View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5932_low_28 (Length: 270)

Name: NF5932_low_28
Description: NF5932
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5932_low_28
NF5932_low_28
[»] chr3 (89 HSPs)
chr3 (1-270)||(4569856-4570128)
chr3 (9-270)||(34491118-34491379)
chr3 (1-269)||(6095592-6095861)
chr3 (20-270)||(30236030-30236281)
chr3 (1-270)||(54593610-54593879)
chr3 (1-265)||(46860382-46860650)
chr3 (9-270)||(49199469-49199733)
chr3 (20-231)||(44700491-44700703)
chr3 (20-220)||(40734452-40734654)
chr3 (20-220)||(44331499-44331701)
chr3 (20-268)||(47304158-47304407)
chr3 (20-231)||(29196398-29196612)
chr3 (1-269)||(41819515-41819786)
chr3 (20-220)||(40735337-40735539)
chr3 (20-220)||(22835014-22835216)
chr3 (9-238)||(43401801-43402033)
chr3 (20-220)||(51398768-51398970)
chr3 (23-220)||(5236472-5236670)
chr3 (24-216)||(760805-760999)
chr3 (9-220)||(19683889-19684103)
chr3 (3-231)||(53921498-53921727)
chr3 (17-220)||(29810822-29811027)
chr3 (20-220)||(32891057-32891260)
chr3 (9-220)||(7762220-7762433)
chr3 (20-220)||(29682313-29682515)
chr3 (20-220)||(31314399-31314601)
chr3 (41-270)||(36018756-36018987)
chr3 (9-238)||(43403744-43403976)
chr3 (9-220)||(9581237-9581450)
chr3 (20-220)||(16498984-16499185)
chr3 (24-220)||(39153377-39153575)
chr3 (9-220)||(45095119-45095331)
chr3 (20-220)||(29813017-29813219)
chr3 (20-230)||(46173311-46173513)
chr3 (20-232)||(9666478-9666693)
chr3 (28-220)||(37408413-37408606)
chr3 (75-263)||(31340268-31340457)
chr3 (20-220)||(5258155-5258358)
chr3 (31-220)||(7764422-7764609)
chr3 (9-220)||(23200138-23200350)
chr3 (20-220)||(23391921-23392123)
chr3 (9-220)||(23197939-23198151)
chr3 (20-220)||(5260334-5260537)
chr3 (17-231)||(23410338-23410553)
chr3 (28-220)||(9636146-9636340)
chr3 (32-257)||(5433906-5434128)
chr3 (3-270)||(55301966-55302228)
chr3 (20-220)||(32744448-32744640)
chr3 (28-171)||(7780024-7780168)
chr3 (9-174)||(801091-801260)
chr3 (32-269)||(35138730-35138968)
chr3 (20-115)||(40913352-40913449)
chr3 (59-269)||(26323124-26323338)
chr3 (9-174)||(6716500-6716667)
chr3 (9-174)||(54635125-54635292)
chr3 (122-217)||(26386597-26386692)
chr3 (47-194)||(51352150-51352298)
chr3 (57-207)||(5373198-5373353)
chr3 (9-174)||(45282983-45283154)
chr3 (199-267)||(40913247-40913315)
chr3 (4-231)||(2075071-2075281)
chr3 (9-174)||(3617449-3617618)
chr3 (20-174)||(25637426-25637584)
chr3 (47-140)||(33191866-33191960)
chr3 (32-169)||(4055788-4055926)
chr3 (68-233)||(8166516-8166685)
chr3 (3-75)||(27305705-27305777)
chr3 (24-162)||(20937668-20937809)
chr3 (32-270)||(39127451-39127693)
chr3 (55-231)||(3148037-3148215)
chr3 (55-152)||(25491014-25491114)
chr3 (20-174)||(4598534-4598693)
chr3 (20-174)||(10056217-10056376)
chr3 (20-174)||(10058439-10058598)
chr3 (20-174)||(10060661-10060820)
chr3 (20-174)||(10062883-10063042)
chr3 (20-174)||(10065105-10065264)
chr3 (20-174)||(10211393-10211552)
chr3 (28-174)||(10209173-10209323)
chr3 (69-225)||(40519258-40519412)
chr3 (56-230)||(1313852-1314029)
chr3 (32-169)||(4075495-4075636)
chr3 (20-174)||(4600755-4600914)
chr3 (68-155)||(24635276-24635366)
chr3 (102-154)||(28253363-28253416)
chr3 (55-168)||(1683483-1683597)
chr3 (63-117)||(54744304-54744359)
chr3 (221-270)||(1683392-1683440)
chr3 (73-102)||(31340242-31340271)
[»] chr6 (48 HSPs)
chr6 (1-269)||(21593570-21593839)
chr6 (1-270)||(26830116-26830387)
chr6 (1-220)||(28137401-28137622)
chr6 (1-270)||(2972932-2973202)
chr6 (1-270)||(5043532-5043803)
chr6 (1-270)||(17762894-17763166)
chr6 (20-270)||(3808719-3808971)
chr6 (20-220)||(9183043-9183245)
chr6 (1-269)||(22424818-22425089)
chr6 (1-189)||(21588916-21589106)
chr6 (20-270)||(603100-603343)
chr6 (20-220)||(33211197-33211399)
chr6 (20-220)||(26954298-26954499)
chr6 (9-220)||(2171532-2171744)
chr6 (28-220)||(5406220-5406412)
chr6 (28-220)||(5410545-5410737)
chr6 (31-220)||(3038926-3039117)
chr6 (9-231)||(31404675-31404897)
chr6 (1-202)||(17757995-17758199)
chr6 (20-220)||(5413405-5413606)
chr6 (11-220)||(30834538-30834750)
chr6 (9-220)||(16452329-16452543)
chr6 (34-233)||(4045364-4045566)
chr6 (28-220)||(33160372-33160567)
chr6 (20-220)||(16568997-16569178)
chr6 (9-174)||(3072759-3072928)
chr6 (9-217)||(6097451-6097643)
chr6 (47-270)||(25073472-25073698)
chr6 (9-174)||(412101-412270)
chr6 (1-131)||(26800630-26800763)
chr6 (20-100)||(5409080-5409161)
chr6 (9-174)||(27647861-27648028)
chr6 (9-174)||(16554869-16555037)
chr6 (9-174)||(16578518-16578686)
chr6 (9-174)||(16616694-16616862)
chr6 (9-174)||(16631425-16631593)
chr6 (9-174)||(16653112-16653280)
chr6 (9-174)||(25421305-25421474)
chr6 (9-174)||(6027246-6027415)
chr6 (106-220)||(16567160-16567265)
chr6 (20-174)||(13153913-13154072)
chr6 (20-174)||(33342116-33342275)
chr6 (20-174)||(34164856-34165015)
chr6 (9-174)||(34167078-34167248)
chr6 (186-270)||(5740970-5741054)
chr6 (32-99)||(9572667-9572735)
chr6 (49-85)||(2908550-2908586)
chr6 (207-270)||(11660512-11660574)
[»] chr1 (85 HSPs)
chr1 (1-270)||(13547082-13547352)
chr1 (2-270)||(11348603-11348872)
chr1 (1-270)||(13548993-13549263)
chr1 (1-270)||(37168202-37168473)
chr1 (1-270)||(193516-193786)
chr1 (1-268)||(47255332-47255601)
chr1 (1-270)||(29136152-29136423)
chr1 (1-270)||(31925700-31925969)
chr1 (2-270)||(47115076-47115347)
chr1 (5-269)||(7482227-7482494)
chr1 (9-270)||(42297975-42298238)
chr1 (20-263)||(19754406-19754651)
chr1 (20-270)||(34603480-34603733)
chr1 (9-270)||(37033072-37033336)
chr1 (20-220)||(28220238-28220440)
chr1 (20-220)||(28265566-28265768)
chr1 (20-220)||(31659192-31659394)
chr1 (20-270)||(19752590-19752842)
chr1 (20-215)||(49918309-49918506)
chr1 (20-220)||(37503569-37503768)
chr1 (20-220)||(834179-834381)
chr1 (20-220)||(44455114-44455316)
chr1 (23-220)||(1833476-1833675)
chr1 (20-220)||(3156820-3157021)
chr1 (20-220)||(3847133-3847335)
chr1 (9-220)||(8550787-8551001)
chr1 (20-213)||(28223433-28223628)
chr1 (20-229)||(46064864-46065074)
chr1 (20-220)||(4552649-4552851)
chr1 (20-220)||(50167187-50167389)
chr1 (20-220)||(50169222-50169424)
chr1 (1-220)||(23555259-23555479)
chr1 (20-220)||(13659348-13659550)
chr1 (20-220)||(196919-197122)
chr1 (20-233)||(15820249-15820463)
chr1 (20-220)||(37559879-37560083)
chr1 (20-231)||(45644366-45644579)
chr1 (20-220)||(10925177-10925382)
chr1 (102-270)||(37879007-37879174)
chr1 (20-217)||(41360872-41361070)
chr1 (9-220)||(3189285-3189498)
chr1 (9-220)||(3198102-3198315)
chr1 (9-220)||(3206941-3207154)
chr1 (20-220)||(13137988-13138188)
chr1 (1-211)||(16455585-16455796)
chr1 (20-220)||(20762626-20762829)
chr1 (3-231)||(927971-928202)
chr1 (20-220)||(40122208-40122412)
chr1 (20-220)||(30476458-30476662)
chr1 (9-174)||(13316352-13316520)
chr1 (9-220)||(51765349-51765565)
chr1 (1-170)||(36683694-36683855)
chr1 (1-219)||(8871055-8871259)
chr1 (20-232)||(44650174-44650389)
chr1 (9-174)||(9987202-9987369)
chr1 (9-174)||(20622237-20622406)
chr1 (34-263)||(6808358-6808595)
chr1 (32-169)||(22079322-22079461)
chr1 (9-174)||(40282377-40282545)
chr1 (24-231)||(37282707-37282916)
chr1 (1-102)||(37876759-37876860)
chr1 (1-99)||(28242382-28242480)
chr1 (9-174)||(9036417-9036584)
chr1 (178-270)||(28242293-28242385)
chr1 (68-242)||(25652018-25652195)
chr1 (20-174)||(21053958-21054115)
chr1 (3-162)||(3460707-3460869)
chr1 (9-174)||(44203631-44203800)
chr1 (47-124)||(5459956-5460035)
chr1 (32-169)||(13938143-13938281)
chr1 (32-270)||(41135724-41135963)
chr1 (103-232)||(44646881-44647010)
chr1 (1-137)||(2262966-2263106)
chr1 (71-206)||(12318585-12318722)
chr1 (48-125)||(9109459-9109539)
chr1 (55-154)||(4535527-4535629)
chr1 (227-270)||(34602560-34602603)
chr1 (32-167)||(2926516-2926653)
chr1 (58-157)||(32471478-32471579)
chr1 (20-79)||(44646816-44646875)
chr1 (68-241)||(1050503-1050678)
chr1 (68-169)||(16914234-16914338)
chr1 (103-160)||(918431-918487)
chr1 (217-258)||(22079237-22079278)
chr1 (185-225)||(1485952-1485992)
[»] chr5 (71 HSPs)
chr5 (6-270)||(40147166-40147431)
chr5 (1-270)||(5057952-5058220)
chr5 (1-269)||(28278222-28278491)
chr5 (1-259)||(213381-213641)
chr5 (23-270)||(38746910-38747158)
chr5 (20-231)||(13488147-13488359)
chr5 (20-220)||(42428442-42428644)
chr5 (20-220)||(533723-533925)
chr5 (1-270)||(27015437-27015698)
chr5 (17-220)||(28750664-28750869)
chr5 (20-220)||(32636778-32636980)
chr5 (24-220)||(42426251-42426449)
chr5 (20-217)||(537982-538181)
chr5 (24-231)||(33831624-33831832)
chr5 (20-220)||(8565958-8566160)
chr5 (24-220)||(39468565-39468763)
chr5 (1-220)||(16452035-16452255)
chr5 (1-258)||(27637605-27637865)
chr5 (7-220)||(31182927-31183140)
chr5 (9-220)||(13239706-13239919)
chr5 (28-220)||(25412716-25412908)
chr5 (1-220)||(3075651-3075872)
chr5 (20-220)||(30682934-30683134)
chr5 (1-270)||(16640933-16641204)
chr5 (9-220)||(13343015-13343228)
chr5 (20-220)||(30182543-30182745)
chr5 (17-231)||(42309944-42310159)
chr5 (20-230)||(9049354-9049565)
chr5 (1-229)||(13695683-13695914)
chr5 (20-220)||(36074054-36074258)
chr5 (9-220)||(37439088-37439309)
chr5 (20-220)||(19806338-19806519)
chr5 (9-217)||(16409440-16409643)
chr5 (9-217)||(26177848-26178050)
chr5 (20-270)||(316667-316920)
chr5 (9-215)||(9789224-9789425)
chr5 (9-215)||(18441648-18441849)
chr5 (79-220)||(5887487-5887630)
chr5 (9-217)||(26170739-26170930)
chr5 (9-174)||(29751160-29751328)
chr5 (9-174)||(22536290-22536457)
chr5 (9-174)||(29720364-29720532)
chr5 (9-174)||(29722524-29722692)
chr5 (42-159)||(10054850-10054969)
chr5 (9-174)||(10593258-10593426)
chr5 (1-102)||(42926965-42927066)
chr5 (21-159)||(33906042-33906184)
chr5 (159-220)||(42926847-42926908)
chr5 (32-253)||(10700674-10700896)
chr5 (68-262)||(35616082-35616278)
chr5 (9-174)||(25078120-25078289)
chr5 (9-174)||(25136089-25136258)
chr5 (32-225)||(3325863-3326058)
chr5 (115-270)||(4160537-4160690)
chr5 (58-161)||(22097877-22097981)
chr5 (9-174)||(40380090-40380259)
chr5 (9-174)||(40382301-40382470)
chr5 (75-130)||(42926911-42926968)
chr5 (20-119)||(16546684-16546788)
chr5 (32-73)||(4160702-4160743)
chr5 (71-160)||(30802843-30802934)
chr5 (45-133)||(8445756-8445847)
chr5 (20-174)||(16544407-16544566)
chr5 (17-60)||(5887443-5887486)
chr5 (20-100)||(30793212-30793292)
chr5 (71-137)||(32609572-32609641)
chr5 (217-270)||(14689622-14689674)
chr5 (102-160)||(6741941-6741998)
chr5 (197-268)||(21205842-21205914)
chr5 (189-241)||(32576481-32576533)
chr5 (56-125)||(35779350-35779421)
[»] chr8 (67 HSPs)
chr8 (1-270)||(4283429-4283699)
chr8 (1-270)||(42434984-42435254)
chr8 (20-270)||(40221650-40221901)
chr8 (1-270)||(18655306-18655575)
chr8 (1-270)||(11383891-11384160)
chr8 (20-231)||(27811222-27811434)
chr8 (43-270)||(44353697-44353926)
chr8 (20-220)||(15212740-15212942)
chr8 (17-220)||(4731612-4731817)
chr8 (20-220)||(33352104-33352306)
chr8 (20-220)||(43036377-43036579)
chr8 (1-262)||(40328692-40328951)
chr8 (20-220)||(1345383-1345585)
chr8 (23-231)||(18141764-18141973)
chr8 (1-214)||(1292457-1292671)
chr8 (20-233)||(40321022-40321236)
chr8 (20-220)||(3303682-3303884)
chr8 (27-220)||(30143296-30143489)
chr8 (20-220)||(5689225-5689427)
chr8 (20-232)||(10930211-10930424)
chr8 (9-219)||(42498149-42498362)
chr8 (4-231)||(4162444-4162668)
chr8 (20-231)||(30291549-30291764)
chr8 (20-217)||(19491711-19491909)
chr8 (20-220)||(6598926-6599128)
chr8 (20-220)||(6674379-6674581)
chr8 (6-225)||(8965689-8965910)
chr8 (9-220)||(34254331-34254543)
chr8 (20-220)||(12702646-12702852)
chr8 (9-220)||(17982607-17982821)
chr8 (9-220)||(34256507-34256719)
chr8 (9-220)||(31218211-31218425)
chr8 (20-220)||(4743226-4743417)
chr8 (20-220)||(9765703-9765900)
chr8 (28-220)||(44303808-44304003)
chr8 (20-220)||(41366627-41366828)
chr8 (28-220)||(19945379-19945574)
chr8 (20-220)||(18106093-18106292)
chr8 (23-206)||(3772160-3772345)
chr8 (9-220)||(1746219-1746432)
chr8 (57-220)||(10929753-10929907)
chr8 (20-231)||(8153705-8153914)
chr8 (87-220)||(41364926-41365061)
chr8 (11-174)||(2627735-2627902)
chr8 (1-136)||(10015119-10015254)
chr8 (2-219)||(11711993-11712214)
chr8 (20-98)||(4733784-4733862)
chr8 (4-114)||(3073870-3073981)
chr8 (32-230)||(7597559-7597759)
chr8 (9-174)||(25689955-25690122)
chr8 (20-174)||(3439504-3439660)
chr8 (32-159)||(32902197-32902327)
chr8 (44-152)||(1822313-1822425)
chr8 (44-152)||(1856758-1856870)
chr8 (20-231)||(29796331-29796547)
chr8 (67-270)||(10240062-10240264)
chr8 (20-174)||(15290522-15290681)
chr8 (20-174)||(15470891-15471050)
chr8 (20-174)||(42575335-42575494)
chr8 (72-233)||(3231859-3232023)
chr8 (56-153)||(30909389-30909487)
chr8 (103-267)||(33655402-33655565)
chr8 (181-230)||(1872084-1872133)
chr8 (58-125)||(38860413-38860482)
chr8 (49-85)||(38863949-38863985)
chr8 (59-125)||(11137074-11137146)
chr8 (102-160)||(42093131-42093188)
[»] chr2 (58 HSPs)
chr2 (1-270)||(35446877-35447147)
chr2 (6-270)||(45726834-45727099)
chr2 (3-270)||(1631727-1631995)
chr2 (20-270)||(42288123-42288373)
chr2 (20-220)||(17057381-17057583)
chr2 (20-220)||(17085364-17085566)
chr2 (20-220)||(36318021-36318223)
chr2 (20-220)||(36773516-36773718)
chr2 (20-220)||(29867823-29868025)
chr2 (23-220)||(42362306-42362505)
chr2 (20-220)||(723756-723958)
chr2 (20-220)||(38312194-38312396)
chr2 (20-233)||(33162462-33162676)
chr2 (20-220)||(34139782-34139985)
chr2 (20-220)||(2334429-2334631)
chr2 (20-220)||(14633837-14634040)
chr2 (20-220)||(11151603-11151805)
chr2 (20-220)||(11690455-11690657)
chr2 (20-220)||(11067259-11067461)
chr2 (9-217)||(36988076-36988286)
chr2 (20-270)||(17450495-17450733)
chr2 (9-220)||(45099709-45099922)
chr2 (9-220)||(5723256-5723468)
chr2 (20-269)||(24397962-24398215)
chr2 (24-231)||(13121712-13121919)
chr2 (9-220)||(4503133-4503346)
chr2 (9-221)||(6595006-6595221)
chr2 (9-217)||(36205665-36205874)
chr2 (28-220)||(4484350-4484544)
chr2 (3-233)||(17490143-17490368)
chr2 (28-220)||(30833300-30833494)
chr2 (20-220)||(26353143-26353340)
chr2 (3-231)||(11049493-11049727)
chr2 (46-225)||(7815311-7815492)
chr2 (35-220)||(14202439-14202621)
chr2 (74-220)||(24885615-24885763)
chr2 (1-254)||(33648089-33648348)
chr2 (9-217)||(32289530-32289732)
chr2 (1-125)||(7451167-7451292)
chr2 (9-174)||(6266691-6266859)
chr2 (130-220)||(39284839-39284929)
chr2 (68-231)||(12123644-12123809)
chr2 (20-174)||(13656043-13656200)
chr2 (20-82)||(39284930-39284992)
chr2 (32-215)||(30218068-30218254)
chr2 (9-174)||(12647386-12647555)
chr2 (34-219)||(42019896-42020085)
chr2 (18-85)||(28672022-28672090)
chr2 (47-153)||(42261524-42261633)
chr2 (31-77)||(42412117-42412162)
chr2 (50-125)||(24197946-24198023)
chr2 (68-154)||(34811281-34811370)
chr2 (84-125)||(4561137-4561180)
chr2 (55-154)||(41454254-41454356)
chr2 (58-114)||(16605654-16605711)
chr2 (81-113)||(28861131-28861163)
chr2 (17-73)||(34388871-34388926)
chr2 (110-154)||(41446159-41446203)
[»] chr7 (83 HSPs)
chr7 (1-270)||(22269878-22270148)
chr7 (1-270)||(29608641-29608912)
chr7 (20-270)||(2360984-2361234)
chr7 (9-270)||(34310716-34310979)
chr7 (2-270)||(48599328-48599597)
chr7 (20-269)||(6431877-6432127)
chr7 (1-270)||(4508699-4508969)
chr7 (5-268)||(3258901-3259166)
chr7 (20-270)||(2390187-2390438)
chr7 (1-270)||(4512383-4512653)
chr7 (20-219)||(30024744-30024945)
chr7 (1-270)||(4510541-4510811)
chr7 (1-270)||(8359308-8359581)
chr7 (20-220)||(27347771-27347973)
chr7 (26-220)||(48491533-48491729)
chr7 (20-220)||(14069845-14070047)
chr7 (20-220)||(14379873-14380075)
chr7 (20-220)||(31732981-31733183)
chr7 (20-220)||(47676148-47676350)
chr7 (20-231)||(47673956-47674167)
chr7 (24-220)||(8153296-8153494)
chr7 (20-220)||(41317446-41317648)
chr7 (1-220)||(31105386-31105607)
chr7 (20-220)||(4586115-4586317)
chr7 (20-231)||(36146420-36146633)
chr7 (20-220)||(43864198-43864400)
chr7 (17-220)||(1113611-1113816)
chr7 (21-220)||(18126598-18126799)
chr7 (24-220)||(495999-496197)
chr7 (20-220)||(48489385-48489587)
chr7 (9-233)||(23554982-23555208)
chr7 (9-220)||(35853869-35854082)
chr7 (20-220)||(38671234-38671436)
chr7 (23-220)||(26417270-26417468)
chr7 (20-220)||(41649023-41649224)
chr7 (9-220)||(29991009-29991221)
chr7 (1-231)||(4253521-4253754)
chr7 (20-220)||(12097879-12098073)
chr7 (24-227)||(23565077-23565282)
chr7 (1-142)||(32358047-32358190)
chr7 (28-220)||(19502132-19502326)
chr7 (20-269)||(22328401-22328661)
chr7 (20-231)||(25615807-25616010)
chr7 (66-231)||(31518739-31518905)
chr7 (28-220)||(4178729-4178921)
chr7 (28-220)||(25766980-25767171)
chr7 (2-231)||(36574510-36574740)
chr7 (1-220)||(48408757-48408981)
chr7 (1-166)||(31518911-31519078)
chr7 (20-215)||(23343934-23344129)
chr7 (20-148)||(2759209-2759339)
chr7 (9-220)||(39731331-39731537)
chr7 (102-221)||(4538636-4538755)
chr7 (102-220)||(24525992-24526111)
chr7 (20-131)||(6359964-6360077)
chr7 (9-174)||(20343897-20344064)
chr7 (28-174)||(43504174-43504323)
chr7 (20-225)||(3904628-3904836)
chr7 (24-102)||(24525518-24525596)
chr7 (9-174)||(24789841-24790009)
chr7 (167-270)||(6360073-6360175)
chr7 (42-153)||(5116625-5116739)
chr7 (7-153)||(18396338-18396488)
chr7 (143-220)||(2761439-2761516)
chr7 (9-174)||(6592340-6592509)
chr7 (9-174)||(18388760-18388929)
chr7 (9-174)||(18392196-18392365)
chr7 (20-82)||(30814530-30814592)
chr7 (83-261)||(1360226-1360409)
chr7 (9-174)||(6594558-6594727)
chr7 (20-174)||(32060333-32060493)
chr7 (157-220)||(24514912-24514974)
chr7 (110-231)||(5514113-5514234)
chr7 (20-90)||(1560677-1560749)
chr7 (2-96)||(5513661-5513755)
chr7 (32-231)||(26639264-26639469)
chr7 (68-213)||(27073778-27073925)
chr7 (68-213)||(27204388-27204535)
chr7 (163-225)||(30843389-30843451)
chr7 (55-154)||(43363518-43363622)
chr7 (102-163)||(13065494-13065555)
chr7 (203-247)||(23794023-23794068)
chr7 (103-174)||(1562103-1562173)
[»] chr4 (93 HSPs)
chr4 (1-267)||(40632353-40632620)
chr4 (20-270)||(54882925-54883176)
chr4 (1-270)||(50673840-50674109)
chr4 (1-270)||(6655861-6656131)
chr4 (1-270)||(41964320-41964591)
chr4 (1-269)||(12073298-12073568)
chr4 (1-262)||(8665320-8665583)
chr4 (1-269)||(35662346-35662616)
chr4 (9-270)||(2209618-2209882)
chr4 (1-262)||(46703412-46703677)
chr4 (1-256)||(41639345-41639601)
chr4 (1-262)||(8648051-8648314)
chr4 (20-220)||(26175648-26175850)
chr4 (1-270)||(379283-379556)
chr4 (20-268)||(27416977-27417222)
chr4 (20-220)||(36994478-36994680)
chr4 (20-216)||(47038423-47038619)
chr4 (20-220)||(5429633-5429835)
chr4 (20-220)||(9927470-9927671)
chr4 (20-220)||(48893650-48893856)
chr4 (20-233)||(36463401-36463615)
chr4 (24-220)||(54199922-54200120)
chr4 (9-220)||(56178637-56178850)
chr4 (1-220)||(31474104-31474326)
chr4 (20-220)||(34570426-34570628)
chr4 (9-270)||(50262701-50262961)
chr4 (9-220)||(37740580-37740792)
chr4 (20-220)||(12739562-12739764)
chr4 (9-220)||(52095363-52095576)
chr4 (20-231)||(52467366-52467579)
chr4 (1-231)||(37229714-37229947)
chr4 (28-220)||(48142996-48143191)
chr4 (20-220)||(5871774-5871976)
chr4 (1-220)||(6542172-6542395)
chr4 (50-231)||(24969055-24969238)
chr4 (20-267)||(12119445-12119696)
chr4 (40-218)||(12745468-12745648)
chr4 (45-214)||(3913408-3913579)
chr4 (20-220)||(29254448-29254650)
chr4 (28-187)||(26364223-26364384)
chr4 (1-237)||(21688186-21688425)
chr4 (85-270)||(55085442-55085628)
chr4 (5-220)||(4587912-4588130)
chr4 (44-220)||(12747792-12747970)
chr4 (7-220)||(29999804-30000019)
chr4 (20-190)||(46147403-46147575)
chr4 (1-230)||(5207835-5208066)
chr4 (20-220)||(45687194-45687397)
chr4 (3-263)||(26699436-26699702)
chr4 (9-220)||(5370083-5370300)
chr4 (5-231)||(51337008-51337235)
chr4 (28-220)||(52082684-52082871)
chr4 (20-161)||(12743937-12744080)
chr4 (20-161)||(12745326-12745469)
chr4 (9-220)||(13009445-13009645)
chr4 (20-220)||(13992304-13992499)
chr4 (32-270)||(33989766-33989989)
chr4 (40-154)||(12744079-12744195)
chr4 (9-174)||(31495316-31495485)
chr4 (1-231)||(29056301-29056534)
chr4 (88-224)||(41639214-41639351)
chr4 (45-233)||(48142412-48142605)
chr4 (1-263)||(22882744-22883010)
chr4 (1-263)||(22934408-22934674)
chr4 (34-270)||(33089792-33090021)
chr4 (9-174)||(8393394-8393562)
chr4 (9-174)||(8395603-8395771)
chr4 (45-270)||(35369482-35369704)
chr4 (72-262)||(32091391-32091583)
chr4 (3-225)||(44967823-44968048)
chr4 (24-204)||(53345187-53345370)
chr4 (1-160)||(5349924-5350084)
chr4 (18-153)||(34112838-34112975)
chr4 (218-269)||(26364171-26364222)
chr4 (49-231)||(6677412-6677597)
chr4 (30-174)||(7124901-7125048)
chr4 (20-174)||(5136063-5136222)
chr4 (20-174)||(5138288-5138447)
chr4 (217-269)||(41961316-41961368)
chr4 (70-154)||(44570427-44570514)
chr4 (42-241)||(52065530-52065730)
chr4 (2-154)||(21703829-21703985)
chr4 (34-140)||(37754986-37755095)
chr4 (30-174)||(7122682-7122829)
chr4 (1-54)||(24969787-24969840)
chr4 (84-154)||(34788851-34788923)
chr4 (107-215)||(35370449-35370557)
chr4 (55-154)||(16422653-16422755)
chr4 (58-126)||(1122865-1122937)
chr4 (176-225)||(5349855-5349904)
chr4 (218-259)||(25723433-25723474)
chr4 (185-233)||(3677403-3677451)
chr4 (102-160)||(37781951-37782008)
[»] scaffold0466 (1 HSPs)
scaffold0466 (1-270)||(7233-7502)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (1-268)||(17996-18262)
[»] scaffold0286 (1 HSPs)
scaffold0286 (9-270)||(11463-11725)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (20-220)||(20427-20629)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (20-220)||(149109-149311)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (63-270)||(80338-80546)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (28-220)||(114557-114750)
[»] scaffold0002 (2 HSPs)
scaffold0002 (9-231)||(434477-434701)
scaffold0002 (47-153)||(490359-490468)
[»] scaffold1519 (1 HSPs)
scaffold1519 (9-220)||(871-1083)
[»] scaffold0491 (2 HSPs)
scaffold0491 (9-220)||(11161-11375)
scaffold0491 (9-220)||(8735-8949)
[»] scaffold0236 (1 HSPs)
scaffold0236 (1-196)||(10468-10664)
[»] scaffold0219 (1 HSPs)
scaffold0219 (18-233)||(27451-27670)
[»] scaffold0565 (1 HSPs)
scaffold0565 (9-174)||(2604-2773)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (55-225)||(25002-25175)
[»] scaffold0674 (1 HSPs)
scaffold0674 (20-174)||(3737-3895)
[»] scaffold0137 (1 HSPs)
scaffold0137 (20-174)||(6272-6430)
[»] scaffold0197 (1 HSPs)
scaffold0197 (204-267)||(1594-1657)
[»] scaffold0129 (1 HSPs)
scaffold0129 (184-231)||(19117-19163)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 218; Significance: 1e-120; HSPs: 89)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 4570128 - 4569856
Alignment:
Q  1 ccaagaaatgttcacacaattcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaa 99  Q
    |||||||||||| || || |||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4570128 ccaagaaatgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaa 4570029  T
Q  100 atg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgatttt 197  Q
    |||  |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4570028 atgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgatttt 4569929  T
Q  198 cactcacccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcc 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4569928 cactcacccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcc 4569856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 9 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 34491379 - 34491118
Alignment:
Q  9 tgttcacacaattcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaat--gttac 106  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  34491379 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttac 34491280  T
Q  107 aagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcaccc 206  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||  || |||||||| |||    
T  34491279 aagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaataacacactca--gaatttcactctccc 34491182  T
Q  207 aaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcc 270  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34491181 aaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcc 34491118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Original strand, 6095592 - 6095861
Alignment:
Q  1 ccaagaaatgttcacacaattcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6095592 ccaagaaatgttcacacagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 6095691  T
Q  101 t--gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttc 198  Q
    |  |||||||||||||| |||||| ||  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||    
T  6095692 tgggttacaagaaattaacttcaagaagtttacaaagaacaaccctaatttctactcattttcccaatctcaccaatgaataagacactc-atgattttc 6095790  T
Q  199 actcacccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagc 269  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  6095791 actctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacctttagc 6095861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 20 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 30236281 - 30236030
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaat--gttacaagaaattagc 117  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  30236281 ttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttacaagaaattagc 30236182  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 217  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  30236181 ttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcatcaatgaacaagacactc-atgattttcactatcccaaggtgtttac 30236083  T
Q  218 aattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcc 270  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  30236082 aattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaatcattagcc 30236030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 54593879 - 54593610
Alignment:
Q  1 ccaagaaatgttcacacaattcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 100  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54593879 ccaagaaatgttcacccagtttggtccaacttgacatactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 54593780  T
Q  101 t--gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttc 198  Q
    |  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  54593779 tgggttacaataaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctgcacattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttc 54593681  T
Q  199 actcacccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcc 270  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  54593680 actctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaa-caacccttagcc 54593610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 46860650 - 46860382
Alignment:
Q  1 ccaagaaatgttcacacaattcggtccaact-tgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaa 99  Q
    |||| |||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  46860650 ccaaaaaatgttcatccaattcggtccaacaatgacctactctggaggaaagattgatctctccaatccactatcaatgagttattacaaagagatacaa 46860551  T
Q  100 atg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatg-attt 196  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| || ||||    
T  46860550 atgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcattgaattt 46860451  T
Q  197 tcactcacccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaaccct 265  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  46860450 tcactctcccaaggtgtttacaattgtttctcaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaaccct 46860382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 9 - 270
Target Start/End: Original strand, 49199469 - 49199733
Alignment:
Q  9 tgttcacacaattcggtccaact-tgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaat---gtt 104  Q
    ||||||| || |||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||    
T  49199469 tgttcacccagttcggtccaaccatgacctagtctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaatgggtt 49199568  T
Q  105 acaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcac 204  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| |    
T  49199569 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccttaatttctacccattttcccaatctcaccaacgaacaagacactc-atgattttcactctc 49199667  T
Q  205 ccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcc 270  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  49199668 ccaaagtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaaccattagcc 49199733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 20 - 231
Target Start/End: Original strand, 44700491 - 44700703
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaat--gttacaagaaattagc 117  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  44700491 ttcggtccaacttgacctaatgtgggg-agagattgatctctccaatccactatcaaagagttcttacaaagagatacaaataggttacaagaaattagc 44700589  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44700590 ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 44700689  T
Q  218 aattgttttccaac 231  Q
    || ||||| |||||    
T  44700690 aaatgtttcccaac 44700703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 40734654 - 40734452
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgt--tacaagaaattagc 117  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||     
T  40734654 ttcggtccaacttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgtgttacaagaaattagg 40734555  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 217  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40734554 ttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 40734455  T
Q  218 aat 220  Q
    |||    
T  40734454 aat 40734452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 44331701 - 44331499
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagc 117  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  44331701 ttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaataagttcttacaaagagatacaaatggcttacaagaaattagc 44331602  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 217  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44331601 ttcaacaagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcctaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 44331502  T
Q  218 aat 220  Q
    |||    
T  44331501 aat 44331499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 20 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 47304407 - 47304158
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagc 117  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||| |||| |    
T  47304407 ttcggtcaaacttgacctaatcttggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacgaagagatacagatgggttacaagatattaac 47304308  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 217  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||     
T  47304307 ttcaacaagctcacaaagaacaaccataatttctacccattttctcaatctcacaaatgaacaagacactca-tgattttcactctcccagggtgtttaa 47304209  T
Q  218 aattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttag 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  47304208 aattgttttccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttag 47304158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 20 - 231
Target Start/End: Original strand, 29196398 - 29196612
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagc 117  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||    
T  29196398 ttcggtccaacttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttccaagaaattagc 29196497  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaa-ccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgttta 216  Q
    ||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29196498 tttgacaagctcacaaagaacaaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgttta 29196597  T
Q  217 caattgttttccaac 231  Q
    ||| ||||| |||||    
T  29196598 caaatgtttcccaac 29196612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Original strand, 41819515 - 41819786
Alignment:
Q  1 ccaagaaatgttcacacaattcggtccaact-tgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaa 99  Q
    |||| |||||||||| || || ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41819515 ccaataaatgttcacccagtttggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatgtctccaatccactat-aatgagttcttacaaagagatacaa 41819613  T
Q  100 at---gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattt 196  Q
    |    ||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||   ||||    
T  41819614 aatgggttacaagaaattagcttagacaagctcacaaaaaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgaattt 41819713  T
Q  197 tcactcacccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagc 269  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  41819714 tcactctcccaaggtgtttacaattatttcccaactctagaatctaaccgctaaaagagaaccaacccttagc 41819786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 40735539 - 40735337
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaat--gttacaagaaattagc 117  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||    
T  40735539 ttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaactggttacaataaattagc 40735440  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 217  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  40735439 ttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcacttttccaaggtgtttac 40735340  T
Q  218 aat 220  Q
    |||    
T  40735339 aat 40735337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Original strand, 22835014 - 22835216
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagc 117  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  22835014 ttcggtccaacttgacctaatatggcggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgggttacaagaaattagc 22835113  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 217  Q
    || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22835114 ttaaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgattac 22835213  T
Q  218 aat 220  Q
    |||    
T  22835214 aat 22835216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 9 - 238
Target Start/End: Original strand, 43401801 - 43402033
Alignment:
Q  9 tgttcacacaattcggtccaact-tgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaat---gtt 104  Q
    ||||||| || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    |||    
T  43401801 tgttcacccagttcggtccaaccatgacctactctggaggagagattaatttctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagataaaaaatgcgtt 43401900  T
Q  105 acaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcac 204  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| |    
T  43401901 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctc 43401999  T
Q  205 ccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaa 238  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  43402000 ccaaggtgtttacaatcgtttcccaactctagaa 43402033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 51398970 - 51398768
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagc 117  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  51398970 ttcggtccaacttgacctaatctgggggagagataaatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagc 51398871  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 217  Q
    ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  51398870 ttcaacaagttcactaagaacaaccctaatttctacccatttttccaatctcatcaatgaacaagacactcaatgattttcactcatccaaggtgtttac 51398771  T
Q  218 aat 220  Q
    |||    
T  51398770 aat 51398768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 23 - 220
Target Start/End: Original strand, 5236472 - 5236670
Alignment:
Q  23 ggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttc 120  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  5236472 ggtccaaattgacctaatctggggaa-agattgatctctcgaatccattatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttc 5236570  T
Q  121 aacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 220  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5236571 aacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 5236670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 24 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 760999 - 760805
Alignment:
Q  24 gtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttca 121  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |    
T  760999 gtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgggttacaagaaattagcttaa 760900  T
Q  122 acaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgttta 216  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  760899 acaagctcacaaagaacagacctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcatccaaggtgttta 760805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 9 - 220
Target Start/End: Original strand, 19683889 - 19684103
Alignment:
Q  9 tgttcacacaattcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--tta 105  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  19683889 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactatggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtta 19683988  T
Q  106 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 205  Q
    ||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  19683989 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacattcaatgattttcactcacc 19684088  T
Q  206 caaggtgtttacaat 220  Q
    |||||||||||||||    
T  19684089 caaggtgtttacaat 19684103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 3 - 231
Target Start/End: Original strand, 53921498 - 53921727
Alignment:
Q  3 aagaaatgttcacacaattcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg 102  Q
    |||||||||| |  || ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  53921498 aagaaatgtttatccagttcggtcaaacttgatctactccgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaatgatacaaatg 53921597  T
Q  103 --ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcac 200  Q
      ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  53921598 agttacaagaaattagctttaacaagctcacaaacaacaaacctaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcac 53921697  T
Q  201 tcacccaaggtgtttacaattgttttccaac 231  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  53921698 tcacccaaggtttttacaa-tgttttccaac 53921727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 17 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 29811027 - 29810822
Alignment:
Q  17 caattcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaatt 114  Q
    |||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  29811027 caattcggtttaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaatt 29810928  T
Q  115 agcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtt 214  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29810927 agcttcaacaagttcacaaagaacaactctaatttctacatattttcctaatctcaccaatgaataagacattcaatgattttcactcacccaaggtgtt 29810828  T
Q  215 tacaat 220  Q
    ||||||    
T  29810827 tacaat 29810822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 32891260 - 32891057
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaat--gttacaagaaattagc 117  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  32891260 ttcggtccaacatgacctactccgggggagagatttatctctccaatccactatcaacgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagc 32891161  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgttta 216  Q
    |||||||| |||||||||||| || | |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32891160 ttcaacaagctcacaaagaacaaaacttaatttctacccattttctcaatctcaccgaagaacaagacactcaatgatttttactcacccaaggtgttta 32891061  T
Q  217 caat 220  Q
    ||||    
T  32891060 caat 32891057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 9 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 7762433 - 7762220
Alignment:
Q  9 tgttcacacaattcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--tta 105  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  7762433 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagagtta 7762334  T
Q  106 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 205  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| |    
T  7762333 caagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccctttttctcaatctcaccaatgaataagacactcaatgattttcactca-c 7762235  T
Q  206 caaggtgtttacaat 220  Q
    ||||||||| |||||    
T  7762234 caaggtgttcacaat 7762220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 29682515 - 29682313
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagc 117  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||    
T  29682515 ttcggtccaacttgatctaatctaggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgggtgacaagaaattagc 29682416  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 217  Q
    || ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29682415 ttaaacaagctcacaaagaacaaacataatttctacccattttcccaatctcacaaataaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 29682316  T
Q  218 aat 220  Q
    |||    
T  29682315 aat 29682313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 31314601 - 31314399
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagc 117  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||    
T  31314601 ttcggtccaacttgacctaatatgggggagatattgatctctccaatccactatcaaagagttcttacaaaaagatacaaatgggttacaagaaattagc 31314502  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 217  Q
    ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31314501 ttcaacaagatcacaatgaacaaccctaatttctacccattttctcaatctcacctatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaagtgtttac 31314402  T
Q  218 aat 220  Q
    |||    
T  31314401 aat 31314399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 41 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 36018987 - 36018756
Alignment:
Q  41 ctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaat---gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaa 137  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  36018987 ctgggggagagattgacctctccaatccactat-aatgagttcttacaaagagatacaaaatgagttacaagaaattaacttcaacaagctcacaaagaa 36018889  T
Q  138 caaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgttttccaactctaga 237  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36018888 caaccctaatttcaacccattttcccaatttcaccaatgaacaagtcactcgttaattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctaga 36018789  T
Q  238 atctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcc 270  Q
    |||||| | ||||||||||||||| || |||||    
T  36018788 atctaaaccccaaaagagaaccaatccatagcc 36018756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 9 - 238
Target Start/End: Original strand, 43403744 - 43403976
Alignment:
Q  9 tgttcacacaattcggtccaact-tgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaa-atg--tt 104  Q
    ||||||| || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||    
T  43403744 tgttcacccagttcggtccaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagataaaacatgagtt 43403843  T
Q  105 acaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcac 204  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| |    
T  43403844 acaagaaatgagcttcaacaagctcacaaagaacaagcctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctc 43403942  T
Q  205 ccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaa 238  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||| |||||    
T  43403943 ccaaagtgtttacaattgtttcccaactttagaa 43403976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 9 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 9581450 - 9581237
Alignment:
Q  9 tgttcacacaattcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaat--gtta 105  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||    
T  9581450 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgggtta 9581351  T
Q  106 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 205  Q
     ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9581350 aaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctaccca-tttccgaatcccacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 9581252  T
Q  206 caaggtgtttacaat 220  Q
    |||||||||||||||    
T  9581251 caaggtgtttacaat 9581237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 16499185 - 16498984
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaat--gttacaagaaattagc 117  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||    
T  16499185 ttcggtccaacttaacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatataaatgggtaacaagaaattagc 16499086  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 217  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  16499085 ttcaacaagcttacaaa-aacaaccctaatttctatccgttttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactaccccaaggtgtttac 16498987  T
Q  218 aat 220  Q
    |||    
T  16498986 aat 16498984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 24 - 220
Target Start/End: Original strand, 39153377 - 39153575
Alignment:
Q  24 gtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttca 121  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |    
T  39153377 gtccaacttgacctaatctgggggagagattgttctctccaatccactatcaatgagttcttataaagggatacaaatgagttacaagaaattagcttaa 39153476  T
Q  122 acaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 220  Q
    |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39153477 acaagctcacaatgaacaaacctaatttctacccattttcccaatctcacacatgaacaagacactcaatgattttcattcacccaaggtgtttacaat 39153575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 9 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 45095331 - 45095119
Alignment:
Q  9 tgttcacacaattcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgtta 105  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  45095331 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtta 45095232  T
Q  106 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 205  Q
    ||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  45095231 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-ccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-c 45095134  T
Q  206 caaggtgtttacaat 220  Q
    |||||||||||||||    
T  45095133 caaggtgtttacaat 45095119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 29813219 - 29813017
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagc 117  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||    
T  29813219 ttcggtccaacatgaccaaatctgggggagagattgatctctccaatccactataaatgagttcttacaaagagatgcaaatgggttacaagaaattagc 29813120  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 217  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||  | ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29813119 ttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacctatttttccaatctcaccaattaacaagcccctcaatgattttcactcacccaatgtgtttac 29813020  T
Q  218 aat 220  Q
    |||    
T  29813019 aat 29813017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 20 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 46173513 - 46173311
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaat--gttacaagaaattagc 117  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  46173513 ttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagc 46173414  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 217  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||         ||||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  46173413 ttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctaccaatttt---------accaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttac 46173324  T
Q  218 aattgttttccaa 230  Q
    |||||||| ||||    
T  46173323 aattgtttcccaa 46173311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 20 - 232
Target Start/End: Original strand, 9666478 - 9666693
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagc 117  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||    
T  9666478 ttcggtccaactttacctaatctgggggagagatcaatctctccaatccactatcaaagaattcttacaaagaggtataaatgagttacaagaaattagc 9666577  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaacc-ctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgttta 216  Q
    |||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9666578 ttcaacaagctcacaaagaacaaaatctaatttctacccatttttccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgttta 9666677  T
Q  217 caattgttttccaact 232  Q
    ||| ||||| ||||||    
T  9666678 caaatgtttcccaact 9666693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 28 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 37408606 - 37408413
Alignment:
Q  28 aacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaa 125  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||  ||||    
T  37408606 aacttgacctactctggaggagagattgatctcttcaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaa 37408507  T
Q  126 actcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 220  Q
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  37408506 gttcacaaagaacaaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaataattttcactca-ctaaggtgtttacaat 37408413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 75 - 263
Target Start/End: Original strand, 31340268 - 31340457
Alignment:
Q  75 aatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcacc 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  31340268 aatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacatgaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaacctcaatttctaccaattttcccaatctcacc 31340367  T
Q  173 aaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacc 263  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| | |||||||    
T  31340368 aatgaacaaaacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccctaaaagggcaccaacc 31340457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Original strand, 5258155 - 5258358
Alignment:
Q  20 ttcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgttacaagaaattag 116  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  5258155 ttcggtccaaacttgacctactctggagaagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagggttacaagaaattag 5258254  T
Q  117 cttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctaccc-attttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgttt 215  Q
    |||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5258255 ctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-ccaaggtgttt 5258353  T
Q  216 acaat 220  Q
    |||||    
T  5258354 acaat 5258358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 31 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 7764609 - 7764422
Alignment:
Q  31 ttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgttacaagaaattagcttcaacaaact 128  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||  |    
T  7764609 ttgacctactctggaggagagattcatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttaacaagtt 7764510  T
Q  129 cacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7764509 cacaaagaacaaccctaatttctaccc-ttttccc--tctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-ccaaggtgtttacaat 7764422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 9 - 220
Target Start/End: Original strand, 23200138 - 23200350
Alignment:
Q  9 tgttcacacaattcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgtta 105  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||    
T  23200138 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaattcactatcaatgagttcttacaaaaagatacaaaagggtta 23200237  T
Q  106 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 205  Q
    ||||||||||||||  ||||  |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  23200238 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaactctaatttctaccatttttcccaatctcacc-aagaacaagacactcaatgattttcactca-c 23200335  T
Q  206 caaggtgtttacaat 220  Q
    |||||||||||||||    
T  23200336 caaggtgtttacaat 23200350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Original strand, 23391921 - 23392123
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagc 117  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||| |    
T  23391921 ttcggtccaacttgacctaatttgggggagagatttatctctacaatccactatcaaagagttcttgcaaagtgatacaaatgggttacaagaaattatc 23392020  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 217  Q
    || ||||| |||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23392021 ttaaacaagctcacaaagaacaaacttaatttctactcattttcccaaactcaccaatgaaaaagacactaaatgattttcactcacccaaggtgtttac 23392120  T
Q  218 aat 220  Q
    |||    
T  23392121 aat 23392123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 9 - 220
Target Start/End: Original strand, 23197939 - 23198151
Alignment:
Q  9 tgttcacacaattcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgtta 105  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||    
T  23197939 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaattcactatcaatgagttcttacaaaaagatacaaaagggtta 23198038  T
Q  106 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 205  Q
    ||||||||||||||  ||||  ||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  23198039 caagaaattagctttgacaagttcacaaaaaacaactctaatttctaccatttttcccaatctcacc-aagaacaagacactcaatgattttcactca-c 23198136  T
Q  206 caaggtgtttacaat 220  Q
    |||||||||||||||    
T  23198137 caaggtgtttacaat 23198151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Original strand, 5260334 - 5260537
Alignment:
Q  20 ttcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgttacaagaaattag 116  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  5260334 ttcggtccaaacttgacctactttggagaagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagggttacaagaaattag 5260433  T
Q  117 cttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctaccc-attttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgttt 215  Q
    |||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5260434 ctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaccaagacactcaatgattttcactca-ccaaggtgttt 5260532  T
Q  216 acaat 220  Q
    |||||    
T  5260533 acaat 5260537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 17 - 231
Target Start/End: Original strand, 23410338 - 23410553
Alignment:
Q  17 caattcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaatt 114  Q
    ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||  ||| | ||||||    
T  23410338 caattcgttccaacttgacctaatttgggggagagatttatctctccaatccattatctaagagttcttacaaagtgatacaaatgggttatacgaaatt 23410437  T
Q  115 agcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtt 214  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||| |||| || |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23410438 agcttaaacaagctcacaaagaataaacataatttctacccattttccaaatttcactaatgaacaagacactcaatgattttcactcactcaaggtgtt 23410537  T
Q  215 tacaattgttttccaac 231  Q
    ||||| |||||||||||    
T  23410538 tacaa-tgttttccaac 23410553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 28 - 220
Target Start/End: Original strand, 9636146 - 9636340
Alignment:
Q  28 aacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgttacaagaaattagcttcaacaa 125  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||| ||  ||||    
T  9636146 aacttgacctactttggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaaagatacaaaagggttacaagaaattagttttgacaa 9636245  T
Q  126 actcacaaagaacaaccctaatttctacccattt-tcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 220  Q
