View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5921_low_2 (Length: 825)

Name: NF5921_low_2
Description: NF5921
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5921_low_2
NF5921_low_2
[»] chr6 (38 HSPs)
chr6 (18-810)||(4574559-4575354)
chr6 (18-810)||(4560757-4561551)
chr6 (103-810)||(4480944-4481651)
chr6 (112-810)||(4266346-4267047)
chr6 (118-810)||(3171992-3172684)
chr6 (56-810)||(4489484-4490236)
chr6 (56-810)||(4461374-4462131)
chr6 (60-810)||(4470054-4470806)
chr6 (102-807)||(4514294-4514999)
chr6 (112-810)||(4457845-4458547)
chr6 (366-810)||(4503834-4504278)
chr6 (112-808)||(4506110-4506806)
chr6 (322-810)||(4563962-4564453)
chr6 (381-805)||(4598427-4598851)
chr6 (381-810)||(4613170-4613599)
chr6 (322-781)||(4299214-4299673)
chr6 (405-808)||(4516574-4516977)
chr6 (403-810)||(4585887-4586294)
chr6 (322-809)||(4626203-4626690)
chr6 (381-810)||(4579683-4580112)
chr6 (322-810)||(4259547-4260035)
chr6 (450-808)||(4602042-4602400)
chr6 (432-810)||(4617273-4617651)
chr6 (312-810)||(4592482-4592983)
chr6 (312-810)||(4622393-4622889)
chr6 (444-810)||(4557376-4557742)
chr6 (444-810)||(4571223-4571589)
chr6 (403-810)||(4256098-4256492)
chr6 (556-808)||(4568309-4568561)
chr6 (670-808)||(4493208-4493346)
chr6 (269-350)||(4503725-4503806)
chr6 (119-211)||(4517171-4517263)
chr6 (127-199)||(4593096-4593168)
chr6 (687-798)||(4391885-4391996)
chr6 (120-199)||(4602654-4602733)
chr6 (120-199)||(4617887-4617966)
chr6 (445-485)||(4835531-4835571)
chr6 (103-181)||(4503643-4503721)
[»] chr5 (2 HSPs)
chr5 (112-810)||(24103250-24103951)
chr5 (583-806)||(27999753-27999976)
[»] chr8 (4 HSPs)
chr8 (103-810)||(20863017-20863724)
chr8 (312-810)||(1674477-1674979)
chr8 (444-810)||(16685782-16686148)
chr8 (122-212)||(1675079-1675169)
[»] chr3 (2 HSPs)
chr3 (312-810)||(1281365-1281866)
chr3 (128-212)||(1281966-1282050)
[»] chr7 (1 HSPs)
chr7 (322-810)||(3086671-3087159)
[»] scaffold0477 (1 HSPs)
scaffold0477 (322-810)||(4082-4567)
[»] scaffold0288 (1 HSPs)
scaffold0288 (321-810)||(3110-3600)
[»] scaffold0475 (2 HSPs)
scaffold0475 (687-810)||(3443-3565)
scaffold0475 (582-628)||(3162-3208)
[»] scaffold0199 (2 HSPs)
scaffold0199 (312-520)||(4-216)
scaffold0199 (122-212)||(316-406)
[»] chr2 (1 HSPs)
chr2 (671-712)||(1351057-1351098)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 741; Significance: 0; HSPs: 38)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 741; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 4575354 - 4574559
Alignment:
Q  18 atatgcaatatcagtaggataacacaaccaaaattatt-ttgcaaatgtgattgtaaaccatgatatatat--ttatacatatgacttgctattgatttt 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  4575354 atatgcaatatcagtaggataacacaaccaaaattattattgcaaatgtgattttaaaccttgatatatatatttatacatatgacttgctattgatttt 4575255  T
Q  115 tgcaattatgacatgcagatgagagtgatctaacaaatgaatatttggacacaaaaattgactggatcccaggtttgaaaaacttcagattgaaggatct 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4575254 tgcaattatgacatgcagatgagagtgatctaacaaatgaatatttggacacaaaaattgactggatcccaggtttgaaaaacttcagattgaaggatct 4575155  T
Q  215 tcctaggttaataaagacaaaaaatcctaatgacttgacgataagatttaacactgaagtggcagataaatgtcatagagcttctggtatgctattcaat 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4575154 tcctaggttaataaagacaaaaaatcctaatgacttgacgataagatttaatactgaagtggcagataaatgtcatagagcttctggtatggtattcaat 4575055  T
Q  315 acttcgaatgaacttgagagtgatgttatgaatgctttctattctttgtttccttctctatacacaattggtccattagcttcttttctaaatcaaagtc 414  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4575054 acttctaatgaacttgagagtgatgttatgaatgctttctattctatgttcccttctctatacacaattggtccattagcttcttttgtaaatcaaagtc 4574955  T
Q  415 cacaaaatgacttgacatctttagactctaatctttggaaagaagatactaaatgtcttgaatggcttgaatcaaaagaaccaagatctgttgtttatgt 514  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4574954 cacaaaatgacttgacatctttagactctaatctttggaaagaagatactaaatgtcttgaatggattgaatcaaaagaaccaagatctgttgtttatgt 4574855  T
Q  515 aaattttggcagcatcactgttatgtctcgagagaagctcgtagagtttgcttggggtttggccaacagcaaaaaaccctttttgtggatcattaggcct 614  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4574854 aaattttggcagcatcactgttatgtctcgagagaagctcgtagagtttgcttggggtttggccaacagcaaaaaaccctttttgtggatcattaggcct 4574755  T
Q  615 gatcttgtcattggtggctcggtggttttctcatctgattttttgaaagaaatttcagatagaggactaatagcaagttggtgtccacaagagaaagtat 714  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4574754 gatcttgtcattggtggctcggtggttttctcatctgattttttgaaagaaatttcagatagaggactaatagcaagttggtgtccacaagagaaagtat 4574655  T
Q  715 tgaaccacctttcagtcggtggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatatgtgctggagttccaatgttatgttggccat 810  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4574654 tgaaccacctttcagtcggtggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatatgtgctggagttccaatgttatgttggccat 4574559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 643; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 4561551 - 4560757
Alignment:
Q  18 atatgcaatatcagtaggataacacaaccaaaattatt-ttgcaaatgtgattgtaaaccatgatatatatttatacatatgactt---gctattgattt 113  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||  |||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  4561551 atatgcaatatcaatatgatagcacaggcaaaattattattgttaatgtgattttaaaccatgatatatatttatacatatgactttaagctattgattt 4561452  T
Q  114 ttgcaattatgacatgcagatgagagtgatctaacaaatgaatatttggacacaaaaattgactggatcccaggtttgaaaaacttcagattgaaggatc 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4561451 ttgcaattatgacatgcagatgagagtgatctaacaaatgaatatctggacacgaaagttgactggatcccaggtttgaaaaacttcagattgaaggatc 4561352  T
Q  214 ttcctaggttaataaagacaaaaaatcctaatgacttgacgataagatttaacactgaagtggcagataaatgtcatagagcttctggtatgctattcaa 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  4561351 ttcctaggttaataaagacaaaaaatcctaatgacttgacgataagatttaacactgaagtggcagataaatgtcttagagcttctggtatggtattcaa 4561252  T
Q  314 tacttcgaatgaacttgagagtgatgttatgaatgctttctattctttgtttccttctctatacacaattggtccattagcttcttttctaaatcaaagt 413  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4561251 tacttctaatgaacttgagagtgatgttatgaatgctttctattctatgttcccttctctatacacaattggtccattagcttcttttgtaaatcaaagt 4561152  T
Q  414 ccacaaaatgacttgacatctttagactctaatctttggaaagaagatactaaatgtcttgaatggcttgaatcaaaagaaccaagatctgttgtttatg 513  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4561151 ccacaaaatcacttgacatctttagactgtaatctttggaaagaagatactaaatgtcttgaatggcttgaatcaaaagaaccaggatctgttgtttatg 4561052  T
Q  514 taaattttggcagcatcactgttatgtctcgagagaagctcgtagagtttgcttggggtttggccaacagcaaaaaaccctttttgtggatcattaggcc 613  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  4561051 taaattttggcagcatcactgttaagtctcaagagaagc-cttagagtttgcttggggtttggccaacagcaagaaaccatttttatggatcattaggcc 4560953  T
Q  614 tgatcttgtcattggtggctcggtggttttctcatctgattttttgaaagaaatttcagatagaggactaatagcaagttggtgtccacaagagaaagta 713  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4560952 tgatcttgtcattggtggctcggtggttttctcatctga-tttttgaaagaaatttcagatagaggactaatagcaagttggtgtccacaagagaaagta 4560854  T
Q  714 ttgaaccacctttcagtcggtggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatatgtgctggagttccaatgttatgttggccat 810  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4560853 ttgaaccacccatcagtcggtggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatatgtgctggagttccaatgttgtgttggccat 4560757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 103 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 4481651 - 4480944
Alignment:
Q  103 gctattgatttttgcaattatgacatgcagatgagagtgatctaacaaatgaatatttggacacaaaaattgactggatcccaggtttgaaaaacttcag 202  Q
    |||||||| |||||  ||| ||| |||||||||||||| || ||||| ||| |||||||||| ||| | | |||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  4481651 gctattgaattttgtgattgtgatatgcagatgagagttatttaacagatggatatttggacgcaacagtagactggattccaggtttgaaaaactttag 4481552  T
Q  203 attgaaggatcttcctaggttaataaagacaaaaaatcctaatgacttgacgataagatttaacactgaagtggcagataaatgtcatagagcttctggt 302  Q
    ||||||||| ||||||   ||||| |||  || | |||||||| ||||||  |||| || ||| | ||||||| ||||||||||||| ||||| |||| |    
T  4481551 attgaaggaccttcctgatttaattaaggtaacagatcctaatcacttgatcataaaatataaaaatgaagtgacagataaatgtcaaagagcatctgct 4481452  T
Q  303 atgctattcaatacttcgaatgaacttgagagtgatgttatgaatgctttctattctttgtttccttctctatacacaattggtccattagcttcttttc 402  Q
     |  |  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||     
T  4481451 tttgttatcaatacttcttatgaacttgagagtgatgttatgaattctctctattctatattcccttctctatacaccattggtccattggcttcttttt 4481352  T
Q  403 taaatcaaagtccacaaaatgacttgacatctttagactctaatctttggaaagaagatactaaatgtcttgaatggcttgaatcaaaagaaccaagatc 502  Q
    ||||||||||||||||| || |||||  | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4481351 taaatcaaagtccacaatatcacttggaaacattagactctaatctttggaaagaagatactaaatgtcttgaatggcttgaatcaaaagaaccaggatc 4481252  T
Q  503 tgttgtttatgtaaattttggcagcatcactgttatgtctcgagagaagctcgtagagtttgcttggggtttggccaacagcaaaaaaccctttttgtgg 602  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  ||||||||||    
T  4481251 tgttgtttatgtaaattttggcagcatcacaattatgtctcaagagaaactcttagagtttgcttggggttttgccaatagcaaaaaaaactttttgtgg 4481152  T
Q  603 atcattaggcctgatcttgtcattggtggctcggtggttttctcatctgattttttgaaagaaatttcagatagaggactaatagcaagttggtgtccac 702  Q
    || |||||| || ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| | |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4481151 attattaggtctaatcttgtcattggtggctcagtggtgttgtcatctgagtatttgaaagaaatttcaaatagaggcctaatagcaagttggtgtccac 4481052  T
Q  703 aagagaaagtattgaaccacctttcagtcggtggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatatgtgctggagttccaatgttatg 802  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||    
T  4481051 aagagaaagttttgaaccacccttcaatcggcggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagtgtatgtgctggagtgccaatgttgtg 4480952  T
Q  803 ttggccat 810  Q
    ||||||||    
T  4480951 ttggccat 4480944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 112 - 810
Target Start/End: Original strand, 4266346 - 4267047
Alignment:
Q  112 ttttgcaattatgacatgcagatgagagtgatctaacaaatgaatatttggacacaaaaattg---actggatcccaggtttgaaaaacttcagattgaa 208  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||| |||||||||||| |||||| || |  ||| |||   ||||||| | ||||||| ||||||| || |||||    
T  4266346 ttttgcaattgcgatatgcagatgagagttatctaacaaatggatatttagataataaagttggtgactggattcaaggtttgcaaaactttaggttgaa 4266445  T
Q  209 ggatcttcctaggttaataaagacaaaaaatcctaatgacttgacgataagatttaacactgaagtggcagataaatgtcatagagcttctggtatgcta 308  Q
    ||| ||||||   || | || ||  | | |||||||||| |||| ||||| |||||  || |||||||| |||| ||||||  |||| |||  |||  |     
