View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5921_low_60 (Length: 289)

Name: NF5921_low_60
Description: NF5921
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5921_low_60
NF5921_low_60
[»] chr1 (51 HSPs)
chr1 (10-289)||(49740946-49741226)
chr1 (24-288)||(16433113-16433379)
chr1 (77-289)||(12494880-12495099)
chr1 (125-288)||(9982945-9983108)
chr1 (117-284)||(34673329-34673496)
chr1 (80-284)||(29871288-29871499)
chr1 (10-289)||(44615395-44615695)
chr1 (10-289)||(44792874-44793174)
chr1 (149-288)||(35936896-35937035)
chr1 (10-288)||(49250693-49250992)
chr1 (40-288)||(3627947-3628206)
chr1 (85-289)||(17134816-17135028)
chr1 (85-289)||(18354088-18354300)
chr1 (85-289)||(45866193-45866405)
chr1 (117-288)||(28297803-28297976)
chr1 (85-288)||(29936286-29936497)
chr1 (10-288)||(36187140-36187439)
chr1 (125-288)||(40087518-40087682)
chr1 (117-288)||(23966742-23966915)
chr1 (13-288)||(51421728-51422024)
chr1 (10-288)||(34610943-34611242)
chr1 (117-288)||(42439717-42439889)
chr1 (117-287)||(24236808-24236979)
chr1 (117-289)||(17092006-17092179)
chr1 (85-288)||(19572520-19572730)
chr1 (143-288)||(20774502-20774649)
chr1 (10-288)||(5180915-5181208)
chr1 (85-281)||(16408823-16409023)
chr1 (148-288)||(42707908-42708049)
chr1 (117-288)||(50426708-50426874)
chr1 (200-288)||(44632266-44632354)
chr1 (117-216)||(13390356-13390455)
chr1 (85-216)||(23490779-23490917)
chr1 (171-288)||(34060121-34060238)
chr1 (10-280)||(24710736-24711016)
chr1 (145-258)||(2514668-2514782)
chr1 (142-288)||(39616173-39616320)
chr1 (200-287)||(13020559-13020647)
chr1 (125-167)||(16903515-16903557)
chr1 (10-87)||(24236681-24236759)
chr1 (10-83)||(40087384-40087458)
chr1 (129-174)||(41477011-41477056)
chr1 (10-77)||(29936523-29936591)
chr1 (10-83)||(20774661-20774735)
chr1 (230-280)||(23493497-23493547)
chr1 (40-124)||(2581612-2581697)
chr1 (127-168)||(8880439-8880480)
chr1 (125-166)||(23058459-23058500)
chr1 (125-174)||(48125738-48125787)
chr1 (80-124)||(10778570-10778614)
chr1 (80-124)||(33293534-33293578)
[»] chr4 (55 HSPs)
chr4 (77-289)||(1724311-1724530)
chr4 (10-288)||(5902541-5902834)
chr4 (88-289)||(26564706-26564914)
chr4 (10-288)||(37348999-37349286)
chr4 (53-288)||(12825439-12825680)
chr4 (120-288)||(19534331-19534499)
chr4 (87-289)||(7985136-7985342)
chr4 (77-289)||(6482036-6482256)
chr4 (85-288)||(44317409-44317621)
chr4 (132-289)||(13770518-13770675)
chr4 (10-288)||(32585363-32585657)
chr4 (85-288)||(48459356-48459567)
chr4 (86-288)||(47550363-47550573)
chr4 (85-288)||(6382281-6382493)
chr4 (10-288)||(43893103-43893401)
chr4 (85-288)||(7608845-7609056)
chr4 (117-289)||(21423735-21423908)
chr4 (119-288)||(31918608-31918779)
chr4 (117-288)||(11122917-11123089)
chr4 (117-284)||(37107291-37107458)
chr4 (85-288)||(31752331-31752542)
chr4 (85-288)||(11027947-11028159)
chr4 (145-284)||(9230164-9230301)
chr4 (169-289)||(425698-425818)
chr4 (117-289)||(42299665-42299837)
chr4 (117-284)||(39046832-39046999)
chr4 (70-288)||(32596178-32596403)
chr4 (117-258)||(55826671-55826814)
chr4 (117-261)||(47239433-47239578)
chr4 (133-289)||(39188390-39188545)
chr4 (154-289)||(42774635-42774771)
chr4 (125-284)||(28695198-28695357)
chr4 (190-283)||(39375160-39375253)
chr4 (142-258)||(13015324-13015446)
chr4 (195-284)||(29755456-29755545)
chr4 (201-283)||(15987372-15987455)
chr4 (224-289)||(53906437-53906502)
chr4 (53-157)||(29527819-29527930)
chr4 (120-198)||(53906356-53906434)
chr4 (176-286)||(4766419-4766531)
chr4 (117-162)||(15987310-15987355)
chr4 (71-157)||(24637199-24637281)
chr4 (125-174)||(42907876-42907925)
chr4 (53-173)||(568408-568523)
chr4 (246-289)||(13015550-13015593)
chr4 (10-79)||(7609074-7609144)
chr4 (10-79)||(11028177-11028247)
chr4 (131-173)||(11172960-11173002)
chr4 (10-83)||(31918479-31918553)
chr4 (10-83)||(53906259-53906333)
chr4 (10-83)||(55826544-55826618)
chr4 (53-173)||(10574396-10574523)
chr4 (71-104)||(11173040-11173073)
chr4 (71-104)||(31782680-31782713)
chr4 (80-124)||(43309530-43309574)
[»] chr3 (55 HSPs)
chr3 (10-289)||(4015964-4016263)
chr3 (77-289)||(4557305-4557524)
chr3 (117-288)||(53631774-53631945)
chr3 (10-288)||(49025550-49025836)
chr3 (117-284)||(54317018-54317185)
chr3 (120-288)||(34119528-34119694)
chr3 (80-284)||(42758248-42758459)
chr3 (85-289)||(48390825-48391036)
chr3 (10-288)||(39655193-39655492)
chr3 (10-288)||(44252616-44252915)
chr3 (10-288)||(44953355-44953654)
chr3 (125-288)||(31126850-31127013)
chr3 (10-288)||(22535761-22536060)
chr3 (85-288)||(44172495-44172706)
chr3 (85-288)||(44179195-44179406)
chr3 (128-288)||(830879-831039)
chr3 (10-288)||(7469698-7469997)
chr3 (10-288)||(49579933-49580232)
chr3 (10-288)||(52572478-52572777)
chr3 (117-288)||(19111605-19111775)
chr3 (133-289)||(30682690-30682846)
chr3 (117-288)||(29284205-29284377)
chr3 (10-288)||(39728540-39728839)
chr3 (145-288)||(41937077-41937220)
chr3 (85-287)||(20086879-20087077)
chr3 (117-261)||(44639170-44639315)
chr3 (125-288)||(29842177-29842341)
chr3 (125-288)||(44106847-44107011)
chr3 (85-288)||(6738413-6738613)
chr3 (85-285)||(34025826-34026034)
chr3 (117-288)||(52198023-52198196)
chr3 (117-287)||(23580698-23580868)
chr3 (136-289)||(10823759-10823913)
chr3 (125-286)||(17146205-17146367)
chr3 (86-289)||(34154286-34154493)
chr3 (86-288)||(43582447-43582656)
chr3 (10-183)||(23546868-23547055)
chr3 (171-288)||(23547073-23547191)
chr3 (10-186)||(48305561-48305757)
chr3 (85-251)||(23154073-23154245)
chr3 (143-211)||(23910317-23910385)
chr3 (77-124)||(30616281-30616328)
chr3 (62-124)||(1337081-1337143)
chr3 (191-288)||(48306657-48306755)
chr3 (77-166)||(10043282-10043378)
chr3 (10-83)||(54317238-54317312)
chr3 (219-284)||(55438829-55438894)
chr3 (10-89)||(10371193-10371273)
chr3 (10-68)||(12369103-12369162)
chr3 (10-83)||(29284430-29284504)
chr3 (10-83)||(29858495-29858569)
chr3 (125-167)||(30904870-30904912)
chr3 (10-83)||(42243481-42243555)
chr3 (188-256)||(1772540-1772608)
chr3 (40-87)||(3385806-3385854)
[»] chr6 (40 HSPs)
chr6 (10-288)||(24602788-24603074)
chr6 (19-288)||(14505956-14506233)
chr6 (135-288)||(14032426-14032579)
chr6 (10-288)||(10188000-10188292)
chr6 (10-289)||(27534552-27534852)
chr6 (119-287)||(30816128-30816299)
chr6 (10-288)||(32853713-32854012)
chr6 (86-288)||(12678103-12678311)
chr6 (87-286)||(24225569-24225776)
chr6 (85-261)||(27738668-27738852)
chr6 (85-288)||(2367195-2367406)
chr6 (53-289)||(7393863-7394106)
chr6 (117-288)||(3483970-3484142)
chr6 (10-288)||(5863303-5863602)
chr6 (53-215)||(32053031-32053206)
chr6 (81-261)||(11762342-11762529)
chr6 (125-286)||(14254830-14254991)
chr6 (117-288)||(10142565-10142737)
chr6 (116-288)||(12141254-12141427)
chr6 (191-288)||(14410954-14411051)
chr6 (191-289)||(14245116-14245214)
chr6 (120-216)||(12309514-12309610)
chr6 (85-198)||(32532500-32532620)
chr6 (77-174)||(13769056-13769160)
chr6 (53-161)||(14410832-14410946)
chr6 (77-154)||(28079696-28079780)
chr6 (10-83)||(31496528-31496602)
chr6 (10-83)||(31501914-31501988)
chr6 (224-288)||(32532433-32532497)
chr6 (10-83)||(30986347-30986421)
chr6 (40-124)||(9402629-9402714)
chr6 (80-124)||(18908934-18908978)
chr6 (85-167)||(15498315-15498404)
chr6 (53-124)||(29199861-29199932)
chr6 (10-83)||(3483843-3483917)
chr6 (10-83)||(12141479-12141553)
chr6 (10-99)||(14034568-14034658)
chr6 (53-106)||(8320771-8320824)
chr6 (125-174)||(29341240-29341289)
chr6 (40-79)||(9442527-9442567)
[»] chr8 (38 HSPs)
chr8 (10-289)||(17469124-17469411)
chr8 (118-289)||(24568808-24568978)
chr8 (80-289)||(1012486-1012703)
chr8 (85-289)||(43113634-43113845)
chr8 (77-288)||(20399461-20399680)
chr8 (120-289)||(34139316-34139485)
chr8 (10-288)||(32302929-32303229)
chr8 (117-288)||(24870071-24870242)
chr8 (117-287)||(24927819-24927990)
chr8 (86-289)||(45235933-45236144)
chr8 (85-288)||(29108830-29109041)
chr8 (53-277)||(14186205-14186432)
chr8 (10-284)||(36131849-36132130)
chr8 (85-288)||(27932282-27932493)
chr8 (142-289)||(28977186-28977334)
chr8 (85-289)||(1063375-1063587)
chr8 (143-288)||(2075907-2076053)
chr8 (188-289)||(35215373-35215474)
chr8 (10-278)||(34776945-34777228)
chr8 (142-288)||(4230791-4230938)
chr8 (125-288)||(34021348-34021509)
chr8 (149-288)||(17220586-17220726)
chr8 (53-124)||(9642327-9642398)
chr8 (195-278)||(29089589-29089672)
chr8 (120-289)||(11255058-11255224)
chr8 (85-288)||(39445584-39445786)
chr8 (224-288)||(40248502-40248566)
chr8 (77-198)||(40248371-40248499)
chr8 (53-167)||(5700347-5700468)
chr8 (10-83)||(4230650-4230724)
chr8 (10-83)||(24928043-24928117)
chr8 (125-167)||(30481476-30481518)
chr8 (10-83)||(5858572-5858646)
chr8 (10-83)||(40248291-40248365)
chr8 (10-81)||(1063609-1063681)
chr8 (130-174)||(9476073-9476117)
chr8 (40-83)||(27932507-27932551)
chr8 (224-288)||(31325134-31325197)
[»] chr2 (35 HSPs)
chr2 (10-288)||(6027821-6028108)
chr2 (120-289)||(31942236-31942405)
chr2 (117-288)||(19104888-19105059)
chr2 (85-288)||(24414140-24414351)
chr2 (10-288)||(30846815-30847115)
chr2 (10-288)||(9632256-9632555)
chr2 (117-288)||(13705408-13705580)
chr2 (117-288)||(14540656-14540823)
chr2 (117-289)||(36128153-36128327)
chr2 (86-289)||(45256692-45256903)
chr2 (93-288)||(10920515-10920711)
chr2 (10-288)||(37999353-37999646)
chr2 (10-288)||(13830606-13830904)
chr2 (145-289)||(16226803-16226946)
chr2 (120-288)||(8915987-8916156)
chr2 (85-288)||(10208438-10208649)
chr2 (86-289)||(12193836-12194047)
chr2 (117-287)||(7314695-7314866)
chr2 (85-288)||(37106569-37106773)
chr2 (117-288)||(42798035-42798208)
chr2 (86-288)||(45115428-45115638)
chr2 (85-288)||(44746117-44746328)
chr2 (195-288)||(37472854-37472948)
chr2 (78-174)||(35248386-35248489)
chr2 (142-289)||(18106162-18106310)
chr2 (238-289)||(37319811-37319862)
chr2 (77-124)||(15546786-15546833)
chr2 (76-174)||(25210362-25210467)
chr2 (10-83)||(12341695-12341769)
chr2 (10-124)||(37472679-37472806)
chr2 (129-174)||(35965320-35965365)
chr2 (77-173)||(38342519-38342622)
chr2 (70-106)||(35409160-35409196)
chr2 (10-83)||(24414052-24414126)
chr2 (10-83)||(36128026-36128100)
[»] chr5 (47 HSPs)
chr5 (10-289)||(12447250-12447536)
chr5 (53-284)||(38006446-38006684)
chr5 (117-288)||(2412774-2412945)
chr5 (61-288)||(2985017-2985251)
chr5 (117-289)||(35194037-35194209)
chr5 (131-286)||(27088414-27088568)
chr5 (142-288)||(3573094-3573240)
chr5 (85-288)||(4582988-4583199)
chr5 (10-288)||(5908609-5908908)
chr5 (10-288)||(4920695-4920994)
chr5 (117-288)||(30115353-30115524)
chr5 (120-287)||(18206888-18207056)
chr5 (117-288)||(1218626-1218796)
chr5 (85-289)||(17853302-17853512)
chr5 (80-288)||(6155924-6156138)
chr5 (117-289)||(28045523-28045696)
chr5 (117-278)||(6092566-6092728)
chr5 (10-288)||(12834495-12834795)
chr5 (93-288)||(35311692-35311894)
chr5 (117-288)||(22694949-22695121)
chr5 (87-288)||(42987490-42987699)
chr5 (85-289)||(15890075-15890286)
chr5 (155-289)||(33862270-33862403)
chr5 (86-288)||(12866561-12866772)
chr5 (10-288)||(40517675-40517974)
chr5 (10-167)||(10127072-10127242)
chr5 (10-288)||(29245872-29246171)
chr5 (117-288)||(30996466-30996637)
chr5 (117-284)||(13402052-13402218)
chr5 (120-288)||(3564778-3564947)
chr5 (133-286)||(42717696-42717849)
chr5 (87-288)||(27302746-27302952)
chr5 (152-284)||(8453457-8453587)
chr5 (171-288)||(20973587-20973705)
chr5 (129-287)||(6369566-6369725)
chr5 (53-124)||(10822503-10822574)
chr5 (142-233)||(33420404-33420494)
chr5 (86-167)||(27900411-27900499)
chr5 (224-288)||(10126977-10127041)
chr5 (145-216)||(15564578-15564649)
chr5 (10-83)||(12866472-12866546)
chr5 (10-83)||(17853214-17853288)
chr5 (10-83)||(20973417-20973491)
chr5 (10-83)||(33727922-33727996)
chr5 (117-154)||(20973544-20973581)
chr5 (10-51)||(27088294-27088335)
chr5 (142-174)||(17153153-17153185)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (77-286)||(33265-33481)
[»] chr7 (67 HSPs)
chr7 (40-284)||(3920417-3920669)
chr7 (80-284)||(5376964-5377175)
chr7 (10-284)||(27850252-27850540)
chr7 (77-289)||(2630574-2630793)
chr7 (77-289)||(12980250-12980470)
chr7 (77-288)||(18825872-18826090)
chr7 (10-280)||(26622834-26623112)
chr7 (10-273)||(26004406-26004675)
chr7 (119-288)||(25782956-25783125)
chr7 (10-288)||(35074343-35074643)
chr7 (10-288)||(7779882-7780181)
chr7 (10-288)||(30650505-30650804)
chr7 (80-289)||(16078887-16079103)
chr7 (10-289)||(17885338-17885638)
chr7 (85-288)||(21702533-21702744)
chr7 (117-288)||(18125275-18125447)
chr7 (125-288)||(46127238-46127398)
chr7 (117-288)||(37579137-37579308)
chr7 (40-288)||(24425256-24425511)
chr7 (85-288)||(45379980-45380192)
chr7 (85-288)||(16866043-16866254)
chr7 (86-288)||(45885774-45885984)
chr7 (85-288)||(39456023-39456232)
chr7 (85-288)||(38139800-38140012)
chr7 (125-261)||(17851755-17851892)
chr7 (142-289)||(37182148-37182296)
chr7 (117-259)||(44658496-44658639)
chr7 (119-288)||(37196047-37196217)
chr7 (127-288)||(44794084-44794246)
chr7 (132-288)||(23328484-23328641)
chr7 (85-288)||(38152776-38152972)
chr7 (117-280)||(25905510-25905674)
chr7 (40-257)||(16811635-16811860)
chr7 (142-288)||(24753050-24753196)
chr7 (119-285)||(44734406-44734573)
chr7 (85-287)||(41103528-41103741)
chr7 (85-216)||(3226954-3227092)
chr7 (200-284)||(5916196-5916280)
chr7 (10-167)||(23475195-23475360)
chr7 (10-288)||(39316869-39317168)
chr7 (154-289)||(44985984-44986118)
chr7 (117-288)||(45708912-45709081)
chr7 (10-198)||(10072431-10072639)
chr7 (85-288)||(41741458-41741668)
chr7 (85-287)||(25979925-25980135)
chr7 (224-284)||(26004675-26004735)
chr7 (10-167)||(23533536-23533700)
chr7 (13-288)||(43507307-43507615)
chr7 (77-162)||(3157084-3157176)
chr7 (40-167)||(19439972-19440107)
chr7 (224-288)||(3227698-3227762)
chr7 (10-83)||(18825786-18825860)
chr7 (10-83)||(24753262-24753336)
chr7 (77-124)||(27896475-27896522)
chr7 (152-198)||(3274761-3274807)
chr7 (226-288)||(10072363-10072425)
chr7 (10-83)||(12980476-12980550)
chr7 (10-83)||(16866268-16866342)
chr7 (10-83)||(25905727-25905801)
chr7 (86-124)||(33841124-33841162)
chr7 (10-83)||(37182373-37182447)
chr7 (10-67)||(37195929-37195987)
chr7 (53-122)||(21750830-21750899)
chr7 (53-106)||(43550393-43550446)
chr7 (80-124)||(10995837-10995881)
chr7 (129-173)||(32546182-32546226)
chr7 (40-83)||(37218104-37218148)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (19-288)||(90467-90750)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (125-288)||(197382-197545)
[»] scaffold0294 (1 HSPs)
scaffold0294 (119-288)||(14645-14814)
[»] scaffold0135 (1 HSPs)
scaffold0135 (145-284)||(36030-36167)
[»] scaffold0027 (2 HSPs)
scaffold0027 (152-289)||(6275-6412)
scaffold0027 (10-75)||(7798-7864)
[»] scaffold0189 (1 HSPs)
scaffold0189 (142-289)||(4125-4274)
[»] scaffold0097 (1 HSPs)
scaffold0097 (142-289)||(33452-33603)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (220-289)||(14295-14364)
[»] scaffold0519 (1 HSPs)
scaffold0519 (120-289)||(10169-10335)
[»] scaffold0795 (1 HSPs)
scaffold0795 (10-83)||(318-391)
[»] scaffold0902 (1 HSPs)
scaffold0902 (220-289)||(754-823)
[»] scaffold1630 (1 HSPs)
scaffold1630 (236-288)||(1492-1544)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 51)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 10 - 289
Target Start/End: Original strand, 49740946 - 49741226
Alignment:
Q  10 aacaaaatccatacccgtggttatccatctgaaccaaactcaatt-gacgggttttcccctttttgactgggtttaggttttccccgatttcaaaacatg 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  49740946 aacaaaatccatacccgtggttatccacttgaaccaaactcaatttgacggattttcccctttttgactgggtttaggttttccccaatttcaaaacatg 49741045  T
Q  109 gatatgggacgggtaaataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgttt 208  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  49741046 gatatgggacgggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgttatgttattttgttt 49741145  T
Q  209 gataattgatgtgttataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtgaa 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  49741146 gataattgatgtgttataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtttaacaaatgttaaagtgaa 49741226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 24 - 288
Target Start/End: Original strand, 16433113 - 16433379
Alignment:
Q  24 ccgtggttatccatctgaaccaaactcaatt-gacgggttttcccctttttgactgggtttaggttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggt 122  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||  |||||| |||||||||||||| || ||||||||||||    
T  16433113 ccgtggttacccatccgaaccaaactcaatttgacggattttccccattttgattgggtttgagttttctccgatttcaaaacacgggtatgggacgggt 16433212  T
Q  123 aa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataatt 215  Q
    ||       ||||||||||   ||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||     
T  16433213 aacggatatataggtaccc---ccgaacccatacccaaacccaccccaaatgcagaaaattactttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataat- 16433308  T
Q  216 gatgtgttataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtga 288  Q
      ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  16433309 --tgtattataaaaactaccattgatatttaaaggagcaactaaatcaattggtctaacaaatattaaagtga 16433379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 77 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 12495099 - 12494880
Alignment:
Q  77 tgggtttaggttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgca 169  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||       ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |    
T  12495099 tgggttttggtttttcccgatttcaaaacacggatatgggacgtgtaacgggtatataggtacccacctcgaacccatacccaaacccgtcccaaatgta 12495000  T
Q  170 gaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgttataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggt 269  Q
    |||||||||| |||||| | ||| ||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  12494999 gaaaactactatatgttgacatgacatgttattttgttttataattggcgtgttataaaaactaccactgatatttaaaggagcaactaaatttatcggt 12494900  T
Q  270 ctaacaaatgttaaagtgaa 289  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  12494899 ctaacaaatgttaaagtgaa 12494880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 125 - 288
Target Start/End: Original strand, 9982945 - 9983108
Alignment:
Q  125 ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgtta 224  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    |||||    
T  9982945 ataggtacccaccccgaacccatacccaaacccatcccgaatgcagaaaattactttatgttaatatatcatgttattttgtttgataattctcatgtta 9983044  T
Q  225 taaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtga 288  Q
    | |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9983045 tcaaaactaccattgatattcaaaggagcaactaaattaatcggtctaacaaatgttaaagtga 9983108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 117 - 284
Target Start/End: Original strand, 34673329 - 34673496
Alignment:
Q  117 acgggtaaataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattg 216  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  34673329 acgggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaacctgttccgaacgaagaaaactactttatgttgatatgccatgttattttgtttgataattg 34673428  T
Q  217 atgtgttataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaa 284  Q
      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  34673429 ccgtgttataaaaactaccattgatatttaaaggagcaactaaatcaaccggtctaacaaatgttaaa 34673496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 80 - 284
Target Start/End: Original strand, 29871288 - 29871499
Alignment:
Q  80 gtttaggttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaa 172  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||       |||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29871288 gtttgggttttctccgatttcaaaacatgggtatgggacaggtaactggtatataggtacccaccctgaactcatacccaaacccgtcccgaatgtagaa 29871387  T
Q  173 aactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgttataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtcta 272  Q
    || || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  29871388 aattattttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattcccatgttataaaaactaccattgatatttaaaggagcaactacatcaatcggtcta 29871487  T
Q  273 acaaatgttaaa 284  Q
    |||||| |||||    
T  29871488 acaaatattaaa 29871499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 289
Target Start/End: Original strand, 44615395 - 44615695
Alignment:
Q  10 aacaaaatccatacccgtggttatccatctgaaccaaactcaatt-gacgggttttcccctttttgactgggtttaggt------------tttccccga 96  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||| |   ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| |||            |||||| ||    
T  44615395 aacaaaacccatacccgtggttacccacccagaccaaactcaatttgacgggtttttcccgttttgactgggtttgggtatgagtttgggttttccctga 44615494  T
Q  97 tttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaa-ctactttatgttaa 188  Q
    ||| |||||| || ||||||||||||||       |||||||||||||||  || |||||||||||||||||| ||| || |||| ||||||||| || |    
T  44615495 tttaaaaacacgggtatgggacgggtaacaggtatataggtacccaccccaaactcatacccaaacccgtcccaaatccaaaaaaactactttatcttga 44615594  T
Q  189 tatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgttataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtga 288  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44615595 tatgccatgttattttgtttgataattgtcgtgttataaaaactattattgatatttaaaggagaaactaaatcaatcggtctaacaaatgttaaagtga 44615694  T
Q  289 a 289  Q
    |    
T  44615695 a 44615695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 44793174 - 44792874
Alignment:
Q  10 aacaaaatccatacccgtggttatccatctgaaccaaactcaatt-gacgggttttcccctttttgactgggtttaggt------------tttccccga 96  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||| |   ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| |||            |||||| ||    
T  44793174 aacaaaacccatacccgtggttacccacccagaccaaactcaatttgacgggtttttcccgttttgactgggtttgggtatgagtttgggttttccctga 44793075  T
Q  97 tttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaa-ctactttatgttaa 188  Q
    ||| |||||| || ||||||||||||||       |||||||||||||||  || |||||||||||||||||| ||| || |||| ||||||||| || |    
T  44793074 tttaaaaacacgggtatgggacgggtaacaggtatataggtacccaccccaaactcatacccaaacccgtcccaaatccaaaaaaactactttatcttga 44792975  T
Q  189 tatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgttataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtga 288  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44792974 tatgccatgttattttgtttgataattgtcgtgttataaaaactattattgatatttaaaggagaaactaaatcaatcggtctaacaaatgttaaagtga 44792875  T
Q  289 a 289  Q
    |    
T  44792874 a 44792874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 149 - 288
Target Start/End: Original strand, 35936896 - 35937035
Alignment:
Q  149 cccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgttataaaaactactattgatatttaaa 248  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||   |||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  35936896 cccaaacccgtcatgaatgtagaaaattactttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataatttccgtgttacaaaaactaccattgatatttaaa 35936995  T
Q  249 ggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtga 288  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  35936996 ggagcaactaaatcaattggtctaacaaatgttaaagtga 35937035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 288
Target Start/End: Original strand, 49250693 - 49250992
Alignment:
Q  10 aacaaaatccatacccgtggttatccatctgaaccaaactcaatt-gacgggttttcccctttttgactgggtttaggt------------tttccccga 96  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  | |||||||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||            |||||||||    
T  49250693 aacaaaattcatacccgtggttatccgcccgaaccaaattcaatttgacgggttttctccgttttgactgggtttgggtatgggtatgagttttccccga 49250792  T
Q  97 tttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaat 189  Q
    | |||||||| || ||||||||||||||       ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| ||    
T  49250793 tctcaaaacacgggtatgggacgggtaatgggtatataggtatccacctcgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaactactttatgttgat 49250892  T
Q  190 atgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgtt-ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtga 288  Q
    |||| |||  |||||||||||||||||   |||| ||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||| | |  ||||||||||||| |||||||    
T  49250893 atgttatgctattttgtttgataattgtcatgttgataaaaactatcattgatatttaaaagatcaactaaattattttgtctaacaaatgtgaaagtga 49250992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 40 - 288
Target Start/End: Original strand, 3627947 - 3628206
Alignment:
Q  40 gaaccaaactcaatt-gacgggttttcccctttttgactgggtttaggttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaaa-------taggta 131  Q
    ||||||||||||||| || | ||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||        ||||||    
T  3627947 gaaccaaactcaatttgatgagtttttcccgttttgactgggtataggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatgtaggta 3628046  T
Q  132 cccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatg--cagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgtt-ataaa 228  Q
    ||||||||| |||||||| ||  || ||||| ||||   | |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    |||| |||||    
T  3628047 cccaccccgaacccatactcattccagtcccaaatgtaaaaaaaattactttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattatcatgttaataaa 3628146  T
Q  229 aactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtga 288  Q
    |||||| ||| |||||||| ||| ||||||||| | |  |||||||||||||||||||||    
T  3628147 aactaccattaatatttaacggatcaactaaatcattacgtctaacaaatgttaaagtga 3628206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 85 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 17135028 - 17134816
Alignment:
Q  85 ggttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaacta 177  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||       |||||||||  ||||| ||||||||||| || ||||||  ||| | |||| ||    
T  17135028 ggttttccccgatttcaaaacacgggtatgagacgggtaacgggtatataggtaccatccccgaacccatacccatactcgtcccatatgtaaaaaatta 17134929  T
Q  178 ctttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgtt-ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaa 276  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||   |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |  |||||||||    
T  17134928 ctttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcatttcgtctaacaa 17134829  T
Q  277 atgttaaagtgaa 289  Q
    |||||||||||||    
T  17134828 atgttaaagtgaa 17134816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 85 - 289
Target Start/End: Original strand, 18354088 - 18354300
Alignment:
Q  85 ggttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaacta 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||       ||| || ||||||||| ||| ||||||| || |||||| |||| | |||| ||    
T  18354088 ggttttccccgatttcaaaacatgggtatgggacgggtaacgggtatataagttcccaccccgaaccgatacccatactcgtcccaaatgtaaaaaatta 18354187  T
Q  178 ctttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgtt-ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaa 276  Q
     |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||   |||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| | || ||||| |||    
T  18354188 ttttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaagatcaactaaatcattccgtctatcaa 18354287  T
Q  277 atgttaaagtgaa 289  Q
    |||||||||||||    
T  18354288 atgttaaagtgaa 18354300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 85 - 289
Target Start/End: Original strand, 45866193 - 45866405
Alignment:
Q  85 ggttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaacta 177  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||       |||||||||||||||  || |||||||| |||| |||| |||| | |||| ||    
T  45866193 ggttttccccgatttcaaaacacgggtatgagacaggtaatgagtatataggtacccaccccaaactcatacccatacccatcccaaatgtaaaaaatta 45866292  T
Q  178 ctttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgtt-ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaa 276  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||    
T  45866293 ctttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattatcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattctgtctaacaa 45866392  T
Q  277 atgttaaagtgaa 289  Q
    |||||||||||||    
T  45866393 atgttaaagtgaa 45866405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 117 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 28297976 - 28297803
Alignment:
Q  117 acgggtaaataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatg-cagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataatt 215  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  | ||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  28297976 acgggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaaactattttatgttgatatgttatgttattttgtttgataatt 28297877  T
Q  216 gatgtgtt-ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtga 288  Q
    |   |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |  ||||||||||||| |||||||    
T  28297876 gtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaattattttgtctaacaaatgtgaaagtga 28297803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 29936497 - 29936286
Alignment:
Q  85 ggttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaacta 177  Q
    ||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||       |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||    
T  29936497 ggttttccccgatctcaaaatacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaatta 29936398  T
Q  178 ctttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgtt-ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaa 276  Q
    ||||||||| |||||| |||| ||||| ||| |||||||   |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |  |||||||||    
T  29936397 ctttatgttgatatgtaatgttatttttttttataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaa 29936298  T
Q  277 atgttaaagtga 288  Q
    |||| |||||||    
T  29936297 atgtgaaagtga 29936286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 288
Target Start/End: Original strand, 36187140 - 36187439
Alignment:
Q  10 aacaaaatccatacccgtggttatccatctgaaccaaactcaatt-gacgggttttcccctttttgactgggtttaggt------------tttccccga 96  Q
    ||||||| |||||||||| |||| ||  | ||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| |||            |||||||||    
T  36187140 aacaaaacccatacccgtcgttacccgcccgaaccaaactcaatttggcgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccga 36187239  T
Q  97 tttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaat 189  Q
    | |||||||| || ||||||||||||||       |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| | |||  || |||||||| ||    
T  36187240 tctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccctgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaagttattttatgttgat 36187339  T
Q  190 atgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgtt-ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtga 288  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||   |||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| | |  ||||||||||||| |||||||    
T  36187340 atgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaatgatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtgaaagtga 36187439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 125 - 288
Target Start/End: Original strand, 40087518 - 40087682
Alignment:
Q  125 ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgtt- 223  Q
    |||||||||||||||| || ||||| || ||||||||| |||| | |||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||   ||||     
T  40087518 ataggtacccaccccgaactcatactcatacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatatcatgttattttgtttgataattgtcatgtta 40087617  T
Q  224 ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtga 288  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||||    
T  40087618 ataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtga 40087682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 117 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 23966915 - 23966742
Alignment:
Q  117 acgggtaaataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaact-actttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataatt 215  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||| |||| | |||| | |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  23966915 acgggtatataggtacccaccccgaacccatactcatacccgtcccaaatgtaaaaaaattactttatgttgatatgttatgttattttgtttgataatt 23966816  T
Q  216 g--atgtgttataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtga 288  Q
    |  |||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||    
T  23966815 gtcatgt-ttataaaaactactattgatatttaaagtatcaactaaatcattccatctaacaaatgttaaagtga 23966742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 51422024 - 51421728
Alignment:
Q  13 aaaatccatacccgtggttatccatctgaaccaaactcaatt-gacgggttttcccctttttgactgggtt------------taggttttccccgattt 99  Q
    |||||||||| ||||||||| ||  | ||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||            | |||||| |||||| |    
T  51422024 aaaatccatatccgtggttacccgcccgaaccaaacccaatttgatgggttttccccattttgactgggtttgggtatgggtatgggtttttcccgatct 51421925  T
Q  100 caaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatg 192  Q
    ||||||| || ||||||||||||||       ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||| |||| |||||| |||||    
T  51421924 caaaacacgggtatgggacgggtaacatgtatatatgtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaattactctatgttgatatg 51421825  T
Q  193 tcatgtcattttgtttgataattgatgtgtt-ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtga 288  Q
    | |||| |||||||||||||||||   |||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| | |  ||||||||||||| |||||||    
T  51421824 ttatgttattttgtttgataattgccatgttaataaaaactaccattgctatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtgaaagtga 51421728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 34611242 - 34610943
Alignment:
Q  10 aacaaaatccatacccgtggttatccatctgaaccaaactcaa-ttgacgggttttcccctttttga------------ctgggtttaggttttccccga 96  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||             ||||| | |||||| |||||    
T  34611242 aacaaaatccatacccgtggttacccgcctgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgattgaatttgggtatgggtatgggtttttcccga 34611143  T
Q  97 tttcaaaacatggatatggg-------acgggtaaataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaat 189  Q
    | |||||||| || ||||||       ||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | || ||||||||||||| ||    
T  34611142 tctcaaaacacgggtatgggacatgtaacgtgtatataggtactcaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaatactactttatgttgat 34611043  T
Q  190 atgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgtt-ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtga 288  Q
    |||| || | |||||||||||||||||   |||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||    
T  34611042 atgttatattattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaagatcaactaaataattttgtctaacaaatgtgaaagtga 34610943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 117 - 288
Target Start/End: Original strand, 42439717 - 42439889
Alignment:
Q  117 acgggtaaataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattg 216  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||| |||| | |||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||    
T  42439717 acgggtatataggtacccaccccgaacccatatccaaactcatcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattg 42439816  T
Q  217 atgtgtt-ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtga 288  Q
       |||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| | |  |||||||||||||||||||||    
T  42439817 tcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgttaaagtga 42439889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 117 - 287
Target Start/End: Original strand, 24236808 - 24236979
Alignment:
Q  117 acgggtaaataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattg 216  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| | |||| || |||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||    
T  24236808 acgggtatataggtacccaccccgaacccatactcaaacccgtcccaaatgtaaaaaattattttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattg 24236907  T
Q  217 atgtgtt-ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtg 287  Q
       |||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| | |  ||||||||||||| ||||||    
T  24236908 tcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtgaaagtg 24236979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 117 - 289
Target Start/End: Original strand, 17092006 - 17092179
Alignment:
Q  117 acgggtaaataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattg 216  Q
    ||||||| ||||| || ||||||| |||||| |||| ||||||||| |||| | |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17092006 acgggtatataggcactcaccccgaacccatgcccatacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattg 17092105  T
Q  217 atgtgtt-ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtgaa 289  Q
       |||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| | ||  ||||| |||||||||||||||    
T  17092106 tcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattccatctaataaatgttaaagtgaa 17092179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 19572520 - 19572730
Alignment:
Q  85 ggttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaacta 177  Q
    |||||| ||||||||||||||| || |||||||| |||||       |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||| |||| | |||| ||    
T  19572520 ggtttttcccgatttcaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatactcatacccgtcccaaatgtaaaaaatta 19572619  T
Q  178 ctttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgtt-ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaa 276  Q
