View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5921_high_51 (Length: 345)

Name: NF5921_high_51
Description: NF5921
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5921_high_51
NF5921_high_51
[»] scaffold0264 (1 HSPs)
scaffold0264 (18-342)||(3379-3703)
[»] chr6 (30 HSPs)
chr6 (18-342)||(16789345-16789669)
chr6 (18-342)||(22859592-22859916)
chr6 (18-342)||(1585812-1586136)
chr6 (18-342)||(27508051-27508375)
chr6 (32-342)||(27525265-27525575)
chr6 (18-339)||(33317139-33317462)
chr6 (18-342)||(14074754-14075079)
chr6 (19-342)||(8613194-8613519)
chr6 (36-342)||(18019532-18019839)
chr6 (32-342)||(20736032-20736343)
chr6 (18-237)||(17120315-17120533)
chr6 (26-342)||(22559898-22560214)
chr6 (34-212)||(21994878-21995055)
chr6 (34-342)||(19735222-19735529)
chr6 (32-252)||(19218712-19218931)
chr6 (17-342)||(10358757-10359080)
chr6 (18-257)||(4073849-4074088)
chr6 (17-86)||(11652181-11652250)
chr6 (17-86)||(17684149-17684218)
chr6 (17-86)||(17691120-17691189)
chr6 (216-342)||(21995430-21995558)
chr6 (17-86)||(27380932-27381001)
chr6 (17-86)||(27471315-27471384)
chr6 (17-86)||(29309348-29309417)
chr6 (17-86)||(29316307-29316376)
chr6 (17-86)||(27297087-27297156)
chr6 (17-99)||(16559139-16559221)
chr6 (17-62)||(16394149-16394194)
chr6 (17-86)||(25536871-25536940)
chr6 (232-296)||(17119024-17119088)
[»] chr4 (41 HSPs)
chr4 (18-342)||(18110747-18111071)
chr4 (18-342)||(17299663-17299987)
chr4 (18-342)||(2677287-2677611)
chr4 (18-342)||(15815295-15815619)
chr4 (18-342)||(26531887-26532211)
chr4 (18-342)||(3368727-3369051)
chr4 (18-342)||(5870692-5871015)
chr4 (18-342)||(20244211-20244535)
chr4 (18-342)||(4675687-4676011)
chr4 (18-342)||(18163436-18163760)
chr4 (18-342)||(34975825-34976151)
chr4 (18-342)||(4546336-4546662)
chr4 (18-265)||(1941998-1942245)
chr4 (18-339)||(15461771-15462097)
chr4 (19-342)||(9487826-9488147)
chr4 (18-342)||(30040192-30040517)
chr4 (18-265)||(9538232-9538479)
chr4 (26-257)||(11421289-11421514)
chr4 (18-297)||(5616669-5616948)
chr4 (18-297)||(32636757-32637036)
chr4 (20-297)||(19362686-19362962)
chr4 (18-173)||(5528352-5528507)
chr4 (26-161)||(19365802-19365937)
chr4 (17-257)||(23055852-23056092)
chr4 (157-342)||(19373759-19373945)
chr4 (17-106)||(19926420-19926509)
chr4 (17-86)||(5707778-5707847)
chr4 (17-86)||(5714406-5714475)
chr4 (17-86)||(8858625-8858694)
chr4 (17-86)||(18262670-18262739)
chr4 (17-86)||(18269531-18269600)
chr4 (17-86)||(26964098-26964167)
chr4 (17-72)||(869055-869110)
chr4 (17-86)||(10621013-10621082)
chr4 (17-86)||(26970921-26970990)
chr4 (17-86)||(28392814-28392883)
chr4 (17-86)||(55613141-55613210)
chr4 (17-86)||(5667809-5667878)
chr4 (19-72)||(8845663-8845716)
chr4 (17-86)||(10628092-10628161)
chr4 (17-86)||(35224018-35224087)
[»] chr3 (34 HSPs)
chr3 (18-342)||(12300184-12300508)
chr3 (18-342)||(20147258-20147582)
chr3 (18-342)||(55427295-55427619)
chr3 (18-342)||(21034512-21034837)
chr3 (18-342)||(21399066-21399391)
chr3 (18-342)||(28088380-28088705)
chr3 (18-342)||(15846239-15846564)
chr3 (18-342)||(15316878-15317204)
chr3 (18-342)||(25978430-25978756)
chr3 (18-339)||(11787861-11788184)
chr3 (18-210)||(14890665-14890857)
chr3 (26-241)||(26816574-26816788)
chr3 (26-342)||(14147303-14147619)
chr3 (18-342)||(15537809-15538135)
chr3 (17-86)||(6110522-6110591)
chr3 (17-86)||(8490953-8491022)
chr3 (17-86)||(13211760-13211829)
chr3 (17-86)||(13249065-13249134)
chr3 (17-86)||(18523121-18523190)
chr3 (32-109)||(30464284-30464360)
chr3 (17-72)||(10572286-10572341)
chr3 (17-72)||(15341913-15341968)
chr3 (17-72)||(15357280-15357335)
chr3 (17-72)||(17780812-17780867)
chr3 (17-86)||(13517265-13517334)
chr3 (17-86)||(15600564-15600633)
chr3 (17-86)||(15607109-15607178)
chr3 (94-175)||(16240889-16240970)
chr3 (17-86)||(16482163-16482232)
chr3 (17-86)||(18520433-18520502)
chr3 (17-86)||(32056579-32056648)
chr3 (17-72)||(17136811-17136866)
chr3 (17-86)||(10579036-10579104)
chr3 (17-86)||(17199864-17199933)
[»] chr8 (26 HSPs)
chr8 (18-342)||(27007221-27007545)
chr8 (18-342)||(27014364-27014688)
chr8 (18-342)||(22130313-22130637)
chr8 (18-342)||(27880191-27880515)
chr8 (18-342)||(28020372-28020696)
chr8 (18-342)||(45533977-45534301)
chr8 (19-342)||(21916951-21917274)
chr8 (18-342)||(22659197-22659522)
chr8 (18-342)||(6431160-6431486)
chr8 (18-342)||(2962634-2962960)
chr8 (18-342)||(25611469-25611794)
chr8 (18-342)||(21969607-21969932)
chr8 (18-342)||(8370956-8371281)
chr8 (18-297)||(12562397-12562677)
chr8 (18-342)||(26240758-26241084)
chr8 (26-257)||(8781664-8781895)
chr8 (26-342)||(18835632-18835945)
chr8 (18-342)||(20534912-20535238)
chr8 (17-257)||(27098785-27099025)
chr8 (17-86)||(28548505-28548574)
chr8 (17-86)||(6094581-6094650)
chr8 (17-86)||(15326656-15326725)
chr8 (17-86)||(15507025-15507094)
chr8 (17-72)||(24643106-24643161)
chr8 (17-62)||(22171945-22171990)
chr8 (18-50)||(36970523-36970555)
[»] chr7 (36 HSPs)
chr7 (18-342)||(48808200-48808524)
chr7 (18-342)||(18400378-18400702)
chr7 (18-342)||(18407362-18407686)
chr7 (18-342)||(2204826-2205150)
chr7 (18-342)||(15730025-15730349)
chr7 (18-342)||(18139042-18139366)
chr7 (18-342)||(30254412-30254736)
chr7 (18-342)||(19231162-19231487)
chr7 (18-342)||(8465273-8465598)
chr7 (18-342)||(34128847-34129173)
chr7 (18-342)||(18258826-18259152)
chr7 (18-342)||(41680671-41680996)
chr7 (18-342)||(47166562-47166887)
chr7 (18-342)||(10668604-10668929)
chr7 (18-342)||(28130835-28131161)
chr7 (26-265)||(16011724-16011962)
chr7 (32-345)||(19393126-19393438)
chr7 (17-342)||(18257269-18257594)
chr7 (26-235)||(14592133-14592341)
chr7 (32-238)||(31190248-31190453)
chr7 (18-342)||(15168997-15169318)
chr7 (17-297)||(12409800-12410080)
chr7 (29-252)||(19388840-19389067)
chr7 (130-341)||(24443081-24443294)
chr7 (17-129)||(12392911-12393022)
chr7 (17-86)||(11542660-11542729)
chr7 (17-72)||(11535756-11535811)
chr7 (102-188)||(8836636-8836722)
chr7 (34-123)||(25845399-25845488)
chr7 (17-86)||(12738994-12739063)
chr7 (193-257)||(25845313-25845377)
chr7 (17-72)||(29328242-29328297)
chr7 (216-342)||(31190108-31190237)
chr7 (17-86)||(12751284-12751353)
chr7 (17-86)||(15152901-15152970)
chr7 (34-121)||(25845820-25845907)
[»] chr5 (23 HSPs)
chr5 (18-342)||(32173-32497)
chr5 (18-342)||(23546196-23546520)
chr5 (18-342)||(12789367-12789691)
chr5 (18-342)||(24933010-24933334)
chr5 (18-342)||(9811435-9811761)
chr5 (18-342)||(12703576-12703902)
chr5 (18-342)||(12764692-12765018)
chr5 (19-342)||(7865132-7865457)
chr5 (18-342)||(20941301-20941626)
chr5 (18-342)||(22941524-22941850)
chr5 (18-342)||(25805088-25805413)
chr5 (18-342)||(31097090-31097415)
chr5 (18-342)||(26245376-26245701)
chr5 (22-342)||(5097929-5098248)
chr5 (18-265)||(20100025-20100271)
chr5 (52-342)||(39535503-39535791)
chr5 (91-342)||(31651482-31651736)
chr5 (26-172)||(26129568-26129713)
chr5 (17-86)||(24695146-24695215)
chr5 (17-86)||(24701910-24701979)
chr5 (19-63)||(18569564-18569608)
chr5 (17-71)||(19706914-19706968)
chr5 (17-86)||(19714178-19714247)
[»] chr2 (11 HSPs)
chr2 (18-342)||(24249736-24250060)
chr2 (18-342)||(30174651-30174975)
chr2 (18-342)||(24228917-24229243)
chr2 (26-342)||(19616717-19617034)
chr2 (37-340)||(24763376-24763680)
chr2 (18-342)||(15341704-15342030)
chr2 (18-342)||(29800745-29801071)
chr2 (66-189)||(20687273-20687396)
chr2 (34-189)||(40300794-40300949)
chr2 (95-202)||(21627102-21627209)
chr2 (21-86)||(21329928-21329993)
[»] chr1 (24 HSPs)
chr1 (18-342)||(9456390-9456714)
chr1 (18-342)||(20390943-20391267)
chr1 (18-342)||(20779349-20779673)
chr1 (18-342)||(42816693-42817017)
chr1 (18-342)||(22669961-22670285)
chr1 (18-342)||(28134426-28134751)
chr1 (18-342)||(19706142-19706467)
chr1 (18-342)||(43802068-43802393)
chr1 (18-342)||(47667188-47667513)
chr1 (18-342)||(22612766-22613091)
chr1 (18-342)||(634208-634538)
chr1 (186-342)||(14482332-14482488)
chr1 (26-342)||(8727949-8728262)
chr1 (18-166)||(28145603-28145751)
chr1 (18-210)||(29096996-29097188)
chr1 (286-342)||(9460754-9460810)
chr1 (156-251)||(51997680-51997775)
chr1 (17-86)||(18252488-18252557)
chr1 (17-86)||(18532194-18532263)
chr1 (106-201)||(19819493-19819588)
chr1 (17-71)||(27131105-27131159)
chr1 (17-71)||(27310272-27310326)
chr1 (306-342)||(33283560-33283596)
chr1 (17-72)||(16358729-16358784)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (18-342)||(120004-120328)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (18-332)||(260-576)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (18-265)||(67155-67402)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (18-342)||(457-782)
[»] scaffold0376 (1 HSPs)
scaffold0376 (18-261)||(11311-11554)
[»] scaffold0466 (1 HSPs)
scaffold0466 (17-342)||(12652-12978)
[»] scaffold0086 (1 HSPs)
scaffold0086 (18-342)||(54038-54362)
[»] scaffold0111 (1 HSPs)
scaffold0111 (26-297)||(26824-27094)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (18-342)||(9394-9741)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (32-342)||(39690-40002)
[»] scaffold0390 (2 HSPs)
scaffold0390 (17-86)||(6614-6683)
scaffold0390 (17-86)||(13630-13699)
[»] scaffold0496 (1 HSPs)
scaffold0496 (101-200)||(11592-11690)
[»] scaffold0433 (1 HSPs)
scaffold0433 (17-86)||(7565-7634)
[»] scaffold0389 (1 HSPs)
scaffold0389 (277-342)||(696-761)
[»] scaffold0234 (2 HSPs)
scaffold0234 (17-86)||(2001-2070)
scaffold0234 (17-86)||(10892-10961)
[»] scaffold0136 (1 HSPs)
scaffold0136 (22-167)||(9009-9154)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (93-167)||(82886-82960)
[»] scaffold0186 (1 HSPs)
scaffold0186 (17-86)||(25670-25739)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (37-86)||(18765-18814)
[»] scaffold0063 (1 HSPs)
scaffold0063 (17-86)||(5980-6049)


Alignment Details
Target: scaffold0264 (Bit Score: 305; Significance: 1e-172; HSPs: 1)
Name: scaffold0264
Description:

Target: scaffold0264; HSP #1
Raw Score: 305; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 18 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 3703 - 3379
Alignment:
Q  18 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3703 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggatttgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 3604  T
Q  118 gatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 217  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3603 gatgaaatatgactataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggacttattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 3504  T
Q  218 aaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcatgaaagg 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3503 aaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgagacaaaggagtaattatacacatatgtgttatcatgaaagg 3404  T
Q  318 tttcgtcagatcacttgacattctt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  3403 tttcgtcagatcacttgacattctt 3379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 305; Significance: 1e-172; HSPs: 30)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 305; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 18 - 342
Target Start/End: Original strand, 16789345 - 16789669
Alignment:
Q  18 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16789345 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgagatttgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 16789444  T
Q  118 gatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 217  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16789445 gatgaaatatgactataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggacttattcgttaaatagtatatttcggaatcatgataaat 16789544  T
Q  218 aaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcatgaaagg 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16789545 aaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcatgaaagg 16789644  T
Q  318 tttcgtcagatcacttgacattctt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  16789645 tttcgtcagatcacttgacattctt 16789669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 18 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 22859916 - 22859592
Alignment:
Q  18 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22859916 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggatttgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 22859817  T
Q  118 gatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 217  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22859816 gatgaaatatgactataaatatgcatggccatgctgaactaagtcaatataagatattggacttattcgttaaatagtacatttcggaatcaagataaat 22859717  T
Q  218 aaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcatgaaagg 317  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  22859716 gaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgagatcaatgaagatattgagacaaaggagtaattatacacatatgtattatcatgaaagg 22859617  T
Q  318 tttcgtcagatcacttgacattctt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  22859616 tttcgtcagatcacttgacattctt 22859592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 18 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 1586136 - 1585812
Alignment:
Q  18 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 117  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1586136 gttggttgatgggtacttgatgaatcatgctgaggggcatgagtgttccagatgggatttgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 1586037  T
Q  118 gatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 217  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1586036 gatgaaatatgactataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggacttattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 1585937  T
Q  218 aaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcatgaaagg 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1585936 aaacattgatctatacaagggtgacgctatctatgccttgagatcaatgaagatattgagacaaaggagtaattatacacatatgtgttatcatgaaagg 1585837  T
Q  318 tttcgtcagatcacttgacattctt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  1585836 tttcgtcagatcacttgacattctt 1585812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 18 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 27508375 - 27508051
Alignment:
Q  18 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 117  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27508375 gttggttgatgggtacttgatgaatcatgctgaggggcatgagtatcctagatgggatttgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 27508276  T
Q  118 gatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 217  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27508275 gatgaaatatgactataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggacttattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 27508176  T
Q  218 aaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcatgaaagg 317  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  27508175 gaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgagacaaaggagtaattatacacatatgtattatcatgaaagg 27508076  T
Q  318 tttcgtcagatcacttgacattctt 342  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  27508075 tttcgtcggatcacttgacattctt 27508051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 32 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 27525575 - 27525265
Alignment:
Q  32 acttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctcttgatgaaatatgatt 131  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  27525575 acttgatgaatcatgctgaggggcatgagtgtcctagatgggatttgtccctcctcataaacaggagatatatctttagacctcttgatgaaatatgact 27525476  T
Q  132 ataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaataaacattgatctat 231  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27525475 ataaatatgaatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggacttattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaatgaacattgatctat 27525376  T
Q  232 acaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcatgaaaggtttcgtcagatcac 331  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27525375 ataaaggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgagacaaaggagtaattatacacatatgtattatcatgaaaggtttcgtcagatcac 27525276  T
Q  332 ttgacattctt 342  Q
    |||||||||||    
T  27525275 ttgacattctt 27525265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 18 - 339
Target Start/End: Original strand, 33317139 - 33317462
Alignment:
Q  18 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 117  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33317139 gttggttgatgggtacttgatgaatcatgctgagggacatgagtgtcctagatgggatttgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 33317238  T
Q  118 gatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 217  Q
    |||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||| | ||    
T  33317239 gatgaaatatgactgtaaaattgcatggccatgccgaactaagtcaatatgagatattggacttattcgttattcagtatatttcggaatcaagaaatat 33317338  T
Q  218 aaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcatg--aaa 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||  |  | ||||||||  |||    
T  33317339 aaacattgatctatacaagggtgacaatatctatgcattgggatcaataaagatatcgagacaaaggagtaattgtacacaaaattattatcatggaaaa 33317438  T
Q  316 ggtttcgtcagatcacttgacatt 339  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  33317439 tgtttcgtcagatcacttgacatt 33317462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 18 - 342
Target Start/End: Original strand, 14074754 - 14075079
Alignment:
Q  18 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 117  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14074754 gttggttgatgggtacttgatgaatcatgctaagggacatgagtgtcctagatgggatttgtccctcctcataaataggagatatatctttaggcctctt 14074853  T
Q  118 gatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 217  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||   |||||||||| ||||||||| | ||    
T  14074854 gatgaaatatgactataaaaatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggacttattatttattcagtatatttcagaatcaagaaatat 14074953  T
Q  218 aaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcat-gaaag 316  Q
    ||| ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||| ||||| |  || ||||||| |||||    
T  14074954 aaatattgatctaaacaaggctgaaaatatctatgccttgggatcaataatgatatcgagacaaaggagtaattgtacacatgagtattatcatggaaag 14075053  T
Q  317 gtttcgtcagatcacttgacattctt 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  14075054 gtttcgtcagatcacttgacattctt 14075079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 19 - 342
Target Start/End: Original strand, 8613194 - 8613519
Alignment:
Q  19 ttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctcttg 118  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8613194 ttggttgatgggtacttgatgaatcatgctgagggatatgagtgtcctagatgtgatttgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctcttg 8613293  T
Q  119 atgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaata 218  Q
    ||||||||||| | ||||  |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||| | |||    
T  8613294 atgaaatatgactgtaaaattgcatggttatgccgaactaagtcaatatgagatattggacttattcgttattcagtatatttcggaatcaagaaatata 8613393  T
Q  219 aacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcatg--aaag 316  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||  | ||||||||  |||     
T  8613394 aacattgatctatacaatggtgacaatatctatgcattgggatcaataaagatatcgagacaaaggagtaattgtacacataattattatcatggaaaat 8613493  T
Q  317 gtttcgtcagatcacttgacattctt 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  8613494 gtttcgtcagatcacttgacattctt 8613519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 36 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 18019839 - 18019532
Alignment:
Q  36 gatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctcttgatgaaatatgattataa 135  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  18019839 gatgaatcatgctaaggggcatgagtgtcctagatgggatctgtccctcctcataaaaaggagatatatctttaggcctcttgatgaaatatgactgtaa 18019740  T
Q  136 atatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaataaacattgatctatacaa 235  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||   | |||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||    
T  18019739 aactgcatggccatgccgaactaagtcaatatgagatattggacttattcgttattcaatatatttcggaatcaagaaatataattattgatctatacaa 18019640  T
Q  236 gggtgacactatctatgccttgggatcaat-gaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcatgaaaggtttcgtcagatcacttg 334  Q
    |||||||| || |||||||||| |||||||  ||| ||| | ||||||||||||||| ||||| |   | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18019639 gggtgacaatacctatgccttgagatcaataaaaggtatcgagacaaaggagtaattgtacacatgaatattatcatgaaaggtttcgtcagatcacttg 18019540  T
Q  335 acattctt 342  Q
    ||||||||    
T  18019539 acattctt 18019532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 32 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 20736343 - 20736032
Alignment:
Q  32 acttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctcttgatgaaatatgatt 131  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20736343 acttgatgaatcatgttgagggacatgagtgtcctagatgagatttgtccctcctcataat-aggagatatatctttaggcctctttatgaaatatgatt 20736245  T
Q  132 ataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaataaacattgatctat 231  Q
     ||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||   |||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||    
T  20736244 gtaaagttgtatggccatgccgaactaagtcaatatgagataatagacttattcgttattcagtatatttcgggatcaagaaatataaatattgatctat 20736145  T
Q  232 acaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcatg--aaaggtttcgtcagatc 329  Q
    |||||| |||||  |||||||||||| ||| |||  ||||||| |||||||||| ||||| ||||| |   | ||||||||  |||||||||||||||||    
T  20736144 acaaggatgacaaaatctatgccttgtgataaatatagatattatgacaaaggaataattgtacacatgaatattatcatggaaaaggtttcgtcagatc 20736045  T
Q  330 acttgacattctt 342  Q
    |||||||||||||    
T  20736044 acttgacattctt 20736032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 18 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 17120533 - 17120315
Alignment:
Q  18 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 117  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  17120533 gttggttgatgggtgcttgatgaatcatgctgagggacatgagtgtcctagatggaatttgtccctcctcataa-caggagatatatctttaggcttctt 17120435  T
Q  118 gatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 217  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||   |||||||||||| ||||||| | ||    
T  17120434 gatgaaatatgattgtaaaactgcatggccatgccgaactaagtcaatatgagattttgaacttattcgttattcagtatatttcgggatcaagaaatat 17120335  T
Q  218 aaacattgatctatacaagg 237  Q
    ||| |||||||| |||||||    
T  17120334 aaatattgatctttacaagg 17120315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 26 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 22560214 - 22559898
Alignment:
Q  26 atgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctcttgatgaaat 125  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22560214 atgggtacttgatgaatcatgttgagggacatgagtgtcctagatgggatttgtccctcctcataa-caggagatatatctttaggcctcttgatgaaat 22560116  T
Q  126 atgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaataaacattg 225  Q
    |||| ||||||  ||||||||| |||| ||  |||||||||| ||||||||| ||  ||| |||   |||||||||| | ||||||| | ||||| ||||    
T  22560115 atgactataaaattgcatggccgtgccaaatcaagtcaatatgagatattgggcttgttctttattcagtatatttcaggatcaagaaatataaatattg 22560016  T
Q  226 atctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcatg-aaaggtttcgtc 324  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||   | | ||   ||||||| ||||||| ||||| |   | |||||||| ||||||||||||    
T  22560015 atctatacaagggtgacaaaatctttgccttgtgatcaacataaacatgaggacaaagaagtaattgtacacatgaatattatcatgaaaaggtttcgtc 22559916  T
Q  325 agatcacttgacattctt 342  Q
    ||||||  ||||||||||    
T  22559915 agatcatgtgacattctt 22559898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 34 - 212
Target Start/End: Original strand, 21994878 - 21995055
Alignment:
Q  34 ttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctcttgatgaaatatgattat 133  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |   |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||    
T  21994878 ttgatgaatcatgcagagggacatgagtgtcctatactagatttgtccctcctcataa-catgagatatatctttaggcctcttgatgagatataactat 21994976  T
Q  134 aaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaaga 212  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||   ||||||||| || |||||||    
T  21994977 aaagttgcatggccatgccgaactaagtcaatatgagatattagacttattcgttattcagtatattttgggatcaaga 21995055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 34 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 19735529 - 19735222
Alignment:
Q  34 ttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctcttgatgaaatatgattat 133  Q
    |||| |||||||| |||| | |||||||||  |||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |    
T  19735529 ttgaggaatcatgttgagcgacatgagtgttttagatgagatttgtccctcctcataa-cagtagatatatctttaggccttttaatgaaatatgactgt 19735431  T
Q  134 aaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaataaacattgatctatac 233  Q
    |||  | |||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||| |||| ||| ||||   |||||||||||| ||||||| | || || ||||||||||||    
T  19735430 aaagtttcatg-ccatgtcgaaccaagtcaatatgagatattagacttattagttattcagtatatttcgggatcaagaaatattaagattgatctatac 19735332  T
Q  234 aagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcat-gaaaggtttcgtcagatcact 332  Q
    ||||||||||  || ||||||||| |||||||  | |||     |||||||||||||| ||||| |  || |||||||  ||| |||| |||| ||||||    
T  19735331 aagggtgacaaaatatatgccttgtgatcaatatatatacgagtacaaaggagtaattgtacacatgagtattatcataaaaatgttttgtcaaatcact 19735232  T
Q  333 tgacattctt 342  Q
    ||||||||||    
T  19735231 tgacattctt 19735222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 32 - 252
Target Start/End: Original strand, 19218712 - 19218931
