View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5937-Insertion-2 (Length: 959)

Name: NF5937-Insertion-2
Description: NF5937
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5937-Insertion-2
NF5937-Insertion-2
[»] chr6 (16 HSPs)
chr6 (96-913)||(2678351-2679163)
chr6 (186-430)||(2617739-2617982)
chr6 (167-429)||(2583935-2584198)
chr6 (186-379)||(2646484-2646677)
chr6 (189-413)||(2431231-2431460)
chr6 (183-413)||(2601670-2601902)
chr6 (185-372)||(2574311-2574498)
chr6 (186-371)||(2447304-2447489)
chr6 (722-913)||(2618843-2619034)
chr6 (752-913)||(2573873-2574034)
chr6 (743-913)||(2601352-2601522)
chr6 (724-913)||(2585154-2585343)
chr6 (736-913)||(2646133-2646310)
chr6 (722-879)||(2447698-2447855)
chr6 (725-912)||(2431668-2431853)
chr6 (12-94)||(2679208-2679290)
[»] chr7 (1 HSPs)
chr7 (189-371)||(17874976-17875158)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 753; Significance: 0; HSPs: 16)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 753; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 96 - 913
Target Start/End: Complemental strand, 2679163 - 2678351
Alignment:
Q  96 attttgaggactaaactgataatttattctttccaaaaatgatacacaagtattaacaatattgtaccctctttttactttgtgaggaacttcagagggt 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2679163 attttgaggactaaactgataatttattctttccaaa--tgatacacaagtattaaca---ttgtaccctcgttttactttgtgaggaacttcagagggt 2679069  T
Q  196 tattgttggacaagaacaggtgaaagacaagctgcaagaatgagagctagatacttaaaagcagttctaagacaagaggtatcatactttgatttgcatg 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  2679068 tattgttggacaagaacaggtgaaagacaagctgcaagaatgagagctagatacttaaaagcagttctaagacaagaagtagcatactttgatttgcatg 2678969  T
Q  296 ttacaagcacatcagaagtcatcacaagtgtctctaacgacagcctagtgattcaagatgttcttagtgaaaaggtataaaaaataaaatttgttttact 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2678968 ttacaagcacatcagaagtcatcacaagtgtctctaacgacagcctagtgattcaagatgttcttagtgaaaaggtataaaaaataaaatttgttttact 2678869  T
Q  396 ttatatcaatttttattttatacaaggatgaaaatagatcaggtcagacaagtcaaactttgatcaaataagttaggcatgttataaaagttcaaggtct 495  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2678868 ttatatcaatttttattttatacaaggatgaaaatagatcaggtcagacaagtcaaactttgatcaaataagttaggcatgttataaaagttcaaggtat 2678769  T
Q  496 gcgtctgatctattatttggcataggctatttttaaggagtgcttcttttctgaccactaggttttaaaaaaccacacgagttagaaaaatatacttctg 595  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2678768 gcgtctgatctattacttggcataggctatttttaaggagtgcttcttttctgaccactaggttttaaaaaaccacacgagttagaaaaatatacttctg 2678669  T
Q  596 aagttacttagtggtcgggaaagaatctccccatttaagggtttctcgtggccatttataaaatctaactaggcctaaaaacctatttacagacctactt 695  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  2678668 aagttaattaggggtcgggaaagaatctccccatttaagggtttctcgtggccatttataaaatctaactaggcctaaaagcttatttacagacctactt 2678569  T
Q  696 tacatttaagtttctataattatgtgttgttaatttattctaacttaaaaattatataggttccaaattttttgatgaatgcatctatgttcattggaag 795  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2678568 tacatttaagtttctataattatgtgttgttaatttattctaacttaaaaattatataggttccaaattttttgatgaatgcatctatgttcattggaag 2678469  T
Q  796 ctacatagtggcatttgcattgttatggagattagcaattgttgggttcccttttgtggcactacttgtgattcctggtttcatgtatgggagaactttg 895  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2678468 ctacatagtggcatttgcattgttatggagattagcaattgttgggttcccttttgtggtactacttgtgattcctggtttcatgtatgggagaactttg 2678369  T
Q  896 atgggattggctagaaaa 913  Q
    ||||||||||||||||||    
T  2678368 atgggattggctagaaaa 2678351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 186 - 430
Target Start/End: Original strand, 2617739 - 2617982
Alignment:
Q  186 ttcagagggttattgttggacaagaacaggtgaaagacaagctgcaagaatgagagctagatacttaaaagcagttctaagacaagaggtatcatacttt 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  2617739 ttcagagggttattgttggacaagaacaggtgaaagacaagctgcaagaatgagagttaggtacttaaaagcagttctaagacaagaagtagcatacttt 2617838  T
