 883  Q
    || ||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||   ||||  ||||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  12495 atagtgcaaggaattgg-tcccgagagtttatttatatgaaggataatagaatccaaattgaccaagttacctatggaatgtggaatttgtccggtgaga 12397  T
Q  884 gcatttgagtcaaaatataattcacttagtttcgttaaatttccgatagtgaaag 938  Q
    |||||||||  || |  ||| ||| | ||||| || |||||||| ||||||||||    
T  12396 gcatttgagaaaagagttaactcagtgagttttgtcaaatttcctatagtgaaag 12342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0365; HSP #4
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 685 - 892
Target Start/End: Complemental strand, 12451 - 12244
Alignment:
Q  685 aatagtatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttgtccagtgagagcatttgagaaaaatgataatctacttgctttcgttaaatttccg 784  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  | |||   | |   ||| || ||||||||     
T  12451 aatagaatccaaattgaccaagttacctatggaatgtggaatttgtccggtgagagcatttgagaaaagagttaactcagtgagttttgtcaaatttcct 12352  T
Q  785 atggtggaaggaattggttcctgagagattatttattgaaaggtaaataatatccaaattgatcaagttacctatggaa-gtggaatttgtcctgtgaga 883  Q
    || ||| ||||||| || ||| || ||  ||||| |   ||||  |||| |||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  12351 atagtgaaaggaatagg-tccagatagtgtatttgtatgaaggacaatagtatccaaattgaccaagttatatatggaaggtggaatttgtccggtgaga 12253  T
Q  884 gcatttgag 892  Q
    |||||||||    
T  12252 gcatttgag 12244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0365; HSP #5
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 685 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 12307 - 12240
Alignment:
Q  685 aatagtatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttgtccagtgagagcatttgagaaaa 752  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12307 aatagtatccaaattgaccaagttatatatggaaggtggaatttgtccggtgagagcatttgagaaaa 12240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0365; HSP #6
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 56 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 12648 - 12541
Alignment:
Q  56 aaatttccgatggtggaaggaattggtcctgagagatgatttattgaaaggtaaatagtatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttgtc 155  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||| ||| | | |||| |||||| |  ||||| |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12648 aaatttccgatagtgggaggaattggtccagagggtttatttgttgaaatggtaatagaatccaagttgaccaagttaccaatggaaggtggaatttgtc 12549  T
Q  156 cagtgaga 163  Q
    | ||||||    
T  12548 cggtgaga 12541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0365; HSP #7
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 12488 - 12397
Alignment:
Q  72 aaggaattggtcctgagagatgatttattgaaaggtaaatagtatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttgtccagtgaga 163  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||||||   ||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  12488 aaggaattggtcccgagagtttatttatatgaaggataatagaatccaaattgaccaagttacctatggaatgtggaatttgtccggtgaga 12397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0365; HSP #8
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 776 - 892
Target Start/End: Complemental strand, 12648 - 12532
Alignment:
Q  776 aaatttccgatggtggaaggaattggttcctgagagattatttattgaaaggtaaataatatccaaattgatcaagttacctatggaag-tggaatttgt 874  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||| || ||| | |||||| |||||| |  ||||  |||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  12648 aaatttccgatagtgggaggaattggt-ccagagggtttatttgttgaaatggtaatagaatccaagttgaccaagttaccaatggaaggtggaatttgt 12550  T
Q  875 cctgtgagagcatttgag 892  Q
    || |||||||||||||||    
T  12549 ccggtgagagcatttgag 12532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0365; HSP #9
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 12307 - 12253
Alignment:
Q  109 aatagtatccaaattgatcaagttacctatggaaggtggaatttgtccagtgaga 163  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12307 aatagtatccaaattgaccaagttatatatggaaggtggaatttgtccggtgaga 12253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University