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 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5919_high_3 (Length: 510)

Name: NF5919_high_3
Description: NF5919
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5919_high_3
NF5919_high_3
[»] chr5 (17 HSPs)
chr5 (11-429)||(3259306-3259721)
chr5 (11-429)||(4737279-4737716)
chr5 (11-429)||(12281249-12281684)
chr5 (12-429)||(10394339-10394776)
chr5 (12-429)||(25836088-25836522)
chr5 (12-429)||(9917963-9918395)
chr5 (192-429)||(15915397-15915632)
chr5 (135-319)||(14481022-14481207)
chr5 (179-319)||(491754-491893)
chr5 (352-429)||(14481201-14481278)
chr5 (11-186)||(491057-491252)
chr5 (11-92)||(14480891-14480972)
chr5 (11-92)||(15915226-15915307)
chr5 (12-68)||(15883309-15883365)
chr5 (386-429)||(491912-491955)
chr5 (89-159)||(15915322-15915392)
chr5 (354-426)||(36038331-36038403)
[»] chr7 (9 HSPs)
chr7 (11-429)||(36783901-36784336)
chr7 (12-429)||(42489448-42489884)
chr7 (12-429)||(24306583-24307019)
chr7 (11-429)||(30002037-30002471)
chr7 (11-429)||(30468835-30469259)
chr7 (84-429)||(32022137-32022483)
chr7 (190-429)||(26928728-26928966)
chr7 (11-92)||(37706154-37706235)
chr7 (39-90)||(32022074-32022125)
[»] chr2 (10 HSPs)
chr2 (12-429)||(2054589-2054993)
chr2 (11-429)||(37875533-37875969)
chr2 (11-429)||(34452392-34452827)
chr2 (12-429)||(8043185-8043617)
chr2 (11-425)||(863348-863779)
chr2 (12-429)||(36150479-36150917)
chr2 (12-219)||(27006070-27006295)
chr2 (344-426)||(7486627-7486709)
chr2 (364-429)||(7498063-7498128)
chr2 (279-327)||(7486563-7486611)
[»] chr4 (8 HSPs)
chr4 (11-429)||(36855051-36855487)
chr4 (11-429)||(12834653-12835089)
chr4 (12-429)||(42419219-42419622)
chr4 (11-429)||(19549604-19550046)
chr4 (11-429)||(50696418-50696839)
chr4 (12-429)||(25478216-25478618)
chr4 (11-331)||(18032899-18033236)
chr4 (12-74)||(6784984-6785046)
[»] chr1 (11 HSPs)
chr1 (11-429)||(51660835-51661270)
chr1 (11-429)||(23173518-23173954)
chr1 (12-429)||(24081597-24082028)
chr1 (11-428)||(39870205-39870631)
chr1 (17-429)||(31150912-31151341)
chr1 (15-429)||(23601971-23602371)
chr1 (135-426)||(48577085-48577374)
chr1 (84-226)||(18248961-18249103)
chr1 (11-92)||(48644663-48644744)
chr1 (12-92)||(18249144-18249224)
chr1 (48-92)||(18249113-18249157)
[»] chr3 (10 HSPs)
chr3 (12-429)||(37986557-37986993)
chr3 (12-429)||(46915114-46915547)
chr3 (12-429)||(16302867-16303301)
chr3 (12-429)||(50802067-50802501)
chr3 (84-429)||(46888710-46889057)
chr3 (12-429)||(50873376-50873813)
chr3 (289-429)||(13643802-13643942)
chr3 (12-92)||(46889098-46889178)
chr3 (48-92)||(46889067-46889111)
chr3 (12-57)||(18346898-18346943)
[»] chr6 (6 HSPs)
chr6 (12-426)||(18969348-18969762)
chr6 (12-429)||(24063162-24063598)
chr6 (136-429)||(5121016-5121308)
chr6 (12-219)||(34713044-34713270)
chr6 (12-68)||(5114346-5114402)
chr6 (97-127)||(5114418-5114448)
[»] chr8 (9 HSPs)
chr8 (84-426)||(20054506-20054850)
chr8 (11-319)||(34654344-34654671)
chr8 (39-303)||(14762768-14763038)
chr8 (11-224)||(41273275-41273506)
chr8 (342-429)||(14763061-14763148)
chr8 (352-429)||(34654665-34654742)
chr8 (7-88)||(24022858-24022939)
chr8 (11-159)||(41273107-41273273)
chr8 (47-87)||(20054865-20054905)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 282; Significance: 1e-158; HSPs: 17)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 11 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 3259721 - 3259306
Alignment:
Q  11 aatatctatcatcattaatttataatcgaacattccatttttatttctccaaatttatttgttcctctgttttatttccccagatatctataatcatact 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||| |    
T  3259721 aatatctatcatcattaatttataatcaaacattccatttttatttccccaaatttatttgttcctct--tttatttccccaaatttctataatcatatt 3259624  T
Q  111 caaacttcttttctaaannnnnnnataaaatgaatggttgaactcatatccatatggttgtttgagtcatcatcaccatcaatgatatttctttgtcttt 210  Q
    |||||||||||||||||       |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3259623 caaacttcttttctaaacttttttataaaatgaatgtttgaactcatatacctatggttgtttgagtcatcatcaacatcaatgatatttctttgtcttt 3259524  T
Q  211 atctcatatactcatannnnnnnaataattaattaaattgtattaaaaattaaccaacaagctcgacaaatgattcttgaattgttcatgctaattagat 310  Q
    ||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3259523 atctcatatactcatatttttttaataattaattaaattgtattaaaaa-aaaccaacaagctcgacaaatgattcttgaattgttcatgctaattagat 3259425  T
Q  311 tattttgtcactcataggtctaannnnnnnnagaggactcgttgtgtcttatgtttaactgaattatgatttatcatgattttataaaaattataaagtt 410  Q
    |||||||||||||||||||||||        |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3259424 tattttgtcactcataggtctaattttttttagaggattcgttgtgtctcatgtttaactgaattatgatttatcatgatgttataaaaattataaagtt 3259325  T
Q  411 tgagtttgtgcttatggcc 429  Q
    |||||||||||||||||||    
T  3259324 tgagtttgtgcttatggcc 3259306  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 11 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 4737716 - 4737279
Alignment:
Q  11 aatatctatcatcattaatttataatcgaacattccatttttatttctccaaatttatttgttcctctgttttatttcccca------------------ 92  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||                      
T  4737716 aatatctatcatcattaatttataatcaaacattccatttttatttccccaaatttatttgttcctcttttttatttccccaaatttataaattttccca 4737617  T
Q  93 gatatctataatcatactcaaacttcttttctaaannnnnnnataaaatgaatggttgaactcatatccatatggttgtttgagtcatcatcaccatcaa 192  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||       ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4737616 gatttctataatcatactcaaacttcttttccaaacttttttataaaatgaatggttgaactcatatacatatggttgtttgagtcatcatcaccatcaa 4737517  T
Q  193 tgatatttctttgtctttatctcatatactcatannnnnnnaataattaattaaattgtattaaaaattaaccaacaagctcgacaaatgattcttgaat 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  4737516 tgatatttctttgtctttatctcatatactcatatttttttaataattaattaaattgtattaaaaaaaaaccaacaagctcgaaaaataattcttgaat 4737417  T
Q  293 tgttcatgctaattagattattttgtcactcataggtctaannnnnnnnagaggactcgttgtgtcttatgtttaactgaattatgatttatcatgattt 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4737416 tgttcatgctaattagattattttgtcactcataggtctaattttttttagaggactcgttgtgtctcatgtttaactgaattatgatttatcatgattt 4737317  T
Q  393 tat-aaaaattataaagtttgagtttgtgcttatggcc 429  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4737316 tataaaaaattataaagtttgagtttgcgcttatggcc 4737279  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 11 - 429
Target Start/End: Original strand, 12281249 - 12281684
Alignment:
Q  11 aatatctatcatcattaatttataatcgaacattccatttttatttctccaaatttatttgttcctctgttttatttcccca------------------ 92  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||                      
T  12281249 aatatctatcatcattaatttataaccaaacattccatttttatttccccaaatttatttgttcctcttttttatttccccaaatttataaattttccca 12281348  T
Q  93 gatatctataatcatactcaaacttcttttctaaannnnnnnataaaatgaatggttgaactcatatccatatggttgtttgagtcatcatcaccatcaa 192  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12281349 gatttctataatcatactcaaacttcttttctaaacttttttataaaatgaatggttgaactcatatacctatggttgtttgagtcattatcaccatcaa 12281448  T
Q  193 tgatatttctttgtctttatctcatatactcatannnnnnnaataattaattaaattgtattaaaaattaaccaacaagctcgacaaatgattcttgaat 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12281449 tgatatttctttgtctttatctcatatactcatatttttttaataattaattaatttgtattaaaaa-aaatcaacaagctcgacaaatgattcttgaat 12281547  T
Q  293 tgttcatgctaattagattattttgtcactcataggtctaannnnnnnnagaggactcgttgtgtcttatgtttaactgaattatgatttatcatgattt 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12281548 tgttcatgctaattagattattttgtcactcataggtctaattttttttagaggactcgttgtgtctcatgtttaactgaattaagatttatcatgattt 12281647  T
Q  393 tataaaaattataaagtttgagtttgtgcttatggcc 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12281648 tataaaaattataaagtttgagtttgtgcttatggcc 12281684  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 12 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 10394776 - 10394339
Alignment:
Q  12 atatctatcatcattaatttataatcgaacattccatttttatttctccaaatttatttgttcctctgttttatttcccca------------------g 93  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||                  |    
T  10394776 atatctatcattattaatttataatcaaacattctatttttatttccccaaatttatttgttcctcttttttatttccccaaatttataaattttcccag 10394677  T
Q  94 atatctataatcatactcaaacttcttttctaaannnnnnnataaaatgaatggttgaactcatatccatatggttgtttgagtcatcatcaccatcaat 193  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||       ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10394676 atttctataatcatactcaaactttttttctaaatttttttataaaatgaatggttgaactcatatacatatggttgtttgagtcatcatcaccatcaat 10394577  T
Q  194 gatatttctttgtctttatctcatatactcatannnnnnnaataattaattaaattgtatt-aaaaattaaccaacaagctcgacaaatgattcttgaat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10394576 gatatttctttgtctttatctcatatactcatatttttttaataattaattaaattgtattaaaaaaaaaaccaacaagctcgacaaatgattcttgaat 10394477  T
Q  293 tgttcatgctaattagattattttgtcactcataggtctaa-nnnnnnnnagaggactcgttgtgtcttatgtttaactgaattatgatttatcatgatt 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  10394476 tgttcatgctaattagattattttgtcactcataggtctaatgtttttttagaggactcgttgtgtctcatgttttactgaattaagatttatcatgatt 10394377  T
Q  392 ttataaaaattataaagtttgagtttgtgcttatggcc 429  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10394376 ttataaaaattataaagtttgaatttgtgcttatggcc 10394339  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 12 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 25836522 - 25836088
Alignment:
Q  12 atatctatcatcattaatttataatcgaacattccatttttatttctccaaatttatttgttcctctgttttatttcccca------------------g 93  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||                  |    
T  25836522 atatctatcatcattaatttataatcaaacattccatttttatttccccaaatttatttgttcctcttttttatttccccaaatttataaattttcctag 25836423  T
Q  94 atatctataatcatactcaaacttcttttctaaannnnnnnataaaatgaatggttgaactcatatccatatggttgtttgagtcatcatcaccatcaat 193  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||       ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25836422 atttctataatcatactcaaactttttttctaaacttttttataaaatgaatggttgaactcatatacc-atggttgtttgaatcatcatcaccatcaat 25836324  T
Q  194 gatatttctttgtctttatctcatatactcatannnnnnnaataattaattaaattgtattaaaaattaaccaacaagctcgacaaatgattcttg-aat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||       | ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  25836323 gatatttctttgtctttatctcatatactcatatttttttattaattaattaaattgtattaaaaa-aaaccaacaagctcgacaaatgactcttgaaat 25836225  T
Q  293 tgttcatgctaattagattattttgtcactcataggtctaannnnnnnnagaggactcgttgtgtcttatgtttaactgaattatgatttatcatgattt 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25836224 tgttcatgctaattagattattttgtcactcataggtctaattttttttagaggacttgttgtgtctcatgtttaactgaattaagatttatcatgattt 25836125  T
Q  393 tataaaaattataaagtttgagtttgtgcttatggcc 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25836124 tataaaaattataaagtttgagtttgtgcttatggcc 25836088  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 12 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 9918395 - 9917963
Alignment:
Q  12 atatctatcatcattaatttataatcgaacattccatttttatttctccaaatttatttgttcctctgttttatttcccca------------------g 93  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||                  |    
T  9918395 atatctatcatcattaatttataatcaaacattccatttttatttccccaaatttatttgctcctcttttttatttccccaaatttataaattttcccag 9918296  T
Q  94 atatctataatcatactcaaacttcttttctaaannnnnnnataaaatgaatggttgaactcatatccatatggttgtttgagtcatcatcaccatcaat 193  Q
    || ||||||||||||||||  ||| |||||||||       |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9918295 atttctataatcatactca--ctttttttctaaacttttttataaaatgaatggttgaactcatatatctatggttgtttgaatcatcatcaccatcaat 9918198  T
Q  194 gatatttctttgtctttatctcatatactcatannnnnnnaataattaattaaattgtattaaaaattaaccaacaagctcgacaaatgattcttg-aat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||       | ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||| |||    
T  9918197 gatatttctttgtctttatctcatatactcatatttttttattaattaattaaattgtattaaaaa--aaccaactagctcgacaaataattcttgaaat 9918100  T
Q  293 tgttcatgctaattagattattttgtcactcataggtctaannnnnnnnagaggactcgttgtgtcttatgtttaactgaattatgatttatcatgattt 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9918099 tgttcatgctaattagattattttgtcactcataggtctaattttttttagaggactcgttgtgtctcatgtttaactgaattaagatttatcatgattt 9918000  T
Q  393 tataaaaattataaagtttgagtttgtgcttatggcc 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9917999 tataaaaattataaagtttgagtttgtgcttatggcc 9917963  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 192 - 429
Target Start/End: Original strand, 15915397 - 15915632
Alignment:
Q  192 atgatatttctttgtctttatctcatatactcatannnnnnnaataattaattaaattgtattaaaaattaaccaacaagctcgacaaatgattcttgaa 291  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| | ||||||| |||||||||    
T  15915397 atgatatttctttgtctttatctcatatactcatatttttttaataattaattaaattgtattaaaaa--aatcaacaagattgacaaataattcttgaa 15915494  T
Q  292 ttgttcatgctaattagattattttgtcactcataggtctaannnnnnnnagaggactcgttgtgtcttatgtttaactgaattatgatttatcatgatt 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15915495 ttgttcatgctaattagattattttgtcactcataggtctaattttttttagatgactcgttgtatctcatgtttaactgaattaagatttatcatgatt 15915594  T
Q  392 ttataaaaattataaagtttgagtttgtgcttatggcc 429  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15915595 ttataaaaattataaagtttaagtttgtgcttatggcc 15915632  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 135 - 319
Target Start/End: Original strand, 14481022 - 14481207
Alignment:
Q  135 ataaaatgaatggttgaactcatatccatatggttgtttgagtcatcatcaccatcaatgatatttctttgtctttatctcatatactcatannnnnnna 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |    
T  14481022 ataaaatgaatggttgaactcatatacctatgattgtttgagtcatcatcaccatcaatgatatttctttgtctttatctcatatactcatattttttta 14481121  T
Q  235 ataattaattaaattgtatt-aaaaattaaccaacaagctcgacaaatgattcttgaattgttcatgctaattagattattttgtc 319  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14481122 ataattaattgaattgtattaaaaaaaaaaccaacaagctcgacaaatgattcttgaattgttcatgctaattagattattgtgtc 14481207  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 179 - 319
Target Start/End: Original strand, 491754 - 491893
Alignment:
Q  179 atcatcaccatcaatgatatttctttgtctttatctcatatactcatannnnnnnaataattaattaaattgtattaaaaattaaccaacaagctcgaca 278  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  491754 atcatcaccatcaatgacatttctttgtctttatctcatatactcatatttttttaataattaattaaattgtattaaaaaa-aaccaacaagctcgaca 491852  T
Q  279 aatgattcttgaattgttcatgctaattagattattttgtc 319  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  491853 aatgattcttgaattgtttatgctaattagattattgtgtc 491893  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 352 - 429
Target Start/End: Original strand, 14481201 - 14481278
Alignment:
Q  352 ttgtgtcttatgtttaactgaattatgatttatcatgattttataaaaattataaagtttgagtttgtgcttatggcc 429  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14481201 ttgtgtctcatgtttaactgaattaagatttatcatgattttataaaaattataaagtttgagtttgtgcttatggcc 14481278  T