      |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9636246 gttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttctcccaatctcaccaatgaccaagacactcaatgattttcactca-ccaaggtgtttacaat 9636340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 32 - 257
Target Start/End: Original strand, 5433906 - 5434128
Alignment:
Q  32 tgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaact 128  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||         |||||| ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||| ||||| ||    
T  5433906 tgacctactatggaggagagattgatctctccaatccaccg-------gttctttacaaagagatataaaagggttacaagaaattagctttaacaagct 5433998  T
Q  129 cacaaagaacaa-ccctaatttctacccattt-tcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgtttt 226  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  5433999 cacaaagaacaaaccctaatttctaccattttctcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc-aaggtgtttacaattgtttc 5434097  T
Q  227 ccaactctagaatctaaccaccaaaagagaa 257  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  5434098 ccaactctataatctaacccccaaaagagaa 5434128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 270
Target Start/End: Original strand, 55301966 - 55302228
Alignment:
Q  3 aagaaatgttcacacaattcggtccaact-tgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaat 101  Q
    |||||||||||||  | |||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  55301966 aagaaatgttcaccaagttcggtccaacaatgacctactatggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatacaaat 55302065  T
Q  102 --gt---------tacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaa 190  Q
      ||         ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||                | |||||| |||||| |    
T  55302066 aggttacaagaaatacaagaaattagcttcaacaaacttacaaagaacaaccctaatttctacccat----------------atgaacaagacactc-a 55302148  T
Q  191 tgattttcactcacccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcc 270  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  55302149 tgattttcactctcccaaggtatttacaattgtttcccaactctataatctaacctacaaaagagaaccaacccctagcc 55302228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Original strand, 32744448 - 32744640
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaat--gttacaagaaattagc 117  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  32744448 ttcggtccaacttgacctaatctgggggatagatttatctcttcaatccactatcaaagagttcttacaaagtgatacaaatgagttacaagaaattagc 32744547  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 217  Q
    || ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||        |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  32744548 ttaaacaagctcacaaagaacaa-actaatttctacccattttttcaatctc--------acaaaatactcaatgattttcactca-ccaatgtgtttac 32744637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 28 - 171
Target Start/End: Original strand, 7780024 - 7780168
Alignment:
Q  28 aacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatac-aaatgttacaagaaattagcttcaacaa 125  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| ||  ||||    
T  7780024 aacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaaggttacaagaaattagatttgacaa 7780123  T
Q  126 actcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcac 171  Q
      |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7780124 gttcacaatgaacaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 7780168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 9 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 801260 - 801091
Alignment:
Q  9 tgttcacacaattcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaa---tgt 103  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    ||    
T  801260 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaaagagt 801161  T
Q  104 tacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 174  Q
    ||||||||||||| ||  ||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  801160 tacaagaaattagatttgacaagttcacaatgaacaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 801091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 32 - 269
Target Start/End: Original strand, 35138730 - 35138968
Alignment:
Q  32 tgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaact 128  Q
    ||||||||| | |||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  || |||||||||| ||||||||||||    
T  35138730 tgacctacttttgggg-gagattgttctcttccatccactatcaatgagttctttacaaagagatacaaaagagttgcaagaaattaacttcaacaaact 35138828  T
Q  129 cacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc-accaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgttt-acaattgtttt 226  Q
    ||| |||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||   | | |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||    
T  35138829 caccaagaacaaacataatttctaccca-tttctcaatctctttccatgaacaagacactcaatgattttcactctcccaaggtgtttcacaattg-ttt 35138926  T
Q  227 ccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagc 269  Q
    |||||| || ||| ||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  35138927 ccaactttaaaatttaacc-ccaaaagagaattaacccttagc 35138968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 40913449 - 40913352
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaat--gttacaagaaatta 115  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  40913449 ttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcgatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaatta 40913352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 59 - 269
Target Start/End: Original strand, 26323124 - 26323338
Alignment:
Q  59 tctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaat--gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctaccc 155  Q
    |||||| | ||||||||||||||| || || |||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||   || ||||| |||||||| |||||    
T  26323124 tctccacttcactatcaatgagttttttaccaagatatacaaaaaggttacaagaaattagcttcaacaaactcttcaaaaacaaacctaatttttaccc 26323223  T
Q  156 attttcccaatctca-ccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac-aattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaag 253  Q
     ||||| |||||||| || | |||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||||||  ||||||    
T  26323224 -ttttctcaatctcatcccatgaacaagacacttaatgatgttcactcactcaaggtgtttcccaattgtttcccaactctaaaatctaaccctcaaaag 26323322  T
Q  254 agaaccaacccttagc 269  Q
    ||||||||||||||||    
T  26323323 agaaccaacccttagc 26323338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 6716667 - 6716500
Alignment:
Q  9 tgttcacacaattcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatac-aaatgtta 105  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||| ||||    
T  6716667 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggtta 6716568  T
Q  106 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 174  Q
    ||||||||||||||  ||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6716567 caagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 6716500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 54635292 - 54635125
Alignment:
Q  9 tgttcacacaattcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatac-aaatgtta 105  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||| ||||    
T  54635292 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggtta 54635193  T
Q  106 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 174  Q
    ||||||||||||||  ||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  54635192 caagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 54635125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 122 - 217
Target Start/End: Original strand, 26386597 - 26386692
Alignment:
Q  122 acaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 217  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  26386597 acaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaagtatttac 26386692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 47 - 194
Target Start/End: Original strand, 51352150 - 51352298
Alignment:
Q  47 gagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaat-gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccct 144  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| || || ||||||| |||| ||||||    
T  51352150 gagagattgatctctcaaatccactctcaatgagttattacaaagaaatacaaatggttacaagaaattaactttaaaaagctcacaatgaacaaaccct 51352249  T
Q  145 aatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgat 194  Q
    || |||||  |||||||| |||||||||||  ||||| ||||||||||||    
T  51352250 aacttcta-tcattttcctaatctcaccaataaacaagacactcaatgat 51352298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 57 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 5373353 - 5373198
Alignment:
Q  57 tctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaac-cctaatttcta 152  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||| ||| |  |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||    
T  5373353 tctctccaatccattggcaatgagttccttacaaagagatataaaagggttacaataaattagcttcaacaagctcaaaaagaacaaagcctaatttcta 5373254  T
Q  153 cccatttt-cccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcaccca 207  Q
    ||| |||| |||||||||  ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  5373253 cccttttttcccaatctcttcaatgaacaagacactcaatgattttccctcaccca 5373198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 9 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 45283154 - 45282983
Alignment:
Q  9 tgttcacacaattcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttcttacaaaga----gatacaaatg 102  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    |||||||| |    
T  45283154 tgttcactcagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaaaaagggatacaaaag 45283055  T
Q  103 -ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 174  Q
     |||||||||||||||||  ||||  |||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45283054 gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 45282983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 199 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 40913315 - 40913247
Alignment:
Q  199 actcacccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaaccctta 267  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40913315 actctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaaccctta 40913247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 4 - 231
Target Start/End: Original strand, 2075071 - 2075281
Alignment:
Q  4 agaaatgttcacacaattcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgt 103  Q
    ||||||||| || || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||               ||  |     
T  2075071 agaaatgtttacccagttcgatccaacttgacctactctcggggagagattgatctctcaaatccactatcaattagtt---------------aatggg 2075155  T
Q  104 tacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaa-caaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactc 202  Q
    ||||| ||||||||||  | || ||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  2075156 tacaataaattagctt--aaaagctcacaaagaaccaactctaattactaccatttttcccaatatcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc 2075253  T
Q  203 acccaaggtgtttacaattgttttccaac 231  Q
    |  ||||||||||| || ||||| |||||    
T  2075254 a-gcaaggtgtttataaatgtttcccaac 2075281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 9 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 3617618 - 3617449
Alignment:
Q  9 tgttcacacaattcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaa-atgt 103  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| | ||    
T  3617618 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggt 3617519  T
Q  104 tacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 174  Q
    ||||||||||||||||  ||||  |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  3617518 tacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 3617449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 20 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 25637584 - 25637426
Alignment:
Q  20 ttcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaa-atgttacaagaaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| | |||||||||||||    
T  25637584 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaatt 25637485  T
Q  115 agcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 174  Q
    |||||  ||||  |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  25637484 agctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 25637426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 47 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 33191960 - 33191866
Alignment:
Q  47 gagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaatgttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaa 140  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||  |||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  33191960 gagagattgatctctctaatccactatcaatgagttctttacaaagacataaaatggttacaagaacttagcttcaacaagctctctaagaacaa 33191866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 32 - 169
Target Start/End: Original strand, 4055788 - 4055926
Alignment:
Q  32 tgacctac-tctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgag-ttcttacaaagagatacaa---atgttacaagaaattagcttcaacaaa 126  Q
    |||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   | |||||||||||||| |||  ||||     
T  4055788 tgacctacatctgggggagaga--gatctcttcaatccactatcaatgagtttcttacaaagagatacaaaagaggttacaagaaattaacttttacaag 4055885  T
Q  127 ctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 169  Q
     || | |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4055886 ttctccaagaacaa-cctaatttctaccca-tttcccaatctc 4055926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 68 - 233
Target Start/End: Original strand, 8166516 - 8166685
Alignment:
Q  68 cactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaat--gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttccca 164  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||||||||||   |||| |||| |||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| || |||  ||    
T  8166516 cactatcaacaagttctttacaaagagatacaaaaaggttataagatattaacttcaacaaactctccaagaacaaacctaatttctactca-tttatca 8166614  T
Q  165 atctcaccaaagaaca--aaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgttttccaactc 233  Q
    |||||  | | |||||  | |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||||    
T  8166615 atctcttccatgaacaagacacactcaatgattttcacccacccaatgtgtttacaaatgtttttcaactc 8166685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 3 - 75
Target Start/End: Original strand, 27305705 - 27305777
Alignment:
Q  3 aagaaatgttcacacaattcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatca 75  Q
    |||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27305705 aagaaatgtatacacagttcggtccaaattgacctactttggaggagagattgatctctccaatccactatca 27305777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 24 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 20937809 - 20937668
Alignment:
Q  24 gtccaact-tgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctta-caaagagatacaaatg--ttacaagaaattagctt 119  Q
    |||||||| |||| |||| |||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||| |  ||||||||||||| |||    
T  20937809 gtccaactatgacatactttgggggaacgattgatctctccaatcta-tatcaatgagttcttttcaaagagatacaaaagggttacaagaaattaactt 20937711  T
Q  120 caacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcc 162  Q
    |||||| ||| | || ||||| | ||||||||||| |||||||    
T  20937710 caacaagctctccaaaaacaaacataatttctacctattttcc 20937668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 32 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 39127693 - 39127451
Alignment:
Q  32 tgacctactctgggggagagattgatctctccaatccact-atcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgt--tacaagaaattagcttcaacaaac 127  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||| || |||||| | ||||||||||| || || || |||||||||     || ||||||||||||||||||| |    
T  39127693 tgacctgctctggaggagagattgatctttcaaatccatttatcaatgagttatttacgaaaagatacaaaaaaactataagaaattagcttcaacaagc 39127594  T
Q  128 tcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaa-gaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac-aattgttt 225  Q
    |||| |||||||| | |||||| |||  |||| | |||||||  |  | ||| || || |||||||||||||||||  ||||||| ||| | ||||||||    
T  39127593 tcaccaagaacaaacataatttatacttattt-ctcaatctcttctcatgaataagacgctcaatgattttcactcttccaaggtattttccaattgttt 39127495  T
Q  226 tccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcc 270  Q
     | ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  39127494 ccaaactctagaatttaaccac-aaaagagaactaacccttagcc 39127451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 55 - 231
Target Start/End: Original strand, 3148037 - 3148215
Alignment:
Q  55 gatctctccaatccactatcaatgag-ttcttacaaagagatacaa--atgttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttct 151  Q
    ||||||| || | ||| ||||||||| |||||||||| | ||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||   ||||| || ||||||||||    
T  3148037 gatctctgcacttcacaatcaatgagattcttacaaacaaatacaataaggttacaagaaattagcttcaacaagctcttcaagaagaaacctaatttct 3148136  T
Q  152 acccattttcccaatctc-accaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgttttccaac 231  Q
    | ||| |||| |||||||  || |  ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||    
T  3148137 atcca-tttctcaatctcttcccacaaacaaaagactcaattattttcactca-ccaaaatgtttacaattgtttcccaac 3148215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 55 - 152
Target Start/End: Original strand, 25491014 - 25491114
Alignment:
Q  55 gatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgt--tacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttct 151  Q
    |||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |   || ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  25491014 gatctctccacttcactatcaatgatttctttacaaagagatacaaaaggagtataagaaatcagcttcaacaagctctcaaagaacaaacctaatttct 25491113  T
Q  152 a 152  Q
    |    
T  25491114 a 25491114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 174
Target Start/End: Original strand, 4598534 - 4598693
Alignment:
Q  20 ttcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttctt-acaaagaga-tacaa-atgttacaagaaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  || ||||| | |||||||||||||    
T  4598534 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaatt 4598633  T
Q  115 agcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 174  Q
    ||||| |  |   |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  4598634 agcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 4598693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 10056376 - 10056217
Alignment:
Q  20 ttcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttctt-acaaagaga-tacaa-atgttacaagaaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  || ||||| | |||||||||||||    
T  10056376 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaatt 10056277  T
Q  115 agcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 174  Q
    ||||| |  |   |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  10056276 agcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 10056217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 10058598 - 10058439
Alignment:
Q  20 ttcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttctt-acaaagaga-tacaa-atgttacaagaaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  || ||||| | |||||||||||||    
T  10058598 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaatt 10058499  T
Q  115 agcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 174  Q
    ||||| |  |   |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  10058498 agcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 10058439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 10060820 - 10060661
Alignment:
Q  20 ttcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttctt-acaaagaga-tacaa-atgttacaagaaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  || ||||| | |||||||||||||    
T  10060820 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaatt 10060721  T
Q  115 agcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 174  Q
    ||||| |  |   |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  10060720 agcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 10060661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 10063042 - 10062883
Alignment:
Q  20 ttcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttctt-acaaagaga-tacaa-atgttacaagaaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  || ||||| | |||||||||||||    
T  10063042 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaatt 10062943  T
Q  115 agcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 174  Q
    ||||| |  |   |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  10062942 agcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 10062883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 10065264 - 10065105
Alignment:
Q  20 ttcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttctt-acaaagaga-tacaa-atgttacaagaaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  || ||||| | |||||||||||||    
T  10065264 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaatt 10065165  T
Q  115 agcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 174  Q
    ||||| |  |   |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  10065164 agcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 10065105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 10211552 - 10211393
Alignment:
Q  20 ttcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttctt-acaaagaga-tacaa-atgttacaagaaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  || ||||| | |||||||||||||    
T  10211552 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaatt 10211453  T
Q  115 agcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 174  Q
    ||||| |  |   |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  10211452 agcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 10211393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 10209323 - 10209173
Alignment:
Q  28 aacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttctt-acaaagaga-tacaa-atgttacaagaaattagcttcaac 123  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  || ||||| | |||||||||||||||||| |      
T  10209323 aacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggactacaagaggttacaagaaattagcttgaca 10209224  T
Q  124 aaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 174  Q
    |   |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  10209223 atgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 10209173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 69 - 225
Target Start/End: Original strand, 40519258 - 40519412
Alignment:
Q  69 actatcaatgagttctt-acaaagagatacaaa-tgttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaa 165  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||    | ||||||| ||| ||||||||||    |||||| ||    
T  40519258 actatcaatgagttctttacaaagagatacaaaatattacaagaaattaacttcaacaa----ataaagaacaaactctaatttcta-ttgttttcctaa 40519352  T
Q  166 tctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgttt 225  Q
    | || |||| ||| || ||| ||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||    
T  40519353 tatctccaatgaataagacattcaatgattttcactcacaaaaaatgtttacaattgttt 40519412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 56 - 230
Target Start/End: Original strand, 1313852 - 1314029
Alignment:
Q  56 atctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttct 151  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||| |  || |||||||||||||| ||||| ||| | |||||| || | |||||| |    
T  1313852 atctctctaatccaatatcaatgagttcttttcaaagatatacaaaaggcttgcaagaaattagctttaacaagctctccaagaacaaaacataattttt 1313951  T
Q  152 acccattttcccaatctc-accaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgttttccaa 230  Q
    |||| ||||| |||||||  |  ||||| || | ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  1313952 accc-ttttctcaatctcttctcaagaataagagactcaat-aatttcactcacccaaggtgtttacaaatgtttcccaa 1314029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 32 - 169
Target Start/End: Original strand, 4075495 - 4075636
Alignment:
Q  32 tgacctac-tctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgag-ttcttacaaagagatacaa---atgttacaagaaattagcttcaacaaa 126  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||   | |||||||||||||| |||  ||||     
T  4075495 tgacctacatctgggggagag--tgatctctccaatccactatcaaagagtttcttacaaagtgatacaaaagaggttacaagaaattaacttttacaag 4075592  T
Q  127 ctcacaaagaacaacc--ctaatttctacccattttcccaatctc 169  Q
     || | ||||||| ||   ||||||||||||| ||||||||||||    
T  4075593 ttctctaagaacagcctaataatttctaccca-tttcccaatctc 4075636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 20 - 174
Target Start/End: Original strand, 4600755 - 4600914
Alignment:
Q  20 ttcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttctt-acaaagaga-tacaaatg-ttacaagaaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | |||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  || |||||| | ||||||||||||    
T  4600755 ttcggtccaaacttgacctactctagaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaaaggttacaagaaatt 4600854  T
Q  115 agcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 174  Q
    ||||| |  |   |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  4600855 agcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 4600914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 24635366 - 24635276
Alignment:
Q  68 cactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaat--gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctaccc 155  Q
    |||||||||||| ||  ||| |||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||||    
T  24635366 cactatcaatgaattgattataaagagatacaaaatagttacaaaaaattagcttcaacaaactctccaagaacaaacttaatttctaccc 24635276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 102 - 154
Target Start/End: Original strand, 28253363 - 28253416
Alignment:
Q  102 gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacc 154  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  28253363 gttacaagaaattaacttcaacaagctcacaatgaacgaaccctaatttctacc 28253416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 55 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 1683597 - 1683483
Alignment:
Q  55 gatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagat-acaaatgttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttcta 152  Q
    |||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||| | ||| | |||||||||||||| |||| || ||| | |||||| | | |||||||||    
T  1683597 gatctctccacttcactataaatgagttctttacaaagagattaaaaacgatacaagaaattagcatcaataagctctcgaagaacgaacttaatttcta 1683498  T
Q  153 cccattttcccaatct 168  Q
     |||||||| ||||||    
T  1683497 -ccattttctcaatct 1683483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 63 - 117
Target Start/End: Original strand, 54744304 - 54744359
Alignment:
Q  63 caatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgttacaagaaattagc 117  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  54744304 caatccactatcagtaagttctttacaaagagatacaaaagttacaataaattagc 54744359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 221 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 1683440 - 1683392
Alignment:
Q  221 tgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcc 270  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  1683440 tgtttcccaactctagattctaacc-ccaaaagataaccaacccttagcc 1683392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 73 - 102
Target Start/End: Original strand, 31340242 - 31340271
Alignment:
Q  73 tcaatgagttcttacaaagagatacaaatg 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31340242 tcaatgagttcttacaaagagatacaaatg 31340271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 216; Significance: 1e-119; HSPs: 48)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 21593839 - 21593570
Alignment:
Q  1 ccaagaaatgttcacacaattcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 100  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21593839 ccaagaaatgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 21593740  T
Q  101 t--gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttc 198  Q
    |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  21593739 tgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttc 21593641  T
Q  199 actcacccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagc 269  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21593640 actctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagc 21593570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Original strand, 26830116 - 26830387
Alignment:
Q  1 ccaagaaatgttcacacaattcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 100  Q
    ||||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26830116 ccaagaaatgttcacccagttcagtcaaacttgacctactttggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 26830215  T
Q  101 tg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctca-ccaaagaacaaaacactcaatgatttt 197  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||    
T  26830216 tggattacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaactctaatttctacccatttttccaatctcacccaatgaacaagacactc-atgatttt 26830314  T
Q  198 cactcacccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcc 270  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26830315 cactctcccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcc 26830387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 28137401 - 28137622
Alignment:
Q  1 ccaagaaatgttcacacaattcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28137401 ccaagaaatgttcacacaattcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagaaatacaaa 28137500  T
Q  101 tg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttc 198  Q
    ||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  28137501 tgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccattctcaccaatgaacaagacactcaatgattttc 28137600  T
Q  199 actcacccaaggtgtttacaat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  28137601 actcacccaaggtgtttacaat 28137622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Original strand, 2972932 - 2973202
Alignment:
Q  1 ccaagaaatgttcacacaattcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 100  Q
    |||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2972932 ccaagaaatgttcacctagttcggtcgaacttgacctactcttgaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 2973031  T
Q  101 t--gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttc 198  Q
    |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||  |||||||||    
T  2973032 tgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacacgacact-tatgattttc 2973130  T
Q  199 actcacccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcc 270  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  2973131 actctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaatccctaaaagagaaccaacccttagcc 2973202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 5043803 - 5043532
Alignment:
Q  1 ccaagaaatgttcacacaattcggtccaact-tgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaa 99  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5043803 ccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactatggaggagagattgatctctccaatctactatcaatgagttcttacaaagagatacaa 5043704  T
Q  100 atg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgatttt 197  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||| ||||||| |||||||    
T  5043703 atgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctactcattttctcaatctcacgaatgaacaagacactca-tgatttt 5043605  T
Q  198 cactcacccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcc 270  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  5043604 cactctcacaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagcc 5043532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 17763166 - 17762894
Alignment:
Q  1 ccaagaaatgttcacacaattcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaa 99  Q
    |||||||||||||||  | |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  17763166 ccaagaaatgttcacctagttcggtccaaacttgatctactctggaggagagattgatcactccaatccactatcaatgagttcttccaaaaagatacaa 17763067  T
Q  100 atg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgatttt 197  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||   |||||    
T  17763066 atgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcatgaatttt 17762967  T
Q  198 cactcacccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcc 270  Q
    ||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17762966 cactctctcaaagtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcc 17762894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 20 - 270
Target Start/End: Original strand, 3808719 - 3808971
Alignment:
Q  20 ttcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaat---gttacaagaaatta 115  Q
    |||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||    
T  3808719 ttcggtccaatcatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaatgggttacaagaaatta 3808818  T
Q  116 gcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgttt 215  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||   |||||||||||| ||||||||||||    
T  3808819 gtttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacctattttcccaatctcaccaatgaacaagacact-tgtgattttcactctcccaaggtgttt 3808917  T
Q  216 acaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcc 270  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  3808918 acaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaa-agaaccaacccttagcc 3808971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Original strand, 9183043 - 9183245
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagc 117  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  9183043 ttcggtccaacttgacataatctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagc 9183142  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 217  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9183143 ttcaacaaattcacaaagaacaaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 9183242  T
Q  218 aat 220  Q
    |||    
T  9183243 aat 9183245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Original strand, 22424818 - 22425089
Alignment:
Q  1 ccaagaaatgttcacacaattcggtccaact-tgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaa 99  Q
    ||||||||||||||| || | |||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22424818 ccaagaaatgttcacccagtacggtccaacaatgacctactctgaaggagagattgatctctccaatccactat-aatgagttcttacaaagagatacaa 22424916  T
Q  100 at----gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgatt 195  Q
    |     |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||   |||    
T  22424917 aaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaacgaacaagacactcatgaatt 22425016  T
Q  196 ttcactcacccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagc 269  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22425017 ttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacc-ccaaaagagaaccaacccttagc 22425089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 21589106 - 21588916
Alignment:
Q  1 ccaagaaatgttcacacaattcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 100  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21589106 ccaagaaatgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 21589007  T
Q  101 t--gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactca 189  Q
    |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  21589006 tgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactca 21588916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 20 - 270
Target Start/End: Original strand, 603100 - 603343
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaat--gttacaagaaattagc 117  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  603100 ttcggtccaacttgacctaatcttggggagagattgatttctccaatccactatcaacgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagc 603199  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 217  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||        |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  603200 ttcaacaagctcacaaagaacaacacaaatttcta--------cccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactatcccaaggtgtttac 603290  T
Q  218 aattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcc 270  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  603291 aattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaaccattagcc 603343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Original strand, 33211197 - 33211399
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgt--tacaagaaattagc 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |    
T  33211197 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccattataaatgagttcttacaaagagatacaaatgagctacaagaaattaac 33211296  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 217  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  33211297 ttcatcaagctcacaaagaacaaccataatttctaccaattttcccaatctcaccaatgaacaaaacactcaatgattttcagtgacccaaggtgtttac 33211396  T
Q  218 aat 220  Q
    |||    
T  33211397 aat 33211399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Original strand, 26954298 - 26954499
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaat--gttacaagaaattagc 117  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  26954298 ttcggtccaacttgacctactttgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacagatgagttacaagaaattagc 26954397  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 217  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  26954398 ttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttata-ccaatttcccaatctcacatatgaacaagacactcaatgattttcactccccaaaggtgtttac 26954496  T
Q  218 aat 220  Q
    |||    
T  26954497 aat 26954499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 9 - 220
Target Start/End: Original strand, 2171532 - 2171744
Alignment:
Q  9 tgttcacacaattcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg-ttac 106  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  2171532 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaagggttac 2171631  T
Q  107 aagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcaccc 206  Q
    |||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  2171632 aagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccatttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-cc 2171730  T
Q  207 aaggtgtttacaat 220  Q
    ||||||||||||||    
T  2171731 aaggtgtttacaat 2171744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 28 - 220
Target Start/End: Original strand, 5406220 - 5406412
Alignment:
Q  28 aacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgttacaagaaattagcttcaacaa 125  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||  ||||    
T  5406220 aacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaa 5406319  T
Q  126 actcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 220  Q
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5406320 gttcacaaagaacaaccctaatttcta-ccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-ccaaggtgtttacaat 5406412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 28 - 220
Target Start/End: Original strand, 5410545 - 5410737
Alignment:
Q  28 aacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgttacaagaaattagcttcaacaa 125  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||  ||||    
T  5410545 aacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaa 5410644  T
Q  126 actcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 220  Q
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5410645 gttcacaaagaacaaccctaatttcta-ccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-ccaaggtgtttacaat 5410737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 31 - 220
Target Start/End: Original strand, 3038926 - 3039117
Alignment:
Q  31 ttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaact 128  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || ||    
T  3038926 ttgacctaatctgggggagagattaatctctccaatccactattaaagagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaaaaagct 3039025  T
Q  129 cacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 220  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3039026 cacaatgaacaaccctaatttctaccaattttcccaatctcaccaatgaacaagacattcaatgattttcactcactcaaggtgtttacaat 3039117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 9 - 231
Target Start/End: Original strand, 31404675 - 31404897
Alignment:
Q  9 tgttcacacaattcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgtta 105  Q
    ||||||| || |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  31404675 tgttcacccagttcggtccaaacttggcctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtta 31404774  T
Q  106 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 205  Q
    ||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  31404775 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-ccattttcccaatctcactgatgaacaagacactcaatgattttcactca-c 31404872  T
Q  206 caaggtgtttacaattgttttccaac 231  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  31404873 caaggtgtttacaa-tgttttccaac 31404897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 17758199 - 17757995
Alignment:
Q  1 ccaagaaatgttcacacaattcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaa 99  Q
    |||||||||||||||  | |||||||||| ||||| ||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17758199 ccaagaaatgttcacctagttcggtccaaacttgaactactctagaggggagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaa 17758100  T
Q  100 atg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgatttt 197  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || |||||||   |||||    
T  17758099 atgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaagaagacactcatgaatttt 17758000  T
Q  198 cactc 202  Q
    |||||    
T  17757999 cactc 17757995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Original strand, 5413405 - 5413606
Alignment:
Q  20 ttcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgttacaagaaattag 116  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  5413405 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagaaattag 5413504  T
Q  117 cttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgttta 216  Q
    |||  ||||  || |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  5413505 ctttgacaagttcgcaaagaacaaccctaatttcta-cctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-ccaatgtgttta 5413602  T
Q  217 caat 220  Q
    ||||    
T  5413603 caat 5413606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 11 - 220
Target Start/End: Original strand, 30834538 - 30834750
Alignment:
Q  11 ttcacacaattcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgttaca 107  Q
    ||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||    
T  30834538 ttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagggttaca 30834637  T
Q  108 agaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctaccc-attttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcaccc 206  Q
    ||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  30834638 agaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-cc 30834736  T
Q  207 aaggtgtttacaat 220  Q
     |||||||||||||    
T  30834737 gaggtgtttacaat 30834750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 220
Target Start/End: Original strand, 16452329 - 16452543
Alignment:
Q  9 tgttcacacaattcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagata--caaatgtta 105  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||  ||||    
T  16452329 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttccaaagagatatgaaagggtta 16452428  T
Q  106 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctaccc-attttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcac 204  Q
    ||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||     
T  16452429 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 16452527  T
Q  205 ccaaggtgtttacaat 220  Q
    ||||||||||||||||    
T  16452528 ccaaggtgtttacaat 16452543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 34 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 4045566 - 4045364
Alignment:
Q  34 acctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaa-tg-ttacaagaaattagcttcaacaaactca 130  Q
    ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4045566 acctactttggggtagaaattgatctctccaatccactatcaatgagttatttacaaagagatataaaatgattacaagaaattagcttcaacaagctca 4045467  T
Q  131 caaagaacaa-ccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgttttcca 229  Q
     ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||    
T  4045466 taaagaacaaaccctaatttctacc-attttcccaatctctccaataaacaagacactcaatgattttcactcaccctaggtgtttacaaatgtttccca 4045368  T
Q  230 actc 233  Q
    ||||    
T  4045367 actc 4045364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 28 - 220
Target Start/End: Original strand, 33160372 - 33160567
Alignment:
Q  28 aacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgttacaagaaattagcttcaacaa 125  Q
    |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||  ||||    
T  33160372 aacttgaaatactctggaggagagattgatctctccaatccaccatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaa 33160471  T
Q  126 actcacaaagaacaaccctaatttctacc-cattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatga-ttttcactcacccaaggtgtttacaat 220  Q
      |||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  33160472 gttcacaaagaacaactctaatttctacctttttttcccaatctcaccaatgaataagacactcaatgatttttcactca-ccaaggtgtttacaat 33160567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 16569178 - 16568997
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgttacaagaaattagctt 119  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||    
T  16569178 ttcggtccaacttgacctaatctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaag----------gttacaagaaattagctt 16569089  T
Q  120 caacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttaca 218  Q
     ||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||          ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16569088 aaacaagctcacaaagaacaaaacctaatttctacccattttctcaatct----------caagacactcaatgattttcacttacccaaggtgtttaca 16568999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 9 - 174
Target Start/End: Original strand, 3072759 - 3072928
Alignment:
Q  9 tgttcacacaattcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaa---tgt 103  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    ||    
T  3072759 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaattcactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaaagagt 3072858  T
Q  104 tacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 174  Q
    ||||||||||||| ||  ||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3072859 tacaagaaattagatttgacaagttcacaatgaacaaccctaatttcta-ccattttcccaatctcaccaa 3072928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 217
Target Start/End: Original strand, 6097451 - 6097643
Alignment:
Q  9 tgttcacacaattcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgttaca 107  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||       ||||||    
T  6097451 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaa-aga-------gttaca 6097542  T
Q  108 agaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcaccca 207  Q
    ||||||||| ||  ||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||       ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6097543 agaaattagatttgacaagttcacaaagaacaatcctaatttcta-ccatttttccaatctcac-------caaaacactcaatgattttcactca-cca 6097633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 47 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 25073698 - 25073472
Alignment:
Q  47 gagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccc 143  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |  |||||| ||| |||||| ||||| ||||| ||||| ||  |    
T  25073698 gagagattgatttctctaatccactatcaatgagttctttacatagagatacaaaagggttacaataaaatagctttaacaagctcacgaagaataaatc 25073599  T
Q  144 taatttctacccattttcccaatctca-ccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac-aattgttttccaactctagaatct 241  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||  || | |||||| | |||||||||||| |||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  25073598 taatttctacc-attttttcaatctcctcccatgaacaagatactcaatgattt-cactcacccaagatgtttcccaattgtttcccaactctagaatct 25073501  T
Q  242 aaccaccaaaagagaaccaacccttagcc 270  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  25073500 aacccccaaaagagaatcaacccttagcc 25073472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 412270 - 412101
Alignment:
Q  9 tgttcacacaattcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaa---tgt 103  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    ||    
T  412270 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctctaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaaagagt 412171  T
Q  104 tacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 174  Q
    ||||||||||||| ||  | ||  |||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  412170 tacaagaaattagatttgataagttcacaatgaacaaccctaatttcta-cctttttcccaatctcaccaa 412101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 26800763 - 26800630
Alignment:
Q  1 ccaagaaatgttcacacaattcggtccaact-tgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaa 99  Q
    ||||||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26800763 ccaagaaatgttcatccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat-aatgagttcttacaaagagatacaa 26800665  T
Q  100 a---tgttacaagaaattagcttcaacaaactcac 131  Q
    |    |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26800664 aattagttacaagaaattagcttcaacaagctcac 26800630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 100
Target Start/End: Original strand, 5409080 - 5409161
Alignment:
Q  20 ttcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5409080 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 5409161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 27648028 - 27647861
Alignment:
Q  9 tgttcacacaattcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatac-aaatgtta 105  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||| ||||    
T  27648028 tgttcacccagttcggtccaaacttgatctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggtta 27647929  T
Q  106 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 174  Q
    ||||||||||||||  ||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27647928 caagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 27647861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 9 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 16555037 - 16554869
Alignment:
Q  9 tgttcacacaattcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatac-aaatgtt 104  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||| |||    
T  16555037 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactttggaggagagtttgcactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggtt 16554938  T
Q  105 acaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 174  Q
    |||||||||||||||  ||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16554937 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 16554869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 9 - 174
Target Start/End: Original strand, 16578518 - 16578686
Alignment:
Q  9 tgttcacacaattcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatac-aaatgtt 104  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||| |||    
T  16578518 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgcactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggtt 16578617  T
Q  105 acaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 174  Q
    |||||||||||||||  ||||  |||||| || | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16578618 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgagcaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 16578686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 9 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 16616862 - 16616694
Alignment:
Q  9 tgttcacacaattcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatac-aaatgtt 104  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||| |||    
T  16616862 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgcactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggtt 16616763  T
Q  105 acaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 174  Q
    |||||||||||||||  ||||  |||||| || | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16616762 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgagcaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 16616694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 9 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 16631593 - 16631425
Alignment:
Q  9 tgttcacacaattcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatac-aaatgtt 104  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||| |||    
T  16631593 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactttggaggagagtttgcactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggtt 16631494  T
Q  105 acaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 174  Q
    |||||||||||||||  ||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16631493 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 16631425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 9 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 16653280 - 16653112
Alignment:
Q  9 tgttcacacaattcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatac-aaatgtt 104  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||| |||    
T  16653280 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgcactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggtt 16653181  T
Q  105 acaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 174  Q
    |||||||||||||||  ||||  |||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  16653180 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttttaccc-ttttcccaatctcaccaa 16653112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 9 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 25421474 - 25421305
Alignment:
Q  9 tgttcacacaattcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaa-atgt 103  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| | ||    
T  25421474 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggt 25421375  T
Q  104 tacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 174  Q
    ||||||||||||||||  ||||  |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  25421374 tacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 25421305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 6027415 - 6027246
Alignment:
Q  9 tgttcacacaattcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaa-atgt 103  Q
    ||||||| || |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| | ||    