Q  286 gatttgcatgttacaagcacatcagaagtcatcacaagtgtctctaacgacagcctagtgattcaagatgttcttagtgaaaaggtataaaaaataaaat 385  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2617839 gatttgcatgttacaagcacatcagaagtcatcacaagtgtctcaaacgacatcctagtaattcaagatgttcttagtgaaaaggtataaaaattaaaat 2617938  T
Q  386 ttgttttactttatatcaatttttattttatacaaggatgaaaat 430  Q
    || |||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||||    
T  2617939 ttattttactttatatcaa-ttttattctatatagggatgaaaat 2617982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 184; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 167 - 429
Target Start/End: Original strand, 2583935 - 2584198
Alignment:
Q  167 tttttactttgtgaggaacttcagagggttattgttggacaagaacaggtgaaagacaagctgcaagaatgagagctagatacttaaaagcagttctaag 266  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2583935 tttttacttggtgaggaatttcagagggttattgttggacaagaacaggtgaaagacaagctgcaagaatgagagctaggtacttaaaagcagttctaag 2584034  T
Q  267 acaagaggtatcatactttgatttgcatgttacaagcacatcagaagtcatcacaagtgtctctaacgacagcctagtgattcaagatgttcttagtgaa 366  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  2584035 acaagaagtagcatactttgatttgcatgttacaagcacatcagaagtcatcacaagtgtctctaacgacatcctagtaattcaagatgttcttagtgaa 2584134  T
Q  367 aaggtataaaaaataaaatttgttttactttatatcaatttttattt-tatacaaggatgaaaa 429  Q
    ||||||||||   |  | ||  ||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||    
T  2584135 aaggtataaattttttatttatttttactttatataaatttttatttctatatagggatgaaaa 2584198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 186 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 2646677 - 2646484
Alignment:
Q  186 ttcagagggttattgttggacaagaacaggtgaaagacaagctgcaagaatgagagctagatacttaaaagcagttctaagacaagaggtatcatacttt 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2646677 ttcagagggttattgttggacaagaacaggtgaaagacaagctgcaagaatgagagttaggtacttaaaagcagttctaagacaagaagtatcatacttt 2646578  T
Q  286 gatttgcatgttacaagcacatcagaagtcatcacaagtgtctctaacgacagcctagtgattcaagatgttcttagtgaaaaggtataaaaaa 379  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2646577 gatttgcatattacaagcacatcagaagtcatcaccagtgtctctaacgacagtctggtaattcaagacgttcttagtgaaaaggtataaaaaa 2646484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 189 - 413
Target Start/End: Original strand, 2431231 - 2431460
Alignment:
Q  189 agagggttattgttggacaagaacaggtgaaagacaagctgcaagaatgagagctagatacttaaaagcagttctaagacaagaggtatcatactttgat 288  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2431231 agagggctattgttggacaagaacaggtgaaagacaagctgcaagaatgagagttaggtacttaaaagcagttctaagacaagaagtatcatactttgat 2431330  T
Q  289 ttgcatgttacaagcacatcagaagtcatcacaagtgtctctaacgacagcctagtgattcaagatgttcttagtgaaaaggtat-----aaaaaataaa 383  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||     |||||| |||    
T  2431331 ttgcatgttacaagcacaacagatgtcatcaccagtgtatctagtgacagcctagtaattcaagatgttcttagtgacaaggtatgaaaaaaaaaaaaaa 2431430  T
Q  384 atttgttttactttatatcaatttttattt 413  Q
    |||  |||||||||||||||| ||| ||||    
T  2431431 attcattttactttatatcaaatttgattt 2431460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 183 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 2601902 - 2601670
Alignment:
Q  183 aacttcagagggttattgttggacaagaacaggtgaaagacaagctgcaagaatgagagctagatacttaaaagcagttctaagacaagaggtatcatac 282  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||    
T  2601902 aactacagagggttattgttggacaagaacagatgaaagacaagctgcaagaatgagagttaggtacttaaaagcagttttaagacaagaagtagcatac 2601803  T
Q  283 tttgatttgcatgttacaagcacatcagaagtcatcacaagtgtctctaacgacagcctagtgattcaagatgttcttagtgaaaaggta-taaaaaata 381  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||||||| |||| |||||||||    ||||||    
T  2601802 tttgatttgcatgttacaagcacatcagaagtcatcaccagtgtctccaatgatagcctggtaattcaagatgttattagcgaaaaggtaccccaaaata 2601703  T
Q  382 -aaatttgttttactttatatcaatttttattt 413  Q