Alignment:
Q  32 acttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctcttgatgaaatatgatt 131  Q
    |||||| |||||||  |||||| ||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||  | ||||||| |||||| |  |||||||||||||||| |    
T  19218712 acttgacgaatcatattgagggacatgagtgtccaagataggatttgttcctcctcataat-atgagatatttctttaagtttcttgatgaaatatgact 19218810  T
Q  132 ataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaataaacattgatctat 231  Q
    |||||  |||||||||| ||| ||  |||||||||| ||||||||| || ||||||||   ||||||||| || ||||||| | ||||| ||||||||||    
T  19218811 ataaaattgcatggccaggccaaatgaagtcaatatcagatattgggcttattcgttattcagtatattttgggatcaagaaatataaatattgatctat 19218910  T
Q  232 acaagggtgacactatctatg 252  Q
    |||||| |||||  |||||||    
T  19218911 acaaggttgacaaaatctatg 19218931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 17 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 10359080 - 10358757
Alignment:
Q  17 agttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcct-cataaacaggagatatatctttaggcctc 115  Q
    |||||||| || | ||||||| |||||||| |||||| ||| |||||| |||||| |||  ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  10359080 agttggttaattgacacttgacgaatcatgttgagggacataagtgtcttagatgagatatgtccctccttcataa-cagaagatatatctttaggccta 10358982  T
Q  116 ttgatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataa 215  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||  || ||||||| ||| ||||||||   | |||| |||   ||||||||| || ||||||| |     
T  10358981 ttgatgaaatatgattgtaaaattgcatggctatgctaaattaagtcattatgagatattgagattattcattattcagtatattt-gggatcaagaaat 10358883  T
Q  216 ataaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcatg--a 313  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| | |||||  ||||||  ||||||| |   |||| ||||| |     ||||||||  |    
T  10358882 ataaatattgatctatacaagggtgacaaaatctatgcattgtgttcaatatagatatgatgacaaaag---aattgtacacatgaacattatcatggaa 10358786  T
Q  314 aaggtttcgtcagatcacttgacattctt 342  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10358785 aaggtttcgtcagatcacttggcattctt 10358757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 257
Target Start/End: Original strand, 4073849 - 4074088
Alignment:
Q  18 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcct-cataaacaggagatatatctttaggcctct 116  Q
    ||||||| |||| || ||||  |||||| ||||||| ||||| |||| |||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||    
T  4073849 gttggttaatggacatttgacaaatcattctgagggacatgaatgtcatagatgtgatttgtccctccttcataa-caggagatatatttttagacctct 4073947  T
Q  117 tgatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaa 216  Q
    ||||||||||||| | ||||  |||||  ||||| | || |||| |||||| ||||||| |||| ||||||||   ||||||||||| ||| || | | |    
T  4073948 tgatgaaatatgactgtaaaattgcataaccatgtcaaattaaggcaatattagatattagacttattcgttactcagtatatttcgaaataaaaaaata 4074047  T
Q  217 taaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttg 257  Q
    |||| |||||  |||||||||||  ||| ||||||| ||||    
T  4074048 taaatattgagttatacaagggtagcacaatctatgtcttg 4074088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 86
Target Start/End: Original strand, 11652181 - 11652250
Alignment:
Q  17 agttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcct 86  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| | |||||||    
T  11652181 agttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccctcct 11652250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 17684218 - 17684149
Alignment:
Q  17 agttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcct 86  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| | |||||||    
T  17684218 agttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccctcct 17684149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 17691189 - 17691120
Alignment:
Q  17 agttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcct 86  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| | |||||||    
T  17691189 agttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccctcct 17691120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 342
Target Start/End: Original strand, 21995430 - 21995558
Alignment:
Q  216 ataaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcatg--a 313  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||  ||||||   |||||| ||||||||  |||| |   |||||| |||  |    
T  21995430 ataaatattgacctatacaagggtgacaaaatctatgccttgtgatcaatatagatatgaggacaaaagagtaattgaacacatgaatgttatgatggaa 21995529  T
Q  314 aaggtttcgtcagatcacttgacattctt 342  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  21995530 aaggttttgtcagatcacttaacattctt 21995558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 27381001 - 27380932
Alignment:
Q  17 agttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcct 86  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| | |||||||    
T  27381001 agttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccctcct 27380932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 27471384 - 27471315
Alignment:
Q  17 agttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcct 86  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| | |||||||    
T  27471384 agttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccctcct 27471315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 86
Target Start/End: Original strand, 29309348 - 29309417
Alignment:
Q  17 agttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcct 86  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| | |||||||    
T  29309348 agttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccctcct 29309417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 86
Target Start/End: Original strand, 29316307 - 29316376
Alignment:
Q  17 agttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcct 86  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| | |||||||    
T  29316307 agttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccctcct 29316376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 86
Target Start/End: Original strand, 27297087 - 27297156
Alignment:
Q  17 agttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcct 86  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||| | |||||||    
T  27297087 agttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggatatgagtgacctagatggaatttgcccctcct 27297156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 16559221 - 16559139
Alignment:
Q  17 agttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggaga 99  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||| ||| | ||||||| |  |||||||||    
T  16559221 agttggttgatgggtactccatgaatcattctgagggacatgagtgacctggatggaatttgcccctcctaaataacaggaga 16559139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 16394194 - 16394149
Alignment:
Q  17 agttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtg 62  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  16394194 agttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtg 16394149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 25536940 - 25536871
Alignment:
Q  17 agttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcct 86  Q
    |||||||||||||| |||  |||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||| ||| | |||||||    
T  25536940 agttggttgatgggtactccatgaattatgttgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccctcct 25536871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 232 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 17119088 - 17119024
Alignment:
Q  232 acaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgtgacaaaggagtaattataca 296  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||  ||||||   ||||||||||||||| ||||    
T  17119088 acaagggcgacaatatctatgccttgagatcaatatagatataaggacaaaggagtaattgtaca 17119024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 305; Significance: 1e-172; HSPs: 41)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 305; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 18 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 18111071 - 18110747
Alignment:
Q  18 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18111071 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggatttgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 18110972  T
Q  118 gatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 217  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18110971 gatgaaatatgactataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggacttattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 18110872  T
Q  218 aaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcatgaaagg 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18110871 aaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgagacaaaggagtaattatacacatatgtgttatcatgaaagg 18110772  T
Q  318 tttcgtcagatcacttgacattctt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  18110771 tttcgtcagatcacttgacattctt 18110747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 18 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 17299987 - 17299663
Alignment:
Q  18 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 117  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17299987 gttggttgatgagcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggatttgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 17299888  T
Q  118 gatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 217  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17299887 gatgaaatatgactataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggacttattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 17299788  T
Q  218 aaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcatgaaagg 317  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17299787 taacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgtgacaaaggagtaattatgcacctatgtgttatcatgaaagg 17299688  T
Q  318 tttcgtcagatcacttgacattctt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  17299687 tttcgtcagatcacttgacattctt 17299663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 18 - 342
Target Start/End: Original strand, 2677287 - 2677611
Alignment:
Q  18 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2677287 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggatttgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 2677386  T
Q  118 gatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 217  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2677387 gatgaaatatgactataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggacttattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 2677486  T
Q  218 aaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcatgaaagg 317  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  2677487 gaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgagacaaaggagtaattatacacatatgtattatcatgaaagg 2677586  T
Q  318 tttcgtcagatcacttgacattctt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  2677587 tttcgtcagatcacttgacattctt 2677611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 18 - 342
Target Start/End: Original strand, 15815295 - 15815619
Alignment:
Q  18 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15815295 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggatttgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 15815394  T
Q  118 gatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 217  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15815395 gatgaaatatgactataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggacttattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 15815494  T
Q  218 aaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcatgaaagg 317  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  15815495 gaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgagacaaaggagtaattatacacatatgtattatcatgaaagg 15815594  T
Q  318 tttcgtcagatcacttgacattctt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  15815595 tttcgtcagatcacttgacattctt 15815619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 18 - 342
Target Start/End: Original strand, 26531887 - 26532211
Alignment:
Q  18 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26531887 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggatttgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 26531986  T
Q  118 gatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 217  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26531987 gatgaaatatgactataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggacttattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 26532086  T
Q  218 aaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcatgaaagg 317  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  26532087 gaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgagacaaaggagtaattatacacatatgtattatcatgaaagg 26532186  T
Q  318 tttcgtcagatcacttgacattctt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  26532187 tttcgtcagatcacttgacattctt 26532211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 18 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 3369051 - 3368727
Alignment:
Q  18 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 117  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3369051 gttggttgatgggtacttgatgaatcatgctgaggggcatgagtgtcctagatgggatttgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 3368952  T
Q  118 gatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 217  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3368951 gatgaaatatgactataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggacttattcgttaaatagtatattttggaatcaagataaat 3368852  T
Q  218 aaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcatgaaagg 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  3368851 aaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgagacaaaggagtaattatacacatatgtattatcatgaaagg 3368752  T
Q  318 tttcgtcagatcacttgacattctt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  3368751 tttcgtcagatcacttgacattctt 3368727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 18 - 342
Target Start/End: Original strand, 5870692 - 5871015
Alignment:
Q  18 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 117  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5870692 gttggttgatgagtacttgatgaatcatgctgaggg-catgagtgtcctagatgggatttgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 5870790  T
Q  118 gatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 217  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5870791 gatgaaatatgactataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggacttattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 5870890  T
Q  218 aaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcatgaaagg 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5870891 aaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgagacaaaggagtaattatacacttatgtgttatcatgaaagg 5870990  T
Q  318 tttcgtcagatcacttgacattctt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  5870991 tttcgtcagatcacttgacattctt 5871015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 18 - 342
Target Start/End: Original strand, 20244211 - 20244535
Alignment:
Q  18 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 117  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20244211 gttggttgatgggtacttgatgaatcatgctgaggggcatgagtgttctagatgggatttgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 20244310  T
Q  118 gatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 217  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20244311 gatgaaatatgactataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggacttattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 20244410  T
Q  218 aaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcatgaaagg 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20244411 aaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgagatcaatgaagatattgagacaaaggagtaattatacacatatgtgttatcatgaaagg 20244510  T
Q  318 tttcgtcagatcacttgacattctt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  20244511 tttcgtcagatcacttgacattctt 20244535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 18 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 4676011 - 4675687
Alignment:
Q  18 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 117  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4676011 gttggttgatgggtacttgatgaatcatgctgaggggcatgagtgttctagatgggatttgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 4675912  T
Q  118 gatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 217  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4675911 gatgaaatatgactataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggacttattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 4675812  T
Q  218 aaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcatgaaagg 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4675811 aaacattgatctatacaagggtgacactatctatgctttgagatcaatgaagatattgagacaaaggagtaattatacacatatgtgttatcatgaaagg 4675712  T
Q  318 tttcgtcagatcacttgacattctt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  4675711 tttcgtcagatcacttgacattctt 4675687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 18 - 342
Target Start/End: Original strand, 18163436 - 18163760
Alignment:
Q  18 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 117  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18163436 gttggttgatgggtacttgatgaatcatgctgaggggcatgagtgttctagatgggatttgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 18163535  T
Q  118 gatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 217  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18163536 gatgaaatatgactataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggacttattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 18163635  T
Q  218 aaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcatgaaagg 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18163636 aaacattgatctatacaagggtgacactaactatgccttgagatcaatgaagatattgagacaaaggagtaattatacacatatgtgttatcatgaaagg 18163735  T
Q  318 tttcgtcagatcacttgacattctt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  18163736 tttcgtcagatcacttgacattctt 18163760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 18 - 342
Target Start/End: Original strand, 34975825 - 34976151
Alignment:
Q  18 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 117  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34975825 gttggttgatgggtacttgatgaatcatgttgaggggcatgagtgccctagatgggatttgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 34975924  T
Q  118 gatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 217  Q
    |||||||||||  | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||| | ||    
T  34975925 gatgaaatatgcctgtaaaactgcatggccatgccgaactaagtcaatatgagatattggacttattcgttattcagtatatttcggaatcaagaaatat 34976024  T
Q  218 aaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaat-gaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcat-gaaa 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||  | ||||||||||||||| ||||| |  || ||||||| ||||    
T  34976025 aaacattgatctatacaagggtgacaatatctatgccttgggatcaataaaaggtaccgagacaaaggagtaattgtacacatgagtattatcatggaaa 34976124  T
Q  316 ggtttcgtcagatcacttgacattctt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  34976125 ggtttcgtcagatcacttgacattctt 34976151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 18 - 342
Target Start/End: Original strand, 4546336 - 4546662
Alignment:
Q  18 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 117  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4546336 gttggttgatgggtacttgatgaatcatgctgagggacatgagtgtcctagatgggatttgtccctcctcataaacaggagatatatctttagacctctt 4546435  T
Q  118 gatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 217  Q
    |||||||||||| | ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||   ||||||||| | |||||||| | ||    
T  4546436 gatgaaatatgactgtaaaattgcatggccgtgccgaactaagtcaatatgggatattggacttattcgttattcagtatattttgtaatcaagaaatat 4546535  T
Q  218 aaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcatg--aaa 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||| ||||| ||  | ||||||||  |||    
T  4546536 aaacattgatctatacaagggtgacaatatctatgccttgggatcaataaagatatcaagacaaaggagtaattgtacacataattattatcatggaaaa 4546635  T
Q  316 ggtttcgtcagatcacttgacattctt 342  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||    
T  4546636 ggtttcgttagatcacttgacattctt 4546662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 1941998 - 1942245
Alignment:
Q  18 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 117  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1941998 gttggttgatgggtacttgatgaatcatgctgagggacatgagtgtcctagatgggatttgtccctcctcataaacaagagatatatctttaggcctctt 1942097  T
Q  118 gatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 217  Q
    |||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||| | ||    
T  1942098 gatgaaatatgactgtaaaattgcatggccatgccgaactaagtcaatatgagatattggacttattcgttattcagtatatttcggaatcaagaaatat 1942197  T
Q  218 aaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaat 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  1942198 aaacattgatctatacaagggtgacaatatatatgccttgggatcaat 1942245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 18 - 339
Target Start/End: Original strand, 15461771 - 15462097
Alignment:
Q  18 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatct----ttaggcc 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    |||||||    
T  15461771 gttggttgatgggtacttgatgaatcatgctaaggggcatgagtgtcctagatgggatttgtccctcctcataaacaggagatatatatatcgttaggcc 15461870  T
Q  114 tcttgatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagat 213  Q
    |||||||||||||||| | ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||     
T  15461871 tcttgatgaaatatgactgtaaaactgcatcgccatgccgaactaagtcaatataagattttggacttattcgttattcagtatatttcggaatcaagaa 15461970  T
Q  214 aaataaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaat-gaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcatg 312  Q
    | ||||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||  ||| ||| | ||||||||||||||| ||||| |   ||||||||||    
T  15461971 atataattattgatctatacaagggtgacaatacctatgccttgagatcaataaaaggtatcgagacaaaggagtaattgtacacatgaatgttatcatg 15462070  T
Q  313 aaaggtttcgtcagatcacttgacatt 339  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  15462071 aaaggtttcatcagatcacttgacatt 15462097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 19 - 342
Target Start/End: Original strand, 9487826 - 9488147
Alignment:
Q  19 ttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctcttg 118  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9487826 ttggttgatgggtacttgatgaatcatgttgagggacatgagtgttctatatgggatttgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcgtcttg 9487925  T
Q  119 atgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaata 218  Q
    ||||||||||| | ||||     || | |||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||| | |||    
T  9487926 atgaaatatgactgtaaa-----attgtcatgccgaactaagtcaatatgggatattggacttattcgttattcagtatatttcggaatcaagaaatata 9488020  T
Q  219 aacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcatg---aaa 315  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||| | ||  | ||||||||   |||    
T  9488021 aacattgatcgatacaagggtgacaatatctatgccttgggatcaataaagatatcgagacaaaggagtaattgtacgcataattattatcatgcaaaaa 9488120  T
Q  316 ggtttcgtcagatcacttgacattctt 342  Q
    | |||||||||||||||||||||||||    
T  9488121 gttttcgtcagatcacttgacattctt 9488147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 18 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 30040517 - 30040192
Alignment:
Q  18 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 117  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||    
T  30040517 gttggttaatgagtacttgatgaatcatgctgagggacatgagtgtcctagatgagatttgtccctcctcataa-caggagatatatctttaggactttt 30040419  T
Q  118 gatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 217  Q
    |||||||||||| | ||||  |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||   ||||||||||   ||||||| | ||    
T  30040418 gatgaaatatgactgtaaaattgcatgaccatgccgaactaagtcaatatgagatattggacatattagttattcagtatatttcaagatcaagaaatat 30040319  T
Q  218 aaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcatg--aaa 315  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||  ||||||||||||||| ||||| ||  | ||||||||  |||    
T  30040318 aaatattgatctatacaagggtgacaatatctatgccttgtgatcaatatagatattaggacaaaggagtaattgtacacataaatattatcatggaaaa 30040219  T
Q  316 ggtttcgtcagatcacttgacattctt 342  Q
     ||||||||||||||||||||||||||    
T  30040218 agtttcgtcagatcacttgacattctt 30040192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 9538232 - 9538479
Alignment:
Q  18 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcct-cataaacaggagatatatctttaggcctct 116  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||  |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9538232 gttggttaatgggcacttgacgaatcatgttgagggacatgagtttcctagattagatttgtccctccttcataa-caggagatatatctttaggcctct 9538330  T
Q  117 tgatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaa 216  Q
    ||||||||||||| | ||||  || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||   | |||||||||| ||||| | | |    
T  9538331 tgatgaaatatgactgtaaaattgtatggccatgccgaattaagtcaatatgagatattagacttattagttattcaatatatttcgggatcaacaaata 9538430  T
Q  217 taaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaat 265  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||    
T  9538431 taaatattgatctatacaagggtgacaaaatctatgccttgtgatcaat 9538479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 26 - 257
Target Start/End: Original strand, 11421289 - 11421514
