View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5921_high_1 (Length: 970)

Name: NF5921_high_1
Description: NF5921
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5921_high_1
NF5921_high_1
[»] chr6 (126 HSPs)
chr6 (17-962)||(27851213-27852181)
chr6 (17-954)||(20733321-20734279)
chr6 (529-925)||(34296664-34297072)
chr6 (529-765)||(28947764-28948000)
chr6 (529-799)||(611127-611396)
chr6 (529-799)||(18658593-18658862)
chr6 (529-794)||(25619353-25619618)
chr6 (529-767)||(19825885-19826123)
chr6 (529-799)||(29847899-29848170)
chr6 (529-765)||(19655625-19655861)
chr6 (529-787)||(20556489-20556747)
chr6 (529-794)||(14979018-14979283)
chr6 (529-794)||(15817154-15817418)
chr6 (529-761)||(5834131-5834362)
chr6 (529-765)||(7827392-7827628)
chr6 (529-765)||(17318518-17318754)
chr6 (529-727)||(1254215-1254413)
chr6 (529-755)||(25347556-25347782)
chr6 (529-767)||(13764771-13765002)
chr6 (533-765)||(18702984-18703216)
chr6 (533-765)||(18708919-18709151)
chr6 (529-767)||(15173851-15174089)
chr6 (529-748)||(15891107-15891326)
chr6 (529-755)||(8767659-8767885)
chr6 (529-761)||(20177170-20177401)
chr6 (529-765)||(23150663-23150898)
chr6 (529-765)||(25601673-25601909)
chr6 (548-767)||(19443695-19443914)
chr6 (529-765)||(31734128-31734362)
chr6 (515-759)||(18928149-18928393)
chr6 (529-761)||(22158590-22158821)
chr6 (529-755)||(8759913-8760138)
chr6 (529-767)||(16133066-16133304)
chr6 (529-767)||(23956280-23956518)
chr6 (529-794)||(4477049-4477314)
chr6 (529-765)||(27125872-27126109)
chr6 (529-765)||(23491567-23491803)
chr6 (529-765)||(23497165-23497401)
chr6 (533-718)||(755-940)
chr6 (529-761)||(20182988-20183219)
chr6 (529-761)||(22152772-22153003)
chr6 (529-765)||(19773105-19773341)
chr6 (529-720)||(23655804-23655995)
chr6 (529-765)||(15705007-15705243)
chr6 (529-765)||(25921150-25921385)
chr6 (529-765)||(27317949-27318187)
chr6 (529-765)||(18455468-18455703)
chr6 (529-765)||(32259268-32259502)
chr6 (529-794)||(23838399-23838655)
chr6 (529-765)||(18398339-18398574)
chr6 (529-715)||(25807602-25807788)
chr6 (529-765)||(13285129-13285364)
chr6 (533-690)||(29044805-29044962)
chr6 (532-760)||(17857091-17857319)
chr6 (529-765)||(18585040-18585274)
chr6 (529-701)||(31022093-31022265)
chr6 (529-765)||(22556669-22556905)
chr6 (533-761)||(20411072-20411299)
chr6 (529-639)||(7430069-7430179)
chr6 (626-749)||(27556905-27557028)
chr6 (529-639)||(14594021-14594131)
chr6 (529-688)||(34141023-34141180)
chr6 (529-688)||(34153639-34153796)
chr6 (529-648)||(12942666-12942785)
chr6 (634-745)||(23415151-23415262)
chr6 (529-649)||(27330368-27330488)
chr6 (529-649)||(27391108-27391228)
chr6 (831-954)||(2201139-2201261)
chr6 (831-954)||(22420987-22421109)
chr6 (529-648)||(23415441-23415560)
chr6 (529-648)||(28288903-28289022)
chr6 (529-759)||(15938622-15938851)
chr6 (529-658)||(22806276-22806405)
chr6 (529-689)||(23221361-23221521)
chr6 (797-962)||(25956519-25956697)
chr6 (529-689)||(35057000-35057160)
chr6 (533-648)||(15891979-15892094)
chr6 (529-648)||(27557199-27557318)
chr6 (530-648)||(33862270-33862388)
chr6 (529-648)||(1540478-1540597)
chr6 (529-616)||(16135613-16135699)
chr6 (536-760)||(31161862-31162085)
chr6 (842-901)||(19399830-19399889)
chr6 (552-759)||(22523388-22523594)
chr6 (530-648)||(17883065-17883183)
chr6 (709-787)||(25752948-25753026)
chr6 (709-787)||(25755118-25755196)
chr6 (534-648)||(12742794-12742908)
chr6 (529-612)||(19234658-19234741)
chr6 (533-648)||(19858493-19858608)
chr6 (76-224)||(19545282-19545430)
chr6 (351-538)||(19545733-19545921)
chr6 (685-760)||(16135519-16135594)
chr6 (842-901)||(18927896-18927954)
chr6 (529-632)||(31163519-31163622)
chr6 (529-619)||(1555527-1555617)
chr6 (529-595)||(33315095-33315161)
chr6 (529-594)||(10487996-10488061)
chr6 (529-594)||(16240321-16240386)
chr6 (529-594)||(16377267-16377332)
chr6 (529-594)||(16384591-16384656)
chr6 (529-594)||(16556964-16557029)
chr6 (529-594)||(16633520-16633585)
chr6 (832-901)||(25956715-25956783)
chr6 (716-765)||(29044682-29044731)
chr6 (529-593)||(18334159-18334223)
chr6 (721-765)||(19234617-19234661)
chr6 (529-593)||(22226588-22226652)
chr6 (529-593)||(24423078-24423142)
chr6 (529-593)||(25904501-25904565)
chr6 (833-893)||(31630622-31630681)
chr6 (529-632)||(3007508-3007611)
chr6 (529-572)||(16650194-16650237)
chr6 (529-619)||(16826387-16826477)
chr6 (529-619)||(21776115-21776205)
chr6 (533-619)||(25175112-25175198)
chr6 (529-619)||(27654616-27654706)
chr6 (529-571)||(35016023-35016065)
chr6 (529-593)||(8055561-8055625)
chr6 (529-593)||(33864809-33864873)
chr6 (529-572)||(19609627-19609670)
chr6 (530-593)||(26924015-26924078)
chr6 (852-899)||(27851129-27851176)
chr6 (410-448)||(10487959-10487997)
chr6 (410-448)||(16377331-16377369)
chr6 (410-448)||(16384655-16384693)
[»] chr2 (119 HSPs)
chr2 (17-794)||(34858269-34859046)
chr2 (17-794)||(34873331-34874108)
chr2 (17-794)||(27472644-27473431)
chr2 (19-759)||(20915531-20916280)
chr2 (529-782)||(26903561-26903814)
chr2 (530-765)||(24273656-24273891)
chr2 (529-794)||(18358365-18358630)
chr2 (529-794)||(22173424-22173689)
chr2 (529-793)||(41301369-41301633)
chr2 (529-799)||(31520504-31520773)
chr2 (529-791)||(21081367-21081629)
chr2 (529-767)||(25183605-25183843)
chr2 (533-765)||(43707685-43707916)
chr2 (529-799)||(24883773-24884042)
chr2 (529-794)||(21073123-21073388)
chr2 (529-765)||(9975349-9975585)
chr2 (530-799)||(10039531-10039799)
chr2 (529-765)||(36839591-36839827)
chr2 (529-765)||(5031526-5031762)
chr2 (529-765)||(23969019-23969255)
chr2 (529-765)||(24781236-24781472)
chr2 (529-767)||(21915040-21915278)
chr2 (529-761)||(27484866-27485098)
chr2 (529-794)||(19662051-19662316)
chr2 (529-902)||(2524143-2524510)
chr2 (529-765)||(17306907-17307143)
chr2 (529-767)||(23338796-23339034)
chr2 (529-794)||(9242151-9242416)
chr2 (529-782)||(20590718-20590971)
chr2 (529-765)||(24515606-24515842)
chr2 (529-751)||(18388693-18388915)
chr2 (529-765)||(28349328-28349573)
chr2 (529-765)||(28652898-28653134)
chr2 (533-757)||(6482946-6483171)
chr2 (533-757)||(6486413-6486638)
chr2 (529-760)||(21368532-21368763)
chr2 (529-794)||(6260774-6261039)
chr2 (529-765)||(19201596-19201833)
chr2 (532-765)||(23068849-23069082)
chr2 (529-765)||(9785002-9785238)
chr2 (529-761)||(22690105-22690336)
chr2 (529-761)||(22694701-22694932)
chr2 (529-765)||(22686260-22686495)
chr2 (537-765)||(25587091-25587318)
chr2 (532-762)||(21335852-21336081)
chr2 (529-765)||(21316058-21316293)
chr2 (536-765)||(22332138-22332365)
chr2 (529-765)||(1384082-1384317)
chr2 (529-690)||(23778691-23778853)
chr2 (567-765)||(29113782-29113979)
chr2 (536-764)||(23609898-23610125)
chr2 (529-765)||(28345472-28345707)
chr2 (662-794)||(30643810-30643942)
chr2 (633-749)||(31345379-31345495)
chr2 (529-648)||(10684329-10684448)
chr2 (529-648)||(20261696-20261815)
chr2 (831-962)||(24865480-24865610)
chr2 (529-629)||(22255768-22255868)
chr2 (831-962)||(22501001-22501131)
chr2 (831-962)||(22508935-22509065)
chr2 (529-686)||(20272855-20273012)
chr2 (679-799)||(22501255-22501374)
chr2 (679-799)||(22509189-22509308)
chr2 (529-727)||(22786694-22786891)
chr2 (533-648)||(31345656-31345771)
chr2 (529-648)||(38967956-38968075)
chr2 (530-648)||(24897763-24897881)
chr2 (530-648)||(24900246-24900364)
chr2 (530-648)||(24902723-24902841)
chr2 (530-648)||(24905200-24905318)
chr2 (530-648)||(24907675-24907793)
chr2 (831-962)||(7672268-7672392)
chr2 (529-609)||(7186942-7187022)
chr2 (530-648)||(23136056-23136174)
chr2 (529-645)||(40911863-40911979)
chr2 (40-277)||(22497311-22497547)
chr2 (529-632)||(36734881-36734984)
chr2 (529-610)||(22501375-22501456)
chr2 (529-610)||(22509309-22509390)
chr2 (78-189)||(26861356-26861467)
chr2 (757-901)||(6576446-6576602)
chr2 (351-538)||(22497699-22497887)
chr2 (351-538)||(19445229-19445416)
chr2 (842-901)||(24436263-24436321)
chr2 (533-633)||(15632770-15632870)
chr2 (529-685)||(24302220-24302374)
chr2 (529-701)||(28031877-28032049)
chr2 (529-572)||(24383124-24383167)
chr2 (716-763)||(24841375-24841422)
chr2 (529-619)||(19887294-19887384)
chr2 (529-594)||(11232232-11232297)
chr2 (529-594)||(12727736-12727801)
chr2 (529-594)||(22514079-22514144)
chr2 (529-594)||(28776681-28776746)
chr2 (529-593)||(18809474-18809538)
chr2 (861-929)||(22501128-22501195)
chr2 (861-929)||(22509062-22509129)
chr2 (529-593)||(28577630-28577694)
chr2 (529-594)||(16900840-16900905)
chr2 (529-594)||(16994231-16994296)
chr2 (529-594)||(24686617-24686682)
chr2 (529-594)||(27261357-27261422)
chr2 (730-767)||(34492089-34492126)
chr2 (529-593)||(571929-571993)
chr2 (529-593)||(23711580-23711644)
chr2 (529-565)||(23760032-23760068)
chr2 (861-901)||(24883673-24883713)
chr2 (529-593)||(26505910-26505974)
chr2 (529-593)||(26508388-26508452)
chr2 (529-593)||(27920331-27920395)
chr2 (529-593)||(32039065-32039129)
chr2 (529-565)||(34823804-34823840)
chr2 (529-592)||(23131394-23131457)
chr2 (529-592)||(23133861-23133924)
chr2 (529-592)||(34402089-34402152)
chr2 (410-448)||(11232296-11232334)
chr2 (410-448)||(22514143-22514181)
chr2 (410-448)||(28776745-28776783)
chr2 (40-118)||(29718215-29718294)
[»] scaffold0032 (3 HSPs)
scaffold0032 (17-794)||(67485-68272)
scaffold0032 (529-760)||(116801-117032)
scaffold0032 (577-765)||(62414-62602)
[»] chr8 (130 HSPs)
chr8 (17-794)||(22237127-22237915)
chr8 (19-794)||(19807473-19808258)
chr8 (157-764)||(21321365-21321971)
chr8 (157-764)||(21325963-21326569)
chr8 (529-962)||(41680530-41680962)
chr8 (529-929)||(42559924-42560334)
chr8 (529-962)||(21579603-21580046)
chr8 (529-962)||(29763265-29763707)
chr8 (537-794)||(17460691-17460948)
chr8 (529-797)||(39694924-39695191)
chr8 (529-794)||(25483870-25484135)
chr8 (529-767)||(44522822-44523060)
chr8 (529-767)||(364206-364444)
chr8 (529-799)||(15635576-15635845)
chr8 (529-767)||(19882386-19882624)
chr8 (529-762)||(18024091-18024324)
chr8 (529-765)||(20178917-20179153)
chr8 (529-763)||(38185482-38185716)
chr8 (529-763)||(26454133-26454367)
chr8 (529-765)||(5760953-5761189)
chr8 (529-754)||(39363955-39364180)
chr8 (533-765)||(6102153-6102385)
chr8 (529-765)||(19140185-19140421)
chr8 (529-765)||(39936407-39936642)
chr8 (529-763)||(19880250-19880484)
chr8 (529-767)||(20454657-20454895)
chr8 (529-799)||(20455383-20455652)
chr8 (529-799)||(20460361-20460630)
chr8 (529-763)||(21861016-21861250)
chr8 (529-767)||(23478498-23478736)
chr8 (529-758)||(18833898-18834127)
chr8 (529-765)||(42818303-42818539)
chr8 (529-767)||(44432279-44432518)
chr8 (529-794)||(27941285-27941550)
chr8 (529-759)||(6573453-6573682)
chr8 (529-767)||(17795650-17795888)
chr8 (529-764)||(32950022-32950241)
chr8 (529-757)||(8728333-8728561)
chr8 (529-757)||(44476851-44477080)
chr8 (529-757)||(44480113-44480342)
chr8 (529-767)||(11775140-11775378)
chr8 (529-759)||(22207693-22207923)
chr8 (596-765)||(361675-361844)
chr8 (532-799)||(42265994-42266257)
chr8 (529-765)||(17437714-17437950)
chr8 (529-759)||(5082608-5082838)
chr8 (529-765)||(20084034-20084270)
chr8 (529-765)||(22483167-22483402)
chr8 (529-760)||(17501350-17501581)
chr8 (529-700)||(23660700-23660871)
chr8 (537-762)||(20517522-20517746)
chr8 (529-761)||(22258700-22258931)
chr8 (529-765)||(22344462-22344697)
chr8 (529-765)||(22356122-22356357)
chr8 (529-765)||(4381189-4381424)
chr8 (529-765)||(36305079-36305314)
chr8 (559-765)||(18816886-18817093)
chr8 (529-754)||(23914355-23914579)
chr8 (533-761)||(23670073-23670300)
chr8 (529-761)||(38988890-38989121)
chr8 (529-761)||(39019987-39020218)
chr8 (529-765)||(17978813-17979048)
chr8 (529-763)||(24907198-24907430)
chr8 (596-765)||(18815286-18815454)
chr8 (529-690)||(36732920-36733081)
chr8 (529-765)||(22474172-22474407)
chr8 (529-757)||(36405456-36405683)
chr8 (828-954)||(32807285-32807410)
chr8 (550-749)||(14397521-14397720)
chr8 (529-690)||(21399205-21399366)
chr8 (529-690)||(21793698-21793859)
chr8 (529-765)||(21513741-21513975)
chr8 (663-767)||(8414240-8414344)
chr8 (529-648)||(16198371-16198490)
chr8 (757-959)||(39833887-39834092)
chr8 (530-648)||(14397308-14397426)
chr8 (530-648)||(18677632-18677750)
chr8 (530-648)||(24485611-24485729)
chr8 (529-759)||(24624095-24624324)
chr8 (529-763)||(25757575-25757808)
chr8 (577-765)||(18118608-18118796)
chr8 (532-763)||(19331976-19332204)
chr8 (530-648)||(4541941-4542059)
chr8 (529-759)||(18827650-18827879)
chr8 (529-763)||(25295555-25295788)
chr8 (757-893)||(18760615-18760763)
chr8 (530-638)||(22002239-22002347)
chr8 (679-765)||(21345945-21346031)
chr8 (528-661)||(22313355-22313488)
chr8 (529-758)||(24238843-24239071)
chr8 (774-837)||(3273288-3273351)
chr8 (529-611)||(4233215-4233297)
chr8 (40-138)||(15727651-15727749)
chr8 (529-690)||(21495086-21495247)
chr8 (529-763)||(45559572-45559798)
chr8 (529-624)||(8414145-8414240)
chr8 (833-901)||(27472391-27472458)
chr8 (833-901)||(38550086-38550153)
chr8 (774-821)||(23450822-23450869)
chr8 (774-821)||(24495934-24495981)
chr8 (774-821)||(34301900-34301947)
chr8 (529-620)||(45290114-45290205)
chr8 (529-594)||(272183-272248)
chr8 (529-594)||(643601-643666)
chr8 (529-594)||(829407-829472)
chr8 (832-901)||(1327119-1327187)
chr8 (716-765)||(5080429-5080478)
chr8 (529-594)||(29759454-29759519)
chr8 (529-593)||(1484933-1484997)
chr8 (529-593)||(20045762-20045826)
chr8 (529-572)||(22089392-22089435)
chr8 (529-594)||(15320008-15320073)
chr8 (529-594)||(15500377-15500442)
chr8 (529-594)||(39114440-39114505)
chr8 (529-593)||(5852859-5852923)
chr8 (529-593)||(14409011-14409075)
chr8 (842-901)||(3273212-3273270)
chr8 (529-592)||(4483812-4483875)
chr8 (529-572)||(18618877-18618919)
chr8 (529-572)||(22007105-22007148)
chr8 (529-619)||(223324-223414)
chr8 (410-448)||(272247-272285)
chr8 (410-448)||(643564-643602)
chr8 (529-619)||(688095-688185)
chr8 (529-619)||(736947-737037)
chr8 (410-448)||(829370-829408)
chr8 (529-619)||(860842-860932)
chr8 (409-451)||(17861769-17861811)
chr8 (723-757)||(18122329-18122363)
chr8 (529-594)||(17150635-17150700)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (17-962)||(10907-11864)
[»] chr4 (128 HSPs)
chr4 (48-794)||(10056863-10057619)
chr4 (529-962)||(33186114-33186557)
chr4 (529-797)||(9638396-9638663)
chr4 (529-785)||(15990439-15990695)
chr4 (529-794)||(630299-630564)
chr4 (532-765)||(3337519-3337752)
chr4 (531-799)||(10704885-10705152)
chr4 (531-799)||(10918655-10918922)
chr4 (529-787)||(12611249-12611507)
chr4 (529-787)||(23802860-23803118)
chr4 (529-767)||(56115232-56115470)
chr4 (529-765)||(35660266-35660502)
chr4 (529-763)||(15008388-15008622)
chr4 (529-794)||(24046930-24047195)
chr4 (529-765)||(25091073-25091309)
chr4 (529-765)||(53630869-53631105)
chr4 (529-767)||(10694643-10694881)
chr4 (529-767)||(10908409-10908647)
chr4 (529-787)||(51463463-51463721)
chr4 (529-794)||(18212957-18213222)
chr4 (529-767)||(15447812-15448050)
chr4 (533-765)||(19609744-19609976)
chr4 (529-767)||(40619948-40620186)
chr4 (529-765)||(10356832-10357068)
chr4 (529-765)||(16997950-16998181)
chr4 (529-765)||(42875219-42875455)
chr4 (127-371)||(14185706-14185949)
chr4 (529-765)||(14549046-14549282)
chr4 (529-765)||(37019089-37019325)
chr4 (529-760)||(15114648-15114878)
chr4 (529-784)||(16277723-16277978)
chr4 (529-784)||(53387333-53387588)
chr4 (529-767)||(33849160-33849398)
chr4 (529-765)||(19435093-19435330)
chr4 (529-759)||(9923622-9923852)
chr4 (529-767)||(28385661-28385899)
chr4 (534-759)||(11479012-11479237)
chr4 (529-765)||(33243692-33243928)
chr4 (529-765)||(11425375-11425601)
chr4 (533-717)||(15011913-15012097)
chr4 (529-765)||(14630246-14630482)
chr4 (529-761)||(15344301-15344531)
chr4 (529-765)||(19566315-19566550)
chr4 (530-764)||(10237895-10238128)
chr4 (530-760)||(15214442-15214672)
chr4 (529-765)||(16026325-16026559)
chr4 (530-765)||(25513163-25513397)
chr4 (529-765)||(26445305-26445540)
chr4 (529-765)||(3485331-3485564)
chr4 (529-761)||(40229727-40229959)
chr4 (532-761)||(44024003-44024231)
chr4 (529-765)||(2425017-2425252)
chr4 (635-767)||(15883917-15884049)
chr4 (529-761)||(46740623-46740854)
chr4 (529-761)||(45314733-45314964)
chr4 (529-673)||(55582703-55582847)
chr4 (529-648)||(30147392-30147511)
chr4 (529-648)||(15534658-15534777)
chr4 (529-759)||(20595827-20596056)
chr4 (542-656)||(22725494-22725608)
chr4 (529-689)||(13046041-13046201)
chr4 (831-937)||(15880734-15880839)
chr4 (529-648)||(14049054-14049173)
chr4 (529-672)||(18108274-18108417)
chr4 (529-648)||(36038347-36038466)
chr4 (529-648)||(49547340-49547459)
chr4 (530-648)||(12033341-12033459)
chr4 (530-648)||(44615765-44615883)
chr4 (684-765)||(13036328-13036409)
chr4 (833-962)||(13844584-13844712)
chr4 (624-765)||(14508182-14508322)
chr4 (693-797)||(9871126-9871229)
chr4 (529-684)||(19081737-19081892)
chr4 (529-640)||(14185427-14185538)
chr4 (795-957)||(46642884-46643058)
chr4 (530-648)||(50221907-50222025)
chr4 (40-451)||(20872330-20872737)
chr4 (529-689)||(17376062-17376222)
chr4 (531-648)||(19243177-19243294)
chr4 (624-758)||(12622799-12622932)
chr4 (691-767)||(43251120-43251197)
chr4 (529-686)||(54364086-54364243)
chr4 (304-543)||(9886387-9886626)
chr4 (530-648)||(29267830-29267948)
chr4 (716-765)||(26922254-26922303)
chr4 (529-586)||(9871071-9871128)
chr4 (76-224)||(18554858-18555006)
chr4 (832-901)||(52873251-52873319)
chr4 (529-594)||(55377205-55377270)
chr4 (833-893)||(362213-362272)
chr4 (351-538)||(18555309-18555497)
chr4 (842-901)||(9923369-9923427)
chr4 (842-901)||(11479432-11479490)
chr4 (529-619)||(18247739-18247829)
chr4 (529-619)||(19020009-19020099)
chr4 (529-619)||(22355079-22355169)
chr4 (529-594)||(5683375-5683440)
chr4 (529-594)||(14951295-14951360)
chr4 (716-765)||(55582624-55582673)
chr4 (440-544)||(13234547-13234651)
chr4 (529-593)||(15117919-15117983)
chr4 (529-593)||(16731702-16731766)
chr4 (758-901)||(35812115-35812269)
chr4 (529-592)||(7640753-7640816)
chr4 (842-881)||(14185252-14185291)
chr4 (529-592)||(18239179-18239242)
chr4 (67-168)||(13235113-13235214)
chr4 (801-839)||(13844720-13844758)
chr4 (533-619)||(17146303-17146389)
chr4 (529-567)||(18168345-18168383)
chr4 (529-619)||(47357183-47357273)
chr4 (852-901)||(13844498-13844547)
chr4 (800-837)||(14185309-14185346)
chr4 (883-952)||(15190360-15190428)
chr4 (529-594)||(15287878-15287943)
chr4 (529-594)||(15294988-15295053)
chr4 (529-594)||(18293675-18293740)
chr4 (832-901)||(46642793-46642861)
chr4 (529-565)||(14995698-14995734)
chr4 (883-962)||(15099383-15099461)
chr4 (529-571)||(8374088-8374130)
chr4 (529-619)||(10643746-10643836)
chr4 (419-452)||(11557822-11557855)
chr4 (40-224)||(13267830-13268014)
chr4 (529-622)||(19622912-19623005)
chr4 (185-286)||(22201181-22201281)
chr4 (529-594)||(25120054-25120119)
chr4 (529-629)||(32461313-32461414)
[»] scaffold0153 (2 HSPs)
scaffold0153 (17-714)||(4568-5272)
scaffold0153 (17-623)||(11679-12292)
[»] chr3 (178 HSPs)
chr3 (17-794)||(14966393-14967159)
chr3 (17-563)||(52988935-52989491)
chr3 (529-940)||(11912955-11913377)
chr3 (529-962)||(31224349-31224794)
chr3 (529-901)||(1988628-1989012)
chr3 (529-794)||(24152840-24153105)
chr3 (529-793)||(10833735-10833999)
chr3 (529-765)||(11192501-11192736)
chr3 (529-767)||(14641946-14642184)
chr3 (529-787)||(2248366-2248624)
chr3 (529-799)||(3394398-3394667)
chr3 (529-798)||(179103-179371)
chr3 (529-799)||(12275936-12276205)
chr3 (529-794)||(43550073-43550338)
chr3 (533-797)||(6158786-6159049)
chr3 (529-765)||(40807416-40807652)
chr3 (529-787)||(50243131-50243389)
chr3 (529-763)||(50351396-50351630)
chr3 (533-793)||(8928065-8928325)
chr3 (529-765)||(14441588-14441824)
chr3 (529-764)||(6819530-6819765)
chr3 (529-799)||(13522806-13523076)
chr3 (529-767)||(18367154-18367392)
chr3 (529-765)||(54875879-54876115)
chr3 (529-790)||(16643400-16643661)
chr3 (529-765)||(5206050-5206286)
chr3 (529-765)||(14508268-14508503)
chr3 (529-765)||(17693488-17693724)
chr3 (529-761)||(43928775-43929007)
chr3 (529-767)||(10989200-10989437)
chr3 (529-767)||(16979328-16979566)
chr3 (532-794)||(18889755-18890017)
chr3 (529-765)||(2841859-2842094)
chr3 (529-765)||(40812253-40812489)
chr3 (529-759)||(33564555-33564785)
chr3 (530-767)||(6805358-6805595)
chr3 (530-767)||(42324618-42324855)
chr3 (529-765)||(35064977-35065212)
chr3 (529-767)||(37038236-37038475)
chr3 (529-784)||(55292037-55292292)
chr3 (533-759)||(53646460-53646686)
chr3 (580-765)||(44273894-44274079)
chr3 (566-782)||(13029709-13029925)
chr3 (529-765)||(17538527-17538762)
chr3 (529-765)||(17685239-17685475)
chr3 (529-765)||(22306979-22307215)
chr3 (529-784)||(10554668-10554923)
chr3 (529-767)||(41945-42183)
chr3 (529-767)||(35961283-35961521)
chr3 (529-794)||(9533520-9533785)
chr3 (529-794)||(14763357-14763622)
chr3 (529-758)||(17670105-17670334)
chr3 (566-782)||(13026117-13026333)
chr3 (529-765)||(15931903-15932139)
chr3 (529-757)||(20248380-20248608)
chr3 (532-765)||(13519702-13519936)
chr3 (529-755)||(17513010-17513236)
chr3 (529-794)||(23371103-23371368)
chr3 (127-371)||(36528533-36528775)
chr3 (529-763)||(43889195-43889429)
chr3 (529-762)||(3803258-3803491)
chr3 (529-765)||(35354019-35354258)
chr3 (529-757)||(38311399-38311628)
chr3 (529-765)||(12511268-12511504)
chr3 (529-765)||(17519269-17519505)
chr3 (529-765)||(17534131-17534367)
chr3 (529-767)||(10563127-10563365)
chr3 (529-759)||(17044392-17044622)
chr3 (532-742)||(18893067-18893277)
chr3 (529-794)||(51300786-51301051)
chr3 (529-755)||(19443941-19444167)
chr3 (529-765)||(10541854-10542090)
chr3 (530-765)||(41172767-41173003)
chr3 (529-765)||(14519683-14519918)
chr3 (529-765)||(18699869-18700105)
chr3 (533-761)||(50348426-50348654)
chr3 (529-765)||(49900148-49900392)
chr3 (580-765)||(12470222-12470407)
chr3 (530-765)||(14671244-14671479)
chr3 (127-371)||(3264107-3264345)
chr3 (529-765)||(50755778-50756013)
chr3 (532-767)||(16324940-16325175)
chr3 (537-765)||(6156126-6156353)
chr3 (530-765)||(9511563-9511797)
chr3 (530-765)||(9519538-9519772)
chr3 (529-757)||(18739325-18739551)
chr3 (529-660)||(51602996-51603127)
chr3 (529-765)||(14152795-14153031)
chr3 (529-764)||(17937949-17938182)
chr3 (579-721)||(14567658-14567800)
chr3 (529-765)||(54330702-54330937)
chr3 (529-764)||(15565935-15566169)
chr3 (529-680)||(17046631-17046782)
chr3 (529-765)||(24546257-24546496)
chr3 (529-764)||(25104600-25104832)
chr3 (529-662)||(19568807-19568940)
chr3 (529-676)||(5215156-5215303)
chr3 (346-640)||(36528062-36528365)
chr3 (335-640)||(3264502-3264817)
chr3 (529-765)||(12952462-12952697)
chr3 (529-761)||(17207766-17207996)
chr3 (529-656)||(46723022-46723149)
chr3 (599-749)||(5223566-5223716)
chr3 (792-962)||(15447658-15447837)
chr3 (633-749)||(15465337-15465453)
chr3 (633-749)||(26055128-26055244)
chr3 (666-765)||(11258887-11258986)
chr3 (529-639)||(14647499-14647609)
chr3 (607-767)||(22652250-22652409)
chr3 (842-962)||(31415416-31415535)
chr3 (667-794)||(52989492-52989618)
chr3 (529-648)||(12305599-12305718)
chr3 (529-648)||(15465631-15465750)
chr3 (831-936)||(6808175-6808279)
chr3 (532-653)||(8631274-8631395)
chr3 (529-638)||(54521309-54521418)
chr3 (529-648)||(5223860-5223979)
chr3 (529-648)||(26054831-26054950)
chr3 (529-624)||(13436799-13436894)
chr3 (529-648)||(29544408-29544527)
chr3 (667-765)||(14682743-14682841)
chr3 (529-689)||(8023718-8023878)
chr3 (529-648)||(22764026-22764145)
chr3 (529-648)||(28848188-28848307)
chr3 (712-794)||(18892981-18893063)
chr3 (706-765)||(19568941-19569000)
chr3 (529-631)||(11258984-11259086)
chr3 (530-648)||(15978009-15978127)
chr3 (832-901)||(49969963-49970032)
chr3 (769-957)||(12269620-12269817)
chr3 (530-648)||(7780914-7781032)
chr3 (530-638)||(16453847-16453955)
chr3 (564-639)||(11986837-11986912)
chr3 (529-689)||(6002443-6002603)
chr3 (717-765)||(17046582-17046630)
chr3 (73-224)||(22161555-22161706)
chr3 (529-689)||(40039740-40039900)
chr3 (529-572)||(17956848-17956891)
chr3 (903-962)||(18439864-18439923)
chr3 (774-821)||(12158633-12158680)
chr3 (529-624)||(17759054-17759149)
chr3 (529-624)||(19060374-19060469)
chr3 (529-594)||(1468633-1468698)
chr3 (54-166)||(10340938-10341050)
chr3 (529-594)||(14528644-14528709)
chr3 (852-901)||(20630210-20630259)
chr3 (529-594)||(54039146-54039211)
chr3 (73-224)||(21999360-21999511)
chr3 (529-593)||(34159857-34159921)
chr3 (678-765)||(42353218-42353306)
chr3 (883-962)||(1465419-1465497)
chr3 (529-648)||(10247290-10247409)
chr3 (529-572)||(16820509-16820552)
chr3 (529-572)||(25058345-25058388)
chr3 (529-572)||(49231815-49231858)
chr3 (529-592)||(55477023-55477086)
chr3 (529-654)||(4656182-4656305)
chr3 (529-619)||(8276493-8276583)
chr3 (529-567)||(12808557-12808595)
chr3 (529-571)||(28557418-28557460)
chr3 (529-619)||(30152450-30152540)
chr3 (842-929)||(49389772-49389859)
chr3 (529-690)||(14284518-14284679)
chr3 (529-594)||(16934830-16934895)
chr3 (832-901)||(18439941-18440009)
chr3 (410-491)||(27868748-27868828)
chr3 (529-594)||(51158663-51158728)
chr3 (529-593)||(17463709-17463773)
chr3 (73-224)||(21976929-21977080)
chr3 (54-174)||(10302604-10302725)
chr3 (529-592)||(15412963-15413026)
chr3 (410-448)||(1468697-1468735)
chr3 (529-619)||(8269382-8269472)
chr3 (723-765)||(14568649-14568691)
chr3 (41-222)||(27868380-27868561)
chr3 (859-901)||(30175304-30175346)
chr3 (863-901)||(40812058-40812096)
chr3 (832-901)||(12269529-12269597)
[»] scaffold0686 (2 HSPs)
scaffold0686 (17-654)||(767-1414)
scaffold0686 (529-572)||(6949-6992)
[»] scaffold0174 (2 HSPs)
scaffold0174 (17-559)||(13060-13612)
scaffold0174 (529-689)||(20470-20630)
[»] chr7 (170 HSPs)
chr7 (17-559)||(11091080-11091621)
chr7 (134-794)||(46579915-46580571)
chr7 (239-767)||(48812256-48812794)
chr7 (529-929)||(15213744-15214155)
chr7 (529-962)||(30820652-30821096)
chr7 (529-962)||(36685645-36686090)
chr7 (529-793)||(18456044-18456308)
chr7 (529-799)||(8756792-8757061)
chr7 (529-797)||(58814-59081)
chr7 (529-797)||(17070689-17070956)
chr7 (529-767)||(708951-709189)
chr7 (529-839)||(37727323-37727631)
chr7 (529-762)||(14415880-14416113)
chr7 (529-765)||(33001334-33001570)
chr7 (529-767)||(32160598-32160836)
chr7 (529-799)||(40555139-40555408)
chr7 (529-767)||(47975307-47975545)
chr7 (529-794)||(11661497-11661761)
chr7 (529-794)||(13647633-13647898)
chr7 (529-767)||(14191484-14191720)
chr7 (533-799)||(12755106-12755371)
chr7 (529-767)||(13408190-13408428)
chr7 (529-767)||(16462454-16462692)
chr7 (529-763)||(19282514-19282748)
chr7 (529-765)||(12465656-12465892)
chr7 (529-765)||(13745172-13745408)
chr7 (529-757)||(15167403-15167631)
chr7 (529-765)||(44374366-44374602)
chr7 (529-765)||(44383231-44383467)
chr7 (529-767)||(14188690-14188926)
chr7 (529-799)||(832419-832688)
chr7 (529-799)||(1197599-1197868)
chr7 (529-767)||(16550400-16550638)
chr7 (529-767)||(16615024-16615262)
chr7 (529-793)||(29004214-29004478)
chr7 (529-799)||(4325443-4325712)
chr7 (529-765)||(12371695-12371931)
chr7 (529-765)||(46386483-46386719)
chr7 (533-761)||(48743727-48743955)
chr7 (529-767)||(13699285-13699523)
chr7 (529-767)||(47094498-47094736)
chr7 (529-765)||(11066888-11067124)
chr7 (529-765)||(13147868-13148104)
chr7 (529-753)||(32771760-32771984)
chr7 (529-784)||(17505400-17505655)
chr7 (529-784)||(17547559-17547814)
chr7 (529-767)||(34957589-34957827)
chr7 (529-794)||(18607678-18607943)
chr7 (529-757)||(10896390-10896618)
chr7 (529-794)||(14422176-14422441)
chr7 (529-794)||(18872551-18872816)
chr7 (529-767)||(38828479-38828717)
chr7 (529-794)||(16008769-16009034)
chr7 (529-765)||(8851555-8851791)
chr7 (529-761)||(32433985-32434217)
chr7 (530-790)||(16998821-16999087)
chr7 (529-794)||(147809-148074)
chr7 (529-794)||(14566393-14566658)
chr7 (529-733)||(13864791-13864995)
chr7 (529-765)||(20585776-20586008)
chr7 (533-761)||(14153372-14153599)
chr7 (599-765)||(12127630-12127796)
chr7 (605-765)||(13745672-13745832)
chr7 (533-765)||(14258772-14259004)
chr7 (529-765)||(21538585-21538820)
chr7 (529-765)||(32301602-32301838)
chr7 (529-730)||(12323326-12323527)
chr7 (529-710)||(29052551-29052732)
chr7 (529-765)||(14928728-14928964)
chr7 (599-759)||(15119761-15119921)
chr7 (529-765)||(15352194-15352430)
chr7 (529-684)||(15720250-15720405)
chr7 (529-765)||(16580080-16580316)
chr7 (529-757)||(20619714-20619942)
chr7 (529-765)||(39292133-39292368)
chr7 (641-794)||(14273739-14273892)
chr7 (628-765)||(13894515-13894652)
chr7 (608-765)||(16460407-16460564)
chr7 (529-765)||(43277139-43277376)
chr7 (529-765)||(24270378-24270613)
chr7 (529-765)||(25941858-25942093)
chr7 (607-765)||(16585425-16585583)
chr7 (529-765)||(18875242-18875478)
chr7 (529-765)||(48213341-48213576)
chr7 (529-760)||(15978452-15978682)
chr7 (529-759)||(9743477-9743706)
chr7 (757-937)||(11085036-11085227)
chr7 (529-765)||(4691292-4691527)
chr7 (529-761)||(14161251-14161482)
chr7 (529-765)||(3287417-3287646)
chr7 (537-760)||(3192697-3192920)
chr7 (757-954)||(11092757-11092965)
chr7 (626-749)||(13918260-13918383)
chr7 (351-625)||(11309869-11310153)
chr7 (537-764)||(18080122-18080348)
chr7 (633-749)||(25926993-25927109)
chr7 (831-954)||(9320439-9320561)
chr7 (542-765)||(20252751-20252973)
chr7 (529-626)||(13897805-13897902)
chr7 (529-763)||(8563987-8564220)
chr7 (533-765)||(15576233-15576462)
chr7 (529-761)||(8514142-8514373)
chr7 (842-962)||(38480249-38480368)
chr7 (529-648)||(1856796-1856915)
chr7 (529-648)||(23664519-23664638)
chr7 (529-760)||(28719885-28720105)
chr7 (529-648)||(11303724-11303843)
chr7 (529-648)||(13917969-13918088)
chr7 (529-648)||(29800906-29801025)
chr7 (529-681)||(46473562-46473714)
chr7 (529-648)||(16108255-16108374)
chr7 (529-648)||(25926696-25926815)
chr7 (529-648)||(29797087-29797206)
chr7 (20-96)||(46579839-46579915)
chr7 (529-759)||(3136721-3136947)
chr7 (656-765)||(20487863-20487972)
chr7 (529-648)||(32125967-32126086)
chr7 (530-648)||(41523394-41523512)
chr7 (530-648)||(41525856-41525974)
chr7 (795-937)||(15439322-15439477)
chr7 (633-695)||(1857092-1857154)
chr7 (17-87)||(11085425-11085495)
chr7 (530-648)||(24702705-24702823)
chr7 (530-648)||(24705152-24705270)
chr7 (529-613)||(44190645-44190729)
chr7 (706-765)||(15720196-15720255)
chr7 (529-688)||(37538905-37539064)
chr7 (529-593)||(14105863-14105927)
chr7 (529-661)||(16065971-16066103)
chr7 (533-648)||(14948693-14948808)
chr7 (716-765)||(21675491-21675540)
chr7 (529-648)||(18431188-18431307)
chr7 (529-675)||(12191835-12191981)
chr7 (832-901)||(8468386-8468454)
chr7 (832-901)||(14270138-14270206)
chr7 (833-901)||(45847735-45847802)
chr7 (56-138)||(16379147-16379230)
chr7 (903-962)||(17232666-17232725)
chr7 (529-594)||(125990-126055)
chr7 (529-594)||(7822038-7822103)
chr7 (529-594)||(7829349-7829414)
chr7 (529-594)||(11287001-11287066)
chr7 (440-537)||(16379716-16379813)
chr7 (832-893)||(17232588-17232648)
chr7 (529-594)||(27102531-27102596)
chr7 (529-594)||(27109879-27109944)
chr7 (529-594)||(27175730-27175795)
chr7 (529-594)||(38784623-38784688)
chr7 (529-593)||(15376280-15376344)
chr7 (529-593)||(20384690-20384754)
chr7 (883-962)||(9389705-9389783)
chr7 (529-584)||(16383153-16383208)
chr7 (529-572)||(19194764-19194807)
chr7 (106-224)||(11800147-11800265)
chr7 (529-619)||(15760758-15760848)
chr7 (903-956)||(8468471-8468524)
chr7 (529-594)||(10001004-10001069)
chr7 (529-593)||(456853-456917)
chr7 (529-593)||(27217392-27217456)
chr7 (529-613)||(39431624-39431707)
chr7 (706-749)||(1858646-1858689)
chr7 (529-632)||(21660570-21660673)
chr7 (842-901)||(37727648-37727707)
chr7 (410-448)||(7822001-7822039)
chr7 (410-448)||(7829312-7829350)
chr7 (410-448)||(27102595-27102633)
chr7 (410-448)||(27109943-27109981)
chr7 (410-448)||(27175693-27175731)
chr7 (410-448)||(38784687-38784725)
chr7 (757-794)||(11768777-11768814)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (17-559)||(1361-1913)
[»] scaffold0737 (2 HSPs)
scaffold0737 (533-954)||(6077-6510)
scaffold0737 (529-765)||(5109-5345)
[»] chr5 (119 HSPs)
chr5 (529-925)||(36460219-36460626)
chr5 (529-962)||(21557440-21557885)
chr5 (529-962)||(21554775-21555219)
chr5 (529-794)||(18418803-18419068)
chr5 (529-794)||(22412398-22412662)
chr5 (529-765)||(32607721-32607957)
chr5 (529-799)||(24277002-24277271)
chr5 (529-799)||(24384942-24385211)
chr5 (533-794)||(30138564-30138824)
chr5 (529-956)||(17875232-17875655)
chr5 (529-765)||(21399400-21399635)
chr5 (529-792)||(6766054-6766317)
chr5 (529-767)||(263275-263513)
chr5 (529-767)||(17011144-17011382)
chr5 (533-799)||(17812783-17813048)
chr5 (529-791)||(29448232-29448494)
chr5 (529-787)||(31456196-31456454)
chr5 (529-764)||(27868971-27869206)
chr5 (529-765)||(20565974-20566210)
chr5 (529-765)||(19921054-19921289)
chr5 (529-761)||(20197982-20198216)
chr5 (529-759)||(26761827-26762057)
chr5 (529-757)||(22750372-22750597)
chr5 (529-794)||(38145134-38145399)
chr5 (529-759)||(8833603-8833824)
chr5 (529-762)||(41875989-41876222)
chr5 (687-962)||(12122076-12122361)
chr5 (533-767)||(33472964-33473198)
chr5 (529-794)||(28370652-28370917)
chr5 (529-767)||(22758286-22758525)
chr5 (529-757)||(19511614-19511843)
chr5 (529-794)||(37598513-37598778)
chr5 (529-757)||(22336748-22336976)
chr5 (551-759)||(33895300-33895508)
chr5 (529-794)||(42960767-42961033)
chr5 (529-757)||(22340286-22340514)
chr5 (530-765)||(36509181-36509409)
chr5 (529-684)||(40917369-40917524)
chr5 (529-765)||(16062906-16063141)
chr5 (529-765)||(1627777-1628012)
chr5 (529-765)||(16605000-16605235)
chr5 (529-765)||(18744070-18744305)
chr5 (530-761)||(8504266-8504496)
chr5 (529-763)||(14026204-14026437)
chr5 (529-656)||(24617319-24617446)
chr5 (529-656)||(24713550-24713677)
chr5 (529-656)||(24746578-24746705)
chr5 (529-761)||(23199788-23200017)
chr5 (529-656)||(24668593-24668720)
chr5 (529-656)||(24738362-24738489)
chr5 (529-656)||(24751131-24751258)
chr5 (599-765)||(22111020-22111185)
chr5 (757-962)||(30615768-30615983)
chr5 (529-689)||(17908963-17909123)
chr5 (529-760)||(28901346-28901576)
chr5 (529-760)||(28937741-28937971)
chr5 (529-639)||(43243054-43243164)
chr5 (529-648)||(37804469-37804588)
chr5 (831-957)||(24212385-24212510)
chr5 (831-931)||(35852666-35852765)
chr5 (351-538)||(25581944-25582130)
chr5 (798-962)||(31455702-31455881)
chr5 (40-446)||(25581448-25581848)
chr5 (833-962)||(5889124-5889252)
chr5 (842-962)||(31455089-31455211)
chr5 (115-441)||(32948402-32948721)
chr5 (529-756)||(31478801-31479026)
chr5 (530-648)||(10732508-10732626)
chr5 (333-545)||(13938457-13938669)
chr5 (351-538)||(32948116-32948303)
chr5 (530-648)||(42244933-42245051)
chr5 (629-765)||(30611973-30612108)
chr5 (629-765)||(30613933-30614068)
chr5 (621-761)||(26749538-26749677)
chr5 (529-648)||(29351402-29351521)
chr5 (529-619)||(22367114-22367204)
chr5 (529-594)||(27183188-27183253)
chr5 (529-648)||(29346456-29346575)
chr5 (529-648)||(29348929-29349048)
chr5 (842-901)||(29915177-29915235)
chr5 (832-901)||(5889269-5889337)
chr5 (530-619)||(21074229-21074318)
chr5 (529-594)||(21933262-21933327)
chr5 (529-594)||(21939432-21939497)
chr5 (529-594)||(35581365-35581430)
chr5 (529-594)||(36990658-36990723)
chr5 (529-593)||(1168811-1168875)
chr5 (902-962)||(21741559-21741619)
chr5 (529-572)||(1220363-1220406)
chr5 (757-839)||(5889036-5889116)
chr5 (529-592)||(23065046-23065109)
chr5 (529-619)||(11903-11993)
chr5 (529-619)||(18778625-18778715)
chr5 (410-448)||(21933326-21933364)
chr5 (410-448)||(21939496-21939534)
chr5 (529-619)||(25426177-25426267)
chr5 (67-138)||(25791722-25791795)
chr5 (529-594)||(7424902-7424967)
chr5 (529-626)||(7528421-7528518)
chr5 (529-594)||(11212713-11212778)
chr5 (529-594)||(22883923-22883988)
chr5 (529-594)||(43444028-43444093)
chr5 (529-593)||(20909543-20909607)
chr5 (529-572)||(10778811-10778854)
chr5 (529-572)||(19499475-19499518)
chr5 (158-277)||(24564665-24564783)
chr5 (158-277)||(24605700-24605818)
chr5 (529-572)||(35791744-35791787)
chr5 (529-592)||(39245668-39245731)
chr5 (529-592)||(39363916-39363979)
chr5 (529-619)||(11342190-11342280)
chr5 (384-450)||(24564504-24564570)
chr5 (384-450)||(24605539-24605605)
chr5 (530-572)||(32950260-32950302)
chr5 (410-448)||(35581328-35581366)
chr5 (410-448)||(36990722-36990760)
chr5 (215-276)||(13938719-13938779)
chr5 (529-594)||(23506528-23506593)
chr5 (54-138)||(23909077-23909161)
[»] scaffold0599 (2 HSPs)
scaffold0599 (529-940)||(231-653)
scaffold0599 (831-940)||(4649-4757)
[»] chr1 (88 HSPs)
chr1 (17-251)||(21995741-21995975)
chr1 (529-767)||(44822518-44822756)
chr1 (529-797)||(8276388-8276655)
chr1 (529-799)||(21180721-21180990)
chr1 (529-794)||(28312739-28313004)
chr1 (529-765)||(21239691-21239927)
chr1 (529-799)||(24815248-24815517)
chr1 (529-786)||(20031286-20031543)
chr1 (529-767)||(2332606-2332844)
chr1 (529-794)||(22130461-22130726)
chr1 (529-767)||(50000891-50001130)
chr1 (529-799)||(7792248-7792517)
chr1 (529-799)||(16401055-16401324)
chr1 (533-765)||(41225851-41226083)
chr1 (533-765)||(41227104-41227336)
chr1 (529-765)||(42912470-42912706)
chr1 (529-765)||(7052451-7052688)
chr1 (529-767)||(29764030-29764272)
chr1 (529-765)||(12710308-12710544)
chr1 (530-765)||(51323695-51323930)
chr1 (529-767)||(46198121-46198359)
chr1 (529-794)||(13881012-13881277)
chr1 (529-765)||(20588099-20588335)
chr1 (529-765)||(20592637-20592873)
chr1 (532-767)||(38057050-38057285)
chr1 (529-794)||(20437623-20437888)
chr1 (529-765)||(38887483-38887720)
chr1 (529-765)||(4596241-4596477)
chr1 (529-765)||(16058710-16058946)
chr1 (529-765)||(19676131-19676367)
chr1 (529-765)||(21046445-21046681)
chr1 (529-799)||(22349975-22350244)
chr1 (529-767)||(296773-297011)
chr1 (529-755)||(23194947-23195173)
chr1 (529-765)||(45496365-45496602)
chr1 (529-787)||(45574448-45574695)
chr1 (540-765)||(14238019-14238244)
chr1 (529-765)||(20634030-20634267)
chr1 (533-765)||(51082636-51082868)
chr1 (529-765)||(50544272-50544507)
chr1 (529-757)||(16372178-16372407)
chr1 (529-765)||(22823803-22824038)
chr1 (529-761)||(1643020-1643249)
chr1 (529-765)||(39060516-39060752)
chr1 (529-765)||(17902158-17902393)
chr1 (757-913)||(51326904-51327058)
chr1 (529-761)||(14792958-14793189)
chr1 (529-762)||(24720090-24720322)
chr1 (529-761)||(44891873-44892103)
chr1 (529-644)||(21659685-21659800)
chr1 (606-767)||(294454-294624)
chr1 (529-765)||(6833635-6833870)
chr1 (529-765)||(18121025-18121260)
chr1 (529-688)||(9784739-9784898)
chr1 (529-648)||(13227340-13227459)
chr1 (529-648)||(29535528-29535647)
chr1 (757-944)||(12328479-12328677)
chr1 (529-760)||(16655793-16656023)
chr1 (831-954)||(51274298-51274420)
chr1 (831-902)||(8885468-8885539)
chr1 (530-648)||(16362395-16362513)
chr1 (530-648)||(21841243-21841361)
chr1 (530-648)||(21922859-21922977)
chr1 (833-962)||(28194397-28194525)
chr1 (530-648)||(41372948-41373066)
chr1 (529-640)||(10812765-10812876)
chr1 (833-962)||(43697418-43697546)
chr1 (530-638)||(23593301-23593409)
chr1 (883-962)||(20636883-20636961)
chr1 (832-901)||(28194543-28194611)
chr1 (832-901)||(43543069-43543137)
chr1 (883-956)||(49261380-49261452)
chr1 (529-594)||(17003934-17003999)
chr1 (529-593)||(13989397-13989461)
chr1 (529-619)||(18060594-18060684)
chr1 (529-595)||(21650889-21650955)
chr1 (797-839)||(43697554-43697596)
chr1 (419-455)||(21495968-21496004)
chr1 (529-577)||(38055971-38056019)
chr1 (536-615)||(20708726-20708805)
chr1 (110-240)||(15544090-15544220)
chr1 (410-448)||(17003897-17003935)
chr1 (529-619)||(22366527-22366617)
chr1 (410-448)||(38056036-38056074)
chr1 (863-901)||(48301083-48301121)
chr1 (529-594)||(21858617-21858682)
chr1 (832-901)||(43697332-43697400)
chr1 (833-901)||(46382652-46382717)
[»] scaffold0328 (1 HSPs)
scaffold0328 (529-799)||(19040-19309)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (529-794)||(15964-16229)
[»] scaffold0180 (2 HSPs)
scaffold0180 (529-765)||(28764-29000)
scaffold0180 (529-624)||(9996-10091)
[»] scaffold0337 (1 HSPs)
scaffold0337 (529-794)||(9352-9617)
[»] scaffold0290 (2 HSPs)
scaffold0290 (529-794)||(384-649)
scaffold0290 (40-128)||(11953-12041)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (498-794)||(12360-12656)
[»] scaffold0023 (4 HSPs)
scaffold0023 (540-794)||(105304-105557)
scaffold0023 (529-767)||(162702-162940)
scaffold0023 (529-593)||(94942-95006)
scaffold0023 (529-559)||(154871-154901)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (529-794)||(408-672)
[»] scaffold0334 (2 HSPs)
scaffold0334 (529-765)||(1505-1741)
scaffold0334 (529-700)||(1-172)
[»] scaffold0106 (2 HSPs)
scaffold0106 (529-765)||(21153-21389)
scaffold0106 (529-594)||(41282-41347)
[»] scaffold0026 (4 HSPs)
scaffold0026 (529-767)||(21499-21737)
scaffold0026 (529-794)||(110878-111143)
scaffold0026 (529-765)||(146152-146388)
scaffold0026 (529-755)||(123956-124182)
[»] scaffold0630 (1 HSPs)
scaffold0630 (529-797)||(8453-8720)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (529-797)||(6188-6455)
[»] scaffold0061 (4 HSPs)
scaffold0061 (529-765)||(14982-15218)
scaffold0061 (529-765)||(24040-24276)
scaffold0061 (833-893)||(15439-15499)
scaffold0061 (833-893)||(24497-24557)
[»] scaffold0220 (3 HSPs)
scaffold0220 (529-767)||(13364-13602)
scaffold0220 (530-767)||(16182-16419)
scaffold0220 (539-733)||(8688-8882)
[»] scaffold0338 (3 HSPs)
scaffold0338 (529-782)||(3338-3591)
scaffold0338 (529-603)||(1-75)
scaffold0338 (529-594)||(8591-8656)
[»] scaffold1283 (1 HSPs)
scaffold1283 (529-765)||(863-1099)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (529-765)||(39519-39755)
[»] scaffold0607 (1 HSPs)
scaffold0607 (529-799)||(3093-3362)
[»] scaffold0515 (1 HSPs)
scaffold0515 (529-767)||(4448-4690)
[»] scaffold0306 (1 HSPs)
scaffold0306 (529-767)||(4448-4690)
[»] scaffold0001 (5 HSPs)
scaffold0001 (533-786)||(152610-152863)
scaffold0001 (529-797)||(77076-77343)
scaffold0001 (529-767)||(176210-176448)
scaffold0001 (529-767)||(168857-169095)
scaffold0001 (842-901)||(76962-77019)
[»] scaffold0104 (4 HSPs)
scaffold0104 (529-753)||(26358-26582)
scaffold0104 (529-753)||(27740-27964)
scaffold0104 (529-765)||(7639-7875)
scaffold0104 (529-765)||(14270-14506)
[»] scaffold0109 (3 HSPs)
scaffold0109 (529-767)||(2757-2994)
scaffold0109 (529-765)||(373-609)
scaffold0109 (540-765)||(5687-5912)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (529-799)||(159346-159615)
[»] scaffold0635 (1 HSPs)
scaffold0635 (530-799)||(7271-7539)
[»] scaffold0151 (1 HSPs)
scaffold0151 (529-765)||(9475-9711)
[»] scaffold0080 (4 HSPs)
scaffold0080 (529-765)||(22187-22423)
scaffold0080 (533-793)||(29124-29384)
scaffold0080 (533-793)||(34589-34849)
scaffold0080 (758-902)||(59231-59386)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (529-765)||(78484-78720)
[»] scaffold0672 (1 HSPs)
scaffold0672 (533-763)||(7956-8186)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (529-763)||(21677-21911)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (529-767)||(5876-6114)
[»] scaffold0364 (3 HSPs)
scaffold0364 (540-765)||(7553-7778)
scaffold0364 (110-448)||(14164-14495)
scaffold0364 (413-544)||(13877-14008)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (531-799)||(51345-51612)
scaffold0042 (540-666)||(67187-67313)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (530-794)||(82378-82641)
[»] scaffold0384 (1 HSPs)
scaffold0384 (551-765)||(7803-8017)
[»] scaffold0123 (2 HSPs)
scaffold0123 (529-767)||(6443-6681)
scaffold0123 (598-765)||(16358-16524)
[»] scaffold0108 (2 HSPs)
scaffold0108 (533-767)||(5835-6069)
scaffold0108 (529-765)||(7179-7413)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (529-767)||(11903-12141)
[»] scaffold1783 (1 HSPs)
scaffold1783 (529-794)||(641-905)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (530-799)||(8444-8712)
[»] scaffold0083 (4 HSPs)
scaffold0083 (529-765)||(378-614)
scaffold0083 (529-765)||(5682-5918)
scaffold0083 (529-640)||(1480-1591)
scaffold0083 (529-572)||(11401-11444)
[»] scaffold0462 (3 HSPs)
scaffold0462 (529-767)||(10638-10877)
scaffold0462 (529-761)||(744-974)
scaffold0462 (529-761)||(6250-6480)
[»] scaffold0064 (2 HSPs)
scaffold0064 (530-765)||(58168-58403)
scaffold0064 (529-648)||(68438-68557)
[»] scaffold0046 (1 HSPs)
scaffold0046 (529-767)||(22165-22403)
[»] scaffold0125 (2 HSPs)
scaffold0125 (534-794)||(1510-1770)
scaffold0125 (529-765)||(27720-27956)
[»] scaffold0057 (2 HSPs)
scaffold0057 (532-767)||(70227-70462)
scaffold0057 (529-662)||(71934-72067)
[»] scaffold0371 (3 HSPs)
scaffold0371 (529-759)||(10843-11073)
scaffold0371 (626-721)||(17223-17318)
scaffold0371 (774-837)||(3212-3275)
[»] scaffold0077 (5 HSPs)
scaffold0077 (529-767)||(22987-23225)
scaffold0077 (529-755)||(17653-17879)
scaffold0077 (529-738)||(33786-33995)
scaffold0077 (529-718)||(22575-22765)
scaffold0077 (624-755)||(23381-23512)
[»] scaffold0051 (3 HSPs)
scaffold0051 (529-758)||(64465-64694)
scaffold0051 (633-749)||(31386-31502)
scaffold0051 (529-648)||(31680-31799)
[»] scaffold0039 (2 HSPs)
scaffold0039 (529-765)||(10325-10562)
scaffold0039 (529-572)||(19919-19962)
[»] scaffold0632 (1 HSPs)
scaffold0632 (529-765)||(585-821)
[»] scaffold0452 (2 HSPs)
scaffold0452 (529-765)||(13061-13297)
scaffold0452 (529-760)||(8046-8277)
[»] scaffold0116 (4 HSPs)
scaffold0116 (531-799)||(35969-36236)
scaffold0116 (797-962)||(43682-43860)
scaffold0116 (797-962)||(47602-47780)
scaffold0116 (832-901)||(43878-43946)
[»] scaffold0802 (2 HSPs)
scaffold0802 (529-759)||(5063-5293)
scaffold0802 (842-901)||(5478-5536)
[»] scaffold0019 (4 HSPs)
scaffold0019 (537-794)||(133568-133825)
scaffold0019 (529-794)||(133141-133406)
scaffold0019 (605-765)||(29578-29738)
scaffold0019 (529-620)||(33803-33894)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (533-765)||(126168-126400)
scaffold0011 (529-761)||(32878-33109)
[»] scaffold0529 (2 HSPs)
scaffold0529 (579-765)||(7937-8123)
scaffold0529 (619-734)||(8152-8267)
[»] scaffold0335 (3 HSPs)
scaffold0335 (529-759)||(1130-1360)
scaffold0335 (529-594)||(6215-6280)
scaffold0335 (842-901)||(877-935)
[»] scaffold0544 (1 HSPs)
scaffold0544 (529-794)||(2123-2388)
[»] scaffold0439 (2 HSPs)
scaffold0439 (533-765)||(11579-11811)
scaffold0439 (529-765)||(3839-4076)
[»] scaffold0241 (3 HSPs)
scaffold0241 (529-765)||(1984-2220)
scaffold0241 (529-681)||(5413-5565)
scaffold0241 (673-765)||(5137-5229)
[»] scaffold0034 (5 HSPs)
scaffold0034 (529-765)||(120330-120566)
scaffold0034 (529-722)||(29593-29786)
scaffold0034 (529-594)||(39990-40055)
scaffold0034 (529-594)||(45473-45538)
scaffold0034 (529-594)||(79028-79093)
[»] scaffold0308 (1 HSPs)
scaffold0308 (564-767)||(12752-12955)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (530-765)||(143033-143268)
scaffold0020 (551-727)||(169415-169591)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (529-757)||(6984-7213)
[»] scaffold0111 (2 HSPs)
scaffold0111 (529-765)||(12932-13168)
scaffold0111 (706-765)||(19376-19435)
[»] scaffold1539 (1 HSPs)
scaffold1539 (534-765)||(1327-1558)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (541-767)||(138193-138419)
[»] scaffold1633 (1 HSPs)
scaffold1633 (529-765)||(625-861)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (529-765)||(5722-5958)
[»] scaffold0375 (1 HSPs)
scaffold0375 (582-758)||(8752-8928)
[»] scaffold0292 (1 HSPs)
scaffold0292 (529-765)||(6933-7169)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (529-728)||(23600-23799)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (529-763)||(21490-21724)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (533-730)||(106603-106800)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (529-765)||(21072-21308)
[»] scaffold0546 (3 HSPs)
scaffold0546 (540-765)||(7395-7620)
scaffold0546 (529-639)||(10313-10423)
scaffold0546 (713-765)||(11215-11267)
[»] scaffold0021 (1 HSPs)
scaffold0021 (529-765)||(168857-169094)
[»] scaffold1186 (1 HSPs)
scaffold1186 (529-765)||(1131-1367)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (529-765)||(30032-30268)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (529-765)||(186901-187137)
[»] scaffold0232 (1 HSPs)
scaffold0232 (529-765)||(3690-3926)
[»] scaffold0134 (2 HSPs)
scaffold0134 (617-765)||(9711-9858)
scaffold0134 (529-593)||(38353-38417)
[»] scaffold0146 (1 HSPs)
scaffold0146 (610-765)||(22478-22633)
[»] scaffold1766 (1 HSPs)
scaffold1766 (551-727)||(1112-1288)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (577-729)||(11101-11253)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (533-761)||(66432-66660)
scaffold0004 (832-901)||(362964-363032)
[»] scaffold1204 (1 HSPs)
scaffold1204 (530-760)||(747-977)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (529-765)||(25936-26171)
[»] scaffold0825 (2 HSPs)
scaffold0825 (529-672)||(1030-1173)
scaffold0825 (691-799)||(1373-1480)
[»] scaffold0521 (1 HSPs)
scaffold0521 (529-760)||(7931-8162)
[»] scaffold0117 (3 HSPs)
scaffold0117 (529-661)||(21285-21417)
scaffold0117 (633-749)||(39515-39631)
scaffold0117 (602-648)||(39809-39855)
[»] scaffold0054 (1 HSPs)
scaffold0054 (529-761)||(65377-65608)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (529-765)||(34685-34916)
[»] scaffold0684 (1 HSPs)
scaffold0684 (529-686)||(1-158)
[»] scaffold0401 (1 HSPs)
scaffold0401 (529-761)||(8244-8476)
[»] scaffold0149 (2 HSPs)
scaffold0149 (626-767)||(21059-21200)
scaffold0149 (774-821)||(36193-36240)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (529-764)||(10132-10356)
[»] scaffold0213 (2 HSPs)
scaffold0213 (529-765)||(18585-18820)
scaffold0213 (529-594)||(28494-28559)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (529-760)||(11603-11833)
[»] scaffold0138 (2 HSPs)
scaffold0138 (634-767)||(33336-33469)
scaffold0138 (532-648)||(33648-33764)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (529-761)||(18050-18281)
[»] scaffold0048 (1 HSPs)
scaffold0048 (533-761)||(56401-56628)
[»] scaffold0468 (1 HSPs)
scaffold0468 (529-760)||(11614-11844)
[»] scaffold0409 (2 HSPs)
scaffold0409 (529-760)||(2176-2406)
scaffold0409 (529-760)||(10431-10661)
[»] scaffold1160 (1 HSPs)
scaffold1160 (529-761)||(110-341)
[»] scaffold0063 (2 HSPs)
scaffold0063 (529-761)||(62143-62374)
scaffold0063 (529-593)||(39305-39369)
[»] scaffold0103 (1 HSPs)
scaffold0103 (529-758)||(32671-32899)
[»] scaffold0256 (2 HSPs)
scaffold0256 (529-673)||(2449-2593)
scaffold0256 (671-765)||(3059-3153)
[»] scaffold0230 (2 HSPs)
scaffold0230 (529-765)||(7251-7485)
scaffold0230 (530-648)||(14424-14542)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (529-670)||(2403-2543)
[»] scaffold0086 (1 HSPs)
scaffold0086 (529-765)||(35913-36148)
[»] scaffold0293 (2 HSPs)
scaffold0293 (626-749)||(19945-20068)
scaffold0293 (529-648)||(19655-19774)
[»] scaffold0071 (1 HSPs)
scaffold0071 (792-962)||(14352-14534)
[»] scaffold1351 (1 HSPs)
scaffold1351 (831-962)||(1578-1708)
[»] scaffold0317 (1 HSPs)
scaffold0317 (529-759)||(13168-13402)
[»] scaffold0414 (1 HSPs)
scaffold0414 (529-761)||(11743-11974)
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (529-649)||(24459-24579)
scaffold0162 (716-761)||(24586-24631)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (540-765)||(18533-18758)
[»] scaffold0369 (2 HSPs)
scaffold0369 (529-638)||(16384-16493)
scaffold0369 (687-765)||(16524-16602)
[»] scaffold0422 (1 HSPs)
scaffold0422 (529-648)||(3500-3619)
[»] scaffold2015 (1 HSPs)
scaffold2015 (529-627)||(79-177)
[»] scaffold0516 (1 HSPs)
scaffold0516 (540-690)||(8027-8177)
[»] scaffold0200 (2 HSPs)
scaffold0200 (633-749)||(17836-17952)
scaffold0200 (531-648)||(18130-18247)
[»] scaffold0436 (1 HSPs)
scaffold0436 (529-648)||(8495-8614)
[»] scaffold0815 (1 HSPs)
scaffold0815 (846-962)||(496-611)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (530-648)||(21225-21343)
[»] scaffold0013 (2 HSPs)
scaffold0013 (537-661)||(7781-7905)
scaffold0013 (716-764)||(7929-7977)
[»] scaffold1278 (1 HSPs)
scaffold1278 (529-759)||(880-1109)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (529-648)||(11766-11885)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (676-757)||(2377-2458)
[»] scaffold0434 (1 HSPs)
scaffold0434 (829-901)||(6767-6839)
[»] scaffold1405 (1 HSPs)
scaffold1405 (351-538)||(1217-1403)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (534-648)||(53-168)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (530-648)||(9718-9836)
[»] scaffold0127 (1 HSPs)
scaffold0127 (529-624)||(9601-9696)
[»] scaffold0145 (1 HSPs)
scaffold0145 (17-78)||(10650-10711)
[»] scaffold0956 (1 HSPs)
scaffold0956 (529-613)||(2319-2403)
[»] scaffold0381 (1 HSPs)
scaffold0381 (304-543)||(11918-12157)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (706-763)||(2362-2419)
[»] scaffold1662 (1 HSPs)
scaffold1662 (713-765)||(1-53)
[»] scaffold0016 (2 HSPs)
scaffold0016 (529-613)||(174544-174628)
scaffold0016 (529-559)||(167108-167138)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (903-955)||(85300-85352)
scaffold0009 (832-901)||(85207-85275)
[»] scaffold0810 (2 HSPs)
scaffold0810 (757-839)||(3112-3192)
scaffold0810 (842-901)||(3004-3062)
[»] scaffold0695 (1 HSPs)
scaffold0695 (529-648)||(6423-6542)
[»] scaffold0028 (5 HSPs)
scaffold0028 (530-648)||(134687-134805)
scaffold0028 (530-648)||(137156-137274)
scaffold0028 (530-648)||(139625-139743)
scaffold0028 (530-648)||(142094-142212)
scaffold0028 (530-648)||(144563-144681)
[»] scaffold0118 (2 HSPs)
scaffold0118 (94-224)||(11779-11909)
scaffold0118 (529-672)||(35026-35169)
[»] scaffold1753 (1 HSPs)
scaffold1753 (529-594)||(893-958)
[»] scaffold1164 (1 HSPs)
scaffold1164 (529-594)||(935-1000)
[»] scaffold0385 (1 HSPs)
scaffold0385 (40-128)||(16052-16140)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (299-448)||(1110-1259)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (832-901)||(36142-36210)
[»] scaffold1404 (1 HSPs)
scaffold1404 (529-572)||(1422-1465)
[»] scaffold0315 (1 HSPs)
scaffold0315 (529-572)||(18252-18295)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (529-592)||(37886-37949)
scaffold0044 (529-592)||(40932-40995)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (529-594)||(30495-30560)
[»] scaffold0076 (2 HSPs)
scaffold0076 (529-594)||(38400-38465)
scaffold0076 (410-448)||(38363-38401)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (529-594)||(53971-54036)
[»] scaffold1137 (1 HSPs)
scaffold1137 (883-962)||(2300-2378)
[»] scaffold1043 (1 HSPs)
scaffold1043 (410-451)||(951-992)
[»] scaffold0513 (1 HSPs)
scaffold0513 (832-901)||(10963-11031)
[»] scaffold0269 (1 HSPs)
scaffold0269 (529-594)||(15803-15868)
[»] scaffold0173 (1 HSPs)
scaffold0173 (529-690)||(4680-4841)
[»] scaffold0094 (1 HSPs)
scaffold0094 (76-224)||(2637-2785)
[»] scaffold0377 (1 HSPs)
scaffold0377 (774-814)||(16753-16793)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (622-690)||(40902-40970)
scaffold0139 (537-592)||(40834-40889)
[»] scaffold1559 (1 HSPs)
scaffold1559 (419-458)||(696-735)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (529-608)||(13909-13988)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (529-571)||(110084-110126)
scaffold0035 (529-571)||(118585-118627)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (533-594)||(1279-1340)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (529-594)||(32126-32191)
[»] scaffold0170 (1 HSPs)
scaffold0170 (410-451)||(17740-17781)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (529-594)||(40653-40718)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 786; Significance: 0; HSPs: 126)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 786; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 962
Target Start/End: Complemental strand, 27852181 - 27851213
Alignment:
Q  17 aggttttagaatttgagagattagaattaaaagatgaaattgaaagtttcgaattaaggaaaactagtttatgtttcgaattgagtttctagtcttaaaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27852181 aggttttagaatttgagagattagaattaaaagatgaaattgaaagtttcgaattaaggaaaactagtttatgtttcgaattgagtttctagtattaaaa 27852082  T
Q  117 agagtggataatacagtaggttgatgaataattattgttataatgatagggtgatcatagggtaatgattagggttatgtttggagagtattggatcgaa 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27852081 agagtggataatacagtaggttgatgaataattagtgttataatgatagggtgatcatagggtaatgattagggtcatgtttggagagtattggatcgaa 27851982  T
Q  217 aacggagtcgaaaagatttccccaaaggcgaaatcgcagctgaactacgattttgctgtcagtgtgcaaaacgcgtttttattgtcgcagtttgacaagt 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27851981 aacggagtcgaaaagatttccccaaaggcgaaatcgcagctgaactgcgattttgctatcaatgtgcaaaacacgtttttattgtcgcagtttgacaagt 27851882  T
Q  317 ttaagtttcaaactgagtttaggtgccttcacgtaagttgtagatatggatgttatctgtccctcgactttggaggtactcgatttaagcacatagaact 416  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27851881 ttaagtttcgaactgggtttaggtgccctcacgaaagttgtatatatggatgttatctgtccctaggctttggaggtactcgatttaagcacatagaact 27851782  T
Q  417 caagttatgatcaaattactacacaggggtc----------agcacagttgtcctcttttcccgagcataggaaaatctacttttctggaattttttgtt 506  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  27851781 caagttatgatcaaattactacacaggggtcagcagggatcagcacagtcgtcctcttttcccgagcataggaaaatcaacttttctggaattttctgtt 27851682  T
Q  507 ctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagata 606  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27851681 ttgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttttagataattttgttagctttccaatggatttggtttcacttgaaaatgatttttgatttttgagata 27851582  T
Q  607 tgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatctta 706  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  27851581 tgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaagctca 27851482  T
Q  707 aaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttgttaatgattata 806  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27851481 aaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttgttaatgattata 27851382  T
Q  807 atgaggttcagagaggatgaataagatgatttata-------------ttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaa 893  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27851381 atgaggttcagagaggatgaataagatgatttatattgatgatttaccttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaa 27851282  T
Q  894 attgtaatttgttatatatgaaaattattattgatggttacttgatgtgtatgtttaaatgatgatgtc 962  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  27851281 attgtaatttgttatatatgaagattattattgatggttacttgttgtgtatgtttaaatgatgttgtc 27851213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 682; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 954
Target Start/End: Original strand, 20733321 - 20734279
Alignment:
Q  17 aggttttagaatttgagagattagaattaaaagatgaaattgaaagtttcgaattaaggaaaactagtttatgtttcgaattgagtttctagtcttaaaa 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20733321 aggttttagaatttgagagattagaattaaaagatgaaattgaaagctgagaattaaggaaaactagtttaggtttcgaattgagtttctagtcttaaaa 20733420  T
Q  117 agagtggataatacagtaggttgatgaataattattgttataatgatagggtgatcatagggtaatgattagggttatgtttggagagtattggatcgaa 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20733421 agagtggataatacagtaggttgatgaataattagtgttataatgataaggtaatcataggataatgattagggtcatgtttggagagtattggatcgaa 20733520  T
Q  217 aacggagtcgaaaagatttccccaaaggcgaaatcgcagctgaactacgattttgctgtcagtgtgcaaaacgcgtttttattgtcgcagtttgacaagt 316  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||    
T  20733521 aacggagttgaaaagatttccccaaaggcgaaatcgcagctgaactgcgattttgctgtcggtgtgcaaaacgcatttttattgtctcagtttgacgagt 20733620  T
Q  317 ttaagtttcaaactgagtttaggtgccttcacgtaagttgtagatatggatgttatctgtccctcgactttggaggtactcgatttaagcacatagaact 416  Q
    |||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20733621 ttaaatttcgaactgggtttaggtgccttcacgaaagttgtagatatggatgttatctgtcactcggctttggaggcactcgatttaagcacatagaact 20733720  T
Q  417 caagttatgatcaaattactaca----------caggggtcagcacagttgtcctcttttcccgagcataggaaaatctacttttctggaattttttgtt 506  Q
    |||||||||||||||||||||||          ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| | ||    
T  20733721 caagttatgatcaaattactacacatgggtcagcagggatcagcacagtcgtcctcttttcccgagcattggaaaatcaatttttctggaattttctatt 20733820  T
Q  507 ctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagata 606  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  20733821 ctgaattaggtttgggagtattcatgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttagtttcacttgaaaatgatttttggtttttgagata 20733920  T
Q  607 tgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatctta 706  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  20733921 tgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatc-tatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaagctca 20734019  T
Q  707 aaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttgttaatgattata 806  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20734020 aaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgacccttggggtaggaatgaaggttgttaatgattata 20734119  T
Q  807 atgaggttcagagaggatgaataagatgatttata-------------ttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaa 893  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20734120 atgaggttcagagaggatgaataaaatgatttatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaa 20734219  T
Q  894 attgtaatttgttatatatgaaaattattattgatggttacttgatgtgtatgtttaaatg 954  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||    
T  20734220 attgtaa-ttgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatg 20734279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 529 - 925
Target Start/End: Original strand, 34296664 - 34297072
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgtt-agctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggag 627  Q
    |||||||||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34296664 catgaaagttgtagatatttttttttagcttcccaaaggctttggcttcacttgaaaatgatttttggtttttgggatatgatgaaaatactccaaggag 34296763  T
Q  628 gtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagtt 727  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  34296764 gtcttagtgaaatcttatgaaaattcagtataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaaggactatgagtt 34296863  T
Q  728 caattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttgttaatgattataatgaggttcagagaggatgaa 827  Q
     ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34296864 taattagggtgtttaagagtatgtaacttatgttgtgagtcgacccttggggttggaat-gaagttgttaatgattataatgaggttcaaagaggatgaa 34296962  T
Q  828 taagatgatttata-------------ttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaatttgttatatatga 914  Q
    |||||||||| |||             |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34296963 taagatgattaataatgatgatttactttgatgattagatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaa-ttgttatatatga 34297061  T
Q  915 aaattattatt 925  Q
      |||||||||    
T  34297062 tgattattatt 34297072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 28948000 - 28947764
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28948000 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatgactttgctttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 28947901  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||     
T  28947900 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttt 28947801  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28947800 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 28947764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 529 - 799
Target Start/End: Complemental strand, 611396 - 611127
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  611396 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgatttgacttgaaaataatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 611297  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| || ||||||||||||    
T  611296 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactaaaattactatgagttc 611197  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttgttaat 799  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||| |||||||| | |||||||||    
T  611196 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatgaaagttgttaat 611127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 529 - 799
Target Start/End: Complemental strand, 18658862 - 18658593
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||    
T  18658862 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgaaatatgataaaaatactccgaggagg 18658763  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  18658762 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatctaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 18658663  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttgttaat 799  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||| |||||||||| |||||||||    
T  18658662 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaagttgttaat 18658593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 529 - 794
Target Start/End: Original strand, 25619353 - 25619618
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  25619353 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttattttttgagatatgatggaaatagtccaaggagg 25619452  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||    
T  25619453 tcttagtgaaatcttaggaaaattcagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaccctcaaaactagaagtaccatgagttc 25619552  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttg 794  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  25619553 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatcattggggtaggaatggaggttg 25619618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 529 - 767
Target Start/End: Original strand, 19825885 - 19826123
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19825885 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatgaatttgttttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 19825984  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19825985 tcttagtaaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatcggataattccaaaccttaaaactagaagtactatgagttc 19826084  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 767  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  19826085 aattaaggtgtttaagagtatttaaattatgttgtgagt 19826123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 178; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 529 - 799
Target Start/End: Original strand, 29847899 - 29848170
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  29847899 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatgaatttggtttgacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaagtagg 29847998  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatg--aaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagt 726  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  29847999 tcttaatgaaatcttatgaaaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagt 29848098  T
Q  727 tcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttgttaat 799  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||| || | ||||| ||||||| || |||||||||    
T  29848099 tcaattaaggtgtttaagagtatttaatccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatagaagttgttaat 29848170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 177; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Original strand, 19655625 - 19655861
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||| ||||| || || ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19655625 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 19655724  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||    
T  19655725 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 19655824  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19655825 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 19655861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 175; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 529 - 787
Target Start/End: Original strand, 20556489 - 20556747
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20556489 catgaaagttgtagataattgagttagctttccaatggctttggtttcacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatagtccaaggagg 20556588  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||| |||||||||||     
T  20556589 tcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccgtttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaaatactatgagtta 20556688  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatg 787  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| || | || |||||||||||    
T  20556689 aattaaggtgttaaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttcgggtaggaatg 20556747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 170; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 529 - 794
Target Start/End: Original strand, 14979018 - 14979283
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14979018 catgaaagttgtagataattaagttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatgtttagtttttgagatatgatgaaaatagtccaaggagg 14979117  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||  || |||||||||||||||||||||||    
T  14979118 tcttggtgaaatcttaggaaaattcagtataaccttttctaatttaatccaaaacttatagaataatttcaaccctcaaaactagaagtactatgagttc 14979217  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttg 794  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  14979218 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatcattggggtagggatggaggttg 14979283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 170; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 529 - 794
Target Start/End: Original strand, 15817154 - 15817418
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  15817154 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatatttggtttttgagatatgatgataatactccaagaagg 15817253  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  || ||||||||||||| |||||| ||    
T  15817254 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaagggataattccaaccctcaaaactagaagtattatgaggtc 15817353  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttg 794  Q
    ||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||    
T  15817354 aattaagttgtttaagattatttaacccatgttgtgagttgatc-ttggggtaggaatggaggttg 15817418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 169; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 529 - 761
Target Start/End: Original strand, 5834131 - 5834362
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  5834131 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttcacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaagtagg 5834230  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  5834231 tcttagtgaaatattatgaaaattcagcataaccgtttctaag-taatccaaaacatagggaataattctaaatctcaaaactagaagtactaggagttc 5834329  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 761  Q
    ||||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  5834330 aattaaggtgactaagagtatttaacctatgtt 5834362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 169; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 7827628 - 7827392
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||| | ||||||||| || || ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7827628 catgaaagttgtagataattgagttagctttctagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagaagg 7827529  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  7827528 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaattagaagtactatgagttc 7827429  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7827428 aactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 7827392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 169; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Original strand, 17318518 - 17318754
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||| || || ||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17318518 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgagttttggttcttgagatatgatgaaaatacttcaaggagg 17318617  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||    
T  17318618 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaaggtaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 17318717  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17318718 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 17318754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 167; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 529 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 1254413 - 1254215
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1254413 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttcacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactctaaggagg 1254314  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagtt 727  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  1254313 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagtataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagtt 1254215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 167; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 529 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 25347782 - 25347556
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25347782 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcgttggtttaacttgaaaatgatttttattttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 25347683  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| | ||||||||    
T  25347682 tcttagtgaaatcgtaggaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctccaaactagaagtgccatgagttc 25347583  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacc 755  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  25347582 aattaaggtgtttgagagtatttaacc 25347556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 165; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 529 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 13765002 - 13764771
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||       ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13765002 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgactttt-------gagttatgatgaaaatactccaaggagg 13764910  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||     
T  13764909 tcttaatgaaatattatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagtta 13764810  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 767  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13764809 aattaaggtgttttagagtatttaacctatgttgtgagt 13764771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 165; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 533 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 18703216 - 18702984
Alignment:
Q  533 aaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtctt 632  Q
    |||||| ||||| |||  |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  18703216 aaagttgtagattattgagttagctttccaatggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagcaggtcat 18703117  T
Q  633 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaatt 732  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  18703116 agtgaaatctaatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaatt 18703017  T
Q  733 agggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18703016 agggtttttaagagtatttaacctatgttgtga 18702984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 165; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 533 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 18709151 - 18708919
Alignment:
Q  533 aaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtctt 632  Q
    |||||| ||||| |||  |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  18709151 aaagttgtagatcattgagttagctttccaatggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagcaggtcat 18709052  T
Q  633 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaatt 732  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |    
T  18709051 agtgaaatctaatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaact 18708952  T
Q  733 agggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18708951 agggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 18708919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 529 - 767
Target Start/End: Original strand, 15173851 - 15174089
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15173851 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggatttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaatgagg 15173950  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  15173951 tcttagtgaaatcttatgaaaattcaacataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 15174050  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 767  Q
    |||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15174051 aattaaattgtttaagggtatttaacctatgttgtgagt 15174089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 160; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 529 - 748
Target Start/End: Original strand, 15891107 - 15891326
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15891107 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaagagg 15891206  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||    
T  15891207 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctaaaaactagaagtactatgatttc 15891306  T
Q  729 aattagggtgtttaagagta 748  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  15891307 aattagggtgtttaagagta 15891326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 159; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 529 - 755
Target Start/End: Original strand, 8767659 - 8767885
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  8767659 catgaaagttgtagatacttttgttagctttccaatggctttggtttgacatgaaaataatttttggtttttgagatattatgaaagtactccaaggagg 8767758  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  8767759 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagtgaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttc 8767858  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacc 755  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  8767859 aattaaggtgtttaagaatatttaacc 8767885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 157; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 529 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 20177401 - 20177170
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20177401 catgaaagttttagacaattttgttagctttccaatggctttagtttcacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 20177302  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| || |||||||||| ||| || ||||||| |||||||| ||||||    
T  20177301 tcttagtgaaatattatgaaaattcagcataaccgtttctaag-caatccaaaacatagggaataattctaaacctcaaaactataagtactaggagttc 20177203  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 761  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  20177202 aattaaggtgtctaagagtatttaacctatgtt 20177170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 157; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Original strand, 23150663 - 23150898
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||| || || ||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  23150663 catgaaagttgtagataattgagttagcttttcaatggctttggtttgacgtgaaaataatttttggttcttgagatatgatgaaaatattccaagtagg 23150762  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  23150763 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaattagaagtactatgagttc 23150862  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23150863 aacta-ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 23150898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 157; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Original strand, 25601673 - 25601909
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| ||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  25601673 catgaaagttttagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgagttttggtttttgcgttatgatgaaaatactccaaggagg 25601772  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| || |||||     
T  25601773 ttttagtgaaattttatgaaaattcagcacaaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtaataagagttt 25601872  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25601873 aattaaggggtttaagagtatttaacctatgtggtga 25601909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 548 - 767
Target Start/End: Original strand, 19443695 - 19443914
Alignment:
Q  548 tttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatga 647  Q
    |||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  19443695 tttgttagctttccaatggcgttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgaagaaaatactccacgtaggtcttagtgaaatcttatga 19443794  T
Q  648 aaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagt 747  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19443795 aaattcagcataaccatttccaagttaatcgaaaacttatgggataattccagaactaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 19443894  T
Q  748 atttaacctatgttgtgagt 767  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  19443895 atttaacccatgttgtgagt 19443914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 154; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 31734362 - 31734128
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||| |||||| ||||||||| || || ||||||| || ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31734362 catgaaagttgtagataattgagttagttttccagtggctttggtttgacgtgaaaataatattagattcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 31734263  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||    
T  31734262 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataatcgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtac--tgagttc 31734165  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31734164 aactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 31734128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 515 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 18928393 - 18928149
Alignment:
Q  515 ggtttgggagtcttcatgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaa 614  Q
    |||||||| || | |||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  18928393 ggtttgggtgtatacatgaaagttgtagagaattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaattatttttggtttttgagatatgatgaaa 18928294  T
Q  615 atactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactaga 714  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||||||    
T  18928293 atactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcctaacagtttctaagttaatccaaaacttatggaatgattcaaaaactcaaaactaga 18928194  T
Q  715 agtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatg 759  Q
    ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  18928193 agtactaggggttcaattaaggtgtttaagagtattttacctatg 18928149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 529 - 761
Target Start/End: Original strand, 22158590 - 22158821
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22158590 catgaaagttttagacaattttgttagctttccaatggctttagtttcacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 22158689  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| || |||||||||| ||| || ||||||| |||||||| ||||||    
T  22158690 tcttagtgaaatattatgaaaattcagcataaccgtttctaag-aaatccaaaacatagggaataattctaaacctcaaaactaaaagtactaggagttc 22158788  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 761  Q
    ||||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  22158789 aattaaggtgactaagagtatttaacctatgtt 22158821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 529 - 755
Target Start/End: Original strand, 8759913 - 8760138
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || || ||||||| |||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8759913 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctgtggattgacatgaaaataattttgg-tttttgagatattatgaaaatactccaaggagg 8760011  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||    
T  8760012 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagtgaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttc 8760111  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacc 755  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  8760112 aattaaggtgtttaagaatatttaacc 8760138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 529 - 767
Target Start/End: Original strand, 16133066 - 16133304
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||| || |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16133066 catgaaagttgtagaaaattttgttagctttccaatgtcgttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 16133165  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||| |||||||||   || |||||||||||||||||||||||    
T  16133166 tcttagtgaattcataggaaaattcagcataaccatttccaagttaatcggaaacttatgggataattccaggactaaaaactagaagtactatgagttc 16133265  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 767  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16133266 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagt 16133304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 147; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 529 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 23956518 - 23956280
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | | ||  | ||||||||||||||  |||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23956518 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactctagtttggcgtgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggagg 23956419  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| | |||     
T  23956418 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttt 23956319  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 767  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23956318 aattaaggtgtttaagagtatttaacctaagttgtgagt 23956280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 529 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 4477314 - 4477049
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| || |||  ||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||    
T  4477314 catgaaagttgtagataatttcgttagctttccaatggatttggtttgactctaaaatgatttttggtttatgagttatgatgaaaatactccaagtagg 4477215  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||| ||||||  ||| ||||||||||  || ||||||||||||| ||||||| |    
T  4477214 tcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatcaaaaactggtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgc 4477115  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttg 794  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  4477114 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttg 4477049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Original strand, 27125872 - 27126109
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaattt-ttgagatatgatgaaaatactccaaggag 627  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||| | || |  ||||||||||||||   || |||||||| ||||||||||||  ||  ||    
T  27125872 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggcttttgtttgaggtgaaaatgattttttggttcttgagatacgatgaaaatactttaaaaag 27125971  T
Q  628 gtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagtt 727  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  27125972 gtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaagaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagtt 27126071  T
Q  728 caattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27126072 caactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 27126109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Original strand, 23491567 - 23491803
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  23491567 catggaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttggattgaaaataatttttggtttttgagatatgatgacaatattccaaggagg 23491666  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||| ||||||||||| |||||     
T  23491667 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgttactaagttaatccaaaacttaggtaataattccaaacctcaaaaatagaagtactaggagttt 23491766  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  23491767 aattaaggtgtttaagagtatctaacatatgttgtga 23491803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Original strand, 23497165 - 23497401
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  23497165 catggaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttggattgaaaataatttttggtttttgagatatgatgacaatattccaaggagg 23497264  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||| ||||||||||| |||||     
T  23497265 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgttactaagttaatccaaaacttaggtaataattccaaacctcaaaaatagaagtactaggagttt 23497364  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  23497365 aattaaggtgtttaagagtatctaacatatgttgtga 23497401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 533 - 718
Target Start/End: Complemental strand, 940 - 755
Alignment:
Q  533 aaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtctt 632  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  940 aaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggttttacttgaaaatgattttttgtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtctt 841  T
Q  633 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagta 718  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  840 agtgaaatcttatgaaaattcagtataattgtttctaagttaatctaaaatttatggaataattccaaagctcaaaactagaagta 755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 137; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 529 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 20183219 - 20182988
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | || || |||| ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  20183219 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttaaaaatgatttttcgtttttgagttatgatgaaaatactccaagtagg 20183120  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | | || ||||||||||||||||||     
T  20183119 tcttagtgaaatcttatgaaaatttagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggatgattccaaa-cctcaagctagaagtactatgagttt 20183021  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 761  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  20183020 aattaaggtgtttaagagtatttaacctttgtt 20182988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 137; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 529 - 761
Target Start/End: Original strand, 22152772 - 22153003
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | || || |||| ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  22152772 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttaaaaatgatttttcgtttttgagttatgatgaaaatactccaagtagg 22152871  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | | || ||||||||||||||||||     
T  22152872 tcttagtgaaatcttatgaaaatttagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggatgattccaaa-cctcaagctagaagtactatgagttt 22152970  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 761  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  22152971 aattaaggtgtttaagagtatttaacctttgtt 22153003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Original strand, 19773105 - 19773341
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||| |||||| ||| ||| | || || ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19773105 catgaaagttgtagataattgagttagttttccagtggtttttgtttgacatgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagtagg 19773204  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||     
T  19773205 tcttagtgaaattttatgaaaatttagcataactgtttttaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 19773304  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  19773305 aattaaggggtttaagagtatttaacatgtgttgtga 19773341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 132; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 529 - 720
Target Start/End: Complemental strand, 23655995 - 23655804
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23655995 catgaaagttttagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgccttgaaaataatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 23655896  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtact 720  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  23655895 tcttagtaaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacttagagaataattccaaacctcaaaactagaagtact 23655804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Original strand, 15705007 - 15705243
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    ||||||| || |||||||||  |||||||||||| ||| ||||| || || ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||  |||| |||    
T  15705007 catgaaaattgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatacctcaagtagg 15705106  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||     
T  15705107 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttcttagttaatccaaaatttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 15705206  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  15705207 aattaaggggtttaagagtatttaacatgtgttgtga 15705243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 25921385 - 25921150
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25921385 catgaaagttttagataattgtgttatctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 25921286  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||| || |||||||||||| | |   |||||| ||| ||| |    |||||||||||||    
T  25921285 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatgaattgtctccaaa-cttcaaagtttgtgtactatgagttc 25921187  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25921186 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 25921150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Original strand, 27317949 - 27318187
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagcttt--ccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaagga 626  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||||| |  ||| ||||||||  || || |||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27317949 catgaaagttgtagataattgagttagctatatccagtggctttgatttgacgtgaaaaggatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaaga 27318048  T
Q  627 ggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagt 726  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||    
T  27318049 ggttttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaattcaaaactagaggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactatgagt 27318148  T
Q  727 tcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27318149 tcaaatatggtgtttaagagtatttaacctacgttgtga 27318187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Original strand, 18455468 - 18455703
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  18455468 catgaaagttgtaggtaattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatacttcaaggagg 18455567  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    | |||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||| || |||||||||||||| |   ||||||  | ||| || | | ||||||||||||    
T  18455568 ttttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttgta-tactatgagttc 18455666  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18455667 aattaaggtctttaagagtatttaacctatgttgtga 18455703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 32259502 - 32259268
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||||| || || ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32259502 catgaaagttgtagataattgtgttagttttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttgctttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 32259403  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||| || || |||||||||||||| |   |||||| ||| || || |  |||||||||||||    
T  32259402 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaa-cttcaagcttg-tgtactatgagttc 32259305  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32259304 aattaaggtgcttaagagtatttaacctatgttgtga 32259268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 529 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 23838655 - 23838399
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||||||||  |||  ||| |||||||||||||||||||| | |    
T  23838655 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtatg 23838556  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||| |||||||| ||||||| |    
T  23838555 tcttagggaaatcttaagaaaattcagcacaaccattaccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtaatatgagtgc 23838456  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttg 794  Q
    ||||| |||||         ||||||| || |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||    
T  23838455 aattaaggtgt---------tttaacccattttgtgagttgacccttgaggtaggaatggaggttg 23838399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 109; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 18398574 - 18398339
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  18398574 catgaaagttttagataattgtgttagctttctattggatttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatactccagggagg 18398475  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| ||| |||||||| |||||||  ||||||||| || ||||||||||| || |   ||||||  | |||||| |  || ||||||| ||    
T  18398474 tcttagtgaaattttacgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatagattgtgtccaaacttcaaaacttg-tgttctatgagctc 18398376  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18398375 aattaaggtgtttaagagtatttaacttatgttgtga 18398339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 529 - 715
Target Start/End: Complemental strand, 25807788 - 25807602
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||  | ||||||| ||||||  |||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25807788 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactctggtttgtcgtgaaaattatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggagg 25807689  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaa 715  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||    
T  25807688 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaa 25807602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 13285364 - 13285129
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | || |||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  13285364 catgaaaattttagataattatgttagctttctagtggctttagttttacttgaaaatgatttttggtttttgatttatgatgaaaacactccaaggagg 13285265  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||  || |||||||||||||| |   ||||||  | |||||| |  |||||||||||||    
T  13285264 tcttggtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagccaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaaacttg-tgtactatgagttc 13285166  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13285165 atttaaggtgtttaagagtatttaacctatattgtga 13285129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 98; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 533 - 690
Target Start/End: Complemental strand, 29044962 - 29044805
Alignment:
Q  533 aaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtctt 632  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  29044962 aaagttttagataattgtgttagctttccagtggctttggttttacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatacttcaaggagatctt 29044863  T
Q  633 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgga 690  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||| || ||||||||||||||    
T  29044862 agtgaaatgttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatgga 29044805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 532 - 760
Target Start/End: Original strand, 17857091 - 17857319
Alignment:
Q  532 gaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtct 631  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||    
T  17857091 gaaagttttagataattgtgttagatttccaatggctttggtatgacttgaaaatgatttttagattttgggttatgatgaaaacactccaaggaggtct 17857190  T
Q  632 tagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaat 731  Q
    | ||||||| |||||||||||| | |||||  ||||||||| || |||||||||||||  |  |||||||  | ||||| ||||||| || || || |||    
T  17857191 tggtgaaattttatgaaaattccggataactatttctaagtcaacccaaaacttatggtttgtttccaaacttcaaaacgagaagtattaggaatttaat 17857290  T
Q  732 tagggtgtttaagagtatttaacctatgt 760  Q
    || |  |||||||||||||||||||||||    
T  17857291 taagaggtttaagagtatttaacctatgt 17857319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 18585274 - 18585040
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18585274 catgaatgttttagataattgtgttagctttccagtggatttggtttgacttgaaaattatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 18585175  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||| || || |||||||||| ||  |  ||||  | ||| || |  ||||| |||||||    
T  18585174 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaaccccaaacttatgg-attgtctcaaacttcaaagcttg-tgtactgtgagttc 18585077  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  18585076 aattaaggtgtttaaaagtatttaacctaagttgtga 18585040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 529 - 701
Target Start/End: Original strand, 31022093 - 31022265
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||  | ||||||||||||||  |||  ||| ||||||||||||||| |||||||     
T  31022093 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactctggtttggcgtgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatacttcaaggaga 31022192  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaa 701  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31022193 tcttagtgaaattttatgaaaattcactaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaa 31022265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 93; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 22556905 - 22556669
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    ||||||| || ||||||||| |||| | |||| | ||| ||||| || |||||||||||||||||  | |||||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  22556905 catgaaacttgtagataattgtgtttgatttctagtggatttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagttatgatgaacatactccaagaagg 22556806  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| |||||||||||  |||||||| |||||| || || |||||||||||||| |   ||||||  | |||||||||||||||| |||||     
T  22556805 tcttagtgaaattttatgaaaattttgcataaccatttctaggtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacatcaaaactagaagtactaggagttt 22556706  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
     |||| || ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22556705 cattaaggggtttaagagtatttaacctattttgtga 22556669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 533 - 761
Target Start/End: Original strand, 20411072 - 20411299
Alignment:
Q  533 aaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtctt 632  Q
    |||||| |||| |||| ||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||| | ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20411072 aaagttgtagacaattgtgttagcattccagtggctttggtttgacttgaaaataagttttggtttttgaggtatgatgaaaatactccaaggagatctt 20411171  T
Q  633 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaatt 732  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||  |||||| || || |||||||||||||| |   ||||||  | ||| || |  ||| |||||||||||||    
T  20411172 agtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtatccaaacttcaaagcttg-tgtaatatgagttcaatt 20411270  T
Q  733 agggtgtttaagagtatttaacctatgtt 761  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||    
T  20411271 aagttgtttaagagtatttaacctatgtt 20411299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 529 - 639
Target Start/End: Complemental strand, 7430179 - 7430069
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  7430179 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaga 7430080  T
Q  629 tcttagtgaaa 639  Q
    ||||| |||||    
T  7430079 tcttaatgaaa 7430069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 626 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 27557028 - 27556905
Alignment:
Q  626 aggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgag 725  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  || |||| ||||||| |||||||    
T  27557028 aggtcatagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaattagaagttctatgag 27556929  T
Q  726 ttcaattagggtgtttaagagtat 749  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
T  27556928 ttcaattaaggtgtttaagagtat 27556905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 529 - 639
Target Start/End: Original strand, 14594021 - 14594131
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14594021 catgaaagttgtagataattttgttagctttccgatggctttggtttgatttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaga 14594120  T
Q  629 tcttagtgaaa 639  Q
    ||||| |||||    
T  14594121 tcttaatgaaa 14594131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 529 - 688
Target Start/End: Original strand, 34141023 - 34141180
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||  | |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||     
T  34141023 catgaaagttttagataatt--gttagctttctagtggcgttggtatgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgataaaaatactccaagaaga 34141120  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatg 688  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||| || ||||||||||||    
T  34141121 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatg 34141180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 529 - 688
Target Start/End: Original strand, 34153639 - 34153796
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||  | |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||     
T  34153639 catgaaagttttagataatt--gttagctttctagtggcgttggtatgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgataaaaatactccaagaaga 34153736  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatg 688  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||| || ||||||||||||    
T  34153737 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatg 34153796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 529 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 12942785 - 12942666
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12942785 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttagtttgactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggagg 12942686  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaa 648  Q
    |||||||||| | |||||||    
T  12942685 tcttagtgaatttttatgaa 12942666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 634 - 745
Target Start/End: Complemental strand, 23415262 - 23415151
Alignment:
Q  634 gtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaatta 733  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  || |||||||||||| |||||||||||||||    
T  23415262 gtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagttctatgagttcaatta 23415163  T
Q  734 gggtgtttaaga 745  Q
     |||||||||||    
T  23415162 aggtgtttaaga 23415151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 529 - 649
Target Start/End: Original strand, 27330368 - 27330488
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||| |||||| ||||||||| || || ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27330368 catgaaagttgtagataattgagttagttttccagtggctttggtttgacatgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 27330467  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaa 649  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  27330468 tcttagtgaaatcttatgaaa 27330488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 529 - 649
Target Start/End: Original strand, 27391108 - 27391228
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||| |||||| ||||||||| || || ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27391108 catgaaagttgtagataattgagttagttttccagtggctttggtttgacatgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 27391207  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaa 649  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  27391208 tcttagtgaaatcttatgaaa 27391228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 831 - 954
Target Start/End: Complemental strand, 2201261 - 2201139
Alignment:
Q  831 gatgatttatattgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaatttgttatatatgaaaattattattgatgg 930  Q
    |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  2201261 gatgatttactttgatgattaaatatgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaa-ttgttatatatgatgattattattgatgg 2201163  T
Q  931 ttacttgatgtgtatgtttaaatg 954  Q
    | ||||| ||  ||||| ||||||    
T  2201162 tgacttgctgcatatgtctaaatg 2201139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 831 - 954
Target Start/End: Complemental strand, 22421109 - 22420987
Alignment:
Q  831 gatgatttatattgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaatttgttatatatgaaaattattattgatgg 930  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| |    
T  22421109 gatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaa-ttgttatatatgatgattattattgatag 22421011  T
Q  931 ttacttgatgtgtatgtttaaatg 954  Q
    | ||||| ||  ||||| ||||||    
T  22421010 tgacttgttgcatatgtctaaatg 22420987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 529 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 23415560 - 23415441
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23415560 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacatgaaaatgatttttgttgtttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 23415461  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaa 648  Q
    |||||||||| | |||||||    
T  23415460 tcttagtgaatttttatgaa 23415441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 529 - 648
Target Start/End: Original strand, 28288903 - 28289022
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28288903 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggttggactcgaaaatgagttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggagg 28289002  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaa 648  Q
    |||||||||| | |||||||    
T  28289003 tcttagtgaatttttatgaa 28289022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 529 - 759
Target Start/End: Original strand, 15938622 - 15938851
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||| | ||| || | |||||||||||||||| || |||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||| |||    
T  15938622 catgaaagttatagatgaattttttggttttccaatggctttggtttgacttgaaaattatttttatcttttgagttatgatgaaaatactctaagtagg 15938721  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||  ||| ||||| || |||||||||||||  |  |||||||  | |||| | | |||  || ||||||    
T  15938722 tcttggtgaaattttacgaaaatttagcataactatttttaagtcaacccaaaacttatggtttgtttccaaaattcaaaaattg-agtgttaggagttc 15938820  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatg 759  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  15938821 aattaaggtgtttaagggtatttaacctatg 15938851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 529 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 22806405 - 22806276
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    ||||||| || |||||||||  |||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22806405 catgaaatttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacctgaaaatgatttttggttcgtgagatatgatgaaaatactccaagtagg 22806306  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcat 658  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22806305 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcat 22806276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 529 - 689
Target Start/End: Complemental strand, 23221521 - 23221361
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||| || ||||||||||||| ||||  ||| ||| |||||||||||||||||| |  ||    
T  23221521 catgaaagttttagataattgtgttagctttccaatttttttggtttgacttgaaaatgatatttagatttggagttatgatgaaaatactccatgtggg 23221422  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgg 689  Q
    ||||||| |||  |||||||||||||||||||   || |||||||||  |||| |||||||    
T  23221421 tcttagtaaaactttatgaaaattcagcataatttttcctaagttaaatcaaaccttatgg 23221361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 797 - 962
Target Start/End: Original strand, 25956519 - 25956697
Alignment:
Q  797 aatgattataatgaggttcagagaggatgaataagatgattta------------ta--ttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagac 882  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||            ||  |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||      
T  25956519 aatgattataatgaggttcagagaggatgattaagatgatttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaagtt 25956618  T
Q  883 gttgatatgaaattgtaatttgttatatatgaaaattattattgatggttacttgatgtgtatgtttaaatgatgatgtc 962  Q
    ||||||||| | ||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  25956619 gttgatatggagttgcaaat-gttatatatgaagattattattgatggttacttgctgtatatgtttaaatgatgttgtc 25956697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 529 - 689
Target Start/End: Complemental strand, 35057160 - 35057000
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||| ||| |   ||||||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  35057160 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttagtttgacttgaaaatgttttatggattttgagttatgatgaaaacactccaagtagg 35057061  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgg 689  Q
    |||| | ||||| ||| | ||| |  |||||||  |||| |||| || | |||||||||||    
T  35057060 tcttggagaaattttaaggaaacttggcataactatttccaagtcaaccaaaaacttatgg 35057000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 533 - 648
Target Start/End: Original strand, 15891979 - 15892094
Alignment:
Q  533 aaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtctt 632  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    | ||||||||||||  |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15891979 aaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttttgttttgtgttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtctt 15892078  T
Q  633 agtgaaatcttatgaa 648  Q
    |||||||| |||||||    
T  15892079 agtgaaattttatgaa 15892094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 529 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 27557318 - 27557199
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||| ||| | || || ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27557318 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccggtggatttagtttgacatgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggatg 27557219  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaa 648  Q
    |||||||||| | |||||||    
T  27557218 tcttagtgaatttttatgaa 27557199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 530 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 33862388 - 33862270
Alignment:
Q  530 atgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggt 629  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |  | | ||||||| ||||  |||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33862388 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggt 33862289  T
Q  630 cttagtgaaatcttatgaa 648  Q
    ||||||||| | |||||||    
T  33862288 cttagtgaatttttatgaa 33862270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 529 - 648
Target Start/End: Original strand, 1540478 - 1540597
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |  | | ||||||| ||||  |||  | | ||||||||||||||||||||||||    
T  1540478 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtgtggcataaaaatgagttttggtttaggcgttatgatgaaaatactccaaggagg 1540577  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaa 648  Q
    |||||||||| | |||||||    
T  1540578 tcttagtgaatttttatgaa 1540597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 529 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 16135699 - 16135613
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaat 616  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  16135699 catgaaagttttagttaattttgttagctttccaatggctttggtttaactt-aaaatgatttttatattttgagatatgatgtaaat 16135613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 536 - 760
Target Start/End: Original strand, 31161862 - 31162085
Alignment:
Q  536 gttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagt 635  Q
    |||||||||||||   ||||| |||||||| |||||  || || | |||||||||||||  ||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||| |     
T  31161862 gttttagataattgaattagcattccaatgactttgatttgacatcaaaatgatttttagattttgagttatgttgaaaacactccaagtaggtcttgga 31161961  T
Q  636 gaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaattagg 735  Q
    ||||| ||| | ||||| ||||| ||  |||| |||| || |||||||||||||  |  |||||||| | |||||| | |||| || ||||| ||||| |    
T  31161962 gaaattttaagtaaatttagcatgactatttccaagtcaacccaaaacttatggtttgtttccaaatttcaaaacttg-agtattaagagtttaattatg 31162060  T
Q  736 gtgtttaagagtatttaacctatgt 760  Q
     ||||||| ||||||||||||||||    
T  31162061 atgtttaaaagtatttaacctatgt 31162085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 842 - 901
Target Start/End: Complemental strand, 19399889 - 19399830
Alignment:
Q  842 ttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaat 901  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  19399889 ttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaat 19399830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 552 - 759
Target Start/End: Original strand, 22523388 - 22523594
Alignment:
Q  552 ttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 651  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||  ||| || ||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||  ||| ||||||| ||||||| ||| ||||||    
T  22523388 ttagctttctaatggctttgttttggcttaaagatgatttttaggttttgagttatggtgaaaatactaaaagtaggtcttggtgaaattttacgaaaat 22523487  T
Q  652 tcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtattt 751  Q
    ||||||||||  ||| ||||| || ||| || ||||||  |  |  |||| || |||||| | ||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  22523488 tcagcataactatttttaagtgaacccataagttatggtttggtcgcaaacctcaaaacttg-agtactaggagtttaataaggatgtttaagagtattt 22523586  T
Q  752 aacctatg 759  Q
    ||||||||    
T  22523587 aacctatg 22523594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 530 - 648
Target Start/End: Original strand, 17883065 - 17883183
Alignment:
Q  530 atgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggt 629  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||  | | ||  ||||||||  |||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17883065 atgaaagttgtagataatttctttagctttccaatggctttggtttggcgttaatttgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggt 17883164  T
Q  630 cttagtgaaatcttatgaa 648  Q
    ||||||||| | |||||||    
T  17883165 cttagtgaatttttatgaa 17883183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 709 - 787
Target Start/End: Complemental strand, 25753026 - 25752948
Alignment:
Q  709 actagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatg 787  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||| || | ||||||||||||||    
T  25753026 actagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttagaccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatg 25752948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 709 - 787
Target Start/End: Complemental strand, 25755196 - 25755118
Alignment:
Q  709 actagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatg 787  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||| || | ||||||||||||||    
T  25755196 actagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttagaccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatg 25755118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 534 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 12742908 - 12742794
Alignment:
Q  534 aagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtctta 633  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  |    | ||| ||||||||  |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12742908 aagttgtagataattttgttagctttccaatggctttagtgtggagtaaaattgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtctta 12742809  T
Q  634 gtgaaatcttatgaa 648  Q
    ||||| | |||||||    
T  12742808 gtgaatttttatgaa 12742794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 529 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 19234741 - 19234658
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatga 612  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||| ||| || ||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  19234741 catgatagttttagacaattgtgttagattttcattggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatga 19234658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 533 - 648
Target Start/End: Original strand, 19858493 - 19858608
Alignment:
Q  533 aaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtctt 632  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||| | |||| | || || |||||||||||| ||||  |||  ||| |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  19858493 aaagttgtagataattgtgttagctttctagtggcgtcggtttgacttgaaaatgaattttggtttaggagttatgatgaaaatactcaaaggagatctt 19858592  T
Q  633 agtgaaatcttatgaa 648  Q
    |||||| | |||||||    
T  19858593 agtgaatttttatgaa 19858608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 224
Target Start/End: Original strand, 19545282 - 19545430
Alignment:
Q  76 aaaactagtttatgtttc-gaattgagtttctagtcttaaaaagagtggataatacagtaggttgatgaataattattgttataatgatagggtgatcat 174  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||| | ||| ||||| ||||  |||||||||||||| ||    
T  19545282 aaaactagtttaggtttttgaattgagttt-tagtcttaaaaagagtggataatctggtaggttaacgaagaattagtgtttgaatgatagggtgatgat 19545380  T
Q  175 agggtaatgattagggttatgtttggagagtattggatcgaaaacggagt 224  Q
     | || | |||||||||   |||||| |||| | || |||||||||||||    
T  19545381 ggagtgaagattagggtcgggtttggcgagtttagggtcgaaaacggagt 19545430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 351 - 538
Target Start/End: Original strand, 19545733 - 19545921
Alignment:
Q  351 aagttgtagatatggatgttatctgtccctcgactttggaggtactcgatttaagcacatagaactcaagttatgatcaaattactacacaggggtcagc 450  Q
    |||| |||||||| ||||||| || || || | ||||||||| |||| ||||||| |  || |||||||| |||||| ||| || | |||||||||||||    
T  19545733 aagtggtagatatcgatgttagctttcactagcctttggagggactctatttaagtatctataactcaagatatgatgaaaatagtgcacaggggtcagc 19545832  T
Q  451 acagttgtcctcttttcccgagcataggaaaa-tctacttttctggaattttttgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagtt 538  Q
    |  || ||| ||||| ||| | |||||||||| || | |||||||  | ||| |||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  19545833 agggtcgtcttctttccccaaacataggaaaagtcaatttttctgccactttatgttccaaataaggtttgggagtcttcatggaagtt 19545921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 685 - 760
Target Start/End: Complemental strand, 16135594 - 16135519
Alignment:
Q  685 tatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgt 760  Q
    ||||||||| ||||||| || ||||||| |||||||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  16135594 tatggaatatttccaaacctcaaaactataagtactaggagtttaattaagaggtttaagagtatttaacctatgt 16135519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 842 - 901
Target Start/End: Complemental strand, 18927954 - 18927896
Alignment:
Q  842 ttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaat 901  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  18927954 ttgatgattaaatgtgaaag-atttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaat 18927896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 529 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 31163622 - 31163519
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||| || ||||||||||| ||| |   ||||||| ||||||||||| ||| |||| |||    
T  31163622 catgaaggttttagataattatgttatatttccaatggcgttggtttgacttgaaaatgttttgtggattttgagttatgatgaaaacacttcaagtagg 31163523  T
Q  629 tctt 632  Q
    ||||    
T  31163522 tctt 31163519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 529 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 1555617 - 1555527
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatact 619  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || || |  ||||||||||||    |||||||||||| ||| ||||    
T  1555617 catgaaagttttaaataattttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 1555527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 529 - 595
Target Start/End: Original strand, 33315095 - 33315161
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaa 595  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||  |  |||||||||||||    
T  33315095 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttaa 33315161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 529 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 10488061 - 10487996
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgattttta 594  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||  |  ||||||||||||    
T  10488061 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgattttta 10487996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 529 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 16240386 - 16240321
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgattttta 594  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || || |  ||||||||||||    
T  16240386 catgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgattttta 16240321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 529 - 594
Target Start/End: Original strand, 16377267 - 16377332
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgattttta 594  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||  |  ||||||||||||    
T  16377267 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgattttta 16377332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 529 - 594
Target Start/End: Original strand, 16384591 - 16384656
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgattttta 594  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||  |  ||||||||||||    
T  16384591 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgattttta 16384656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 529 - 594
Target Start/End: Original strand, 16556964 - 16557029
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgattttta 594  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || || |  ||||||||||||    
T  16556964 catgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttaacgtccaaatgattttta 16557029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 529 - 594
Target Start/End: Original strand, 16633520 - 16633585
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgattttta 594  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || || |  ||||||||||||    
T  16633520 catgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttaacgtccaaatgattttta 16633585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 832 - 901
Target Start/End: Original strand, 25956715 - 25956783
Alignment:
Q  832 atgatttatattgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaat 901  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  25956715 atgatttactttgatgattaa-tgtgagaatatttatatattgtgaaagatgctgatatgaagttgtaat 25956783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 716 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 29044731 - 29044682
Alignment:
Q  716 gtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29044731 gtactgtgagttcaattaaggtgtttaagagtatataacctatgttgtga 29044682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 529 - 593
Target Start/End: Original strand, 18334159 - 18334223
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgattttt 593  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | || || |||||||||||||||||    
T  18334159 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgattttt 18334223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #107
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 721 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 19234661 - 19234617
Alignment:
Q  721 atgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19234661 atgagttcaattaaggtgtttaaaagtatttaacctatgttgtga 19234617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #108
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 529 - 593
Target Start/End: Original strand, 22226588 - 22226652
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgattttt 593  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || || |  |||||||||||    
T  22226588 catgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgattttt 22226652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #109
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 529 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 24423142 - 24423078
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgattttt 593  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | || || |||||||||||||||||    
T  24423142 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgattttt 24423078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #110
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 529 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 25904565 - 25904501
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgattttt 593  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || || |  |||||||||||    
T  25904565 catgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgattttt 25904501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #111
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 833 - 893
Target Start/End: Original strand, 31630622 - 31630681
Alignment:
Q  833 tgatttatattgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaa 893  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31630622 tgatttactttgatgattaa-tgtgagaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaa 31630681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #112
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 529 - 632
Target Start/End: Original strand, 3007508 - 3007611
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||| |||||||||||||  |||| |||| ||||||| |||| || ||||||||||| ||| |   ||||||| ||||||||||| ||| |||| |||    
T  3007508 catgaaggttttagataattaggttatcttttcaatggcgttggtttgacttgaaaatgttttgtggattttgagttatgatgaaaacacttcaagtagg 3007607  T
Q  629 tctt 632  Q
    ||||    
T  3007608 tctt 3007611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #113
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 529 - 572
Target Start/End: Original strand, 16650194 - 16650237
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgg 572  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  16650194 catgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttgg 16650237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #114
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 529 - 619
Target Start/End: Original strand, 16826387 - 16826477
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatact 619  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| || || |  ||||||||||||    |||||||||||| ||| ||||    
T  16826387 catgaaagttgtagacaattttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 16826477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #115
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 529 - 619
Target Start/End: Original strand, 21776115 - 21776205
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatact 619  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||   |||||||||||||    |||||||||||| ||| ||||    
T  21776115 catgaaagttgtagataactttgttagctttctaatggctttggtttgacgccaaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 21776205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #116
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 533 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 25175198 - 25175112
Alignment:
Q  533 aaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatact 619  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| || || |  ||||||||||||  | |||||||||||| ||| ||||    
T  25175198 aaagttgtagataattttgttagctttctaatggcattggtttgacgtccaaatgatttttagatattgagatatgattaaattact 25175112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #117
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 529 - 619
Target Start/End: Original strand, 27654616 - 27654706
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatact 619  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| || || |  ||||||||||||    |||||||||||| ||| ||||    
T  27654616 catgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggcattggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 27654706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #118
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 529 - 571
Target Start/End: Original strand, 35016023 - 35016065
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttg 571  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  35016023 catgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttg 35016065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #119
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 529 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 8055625 - 8055561
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgattttt 593  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | || || |||||||||||| ||||    
T  8055625 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgaatttt 8055561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #120
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 529 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 33864873 - 33864809
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgattttt 593  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||| || |||| | || || |||||||||||||||||    
T  33864873 catgaaagttgtagataattgtgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgattttt 33864809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #121
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 529 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 19609670 - 19609627
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgg 572  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  19609670 catgaaagttgtagataattttattagctttctaatggctttgg 19609627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #122
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 530 - 593
Target Start/End: Original strand, 26924015 - 26924078
Alignment:
Q  530 atgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgattttt 593  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||| || |||| | || || |||||||||||||||||    
T  26924015 atgaaagttgtagataattgtgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgattttt 26924078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #123
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 852 - 899
Target Start/End: Complemental strand, 27851176 - 27851129
Alignment:
Q  852 aatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgta 899  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  27851176 aatgtgagaatatttatatattgtgaaagatgctgatatgaagttgta 27851129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #124
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 410 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 10487997 - 10487959
Alignment:
Q  410 tagaactcaagttatgatcaaattactacacaggggtca 448  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10487997 tagaactcgagttatgatcaaattactacacatgggtca 10487959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #125
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 410 - 448
Target Start/End: Original strand, 16377331 - 16377369
Alignment:
Q  410 tagaactcaagttatgatcaaattactacacaggggtca 448  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16377331 tagaactcgagttatgatcaaattactacacatgggtca 16377369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #126
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 410 - 448
Target Start/End: Original strand, 16384655 - 16384693
Alignment:
Q  410 tagaactcaagttatgatcaaattactacacaggggtca 448  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16384655 tagaactcgagttatgatcaaattactacacatgggtca 16384693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 578; Significance: 0; HSPs: 119)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 578; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 794
Target Start/End: Original strand, 34858269 - 34859046
Alignment:
Q  17 aggttttagaatttgagagattagaattaaaagatgaaattgaaagtttcgaattaaggaaaactagtttatgtttcgaattgagtttctagtcttaaaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34858269 aggttttagaatttgagagattagaattaaaagatgaaattgaaagttgagaattaaggaaaactagtttaggtttcgaattgagtttctagtcttaaaa 34858368  T
Q  117 agagtggataatacagtaggttgatgaataattattgttataatgatagggtgatcatagggtaatgattagggttatgtttggagagtattggatcgaa 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  34858369 agagtggataatacagtaggttgatgaataattagtgttataatgatagggtgatcatagggtaatgattagggtcatgtttggagagtattgtatcgaa 34858468  T
Q  217 aacggagtcgaaaagatttccccaaaggcgaaatcgcagctgaactacgattttgctgtcagtgtgcaaaacgcgtttttattgtcgcagtttgacaagt 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  34858469 aacggagtcgaaaagatttccccaaaggcgaaatcgcagctgaactgcgattttgctttcggtgtgcaaaacacgtttttattgtctcagtttgacaagt 34858568  T
Q  317 ttaagtttcaaactgagtttaggtgccttcacgtaagttgtagatatggatgttatctgtccctcgactttggaggtactcgatttaagcacatagaact 416  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  34858569 ttaagtttcgaactgggtttaggtgccttcataaaagttgtacatatggatgttatctgtcactcggcttttgaggcactcgatttaagcacatagaact 34858668  T
Q  417 caagttatgatcaaattactacacaggggtcagcacagttgtcctcttttcccgagcataggaaaatctacttttctggaattttttgttctgaattagg 516  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34858669 caagatatgatcaaattactacacaggggtcagcacaatcgtcctttttttccgagcataggaaaatcaacttttctggaattttctgttctgaattagg 34858768  T
Q  517 tttgggagtcttcatgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaat 616  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  34858769 tttggaagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcattggttttacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaat 34858868  T
Q  617 actccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaag 716  Q
    |||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||||||||    
T  34858869 actccaaaaaggtcttagagaaatcttaggaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataatttcaaacctcaaaactagaag 34858968  T
Q  717 tactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttg 794  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||| |||||||||||||||    
T  34858969 tactaggagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatgagttgatccttgggataggaatggaggttg 34859046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 578; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 794
Target Start/End: Original strand, 34873331 - 34874108
Alignment:
Q  17 aggttttagaatttgagagattagaattaaaagatgaaattgaaagtttcgaattaaggaaaactagtttatgtttcgaattgagtttctagtcttaaaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34873331 aggttttagaatttgagagattagaattaaaagatgaaattgaaagttgagaattaaggaaaactagtttaggtttcgaattgagtttctagtcttaaaa 34873430  T
Q  117 agagtggataatacagtaggttgatgaataattattgttataatgatagggtgatcatagggtaatgattagggttatgtttggagagtattggatcgaa 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  34873431 agagtggataatacagtaggttgatgaataattagtgttataatgatagggtgatcatagggtaatgattagggtcatgtttggagagtattgtatcgaa 34873530  T
Q  217 aacggagtcgaaaagatttccccaaaggcgaaatcgcagctgaactacgattttgctgtcagtgtgcaaaacgcgtttttattgtcgcagtttgacaagt 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  34873531 aacggagtcgaaaagatttccccaaaggcgaaatcgcagctgaactgcgattttgctttcggtgtgcaaaacacgtttttattgtctcagtttgacaagt 34873630  T
Q  317 ttaagtttcaaactgagtttaggtgccttcacgtaagttgtagatatggatgttatctgtccctcgactttggaggtactcgatttaagcacatagaact 416  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  34873631 ttaagtttcgaactgggtttaggtgccttcataaaagttgtacatatggatgttatctgtcactcggcttttgaggcactcgatttaagcacatagaact 34873730  T
Q  417 caagttatgatcaaattactacacaggggtcagcacagttgtcctcttttcccgagcataggaaaatctacttttctggaattttttgttctgaattagg 516  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34873731 caagatatgatcaaattactacacaggggtcagcacaatcgtcctttttttccgagcataggaaaatcaacttttctggaattttctgttctgaattagg 34873830  T
Q  517 tttgggagtcttcatgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaat 616  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  34873831 tttggaagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcattggttttacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaat 34873930  T
Q  617 actccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaag 716  Q
    |||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||||||||    
T  34873931 actccaaaaaggtcttagagaaatcttaggaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataatttcaaacctcaaaactagaag 34874030  T
Q  717 tactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttg 794  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||| |||||||||||||||    
T  34874031 tactaggagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatgagttgatccttgggataggaatggaggttg 34874108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 573; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 27473431 - 27472644
Alignment:
Q  17 aggttttagaatttgagagattagaattaaaagatgaaattgaaagtttcgaattaaggaaaactagtttatgtttcgaattgagtttctagtcttaaaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27473431 aggttttagaatttgagagattagaattaaaagatgaaattgaaagttgagaattaaggaaaactatattaggtttcgaattgagtttctagtcttaaaa 27473332  T
Q  117 agagtggataatacagtaggttgatgaataattattgttataatgatagggtgatcatagggtaatgattagggttatgtttggagagtattggatcgaa 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27473331 agagtggataatacagtaggttgatgaataattagtgttataatgatagggtggtcatagggtaatgattagggtcatgtttggagagtattggatcgaa 27473232  T
Q  217 aacggagtcgaaaagatttccccaaaggcgaaatcgcagctgaactacgattttgctgtcagtgtgcaaaacgcgtttttattgtcgcagtttgacaagt 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27473231 aacggagtcgaaaagatttccccaaaagcgaaatcgcagctgaactgcgattttgctgtcagtgtgcaaaacgcgtttttattgtctcagtttgacaagt 27473132  T
Q  317 ttaagtttcaaactgagtttaggtgccttcacgtaagttgtagatatggatgttatctgtccctcgactttggaggtactcgatttaagcacatagaact 416  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  27473131 ttaagtttcaaactaggtttaggtgccttcacgaaatttgtagatatggatgttatctgtcactcggctttggaggcacttgatttaagcacatagaact 27473032  T
Q  417 caagttatgatcaaattactacacaggggtc----------agcacagttgtcctcttttcccgagcataggaaaatctacttttctggaattttttgtt 506  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||          |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  27473031 ctagatatgatcaaattactacacaggggtcagcaggggtcagcacagtcgtcctcttttcccgagcataggaaaatcaacttttctggaattttctgtt 27472932  T
Q  507 ctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagata 606  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||   |||| || |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  27472931 ctgaattaggtttgggagtcttcattaaagttgtagataattttgttagctttccagtgaaattggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagata 27472832  T
Q  607 tgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatctta 706  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |    
T  27472831 tgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctca 27472732  T
Q  707 aaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttg 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| || | ||||||||||| |||||||||    
T  27472731 aaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacttatgttatgagttgatccttggggtaggactggaggttg 27472644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 520; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 20916280 - 20915531
Alignment:
Q  19 gttttagaatttgagagattagaattaaaagatgaaattgaaagtttcgaattaaggaaaactagtttatgtttcgaattgagtttctagtcttaaaaag 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  20916280 gttttagaatttgagagattagaattaaaagatgaaattgaaagctgagaattaaggaaaactagtttaggtttcgaattgagtctctagtcttaaaa-g 20916182  T
Q  119 agtggataatacagtaggttgatgaataattattgttataatgatagggtgatcatagggtaatgattagggttatgtttggagagtattggatcgaaaa 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  20916181 agtggataatacagtaggttgatgaataattagtgttataatgatagattaatcatagggtaatgattagggtcaggtttggagagtattggatcgaaaa 20916082  T
Q  219 cggagtcgaaaagatttccccaaaggcgaaatcgcagctgaactacgattttgctgtcagtgtgcaaaacgcgtttttattgtcgcagtttgacaagttt 318  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  20916081 cggattcgaaaagatttccccaaaggcgaaatcgcagctgaactgcgattttgctgtcagtgtgcaaaacgcatttttattgtctcagtttgacaagttt 20915982  T
Q  319 aagtttcaaactgagtttaggtgccttcacgtaagttgtagatatggatgttatctgtccctcgactttggaggtactcgatttaagcacatagaactca 418  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20915981 aagtttcgaactgggtttaggtgccttcacaaaagttgtagatatggatgttatgtgtcactcggctttgcaggcactcgatttaagcacatagaactca 20915882  T
Q  419 agttatgatcaaattactacacaggggtc----------agcacagttgtcctcttttcccgagcataggaaaatctacttttctggaattttttgttct 508  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||          |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||    
T  20915881 agatatgatcaaattactacataggggtcagcagggatcagcacagtcgtcctcttttcccgagcataggaaaatcaacttttttggaattttatgttct 20915782  T
Q  509 gaattaggtttgggagtcttcatgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatg 608  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  20915781 gaattaggtttgggagtcttcatgaaagatttagataattttgttagttttccaattgctttggtttgacttgaaaatgattcttattttttgagatatg 20915682  T
Q  609 atgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaa 708  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||    
T  20915681 atgaaaatactccaatgatatcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaa 20915582  T
Q  709 actagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatg 759  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  20915581 actagaagtactatgagttcaattaagctgtttaagagtatttaacctatg 20915531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 529 - 782
Target Start/End: Complemental strand, 26903814 - 26903561
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26903814 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggatttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 26903715  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||    
T  26903714 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactaggagttc 26903615  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtag 782  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||    
T  26903614 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatattgtgagttggtcattggggtag 26903561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 530 - 765
Target Start/End: Original strand, 24273656 - 24273891
Alignment:
Q  530 atgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggt 629  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24273656 atgaaagttttagataattttgttagctttccaatgactttggtttgacctgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggt 24273755  T
Q  630 cttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttca 729  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  24273756 cttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttca 24273855  T
Q  730 attagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24273856 attaaggtgtttaagtgtatttaacctatgttgtga 24273891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 190; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 529 - 794
Target Start/End: Original strand, 18358365 - 18358630
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18358365 catgaaagttgtagataattgtgttagcttttcagtggctttggtttgacttgaaaatgttttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 18358464  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  18358465 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 18358564  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttg 794  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||    
T  18358565 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttg 18358630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 190; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 529 - 794
Target Start/End: Original strand, 22173424 - 22173689
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22173424 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatgggtttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatagtccaaggagg 22173523  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||||  |||||||||||||||    
T  22173524 tcttagtgaaaccttatgaaaatttagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattcaaaccctcaaaactcaaagtactatgagttc 22173623  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttg 794  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||    
T  22173624 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatgggggttg 22173689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 185; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 529 - 793
Target Start/End: Original strand, 41301369 - 41301633
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41301369 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaagtgatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 41301468  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  41301469 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttatgagataattccaacccttaaaactagaagtactatgagttc 41301568  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggtt 793  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||| |||||||| |||||    
T  41301569 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttgggttaggaatgaaggtt 41301633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 529 - 799
Target Start/End: Complemental strand, 31520773 - 31520504
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31520773 catgaaagttttagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 31520674  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||  |||||||||||||||    
T  31520673 tcatagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatagaataattccaaccctcaaaactgaaagtactatgagttc 31520574  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttgttaat 799  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||  | | ||||| |||||||||| |||||||||    
T  31520573 aattaaggtgtttaagagtatttaactcatgttgtgagtttatc-ttgggataggaatggaagttgttaat 31520504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 179; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 529 - 791
Target Start/End: Original strand, 21081367 - 21081629
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||| || |||| ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21081367 catgaaagttgtagataattgtgttagctttctagtggctttggtttgacttaaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 21081466  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  21081467 tcttagtgaaatcttatgaaaatttagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 21081566  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggagg 791  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||    
T  21081567 aattaagttgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtaggaatggagg 21081629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 179; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 529 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 25183843 - 25183605
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25183843 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 25183744  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||    
T  25183743 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactataagtattatgagttc 25183644  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 767  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25183643 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 25183605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 177; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 533 - 765
Target Start/End: Original strand, 43707685 - 43707916
Alignment:
Q  533 aaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtctt 632  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43707685 aaagttttagataattttgttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtctt 43707784  T
Q  633 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaatt 732  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  43707785 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccg-ttctaagttaatctaaaacttatggaataattcgaaacctcaaaactagaagtaccatgagttcaatt 43707883  T
Q  733 agggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43707884 aaggtgtttaagattatttaacctatgttgtga 43707916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 175; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 529 - 799
Target Start/End: Complemental strand, 24884042 - 24883773
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24884042 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 24883943  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||||    
T  24883942 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagtataaccctttctaagttaatctaaaacttatggaataattccaaccctcaaaactagaattactatgagttc 24883843  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttgttaat 799  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| || | ||||| |||||||| | |||||||||    
T  24883842 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgtagtgagttgatc-ttgggataggaatgaaagttgttaat 24883773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 174; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 529 - 794
Target Start/End: Original strand, 21073123 - 21073388
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| | |    
T  21073123 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgacttttagtttttgagttatgatggaaatactccaagtaag 21073222  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||| | |||||||||    
T  21073223 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaattcaaaacttatgggataattccaatactcaaaactagaagcaatatgagttc 21073322  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttg 794  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  21073323 aattaaggtatttcagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttg 21073388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 173; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 9975585 - 9975349
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||| |||||| ||||||||| || || ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9975585 catgaaagttgtagataattgagttagttttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 9975486  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||    
T  9975485 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 9975386  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9975385 aactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 9975349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 170; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 530 - 799
Target Start/End: Original strand, 10039531 - 10039799
Alignment:
Q  530 atgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggt 629  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||  |||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10039531 atgaaagttttagataattgtgttagctttctagtggtattggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccagggaggt 10039630  T
Q  630 cttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttca 729  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  10039631 cttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttca 10039730  T
Q  730 attagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttgttaat 799  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||| || | ||||| || ||||||| |||||||||    
T  10039731 attaaggtgtttaagagtatttaatccatgatgtgagttgatc-ttgggatatgaatggaagttgttaat 10039799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 169; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 36839827 - 36839591
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||| |||||| ||| ||||| || || ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36839827 catgaaagttgtagataattgagttagttttccagtggatttggttttacatgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 36839728  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  36839727 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataatcgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 36839628  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36839627 aactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 36839591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 165; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Original strand, 5031526 - 5031762
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||| ||||| || || ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5031526 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggatttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 5031625  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||    
T  5031626 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactataagtactatgagttc 5031725  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5031726 aactaggctgtttaagagtatttaacatatgttgtga 5031762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 165; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Original strand, 23969019 - 23969255
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| |  | |||||    
T  23969019 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatacgatgaaaataattaatggagg 23969118  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  23969119 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataacagtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 23969218  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23969219 aactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 23969255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 165; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Original strand, 24781236 - 24781472
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||     
T  24781236 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaga 24781335  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||    
T  24781336 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaatttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 24781435  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24781436 aactagggtgtttaagaatatttaacctatgttgtga 24781472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 529 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 21915278 - 21915040
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  | ||||||| | ||||  |||  ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  21915278 catgaaagttgtagataattttgttagatttccaatggctttggtttggcgtgaaaataagttttggtttaggagttatgatgaaaataccccaaggagg 21915179  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  21915178 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 21915079  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 767  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21915078 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 21915040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 157; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 529 - 761
Target Start/End: Original strand, 27484866 - 27485098
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||| | |||||||||  |||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  27484866 catgaaagatgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacatgaaaatgatttttggttcttgagatataatgaaaatactccaagtagg 27484965  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  27484966 tcttagtggaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 27485065  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 761  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27485066 aactagggtgtttaagagtatttaacatatgtt 27485098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 154; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 529 - 794
Target Start/End: Original strand, 19662051 - 19662316
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||||||||  |||  ||| |||||||||||||||||||| |||    
T  19662051 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 19662150  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||  || ||||||||||||| ||||||| |    
T  19662151 tcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttgtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgc 19662250  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttg 794  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  19662251 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttg 19662316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 529 - 902
Target Start/End: Original strand, 2524143 - 2524510
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||| |||||| ||||||||| || || ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||       
T  2524143 catgaaagttgtagataattgagttagatttccagtggctttggtttgacatgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagg--- 2524239  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaa-gttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagtt 727  Q
                 |||||||||||||||||||||   ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  2524240 -------------ttatgaaaattcagcataacc---tctaaagttaatctaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactataagtactatgagtt 2524323  T
Q  728 caattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttgttaatgattataatgaggttcagagaggatgaa 827  Q
    |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2524324 caatcaaggtatttaagagtatttaacctatgttgtgagttgacctttagggtaggagt-gaagttgttaatgattataatgaggttcagagagtatgaa 2524422  T
Q  828 taagatgatttata-------------ttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaatt 902  Q
    |||||||||| |||             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2524423 taagatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatcaaattgtaatt 2524510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 17307143 - 17306907
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||| | ||||||||| || || ||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17307143 catgaaagttgtagataattgagttagctttctagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcctgagatatgatgaaaatactccaaggagg 17307044  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  17307043 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttcttagttaatccaaaacttaaggaataattccaaaactcaaaactagaagtactatgagttc 17306944  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    || || |||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  17306943 aactaaggtgtttaagatcatttaacatatgttgtga 17306907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 529 - 767
Target Start/End: Original strand, 23338796 - 23339034
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| |||  |||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23338796 catgaaagttgtagataattttactagctttccaatggctttggtttgactcgaaaatgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggagg 23338895  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||    
T  23338896 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtactatgagttc 23338995  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 767  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| | |||||||||||    
T  23338996 aattaaggtgtttacgagtatttaatccatgttgtgagt 23339034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 150; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 529 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 9242416 - 9242151
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||| ||||||||  |||  ||| |||||||||||||||||||| ||     
T  9242416 catggaagttttagataattttgttagcttcccaatggctttggtttgactttaaagtgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaga 9242317  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||| ||||||| |    
T  9242316 tcttagggaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgc 9242217  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttg 794  Q
    || || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||    
T  9242216 aactaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatgaaggttg 9242151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 150; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 529 - 782
Target Start/End: Original strand, 20590718 - 20590971
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  20590718 catgaaagctgtagataattttgttatctttccaatggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggtttttgagttatcatgaaaatactccaaggagg 20590817  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||    
T  20590818 tcttactgaaatcttatgaaaattcagcataaccctttttaagttaatccaaaacttaagggataattccaagactcaaaactagaagtaatatgagttc 20590917  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtag 782  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||| |||||    
T  20590918 aattaaggtgtctaagagtatttaacccatgttatgagtagacccttgaggtag 20590971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 24515842 - 24515606
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||| ||  |||||||||||| || |||||| || || ||||||||||||||  || || |||||||||||||||||||||||||||    
T  24515842 catgaaagttgtagatagttgagttagctttccagtgtctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttctttagatatgatgaaaatactccaaggagg 24515743  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24515742 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagtataatcgtttctacgttaatccaaaacttaaggaataaattcaaatctcaaaactagaagtactatgagttc 24515643  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24515642 aattaaggtgtttaagagtatttaatctatgttgtga 24515606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 147; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 529 - 751
Target Start/End: Original strand, 18388693 - 18388915
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||| || |||||| || |||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18388693 catgaaagttgtagataattgggttagctttccagtgactttggtttgacttaaaaatgatttatggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 18388792  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||    
T  18388793 tcttagtgaaatctttggaaaattcagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttc 18388892  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtattt 751  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  18388893 aattaaggtgtttaagagtattt 18388915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 28349573 - 28349328
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  28349573 catgaaagttttagataattttgttagctttgcaatggctttggtttgacttaaaaatgatttttagtttttgagatatgatggaaatactccaagtagg 28349474  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaactta---------tggaataattccaaatcttaaaactagaagtac 719  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||         ||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  28349473 tcttcgtgaaatcttatgaaaattcagctcaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattgggataattccaaagctcaaaactagaagtac 28349374  T
Q  720 tatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  28349373 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaatccatgttgtga 28349328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 145; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Original strand, 28652898 - 28653134
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||| ||| || ||||||||| || || ||||||||||||||  || |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28652898 catgaaagttgtagataattgagttagattttcagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgataaaaatactccaaggagg 28652997  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  28652998 tcttagtgaaatcttatggaaattcagcataaccgtttttaggttaatccgaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 28653097  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  28653098 aactagggtgtttaagagtatttaacatatcttgtga 28653134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 533 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 6483171 - 6482946
Alignment:
Q  533 aaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtctt 632  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||  |||   || ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  6483171 aaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttcaaaatgatttttggtttagaagttatgatggaaatactccaagtaggtctt 6483072  T
Q  633 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatct-taaaactagaagtactatgagttcaat 731  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  6483071 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataatttcaaacctcgaaaactagaagtattatgaattcaat 6482972  T
Q  732 tagggtgtttaagagtatttaaccta 757  Q
    || |||||||||||||||||||||||    
T  6482971 taaggtgtttaagagtatttaaccta 6482946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 533 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 6486638 - 6486413
Alignment:
Q  533 aaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtctt 632  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||  |||   || ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  6486638 aaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactttaaaatgatttttggtttagaagttatgatggaaatactccaagtaggtctt 6486539  T
Q  633 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatct-taaaactagaagtactatgagttcaat 731  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  6486538 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataatttcaaacctcgaaaactagaagtattatgaattcaat 6486439  T
Q  732 tagggtgtttaagagtatttaaccta 757  Q
    || |||||||||||||||||||||||    
T  6486438 taaggtgtttaagagtatttaaccta 6486413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 140; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 529 - 760
Target Start/End: Complemental strand, 21368763 - 21368532
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||| ||  ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21368763 catgaaagttttagataattgtgttagctttccggtggatttggtttggcttgaaaatgagttttggtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggagg 21368664  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| |||||     
T  21368663 tcttagtgaaattttatgaaaattcaacataaccgtttctaagttaatccaaaaattatggaataattctaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 21368564  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgt 760  Q
    || || |  |||||||||||||||||||||||    
T  21368563 aaataagaggtttaagagtatttaacctatgt 21368532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 529 - 794
Target Start/End: Original strand, 6260774 - 6261039
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||  |||  ||| |||||||||||||||||||| |||    
T  6260774 catgaaagttgtagataattttgttaactttccaatggctttggtttgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 6260873  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||  || |||||||||| || || ||||      
T  6260874 tcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttgtgggataattccaaggctcaaaactagaaatattacgagtga 6260973  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttg 794  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  6260974 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttagggtaggaatggaggttg 6261039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Original strand, 19201596 - 19201833
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaa-tactccaaggag 627  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||| || || |||||||||| | |  || ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19201596 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatatgtggttcttgagatatgatgaaaaatactccaaggag 19201695  T
Q  628 gtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagtt 727  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| || |||||||||||||||| |||||    
T  19201696 gtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatttaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagtt 19201795  T
Q  728 caattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
     ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19201796 taattaaggggtttaagagtatttaacctatgtggtga 19201833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 532 - 765
Target Start/End: Original strand, 23068849 - 23069082
Alignment:
Q  532 gaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtct 631  Q
    ||||||| |||||||||  ||| | |||| | ||||||||| || || ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23068849 gaaagttgtagataattgagtttgttttctagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttattgagatatgatgaaaatactccaagtaggtct 23068948  T
Q  632 tagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaat 731  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||| |||    
T  23068949 tagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactataagtactaagagtttaat 23069048  T
Q  732 tagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    || || ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  23069049 taaggggtttaagagtatttaacatgtgttgtga 23069082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 125; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 9785238 - 9785002
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| | ||||||| ||||||||||| | |||| |||| || |||| ||||||||||||  |||  ||| |||||||||||||||||||| |||    
T  9785238 catgaaagttgttgataattgtgttagctttcaagtggcgttggtttgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 9785139  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||     
T  9785138 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataattgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagaactaggagttt 9785039  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||| || |||||| |||||||||| | ||||||||    
T  9785038 aattaaggggtttaacagtatttaacatgtgttgtga 9785002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 529 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 22690336 - 22690105
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    ||||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||| | || || |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22690336 catgaaagttggagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 22690237  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  ||||||  ||||||||| || |||||||||||||| |   |||||| ||| ||| |    |||||||||||||    
T  22690236 tcttagtgaaattttatgaaaattccacataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaa-cttcaaagtcagtgtactatgagttc 22690138  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 761  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  22690137 aattaagatgtttaagagtatttaacctatgtt 22690105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 529 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 22694932 - 22694701
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    ||||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||| |||| || |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22694932 catgaaagttggagataattgtgttagctttccagtggcgttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 22694833  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  ||||||  |||||| || || |||||||||||||| |   |||||| ||| ||| |    |||||||||||||    
T  22694832 tcttagtgaaattttatgaaaattccacataactatttctatgtcaacccaaaacttatggattgtctccaaa-cttcaaagtcagtgtactatgagttc 22694734  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 761  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  22694733 aattaagatgtttaagagtatttaacctatgtt 22694701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 22686495 - 22686260
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||| |||| ||| |||    
T  22686495 catgaacgttttagatatttttattagctttccaatggctttggtttgacttgaatatgatttttggtttttgaggtatgatgaaaacactctaagtagg 22686396  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||| |||  ||||||| | || |||||||||||||| |   || |||  | ||| || |  |||||||||||||    
T  22686395 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcacaactatttctaattcaacccaaaacttatggattgtctcgaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttc 22686297  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22686296 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 22686260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 537 - 765
Target Start/End: Original strand, 25587091 - 25587318
Alignment:
Q  537 ttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtg 636  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25587091 ttttagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtg 25587190  T
Q  637 aaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaattaggg 736  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||  |||||| || || |||||||||||||| |   ||||||  | ||| || |  ||||| |||||||||||| |     
T  25587191 aaattttatgaaaattccacataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactgtgagttcaattaaga 25587289  T
Q  737 tgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  25587290 tgtttaagaaaatttaacctatgttgtga 25587318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 532 - 762
Target Start/End: Original strand, 21335852 - 21336081
Alignment:
Q  532 gaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtct 631  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21335852 gaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggattttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtct 21335951  T
Q  632 tagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaat 731  Q
    ||||||| | |||||||||||| |||||||  ||||||||| || ||||||  |||||| |   ||||||  | ||| || |  ||||||||||||||||    
T  21335952 tagtgaagttttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaagctatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaat 21336050  T
Q  732 tagggtgtttaagagtatttaacctatgttg 762  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||    
T  21336051 taagatgtttaagagtatttaacctatgttg 21336081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Original strand, 21316058 - 21316293
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || | || | || || ||||||| || |||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  21316058 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtgtccttcgtttgacgtgaaaataatatttggtttttgagttatgatgaaaatacttcaaggagg 21316157  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| |||||||||||| || ||||  ||||||||| || |||||||||||||| |   ||||||  | ||| || |  |||||||||||||    
T  21316158 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcttaactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttc 21316256  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21316257 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 21316293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 536 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 22332365 - 22332138
Alignment:
Q  536 gttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagt 635  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||  ||||||| ||||  ||||| ||||||| |||||||| ||    
T  22332365 gttttagataattgtgttagctttccagtggctttgatttgacttgaaaatgatttttagattttgagttatggcgaaaacactccaatgaggtcttggt 22332266  T
Q  636 gaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaattagg 735  Q
    | ||| |||||||||||| |||||||  ||||||||| || |||||||||||||| |  |||||||  | |||| | |  |||||||||||||||||| |    
T  22332265 g-aattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtttccaaacttcaaaaattg-tgtactatgagttcaattaag 22332168  T
Q  736 gtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22332167 gtgttcaagagtatttaacctatgttgtga 22332138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 93; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Original strand, 1384082 - 1384317
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  1384082 catgaaagttgtagataattgtattagctttccagtggctttggattgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaacgagg 1384181  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  ||||||  ||||||||| ||  ||||||||||| | |   ||||||  | ||| || |  |||| ||||||||    
T  1384182 tcttagtgaaattttatgaaaattccacataactatttctaagtcaactcaaaacttatgaattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtaccatgagttc 1384280  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
     |||| |||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  1384281 tattaaggtgtttacgagtatttaacctatgctgtga 1384317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 529 - 690
Target Start/End: Original strand, 23778691 - 23778853
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  23778691 catgaaagttttagataattgtgttagctttccaatggctttgatttgacttgaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatactctaaggagg 23778790  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatg-aaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgga 690  Q
    | |||||||||| ||| | ||||||| |||||||  ||||||||| || ||||| ||||||||    
T  23778791 ttttagtgaaattttacgaaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaccttatgga 23778853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 567 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 29113979 - 29113782
Alignment:
Q  567 ctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgttt 666  Q
    |||||| || |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||  ||     
T  29113979 ctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaattttatgaaaattccacataactattc 29113880  T
Q  667 ctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    |||||| || |||||||||||||| |  ||||||| ||| ||| |    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29113879 ctaagtcaacccaaaacttatggattgtttccaaa-cttcaaaatttgtgtactattagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 29113782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 536 - 764
Target Start/End: Complemental strand, 23610125 - 23609898
Alignment:
Q  536 gttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagt 635  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| ||  ||| | || |||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23610125 gttttagataattgtgctagctttccagtgtatttagtttgacttgaaaatgatttacgatttttgagttatgatgaaaatactcgaaggaggtcttagt 23610026  T
Q  636 gaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaattagg 735  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||||  ||||||||| || ||||||| |||||| |   ||||||  | ||| || |  ||||| |||||||||||| |    
T  23610025 gaaattttatgcaaattctgcataactatttctaagtcaacccaaaacctatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactgtgagttcaattaag 23609927  T
Q  736 gtgtttaagagtatttaacctatgttgtg 764  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23609926 gtgtttaagagtatttaacctatgttgtg 23609898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Original strand, 28345472 - 28345707
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  28345472 catgaaaattttagataattgtgttagctttccagtggctttgattttacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaaggagg 28345571  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||| |||||||  ||||||||  || | ||||||||||||     ||||||  | |||||| |  |||||||||||||    
T  28345572 tcttggtgaaattttacgaaaattccgcataactatttctaagccaaccaaaaacttatggatcgtctccaaacttcaaaacttg-tgtactatgagttc 28345670  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    | ||| ||||||||| |||| |||| |||||||||||    
T  28345671 atttaaggtgtttaatagtacttaatctatgttgtga 28345707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 662 - 794
Target Start/End: Original strand, 30643810 - 30643942
Alignment:
Q  662 cgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 761  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||  || ||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  30643810 cgtttccaagttaatccaaaacttgtgggataattccaaggctcaaaactaaaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgtt 30643909  T
Q  762 gtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttg 794  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  30643910 gtgagttgaccattagggtaggaatggaggttg 30643942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 633 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 31345495 - 31345379
Alignment:
Q  633 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaatt 732  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||  || |||||||||||| ||||||||||||||    
T  31345495 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttataggataataccaaccctcaaaactagaagttctatgagttcaatt 31345396  T
Q  733 agggtgtttaagagtat 749  Q
    | |||||||||||||||    
T  31345395 aaggtgtttaagagtat 31345379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 529 - 648
Target Start/End: Original strand, 10684329 - 10684448
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10684329 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttagttttactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggagg 10684428  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaa 648  Q
    |||||||||| | |||||||    
T  10684429 tcttagtgaatttttatgaa 10684448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 529 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 20261815 - 20261696
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20261815 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttagtttgactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggagg 20261716  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaa 648  Q
    |||||||||| | |||||||    
T  20261715 tcttagtgaatttttatgaa 20261696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 831 - 962
Target Start/End: Original strand, 24865480 - 24865610
Alignment:
Q  831 gatgatttatattgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaatttgttatatatgaaaattattattgatgg 930  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  24865480 gatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaa-ttgttatataagatgattattattgatgg 24865578  T
Q  931 ttacttgatgtgtatgtttaaatgatgatgtc 962  Q
    | ||||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  24865579 tgacttgatgcatatgtttaaatgatgttgtc 24865610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 529 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 22255868 - 22255768
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  22255868 catgaaagttttagataattgtgttagctttccaatggatttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatactctaaggagg 22255769  T
Q  629 t 629  Q
    |    
T  22255768 t 22255768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 831 - 962
Target Start/End: Complemental strand, 22501131 - 22501001
Alignment:
Q  831 gatgatttatattgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaatttgttatatatgaaaattattattgatgg 930  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||  |||| |||||||||    
T  22501131 gatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatataatgtgaaagacgttgatatgaagttgtaa-ttgttatataagatgattaatattgatgg 22501033  T
Q  931 ttacttgatgtgtatgtttaaatgatgatgtc 962  Q
    | ||||| ||  ||||||||||||||| ||||    
T  22501032 taacttgctgcatatgtttaaatgatgctgtc 22501001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 831 - 962
Target Start/End: Complemental strand, 22509065 - 22508935
Alignment:
Q  831 gatgatttatattgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaatttgttatatatgaaaattattattgatgg 930  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||  |||| |||||||||    
T  22509065 gatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatataatgtgaaagacgttgatatgaagttgtaa-ttgttatataagatgattaatattgatgg 22508967  T
Q  931 ttacttgatgtgtatgtttaaatgatgatgtc 962  Q
    | ||||| ||  ||||||||||||||| ||||    
T  22508966 taacttgctgcatatgtttaaatgatgctgtc 22508935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 529 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 20273012 - 20272855
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||| | || | || |||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||| |||    
T  20273012 catgaaagttttagataatctcgttagctttccaatgaatttagattgatttaaaaatgatttttagattttgagttatgatggaaatactccaagtagg 20272913  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaactta 686  Q
    |||| || || | |||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  20272912 tcttggtaaatttttaccaaaattcagcataaccgtttctatgtcaatccaaaactta 20272855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 679 - 799
Target Start/End: Complemental strand, 22501374 - 22501255
Alignment:
Q  679 aaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggg 778  Q
    ||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| || | |||||    
T  22501374 aaaacttatggaataattccaaccctcaaaactagaggtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgtcgtgagttgatc-ttggg 22501276  T
Q  779 gtaggaatggaggttgttaat 799  Q
     |||||||||| |||||||||    
T  22501275 ataggaatggaagttgttaat 22501255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 679 - 799
Target Start/End: Complemental strand, 22509308 - 22509189
Alignment:
Q  679 aaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggg 778  Q
    ||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| || | |||||    
T  22509308 aaaacttatggaataattccaaccctcaaaactagaggtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgtcgtgagttgatc-ttggg 22509210  T
Q  779 gtaggaatggaggttgttaat 799  Q
     |||||||||| |||||||||    
T  22509209 ataggaatggaagttgttaat 22509189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 529 - 727
Target Start/End: Original strand, 22786694 - 22786891
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | || |||| |||||| ||||||  ||||||||||||| | || ||| ||||| | |    
T  22786694 catgaaagttttagctaattttattagctttccaatggctttagtttgacttaaaaatgttttttagattttgagatatgagggaattaccccaagcaag 22786793  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagtt 727  Q
    |||| || || | || ||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||   ||||||| || ||||||||||||| || |||||    
T  22786794 tcttggtaaatttttgtgaaaatt-tgcataaccgtttctaactcaatccaaaacctatggaacgtttccaaacctcaaaactagaagtattaggagtt 22786891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 533 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 31345771 - 31345656
Alignment:
Q  533 aaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtctt 632  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| || ||||||||| || || ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31345771 aaagttgtagataattgtgttagcttttcagtggctttggtttgacatgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtctt 31345672  T
Q  633 agtgaaatcttatgaa 648  Q
    ||| || | |||||||    
T  31345671 agtaaatttttatgaa 31345656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 529 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 38968075 - 38967956
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | || || |||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38968075 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgattttttgtttaggagttatgatgaaaatactccaaggagg 38967976  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaa 648  Q
    |||||||||| | |||||||    
T  38967975 tcttagtgaatttttatgaa 38967956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 530 - 648
Target Start/End: Original strand, 24897763 - 24897881
Alignment:
Q  530 atgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggt 629  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | | ||||||||||||  |||  ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  24897763 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgatttttggtttaggagttttgatgaaaatactccaaggaggt 24897862  T
Q  630 cttagtgaaatcttatgaa 648  Q
    ||||||||| | |||||||    
T  24897863 cttagtgaatttttatgaa 24897881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 530 - 648
Target Start/End: Original strand, 24900246 - 24900364
Alignment:
Q  530 atgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggt 629  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | | ||||||||||||  |||  ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  24900246 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgatttttggtttaggagttttgatgaaaatactccaaggaggt 24900345  T
Q  630 cttagtgaaatcttatgaa 648  Q
    ||||||||| | |||||||    
T  24900346 cttagtgaatttttatgaa 24900364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 530 - 648
Target Start/End: Original strand, 24902723 - 24902841
Alignment:
Q  530 atgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggt 629  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | | ||||||||||||  |||  ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  24902723 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgatttttggtttaggagttttgatgaaaatactccaaggaggt 24902822  T
Q  630 cttagtgaaatcttatgaa 648  Q
    ||||||||| | |||||||    
T  24902823 cttagtgaatttttatgaa 24902841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 530 - 648
Target Start/End: Original strand, 24905200 - 24905318
Alignment:
Q  530 atgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggt 629  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | | ||||||||||||  |||  ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  24905200 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgatttttggtttaggagttttgatgaaaatactccaaggaggt 24905299  T
Q  630 cttagtgaaatcttatgaa 648  Q
    ||||||||| | |||||||    
T  24905300 cttagtgaatttttatgaa 24905318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 530 - 648
Target Start/End: Original strand, 24907675 - 24907793
Alignment:
Q  530 atgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggt 629  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | | ||||||||||||  |||  ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  24907675 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgatttttggtttaggagttttgatgaaaatactccaaggaggt 24907774  T
Q  630 cttagtgaaatcttatgaa 648  Q
    ||||||||| | |||||||    
T  24907775 cttagtgaatttttatgaa 24907793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 831 - 962
Target Start/End: Original strand, 7672268 - 7672392
Alignment:
Q  831 gatgatttatattgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaatttgttatatatgaaaattattattgatgg 930  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       || |||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  7672268 gatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatg-------aagttgttatataagatgattattattgatgg 7672360  T
Q  931 ttacttgatgtgtatgtttaaatgatgatgtc 962  Q
    | ||||||||  || |||||||||||| ||||    
T  7672361 tgacttgatgcatacgtttaaatgatgctgtc 7672392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 529 - 609
Target Start/End: Complemental strand, 7187022 - 7186942
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatga 609  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7187022 catgaaagttgtagataattgagttagctttccaatggctttggtttcacttgaaaatgatttttagtttttgagatatga 7186942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 530 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 23136174 - 23136056
Alignment:
Q  530 atgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggt 629  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |  | | ||||||| ||||  |||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23136174 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggt 23136075  T
Q  630 cttagtgaaatcttatgaa 648  Q
    ||||||||| | |||||||    
T  23136074 cttagtgaatttttatgaa 23136056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 529 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 40911979 - 40911863
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||| | ||||||  || || ||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||| |||     
T  40911979 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtagctttgatttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatataatgaaaatactccaatgaga 40911880  T
Q  629 tcttagtgaaatcttat 645  Q
    |||||||||||||||||    
T  40911879 tcttagtgaaatcttat 40911863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 40 - 277
Target Start/End: Original strand, 22497311 - 22497547
Alignment:
Q  40 gaattaaaagatgaaattgaaagtttcgaattaaggaaaactagtttatgtttc-gaattgagtttct--agtcttaaaaagagtggataatacagtagg 136  Q
    ||||||||||||||| |||||||    ||||| ||||||| || |||| ||||  ||||||||||| |  || ||||||| ||||||||||||  |||||    
T  22497311 gaattaaaagatgaagttgaaaga---gaattgaggaaaattaatttaggtttttgaattgagtttttttagccttaaaaggagtggataatatggtagg 22497407  T
Q  137 ttgatgaataattattgttataatgatagggtgatcatagggtaatgattagggttatgtttggagagtattggatcgaaaacggagtcgaaaagatttc 236  Q
    |||| ||| ||||| ||||  ||| ||||||| ||||  |||| | |||||||||    |||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||  |||    
T  22497408 ttgacgaagaattagtgtttgaataatagggtaatcacggggtgaagattagggtcgattttggagagtataggatcaaaaacagagtcaaaaagggttc 22497507  T
Q  237 cccaaaggcgaaatcgcagctgaactacgattttgctgtca 277  Q