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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 186
Target Start/End: Original strand, 491057 - 491252
Alignment:
Q  11 aatatctatcatcattaatttataatcgaacattccatttttatttctccaaatttatttgttcctctgttttatttc------------------ccca 92  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||                  ||||    
T  491057 aatatctatcatcattaatttataatcaaacattccatttttatttcctcaaatttatttgttcctcttttttatttccccatatttatatattttccca 491156  T
Q  93 gatatctat--aatcatactcaaacttcttttctaaannnnnnnataaaatgaatggttgaactcatatccatatggttgtttgagtcatcatcac 186  Q
    ||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||       ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||    
T  491157 gatttctataaaatcatactcaaacttattttctaaacttttttataaaatgaatggttgaactcatatacctatgattgtttgagtcatcatcac 491252  T

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Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 92
Target Start/End: Original strand, 14480891 - 14480972
Alignment:
Q  11 aatatctatcatcattaatttataatcgaacattccatttttatttctccaaatttatttgttcctctgttttatttcccca 92  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  14480891 aatatctatcatcattaatttataatcaaacattccatttttatttcctcaaatttatttgttccttttttttatttcccca 14480972  T

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Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 92
Target Start/End: Original strand, 15915226 - 15915307
Alignment:
Q  11 aatatctatcatcattaatttataatcgaacattccatttttatttctccaaatttatttgttcctctgttttatttcccca 92  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  15915226 aatatctatcatcattaatttataatcaaacattccatttttatttcctcaaatttatttgttcctcttttttattttccca 15915307  T

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Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 12 - 68
Target Start/End: Original strand, 15883309 - 15883365
Alignment:
Q  12 atatctatcatcattaatttataatcgaacattccatttttatttctccaaatttat 68  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15883309 atatctatcatcattaatttataatcaaacattccatttttatttccccaaatttat 15883365  T

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Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 386 - 429
Target Start/End: Original strand, 491912 - 491955
Alignment:
Q  386 atgattttataaaaattataaagtttgagtttgtgcttatggcc 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  491912 atgattttataaaaattataaagtttgagtttgtgcttatggcc 491955  T

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Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 159
Target Start/End: Original strand, 15915322 - 15915392
Alignment:
Q  89 cccagatatctataatcatactcaaacttcttttctaaannnnnnnataaaatgaatggttgaactcatat 159  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||       || ||||||||||||||||||||||    
T  15915322 cccagatttctataatcatactcaaacttcttttctaaacttttttatgaaatgaatggttgaactcatat 15915392  T

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Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 354 - 426
Target Start/End: Original strand, 36038331 - 36038403
Alignment:
Q  354 gtgtcttatgtttaactgaattatgatttatcatgattttataaaaattataaagtttgagtttgtgcttatg 426  Q
    |||||| || ||||||| |||||  ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  36038331 gtgtctcatatttaactaaattaaaatttatcatcaatttataaaaattatagagtttgagtccgtgcttatg 36038403  T