Alignment:
Q  26 atgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctcttgatgaaat 125  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11421289 atgggtactcgatgaatcatgctgagggacatgagtgtcctagatgagatttttccatcctcataa-catgagatatatctttaggcctcttgatgaaat 11421387  T
Q  126 atgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaataaacattg 225  Q
    |||| ||||||  |||||| |||||||||     |||||||| |||||||||||| ||||||||   |||||||||||| ||||||| | ||||| ||||    
T  11421388 atgactataaagttgcatgaccatgccga-----gtcaatatgagatattggacttattcgttattcagtatatttcgggatcaagaaatataaatattg 11421482  T
Q  226 atctatacaagggtgacactatctatgccttg 257  Q
    |||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  11421483 atctatacaagggtggtaatatctatgccttg 11421514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 18 - 297
Target Start/End: Original strand, 5616669 - 5616948
Alignment:
Q  18 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcct-cataaacaggagatatatctttaggcctct 116  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  5616669 gttggttaatgggcacatgacgaatcatgttgagggacatgagtgttctagatgggatttgtccctccttcataaa-aggagatatattattaggcctct 5616767  T
Q  117 tgatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaa 216  Q
    |||||||||||||||  |||  ||||||| |||||| || ||||||||||| ||||||||| || ||||||||   | ||||||| || ||||||| | |    
T  5616768 tgatgaaatatgattgcaaaattgcatggtcatgccaaattaagtcaatatgagatattgggcttattcgttattcaatatattttgggatcaagaaata 5616867  T
Q  217 taaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgtgacaaaggagtaattatacac 297  Q
    |||| |||||||||||||||| || ||  ||||||| |||| |||||||  ||| ||   ||||||||||||||| |||||    
T  5616868 taaatattgatctatacaaggatgccaaaatctatgtcttgtgatcaatatagacatgaggacaaaggagtaattgtacac 5616948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 18 - 297
Target Start/End: Original strand, 32636757 - 32637036
Alignment:
Q  18 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcct-cataaacaggagatatatctttaggcctct 116  Q
    ||||||| |||||||||| | ||||||    || || |||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  32636757 gttggttaatgggcacttaacgaatcacttcgaaggacatgagtgacctagatgggatttgtccctccttcataa-catgagatatatctttaggcctct 32636855  T
Q  117 tgatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaa 216  Q
    ||||||| ||||| | ||||  |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||||||   |||||||||||| ||||||| | |    
T  32636856 tgatgaattatgactgtaaaattgcatggccatgccaaattaagtcaatatgagatattgggctcattcgttattcagtatatttcgggatcaagaaata 32636955  T
Q  217 taaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgtgacaaaggagtaattatacac 297  Q
     ||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||| |||||||  ||||||   |||||| |||||||| |||||    
T  32636956 aaaatattgatctatacaggggtgacaaaatctatgtcttgtgatcaatatagatatgaggacaaatgagtaattgtacac 32637036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 20 - 297
Target Start/End: Original strand, 19362686 - 19362962
Alignment:
Q  20 tggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcct-cataaacaggagatatatctttaggcctcttg 118  Q
    ||||| |||| ||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||   || |||  ||||||||||||||||    
T  19362686 tggttaatggccacttgacgaatcatgttgagggacatgagtgtcctagatgcgatttgtccctccttcataattggg-gattaatctttaggcctcttg 19362784  T
Q  119 atgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaata 218  Q
    ||||||| ||| | ||||  |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||   | |||||||||  ||||||| | |||    
T  19362785 atgaaatgtgactgtaaaattgcatggccatgccaaactaagtcaatatgagatattggacttagtcgttattcaatatatttcgagatcaagaaatata 19362884  T
Q  219 aacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgtgacaaaggagtaattatacac 297  Q
    || |||||||||||||| |||||||  ||||||| |||| |||||||  ||||||   |||||| |||||||| |||||    
T  19362885 aatattgatctatacaa-ggtgacaaaatctatgtcttgtgatcaatatagatataaggacaaatgagtaattgtacac 19362962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 5528507 - 5528352
Alignment:
Q  18 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcct-cataaacaggagatatatctttaggcctct 116  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| || ||||||| |||| | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||  |||    
T  5528507 gttggttaatgggcatttgatgaatcatgttgagggacatgagagttctagatgagatttgcccctccttcataa-caggagatatatctttaggtttct 5528409  T
Q  117 tgatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagata 173  Q
    || |||||||||| | ||||  | |||| |||||||||| ||||||||||| |||||    
T  5528408 tggtgaaatatgactgtaaaactacatgaccatgccgaattaagtcaatatgagata 5528352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 26 - 161
Target Start/End: Original strand, 19365802 - 19365937
Alignment:
Q  26 atgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctcttgatgaaat 125  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||| ||| |||| |||||||||   ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  19365802 atgggcacttgacgaatcattctgagggacgtgagtgtcctacatgtgatttgtccctccttcaaaataggagattaatctttaggcctcttgatgaaat 19365901  T
Q  126 atgattataaatatgcatggccatgccgaactaagt 161  Q
    |||| | ||||  |||||||||||||  ||||||||    
T  19365902 atgactgtaaaattgcatggccatgctaaactaagt 19365937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 23056092 - 23055852
Alignment:
Q  17 agttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctct 116  Q
    |||||||| ||||  | |||| |||||||| |||| | ||||||||||||| ||| |||| | ||||| |    |||| || |||||| ||||| |||||    
T  23056092 agttggttaatggttatttgacgaatcatgttgagcgacatgagtgtcctaaatgtgatttgaccctcttgtataacaagaaatatatatttagacctct 23055993  T
Q  117 tgatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaa 216  Q
    ||| ||||||||| ||||||  || ||| |||||||||| ||||| |||||  |||||| |||| ||||||||   || ||||||||| ||||||| | |    
T  23055992 tgacgaaatatgactataaaattgaatgaccatgccgaattaagtaaatatgggatatttgacttattcgttactcaggatatttcgggatcaagaaata 23055893  T
Q  217 taaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttg 257  Q
    |||| | |||  ||||||| | |||||| || |||| ||||    
T  23055892 taaatactgagatatacaaagatgacacaatttatgtcttg 23055852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 157 - 342
Target Start/End: Original strand, 19373759 - 19373945
Alignment:
Q  157 taagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaataaacattgatctatacaagggtgacactatctatgcctt 256  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | ||||||   | |||||||||  || |||| | ||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  19373759 taagtcaatatgagatattggactaagtcgttattcaatatatttcgagattaagaaatataaatattgatctatacaa-ggtgacaaaatctatgcctt 19373857  T
Q  257 gggatcaatgaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcatg--aaaggtttcgtcagatcacttgacattctt 342  Q
    | |||||||  ||||||   |||| ||||| |||| ||||| |     ||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  19373858 gtgatcaatatagatatgaggacataggaggaattgtacacatgaacattatcatggaaaaggtttcgttagagcacttgacattctt 19373945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 19926509 - 19926420
Alignment:
Q  17 agttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcct-cataaacaggagatatatct 106  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| | ||||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  19926509 agttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccctcctacat-aacaggagaaatatct 19926420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 86
Target Start/End: Original strand, 5707778 - 5707847
Alignment:
Q  17 agttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcct 86  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| | |||||||    
T  5707778 agttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccctcct 5707847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 86
Target Start/End: Original strand, 5714406 - 5714475
Alignment:
Q  17 agttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcct 86  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| | |||||||    
T  5714406 agttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccctcct 5714475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 86
Target Start/End: Original strand, 8858625 - 8858694
Alignment:
Q  17 agttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcct 86  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| | |||||||    
T  8858625 agttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccctcct 8858694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 86
Target Start/End: Original strand, 18262670 - 18262739
Alignment:
Q  17 agttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcct 86  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| | |||||||    
T  18262670 agttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccctcct 18262739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 86
Target Start/End: Original strand, 18269531 - 18269600
Alignment:
Q  17 agttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcct 86  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| | |||||||    
T  18269531 agttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccctcct 18269600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 86
Target Start/End: Original strand, 26964098 - 26964167
Alignment:
Q  17 agttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcct 86  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| | |||||||    
T  26964098 agttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccctcct 26964167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 72
Target Start/End: Original strand, 869055 - 869110
Alignment:
Q  17 agttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgg 72  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  869055 agttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatgg 869110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 10621082 - 10621013
Alignment:
Q  17 agttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcct 86  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||| | |||||||    
T  10621082 agttggttgatgggtactccatgaatcatgttgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccctcct 10621013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 86
Target Start/End: Original strand, 26970921 - 26970990
Alignment:
Q  17 agttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcct 86  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||| | |||||||    
T  26970921 agttggttgatgggtactccatgaatcatgctgaggaacatgagtgacctagatggaatttgcccctcct 26970990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 28392883 - 28392814
Alignment:
Q  17 agttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcct 86  Q
    |||||||||||| | |||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| | |||||||    
T  28392883 agttggttgatgagtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccctcct 28392814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 86
Target Start/End: Original strand, 55613141 - 55613210
Alignment:
Q  17 agttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcct 86  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||| | |||||||    
T  55613141 agttggttgatgggtactccatgaatcatgttgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccctcct 55613210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 5667878 - 5667809
Alignment:
Q  17 agttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcct 86  Q
    |||||||||||||| |||  | ||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||| | |||||||    
T  5667878 agttggttgatgggtactccacgaatcatgctgagggacatgactgacctagatggaatttgcccctcct 5667809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 72
Target Start/End: Original strand, 8845663 - 8845716
Alignment:
Q  19 ttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgg 72  Q
    |||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||    
T  8845663 ttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacattagtgacctagatgg 8845716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 10628161 - 10628092
Alignment:
Q  17 agttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcct 86  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||| | |||| |||||||| ||||||||| ||| | |||||||    
T  10628161 agttggttgatgggtactccatgaatcatgttaagggacatgagtgacctagatggaatttgcccctcct 10628092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 86
Target Start/End: Original strand, 35224018 - 35224087
Alignment:
Q  17 agttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcct 86  Q
    |||||||||||| | |||  | ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| | |||||||    
T  35224018 agttggttgatgtgtactccacgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccctcct 35224087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 301; Significance: 1e-169; HSPs: 34)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 18 - 342
Target Start/End: Original strand, 12300184 - 12300508
Alignment:
Q  18 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 117  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12300184 gttggttgatgggtacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggatttgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 12300283  T
Q  118 gatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 217  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12300284 gatgaaatatgactataaatatgcatggccatgccaaactaagtcaatataagatattggacttattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 12300383  T
Q  218 aaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcatgaaagg 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12300384 aaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgtgacaaaggagtaattatacacttatgtgttatcatgaaagg 12300483  T
Q  318 tttcgtcagatcacttgacattctt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  12300484 tttcgtcagatcacttgacattctt 12300508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 18 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 20147582 - 20147258
Alignment:
Q  18 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20147582 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggatttgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 20147483  T
Q  118 gatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 217  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20147482 gatgaaatatgactataaatatgcatggccatgctgaactaagtcaatataagatattggacttattcgttaaatagtacatttcggaatcaagataaat 20147383  T
Q  218 aaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcatgaaagg 317  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  20147382 gaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgagacaaaggagtaattatacacatatgtattatcatgaaatg 20147283  T
Q  318 tttcgtcagatcacttgacattctt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  20147282 tttcgtcagatcacttgacattctt 20147258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 18 - 342
Target Start/End: Original strand, 55427295 - 55427619
Alignment:
Q  18 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 117  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55427295 gttggttgatgggtacttgatgaatcatgctgaggggcatgagtgttctagatgggatttgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 55427394  T
Q  118 gatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 217  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55427395 gatgaaatatgactataaatatgcatggtcatgccgaactaagtcaatataagatattggacttattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 55427494  T
Q  218 aaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcatgaaagg 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  55427495 aaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgagatcaatgaagatattgagacaaaggagtaattatacacatatgtgttatcatgaaagg 55427594  T
Q  318 tttcgtcagatcacttgacattctt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  55427595 tttcgtcagatcacttgacattctt 55427619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 18 - 342
Target Start/End: Original strand, 21034512 - 21034837
Alignment:
Q  18 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 117  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21034512 gttggttgatgggtacttgatgaatcatgctgaggggcatgagtgtcctagatgggatttgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 21034611  T
Q  118 gatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 217  Q
    |||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||| | ||    
T  21034612 gatgaaatatgactgtaaaactgcatggccatgccgaactaagtcaatatgagatattggacttattcgttattcagtatatttcggaatcaagaaatat 21034711  T
Q  218 aaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaat-gaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcatgaaag 316  Q
    ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  ||| ||| | ||||||||||||||| ||||| |   | ||||||||||||    
T  21034712 aattattgatctatacaagggtgacaatacctatgccttgggatcaataaaaggtatcgagacaaaggagtaattgtacacatgaatattatcatgaaag 21034811  T
Q  317 gtttcgtcagatcacttgacattctt 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  21034812 gtttcgtcagatcacttgacattctt 21034837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 18 - 342
Target Start/End: Original strand, 21399066 - 21399391
Alignment:
Q  18 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 117  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21399066 gttggttgatgggtacttgatgaatcatgctaaggggcatgagtgtcctagatgggatttgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 21399165  T
Q  118 gatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 217  Q
    |||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||| | ||    
T  21399166 gatgaaatatgactgtaaaattgcatggccatgccgaactaagtcaatatgagatattggacttattcgttattcagtatatttcggaatcaagaaatat 21399265  T
Q  218 aaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaat-gaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcatgaaag 316  Q
    ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  ||| ||| | |||||| |||||||| ||||| |   | ||||||||||||    
T  21399266 aattattgatctatacaagggtgacaatacctatgccttgggatcaataaaaggtatcgagacaaaagagtaattgtacacatgaattttatcatgaaag 21399365  T
Q  317 gtttcgtcagatcacttgacattctt 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  21399366 gtttcgtcagatcacttgacattctt 21399391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 18 - 342
Target Start/End: Original strand, 28088380 - 28088705
Alignment:
Q  18 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 117  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||    
T  28088380 gttggttgatggatacttgatgaatcatgctgagggacatgagtgtcctagatgggatttgtccctcctcataaacaggagatatatttttaggctgctt 28088479  T
Q  118 gatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 217  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||   |||||||||||||||||||| | ||    
T  28088480 gatgaaatatgattgtaaaactgcatggccatgctgaactaagtaaatataagatattggacttattcattattcagtatatttcggaatcaagaaatat 28088579  T
Q  218 aaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcat-gaaag 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||  | ||||| |  || ||||||| |||||    
T  28088580 aaacattgatctatacaagggtgacaatatctatgccttgggatcaataaagatatcgagacaaaggagtagctgtacacatgagtattatcatggaaag 28088679  T
Q  317 gtttcgtcagatcacttgacattctt 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  28088680 gtttcgtcagatcacttgacattctt 28088705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 18 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 15846564 - 15846239
Alignment:
Q  18 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 117  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15846564 gttggttgatgggtacttgatgaatcatgctaaggggcatgagtgtcctatatgggatttgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctcct 15846465  T
Q  118 gatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 217  Q
    |||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||| | ||    
T  15846464 gatgaaatatgactgtaaaactgcatggccatgccgaactaagtcaatatgagatattggacttattcgttattcagtatatttcggaatcaagaaatat 15846365  T
Q  218 aaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaat-gaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcatgaaag 316  Q
    ||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||  ||| ||| | ||||||||||||||||||||| |   | ||||||||||||    
T  15846364 aattattgatctatacaagggtgacaatacctatgccttgagatcaataaaaggtatcgagacaaaggagtaattatacacatgaatattatcatgaaag 15846265  T
Q  317 gtttcgtcagatcacttgacattctt 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  15846264 gtttcgtcagatcacttgacattctt 15846239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 18 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 15317204 - 15316878
Alignment:
Q  18 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 117  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  15317204 gttggttgacgggtacttgatgaatcatgctgagggacatgagtgtcctagatcagatttgtccctcctcataaacaggagatatatctttaagactctt 15317105  T
Q  118 gatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 217  Q
    |||||||||||| | |||| | |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||| | ||    
T  15317104 gatgaaatatgactgtaaaaaagcatggccatgccgaactaagtaaatatgagatattggacttattcgttattcagtatatttcggaatcaagaaatat 15317005  T
Q  218 aaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcatg--aaa 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||| ||||||| | ||||| ||||||||| ||||| ||  |  |||||||  |||    
T  15317004 aaacattgatctatacaagggtgacaatatttatgcattgagatcaataaagatatcgagacaatggagtaattgtacacataattaatatcatggaaaa 15316905  T
Q  316 ggtttcgtcagatcacttgacattctt 342  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||    
T  15316904 ggtttcgtcatatcacttgacattctt 15316878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 18 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 25978756 - 25978430
Alignment:
Q  18 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 117  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25978756 gttggttgatgggtacttgatgaatcatgttgagggacatgagtgtcctagatgagatttgtctcttctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 25978657  T
Q  118 gatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 217  Q
    |||||||||||| | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||| ||||   |||||||||||||||||||| | ||    
T  25978656 gatgaaatatgactgtaaaattgcatggccatgccgaactaagtcaatatgggatattgaacttatttgttattcagtatatttcggaatcaagaaatat 25978557  T
Q  218 aaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcatg--aaa 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||| | ||  | ||||||||  |||    
T  25978556 aaacattgatctatacaagggtgacaatatctatgccttgggatcaataaagatatcgagacaaaggagtaattgtacgcataattattatcatggaaaa 25978457  T
Q  316 ggtttcgtcagatcacttgacattctt 342  Q
      |||||||| ||||||||| ||||||    
T  25978456 tatttcgtcaaatcacttgatattctt 25978430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 18 - 339
Target Start/End: Original strand, 11787861 - 11788184
Alignment:
Q  18 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 117  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||    
T  11787861 gttggttgatgggtacttaatgaatcatgttgagggacatgagtgtcctagataggatttgtccctcctcataaccaagagatatatccttaggcatctt 11787960  T
Q  118 gatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 217  Q
     ||||||||||| | ||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||   |||||||||||||||||| | | ||    
T  11787961 aatgaaatatgactgtaaaattgtatggccatgccgaactaagtcaatatgagatattagacttattcgttattcagtatatttcggaatcaataaatat 11788060  T
Q  218 aaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcatg--aaa 315  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| ||||| ||  | ||||||||  |||    
T  11788061 aaacattggtctatacaagggtgacaatatctatgccttgggatcaataaagatattgagaaaaaggagtaattgtacacataattattatcatggaaaa 11788160  T
Q  316 ggtttcgtcagatcacttgacatt 339  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  11788161 ggtttcgtcagatcacttgacatt 11788184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 14890665 - 14890857
Alignment:
Q  18 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 117  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14890665 gttggttgatgggtacttgatgaatcatgctaagggacatgagtgtcctagatgggatttgttcctcctcattaacaggagatatatctttaggcctctt 14890764  T
Q  118 gatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaa 210  Q
    |||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||    
T  14890765 gatgaaatatgactgtaaaactgcatggccatgccgaactaagtcaatatgagatattggacttattcgttattcagtatatttcggaatcaa 14890857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 26 - 241
Target Start/End: Original strand, 26816574 - 26816788
Alignment:
Q  26 atgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctcttgatgaaat 125  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||| | |||||||||||||||||| ||| ||| || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26816574 atgggtacttgaggaatcatgttgagtgacatgagtgtcctagatggtatttgtctcttctcataa-catgagatatatctttaggcctcttgatgaaat 26816672  T
Q  126 atgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaataaacattg 225  Q
    |||| | ||||  ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| | || || ||||    |||||||||||||||||| | | ||||| ||||    
T  26816673 atgactgtaaaattgcatggccatgccgaattaagtcaacatgagatattaggcttatccgtttttcagtatatttcggaatcaaaaaatataaatattg 26816772  T
Q  226 atctatacaagggtga 241  Q
    ||||||||||||||||    
T  26816773 atctatacaagggtga 26816788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 26 - 342
Target Start/End: Original strand, 14147303 - 14147619
Alignment:
Q  26 atgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctcttgatgaaat 125  Q
    ||||| |||||||||| |||  |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14147303 atgggtacttgatgaaccatcttgagggacatgagtatcctagatgggatttgtccctccttataa-caggagatatatctttaggcctcttgatgaaat 14147401  T