T  6027415 tgttcacccagttcggtccaaacttgacatactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggt 6027316  T
Q  104 tacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 174  Q
    ||||||||||||||||  ||||  |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  6027315 tacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 6027246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 106 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 16567265 - 16567160
Alignment:
Q  106 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaac-cctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcac 204  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||          | ||||||||||||||||||||||    
T  16567265 caagaaattagcttaaacaagctcacaaaaaacaaaacctaatttctaaccattttcccaatctca----------agacactcaatgattttcactcac 16567176  T
Q  205 ccaaggtgtttacaat 220  Q
    ||||||||||||||||    
T  16567175 ccaaggtgtttacaat 16567160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 13154072 - 13153913
Alignment:
Q  20 ttcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttctt-acaaagaga-tacaa-atgttacaagaaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  || ||||| | |||||||||||||    
T  13154072 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaatt 13153973  T
Q  115 agcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 174  Q
    ||||| |  |   |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  13153972 agcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 13153913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 174
Target Start/End: Original strand, 33342116 - 33342275
Alignment:
Q  20 ttcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttctt-acaaagaga-tacaa-atgttacaagaaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  || ||||| | |||||||||||||    
T  33342116 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggagtacaagaggttacaagaaatt 33342215  T
Q  115 agcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 174  Q
    ||||| |  |   |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  33342216 agcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 33342275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 34165015 - 34164856
Alignment:
Q  20 ttcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttctt-acaaagaga-tacaa-atgttacaagaaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  || ||||| | |||||||||||||    
T  34165015 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaatt 34164916  T
Q  115 agcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 174  Q
    ||||| |  |   |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  34164915 agcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 34164856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 34167248 - 34167078
Alignment:
Q  9 tgttcacacaattcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaa-atgt 103  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| ||| ||||| |||| ||||  |||||| | ||    
T  34167248 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaataagttctttacaaaaggaatacaagaggt 34167149  T
Q  104 tacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 174  Q
    |||||||||||||||| |  |   |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  34167148 tacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 34167078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 270
Target Start/End: Original strand, 5740970 - 5741054
Alignment:
Q  186 ctcaatgattttcactcacccaaggtgtttac-aattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcc 270  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| || |||   |||||||||||||||    
T  5740970 ctcaatgattt-cactcaccgaaggtgttttccaattgttttccaactttagaatctaaccccccaaaagtaaccaacccttagcc 5741054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 9572735 - 9572667
Alignment:
Q  32 tgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaa 99  Q
    |||||||||||   | |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||    
T  9572735 tgacctactctaaagtagagattgatctctgcaatccactatcaatgggttcttaacaaagagttacaa 9572667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 49 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 2908586 - 2908550
Alignment:
Q  49 gagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt 85  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  2908586 gagattgatttcttcaatccactatcaatgagttctt 2908550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 207 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 11660574 - 11660512
Alignment:
Q  207 aaggtgtttacaa-ttgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcc 270  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  11660574 aaggtgtttacaaattgtttccgaactctagaatctaacc-ccaaaa-tgaaccaacccttagcc 11660512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 85)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Original strand, 13547082 - 13547352
Alignment:
Q  1 ccaagaaatgttcacacaattcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 100  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13547082 ccaagaaatgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 13547181  T
Q  101 t--gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttc 198  Q
    |  ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  13547182 tgggttacaagaaaatagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttc 13547280  T
Q  199 actcacccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcc 270  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13547281 actctcccaaggtgtttacaattgtttcccaaatctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcc 13547352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 2 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 11348872 - 11348603
Alignment:
Q  2 caagaaatgttcacacaattcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaat 101  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11348872 caagaaatgttcactcagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttagaaagagatacaaat 11348773  T
Q  102 --gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttca 199  Q
      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||    
T  11348772 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctaccaattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttca 11348674  T
Q  200 ctcacccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcc 270  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11348673 ctctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcc 11348603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Original strand, 13548993 - 13549263
Alignment:
Q  1 ccaagaaatgttcacacaattcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 100  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13548993 ccaagaaatgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 13549092  T
Q  101 t--gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttc 198  Q
    |  |||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  13549093 tgggttacatgaaattaggtttaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttc 13549191  T
Q  199 actcacccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcc 270  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13549192 actctcccaaggtgtttacaattgtttcccaaatctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcc 13549263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 37168473 - 37168202
Alignment:
Q  1 ccaagaaatgttcacacaattcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 100  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37168473 ccaagaaatgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 37168374  T
Q  101 ---tgttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgatttt 197  Q
        |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  37168373 atgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgatttt 37168275  T
Q  198 cactcacccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcc 270  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  37168274 cactctctcaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaatcaacctttagcc 37168202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 193786 - 193516
Alignment:
Q  1 ccaagaaatgttcacacaattcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 100  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  193786 ccaagaaatgttcacccagttcggtccaacttgacatactctggagaagagattgatctctccaatccactatcaatgagttattacaaagagatacaaa 193687  T
Q  101 t--gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttc 198  Q
    |  |||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  193686 tgagttacaagaaattagcttcaacaagctaataaagaacaaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttc 193588  T
Q  199 actcacccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcc 270  Q
    || | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  193587 accctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcc 193516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 47255332 - 47255601
Alignment:
Q  1 ccaagaaatgttcacacaattcggtccaact-tgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaa 99  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47255332 ccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaa 47255431  T
Q  100 atg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgatttt 197  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  47255432 atgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgatttt 47255530  T
Q  198 cactcacccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttag 268  Q
    ||||| |||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  47255531 cactctcccaaggcatttacaattatttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttag 47255601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 29136423 - 29136152
Alignment:
Q  1 ccaagaaatgttcacacaattcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaa 99  Q
    |||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29136423 ccaagaaatgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccacgatcaatgagttcttacaaagaaatacaa 29136324  T
Q  100 atg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgatttt 197  Q
    |||  || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  29136323 atgggttccaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgatttt 29136225  T
Q  198 cactcacccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcc 270  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  29136224 cactctcccaaggtgtttacaattgtttcacaactctagaatctaacccccaaaagagaactaacccttagcc 29136152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Original strand, 31925700 - 31925969
Alignment:
Q  1 ccaagaaatgttcacacaattcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 100  Q
    |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31925700 ccaagaaatgttcacctagttcggtccaacttgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 31925799  T
Q  101 t--gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttc 198  Q
    |  |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  31925800 tgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaatgaacatccctaatttctacccatttttccactctcaccaatgaacaagacactc-atgattttc 31925898  T
Q  199 actcacccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcc 270  Q
    |||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  31925899 actctcccaaggtgtttacaactg-cttccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaaccattagcc 31925969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 2 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 47115347 - 47115076
Alignment:
Q  2 caagaaatgttcacacaattcggtccaact-tgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 100  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  47115347 caagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggagcagagattgatctctccaatccactatcaatgggtttttacaaagagatacaaa 47115248  T
Q  101 t---gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgatttt 197  Q
        |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  47115247 atgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctaccaattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgatttt 47115149  T
Q  198 cactcacccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcc 270  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  47115148 cactctcccaagatgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcc 47115076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 5 - 269
Target Start/End: Original strand, 7482227 - 7482494
Alignment:
Q  5 gaaatgttcacacaattcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaat--- 101  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||        
T  7482227 gaaatgttcacctagttcggtccaacttgacctactctgaaggagagattgatctctccaattcactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaatgg 7482326  T
Q  102 gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcact 201  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||   |||||||||    
T  7482327 gttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatttacccaatctcaccaatgaacaatacactcatgaattttcact 7482426  T
Q  202 cacccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagc 269  Q
      ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7482427 ttcccaaggtgtttacaattgcttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagc 7482494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 9 - 270
Target Start/End: Original strand, 42297975 - 42298238
Alignment:
Q  9 tgttcacacaattcggtccaact-tgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--tta 105  Q
    ||||||| || |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  42297975 tgttcacccagttcggtccaaccatgacctactctggaggagagattgatctcttcaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 42298074  T
Q  106 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||| ||    
T  42298075 caagaaattagcttcaacaagctcacaaaaaacaaccctaatttctaccaattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgatttttactctcc 42298173  T
Q  206 caaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcc 270  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  42298174 caaggtgtttacaattgtttcacaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagcc 42298238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 20 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 19754651 - 19754406
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaat--gttacaagaaattagc 117  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  19754651 ttcggtccaacttgacctaatctgagggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatcggttacaagaaattagc 19754552  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctaccca-ttttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgttta 216  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  19754551 ttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatttttctcaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctctcaaggtgttta 19754453  T
Q  217 caattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacc 263  Q
    | | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19754452 cgaatgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacc 19754406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 20 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 34603733 - 34603480
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaat---gttacaagaaattag 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    |||||||||||||||    
T  34603733 ttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctcttcaatccaccatcaatgagttcttacaaagagataaaaaatgggttacaagaaattag 34603634  T
Q  117 cttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgttta 216  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||   |||||||||  |||||||||||||    
T  34603633 cttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttttcaatctcaccaatgaacaagacactcatgaattttcactttcccaaggtgttta 34603534  T
Q  217 caattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcc 270  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34603533 caattgtttcccaactctagaatctaacctccaaaagagaaccaacccttagcc 34603480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 9 - 270
Target Start/End: Original strand, 37033072 - 37033336
Alignment:
Q  9 tgttcacacaattcggtccaact-tgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa-tg--tt 104  Q
    ||||||| || |||||||||||  ||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||    
T  37033072 tgttcacccagttcggtccaaccatgacctactatggagaagagattaatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatgcaaaatggatt 37033171  T
Q  105 acaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcac 204  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| |    
T  37033172 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctc 37033270  T
Q  205 ccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcc 270  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||    
T  37033271 ccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaaccccaaaaagagaaccaacccatagcc 37033336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Original strand, 28220238 - 28220440
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagc 117  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  28220238 ttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagc 28220337  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 217  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28220338 ttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttccgaatctcaccaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaaggtgttttc 28220437  T
Q  218 aat 220  Q
    |||    
T  28220438 aat 28220440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Original strand, 28265566 - 28265768
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagc 117  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  28265566 ttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaagagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagc 28265665  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 217  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28265666 ttcaacaagctcacaatgaacaaccctaatttctacctattttcccaatctcgccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 28265765  T
Q  218 aat 220  Q
    |||    
T  28265766 aat 28265768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 31659394 - 31659192
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagc 117  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  31659394 ttcggtccaacttgacctaatctgagggagagattgatctctccaatccactatcaataagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagc 31659295  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 217  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31659294 ttcaacaagctcacaaagaacagccctaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 31659195  T
Q  218 aat 220  Q
    |||    
T  31659194 aat 31659192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 20 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 19752842 - 19752590
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaat--gttacaagaaattagc 117  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  19752842 ttcggtccaacttgacctaatatgggagagagattgatctctccaatcctctatcaatgagttcttacaaagagatacaaatcggttacaagaaattagc 19752743  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccatttt-cccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgttta 216  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  19752742 ttcaacaagctcgcaaagaacaaccctaatttctacccattttactcaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctctcaaggtgttta 19752644  T
Q  217 caattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcc 270  Q
    | ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  19752643 cgattatttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaatcattagcc 19752590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 20 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 49918506 - 49918309
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagc 117  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  49918506 ttcggtccaacttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagc 49918407  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgttt 215  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49918406 ttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgttt 49918309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Original strand, 37503569 - 37503768
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgttacaagaaattagctt 119  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  37503569 ttcgatccaacttgacataatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaag-gttacaagaaattagctt 37503667  T
Q  120 caacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa 219  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37503668 caacaagttcacaaagaacaaccctaatttttacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa 37503767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Original strand, 834179 - 834381
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagc 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  834179 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagatagatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgggttacaagaaattagc 834278  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 217  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  834279 ttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcacgcacccaaggtgtttac 834378  T
Q  218 aat 220  Q
    |||    
T  834379 aat 834381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 44455316 - 44455114
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagc 117  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||     
T  44455316 ttcggtcaaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaaagatacaaatgagttacaagaaattagt 44455217  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 217  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44455216 ttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatggttttcactcacccaaggtgtttac 44455117  T
Q  218 aat 220  Q
    |||    
T  44455116 aat 44455114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 23 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 1833675 - 1833476
Alignment:
Q  23 ggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttc 120  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  1833675 ggtccaatttgacctaatctggtggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaatttagcttc 1833576  T
Q  121 aacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 220  Q
    || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1833575 aatagattcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 1833476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 3157021 - 3156820
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagc 117  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  3157021 ttcggtccaacttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagc 3156922  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 217  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  3156921 ttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-ccagggtgtttac 3156823  T
Q  218 aat 220  Q
    |||    
T  3156822 aat 3156820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Original strand, 3847133 - 3847335
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagc 117  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| || |||||    
T  3847133 ttcggtccaacttgacctaatctggggaagagatggatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgggttacaaaaatttagc 3847232  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 217  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3847233 ttaaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 3847332  T
Q  218 aat 220  Q
    |||    
T  3847333 aat 3847335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 9 - 220
Target Start/End: Original strand, 8550787 - 8551001
Alignment:
Q  9 tgttcacacaattcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--tta 105  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||    
T  8550787 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgagtta 8550886  T
Q  106 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 205  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8550887 caagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 8550986  T
Q  206 caaggtgtttacaat 220  Q
    ||| |||||||||||    
T  8550987 caatgtgtttacaat 8551001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 20 - 213
Target Start/End: Original strand, 28223433 - 28223628
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagc 117  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  28223433 ttcggtccaacttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagc 28223532  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgt 213  Q
    ||||||||  ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28223533 ttcaacaagttcagaaagatcaaccataatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgt 28223628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 20 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 46065074 - 46064864
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagc 117  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  46065074 ttcgatccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatgaatgagttcttacaaagagatacacatgagttacaagaaattagc 46064975  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 217  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46064974 ttcaacgagctcacaaagaacaaacctaatttttatccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 46064875  T
Q  218 aattgttttcca 229  Q
    || |||||||||    
T  46064874 aa-tgttttcca 46064864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Original strand, 4552649 - 4552851
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagc 117  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||    
T  4552649 ttcggtccaacttgacctactctgagggagagattgatctctccaatccattatcaatgagttcttacaaagggatacaaaggggttacaagaaattagc 4552748  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 217  Q
    |||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4552749 ttcaacaagctcacaaaggacaaacctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttccctcacccaaggtgtttac 4552848  T
Q  218 aat 220  Q
    |||    
T  4552849 aat 4552851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Original strand, 50167187 - 50167389
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagc 117  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  50167187 ttcggtccaacttgagctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagc 50167286  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 217  Q
    ||  |||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50167287 tttgacaagctcacaaataacaaccctaatttctactaattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 50167386  T
Q  218 aat 220  Q
    |||    
T  50167387 aat 50167389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Original strand, 50169222 - 50169424
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagc 117  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  50169222 ttcggtccaacttgacctaatctaggggagagattgatctcttcaatccactatcaatgagtacttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagc 50169321  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 217  Q
    ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  50169322 tttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtatttac 50169421  T
Q  218 aat 220  Q
    |||    
T  50169422 aat 50169424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 23555259 - 23555479
Alignment:
Q  1 ccaagaaatgttcacacaattcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 100  Q
    |||||||||||| || || |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23555259 ccaagaaatgtttactcagttcgatccaacttgacctactatgggg-agagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 23555357  T
Q  101 tg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttc 198  Q
    ||  ||| |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||    
T  23555358 tgagttataagaaattagtttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaaagaataagacactcaataattttc 23555457  T
Q  199 actcacccaaggtgtttacaat 220  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  23555458 attcacccaaggtgtttacaat 23555479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Original strand, 13659348 - 13659550
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagc 117  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||    
T  13659348 ttcggtccaacttaacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatataaatgggtaacaagaaattagc 13659447  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 217  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  13659448 ttcaacaagcttacaaaaaacaaccctaatttctatccgttttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactaccccaaggtgtttac 13659547  T
Q  218 aat 220  Q
    |||    
T  13659548 aat 13659550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Original strand, 196919 - 197122
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctggggg-agagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattag 116  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||     
T  196919 ttcggtccaacttgacctaatctggggggagagataaatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgagttacaagaaattaa 197018  T
Q  117 cttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgttta 216  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  197019 cttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctaccaattttctcaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgttta 197118  T
Q  217 caat 220  Q
    ||||    
T  197119 caat 197122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15820463 - 15820249
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgt--tacaagaaattagc 117  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  15820463 ttcgatccaacttgacctactctggatgagagatttatctcttcaatgcactatcaatgagttcttaaaaagagatacaaatgtgttacaagaaattagc 15820364  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 217  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15820363 ttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttttacccatctttccaatatcaccaaagaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 15820264  T
Q  218 aattgttttccaactc 233  Q
    || ||||| |||||||    
T  15820263 aa-tgtttcccaactc 15820249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Original strand, 37559879 - 37560083
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactct-gggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattag 116  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  37559879 ttcggtccaacttgacctaatctagggggagagattgatctctccaattcactatcaacgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattag 37559978  T
Q  117 ctt-caacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgttt 215  Q
    ||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  37559979 ctttcaacaagttcacaaagaacaactctaatttctacccattttcctaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacctaatgtgttt 37560078  T
Q  216 acaat 220  Q
    |||||    
T  37560079 acaat 37560083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 20 - 231
Target Start/End: Original strand, 45644366 - 45644579
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaat--gttacaagaaattagc 117  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  45644366 ttcggtccaacttgacctaatctgggggagatattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttgcaagaaattagc 45644465  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgttta 216  Q
    ||  |||| |||||||||||| || | ||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45644466 tttgacaagctcacaaagaacaaaacttaatttctatccattttctcaatctcaccaatgaacaagacacttaatgattttcactcacccaagatgttta 45644565  T
Q  217 caattgttttccaac 231  Q
    ||| |||||||||||    
T  45644566 caa-tgttttccaac 45644579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 10925382 - 10925177
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt---acaaagagatacaaatg--ttacaagaaatt 114  Q
    |||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  10925382 ttcgatccaactttacctaatctaggggagagattgatttctccaatccactatcaatgaattcttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaatt 10925283  T
Q  115 agcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtt 214  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10925282 agcttcaacaagctcacaaagaacaaccataatttctatccattttttcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtt 10925183  T
Q  215 tacaat 220  Q
    ||||||    
T  10925182 tacaat 10925177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 102 - 270
Target Start/End: Original strand, 37879007 - 37879174
Alignment:
Q  102 gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcact 201  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  37879007 gttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacctattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcact 37879105  T
Q  202 cacccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcc 270  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  37879106 ctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaatccttagcc 37879174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 20 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 41361070 - 41360872
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagc 117  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||     
T  41361070 ttcggtccaatatgacctactatgggggagatattgatctctttaatccactatcaacgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagt 41360971  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 217  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  41360970 ttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaat-attttcactcacccaagatgtttac 41360872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 9 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 3189498 - 3189285
Alignment:
Q  9 tgttcacacaattcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--tta 105  Q
    ||||||| || |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||    
T  3189498 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggatgagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaaagatacaaaagagtta 3189399  T
Q  106 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 205  Q
    || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| |    
T  3189398 caggaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttataccctttttccaaatctcaccaatgaacaagacactcagtgattttcactca-c 3189300  T
Q  206 caaggtgtttacaat 220  Q
    |||||||||||||||    
T  3189299 caaggtgtttacaat 3189285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 9 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 3198315 - 3198102
Alignment:
Q  9 tgttcacacaattcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--tta 105  Q
    ||||||| || |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||    
T  3198315 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggatgagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaaagatacaaaagagtta 3198216  T
Q  106 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 205  Q
    || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| |    
T  3198215 caggaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttataccctttttccaaatctcaccaatgaacaagacactcagtgattttcactca-c 3198117  T
Q  206 caaggtgtttacaat 220  Q
    |||||||||||||||    
T  3198116 caaggtgtttacaat 3198102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 9 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 3207154 - 3206941
Alignment:
Q  9 tgttcacacaattcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--tta 105  Q
    ||||||| || |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||    
T  3207154 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggatgagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaaagatacaaaagagtta 3207055  T
Q  106 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 205  Q
    || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| |    
T  3207054 caggaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttataccctttttccaaatctcaccaatgaacaagacactcagtgattttcactca-c 3206956  T
Q  206 caaggtgtttacaat 220  Q
    |||||||||||||||    
T  3206955 caaggtgtttacaat 3206941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Original strand, 13137988 - 13138188
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaat--gttacaagaaattagc 117  Q
    ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  13137988 ttcggtccaatatgacctactctaggggagagattgctctcttcaatccactatcaatgtgttcttacaaagagatgcaaatgggttacaagaaattagc 13138087  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 217  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13138088 ttcaacaagctcacaaagaacga-cctaatttctatccatttt-tcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 13138185  T
Q  218 aat 220  Q
    |||    
T  13138186 aat 13138188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 16455796 - 16455585
Alignment:
Q  1 ccaagaaatgttcacacaattcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 100  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||| |||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16455796 ccaagaaatgtttacacagtttggtccaatttgaccgactatgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacacagagatacaaa 16455697  T
Q  101 t--gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttc 198  Q
    |  |||||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||  |||||||||  ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  16455696 tgggttacaagaaattagcttcaacaagctcac-tagaaaaaatctaatttctcaccattttaccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttc 16455598  T
Q  199 actcacccaaggt 211  Q
    |||||||||||||    
T  16455597 actcacccaaggt 16455585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 20762829 - 20762626
Alignment:
Q  20 ttcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgttacaagaaattag 116  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||    
T  20762829 ttcggtccaaacttgacctactctgtaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacgaagagatacaaaagggttacaagaaattag 20762730  T
Q  117 cttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctaccc-attttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgttt 215  Q
    |||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20762729 ctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttttctcaatctcaccaatgaacaagatactcaatgattttcactca-ccaaggtgttt 20762631  T
Q  216 acaat 220  Q
    |||||    
T  20762630 acaat 20762626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 231
Target Start/End: Original strand, 927971 - 928202
Alignment:
Q  3 aagaaatgttcacacaattcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg 102  Q
    |||||||||| || || ||||||| ||||||||||||  ||||| |||| ||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| |    
T  927971 aagaaatgtttacccagttcggtctaacttgacctaccttggggaagaggttggtctctctaatccactattaatgagtttttacaaagagatccaaaag 928070  T
Q  103 --ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaa-ccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttca 199  Q
      ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |  |||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  928071 ggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttctatcattttttccaatatcaccaaagaacaagacactcattgattttca 928170  T
Q  200 ctcacccaaggtgtttacaattgttttccaac 231  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  928171 ctcacccaaggtgtttacaaatgtttcccaac 928202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Original strand, 40122208 - 40122412
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactat--caatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaatta 115  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||    
T  40122208 ttcggtccaacttgacctaatatgggggagagattgatctctctaatccactatatcaaagagttcttacaaagtgatacaaatgagttataagaaatta 40122307  T
Q  116 gcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgttt 215  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||| || |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40122308 gcttaaacaagctcacaaagaacaaatctaatttcgacccatttttccaatctcacaaatgaacaagacattcaatgatttttactcacccaaggtgttt 40122407  T
Q  216 acaat 220  Q
    |||||    
T  40122408 acaat 40122412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Original strand, 30476458 - 30476662
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaat--gttacaagaaattagc 117  Q
    ||||||||||||| ||||  | ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |    
T  30476458 ttcggtccaacttaacctcatatggggtagagattgatctgtccaatccagtatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaataaattatc 30476557  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa---agaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtt 214  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    |||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30476558 ttcaacaagttcataaagaacaaccctaatttctacctattttcccaatctcaccaatattgaacaaga-actcaatgattttcacccacccaaggtgtt 30476656  T
Q  215 tacaat 220  Q
    ||||||    
T  30476657 tacaat 30476662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 174
Target Start/End: Original strand, 13316352 - 13316520
Alignment:
Q  9 tgttcacacaattcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgtta 105  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||    
T  13316352 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagggtta 13316451  T
Q  106 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 174  Q
    ||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13316452 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaa 13316520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 9 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 51765565 - 51765349
Alignment:
Q  9 tgttcacacaattcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaa---tgt 103  Q
    ||||||| || |||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    ||    
T  51765565 tgttcacccagttcggtccaaacttgtcctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaaggggt 51765466  T
Q  104 tacaagaaattagcttcaacaaactcacaaa-gaacaaccctaatttctacccattt-tcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcact 201  Q
    ||||||||||||||||  ||||  ||||||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  51765465 tacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacccttttctcccaatcaaacc-aagaacaagacactcaatgatttacact 51765367  T
Q  202 cacccaaggtgtttacaat 220  Q
    || ||||||||||||||||    
T  51765366 ca-ccaaggtgtttacaat 51765349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 36683855 - 36683694
Alignment:
Q  1 ccaagaaatgttcacacaattcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 100  Q
    |||||| ||||| || || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||          
T  36683855 ccaagagatgtttactcagttcggtctaacttgacctactctgggggagagattgatttctacaatccactatcaatgagttcttacaaa-tga------ 36683763  T
Q  101 tgttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctca 170  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36683762 -gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaataaacctaatttctacctattttcccaatctca 36683694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 8871055 - 8871259
Alignment:
Q  1 ccaagaaatgttcacacaattcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 100  Q
    |||| ||||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||  |           
T  8871055 ccaataaatgtttactcaattcggtccaacttggcctactatgggggagagattgatctctccaatccactatcaa-gagtt---acaaaatg------- 8871143  T
Q  101 tgttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttca 199  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||  |||||||||     
T  8871144 -gttacaagaaattagcttcaacgaactcacaaagaacaaaccctaatttcta-ccattttccaaatctcacaaaagaacaagacact--atgattttcg 8871239  T
Q  200 ctcacccaaggtgtttacaa 219  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  8871240 ctcatccaaggtgtttacaa 8871259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 20 - 232
Target Start/End: Original strand, 44650174 - 44650389
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatg--ttacaagaaattag 116  Q
    |||||||||| |||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||| |  |||||| |||||||    
T  44650174 ttcggtccaaattgacctacttttgggaagagattgatctcttcaatccactattaatgaattatttacaaagagatataaaagatttacaataaattag 44650273  T
Q  117 cttcaacaaactcacaaagaacaaccc-taatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgttt 215  Q
    | | |||||||||||||||||||| || |||||| |||   ||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  44650274 cgttaacaaactcacaaagaacaaaccataatttttacat-ttttctcaatctctccaatgaacaagacactcaataattttcactcacccaaagtgttt 44650372  T
Q  216 acaattgttttccaact 232  Q
    |||| ||||||||||||    
T  44650373 acaaatgttttccaact 44650389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 9987369 - 9987202
Alignment:
Q  9 tgttcacacaattcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatac-aaatgtta 105  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| ||| |||     
T  9987369 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaatgagttcttgcaaaagggatacaaaaggttg 9987270  T
Q  106 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 174  Q
    ||||||||||| ||  ||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9987269 caagaaattagattagacaagttcacaatgaacaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 9987202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 174
Target Start/End: Original strand, 20622237 - 20622406
Alignment:
Q  9 tgttcacacaattcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac---aaagagatac-aaatgt 103  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||   |||| ||||| ||| ||    
T  20622237 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaaaagggatacaaaaggt 20622336  T
Q  104 tacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 174  Q
    ||||||||||||| ||  ||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20622337 tacaagaaattagatttgacaagttcacaatgaacaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 20622406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 34 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 6808595 - 6808358
Alignment:
Q  34 acctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaa--tgttacaagaaattagcttcaacaaactca 130  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||| |||     
T  6808595 acctactctgaggaagagattgatctctccaatccactataaatgagttctttacaaagagatacaaaagagttacaagaagttagcttcaacaagctct 6808496  T
Q  131 caaagaac------aaccctaatttctacccattttcccaatctc-accaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgt 223  Q
    | ||||||      || ||||||||||| |||||| || |||||| ||  | |||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||| | | |||    
T  6808495 ccaagaacaaacctaatcctaatttcta-ccatttccctaatctctactcatgaacaagacactcaataattttcactctcccaaagtgtttcccaatgt 6808397  T
Q  224 tttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacc 263  Q
    ||  ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  6808396 ttctcaactctagaatctaacc-tcgaaagagaaccaacc 6808358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 32 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 22079461 - 22079322
Alignment:
Q  32 tgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaa--tgttacaagaaattagcttcaacaaact 128  Q
    ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||| ||    
T  22079461 tgacctactttggaggagaaattgatctctccaatccaatatcaatgagttctttacaaagagatacaaaatggttacaagaaattagctttaacaagct 22079362  T
Q  129 cacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 169  Q
    |||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  22079361 cacaaagaacaaacataatttcta-ccatttttccaatctc 22079322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 40282545 - 40282377
Alignment:
Q  9 tgttcacacaattcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatac-aaatgtta 105  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||| ||||    
T  40282545 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggtta 40282446  T
Q  106 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 174  Q
    ||||||||||| ||  ||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40282445 caagaaattagattagacaagttcacaatgaactaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 40282377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 24 - 231
Target Start/End: Original strand, 37282707 - 37282916
Alignment:
Q  24 gtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttc 120  Q
    |||||| |||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||| |  |||| | |||||||||||    
T  37282707 gtccaaattgacctactccaaaggagagatttatctctccaatccactactaatgagttctttacaaagagatgcaaaagggttaccataaattagcttc 37282806  T
Q  121 aacaaactcacaaagaacaa-ccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa 219  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||  |||||  |||||| |||| |||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||    
T  37282807 aacaagctcacaaggaacaaaccctaatttataccatttttc--aatctctccaatgaacaagacactcaatggttttcactcatacaaggtgtttaaaa 37282904  T
Q  220 ttgttttccaac 231  Q
      ||||||||||    
T  37282905 aagttttccaac 37282916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Original strand, 37876759 - 37876860
Alignment:
Q  1 ccaagaaatgttcacacaattcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 100  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37876759 ccaagaaatgttcacccagttcggttcaacttgatgtactctggaggagagattgatctctgcaatccactatcaatgagttattacaaagagatacaaa 37876858  T
Q  101 tg 102  Q
    ||    
T  37876859 tg 37876860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 28242480 - 28242382
Alignment:
Q  1 ccaagaaatgttcacacaattcggtccaact-tgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaa 99  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28242480 ccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat-aatgagttcttacaaagagatacaa 28242382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 9036584 - 9036417
Alignment:
Q  9 tgttcacacaattcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatac-aaatgtta 105  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||| ||||    
T  9036584 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctcgaggagagattgtactcttcaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggtta 9036485  T
Q  106 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 174  Q
    ||||||||||||||  ||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9036484 caagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 9036417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 178 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 28242385 - 28242293
Alignment:
Q  178 acaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcc 270  Q
    |||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||    
T  28242385 acaagacactcaagaattttcactctcccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaacccctaaaagagaaccaacccatagcc 28242293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 68 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 25652195 - 25652018
Alignment:
Q  68 cactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttccca 164  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  | ||||||||||| |||| | ||    
T  25652195 cactatcaaagagttctttacaaagagatacaagagagttacaagaaattagcttcaacaaactctcaaataacacacttaatttctaccaattt-ctca 25652097  T
Q  165 atctcaccaaa-gaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatcta 242  Q
    || |   |  | |||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25652096 atattttctcatgaacaaaatactcaatgattttcacacacttaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatcta 25652018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 20 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 21054115 - 21053958
Alignment:
Q  20 ttcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatac-aaatgttacaagaaattag 116  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  21054115 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggttgcaagaaattag 21054016  T
Q  117 cttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 174  Q
     ||  ||||  |||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  21054015 atttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacac-ttttcccaatctcaccaa 21053958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 3 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 3460869 - 3460707
Alignment:
Q  3 aagaaatgttcacacaattcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaat 101  Q
    |||||||||| ||  |||| |||| || |||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||| |||||||     
T  3460869 aagaaatgtttacctaatttggtctaaattgacctactctagga-agatattgatctctccaatcgactatcaatatgttctttacaaagatatacaaaa 3460771  T
Q  102 g--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcc 162  Q
    |  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||    
T  3460770 gggttacaataaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaactctaatttctaccctttttcc 3460707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 9 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 44203800 - 44203631
Alignment:
Q  9 tgttcacacaattcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaa-atgt 103  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| | ||    
T  44203800 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggt 44203701  T
Q  104 tacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 174  Q
    ||||||||||||||||  ||||  |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  44203700 tacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 44203631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 47 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 5460035 - 5459956
Alignment:
Q  47 gagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagata-caaatgttacaagaaattagcttcaaca 124  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  5460035 gagagattgatctctccaatctactatcaatgagttctttacaaagaaatataaaatgttacaagaaattagcttcaaca 5459956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 32 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 13938281 - 13938143
Alignment:
Q  32 tgacctac-tctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgag-ttcttacaaagagatac---aaatgttacaagaaattagcttcaacaaa 126  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||  ||  ||||     
T  13938281 tgacctacatctgggggagaga--gatctctccaatccactatcaatgagtttcttacaaagagatacaaaaaaggttacaagaaattatattttacaag 13938184  T
Q  127 ctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 169  Q
     || | |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13938183 ttctccaagaacaa-cctaatttctaccca-tttcccaatctc 13938143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 32 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 41135963 - 41135724