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Target: chr7 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 9)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 11 - 429
Target Start/End: Original strand, 36783901 - 36784336
Alignment:
Q  11 aatatctatcatcattaatttataatcgaacattccatttttatttctccaaatttatttgttcctctgttttatttcccca------------------ 92  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||                      
T  36783901 aatatctatcatcattaatttataatcaaacattccatttttatttctccaaatttatttgttcctcttttttattttcccaaatttataaattttccca 36784000  T
Q  93 gatatctataatcatactcaaacttcttttctaaannnnnnnataaaatgaatggttgaactcatatccatatggttgtttgagtcatcatcaccatcaa 192  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36784001 gatttctataatcattctcaaacttcttttctaaacttttttataaaatgaatggttgaactcatatacttatggttgtttgagtcatcatcaccatcaa 36784100  T
Q  193 tgatatttctttgtctttatctcatatactcatannnnnnnaataattaattaaattgtattaaaaattaaccaacaagctcgacaaatgattcttgaat 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36784101 tgatatttctttgtctttatctcatatactcatatttttttaataattaattaaattgtattaaaaa-aaaccaacaagctcgacaaatgattcttgaat 36784199  T
Q  293 tgttcatgctaattagattattttgtcactcataggtctaannnnnnnnagaggactcgttgtgtcttatgtttaactgaattatgatttatcatgattt 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36784200 tgttcatgctaattagattattttgtcactcataggtctaattttttttagaggattcgttgtgtctcatgtttaactgaattaagatttatcatgattt 36784299  T
Q  393 tataaaaattataaagtttgagtttgtgcttatggcc 429  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36784300 tataaaatttataaagtttgagtttgtgcttatggcc 36784336  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 12 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 42489884 - 42489448
Alignment:
Q  12 atatctatcatcattaatttataatcgaacattccatttttatttctccaaatttatttgttcctctgttttatttcccca------------------g 93  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||                  |    
T  42489884 atatctatcattattaatttataatcaaacattccatttttatttccccaaatttatttgttcctcttttttatttccccaaatttataaattttcctag 42489785  T
Q  94 atatctataatcatactcaaacttcttttctaaannnnnnnataaaatgaatggttgaactcatatccatatggttgtttgagtcatcatcaccatcaat 193  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||       ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42489784 atttctataatcatactcaaactttttttctaaacttttttataaaatgaatggttgaactcatatacctatggttgtttgagtcatcatcaccatcaat 42489685  T
Q  194 gatatttctttgtctttatctcatatactcatannnnnnnaataattaattaaattgtattaaaaattaaccaacaagctcgacaaatgattcttgaatt 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42489684 gatatttctttgtctttatctcatatactcatatttttttaataattaattaaattgtattagaaaaaaaccaacaagctcgacaaatgattcttgaatt 42489585  T
Q  294 gttcatgctaattagattattttgtcactcataggtctaa-nnnnnnnnagaggactcgttgtgtcttatgtttaactgaattatgatttatcatgattt 392  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||         |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42489584 gttcatgctaattagattattttttcactcataggtctaatgtttttttagaggactcgttgtgtctcatgtttaactgaattaagatttatcatgattt 42489485  T
Q  393 tataaaaattataaagtttgagtttgtgcttatggcc 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42489484 tataaaaattataaagtttgagtttgtgcttatggcc 42489448  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 12 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 24307019 - 24306583
Alignment:
Q  12 atatctatcatcattaatttataatcgaacattccatttttatttctccaaatttatttgttcctctgttttatttc------------------cccag 93  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||                  |||||    
T  24307019 atatctatcattattaatttataatcaaacattccatttttatttccccaaatttatttgttcttcttttttatttctccaaatttataaattttcccag 24306920  T
Q  94 atatctataatcatactcaaacttcttttctaaannnnnnnataaaatgaatggttgaactcatatccatatggttgtttgagtcatcatcaccatcaat 193  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||       ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24306919 atttctataatcatactcaaactttttttctaaacttttttataaaatgaatggttgaactcatatacctatggttgtttgagtcatcatcaccatcaat 24306820  T
Q  194 gatatttctttgtctttatctcatatactcatannnnnnnaataattaattaaattgtattaaaaattaaccaacaagctcgacaaatgattcttgaatt 293  Q
    ||| ||| ||| |||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24306819 gatttttatttttctttatctcatatactcatatttttttaataattaattaaattgtattaaaaaaaaaccaacaagctcgacaaatgattcttgaatt 24306720  T
Q  294 gttcatgctaattagattattttgtcactcataggtctaa-nnnnnnnnagaggactcgttgtgtcttatgtttaactgaattatgatttatcatgattt 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24306719 gttcatgctaattagattattttgtcactcataggtctaatgtttttttagaggactcgttgtgtctcatgtttaactgaattaagatttatcatgattt 24306620  T
Q  393 tataaaaattataaagtttgagtttgtgcttatggcc 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24306619 tataaaaattataaagtttgagtttgtgcttatggcc 24306583  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 11 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 30002471 - 30002037
Alignment:
Q  11 aatatctatcatcattaatttataatcgaacattccatttttatttctccaaatttatttgttcctctgttttatttcccca------------------ 92  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||                      
T  30002471 aatatctatcatcattaatttataatcaaacatttcatttttatttccccaaatttatttgttcctcttttttatttccccaaatttataaattttctca 30002372  T
Q  93 gatatctataatcatactcaaacttcttttctaaannnnnnnataaaatgaatggttgaactcatatccatatggttgtttgagtcatcatcaccatcaa 192  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30002371 gatttctataatcatactcaaacttcttttctaaacttttttataaaatgaatggtttaactcatatacctatggttgtttgagttatcatcaccatcaa 30002272  T
Q  193 tgatatttctttgtctttatctcatatactcatannnnnnnaataattaattaaattgtattaaaaattaaccaacaagctcgacaaatgattcttgaat 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||| | | | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30002271 tgatatttctttgtctttatctcatatactcatatttttttaataattaattaaattgtattaaacaat-atcaacaagctcgacaaatgattcttgaat 30002173  T
Q  293 tgttcatgctaattagattattttgtcactcataggtctaannnnnnnnagaggactcgttgtgtcttatgtttaactgaattatgatttatcatgattt 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  30002172 tgttcatgctaattagattattttgtcactcataggtctaa-tttttttagaggactccttgtgtctcatgtttaacttaattaagatttatcatgattt 30002074  T
Q  393 tataaaaattataaagtttgagtttgtgcttatggcc 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30002073 tataaaaattataaagtttgagtttgtgcttatggcc 30002037  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 11 - 429
Target Start/End: Original strand, 30468835 - 30469259
Alignment:
Q  11 aatatctatcatcattaatttataatcgaacattccatttttatttctccaaatttatttgttcctctgttttatttcccca------------------ 92  Q
    ||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||                      
T  30468835 aatatctatcatcattaatttatca---aacattccatttttatttccccaaatttatttgttgctcttttttatttccccaaatttataaattttccca 30468931  T
Q  93 gatatctataatcatactcaaacttcttttctaaannnnnnnataaaatgaatggttgaactcatatccatatggttgtttgagtcatcatcaccatcaa 192  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30468932 gatttctataatcatactcaaacttcttttctaaacttttttataaaatgaatggttgaactcatatagctatggttgtttgagtcatcatcaccatcaa 30469031  T
Q  193 tgatatttctttgtctttatctcatatactcatannnnnnnaataattaattaaattgtattaaaaattaaccaacaagctcgacaaatgattcttgaat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |  |        ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30469032 tgatatttctttgtctttatctcatattttttt--------aataattaattaaattgtattaaaaa-aaaccaacaagctcgacaaatgattcttgaat 30469122  T
Q  293 tgttcatgctaattagattattttgtcactcataggtctaannnnnnnnagaggactcgttgtgtcttatgtttaactgaattatgatttatcatgattt 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30469123 tgttcatgctaattagattattttgtcactcataggtctaattttttttagaggactcgttgtgtctcatgtttaactgaattaagatttatcatgattt 30469222  T
Q  393 tataaaaattataaagtttgagtttgtgcttatggcc 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30469223 tataaaaattataaagtttgagtttgtgcttatggcc 30469259  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 84 - 429
Target Start/End: Original strand, 32022137 - 32022483
Alignment:
Q  84 atttccccagatatctataatcatactcaaacttcttttctaaannnnnnnataaaatgaatggttgaactcatatccatatggttgtttgagtcatcat 183  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||       ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  32022137 attttcccagatttctataatcatactcaaactttttttctaaacttttttataaaatgaatggttgaactcatacacctatggttgtttgagtcatcat 32022236  T
Q  184 caccatcaatgatatttctttgtctttatctcatatactcatannnnnnnaataattaattaaattgtatt-aaaaattaaccaacaagctcgacaaatg 282  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||| |||| |||||  ||| |||||||||||||||||    
T  32022237 caccatcaatgatatttccctgtctttatctcatatactcatatttttttaataattaattaaattatattaaaaaaaaaactaacaagctcgacaaatg 32022336  T
Q  283 attcttgaattgttcatgctaattagattattttgtcactcataggtctaannnnnnnnagaggactcgttgtgtcttatgtttaactgaattatgattt 382  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||        |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  32022337 attcttgaattgttcatgctaattagattattttgtcacttataggtctaattttttttagaggactcgttgtgtctcatgtttaactgaattaagattt 32022436  T
Q  383 atcatgattttataaaaattataaagtttgagtttgtgcttatggcc 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32022437 atcatgattttataaaaattataaagtttgagtttgtgcttatggcc 32022483  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 190 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 26928966 - 26928728
Alignment:
Q  190 caatgatatttctttgtctttatctcatatactcatannnnnnnaataattaattaaattgtattaaaaattaaccaacaagctcgacaaatgattcttg 289  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26928966 caatgatatttctttgtctttatttcatatactcatatttttttaataattaattaaattgtattaaaaa--aaccaacaagctcgacaaatgattcttg 26928869  T
Q  290 aattgttcatgctaattagattattttgtcactcataggtctaa-nnnnnnnnagaggactcgttgtgtcttatgtttaactgaattatgatttatcatg 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  26928868 aattgttcatgctaattagattattttgtcactcataggtctaatgtttttttagaggactcgttgtgtctcatgtttaactgaattaagatttatcatg 26928769  T
Q  389 attttataaaaattataaagtttgagtttgtgcttatggcc 429  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26928768 attttataaaaattataaaatttgagtttgtgcttatggcc 26928728  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 37706235 - 37706154
Alignment:
Q  11 aatatctatcatcattaatttataatcgaacattccatttttatttctccaaatttatttgttcctctgttttatttcccca 92  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37706235 aataactatcattattaatttataatcaaacattccatttttatttccccaaatttatttgttcctcttttttatttcccca 37706154  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 39 - 90
Target Start/End: Original strand, 32022074 - 32022125
Alignment:
Q  39 aacattccatttttatttctccaaatttatttgttcctctgttttatttccc 90  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32022074 aacattccatttttatttccccaaatttatttgttcctcttttttatttccc 32022125  T