    | ||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22497508 ctcaa-ggcaaaatcgcagctgaactacaattttgctgtca 22497547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 529 - 632
Target Start/End: Original strand, 36734881 - 36734984
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |   ||||||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  36734881 catgaaagttttagataatgttgttagatttccaatggctttggtttgacttgaaaatgttttgtgggttttgagttatgatgaaaacactccaagtagg 36734980  T
Q  629 tctt 632  Q
    ||||    
T  36734981 tctt 36734984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 529 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 22501456 - 22501375
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgat 610  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  22501456 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttgtagtttttgagatatgat 22501375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 529 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 22509390 - 22509309
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgat 610  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  22509390 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttgtagtttttgagatatgat 22509309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 78 - 189
Target Start/End: Original strand, 26861356 - 26861467
Alignment:
Q  78 aactagtttatgtttcgaattgagtttctagtcttaaaaagagtggataatacagtaggttgatgaataattattgttataatgatagggtgatcatagg 177  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||| ||||| |||| ||| |||||||| || ||| |    
T  26861356 aactagtttaggttttgaattgagtttttagtcttaaaaagagtggataatctggtaggttaatgaagaattaatgttctaacgatagggtaataatatg 26861455  T
Q  178 gtaatgattagg 189  Q
    || | |||||||    
T  26861456 gtgaagattagg 26861467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 757 - 901
Target Start/End: Complemental strand, 6576602 - 6576446
Alignment:
Q  757 atgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttgttaatgattataatgaggttcagagaggatgaataagatgatttatattg------------ 844  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||| | || || ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| || |||                
T  6576602 atgttatgagttgacctttggggtagaagtgaag-ttgttaatgattataatgaagttcggagagtatgaataagatgattaatgttgtggatttaagtt 6576504  T
Q  845 -atgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaat 901  Q
     ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  6576503 gatgattaaaagtgaaaaaatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaat 6576446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 351 - 538
Target Start/End: Original strand, 22497699 - 22497887
Alignment:
Q  351 aagttgtagatatggatgttatctgtccctcgactttggaggtactcgatttaagcacatagaactcaagttatgatcaaattac-tacacaggggtcag 449  Q
    |||||||||||||| |||||| || || ||   ||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||| |||| ||||| ||| |||||||||||||     
T  22497699 aagttgtagatatgaatgttagctttcactatcctttggagggactccatttaagcatctagaactcaagatatggtcaaaatacttacacaggggtcaa 22497798  T
Q  450 cacagttgtcctcttttcccgagcataggaaaatctacttttctggaattttttgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagtt 538  Q
    ||   |  |  ||||| ||| ||| |||||||  | ||||||||   | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22497799 caggatcttggtctttccccaagcttaggaaacccaacttttctaccactttttgttccgaattaggtctgggagtcttcatgaaagtt 22497887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 351 - 538
Target Start/End: Original strand, 19445229 - 19445416
Alignment:
Q  351 aagttgtagatatggatgttatctgtccctcgactttggaggtactcgatttaagcacatagaactcaagttatgatcaaattactacacaggggtcagc 450  Q
    ||||||||||||||||| |||  | |  || ||||||  ||| |||| ||||||| |  || |||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  19445229 aagttgtagatatggattttagttttaactagactttctagggactctatttaagtatctataactcaagatatgataaaaatactacataggggtcagc 19445328  T
Q  451 acagttgtcctcttttcccgagcataggaaaatctacttttctggaattttttgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagtt 538  Q
    |  || ||||||||| ||| | ||| |||||||| | || | || || ||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  19445329 agggtcgtcctctttccccaaacatgggaaaatcaaattgtgtgcaactttatgttccgaattaggtttggaagtctgcatgaaagtt 19445416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 842 - 901
Target Start/End: Complemental strand, 24436321 - 24436263
Alignment:
Q  842 ttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaat 901  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24436321 ttgatgattaaatgtgaaag-atttatatattgtgaaagatgttgatatgaaattgtaat 24436263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 533 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 15632870 - 15632770
Alignment:
Q  533 aaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtctt 632  Q
    |||||| ||||||||  |||| |||||| ||||||||||| || ||||| |||| | |||||||||||||| |||| |  ||| ||||||||||||||||    
T  15632870 aaagttgtagataatgatgttggctttctaatggctttggtttgacttggaaataagttttaatttttgagttatgttacaaaaactccaaggaggtctt 15632771  T
Q  633 a 633  Q
    |    
T  15632770 a 15632770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 529 - 685
Target Start/End: Complemental strand, 24302374 - 24302220
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||| |  || |||| |||||| ||||||  ||||| | ||||||||||||||| |||| |||    
T  24302374 catgaaagttttagataaagatgttagctttctaatggcttcgatttaactt-aaaatg-tttttaggttttgtgctatgatgaaaatactacaagtagg 24302277  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaactt 685  Q
    ||||  || |||  || ||||||||||||||||  ||| ||||| || |||||||||    
T  24302276 tcttgatgcaattgtacgaaaattcagcataactatttttaagtgaacccaaaactt 24302220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 529 - 701
Target Start/End: Original strand, 28031877 - 28032049
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||| |  ||||| |||| |||| ||  ||||||||| || |||  |||||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  28031877 catgaaagttttagacaattgagttggtattccattggccttggtttggcttgaaaataatgttttgtttttgagttatgaagaaaatactctaaggagg 28031976  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaa 701  Q
    | ||| | |||  ||| |||||||| ||| ||  |||||||||| || ||||| |||||||| || |||||||    
T  28031977 ttttaataaaactttacgaaaattccgcacaattgtttctaagtcaacccaaaccttatggattatttccaaa 28032049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 529 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 24383167 - 24383124
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgg 572  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24383167 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggatttgg 24383124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 716 - 763
Target Start/End: Complemental strand, 24841422 - 24841375
Alignment:
Q  716 gtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 763  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24841422 gtactatgagttcaattaaggtatttaagagtatttaacctatgttgt 24841375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 529 - 619
Target Start/End: Original strand, 19887294 - 19887384
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatact 619  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |  ||||||||||||    |||||||||||| ||| ||||    
T  19887294 catgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 19887384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 529 - 594
Target Start/End: Original strand, 11232232 - 11232297
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgattttta 594  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||  |  ||||||||||||    
T  11232232 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgattttta 11232297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 529 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 12727801 - 12727736
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgattttta 594  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |  ||||||||||||    
T  12727801 catgaaagttttaggtaattttgttagctttctaatggccttgggttgacgtccaaatgattttta 12727736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 529 - 594
Target Start/End: Original strand, 22514079 - 22514144
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgattttta 594  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||  |  ||||||||||||    
T  22514079 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgattttta 22514144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 529 - 594
Target Start/End: Original strand, 28776681 - 28776746
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgattttta 594  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||  |  ||||||||||||    
T  28776681 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgattttta 28776746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 529 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 18809538 - 18809474
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgattttt 593  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | || || |||||||||||||||||    
T  18809538 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgattttt 18809474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 861 - 929
Target Start/End: Complemental strand, 22501195 - 22501128
Alignment:
Q  861 atatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaatttgttatatatgaaaattattattgatg 929  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||  |||| ||||||||    
T  22501195 atatttatataatgtgaaagacgttgatatgaagttgtaa-ttgttatataagatgattaatattgatg 22501128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 861 - 929
Target Start/End: Complemental strand, 22509129 - 22509062
Alignment:
Q  861 atatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaatttgttatatatgaaaattattattgatg 929  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||  |||| ||||||||    
T  22509129 atatttatataatgtgaaagacgttgatatgaagttgtaa-ttgttatataagatgattaatattgatg 22509062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 529 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 28577694 - 28577630
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgattttt 593  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | || || |||||||||||||||||    
T  28577694 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgattttt 28577630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 529 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 16900905 - 16900840
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgattttta 594  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || || |  ||||||||||||    
T  16900905 catgaaaattttagataattttgttagctttctaatgactttggtttgacgtccaaatgattttta 16900840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 529 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 16994296 - 16994231
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgattttta 594  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || || |  ||||||||||||    
T  16994296 catgaaaattttagataattttgttagctttctaatgactttggtttgacgtccaaatgattttta 16994231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 529 - 594
Target Start/End: Original strand, 24686617 - 24686682
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgattttta 594  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| || || |  ||||||||||||    
T  24686617 catgaaagttttagataattaagttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgattttta 24686682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 529 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 27261422 - 27261357
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgattttta 594  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||  |||| |||||||    
T  27261422 catgaaaattttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaataattttta 27261357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 730 - 767
Target Start/End: Original strand, 34492089 - 34492126
Alignment:
Q  730 attagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 767  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34492089 attaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 34492126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 529 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 571993 - 571929
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgattttt 593  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | || || |||||||||||| ||||    
T  571993 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgaatttt 571929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 529 - 593
Target Start/End: Original strand, 23711580 - 23711644
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgattttt 593  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||| || |||| | || || |||||||||||||||||    
T  23711580 catgaaagttgtagataattgtgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgattttt 23711644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 529 - 565
Target Start/End: Original strand, 23760032 - 23760068
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatg 565  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23760032 catggaagttttagataattttgttagctttccaatg 23760068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 861 - 901
Target Start/End: Complemental strand, 24883713 - 24883673
Alignment:
Q  861 atatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaat 901  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  24883713 atatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaat 24883673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 529 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 26505974 - 26505910
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgattttt 593  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||| || |||| | || || |||||||||||||||||    
T  26505974 catgaaagttgtagataattgtgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgattttt 26505910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 529 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 26508452 - 26508388
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgattttt 593  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||| || |||| | || || |||||||||||||||||    
T  26508452 catgaaagttgtagataattgtgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgattttt 26508388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 529 - 593
Target Start/End: Original strand, 27920331 - 27920395
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgattttt 593  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||| || |||| | || || |||||||||||||||||    
T  27920331 catgaaagttgtagataattgtgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgattttt 27920395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 529 - 593
Target Start/End: Original strand, 32039065 - 32039129
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgattttt 593  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||| || |||| | || || |||||||||||||||||    
T  32039065 catgaaagttgtagataattgtgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgattttt 32039129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 529 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 34823840 - 34823804
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatg 565  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34823840 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatg 34823804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 529 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 23131457 - 23131394
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttt 592  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||  |  | |||||||||||||||||||    
T  23131457 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggtgtcagtttcacttgaaaatgatttt 23131394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #114
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 529 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 23133924 - 23133861
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttt 592  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||  |  | |||||||||||||||||||    
T  23133924 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggtgtcagtttcacttgaaaatgatttt 23133861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #115
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 529 - 592
Target Start/End: Original strand, 34402089 - 34402152
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttt 592  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||  |  | |||||||||||||||||||    
T  34402089 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggtgtcagtttcacttgaaaatgatttt 34402152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #116
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 410 - 448
Target Start/End: Original strand, 11232296 - 11232334
Alignment:
Q  410 tagaactcaagttatgatcaaattactacacaggggtca 448  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11232296 tagaactcgagttatgatcaaattactacacatgggtca 11232334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #117
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 410 - 448
Target Start/End: Original strand, 22514143 - 22514181
Alignment:
Q  410 tagaactcaagttatgatcaaattactacacaggggtca 448  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22514143 tagaactcgagttatgatcaaattactacacatgggtca 22514181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #118
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 410 - 448
Target Start/End: Original strand, 28776745 - 28776783
Alignment:
Q  410 tagaactcaagttatgatcaaattactacacaggggtca 448  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28776745 tagaactcgagttatgatcaaattactacacatgggtca 28776783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #119
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 40 - 118
Target Start/End: Original strand, 29718215 - 29718294
Alignment:
Q  40 gaattaaaagatgaaattgaaagtttcgaattaaggaaaactagttta--tgtttcgaattgagtttctagtcttaaaaag 118  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  29718215 gaattaaaagatgaagttgaaagatgagaattaagg-aaactagtttaggtttttcgaattgagtttttaaccttaaaaag 29718294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 561; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 561; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 68272 - 67485
Alignment:
Q  17 aggttttagaatttgagagattagaattaaaagatgaaattgaaagtttcgaattaaggaaaactagtttatgtttcgaattgagtttctagtcttaaaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  68272 aggttttagaatttgagagattagaattaaaagatgaaattgaaagttgagaattaaggaaaattagtttaggtttcgaattgagtttctagtcttaaaa 68173  T
Q  117 agagtggataatacagtaggttgatgaataattattgttataatgatagggtgatcatagggtaatgattagggttatgtttggagagtattggatcgaa 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  68172 agagtggataatacagtaggttgatgaataattagtgttataatgatagggtgatcatagggtaataattagggtcatgtttggagagtattggatcgaa 68073  T
Q  217 aacggagtcgaaaagatttccccaaaggcgaaatcgcagctgaactacgattttgctgtcagtgtgcaaaacgcgtttttattgtcgcagtttgacaagt 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  68072 aacggagtcgaaaagatttccccaaaggcgaaatcgcagctgaactgcgattttgctgtcagtgtgcaaaacgtgtttttattgtctcagtttgacaagt 67973  T
Q  317 ttaagtttcaaactgagtttaggtgccttcacgtaagttgtagatatggatgttatctgtccctcgactttggaggtactcgatttaagcacatagaact 416  Q
    ||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  67972 ttaagtttcgaactggatttaggtgccttcacgaaagttgtatatatggatgatatctgtcactcggctttggaggcactcgatttaagcacatagaact 67873  T
Q  417 caagttatgatcaaattactacacaggggtc----------agcacagttgtcctcttttcccgagcataggaaaatctacttttctggaattttttgtt 506  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||          |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||| ||||    
T  67872 caagatataatcaaattactacacaggggtcagcagggatcagcacagtcgccctcttttcccgagcataggaaaatccacttttatgaaattttctgtt 67773  T
Q  507 ctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagata 606  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||    
T  67772 ctgaattagatttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagctttcctatggctttggtttgactttaaaatgatttttggtttttgagata 67673  T
Q  607 tgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatctta 706  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |    
T  67672 tgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagagaataattccaaatctga 67573  T
Q  707 aaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttg 794  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  67572 aaactagaagtactaggatttcaattaaggtgtttaagaatatttaacctatgttaagagttgatcattggggtaggaatggatgttg 67485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 529 - 760
Target Start/End: Original strand, 116801 - 117032
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||  | ||||||||||    
T  116801 catgaaagtttcagataattgtgttagctttgcagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttagattttgagttatgaggaaaccattccaaggagg 116900  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||   |||||  ||||||||| || |||||||||||||  |  |||||||  | ||||| ||||||| || |||||     
T  116901 tcttggtgaaattttatgaaaattctatataactatttctaagtcaacccaaaacttatggtttgtttccaaacttcaaaaccagaagtattaggagttt 117000  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgt 760  Q
    || || |  ||||||||||||| |||||||||    
T  117001 aagtaagaggtttaagagtattaaacctatgt 117032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #3
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 577 - 765
Target Start/End: Original strand, 62414 - 62602
Alignment:
Q  577 acttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaat 676  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||| ||     
T  62414 acttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaaa 62513  T
Q  677 ccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgttta-agagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||||||| |||| |   |||||| |||  ||      |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  62514 ccaaaacttgtggattgtctccaaa-cttctaagcctgtgtactatgagttcaattaaggtgtttagggagtatttaacctatgttgtga 62602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 555; Significance: 0; HSPs: 130)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 555; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 794
Target Start/End: Original strand, 22237127 - 22237915
Alignment:
Q  17 aggttttagaatttgagagattagaattaaaagatgaaattgaaagtttcgaattaaggaaaactagtttatgtttcgaattgagtttctagtcttaaaa 116  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22237127 aggtttcagaatttgagagattagaattaaaagatgaaattgaaagttgagaattaaggaaaactagtttaggtttcgaattgagtttctagtcttaaaa 22237226  T
Q  117 agagtggataatacagtaggttgatgaataattattgttataatgatagggtgatcatagggtaatgattagggttatgtttggagagtattggatcgaa 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  22237227 agagtggataatacagtaggttgatgaataattggtgttataatgatagggtgattatagggtaatgattagggtcatgtttggagagtattggatcaaa 22237326  T
Q  217 aacggagtcgaaaagatttccccaaaggcgaaatcgcagctgaactacgattttgctgtcagtgtgcaaaacgcgtttttattgtcgcagtttgacaagt 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |    
T  22237327 aacggagtcgaaaagatttccccaaaggcgaaatcccagctgaactgcgattttgctgtcagtgtgcaacacgcatttttattgtctcagtttgacaaat 22237426  T
Q  317 ttaagtttcaaactgagtttaggtgccttcacgtaagttgtagatatggatgttatctgtccctcgactttggaggtactcgatttaagcacatagaact 416  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||| |||| |||| |||||||||||||    
T  22237427 ttaagtttcgaactgggtttaggtgccttcacgaaagttgtagatatgaatgttatttgtcactcggctttggaggcactcaatttgagcacatagaact 22237526  T
Q  417 caagttatgatcaaattactacacagggg-----------tcagcacagttgtcctcttttcccgagcataggaaaatctacttttctggaattttttgt 505  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||           |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  22237527 caagatatgatcaaattactacacagggggtcagcagggatcagcacagtcgtcctcttttcccgagcataggaaaatcaacttttctggaattttctgt 22237626  T
Q  506 tctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagat 605  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  22237627 tctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcattggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagat 22237726  T
Q  606 atgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatctt 705  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||     
T  22237727 atgttgaaaatactccaaggaggtcttagagaaatcttaggaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctc 22237826  T
Q  706 aaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttg 794  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||    
T  22237827 aaaactagaagtactaggagtttaattatgttgtttaagagtatttaacctatgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttg 22237915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 535; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 794
Target Start/End: Original strand, 19807473 - 19808258
Alignment:
Q  19 gttttagaatttgagagattagaattaaaagatgaaattgaaagtttcgaattaaggaaaactagtttatgtttcgaattgagtttctagtcttaaaaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19807473 gttttagaatttgagagattagaattaaaagatgaaattgaaagttgagaattaaggaaaaatagtttaagtttcgaattgagtttctagtcttaaaaag 19807572  T
Q  119 agtggataatacagtaggttgatgaataattattgttataatgatagggtgatcatagggtaatgattagggttatgtttggagagtattggatcgaaaa 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19807573 agtggataatacagtaggttgatgaataattagtgttataatgacagggtgatcatagggtaatggttagggtcatgtttggagagtattggatcgaaaa 19807672  T
Q  219 cggagtcgaaaagatttccccaaaggcgaaatcgcagctgaactacgattttgctgtcagtgtgcaaaacgcgtttttattgtcgcagtttgacaagttt 318  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| |||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19807673 cggagtcgaaaagatttttccaaaggcgaaattgcagttgaactgcaattttgctgtcaatgtgcaaaacgcgtttttattgtctcagtttgacaagttt 19807772  T
Q  319 aagtttcaaactgagtttaggtgccttcacgtaagttgtagatatggatgttatctgtccctcgactttggaggtactcgatttaagcacatagaactca 418  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  19807773 aagtttcgaactgggtttaggtgccttcgcaaaagttgtagatatggatgttatctgtcactcggctttggaggcactcgatttaagcacaaagaactca 19807872  T
Q  419 agttatgatcaaattactaca----------caggggtcagcacagttgtcctcttttcccgagcataggaaaatctacttttctggaattttttgttct 508  Q
    || ||||||||||||||||||          ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  19807873 agatatgatcaaattactacacaagggtcagcagggatcagcacagtcgtcctcttttcccgagcataggaaaatcaacttttctggaattttctgttct 19807972  T
Q  509 gaattaggtttgggagtcttcatgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatg 608  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||   |||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  19807973 gaattagatttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgtaagctttccaatgatattggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 19808072  T
Q  609 atgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaa 708  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||    
T  19808073 atgaaaatcctctaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaa 19808172  T
Q  709 actagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttg 794  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||    
T  19808173 actagaagtactaggagtttaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttg 19808258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 432; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 157 - 764
Target Start/End: Original strand, 21321365 - 21321971
Alignment:
Q  157 taatgatagggtgatcatagggtaatgattagggttatgtttggagagtattggatcgaaaacggagtcgaaaagatttccccaaaggcgaaatcgcagc 256  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21321365 taatgatagggtgatcatagggta-tgattagggtcatgtttggagagtattggatcgaacacggagtcgaaaagatttccccaaaggcgaaatcgcagc 21321463  T
Q  257 tgaactacgattttgctgtcagtgtgcaaaacgcgtttttattgtcgcagtttgacaagtttaagtttcaaactgagtttaggtgccttcacgtaagttg 356  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  21321464 tgaactgcgattttgctgtcagtgtgcaagacgcgttttcattgtcgcagtttgacaagtttaagtttcgaactgggtttaggtgccttcacgaaagttg 21321563  T
Q  357 tagatatggatgttatctgtccctcgactttggaggtactcgatttaagcacatagaactcaagttatgatcaaattactacacaggggtcagcacagtt 456  Q
    ||||||| ||||||||||||| || |   ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21321564 tagatatagatgttatctgtcactaggaattggaggcactcgatttaggcacatagaactcaagttatgatcaaattactacacaggggtcagcacagtc 21321663  T
Q  457 gtcctcttttcccgagcataggaaaatctacttttctggaattttttgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttttagataattttgttagc 556  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  21321664 gtcctcttttcccgagcataggaaaatcaacttttctggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagtttttgataatttggttagc 21321763  T
Q  557 tttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagc 656  Q
    ||||||||||||| |  || |||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21321764 tttccaatggcttagatttgacttgaaaatgacttttagtttttgagttatgatcaaaatactccaagatggtcttagtaaaatcttatgaaaattcagc 21321863  T
Q  657 ataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacct 756  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  21321864 ataaccagttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctaaaaattataagtactatgagttcaattaaagtgtttaagagtatttaacct 21321963  T
Q  757 atgttgtg 764  Q
    ||||||||    
T  21321964 atgttgtg 21321971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 400; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 157 - 764
Target Start/End: Original strand, 21325963 - 21326569
Alignment:
Q  157 taatgatagggtgatcatagggtaatgattagggttatgtttggagagtattggatcgaaaacggagtcgaaaagatttccccaaaggcgaaatcgcagc 256  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  21325963 taatgatagggtggtcatagggta-tgattagggtcatgtttggagagtattggatcgaacacggagtcgaaaagattttcccaaaggcggaatcgcagc 21326061  T
Q  257 tgaactacgattttgctgtcagtgtgcaaaacgcgtttttattgtcgcagtttgacaagtttaagtttcaaactgagtttaggtgccttcacgtaagttg 356  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||    
T  21326062 tgaactgcgattttgctgttagtgtgcaagacgcgttttcattgtcgcagtttgacaagtttaagtttcgaattgggtttaggtgccttcacgaaagttg 21326161  T
Q  357 tagatatggatgttatctgtccctcgactttggaggtactcgatttaagcacatagaactcaagttatgatcaaattactacacaggggtcagcacagtt 456  Q
    ||||||| ||||||||||||| || |   ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21326162 tagatatagatgttatctgtcactaggaattggaggcactcgatttaggcacatagaactcaagttatgatcaaattactacacaggggtcagcacagtc 21326261  T
Q  457 gtcctcttttcccgagcataggaaaatctacttttctggaattttttgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttttagataattttgttagc 556  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||    
T  21326262 gtcctcttttctcgagtataggaaaatcaacgtttctggaattttctgttctgaattaggtttgggagtctgcatgaaagctttagataatttggttagc 21326361  T
Q  557 tttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagc 656  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21326362 tttccaatggctttggtttgacttgaaaatgacttttagtttttgagttatgatcaaaatactccaagatggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagc 21326461  T
Q  657 ataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacct 756  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||| || |||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  21326462 ataaccagttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctaaaaattaaaagtacaatgagttcaattaaagagtttaagagtatttaacct 21326561  T
Q  757 atgttgtg 764  Q
    ||||||||    
T  21326562 atgttgtg 21326569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 529 - 962
Target Start/End: Original strand, 41680530 - 41680962
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41680530 catgaaagttttagataattatgttagctttccaatggctttggattgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 41680629  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  41680630 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttc 41680729  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttgttaatgattataatgaggttcagagaggatgaat 828  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41680730 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgacccttggggtaggaatggaggttgttaatgattataatgaggttcaaagaggatgaat 41680829  T
Q  829 aagatgatttatattgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaatttgttatatatgaaaattattattgat 928  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||    
T  41680830 aagatgatttatattgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagatattgatatcaaattgtaa-ttgttatatatgatgattattattgat 41680928  T
Q  929 ggttacttgatgtgtatgtttaaatgatgatgtc 962  Q
    ||| ||||| ||  |||||||||||| |||||||    
T  41680929 ggtgacttgctgcatatgtttaaatggtgatgtc 41680962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 529 - 929
Target Start/End: Original strand, 42559924 - 42560334
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42559924 catgaaagttgtagataattttgttagcttttcaatggctttggtttcacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 42560023  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  42560024 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagtataaccgtttctaagttaatccaaaacttatagaataattccaaagc-tcaaactagaagtactatgagttc 42560122  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttgttaatgattataatgaggttcagagaggatgaat 828  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42560123 aattagggtgtttaagagtatgtaacttatgttgtgagtcgacccttggggttggaat-gaagttgttaatgattataatgaggttcagagaggatgaat 42560221  T
Q  829 aagatgatttata-------------ttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaatttgttatatatgaa 915  Q
    ||||||||| |||             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  42560222 aagatgattaataatgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaatacgttgatatgaaattgtaa-ttgttatatatgat 42560320  T
Q  916 aattattattgatg 929  Q
     |||||||||||||    
T  42560321 gattattattgatg 42560334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 529 - 962
Target Start/End: Original strand, 21579603 - 21580046
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||| || ||| ||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  21579603 catgaaagttgtagataattttgttagatttctagtggctttggtttgactcgaatatgatttttagtttttgatttatgatgaaaatactccaaggagg 21579702  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||| ||||||||||||    
T  21579703 tcttagtgaaatcttaggaaaatttagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaccctcaaaattagaaatactatgagttc 21579802  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttgttaatgattataatgaggttcagagaggatgaat 828  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21579803 aattaaggtgtttaagagtgtttaacctatgttgtgagttgatc-ttggtataggaat-gaagttgttaatgattataatgaggttcagagaggatgaat 21579900  T
Q  829 aagatgatttata-------------ttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaatttgttatatatgaa 915  Q
    ||||||||| |||             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||     
T  21579901 aagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaa-ttgttatatatgat 21579999  T
Q  916 aattattattgatggttacttgatgtgtatgtttaaatgatgatgtc 962  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||| ||||    
T  21580000 aattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgatgttgtc 21580046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 529 - 962
Target Start/End: Original strand, 29763265 - 29763707
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  29763265 catgaaagttgtagataattttgttagctttctagtgtctttggtttgactcgaaaatgaattttagtttttgagttataatgaaaatactccaaggagg 29763364  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || |||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||    
T  29763365 tcttagtgaaatcttaggaaaatttagaataatcatttctaagttaatccgaaacttatagaataattccaaccctcaaaactagaagtaatatgagttc 29763464  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttgttaatgattataatgaggttcagagaggatgaat 828  Q
    ||||| | ||   |||||| ||||||||||||||||| | || | ||||| ||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29763465 aattaagatgggaaagagtgtttaacctatgttgtgaattgatc-ttgggatagaaat-gaagttgttaatgattataatgaggttcagagaggatgaat 29763562  T
Q  829 aagatgatttata-------------ttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaatttgttatatatgaa 915  Q
    ||||||||| |||             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||     
T  29763563 aagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaa-ttgttatatatgat 29763661  T
Q  916 aattattattgatggttacttgatgtgtatgtttaaatgatgatgtc 962  Q
     |||||||| |||||| | ||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  29763662 gattattatcgatggtga-ttgctgcatatgtttaaatgatgatgtc 29763707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 537 - 794
Target Start/End: Original strand, 17460691 - 17460948
Alignment:
Q  537 ttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtg 636  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17460691 ttttagataattttgttagtttttcaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtg 17460790  T
Q  637 aaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaattaggg 736  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17460791 aaaccttatgaaaattcaacataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaagg 17460890  T
Q  737 tgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttg 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||    
T  17460891 tgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttgatccttggggtaggaatggaggttg 17460948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 529 - 797
Target Start/End: Original strand, 39694924 - 39695191
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39694924 catgaaaattttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacctgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 39695023  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  39695024 tcttagtgaaatcttaggaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 39695123  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttgtta 797  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||| |||||||||| |||||||    
T  39695124 aattaaggtgtttaagagtgtttaacctatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaagttgtta 39695191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 190; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 529 - 794
Target Start/End: Original strand, 25483870 - 25484135
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25483870 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatgcctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatagtccaaggagg 25483969  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  || |||| ||||||||||||||||||    
T  25483970 tcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaacgtttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaattagaagtactatgagttc 25484069  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttg 794  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||    
T  25484070 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatgggggttg 25484135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 529 - 767
Target Start/End: Original strand, 44522822 - 44523060
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44522822 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcgttggtttgacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 44522921  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||    
T  44522922 tcttagtgaaatctcatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtactatgagttc 44523021  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 767  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| | |||||||||||    
T  44523022 aattaaggtgtttacgagtatttaatccatgttgtgagt 44523060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 529 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 364444 - 364206
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  364444 catgaaagttgtggataattttgttagctttccaatggctttagtttgacttgaaaatgatttttagtttttaagatatgatgaaaatactccaaggagg 364345  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  364344 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttc 364245  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 767  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  364244 aattaaggtgtttaagattatttaatccatgttgtgagt 364206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 529 - 799
Target Start/End: Original strand, 15635576 - 15635845
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||   ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  15635576 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttggcttttgagatataatgaagatactccaaggagg 15635675  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||    
T  15635676 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaatcctcaaaactagaagtactatgagttc 15635775  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttgttaat 799  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||| |||||||||| |||||||||    
T  15635776 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaagttgttaat 15635845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 529 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 19882624 - 19882386
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  19882624 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgaattttagtttttgagttataatgaaaatactccaaggagg 19882525  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||     
T  19882524 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatcccaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagtta 19882425  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 767  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19882424 aattaaggtgtttaagggtatttaacctatgttgtgagt 19882386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 178; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 529 - 762
Target Start/End: Original strand, 18024091 - 18024324
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18024091 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatagctttgatttgactcgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 18024190  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||    
T  18024191 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggcatagttccaaggctcaaaactagaagtactatgagttc 18024290  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttg 762  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18024291 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttg 18024324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 173; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Original strand, 20178917 - 20179153
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||| || |||||| || || |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20178917 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgactttggtttgacatgaaaatgatttttgattcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 20179016  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||    
T  20179017 tcttagtgaaatcttatgaaaattcaacataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccagacctcaaaactagaagtactatgagttc 20179116  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20179117 aaatagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 20179153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 171; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 529 - 763
Target Start/End: Original strand, 38185482 - 38185716
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  38185482 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactttggtttgactcgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaagtagg 38185581  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||    
T  38185582 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtattatgagttc 38185681  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 763  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||    
T  38185682 aattaaggtgtttaagagtatttaatccatgttgt 38185716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 167; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 529 - 763
Target Start/End: Complemental strand, 26454367 - 26454133
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| |||| || |||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26454367 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcattggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatataatgaaaatactccaaggagg 26454268  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||||||||||| |||||||||    
T  26454267 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatggaataatttcaaacatcaaaactagaagtattatgagttc 26454168  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 763  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26454167 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 26454133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 165; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 5761189 - 5760953
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| | |||||||  |||||||||||| ||||||||| || || ||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5761189 catgaaagttgtcgataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaattatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 5761090  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  5761089 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataactgtttctaggttaatcaaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtaccatgagttc 5760990  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5760989 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 5760953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 162; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 529 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 39364180 - 39363955
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  39364180 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcgttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgataaaaatactccaaagagg 39364081  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||    
T  39364080 tcttagtgaaatcgtaggaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctccaaactagaagtgctatgagttc 39363981  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaac 754  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  39363980 aattaaggtgtttgagagtatttaac 39363955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 533 - 765
Target Start/End: Original strand, 6102153 - 6102385
Alignment:
Q  533 aaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtctt 632  Q
    |||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||| || || || ||||| |||||  || |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6102153 aaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgcaaatggtttttggttcttgagatatgataaaaatactccaaggaggtctt 6102252  T
Q  633 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaatt 732  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  6102253 agtgaaatcttatgaaaattcagcataacagtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaatt 6102352  T
Q  733 agggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  6102353 aggatatttaagagtatttaacctatgttgtga 6102385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 19140421 - 19140185
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||| || || ||| ||||||||||  || ||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  19140421 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgacaatgatttttggttcttgtgatatgatgcaaatactccaaggagg 19140322  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  19140321 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 19140222  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19140221 aactagggtgtttaacagtatttaacctatgttgtga 19140185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Original strand, 39936407 - 39936642
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||  ||||||||| || || ||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39936407 catgaaagttgtagataattgagttagctttccggtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggctcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 39936506  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  39936507 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaagaaataattccaaatctcgaaactagaagtactatgagttc 39936606  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39936607 aacta-ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 39936642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 159; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 529 - 763
Target Start/End: Complemental strand, 19880484 - 19880250
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    ||||||||||||||  |||  ||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  19880484 catgaaagttgtagataattttgttagcttttcaatggctttggtttggtgtgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactacaaggagg 19880385  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  19880384 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttattggataattccaaatctcgaaactagaagtactatgagttc 19880285  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 763  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19880284 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 19880250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 159; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 529 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 20454895 - 20454657
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||   || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20454895 catgaaagttgtagataattgagttagctttccattggctttcatttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactcgaaggagg 20454796  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |  |||||||||||||||||||||||    
T  20454795 tcttggtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattcaaacccacaaaactagaagtactatgagttc 20454696  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 767  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20454695 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagt 20454657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 159; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 529 - 799
Target Start/End: Complemental strand, 20455652 - 20455383
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||| | ||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20455652 catgaaagttgtagataattgagttagctttctagtggctttcgtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaataccccaaggagg 20455553  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||   || |||||||||||||||||||| ||    
T  20455552 tcttggtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgagataattccatccctcaaaactagaagtactatgaggtc 20455453  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttgttaat 799  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||| |||||||| | |||||||||    
T  20455452 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatgtaagttgttaat 20455383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 159; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 529 - 799
Target Start/End: Complemental strand, 20460630 - 20460361
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||| | ||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20460630 catgaaagttgtagataattgagttagctttctagtggctttcgtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaataccccaaggagg 20460531  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||   || |||||||||||||||||||| ||    
T  20460530 tcttggtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgagataattccatccctcaaaactagaagtactatgaggtc 20460431  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttgttaat 799  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||| |||||||| | |||||||||    
T  20460430 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatgtaagttgttaat 20460361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 159; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 529 - 763
Target Start/End: Original strand, 21861016 - 21861250
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||| | || ||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21861016 catgaaagttgtagataatttggttagctttctaaaggcttttgtttgacttgaaaatgatatttggtttttgagatatgctgaaaatactccaaggagg 21861115  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||    
T  21861116 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtttatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttc 21861215  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 763  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21861216 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgt 21861250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 159; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 529 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 23478736 - 23478498
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||| || || |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23478736 catgaaagttgtagataattgtgttacctttccagtggcttgggtttgacttgaaaatgatttttagtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 23478637  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  23478636 tcttagtgaaatcttatgaaaatgcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 23478537  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 767  Q
    || || ||||||| | |||||||||| ||||||||||||    
T  23478536 aactaaggtgtttcatagtatttaacatatgttgtgagt 23478498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 529 - 758
Target Start/End: Complemental strand, 18834127 - 18833898
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18834127 catgaaagttgtagataattgtgttagcttttcagtggctttggttttacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 18834028  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||     
T  18834027 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataatcgtttctaagttaatcaaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 18833928  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctat 758  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  18833927 aattaaggggtttaagagtatttaacctat 18833898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 157; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Original strand, 42818303 - 42818539
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||| |||||| ||||||| | || || ||||||||||||||  || || |||||||||||||||||||||||||||    
T  42818303 catgaaagttgtagataattgagttagatttccagtggctttagtttgacgtgaaaatgatttttggttcttaagatatgatgaaaatactccaaggagg 42818402  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  42818403 ttttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 42818502  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  42818503 aactagggtgtttaagagtatttaatctatggtgtga 42818539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 529 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 44432518 - 44432279
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaa-tttttgagatatgatgaaaatactccaaggag 627  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||   |||||||| ||||||| |||||||| | ||||    
T  44432518 catgaaagttgtagataattttgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgattttttggtttttgagttatgatggaaatactctagggag 44432419  T
Q  628 gtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagtt 727  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  44432418 gtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagtt 44432319  T
Q  728 caattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 767  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  44432318 caattaaggtgtttaagagtatttaatccatgttgtgagt 44432279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 154; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 529 - 794
Target Start/End: Original strand, 27941285 - 27941550
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||| ||||||||||||  |||  ||| ||||||||||||||| |||| |||    
T  27941285 catggaagttttagataattttgttagctttccaatggcttcggtgtgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatacttcaagtagg 27941384  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||| ||||||| |    
T  27941385 tcttagggaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaatgctcaaaactagaagtaatatgagtgc 27941484  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttg 794  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  27941485 aattaaggtgtttaatagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttg 27941550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 529 - 759
Target Start/End: Original strand, 6573453 - 6573682
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6573453 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccggtggctttggtttgacttgaaaatgatttttgatttt-gagatatgatgaaaatactccaaggagg 6573551  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||| | ||||    
T  6573552 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaggtactaggggttc 6573651  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatg 759  Q
    ||||| | ||||||||||||| |||| ||||    
T  6573652 aattaagttgtttaagagtatctaacatatg 6573682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 529 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 17795888 - 17795650
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||| ||||||||| |||  |||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17795888 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttgggtttgactcgaaaatgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggagg 17795789  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||    
T  17795788 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtactatgagttc 17795689  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 767  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||| | |||||||||||    
T  17795688 aattaaggtgtttacaagtatttaatccatgttgtgagt 17795650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 147; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 529 - 764
Target Start/End: Complemental strand, 32950241 - 32950022
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||                ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32950241 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttga----------------ttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 32950158  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||     
T  32950157 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttt 32950058  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtg 764  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32950057 aattaaggtgtttaagattatttaacctatgttgtg 32950022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 529 - 757
Target Start/End: Original strand, 8728333 - 8728561
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||| ||||| |||  ||| ||||||||||||||| |||| |||    
T  8728333 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactttaaaatgaattttagtttaggagttatgatgaaaatactacaagtagg 8728432  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattcc-aaatcttaaaactagaagtactatgagtt 727  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||  |||||||||||| ||||||||    
T  8728433 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatcc-aaacttagggaataattccaaaacctcgaaactagaagtattatgagtt 8728531  T
Q  728 caattagggtgtttaagagtatttaaccta 757  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8728532 caattaaggtgtttaagagtatttaaccta 8728561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 529 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 44477080 - 44476851
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||  |||   || ||||||| |||||||||||| |||    
T  44477080 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactttaaaatgatttttggtttagaagttatgatggaaatactccaagtagg 44476981  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatct-taaaactagaagtactatgagtt 727  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||| ||||| ||    
T  44476980 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataatttcaaacctcgaaaactagaagtattatgaatt 44476881  T
Q  728 caattagggtgtttaagagtatttaaccta 757  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44476880 caattaaggtgtttaagagtatttaaccta 44476851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 529 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 44480342 - 44480113
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||  |||   || ||||||| |||||||||||| |||    
T  44480342 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactttaaaatgatttttggtttagaagttatgatggaaatactccaagtagg 44480243  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatct-taaaactagaagtactatgagtt 727  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||| ||||| ||    
T  44480242 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataatttcaaacctcgaaaactagaagtattatgaatt 44480143  T
Q  728 caattagggtgtttaagagtatttaaccta 757  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44480142 caattaaggtgtttaagagtatttaaccta 44480113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 529 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 11775378 - 11775140
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || | | ||  | ||||||||||||||  |||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11775378 catgaaagttgtagataattttgttagatttccaatgactctagtttggcgtgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggagg 11775279  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| | |||     
T  11775278 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttt 11775179  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 767  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11775178 aattaaggtgtttaagagtatttaacctaagttgtgagt 11775140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 529 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 22207923 - 22207693
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| | ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22207923 catgaaagttgtaaataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaataagttttgggttttgagatatgatgaaaatactccaaggaga 22207824  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  | | ||||    
T  22207823 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaaattaatccaaaacttatggaataattccaaacctgaaaactagaagtatcaggggttc 22207724  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatg 759  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22207723 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatg 22207693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 596 - 765
Target Start/End: Original strand, 361675 - 361844
Alignment:
Q  596 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataat 695  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  361675 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataat 361774  T
Q  696 tccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    |||||| || |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  361775 tccaaagctcaaaactaggagtactatgagtttaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 361844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 532 - 799
Target Start/End: Original strand, 42265994 - 42266257
Alignment:
Q  532 gaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtct 631  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||| | || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42265994 gaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttagtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtct 42266093  T
Q  632 tagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaat 731  Q
    ||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  42266094 tagtgaaatctt---aaaattcagtataaccttttctaagttaatccaaagcttatggaataattccaaccctccaaactagaagtactatgagttcaat 42266190  T
Q  732 tagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttgttaat 799  Q
    || |||||||||||||||| |||  |||||| ||||  | | ||||| |||||||||| |||||||||    
T  42266191 taaggtgtttaagagtattcaactcatgttgagagttaatc-ttgggataggaatggaagttgttaat 42266257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Original strand, 17437714 - 17437950
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||| || || | ||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17437714 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtaaaaatgattttttgttcttgagatatgatgaaaatactccaatgagg 17437813  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || || ||     
T  17437814 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcacaaccgtttctaatttaatccaaaacttatggaataattccaaatctcaaaactagaaataataggatttt 17437913  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17437914 aattaaggagtttaagagtatttaacctatgtggtga 17437950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 529 - 759
Target Start/End: Original strand, 5082608 - 5082838
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||| || || ||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5082608 catgaaagttttagataattgagttagctttccagtggttttggtttaacatgaaaataatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagtagg 5082707  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||| |||||     
T  5082708 tctgagtgaaattttatgaaaattcagcataatcgtttctaagttaatccaaaacttatggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 5082807  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatg 759  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  5082808 aattaaggggtttaagagtatttaacttatg 5082838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Original strand, 20084034 - 20084270
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  20084034 catgaaagttttagataattatgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttataatgaaaatactccaaagagg 20084133  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  ||||||||||||| | | ||||||||||||||| |||||     
T  20084134 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcagtccaaaacttagagaataattccaaa-cctcaaactagaagtactaggagttt 20084232  T
Q  729 aatt-agggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    |||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||    
T  20084233 aattaagggggcttaagattatttaacctatgttgtga 20084270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 22483402 - 22483167
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22483402 catgaaagttttagataattgtgtaagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatatttggtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggagg 22483303  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||| || |||||||||||||| |   ||||||  | |||||| |  |||||||||||||    
T  22483302 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaaacttg-tgtactatgagttc 22483204  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22483203 aattaaggtgtttaagagtatttaacttatgttgtga 22483167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 120; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 529 - 760
Target Start/End: Complemental strand, 17501581 - 17501350
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || || |||| |||||||||||||  ||||||||||||||| || ||| ||||| | |    
T  17501581 catgaaagtttgagataattttattagctttccaatggcttgggtttaacttaaaaatgatttttagattttgagatatgatggaattaccccaagcaag 17501482  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||| || || | ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||| |||||     
T  17501481 tcttggtaaatttttatgaaaaattagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacttatggaatatttccaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 17501382  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgt 760  Q
    ||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  17501381 aattaagaggtttaagagtatttaacctatgt 17501350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 120; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 529 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 23660871 - 23660700
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  23660871 catgaaagttgtagataattgagttagctttacagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaattagtccaaggagg 23660772  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaa 700  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23660771 tcttagtgaaatcttaggaaaattcagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaa 23660700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 537 - 762
Target Start/End: Original strand, 20517522 - 20517746
Alignment:
Q  537 ttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtg 636  Q
    |||||||||| | |||||| |||||| ||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20517522 ttttagataactgtgttagttttccagtggctttggcttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttggtg 20517621  T
Q  637 aaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaattaggg 736  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||||||     ||||||  | |||||| |  |||||||||||||||||| ||    
T  20517622 aaattttatgaaaattccgcataactgtttctaagtcaacccaaaacttatggatcgtctccaaacttcaaaacttg-tgtactatgagttcaattaagg 20517720  T
Q  737 tgtttaagagtatttaacctatgttg 762  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  20517721 tgtttaagagtatttaacctatgttg 20517746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 529 - 761
Target Start/End: Original strand, 22258700 - 22258931
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  22258700 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggttttttagttatgatgaaaatactccaaggagg 22258799  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||| || || |||||||||||||| |   ||||||  | ||| || |  |||||||||||||    
T  22258800 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtatccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttc 22258898  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 761  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  22258899 aattaaggtgtttaagagtatttaaactatgtt 22258931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 22344697 - 22344462
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22344697 catgaaaattttagataattgtgttagctttctagtggctttggttttacttgaaaatgatttttggattttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 22344598  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||| || |||||||||||||| |   || |||  | ||| || |  ||||| |||||||    
T  22344597 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctctaaacttcaaagcttg-tgtactgtgagttc 22344499  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22344498 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 22344462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 22356357 - 22356122
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22356357 catgaaaattttagataattgtgttagctttctagtggctttggttttacttgaaaatgatttttggattttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 22356258  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||| || |||||||||||||| |   || |||  | ||| || |  ||||| |||||||    
T  22356257 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctctaaacttcaaagcttg-tgtactgtgagttc 22356159  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22356158 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 22356122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Original strand, 4381189 - 4381424
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||| | || |||||||||||||||||  |||||||| || ||| |||||||| ||||||||    
T  4381189 catgaaagttgtagataattgtgttagctttctagtggctttagtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttacgataaaaatacttcaaggagg 4381288  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||| || |||||||||||| | |   ||||||  | ||| || |  |||||||||||||    
T  4381289 tcttagtgaaattttatgaaaattctgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatgaattttctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttc 4381387  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4381388 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 4381424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 36305314 - 36305079
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | || ||||||||||| |||||  |||||||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  36305314 catgaaagttttagataattgtgttagctttccagtggctttagtttgacttgaaaatggtttttgctttttgagttatgataaaaatactccaatgagg 36305215  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| |||||||||||  |||||||  ||||||||| || |||||||| ||||| |   ||||||  | |||||| |  ||||||||||| |    
T  36305214 tcttagtgaaattttatgaaaatttcgcataactatttctaagtaaacccaaaactcatggattgtctccaaacttcaaaacttg-tgtactatgagtcc 36305116  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36305115 aattaagatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 36305079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 559 - 765
Target Start/End: Original strand, 18816886 - 18817093
Alignment:
Q  559 tccaatggctttgggttcacttgaaaatgattttt--aatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagc 656  Q
    |||| ||||||||| || |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  18816886 tccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattctgc 18816985  T
Q  657 ataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacct 756  Q
    ||||   ||||||||| || |||||||||||||| |   ||||||  | ||| || |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18816986 ataattatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacatcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacct 18817084  T
Q  757 atgttgtga 765  Q
    |||||||||    
T  18817085 atgttgtga 18817093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 529 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 23914579 - 23914355
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | || || |||| ||||||||||||  |||   || ||||||||||||||| |||| |||    
T  23914579 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgactttaaaatgatttttggtttagaagttatgatgaaaatacttcaagtagg 23914480  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    || || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||| |||||     
T  23914479 tcctattgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataatttcaaacctcaaaagtagaagtactaggagtt- 23914381  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaac 754  Q
     |||| || |||||| ||||||||||    
T  23914380 tattaaggggtttaacagtatttaac 23914355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 533 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 23670300 - 23670073
Alignment:
Q  533 aaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtctt 632  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  23670300 aaagttgtagataattgtgttagctttctagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactctaaggaggtctt 23670201  T
Q  633 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaatt 732  Q
    |||||||| |||| ||||||| |||||||  |||||| || || |||||||||||| | |   |||||| ||| |||      |||||||||||||||||    
T  23670200 agtgaaattttattaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatgaattgtatccaaa-cttcaaagattgtgtactatgagttcaatt 23670102  T
Q  733 agggtgtttaagagtatttaacctatgtt 761  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||    
T  23670101 aaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 23670073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 529 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 38989121 - 38988890
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||  |||||  | ||||||||||||||||||||||||    
T  38989121 catgaaaattgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttaggttatgatgaaaatactccaaggagg 38989022  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||  | || ||| |||||||||| |   ||||||  | ||| || |  ||||||| |||||    
T  38989021 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctagttcaacccagaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactataagttc 38988923  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 761  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  38988922 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 38988890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 529 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 39020218 - 39019987
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||  |||||  | ||||||||||||||||||||||||    
T  39020218 catgaaaattgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttaggttatgatgaaaatactccaaggagg 39020119  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||  | || ||| |||||||||| |   ||||||  | ||| || |  ||||||| |||||    
T  39020118 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctagttcaacccagaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactataagttc 39020020  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 761  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39020019 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 39019987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 93; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Original strand, 17978813 - 17979048
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||  ||||| ||||||||| || |||||||||| | ||||  |||||||| ||||||||||||| | ||| ||||    
T  17978813 catgaaagttgtagataattgtgttagagttccagtggctttggtttgacttgaaaataagttttggtttttgagttatgatgaaaatatttcaaagagg 17978912  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| |||||||||||| | |||||  ||||||||| || |||||||||||||| |   |||||| ||| ||| |    |||||||||||||    
T  17978913 tcttagtgaaattttatgaaaattccggataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaa-cttcaaagtttgtgtactatgagttc 17979011  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17979012 aattaaggtgtttaatagtatttaacctatgttgtga 17979048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 529 - 763
Target Start/End: Complemental strand, 24907430 - 24907198
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||| |||||| |||||| ||||||||||| | ||||||||| || |||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  24907430 catgaatgttttatataattgtgttagctttctagtggctttggtttgactttaaaatgatttttgatttttgagttatgacgaaaatactctaaggagg 24907331  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    | | |||||||| |||||||||||| |||||||   |||||||| || |||||||||||||| |  |||||| | | |||||| |  |||||||||||||    
T  24907330 tttgagtgaaattttatgaaaattccgcataactaattctaagtcaacccaaaacttatggattgtttccaact-tcaaaacttg-tgtactatgagttc 24907233  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 763  Q
    ||||| | ||||||||| |||||||||||| ||||    
T  24907232 aattaagttgtttaagaatatttaacctatattgt 24907198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 596 - 765
Target Start/End: Original strand, 18815286 - 18815454
Alignment:
Q  596 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataat 695  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||| || |||||||||||||| |       
T  18815286 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattctgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtc 18815385  T
Q  696 tccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    |||||| ||| ||| |    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18815386 tccaaa-cttcaaagtttgtgtactatgagttcaattaaagtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 18815454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 529 - 690
Target Start/End: Original strand, 36732920 - 36733081
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  36732920 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatatttggtttttgagttatgatgaaaatactccaatgagg 36733019  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgga 690  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||| || ||||||||||||||    
T  36733020 tcttggtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatgga 36733081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 22474407 - 22474172
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| | || ||||||||| |||||||  |||||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  22474407 catgaaagttgtagataattgtgttagctttcccatggctttagtttgacttgaaaacgatttttggtttttgaattatgatgaaaatagtccaaggagg 22474308  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||  |||||   |||||| || || |||||| ||||||| |   ||||||  | ||| || |  |||||||||||||    
T  22474307 tcttagtgaaattttatgaaaactccacataattatttctaggtcaacccaaaatttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttc 22474209  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22474208 aattaaggtgcttaagagtatttaacctatgttgtga 22474172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 529 - 757
Target Start/End: Original strand, 36405456 - 36405683
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||||||||  ||||||||  || | |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36405456 catgaaaattgtagataattgtgttagctttcccgtggctttgaattgatttgaaaatgatttttgttttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 36405555  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||| || || |||||||||||| | |   ||||||  | ||| || |  |||||||||||||    
T  36405556 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatgaattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttc 36405654  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaaccta 757  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||    
T  36405655 aattaatgtgtttaatagtatttaaccta 36405683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 828 - 954
Target Start/End: Complemental strand, 32807410 - 32807285
Alignment:
Q  828 taagatgatttatattgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaatttgttatatatgaaaattattattga 927  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  32807410 taagatgattaatattgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaa-ttgttatatatgatgattattattga 32807312  T
Q  928 tggttacttgatgtgtatgtttaaatg 954  Q
    |||| ||||| ||  ||||| ||||||    
T  32807311 tggtgacttgctgcatatgtctaaatg 32807285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 550 - 749
Target Start/End: Original strand, 14397521 - 14397720
Alignment:
Q  550 tgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 649  Q
    ||||||||||| |||| | |||| || |||| |||||||||| ||    ||||| |||| | ||| |||| || | |||||  |||||||||||||||||    
T  14397521 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttgtagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaaatcttatgaaa 14397620  T
Q  650 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtat 749  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  || |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14397621 attcagcataatcatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagttctatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 14397720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 529 - 690
Target Start/End: Complemental strand, 21399366 - 21399205
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||| || || || || ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21399366 catgaaagttgtagataattgagttagttttccaatggattcggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 21399267  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgga 690  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| |||||||  |||||| || || ||||||||||||||    
T  21399266 tcttagtaaaattttatgaaaattctgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatgga 21399205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 529 - 690
Target Start/End: Complemental strand, 21793859 - 21793698
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||| || || || || ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21793859 catgaaagttgtagataattgagttagttttccaatggattcggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 21793760  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgga 690  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| |||||||  |||||| || || ||||||||||||||    
T  21793759 tcttagtaaaattttatgaaaattctgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatgga 21793698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 21513975 - 21513741
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||| ||| | ||||||||| ||  ||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  21513975 catgaaagttgtagataattgtgttagcattctagtggctttggtttggcttgaaaatgatttttgggttttgagatatgatcaaaatactccaa-gagg 21513877  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||| || || |||||| ||||||| |   |||||| ||| |||      | |||||||||||    
T  21513876 tcttagtgaaattttatgaaaattctgcataactatttctaggtcaacccaaaatttatggattgtctccaaa-cttcaaagcttttgcactatgagttc 21513778  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  21513777 aattaaggtgtttaagagtatttaacatattttgtga 21513741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 663 - 767
Target Start/End: Original strand, 8414240 - 8414344
Alignment:
Q  663 gtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttg 762  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8414240 gtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctaagttg 8414339  T
Q  763 tgagt 767  Q
    |||||    
T  8414340 tgagt 8414344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 529 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 16198490 - 16198371
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  16198490 catgaaagttgtatataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgattaaaatactccacggagg 16198391  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaa 648  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  16198390 tcttagtgaaattttatgaa 16198371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 757 - 959
Target Start/End: Complemental strand, 39834092 - 39833887
Alignment:
Q  757 atgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttgttaatgattataatgaggttcagagaggatgaataa-----gatgatttatattgatgatta 851  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||||| || || ||  |||||||||||||||| | |||||||||||| | |     | |||||||  ||||||||||    
T  39834092 atgttatgagttgacctttggggtaggactgaagctt--taatgattataatgagttccagagaggatgatttaatattgttgatttacgttgatgatta 39833995  T
Q  852 aatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaatttgttatatatgaaaattattattgatggttacttgatgtgtatgtttaa 951  Q
    |||||||||| || ||||||  ||||| |  ||||||||||| ||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  39833994 aatgtgaaaagatctatataacgtgaatgttgttgatatgaagttgcaaatggttatatatgaagattattattgatggttactcgctgtatatgtttaa 39833895  T
Q  952 atgatgat 959  Q
    ||||||||    
T  39833894 atgatgat 39833887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 530 - 648
Target Start/End: Original strand, 14397308 - 14397426
Alignment:
Q  530 atgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggt 629  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |    ||||||||||||||  |||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14397308 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtatggtgtgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggt 14397407  T
Q  630 cttagtgaaatcttatgaa 648  Q
    ||||||||||  |||||||    
T  14397408 cttagtgaaaatttatgaa 14397426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 530 - 648
Target Start/End: Original strand, 18677632 - 18677750
Alignment:
Q  530 atgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggt 629  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  | | ||||||||||||  |||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18677632 atgaaagttgtagataattttgttacctttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggt 18677731  T
Q  630 cttagtgaaatcttatgaa 648  Q
    ||||||||| | |||||||    
T  18677732 cttagtgaatttttatgaa 18677750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 530 - 648
Target Start/End: Original strand, 24485611 - 24485729
Alignment:
Q  530 atgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggt 629  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||| ||||  |||  ||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  24485611 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggcttggcgtgaaaatgacttttggtttaggagttatgattaaaatactccaaggaggt 24485710  T
Q  630 cttagtgaaatcttatgaa 648  Q
    ||||||||| | |||||||    
T  24485711 cttagtgaatttttatgaa 24485729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 529 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 24624324 - 24624095
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    ||||||||||||| ||||   |||||  |||| ||||| ||||| || |||| ||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  24624324 catgaaagttttatataaagatgttatatttctaatggatttggtttgacttaaaaattatttttagattttgagttatgatgaaaatactccaagtagg 24624225  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||| ||| ||| ||| ||||||||| ||||||  ||||||||| || ||||||  |||||  |  | ||||| | ||||||| | | || || |||||     
T  24624224 tctttgtgcaattttacgaaaattcaacataactatttctaagtgaacccaaaagctatggtttggtcccaaaccctaaaacttg-attaataggagttt 24624126  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatg 759  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24624125 aattaggatgtttaagagtatttaacctatg 24624095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 529 - 763
Target Start/End: Complemental strand, 25757808 - 25757575
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| | ||| |||||| ||||| || |||||||||| |||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||  ||    
T  25757808 catgaaagttatagataattgtgttggtttttcaatggttttggtttgacttgaaaataatttttagatttggagttatgatgaaaatactccaagtggg 25757709  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||||  |||  |||||||||||||||||||   || ||||||||| |||||  ||||||  |  ||||||| ||| ||| |   |||| || |||||     
T  25757708 tcttagcaaaactttatgaaaattcagcataattattcctaagttaaaccaaactttatggtttgtttccaaa-cttcaaaatttgagtattaggagttt 25757610  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 763  Q
    ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  25757609 aattaagaggtttaagagtatttaacctatgttgt 25757575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 577 - 765
Target Start/End: Original strand, 18118608 - 18118796
Alignment:
Q  577 acttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaat 676  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||||| |||| || ||| ||||| ||||||| || || | ||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  18118608 acttaaaaatgatttttagattttgagataagatggaattacaccaagtaggtcttggtaaatttttacgaaaattcagcctaaccgtttctaagtcaat 18118707  T
Q  677 ccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtacta-tgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    |||||||||||||  |  | |||||  | |||||| | |||| ||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18118708 ccaaaacttatggtttgttcccaaacttcaaaacttg-agtattagggagttcaattaaggtgttttagagtatttaacctatgttgtga 18118796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 532 - 763
Target Start/End: Original strand, 19331976 - 19332204
Alignment:
Q  532 gaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtct 631  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||| | || ||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||  |||||    
T  19331976 gaaagttttagataattgtgttagctttgcaatagtttttgtttgacttgaaaatgatttttagatttggagttatgatgaaaatactccaagtgggtct 19332075  T
Q  632 tagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaat 731  Q
    |||| ||| ||| |||||||| |||||||   || ||||||||| ||||| |||||||  |  ||||||| ||| ||| |  ||||| |  || || |||    
T  19332076 tagt-aaaactt-tgaaaatttagcataaatattcctaagttaaaccaaatcttatggtttgtttccaaa-cttcaaaatttaagtattcggattttaat 19332172  T
Q  732 tagggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 763  Q
    || |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  19332173 taagaggtttaagagtatttaacctatgttgt 19332204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 530 - 648
Target Start/End: Original strand, 4541941 - 4542059
Alignment:
Q  530 atgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggt 629  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |  | | ||||||| ||||  |||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4541941 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggt 4542040  T
Q  630 cttagtgaaatcttatgaa 648  Q
    ||||||||| | |||||||    
T  4542041 cttagtgaatttttatgaa 4542059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 529 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 18827879 - 18827650
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    ||||||||||||||||||   |||||| |||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||| ||| |||||||| |||| |||||||||| |||| ||     
T  18827879 catgaaagttttagataaagatgttagatttccaatggatttggtttggcttaaaaatgattgttagtttttgagttatggtgaaaatactacaagtaga 18827780  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||  |||||| ||| ||||||||| |||||   ||| | ||  |||||||||  |||||  | |||||||| || |||||| | ||||||| ||||      
T  18827779 tcttgctgaaattttacgaaaattcaacataattatttttgagcgaatccaaaagatatggtttgattccaaaactcaaaacttg-agtactaggagtct 18827681  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatg 759  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  18827680 aattaggatgtttaagagtatttaaactatg 18827650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 529 - 763
Target Start/End: Complemental strand, 25295788 - 25295555
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| | ||| |||||| ||||| || |||||||||| |||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||  ||    
T  25295788 catgaaagttatagataattgtgttggtttttcaatggttttggtttgacttgaaaataatttttagatttggagttatgatgaaaatactccaagtggg 25295689  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||||  |||  | |||||||||||||||||   || ||||||||| |||||  ||||||  |  ||||||| ||| ||| |   |||| || |||||     
T  25295688 tcttagcaaaacttcatgaaaattcagcataattattcctaagttaaaccaaactttatggtttgtttccaaa-cttcaaaatttgagtattaggagttt 25295590  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 763  Q
    ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  25295589 aattaagaggtttaagagtatttaacctatgttgt 25295555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 757 - 893
Target Start/End: Complemental strand, 18760763 - 18760615
Alignment:
Q  757 atgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttgttaatgattataatgaggttcagagaggatgaataagatgatttatatt------------- 843  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||| | || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||                 
T  18760763 atgttatgagttgacctttggggtagaagtgaag-ttgttaatgattataatgaggttcagagagtatgaataagatgattaatattgtgggtttaagta 18760665  T
Q  844 gatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaa 893  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18760664 gatgattaaatgtgaaaagatttatatattgtgaaagatgttgatatgaa 18760615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 530 - 638
Target Start/End: Complemental strand, 22002347 - 22002239
Alignment:
Q  530 atgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggt 629  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| || || | ||||| | ||||  |||  ||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  22002347 atgaaagttgtagataatttggttagctttccaatggctttggtttgacgtaaaaataagttttggtttaggagttatgatgaaaataccccaaggaggt 22002248  T
Q  630 cttagtgaa 638  Q
    |||||||||    
T  22002247 cttagtgaa 22002239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 679 - 765
Target Start/End: Original strand, 21345945 - 21346031
Alignment:
Q  679 aaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||| |||||||||| | ||||||||    
T  21345945 aaaacttagggaataattccaaatctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaacagtatttaacatgtgttgtga 21346031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 528 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 22313488 - 22313355
Alignment:
Q  528 tcatgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggag 627  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || || ||||||||||| ||| | | ||||||| ||||||||||| ||| ||||  |    
T  22313488 tcatgaaagttttagataattttgttagctttccaatggttccggtttgacttgaaaatgttttgtgaattttgagttatgatgaaaacactgcaagtgg 22313389  T
Q  628 gtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataac 661  Q
    ||||| | ||||| ||| | ||| | ||||||||    
T  22313388 gtcttggagaaattttaaggaaacttagcataac 22313355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 529 - 758
Target Start/End: Complemental strand, 24239071 - 24238843
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||| |||||| ||| |   ||||||| ||| ||||||| ||||||||  ||    
T  24239071 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggatttagtttgacttaaaaatgttttgtggattttgagttataatgaaaacactccaagaggg 24238972  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||   ||||| ||| | ||| | |||||||   |||| |||| || ||||||||||| |  |  |||||||  | |||||| |  |||||||||||||    
T  24238971 tcttgaagaaattttaaggaaacttagcataattatttccaagtcaacccaaaacttatcgtttgtttccaaacttcaaaacttg-tgtactatgagttc 24238873  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctat 758  Q
    |||||  |||||||||| || |||||||||    
T  24238872 aattaatgtgtttaagattaattaacctat 24238843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 774 - 837
Target Start/End: Complemental strand, 3273351 - 3273288
Alignment:
Q  774 ttggggtaggaatggaggttgttaatgattataatgaggttcagagaggatgaataagatgatt 837  Q
    |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3273351 ttggggtatgaatgaaagttgttaatgattataatgaggttcagagagtatgaataagatgatt 3273288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 529 - 611
Target Start/End: Complemental strand, 4233297 - 4233215
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatg 611  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | || |||| ||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  4233297 catgaaagtttgagataattttattagctttccaatggctttcgtttgacttaaaaataatttttagattttgagatatgatg 4233215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 40 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 15727749 - 15727651
Alignment:
Q  40 gaattaaaagatgaaattgaaagtttcgaattaaggaaaactagtttatgtttcgaattgagtttctagtcttaaaaagagtggataatacagtaggtt 138  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |  ||||| ||||||||||||||   ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  15727749 gaattaaaagatgaagttgaaagataagaattgaggaaaactagttttgattttgaattgagtttttattcttaaaaagagtggataatccggtaggtt 15727651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 529 - 690
Target Start/End: Original strand, 21495086 - 21495247
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||| || ||||| |||| |||| || |||||||||| || |||  |||||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  21495086 catgaaagttttagacaattgagttggcattccattggccttggtttgacttgaaaataatgttttgtttttgagttatgaagaaaatactctaaggagg 21495185  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgga 690  Q
    | ||| | |||  ||| |||||||| ||| ||  |||||||||| || ||||| ||||||||    
T  21495186 ttttaataaaactttacgaaaattccgcacaattgtttctaagtcaacccaaaccttatgga 21495247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 529 - 763
Target Start/End: Original strand, 45559572 - 45559798
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| || |||||||||| |||||||  |||        ||||||||||||||||    |    
T  45559572 catgaaagttttagataattgtgttagctttccaattgttttggtttgacttgaaaataatttttagattt-------ggatgaaaatactccaaatgag 45559664  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||| |||||   || ||||||||| ||||| |||||||  |  ||||||| ||| ||| |   |||| || || ||     
T  45559665 tcttagtaaaactttatgaaaattcaacataattattcctaagttaaaccaaaccttatggtttgtttccaaa-cttcaaaatttgagtattaggatttt 45559763  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 763  Q
    ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  45559764 aattaagaggtttaagagtatttaacctatgttgt 45559798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 529 - 624
Target Start/End: Original strand, 8414145 - 8414240
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaag 624  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | | ||  | ||||||||||||||  |||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  8414145 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactctagtttggcgtgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaag 8414240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 833 - 901
Target Start/End: Original strand, 27472391 - 27472458
Alignment:
Q  833 tgatttatattgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaat 901  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  27472391 tgatttactttgatgattaa-tgtgagaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaat 27472458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 833 - 901
Target Start/End: Original strand, 38550086 - 38550153
Alignment:
Q  833 tgatttatattgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaat 901  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  38550086 tgatttactttgatgattaa-tgtgagaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaat 38550153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 774 - 821
Target Start/End: Complemental strand, 23450869 - 23450822
Alignment:
Q  774 ttggggtaggaatggaggttgttaatgattataatgaggttcagagag 821  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23450869 ttggggtaggaatggaagttgttaatgattataatgaggttgagagag 23450822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 774 - 821
Target Start/End: Complemental strand, 24495981 - 24495934
Alignment:
Q  774 ttggggtaggaatggaggttgttaatgattataatgaggttcagagag 821  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24495981 ttggggtaggaatggaagttgttaatgattataatgaggttgagagag 24495934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 774 - 821
Target Start/End: Complemental strand, 34301947 - 34301900
Alignment:
Q  774 ttggggtaggaatggaggttgttaatgattataatgaggttcagagag 821  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34301947 ttggggtaggaatggaagttgttaatgattataatgaggttgagagag 34301900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 529 - 620
Target Start/End: Original strand, 45290114 - 45290205
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactc 620  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | || || |||||||||||| ||||  |||  ||| ||||||||||||||||    
T  45290114 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgaattttgttttaggagttatgatgaaaatactc 45290205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 529 - 594
Target Start/End: Original strand, 272183 - 272248
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgattttta 594  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||  |  ||||||||||||    
T  272183 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgattttta 272248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 529 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 643666 - 643601
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgattttta 594  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||  |  ||||||||||||    
T  643666 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgattttta 643601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 529 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 829472 - 829407
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgattttta 594  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||  |  ||||||||||||    
T  829472 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgattttta 829407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 832 - 901
Target Start/End: Original strand, 1327119 - 1327187
Alignment:
Q  832 atgatttatattgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaat 901  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||    
T  1327119 atgatttactttgatgattaa-tgtgagaatatttatatattgtgaacgatgttgatatgaagttgtaat 1327187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 716 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 5080478 - 5080429
Alignment:
Q  716 gtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5080478 gtactgtgagttcaattaaggtgtttaaaagtatttaacctatgttgtga 5080429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 529 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 29759519 - 29759454
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgattttta 594  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||||||||||    
T  29759519 catgaaaggtttagataattgtgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgattttta 29759454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 529 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 1484997 - 1484933
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgattttt 593  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | || || |||||||||||||||||    
T  1484997 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgattttt 1484933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 529 - 593
Target Start/End: Original strand, 20045762 - 20045826
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgattttt 593  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | || || |||||||||||||||||    
T  20045762 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgattttt 20045826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 529 - 572
Target Start/End: Original strand, 22089392 - 22089435
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgg 572  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  22089392 catgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttgg 22089435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #112
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 529 - 594
Target Start/End: Original strand, 15320008 - 15320073
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgattttta 594  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| || || |  ||||||||||||    
T  15320008 catgaaagttttagataactatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgattttta 15320073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #113
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 529 - 594
Target Start/End: Original strand, 15500377 - 15500442
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgattttta 594  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| || || |  ||||||||||||    
T  15500377 catgaaagttttagataactatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgattttta 15500442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #114
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 529 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 39114505 - 39114440
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgattttta 594  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| || || |  ||||||||||||    
T  39114505 catgaaagttttagataattatgttagttttctaatggctttggtttgacatccaaatgattttta 39114440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #115
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 529 - 593
Target Start/End: Original strand, 5852859 - 5852923
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgattttt 593  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||| || |||| | || || |||||||||||||||||    
T  5852859 catgaaagttgtagataattgtgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgattttt 5852923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #116
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 529 - 593
Target Start/End: Original strand, 14409011 - 14409075
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgattttt 593  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||| || |||| | || || |||||||||||||||||    
T  14409011 catgaaagttgtagataattgtgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgattttt 14409075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #117
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 842 - 901
Target Start/End: Complemental strand, 3273270 - 3273212
Alignment:
Q  842 ttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaat 901  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  3273270 ttgatgattaaatgtgaaag-atttatatattgtgaaaaatgttggtatgaagttgtaat 3273212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #118
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 529 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 4483875 - 4483812
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttt 592  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||  |  | |||||||||||||||||||    
T  4483875 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggtgtcagtttcacttgaaaatgatttt 4483812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #119
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 529 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 18618919 - 18618877
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgg 572  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18618919 catgaaagtttt-gataattttgttagctttctaatggctttgg 18618877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #120
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 529 - 572
Target Start/End: Original strand, 22007105 - 22007148
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgg 572  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  22007105 catgaaagttatagataattttgttagctttctaatggcgttgg 22007148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #121
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 529 - 619
Target Start/End: Original strand, 223324 - 223414
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatact 619  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||| || || |  ||||||||||||    |||||||||||| ||| ||||    
T  223324 catgaaagttgtagataattttattagctttctaatggccttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 223414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #122
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 410 - 448
Target Start/End: Original strand, 272247 - 272285
Alignment:
Q  410 tagaactcaagttatgatcaaattactacacaggggtca 448  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  272247 tagaactcgagttatgatcaaattactacacatgggtca 272285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #123
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 410 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 643602 - 643564
Alignment:
Q  410 tagaactcaagttatgatcaaattactacacaggggtca 448  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  643602 tagaactcgagttatgatcaaattactacacatgggtca 643564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #124
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 529 - 619
Target Start/End: Original strand, 688095 - 688185
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatact 619  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||| || || |  ||||||||||||    |||||||||||| ||| ||||    
T  688095 catgaaagttgtagataattttattagctttctaatggccttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 688185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #125
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 529 - 619
Target Start/End: Original strand, 736947 - 737037
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatact 619  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||| || || |  ||||||||||||    |||||||||||| ||| ||||    
T  736947 catgaaagttgtagataattttattagctttctaatggccttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 737037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #126
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 410 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 829408 - 829370
Alignment:
Q  410 tagaactcaagttatgatcaaattactacacaggggtca 448  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  829408 tagaactcgagttatgatcaaattactacacatgggtca 829370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #127
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 529 - 619
Target Start/End: Original strand, 860842 - 860932
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatact 619  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||| || || |  ||||||||||||    |||||||||||| ||| ||||    
T  860842 catgaaagttgtagataattttattagctttctaatggccttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 860932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #128
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 409 - 451
Target Start/End: Original strand, 17861769 - 17861811
Alignment:
Q  409 atagaactcaagttatgatcaaattactacacaggggtcagca 451  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  17861769 atagaactcaagatatgatcaaaatactacacatgggtcagca 17861811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #129
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 723 - 757
Target Start/End: Original strand, 18122329 - 18122363
Alignment:
Q  723 gagttcaattagggtgtttaagagtatttaaccta 757  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18122329 gagttcaattaaggtgtttaagagtatttaaccta 18122363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #130
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 529 - 594
Target Start/End: Original strand, 17150635 - 17150700
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgattttta 594  Q
    ||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |  ||||  ||||||||||||    
T  17150635 catgaaagttgcagataattatgttagctttctaatggctttggttggacttccaaatgattttta 17150700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 539; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 539; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 962
Target Start/End: Complemental strand, 11864 - 10907
Alignment:
Q  17 aggttttagaatttgagagattagaattaaaagatgaaattgaaagtttcgaattaaggaaaactagtttatgtttcgaattgagtttctagtcttaaaa 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  11864 aggttttagaatttgagagattagaattaaaagatgaaattgaaagctaagaattaaggaaaactagtttaggttttgaattgagtttctagtcttaaaa 11765  T
Q  117 agagtggataatacagtaggttgatgaataattattgttataatgatagggtgatcatagggtaatgattagggttatgtttggagagtattggatcgaa 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||           |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  11764 agagtggataatacagtaggttgatgaaaaattagtgttataatgatagggt-----------aatgattagggtcatgtttggagaatattggatcgaa 11676  T
Q  217 aacggagtcgaaaagatttccccaaaggcgaaatcgcagctgaactacgattttgctgtcagtgtgcaaaacgcgtttttattgtcgcagtttgacaagt 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  11675 aacggagtcgaaaagatttccccaaaggcgaaatcgcagctgaactgcgattttgatatcagtgtgcaaaacacgtttttattgtctcagtttgacaagt 11576  T
Q  317 ttaagtttcaaactgagtttaggtgccttcacgtaagttgtagatatggatgttatctgtccctcgactttggaggtactcgatttaagcacatagaact 416  Q
    ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  11575 ttaggtttcgaactgggtttaggtgccttcacgaaagttgtagatatggatgttatctgtcactcggctttggagaaactcgaattaagcacatagaact 11476  T
Q  417 caagttatgatcaaattactacacaggggtcagca----------cagttgtcctcttttcccgagcataggaaaatctacttttctggaattttttgtt 506  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||          |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||    
T  11475 caagatatgatcaaattactacacaggggtcagcagggatcagcacagtcgtcctcttttcccgagcataggaaaatcaacttttctggaattttctatt 11376  T
Q  507 ctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagata 606  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  11375 ctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattgtgttatctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgacttttggtttttgagata 11276  T
Q  607 tgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatctta 706  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || |    
T  11275 tgatgaaaatacgccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataatttcaaacctca 11176  T
Q  707 aaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttgttaatgattata 806  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | |||||||| |||  ||  |||||||| ||  ||    
T  11175 aaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggta-gaaacgaaattgttaataatatta 11077  T
Q  807 atgaggttcagagag-----------gatgaataa----gatgatttatattgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatg 891  Q
    |||  ||||||||||           ||||| |||    |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11076 atgttgttcagagagtctgaaattaagatgattaatgttgatgatttactatgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatg 10977  T
Q  892 aaattgtaatttgttatatatgaaaattattattgatggttacttgatgtgtatgtttaaatgatgatgtc 962  Q
    || || ||| |||||||||||||  |||||||||||| || ||||| ||  ||||||||||||||| ||||    
T  10976 aatttttaa-ttgttatatatgatgattattattgattgtgacttgctgcatatgtttaaatgatgttgtc 10907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 534; Significance: 0; HSPs: 128)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 534; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 48 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 10057619 - 10056863
Alignment:
Q  48 agatgaaattgaaagtttcgaattaaggaaaactagtttatgtttcgaattgagtttctagtcttaaaaagagtggataatacagtaggttgatgaataa 147  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10057619 agatgaaattgaaagttgagaattaaggaaaactagtttaggtttcgaattgagtttctagtcttaaaaagagtggataatacagtaggttgatgaataa 10057520  T
Q  148 ttattgttataatgatagggtgatcatagggtaatgattagggttatgtttggagagtattggatcgaaaacggagtcgaaaagatttccccaaaggcga 247  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10057519 ttagagttataatgatagggtgatcatagggtaatgattatggttatgtttggagagtatcggatcgaaaacggagtcgaaaagatttccccaaaggcga 10057420  T
Q  248 aatcgcagctgaactacgattttgctgtcagtgtgcaaaacgcgtttttattgtcgcagtttgacaagtttaagtttcaaactgagtttaggtgccttca 347  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| |    
T  10057419 aatcgcaactgaactgcgattttgctgtcagtgtgcaaaacgcgtttttattgtctcagtttgacaagtttaaatttcgaactgggtttaggtgccttaa 10057320  T
Q  348 cgtaagttgtagatatggatgttatctgtccctcgactttggaggtactcgatttaagcacatagaactcaagttatgatcaaattactacacaggggtc 447  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10057319 cgaaagttgtagatatggatgttatctgtcactcggcttttgaggcactcgatttaagcacatagaactcaagatatgatcaaattactacacaggggtc 10057220  T
Q  448 ----------agcacagttgtcctcttttcccgagcataggaaaatctacttttctggaattttttgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagt 537  Q
              |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  10057219 agcagggatcagcacagtcgtcctcttttcccgagcataggaaaatcaacttttctggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcaccaaagt 10057120  T
Q  538 tttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtga 637  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10057119 tgtagataattttgttagctttccaatggcattggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactctaaggaggtcttagtga 10057020  T
Q  638 aatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaattagggt 737  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| |||||||||| | ||||||||||| |||    
T  10057019 aattttatgaaaattcagcataacagtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaatctagaagtaccaggagttcaattaaggt 10056920  T
Q  738 gtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttg 794  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||| || | || ||||||||||||||||||    
T  10056919 gtttaagagtatttaacatatgttatgagttgatcctttgggtaggaatggaggttg 10056863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 529 - 962
Target Start/End: Complemental strand, 33186557 - 33186114
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  33186557 catgaaagttgtagataattttgttagctttccagtggctttggtttgactcgaaaataatttttagtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaga 33186458  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  || |||| ||||||||||||||||||    
T  33186457 tcttagtgaaatcttaggaaaatttagtataacattttctaagttagtccaaaacttatggaataactccaaccctcaaaattagaagtactatgagttc 33186358  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttgttaatgattataatgaggttcagagaggatgaat 828  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33186357 aattaaggtgtttaagagtgtttaacctatgttgtgagttgatc-ttggtataggaat-gaagttgttaatgattataatgaggttcagagaggatgaat 33186260  T
Q  829 aagatgatttata-------------ttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaatttgttatatatgaa 915  Q
    ||||||||| |||             |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||     
T  33186259 aagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattatgaaagacgttgatatgaagttgtaa-ttgttatatatgat 33186161  T
Q  916 aattattattgatggttacttgatgtgtatgtttaaatgatgatgtc 962  Q
     ||||||||||||||| ||||| ||  | ||||||||||||||||||    
T  33186160 gattattattgatggtgacttgctgcatttgtttaaatgatgatgtc 33186114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 529 - 797
Target Start/End: Complemental strand, 9638663 - 9638396
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9638663 catgaaagttttatataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 9638564  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9638563 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaatctcaaaactagaagtactatgagttc 9638464  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttgtta 797  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||| |||||||||| |||||||    
T  9638463 aattaaggtgtttaagagtatttaatctatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaagttgtta 9638396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 529 - 785
Target Start/End: Complemental strand, 15990695 - 15990439
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15990695 catgaaagttttagataatttagttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 15990596  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||    
T  15990595 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatctaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactaggagttc 15990496  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaa 785  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  15990495 aattaaggtgtttaagattatttaacctatgttgtgagttggtcattggggtaggaa 15990439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 529 - 794
Target Start/End: Original strand, 630299 - 630564
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  630299 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 630398  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||  || |||||||||||||||||||||||    
T  630399 tcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccgtttctaatttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagtactatgagttc 630498  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttg 794  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | |||||||| ||||||||||||    
T  630499 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtatgaatggaggttg 630564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 190; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 532 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 3337752 - 3337519
Alignment:
Q  532 gaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtct 631  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3337752 gaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagttttcaatatatgatgaaaatactccaaggaggtct 3337653  T
Q  632 tagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaat 731  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  3337652 tagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaat 3337553  T
Q  732 tagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3337552 taaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 3337519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 531 - 799
Target Start/End: Complemental strand, 10705152 - 10704885
Alignment:
Q  531 tgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtc 630  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  10705152 tgaaagttttagataattatgttagctttccaatggctctggcttgacttgaaaataattttttgtttttgagatatgatgaaaatattgcaaggaggtc 10705053  T
Q  631 ttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaa 730  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  10705052 ttagtgaaatcttaggaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaa 10704953  T
Q  731 ttagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttgttaat 799  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||| |||||||||| |||||||||    
T  10704952 ttaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaagttgttaat 10704885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 531 - 799
Target Start/End: Complemental strand, 10918922 - 10918655
Alignment:
Q  531 tgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtc 630  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  10918922 tgaaagttttagataattatgttagctttccaatggctctggcttgacttgaaaataattttttgtttttgagatatgatgaaaatattgcaaggaggtc 10918823  T
Q  631 ttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaa 730  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  10918822 ttagtgaaatcttaggaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaa 10918723  T
Q  731 ttagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttgttaat 799  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||| |||||||||| |||||||||    
T  10918722 ttaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaagttgttaat 10918655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 529 - 787
Target Start/End: Complemental strand, 12611507 - 12611249
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  12611507 catgaaagttgtagataattgagttagctttccaatggctttggtttcacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatagtccaacgagg 12611408  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  || |||||||||||||||||||||||    
T  12611407 tcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagtactatgagttc 12611308  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatg 787  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||||||||    
T  12611307 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatg 12611249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 179; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 529 - 787
Target Start/End: Original strand, 23802860 - 23803118
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  23802860 catgaaagttgtagataattgagttagctttccaatggctttggtttcacttgaaaatgatttttagtttttgagatgtgatgaaaatagtccaaggagg 23802959  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  || |||||||||||||||||||||||    
T  23802960 tcttagtgaaaccttatgaaaatttagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagtactatgagttc 23803059  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatg 787  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || | ||||||||||||||    
T  23803060 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttatgagttgatccttggggtaggaatg 23803118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 179; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 529 - 767
Target Start/End: Original strand, 56115232 - 56115470
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  56115232 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttgatttgacttgaaaatgatttttagtttttaagatatgatgaaaatactccaaggagg 56115331  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||    
T  56115332 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaagcagaagtactatgagttc 56115431  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 767  Q
     |||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  56115432 tattaaggtgtttaagagtatttaatccatgttgtgagt 56115470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 177; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 35660502 - 35660266
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35660502 catgaaagttttagatagttttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 35660403  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||| |||||     
T  35660402 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacttatggaataatctcaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 35660303  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35660302 aattaaagtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 35660266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 175; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 529 - 763
Target Start/End: Complemental strand, 15008622 - 15008388
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15008622 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggttttacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 15008523  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  15008522 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatggcataattcgaaacctcaaaactagaagtattatgagttc 15008423  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 763  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15008422 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 15008388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 174; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 529 - 794
Target Start/End: Original strand, 24046930 - 24047195
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||| ||||||| |||||||| | | |||    
T  24046930 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgattcttggtttttgagttatgatggaaatactctaggtagg 24047029  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||    
T  24047030 tcttagtgaaaccttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagttc 24047129  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttg 794  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  24047130 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgaccattagggtaggaatggaggttg 24047195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 173; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 25091309 - 25091073
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25091309 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 25091210  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||    
T  25091209 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcgaaactagaagtactatgagttc 25091110  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25091109 aactagggtgtttaagagtatttaaccaatgttgtga 25091073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 173; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Original strand, 53630869 - 53631105
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  53630869 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaatgagg 53630968  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  53630969 tcttagtgaaatcttatgaaaattcggcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattcaaaacctcaaaactagaagtattatgagttc 53631068  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53631069 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 53631105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 171; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 529 - 767
Target Start/End: Original strand, 10694643 - 10694881
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10694643 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaataatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactctaaggagg 10694742  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  10694743 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttattccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 10694842  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 767  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10694843 aattaaggtgtttaagattatttaacctatgttgtgagt 10694881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 171; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 529 - 767
Target Start/End: Original strand, 10908409 - 10908647
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10908409 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaataatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactctaaggagg 10908508  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  10908509 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttattccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 10908608  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 767  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10908609 aattaaggtgtttaagattatttaacctatgttgtgagt 10908647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 171; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 529 - 787
Target Start/End: Original strand, 51463463 - 51463721
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  51463463 catgaaagttgtagataattgagttagctttccaatggctttggtttcacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatagtctaaggagg 51463562  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||     
T  51463563 tcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaatttatgcgataataccaaccctcaaaactagaagtactatgagttt 51463662  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatg 787  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||||||||    
T  51463663 aattaaggcgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatg 51463721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 170; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 529 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 18213222 - 18212957
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||  |||  ||| |||||||||||||||||||| |||    
T  18213222 catggaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 18213123  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||| ||||||| |    
T  18213122 tcttagggaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgc 18213023  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttg 794  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  18213022 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttg 18212957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 167; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 529 - 767
Target Start/End: Original strand, 15447812 - 15448050
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||| |||||  |||||||||| | |||||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15447812 catgaaagttgtaggtaattgagttagctttctattggctttggtctgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 15447911  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||| ||||||||||||||||    
T  15447912 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactggaagtactatgagttc 15448011  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 767  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  15448012 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttctgagt 15448050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 165; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 533 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 19609976 - 19609744
Alignment:
Q  533 aaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtctt 632  Q
    |||||| |||||||||  |||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19609976 aaagttgtagataattgagttacctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtctt 19609877  T
Q  633 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaatt 732  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| |    
T  19609876 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaaattaatccaaaacttaaggtataattccaaacctcaaaactagaagtactatcagttcaact 19609777  T
Q  733 agggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19609776 agggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 19609744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 529 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 40620186 - 40619948
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| || |||||| || |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40620186 catgaaagttgtaaataattgtgctagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaatgagg 40620087  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  40620086 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaatctcaaaactagaagtactatgagtta 40619987  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 767  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  40619986 aattaaggtgtttaagagtattatacctatgttgtgagt 40619948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Original strand, 10356832 - 10357068
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||   |||||||||||| |||||||||  | || ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10356832 catgaaagttgtagataatggagttagctttccagtggctttggtgtgacatgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatacaccaaggagg 10356931  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  10356932 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtattatgagttc 10357031  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10357032 aactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 10357068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 16998181 - 16997950
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16998181 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttaaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 16998082  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||     ||||||||||||||     
T  16998081 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaa-----aagtactatgagttg 16997987  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16997986 aactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 16997950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 42875455 - 42875219
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||| || || ||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42875455 catgaaagttgtagataattaagttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaataatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 42875356  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  42875355 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcgtaactgtttctaagttaatccaaaacttaatgaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 42875256  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42875255 aactagggtgtttaggagtatttaacctatgttgtga 42875219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 157; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 127 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 14185949 - 14185706
Alignment:
Q  127 atacagtaggttgatgaataattattgttataatgatagggtgatcatagggtaatgattagggttatgtttggagagtattggatcgaaaacggagtcg 226  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  14185949 atacagtaggttgatgaataattggtgttctaatgataggttaatcatagggtaatgattagggtcaagtttggaaagtattggatcgaaaacgaagtcg 14185850  T
Q  227 aaaagatttccccaaaggcgaaatcgcagctgaactacgattttgctgtcagtgtgcaaaacgcgtttttattgtcgcagtttgacaagtttaagtttca 326  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |       
T  14185849 aaaagatttccccaa-ggcgaaatcgcagctgaactgcgattttgctgtcagtgtgcaaaacgcgtttttattgtctcagtttgacaagtttaaggtctg 14185751  T
Q  327 aactgagtttaggtgccttcacgtaagttgtagatatggatgtta 371  Q
    ||||| ||||||| | ||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  14185750 aactgggtttaggagtcttcacgaaagttgtaggtatggatgtta 14185706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 157; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 14549282 - 14549046
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||| || |  ||||||||| ||||  || |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  14549282 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgatgtgaaaatgagttttggttcttgagatatgatgaaagtactccatggagg 14549183  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  14549182 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaagactagaagtactatgagttc 14549083  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14549082 aactagggtgtttaagagtatttagcctatgttgtga 14549046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 157; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 37019325 - 37019089
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37019325 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 37019226  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  37019225 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataatcgtttataagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgggttc 37019126  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37019125 aactaaggtgtttaagagtatttaacctatgctgtga 37019089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 529 - 760
Target Start/End: Complemental strand, 15114878 - 15114648
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||||| || || ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  15114878 catgaaagttgtagataatttagttagatttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactcaaagtagg 15114779  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||     
T  15114778 tcttagtgaaat-ttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaaccttaaaactagaagtactaggagttt 15114680  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgt 760  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  15114679 aattaaggagtttaagagtatttaacctatgt 15114648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 529 - 784
Target Start/End: Original strand, 16277723 - 16277978
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  16277723 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaacggctttggtttgactcgaaaatgatttttggtttttgagttatcatgaaaatactccaaggagg 16277822  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||    
T  16277823 ttttactgaaatcttatgaaaattcagcataaccctttttaagttaatccaaaacttatgggataattccaagactcaaaactagaagtaatatgagttc 16277922  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtagga 784  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||| |||||||    
T  16277923 aattaaggtgtctaagagtatttaacccatgttatgagtagacccttgaggtagga 16277978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 529 - 784
Target Start/End: Original strand, 53387333 - 53387588
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  53387333 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggatttggtttgacgtgaaaatgatttttggtttttgagttatcatgaaaatactccaaggagg 53387432  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||| |||||||| |||||||||    
T  53387433 tcttactgaaatcttatgaaaattcagcataaccctttttaagttaatccaaaacttatgggataattccaagactcaaaattagaagtaatatgagttc 53387532  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtagga 784  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||| |||||||    
T  53387533 aattaaggtgtctaagagtatttaacccatgttatgagtagacccttgaggtagga 53387588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 155; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 529 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 33849398 - 33849160
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | ||||||||| |||  |||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33849398 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatcgaaaatgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggagg 33849299  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||    
T  33849298 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtactatgagttc 33849199  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 767  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| | |||||||||||    
T  33849198 aattaaggtgtttacgagtatttaatccatgttgtgagt 33849160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 154; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Original strand, 19435093 - 19435330
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  19435093 catgaaagttgtagataactttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatactccaaagagg 19435192  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| | || |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||     
T  19435193 tcttagtgaaattatatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcagtctaaaatttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 19435292  T
Q  729 aatt-agggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19435293 aattaagggggtttaagagtatttaacctatgttgtga 19435330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 529 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 9923852 - 9923622
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||| | || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9923852 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccggtggctttagtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 9923753  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||| | ||||    
T  9923752 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcctaacagtttctaagttaatccaaaacttatggaatgattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttc 9923653  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatg 759  Q
    ||||| ||||||||| ||| |||||||||||    
T  9923652 aattaaggtgtttaatagtgtttaacctatg 9923622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 147; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 529 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 28385899 - 28385661
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||  | ||||||||||||||  |||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28385899 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactctggtttggcgtgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggagg 28385800  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| | ||||    
T  28385799 tcttagtgaatttttatgaaaattcagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttc 28385700  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 767  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  28385699 aattaaggtgtttaagagtatttaacccaagttgtgagt 28385661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 534 - 759
Target Start/End: Original strand, 11479012 - 11479237
Alignment:
Q  534 aagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtctta 633  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11479012 aagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaggtctta 11479111  T
Q  634 gtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaatta 733  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||| | |||||||||    
T  11479112 gtgaaattttatgaaaattcagcctaacagtttccaagttaatccaaaacttatggaatgattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttcaatta 11479211  T
Q  734 gggtgtttaagagtatttaacctatg 759  Q
     ||||||||||| |||||||||||||    
T  11479212 aggtgtttaagattatttaacctatg 11479237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 145; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Original strand, 33243692 - 33243928
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||  || |||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| | ||    
T  33243692 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgattttgatttgacttgaaaataatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaagggg 33243791  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||| |||||     
T  33243792 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggatgattccaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 33243891  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  33243892 aattgaggtgtttaagagtagctaacctatgttgtga 33243928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 11425601 - 11425375
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||| |||  |||||||||||| | ||||||| || || || |||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11425601 catgaaagttgtagatgattgagttagctttccagtagctttggttttacgtgcaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatattccaaggagg 11425502  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  11425501 tcttagtgaaa----------attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactattagttc 11425412  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11425411 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 11425375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 533 - 717
Target Start/End: Original strand, 15011913 - 15012097
Alignment:
Q  533 aaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtctt 632  Q
    |||||| |||||||||  |||||||||||  ||||||||| || || ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15011913 aaagttgtagataattaagttagctttcccgtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttagttcttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtctt 15012012  T
Q  633 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagt 717  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  15012013 agtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagt 15012097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 125; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 14630482 - 14630246
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||||| || |||| ||||| |||||   || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14630482 catgaaagttgtagataattgtgttagttttccagtggctttggtttgacttaaaaattattttcggttcttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 14630383  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| ||||||||| || |||||||  |||||| || || |||||||||||||| |   |||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  14630382 tcttagtgaaattttatgaaaaatccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 14630283  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14630282 aattagggtgtttaagtgtatttaacctatgttgtga 14630246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 125; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 529 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 15344531 - 15344301
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15344531 catgaaagttttagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 15344432  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||| || || ||||||||||| |   ||||||| | ||| ||  | |||||||||||||    
T  15344431 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaaccccaaacttatggattgtctccaaat-tcaaagct-tatgtactatgagttc 15344334  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 761  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15344333 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 15344301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 125; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Original strand, 19566315 - 19566550
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19566315 catgaaagttttagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgaattgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 19566414  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||| |||||| || ||||||||| |||||||  ||||||||| || |||||||||||||| |   ||||||  | |||||| |  |||||||||||||    
T  19566415 tcttactgaaattttgtgaaaattctgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaaacttg-tgtactatgagttc 19566513  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19566514 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 19566550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 530 - 764
Target Start/End: Original strand, 10237895 - 10238128
Alignment:
Q  530 atgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggt 629  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| || |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10237895 atgaaagttttagataattgtgttagctttccagtggcgttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggt 10237994  T
Q  630 cttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttca 729  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||| || |||||||||||||| |  |||||||  | |||||| |  |||||||||||| |    
T  10237995 cttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtttccaaacttcaaaacttg-tgtactatgagttaa 10238093  T
Q  730 attagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtg 764  Q
    ||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  10238094 attaatgtgtttaagagtatttaagctacgttgtg 10238128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 115; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 530 - 760
Target Start/End: Original strand, 15214442 - 15214672
Alignment:
Q  530 atgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggt 629  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||   ||||||||||||||| || ||| ||||| | ||    
T  15214442 atgaaagttttaattaattttgttagctttccaatggctttggtttgacttaaaaatgatttttggattttgagatatgatggaattaccccaagcaagt 15214541  T
Q  630 cttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttca 729  Q
    ||| || || | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||  ||||| ||||||||| ||||| |    
T  15214542 cttggtaaatttttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacttattgaatatttccaaacctcgaaactggaagtactaggagttta 15214641  T
Q  730 attagggtgtttaagagtatttaacctatgt 760  Q
    |||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  15214642 attaagaggtttaagagtatttaacctatgt 15214672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 109; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Original strand, 16026325 - 16026559
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||  | || ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16026325 catgaaagttttagataattgtgctagctttccagtggcttcagtttgacttgaaaatgatttttgatttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 16026424  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||   |||||||||||| |||||||||||||| |   | |||| ||| ||| |    |||||||||||||    
T  16026425 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataagtatttctaagttaacccaaaacttatggattgtctacaaa-cttcaaagtttgtgtactatgagttc 16026523  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  16026524 aattaaggtgtttaagagta-ttaacccatgttgtga 16026559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 530 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 25513397 - 25513163
Alignment:
Q  530 atgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggt 629  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25513397 atgaaagttgtagataattgtgttagctttccattgactttggttcgacttgaaaatgatttttgatttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggt 25513298  T
Q  630 cttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttca 729  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| |||||||  ||||||||| || |||||||||||||  |   | |||| || ||| || |  |||||| |||||||    
T  25513297 cttagtgaaattttatgaaagttccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatgggttgtcttcaaacctcaaagcttg-tgtactacgagttca 25513199  T
Q  730 attagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25513198 attacggtgtttaagaatatttaacctatgttgtga 25513163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 26445540 - 26445305
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||| | ||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26445540 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtagctttggtttgaattgaaaatgatttttgatttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 26445441  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||| ||||||| |||||||||||  | |||||  ||||||||| || |||||||||||||| |   ||||||  | ||| || |  ||||||||| |||    
T  26445440 tcttggtgaaattttatgaaaatttcggataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgatttc 26445342  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26445341 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 26445305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 3485564 - 3485331
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| |||| | |||| |  | || |||||||||||||||||  |||  ||| |||||||||||||||||||||||     
T  3485564 catgaaagttgtagataattgtgttagttttctagtggcgtcagtttgacttgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaga 3485465  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |  || ||||||||||||| |||||     
T  3485464 tcttagtgaattgtta--aaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaacccc-aagactagaagtactaggagttt 3485368  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  3485367 aattaaggtgtttaagagtatctagcatatgttgtga 3485331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 529 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 40229959 - 40229727
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  40229959 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttataatgaaaatactccaaggagg 40229860  T
Q  629 tctt-agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagtt 727  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| ||||||   |||||| || || |||||||||||||| |   ||||||  | ||| || |  ||||||||||||    
T  40229859 tcttaagtgaaattttatgaaaattctgcataattatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagtt 40229761  T
Q  728 caattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 761  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  40229760 caattaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 40229727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 532 - 761
Target Start/End: Original strand, 44024003 - 44024231
Alignment:
Q  532 gaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtct 631  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| |||||  ||||||||| || |||||||||| ||||||  ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  44024003 gaaagttgtagataattgtgttagatttcccgtggctttggtttgacttgaaaataatttttggtttctgagttattatgaaaatactccaaggaggtct 44024102  T
Q  632 tagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaat 731  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| || || |||||||||||||| |   ||||||  | ||| || |  ||||||||||||||||    
T  44024103 tagtgaaattttatgaaaattccgcataactgtttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaat 44024201  T
Q  732 tagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 761  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||    
T  44024202 taaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 44024231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Original strand, 2425017 - 2425252
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||| | || |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  2425017 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttagtttgacttgaaaatgatttttgctttttgagttatgatgaaactactccaaggagg 2425116  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| |||||||  |||||| || || |||||||||||||| |   ||||||  | |||  | |  | |||||||||||    
T  2425117 tcttagtgaaattttatgaaatttccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaaattcaaaggttg-tgcactatgagttc 2425215  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2425216 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 2425252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 635 - 767
Target Start/End: Original strand, 15883917 - 15884049
Alignment:
Q  635 tgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaattag 734  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||     
T  15883917 tgaaattttatgaaaatttagcataaccgtttctaagttgatccaaaacttagggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaa 15884016  T
Q  735 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 767  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15884017 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 15884049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 529 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 46740854 - 46740623
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| || ||||||||||||| |||  |||||||| |||||| |||||||||||| || |    
T  46740854 catgaaagttgtagataattttgttagctttccagtgactttggtttgacttgaaaatgatgtttggtttttgagttatgataaaaatactccaaagacg 46740755  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| || ||||||||| |||||||  |||||| || || |||||||||||||| |   ||||||  | ||| || |  |||||||||||||    
T  46740754 tcttagtgaaattttgtgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttc 46740656  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 761  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  46740655 aattaagatgtttaagagtatttaacctatgtt 46740623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 93; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 529 - 761
Target Start/End: Original strand, 45314733 - 45314964
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||||| || ||||||   || |||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45314733 catgaaagttgtagataattgtgttagatttccagtggctttggtttgacttgagtctggtttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 45314832  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||| || ||||||||| |||| |   ||||||  | ||| || |  | | |||||||||    
T  45314833 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttgtggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgcattatgagttc 45314931  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 761  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  45314932 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 45314964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 529 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 55582847 - 55582703
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  55582847 catgaaagttttagataatcgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatgtttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaga 55582748  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtt 673  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  55582747 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtt 55582703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 88; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 529 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 30147511 - 30147392
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  30147511 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggttttacttaaaaatgatttttaacttttgagatatgatggaaatactccaagtagg 30147412  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaa 648  Q
    |||||||||| | |||||||    
T  30147411 tcttagtgaatttttatgaa 30147392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 529 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 15534777 - 15534658
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15534777 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttagtttgactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggagg 15534678  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaa 648  Q
    |||||||||| | |||||||    
T  15534677 tcttagtgaatttttatgaa 15534658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 529 - 759
Target Start/End: Original strand, 20595827 - 20596056
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||||||||||  | | ||||||||| ||||||||||| || || ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||| |||    
T  20595827 catgaaagttttagatacatgtattagctttctaatggctttggtttgacatgaaaataatttttagattttgagttatgatgaaaatacttcaagtagg 20595926  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||||||||||   ||| ||||| || || ||||||||||  | || ||||| || |||||| | |||  || ||||||    
T  20595927 tcttggtgaaattttacgaaaattcagcataattatttgtaagtcaaccccaaacttatggtttgatgccaaacctcaaaacttg-agttataggagttc 20596025  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatg 759  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  20596026 aattatgatgtttaagagtatttaacctatg 20596056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 542 - 656
Target Start/End: Original strand, 22725494 - 22725608
Alignment:
Q  542 gataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatc 641  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  22725494 gataattttgttagctttccaaaggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaagtcttactgaaatc 22725593  T
Q  642 ttatgaaaattcagc 656  Q
    |||||||||||||||    
T  22725594 ttatgaaaattcagc 22725608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 529 - 689
Target Start/End: Original strand, 13046041 - 13046201
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||  |||| |  |||||||||||||||||||| |||    
T  13046041 catgaaagttttatataaatttgttagctttccaatgcctttggtttgacttgaaaatgatttttatatttttatttatgatgaaaatactccaagtagg 13046140  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgg 689  Q
    |||| || |||| ||| ||||||||| ||||||| ||||||| | || |||||| ||||||    
T  13046141 tcttggtaaaattttacgaaaattcaacataaccatttctaaatcaacccaaaagttatgg 13046201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 831 - 937
Target Start/End: Complemental strand, 15880839 - 15880734
Alignment:
Q  831 gatgatttatattgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaatttgttatatatgaaaattattattgatgg 930  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  15880839 gatgatttactttgattattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaa-ttgttatatatgatgattattattgatgg 15880741  T
Q  931 ttacttg 937  Q
    | |||||    
T  15880740 tgacttg 15880734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 529 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 14049173 - 14049054
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| |||  |||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  14049173 catgaaagttgtatataattttgttagctttccaatggctttggtttgactcgaaaatgatatttggtttttgagatatcataaaaatactccaaggagg 14049074  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaa 648  Q
    |||||||||| | |||||||    
T  14049073 tcttagtgaatttttatgaa 14049054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 529 - 672
Target Start/End: Original strand, 18108274 - 18108417
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| |||||| |||  | || || |||| ||||||||||||  |||  ||| |||||||||||||||||||| |||    
T  18108274 catgaaagttgtagataattgtgttagatttccagtggtgtcggtttgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 18108373  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagt 672  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18108374 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaagt 18108417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 529 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 36038466 - 36038347
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || ||| |||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  36038466 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttaatttgactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgataaaaatactcaaaggagg 36038367  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaa 648  Q
    |||||||||| | |||||||    
T  36038366 tcttagtgaatttttatgaa 36038347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 529 - 648
Target Start/End: Original strand, 49547340 - 49547459
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||  | ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  49547340 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactctggtttggcgtgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggagg 49547439  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaa 648  Q
    ||||| |||| | |||||||    
T  49547440 tcttaatgaatttttatgaa 49547459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 530 - 648
Target Start/End: Original strand, 12033341 - 12033459
Alignment:
Q  530 atgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggt 629  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | | ||||||||||||  |||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12033341 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggt 12033440  T
Q  630 cttagtgaaatcttatgaa 648  Q
    ||||||||| | |||||||    
T  12033441 cttagtgaatttttatgaa 12033459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 530 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 44615883 - 44615765
Alignment:
Q  530 atgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggt 629  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | | ||||||||||||  |||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44615883 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggt 44615784  T
Q  630 cttagtgaaatcttatgaa 648  Q
    ||||||||| | |||||||    
T  44615783 cttagtgaatttttatgaa 44615765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 684 - 765
Target Start/End: Original strand, 13036328 - 13036409
Alignment:
Q  684 ttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13036328 ttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatattgtga 13036409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 833 - 962
Target Start/End: Complemental strand, 13844712 - 13844584
Alignment:
Q  833 tgatttatattgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaatttgttatatatgaaaattattattgatggtt 932  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||| | ||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13844712 tgatttacgttgatgattaaatgtgaaaatatctatataatgtgaaagttgttgatatggagttgcaaat-gttatatatgaagattattattgatggtt 13844614  T
Q  933 acttgatgtgtatgtttaaatgatgatgtc 962  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  13844613 acttgttgtatatgtttaaatgatgttgtc 13844584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 624 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 14508322 - 14508182
Alignment:
Q  624 ggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatg 723  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||| || || |||||||||||||| |   ||||||  ||||| || |  ||||||||    
T  14508322 ggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaactttaaagcttgt-gtactatg 14508224  T
Q  724 agttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14508223 agttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 14508182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 693 - 797
Target Start/End: Original strand, 9871126 - 9871229
Alignment:
Q  693 aattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggt 792  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | | ||||| |||||||||| ||    
T  9871126 aattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtttatc-ttgggataggaatggaagt 9871224  T
Q  793 tgtta 797  Q
    |||||    
T  9871225 tgtta 9871229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 529 - 684
Target Start/End: Original strand, 19081737 - 19081892
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||||||||||| |  |||| ||||||| ||| ||| | || || | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||     
T  19081737 catgaaagttttagataaatgagttatctttccactggattttgtttgacatcaaaatgatttttaaattttgagttatgatgaaaacacttcaaggaga 19081836  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaact 684  Q
    |||| || |||| ||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||    
T  19081837 tcttggtaaaattttacgaaaattcagcataaccgtttccaagtcaacccaaaact 19081892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 529 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 14185538 - 14185427
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||||||  | |||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  14185538 catgaaagttgtagataagtgtgttagctttccagtggctttggtgtgacttgaaaatgattcttggtttttgagttatgatgaaaatacgccaaggagg 14185439  T
Q  629 tcttagtgaaat 640  Q
    |||||| |||||    
T  14185438 tcttagcgaaat 14185427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 795 - 957
Target Start/End: Complemental strand, 46643058 - 46642884
Alignment:
Q  795 ttaatgattataatgaggttcagagaggatgaataagatgattta-tattgatgattaaa------------tgtgaaaatatttatatattgtgaaaga 881  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||            || ||||| ||||||||||||||||||     
T  46643058 ttaatgattataatgaggttcagagaggatgactaagatgatttaatattgttgtttaaagttgatgattaatgcgaaaagatttatatattgtgaaagt 46642959  T
Q  882 cgttgatatgaaattgtaatttgttatatatgaaaattattattgatggttacttgatgtgtatgtttaaatgatg 957  Q
     ||| ||||||| |||||||| |||| ||||||| | |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  46642958 tgttaatatgaagttgtaatt-gttacatatgaagaatattattggtggttacttgttgtatatgtttaaatgatg 46642884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 530 - 648
Target Start/End: Original strand, 50221907 - 50222025
Alignment:
Q  530 atgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggt 629  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||  | | ||||||||||||  |||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  50221907 atgaaagttgtagataagtttgttggctttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggt 50222006  T
Q  630 cttagtgaaatcttatgaa 648  Q
    ||||||||| | |||||||    
T  50222007 cttagtgaatttttatgaa 50222025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 40 - 451
Target Start/End: Original strand, 20872330 - 20872737
Alignment:
Q  40 gaattaaaagatgaaattgaaagtttcgaattaaggaaaactagttta-tgtttcgaattgagtttcta-gtcttaaaaagagtggataatacagtaggt 137  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |   |||| ||||||||||||||| |  || ||||||||||| |  | |||||||||||||||||||   ||||||    
T  20872330 gaattaaaagatgaagttgaaatatcataattgaggaaaactagtttagtactttgaattgagtttttttgacttaaaaagagtggataatctggtaggt 20872429  T
Q  138 tgatgaataattattgttataatgatagggtgatcatagg-gtaatgattagggttatgtttggagagtattggatcgaaaacggagtcgaaaagatttc 236  Q
    | | ||| ||||| ||||  ||||||||||| ||||| |  || |  ||||||||   ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||  |||    
T  20872430 taacgaagaattagtgtttgaatgatagggtaatcatggaagtgaatattagggtcgagtttggagagtacatgatcgaaaacggagtcgaaaagggttc 20872529  T
Q  237 cccaaaggcgaaatcgcagctgaactacgattttgctgtcagtgtgcaaaacgcgttt-ttattgtcgcagtttgacaagtttaagtttcaaactgagtt 335  Q
    |||||| |||||||||||||  |||| | ||||||||||||  ||       |||||| ||| | ||  |||||||||||||||||||   || || |||    
T  20872530 cccaaa-gcgaaatcgcagcacaactgcaattttgctgtcaccgt-------gcgtttcttactctcttagtttgacaagtttaagttctgaattgggtt 20872621  T
Q  336 taggtgccttcacgtaagttgtagatatggatgttatctgtccctcgactttggaggtactcgatttaagcacatagaactcaagttatgatcaaattac 435  Q
    |||||| ||||| | |  ||||||||||||||||||  | || || | ||||||||| ||| ||||||||||  |||| |||||  |||||||||| |||    
T  20872622 taggtgtcttcatgaacattgtagatatggatgttaggtttcactagcctttggaggaacttgatttaagcatctagatctcaatatatgatcaaaatac 20872721  T
Q  436 tacacaggggtcagca 451  Q
     ||| |||| ||||||    
T  20872722 cacaaagggttcagca 20872737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 529 - 689
Target Start/End: Original strand, 17376062 - 17376222
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||| |   ||||||| ||||||||||| ||| ||||  ||    
T  17376062 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggatttaggtttacttgaaaatgttttgtggattttgagttatgatgaaaacacttcaagtggg 17376161  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgg 689  Q
    ||||   ||||| ||| | ||| | ||||||||  |||| |||| || |||||||||||||    
T  17376162 tcttgaagaaattttaaggaaacttagcataactatttccaagtcaacccaaaacttatgg 17376222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 531 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 19243294 - 19243177
Alignment:
Q  531 tgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtc 630  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    | || |||||||||  |||  | | ||||||||||||||||||||||||||    
T  19243294 tgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttggagtaaatatgatttttggtttaggtgttatgatgaaaatactccaaggaggtc 19243195  T
Q  631 ttagtgaaatcttatgaa 648  Q
    |||||||| | |||||||    
T  19243194 ttagtgaatttttatgaa 19243177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 624 - 758
Target Start/End: Complemental strand, 12622932 - 12622799
Alignment:
Q  624 ggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatg 723  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||| || || || |||||||||||||| |   ||||||  | ||| || |  ||||||||    
T  12622932 ggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttttaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttgt-gtactatg 12622834  T
Q  724 agttcaattagggtgtttaagagtatttaacctat 758  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12622833 agttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctat 12622799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 691 - 767
Target Start/End: Original strand, 43251120 - 43251197
Alignment:
Q  691 ataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaattagggtg-tttaagagtatttaacctatgttgtgagt 767  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | |||||||||||    
T  43251120 ataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgttttaagagtatttaatccatgttgtgagt 43251197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 529 - 686
Target Start/End: Original strand, 54364086 - 54364243
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| | || ||||||||||| ||| |   ||||||| ||||||||||| ||||||||  ||    
T  54364086 catgaaagttttagataattttgttagatttccaatgaatttagtttgacttgaaaatgttttgtggattttgagttatgatgaaaacactccaagtggg 54364185  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaactta 686  Q
    |||| | ||||| ||| | ||| | ||||||||  |||| |||| || ||||||||||    
T  54364186 tcttggagaaattttaagtaaacttagcataactatttccaagtcaacccaaaactta 54364243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 304 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 9886626 - 9886387
Alignment:
Q  304 cagtttgacaagtttaagtttcaaactgagtttaggtgccttcacgtaagttgtagatatggatgttatctgtccctcgactttggaggtactcgattta 403  Q
    ||||||| ||||||||||||   || || ||||||||| ||| |   || ||||||||||||||||||  | || || | |||| || | |||| |||||    
T  9886626 cagtttggcaagtttaagttatgaattgggtttaggtgtctttataaaatttgtagatatggatgttagttttcactagcctttagatggactcaattta 9886527  T
Q  404 agcacatagaactcaagttatgatcaaattactacacaggggtcagcacagttgtcctcttttcccgagcataggaaaatctacttttctggaatttttt 503  Q
    |  |  ||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||  ||||| || ||| ||| | | |||||||||| ||||||||   | ||| |    
T  9886526 aaaatctagaaatcaagatatgatcaaaatactacacaagggtcaacaaggttgtgctttttccccaaacttaggaaaatcaacttttctaccactttct 9886427  T
Q  504 gttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttttaga 543  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  9886426 tttctgaattaggtttgggagtattcatgaaagttgtaga 9886387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 530 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 29267948 - 29267830
Alignment:
Q  530 atgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggt 629  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |  |    | ||||||||||||  |||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29267948 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactttagtgtggagtaaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggt 29267849  T
Q  630 cttagtgaaatcttatgaa 648  Q
    || |||||| | |||||||    
T  29267848 ctcagtgaatttttatgaa 29267830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 716 - 765
Target Start/End: Original strand, 26922254 - 26922303
Alignment:
Q  716 gtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26922254 gtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 26922303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 529 - 586
Target Start/End: Original strand, 9871071 - 9871128
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaat 586  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||    
T  9871071 catgaaagttttagataattttgttagcttttcaatgactttggtttgacttgaaaat 9871128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 224
Target Start/End: Original strand, 18554858 - 18555006
Alignment:
Q  76 aaaactagtttatgtttc-gaattgagtttctagtcttaaaaagagtggataatacagtaggttgatgaataattattgttataatgatagggtgatcat 174  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||| | ||| ||||| ||||  |||||||||||||| ||    
T  18554858 aaaactagtttaggtttttgaattgagttt-tagtcttaaaaagagtggataatctggtaggttaacgaagaattagtgtttgaatgatagggtgatgat 18554956  T
Q  175 agggtaatgattagggttatgtttggagagtattggatcgaaaacggagt 224  Q
     | || | |||||||||   |||||| |||| | || |||||||||||||    
T  18554957 ggagtgaagattagggtcgggtttggcgagtttagggtcgaaaacggagt 18555006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 832 - 901
Target Start/End: Original strand, 52873251 - 52873319
Alignment:
Q  832 atgatttatattgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaat 901  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  52873251 atgatttactttgatgattaa-tgtgagaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaat 52873319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 529 - 594
Target Start/End: Original strand, 55377205 - 55377270
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgattttta 594  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||||||||||    
T  55377205 catgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgattttta 55377270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 833 - 893
Target Start/End: Complemental strand, 362272 - 362213
Alignment:
Q  833 tgatttatattgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaa 893  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  362272 tgatttactttgatgattaa-tgtgagaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaa 362213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 351 - 538
Target Start/End: Original strand, 18555309 - 18555497
Alignment:
Q  351 aagttgtagatatggatgttatctgtccctcgactttggaggtactcgatttaagcacatagaactcaagttatgatcaaattactacacaggggtcagc 450  Q
    |||| |||||||| ||||||| || || || | ||||||||| |||| ||||||| |  || |||||||| |||||| ||| || | |||||||||||||    
T  18555309 aagtggtagatatcgatgttagctttcactagcctttggagggactctatttaagtatctataactcaagatatgatgaaaatagtgcacaggggtcagc 18555408  T
Q  451 acagttgtcctcttttcccgagcataggaaaa-tctacttttctggaattttttgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagtt 538  Q
    |  || ||| ||||| ||| | |||||||||| || | |||||||  | ||| |||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  18555409 agggtcgtcttctttccccaaacataggaaaagtcaatttttctgccactttatgttccaaataaggtttgggagtcttcatggaagtt 18555497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 842 - 901
Target Start/End: Complemental strand, 9923427 - 9923369
Alignment:
Q  842 ttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaat 901  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  9923427 ttgatgattaaatgtgaaag-atttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaat 9923369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 842 - 901
Target Start/End: Original strand, 11479432 - 11479490
Alignment:
Q  842 ttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaat 901  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  11479432 ttgatgattaaatgtgaaag-atttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaat 11479490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 529 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 18247829 - 18247739
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatact 619  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |  ||||||||||||    |||||||||||| ||| ||||    
T  18247829 catgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 18247739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 529 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 19020099 - 19020009
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatact 619  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |  ||||||||||||    |||||||||||| ||| ||||    
T  19020099 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatggttttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 19020009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 529 - 619
Target Start/End: Original strand, 22355079 - 22355169
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatact 619  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |  ||||||||||||    |||||||||||| ||| ||||    
T  22355079 catgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 22355169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 529 - 594
Target Start/End: Original strand, 5683375 - 5683440
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgattttta 594  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || || |  ||||||||||||    
T  5683375 catgaaagttttaggtaattttgttagctttccaatggttttggtttgacgtccaaatgattttta 5683440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 529 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 14951360 - 14951295
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgattttta 594  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||||||||||    
T  14951360 catgaaagttgtagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgattttta 14951295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 716 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 55582673 - 55582624
Alignment:
Q  716 gtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  55582673 gtactatgagttcaattaaagtgtttaagagtatttaatctatgttgtga 55582624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 440 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 13234651 - 13234547
Alignment:
Q  440 caggggtcagcacagttgtcctcttttcccgagcataggaaaatctacttttctggaattttttgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttt 539  Q
    ||||||||||||  || ||||||||| |||   |||||||||||| | | |||||  | ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  13234651 caggggtcagcaaggtcgtcctctttccccatacataggaaaatcaattgttctgtcactttatgttccgaattaggtttggtagtcttcatgaaagttg 13234552  T
Q  540 tagat 544  Q
    |||||    
T  13234551 tagat 13234547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 529 - 593
Target Start/End: Original strand, 15117919 - 15117983
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgattttt 593  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | || || |||||||||||||||||    
T  15117919 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgattttt 15117983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 529 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 16731766 - 16731702
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgattttt 593  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||  |||||||||||    
T  16731766 catgaaagttttagataattatgttagctctctaatggctttggtttgacttccaaatgattttt 16731702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 758 - 901
Target Start/End: Original strand, 35812115 - 35812269
Alignment:
Q  758 tgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttgttaatgattataatgaggttcagagaggatgaataagat-------------gatttatattg 844  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||||| || || || |||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||             ||||||  |||    
T  35812115 tgttatgagttgacctttggggtaggagtgaagttt-ttaatgattataatgaagttcagagagtataaataagatgattaatgttgtggatttaagttg 35812213  T
Q  845 atgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaat 901  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  35812214 atgattaaatgtg-gaagatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaat 35812269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 529 - 592
Target Start/End: Original strand, 7640753 - 7640816
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttt 592  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | || || ||||||||||||||||    
T  7640753 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttt 7640816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 842 - 881
Target Start/End: Complemental strand, 14185291 - 14185252
Alignment:
Q  842 ttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaaga 881  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14185291 ttgatggttaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaaga 14185252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 529 - 592
Target Start/End: Original strand, 18239179 - 18239242
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttt 592  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| |  | |||||||||||||||||||    
T  18239179 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtctgtttcacttgaaaatgatttt 18239242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 67 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 13235214 - 13235113
Alignment:
Q  67 gaattaaggaaaactagtttatgtttc-gaattgagtttctagtcttaaaaagagtggataatacagtaggttgatgaataattattgttataatgatag 165  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||| | ||||||||| |||   ||||||||    
T  13235214 gaattgaggaaaaccagtttaggtttttgaattgagttt-tagtcttaaaaagagtggatatttcggtaggttaacgaataattagtgtatgaatgatag 13235116  T
Q  166 ggt 168  Q
    |||    
T  13235115 ggt 13235113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 801 - 839
Target Start/End: Complemental strand, 13844758 - 13844720
Alignment:
Q  801 attataatgaggttcagagaggatgaataagatgattta 839  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13844758 attataatgaggttcagagaggatgattaagatgattta 13844720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 533 - 619
Target Start/End: Original strand, 17146303 - 17146389
Alignment:
Q  533 aaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatact 619  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |  ||||||||||||    |||||||||||| ||| ||||    
T  17146303 aaagttgtagataattttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 17146389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 529 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 18168383 - 18168345
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggc 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18168383 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatggc 18168345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 529 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 47357273 - 47357183
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatact 619  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| || || |  ||||||||||||    |||||||||||| ||| ||||    
T  47357273 catgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggccttggtttgacatccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 47357183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 852 - 901
Target Start/End: Complemental strand, 13844547 - 13844498
Alignment:
Q  852 aatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaat 901  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  13844547 aatgtgagaatatttatatattgtgaaagatgctgatatgaagttgtaat 13844498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 800 - 837
Target Start/End: Complemental strand, 14185346 - 14185309
Alignment:
Q  800 gattataatgaggttcagagaggatgaataagatgatt 837  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14185346 gattataatgaggttcagagagtatgaataagatgatt 14185309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 883 - 952
Target Start/End: Complemental strand, 15190428 - 15190360
Alignment:
Q  883 gttgatatgaaattgtaatttgttatatatgaaaattattattgatggttacttgatgtgtatgtttaaa 952  Q
    ||||||||||| ||| |||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  15190428 gttgatatgaagttgaaatt-gttatacatgaagattattaatgatggttacttgctgtatatgtttaaa 15190360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 529 - 594
Target Start/End: Original strand, 15287878 - 15287943
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgattttta 594  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || || |  ||||||||||||    
T  15287878 catgaaagttgtagataattttattagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgattttta 15287943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 529 - 594
Target Start/End: Original strand, 15294988 - 15295053
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgattttta 594  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || || |  ||||||||||||    
T  15294988 catgaaagttgtagataattttattagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgattttta 15295053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 529 - 594
Target Start/End: Original strand, 18293675 - 18293740
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgattttta 594  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| || || |  ||||||||||||    
T  18293675 catgaaagttttagataattatgttagatttctaatggctttggtttgacgtccaaatgattttta 18293740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 832 - 901
Target Start/End: Complemental strand, 46642861 - 46642793
Alignment:
Q  832 atgatttatattgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaat 901  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||||| || ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  46642861 atgatttaatttgatgattaa-tgtgagaagatttataaactgtgaaagacgttgatatgaagttgtaat 46642793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 529 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 14995734 - 14995698
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatg 565  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14995734 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatg 14995698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 883 - 962
Target Start/End: Complemental strand, 15099461 - 15099383
Alignment:
Q  883 gttgatatgaaattgtaatttgttatatatgaaaattattattgatggttacttgatgtgtatgtttaaatgatgatgtc 962  Q
    ||||||||||| ||| |||| |||||| || || ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||    
T  15099461 gttgatatgaagttgaaatt-gttatacataaagattattaatgatggttacttgctgtatatgtttaaaagatgttgtc 15099383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 529 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 8374130 - 8374088
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttg 571  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  8374130 catgaaagttgtagataattttgttaactttctaatggctttg 8374088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 529 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 10643836 - 10643746
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatact 619  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || |  ||||||||||||    |||||||||||| ||| ||||    
T  10643836 catgaaagttgtagataattatgttagctttctaatggttttggtttgacatccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 10643746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 419 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 11557855 - 11557822
Alignment:
Q  419 agttatgatcaaattactacacaggggtcagcac 452  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11557855 agttatgatcaaaatactacacaggggtcagcac 11557822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 40 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 13268014 - 13267830
Alignment:
Q  40 gaattaaaagatgaaattgaaagtttcgaattaaggaaaactagtttatgtttc-gaattgagtttctagtcttaaaaagagtggataatacagtaggtt 138  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| |   |||| || ||||||||||||  |||  ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||   |||||||    
T  13268014 gaattgaaagatgaagttgaaagatgacaattgagtaaaactagtttagatttttgaattgagttt-tagtcttaaaaaaagtggataatcaggtaggtt 13267916  T
Q  139 gatgaataattattgttataatgatagggtgatcatagggtaatgattagggttatgtttggagagtattggatcgaaaacggagt 224  Q
     | ||| ||||| | ||  |||||||||||  |||| | || | |||||||||   |||||| |||| | || |||||||||||||    
T  13267915 aacgaagaattagtttttgaatgatagggtagtcatggagtgaagattagggtcgagtttggtgagtttagggtcgaaaacggagt 13267830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 529 - 622
Target Start/End: Original strand, 19622912 - 19623005
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactcca 622  Q
    ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| | ||| | || | ||||||||| ||| |   ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  19622912 catgaaaattttaggtaattttgatagctttccaataggttttgtttgatttgaaaatgttttgtggattttgagttatgatgaaaacactcca 19623005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 185 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 22201281 - 22201181
Alignment:
Q  185 ttagggttatgtttggagagtattggatcgaaaacggagtcgaaaagatttccccaaaggcgaaatcgcagctgaactacgattttgctgtcagtgtgca 284  Q
    ||||||| | |||||||||||||   |||||||||||||||||||||   ||||| ||||| ||||| ||||  |||  |||||||| ||||| ||||||    
T  22201281 ttagggtcaagtttggagagtatataatcgaaaacggagtcgaaaag-ggtcccctaaggcaaaatcacagcaaaaccgcgattttgttgtcactgtgca 22201183  T
Q  285 aa 286  Q
    ||    
T  22201182 aa 22201181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 529 - 594
Target Start/End: Original strand, 25120054 - 25120119
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgattttta 594  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||| || || |  ||||||||||||    
T  25120054 catgaaagttttaggtaattaagttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgattttta 25120119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 529 - 629
Target Start/End: Original strand, 32461313 - 32461414
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgat-ttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggag 627  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||| || ||||| |||| |||| || | |||||||| || ||||  |||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  32461313 catgaaagttttagacaattgagttggcattccattggccttggtttgatttgaaaataatgtttttgtttttgagttatgaagaaaatactctaaggag 32461412  T
Q  628 gt 629  Q
    ||    
T  32461413 gt 32461414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0153 (Bit Score: 519; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0153
Description:

Target: scaffold0153; HSP #1
Raw Score: 519; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 5272 - 4568
Alignment:
Q  17 aggttttagaatttgagagattagaattaaaagatgaaattgaaagtttcgaattaaggaaaactagtttatgtttcgaattgagtttctagtcttaaaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||    
T  5272 aggttttagaatttgagagattagaattaaaagatgaaattgaaagttgagaattaaagaaaactagtttaggt---gaattgagtttctagtcttaaaa 5176  T
Q  117 agagtggataatacagtaggttgatgaataattattgttataatgatagggtgatcatagggtaatgattagggttatgtttggagagtattggatcgaa 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5175 agagtggataatacagtaggttgatgaataattagtgttataatgatagggtgatcatagggtaatgattagggtcatgtttggagagtattggatcgaa 5076  T
Q  217 aacggagtcgaaaagatttccccaaaggcgaaatcgcagctgaactacgattttgctgtcagtgtgcaaaacgcgtttttattgtcgcagtttgacaagt 316  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  5075 aatggagtcgaaaagatttccccaaaggcgaaatcgcagctgaactgcgattttgctgtcagtgtgcaaaacacgtttttattgtctcagtttgacaagt 4976  T
Q  317 ttaagtttcaaactgagtttaggtgccttcacgtaagttgtagatatggatgttatctgtccctcgactttggaggtactcgatttaagcacatagaact 416  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4975 ttaagtttcgaactgggtttaggttctttcacgaaagttgtagatatggatgttatctgtcactcgtgtttggaggcactcgatttaagcacatagaact 4876  T
Q  417 caagttatgatcaaattactacacaggggtcag----------cacagttgtcctcttttcccgagcataggaaaatctacttttctggaattttttgtt 506  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||          |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  4875 caaaatatgatcaaattactacacaggggtcagcagggatcaacacagtcgtcctcttttcacgagcataggaaaatcaacttttctggaattttctgtt 4776  T
Q  507 ctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagata 606  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  4775 ctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcattggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagata 4676  T
Q  607 tgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatctta 706  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |    
T  4675 tgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctca 4576  T
Q  707 aaactaga 714  Q
    ||||||||    
T  4575 aaactaga 4568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0153; HSP #2
Raw Score: 460; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 12292 - 11679
Alignment:
Q  17 aggttttagaatttgagagattagaattaaaagatgaaattgaaagtttcgaattaaggaaaactagtttatgtttcgaattgagtttctagtcttaaaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||    
T  12292 aggttttagaatttgagagattagaattaaaagatgaaattgaaagttgagaattaaagaaaactagtttaggt---gaattgagtttctagtcttaaaa 12196  T
Q  117 agagtggataatacagtaggttgatgaataattattgttataatgatagggtgatcatagggtaatgattagggttatgtttggagagtattggatcgaa 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12195 agagtggataatacagtaggttgatgaataattagtgttataatgatagggtgatcatagggtaatgattagggtcatgtttggagagtattggatcgaa 12096  T
Q  217 aacggagtcgaaaagatttccccaaaggcgaaatcgcagctgaactacgattttgctgtcagtgtgcaaaacgcgtttttattgtcgcagtttgacaagt 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  12095 aacggagtcgaaaagatttccccaaaggcgaaatcgcagctgaactgcgattttgctgtcagtgtgcaaaacacgtttttattgtctcagtttgacaagt 11996  T
Q  317 ttaagtttcaaactgagtttaggtgccttcacgtaagttgtagatatggatgttatctgtccctcgactttggaggtactcgatttaagcacatagaact 416  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11995 ttaagtttcgaactgggtttaggtgccttcacgaaagttgtagatatggatgttatctgtcactcggctttggaggcactcgatttaagcacatagaact 11896  T
Q  417 caagttatgatcaaattactacacaggggtcag----------cacagttgtcctcttttcccgagcataggaaaatctacttttctggaattttttgtt 506  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||          |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  11895 caaaatatgatcaaattactacacaggggtcagcagggatcaacacagtcgtcctcttttcacgagcataggaaaatcaacttttctggaattttctgtt 11796  T
Q  507 ctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagata 606  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  11795 ctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcattggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagata 11696  T
Q  607 tgatgaaaatactccaa 623  Q
    |||||||||||||||||    
T  11695 tgatgaaaatactccaa 11679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 507; Significance: 0; HSPs: 178)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 507; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 14967159 - 14966393
Alignment:
Q  17 aggttttagaatttgagagattagaattaaaagatgaaattgaaagtttcgaattaaggaaaactagtttatgtttcgaattgagtttctagtcttaaaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  14967159 aggttttagaatttgagagattagaattaaaagatgaaattgaaagttgagaattaaggaaaactagtttagatttcgaattgaatttctagttttaaaa 14967060  T
Q  117 agagtggataatacagtaggttgatgaataattattgttataatgatag----ggtgatcatagggtaatgattagggttatgtttggagagtattggat 212  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14967059 agagtggataatacagtatgttgatgaacaattagtgttataatgatagatagggtgatcacagggtaatgattagggtcatgtttggagagtattggat 14966960  T
Q  213 cgaaaacggagtcgaaaagatttccccaaaggcgaaatcgcagctgaactacgattttgctgtcagtgtgcaaaacgcgtttttattgtcgcagtttgac 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  14966959 cgaaaacggagtcgaaaagatttccccaaaggcgaaatcgcagctgaactgcgattttgctgttagtgtgcaaaacgcgtttttattgtctcattttgac 14966860  T
Q  313 aagtttaagtttcaaactgagtttaggtgccttcacgtaagttgtagatatggatgttatctgtccctcgactttggaggtactcgatttaagcacatag 412  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||               |||||||||     
T  14966859 aagtttaagtttcgaactgggttaaggtgccttcacaaaagttgtatatatggatgttatctgtcactcggcttt---------------aagcacatat 14966775  T
Q  413 aactcaagttatgatcaaattactacacaggggtcagcacagttgtcctcttttcccgagcataggaaaatctacttttctggaattttttgttctgaat 512  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  14966774 aactcaagatatgatcaaattactacacaggggtcaacacagtcgtcctcttttctcgagcatacgaaaatcaacttttctggaattttctgttctgaat 14966675  T
Q  513 taggtttgggagtcttcatgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatga 612  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| | |||| || |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  14966674 taggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataatttttttagcttttcaatgacattggtttgacttgaaaataatttttggtttttgagatatgatga 14966575  T
Q  613 aaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaacta 712  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||    
T  14966574 aaatactccaaggaagtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattctaaacctaaaaacta 14966475  T
Q  713 gaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttg 794  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  14966474 gaagtactaggagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatgagttgatcattggggtaggaatggaggttg 14966393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 414; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 563
Target Start/End: Original strand, 52988935 - 52989491
Alignment:
Q  17 aggttttagaatttgagagattagaattaaaagatgaaattgaaagtttcgaattaaggaaaactagtttatgtttcgaattgagtttctagtcttaaaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  52988935 aggttttagaatttgagagattagaattaaaagatgaaattgaaagttgagaattaaggaaaactagtttaggtttcgaattgagtttctagtcttaaaa 52989034  T
Q  117 agagtggataatacagtaggttgatgaataattattgttataatgatagggtgatcatagggtaatgattagggttatgtttggagagtattggatcgaa 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  52989035 agagtggataatacagtaggttgatgaataattagtgttataatgatagggtgatcatatgataatgattagggtcatgtttggagagtattggatcgaa 52989134  T
Q  217 aacggagtcgaaaagatttccccaaaggcgaaatcgcagctgaactacgattttgctgtcagtgtgcaaaacgcgtttttattgtcgcagtttgacaagt 316  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||    
T  52989135 aacagagtcgaaaagattttcccaaaggcgaaatcgcaactgaactacgattttgctgtcagtgtgcaaaacgtgtttttatagtctcagtttgacaagt 52989234  T
Q  317 ttaagtttcaaactgagtttaggtgccttcacgtaagttgtagatatggatgttatctgtccctcgactttggaggtactcgatttaagcacatagaact 416  Q
    ||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  52989235 ttaagtttcgaactggatttaggtgccttcacgaaagttgtagatatggatgttatctgtcactcggctttggaggcactcaatttaagcacatagaact 52989334  T
Q  417 caagttatgatcaaattactacacaggggtcag----------cacagttgtcctcttttcccgagcataggaaaatctacttttctggaattttttgtt 506  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||          |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||    
T  52989335 caagatatgatcaaattactacacaggggtcagcagggatcaacacagtcgtcctcttttcccgagcataggaaaatcaatttttctggaattttctgtt 52989434  T
Q  507 ctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttttagataattttgttagctttccaa 563  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  52989435 ctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaa 52989491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 529 - 940
Target Start/End: Complemental strand, 11913377 - 11912955
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11913377 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactttggtttcacttgaaaatgatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaagagg 11913278  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  11913277 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagtataaccatttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttc 11913178  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttgttaatgattataatgaggttcagagaggatgaat 828  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| |||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11913177 aattagggtgtttaagagtatgtaacttatgttttgattcgacccttggggtaggaat-gaagttgttaatgattataattaggttcagagaggatgaat 11913079  T
Q  829 aagatgatttata-------------ttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaatttgttatatatgaa 915  Q
    ||||||||| |||             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  11913078 aagatgattaataatgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaa-ttgttatatatgat 11912980  T
Q  916 aattattattgatggttacttgatg 940  Q
     ||||||||||||| | ||||||||    
T  11912979 tattattattgatgttgacttgatg 11912955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 529 - 962
Target Start/End: Original strand, 31224349 - 31224794
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||  |||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31224349 catgaaagttttagataattgtgttagctttctagtggtattggtttcacttgaaaatgatttttggtttttaagatatgatgaaaatactccaaggagg 31224448  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||||||    
T  31224449 tcttagtgaaatcttaggaaatttcagtataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 31224548  T
Q  729 aattagggtg-tttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttgttaatgattataatgaggttcagagaggatgaa 827  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31224549 aattagggtgttttaagagtatttaacccatgctgtgagtcgacccttggggtcggaat-gaatttgttaatgattataatgaggttcagagaggatgaa 31224647  T
Q  828 taagatgatttata-------------ttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaatttgttatatatga 914  Q
    |||||||||| |||             |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  31224648 taagatgattaatattgatgttttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatataatgtgaaagacgttgatatgaagttgtaa-ttgttatatatga 31224746  T
Q  915 aaattattattgatggttacttgatgtgtatgtttaaatgatgatgtc 962  Q
      ||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||| ||||    
T  31224747 tgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgatgttgtc 31224794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 529 - 901
Target Start/End: Original strand, 1988628 - 1989012
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1988628 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttagtttgacttgaaaatgatatttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 1988727  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||| || ||||||||||||    
T  1988728 tcttagtgcaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactataactactatgagttc 1988827  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttgttaatgattataatgaggttcagagaggatgaat 828  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || | ||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1988828 aattaaggtgtttaagagtgtttaaccaatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatgaagat-gttaatgattataatgaggttcagagaggatgatt 1988925  T
Q  829 aagatgattta-tattg-------------atgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaat 901  Q
    ||||||||||| |||||             ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  1988926 aagatgatttaatattgttgattcacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaagttgttgatatgaagttgtaat 1989012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 529 - 794
Target Start/End: Original strand, 24152840 - 24153105
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24152840 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 24152939  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||    
T  24152940 tcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccgtttctaaattaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttc 24153039  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttg 794  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||    
T  24153040 aattaaggtgtctaagagtacttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatggaggttg 24153105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 529 - 793
Target Start/End: Original strand, 10833735 - 10833999
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10833735 catgaaagttttagaaaattttgttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgaattttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 10833834  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||    
T  10833835 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagttc 10833934  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggtt 793  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  10833935 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggtt 10833999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 11192736 - 11192501
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11192736 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttt-tttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 11192638  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  11192637 ccttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 11192538  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11192537 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 11192501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 529 - 767
Target Start/End: Original strand, 14641946 - 14642184
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14641946 catgaaagttttagataatttcgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggagg 14642045  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  14642046 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 14642145  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 767  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14642146 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 14642184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 529 - 787
Target Start/End: Original strand, 2248366 - 2248624
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2248366 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactcgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 2248465  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  2248466 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaacccttaaaactagaagtactatgagttc 2248565  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatg 787  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||| ||||||||    
T  2248566 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttgggttaggaatg 2248624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 529 - 799
Target Start/End: Original strand, 3394398 - 3394667
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3394398 catgaaagttttagataactttgttagctttccaatggctttggtttgacttaaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 3394497  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||| |||    
T  3394498 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaagctcaaaactagaagtactatgaattc 3394597  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttgttaat 799  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||| |||||||||| |||||||||    
T  3394598 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaagttgttaat 3394667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 190; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 529 - 798
Target Start/End: Original strand, 179103 - 179371
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  179103 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttattttttgagatatgatgaaaataccccaagtagg 179202  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||     
T  179203 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttg 179302  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttgttaa 798  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||||||| || | ||||| |||||||||||||||||||    
T  179303 aattaaggtgtttaacagtatttaatccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaggttgttaa 179371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 529 - 799
Target Start/End: Complemental strand, 12276205 - 12275936
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12276205 catgaaaattttagataatttggttagctttccaatgactttggtttgacttaaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 12276106  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  12276105 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaagccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttc 12276006  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttgttaat 799  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || | ||||| |||||||||| |||||||||    
T  12276005 aattaaggtgtttaagagtgtttaacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaagttgttaat 12275936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 529 - 794
Target Start/End: Original strand, 43550073 - 43550338
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43550073 catgaaagttgtagataattttgttaattttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgataaaaatactccaaggagg 43550172  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||  || |||||||||||||||||||||||    
T  43550173 tcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccgtttctaaattaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagtactatgagttc 43550272  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttg 794  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||    
T  43550273 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatgggggttg 43550338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 181; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 533 - 797
Target Start/End: Complemental strand, 6159049 - 6158786
Alignment:
Q  533 aaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtctt 632  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6159049 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatgtttgatttttgagttatgatgaaaatactccaaagaggtctt 6158950  T
Q  633 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaatt 732  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  6158949 agtgaaattttatgaaaattcaacataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaatt 6158850  T
Q  733 agggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttgtta 797  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| |||||||||| |||||||    
T  6158849 aaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaagttgtta 6158786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 181; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 40807652 - 40807416
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40807652 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 40807553  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  40807552 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 40807453  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40807452 aactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 40807416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 179; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 529 - 787
Target Start/End: Complemental strand, 50243389 - 50243131
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  50243389 catgaaagttgtagataattgagttacatttccaatggctttggtttcacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatagtccaaggagg 50243290  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||    
T  50243289 tcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgagataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttc 50243190  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatg 787  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | |||||||| |||||    
T  50243189 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtatgaatg 50243131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 179; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 529 - 763
Target Start/End: Original strand, 50351396 - 50351630
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50351396 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 50351495  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||     
T  50351496 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccatttctaagtcgatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaacttgaagtactatgagttt 50351595  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 763  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  50351596 aattaaggtgtttaagagtatttaacatatgttgt 50351630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 177; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 533 - 793
Target Start/End: Original strand, 8928065 - 8928325
Alignment:
Q  533 aaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtctt 632  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| || || ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8928065 aaagttgtagataattttgttagatttccaatggctttggtttgacctgaaaatgatttttggtttttgagatataatgaaaatactccaaggaggtctt 8928164  T
Q  633 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaatt 732  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||    
T  8928165 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagataatccaaaacttatgggataattccaaggctaaaaactagaagtactatgagttcaatt 8928264  T
Q  733 agggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggtt 793  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||| |||||||| |||||    
T  8928265 aaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttgggttaggaatgaaggtt 8928325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 177; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 14441824 - 14441588
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||| |||||| || |||||| || || ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14441824 catgaaagttgtagataattgagttagttttccagtgactttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 14441725  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||    
T  14441724 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 14441625  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14441624 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 14441588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 176; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 529 - 764
Target Start/End: Complemental strand, 6819765 - 6819530
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6819765 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactttggtttgacatgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 6819666  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||    
T  6819665 tcttagtgaaatcttatgaaaattaaggataaccgtttctaagttaatccaaaacttgtgggataattccaaagctcaaaactataagtactatgagttc 6819566  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtg 764  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6819565 aattaaggtgtttaagagtatttaatctatgttgtg 6819530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 176; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 529 - 799
Target Start/End: Original strand, 13522806 - 13523076
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  13522806 catgaaagttttagagaattttgttagctttccaatggctttggtttaacttgaaaataatttttagtttttgagatatgatgagaatactccaagtagg 13522905  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatcc-aaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagtt 727  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||    
T  13522906 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataatcatttctaagttaatccaaaaacttatgcgataattccaaggctcaaaactagaagtactatgagtt 13523005  T
Q  728 caattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttgttaat 799  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||| |||||||||| |||||||||    
T  13523006 caattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaagttgttaat 13523076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 175; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 529 - 767
Target Start/End: Original strand, 18367154 - 18367392
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  18367154 catgaaagttttagataatttttttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatatttcaaggagg 18367253  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||    
T  18367254 tcttagtgaaatcttaggaaaattcagtataacccgttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaccctcaaagctagaagtactatgagttc 18367353  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 767  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18367354 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagt 18367392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 173; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Original strand, 54875879 - 54876115
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||  |||| || || ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54875879 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggagttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 54875978  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  54875979 tcttagtgaaatcttgtgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 54876078  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54876079 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 54876115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 170; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 529 - 790
Target Start/End: Complemental strand, 16643661 - 16643400
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||| ||||  |||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16643661 catgaaagttgtagacaattgagttagctttctagtggctttggtttgacttgaaaatgatttatagtttttgagatatgatgaaaatagtccaaggagg 16643562  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||    
T  16643561 tcttagtgaaatcttaggaaaattcagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaacactcaaaactagaagtactatgagttc 16643462  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggag 790  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||| || | |||||||||||||||||    
T  16643461 aattaaggtgtttaagagtatttaatccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatggag 16643400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 169; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Original strand, 5206050 - 5206286
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||| |||||| ||||||||| || || |||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5206050 catgaaagttgtagataattgagttagatttccagtggctttggtttgacatgaaaatgatatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 5206149  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  5206150 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 5206249  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5206250 aattatggtgtttaagattatttaacctatgttgtga 5206286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 169; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 14508503 - 14508268
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||||||||| |||||||||| || || ||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14508503 catgaaagttgtagataattgagttagctttcctatggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcatgagatatgatgaaaatactccaaggagg 14508404  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  14508403 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgttt-taagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 14508305  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14508304 aactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 14508268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 169; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 17693724 - 17693488
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||| || |  ||||| | ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17693724 catgaaagttgtagataattgagttagttttccaatggctttggtttgatgtgaaagttatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 17693625  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  17693624 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 17693525  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17693524 aaatagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 17693488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 169; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 529 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 43929007 - 43928775
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |  ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43929007 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgatttgatctgaaaataatttttaatttttgagatataatgaaaatactccaaggagg 43928908  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  43928907 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataatcatttctaagttgatccaaaacttatggaataattccaaagctcaaaattagaagtactatgagttc 43928808  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 761  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  43928807 aattaaggtgcttaagagtatttaacatatgtt 43928775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 167; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 529 - 767
Target Start/End: Original strand, 10989200 - 10989437
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | || ||||||| |||||   ||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  10989200 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtctgacatgaaaataattttgg-tttttaagatatgatgaaaatgctccaaggagg 10989298  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  10989299 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttc 10989398  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 767  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  10989399 aattaaggtgtttaagagtatttaatccatgttgtgagt 10989437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 167; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 529 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 16979566 - 16979328
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16979566 catgaaagttgtagataattgtgttagctttctagtggctttggtttgacttgaaaatgattttttgtgtttgagatatgatgaaaatactccaaagagg 16979467  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  16979466 tcttagtgaaatcttataaaaattcagcatgaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtattatgagttc 16979367  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 767  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16979366 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 16979328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 167; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 532 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 18890017 - 18889755
Alignment:
Q  532 gaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtct 631  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| | ||||||    
T  18890017 gaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttaatgtttgagttatgatggaaatactccaggtaggtct 18889918  T
Q  632 tagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaat 731  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  || ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  18889917 tagtgaaatcttatgaaaattccgcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggatagttccaaggctcaaatctagaagtaatatgagttcaat 18889818  T
Q  732 tagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttg 794  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||  ||||||||||||||    
T  18889817 taaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagatgacccttgggacaggaatggaggttg 18889755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 165; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Original strand, 2841859 - 2842094
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||  || |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2841859 catgaaagttttagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgataaaaatactccaaggagg 2841958  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||    
T  2841959 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccg-ttccaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 2842057  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2842058 aactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 2842094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 165; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 40812489 - 40812253
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40812489 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggtgcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 40812390  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||     
T  40812389 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 40812290  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40812289 aattaaggggtttaagagtatttaacctatgtggtga 40812253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 529 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 33564785 - 33564555
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33564785 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgattttttgtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 33564686  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| | ||||    
T  33564685 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcctaacagtttctatgttaatccaaaacttatggaataattccaatcctcaaaactagaagtactaggggttc 33564586  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatg 759  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33564585 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatg 33564555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 162; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 530 - 767
Target Start/End: Original strand, 6805358 - 6805595
Alignment:
Q  530 atgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggt 629  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||||  | ||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6805358 atgaaagttgtggataattatgttagctttccagtggctttggtgtgacttgaaaatgatttctggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggt 6805457  T
Q  630 cttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttca 729  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||    
T  6805458 cctagtgaaatcttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatctaaaacttatggaataattccaaacctcaaaattagaagtactatgagttca 6805557  T
Q  730 attagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 767  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6805558 attaagttgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 6805595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 162; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 530 - 767
Target Start/End: Original strand, 42324618 - 42324855
Alignment:
Q  530 atgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggt 629  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  42324618 atgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatataatcaaaatactccaaggaggt 42324717  T
Q  630 cttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttca 729  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||| || ||||||||  |||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  42324718 cttagtgaaatcttagaaaaattcagtataaccatttctaagttagtcaaaaacttagagaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttca 42324817  T
Q  730 attagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 767  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42324818 attaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagt 42324855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Original strand, 35064977 - 35065212
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||| || || ||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  35064977 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaattatttttggttcttgagatatgatgaaaatactcccatgagg 35065076  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||    
T  35065077 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatt-caaacctcaaaactagaagtactatgagttc 35065175  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35065176 aactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 35065212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 160; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 529 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 37038475 - 37038236
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaa-tactccaaggag 627  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || | |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||  |||    
T  37038475 catgaaagttttagataattttattagcttttcaatggctttggtttgatttgaaaatgatttttggtttttgagatatgataaaaaatactccagagag 37038376  T
Q  628 gtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagtt 727  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||    
T  37038375 gtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattcaaaacctcaaaactagaagtactatgagtt 37038276  T
Q  728 caattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 767  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37038275 caattaagatgtttaagagtatttaacctatgttttgagt 37038236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 160; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 529 - 784
Target Start/End: Original strand, 55292037 - 55292292
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  55292037 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggtttttgagttatcatgaaaatactccaaggagg 55292136  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||    
T  55292137 tcttactgaaatcttatgaaaattcagcataaccctttttaagttaacccaaaacttatgggataattccaagactcaaaactagaagtaatatgagttc 55292236  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtagga 784  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||| ||| |||||||    
T  55292237 aattaaggtgtttaaaagtatttaacccatgttatgagtagacctttgaggtagga 55292292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 159; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 533 - 759
Target Start/End: Original strand, 53646460 - 53646686
Alignment:
Q  533 aaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtctt 632  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  53646460 aaagttgtagataattttgttagatttccaatgattttggtttgacttgaaaatgatttttgttttttgagatatgatgaaaatactccaaggagatctt 53646559  T
Q  633 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaatt 732  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| | ||||||||    
T  53646560 agtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttcaatt 53646659  T
Q  733 agggtgtttaagagtatttaacctatg 759  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||    
T  53646660 aaggtgtttaagagtatttaacatatg 53646686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 580 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 44274079 - 44273894
Alignment:
Q  580 tgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatcca 679  Q
    ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44274079 tgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatcca 44273980  T
Q  680 aaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  44273979 aaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtttttaagagtatttaacctatgttgtga 44273894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 157; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 566 - 782
Target Start/End: Original strand, 13029709 - 13029925
Alignment:
Q  566 gctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtt 665  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  13029709 gctttggtttgacttgaaaatgatttttagttttttaaatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatt 13029808  T
Q  666 tctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13029809 tctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactaggagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 13029908  T
Q  766 gtcgaccattggggtag 782  Q
    || |  |||||||||||    
T  13029909 gttggtcattggggtag 13029925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 157; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 17538762 - 17538527
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||  |||||| || || || |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17538762 catgaaagttgtagataaatgagttagctttccaatt-ctttggtttgacgtgcaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 17538664  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  17538663 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccttttctaagttaatccaaaacttaaggaataattcgaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 17538564  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17538563 aactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 17538527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 157; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Original strand, 17685239 - 17685475
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    ||||||| || |||||||||  |||||||||||| |||| |||| || || ||||||||| ||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17685239 catgaaaattgtagataattgagttagctttccagtggcgttggtttgacgtgaaaatgaattttggtacttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 17685338  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| |||    
T  17685339 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaaatactatgaattc 17685438  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  17685439 aattagggtgtttaagagtatttaatctatcttgtga 17685475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 157; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Original strand, 22306979 - 22307215
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| ||||||| || |||||| || || |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22306979 catgaaagttgtagataatttagttatctttccagtgactttggtttgacgtgaaaatgatttttgattattgagatatgatgaaaatactcgaaggagg 22307078  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  22307079 tcttactgaaatcctatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatcccaaacttaaggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 22307178  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22307179 aactagggtgtttaagagtatttaacttatgttgtga 22307215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 529 - 784
Target Start/End: Complemental strand, 10554923 - 10554668
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| |||  |||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10554923 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactcgaaaatgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggagg 10554824  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||  || ||||||||||||| |||||||||    
T  10554823 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccctttttaagttaatccaaaacttatgggataattcaaaggctcaaaactagaagtaatatgagttc 10554724  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtagga 784  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||| |||||||    
T  10554723 aattaaggtgtctaagagtatttaacccatgttatgagtagacccttgaggtagga 10554668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 155; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 529 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 42183 - 41945
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||  | ||||||| ||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42183 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactctggtttggcatgaaaataatttttagtttaagagttatgatgaaaatactccaaggagg 42084  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| | ||||    
T  42083 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttc 41984  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 767  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41983 aattaaggtgtttaagagtatttaacctaagttgtgagt 41945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 155; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 529 - 767
Target Start/End: Original strand, 35961283 - 35961521
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | || || |||||||||||||||||  |||  ||| |||||||||||||||||||| |||    
T  35961283 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 35961382  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  35961383 tcttagtgaaattttatgaaaaattagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaaatagaagtactatgagttc 35961482  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 767  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35961483 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 35961521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 154; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 529 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 9533785 - 9533520
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||||||||  |||  ||| |||||||||||||||||||| |||    
T  9533785 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 9533686  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||| |||||||| ||||||| |    
T  9533685 tcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgc 9533586  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttg 794  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  9533585 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttg 9533520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 154; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 529 - 794
Target Start/End: Original strand, 14763357 - 14763622
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||||||||  |||  ||| |||||||||||||||||||| |||    
T  14763357 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 14763456  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||  || ||||||||||||| ||||||| |    
T  14763457 tcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttgtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgc 14763556  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttg 794  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  14763557 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttg 14763622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 154; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 529 - 758
Target Start/End: Original strand, 17670105 - 17670334
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||||||| || |||| |||| || || ||||||||| ||||  |  ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17670105 catgaaagttgtagataattgagttagcttttcagtggcgttggtttgacgtgaaaatgaattttggtacttgagatatgatgaaaatactacaaggagg 17670204  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||    
T  17670205 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaaatactatgagttc 17670304  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctat 758  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17670305 aattagggtgtttaagagtatttaatctat 17670334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 566 - 782
Target Start/End: Original strand, 13026117 - 13026333
Alignment:
Q  566 gctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtt 665  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  13026117 gctttggtttgacttgaaaatgatttttagttttttaaatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatt 13026216  T
Q  666 tctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13026217 tctaagttaatccaaaaattatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactaggagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 13026316  T
Q  766 gtcgaccattggggtag 782  Q
    || |  |||||||||||    
T  13026317 gttggtcattggggtag 13026333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Original strand, 15931903 - 15932139
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||| |||| || |  || ||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15931903 catgaaagttatagataattgagttagctttccagtggccttggtttgatgtgcaaatgattttgggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 15932002  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  15932003 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaagaaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 15932102  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    || |||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  15932103 aactagggtgtttaagagtatttcatctatgttgtga 15932139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 529 - 757
Target Start/End: Original strand, 20248380 - 20248608
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||  |||  ||| |||||||||||||||||||| |||    
T  20248380 catgaaagttgtagataattttgttagttttccaatggctttggtttgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 20248479  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||  |||||||||||| |||||||||    
T  20248480 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaatatttccaaacctcgaaactagaagtattatgagttc 20248579  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaaccta 757  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  20248580 aattaaggtgtttaaaagtatttaaccta 20248608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 532 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 13519936 - 13519702
Alignment:
Q  532 gaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtct 631  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| | || |||| | || |||||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13519936 gaaagtcttagataattatgttagctttctattgactttcgtttgacttgaaattgatttttggtttttgagatataatgaaaatactccaaggaggtct 13519837  T
Q  632 tagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaat 731  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||| |||||  ||    
T  13519836 tagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagtttgat 13519737  T
Q  732 t-agggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13519736 taagggggtttaagagtatttaacctatgttgtga 13519702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 529 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 17513236 - 17513010
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |  |||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17513236 catgaaagttgtagattattttgttagctttctaattgagttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 17513137  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||    
T  17513136 tcttagtgaaatcgtaggaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttattgaataattccaaacctccaaactagaagtgctatgagttc 17513037  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacc 755  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  17513036 aattaaggtgtttgagagtatttaacc 17513010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 150; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 529 - 794
Target Start/End: Original strand, 23371103 - 23371368
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||||||||  |||  ||| |||||||||||||||||||| |||    
T  23371103 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactataaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 23371202  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||  || ||||||||||||| ||||||| |    
T  23371203 tcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaactggtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgc 23371302  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttg 794  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  23371303 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttg 23371368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 127 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 36528775 - 36528533
Alignment:
Q  127 atacagtaggttgatgaataattattgttataatgatagggtgatcatagggtaatgattagggttatgtttggagagtattggatcgaaaacggagtcg 226  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  36528775 atacagtaggttgatgaataattggtgttataacgataggttaatcatagggtaatgattagggtcatgtttggagagtaatggatcgaaaacggaatcg 36528676  T
Q  227 aaaagatttccccaaaggcgaaatcgcagctgaactacgattttgctgtcagtgtgcaaaacgcgtttttattgtcgcagtttgacaagtttaagtttca 326  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  36528675 aaaatatttcccc-aaggcgaaatcgcagctgaactgcgattttgctgtcagtgttcaaaacgcg-ttttattgtctcagtttgacaagtttaagttcca 36528578  T
Q  327 aactgagtttaggtgccttcacgtaagttgtagatatggatgtta 371  Q
    ||||| |||||||||    |||| ||||||||| |||||||||||    
T  36528577 aactgggtttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtta 36528533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 147; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 529 - 763
Target Start/End: Original strand, 43889195 - 43889429
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  43889195 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagtagg 43889294  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||     
T  43889295 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaatttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 43889394  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 763  Q
    ||||| ||  |||||||||||||||| | ||||||    
T  43889395 aattaagggttttaagagtatttaacatgtgttgt 43889429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 529 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 3803491 - 3803258
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | | ||  | ||||||||||||||  |||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3803491 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactctagtttggcgtgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggagg 3803392  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||     
T  3803391 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccgtttctaagttaatcaaaatcttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagtta 3803292  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttg 762  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3803291 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttg 3803258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 35354258 - 35354019
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgat---ttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaagg 625  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||   ||||  || ||||||||||||||||||||||||| |    
T  35354258 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacg 35354159  T
Q  626 aggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgag 725  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||  |||    
T  35354158 agatcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactgggag 35354059  T
Q  726 ttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35354058 tttaattaaggggtttaagagtatttaacctatgttgtga 35354019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 529 - 757
Target Start/End: Original strand, 38311399 - 38311628
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||  |||  ||| |||||||||||||||||||| |||    
T  38311399 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 38311498  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattcc-aaatcttaaaactagaagtactatgagtt 727  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||  |||||||||||| ||||||||    
T  38311499 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttccaagttaatccaaaacttagggaataattccaaaacctcgaaactagaagtattatgagtt 38311598  T
Q  728 caattagggtgtttaagagtatttaaccta 757  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38311599 caattaaggtgtttaagagtatttaaccta 38311628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 145; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 12511504 - 12511268
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||| |||||| ||||||||| || |  ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12511504 catgaaagttgtagataattgagttagatttccagtggctttggtttgatgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagtagg 12511405  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||     
T  12511404 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttcttagttaatccaaaacttatggaataattccaaaccttaaaactagaagtactaggagttt 12511305  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  12511304 aattaaggggtttaagagtatttaacatgtgttgtga 12511268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 145; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Original strand, 17519269 - 17519505
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||| |||||   ||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||   | ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17519269 catgaaagttgtaggtaattgacttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggatcttgagatgtgatgaaaatactccaaggagg 17519368  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||    
T  17519369 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgttactaagataatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 17519468  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    || || |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17519469 aactaaggtgtttaagagtatttaacatatgttgtga 17519505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 145; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Original strand, 17534131 - 17534367
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||| |||||   ||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||   | ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17534131 catgaaagttgtaggtaattgacttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggatcttgagatgtgatgaaaatactccaaggagg 17534230  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||    
T  17534231 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgttactaagataatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 17534330  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    || || |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17534331 aactaaggtgtttaagagtatttaacatatgttgtga 17534367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 529 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 10563365 - 10563127
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    ||||||||||  ||||||||  |||||||||||| ||||||||| || |  ||||||||||||||  |  ||||||||||||||| |||||| ||| |||    
T  10563365 catgaaagttgcagataattgagttagctttccagtggctttggtttgatgtgaaaatgatttttggtgcttgagatatgatgaacatactcaaagtagg 10563266  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||||||    
T  10563265 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagtataatcatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 10563166  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 767  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10563165 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 10563127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 529 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 17044622 - 17044392
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    ||||||| || |||||||||  ||||| |||||| ||||||| | || || ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17044622 catgaaatttatagataattgagttagatttccagtggctttagtttgacgtgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 17044523  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||| | ||||    
T  17044522 tcttagtgaaattttatgaaaattcaacataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaattagaaatactaggggttc 17044423  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatg 759  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17044422 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatg 17044392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 532 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 18893277 - 18893067
Alignment:
Q  532 gaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtct 631  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  18893277 gaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgacttttagtttttgagttatgatggaaatactccaagtaggtct 18893178  T
Q  632 tagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaat 731  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||| ||||| |||||||| |||    
T  18893177 tagtgaaatcttatgaaaattcagcagaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactacaagtaatatgagtttaat 18893078  T
Q  732 tagggtgttta 742  Q
    || ||||||||    
T  18893077 taaggtgttta 18893067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 529 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 51301051 - 51300786
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||  ||||||||||||  |||  ||  |||||||||||||||||||| |||    
T  51301051 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggatttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggatttatgatgaaaatactccaagtagg 51300952  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||  || ||||||||||||| |||||||      
T  51300951 tcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaactggtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgt 51300852  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttg 794  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  51300851 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttg 51300786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 135; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 529 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 19444167 - 19443941
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19444167 catgaaagttgtagataattttgttagcttcccaatggctttggtttgacatgaaagtgatttttggtttttgagatattatgaaaatactccaaggagg 19444068  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||| | ||||||||    
T  19444067 tcttattaaaattttatgaaaattcagcataaccatttctaagtgaatccaaaacttatgggataattccaaagctccaaactagaagtgccatgagttc 19443968  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacc 755  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  19443967 aattaaggtgtttgagaatatttaacc 19443941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Original strand, 10541854 - 10542090
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||| | || || |||||||||||||||||  |||  ||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  10541854 catgaaagttgtagataattgtgttatctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttaggagttatcatgaaaatacttcaaggagg 10541953  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||     
T  10541954 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 10542053  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||| || |||||| |||||||||| | ||||||||    
T  10542054 aattaaggggtttaacagtatttaacatgtgttgtga 10542090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 530 - 765
Target Start/End: Original strand, 41172767 - 41173003
Alignment:
Q  530 atgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggt 629  Q
    ||||||||| |||||||||  ||||||||||||  |||||| | || || ||||||  ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41172767 atgaaagttgtagataattgagttagctttccagcggctttcgtttgacgtgaaaacaattttttgttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggt 41172866  T
Q  630 cttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttca 729  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||| || |||||||||||||||| ||||| |    
T  41172867 cttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacttagagaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagttta 41172966  T
Q  730 att-agggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41172967 attaagggggtttaagagtatttaacctatgttgtga 41173003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 14519918 - 14519683
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| |||| || |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14519918 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcattggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 14519819  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| |   ||||||  | ||| || |  |||||||||||||    
T  14519818 tcttagtgaaattttatgaaaattctgcataactatttctaagtcaatccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttc 14519720  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14519719 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 14519683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Original strand, 18699869 - 18700105
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||| |||||| |||||||   || || ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18699869 catgaaagttgtagataattgagttagatttccagtggctttaatttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagtagg 18699968  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||| ||| |||||     
T  18699969 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttttggaataattccaaacctcaaaactagaagtgctaggagttt 18700068  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    | ||| ||  |||||||||||||||| | ||||||||    
T  18700069 agttaagggatttaagagtatttaacatgtgttgtga 18700105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 533 - 761
Target Start/End: Original strand, 50348426 - 50348654
Alignment:
Q  533 aaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtctt 632  Q
    |||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||| | || || ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  50348426 aaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttagtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtctt 50348525  T
Q  633 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaatt 732  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || ||||||| |||||||| | ||| ||||    
T  50348526 ggtgaaatcttatgaaaattcagtataaccatttctaagttaatccaaaactcatgggataattccaaacctcaaaactataagtactaggggtttaatt 50348625  T
Q  733 agggtgtttaagagtatttaacctatgtt 761  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||    
T  50348626 aaggggtttaagagtatttaacctatgtt 50348654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 49900392 - 49900148
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||||||| || ||| ||||| || || |||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49900392 catgaaagttgtagataattaagttagcttttcagtggatttggtttgacgtgaaaatggtttttggttattgagatatgatgaaaatactccaaggagg 49900293  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttcta--------agttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtact 720  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  49900292 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtact 49900193  T
Q  721 atgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    |  |||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  49900192 agaagtttaattaaggattttaagagtatttaacctatgtggtga 49900148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 580 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 12470407 - 12470222
Alignment:
Q  580 tgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatcca 679  Q
    ||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12470407 tgaaaattatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaatttaatcca 12470308  T
Q  680 aaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  12470307 aaacttatggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagtttaattaaggggtttaagagtatttaacatgtgttgtga 12470222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 530 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 14671479 - 14671244
Alignment:
Q  530 atgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggt 629  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||  | |  || |||| ||||||||||||  |||  ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  14671479 atgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggtgtcgatttgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggt 14671380  T
Q  630 cttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttca 729  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| |    
T  14671379 cttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttgtaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagttta 14671280  T
Q  730 attagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    |||| || |||||| |||||||||| | ||||||||    
T  14671279 attaaggggtttaacagtatttaacatgtgttgtga 14671244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 127 - 371
Target Start/End: Original strand, 3264107 - 3264345
Alignment:
Q  127 atacagtaggttgatgaataattattgttataatgatagggtgatcatagggtaatgattagggttatgtttggagagtattggatcgaaaacggagtcg 226  Q
    ||||||||| |||||||||||||  |||| |||||||| | | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||      
T  3264107 atacagtagattgatgaataattggtgttctaatgataagttaatcatagggtaatgattagggtcaagtttggagagtattgggtcgaaaacggagttt 3264206  T
Q  227 aaaagatttccccaaaggcgaaatcgcagctgaactacgattttgctgtcagtgtgcaaaacgcgtttttattgtcgcagtttgacaagtttaagtttca 326  Q
    ||     ||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |     
T  3264207 aag----ttcc--aaaggcgaaatcgcagctgaactgcgattttgctgtcagtgtgcaaaatgagtttttattgtctcagtttgacaagtttaagttccg 3264300  T
Q  327 aactgagtttaggtgccttcacgtaagttgtagatatggatgtta 371  Q
    ||||| ||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  3264301 aactgggtttaggtgtcttcatgaaagttgtaggtatggatgtta 3264345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Original strand, 50755778 - 50756013
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  50755778 catgaaagttttagataatcgtgttagctttctagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggtgg 50755877  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||| || |||||| ||||||| |   ||||||  | ||| || |  |||||||||||||    
T  50755878 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaatttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttc 50755976  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50755977 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 50756013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 120; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 532 - 767
Target Start/End: Original strand, 16324940 - 16325175
Alignment:
Q  532 gaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtct 631  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||  | |||||||||||| |  |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16324940 gaaagttgtagataattttgttatctttccaatggatttggtttggcgtgaaaatgatttatggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtct 16325039  T
Q  632 tagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaat 731  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||  || |||||||||||||||| | |||||||    
T  16325040 tagtgaaattttatgaaaatttagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttatcggataatttcaaggctaaaaactagaagtactaggggttcaat 16325139  T
Q  732 tagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 767  Q
    || |||||||| || |||||| |||| |||||||||    
T  16325140 taaggtgtttatgaatatttatcctaagttgtgagt 16325175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 537 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 6156353 - 6156126
Alignment:
Q  537 ttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtg 636  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| || |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6156353 ttttagataattgtgttagctttccagtggcgttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtg 6156254  T
Q  637 aaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaattaggg 736  Q
    |||| |||||||||||  |||||||  ||||||||| || |||||||||||||| |   ||||||  | ||| || |  |||||||||||||||||| ||    
T  6156253 aaattttatgaaaatttcgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaagg 6156155  T
Q  737 tgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6156154 tgtttaagagtatttaacctatgttgtga 6156126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 530 - 765
Target Start/End: Original strand, 9511563 - 9511797
Alignment:
Q  530 atgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggt 629  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9511563 atgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttcaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggt 9511662  T
Q  630 cttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttca 729  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||| || ||||||||||||||     ||||||  | |||||| |  |||||||||| | |    
T  9511663 cttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggatcgtctccaaacttcaaaacttg-tgtactatgagatta 9511761  T
Q  730 attagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9511762 attaaggtgcttaagagtatttaacctatgttgtga 9511797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 530 - 765
Target Start/End: Original strand, 9519538 - 9519772
Alignment:
Q  530 atgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggt 629  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9519538 atgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttcaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggt 9519637  T
Q  630 cttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttca 729  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||| || ||||||||||||||     ||||||  | |||||| |  |||||||||| | |    
T  9519638 cttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggatcgtctccaaacttcaaaacttg-tgtactatgagatta 9519736  T
Q  730 attagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9519737 attaaggtgcttaagagtatttaacctatgttgtga 9519772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 529 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 18739551 - 18739325
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18739551 catgaaagttttagataattgtgttagctttccaatggctttggtttcactttaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 18739452  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| ||| |||||||| |||||||  ||||||||| || ||||| |||||||| |  ||||||| ||| ||| |     || |||||||||    
T  18739451 tcttagtgaaattttacgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaccttatggattgtttccaaa-ctttaaagtttgtttattatgagttc 18739353  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaaccta 757  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  18739352 aattaagg-gtttaagagtatttaaccta 18739325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 529 - 660
Target Start/End: Original strand, 51602996 - 51603127
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51602996 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttcacttgaaaatgattttttgtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 51603095  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataa 660  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  51603096 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagtataa 51603127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 109; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Original strand, 14152795 - 14153031
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||  || ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| || ||||  |||||||| ||||||||||||||| |||| |||    
T  14152795 catgaaagttgtagatttttgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaaagaattttggtttttgagttatgatgaaaatacttcaagaagg 14152894  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||| | |||||||||||| |||||||  |||||| || || |||||||||||||| |   |||||| || |||||||||||||||| |||||     
T  14152895 tcttagtgaacttttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 14152994  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14152995 aattaaggggtttaagagtatttaacctatgttgtga 14153031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 529 - 764
Target Start/End: Complemental strand, 17938182 - 17937949
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  17938182 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgatttatgatgaaaatactctaaggagg 17938083  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| ||| |||||||| |||||||  ||||||||| || ||||| |||||||| |  ||||||| ||| ||| |     || |||||||||    
T  17938082 tcttagtgaaattttacgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaccttatggattgtttccaaa-ctttaaagtttgtttattatgagttc 17937984  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtg 764  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  17937983 aattaagg-gtttaagagtatttaacctaggttgtg 17937949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 579 - 721
Target Start/End: Original strand, 14567658 - 14567800
Alignment:
Q  579 ttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatcc 678  Q
    ||||||||||  |||| |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14567658 ttgaaaatgacatttagtttttgatttatgatcaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatcc 14567757  T
Q  679 aaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtacta 721  Q
    |||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  14567758 aaaacttatgaaataattccaaacctcaaaactagaagtacta 14567800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Original strand, 54330702 - 54330937
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||| ||||||||    
T  54330702 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgatttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacacttcaaggagg 54330801  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||| || || || |||||||||||||| |   ||||||  | ||| || |  ||| |||||||||    
T  54330802 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttttaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtattatgagttc 54330900  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54330901 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 54330937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 529 - 764
Target Start/End: Complemental strand, 15566169 - 15565935
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| |  | || |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15566169 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcatcagtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 15566070  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    || ||||||||| |||||||||||  |||||||  ||||||||| || |||||||||||||| |   |||||| ||| |||    |  ||||||||||||    
T  15566069 tcatagtgaaattttatgaaaatttcgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaa-cttcaaagcctatttactatgagttc 15565971  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtg 764  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15565970 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtg 15565935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 529 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 17046782 - 17046631
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||| |||||| ||||||||| || || ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17046782 catgaaagttatagataattgagttagatttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 17046683  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaa 680  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17046682 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaa 17046631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 24546496 - 24546257
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  24546496 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaga 24546397  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatga----aaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatga 724  Q
    |||||||||||| ||||||    |||||| |||||||  ||||||||| || |||||||| ||||| |   |||||| ||| |||      |||||||||    
T  24546396 tcttagtgaaattttatgaaattaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaactcatggattgtctccaaa-cttcaaagcctgtgtactatga 24546298  T
Q  725 gttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24546297 gttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 24546257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 529 - 764
Target Start/End: Original strand, 25104600 - 25104832
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||  || |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25104600 catgaaagttt-agataattgtgttagctttccagtggctttgatttgacttgaaa-tgatttttgatttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 25104697  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||| |||||||  |||| |||| || |||||||||||||| |  ||||||| ||| ||| |    ||||||| |||||    
T  25104698 tcttagtaaaattttacgaaaattccgcataactatttccaagtcaacccaaaacttatggattgtttccaaa-cttcaaaatttgtgtactatcagttc 25104796  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtg 764  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25104797 aattaaggtgtttaagagtatttaacttatgttgtg 25104832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 98; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 529 - 662
Target Start/End: Original strand, 19568807 - 19568940
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19568807 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaagcagg 19568906  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataacc 662  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  19568907 tcttagtgaaatcttagcaaaattcagtataacc 19568940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 529 - 676
Target Start/End: Complemental strand, 5215303 - 5215156
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||| |  |||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5215303 catgaaagttgtagataaatgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactacaaggagg 5215204  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaat 676  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5215203 tcttagtgaaatcttgtgaaaattcagcataaccgtttctaagttaat 5215156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 346 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 36528365 - 36528062
Alignment:
Q  346 cacgtaagttgtagatatggatgttatctgtccctcgactttggaggtactcgatttaagcacatagaactcaagttatgatcaaattactacacagggg 445  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||| || | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  36528365 cacgaaagttgtaggtatggatgttatctgtcactagcctttggaggcactagatttaagcacatagaactcaagttatgatcaaaatactacacagagg 36528266  T
Q  446 tcag----------cacagttgtcctcttttcccgagcataggaaaatctacttttctggaattttttgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaa 535  Q
    ||||          ||| |  || |||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||| ||||  |||||   ||| || ||   || ||||    
T  36528265 tcagcagggataaacacggccgtgctctttccccgagcttaggtaaatcaacttttctggaactttctgtttcgaatttccttt-ggtgtaaacacgaaa 36528167  T
Q  536 gttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagt 635  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || || ||||||||||| ||  | |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||     
T  36528166 gttttagataattttgtcagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgattcttggtgtttgatttatgatgaaaataccccaaggaggtcttagc 36528067  T
Q  636 gaaat 640  Q
    |||||    
T  36528066 gaaat 36528062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 93; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 335 - 640
Target Start/End: Original strand, 3264502 - 3264817
Alignment:
Q  335 ttaggtgccttcacgtaagttgtagatatggatgttatctgtccctcgactttggaggtactcgatttaagcacatagaactcaagttatgatcaaatta 434  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || |  |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  3264502 ttaggtgtcttcacgaaagttgtaggtatggatgttatctgtcactagcatttggagacactcgatttgagcacatagaactcaagctatgatcaaaata 3264601  T
Q  435 ctacacaggggtcag----------cacagttgtcctcttttcccgagcataggaaaatctacttttctggaattttttgttctgaattaggtttgggag 524  Q
    |||||||| ||||||          ||| || || |||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||||||| ||||  |||||    || || |    
T  3264602 ctacacagaggtcagtagggatcaacacggtcgtgctctttccccgagcttaggaaaaccaacttttctggaattttctgtttcgaattgtcctttggtg 3264701  T
Q  525 tcttcatgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaag 624  Q
    |   || ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| || || |||||||||||||| || |||||  | |||||||||||| |||||    
T  3264702 taaacacgaaagttttagataattttgttagcttcccagtggccatggtttgacgtgaaaatgatttttgatgtttgatttgtgatgaaaataccccaag 3264801  T
Q  625 gaggtcttagtgaaat 640  Q
    |||||||||| |||||    
T  3264802 gaggtcttagcgaaat 3264817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 93; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 12952697 - 12952462
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||||||||||||  |||||  |||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12952697 catgaaagttttagataatagtgttaaatttccattggctttggtttgacttgaaactgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 12952598  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| ||| |||||| | |||||||  |||| |||| || ||||||||||| || |   ||||||  | ||| || |  || ||||||| ||    
T  12952597 tcttagtgaaattttacgaaaatcccgcataactatttcaaagtcaacccaaaacttatagattgtgtccaaacttcaaatcttg-tgttctatgagctc 12952499  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12952498 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 12952462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 93; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 529 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 17207996 - 17207766
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || | ||| |||||| ||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17207996 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggttttaattgcaaatgaattttggtttt-gagttatgatgaaaatactccaaggagg 17207898  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||| || ||||||||||| || |   ||||||  | ||| || |  |||||||||||||    
T  17207897 tcttactgaaatgttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttattgattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttc 17207799  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 761  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||    
T  17207798 aaataaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 17207766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 529 - 656
Target Start/End: Original strand, 46723022 - 46723149
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  46723022 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 46723121  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagc 656  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  46723122 tcttactaaaatcttatgaaaattcagc 46723149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 599 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 5223716 - 5223566
Alignment:
Q  599 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattcc 698  Q
    ||||| |||||| ||| ||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  5223716 ttgagttatgatcaaattactccacgtaggtcacagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatcaaaaacttatgggataatacc 5223617  T
Q  699 aaatcttaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtat 749  Q
    ||  || |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5223616 aaccctcaaaactagaagttctatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 5223566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 792 - 962
Target Start/End: Original strand, 15447658 - 15447837
Alignment:
Q  792 ttgttaatgattataatgaggttcagagaggatgaataagatgatttatattga-------------tgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaa 878  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||             |||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  15447658 ttgttaatgattataatgaggttcagagaggatgaataagatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatattcatataatgtgaa 15447757  T
Q  879 agacgttgatatgaaattgtaatttgttatatatgaaaattattattgatggttacttgatgtgtatgtttaaatgatgatgtc 962  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  15447758 agacgttgatatgaagttgtaa-ttgttatatatg---attattattgatggtgacttgatgcatatgtttaaatgatgttgtc 15447837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 633 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 15465453 - 15465337
Alignment:
Q  633 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaatt 732  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  || |||||||||||| ||||||||||||||    
T  15465453 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagttctatgagttcaatt 15465354  T
Q  733 agggtgtttaagagtat 749  Q
    | |||||||||||||||    
T  15465353 aaggtgtttaagagtat 15465337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 633 - 749
Target Start/End: Original strand, 26055128 - 26055244
Alignment:
Q  633 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaatt 732  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  || |||||||||||| ||||||||||||||    
T  26055128 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagttctatgagttcaatt 26055227  T
Q  733 agggtgtttaagagtat 749  Q
    | |||||||||||||||    
T  26055228 aaggtgtttaagagtat 26055244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 666 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 11258986 - 11258887
Alignment:
Q  666 tctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11258986 tctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 11258887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 529 - 639
Target Start/End: Original strand, 14647499 - 14647609
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14647499 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaga 14647598  T
Q  629 tcttagtgaaa 639  Q
    ||||| |||||    
T  14647599 tcttaatgaaa 14647609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 607 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 22652409 - 22652250
Alignment:
Q  607 tgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatctta 706  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||| || || |||||||||||||| |   ||||||  | |    
T  22652409 tgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattctgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtatccaaacttca 22652310  T
Q  707 aaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 767  Q
    || || |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22652309 aagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 22652250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 842 - 962
Target Start/End: Complemental strand, 31415535 - 31415416
Alignment:
Q  842 ttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaatttgttatatatgaaaattattattgatggttacttgatgt 941  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||     
T  31415535 ttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaa-ttgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgc 31415437  T
Q  942 gtatgtttaaatgatgatgtc 962  Q
     ||||||||||||||| ||||    
T  31415436 atatgtttaaatgatgttgtc 31415416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 667 - 794
Target Start/End: Original strand, 52989492 - 52989618
Alignment:
Q  667 ctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgag 766  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  52989492 ctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatgag 52989591  T
Q  767 tcgaccattggggtaggaatggaggttg 794  Q
    | || | || ||||||||||| ||||||    
T  52989592 ttgatcctt-gggtaggaatgaaggttg 52989618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 529 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 12305718 - 12305599
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| | || ||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12305718 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactttagtttgactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggagg 12305619  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaa 648  Q
    |||||||||| | |||||||    
T  12305618 tcttagtgaatttttatgaa 12305599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 529 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 15465750 - 15465631
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15465750 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacatgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 15465651  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaa 648  Q
    |||||||||| | |||||||    
T  15465650 tcttagtgaatttttatgaa 15465631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 831 - 936
Target Start/End: Complemental strand, 6808279 - 6808175
Alignment:
Q  831 gatgatttatattgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaatttgttatatatgaaaattattattgatgg 930  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  6808279 gatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaa-ttgttatatataatgattattattgatgg 6808181  T
Q  931 ttactt 936  Q
    | ||||    
T  6808180 tgactt 6808175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 532 - 653
Target Start/End: Complemental strand, 8631395 - 8631274
Alignment:
Q  532 gaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtct 631  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||    
T  8631395 gaaagttttagataatgatgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagttatgttgaaaacactccaaggagatct 8631296  T
Q  632 tagtgaaatcttatgaaaattc 653  Q
    || |||||| ||| ||||||||    
T  8631295 tattgaaattttacgaaaattc 8631274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 529 - 638
Target Start/End: Complemental strand, 54521418 - 54521309
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || ||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  54521418 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttaattttactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggagg 54521319  T
Q  629 tcttagtgaa 638  Q
    ||||||||||    
T  54521318 tcttagtgaa 54521309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 529 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 5223979 - 5223860
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||| || ||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5223979 catgaaagttgtagatagttgtgttagctttccagtggctttggtttgacatgaaaatgatttttggtgtttgcgatatgatgaaaatactccaaggagg 5223880  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaa 648  Q
    |||||||||| | |||||||    
T  5223879 tcttagtgaatttttatgaa 5223860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 529 - 648
Target Start/End: Original strand, 26054831 - 26054950
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| || || || ||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26054831 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcttcggttttacatgaaaatgatttttggtgtttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 26054930  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaa 648  Q
    |||||||||| | |||||||    
T  26054931 tcttagtgaatttttatgaa 26054950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 529 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 13436894 - 13436799
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaag 624  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13436894 catgaaagttgtagataatgttgttagctttccaatggatttggtttggcttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaag 13436799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 529 - 648
Target Start/End: Original strand, 29544408 - 29544527
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||   || ||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29544408 catgaaagttgtagataatttgtttagctttccaatggctttaatttgactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggagg 29544507  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaa 648  Q
    |||| ||||| | |||||||    
T  29544508 tcttggtgaatttttatgaa 29544527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 667 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 14682841 - 14682743
Alignment:
Q  667 ctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||| |||||||||| | ||||||||    
T  14682841 ctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaacagtatttaacatgtgttgtga 14682743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 529 - 689
Target Start/End: Complemental strand, 8023878 - 8023718
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| || || |||| |||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||| |||| |||    
T  8023878 catgaaagttttagataaatatgttagctttctaatggcttgggtttgacttaaaaatgatttctagattttgagttatgatgaaaatactacaagtagg 8023779  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgg 689  Q
    | || ||| ||| | | ||||||| ||||||||  ||| ||||| || |||||||||||||    
T  8023778 ttttggtgcaatttaacgaaaatttagcataactatttttaagtcaacccaaaacttatgg 8023718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 529 - 648
Target Start/End: Original strand, 22764026 - 22764145
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||||||| || ||||||||| || || ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||     
T  22764026 catgaaagttatagataattgagttagcttttcagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagtaga 22764125  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaa 648  Q
    |||||||||| | |||||||    
T  22764126 tcttagtgaatttttatgaa 22764145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 529 - 648
Target Start/End: Original strand, 28848188 - 28848307
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |  | | ||||||| ||||  |||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28848188 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggagg 28848287  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaa 648  Q
    |||||||||| | |||||||    
T  28848288 tcttagtgaatttttatgaa 28848307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 712 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 18893063 - 18892981
Alignment:
Q  712 agaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttg 794  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||    
T  18893063 agaagtaatatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagatgacccttggggtaggaatggaggttg 18892981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 706 - 765
Target Start/End: Original strand, 19568941 - 19569000
Alignment:
Q  706 aaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19568941 aaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 19569000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 529 - 631
Target Start/End: Complemental strand, 11259086 - 11258984
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||| || |  ||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11259086 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgatgtgaaaatgatttttggctcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 11258987  T
Q  629 tct 631  Q
    |||    
T  11258986 tct 11258984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 530 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 15978127 - 15978009
Alignment:
Q  530 atgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggt 629  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     | | ||||||| ||||  |||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15978127 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtggggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggt 15978028  T
Q  630 cttagtgaaatcttatgaa 648  Q
    ||||||||| | |||||||    
T  15978027 cttagtgaatttttatgaa 15978009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 832 - 901
Target Start/End: Original strand, 49969963 - 49970032
Alignment:
Q  832 atgatttatattgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaat 901  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  49969963 atgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaat 49970032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 769 - 957
Target Start/End: Complemental strand, 12269817 - 12269620
Alignment:
Q  769 gaccattggggtaggaatggaggttgttaatgattataatgaggttcagagaggatgaataagatgattta-tattgatgattaaatgtga--------- 858  Q
    |||| |||||||||||||| || ||  |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||  |||             
T  12269817 gacctttggggtaggaatgaagctt--taatgattgtaatgaggttcagagaggatgactaagatgatttaatattgttgtttaaagttgatgattaatg 12269720  T
Q  859 --aaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaatttgttatatatgaaaattattattgatggttacttgatgtgtatgtttaaatgat 956  Q
      ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||| | |||||| | |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  12269719 aaaaagatttatatattgtgaaagttgttgatatgaagttgtatttt-ttacatatgaagaatattatcggtggttacttgttgtatatgtttaaatgat 12269621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 530 - 648
Target Start/End: Original strand, 7780914 - 7781032
Alignment:
Q  530 atgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggt 629  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |  | | ||||||| || |  |||  | | |||||||||||||||||||||||||    
T  7780914 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtgtggcgtaaaaatgagttctggtttaggcgttatgatgaaaatactccaaggaggt 7781013  T
Q  630 cttagtgaaatcttatgaa 648  Q
    ||||||||| | |||||||    
T  7781014 cttagtgaatttttatgaa 7781032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 530 - 638
Target Start/End: Original strand, 16453847 - 16453955
Alignment:
Q  530 atgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggt 629  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |  | | ||||||| ||||  |||  ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  16453847 atgaaagttgtagataattttattagctttccaatggctttggtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggt 16453946  T
Q  630 cttagtgaa 638  Q
    |||||||||    
T  16453947 cttagtgaa 16453955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 564 - 639
Target Start/End: Original strand, 11986837 - 11986912
Alignment:
Q  564 tggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaa 639  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  11986837 tggctttggtttgacttgaaaatgatctttagtttttgagttatgatgaaaatactacaagggggtcttagtgaaa 11986912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 529 - 689
Target Start/End: Complemental strand, 6002603 - 6002443
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| || | || ||||||||||| ||| |   ||||||| ||||||||||| ||| |||| |||    
T  6002603 catgaaggttttagataattatgttatctttccaatggcgttagtttgacttgaaaatgttttgtggattttgagttatgatgaaaacacttcaagtagg 6002504  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgg 689  Q
    |||| | ||||| |||   ||||| ||||||||  |||| |||| | ||||| ||||||||    
T  6002503 tcttggggaaattttaaagaaatttagcataactatttccaagtcattccaatacttatgg 6002443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 717 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 17046630 - 17046582
Alignment:
Q  717 tactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17046630 tactattagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 17046582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 73 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 22161706 - 22161555
Alignment:
Q  73 aggaaaactagtttatgtttc-gaattgagtttctagtcttaaaaagagtggataatacagtaggttgatgaataattattgttataatgatagggtgat 171  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||| ||||| ||||  |||||||||||  |    
T  22161706 aggaaaactagtttaggtttttgaattgagttt-tagtcttaaaaagagtggataatcaggtaggttaatgaagaattagtgtttgaatgatagggtagt 22161608  T
Q  172 catagggtaatgattagggttatgtttggagagtattggatcgaaaacggagt 224  Q
    ||| | ||||  ||||||||   |||||| |||| | || |||||||||||||    
T  22161607 catggagtaactattagggtcgagtttggcgagtttagggtcgaaaacggagt 22161555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 529 - 689
Target Start/End: Original strand, 40039740 - 40039900
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| || ||||||||||  ||| |   ||||||| ||||||||||| ||| ||||  ||    
T  40039740 catgaaagttttagataattttgttatcttttcaatggatttggtttgacttgaaaatattttatggattttgagttatgatgaaaacacttcaagaggg 40039839  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgg 689  Q
    ||||   ||||| ||| | ||| | ||||||||  |||| |||| || |||||||||||||    
T  40039840 tcttgaagaaattttaaggaaacttagcataactatttccaagtcaacccaaaacttatgg 40039900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 529 - 572
Target Start/End: Original strand, 17956848 - 17956891
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgg 572  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17956848 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgg 17956891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 903 - 962
Target Start/End: Original strand, 18439864 - 18439923
Alignment:
Q  903 tgttatatatgaaaattattattgatggttacttgatgtgtatgtttaaatgatgatgtc 962  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  18439864 tgttatatatgaagattattattgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttgtc 18439923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 774 - 821
Target Start/End: Complemental strand, 12158680 - 12158633
Alignment:
Q  774 ttggggtaggaatggaggttgttaatgattataatgaggttcagagag 821  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12158680 ttggggtaggaatggaagttgttaatgattataatgaggttgagagag 12158633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 529 - 624
Target Start/End: Original strand, 17759054 - 17759149
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaag 624  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||| |||||  ||| |   ||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  17759054 catgaaagttttagataattttgttagcttttcaatggatttggtttgacttaaaaattgtttgtggattttgagttatgataaaaacactccaag 17759149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 529 - 624
Target Start/End: Original strand, 19060374 - 19060469
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaag 624  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||| |||||  ||| |   ||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  19060374 catgaaagttttagataattttgttagcttttcaatggatttggtttgacttaaaaattgtttgtggattttgagttatgataaaaacactccaag 19060469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 529 - 594
Target Start/End: Original strand, 1468633 - 1468698
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgattttta 594  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||  |  ||||||||||||    
T  1468633 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgattttta 1468698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 10341050 - 10340938
Alignment:
Q  54 aattgaaagtttcgaattaaggaaaactagtttatgtttc-gaattgagtttctagtcttaaaaagagtggataatacagtaggttgatgaataattatt 152  Q
    ||||||||| |  ||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||| | ||| ||||| |    
T  10341050 aattgaaagatgagaattgaggaaaactagtttaagtttttgaattgagttt-tagtctttaaaagagtggataatccggtaggttaacgaagaattagt 10340952  T
Q  153 gttataatgatagg 166  Q
    |||  |||||||||    
T  10340951 gtttgaatgatagg 10340938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 529 - 594
Target Start/End: Original strand, 14528644 - 14528709
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgattttta 594  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||  ||||||||||||    
T  14528644 catgaaagttttagataattatgttagctttctaatggatttggtttgacttccaaatgattttta 14528709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 852 - 901
Target Start/End: Original strand, 20630210 - 20630259
Alignment:
Q  852 aatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaat 901  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  20630210 aatgtgagaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaat 20630259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 529 - 594
Target Start/End: Original strand, 54039146 - 54039211
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgattttta 594  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |  ||||||||||||    
T  54039146 catgaatgttttagataattttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgattttta 54039211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 21999511 - 21999360
Alignment:
Q  73 aggaaaactagtttatgtttc-gaattgagtttctagtcttaaaaagagtggataatacagtaggttgatgaataattattgttataatgatagggtgat 171  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||| ||||| ||||  ||||| |||||  |    
T  21999511 aggaaaactagtttaggtttttgaattgagttt-tagtcttaaaaagagtggataatcaggtaggttaatgaagaattagtgtttgaatgacagggtagt 21999413  T
Q  172 catagggtaatgattagggttatgtttggagagtattggatcgaaaacggagt 224  Q
    ||| | ||||  ||||||||   |||||| |||| | || | |||||||||||    
T  21999412 catggagtaaatattagggtcgagtttggcgagtttagggttgaaaacggagt 21999360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 529 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 34159921 - 34159857
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgattttt 593  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | || || |||||||||||||||||    
T  34159921 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgattttt 34159857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 678 - 765
Target Start/End: Original strand, 42353218 - 42353306
Alignment:
Q  678 caaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaatta-gggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| || ||||| | ||||| || ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42353218 caaaacttagggaataattctaaacctcaaaacaaaaagtattaggagtttaattaagggagtttaagagtatttaacgtatgttgtga 42353306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 883 - 962
Target Start/End: Original strand, 1465419 - 1465497
Alignment:
Q  883 gttgatatgaaattgtaatttgttatatatgaaaattattattgatggttacttgatgtgtatgtttaaatgatgatgtc 962  Q
    ||||||||||| ||| |||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||    
T  1465419 gttgatatgaagttgaaatt-gttatacatgaagattattaatgatggttacttgctctatatgtttaaatgatgttgtc 1465497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 529 - 648
Target Start/End: Original strand, 10247290 - 10247409
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||||||| || |||| | || || |||||||||||||||||  ||| || | |||| | ||| |||| || |||||    
T  10247290 catgaaagttgtagataattgcgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgtgttatggtcaaattactgcacggagg 10247389  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaa 648  Q
    |||||||||| | |||||||    
T  10247390 tcttagtgaatttttatgaa 10247409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 529 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 16820552 - 16820509
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgg 572  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  16820552 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcattgg 16820509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 529 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 25058388 - 25058345
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgg 572  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  25058388 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttgg 25058345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 529 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 49231858 - 49231815
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgg 572  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  49231858 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttgg 49231815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 529 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 55477086 - 55477023
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttt 592  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | || || ||||||||||||||||    
T  55477086 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttt 55477023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 529 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 4656305 - 4656182
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||||||| ||| |||||| ||  |||||||||||| | ||  ||||| | |||||||| ||||||||||| | |    
T  4656305 catgaaagttttagata--tgtgttagctttcccatgactttggtttggcttgaaaatgatgtctatattttgggttatgatgacaatactccaagtatg 4656208  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattca 654  Q
    ||||  | |||| ||| |||||||||    
T  4656207 tcttgataaaattttacgaaaattca 4656182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 529 - 619
Target Start/End: Original strand, 8276493 - 8276583
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatact 619  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || || |  ||||||||||||    |||||||||||| ||| ||||    
T  8276493 catgaaagttgtagataattttattagctttctaatggctttggtttgacgtcgaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 8276583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 529 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 12808595 - 12808557
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggc 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12808595 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatggc 12808557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 529 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 28557460 - 28557418
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttg 571  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  28557460 catgaaagttttagataattatgttagctttcaaatggctttg 28557418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 529 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 30152540 - 30152450
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatact 619  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| || || |  ||||||||||||   |||||| |||||| ||| ||||    
T  30152540 catgaaagttttagataattaagttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaatttgagttatgatcaaattact 30152450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 842 - 929
Target Start/End: Original strand, 49389772 - 49389859
Alignment:
Q  842 ttgatgattaaatgtgaaaatattt--atatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaatttgttatatatgaaaattattattgatg 929  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  ||||||||||| |||||| ||||||||| |||  |||||| ||||||    
T  49389772 ttgatgattaaatgtgaaaatatttagatatattgtg-aagttgttgatatgaagttgtaa-ttgttatatttgatgattattgttgatg 49389859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 529 - 690
Target Start/End: Complemental strand, 14284679 - 14284518
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||| |  ||||| |||| |||| || |||||||||| || |||  |||||||| |||||  ||||||||| | |||||    
T  14284679 catgaaagttttagacaattgagttggaattccattggccttggtttgacttgaaaataatgttttgtttttgagttatgaataaaatactctacggagg 14284580  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgga 690  Q
    | ||| | |||  ||| |||||||| ||| ||  |||||||||| || ||||| ||||||||    
T  14284579 ttttaataaaactttacgaaaattccgcacaattgtttctaagtcaacccaaaccttatgga 14284518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 529 - 594
Target Start/End: Original strand, 16934830 - 16934895
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgattttta 594  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| || || |  ||||||||||||    
T  16934830 catgaaagttttaggtaattttgttagctttctaatggccttggtttgacgtccaaatgattttta 16934895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 832 - 901
Target Start/End: Original strand, 18439941 - 18440009
Alignment:
Q  832 atgatttatattgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaat 901  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  18439941 atgatttactttgatgattaa-tgtgagaatatctatatattgtgaaagatgatgatatgaagttgtaat 18440009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 410 - 491
Target Start/End: Original strand, 27868748 - 27868828
Alignment:
Q  410 tagaactcaagttatgatcaaattactacacaggggtcagcacagttgtcctcttttcccgagcataggaaaatctactttt 491  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||  || || ||||||||| | || |||||||||| ||||||    
T  27868748 tagaactcaagatatgatcaaaatactacacagaggtcagcagggtcgtgctcttttccag-gcttaggaaaatcaactttt 27868828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 529 - 594
Target Start/End: Original strand, 51158663 - 51158728
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgattttta 594  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || || |  ||||||||||||    
T  51158663 catgaaaattttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgattttta 51158728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 529 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 17463773 - 17463709
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgattttt 593  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||| || |||| | || || |||||||||||||||||    
T  17463773 catgaaagttgtagataattgtgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgattttt 17463709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #169
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 73 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 21977080 - 21976929
Alignment:
Q  73 aggaaaactagtttatgtttc-gaattgagtttctagtcttaaaaagagtggataatacagtaggttgatgaataattattgttataatgatagggtgat 171  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||   ||||||| ||||| ||||| ||||  ||||| |||||  |    
T  21977080 aggaaaactagtttaggtttttgaattgagttt-tagtctttaaaagagtggataatcaggtaggttaatgaagaattagtgtttgaatgacagggtagt 21976982  T
Q  172 catagggtaatgattagggttatgtttggagagtattggatcgaaaacggagt 224  Q
    ||| | ||||  ||||||||   |||||| |||| | || | |||||||||||    
T  21976981 catggagtaaatattagggtcgagtttggcgagtttagggttgaaaacggagt 21976929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #170
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 10302725 - 10302604
Alignment:
Q  54 aattgaaagtttcgaattaaggaaaactagttt--atgtttcgaattgagtttctagtcttaaaaagagtggataatacagtaggttgatgaataattat 151  Q
    ||||||||| |  ||||| ||||||||||||||  |  ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||   ||||||| | ||| |||||     
T  10302725 aattgaaagatgagaattgaggaaaactagttttaagtttttgaattgagttt-tagtctttaaaagagtggataatctggtaggttaacgaagaattag 10302627  T
Q  152 tgttataatgatagggtgatcat 174  Q
    ||||  ||||||||||| |||||    
T  10302626 tgtttgaatgatagggtaatcat 10302604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #171
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 529 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 15413026 - 15412963
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttt 592  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | |  || ||||||||||||||||    
T  15413026 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcgatttgacttgaaaatgatttt 15412963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #172
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 410 - 448
Target Start/End: Original strand, 1468697 - 1468735
Alignment:
Q  410 tagaactcaagttatgatcaaattactacacaggggtca 448  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1468697 tagaactcgagttatgatcaaattactacacatgggtca 1468735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #173
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 529 - 619
Target Start/End: Original strand, 8269382 - 8269472
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatact 619  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| || || || |  ||||||||||||    |||||||||||| ||| ||||    
T  8269382 catgaaagttgtagataattttattagctttctaatggcttgggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 8269472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #174
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 723 - 765
Target Start/End: Original strand, 14568649 - 14568691
Alignment:
Q  723 gagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14568649 gagtttaattaaggtgtttaagagtatctaacctatgttgtga 14568691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #175
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 41 - 222
Target Start/End: Original strand, 27868380 - 27868561
Alignment:
Q  41 aattaaaagatgaaattgaaagtttcgaattaaggaaaactagtttatgttt-cgaattgagtttctagtcttaaaaagagtggataatacagtaggttg 139  Q
    |||| ||||||||| || |||| |  ||||| |||||||| | |||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   |||||||     
T  27868380 aattgaaagatgaagttaaaagatgagaattgaggaaaacaaatttaggttttcgaattgagttt-tagttttaaaaagagtggataatctggtaggtta 27868478  T
Q  140 atgaataattattgttataatgatagggtgatcatagggtaatgattagggttatgtttggagagtattggatcgaaaacgga 222  Q
    | ||| ||||  ||||  ||||||||| |||| || | || |  |||||||||  |||||| |||| | || |||||||||||    
T  27868479 acgaagaattgatgtttgaatgataggttgattatggagtgaatattagggttgagtttggcgagtttagggtcgaaaacgga 27868561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #176
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 859 - 901
Target Start/End: Original strand, 30175304 - 30175346
Alignment:
Q  859 aaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaat 901  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  30175304 aaatatttatatactgtgaaagatgttgatatgaagttgtaat 30175346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #177
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 863 - 901
Target Start/End: Complemental strand, 40812096 - 40812058
Alignment:
Q  863 atttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaat 901  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  40812096 atttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaat 40812058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #178
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 832 - 901
Target Start/End: Complemental strand, 12269597 - 12269529
Alignment:
Q  832 atgatttatattgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaat 901  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||||    
T  12269597 atgatttaagttgatgattaa-tgtgagaagatttataaattttgaaggacgttgatatgaagttgtaat 12269529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686 (Bit Score: 457; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0686
Description:

Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 457; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 1414 - 767
Alignment:
Q  17 aggttttagaatttgagagattagaattaaaagatgaaattgaaagtttcgaattaaggaaaactagtttatgtttcgaattgagtttctagtcttaaaa 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1414 aggttttagaatttgagagattagaattaaaagatgaaattgaaagatgagaattaaggaaaactagtttaggtttcgaattgagtttctagtcttaaaa 1315  T
Q  117 agagtggataatacagtaggttgatgaataattattgttataatgatagggtgatcatagggtaatgattagggttatgtttggagagtattggatcgaa 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  1314 agagtggataatacagtaggttgatgaataattagtgttataatgatagggttatcatagggtaatgattagggtcatgtttggagagtattgtatcgaa 1215  T
Q  217 aacggagtcgaaaagatttccccaaaggcgaaatcgcagctgaactacgattttgctgtcagtgtgcaaaacgcgtttttattgtcgcagtttgacaagt 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1214 aacggagtcgaaaagatttccccaaaggcgaaatcgcagctgaactgcgactttgctgtcagtgtgcaaaacgcgtttttattgtctcagtttgacaagt 1115  T
Q  317 ttaagtttcaaactgagtttaggtgccttcacgtaagttgtagatatggatgttatctgtccctcgactttggaggtactcgatttaagcacatagaact 416  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1114 ttaagtttcgaactgggtttaggtgtcttcacgaaagttgtagacatggatgttatctgtcactcggctttggaggaactcgatttaagcacatagaact 1015  T
Q  417 caagttatgatcaaattactaca----------caggggtcagcacagttgtcctcttttcccgagcataggaaaatctacttttctggaattttttgtt 506  Q
    |||| ||||||||||||||||||           |||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||    
T  1014 caagatatgatcaaattactacaaaggaatcaggagggatcagcacagtcgtcttcttttcccgagcataggaaaatcaacttttctggatttctctgtt 915  T
Q  507 ctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagata 606  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  914 ctgaattaggtttaggaatcttcatcaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagata 815  T
Q  607 tgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattca 654  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  814 tgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgacattttatgaaaattca 767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 529 - 572
Target Start/End: Original strand, 6949 - 6992
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgg 572  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  6949 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttgg 6992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174 (Bit Score: 382; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0174
Description:

Target: scaffold0174; HSP #1
Raw Score: 382; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 13612 - 13060
Alignment:
Q  17 aggttttagaatttgagagattagaattaaaagatgaaattgaaagtttcgaattaaggaaaactagtttatgtttcgaattgagtttctagtcttaaaa 116  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  13612 aggttttagaatttgagagtttagaattaaaagatgaaattgaaatttgagaattaaggaaaaccagtttaggtttcgaattgaatttctagtcttaaaa 13513  T
Q  117 agagtggataatacagtaggttgatgaataattattgttataatgatagggtgatcatagggtaatgattagggttatgtttggagagtattggatcgaa 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13512 agagtggataatacagtaggttgatgaataattagtgttataatgatagggtgatcatagggtaatgattagggtcatgtttggagagtattggatcgaa 13413  T
Q  217 aacggagtcgaaaagatttccccaaaggcgaaatcgcagctgaactacgattttgctgtcagtgtgcaaaacgcgtttttattgtcgcagtttgacaagt 316  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  13412 aaaggagtcgaaaagatttccccaaaggcgaaatcgcagctgaactgggattttgttgtcagtgtgcaaaacacgtttttattgtctcagtttgacaagt 13313  T
Q  317 ttaagtttcaaactgagtttaggtgccttcacgtaagttgtagatatggatgttatctgtccctcgactttggaggtactcgatttaagcacatagaact 416  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  13312 ttaagtttcgaactgggtttaggttctttcacgaaagttgtagatatggatgttatctgtcactcgtgtttggaggcactcgatttaagcacatagaaca 13213  T
Q  417 caagttatgatcaaattactacacaggggtc----------agcacagttgtcctcttttcccgagcataggaaaatctacttttctggaattttttgtt 506  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||          |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||    
T  13212 caagatatgatcaaattactacacaggggtcagcagggatcagcacagtcgtcctcttttcccgagcataggaaaatcaacttttctggaattgtctgtt 13113  T
Q  507 ctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttttagataattttgttagcttt 559  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||    
T  13112 ctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagatatggttgttagcttt 13060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 529 - 689
Target Start/End: Original strand, 20470 - 20630
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||  ||||||| ||||| | |||||||||||| |||    
T  20470 catgaaagttttagataattgtgttagtgttccaatggttttggtttgacttgaaaatgatttttagattttgagttatgacggaaatactccaagtagg 20569  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgg 689  Q
    |||| | ||||| ||| | ||| | ||||||||  |||| |||| || || ||||||||||    
T  20570 tcttggagaaattttaaggaaacttagcataactatttccaagtcaacccgaaacttatgg 20630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 379; Significance: 0; HSPs: 170)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 11091621 - 11091080
Alignment:
Q  17 aggttttagaatttgagagattagaattaaaagatgaaattgaaagtttcgaattaaggaaaactagtttatgtttcgaattgagtttctagtcttaaaa 116  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11091621 aggttttagaatctgagagattagaattaaaagatgaaattgaaagctgagaattaaggaaaactagtttaggtt-cgaattgagtttctagtcttaaaa 11091523  T
Q  117 agagtggataatacagtaggttgatgaataattattgttataatgatagggtgatcatagggtaatgattagggttatgtttggagagtattggatcgaa 216  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11091522 agagtggataatacattaggttgatgaataattagtgttataatgatagggtaatcatagggtaatgattagggtcatgtttggagagtattggatcgaa 11091423  T
Q  217 aacggagtcgaaaagatttccccaaaggcgaaatcgcagctgaactacgattttgctgtcagtgtgcaaaacgcgtttttattgtcgcagtttgacaagt 316  Q
    || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  11091422 aatggagttgaaaagatttcctcaaaggcgaaatcgcagctgaactacgattttgctgtcagtgtgcaaaatgcgtttttattgtctcagtttgacaagt 11091323  T
Q  317 ttaagtttcaaactgagtttaggtgccttcacgtaagttgtagatatggatgttatctgtccctcgactttggaggtactcgatttaagcacatagaact 416  Q
    ||||||||| || || ||||||||  ||||    |||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  11091322 ttaagtttcgaaatgggtttaggtttcttcgtaaaagttgtagatatggatgttatttgtcactcggctttggaggcactcgatttaagcacatataact 11091223  T
Q  417 caagttatgatcaaattactacacaggggtcagcacagttgtcctcttttcccgagcataggaaaatctacttttctggaattttttgttctgaattagg 516  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  11091222 caagatataatcaaattactacacaggggtcagcacagtcgtgctcttttcccgagcataggaaaatcaacttttctggaattttctgttctgaattaag 11091123  T
Q  517 tttgggagtcttcatgaaagttttagataattttgttagcttt 559  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||    
T  11091122 tttgggagtcttcatgaaagttgtagatatggttgttagcttt 11091080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 374; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 134 - 794
Target Start/End: Original strand, 46579915 - 46580571
Alignment:
Q  134 aggttgatgaataattattgttataatgatagggtgatcatagggtaatgattagggttatgtttggagagtattggatcgaaaacggagtcgaaaagat 233  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46579915 aggttgatgaataattagtgttataatgatagggtgatcatagggtaattattagggtcatgtttggagagtattggatcgaaaacggagtcgaaaagat 46580014  T
Q  234 ttccccaaaggcgaaatcgcagctgaactacgattttgctgtcagtgtgcaaaacgcgtttttattgtcgcagtttgacaagtttaagtttcaaactgag 333  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||| |    
T  46580015 ttacccaaaggcgaaatcgcagctgaactgcgattttgctgtcagtgtgcaaaacgcgtttttattgtctcagtttgacaagtttaacttttgaactggg 46580114  T
Q  334 tttaggtgccttcacgtaagttgtagatatggatgttatctgtccctcgactttggaggtactcgatttaagcacatagaactcaagttatgatcaaatt 433  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  46580115 tttaggtgccttcacaaaagttgtagatatggatgttatatgtcactcggatttggaggcactcgatttaagcacatagaactcaagatatgatcaaatt 46580214  T
Q  434 actacacagggg----------tcagcacagttgtcctcttttcccgagcataggaaaatctacttttctggaattttttgttctgaattaggtttggga 523  Q
    |||| |||||||          |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||  ||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  46580215 actatacaggggtcagcagggatcagcacagtcgtcctcttttcccgagcataggaaaatcaaattttcctgaattttctattctgaattgggtttggga 46580314  T
Q  524 gtcttcatgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaa 623  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| | || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  46580315 gtcttcatgaaagttgtagataattttgttagttttccaatgactttagtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaa 46580414  T
Q  624 ggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttat-ggaataattccaaatcttaaaactagaagtactat 722  Q
    |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||             ||||  |  ||| || ||||||||| |||| || ||||||||||||||||     
T  46580415 ggagttcttactgaaattttatgaaaattcagcata-------------taat--attactgatgggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactag 46580499  T
Q  723 gagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttg 794  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||    
T  46580500 gagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttg 46580571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 239 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 48812794 - 48812256
Alignment:
Q  239 caaaggcgaaatcgcagctgaactacgattttgctgtcagtgtgcaaaacgcgtttttattgtcgcagtttgacaagtttaagtttcaaactgagtttag 338  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  48812794 caaaggtgaaatcgcagctgaactgcgattttgttgttaatgtgcaaaacgcatttttattgtctcaatttgacaagtttaagtttcgaactgggtttag 48812695  T
Q  339 gtgccttcacgtaagttgtagatatggatgttatctgtccctcgactttggaggtactcgatttaagcacatagaactcaagttatgatcaaattactac 438  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  48812694 gtgccttcacaaaagttgtagatatggatgttatctgtcactcggctttggaggcactccagtttagcacatagaactcaagatatgatcaaattactac 48812595  T
Q  439 acaggggtca----------gcacagttgtcctcttttcccgagcataggaaaatctacttttctggaattttttgttctgaattaggtttgggagtctt 528  Q
    ||| ||||||          ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  48812594 acaagggtcaacagggatcagcacagtcgtcctcttttcccgagcataggaaaatcaacttttctggaattttctgttccgaattaggtttggaagtctt 48812495  T
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  48812494 catgaaagttgtatataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactgcaaggagg 48812395  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||| || |||||     
T  48812394 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagagaataattccaaacctcaaaactagaagtattaggagttt 48812295  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 767  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48812294 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 48812256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 529 - 929
Target Start/End: Complemental strand, 15214155 - 15213744
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15214155 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttcacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 15214056  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  15214055 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagtataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttc 15213956  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttgttaatgattataatgaggttcagagaggatgaat 828  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15213955 aattagggtgtttaagagtatgtaatttatgttgtgagtcgacccttgggtttggaat-gaagttgttaatgattataatgaggtttagagaggatgaat 15213857  T
Q  829 aagatgatttata-------------ttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaatttgttatatatgaa 915  Q
    ||||||||| |||             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  15213856 aagatgattaataatgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacattgatatgaaattgtaa-ttgttatatatgat 15213758  T
Q  916 aattattattgatg 929  Q
     |||||||||||||    
T  15213757 gattattattgatg 15213744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 529 - 962
Target Start/End: Original strand, 30820652 - 30821096
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||  |||| || |||||||||| ||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||     
T  30820652 catgaaagttttagataattgtgttagctttctagtggtattggtttgacttgaaaataatttttggtttttaagatatgataaaaatactccaaggaga 30820751  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  30820752 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagataatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 30820851  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttgttaatgattataatgaggttcagagaggatgaat 828  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30820852 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagtcgacccttggggtaggaat-gaatttgttaatgattataatgaggttcagagaggatgaat 30820950  T
Q  829 aagatgatttata-------------ttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaatttgttatatatgaa 915  Q
    ||||||||| |||             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||     
T  30820951 aagatgattaatattgatgttttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaatacgttgatatgaagttgtaa-ttgttatatatgat 30821049  T
Q  916 aattattattgatggttacttgatgtgtatgtttaaatgatgatgtc 962  Q
     ||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||| ||||    
T  30821050 gattattattgatggtaacttgctgcatatgtttaaatgatgttgtc 30821096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 529 - 962
Target Start/End: Original strand, 36685645 - 36686090
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36685645 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 36685744  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||||||    
T  36685745 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcgtaaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 36685844  T
Q  729 aattagggtg-tttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttgttaatgattataatgaggttcagagaggatgaa 827  Q
    ||||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36685845 aattaagatgttttaagagtatttaacccatgttgtgagtcgacccttggggtaggaat-gaatttgttaatgattataatgaggttcacagaggatgaa 36685943  T
Q  828 taagatgatttata-------------ttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaatttgttatatatga 914  Q
    |||||||||| |||             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||    
T  36685944 taagatgattaatattgatgttttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgctgatatgaagttttaa-ttgttatatatga 36686042  T
Q  915 aaattattattgatggttacttgatgtgtatgtttaaatgatgatgtc 962  Q
      ||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||| ||||    
T  36686043 tgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgatgttgtc 36686090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 529 - 793
Target Start/End: Original strand, 18456044 - 18456308
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18456044 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 18456143  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||    
T  18456144 tcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccatttctaaattaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttc 18456243  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggtt 793  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  18456244 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatggaggtt 18456308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 529 - 799
Target Start/End: Original strand, 8756792 - 8757061
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  8756792 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggatttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgataaaaatactccgaggagg 8756891  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  8756892 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttttgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 8756991  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttgttaat 799  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||| |||||||||| |||||||||    
T  8756992 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaagttgttaat 8757061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 529 - 797
Target Start/End: Original strand, 58814 - 59081
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  58814 catgaaagttttatataattttgttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgaattttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 58913  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||     
T  58914 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttt 59013  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttgtta 797  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| |||||||| | |||||||    
T  59014 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatgaaagttgtta 59081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 529 - 797
Target Start/End: Original strand, 17070689 - 17070956
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17070689 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatgactttgttttgacttgaaaatgatttttattttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 17070788  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  17070789 tcttattgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaattctcaaaactagaagtactatgagttc 17070888  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttgtta 797  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||||| || ||||||| |||||||    
T  17070889 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtaagttgatc-ttgggatatgaatggaagttgtta 17070956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 529 - 767
Target Start/End: Original strand, 708951 - 709189
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  708951 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 709050  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  709051 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcttaactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactattagttc 709150  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 767  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  709151 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 709189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 529 - 839
Target Start/End: Original strand, 37727323 - 37727631
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  37727323 catgaaagttgtatataattttgttagctttccagtggctttggtttgactcaaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatgctccaaggagg 37727422  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||    
T  37727423 tcttagtgaaatcttaggaaaatttagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaccatcaaaactagaagtactatgagttc 37727522  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttgttaatgattataatgaggttcagagaggatgaat 828  Q
    ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||| ||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  37727523 aatcaaggtgtttaagagtttttaacctatgttgtgagttgatc-ttgggataggaat-gaagatgttaatgattataatgaggttcagagaggatgatt 37727620  T
Q  829 aagatgattta 839  Q
    |||||||||||    
T  37727621 aagatgattta 37727631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 529 - 762
Target Start/End: Original strand, 14415880 - 14416113
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  14415880 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgacttttagtgtttgatttatgatgaaaatactccaaggagg 14415979  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  14415980 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 14416079  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttg 762  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14416080 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttg 14416113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 185; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 33001570 - 33001334
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33001570 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttaacttgaaaatgatttttgatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 33001471  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||    
T  33001470 tcttagtgaaatcttaggaaaattcagtatatccatttcttagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaaatactatgagttc 33001371  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33001370 aattaaggtgtttaagagaatttaacctatgttgtga 33001334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 529 - 767
Target Start/End: Original strand, 32160598 - 32160836
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32160598 catgaaagttgtagataattgtcttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 32160697  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  32160698 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 32160797  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 767  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32160798 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 32160836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 529 - 799
Target Start/End: Original strand, 40555139 - 40555408
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  40555139 catgaaagttttagataattttgttaactttccaatggctttggtttgacttcaaaatgatttttgatttttgagatatgatgtaaatactccaaggaag 40555238  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  40555239 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttc 40555338  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttgttaat 799  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||| || | ||||| ||||||| || |||||||||    
T  40555339 aattaaggtgtttaagtgtatttaacccatattgtgagttgatc-ttgggataggaatagaagttgttaat 40555408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 179; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 529 - 767
Target Start/End: Original strand, 47975307 - 47975545
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  47975307 catgaaagttgtagataattgtgttagcttttcagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttgatgtttgagatatgatgaaaatgctccaaggagg 47975406  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  47975407 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataacagtttctaagttaatccaaaacttatggaataatttcaaacatcaaaactagaagtactatgagttc 47975506  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 767  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47975507 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 47975545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 178; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 529 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 11661761 - 11661497
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| |||    
T  11661761 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgacttttattttttgagttatgatggaaatactccaagtagg 11661662  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||    
T  11661661 tcttagtgaaatcttatgaaaattcaacacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagttc 11661562  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttg 794  Q
    |||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  11661561 aattaatgtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacc-ctggggtaggaatggaggttg 11661497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 178; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 529 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 13647898 - 13647633
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13647898 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 13647799  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||  || |||||||||||||||||||||||    
T  13647798 tcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccgtttctaaattaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagtactatgagttc 13647699  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttg 794  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||    
T  13647698 aattaaggtgtttaagattatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatgggggttg 13647633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 176; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 529 - 767
Target Start/End: Original strand, 14191484 - 14191720
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14191484 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgactt--agtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 14191581  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||| |||||    
T  14191582 tcttagtgaaatattatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactataagtactataagttc 14191681  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 767  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14191682 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 14191720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 175; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 533 - 799
Target Start/End: Original strand, 12755106 - 12755371
Alignment:
Q  533 aaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtctt 632  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12755106 aaagttgtagataattttgttagatttccaatggctttggtttgactagaaaatgagttttagattttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtctt 12755205  T
Q  633 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaatt 732  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12755206 ggtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaacccttaaaactagaggtactatgagttcaatt 12755305  T
Q  733 agggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttgttaat 799  Q
    | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || | ||||| |||||||| | |||||||||    
T  12755306 aaggtgtttaagagtatttgacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatgaaagttgttaat 12755371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 175; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 529 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 13408428 - 13408190
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  13408428 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactcgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaattctccaagtagg 13408329  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  || |||||||||||||||||||||||    
T  13408328 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaggctcaaaactagaagtactatgagttc 13408229  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 767  Q
    ||||| | | ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13408228 aattaagttttttaagagtatttaacccatgttgtgagt 13408190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 175; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 529 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 16462692 - 16462454
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16462692 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 16462593  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||     
T  16462592 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcatagctgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagtta 16462493  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 767  Q
    ||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  16462492 aattaaggtgattaacagtatttaacctatgttgtgagt 16462454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 175; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 529 - 763
Target Start/End: Complemental strand, 19282748 - 19282514
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||  | |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19282748 catgaaagttgtagataattgtgttagctttttagtggctttgagttgacttgaaaatgatttttgatttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 19282649  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  19282648 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaaatagaagtactatgagttc 19282549  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 763  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19282548 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 19282514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 173; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Original strand, 12465656 - 12465892
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12465656 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 12465755  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||    
T  12465756 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgacttc 12465855  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12465856 aattaggatgtttaagagtatttaacttatgttgtga 12465892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 173; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Original strand, 13745172 - 13745408
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13745172 catgaaagttttagataattgtgttagctttctagtggctttggtttgacttgaaaatgatatttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 13745271  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  13745272 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcgatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 13745371  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13745372 aattaaggtgtttcagagtatttaacctatgttgtga 13745408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 173; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 529 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 15167631 - 15167403
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  15167631 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatggctttggtttgacttgaaaatgacttttagtttttgagttatgatgaaaatactccaagtagg 15167532  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  |||||||||||| |||||||||    
T  15167531 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataatttcaaacctcgaaactagaagtattatgagttc 15167432  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaaccta 757  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15167431 aattaaggtgtttaagagtatttaaccta 15167403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 173; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 44374602 - 44374366
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||| || |||||| || || |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44374602 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgactttggtttgacatgaaaatgatttttgattcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 44374503  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||    
T  44374502 tcttagtgaaatcttatgaaaattcaacataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccagacctcaaaactagaagtactatgagttc 44374403  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44374402 aaatagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 44374366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 173; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 44383467 - 44383231
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||| || |||||| || || |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44383467 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgactttggtttgacatgaaaatgatttttgattcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 44383368  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||    
T  44383367 tcttagtgaaatcttatgaaaattcaacataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccagacctcaaaactagaagtactatgagttc 44383268  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44383267 aaatagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 44383231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 172; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 529 - 767
Target Start/End: Original strand, 14188690 - 14188926
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14188690 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgactt--agtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 14188787  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||| |||||    
T  14188788 tctttgtgaaatattatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactataagtactattagttc 14188887  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 767  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14188888 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 14188926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 171; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 529 - 799
Target Start/End: Original strand, 832419 - 832688
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  832419 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactcaaaaatgatttttattttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 832518  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||    
T  832519 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaagactcaaaactagaagtaatatgagttc 832618  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttgttaat 799  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||| |||||||| | |||||||||    
T  832619 aattaagatgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatgaaagttgttaat 832688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 171; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 529 - 799
Target Start/End: Original strand, 1197599 - 1197868
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1197599 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactcaaaaatgatttttattttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 1197698  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||    
T  1197699 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaagactcaaaactagaagtaatatgagttc 1197798  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttgttaat 799  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||| |||||||| | |||||||||    
T  1197799 aattaagatgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatgaaagttgttaat 1197868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 171; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 529 - 767
Target Start/End: Original strand, 16550400 - 16550638
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16550400 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgattttttgtatttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 16550499  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||     
T  16550500 tcttagtgaaatcttatgaaaattgagaataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttt 16550599  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 767  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16550600 aattaaagtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 16550638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 171; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 529 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 16615262 - 16615024
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16615262 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgattttttgtatttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 16615163  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||     
T  16615162 tcttagtgaaatcttatgaaaattgagaataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttt 16615063  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 767  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16615062 aattaaagtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 16615024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 169; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 529 - 793
Target Start/End: Complemental strand, 29004478 - 29004214
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  29004478 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcgttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactcaagggagg 29004379  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||   || |||||||||||||||||||||||    
T  29004378 tcctagtgaaatcttatgaaaatttagcataaccgtttccaagttaatcgaaaacttatgggataattccaggactaaaaactagaagtactatgagttc 29004279  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggtt 793  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | || || |||||||| |||||    
T  29004278 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatcctttggttaggaatgaaggtt 29004214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 167; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 529 - 799
Target Start/End: Complemental strand, 4325712 - 4325443
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||| ||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4325712 catgaatgttgtagataattgcgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaataatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaagaagg 4325613  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  4325612 tcttaatgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgcgataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttc 4325513  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttgttaat 799  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||| || | ||||| |||||||||| |||||||||    
T  4325512 aattaaggtgtttaagagtatttaatccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaagttgttaat 4325443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 165; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 12371931 - 12371695
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||  || ||| |||||| | |||||||||||||||||    
T  12371931 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgcgatatggtaaaaatactccaaggagg 12371832  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  12371831 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 12371732  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12371731 aactaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 12371695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 165; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Original strand, 46386483 - 46386719
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||| ||  |||||||||||| ||||||||| || |  ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  46386483 catgaaagttgtagatagttgagttagctttccagtggctttggtttgaagtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatattccaaggagg 46386582  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  46386583 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 46386682  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46386683 aactatggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 46386719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 165; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 533 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 48743955 - 48743727
Alignment:
Q  533 aaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtctt 632  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||    
T  48743955 aaagttttagataattttgttagcttttcaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggagaactt 48743856  T
Q  633 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaatt 732  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||    
T  48743855 agtgaaatcttataaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagatgtactatgagttcaatt 48743756  T
Q  733 agggtgtttaagagtatttaacctatgtt 761  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  48743755 aaggtgtttaggagtatttaacatatgtt 48743727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 529 - 767
Target Start/End: Original strand, 13699285 - 13699523
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13699285 catgaaagctttagataattgtgttagctttccaatggatttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 13699384  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
     ||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||     
T  13699385 ccttagtgaaatcttaggaaaattcagtataaccatttctaagttaatctgaaacttatggaataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttt 13699484  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 767  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13699485 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagt 13699523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 529 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 47094736 - 47094498
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||  || || ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47094736 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttgatttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 47094637  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||| |||    
T  47094636 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagtagtactatgatttc 47094537  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 767  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47094536 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 47094498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 11067124 - 11066888
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||  || || ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11067124 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttgatttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccatggagg 11067025  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||||||||||| |||    
T  11067024 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattgcaaacctcaaaactagaagtactatgatttc 11066925  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11066924 aactagggtgtttaagagtatttaacttatgttgtga 11066888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Original strand, 13147868 - 13148104
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||| ||||| || || ||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13147868 catgaaagttgtagataattgagttagctttccattggatttggtttgacgtgaaaatcattttttgttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 13147967  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||| ||    
T  13147968 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactacaagtattatgagatc 13148067  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13148068 aactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 13148104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 529 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 32771984 - 32771760
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| | |||    
T  32771984 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactcgaaaatgatttttagtttttgagatgtgatgaaaataatccaggtagg 32771885  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||    
T  32771884 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagttc 32771785  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaa 753  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  32771784 aattaaggtgtttaagagtatttaa 32771760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 160; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 529 - 784
Target Start/End: Original strand, 17505400 - 17505655
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  17505400 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactttggtttgacgtgaaaatgatttttggtttttgagttatcatgaaaatactccaaggagg 17505499  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||    
T  17505500 tcttactgaaatcttatgaaaattcagcataaccctttttaagttaatccaaaacttatgggataattccaagactcaaaactagaagtaatatgagttc 17505599  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtagga 784  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||| |||||||    
T  17505600 aattaaggtgtctaagagtatttaacccatgttatgagtagacccttgaggtagga 17505655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 160; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 529 - 784
Target Start/End: Complemental strand, 17547814 - 17547559
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  17547814 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactttggtttgacgtgaaaatgatttttggtttttgagttatcatgaaaatactccaaggagg 17547715  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||    
T  17547714 tcttactgaaatcttatgaaaattcagcataaccctttttaagttaatccaaaacttatgggataattccaagactcaaaactagaagtaatatgagttc 17547615  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtagga 784  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||| |||||||    
T  17547614 aattaaggtgtctaagagtatttaacccatgttatgagtagacccttgaggtagga 17547559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 159; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 529 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 34957827 - 34957589
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  34957827 catgaaagttgtagataattttgttagctttcaaatggctttggtttgactcaaaaatgatttttagtttttgagatatgattaaaatactccaagtagg 34957728  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||   | ||||||||||||| |||||||||    
T  34957727 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaaggtaatccaaaacttatgggataattccaaggatcaaaactagaagtattatgagttc 34957628  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 767  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  34957627 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttatgagt 34957589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 529 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 18607943 - 18607678
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||  |||  ||| |||||||||||||||||||| |||    
T  18607943 catggaagttttagatacttttgtcagctttccaatggctttggtttgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 18607844  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||| ||||||| |    
T  18607843 tcttaaggaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgc 18607744  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttg 794  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  18607743 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttg 18607678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 157; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 529 - 757
Target Start/End: Original strand, 10896390 - 10896618
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||||| |||    
T  10896390 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactttaaaatgatttttagtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 10896489  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||    
T  10896490 tcttagggaaatcttatgaaaattcagcacaaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcgaaactagaagtattatgagttc 10896589  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaaccta 757  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||    
T  10896590 aattaagctgtttaagagtatttaaccta 10896618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 154; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 529 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 14422441 - 14422176
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||||||||  |||  ||| |||||||||||||||||||| |||    
T  14422441 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 14422342  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||| ||||||| |    
T  14422341 tcttagggaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgc 14422242  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttg 794  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||    
T  14422241 aattaaggtgtttaagagcatttaacccatgttgtgaggttacccttggggtaggaatggaggttg 14422176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 154; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 529 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 18872816 - 18872551
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||||||||  |||  ||| |||||||||||||||||||| |||    
T  18872816 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 18872717  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||  || ||||||||||||| ||||||| |    
T  18872716 tcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttgtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgc 18872617  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttg 794  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  18872616 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttg 18872551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 529 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 38828717 - 38828479
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||| | |||||    
T  38828717 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatggaaatactctagggagg 38828618  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||  || |||||||||||||||||||||||    
T  38828617 tcttagtgaaaccttatgaaaattcagcacaactatttctaagttaatccaaaacttatgagacaattccaaggctcaaaactagaagtactatgagttc 38828518  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 767  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  38828517 aattaaggtgtttaagagtatttaacccacgttgtgagt 38828479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 150; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 529 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 16009034 - 16008769
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||  ||||||||||||  |||  ||| |||||||||||||||||||| |||    
T  16009034 catgaaagttgtagataattttgctagctttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 16008935  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||  || ||||||||||||| ||||||| |    
T  16008934 tcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttgtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgc 16008835  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttg 794  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  16008834 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttg 16008769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Original strand, 8851555 - 8851791
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||| |||||| ||||||||| || || ||||||||| ||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8851555 catgaaagttgtagataattgagttaggtttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgagttttggttctggagatatgatgaaaatactccaaggagg 8851654  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||| |||||     
T  8851655 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 8851754  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  8851755 aattaaggggtttaagattatttaacctatgtggtga 8851791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 529 - 761
Target Start/End: Original strand, 32433985 - 32434217
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  | |||  ||||||||||||||| || || ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32433985 catgaaagttgtagataattgagctagtgttccaatggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaag 32434084  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||    
T  32434085 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaaattaatccaaaacttaatgaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 32434184  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 761  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32434185 aactagggtgtttaagagtatttaatctatgtt 32434217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 530 - 790
Target Start/End: Complemental strand, 16999087 - 16998821
Alignment:
Q  530 atgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggt 629  Q
    ||||||||  |||||||||  |||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  16999087 atgaaagtagtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagagatgatgaaaatactccaaggagat 16998988  T
Q  630 cttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagt------actatg 723  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||      || |||    
T  16998987 cttagtgaaatcttaggaaaattcagtataaccttttctatgttaatccaaaacttatagaataattccaaccctcaaaactagaagtaccatcaccatg 16998888  T
Q  724 agttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggag 790  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | |||||||||||||||||    
T  16998887 agttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatggag 16998821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 529 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 148074 - 147809
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| || |||  ||||||| ||||  |||  ||| |||||||||||||||||||| |||    
T  148074 catgaaagttgtagataattctgttagctttacaatggctttggtttgactctaaaatgaattttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 147975  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||| ||||||| |    
T  147974 tcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgc 147875  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttg 794  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  147874 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgaattgacccttggggtaggaatggaggttg 147809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 529 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 14566658 - 14566393
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||||||||  |||  ||| |||||||||||||||||||| |||    
T  14566658 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 14566559  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||  || ||||||||||||| |||||||      
T  14566558 tcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaactggtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgt 14566459  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttg 794  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  14566458 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttg 14566393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 529 - 733
Target Start/End: Original strand, 13864791 - 13864995
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13864791 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggatttgggttgacttaaaaatgatttttagtttttgagatatgaggaaaatactccaaggagg 13864890  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||    
T  13864891 tcttagtgaaatcttagaaaaattcagtacaaccttttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaagtagaagtactatgagttc 13864990  T
Q  729 aatta 733  Q
    |||||    
T  13864991 aatta 13864995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 140; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 20586008 - 20585776
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||  ||||||||| || || ||||||||| ||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20586008 catgaaagttgtagataattgagttagctttcccgtggctttggtttgacgtgaaaatgagttttggttcttgaggtatgatgaaaatactccaaggagg 20585909  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  20585908 t----gtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaattagaagtactatgagttc 20585813  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20585812 aactagggtgtttaagagtatttaacttatgttgtga 20585776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 533 - 761
Target Start/End: Original strand, 14153372 - 14153599
Alignment:
Q  533 aaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtctt 632  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14153372 aaagttgtagataattttgttagctttacaatggctttggtttgacttgaaaataatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtctt 14153471  T
Q  633 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaatt 732  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |   |||||| ||| |||      |||||||||||||||||    
T  14153472 agtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaatttaatccaaaacttatggattgtctccaaa-cttcaaagcctgtgtactatgagttcaatt 14153570  T
Q  733 agggtgtttaagagtatttaacctatgtt 761  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||    
T  14153571 aaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 14153599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 599 - 765
Target Start/End: Original strand, 12127630 - 12127796
Alignment:
Q  599 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattcc 698  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  12127630 ttgagatatgatgaaaatacttcagggaggtattagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaagttaaggaataattcc 12127729  T
Q  699 aaatcttaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12127730 aaacctcaaaactagaagtactatgagttcaaatagggtgtttaagagtatttaacgtatgttgtga 12127796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 605 - 765
Target Start/End: Original strand, 13745672 - 13745832
Alignment:
Q  605 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatct 704  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  13745672 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatagccgtttctaagtcaatccaaaacttattgaataattccaaacct 13745771  T
Q  705 taaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13745772 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 13745832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 533 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 14259004 - 14258772
Alignment:
Q  533 aaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtctt 632  Q
    |||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||  || || |||||||||  |||  || ||||||||||||||||  |||||||| |||||||    
T  14259004 aaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttgctttgacatgaaaatgaactttggttcttgagatatgatgaaaggactccaagtaggtctt 14258905  T
Q  633 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaatt 732  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| ||||    
T  14258904 agtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttcaaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaatt 14258805  T
Q  733 agggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    | || ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  14258804 aaggggtttaagagtatttaacatttgttgtga 14258772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Original strand, 21538585 - 21538820
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  21538585 catgaaagttttagataattttgttagttttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttaaattttgagttatgatgaaaacactccaaggagg 21538684  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||| || ||||||||||| || |  |||||||  | |||||| |  ||||||| |||||    
T  21538685 tcttggtgaaattttatgaaaattccgcataatcatttctaagtcaacccaaaacttatagattgtttccaaacttcaaaacttg-tgtactattagttc 21538783  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21538784 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 21538820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 32301838 - 32301602
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||| |||||| || |||||| || || ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  32301838 catgaaagttgtagataattgagttagttttccagtgactttggtttgacatgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagtagg 32301739  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| |||||||| |||||     
T  32301738 tcttaatgaaattttatgaaaatacagcataaccgtttataagttaatccaaaacttatggaataatttcaaacctcaaaactataagtactaggagttt 32301639  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  32301638 aattaaggggtttaagagtatttaacatgtgttgtga 32301602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 529 - 730
Target Start/End: Original strand, 12323326 - 12323527
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||   |||||||| || || |||||||||| |||  || |||||||||||||||||||||  |||||||    
T  12323326 catgaaagttgtagataattgagttagctttccgggggctttggtttgacgtgaaaatgatatttggttcttgagatatgatgaaaatacttgaaggagg 12323425  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||    
T  12323426 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactaaaagtactatgagttc 12323525  T
Q  729 aa 730  Q
    ||    
T  12323526 aa 12323527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 529 - 710
Target Start/End: Original strand, 29052551 - 29052732
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29052551 catgaaagttgtaggtaattgtgttagctttccagtggttttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 29052650  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaac 710  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  29052651 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaac 29052732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 125; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Original strand, 14928728 - 14928964
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |  | || ||| |||||||||||||  |||  ||| ||||||||||||| | |||||||     
T  14928728 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccaatggcgtcagtttgactagaaaatgatttttggtttacgagttatgatgaaaataatacaaggagt 14928827  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||     
T  14928828 acttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaagactagaagtactaggagttt 14928927  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    |||||  |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  14928928 aattaaagtgtttaaaagtatctaacctatgttgtga 14928964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 125; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 599 - 759
Target Start/End: Original strand, 15119761 - 15119921
Alignment:
Q  599 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattcc 698  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15119761 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttataaatattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattcc 15119860  T
Q  699 aaatcttaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatg 759  Q
    ||| || |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15119861 aaaactcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatg 15119921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 125; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Original strand, 15352194 - 15352430
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |  | || ||| |||||||||||||  |||  ||| ||||||||||||| | |||||||     
T  15352194 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccaatggcgtcagtttgactagaaaatgatttttggtttacgagttatgatgaaaataatacaaggagt 15352293  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||     
T  15352294 acttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaagactagaagtactaggagttt 15352393  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    |||||  |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  15352394 aattaatgtgtttaaaagtatctaacctatgttgtga 15352430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 529 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 15720405 - 15720250
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||  |||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  15720405 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggttttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgaggtatgataaaaatactccaaggagg 15720306  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaact 684  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15720305 tcttagcgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaact 15720250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 16580316 - 16580080
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||| || |||| || | || || |||||||| |||||  |||  ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  16580316 catgaaagttgtagataattgtgttagcttttcagtggcgttagtttgacatgaaaatggtttttggtttaggagttgtgatgaaaatactccaaggagg 16580217  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||||| |||||     
T  16580216 tcttagtgaatttttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 16580117  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||| || |||||| |||||||||| | ||||||||    
T  16580116 aattaaggggtttaacagtatttaacatgtgttgtga 16580080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 529 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 20619942 - 20619714
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||| | |||| ||  | || |||||| |||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20619942 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtagcttcggtgtgacgtgaaaaagatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagtagg 20619843  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| || || ||     
T  20619842 tcttaataaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccataacttatggaataattccaaaactcaaaattagaagtattaggatttt 20619743  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaaccta 757  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  20619742 aattaaggggtttaagagtatttaaccta 20619714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Original strand, 39292133 - 39292368
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| || | |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39292133 catgaaaattttagataattttgttagctttccattgactttggtttgaattgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 39292232  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| |||||||  ||| ||| | ||  ||||||||||||| |  |||||||  | |||||| |  |||||||||||||    
T  39292233 tcttggtgaaattttatgaaaattccgcataactatttttaaatcaactcaaaacttatggattgtttccaaacttcaaaacttg-tgtactatgagttc 39292331  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39292332 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 39292368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 641 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 14273892 - 14273739
Alignment:
Q  641 cttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtt 740  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  14273892 cttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaacccttaaaactagaagtactatgagttcaattaagatgtt 14273793  T
Q  741 taagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttg 794  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||    
T  14273792 taagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatgaaggttg 14273739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 628 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 13894652 - 13894515
Alignment:
Q  628 gtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagtt 727  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  13894652 gtcttagtgaaatcttattaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggatgattccaaagctcaaaactagaagtactatgagtt 13894553  T
Q  728 caattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13894552 caattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 13894515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 608 - 765
Target Start/End: Original strand, 16460407 - 16460564
Alignment:
Q  608 gatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaa 707  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  16460407 gatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaa 16460506  T
Q  708 aactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||| | |||||||| | ||||||||    
T  16460507 aactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaatattatttaacatgtgttgtga 16460564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Original strand, 43277139 - 43277376
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| |||    
T  43277139 catgaaagttgtagataattgtgttagctttcaagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatacttcaagaagg 43277238  T
Q  629 tcttagtgaaatcttat-gaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagtt 727  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||| |||||||  |||||| || ||  ||||||||||||| |   |||||| || |||||||||||||||| |||||    
T  43277239 tcttagtgaaattttatcaaaaattccgcataactatttctaggtcaactcaaaacttatggattgtctccaaacctcaaaactagaagtactaggagtt 43277338  T
Q  728 caattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
     ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43277339 taattaaggggtttaagagtatttaacatatgttgtga 43277376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 109; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Original strand, 24270378 - 24270613
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  |||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24270378 catgaaagttttagataattgtgttagctttcaaatggaattggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagg 24270477  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||| ||||| || | |||||||||||| |   ||||||  | ||| || |  ||| | |||||||    
T  24270478 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttttaagtcaaccgaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtattgtgagttc 24270576  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24270577 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 24270613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 109; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 25942093 - 25941858
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  25942093 catgaaagttttagataattgtgttagctttctagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatgctccaaggagg 25941994  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||| |   |||||| || || ||||| |||||||| |   ||||||  | ||| || |  |||||||||||||    
T  25941993 tcttagtgaaattttatgaaaattctgcatgataatttctaggtcaacccaaatcttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttc 25941895  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25941894 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 25941858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 607 - 765
Target Start/End: Original strand, 16585425 - 16585583
Alignment:
Q  607 tgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatctta 706  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || |    
T  16585425 tgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataatttcaaacctca 16585524  T
Q  707 aaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||| |||||||||| | ||||||||    
T  16585525 aaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaacagtatttaacatgtgttgtga 16585583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Original strand, 18875242 - 18875478
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||| ||||| || || ||||||| ||||||  || |||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  18875242 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggatttggtttgacgtgaaaataatttttggttcttgagatatgataaaaatactccaaggatg 18875341  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||| || |||||||||||| |||| |   |||||| || |||||||||||||  | |||||     
T  18875342 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaatccaaaacttgtggattgtctccaaacctcaaaactagaagtaacaggagttt 18875441  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18875442 aattaaggggtttaagagtatttaacctatgttgtga 18875478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Original strand, 48213341 - 48213576
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| |||||| | ||||||| || |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  48213341 catgaaagttgtagataattgtgttagatttccattcgctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatacttcaaggagg 48213440  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||| ||||| || | |||||||||||| |   |||||| ||| |||  |   |||||||||||||    
T  48213441 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttttaagtcaacctaaaacttatggattgtctccaaa-cttcaaagcatgtgtactatgagttc 48213539  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  48213540 aattaaggtgtttaagaatatttaacctatgttgtga 48213576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 529 - 760
Target Start/End: Original strand, 15978452 - 15978682
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||| || ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  15978452 catgaaagttttagataattgtgttagctttccactgactttggcttgacttgaaaatgatttttagattttgagttatgatgaaaacactccaaggagg 15978551  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||  || |||  |||||||||||  |||||||  ||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||| | |||     
T  15978552 tctcggtaaaactttatgaaaatttcgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggaatgtttccaaacctcaaaactagaagtactaggggtt- 15978650  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgt 760  Q
    ||||| |  ||||||||| | |||||||||||    
T  15978651 aattaagaggtttaagagcacttaacctatgt 15978682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 529 - 759
Target Start/End: Original strand, 9743477 - 9743706
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||   ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  9743477 catgaaagttgtagataattgttttagcttttcagtggctttggtttgacttgaaaatgattttgtctttttaagttatgatgaaaatactccaaggagg 9743576  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||| || || |||||||||||||| |   ||||||  ||||| || |  |||||||||||||    
T  9743577 tcttagtgaaattttatgaaaattcggcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaactttaaagcttg-tgtactatgagttc 9743675  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatg 759  Q
    ||||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  9743676 aattaaggcgtttaagcgtatttaacctatg 9743706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 98; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 757 - 937
Target Start/End: Complemental strand, 11085227 - 11085036
Alignment:
Q  757 atgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttgttaatgattataatgaggttcagagaggatgaataagatgatttatattgatgatt------ 850  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||          
T  11085227 atgttatgagtcgacccttggggtaggaatgaag-ttattaatgattataatgaggttcagagaggatgaataagatgattaatattgatgatttacttt 11085129  T
Q  851 -------aaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaatttgttatatatgaaaattattattgatggttacttg 937  Q
           |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  11085128 gatgattaaatgtgaaactatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaa-ttgttatatatgatgattattattgatggtgacttg 11085036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Original strand, 4691292 - 4691527
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| |||||| |||  | || || |||||||||| ||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  4691292 catgaaagttgtagataattgtgttagatttccagtggagtcggtttgacttgaaaataatttttggtttttgatttatgatgaaaatactccaaggagg 4691391  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||| || |||||||||||||| |   |||||| ||| ||| |    ||||||||||||     
T  4691392 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaa-cttcaaagtttgtgtactatgagtta 4691490  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4691491 aattaaggtgtttaagagtatttaaccaatgttgtga 4691527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 529 - 761
Target Start/End: Original strand, 14161251 - 14161482
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||||| || |||||||||| ||||||  |||||||| | |||| ||||||||||||| |||    
T  14161251 catgaaagttgtagataattgtgttagatttccattggctttggtttgacttgaaaatcatttttggtttttgaggtttgataaaaatactccaagaagg 14161350  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||| || || |||||||||||||| |   ||||||  | ||| || |  |||||||||||||    
T  14161351 tcttagtgaaattttatgaaaattctgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttc 14161449  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 761  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  14161450 aattaaggtgtttaagattatttaacctatgtt 14161482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 95; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 3287646 - 3287417
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  3287646 catgacagttgtagataattgtgttagctttctagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttgatttttgagttatgatgaaaatactccaagaagg 3287547  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||| || || |||||||||||||| |   |||       ||| ||||||||| || |||||     
T  3287546 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctcc-------aaacctagaagtattaggagttt 3287454  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||    
T  3287453 aattaaggggtttaagaatatttaacgtatgttgtga 3287417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 537 - 760
Target Start/End: Original strand, 3192697 - 3192920
Alignment:
Q  537 ttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtg 636  Q
    |||||||||||| |||||| ||| || || |||||| || ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  3192697 ttttagataattgtgttagttttgcagtgtctttggtttgacttgaaaatgatttttagattttgagttatgatgaaaacactccaaggaggtcttggtg 3192796  T
Q  637 aaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaattaggg 736  Q
    |||| |||||||||||  |||||||  ||||||||| || ||||||||||||   |  ||| |||  | ||||||||||||| |||||||| ||||| |     
T  3192797 aaattttatgaaaattgtgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatgatttgtttctaaacttcaaaactagaagtattatgagtttaattaaga 3192896  T
Q  737 tgtttaagagtatttaacctatgt 760  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  3192897 ggtttaagagtatttaacctatgt 3192920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 757 - 954
Target Start/End: Complemental strand, 11092965 - 11092757
Alignment:
Q  757 atgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttgttaatgattataatgaggttcagagaggatgaataagatgatttatattgatgatt------ 850  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||          
T  11092965 atgttatgagtcgacccttggggtaggaatgaag-ttattaatgattataatgaggttcagagagtgtgaataagatgattaatattgatgatttacttt 11092867  T
Q  851 -------aaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaatttgttatatatgaaaattattattgatggttacttgatgtgt 943  Q
           ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||  |    
T  11092866 gatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaaattgtaa-ttgttatatatgatgattattattgatggtgacttgttgcat 11092768  T
Q  944 atgtttaaatg 954  Q
    | |||||||||    
T  11092767 acgtttaaatg 11092757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 88; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 626 - 749
Target Start/End: Original strand, 13918260 - 13918383
Alignment:
Q  626 aggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgag 725  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  || |||||||||||| |||||||    
T  13918260 aggtcatagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagttctatgag 13918359  T
Q  726 ttcaattagggtgtttaagagtat 749  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
T  13918360 ttcaattaaggtgtttaagagtat 13918383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 351 - 625
Target Start/End: Complemental strand, 11310153 - 11309869
Alignment:
Q  351 aagttgtagatatggatgttatctgtccctcgactttggaggtactcgatttaagcacatagaactcaagttatgatcaaattactacacaggggtcag- 449  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| || | |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| || |||||      
T  11310153 aagttgtaggtatagatgttatctgtcactagcctttagaggcactcgatttaagtacatagaactcaagatatgatcaaaatactacagagaggtcaat 11310054  T
Q  450 ---------cacagttgtcctcttttcccgagcataggaaaatctacttttctggaattttttgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagtttt 540  Q
             ||| || || |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||  |||||    || || ||   |||||||||| |    
T  11310053 agagatcaacacggtcgtgctctttccccgagcttaggaaaatcaacttttctggaatttcctgtttcgaattgtcctttggtgtaaacatgaaagttgt 11309954  T
Q  541 agataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaagg 625  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11309953 agataattgtgttagctttccattggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaataccccaagg 11309869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 537 - 764
Target Start/End: Original strand, 18080122 - 18080348
Alignment:
Q  537 ttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtg 636  Q
    |||||||||||| |||||||||| || ||||||||  || |||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18080122 ttttagataattgtgttagctttacagtggctttgatttgacttgaaaatgatttttggtttttgacttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtg 18080221  T
Q  637 aaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatctta-aaactagaagtactatgagttcaattagg 735  Q
    |||| | |||||||||| |||||||  |||||| || || |||||||||||||| |  ||||||| |||| ||||| |  ||||||||| ||| |||| |    
T  18080222 aaatttaatgaaaattccgcataactatttctatgtcaacccaaaacttatggattgtttccaaa-cttagaaacttg-tgtactatgaattcgattaag 18080319  T
Q  736 gtgtttaagagtatttaacctatgttgtg 764  Q
    |||||| || ||||||||  |||||||||    
T  18080320 gtgtttcagggtatttaagttatgttgtg 18080348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 633 - 749
Target Start/End: Original strand, 25926993 - 25927109
Alignment:
Q  633 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaatt 732  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  || |||||||||||| ||||||||||||||    
T  25926993 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagttctatgagttcaatt 25927092  T
Q  733 agggtgtttaagagtat 749  Q
    | |||||||||||||||    
T  25927093 aaggtgtttaagagtat 25927109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 831 - 954
Target Start/End: Original strand, 9320439 - 9320561
Alignment:
Q  831 gatgatttatattgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaatttgttatatatgaaaattattattgatgg 930  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  9320439 gatgatttattttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaa-ttgttatatatgatgattattattgatgg 9320537  T
Q  931 ttacttgatgtgtatgtttaaatg 954  Q
    | ||||| ||  ||||| ||||||    
T  9320538 tgacttgttgcatatgtctaaatg 9320561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 542 - 765
Target Start/End: Original strand, 20252751 - 20252973
Alignment:
Q  542 gataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatc 641  Q
    ||||||| | ||||||||||| ||| ||||| || || ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||     
T  20252751 gataattgtattagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaatgaggtcttagtaaaatt 20252850  T
Q  642 ttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgttt 741  Q
    ||| |||||||| |||||||  ||||||||| || |||||| ||||||| |   |||||| ||| |||      |||||||||||||||||| | |||||    
T  20252851 ttacgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaatttatggattgtctccaaa-cttcaaagcttttgtactatgagttcaattaagatgttt 20252949  T
Q  742 aagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  20252950 aagagtatttaacctatgttgtga 20252973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 529 - 626
Target Start/End: Complemental strand, 13897902 - 13897805
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaagga 626  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13897902 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgattattagtttttgagatatgatgaaaatactccaagga 13897805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 529 - 763
Target Start/End: Original strand, 8563987 - 8564220
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| |  | |  |||| ||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||  ||    
T  8563987 catgaaagttttagataattgtgttagcttttcaatggttttcgtgtgatgtgaagatgatttttagattttaagttatgatgaaaatactccaagtggg 8564086  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||| || |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||  |  |||||||    |||| | |  ||||||||| |||    
T  8564087 tcttggtaaaactttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcaacccaaagctaatggtttgtttccaaactccaaaaattg-tgtactatgatttc 8564185  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 763  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8564186 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 8564220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 533 - 765
Target Start/End: Original strand, 15576233 - 15576462
Alignment:
Q  533 aaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtctt 632  Q
    |||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||| || || ||||||| ||||||  |||||||| ||| || ||||| ||||||| |||| ||    
T  15576233 aaagttgtagataatt--gttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaataatttttggtttttgagttatcataaaaatgctccaagaaggtttt 15576330  T
Q  633 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaatt 732  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||| || |||||||||||||| |   ||||||  | ||| || |   ||||||||||||||||    
T  15576331 agtgaaattttatgaaaattctgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tctactatgagttcaatt 15576429  T
Q  733 agggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    | |||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  15576430 aaggtgtttaagggtatttaacttatgttgtga 15576462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 529 - 761
Target Start/End: Original strand, 8514142 - 8514373
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| |||| | | ||||||| || ||||||||| || ||||   ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  8514142 catgaaagttgtagataattgtgttagatttcgagttgctttggtttgacttgaaaaagaattttgggttttgaattatgatgaaaatactccaaggagg 8514241  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| || ||||||||| |||||||  |||||| || || |||||||||||||| |   |  |||  | ||| || |  |||||||||||||    
T  8514242 tcttagtgaaattttgtgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtcttaaaacttcaaatcttg-tgtactatgagttc 8514340  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 761  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  8514341 aattaaggtgtttaagagtatttaacatatgtt 8514373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 842 - 962
Target Start/End: Complemental strand, 38480368 - 38480249
Alignment:
Q  842 ttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaatttgttatatatgaaaattattattgatggttacttgatgt 941  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||     
T  38480368 ttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaa-ttgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgc 38480270  T
Q  942 gtatgtttaaatgatgatgtc 962  Q
     ||| ||||||||||| ||||    
T  38480269 atatatttaaatgatgttgtc 38480249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 529 - 648
Target Start/End: Original strand, 1856796 - 1856915
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1856796 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacatgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 1856895  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaa 648  Q
    |||||||||| | |||||||    
T  1856896 tcttagtgaatttttatgaa 1856915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 529 - 648
Target Start/End: Original strand, 23664519 - 23664638
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23664519 catgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggctttagtttgactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggagg 23664618  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaa 648  Q
    |||||||||| | |||||||    
T  23664619 tcttagtgaatttttatgaa 23664638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 529 - 760
Target Start/End: Complemental strand, 28720105 - 28719885
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||  ||||||           | ||| ||||| | |    
T  28720105 catgaaagttttagataattttattagctttccaattggtttggtttgacttaaaaatgatttttatattttga-----------attaccccaagcaag 28720017  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||| || |  | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||  ||||||| |||||     
T  28720016 tcttggtaactttttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacttagggaatatttccaaacctcaaaactatgagtactaggagttt 28719917  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgt 760  Q
    ||||| |  |||||| ||||||||||||||||    
T  28719916 aattaagaggtttaaaagtatttaacctatgt 28719885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 529 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 11303843 - 11303724
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || ||| |||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11303843 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttaatttgactcgaaattgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggagg 11303744  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaa 648  Q
    |||||||||| | |||||||    
T  11303743 tcttagtgaatttttatgaa 11303724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 529 - 648
Target Start/End: Original strand, 13917969 - 13918088
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13917969 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacatgaaaatgattattggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 13918068  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaa 648  Q
    |||||||||| | |||||||    
T  13918069 tcttagtgaatttttatgaa 13918088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 529 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 29801025 - 29800906
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || ||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29801025 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttaatttgactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccacggagg 29800926  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaa 648  Q
    |||||||||| | |||||||    
T  29800925 tcttagtgaatttttatgaa 29800906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 529 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 46473714 - 46473562
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| || ||| |||||||| |||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||  ||    
T  46473714 catgaaagttttagataattgtgttagctttccaatagttttggtttgactagaaaatgaattttacatttggaggtatgatgaaaatactccaagcggg 46473615  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaa 681  Q
    ||||||| |||  |||||||||||||||||||   || ||||||||| |||||    
T  46473614 tcttagtaaaactttatgaaaattcagcataattattcctaagttaaaccaaa 46473562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 529 - 648
Target Start/End: Original strand, 16108255 - 16108374
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||| ||||| ||  ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16108255 catgaaagttgtagataattttgttacctttttaatggatttggtttggcttgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggagg 16108354  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaa 648  Q
    |||||||||| | |||||||    
T  16108355 tcttagtgaatttttatgaa 16108374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 529 - 648
Target Start/End: Original strand, 25926696 - 25926815
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||| | || || ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25926696 catgaaagttgtagataattgtgttagctttctagtggctttagtttgacatgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 25926795  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaa 648  Q
    |||||||||| | |||||||    
T  25926796 tcttagtgaatttttatgaa 25926815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 529 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 29797206 - 29797087
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |   || ||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29797206 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctctaatttgactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccacggagg 29797107  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaa 648  Q
    |||||||||| | |||||||    
T  29797106 tcttagtgaatttttatgaa 29797087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 96
Target Start/End: Original strand, 46579839 - 46579915
Alignment:
Q  20 ttttagaatttgagagattagaattaaaagatgaaattgaaagtttcgaattaaggaaaactagtttatgtttcgaa 96  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  46579839 ttttagaatttgagagattagaattaaaagatgaaattgaaagttgagaattaaggaaaactagtttaggtttcgaa 46579915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 529 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 3136947 - 3136721
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||  || ||   ||||||| |||||  ||||||| || | ||||||||||||||| |||    
T  3136947 catgaaagttttagataaatgatttagctttccaatggctttgctttgacc--aaaatgagttttatattttgagttagg-tgaaaatactccaagtagg 3136851  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||| || |||| ||| ||||||| |||||||| ||||| |||| || |||||||||||||  |  |||||||  | |||||| | ||||||| |||||     
T  3136850 tcttggtaaaattttaagaaaattaagcataactgtttccaagtcaacccaaaacttatggtttgtttccaaacatcaaaacttg-agtactaagagttt 3136752  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatg 759  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  3136751 aattaggatgtttaagagtgtttaacctatg 3136721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 656 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 20487972 - 20487863
Alignment:
Q  656 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacc 755  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| | ||| ||||| || |||||| ||||||||||     
T  20487972 cataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactaggagtactaggtgtttaattaaggggtttaacagtatttaaca 20487873  T
Q  756 tatgttgtga 765  Q
    | ||||||||    
T  20487872 tgtgttgtga 20487863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 529 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 32126086 - 32125967
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |  | | ||||||| ||||  |||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32126086 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggagg 32125987  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaa 648  Q
    |||||||||| | |||||||    
T  32125986 tcttagtgaatttttatgaa 32125967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 530 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 41523512 - 41523394
Alignment:
Q  530 atgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggt 629  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |  | | ||||||| ||||  |||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41523512 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggt 41523413  T
Q  630 cttagtgaaatcttatgaa 648  Q
    ||||||||| | |||||||    
T  41523412 cttagtgaatttttatgaa 41523394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 530 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 41525974 - 41525856
Alignment:
Q  530 atgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggt 629  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |  | | ||||||| ||||  |||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41525974 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggt 41525875  T
Q  630 cttagtgaaatcttatgaa 648  Q
    ||||||||| | |||||||    
T  41525874 cttagtgaatttttatgaa 41525856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 795 - 937
Target Start/End: Complemental strand, 15439477 - 15439322
Alignment:
Q  795 ttaatgattataatgaggttcagagaggatgaataagatgattta------------ta--ttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaag 880  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||            ||  |||||||||||||||||||| || ||||   ||||||||    
T  15439477 ttaatgattataatgaggttcagagaggatgactaagatgatttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatactatgtgaaag 15439378  T
Q  881 acgttgatatgaaattgtaatttgttatatatgaaaattattattgatggttacttg 937  Q
      ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15439377 ttgttgatatgaagttgtaatt-gttatatatgaagattattattgatggttacttg 15439322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 633 - 695
Target Start/End: Original strand, 1857092 - 1857154
Alignment:
Q  633 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataat 695  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1857092 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataat 1857154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 11085495 - 11085425
Alignment:
Q  17 aggttttagaatttgagagattagaattaaaagatgaaattgaaagtttcgaattaaggaaaactagttta 87  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||    
T  11085495 aggttttagaatttgagagattagaattaaaagatgaaattgaaaactgagaattaaggaaaactagttta 11085425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 530 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 24702823 - 24702705
Alignment:
Q  530 atgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggt 629  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||  |  | | ||||||| ||||  |||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24702823 atgaaatttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggt 24702724  T
Q  630 cttagtgaaatcttatgaa 648  Q
    ||||||||| | |||||||    
T  24702723 cttagtgaatttttatgaa 24702705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 530 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 24705270 - 24705152
Alignment:
Q  530 atgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggt 629  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||  |  | | ||||||| ||||  |||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24705270 atgaaatttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggt 24705171  T
Q  630 cttagtgaaatcttatgaa 648  Q
    ||||||||| | |||||||    
T  24705170 cttagtgaatttttatgaa 24705152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 529 - 613
Target Start/End: Original strand, 44190645 - 44190729
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaa 613  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  44190645 catgaaagttgtagataattgcgttagcttttcaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaa 44190729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 706 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 15720255 - 15720196
Alignment:
Q  706 aaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15720255 aaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacttatgttgtga 15720196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 529 - 688
Target Start/End: Complemental strand, 37539064 - 37538905
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||| ||| |   ||||||| ||| ||||||| |||||||| |||    
T  37539064 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatgtctttggtttgacttaaaaatgttttgtggattttgagttattatgaaaacactccaagtagg 37538965  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatg 688  Q
    |||| | ||||| ||| | ||| |  |||||||  |||| |||| ||  |||||||||||    
T  37538964 tcttggagaaattttaaggaaacttggcataactatttccaagtcaacacaaaacttatg 37538905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 529 - 593
Target Start/End: Original strand, 14105863 - 14105927
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgattttt 593  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  14105863 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacgtgaaaatgattttt 14105927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 529 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 16066103 - 16065971
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||| |||| || |||||||| || |||| ||||| |||||||  ||||| | ||||||||||| |||||||| |||    
T  16066103 catgaaagtattagataaagttgttagatttctaacggctttggtttgactttaaaataatttttagattttgtgttatgatgaaaacactccaagtagg 16066004  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataac 661  Q
    |||| ||| ||| |||  |||||||||||||||    
T  16066003 tcttggtgcaattttacaaaaattcagcataac 16065971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 533 - 648
Target Start/End: Original strand, 14948693 - 14948808
Alignment:
Q  533 aaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtctt 632  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |  |  | | ||||||| ||||  |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14948693 aaagttgtagataattttgttagccttccaatggctttagtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtctt 14948792  T
Q  633 agtgaaatcttatgaa 648  Q
    |||||| | |||||||    
T  14948793 agtgaatttttatgaa 14948808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 716 - 765
Target Start/End: Original strand, 21675491 - 21675540
Alignment:
Q  716 gtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21675491 gtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 21675540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 529 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 18431307 - 18431188
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||| | || || ||||||||||||||||   |||  | | |||||||||||||||| ||| |||    
T  18431307 catgaaagttgtagataattgtgttatctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgattttcggtttaggtgttatgatgaaaatactcaaagtagg 18431208  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaa 648  Q
    |||||||||| | |||||||    
T  18431207 tcttagtgaatttttatgaa 18431188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 529 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 12191981 - 12191835
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||  ||| |   ||||||| ||| ||  ||| |||||||| |||    
T  12191981 catgaaagttttagataattctgttaactttccattggctttggtttgacttgaaaatattttgtggattttgagttatcatataaacactccaagtagg 12191882  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaa 675  Q
    |||| |   ||| ||| |||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  12191881 tcttggaagaattttacgaaaattcagcataaccacttctaaattaa 12191835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 832 - 901
Target Start/End: Complemental strand, 8468454 - 8468386
Alignment:
Q  832 atgatttatattgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaat 901  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  8468454 atgatttactttgatgattaa-tgtgataatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaat 8468386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 832 - 901
Target Start/End: Original strand, 14270138 - 14270206
Alignment:
Q  832 atgatttatattgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaat 901  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  14270138 atgatttactttgatgattaa-tgtgagaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaat 14270206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 833 - 901
Target Start/End: Original strand, 45847735 - 45847802
Alignment:
Q  833 tgatttatattgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaat 901  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  45847735 tgatttactttgatgattaa-tgtgagaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaat 45847802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 138
Target Start/End: Original strand, 16379147 - 16379230
Alignment:
Q  56 ttgaaagtttcgaattaaggaaaactagtttatgtttc-gaattgagtttctagtcttaaaaagagtggataatacagtaggtt 138  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| |||||||||    
T  16379147 ttgaaagttgagaattgaggaaaactagtttaggtttttgaattgagtttttagttttaaaaagagtggctaatccagtaggtt 16379230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 903 - 962
Target Start/End: Complemental strand, 17232725 - 17232666
Alignment:
Q  903 tgttatatatgaaaattattattgatggttacttgatgtgtatgtttaaatgatgatgtc 962  Q
    ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  17232725 tgttacatatgaagattattaatgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgatgtc 17232666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #139
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 529 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 126055 - 125990
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgattttta 594  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||  |||||| |||||    
T  126055 catgaaagttttagataattgtgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgagtttta 125990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #140
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 529 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 7822103 - 7822038
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgattttta 594  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||  |  ||||||||||||    
T  7822103 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgattttta 7822038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #141
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 529 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 7829414 - 7829349
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgattttta 594  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||  |  ||||||||||||    
T  7829414 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgattttta 7829349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #142
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 529 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 11287066 - 11287001
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgattttta 594  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||  |||  ||||||||||||    
T  11287066 catgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgtcttccaaatgattttta 11287001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #143
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 440 - 537
Target Start/End: Original strand, 16379716 - 16379813
Alignment:
Q  440 caggggtcagcacagttgtcctcttttcccgagcataggaaaatctacttttctggaattttttgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagt 537  Q
    ||||||||||||  || ||||||||| ||| | |||||||||||  | |||||||  | ||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16379716 caggggtcagcagggtcgtcctctttccccaaacataggaaaatgaatttttctgccactttatgttttgaattagatttgggagtcttcatgaaagt 16379813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #144
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 832 - 893
Target Start/End: Complemental strand, 17232648 - 17232588
Alignment:
Q  832 atgatttatattgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaa 893  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17232648 atgatttactttgatgattaa-tgtgagaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaa 17232588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #145
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 529 - 594
Target Start/End: Original strand, 27102531 - 27102596
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgattttta 594  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||  |  ||||||||||||    
T  27102531 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgattttta 27102596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #146
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 529 - 594
Target Start/End: Original strand, 27109879 - 27109944
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgattttta 594  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||  |  ||||||||||||    
T  27109879 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgattttta 27109944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #147
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 529 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 27175795 - 27175730
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgattttta 594  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||  |  ||||||||||||    
T  27175795 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgattttta 27175730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #148
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 529 - 594
Target Start/End: Original strand, 38784623 - 38784688
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgattttta 594  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||  |  ||||||||||||    
T  38784623 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgattttta 38784688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #149
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 529 - 593
Target Start/End: Original strand, 15376280 - 15376344
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgattttt 593  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | || || |||||||||||||||||    
T  15376280 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgattttt 15376344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #150
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 529 - 593
Target Start/End: Original strand, 20384690 - 20384754
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgattttt 593  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | || || |||||||||||||||||    
T  20384690 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgattttt 20384754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #151
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 883 - 962
Target Start/End: Original strand, 9389705 - 9389783
Alignment:
Q  883 gttgatatgaaattgtaatttgttatatatgaaaattattattgatggttacttgatgtgtatgtttaaatgatgatgtc 962  Q
    ||||||||||| ||| |||| | |||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  9389705 gttgatatgaagttgaaatt-gatatacatgaagattattaatgatggttacttgctgtatatgtttaaatgatgttgtc 9389783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #152
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 529 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 16383208 - 16383153
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaa 584  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | || ||||||||    
T  16383208 catgaaagttttagataattttgttagcttttcaatggattttgtttgacttgaaa 16383153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #153
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 529 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 19194807 - 19194764
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgg 572  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  19194807 catgaaagttttagataattttgttagctttccattggatttgg 19194764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #154
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 106 - 224
Target Start/End: Original strand, 11800147 - 11800265
Alignment:
Q  106 tagtcttaaaaagagtggataatacagtaggttgatgaataattattgttataatgatagggtgatcatagggtaatgattagggttatgtttggagagt 205  Q
    |||||||||||||| ||||||||   ||||||| | ||| ||||| ||||  ||||||||||| ||||| | || | ||||||||||  |||||| ||||    
T  11800147 tagtcttaaaaagaatggataatctggtaggttaaagaagaattagtgtttcaatgatagggtaatcatggagtgaagattagggttgagtttggcgagt 11800246  T
Q  206 attggatcgaaaacggagt 224  Q
     | || |||||||||||||    
T  11800247 ttagggtcgaaaacggagt 11800265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #155
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 529 - 619
Target Start/End: Original strand, 15760758 - 15760848
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatact 619  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| || || |  ||||||||||||    |||||||||||| ||| ||||    
T  15760758 catgaaagttataaataattttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 15760848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #156
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 903 - 956
Target Start/End: Complemental strand, 8468524 - 8468471
Alignment:
Q  903 tgttatatatgaaaattattattgatggttacttgatgtgtatgtttaaatgat 956  Q
    ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  8468524 tgttacatatgaagattattaatgatggttacttgttgtatatgtttaaatgat 8468471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #157
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 529 - 594
Target Start/End: Original strand, 10001004 - 10001069
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgattttta 594  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| || || |  ||||||||||||    
T  10001004 catgaaagttgtagataattttgttagctttctaatgactttggtttgacgtccaaatgattttta 10001069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #158
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 529 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 456917 - 456853
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgattttt 593  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | || |  |||||||||||| ||||    
T  456917 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccaatggcgtcggttggacttgaaaatgaatttt 456853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #159
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 529 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 27217456 - 27217392
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgattttt 593  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||| || |||| | || || |||||||||||||||||    
T  27217456 catgaaagttgtagataattgtgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgattttt 27217392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #160
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 529 - 613
Target Start/End: Original strand, 39431624 - 39431707
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaa 613  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| |||| || || |||||| || ||||| |||||||||||   |||||||||||||||||    
T  39431624 catgaaagttgtagataattgtgttaacttttcagtgactttggcttgacttggaaatgattttt-ggttttgagatatgatgaa 39431707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #161
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 706 - 749
Target Start/End: Original strand, 1858646 - 1858689
Alignment:
Q  706 aaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtat 749  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  1858646 aaaactagaagttctacgagttcaattaaggtgtttaagagtat 1858689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #162
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 529 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 21660673 - 21660570
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||| |||| | |||||| ||||| |||||||||||| |||| || || |||||||| ||| |   ||||||| ||||||||||| ||| |||| |||    
T  21660673 catgaaggtttcaaataattatgttatctttccaatggcgttggtttgacatgaaaatgttttgtggattttgagttatgatgaaaacacttcaagtagg 21660574  T
Q  629 tctt 632  Q
    ||||    
T  21660573 tctt 21660570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #163
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 842 - 901
Target Start/End: Original strand, 37727648 - 37727707
Alignment:
Q  842 ttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaat 901  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||  || |||||||| |||||||    
T  37727648 ttgatgattaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaagttgtagatatgaagttgtaat 37727707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #164
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 410 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 7822039 - 7822001
Alignment:
Q  410 tagaactcaagttatgatcaaattactacacaggggtca 448  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7822039 tagaactcgagttatgatcaaattactacacatgggtca 7822001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #165
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 410 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 7829350 - 7829312
Alignment:
Q  410 tagaactcaagttatgatcaaattactacacaggggtca 448  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7829350 tagaactcgagttatgatcaaattactacacatgggtca 7829312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #166
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 410 - 448
Target Start/End: Original strand, 27102595 - 27102633
Alignment:
Q  410 tagaactcaagttatgatcaaattactacacaggggtca 448  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27102595 tagaactcgagttatgatcaaattactacacatgggtca 27102633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #167
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 410 - 448
Target Start/End: Original strand, 27109943 - 27109981
Alignment:
Q  410 tagaactcaagttatgatcaaattactacacaggggtca 448  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27109943 tagaactcgagttatgatcaaattactacacatgggtca 27109981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #168
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 410 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 27175731 - 27175693
Alignment:
Q  410 tagaactcaagttatgatcaaattactacacaggggtca 448  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27175731 tagaactcgagttatgatcaaattactacacatgggtca 27175693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #169
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 410 - 448
Target Start/End: Original strand, 38784687 - 38784725
Alignment:
Q  410 tagaactcaagttatgatcaaattactacacaggggtca 448  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38784687 tagaactcgagttatgatcaaattactacacatgggtca 38784725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #170
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 757 - 794
Target Start/End: Original strand, 11768777 - 11768814
Alignment:
Q  757 atgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttg 794  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11768777 atgttatgagtcgacccttggggtaggaatggaggttg 11768814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 378; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 378; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 1913 - 1361
Alignment:
Q  17 aggttttagaatttgagagattagaattaaaagatgaaattgaaagtttcgaattaaggaaaactagtttatgtttcgaattgagtttctagtcttaaaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1913 aggttttagaatttgagagattagaattaaaagatgaaattgaaagttgagaattaaggtaaactagtttaggtttcgaattgagtttctagtcttaaaa 1814  T
Q  117 agagtggataatacagtaggttgatgaataattattgttataatgatagggtgatcatagggtaatgattagggttatgtttggagagtattggatcgaa 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1813 agagtggataatacagtaggttgatgaataattagtgttataatgataggttgatcatagggtaatgattagggtcatgtttggagagtattggatcgaa 1714  T
Q  217 aacggagtcgaaaagatttccccaaaggcgaaatcgcagctgaactacgattttgctgtcagtgtgcaaaacgcgtttttattgtcgcagtttgacaagt 316  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  1713 aacgtagtcgaaaagatttccctaaaggcggaatcgcagctgaactgcgattttgctgtcagtgtgcaaaaggcgtgtttattgtctcagtttgacaagt 1614  T
Q  317 ttaagtttcaaactgagtttaggtgccttcacgtaagttgtagatatggatgttatctgtccctcgactttggaggtactcgatttaagcacatagaact 416  Q
    ||||||||| |||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||    
T  1613 ttaagtttcgaactggatttaggtaccttcacgaaagttgtagatatagatgttatctgtcactcggctttagaggcactcaatttaagcacatagaact 1514  T
Q  417 caagttatgatcaaattactaca----------caggggtcagcacagttgtcctcttttcccgagcataggaaaatctacttttctggaattttttgtt 506  Q
    |||| ||||||||||||||||||          ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  1513 caagatatgatcaaattactacacaggagtcagcagggatcagcacagtcgtcctcttttcgcgagcataggaaaatcaacttttctggaattttctgtt 1414  T
Q  507 ctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttttagataattttgttagcttt 559  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||    
T  1413 ctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagatatggttgttagcttt 1361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 284; Significance: 1e-159; HSPs: 2)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 533 - 954
Target Start/End: Original strand, 6077 - 6510
Alignment:
Q  533 aaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtctt 632  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6077 aaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttcacttgaaaatgaaatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtctt 6176  T
Q  633 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaatt 732  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  6177 agtgaaatcttataaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaagatcaaaactagaagtactatgagttcaatt 6276  T
Q  733 aggg-tgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttgttaatgattataatgaggttcagagaggatgaataag 831  Q
    |||| | |||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6277 agggttttttaagagtatttaacttatgttgtgagtagacccttggggtaggaa-ggaagttgttaatgattataatgaggttcagagaggatgaataag 6375  T
Q  832 atgatttata-------------ttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaatttgttatatatgaaaat 918  Q
    |||||| |||             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||    
T  6376 atgattaataataatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaa-ttgttatatatgatgat 6474  T
Q  919 tattattgatggttacttgatgtgtatgtttaaatg 954  Q
    ||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||    
T  6475 tattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatg 6510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Original strand, 5109 - 5345
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5109 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttgtttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 5208  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  5209 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 5308  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5309 aactagggtgtttaagagtatttaaactatgttgtga 5345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 282; Significance: 1e-157; HSPs: 119)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 282; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 529 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 36460626 - 36460219
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36460626 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttcacttgaaaatgattttttgtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 36460527  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  36460526 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagtataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttc 36460427  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttgttaatgattataatgaggttcagagaggatgaat 828  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  36460426 aattagggtgtttaagagtatgtaacttatgttgtgagtcgacccttggggttggaat-gaagttgttaatgattataatgaggttcagagaggatgaac 36460328  T
Q  829 aagatgatttata-------------ttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaatttgttatatatgaa 915  Q
    ||||||||| |||             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  36460327 aagatgattaataatgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaa-ttgttatatatgat 36460229  T
Q  916 aattattatt 925  Q
     |||||||||    
T  36460228 gattattatt 36460219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 529 - 962
Target Start/End: Original strand, 21557440 - 21557885
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||  |||| || |||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  21557440 catgaaagttttagataattgtgttagctttctagtggtattggtttgacttgaaaatgatttttggcttttaagatatgatgaaaatactccaaggatg 21557539  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  21557540 tcttagtgaaatcttacgaaaattcagtataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactataagttc 21557639  T
Q  729 aattagggtgttt-aagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttgttaatgattataatgaggttcagagaggatgaa 827  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21557640 aattaaggtgtttaaagagtatttaaactatgttgtgagtcgacccttggggtaggaat-gaatttgttaatgattataatgaggttcagagaggatgaa 21557738  T
Q  828 taagatgatttata-------------ttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaatttgttatatatga 914  Q
    |||||||||| |||             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  21557739 taagatgattaatattgatgttttagtttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaa-ttgttatatatga 21557837  T
Q  915 aaattattattgatggttacttgatgtgtatgtttaaatgatgatgtc 962  Q
      |||||||||||| || ||||| ||  ||||||||||||||| ||||    
T  21557838 tgattattattgatagtgacttgctgcatatgtttaaatgatgttgtc 21557885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 529 - 962
Target Start/End: Original strand, 21554775 - 21555219
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||  |||| || ||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  21554775 catgaaagttttagataattgtgttagctttctagtggtattggtttgacttgaaaatgattttgg-tttttaagatatgatgaaaatactccaagtagg 21554873  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||| ||||||    
T  21554874 tcttagtgaaatcttaggaaaattcagtctaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaacctcaaaactagaagtactacgagttc 21554973  T
Q  729 aattagggtgttt-aagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttgttaatgattataatgaggttcagagaggatgaa 827  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||| ||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21554974 aattaaggtgtttaaagagtatttaacccatgttgtgagtcgacccttgagttaggaat-gaatttgctaatgatgataatgaggttcagagaggatgaa 21555072  T
Q  828 taagatgatttata-------------ttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaatttgttatatatga 914  Q
    |||||||||| |||             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||    
T  21555073 taagatgattaatattgatgttttagtttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgacataaagttgtaa-ttgttatatatga 21555171  T
Q  915 aaattattattgatggttacttgatgtgtatgtttaaatgatgatgtc 962  Q
      ||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||| ||||    
T  21555172 tgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgatgttgtc 21555219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 529 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 18419068 - 18418803
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18419068 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 18418969  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||    
T  18418968 tcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataatcgtttctaaattaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttc 18418869  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttg 794  Q
    |||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||    
T  18418868 aattaaagtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatggaggttg 18418803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 529 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 22412662 - 22412398
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22412662 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatgactttattttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaagtagg 22412563  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  22412562 tcttagtgaaattttatgaaagttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 22412463  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttg 794  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||    
T  22412462 aattaaggtgtttaagagtgtttaacctatgttgtgagttgatc-ttggggtaggaatggaggttg 22412398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Original strand, 32607721 - 32607957
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32607721 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatgtctttggtttgacttgaaaataatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaag 32607820  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  32607821 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagctaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactataagttc 32607920  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32607921 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 32607957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 529 - 799
Target Start/End: Original strand, 24277002 - 24277271
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24277002 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggatttggttttacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 24277101  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||| |||||||||||||||    
T  24277102 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactataagtactatgagttc 24277201  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttgttaat 799  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||| |||||||||| |||||||||    
T  24277202 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaagttgttaat 24277271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 529 - 799
Target Start/End: Complemental strand, 24385211 - 24384942
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24385211 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggatttggttttacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 24385112  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||| |||||||||||||||    
T  24385111 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactataagtactatgagttc 24385012  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttgttaat 799  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||| |||||||||| |||||||||    
T  24385011 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaagttgttaat 24384942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 533 - 794
Target Start/End: Original strand, 30138564 - 30138824
Alignment:
Q  533 aaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtctt 632  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30138564 aaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttattttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtttt 30138663  T
Q  633 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaatt 732  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||    
T  30138664 agtgaac-cttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaacccaaaatttatgggataatttcaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaatt 30138762  T
Q  733 agggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttg 794  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||    
T  30138763 aaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatggaggttg 30138824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 180; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 529 - 956
Target Start/End: Complemental strand, 17875655 - 17875232
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  17875655 catgaaagttgtagataattgagttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgataaaaatactccgaggagg 17875556  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||    
T  17875555 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttccaagttaatccaaaacttatagaataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttc 17875456  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttgttaatga-ttataatgaggttcagagaggatgaa 827  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  | |||||||| || | ||||| || ||||||  ||||||||| | |||||  ||  | |||||||  ||||    
T  17875455 aattaaggtgtttaagagtatttaacccctattgtgagttgatc-ttgggatatgaatggtagttgttaataagttata--gacttacagagagtctgaa 17875359  T
Q  828 taagatgatttat-attgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaatttgttatatatgaaaattattattg 926  Q
    | | |||||| || |||| || ||  |  | || ||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  17875358 tcaaatgattaatgattgttggtt--agtttaagatatttatataatgataaagacgttgatatgaagttctaa-ttgttatatatgatgattattattg 17875262  T
Q  927 atggttacttgatgtgtatgtttaaatgat 956  Q
    ||||| ||||| ||  ||||||||||||||    
T  17875261 atggtgacttgctgcatatgtttaaatgat 17875232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 177; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Original strand, 21399400 - 21399635
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21399400 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatgactttggtttgactt-aaaatgattttcagtttttgagatatgataaaaatactccaaggagg 21399498  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    | |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  21399499 ttttagtgaaattttatgaaaatttagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 21399598  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21399599 aattaaggtgtttaagagtatttaacctattttgtga 21399635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 176; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 529 - 792
Target Start/End: Complemental strand, 6766317 - 6766054
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| | || |||| |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6766317 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacttttgtttgacttaaaaatgatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaag 6766218  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  6766217 tcttggtaaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaaatagaagtactatgagttc 6766118  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggt 792  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||    
T  6766117 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggt 6766054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 175; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 529 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 263513 - 263275
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  263513 catgaaagttatagataattgtgttagctttccgatgactttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatacgccaaggagg 263414  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||||||    
T  263413 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattgcaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 263314  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 767  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  263313 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 263275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 171; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 529 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 17011382 - 17011144
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17011382 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttcagatatgatgaaaatactccaaggagg 17011283  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||    
T  17011282 tcttagtgaaatcttatgaaaatttagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacttcaaaactaaaagtactatgagttc 17011183  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 767  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17011182 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 17011144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 171; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 533 - 799
Target Start/End: Complemental strand, 17813048 - 17812783
Alignment:
Q  533 aaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtctt 632  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17813048 aaagttgtagataatttttttagctttccaatggctttgatttgacttgaaaatgatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtctt 17812949  T
Q  633 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaatt 732  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||||||    
T  17812948 agtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaagggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgaattcaatt 17812849  T
Q  733 agggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttgttaat 799  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||| |||||||| | |||||||||    
T  17812848 aaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatgaaagttgttaat 17812783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 171; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 529 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 29448494 - 29448232
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||| | || |||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29448494 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccggtggctttagtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatattatgaaaatactccaaggagg 29448395  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  29448394 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaacctcaaaactagaagtagtatgagttc 29448295  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggagg 791  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||||||    
T  29448294 aattaagatgtttaagagtatttaacctatgttatgagttgatccttggggtaggaatggagg 29448232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 167; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 529 - 787
Target Start/End: Complemental strand, 31456454 - 31456196
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  |||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31456454 catgaaagttgtagataattgagttaactttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 31456355  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||  ||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||| |||||||||||     
T  31456354 tcttagtgaaatcttgggaaaattaagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaaaaattccaaccctcaaaactagaaatactatgagttt 31456255  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatg 787  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31456254 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatattgtgagtcgacccttggggtaggaatg 31456196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 164; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 529 - 764
Target Start/End: Original strand, 27868971 - 27869206
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27868971 catgaaagttgtagataattctgttagctttccaatggctttggtttgactcgaaaatgatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 27869070  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||    
T  27869071 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaacatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaccatgagttc 27869170  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtg 764  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27869171 aattaaggtgtttgagagtatttaacctatgttgtg 27869206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 20566210 - 20565974
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||  ||| || ||||||||| || || ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20566210 catgaaagttgtagataattgagttaaattttcagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 20566111  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||||||| ||||||||||||    
T  20566110 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaattactatgagttc 20566011  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20566010 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 20565974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 157; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 19921289 - 19921054
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||| |||  |||||||||||| ||| ||||| || || ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||      
T  19921289 catgaaagttgtagatgattgagttagctttccagtgg-tttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaaa 19921191  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19921190 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaaccttaaaactagaagtactatgagttc 19921091  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19921090 aactagggtgtttaagagtatttaacatatgttgtga 19921054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 529 - 761
Target Start/End: Original strand, 20197982 - 20198216
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttg--agatatgatgaaaatactccaagga 626  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||  |||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  20197982 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttttttttttttagatatgatgaaaatactccaagga 20198081  T
Q  627 ggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagt 726  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||||    
T  20198082 ggtcttagtgacattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaacttgaagtactaggagt 20198181  T
Q  727 tcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 761  Q
    | ||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  20198182 ttaattaaggggtataagagtatttaacctatgtt 20198216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 155; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 529 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 26762057 - 26761827
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26762057 catgaaagttgtagataaatgtgttagctttccagtggctttggttttacttgaaactgatttttgatttttgagatatgatgaaaatacttcaaggagg 26761958  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||| | ||||    
T  26761957 tcttagtgaaattttatgaacattcaacataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataactccaaacctcaaaactagaagtactaggggttc 26761858  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatg 759  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26761857 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatg 26761827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 529 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 22750597 - 22750372
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |   ||| |||||||||| | ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| | |    
T  22750597 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcat---gttgacttgaaaataacttttagtttttgagttatgatggaaatactccaagtaag 22750501  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||    
T  22750500 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcgaaactagaagtattatgagttc 22750401  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaaccta 757  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22750400 aattaaggtgtttaagagtatttaaccta 22750372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 150; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 529 - 794
Target Start/End: Original strand, 38145134 - 38145399
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||||||||  |||  ||| |||||||||||||||||||| |||    
T  38145134 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 38145233  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||  || ||||||||||||| || |||| |    
T  38145234 tcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttgtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatacgagtgc 38145333  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttg 794  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  38145334 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttg 38145399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 529 - 759
Target Start/End: Original strand, 8833603 - 8833824
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8833603 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttt--------gagatatgatgaaaatactccaaggagg 8833694  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| | ||||    
T  8833695 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttc 8833794  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatg 759  Q
     |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  8833795 -attaagttgtttaagagtatttaacctatg 8833824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 529 - 762
Target Start/End: Original strand, 41875989 - 41876222
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||| ||  | ||||||||||||||  |||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41875989 catgaaagttgtagataattttgttagatttccaatgactctggtttggcatgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggagg 41876088  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||     
T  41876089 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccgtttctaagttaatccaaatcttagggaataattccaaacctcaaaactaaaagtactatgagtta 41876188  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttg 762  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41876189 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttg 41876222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 145; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 687 - 962
Target Start/End: Original strand, 12122076 - 12122361
Alignment:
Q  687 tggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaat 786  Q
    ||||||||||| ||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||| |||||||    
T  12122076 tggaataattctaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtgtttaacctatgttgtgagttgatc-ttgggataggaat 12122174  T
Q  787 ggaggttgttaatgattataatgaggttcagagaggatgaataagatgatttata-------------ttgatgattaaatgtgaaaatatttatatatt 873  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||             ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12122175 -gaagttgttaatgattataatgaggttcagagaggatgaataagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatatt 12122273  T
Q  874 gtgaaagacgttgatatgaaattgtaatttgttatatatgaaaattattattgatggttacttgatgtgtatgtttaaatgatgatgtc 962  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||  |  ||||||||||||||||||||    
T  12122274 gtgaaagacgttgatatgaagttgtaa-ttgttatatatgatgattattattgatggtgacttgcggcatatgtttaaatgatgatgtc 12122361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 533 - 767
Target Start/End: Original strand, 33472964 - 33473198
Alignment:
Q  533 aaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtctt 632  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || | | ||  | ||||||||||||||  |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33472964 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgactctagtttggcgtgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtctt 33473063  T
Q  633 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaatt 732  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| | ||| ||||    
T  33473064 agtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggtttaatt 33473163  T
Q  733 agggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 767  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33473164 aaggtgtttaagagtatttaacctaagttgtgagt 33473198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 529 - 794
Target Start/End: Original strand, 28370652 - 28370917
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||  ||||||||||||  |||  ||| |||||||||||||||||||| |||    
T  28370652 catgaaagttgtagataattttgttagctttccagtggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 28370751  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||  || ||||||||||||| |||||||      
T  28370752 tcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaactggtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgt 28370851  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttg 794  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  28370852 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttg 28370917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 140; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 529 - 767
Target Start/End: Original strand, 22758286 - 22758525
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttg-agatatgatgaaaatactccaaggag 627  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||  |||||  || ||||||| |||||||| | ||||    
T  22758286 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttagcttgacttgaaaatgatttttggtttttttagttatgatggaaatactctagggag 22758385  T
Q  628 gtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagtt 727  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||| ||||||||||    
T  22758386 gtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagcactatgagtt 22758485  T
Q  728 caattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 767  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| | |||||||||||    
T  22758486 caattaaggtgtttacgagtatttaatccatgttgtgagt 22758525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 529 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 19511843 - 19511614
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||  |||   || ||||||| |||||||||||| |||    
T  19511843 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactttaaaatgatttttggtttagaagttatgatggaaatactccaagtagg 19511744  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatct-taaaactagaagtactatgagtt 727  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||| | ||||| ||    
T  19511743 tcttagtggaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataatttcaaacctcgaaaactagaagcattatgaatt 19511644  T
Q  728 caattagggtgtttaagagtatttaaccta 757  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19511643 caattaaggtgtttaagagtatttaaccta 19511614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 529 - 794
Target Start/End: Original strand, 37598513 - 37598778
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| || |||  ||||||||||||  |||  ||| |||||||||||||||||||| |||    
T  37598513 catgaaagttgtaaataattttgttagatttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 37598612  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||  || |||||||||| || ||||||| |    
T  37598613 tcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttgtgggacaattccaaggctcaaaactagaattaatatgagtgc 37598712  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttg 794  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  37598713 aattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttg 37598778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 529 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 22336976 - 22336748
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||||||||  |||  ||| |||||||||||||||||||| |||    
T  22336976 catggaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 22336877  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||| ||||| |||||||      
T  22336876 tcttagggaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactaaaagtaatatgagtga 22336777  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaaccta 757  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22336776 aattaaggtgtttaagagtatttaaccta 22336748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 551 - 759
Target Start/End: Original strand, 33895300 - 33895508
Alignment:
Q  551 gttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 650  Q
    |||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  33895300 gttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatattgtgaaaa 33895399  T
Q  651 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatt 750  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| || ||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||    
T  33895400 ttcagcataatcgtttctaagttaatccaaaacttatagaataaatccaaacctcaaaactataagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatt 33895499  T
Q  751 taacctatg 759  Q
    |||||||||    
T  33895500 taacctatg 33895508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 529 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 42961033 - 42960767
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  |||||| |||||  |||  ||| |||||||||||||||||||| |||    
T  42961033 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactctaaaatggtttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 42960934  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||| | ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||  || ||||||||||||| ||||||| |    
T  42960933 tcttcgggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttgtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgc 42960834  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcga-ccattggggtaggaatggaggttg 794  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| || || | |||||||||||||||||||    
T  42960833 aattaaggtgcttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttgggggtaggaatggaggttg 42960767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 529 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 22340514 - 22340286
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||||||||  |||  ||| |||||||||||||||||||| |||    
T  22340514 catggaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaagagttatgatgaaaatactccaagtagg 22340415  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||  || ||||||| ||||| |||||||      
T  22340414 tcttagggaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttccaagttaatccaaaacttataggataattccaaggctcaaaactaaaagtaatatgagtga 22340315  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaaccta 757  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22340314 aattaaggtgtttaagagtatttaaccta 22340286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 530 - 765
Target Start/End: Original strand, 36509181 - 36509409
Alignment:
Q  530 atgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggt 629  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| |        ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36509181 atgagagttttagatatttatgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaagg--------tttttgagatatgatgaaaatgctccaaggaggt 36509272  T
Q  630 cttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttca 729  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||| || |||||||||||||||| ||||| |    
T  36509273 cttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacttagagaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagttta 36509372  T
Q  730 att-agggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36509373 attaagggggtttaagagtatttaacctatgttgtga 36509409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 529 - 684
Target Start/End: Original strand, 40917369 - 40917524
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40917369 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactcaaaggagg 40917468  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaact 684  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40917469 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaact 40917524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 16063141 - 16062906
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||| || ||| ||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16063141 catgaaagttgtagataattgtgttagctttacagtggatttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 16063042  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||| || ||||||||||| || |   || |||  | ||| || |  |||||||||||||    
T  16063041 tcttagtgaaattttatgaaaattctgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatagattgtctctaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttc 16062943  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16062942 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 16062906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Original strand, 1627777 - 1628012
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  1627777 catgaaagttttagataattgtgttatctttctagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttaacttttgagttatgatgaaaatactcgaaggagg 1627876  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| |||||||  |||||| || || |||||||||||||| |   ||||||  | ||| || |  |||||||||||||    
T  1627877 tcttaatgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattttctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttc 1627975  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1627976 aattaacgtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 1628012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 109; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Original strand, 16605000 - 16605235
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16605000 catgaaagttttagataattgtgttagctttctagtggctttggtttgacttgaaaatggtttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaagagg 16605099  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||  |||||||||||| |||||||  ||| ||||| || |||||||||||||| |   ||||||  | ||| || |  ||||| |||||||    
T  16605100 tcttagtgaaagtttatgaaaattccgcataactatttataagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactgtgagttc 16605198  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16605199 aattaaagtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 16605235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 18744305 - 18744070
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||  || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18744305 catgaaagttatagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatatttggttcttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 18744206  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| |||||||  |||||| || || |||||||||||||| |   ||||||  | ||| || |  | |||||||||||    
T  18744205 tcttagtgaaattttataaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgcactatgagttc 18744107  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18744106 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 18744070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 530 - 761
Target Start/End: Original strand, 8504266 - 8504496
Alignment:
Q  530 atgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggt 629  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8504266 atgaaagttgtagataattatgttagctttcctgtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggt 8504365  T
Q  630 cttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttca 729  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||| || || |||||||||||||| |   | ||||  | ||| || |  ||||||||| ||||    
T  8504366 cttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtcttcaaacttcaaagcttg-tgtactatgaattca 8504464  T
Q  730 attagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 761  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  8504465 attaaggtgtttaagattatttaacctatgtt 8504496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 103; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 529 - 763
Target Start/End: Original strand, 14026204 - 14026437
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||| || |||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14026204 catgaaagttttagataattatgttatatttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggttcttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 14026303  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| |||||||||| | || ||||  ||||||||| || ||||||| |||||| |   ||||||  | ||| || |  ||||||||||||     
T  14026304 tcttagtgaaattttatgaaaatcccgcctaactatttctaagtcaacccaaaacatatggattgtctccaaacttcaaatcttg-tgtactatgagttg 14026402  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 763  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14026403 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 14026437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 529 - 656
Target Start/End: Original strand, 24617319 - 24617446
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24617319 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 24617418  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagc 656  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24617419 tcttactgaaatcttatgaaaattcagc 24617446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 529 - 656
Target Start/End: Original strand, 24713550 - 24713677
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24713550 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 24713649  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagc 656  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24713650 tcttactgaaatcttatgaaaattcagc 24713677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 529 - 656
Target Start/End: Original strand, 24746578 - 24746705
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24746578 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 24746677  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagc 656  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24746678 tcttactgaaatcttatgaaaattcagc 24746705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 529 - 761
Target Start/End: Original strand, 23199788 - 23200017
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||   ||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23199788 catgaaagttgtagataattgtgttagctttcccatggctttggtttgacttgaaaat---ttttggtttctgagttatgatgaaaatactccaaggagg 23199884  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||| || || |||||||||||||| |   ||||||  | ||| || |  |||||||||||||    
T  23199885 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaaattcaaagcttg-tgtactatgagttc 23199983  T
Q  729 aattagggtgttt-aagagtatttaacctatgtt 761  Q
    |||||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  23199984 aattaaagtgtttgaagagtatttaacctatgtt 23200017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 529 - 656
Target Start/End: Original strand, 24668593 - 24668720
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | || || ||||||||||||||  |||||| | |||||||||| |||||||||||||    
T  24668593 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttttgattgacgtgaaaatgatttttggtttttgggttatgatgaaattactccaaggagg 24668692  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagc 656  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24668693 tcttactgaaatcttatgaaaattcagc 24668720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 529 - 656
Target Start/End: Original strand, 24738362 - 24738489
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | || || ||||||||||||||  |||||| | |||||||||| |||||||||||||    
T  24738362 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttttgattgacgtgaaaatgatttttggtttttgggttatgatgaaattactccaaggagg 24738461  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagc 656  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24738462 tcttactgaaatcttatgaaaattcagc 24738489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 529 - 656
Target Start/End: Original strand, 24751131 - 24751258
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | || || ||||||||||||||  |||||| | |||||||||| |||||||||||||    
T  24751131 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttttgattgacgtgaaaatgatttttggtttttgggttatgatgaaattactccaaggagg 24751230  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagc 656  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24751231 tcttactgaaatcttatgaaaattcagc 24751258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 599 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 22111185 - 22111020
Alignment:
Q  599 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattcc 698  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||| || |||||||||||||| |   |||    
T  22111185 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctcc 22111086  T
Q  699 aaatcttaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    |||  | ||| || |  ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22111085 aaacttcaaagcttg-tgtactgtgagttctattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 22111020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 757 - 962
Target Start/End: Complemental strand, 30615983 - 30615768
Alignment:
Q  757 atgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttgttaatgattataatgaggttcagagaggatgaataagatgatttatattgat---------- 846  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||              
T  30615983 atgttatgagtcgacccatggggtaggaatgaag-ttgttaaggattataatgaggttcagagaggatgaataagatgattaatattgataatttacttt 30615885  T
Q  847 ---gattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaatttgttatatatgaaaattattattgatggttacttgatgtgt 943  Q
       ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  |||  ||||||| ||||||| ||||| ||  |    
T  30615884 tatgattaaatgtgaaaatatt-atatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaa-ttgttataattgatgattattaatgatggtgacttgctgcat 30615787  T
Q  944 atgtttaaatgatgatgtc 962  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  30615786 atgtttaaacgatgatgtc 30615768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 529 - 689
Target Start/End: Complemental strand, 17909123 - 17908963
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  17909123 catgaaagttttagataattatgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatactctaaggagg 17909024  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgg 689  Q
    | ||| | |||  ||| |||||||| ||| ||  || ||||||| || ||||| |||||||    
T  17909023 ttttaataaaactttacgaaaattccgcacaattgtctctaagtcaacccaaaccttatgg 17908963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 529 - 760
Target Start/End: Complemental strand, 28901576 - 28901346
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| || |||| |||||||||| ||  |||||||||||| || || ||| ||||| | |    
T  28901576 catgaaagttttagataattttgttaggtttctaatgactttggtttgacttaaaaatgatttatagattttgagatatggtggaattaccccaagcaag 28901477  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||| || || | ||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||  ||||||| || |||| ||||||||||| |||||     
T  28901476 tcttggtaaatttttatgaaaatt-agcataaccatttataagtaaatccaaaacttgtggaatgtttccaaacctcaaaattagaagtactaggagttt 28901378  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgt 760  Q
    |||||    |||  ||||||||||||||||||    
T  28901377 aattaaaaggttggagagtatttaacctatgt 28901346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 529 - 760
Target Start/End: Complemental strand, 28937971 - 28937741
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| || |||| |||||||||| ||  |||||||||||| || || ||| ||||| | |    
T  28937971 catgaaagttttagataattttgttaggtttctaatgactttggtttgacttaaaaatgatttatagattttgagatatggtggaattaccccaagcaag 28937872  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||| || || | ||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||  ||||||| || |||| ||||||||||| |||||     
T  28937871 tcttggtaaatttttatgaaaatt-agcataaccatttataagtaaatccaaaacttgtggaatgtttccaaacctcaaaattagaagtactaggagttt 28937773  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgt 760  Q
    |||||    |||  ||||||||||||||||||    
T  28937772 aattaaaaggttggagagtatttaacctatgt 28937741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 529 - 639
Target Start/End: Original strand, 43243054 - 43243164
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  43243054 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgattttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaga 43243153  T
Q  629 tcttagtgaaa 639  Q
    ||||| |||||    
T  43243154 tcttaatgaaa 43243164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 529 - 648
Target Start/End: Original strand, 37804469 - 37804588
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| | || ||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37804469 catgaaagttgtagataatgttgttagctttccaatggctttagtttgactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggagg 37804568  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaa 648  Q
    |||||||||| | |||||||    
T  37804569 tcttagtgaatttttatgaa 37804588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 831 - 957
Target Start/End: Complemental strand, 24212510 - 24212385
Alignment:
Q  831 gatgatttatattgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaatttgttatatatgaaaattattattgatgg 930  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  |||| |||||||||    
T  24212510 gatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaa-ttgttatatatgatgattaatattgatgg 24212412  T
Q  931 ttacttgatgtgtatgtttaaatgatg 957  Q
    | ||||| ||  ||||| |||||||||    
T  24212411 tgacttgctgcatatgtctaaatgatg 24212385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 831 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 35852765 - 35852666
Alignment:
Q  831 gatgatttatattgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaatttgttatatatgaaaattattattgatgg 930  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  35852765 gatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaa-ttgttatatacgatgattattattgatgg 35852667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 351 - 538
Target Start/End: Original strand, 25581944 - 25582130
Alignment:
Q  351 aagttgtagatatggatgttatctgtccctcgactttggaggtactcgatttaagcacatagaactcaagttatgatcaaattactacacaggggtcagc 450  Q
    |||||||||||||||||||||  | || || | ||||||||| |||| ||||||| |  ||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  25581944 aagttgtagatatggatgttacatttcactagcctttggagggactctatttaagtatctagaactcaagatatgatgaaaatactacataggggtcagc 25582043  T
Q  451 acagttgtcctcttttcccgagcataggaaaatctacttttctggaattttttgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagtt 538  Q
    |  || |||||||||| || | ||||| |||||| | |||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25582044 agggtcgtcctctttttccaaacatagaaaaatc-aattttctgtcactttatgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagtt 25582130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 798 - 962
Target Start/End: Complemental strand, 31455881 - 31455702
Alignment:
Q  798 atgattataatgaggttcagagaggatgaataagatgatttatattgatg-------------attaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgt 884  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||             |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31455881 atgattataatgaggttcggagaggatgaataagatgattaatattgatgttttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaaaacgt 31455782  T
Q  885 tgatatgaaattgtaatttgttatatatgaaa---attattattgatggttacttgatgtgtatgtttaaatgatgatgtc 962  Q
    ||||||||| |||||| | |||||| |||| |   ||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||| ||||    
T  31455781 tgatatgaagttgtaa-tcgttataaatgatattgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgatgttgtc 31455702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 40 - 446
Target Start/End: Original strand, 25581448 - 25581848
Alignment:
Q  40 gaattaaaagatgaaattgaaagtttcgaattaaggaaaactagtttatgtttc-gaattgagtttct-agtcttaaaaagagtggataatacagtaggt 137  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |  ||||| || |||||| |||||  |||  ||||||||||| | |  | ||||||||||||||||| ||||||||    
T  25581448 gaattaaaagatgaagttgaaagatgagaattgagtaaaacttgtttaactttttgaattgagttttttaaccataaaaagagtggataatccagtaggt 25581547  T
Q  138 tgatgaataattattgttataatgatagggtgatcatagggtaatgattagggttatgtttggagagtattggatcgaaaacggagtcgaaaagatttcc 237  Q
    | |  || ||||| ||||  | |||||| || ||||| |||| | |||||||||   |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||  ||||    
T  25581548 taacaaagaattagtgttcaattgatagtgtaatcatggggtgaagattagggtcgagtttggagagtatacgatcaaaaacggagtcgaaaagggttcc 25581647  T
Q  238 ccaaaggcgaaatcgcagctgaactacgattttgctgtcagtgtgcaaaacgcgtttttattgtcgcagtttgacaagtttaagtttcaaactgagttta 337  Q
    | ||  | |||| ||||||  ||||  ||||||||| |||  |||||       || ||| |||| |||||||||||||||||||| | || || |||||    
T  25581648 cgaa--gtgaaaacgcagcataactgtgattttgctatcaccgtgcat------ttcttactgtctcagtttgacaagtttaagttccgaaatgggttta 25581739  T
Q  338 ggtgccttcacgtaagttgtagatatggatgttatctgtccctcgactttggaggtactcgatttaagcacatagaactcaagttatgatcaaattacta 437  Q
     ||| | ||| | |||||||| ||||||||||||||| || |||| |||||||   |||||||||||||   |||||||| || |||||||||| || ||    
T  25581740 agtgtcatcatgaaagttgtatatatggatgttatctttcactcgcctttggattgactcgatttaagcgtctagaactctagatatgatcaaaatatta 25581839  T
Q  438 cacaggggt 446  Q
    ||| |||||    
T  25581840 cactggggt 25581848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 833 - 962
Target Start/End: Original strand, 5889124 - 5889252
Alignment:
Q  833 tgatttatattgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaatttgttatatatgaaaattattattgatggtt 932  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||  ||||||||| | ||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  5889124 tgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaagttgttgatatgtagttgcaatt-gttatacatgaagattattattgatggtt 5889222  T
Q  933 acttgatgtgtatgtttaaatgatgatgtc 962  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  5889223 acttgctgtatatgtttaaatgatgttgtc 5889252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 842 - 962
Target Start/End: Complemental strand, 31455211 - 31455089
Alignment:
Q  842 ttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaatttgttatatatgaaa---attattattgatggttacttga 938  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| | |||||| |||| |   ||||||||||||||| ||||||    
T  31455211 ttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaaaacgttgatattaagttgtaa-tcgttataaatgatattgattattattgatggtgacttga 31455113  T
Q  939 tgtgtatgtttaaatgatgatgtc 962  Q
    ||  ||||||||||||||| ||||    
T  31455112 tgcatatgtttaaatgatgttgtc 31455089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 115 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 32948721 - 32948402
Alignment:
Q  115 aaagagtggataatacagtaggttgatgaataattattgttataatgatagggtgatcatagggtaatgattagggttatgtttggagagtattggatcg 214  Q
    |||||||||||||| || ||||||||  || ||||| ||||  |||||||| || ||||| |||| | |||||||||    ||||||||||||  ||||     
T  32948721 aaagagtggataatccattaggttgacaaagaattagtgtttgaatgatagtgtaatcatggggtgaagattagggtcgaatttggagagtatatgatca 32948622  T
Q  215 aaaacggagtcgaaaagatttccccaaaggcgaaatcgcagctgaactacgattttgctgtcagtgtgcaaaacgcgttt-ttattgtcgcagtttgaca 313  Q
    |||||  ||| ||||||  ||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||        |||| ||| |||| |  |||||||    
T  32948621 aaaacaaagtagaaaagggttccccaaagt-gaaatcgcagcagaactgcgattttgctgtcactgtgt-------gtttcttactgtctctatttgaca 32948530  T
Q  314 agtttaagtttcaaactgagtttaggtgccttcacgtaagttgtagatatggatgttatctgtccctcgactttggaggtactcgatttaagcacataga 413  Q
    |||||||||| | |||||||||||| || ||||| | ||| |||| ||||||||||||||| || ||  |||||||||  |||  ||||||||   ||||    
T  32948529 agtttaagttccgaactgagtttagatgtcttcatgaaagatgtatatatggatgttatctttcactatactttggagtgactttatttaagcgtctaga 32948430  T
Q  414 actcaagttatgatcaaattactacaca 441  Q
    |||| || |||||||||| |||||||||    
T  32948429 actctagatatgatcaaaatactacaca 32948402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 529 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 31479026 - 31478801
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||  |||| |||||| || |||| ||||  |||||||  ||||||  ||||||||||||||| | || |||    
T  31479026 catgaaagttttagataaagatgttagctttataatgactttggtttgacttaaaaagaatttttagattttgatttatgatgaaaatactac-agtagg 31478928  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||| ||  |||||  |||||  |  ||||||| || |||||| | ||||||| |||||     
T  31478927 tcttggtgaaattttacgaaaattcagcataaccatttttaagtgaactcaaaagctatggtttggttccaaaactcaaaacttg-agtactaggagttt 31478829  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacct 756  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  31478828 aattatgatgtttaagagtatttaacct 31478801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 530 - 648
Target Start/End: Original strand, 10732508 - 10732626
Alignment:
Q  530 atgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggt 629  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |  | | ||||||| ||||  |||  ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  10732508 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatacttcaaggaggt 10732607  T
Q  630 cttagtgaaatcttatgaa 648  Q
    ||||||||| | |||||||    
T  10732608 cttagtgaatttttatgaa 10732626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 333 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 13938669 - 13938457
Alignment:
Q  333 gtttaggtgccttcacgtaagttgtagatatggatgttatctgtccctcgactttggaggtactcgatttaagcacatagaactcaagttatgatcaaat 432  Q
    ||||| ||| ||||| | |||||||||||||| ||||||  | || || |  |||| ||| | | ||||||||||   ||||| |||| ||||||||||     
T  13938669 gtttatgtgtcttcatgaaagttgtagatatgaatgttagatttcactagcatttgtagggattggatttaagcattcagaacgcaagatatgatcaaaa 13938570  T
Q  433 tactacacaggggtcagcacagttgtcctcttttcccgagcataggaaaatctacttttctggaattttttgttctgaattaggtttgggagtcttcatg 532  Q
    ||||||||| |||||||||  || || |||||| ||| ||| |||||||||| || |||||   | ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  13938569 tactacacatgggtcagcaaggtcgtgctctttccccaagcttaggaaaatcaacatttctaccactttctgttccgaattaggtttgggcgtcttcatg 13938470  T
Q  533 aaagttttagata 545  Q
    |||||| ||||||    
T  13938469 aaagttgtagata 13938457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 351 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 32948303 - 32948116
Alignment:
Q  351 aagttgtagatatggatgttatctgtccctcgactttggaggtactcgatttaagcacatagaactcaagttatgatcaaattactacacaggggtcagc 450  Q
    ||||||||||||||||| ||| || || || ||| ||||||| | || ||||||| | ||||||| |||| |||||| ||  |||||||||  |||||||    
T  32948303 aagttgtagatatggattttagctttcactagacgttggaggaaatctatttaagtatatagaacccaagatatgataaagatactacacaaaggtcagc 32948204  T
Q  451 acagttgtcctcttttcccgagcataggaaaatctacttttctggaattttttgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagtt 538  Q
    |  || ||||||||| ||| | |||| ||||||| | |||||||  | ||| ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  32948203 agggtcgtcctctttccccaaacataagaaaatcaatttttctgccactttatgttccgaattaggtttggaagtcttcaagaaagtt 32948116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 530 - 648
Target Start/End: Original strand, 42244933 - 42245051
Alignment:
Q  530 atgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggt 629  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |  | | ||||||| ||||  |||  ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  42244933 atgaaagttgtagataattttattagctttccaatggctttggtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggt 42245032  T
Q  630 cttagtgaaatcttatgaa 648  Q
    ||||||||| | |||||||    
T  42245033 cttagtgaatttttatgaa 42245051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 629 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 30612108 - 30611973
Alignment:
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| |||||||  ||| ||||| || |||||| ||||||| |   ||||||  | |||||| |  ||||||||||||     
T  30612108 tcttagtgaaattttataaaaattccgcataactatttgtaagtcaacccaaaatttatggattgtctccaaaattcaaaacttgt-gtactatgagttg 30612010  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30612009 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 30611973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 629 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 30614068 - 30613933
Alignment:
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||| || |||||||||||||| |   |  |||  | ||| || |  ||||||||||||     
T  30614068 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctttaaaattcaaagcttgt-gtactatgagttg 30613970  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30613969 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 30613933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 621 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 26749677 - 26749538
Alignment:
Q  621 caaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtact 720  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||  ||| || || || |||||| ||||||| |   ||||||  | ||| ||    |||||    
T  26749677 caaggaggtcttagcgaaattttatgaaaattccgcataactatttataggtcaacccaaaatttatggattgtctccaaacttcaaagctttt-gtact 26749579  T
Q  721 atgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 761  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26749578 atgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 26749538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 529 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 29351521 - 29351402
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||| || |||| | || || |||||||||||||||||  ||| |||| |||| | ||| |||| || |||||    
T  29351521 catgaaagttgtagataattgtgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacggagg 29351422  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaa 648  Q
    |||||||||| | |||||||    
T  29351421 tcttagtgaatttttatgaa 29351402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 529 - 619
Target Start/End: Original strand, 22367114 - 22367204
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatact 619  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |  |||||||||||||   |||||||||||| ||| ||||    
T  22367114 catgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttaaaacttgagatatgattaaattact 22367204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 529 - 594
Target Start/End: Original strand, 27183188 - 27183253
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgattttta 594  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||||||||||    
T  27183188 catgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgattttta 27183253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 529 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 29346575 - 29346456
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||||||| || |||| | || || |||||||||||||||||  ||| |||| |||| | ||| |||| || |||||    
T  29346575 catgaaagttgtagataattgcgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacggagg 29346476  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaa 648  Q
    |||||||||| | |||||||    
T  29346475 tcttagtgaatttttatgaa 29346456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 529 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 29349048 - 29348929
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||||||| || |||| | || || |||||||||||||||||  ||| |||| |||| | ||| |||| || |||||    
T  29349048 catgaaagttgtagataattgcgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacggagg 29348949  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaa 648  Q
    |||||||||| | |||||||    
T  29348948 tcttagtgaatttttatgaa 29348929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 842 - 901
Target Start/End: Original strand, 29915177 - 29915235
Alignment:
Q  842 ttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaat 901  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  29915177 ttgatgattaa-tgtgagaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaat 29915235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 832 - 901
Target Start/End: Original strand, 5889269 - 5889337
Alignment:
Q  832 atgatttatattgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaat 901  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  5889269 atgatttactttgatgattaa-tgtgagaatatttatatattgtgaaagatgctgatatgaagttgtaat 5889337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 530 - 619
Target Start/End: Original strand, 21074229 - 21074318
Alignment:
Q  530 atgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatact 619  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || || |  ||||||||||||    |||||||||||| ||| ||||    
T  21074229 atgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcattggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 21074318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 529 - 594
Target Start/End: Original strand, 21933262 - 21933327
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgattttta 594  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||  |  ||||||||||||    
T  21933262 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgattttta 21933327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 529 - 594
Target Start/End: Original strand, 21939432 - 21939497
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgattttta 594  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||  |  ||||||||||||    
T  21939432 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgattttta 21939497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 529 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 35581430 - 35581365
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgattttta 594  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||  |  ||||||||||||    
T  35581430 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgattttta 35581365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 529 - 594
Target Start/End: Original strand, 36990658 - 36990723
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgattttta 594  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||  |  ||||||||||||    
T  36990658 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgattttta 36990723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 529 - 593
Target Start/End: Original strand, 1168811 - 1168875
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgattttt 593  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||  |||  |||||||||||    
T  1168811 catgaaagttttagataattgtgttagctttctaatggctttggtttggcttccaaatgattttt 1168875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 902 - 962
Target Start/End: Original strand, 21741559 - 21741619
Alignment:
Q  902 ttgttatatatgaaaattattattgatggttacttgatgtgtatgtttaaatgatgatgtc 962  Q
    |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  21741559 ttgttatacatgaagattattaatgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttgtc 21741619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 529 - 572
Target Start/End: Original strand, 1220363 - 1220406
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgg 572  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  1220363 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttgg 1220406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 757 - 839
Target Start/End: Original strand, 5889036 - 5889116
Alignment:
Q  757 atgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttgttaatgattataatgaggttcagagaggatgaataagatgattta 839  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||||| || || ||  |||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  5889036 atgttatgagttgacctttggggtaggactgaagctt--taatgattctaatgaggttcagagaggatgattatgatgattta 5889116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 529 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 23065109 - 23065046
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttt 592  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | || || ||||||||||||||||    
T  23065109 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttt 23065046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 529 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 11993 - 11903
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatact 619  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| || || |  ||||||||||||    |||||||||||| ||| ||||    
T  11993 catgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggcattggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 11903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 529 - 619
Target Start/End: Original strand, 18778625 - 18778715
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatact 619  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||| || || |  ||||||||||||    |||||||||||| ||| ||||    
T  18778625 catgaaagttgtagataattttgttagatttctaatggctttggttttacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 18778715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 410 - 448
Target Start/End: Original strand, 21933326 - 21933364
Alignment:
Q  410 tagaactcaagttatgatcaaattactacacaggggtca 448  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21933326 tagaactcgagttatgatcaaattactacacaggggtca 21933364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 410 - 448
Target Start/End: Original strand, 21939496 - 21939534
Alignment:
Q  410 tagaactcaagttatgatcaaattactacacaggggtca 448  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21939496 tagaactcgagttatgatcaaattactacacaggggtca 21939534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 529 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 25426267 - 25426177
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatact 619  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| || || |  ||||||||||||    |||||||||||| ||| ||||    
T  25426267 catgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggcattggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 25426177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 67 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 25791795 - 25791722
Alignment:
Q  67 gaattaaggaaaactagttta--tgtttcgaattgagtttctagtcttaaaaagagtggataatacagtaggtt 138  Q
    ||||| || ||||||||||||  | |||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  25791795 gaattgagaaaaactagtttagttttttctaattgagtttttagtcttaaaaagagtgaataatccagtaggtt 25791722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 529 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 7424967 - 7424902
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgattttta 594  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || || |  ||||||||||||    
T  7424967 catgaaagttgtagataattttattagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgattttta 7424902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 529 - 626
Target Start/End: Complemental strand, 7528518 - 7528421
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaagga 626  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||| || ||||| |||| |||| || |||||||||| || |||  |||||||| ||||| |||||||||| |||||    
T  7528518 catgaaagttttagacaattgagttggcattccattggccttggtttgacttgaaaataatgttttgtttttgagttatgaagaaaatactctaagga 7528421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 529 - 594
Target Start/End: Original strand, 11212713 - 11212778
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgattttta 594  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| || || |  ||||||||||||    
T  11212713 catgaaaattttagataattttgttagctttcttatggctttggtttaacgtccaaatgattttta 11212778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 529 - 594
Target Start/End: Original strand, 22883923 - 22883988
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgattttta 594  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || || |  ||||||||||||    
T  22883923 catgaaagttttaggtaattatgttagctttctaatggctttggtttgacgttcaaatgattttta 22883988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 529 - 594
Target Start/End: Original strand, 43444028 - 43444093
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgattttta 594  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || || |  ||||||||||||    
T  43444028 catgaaagttgtagataactttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgattttta 43444093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 529 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 20909607 - 20909543
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgattttt 593  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||| || |||| | || || |||||||||||||||||    
T  20909607 catgaaagttgtagataattgtgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgattttt 20909543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 529 - 572
Target Start/End: Original strand, 10778811 - 10778854
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgg 572  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  10778811 catgaaacttttagataattttgttagctttctaatggcgttgg 10778854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 529 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 19499518 - 19499475
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgg 572  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  19499518 catgaaagttgtagataattttgttagctttctaatagctttgg 19499475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 24564783 - 24564665
Alignment:
Q  158 aatgatagggtgatcatagggtaatgattagggttatgtttggagagtattggatcgaaaacggagtcgaaaagatttccccaaaggcgaaatcgcagct 257  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| ||||||||     ||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||  ||||||||| |  |||||||||      
T  24564783 aatgatagggtaatcatgggataaagattagggccgattttagagagtatatgatcgaaaacggagtcaaaaagggttccccaaa-gttaaatcgcagaa 24564685  T
Q  258 gaactacgattttgctgtca 277  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  24564684 gaactgcgattttgctgtca 24564665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 24605818 - 24605700
Alignment:
Q  158 aatgatagggtgatcatagggtaatgattagggttatgtttggagagtattggatcgaaaacggagtcgaaaagatttccccaaaggcgaaatcgcagct 257  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| ||||||||     ||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||  ||||||||| |  |||||||||      
T  24605818 aatgatagggtaatcatgggataaagattagggccgattttagagagtatatgatcgaaaacggagtcaaaaagggttccccaaa-gttaaatcgcagaa 24605720  T
Q  258 gaactacgattttgctgtca 277  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  24605719 gaactgcgattttgctgtca 24605700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 529 - 572
Target Start/End: Original strand, 35791744 - 35791787
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgg 572  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  35791744 catgaaagttgtagataattttgttagctttctaatgactttgg 35791787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 529 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 39245731 - 39245668
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttt 592  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | || || |||||||||| |||||    
T  39245731 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaattatttt 39245668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 529 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 39363979 - 39363916
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttt 592  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||  |  | |||||||||||||||||||    
T  39363979 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggtgtcagtttcacttgaaaatgatttt 39363916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 529 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 11342280 - 11342190
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatact 619  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||| || || |  ||||||||||||    |||||||||||| ||| ||||    
T  11342280 catgaaagttgtagataattaagttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 11342190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 384 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 24564570 - 24564504
Alignment:
Q  384 ctttggaggtactcgatttaagcacatagaactcaagttatgatcaaattactacacaggggtcagc 450  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||  ||||| ||||  |||||||||| |||||||||||| |||||    
T  24564570 ctttgaagggactcgatttaagcatctagaattcaatatatgatcaaaatactacacagggatcagc 24564504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 384 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 24605605 - 24605539
Alignment:
Q  384 ctttggaggtactcgatttaagcacatagaactcaagttatgatcaaattactacacaggggtcagc 450  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||  ||||| ||||  |||||||||| |||||||||||| |||||    
T  24605605 ctttgaagggactcgatttaagcatctagaattcaatatatgatcaaaatactacacagggatcagc 24605539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 530 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 32950302 - 32950260
Alignment:
Q  530 atgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgg 572  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  32950302 atgaaagttttagatagttatgttagctttctaatggctttgg 32950260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 410 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 35581366 - 35581328
Alignment:
Q  410 tagaactcaagttatgatcaaattactacacaggggtca 448  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35581366 tagaactcgagttatgatcaaattactacacatgggtca 35581328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 410 - 448
Target Start/End: Original strand, 36990722 - 36990760
Alignment:
Q  410 tagaactcaagttatgatcaaattactacacaggggtca 448  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36990722 tagaactcgagttatgatcaaattactacacatgggtca 36990760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 215 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 13938779 - 13938719
Alignment:
Q  215 aaaacggagtcgaaaagatttccccaaaggcgaaatcgcagctgaactacgattttgctgtc 276  Q
    |||| |||||| |||||  |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  13938779 aaaatggagtctaaaagggttccccaaag-cgaaatcgcagcagaactacgattttgttgtc 13938719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 529 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 23506593 - 23506528
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgattttta 594  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||| || || |  ||||||||||||    
T  23506593 catgaaagttttagataattatgttagttttctaatgactttggtttgacgtccaaatgattttta 23506528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 23909161 - 23909077
Alignment:
Q  54 aattgaaagtttcgaattaaggaaaactagtttatg-tttcgaattgagtttctagtcttaaaaagagtggataatacagtaggtt 138  Q
    ||||||||| |  ||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| | |||||||    
T  23909161 aattgaaagatgggaattgaggaaaactagtttaagtttttgaattgagttt-tagtctttaaaaaagtggataattcggtaggtt 23909077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0599 (Bit Score: 265; Significance: 1e-147; HSPs: 2)
Name: scaffold0599
Description:

Target: scaffold0599; HSP #1
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 529 - 940
Target Start/End: Complemental strand, 653 - 231
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  653 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactttggtttcacttgaaaatgatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaagagg 554  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  553 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagtataaccatttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaagctcaaaactagaagtactttgagttc 454  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttgttaatgattataatgaggttcagagaggatgaat 828  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| |||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  453 aattagggtgtttaagagtatgtaacttatgttttgattcgacccttggggtaggaat-gaagttgttaatgattataattaggttcagagaggatgaat 355  T
Q  829 aagatgatttata-------------ttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaatttgttatatatgaa 915  Q
    ||||||||| |||             |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  354 aagatgattaataatgatgatttactttgatgattatatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaa-ttgttatatatgat 256  T
Q  916 aattattattgatggttacttgatg 940  Q
     ||||||||||||| | ||||||||    
T  255 tattattattgatgttgacttgatg 231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0599; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 831 - 940
Target Start/End: Complemental strand, 4757 - 4649
Alignment:
Q  831 gatgatttatattgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaatttgttatatatgaaaattattattgatgg 930  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||     
T  4757 gatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaa-ttgttatatatgattattattattgatgt 4659  T
Q  931 ttacttgatg 940  Q
    | ||||||||    
T  4658 tgacttgatg 4649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 203; Significance: 1e-110; HSPs: 88)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 17 - 251
Target Start/End: Original strand, 21995741 - 21995975
Alignment:
Q  17 aggttttagaatttgagagattagaattaaaagatgaaattgaaagtttcgaattaaggaaaactagtttatgtttcgaattgagtttctagtcttaaaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21995741 aggttttagaatttgagagattagaattaaaagatgaaattgaaagttgagaattaaggaaaactagtttaggtttcgaattgagtttctagtcttaaaa 21995840  T
Q  117 agagtggataatacagtaggttgatgaataattattgttataatgatagggtgatcatagggtaatgattagggttatgtttggagagtattggatcgaa 216  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  21995841 agagtggatcatacagtaggttgatgaataattagtgttataatgataggttgatcatagggtaatgattagggtcatgtttggagagtattggatcaaa 21995940  T
Q  217 aacggagtcgaaaagatttccccaaaggcgaaatc 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21995941 aacggagtcgaaaagatttccccaaaggcgaaatc 21995975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 529 - 767
Target Start/End: Original strand, 44822518 - 44822756
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44822518 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 44822617  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  44822618 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttccaagttaatccaaaacttacgggataattccaaacctcaaaactagaagtaatatgagttc 44822717  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 767  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44822718 aattaaggggtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 44822756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 529 - 797
Target Start/End: Original strand, 8276388 - 8276655
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8276388 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttggcttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 8276487  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||    
T  8276488 tcttagtaaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgagataattccaaacctcaaaactagaagtactataggttc 8276587  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttgtta 797  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| |||||||||| |||||||    
T  8276588 aattaaggcgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaagttgtta 8276655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 529 - 799
Target Start/End: Original strand, 21180721 - 21180990
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21180721 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggatttggtttgacttgaaaatgaattttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 21180820  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21180821 tcttagtgaaattttatgaaatttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaattcttaaaactagaagtactatgagttc 21180920  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttgttaat 799  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||   ||||| |||||||||| |||||||||    
T  21180921 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga-ttttgggataggaatggaagttgttaat 21180990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 190; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 529 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 28313004 - 28312739
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| |||    
T  28313004 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgacttttagtttttgagttatgatggaaatactccaagtagg 28312905  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  || ||||||||||||| |||||||||    
T  28312904 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaggctcaaaactagaagtaatatgagttc 28312805  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttg 794  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  28312804 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttg 28312739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Original strand, 21239691 - 21239927
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21239691 catgaaagttttagataatttggttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 21239790  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  21239791 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataatcgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 21239890  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  21239891 aattaaggtgtttaagaatttttaacctatgttgtga 21239927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 529 - 799
Target Start/End: Original strand, 24815248 - 24815517
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24815248 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgtctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 24815347  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||  || ||||||||||||| |||||||||    
T  24815348 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccgtttccaagttaatccaaaacttatgggataattctaaggctcaaaactagaagtaatatgagttc 24815447  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttgttaat 799  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||| |||||||||| |||||||||    
T  24815448 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaagttgttaat 24815517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 182; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 529 - 786
Target Start/End: Original strand, 20031286 - 20031543
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  20031286 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgtttttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactcaatggagg 20031385  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  20031386 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaacccttaaaactagaagtactatgagttc 20031485  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaat 786  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| || | ||||| |||||||    
T  20031486 aattaaggtgtttaggagtatttaacccatgttgtgagttgatccttgggttaggaat 20031543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 175; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 529 - 767
Target Start/End: Original strand, 2332606 - 2332844
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| | |||||    
T  2332606 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagttatgatggaaatactctagggagg 2332705  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  2332706 tcttagtgaaaccttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttc 2332805  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 767  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2332806 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagt 2332844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 174; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 529 - 794
Target Start/End: Original strand, 22130461 - 22130726
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| || | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22130461 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggaattggtttgatttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 22130560  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||  || |||||||||||||||||||||||    
T  22130561 tcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataatcttttctaatttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagtactatgagttc 22130660  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttg 794  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  | | |||||||||||||||| ||||    
T  22130661 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagtttatccttggggtaggaatggaagttg 22130726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 172; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 529 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 50001130 - 50000891
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50001130 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccaatggctttagtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 50001031  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatcc-aaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagtt 727  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||    
T  50001030 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaaacttatgagataattcaaaacctcaaaactagaagtactatgagtt 50000931  T
Q  728 caattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 767  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50000930 caattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 50000891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 171; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 529 - 799
Target Start/End: Original strand, 7792248 - 7792517
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| || | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7792248 catgaaagttgtagataattttgttagatttccaatggctttggtttgaattgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 7792347  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||| | |||||||    
T  7792348 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccgtttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatgtgagttc 7792447  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttgttaat 799  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| | || | ||||| |||||||||| |||||||||    
T  7792448 aattaaggtgtttaagagcatttaacccatgttgtgatttgatc-ttgggataggaatggaagttgttaat 7792517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 171; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 529 - 799
Target Start/End: Complemental strand, 16401324 - 16401055
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16401324 catgaaagttttagataattgtgttagctttccaatggctttggtttgactcaaaaatgacttttagtgtttgagatatgatcaaaatactccaaggagg 16401225  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||    
T  16401224 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcaaaatcgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttc 16401125  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttgttaat 799  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || | |||||  |||||||||||||||||||    
T  16401124 aattaaggtgtttaatagtatttaacccatgttttgagttgatc-ttgggacaggaatggaggttgttaat 16401055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 169; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 533 - 765
Target Start/End: Original strand, 41225851 - 41226083
Alignment:
Q  533 aaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtctt 632  Q
    |||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||| || ||  |||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41225851 aaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggattgacgagaaaatgatttttagttcttgagatatgataaaaatactccaaggaggtctt 41225950  T
Q  633 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaatt 732  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |    
T  41225951 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaact 41226050  T
Q  733 agggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41226051 aggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 41226083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 169; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 533 - 765
Target Start/End: Original strand, 41227104 - 41227336
Alignment:
Q  533 aaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtctt 632  Q
    |||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||| || ||  |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41227104 aaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgcgaaaatgattttttgttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtctt 41227203  T
Q  633 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaatt 732  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |    
T  41227204 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaact 41227303  T
Q  733 agggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41227304 aggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 41227336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 169; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 42912706 - 42912470
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42912706 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaagagg 42912607  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  42912606 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactataagttc 42912507  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  42912506 aattagggtgtttaagagtatttaatatatgttgtga 42912470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Original strand, 7052451 - 7052688
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7052451 catgaaagttttagataattttgttaactttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 7052550  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    | |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||     
T  7052551 tattagtgaaattttatgaaaattctgcataaccgtttctaagtcagtccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 7052650  T
Q  729 aatt-agggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7052651 aattaagggggtttaagagtatttaacctatgttgtga 7052688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 529 - 767
Target Start/End: Original strand, 29764030 - 29764272
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| || || ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29764030 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggatttggtttaacatgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 29764129  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaat----cttaaaactagaagtactatga 724  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    || |||||||||||||||||||    
T  29764130 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaattaacctcaaaactagaagtactatga 29764229  T
Q  725 gttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 767  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29764230 gttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 29764272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 165; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 12710544 - 12710308
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| || ||||  ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12710544 catgaaagttttagataattgtgttagctttccagtggcgttggtttgacttacaaatgatttttgatttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 12710445  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  12710444 tcttagtgaaaatttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcaatccgaaacttatggaataactccaaacctcaaaactagaagtattatgagttc 12710345  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12710344 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 12710308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 164; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 530 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 51323930 - 51323695
Alignment:
Q  530 atgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggt 629  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51323930 atgaaagttgtagataattgtgttagatttccagtggctttggtttgacttgaaaatgattttttgtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggt 51323831  T
Q  630 cttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttca 729  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  51323830 cttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaattcaaaacttatggaataactccaaaccttaaaactagaagtactatgagttca 51323731  T
Q  730 attagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51323730 attaaggtgtttaagagtatttaacatatgttgtga 51323695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 529 - 767
Target Start/End: Original strand, 46198121 - 46198359
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||  || |||||| || |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  46198121 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccggtgactttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatacttcaaggagg 46198220  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||||||    
T  46198221 tcttaatgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 46198320  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 767  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  46198321 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatattgtgagt 46198359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 162; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 529 - 794
Target Start/End: Original strand, 13881012 - 13881277
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||||||| || ||| ||||| || ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  13881012 catgaaagttgtagataattgagttagctttacagtggttttggtttgacttggaaatgatttttagtttttgtgatatgatgaaattagtccaaggagg 13881111  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||||| |||||||||    
T  13881112 tcttagtgaaatcttaggaaaattcagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaccctcaaaactaaaagtaatatgagttc 13881211  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttg 794  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||    
T  13881212 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatggaggttg 13881277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 20588335 - 20588099
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||    ||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  20588335 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttggtgtgaaaatcatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaagaga 20588236  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  20588235 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 20588136  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20588135 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 20588099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 20592873 - 20592637
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||    ||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  20592873 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttggtgtgaaaatcatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaagaga 20592774  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  20592773 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 20592674  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20592673 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 20592637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 160; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 532 - 767
Target Start/End: Original strand, 38057050 - 38057285
Alignment:
Q  532 gaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtct 631  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | || ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  38057050 gaaagttttagataattttgttagctttctagtggctttcgtttaacttgcaaattatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaagggggtat 38057149  T
Q  632 tagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaat 731  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  38057150 tagtgaaatcttatgaaaattcagtataaccatttctaagttaatacaaaacttatgggattattccaaacctcaaaactagaagtactatgagtacaat 38057249  T
Q  732 tagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 767  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38057250 taaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 38057285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 529 - 794
Target Start/End: Original strand, 20437623 - 20437888
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||  ||||||||||||  |||  ||| |||||||||||||||||||| |||    
T  20437623 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggatttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 20437722  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| |    
T  20437723 tcttagggaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggcttaaaactagaagtaatatgagtgc 20437822  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttg 794  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||    
T  20437823 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgaggttacccttggggtaggaatggaggttg 20437888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Original strand, 38887483 - 38887720
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  38887483 catgaaagttgtagataattttgttagctttcgaatggctttggtttgatttgaaaatgatttttgatttttgaggtatgatgaaaatactccaaagagg 38887582  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||| || |||||||||||||||| |||||     
T  38887583 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacttagagaataattacaaaactcaaaactagaagtactaggagttt 38887682  T
Q  729 aatt-agggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38887683 aattaagggggtttaagagtatttaacctatgttgtga 38887720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 157; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Original strand, 4596241 - 4596477
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4596241 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 4596340  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||||| |||  ||||    
T  4596341 tcttagtgaaatcttatgaaaattcaacataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtaatataggttc 4596440  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4596441 aactagggtgcttaagagtatttaacctatgttgtga 4596477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 157; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Original strand, 16058710 - 16058946
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||  || ||  |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16058710 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttgatttgacgagaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 16058809  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  16058810 ttttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaatttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 16058909  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  16058910 aactagggtgtttaagattatttaagctatgttgtga 16058946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 157; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 19676367 - 19676131
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||| ||| | |  || ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19676367 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttagttggacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 19676268  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  19676267 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 19676168  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  19676167 aactagggtgtttaagagtatttaatatatgttgtga 19676131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 157; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Original strand, 21046445 - 21046681
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||| |||||| ||||||||| || |  ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  21046445 catgaaagttgtagataattgagttaggtttccagtggctttggtttgatgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaataatccaaagagg 21046544  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  21046545 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgggttc 21046644  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21046645 aattagggtgtttaagtgtatttaacctatgttgtga 21046681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 155; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 529 - 799
Target Start/End: Complemental strand, 22350244 - 22349975
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    ||||||| || ||||||| |  |||||||||||| ||||||||| || |||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22350244 catgaaatttgtagataactgagttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatcatttctagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 22350145  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||    
T  22350144 tcttagtgaaatcttaggaaaattcagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaccctcaaaactagaagtactacgagttc 22350045  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttgttaat 799  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||  |||||| |||| || | ||||| |||||||||| |||||||||    
T  22350044 aattaaggtgtttaagagtattcaactcatgttgagagttgatc-ttgggataggaatggaagttgttaat 22349975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 529 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 297011 - 296773
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  297011 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactcgaaaatgatatttgatttaggagttatgatgaaaatactccaaggagg 296912  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||    
T  296911 tcttagcgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaaattaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaccatgagttc 296812  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 767  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| | |||||||||||    
T  296811 aattaaggtgtttacgagtatttaatccatgttgtgagt 296773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 147; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 529 - 755
Target Start/End: Original strand, 23194947 - 23195173
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| ||||| | |||||| |||||| |||||||||| | ||||    
T  23194947 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactttggtttaacttgaaaatgacttttagtgtttgagttatgataaaaatactcctaagagg 23195046  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||    
T  23195047 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccctttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctccaaactagaagtaccatgagttc 23195146  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacc 755  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  23195147 aattaaggtgtttgagagtatttaacc 23195173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 45496602 - 45496365
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |||| | || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45496602 catgaaaattttagataattgtgttagctttctaatgactttagttttacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 45496503  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||  |||||||||||||| ||||||     
T  45496502 tcttggtgaaattttatgaaaactcagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacttagggaataatttcaaacctccaaactagaagtactctgagttt 45496403  T
Q  729 aatt-agggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  45496402 aattaaggggatttaagagtatttaacctatgttgtga 45496365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 529 - 787
Target Start/End: Original strand, 45574448 - 45574695
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45574448 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 45574547  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||| |||||||           ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||  || |||||||||||| ||||||||||    
T  45574548 tcttggtgaaat-----------tcagcataaccgtttctaaattaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagtgctatgagttc 45574636  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatg 787  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| || | ||||||||||||||    
T  45574637 aattaaggtgtttaagcgtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatg 45574695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 540 - 765
Target Start/End: Original strand, 14238019 - 14238244
Alignment:
Q  540 tagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaa 639  Q
    ||||||||| |||||||||| || |||| | || || |||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14238019 tagataattgtgttagcttttcagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttagtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaa 14238118  T
Q  640 tcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgt 739  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  14238119 ttttatgaaaattcagcataactgtttctgagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaagactagaagtactaggagtttaattaaggtgt 14238218  T
Q  740 ttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    |||||||||| |||||||||||||||    
T  14238219 ttaagagtatctaacctatgttgtga 14238244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Original strand, 20634030 - 20634267
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20634030 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 20634129  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||   |||||||| |||| || |||||||||||||||| |||||     
T  20634130 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctatgtcaatccaaaacttggagaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 20634229  T
Q  729 aatt-agggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    |||| || | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20634230 aattaagagggtttaagagtatttaacctatgttgtga 20634267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 137; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 533 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 51082868 - 51082636
Alignment:
Q  533 aaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtctt 632  Q
    |||||| ||||||||| | ||| ||||||| |||| | || || |||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  51082868 aaagttgtagataattgtattatctttccagtggcgtaggtttgacttgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtctt 51082769  T
Q  633 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaatt 732  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||| ||||| ||||    
T  51082768 agtgaaattttaagaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaagactagaagtactaggagtttaatt 51082669  T
Q  733 agggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  51082668 aaggtgtttaagagtatctaacctatgttgtga 51082636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 50544507 - 50544272
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||   ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50544507 catgaaagttgtagataattgtgttagctttcgggtggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 50544408  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    | |||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||| || |||||||||||||| |   ||||||| | ||| || |  |||||||||||||    
T  50544407 ttttagtgaaattttatgaaaattcggcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaatttcaaagcttg-tgtactatgagttc 50544309  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50544308 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 50544272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 529 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 16372407 - 16372178
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||  |||  ||| |||||||||||||||||||| |||    
T  16372407 catggaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 16372308  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatct-taaaactagaagtactatgagtt 727  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||  |||| || ||||| |||||||     
T  16372307 tcttagggaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctacaaaaataaaagtaatatgagtg 16372208  T
Q  728 caattagggtgtttaagagtatttaaccta 757  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16372207 aaattaaggtgtttaagagtatttaaccta 16372178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 125; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Original strand, 22823803 - 22824038
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22823803 catgaaagttttagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttcaaaataatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 22823902  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||| || |||||||||||||| |   ||||||  | |||||| |  |||||||||||||    
T  22823903 tcttggtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaaacttg-tgtactatgagttc 22824001  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22824002 aattaaggtgtttaagattatttaacctatgttgtga 22824038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 529 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 1643249 - 1643020
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | || |||||||  ||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  1643249 catgaaagttttagataattgtgttaactttccaatggctttagtttgacttgaa--tgatttttggtttttgagttatgatgaaaatacgccaaggagg 1643152  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||| || || |||||||||||||| |   ||||||  | |||||| |  |||||||||||||    
T  1643151 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctatgtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaaacttg-tgtactatgagttc 1643053  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 761  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1643052 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 1643020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 39060752 - 39060516
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaa-tggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggag 627  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39060752 catgaaagttttagataattgtgttagctttccaagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggag 39060653  T
Q  628 gtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagtt 727  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  | |||||  ||||||||| || |||||||||||||| |   || |||    ||| || |  ||||||||||||    
T  39060652 gtcttagtgaaattttatgaaaatttcgtataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctctaaactccaaagcttg-tgtactatgagtt 39060554  T
Q  728 caattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39060553 caattaagatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 39060516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 109; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Original strand, 17902158 - 17902393
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||  ||||  || ||||||||||||||||||||| ||    
T  17902158 catgaaagttttagataattgtgttagctttccagtggctttggcttgacttgaaaatgatttttggttttcaagttatgatgaaaatactccaaggtgg 17902257  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||  |||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||| || |||||||||||||| |   ||||||  || |||  |   |||||||||||||    
T  17902258 tcttgatgaaattttatgaaaattctgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaa-attcaaagcatgtgtactatgagttc 17902356  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17902357 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 17902393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 757 - 913
Target Start/End: Complemental strand, 51327058 - 51326904
Alignment:
Q  757 atgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttgttaatgattataatgaggttcagagaggatgaataagatgatttatattgatgattaaatgt 856  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  51327058 atgttatgagtcgacccttggggtagggatgaag-ttgttaatgattataatgaggttcaaagaggatgaataagatgattaatattgatgattaaatgt 51326960  T
Q  857 gaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaatttgttatatatg 913  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  51326959 gaacatatttatatattatgaaagacgttgatatgaagttgtaa-ttgttatatatg 51326904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 529 - 761
Target Start/End: Original strand, 14792958 - 14793189
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| || |||||| ||||||||||||| || |||||| |  |||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14792958 catgaaagttgtacataattgtgttagctttccagtgactttggttggacttgaaaatgatttttggttttagagttatgatgaaaatactccaaggagg 14793057  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| |||||||||||  |||||||  |||||| || || |||||||||||||| |   ||||||  | ||| || |  |||||||||||||    
T  14793058 tcttagtgaaattttatgaaaatttcgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttc 14793156  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 761  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14793157 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 14793189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 98; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 529 - 762
Target Start/End: Original strand, 24720090 - 24720322
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||| || |||||    
T  24720090 catgaaagttgtagataattgagttagccttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggttttttagttatgatgaaaatacttcatggagg 24720189  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||| || |||||||||||||| |   ||||||  | ||| || |  | |||||||||||    
T  24720190 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgcactatgagttc 24720288  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttg 762  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24720289 agttaaggtgtttaagagtatttaacctatgttg 24720322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 93; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 529 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 44892103 - 44891873
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||     
T  44892103 catgaaagttgtagataattttgttagatttcccgtggctttggtttgccttgaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatactctaaggaga 44892004  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||| || || |||||| ||||||| |   ||||||  | ||| || | | |||||||||| |    
T  44892003 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaatttatggattgtctccaaacttcaaatcttgta-tactatgagtac 44891905  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 761  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  44891904 aattaaggtgtttaagagta-ttaacctatgtt 44891873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 88; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 529 - 644
Target Start/End: Complemental strand, 21659800 - 21659685
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21659800 catgaaagtcttagataattttgttagctttccaatggcttcggtttggcatgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 21659701  T
Q  629 tcttagtgaaatctta 644  Q
    ||||||||||||||||    
T  21659700 tcttagtgaaatctta 21659685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 606 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 294624 - 294454
Alignment:
Q  606 atgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaactta---------tggaataatt 696  Q
    |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||         ||| ||||||    
T  294624 atgatggaaatactccaagtatgtcttagtgaaatcttatgaaaatttagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattgggataatt 294525  T
Q  697 ccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 767  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  294524 ccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagagtatttaatccatgttgtgagt 294454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 6833870 - 6833635
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| ||||   ||| ||||| || | |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6833870 catgaaagttttagataactctgttagatttctggtggatttggttttaattgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 6833771  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| |||||||||||  | |||||  ||||||||| || |||||||||||||| |   ||||||| | ||| || |   |||| |||||||    
T  6833770 tcttagtgaaattttatgaaaatttcgaataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaatttcaaagcttg-tttactgtgagttc 6833672  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||| || | |||||||||| |||||||||||||||    
T  6833671 aattaaggagcttaagagtatataacctatgttgtga 6833635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 18121260 - 18121025
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||| | ||| ||||| |  |||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18121260 catgaaagttgtagataattgagttagctttctagtggatttggttggacttgaaaatgatttttggttcttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 18121161  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| |||||||||||  ||||||   |||||| || || |||||||||||||| |   |||||| ||| |||      | ||||||| |||    
T  18121160 tcttagtgaaattttatgaaaatttcgcataattatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaa-cttcaaagcctgtgcactatgaattc 18121062  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18121061 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 18121025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 529 - 688
Target Start/End: Original strand, 9784739 - 9784898
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||     
T  9784739 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggttttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatacttcaaggaga 9784838  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatg 688  Q
    |||| ||||||| |||| |||||||  ||||||  | || |||| || ||||||||||||    
T  9784839 tcttggtgaaattttataaaaattccacataactatctccaagtcaacccaaaacttatg 9784898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 529 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 13227459 - 13227340
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  13227459 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatgactttggttttacttgaaaatgatttttagcttttgagatatgatggaaatactccaagtagg 13227360  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaa 648  Q
    |||||||||| | |||||||    
T  13227359 tcttagtgaatttttatgaa 13227340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 529 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 29535647 - 29535528
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  29535647 catgaaaattttagataattttgttagctttccaatggctttggttttacttgaaaatgatttttagcttttgagatatgatggaaatactccaagtagg 29535548  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaa 648  Q
    |||||||||| | |||||||    
T  29535547 tcttagtgaatttttatgaa 29535528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 757 - 944
Target Start/End: Original strand, 12328479 - 12328677
Alignment:
Q  757 atgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttgttaatgattataatgaggttcagagaggatgaataagatgatttatattga----------- 845  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||               
T  12328479 atgttatgagtcgacccttggggtatgaatgaag-ttgttaaagattataatgaggtgctgagaggatgaataagatgattaatattgatgatttacttt 12328577  T
Q  846 --tgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaatttgttatatatgaaaattattattgatggttacttgatgtgt 943  Q
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  12328578 gatgattaaatttgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagatgtaa-ttgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgtgt 12328676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 529 - 760
Target Start/End: Complemental strand, 16656023 - 16655793
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| || |||| |||||||||| ||  |||||||||||| || || ||| ||||| | |    
T  16656023 catgaaagttttagataattttgttaggtttctaatgactttggtttgacttaaaaatgatttatagattttgagatatggtggaattaccccaagcaag 16655924  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||| || || | ||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||  ||||||| || |||| ||||||||||| |||||     
T  16655923 tcttggtaaatttttatgaaaatt-agcataaccatttataagtaaatccaaaacttgtggaatgtttccaaacctcaaaattagaagtactaggagttt 16655825  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgt 760  Q
    |||||    |||  ||||||||||||||||||    
T  16655824 aattaaaaggttggagagtatttaacctatgt 16655793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 831 - 954
Target Start/End: Original strand, 51274298 - 51274420
Alignment:
Q  831 gatgatttatattgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaatttgttatatatgaaaattattattgatgg 930  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  51274298 gatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaa-ttgttatataagatgattattattgatgg 51274396  T
Q  931 ttacttgatgtgtatgtttaaatg 954  Q
    | ||||||||  ||||||||||||    
T  51274397 tgacttgatgcatatgtttaaatg 51274420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 831 - 902
Target Start/End: Complemental strand, 8885539 - 8885468
Alignment:
Q  831 gatgatttatattgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaatt 902  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8885539 gatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaatt 8885468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 530 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 16362513 - 16362395
Alignment:
Q  530 atgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggt 629  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  | | ||||||||||||  |||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16362513 atgaaagttgtagataatttcgttagctttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggt 16362414  T
Q  630 cttagtgaaatcttatgaa 648  Q
    ||||||||| | |||||||    
T  16362413 cttagtgaatttttatgaa 16362395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 530 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 21841361 - 21841243
Alignment:
Q  530 atgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggt 629  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | | ||||||| ||||  |||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21841361 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgaattttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggt 21841262  T
Q  630 cttagtgaaatcttatgaa 648  Q
    ||||||||| | |||||||    
T  21841261 cttagtgaatttttatgaa 21841243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 530 - 648
Target Start/End: Original strand, 21922859 - 21922977
Alignment:
Q  530 atgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggt 629  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | | ||||||| ||||  |||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21922859 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggt 21922958  T
Q  630 cttagtgaaatcttatgaa 648  Q
    ||||||||| | |||||||    
T  21922959 cttagtgaatttttatgaa 21922977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 833 - 962
Target Start/End: Original strand, 28194397 - 28194525
Alignment:
Q  833 tgatttatattgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaatttgttatatatgaaaattattattgatggtt 932  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||  ||||||||| | ||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28194397 tgatttacgttgatgattaaatgtgaaaaaatctatataatgtgaaagttgttgatatgtagttgcaaat-gttatatatgaagattattattgatggtt 28194495  T
Q  933 acttgatgtgtatgtttaaatgatgatgtc 962  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  28194496 acttgctgtatatgtttaaatgatgttgtc 28194525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 530 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 41373066 - 41372948
Alignment:
Q  530 atgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggt 629  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  | | ||||||| ||||  |||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41373066 atgaaagttgtagataattttgttagatttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggt 41372967  T
Q  630 cttagtgaaatcttatgaa 648  Q
    ||||||||| | |||||||    
T  41372966 cttagtgaatttttatgaa 41372948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 529 - 640
Target Start/End: Original strand, 10812765 - 10812876
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||  ||||||||| ||||||||||||| || |||||| || ||||  |||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10812765 catgaaagtcgtagataattgtgttagctttccagtgcctttggtttgacttagaaatgatttttggtctttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 10812864  T
Q  629 tcttagtgaaat 640  Q
    |||||| |||||    
T  10812865 tcttagcgaaat 10812876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 833 - 962
Target Start/End: Complemental strand, 43697546 - 43697418
Alignment:
Q  833 tgatttatattgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaatttgttatatatgaaaattattattgatggtt 932  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||  ||||||||| | ||| || | |||||||||||| |||||||||| |||||    
T  43697546 tgatttaagttgatgattaaatgtgaaaagatctatatagtgtgaaagttgttgatatggagttgcaaat-gttatatatgaagattattattgttggtt 43697448  T
Q  933 acttgatgtgtatgtttaaatgatgatgtc 962  Q
    ||||| ||| |||||||| |||||| ||||    
T  43697447 acttgctgtatatgtttatatgatgctgtc 43697418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 530 - 638
Target Start/End: Original strand, 23593301 - 23593409
Alignment:
Q  530 atgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggt 629  Q
    ||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||    | ||||||||||||  |||  ||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  23593301 atgaaagtcgtagataatttagttatctttccaatggctttggtttggagtaaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaattactccaaggaggt 23593400  T
Q  630 cttagtgaa 638  Q
    |||||||||    
T  23593401 cttagtgaa 23593409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 883 - 962
Target Start/End: Complemental strand, 20636961 - 20636883
Alignment:
Q  883 gttgatatgaaattgtaatttgttatatatgaaaattattattgatggttacttgatgtgtatgtttaaatgatgatgtc 962  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  20636961 gttgacatgaagttgtaatt-gttatacatgaatattattattgatggttacttgctgtatatgtttaaatgatgttgtc 20636883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 832 - 901
Target Start/End: Original strand, 28194543 - 28194611
Alignment:
Q  832 atgatttatattgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaat 901  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  28194543 atgatttactttgatgattaa-tgtgagaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaat 28194611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 832 - 901
Target Start/End: Complemental strand, 43543137 - 43543069
Alignment:
Q  832 atgatttatattgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaat 901  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  43543137 atgatttactttgatgattaa-tgtgagaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaat 43543069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 883 - 956
Target Start/End: Complemental strand, 49261452 - 49261380
Alignment:
Q  883 gttgatatgaaattgtaatttgttatatatgaaaattattattgatggttacttgatgtgtatgtttaaatgat 956  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  49261452 gttgatatgaagttgtaatt-gttatacatgaagattattattgatggttacttgttatatatgtttaaatgat 49261380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 529 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 17003999 - 17003934
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgattttta 594  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||  |  ||||||||||||    
T  17003999 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgattttta 17003934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 529 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 13989461 - 13989397
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgattttt 593  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | || || |||||||||||||||||    
T  13989461 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgattttt 13989397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 529 - 619
Target Start/End: Original strand, 18060594 - 18060684
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatact 619  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || || |  |||||||||| ||   |||||||||||| ||| ||||    
T  18060594 catgaaagttttaggtaattatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgattttaaaaacttgagatatgattaaattact 18060684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 529 - 595
Target Start/End: Original strand, 21650889 - 21650955
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaa 595  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| || || |  |||||||||||||    
T  21650889 catgaaagttttaggtaattttgttagctttctaatggccttggtttgacgtccaaatgatttttaa 21650955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 797 - 839
Target Start/End: Complemental strand, 43697596 - 43697554
Alignment:
Q  797 aatgattataatgaggttcagagaggatgaataagatgattta 839  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43697596 aatgattttaatgaggttcagagaggatgattaagatgattta 43697554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 419 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 21496004 - 21495968
Alignment:
Q  419 agttatgatcaaattactacacaggggtcagcacagt 455  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21496004 agttatgatcaaattactacacagaggtcagcacagt 21495968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 529 - 577
Target Start/End: Original strand, 38055971 - 38056019
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttca 577  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||    
T  38055971 catgaaagttttagataattttgttagccttctaatggcgttggtttca 38056019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 536 - 615
Target Start/End: Original strand, 20708726 - 20708805
Alignment:
Q  536 gttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaa 615  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||| |||| || |||| |||||| ||| |   ||||||| |||||||||||    
T  20708726 gttttagataattttgctatctttccaatggcgttggtttgacttaaaaatgttttgtggattttgagttatgatgaaaa 20708805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 110 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 15544220 - 15544090
Alignment:
Q  110 cttaaaaagagtggataatacagtaggttgatgaataattattgttataatgatagggtgatcatagggtaatgattagggttatgtttggagagtattg 209  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||| |  || ||||| ||||  | ||||||||| ||||| |||| | ||||| ||    |||||||||||||      
T  15544220 cttaaaaagagtggataatctggtaggttaacaaagaattagtgtttgattgatagggtaatcatggggtgaagattatggccgagtttggagagtatat 15544121  T
Q  210 gatcgaaaacggagtcgaaaagatttcccca 240  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  15544120 gatctaaaacggagtcgaaaagggttcccca 15544090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 410 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 17003935 - 17003897
Alignment:
Q  410 tagaactcaagttatgatcaaattactacacaggggtca 448  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17003935 tagaactcgagttatgatcaaattactacacatgggtca 17003897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 529 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 22366617 - 22366527
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatact 619  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| |||||| || || |  ||||||||||||    |||||||||||| ||| ||||    
T  22366617 catgaaagttgtagaaaattttgttagctttctaatgactttggtttgacatcgaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 22366527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 410 - 448
Target Start/End: Original strand, 38056036 - 38056074
Alignment:
Q  410 tagaactcaagttatgatcaaattactacacaggggtca 448  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38056036 tagaactcgagttatgatcaaattactacacatgggtca 38056074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 863 - 901
Target Start/End: Complemental strand, 48301121 - 48301083
Alignment:
Q  863 atttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaat 901  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  48301121 atttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaat 48301083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 529 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 21858682 - 21858617
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgattttta 594  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| || || |  ||||||||||||    
T  21858682 catgaaagttttagatagttatgttagctttctaacggctttggtttgacgtccaaatgattttta 21858617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 832 - 901
Target Start/End: Complemental strand, 43697400 - 43697332
Alignment:
Q  832 atgatttatattgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaat 901  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  43697400 atgatttactttgatgattaa-tgtgagattattgatatattgtgaaagatgctgatatgaagttgtaat 43697332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 833 - 901
Target Start/End: Original strand, 46382652 - 46382717
Alignment:
Q  833 tgatttatattgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaat 901  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  46382652 tgatttactttgatgattaa-tgtgagaatatttata--ttgtgaaagatgttgatatgaagttgtaat 46382717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0328 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0328
Description:

Target: scaffold0328; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 529 - 799
Target Start/End: Original strand, 19040 - 19309
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  19040 catgaaagttttagataattttgttagctttacaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactacaaggaga 19139  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  19140 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 19239  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttgttaat 799  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||| |||||||||| |||||||||    
T  19240 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaagttgttaat 19309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 198; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 529 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 16229 - 15964
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16229 catgaaagttttagataactttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttattttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 16130  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||| |||||| |||||    
T  16129 tcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaaatactataagttc 16030  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttg 794  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||    
T  16029 aattaaggtgtttaatagtatttaacctatgttgtgagtttatccttggggtaggaatggaggttg 15964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 193; Significance: 1e-104; HSPs: 2)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Original strand, 28764 - 29000
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28764 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 28863  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  28864 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttc 28963  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28964 aattaaggtgtttaaaagtatttaacctatgttgtga 29000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 529 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 10091 - 9996
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaag 624  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10091 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgattttggtttgactcgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaag 9996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0337 (Bit Score: 190; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0337
Description:

Target: scaffold0337; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 529 - 794
Target Start/End: Original strand, 9352 - 9617
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9352 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactggaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaagtagg 9451  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||| ||||||| |    
T  9452 tcttagtgaaatcttatgataattcagcacaaccgtttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtac 9551  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttg 794  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  9552 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttg 9617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0290 (Bit Score: 190; Significance: 1e-102; HSPs: 2)
Name: scaffold0290
Description:

Target: scaffold0290; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 529 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 649 - 384
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  649 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatggttttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaaaagg 550  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||    
T  549 tcttagtgaaatcttgtgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttc 450  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttg 794  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||| || | |||||||||||||||||||||    
T  449 aattaaggtgtttaagagcatttaacccgtgttgtgagttgatccttggggtaggaatggaggttg 384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0290; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 40 - 128
Target Start/End: Original strand, 11953 - 12041
Alignment:
Q  40 gaattaaaagatgaaattgaaagtttcgaattaaggaaaactagtttatgtttc-gaattgagtttctagtcttaaaaagagtggataat 128  Q
    ||||||||||||||| ||||| | |  ||| | ||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  11953 gaattaaaagatgaagttgaatgatgagaaatgaggaaaactagtttaggtttttgaattgagttt-tagttttaaaaagagtggataat 12041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 498 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 12656 - 12360
Alignment:
Q  498 ttttttgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatt 597  Q
    ||||||||| |||||| | ||| || ||  ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  12656 ttttttgttttgaatttgctttcggtgtaatcatgaaagttgtagataattgagttagctttccaatggctttggtttcacttgaaaatgatttttagtt 12557  T
Q  598 tttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattc 697  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12556 tttgagatatgaagaaaatagtccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattc 12457  T
Q  698 caaatcttaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttg 794  Q
    |||  || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||| || | ||||||||||||||| |||||    
T  12456 caaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagagtatttaacccattttgtgagttgatccttggggtaggaatgggggttg 12360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 4)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 540 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 105557 - 105304
Alignment:
Q  540 tagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaa 639  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  105557 tagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatatttagtttttgagatatgatgaaaatacaccaaggaggtctaagtgaaa 105458  T
Q  640 tcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgt 739  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  105457 ttttatgaaaattcagcataacagtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaaactcaaaactagaagtactatgagttcaattaaagtgt 105358  T
Q  740 ttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttg 794  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||    
T  105357 ttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc-ttggggtaggaatggaggttg 105304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 529 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 162940 - 162702
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  162940 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggatttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttaagatatgatgaaaatactccaagaagg 162841  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  162840 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacatatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttc 162741  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 767  Q
    ||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  162740 aattaaggtgtttaagagtatttaattcatgttgtgagt 162702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 529 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 95006 - 94942
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgattttt 593  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | || || |||||||||||||||||    
T  95006 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgattttt 94942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 529 - 559
Target Start/End: Original strand, 154871 - 154901
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagcttt 559  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  154871 catgaaagttttagataattttgttagcttt 154901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 529 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 672 - 408
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  672 catgaaagttgtagataattgagttagctttccaatggctttggtttcacttgaaaatgatttttagttttttagatatgatgaaaatagtccaaggagg 573  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  || |||||||||||||||||||||||    
T  572 tcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagtactatgagttc 473  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttg 794  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||    
T  472 aattaaggtg-ttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334 (Bit Score: 185; Significance: 1e-99; HSPs: 2)
Name: scaffold0334
Description:

Target: scaffold0334; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 1741 - 1505
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1741 catgaaagttttagataattttgttagctttacaatggctttggtttaacttgaaaatgatttttagtttttgagatgtgatgaaaatactccaaggagg 1642  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  1641 tcttagtgaaatcttatgaaaattcggcataaccaattctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaacaagaagtactatgagttc 1542  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1541 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 1505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 529 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 172 - 1
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  172 catgaaagttttagataattttgttatctttccaatggctttggtttaactggaaaatgatttttagtttttgagatgtgatgaaaatactccaaggagg 73  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaa 700  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  72 tcttagtgaaatcttatgaaaattcggcataaccaattctatgttaatccaaaacttatgggataattccaa 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 185; Significance: 1e-99; HSPs: 2)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 21389 - 21153
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21389 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttggaaatgatttctagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 21290  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  21289 tcttagtgaaatcttaagaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattttaattctcaaaactagaagtactatgagttc 21190  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21189 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 21153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 529 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 41347 - 41282
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgattttta 594  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| || ||||  |||| |||||||    
T  41347 catgaaagttttagataattatgttagatttctaatggctttggcttgacttccaaattattttta 41282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 183; Significance: 2e-98; HSPs: 4)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 529 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 21737 - 21499
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21737 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttaacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 21638  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  21637 tcttagtgaaatcttatgaaaatccagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 21538  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 767  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21537 aattaaggtgtttaagagtatttcacctatgttgtgagt 21499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 529 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 111143 - 110878
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||||||||  |||  ||| |||||||||||||||||||| |||    
T  111143 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 111044  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||  || ||||||||||||| ||||||| |    
T  111043 tcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttgtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgc 110944  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttg 794  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  110943 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttg 110878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 146388 - 146152
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  ||| |||||||| ||||||||| || || |||||| |||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||     
T  146388 catgaaagttgtagataattgagtttgctttccagtggctttggtttgacgtgaaaaggatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaga 146289  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  146288 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagaataacagtttctaagttaatccaaaacatatgtaataattcaaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 146189  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  146188 aattaggatgtttaagagtatttaatctatgttgtga 146152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 529 - 755
Target Start/End: Original strand, 123956 - 124182
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || ||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  123956 catgaaagttgtagataattttgttagcattccaatggctttgaattgacatgaaaataatttttggtttttgagatattatgaaaatactccaatgagg 124055  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||||||    
T  124056 tgttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagtgaatccaaaacttatgggataatttcaaagctcaaaactagaagtactatgagttc 124155  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacc 755  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  124156 aattaaggtgtttaagaatatttaacc 124182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0630 (Bit Score: 181; Significance: 3e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0630
Description:

Target: scaffold0630; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 529 - 797
Target Start/End: Complemental strand, 8720 - 8453
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  8720 catgaaagttgtagataattatgttagctttccagtggctttggtttcacttgaaaatgatttttggtgtttgatatatgatgaaaatactccaaggaag 8621  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||    
T  8620 tcttggtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactacaagtactatgagttc 8521  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttgtta 797  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||| | |||||||    
T  8520 aattaagatgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttga-tattgggataggaatgaaagttgtta 8453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 181; Significance: 3e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 529 - 797
Target Start/End: Complemental strand, 6455 - 6188
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  6455 catgaaagttttagataattttgttagctttgcaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaaaactccaagtagg 6356  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  6355 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttttgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttc 6256  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttgtta 797  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||| || | ||||| |||||||||| |||||||    
T  6255 aattaaggtgtttaagagtttttaatccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaagttgtta 6188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 181; Significance: 3e-97; HSPs: 4)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Original strand, 14982 - 15218
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||| || || ||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14982 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgacaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 15081  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  15082 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatctaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 15181  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15182 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 15218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Original strand, 24040 - 24276
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||| || || ||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24040 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgacaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 24139  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  24140 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatctaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 24239  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24240 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 24276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 833 - 893
Target Start/End: Original strand, 15439 - 15499
Alignment:
Q  833 tgatttatattgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaa 893  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  15439 tgatttaagttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaaaatgttgatatgaa 15499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061; HSP #4
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 833 - 893
Target Start/End: Original strand, 24497 - 24557
Alignment:
Q  833 tgatttatattgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaa 893  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  24497 tgatttaagttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaaaatgttgatatgaa 24557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 179; Significance: 4e-96; HSPs: 3)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 529 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 13602 - 13364
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13602 catgaaagttttagatatttttgttagctttccaatggatttggtttgacttgaaaatgattttaaatttttgaaatatgatgaaaatactccaaggagg 13503  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||| || || |||||||||||||||||||||||    
T  13502 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacatatgagataattcccaacctcaaaactagaagtactatgagttc 13403  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 767  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13402 aattaagttgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 13364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 530 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 16419 - 16182
Alignment:
Q  530 atgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggt 629  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  16419 atgaaagttttagatacttttgctagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgcgatatgatgaaaatactttaaggaggt 16320  T
Q  630 cttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttca 729  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||  || || ||||||||||||||||||||||||    
T  16319 cttagtgaaatcttatgaatattcagcataatcatttctaagttaatccaaaacttatgggataattctcaacctcaaaactagaagtactatgagttca 16220  T
Q  730 attagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 767  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16219 atgaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 16182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 539 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 8882 - 8688
Alignment:
Q  539 ttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaa 638  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8882 ttagatatttttgttagctttccaatggttttggtttgacttgaaaatgattttaaatttttgaaatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaa 8783  T
Q  639 atcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaatta 733  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8782 atcttgtgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacatatgagataattcccaacctcaaaactagaagtactatgagttcaatta 8688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 178; Significance: 2e-95; HSPs: 3)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 529 - 782
Target Start/End: Original strand, 3338 - 3591
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  3338 catgaaagttgtcaataattgtgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgattttttctgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaga 3437  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  3438 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 3537  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtag 782  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||    
T  3538 aattaaggtgtttaatagtatttaacctatgttgtgagttggcccttggggtag 3591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 529 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 75 - 1
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgag 603  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  75 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttaatttttgag 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 529 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 8656 - 8591
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgattttta 594  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||  | ||||||||||    
T  8656 catgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacttctagatgattttta 8591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1283 (Bit Score: 177; Significance: 7e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold1283
Description:

Target: scaffold1283; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Original strand, 863 - 1099
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||| |||||| ||||||||| || || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  863 catgaaagttgtagataattgagttagatttccagtggctttggattgacgtgaaaatgatttttagttcttgagatatgatgaaaatactccaaagagg 962  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  963 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattcaaaacctcaaaactagaagtattatgagttc 1062  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1063 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 1099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 177; Significance: 7e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 39755 - 39519
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39755 catgaaagttttagataatttttttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 39656  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||| |||    
T  39655 gcttagtgaaatcttatgaaaattcaggataatcgtttctatgttaatccaaaacttatggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgatttc 39556  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39555 aattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 39519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0607 (Bit Score: 175; Significance: 1e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0607
Description:

Target: scaffold0607; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 529 - 799
Target Start/End: Complemental strand, 3362 - 3093
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | || ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3362 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatgacttttgtttgacttgaaaatgatattttgtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 3263  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||    
T  3262 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgagataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttc 3163  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttgttaat 799  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||| |||||| |||| || | ||||| || ||||||| |||||||||    
T  3162 aattaagatgtttaagagtatttaacccatgttgcgagttgatc-ttgggatatgaatggaagttgttaat 3093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0515 (Bit Score: 174; Significance: 4e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0515
Description:

Target: scaffold0515; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 529 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 4690 - 4448
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4690 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 4591  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaat----cttaaaactagaagtactatga 724  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    || |||||||||||||||||||    
T  4590 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaattaacctcaaaactagaagtactatga 4491  T
Q  725 gttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 767  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4490 gttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 4448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306 (Bit Score: 174; Significance: 4e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0306
Description:

Target: scaffold0306; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 529 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 4690 - 4448
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4690 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 4591  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaat----cttaaaactagaagtactatga 724  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    || |||||||||||||||||||    
T  4590 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaattaacctcaaaactagaagtactatga 4491  T
Q  725 gttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 767  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4490 gttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 4448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 174; Significance: 4e-93; HSPs: 5)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 533 - 786
Target Start/End: Original strand, 152610 - 152863
Alignment:
Q  533 aaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtctt 632  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  152610 aaagttgtagataattttgttagctttccaatggttttggtttgacttgaaaatgatatttattttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtctt 152709  T
Q  633 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaatt 732  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  152710 agtgaaattttatgaaaattcagcaaaactgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaacccttaaaactagaagtactatgagttcaatt 152809  T
Q  733 agggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaat 786  Q
    | ||||||||||||||||||| | ||||||| ||| || | ||||| |||||||    
T  152810 aaggtgtttaagagtatttaatccatgttgtaagttgatccttgggttaggaat 152863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 529 - 797
Target Start/End: Complemental strand, 77343 - 77076
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||  || || || |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  77343 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttgatttgacgtggaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 77244  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  77243 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataagcgtttctaagttaattcaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtacaatgagttc 77144  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttgtta 797  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || | ||||| ||||||| || |||||||    
T  77143 aattaaggtgtttaagattatttaacctatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatagaagttgtta 77076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 529 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 176448 - 176210
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| || || ||||||| || |||  |||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  176448 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactctggtttgacgtgaaaataatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggagg 176349  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| | ||||    
T  176348 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttc 176249  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 767  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  176248 aattaaggtgtttaagagtatttaacctaagttgtgagt 176210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 529 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 169095 - 168857
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| || || ||||||| || |||  |||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  169095 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactctggtttgacgtgaaaataatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggagg 168996  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| | ||||    
T  168995 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttc 168896  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 767  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  168895 aattaaggagtttaagagtatttaacctaagttgtgagt 168857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #5
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 842 - 901
Target Start/End: Complemental strand, 77019 - 76962
Alignment:
Q  842 ttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaat 901  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  77019 ttgatgattaaatgtgaaaat--ttatatattgtgaaagatgtggatatgaagttgtaat 76962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 173; Significance: 2e-92; HSPs: 4)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 529 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 26582 - 26358
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  26582 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactagaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaggtagg 26483  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  26482 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaagctcaaaactagaagtaatatgagttc 26383  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaa 753  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  26382 aattaaggtgtttaagagtatttaa 26358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 529 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 27964 - 27740
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  27964 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactagaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaggtagg 27865  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  27864 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaagctcaaaactagaagtaatatgagttc 27765  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaa 753  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  27764 aattaaggtgtttaagagtatttaa 27740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 7875 - 7639
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || |  |||||| ||| |||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  7875 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgatgtgaaaaagatatttggtttttgagttatgatgaaaatactccaagaagg 7776  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||     
T  7775 tctttgtgtaattttatgaaaattcagcataattgtttgtaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 7676  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7675 agttaaggggtttaagagtatttaacctatgttgtga 7639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 14506 - 14270
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || |  |||||| ||| |||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  14506 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgatgtgaaaaagatatttggtttttgagttatgatgaaaatactccaagaagg 14407  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||     
T  14406 tctttgtgtaattttatgaaaattcagcataattgtttgtaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 14307  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14306 agttaaggggtttaagagtatttaacctatgttgtga 14270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 171; Significance: 3e-91; HSPs: 3)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 529 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 2994 - 2757
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2994 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggatttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttaagatatgatgaaaatactccaaggagg 2895  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| || |||||||||| ||||| ||||||    
T  2894 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatcc-aagcttatgggataattccaaagctcaaaactagaaatactacgagttc 2796  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 767  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  2795 aattaaggtgtttaagagtatttaatccatgttgtgagt 2757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Original strand, 373 - 609
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | || || ||||||||| |  ||||  |||  ||| |||| |||||||||||||||||||    
T  373 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcatcggtttgacttgaaaaagtattttggtttaggagttatgttgaaaatactccaaggagg 472  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||     
T  473 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactcgaagtactaggagttt 572  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  573 aattaaggtgtttaagagtatctaacctatgttgtga 609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #3
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 540 - 765
Target Start/End: Original strand, 5687 - 5912
Alignment:
Q  540 tagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaa 639  Q
    ||||||||| |||||| ||| || |||| | || || |||||||||||||||||  |||  ||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5687 tagataattgtgttagattttcagtggcatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttaggagttatgttgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaa 5786  T
Q  640 tcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgt 739  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  5787 ttttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggtgt 5886  T
Q  740 ttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||||||||  |||||||| |||||    
T  5887 ttaagagtatcaaacctatgctgtga 5912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 171; Significance: 3e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 529 - 799
Target Start/End: Original strand, 159346 - 159615
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  159346 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaataatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggagg 159445  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  159446 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaaattaatccaaaacttatgggataattcaaaagctcaaaactagaagtactatgagttc 159545  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttgttaat 799  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||  |||||| |||| || | ||||| |||||||| | |||||||||    
T  159546 aattaaggtgattaagagtattcaactcatgttgagagttgatc-ttgggataggaatgaaagttgttaat 159615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0635 (Bit Score: 170; Significance: 1e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0635
Description:

Target: scaffold0635; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 530 - 799
Target Start/End: Complemental strand, 7539 - 7271
Alignment:
Q  530 atgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggt 629  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||  |||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7539 atgaaagttttagataattgtgttagctttctagtggtattggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccagggaggt 7440  T
Q  630 cttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttca 729  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  7439 cttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttca 7340  T
Q  730 attagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttgttaat 799  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||| || | ||||| || ||||||| |||||||||    
T  7339 attaaggtgtttaagagtatttaatccatgatgtgagttgatc-ttgggatatgaatggaagttgttaat 7271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 169; Significance: 4e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 9711 - 9475
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9711 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgaattttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 9612  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||  || ||||||||||||||||||||||     
T  9611 tcttagtgaaatcttatgaaaattaagcataactatttctaagttaatccaaaacttatgagacaattccaaggctcaaaactagaagtactatgagttt 9512  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9511 aattaaggtgtttaagattatttaacctatgttgtga 9475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 169; Significance: 4e-90; HSPs: 4)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Original strand, 22187 - 22423
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    ||||||| || |||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22187 catgaaaattgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttcacgtgaaaattatttttggttattgagatatgatgaaaatgctccaaggagg 22286  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||    
T  22287 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaacttgaagtactatgagttc 22386  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22387 aactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 22423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 533 - 793
Target Start/End: Complemental strand, 29384 - 29124
Alignment:
Q  533 aaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtctt 632  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | || |||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29384 aaagttttagataattttgtaagctttcgaatggctttagtttgacttaaaaatgatttttagtttttaaaatatgatgaaaatactccacggaggtctt 29285  T
Q  633 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaatt 732  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||||    
T  29284 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttccatgttaatcaaaaacttatgggataattccaggactaaaaactagaagtattatgagttcaatt 29185  T
Q  733 agggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggtt 793  Q
    | ||||||||||||||||||| | ||||||||||| || | ||||| |||||||| |||||    
T  29184 aaggtgtttaagagtatttaagccatgttgtgagttgatccttgggttaggaatgaaggtt 29124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 533 - 793
Target Start/End: Complemental strand, 34849 - 34589
Alignment:
Q  533 aaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtctt 632  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | || |||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34849 aaagttttagataattttgtaagctttcgaatggctttagtttgacttaaaaatgatttttagtttttaaaatatgatgaaaatactccacggaggtctt 34750  T
Q  633 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaatt 732  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||||    
T  34749 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttccatgttaatcaaaaacttatgggataattccaggactaaaaactagaagtattatgagttcaatt 34650  T
Q  733 agggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggtt 793  Q
    | ||||||||||||||||||| | ||||||||||| || | ||||| |||||||| |||||    
T  34649 aaggtgtttaagagtatttaagccatgttgtgagttgatccttgggttaggaatgaaggtt 34589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 758 - 902
Target Start/End: Original strand, 59231 - 59386
Alignment:
Q  758 tgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttgttaatgattataatgaggttcagagaggatgaataagatgatttatattg------------- 844  Q
    |||| ||||| |||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || |||                 
T  59231 tgttatgagttgacctttggggtatgagtgaag-ttgttaatgattataatgaggttcagagtgtatgaataagatgattaatgttgtggatttaagttg 59329  T
Q  845 atgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaatt 902  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  59330 atgattaaatgtgaaag-atttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatt 59386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 169; Significance: 4e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 78720 - 78484
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||| || || |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  78720 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttgattcttgagatatgatgaaaatactccaaggaga 78621  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  78620 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 78521  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    || || |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  78520 aactaaggtgttaaagagtatttaacctatgttgtga 78484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0672 (Bit Score: 167; Significance: 6e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0672
Description:

Target: scaffold0672; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 533 - 763
Target Start/End: Original strand, 7956 - 8186
Alignment:
Q  533 aaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtctt 632  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7956 aaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtctt 8055  T
Q  633 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaatt 732  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||    
T  8056 agtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaatt 8155  T
Q  733 agggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 763  Q
    | |||||||| || ||||||||| |||||||    
T  8156 aaggtgtttatgattatttaacccatgttgt 8186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 167; Significance: 6e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 529 - 763
Target Start/End: Complemental strand, 21911 - 21677
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21911 catgaaagttgttgataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatatttggtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggagg 21812  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||    
T  21811 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcacaaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttc 21712  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 763  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  21711 aattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgt 21677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 167; Significance: 6e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 529 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 6114 - 5876
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||||| || |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6114 catgaaagttgtagataattgtgttagatttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactctaaggagg 6015  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| | ||||    
T  6014 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttc 5915  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 767  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5914 aattaaggtgtttaagagtatttaacatatgttgtgagt 5876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0364 (Bit Score: 166; Significance: 2e-88; HSPs: 3)
Name: scaffold0364
Description:

Target: scaffold0364; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 540 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 7778 - 7553
Alignment:
Q  540 tagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaa 639  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7778 tagataattttgttagctttccaatggttttgatttgacttgaaaattatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtcaaa 7679  T
Q  640 tcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgt 739  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7678 tcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatggaataattcaaaagctcaaaattagaagtactatgagttcaattaaggtgt 7579  T
Q  740 ttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    |||  |||||||||||||||||||||    
T  7578 ttattagtatttaacctatgttgtga 7553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0364; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 110 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 14495 - 14164
Alignment:
Q  110 cttaaaaagagtggataatacagtaggttgatgaataattattgttataatgatagggtgatcatagggtaatgattagggttatgtttggagagtattg 209  Q
    |||||||| | |||||||| || |||||| |  || ||||| ||||  |||||||| || ||||| |||| | ||| ||||||  |||||||||||||      
T  14495 cttaaaaacaatggataattcaataggtttacaaagaattagtgtttgaatgatagtgtaatcatggggtgaagataagggttgagtttggagagtatat 14396  T
Q  210 gatcgaaaacggagtcgaaaagatttccccaaaggcgaaatcgcagctgaactacgattttgctgtcagtgtgcaaaacgcgttt-ttattgtcgcagtt 308  Q
    |||| |||||| ||||||||||  ||||  ||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||       |||||| ||| |||| |||||    
T  14395 gatcaaaaacgaagtcgaaaagggttccttaaa-gtgaaatcgcagcagaactgcgattttgctgtcaccgt-------gcgtttcttactgtctcagtt 14304  T
Q  309 tgacaagtttaagtttcaaactgagtttaggtgccttcacgtaagttgtagatatggatgttatctgtccctcgactttggaggtactcgatttaagcac 408  Q
    |  |||||||||||| ||||||| |||||| || ||    | |||||||| ||||||||||||||| || ||   ||||||||  |||||||||||||      
T  14303 ttgcaagtttaagttccaaactgggtttagttgtctgtgtgaaagttgtatatatggatgttatctttcactaacctttggagtgactcgatttaagcgt 14204  T
Q  409 atagaactcaagttatgatcaaattactacacaggggtca 448  Q
     || ||||| || |||||||||| ||||||||||||||||    
T  14203 ctataactctagatatgatcaaaatactacacaggggtca 14164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0364; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 413 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 14008 - 13877
Alignment:
Q  413 aactcaagttatgatcaaattactacacaggggtcagcacagttgtcctcttttcccgagcataggaaaatctacttttctggaattttttgttctgaat 512  Q
    |||||||| |||||| ||| |||||||||| | ||||||  || ||||||||||||| | |||||||||||| | |||||||  | ||| ||||| ||||    
T  14008 aactcaagatatgatgaaaatactacacagagatcagcagggtcgtcctcttttcccaaacataggaaaatcaatttttctgccactttatgttccgaat 13909  T
Q  513 taggtttgggagtcttcatgaaagttttagat 544  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  13908 taggtttggaagtcttcatgaaagttgtagat 13877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 165; Significance: 1e-87; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 531 - 799
Target Start/End: Complemental strand, 51612 - 51345
Alignment:
Q  531 tgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtc 630  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  51612 tgaaagttttagataattttgttagctttccagtggatttggtctgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatcaaaatactccaagtaggtc 51513  T
Q  631 ttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaa 730  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||    
T  51512 ttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgagataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttaaa 51413  T
Q  731 ttagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttgttaat 799  Q
     || ||||||||||||||||||| | ||||||||||| || | ||||| |||||||||| | |||||||    
T  51412 ataaggtgtttaagagtatttaatcaatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaagatgttaat 51345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 540 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 67313 - 67187
Alignment:
Q  540 tagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaa 639  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  67313 tagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaa 67214  T
Q  640 tcttatgaaaattcagcataaccgttt 666  Q
    | |||||||||||||||||||||||||    
T  67213 ttttatgaaaattcagcataaccgttt 67187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 165; Significance: 1e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 530 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 82641 - 82378
Alignment:
Q  530 atgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggt 629  Q
    ||||||||| |||||||||  |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  82641 atgaaagttgtagataattaagttagctttccaattgttttggtttcacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatagtccaaggaggt 82542  T
Q  630 cttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttca 729  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||  || ||||||||||||| ||||||||||    
T  82541 cttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaattcaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagtattatgagttca 82442  T
Q  730 attagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttg 794  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||| ||||||| |||||    
T  82441 attaaggtg-ttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggttggaatgggggttg 82378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0384 (Bit Score: 163; Significance: 1e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0384
Description:

Target: scaffold0384; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 551 - 765
Target Start/End: Original strand, 7803 - 8017
Alignment:
Q  551 gttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 650  Q
    |||||||||| | ||||||||| || || ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7803 gttagctttctagtggctttggttttacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 7902  T
Q  651 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatt 750  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7903 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacttcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatt 8002  T
Q  751 taacctatgttgtga 765  Q
    |||||||||||||||    
T  8003 taacctatgttgtga 8017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 163; Significance: 1e-86; HSPs: 2)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 529 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 6681 - 6443
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || || | |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6681 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatgacttcggtttgaattgaaaattagttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 6582  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||||||    
T  6581 tcttagtgaaatcttaggaaaattcagtataatcatttataagttaatccaaaacttatgggataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 6482  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 767  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  6481 aattagggtgtttaagagtgtttaacctatgttatgagt 6443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 598 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 16524 - 16358
Alignment:
Q  598 tttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattc 697  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||| || |||||||||||||| |   ||    
T  16524 tttgagttatgatgaaaatactccaaggatgtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattttctc 16425  T
Q  698 caaatcttaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    |||| ||| |||    | |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16424 caaa-cttcaaagatcatgtactatgagttcaattaaggggtttaagagtatttaacctatgttgtga 16358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 163; Significance: 1e-86; HSPs: 2)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 533 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 6069 - 5835
Alignment:
Q  533 aaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtctt 632  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6069 aaagttgtagataattgtgttagctttccattggatttggtttgacttgaaaatgatttttgatttttgagttatgatgaaaatactccaaagaggtctt 5970  T
Q  633 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaatt 732  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  5969 agtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttcaaagtcagtccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaatt 5870  T
Q  733 agggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 767  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5869 aaggtgtttaatagtatttaacctatgttgtgagt 5835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Original strand, 7179 - 7413
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| ||||||  ||||  || |||||| |||||||||||||||||    
T  7179 catgaaagttttatataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaataattttttgtttta-agttatgataaaaatactccaaggagg 7277  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||| || |||||| ||||||| |   ||||||  || ||| |    ||||||||||||     
T  7278 tcttagtgaaattttatgaaaattctgcataactatttctaagtcaacccaaaatttatggattgtctccaaa-attcaaagtttgtgtactatgagtta 7376  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7377 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 7413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 163; Significance: 1e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 529 - 767
Target Start/End: Original strand, 11903 - 12141
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||  | |||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  11903 catgaaaattgtagataattgtgttagctttccagtggctttggttttacttgaaaatgatttttggtgtttgaattattatgaaaatactccaaggagg 12002  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  12003 tcttagtgaaatcttatgaaaatttagcataactgtttcaaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 12102  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 767  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12103 aattaaggtgtttaagagtaattaacctatgttgtgagt 12141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1783 (Bit Score: 162; Significance: 6e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold1783
Description:

Target: scaffold1783; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 529 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 905 - 641
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| |||||| || |||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  905 catgaaagttgtagataattttgttagcttacgaatgactttggtttgacttgaaactgatatttcgtttttgagatatgatgaaaatactacaaggagg 806  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||    
T  805 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctccaaactagaagtactatgagttc 706  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttg 794  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| || | |||| ||||||||||||||||    
T  705 aattaaggtgtttaagattatttaacccatgttatgagttgatc-ttggagtaggaatggaggttg 641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 162; Significance: 6e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 530 - 799
Target Start/End: Complemental strand, 8712 - 8444
Alignment:
Q  530 atgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggt 629  Q
    ||||||||| |||||||||  |||||||||||| || |||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8712 atgaaagttgtagataattgcgttagctttccagtgtctttggtttgacttgaaaatgatttttattttttgagatatgatgaaaatactctaaggaggt 8613  T
Q  630 cttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttca 729  Q
     |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  8612 gttagtgaaattttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttca 8513  T
Q  730 attagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttgttaat 799  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| | ||||||||||| || | ||||| || ||||||| |||||||||    
T  8512 attaaggtgtttaaaagtatttaatccatgttgtgagttgatc-ttgggatatgaatggacgttgttaat 8444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 161; Significance: 2e-85; HSPs: 4)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Original strand, 378 - 614
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  378 catgaaagttttagataattttgatagctttccaatggttttgctttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactacaaggagg 477  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||     
T  478 tcttagtgaaatcttaggaaaattcagtatatccatttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaaatactatgagtta 577  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  578 aattaaggtgtttaagagaatttaatctatgttgtga 614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Original strand, 5682 - 5918
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5682 catgaaagttttagataattttgatagctttccaatggttttgctttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactacaaggagg 5781  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||     
T  5782 tcttagtgaaatcttaggaaaattcagtatatccatttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaaatactatgagtta 5881  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  5882 aattaaggtgtttaagagaatttaatctatgttgtga 5918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 529 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 1591 - 1480
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1591 catgaaagttgtagataattgtgctagctttccagtggttttggtttgacttgaaaatgatattttgtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 1492  T
Q  629 tcttagtgaaat 640  Q
    ||||||||||||    
T  1491 tcttagtgaaat 1480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #4
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 529 - 572
Target Start/End: Original strand, 11401 - 11444
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgg 572  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11401 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgg 11444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462 (Bit Score: 160; Significance: 9e-85; HSPs: 3)
Name: scaffold0462
Description:

Target: scaffold0462; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 529 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 10877 - 10638
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||| || | ||||||| ||||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10877 catgaaagttgtagataattgtgttagcttttcagtagctttggtttcacttgaaaattatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaagagg 10778  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataacc-gtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagtt 727  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  10777 acttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccattttctaagttaatccaaaacttaagggataattccaaaactcaaaactagaagtactatgagtt 10678  T
Q  728 caattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 767  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10677 caattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 10638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 529 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 974 - 744
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||| ||||| || |||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  974 catgaaagttgtagataattgtgttagctttctagtgggtttggtttgacttgaaaatgatttttggtttctgagttatgatgaaaatact-caatgagg 876  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||| |||  |||||| || || |||||||||||||| |   |||||| ||| |||      ||||||| | |||    
T  875 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcagaactatttctatgtcaacccaaaacttatggattgtctccaaa-cttcaaagcttttgtactataaattc 777  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 761  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  776 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462; HSP #3
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 529 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 6480 - 6250
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||| ||||| || |||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  6480 catgaaagttgtagataattgtgttagctttctagtgggtttggtttgacttgaaaatgatttttggtttctgagttatgatgaaaatact-caatgagg 6382  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||| |||  |||||| || || |||||||||||||| |   |||||| ||| |||      ||||||| | |||    
T  6381 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcagaactatttctatgtcaacccaaaacttatggattgtctccaaa-cttcaaagcttttgtactataaattc 6283  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 761  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6282 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 6250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 160; Significance: 9e-85; HSPs: 2)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 530 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 58403 - 58168
Alignment:
Q  530 atgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggt 629  Q
    ||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  58403 atgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatctgatgaaaatactccaaggagat 58304  T
Q  630 cttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttca 729  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  58303 cttagtgaaatcttatgaaaattcagcataagcgtttctaagttaatccaaaacataaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttca 58204  T
Q  730 attagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  58203 actagggtgtttaagagtatttaacctgtgttgtga 58168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 529 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 68557 - 68438
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||  ||    
T  68557 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggatttggttttacttgaaaatgatttttatcttttgagatatgatggaaatactccaagttgg 68458  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaa 648  Q
    |||||||||| | |||||||    
T  68457 tcttagtgaatttttatgaa 68438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 159; Significance: 4e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 529 - 767
Target Start/End: Original strand, 22165 - 22403
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||| ||| | || |||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22165 catgaaagttgtagataattgtgttaactttccagtggattttgtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgacatatgatgaaaatactccaaggagg 22264  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  22265 tcttagtgaaatcttatgaagattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaacctaaaaactagaagtattatgagttc 22364  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 767  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22365 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 22403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 158; Significance: 1e-83; HSPs: 2)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 534 - 794
Target Start/End: Original strand, 1510 - 1770
Alignment:
Q  534 aagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaa-tgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtctt 632  Q
    ||||| |||||||||  |||| ||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1510 aagttgtagataattgagttatctttccagtggctttggtttgacttgaaaaatgatttttattttttgagatatgatgaaaatactccatggaggtctt 1609  T
Q  633 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaatt 732  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  1610 agtgaaatcttaggaaaattcagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaacccccaaaactagaagtactatgagttcaatt 1709  T
Q  733 agggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttg 794  Q
    | ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||    
T  1710 aaggt-tttaagattatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatggaggttg 1770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 27956 - 27720
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | || | |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | | ||||||    
T  27956 catgaaagttttagataattgtgttagctttccagtggctttagtttgaattgaaaatgattttttgtttttgagatatgatgaaaataattccaggagg 27857  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |    
T  27856 tcttactgaaattttatgaaaattcagcaaaaccgtttctaagtcaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagtac 27757  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27756 aattaaggtgtttaagagtatttaatctatgttgtga 27720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 156; Significance: 2e-82; HSPs: 2)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 532 - 767
Target Start/End: Original strand, 70227 - 70462
Alignment:
Q  532 gaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtct 631  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||| | || ||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  70227 gaaagttgtaggtaattgtgttagctttccagtggctttagtttgactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggaggtct 70326  T
Q  632 tagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaat 731  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  70327 tagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatcaaaaacttatgagataattccaaaactcaaaactagaagtactataagttcaat 70426  T
Q  732 tagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 767  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  70427 taaggtgtttaagagtatttaacctatgttatgagt 70462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 529 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 72067 - 71934
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  72067 catgaaagttgtagataattgagttagctttccaattgctttggtttcacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatagtccaaggagg 71968  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataacc 662  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  71967 tcttagtgaaaccttatgaaaattcaggataacc 71934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371 (Bit Score: 155; Significance: 9e-82; HSPs: 3)
Name: scaffold0371
Description:

Target: scaffold0371; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 529 - 759
Target Start/End: Original strand, 10843 - 11073
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  10843 catgaaagttgtagataattgtgttaactttccagtggctttggtttgacttgaaaatgaattttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaga 10942  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| | ||||    
T  10943 tcttagtgaaattttatgaaaattcagaataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattcgaaacctcaaaactagaagtactaggggttc 11042  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatg 759  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11043 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatg 11073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 626 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 17318 - 17223
Alignment:
Q  626 aggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtacta 721  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  17318 aggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattttaaatctcaaaactagaagtacta 17223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 774 - 837
Target Start/End: Complemental strand, 3275 - 3212
Alignment:
Q  774 ttggggtaggaatggaggttgttaatgattataatgaggttcagagaggatgaataagatgatt 837  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3275 ttggggttggaatggaagttgttaatgattataatgaggttcagagagtatgaataagatgatt 3212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 155; Significance: 9e-82; HSPs: 5)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 529 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 23225 - 22987
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||| | |||||    
T  23225 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaattgaaaatgatttttggtttttgagttatgatggaaatactctagggagg 23126  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||    
T  23125 tcttagtgaaaccttatgaaaattcagcacatccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaatgctcaaaactagaagtactatgagttc 23026  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 767  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  23025 aattaaggtgtttaagagtatttaatccatgttgtgagt 22987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 529 - 755
Target Start/End: Original strand, 17653 - 17879
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||| | ||| |    
T  17653 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgattttttgtttttgagttatgatggaaatactctagggatg 17752  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||    
T  17753 tcttagtgaaaccttatgaaaattcagcacagccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagttc 17852  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacc 755  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  17853 aattaaggtgtttaagaatatttaacc 17879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 529 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 33995 - 33786
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||| ||||| | |||| || || || ||||||| | ||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33995 catgaaagttgtagataattgagttagcattccagtagcttcggtttgacgtgaaaataaattttggttctcgagatatgatgaaaatactccaaggagg 33896  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||    
T  33895 tcttagtaaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactataagtactatgagttc 33796  T
Q  729 aattagggtg 738  Q
    || |||||||    
T  33795 aactagggtg 33786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #4
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 529 - 718
Target Start/End: Original strand, 22575 - 22765
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaagg-ag 627  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| || |||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||| | || ||    
T  22575 catgaaagttgtagataattttgttagcattccaatgactttggtttgacttgaaaatgattttttgtttttgagttatgatggaaatactctaggggag 22674  T
Q  628 gtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagta 718  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||    
T  22675 gtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagta 22765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #5
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 624 - 755
Target Start/End: Original strand, 23381 - 23512
Alignment:
Q  624 ggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatg 723  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||| ||||    
T  23381 ggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatg 23480  T
Q  724 agttcaattagggtgtttaagagtatttaacc 755  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  23481 agttcaattaaggtgtttaagaatatttaacc 23512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 154; Significance: 4e-81; HSPs: 3)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 529 - 758
Target Start/End: Original strand, 64465 - 64694
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  64465 catgaaagttgtagataattgtgttagatttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaagaagg 64564  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||||||||| | ||||    
T  64565 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttgtggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggggttc 64664  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctat 758  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  64665 aattaaggtgtttaagagtagttaacctat 64694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 633 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 31502 - 31386
Alignment:
Q  633 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaatt 732  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31502 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaatccttaaaactagaagttctatgagttcaatt 31403  T
Q  733 agggtgtttaagagtat 749  Q
    | |||||||||||||||    
T  31402 aaggtgtttaagagtat 31386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 529 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 31799 - 31680
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| |||||  |||||||||||| || ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31799 catgaaagttgtagataattgtgttagatttccggtggctttgggtttacatgaaaatgattttttgtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 31700  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaa 648  Q
    |||||||||| | |||||||    
T  31699 tcttagtgaatttttatgaa 31680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 154; Significance: 4e-81; HSPs: 2)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Original strand, 10325 - 10562
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10325 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtagctttggtttaacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 10424  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||     
T  10425 tcttagtgaaatcttaggaaaattcagcataaacgtttctaagttaatccaaaacttatagaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 10524  T
Q  729 aatt-agggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    |||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  10525 aattaagggggtttatgagtatttaacctacgttgtga 10562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 529 - 572
Target Start/End: Original strand, 19919 - 19962
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgg 572  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19919 catgaaagttttagataattatgttagctttccaatggctttgg 19962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0632 (Bit Score: 153; Significance: 1e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0632
Description:

Target: scaffold0632; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 821 - 585
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||| |  ||||||| | || |||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  821 catgaaagttgtagataattgtgttagcttttccgtggcttttgtttgacttgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 722  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| | ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |    
T  721 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataactgtttctaaggtagtccaatatttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagtcc 622  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  621 aactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0452 (Bit Score: 153; Significance: 1e-80; HSPs: 2)
Name: scaffold0452
Description:

Target: scaffold0452; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Original strand, 13061 - 13297
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||  | || |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13061 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtgtgacgtgaaaatgatttttgattcttgagatatgatgaaaatactccaagtagg 13160  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| |||||     
T  13161 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaaatagaagtactaggagttt 13260  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  13261 aattaaggggtttaagagtatttaacatgtgttgtga 13297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0452; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 529 - 760
Target Start/End: Original strand, 8046 - 8277
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| || |||| |||||||| ||||  ||| ||||||||||| || ||| ||||| | |    
T  8046 catgaaaattttagataattttgttagccttcctatggatttggtttgacttaaaaatgatgtttagatttagagatatgatggaattaccccaagcaag 8145  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||| || || | ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||||| |||||     
T  8146 tcttggtaaatttttatgaaaattcagcataaccgtttctaactcaatccaaaacttatggaatatttccaaaactcaaaactagaaatactaggagttt 8245  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgt 760  Q
    ||||| |  ||||||||||||||||| |||||    
T  8246 aattaagaggtttaagagtatttaacgtatgt 8277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 153; Significance: 1e-80; HSPs: 4)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 531 - 799
Target Start/End: Original strand, 35969 - 36236
Alignment:
Q  531 tgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtc 630  Q
    |||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  35969 tgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttctggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtt 36068  T
Q  631 ttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaa 730  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  36069 ttagtgaaatcttaggaaaattcagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaa 36168  T
Q  731 ttagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttgttaat 799  Q
    ||| ||||||||||||||||  ||  |||||| |||| || | ||||| |||||||| | |||||||||    
T  36169 ttaaggtgtttaagagtattcgactcatgttgagagttgatc-ttgggataggaatgaaagttgttaat 36236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 797 - 962
Target Start/End: Original strand, 43682 - 43860
Alignment:
Q  797 aatgattataatgaggttcagagaggatgaataagatgattta------------ta--ttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagac 882  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||            ||  |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||      
T  43682 aatgattataatgaggttcagagaggatgattaagatgatttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaagtt 43781  T
Q  883 gttgatatgaaattgtaatttgttatatatgaaaattattattgatggttacttgatgtgtatgtttaaatgatgatgtc 962  Q
    ||||||||| | ||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  43782 gttgatatggagttgcaaat-gttatatatgaagattattattgatggttacttgctgtatatgtttaaatgatgttgtc 43860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 797 - 962
Target Start/End: Original strand, 47602 - 47780
Alignment:
Q  797 aatgattataatgaggttcagagaggatgaataagatgattta------------ta--ttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagac 882  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||            ||  |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||      
T  47602 aatgattataatgaggttcagagaggatgattaagatgatttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaagtt 47701  T
Q  883 gttgatatgaaattgtaatttgttatatatgaaaattattattgatggttacttgatgtgtatgtttaaatgatgatgtc 962  Q
    ||||||||| | ||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  47702 gttgatatgtagttgcaaat-gttatatatgaagattattattgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttgtc 47780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 832 - 901
Target Start/End: Original strand, 43878 - 43946
Alignment:
Q  832 atgatttatattgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaat 901  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  43878 atgatttactttgatgattaa-tgtgagaatatttatatattgtgaaagatgctgatatgaagttgtaat 43946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0802 (Bit Score: 151; Significance: 2e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0802
Description:

Target: scaffold0802; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 529 - 759
Target Start/End: Original strand, 5063 - 5293
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  5063 catgaaagttgtagataactgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaataatttttgatttttgagatatgatgaaaatacttcaagaagg 5162  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| ||| | ||||    
T  5163 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcctaacagtttctaagttaatccaaaacttatggaatgattccaaacctcaaaactagaagttctaggggttc 5262  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatg 759  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5263 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatg 5293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0802; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 842 - 901
Target Start/End: Original strand, 5478 - 5536
Alignment:
Q  842 ttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaat 901  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  5478 ttgatgattaaatgtgaaag-atttatatattgtgaaaggtgttgatatgaagttgtaat 5536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 150; Significance: 9e-79; HSPs: 4)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 537 - 794
Target Start/End: Original strand, 133568 - 133825
Alignment:
Q  537 ttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtg 636  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||| ||||||||||||  |||  ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| |    
T  133568 ttttagataattttgttagctttccaatggctttagtttgactttaaaatgattttttgtttaggagttatgttgaaaatactccaagtaggtcttaggg 133667  T
Q  637 aaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaattaggg 736  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||| |||||||| ||||||| |||||| ||    
T  133668 aaatcttatgaaatttcagcacaaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtaatatgagtgcaattaagg 133767  T
Q  737 tgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttg 794  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  133768 tgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttg 133825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 529 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 133406 - 133141
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||  |||||||||||  |||  ||| |||||||||||||||| ||| |||    
T  133406 catgaaagttttagataattttgttagcttttcaatggctttggtttgacttttaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactcaaagtagg 133307  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||    
T  133306 tcttagggaaatcttatgaaaattcagcacaaccattttcaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagttc 133207  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttg 794  Q
    ||||| |  ||||||| |||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  133206 aattaagaggtttaagtgtatttaactcatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttg 133141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #3
Raw Score: 109; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 605 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 29738 - 29578
Alignment:
Q  605 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatct 704  Q
    ||||||||||||||| ||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  29738 tatgatgaaaatactacaaggaatacttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacct 29639  T
Q  705 taaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
     || ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29638 caagactagaagtactaagagtttaattaaggtgtttaagagtatctaacctatgttgtga 29578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #4
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 529 - 620
Target Start/End: Complemental strand, 33894 - 33803
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactc 620  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||  |||  ||| ||||||||||||||||    
T  33894 catggaagttttagataattttgttagatttccaatggctttggtttgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactc 33803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 149; Significance: 3e-78; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 533 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 126400 - 126168
Alignment:
Q  533 aaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtctt 632  Q
    |||||| |||||||||  |||||||||||| | ||||||| || || |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  126400 aaagttgtagataattgagttagctttccagttgctttggtttaacgtgaaaatgatttttgattcttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtctt 126301  T
Q  633 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaatt 732  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||| ||||    
T  126300 agtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattctaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaatt 126201  T
Q  733 agggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    | || ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  126200 aaggggtttaagagtatttaacatgtgttgtga 126168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 529 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 33109 - 32878
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| ||||   ||| ||||| || |||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33109 catgaaagttgtagataattgtgttagatttcttgtggatttggtttgacttgaaaatgaattttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 33010  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||| || || || |||||||||||||| |   ||||||  | ||| || |  |||||||||||||    
T  33009 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactttttttaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttc 32911  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 761  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32910 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 32878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 147; Significance: 5e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 579 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 8123 - 7937
Alignment:
Q  579 ttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatcc 678  Q
    ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  8123 ttgaaaatgatttttgactcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataattgtttctaagttaatcc 8024  T
Q  679 aaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    |||||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8023 aaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagtttaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 7937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 619 - 734
Target Start/End: Original strand, 8152 - 8267
Alignment:
Q  619 tccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagta 718  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||||     
T  8152 tccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataattgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtt 8251  T
Q  719 ctatgagttcaattag 734  Q
    ||||||||||||||||    
T  8252 ctatgagttcaattag 8267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 147; Significance: 5e-77; HSPs: 3)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 529 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 1360 - 1130
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  || || |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  1360 catgaaagttgtagataattgagtaagatttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttgatttttgagatatgatgaaaatactccaaggata 1261  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| | ||||    
T  1260 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcctaacagtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttc 1161  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatg 759  Q
    ||||| | || ||||||||||||||||||||    
T  1160 aattaagatggttaagagtatttaacctatg 1130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 529 - 594
Target Start/End: Original strand, 6215 - 6280
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgattttta 594  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||||||||||    
T  6215 catgaaagttatagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacttctaaatgattttta 6280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 842 - 901
Target Start/End: Complemental strand, 935 - 877
Alignment:
Q  842 ttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaat 901  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  935 ttgatgattaaatgtgaaag-attaatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaat 877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0544 (Bit Score: 146; Significance: 2e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0544
Description:

Target: scaffold0544; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 529 - 794
Target Start/End: Original strand, 2123 - 2388
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||||||||  |||  ||| |||||||||||||||||||| |||    
T  2123 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactataaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 2222  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||| ||||||  ||| ||||||||||  || ||||||||||||| ||||||| |    
T  2223 tcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatcaaaaactggtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgc 2322  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttg 794  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  2323 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttg 2388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439 (Bit Score: 145; Significance: 8e-76; HSPs: 2)
Name: scaffold0439
Description:

Target: scaffold0439; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 533 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 11811 - 11579
Alignment:
Q  533 aaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtctt 632  Q
    |||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| ||| || |||||||||||||||||||||    
T  11811 aaagttgtagataattaagttagctttccattggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagttattatcaaaatactccaaggaggtctt 11712  T
Q  633 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaatt 732  Q
    || |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||| || ||||| ||||    
T  11711 agcgaaatcttatgaaaattcagcacagccgtttctaagttaatccaaaacctagggaataattccaaacctcaaaactagaagtattaggagtttaatt 11612  T
Q  733 agggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11611 acggtgtttaagagtatttgacctatgttgtga 11579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 4076 - 3839
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  4076 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctctggtttgacttgaaaatgacttttggtatttgagatatgatgaaaatactccatggaga 3977  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||  |||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||     
T  3976 tcttagtgaaattttatgaaaatttagtttaacagtttctaagtcaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactggaagtactaggagttt 3877  T
Q  729 aatt-agggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    |||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  3876 aattaagggggttttagagtatttaacctatgttgtga 3839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241 (Bit Score: 145; Significance: 8e-76; HSPs: 3)
Name: scaffold0241
Description:

Target: scaffold0241; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 2220 - 1984
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    ||||||| || ||||||| |  |||||||||||| || |||| | || || ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2220 catgaaaattgtagataaatgagttagctttccagtgactttagtttgacgtgaaaataatttttgattcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 2121  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | || ||||||||||||| |||||||||    
T  2120 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcatacctcaaaactagaagtattatgagttc 2021  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
     |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  2020 tattagggtatttaagggtatttaacctatgttgtga 1984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 529 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 5565 - 5413
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||| || |||||| || || |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5565 catgaaagttgtagataattaagttagctttccactgactttggtttgacatgaaaatgatttttgattcttgagatatgatgaaaatactctaaggagg 5466  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaa 681  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5465 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaa 5413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241; HSP #3
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 673 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 5229 - 5137
Alignment:
Q  673 taatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5229 taatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 5137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 145; Significance: 8e-76; HSPs: 5)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 120566 - 120330
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||| | || ||  |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  120566 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttagtttgacgcgaaaatgatttttttttcttgagatatgatgaaaatacttcaagtagg 120467  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||     
T  120466 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttt 120367  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  120366 aattaaggggtttaagagtatttaacatgtgttgtga 120330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 529 - 722
Target Start/End: Original strand, 29593 - 29786
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||||  || |||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29593 catgaaagttgtagataattgtgttagatttccagtggctttgatttgacttgaaaatcatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 29692  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactat 722  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  29693 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactat 29786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 529 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 40055 - 39990
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgattttta 594  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||||| || ||||  ||||||||||||    
T  40055 catgaaagttttatataattatgtcagctttctaatggctttggttttacttccaaatgattttta 39990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 529 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 45538 - 45473
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgattttta 594  Q
    ||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||  |||| |||||||    
T  45538 catgaaagttttatatcattatgttagctttctaatggctttggttttacttccaaataattttta 45473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 529 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 79093 - 79028
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgattttta 594  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||| || || |  ||||||||||||    
T  79093 catgaaagttttagacaattatgttagctttctaattgctttggtttgacatccaaatgattttta 79028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0308 (Bit Score: 144; Significance: 3e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0308
Description:

Target: scaffold0308; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 564 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 12955 - 12752
Alignment:
Q  564 tggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccg 663  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||     
T  12955 tggctttggttttacttgaaaatgatttctagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcagtataacct 12856  T
Q  664 tttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 763  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||     
T  12855 tttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaatccataaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattcaactcatgttga 12756  T
Q  764 gagt 767  Q
    ||||    
T  12755 gagt 12752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 144; Significance: 3e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 530 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 143268 - 143033
Alignment:
Q  530 atgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggt 629  Q
    ||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||| ||| | || || ||||||  ||||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  143268 atgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttagtttgacatgaaaagaatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagtaggt 143169  T
Q  630 cttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttca 729  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| |    
T  143168 cttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagttta 143069  T
Q  730 attagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  143068 attaaggggtttaagagtatttaacctatgtggtga 143033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 551 - 727
Target Start/End: Original strand, 169415 - 169591
Alignment:
Q  551 gttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 650  Q
    |||||||||||| ||||||| | || || ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  169415 gttagctttccagtggctttagtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactctaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaa 169514  T
Q  651 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagtt 727  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||||| |||||    
T  169515 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagtt 169591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 142; Significance: 5e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 529 - 757
Target Start/End: Original strand, 6984 - 7213
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttc-acttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggag 627  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||  || ||||||||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  6984 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggcttttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatattatgaaaatactccaagtag 7083  T
Q  628 gtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagtt 727  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||    
T  7084 atcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtt 7183  T
Q  728 caattagggtgtttaagagtatttaaccta 757  Q
     ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  7184 taattaaggggtttaagagtatttaaccta 7213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 141; Significance: 2e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Original strand, 12932 - 13168
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||| |||||| ||| ||||| || || ||||||||||||||  ||  ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12932 catgaaagttgtagataattgagttagatttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcctgagatatgttgaaaatactccaaggagg 13031  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||| |||||||||||||||    
T  13032 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcacaaccatttttaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactaaaagtactatgagttc 13131  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13132 aactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 13168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 706 - 765
Target Start/End: Original strand, 19376 - 19435
Alignment:
Q  706 aaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19376 aaaactaaaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 19435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1539 (Bit Score: 140; Significance: 8e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold1539
Description:

Target: scaffold1539; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 534 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 1558 - 1327
Alignment:
Q  534 aagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtctta 633  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||| || |||||| || |  ||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1558 aagttgtagataattgagttagctttccagtgactttggtttgatgtgaaaatgatttttggttcttgggatatgatgaaaatactccaagtaggtctta 1459  T
Q  634 gtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaatta 733  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  1458 gtgaaattttatgaaaatttagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaatta 1359  T
Q  734 gggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
     || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1358 aggggtttaagagtatttaacctatgtggtga 1327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 139; Significance: 3e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 541 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 138419 - 138193
Alignment:
Q  541 agataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaat 640  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||     
T  138419 agataatttagttagctttccaatggatttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatggaaatactctagggaggtcttcgtgaaac 138320  T
Q  641 cttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtt 740  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  138319 cttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgtgataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtt 138220  T
Q  741 taagagtatttaacctatgttgtgagt 767  Q
    || |||||||||| | |||||||||||    
T  138219 tacgagtatttaatccatgttgtgagt 138193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1633 (Bit Score: 137; Significance: 5e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold1633
Description:

Target: scaffold1633; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 861 - 625
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||||||| || | ||||||| || || ||||||||| ||||  || | |||||||||| |||||||||||||||||    
T  861 catgaaagttgtagataattgagttagcttttcagttgctttggtttgacgtgaaaatgaattttggttctcgagatatgataaaaatactccaaggagg 762  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||    
T  761 tcttagtgaaatcttaggaaaattcaacataaccgtttctaagttaattcaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactataagtactatgagttc 662  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  661 aactagggggtttaagagtatttaacctattttgtga 625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 137; Significance: 5e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Original strand, 5722 - 5958
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | || || |||| ||||||||||||  |||  ||| |||||||||||||||||||| |||    
T  5722 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 5821  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||     
T  5822 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 5921  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||| || |||||| |||||||||| | ||||||||    
T  5922 aattaaggggtttaacagtatttaacatgtgttgtga 5958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 137; Significance: 5e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 582 - 758
Target Start/End: Original strand, 8752 - 8928
Alignment:
Q  582 aaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaa 681  Q
    ||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8752 aaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaa 8851  T
Q  682 acttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctat 758  Q
    ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  8852 acttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaaactat 8928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 137; Significance: 5e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 7169 - 6933
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||||| |||| ||||||||| || || | ||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  7169 catgaaagttgtagataattgagttagctctccagtggctttggtttgacgtaaaaatgatttttggttcttgatatatgatgaaaatactccaagtagg 7070  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||     
T  7069 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttcttagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaagagttt 6970  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  6969 aattaaggggtttaagagtatttaacatgtgttgtga 6933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 136; Significance: 2e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 529 - 728
Target Start/End: Original strand, 23600 - 23799
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23600 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttaaaaatgattttttgtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 23699  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||    
T  23700 tcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataagcgtttctaaattaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttc 23799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 135; Significance: 8e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 529 - 763
Target Start/End: Complemental strand, 21724 - 21490
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||| |||||| ||| ||||| || || ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21724 catgaaagttgtagataattgagttagatttccagtggatttggtttgacgtgaaaatgatttttggttattgagatatgatgaaaatactccaagtagg 21625  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| || |||||     
T  21624 tcttggtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaaactcaaaactagaagtattaggagttt 21525  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 763  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| | ||||||    
T  21524 aattaaggggtttaagagtatttaacatgtgttgt 21490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 134; Significance: 3e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 533 - 730
Target Start/End: Original strand, 106603 - 106800
Alignment:
Q  533 aaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtctt 632  Q
    |||||| |||||||||  |||||||||||| ||   |||| || || ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  106603 aaagttgtagataattgagttagctttccagtgaaattggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtctt 106702  T
Q  633 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaa 730  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  106703 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaa 106800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 133; Significance: 1e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 21308 - 21072
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    ||||||| || ||| |||||  ||||| |||||| ||||||||| || || ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||| ||     
T  21308 catgaaaattgtaggtaattgagttagatttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcgtgagatatgatgaaaatactccaagtaga 21209  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||     
T  21208 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 21109  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||| || |||||| |||||||||| | ||||||||    
T  21108 aattaaggggtttaatagtatttaacatgtgttgtga 21072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 130; Significance: 7e-67; HSPs: 3)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 540 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 7620 - 7395
Alignment:
Q  540 tagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaa 639  Q
    ||||||||| |||||| ||| || |||| | || || |||||||||||||||||  |||  ||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7620 tagataattgtgttagattttcagtggcatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttaggagttatgttgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaa 7521  T
Q  640 tcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgt 739  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  7520 ttttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggtgt 7421  T
Q  740 ttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||||||||  |||||||| |||||    
T  7420 ttaagagtatcaaacctatgctgtga 7395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 529 - 639
Target Start/End: Original strand, 10313 - 10423
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10313 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggatttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttaagatatgatgaaaatactccaaggagg 10412  T
Q  629 tcttagtgaaa 639  Q
    |||||||||||    
T  10413 tcttagtgaaa 10423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 713 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 11267 - 11215
Alignment:
Q  713 gaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11267 gaagtactaggagtttaattaaggtgtttaagagtatctaacctatgttgtga 11215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 126; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 169094 - 168857
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  169094 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacctgaaaatgacttttggtttttgagatatgatgaaaatactctaaggaga 168995  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||| ||||||||| |||||     
T  168994 tcttagtgaaattttatgaaaatttagtataacagtttctaagtcaatccaaaacttagggaataattccaaacctctaaactggaagtactaggagttt 168895  T
Q  729 aatt-agggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    |||| |||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  168894 aattaagggggttttagagtatttaacttatgttgtga 168857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1186 (Bit Score: 125; Significance: 7e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold1186
Description:

Target: scaffold1186; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 1367 - 1131
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||||| || |||| ||||| |||||   || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1367 catgaaagttgtagataattgtgttagttttccagtggctttggtttgacttaaaaattattttcggttcttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 1268  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| ||||||||| || |||||||  |||||| || || |||||||||||||| |   |||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  1267 tcttagtgaaattttatgaaaaatccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 1168  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1167 aattagggtgtttaagtgtatttaacctatgttgtga 1131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 125; Significance: 7e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 30268 - 30032
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || | | || || ||| ||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||| |||||||     
T  30268 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtgtcgtaggtttgactagaaaatgatttttgatttaggagttatgatgaaaatactacaaggagt 30169  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || || |||||||||| || |||||     
T  30168 acttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaggaaataattccaaacctcaagactagaagtaataggagttt 30069  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  30068 aattaaggtgtttaagagtatctaacttatgttgtga 30032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 125; Significance: 7e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Original strand, 186901 - 187137
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||||| || |||| ||||| |||||   || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  186901 catgaaagttgtagataattgtgttagttttccagtggctttggtttgacttaaaaattattttcggttcttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 187000  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| ||||||||| || |||||||  |||||| || || |||||||||||||| |   |||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  187001 tcttagtgaaattttatgaaaaatccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 187100  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  187101 aattagggtgtttaagtgtatttaacctatgttgtga 187137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0232 (Bit Score: 121; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0232
Description:

Target: scaffold0232; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 3926 - 3690
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |  | || || |||| ||||||||||||  |||  ||| |||||||||||||||||||| |||    
T  3926 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccattagagtcggtttgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 3827  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||     
T  3826 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaaggactaggagttt 3727  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||| || |||||| | |||||||| | ||||||||    
T  3726 aattaaggggtttaacaatatttaacatgtgttgtga 3690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 121; Significance: 2e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 617 - 765
Target Start/End: Original strand, 9711 - 9858
Alignment:
Q  617 actccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaag 716  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  9711 actccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaag 9810  T
Q  717 tactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9811 tactatgagttcaacta-ggtgtttaagagtatttaacctatattgtga 9858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 529 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 38417 - 38353
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgattttt 593  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | || || |||||||||||||||||    
T  38417 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgattttt 38353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 120; Significance: 7e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 610 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 22633 - 22478
Alignment:
Q  610 tgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaa 709  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  22633 tgaaaatactccaaggaggtcgtagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaa 22534  T
Q  710 ctagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22533 ctagaagtactaggagtttaattaaggtgtttaagagtatctaacctatgttgtga 22478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1766 (Bit Score: 117; Significance: 4e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold1766
Description:

Target: scaffold1766; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 551 - 727
Target Start/End: Original strand, 1112 - 1288
Alignment:
Q  551 gttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 650  Q
    |||||||||||| ||||||| | || || ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1112 gttagctttccagtggctttagtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactctaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaa 1211  T
Q  651 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagtt 727  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||||| |||||    
T  1212 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagtt 1288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 117; Significance: 4e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 577 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 11253 - 11101
Alignment:
Q  577 acttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaat 676  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11253 acttgaaaatgatttttggtttttgatatatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaat 11154  T
Q  677 ccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttca 729  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  11153 ctaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttca 11101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 117; Significance: 4e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 533 - 761
Target Start/End: Original strand, 66432 - 66660
Alignment:
Q  533 aaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtctt 632  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  66432 aaagttttagataattgtgttagctttccagtggctttgatttgacttgaaaatgattttttgtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtctt 66531  T
Q  633 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaatt 732  Q
    |||||||| |||||||||||| || ||||  ||||||||| || |||||||||||||| |   |||||   | |||||||||||||||| ||||||||||    
T  66532 agtgaaattttatgaaaattccgcctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaagcttcaaaactagaagtactaggagttcaatt 66631  T
Q  733 agggtgtttaagagtatttaacctatgtt 761  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  66632 aaggtgcttaagagtatttaacctatgtt 66660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 832 - 901
Target Start/End: Complemental strand, 363032 - 362964
Alignment:
Q  832 atgatttatattgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaat 901  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||    
T  363032 atgatttactttgatgattaa-tgtgagaatatttatatattttgaaagatgttgatatgaagttgtaat 362964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1204 (Bit Score: 115; Significance: 7e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold1204
Description:

Target: scaffold1204; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 530 - 760
Target Start/End: Original strand, 747 - 977
Alignment:
Q  530 atgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggt 629  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||   ||||||||||||||| || ||| ||||| | ||    
T  747 atgaaagttttaattaattttgttagctttccaatggctttggtttgacttaaaaatgatttttggattttgagatatgatggaattaccccaagcaagt 846  T
Q  630 cttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttca 729  Q
    ||| || || | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||| ||  ||||||||||||||| ||||| |    
T  847 cttggtaaatttttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcaatacaaaacttatagaatatttccaaacctcgaaactagaagtactaggagttta 946  T
Q  730 attagggtgtttaagagtatttaacctatgt 760  Q
    |||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  947 attaagaggtttaagagtatttaacctatgt 977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 114; Significance: 3e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 26171 - 25936
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  26171 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaattatttttagtttttgagctatgatgaaaataccccaaggagg 26072  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatctt-aaaactagaagtactatgagtt 727  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||| || |||||||| |||| ||  |    |||||| |||||| |  ||||||||||||    
T  26071 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaactgatgg-atcgtcttcaatcttcaaaacttg-tgtactatgagtt 25974  T
Q  728 caattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25973 caattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 25936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0825 (Bit Score: 112; Significance: 4e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0825
Description:

Target: scaffold0825; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 529 - 672
Target Start/End: Original strand, 1030 - 1173
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1030 catgaaagttttagataatttttttatctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaagtagg 1129  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagt 672  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  1130 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagt 1173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0825; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 691 - 799
Target Start/End: Original strand, 1373 - 1480
Alignment:
Q  691 ataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggag 790  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||| || | ||||| |||||||| |     
T  1373 ataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaatccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatgaaa 1471  T
Q  791 gttgttaat 799  Q
    |||||||||    
T  1472 gttgttaat 1480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0521 (Bit Score: 112; Significance: 4e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0521
Description:

Target: scaffold0521; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 529 - 760
Target Start/End: Complemental strand, 8162 - 7931
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||| ||  ||||||||||||||| || ||| ||||| | |    
T  8162 catgaaaattttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttaaaaatgatttgtagattttgagatatgatggaattaccccaagaaag 8063  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||| || || | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||  ||||||| || |||||||||||||||| |||||     
T  8062 tcttggtaaatttttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacatatgaaatgtttccaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 7963  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgt 760  Q
    ||||| |  |||| ||| ||||||||||||||    
T  7962 aattaagaggtttgagaatatttaacctatgt 7931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 109; Significance: 3e-54; HSPs: 3)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 529 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 21417 - 21285
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21417 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 21318  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataac 661  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21317 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataac 21285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 633 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 39631 - 39515
Alignment:
Q  633 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaatt 732  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  || |||||||||| | ||||||||||||||    
T  39631 agtgaaatcttaagaaaattcaggataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaatttctatgagttcaatt 39532  T
Q  733 agggtgtttaagagtat 749  Q
    | |||||||||||||||    
T  39531 aaggtgtttaagagtat 39515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 602 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 39855 - 39809
Alignment:
Q  602 agatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 648  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  39855 agatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaacttttatgaa 39809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 109; Significance: 3e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 529 - 761
Target Start/End: Original strand, 65377 - 65608
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||||| || ||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  65377 catgaaagttgtagataattgtgttagatttccagtggctttggtttgacttgaaaaggagttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 65476  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||| || || |||||||||||| | |   ||||||  | ||| || |  |||||||||||||    
T  65477 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatgaattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttc 65575  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 761  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  65576 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 65608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 108; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 34916 - 34685
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  34916 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttttttttttagttatgatgaaaatactccaaggagg 34817  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |||||||  ||||||    || |||||||||||||| |   ||||||  | ||| || |  |||||||||||||    
T  34816 tcttagtgaaattttatgaaaataccgcataactatttcta----aacccaaaacttatggattttctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttc 34722  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34721 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 34685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0684 (Bit Score: 106; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0684
Description:

Target: scaffold0684; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 529 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 158 - 1
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  158 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttagtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatggaaatagtccaaggagg 59  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaactta 686  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  58 tcttagtgaaatcttaggaaaattcagtataaccttttctaagttaatccaaaactta 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0401 (Bit Score: 106; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0401
Description:

Target: scaffold0401; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 529 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 8476 - 8244
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaattttt-gagatatgatgaaaatactccaaggag 627  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  8476 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttgaattgacttgaaaatgatttttggttttttgagttatgatgaaaatactccaaggag 8377  T
Q  628 gtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagtt 727  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||| || || |||||||||||||| |   ||||||  | ||| || |  ||||||||| ||    
T  8376 gtcttagtgaaattttatgaaaattctgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgaatt 8278  T
Q  728 caattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 761  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8277 caattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 8244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 106; Significance: 2e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 626 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 21200 - 21059
Alignment:
Q  626 aggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgag 725  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  21200 aggtctcagtgaaattttatgaaaattcagcacaaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgag 21101  T
Q  726 ttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 767  Q
    |||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21100 ttcaattaagggttttaagagcatttaacctatgttgtgagt 21059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 774 - 821
Target Start/End: Original strand, 36193 - 36240
Alignment:
Q  774 ttggggtaggaatggaggttgttaatgattataatgaggttcagagag 821  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  36193 ttggggtaggaatagaagttgttaatgattataataaggttgagagag 36240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 105; Significance: 6e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 529 - 764
Target Start/End: Complemental strand, 10356 - 10132
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| |||| | ||| ||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10356 catgaaagttttagaaaattgtgttagatttcaagtggttttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaagtagg 10257  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||| | ||||||||| || ||          |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||     
T  10256 tcttagtgaatt-ttatgaaaagtccgc----------ctaagtcaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 10168  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtg 764  Q
    ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||    
T  10167 aattaaggggtttgagagtatttaacctatgttgtg 10132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 105; Significance: 6e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 18820 - 18585
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||| || ||||||||||||| || |||||| || |||||| |||| |||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||| |    
T  18820 catgaaagttgtagatatttgtgttagctttccagtgactttggtttgacttgataatggtttttgtttttcgagttatgatgaaaatactccaaggaag 18721  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| |   ||||||  | ||| || |  |||||||||||||    
T  18720 tcttagagaaatcttatgaaaattctgcataactatttctaagtcaatccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttc 18622  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18621 aattaaggtgtttaagagtatttaacatatgttgtga 18585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 529 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 28559 - 28494
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgattttta 594  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||||| || || |  ||||||||||||    
T  28559 catgaaagttgtagataatttttttagttttctaatggctttggtttgacgtccaaatgattttta 28494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 104; Significance: 2e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 529 - 760
Target Start/End: Original strand, 11603 - 11833
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| || |||| |||||||||| ||  |||||||||||| || || ||  ||||| |||    
T  11603 catgaaagttctagataatttagttagctttccaatgggtttggtttgacttaaaaatgatttatagattttgagatatggtggaattaacccaagcagg 11702  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||| || || | ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||| |||||     
T  11703 tcttggtaaatttttatggaaattcagcataaccgtttctaaatcaatccaaaacttatggaatatttccaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 11802  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgt 760  Q
    ||||| |  |||||||||| ||||||||||||    
T  11803 aattaagaggtttaagagt-tttaacctatgt 11833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 102; Significance: 4e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 634 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 33469 - 33336
Alignment:
Q  634 gtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaatta 733  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33469 gtgaaatcttatgaaaattcagaataaccatttctaagttaatccaaaacttatgagataattccaaacctcaaaactagaagcactatgagttcaatta 33370  T
Q  734 gggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 767  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33369 aggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 33336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 532 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 33764 - 33648
Alignment:
Q  532 gaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtct 631  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||| || |||||||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33764 gaaagttgtagataattgtgttagctttccagtgactttggtttgacttgaaaatgagttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccgaggaggtct 33665  T
Q  632 tagtgaaatcttatgaa 648  Q
    ||||||| | |||||||    
T  33664 tagtgaatttttatgaa 33648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 101; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 529 - 761
Target Start/End: Original strand, 18050 - 18281
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||| || |||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  18050 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggatttggtttgacttgaaaatcatgttttgtttttgagttatgatgaaaatactccaagcagg 18149  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||| || || |||||||||||||| |   ||||||  | ||| || |  ||| |||||||||    
T  18150 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtattatgagttc 18248  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 761  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18249 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 18281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0048 (Bit Score: 101; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0048
Description:

Target: scaffold0048; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 533 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 56628 - 56401
Alignment:
Q  533 aaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtctt 632  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| || ||||| |||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  56628 aaagttgtagataattgtgttagctttccattggttttggtttaacttgcaaatgatttttggttttggagttatgatgaaaatactccaaggaggtctt 56529  T
Q  633 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaatt 732  Q
    ||| |||| |||||||||||| |||||||  |||||| || || |||||||||||||| |   ||||||  | ||| || |  |||||||||||||||||    
T  56528 agtaaaattttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaatt 56430  T
Q  733 agggtgtttaagagtatttaacctatgtt 761  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||    
T  56429 aaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 56401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468 (Bit Score: 100; Significance: 6e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0468
Description:

Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 529 - 760
Target Start/End: Original strand, 11614 - 11844
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| || | ||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||    
T  11614 catgaaagtttaagataattgtgttagctttccagtggatttggtttaatttgaaaatgatttttagattttgagttatgatggaaatactccaaggcgg 11713  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||| || |||| |||||||||||  |||||||  ||||||||| || |||||||||||||| |  ||||||| || |||||||||||||||| |||||     
T  11714 tcttggtaaaattttatgaaaatttcgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtttccaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 11813  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgt 760  Q
    |||||  | | |||||||||||||||||||||    
T  11814 aatta-agaggttaagagtatttaacctatgt 11844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409 (Bit Score: 100; Significance: 6e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0409
Description:

Target: scaffold0409; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 529 - 760
Target Start/End: Original strand, 2176 - 2406
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||  ||| |||||||||| ||  |||||||||||| || || ||| ||||| |||    
T  2176 catgaaagttttagataatttagttagatttccaatggttttggtttgccttaaaaatgatttatagattttgagatatggtggaattaccccaagtagg 2275  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||| || || | ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||| |||||     
T  2276 tcttggtaaatttttatggaaattcagcataaccgtttctaaatcaatccaaaacttatggaatatttccaaacctcaaaactagaagaactaggagttt 2375  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgt 760  Q
    ||||| |  |||||||||| ||||||||||||    
T  2376 aattaagaggtttaagagt-tttaacctatgt 2406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 529 - 760
Target Start/End: Original strand, 10431 - 10661
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||  ||| |||||||||| ||  |||||||||||| || || ||| ||||| |||    
T  10431 catgaaagttttagataatttagttagatttccaatggttttggtttgccttaaaaatgatttatagattttgagatatggtggaattaccccaagtagg 10530  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||| || || | ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||| |||||     
T  10531 tcttggtaaatttttatggaaattcagcataaccgtttctaaatcaatccaaaacttatggaatatttccaaacctcaaaactagaagaactaggagttt 10630  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgt 760  Q
    ||||| |  |||| ||||| ||||||||||||    
T  10631 aattaagaggtttgagagt-tttaacctatgt 10661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1160 (Bit Score: 97; Significance: 4e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold1160
Description:

Target: scaffold1160; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 529 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 341 - 110
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||  ||||||     
T  341 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggttttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactgtaaggaga 242  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| |||||||||||  |||||||  |||||| || || | |||||||||||| |   ||||||  | ||| || |  |||||||||||||    
T  241 tcttagtgaaattttatgaaaatttcgcataactatttctaggtcaacctaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttc 143  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 761  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  142 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 97; Significance: 4e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 529 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 62374 - 62143
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||| | |||||| |||||  ||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  62374 catgaaagttgtagataactgtgttagatttcccgtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatagtccaaggagg 62275  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||   ||||| || || |||||||||||||| |   ||||||  | ||| || |  ||||||||| |||    
T  62274 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactacttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgaattc 62176  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 761  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  62175 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 62143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 529 - 593
Target Start/End: Original strand, 39305 - 39369
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgattttt 593  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | || || |||||||||||||||||    
T  39305 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccaatggcgtcggtttgacttgaaaatgattttt 39369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103 (Bit Score: 94; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0103
Description:

Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 529 - 758
Target Start/End: Complemental strand, 32899 - 32671
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| |||||||||| ||  |||| |||||||||| || ||| ||||| | |    
T  32899 catgaaagttttagataattttgttatctttccaatggctttggtttgacttaaaaatgatttctagatttttagatatgatggaattaccccaagcaag 32800  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||  | || | ||||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||| |||||     
T  32799 tcttgataaatttttatgaaaatt-agcataatcgtttctaaatcaatccaaaacttatggaatgtttccaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 32701  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctat 758  Q
    ||||| |  |||  ||||||||||||||||    
T  32700 aattaagaagttggagagtatttaacctat 32671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 93; Significance: 9e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 529 - 673
Target Start/End: Original strand, 2449 - 2593
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||  || |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  2449 catgaaagttttagataattgtgttagctttccagttgctttgatttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatagtccaaggagg 2548  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtt 673  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  2549 tcttagtaaaatcttatgaaaattcagcataattgtttctaagtt 2593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 671 - 765
Target Start/End: Original strand, 3059 - 3153
Alignment:
Q  671 gttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3059 gttaatccaaaacttatggaataattccaaaactcaaaactagaagtattatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 3153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 93; Significance: 9e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Original strand, 7251 - 7485
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7251 catgaatgttttagataattgtgttagctttccagtggatttggtttgacttgaaaattatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 7350  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||  |||||||||||| |||||||  ||||||||| || || |||||||||| ||  |  ||||  | ||| || |  ||||| |||||||    
T  7351 tcttagtgaaagtttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaaccccaaacttatgg-attgtctcaaacttcaaagcttg-tgtactgtgagttc 7448  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  7449 aattaaggtgtttaaaagtatttaacctaagttgtga 7485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 530 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 14542 - 14424
Alignment:
Q  530 atgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggt 629  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  |    | ||||||||||||  |||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14542 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttagtgtggagtaaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggt 14443  T
Q  630 cttagtgaaatcttatgaa 648  Q
    ||||||||| | |||||||    
T  14442 cttagtgaatttttatgaa 14424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 90; Significance: 5e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 529 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 2543 - 2403
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  2543 catgaaagttgtagataattttgttag-tttccaatggctttggttagacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactacaaagagg 2445  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaa 670  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2444 tcttagtgaagttttatgaaaattcagcataaccgtttctaa 2403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086 (Bit Score: 89; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0086
Description:

Target: scaffold0086; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 529 - 765
Target Start/End: Original strand, 35913 - 36148
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  | || |||||||||||||||||   |||| || |||||||||||||||| ||||| |    
T  35913 catgaaagttttagataattttgctagctttccaatgacttcagttttacttgaaaatgattttttgctttttagttatgatgaaaatactcaaaggatg 36012  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| |||||||  ||||||||| ||  ||||||||||| | |   ||||||  | ||| || |  |||||| |||||     
T  36013 tcttagtgaaattttataaaaattccgcataactatttctaagtcaactcaaaacttatgtattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactaggagttt 36111  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36112 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 36148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 88; Significance: 9e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 626 - 749
Target Start/End: Original strand, 19945 - 20068
Alignment:
Q  626 aggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgag 725  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  || |||||||||||| |||||||    
T  19945 aggtcatagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagttctatgag 20044  T
Q  726 ttcaattagggtgtttaagagtat 749  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
T  20045 ttcaattaaggtgtttaagagtat 20068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 529 - 648
Target Start/End: Original strand, 19655 - 19774
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||| | || || ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19655 catgaaaattgtagataattgtgttagctttccattggctttagtttgacatgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 19754  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaa 648  Q
    |||||||||| | |||||||    
T  19755 tcttagtgaatttttatgaa 19774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 88; Significance: 9e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 792 - 962
Target Start/End: Complemental strand, 14534 - 14352
Alignment:
Q  792 ttgttaatgattataatgaggttcagagaggatgaataagatgatttatattgatgatt-------------aaatgtgaaaatatttatatattgtgaa 878  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||             ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  14534 ttgttaatgattataatgaggttcagagaggatgaataagatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatattcatataatgtgaa 14435  T
Q  879 agacgttgatatgaaattgtaatttgttatatatgaaaattattattgatggttacttgatgtgtatgtttaaatgatgatgtc 962  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  14434 agacgttgatatgaagttgtaa-ttgttatataagatgattattattgatggtgacttgatgcatatgtttaaatgatgttgtc 14352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1351 (Bit Score: 84; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold1351
Description:

Target: scaffold1351; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 831 - 962
Target Start/End: Complemental strand, 1708 - 1578
Alignment:
Q  831 gatgatttatattgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaatttgttatatatgaaaattattattgatgg 930  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  1708 gatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaa-ttgttatataagatgattattattgatgg 1610  T
Q  931 ttacttgatgtgtatgtttaaatgatgatgtc 962  Q
    | ||||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  1609 tgacttgatgcatatgtttaaatgatgttgtc 1578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 82; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 529 - 759
Target Start/End: Original strand, 13168 - 13402
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgaga----tatgatgaaaatactccaag 624  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||| ||||  || ||||     ||||||||||| |||| |||    
T  13168 catgaaagttttagataattgtgttagctttccagtggttttggtttgacttgaaaatgatatttaggttgtgagtgagttatgatgaaaacactcgaag 13267  T
Q  625 gaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatga 724  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||| || |||||||||||||| |  | |||||  | ||||||| ||||| || ||    
T  13268 gaggtcttggtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgttcccaaacttcaaaactataagtattacga 13367  T
Q  725 gttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatg 759  Q
    ||| ||||| |  ||||||||||||||||| ||||    
T  13368 gtttaattaagaggtttaagagtatttaacatatg 13402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0414 (Bit Score: 81; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0414
Description:

Target: scaffold0414; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 529 - 761
Target Start/End: Original strand, 11743 - 11974
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||   |||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||    
T  11743 catgaaagttgtagataattgtgttagatttccagtggctttggttttggttgaaaatgatttttggtttttgagttataatgaaaatactccaaggggg 11842  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    |||||||||||| |||||||||||   ||||||  |||||| || || | |||||||||||| |   ||||||  | ||| || |  ||| |||||||||    
T  11843 tcttagtgaaattttatgaaaatttcacataactatttctaggtcaaccgaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtattatgagttc 11941  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 761  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  11942 aattaaggtgcttaagagtatttaacctatgtt 11974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 81; Significance: 1e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 529 - 649
Target Start/End: Original strand, 24459 - 24579
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  24459 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggttttacttgaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatactccaaagaga 24558  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaa 649  Q
    |||||||||||| ||||||||    
T  24559 tcttagtgaaattttatgaaa 24579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 716 - 761
Target Start/End: Original strand, 24586 - 24631
Alignment:
Q  716 gtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 761  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24586 gtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 24631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 79; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 540 - 765
Target Start/End: Original strand, 18533 - 18758
Alignment:
Q  540 tagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaa 639  Q
    |||| |||| |||||||||| || |||| | || || ||| ||| || ||||||  |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18533 tagacaattgtgttagctttacagtggcgtcggtttgactcgaatataatttttggtttttgatttatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaa 18632  T
Q  640 tcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgt 739  Q
    | |||||||||||| |||||||  ||||||||| || |||||||||||||| |   |||||| ||| ||| |    |||||||||||||||||| |||||    
T  18633 ttttatgaaaattcggcataactatttctaagtcaaaccaaaacttatggattgtctccaaa-cttcaaagtctgtgtactatgagttcaattaaggtgt 18731  T
Q  740 tt-aagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  18732 ttaaagagtatttaacctatgttgtga 18758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 78; Significance: 8e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 529 - 638
Target Start/End: Original strand, 16384 - 16493
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  16384 catgaaagttttagataattttgttagatttccaatggctttggtttgacttcaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaagtagg 16483  T
Q  629 tcttagtgaa 638  Q
    ||||||||||    
T  16484 tcttagtgaa 16493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 687 - 765
Target Start/End: Original strand, 16524 - 16602
Alignment:
Q  687 tggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||||||||| ||| || ||||||| |||||||| || || ||||| ||  ||||| | |||||||||||||||||||    
T  16524 tggaataattcaaaacctcaaaactataagtactaggaatttaattaagggttttaaaaatatttaacctatgttgtga 16602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422 (Bit Score: 76; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0422
Description:

Target: scaffold0422; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 529 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 3619 - 3500
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  3619 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactcgaaaatgatatttggtttttgagatatgacgaaaataatccaaggagg 3520  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaa 648  Q
    |||||||||| | |||||||    
T  3519 tcttagtgaatttttatgaa 3500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2015 (Bit Score: 75; Significance: 5e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold2015
Description:

Target: scaffold2015; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 529 - 627
Target Start/End: Original strand, 79 - 177
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggag 627  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  79 catgaaagtcgtagataattttgttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggag 177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0516 (Bit Score: 75; Significance: 5e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0516
Description:

Target: scaffold0516; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 540 - 690
Target Start/End: Original strand, 8027 - 8177
Alignment:
Q  540 tagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaa 639  Q
    ||||||||| |||||| |||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||  |||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  8027 tagataattgtgttagatttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatatttggtttttgagttatgaagaaaataccacaaggaggtcttagtgaaa 8126  T
Q  640 tcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgga 690  Q
    | |||||||||||| |||||||  ||||| ||| || ||||||||||||||    
T  8127 ttttatgaaaattccgcataactatttcttagtcaacccaaaacttatgga 8177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200 (Bit Score: 73; Significance: 8e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0200
Description:

Target: scaffold0200; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 633 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 17952 - 17836
Alignment:
Q  633 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaatt 732  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||  || ||||||| |||| ||||||||||||||    
T  17952 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagtttatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactataagttctatgagttcaatt 17853  T
Q  733 agggtgtttaagagtat 749  Q
    | | |||||||||||||    
T  17852 aagatgtttaagagtat 17836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 531 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 18247 - 18130
Alignment:
Q  531 tgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtc 630  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| | || || ||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18247 tgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcttttgtttgacatgaaaataatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtc 18148  T
Q  631 ttagtgaaatcttatgaa 648  Q
    |||||||| | |||||||    
T  18147 ttagtgaatttttatgaa 18130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0436 (Bit Score: 72; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0436
Description:

Target: scaffold0436; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 529 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 8614 - 8495
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8614 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgaattgaaaatgatattttgtttttgagatatgatgaaaataatccaaggagg 8515  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaa 648  Q
    |||||||||| | |||||||    
T  8514 tcttagtgaatttttatgaa 8495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0815 (Bit Score: 69; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0815
Description:

Target: scaffold0815; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 846 - 962
Target Start/End: Complemental strand, 611 - 496
Alignment:
Q  846 tgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaatttgttatatatgaaaattattattgatggttacttgatgtgtat 945  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||  |||    
T  611 tgattaaatgagaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattataa-ttgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatat 513  T
Q  946 gtttaaatgatgatgtc 962  Q
    ||| |||||||| ||||    
T  512 gttaaaatgatgttgtc 496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 67; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 530 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 21343 - 21225
Alignment:
Q  530 atgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggt 629  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | | ||||||||||||  |||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21343 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggt 21244  T
Q  630 cttagtgaaatcttatgaa 648  Q
    ||||||||| | |||||||    
T  21243 cttagtgaatttttatgaa 21225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 65; Significance: 5e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 537 - 661
Target Start/End: Original strand, 7781 - 7905
Alignment:
Q  537 ttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtg 636  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || | || ||||||||||||  |||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7781 ttttagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgaattaaaaatgatttttggtttgagagttttgatgaaaatactccaaggaggtcttagtg 7880  T
Q  637 aaatcttatgaaaattcagcataac 661  Q
    |||| ||| |||||||| |||||||    
T  7881 aaattttacgaaaattccgcataac 7905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 716 - 764
Target Start/End: Original strand, 7929 - 7977
Alignment:
Q  716 gtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtg 764  Q
    |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  7929 gtactatgagtttaattaaggtgcttaagagtatttaacctctgttgtg 7977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1278 (Bit Score: 63; Significance: 7e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold1278
Description:

Target: scaffold1278; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 529 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 1109 - 880
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||| |||  ||||  ||| | || ||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||  ||    
T  1109 catgaaagttttatataattgtgttagatttataatgattttagtttgacttgaaaatgatttttatattttaagttatgatgaaaatactccaagtggg 1010  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttc 728  Q
    ||||||  |||  |||  |||||||||||||||| ||||| ||| || ||||| |||||||  |  |||||||    ||||||  | ||||| |||||||    
T  1009 tcttaggaaaactttacaaaaattcagcataaccatttcttagtcaacccaaagcttatggtttgtttccaaactccaaaact-tatgtactttgagttc 911  T
Q  729 aattagggtgtttaagagtatttaacctatg 759  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  910 aattaaggtgtttaagggtatttaacctatg 880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 60; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 529 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 11885 - 11766
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    | || |||||||||  |||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11885 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttagagtaaacatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggagg 11786  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaa 648  Q
    |||||||||| | |||||||    
T  11785 tcttagtgaatttttatgaa 11766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 58; Significance: 7e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 676 - 757
Target Start/End: Original strand, 2377 - 2458
Alignment:
Q  676 tccaaaacttatggaataattccaaatcttaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaaccta 757  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  2377 tccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatttaaccta 2458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0434 (Bit Score: 57; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0434
Description:

Target: scaffold0434; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 829 - 901
Target Start/End: Original strand, 6767 - 6839
Alignment:
Q  829 aagatgatttatattgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaat 901  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  6767 aagatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatggagttgtaat 6839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1405 (Bit Score: 56; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold1405
Description:

Target: scaffold1405; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 351 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 1403 - 1217
Alignment:
Q  351 aagttgtagatatggatgttatctgtccctcgactttggaggtactcgatttaagcacatagaactcaagttatgatcaaattactacacaggggtcagc 450  Q
    |||||||||||||||||||||  | || || | |||| |||| |||| ||||||| |  ||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  1403 aagttgtagatatggatgttaaatttcactagcctttagagggactctatttaagtatctagaactcaatatatgatgaaaatactacacaggggtcagc 1304  T
Q  451 acagttgtcctcttttcccgagcataggaaaatctacttttctggaattttttgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagtt 538  Q
    |  || |||||||||  || | ||||| || ||| | |||||||  | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1303 agggtcgtcctctttctccaaacatagaaatatcaa-ttttctgccactttatgttctgaattaggtttggaagtcttcatgaaagtt 1217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 56; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 534 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 168 - 53
Alignment:
Q  534 aagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcac-ttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtctt 632  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |  ||||||||||||  |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  168 aagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttggcgtaaaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtctt 69  T
Q  633 agtgaaatcttatgaa 648  Q
    |||||| | |||||||    
T  68 agtgaatttttatgaa 53  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 55; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 530 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 9836 - 9718
Alignment:
Q  530 atgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggt 629  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    | ||||| || |||  |||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9836 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttggagtaaaaattatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggt 9737  T
Q  630 cttagtgaaatcttatgaa 648  Q
    ||||||||| | |||||||    
T  9736 cttagtgaatttttatgaa 9718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0127 (Bit Score: 52; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0127
Description:

Target: scaffold0127; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 529 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 9696 - 9601
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaag 624  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||||||||  |||  ||| ||||||||||||||| ||||    
T  9696 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatacttcaag 9601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 50; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 10711 - 10650
Alignment:
Q  17 aggttttagaatttgagagattagaattaaaagatgaaattgaaagtttcgaattaaggaaa 78  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  10711 aggttttagaatttgagagattagaattaaaagatgaaattcaaagttgagaattaaggaaa 10650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0956 (Bit Score: 49; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0956
Description:

Target: scaffold0956; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 529 - 613
Target Start/End: Original strand, 2319 - 2403
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaa 613  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  2319 catgaaagttgtagataattgcgttagctttctagtggctttggtttgacttgaaaatgattttttgtttttgagatatgatgaa 2403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0381 (Bit Score: 48; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0381
Description:

Target: scaffold0381; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 304 - 543
Target Start/End: Original strand, 11918 - 12157
Alignment:
Q  304 cagtttgacaagtttaagtttcaaactgagtttaggtgccttcacgtaagttgtagatatggatgttatctgtccctcgactttggaggtactcgattta 403  Q
    ||||||| ||||||||||||   || || ||||||||| ||| |   || ||||||||||||||||||  | || || | |||| || | |||| |||||    
T  11918 cagtttggcaagtttaagttatgaattgggtttaggtgtctttataaaatttgtagatatggatgttagttttcactagcctttagatggactcaattta 12017  T
Q  404 agcacatagaactcaagttatgatcaaattactacacaggggtcagcacagttgtcctcttttcccgagcataggaaaatctacttttctggaatttttt 503  Q
    |  |  ||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||  ||||| || ||| ||| | | |||||||||| ||||||||   | ||| |    
T  12018 aaaatctagaaatcaagatatgatcaaaatactacacaagggtcaacaaggttgtgctttttccccaaacttaggaaaatcaacttttctaccactttct 12117  T
Q  504 gttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttttaga 543  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  12118 tttctgaattaggtttgggagtattcatgaaagttgtaga 12157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 46; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 706 - 763
Target Start/End: Complemental strand, 2419 - 2362
Alignment:
Q  706 aaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 763  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||    
T  2419 aaaactagaagtactatgagttcaattaagatgtttaagagtatttaacccatgttgt 2362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1662 (Bit Score: 45; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1662
Description:

Target: scaffold1662; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 713 - 765
Target Start/End: Original strand, 1 - 53
Alignment:
Q  713 gaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 765  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1 gaagtgctatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 53  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 45; Significance: 4e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 529 - 613
Target Start/End: Original strand, 174544 - 174628
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaa 613  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  174544 catgaaagttgtagataattgcgttagccttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgatatatgatgaa 174628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 529 - 559
Target Start/End: Original strand, 167108 - 167138
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagcttt 559  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  167108 catgaaagttttagataattttgttagcttt 167138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 45; Significance: 4e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 903 - 955
Target Start/End: Complemental strand, 85352 - 85300
Alignment:
Q  903 tgttatatatgaaaattattattgatggttacttgatgtgtatgtttaaatga 955  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  85352 tgttatatatgaagattattattgatggttacttgatgtatatgtttaaatga 85300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 832 - 901
Target Start/End: Complemental strand, 85275 - 85207
Alignment:
Q  832 atgatttatattgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaat 901  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  85275 atgatttactttgatgattaa-tgtgagaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaat 85207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0810 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0810
Description:

Target: scaffold0810; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 757 - 839
Target Start/End: Complemental strand, 3192 - 3112
Alignment:
Q  757 atgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttgttaatgattataatgaggttcagagaggatgaataagatgattta 839  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||| || || ||  |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3192 atgttatgagttgaccattggggtaggactgaagctt--taatgattataacgaggttcagagaggatgattaagatgattta 3112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0810; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 842 - 901
Target Start/End: Complemental strand, 3062 - 3004
Alignment:
Q  842 ttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaat 901  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  3062 ttgatgattaa-tgtgagaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaat 3004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0695 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0695
Description:

Target: scaffold0695; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 529 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 6542 - 6423
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    ||||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||| | ||  | |||||||||||||||||  |||  ||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  6542 catgaaagttgcagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtgtgacttgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgcaaatactcaaaggagg 6443  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaa 648  Q
    ||||| |||| | |||||||    
T  6442 tcttaatgaatttttatgaa 6423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 5)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 530 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 134805 - 134687
Alignment:
Q  530 atgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttt-taatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  | | |||||  |||| || |||  ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  134805 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttcgttttgcgt-aaaatatttttatagtttaggagttatgatgacaatactccaaggagg 134707  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaa 648  Q
    |||||||||| | |||||||    
T  134706 tcttagtgaatttttatgaa 134687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 530 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 137274 - 137156
Alignment:
Q  530 atgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttt-taatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  | | |||||  |||| || |||  ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  137274 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttcgttttgcgt-aaaatatttttatagtttaggagttatgatgacaatactccaaggagg 137176  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaa 648  Q
    |||||||||| | |||||||    
T  137175 tcttagtgaatttttatgaa 137156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 530 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 139743 - 139625
Alignment:
Q  530 atgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttt-taatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  | | |||||  |||| || |||  ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  139743 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttcgttttgcgt-aaaatatttttatagtttaggagttatgatgacaatactccaaggagg 139645  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaa 648  Q
    |||||||||| | |||||||    
T  139644 tcttagtgaatttttatgaa 139625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 530 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 142212 - 142094
Alignment:
Q  530 atgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttt-taatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  | | |||||  |||| || |||  ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  142212 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttcgttttgcgt-aaaatatttttatagtttaggagttatgatgacaatactccaaggagg 142114  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaa 648  Q
    |||||||||| | |||||||    
T  142113 tcttagtgaatttttatgaa 142094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 530 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 144681 - 144563
Alignment:
Q  530 atgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttt-taatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  | | |||||  |||| || |||  ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  144681 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttcgttttgcgt-aaaatatttttatagtttaggagttatgatgacaatactccaaggagg 144583  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaa 648  Q
    |||||||||| | |||||||    
T  144582 tcttagtgaatttttatgaa 144563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 94 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 11909 - 11779
Alignment:
Q  94 gaattgagtttctagtcttaaaaagagtggataatacagtaggttgatgaataattattgttataatgatagggtgatcatagggtaatgattagggtta 193  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| | ||| ||||| ||||  |||||||||||  |||| | || | |||||||||      
T  11909 gaattgagtttttagtcttaaaaagagtggataatcaagtaggttcacgaagaattagtgtttgaatgatagggtagtcatggagtgaagattagggtcg 11810  T
Q  194 tgtttggagagtattggatcgaaaacggagt 224  Q
     |||||| |||| | || |||||||||||||    
T  11809 agtttggtgagtttagggtcgaaaacggagt 11779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 529 - 672
Target Start/End: Original strand, 35026 - 35169
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||| || ||||| |||| |||| || |||||||||| || |||  |||||||| ||||| |||||||||| ||||| |    
T  35026 catgaaagttttagagaattgagttggcattccattggccttggtttgacttgaaaataatattttgtttttgagttatgaagaaaatactctaaggatg 35125  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagt 672  Q
    | ||| | |||  ||| |||||||| ||| ||  ||||||||||    
T  35126 ttttaataaaactttaggaaaattccgcacaattgtttctaagt 35169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1753 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1753
Description:

Target: scaffold1753; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 529 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 958 - 893
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgattttta 594  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || || || ||||||||||||    
T  958 catgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacgtgcaaatgattttta 893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1164 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1164
Description:

Target: scaffold1164; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 529 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 1000 - 935
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgattttta 594  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||||||||||    
T  1000 catgaaagttttagataattgtgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgattttta 935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0385 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0385
Description:

Target: scaffold0385; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 16140 - 16052
Alignment:
Q  40 gaattaaaagatgaaattgaaagtttcgaattaaggaaaactagtttatg-tttcgaattgagtttctagtcttaaaaagagtggataat 128  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |   |||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16140 gaattgaaagatgaaattgaaagatgacaattgaggaaaactagtttaagtttttgaattgagttt-tagtcttaaaaagagtggataat 16052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 299 - 448
Target Start/End: Original strand, 1110 - 1259
Alignment:
Q  299 tgtcgcagtttgacaagtttaagtttcaaactgagtttaggtgccttcacgtaagttgtagatatggatgttatctgtccctcgactttggaggtactcg 398  Q
    |||| ||||||||||||||||||||   ||||| ||||| ||| ||||| | |||||| ||||||||||| ||||| || || | ||||||||  |||||    
T  1110 tgtctcagtttgacaagtttaagttctgaactgggtttaagtgtcttcatgaaagttgcagatatggatggtatctttcactagcctttggagtgactcg 1209  T
Q  399 atttaagcacatagaactcaagttatgatcaaattactacacaggggtca 448  Q
    ||||||||   ||||| || |  |||||||||  || |||||||||||||    
T  1210 atttaagcgtctagaaatctatatatgatcaatatattacacaggggtca 1259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 832 - 901
Target Start/End: Original strand, 36142 - 36210
Alignment:
Q  832 atgatttatattgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaat 901  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  36142 atgatttactttgatgattaa-tgtgagaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaat 36210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1404 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1404
Description:

Target: scaffold1404; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 529 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 1465 - 1422
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgg 572  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1465 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatggctttgg 1422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0315
Description:

Target: scaffold0315; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 529 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 18295 - 18252
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgg 572  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18295 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatggctttgg 18252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 529 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 37949 - 37886
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttt 592  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||||||||    
T  37949 catgaaagttttagataattatgttagctttcaaatggctttggtttgacttccaaatgatttt 37886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 529 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 40995 - 40932
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttt 592  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||| || |||| | || || ||||||||||||||||    
T  40995 catgaaagttgtagataattgtgttagctttacagtggcatcggtttgacttgaaaatgatttt 40932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 529 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 30560 - 30495
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgattttta 594  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || || |  ||||||||||||    
T  30560 catgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgattttta 30495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 529 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 38465 - 38400
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgattttta 594  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||  |  ||||||||||||    
T  38465 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgattttta 38400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 410 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 38401 - 38363
Alignment:
Q  410 tagaactcaagttatgatcaaattactacacaggggtca 448  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38401 tagaactcgagttatgatcaaattactacacatgggtca 38363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 529 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 54036 - 53971
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgattttta 594  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||  ||||||||||||    
T  54036 catgaaagttttagataattatgttaactttctaatggctttggtttgactttcaaatgattttta 53971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1137 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold1137
Description:

Target: scaffold1137; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 883 - 962
Target Start/End: Original strand, 2300 - 2378
Alignment:
Q  883 gttgatatgaaattgtaatttgttatatatgaaaattattattgatggttacttgatgtgtatgtttaaatgatgatgtc 962  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||| || ||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  2300 gttgatatgaagttgaaatt-gttgtacatgaagattattaatgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgctgtc 2378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1043 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1043
Description:

Target: scaffold1043; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 410 - 451
Target Start/End: Original strand, 951 - 992
Alignment:
Q  410 tagaactcaagttatgatcaaattactacacaggggtcagca 451  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  951 tagaactcaagatatgatcaaaatactacacaggggtcagca 992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0513
Description:

Target: scaffold0513; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 832 - 901
Target Start/End: Original strand, 10963 - 11031
Alignment:
Q  832 atgatttatattgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaat 901  Q
    ||||||||  ||||||||| | ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  10963 atgatttactttgatgattta-tgtgagaatatttatatattgtaaaagatgttgatatgaagttgtaat 11031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 529 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 15868 - 15803
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgattttta 594  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||| || ||||  ||||||||||||    
T  15868 catgaaagttttagataattaagttagatttctaatggctttggtttgacttccaaatgattttta 15803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0173 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0173
Description:

Target: scaffold0173; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 529 - 690
Target Start/End: Complemental strand, 4841 - 4680
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 628  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||| || |||||  ||| |||| || |||||||||| || | |  |||||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  4841 catgaaagttttagacaattgagttggcattccataggccttggtttgacttgaaaataatgtgttgtttttgagttatgaagaaaatactctaaggagg 4742  T
Q  629 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgga 690  Q
    | ||  | |||  ||| |||||||| ||| ||  |||||||||| || ||||| ||||||||    
T  4741 ttttgataaaactttacgaaaattccgcacaattgtttctaagtcaacccaaaccttatgga 4680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0094 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0094
Description:

Target: scaffold0094; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 76 - 224
Target Start/End: Original strand, 2637 - 2785
Alignment:
Q  76 aaaactagtttatgtttc-gaattgagtttctagtcttaaaaagagtggataatacagtaggttgatgaataattattgttataatgatagggtgatcat 174  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||   | ||||| | ||| ||||| ||||  ||| |||||||||| ||    
T  2637 aaaactagtttaagtttttgaattgagttt-tagtcttaaaaagagtggataatctggcaggttaacgaagaattagtgtttgaataatagggtgatgat 2735  T
Q  175 agggtaatgattagggttatgtttggagagtattggatcgaaaacggagt 224  Q
     | || | |||| |||||  |||||| |||| | || |||||||||||||    
T  2736 ggagtgaagattcgggttgggtttggcgagtttagggtcgaaaacggagt 2785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0377 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0377
Description:

Target: scaffold0377; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 774 - 814
Target Start/End: Original strand, 16753 - 16793
Alignment:
Q  774 ttggggtaggaatggaggttgttaatgattataatgaggtt 814  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  16753 ttggggtaggaatgaaagttgttaatgattataatgaggtt 16793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 622 - 690
Target Start/End: Original strand, 40902 - 40970
Alignment:
Q  622 aaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgga 690  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||  | || ||||||||||||||    
T  40902 aaggaggtcttggtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctatatcaaaccaaaacttatgga 40970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 537 - 592
Target Start/End: Original strand, 40834 - 40889
Alignment:
Q  537 ttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttt 592  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| || | ||||||||||||||    
T  40834 ttttagataattgtgttagctttccactagctttggtttgaattgaaaatgatttt 40889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1559 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1559
Description:

Target: scaffold1559; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 419 - 458
Target Start/End: Original strand, 696 - 735
Alignment:
Q  419 agttatgatcaaattactacacaggggtcagcacagttgt 458  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  696 agttatgatcaaaatactacacatgggtcagcacagttgt 735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 529 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 13988 - 13909
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgatttttaatttttgagatatg 608  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||  | || || |||||||||||| ||||  |||||||| ||||    
T  13988 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggaatcggtttgacttgaaaatgagttttggtttttgagttatg 13909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 529 - 571
Target Start/End: Original strand, 110084 - 110126
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttg 571  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  110084 catgaaagttttagataattacgttagctttctaatggctttg 110126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 529 - 571
Target Start/End: Original strand, 118585 - 118627
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttg 571  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  118585 catgaaagttttagataattacgttagctttctaatggctttg 118627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 533 - 594
Target Start/End: Original strand, 1279 - 1340
Alignment:
Q  533 aaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgattttta 594  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || | ||  ||||||||||||    
T  1279 aaagttttagataattgtgttagctttctaatggttttggtttgatttccaaatgattttta 1340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 529 - 594
Target Start/End: Original strand, 32126 - 32191
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgattttta 594  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||| || || |  ||||||||||||    
T  32126 catgaaagttttaggtaattaagttagctttctaatggctttggtttaacgtccaaatgattttta 32191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0170 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0170
Description:

Target: scaffold0170; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 410 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 17781 - 17740
Alignment:
Q  410 tagaactcaagttatgatcaaattactacacaggggtcagca 451  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  17781 tagaactcaagatatgatcaaaatactacacatgggtcagca 17740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 529 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 40718 - 40653
Alignment:
Q  529 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgggttcacttgaaaatgattttta 594  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||| || || |  ||||||||||||    
T  40718 catgaaagttttaggtaattaagttagctttctaatggctttggtttaacgtccaaatgattttta 40653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University