View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5946-Insertion-2 (Length: 964)

Name: NF5946-Insertion-2
Description: NF5946
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5946-Insertion-2
NF5946-Insertion-2
[»] chr6 (62 HSPs)
chr6 (9-713)||(4072772-4073477)
chr6 (710-894)||(31100012-31100198)
chr6 (710-889)||(2442388-2442569)
chr6 (716-889)||(20804960-20805134)
chr6 (708-889)||(12297326-12297509)
chr6 (708-889)||(30811151-30811334)
chr6 (713-889)||(14227538-14227715)
chr6 (729-889)||(32731742-32731903)
chr6 (732-889)||(34232917-34233075)
chr6 (713-894)||(31451952-31452134)
chr6 (746-894)||(10856133-10856282)
chr6 (705-889)||(558326-558505)
chr6 (713-864)||(1806343-1806494)
chr6 (712-889)||(6709698-6709870)
chr6 (744-894)||(33453734-33453885)
chr6 (746-889)||(34685018-34685161)
chr6 (716-889)||(7317613-7317788)
chr6 (753-889)||(12432623-12432760)
chr6 (753-889)||(33540728-33540865)
chr6 (731-894)||(3636638-3636801)
chr6 (711-889)||(34903924-34904091)
chr6 (789-889)||(5943035-5943136)
chr6 (746-889)||(34439683-34439827)
chr6 (787-885)||(5681561-5681660)
chr6 (746-889)||(28076423-28076567)
chr6 (746-889)||(3108008-3108153)
chr6 (556-713)||(19218179-19218332)
chr6 (793-889)||(2970722-2970819)
chr6 (752-889)||(29823038-29823176)
chr6 (753-889)||(5301604-5301741)
chr6 (746-889)||(11015590-11015734)
chr6 (791-889)||(31049379-31049478)
chr6 (710-889)||(29414926-29415094)
chr6 (803-889)||(12140881-12140968)
chr6 (787-889)||(20563435-20563538)
chr6 (805-889)||(21894311-21894396)
chr6 (753-889)||(7292551-7292688)
chr6 (556-713)||(20736729-20736882)
chr6 (753-889)||(23648201-23648338)
chr6 (555-654)||(1586565-1586664)
chr6 (791-885)||(15591157-15591252)
chr6 (556-654)||(5758936-5759034)
chr6 (556-654)||(16788818-16788916)
chr6 (556-653)||(18020299-18020396)
chr6 (806-889)||(6104673-6104757)
chr6 (789-886)||(1225475-1225573)
chr6 (556-654)||(14074227-14074325)
chr6 (556-654)||(22860345-22860443)
chr6 (556-653)||(8612664-8612761)
chr6 (554-654)||(13947499-13947600)
chr6 (555-654)||(13995400-13995499)
chr6 (556-654)||(14996859-14996957)
chr6 (557-713)||(10359436-10359588)
chr6 (556-654)||(27508804-27508903)
chr6 (806-876)||(9896766-9896836)
chr6 (556-713)||(22560587-22560740)
chr6 (556-654)||(27528390-27528489)
chr6 (556-630)||(21993711-21993784)
chr6 (805-889)||(5893896-5893981)
chr6 (602-713)||(23846772-23846879)
chr6 (815-876)||(26561419-26561480)
chr6 (556-654)||(17120905-17121002)
[»] chr1 (102 HSPs)
chr1 (706-889)||(31150412-31150596)
chr1 (707-889)||(42064304-42064487)
chr1 (708-894)||(13121566-13121753)
chr1 (717-889)||(26204249-26204422)
chr1 (710-889)||(29586126-29586306)
chr1 (716-889)||(36301092-36301265)
chr1 (711-894)||(7710936-7711121)
chr1 (708-894)||(17046694-17046882)
chr1 (708-894)||(39826565-39826753)
chr1 (713-889)||(36838682-36838860)
chr1 (713-889)||(44909811-44909988)
chr1 (711-894)||(47134513-47134697)
chr1 (713-889)||(30721610-30721789)
chr1 (713-886)||(33524498-33524673)
chr1 (716-889)||(1917999-1918173)
chr1 (729-889)||(19898895-19899056)
chr1 (713-889)||(30774056-30774229)
chr1 (713-889)||(15313214-15313391)
chr1 (732-889)||(17499872-17500030)
chr1 (709-889)||(26843717-26843899)
chr1 (709-889)||(32368326-32368508)