T  4266446 ggaccttcctgattttacaaggattacagatcctaatgatttgatgataaaatttattaccgaagtggcggatagatgtcaccgagcctcttctattgtt 4266545  T
Q  309 ttcaatacttcgaatgaacttgagagtgatgttatgaatgctttctattctttgtttccttctctatacacaattggtccattagcttcttttctaaatc 408  Q
     ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| |||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  4266546 atcaatacttcatatgaacttgagagtgatgttatgaatgctctctactctatgttcccttctatatacaccattggcccatttgcttcttttttaaatc 4266645  T
Q  409 aaagtccacaaaatgacttgacatctttagactctaatctttggaaagaagatactaaatgtcttgaatggcttgaatcaaaagaaccaagatctgttgt 508  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4266646 aaagtccacaaaatcacttggcatctttaaattccaatctttggaaagaagatactaaatgtcttgagtggcttgaatcaaaagaaccaagatctgttgt 4266745  T
Q  509 ttatgtaaattttggcagcatcactgttatgtctcgagagaagctcgtagagtttgcttggggtttggccaacagcaaaaaaccctttttgtggatcatt 608  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||    
T  4266746 ttatgtaaattttggtagcatcacagttatgtcacgagagaagctcttagagtttgcttggggtttggccaacagcaagaacccttttttgtggataatt 4266845  T
Q  609 aggcctgatcttgtcattggtggctcggtggttttctcatctgattttttgaaagaaatttcagatagaggactaatagcaagttggtgtccacaagaga 708  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4266846 aggcctgatcttgtcattgggggctcagttgttttgtcatctgatttttttaaagaaatttcagatagaggactaatagcaagttggtgtccacaagata 4266945  T
Q  709 aagtattgaaccacctttcagtcggtggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatatgtgctggagttccaatgttatgttggcc 808  Q
    |||| |||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  4266946 aagtgttgaaccacccttcgattggtggattcttgactcattgcggatggaattcaaccactgaaagcatatgtgctggagtgccaatgttgtgttggcc 4267045  T
Q  809 at 810  Q
    ||    
T  4267046 at 4267047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 118 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 3172684 - 3171992
Alignment:
Q  118 aattatgacatgcagatgagagtgatctaacaaatgaatatttggacacaaaaattgactggatcccaggtttgaaaaacttcagattgaaggatcttcc 217  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  3172684 aattatgatatgcagatgagagttatgaaacaaatggatatttggacactatagttgactggattccaggtttgaaaaactttagattgaagcatcttcc 3172585  T
Q  218 taggttaataaagacaaaaaatcctaatgacttgacgataagatttaacactgaagtggcagataaatgtcatagagcttctggtatgctattcaatact 317  Q
    ||  ||||| | || |||| |||||||||| |||| ||||  |||||  | |||||| | |||||||||||| | |||||||| |||  | ||||| |||    
T  3172584 tactttaattaggataaaagatcctaatgatttgatgatagaatttatgattgaagtaggagataaatgtcacaaagcttctgctattgttttcaacact 3172485  T
Q  318 tcgaatgaacttgagagtgatgttatgaatgctttctattctttgtttccttctctatacacaattggtccattagcttcttttctaaatcaaagtccac 417  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| || |   |||| | || ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||| ||||||||| |    
T  3172484 tctaatgaacttgagagtgatgttatgaatactcttagttctatattcccttctctatacacaattggtccgttcgcttcgtttttaagtcaaagtccgc 3172385  T
Q  418 aaaatgacttgacatctttagactctaatctttggaaagaagatactaaatgtcttgaatggcttgaatcaaaagaaccaagatctgttgtttatgtaaa 517  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  3172384 aaaatcacttggcatctttagattctaatctttggaaagaagatactaaatgtcttgaatggcttgaaacaaaagaatcaaaatctgttgtttatgtaaa 3172285  T
Q  518 ttttggcagcatcactgttatgtctcgagagaagctcgtagagtttgcttggggtttggccaacagcaaaaaaccctttttgtggatcattaggcctgat 617  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| ||||||  |  ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3172284 ttttggcagcatcatagttatgtctcaagagaaattattagagtttgcttggggtttagccaacagcaagaaaccctttttgtggattattaggcctgat 3172185  T
Q  618 cttgtcattggtggctcggtggttttctcatctgattttttgaaagaaatttcagatagaggactaatagcaagttggtgtccacaagagaaagtattga 717  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  3172184 cttgtcattggtggctcggttgttttgtcatcggagtttgtgaatgaaatttcagatagaggcctaatagcaagttggtgtccgcaagagaaagtgttga 3172085  T
Q  718 accacctttcagtcggtggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatatgtgctggagttccaatgttatgttggccat 810  Q
    |||| | |||| | || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| | |||||||| ||| ||||||    
T  3172084 accatccttcaattggcggattcttgactcactgcggatggaactcaaccacggaaagtgtatgtgctggaatgccaatgttgtgtaggccat 3171992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 56 - 810
Target Start/End: Original strand, 4489484 - 4490236
Alignment:
Q  56 ttgcaaatgtgattgtaaaccatgatatatattt-atacatatgactt---gctattgatttttgcaattatgacatgcagatgagagtgatctaacaaa 151  Q
    ||||||| | |||| |||||| |||||||||||| ||| |||| ||||   |||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||| |    
T  4489484 ttgcaaaggcgattttaaaccttgatatatattttatatatataacttcaagctattgacttttgaaattgtgatatgcagatgagagtaatctaacaga 4489583  T
Q  152 tgaatatttggacacaaaaattgactggatcccaggtttgaaaaacttcagattgaaggatcttcctaggttaataaagacaaaaaatcctaatgacttg 251  Q
    || | |||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||| | | || ||||||||| |||||    |||||| || |||| ||||| |||         
T  4489584 tggaaatttggacactaaagttgaatggattccaggtttgaaaagcattagtttgaaggattttcctgatataataaggataaaagatcctgatgt---- 4489679  T
Q  252 acgataagatttaacactgaagtggcagataaatgtcatagagcttctggtatgctattcaatacttcgaatgaacttgagagtgatgttatgaatgctt 351  Q
      ||||| || ||| | ||||| | ||||||||||||| ||||  ||    ||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||     
T  4489680 --gataaaatataaaattgaagagacagataaatgtcaaagaggctcaaccattattttcaatacttctaatgaacttgagagtgatgctatcaatgctc 4489777  T
Q  352 tctattctttgtttccttctctatacacaattggtccattagcttcttttctaaatcaaagtccacaaaatgacttgacatctttagactctaatctttg 451  Q
    |   |||| | || |||||| ||||||||||||| |||||  |||||||| || |||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  4489778 ttagttctatattcccttctgtatacacaattggcccattttcttcttttttagatcaaattccagaaaatcacttgaaatctttagactctaatctttg 4489877  T
Q  452 gaaagaagatactaaatgtcttgaatggcttgaatcaaaagaaccaagatctgttgtttatgtaaattttggcagcatcactgttatgtctcgagagaag 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4489878 gaaagaagatactaaatgtcttgaatggcttgaatcaaaagaaccaggatctgttgtttatgtaaattttggcagcatcactgttatgtctcgagagaag 4489977  T
Q  552 ctcgtagagtttgcttggggtttggccaacagcaaaaaaccctttttgtggatcattaggcctgatcttgtcattggtggctcggtggttttctcatctg 651  Q
    ||  |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||| || |||||||    
T  4489978 ctattagagtttgcatggggtttggccaacagcaagaaaccctttttgtggatcattaggcctgatcttgttattggtggctcacaggtgttgtcatctg 4490077  T
Q  652 attttttgaaagaaatttcagatagaggactaatagcaagttggtgtccacaagagaaagtattgaaccacctttcagtcggtggattcttgactcattg 751  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||||    
T  4490078 attttttgaaagaaatttcagatagaggactaatagcaagttggtgtccacaagagaaggtattgaatcacccttcaattggtggattcttgactcattg 4490177  T
Q  752 cggatggaactcaaccactgaaagcatatgtgctggagttccaatgttatgttggccat 810  Q
     ||||||||||||| ||  || || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  4490178 tggatggaactcaatcatggagagtatatgtgctggagtgccaatgttgtgttggccat 4490236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 56 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 4462131 - 4461374
Alignment:
Q  56 ttgcaaatgtgattgtaaaccatgatatatatttatacatatgactt---gctattgatttttgcaattatgacatgcagatgagagtgatctaacaaat 152  Q
    |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||  |||| ||||   |||||||| ||||  |||||||| |||||||||||| | |||||||| ||    
T  4462131 ttgcaaatgtgattttataccttgatatatatttatgtatataacttcaagctattgacttttttaattatgatatgcagatgagatttatctaacagat 4462032  T
Q  153 gaatatttggacacaaaaattgactggatcccaggtttgaaaaacttcagattgaaggatcttcctaggttaataaagacaaaaaatcctaatgacttga 252  Q
    | |||||| |||||  || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||     |||||||| |||| |||||||| |||||     
T  4462031 ggatatttagacactgaagttgactggattccaggtttgaaaaatttcagattgaaggattttcctgaaacaataaagataaaagatcctaataacttgc 4461932  T
Q  253 cgataagatttaacactgaagtggcagataaatgtcatagagcttctggtatgctattcaatacttcgaatgaacttgagagtgatgttatgaatgcttt 352  Q
     ||||| ||||  || |||| || ||||||||||||| |||||||||| | |  | || |||||||| |||||||| || |||||| |||||||||   |    
T  4461931 tgataaaatttgtcagtgaaatgacagataaatgtcacagagcttctgctgttattttgaatacttctaatgaactcgaaagtgatattatgaatgaact 4461832  T
Q  353 ctattctttgtttccttctctatacacaattggtccattagcttcttttctaaatcaaagtccacaaaatgacttgacatctttagactctaatctttgg 452  Q
    ||||| | | || |||||||||||||| ||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| | || |||||||||    
T  4461831 ctattttatattcccttctctatacaccattggtccactttcttcttttataaatcaaagtccacaaaatcacctggcatctttaaattccaatctttgg 4461732  T
Q  453 aaagaagatactaaatgtcttgaatggcttgaatcaaaagaaccaagatctgttgtttatgtaaattttggcagcatcactgttatgtctcgagagaagc 552  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||  | |    
T  4461731 aaagaagatactaaatgtcttgaatggcttgaatcaaaagaaccaggatctgttgtctatgtaaattttggcagcatcacagttatgactcctgatcaac 4461632  T
Q  553 tcgtagagtttgcttggggtttggccaacagcaaaaaaccctttttgtggatcattaggcctgatcttgtcattggtggctcggtggttttctcatctga 652  Q
    |  ||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||| ||||||||    
T  4461631 tgttagagtttgcttggggtttggctgatagcaagaaaccctttttatggatcattaggcctgatcttgtcattggcggctcgtttattttgtcatctga 4461532  T
Q  653 ttttttgaaagaaatttcagatagaggactaatagcaagttggtgtccacaagagaaagtattgaaccacctttcagtcggtggattcttgactcattgc 752  Q
     ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||     
T  4461531 gtttgtgaatgaaatttcagatagaggcctaatagcaagctggtgtccgcaagagcaagtactgaaccacccttcaattggtggattcttgactcattgt 4461432  T
Q  753 ggatggaactcaaccactgaaagcatatgtgctggagttccaatgttatgttggccat 810  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  4461431 ggatggaattcaaccactgaaagcatatgtgctggagtgccgatgttgtgttggccat 4461374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 60 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 4470806 - 4470054
Alignment:
Q  60 aaatgtgattgtaaaccatgatatatatttatacatatgactt--gctattgatttttgcaattatgacatgcagatgagagtgatctaacaaatgaata 157  Q
    |||||||||| |||||| || |||||||||||  |||| ||||  |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| |||    
T  4470806 aaatgtgattttaaaccttggtatatatttatgtatataacttcagctattgactttttcaattatgatatgcagatgagagttatctaatagatggata 4470707  T
Q  158 tttggacacaaaaattgactggatcccaggtttgaaaaacttcagattgaaggatcttcctaggttaataaagacaaaaaatcctaatgacttgacgata 257  Q
    ||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||     |||||||| |||| ||||||||||||| | | ||    
T  4470706 tttcgacattgaagttgactggattccaggtttgaaaaacttcagattgaaggattttcctgaaacaataaagataaaagatcctaatgactttatgtta 4470607  T
Q  258 agatttaacactgaagtggcagataaatgtcatagagcttctggtatgctattcaatacttcgaatgaacttgagagtgatgttatgaatgctttctatt 357  Q
    | || ||  | ||||||| || |||||||||| |||||||||| |||  | || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||    