     |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||   |||| ||||||||||| ||||||| || ||||| ||| ||||| | |  |||||||||    
T  19572620 ttttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattgccatgttaataaaaactaccattgata-ttgaaggatcaattaaatcattacgtctaacaa 19572718  T
Q  277 atgttaaagtga 288  Q
    ||||||||||||    
T  19572719 atgttaaagtga 19572730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 143 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 20774649 - 20774502
Alignment:
Q  143 cccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaa-ctactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgtta-taaaaactactattga 240  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | |||| |||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||   ||||| ||||||||  ||||||    
T  20774649 cccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaaactactttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaacttttattga 20774550  T
Q  241 tatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtga 288  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||    
T  20774549 tatttaaaggatcaactaaataattttgtctaacaaatgtgaaagtga 20774502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 5181208 - 5180915
Alignment:
Q  10 aacaaaatccatacccgtggttatccatctgaaccaaactcaatt-gacgggttttcccctttttgactgggtttaggt------------tttccccga 96  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||  | |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||            |||||||||    
T  5181208 aacaaaacccatacccgcggttacccgcccgaaccaaattcaatttgacgggttttccccattttgactgggtttaggtatgggtatgggttttccccga 5181109  T
Q  97 tttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaat 189  Q
    |||||||| | || ||||||||||||||       ||||| |||||||||  ||||||||||      || || |||| | |||| || |||||||| ||    
T  5181108 tttcaaaatacgggtatgggacgggtaacgggtatataggcacccaccccaaacccataccc------gttccaaatgtaaaaaattattttatgttgat 5181015  T
Q  190 atgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgtta-taaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtga 288  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||   ||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |  ||||||||||| |||||||||    
T  5181014 atgtcatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcatttcgtctaacaaattttaaagtga 5180915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 85 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 16409023 - 16408823
Alignment:
Q  85 ggttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaacta 177  Q
    |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||       ||||||||| |||||| ||||||| | |||||||  || |||| | |||| ||    
T  16409023 ggttttccccaatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacaggtatataggtaccgaccccgaacccatagctaaacccgctccaaatgtaaaaaatta 16408924  T
Q  178 ctttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgtta-taaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaa 276  Q
    ||||||||    ||||||||| |||||||||||||||||   ||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||    
T  16408923 ctttatgt----atgtcatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattccgtctaacaa 16408828  T
Q  277 atgtt 281  Q
    |||||    
T  16408827 atgtt 16408823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 148 - 288
Target Start/End: Original strand, 42707908 - 42708049
Alignment:
Q  148 acccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgtta-taaaaactactattgatattta 246  Q
    ||||| ||||||||| |||| | |||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||   ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  42707908 acccatacccgtcccaaatgtaaaaaattattttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatattta 42708007  T
Q  247 aaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtga 288  Q
    ||||| ||||||||| | || |||||||| ||||||||||||    
T  42708008 aaggatcaactaaatcattccgtctaacagatgttaaagtga 42708049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 117 - 288
Target Start/End: Original strand, 50426708 - 50426874
Alignment:
Q  117 acgggtaaataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattg 216  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||      ||||| |||| | |||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50426708 acgggtatataggtacccaccccgaacccataccc------gtcccaaatgtaaaaatttactttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattg 50426801  T
Q  217 atgtgtt-ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtga 288  Q
       |||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| | || |||| ||||||||||||||||    
T  50426802 tcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattccgtcttacaaatgttaaagtga 50426874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 200 - 288
Target Start/End: Original strand, 44632266 - 44632354
Alignment:
Q  200 attttgtttgataattgatgtgttataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtga 288  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  44632266 attttgtttgacaattgtcgtgttataaaaactatcattgatatttaaaggagcaactaaatcaataggtctaacaaatgttaaagtga 44632354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 117 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 13390455 - 13390356
Alignment:
Q  117 acgggtaaataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattg 216  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||| | |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13390455 acgggtatataggtacccaccccgaactcatacccatacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattg 13390356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 85 - 216
Target Start/End: Original strand, 23490779 - 23490917
Alignment:
Q  85 ggttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaacta 177  Q
    ||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||       |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||    
T  23490779 ggttttccccgatctcgaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccataccaaaacccgtcccaaatgtaaaaaacta 23490878  T
Q  178 ctttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattg 216  Q
     |||||||  |||||| |||| |||||||||||||||||    
T  23490879 atttatgtggatatgttatgttattttgtttgataattg 23490917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 171 - 288
Target Start/End: Original strand, 34060121 - 34060238
Alignment:
Q  171 aaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgtta-taaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggt 269  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||   ||||| ||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| | || ||    
T  34060121 aaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaacaaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattccgt 34060219  T
Q  270 ctaacaaatgttaaagtga 288  Q
    |||||||||||||||||||    
T  34060220 ctaacaaatgttaaagtga 34060238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 24711016 - 24710736
Alignment:
Q  10 aacaaaatccatacccgtggttatccatctgaaccaaactcaatt-gacgggttttcccctttttgactgggtttag------------gttttccccga 96  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |            |||||||||||    
T  24711016 aacaaaacccacacccgtgattatccacccgaaccaaattcaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttggatatgagtatgggttttccccga 24710917  T
Q  97 tttcaaaacatggatatgggacgggtaaataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcat 196  Q
    | |||||||| || ||||||||||||||   ||||   |    | |||||||| |||||||||||| |||| | |||| ||||||||||| |||  | ||    
T  24710916 tctcaaaacacgggtatgggacgggtaacg-ggtatatag---gtacccatactcaaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatacattat 24710821  T
Q  197 gtcattttgtttgataattgatgtgtt-ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgt 280  Q
    || |||||||||||||||||   |||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| | |  |||||||||||||    
T  24710820 gttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgt 24710736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 145 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 2514782 - 2514668
Alignment:
Q  145 catacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgtt-aatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgttataaaaactactattgatat 243  Q
    |||||| ||| | |||||||||||| |||| || |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||    
T  2514782 catacctaaatctgtcccgaatgcataaaattattttatgttgaacatgtcatgttattttgtttgataattgccgtgtaataaaaactaccattgatat 2514683  T
Q  244 ttaaaggagcaacta 258  Q
    |||||| || |||||    
T  2514682 ttaaagtagtaacta 2514668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 142 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 39616320 - 39616173
Alignment:
Q  142 acccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgtt-ataaaaactactattga 240  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| | |||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||    |||| ||||||| ||| |||||    
T  39616320 acccatacccatacccgtcccaaatgtaaaaaattattttatgttgatatgtcatgttattttgtttgctaattatcatgttaataaaaattaccattga 39616221  T
Q  241 tatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtga 288  Q
    |||||||| || ||  ||||| | || |||||||| ||||||||||||    
T  39616220 tatttaaatgatcagttaaatcattccgtctaacagatgttaaagtga 39616173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 13020647 - 13020559
Alignment:
Q  200 attttgtttgataattgatgtgtta-taaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtg 287  Q
    |||||||||||||||||   ||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| | || ||||||||||| ||||||||    
T  13020647 attttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaagtatcaactaaatcattccgtctaacaaatattaaagtg 13020559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 16903557 - 16903515
Alignment:
Q  125 ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatg 167  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  16903557 ataggtacccaccccgaactcatacccaaacccgtcccgaatg 16903515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 87
Target Start/End: Original strand, 24236681 - 24236759
Alignment:
Q  10 aacaaaatccatacccgtggttatccatctgaaccaaactcaatt-gacgggttttcccctttttgactgggtttaggt 87  Q
    |||||||  ||||||| |||||| ||  | ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  24236681 aacaaaactcatacccatggttacccgcccgaaccaaactcaatttgacgggtttttcccgttttgactgggtttaggt 24236759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 83
Target Start/End: Original strand, 40087384 - 40087458
Alignment:
Q  10 aacaaaatccatacccgtggttatccatctgaaccaaactcaa-ttgacgggttttcccctttttgactgggttt 83  Q
    |||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  40087384 aacaaaactcatacccgcggttatccgtctgaaccaaattcaatttgacggattttccccgttttgactgagttt 40087458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 129 - 174
Target Start/End: Original strand, 41477011 - 41477056
Alignment:
Q  129 gtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaa 174  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41477011 gtacccaccccgaatccatacccaaacccgtcccgaaagcagaaaa 41477056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 29936591 - 29936523
Alignment:
Q  10 aacaaaatccatacccgtggttatccatctgaaccaaactcaatt-gacgggttttcccctttttgact 77  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||  | ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  29936591 aacaaaacccatacccgtggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgact 29936523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 20774735 - 20774661
Alignment:
Q  10 aacaaaatccatacccgtggttatccatctgaaccaaactcaatt-gacgggttttcccctttttgactgggttt 83  Q
    ||||||| |||||| |||||||| ||  | ||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  20774735 aacaaaacccatactcgtggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacggattttccccgttttgactgggttt 20774661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 230 - 280
Target Start/End: Original strand, 23493497 - 23493547
Alignment:
Q  230 actactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgt 280  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||    
T  23493497 actaccattgatatttaaaggatcaactaaataattttgtctaacaaatgt 23493547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 40 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 2581697 - 2581612
Alignment:
Q  40 gaaccaaactcaatt-gacgggttttcccctttttgactgggtttaggttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaa 124  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |   ||||||||| ||||  |||||| | ||||| ||||||||| || |||||||||||    
T  2581697 gaaccaaactcaatttgacgggtttttcagcttttgactgagtttgagttttctctgattttaaaacatgggtaagggacgggtaa 2581612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 127 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 8880480 - 8880439
Alignment:
Q  127 aggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgc 168  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8880480 aggtatccaccctggacccatacccaaacccgtcccaaatgc 8880439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 23058500 - 23058459
Alignment:
Q  125 ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaat 166  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  23058500 ataggtacccaccccgaacccatacccaaaccctacccgaat 23058459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 174
Target Start/End: Original strand, 48125738 - 48125787
Alignment:
Q  125 ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaa 174  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||||    
T  48125738 ataggtatccaccccgaacccatacccaaactcgtcgcgaatgtagaaaa 48125787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 80 - 124
Target Start/End: Original strand, 10778570 - 10778614
Alignment:
Q  80 gtttaggttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaa 124  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  10778570 gtttaagtttttcccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaa 10778614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 80 - 124
Target Start/End: Original strand, 33293534 - 33293578
Alignment:
Q  80 gtttaggttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaa 124  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  33293534 gtttgggtttttcccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaa 33293578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 170; Significance: 3e-91; HSPs: 55)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 77 - 289
Target Start/End: Original strand, 1724311 - 1724530
Alignment:
Q  77 tgggtttaggttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgca 169  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||       |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1724311 tgggtttgggttttccccgatttcaaaacatgggtatgggacgggtaacggttatataggtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccgaatgca 1724410  T
Q  170 gaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgttataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggt 269  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1724411 gaaaactactttatgttgatatgtcatgttattttgttagataattgatgtgttataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggt 1724510  T
Q  270 ctaacaaatgttaaagtgaa 289  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  1724511 ctaacaaatgttaaagtgaa 1724530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 10 - 288
Target Start/End: Original strand, 5902541 - 5902834
Alignment:
Q  10 aacaaaatccatacccgtggttatccatctgaaccaaactcaatt-gacgggttttcccctttttgactgggtttaggt------tttccccgatttcaa 102  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||      |||||||||| || |    
T  5902541 aacaaaacctatacccgtggttacccgcccgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggttttccccgatctcga 5902640  T
Q  103 aacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtca 195  Q
    |||| || ||||||||||||||       |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| |||||| |    
T  5902641 aacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaactactttatgttgatatgtta 5902740  T
Q  196 tgtcattttgtttgataattgatgtgtt-ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtga 288  Q
    | | |||||||||||||||||   |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||    
T  5902741 tcttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaataattttgtctaacaaatgtgaaagtga 5902834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 88 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 26564914 - 26564706
Alignment:
Q  88 tttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactt 180  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||       |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26564914 tttccccgatttcaaaacgcgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaaaccatacccaaacccgtcccaaatgcagaaaactactt 26564815  T
Q  181 tatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgttataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgt 280  Q
    |||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| |||||||||    
T  26564814 tatgttgatatgtcatgttagtttgtttgataactgccgtgttataaaaactatcattgatatttaacggaacaactaaatcaatcggtcaaacaaatgt 26564715  T
Q  281 taaagtgaa 289  Q
    |||||||||    
T  26564714 taaagtgaa 26564706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 10 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 37349286 - 37348999
Alignment:
Q  10 aacaaaatccatacccgtggttatccatctgaaccaaactcaatt-gacgggttttcccctttttgactgggtttaggt------------tttccccga 96  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||  | ||||||||| ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| |||            |||||||||    
T  37349286 aacaaaacccatacccgtggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacaggttttccccgttttgactgggtttgggtatgagtttgagttttccccga 37349187  T
Q  97 tttcaaaacatggatatgggacgggtaaataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcat 196  Q
    |||||||||| || ||    | ||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||    
T  37349186 tttcaaaacacgggta----atgggtatataggtatccaccctgaacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaattattttatgttgatatgccat 37349091  T
Q  197 gtcattttgtttgataattgatgtgttataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtga 288  Q
    || ||||||||||||||||   | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  37349090 gttattttgtttgataattctcgcgttataaaaactaccgttgatatttaaaggagcaactaaattaatcggtctaacaaatcttaaagtga 37348999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 53 - 288
Target Start/End: Original strand, 12825439 - 12825680
Alignment:
Q  53 ttgacgggttttcccctttttgactgggtttaggttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggaccc 145  Q
    |||||| |||||||| |||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||       ||| |||||||||| | |||     
T  12825439 ttgacgtgttttcccgtttt-gactgagtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacggatatatacgtacccaccctgaacct 12825537  T
Q  146 atacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgttataaaaactactattgatattt 245  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||  ||||||||||    
T  12825538 atacccaaacctgtcccgagtgcagaaaattactttatgttgatatatcatgttattttgtttgataattatcgtgttataaaaactaaaattgatattt 12825637  T
Q  246 aaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtga 288  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||    
T  12825638 aaaggagcaactaaatcaattggtctaataaatattaaagtga 12825680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 120 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 19534499 - 19534331
Alignment:
Q  120 ggtaaataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatg 219  Q
    |||| ||||||||||||| || || |||||||||||||||| |||||| |||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  |    
T  19534499 ggtatataggtacccacctcgaactcatacccaaacccgtcacgaatgtagaaaattattttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattgtcg 19534400  T
Q  220 tgttataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtga 288  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19534399 tgttataaaaactaccattgatatctaaaggagcaactaaatcaatcggtctaacaaatgttaaagtga 19534331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 87 - 289
Target Start/End: Original strand, 7985136 - 7985342
Alignment:
Q  87 ttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaaa---taggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttat 183  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||    || |||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  7985136 ttttctccgatttcaaaacatgggtatgggacggataacatgtatgtactcatcccgaacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaagtattttat 7985235  T
Q  184 gttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgttat-aaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgtta 282  Q
    ||| ||| ||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  7985236 gttgataagtcatgttattttgtttgataattgtcgtgttataaaaaactaccgttgatatttaaatgagcaactaaatcaattggtctaacaaatgtta 7985335  T
Q  283 aagtgaa 289  Q
    |||||||    
T  7985336 aagtgaa 7985342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 77 - 289
Target Start/End: Original strand, 6482036 - 6482256
Alignment:
Q  77 tgggtttaggttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaaa-------taggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgca 169  Q
    ||||||| |||||||||| |||| |||||| || ||||||||| |||||       || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6482036 tgggtttgggttttccccaatttaaaaacacgggtatgggacgagtaaagggtatatatgtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgca 6482135  T
Q  170 gaaaa-ctactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgttataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcgg 268  Q
     |||| ||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  6482136 aaaaaactaatttatattgatatgccatgttattttgtttgataattgtcgtgttataaaaactaacattgatatttaaaggagaaactaaatcaatcgg 6482235  T
Q  269 tctaacaaatgttaaagtgaa 289  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  6482236 tctaacaaatgttaaagtgaa 6482256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 44317621 - 44317409
Alignment:
Q  85 ggttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaa-ct 176  Q
    ||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||       |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||    
T  44317621 ggttttccccgatctcgaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaaact 44317522  T
Q  177 actttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgtta-taaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaaca 275  Q
    |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||   ||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||    
T  44317521 actttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactacgattgatatttaaaggatcaactaaataattttgtctaaca 44317422  T
Q  276 aatgttaaagtga 288  Q
    ||||| |||||||    
T  44317421 aatgtgaaagtga 44317409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 132 - 289
Target Start/End: Original strand, 13770518 - 13770675
Alignment:
Q  132 cccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgttataaaaac 231  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  13770518 cccaccccgaactcatactcaaacccgtcccgaatgcataaaactattttatgttaataagccatgttattttgtttgataattaccgtgttataaaaac 13770617  T
Q  232 tactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtgaa 289  Q
     || ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  13770618 gaccattaatatttgaaggagcaactaaatcaatcggtcaaacaaatgttaaagtgaa 13770675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 32585657 - 32585363
Alignment:
Q  10 aacaaaatccatacccgtggttatccatctgaaccaaactcaatt-gacgggttttcccctttttgactgggtttaggt------tttccccgatttcaa 102  Q
    |||||||  |||||||| ||||||||  |  |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||      |||| ||||||||||    
T  32585657 aacaaaactcatacccgcggttatccgcccaaaccaaacccaatttgaccggttttcccctttttgactgggtttgggtatgaattttctccgatttcaa 32585558  T
Q  103 aacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtca 195  Q
    |||| || |||||||| |||||       |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| | |||  ||||||||||| |||||||     
T  32585557 aacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccctgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaacttactttatgtttatatgtct 32585458  T
Q  196 tgtcattttgtttgataattgatgtgtt-ataaaaactact-attgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtga 288  Q
    ||| |||||||||||||||||   |||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||| |||||||||||    
T  32585457 tgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattccgtctaacaattgttaaagtga 32585363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 48459567 - 48459356
Alignment:
Q  85 ggttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaacta 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||       |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||| | |||| ||    
T  48459567 ggttttccccgatttcaaaacatgggtatggaacgggtaacaggtatataggtacccaccccgaacccatacccatacccatcccaaatgtaaaaaatta 48459468  T
Q  178 ctttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgtt-ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaa 276  Q
    ||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||   |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |  |||||| ||    
T  48459467 ctttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaaaaa 48459368  T
Q  277 atgttaaagtga 288  Q
    ||||||||||||    
T  48459367 atgttaaagtga 48459356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 86 - 288
Target Start/End: Original strand, 47550363 - 47550573
Alignment:
Q  86 gttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactac 178  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||       |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||     
T  47550363 gttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacaggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaattat 47550462  T
Q  179 tttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgtt-ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaa 277  Q
    |||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||   |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |  ||||||||||    
T  47550463 tttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaa 47550562  T
Q  278 tgttaaagtga 288  Q
    ||| |||||||    
T  47550563 tgtgaaagtga 47550573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 6382281 - 6382493
Alignment:
Q  85 ggttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaa-ct 176  Q
    ||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||       |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||    
T  6382281 ggttttctccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaaact 6382380  T
Q  177 actttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgtta-taaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaaca 275  Q
    | |||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||   ||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||    
T  6382381 attttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaataattttgtctaaca 6382480  T
Q  276 aatgttaaagtga 288  Q
    ||||| |||||||    
T  6382481 aatgtgaaagtga 6382493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 43893401 - 43893103
Alignment:
Q  10 aacaaaatccatacccgtggttatccatctgaaccaaactcaatt-gacgggttttcccctttttgactgggtttaggt-----------tttccccgat 97  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||  | || |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||           ||||||||||    
T  43893401 aacaaaacccatacccgtggttacccgcccgagccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggtttccccgat 43893302  T
Q  98 ttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaata 190  Q
     || ||||| || ||||||||||||||       ||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| |||    
T  43893301 ctcgaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtatccaccccgaattcatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaactactttatgttgata 43893202  T
Q  191 tgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgtt-ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtga 288  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||   |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |  ||||||||||||| |||||||    
T  43893201 tgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaattattttgtctaacaaatgtgaaagtga 43893103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 7609056 - 7608845
Alignment:
Q  85 ggttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaacta 177  Q
    ||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||       |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  7609056 ggttttccccgatctcgaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaacta 7608957  T
Q  178 ctttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgtt-ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaa 276  Q
    || |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||   |||| |||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||    
T  7608956 ctctatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactgtcattgatatttaaaggatcaactaaataattttgtctaacaa 7608857  T
Q  277 atgttaaagtga 288  Q
    |||| |||||||    
T  7608856 atgtgaaagtga 7608845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 117 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 21423908 - 21423735
Alignment:
Q  117 acgggtaaataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattg 216  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||| | |||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||||||||    
T  21423908 acgggtatataggtacccaccccaaacccatacacaaacccgtcccaaatgtaaaaaactactttatgttgatatgttatattattttgtttgataattg 21423809  T
Q  217 atgtgtt-ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtgaa 289  Q
       |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||    
T  21423808 tcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaataattttgtctaacaaatgtgaaagtgaa 21423735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 119 - 288
Target Start/End: Original strand, 31918608 - 31918779
Alignment:
Q  119 gggtaaataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaa-ctactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattga 217  Q
    ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||| |||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||     
T  31918608 gggtatatagttacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaaactactttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgt 31918707  T
Q  218 tgtgtta-taaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtga 288  Q
      ||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||    
T  31918708 catgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaataattttgtctaacaaatgtgaaagtga 31918779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 117 - 288
Target Start/End: Original strand, 11122917 - 11123089
Alignment:
Q  117 acgggtaaataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattg 216  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||| |||||||    
T  11122917 acgggtatataggtacccaccccgaacccatactcaaacccgtcccaaatgtaaaaaactactttatgttgatatgttttgttattttgttttataattg 11123016  T
Q  217 atgtgtt-ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtga 288  Q
       |||| ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||    
T  11123017 tcatgttaataaaaagtaccattgatatttaaaggatcaactaaataattttgtctaacaaatgtgaaagtga 11123089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 117 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 37107458 - 37107291
Alignment:
Q  117 acgggtaaataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattg 216  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |   ||||| |||    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37107458 acgggtatataggtacccaccccgaatttataccaaaatatatcccgaatgcagaaaattactttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattg 37107359  T
Q  217 atgtgttataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaa 284  Q
       ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||    
T  37107358 ccatgttataaaaactaccattggtatttaaagaagcaactaaatcaatcggtctgacaaatattaaa 37107291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 31752542 - 31752331
Alignment:
Q  85 ggttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaacta 177  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||| |||| ||||       |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| | |||| ||    
T  31752542 ggttttccccgatttcaaaacacgggtatgagacgagtaacgagtatataggttcccaccccgaacccatacccatacccgtcccaaatgtaaaaaatta 31752443  T
Q  178 ctttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgtt-ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaa 276  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||   |||| ||||||||||  | ||||||||||| || ||||||||| | || ||||| |||    
T  31752442 ctttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaacaatgatatttaaaagatcaactaaatcattccgtctatcaa 31752343  T
Q  277 atgttaaagtga 288  Q
    ||||||||||||    
T  31752342 atgttaaagtga 31752331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 11028159 - 11027947
Alignment:
Q  85 ggttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaact- 176  Q
    ||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||       |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||| | |||| |     
T  11028159 ggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacccaaacctgtcccaaatgtaaaaaaatt 11028060  T
Q  177 actttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgtta-taaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaaca 275  Q
    ||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| | |  ||||||||    
T  11028059 actttatattgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactactatttatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaaca 11027960  T
Q  276 aatgttaaagtga 288  Q
    ||||| |||||||    
T  11027959 aatgtgaaagtga 11027947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 145 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 9230301 - 9230164
Alignment:
Q  145 catacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgttataaaaactactattgatatt 244  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||  |    ||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||    
T  9230301 cataaccaaacccgtcccgaatgcagaaaattaccat----taatatgtcatgttattttgtttgataactgtcgtgttataaaaactaccattgatatt 9230206  T
Q  245 taaagg--agcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaa 284  Q
    ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9230205 taaaggaaagcaactaaatcaatcggtctaacaaatgttaaa 9230164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 169 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 425818 - 425698
Alignment:
Q  169 agaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgttataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcgg 268  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||    
T  425818 agaaaattactttatgttgatatgccatgttattttgtttgataattgtcatgttataaaaactaccattgatatttaaaagaacaactaaatcaatcgg 425719  T
Q  269 tctaacaaatgttaaagtgaa 289  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  425718 tctaacaaatcttaaagtgaa 425698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 117 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 42299837 - 42299665
Alignment:
Q  117 acgggtaaataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattg 216  Q
    ||||||| |||||||||||||| | |||||||| ||||| |||||| |||  | |||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  42299837 acgggtatataggtacccaccctgaacccatactcaaacacgtcccaaatata-aaaagtactttatgttgatatgccatgttattttgtttgataattg 42299739  T
Q  217 atgtgtta-taaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtgaa 289  Q
       ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |  |  |||||||||||||||||||||    
T  42299738 tcttgttaataaaaactactgttgatatttaaatgagcaactaaatcatcctctctaacaaatgttaaagtgaa 42299665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 117 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 39046999 - 39046832
Alignment:
Q  117 acgggtaaataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattg 216  Q
    ||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||| |||| | |||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||    
T  39046999 acgggtatataggtacccactccaaacccatacccatacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattg 39046901  T
Q  217 atgtgtt-ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaa 284  Q
       |||| |||||||||||  |||||||||||||||  |||||||| | || |||||||||||||||||    
T  39046900 tcatgttaataaaaactaccgttgatatttaaaggattaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaa 39046832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 70 - 288
Target Start/End: Original strand, 32596178 - 32596403
Alignment:
Q  70 ttttgactgggtttaggttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtccc 162  Q
    |||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||       |||||| |||||| |  || |||||||||||  ||| |    
T  32596178 ttttgaatgggttggggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtccccacctcaaactcatacccaaacttgtctc 32596277  T
Q  163 gaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgttataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaata 262  Q
    ||||| |||||| || |||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||  ||| |||||| ||||| |||||||||     
T  32596278 gaatgtagaaaattattttatgttgatataccatgtcatttggtttgataattgtcatgttataaaaactagcattaatatttgaaggaacaactaaatc 32596377  T
Q  263 aatcggtctaacaaatgttaaagtga 288  Q