Alignment:
Q  32 tgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaact 128  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||||||||   | || |||||| |||||||| ||||| ||||||||| |  ||||||||||||| |||||| ||  |    
T  41135963 tgacctactctgagggagaga--gatctctctgcttcagtatcaacgagttctttacaaatagatacaaaaggtttacaagaaattaacttcaaaaagtt 41135866  T
Q  129 cacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaag-aacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgttta-caattgtttt 226  Q
    |   ||||||||  ||||||||||||| |||||  | ||||  || || ||||| | |||||||||||| | ||||||||||||||||  ||| |||||     
T  41135865 cttcaagaacaaatctaatttctaccctttttct-attctcctcacaggaacaagagactcaatgatttcc-ctcacccaaggtgtttttcaaatgtttc 41135768  T
Q  227 ccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcc 270  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  41135767 tcaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaatccttagcc 41135724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 103 - 232
Target Start/End: Original strand, 44646881 - 44647010
Alignment:
Q  103 ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccc-taatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcact 201  Q
    |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| || |||||| |||   ||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||    
T  44646881 ttacaataaattagcgttaacaaactcacaaagaacaaaccataatttttacat-ttttctcaatctctccaatgaacaagacactcaataattttcact 44646979  T
Q  202 cacccaaggtgtttacaattgttttccaact 232  Q
    || |||| || ||||||| | ||||||||||    
T  44646980 catccaaagtatttacaaatattttccaact 44647010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 2262966 - 2263106
Alignment:
Q  1 ccaagaaatgttcacacaattcggtccaact-tgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagataca 98  Q
    |||||||||||| || || ||||| |||||  |||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| |    
T  2262966 ccaagaaatgtttactcagttcggaccaacaatgacctaccctaagggaaagattgatctcttcaatccactatcaataagttctttacaaaaagatata 2263065  T
Q  99 aa--tgttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaa 137  Q
    ||   |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  2263066 aaagggttacaagaaattatcttcaacaagctcaccaagaa 2263106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 71 - 206
Target Start/End: Original strand, 12318585 - 12318722
Alignment:
Q  71 tatcaatgagttcttaca-aagagatacaaat--gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatc 167  Q
    |||||||||||||||| | |||| |||||||   |||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  12318585 tatcaatgagttcttaaagaagacatacaaaatggttacaagaaattagcttcaacaagctctccatgaacaaacctaatttctaccca-tttccaaatc 12318683  T
Q  168 tc-accaaagaacaaaacactcaatgattttcactcaccc 206  Q
    || ||| | |||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  12318684 tctacccatgaacaagaaactcaatga-tttcactcaccc 12318722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 48 - 125
Target Start/End: Original strand, 9109459 - 9109539
Alignment:
Q  48 agagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaa--tgttacaagaaattagcttcaacaa 125  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||    
T  9109459 agagattgatctctccaatacactatcaacgtgttctttacaaagagatacaaaagggttacaagaaattaacttcaacaa 9109539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 154
Target Start/End: Original strand, 4535527 - 4535629
Alignment:
Q  55 gatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaa--tgttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttct 151  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||| || ||| | |||||||| | ||||||||    
T  4535527 gatctctccacttaactatcaatgagttctttacaaagagatacaaaaatgttacaagaaattgacttcaataagctctccaagaacaaacttaatttct 4535626  T
Q  152 acc 154  Q
    |||    
T  4535627 acc 4535629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 270
Target Start/End: Original strand, 34602560 - 34602603
Alignment:
Q  227 ccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcc 270  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34602560 ccaactctagaatctaacctccaaaagagaaccaacccttagcc 34602603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 2926653 - 2926516
Alignment:
Q  32 tgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagat--acaaatgttacaagaaattagcttcaacaaact 128  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || |||||||||  | ||| ||||||| |||||| ||| |||||  |    
T  2926653 tgacctactctgcagaagagattgatctctccaatccactaccaatgaattcgtttcaaagagatgcaaaaaggttacaataaattaactttaacaagtt 2926554  T
Q  129 cacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatc 167  Q
    |   ||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  2926553 cttcaagcacaaacctaatttcta-ccatttttccaatc 2926516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 32471579 - 32471478
Alignment:
Q  58 ctctccaatccactatcaatgag-ttcttacaaagagatacaaa--tgttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacc 154  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||| ||| |||||| ||||||| |  || |||||||||| |||||||| ||||    
T  32471579 ctctcgaatccactatcaatgagtttcttacaaagagatacaaaagagttgcaataaattaacttcaac-agttctcaaagaacaaacctaatttatacc 32471481  T
Q  155 cat 157  Q
    |||    
T  32471480 cat 32471478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 79
Target Start/End: Original strand, 44646816 - 44646875
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatga 79  Q
    |||||||||| |||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  44646816 ttcggtccaaattgacctacttttgggaagagattgatctcttcaatccactattaatga 44646875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 241
Target Start/End: Original strand, 1050503 - 1050678
Alignment:
Q  68 cactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaa--tgttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttccca 164  Q
    ||||||||| ||||| || ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| || ||| | |||||||  ||||||||  ||||| |||||||    
T  1050503 cactatcaacgagttatttacaaagagacacaaaaatgttacaagaaattagcttcaataagctctcgaagaacacacctaattttcaccca-tttccca 1050601  T
Q  165 atctcacca-aagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatct 241  Q
    |||||  || | |||||| | ||||||| | |||||||||  ||| |||| ||||| ||||| ||||| | |||||||    
T  1050602 atctcttcacatgaacaagagactcaat-aatttcactcattcaatgtgtgtacaaatgtttcccaacccaagaatct 1050678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 169
Target Start/End: Original strand, 16914234 - 16914338
Alignment:
Q  68 cactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatg--ttacaagaaa-ttagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttccc 163  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  ||| |||||| ||||||||||||  ||| | |||||||| | |||||| |||||| ||||||    
T  16914234 cactatcaatgagttctttacaaagagatacaaaagggttagaagaaacttagcttcaacaggctctccaagaacaaacataatttttaccca-tttccc 16914332  T
Q  164 aatctc 169  Q
    ||||||    
T  16914333 aatctc 16914338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 103 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 918487 - 918431
Alignment:
Q  103 ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccatttt 160  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  918487 ttacaagaaattatctt--acaaactcacaaagaacaaaccataatttctacccatttt 918431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 217 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 22079278 - 22079237
Alignment:
Q  217 caattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaac 258  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22079278 caattgtttctcaactctagaatctaacccccaaaagagaac 22079237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 185 - 225
Target Start/End: Original strand, 1485952 - 1485992
Alignment:
Q  185 actcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgttt 225  Q
    ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  1485952 actcaatgattttcactcacttaatgtgtttacaattgttt 1485992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 71)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 6 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 40147431 - 40147166
Alignment:
Q  6 aaatgttcacacaattcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaat--gt 103  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  40147431 aaatgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagt 40147332  T
Q  104 tacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactca 203  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| |||||     
T  40147331 tacaagaaattagcttcaacaagctcacgaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgatttccactct 40147233  T
Q  204 cccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcc 270  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40147232 cccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcc 40147166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 5058220 - 5057952
Alignment:
Q  1 ccaagaaatgttcacacaattcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 100  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5058220 ccaagaaatgttcacccagttcggtccaacttgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 5058121  T
Q  101 t--gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttc 198  Q
    |  | ||||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  5058120 tgggatacaagaaaatagcttcaacaagctcac--agaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttc 5058024  T
Q  199 actcacccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcc 270  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5058023 actcttccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcc 5057952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 28278491 - 28278222
Alignment:
Q  1 ccaagaaatgttcacacaattcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 100  Q
    ||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28278491 ccaagaattgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaa 28278392  T
Q  101 t--gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttc 198  Q
    |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  28278391 tgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccataatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttc 28278293  T
Q  199 actcacccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagc 269  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  28278292 actctcccaatgtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccctaaaagagagccaacccttagc 28278222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 213641 - 213381
Alignment:
Q  1 ccaagaaatgttcacacaattcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaa 99  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  213641 ccaagaaatgttcacccagttcggtccaaacttgacctactatggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaa 213542  T
Q  100 atg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgatttt 197  Q
    |||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  213541 atgggttacaagaaattagctttaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgatttt 213443  T
Q  198 cactcacccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaacc 259  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  213442 cactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaacc 213381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 23 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 38747158 - 38746910
Alignment:
Q  23 ggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttc 120  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  38747158 ggtccaacttgacctgatctgagggagagattgatctctccaatcctctatcaatgagtttttccaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttc 38747059  T
Q  121 aacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 220  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38747058 aacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcattaatgaacaagatactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaat 38746960  T
Q  221 tgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcc 270  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38746959 tgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcc 38746910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 20 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 13488359 - 13488147
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagc 117  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  13488359 ttcggtccaacttgacctaatctcggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagc 13488260  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 217  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13488259 ttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatcttaccaatgaacaagacactcaataattttcactcacccaaggtgtttac 13488160  T
Q  218 aattgttttccaac 231  Q
    || |||||||||||    
T  13488159 aa-tgttttccaac 13488147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Original strand, 42428442 - 42428644
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagc 117  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  42428442 ttcggtccaacttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagc 42428541  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 217  Q
    ||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42428542 ttcaacaagttcacaaagaaaaaccataatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 42428641  T
Q  218 aat 220  Q
    |||    
T  42428642 aat 42428644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 533925 - 533723
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagc 117  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  533925 ttcggtccaacttgacctaatatgggggagagattgatctttccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaaaaaattagc 533826  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 217  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  533825 ttcaacaagctcacaaagaccaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacacgcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 533726  T
Q  218 aat 220  Q
    |||    
T  533725 aat 533723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 27015698 - 27015437
Alignment:
Q  1 ccaagaaatgttcacacaattcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 100  Q
    |||| |||||||||| || ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27015698 ccaaaaaatgttcacccagttcggtccaacttgacctattttggaggagagattgatctgtacaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 27015599  T
Q  101 tgttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcac 200  Q
    ||      |  ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||    
T  27015598 tg------ggtattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacctattttcccaatctcaccaatgaccaaa-cactca-tgattttcac 27015507  T
Q  201 tcacccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcc 270  Q
    || |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27015506 tctcccaagatgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcc 27015437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 17 - 220
Target Start/End: Original strand, 28750664 - 28750869
Alignment:
Q  17 caattcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaatt 114  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||||    
T  28750664 caattcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaaagatacaaatgggttacaggaaatt 28750763  T
Q  115 agcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtt 214  Q
    | |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28750764 aacttcaacaatttcataaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtt 28750863  T
Q  215 tacaat 220  Q
    | ||||    
T  28750864 ttcaat 28750869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 32636980 - 32636778
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagc 117  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  32636980 ttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaagagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagc 32636881  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 217  Q
    ||  ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32636880 tttgacaagttcacaaagaacaaccataatttctacccattttcccaatctcaccaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 32636781  T
Q  218 aat 220  Q
    |||    
T  32636780 aat 32636778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 24 - 220
Target Start/End: Original strand, 42426251 - 42426449
Alignment:
Q  24 gtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttca 121  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  42426251 gtccaacttgacctaatcagggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttgcaagaaattagcttca 42426350  T
Q  122 acaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 220  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42426351 acaatttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaataattttcactcacccaaggtgtttacaat 42426449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 20 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 538181 - 537982
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagc 117  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  538181 ttcggtccaacttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatctactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagc 538082  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 217  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  538081 ttcaacaagctcacaaagagcaaccttaatttctacccattttcccaatctcactaatgaacaagacacgcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 537982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 24 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 33831832 - 33831624
Alignment:
Q  24 gtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttca 121  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |    
T  33831832 gtccaacttgacctaatatgggggagagattgatctcttcaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttaa 33831733  T
Q  122 acaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatt 221  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| || ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33831732 acaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-t 33831634  T
Q  222 gttttccaac 231  Q
    ||||||||||    
T  33831633 gttttccaac 33831624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Original strand, 8565958 - 8566160
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagc 117  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||    
T  8565958 ttcggtccaacttgacctaatctgggtgagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacagagggatacaaatgggttacaagaaattagc 8566057  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 217  Q
    || ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8566058 ttaaacaagctcacaaagaacaaacctaagttctacccattttctcaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 8566157  T
Q  218 aat 220  Q
    |||    
T  8566158 aat 8566160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 24 - 220
Target Start/End: Original strand, 39468565 - 39468763
Alignment:
Q  24 gtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttca 121  Q
    |||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  39468565 gtccaatttaacctaatatgggggagagattgatctctctaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttca 39468664  T
Q  122 acaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 220  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39468665 acaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcactaatgaacaagacactcaatgattttcactcactcaaggtgtttacaat 39468763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 16452255 - 16452035
Alignment:
Q  1 ccaagaaatgttcacacaattcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 100  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16452255 ccaagaaatgtttacccagttcggtccaacttgacctactctgggggagagatttatctctccaatccactatgaatgagttcttacaaagagatacaaa 16452156  T
Q  101 t--gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttc 198  Q
    |  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||    
T  16452155 tgggttacaagaaattagcttcaacaagctcagaaagaacaaacttaatttctacccatttttccaatctcatcaatgaacaagacactcaatgattgtc 16452056  T
Q  199 actcacccaaggtgtttacaat 220  Q
    ||| | ||||||||||||||||    
T  16452055 actta-ccaaggtgtttacaat 16452035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 258
Target Start/End: Original strand, 27637605 - 27637865
Alignment:
Q  1 ccaagaaatgttcacacaattcggtccaact-tgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaa 99  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27637605 ccaagaaatattcacccagttcggtccaacaatgacctactctgcaggagagattgatctctccaatccactat-aatgagttcttacaaagagatacaa 27637703  T
Q  100 at---gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattt 196  Q
    |    ||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||   ||||    
T  27637704 aatgggttacaagaaattagtttaaacaagctcataaagaacaaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcatgaattt 27637803  T
Q  197 tcactcacccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaac 258  Q
    ||||||  |||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  27637804 tcactcttccaaggtgttcacaattgtttcccaactctagcatctaacccccaaaagagaac 27637865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 7 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 31183140 - 31182927
Alignment:
Q  7 aatgttcacacaattcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaat-gtta 105  Q
    |||||| || || ||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  31183140 aatgttgacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagagatagatctctccaatccagtatcaatgagttcttacaaagggatacaaatggtta 31183041  T
Q  106 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 205  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31183040 caagaaattaacttaaacaaactcacaaagaacaatcctaatttctacccatttt-ccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 31182942  T
Q  206 caaggtgtttacaat 220  Q
     ||||||||||||||    
T  31182941 taaggtgtttacaat 31182927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 9 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 13239919 - 13239706
Alignment:
Q  9 tgttcacacaattcggtccaactt-gacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--tta 105  Q
    ||||||| || |||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  13239919 tgttcacccagttcggtccaaatttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagagtta 13239820  T
Q  106 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 205  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  13239819 caagaaattagcttcaacaagttcacaaagaaaaaccctaatttctaccattttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-c 13239721  T
Q  206 caaggtgtttacaat 220  Q
    |||||||||||||||    
T  13239720 caaggtgtttacaat 13239706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 28 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 25412908 - 25412716
Alignment:
Q  28 aacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgttacaagaaattagcttcaacaa 125  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||  ||||    
T  25412908 aacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaa 25412809  T
Q  126 actcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 220  Q
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25412808 gttcacaaagaacaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-ccaaggtgtttacaat 25412716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 3075651 - 3075872
Alignment:
Q  1 ccaagaaatgttcacacaattcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| |||||||||    
T  3075651 ccaagaaatgttcacccaatttggtccaacttgacctactatgagggagagattgatctctccaattcactatcaacgaattcttacaaaaagatacaaa 3075750  T
Q  101 tg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttc 198  Q
    ||  |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| || |||| | ||||||||||||||||    
T  3075751 tgggttacaagaaattagattcagcaagctcacaaagaacaaacctaatttctacctattttctcaatctcacaaatgaacgagacactcaatgattttc 3075850  T
Q  199 actcacccaaggtgtttacaat 220  Q
    ||||| | ||||||||||||||    
T  3075851 actcatcaaaggtgtttacaat 3075872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Original strand, 30682934 - 30683134
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgag--ttcttacaaagagatacaaa--tgttacaagaaatta 115  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||   ||||||||||||||    
T  30682934 ttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtattcttacaaagaaatacaaaagggttacaagaaatta 30683033  T
Q  116 gcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgttt 215  Q
    ||||||||||  ||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30683034 gcttcaacaagttcacaaag---aaccctaatttctaccctttttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactca-ccaaggtgttt 30683129  T
Q  216 acaat 220  Q
    |||||    
T  30683130 acaat 30683134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Original strand, 16640933 - 16641204
Alignment:
Q  1 ccaagaaatgttcacacaattcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 100  Q
    |||||||||||| || || ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  16640933 ccaagaaatgtttacccagttcggccctacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaa---gttcttacaaagagatacaaa 16641029  T
Q  101 tg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaacc-ctaatttctacccatttt--cccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgatt 195  Q
     |  |||  |||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||  ||||  | ||||||| |||| |||||| ||||| ||||| |    
T  16641030 agagttatcagaaatcagcttcaacaagctcacaaagaacaaacactaatttctaccatttttttctcaatctcgccaatgaacaagacacttaatgaat 16641129  T
Q  196 ttcactcacccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcc 270  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||    
T  16641130 ttcactcactcaaggtgtttacaaatgttccccaactctagaatctaatccccaaaagagaaccaacctttagcc 16641204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 13343228 - 13343015
Alignment:
Q  9 tgttcacacaattcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--tta 105  Q
    ||||||| || |||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||    
T  13343228 tgttcacccagttcggtccaaacatgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctt-caaagagatacaaaaggatta 13343130  T
Q  106 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctaccc-attttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcac 204  Q
    ||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||     
T  13343129 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 13343031  T
Q  205 ccaaggtgtttacaat 220  Q
    ||||||||||||||||    
T  13343030 ccaaggtgtttacaat 13343015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 30182745 - 30182543
Alignment:
Q  20 ttcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattag 116  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |  ||||||||||||||    
T  30182745 ttcggtccaaacttgacatactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttccaaagagatagaaaagggttacaagaaattag 30182646  T
Q  117 cttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgttta 216  Q
    |||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  30182645 ctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccatttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-ccaaggtgtttg 30182547  T
Q  217 caat 220  Q
    ||||    
T  30182546 caat 30182543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 17 - 231
Target Start/End: Original strand, 42309944 - 42310159
Alignment:
Q  17 caattcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaatt 114  Q
    |||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  42309944 caattcggtcaaacttaatctactatgggggagagattgatctcgctaatccactatcaataagttcttacaaagagatacaaaagagttacaagaaatt 42310043  T
Q  115 agcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtt 214  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| | | ||||||||||| |||| |||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||  ||||    
T  42310044 agcttcaacaagctcacaaagatcaaacttgatttctacccaatttctcaatctcaccaatgagcaagacactcaatgattttcacttacccaaaatgtt 42310143  T
Q  215 tacaattgttttccaac 231  Q
    ||||| |||||||||||    
T  42310144 tacaa-tgttttccaac 42310159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 20 - 230
Target Start/End: Original strand, 9049354 - 9049565
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgttacaagaaattagc 117  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  9049354 ttcggtccaacttcacctactttgggggagatattgatctctccaatccactgtcaatgagttcttacaaagagatacaaaatggttacaagaaattagc 9049453  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 217  Q
    |||||||| |||||||| |  ||| ||||||||||  ||||||||||| ||||| ||  ||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  9049454 ttcaacaagctcacaaaaacaaacactaatttcta-tcattttcccaaactcactaatcaacaagacactcagtgatttttactcacccaaagtgtttac 9049552  T
Q  218 aattgttttccaa 230  Q
    || ||||| ||||    
T  9049553 aaatgtttcccaa 9049565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 13695683 - 13695914
Alignment:
Q  1 ccaagaaatgttcacacaattcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaa 99  Q
    |||||||||||| ||  | || ||||||| |||||||||| ||| ||||||| | ||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  13695683 ccaagaaatgtttacctagtttggtccaagttgacctactatggaggagagaataatctctctaatccactattaatgagttctttacaaagagatacaa 13695782  T
Q  100 atg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaa-ccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattt 196  Q
    | |  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||||    
T  13695783 aagggttacaagaaattagctttaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttgtaccc-ttttcccaatctctccaaagaaaaagatactcaatgattt 13695881  T
Q  197 tcactcacccaaggtgtttacaattgttttcca 229  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  13695882 tcactcacacaaggtgtttacaaatgttttcca 13695914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Original strand, 36074054 - 36074258
Alignment:
Q  20 ttcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgttacaagaaattag 116  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  36074054 ttcggtccaaacttgacctactttggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctt-caaagagatacaaaagagttacaagaaattag 36074152  T
Q  117 cttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctaccc---attttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgt 213  Q
    |||  ||||  || |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36074153 ctttgacaagttcgcaaagaacaaccctaatttctacccttttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-ccaaggtgt 36074251  T
Q  214 ttacaat 220  Q
    |||||||    
T  36074252 ttacaat 36074258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 37439309 - 37439088
Alignment:
Q  9 tgttcacacaattcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgtta 105  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  37439309 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagagtta 37439210  T
Q  106 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccatt--------ttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgatttt 197  Q
    |||||||||| |||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||        |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  37439209 caagaaattaactttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccttttatttttccttcccaatctcaccaatgaataagacactcaatgatttt 37439110  T
Q  198 cactcacccaaggtgtttacaat 220  Q
    |||||| |||| |||||||||||    
T  37439109 cactca-ccaaagtgtttacaat 37439088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 19806519 - 19806338
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgttacaagaaattagctt 119  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||                 ||| |||||||||||||    
T  19806519 ttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaggagttctt-----------------ttagaagaaattagctt 19806437  T
Q  120 caacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa 219  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19806436 caacaaactcacaaagaacaacc-taatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatga-tttcactcacccaaggtgtttacaa 19806339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 16409643 - 16409440
Alignment:
Q  9 tgttcacacaattcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaa--tgtt 104  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||    
T  16409643 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaagagtt 16409544  T
Q  105 acaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcac 204  Q
    |||||||||||| ||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||       ||| |||||||||||||||||||||     
T  16409543 acaagaaattagatttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccc-tttttccaatctcac-------caagacactcaatgattttcactca- 16409453  T
Q  205 ccaaggtgtttac 217  Q
    |||||||||||||    
T  16409452 ccaaggtgtttac 16409440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 9 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 26178050 - 26177848
Alignment:
Q  9 tgttcacacaattcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaa--tgtt 104  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||    
T  26178050 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaagagtt 26177951  T
Q  105 acaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcac 204  Q
    |||||||||||| ||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||       ||| |||||||||||||||||||||     
T  26177950 acaagaaattagatttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccc--ttttccaatctcac-------caagacactcaatgattttcactca- 26177861  T
Q  205 ccaaggtgtttac 217  Q
    |||||||||||||    
T  26177860 ccaaggtgtttac 26177848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 20 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 316920 - 316667
Alignment:
Q  20 ttcggtccaact-tgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaatta 115  Q
    |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  316920 ttcggtccaacaatgacctactctaggggagagattgatccctccgatccattatcaatgagttctttacaaagagatacaaaaggattacaagaaatta 316821  T
Q  116 gcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatc---tcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtg 212  Q
    |||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| || ||||| |||||   || || |  ||||| | || |||||| |||||||||||| || |     
T  316820 gcttcaacaagctctccaagaacaaacctaatttcta-cctttttctcaatcttttccccta--aacaagagacccaatga-tttcactcacccgagttt 316725  T
Q  213 tttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcc 270  Q
    ||  |||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  316724 ttcccaattgttttccaactttaaaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcc 316667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 215
Target Start/End: Original strand, 9789224 - 9789425
Alignment:
Q  9 tgttcacacaattcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaa--tgtt 104  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||    
T  9789224 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaagagtt 9789323  T
Q  105 acaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcac 204  Q
    |||||||||||| ||  ||||  |||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||       ||| |||||||||||||||||||||     
T  9789324 acaagaaattagatttgacaagttcacaaggaacaaccttaatttctaccc-tttttccaatctcac-------caagacactcaatgattttcactca- 9789414  T
Q  205 ccaaggtgttt 215  Q
    |||||||||||    
T  9789415 ccaaggtgttt 9789425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 215
Target Start/End: Original strand, 18441648 - 18441849
Alignment:
Q  9 tgttcacacaattcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaa--tgtt 104  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||    
T  18441648 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaagagtt 18441747  T
Q  105 acaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcac 204  Q
    |||||||||||| ||  ||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||       ||| |||||||||||||||||||||     
T  18441748 acaagaaattagatttgacaagttcacaaggaacaaccctaatttctaccc-tttttccaatctcac-------caagacactcaatgattttcactca- 18441838  T
Q  205 ccaaggtgttt 215  Q
    |||||||||||    
T  18441839 ccaaggtgttt 18441849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 79 - 220
Target Start/End: Original strand, 5887487 - 5887630
Alignment:
Q  79 agttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaag 176  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||| || |    
T  5887487 agttcttacaaagtgatacaaatgggttgcaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaatctaatttctatccattttctcaatctcacaaatg 5887586  T
Q  177 aacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 220  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5887587 aacaagacattcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 5887630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 26170930 - 26170739
Alignment:
Q  9 tgttcacacaattcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgttaca 107  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||       ||||||    
T  26170930 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaa-aga-------gttaca 26170839  T
Q  108 agaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcaccca 207  Q
    ||||||||| ||  ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||||       ||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  26170838 agaaattagatttgacaagttcacaaagaacaatcctaatttctaccc--ttttccaatctcac-------caagacactcaatgattttcactca-cca 26170749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 174
Target Start/End: Original strand, 29751160 - 29751328
Alignment:
Q  9 tgttcacacaattcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatac-aaatgtta 105  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||| ||||    
T  29751160 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggtta 29751259  T
Q  106 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 174  Q
    ||||||||||| ||  ||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29751260 caagaaattagatttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 29751328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 174
Target Start/End: Original strand, 22536290 - 22536457
Alignment:
Q  9 tgttcacacaattcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatac-aaatgtta 105  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||| ||||    
T  22536290 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactccccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggtta 22536389  T
Q  106 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 174  Q
    ||||||||||||||  ||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22536390 caagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 22536457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 29720532 - 29720364
Alignment:
Q  9 tgttcacacaattcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatac-aaatgtta 105  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||| ||||    
T  29720532 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggtta 29720433  T
Q  106 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 174  Q
    ||||||||||| ||  ||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29720432 caagaaattagattagacaagttcacaatgaactaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 29720364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 29722692 - 29722524
Alignment:
Q  9 tgttcacacaattcggtccaactt-gacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatac-aaatgtta 105  Q
    ||||||| || |||||||||| || |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||| ||||    
T  29722692 tgttcacccagttcggtccaaatttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggtta 29722593  T
Q  106 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 174  Q
    ||||||||||| ||  ||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29722592 caagaaattagattagacaagttcacaatgaactaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 29722524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 42 - 159
Target Start/End: Original strand, 10054850 - 10054969
Alignment:
Q  42 tgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaatg-ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaaca 139  Q
    ||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||   |||||||    
T  10054850 tgggggagatattgatatctccaatacactatcaatgagttcattacaaagagatacaaaaggttataagaaattagcttcaacaaactcttcaagaaca 10054949  T
Q  140 accctaatttctacccattt 159  Q
    | | ||||||||||||||||    
T  10054950 aacataatttctacccattt 10054969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 9 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 10593426 - 10593258
Alignment:
Q  9 tgttcacacaattcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatac-aaatgtt 104  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||| |||    
T  10593426 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggtt 10593327  T
Q  105 acaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 174  Q
    |||||||||||||||  ||||  |||| | |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  10593326 acaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttctcccaatctcaccaa 10593258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 42927066 - 42926965
Alignment:
Q  1 ccaagaaatgttcacacaattcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 100  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| || | |||||||| || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42927066 ccaagaaatgtttacccagttcggtccaacttgacctactatgagagagagatttatttcttcaatccactgtcaatgagttcttacaaagagatacaaa 42926967  T
Q  101 tg 102  Q
    ||    
T  42926966 tg 42926965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 159
Target Start/End: Original strand, 33906042 - 33906184
Alignment:
Q  21 tcggtccaac-ttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattag 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||    
T  33906042 tcggtccaacattgacctactctagggaagagattgatctttccaatctactatcaatgagttctttacaaagagatacaaaaggattacaagaagttag 33906141  T
Q  117 cttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattt 159  Q
    |||| |||| ||| | ||| || | |||||||| |||||||||    
T  33906142 cttcgacaagctctccaagcactaacctaatttatacccattt 33906184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 159 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 42926908 - 42926847
Alignment:
Q  159 ttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42926908 ttcccaatctcaccaaagaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 42926847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 32 - 253
Target Start/End: Original strand, 10700674 - 10700896
Alignment:
Q  32 tgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaa--tgttacaagaaattagcttcaacaaact 128  Q
    ||||||||| |||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||   |||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||| ||    
T  10700674 tgacctactatgggggagaga--gatctctccacttcactatcaatgagttctttttaaagagatacaaaaatgttataagaa-ttagcttcaacaagct 10700770  T
Q  129 cacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatct-caccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac-aattgtttt 226  Q
    | | |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||      | |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||     
T  10700771 ctctaagaacaaacctaatttcta-ccttttttccaatctattttcatgaacaaaatactcaatgattttcacgcacccaaggtgtttcctaattgtttc 10700869  T
Q  227 ccaactctagaatctaaccaccaaaag 253  Q
    |||  | ||||||||| || |||||||    
T  10700870 ccatttttagaatctagcccccaaaag 10700896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 68 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 35616278 - 35616082
Alignment:
Q  68 cactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttccca 164  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |  ||||||||||||| ||| ||| | ||| | |||||||| |||||||||||| ||||| | ||    
T  35616278 cactatcaatgagttctttacaaagaaatacaaaagggttacaagaaattaacttaaacgagctctccaagaacaaacctaatttctactcattt-ctca 35616180  T
Q  165 atctca-ccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac-aattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaac 262  Q
    |||||  ||   |||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  35616179 atctcttcccgtgaacaagagactcaatgattt-cactcacccaaggtgtttcctaattgtttccaaactctagaatctaacca-caaaagagaatcaac 35616082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 9 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 25078289 - 25078120
Alignment:
Q  9 tgttcacacaattcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaa-atgt 103  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| | ||    
T  25078289 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggt 25078190  T
Q  104 tacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 174  Q
    ||||||||||||||||  ||||  |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  25078189 tacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 25078120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 9 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 25136258 - 25136089
Alignment:
Q  9 tgttcacacaattcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaa-atgt 103  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| | ||    
T  25136258 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggt 25136159  T
Q  104 tacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 174  Q
    ||||||||||||||||  ||||  |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  25136158 tacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 25136089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 32 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 3326058 - 3325863
Alignment:
Q  32 tgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagataca-aatg-ttacaagaaattagcttcaacaaact 128  Q
    ||||||||| || | |||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  3326058 tgacctactatgtgagagatattgatctctctaatccaccatcattgagttctttacaaagagatacacaatggttacaagaaattagcttcaacaagct 3325959  T
Q  129 cacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc-accaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgttt 225  Q
    |   ||||||||  |||||||||| || ||||  |||| ||  || |||||||| | || |||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3325958 cttcaagaacaaaactaatttcta-cctttttttcaatttcttcctaagaacaagatacccaatg-gtttcactcacccaaggtgtttacaaatgttt 3325863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 115 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 4160690 - 4160537
Alignment:
Q  115 agcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaa-gaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgt 213  Q
    |||||||||||  || | |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||  |  | || ||||||| ||| |||||| |||||| |||| ||||    
T  4160690 agcttcaacaagttctccaagaacaaacctaatttctacc-attttccaaatctcctctcatgagcaaaacattcattgattt-cactcaaccaatgtgt 4160593  T
Q  214 ttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcc 270  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4160592 ttacaattgtttctcaactct-gaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcc 4160537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 58 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 22097981 - 22097877
Alignment:
Q  58 ctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctaccca 156  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||  |||| ||||||||| |||||||||| || | |||||||||||||||||||||||     
T  22097981 ctctctaatccactatcaatgagttttttacaaatagatacaagggttataagaaattaacttcaacaaattctccaagaacaaccctaatttctaccct 22097882  T
Q  157 ttttc 161  Q
    |||||    
T  22097881 ttttc 22097877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 40380259 - 40380090
Alignment:
Q  9 tgttcacacaattcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaa-atgt 103  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| | ||    
T  40380259 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgaactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggt 40380160  T
Q  104 tacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 174  Q
    ||||||||||||| ||  ||||  |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  40380159 tacaagaaattag-tttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 40380090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 40382470 - 40382301
Alignment:
Q  9 tgttcacacaattcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaa-atgt 103  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| | ||    
T  40382470 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgaactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggt 40382371  T
Q  104 tacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 174  Q
    ||||||||||||||||  ||||  |||| | |||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  40382370 tacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaacttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 40382301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 42926968 - 42926911
Alignment:
Q  75 aatgagttcttacaaagagatacaaat--gttacaagaaattagcttcaacaaactca 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42926968 aatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaatctca 42926911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 16546788 - 16546684
Alignment:
Q  20 ttcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaa-atgttacaagaaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| | |||||||||||||    
T  16546788 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaatt 16546689  T
Q  115 agctt 119  Q
    |||||    
T  16546688 agctt 16546684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 4160743 - 4160702
Alignment:
Q  32 tgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactat 73  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4160743 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat 4160702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 71 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 30802934 - 30802843
Alignment:
Q  71 tatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccatttt 160  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||||||| |  |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  30802934 tatcaacgagttctttacaaatagatacaaaaggattacaataaattagtttcaacaagctcacaaagaacaaacctaa-ttctacccatttt 30802843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 45 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 8445847 - 8445756
Alignment:
Q  45 gggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaa 133  Q
    |||||||||| |||| || |||| ||||||||| ||||||| | ||||| ||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8445847 gggagagattcatctttctaatctactatcaattagttctttataaagaaatacaaaagggttacaagaaattagcttcaacaaacttacaa 8445756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 20 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 16544566 - 16544407
Alignment:
Q  20 ttcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaa-atgttacaagaaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| | ||||  |||||||    
T  16544566 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttatgagaaatt 16544467  T
Q  115 agcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 174  Q
    ||||| |  |   |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  16544466 agcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 16544407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 60
Target Start/End: Original strand, 5887443 - 5887486
Alignment:
Q  17 caattcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctc 60  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  5887443 caattcggtccaacttgacctaatctgggggagagatagatctc 5887486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 20 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 30793292 - 30793212
Alignment:
Q  20 ttcggtccaact-tgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaa 100  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |||||||||  |||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  30793292 ttcggtccaacaatgacttactctaggggagaga--gatctctccacttcactatcaattagttctttacaaagagatacaaa 30793212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 71 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 32609641 - 32609572
Alignment:
Q  71 tatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaa 137  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  32609641 tatcaataagttctttacaaagaaatacaaaagagttacaagaaattaacttcaacaaactctcaaagaa 32609572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 217 - 270
Target Start/End: Original strand, 14689622 - 14689674
Alignment:
Q  217 caattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcc 270  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||    
T  14689622 caattgtttcacaactctagaatctatcc-ccaaaagagaaccaacccctagcc 14689674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 102 - 160
Target Start/End: Original strand, 6741941 - 6741998
Alignment:
Q  102 gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccatttt 160  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||    
T  6741941 gttacaagaaattagctt--gcaaactcacaaagaacaaaacctaatttctactcatttt 6741998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 268
Target Start/End: Original strand, 21205842 - 21205914
Alignment:
Q  197 tcactcacccaaggtgtttac-aattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttag 268  Q
    |||||||| |||||||||| | |||| | ||||||||| | |||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  21205842 tcactcactcaaggtgtttcccaattatattccaactccataatctaaccctcaaaagagaaccaatccttag 21205914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 189 - 241
Target Start/End: Original strand, 32576481 - 32576533
Alignment:
Q  189 aatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatct 241  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  32576481 aatgattttcactcatcttaggtgtttacaattgtttcccaacccaagaatct 32576533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 35779421 - 35779350
Alignment:
Q  56 atctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatac--aaatgttacaagaaattagcttcaacaa 125  Q
    ||||||||||| || | ||||| | || ||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||    
T  35779421 atctctccaattcattgtcaataaatttttacaaagagaaaccaaaatgttacaagaaattatcttcaacaa 35779350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 201; Significance: 1e-110; HSPs: 67)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 4283699 - 4283429
Alignment:
Q  1 ccaagaaatgttcacacaattcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 100  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4283699 ccaagaaatgttcacccagttcggtccaacttgacctactctagaggggagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 4283600  T