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Target: chr2 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 10)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 12 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 2054993 - 2054589
Alignment:
Q  12 atatctatcatcattaatttataatcgaacattccatttttatttctccaaatttatttgttcctctgttttatttccccagatatctataatcatactc 111  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  2054993 atatctatcattattaatttataatcaaacattccatttttatttccccaaatttatttgttcctcttttttattttcccagatttctataatcatactc 2054894  T
Q  112 aaacttcttttctaaannnnnnnataaaatgaatggttgaactcatatccatatggttgtttgagtcatcatcaccatcaatgatatttctttgtcttta 211  Q
    |||||| |||             |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2054893 aaactttttt-------------ataaaatgaatggttgaactcatatatctatggttgtttgagtcatcatcaccatcaatgatatttatttgtcttta 2054807  T
Q  212 tctcatatactcatannnnnnnaataattaattaaattgtattaaaaattaaccaacaagctcgacaaatgattcttgaattgttcatgctaattagatt 311  Q
    |||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2054806 tctcatatactcatatttttttaataattaattaaattgtattaaaaa-aaaccaacaagctcgacaaatgattcttgaattgttcatgctaattagatt 2054708  T
Q  312 attttgtcactcataggtctaa-nnnnnnnnagaggactcgttgtgtcttatgtttaactgaattatgatttatcatgattttataaaaattataaagtt 410  Q
    ||||||||||||| ||||||||         |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2054707 attttgtcactcagaggtctaatgtttttttagaggactcgttgtgtctcatgtttaactgaattaagatttatcatgattttataaaaattataaagtt 2054608  T
Q  411 tgagtttgtgcttatggcc 429  Q
    |||||||||||||||||||    
T  2054607 tgagtttgtgcttatggcc 2054589  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 11 - 429
Target Start/End: Original strand, 37875533 - 37875969
Alignment:
Q  11 aatatctatcatcattaatttataatcgaacattccatttttatttctccaaatttatttgttcctctgttttatttcccca------------------ 92  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||                      
T  37875533 aatatctatcatcattaatttataatcaaacattccatttttatttcctaaaatttatttgttcctcttttttatttccccaaatttataaattttttca 37875632  T
Q  93 gatatctataatcatactcaaacttcttttctaaannnnnnnataaaatgaatggttgaactcatatccatatggttgtttgagtcatcatcaccatcaa 192  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37875633 gatttctataatcatactcaaacttcttttctaaacttttttataaaatgaatggttgaactcatatacctatggttgtttgagtcatcatcaccatcaa 37875732  T
Q  193 tgatatttctttgtctttatctcatatactcatannnnnnnaataattaattaaattgtattaaaaattaaccaacaagctcgacaaatgattcttgaat 292  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||       |||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37875733 tgatatttcttagtctttatctcatatactcatatttttttaataatgaattaaattgtattaaaaaaaaaccaacaagctcgacaaatgattcttgaat 37875832  T
Q  293 tgttcatgctaattagattattttgtcactcataggtctaannnnnnnnagaggactcgttgtgtcttatgtttaactgaattatgatttatcatgattt 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37875833 tgttcatgctaattagattattttgtcactcataggtctaattttttttagaggactcattgtgtctcatgtttaactgaattaagatttatcatgattt 37875932  T
Q  393 tataaaaattataaagtttgagtttgtgcttatggcc 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37875933 tataaaaattataaagtttgagtttgtgcttatggcc 37875969  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 11 - 429
Target Start/End: Original strand, 34452392 - 34452827
Alignment:
Q  11 aatatctatcatcattaatttataatcgaacattccatttttatttctccaaatttatttgttcctctgttttatttcccca------------------ 92  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||                      
T  34452392 aatatctatcatcattaatttataatcaaacattccatttttatttccccaaatttatttgttcctcttttttatttccccaaatttataaattttccca 34452491  T
Q  93 gatatctataatcatactcaaacttcttttctaaannnnnnnataaaatgaatggttgaactcatatccatatggttgtttgagtcatcatcaccatcaa 192  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||       || |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34452492 gatttctataatcatactcaaacttcttttctaaacttttttatgaaatgaatggttgaactcatatacctatggttgtttgagtcatcatcaccatcaa 34452591  T
Q  193 tgatatttctttgtctttatctcatatactcatannnnnnnaataattaattaaattgtattaaaaattaaccaacaagctcgacaaatgattcttgaat 292  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  34452592 tgatatttctttgtctttatcttatatactcatatttttttaataattaattaaattgtattaaaaa-aaatcaacaagattgacaaatgattcttgaat 34452690  T
Q  293 tgttcatgctaattagattattttgtcactcataggtctaannnnnnnnagaggactcgttgtgtcttatgtttaactgaattatgatttatcatgattt 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||| |||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34452691 tgttcatgctaattagattattttgtcactcataggtctaattttttttagaagactcgttgtgtatcatgtttaactgaattaagatttatcatgattt 34452790  T
Q  393 tataaaaattataaagtttgagtttgtgcttatggcc 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34452791 tataaaaattataaagtttgagtttgtgcttatggcc 34452827  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 12 - 429
Target Start/End: Original strand, 8043185 - 8043617
Alignment:
Q  12 atatctatcatcattaatttataatcgaacattccatttttatttctccaaatttatttgttcctctgttttatttccccagatat-------------- 97  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |                  
T  8043185 atatctatcattattaatttataatcaaacattccatttttatttccccaaatttatttgttcctcttttttatttccccaaatttataaattttcccat 8043284  T
Q  98 ----ctataatcatactcaaacttcttttctaaannnnnnnataaaatgaatggttgaactcatatccatatggttgtttgagtcatcatcaccatcaat 193  Q
        |||||||||||||||||||| |||||||||       |||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8043285 atttctataatcatactcaaactttttttctaaacttttttataaaatgaatgattgaactcatatacctatggttgtttgagtcatcatcaccatcaat 8043384  T
Q  194 gatatttctttgtctttatctcatatactcatannnnnnnaataattaattaaattgtattaaaaattaaccaacaagctcgacaaatgattcttgaatt 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||       ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8043385 gatatttctttgtctttatctcatatattcatatttttt-aataattaattaaattgtattaaaaaaaaaccaacaagctcgacaaatgattcttgaatt 8043483  T
Q  294 gttcatgctaattagattattttgtcactcataggtctaa-nnnnnnnnagaggactcgttgtgtcttatgtttaactgaattatgatttatcatgattt 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| |  |    
T  8043484 gttcatgctaattagattattttgtcactcataggtctaatgtttttttagaggactcgttgtgtctcatgtttaactgaattaaga-ttatcataa--t 8043580  T
Q  393 tataaaaattataaagtttgagtttgtgcttatggcc 429  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8043581 tatgaaaattataaagtttgagtttgtgcttatggcc 8043617  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 11 - 425
Target Start/End: Original strand, 863348 - 863779
Alignment:
Q  11 aatatctatcatcattaatttataatcgaacattccatttttatttctccaaatttatttgttcctctgttttatttccccagatat------------- 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || |                 
T  863348 aatatctatcatcattaatttataatcaaacattccatttttatttcctcaattttatttgttcctcttttttatttccccaaatttataaattttctca 863447  T
Q  98 -----ctataatcatactcaaacttcttttctaaannnnnnnataaaatgaatggttgaactcatatccatatggttgtttgagtcatcatcaccatcaa 192  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||| ||| ||||||||||   |||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  863448 tatttctataatcatactcaaacttcttttctaaatgtttttataaaatgaagggtagaactcatatatctatggttgtttgagtcattatcactatcaa 863547  T
Q  193 tgatatttctttgtctttatctcatatactcatannnnnnnaataattaattaaattgtatt-aaaaattaaccaacaagctcgacaaatgattcttgaa 291  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  863548 tgatatttctttgtctttatctcatatactcatttttttttaataattaattaaattgtattaaaaaaaaaacaaacaagctcgactaatgattcttgaa 863647  T
Q  292 ttgttcatgctaattagattattttgtcactcataggtctaannnnnnnnagaggactcgttgtgtcttatgtttaactgaattatgatttatcatgatt 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||  ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  863648 ttgttcatgctaattagattattttgtcactcataggtctaa-tttttttaga-cactcgttgtgtctcatgtttaactgaattaagatttatcatgatt 863745  T
Q  392 ttataaaaattataaagtttgagtttgtgcttat 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  863746 ttataaaaattataaagtttgagtttgtgcttat 863779  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 12 - 429
Target Start/End: Original strand, 36150479 - 36150917
Alignment:
Q  12 atatctatcatcattaatttataatcgaacattccatttttatttctccaaatttatttgttcctctgttttatttccccagatat-------------- 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || |                  
T  36150479 atatctatcatcattaatttataatcaaacattccatttttatttccccaaatttatttgttcctcttttttacttccccaaatttataaattttcccat 36150578  T
Q  98 ----ctataatcatactcaaacttcttttctaaannnnnnnataaaatgaatggttgaactcatatccatatggttgtttgagtcatcatcaccatcaat 193  Q
        ||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36150579 atttctataatcatactcaaacttcttttctaaacttttttataaaatgaatggtagaactcatatacctatggttgtttgagt-atcatcaccatcaat 36150677  T
Q  194 gatatttctttgtctttatctcatata--ctcatannnnnnnaataattaattaaattgtattaaaaattaaccaacaagctcgacaaatgattcttgaa 291  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||       ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36150678 gatatttctttgtctttatctcatatatactcatatttttttaataattaattaaattgtattaaaaaa-aaccaacaagctcgactaatgattcttgaa 36150776  T
Q  292 ttgttcatgctaattagattattttgtcactcataggtctaannnnnnnnagaggactcgttgtgtcttatgtttaactgaattatgatt----tatcat 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||        ||||||||| | |||||| || ||||||||||||| ||||    ||||||    
T  36150777 ttgttcatgctaattagattattttatcactcataggtttaa-tttttttagaggactcatcgtgtctcatatttaactgaattaagatttatatatcat 36150875  T
Q  388 gattttataaaaattataaagtttgagtttgtgcttatggcc 429  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36150876 gattttataaaaatcataaagtttgagtttgtgcttatggcc 36150917  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 27006295 - 27006070
Alignment:
Q  12 atatctatcatcattaatttataatcgaacattccatttttatttctccaaatttatttgttcctctgttttatttc------------------cccag 93  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||                  |||||    
T  27006295 atatttatcatcattaatttataatgaaacattccatttttatttccccaaatttatttgttcctcttttttatttccccaaatttataaattttcccag 27006196  T
Q  94 atatctataatcatactcaaacttcttttctaaa-nnnnnnnataaaatgaatggttgaactcatatccatatggttgtttgagtcatcatcaccatcaa 192  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||  ||||| |||  | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27006195 atttttataatcatactcaaacttcttttctaaactttttttataaaatgaatggcagaactaata--cctatggttgcttgagtcatcatcaccatcaa 27006098  T
Q  193 tgatatttctttgtc-tttatctcatat 219  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27006097 tgatatttctttgtcttttatctcatat 27006070  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 344 - 426
Target Start/End: Original strand, 7486627 - 7486709
Alignment:
Q  344 aggactcgttgtgtcttatgtttaactgaattatgatttatcatgattttataaaaattataaagtttgagtttgtgcttatg 426  Q
    ||||||| | |||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  7486627 aggactcatcgtgtctcatgtttaactgaattaagctttatcatgtttttataaaaattaaaaagttcgagtttgtacttatg 7486709  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 364 - 429
Target Start/End: Original strand, 7498063 - 7498128
Alignment:
Q  364 tttaactgaattatgatttatcatgattttataaaaattataaagtttgagtttgtgcttatggcc 429  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||    
T  7498063 tttaactgaattaagctttatcatgtttttataaaaattaaaaagttcgagtttgtacttatggcc 7498128  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 279 - 327
Target Start/End: Original strand, 7486563 - 7486611
Alignment:
Q  279 aatgattcttgaattgttcatgctaattagattattttgtcactcatag 327  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||    
T  7486563 aatgattcttgtattgtccatgccagttagattattttggcactcatag 7486611  T