    | |  ||||||||||| |||||||||    
T  32596378 attaagtctaacaaattttaaagtga 32596403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 117 - 258
Target Start/End: Original strand, 55826671 - 55826814
Alignment:
Q  117 acgggtaaataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatg-cagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataatt 215  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  55826671 acgggtatataggtacccaccccgaacccatatccaaacccgtcccaaatgtaaaaaaactactttatgttgatatgttatgttattttgtttgataatt 55826770  T
Q  216 gatgtgtt-ataaaaactactattgatatttaaaggagcaacta 258  Q
    |    ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  55826771 gtcacgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaacta 55826814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 117 - 261
Target Start/End: Original strand, 47239433 - 47239578
Alignment:
Q  117 acgggtaaataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattg 216  Q
    ||||||| |||||| ||||||| | ||||||||||| ||| ||||| |||| | |||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  47239433 acgggtatataggttcccaccctgaacccatacccatacctgtcccaaatgtaaaaaattattttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattg 47239532  T
Q  217 atgtgtt-ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaat 261  Q
       |||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||    
T  47239533 tcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaat 47239578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 133 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 39188545 - 39188390
Alignment:
Q  133 ccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgttataaaaact 232  Q
    |||||||  ||||||  |||||| | ||||||||||| |||| |  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||| |||||||    
T  39188545 ccaccccaaacccatgtccaaactcatcccgaatgcataaaattgttttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataactgtcgtgtta-aaaaact 39188447  T
Q  233 actattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtgaa 289  Q
    || ||| |||||||||| |  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  39188446 accatttatatttaaagaaaaaactaaatcaatcgttctaacaaatgttaaagtgaa 39188390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 154 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 42774771 - 42774635
Alignment:
Q  154 acccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgtta-taaaaactactattgatatttaaaggag 252  Q
    ||||||||  |||| | |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||   ||||| |||||||||| ||||||||||||||||     
T  42774771 acccgtccaaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggat 42774672  T
Q  253 caactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtgaa 289  Q
    ||||||||| | ||  |||||||||||||||| ||||    
T  42774671 caactaaatcattccttctaacaaatgttaaaatgaa 42774635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 125 - 284
Target Start/End: Original strand, 28695198 - 28695357
Alignment:
Q  125 ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgtta 224  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||| |||| | |||  || ||| | ||||||||| |||||  |||| ||||| |||||||||||    ||||    
T  28695198 ataggtactcaccccgaactcatacccaaactcgtctcaaatataggaaattgctttatgttgatatgcaatgttattttatttgataattgtcacgtta 28695297  T
Q  225 taaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaa 284  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  28695298 taaaaactatcattaatatttaaaggagcaactaaatcattcggtttaacaaatgttaaa 28695357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 190 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 39375253 - 39375160
Alignment:
Q  190 atgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgttataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaa 283  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| | | |||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||    
T  39375253 atgtcatgttattttgtttgataattgccgtgttataaaaactaccactaatatttaaaggaacaactaaataaatcaatcgaacaaatgttaa 39375160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 142 - 258
Target Start/End: Original strand, 13015324 - 13015446
Alignment:
Q  142 acccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataa--ttgat----gtgttataaaaactact 235  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| | |||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  || ||     |||||||||||||||     
T  13015324 acccatactcaaacccgtctcgaatgtaaaaaattattttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattttcattttcatgttataaaaactacc 13015423  T
Q  236 attgatatttaaaggagcaacta 258  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  13015424 attgatatttaaaggagcaacta 13015446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 195 - 284
Target Start/End: Original strand, 29755456 - 29755545
Alignment:
Q  195 atgtcattttgtttgataattgatgtgttataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaa 284  Q
    |||| ||||||||||||||||   |||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  29755456 atgttattttgtttgataattaccgtgttataaacactaccattgatatttaaagaagtaactaaatcaatcgatctaacaaatgttaaa 29755545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 201 - 283
Target Start/End: Original strand, 15987372 - 15987455
Alignment:
Q  201 ttttgtttgataattgatgtgtta-taaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaa 283  Q
    ||||||||||||||||   ||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||    
T  15987372 ttttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaa 15987455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 224 - 289
Target Start/End: Original strand, 53906437 - 53906502
Alignment:
Q  224 ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtgaa 289  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||    
T  53906437 ataaaaactactattgatatttaatggatcaactaaatcattccttctaacaaatgttaaagtgaa 53906502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 53 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 29527930 - 29527819
Alignment:
Q  53 ttgacgggttttcccctttttgactgggtttaggttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggaccc 145  Q
    ||||||||||||||||  |||||  |||||| |||||||||||||||||||| | || || | |||||||||       ||| |||||||||||| ||||    
T  29527930 ttgacgggttttccccgctttgatagggtttgggttttccccgatttcaaaatacgggtacgtgacgggtaacggggatatatgtacccaccccgaaccc 29527831  T
Q  146 atacccaaaccc 157  Q
    ||||||||||||    
T  29527830 atacccaaaccc 29527819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 198
Target Start/End: Original strand, 53906356 - 53906434
Alignment:
Q  120 ggtaaataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgt 198  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||| | |||| |||||| |||| | |||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  53906356 ggtatataggtacccaccccgaacccatatctaaactcgtcccaaatgtaaaaaattacttcatgttgatatgtcatgt 53906434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 286
Target Start/End: Original strand, 4766419 - 4766531
Alignment:
Q  176 tactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgtta--taaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaa 273  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||   |||||   ||||||||  ||||||||||||||||  |||||||| | |   |||||    
T  4766419 tactttatgttgatatgttatgttattttatttgataattgtcatgttaataaaaaactatcattgatatttaaaggataaactaaatcattacctctaa 4766518  T
Q  274 caaatgttaaagt 286  Q
    |||||||||||||    
T  4766519 caaatgttaaagt 4766531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 117 - 162
Target Start/End: Original strand, 15987310 - 15987355
Alignment:
Q  117 acgggtaaataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtccc 162  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15987310 acgggtatatagatacccaccccgaacccatacccaaacccgtccc 15987355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 71 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 24637281 - 24637199
Alignment:
Q  71 tttgactgggtttaggttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaaataggtacccaccccggacccatacccaaaccc 157  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | || ||    ||||| | ||| || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  24637281 tttgactgggtttgggttttccccgatttcaaaatacgggta----acggggatatatgtgcccacccaggacccatacccaaaccc 24637199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 125 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 42907925 - 42907876
Alignment:
Q  125 ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaa 174  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  42907925 ataggtacccaccccgagcccatacccaaactcgtcccgaatgtagaaaa 42907876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 53 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 568523 - 568408
Alignment:
Q  53 ttgacgggttttcccctttttgactgggtttaggttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaaataggtacccaccccggacccataccca 152  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| | ||  ||     ||| | ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  568523 ttgacgggttttccccgatttgactaggtttgggtttttcccgatttcaaaatagggtaat-----ggggatatatgtacccaccccgaacccataccca 568429  T
Q  153 aacccgtcccgaatgcagaaa 173  Q
    ||||   |||||||| |||||    
T  568428 aaccttacccgaatgtagaaa 568408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 246 - 289
Target Start/End: Original strand, 13015550 - 13015593
Alignment:
Q  246 aaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtgaa 289  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||    
T  13015550 aaaggagcaactaaattattcggtctaacagatgttaaagtgaa 13015593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 7609144 - 7609074
Alignment:
Q  10 aacaaaatccatacccgtggttatccatctgaaccaaactcaatt-gacgggttttcccctttttgactgg 79  Q
    ||||||| |||||| |||||||| ||| | |||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  7609144 aacaaaacccatactcgtggttacccacccgaactaaacccaatttgacgggttttccccgttttgactgg 7609074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 11028247 - 11028177
Alignment:
Q  10 aacaaaatccatacccgtggttatccatctgaaccaaactcaatt-gacgggttttcccctttttgactgg 79  Q
    ||||||| |||||| |||||||| ||| | ||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  11028247 aacaaaacccatacacgtggttacccacccgaaccaaacccaatttgacgggttttctccgttttgactgg 11028177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 131 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 11173002 - 11172960
Alignment:
Q  131 acccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaa 173  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  11173002 acccaccccgaacccatacccaaacccttcccgaatgtagaaa 11172960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 83
Target Start/End: Original strand, 31918479 - 31918553
Alignment:
Q  10 aacaaaatccatacccgtggttatccatctgaaccaaactcaatt-gacgggttttcccctttttgactgggttt 83  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| |   | ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31918479 aacaaaacccatatccgtggttacctgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgactgggttt 31918553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 83
Target Start/End: Original strand, 53906259 - 53906333
Alignment:
Q  10 aacaaaatccatacccgtggttatccatctgaaccaaactcaatt-gacgggttttcccctttttgactgggttt 83  Q
    ||||||| ||||||||  ||||||||  | ||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  53906259 aacaaaacccatacccacggttatccgcccgaaccaaacccaatttgacgggtttttcccgttttgactgggttt 53906333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 83
Target Start/End: Original strand, 55826544 - 55826618
Alignment:
Q  10 aacaaaatccatacccgtggttatccatctgaaccaaactcaa-ttgacgggttttcccctttttgactgggttt 83  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || || ||||||||  ||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  55826544 aacaaaacccatacccgtggttacccgtccgaaccaaatccaatttgacggattttccctgttttgactgggttt 55826618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 173
Target Start/End: Original strand, 10574396 - 10574523
Alignment:
Q  53 ttgacgggttttcccctttttgactgggtttaggttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggaccc 145  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||   ||||||||||||||| || |  | || |||||||||||       ||| |||||| ||||| || |    
T  10574396 ttgacgggttttccccgatttgactgggtttgaattttccccgatttcataatacaggtacgggacgggtaacggggatatatgtacccgccccgaactc 10574495  T
Q  146 atacccaaacccgtcccgaatgcagaaa 173  Q
    ||||||||||||  |||||||| |||||    
T  10574496 atacccaaaccctacccgaatgtagaaa 10574523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 11173073 - 11173040
Alignment:
Q  71 tttgactgggtttaggttttccccgatttcaaaa 104  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11173073 tttgactgggtttgggttttccccgatttcaaaa 11173040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 31782713 - 31782680
Alignment:
Q  71 tttgactgggtttaggttttccccgatttcaaaa 104  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31782713 tttgactgggtttgggttttccccgatttcaaaa 31782680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 80 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 43309574 - 43309530
Alignment:
Q  80 gtttaggttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaa 124  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  43309574 gtttgggtttttcccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaa 43309530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 55)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 10 - 289
Target Start/End: Original strand, 4015964 - 4016263
Alignment:
Q  10 aacaaaatccatacccgtggttatccatctgaaccaaactcaatt-gacgggttttcccctttttgact------------gggtttaggttttccccga 96  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||| | |||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||            |||||| ||||||||||||    
T  4015964 aacaaaacccatacccgtggttacccacccgaacgaaactcaatttgacgggtttttcccgttttgactaggtttgggtatgggtttgggttttccccga 4016063  T
Q  97 tttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaat 189  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||       |||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  4016064 tttcaaaacatgggtatgggacggataacgggtatataggtacccactccgaacccatacccaaactcgtcccgaatgcagaaaactaccttatgttgat 4016163  T
Q  190 atgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgttataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtgaa 289  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4016164 atgtcatgttattttgtttgataattgatgtgttataaaaactactatcgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtgaa 4016263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 77 - 289
Target Start/End: Original strand, 4557305 - 4557524
Alignment:
Q  77 tgggtttaggttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgca 169  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||       |||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||    
T  4557305 tgggtttgggttttccccgttttcaaaacatgggtatgggacgggtaacgagtatataggtacccaccccgaacccatacccaaatctatcccgaatgca 4557404  T
Q  170 gaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgttataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggt 269  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4557405 gaaaattactttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattgatgtgttataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggt 4557504  T
Q  270 ctaacaaatgttaaagtgaa 289  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  4557505 ctaacaaatgttaaagtgaa 4557524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 117 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 53631945 - 53631774
Alignment:
Q  117 acgggtaaataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattg 216  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  53631945 acgggtatataggtacccaccccgaacccatactcaaactcgtcccgaatctagaaaattactttatgttgatatgccatgttattttgtttgataattg 53631846  T
Q  217 atgtgttataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtga 288  Q
      |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  53631845 ccgtgttataaaaactaccattgatatttaaaggagcaactaaatcgatcggtctaacaaatgataaagtga 53631774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 49025836 - 49025550
Alignment:
Q  10 aacaaaatccatacccgtggttatccatctgaaccaaactcaatt-gacgggttttcccctttttgactgggtttaggttttccccgatttcaaaacatg 108  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||| || ||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |    
T  49025836 aacaaaatccatacccgtggttacccgcctgaaccaaacccaatttgatgggtttttcctgttttgactgggtttgggttttccccgatctcaaaacacg 49025737  T
Q  109 gatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcat 201  Q
    | ||||||||||||||       |||||||| || || | ||||||||||||||||||||| |||| | |||| |||||| |||| |||||| |||| ||    
T  49025736 ggtatgggacgggtaacaggtatataggtacacatcc-gaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttgtgttgatatgttatgttat 49025638  T
Q  202 tttgtttgataattgatgtgtt-ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtga 288  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |  |||||| |||||| |||||||    
T  49025637 tttgtttgataattgttatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaataaatgtgaaagtga 49025550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 117 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 54317185 - 54317018
Alignment:
Q  117 acgggtaaataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattg 216  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || | |||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  54317185 acgggtatataggtacccaccccgaacccattcccaaacccgtcccaaacgaagaaaattactttatgttgatatgccatgttattttgtttgataattg 54317086  T
Q  217 atgtgttataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaa 284  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||    
T  54317085 ccgtgttataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaatcaacatgtctaacaaatgttaaa 54317018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 120 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 34119694 - 34119528
Alignment:
Q  120 ggtaaataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatg 219  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| |||   |||||||||||||||||  |    
T  34119694 ggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaatccgtcccaaatgcagaaaactactttgtgttgatatgccatt--attttgtttgataattgtcg 34119597  T
Q  220 tgttataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtga 288  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34119596 tgttataaaaactaacattgatattgaaatgagcaactaaatcaatcggtctaacaaatgttaaagtga 34119528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 80 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 42758459 - 42758248
Alignment:
Q  80 gtttaggttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaa 172  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||||       |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  42758459 gtttgggtttcccccgatttcaaaacacaggtatgggacgggtaacaggtatataggtatgcaccccgaacccatacccaaacccgtcccgaacgaagaa 42758360  T
Q  173 aactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgttataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtcta 272  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||    
T  42758359 aattactttatgttgatatgccatgttattttgtttgataattgccatgttataaaaactatcattgatatttaaaggagcaattaaatcaaccggtcta 42758260  T
Q  273 acaaatgttaaa 284  Q
    ||||||||||||    
T  42758259 acaaatgttaaa 42758248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 85 - 289
Target Start/End: Original strand, 48390825 - 48391036
Alignment:
Q  85 ggttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaacta 177  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||       ||||||||||| || | ||||||||||| |||||||||||| | | |||| ||    
T  48390825 ggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggaatataggtacccatcctgaacccatacccatacccgtcccgaacgtaaaaaatta 48390924  T
Q  178 ctttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgttataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaa 277  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||   ||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| | || ||||||||||    
T  48390925 ctttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattgtcatgttaaaaaaactaccattgatatttaaaagatcaactaaatcattccgtctaacaaa 48391024  T
Q  278 tgttaaagtgaa 289  Q
    |||| |||||||    
T  48391025 tgttgaagtgaa 48391036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 10 - 288
Target Start/End: Original strand, 39655193 - 39655492
Alignment:
Q  10 aacaaaatccatacccgtggttatccatctgaaccaaactcaatt-gacgggttttcccctttttgactgggtttaggt------------tttccccga 96  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||  | ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| |||            |||||||||    
T  39655193 aacaaaacccatacccgtggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtatgggttttccccga 39655292  T
Q  97 tttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaat 189  Q
    | |||||||| || ||||||||||||||       |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | |||| | |||||||||||||||| ||    
T  39655293 tctcaaaacacgggtatgggacgggtaacaggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacccgtctcaaatgtaaaaaactactttatgttgat 39655392  T
Q  190 atgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgtt-ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtga 288  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||   |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |   |||||||||||| |||||||    
T  39655393 atgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaataattttctctaacaaatgtgaaagtga 39655492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 10 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 44252915 - 44252616
Alignment:
Q  10 aacaaaatccatacccgtggttatccatctgaaccaaactcaatt-gacgggttttcccctttttgactgggtttaggt------------tttccccga 96  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || ||| |||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||            |||||||||    
T  44252915 aacaaaatccatacccgtggttacccgtccgaatcaaaccaaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccga 44252816  T
Q  97 tttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaat 189  Q
    | || ||||| || ||||||||| ||||       |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||| ||    
T  44252815 tctcgaaacacgggtatgggacgtgtaacaggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatataaaaaactactttatgttgat 44252716  T
Q  190 atgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgtt-ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtga 288  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||   |||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||    
T  44252715 atgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaataattttgtctaacaaatgtgaaagtga 44252616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 10 - 288
Target Start/End: Original strand, 44953355 - 44953654
Alignment:
Q  10 aacaaaatccatacccgtggttatccatctgaaccaaactcaatt-gacgggttttcccctttttgactgggtttaggttt------------tccccga 96  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||    ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||            |||||||    
T  44953355 aacaaaattcatacccgtggttacccgctcgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtttgggtatgggttttccccga 44953454  T
Q  97 tttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaat 189  Q
    | |||||||| || ||||||||||||||       |||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||| |||| | |||||||||||||||| ||    
T  44953455 tctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtactcaccccgaactcatactcaaacccgtcccaaatgtaaaaaactactttatgttgat 44953554  T
Q  190 atgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgtt-ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtga 288  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||   |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||    
T  44953555 atgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaataattttgtctaacaaatgtgaaagtga 44953654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 125 - 288
Target Start/End: Original strand, 31126850 - 31127013
Alignment:
Q  125 ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgtta 224  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||  || |||    
T  31126850 ataggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgcagaaaactacattgtgttgatatgccatgttattttgtttgataattgtcgtatta 31126949  T
Q  225 taaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtga 288  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  31126950 taaaaactaacattgatattgaaaggagcaactaaatcaatcagtctaacaaatgttaaagtga 31127013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 288
Target Start/End: Original strand, 22535761 - 22536060
Alignment:
Q  10 aacaaaatccatacccgtggttatccatctgaaccaaactcaatt-gacgggttttcccctttttgactgggtttaggt------------tttccccga 96  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||            ||||||| |    
T  22535761 aacaaaacccatacccgcggttatccgcccgaaccaaactcaatttgatgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgagttttccccaa 22535860  T
Q  97 tttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaat 189  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||       | ||| |||||||||| |||||||| || || |||||  |||| | |||| || |||||||| ||    
T  22535861 tttcaaaacacggatatgggacgggtaacgggtatacaggcacccaccccgaacccatacacatactcgtcctaaatgtaaaaaattattttatgttgat 22535960  T
Q  190 atgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgtta-taaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtga 288  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||   ||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||||    
T  22535961 atgtcatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattctgtctaacaaatgttaaagtga 22536060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 44172706 - 44172495
Alignment:
Q  85 ggttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaacta 177  Q
    ||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||       ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||    
T  44172706 ggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataagtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaatta 44172607  T
Q  178 ctttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgtt-ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaa 276  Q
    ||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||   |||| ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| | |  |||||||||    
T  44172606 ctttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccactgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaa 44172507  T
Q  277 atgttaaagtga 288  Q
    |||| |||||||    
T  44172506 atgtgaaagtga 44172495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 44179406 - 44179195
Alignment:
Q  85 ggttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaacta 177  Q
    ||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||       ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||    
T  44179406 ggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataagtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaatta 44179307  T
Q  178 ctttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgtt-ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaa 276  Q
    ||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||   |||| ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| | |  |||||||||    
T  44179306 ctttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccactgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaa 44179207  T
Q  277 atgttaaagtga 288  Q
    |||| |||||||    
T  44179206 atgtgaaagtga 44179195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 128 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 831039 - 830879
Alignment:
Q  128 ggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgttataa 227  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||  || ||||||    
T  831039 ggtacccaccctgaacccatacccaaattcgtcccgaatgcagaaaattactttatgttaatatgctatgttattttgtttgataattgccgtcttataa 830940  T
Q  228 aaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtga 288  Q
    ||||||  |||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  830939 aaactatcattgatattttaaggagaaactaaatcaattggtctaaaaaatgttaacgtga 830879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 288
Target Start/End: Original strand, 7469698 - 7469997
Alignment:
Q  10 aacaaaatccatacccgtggttatccatctgaaccaaactcaatt-gacgggttttcccctttttgactgggtttaggt------------tttccccga 96  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||  | ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||            |||||| ||    
T  7469698 aacaaaacccatacccgtggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccctga 7469797  T
Q  97 tttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaat 189  Q
    | || ||||| || ||||||||||||||       |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| | || ||||||||||||  ||    
T  7469798 tctcgaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatacacaaacccgtcccaaatgtaaaacactactttatgtggat 7469897  T
Q  190 atgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgtt-ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtga 288  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||   | || ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||    
T  7469898 atgttatgttattttgtttgataattgtcatcttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaataattttgtctaacaaatgtgaaagtga 7469997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 49580232 - 49579933
Alignment:
Q  10 aacaaaatccatacccgtggttatccatctgaaccaaactcaatt-gacgggttttcccctttttgactgggtttaggt------------tttccccga 96  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||            |||||||||    
T  49580232 aacaaaacccatacccgtggttatccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccga 49580133  T
Q  97 tttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaat 189  Q
    | |||||||| || ||||||||||||||       ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||| | |||| |||||||| || ||    
T  49580132 tctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataggtacccacctcgaacccatactcaaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatattgat 49580033  T
Q  190 atgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgtt-ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtga 288  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||||   |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |  ||||||||||||| |||||||    
T  49580032 atgttatgttattttgtttgatgattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtgaaagtga 49579933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 52572777 - 52572478
Alignment:
Q  10 aacaaaatccatacccgtggttatccatctgaaccaaactcaatt-gacgggttttcccctttttgactgggtttaggt------------tttccccga 96  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| |||            ||||| |||    
T  52572777 aacaaaacccatacccgtggttatccgcccgaaccaaactcaatttgacaggttttccccattttgactgggtttgggtatgggtatgagttttcctcga 52572678  T
Q  97 tttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaat 189  Q
    | |||||||| || ||||||||||||||       ||||| |||||||||| | |||||| ||| |||||||| |||| | |||| ||||||||||||||    
T  52572677 tctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatatagggacccaccccgaatccatactcaagcccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttaat 52572578  T
Q  190 atgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgtt-ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtga 288  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||   |||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| | |  ||||||||||||| |||||||    
T  52572577 atgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaagtatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtgaaagtga 52572478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 117 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 19111775 - 19111605
Alignment:
Q  117 acgggtaaataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattg 216  Q
    ||||||| ||| ||||||||||   |||||| ||||||||||| |  |||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||     
T  19111775 acgggtatataagtacccaccctaaacccatgcccaaacccgtacaaaatgtagaaaattactttatgtta-tatgtcatgttattttgtttgataattt 19111677  T
Q  217 atgtgttataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtga 288  Q
      |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  19111676 tcgtgttataaaaactaccattgatatttaaaggagtaactaaatcaattggtataacaaatgttaaagtga 19111605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 133 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 30682846 - 30682690
Alignment:
Q  133 ccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgttataaaaact 232  Q
    ||||| || ||| |||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |   |||||||||||||    
T  30682846 ccacctcgaacctatactcaaacccgtcctgaatgtagaaaattactttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataatggtcatgttataaaaact 30682747  T
Q  233 actattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtgaa 289  Q
    |  |||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||    
T  30682746 atcattgatatttaaaggagcaattaaatcattcgttctaacaaatgttaaagtgaa 30682690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 117 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 29284377 - 29284205
Alignment:
Q  117 acgggtaaataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattg 216  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||    
T  29284377 acgggtatataggtacccagcccgaacccatacccaaacccgtcccagatgtaaaaaactactttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattg 29284278  T
Q  217 atgtgtt-ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtga 288  Q
       |||| ||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||| |  || |||||||||| |||||||    
T  29284277 tcatgttaataaaaactaccattaatatttaaaagatcaactaaataattttgtttaacaaatgtgaaagtga 29284205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 39728839 - 39728540
Alignment:
Q  10 aacaaaatccatacccgtggttatccatctgaaccaaactcaatt-gacgggttttcccctttttgactgggtt------------taggttttccccga 96  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || || ||||||||  ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||            |||||||||| |||    
T  39728839 aacaaaacccatacccgtggttacccgtccgaaccaaatccaatttgacggattttccccgttttgactgggtttgggtatgagtataggttttcctcga 39728740  T
Q  97 tttcaaaacatggatatggg-------acgggtaaataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaat 189  Q
    | |||||| | || ||||||       ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||| ||    
T  39728739 tctcaaaatacgggtatgggatgggtaacgggtatataagtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgat 39728640  T
Q  190 atgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgtt-ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtga 288  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||| | |  ||||||||||||| |||||||    
T  39728639 atgtaatgttattttgtttgataattgttctgttaataaaaactatcattgatatttaaaagattaactaaatcattttgtctaacaaatgtgaaagtga 39728540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 145 - 288
Target Start/End: Original strand, 41937077 - 41937220
Alignment:
Q  145 catacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgttataaaaactactattgatatt 244  Q
    ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| |||| | ||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||| ||||  |||||||||    
T  41937077 catacccaaactcgtctcaaatgcagaaaactactttgtgttgacatgtcatattattttgtttgataattgtcgtgttataaagactaacattgatatt 41937176  T
Q  245 taaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtga 288  Q
     ||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41937177 gaaatgaacaactaaatcaatcggtctaacaaatgttaaagtga 41937220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 85 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 20087077 - 20086879
Alignment:
Q  85 ggttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaaataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatg 184  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||    | ||||| |||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||| |||| | |||| || ||||||    
T  20087077 ggttttccccgatttcaaaacacgggta----atgggtatataggtacccaccccgaaccc-tactcatacccgtcccaaatgtaaaaaattattttatg 20086983  T
Q  185 ttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgtta-taaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaa 283  Q
    || ||||||||||| |||||| ||||||||||   ||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||  |||||||||||||||    
T  20086982 ttgatatgtcatgttattttgcttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattccatctaacaaatgttaa 20086883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 117 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 44639315 - 44639170
Alignment:
Q  117 acgggtaaataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattg 216  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| | |||| || |||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||    
T  44639315 acgggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaacccgttccaaatgtaaaaaattattttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattg 44639216  T
Q  217 atgtgtt-ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaat 261  Q
       |||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  44639215 tcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaat 44639170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 125 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 29842341 - 29842177