Q  101 t--gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttc 198  Q
    |  |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  4283599 tgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaaaaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttc 4283501  T
Q  199 actcacccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcc 270  Q
    |||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4283500 actctcctaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcc 4283429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Original strand, 42434984 - 42435254
Alignment:
Q  1 ccaagaaatgttcacacaattcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 100  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42434984 ccaagaaatgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatttctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 42435083  T
Q  101 t--gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttc 198  Q
    |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  42435084 tgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttc 42435182  T
Q  199 actcacccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcc 270  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  42435183 actctcccaaagtgtttacaattgtttaccaactctagaatctaaccctcaaaagagaaccaacccttagcc 42435254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 20 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 40221901 - 40221650
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaat--gttacaagaaattagc 117  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||     
T  40221901 ttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaacgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagt 40221802  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 217  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40221801 ttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttaccaatctcaccaaagaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttac 40221703  T
Q  218 aattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcc 270  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  40221702 aattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacctttagcc 40221650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 18655575 - 18655306
Alignment:
Q  1 ccaagaaatgttcacacaattcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 100  Q
    |||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18655575 ccaaaaaatgttcacccagttcggtccaacttgacctactttggaggagagattgatctctctaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 18655476  T
Q  101 t--gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttc 198  Q
    |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  18655475 tgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccttaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaaaacactc-atgattttc 18655377  T
Q  199 actcacccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcc 270  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||    
T  18655376 actctcccaaggtgtttacaattgtttcctaagtctagaatctaacc-ccaaaagagtatcaacccttagcc 18655306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 11384160 - 11383891
Alignment:
Q  1 ccaagaaatgttcacacaattcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 100  Q
    |||| |||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11384160 ccaaaaaatgttcacccagttcggtccaacttaacctactctggaggagagatcgatgtctccaatccagtatcaatgggttcttacaaagagatacaaa 11384061  T
Q  101 t--gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttc 198  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||| |||||||||    
T  11384060 tgagttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccatttttccaatctca-taatgaacaagacactc-atgattttc 11383963  T
Q  199 actcacccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcc 270  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11383962 actctcccaaggtgtttacaattatttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcc 11383891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 20 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 27811434 - 27811222
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagc 117  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  27811434 ttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctcttcaatccactatcaatgggttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagc 27811335  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 217  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27811334 ttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 27811235  T
Q  218 aattgttttccaac 231  Q
    || |||||||||||    
T  27811234 aa-tgttttccaac 27811222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 43 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 44353926 - 44353697
Alignment:
Q  43 gggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgt--tacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaa 140  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  44353926 gggggagagattgatcttttcaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgtgttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaa 44353827  T
Q  141 ccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatc 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44353826 ccctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagatactcaatgatttttactcacccaatgtgtttacaattgtttcccaactctagaatc 44353727  T
Q  241 taaccaccaaaagagaaccaacccttagcc 270  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44353726 taacccccaaaagagaaccaacccttagcc 44353697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 15212942 - 15212740
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagc 117  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  15212942 ttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccattatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagc 15212843  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 217  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15212842 ttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacattcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 15212743  T
Q  218 aat 220  Q
    |||    
T  15212742 aat 15212740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 17 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 4731817 - 4731612
Alignment:
Q  17 caattcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaatt 114  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  4731817 caattcggtccaacttgaccgaatctgggggagagatcgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaatt 4731718  T
Q  115 agcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtt 214  Q
    || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4731717 aggttcaacaagctcacaaagagcaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtt 4731618  T
Q  215 tacaat 220  Q
    ||||||    
T  4731617 tacaat 4731612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 33352306 - 33352104
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagc 117  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||     
T  33352306 ttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagg 33352207  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 217  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33352206 ttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttttacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcaatcacccaaggtgtttac 33352107  T
Q  218 aat 220  Q
    |||    
T  33352106 aat 33352104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 43036579 - 43036377
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagc 117  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||     
T  43036579 ttcggtccaacttgacctaatctggaggagagattgatctctcaaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattacaagaaattagt 43036480  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 217  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43036479 ttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 43036380  T
Q  218 aat 220  Q
    |||    
T  43036379 aat 43036377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 40328951 - 40328692
Alignment:
Q  1 ccaagaaatgttcacacaattcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 100  Q
    ||||||||||||||| || ||| ||||||    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40328951 ccaagaaatgttcactcagttccgtccaa----acctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 40328856  T
Q  101 ---tgttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgatttt 197  Q
        ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| || ||||||||    
T  40328855 atgagttacaagaaattagtttaaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacattc-atgatttt 40328757  T
Q  198 cactcacccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaac 262  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40328756 cactctcccaagatgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaac 40328692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Original strand, 1345383 - 1345585
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagc 117  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  1345383 ttcggtctaacttgacctactctgggggagagattgaactcttcaatccactatcaatgagttctttcaaagagatacatatgggttacaagaaattagc 1345482  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 217  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1345483 ttcaataaactcacaaagaacaaccctaatttctacacattttcccaatctcacaaatgaacaagacattcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 1345582  T
Q  218 aat 220  Q
    |||    
T  1345583 aat 1345585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 23 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 18141973 - 18141764
Alignment:
Q  23 ggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttc 120  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  18141973 ggtccaacttgacctaatctaggggagagattgatctctccaatccactatcaaagagttcttacaaagtgatacaaatgggttacaagaaattagcttc 18141874  T
Q  121 aacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 220  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  18141873 aacaagctcacaaagaacaacc-taatttctacccattttcacaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcgcccaaggtgtttacaaa 18141775  T
Q  221 tgttttccaac 231  Q
    ||||| |||||    
T  18141774 tgtttcccaac 18141764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 1292457 - 1292671
Alignment:
Q  1 ccaagaaatgttcacacaattcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 100  Q
    ||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1292457 ccaagaaatgtttgcccagttcggtccaacttgacctactctgggg-agagatttatttctcaaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 1292555  T
Q  101 tg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttc 198  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  1292556 tgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacttaatttctacccattttctcaatctcaccaaagaacaagacactcaataattttc 1292655  T
Q  199 actcacccaaggtgtt 214  Q
    ||||||||||||||||    
T  1292656 actcacccaaggtgtt 1292671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 40321236 - 40321022
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagc 117  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||||| |    
T  40321236 ttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaagagtttttacaaagagatactaatgggttacaagaaattaac 40321137  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 217  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  40321136 ttcaacaagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcacctatgaacaagacactcaatgattttcagtcactcaaggtgtttac 40321037  T
Q  218 aattgttttccaactc 233  Q
    || ||||| |||||||    
T  40321036 aa-tgtttcccaactc 40321022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Original strand, 3303682 - 3303884
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagc 117  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||     
T  3303682 ttcggtccaacttgacctactgtgggggagagattgatctcttcaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagg 3303781  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 217  Q
    || ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3303782 ttaaacaagctcacaaagaacaaacttaatttctacccattttcccaatctcaccaataaacaagatactcaatgattttcactcactcaaggtgtttac 3303881  T
Q  218 aat 220  Q
    |||    
T  3303882 aat 3303884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 27 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 30143489 - 30143296
Alignment:
Q  27 caacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaat--gttacaagaaattagcttcaaca 124  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  30143489 caacttgaccttatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaaca 30143390  T
Q  125 aactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 220  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30143389 agctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctggccaatgaacaagaca--caatgattttcactcacccaatgtgtttacaat 30143296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 5689427 - 5689225
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagc 117  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  5689427 ttcggtccaacttgaccaaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagc 5689328  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 217  Q
    ||  |||| ||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5689327 tttgacaagctcacaaagcaccaccttaatttctacccatttttccaatctcattaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 5689228  T
Q  218 aat 220  Q
    |||    
T  5689227 aat 5689225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 20 - 232
Target Start/End: Original strand, 10930211 - 10930424
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaat--gttacaagaaattagc 117  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  10930211 ttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgtgttcttacaaagagatataaatgggttacaagaaattagc 10930310  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 217  Q
    |||||| | |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| |||||| ||||||||||||| |||||  |||||||    
T  10930311 ttcaacgagctcacaaagagcaaccctaatttctatccattttcccaatctcaccgatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaaatgtttac 10930409  T
Q  218 aattgttttccaact 232  Q
    |||||||| ||||||    
T  10930410 aattgtttcccaact 10930424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 9 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 42498362 - 42498149
Alignment:
Q  9 tgttcacacaattcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgtta 105  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||    
T  42498362 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagaaatacaaaagggtta 42498263  T
Q  106 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacc-cattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcac 204  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||     
T  42498262 caagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacctttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 42498164  T
Q  205 ccaaggtgtttacaa 219  Q
    |||||||||||||||    
T  42498163 ccaaggtgtttacaa 42498149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 4 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 4162668 - 4162444
Alignment:
Q  4 agaaatgttcacacaattcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaat-- 101  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  4162668 agaaatgtttacccaattcggtccaacttgacctactcttggggagagattgatatctccaatcc-ctatcaatgagttcttacaaagagatacaaatga 4162570  T
Q  102 gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcact 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| ||||| |||||||||||||||   |||||| || |||||| |||||||||||||||||||    
T  4162569 gttacaagaaattagcttcaacaagttctcaaagaacaaacctaacttctacccattttcc---tctcactaatgaacaagacactcaatgattttcact 4162473  T
Q  202 cacccaaggtgtttacaattgttttccaac 231  Q
    | | |||||||||||||| |||||||||||    
T  4162472 cgctcaaggtgtttacaa-tgttttccaac 4162444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 20 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 30291764 - 30291549
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgg-gggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattag 116  Q
    |||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  30291764 ttcggtccaacttggcataatctggagggagagattgatctctccaatccactatcaaagaattcttacaaagtgatacaaatgagttacaagaaattag 30291665  T
Q  117 cttcaacaaactcacaaagaacaac-cctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgttt 215  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30291664 cttcaacaagctcacaaagaacaaaacctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcaatcacccaaggtgttt 30291565  T
Q  216 acaattgttttccaac 231  Q
    |||| ||||| |||||    
T  30291564 acaaatgtttcccaac 30291549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 20 - 217
Target Start/End: Original strand, 19491711 - 19491909
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagc 117  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||     
T  19491711 ttcggtccaatatgacctactatgggggagatattgatctctttaatccactatcaacgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagt 19491810  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 217  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  19491811 ttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaat-attttcactcacccaagatgtttac 19491909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 6599128 - 6598926
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagc 117  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||  |||||||||||||||    
T  6599128 ttcggtccaacttgacctaatatgggggagagattgatctctctaatccactatcaatgagttcttacaaaagtatacaaatgggttacaagaaattagc 6599029  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 217  Q
    || ||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6599028 ttaaacaagctcgcaaagaacaaacttaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacacttaatgattttcactcactcaaggtgtttac 6598929  T
Q  218 aat 220  Q
    |||    
T  6598928 aat 6598926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 6674581 - 6674379
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagc 117  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||  |||||||||||||||    
T  6674581 ttcggtccaacttgacctaatatgggggagagattgatctctctaatccactatcaatgagttcttacaaaagtatacaaatgggttacaagaaattagc 6674482  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 217  Q
    || ||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6674481 ttaaacaagctcgcaaagaacaaacttaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacacttaatgattttcactcactcaaggtgtttac 6674382  T
Q  218 aat 220  Q
    |||    
T  6674381 aat 6674379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 6 - 225
Target Start/End: Original strand, 8965689 - 8965910
Alignment:
Q  6 aaatgttcacacaattcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgt 103  Q
    ||||||| || || ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||    
T  8965689 aaatgtttacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagagatttatctctccgatgcactatcaatgagttcttacaaagagatataaaagggt 8965788  T
Q  104 tacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactc 202  Q
    || ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  8965789 tataagaaattaacttcaacaaactcataaagaacaaaccctaatttcta-cctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc 8965887  T
Q  203 acccaaggtgtttacaattgttt 225  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  8965888 acccaaggtgtttacaaatgttt 8965910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 9 - 220
Target Start/End: Original strand, 34254331 - 34254543
Alignment:
Q  9 tgttcacacaattcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgtta 105  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||    
T  34254331 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatcaataagttcttacaaagagatacaaaagggtta 34254430  T
Q  106 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 205  Q
    |||||||||| |||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  34254431 caagaaattaactttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-c 34254528  T
Q  206 caaggtgtttacaat 220  Q
    |||||||||||||||    
T  34254529 caaggtgtttacaat 34254543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Original strand, 12702646 - 12702852
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgttacaagaaattagc 117  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||    
T  12702646 ttcggtccaacttgacctaatctaggggagagattgatctctccaatccaatatcaatgagttcttacaaagagacacaaaagggttacaagaaattagc 12702745  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctaccc-----attttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtg 212  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  12702746 ttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttttttttcccaatctcaccaatgaacaagacacttaatgattttcactca-ccaaggtg 12702844  T
Q  213 tttacaat 220  Q
    ||||||||    
T  12702845 tttacaat 12702852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 9 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 17982821 - 17982607
Alignment:
Q  9 tgttcacacaattcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgtta 105  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||    
T  17982821 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagggtta 17982722  T
Q  106 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctaccc-attttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcac 204  Q
    |||||||||| |||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||     
T  17982721 caagaaattaactttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 17982623  T
Q  205 ccaaggtgtttacaat 220  Q
    ||||||||||||||||    
T  17982622 ccaaggtgtttacaat 17982607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 9 - 220
Target Start/End: Original strand, 34256507 - 34256719
Alignment:
Q  9 tgttcacacaattcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgtta 105  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  34256507 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtta 34256606  T
Q  106 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 205  Q
    |||||||||| |||  ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || |    
T  34256607 caagaaattaactttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-ccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcacaca-c 34256704  T
Q  206 caaggtgtttacaat 220  Q
    |||||||||||||||    
T  34256705 caaggtgtttacaat 34256719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 31218425 - 31218211
Alignment:
Q  9 tgttcacacaattcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgtta 105  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||    
T  31218425 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagggtta 31218326  T
Q  106 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacc-cattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcac 204  Q
    ||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||     
T  31218325 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccattttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 31218227  T
Q  205 ccaaggtgtttacaat 220  Q
    ||||||||||||||||    
T  31218226 ccaaggtgtttacaat 31218211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Original strand, 4743226 - 4743417
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgttacaagaaattagctt 119  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |        |||||||||  |||||||    
T  4743226 ttcggtccaacttgacctactttgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatgg--------gttacaagattttagctt 4743317  T
Q  120 caacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa 219  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4743318 caacaaacacacaaagaacaaacctaatt-ctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcgctcacccaaggtgtttacaa 4743416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 9765900 - 9765703
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagc 117  Q
    ||||||||||  ||||||| |||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  9765900 ttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagc-agctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagc 9765802  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 217  Q
    ||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    |||||||||||||||||||||||    
T  9765801 tttgccaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaa----tttcactcacccaaggtgtttac 9765706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 28 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 44304003 - 44303808
Alignment:
Q  28 aacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaa 125  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||  ||||    
T  44304003 aacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttaaaaagagatacaaaaggattacaagaaattagctttgacaa 44303904  T
Q  126 actcacaaagaacaaccctaatttctaccc--attttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 220  Q
      ||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44303903 gttcacaaagaacaaccttaatttctaccctttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-ccaaggtgtttacaat 44303808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Original strand, 41366627 - 41366828
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaat--gttacaagaaattagc 117  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||||||||||    
T  41366627 ttcggtccaacttgacctaatctaggg-agagattgatctctccaatccactataaatgagttcttacaaagggatacaaataggttaaaagaaattagc 41366725  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 217  Q
    || ||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||     |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41366726 ttaaacaagcttacaaagaacaaacataatttctacccattttctcaatctcagtcttgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 41366825  T
Q  218 aat 220  Q
    |||    
T  41366826 aat 41366828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 28 - 220
Target Start/End: Original strand, 19945379 - 19945574
Alignment:
Q  28 aacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa---tgttacaagaaattagcttcaaca 124  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||  |||    
T  19945379 aacttgacctactctcgaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagtggttacaagaaattagctttgaca 19945478  T
Q  125 aactcacaaagaacaaccctaatttctaccc-attttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 220  Q
    |  ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19945479 agttcacaaagaacaaccataatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-ccaaggtgtttacaat 19945574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Original strand, 18106093 - 18106292
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagc 117  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||    
T  18106093 ttcggtccaacttgacctattctgggg-agagattgatctctccaaac-actatcaatgagttcttacaaa-agatacaaatgagttacaagaaattagc 18106189  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 217  Q
    |||||||| ||| |||||||||||  || |||||| ||||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  18106190 ttcaacaagctcgcaaagaacaactatagtttctatccatttttccaatctcaccgatgaacaagacactcaacaattttcactcacccaaggtgtttac 18106289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 23 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 3772345 - 3772160
Alignment:
Q  23 ggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttc 120  Q
    ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||     
T  3772345 ggtccaacttgacctactctgagagatagattgatctctccaatccactatcaataaattcttacaaagatatacaaatgagttacaagaaattagctta 3772246  T
Q  121 aacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcaccc 206  Q
    || || |||||||||||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  3772245 aataagctcacaaagaacaaacctaatttctatcaattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatcattttcactcaccc 3772160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 9 - 220
Target Start/End: Original strand, 1746219 - 1746432
Alignment:
Q  9 tgttcacacaattcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgtta 105  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||    
T  1746219 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactatggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctt-caaagagatacaaaagggtta 1746317  T
Q  106 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacc-cattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcac 204  Q
    ||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||   ||||  |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||     
T  1746318 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacctttttttttcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 1746416  T
Q  205 ccaaggtgtttacaat 220  Q
    ||||||||||||||||    
T  1746417 ccaaggtgtttacaat 1746432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 57 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 10929907 - 10929753
Alignment:
Q  57 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctaccca 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||    
T  10929907 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagag---------ttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacataatttctaccca 10929817  T
Q  157 ttttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 220  Q
    ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  10929816 ttttccatatctcaccaaagaacaagacactcaatgattttcactaatccaaggtgtttacaat 10929753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 20 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 8153914 - 8153705
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgttacaagaaattagc 117  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||| ||| |||||    
T  8153914 ttcggtccaacttgacctactctgaggaagagattgatctctccaatcaactatcaatgagttcttacaaagatatacaaaagagttacacgaatttagc 8153815  T
Q  118 ttcaacaaa-ctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaaca--aaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtt 214  Q
    ||||||||| |||| |      |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  8153814 ttcaacaaagctcaga------aaccctaatttcta-ccattttctcaatctcaccaatgaacatgacacactcaatgattttcactcatccaaggtgta 8153722  T
Q  215 tacaattgttttccaac 231  Q
    ||||| ||||| |||||    
T  8153721 tacaaatgtttcccaac 8153705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 87 - 220
Target Start/End: Original strand, 41364926 - 41365061
Alignment:
Q  87 caaagagatacaaatgt--tacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaac 184  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||     |||||| ||    
T  41364926 caaagggatacaaatgtgttacaagaaattagcttaaacaaactcacaaagaacaaacctaatttctaccaattttcccaatctcagtcttgaacaagac 41365025  T
Q  185 actcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41365026 actcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 41365061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 2627902 - 2627735
Alignment:
Q  11 ttcacacaattcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttaca-aagagatacaaa---tgtta 105  Q
    ||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    |||     
T  2627902 ttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacacaagagatacaaaaagagttg 2627803  T
Q  106 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 174  Q
    ||||||||||| ||  ||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2627802 caagaaattagatttgacaagttcacaatgaacaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 2627735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 10015254 - 10015119
Alignment:
Q  1 ccaagaaatgttcacacaattcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 100  Q
    |||||||||| | || || ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  10015254 ccaagaaatgattacccagttcggtccaacttgacctactatggag-agagatttatctctccaatccactatcaatgagttccta-aaagagatacaaa 10015157  T
Q  101 t--gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaaga 136  Q
    |  |||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  10015156 tgagttacaagaaattagcttcaacaagcacacaaaga 10015119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 2 - 219
Target Start/End: Original strand, 11711993 - 11712214
Alignment:
Q  2 caagaaatgttcacacaattcggtccaact-tgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaa 99  Q
    ||||||||||| || ||||| || |||||  ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||    
T  11711993 caagaaatgtttacccaattaggaccaacaatgacctactttgagggagagattgatctcttcaatccactatcaatgagttatttacaaagagatataa 11712092  T
Q  100 atg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaac-cctaatttctacccattttcccaatctca-ccaaagaacaaaacactcaatgatt 195  Q
    | |  || |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||  |||||||| ||   |||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||| |    
T  11712093 aagggtttcaagaaattagcttcaacaagctctcaaggaacaaaacctaatttatatt-attttctcaatctcttccaaagaacaaaagactcaatga-t 11712190  T
Q  196 ttcactcacccaaggtgtttacaa 219  Q
    |||||||| ||||| |||||||||    
T  11712191 ttcactcatccaagatgtttacaa 11712214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 20 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 4733862 - 4733784
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagataca 98  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4733862 ttcggtccaacttgacctaatctgggggagagatcgatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagataca 4733784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 4 - 114
Target Start/End: Original strand, 3073870 - 3073981
Alignment:
Q  4 agaaatgttcacacaattcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatac--aaat 101  Q
    ||||||||| || || ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  3073870 agaaatgtttacccagttcggcccaacttgacctactatgggg-agagattgatctctccaagccattatcaatgagttcttacaaagagatacaaaaat 3073968  T
Q  102 gttacaagaaatt 114  Q
    |||||||||||||    
T  3073969 gttacaagaaatt 3073981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 32 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 7597759 - 7597559
Alignment:
Q  32 tgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaact 128  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||| ||    
T  7597759 tgacctactatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgcattctttacaaagagatacaaaaggattataagaaattagcttcaacaagct 7597660  T
Q  129 cacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctc-accaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgtttt 226  Q
    | | |||||| || ||| |||| | | | |||| ||||||||  || |||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||| ||||||| |||||     
T  7597659 ctccaagaacaaaacctgatttattctc-tttttccaatctcttcccaagaacaaaagactcaatga--ttcactcactcaaggtatttacaaatgtttc 7597563  T
Q  227 ccaa 230  Q
    ||||    
T  7597562 ccaa 7597559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 25690122 - 25689955
Alignment:
Q  9 tgttcacacaattcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatac-aaatgtta 105  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||| ||||    
T  25690122 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggtta 25690023  T
Q  106 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 174  Q
    ||||||||||||||  ||||  |||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  25690022 caagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttcta-cctttttcccaatctcaccaa 25689955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 20 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 3439660 - 3439504
Alignment:
Q  20 ttcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatac-aaatgttacaagaaattag 116  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||    
T  3439660 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattag 3439561  T
Q  117 cttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 174  Q
    |||   |||  ||| || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3439560 ctt-gccaagttcataatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 3439504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 32 - 159
Target Start/End: Original strand, 32902197 - 32902327
Alignment:
Q  32 tgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatac--aaatgttacaagaaattagcttcaacaaact 128  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| | |    
T  32902197 tgacctactcagggggagagattgatctctcaaattcactatcaatgaattctttagaaagagatacaaaaaagttacaagaaattagcttcaacagagt 32902296  T
Q  129 cacaaagaacaaccctaatttctacccattt 159  Q
    | | | |||||| | ||||||||||||||||    
T  32902297 ctccatgaacaaacataatttctacccattt 32902327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 44 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 1822425 - 1822313
Alignment:
Q  44 ggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-a 139  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| || ||||| ||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  1822425 ggggagagattgatctctccaattcactattagtgagttatttacaaatagatataaaagggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaa 1822326  T
Q  140 accctaatttcta 152  Q
    ||| |||||||||    
T  1822325 accataatttcta 1822313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 44 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 1856870 - 1856758
Alignment:
Q  44 ggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-a 139  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| || ||||| ||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  1856870 ggggagagattgatctctccaattcactattagtgagttatttacaaatagatataaaagggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaa 1856771  T
Q  140 accctaatttcta 152  Q
    ||| |||||||||    
T  1856770 accataatttcta 1856758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 20 - 231
Target Start/End: Original strand, 29796331 - 29796547
Alignment:
Q  20 ttcggtccaact-tgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgag--ttcttacaaagagatac--aaatgttacaagaaatt 114  Q
    |||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  || ||||||| || |||  ||||||||||||||||     
T  29796331 ttcggtccaacaatgacctacattgggggagagattgatctctccaatccattataaatgagtttttttacaaataggtacaaaaatgttacaagaaatc 29796430  T
Q  115 agcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctc-accaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtg 212  Q
    |||||||||||  || | |||||| |||| | |||||||| | |||||||||||||  |  |||||||| | |||||||||  ||||||| |||||| |     
T  29796431 agcttcaacaagttctccaagaacaaaccttgatttctactc-ttttcccaatctcttctcaagaacaagagactcaatga-attcactcgcccaagata 29796528  T
Q  213 tttacaattgttttccaac 231  Q
    ||||||| ||||| |||||    
T  29796529 tttacaaatgtttcccaac 29796547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 67 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 10240264 - 10240062
Alignment:
Q  67 ccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaa-atg-ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcc 162  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||  | || |||    
T  10240264 ccactatcaatgagttctttacaaagagatccaacatggttacaagaaattagattcaacaagctcacaaagaacaaacccaaatttcta-tctttgtcc 10240166  T
Q  163 caatct-caccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgttt-acaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaacca 260  Q
    |||||| | || |||||||| | |||| |    |||| |||||| ||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||||||  || |||||||||||    
T  10240165 caatctcctcccaagaacaagagactcga----tttcgctcacctaagatgtttctcaattgtttcccaaatctagaatctaac--cccaaagagaacca 10240072  T
Q  261 acccttagcc 270  Q
    || |||||||    
T  10240071 actcttagcc 10240062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 15290681 - 15290522
Alignment:
Q  20 ttcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttctt-acaaagaga-tacaa-atgttacaagaaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  || ||||| | |||||||||||||    
T  15290681 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaatt 15290582  T
Q  115 agcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 174  Q
    ||||| |  |   |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  15290581 agcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 15290522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 15471050 - 15470891
Alignment:
Q  20 ttcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttctt-acaaagaga-tacaa-atgttacaagaaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  || ||||| | |||||||||||||    
T  15471050 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaatt 15470951  T
Q  115 agcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 174  Q
    ||||| |  |   |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  15470950 agcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 15470891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 174
Target Start/End: Original strand, 42575335 - 42575494
Alignment:
Q  20 ttcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttctt-acaaagaga-tacaa-atgttacaagaaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  || ||||| | |||||||||||||    
T  42575335 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaatt 42575434  T
Q  115 agcttcaacaaactcacaaagaacaa-ccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 174  Q
    ||||| |  |   |||| | |||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  42575435 agcttgacaatgttcactatgaacaatccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 42575494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 72 - 233
Target Start/End: Original strand, 3231859 - 3232023
Alignment:
Q  72 atcaatgagttctt-acaaagagatacaaat--gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatc 167  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||   |||| || |||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||| |  ||||| |||||    
T  3231859 atcaataagttctttacaaagagatacaaaatggttaaaaaaaattagcttcaacaagctcacgaagaacaaagcctaatttcta-catttttctcaatc 3231957  T
Q  168 tc-accaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgttttccaactc 233  Q
    ||  || |||||||| | |||||||||  ||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||    
T  3231958 tcttcctaagaacaagagactcaatga-attcacccacccaaggtgtttactaatgtttcccaactc 3232023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 30909487 - 30909389
Alignment:
Q  56 atctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa-tgttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctac 153  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||| || ||||| ||| | ||||  || ||||||||||||    
T  30909487 atctctccaattcactatcaacgagtcattacaaagagatacaaagagttacaagaaattagtttaaacaagctctccaagagtaaacctaatttctac 30909389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 267
Target Start/End: Original strand, 33655402 - 33655565
Alignment:
Q  103 ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactc 202  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||| | |||| |  ||| ||  | | |||||| |||||||||||||| |||||    
T  33655402 ttacgagaaatcagcttcaacaaactctctaagaacaaatctaatttctatctattt-cttaatatcttccatgaacaagacactcaatgattt-cactc 33655499  T
Q  203 acccaaggtgtttacaa-ttgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaaccctta 267  Q
    | ||||| ||||| ||| || ||||||||||||| ||| |||||    ||||||||||||||||||    
T  33655500 atccaagatgttttcaaattattttccaactctaaaatttaacccttgaaagagaaccaaccctta 33655565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 181 - 230
Target Start/End: Original strand, 1872084 - 1872133
Alignment:
Q  181 aaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgttttccaa 230  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| ||||||||||    
T  1872084 aaacactcaatgattttcactcagccaatgtatttacaaatgttttccaa 1872133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 58 - 125
Target Start/End: Original strand, 38860413 - 38860482
Alignment:
Q  58 ctctccaatccactatcaatgagtt-cttacaaagagatacaaatgttacaagaaattag-cttcaacaa 125  Q
    |||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||||||    
T  38860413 ctctccaatccactatcaaatagtttcttacaaagagatacaatagttataagaaattagccttcaacaa 38860482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 38863985 - 38863949
Alignment:
Q  49 gagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt 85  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38863985 gagattgatctctccaatccactatcaacgagttctt 38863949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 59 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 11137146 - 11137074
Alignment:
Q  59 tctccaatccactatcaatgagttctt----acaaagagatacaaat--gttacaagaaattagcttcaacaa 125  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||    |||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||    
T  11137146 tctccaattcactatcaatgagtttttttttacaaagagatacaaaacggttataagaaattagcttcaacaa 11137074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 102 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 42093188 - 42093131
Alignment:
Q  102 gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaaca-accctaatttctacccatttt 160  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||    
T  42093188 gttacaagaaattagctt--acaaactcacaaagaacatatcataatttctacctatttt 42093131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 58)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Original strand, 35446877 - 35447147
Alignment:
Q  1 ccaagaaatgttcacacaattcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 100  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35446877 ccaagaaatgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagagtgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 35446976  T
Q  101 t--gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttc 198  Q
    |  ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  35446977 tgggttacaagaaattagattcaacaagatcacaaagaacaaccctaatttctaccaattttaccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttc 35447075  T
Q  199 actcacccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcc 270  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35447076 actctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcc 35447147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 6 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 45727099 - 45726834
Alignment:
Q  6 aaatgttcacacaattcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaat--gt 103  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  45727099 aaatgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggt 45727000  T
Q  104 tacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactca 203  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||||     
T  45726999 tacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaactctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaataagacactc-atgattttcactct 45726901  T
Q  204 cccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcc 270  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45726900 cccaaggtgtttacaattgtttcctaaccctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcc 45726834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 3 - 270
Target Start/End: Original strand, 1631727 - 1631995
Alignment:
Q  3 aagaaatgttcacacaattcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaat- 101  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  1631727 aagaaatattcactcagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatttctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg 1631826  T
Q  102 -gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcac 200  Q
     ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  1631827 ggttacaagatattagcttcaacaagctcacaaagaacaatcctaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcac 1631925  T
Q  201 tcacccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcc 270  Q
    || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1631926 tctctcaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcc 1631995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 20 - 270
Target Start/End: Original strand, 42288123 - 42288373
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagc 117  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||    
T  42288123 ttcggtccaacttgacctaatctgggg-agagattgatctctccaatccattatcaatgagctcttacaaagaaatacaaatgggttacaataaattagc 42288221  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 217  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  42288222 ttcaacaagctcacaaagaacaaccttaatttctacccattttcccaatctcaccaatgcacaagacactc-gtgattttcactctcccaaggtgtttac 42288320  T
Q  218 aattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcc 270  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  42288321 aattgtttcccaactctagaatctaaacccgaaaagagaaccaacccttagcc 42288373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Original strand, 17057381 - 17057583
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagc 117  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  17057381 ttcggtccaacttgacctagtctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaaaaaattagc 17057480  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 217  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17057481 ttcaacaagcttgcaaagaacaaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 17057580  T
Q  218 aat 220  Q
    |||    
T  17057581 aat 17057583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Original strand, 17085364 - 17085566
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagc 117  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  17085364 ttcggtccaacttgacctagtctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaaaaaattagc 17085463  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 217  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17085464 ttcaacaagcttgcaaagaacaaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 17085563  T
Q  218 aat 220  Q
    |||    
T  17085564 aat 17085566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Original strand, 36318021 - 36318223
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagc 117  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||     
T  36318021 ttcggtccaacttgacctactctaagggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaataaattagt 36318120  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 217  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36318121 ttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 36318220  T
Q  218 aat 220  Q
    |||    
T  36318221 aat 36318223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 36773718 - 36773516
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagc 117  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  36773718 ttcggtccaacttgacataatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaagagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagc 36773619  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 217  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36773618 ttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttattcccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 36773519  T
Q  218 aat 220  Q
    |||    
T  36773518 aat 36773516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 29868025 - 29867823
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagc 117  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  29868025 ttcggtccaacttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatcaaagagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagc 29867926  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 217  Q
    ||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29867925 tttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 29867826  T
Q  218 aat 220  Q
    |||    
T  29867825 aat 29867823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 23 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 42362505 - 42362306
Alignment:
Q  23 ggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttc 120  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||     
T  42362505 ggtccaacttgacctaatctgggggagagatagatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgggttacaagaaattagctta 42362406  T
Q  121 aacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 220  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42362405 aacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 42362306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Original strand, 723756 - 723958
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagc 117  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  723756 ttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgggttacaagaaattagc 723855  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 217  Q
    || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  723856 ttaaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccagttttccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 723955  T
Q  218 aat 220  Q
    |||    
T  723956 aat 723958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 38312396 - 38312194
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagc 117  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||     
T  38312396 ttcggtccaacttgacataatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagt 38312297  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 217  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  38312296 ttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacacaaggtgtatac 38312197  T
Q  218 aat 220  Q
    |||    
T  38312196 aat 38312194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 20 - 233
Target Start/End: Original strand, 33162462 - 33162676
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagc 117  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  33162462 ttcggtccaacttgacctaatctaggggagagattgatctctctaatccactatcaatgagttcttacagagagatacaaatgggttacaagaaattagc 33162561  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 217  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  33162562 ttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcctaatttcaccaatgaacaagacactcgatgattttcaatcacccaaggtgtttac 33162661  T
Q  218 aattgttttccaactc 233  Q
    || ||||| |||||||    
T  33162662 aa-tgtttcccaactc 33162676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Original strand, 34139782 - 34139985
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaa-gagatacaaatg--ttacaagaaattag 116  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||  ||||||||||||||    
T  34139782 ttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagggatacatatgggttacaagaaattag 34139881  T
Q  117 cttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgttta 216  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34139882 cttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttctcaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgttta 34139981  T