T  4470606 aaatatacaaatgaagtgacaaataaatgtcaaagagcttctgctattgttttgaatacttctaatgaacttgaaagtgatgttatgaatgaactctatt 4470507  T
Q  358 ctttgtttccttctctatacacaattggtccattagcttcttttctaaatcaaagtccacaaaatgacttgacatctttagactctaatctttggaaaga 457  Q
    || | || |||||||||||| | ||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||| |  |  |||||||| | |  ||||||||||||||    
T  4470506 ctatattcccttctctatacgccattggtccactttcttcttttttaaatcaaagtccacaaaatcatctagcatctttaaatttcaatctttggaaaga 4470407  T
Q  458 agatactaaatgtcttgaatggcttgaatcaaaagaaccaagatctgttgtttatgtaaattttggcagcatcactgttatgtctcgagagaagctcgta 557  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||| ||  ||    
T  4470406 agatactaaatgtcttgagtggcttgaatcaaaagaaccaggatctgttgtctatgtaaatttcggcagcgtcacagttatgtctccagagaaactgtta 4470307  T
Q  558 gagtttgcttggggtttggccaacagcaaaaaaccctttttgtggatcattaggcctgatcttgtcattggtggctcggtggttttctcatctgattttt 657  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||     
T  4470306 gagtttgcttggggtttggcaaatagcaagcaaccctttttgtggatcattaggcccgatcttgtcattggcggctcggtagttttctcatcagagattg 4470207  T
Q  658 tgaaagaaatttcagatagaggactaatagcaagttggtgtccacaagagaaagtattgaaccacctttcagtcggtggattcttgactcattgcggatg 757  Q
    | || | ||||||||||||||| ||||| |  |  |||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4470206 taaatggaatttcagatagaggcctaatcgtgaactggtgtcctcaagagcaagtactgaaccacccttcaatcggtggattcttgactcattgcggatg 4470107  T
Q  758 gaactcaaccactgaaagcatatgtgctggagttccaatgttatgttggccat 810  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||    
T  4470106 gaactcaaccactgaaagcatatgcgctggagtgccaatgttgtgttggccat 4470054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 102 - 807
Target Start/End: Original strand, 4514294 - 4514999
Alignment:
Q  102 tgctattgatttttgcaattatgacatgcagatgagagtgatctaacaaatgaatatttggacacaaaaattgactggatcccaggtttgaaaaacttca 201  Q
    ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||  |||||| |    
T  4514294 tgctatttacttttgcaattatgatatgcagatgagagttatttgacaaatggatatttggacactaaagttgactggattccaggtttgcgaaacttta 4514393  T
Q  202 gattgaaggatcttcctaggttaataaagacaaaaaatcctaatgacttgacgataagatttaacactgaagtggcagataaatgtcatagagcttctgg 301  Q
    || ||||||| ||||||   || |||  ||||| | || ||||||| |||| | ||  ||||| |  |||| ||| ||||| |  ||||||||||||||     
T  4514394 gactgaaggaccttcctgattttatacggacaacagatgctaatgatttgatgttagaatttatctttgaaatggtagatagacttcatagagcttctgc 4514493  T
Q  302 tatgctattcaatacttcgaatgaacttgagagtgatgttatgaatgctttctattctttgtttccttctctatacacaattggtccattagcttctttt 401  Q
    |||  | || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| || | |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||    
T  4514494 tatttttttaaatacttctaatgatcttgagagtgatgttatgaatgctctttattctatgctcccttctctatacaccattggcccatttgcttcgttt 4514593  T
Q  402 ctaaatcaaagtccacaaaatgacttgacatctttagactctaatctttggaaagaagatactaaatgtcttgaatggcttgaatcaaaagaaccaagat 501  Q
     | |||||||||||||||||| |||||  ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  4514594 ttgaatcaaagtccacaaaatcacttggaatctttaggttccaatctttggaaagaagatactaaatgtcttgaatggcttgaatcaaaagaatcaggat 4514693  T
Q  502 ctgttgtttatgtaaattttggcagcatcactgttatgtctcgagagaagctcgtagagtttgcttggggtttggccaacagcaaaaaaccctttttgtg 601  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||  |||||  |  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||    
T  4514694 ctgttgtttatgttaattttggtagcatcacgattatgtctccggagaaattgttagagtttgcttggggtttggccaatagcaagaaaacctttttatg 4514793  T
Q  602 gatcattaggcctgatcttgtcattggtggctcggtggttttctcatctgattttttgaaagaaatttcagatagaggactaatagcaagttggtgtcca 701  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||| |||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4514794 gatcattaggcctgatcttgtcattggtggctcagtggttttgtcgtctgagtttgtgaatgaaattgcagatagaggcctaatagcaagttggtgtcca 4514893  T
Q  702 caagagaaagtattgaaccacctttcagtcggtggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatatgtgctggagttccaatgttat 801  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| | |    
T  4514894 caagagaaagttttgaaccacccttcaattggcggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgagagcatatgcgctggagtgccaatgcttt 4514993  T
Q  802 gttggc 807  Q
    ||||||    
T  4514994 gttggc 4514999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 112 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 4458547 - 4457845
Alignment:
Q  112 ttttgcaattatgacatgcagatgagagtgatctaacaaatgaatatttggacacaaaaat---tgactggatcccaggtttgaaaaacttcagattgaa 208  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||| |||| |   |||||||||  |||||||| ||||||| || |||||    
T  4458547 ttttgcaattacaatatgcagaagagagttatttaacaaatggatatttggacaaaaaagtcggtgactggatttcaggtttgcaaaactttaggttgaa 4458448  T
Q  209 ggatcttcctaggttaataaagacaaaaaatcctaatgacttgacgataagatttaacactgaagtggcagataaatgtcatagagcttctggtatgcta 308  Q
    ||| ||||||   || |||||||  | | |||||||| | |||| ||||| |||||  || ||||||||||||| |||||||||||| |||  |||  |     
T  4458447 ggaccttcctgattttataaagattacagatcctaataatttgatgataaaatttataaccgaagtggcagatagatgtcatagagcctcttctattgtt 4458348  T
Q  309 ttcaatacttcgaatgaacttgagagtgatgttatgaatgctttctattctttgtttccttctctatacacaattggtccattagcttcttttctaaatc 408  Q
     ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||| |||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  4458347 atcaatacttcttatgaacttgagagtgatgttatgaatactctctactctatgttcccttctatatacaccattggcccatttgcttcttttataaatc 4458248  T
Q  409 aaagtccacaaaatgacttgacatctttagactctaatctttggaaagaagatactaaatgtcttgaatggcttgaatcaaaagaaccaagatctgttgt 508  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  4458247 aaagtccacaaaatcacttggcatctttaaattccaatctttggaaagaatatactaaatgtcttgagtggcttgaatcaaaagaaccaaagtctgttat 4458148  T
Q  509 ttatgtaaattttggcagcatcactgttatgtctcgagagaagctcgtagagtttgcttggggtttggccaacagcaa-aaaaccctttttgtggatcat 607  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |     
T  4458147 ttatgtaaattttggaagcatcacagttatgtctcaagagaagctcttagaatttgcttgggttttggccaacagcaagaaaaccttttttgtggataac 4458048  T
Q  608 taggcctgatcttgtcattggtggctcggtggttttctcatctgattttttgaaagaaatttcagatagaggactaatagcaagttggtgtccacaagag 707  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||| |||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||     
T  4458047 taggcctgatcttgtcattggtggctcggttgttttgtcatcggattttgtgaatgaaacttctgatagaggcttaatagcaagttggtgtccacaagat 4457948  T
Q  708 aaagtattgaaccacctttcagtcggtggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatatgtgctggagttccaatgttatgttggc 807  Q
    ||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |  ||||||    
T  4457947 aaagtgttgaaccacccttcaatcggaggattcttgactcattgtggatgaaactcaaccactgaaagcatatgcgctggagtgccaatgctgcgttggc 4457848  T
Q  808 cat 810  Q
    |||    
T  4457847 cat 4457845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 366 - 810
Target Start/End: Original strand, 4503834 - 4504278
Alignment:
Q  366 ccttctctatacacaattggtccattagcttcttttctaaatcaaagtccacaaaatgacttgacatctttagactctaatctttggaaagaagatacta 465  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4503834 ccttctctatacacaattggtccattagcttcttttgtaaatcaaagtccacaaaatgacttgacatctttagactctaatctttggaaagaagatacta 4503933  T
Q  466 aatgtcttgaatggcttgaatcaaaagaaccaagatctgttgtttatgtaaattttggcagcatcactgttatgtctcgagagaagctcgtagagtttgc 565  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||| ||  |  ||||||||||    
T  4503934 aatgtcttgattggcttgaattaaaagaaccaggatctgttgtttatgtaaattttggcagcattacagttatgtcttaagataaattgttagagtttgc 4504033  T
Q  566 ttggggtttggccaacagcaaaaaaccctttttgtggatcattaggcctgatcttgtcattggtggctcggtggttttctcatctgattttttgaaagaa 665  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| || |||||||||||| |||| |||    
T  4504034 ttggggtttggccaatagcaagaaaccttttttgtggattattaggcctgatcttgttattggtggctcagaggtgttgtcatctgattttgtgaatgaa 4504133  T
Q  666 atttcagatagaggactaatagcaagttggtgtccacaagagaaagtattgaaccacctttcagtcggtggattcttgactcattgcggatggaactcaa 765  Q
    | |||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4504134 acttctaatagaggacttgtagcaagttggtgtccacaagataaagtgttgaaccacccttcaatcggaggattcttgactcattgtggatggaactcaa 4504233  T
Q  766 ccactgaaagcatatgtgctggagttccaatgttatgttggccat 810  Q
    ||||||||||  | ||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  4504234 ccactgaaagtgtttgtgctggagtgccaatgttgtgttggccat 4504278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 112 - 808
Target Start/End: Complemental strand, 4506806 - 4506110
Alignment:
Q  112 ttttgcaattatgacatgcagatgagagtgatctaacaaatgaatatttggacacaaaaattgactggatcccaggtttgaaaaacttcagattgaagga 211  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||  | |||||||| |||||||||| |||||| ||| |||| ||    
T  4506806 ttttgtaattatgatatgcagatgagagttatctaacaaatggatatttggacactaaggtagactggattccaggtttgagaaactttagactgaaaga 4506707  T
Q  212 tcttcctaggttaataaagacaaaaaatcctaatgacttgacgataagatttaacactgaagtggcagataaatgtcatagagcttctggtatgctattc 311  Q
    |||||||   || |||| ||||| | ||||||| || |||| ||||  |||||  | |||||  ||||| | || ||||||||| |||  |||  |  ||    
T  4506706 tcttcctgattttataaggacaacagatcctaacgatttgaggatagaatttattattgaagcagcagaaacatttcatagagcctcttctattgttctc 4506607  T
Q  312 aatacttcgaatgaacttgagagtgatgttatgaatgctttctattctttgtttccttctctatacacaattggtccattagcttcttttctaaatcaaa 411  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||  | ||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||| ||| |||||||||    
T  4506606 aatacttctaatgaacttgagagtaatgttctgaatgctcttgatattatgtttccttctctatacactattggccctttaacttcatttgtaaatcaaa 4506507  T
Q  412 gtccacaaaatgacttgacatctttagactctaatctttggaaagaagatactaaatgtcttgaatggcttgaatcaaaagaaccaagatctgttgttta 511  Q
    ||||||||||| | ||  || ||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    |||||||||||    
T  4506506 gtccacaaaatcagtttgcaactttagattcaaatctttggaaagaggatactaaatgtctcgaatggctggaatcaaaagaaccggcttctgttgttta 4506407  T
Q  512 tgtaaattttggcagcatcactgttatgtctcgagagaagctcgtagagtttgcttggggtttggccaacagcaaaaaaccctttttgtggatcattagg 611  Q
    ||| |||||||| ||||||||  |||||||||  |||||  |  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4506406 tgtgaattttggaagcatcacaattatgtctccggagaaatttttagagtttgcttggggtttggccaatagcaagaaaccctttttgtggatcattagg 4506307  T
Q  612 cctgatcttgtcattggtggctcggtggttttctcatctgattttttgaaagaaatttcagatagaggactaatagcaagttggtgtccacaagagaaag 711  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || || |||   || ||||||||||||||| | || |||||||| |||||| ||||||||||||    
T  4506306 cctgatcttgtaattggtggctcagtggttttgtcttcagagtttgcaaatgaaatttcagatagaagccttatagcaagctggtgttcacaagagaaag 4506207  T
Q  712 tattgaaccacctttcagtcggtggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatatgtgctggagttccaatgttatgttggcc 808  Q