     |||||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  2601702 taaattcattttactctatatcaatttttattt 2601670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 185 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 2574498 - 2574311
Alignment:
Q  185 cttcagagggttattgttggacaagaacaggtgaaagacaagctgcaagaatgagagctagatacttaaaagcagttctaagacaagaggtatcatactt 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||    
T  2574498 cttcagagggttattgttggacaagaacaggtgaaagacaagctgcaagaatgagagttaggtacttaaaagcaattctaagacaagatgtagcttactt 2574399  T
Q  285 tgatttgcatgttacaagcacatcagaagtcatcacaagtgtctctaacgacagcctagtgattcaagatgttcttagtgaaaaggta 372  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||||||| |||| |||||||||    
T  2574398 tgatttgcatattacaagcacatcagaagtcatcaccagtgtctccaatgatagcctcgtaattcaagatgttattagcgaaaaggta 2574311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 186 - 371
Target Start/End: Original strand, 2447304 - 2447489
Alignment:
Q  186 ttcagagggttattgttggacaagaacaggtgaaagacaagctgcaagaatgagagctagatacttaaaagcagttctaagacaagaggtatcatacttt 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  2447304 ttcagagggttattgttggacaagaacaggtgagagacaagctgcaagaatgagagttaggtacttaaaagcagttctaagacaagaagtagcatacttt 2447403  T
Q  286 gatttgcatgttacaagcacatcagaagtcatcacaagtgtctctaacgacagcctagtgattcaagatgttcttagtgaaaaggt 371  Q
    |||||||| | |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  2447404 gatttgcacggtacaagcatatcagaagtcatcaccaatgtctctagtgacagcctaataattcaagatgtccttagtgaaaaggt 2447489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 722 - 913
Target Start/End: Original strand, 2618843 - 2619034
Alignment:
Q  722 ttgttaatttattctaacttaaaaattatataggttccaaattttttgatgaatgcatctatgttcattggaagctacatagtggcatttgcattgttat 821  Q
    |||||||||| || | |||| |||| || ||||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  2618843 ttgttaatttcttgttacttgaaaactacataggttccgaattttgtgatgaatacatctattttctttggaggatacatagtggcatttgcattgttat 2618942  T
Q  822 ggagattagcaattgttgggttcccttttgtggcactacttgtgattcctggtttcatgtatgggagaactttgatgggattggctagaaaa 913  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  2618943 ggagattggcaattgttgggttcccttttgtggtactacttgtgattcctggtttcatgtatggaagaactatgatgggattggctagaaaa 2619034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 752 - 913
Target Start/End: Complemental strand, 2574034 - 2573873
Alignment:
Q  752 taggttccaaattttttgatgaatgcatctatgttcattggaagctacatagtggcatttgcattgttatggagattagcaattgttgggttcccttttg 851  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  2574034 taggttccaaattttttgatgaatgcatctatgttccttggaagctacatagcagcatttgcattgttatggagattggcaattgttgggttcccttttt 2573935  T
Q  852 tggcactacttgtgattcctggtttcatgtatgggagaactttgatgggattggctagaaaa 913  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||    
T  2573934 tggtactactagtgattcctggtttcatgtatggaagaatttcgatgggattggctagaaaa 2573873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 743 - 913
Target Start/End: Complemental strand, 2601522 - 2601352
Alignment:
Q  743 aaaattatataggttccaaattttttgatgaatgcatctatgttcattggaagctacatagtggcatttgcattgttatggagattagcaattgttgggt 842  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  2601522 aaaattatataggttccaaattttttgatgaatgtgtctatgttccttggaagctacatagcagcatttgcatcgttatggagattggcaattgttgggt 2601423  T
Q  843 tcccttttgtggcactacttgtgattcctggtttcatgtatgggagaactttgatgggattggctagaaaa 913  Q
    |||||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||    
T  2601422 tcccttttttggtattactagtgattcctggtttcatgtatggaaggacttcgatgggattggctagaaaa 2601352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 724 - 913
Target Start/End: Original strand, 2585154 - 2585343
Alignment:
Q  724 gttaatttattctaacttaaaaattatataggttccaaattttttgatgaatgcatctatgttcattggaagctacatagtggcatttgcattgttatgg 823  Q
    |||||||| || | |||| |||| || |||||||||  |||||||||||||| ||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||    