Alignment:
Q  125 ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgtt- 223  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || ||||||| | |||| | |||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||   ||||     
T  29842341 ataggtacccaccccgaacccatactcatacccgtctcaaatgtaaaaaattactttatgttgatttgtcatgttattttgtttgataattgtcatgtta 29842242  T
Q  224 ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtga 288  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |  |||||||||||||| ||||||    
T  29842241 ataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcatttcgtctaacaaatgttgaagtga 29842177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 125 - 288
Target Start/End: Original strand, 44106847 - 44107011
Alignment:
Q  125 ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgtt- 223  Q
    ||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||| |||| | |||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||   ||||     
T  44106847 ataggtatctaccccgaacccatactcaaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttaatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgtta 44106946  T
Q  224 ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtga 288  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |  |||| |||||||| |||||||    
T  44106947 ataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtcttacaaatgtgaaagtga 44107011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 6738413 - 6738613
Alignment:
Q  85 ggttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaaataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatg 184  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||    ||||||| |||||||||||||||  | |||||| || ||||||||| |||| | |||| |||||||||    
T  6738413 ggttttccccgatttcaaaacacgggta----acgggtatataggtacccaccccaaatccatactcatacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatg 6738508  T
Q  185 ttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgtt-ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaa 283  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||   |||| ||||||||||| |||||||||  ||||| ||| ||||| | |  |||||||| |||||||    
T  6738509 ttgatatgtcatgttattttgtttgataattgccatgttaataaaaactaccattgatattggaaggatcaattaaatcattatgtctaacagatgttaa 6738608  T
Q  284 agtga 288  Q
    |||||    
T  6738609 agtga 6738613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 85 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 34026034 - 34025826
Alignment:
Q  85 ggttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaacta 177  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||       ||||||  |||||||| || |||||||| ||||||||| |||| | |||| ||    
T  34026034 ggttttccccgatttcaaaacacaggtatgggacgggtaacgagtatataggtttccaccccgaactcatacccatacccgtcccaaatgtaaaaaatta 34025935  T
Q  178 ctttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgtt-ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaa 276  Q
     |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||   |||| ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||  |||| |||    
T  34025934 ttttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaattaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattccatctatcaa 34025835  T
Q  277 atgttaaag 285  Q
    |||||||||    
T  34025834 atgttaaag 34025826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 117 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 52198196 - 52198023
Alignment:
Q  117 acgggtaaataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatg-tcattttgtttgataatt 215  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| | |||| ||||||| ||| |||||  ||| | ||||||||||||||||    
T  52198196 acgggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaacccgttccaaatgtaaaaaattactttacgttgatatgctatgtttattttgtttgataatt 52198097  T
Q  216 gatgtgtt-ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtga 288  Q
    |   |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |  ||||||||||||| |||||||    
T  52198096 gtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtgaaagtga 52198023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 117 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 23580868 - 23580698
Alignment:
Q  117 acgggtaaataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattg 216  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||   |||| |||| | |||| || |||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||    
T  23580868 acgggtatataggtacccactccgaacccatacccacacttatcccaaatgtaaaaaattattttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattg 23580770  T
Q  217 atgtgtta-taaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtg 287  Q
       ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || || |||||||||||||||||    
T  23580769 tcatgttaataaaaactactattgatatttaaaggatcaactaaatcattccgtataacaaatgttaaagtg 23580698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 136 - 289
Target Start/End: Original strand, 10823759 - 10823913
Alignment:
Q  136 ccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgtt-ataaaaactac 234  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||| |||| | |||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||   |||| |||||||||||    
T  10823759 ccccgaacccatacccaaacctctcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactac 10823858  T
Q  235 tattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtgaa 289  Q
     |||||||||||||||| ||||||||| | |  ||||||||||||| ||||||||    
T  10823859 cattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtgaaagtgaa 10823913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 125 - 286
Target Start/End: Original strand, 17146205 - 17146367
Alignment:
Q  125 ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgtt- 223  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||| |||| | |||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||   ||||     
T  17146205 ataggtatccaccccgaacccatacacaaacccttcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgtta 17146304  T
Q  224 ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagt 286  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| | |  ||||||||||||| |||||    
T  17146305 ataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtgaaagt 17146367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 86 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 34154493 - 34154286
Alignment:
Q  86 gttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaact-a 177  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||       |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| | |||| | |    
T  34154493 gttttccccgatttcaaaacatgggtatgaaacgggtaacaagaatataggtacccaccccgaacccatacccatacccgtcccaaatgtaaaaaaatta 34154394  T
Q  178 ctttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgtta-taaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaa 276  Q
    ||||||||| |||||| ||     |||||||||||||||   ||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |  |||||||||    
T  34154393 ctttatgttgatatgttat-----tttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattatgtctaacaa 34154299  T
Q  277 atgttaaagtgaa 289  Q
    || ||||||||||    
T  34154298 atattaaagtgaa 34154286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 86 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 43582656 - 43582447
Alignment:
Q  86 gttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaaa-------taggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactac 178  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||        ||||||||||||| | |||||||  || ||||||||| |||| | |||| |||    
T  43582656 gttttccccgatttcaaaacacgggtatgagacgggtaacgtgtatgtaggtacccaccc-gaacccatattcatacccgtcccaaatgtaaaaaattac 43582558  T
Q  179 tttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgt-tataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaa 277  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    |||  ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |  ||||||||||    
T  43582557 tttatattgatatgtcatgttattttgtttgataattatcatgtaaataaaaactaccattgatatttaacggatcaactaaatcattacgtctaacaaa 43582458  T
Q  278 tgttaaagtga 288  Q
    |||||||||||    
T  43582457 tgttaaagtga 43582447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 183
Target Start/End: Original strand, 23546868 - 23547055
Alignment:
Q  10 aacaaaatccatacccgtggttatccatctgaaccaaactcaattga-cgggttttcccctttttgactgggtttaggt------tttccccgatttcaa 102  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||   |||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||| |||      |||||||||| || |    
T  23546868 aacaaaacccatacccgtggttacccgcatgaaccaaacccaatttaacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggttttccccgatctcga 23546967  T
Q  103 aacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttat 183  Q
    |||| || ||||||||||||||       |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| | |||||||||||||    
T  23546968 aacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactactttat 23547055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 171 - 288
Target Start/End: Original strand, 23547073 - 23547191
Alignment:
Q  171 aaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgtt-ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggt 269  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||   |||| ||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||| |  ||    
T  23547073 aaaactactttatgttaatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactagcatttatatttaaaggatcaactaaataattttgt 23547172  T
Q  270 ctaacaaatgttaaagtga 288  Q
     |||||||||| |||||||    
T  23547173 ttaacaaatgtgaaagtga 23547191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 10 - 186
Target Start/End: Original strand, 48305561 - 48305757
Alignment:
Q  10 aacaaaatccatacccgtggttatccatctgaaccaaactcaat-tgacgggttttcccctttttgactgggtttag------------gttttccccga 96  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |            ||||||||| |    
T  48305561 aacaaaatccatacccgcggttacccacccgaaccaaacccaatctgacgggttttccccattttgactgggtttggttatgggtatgagttttccccaa 48305660  T
Q  97 tttcaaaacatggatatggga-------cgggtaaataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgtt 186  Q
    |||||||||| || ||||| |       |||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||| | |||| |||||||||||    
T  48305661 tttcaaaacacgggtatggaacgagtatcgggtatataggtacccaccccgaacctatacccaaacccgttccaaatgtaaaaaattactttatgtt 48305757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 251
Target Start/End: Original strand, 23154073 - 23154245
Alignment:
Q  85 ggttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaacta 177  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||       |||||||||||| ||| |||||||| || |||  |||| |||| | |||| ||    
T  23154073 ggttttccccgatttcaaa-cacgggtatggaacgggtaacgagtatataggtacccactccgaacccatactcatacctatcccaaatgtaaaaaatta 23154171  T
Q  178 ctttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgtt-ataaaaactactattgatatttaaagga 251  Q
    ||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||   |||| |||||||||||  |||||||||||||||    
T  23154172 ctttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccgttgatatttaaagga 23154245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 143 - 211
Target Start/End: Original strand, 23910317 - 23910385
Alignment:
Q  143 cccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgat 211  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  23910317 cccacacctaaacccgtcccgaatgtagaaaattactttatgttgatatgtcatgttattttgtttgat 23910385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 124
Target Start/End: Original strand, 30616281 - 30616328
Alignment:
Q  77 tgggtttaggttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaa 124  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30616281 tgggtttgggttttccccgatttcaaaacacggatatgggacgggtaa 30616328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 62 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 1337143 - 1337081
Alignment:
Q  62 tttcccctttttgactgggtttaggttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaa 124  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  1337143 tttccccgttttgactgggtttgggttttcaccgatttcaaaacaagtgtatgggacgggtaa 1337081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 191 - 288
Target Start/End: Original strand, 48306657 - 48306755
Alignment:
Q  191 tgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgtta-taaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtga 288  Q
    |||||||| | |||||||||||||||   ||||| |||||||||  |||||||||||||| | ||||||||| | || ||||||||||| |||||||||    
T  48306657 tgtcatgttaatttgtttgataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaagtatcaactaaatcattccgtctaacaaatattaaagtga 48306755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 166
Target Start/End: Original strand, 10043282 - 10043378
Alignment:
Q  77 tgggtttaggttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaat 166  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||       ||| | |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||    
T  10043282 tgggtttgggttttccctggtttcaaaacatgggtatgggacgggtaacggggttatatgcacccaccccgaacccatacccatacccatcccgaat 10043378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 54317312 - 54317238
Alignment:
Q  10 aacaaaatccatacccgtggttatccatctgaaccaaactcaatt-gacgggttttcccctttttgactgggttt 83  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||  | ||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  54317312 aacaaaatccatatccgtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggttt 54317238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 219 - 284
Target Start/End: Original strand, 55438829 - 55438894
Alignment:
Q  219 gtgttataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaa 284  Q
    ||||||| |||||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  55438829 gtgttattaaaactaccatcgatatttggaggagcaactaaatcaatcgctttaacaaatgttaaa 55438894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 89
Target Start/End: Original strand, 10371193 - 10371273
Alignment:
Q  10 aacaaaatccatacccgtggttatccatctgaaccaaactcaatt-gacgggttttcccctttttgactgggtttaggttt 89  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||    ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  10371193 aacaaaacccagacccgtggttacccgctcgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggttt 10371273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 10 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 12369162 - 12369103
Alignment:
Q  10 aacaaaatccatacccgtggttatccatctgaaccaaactcaa-ttgacgggttttcccc 68  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  12369162 aacaaaacccatacccgtggttattcacccgaaccaaactcaatttgacggattttcccc 12369103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 29284504 - 29284430
Alignment:
Q  10 aacaaaatccatacccgtggttatccatctgaaccaaactcaatt-gacgggttttcccctttttgactgggttt 83  Q
    |||||||  |||||||||||||| ||  | ||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  29284504 aacaaaactcatacccgtggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttctccgttttgactgggttt 29284430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 83
Target Start/End: Original strand, 29858495 - 29858569
Alignment:
Q  10 aacaaaatccatacccgtggttatccatctgaaccaaactcaa-ttgacgggttttcccctttttgactgggttt 83  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||  | ||||||||| ||| || |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  29858495 aacaaaacccatacccgtggttacccgcccgaaccaaacccaatttaacggattttccccgttttgactgggttt 29858569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 167
Target Start/End: Original strand, 30904870 - 30904912
Alignment:
Q  125 ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatg 167  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  30904870 ataggtacccaccccgaacccatacccaaatccgtctcgaatg 30904912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 42243555 - 42243481
Alignment:
Q  10 aacaaaatccatacccgtggttatccatctgaaccaaactcaatt-gacgggttttcccctttttgactgggttt 83  Q
    ||||||||||||| | | ||  |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  42243555 aacaaaatccatatctgcgggcatccgtctgaaccaaacccaatttgacgggttttccccggtttgactgggttt 42243481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 256
Target Start/End: Original strand, 1772540 - 1772608
Alignment:
Q  188 atatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgttataaaaactactattgatatttaaaggagcaac 256  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||    || ||||| ||||  |||||||| |||||||||||||    
T  1772540 atatgtcatgttattttgtttgataattatcatgatataagaacttttattgatacttaaaggagcaac 1772608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 40 - 87
Target Start/End: Original strand, 3385806 - 3385854
Alignment:
Q  40 gaaccaaactcaatt-gacgggttttcccctttttgactgggtttaggt 87  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  3385806 gaaccaaacccaattcgacgggttttccccgctttgactgggtttaggt 3385854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 40)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 10 - 288
Target Start/End: Original strand, 24602788 - 24603074
Alignment:
Q  10 aacaaaatccatacccgtggttatccatctgaaccaaactcaatt-gacgggttttcccctttttgactgggtttaggttttccccgatttcaaaacatg 108  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| | |||| |||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  24602788 aacaaaatccatacacgtggttacccacccgaacgaaactcaatttgacggtttttccctgttttgactgggtttgggttttcccagatttcaaaacatg 24602887  T
Q  109 gatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcat 201  Q
    | |||| |||||||||       |||| ||||||||||| |||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||    
T  24602888 ggtatgtgacgggtaacaggtatatagatacccaccccgaacccatacccaaacccatcacgaatgtagaaaattactttatgttgatgtgccatgttat 24602987  T
Q  202 tttgtttgataattgatgtgttataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtga 288  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24602988 tttgtttgataattgacgtgttataaaaactaccattgatatttaaaggaacaactaaatcaatcggtctaacaaatgttaaagtga 24603074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 19 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 14506233 - 14505956
Alignment:
Q  19 catacccgtggttatccatctgaaccaaactcaatt-gacgggttttcccctttttgactgggtttaggttttccccgatttcaaaacatggatatggga 117  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | |||||||    
T  14506233 catacccgtggttaaccatccgaacgaaactcaatttgacgggttttccccattttgactgggtttgggttttccccgatttcaaaacacaggtatggga 14506134  T
Q  118 cgggtaaa-------taggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttga 210  Q
    |||||||        ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| || |||||||||||    
T  14506133 cgggtaacaagtatttaggtacccaccccgaacccatacttaaacccgtcccaaatgcagaaaactactttgtgttgatatgtcacgttattttgtttga 14506034  T
Q  211 taattgatgtgttataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtga 288  Q
    ||||||  |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  14506033 taattgtcgtgttataaaaactaacattgatattgaaaggagcaactaaatcaatcagtctaacaaatgttaaagtga 14505956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 135 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 14032579 - 14032426
Alignment:
Q  135 accccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgttataaaaactac 234  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  14032579 accccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgcataaaattactttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattgttgtgttataaaaactat 14032480  T
Q  235 tattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtga 288  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14032479 cattgatatttaaaggagcaactaaatcaatcggtctaacaaatgttaaagtga 14032426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 10 - 288
Target Start/End: Original strand, 10188000 - 10188292
Alignment:
Q  10 aacaaaatccatacccgtggttatccatctgaaccaaactcaatt-gacgggttttcccctttttgactgggtttaggt------------tttccccga 96  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||  | ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||            |||||||||    
T  10188000 aacaaaacccatacccgtggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccga 10188099  T
Q  97 tttcaaaacatggatatgggacgggtaaataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcat 196  Q
    | |||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| | |||| || |||||||| |||| | ||    
T  10188100 tctcaaaacacgggtatgggacgggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaacccatcccaaatgtaaaaaattattttatgttgatatattat 10188199  T
Q  197 gtcattttgtttgataattgatgtgtt-ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtga 288  Q
    || |||||||| ||||||||   |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |  ||||||||||||| |||||||    
T  10188200 gttattttgttcgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtgaaagtga 10188292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 27534852 - 27534552
Alignment:
Q  10 aacaaaatccatacccgtggttatccatctgaaccaaactcaatt-gacgggttttcccctttttgactgggtttaggt------------tttccccga 96  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| |||            |||||||||    
T  27534852 aacaaaacccatacccgtggttaaccgtccgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtatgagttttccccga 27534753  T
Q  97 tttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaat 189  Q
    | || ||||| || ||||||||||||||       |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| ||    
T  27534752 tctcgaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaatccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaactactttatgttgat 27534653  T
Q  190 atgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgtt-ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtga 288  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||   |||| ||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||    
T  27534652 atgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaagaatcaactaaataattttgtctaacaaatgtgaaagtga 27534553  T
Q  289 a 289  Q
    |    
T  27534552 a 27534552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 119 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 30816299 - 30816128
Alignment:
Q  119 gggtaaataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaa---ctactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataatt 215  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||| |||||| |||| |||||||| |||||||    
T  30816299 gggtatataggaacccaccccgaacccatatccaaacccgtcccgaatgcaaaaaaaaactactttatgttgatatgtgatgttattttgttggataatt 30816200  T
Q  216 gatgtgttataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtg 287  Q
    |  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30816199 gccgtgttataaaaactaccattgacatttaaaggagcacctaaatcaatcggtctaacaaatgttaaagtg 30816128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 32854012 - 32853713
Alignment:
Q  10 aacaaaatccatacccgtggttatccatctgaaccaaactcaatt-gacgggttttcccctttttgactgggtttag------------gttttccccga 96  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |            |||||||||||    
T  32854012 aacaaaacccatacccgtggttatccgaccgaaccaaacccaatttgacgggttttctccgttttgactgggtttggttatgggtatgggttttccccga 32853913  T
Q  97 tttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaat 189  Q
    | |||||||| || ||||||||||||||       |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||| ||    
T  32853912 tctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgat 32853813  T
Q  190 atgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgtt-ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtga 288  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||   |||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| | |  ||||||||||||| |||||||    
T  32853812 atgttatgttattttgtttgataattgccatgttaataaaaactaccattgatatttaaatgatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtgaaagtga 32853713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 86 - 288
Target Start/End: Original strand, 12678103 - 12678311
Alignment:
Q  86 gttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaaa-------taggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactac 178  Q
    ||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||       ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||     
T  12678103 gttttccccgatttcaagacacaggtatgggacgggtaaagggtatataggtacccaccctgaacccatacccaaacccgtcccgaattgagaaaattat 12678202  T
Q  179 tttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgttataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaat 278  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||     
T  12678203 tttatattgatatgtcatgttattttgtttgataattgtcgtgttataaaaattatcattgatatttaaaggagcaactaaatcaatcggtctaataaa- 12678301  T
Q  279 gttaaagtga 288  Q
    ||||||||||    
T  12678302 gttaaagtga 12678311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 87 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 24225776 - 24225569
Alignment:
Q  87 ttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactact 179  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||       |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| | |||| || |    
T  24225776 ttttccccgatctcaaaacacggatatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatgcccaaacccgtcccaaatgtaaaaaattatt 24225677  T
Q  180 ttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgtt-ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaat 278  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||   |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||    
T  24225676 ttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaataattttgtctaacaaat 24225577  T
Q  279 gttaaagt 286  Q
    || |||||    
T  24225576 gtgaaagt 24225569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 85 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 27738852 - 27738668
Alignment:
Q  85 ggttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaacta 177  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||       ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||    
T  27738852 ggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacagatatatatgtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaatta 27738753  T
Q  178 ctttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgtt-ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaat 261  Q
    ||||||||| |||||| |||| ||||||| |||||||||   |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27738752 ctttatgttgatatgttatgttattttgtatgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggagcaactaaat 27738668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 2367406 - 2367195
Alignment:
Q  85 ggttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaacta 177  Q
    ||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||       ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||    
T  2367406 ggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataagtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatggaaaaaatta 2367307  T
Q  178 ctttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgtt-ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaa 276  Q
    ||||||||  |||||| |||| |||||||||||||||||   |||| ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| | |  |||||||||    
T  2367306 ctttatgtggatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggataaactaaatcattttgtctaacaa 2367207  T
Q  277 atgttaaagtga 288  Q
    ||||||||||||    
T  2367206 atgttaaagtga 2367195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 53 - 289
Target Start/End: Original strand, 7393863 - 7394106
Alignment:
Q  53 ttgacgggttttcccctttttgactgggtttaggttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggaccc 145  Q
    ||||||| |||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| |  || | ||||| |||       ||||||| |||||||| ||||    
T  7393863 ttgacggattttccccattttgattgggtttggattttccccgatttcaaaacacgagtaagagacggataatgggtatataggtatccaccccgaaccc 7393962  T
Q  146 atacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgttataaaaactactattgatattt 245  Q
    |||| ||||| | ||| ||||||| |||  || ||||||||  ||| |||| | ||||||||||||||||   |||||||||||||||  ||||||||||    
T  7393963 atactcaaactcatcctgaatgcataaatttattttatgttggtatatcatattattttgtttgataattaccgtgttataaaaactaacattgatattt 7394062  T
Q  246 aaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtgaa 289  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7394063 aaaggaacaactaaatcaatcggtctaacaaatgttaaagtgaa 7394106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 117 - 288
Target Start/End: Original strand, 3483970 - 3484142
Alignment:
Q  117 acgggtaaataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattg 216  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||| |||||||    
T  3483970 acgggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgttattttgtttcataattg 3484069  T
Q  217 atgtgtt-ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtga 288  Q
       | || ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||    
T  3484070 tcatcttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaataattttgtctaacaaatgtgaaagtga 3484142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 288
Target Start/End: Original strand, 5863303 - 5863602
Alignment:
Q  10 aacaaaatccatacccgtggttatccatctgaaccaaactcaatt-gacgggttttcccctttttgactgggtttaggt------------tttccccga 96  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |   | ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||            |||||||||    
T  5863303 aacaaaacccatacccgtggttacctgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccga 5863402  T
Q  97 tttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaat 189  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||       |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| | |||| || |||||||| ||    
T  5863403 tttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatatagatacccacctcgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaaatattttatgttgat 5863502  T
Q  190 atgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgtt-ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtga 288  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||    |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |  |||||| |||||| |||||||    
T  5863503 atgttatgttattttgtttgataattatcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaaaaaatgtgaaagtga 5863602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 53 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 32053206 - 32053031
Alignment:
Q  53 ttgacgggttttcccctttttgactgggtttaggt------tttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccacccc 139  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||    
T  32053206 ttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaacgggtatatatgtacccacccc 32053107  T
Q  140 ggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataatt 215  Q
      ||||||||||||||||||||  |||| | |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32053106 aaacccatacccaaacccgtccaaaatgtaaaaaaatactttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataatt 32053031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 81 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 11762529 - 11762342
Alignment:
Q  81 tttaggttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaa 173  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||       ||||||  |||||||| || ||||||||||||| |||| |||| |||||    
T  11762529 tttaggtttttcccgatttctaaacaagggtatgggacgggtaacgggtatataggtgtccaccccgaactcatacccaaacccatcccaaatgtagaaa 11762430  T
Q  174 actactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgttataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaat 261  Q
    | ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||  |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  11762429 attactttatgttgatatgccatgttattttgttatataattgtcgtgttataaaaactaccattgatatttataggagcaactaaat 11762342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 125 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 14254991 - 14254830
Alignment:
Q  125 ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgtta 224  Q
    |||||||||||||  | |||||||||||||  |||||| |||||| | ||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||    
T  14254991 ataggtacccaccatgaacccatacccaaattcgtcccaaatgcaaataataactttatgttgatatgtcatgttattttgtttgaaatttgatgtgtta 14254892  T
Q  225 taaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagt 286  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  14254891 taaaaactatcattgatatttaaaggagcgattaaatcattcggtctaataaatgttaaagt 14254830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 117 - 288
Target Start/End: Original strand, 10142565 - 10142737
Alignment:
Q  117 acgggtaaataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattg 216  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||| | |||| || |||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||    
T  10142565 acgggtatataggtacccaccccgaactcatacccaaacctgtcccaaatgtaaaaaattattttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattg 10142664  T
Q  217 atgtgtt-ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtga 288  Q
       |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |  ||||||||||||| |||||||    
T  10142665 tcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtgaaagtga 10142737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 116 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 12141427 - 12141254
Alignment:
Q  116 gacgggtaaataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataatt 215  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||| || |||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||    
T  12141427 gacgggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaattattttatgttgatacgttatgttattttgtttgataatt 12141328  T
Q  216 gatgtgtt-ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtga 288  Q
    |   | || ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| | |  ||||||||||||| |||||||    
T  12141327 gtcatcttaataaaaactaacattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtgaaagtga 12141254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 191 - 288
Target Start/End: Original strand, 14410954 - 14411051
Alignment:
Q  191 tgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgttataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtga 288  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14410954 tgtcgtgttattttgtttgataattgtcgtgttataaaaaccatcattgatatttaaaggagaaactaaatcaatcggtctaacaaatgttaaagtga 14411051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 191 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 14245214 - 14245116
Alignment:
Q  191 tgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgttataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtgaa 289  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  14245214 tgtcatgttattttgtttgaaaattgtcgtgttataaaaactaccattaatatttaaaggagcgactaaatcattcggtctaataaatgttaaagtgaa 14245116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 120 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 12309610 - 12309514
Alignment:
Q  120 ggtaaataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattg 216  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12309610 ggtatatatgtacccaccccgaaccgatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattg 12309514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 85 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 32532620 - 32532500
Alignment:
Q  85 ggttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaacta 177  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||       |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||| |||| | |||| ||    
T  32532620 ggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaatgggtatataggtacccaccccgaacccatactcatacccgtcccaaatgtaaaaaatta 32532521  T
Q  178 ctttatgttaatatgtcatgt 198  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  32532520 ctttatgttgatatgtcatgt 32532500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 77 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 13769160 - 13769056
Alignment:
Q  77 tgggtttaggttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgca 169  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||       |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  13769160 tgggtttcggttttccccgacttcaaaacatgggtatgggacgggtaacggacatataggtacccacccagaacccatatccaaacccgtcctgaatgta 13769061  T
Q  170 gaaaa 174  Q
    |||||    
T  13769060 gaaaa 13769056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 53 - 161
Target Start/End: Original strand, 14410832 - 14410946
Alignment:
Q  53 ttgacgggttttcccctttttgactgggtttaggttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggaccc 145  Q
    ||||||| ||||||| |||| |||| |||||  |||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||       |||||||||||||||| ||||    
T  14410832 ttgacggattttcccgtttt-gactaggtttgagttttcccagatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaaccc 14410930  T
Q  146 atacccaaacccgtcc 161  Q
    ||||||||||||||||    
T  14410931 atacccaaacccgtcc 14410946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 154
Target Start/End: Original strand, 28079696 - 28079780
Alignment:
Q  77 tgggtttaggttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaa 154  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||       |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28079696 tgggtttgggttttccccgatttcaaaacatgggtacgggacgggtaacggggatataggtacccaccccgaacccatacccaaa 28079780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 31496602 - 31496528