    | || || |||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||||||    
T  4506206 tgttaaatcacccttcaattggtggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatatgcgctggagtgccaatgctgtgttggcc 4506110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 322 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 4564453 - 4563962
Alignment:
Q  322 atgaacttgagagtgatgttatgaatgctttctattctttgtttccttctctatacacaattggtccattagcttcttttctaaatcaaagtccacaaa- 420  Q
    |||||||| |||||||||| || |||||| |||  ||| ||||||||||||| ||| | ||||| || ||| |||| ||  |||| |||| ||||||||     
T  4564453 atgaactttagagtgatgtaataaatgctctctcctctatgtttccttctctttaccccattggccctttaccttcattattaaaccaaactccacaaat 4564354  T
Q  421 --atgacttgacatctttagactctaatctttggaaagaagatactaaatgtcttgaatggcttgaatcaaaagaaccaagatctgttgtttatgtaaat 518  Q
      || | |||   |||||||  || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||  |||| ||||||||||| |||    
T  4564353 tcatcaattggattctttaggttccaacctttggaaagaagatactaagtgtcttgaatggcttgaatccaaggagccgggatccgttgtttatgtgaat 4564254  T
Q  519 tttggcagcatcactgttatgtctcgagagaagctcgtagagtttgcttggggtttggccaacagcaaaaaaccctttttgtggatcattaggcctgatc 618  Q
    ||||| ||||| || |||||| | | | |  | ||  | || ||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4564253 tttggaagcattacagttatgacaccaaaacaactgttggaatttgcttgggggttggccaattgcaataaaccctttttgtggatcattaggcctgacc 4564154  T
Q  619 ttgtcattggtggctcggtggttttctcatctgattttttgaaagaaatttcagatagaggactaatagcaagttggtgtccacaagagaaagtattgaa 718  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4564153 ttgtcattggtggctcagtcgttttgtcatctgagtttgtgaatgaaatttcagatagaggcttaattgcaagttggtgtccacaggagaaagtattgaa 4564054  T
Q  719 ccacctttcagtcggtggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatatgtgctggagttccaatgttatgttggccat 810  Q
    ||||| |||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4564053 ccacccttcaattggcggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatatgtgctggagttccaatgttgtgttggccat 4563962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 381 - 805
Target Start/End: Complemental strand, 4598851 - 4598427
Alignment:
Q  381 attggtccattagcttcttttctaaatcaaagtccacaaaatgacttgacatctttagactctaatctttggaaagaagatactaaatgtcttgaatggc 480  Q
    ||||| || ||| |||| ||| |||||||||||| ||||||  | ||| |||||||||   | |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  4598851 attggccctttatcttcgtttttaaatcaaagtcaacaaaagcatttggcatctttaggtaccaatctttggaaagaagataccaagtgtcttgactggc 4598752  T
Q  481 ttgaatcaaaagaaccaagatctgttgtttatgtaaattttggcagcatcactgttatgtctcgagagaagctcgtagagtttgcttggggtttggccaa 580  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || || ||| ||  ||| ||| |  |||| ||||||||||||||||||||    
T  4598751 ttgaatccaatgaaccaaggtctgttgtttatgtgaattttgggagcataacggtgatgactgcagaaaagttgttagactttgcttggggtttggccaa 4598652  T
Q  581 cagcaaaaaaccctttttgtggatcattaggcctgatcttgtcattggtggctcggtggttttctcatctgattttttgaaagaaatttcagatagagga 680  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||| |||| |||||||||||||||||     
T  4598651 tagcaagaaaccctttttgtggatcattaggcctgatcttgtcattggtggctcggttgttttgtcatcggagtttgtgaatgaaatttcagatagaggc 4598552  T
Q  681 ctaatagcaagttggtgtccacaagagaaagtattgaaccacctttcagtcggtggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatat 780  Q
     || | ||||| |||||||  |||||| ||||||| ||||| | |||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4598551 ttagttgcaagctggtgtctgcaagagcaagtattaaaccatccttcaattggtggattcttaactcattgcggatggaactcaaccactgaaagtatat 4598452  T
Q  781 gtgctggagttccaatgttatgttg 805  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||    
T  4598451 gtgccggagtgccaatgttgtgttg 4598427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 381 - 810
Target Start/End: Original strand, 4613170 - 4613599
Alignment:
Q  381 attggtccattagcttcttttctaaatcaaagtccacaaaatgacttgacatctttagactctaatctttggaaagaagatactaaatgtcttgaatggc 480  Q
    |||||||| ||| ||||  || ||| |||||||||||||||| ||||| ||  ||||    | |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  4613170 attggtcctttatcttcacttttaagtcaaagtccacaaaatcacttggcaagtttaagtaccaatctttggaaagaagataccaagtgtcttgattggc 4613269  T
Q  481 ttgaatcaaaagaaccaagatctgttgtttatgtaaattttggcagcatcactgttatgtctcgagagaagctcgtagagtttgcttggggtttggccaa 580  Q
    ||||||| || ||||| |  || ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||| ||  ||| || ||  |||||||||||||||||||||| ||    
T  4613270 ttgaatccaaggaaccgaagtccgttgtttatgtgaattttgggagcatgaccgttatgactgcagaaaaactattagagtttgcttggggtttggcgaa 4613369  T
Q  581 cagcaaaaaaccctttttgtggatcattaggcctgatcttgtcattggtggctcggtggttttctcatctgattttttgaaagaaatttcagatagagga 680  Q
     |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || ||| |||| |||||||||||||||||     
T  4613370 tagcaagcaaccctttttgtggatcattaggcctgatcttgtcattggcggctcagttgttttgtcatcagagtttgtgaatgaaatttcagatagaggc 4613469  T
Q  681 ctaatagcaagttggtgtccacaagagaaagtattgaaccacctttcagtcggtggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatat 780  Q
    ||||| || || |||||||| |||||| ||||||| ||||||| |||| | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4613470 ctaatcgcgagctggtgtcctcaagagcaagtattaaaccacccttcaattggcggattcttgactcattgtggatggaactcaaccactgaaagcatat 4613569  T
Q  781 gtgctggagttccaatgttatgttggccat 810  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  4613570 gtgctggagtgccaatgttgtgttggccat 4613599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 322 - 781
Target Start/End: Original strand, 4299214 - 4299673
Alignment:
Q  322 atgaacttgagagtgatgttatgaatgctttctattctttgtttccttctctatacacaattggtccattagcttcttttctaaatcaaagtccacaaaa 421  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||||| |||| || ||||| || ||| |||| ||  ||||||||| |||||| ||    
T  4299214 atgaacttgagagtgatgtaatgaatgctctctattctatgttcccttctttatatactattggacctttaccttcattattaaatcaaactccacataa 4299313  T
Q  422 tgacttgacatctttagactctaatctttggaaagaagatactaaatgtcttgaatggcttgaatcaaaagaaccaagatctgttgtttatgtaaatttt 521  Q
    | |||||  ||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||  |||| ||||||||||| ||||||    
T  4299314 tcacttggaatctttaggttccaatctttggaaagaagataccaaatgtcttgaatggcttgaatccaaggagccgggatcggttgtttatgtgaatttt 4299413  T
Q  522 ggcagcatcactgttatgtctcgagagaagctcgtagagtttgcttggggtttggccaacagcaaaaaaccctttttgtggatcattaggcctgatcttg 621  Q
    |||||| | || |||||| ||| |||| | ||  ||||| |||||||||||||||||||  |||  ||||| |||||||||||||||||||| || ||||    
T  4299414 ggcagcgttacagttatgactccagagcaactgttagagattgcttggggtttggccaattgcaggaaaccatttttgtggatcattaggccagaccttg 4299513  T
Q  622 tcattggtggctcggtggttttctcatctgattttttgaaagaaatttcagatagaggactaatagcaagttggtgtccacaagagaaagtattgaacca 721  Q
    ||||||| |||| | |  |||| |||||||| |||  ||| ||||||||| ||||||| ||||  ||||| | ||||||||||||  ||||| |||||||    
T  4299514 tcattggcggcttgtttattttgtcatctgagtttgagaatgaaatttcaaatagaggcctaaccgcaagctagtgtccacaagaacaagtactgaacca 4299613  T
Q  722 cctttcagtcggtggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatatg 781  Q
    || |||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4299614 cccttcaattggtggattcttgactcactgtggatggaactcaaccattgaaagcatatg 4299673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 405 - 808
Target Start/End: Complemental strand, 4516977 - 4516574
Alignment:
Q  405 aatcaaagtccacaaaatgacttgacatctttagactctaatctttggaaagaagatactaaatgtcttgaatggcttgaatcaaaagaaccaagatctg 504  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| | ||| |||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||| | | ||||    
T  4516977 aatcaaagtccgcaaaataacttggcttctataggttctaatctttggaaagaagatatgaaatgtcttgaatggcttgaatctaaggaacaaggttctg 4516878  T
Q  505 ttgtttatgtaaattttggcagcatcactgttatgtctcgagagaagctcgtagagtttgcttggggtttggccaacagcaaaaaaccctttttgtggat 604  Q
    | |||||||| |||||||| |||||||| || ||| ||| |||  | ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  4516877 tagtttatgtgaattttggaagcatcacggtcatgactccagatcaactgttagagttcgcttggggtttggccaacagcaagaaaccttttttgtggat 4516778  T
Q  605 cattaggcctgatcttgtcattggtggctcggtggttttctcatctgattttttgaaagaaatttcagatagaggactaatagcaagttggtgtccacaa 704  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||| |||| |||| ||| ||||||||  |||||||||| |||||||| |||    
T  4516777 tattaggcctgaccttgtcattggtggctcggttattttgtcatccgattttgtgaatgaaacttcggatagaggcgtaatagcaagctggtgtccgcaa 4516678  T
Q  705 gagaaagtattgaaccacctttcagtcggtggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatatgtgctggagttccaatgttatgtt 804  Q
    |||||||| |||||||| | |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| || |  |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||    
T  4516677 gagaaagtgttgaaccatccttcagttggaggattcttgactcattgtggatggaactccacaatggaaagcatctgtgccggagtaccaatgttgtgtt 4516578  T
Q  805 ggcc 808  Q
    ||||    
T  4516577 ggcc 4516574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 403 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 4586294 - 4585887
Alignment:
Q  403 taaatcaaagtccacaaaatgacttgacatctttagactctaatctttggaaagaagatactaaatgtcttgaatggcttgaatcaaaagaaccaagatc 502  Q
    |||||||||||||||||||  ||||  ||||||||    | |||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||| || ||    
T  4586294 taaatcaaagtccacaaaaccacttagcatctttaagtacaaatctttggaaagaggataccaagtgtcttgattggcttgaatcaaaggaaccgaggtc 4586195  T
Q  503 tgttgtttatgtaaattttggcagcatcactgttatgtctcgagagaagctcgtagagtttgcttggggtttggccaacagcaaaaaaccctttttgtgg 602  Q
     ||||||||||| |||||||| ||||  || |||||| ||  ||| || ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||  ||||| |||    
T  4586194 cgttgtttatgtgaattttgggagcacaacagttatgactacagaaaaactattagagtttgcttggggtttggccaatagcaagcaacattttttatgg 4586095  T
Q  603 atcattaggcctgatcttgtcattggtggctcggtggttttctcatctgattttttgaaagaaatttcagatagaggactaatagcaagttggtgtccac 702  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||| |||  ||| ||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||| || |    
T  4586094 atcattagacctgatcttgtcattggtggttccttggttttgtcatctgagtttaagaatgaaatttcagatagaggcctaatcgcgggttggtgcccgc 4585995  T
Q  703 aagagaaagtattgaaccacctttcagtcggtggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatatgtgctggagttccaatgttatg 802  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  4585994 aagagcaagtattgaaccacccttcaattggtggattcttgactcactgtggatggaactcaaccactgaaagcatatgtgctggagtgccaatgttgtg 4585895  T
Q  803 ttggccat 810  Q
    ||||||||    
T  4585894 ttggccat 4585887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 322 - 809
Target Start/End: Complemental strand, 4626690 - 4626203
Alignment:
Q  322 atgaacttgagagtgatgttatgaatgctttctattctttgtttccttctctatacacaattggtccattagcttcttttctaaatcaaagtccacaaaa 421  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||  ||| | |||| |||| || ||||| || ||   |||| || | |||| ||||||||||||    