Q  126 atgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaataaacattg 225  Q
    || |   ||||  | ||||| |||||||||  ||||||  || ||||||||| ||  |||||||   ||||||||| || ||||| | | ||||| ||||    
T  14147402 ataacagtaaaatttcatggtcatgccgaatcaagtcacaatgagatattgggcttgttcgttattcagtatattttgggatcaaaaaatataaatattg 14147501  T
Q  226 atctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgtgacaaaggagtaat-tatacacctatgtgttatcatgaaaggtttcgtc 324  Q
    |||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||  ||||||    ||||||||||||| | ||||| |   | |||||   ||||||||||||    
T  14147502 atctatacaagggtgaaaaaatctatgccttgtgatcaatatagatatgagcacaaaggagtaatatgtacacatgaatattatctgaaaaggtttcgtc 14147601  T
Q  325 agatcacttgacattctt 342  Q
    | ||||||||||||||||    
T  14147602 atatcacttgacattctt 14147619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 18 - 342
Target Start/End: Original strand, 15537809 - 15538135
Alignment:
Q  18 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcct-cataaacaggagatatatctttaggcctct 116  Q
    ||||||| |||| |||| || ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||    
T  15537809 gttggttaatggacactcgacgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatgagatttgtccctccttcataataag-agatatatctttaggcctct 15537907  T
Q  117 tgatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaa 216  Q
    ||||||||||||| | ||||  | ||||| ||||| ||| ||||||||||| ||| ||||| || |||| |||   | ||||||| || ||| ||| | |    
T  15537908 tgatgaaatatgactgtaaaatttcatggtcatgctgaattaagtcaatatgagacattgggcttattcattattcaatatattttgggatctagaaata 15538007  T
Q  217 taaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcatg--aa 314  Q
    |||| |||||| |||| ||||||||||  ||||||| |||| |||||||  ||||||   |||||| | |||||| ||||| |     ||||||||  ||    
T  15538008 taaatattgatttatataagggtgacaaaatctatgtcttgtgatcaatatagatatgaggacaaatgcgtaattgtacacatgaacattatcatggaaa 15538107  T
Q  315 aggtttcgtcagatcacttgacattctt 342  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15538108 aggtttcgtcatatcacttgacattctt 15538135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 86
Target Start/End: Original strand, 6110522 - 6110591
Alignment:
Q  17 agttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcct 86  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||  ||||||||    
T  6110522 agttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatttttccctcct 6110591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 86
Target Start/End: Original strand, 8490953 - 8491022
Alignment:
Q  17 agttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcct 86  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| | |||||||    
T  8490953 agttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccctcct 8491022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 86
Target Start/End: Original strand, 13211760 - 13211829
Alignment:
Q  17 agttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcct 86  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| | |||||||    
T  13211760 agttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccctcct 13211829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 86
Target Start/End: Original strand, 13249065 - 13249134
Alignment:
Q  17 agttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcct 86  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| | |||||||    
T  13249065 agttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccctcct 13249134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 86
Target Start/End: Original strand, 18523121 - 18523190
Alignment:
Q  17 agttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcct 86  Q
    |||||||||||||| |||  |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  18523121 agttggttgatgggtactccatgaataatgctgagggacatgagtgacctagatggaatttgtccctcct 18523190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 109
Target Start/End: Original strand, 30464284 - 30464360
Alignment:
Q  32 acttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatcttta 109  Q
    |||||| |||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  30464284 acttgacgaatcatggtgagagacatgagtgtcctagatgagatttgtccctcctca-aaagagaagatatatcttta 30464360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 10572341 - 10572286
Alignment:
Q  17 agttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgg 72  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  10572341 agttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatgg 10572286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 15341968 - 15341913
Alignment:
Q  17 agttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgg 72  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  15341968 agttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatgg 15341913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 15357335 - 15357280
Alignment:
Q  17 agttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgg 72  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  15357335 agttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatgg 15357280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 17780867 - 17780812
Alignment:
Q  17 agttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgg 72  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  17780867 agttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatgg 17780812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 86
Target Start/End: Original strand, 13517265 - 13517334
Alignment:
Q  17 agttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcct 86  Q
    ||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| | |||||||    
T  13517265 agttggtagatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccctcct 13517334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 15600633 - 15600564
Alignment:
Q  17 agttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcct 86  Q
    |||||||||||||| ||   ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| | |||||||    
T  15600633 agttggttgatgggtaccccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccctcct 15600564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 15607178 - 15607109
Alignment:
Q  17 agttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcct 86  Q
    |||||||||||||| ||   ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| | |||||||    
T  15607178 agttggttgatgggtaccccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccctcct 15607109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 175
Target Start/End: Original strand, 16240889 - 16240970
Alignment:
Q  94 aggagatatatctttaggcctcttgatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatatt 175  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  | |||| | || | || ||| |||||||||||||||| |||||||    
T  16240889 aggagaaatatctttaggcctcttgatggaatatgcgtgtaaaaaggcttagcaatgtcgaactaagtcaatatgagatatt 16240970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 16482232 - 16482163
Alignment:
Q  17 agttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcct 86  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||| | |||||||    
T  16482232 agttggttgatgggtactccatgaatcatgttgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccctcct 16482163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 86
Target Start/End: Original strand, 18520433 - 18520502
Alignment:
Q  17 agttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcct 86  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||| | |||||||    
T  18520433 agttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgagctagatggaatttgcccctcct 18520502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 32056648 - 32056579
Alignment:
Q  17 agttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcct 86  Q
    |||||||||||||  |||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| | |||||||    
T  32056648 agttggttgatggatactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccctcct 32056579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 17 - 72
Target Start/End: Original strand, 17136811 - 17136866
Alignment:
Q  17 agttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgg 72  Q
    |||||||||||||  |||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  17136811 agttggttgatggatactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatgg 17136866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 10579104 - 10579036
Alignment:
Q  17 agttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcct 86  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||| | |||||||    
T  10579104 agttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggac-tgagtgacctagatggaatttgcccctcct 10579036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 17199933 - 17199864
Alignment:
Q  17 agttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcct 86  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||| |||||| |||||||| | ||||||| ||| | |||||||    
T  17199933 agttggttgatgggtactccatgaatcatgatgagggacatgagtgccgtagatggaatttgcccctcct 17199864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 297; Significance: 1e-167; HSPs: 26)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 18 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 27007545 - 27007221
Alignment:
Q  18 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27007545 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggatttgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 27007446  T
Q  118 gatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 217  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27007445 gatgaaatatgactataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggacttattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 27007346  T
Q  218 aaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcatgaaagg 317  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  27007345 gaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgagacaaaggagtaattatacacatatgtattatcatgaaagg 27007246  T
Q  318 tttcgtcagatcacttgacattctt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  27007245 tttcgtcagatcacttgacattctt 27007221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 18 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 27014688 - 27014364
Alignment:
Q  18 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27014688 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggatttgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 27014589  T
Q  118 gatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 217  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27014588 gatgaaatatgactataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggacttattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 27014489  T
Q  218 aaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcatgaaagg 317  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  27014488 gaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgagacaaaggagtaattatacacatatgtattatcatgaaagg 27014389  T
Q  318 tttcgtcagatcacttgacattctt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  27014388 tttcgtcagatcacttgacattctt 27014364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 18 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 22130637 - 22130313
Alignment:
Q  18 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22130637 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggatttgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 22130538  T
Q  118 gatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 217  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22130537 gatgaaatatgactataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggacttattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 22130438  T
Q  218 aaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcatgaaagg 317  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  22130437 gaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgagacaaaggggtaattatacacatatgtattatcatgaaagg 22130338  T
Q  318 tttcgtcagatcacttgacattctt 342  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    
T  22130337 tttcgtcagatcacttgacactctt 22130313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 18 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 27880515 - 27880191
Alignment:
Q  18 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27880515 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggatttgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 27880416  T
Q  118 gatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 217  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27880415 gatgaaatatgactataaatatgcatggccatgctgaactaagtcaatataagatattggacttattcgttaaatagtacatttcggaatcaagataaat 27880316  T
Q  218 aaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcatgaaagg 317  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  27880315 gaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgagacaaaggagtaattatacacatatgtattatcatgaaagg 27880216  T
Q  318 tttcgtcagatcacttgacattctt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  27880215 tttcgtcagatcacttgacattctt 27880191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 18 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 28020696 - 28020372
Alignment:
Q  18 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28020696 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggatttgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 28020597  T
Q  118 gatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 217  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28020596 gatgaaatatgactataaatatgcatggccatgctgaactaagtcaatataagatattggacttattcgttaaatagtacatttcggaatcaagataaat 28020497  T
Q  218 aaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcatgaaagg 317  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  28020496 gaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgagacaaaggagtaattatacacatatgtattatcatgaaagg 28020397  T
Q  318 tttcgtcagatcacttgacattctt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  28020396 tttcgtcagatcacttgacattctt 28020372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 18 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 45534301 - 45533977
Alignment:
Q  18 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 117  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45534301 gttggttgatgggtacttgatgaatcatgctgaggagcatgagtgttctagatgggatttgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 45534202  T
Q  118 gatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 217  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45534201 gatgaaatatgactataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggacttattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 45534102  T
Q  218 aaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcatgaaagg 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45534101 aaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgagatcaatgaagatattgagacaaaggagtaattatacacatatgtgttatcatgaaagg 45534002  T
Q  318 tttcgtcagatcacttgacattctt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  45534001 tttcgtcagatcacttgacattctt 45533977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 19 - 342
Target Start/End: Original strand, 21916951 - 21917274
Alignment:
Q  19 ttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctcttg 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21916951 ttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggccatgagtgtcctagatgggatttgtctctcctcataaacaggagatatatctttaggcctcttg 21917050  T
Q  119 atgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaata 218  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21917051 atgaaatatgactataaatatgcatggccatgctgaactaagtcaatataagatattggacttattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaatg 21917150  T
Q  219 aacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcatgaaaggt 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  21917151 aacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgagatcaatgaagatattgagacaaaggagtaattatacacatatgtattatcatgaaaggt 21917250  T
Q  319 ttcgtcagatcacttgacattctt 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  21917251 ttcgtcagatcacttgacattctt 21917274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 18 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 22659522 - 22659197
Alignment:
Q  18 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 117  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22659522 gttggttgatgggtacttgatgaatcatgctgagggacatgagtgtcctagatgggatttgtgcctcctcataaacaggagataaatctttaggcctctt 22659423  T
Q  118 gatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 217  Q
    |||||||||||| | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| | ||    
T  22659422 gatgaaatatgactgtaaaactgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggacttattcgttaatcagtatatttcggaatcaagaaatat 22659323  T
Q  218 aaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcat-gaaag 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |  || ||||||| ||||     
T  22659322 aaacattgatctatacaagggtgacaatatctatgccttgggatcaataaagatattgagacaaaggagtaattgtacacatgagtattatcatggaaaa 22659223  T
Q  317 gtttcgtcagatcacttgacattctt 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  22659222 gtttcgtcagatcacttgacattctt 22659197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 18 - 342
Target Start/End: Original strand, 6431160 - 6431486
Alignment:
Q  18 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 117  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6431160 gttggttgatgggtacttgatgaatcatgctgagggacatgagtgtcctagatgagatttgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 6431259  T
Q  118 gatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 217  Q
    |||||||||||| | ||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||    
T  6431260 gatgaaatatgactgtaaaattgcatggtcatgccggactaagtcaatatgagatattggacttattcgttatttagtatatttcggaatcaagaaatat 6431359  T
Q  218 aaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcatg--aaa 315  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||  | ||||||||  |||    
T  6431360 aaacattgatccatacaagggtgacaatatctatgtcttgggatcaataaagatatcgagacaaaggagtaattttacacataattattatcatgaaaaa 6431459  T
Q  316 ggtttcgtcagatcacttgacattctt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  6431460 ggtttcgtcagatcacttgacattctt 6431486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 18 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 2962960 - 2962634
Alignment:
Q  18 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 117  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2962960 gttggttgatggttacttgatgaatcatgctgagggacatgagtgtcctagatgggatctgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggtctctt 2962861  T
Q  118 gatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 217  Q
    |||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||| | ||    
T  2962860 gatgaaatatgactgtaaaattgcatggccatgccgaactaagtcaatatgagatattggacttattcgttattcagtatatttcggaatcaagaaatat 2962761  T
Q  218 aaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcatg--aaa 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||| | || |||||||||||| ||||| ||  | ||||||||  |||    
T  2962760 aaacattgatctatacaagggtgacaatatctatgcatttggatcaataaagatatcgagaaaaaggagtaattgtacacataattattatcatggaaaa 2962661  T
Q  316 ggtttcgtcagatcacttgacattctt 342  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||    
T  2962660 ggtttcgttagatcacttgacattctt 2962634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 18 - 342
Target Start/End: Original strand, 25611469 - 25611794
Alignment:
Q  18 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25611469 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctaaggggcatgagtgtcctagatgggatttgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 25611568  T
Q  118 gatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 217  Q
    |||||||||||| | ||||  ||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||| | ||    
T  25611569 gatgaaatatgactgtaaaactgcatagccatgacgaactaagtcaatatgagatattggacttattcgttattcagtatatttcggaatcaagaaatat 25611668  T
Q  218 aaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaat-gaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcatgaaag 316  Q
    ||  |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||  ||| ||| | ||||||||||||||| ||| | |   | ||||||||||||    
T  25611669 aattattgatctatacaagggtgacaatacatatgccttgagatcaataaaaggtatcgagacaaaggagtaattgtacgcatgaatattatcatgaaag 25611768  T
Q  317 gtttcgtcagatcacttgacattctt 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  25611769 gtttcgtcagatcacttgacattctt 25611794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 18 - 342
Target Start/End: Original strand, 21969607 - 21969932
Alignment:
Q  18 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 117  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  21969607 gttggttgatgggtacttgatgaatcatgctaatggacatgagtgtcctagatgggatttatccctcctcattaacaagagatatatctttaggcctctt 21969706  T
Q  118 gatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 217  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||   |||||||||| ||||||||| | ||    
T  21969707 gatgaaatatgattgtaaaactgcatggccatgccgaactaagtcaatatgagatattggacttattcgttatccagtatatttccgaatcaagaaatat 21969806  T
Q  218 aaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaat-gaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcatgaaag 316  Q
    ||  |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||  ||| ||| | ||||||||||||||| ||||| |   | ||||||||||||    
T  21969807 aattattgatctatacaagggtgacaatacctatgtcttgggatcaataaaaggtatcgagacaaaggagtaattgtacacgtgaatattatcatgaaag 21969906  T
Q  317 gtttcgtcagatcacttgacattctt 342  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||    
T  21969907 gtttcgtcagatcacttgatattctt 21969932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 18 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 8371281 - 8370956
Alignment:
Q  18 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 117  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  8371281 gttggttgatgggtacttgatgaatcatgctaaggggcatgagtgtcctagatgagatttgtccctcctcattaacagaagatatatctttaggcctctt 8371182  T
Q  118 gatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 217  Q
    |||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||   | |||||||||||||||||| | ||    
T  8371181 gatgaaatatgactgtaaaactgcatggccatgccgaactaagtcaatatgagatattggacttattcgttattcaatatatttcggaatcaagaaatat 8371082  T
Q  218 aaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaat-gaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcatgaaag 316  Q
    ||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||| | || |||||||||||| ||||| |   | ||| ||||| ||    
T  8371081 aattattgatctatacaaggatgacaatatctatgccttgggatcaatataaggtatcgagataaaggagtaattgtacacatgaatattaccatgagag 8370982  T
Q  317 gtttcgtcagatcacttgacattctt 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  8370981 gtttcgtcagatcacttgacattctt 8370956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 18 - 297
Target Start/End: Original strand, 12562397 - 12562677
Alignment:
Q  18 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 117  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  12562397 gttggttgatgggtacttgatgaatcatgctaaggggcatgagtgtcctagatgagatttgtccctcctcataaacaagagatatatctttaggtctctt 12562496  T
Q  118 gatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 217  Q
    |||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||| | ||    
T  12562497 gatgaaatatgactgtaaaactgcatggccatgccgaactaagtcaatatgagatattggacttattcgttattcagtatatttcggaatcaagaaatat 12562596  T
Q  218 aaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaat-gaagatattgtgacaaaggagtaattatacac 297  Q
    ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||| |||||    
T  12562597 aattattgatctatacaagggtgacaatacctatgccttgggatcaataaaaggtattgagacaaaggagtaattgtacac 12562677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 18 - 342
Target Start/End: Original strand, 26240758 - 26241084
Alignment:
Q  18 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 117  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26240758 gttggttgatgggtacttgatgaatcatgctaaggggcatgagtgtcctagatgagatttgtcactcctcataagcaggagatatatctttaggcctctt 26240857  T
Q  118 gatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 217  Q
    |||||||||||| | ||||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |    |||||||||||| ||||| | | ||    
T  26240858 gatgaaatatgactgtaaaactgcatggctatgccgaactaagtcaatatgagatattggacttattcgctgttcagtatatttcgggatcaaaaaatat 26240957  T
Q  218 aaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaat-gaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcat-gaaa 315  Q
    ||  ||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||  ||| ||| | ||||||||||||||| ||||| |  || ||||||| ||||    
T  26240958 aattattgatctacacaagggtgacaatacctatgccttgggatcaataaaaggtatggagacaaaggagtaattgtacacatgagtattatcatggaaa 26241057  T
Q  316 ggtttcgtcagatcacttgacattctt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  26241058 ggtttcgtcagatcacttgacattctt 26241084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 26 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 8781895 - 8781664
Alignment:
Q  26 atgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcc-tcataaacaggagatatatctttaggcctcttgatgaaa 124  Q
    |||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8781895 atggacacttgacgaatcatgttgagggacatgagtgtcctagatggaatttgtccctccctcataa-caggagatatatctttaggcctcttgatgaaa 8781797  T
Q  125 tatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaataaacatt 224  Q