Q  217 caat 220  Q
    ||||    
T  34139982 caat 34139985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Original strand, 2334429 - 2334631
Alignment:
Q  20 ttcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattag 116  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||    
T  2334429 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagagttactagaaattag 2334528  T
Q  117 cttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgttta 216  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2334529 cttcaacaagttcacaaagaacaacccttatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-ccaaggtgttta 2334627  T
Q  217 caat 220  Q
    ||||    
T  2334628 caat 2334631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Original strand, 14633837 - 14634040
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaa-gagatacaaatg--ttacaagaaattag 116  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||    
T  14633837 ttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatctatgagttcttacaaaagggatacaaatgggttacaagaaattag 14633936  T
Q  117 cttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgttta 216  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14633937 cttaaacaagctcacaaagaacaatcctaatttctacccattttaccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgttta 14634036  T
Q  217 caat 220  Q
    ||||    
T  14634037 caat 14634040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Original strand, 11151603 - 11151805
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagc 117  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  11151603 ttcggtccaacttgacctaatctgggggagaggttgatctctccaatccactatctaagagttcttacaaagtgatacaaatgggttacaagaaattagc 11151702  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 217  Q
    || ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11151703 ttaaacaagctcacaaagaacaaatctaatttctacccattttcccaatttcaccaatgaacaagagactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 11151802  T
Q  218 aat 220  Q
    |||    
T  11151803 aat 11151805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 11690657 - 11690455
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagc 117  Q
    |||||||||||||||| || | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  11690657 ttcggtccaacttgacgtaatatgggggagaggttgatctctccaatccactatcaacgatttcttacaaagggatacaaatgggttacaagaaattagc 11690558  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 217  Q
    || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11690557 ttaaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 11690458  T
Q  218 aat 220  Q
    |||    
T  11690457 aat 11690455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 11067461 - 11067259
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagc 117  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  11067461 ttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctcttcaatccattataaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagc 11067362  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 217  Q
    ||  |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11067361 tttgacaagctcacaaagtacaacactaatttctacccatttttccaatttcaccaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 11067262  T
Q  218 aat 220  Q
    |||    
T  11067261 aat 11067259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 9 - 217
Target Start/End: Original strand, 36988076 - 36988286
Alignment:
Q  9 tgttcacacaattcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgtta 105  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  36988076 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagagtta 36988175  T
Q  106 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 205  Q
    ||||||||||| ||  |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  36988176 caagaaattagttttgacaagctcacatagaacaaccctaatttctacccttttttccaatcccaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-c 36988274  T
Q  206 caaggtgtttac 217  Q
    ||||||||||||    
T  36988275 caaggtgtttac 36988286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 20 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 17450733 - 17450495
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgttacaagaaattagctt 119  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |        ||||||| ||||||||||    
T  17450733 ttcggtccaacttgacctactctgtgg-agagattgatctctccaatccactatcaatgagttc--acaaatgg--------gttacaa-aaattagctt 17450646  T
Q  120 caacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa 219  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17450645 caacaagctcacaaagaacaagcctaatctctacccatttttcaaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttgcaa 17450546  T
Q  220 ttgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcc 270  Q
     ||||| |||||||||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||||    
T  17450545 atgtttgccaactctagaatccaacccccaatagagaatcaacccttagcc 17450495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 9 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 45099922 - 45099709
Alignment:
Q  9 tgttcacacaattcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgtta 105  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||    
T  45099922 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctt-caaagagatacaaaagagtta 45099824  T
Q  106 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctaccc-attttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcac 204  Q
    ||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||     
T  45099823 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 45099725  T
Q  205 ccaaggtgtttacaat 220  Q
    ||||||||||||||||    
T  45099724 ccaaggtgtttacaat 45099709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 9 - 220
Target Start/End: Original strand, 5723256 - 5723468
Alignment:
Q  9 tgttcacacaattcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatac--aaatgtta 105  Q
    ||||||| || |||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||    
T  5723256 tgttcacccagttcggtccaaacttaacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaaaggtta 5723355  T
Q  106 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 205  Q
    ||||||||||||||  ||||  ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  5723356 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaagcctaatttctaccc-ttttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-c 5723453  T
Q  206 caaggtgtttacaat 220  Q
    |||||||||||||||    
T  5723454 caaggtgtttacaat 5723468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 20 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 24398215 - 24397962
Alignment:
Q  20 ttcggtccaact-tgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaa--tgttacaagaaatta 115  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  24398215 ttcggtccaacaatgacctactatgggggagagattgatctctccaatccattatcaatgagttctttacaaagagatacaaaagggttacaagaaatta 24398116  T
Q  116 gcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccatt-ttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactc-acccaaggtg 212  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||| ||| |||||||| || ||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||  || ||||||    
T  24398115 gcttcaacaagctcacaaagaacaaaccttaacttctaccctttcttcacaatctcaccaatgaacaagacactcattgattttcactcttccaaaggtg 24398016  T
Q  213 tttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagc 269  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||   ||||||||||||||||    
T  24398015 tttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaa---agaaccaacccttagc 24397962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 24 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 13121919 - 13121712
Alignment:
Q  24 gtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgttacaagaaattagcttcaac 123  Q
    ||||||||| || || | ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  13121919 gtccaacttaacatagtttggaggagagattgatttcttcaatccactatcaatgagtttctacaaagagatacaaaggttacaagaaattatcttcaac 13121820  T
Q  124 aaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattg 222  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  13121819 aagctcacaaagaacaaaccctaatttcta-ccattttcccagtctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaatgtgtttacaaatg 13121721  T
Q  223 ttttccaac 231  Q
    ||| |||||    
T  13121720 tttcccaac 13121712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 9 - 220
Target Start/End: Original strand, 4503133 - 4503346
Alignment:
Q  9 tgttcacacaattcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgtta 105  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||    
T  4503133 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctt-caaagagatacaaaagagtta 4503231  T
Q  106 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacc-cattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcac 204  Q
    ||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||     
T  4503232 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccattttttcccaatctctccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 4503330  T
Q  205 ccaaggtgtttacaat 220  Q
    ||||||||||||||||    
T  4503331 ccaaggtgtttacaat 4503346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 9 - 221
Target Start/End: Original strand, 6595006 - 6595221
Alignment:
Q  9 tgttcacacaattcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgtta 105  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||   ||||    
T  6595006 tgttcactcagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaacgagttcttacaaagagattcaaaagggtta 6595105  T
Q  106 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacc-cattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcac 204  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||      
T  6595106 caagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccattttttcctaatctcaccaatgaacaagacacccaatgattctcactc-t 6595204  T
Q  205 ccaaggtgtttacaatt 221  Q
    |||| ||||||||||||    
T  6595205 ccaaagtgtttacaatt 6595221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 9 - 217
Target Start/End: Original strand, 36205665 - 36205874
Alignment:
Q  9 tgttcacacaattcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--tta 105  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||| |  |||    
T  36205665 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggatagattgaactctccaatccgctgtcaatgagttctt-caaagagatacaaaagagtta 36205763  T
Q  106 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 205  Q
    ||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  36205764 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccatttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-c 36205862  T
Q  206 caaggtgtttac 217  Q
    ||||||||||||    
T  36205863 caaggtgtttac 36205874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 28 - 220
Target Start/End: Original strand, 4484350 - 4484544
Alignment:
Q  28 aacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaa--tgttacaagaaattagcttcaaca 124  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||  |||    
T  4484350 aacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgaca 4484449  T
Q  125 aactcacaaagaacaaccctaatttctacccattt-tcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 220  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  4484450 agttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttctcccaatttcacc-aagaacaagacactcaatgatttacactca-ccaaggtgtttacaat 4484544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 3 - 233
Target Start/End: Original strand, 17490143 - 17490368
Alignment:
Q  3 aagaaatgttcacacaattcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa-- 100  Q
    |||||||||| || || |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||      
T  17490143 aagaaatgtttacccagttcggtccaaattgacctactctaggggagagattgatctctacaatccactatcaatgagttcttacaaagagttacaaaag 17490242  T
Q  101 tgttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcac 200  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    |||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||    
T  17490243 agttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaataa----aatttcta-ccatttt-ccaatctcaacaatgaacaagacattcaatgattttcac 17490336  T
Q  201 tcacccaaggtgtttacaattgttttccaactc 233  Q
     ||||||  |||||| ||| |||||||||||||    
T  17490337 ccacccactgtgtttgcaa-tgttttccaactc 17490368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 28 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 30833494 - 30833300
Alignment:
Q  28 aacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaa--tgttacaagaaattagcttcaaca 124  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||| |||  |||    
T  30833494 aacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaagggttacaagaaattaactttgaca 30833395  T
Q  125 aactcacaaagaacaaccctaatttctacccattt-tcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 220  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||    
T  30833394 agttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttctcccaatctcacc-aagaacaagacactcaatgatttacactca-ccaaagtgtttacaat 30833300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 26353340 - 26353143
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgttacaagaaattagc 117  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||||||||||||    
T  26353340 ttcggtccaacttgacctactctaagggagagagtgatctctccaatccactatcaatgagtacttacaaaaagatacaaaagtgttacaagaaattagc 26353241  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgttta 216  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | ||||  ||||||||||||||     |||||||||| ||||||||||||| |  |||||||    
T  26353240 ttcaacaaactcacaaagaacaaaccttaatttctacac-ttttttcaatctcaccaaag-----aacactcaataattttcactcaccgagagtgttta 26353147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 11049727 - 11049493
Alignment:
Q  3 aagaaatgttcacacaattcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaat- 101  Q
    |||||||||| || || ||| |||||| |||||||| | ||  |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  11049727 aagaaatgtttacccagttcagtccaatttgacctattatgaaggagagattgatcttttcaatctactatcaatgagttcttacaaagagatactaaaa 11049628  T
Q  102 --gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaa---gaacaa-ccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgatt 195  Q
      |||| ||||||||||||||||||| ||||||||   |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  11049627 gggttataagaaattagcttcaacaagctcacaaattagaacaaaccctaatttatacc-attttcctaatctcaccaaaaaacaagacactcaatgatt 11049529  T
Q  196 ttcactcacccaaggtgtttacaattgttttccaac 231  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  11049528 ttcacttacccaaggtgtttacaaatgtttcccaac 11049493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 46 - 225
Target Start/End: Original strand, 7815311 - 7815492
Alignment:
Q  46 ggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aacc 142  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||   ||||||| ||||    
T  7815311 ggagagattaatctctccaatccactataaatgagttcttacaaagagatacaaaagagttacaagaaattagcttcaacaagcttctaaagaacaaacc 7815410  T
Q  143 ctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgttt 225  Q
    |||||||| | || ||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  7815411 ctaatttc-aacctttttctcaatctcaccaatgaacaagacacgcaatgattttcacccacctaaggtgtttacaaatgttt 7815492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 35 - 220
Target Start/End: Original strand, 14202439 - 14202621
Alignment:
Q  35 cctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaa 134  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||      |||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  14202439 cctaatcttggggagagattgatctctccaatctactatcaatgagttcttacaaag-gatga----gttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaa 14202533  T
Q  135 gaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaaca--aaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 220  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||  || ||| |  | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14202534 gaacaaacataatttctacccattttcccaatctcagaaatgaaaaagacacactcaataattttcactcacccaaggtgtttacaat 14202621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 74 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 24885763 - 24885615
Alignment:
Q  74 caatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcac 171  Q
    ||||||||||||||| || | ||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | ||    
T  24885763 caatgagttcttacagaggggtacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctactcattttcccaattttac 24885664  T
Q  172 caaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 220  Q
     || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24885663 aaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 24885615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 33648348 - 33648089
Alignment:
Q  1 ccaagaaatgttcacacaattcggtccaact-tgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagataca 98  Q
    |||| ||||||| || || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  33648348 ccaataaatgtttacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccgctatcaatgagttctttacaaagaaataca 33648249  T
Q  99 aa--tgttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatct-caccaaagaacaaaacactcaatgat 194  Q
    ||   |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||| | |  | | |||| ||||||||| ||    
T  33648248 aaagggttacaggaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccctaattttta-ccattttctcaatctcctctcatgtacaagacactcaattat 33648150  T
Q  195 tttcactcacccaaggtg-tttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaaga 254  Q
    |||||||| |||||| || |||||  || | | ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33648149 tttcactctcccaagatgttttacggttatgtcccaactctagaatctaacccccaaaaga 33648089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 9 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 32289732 - 32289530
Alignment:
Q  9 tgttcacacaattcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaa--tgtt 104  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||    
T  32289732 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctctaatttactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaagagtt 32289633  T
Q  105 acaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcac 204  Q
    |||||||||||| ||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||       ||| |||||||||||||||||||||     
T  32289632 acaagaaattagatttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccc--ttttccaatctcac-------caagacactcaatgattttcactca- 32289543  T
Q  205 ccaaggtgtttac 217  Q
    |||||||||||||    
T  32289542 ccaaggtgtttac 32289530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 7451292 - 7451167
Alignment:
Q  1 ccaagaaatgttcacacaattcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 100  Q
    |||| |||||||||| || |||| |||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7451292 ccaataaatgttcacccagttcg-tccaacttgacctactgtagaggagagattgatctctgcaatccactatcaatgagttattacaaagagatacaaa 7451194  T
Q  101 tg--ttacaagaaattagcttcaacaa 125  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||    
T  7451193 tgaattacaagaaattagcttcaacaa 7451167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 6266859 - 6266691
Alignment:
Q  9 tgttcacacaattcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatac-aaatgtta 105  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||| ||||    
T  6266859 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggtta 6266760  T
Q  106 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 174  Q
    ||||||||||| ||  ||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6266759 caagaaattagatttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 6266691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 130 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 39284929 - 39284839
Alignment:
Q  130 acaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 220  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39284929 acaaagagcaaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagatactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 39284839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 68 - 231
Target Start/End: Original strand, 12123644 - 12123809
Alignment:
Q  68 cactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttccca 164  Q
    |||||||| ||||||||| |||||  |||||||| |  ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| |||||| |||    
T  12123644 cactatcattgagttctttacaaaatgatacaaaagagttacaagaaataagcttcaacaaaatcataaagaacaactctaatttatactcatttt-cca 12123742  T
Q  165 atctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgttttccaac 231  Q
    ||||| | || |||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||    
T  12123743 atctctcaaatgaacaagacactcgatgattttcactcatccaaggtgtttataaatgtttcccaac 12123809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 20 - 174
Target Start/End: Original strand, 13656043 - 13656200
Alignment:
Q  20 ttcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaa-atgttacaagaaatta 115  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||||||    
T  13656043 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagaggttacaagaaatta 13656142  T
Q  116 gcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 174  Q
    ||||  ||||  |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  13656143 gctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 13656200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 20 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 39284992 - 39284930
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt 82  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39284992 ttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt 39284930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 32 - 215
Target Start/End: Original strand, 30218068 - 30218254
Alignment:
Q  32 tgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaat--gttacaagaaattagcttcaacaaact 128  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||| || || |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| || ||    
T  30218068 tgacttactctgggggagtgattgatcttttcaacccactatcaatgaattatttacaaagagatacaaaatggttacaagaaattagcttcaataagct 30218167  T
Q  129 cacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatct-caccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgttt 215  Q
    | | |||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||| |  | | |||||| |||||||||||||| |||||   ||||||||||    
T  30218168 ctccaagaacaaacctaacttctaccca-tttctcaatctccttccatgaacaagacactcaatgatttccactctgtcaaggtgttt 30218254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 9 - 174
Target Start/End: Original strand, 12647386 - 12647555
Alignment:
Q  9 tgttcacacaattcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaa-atgt 103  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| | ||    
T  12647386 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggt 12647485  T
Q  104 tacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 174  Q
    ||||||||||||||||  ||||  |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  12647486 tacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 12647555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 34 - 219
Target Start/End: Original strand, 42019896 - 42020085
Alignment:
Q  34 acctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgag---ttcttacaaagagatacaaa--tgttacaagaaattagcttcaacaaact 128  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||   || |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||| ||    
T  42019896 acctactatggggaagagattgatctctcaaattcactatcaatgagttttttttacaaagagatacaaaagagttacaagaaattagcttctacaagct 42019995  T
Q  129 cacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc-accaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa 219  Q
        |||||||| | ||| |||||||| |||| | ||||||  || ||||| || | ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  42019996 ttataagaacaaacataaattctaccc-tttttctaatctcttcccaagaaaaatagactcaatga-tttcactcacccacgatgtttacaa 42020085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 28672090 - 28672022
Alignment:
Q  18 aattcggtccaact-tgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt 85  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  28672090 aattcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactgtcagtgagttctt 28672022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 153
Target Start/End: Original strand, 42261524 - 42261633
Alignment:
Q  47 gagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccc 143  Q
    |||||| ||||||||||  | |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |     
T  42261524 gagagaatgatctctccgcttcactatcaatgagtactttacaaagatatacaaaagagttacaagaaattagcttcaacaagctctccaagaacaaact 42261623  T
Q  144 taatttctac 153  Q
    ||||||||||    
T  42261624 taatttctac 42261633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 31 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 42412162 - 42412117
Alignment:
Q  31 ttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaat 77  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42412162 ttgacctactctgggg-agagattgatctctccaatccactatcaat 42412117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 24198023 - 24197946
Alignment:
Q  50 agattgatctctccaatccactatcaatgagtt-cttacaaagagatacaaatgttacaagaaattag-cttcaacaa 125  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||| ||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  24198023 agatagatctctccaatccattatcaaagagtttcttgcaaagagatacaagggttacaagaaattagccttcaacaa 24197946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 154
Target Start/End: Original strand, 34811281 - 34811370
Alignment:
Q  68 cactatcaatgagtt-cttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacc 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |  |||||| |||||||||||||||| ||| | |||| ||| | |||||||||||    
T  34811281 cactatcaatgagtttcttacaaagagatataaaagagttacaataaattagcttcaacaagctctctaagagcaatcttaatttctacc 34811370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 4561180 - 4561137
Alignment:
Q  84 ttacaaagagatacaaa--tgttacaagaaattagcttcaacaa 125  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  4561180 ttacaaagagatacaaaaatgttacaagaaattagcttcaacaa 4561137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 55 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 41454356 - 41454254
Alignment:
Q  55 gatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttct 151  Q
    ||||| |||| | |||||||||||||||||| ||||| | ||||||| |  || | |||||||||||||||||| ||| |||| |||||  |||||||||    
T  41454356 gatctgtccacttcactatcaatgagttctttacaaatatatacaaaagagttgctagaaattagcttcaacaagctctcaaaaaacaaatctaatttct 41454257  T
Q  152 acc 154  Q
    |||    
T  41454256 acc 41454254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 58 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 16605711 - 16605654
Alignment:
Q  58 ctctccaatccactatcaatgag-ttcttacaaagagatacaaatgttacaagaaatt 114  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||  |||||||||||||    
T  16605711 ctctccaatccattatcaatgagtttcttataaagatatacaagagttacaagaaatt 16605654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 81 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 28861163 - 28861131
Alignment:
Q  81 ttcttacaaagagatacaaatgttacaagaaat 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28861163 ttcttacaaagagatacaaatgttacaacaaat 28861131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 73
Target Start/End: Original strand, 34388871 - 34388926
Alignment:
Q  17 caattcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactat 73  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| | | ||||||||||||||||    
T  34388871 caattcggtccaatatgacctaatctgggggagagagt-agctctccaatccactat 34388926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 110 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 41446203 - 41446159
Alignment:
Q  110 aaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacc 154  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||    
T  41446203 aaattagcttcaacaagctctcaaagaacaaacataatttctacc 41446159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 83)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 22270148 - 22269878
Alignment:
Q  1 ccaagaaatgttcacacaattcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 100  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22270148 ccaagagatgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatcagttcttacaaagagatacaaa 22270049  T
Q  101 tg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttc 198  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||   ||||||    
T  22270048 tgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgaattttc 22269949  T
Q  199 actcacccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcc 270  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  22269948 actctcccaaggtgtttagaattg-tttccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccatagcc 22269878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 29608912 - 29608641
Alignment:
Q  1 ccaagaaatgttcacacaattcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 100  Q
    ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29608912 ccaagaaatattcactcagttcggtccaacttgacctactctggaggagtgattgatatctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 29608813  T
Q  101 tg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttc 198  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   | ||||    
T  29608812 tgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaagacactcatgaagtttc 29608713  T
Q  199 actcacccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcc 270  Q
     ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29608712 gctctctcaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcc 29608641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 20 - 270
Target Start/End: Original strand, 2360984 - 2361234
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagc 117  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  2360984 ttcggttcaacttgacctaatctgggggagagattgatatctcaaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagc 2361083  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 217  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2361084 ttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttac 2361182  T
Q  218 aattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcc 270  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  2361183 aattgtttcccaactctagaatctaacc-tcaaaagagaaccaacccttagcc 2361234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 9 - 270
Target Start/End: Original strand, 34310716 - 34310979
Alignment:
Q  9 tgttcacacaattcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgt--ta 105  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||    
T  34310716 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaaagatacaaatgtgtta 34310815  T
Q  106 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 205  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||    
T  34310816 caagaaattagcttcaacaatttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 34310914  T
Q  206 caaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcc 270  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  34310915 caaggtgtttacaattatttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacctttagcc 34310979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 2 - 270
Target Start/End: Original strand, 48599328 - 48599597
Alignment:
Q  2 caagaaatgttcacacaattcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaat 101  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  48599328 caagaaatgttcacccagttcggtccaacttgatctgctctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagctcttccaaagagatacaaat 48599427  T
Q  102 --gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttca 199  Q
      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| || ||||||||||    
T  48599428 gagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatatcaccaatgaacaagacaatc-atgattttca 48599526  T
Q  200 ctcacccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcc 270  Q
    |||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  48599527 ctcctccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatataacccccaaaagagaaccaacccttagcc 48599597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 20 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 6432127 - 6431877
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaat--gttacaagaaattagc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  6432127 ttcggtccaacttgacctactctgaaggagagattgatctctccaatccactatcaacgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagc 6432028  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 217  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  6432027 ttcaacaagctcacaaagaacaatcctaatttctacccattttcccaatctaaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaatgtgtttac 6431929  T
Q  218 aattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagc 269  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  6431928 aattgtttcccaactctagaatctaaccctcaaaagagaaccaacccttagc 6431877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Original strand, 4508699 - 4508969
Alignment:
Q  1 ccaagaaatgttcacacaattcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 100  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4508699 ccaagaaatgttcacccagttcggtccaacttaacctactctgaagaagagattgatctctccaatccactctcaatgagttcttacaaagagatacaaa 4508798  T
Q  101 t--gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttc 198  Q
    |  ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||    
T  4508799 tgggttacaagaaattagcttcaataagctcacaaagaacaaccctaatttctactcattttcccaatctcaccaatcaacaagacactc-atgattttc 4508897  T
Q  199 actcacccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcc 270  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||    
T  4508898 actctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccataaaagagaaccaatccttagcc 4508969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 5 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 3259166 - 3258901
Alignment:
Q  5 gaaatgttcacacaattcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg-- 102  Q
    ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||      
T  3259166 gaaatgttcacccagttcggttcaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgggtttttacaaagagatacaaatgag 3259067  T
Q  103 ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactc 202  Q
    |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||   |||||||||     
T  3259066 ttacaataaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaccctagtttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgaattttcactt 3258967  T
Q  203 acccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttag 268  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  3258966 tcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaatgagaaccaacccttag 3258901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 20 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 2390438 - 2390187
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaat--gttacaagaaattagc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  2390438 ttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatatatgagttattacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagc 2390339  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 217  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||| |||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  2390338 ttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatttttcgaatttcaccaatgaacaagacact-tatgattttcgctctcccaaggtgtttac 2390240  T
Q  218 aattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcc 270  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2390239 aattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcc 2390187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Original strand, 4512383 - 4512653
Alignment:
Q  1 ccaagaaatgttcacacaattcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 100  Q
    ||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4512383 ccaagaaatgttcacccagtacggtccaacttgacctactctacaggagagattgatttcttcaatccactatcaatgagttcttataaagagatacaaa 4512482  T
Q  101 t--gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttc 198  Q
    |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||  ||||| |||||||||    
T  4512483 tgggttacaagaaattagcttcaataaactcacaaagaacaaccttaatttctacccattttccaaatctcaccaatcaacaaggcactc-atgattttc 4512581  T
Q  199 actcacccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcc 270  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  4512582 actctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatataacccccaaaagagaactaacccttagcc 4512653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Original strand, 30024744 - 30024945
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagc 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  30024744 ttcggtccaacttgacctactctgggggagtgattgatctctccaatccactatcaaagagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagc 30024843  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 217  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30024844 ttcaacaagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 30024943  T
Q  218 aa 219  Q
    ||    
T  30024944 aa 30024945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Original strand, 4510541 - 4510811
Alignment:
Q  1 ccaagaaatgttcacacaattcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 100  Q
    ||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4510541 ccaagaaatgttcacccagtacggtccaacttgacctactctacaggagagattgatttcttcaatccactatcaatgagttcttataaagagatacaaa 4510640  T
Q  101 t--gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttc 198  Q
    |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||  ||||| |||||||||    
T  4510641 tgggttacaagaaattagcttcaataaactcacaaagaacaaccttaatttctacccattttccaaatctcaccaatcaacaaggcactc-atgattttc 4510739  T
Q  199 actcacccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcc 270  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||| | ||||||    
T  4510740 actctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccataaaagagaaccaatcgttagcc 4510811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Original strand, 8359308 - 8359581
Alignment:
Q  1 ccaagaaatgttcacacaattcggtccaact-tgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaa 99  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8359308 ccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaa 8359407  T
Q  100 a---tgttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattt 196  Q
    |    ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||    
T  8359408 aatgggttacaagaaattagtttaaacaagctcacaaagaaaaaccctaatttctacccattttcccaatctccccaatgaacaagacactc-atgattt 8359506  T
Q  197 tcactcacccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatct-aaccaccaaaagagaaccaacccttagcc 270  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| | ||||||| |||||||    
T  8359507 tcactctctcaaggtgtttacaattgttttccaactcaagaatctaaacccccaaaaaataaccaactcttagcc 8359581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 27347973 - 27347771
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagc 117  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  27347973 ttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctgcaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagc 27347874  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 217  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27347873 ttcaacaagttcacaaagaacaatcctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaatgtgtttac 27347774  T
Q  218 aat 220  Q
    |||    
T  27347773 aat 27347771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 26 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 48491729 - 48491533
Alignment:
Q  26 ccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaac 123  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  48491729 ccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctttcaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaac 48491630  T
Q  124 aaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 220  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  48491629 aagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaagtgtttacaat 48491533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Original strand, 14069845 - 14070047
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagc 117  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  14069845 ttcggtccaacttgacctaatcttggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagc 14069944  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 217  Q
    ||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14069945 tttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 14070044  T
Q  218 aat 220  Q
    |||    
T  14070045 aat 14070047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Original strand, 14379873 - 14380075
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagc 117  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  14379873 ttcggtccaacttgacctaatctaggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagc 14379972  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 217  Q
    ||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14379973 tttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 14380072  T
Q  218 aat 220  Q
    |||    
T  14380073 aat 14380075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Original strand, 31732981 - 31733183
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagc 117  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  31732981 ttcggtccaacttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccagtatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagc 31733080  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 217  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31733081 ttcaccaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttctcagtctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 31733180  T
Q  218 aat 220  Q
    |||    
T  31733181 aat 31733183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Original strand, 47676148 - 47676350
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagc 117  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  47676148 ttcggtccaacttgacctaatatgggggagagattgatctctccattccactatcattgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagc 47676247  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 217  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  47676248 ttcaacaaattcacaaagaacaaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcattgattttcactcacccaaggtgtttac 47676347  T
Q  218 aat 220  Q
    |||    
T  47676348 aat 47676350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 20 - 231
Target Start/End: Original strand, 47673956 - 47674167
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagc 117  Q
    |||||||||||||||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  47673956 ttcggtccaacttgacttaatatgggg-agagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagc 47674054  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 217  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47674055 ttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 47674154  T
Q  218 aattgttttccaac 231  Q
    || |||||||||||    
T  47674155 aa-tgttttccaac 47674167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 24 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 8153494 - 8153296
Alignment:
Q  24 gtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttca 121  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||      
T  8153494 gtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttattacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagctttg 8153395  T
Q  122 acaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8153394 acaatctcacaaagaacaaccctaatttctactcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaatgtgtttacaat 8153296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Original strand, 41317446 - 41317648
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagc 117  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  41317446 ttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatggattacaagaaattagc 41317545  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 217  Q
    ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41317546 tttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctaccaattttcccaatctcaccaatgaacaagagactcaatgattttcactcatccaaggtgtttac 41317645  T
Q  218 aat 220  Q
    |||    
T  41317646 aat 41317648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 31105386 - 31105607
Alignment:
Q  1 ccaagaaatgttcacacaattcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 100  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31105386 ccaagaaatgtttacccagttcggtccaacttgatctactcttggggagagatttatctctccaatccaccatcaatgagttcttacaaaaagatacaaa 31105485  T
Q  101 tg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttc 198  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||    
T  31105486 tgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaaaaaatctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttc 31105585  T
Q  199 actcacccaaggtgtttacaat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  31105586 actcacccaaggtgtttacaat 31105607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 4586317 - 4586115
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagc 117  Q
    |||||||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||    
T  4586317 ttcggtccaagttgacataatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagataaaaatgggttacaaaaaattagc 4586218  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 217  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4586217 ttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgatttacactcacccaaggtgtttac 4586118  T
Q  218 aat 220  Q
    |||    
T  4586117 aat 4586115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 20 - 231
Target Start/End: Original strand, 36146420 - 36146633
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagc 117  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  36146420 ttcggtccaacttgacctaatatgggggagagattgatctctcaaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttaca-gaaattagc 36146518  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaacc-ctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgttta 216  Q
    |||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36146519 ttcaacaagctcacaaataacaaactctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgttta 36146618  T
Q  217 caattgttttccaac 231  Q
    ||| ||||| |||||    
T  36146619 caaatgtttcccaac 36146633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 43864400 - 43864198
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagc 117  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  43864400 ttcggtccaacttgacctaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaattagtttttacaaagagatacaaatgggttacaggaaattagc 43864301  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 217  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43864300 ttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccacttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 43864201  T
Q  218 aat 220  Q
    |||    
T  43864200 aat 43864198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 17 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 1113816 - 1113611
Alignment:
Q  17 caattcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  1113816 caattcggtcaaacttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatctactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttataagaaatt 1113717  T
Q  115 agcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtt 214  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1113716 agcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttctcaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaagttgtt 1113617  T
Q  215 tacaat 220  Q
    ||||||    
T  1113616 tacaat 1113611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 18126799 - 18126598
Alignment:
Q  21 tcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagct 118  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  18126799 tcggtcaaacttgacctagtctgggggagagattgattcctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagct 18126700  T
Q  119 tcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttaca 218  Q
    | |||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18126699 tgaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacacatttttccaatctcaccaatgaacaaaacactcaatgattttcactcacccaagttgtttaca 18126600  T
Q  219 at 220  Q
    ||    
T  18126599 at 18126598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 24 - 220
Target Start/End: Original strand, 495999 - 496197
Alignment:
Q  24 gtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttca 121  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  495999 gtccaacttgacctactataggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttataaagagatacaaatgggttgcaagaaattagcttca 496098  T
Q  122 acaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 220  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  496099 acaagctcacaaagaactaccctaatttctacccattttcccaatctcacaaattaacaaaacactaaatgattttcactcacccaaggtttttacaat 496197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 48489587 - 48489385
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagc 117  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  48489587 ttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatgaatgagttattgcaaagagatacaaatgggttacaagaaattagc 48489488  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 217  Q
    ||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  48489487 ttcaacaagttttcaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacatttaatgattttcactcacccaaggtgtttac 48489388  T
Q  218 aat 220  Q
    |||    
T  48489387 aat 48489385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 9 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 23555208 - 23554982
Alignment:
Q  9 tgttcacacaattcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgtta 105  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||    
T  23555208 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagaggtacaaaagtgtta 23555109  T
Q  106 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacc-cattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcac 204  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||     
T  23555108 caagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccattttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 23555010  T
Q  205 ccaaggtgtttacaattgttttccaactc 233  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  23555009 ccaaggtgtttacaa-tgtttcccaactc 23554982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 9 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 35854082 - 35853869
Alignment:
Q  9 tgttcacacaattcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--tta 105  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  35854082 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtta 35853983  T
Q  106 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 205  Q
    ||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  35853982 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-c 35853884  T
Q  206 caaggtgtttacaat 220  Q
    |||||||||||||||    
T  35853883 caaggtgtttacaat 35853869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Original strand, 38671234 - 38671436
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgt--tacaagaaattagc 117  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||||||    
T  38671234 ttcggtccaacttgacctattttgggggatagatttatctcttcaatccactatcaatgagttcttacaaagtgatacaaatgtgttacaataaattagc 38671333  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 217  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38671334 ttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcgctcacccaaggtgtttac 38671433  T
Q  218 aat 220  Q
    |||    
T  38671434 aat 38671436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 23 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 26417468 - 26417270
Alignment:
Q  23 ggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttc 120  Q
    ||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  26417468 ggtccaatttgacctaacctgggg-agagattgatctctccaatccactatcaacgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattatcttc 26417370  T
Q  121 aacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 220  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||    
T  26417369 aacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcacccgctcaaggtgtttacaat 26417270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Original strand, 41649023 - 41649224
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaat--gttacaagaaattagc 117  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  41649023 ttcggtccaacttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgggttacaagaaattagc 41649122  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 217  Q
     | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41649123 -taaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctaccaatttttccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcacttacccaaggtgtttac 41649221  T
Q  218 aat 220  Q
    |||    
T  41649222 aat 41649224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 9 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 29991221 - 29991009
Alignment:
Q  9 tgttcacacaattcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgtta 105  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||   ||||    
T  29991221 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttattagaaagagatacaaaagggtta 29991122  T
Q  106 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 205  Q
    ||||||||||||||  ||||  ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  29991121 caagaaattagctttgacaagttcacaaataacaaccctaatttctatcc-ttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-c 29991024  T
Q  206 caaggtgtttacaat 220  Q
    |||||||||||||||    
T  29991023 caaggtgtttacaat 29991009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 4253521 - 4253754
Alignment:
Q  1 ccaagaaatgttcacacaattcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaa 99  Q
    |||||||||||| ||  | |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||    
T  4253521 ccaagaaatgtttacctagttcggtccaaattgacctactctgtgggagagattgatctctctaatccattatcaatgagttctttccaaagagatataa 4253620  T