T  4626690 atgaacttgagggtgatgtaatgaatgcgctctattctacgttcctttctgtatataccattggacctttgcattctcttttgaatcgaagtccacaaaa 4626591  T
Q  422 tgacttgacatctttagactctaatctttggaaagaagatactaaatgtcttgaatggcttgaatcaaaagaaccaagatctgttgtttatgtaaatttt 521  Q
      | |||| ||||||||  || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||  || |||||||  |||||||||||||| || |||    
T  4626590 ccagttgatatctttaggttccaatctttggaaagaagacaccaattgtcttgaatggcttgaattcaaggaaccaaagtctgttgtttatgtgaacttt 4626491  T
Q  522 ggcagcatcactgttatgtctcgagagaagctcgtagagtttgcttggggtttggccaacagcaaaaaaccctttttgtggatcattaggcctgatcttg 621  Q
    |||||| | |  |||||| ||| | |||| ||  ||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4626490 ggcagcgttatagttatgactccacagaaactgttagagtttgcttggggtttggctgatagcaagaaaccctttttgtggatcattaggcctgatcttg 4626391  T
Q  622 tcattggtggctcggtggttttctcatctgattttttgaaagaaatttcagatagaggactaatagcaagttggtgtccacaagagaaagtattgaacca 721  Q
    | |||||||||||  |  |||  ||||| || |||  ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||    
T  4626390 tgattggtggctcatttatttcgtcatccgagtttgagaatgaaatttcagatagaggcctaatcgcaagctggtgtccgcaagagaaagtactgaacca 4626291  T
Q  722 cctttcagtcggtggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatatgtgctggagttccaatgttatgttggcca 809  Q
     | |||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||    
T  4626290 tccttcaattggtggattcttaactcattgtggatggaactcaaccattgaaagcatatgcgctggagttccaatgctgtgttggcca 4626203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 381 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 4580112 - 4579683
Alignment:
Q  381 attggtccattagcttcttttctaaatcaaagtccacaaaatgacttgacatctttagactctaatctttggaaagaagatactaaatgtcttgaatggc 480  Q
    ||||| || ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||  | ||||||||||||  | | ||| |||||||||||||||| || |||||| | ||||    
T  4580112 attggccctttatcttcgtttttaaatcaaagtccagaaaaccatttgacatctttaagcaccaatttttggaaagaagataccaagtgtctttattggc 4580013  T
Q  481 ttgaatcaaaagaaccaagatctgttgtttatgtaaattttggcagcatcactgttatgtctcgagagaagctcgtagagtttgcttggggtttggccaa 580  Q
    ||||||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||| | || |||||| ||  ||| || ||  |||||||||| |||||||| || ||    
T  4580012 ttgaatccaaggaacctaggtctgttgtttatgtgaattttgggagcttgacagttatgactgcagaaaaactgttagagtttgcatggggtttagcaaa 4579913  T
Q  581 cagcaaaaaaccctttttgtggatcattaggcctgatcttgtcattggtggctcggtggttttctcatctgattttttgaaagaaatttcagatagagga 680  Q
     |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |  ||||| ||||| || ||| |||| |||||||||||||||||     
T  4579912 tagcaagcaaccctttttgtggatcattaggcccgatcttgtcatcggcggctcagctgttttgtcatcggagtttgtgaatgaaatttcagatagaggc 4579813  T
Q  681 ctaatagcaagttggtgtccacaagagaaagtattgaaccacctttcagtcggtggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatat 780  Q
    |||||| | || |||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4579812 ctaataacgagctggtgtccgcaagagcaagtactgaaccacccttcaattggtggattcttgactcattgcggatggaactcaatcactgaaagcatat 4579713  T
Q  781 gtgctggagttccaatgttatgttggccat 810  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4579712 ctgctggagttccaatgttgtgttggccat 4579683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 322 - 810
Target Start/End: Original strand, 4259547 - 4260035
Alignment:
Q  322 atgaacttgagagtgatgttatgaatgctttctattctttgtttccttctctatacacaattggtccattagcttcttttctaaatcaaagtccacaaaa 421  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||   |||||||| |||| |||||| ||||  | ||||| || ||| |||| ||  ||||||||| |||||| ||    
T  4259547 atgaacttgagagtgatgtaatgaatgtgctctattctatgttcccttctttatatgctattggacctttaccttcattattaaatcaaactccacataa 4259646  T
Q  422 tgacttgacatctttagactctaatctttggaaagaagatactaaatgtcttgaatggcttgaatcaaaagaaccaagatctgttgtttatgtaaatttt 521  Q
    | || || |||| ||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||    ||||||||||| || ||||||    
T  4259647 tcacctggcatcgttaggttccaatctttggaaagaagataccaaatgtcttgaatggcttgaatttaaggaacctgagtctgttgtttacgtgaatttt 4259746  T
Q  522 ggcagcatcactgttatgtctcgagagaagctcgtagagtttgcttggggtttggccaacagcaaaaaaccctttttgtggatcattaggcctgatcttg 621  Q
    |||||||| || |||||| ||| |||  |  |  |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  4259747 ggcagcattacagttatgactccagatcaatttttagagtttgcttggggattggccaatagcaagaaaccctttttgtggatcattaggcctgacctca 4259846  T
Q  622 tcattggtggctcggtggttttctcatctgattttttgaaagaaatttcagatagaggactaatagcaagttggtgtccacaagagaaagtattgaacca 721  Q
    | |||||||||||  |  |||| |||||||| |||  ||  |||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  4259847 ttattggtggctcctttattttgtcatctgagtttgagagtgaaatttcggatagaggcctaatcgcgagctggtgtccgcaagagcaagtactgaacca 4259946  T
Q  722 cctttcagtcggtggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatatgtgctggagttccaatgttatgttggccat 810  Q
    |  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  4259947 ctcttcagttggtggattcttaactcattgcggatggaactcaaccattgaaagcatttgtgccgaagttccaatgttgtgttggccat 4260035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 450 - 808
Target Start/End: Complemental strand, 4602400 - 4602042
Alignment:
Q  450 tggaaagaagatactaaatgtcttgaatggcttgaatcaaaagaaccaagatctgttgtttatgtaaattttggcagcatcactgttatgtctcgagaga 549  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || || ||  |||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||| | |   |      
T  4602400 tggaaagaagatactgagtgtcttgaatggcttgaatccaaggagccgggatccgttgtttatgtgaattttggcagcattacagttatgacaccccatc 4602301  T
Q  550 agctcgtagagtttgcttggggtttggccaacagcaaaaaaccctttttgtggatcattaggcctgatcttgtcattggtggctcggtggttttctcatc 649  Q
    |  |  |||| || |||||||||||||||||  || | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||    
T  4602300 aattattagaattcgcttggggtttggccaattgccataaaccatttttgtggatcattaggcctgatcttgtcattggtggctcagtgattttgtcatc 4602201  T
Q  650 tgattttttgaaagaaatttcagatagaggactaatagcaagttggtgtccacaagagaaagtattgaaccacctttcagtcggtggattcttgactcat 749  Q
    ||| |||   || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||| |||||||||||||||    
T  4602200 tgagtttacaaatgaaatttcagatagaggcctaatagcaagttggtgtccacaagagaaagtgttgaaccacccttcgatcggcggattcttgactcat 4602101  T
Q  750 tgcggatggaactcaaccactgaaagcatatgtgctggagttccaatgttatgttggcc 808  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  4602100 tgtggatggaactcaaccactgaaagcatatgtgctggagtgccgatgttgtgttggcc 4602042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 167; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 432 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 4617651 - 4617273
Alignment:
Q  432 tctttagactctaatctttggaaagaagatactaaatgtcttgaatggcttgaatcaaaagaaccaagatctgttgtttatgtaaattttggcagcatca 531  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||| || || ||  |||| ||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  4617651 tctttagattccaacctttggaaagaagatacagagtgtcttgattggcttgaatccaaggagccgggatcagttgtttatgtgaatttcggcagcatta 4617552  T
Q  532 ctgttatgtctcgagagaagctcgtagagtttgcttggggtttggccaacagcaaaaaaccctttttgtggatcattaggcctgatcttgtcattggtgg 631  Q
    | |||||| | |  ||| |  |  | || ||||||||||||||||||||  |||| ||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4617551 cagttatgacacccgagcaattactggaatttgcttggggtttggccaattgcaagaaatcatttttgtggatcataaggcctgatcttgtcattggtgg 4617452  T
Q  632 ctcggtggttttctcatctgattttttgaaagaaatttcagatagaggactaatagcaagttggtgtccacaagagaaagtattgaaccacctttcagtc 731  Q
    ||| ||| ||||||||||||| |||   || |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||    
T  4617451 ctcagtgattttctcatctgagtttacaaatgaaattgcagatagaggcctaatagcaagttggtgtccacaagacaaagtgttgaaccacccttcaatc 4617352  T
Q  732 ggtggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatatgtgctggagttccaatgttatgttggccat 810  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||    
T  4617351 ggaggattcttgactcattgcggatggaattcaaccactgaaagtatatgcgctggagtgccaatgttgtgttggccat 4617273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 160; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 312 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 4592983 - 4592482
Alignment:
Q  312 aatacttcgaatgaacttgagagtgatgttatgaatgctttctattctttgtttccttctctatacacaattggtccattagcttcttttctaaatcaaa 411  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||| || |||||| |||  ||| ||||||||||||| ||| | ||||| || ||| |||| ||  |||| ||||    
T  4592983 aatactttcaatgaacttgagagtgatgtaataaatgctctctcctctatgtttccttctctttaccccattggccctttaccttcattattaaaccaaa 4592884  T
Q  412 gtccacaaa---atgacttgacatctttagactctaatctttggaaagaagatactaaatgtcttgaatggcttgaatcaaaagaaccaagatctgttgt 508  Q
     ||||||||   || | |||   ||||| |  || ||  | ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| || ||| |  | || |||||    
T  4592883 ctccacaaatccatcaattggattcttttggttccaacatatggaaagaagatactgagtgtcttaaatggcttgaatcgaaggaatcgggttccgttgt 4592784  T
Q  509 ttatgtaaattttggcagcatcactgttatgtctcgagagaagctcgtagagtttgcttggggtttggccaacagcaaaaaaccctttttgtggatcatt 608  Q
    |||||| ||||| |||||| | || ||||||  |  ||||||  |  |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||    
T  4592783 ttatgtgaatttcggcagccttacagttatgaatgaagagaaaatgttagagtttgcttggggtttggccaattgcaataaaccttttttgtggatcatt 4592684  T
Q  609 aggcctgatcttgtcattggtggctcggtggttttctcatctgattttttgaaagaaatttcagatagaggactaatagcaagttggtgtccacaagaga 708  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  | ||||| ||||| || ||| |||| |||||||||||||||||  |||| || || |||||||| ||||||     
T  4592683 aggcctgatcttgtcattggtggcacaattgttttgtcatcggagtttgtgaatgaaatttcagatagaggcgtaatcgcgagctggtgtcctcaagagc 4592584  T
Q  709 aagtattgaaccacctttcagtcggtggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatatgtgctggagttccaatgttatgttggcc 808  Q
    ||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  4592583 aagtattaaaccacccttcaattggtggattcttgactcattgtggatggaactcaaccactgaaagtatatgtgctggaattccaatgttgtgttggcc 4592484  T
Q  809 at 810  Q
    ||    
T  4592483 at 4592482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 312 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 4622889 - 4622393
Alignment:
Q  312 aatacttcgaatgaacttgagagtgatgttatgaatgctttctattctttgtttccttctctatacacaattggtccattagcttcttttctaaatcaaa 411  Q
    |||||||  ||||||||||||| |||||  ||||||||  |||||||  |||| || ||| | || ||  |||| || ||| |||| ||  |||||||||    
T  4622889 aatacttataatgaacttgagactgatgcgatgaatgcgctctattcaatgttcccatctttgtataccgttggacctttaccttcattattaaatcaaa 4622790  T
Q  412 gtccacaaaatgacttgacatctttagactctaatctttggaaagaagatactaaatgtcttgaatggcttgaatcaaaagaaccaagatctgttgttta 511  Q
     |||||| ||| ||||| ||||| |||  || |||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||| || |||||  || || |||||||    