    ||||| ||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||   | ||||||| || ||||||| | ||||| |||    
T  8781796 tatgactataaaattgcatgaccatgccgaattaagtcaatatgagatattgggcttattcgttattcaatatattttgggatcaagaaatataaatatt 8781697  T
Q  225 gatctatacaagggtgacactatctatgccttg 257  Q
    ||| |||||||||||||||  ||||||| ||||    
T  8781696 gatatatacaagggtgacaaaatctatgtcttg 8781664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 26 - 342
Target Start/End: Original strand, 18835632 - 18835945
Alignment:
Q  26 atgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctcttgatgaaat 125  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | ||    ||||||||||| |||| ||||||||| || |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18835632 atgggcacttgctgaatcatgctgagagaca----tgtcctagatgagatttgtccctcctgat-aacatgagatgtatctttaggcctcttgatgaaat 18835726  T
Q  126 atgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaataaacattg 225  Q
    ||||   ||||  |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||   |||||||||||| ||||||| | ||||| ||||    
T  18835727 atgaccgtaaaattgcatggccatgccaaactaagtcaatatgagatattggacttatttgttattcagtatatttcgggatcaagaaatataaatattg 18835826  T
Q  226 atctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcatg--aaaggtttcgt 323  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||| | |  |||||||  ||||||   |||| |||||||||| ||||| |   | ||||||||  |||||||||||    
T  18835827 atctatacaatggtgacaaaatctatgtcatttgatcaatatagatatgaagacagaggagtaattgtacacatgaatattatcatgaaaaaggtttcgt 18835926  T
Q  324 cagatcacttgacattctt 342  Q
    || ||||||||||||||||    
T  18835927 caaatcacttgacattctt 18835945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 18 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 20535238 - 20534912
Alignment:
Q  18 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcct-cataaacaggagatatatctttaggcctct 116  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||||||  |||||| ||||| |||| || |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  20535238 gttggttaatgggcacttgacaaatcatattgagggacatgaatgtcgtaaatgggatttgtccctccttcataa-caggagatatatctttaggcctat 20535140  T
Q  117 tgatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaa 216  Q
    ||||||||||||| | ||||  |||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||   |||||||||||| ||||||| | |    
T  20535139 tgatgaaatatgactgtaaaattgcaaggccatgctgaattaagtcaatatgagatattgggcttattcgttattcagtatatttcgggatcaagaaata 20535040  T
Q  217 taaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcatg--aa 314  Q
    |||| ||||||||||| | || |||||  |||||||||||| |||||||  ||||||   ||||||||| ||||||| ||| |     ||||||||  ||    
T  20535039 taaatattgatctatatagggatgacaaaatctatgccttgtgatcaatatagatatgaggacaaaggaataattatgcacatgaacattatcatggaaa 20534940  T
Q  315 aggtttcgtcagatcacttgacattctt 342  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||    
T  20534939 atgtttcgtcagatcatttgacattctt 20534912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 27099025 - 27098785
Alignment:
Q  17 agttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcct-cataaacaggagatatatctttaggcctc 115  Q
    |||||||| ||||  | ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| |||| | ||||||| ||| |||| |||| || |||||||| |||    
T  27099025 agttggttaatggaaagttgatgaatcatgatgagggacataagtgtcctagatgagatttgcccctcctgcat-aacacgagaaatgtctttaggtctc 27098927  T
Q  116 ttgatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataa 215  Q
    |||||||||| ||| | ||||  ||||||  ||||||| | |||||||||||  ||||||||| | |||| |||   | |||||||  | ||||||| |     
T  27098926 ttgatgaaatgtgactgtaaaattgcatgatcatgccggattaagtcaatatgggatattggatttattcattactcaatatattttaggatcaagaaat 27098827  T
Q  216 ataaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttg 257  Q
    || |  ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  27098826 attactattgagctatacaagggtgacacaatctatgtcttg 27098785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 86
Target Start/End: Original strand, 28548505 - 28548574
Alignment:
Q  17 agttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcct 86  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| | |||||||    
T  28548505 agttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtggcctagatggaatttgcccctcct 28548574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 86
Target Start/End: Original strand, 6094581 - 6094650
Alignment:
Q  17 agttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcct 86  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||| || |||||| ||| | |||||||    
T  6094581 agttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgaccaagatggaatttgcccctcct 6094650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 86
Target Start/End: Original strand, 15326656 - 15326725
Alignment:
Q  17 agttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcct 86  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||| | |||||||    
T  15326656 agttggttgatgggtactccatgaatcatgttgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccctcct 15326725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 86
Target Start/End: Original strand, 15507025 - 15507094
Alignment:
Q  17 agttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcct 86  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||| | |||||||    
T  15507025 agttggttgatgggtactccatgaatcatgttgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccctcct 15507094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 17 - 72
Target Start/End: Original strand, 24643106 - 24643161
Alignment:
Q  17 agttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgg 72  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  24643106 agttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgatctagatgg 24643161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 62
Target Start/End: Original strand, 22171945 - 22171990
Alignment:
Q  17 agttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtg 62  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  22171945 agttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtg 22171990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 18 - 50
Target Start/End: Original strand, 36970523 - 36970555
Alignment:
Q  18 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctga 50  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36970523 gttggttgatgggtacttgatgaatcatgctga 36970555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 297; Significance: 1e-167; HSPs: 36)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 18 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 48808524 - 48808200
Alignment:
Q  18 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48808524 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggatttgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 48808425  T
Q  118 gatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 217  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48808424 gatgaaatatgactataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggacttattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 48808325  T
Q  218 aaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcatgaaagg 317  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  48808324 gaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgagacaaaggagtaattatacacatatgtattatcatgaaagg 48808225  T
Q  318 tttcgtcagatcacttgacattctt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  48808224 tttcgtcagatcacttgacattctt 48808200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 18 - 342
Target Start/End: Original strand, 18400378 - 18400702
Alignment:
Q  18 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18400378 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggatttgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 18400477  T
Q  118 gatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 217  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18400478 gatgaaatatgactataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggacttattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 18400577  T
Q  218 aaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcatgaaagg 317  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  18400578 gaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgagacaaaggggtaattatacacatatgtattatcatgaaagg 18400677  T
Q  318 tttcgtcagatcacttgacattctt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  18400678 tttcgtcagatcacttgacattctt 18400702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 18 - 342
Target Start/End: Original strand, 18407362 - 18407686
Alignment:
Q  18 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18407362 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggatttgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 18407461  T
Q  118 gatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 217  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18407462 gatgaaatatgactataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggacttattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 18407561  T
Q  218 aaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcatgaaagg 317  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  18407562 gaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgagacaaaggggtaattatacacatatgtattatcatgaaagg 18407661  T
Q  318 tttcgtcagatcacttgacattctt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  18407662 tttcgtcagatcacttgacattctt 18407686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 18 - 342
Target Start/End: Original strand, 2204826 - 2205150
Alignment:
Q  18 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2204826 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggatttgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 2204925  T
Q  118 gatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 217  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2204926 gatgaaatatgactataaatatgcatggccatgctgaactaagtcaatataagatattggacttattcgttaaatagtacatttcggaatcaagataaat 2205025  T
Q  218 aaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcatgaaagg 317  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  2205026 gaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgagacaaaggagtaattatacacatatgtattatcatgaaagg 2205125  T
Q  318 tttcgtcagatcacttgacattctt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  2205126 tttcgtcagatcacttgacattctt 2205150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 18 - 342
Target Start/End: Original strand, 15730025 - 15730349
Alignment:
Q  18 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 117  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15730025 gttggttgatgggtacttgatgaatcatgctgaggggcatgagtgttccagatgggatttgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 15730124  T
Q  118 gatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 217  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15730125 gatgaaatatgactataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggacttattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 15730224  T
Q  218 aaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcatgaaagg 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15730225 aaacattgatctatacaagggtgacgctatctatgccttgagatcaatgaagatattgagacaaaggagtaattatacacatatgtgttatcatgaaagg 15730324  T
Q  318 tttcgtcagatcacttgacattctt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  15730325 tttcgtcagatcacttgacattctt 15730349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 18 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 18139366 - 18139042
Alignment:
Q  18 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 117  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18139366 gttggttgatgggtacttgatgaatcatgttgaggggcatgagtgtcctagatgggatttgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 18139267  T
Q  118 gatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 217  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18139266 gatgaaatatgactataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggacttattcgttaaatagtatatttaggaatcaagataaat 18139167  T
Q  218 aaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcatgaaagg 317  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  18139166 agacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgagacaaaggagtaattatacacatatgtattatcatgaaagg 18139067  T
Q  318 tttcgtcagatcacttgacattctt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  18139066 tttcgtcagatcacttgacattctt 18139042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 18 - 342
Target Start/End: Original strand, 30254412 - 30254736
Alignment:
Q  18 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 117  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30254412 gttggttgatgggtacttgataaatcatgctaagggacatgagtgtcctagatgggatttgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 30254511  T
Q  118 gatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 217  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  30254512 gatgaaatatgactataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggacttattcgttaaatagtatattttgggatcaagataaat 30254611  T
Q  218 aaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcatgaaagg 317  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  30254612 agacattgatctatacaagggtgacaccatctatgccttgggatcaatgaagatattgagacaaaggagtaattatacacatatgtattatcatgaaagg 30254711  T
Q  318 tttcgtcagatcacttgacattctt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  30254712 tttcgtcagatcacttgacattctt 30254736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 18 - 342
Target Start/End: Original strand, 19231162 - 19231487
Alignment:
Q  18 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 117  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19231162 gttggttgatgggtacttgatgaatcatgctgaggggcatgagtgttctagatgagattcgtccctcctcataaacatgagatatatctttaggcctctt 19231261  T
Q  118 gatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 217  Q
    |||||||||||| | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||| |||||||||| | ||    
T  19231262 gatgaaatatgaatgtaaaactgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggacttattcgttattcagtatattttggaatcaagaaatat 19231361  T
Q  218 aaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcat-gaaag 316  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||||||| || || |  || ||||||| |||||    
T  19231362 aaatattgatctatacaagggtgacaatatctatgccttgggatcaataaagatatcgagacaaaagagtaattgtagacatgagtattatcatggaaag 19231461  T
Q  317 gtttcgtcagatcacttgacattctt 342  Q
    |||| |||||||||||||||||||||    
T  19231462 gttttgtcagatcacttgacattctt 19231487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 18 - 342
Target Start/End: Original strand, 8465273 - 8465598
Alignment:
Q  18 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 117  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8465273 gttggttgatgggtacttgatgaatcatgctaagggacatgagtgtcctagataggatttgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 8465372  T
Q  118 gatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 217  Q
    |||||||||||| | ||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||| | ||    
T  8465373 gatgaaatatgactgtaaaactgcaaggccatgccgaactaagtcaatatgagatattggacttattcgttattcagtatatttcggaatcaagaaatat 8465472  T
Q  218 aaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaat-gaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcatgaaag 316  Q
    ||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||  ||| ||| | ||||||||||||||||||||| |   | ||||||||||||    
T  8465473 aattattgatctatacaagggtgacaatacctatgccttgagatcaataaaaggtatcgagacaaaggagtaattatacacatgaatattatcatgaaag 8465572  T
Q  317 gtttcgtcagatcacttgacattctt 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  8465573 gtttcgtcagatcacttgacattctt 8465598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 18 - 342
Target Start/End: Original strand, 34128847 - 34129173
Alignment:
Q  18 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 117  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34128847 gttggttgatgggtacttgatgaatcatgttgagggacatgagtgtcctagatgggatttgtccctcctcataaacaggagatatatctttagacctctt 34128946  T
Q  118 gatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 217  Q
    |||||||||||| | ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||   |||||||||||||||||||| | ||    
T  34128947 gatgaaatatgactgtaaaattgcatggtcatgccgaactaagtcaatatgagatattagacttattcgttattcagtatatttcggaatcaagaaatat 34129046  T
Q  218 aaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcatg--aaa 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||||| || || ||  | ||||||||  |||    
T  34129047 aaacattgatctatacaagggtgacaatatctatgcattgagatcaataaagatatcgagacaaaggagtaattgtaaacataattattatcatggaaaa 34129146  T
Q  316 ggtttcgtcagatcacttgacattctt 342  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||    
T  34129147 ggtttcgtcatatcacttgacattctt 34129173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 18 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 18259152 - 18258826
Alignment:
Q  18 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 117  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  18259152 gttggttgatgggtacttgatgaatcatgctaagggacatgagtgtcctagataggatttctccctcctcataaacatgaaatatatctttaggcctctt 18259053  T
Q  118 gatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 217  Q
    |||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||| | ||    
T  18259052 gatgaaatatgactgtaaaattgcatggccatgccgaactaagtcaatgtgggatattggacttattcgttattcagtatatttcggaatcaagaaatat 18258953  T
Q  218 aaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcatg--aaa 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||| ||| | ||  | ||||||||  |||    
T  18258952 aaacattgatctatacaagggtgacaatatctatgccttgggatcaataaagatatcgagacaacggagtaattgtacgcataattattatcatggaaaa 18258853  T
Q  316 ggtttcgtcagatcacttgacattctt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  18258852 ggtttcgtcagatcacttgacattctt 18258826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 18 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 41680996 - 41680671
Alignment:
Q  18 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 117  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41680996 gttggttgattggtacttgatgaatcatgttgagggacatgagtgtcctagatggaatttgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 41680897  T
Q  118 gatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 217  Q
    |||||||||||  | ||||  |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||| | ||    
T  41680896 gatgaaatatgtctgtaaaactgcatggccatgccgaactaagtctatatgagatattggacttattcgttatttagtatatttcgtaatcaagaaatat 41680797  T
Q  218 aaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcat-gaaag 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||| |  || ||||||| |||||    
T  41680796 aaacattgatctatacaagggtgacaatatctatatcttgggatcaataaagatatagagacaaaggagtaattgtacacatgagtattatcatggaaag 41680697  T
Q  317 gtttcgtcagatcacttgacattctt 342  Q
      ||||||| ||||||||||||||||    
T  41680696 tcttcgtcatatcacttgacattctt 41680671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 18 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 47166887 - 47166562
Alignment:
Q  18 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 117  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47166887 gttggttgatgggtacttgataaatcatgttgagggacatgagtgtcctagatgggatttgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 47166788  T
Q  118 gatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 217  Q
    |||||||||| | | ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||   ||||||||| |||||||||| | ||    
T  47166787 gatgaaatat-actgtaaaattgcatggtcatgccgaactaagtcaatatgagatattggacttattcgttattcagtatattttggaatcaagaaatat 47166689  T
Q  218 aaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcatg--aaa 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||| | |||||| |||||||| ||||| ||  | ||||||||  |||    
T  47166688 aaacattgatctatacaagggtgacaatatttatgctttgggatcaataaagatatcgagacaaaagagtaattgtacacataattattatcatggaaaa 47166589  T
Q  316 ggtttcgtcagatcacttgacattctt 342  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||    
T  47166588 ggtttcgttagatcacttgacattctt 47166562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 18 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 10668929 - 10668604
Alignment:
Q  18 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 117  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10668929 gttggttgatgggtacttgatgaatcatgctgagggacatgagtgtcccagatgggatttgtccctcctcataaacagtagatatatctttaggcctctt 10668830  T
Q  118 gatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 217  Q
    |||| |||| || ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||   | |||||||||||||||||| | ||    
T  10668829 gatggaatacgactataaaattgcatgtccatgccgaactaagtcaatatgagatattggacttattcgttattcaatatatttcggaatcaagaaatat 10668730  T
Q  218 aaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcatg-aaag 316  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||| ||||| |   | |||||||| |||     
T  10668729 aaacattgatctagacaaggatgacaatatctatgccttgggatcaacaaagatatcgagacaaaggagtaattgtacacatgaatattatcatgaaaaa 10668630  T
Q  317 gtttcgtcagatcacttgacattctt 342  Q
    |||||||||||||||  |||||||||    
T  10668629 gtttcgtcagatcacaagacattctt 10668604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 18 - 342
Target Start/End: Original strand, 28130835 - 28131161
Alignment:
Q  18 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 117  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28130835 gttggttgatgggtacttaatgaatcatgttgagggacatgagtgtcatagatgaaatttgtccctcctcataaacaggagatatatcttcaggcctctt 28130934  T
Q  118 gatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 217  Q
    |||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||| | ||    
T  28130935 gatgaaatatgactgtaaaactgcatggccatgccgaactaagtcaatatgagatgttggacttattcgttattcagtatatttcggaatcaagaaatat 28131034  T
Q  218 aaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcatg--aaa 315  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||  |||||||  |||||| ||||||| |||||| || || ||||||||  |||    
T  28131035 aaatattgatctatacaagggtgacaaaatctatgccttgagatcaatatagatattaggacaaatgagtaatcatacacataagtattatcatggaaaa 28131134  T
Q  316 ggtttcgtcagatcacttgacattctt 342  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||    
T  28131135 ggtttcgtcatatcacttgacattctt 28131161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 265
Target Start/End: Original strand, 16011724 - 16011962
Alignment:
Q  26 atgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctcttgatgaaat 125  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||| ||| |||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16011724 atgggtacttgatgaatcatgttgagggacatgagtgtcctaggtgagatttgtcgctcctcataa-catgagatatatcttgaggcctcttgatgaaat 16011822  T
Q  126 atgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaataaacattg 225  Q
    |||| | ||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  16011823 atgactgtaaagttgcacggccatgccgaactaagtcaatatgagatattggacttattcgttattcagtatatttcggaatcaagaaatataaatattg 16011922  T
Q  226 atctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaat 265  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  16011923 atctatacaagggtgacaatatctatgccttgtgatcaat 16011962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 32 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 19393438 - 19393126
Alignment:
Q  32 acttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctcttgatgaaatatgatt 131  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||      
T  19393438 acttgatgaatcatgctgagggacatgagtgtcctagattggatttgtccctcctcata--caggagatatatcttctggcctcttgatgaaatatgacg 19393341  T
Q  132 ataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaataaacattgatctat 231  Q
     ||||  |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| | ||||  ||   |||||| ||||||||||||| | ||||| |||||| |||    
T  19393340 -taaagttgcatggccatgccaacctaagtcaatatgagatattggagttattctatattcagtatacttcggaatcaagaaatataaatattgatatat 19393242  T
Q  232 acaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcatg--aaaggtttcgtcagatc 329  Q
    |||||||||| |  |||||||||||| |||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||| |   | ||||||||  ||||||||| |||||||    
T  19393241 acaagggtgaaaaaatctatgccttgtgatcaatatagatattaggacaaaggagtaattatacacatgaatattatcatggaaaaggtttcatcagatc 19393142  T
Q  330 acttgacattcttctc 345  Q
    ||||||||||||||||    
T  19393141 acttgacattcttctc 19393126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 17 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 18257594 - 18257269
Alignment:
Q  17 agttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcct-cataaacaggagatatatctttaggcctc 115  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  18257594 agttggttgatgggtacttgaagaatcatgttgatggacatgagtgtcctagatgggatttgtccctccttcataa-cagaagatatatctt-aggcctc 18257497  T
Q  116 ttgatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataa 215  Q
    |||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| |||    ||||||||||| ||||||| |     
T  18257496 ttgatgaaatatgactgtaaagatgcatggccatgccgaactaagtcaatatgagatattgggcttattcattattcggtatatttcgggatcaagaaat 18257397  T
Q  216 ataaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcat-gaa 314  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||  |||||| |||||  ||||||  |||||    ||||||||||||||| ||||| |   | |||| || |||    
T  18257396 ataaatattgatctatacaaggatgacaaaatctataccttgtaatcaatatagatacgaggacaaaggagtaattgtacacatgaatattattatggaa 18257297  T