Alignment:
Q  10 aacaaaatccatacccgtggttatccatctgaaccaaactcaatt-gacgggttttcccctttttgactgggttt 83  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || ||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31496602 aacaaaacccatacccgtggttacccgtccaaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgactgggttt 31496528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 31501988 - 31501914
Alignment:
Q  10 aacaaaatccatacccgtggttatccatctgaaccaaactcaatt-gacgggttttcccctttttgactgggttt 83  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || ||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31501988 aacaaaacccatacccgtggttacccgtccaaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgactgggttt 31501914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 32532497 - 32532433
Alignment:
Q  224 ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtga 288  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||||    
T  32532497 ataaaaactaccaatgatatttaaaggaccaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtga 32532433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 10 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 30986421 - 30986347
Alignment:
Q  10 aacaaaatccatacccgtggttatccatctgaaccaaactcaa-ttgacgggttttcccctttttgactgggttt 83  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||  | ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  30986421 aacaaaacccatacccgtggttacccgcccgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgactgagttt 30986347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 9402714 - 9402629
Alignment:
Q  40 gaaccaaactcaatt-gacgggttttcccctttttgactgggtttaggttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaa 124  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  9402714 gaaccaaacccaatttgatggattttccccgctttgactggatttgggttttccccgatttcaaaacatgggtacaggacgggtaa 9402629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 18908978 - 18908934
Alignment:
Q  80 gtttaggttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaa 124  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  18908978 gtttgggttttccccgatttcaaaatacggatatgggacgggtaa 18908934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 15498404 - 15498315
Alignment:
Q  85 ggttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatg 167  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||       ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  15498404 ggttttccccgatttcaaaacacgggtatgagacaggtaatgggtatataggtacccatcccgaacccacacccaaacccgtcccaaatg 15498315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 53 - 124
Target Start/End: Original strand, 29199861 - 29199932
Alignment:
Q  53 ttgacgggttttcccctttttgactgggtttaggttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaa 124  Q
    ||||||| ||||||||  ||||| ||||||| | |||||||||||||||||| | || || |||||||||||    
T  29199861 ttgacggattttccccgatttgattgggtttggattttccccgatttcaaaatacgggtacgggacgggtaa 29199932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 83
Target Start/End: Original strand, 3483843 - 3483917
Alignment:
Q  10 aacaaaatccatacccgtggttatccatctgaaccaaactcaatt-gacgggttttcccctttttgactgggttt 83  Q
    ||||||| |||||| | |||||| ||  | ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3483843 aacaaaacccatactcatggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgactgggttt 3483917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 12141553 - 12141479
Alignment:
Q  10 aacaaaatccatacccgtggttatccatctgaaccaaactcaatt-gacgggttttcccctttttgactgggttt 83  Q
    ||||||| |||||||  |||||| ||  | |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12141553 aacaaaacccatacctatggttacccgcccgaaccaaattcaatttgacgggttttccccgttttgactgggttt 12141479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 14034658 - 14034568
Alignment:
Q  10 aacaaaatccatacccgtggttatccatctgaaccaaactcaatt-gacgggttttcccctttttgactgggtttaggttttccccgattt 99  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| ||| | |||| |||| || || || ||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  14034658 aacaaaacccataaccgtggttacccacccgaactaaacccattttgatgggttttacccgttttgactgggtttgagttttccccgattt 14034568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 106
Target Start/End: Original strand, 8320771 - 8320824
Alignment:
Q  53 ttgacgggttttcccctttttgactgggtttaggttttccccgatttcaaaaca 106  Q
    ||||||| ||||||||  ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  8320771 ttgacggattttccccgctttgactaggtttgggttttccccaatttcaaaaca 8320824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 29341289 - 29341240
Alignment:
Q  125 ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaa 174  Q
    ||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29341289 ataggtacccatcccaaactcatacccaaacccgtcccgaatgtagaaaa 29341240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 40 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 9442567 - 9442527
Alignment:
Q  40 gaaccaaactcaatt-gacgggttttcccctttttgactgg 79  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  9442567 gaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgactgg 9442527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 38)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 17469411 - 17469124
Alignment:
Q  10 aacaaaatccatacccgtggttatccatctgaaccaaactcaatt-gacgggttttcccctttttgactgggtttaggttttccccgatttcaaaacatg 108  Q
    ||||||| |||||||||| |||| ||| | ||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  17469411 aacaaaacccatacccgtagttacccacccgaaccaaacccaatttgacggattttccccgttttgactgggtttgggttttccccgatttcaaaacacg 17469312  T
Q  109 gatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcat 201  Q
    | ||||||||||||||       |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  17469311 ggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacccgtcccaactgcagaaaactactttatgttgatatgccatgttat 17469212  T
Q  202 tttgtttgataattgatgtgttataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtgaa 289  Q
    |||||||||||||||   |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  17469211 tttgtttgataattgccttgttataaaagctaccattgatatttaaaggagaaactaaatcaatgggtctaaaaaattttaaagtgaa 17469124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 118 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 24568978 - 24568808
Alignment:
Q  118 cgggtaaataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattga 217  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  24568978 cgggtatataggtatccaccccgaacccatactcaaatccgtcccgaatggagaaaactactttatgttgatatgtca-gttattttgtttgataattga 24568880  T
Q  218 tgtgttataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtgaa 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24568879 tgtgttataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtgaa 24568808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 80 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 1012703 - 1012486
Alignment:
Q  80 gtttaggttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaa 172  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||       |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  1012703 gtttgggttttccccgattt-aaaacatgagtatgggacgggtaatgggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaactcgtcccgaatgcaaaa 1012605  T
Q  173 aa--ctactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgttataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtc 270  Q
    ||  |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1012604 aaaactactttatgttgatatgccatgttattttgtttgataattgctgtgttataaaaagtaccattgatatttaaaggagcaactaaatcaatcggtc 1012505  T
Q  271 taacaaatgttaaagtgaa 289  Q
    |||||||||||||||||||    
T  1012504 taacaaatgttaaagtgaa 1012486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 85 - 289
Target Start/End: Original strand, 43113634 - 43113845
Alignment:
Q  85 ggttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaacta 177  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||       |||||||||||||||| || |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  43113634 ggtttttcccgatttcaaaacacgggcatgggacgggtaacaggtatataggtacccaccccgaactcatacccaaatccgtctcgaatgcagaaaacta 43113733  T
Q  178 ctttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgttataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaa 277  Q
    ||| ||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  43113734 cttcatgttgatatgttatgttattttgttagataattgtcgtgttataaaaactatcattgatatttgaaggagcaactaaatcaatcggtataacaaa 43113833  T
Q  278 tgttaaagtgaa 289  Q
    ||||||||||||    
T  43113834 tgttaaagtgaa 43113845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 77 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 20399680 - 20399461
Alignment:
Q  77 tgggtttaggttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgca 169  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||       |||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  20399680 tgggtttgggttttctccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatatagatacccaccccgaacccattcccaaacccgtcccgaatgca 20399581  T
Q  170 gaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttg-ataattgatgtgttataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcgg 268  Q
     |||| || |||||||| ||||  ||||| ||||| |||  |||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||| ||||||    
T  20399580 aaaaattattttatgttgatataccatgttattttttttatataattgtcgtgttataaaaactagcattgatatttaaaggaccaaccaaatcaatcgg 20399481  T
Q  269 tctaacaaatgttaaagtga 288  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  20399480 tctaacaaatgttaaagtga 20399461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 120 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 34139485 - 34139316
Alignment:
Q  120 ggtaaataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaact-actttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgat 218  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| |||   ||||| |||||||||||||||||      
T  34139485 ggtatataggtacccaccccgaacc-atacccaaacccgtcccgaatgcaaaaaaattactttatgttgatagaccatgttattttgtttgataattgtc 34139387  T
Q  219 gtgttataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtgaa 289  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34139386 gtgttataaaaactaccattgatatttaaaggagtaaacaaatcaatcggtctaacaaatgttaaagtgaa 34139316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 32303229 - 32302929
Alignment:
Q  10 aacaaaatccatacccgtggttatccatctgaaccaaactcaatt-gacgggttttcccctttttgactgggtttaggt------------tttccccga 96  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||  | ||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||            |||||||||    
T  32303229 aacaaaacccatacccgtggttacccgcccgaaacaaacccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccga 32303130  T
Q  97 tttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaa-ctactttatgttaa 188  Q
    | || ||||| || ||||||||||||||       |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||| |||||||| |    
T  32303129 tctcgaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaaactattttatgttga 32303030  T
Q  189 tatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgtta-taaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtg 287  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||   ||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||    
T  32303029 tatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaataattttgtctaacaaatgtgaaagtg 32302930  T
Q  288 a 288  Q
    |    
T  32302929 a 32302929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 117 - 288
Target Start/End: Original strand, 24870071 - 24870242
Alignment:
Q  117 acgggtaaataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattg 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||| | |||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  24870071 acgggtatataggtacccaccccgagcccatacctaaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtcatgttaatttgtttgataattg 24870170  T
Q  217 atgtgttataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtga 288  Q
       |||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||||    
T  24870171 tcatgttaataaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtga 24870242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 117 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 24927990 - 24927819
Alignment:
Q  117 acgggtaaataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattg 216  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||||||    
T  24927990 acgggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgttatgttattttgtttgataattg 24927891  T
Q  217 atgtgtt-ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtg 287  Q
       | || ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||    
T  24927890 tcatcttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaataattttgtctaacaaatgtgaaagtg 24927819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 86 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 45236144 - 45235933
Alignment:
Q  86 gttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactac 178  Q
    |||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||       |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||| | |||| ||     
T  45236144 gttttccctgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaatgggtatataggtacccaccccgaacccatatccatacccgtcccaaatgtaaaaaattaa 45236045  T
Q  179 tttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgtt-ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaa 277  Q
    |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||    |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||    
T  45236044 tttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattatcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattccgtctaacaaa 45235945  T
Q  278 tgttaaagtgaa 289  Q
    ||||||||||||    
T  45235944 tgttaaagtgaa 45235933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 29108830 - 29109041
Alignment:
Q  85 ggttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaacta 177  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||       ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| | |||| ||    
T  29108830 ggtttttcccgattttaaaacatgggtatgggacgggtaacgggtatatatgtacccaccccgaacccatacccatacccgtcccaaatgtaaaaaatta 29108929  T
Q  178 ctttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgtt-ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaa 276  Q
    ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||   |||| ||||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||| | |  |||||||||    
T  29108930 ctttatgttgatatgtcatattattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttgaaggatcaattaaatcattacgtctaacaa 29109029  T
Q  277 atgttaaagtga 288  Q
    ||||||||||||    
T  29109030 atgttaaagtga 29109041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 53 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 14186432 - 14186205
Alignment:
Q  53 ttgacgggttttcccctttttgactgggtttaggttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggaccc 145  Q
    ||||||||||||| || |||||| |||||||  ||||| | ||||||||||||| || ||||||| ||||||       |||||||| ||||| | ||||    
T  14186432 ttgacgggttttctccgttttgattgggtttgagtttttctcgatttcaaaacacgggtatgggatgggtaacggatatataggtactcaccctgaaccc 14186333  T
Q  146 atacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgttataaaaactactattgatattt 245  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |  |||||    ||||||| ||||||||||    
T  14186332 atacccaaacccgtcctgaatgtagaaaattaatttatgttaatatgccatgttattttgtttgataacagtcgtgtt----aaactaccattgatattt 14186237  T
Q  246 aaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaa 277  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  14186236 aaaggagtaactaaatcaattggtctaacaaa 14186205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 284
Target Start/End: Original strand, 36131849 - 36132130
Alignment:
Q  10 aacaaaatccatacccgtggttatccatctgaaccaaactcaatt-gacgggttttcccctttttgactgggtttaggttttccccgatttcaaaacatg 108  Q
    |||||||| |||| ||||||||| ||| | |||||||||  |||| || || ||||  || |||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||| |    
T  36131849 aacaaaattcatatccgtggttacccacccgaaccaaacctaatttgatggattttttccgttttgattgggtttgagttttcccctatttcaaaacacg 36131948  T
Q  109 gatatgggacgggtaaat-------aggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcat 201  Q
      ||||||| |||||||        ||||| |||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||  || ||||||||| |||||||||| ||    
T  36131949 agtatgggatgggtaaagggcatacaggtatccaccccgaactcatacacaaatccgtcccgaatgcagaaagttattttatgtta-tatgtcatgttat 36132047  T
Q  202 tttgtttgataattgatgtgttataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaa 284  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||| | |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  36132048 tttgtttgataattgccgtgttataaaaattaccattaaaatttaaagaagcaattaaattaatcggtcaaacaaatgttaaa 36132130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 27932493 - 27932282
Alignment:
Q  85 ggttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaacta 177  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||       |||||||||||||||| |||||||| || | ||||||| |||| | |||| ||    
T  27932493 ggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgagtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatactcatatccgtcccaaatgtaaaaaatta 27932394  T
Q  178 ctttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgtt-ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaa 276  Q
     |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||   |||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||| | |  |||||||||    
T  27932393 ttttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaattaaatcattacgtctaacaa 27932294  T
Q  277 atgttaaagtga 288  Q
    ||||||||||||    
T  27932293 atgttaaagtga 27932282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 142 - 289
Target Start/End: Original strand, 28977186 - 28977334
Alignment:
Q  142 acccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgtt-ataaaaactactattga 240  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||   |||| ||||||||||| |||||    
T  28977186 acccacacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaactactttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattga 28977285  T
Q  241 tatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtgaa 289  Q
    |||||||| || ||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||    
T  28977286 tatttaaatgatcaactaaataattttgtctaacaaatgtgaaagtgaa 28977334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 85 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 1063587 - 1063375
Alignment:
Q  85 ggttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaacta 177  Q
    |||||| ||||||||||||||| || |||||||||| |||       ||| |||||||||||| || |||||||||| || |||| | || | |||| ||    
T  1063587 ggtttttcccgatttcaaaacacgggtatgggacggttaacgggtatataagtacccaccccgaactcatacccaaatccatcccaagtgtaaaaaatta 1063488  T
Q  178 ctttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgtt-ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaa 276  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||   |||| ||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| | || |||||||||    
T  1063487 ctttatgttgatatgtcttgttattttgtttgataattgtcatgttgataaaaattaccattgatatttaaacgatcaactaaatcattccgtctaacaa 1063388  T
Q  277 atgttaaagtgaa 289  Q
    |||||||||||||    
T  1063387 atgttaaagtgaa 1063375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 143 - 288
Target Start/End: Original strand, 2075907 - 2076053
Alignment:
Q  143 cccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgtt-ataaaaactactattgat 241  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||   |||| ||||||||||| ||||||    
T  2075907 cccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgat 2076006  T
Q  242 atttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtga 288  Q
    |||||||||| ||||||||| | |  ||||||||||||| |||||||    
T  2076007 atttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtgaaagtga 2076053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 188 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 35215474 - 35215373
Alignment:
Q  188 atatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgttataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtg 287  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35215474 atatgccatgttattttgtttgataattgtcgtgttataaaaactacccttgatatttaatggagcaactaaatcaatcggtctaacaaatgttaaagtg 35215375  T
Q  288 aa 289  Q
    ||    
T  35215374 aa 35215373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 10 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 34777228 - 34776945
Alignment:
Q  10 aacaaaatccatacccgtggttatccatctgaaccaaactcaattga-cgggttttcccctttttgactgggtttaggt------tttccccgatttcaa 102  Q
    |||||||  |||||||||| ||| || || ||||||||| ||||| | |||||||| ||| |||||||||||||| |||      ||| |||||| ||||    
T  34777228 aacaaaactcatacccgtgattacccgtccgaaccaaacccaatttaacgggtttttcccgttttgactgggtttgggtatgggtttttcccgatctcaa 34777129  T
Q  103 aacatggatatgggacgggtaaa-------taggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtca 195  Q
    |||| || ||||| ||| ||||        ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| |||| | |||| || |||||||| |||||| |    
T  34777128 aacacgggtatggaacgagtaacaggtatttaggtacccaccccgaacccatacccaaatccatcccaaatgtaaaaaattattttatgttgatatgtta 34777029  T
Q  196 tgtcattttgtttgataattgatgtgtt-ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaat 278  Q
    ||| |||||||||||||||||   |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |  |||||||||||    
T  34777028 tgttattttgtttgataattgcaatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaat 34776945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 142 - 288
Target Start/End: Original strand, 4230791 - 4230938
Alignment:
Q  142 acccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgtt-ataaaaactactattga 240  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||| |||  | |||| |||||||||||||||||   |||| ||||||||||  |||||    
T  4230791 acccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatacattatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactatcattga 4230890  T
Q  241 tatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtga 288  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |  ||||||||||||| |||||||    
T  4230891 tatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtaaaagtga 4230938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 125 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 34021509 - 34021348
Alignment:
Q  125 ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgtta 224  Q
    |||||||| ||||||  ||| |||| || || ||||| ||||||||||||  | |||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||   |  ||    
T  34021509 ataggtacacaccccaaaccaatacacagactcgtcctgaatgcagaaaatca-tttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgtcattata 34021412  T
Q  225 taaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtga 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||   ||||||||||||||||||||    
T  34021411 taaaaactactattgatatttaaaggagcaacgaaatcaattaatctaacaaatgttaaagtga 34021348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 149 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 17220726 - 17220586
Alignment:
Q  149 cccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgtt-ataaaaactactattgatatttaa 247  Q
    |||| ||||||||| |||| | || | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||   |||| ||||||||||| |||||||||| |    
T  17220726 cccatacccgtcccaaatgtaaaagattactttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttga 17220627  T
Q  248 aggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtga 288  Q
    |||| ||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||    
T  17220626 aggatcaattaaatcattacgtctaacaaatgttaaagtga 17220586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 53 - 124
Target Start/End: Original strand, 9642327 - 9642398
Alignment:
Q  53 ttgacgggttttcccctttttgactgggtttaggttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaa 124  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  9642327 ttgacgggttttccccgctttgactgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaa 9642398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 195 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 29089672 - 29089589
Alignment:
Q  195 atgtcattttgtttgataattgatgtgttataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaat 278  Q
    |||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  29089672 atgttattttgtttgataattattgtgttattaaaactatcattgatatttaaaggagcaactaaattaatgggtctaacaaat 29089589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 120 - 289
Target Start/End: Original strand, 11255058 - 11255224
Alignment:
Q  120 ggtaaataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatg 219  Q
    |||| ||||||||||||  || ||||||||||| ||||||||| |||| | |||| |||||| |||| |||||| |||| |||||||||||||||||       
T  11255058 ggtatataggtacccactacgaacccatacccatacccgtcccaaatgtaaaaaattactttgtgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgtca 11255156  T
Q  220 tgtt-ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtgaa 289  Q
    | || |||||||||||    |  |||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||    
T  11255157 tattaataaaaactac---cgtcatttaaaggatcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaa 11255224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 39445584 - 39445786
Alignment:
Q  85 ggttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaacta 177  Q
    |||||| ||||||||||||||| || |||||||| |||||       |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||| | ||||       
T  39445584 ggtttttcccgatttcaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtttataggtacccaccccgaactcatacccatacccgtcccaaatgtaaaaaa--- 39445680  T
Q  178 ctttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgtt-ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaa 276  Q
         |||  ||||||||||| |||||||||||||||||   |||| ||||||||||| |||||||||| || || ||| ||||| | || |||||||||    
T  39445681 -----tgtagatatgtcatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatattt-aatgatcaattaaatcattccgtctaacaa 39445774  T
Q  277 atgttaaagtga 288  Q
    ||||||||||||    
T  39445775 atgttaaagtga 39445786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 224 - 288
Target Start/End: Original strand, 40248502 - 40248566
Alignment:
Q  224 ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtga 288  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||||    
T  40248502 ataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattcagtctaacaaatgttaaagtga 40248566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 198
Target Start/End: Original strand, 40248371 - 40248499
Alignment:
Q  77 tgggtttaggttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgca 169  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||| || |||| ||||| |||       ||||||||||| |||| ||||||||||| | ||||||| |||| |    
T  40248371 tgggtatatgttttccccgatttcaaaacacgggtatgagacggataacgggtatataggtacccatcccgaacccatacccatatccgtcccaaatgta 40248470  T
Q  170 gaaaactactttatgttaatatgtcatgt 198  Q
     |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  40248471 aaaaattactttatgttgatatgtcatgt 40248499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 5700468 - 5700347
Alignment:
Q  53 ttgacgggttttcccctttttgactgggtttaggttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggaccc 145  Q
    ||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  | |||| ||| |||||       |||| |||||||| || ||||    
T  5700468 ttgacgggttttttccgttttgactgggtttaagtttttcccgatttcaaaacacaggtatgagactggtaacggggatatagatacccacctcgaaccc 5700369  T
Q  146 atacccaaacccgtcccgaatg 167  Q
    ||||||||| || |||||||||    
T  5700368 atacccaaatccatcccgaatg 5700347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 83
Target Start/End: Original strand, 4230650 - 4230724
Alignment:
Q  10 aacaaaatccatacccgtggttatccatctgaaccaaactcaatt-gacgggttttcccctttttgactgggttt 83  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||  | ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4230650 aacaaaatccatacatgtggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccattttgactgggttt 4230724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 24928117 - 24928043
Alignment:
Q  10 aacaaaatccatacccgtggttatccatctgaaccaaactcaatt-gacgggttttcccctttttgactgggttt 83  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||  | ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24928117 aacaaaacccatacccgcggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgactgggttt 24928043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 167
Target Start/End: Original strand, 30481476 - 30481518
Alignment:
Q  125 ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatg 167  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  30481476 ataggtacccaccccgaacccatacccaaactcgtcccgaatg 30481518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 83
Target Start/End: Original strand, 5858572 - 5858646
Alignment:
Q  10 aacaaaatccatacccgtggttatccatctgaaccaaactcaatt-gacgggttttcccctttttgactgggttt 83  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | | | ||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||    
T  5858572 aacaaaatccatacctgtggttacctacccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgattgggttt 5858646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 83
Target Start/End: Original strand, 40248291 - 40248365
Alignment:
Q  10 aacaaaatccatacccgtggttatccatctgaaccaaactcaatt-gacgggttttcccctttttgactgggttt 83  Q
    ||||||| ||||||||| |||||  |  ||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  40248291 aacaaaacccatacccgcggttactcgcctgaaccaaacccaatttgacgggtttttcccgttttgactgggttt 40248365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 10 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 1063681 - 1063609
Alignment:
Q  10 aacaaaatccatacccgtggttatccatctgaaccaaactcaatt-gacgggttttcccctttttgactgggt 81  Q
    |||||||  |||||||||||||| ||  | ||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  1063681 aacaaaactcatacccgtggttacccgcccgaaccaaacccgatttgacgggttttccccgttttgactgggt 1063609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 130 - 174
Target Start/End: Original strand, 9476073 - 9476117
Alignment:
Q  130 tacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaa 174  Q
    |||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  9476073 tacccacctcgaacccatacccaaacccatcccgaatgtagaaaa 9476117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 40 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 27932551 - 27932507
Alignment:
Q  40 gaaccaaactcaatt-gacgggttttcccctttttgactgggttt 83  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27932551 gaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgactgggttt 27932507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 224 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 31325197 - 31325134
Alignment:
Q  224 ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtga 288  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| | |  ||||||||||||| |||||||    
T  31325197 ataaaaactaccattgatatttaaa-gatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtgaaagtga 31325134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 134; Significance: 9e-70; HSPs: 35)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 10 - 288
Target Start/End: Original strand, 6027821 - 6028108
Alignment:
Q  10 aacaaaatccatacccgtggttatccatctgaaccaaactcaatt-gacgggttttcccctttttgactgggtttaggttttccccgatttcaaaacatg 108  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||  | ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  6027821 aacaaaacccatactcgtggttatccgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggttttccccgattttaaaacatg 6027920  T
Q  109 gatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcat 201  Q
    | |||| |||||||||       |||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||| || |||||||| ||| | ||||| ||    
T  6027921 ggtatgagacgggtaacaggtatataggtacccaccccgaacccatactcatacccgtcctgaatgcagaaaagtattttatgttgataagccatgttat 6028020  T
Q  202 tttgtttgataattgatgtgttat-aaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtga 288  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  6028021 tttgtttgataattgtcgtgttataaaaaactatcattgatatttaaaggagcaactaaatcaattggtctaacaaatgttaaagtga 6028108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 120 - 289
Target Start/End: Original strand, 31942236 - 31942405
Alignment:
Q  120 ggtaaataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatg 219  Q
    |||| ||| |||||||||||  ||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||  |    
T  31942236 ggtatataagtacccaccccaaacccataaccaaacctgtcacaaatgcagaaaactactttatgctgatatgccatgttattttgtttgataattgtcg 31942335  T
Q  220 tgttataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtgaa 289  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  31942336 tgttataaaaactaccattgatatttaaaggagcaactaaatcagtcggtctaacaaatgttaaagtgaa 31942405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 117 - 288
Target Start/End: Original strand, 19104888 - 19105059
Alignment:
Q  117 acgggtaaataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattg 216  Q
    ||||||| ||||||| ||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||| ||||||||| |||||||    
T  19104888 acgggtatataggtatccacctcgaatccatactcaaacccgtcccgaatgcagaaaattactttatgttgacgtgtcatgttattttgtttaataattg 19104987  T
Q  217 atgtgttataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtga 288  Q
      ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  19104988 ccgtgttataaaaactactatcgatatttaaaagagcaactaaatcgatcggtctaacaaatgttaaagtga 19105059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 24414140 - 24414351
Alignment:
Q  85 ggttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaacta 177  Q
    ||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||       |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  24414140 ggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacaggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaacta 24414239  T
Q  178 ctttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgtt-ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaa 276  Q
    ||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||   |||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |  |||||||||    
T  24414240 ctttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaatgatcaactaaataattttgtctaacaa 24414339  T
Q  277 atgttaaagtga 288  Q
    |||| |||||||    
T  24414340 atgtgaaagtga 24414351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 30847115 - 30846815
Alignment:
Q  10 aacaaaatccatacccgtggttatccatctgaaccaaactcaatt-gacgggttttcccctttttgactgggtttaggt------------tttccccga 96  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||  | ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||            |||||||||    
T  30847115 aacaaaacccatacccgtggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccga 30847016  T
Q  97 tttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaa-ctactttatgttaa 188  Q
    | || ||||| || ||||||||||||||       |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || | |||| |||||||||||| |    
T  30847015 tctcgaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaattgtaaaaaaactactttatgttga 30846916  T
Q  189 tatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgtta-taaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtg 287  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||   ||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||    
T  30846915 tatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaataattttgtctaacaaatgtgaaagtg 30846816  T
Q  288 a 288  Q
    |    
T  30846815 a 30846815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 9632555 - 9632256
Alignment:
Q  10 aacaaaatccatacccgtggttatccatctgaaccaaactcaatt-gacgggttttcccctttttgactgggttta------------ggttttccccga 96  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| |||||||             ||||||||||||    
T  9632555 aacaaaacccatacccgtggttacccgcccgaaccaaactcaatttgacgggtttttcccgttttgaatgggtttgagtatgggtatgggttttccccga 9632456  T
Q  97 tttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaat 189  Q
    | || ||||| || ||||||||||||||       ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| ||    
T  9632455 tctcgaaacacgggtatgggacgggtaatgggtatataggtatccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaactactttatgttgat 9632356  T
Q  190 atgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgtt-ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtga 288  Q
    |||| |||| ||||| ||| |||||||   |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||    
T  9632355 atgttatgttatttttttttataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaataattttgtctaacaaatgtgaaagtga 9632256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 117 - 288
Target Start/End: Original strand, 13705408 - 13705580
Alignment:
Q  117 acgggtaaataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattg 216  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||   |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13705408 acgggtatataggtacccaccccgaacccatacctaaacccgtcccaaatgtgaaaaattactttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattg 13705507  T
Q  217 atgtgtt-ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtga 288  Q
       |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | || || ||||||||||||||||||    