T  4622789 ctccacataatcacttggcatctctaggttccaatctttggaaagaagatatcaagtgtcttgagtggcttgaatccaaggaacct-ga-ctcttgttta 4622692  T
Q  512 tgtaaattttggcagcatcactgttatgtctcgagagaagctcgtagagtttgcttggggtttggccaacagcaaaaaaccctttttgtggatcattagg 611  Q
     || |||||||||||||| || || ||| |||||||  | ||  ||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4622691 cgtgaattttggcagcattacagtgatgactcgagatcaactattagagtttgcttggggtttggctgatagcaagaaaccctttttgtggatcattagg 4622592  T
Q  612 cctgatcttgtcattggtggctcggtggttttctcatctgattttttgaaagaaatttcagatagaggactaatagcaagttggtgtccacaagagaaag 711  Q
    ||||| |||||||| || |||||| |  |||| |||||||| |||  ||| |||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| |||    
T  4622591 cctgaccttgtcatgggcggctcgtttattttgtcatctgagtttgagaatgaaatttcaggtagaggcctaatcgcaggttggtgtccacaagaggaag 4622492  T
Q  712 tattgaaccacctttcagtcggtggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatatgtgctggagttccaatgttatgttggccat 810  Q
    || | ||||||| | || | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  4622491 tacttaaccaccctgcaattggtggattcttgactcattgtggatggaattcaaccaccgaaagcatatgtgctggagtttcaatgctgtgttggccat 4622393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 444 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 4557742 - 4557376
Alignment:
Q  444 aatctttggaaagaagatactaaatgtcttgaatggcttgaatcaaaagaaccaagatctgttgtttatgtaaattttggcagcatcactgttatgtctc 543  Q
    |||||||||||||||||||  || |||||||  ||||||||||| || ||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||| |      
T  4557742 aatctttggaaagaagataacaagtgtcttggttggcttgaatccaaggaaccgaggtccgttgtttatgtgaattttgggagcatgacagttatgacgg 4557643  T
Q  544 gagagaagctcgtagagtttgcttggggtttggccaacagcaaaaaaccctttttgtggatcattaggcctgatcttgtcattggtggctcggtggtttt 643  Q
     ||| || ||  |||||||||| |||||||| || || |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||    
T  4557642 cagaaaaactgttagagtttgcatggggtttagcaaatagcaagcaaccctttttgtggatcattaggcccgatcttgtcatcggtggctcagttgtttt 4557543  T
Q  644 ctcatctgattttttgaaagaaatttcagatagaggactaatagcaagttggtgtccacaagagaaagtattgaaccacctttcagtcggtggattcttg 743  Q
     ||||| || ||| | || ||||||||||||||||| ||||| ||  | ||||| || |||||| ||||||| ||||| | |||| | ||||||||||||    
T  4557542 gtcatcggagtttgtcaatgaaatttcagatagaggcctaatcgcgggctggtgcccgcaagagcaagtattaaaccatccttcaattggtggattcttg 4557443  T
Q  744 actcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatatgtgctggagttccaatgttatgttggccat 810  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4557442 actcattgtggatggaactcaaccactgaaagcatatctgctggagttccaatgttgtgttggccat 4557376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 444 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 4571589 - 4571223
Alignment:
Q  444 aatctttggaaagaagatactaaatgtcttgaatggcttgaatcaaaagaaccaagatctgttgtttatgtaaattttggcagcatcactgttatgtctc 543  Q
    |||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||  || |||||| ||     
T  4571589 aatctttggaaagaagataacaagtgtcttgattggcttgaatcaaaggaaccgaggtccgttgtttatgtgaattttgggagcaggacagttatgactt 4571490  T
Q  544 gagagaagctcgtagagtttgcttggggtttggccaacagcaaaaaaccctttttgtggatcattaggcctgatcttgtcattggtggctcggtggtttt 643  Q
     ||| || ||  |||||||||| |||||||| || || |||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  4571489 cagaaaaactgttagagtttgcatggggtttagcaaatagcaagcaactctttttgtggatcattaggcccgatcttgtcattggtggctcagttgtttt 4571390  T
Q  644 ctcatctgattttttgaaagaaatttcagatagaggactaatagcaagttggtgtccacaagagaaagtattgaaccacctttcagtcggtggattcttg 743  Q
     ||||| || ||| |||| ||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||  | |||||||||||||||||||| | |||| | ||||| ||||||    
T  4571389 gtcatcggagtttgtgaatgaaatttcagatagaggcctaattgctggttggtgctcgcaagagaaagtattgaaccatccttcaattggtggtttcttg 4571290  T
Q  744 actcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatatgtgctggagttccaatgttatgttggccat 810  Q
    ||||| || |||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||    
T  4571289 actcactgtggatggaactcaacgaccgaaagcatatctactggagttccaatgttgtgttagccat 4571223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 140; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 403 - 810
Target Start/End: Original strand, 4256098 - 4256492
Alignment:
Q  403 taaatcaaagtccacaaaatgacttgacatctttagactctaatctttggaaagaagatactaaatgtcttgaatggcttgaatcaaaagaaccaagatc 502  Q
    ||||||||| |||||| | | ||||| |||| ||||  || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||    ||    
T  4256098 taaatcaaactccacatagtcacttggcatcgttaggttccaatctttggaaagaagataccaagtgtcttgaatggcttgaatccaaggaacctgagtc 4256197  T
Q  503 tgttgtttatgtaaattttggcagcatcactgttatgtctcgagagaagctcgtagagtttgcttggggtttggccaacagcaaaaaaccctttttgtgg 602  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| || |||||| ||| |||  | ||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||     
T  4256198 tgttgtttacgtgaattttggcagcattacagttatgactccagatcaactgttagagtttgcttggggattggccaatagcaagaaaccatttttgtgt 4256297  T
Q  603 atcattaggcctgatcttgtcattggtggctcggtggttttctcatctgattttttgaaagaaatttcagatagaggactaatagcaagttggtgtccac 702  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||  |  |||| |||||||             | |||| |||||||||||||| |  ||||||||||| |    
T  4256298 atcattaggcctgacctcgtcattggtggctcctttattttgtcatctg-------------agtttcggatagaggactaatcgagagttggtgtccgc 4256384  T
Q  703 aagagaaagtattgaaccacctttcagtcggtggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatatgtgctggagttccaatgttatg 802  Q
    ||||| ||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  4256385 aagagcaagtactgaaccactcttcagttggtggattcttgactcattgaggatggaactcaaccattgaaagcatttgtgccggagttccaatgttgtg 4256484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 556 - 808
Target Start/End: Complemental strand, 4568561 - 4568309
Alignment:
Q  556 tagagtttgcttggggtttggccaacagcaaaaaaccctttttgtggatcattaggcctgatcttgtcattggtggctcggtggttttctcatctgattt 655  Q
    |||||||  |||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||  |||| ||||| || ||    
T  4568561 tagagttctcttgaggttttgccaacagcaagaaaccttttttgtggatcattaggccttagcttgtcattggtggctcagttattttgtcatccgagtt 4568462  T
Q  656 tttgaaagaaatttcagatagaggactaatagcaagttggtgtccacaagagaaagtattgaaccacctttcagtcggtggattcttgactcattgcgga 755  Q
    | |||| | || ||| |||||||| | ||||||||| |||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||| |||    
T  4568461 tgtgaatggaacttcggatagaggccaaatagcaagctggtgtccgcaagagcaagtgttgaaccacccttcagttggacgattcttgactcattgtgga 4568362  T
Q  756 tggaactcaaccactgaaagcatatgtgctggagttccaatgttatgttggcc 808  Q
    |||||||| ||    |||||||| |||||  |||| |||||||||||||||||    
T  4568361 tggaactccacattggaaagcatttgtgccagagtaccaatgttatgttggcc 4568309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 670 - 808
Target Start/End: Complemental strand, 4493346 - 4493208
Alignment:
Q  670 cagatagaggactaatagcaagttggtgtccacaagagaaagtattgaaccacctttcagtcggtggattcttgactcattgcggatggaactcaaccac 769  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  4493346 cagatagaggcctaattgctagttggtgtccacaagagaaactgctgaaccaccattcgattggtggattcttgactcattgtggatggaactcaactac 4493247  T
Q  770 tgaaagcatatgtgctggagttccaatgttatgttggcc 808  Q
      ||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  4493246 caaaaacatatgtgccggagtgccaatgttgtgttggcc 4493208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 269 - 350
Target Start/End: Original strand, 4503725 - 4503806
Alignment:
Q  269 tgaagtggcagataaatgtcatagagcttctggtatgctattcaatacttcgaatgaacttgagagtgatgttatgaatgct 350  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || |  ||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4503725 tgaagtggcagataaatgtcaaagagcctcagccattgttttcaatacttctaatgaacttgagagtgatgctatgaatgct 4503806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 119 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 4517263 - 4517171
Alignment:
Q  119 attatgacatgcagatgagagtgatctaacaaatgaatatttggacacaaaaattgactggatcccaggtttgaaaaacttcagattgaagga 211  Q
    ||||||| |||||||||||||| || | ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||  |||||| ||| | |||||    
T  4517263 attatgatatgcagatgagagttatttgacaaatggatatttggacactaaagttgactggattccaggtttgggaaactttagactaaagga 4517171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 127 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 4593168 - 4593096
Alignment:
Q  127 atgcagatgagagtgatctaacaaatgaatatttggacacaaaaattgactggatcccaggtttgaaaaactt 199  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || ||| | || ||||| |||||||||||||||||    
T  4593168 atgcagatgagagttatctaacaaatggatatttggaaactaaagtagattggattccaggtttgaaaaactt 4593096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 687 - 798
Target Start/End: Original strand, 4391885 - 4391996
Alignment:
Q  687 gcaagttggtgtccacaagagaaagtattgaaccacctttcagtcggtggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatatgtgctg 786  Q
    ||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||| || | |  |||||||||| || ||||| ||||| |||||| ||| ||||||||| ||| ||     
T  4391885 gcaagatggtgtccgaaagagcaagtattgaaccacccttgaatttgtggattcttaacgcattgtggatgaaactcacccattgaaagcatttgttcta 4391984  T
Q  787 gagttccaatgt 798  Q
    ||||||||||||    
T  4391985 gagttccaatgt 4391996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 120 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 4602733 - 4602654
Alignment:
Q  120 ttatgacatgcagatgagagtgatctaacaaatgaatatttggacacaaaaattgactggatcccaggtttgaaaaactt 199  Q
    |||||| |||||||||| ||| |||||||||||| || |||||| |||||| | || ||||| |||||||||||||||||    
T  4602733 ttatgatatgcagatgatagttatctaacaaatggatgtttggaaacaaaagtagattggattccaggtttgaaaaactt 4602654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 120 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 4617966 - 4617887
Alignment:
Q  120 ttatgacatgcagatgagagtgatctaacaaatgaatatttggacacaaaaattgactggatcccaggtttgaaaaactt 199  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||| || |||||| || ||| | || ||||| || ||||||||||||||    
T  4617966 ttatgatatgcagatgagagttatctaacaaatggatgtttggaaactaaagtagattggattcccggtttgaaaaactt 4617887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 445 - 485
Target Start/End: Original strand, 4835531 - 4835571
Alignment:
Q  445 atctttggaaagaagatactaaatgtcttgaatggcttgaa 485  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4835531 atctttggaaggaagatacaaaatgtcttgaatggcttgaa 4835571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 103 - 181
Target Start/End: Original strand, 4503643 - 4503721
Alignment:
Q  103 gctattgatttttgcaattatgacatgcagatgagagtgatctaacaaatgaatatttggacacaaaaattgactggat 181  Q
    |||||||| |||||||||| ||  || ||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||  ||| ||||||||||    