Q  100 a--tgttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattt 196  Q
    |   |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  4253621 aagggttacatgaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttcta-ccattttaccaatttcaccaatgaacaagaaactcaatgattt 4253719  T
Q  197 tcactcacccaaggtgtttacaattgttttccaac 231  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  4253720 tcactcacctaaggtgtttacaaatgttttccaac 4253754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Original strand, 12097879 - 12098073
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagc 117  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||       |||||||||||||  ||||||||||||| |    
T  12097879 ttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattcatctctccaatccacta-caaagagtt-------agagatacaaatgggttacaagaaattaac 12097970  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 217  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12097971 ttcaacaagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctaaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaagatgtttac 12098070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 24 - 227
Target Start/End: Original strand, 23565077 - 23565282
Alignment:
Q  24 gtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgttacaagaaattagcttca 121  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||    
T  23565077 gtccaacttgacctactctaggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagagttacaagaaattagtttca 23565176  T
Q  122 acaaactcacaaagaacaa-ccctaatttctaccca--ttttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttaca 218  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |  |||||| ||||||||||| |||||| |||||   | || |||||||||||||||||||||||    
T  23565177 acaagctcacaaagaacaagacctaatttctacctattttttcctaatctcaccaatgaacaagacact---tcatgttcactcacccaaggtgtttaca 23565273  T
Q  219 attgttttc 227  Q
    | |||||||    
T  23565274 aatgttttc 23565282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 32358047 - 32358190
Alignment:
Q  1 ccaagaaatgttcacacaattcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 100  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32358047 ccaagaaatgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 32358146  T
Q  101 t--gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaacc 142  Q
    |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  32358147 tgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagcacaacc 32358190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 28 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 19502326 - 19502132
Alignment:
Q  28 aacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgttacaagaaattagcttcaacaa 125  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||  ||||    
T  19502326 aacttgacttactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaa 19502227  T
Q  126 actcacaaagaacaaccctaatttct-acccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 220  Q
     |||||||| ||||||| |||||||| |||  ||||| |||||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  19502226 gctcacaaaaaacaaccttaatttctaaccttttttcgcaatctcaccactgaacaagacactcaatgattctcactca-ccaaggtgtttacaat 19502132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 20 - 269
Target Start/End: Original strand, 22328401 - 22328661
Alignment:
Q  20 ttcggtccaact-tgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaatta 115  Q
    |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  22328401 ttcggtccaacaatgacctactctaggggagagattgatctctcaaatccactattaatgacttccttgcaaagagatacaaaagagttacaagaaatta 22328500  T
Q  116 gcttcaacaaactcacaaagaacaacc-ctaatttctacccatt-ttcccaatctcaccaaagaacaaa----acactcaatgattttcactcacccaag 209  Q
    |||||||||| |||||||||||||| | |||||||||| || || ||||||||||| | || |||||||    ||||||||||||||||| || | ||||    
T  22328501 gcttcaacaagctcacaaagaacaaactctaatttctaacctttcttcccaatctctctaatgaacaaacaagacactcaatgattttcattccctcaag 22328600  T
Q  210 gtgtttacaattgttttccaactctagaatctaa-ccaccaaaagagaaccaacccttagc 269  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| |||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  22328601 gtgtttacaattgtttcccaactttaggatctaaccccccaaaagagaaccaacccttagc 22328661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 20 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 25616010 - 25615807
Alignment:
Q  20 ttcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaat--gttacaagaaattag 116  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||    
T  25616010 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctctaatccactatcaatgagttcttacaaaatgatacaaatgggttacaagaaattag 25615911  T
Q  117 cttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgttta 216  Q
    ||| ||||| | |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||          ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25615910 cttaaacaagcgcacatagaacaaacctaatttctacccattttcccaatct----------caagacactcaatgattttctctcacccaaggtgttta 25615821  T
Q  217 caattgttttccaac 231  Q
    ||| |||||||||||    
T  25615820 caa-tgttttccaac 25615807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 66 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 31518905 - 31518739
Alignment:
Q  66 tccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttccc 163  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  31518905 tccactgtcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaactagcttcaataagctcacaaagaacaaacctaatttctacctattttccc 31518806  T
Q  164 aatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgttttccaac 231  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  31518805 aatctcaccaatgaacaagacactcgatgattttcactcacccaaggtgtttacga-tgttttccaac 31518739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 4178921 - 4178729
Alignment:
Q  28 aacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaa 125  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||   |||    
T  4178921 aacttgacctgctctggaggagagattgaactgttcaatccactatcaatgagttctt-caaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttcccaa 4178823  T
Q  126 actcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 220  Q
      |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4178822 gttcacaaagaacaaccctaatttctaccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-ccaaggtgtttacaat 4178729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 220
Target Start/End: Original strand, 25766980 - 25767171
Alignment:
Q  28 aacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa---tgttacaagaaattagcttcaaca 124  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    ||||||||||||||||||  |||    
T  25766980 aacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttcaaaagagatacaaaaggggttacaagaaattagctttgaca 25767079  T
Q  125 aactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 220  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||   ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25767080 agttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttttccaatct---caatgaacaagacactcaatgattttcactca-ccaaggtgtttacaat 25767171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 231
Target Start/End: Original strand, 36574510 - 36574740
Alignment:
Q  2 caagaaatgttcacacaattcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaa 100  Q
    ||||||||||| || || || ||||||| |||||||||||| |||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  36574510 caagaaatgtttacccagtttggtccaaattgacctactctagggatg-gattgatctctccaaaccactatcaatgagttctttacaaagagatataaa 36574608  T
Q  101 tg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgatttt 197  Q
     |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||  ||| ||||||||| ||||  ||||| |||||| || |||||    
T  36574609 agggttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaatcttaatttctacc--tttccccaatctctccaataaacaagacactcgataatttt 36574706  T
Q  198 cactcacccaaggtgtttacaattgttttccaac 231  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  36574707 cactcacctaaggtgtttacaaatgttttccaac 36574740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 48408981 - 48408757
Alignment:
Q  1 ccaagaaat-gttcacacaattcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaa-gagatac 97  Q
    ||||||||| |||||| || ||||||| || |||||| |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||    
T  48408981 ccaagaaattgttcacccagttcggtctaaacttgacatactctggaggagagattaaactctccaatccactatcaatgagttatttcaaaagagatac 48408882  T
Q  98 aaatg---ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgat 194  Q
    ||| |   |||||||||||||||||  ||||  | ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  48408881 aaaaggggttacaagaaattagctttgacaagtttacaaagaacaacattaatttctaccctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgat 48408782  T
Q  195 tttcactcacccaaggtgtttacaat 220  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||    
T  48408781 tttcactca-ccaaggtgtttacaat 48408757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 31519078 - 31518911
Alignment:
Q  1 ccaagaaatgttcacacaattcggtccaacttgacctactctgggg-gagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaa 99  Q
    |||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31519078 ccaagaaatgtttatccagttcggtccaacttgacctactctggggagagagattgatctctccaatccactgtcaatgagttcttacaaagagatacaa 31518979  T
Q  100 at--gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaat 166  Q
    ||  |||||||| || ||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  31518978 atgagttacaag-aactagcttcaataagctcacagagaacaaacctaatttctacctattttcccaat 31518911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 20 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 23344129 - 23343934
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||| | |||||||||||||| ||||||| |||| || |  |||||||||||||||    
T  23344129 ttcggtccaacttgacctactctggg--agagattaatttctccaatctattatcaatgagttctcacaaagatatactaaagggttacaagaaattagc 23344032  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaaccct-aatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgttt 215  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23344031 ttcaacaagctcacaaagaataaaccttaatttctaccc-ttttccaaatctcaccaatgaactagacattcaatgattttcactcacccaaggtgttt 23343934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 20 - 148
Target Start/End: Original strand, 2759209 - 2759339
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaat--gttacaagaaattagc 117  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  2759209 ttcggtccaacttgacctaatctggggaagagattgatatctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatataaatgagttacaagaaattagc 2759308  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatt 148  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  2759309 ttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatt 2759339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 9 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 39731537 - 39731331
Alignment:
Q  9 tgttcacacaattcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaa--tgtt 104  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||    
T  39731537 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaagagtt 39731438  T
Q  105 acaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcac 204  Q
    |||||||||||| |   ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||       ||| |||||||||||||||||||||     
T  39731437 acaagaaattagatctgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccc-tttttccaatctcac-------caagacactcaatgattttcactca- 39731347  T
Q  205 ccaaggtgtttacaat 220  Q
    ||||||||||||||||    
T  39731346 ccaaggtgtttacaat 39731331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 102 - 221
Target Start/End: Original strand, 4538636 - 4538755
Alignment:
Q  102 gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcact 201  Q
    |||||||||||||||||| || ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  4538636 gttacaagaaattagcttaaaaaatttcataaagaacaaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcact 4538735  T
Q  202 cacccaaggtgtttacaatt 221  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  4538736 cacccaaggtgtttacaatt 4538755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 102 - 220
Target Start/End: Original strand, 24525992 - 24526111
Alignment:
Q  102 gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaac-cctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcac 200  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  24525992 gttacaagaaattagctttgacaagctcacaaagaacaaaacctaatttctacccattttcccaatttcaccaatgaacaagacactcaatgattttcac 24526091  T
Q  201 tcacccaaggtgtttacaat 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  24526092 tcacccaaggtgtttacaat 24526111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 131
Target Start/End: Original strand, 6359964 - 6360077
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaat--gttacaagaaattagc 117  Q
    |||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  6359964 ttcgatccaacttgacctaatatggggaagagattgatctctccaatcaactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagc 6360063  T
Q  118 ttcaacaaactcac 131  Q
    |||||||| |||||    
T  6360064 ttcaacaagctcac 6360077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 20344064 - 20343897
Alignment:
Q  9 tgttcacacaattcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatac-aaatgtta 105  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||    
T  20344064 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggtta 20343965  T
Q  106 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 174  Q
    ||||||||||||||  ||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20343964 caagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 20343897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 28 - 174
Target Start/End: Original strand, 43504174 - 43504323
Alignment:
Q  28 aacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaa---tgttacaagaaattagcttcaac 123  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    ||||||||||||||| ||  ||    
T  43504174 aacttgacctactatggaggagagattgaactctccaattcactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaaagagttacaagaaattagatttgac 43504273  T
Q  124 aaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 174  Q
    ||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43504274 aagttcacaatgaacaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 43504323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 20 - 225
Target Start/End: Original strand, 3904628 - 3904836
Alignment:
Q  20 ttcggtccaact-tgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaa--tgttacaagaaatta 115  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  3904628 ttcggtccaacaatgacctactctgagggagagattgatctctctgat-cactatcaatgagttctttacaaagagatgcaaaagtgttacaagaaatta 3904726  T
Q  116 gcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctc-accaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgt 213  Q
      ||||| |  ||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  3904727 cattcaataggctctcaaagaacaaaacctaatttcta-ccattttcccaatctcttcctaagaacaagagactcaatga-tttcactcgcccaaggtgt 3904824  T
Q  214 ttacaattgttt 225  Q
    |||||| |||||    
T  3904825 ttacaaatgttt 3904836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 24 - 102
Target Start/End: Original strand, 24525518 - 24525596
Alignment:
Q  24 gtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg 102  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24525518 gtccaacttgacctaatcttggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg 24525596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 24790009 - 24789841
Alignment:
Q  9 tgttcacacaattcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatac-aaatgtta 105  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||| ||||||||    
T  24790009 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagatagtactctccaatccactatcaaagagtttttacaaaagggatacaaaatgtta 24789910  T
Q  106 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 174  Q
    ||||||||||||||  ||||  |||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  24789909 caagaaattagctttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttttaccc-ttttcccaatcttaccaa 24789841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 167 - 270
Target Start/End: Original strand, 6360073 - 6360175
Alignment:
Q  167 ctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaaccctt 266  Q
    |||||||| ||||||  |||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6360073 ctcaccaatgaacaagtcactca-tgattttcattctcccaaggtgtttaaaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaaccctt 6360171  T
Q  267 agcc 270  Q
    ||||    
T  6360172 agcc 6360175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 42 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 5116739 - 5116625
Alignment:
Q  42 tgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac 138  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||| |||||| ||||||||||||  | ||||||    
T  5116739 tgggggagagatttatctctccaattcactatcaatgagttctttacaaagagatacaaaaggtttacaataaattatcttcaacaaactatccaagaac 5116640  T
Q  139 aaccctaatttctac 153  Q
    || ||||||||||||    
T  5116639 aaacctaatttctac 5116625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 18396488 - 18396338
Alignment:
Q  7 aatgttcacacaattcggtccaac-ttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatac-aaatgt 103  Q
    |||||| || || ||||||||| | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||| ||||||    
T  18396488 aatgtttacccagttcggtccaccattgacctactcttgaggagagattgatctctccaatcctctatcaatgaattctttataaagagatacaaaatgt 18396389  T
Q  104 tacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctac 153  Q
    ||||| ||| ||| |||||||||||| | |||||| || ||||||||||||    
T  18396388 tacaaaaaaataggttcaacaaactctccaagaacaaaacctaatttctac 18396338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 143 - 220
Target Start/End: Original strand, 2761439 - 2761516
Alignment:
Q  143 ctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 220  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2761439 ctaatttctaccaattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcgatgattttcactcacccaatgtgtttacaat 2761516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 9 - 174
Target Start/End: Original strand, 6592340 - 6592509
Alignment:
Q  9 tgttcacacaattcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaa-atgt 103  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| | ||    
T  6592340 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggt 6592439  T
Q  104 tacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 174  Q
    ||||||||||||||||  ||||  |||| | |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6592440 tacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccca-tttcccaatctcaccaa 6592509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 9 - 174
Target Start/End: Original strand, 18388760 - 18388929
Alignment:
Q  9 tgttcacacaattcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaa-atgt 103  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| | ||    
T  18388760 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggt 18388859  T
Q  104 tacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 174  Q
    ||||||||||||||||  ||||  |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  18388860 tacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 18388929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 9 - 174
Target Start/End: Original strand, 18392196 - 18392365
Alignment:
Q  9 tgttcacacaattcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaa-atgt 103  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| | ||    
T  18392196 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggt 18392295  T
Q  104 tacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 174  Q
    ||||||||||||||||  ||||  |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  18392296 tacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 18392365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 20 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 30814592 - 30814530
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt 82  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30814592 ttcggtccaacttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt 30814530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 83 - 261
Target Start/End: Original strand, 1360226 - 1360409
Alignment:
Q  83 cttacaaagagatacaaat----gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcac-caaaga 177  Q
    ||||||||||||||||||     ||||||||||||| ||||||||||  || | ||||  || |||||||||||||  ||||||||||||||  | | ||    
T  1360226 cttacaaagagatacaaaaaagggttacaagaaattcgcttcaacaagttctccaagacaaaacctaatttctacct-ttttcccaatctcattccatga 1360324  T
Q  178 acaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac-aattgttttccaactctagaatctaa-ccaccaaaagagaaccaa 261  Q
    |||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  1360325 acaagagactcaatgattt-cactcaccaaaggtgtttcccaattgtttttcaactctagaatctaaccccccaaaagagaaccaa 1360409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 174
Target Start/End: Original strand, 6594558 - 6594727
Alignment:
Q  9 tgttcacacaattcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaa-atgt 103  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| | ||    
T  6594558 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggt 6594657  T
Q  104 tacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 174  Q
    ||||||||||||||||  ||||  |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  6594658 tacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 6594727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 20 - 174
Target Start/End: Original strand, 32060333 - 32060493
Alignment:
Q  20 ttcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttctt-acaaagag---atacaa-atgttacaagaaa 112  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||   |||||| | |||||||||||    
T  32060333 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaaggggatacaagaggttacaagaaa 32060432  T
Q  113 ttagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 174  Q
    |||||||  ||||  |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  32060433 ttagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 32060493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 157 - 220
Target Start/End: Original strand, 24514912 - 24514974
Alignment:
Q  157 ttttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 220  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24514912 ttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-ccaaggtgtttacaat 24514974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 110 - 231
Target Start/End: Original strand, 5514113 - 5514234
Alignment:
Q  110 aaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccc-taatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaa 208  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||| | |||| | |||||| | || |||||| | ||||||||||||||||||| | ||    
T  5514113 aaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaacataatttctactcttttttc-aatctctcaaatgaacaagaaactcaatgattttcactcatcgaa 5514211  T
Q  209 ggtgtttacaattgttttccaac 231  Q
    ||||||||||| ||||| |||||    
T  5514212 ggtgtttacaagtgtttcccaac 5514234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 20 - 90
Target Start/End: Original strand, 1560677 - 1560749
Alignment:
Q  20 ttcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaa 90  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1560677 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 1560749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 96
Target Start/End: Original strand, 5513661 - 5513755
Alignment:
Q  2 caagaaatgttcacacaattcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagata 96  Q
    ||||||||||| || || ||| |||||| |||||||||||||| || ||||||||| |||||||| || | ||||||||||| |||||||||||||    
T  5513661 caagaaatgtttacccagttcagtccaaattgacctactctggaggtgagattgat-tctccaattcagtgtcaatgagttctttacaaagagata 5513755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 26639469 - 26639264
Alignment:
Q  32 tgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagata----caaatg--ttacaagaaattagcttcaaca 124  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| || |||| || |||    |||| |  ||||||||||||| | ||||||    
T  26639469 tgacatactatggaggagagattgatctctctaatccattatcaaagagttatttacaatgatatatatacaaaagggttacaagaaattaacatcaaca 26639370  T
Q  125 aactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc-accaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgt 223  Q
    ||||| | |||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||  || || || || | ||||||||||||| ||||||| || |||||||||| |||    
T  26639369 aactctccaagaacatacctaatttcta-ccattttcacaatctcttcccaaaaagaagagactcaatgatttt-actcacctaaagtgtttacaaatgt 26639272  T
Q  224 tttccaac 231  Q
    || |||||    
T  26639271 ttcccaac 26639264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 27073925 - 27073778
Alignment:
Q  68 cactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttccca 164  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||  |  ||||||||| ||||| |||    
T  27073925 cactgtcaacgagttctttacaaagagatacaaaagagttacaagaaattaacttcaataaactcataacgaacaaaacatatttctaccaatttt-cca 27073827  T
Q  165 atctc-accaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgt 213  Q
    || ||  || |||||||||| | ||||||| ||||||||| |||||||||    
T  27073826 atgtcttcccaagaacaaaagattcaatga-tttcactcatccaaggtgt 27073778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 213
Target Start/End: Original strand, 27204388 - 27204535
Alignment:
Q  68 cactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttccca 164  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||  |  ||||||||| ||||| |||    
T  27204388 cactgtcaacgagttctttacaaagagatacaaaagagttacaagaaattaacttcaataaactcataacgaacaaaacatatttctaccaatttt-cca 27204486  T
Q  165 atctc-accaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgt 213  Q
    || ||  || |||||||||| | ||||||| ||||||||| |||||||||    
T  27204487 atgtcttcccaagaacaaaagattcaatga-tttcactcatccaaggtgt 27204535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 225
Target Start/End: Original strand, 30843389 - 30843451
Alignment:
Q  163 caatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgttt 225  Q
    ||||||| |||| |||||| | ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||    
T  30843389 caatctctccaatgaacaagatactcaatgattttaactcatctaaggtgtttacaaatgttt 30843451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 154
Target Start/End: Original strand, 43363518 - 43363622
Alignment:
Q  55 gatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaa--gagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaattt 149  Q
    ||||| |||| | ||||||||||||||| || |||||  |||||||||| |  |||||| ||||||| |||||||| ||| | |||||||| ||||||||    
T  43363518 gatctatccacttcactatcaatgagttatttacaaatagagatacaaaagagttacaataaattagtttcaacaagctctccaagaacaaacctaattt 43363617  T
Q  150 ctacc 154  Q
    |||||    
T  43363618 ctacc 43363622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 102 - 163
Target Start/End: Original strand, 13065494 - 13065555
Alignment:
Q  102 gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttccc 163  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||  |||||||    
T  13065494 gttacaataaattagtttcaacaaactctcaaagtgcaatcctaatttctaccatttttccc 13065555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 203 - 247
Target Start/End: Original strand, 23794023 - 23794068
Alignment:
Q  203 acccaaggtgtttacaa-ttgttttccaactctagaatctaaccac 247  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23794023 acccaatgtgtttacaaattgtttttcaactctagaatctaaccac 23794068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 103 - 174
Target Start/End: Original strand, 1562103 - 1562173
Alignment:
Q  103 ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 174  Q
    |||||||||||||||||  ||||  |||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1562103 ttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 1562173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 93)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 40632620 - 40632353
Alignment:
Q  1 ccaagaaatgttcacacaattcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 100  Q
    |||||||||||| || || |||||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40632620 ccaagaaatgtttacccagttcggtccaacttgacttactttagaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 40632521  T
Q  101 t--gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttc 198  Q
    |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  40632520 taggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaactctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttc 40632422  T
Q  199 actcacccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaaccctta 267  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40632421 actctcccaaggtgtttacaattgtttctcaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaaccctta 40632353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 20 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 54883176 - 54882925
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagc 117  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  54883176 ttcggtccaacttgacttaatctggaggagagattgatccctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagc 54883077  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 217  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  54883076 ttcaacaagctcacaaaaaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttac 54882978  T
Q  218 aattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcc 270  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  54882977 aattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcc 54882925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Original strand, 50673840 - 50674109
Alignment:
Q  1 ccaagaaatgttcacacaattcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 100  Q
    |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50673840 ccaagaaatgttcacctagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 50673939  T
Q  101 t--gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttc 198  Q
    |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||  |||||| |||||||||    
T  50673940 tgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaag-acaatcctaatttctactcattttctcaatctcacaaatgaacacgacactc-atgattttc 50674037  T
Q  199 actcacccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcc 270  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  50674038 actctcccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcc 50674109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 6656131 - 6655861
Alignment:
Q  1 ccaagaaatgttcacacaattcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6656131 ccaagaaatgttcacccaattcggtccaacttgacctactctggatgagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 6656032  T
Q  101 t--gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttc 198  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |  |||||| |||||| |||||||||    
T  6656031 tgagttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccttaatttctacccattttttcaatctcacaagtgaacaagacactc-atgattttc 6655933  T
Q  199 actcacccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcc 270  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||    
T  6655932 actctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaaccccaaaaagagaaacaacctttagcc 6655861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 41964591 - 41964320
Alignment:
Q  1 ccaagaaatgttcacacaattcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 100  Q
    |||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41964591 ccaagaaatgctcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaa 41964492  T
Q  101 t---gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgatttt 197  Q
        ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||   |||||    
T  41964491 atgggttacaataaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatttcaccaacgaacaagacactcatgaatttt 41964392  T
Q  198 cactcacccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcc 270  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41964391 cactttcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacc-ccaaaagagaaccaacccttagcc 41964320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 12073568 - 12073298
Alignment:
Q  1 ccaagaaatgttcacacaattcggtccaact-tgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaa 99  Q
    |||||||||||||||  | |||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12073568 ccaagaaatgttcacctagttcggtccaacaatgacctactctggaagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaa 12073469  T
Q  100 atg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgatttt 197  Q
    |||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||| |||||||    
T  12073468 atgagttacaataaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccattttcccaatctcaccaataagcaagacactca-tgatttt 12073370  T
Q  198 cactcacccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagc 269  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12073369 cacactcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagc 12073298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 8665583 - 8665320
Alignment:
Q  1 ccaagaaatgttcacacaattcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 100  Q
    ||||||||||| |||  | || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8665583 ccaagaaatgtacacctagtttggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 8665484  T
Q  101 tg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttc 198  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||   ||||||    
T  8665483 tgggttacaagaaattagcttcaacaagctctcaaagaacaaccctaatttctacccattttcccattctcaccaatgaacaagacactcatgaattttc 8665384  T
Q  199 actcacccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaac 262  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  8665383 actcttccaaggtgtttacaattgtttcccaactccagaatctaacccccaaaagaaaaccaac 8665320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 35662616 - 35662346
Alignment:
Q  1 ccaagaaatgttcacacaattcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 100  Q
    |||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35662616 ccaaaaaatgttcattcagttcggtccaacttgacctactcttgaggagatattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 35662517  T
Q  101 t--gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatga-tttt 197  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||    
T  35662516 tgagttacaagaaattagcttcaacaaactcataaagaacaaccctaatttctacccattttttcaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttt 35662418  T
Q  198 cactcacccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagc 269  Q
    ||| | | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  35662417 cacactctcaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacacccaaaagagaaccaacccttagc 35662346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 9 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 2209882 - 2209618
Alignment:
Q  9 tgttcacacaattcggtccaact-tgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaat---gtt 104  Q
    ||||||| || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||    
T  2209882 tgttcacccagttcggtccaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaatgggtt 2209783  T
Q  105 acaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcac 204  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||||| |    
T  2209782 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaaaaaccctaatttctacccattttcccaatctcaacaatgaacaagacactc-atgattttcactctc 2209684  T
Q  205 ccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcc 270  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  2209683 ccaaggtgtttacaattatttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccatagcc 2209618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 46703677 - 46703412
Alignment:
Q  1 ccaagaaatgttcacacaattcggtccaact-tgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaa 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  46703677 ccaagaaatgttcacccaattcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactataaatgagttcttacaaagagatacaa 46703578  T
Q  100 at---gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattt 196  Q
    |    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||   ||||    
T  46703577 aatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctactcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgaattt 46703478  T
Q  197 tcactcacccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaac 262  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  46703477 tcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaacactataatctaacccccaaaagagaaccaac 46703412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 41639601 - 41639345
Alignment:
Q  1 ccaagaaatgttcacacaattcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 100  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  41639601 ccaagaaatgttcactcagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcgatgagttcttacaaatagatacaaa 41639502  T
Q  101 t--gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttc 198  Q
    |  ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| ||||||  ||||||||    
T  41639501 tgggttacaagaaattagcttcaaaaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatcttaccaataaacaagacactc-gtgattttc 41639403  T
Q  199 actcacccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagaga 256  Q
    |||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41639402 actctcctaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagaga 41639345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 8648314 - 8648051
Alignment:
Q  1 ccaagaaatgttcacacaattcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 100  Q
    ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8648314 ccaagaaatgttcacccagtttggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccaatatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 8648215  T
Q  101 tg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttc 198  Q
    ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||   ||||||    
T  8648214 tgggttataagaaattagcttcaacaaactcacaatgaacaaccctaatttctatccattttcccattctcaccaatgaacaagacactcatgaattttc 8648115  T
Q  199 actcacccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaac 262  Q
    ||||  |||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8648114 actcttccaaggtgtttacagttgtttcctaactccagaatctaacccccaaaagagaaccaac 8648051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Original strand, 26175648 - 26175850
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagc 117  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||     
T  26175648 ttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagt 26175747  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 217  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26175748 ttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctccccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 26175847  T
Q  218 aat 220  Q
    |||    
T  26175848 aat 26175850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 379556 - 379283
Alignment:
Q  1 ccaagaaatgttcacacaattcggtccaact-tgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaa 99  Q
    ||||||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  379556 ccaagaaatgttcatccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaattagttcttacaaagcgatacaa 379457  T
Q  100 atg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatga-ttt 196  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| | ||| | ||| |||    
T  379456 atgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccattttctcaatctcacaaatgaacaagatactaattgaattt 379357  T
Q  197 tcactcacccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcc 270  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  379356 tcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccacaaaagagaaccaacccttagcc 379283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 20 - 268
Target Start/End: Original strand, 27416977 - 27417222
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaat--gttacaagaaattagc 117  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  27416977 ttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagc 27417076  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 217  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| |||    |||||||    
T  27417077 ttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacacattttaccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctccc----tgtttac 27417171  T
Q  218 aattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttag 268  Q
    ||||||||   ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27417172 aattgtttcaaaactcaagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttag 27417222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 36994680 - 36994478
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagc 117  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  36994680 ttcggtccaacttgatctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgggttacaagaaattagc 36994581  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 217  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36994580 ttcaacaagctcacaaagaacaaccttaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 36994481  T
Q  218 aat 220  Q
    |||    
T  36994480 aat 36994478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 20 - 216
Target Start/End: Original strand, 47038423 - 47038619
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg-ttacaagaaattagct 118  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  47038423 ttcggtccaacttgacttactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtccttacaaacagatacaaatgattacaagaaattagct 47038522  T
Q  119 tcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgttta 216  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47038523 tcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatttt-ccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgttta 47038619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 5429835 - 5429633
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagc 117  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||    
T  5429835 ttcggtccaacttaacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatagatacaaatgggttacaagaaattagc 5429736  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 217  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5429735 ttcaacaagctcacgaagaataaccctaatttctactcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 5429636  T
Q  218 aat 220  Q
    |||    
T  5429635 aat 5429633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Original strand, 9927470 - 9927671
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagc 117  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  9927470 ttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagc 9927569  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 217  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  9927570 ttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaataagacactcagtgattttcactca-ccaaggtgtttac 9927668  T
Q  218 aat 220  Q
    |||    
T  9927669 aat 9927671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Original strand, 48893650 - 48893856
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaat--gttacaagaaattagc 117  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  48893650 ttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaagagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagc 48893749  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaa----gaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgt 213  Q
    |||||||| ||||||||    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48893750 ttcaacaagctcacaaacaatgaacaaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgt 48893849  T
Q  214 ttacaat 220  Q
    |||||||    
T  48893850 ttacaat 48893856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 20 - 233
Target Start/End: Original strand, 36463401 - 36463615
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagc 117  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  36463401 ttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactgtcaaagagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagc 36463500  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 217  Q
    |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36463501 ttcaacaagctcacaatgaacagccctaatttctatccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgaatttcactcacccaaggtgtttac 36463600  T
Q  218 aattgttttccaactc 233  Q
    || ||||| |||||||    
T  36463601 aa-tgtttcccaactc 36463615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 24 - 220
Target Start/End: Original strand, 54199922 - 54200120
Alignment:
Q  24 gtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttca 121  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  54199922 gtccaacttgacctaatctgggggagagaatgatctctctaattcactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttca 54200021  T
Q  122 acaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 220  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  54200022 acaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaatgtgtttacaat 54200120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 9 - 220
Target Start/End: Original strand, 56178637 - 56178850
Alignment:
Q  9 tgttcacacaattcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--tta 105  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  56178637 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtta 56178736  T
Q  106 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 205  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  56178737 caagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-c 56178835  T
Q  206 caaggtgtttacaat 220  Q
    |||||||||||||||    
T  56178836 caaggtgtttacaat 56178850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 31474326 - 31474104
Alignment:
Q  1 ccaagaaatgttcacacaattcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 100  Q
    |||||| ||||| || || ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31474326 ccaagatatgtttacccagttcggtccaacttgatctactctggtggagagatttatctctccaatcaactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 31474227  T
Q  101 t--gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaa-ccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgatttt 197  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  31474226 tgagttacaagaaattagcttcaacaaactcaaaaagaacaagacctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgatttt 31474127  T
Q  198 cactcacccaaggtgtttacaat 220  Q
    ||||||||||| |||||||||||    
T  31474126 cactcacccaaagtgtttacaat 31474104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Original strand, 34570426 - 34570628
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagc 117  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  34570426 ttcgatccaacttaacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaattgggttacaagaaattagc 34570525  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 217  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  34570526 ttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacctattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaagatgttttc 34570625  T
Q  218 aat 220  Q
    |||    
T  34570626 aat 34570628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 9 - 270
Target Start/End: Original strand, 50262701 - 50262961
Alignment:
Q  9 tgttcacacaattcggtccaact-tgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--tta 105  Q
    ||||||| || |||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  50262701 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggaaagattgatatctccaatcaactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 50262800  T
Q  106 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||  |||   ||| ||||||| |||||||||||| ||    
T  50262801 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccgtaatttcgatccattttcccaatctcaataaa---caagacactca-tgattttcactctcc 50262896  T
Q  206 caaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcc 270  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  50262897 caaggtatttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaaccattagcc 50262961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 9 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 37740792 - 37740580
Alignment:
Q  9 tgttcacacaattcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaat--gttac 106  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  37740792 tgttgacacagttcggtccaacttgaccaaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttac 37740693  T
Q  107 aagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcaccc 206  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||    
T  37740692 aagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttataccctttttccaaatctcaccaatgaacaagacactcagtgattttcactca-cc 37740594  T
Q  207 aaggtgtttacaat 220  Q
    ||||||||||||||    
T  37740593 aaggtgtttacaat 37740580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Original strand, 12739562 - 12739764
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagc 117  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||    
T  12739562 ttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcatacaaatagatacaaatgggttacaagaaattagc 12739661  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 217  Q
    ||  ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  12739662 tttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgatttccactcacctaaggtgtttac 12739761  T
Q  218 aat 220  Q
    |||    
T  12739762 aat 12739764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 9 - 220
Target Start/End: Original strand, 52095363 - 52095576
Alignment:
Q  9 tgttcacacaattcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--tta 105  Q
    ||||||| || |||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  |||    
T  52095363 tgttcacccagttcggtccaaacttg-cctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaaagatttcttacaaagagatacaaatgggtta 52095461  T
Q  106 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 205  Q
    ||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  52095462 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 52095561  T
Q  206 caaggtgtttacaat 220  Q
    |||||||||||||||    
T  52095562 caaggtgtttacaat 52095576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 20 - 231
Target Start/End: Original strand, 52467366 - 52467579
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagc 117  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||    
T  52467366 ttcggtccaacttgacctaatctcggggagagattgatctctccaatccactatcaaaaagttattacaaagtgatacaaatgggttacaagatattagc 52467465  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 217  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52467466 ttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccattttcccaacctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 52467565  T
Q  218 aattgttttccaac 231  Q
    || ||||| |||||    
T  52467566 aaatgtttcccaac 52467579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 37229714 - 37229947
Alignment:
Q  1 ccaagaaatgttcacacaattcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 100  Q
    |||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  37229714 ccaagaaatgtttacctagttcggtccaacttgacctactatgagggagagattgatctctccaatccactataaatgagttcttacaaagagatataaa 37229813  T
Q  101 ---tgttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaaca-accctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattt 196  Q
        ||||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  37229814 aagggttacaacaaatttgctttaacaagctcacaaagaacacaccctaatttcta-ccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcattgattt 37229912  T
Q  197 tcactcacccaaggtgtttacaattgttttccaac 231  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37229913 tcactcacccaaggtgtttacaaatgttttccaac 37229947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 28 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 48143191 - 48142996
Alignment:
Q  28 aacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgttacaagaaattagcttcaacaa 125  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  48143191 aacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttatgaagagatacaaaagggttacaagaaattagcttcaacaa 48143092  T
Q  126 actcacaaagaacaaccctaatttctacc-cattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 220  Q
      |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48143091 gttcacaaagaacaaccctaatttctacctttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 48142996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 5871976 - 5871774
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagc 117  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||  |||||||||||| ||    
T  5871976 ttcggtcaaacttgacctaatctgggggagagattgatctctctaatccactatcaaagagttcttgcaaagtgataaaaatgggttacaagaaatttgc 5871877  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 217  Q
    || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5871876 ttaaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 5871777  T
Q  218 aat 220  Q
    |||    
T  5871776 aat 5871774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 6542172 - 6542395
Alignment:
Q  1 ccaagaaatgttcacacaattcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 100  Q
    |||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6542172 ccaagaaatgtttacccagttcggtccaacttgacctaccctgggggagagattgatctctccaatccactatcaacgagttcttacaaagagatacaaa 6542271  T
Q  101 tg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacc-cattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattt 196  Q
     |  | |||||||||||| |||||||| |||||||||||| || |||||||||||||   ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||    
T  6542272 aggctaacaagaaattagtttcaacaagctcacaaagaacaaatcctaatttctaccattttttcccaatctccccaatgaacaagacactcaataattt 6542371  T
Q  197 tcactcacccaaggtgtttacaat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  6542372 tcactcacccaaggtgtttacaat 6542395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 50 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 24969238 - 24969055
Alignment:
Q  50 agattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaat 147  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||    
T  24969238 agatttatctctccaatccactatcaattagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaatctaat 24969139  T