T  13705508 tcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattccgtataacaaatgttaaagtga 13705580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 117 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 14540823 - 14540656
Alignment:
Q  117 acgggtaaataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattg 216  Q
    ||||||| ||||| |||||| | | | |||||| |||| |||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14540823 acgggtatataggcacccactcggaatccatactcaaatccgtcccgaacgtagaaaattactttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattg 14540724  T
Q  217 atgtgttataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtga 288  Q
      ||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  14540723 tcgtgttataaaaactac----gatatttaaaggagcaactaaatcaatcagtctaacaaatgttaaagtga 14540656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 117 - 289
Target Start/End: Original strand, 36128153 - 36128327
Alignment:
Q  117 acgggtaaataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaa-ctactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataatt 215  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  36128153 acgggtatataggtactcaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaaactactttatgttgatatgttatgttattttgtttgataatt 36128252  T
Q  216 gatgtgtta-taaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtgaa 289  Q
    |   ||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||    
T  36128253 gtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaataattttgtctaacaaatgtgaaagtgaa 36128327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 86 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 45256903 - 45256692
Alignment:
Q  86 gttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactac 178  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||| ||||| |||       ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| | |||| |||    
T  45256903 gttttccccgatttcaaaacacgggtatgagacggttaatgggtatataagtacccaccccgaacccatacctaaacccgtcccaaatgtaaaaaattac 45256804  T
Q  179 tttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgtt-ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaa 277  Q
    ||||| || ||||||| ||| |||||||||||||||||   |||| ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||    
T  45256803 tttattttgatatgtcttgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaattaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattccgtctaacaaa 45256704  T
Q  278 tgttaaagtgaa 289  Q
    ||||||||||||    
T  45256703 tgttaaagtgaa 45256692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 93 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 10920711 - 10920515
Alignment:
Q  93 ccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaaataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatg 192  Q
    ||||| |||||||| |  |||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| | |||| ||||||||||| |||||    
T  10920711 ccgatctcaaaacacgagtatgggacggatatataggtatccaccccgaacccatacccaaatccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatg 10920612  T
Q  193 tcatgtcattttgtttgataattgatgtgtt-ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtga 288  Q
    | |||| |||||||||||||||||   |||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| | |  ||||||||||||| |||||||    
T  10920611 ttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtgaaagtga 10920515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 37999646 - 37999353
Alignment:
Q  10 aacaaaatccatacccgtggttatccatctgaaccaaactcaatt-gacgggttttcccctttttgactgggtttaggt------tttccccgatttcaa 102  Q
    ||||||| ||||| |||||||||  |  | |||||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||| | |||      |||||||||| ||||    
T  37999646 aacaaaacccatatccgtggttagtcgcccgaaccaaattcaatttgacgggtttcccccattttgactgggtatgggtatgggttttccccgatctcaa 37999547  T
Q  103 aacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtca 195  Q
    |||| || |||| |||||||||       ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||| |||||| |    
T  37999546 aacacgggtatgagacgggtaacgggtatataagtacccaccccgaactcatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtta 37999447  T
Q  196 tgtcattttgtttgataattgatgtgtt-ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtga 288  Q
    ||| |||||||||||||||||   |||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| | |  ||||||||||||| |||||||    
T  37999446 tgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaagaatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtgaaagtga 37999353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 13830904 - 13830606
Alignment:
Q  10 aacaaaatccatacccgtggttatccatctgaaccaaactcaatt-gacgggttttcccctttttgactgggtttaggt------------tttccccga 96  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||  | ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||            ||||| |||    
T  13830904 aacaaaacccatacccgtggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccattttgactgggtttgggtatgggtatgggttttcctcga 13830805  T
Q  97 tttcaaaacatggatatgggacgg------gtaaataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaata 190  Q
    | |||||||| || ||||||||||      ||| ||| |||||||||||| |||||||| |||||| ||||| |||| | |||| ||||||||||| |||    
T  13830804 tctcaaaacacgggtatgggacggtaacgggtatataagtacccaccccgaacccatactcaaacctgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgata 13830705  T
Q  191 tgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgt-tataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtga 288  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||   |||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |  ||||||||||||| |||||||    
T  13830704 tgttatgttattttgtttgataattgtcatgtaaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtgaaagtga 13830606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 145 - 289
Target Start/End: Original strand, 16226803 - 16226946
Alignment:
Q  145 catacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgttataaaaactactattgatatt 244  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||    
T  16226803 catacccaaacccgttcggaatgcagaaa-ctacttcatgttgatttgtcatgttattttatttgataattgtcgtgttataaaaactaccattgatatt 16226901  T
Q  245 taaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtgaa 289  Q
    ||||  ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  16226902 taaattagcaactaaatcaattggtctaagaaatgttaaagtgaa 16226946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 120 - 288
Target Start/End: Original strand, 8915987 - 8916156
Alignment:
Q  120 ggtaaataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatg 219  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| | |||| || |||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||       
T  8915987 ggtatataggtacccaccccgaacccatactcaaacccgtcccaaatgtaaaaaattattttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtca 8916086  T
Q  220 tgtt-ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtga 288  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| | |  ||||||||||||| |||||||    
T  8916087 tgttaataaaaactaccattgatatttaaaggattaactaaattattttgtctaacaaatgtgaaagtga 8916156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 10208438 - 10208649
Alignment:
Q  85 ggttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaacta 177  Q
    |||||||||| || | |||||| || ||||||||||||||       ||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||| |||| | |||| ||    
T  10208438 ggttttccccaatcttaaaacacgggtatgggacgggtaatggatatataggtacctaccccgaacccatactcaaaccagtcccaaatgtaaaaaatta 10208537  T
Q  178 ctttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgtt-ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaa 276  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||   |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |  |||| ||||    
T  10208538 ctttatgttaatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtcttacaa 10208637  T
Q  277 atgttaaagtga 288  Q
    |||| |||||||    
T  10208638 atgtgaaagtga 10208649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 86 - 289
Target Start/End: Original strand, 12193836 - 12194047
Alignment:
Q  86 gttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactac 178  Q
    ||||| |||||||||| |||| || ||||||||||||||       |||| |||||||| || | ||||| ||| ||||||||| |||| | |||| |||    
T  12193836 gtttttcccgatttcagaacacgggtatgggacgggtaatgggtatatagatacccacctcgaatccatatccatacccgtcccaaatgtaaaaaattac 12193935  T
Q  179 tttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgtt-ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaa 277  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    |||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || | || ||||||||||    
T  12193936 tttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattatcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactacatcattccgtctaacaaa 12194035  T
Q  278 tgttaaagtgaa 289  Q
    ||||||||||||    
T  12194036 tgttaaagtgaa 12194047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 117 - 287
Target Start/End: Original strand, 7314695 - 7314866
Alignment:
Q  117 acgggtaaataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattg 216  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| | |||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |     
T  7314695 acgggtatataggttcccaccccgaacccatacccacacccgtcccaaatgtaaaaaattattttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataaata 7314794  T
Q  217 atgtgtt-ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtg 287  Q
       |||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| | || ||||| ||||||||||||||    
T  7314795 tcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattccgtctatcaaatgttaaagtg 7314866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 37106773 - 37106569
Alignment:
Q  85 ggttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaacta 177  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||       |||||||||||| ||| ||||||||||      ||||| |||| | |||| ||    
T  37106773 ggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccactccgaacccataccc------gtcccaaatgtaaaaaatta 37106680  T
Q  178 ctttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgtta-taaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaa 276  Q
    ||||||||| |||| | |||| |||||||||||||||||   ||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||    
T  37106679 ctttatgttgatatat-atgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattccgtctaacaa 37106581  T
Q  277 atgttaaagtga 288  Q
    ||||||||||||    
T  37106580 atgttaaagtga 37106569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 117 - 288
Target Start/End: Original strand, 42798035 - 42798208
Alignment:
Q  117 acgggtaaataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaact-actttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataatt 215  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||||| ||||| |||| | |||| | |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  42798035 acgggtatataagtacccaccccgaacccatacacaaacctgtcccaaatgtaaaaaaattactttatgttgatatgttatgttattttgtttgataatt 42798134  T
Q  216 gatgtgtta-taaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtga 288  Q
    |   ||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |  ||||||||||||| |||||||    
T  42798135 gtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtgaaagtga 42798208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 86 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 45115638 - 45115428
Alignment:
Q  86 gttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactac 178  Q
    ||||||| ||||||||||||| || |||| |||||||||       ||||||||||| |||| |||||||   |||||| |||| |||| | |||| |||    
T  45115638 gttttcctcgatttcaaaacacgggtatgagacgggtaacaggtatataggtacccatcccgaacccatagttaaacccatcccaaatgtaaaaaattac 45115539  T
Q  179 tttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgtt-ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaa 277  Q
     ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||   |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| | |  |||||| |||    
T  45115538 attatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaattaaatcattttgtctaataaa 45115439  T
Q  278 tgttaaagtga 288  Q
    |||||||||||    
T  45115438 tgttaaagtga 45115428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 44746117 - 44746328
Alignment:
Q  85 ggttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaacta 177  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||       ||| ||||||||  |  || ||||| |||||||||||| |||| ||||||  |    
T  44746117 ggttttccccgatttcaaaacacgaatatgggacgggtaatgggtatatatgtacccacttcaaactcatactcaaacccgtcccaaatgtagaaaatca 44746216  T
Q  178 ctttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattg--atgtgttataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaaca 275  Q
    |||||| || ||||| ||||| ||||| |||||| ||||  ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||    
T  44746217 ctttatcttgatatgccatgttattttatttgatcattgtaatg-gttataaaaactatcattgatatttaaaggagcaaataaattattccgtctaaca 44746315  T
Q  276 aatgttaaagtga 288  Q
    ||||||| |||||    
T  44746316 aatgttagagtga 44746328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 195 - 288
Target Start/End: Original strand, 37472854 - 37472948
Alignment:
Q  195 atgtcattttgtttgataattgatgtgtta-taaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtga 288  Q
    |||| |||||||||||||||||   ||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||||    
T  37472854 atgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattctgtctaacaaatgttaaagtga 37472948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 78 - 174
Target Start/End: Original strand, 35248386 - 35248489
Alignment:
Q  78 gggtttaggttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaaat-------aggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcag 170  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||||| || |||||||||||||||        |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  35248386 gggtttgggttttccacgattacaaaacacgggtatgggacgggtaaaggggataaaggtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcctgaatgtag 35248485  T
Q  171 aaaa 174  Q
    ||||    
T  35248486 aaaa 35248489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 289
Target Start/End: Original strand, 18106162 - 18106310
Alignment:
Q  142 acccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgtta-taaaaactactattga 240  Q
    |||||||||| |||| || || |||| | |||| || |||||||| |||  | |||| |||||||||||||||||   ||||| |||||||||  |||||    
T  18106162 acccatacccgaacctgttccaaatgtaaaaaattattttatgttgatacattatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactatcattga 18106261  T
Q  241 tatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtgaa 289  Q
    ||||||||||| ||| ||||| | |  ||||||||||||| ||||||||    
T  18106262 tatttaaaggatcaattaaatcattttgtctaacaaatgtgaaagtgaa 18106310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 238 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 37319862 - 37319811
Alignment:
Q  238 tgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtgaa 289  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  37319862 tgatatttaaagtagcaactaaatcaatcggtctaacaaatgttaaaatgaa 37319811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 77 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 15546833 - 15546786
Alignment:
Q  77 tgggtttaggttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaa 124  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  15546833 tgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaa 15546786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 76 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 25210467 - 25210362
Alignment:
Q  76 ctgggtttaggttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgc 168  Q
    ||||||||||||||| ||||| || |||||| || ||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||||     
T  25210467 ctgggtttaggtttttcccgactttaaaacacgggtatgggacgggtaacgaggatatatgtacccaccccaaacccataccaaaacccctcccgaatgt 25210368  T
Q  169 agaaaa 174  Q
    ||||||    
T  25210367 agaaaa 25210362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 12341769 - 12341695
Alignment:
Q  10 aacaaaatccatacccgtggttatccatctgaaccaaactcaatt-gacgggttttcccctttttgactgggttt 83  Q
    |||||||  |||||||| |||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  12341769 aacaaaactcatacccgcggttatccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgactgagttt 12341695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 124
Target Start/End: Original strand, 37472679 - 37472806
Alignment:
Q  10 aacaaaatccatacccgtggttatccatctgaaccaaactcaatt-gacgggttttcccctttttgactgggtttaggt------------tttccccga 96  Q
    ||||||| |||||||||  |||| ||  | ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||            |||||||||    
T  37472679 aacaaaacccatacccgcagttacccgcccgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgagtatggattttccccga 37472778  T
Q  97 tttcaaaacatggatatgggacgggtaa 124  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||    
T  37472779 tttcaaaacacgggtatgggacgggtaa 37472806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 129 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 35965365 - 35965320
Alignment:
Q  129 gtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaa 174  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35965365 gtacccactccgaacccatacccaaacccgtcccgaatgtagaaaa 35965320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 77 - 173
Target Start/End: Original strand, 38342519 - 38342622
Alignment:
Q  77 tgggtttaggttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgca 169  Q
    |||||||  |||||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||       ||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |    
T  38342519 tgggtttgagttttccccgattttaaaatacggatacgggacgggtaacggggatatatgtacccaccccgaacccatacccaaaccctacccgaatgta 38342618  T
Q  170 gaaa 173  Q
    ||||    
T  38342619 gaaa 38342622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 106
Target Start/End: Original strand, 35409160 - 35409196
Alignment:
Q  70 ttttgactgggtttaggttttccccgatttcaaaaca 106  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35409160 ttttgactgggtttgggttttccccgatttcaaaaca 35409196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 83
Target Start/End: Original strand, 24414052 - 24414126
Alignment:
Q  10 aacaaaatccatacccgtggttatccatctgaaccaaactcaatt-gacgggttttcccctttttgactgggttt 83  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||  | ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||    
T  24414052 aacaaaacccatacctgtggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgattgggttt 24414126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 83
Target Start/End: Original strand, 36128026 - 36128100
Alignment:
Q  10 aacaaaatccatacccgtggttatccatctgaaccaaactcaatt-gacgggttttcccctttttgactgggttt 83  Q
    ||||||| |||||||||||||||  | || |||||||||  |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  36128026 aacaaaacccatacccgtggttactcgtccgaaccaaacctaatttgacggattttccccgttttgactgggttt 36128100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 47)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 10 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 12447536 - 12447250
Alignment:
Q  10 aacaaaatccatacccgtggttatccatctgaaccaaactcaatt-gacgggttttcccctttttgactgggtttaggttttccccgatttcaaaacatg 108  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||||  ||||  ||||||      
T  12447536 aacaaaacccatacccgtggttacccacccgaaccaaacccaatttgacggattt-ccccattttgactgggtttgggttttccttgattgtaaaacaca 12447438  T
Q  109 gatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcat 201  Q
    | |||||||| |||||       |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12447437 ggtatgggacaggtaatgggtatataggtacccaccccgaacctatacccaaacccgtcccaaatatagaaaactactttatgttaatatgtcatgttat 12447338  T
Q  202 tttgtttgataattgatgtgttataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtgaa 289  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  12447337 tttgtttgataattgtcgtgttataaaaactaccattgatatttaaaggagcagttaaatcaatcgatctaacaaatgttaaagtgaa 12447250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 53 - 284
Target Start/End: Original strand, 38006446 - 38006684
Alignment:
Q  53 ttgacgggttttcccctttttgactgggtttaggttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggaccc 145  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | || ||||||||| ||||       |||||||||||||||| ||||    
T  38006446 ttgacgggttttctccattttgactgggtttgggttttccccaatttcaaaatacgggtatgggacgcgtaacagatatataggtacccaccccgaaccc 38006545  T
Q  146 atacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgttataaaaactactattgatattt 245  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  || |||||||||| || ||||||||||    
T  38006546 atacccaaatccgtcccgaatgttgaaaattaatttatgttaatatgtcatgttattttgtttgataatagtcgtattataaaaaccaccattgatattt 38006645  T
Q  246 aaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaa 284  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||    
T  38006646 aaaggagcaactaaatcaattggtctaacaattgttaaa 38006684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 117 - 288
Target Start/End: Original strand, 2412774 - 2412945
Alignment:
Q  117 acgggtaaataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattg 216  Q
    ||||||| ||| ||||||| || | ||| |||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2412774 acgggtatatatgtacccatcctgaaccaatacccaaactcgtcccgtatgcagaaaattactttatattgatatgtcatgttattttgtttgataattg 2412873  T
Q  217 atgtgttataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtga 288  Q
     ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  2412874 ttgtgtcataaaaactacaattgatatttaaaggagcaactaaattaatcggtctaacaaatattaaagtga 2412945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 61 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 2985251 - 2985017
Alignment:
Q  61 ttttcccctttttgactgggtttaggttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaa 153  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||       |||||||| || |||| | ||||||||||    
T  2985251 ttttccccgttttgactgggtttgagttttctccgatttcaagacatgggtttgggacgggtaacgggtatataggtactcatcccgaaaccatacccaa 2985152  T
Q  154 acccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgttataaaaactactattgatatttaaaggagc 253  Q
    | | ||| |||||  |||||| || ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  2985151 atctgtctcgaatatagaaaattattttatattgatatgtcatgttattttatttgataattgttgtgttataaaaactatcattgatatttaaaggagc 2985052  T
Q  254 aactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtga 288  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  2985051 aactaaatcaatcggtctaacaaatattaaagtga 2985017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 117 - 289
Target Start/End: Original strand, 35194037 - 35194209
Alignment:
Q  117 acgggtaaataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattg 216  Q
    ||||||| |||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  35194037 acgggtatataggtacccaccccaaactcatactcaaacccgtcccgaatgtagaaaattactttatgttaatatgctatgttattttgtttgataattg 35194136  T
Q  217 atgtgttataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtgaa 289  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  35194137 ctgtgttataaaaactaccattgatatttaaagaataaactaaatcaattggtctaaaaaatgttaaagtgaa 35194209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 131 - 286
Target Start/End: Original strand, 27088414 - 27088568
Alignment:
Q  131 acccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgttataaaaa 230  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| || |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  27088414 acccaccccgaacccatacccaaacccgtctcgaatgtagaaaattattttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgttatgttataaaaa 27088512  T
Q  231 ctactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagt 286  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27088513 ctatcattgatatttaaaggagcaactaaatcaatcggtctaacaaatgttaaagt 27088568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 142 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 3573240 - 3573094
Alignment:
Q  142 acccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgttataaaaactactattgat 241  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| |||||| || |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  3573240 acccatactcaaacccctcccgaatgtagaaaattattttatgttgatatgtcatgttattctgtttgataattgtcgtgttataaaaactaccattgat 3573141  T
Q  242 atttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtga 288  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3573140 attcaaaggagcaactaaatcaatcggtctaacaaatgttaaagtga 3573094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 4583199 - 4582988
Alignment:
Q  85 ggttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaacta 177  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||       |||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||| |||| | |||| ||    
T  4583199 ggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggttcccaccccaaacccatacccatacccgtcccaaatgtaaaaaatta 4583100  T
Q  178 ctttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgtt-ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaa 276  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||   |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | || ||||| |||    
T  4583099 ctttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattccgtctatcaa 4583000  T
Q  277 atgttaaagtga 288  Q
    ||||||||||||    
T  4582999 atgttaaagtga 4582988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 10 - 288
Target Start/End: Original strand, 5908609 - 5908908
Alignment:
Q  10 aacaaaatccatacccgtggttatccatctgaaccaaactcaatt-gacgggttttcccctttttgactgggtttaggt------------tttccccga 96  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| |||            |||||||||    
T  5908609 aacaaaatccatacccgtggttatccgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccattttgattgggtttgggtatgggtatgagttttccccga 5908708  T
Q  97 tttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaat 189  Q
    | || ||||| || ||||||||||||||       ||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||| ||    
T  5908709 tctcgaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatatatgtacacaccccaaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgat 5908808  T
Q  190 atgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgtt-ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtga 288  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||   |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||    
T  5908809 atgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaataattttgtctaacaaatgtgaaagtga 5908908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 4920994 - 4920695
Alignment:
Q  10 aacaaaatccatacccgtggttatccatctgaaccaaactcaatt-gacgggttttcccctttttgactgggtttag------------gttttccccga 96  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||  | ||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |            |||||||||||    
T  4920994 aacaaaacccatacccgtggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttctccgttttgactgggtttggttatgggtatgggttttccccga 4920895  T
Q  97 tttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaat 189  Q
    | |||||||| || ||||||||||||||       ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||| ||    
T  4920894 tctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtatccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgat 4920795  T
Q  190 atgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgtt-ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtga 288  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||   |||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| | |  ||||||||||||| |||||||    
T  4920794 atgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaatgatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtgaaagtga 4920695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 117 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 30115524 - 30115353
Alignment:
Q  117 acgggtaaataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattg 216  Q
    ||||||| || |||||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||||| |||| || |||||||| |||||  |||| |||||||||||||||||    
T  30115524 acgggtatattggtacccatcccgaacccatattcaaacccgtcccgaatgcataaaattattttatgttgatatgctatgttattttgtttgataattg 30115425  T
Q  217 atgtgttataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtga 288  Q
      ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  30115424 ccgtgttataaaaaccaccatttatatttaaaggagcaactaaatcgatcagtctaacaaatgttaaagtga 30115353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 120 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 18207056 - 18206888
Alignment:
Q  120 ggtaaataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactt-tatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataatt-ga 217  Q
    |||| |||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||| |     
T  18207056 ggtatataggtacccaccc-gaacccatattcaaacccgtcccgaatgtagaaaattacttctatgttgatatgccatgttattttgtttaataatttgc 18206958  T
Q  218 tgtgttataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtg 287  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  18206957 cgtgttataaaaactactaatgatatttaaaggagcaactaaatcaatcggtctaacaaatattaaagtg 18206888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 117 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 1218796 - 1218626
Alignment:
Q  117 acgggtaaataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattg 216  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||| | |||| ||||||||||| || ||| |||| |||||||||||||||||    
T  1218796 acgggtatataggtacccactccgaacccatacccatacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatttgt-atgttattttgtttgataattg 1218698  T
Q  217 atgtgttataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtga 288  Q
       ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||||    
T  1218697 tcatgttaaaaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtga 1218626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 85 - 289
Target Start/End: Original strand, 17853302 - 17853512
Alignment:
Q  85 ggttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaacta 177  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||       |||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||| | |||| ||    
T  17853302 ggttttccccgatttcaaa-cacgggtatgggacgggtaacggatatatagatacccactccgaacccatacccatacccgtcccaaatgtaaaaaatta 17853400  T
Q  178 ctttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgtta-taaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaa 276  Q
    ||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||   ||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||    
T  17853401 ctttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattccgtctaacaa 17853499  T
Q  277 atgttaaagtgaa 289  Q
    |||||||||||||    
T  17853500 atgttaaagtgaa 17853512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 80 - 288
Target Start/End: Original strand, 6155924 - 6156138
Alignment:
Q  80 gtttaggttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaa-----ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaa 174  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || ||| |||| |||||     ||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||  |||||    
T  6155924 gtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtataggacaggtaaggtatatatgtacccaccccgaacccatacccaaaaccgtcacaaatgttgaaaa 6156023  T
Q  175 ctactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattg--atgtgttataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtcta 272  Q
     ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||  ||| || ||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||| | || |||||    
T  6156024 ttactttatgtttatatgacatgttattttgtttgataattgtcatg-gtaataaaaaatatcattgatatttaaaggagcaaataaatcattccgtcta 6156122  T
Q  273 acaaatgttaaagtga 288  Q
    ||||||||||||||||    
T  6156123 acaaatgttaaagtga 6156138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 117 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 28045696 - 28045523
Alignment:
Q  117 acgggtaaataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattg 216  Q
    ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||| | |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  28045696 acgggtatataggtacccaccc-gaacccatacccatacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtcatgttattttgttttataattg 28045598  T
Q  217 atgtgtt--ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtgaa 289  Q
     | ||||  ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||    
T  28045597 ttatgttaaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattacgtctaacaaatgttaaagtgaa 28045523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 117 - 278
Target Start/End: Original strand, 6092566 - 6092728
Alignment:
Q  117 acgggtaaataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattg 216  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| | |||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||    
T  6092566 acgggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaatccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattg 6092665  T
Q  217 atgtgtt-ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaat 278  Q
       |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |  |||||||||||    
T  6092666 caatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaat 6092728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 288
Target Start/End: Original strand, 12834495 - 12834795
Alignment:
Q  10 aacaaaatccatacccgtggttatccatctgaaccaaactcaatt-gacgggttttcccctttttgactgggtttaggt------------tttccccga 96  Q
    ||||||| ||||||  ||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||            |||| || |    
T  12834495 aacaaaacccatacatgtggttacccgtccgaaccaaactcaatttgacgggttttccccattttgactgggtttgggtatgggtatgggttttctccaa 12834594  T
Q  97 tttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaat 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| |||| | |||| || |||||||| ||    
T  12834595 tttcaaaacatggatatgggacgggtaacaggtatataggtacctaccccgaacccatacccatacccgtcccaaatgtaaaaaattaatttatgttgat 12834694  T
Q  190 atgtc-atgtcattttgtttgataattgatgtgtt-ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtg 287  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||   |||| ||||||||||| |||||||||| || || ||| |||||   |  ||||||||||||||||||||    
T  12834695 atgtctatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttgaatgatcaattaaatcgttacgtctaacaaatgttaaagtg 12834794  T
Q  288 a 288  Q
    |    
T  12834795 a 12834795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 93 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 35311894 - 35311692
Alignment:
Q  93 ccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgt 185  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||       |||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||| |||| | |||| || |||||||    
T  35311894 ccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacagatatataggtacccactccgaacccatactcatacccgtcccaaatgtaaaaaattattttatgt 35311795  T
Q  186 taatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgtta-taaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaa 284  Q
    | |||||| |||| |||||||||||||||||   ||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||    
T  35311794 tgatatgt-atgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaa 35311696  T
Q  285 gtga 288  Q
    ||||    
T  35311695 gtga 35311692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 117 - 288
Target Start/End: Original strand, 22694949 - 22695121
Alignment:
Q  117 acgggtaaataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattg 216  Q
    ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||| || |||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||    
T  22694949 acgggtatagaggtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaattattttatgttgatatgtaatgttattttgtttgataattg 22695048  T
Q  217 atgtgtt-ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtga 288  Q
       |||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || | |  ||||||||||||| |||||||    
T  22695049 tcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactatatcattttgtctaacaaatgtgaaagtga 22695121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 87 - 288
Target Start/End: Original strand, 42987490 - 42987699
Alignment:
Q  87 ttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactact 179  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||||||||| ||||       ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||| || |    
T  42987490 ttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgtgtaacggatatataggtacccatcccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaattatt 42987589  T
Q  180 ttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgtt-ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaat 278  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||   |||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| | |  |||||||||||    
T  42987590 ttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaat 42987689  T
Q  279 gttaaagtga 288  Q
    || |||||||    
T  42987690 gtgaaagtga 42987699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 85 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 15890286 - 15890075
Alignment:
Q  85 ggttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaacta 177  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||       |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||| | |||| ||    