T  4503643 gctattgagttttgcaattgtgttatacagatgagagttatctaacagatggaaatttggacagtaaagttgactggat 4503721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 340; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 112 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 24103951 - 24103250
Alignment:
Q  112 ttttgcaattatgacatgcagatgagagtgatctaacaaatgaatatttggacacaaaaattga---ctggatcccaggtttgaaaaacttcagattgaa 208  Q
    |||||||||| | | |||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||  ||| |||    | |||| ||||||||| | ||||| || |||||    
T  24103951 ttttgcaattgtaatatgcagatgagagttatctaacaaatggatatttagacaataaagttggtggcaggattccaggtttgcataactttaggttgaa 24103852  T
Q  209 ggatcttcctaggttaataaagacaaaaaatcctaatgacttgacgataagatttaacactgaagtggcagataaatgtcatagagcttctggtatgcta 308  Q
    ||| ||||||   || | || ||  | | |||||||||| |||| ||||| |||||  || |||||||| |  | |||||| ||||| |||  |||  |     
T  24103851 ggaccttcctgattttacaaggattacagatcctaatgatttgatgataaaatttattaccgaagtggcggtaagatgtcacagagcctcttctattgtt 24103752  T
Q  309 ttcaatacttcgaatgaacttgagagtgatgttatgaatgctttctattctttgtttccttctctatacacaattggtccattagcttcttttctaaatc 408  Q
     ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| |||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  24103751 atcaatacttcatatgaacttgagagtgatgttatgaatgctctctactctatgttcccttctatatacaccattggcccatttgcttcttttttaaatc 24103652  T
Q  409 aaagtccacaaaatgacttgacatctttagactctaatctttggaaagaagatactaaatgtcttgaatggcttgaatcaaaagaaccaagatctgttgt 508  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24103651 aaagtccacaaaatcacttggcatctttaaattccaatctttggaaagaagatactaaatgtcttgagtggcttgaatcaaaagaaccaagatcagttgt 24103552  T
Q  509 ttatgtaaattttggcagcatcactgttatgtctcgagagaagctcgtagagtttgcttggggtttggccaacagcaaaaaaccctttttgtggatcatt 608  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||    
T  24103551 ttatgtaaattttggtagcatcacagttatgtcacgagagaagctcttagagtttgcttggggtttggccaatagcaagaacccttttttgtggataatt 24103452  T
Q  609 aggcctgatcttgtcattggtggctcggtggttttctcatctgattttttgaaagaaatttcagatagaggactaatagcaagttggtgtccacaagaga 708  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24103451 aggcctgatcttgtcattgggggctcagttgttttgtcatctgatttttttaaagaagtttcagatagaggactaatagcaagttggtgtccacaagata 24103352  T
Q  709 aagtattgaaccacctttcagtcggtggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatatgtgctggagttccaatgttatgttggcc 808  Q
    |||| || ||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  24103351 aagtgttaaaccacccttcgattggtggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatatgtgctggagtgccaatgttgtgttggcc 24103252  T
Q  809 at 810  Q
    ||    
T  24103251 at 24103250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 583 - 806
Target Start/End: Original strand, 27999753 - 27999976
Alignment:
Q  583 gcaaaaaaccctttttgtggatcattaggcctgatcttgtcattggtggctcggtggttttctcatctgattttttgaaagaaatttcagatagaggact 682  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||    
T  27999753 gcaagaaaccttttttgtggatcactaggcctaatcttgtcattggtggctcagtggttttgtcatctgagtttaggaaagaaatttcagatagaggcct 27999852  T
Q  683 aatagcaagttggtgtccacaagagaaagtattgaaccacctttcagtcggtggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatatgt 782  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || | || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  27999853 aatatcaaattggtgtccacaagagaaagttttgaaccacccttcaatcagcgggttcttgactcactgcggatggaactcaaccaccgaaagcatatgc 27999952  T
Q  783 gctggagttccaatgttatgttgg 806  Q
    |||||||| |||||||| ||||||    
T  27999953 gctggagtgccaatgttgtgttgg 27999976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 4)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 103 - 810
Target Start/End: Original strand, 20863017 - 20863724
Alignment:
Q  103 gctattgatttttgcaattatgacatgcagatgagagtgatctaacaaatgaatatttggacacaaaaattgactggatcccaggtttgaaaaacttcag 202  Q
    |||| ||| ||||| | |||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || ||| ||||  |||| |||||||||  ||| |||||    
T  20863017 gctactgacttttggagttatgatatacagatgagagttatctaacaaatggatatttggagactaaagttgatcggattccaggtttgcgaaatttcag 20863116  T
Q  203 attgaaggatcttcctaggttaataaagacaaaaaatcctaatgacttgacgataagatttaacactgaagtggcagataaatgtcatagagcttctggt 302  Q
    | |||||||  ||| ||  |  |||| ||||| |||||||||||| | |  ||||  ||||  || |||||| | ||||| || ||| ||||| |||| |    
T  20863117 actgaaggactttcttacttgcataaggacaacaaatcctaatgattcgttgatagaatttctcattgaagtagtagatagatttcacagagcctctgct 20863216  T
Q  303 atgctattcaatacttcgaatgaacttgagagtgatgttatgaatgctttctattctttgtttccttctctatacacaattggtccattagcttcttttc 402  Q
    ||  | ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| || || | |||||||     
T  20863217 attgttttcaatactttcaatgagcttgagagtgatgttatgaatgttctctattctatgttcccttctctatacaccattggcccttttgtttcttttt 20863316  T
Q  403 taaatcaaagtccacaaaatgacttgacatctttagactctaatctttggaaagaagatactaaatgtcttgaatggcttgaatcaaaagaaccaagatc 502  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||| || | ||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||    
T  20863317 taaatcaaagtccacagaatcacttggcgtctttagattcaagtctttggaaagaagacactgaatgtcttgcatggcttgaatcgaaagaaccgggatc 20863416  T
Q  503 tgttgtttatgtaaattttggcagcatcactgttatgtctcgagagaagctcgtagagtttgcttggggtttggccaacagcaaaaaaccctttttgtgg 602  Q
    | |||| ||||||||||||||||| | ||| || ||||||  ||| ||  |  |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20863417 tattgtatatgtaaattttggcagtaccacagtcatgtctgtagaaaaattgttagagtttgcatggggtttggccaacagcaagaaaccctttttgtgg 20863516  T
Q  603 atcattaggcctgatcttgtcattggtggctcggtggttttctcatctgattttttgaaagaaatttcagatagaggactaatagcaagttggtgtccac 702  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||| |||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  20863517 atcattaggcctgatcttgtcattggtggctcggtgattttttcatctgcgtttgtgaatgaaatttcagatagaggcctaatcgcgagttggtgtccac 20863616  T
Q  703 aagagaaagtattgaaccacctttcagtcggtggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatatgtgctggagttccaatgttatg 802  Q
    ||||||| || |||||||| | |||| | ||||||||  | |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  20863617 aagagaaggtgttgaaccatccttcaattggtggatttctaactcattgtggatggaactcaaccattgagagcatatgtgctggagtgccaatgttgtg 20863716  T
Q  803 ttggccat 810  Q
     |||||||    
T  20863717 ctggccat 20863724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 312 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 1674979 - 1674477
Alignment:
Q  312 aatacttcgaatgaacttgagagtgatgttatgaatgctttc-tattctttgtttccttctctatacacaattggtccattagcttcttttctaaatcaa 410  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||| || |  ||| || |  ||||||||||||||||| ||| | ||||| || ||| |||| ||  |||| |||    
T  1674979 aatactttcaatgaacttgagagtgatgtaataaccgctctcctcctctttgtttccttctctttaccccattggccctttaccttcattattaaaccaa 1674880  T
Q  411 agtccacaaa---atgacttgacatctttagactctaatctttggaaagaagatactaaatgtcttgaatggcttgaatcaaaagaaccaagatctgttg 507  Q
    | ||||||||   || | ||   ||||||||  || || |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || |||||  |||| ||||    
T  1674879 actccacaaattcatcaattagaatctttaggttccaacctttggaaagaagatactgagtgtcttgaatggcttgaatccaacgaaccgggatcggttg 1674780  T
Q  508 tttatgtaaattttggcagcatcactgttatgtctcgagagaagctcgtagagtttgcttggggtttggccaacagcaaaaaaccctttttgtggatcat 607  Q
    ||||||| ||||| || ||||| | ||||||| ||| |||  | ||  | ||||||||||||||||||||| |  |||| ||||| |||||||||||||     
T  1674779 tttatgtgaatttcggtagcattattgttatgactccagatcaactattggagtttgcttggggtttggccgattgcaagaaaccttttttgtggatcac 1674680  T
Q  608 taggcctgatcttgtcattggtggctcggtggttttctcatctgattttttgaaagaaatttcagatagaggactaatagcaagttggtgtccacaagag 707  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  1674679 taggcctgatcttgtcattggtggctcagtggttttgtcatctgagtttatgaaagaaatttcagatagaggcctaatatcaaattggtgtccacaagag 1674580  T
Q  708 aaagtattgaaccacctttcagtcggtggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatatgtgctggagttccaatgttatgttggc 807  Q
    ||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  1674579 aaagtgttgaaccacccttcaatcggcggattcttgacacactgcggatggaactcaaccactgaaagcatatgcgctggagtgccaatgttgtgttggc 1674480  T
Q  808 cat 810  Q
    |||    
T  1674479 cat 1674477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 444 - 810
Target Start/End: Original strand, 16685782 - 16686148
Alignment:
Q  444 aatctttggaaagaagatactaaatgtcttgaatggcttgaatcaaaagaaccaagatctgttgtttatgtaaattttggcagcatcactgttatgtctc 543  Q
    |||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||| ||     
T  16685782 aatctttggaaataagataccaagtgtcttgattggcttgaatccaaggaaccgagttccgttgtttatgtgaattttgggagcatgacagttatgactg 16685881  T
Q  544 gagagaagctcgtagagtttgcttggggtttggccaacagcaaaaaaccctttttgtggatcattaggcctgatcttgtcattggtggctcggtggtttt 643  Q
     ||| || ||  |||||||||||||||||||| |||| |||||  |||  |||   |||||||||||| |||||||||||||| | || || ||||||||    
T  16685882 cagaaaaactattagagtttgcttggggtttgaccaatagcaagcaacattttcaatggatcattaggtctgatcttgtcatttgcggttccgtggtttt 16685981  T
Q  644 ctcatctgattttttgaaagaaatttcagatagaggactaatagcaagttggtgtccacaagagaaagtattgaaccacctttcagtcggtggattcttg 743  Q
     |||||||| |||  ||| ||||| ||||||||| | ||||| || || ||||| || |||||| ||||||| ||||| | |||| |||||||||||||     
T  16685982 gtcatctgagtttaagaatgaaatctcagatagaagcctaatcgcgagctggtgcccgcaagagcaagtattaaaccatccttcaatcggtggattctta 16686081  T
Q  744 actcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatatgtgctggagttccaatgttatgttggccat 810  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16686082 actcattgtggatggaactcaaccactgaaagtatatatgctggagttccaatgttgtgttggccat 16686148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 122 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 1675169 - 1675079
Alignment:
Q  122 atgacatgcagatgagagtgatctaacaaatgaatatttggacacaaaaattgactggatcccaggtttgaaaaacttcagattgaaggat 212  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||| | || ||||| |||||||||||||||||  | |||||||||    
T  1675169 atgatatgcagatgagagacatctaacaaatggatatttggaaacaaaagtcgagtggattccaggtttgaaaaactttcggttgaaggat 1675079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 200; Significance: 1e-108; HSPs: 2)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 312 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 1281866 - 1281365
Alignment:
Q  312 aatacttcgaatgaacttgagagtgatgttatgaatgctttctattctttgtttccttctctatacacaattggtccattagcttcttttctaaatcaaa 411  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||| || |||||| |||  ||| |  |||||||| | ||| | ||||| || ||| |||| ||  |||| ||||    
T  1281866 aatactttcaatgaacttgagagtgatgtaataaatgctctctcctctataattccttctgtttacccgattggccctttaccttcattattaaaccaaa 1281767  T