Q  315 aggtttcgtcagatcacttgacattctt 342  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||    
T  18257296 aggttttgtcagatcacttgacattctt 18257269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 26 - 235
Target Start/End: Original strand, 14592133 - 14592341
Alignment:
Q  26 atgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctcttgatgaaat 125  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14592133 atgggtacttgatgaatcatgttgagggacatgagtgtcctagatgggatttgtcgctcctcataa-catgagatatatcttgaggcctcttgatgaaat 14592231  T
Q  126 atgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaataaacattg 225  Q
    |||| | ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||   |||||||||||| ||||||| | ||||| ||||    
T  14592232 atgactgtaaagttgcatggccatgctgaactaagtcaatatgagatattggacttattcgttattcagtatatttcgggatcaagaaatataaatattg 14592331  T
Q  226 atctatacaa 235  Q
    || |||||||    
T  14592332 atatatacaa 14592341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 32 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 31190453 - 31190248
Alignment:
Q  32 acttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctcttgatgaaatatgatt 131  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31190453 acttgatgaatcatgctgagggacatgagtgtcctagatgagatttttccctcctcataa-caggagatatatatttaggcctcttgatgaaatatgatt 31190355  T
Q  132 ataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaataaacattgatctat 231  Q
     ||||  | |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||  |||||||   ||||||||| || ||||||| | ||||| ||||||||||    
T  31190354 gtaaaatttcatggccatgccgaatcaagtcaatattagatattggacttgttcgttattcagtatattttgggatcaagaaatataaatattgatctat 31190255  T
Q  232 acaaggg 238  Q
    |||||||    
T  31190254 acaaggg 31190248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 15169318 - 15168997
Alignment:
Q  18 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcc-tcataaacaggagatatatctttaggcctct 116  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||| |||| |||| |||| ||||||||| ||| ||    
T  15169318 gttggttgataggcacttgatgaatcatgctgagggacatgagtgtcctagatgacatt-gtccctccttcat-aacaagagacatatctttaagccact 15169221  T
Q  117 tgatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaa 216  Q
    |||||||  |||| | ||||  ||||||| |||||| |  ||||||||||| ||||||| | || ||| ||||   |||||||||||  ||||||| | |    
T  15169220 tgatgaa--atgactgtaaaattgcatggtcatgccaagttaagtcaatatgagatattaggcttatttgttattcagtatatttcgagatcaagaaata 15169123  T
Q  217 taaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcatg--aa 314  Q
    |||| |||||||  ||||||| |||||  |||||||||||| | ||| |  | ||||   ||||||||||||||| ||||| |   | ||||||||  ||    
T  15169122 taaatattgatc--tacaaggatgacaaaatctatgccttgtgttcagtataaatatgaggacaaaggagtaattgtacacattaatattatcatggaaa 15169025  T
Q  315 aggtttcgtcagatcacttgacattctt 342  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||    
T  15169024 aagtttcgtcagatcacttgacattctt 15168997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 12409800 - 12410080
Alignment:
Q  17 agttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcct-cataaacaggagatatatctttaggcctc 115  Q
    |||||||| |||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||||  |||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  12409800 agttggttaatggacaattgatgaatcatgatgagggacatgagtgttcaagatgatatttttccctcctgcataa-caggagatatatctttaggactc 12409898  T
Q  116 ttgatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataa 215  Q
    |||||||||||||||| ||    | |||| |||||  ||| ||||||| ||| |||||||| | | |||||||||  ||||||||| || ||||||| |     
T  12409899 ttgatgaaatatgattttactatttcatgaccatgttgaattaagtcagtatgagatattgaatttattcgttaatcagtatattttgggatcaagaaat 12409998  T
Q  216 ataaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgt--gacaaaggagtaattatacac 297  Q
    ||||| ||||| ||||  ||||||||||| || |||| ||||   |||||  |||||| ||  | |||||||||||||||||||    
T  12409999 ataaatattgagctat--aagggtgacacaatatatgtcttgtattcaatatagatatagtagggcaaaggagtaattatacac 12410080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 29 - 252
Target Start/End: Original strand, 19388840 - 19389067
Alignment:
Q  29 ggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcct-cata---aacaggagatatatctttaggcctcttgatgaaa 124  Q
    |||| |||| |||||||| |||||| |||||| |||| ||||| |||| ||| ||||| |||    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19388840 ggcatttgacgaatcatgttgagggccatgagcgtccaagatgagatttgtctctcctgcatgcataacatgagatatatctttaggactcttgatgaaa 19388939  T
Q  125 tatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaataaacatt 224  Q
    ||||| | ||||  |||||||  |||||||| ||||||||||| | ||||| |||| ||||||||    |||||||| || ||||| | | | ||| |||    
T  19388940 tatgactgtaaaattgcatggttatgccgaattaagtcaatatcatatatttgacttattcgttattcggtatattttgggatcaataaatacaaatatt 19389039  T
Q  225 gatctatacaagggtgacactatctatg 252  Q
    || | ||||||||||||||| |||||||    
T  19389040 gagccatacaagggtgacacaatctatg 19389067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 130 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 24443294 - 24443081
Alignment:
Q  130 ttataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaataaacattgatct 229  Q
    |||||||  ||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||  || ||||||||   | |||||||||| ||| ||| | ||||| ||||||||    
T  24443294 ttataaaattgcatggtcatgccgtattaagtcaatatgagatattgagcttattcgttattcactatatttcgggatccagaaatataaatattgatct 24443195  T
Q  230 atacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcatg--aaaggtttcgtcaga 327  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||| |||||||  |||||    |||||| |||||||| ||||| |     ||||||||  ||| |||||||||||    
T  24443194 atacaagggtgaaaaaatctatgccttgtgatcaatatagatacgaagacaaaagagtaattgtacacattaacattatcatggaaaatgtttcgtcaga 24443095  T
Q  328 tcacttgacattct 341  Q
    |||||| |||||||    
T  24443094 tcacttaacattct 24443081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 17 - 129
Target Start/End: Original strand, 12392911 - 12393022
Alignment:
Q  17 agttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcct-cataaacaggagatatatctttaggcctc 115  Q
    |||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||| |  |||||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||    
T  12392911 agttggttaaagggcagttgatgaatcatgatgagggacatgagtgtccaagatgagatttg-acctcctgcat-aacatgagatatatctttaggcatc 12393008  T
Q  116 ttgatgaaatatga 129  Q
    ||||||||| ||||    
T  12393009 ttgatgaaacatga 12393022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 11542729 - 11542660
Alignment:
Q  17 agttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcct 86  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| | |||||||    
T  11542729 agttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccctcct 11542660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 11535811 - 11535756
Alignment:
Q  17 agttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgg 72  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  11535811 agttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatgg 11535756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 8836722 - 8836636
Alignment:
Q  102 tatctttaggcctcttgatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgtt 188  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | | ||  || |||| ||||||||| |||||  |||| |||||||||||| |||||||    
T  8836722 tatcattaggcctcttgatgaaatatgactgtgaaattgtatggtcatgccgaattaagttgatatgagatattggacttattcgtt 8836636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 25845488 - 25845399
Alignment:
Q  34 ttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcc-tcataaacaggagatatatctttaggcctcttgatgaa 123  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||  |||  ||||||| |||| |||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  25845488 ttgatgaatcatgctgagggacatgagttttctagatgttatttatccctccttcat-aacatgagatttatctttaggtctcttgatgaa 25845399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 86
Target Start/End: Original strand, 12738994 - 12739063
Alignment:
Q  17 agttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcct 86  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||| | |||||||    
T  12738994 agttggttgatgggtactccatgaatcatgttgagggacatgagtgacctagatggaatttggccctcct 12739063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 25845377 - 25845313
Alignment:
Q  193 agtatatttcggaatcaagataaataaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttg 257  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||| |||||| | ||||| ||||    
T  25845377 agtatatttcggaatcaagaaatataaatattgagctatacaaggatgacacaagctatgtcttg 25845313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 17 - 72
Target Start/End: Original strand, 29328242 - 29328297
Alignment:
Q  17 agttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgg 72  Q
    ||||| |||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  29328242 agttgcttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatgg 29328297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 216 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 31190237 - 31190108
Alignment:
Q  216 ataaacattgatctatacaaggg-tgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcatg-- 312  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||  || |||| |||  |||||||  ||||||   ||||||||||||||| ||||| |   | ||||||||      
T  31190237 ataaacattgatttatacaaggggtgacaaaatatatgacttttgatcaatatagatatgaggacaaaggagtaattgtacacatgaatattatcatgga 31190138  T
Q  313 aaaggtttcgtcagatcacttgacattctt 342  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  31190137 aaagatttcgtcggatcacttgacattctt 31190108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 86
Target Start/End: Original strand, 12751284 - 12751353
Alignment:
Q  17 agttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcct 86  Q
    |||||||||||||  |||  ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||| | |||||||    
T  12751284 agttggttgatggatactccatgaatcatgctgaggaacatgagtgacctagatggaatttgcccctcct 12751353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 86
Target Start/End: Original strand, 15152901 - 15152970
Alignment:
Q  17 agttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcct 86  Q
    |||||||||||||| |||  |||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||| ||| | |||||||    
T  15152901 agttggttgatgggtactccatgaattatgttgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccctcct 15152970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 34 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 25845907 - 25845820
Alignment:
Q  34 ttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcc-tcataaacaggagatatatctttaggcctcttgatg 121  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||  |||  ||||||| |||| |||| ||||| |||||||||| |||| ||||    
T  25845907 ttgatgaatcatgctgagggacatgagttttctagatgttatttatccctccttcat-aacatgagatttatctttaggtctctagatg 25845820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 297; Significance: 1e-167; HSPs: 23)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 18 - 342
Target Start/End: Original strand, 32173 - 32497
Alignment:
Q  18 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32173 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggatttgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 32272  T
Q  118 gatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 217  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32273 gatgaaatatgactataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggacttattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 32372  T
Q  218 aaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcatgaaagg 317  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  32373 gaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgagacaaaggagtaattatacacatatgtattatcatgaaagg 32472  T
Q  318 tttcgtcagatcacttgacattctt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  32473 tttcgtcagatcacttgacattctt 32497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 18 - 342
Target Start/End: Original strand, 23546196 - 23546520
Alignment:
Q  18 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23546196 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggatttgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 23546295  T
Q  118 gatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 217  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23546296 gatgaaatatgactataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggacttattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 23546395  T
Q  218 aaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcatgaaagg 317  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  23546396 gaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgagacaaaggagtaattatacacatatgtattatcatgaaagg 23546495  T
Q  318 tttcgtcagatcacttgacattctt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  23546496 tttcgtcagatcacttgacattctt 23546520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 18 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 12789691 - 12789367
Alignment:
Q  18 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 117  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12789691 gttggttgatgggtacttgatgaatcatgctgaggggcatgagtgttctagatgggatttgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 12789592  T
Q  118 gatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 217  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12789591 gatgaaatatgactataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggacttattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 12789492  T
Q  218 aaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcatgaaagg 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12789491 aaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgagacaaaggagtaattatacacatatgtgttatcatgaaagg 12789392  T
Q  318 tttcgtcagatcacttgacattctt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  12789391 tttcgtcagatcacttgacattctt 12789367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 18 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 24933334 - 24933010
Alignment:
Q  18 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 117  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24933334 gttggttgatgggtacttgatgaatcatgctgaggggcatgagtgttctagatgggatttgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 24933235  T
Q  118 gatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 217  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24933234 gatgaaatatgactataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggacttattcgttaaatagtatatttcagaatcaagataaat 24933135  T
Q  218 aaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcatgaaagg 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24933134 aaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgagatcaatgaagatattgagacaaaggagtaattatacacatatgtgttatcatgaaagg 24933035  T
Q  318 tttcgtcagatcacttgacattctt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  24933034 tttcgtcagatcacttgacattctt 24933010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 18 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 9811761 - 9811435
Alignment:
Q  18 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 117  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9811761 gttggttgatgggtacttgatgaatcatgttgagggacatgagtgtcgtagatgagatttgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 9811662  T
Q  118 gatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 217  Q
    |||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||| | ||    
T  9811661 gatgaaatatgactgtaaaattgcatggccatgccgaactaagtcaatatgagatattggacttattcgttattcagtatatttcggaatcaagaaatat 9811562  T
Q  218 aaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcatg--aaa 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||  | ||||||||  |||    
T  9811561 aaacattgatctatacaagggtgacaatatctatgcattggggtcaataaagatatcgagacaaaggagtaattgtacacataattattatcatggaaaa 9811462  T
Q  316 ggtttcgtcagatcacttgacattctt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  9811461 ggtttcgtcagatcacttgacattctt 9811435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 18 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 12703902 - 12703576
Alignment:
Q  18 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 117  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12703902 gttggttgatgggtacttgatgaatcatgttgagggacatgagtgtcgtagatgagatttgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 12703803  T
Q  118 gatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 217  Q
    |||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||| | ||    
T  12703802 gatgaaatatgactgtaaaattgcatggccatgccgaactaagtcaatatgagatattggacttattcgttattcagtatatttcggaatcaagaaatat 12703703  T
Q  218 aaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcatg--aaa 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||  | ||||||||  |||    
T  12703702 aaacattgatctatacaagggtgacaatatctatgcattggggtcaataaagatatcgagacaaaggagtaattgtacacataattattatcatgaaaaa 12703603  T
Q  316 ggtttcgtcagatcacttgacattctt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  12703602 ggtttcgtcagatcacttgacattctt 12703576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 18 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 12765018 - 12764692
Alignment:
Q  18 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 117  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12765018 gttggttgatgggtacttgatgaatcatgctgagggacatgagtgtcgtagatgggatttgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 12764919  T
Q  118 gatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 217  Q
    |||||||||||| |  |||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||| | ||    
T  12764918 gatgaaatatgactgaaaaattgcatggccaggccgaactaagtcaatatgagatattggacttattcgttattcagtatatttcggaatcaagaaatat 12764819  T
Q  218 aaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcatg--aaa 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||    ||||||||  |||    
T  12764818 aaacattgatctatacaagggtgacgatatctatgcattgggatcaataaagatattgagacaaaggagtaattgtacacataatcattatcatggaaaa 12764719  T
Q  316 ggtttcgtcagatcacttgacattctt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  12764718 ggtttcgtcagatcacttgacattctt 12764692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 19 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 7865457 - 7865132
Alignment:
Q  19 ttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctcttg 118  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7865457 ttggttgatgggtacttgatgaatcatgctgagggatatgagtgtcctagatgggatttgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctcttg 7865358  T
Q  119 atgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaata 218  Q
    ||||||||||| | ||||  |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||| | |||    
T  7865357 atgaaatatgactgtaaaattgcatggttatgccgaactaagtcaatatgagatattggacttattcgttattcagtatatttcggaatcaagaaatata 7865258  T
Q  219 aacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcatg--aaag 316  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||  | ||||||||  |||     
T  7865257 aacattgatctatacaaaggtgacaatatctatgcattgggatcaataaagatatcgagacaaaggagtaattgtacacataattattatcatggaaaat 7865158  T
Q  317 gtttcgtcagatcacttgacattctt 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  7865157 gtttcgtcagatcacttgacattctt 7865132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 18 - 342
Target Start/End: Original strand, 20941301 - 20941626
Alignment:
Q  18 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 117  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20941301 gttggttgatgggtacttgatgaatcatgctaaggggcatgagtgtcctagatgggatttgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 20941400  T
Q  118 gatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 217  Q
    |||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||   |||||||||||||||||||| | ||    
T  20941401 gatgaaatatgactgtaaaactgcatggccatgccgaactaagtcaatatgagatattggacttatttgttattcagtatatttcggaatcaagaaatat 20941500  T
Q  218 aaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaat-gaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcatgaaag 316  Q
    ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  ||| ||| | ||||||||||||||| ||||| |   | ||||||||||||    
T  20941501 aattattgatctatacaagggtgacaatacctatgccttgggatcaataaaaggtatcgagacaaaggagtaattgtacacatgaatattatcatgaaag 20941600  T
Q  317 gtttcgtcagatcacttgacattctt 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  20941601 gtttcgtcagatcacttgacattctt 20941626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 18 - 342
Target Start/End: Original strand, 22941524 - 22941850
Alignment:
Q  18 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 117  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22941524 gttggttgatgggtacttgatgaatcatgctaaggggcatgagtgtcctagatgggatttgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 22941623  T
Q  118 gatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatc-aagataaa 216  Q
    |||||||||||| | ||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||| |||| | |    
T  22941624 gatgaaatatgactgtaaaactgcatggccatgccgatctaagtcaatatgagatattggacttattcgttattcagtatatttcggaatcaaagaaata 22941723  T
Q  217 taaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaat-gaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcatgaaa 315  Q
    |||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  ||| ||| | ||||||||||||||| ||||| |   | |||||||||||    
T  22941724 taattattgatctatacaagggtgacaatacctatgccttgggatcaataaaaggtatcgagacaaaggagtaattgtacacatgaatattatcatgaaa 22941823  T
Q  316 ggtttcgtcagatcacttgacattctt 342  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||    
T  22941824 ggtttcgtcagatcactttacattctt 22941850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 18 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 25805413 - 25805088
Alignment:
Q  18 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 117  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25805413 gttggttgatgggtacttgatgaatcatgctaagggacatgactgtcctagatgggatttgtccctcctcataaacaagagatatatctttaggcctctt 25805314  T
Q  118 gatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 217  Q
    |||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||| | ||    
T  25805313 gatgaaatatgactgtaaaattgcatggccatgccgaactaagtcaatatgagatattggacttattcgttattcagtatatttcggaatcaagaaatat 25805214  T
Q  218 aaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaat-gaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcatgaaag 316  Q
    ||  |||||||||||||| ||||||| || ||||| |||| |||||||  ||| ||| | ||||||||||||||||||||| |   | ||||||||||||    
T  25805213 aataattgatctatacaaaggtgacaatacctatgtcttgagatcaataaaaggtatcgagacaaaggagtaattatacacatgaatattatcatgaaag 25805114  T
Q  317 gtttcgtcagatcacttgacattctt 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  25805113 gtttcgtcagatcacttgacattctt 25805088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 18 - 342
Target Start/End: Original strand, 31097090 - 31097415
Alignment:
Q  18 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 117  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31097090 gttggttgatgggtacttgatgaatcatgctaaggggcatgagtgtcctagatgggatttgtccctcctcataaacaagagatatatctttaggcctctt 31097189  T
Q  118 gatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 217  Q
    |||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |  |||||||||||||||||| | ||    
T  31097190 gatgaaatatgactgtaaaactgcatggccatgccgaactaagtcaatatgagatattggacttattcgtt-attcatatatttcggaatcaagaaatat 31097288  T
Q  218 aaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaat-gaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcat-gaaa 315  Q
    ||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||  ||| ||| | |||||| |||||||| ||||| |  || ||||||| ||||    
T  31097289 aattattgatctatacaagggtgacaatacctatgccttgagatcaataaaaggtatcgagacaaatgagtaattgtacacatgagtattatcatggaaa 31097388  T
Q  316 ggtttcgtcagatcacttgacattctt 342  Q
     ||||| ||| ||||||||||||||||    
T  31097389 agtttcatcatatcacttgacattctt 31097415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 18 - 342
Target Start/End: Original strand, 26245376 - 26245701
Alignment:
Q  18 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 117  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || ||||||  |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26245376 gttggttgatgggtacttgatgaatcatgttgagggacacgagtgttttagatgagatttgtccctcctcataa-caggagatatatctttaggcctctt 26245474  T
Q  118 gatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 217  Q
    ||||| |||||| | ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||   | |||||||| |||||| || | ||    
T  26245475 gatgacatatgactgtaaaattgcatggtcatgccgaactaagtcaatatgagatatttgacttattcgttattcaatatatttcagaatcaggaaatat 26245574  T
Q  218 aaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcatg--aaa 315  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||  ||||||||||||||| ||||| ||  | ||||||||  |||    
T  26245575 aaatattgatctatacaagggtgacaatatctatgccttgagatcaatatagatattaggacaaaggagtaattgtacacataaatattatcatggaaaa 26245674  T
Q  316 ggtttcgtcagatcacttgacattctt 342  Q
     ||||||||||||||||||||||||||    
T  26245675 agtttcgtcagatcacttgacattctt 26245701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 22 - 342
Target Start/End: Original strand, 5097929 - 5098248
Alignment:
Q  22 gttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctcttgatg 121  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5097929 gttgatgggtacatgatgaatcatgctgagggacacgagtgtcctagatgagatttgtccctcctcataa-caggagatatatctttaggcctcttgatg 5098027  T