T  2585154 gttaatttcttgttacttgaaaactacataggttccggattttttgatgaatacatctaatttcattggaggatacatagtggcatttgctttgttatgg 2585253  T
Q  824 agattagcaattgttgggttcccttttgtggcactacttgtgattcctggtttcatgtatgggagaactttgatgggattggctagaaaa 913  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||    
T  2585254 agattagcaattgttgggttcccttttgtggtactacttgtgattcctggtttcatgtatgggagagtttcgatggggttggctagaaaa 2585343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 736 - 913
Target Start/End: Complemental strand, 2646310 - 2646133
Alignment:
Q  736 taacttaaaaattatataggttccaaattttttgatgaatgcatctatgttcattggaagctacatagtggcatttgcattgttatggagattagcaatt 835  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  2646310 taacttgaaaactatgtaggttccaaatttgttgatgaatgcatctatgttcattggaagctatatagtagcatttacattattatggagattggcaatt 2646211  T
Q  836 gttgggttcccttttgtggcactacttgtgattcctggtttcatgtatgggagaactttgatgggattggctagaaaa 913  Q
    || |||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||| | || || | |||||||||||||||||||    
T  2646210 gtagggttcccttttattgttctacttgtgattcctggtttcatgtatcgaaggacatcgatgggattggctagaaaa 2646133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 722 - 879
Target Start/End: Original strand, 2447698 - 2447855
Alignment:
Q  722 ttgttaatttattctaacttaaaaattatataggttccaaattttttgatgaatgcatctatgttcattggaagctacatagtggcatttgcattgttat 821  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  2447698 ttgttaatttattctaacttgaaaactatacaggttccaaattttttgaagcatgtatctaagttcattgggaactacatagtggcatttgcattgttat 2447797  T
Q  822 ggagattagcaattgttgggttcccttttgtggcactacttgtgattcctggtttcat 879  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||| |||||    
T  2447798 ggagattggccattgttgggttcccttttgtggttctaattgtgactcctggcttcat 2447855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 725 - 912
Target Start/End: Original strand, 2431668 - 2431853
Alignment:
Q  725 ttaatttattctaacttaaaaattatataggttccaaattttttgatgaatgcatctatgttcattggaagctacatagtggcatttgcattgttatgga 824  Q
    ||||||| ||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||  |||| ||||||| ||||||||||| |||||||    
T  2431668 ttaatttcttctaacttgaaaactata--ggttccaaattttttggtgaatgcatctaggttcctttcaagcaacatagtagcatttgcattattatgga 2431765  T
Q  825 gattagcaattgttgggttcccttttgtggcactacttgtgattcctggtttcatgtatgggagaactttgatgggattggctagaaa 912  Q
    |||| || |||||||| ||||||||| |||  || |||||||| ||||||| |||||||  ||| | || |||| | |||||||||||    
T  2431766 gattggctattgttggattcccttttatggttcttcttgtgatccctggttacatgtataagaggatttcgatgaggttggctagaaa 2431853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 12 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 2679290 - 2679208
Alignment:
Q  12 agtagtacctaaagttatataaaatctgttagttaagtatccgctattaagatgttacagactatcatgacggattttcacat 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  2679290 agtagtacctaaagttatataaaatctgttagttaagtatccactattaagatgttaaggactaacatgacggattttcacat 2679208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 71; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 189 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 17875158 - 17874976
Alignment:
Q  189 agagggttattgttggacaagaacaggtgaaagacaagctgcaagaatgagagctagatacttaaaagcagttctaagacaagaggtatcatactttgat 288  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||   |  |||||||||||||| || || ||||| ||  | || ||||||    
T  17875158 agagggatattgttggacaaggacaagtggaagacaagctgcaagaatgagatacaagtacttaaaagcagtacttaggcaagaagttgcttattttgat 17875059  T
Q  289 ttgcatgttacaagcacatcagaagtcatcacaagtgtctctaacgacagcctagtgattcaagatgttcttagtgaaaaggt 371  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||   | || |||||||||||||||||||| |||||    
T  17875058 ttgcaggttacaagcacctcagaaatcatcactagtgtctctaatgacactattgtaattcaagatgttcttagtgagaaggt 17874976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University