Q  412 gtccacaaa---atgacttgacatctttagactctaatctttggaaagaagatactaaatgtcttgaatggcttgaatcaaaagaaccaagatctgttgt 508  Q
     ||||||||   || | |||   |||||||| || || ||||||||||||||||   | |||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  1281766 ctccacaaattcatcaattggattctttagattccaacctttggaaagaagatatcgagtgtcttcaatggcttgaatcgaaggaaccgagatctgttgt 1281667  T
Q  509 ttatgtaaattttggcagcatcactgttatgtctcgagagaagctcgtagagtttgcttggggtttggccaacagcaaaaaaccctttttgtggatcatt 608  Q
    |||||| ||||| || ||||| || |||||| ||| |||| | ||    || |||||||||||| |||| || ||||| ||||| ||||||||||||| |    
T  1281666 ttatgtgaatttcggaagcattacagttatgactccagagcaacttcaggaatttgcttggggtctggctaatagcaagaaaccatttttgtggatcact 1281567  T
Q  609 aggcctgatcttgtcattggtggctcggtggttttctcatctgattttttgaaagaaatttcagatagaggactaatagcaagttggtgtccacaagaga 708  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||| |||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1281566 aggcctgatcttgtcattggcggctcagtgattttgtcatctgactttgcgaatgaaatttcagatagaggcctaatagcaagttggtgtccacaagaga 1281467  T
Q  709 aagtattgaaccacctttcagtcggtggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatatgtgctggagttccaatgttatgttggcc 808  Q
    |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  1281466 aagtgttgaaccacccttcaatcggtggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatatgtgctggagtgccaatgttgtgttggcc 1281367  T
Q  809 at 810  Q
    ||    
T  1281366 at 1281365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 128 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 1282050 - 1281966
Alignment:
Q  128 tgcagatgagagtgatctaacaaatgaatatttggacacaaaaattgactggatcccaggtttgaaaaacttcagattgaaggat 212  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| | || ||||| |||||||||||||| ||| | |||||||||    
T  1282050 tgcagatgagagttatctaacaaatggatatttggaaacaaaagtagattggattccaggtttgaaaaatttccggttgaaggat 1281966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 322 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 3087159 - 3086671
Alignment:
Q  322 atgaacttgagagtgatgttatgaatgctttctattctttgtttccttctctatacacaattggtccattagcttcttttctaaatcaaagtccacaaaa 421  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||| |||| |||||  |||| || ||||| |||||| ||||  | |||||||||| | |||| ||    
T  3087159 atgaacttgagagtgatgtaatgaatgcgctatattctgtgttcccttcattatataccattggaccattaccttcactactaaatcaaacttcacataa 3087060  T
Q  422 tgacttgacatctttagactctaatctttggaaagaagatactaaatgtcttgaatggcttgaatcaaaagaaccaagatctgttgtttatgtaaatttt 521  Q
    | ||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||     |||||||||||||| | ||||    
T  3087059 tcacttggcatctttaggttccaatctttggaaagaagataccaagtgtcttgaatggcttgaatcaaagggacttgagtctgttgtttatgtgagtttt 3086960  T
Q  522 ggcagcatcactgttatgtctcgagagaagctcgtagagtttgcttggggtttggccaacagcaaaaaaccctttttgtggatcattaggcctgatcttg 621  Q
    |||||||| || |||||| ||| |||| | ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3086959 ggcagcattacagttatgactcaagagcaactattagagtttgcttggggtttggccaatagcaagaaaccatttttgtggatcattaggcctgatcttg 3086860  T
Q  622 tcattggtggctcggtggttttctcatctgattttttgaaagaaatttcagatagaggactaatagcaagttggtgtccacaagagaaagtattgaacca 721  Q
    ||||||| |||||  |  || | |||||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||    
T  3086859 tcattggcggctcctttattatgtcatctgagtttgagaaagaaatttcagatagaggtctaatcgcaagctggtgtccgcaagagcaagtattgaatca 3086760  T
Q  722 cctttcagtcggtggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatatgtgctggagttccaatgttatgttggccat 810  Q
    || |||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||| ||  ||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  3086759 cccttcaattggtggattcttgactcattgtggatggaactcaacggttgaaagcgtacttgctggagtgccaatgttgtgttggccat 3086671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0477 (Bit Score: 171; Significance: 2e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0477
Description:

Target: scaffold0477; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 322 - 810
Target Start/End: Original strand, 4082 - 4567
Alignment:
Q  322 atgaacttgagagtgatgttatgaatgctttctattctttgtttccttctctatacacaattggtccattagcttcttttctaaatcaaagtccacaaaa 421  Q
    ||||||||||||| | |||  |||||||| |||||||| |||| |||||| |||| || ||||| || ||| |||| ||  ||||||||| |||||| ||    
T  4082 atgaacttgagagcggtgtattgaatgctctctattctatgttcccttctttatataccattggacctttaacttcattattaaatcaaactccacataa 4181  T
Q  422 tgacttgacatctttagactctaatctttggaaagaagatactaaatgtcttgaatggcttgaatcaaaagaaccaagatctgttgtttatgtaaatttt 521  Q
    | |||    ||||||||  || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||| || |||||    || ||||||||||| ||||||    
T  4182 tcacta---atctttaggttccaatctttggaaagaagataccaagtgtcttgagtggcttgcatccaaggaacctgagtcggttgtttatgtgaatttt 4278  T
Q  522 ggcagcatcactgttatgtctcgagagaagctcgtagagtttgcttggggtttggccaacagcaaaaaaccctttttgtggatcattaggcctgatcttg 621  Q
    || ||||| || |||||| ||| |||  | ||  ||||||||||||||| |||| ||||  | || ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4279 ggaagcattacagttatgactccagatcaactgttagagtttgcttgggttttgaccaattgtaagaaatcctttttgtggatcattaggcctgaccttg 4378  T
Q  622 tcattggtggctcggtggttttctcatctgattttttgaaagaaatttcagatagaggactaatagcaagttggtgtccacaagagaaagtattgaacca 721  Q
    ||||||| |||||| |  |||| |||||||| |||  ||| ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  4379 tcattggcggctcgtttattttgtcatctgagtttgagaatgaaatttcagatagaggcctaattgcgagctggtgtccacaagagcaagtactgaacca 4478  T
Q  722 cctttcagtcggtggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatatgtgctggagttccaatgttatgttggccat 810  Q
    || |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||    
T  4479 cccttcaattggtggattcttgactcattgcggatggaactcaaccattgaaagcatatgtgtaggagtgccaatgttgtgttggccat 4567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0288 (Bit Score: 163; Significance: 1e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0288
Description:

Target: scaffold0288; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 321 - 810
Target Start/End: Original strand, 3110 - 3600
Alignment:
Q  321 aatgaacttgagagtgatgttatgaatgctttctattctttgtttccttctctatacacaattggtccattagcttcttttctaaatcaaagtccacaaa 420  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||  || | ||| |||| || ||  ||||||  || || |||||| |||| ||  ||| ||||| |||||| |    
T  3110 aatgaacttgagagtgatgtactgaatgcgctccactctatgttcccatcattatacagtatcggaccattaccttcattattaagtcaaactccacata 3209  T
Q  421 atgacttgacatcttt-agactctaatctttggaaagaagatactaaatgtcttgaatggcttgaatcaaaagaaccaagatctgttgtttatgtaaatt 519  Q
    || |||||  |||||| ||  || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || |||||    |||||||||||||| ||||    
T  3210 atcacttggaatcttttaggttccaatctttggaaagaagataccaagtgtcttgaatggctcgaatccaaggaacctgagtctgttgtttatgtgaatt 3309  T
Q  520 ttggcagcatcactgttatgtctcgagagaagctcgtagagtttgcttggggtttggccaacagcaaaaaaccctttttgtggatcattaggcctgatct 619  Q
    | |||||||| || |||||| ||| | |  | ||  |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3310 tcggcagcattacagttatgactccaaatcaactgttagaatttgcttggggtttggccgatagcaagaaaccgtttttgtggatcattaggcctgatct 3409  T
Q  620 tgtcattggtggctcggtggttttctcatctgattttttgaaagaaatttcagatagaggactaatagcaagttggtgtccacaagagaaagtattgaac 719  Q
    ||||||||| |||||| |  |||| ||||| || |||  ||| ||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||| ||||| ||| |    
T  3410 tgtcattggcggctcgtttattttgtcatcagaatttgagaatgaaatttcagatagaggcctaatcacaagctggtgtccacaagagcaagtactgatc 3509  T
Q  720 cacctttcagtcggtggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatatgtgctggagttccaatgttatgttggccat 810  Q
    |||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||||||||    
T  3510 cacccttcaattggtggattcttgactcattgtggatggaattcaaccactgaaagcatatgcgctggagtaccaatgctttgttggccat 3600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0475 (Bit Score: 56; Significance: 9e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0475
Description:

Target: scaffold0475; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 687 - 810
Target Start/End: Original strand, 3443 - 3565
Alignment:
Q  687 gcaagttggtgtccacaagagaaagtattgaaccacctttcagtcggtggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatatgtgctg 786  Q
    ||||| ||||||||  ||||| |||| |||||||||| || ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||    
T  3443 gcaagatggtgtccgtaagagcaagtgttgaaccaccctt-agttggtggattcttaactcattgtggatggaactcaaccattgaaagcatttgttctg 3541  T
Q  787 gagttccaatgttatgttggccat 810  Q
    ||||||||||| |  |||||||||    
T  3542 gagttccaatgctgcgttggccat 3565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0475; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 582 - 628
Target Start/End: Original strand, 3162 - 3208
Alignment:
Q  582 agcaaaaaaccctttttgtggatcattaggcctgatcttgtcattgg 628  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  3162 agcaagaaaccctttgtgtggatcattaggtctgaccttgtcattgg 3208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0199
Description:

Target: scaffold0199; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 312 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 216 - 4
Alignment:
Q  312 aatacttcgaatgaacttgagagtgatgttatgaatgctttc-tattctttgtttccttctctatacacaattggtccattagcttcttttctaaatcaa 410  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||| || |  ||| || |  ||||||||||||||||| ||| | ||||| || ||| |||| ||  |||| |||    
T  216 aatactttcaatgaacttgagagtgatgtaataaccgctctcctcctctttgtttccttctctttaccccattggccctttaccttcattattaaaccaa 117  T
Q  411 agtccacaaa---atgacttgacatctttagactctaatctttggaaagaagatactaaatgtcttgaatggcttgaatcaaaagaaccaagatctgttg 507  Q
    | ||||||||   || | ||   ||||||||  || || |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || |||||  |||| ||||    
T  116 actccacaaattcatcaattagaatctttaggttccaacctttggaaagaagatactgagtgtcttgaatggcttgaatccaacgaaccgggatcggttg 17  T
Q  508 tttatgtaaattt 520  Q
    ||||||| |||||    
T  16 tttatgtgaattt 4  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 122 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 406 - 316
Alignment:
Q  122 atgacatgcagatgagagtgatctaacaaatgaatatttggacacaaaaattgactggatcccaggtttgaaaaacttcagattgaaggat 212  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||| | || ||||| |||||||||||||||||  | |||||||||    
T  406 atgatatgcagatgagagacatctaacaaatggatatttggaaacaaaagtcgagtggattccaggtttgaaaaactttcggttgaaggat 316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 671 - 712
Target Start/End: Original strand, 1351057 - 1351098
Alignment:
Q  671 agatagaggactaatagcaagttggtgtccacaagagaaagt 712  Q
    ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  1351057 agatagaggactaatggtaggttggtgtccacaagagaaagt 1351098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University