Q  122 aaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaataaac 221  Q
    |||||||| | ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||| |||||||||| |||||||     
T  5098028 aaatatgactgtaaaattgcatggccatgccgaactaagtcgatataagatattggacttattcgttattcagtatattt-ggaatcaagaaaaataaat 5098126  T
Q  222 attgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcatg--aaaggtt 319  Q
    |||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||  ||||||  |||||||  | |||||||| |||| ||||| ||  | ||||||||  |||||||    
T  5098127 attgatctgtacaagggtgacaaaatctatgccatgatatcaatatagatattagggcaaaggagaaattgtacacataaat-ttatcatgaaaaaggtt 5098225  T
Q  320 tcgtcagatcacttgacattctt 342  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  5098226 ccgtcagatcacttgacattctt 5098248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 20100271 - 20100025
Alignment:
Q  18 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 117  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||    
T  20100271 gttggttgatgggtacttgacgaataatgttgagggacatgaatgtcctagatgggacttttccctcctcataa-catgagatatatctttagacctctt 20100173  T
Q  118 gatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 217  Q
    ||| |||||||| ||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| || |||| | ||    
T  20100172 gatcaaatatgactataaaattgcatggccatgtcgaagtaagtcaatatgagatattggacttattcgttatttagtatatttcgggattaagaaatat 20100073  T
Q  218 aaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaat 265  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |  || ||||||||| |||||||    
T  20100072 aaatattgatctatacaagggtgatataatatatgccttgtgatcaat 20100025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 52 - 342
Target Start/End: Original strand, 39535503 - 39535791
Alignment:
Q  52 ggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctcttgatgaaatatgattataaatatgcatggccatgc 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||| | ||||  ||||||| |||||    
T  39535503 ggtcatgagtgtcctagatgggatttgtcgctcctcataa-caggagatatatctttaggc---ttgatgaaatatgactgtaaagttgcatggtcatgc 39535598  T
Q  152 cgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaataaacattgatctatacaagggtgacactatctat 251  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||   | |||||||||| ||||||| | ||||| |||| || ||||||||| |||| |||||||    
T  39535599 cgaactaagtcaatatgagatattagacttattcgttattcattatatttcgggatcaagaaatataaatattgttcaatacaagggggacaatatctat 39535698  T
Q  252 gccttgggatcaatgaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcatg--aaaggtttcgtcagatcacttgacattctt 342  Q
    |||||| |||||||  | |||    |||||| |||||||| ||||  |   | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39535699 gccttgtgatcaatataaatacgaggacaaaagagtaattgtacaaatgaatattatcatggaaaaggtttcgtcagatcacttgacattctt 39535791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 91 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 31651736 - 31651482
Alignment:
Q  91 aacaggagatatatctttaggcctcttgatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaa 190  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||  || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||     
T  31651736 aacaggagatctatctttaggcttcttgatgaaatatgactgtaaaattgaatggccatgccgaattaagtcaatatgagatattggacttattcgttac 31651637  T
Q  191 atagtatatttcggaatcaagataaataaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgtga-caaaggagtaa 289  Q
      | |||||||||| ||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||| |  |||| |||| | |||||  ||||||   || |||| || |||    
T  31651636 taaatatatttcgggatcaagaaatataaatattgagctatacaagggtgacacaacatatgtcttgtgttcaatatagatataaagagcaaatgactaa 31651537  T
Q  290 ttatacacctatgtgttatcatg--aaaggtttcgtcagatcacttgacattctt 342  Q
    |||||||  ||    ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31651536 ttatacatataaacattatcatggaaaaggtttcgtcggatcacttgacattctt 31651482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 26 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 26129713 - 26129568
Alignment:
Q  26 atgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctcttgatgaaat 125  Q
    ||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26129713 atgggtacttaatgaatcatgatgagggacatgagtgtcctagatgagatttgtacctcctcataa-caggggatatatctttaggcctcttgatgaaat 26129615  T
Q  126 atgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagat 172  Q
    |||| | ||||  ||||||| ||||| |||  |||||||||| ||||    
T  26129614 atgactgtaaaattgcatggtcatgctgaatcaagtcaatatgagat 26129568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 24695215 - 24695146
Alignment:
Q  17 agttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcct 86  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| | |||||||    
T  24695215 agttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccctcct 24695146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 24701979 - 24701910
Alignment:
Q  17 agttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcct 86  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| | |||||||    
T  24701979 agttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccctcct 24701910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 18569608 - 18569564
Alignment:
Q  19 ttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgt 63  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  18569608 ttggttgatgggtacttcatgaatcatgctgagggacatgagtgt 18569564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 19706968 - 19706914
Alignment:
Q  17 agttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatg 71  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||    
T  19706968 agttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagcgacctagatg 19706914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 19714247 - 19714178
Alignment:
Q  17 agttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcct 86  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||| |||||| |||||| | ||||||||| ||| | |||||||    
T  19714247 agttggttgatgggtactacatgaatcatgttgagggacatgagcgacctagatggaatttgcccctcct 19714178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 297; Significance: 1e-167; HSPs: 11)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 18 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 24250060 - 24249736
Alignment:
Q  18 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24250060 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggatttgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 24249961  T
Q  118 gatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 217  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24249960 gatgaaatatgactataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggacttattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 24249861  T
Q  218 aaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcatgaaagg 317  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  24249860 gaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgagacaaaggagtaattatacacatatgtattatcatgaaagg 24249761  T
Q  318 tttcgtcagatcacttgacattctt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  24249760 tttcgtcagatcacttgacattctt 24249736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 18 - 342
Target Start/End: Original strand, 30174651 - 30174975
Alignment:
Q  18 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30174651 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggatttgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 30174750  T
Q  118 gatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 217  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30174751 gatgaaatatgactataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggacttattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 30174850  T
Q  218 aaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcatgaaagg 317  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  30174851 gaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgagacaaaggagtaattatacacatatgtattatcatgaaagg 30174950  T
Q  318 tttcgtcagatcacttgacattctt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  30174951 tttcgtcagatcacttgacattctt 30174975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 18 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 24229243 - 24228917
Alignment:
Q  18 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 117  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  24229243 gttggttgaagggtacttgatgaatcatgctgagggacatgagtgtcatagataaaatttgtccctcctcataaacaggagatatatctttaagactctt 24229144  T
Q  118 gatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 217  Q
    | |||||||||| | ||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||| | ||    
T  24229143 ggtgaaatatgactgtaaaaccgcatggccatgccgaactaagtcaatatgagatattggacttattcgttattcagtatatttcggaatcaagaaatat 24229044  T
Q  218 aaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaat-gaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcat-gaaa 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||  | ||||||||||||||| ||||| |  || ||||||| ||||    
T  24229043 aaacattgatctatacaagggtgacaatatctatgccttgggatcaataaaaggtaccgagacaaaggagtaattgtacacatgagtattatcatggaaa 24228944  T
Q  316 ggtttcgtcagatcacttgacattctt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  24228943 ggtttcgtcagatcacttgacattctt 24228917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 342
Target Start/End: Original strand, 19616717 - 19617034
Alignment:
Q  26 atgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctcttgatgaaat 125  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19616717 atgggtacttgatgaatcatgctgagggacatgagtgtcctagataggatttgtccctccttataa-catgagatatatctttatgcctcttgatgaaat 19616815  T
Q  126 atgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaataaacattg 225  Q
    |||| | ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||   |||||||||||| || ||||   ||||| ||||    
T  19616816 atgactgtaaagttgcatggtcatgccgaactaagtcaatatgagatattggacttattcattattcagtatatttcgggataaagaactataaatattg 19616915  T
Q  226 atctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcat--gaaaggtttcgt 323  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||   |||||||||||| || ||||| |   | |||||||   ||| |||||||    
T  19616916 atctatacaagggtgacaatatctatgccttgtgatcaatatagatatgaggacaaaggagtatttgtacacatgaatattatcatcgaaaaagtttcgt 19617015  T
Q  324 cagatcacttgacattctt 342  Q
    || ||||||||||||||||    
T  19617016 catatcacttgacattctt 19617034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 37 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 24763680 - 24763376
Alignment:
Q  37 atgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctcttgatgaaatatgattataaa 136  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | || |    
T  24763680 atgaatcatgctgacggacatgagtgtcctagatgagatttgtccctcctcataa-caggagatttatctttaggcctcttgatgaaatatgactgtata 24763582  T
Q  137 tatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaataaacattgatctatacaag 236  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||    |||||||||||  ||||||| | ||||| |||||| ||||||||    
T  24763581 gttgcatggccatgccgaactaagtcaatatgagatcttggacttatttgttgttcagtatatttcgagatcaagaaatataaatattgatatatacaag 24763482  T
Q  237 ggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcatg--aaaggtttcgtcagatcacttg 334  Q
    ||||||| | |||||  |||| |||||||   |||||   ||||||||||||| ||||||| |   | ||||||||  ||||||||| ||||||||  ||    
T  24763481 ggtgacaatgtctatatcttgtgatcaatattgatataaggacaaaggagtaagtatacacatgaatattatcatggaaaaggtttcatcagatcatatg 24763382  T
Q  335 acattc 340  Q
    ||||||    
T  24763381 acattc 24763376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 18 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 15342030 - 15341704
Alignment:
Q  18 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcct-cataaacaggagatatatctttaggcctct 116  Q
    ||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||     
T  15342030 gttggttaatgggtacttgacaaatcatgctgaggtacatgagtgtcctagatgagatttgtccctccttcataa-caggagatatatctttaggcctca 15341932  T
Q  117 tgatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaa 216  Q
    ||||||||||||| | ||||  ||||||||| || ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||   ||||||||| |  || |||| | |    
T  15341931 tgatgaaatatgactgtaaaattgcatggccctgtcgaactaagtccatatgagatattggacttattcgttattcagtatatttagagataaagaaata 15341832  T
Q  217 taaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcatg--aa 314  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||  |||  ||||||   || ||| |||||||| | ||| |   | ||||||||  ||    
T  15341831 taaatattgatctatacaagggtgacaaaatctatgccttgtgagaaatatagatatgaggataaatgagtaattgtgcacatgaatattatcatggaaa 15341732  T
Q  315 aggtttcgtcagatcacttgacattctt 342  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||    
T  15341731 atgtttcgtcagatcacttgacattctt 15341704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 18 - 342
Target Start/End: Original strand, 29800745 - 29801071
Alignment:
Q  18 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcct-cataaacaggagatatatctttaggcctct 116  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  29800745 gttggttaatgggcacttgacgaatcatgataagggacatgagtgtcctagatgagatttgtcccttcttcataa-catgagatatacctttaggcctct 29800843  T
Q  117 tgatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaa 216  Q
    ||||||||||||| | ||||  ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||   |||||||||||| |||| || | |    
T  29800844 tgatgaaatatgactgtaaaattgcatagtcatgccgaattaagtcaatataagatattgaacttattcgttattcagtatatttcgggatcaggaaata 29800943  T
Q  217 taaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcatg--aa 314  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||  || |||| |||| |||| ||  ||||||   ||||| ||||||||| ||||| |     ||||||||  ||    
T  29800944 taaatattgatctatacaagagtgacaaaatatatgtcttgtgatcgatttagatatgaggacaacggagtaattgtacacatgaacattatcatggaaa 29801043  T
Q  315 aggtttcgtcagatcacttgacattctt 342  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  29801044 aggtttcgtcagatcaattgacattctt 29801071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 66 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 20687396 - 20687273
Alignment:
Q  66 tagatgggattcgtccctcct-cataaacaggagatatatctttaggcctcttgatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaa 164  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| |||||||     
T  20687396 tagatgggatttgtccctccttcataa-catgagatatatctttaggcctcttgatgaaatatgactgtaaagatgcatggccatgccgaattaagtcag 20687298  T
Q  165 tataagatattggactcattcgtta 189  Q
    ||| |||||||||||| ||| ||||    
T  20687297 tatgagatattggacttatttgtta 20687273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 34 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 40300949 - 40300794
Alignment:
Q  34 ttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcata-aacaggagatatatctttaggcctcttgatgaaatatgatta 132  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||   ||||| | ||| |||| |||| |||||||| || ||||||||| ||||||| |     
T  40300949 ttgatgaatcatgttgagggacatgagtgtcctagatgatattttcccctctt-atataacatgagaaatatcttttggtctcttgatggaatatgactg 40300851  T
Q  133 taaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgtta 189  Q
    ||||  | ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| || | ||||||||    
T  40300850 taaaattacatggccatgccgaactaagtcaatgtgagatattagatttattcgtta 40300794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 202
Target Start/End: Original strand, 21627102 - 21627209
Alignment:
Q  95 ggagatatatctttaggcctcttgatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatag 194  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||| |||  | |||| ||| || ||||||||||| || |||||||| |||||||||| | ||||||||   ||    
T  21627102 ggagatatatctttaggtcttttgataaaacatgcctgtaaaaatgtatagccatgccgaattatgtcaatatgagatattggatttattcgttactcag 21627201  T
Q  195 tatatttc 202  Q
    ||||||||    
T  21627202 tatatttc 21627209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 21 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 21329993 - 21329928
Alignment:
Q  21 ggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcct 86  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| | |||||||    
T  21329993 ggttgatggggactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccctcct 21329928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 297; Significance: 1e-167; HSPs: 24)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 18 - 342
Target Start/End: Original strand, 9456390 - 9456714
Alignment:
Q  18 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9456390 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggatttgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 9456489  T
Q  118 gatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 217  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9456490 gatgaaatatgactataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggacttattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 9456589  T
Q  218 aaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcatgaaagg 317  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  9456590 gaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgagacaaaggagtaattatacacatatgtattatcatgaaagg 9456689  T
Q  318 tttcgtcagatcacttgacattctt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  9456690 tttcgtcagatcacttgacattctt 9456714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 18 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 20391267 - 20390943
Alignment:
Q  18 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 117  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20391267 gttggttgatgggtacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggatttgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 20391168  T
Q  118 gatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 217  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20391167 gatgaaatatgactataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggacttattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 20391068  T
Q  218 aaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcatgaaagg 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  20391067 aaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgagacaaaggagtaattatacacatatgtattatcatgaaagg 20390968  T
Q  318 tttcgtcagatcacttgacattctt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  20390967 tttcgtcagatcacttgacattctt 20390943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 18 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 20779673 - 20779349
Alignment:
Q  18 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20779673 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggatttgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 20779574  T
Q  118 gatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 217  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20779573 gatgaaatatgactataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggacttattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 20779474  T
Q  218 aaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcatgaaagg 317  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  20779473 gaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgagacaaaggagtaattatacacatatgtattatcatgaaagg 20779374  T
Q  318 tttcgtcagatcacttgacattctt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  20779373 tttcgtcagatcacttgacattctt 20779349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 18 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 42817017 - 42816693
Alignment:
Q  18 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42817017 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggatttgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 42816918  T
Q  118 gatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 217  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42816917 gatgaaatatgactataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggacttattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 42816818  T
Q  218 aaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcatgaaagg 317  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  42816817 gaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgagacaaaggagtaattatacacatatgtattatcatgaaagg 42816718  T
Q  318 tttcgtcagatcacttgacattctt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  42816717 tttcgtcagatcacttgacattctt 42816693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 18 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 22670285 - 22669961
Alignment:
Q  18 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22670285 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggatttgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 22670186  T
Q  118 gatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 217  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22670185 gatgaaatatgactataaatatgcatggccatgctgaactaagtcaatataagatattggacttattcgttaaatagtacatttcggaatcaagataaat 22670086  T
Q  218 aaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcatgaaagg 317  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  22670085 gaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgagatcaatgaagatattgagacaaaggagtaattatacacatatgtattatcatgaaagg 22669986  T
Q  318 tttcgtcagatcacttgacattctt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  22669985 tttcgtcagatcacttgacattctt 22669961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 18 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 28134751 - 28134426
Alignment:
Q  18 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 117  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28134751 gttggttgatgggtacttgatgaatcatgctaaggggcatgagtgtcctagatgggatttgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 28134652  T
Q  118 gatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 217  Q
    |||||||||||| | ||||  |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||||   |||||||||||||||||||| | ||    
T  28134651 gatgaaatatgactgtaaaactgcatggccatgccgaacgaagtcaatatgagatattgaacttattcgttattcagtatatttcggaatcaagaaatat 28134552  T
Q  218 aaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaat-gaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcatgaaag 316  Q
    ||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||  ||| ||| | ||||||||||||||||||||| |   | ||||||||||||    
T  28134551 aattattgatctatacaagggtgacaatacctatgccttgagatcaataaaaggtatcgagacaaaggagtaattatacacatgaatattatcatgaaag 28134452  T
Q  317 gtttcgtcagatcacttgacattctt 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  28134451 gtttcgtcagatcacttgacattctt 28134426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 18 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 19706467 - 19706142
Alignment:
Q  18 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 117  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19706467 gttggttgatgggtacttgatgaatcatgctaaggggcatgagtgtcctagatgggatctgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 19706368  T
Q  118 gatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 217  Q
    |||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||   ||||||||| |||||||||| | ||    
T  19706367 gatgaaatatgactgtaaaactgcatggccatgccgaactaagtcaatatgagatattggacttattcgttattcagtatattttggaatcaagaaatat 19706268  T
Q  218 aaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaat-gaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcatgaaag 316  Q
    ||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||  ||| ||| | ||||||||||||||| ||||| |   | ||||||||||||    
T  19706267 aattattgatctatacaagggtgacaatacctatgccttgagatcaataaaaggtatcgagacaaaggagtaattgtacacatgaatattatcatgaaag 19706168  T
Q  317 gtttcgtcagatcacttgacattctt 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  19706167 gtttcgtcagatcacttgacattctt 19706142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 18 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 43802393 - 43802068
Alignment:
Q  18 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 117  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43802393 gttggttgatgggtacttgatgaatcatgctaaggggcatgagtgtcctagatgggatttgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 43802294  T
Q  118 gatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 217  Q
    |||||||||||| | ||||  |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||| | ||    
T  43802293 gatgaaatatgactgtaaaactgcatggccatgtcgaactaagtcaatatgagatattggacttattcgttattcagtatatttcggaatcaagaaatat 43802194  T
Q  218 aaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaat-gaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcatgaaag 316  Q
    ||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||  |||||||  ||| ||| | ||||||||||||||| ||||| |   | ||||||||||||    
T  43802193 aattattgatctatacaagggtgacaatacctatgccttaagatcaataaaaggtatcgagacaaaggagtaattgtacacatgaatattatcatgaaag 43802094  T
Q  317 gtttcgtcagatcacttgacattctt 342  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  43802093 gtttcgttagatcacttaacattctt 43802068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 18 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 47667513 - 47667188
Alignment:
Q  18 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 117  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||     
T  47667513 gttggttgatgggtacttgatgaatcatgctaagggacatgagtgtcctagatgggatttgtccctcctcattaacaagagatatatctttaggcctctc 47667414  T
Q  118 gatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 217  Q
    |||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||| | ||    
T  47667413 gatgaaatatgactgtaaaactgcatggccatgccgaactaattcaatatgagatattggacttattcgttattcagtatatttcggaatcaagaaatat 47667314  T