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Target: chr4 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 8)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 11 - 429
Target Start/End: Original strand, 36855051 - 36855487
Alignment:
Q  11 aatatctatcatcattaatttataatcgaacattccatttttatttctccaaatttatttgttcctctgttttatttcccca------------------ 92  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||                      
T  36855051 aatatctatcatcattaatttataatcaaacattccatttttatttcctcaaatttatttgttcctcttttttatttccccaaatttataaattttttca 36855150  T
Q  93 gatatctataatcatactcaaacttcttttctaaannnnnnnataaaatgaatggttgaactcatatccatatggttgtttgagtcatcatcaccatcaa 192  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36855151 gatttctataatcatactcaaacttcttttctaaacttttttataaaatgaatggttgaactcgtatacctatggttgtttgagtcatcatcaccatcaa 36855250  T
Q  193 tgatatttctttgtctttatctcatatactcatannnnnnnaataattaattaaattgtattaaaaattaaccaacaagctcgacaaatgattcttgaat 292  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||       |||||| ||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36855251 tgatatttcttagtctttatctcatatactcatatttttttaataatgaattaaattatattaaaaaaaaaccaacaagctcgacaaatgattcttgaat 36855350  T
Q  293 tgttcatgctaattagattattttgtcactcataggtctaannnnnnnnagaggactcgttgtgtcttatgtttaactgaattatgatttatcatgattt 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36855351 tgttcatgctaattagattattttgtcactcataggtctaattttttttagaggactcgttgtgtctcatgtttaactgaattaagatttatcatgattt 36855450  T
Q  393 tataaaaattataaagtttgagtttgtgcttatggcc 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36855451 tataaaaattataaagtttgagtttgtgcttatggcc 36855487  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 11 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 12835089 - 12834653
Alignment:
Q  11 aatatctatcatcattaatttataatcgaacattccatttttatttctccaaatttatttgttcctctgttttatttcccca------------------ 92  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||                      
T  12835089 aatatctatcatcattaatttataatcaaacattccatttttatttccccaaatttatttgttcctcttttttatttccccaaatttataaattttccca 12834990  T
Q  93 gatatctataatcatactcaaacttcttttctaaannnnnnnataaaatgaatggttgaactcatatccatatggttgtttgagtcatcatcaccatcaa 192  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||       || |||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  12834989 gatttctataatcatactcaaacttcttttctaaacttttttatgaaatgaatggttgaactcatatacctatagttgtttgagtcatcatcactatcaa 12834890  T
Q  193 tgatatttctttgtctttatctcatatactcatannnnnnnaataattaattaaattgtattaaaaattaaccaacaagctcgacaaatgattcttgaat 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  12834889 tgatatttctttgtctttatctcatatactcatatttttttaataattaattaaattgtattaaaaa-aaatcaacaagattgacaaatgattcttgaat 12834791  T
Q  293 tgttcatgctaattagattattttgtcactcataggtctaannnnnnnnagaggactcgttgtgtcttatgtttaactgaattatgatttatcatgattt 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||        |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12834790 tgttcatgctaattagattattttgtcactcatatgtctaattttttttagaggactcgttgtgtctcatgtttaactgaattaagatttatcatgattt 12834691  T
Q  393 tat-aaaaattataaagtttgagtttgtgcttatggcc 429  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12834690 tataaaaaattataaagtttgagtttgtgcttatggcc 12834653  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 12 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 42419622 - 42419219
Alignment:
Q  12 atatctatcatcattaatttataatcgaacattccatttttatttctccaaatttatttgttcctctgttttatttccccagatatctataatcatactc 111  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||               |||| |||| || |||||||||||||||    
T  42419622 atatctatcattattaatttataatcaaacattccatttttatttccccaaatttataa-------------attttccca-atttctataatcatactc 42419537  T
Q  112 aaacttcttttctaaannnnnnnataaaatgaatggttgaactcatatccatatggttgtttgagtcatcatcaccatcaatgatatttctttgtcttta 211  Q
    |||||| |||||||||       ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42419536 aaactttttttctaaacttttttataaaatgaatggttgaactcatatacctatggttgtttgagtcatcatcaccatcaatgatatttctttgtcttta 42419437  T
Q  212 tctcatatactcatannnnnnnaataattaattaaattgtattaaaaattaaccaacaagctcgacaaatgattcttgaattgttcatgctaattagatt 311  Q
    |||||||||||||||       ||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42419436 tctcatatactcatatttttttaataattaagtaaattgtattaaaaa-aaatcaacaagttcgacaaatgattcttgaattgttcatgctaattagatt 42419338  T
Q  312 attttgtcactcataggtctaa-nnnnnnnnagaggactcgttgtgtcttatgtttaactgaattatgatttatcatgattttataaaaattataaagtt 410  Q
    ||||||||||||| ||||||||         |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42419337 attttgtcactcaaaggtctaatgtttttttagaggactcgttgtgtctcatgtttaactgaattaagatttatcatgattttataaaaattataaagtt 42419238  T
Q  411 tgagtttgtgcttatggcc 429  Q
    |||||||||||||||||||    
T  42419237 tgagtttgtgcttatggcc 42419219  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 11 - 429
Target Start/End: Original strand, 19549604 - 19550046
Alignment:
Q  11 aatatctatcatcattaatttataatcgaacattccatttttatttctccaaatttatttgttcctctgttttatttcccca------------------ 92  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||                      
T  19549604 aatatctatcatcattaatttataatcaaacattccatttttatttccccaaatttatttgttcctcttttttatttcctcaaatttataaattttctca 19549703  T
Q  93 gatatctataatcatactcaaacttcttttctaaannnnnnnataaaatgaatggttgaactcatatccatatggttgtttgagtcatcatcaccatcaa 192  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||       ||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  19549704 gatttctataatcatattcaaacttcttttttaaacttttttataaaatgaatggttgaactcatatacctatgattgtttgagtcatgatcaccatcaa 19549803  T
Q  193 tgatatttctttgtctttatctcatatactcatannnnnnnaataattaattaaattgtattaaaaattaaccaacaagctcgacaaatgattcttgaat 292  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||       |||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  19549804 tgatatttcttttcctttatctcatatactcatatttttttaataattaatgaaattgtattaaaaa-aaacaaacaagctcgacaaatggttcttgaat 19549902  T
Q  293 tgttcatgctaattagattattttgtcactcataggtctaannnnnnnnagaggactcgttgtgtcttatgtttaactg-------aattatgatttatc 385  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||| |||||||||||       ||||||||||||||    
T  19549903 tgttcatgctaattagattattttgtcactcataggtctaattttttttagaggactcgttgtgtctcatgtttaactgaattatcaattatgatttatc 19550002  T
Q  386 atgattttataaaaattataaagtttgagtttgtgcttatggcc 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19550003 atgattttataaaaattataaagtttgagtttgtgcttatggcc 19550046  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 11 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 50696839 - 50696418
Alignment:
Q  11 aatatctatcatcattaatttataatcgaacattccatttttatttctccaaatttatttgttcctctgttttatttcccc------------------a 92  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||                  |    
T  50696839 aatatctatgatcattaatttataatcaaacattccatttttatttccccaaatttatttgttcctcttttttatttccccaaatttataaattttccca 50696740  T
Q  93 gatatctataatcatactcaaacttcttttctaaannnnnnnataaaatgaatggttgaactcatatccatatggttgtttgagtcatcatcaccatcaa 192  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||               | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50696739 gatttctataatcatactcaaacttcttttctaaacttttttataaaatgaata--------------cctatggttgtttgagtcatcatcaccatcaa 50696654  T
Q  193 tgatatttctttgtctttatctcatatactcatannnnnnnaataattaattaaattgtattaaaaattaaccaacaagctcgacaaatgattcttgaat 292  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  50696653 tgatatttctttgtctttatatcatatactcatatttttt-aataattaattaaattgtattaaaaaaagaccaacaagctcgacaaataattcttgaat 50696555  T
Q  293 tgttcatgctaattagattattttgtcactcataggtctaannnnnnnnagaggactcgttgtgtcttatgtttaactgaattatgatttatcatgattt 392  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  50696554 tgttcatgccaattagattattttgtcactcataggtctaattttttttagaggactcgttgtgtctcatgtttaattgaattaagatttatcatgattt 50696455  T
Q  393 tataaaaattataaagtttgagtttgtgcttatggcc 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50696454 tataaaaattataaagtttgagtttgtgcttatggcc 50696418  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 12 - 429
Target Start/End: Original strand, 25478216 - 25478618
Alignment:
Q  12 atatctatcatcattaatttataatcgaacattccatttttatttctccaaatttatttgttcctctgttttatttccccagatatctataatcatactc 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||               |||| |||| || |||||||||||||||    
T  25478216 atatctatcatcattaatttataatcaaacattccatttttatttccccaaatttataa-------------attttcccatatttctataatcatactc 25478302  T
Q  112 aaacttcttttctaaannnnnnn-ataaaatgaatggttgaactcatatccatatggttgtttgagtcatcatcaccatcaatgatatttctttgtcttt 210  Q
    ||||||||||||||||        |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  25478303 aaacttcttttctaaagtttttttataaaatgaatggtagaactcatatacatatggttgtttgagtcatcatcaccatcaatgatatttctttgttttt 25478402  T
Q  211 atctcatatactcatannnnnnnaataattaattaaattgtattaaaaattaaccaacaagctcgacaaatgattcttgaattgttcatgctaattagat 310  Q
    ||||| |||||||||        ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25478403 atctcttatactcat-tttttttaattattaattaaattgtattaaaaaa-aaccaacaagctcgactaatgattcttgaattgttcatgctaattagat 25478500  T
Q  311 tattttgtcactcataggtctaannnnnnnnagaggactcgttgtgtcttatgtttaactgaattatgatttatcatgattttataaaaattataaagtt 410  Q
    ||||||||||||||||||| |||        ||||||||| |  ||| | || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25478501 tattttgtcactcataggtttaa-tttttttagaggactcatcatgtttcatatttaactgaattaagatttatcatgattttataaaaattataaagtt 25478599  T
Q  411 tgagtttgtgcttatggcc 429  Q
    |||||||||||||||||||    
T  25478600 tgagtttgtgcttatggcc 25478618  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 11 - 331
Target Start/End: Original strand, 18032899 - 18033236
Alignment:
Q  11 aatatctatcatcattaatttataatcgaacattccatttttatttctccaaatttatttgttcctctgttttatttcccca------------------ 92  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||                      
T  18032899 aatatctatcatcattaatttataatcaaacattccatttttatttcctaaaatttatttgttcctcttttttatttccccaaatttataaattttttca 18032998  T
Q  93 gatatctataatcatactcaaacttcttttctaaannnnnnnataaaatgaatggttgaactcatatccatatggttgtttgagtcatcatcaccatcaa 192  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18032999 gatttctataatcatactcaaacttcttttctaaacttttttataaaatgaatggttgaactcatatacctatggttgtttgagtcatcatcaccatcaa 18033098  T
Q  193 tgatatttctttgtctttatctcatatactcatannnnnnnaataattaattaaattgtattaaaaattaaccaacaagctcgacaaatgattcttgaat 292  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||       |||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18033099 tgatatttcttagtctttatctcatatacncata-ttttttaataatgaattaaattgtattaaaaaaaaaccaacaagctcgacaaatgattcttgaat 18033197  T
Q  293 tgttcatgctaattagattattttgtcactcataggtct 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18033198 tgttcatgctaattagattattttgtcactcataggtct 18033236  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 12 - 74
Target Start/End: Original strand, 6784984 - 6785046
Alignment:
Q  12 atatctatcatcattaatttataatcgaacattccatttttatttctccaaatttatttgttc 74  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6784984 atatctatcattattaatttataatcaaacattccatttttatttccccaaatttatttgttc 6785046  T