Q  148 ttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgttttccaac 231  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  24969138 ttctacccatttttccaatctcaccaaagaacaagactctcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaaatgtttcccaac 24969055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 20 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 12119696 - 12119445
Alignment:
Q  20 ttcggtccaact-tgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatg--ttacaagaaatta 115  Q
    |||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  12119696 ttcggtccaacaatgacctactcttggg-agagattgatctctccaatccactataaatgagttctttacaaagagatacaaaagggttacaagaaatta 12119598  T
Q  116 gcttcaacaaactcacaaagaacaaccc-taatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtt 214  Q
    ||||||| ||  ||||||||||||| || |||||||||| | |||| ||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| ||    
T  12119597 gcttcaaaaagttcacaaagaacaaaccataatttctactcttttttccaatctcacctatgaacaagacactcattgattttcactctcccaaggtatt 12119498  T
Q  215 tacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaaccctta 267  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12119497 tacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaaccctta 12119445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 40 - 218
Target Start/End: Original strand, 12745468 - 12745648
Alignment:
Q  40 tctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaa 137  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||  ||||  ||||||||||    
T  12745468 tctggggaagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagttttgacaagttcacaaagaa 12745567  T
Q  138 caaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttaca 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12745568 caaccctaatttctacccattttcctaatctcgccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttaca 12745648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 45 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 3913579 - 3913408
Alignment:
Q  45 gggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaacc 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  3913579 gggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagatatacaaatgggttaaaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacagct 3913480  T
Q  143 ctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtt 214  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3913479 ctaatttctactcattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtt 3913408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 29254650 - 29254448
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagc 117  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||| |    
T  29254650 ttcggtccaacttgacctaatttgggagagagattgatctctccaatccactatcaacgagttcttacaaagagacacaaatgggttgcaagaaattaac 29254551  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 217  Q
    |||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  29254550 ttcaacaagctcataaaaaacaactctaatttctacccaatttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcattcacccaatgtgtttac 29254451  T
Q  218 aat 220  Q
    |||    
T  29254450 aat 29254448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 28 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 26364384 - 26364223
Alignment:
Q  28 aacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaa 125  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  26364384 aacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactattaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaa 26364285  T
Q  126 actcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacact 187  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  26364284 gttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacact 26364223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 21688425 - 21688186
Alignment:
Q  1 ccaagaaat-gttcacacaattcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaa 99  Q
    ||||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||||||    
T  21688425 ccaagaaattgttgactcaattcggtctaacttgacctaatctaggggagggattgatctctccaattcattatcaatgagttcttccgaagagatacaa 21688326  T
Q  100 at--gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctaccca-ttttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattt 196  Q
    ||  ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||||| |||||| |||||||    
T  21688325 atgagttacaaaaaattagtttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatttttctcaatctcaccgatgaacaagacactc-atgattt 21688227  T
Q  197 tcactcacccaaggtgtttacaattgttttccaactctaga 237  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  21688226 tcactcccccaaggtgtttagaattgtttcccaactctaga 21688186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 85 - 270
Target Start/End: Original strand, 55085442 - 55085628
Alignment:
Q  85 tacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaa 182  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||     
T  55085442 tacaaagagatacaaatggtttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccttaatttctacctattttcc-aatctcaccaatgaacaag 55085540  T
Q  183 acactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcc 270  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  55085541 acagtcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgtttccgaactctagaatctaacccccaaaggagaatcaacccttagcc 55085628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 5 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 4588130 - 4587912
Alignment:
Q  5 gaaatgttcacacaattcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tg 102  Q
    |||||||| || || || |||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  4588130 gaaatgtttacccagtttggtccaacttcacctattatgggggagagattgttctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaaggg 4588031  T
Q  103 ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcact 201  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || | |||||||||||  |||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  4588030 ttacaagaaattagcttcaacaagcttacaaagaacaaatcttaatttctaccttttttcccaatttcaccaatgaacatgacactcaatgattttcact 4587931  T
Q  202 cacccaaggtgtttacaat 220  Q
    |||||||||||||||||||    
T  4587930 cacccaaggtgtttacaat 4587912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 44 - 220
Target Start/End: Original strand, 12747792 - 12747970
Alignment:
Q  44 ggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaac 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  12747792 ggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcatacaaatagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaac 12747891  T
Q  142 cctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 220  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  12747892 cctaatttctatccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgatttccactcacctaaggtgtttacaat 12747970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 7 - 220
Target Start/End: Original strand, 29999804 - 30000019
Alignment:
Q  7 aatgttcacacaattcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaa--tg 102  Q
    ||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||   |    
T  29999804 aatgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaaaagatacaaaagag 29999903  T
Q  103 ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactc 202  Q
    |||||||||||||||||  |||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  29999904 ttacaagaaattagctttgacatgttcacaaagaacaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaacgattttcactc 30000002  T
Q  203 acccaaggtgtttacaat 220  Q
    | ||||||||||||||||    
T  30000003 a-ccaaggtgtttacaat 30000019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 20 - 190
Target Start/End: Original strand, 46147403 - 46147575
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaat--gttacaagaaattagc 117  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  46147403 ttcggtccaacttgacctaatttgggggagagattgatgtctccaatccactatcaaagagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagc 46147502  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaa 190  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| ||| ||||    
T  46147503 ttcaacaagctcacaatgaacaaccctaatttctacccatttttccaatctcaccgatgaacaagacaatcaa 46147575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 5207835 - 5208066
Alignment:
Q  1 ccaagaaatgttcacacaattcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaa--agagataca 98  Q
    |||| ||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||    
T  5207835 ccaataaatgtttacccaattcagtccaaattgacctactctgggagagagattgatctttccaatccactatcaatgagttcttacaaatagatataca 5207934  T
Q  99 aatgttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgatttt 197  Q
    |  ||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| | |||| ||||||  |||| |||||||||    
T  5207935 agggttgcaataaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaaccctaatttctaccc-tttttccaatcactccaatgaacaagtcactaaatgatttt 5208033  T
Q  198 cactcacccaaggtgtttacaattgttttccaa 230  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  5208034 cactcacccaaggtgtttacaaatgtttcccaa 5208066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Original strand, 45687194 - 45687397
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaat--gttacaagaaattagc 117  Q
    |||||||||||||||| || | ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||    
T  45687194 ttcggtccaacttgacataatatggaggagagatagatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatagatacaaatgagttataagaaattagc 45687293  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgttta 216  Q
    ||  |||| |||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  45687294 tttgacaagctcacaaagaacaaaacctaatttcttcccattttcccaatctcaccaatgaacaagacaatcaaaaaatttcactcacccaaggtgttta 45687393  T
Q  217 caat 220  Q
    ||||    
T  45687394 caat 45687397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 3 - 263
Target Start/End: Original strand, 26699436 - 26699702
Alignment:
Q  3 aagaaatgttcacacaattcggtccaact-tgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaa 100  Q
    ||||||| || || || |||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  26699436 aagaaatttttacccagttcggtccaacaatgacctactctgggatagagattgatctctccaatccattataaatgagttctttacaaagagatacaaa 26699535  T
Q  101 tg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaa-ccctaatttctacccatt-ttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattt 196  Q
     |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| | ||||| || |||  |||||| | ||  ||||| ||| ||||||||||    
T  26699536 agagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccctaatctataccctttcttctgaatctctctaataaacaagacattcaatgattt 26699635  T
Q  197 tcactcacccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacc 263  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||||| | |||||||||||||||    
T  26699636 tcactcacccaaagtgtttacaattgtttcccaactttataatctaacccctaaaagagaaccaacc 26699702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 220
Target Start/End: Original strand, 5370083 - 5370300
Alignment:
Q  9 tgttcacacaattcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgtta 105  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  5370083 tgttcactcagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctctagtccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtta 5370182  T
Q  106 caagaaattagc-ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacc---cattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcact 201  Q
    |||||||||||| ||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||     |||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  5370183 caagaaattagcttttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacctcttttttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcact 5370282  T
Q  202 cacccaaggtgtttacaat 220  Q
    || |||| |||||||||||    
T  5370283 ca-ccaaagtgtttacaat 5370300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 5 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 51337235 - 51337008
Alignment:
Q  5 gaaatgttcacacaattcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg-- 102  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |      
T  51337235 gaaatgtttacccagttcggtccaacttgacctaatgtgtgggagagattgatctctctaatacactatcaatgagttcttaaaaagagatacaaaaggg 51337136  T
Q  103 ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaa--ccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcac 200  Q
    ||| || |||||| ||| ||  | ||||||||||||||  || |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  51337135 ttataataaattatcttaaa--agctcacaaagaacaaatccgtaatttctaccctttttctcaatctcaccaatgaacaggacactcaatgattttcac 51337038  T
Q  201 tcacccaaggtgtttacaattgttttccaac 231  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  51337037 tcacccaaggtgtttacaa-tgttttccaac 51337008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 28 - 220
Target Start/End: Original strand, 52082684 - 52082871
Alignment:
Q  28 aacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaa 125  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||       ||||||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||  ||||    
T  52082684 aacttgacctactctggaggagagaatgatctc-------cactatcaaagatttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagttttgacaa 52082776  T
Q  126 actcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 220  Q
      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52082777 gttcacaaagaacaaccctagtttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacagtcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 52082871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 20 - 161
Target Start/End: Original strand, 12743937 - 12744080
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaat--gttacaagaaattagc 117  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  12743937 ttcggtccaacttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagc 12744036  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttc 161  Q
    ||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12744037 tttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacctattttc 12744080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 20 - 161
Target Start/End: Original strand, 12745326 - 12745469
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaat--gttacaagaaattagc 117  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  12745326 ttcggtccaacttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagc 12745425  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttc 161  Q
    ||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12745426 tttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacctattttc 12745469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 9 - 220
Target Start/End: Original strand, 13009445 - 13009645
Alignment:
Q  9 tgttcacacaattcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgttacaa 108  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||        
T  13009445 tgttgacacagttcggtctaacttgacctaatttggaggagagatcgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgtt---- 13009540  T
Q  109 gaaattagcttcaacaaa-ctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcaccca 207  Q
        |||    ||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13009541 ----tta----caagaaagctcacgaagaacaaacctaatttctacccattttcacaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccca 13009632  T
Q  208 aggtgtttacaat 220  Q
    |||||||||||||    
T  13009633 aggtgtttacaat 13009645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Original strand, 13992304 - 13992499
Alignment:
Q  20 ttcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgttacaagaaattag 116  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||    
T  13992304 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttac-aagagatacaaaagagttacaagaaattag 13992402  T
Q  117 cttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctaccc-attttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgttt 215  Q
     ||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||       ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13992403 atttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttcactca-ccaaggtgttt 13992494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 32 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 33989989 - 33989766
Alignment:
Q  32 tgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt-cttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaact 128  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  33989989 tgacctactctggtggagagattgatctctccaatccactattaacgagttatttacaaagagatacaaaaggattacaagaaattagcttcaacaaact 33989890  T
Q  129 cacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgttttcc 228  Q
    | | |||||||| |||| ||||| |||||                  |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||    
T  33989889 ctctaagaacaaacctagtttcttcccat------------------gaacaaaacactcaataatttttactcaaccaaggtgtttacagttgtttccc 33989808  T
Q  229 aactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcc 270  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  33989807 aactctagaatctaacctccaaaagagaacaaatccttagcc 33989766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 40 - 154
Target Start/End: Original strand, 12744079 - 12744195
Alignment:
Q  40 tctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaat--gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaa 137  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||    
T  12744079 tctggggaagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaa 12744178  T
Q  138 caaccctaatttctacc 154  Q
    |||||||||||||||||    
T  12744179 caaccctaatttctacc 12744195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 174
Target Start/End: Original strand, 31495316 - 31495485
Alignment:
Q  9 tgttcacacaattcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaa---tgt 103  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    ||    
T  31495316 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatcaactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaaagagt 31495415  T
Q  104 tacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 174  Q
    ||||||||||||| ||  ||||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31495416 tacaagaaattagatttgacaagttcacaatgaacaatcctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 31495485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 29056534 - 29056301
Alignment:
Q  1 ccaagaaatgttcacacaattcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgag-ttcttacaaagagatacaa 99  Q
    ||||||| |||| ||||| ||||||| || | ||||||| ||||| ||||||| | |||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||| ||    
T  29056534 ccaagaagtgtttacacagttcggtcaaaatggacctacactgggtgagagataggtctctctaatccattatcaatgaggttgttacaaagagatataa 29056435  T
Q  100 atg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaacc-ctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattt 196  Q
    | |  || ||||||||||| |  ||||| | |||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||    
T  29056434 aaggattgcaagaaattagttctaacaagcacacaaagaacaaactctaattcctacc-attttcccaatctctctaatgaacaaaacactcaatgattt 29056336  T
Q  197 tcactcacccaaggtgtttacaattgttttccaac 231  Q
    | ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||    
T  29056335 ttactcacccaaggtgtttccaaatgtttcccaac 29056301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 88 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 41639351 - 41639214
Alignment:
Q  88 aaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaaca 185  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||    
T  41639351 aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaaaaagtttacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatcttaccaataaacaagaca 41639252  T
Q  186 ctcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgtt 224  Q
    |||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  41639251 ctc-gtgattttcactctcctaaggtgtttacaattgtt 41639214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 45 - 233
Target Start/End: Original strand, 48142412 - 48142605
Alignment:
Q  45 gggagagattgatctctccaatccactat--caatgagttctt-acaaagagata--caaatgttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaaca 139  Q
    ||||||||||||||| || |||| |||||  |||||||||||| |||||||||||  |||  ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  48142412 gggagagattgatctttcaaatctactatatcaatgagttctttacaaagagatatacaagggttacaagaaactagcttcaacaagctcacaaagaaca 48142511  T
Q  140 a-ccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgttttccaactc 233  Q
    | |||||||||||| | || |||||||||||| ||| |  ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||| || ||||| |||||||    
T  48142512 aaccctaatttctatc-atgttcccaatctcatcaatgggcaagacactcaatgattttcactcacccgaagtgtttaaaaatgtttcccaactc 48142605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Original strand, 22882744 - 22883010
Alignment:
Q  1 ccaagaaatgttcacacaattcggtccaact-tgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagataca 98  Q
    |||||||||||| |  || |||||||||||  |||||||||| ||||||||  ||||| |||| ||||||||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  22882744 ccaagaaatgtttatccagttcggtccaacaatgacctactccgggggaga--ttgatttctctaatccactaccaatgagttctttacgaagagataca 22882841  T
Q  99 aatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc-accaaagaacaaaacactcaatgatt 195  Q
    || |  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| || |||||||  |||||||   | | ||||||  ||||||||||||    
T  22882842 aaagggttacaagaaattagcttcaacaaactctccaagaacaaacctaatttttatccatttt-tcaatctctttccatgaacaaggcactcaatgatt 22882940  T
Q  196 ttcactcacccaaggtgtttac-aattgttttccaactctagaatctaa-ccaccaaaagagaaccaacc 263  Q
    ||||||  | ||| | |||  | ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  22882941 ttcactttctcaaagcgttacctaattgttttccaattctagaatctaaccccccaaaagagaaccaacc 22883010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Original strand, 22934408 - 22934674
Alignment:
Q  1 ccaagaaatgttcacacaattcggtccaact-tgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagataca 98  Q
    |||||||||||| |  || |||||||||||  |||||||||| ||||||||  ||||| |||| ||||||||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  22934408 ccaagaaatgtttatccagttcggtccaacaatgacctactccgggggaga--ttgatttctctaatccactaccaatgagttctttacgaagagataca 22934505  T
Q  99 aatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc-accaaagaacaaaacactcaatgatt 195  Q
    || |  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| || |||||||  |||||||   | | ||||||  ||||||||||||    
T  22934506 aaagggttacaagaaattagcttcaacaaactctccaagaacaaacctaatttttatccatttt-tcaatctctttccatgaacaaggcactcaatgatt 22934604  T
Q  196 ttcactcacccaaggtgtttac-aattgttttccaactctagaatctaa-ccaccaaaagagaaccaacc 263  Q
    ||||||  | ||| | |||  | ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  22934605 ttcactttctcaaagcgttacctaattgttttccaattctagaatctaaccccccaaaagagaaccaacc 22934674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 34 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 33090021 - 33089792
Alignment:
Q  34 acctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaa--tgttacaagaaattagcttcaacaaactca 130  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||   |||| || |||||||||||||||| |||     
T  33090021 acctactctagaggagagattgatctctctaatccactatcaatgagttctttacagagagatacaaaatggttataataaattagcttcaacaagctct 33089922  T
Q  131 caaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc-accaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgttttcca 229  Q
    | |||||||| | |||||||||  || | || |||||||  || | |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||          ||||| |||    
T  33089921 ccaagaacaaacataatttctattca-tctctcaatctcttcccatgaacaagacactcaatgattttcactcttccaagg----------tgtttccca 33089833  T
Q  230 actctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcc 270  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  33089832 actctataatctaacctccaaaagagaaccaacctttagcc 33089792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 9 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 8393562 - 8393394
Alignment:
Q  9 tgttcacacaattcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatac-aaatgtt 104  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||| |||    
T  8393562 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggtt 8393463  T
Q  105 acaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 174  Q
    |||||||||||||||  |||   |||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8393462 acaagaaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 8393394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 9 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 8395771 - 8395603
Alignment:
Q  9 tgttcacacaattcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatac-aaatgtt 104  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||| |||    
T  8395771 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggtt 8395672  T
Q  105 acaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 174  Q
    |||||||||||||||  |||   |||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8395671 acaagaaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 8395603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 45 - 270
Target Start/End: Original strand, 35369482 - 35369704
Alignment:
Q  45 gggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccc 143  Q
    ||||||||| || |||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| |   |||  |||||||||| |||| ||| ||||| |||||||| ||    
T  35369482 gggagagatcgacctcttcaattcaccatcaatgagttctttacaaagagataga---gttttaagaaattagtttcatcaagctcaccaagaacaaacc 35369578  T
Q  144 taatttctacccattttcccaatctc-accaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgttt-acaattgttttccaactctagaatct 241  Q
    |||||||||| || ||||||||| ||   ||| |||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||  ||||||||| |||| |||| ||||     
T  35369579 taatttctactca-tttcccaatgtcttgcaatgaacaagacactcaatgattttcactc-tacaaggtgtttcccaattgtttcccaattctataatcc 35369676  T
Q  242 aaccaccaaaagagaaccaacccttagcc 270  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35369677 aacc-ccaaaagagaaccaacccttagcc 35369704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 72 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 32091583 - 32091391
Alignment:
Q  72 atcaatgagttctt-acaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatc- 167  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||  |||||||||||||     
T  32091583 atcaatgtgttctttacaaagagatacaaaagagttacaagaaattagtttcaacaaactctccaagaacaaacctaatttcta-gcattttcccaatct 32091485  T
Q  168 tcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgttt-acaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaac 262  Q
    || || | |||||| | ||||||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||||||| | |||| |||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  32091484 tctcccatgaacaagagactcaatga-tttcgctcacccaatgtgtttctcaattgtttccaaactttagaatcttacc-ccaaaaaagaaccaac 32091391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 3 - 225
Target Start/End: Original strand, 44967823 - 44968048
Alignment:
Q  3 aagaaatgttcacacaattcggtccaact-tgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgag-ttcttacaaagagatacaaa 100  Q
    |||||||||| || ||  ||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||| ||| |||| ||| |||| ||| || |||||||||||||||||    
T  44967823 aagaaatgtttacccaggtcggtccaacagtgacttattctgggggagagattgatccctctaatctactctcaacgagttttttacaaagagatacaaa 44967922  T
Q  101 t-gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctc-accaaagaacaaaacactcaatgatttt 197  Q
    | ||||||||||||| |||||| ||| ||| | |||| | || ||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||| |  |||||||| |||    
T  44967923 tggttacaagaaattggcttcagcaagctctccaagagcaaaacctaatttcta-ccattttcccaatctcttcccaagaacaacaggctcaatga-ttt 44968020  T
Q  198 cactcacccaaggtgtttacaattgttt 225  Q
    |||||| ||||  ||||||||| |||||    
T  44968021 cactcaaccaatttgtttacaaatgttt 44968048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 24 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 53345370 - 53345187
Alignment:
Q  24 gtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttc 120  Q
    |||||| ||||||||||||  |  | ||| ||||| || ||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||| ||| |  |||||||||||||| |||    
T  53345370 gtccaaattgacctactctaagtaaaagactgatccctacaatccaatattaatgagttctttacaaaaagatataaaagggttacaagaaattagtttc 53345271  T
Q  121 aacaaactcacaaagaa-caaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcac 204  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||  ||||||| ||||||| || |  ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  53345270 aacaagctcacaaagaatcaaccttaatttcta-tcattttctcaatctctccgataaacaagacactcaatgattttcactcac 53345187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 5350084 - 5349924
Alignment:
Q  1 ccaagaaatgttcacacaattcggtccaact-tgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagataca 98  Q
    |||| ||||||| || |||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||  |||||||||  | || |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  5350084 ccaataaatgtttacccaattcagtccaacaatgacctactctgggg-agaga--gatctctccgcttcattatcaacgagttctttacaaagagataca 5349988  T
Q  99 aatgt--tacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccatttt 160  Q
    || |   |||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5349987 aacgagctacaaggaattagcttcgacaagttcacaaagaacaaacctaatttctacccatttt 5349924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 34112975 - 34112838
Alignment:
Q  18 aattcggtccaact-tgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatg--ttacaagaaat 113  Q
    |||||||||||||  ||||||||| | |||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |  ||||| |||||    
T  34112975 aattcggtccaacaatgacctactataggggagaga--gatctctccacttcactatcaatgagttctttacaaagagatgcaaaagggttacatgaaat 34112878  T
Q  114 tagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctac 153  Q
    |||||||||||| ||| |  ||||||| | ||||||||||    
T  34112877 tagcttcaacaagctctcctagaacaaacataatttctac 34112838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 218 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 26364222 - 26364171
Alignment:
Q  218 aattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagc 269  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26364222 aattgtttcccaactctaaaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagc 26364171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 6677597 - 6677412
Alignment:
Q  49 gagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaag--aacaaccc 143  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| || ||||| ||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||| | |||  || || ||    
T  6677597 gagattgatctctcaaatccattatcaaagacttctttacaaagatatacaaaagggttacaagaaattagcttcaacaagctctccaagaaaaaaaacc 6677498  T
Q  144 taatttctacccattttcccaatctc-accaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgttttccaac 231  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| ||  || |||||||| | ||||||| | ||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||    
T  6677497 taatttcta-ccatttt-ccaatttcttcccaagaacaagagactcaatta-tttcactcatccaatgtgtttacaaatgtttcccaac 6677412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 7125048 - 7124901
Alignment:
Q  30 cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaa-atgttacaagaaattagcttcaacaa 125  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||||| | ||||||||||||||| ||  ||||    
T  7125048 cttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattag-tttgacaa 7124950  T
Q  126 actcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 174  Q
      |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  7124949 gttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 7124901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 5136222 - 5136063
Alignment:
Q  20 ttcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttctt-acaaagaga-tacaa-atgttacaagaaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  || ||||| | |||||||||||||    
T  5136222 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaatt 5136123  T
Q  115 agcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 174  Q
    ||||| |  |   |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  5136122 agcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 5136063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 5138447 - 5138288
Alignment:
Q  20 ttcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttctt-acaaagaga-tacaa-atgttacaagaaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  || ||||| | |||||||||||||    
T  5138447 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaatt 5138348  T
Q  115 agcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 174  Q
    ||||| |  |   |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  5138347 agcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 5138288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 41961368 - 41961316
Alignment:
Q  217 caattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagc 269  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  41961368 caattgtttcccaactctagaatctaaccctcaaaagagaaccaacccttagc 41961316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 70 - 154
Target Start/End: Original strand, 44570427 - 44570514
Alignment:
Q  70 ctatcaatgagttctt-acaaagagatacaaa--tgttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacc 154  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||| | || ||||| | |||||||||||    
T  44570427 ctatcaatgagttctttacaaagagatacaaaaatgttacaagaaattagtttcaacaagctctccaacaacaaacataatttctacc 44570514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 52065730 - 52065530
Alignment:
Q  42 tgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt-cttacaaagagatacaaatg---ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaa 137  Q
    |||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||| |   |||||  ||| ||||||||| || ||| | |||||    
T  52065730 tgggggagaga--gatctctccacttcactatcaatgagtttctaacaaagagatacaaaaggggttacagaaaaatagcttcaataagctctctaagaa 52065633  T
Q  138 caaccctaatttctacccattttcccaatctca-ccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgttttccaactctag 236  Q
    ||||| |||||||||||  ||| |||||| ||  ||   || ||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| | ||    
T  52065632 caacc-taatttctacctgttt-cccaatatcttccgttgatcaagagactcgatgattttcactcacccaaggggttcacaattgtttcccaacccaag 52065535  T
Q  237 aatct 241  Q
    |||||    
T  52065534 aatct 52065530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 2 - 154
Target Start/End: Original strand, 21703829 - 21703985
Alignment:
Q  2 caagaaatgttcacacaattcggtccaact-tgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatac-- 97  Q
    ||||||||||| || || ||||||| |||  ||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||      
T  21703829 caagaaatgtttacccagttcggtcaaacaatgacctactatgggg-atagattgatatctccaatccactgtcaatgagttctttacaaaaagatacaa 21703927  T
Q  98 aaatgttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacc 154  Q
    ||| | |||||||||| | ||||||||| ||  | |||||| || |||||||||||||    
T  21703928 aaagggtacaagaaatcatcttcaacaagctttctaagaacaaaacctaatttctacc 21703985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 34 - 140
Target Start/End: Original strand, 37754986 - 37755095
Alignment:
Q  34 acctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgag-ttcttacaaagagat--acaaatgttacaagaaattagcttcaacaaactca 130  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| || ||| ||||||||  | ||| |||||||||||||| ||||| |||| ||     
T  37754986 acctactatgggggagagattgatctcttcaaaccattatcaatgagttttttagaaagagataaaaaaaggttacaagaaattatcttcaccaaattct 37755085  T
Q  131 caaagaacaa 140  Q
    | ||||||||    
T  37755086 ctaagaacaa 37755095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 7122829 - 7122682
Alignment:
Q  30 cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaa-atgttacaagaaattagcttcaacaa 125  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||||| | ||||||||||||||| ||  ||||    
T  7122829 cttgacctactatggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattag-tttgacaa 7122731  T
Q  126 actcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 174  Q
      |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  7122730 gttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 7122682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 24969840 - 24969787
Alignment:
Q  1 ccaagaaatgttcacacaattcggtccaacttgacctactctgggggagagatt 54  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24969840 ccaagaaatgtttacccagttcggtccaacttgacctactctgggggatagatt 24969787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 84 - 154
Target Start/End: Original strand, 34788851 - 34788923
Alignment:
Q  84 ttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacc 154  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||| ||| | |||| ||| |||||||||||||    
T  34788851 ttacaaagagatacaaaagagttacaagaaattaacttcaacaagctctccaagagcaatcctaatttctacc 34788923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 215
Target Start/End: Original strand, 35370449 - 35370557
Alignment:
Q  107 aagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc-accaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 205  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||| || ||||||||| ||   ||| |||||| ||||||||| ||||||||||       
T  35370449 aagaaattagtttcatcaagctcaccaagaacaaacctaatttctactca-tttcccaatgtcttgcaatgaacaagacactcaataattttcactctta 35370547  T
Q  206 caaggtgttt 215  Q
    ||||||||||    
T  35370548 caaggtgttt 35370557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 55 - 154
Target Start/End: Original strand, 16422653 - 16422755
Alignment:
Q  55 gatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttct 151  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |  || | ||||||||||||||| || ||| |||| ||||| | ||||||||    
T  16422653 gatctctccacttcactatccatgagttcattacaaagatatacaaaagggtttctagaaattagcttcaaaaagctctcaaaaaacaaacataatttct 16422752  T
Q  152 acc 154  Q
    |||    
T  16422753 acc 16422755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 126
Target Start/End: Original strand, 1122865 - 1122937
Alignment:
Q  58 ctctccaatccactatcaatgagtt-cttacaaagagatac---aaatgttacaagaaattagcttcaacaaa 126  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  1122865 ctctcaaatctactatcaatgagtttcttacaaagagatacaaaaaatgttactataaattaacttcaacaaa 1122937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 176 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 5349904 - 5349855
Alignment:
Q  176 gaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgttt 225  Q
    |||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||    
T  5349904 gaacaagacactcaaagattttcaatcatccaaggtgtttacaaatgttt 5349855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 218 - 259
Target Start/End: Original strand, 25723433 - 25723474
Alignment:
Q  218 aattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaacc 259  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  25723433 aattgttttccatctctagaatctaacacccaaaagagaacc 25723474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 185 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 3677451 - 3677403
Alignment:
Q  185 actcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgttttccaactc 233  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  3677451 actcaatgattttctctcatacaaggtgtttataattgtttcccaactc 3677403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 102 - 160
Target Start/End: Original strand, 37781951 - 37782008
Alignment:
Q  102 gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccatttt 160  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| || | |||||||||||||||||    
T  37781951 gttacaagaaattagctt--aaaaactcacaaagaacaaatcttaatttctacccatttt 37782008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 7502 - 7233
Alignment:
Q  1 ccaagaaatgttcacacaattcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 100  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7502 ccaagaaatgttcacccagttcggtccaacttaacctactctagaggagagattgatctttccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 7403  T
Q  101 t--gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttc 198  Q
    |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  7402 tgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccttaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttc 7304  T
Q  199 actcacccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcc 270  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7303 actctcccaaggtgtttacaattg-tttccagctctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcc 7233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 17996 - 18262
Alignment:
Q  1 ccaagaaatgttcacacaattcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaa 99  Q
    ||||||||||||||| || |||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17996 ccaagaaatgttcacccagttcgatccaaacttgacctaccctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt-ttacaaagagatacaa 18094  T
Q  100 atg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgatttt 197  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  18095 atgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaatgaacaaccctaatttctaccaattttcccactctcaccaatgaacaaaacactc-atgatttt 18193  T
Q  198 cactcacccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttag 268  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  18194 cactctcccaaagtgtttacaattg-tttccaactctataatctaacc-ccaaaagagaaccaactcttag 18262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0286 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0286
Description:

Target: scaffold0286; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 9 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 11725 - 11463
Alignment:
Q  9 tgttcacacaattcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--tta 105  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  11725 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 11626  T
Q  106 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 205  Q
    ||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  11625 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccatttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-c 11527  T
Q  206 caaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcc 270  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||    
T  11526 caaggtgtttacaa-tgtttcccaactctagaatctaaccccaaaaagagaaacaacctttagcc 11463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Original strand, 20427 - 20629
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagc 117  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  20427 ttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccaatatcaaagagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagc 20526  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 217  Q
    ||||||||  ||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20527 ttcaacaagttcacaaaaaacaaacctaatttctgctcattttcccaatctcaccaatgaataataaactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 20626  T
Q  218 aat 220  Q
    |||    
T  20627 aat 20629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Original strand, 149109 - 149311
Alignment:
Q  20 ttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagc 117  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||    
T  149109 ttcggtccaacttaacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatataaatgggtaacaagaaattagc 149208  T
Q  118 ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 217  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  149209 ttcaacaagcttacaaaaaacaaccctaatttctatccgttttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactaccccaaggtgtttac 149308  T
Q  218 aat 220  Q
    |||    
T  149309 aat 149311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 63 - 270
Target Start/End: Original strand, 80338 - 80546
Alignment:
Q  63 caatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccatttt 160  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  80338 caattcactatctatgagttcttacaaaaagatacaaatgggttgcaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatttt 80437  T
Q  161 cccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaacca 260  Q
    |||||||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  80438 cccaatctcagcaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgttcacaattgtttcctaactctagaatctaacccccaaaatagaacca 80536  T
Q  261 acccttagcc 270  Q
    ||||||||||    
T  80537 acccttagcc 80546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 28 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 114750 - 114557
Alignment:
Q  28 aacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaa 125  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||  ||||    
T  114750 aacttaacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagcgttacaagaaattagctttgacaa 114651  T
Q  126 actcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 220  Q
      ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  114650 gttcacaaagaacaaccttaatttctaccctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca-ccaaggtgtttacaat 114557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 9 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 434701 - 434477
Alignment:
Q  9 tgttcacacaattcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgtta 105  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  434701 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtta 434602  T
Q  106 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccatttt-cccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcac 204  Q
    ||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||     
T  434601 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccctttttccccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca- 434503  T
Q  205 ccaaggtgtttacaattgttttccaac 231  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||||    
T  434502 ccaaggtatttacca-tgttttccaac 434477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 153
Target Start/End: Original strand, 490359 - 490468
Alignment:
Q  47 gagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccc 143  Q
    |||||| ||||||||||  | |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |     
T  490359 gagagaatgatctctccgcttcactatcaatgagtactttacaaagatatacaaaagagttacaagaaattagcttcaacaagctctccaagaacaaact 490458  T
Q  144 taatttctac 153  Q
    ||||||||||    
T  490459 taatttctac 490468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1519 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold1519
Description:

Target: scaffold1519; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 9 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 1083 - 871
Alignment:
Q  9 tgttcacacaattcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgtta 105  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||   ||||    
T  1083 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttgtt-caaagagatacaaaagggtta 985  T
Q  106 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctaccc-attttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcac 204  Q
    ||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||     
T  984 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttttcccaatctcacc-aagaacaagacactcaatgattttcactca- 887  T
Q  205 ccaaggtgtttacaat 220  Q
    ||||||||||||||||    
T  886 ccaaggtgtttacaat 871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0491
Description:

Target: scaffold0491; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 9 - 220
Target Start/End: Original strand, 11161 - 11375
Alignment:
Q  9 tgttcacacaattcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaa--tgtt 104  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||   |||    
T  11161 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaacgagttcttacaaaagagatacaaaagggtt 11260  T
Q  105 acaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattt-tcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactca 203  Q
    |||||||||||| ||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  11261 acaagaaattagattttacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttctcccaatctcacc-aagaacaagacactcaatgatttacactca 11359  T
Q  204 cccaaggtgtttacaat 220  Q
     ||||||||||||||||    
T  11360 -ccaaggtgtttacaat 11375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 9 - 220
Target Start/End: Original strand, 8735 - 8949
Alignment:
Q  9 tgttcacacaattcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaa--tgtt 104  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||   |||    
T  8735 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaacgagttcttacaaaagagatacaaaagggtt 8834  T
Q  105 acaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattt-tcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactca 203  Q
    |||||||||||| ||  | ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  8835 acaagaaattagattttataagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttctcccaatctcacc-aagaacaagacactcaatggtttacactca 8933  T
Q  204 cccaaggtgtttacaat 220  Q
     ||||||| ||||||||    
T  8934 -ccaaggtctttacaat 8949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0236 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0236
Description:

Target: scaffold0236; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 10664 - 10468
Alignment:
Q  1 ccaagaaatgttcacacaattcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 100  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10664 ccaagaaatgtttacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctcttcaatccactatcaacgagttcttacaaagagatacaaa 10565  T
Q  101 --tgttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattt 196  Q
       ||||||| ||||||||  |||  | |||||||||||| ||||||||||| || |  |||| |||||||||| || |||||| |||||||| |||||    
T  10564 atggttacaataaattagc-acaa-gagctcacaaagaacaaaccctaatttatatctttttttccaatctcacaaatgaacaagacactcaaagattt 10468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0219 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0219
Description:

Target: scaffold0219; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 233
Target Start/End: Original strand, 27451 - 27670
Alignment:
Q  18 aattcggtccaact-tgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt-cttacaaagagatacaaat--gttacaagaaat 113  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  27451 aattcggtccaacaatgacctactatgggggagagattgatctctccaatccactatcaataagttatttacaaagagatacaaatgagttacaagaaat 27550  T
Q  114 tagcttcaacaaactcacaaagaacaa-ccctaatttctacccattttcccaatctc-accaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggt 211  Q
    |||||||||||| |||   ||||||||  | |||||||||| | ||||| |||||||  ||  ||||||| | |||||| || ||||||||| |||||||    
T  27551 tagcttcaacaagctcttcaagaacaatacataatttctactc-ttttcacaatctcttccctagaacaagagactcaaaga-tttcactcatccaaggt 27648  T
Q  212 gtttacaattgttttccaactc 233  Q
    |||||||| ||||| |||||||    
T  27649 gtttacaaatgtttcccaactc 27670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0565 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0565
Description:

Target: scaffold0565; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 9 - 174
Target Start/End: Original strand, 2604 - 2773
Alignment:
Q  9 tgttcacacaattcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaa-atgt 103  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| | ||    
T  2604 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggt 2703  T
Q  104 tacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 174  Q
    ||||||||||||||||  ||||  |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  2704 tacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 2773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 55 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 25175 - 25002
Alignment:
Q  55 gatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaat--gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttct 151  Q
    |||||||| | | |||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||    
T  25175 gatctctctacttcactatcaatgagttctttacaaagagatacaaaaaggttacaagaaattaccttcaacaaactctcaaagaacaaaactagtttct 25076  T
Q  152 acccattttccc-aatctcacca-aagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgttt 225  Q
    | |||||||||| |||||   ||   || ||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25075 a-ccattttcccgaatcttgtcatgtgatcaacagactcaatga-tttcactctcccaaggtgtttacaattgttt 25002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0674 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0674
Description:

Target: scaffold0674; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 20 - 174
Target Start/End: Original strand, 3737 - 3895
Alignment:
Q  20 ttcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttctt-acaaagaga-tacaa-atgttacaagaaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  || ||||| | |||||||||||||    
T  3737 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaatt 3836  T
Q  115 agcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 174  Q
    |||||  |||   |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  3837 agctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 3895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0137 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0137
Description:

Target: scaffold0137; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 6430 - 6272
Alignment:
Q  20 ttcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttctt-acaaa-gagatacaaatg-ttacaagaaatt 114  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||  | ||||||||||||    
T  6430 ttcggtccaaacttaacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagggcttacaagaaatt 6331  T
Q  115 agcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 174  Q
    |||||  ||||  |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  6330 agctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 6272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 204 - 267
Target Start/End: Original strand, 1594 - 1657
Alignment:
Q  204 cccaaggtgtttac-aattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaaccctta 267  Q
    |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  1594 cccaaggtgttttctaattgtttcccaactctagaatctaacc-ccaaaagagaaccaacactta 1657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0129 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0129
Description:

Target: scaffold0129; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 184 - 231
Target Start/End: Original strand, 19117 - 19163
Alignment:
Q  184 cactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgttttccaac 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  19117 cactcaatgattttcactcacccaa-gtgtttacaaatgtttcccaac 19163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University