T  15890286 ggttttctccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccc-gaacccatacccatacccgtcccaaatgtaaaaaatta 15890188  T
Q  178 ctttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgtt-ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaa 276  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||   | || || |||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||| |  |||||||||    
T  15890187 ctttatgttgatatgtcatgttattttatttgataattgtcatattaatgaaaactaccattgatatttgaaggatcaattaaataattacgtctaacaa 15890088  T
Q  277 atgttaaagtgaa 289  Q
    |||||||||||||    
T  15890087 atgttaaagtgaa 15890075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 155 - 289
Target Start/End: Original strand, 33862270 - 33862403
Alignment:
Q  155 cccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgttataaaaactactattgatatttaaaggagca 254  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||   |||| |||||||||| ||||||||||||| || ||    
T  33862270 cccgtcccgaatgcagaaaactattttatgttgatatgccatgttattttgtttgataattgtcatgttgtaaaaactacgattgatatttaaatgacca 33862369  T
Q  255 actaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtgaa 289  Q
    ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||    
T  33862370 actaaatcaat-gggctaacaaatgttaaagtgaa 33862403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 86 - 288
Target Start/End: Original strand, 12866561 - 12866772
Alignment:
Q  86 gttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactac 178  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||       ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||| | |||| |||    
T  12866561 gttttctccgatttcaaaacatgggtatgggacgggtaacaggtatataggtacccaccgcgaacccatacccatacccgtcccaaatgtaaaaaattac 12866660  T
Q  179 tttatgttaatatgtc-atgtcattttgtttgataattgatgtgtt-ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaa 276  Q
    |||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||   |||| ||||||||||| |||||||||| || || ||| |||||   |  |||||||||    
T  12866661 tttatgttgatatgtctatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttgaatgatcaattaaattgttacgtctaacaa 12866760  T
Q  277 atgttaaagtga 288  Q
    ||||||||||||    
T  12866761 atgttaaagtga 12866772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 40517974 - 40517675
Alignment:
Q  10 aacaaaatccatacccgtggttatccatctgaaccaaactcaa-ttgacgggttttcccctttttgactgggtt------------taggttttccccga 96  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||| |||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||            | ||||||||||||    
T  40517974 aacaaaacccatacccgtggttacccgcctgaaccaaattcaatttgacggatttttcccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccga 40517875  T
Q  97 tttcaaaacatggatatggg-------acgggtaaataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaat 189  Q
    |  ||||||| || ||||||       ||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| || | | |||| || |||||||| ||    
T  40517874 tcccaaaacacgggtatgggatgggtaacgggtatatagttacccaccccgaacccatactcaaacccgtcccaaaggtaaaaaattattttatgttgat 40517775  T
Q  190 atgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgtt-ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtga 288  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||   |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |  ||||||||||||| |||||||    
T  40517774 atgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtgaaagtga 40517675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 10127242 - 10127072
Alignment:
Q  10 aacaaaatccatacccgtggttatccatctgaaccaaactcaatt-gacgggttttcccctttttgactgggtttaggt------------tttccccga 96  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||            |||||||||    
T  10127242 aacaaaatccatacccgtggttatccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccga 10127143  T
Q  97 tttcaaaacatggatatgggacgggtaaataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatg 167  Q
    | |||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  10127142 tctcaaaacacgggtatgggacgggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatg 10127072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 288
Target Start/End: Original strand, 29245872 - 29246171
Alignment:
Q  10 aacaaaatccatacccgtggttatccatctgaaccaaactcaatt-gacgggttttcccctttttgactgggtttaggt------------tttccccga 96  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||  | ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||            |||| ||||    
T  29245872 aacaaaacccatacccgcggttacccgcccgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgactaggtttgggtatgggtatgagttttctccga 29245971  T
Q  97 tttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaat 189  Q
    |||||||||| || |||||||||  |||       |||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |||| | |||| || ||||||||  |    
T  29245972 tttcaaaacacgggtatgggacgaataacatgtatataggtacccaccccaaacccatacccatacccatcccaaatgtaaaaaattattttatgttggt 29246071  T
Q  190 atgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgtt-ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtga 288  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||| |||||||||||| | | ||| ||||| | || |||||||||||||||||||||    
T  29246072 atgtcatgttattttgtttgataattgttatgttaataaacactaccattgatatttaatgaatcaattaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtga 29246171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 117 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 30996637 - 30996466
Alignment:
Q  117 acgggtaaataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattg 216  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||| | |||| ||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  30996637 acgggtatataggtacccaccccgaacacacacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttaagttgatatgccatgttattttgtttgataattg 30996538  T
Q  217 atgtgtt-ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtga 288  Q
       |||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||| | || ||||||| |||||||||||||    
T  30996537 tcatgttaataaaaactaccgttgatatttaaaggatcaaataaatcattccgtctaac-aatgttaaagtga 30996466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 117 - 284
Target Start/End: Original strand, 13402052 - 13402218
Alignment:
Q  117 acgggtaaataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattg 216  Q
    |||||||  ||||||||||| ||| ||||| ||| | ||||||||| |||| | |||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||    
T  13402052 acgggtatttaggtacccactccgaaccca-accgatacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattg 13402149  T
Q  217 atgtgtta-taaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaa 284  Q
       ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |  |||||||||||||||||    
T  13402150 tcatgttaataaaaactactattgatatttaaaggatcaactaaatcatttcgtctaacaaatgttaaa 13402218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 120 - 288
Target Start/End: Original strand, 3564778 - 3564947
Alignment:
Q  120 ggtaaataggtaccc-accccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgat 218  Q
    |||| |||||||||| || ||| ||||||| ||| |||||| || |||| | |||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||      
T  3564778 ggtatataggtaccctactccgaacccatatccatacccgttccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgtc 3564876  T
Q  219 gtgtta-taaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtga 288  Q
     ||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||||    
T  3564877 atgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtga 3564947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 133 - 286
Target Start/End: Original strand, 42717696 - 42717849
Alignment:
Q  133 ccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgttt-gataattgatgtgttataaaaac 231  Q
    |||||| | |||||| | |||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||| | ||| ||||  ||||||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  42717696 ccaccctgaacccatgctcaaatccgtcctgaatgcagaaaattactt-atgttgacatgccatgatattttgttttgataattgtcgtgttataaaaac 42717794  T
Q  232 tactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagt 286  Q
    ||  ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  42717795 tatcattgatatttaaaggagaaactaaatcaaccggtctaacaaatgttaaagt 42717849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 87 - 288
Target Start/End: Original strand, 27302746 - 27302952
Alignment:
Q  87 ttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactact 179  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||       |||||||||||||||| | |||||  || || |||||| || | | |||| ||||    
T  27302746 ttttccccgatttcaaaacacggatatgagacggataacaaatatataggtacccaccccgaatccatagtcatacacgtcccaaacgtaaaaaattact 27302845  T
Q  180 ttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgttataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatg 279  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||  ||  |  ||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||  |||||||||||    
T  27302846 ttatgttaatatgtcatgttattttgtttgataattgtcatgt--tactacgtaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattccatctaacaaatg 27302943  T
Q  280 ttaaagtga 288  Q
    |||||||||    
T  27302944 ttaaagtga 27302952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 152 - 284
Target Start/End: Original strand, 8453457 - 8453587
Alignment:
Q  152 aaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgttataaaaactactattgatatttaaagga 251  Q
    |||| |||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||  || ||||||||| |||||||   ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  8453457 aaactcgtcccaaatgtagaaaattagtttatgttaatatgtc--gttattttgtttaataattgtcatgttataaaaattaccattgatatttaaagga 8453554  T
Q  252 gcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaa 284  Q
    | |||||||| | |||||| |||||||||||||    
T  8453555 gtaactaaatcattcggtcaaacaaatgttaaa 8453587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 171 - 288
Target Start/End: Original strand, 20973587 - 20973705
Alignment:
Q  171 aaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgtt-ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggt 269  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||   |||| ||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||| | || ||    
T  20973587 aaaattactttatgttgatatgtcatggtattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatgtaaagtatcaactaaatcattccgt 20973686  T
Q  270 ctaacaaatgttaaagtga 288  Q
    |||| |||| |||||||||    
T  20973687 ctaaaaaatattaaagtga 20973705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 129 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 6369725 - 6369566
Alignment:
Q  129 gtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgtt-ataa 227  Q
    |||||||||||| ||||||||   |||||||||  |||| | |||| ||||||||||| ||  ||| ||| ||||||||||||||||    |||| || |    
T  6369725 gtacccaccccgaacccatactttaacccgtccaaaatgtaaaaaattactttatgttgatgcgtcgtgttattttgtttgataattatcatgttaatga 6369626  T
Q  228 aaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtg 287  Q
    |||||||  ||||| |||||| || ||||||||| | || ||||||||||||||||||||    
T  6369625 aaactaccgttgatgtttaaaagatcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtg 6369566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 53 - 124
Target Start/End: Original strand, 10822503 - 10822574
Alignment:
Q  53 ttgacgggttttcccctttttgactgggtttaggttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaa 124  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  10822503 ttgacgggttttccccattttgactggatttgggttttctccgatttcaaaacacgggtataggacgggtaa 10822574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 142 - 233
Target Start/End: Original strand, 33420404 - 33420494
Alignment:
Q  142 acccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgttataaaaacta 233  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||||| || ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||||    
T  33420404 acccatacccaaacccgtcttgaatgtagaaaa-tattttatattgatatgtcatgttattttatttgataattgtcgtgttataaaaacta 33420494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 167
Target Start/End: Original strand, 27900411 - 27900499
Alignment:
Q  86 gttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatg 167  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||       ||||||||||| | || ||||||||||||| ||| ||||||||    
T  27900411 gtttttcccgatttcaaaacatgggtatgggacgggtaatgtggatataggtacccatctcgaacccatacccaaatccgccccgaatg 27900499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 224 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 10127041 - 10126977
Alignment:
Q  224 ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtga 288  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| | |  ||||||||||||| |||||||    
T  10127041 ataaaaactaccattgatatttaaaagatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtgaaagtga 10126977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 145 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 15564649 - 15564578
Alignment:
Q  145 catacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattg 216  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||  || ||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  15564649 catactcaaactcgtcccgaatgtagaaaattactttacattgatatgtcatgttattttttttgaaaattg 15564578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 83
Target Start/End: Original strand, 12866472 - 12866546
Alignment:
Q  10 aacaaaatccatacccgtggttatccatctgaaccaaactcaatt-gacgggttttcccctttttgactgggttt 83  Q
    ||||||| ||||||  ||||||| || || ||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12866472 aacaaaacccatacatgtggttacccgtccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccattttgactgggttt 12866546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 83
Target Start/End: Original strand, 17853214 - 17853288
Alignment:
Q  10 aacaaaatccatacccgtggttatccatctgaaccaaactcaatt-gacgggttttcccctttttgactgggttt 83  Q
    |||||||  |||||||| ||||| ||| |||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||| |||||||    
T  17853214 aacaaaacgcatacccgcggttacccacctgaaccaaacctaatttgacgggttttccccgttttgattgggttt 17853288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 83
Target Start/End: Original strand, 20973417 - 20973491
Alignment:
Q  10 aacaaaatccatacccgtggttatccatctgaaccaaactcaat-tgacgggttttcccctttttgactgggttt 83  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||  | ||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20973417 aacaaaacccatacccgcggttacccgcccgaaccaaacccattctgacgggttttccccgttttgactgggttt 20973491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 83
Target Start/End: Original strand, 33727922 - 33727996
Alignment:
Q  10 aacaaaatccatacccgtggttatccatctgaaccaaactcaa-ttgacgggttttcccctttttgactgggttt 83  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||  | ||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  33727922 aacaaaacccatacccgtggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacggattttccccgttttgattgggttt 33727996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 117 - 154
Target Start/End: Original strand, 20973544 - 20973581
Alignment:
Q  117 acgggtaaataggtacccaccccggacccatacccaaa 154  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20973544 acgggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaa 20973581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 51
Target Start/End: Original strand, 27088294 - 27088335
Alignment:
Q  10 aacaaaatccatacccgtggttatccatctgaaccaaactca 51  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||    
T  27088294 aacaaaatccatacccgtgattatccacccgaaccaaactca 27088335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 142 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 17153185 - 17153153
Alignment:
Q  142 acccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaa 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17153185 acccatacccaaacccgtcccgaatgtagaaaa 17153153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 77 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 33481 - 33265
Alignment:
Q  77 tgggtttaggttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgca 169  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||       ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  33481 tgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatatatgtacccaccccgaacccatacccaaactcgtcccgaatgca 33382  T
Q  170 gaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgttataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggt 269  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  33381 gaaaactactttatgttgacatgccatgttattttgtttggtaattgttgtgttataaaaactacgattgatatttaaaggaacaactaaatcaatcggt 33282  T
Q  270 ctaacaaatgttaaagt 286  Q
    ||||||| |||||||||    
T  33281 ctaacaattgttaaagt 33265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 67)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 40 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 3920669 - 3920417
Alignment:
Q  40 gaaccaaactcaatt-gacgggttttcccctttttgactgggtttaggttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggta 131  Q
    ||||||||| ||||| || ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||       |||||||    
T  3920669 gaaccaaacccaatttgatgggtttttcccgttttgactgggtttgggttttccccgatttcaaaacactggtatgggacggataacaggtatataggta 3920570  T
Q  132 cccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgttataaaaac 231  Q
    ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| |||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  3920569 cccaccccgaacccatacccaaaactgtcccgaatgtagaaaattattttatgttgatatgccatgttattttgtttgataattgccatgttataaaaac 3920470  T
Q  232 tactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaa 284  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3920469 taccattgatatttaaaggaacaactaaatgaatcggtctaacaaatgttaaa 3920417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 80 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 5377175 - 5376964
Alignment:
Q  80 gtttaggttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaaa-------taggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaa 172  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||       ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  5377175 gtttgggttttccccgatttcaaaacacaggtatgggacgggtaaagggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaatctgtcccgaatgcagaa 5377076  T
Q  173 aactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgttataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtcta 272  Q
    || ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  5377075 aattactttatgttgatatatcatgtaattttgtttgataattgtcgtgttataaaaactaccaatgatatttaaaggagcaactaaatcaatcggttta 5376976  T
Q  273 acaaatgttaaa 284  Q
    ||||||||||||    
T  5376975 acaaatgttaaa 5376964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 10 - 284
Target Start/End: Original strand, 27850252 - 27850540
Alignment:
Q  10 aacaaaatccatacccgtggttatccatctgaaccaaactcaatt-gacgggttttcccctttttgactgggtttaggt------tttccccgatttcaa 102  Q
    |||||||  |||| ||||||||| ||  | ||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||| |||      |||||||||||||||    
T  27850252 aacaaaactcatatccgtggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacggtttttccccgttttgattgggtttgggtatgggttttccccgatttcaa 27850351  T
Q  103 aacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtca 195  Q
    |||| || ||||||||||||||       ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | | ||||||||    
T  27850352 aacacgggtatgggacgggtaacgggtgtataggtacccatcccgaacccatacccaaacccgtcccgaatgtagaaaattactttacgatgatatgtca 27850451  T
Q  196 tgtcattttgtttgataattgatgtgttataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaa 284  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  27850452 tgttattttgtttgataattgtcgtgttataaaaactttcattgatatttaaaggagcaactaaatcaatcgatctaacaaatgttaaa 27850540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 77 - 289
Target Start/End: Original strand, 2630574 - 2630793
Alignment:
Q  77 tgggtttaggttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgca 169  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |       |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2630574 tgggtttgggttttccccgattt-aaaacatgggtatgggacgggtgacgggtatatagatacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccgaatgca 2630672  T
Q  170 gaaaa-ctactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgttataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcgg 268  Q
     |||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  2630673 aaaaaactactttatgttgatatgccatgttattttgtttgataattgccgtattataaaaactaccattgatatttaaatgagcaactaaatcaatcgg 2630772  T
Q  269 tctaacaaatgttaaagtgaa 289  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  2630773 tctatcaaatgttaaagtgaa 2630793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 77 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 12980470 - 12980250
Alignment:
Q  77 tgggtttaggttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgca 169  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||       ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12980470 tgggttttggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaatgggtatataagtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgca 12980371  T
Q  170 gaaaac-tactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgttataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcgg 268  Q
     ||||  || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12980370 aaaaaaatattttatgttgatatgccatgttattttgtttgataattttcgtgttataaaaactatcattgatatttaaaggagcaactaaatcaatcgg 12980271  T
Q  269 tctaacaaatgttaaagtgaa 289  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  12980270 tctaacaaatgttaaagtgaa 12980250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 77 - 288
Target Start/End: Original strand, 18825872 - 18826090
Alignment:
Q  77 tgggtttaggttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgca 169  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||       |||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||| ||| ||    
T  18825872 tgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccgtacccaaacccatcccaaataca 18825971  T
Q  170 gaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgttataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggt 269  Q
    ||||| || |||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||| || ||||||||| |||||||    
T  18825972 gaaaattattttacgttgatatgccatgttattttgtttgataattgtcgtgttataaaaactaccattgatatataaaagaacaactaaatcaatcggt 18826071  T
Q  270 ctaacaaatgttaaagtga 288  Q
    |||||||||||||||||||    
T  18826072 ctaacaaatgttaaagtga 18826090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 10 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 26623112 - 26622834
Alignment:
Q  10 aacaaaatccatacccgtggttatccatctgaaccaaactcaatt-gacgggttttcccctttttgactgggtttaggttttccccgatttcaaaacatg 108  Q
    |||||||  |||||||||| |||||  || |||||||| ||| || | ||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| |    
T  26623112 aacaaaactcatacccgtgtttatcggtccgaaccaaattcattttgtcggattttccccgttttgagtgggtttgggttttccctgatttcaaaacacg 26623013  T
Q  109 gatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcat 201  Q
    | ||||||| ||||||       ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||| |||| || |||||||| ||||| ||||| ||    
T  26623012 ggtatgggatgggtaatgggtatataagtacccaccccgaacccatacccaaactcgtttcgaatgcaaaaaattattttatgttgatatgccatgttat 26622913  T
Q  202 tttgtttgataattgatgtgttataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgt 280  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||    
T  26622912 tttgtttgataattgttgtgttataaaaactaccattgatatttaaaggagcaattaaatcaattggtcaaacaaatgt 26622834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 273
Target Start/End: Original strand, 26004406 - 26004675
Alignment:
Q  10 aacaaaatccatacccgtggttatccatctgaaccaaactcaatt-gacgggttttcccctttttgactgggtttaggttttccccgatttcaaaacatg 108  Q
    |||||||  |||||||||||||| ||  | ||||||||| ||||| || ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||    
T  26004406 aacaaaactcatacccgtggttacccgcccgaaccaaacacaatttgatgggtttttcccgttttgactgggtttgggttttcctcgatttcaaaacttg 26004505  T
Q  109 gatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcat 201  Q
    | ||||||||||||||       |||| ||||||||||| |||||||||  ||| || ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  26004506 ggtatgggacgggtaacaggtatatagatacccaccccgaacccatacc--aactcgccccgaatgcagaaaattactttatgttgatatgccatgttat 26004603  T
Q  202 tttgtttgataattgatgtgttataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaa 273  Q
    |||||||||||||||   | ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  26004604 tttgtttgataattgtcttcttataaaaactatcattgatatttaaaggagcgactaaatcaatcggtctaa 26004675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 119 - 288
Target Start/End: Original strand, 25782956 - 25783125
Alignment:
Q  119 gggtaaataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgat 218  Q
    ||||| |||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||      
T  25782956 gggtatataggtacccaccccgaactcataccaaaatccgtcccgaatgcagaaaattactttatgttaatatctcatattattttgtttgataattgca 25783055  T
Q  219 gtgttataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtga 288  Q
    |||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||    
T  25783056 gtgttataaaaactatcatcaatatttaaaggagcaactaaatcaatcggtataataaatattaaagtga 25783125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 35074643 - 35074343
Alignment:
Q  10 aacaaaatccatacccgtggttatccatctgaaccaaactcaatt-gacgggttttcccctttttgactgggtttaggt------------tttccccga 96  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||  | ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||            |||||||||    
T  35074643 aacaaaacccatacccgtggttacccgcccgaaccaaacccaattagacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccga 35074544  T
Q  97 tttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaa-ctactttatgttaa 188  Q
    | | |||||| || ||||||||||||||       ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||| |||||||||||| |    
T  35074543 tcttaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaacccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaaactactttatgttga 35074444  T
Q  189 tatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgtta-taaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtg 287  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||   ||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||    
T  35074443 tatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaataattttgtctaacaaatgtgaaagtg 35074344  T
Q  288 a 288  Q
    |    
T  35074343 a 35074343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 10 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 7780181 - 7779882
Alignment:
Q  10 aacaaaatccatacccgtggttatccatctgaaccaaactcaatt-gacgggttttcccctttttgactgggtttaggt------------tttccccga 96  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||            |||||||||    
T  7780181 aacaaaacccatacccgtggttacccatccgaaccaaactcaatttgacggattttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccga 7780082  T
Q  97 tttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaat 189  Q
    | |||||||| || |||||||||| |||       |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| | |||  || |||||||| ||    
T  7780081 tctcaaaacacgggtatgggacggataatgggtatataggtacccaccccgaacctatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaatttattttatgttgat 7779982  T
Q  190 atgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgtt-ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtga 288  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||   |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |  ||||||||||||| |||||||    
T  7779981 atgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtgaaagtga 7779882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 10 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 30650804 - 30650505
Alignment:
Q  10 aacaaaatccatacccgtggttatccatctgaaccaaactcaatt-gacgggttttcccctttttgactgggtttaggt------------tttccccga 96  Q
    |||||||  |||||||||||||| ||  | ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||            ||||||| |    
T  30650804 aacaaaactcatacccgtggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttaggtatgggtatgagttttccccaa 30650705  T
Q  97 tttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaat 189  Q
    | |||||||| || ||||||||||||||       |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| | |||| ||||||||||| ||    
T  30650704 tctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaatccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgat 30650605  T
Q  190 atgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgtt-ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtga 288  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||   |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |  ||||||||||||| |||||||    
T  30650604 atgttatgttattttgtttgataattgccatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtgaaagtga 30650505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 80 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 16079103 - 16078887
Alignment:
Q  80 gtttaggttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaa 172  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||       |||||| ||||||||  ||| |||||||||| ||||  |||| |||||    
T  16079103 gtttgggttttctccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtgcccaccccaaacctatacccaaactcgtcatgaatacagaa 16079004  T
Q  173 aactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgttataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtcta 272  Q
    || ||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  16079003 aattactttacgttgatatgccatgttattttgtttgataattgtcgtgttataaaaactacccttgatatttaaaggagaaactaaatcaatcggtcta 16078904  T
Q  273 acaaatgttaaagtgaa 289  Q
    | |||||||||||||||    
T  16078903 aaaaatgttaaagtgaa 16078887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 17885638 - 17885338
Alignment:
Q  10 aacaaaatccatacccgtggttatccatctgaaccaaactcaatt-gacgggttttcccctttttgactgggttta------------ggttttccccga 96  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |   | ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||             ||||||||||||    
T  17885638 aacaaaacccatacccgtggttacctgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgaatatgggtatgggttttccccga 17885539  T
Q  97 tttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaat 189  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||       |||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||| |||| | |||| ||||||||||| ||    
T  17885538 ttttaaaacatgggtatgggacgggtaacgggtatataggttccaaccccgaacccatacccatacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgat 17885439  T
Q  190 atgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgt-tataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtga 288  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||   |||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||    
T  17885438 atgtcatgttattttgtttgataattgtcatgtcaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattccatctatcaaatgttaaagtga 17885339  T
Q  289 a 289  Q
    |    
T  17885338 a 17885338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 21702744 - 21702533
Alignment:
Q  85 ggttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaacta 177  Q
    ||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||       |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||| | |||||||    
T  21702744 ggttttccccgatctcgaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccataccccaacccgtcccaaatgtaaaaaacta 21702645  T
Q  178 ctttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgtt-ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaa 276  Q
    ||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||   |||| ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||    
T  21702644 ctttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccatttatatttaaaggatcaactaaataattttgtctaacaa 21702545  T
Q  277 atgttaaagtga 288  Q
    |||| |||||||    
T  21702544 atgtgaaagtga 21702533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 117 - 288
Target Start/End: Original strand, 18125275 - 18125447
Alignment:
Q  117 acgggtaaataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattg 216  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||    
T  18125275 acgggtatataggtacccaccccgaacgcatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaactactttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattg 18125374  T
Q  217 atgtgtt-ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtga 288  Q
       |||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||    
T  18125375 tcatgttaataaaaactaccattgatatttaaagaatcaactaaataattttgtctaacaaatgtgaaagtga 18125447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 125 - 288
Target Start/End: Original strand, 46127238 - 46127398
Alignment:
Q  125 ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgtta 224  Q
    |||||||||||| |||  | ||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||||||   ||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||    
T  46127238 ataggtacccacaccgatctcatactcaaacccgtcccaaatgcagaaaattattttatg---atatgtcatgttattttgtttgatcattgtcgtgtta 46127334  T
Q  225 taaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtga 288  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  46127335 taataactaccattgatatttaaaggaacaactaaatcaatcggtctaacaaatgttaaagtga 46127398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 117 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 37579308 - 37579137
Alignment:
Q  117 acgggtaaataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattg 216  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||| | ||||||||||| |||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  37579308 acgggtatataggtacccaccccgaacctatacccaaagctgtctcaaatgcagaaaattactttatgttgctatgccatgttattttgtttgataattg 37579209  T
Q  217 atgtgttataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtga 288  Q
       ||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  37579208 tcatgttataaaaattatcattgatatttaaatgagcaactaaatcaatccatctaacaaatgttaaagtga 37579137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 40 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 24425511 - 24425256
Alignment:
Q  40 gaaccaaactcaatt-gacgggttttcccctttttgactgggtttaggttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggta 131  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||| |||||||   ||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||       |||||||    
T  24425511 gaaccaaacccaatttgacggattttctccgttttgattgggtttgaattttctctgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggta 24425412  T
Q  132 cccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgttataaaaac 231  Q
    ||||||| |  |||||  |||||||||| || |||||| |||| |||| |||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||   |||||||||||||    
T  24425411 cccaccctgaccccatttccaaacccgttccaaatgcataaaattactatatgttgatatgccatgttattctgtttgataattatcgtgttataaaaac 24425312  T
Q  232 tactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtga 288  Q
    ||| |||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  24425311 taccattgatatttaaagga-caaataaatcaaccggtctaacaaatgttaaagtga 24425256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 45380192 - 45379980
Alignment:
Q  85 ggttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaact- 176  Q
    |||||| ||||||||||||| | || ||||||||||||||       |||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| |||| | |||| |     
T  45380192 ggtttttcccgatttcaaaatacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatacctaaactcgtcccaaatgtaaaaaaatt 45380093  T
Q  177 actttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgtta-taaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaaca 275  Q
    |||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||   ||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |  ||||||||    
T  45380092 actttatgttgacatgtcatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcagttcgtctaaca 45379993  T
Q  276 aatgttaaagtga 288  Q
    |||||||||||||    
T  45379992 aatgttaaagtga 45379980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 16866254 - 16866043
Alignment:
Q  85 ggttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaacta 177  Q
    ||||||||||||| |||||||| || ||||||||| ||||       |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||    
T  16866254 ggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgagtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaatta 16866155  T
Q  178 ctttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgtt-ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaa 276  Q
    ||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||   |||| ||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||| | |  |||||||||    
T  16866154 ctttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgccatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgattaactaaatcattttgtctaacaa 16866055  T
Q  277 atgttaaagtga 288  Q
    |||| |||||||    
T  16866054 atgtgaaagtga 16866043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 86 - 288
Target Start/End: Original strand, 45885774 - 45885984
Alignment:
Q  86 gttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactac 178  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||       |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||| | |||| |||    