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Target: chr1 (Bit Score: 248; Significance: 1e-137; HSPs: 11)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 11 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 51661270 - 51660835
Alignment:
Q  11 aatatctatcatcattaatttataatcgaacattccatttttatttctccaaatttatttgttcctctgttttatttcccca------------------ 92  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||                      
T  51661270 aatatctatcatcattaatttataatcaaacattccatttttatttccccaagtttatttgttcctcttttttattttcccaaatttataaattttccca 51661171  T
Q  93 gatatctataatcatactcaaacttcttttctaaannnnnnnataaaatgaatggttgaactcatatccatatggttgtttgagtcatcatcaccatcaa 192  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||       ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51661170 gatttctataatcatactcaaacttcttttttaaacttttttataaaatgaatggttgaactcatatacctatggttgtttgagtcatcatcaccatcaa 51661071  T
Q  193 tgatatttctttgtctttatctcatatactcatannnnnnnaataattaattaaattgtattaaaaattaaccaacaagctcgacaaatgattcttgaat 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  51661070 tgatatttctttgtctttatctcatatactcatatttttttaataattaattaaattgtattaaaaa-aaaccaacaagctcgacaaatgattattgaat 51660972  T
Q  293 tgttcatgctaattagattattttgtcactcataggtctaannnnnnnnagaggactcgttgtgtcttatgtttaactgaattatgatttatcatgattt 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  51660971 tgttcatgctaattagattattttgtcactcataggtctaattttttttagaggactcgttgtgtctcatgtttaactaaattaagatttatcatgattt 51660872  T
Q  393 tataaaaattataaagtttgagtttgtgcttatggcc 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51660871 tataaaaattataaagtttgagtttgtgcttatggcc 51660835  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 11 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 23173954 - 23173518
Alignment:
Q  11 aatatctatcatcattaatttataatcgaacattccatttttatttctccaaatttatttgttcctctgttttatttcccca------------------ 92  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||                      
T  23173954 aatatctatcatcgttaatttataatcaaacattccatttttatttccccaaatttatttgtttctcttttttatttccccaaatttataaattttccca 23173855  T
Q  93 gatatctataatcatactcaaacttcttttctaaannnnnnn-ataaaatgaatggttgaactcatatccatatggttgtttgagtcatcatcaccatca 191  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23173854 gatttctataatcatactcaaacttcttttctaaactttttttataaaatgaatggttgaactcatatacctatggttgtttgagtcatcatcaccatca 23173755  T
Q  192 atgatatttctttgtctttatctcatatactcatannnnnnnaataattaattaaattgtattaaaaattaaccaacaagctcgacaaatgattcttgaa 291  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23173754 atgatatttctttatctttatctcatatactcatatttttttaataattaattaaattgtattaaaaa-aaaccaacaagctcgacaaatgatttttgaa 23173656  T
Q  292 ttgttcatgctaattagattattttgtcactcataggtctaannnnnnnnagaggactcgttgtgtcttatgtttaactgaattatgatttatcatgatt 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||        |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23173655 ttgttcatgctaattagattattttgtcactaataggtctaattttttttagaggactcgttgtgtctcatgtttaactgaattaagatttatcatgatt 23173556  T
Q  392 ttataaaaattataaagtttgagtttgtgcttatggcc 429  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  23173555 ttataaaaattataaagttagagtttgtgtttatggcc 23173518  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 12 - 429
Target Start/End: Original strand, 24081597 - 24082028
Alignment:
Q  12 atatctatcatcattaatttataatcgaacattccatttttatttctccaaatttatttgttcctctgttttatttcccca------------------g 93  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||                  |    
T  24081597 atatctatcattattaatttataatcacacattccatttttatttccccaaatttatttgttcctcttttttatttccccaaatttataaattttcccag 24081696  T
Q  94 atatctataatcatactcaaacttcttttctaaannnnnnnataaaatgaatggttgaactcatatccatatggttgtttgagtcatcatcaccatcaat 193  Q
    || | ||||||||||||||||||| |||||||||       ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24081697 atttatataatcatactcaaactttttttctaaacttttttataaaatgaatggttgaactcatatacctatggttgtttgagtcatcatcaccatcaat 24081796  T
Q  194 gatatttctttgtctttatctcatatactcatannnnnnnaataattaattaaattgtattaaaaattaaccaacaagctcgacaaatgattcttgaatt 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||      || |||||||||||||||||||||||||    
T  24081797 gatatttctttgtctttatctcatatactcatatttttttaataattaattaaattgtattaaaaa-----aaaaaagctcgacaaatgattcttgaatt 24081891  T
Q  294 gttcatgctaattagattattttgtcactcataggtctaa-nnnnnnnnagaggactcgttgtgtcttatgtttaactgaattatgatttatcatgattt 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||| |  |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  24081892 gttcatgctaattagattattttgtcactcataggtctaatgtttttttagaggactcgttgtgtctcacatttaactgaattaaaatttatcatgattt 24081991  T
Q  393 tataaaaattataaagtttgagtttgtgcttatggcc 429  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24081992 tataaaaattatgaagtttgagtttgtgcttatggcc 24082028  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 11 - 428
Target Start/End: Original strand, 39870205 - 39870631
Alignment:
Q  11 aatatctatcatcattaatttataatcgaacattccatttttatttctccaaatttatttgttcctctgttttatttcccca------------------ 92  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||                      
T  39870205 aatatctatcatcattaatttataatcaaacattccatttttatttccccaaatttaattgttcctcttttttatttccccaaatttataaatttttcca 39870304  T
Q  93 gatatctataatcatactcaaacttcttttctaaannnnnnnataaaatgaatggttgaactcatatccatatggttgtttgagtcatcatcaccatcaa 192  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||           ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39870305 gatttctataatcatactcaaacttcttttctaaacttttttataaaatgaat-----------tatacctatggttgtttgagtcatgatcaccatcaa 39870393  T
Q  193 tgatatttctttgtctttatctcatatactcatannnnnnnaataattaattaaattgtattaaaaattaa--ccaacaagctcgacaaatgattcttga 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  39870394 tgatatttctttgtctttatctcatatactcatatttttttaataattaattaaattgtattaaaaaaaaaaaccaacaagctcgacaaatgattattga 39870493  T
Q  291 attgttcatgctaattagattattttgtcactcataggtctaannnnnnnnagaggactcgttgtgtcttatgtttaactgaattatgatttatcatgat 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39870494 attgttcatgctaattagattattttgtcactcataggtctaattttttttagaggactcgttgtgtctcatgtttaactgaattaagatttatcatgat 39870593  T
Q  391 tttataaaaattataaagtttgagtttgtgcttatggc 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39870594 tttataaaaattataaagtttgagtttgtgcttatggc 39870631  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 17 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 31151341 - 31150912
Alignment:
Q  17 tatcatcattaatttataatcgaacattccatttttatttctccaaatttatttgttcctctgttttatttcccca------------------gatatc 98  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| ||||                  ||| ||    
T  31151341 tatcatcattaatttataatcaaacattccatttttattttcccaaatttatttgttcctcttttttattttcccaaatttataaattttctcagatttc 31151242  T
Q  99 tataatcatactcaaacttcttttctaaannnnnnnataaaatgaatggttgaactcatatccatatggttgtttgagtcatcatcaccatcaatgatat 198  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||       ||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31151241 tataatcatacttaaactttttttctaaacttttttataaaatgaatggttgaactcatatacctatgattgttagagtcatcatcaccatcaatgatat 31151142  T
Q  199 ttctttgtctttatctcatatactcatannnnnnnaataattaattaaattgtattaaaaattaaccaacaagctcgacaaatgattcttgaattgttca 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31151141 ttctttgtctttatctcatatactcatatttttttaataattaattcaattgtattaaaaaaaaaccaacaagctcgacaaatgattc-tgaattgttca 31151043  T
Q  299 tgctaattagattattttgtcactcataggtctaannnnnnnnagaggactcgttgtgtcttatgtttaactgaattatgatttatcatgattttataaa 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||        |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||   |||    
T  31151042 tgctaattagattattttgtcactcatatgtctaattttttttagaggactcgttgtgtctcatgtttaattgaattaagatttatcatgatttataaaa 31150943  T
Q  399 aattataaagtttgagtttgtgcttatggcc 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31150942 aattataaagtttgagtttgtgcttatggcc 31150912  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 15 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 23602371 - 23601971
Alignment:
Q  15 tctatcatcattaatttataatcgaacattccatttttatttctccaaatttatttgttcctctgttttatttccccagatatctataatcatactcaaa 114  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||               |||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  23602371 tctattatcattaatttataatcaaacattccatttttatttccccaaatttataa-------------attttcccatatttctataatcatactcaaa 23602285  T
Q  115 cttcttttctaaannnnnnnataaaatgaatggttgaactcatatccatatggttgtttgagtcatcatcaccatcaatgatatttctttgtctttatct 214  Q
    |||||||||||||       |||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23602284 cttcttttctaaacttttttataaaatgaatggtagaactcatatacctatggttgtttgagt-atcatcaccatcaatgatatttctttgtctttatct 23602186  T
Q  215 catata--ctcatannnnnnnaataattaattaaattgtattaaaaattaaccaacaagctcgacaaatgattcttgaattgttcatgctaattagatta 312  Q
    ||||||  ||||||       ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23602185 catatatactcatatttttttaataattaattaaattgtattaaaaaa-aaccaacaagctcgactaatgattcttgaattgttcatgctaattagatta 23602087  T
Q  313 ttttgtcactcataggtctaannnnnnnnagaggactcgttgtgtcttatgtttaactgaattatgatttatcatgattttataaaaattataaagtttg 412  Q
    ||||||||||||||||| |||        ||||||||| | |||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23602086 ttttgtcactcataggtttaa-tttttttagaggactcatcgtgtctcatatttaattgaattaagatttatcatgattttataaaaattataaagtttg 23601988  T
Q  413 agtttgtgcttatggcc 429  Q
    |||||||||||||||||    
T  23601987 agtttgtgcttatggcc 23601971  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 178; E-Value: 9e-96
Query Start/End: Original strand, 135 - 426
Target Start/End: Original strand, 48577085 - 48577374
Alignment:
Q  135 ataaaatgaatggttgaactcatatccatatggttgtttgagtcatcatcaccatcaatgatatttctttgtctttatctcatatactcatannnnnnna 234  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |    
T  48577085 ataaaatgaatggttaaactcatatacctatggttgtttgagtcatcatcaccatcaatgatatttctttgtctttatctcatatactcat-ttttttta 48577183  T
Q  235 ataattaattaaattgtattaaaaattaaccaacaagctcgacaaatgattcttgaattgttcatgctaattagattattttgtcactcataggtctaan 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  48577184 ataattaattaaattgtattaaaaaaaaaataacaaactcgacaaatgattcttgaatcgttcatgctaattagattattctgtcactcataggtctaa- 48577282  T
Q  335 nnnnnnnagaggactcgttgtgtcttatgtttaactgaattatgatttatcatgattttataaaaattataaagtttgagtttgtgcttatg 426  Q
           |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  48577283 tttttttagaggactcgttgtgtctcatgtttaactgaattaagatttatcatgattttataaaaattataaagttagagtttgtgtttatg 48577374  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 84 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 18249103 - 18248961
Alignment:
Q  84 atttccccagatatctataatcatactcaaacttcttttctaaannnnnnnataaaatgaatggttgaactcatatccatatggttgtttgagtcatcat 183  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||       ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  18249103 attttcccagatttctataatcatactcaaactttttttctaaacttttttataaaatgaatggttgaactcatatacctatggttgtttgagtcatcat 18249004  T
Q  184 caccatcaatgatatttctttgtctttatctcatatactcata 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18249003 caccatcaatgatatttctttgtctttatctcatatactcata 18248961  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 48644744 - 48644663
Alignment:
Q  11 aatatctatcatcattaatttataatcgaacattccatttttatttctccaaatttatttgttcctctgttttatttcccca 92  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  48644744 aatatctatcatcattaatttataatcaaacattccatttttatttccccaaatttatttgttcctcttttttatttcccca 48644663  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 12 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 18249224 - 18249144
Alignment:
Q  12 atatctatcatcattaatttataatcgaacattccatttttatttctccaaatttatttgttcctctgttttatttcccca 92  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  18249224 atatctatcattattaatttataatcaaacattctatttttatttccccaaatttatttgtttctcttttttatttcccca 18249144  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 48 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 18249157 - 18249113
Alignment:
Q  48 tttttatttctccaaatttatttgttcctctgttttatttcccca 92  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18249157 tttttatttccccaaatttatttgttcctcttttttatttcccca 18249113  T