chr1 (709-894)||(38967446-38967624)
chr1 (712-889)||(2497891-2498070)
chr1 (716-889)||(29704071-29704246)
chr1 (713-889)||(34319359-34319537)
chr1 (716-889)||(38676463-38676637)
chr1 (730-886)||(15348812-15348969)
chr1 (727-894)||(25601971-25602139)
chr1 (713-889)||(1507730-1507909)
chr1 (705-889)||(51422971-51423158)
chr1 (728-889)||(3660931-3661093)
chr1 (746-889)||(322869-323013)
chr1 (746-889)||(50351036-50351180)
chr1 (713-889)||(3270636-3270806)
chr1 (711-850)||(33561922-33562062)
chr1 (712-850)||(2479130-2479268)
chr1 (745-889)||(49220460-49220605)
chr1 (738-889)||(29374326-29374478)
chr1 (746-889)||(34086970-34087114)
chr1 (708-889)||(36043287-36043471)
chr1 (788-885)||(37703716-37703814)
chr1 (739-893)||(50540769-50540924)
chr1 (789-889)||(49185172-49185273)
chr1 (713-889)||(50171284-50171462)
chr1 (746-889)||(46369809-46369952)
chr1 (746-889)||(7781151-7781295)
chr1 (788-885)||(37672341-37672439)
chr1 (744-889)||(3391122-3391268)
chr1 (789-889)||(22098965-22099066)
chr1 (792-891)||(9769958-9770058)
chr1 (798-889)||(43727077-43727169)
chr1 (746-876)||(39583100-39583230)
chr1 (790-889)||(42614122-42614222)
chr1 (802-889)||(49822154-49822242)
chr1 (753-893)||(49240264-49240405)
chr1 (789-860)||(28429076-28429147)
chr1 (788-885)||(5697523-5697621)
chr1 (728-894)||(18347398-18347564)
chr1 (751-889)||(34318415-34318554)
chr1 (790-894)||(30495177-30495282)
chr1 (556-654)||(22234931-22235029)
chr1 (816-889)||(40887949-40888023)
chr1 (805-894)||(44718953-44719043)
chr1 (752-889)||(52703098-52703236)
chr1 (554-654)||(42817446-42817546)
chr1 (556-654)||(9455863-9455961)
chr1 (556-654)||(20780102-20780200)
chr1 (789-894)||(25134895-25135001)
chr1 (556-654)||(28135180-28135278)
chr1 (556-654)||(35930329-35930427)
chr1 (556-654)||(47667931-47668029)
chr1 (822-894)||(40719554-40719627)
chr1 (739-876)||(8221236-8221373)
chr1 (556-654)||(22612234-22612333)
chr1 (791-889)||(42963877-42963976)
chr1 (556-654)||(19706896-19706994)
chr1 (556-654)||(22670714-22670812)
chr1 (796-889)||(36379133-36379227)
chr1 (708-813)||(9169043-9169149)
chr1 (789-889)||(16085598-16085699)
chr1 (789-889)||(46928971-46929072)
chr1 (835-894)||(7024916-7024976)
chr1 (815-889)||(13570780-13570855)
chr1 (739-871)||(46088006-46088138)
chr1 (556-654)||(20391696-20391794)
chr1 (556-654)||(43802822-43802920)
chr1 (804-885)||(44956340-44956422)
chr1 (829-892)||(9169142-9169206)
chr1 (712-779)||(22099687-22099754)
chr1 (712-823)||(7024812-7024924)
chr1 (804-889)||(46056413-46056499)
chr1 (823-876)||(33151975-33152028)
chr1 (813-889)||(41004980-41005057)
chr1 (628-713)||(29096544-29096625)
chr1 (839-889)||(40935894-40935945)
chr1 (816-876)||(2028977-2029037)
chr1 (726-778)||(40719482-40719534)
chr1 (819-889)||(28868998-28869069)
chr1 (836-886)||(9894931-9894982)
chr1 (556-713)||(21881777-21881931)
chr1 (835-884)||(33632331-33632381)
chr1 (585-656)||(26923803-26923871)
[»] chr3 (107 HSPs)
chr3 (708-894)||(46247966-46248153)
chr3 (712-894)||(44748788-44748971)
chr3 (712-889)||(35499568-35499746)
chr3 (713-889)||(28676897-28677075)
chr3 (712-889)||(45345015-45345193)
chr3 (710-889)||(37528730-37528911)
chr3 (713-894)||(8872840-8873023)
chr3 (712-889)||(37088250-37088429)
chr3 (709-889)||(26540923-26541105)