T  45885774 gttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacaagtatataggtacccaccccgaacccataccaaaatccgtcccaaatgtaaaaaattac 45885873  T
Q  179 tttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgtt-ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaa 277  Q
    |||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||   |||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||| | |  ||||||||||    
T  45885874 tttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgccatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaacttaatcattttgtctaacaaa 45885973  T
Q  278 tgttaaagtga 288  Q
    ||| |||||||    
T  45885974 tgtgaaagtga 45885984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 39456023 - 39456232
Alignment:
Q  85 ggttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaacta 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||       |||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||| |||| | |||| ||    
T  39456023 ggttttccccgatttcaaaacatgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacc-atactcatacccgtcccaaatgta-aaaatta 39456120  T
Q  178 ctttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattg--atgtgttataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaaca 275  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  ||| || ||||||| ||| |||||||||  ||||| ||| ||||| | |  ||||||||    
T  39456121 ctttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattgccatg-gtaataaaaattaccattgatattggaaggatcaattaaatcattacgtctaaca 39456219  T
Q  276 aatgttaaagtga 288  Q
    |||||||||||||    
T  39456220 aatgttaaagtga 39456232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 38139800 - 38140012
Alignment:
Q  85 ggttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaact- 176  Q
    |||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||       ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| | |||| | |||| |     
T  38139800 ggttttccccaatttcaaaacacgagtatgggacgggtaatgagtatataagtacccaccccgaacccataaccaaacccgtctcaaatgtaaaaaaatt 38139899  T
Q  177 actttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgtta-taaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaaca 275  Q
    | ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||   ||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||    
T  38139900 attttatattgatatgtcatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattccgtctaaca 38139999  T
Q  276 aatgttaaagtga 288  Q
    |||||||||||||    
T  38140000 aatgttaaagtga 38140012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 125 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 17851892 - 17851755
Alignment:
Q  125 ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgtt- 223  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||   ||||     
T  17851892 ataggtacccatcccgaacccatacccaaacccatcccaaatgtaaaaaactactttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgtta 17851793  T
Q  224 ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaat 261  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||    
T  17851792 ataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaat 17851755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 142 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 37182296 - 37182148
Alignment:
Q  142 acccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgtta-taaaaactactattga 240  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| | |||| ||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||   ||||| |||||||||| |||||    
T  37182296 acccatacccatacccgtcccaaatgtaaaaaattatcttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattga 37182197  T
Q  241 tatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtgaa 289  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||    
T  37182196 tatttaaaggatcaactaaatcattgtgtctaacaaatgttaaagtgaa 37182148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 117 - 259
Target Start/End: Original strand, 44658496 - 44658639
Alignment:
Q  117 acgggtaaataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattg 216  Q
    ||||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||||| || |||| | |||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44658496 acgggtatataggtacctatcccgaacccatacccaaacccgtaccaaatgtaaaaaaatattttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattg 44658595  T
Q  217 atgtgtt-ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaa 259  Q
       |||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  44658596 tcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaa 44658639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 119 - 288
Target Start/End: Original strand, 37196047 - 37196217
Alignment:
Q  119 gggtaaataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgat 218  Q
    ||||| |||| ||||||||||| | |||||||||||||||||   |||| | |||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||      
T  37196047 gggtatatagctacccaccccgaatccatacccaaacccgtcataaatgtaaaaaattactttatgttgatatgttatgttattttgtttgataactgtc 37196146  T
Q  219 gtgtt-ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtga 288  Q
     |||| ||||||||||| |||||||| |||| || ||||||||| | || |||||||||||||||||||||    
T  37196147 atgttaataaaaactaccattgatatataaaagatcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtga 37196217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 127 - 288
Target Start/End: Original strand, 44794084 - 44794246
Alignment:
Q  127 aggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgtta-t 225  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| | |||| || |||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||   ||||| |    
T  44794084 aggtacccaccccgaacccatacccaaacctgtcccaaatgtaaaaaattattttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttact 44794183  T
Q  226 aaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtga 288  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||| | |  ||||||||||||| |||||||    
T  44794184 aaaaactaccattgatacttaaatgatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtgaaagtga 44794246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 132 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 23328641 - 23328484
Alignment:
Q  132 cccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactacttt-atgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgttataaaaa 230  Q
    |||||||||  || |||||||||||||||||||||| |||||| || ||| ||||| | ||||| ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  23328641 cccaccccgatcctatacccaaacccgtcccgaatggagaaaattatttttatgttgacatgtcttgttattttgtttgataattgtcgtgctataaaaa 23328542  T
Q  231 ctactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtga 288  Q
     ||  ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  23328541 ttatcattgatatttaaaggaataactaaatcaatcggtctaataaatgctaaagtga 23328484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 38152972 - 38152776
Alignment:
Q  85 ggttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaacta 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||       |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| | |||| ||    
T  38152972 ggttttccccgatttcaaaacatgggtatggaacggataacggctatataggtacccaccccgaacccatacctaaacccgtcccaaatgtaaaaaatta 38152873  T
Q  178 ctttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgttataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaa 277  Q
     |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||              ||||| |||||||| ||||||| ||||||||| | || ||||||||||    
T  38152872 ttttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataatt--------------actaccattgatatctaaaggatcaactaaatcattccgtctaacaaa 38152787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 117 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 25905674 - 25905510
Alignment:
Q  117 acgggtaaataggtacccaccccggacccatacccaaacc-cgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataatt 215  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| || |||||||||||  |||||| |||| | |||| || |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  25905674 acgggtacataggtacc-accccgaactcatacccaaacatcgtcccaaatgtaaaaaattattttatgttgatatgttatgttattttgtttgataatt 25905576  T
Q  216 gatgtgtta-taaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgt 280  Q
    |   ||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||    
T  25905575 gtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaataattttgtctaacaaatgt 25905510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 40 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 16811860 - 16811635
Alignment:
Q  40 gaaccaaactcaatt-gacgggttttcccctttttgactgggtttaggttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggta 131  Q
    ||||| ||||||||| ||| ||||||| || ||||||||| |||| | ||||||||||| |||||||| || |||| ||||| |||       |||| ||    
T  16811860 gaacctaactcaatttgacaggttttctccattttgactgagtttggattttccccgatctcaaaacacgggtatgagacggataatgggtatatagata 16811761  T
Q  132 cccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgtt-ataaaaa 230  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||| |||| | |||| ||||||||||| |||| | |||| |||||||||||||||||   |||| |||||||    
T  16811760 cccaccc-gaacccatacccaaagccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatattatgttattttgtttgataattgccatgttaataaaaa 16811662  T
Q  231 ctactattgatatttaaaggagcaact 257  Q
    |||| ||||||||||||| || |||||    
T  16811661 ctaccattgatatttaaaagatcaact 16811635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 142 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 24753196 - 24753050
Alignment:
Q  142 acccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgtt-ataaaaactactattga 240  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | |||| || |||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||   |||| ||||||||||| |||||    
T  24753196 acccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaattattttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattga 24753097  T
Q  241 tatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtga 288  Q
    |||||||| || ||||||||| | |  ||||||||||||| |||||||    
T  24753096 tatttaaa-gatcaactaaattattttgtctaacaaatgtgaaagtga 24753050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 119 - 285
Target Start/End: Original strand, 44734406 - 44734573
Alignment:
Q  119 gggtaaataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgat 218  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||| || | ||||||| |||| | |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||      
T  44734406 gggtatataggtacccaccccgaacccatacacatatccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtcatgttattttatttgataattgtc 44734505  T
Q  219 gtgtt-ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaag 285  Q
     |||| ||||||||||  |||||||||| ||||| ||| ||||| | |  ||||||||||| ||||||    
T  44734506 atgttaataaaaactatcattgatatttgaaggatcaattaaatcattacgtctaacaaatattaaag 44734573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 85 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 41103741 - 41103528
Alignment:
Q  85 ggttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaacta 177  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||       ||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||  |||| | |||| ||    
T  41103741 ggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacggttaacgggtatataagtacccaccccgaacccatacataaacccgtcctaaatgtaaaaaatta 41103642  T
Q  178 ctttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgtt-ataaaaactactat---tgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaa 273  Q
     |||||||| |||| || ||| |||||||||||||||||   |||| ||| ||| ||| ||   |||||||||||||| ||||||||| | || ||||||    
T  41103641 ttttatgttgatatctcttgttattttgtttgataattgtcatgttaatacaaattaccattgatgatatttaaaggatcaactaaatcattccgtctaa 41103542  T
Q  274 caaatgttaaagtg 287  Q
    ||||||||||||||    
T  41103541 caaatgttaaagtg 41103528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 85 - 216
Target Start/End: Original strand, 3226954 - 3227092
Alignment:
Q  85 ggttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaacta 177  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||       |||||||||||||||| |||||||| || || | |||| |||| | |||| ||    
T  3226954 ggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacaggaatataggtacccaccccgaacccatactcatacacatcccaaatgtaaaaaatta 3227053  T
Q  178 ctttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattg 216  Q
     |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3227054 ttttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattg 3227092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 200 - 284
Target Start/End: Original strand, 5916196 - 5916280
Alignment:
Q  200 attttgtttgataattgatgtgttataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaa 284  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  5916196 attttgtttgataattgctgtgttatcaaaactaccattgatatttaaaggagtaaatcaatcaatcggtctaacaaatgttaaa 5916280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Original strand, 23475195 - 23475360
Alignment:
Q  10 aacaaaatccatacccgtggttatccatct-gaaccaaactcaatt-gacgggttttcccctttttgactgggtttaggttttccccgatttcaaaacat 107  Q
    ||||||| |||||||||||| || || ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||     
T  23475195 aacaaaacccatacccgtggataccc-tctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgctttgactgggtttgggtttttcccgatttcaaaacac 23475293  T
Q  108 ggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatg 167  Q
    || | ||||| ||||||       ||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  23475294 gggtttgggatgggtaatggggatatatgtacccacttcgaacccatacccaaacccgtcccgaatg 23475360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 39317168 - 39316869
Alignment:
Q  10 aacaaaatccatacccgtggttatccatctgaaccaaactcaatt-gacgggttttcccctttttgactgggtttag------------gttttccccga 96  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |            ||||||| |||    
T  39317168 aacaaaattcatactcgcggttatccgcccgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttggatatgagtatgagttttcctcga 39317069  T
Q  97 tttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaat 189  Q
    |||||||||| || |||||||||||||        ||| ||| ||| || | || |||||||| | ||||| | |||| | |||| || |||||||| ||    
T  39317068 tttcaaaacacgggtatgggacgggtagcgggtatatatgtatccatcctgaactcatacccatatccgtctcaaatgtaaaaaattattttatgttgat 39316969  T
Q  190 atgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgtt-ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtga 288  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||   |||| ||||||||||| |||||||||| ||||| | | ||||| | |  |||||||||||||||||||||    
T  39316968 atgtcatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttgaaggatcgattaaatcattacgtctaacaaatgttaaagtga 39316869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 154 - 289
Target Start/End: Original strand, 44985984 - 44986118
Alignment:
Q  154 acccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgtta-taaaaactactattgatatttaaaggag 252  Q
    ||||||||| |||| | |||| || |||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||   ||||| |||||||||| ||||||||||||||||     
T  44985984 acccgtcccaaatgtaaaaaatta-tttatgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggat 44986081  T
Q  253 caactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtgaa 289  Q
    ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||    
T  44986082 caactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaa 44986118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 117 - 288
Target Start/End: Original strand, 45708912 - 45709081
Alignment:
Q  117 acgggtaaataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattg 216  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || |||||| ||||||||||  |||| | ||   ||||||||||| |||||| || | |||||||||||||||||    
T  45708912 acgggtatataggtacccaccccgaactcatacctaaacccgtccaaaatgtaaaa---tactttatgttgatatgttatattattttgtttgataattg 45709008  T
Q  217 atgtgtt-ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtga 288  Q
       | || ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| | |  ||||||||||||| |||||||    
T  45709009 tcatattaataaaaattaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtgaaagtga 45709081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 10072639 - 10072431
Alignment:
Q  10 aacaaaatccatacccgtggttatccatctgaaccaaactcaatt-gacgggttttcccctttttgactgggtttaggt------------tttccccga 96  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||  | ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||            |||||||||    
T  10072639 aacaaaacccatacccgcggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccga 10072540  T
Q  97 tttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaat 189  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||||       |||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| |||| | |||| ||||||||||| ||    
T  10072539 tttcaaaacacgggtatggaacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatacccataaccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgat 10072440  T
Q  190 atgtcatgt 198  Q
    |||||||||    
T  10072439 atgtcatgt 10072431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 41741458 - 41741668
Alignment:
Q  85 ggttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaaa-------taggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaacta 177  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||| ||||| |||        ||||||||||||| | |||||||  || ||||||||| |||| | |||| ||    
T  41741458 ggttttccccgatttcaaaacacgggtatgagacggataacgggtatgtaggtacccaccc-gaacccatattcatacccgtcccaaatgtaaaaaatta 41741556  T
Q  178 ctttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgtta-taaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaa 276  Q
    ||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||    ||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||| | |  |||||||||    
T  41741557 ctttatactgatatgtcatgttattttgtttgataattatcatgttaataaaaactaccattgatatttaacggatcaattaaatcattacgtctaacaa 41741656  T
Q  277 atgttaaagtga 288  Q
    ||||||||||||    
T  41741657 atgttaaagtga 41741668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 85 - 287
Target Start/End: Original strand, 25979925 - 25980135
Alignment:
Q  85 ggttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaacta 177  Q
    ||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||       ||| |||||||||||  || |||||||||| || | || |||| | |||| ||    
T  25979925 ggttttccccgatttcaaaacacaggtatgagacgggtaacggatatatatgtacccaccccaaactcatacccaaatcctttccaaatgtaaaaaatta 25980024  T
Q  178 ctttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgtt-ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaa 276  Q
     |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||    |||| |||||||||   ||||||||||||||||  || ||||| | || |||||||||    
T  25980025 ttttatgttgaaatgtcatgttattttgtttgataattatcatgttaataaaaacttacattgatatttaaaggattaaataaatcattccgtctaacaa 25980124  T
Q  277 atgttaaagtg 287  Q
    |||||||||||    
T  25980125 atgttaaagtg 25980135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 224 - 284
Target Start/End: Original strand, 26004675 - 26004735
Alignment:
Q  224 ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaa 284  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26004675 ataaaaactaccattgatatttaaaggagcgactaaatcaatcggtctaacaaatgttaaa 26004735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Original strand, 23533536 - 23533700
Alignment:
Q  10 aacaaaatccatacccgtggttatccatctgaaccaaactcaatt-gacgggttttcccctttttgactgggtttaggttttccccgatttcaaaacatg 108  Q
    ||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||| ||||| |||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | |    
T  23533536 aacaaaatccatacccgcgggtaccctcccgaaccaaacccaatttgacgggtttttcccgatttgactgggtttgggttttccccgatttgaaaatacg 23533635  T
Q  109 gatatgggacgggtaa------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatg 167  Q
    | |||| || ||||||      ||| ||||||||  || |||||||||||||| |||||||||||    
T  23533636 ggtatgcgatgggtaatgggatatatgtacccacttcgaacccatacccaaactcgtcccgaatg 23533700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 43507615 - 43507307
Alignment:
Q  13 aaaatccatacccgtggttatccatctgaaccaaactcaatt-gacgggttttcccctttttgactgggtt------------taggttttccccgattt 99  Q
    ||||| |||| ||| ||||| || |||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||            | |||||||||||||||    
T  43507615 aaaattcatatccgcggttacccgtctgaaccaaacccaatttgatgggttttccccgttttgactgggtttgggtataagtatgggttttccccgattt 43507516  T
Q  100 caaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatg 192  Q
    |||||||||| |||| |||||||||       ||||| |||||||| | ||||||||| | || |||||| |||| | |||| || |||||||| |||||    
T  43507515 caaaacatgggtatgagacgggtaacgggtatataggcacccaccctgaacccatacctatactcgtcccaaatgtaaaaaattattttatgttgatatg 43507416  T
Q  193 tc------------atgtcattttgtttgataattgatgtgtt-ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatg 279  Q
    ||            |||| |||||||||||||||||   | || ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| | || |||||||||||     
T  43507415 tcatgttattttgtatgttattttgtttgataattgtcatattaataaaaactaccattgatatttaaaagatcaactaaatcattccgtctaacaaatt 43507316  T
Q  280 ttaaagtga 288  Q
    |||||||||    
T  43507315 ttaaagtga 43507307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 3157176 - 3157084
Alignment:
Q  77 tgggtttaggttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtccc 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||       |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||    
T  3157176 tgggtttaggttttccccgatttcaaaatatgggtatgggacggataacggggatataggtacccacaccgaacctatacccaaacccgtccc 3157084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 40 - 167
Target Start/End: Original strand, 19439972 - 19440107
Alignment:
Q  40 gaaccaaactcaatt-gacgggttttcccctttttgactgggtttaggttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaa-------ataggta 131  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||| ||||| |||||| || | ||||| ||||||       ||| |||    
T  19439972 gaaccaaacccaatttgacgggttttccccgctttgactgggtttgagttttccctgatttgaaaacacgggtttgggatgggtaatggggatatatgta 19440071  T
Q  132 cccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatg 167  Q
    |||||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  19440072 cccacttcgaacccatacccaaacccgtcccgaatg 19440107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 288
Target Start/End: Original strand, 3227698 - 3227762
Alignment:
Q  224 ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtga 288  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||| ||||||    
T  3227698 ataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattccgtctaacaaatgttgaagtga 3227762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 10 - 83
Target Start/End: Original strand, 18825786 - 18825860
Alignment:
Q  10 aacaaaatccatacccgtggttatccatctgaaccaaactcaatt-gacgggttttcccctttttgactgggttt 83  Q
    ||||||| |||||||| |||||| || || ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18825786 aacaaaacccatacccatggttaaccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgactgggttt 18825860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 24753336 - 24753262
Alignment:
Q  10 aacaaaatccatacccgtggttatccatctgaaccaaactcaa-ttgacgggttttcccctttttgactgggttt 83  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || || |||||||| |||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  24753336 aacaaaacccatacccgtggttacccgtccgaaccaaattcaatttgacggattttctccgttttgactgggttt 24753262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 77 - 124
Target Start/End: Original strand, 27896475 - 27896522
Alignment:
Q  77 tgggtttaggttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaa 124  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27896475 tgggtttgggttttcccttatttcaaaacatgggtatgggacgggtaa 27896522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 152 - 198
Target Start/End: Original strand, 3274761 - 3274807
Alignment:
Q  152 aaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgt 198  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  3274761 aaacccgtcccgaatgtagaaaattacattatgttgatatgtcatgt 3274807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 10072425 - 10072363
Alignment:
Q  226 aaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtga 288  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||| | || | |||||||||||||||||||    
T  10072425 aaaaactaccattgataattaaatgatcaactaaatcattccgcctaacaaatgttaaagtga 10072363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 12980550 - 12980476
Alignment:
Q  10 aacaaaatccatacccgtggttatccatctgaaccaaactcaattga-cgggttttcccctttttgactgggttt 83  Q
    |||||||  |||||||||||||| ||    ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  12980550 aacaaaactcatacccgtggttacccgctagaaccaaactcaatttaacgggttttccccattttgactgggttt 12980476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 16866342 - 16866268
Alignment:
Q  10 aacaaaatccatacccgtggttatccatctgaaccaaactcaatt-gacgggttttcccctttttgactgggttt 83  Q
    |||||||  |||| ||||||||| ||  | ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16866342 aacaaaactcatatccgtggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgactgggttt 16866268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 25905801 - 25905727
Alignment:
Q  10 aacaaaatccatacccgtggttatccatctgaaccaaactcaatt-gacgggttttcccctttttgactgggttt 83  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||    |||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25905801 aacaaaacccatacccgtggttacccgctcgaactaaacccaatttgacaggttttcccctttttgactgggttt 25905727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 86 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 33841162 - 33841124
Alignment:
Q  86 gttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaa 124  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  33841162 gttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaa 33841124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 37182447 - 37182373
Alignment:
Q  10 aacaaaatccatacccgtggttatccatctgaaccaaactcaatt-gacgggttttcccctttttgactgggttt 83  Q
    ||||||| ||||| ||| ||||| ||  | ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37182447 aacaaaacccatatccgcggttacccgcccgaatcaaactcaatttgacgggttttccccgttttgactgggttt 37182373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 67
Target Start/End: Original strand, 37195929 - 37195987
Alignment:
Q  10 aacaaaatccatacccgtggttatccatctgaaccaaactcaa-ttgacgggttttccc 67  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||| ||||||| |||||||    
T  37195929 aacaaaatccatacccgtggttatccgcccaaaccaaactcaatttgacggattttccc 37195987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 21750899 - 21750830
Alignment:
Q  53 ttgacgggttttcccctttttgactgggtttaggttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggt 122  Q
    ||||||||||||  ||  |||||  ||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| |||||||    
T  21750899 ttgacgggttttttccgatttgatcgggtttaggtttttcccgatttcaaaatacggatatgagacgggt 21750830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 106
Target Start/End: Original strand, 43550393 - 43550446
Alignment:
Q  53 ttgacgggttttcccctttttgactgggtttaggttttccccgatttcaaaaca 106  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||| ||| ||||||    
T  43550393 ttgacgggttttccccattttgattgggtttgagttttccccgtttttaaaaca 43550446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 80 - 124
Target Start/End: Original strand, 10995837 - 10995881
Alignment:
Q  80 gtttaggttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaa 124  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||    
T  10995837 gtttgggttttccccgatttcaagacacgggtatgggacgggtaa 10995881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 129 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 32546226 - 32546182
Alignment:
Q  129 gtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaa 173  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  32546226 gtacccaccccgaacccatacccaaaccctacccgaatgtagaaa 32546182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 40 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 37218148 - 37218104
Alignment:
Q  40 gaaccaaactcaatt-gacgggttttcccctttttgactgggttt 83  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  37218148 gaaccaaactcaatttgatgggttttccccgttttgactgggttt 37218104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 19 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 90750 - 90467
Alignment:
Q  19 catacccgtggttatccatctgaaccaaactcaatt-gacgggttttcccctttttgactgggtttaggt------tttccccgatttcaaaacatggat 111  Q
    |||||||||||||| ||  | |||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||      ||||||||||||||||||| || |    
T  90750 catacccgtggttacccgcccgaactaaactcaatttgacggattttccccgttttgactgggtttgggtatgggttttccccgatttcaaaacacgggt 90651  T
Q  112 atgggacgggtaa-------ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcatttt 204  Q
    ||| ||||| |||       || ||||||| ||||| |||||||| ||||  ||||| |||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  90650 atgagacggttaacgggtatattggtaccctccccgaacccatacacaaattcgtcctgaatgcagaaaattattttatgttgatatgccatgttatttt 90551  T
Q  205 gtttgataattgatgtgttataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtga 288  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  90550 gtttaataattgatgtgttattaaaacaaccattgatatttaaaggagcaaataaatcaatcggtctaacaaatattaaagtga 90467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 125 - 288
Target Start/End: Original strand, 197382 - 197545
Alignment:
Q  125 ataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgtta 224  Q
    |||||||||||  ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    |||||    
T  197382 ataggtacccaaaccgaatctatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaattactttatgttgatatgccatgttattttgtttgataattaccttgtta 197481  T
Q  225 taaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtga 288  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  197482 taaaaactaccattgatatttaaaggagcaactaaatcaatcggtctaacaaatattaaagtga 197545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0294 (Bit Score: 82; Significance: 9e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0294
Description:

Target: scaffold0294; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 119 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 14814 - 14645
Alignment:
Q  119 gggtaaataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgat 218  Q
    ||||| |||||||||||||  | || ||||||||||| |||||| |||| |||||| || || ||||| |||||  || | ||||||||||||||||  |    
T  14814 gggtatataggtacccaccttgaacacatacccaaactcgtcccaaatgtagaaaattatttaatgttgatatgatatattattttgtttgataattatt 14715  T
Q  219 gtgttataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtga 288  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  14714 gtgttgtaaaaactaccattgatatttaaaggagcaactaaatcaatcggtttaacaaatgttaaagtga 14645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0135 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0135
Description:

Target: scaffold0135; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 145 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 36167 - 36030
Alignment:
Q  145 catacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgttataaaaactactattgatatt 244  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||  |    ||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||    
T  36167 cataaccaaacccgtcccgaatgcagaaaattaccat----taatatgtcatgttattttgtttgataactgtcgtgttataaaaactaccattgatatt 36072  T
Q  245 taaagg--agcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaa 284  Q
    ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36071 taaaggaaagcaactaaatcaatcggtctaacaaatgttaaa 36030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 152 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 6412 - 6275
Alignment:
Q  152 aaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgttataaaaactactattgatatttaaagga 251  Q
    ||||||||| | ||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||  ||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  6412 aaacccgtctcaaatgcagaaagttactttatgttgatatgccatgttattttgtttgatagttgtcgtgctataaaaattaccattgaaatttaaagga 6313  T
Q  252 gcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtgaa 289  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  6312 gcaactaaatcaatcgatctaacaaatgttaaagtgaa 6275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 7864 - 7798
Alignment:
Q  10 aacaaaatccatacccgtggttatccatctgaaccaaactcaa-ttgacgggttttcccctttttga 75  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||| | || |||||||||||||||| ||||||    
T  7864 aacaaaatccatacccgtggttacccacccgaactaaatttaatttgacgggttttccccgttttga 7798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0189 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0189
Description:

Target: scaffold0189; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 142 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 4274 - 4125
Alignment:
Q  142 acccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaac-tactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatgtgtta-taaaaactactattg 239  Q
    |||||||||||||| |||||| |||| | ||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||   ||||| |||||||||  ||||    
T  4274 acccatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaaaatactttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactatcattg 4175  T
Q  240 atatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtgaa 289  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||    
T  4174 atatttaaaggagcaactaaatcattccatctaacaaatgttaaagtgaa 4125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0097 (Bit Score: 62; Significance: 8e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0097
Description:

Target: scaffold0097; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 142 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 33603 - 33452
Alignment:
Q  142 acccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattt---tg-tttgataattgatgtgttataaaaactactat 237  Q
    ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||   || ||||||||||   |||||||||||||||| ||    
T  33603 acccataaccaaacccgtcacaaatgcagaaaactactttatgatgatatgccatgttatttatttgatttgataattttcgtgttataaaaactaccat 33504  T
Q  238 tgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtgaa 289  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| | ||||| |||||||| ||||||||||    
T  33503 tgatatttaaagaagcaattaaatcagtcggtgtaacaaatattaaagtgaa 33452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 220 - 289
Target Start/End: Original strand, 14295 - 14364
Alignment:
Q  220 tgttataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtgaa 289  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14295 tgttataaaaactaccattgatatttaaaggaacaattaaatcaatcggtctaacaaatgttaaagtgaa 14364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0519 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0519
Description:

Target: scaffold0519; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 120 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 10335 - 10169
Alignment:
Q  120 ggtaaataggtacccaccccggacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgtcatgtcattttgtttgataattgatg 219  Q
    |||| ||||||||||||  || ||||||||||| ||||||||| |||| | |||| |||||| |||| |||||| |||| |||||||||||||||||       
T  10335 ggtatataggtacccactacgaacccatacccatacccgtcccaaatgtaaaaaattactttgtgttgatatgt-atgttattttgtttgataattgtca 10237  T
Q  220 tgtt-ataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtgaa 289  Q
    | || |||||||||||    |  |||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||    
T  10236 tattaataaaaactac---cgtcatttaaaggatcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaa 10169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0795 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0795
Description:

Target: scaffold0795; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 10 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 391 - 318
Alignment:
Q  10 aacaaaatccatacccgtggttatccatctgaaccaaactcaattgacgggttttcccctttttgactgggttt 83  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||| ||  | |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  391 aacaaaacccatatccgtgattacccgccagaaccaaactcaattgacgggttttctccgttttgactgagttt 318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0902 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0902
Description:

Target: scaffold0902; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 220 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 823 - 754
Alignment:
Q  220 tgttataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtgaa 289  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||| | ||| || || |||||||| ||||||    
T  823 tgttataaaacctaccattgatatttaaagtagcaaccaaatcattcgatcaaagaaatgttatagtgaa 754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1630 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1630
Description:

Target: scaffold1630; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 236 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 1544 - 1492
Alignment:
Q  236 attgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgttaaagtga 288  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| | |  ||||||||||||| |||||||    
T  1544 attgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtgaaagtga 1492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University