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Target: chr3 (Bit Score: 240; Significance: 1e-133; HSPs: 10)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 12 - 429
Target Start/End: Original strand, 37986557 - 37986993
Alignment:
Q  12 atatctatcatcattaatttataatcgaacattccatttttatttctccaaatttatttgttcctctgttttatttcccca------------------g 93  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||                  |    
T  37986557 atatctatcattattaaattataatcaaacattccatttttatttccccaaatttatttgttcctcttttttatttccccaaatttataaattttcccag 37986656  T
Q  94 atatctataatcatactcaaacttcttttctaaannnnnnnataaaatgaatggttgaactcatatccatatggttgtttgagtcatcatcaccatcaat 193  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||       ||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  37986657 atttctataatcatactcaaactttttttctaaacttttttataaaatgaatggttgaactcatatacctatagttgtttgagtcatcatcacaatcaat 37986756  T
Q  194 gatatttctttgtctttatctcatatactcatannnnnnnaataattaattaaattgtattaaaaattaaccaacaagctcgacaaatgattcttgaatt 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37986757 gatatttctttgtctttatctcatatactcatatttttttaataattaattaaattgtattaaaaaaaaaccaacaagctcgacaaatgattcttgaatt 37986856  T
Q  294 gttcatgctaattagattattttgtcactcataggtctaa-nnnnnnnnagaggactcgttgtgtcttatgtttaactgaattatgatttatcatgattt 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37986857 gttcatgctaattagattattttgtcactcataggtctaatgtttttttagaggacttgttgtgtctcatgtttaactgaattaagatttatcatgattt 37986956  T
Q  393 tataaaaattataaagtttgagtttgtgcttatggcc 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37986957 tataaaaattataaagtttgagtttgtgcttatggcc 37986993  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 12 - 429
Target Start/End: Original strand, 46915114 - 46915547
Alignment:
Q  12 atatctatcatcattaatttataatcgaacattccatttttatttctccaaatttatttgttcctctgttttatttcccca------------------g 93  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||                  |    
T  46915114 atatctatcattattaatttataatcaaacattccatttttatttccccaaatttatttgttcctcttttttatttccccaaatttattaattttcccag 46915213  T
Q  94 atatctataatcatactcaaacttcttttctaaannnnnnnataaaatgaatggttgaactcatatccatatggttgtttgagtcatcatcaccatcaat 193  Q
    || |||||||||||| |||||||| |||||||||       |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46915214 atttctataatcatattcaaactttttttctaaacttttttataaaatgaatggttgaactcatacc--tatggttgtttgagtcatcatcaccatcaat 46915311  T
Q  194 gatatttctttgtctttatctcatatactcatannnnnnnaataattaattaaattgtattaaaaattaaccaacaagctcgacaaatgattcttgaatt 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  46915312 gatatttctttgtctttatctcatatactcatatttttttaataattaattaaattgtattaaaaaa-aatcaacaagctcgacaaatgattcttgaatt 46915410  T
Q  294 gttcatgctaattagattattttgtcactcataggtctaa-nnnnnnnnagaggactcgttgtgtcttatgtttaactgaattatgatttatcatgattt 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  46915411 gttcatgctaattagattattttgtcactcataggtctaatgtttttttagaggactcgttgtgtctcatgtttaaccgaattaagatttatcatgattt 46915510  T
Q  393 tataaaaattataaagtttgagtttgtgcttatggcc 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46915511 tataaaaattataaagtttgagtttgtgcttatggcc 46915547  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 12 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 16303301 - 16302867
Alignment:
Q  12 atatctatcatcattaatttataatcgaacattccatttttatttctccaaatttatttgttcctctgttttatttcccca------------------g 93  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||                  |    
T  16303301 atatctatcatcattaatttataatcaaacattccatttttatttccccaaatttatttgttcctcttttttatttccccaaatttataaattttcccag 16303202  T
Q  94 atatctataatcatactcaaacttcttttctaaannnnnnnataaaatgaatggttgaactcatatccatatggttgtttgagtcatcatcaccatcaat 193  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||       ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16303201 atttctataatcatactcaaactttttttctaaacttttttataaaatgaatggttgaactcatatacctatggttgtttgagtcatcatcaccatcaat 16303102  T
Q  194 gatatttctttgtctttatctcatatactcatannnnnnnaataattaattaaattgtattaaaaattaaccaacaagctcgacaaatgattcttg-aat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||       | ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16303101 gatatttctttgtctttatctcatatgctcatatttttttattaattaattaaattgtattaaaaa-aaaccaacaagctcgacaaatgattcttgaaat 16303003  T
Q  293 tgttcatgctaattagattattttgtcactcataggtctaannnnnnnnagaggactcgttgtgtcttatgtttaactgaattatgatttatcatgattt 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||        ||||||||| |||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16303002 tgttcatgctaattagattattttgtcactcataggtttaattttttttagaggactcattgtgtctca-gtttaactgaattaagatttatcatgattt 16302904  T
Q  393 tataaaaattataaagtttgagtttgtgcttatggcc 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16302903 tataaaaattataaagtttgagtttgtgcatatggcc 16302867  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 12 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 50802501 - 50802067
Alignment:
Q  12 atatctatcatcattaatttataatcgaacattccatttttatttctccaaatttatttgttcctctgttttatttccccagatatcta----------- 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | ||               
T  50802501 atatctatcattattaatttataatcaaacattccatttttatttccccaaatttatttgttcctcttttttatttccccaaatttataaattttcccat 50802402  T
Q  101 -------taatcatactcaaacttcttttctaaannnnnnnataaaatgaatggttgaactcatatccatatggttgtttgagtcatcatcaccatcaat 193  Q
           ||||||||||||||||| |||||||||       ||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50802401 atttatataatcatactcaaactttttttctaaacttttttataaaataaatggttgaactcatatacctatggttgtttgagtcatcatcaccatcaat 50802302  T
Q  194 gatatttctttgtctttatctcatatactcatannnnnnnaataattaattaaattgtattaaaaattaaccaacaagctcgacaaatgattcttgaatt 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50802301 gatatttctttgtctttatctcatatactcatatttttttaataattaattaaattgtattaaaaa-aaaccaacaagctcgacaaatgattcttgaatt 50802203  T
Q  294 gttcatgctaattagattattttgtcactcataggtctaa-nnnnnnnnagaggactcgttgtgtcttatgtttaactgaattatgatttatcatgattt 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||         |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  50802202 gttcatgctaattagattattttgtcactcataggtttaatgtttttttagaggactcgttgtgtctcatgtttaactaaattaagatttatcatgattt 50802103  T
Q  393 tataaaaattataaagtttgagtttgtgcttatggcc 429  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  50802102 tataaaaattataaagtttgag-ttgtgcttatggcc 50802067  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 84 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 46889057 - 46888710
Alignment:
Q  84 atttccccagatatctataatcatactcaaacttctttt-ctaaannnnnnnataaaatgaatggttgaactcatatccatatggttgtttgagtcatca 182  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||       ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  46889057 attttcccagatttctataatcatactcaaacttttttttctaaacttttttataaaatgaatggttgaactcatatacctatggttgtttgcgtcatca 46888958  T
Q  183 tcaccatcaatgatatttctttgtctttatctcatatactcata-nnnnnnnaataattaattaaattgtattaaaaattaaccaacaagctcgacaaat 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  46888957 tcaccatcaatgatatttctttgtctttatctcatatactcatattttttttactaattaattaaattgtattaaaaa-aaaccaacaagctcgacaaat 46888859  T
Q  282 gattcttg-aattgttcatgctaattagattattttgtcactcataggtctaannnnnnnnagaggactcgttgtgtcttatgtttaactgaattatgat 380  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  46888858 gattcttgaaattgttcatgctaattagattattttgtcactcataggtctaattttttttagaggactcgttgtgtctcatgtttaactgaattaagat 46888759  T
Q  381 ttatcatgattttataaaaattataaagtttgagtttgtgcttatggcc 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46888758 ttatcatgattttataaaaattataaagtttgagtttgtgcttatggcc 46888710  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 12 - 429
Target Start/End: Original strand, 50873376 - 50873813
Alignment:
Q  12 atatctatcatcattaatttataatcgaacattccatttttatttctccaaatttatttgttcctctgttttatttccccagatatcta----------- 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | ||               
T  50873376 atatctatcattattaatttataatcatacattccatttttatttccccaaatttatttgttcctcttttttatttccccaaatttataaattttcccat 50873475  T
Q  101 -------taatcatactcaaacttcttttctaaannnnnnnataaaatgaatggttgaactcatatccatatggttgtttgagtcatcatcaccatcaat 193  Q
           ||||||||||||||||| |||||||||       ||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50873476 atttatataatcatactcaaactttttttctaaacttttttataaaataaatggttgaactcatatacctatggttgtttgagtcatcatcaccatcaat 50873575  T
Q  194 gatatttctttgtctttatctcatatactcatannnnnnnaataattaattaaattgtatt--aaaaattaaccaacaagctcgacaaatgattcttgaa 291  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50873576 gatatttctttgtctttatctcatatactcatatttttttaataattaattaaattgtattaaaaaaaaaaaccaacaagctcgacaaatgattcttgaa 50873675  T
Q  292 ttgttcatgctaattagattattttgtcactcataggtctaa-nnnnnnnnagaggactcgttgtgtcttatgtttaactgaattatgatttatcatgat 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||         |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  50873676 ttgttcatgctaattagattattttgtcattcataggtttaatttttttttagaggactcgttgtgtctcatgtttaacttaattaagatttatcatgat 50873775  T
Q  391 tttataaaaattataaagtttgagtttgtgcttatggcc 429  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  50873776 tttataaaaattataaagtttgag-ttgtgcttatggcc 50873813  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 289 - 429
Target Start/End: Original strand, 13643802 - 13643942
Alignment:
Q  289 gaattgttcatgctaattagattattttgtcactcataggtctaannnnnnnnagaggactcgttgtgtcttatgtttaactgaattatgatttatcatg 388  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  13643802 gaattgttcatgctaattagattattttgtcactcataggtctaattttttttagaggactcgttgtgtctcatgtttaactgaattaagatttatcatg 13643901  T
Q  389 attttataaaaattataaagtttgagtttgtgcttatggcc 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13643902 attttataaaaattataaagtttgagtttgtgcttatggcc 13643942  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 46889178 - 46889098
Alignment:
Q  12 atatctatcatcattaatttataatcgaacattccatttttatttctccaaatttatttgttcctctgttttatttcccca 92  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  46889178 atatctatcatcattaatttataatcaaacattccatttttattttcccaaatttatttgtttctcttttttatttcccca 46889098  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 48 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 46889111 - 46889067
Alignment:
Q  48 tttttatttctccaaatttatttgttcctctgttttatttcccca 92  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  46889111 tttttatttccccaaatttatttgttcctcttttttatttcccca 46889067  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 18346943 - 18346898
Alignment:
Q  12 atatctatcatcattaatttataatcgaacattccatttttatttc 57  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||    
T  18346943 atatttatcatcattaattcataatcaaacattctatttttatttc 18346898  T