chr3 (729-889)||(16127146-16127307)
chr3 (729-889)||(29081288-29081449)
chr3 (713-889)||(38185738-38185915)
chr3 (711-889)||(44845589-44845769)
chr3 (728-894)||(46318761-46318929)
chr3 (708-889)||(50499725-50499907)
chr3 (714-889)||(24536561-24536738)
chr3 (708-885)||(54672191-54672369)
chr3 (713-889)||(2579934-2580112)
chr3 (713-889)||(25570346-25570524)
chr3 (710-894)||(40480023-40480209)
chr3 (729-889)||(40563370-40563531)
chr3 (712-889)||(4240252-4240423)
chr3 (712-889)||(19948325-19948504)
chr3 (708-894)||(37713967-37714148)
chr3 (708-889)||(52857858-52858041)
chr3 (729-894)||(21707135-21707301)
chr3 (712-889)||(29718208-29718386)
chr3 (712-889)||(52166097-52166276)
chr3 (744-893)||(42217662-42217812)
chr3 (710-894)||(48942962-48943139)
chr3 (713-889)||(38891993-38892170)
chr3 (746-894)||(43525744-43525893)
chr3 (711-889)||(47897613-47897793)
chr3 (746-889)||(52794896-52795040)
chr3 (712-889)||(30864394-30864571)
chr3 (753-894)||(39876622-39876764)
chr3 (708-889)||(53779000-53779176)
chr3 (710-850)||(44545195-44545335)
chr3 (708-889)||(50317036-50317211)
chr3 (746-889)||(55305116-55305260)
chr3 (713-889)||(46972000-46972178)
chr3 (732-889)||(49853050-49853208)
chr3 (787-889)||(2121869-2121972)
chr3 (712-885)||(33391869-33392044)
chr3 (753-894)||(41246257-41246399)
chr3 (732-865)||(47173555-47173688)
chr3 (712-890)||(48378192-48378372)
chr3 (713-885)||(12063739-12063913)
chr3 (746-894)||(54541937-54542086)
chr3 (789-889)||(2851861-2851962)
chr3 (751-871)||(24628225-24628345)
chr3 (712-843)||(41785775-41785907)
chr3 (746-889)||(52225286-52225430)
chr3 (793-889)||(21603846-21603943)
chr3 (789-889)||(51709055-51709156)
chr3 (556-713)||(14146769-14146922)
chr3 (710-889)||(45368574-45368755)
chr3 (791-889)||(30548790-30548889)
chr3 (751-889)||(46627504-46627644)
chr3 (712-889)||(41518327-41518506)
chr3 (797-889)||(42497046-42497139)
chr3 (746-889)||(44947208-44947352)
chr3 (728-889)||(42465034-42465196)
chr3 (746-889)||(193398-193542)
chr3 (744-876)||(30814271-30814403)
chr3 (746-850)||(39469914-39470018)
chr3 (739-893)||(37489927-37490082)
chr3 (556-716)||(15526503-15526658)
chr3 (728-889)||(35100171-35100326)
chr3 (751-885)||(32026420-32026555)
chr3 (804-893)||(52595337-52595427)
chr3 (805-889)||(51003307-51003392)
chr3 (818-889)||(45693393-45693465)
chr3 (758-885)||(2598608-2598736)
chr3 (555-654)||(21398538-21398637)
chr3 (760-876)||(33897914-33898030)
chr3 (556-654)||(21033985-21034083)
chr3 (556-654)||(55426768-55426866)
chr3 (716-876)||(20450428-20450589)
chr3 (810-885)||(52868190-52868266)
chr3 (789-876)||(7041105-7041192)
chr3 (556-654)||(14890138-14890236)
chr3 (556-654)||(15846993-15847091)
chr3 (556-654)||(20148012-20148110)
chr3 (556-654)||(25979184-25979282)
chr3 (788-889)||(29203034-29203136)
chr3 (718-778)||(24536808-24536869)
chr3 (752-889)||(39719361-39719498)
chr3 (558-654)||(28087967-28088063)
chr3 (712-778)||(52363008-52363075)
chr3 (712-769)||(889679-889736)
chr3 (791-875)||(27446473-27446557)
chr3 (753-885)||(37713151-37713285)
chr3 (556-696)||(14225954-14226091)
chr3 (791-850)||(43740325-43740384)
chr3 (556-654)||(12299658-12299756)
chr3 (732-843)||(45693460-45693571)
chr3 (729-778)||(28394173-28394222)
chr3 (804-876)||(24350286-24350358)