Q  218 aaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaat-gaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcatgaaag 316  Q
    ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  ||| ||| | |||||||||||||||  |||| |   | ||||||||||||    
T  47667313 aattattgatctatacaagggtgacaatacctatgccttgggatcaataaaaggtatcgagacaaaggagtaattgcacacgtgaatattatcatgaaag 47667214  T
Q  317 gtttcgtcagatcacttgacattctt 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  47667213 gtttcgtcagatcacttgacattctt 47667188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 18 - 342
Target Start/End: Original strand, 22612766 - 22613091
Alignment:
Q  18 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 117  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22612766 gttggttgatggctacttgatgaatcatgctaaggggcatgagtgtcctagatgggatttgtccctcctcataaacaggagatatatcttttggcctctt 22612865  T
Q  118 gatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 217  Q
    |||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||| | ||    
T  22612866 gatgaaatatgactgtaaaactgcatggccatgccgaactaagtcaatatgagatattggacttattcgttattcagtatatttcggaatcaagaaatat 22612965  T
Q  218 aaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaat-gaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcatgaaag 316  Q
     |   || |||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||  ||| ||| | |||||||||||| || ||||| ||  | ||||||||||||    
T  22612966 gattttttatctatacaagggtgacaatacctatgccttgagatcaataaaaggtatcgagacaaaggagtacttgtacacataaatattatcatgaaag 22613065  T
Q  317 gtttcgtcagatcacttgacattctt 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  22613066 gtttcgtcagatcacttgacattctt 22613091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 18 - 342
Target Start/End: Original strand, 634208 - 634538
Alignment:
Q  18 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattc----gtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcc 113  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  634208 gttggttgacgagcacttgatgaatcatgctgagggacatgagtgtcctagatgggatttatttgtccatcctcataaataggagatatatatttaggcc 634307  T
Q  114 tcttgatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagat 213  Q
    |||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||   ||||||||| ||||||||||     
T  634308 tcttgatgaaatatgactgtaaaattgcatggccatgcagaactaagtcaatatgagatattggactgattcgttactcagtatattttggaatcaagaa 634407  T
Q  214 aaataaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcatg- 312  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||| |   | ||||||||     
T  634408 atataaacattgatctatacaagggtgacaatatttatgtcttgggatcaataaagatatcgagacaaaggagtaattgtacacatgaatattatcatgg 634507  T
Q  313 -aaaggtttcgtcagatcacttgacattctt 342  Q
     ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  634508 aaaatgtttcgtcagatcacatgacattctt 634538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 186 - 342
Target Start/End: Original strand, 14482332 - 14482488
Alignment:
Q  186 gttaaatagtatatttcggaatcaagataaataaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgtgacaaagga 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  14482332 gttaaatagtatatttcggaatcaagataaataaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgagatcaatgaagatattgagacaaagga 14482431  T
Q  286 gtaattatacacctatgtgttatcatgaaaggtttcgtcagatcacttgacattctt 342  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14482432 gtaattatacacatatgtgttatcatgaaaggtttcgtcagatcacttgacattctt 14482488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 26 - 342
Target Start/End: Original strand, 8727949 - 8728262
Alignment:
Q  26 atgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctcttgatgaaat 125  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||||||    |||||||| |||||||    
T  8727949 atgggtacttgatgaatcatgctgagggacatgagtgtcctagatgagatttgtccctcctcataa-caggaggtatatc----ggcctcttaatgaaat 8728043  T
Q  126 atgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaataaacattg 225  Q
    |||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||   |||||||||| | || |||| | ||||| ||||    
T  8728044 atgattgtaaagttgcatggccatgtcgaactaagtcaatatgagatattggacttattcgttattcagtatatttccggataaagaaatataaatattg 8728143  T
Q  226 atctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcatg--aaaggtttcgt 323  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||  |||||||   |||||||||||||| || |  |   | ||||||||  ||| |||||||    
T  8728144 atctatacaagggtgacaaaatctatgtcttgtgatcaatatagatattagaacaaaggagtaattgtatagatgaatattatcatggaaaatgtttcgt 8728243  T
Q  324 cagatcacttgacattctt 342  Q
    |||||||||||||||||||    
T  8728244 cagatcacttgacattctt 8728262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 18 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 28145751 - 28145603
Alignment:
Q  18 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 117  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  28145751 gttggttgatgggtacttgatgaatcatgctaaggggcatgagtgtcctagatgagattcgtccctcctcataaacaagagatatatccttaggcctctt 28145652  T
Q  118 gatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaata 166  Q
    |||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28145651 gatgaaatatgactataaaactgcatggccatgccgaactaagtcaata 28145603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 29096996 - 29097188
Alignment:
Q  18 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcct-cataaacaggagatatatctttaggcctct 116  Q
    ||||||| ||||||  |||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||    
T  29096996 gttggttaatgggcgtttgacgaatcatgttgagggacatgagtatcctagatgggatgtgtccctccttcataa-catgagatatatctttagacctct 29097094  T
Q  117 tgatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaa 210  Q
    | ||||||||||  ||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||||  || ||||||||   |||||||||||| |||||    
T  29097095 taatgaaatatgtctataaagttgcatggtcatgccgaattaagtcaatttgagatattgagcttattcgttattcagtatatttcgggatcaa 29097188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 286 - 342
Target Start/End: Original strand, 9460754 - 9460810
Alignment:
Q  286 gtaattatacacctatgtgttatcatgaaaggtttcgtcagatcacttgacattctt 342  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9460754 gtaattatacacatatgtattatcatgaaaggtttcgtcagatcacttgacattctt 9460810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 251
Target Start/End: Original strand, 51997680 - 51997775
Alignment:
Q  156 ctaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaataaacattgatctatacaagggtgacactatctat 251  Q
    |||||| ||||| ||||||| |||| |||| |||  ||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||    
T  51997680 ctaagttaatatgagatatttgacttattcattacttagtatatttcagaatcaagaaatataaatattgaactatacaagagtgacacaatctat 51997775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 86
Target Start/End: Original strand, 18252488 - 18252557
Alignment:
Q  17 agttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcct 86  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| | |||||||    
T  18252488 agttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccctcct 18252557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 18532263 - 18532194
Alignment:
Q  17 agttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcct 86  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| | |||||||    
T  18532263 agttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccctcct 18532194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 201
Target Start/End: Original strand, 19819493 - 19819588
Alignment:
Q  106 tttaggcctcttgatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatattt 201  Q
    ||||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||  |||||| | ||| || ||||  ||||||||||    
T  19819493 tttaggcctcttgattaaatatgactgtaaatttgcatggtcatgccgaattaagtcattatgggatatttggctcgtttgttacttagtatattt 19819588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 27131159 - 27131105
Alignment:
Q  17 agttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatg 71  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  27131159 agttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatg 27131105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 27310326 - 27310272
Alignment:
Q  17 agttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatg 71  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  27310326 agttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatg 27310272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 306 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 33283596 - 33283560
Alignment:
Q  306 tatcatgaaaggtttcgtcagatcacttgacattctt 342  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33283596 tatcatgaaaggtttcgtcagattacttgacattctt 33283560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 17 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 16358784 - 16358729
Alignment:
Q  17 agttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgg 72  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||    
T  16358784 agttggttgatgggtactccatgaatcatgttgagggacatgagtgacctagatgg 16358729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 293; Significance: 1e-164; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 18 - 342
Target Start/End: Original strand, 120004 - 120328
Alignment:
Q  18 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  120004 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggatttgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 120103  T
Q  118 gatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 217  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  120104 gatgaaatatgactataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggacttattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 120203  T
Q  218 aaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcatgaaagg 317  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  120204 gaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgagacaaaggggtaattatacacatatgtattatcatgaaagg 120303  T
Q  318 tttcgtcagatcacttgacattctt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  120304 tttcgtcagatcacttgacattctt 120328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 18 - 332
Target Start/End: Original strand, 260 - 576
Alignment:
Q  18 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 117  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  260 gttggttgatgggtacttgatgaatcatgctaaggggcatgagtgtcctagatgggatttgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 359  T
Q  118 gatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 217  Q
    |||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||| | ||    
T  360 gatgaaatatgactgtaaaactgcatggccatgccgaactaagtcaatatgagatattggacttattcgttattcagtatatttcggaatcaagaaatat 459  T
Q  218 aaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaat-gaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcat-gaaa 315  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  ||| ||| | |||||||||||||||  |||  |  || ||||||| ||||    
T  460 aaatattgatctatacaagggtgacaatacctatgccttgggatcaataaaaggtatcgagacaaaggagtaattgaacatatgagtattatcatggaaa 559  T
Q  316 ggtttcgtcagatcact 332  Q
    |||||||||||||||||    
T  560 ggtttcgtcagatcact 576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 184; Significance: 2e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 67402 - 67155
Alignment:
Q  18 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 117  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  67402 gttggttgatgggtacttgatgaatcatgctgagggacatgagtgtcctagatgggatttgtccctcctcataaacaagagatatatctttaggcctctt 67303  T
Q  118 gatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 217  Q
    |||||||||||| | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||| | ||    
T  67302 gatgaaatatgactgtaaaattgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggacttattcgttattcagtatatttcggaatcaagaaatat 67203  T
Q  218 aaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaat 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  67202 aaacattgatctatacaagggtgacaatatatatgccttgggatcaat 67155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 178; Significance: 6e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 18 - 342
Target Start/End: Original strand, 457 - 782
Alignment:
Q  18 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 117  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  457 gttggttgatgggtacttgatgaatcatgctaaggaacatgagtgtcctagatgggatttgtccctcctcattaacagaagatatatctttaggcctctt 556  T
Q  118 gatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 217  Q
    |||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||| | ||    
T  557 gatgaaatatgactgtaaaactgcatggccatgccgaactaagtcaatatgagatattggacttattcgttattcagtatatttcggaatcaagaaatat 656  T
Q  218 aaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaat-gaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcatgaaag 316  Q
    ||  |||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||||  ||| ||| | ||||||||||||||| ||||| |   | ||||||||||||    
T  657 aattattgatctatacaagggtgacaatgcctatgcctttggatcaataaaaggtatcgagacaaaggagtaattgtacacatgaatattatcatgaaag 756  T
Q  317 gtttcgtcagatcacttgacattctt 342  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||    
T  757 gtttcgtaagatcacttgacattctt 782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0376 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0376
Description:

Target: scaffold0376; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 11554 - 11311
Alignment:
Q  18 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 117  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11554 gttggttgatgggtacttgatgaatcatgttgagggtcatgagttttctagatgggatttgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 11455  T
Q  118 gatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 217  Q
    |||||||||||| | ||||  ||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||| | | ||    
T  11454 gatgaaatatgactgtaaaattgcattgttatgccgaactaagtcaatatgagatattggacttattcgttattcagtatatttcggaatcaaaaaatat 11355  T
Q  218 aaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggat 261  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  11354 aaacattgatctgtacaagggtgacaatatctatgcattgggat 11311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466 (Bit Score: 141; Significance: 7e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 12978 - 12652
Alignment:
Q  17 agttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctct 116  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |    
T  12978 agttggttgatgggtacttgatcaatcatgctgagggacatcagtctcctaaatgggatttgtccctcctcataa-caggagataaatctttaggcctat 12880  T
Q  117 tgatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaa 216  Q
    | ||||||||||| | ||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||   | |||||| ||||||||||  | |    
T  12879 tcatgaaatatgactttaaaattgcatggccatgccgaactaggtcaatatgagatattggacttattcgttattcaatatattccggaatcaaggaata 12780  T
Q  217 taaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcat--gaa 314  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||| |||||||   ||||||  ||||||||||||||| ||||| ||  | |||||||   ||    
T  12779 taaatattcatctatacaagagtgacaaaatctatgccttgagatcaatatcgatattaggacaaaggagtaattgtacacataaatattatcatagaaa 12680  T
Q  315 aggtttcgtcagatcacttgacattctt 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12679 aggtttcgtcagatcacttgacattctt 12652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0086
Description:

Target: scaffold0086; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 18 - 342
Target Start/End: Original strand, 54038 - 54362
Alignment:
Q  18 gttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctctt 117  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  54038 gttggttgatgggtacttgatgaatcatgctaagggacatgagtgtcctacatgggatttgtccttcctcataa-caggagatatatctttaggcctttt 54136  T
Q  118 gatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaat 217  Q
    |||||| ||||| | ||||  | ||||| ||| ||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||| | ||    
T  54137 gatgaa-tatgaatgtaaaatttcatggtcataccgcactaagtcgatatgagatattggacttattcgttattcagtatatttcggaatcaagaaatat 54235  T
Q  218 aaacattgatctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcatg--aaa 315  Q
     || ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||  |||||||  | |||||  ||||||||||||||  ||||| ||  | ||||||||  |||    
T  54236 caatattgatctatacaagggtgacaaaatctatgtcttaagatcaatataaatattaggacaaaggagtaatcgtacacataaatattatcatggaaaa 54335  T
Q  316 ggtttcgtcagatcacttgacattctt 342  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||    
T  54336 ggtttcgtcagttcacttgacattctt 54362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 128; Significance: 4e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 26 - 297
Target Start/End: Original strand, 26824 - 27094
Alignment:
Q  26 atgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctcttgatgaaat 125  Q
    ||||| ||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26824 atgggtactcgatgaatcatgttgagggacattagtgtcctagatgagatttgtccctcctcataa-cagaagatatatctttagacctcttgatgaaat 26922  T
Q  126 atgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaataaacattg 225  Q
    |||| | ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||   |||||||||||| ||||||| | ||||| ||||    
T  26923 atgactgtaaagttgcatggtcatgccgaactaagtcaatatgagatatttgacttattcgttattcagtatatttcgggatcaagaaatataaatattg 27022  T
Q  226 atctatacaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgtgacaaaggagtaattatacac 297  Q
    || ||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||  ||||||   |||||||||||||||||||||    
T  27023 atttatacaagggtgaaaaaatctatgccttgtgatcaatatagatatgaagacaaaggagtaattatacac 27094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 119; Significance: 9e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 18 - 342
Target Start/End: Original strand, 9394 - 9741
Alignment:
Q  18 gttggttgatgggc-acttga-tgaatcatg-ctgagggt-catgagtgtcctagatgggattc-gtccc-tcctcataaa-caggagatatatctttag 110  Q
    |||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9394 gttggttgatggggtacttgaatgaatcatgactgagggggcatgagtgttctagatgggattttgtcccctcctcataaaacaggagatatatctttag 9493  T
Q  111 gcct-cttga-tgaaata-tgattataaa-tatgcatggccatgcc--gaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcgg 204  Q
    |||| ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  9494 gccttcttgaatgaaataatgactataaaatatgcatggccatgccccgaa-taagtcaatataagatattggacttattcgttaaatagtatatttcag 9592  T
Q  205 aat-caag-ataaataaacattgatctatacaagggtga-cacta--tctatgcctt-gggatcaatgaagatattgtgac-aaaggagtaattatacac 297  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  9593 aatacaagaataaataaacattgatctatacaagggtgaccactacctctatgccttagagatcaatgaagatattgagacaaaaggagtaattatacac 9692  T
Q  298 -ctatgtgttatcat-gaaagg-tttcgtcagatc-acttgacattctt 342  Q
      ||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  9693 attatgtgttatcatagaaaggttttcgtcagatcaacttgacattctt 9741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 32 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 40002 - 39690
Alignment:
Q  32 acttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcataaacaggagatatatctttaggcctcttgatgaaatatgatt 131  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| | | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  40002 acttgatgaatcatgttgagggacatgagtgtcttagaagagttttgtccctcctcataa-caggagatatatctttaggcctcttgatgaaatatgact 39904  T
Q  132 ataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatttcggaatcaagataaataaacattgatctat 231  Q
    |||||  ||||| | |||||||||  |||| ||||| ||||||  | ||  |||||||   |||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||    
T  39903 ataaaattgcattgtcatgccgaatcaagtaaatatgagatatccggcttgttcgttattcagtatatttcgggatcaagaaatataaatattgatctat 39804  T
Q  232 acaagggtgacactatctatgccttgggatcaatgaagatattgtgacaaaggagtaattatacacctatg--tgttatcatg-aaaggtttcgtcagat 328  Q
    |||||| |||||  ||||||| |||| |||||||  ||||||   |||||||||||||   ||||| ||||  | |||||||| ||| ||||| ||||||    
T  39803 acaaggatgacaaaatctatgacttgtgatcaatatagatatgaggacaaaggagtaacagtacacatatgaatattatcatgaaaaagtttcatcagat 39704  T
Q  329 cacttgacattctt 342  Q
    ||||||||||||||    
T  39703 cacttgacattctt 39690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0390
Description:

Target: scaffold0390; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 17 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 6683 - 6614
Alignment:
Q  17 agttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcct 86  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  6683 agttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatttgtccctcct 6614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 13699 - 13630
Alignment:
Q  17 agttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcct 86  Q
    |||||||||||||  |||  |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  13699 agttggttgatggttactccatgaatcatgttgagggacatgagtgacctagatggaatttgtccctcct 13630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0496 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0496
Description:

Target: scaffold0496; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 101 - 200
Target Start/End: Original strand, 11592 - 11690
Alignment:
Q  101 atatctttaggcctcttgatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatataagatattggactcattcgttaaatagtatatt 200  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||| | |||  ||||||||||||||| | ||||||||||||  |||| |||||| ||||||||  |||||||||    
T  11592 atatctttaggcatcttgatggaatatgactgtaac-atgcatggccatgccaagctaagtcaatatgtgatagtggacttattcgttacttagtatatt 11690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0433 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0433
Description:

Target: scaffold0433; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 86
Target Start/End: Original strand, 7565 - 7634
Alignment:
Q  17 agttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcct 86  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| | |||||||    
T  7565 agttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccctcct 7634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0389 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0389
Description:

Target: scaffold0389; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 277 - 342
Target Start/End: Original strand, 696 - 761
Alignment:
Q  277 gacaaaggagtaattatacacctatgtgttatcatgaaaggtttcgtcagatcacttgacattctt 342  Q
    ||||||||||||||| ||||| |   | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  696 gacaaaggagtaattgtacacgtgcatattatcatgaaaggattcgtcagatcacttgacattctt 761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 2070 - 2001
Alignment:
Q  17 agttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcct 86  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| | |||||||    
T  2070 agttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccctcct 2001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 10961 - 10892
Alignment:
Q  17 agttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcct 86  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| | |||||||    
T  10961 agttggttgatgggtactccatgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccctcct 10892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0136 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0136
Description:

Target: scaffold0136; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 167
Target Start/End: Original strand, 9009 - 9154
Alignment:
Q  22 gttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcctcata-aacaggagatatatctttaggcctcttgat 120  Q
    ||||| ||||| ||||  ||||||| | |||| ||||||||||||| ||| |||| | | ||||| ||| |||| |||| ||||| |||| |||||||||    
T  9009 gttgacgggcagttgacaaatcatgttaagggacatgagtgtcctatatgagatttgcctctcct-atataacatgagaaatatcgttagacctcttgat 9107  T
Q  121 gaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatat 167  Q
    ||||||| ||| ||||  |||||| ||||| | || |||||||||||    
T  9108 gaaatataattgtaaaattgcatgaccatgtcaaattaagtcaatat 9154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 93 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 82960 - 82886
Alignment:
Q  93 caggagatatatctttaggcctcttgatgaaatatgattataaatatgcatggccatgccgaactaagtcaatat 167  Q
    ||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  82960 caggagaaatatcaataggtctcttgatgaaatatgattgtaaaactgcattgtcatgccgaattaagtcaatat 82886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0186 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0186
Description:

Target: scaffold0186; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 25739 - 25670
Alignment:
Q  17 agttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcct 86  Q
    |||||||||||||| |||  || ||||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  25739 agttggttgatgggtactccataaatcatgatgagggacatgagtgacctagatggaattcgcccctcct 25670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 86
Target Start/End: Original strand, 18765 - 18814
Alignment:
Q  37 atgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcct 86  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| | |||||||    
T  18765 atgaatcatgctgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccctcct 18814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 86
Target Start/End: Original strand, 5980 - 6049
Alignment:
Q  17 agttggttgatgggcacttgatgaatcatgctgagggtcatgagtgtcctagatgggattcgtccctcct 86  Q
    |||||||||||||| |||  || ||||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||| | |||||||    
T  5980 agttggttgatgggtactccatcaatcatgatgagggacatgagtgacctagatggaatttgcccctcct 6049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University