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Target: chr6 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 6)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 12 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 18969762 - 18969348
Alignment:
Q  12 atatctatcatcattaatttataatcgaacattccatttttatttctccaaatttatttgttcctctgttttatttccccagatatctataatcatactc 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| || |||||||||||||||    
T  18969762 atatctatcatcattaatttataatcaaacattccatttttatttctccaaatttatttgttcctcttttttatttttcca-atttctataatcatactc 18969664  T
Q  112 aaacttcttttctaa-annnnnnnataaaatgaatggttgaactcatatccatatggttgtttgagtcatcatcaccatcaatgatatttctttgtcttt 210  Q
    |||||| ||||||||         ||||||||||||||| ||||||||| | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18969663 aaactttttttctaatttttttttataaaatgaatggttaaactcatatacctattgtcgtttgagtcatcatcaccatcaatgatatttctttgtcttt 18969564  T
Q  211 atctcatatactc-atannnnnnnaataattaattaaattgtattaaaaattaaccaacaagctcgacaaatgattcttgaattgttcatgctaattaga 309  Q
    |||||||||||||  |        ||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18969563 atctcatatactctttttttttttaataattaattaaattgtattaaaaa--aaataacaaactcgacaaatgattcttgaattgttcgtgctaattaga 18969466  T
Q  310 ttattttgtcactcataggtctaa-nnnnnnnnagaggactcgttgtgtcttatgtttaactgaattatgatttatcatgattttataaaaattataaag 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18969465 ttattttgtcactcataggtctaatatttttttagaggactcgttgtgtctcatgtttaactgaattaagatttatcatgattttataaaaattataaag 18969366  T
Q  409 tttgagtttgtgcttatg 426  Q
    |||||||||||| |||||    
T  18969365 tttgagtttgtgtttatg 18969348  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 12 - 429
Target Start/End: Original strand, 24063162 - 24063598
Alignment:
Q  12 atatctatcatcattaatttataatcgaacattccatttttatttctccaaatttatttgttcctctgttttatttccccagatat-------------- 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |                  
T  24063162 atatctatcatcattaatttataatcaaacatttcatttttatttccccaaatttatttgttcctcttttttatttccccaaatttataaattttcccat 24063261  T
Q  98 ----ctataatcatactcaaacttcttttctaaannnnnnn-ataaaatgaatggttgaactcatatccatatggttgtttgagtcatcatcaccatcaa 192  Q
        |||||||||||||||||||| ||||| |||        |||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24063262 atttctataatcatactcaaacttattttcaaaactttttttataaaatgaatggtagaactcatatacctatggttgtttgagt-atcatcaccatcaa 24063360  T
Q  193 tgatatttctttgtctttatctcatata--ctcatannnnnnnaataattaattaaattgtattaaaaattaaccaacaagctcgacaaatgattcttga 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||       ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24063361 tgatatttctttgtctttatctcatatatactcatatttttttaataattaattaaattgtattaaaaa--aaccaacaagctcgactaatgattcttga 24063458  T
Q  291 attgttcatgctaattagattattttgtcactcataggtctaa-nnnnnnnnagaggactcgttgtgtcttatgtttaactgaattatgatttatcatga 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||         ||||||||  | |||||| || ||||||||||||| ||||||||||||    
T  24063459 attgttcatgctaattagattattttgtcactcataggtttaatttttttttagaggacttatcgtgtctcatatttaactgaattaagatttatcatga 24063558  T
Q  390 ttttataaaaattataaagtttgagtttgtgcttatggcc 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24063559 ttttataaaaattataaagtttgagtttgtgcttatggcc 24063598  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 136 - 429
Target Start/End: Original strand, 5121016 - 5121308
Alignment:
Q  136 taaaatgaatggttgaactcatatccatatggttgtttgagtcatcatcaccatcaatgatatttctttgtctttatctcatatactcatannnnnnnaa 235  Q
    ||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||    
T  5121016 taaaatgaatggtagaactcatatatctatggttgtttgagtcatcatcaccatcaatgatatttctttgtctttatctcatatactcatatttttttaa 5121115  T
Q  236 taattaattaaattgtattaaaaattaaccaacaagctcgacaaatgattcttgaattgttcatgctaattagattattttgtcactcataggtctaann 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||      
T  5121116 taattaattaaattgtattaaaaaaaaactaacaagctcgactaataattcttgaattgttcgtgctaattagattattttgtcactcataggtttaa-t 5121214  T
Q  336 nnnnnnagaggactcgttgtgtcttatgtttaactgaattatgatttatcatgattttataaaaattataaagtttgagtttgtgcttatggcc 429  Q
          ||||||||| |||||||| || |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5121215 ttttttagaggactcattgtgtctcatatttaactgaattaaaatttatcatgattttataaaaattataaagtttgagtttgtgcttatggcc 5121308  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 12 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 34713270 - 34713044
Alignment:
Q  12 atatctatcatcattaatttataatcgaacattccatttttatttctccaaatttatttgttcctctgttttatttcccca------------------g 93  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||                  |    
T  34713270 atatttatcatcgttaatttataatcaaacatttcatttttatttctccaaatttatttgttcctcttttttatttccccaaatttataaattttcccag 34713171  T
Q  94 atatctataatcatactcaaacttcttttctaaannnnnnn-ataaaatgaatggttgaactcatatccatatggttgtttgagtcatcatcaccatcaa 192  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34713170 atttctataatcatactcaaacttcttttctaaactttttttataaaatgaatggtagaattcatatacctatggttgtttgagtcatcatcaccatcaa 34713071  T
Q  193 tgatatttctttgtctttatctcatat 219  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||    
T  34713070 tgatatttctttgtttttatctcatat 34713044  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 12 - 68
Target Start/End: Original strand, 5114346 - 5114402
Alignment:
Q  12 atatctatcatcattaatttataatcgaacattccatttttatttctccaaatttat 68  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5114346 atatatatcatcattaatttataatcaaacattccatttttatttccccaaatttat 5114402  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 97 - 127
Target Start/End: Original strand, 5114418 - 5114448
Alignment:
Q  97 tctataatcatactcaaacttcttttctaaa 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5114418 tctataatcatactcaaacttcttttctaaa 5114448  T

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Target: chr8 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 9)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 84 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 20054850 - 20054506
Alignment:
Q  84 atttccccagatatctataatcatactcaaacttcttttctaaannnnnnnataaaatgaatggttgaactcatatccatatggttgtttgagtcatcat 183  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||       ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  20054850 attttcccagatttctataatcatactcaaactttttttctaaacttttttataaaatgaatggttgaactcatatacctatggttgtttgagtcatcat 20054751  T
Q  184 caccatcaatgatatttctttgtctttatctcatatactcatannnnnnnaataattaattaaattgtatt-aaaaattaaccaacaagctcgacaaatg 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||    
T  20054750 caccatcaatgatatttctttgtctttatctcatatactcatatttttttaataattaattaaattatattaaaaaaaaaaccaacaagctcgacaaatg 20054651  T
Q  283 attcttgaattgttcatgctaattagattattttgtcactcataggtctaa-nnnnnnnnagaggactcgttgtgtcttatgtttaactgaattatgatt 381  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||         ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  20054650 attcttgaattgttcatgctaattagattattttgtcactcataggtttaatgtttttttagaggactcgttgcgtctcatgtttaactgaattaagatt 20054551  T
Q  382 tatcatgattttataaaaattataaag-tttgagtttgtgcttatg 426  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20054550 tatcatga-tttataaaaattataaagttttgagtttgtgcttatg 20054506  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 319
Target Start/End: Original strand, 34654344 - 34654671
Alignment:
Q  11 aatatctatcatcattaatttataatcgaacattccatttttatttctccaaatttatttgttcctctgttttatttcccca------------------ 92  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||                      
T  34654344 aatatctatcatcattaatttataatcaaacattccatttttatttcctcaaatttatttgttcctattttttatttccccaaatttatatattttccca 34654443  T
Q  93 gatatctataa--tcatactcaaacttcttttctaaannnnnnnataaaatgaatggttgaactcatatccatatggttgtttgagtcatcatcaccatc 190  Q
    ||| |||||||  ||| |||||||||| |||||||||       ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  34654444 gatttctataaaatcacactcaaacttattttctaaacttttttataaaatgaatggttgaactcatatacctatgattgtttgagtcatcatcaccatc 34654543  T
Q  191 aatgatatttctttgtctttatctcatatactcatannnnnnnaataattaattaaattgtattaaaaattaaccaacaagctcgacaaatgattcttga 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34654544 aatgatatttctttgtctttatctcatatactcatatttttttaataattaattaaattgtattaaaaa-aaaccaacaagctcgacaaatgattcttga 34654642  T
Q  291 attgttcatgctaattagattattttgtc 319  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34654643 attgttcatgctaattagattattgtgtc 34654671  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 39 - 303
Target Start/End: Original strand, 14762768 - 14763038
Alignment:
Q  39 aacattccatttttatttctccaaatttatttgttcctctgttttatttccccagatatctataatcatactcaaacttcttttctaaannnnnnnataa 138  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||       ||||    
T  14762768 aacattccatttttatttccccaaatttatttgttcctcttttttatttccccaaatttctacaatcatactcaaacttcttttctaaacttttttataa 14762867  T
Q  139 aatgaatggttgaactcatatccatatggttgtttgagtcatc----atcaccatcaatgatatttctttgtctttatctcatatactcatannnnnnna 234  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||       |    
T  14762868 aatgaatggttgaactcatatacatgtggttgtttgaatcatcatcgatcaccatcaatgatatttctttgtctttatctcatatgctcatattttttta 14762967  T
Q  235 ataattaattaaattgtattaaaaattaaccaacaagctcgacaaatgattc---ttgaattgttcatgcta 303  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  14762968 ataattaactaaattgtattaaaaa-aaatcaacaagctcgacaaatgattcttgttgaattgttcatgcta 14763038  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 11 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 41273506 - 41273275
Alignment:
Q  11 aatatctatcatcattaatttataatcgaacattccatttttatttctccaaatttatttgttcctctgttttatttcccca------------------ 92  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||                      
T  41273506 aatatctatcatcattaatttataatcaaacattccatttttattttcccaaatttatttgtttctcttttttatttccccaaatttataaattttccca 41273407  T
Q  93 gatatctataatcatactcaaacttcttttctaaannnnnnnataaaatgaatggttgaactcatatccatatggttgtttgagtcatcatcaccatcaa 192  Q
    ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41273406 gatttctataatcacagtcaaacttcttttctaaacttttttataaaatgaatggttgaactcatatacctatggttgtttgagtcatcatcaccatcaa 41273307  T
Q  193 tgatatttctttgtctttatctcatatactca 224  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41273306 tgatatttctttatctttatctcatatactca 41273275  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 342 - 429
Target Start/End: Original strand, 14763061 - 14763148
Alignment:
Q  342 agaggactcgttgtgtcttatgtttaactgaattatgatttatcatgattttataaaaattataaagtttgagtttgtgcttatggcc 429  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14763061 agaggactcgttgtgtgtcatgtttaactgaattatgatttatcatgattttataaaaattataaagtttgagtttgtgcttatggcc 14763148  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 352 - 429
Target Start/End: Original strand, 34654665 - 34654742
Alignment:
Q  352 ttgtgtcttatgtttaactgaattatgatttatcatgattttataaaaattataaagtttgagtttgtgcttatggcc 429  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34654665 ttgtgtctcatgtttaactgaattaagatttatcatgattttataaaaattataaagtttgagtttgtgcttatggcc 34654742  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 7 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 24022939 - 24022858
Alignment:
Q  7 gaagaatatctatcatcattaatttataatcgaacattccatttttatttctccaaatttatttgttcctctgttttatttc 88  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24022939 gaagcatatctatcatcattaatttataatcaaacattccatttttatttccccaaatttatttgttcctcttttttatttc 24022858  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 159
Target Start/End: Original strand, 41273107 - 41273273
Alignment:
Q  11 aatatctatcatcattaatttataatcgaacattccatttttatttctccaaatttatttgttcctctgttttatttc------------------ccca 92  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| |||||||||                  ||||    
T  41273107 aatatctatcatcattaatttataatcaaacattccatttttatttcctcaaatttatttgtttctcttttttatttccccaaatttataaattttccca 41273206  T
Q  93 gatatctataatcatactcaaacttcttttctaaannnnnnnataaaatgaatggttgaactcatat 159  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||    
T  41273207 gatttctataatcatactcaaacttcttttctaaacttttttataaaatgaatggttgaactcatat 41273273  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 20054905 - 20054865
Alignment:
Q  47 atttttatttctccaaatttatttgttcctctgttttattt 87  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20054905 atttttatttccccaaatttatttgttcctcttttttattt 20054865  T

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