chr3 (712-816)||(51950322-51950427)
chr3 (731-894)||(52931147-52931299)
chr3 (820-889)||(5506704-5506774)
chr3 (791-894)||(32982914-32983011)
chr3 (711-760)||(52788648-52788698)
chr3 (746-778)||(52788677-52788709)
chr3 (584-633)||(27432334-27432383)
chr3 (710-750)||(54542075-54542116)
[»] chr2 (86 HSPs)
chr2 (712-894)||(5039738-5039922)
chr2 (712-889)||(16486846-16487024)
chr2 (713-889)||(3377357-3377534)
chr2 (709-885)||(36999450-36999627)
chr2 (728-894)||(43135597-43135764)
chr2 (711-894)||(4038334-4038518)
chr2 (712-889)||(2266151-2266329)
chr2 (709-889)||(40024941-40025123)
chr2 (713-889)||(8688961-8689138)
chr2 (706-889)||(9886950-9887134)
chr2 (713-889)||(13111741-13111920)
chr2 (708-889)||(37356128-37356311)
chr2 (732-889)||(36712535-36712693)
chr2 (710-889)||(2546323-2546504)
chr2 (729-889)||(4453522-4453683)
chr2 (710-889)||(41322717-41322898)
chr2 (710-889)||(8815175-8815355)
chr2 (716-889)||(28382679-28382854)
chr2 (716-889)||(38579007-38579182)
chr2 (713-889)||(650779-650956)
chr2 (709-893)||(41796737-41796923)
chr2 (713-889)||(10839579-10839756)
chr2 (712-893)||(6760599-6760782)
chr2 (713-889)||(21865210-21865389)
chr2 (710-889)||(24402051-24402225)
chr2 (739-889)||(15521470-15521621)
chr2 (712-885)||(26911475-26911649)
chr2 (713-889)||(43507561-43507732)
chr2 (735-894)||(4385519-4385679)
chr2 (747-894)||(31616380-31616528)
chr2 (753-889)||(39167756-39167893)
chr2 (744-889)||(10393034-10393180)
chr2 (746-889)||(17263752-17263896)
chr2 (746-889)||(29514832-29514975)
chr2 (731-889)||(6232279-6232438)
chr2 (751-889)||(7400390-7400529)
chr2 (744-893)||(40869354-40869504)
chr2 (732-889)||(38880781-38880940)
chr2 (730-885)||(10727812-10727968)
chr2 (712-851)||(18212083-18212223)
chr2 (759-876)||(7213674-7213791)
chr2 (787-894)||(43285657-43285765)
chr2 (751-889)||(38842838-38842977)
chr2 (789-894)||(42132708-42132814)
chr2 (716-889)||(44275630-44275804)
chr2 (713-889)||(13527903-13528079)
chr2 (555-713)||(21626428-21626582)
chr2 (791-886)||(8070622-8070718)
chr2 (732-889)||(8339963-8340121)
chr2 (710-823)||(18710152-18710265)
chr2 (810-889)||(24019948-24020028)
chr2 (793-889)||(9053129-9053226)
chr2 (556-704)||(29800175-29800319)
chr2 (556-654)||(24250489-24250587)
chr2 (810-889)||(23356983-23357063)
chr2 (553-702)||(24763969-24764114)
chr2 (565-713)||(15342404-15342548)
chr2 (815-889)||(16669119-16669194)
chr2 (815-889)||(25071437-25071512)
chr2 (789-886)||(15250146-15250244)
chr2 (556-654)||(30174124-30174222)
chr2 (797-889)||(2047320-2047412)
chr2 (556-654)||(24229672-24229770)
chr2 (713-893)||(6153457-6153625)
chr2 (805-876)||(2221446-2221517)
chr2 (788-893)||(34884850-34884956)
chr2 (809-889)||(4055951-4056032)
chr2 (830-889)||(41877821-41877881)
chr2 (815-885)||(2758898-2758969)
chr2 (815-889)||(7823546-7823621)
chr2 (820-889)||(6222638-6222708)
chr2 (746-887)||(5520069-5520211)
chr2 (826-894)||(37674497-37674566)
chr2 (788-886)||(598931-599030)
chr2 (578-703)||(19616205-19616327)
chr2 (846-894)||(18710268-18710317)
chr2 (556-713)||(18852183-18852337)
chr2 (731-823)||(7569768-7569861)
chr2 (602-713)||(28719196-28719304)
chr2 (588-676)||(28741394-28741478)
chr2 (844-891)||(13351601-13351649)
chr2 (832-889)||(13761842-13761898)
chr2 (729-760)||(29514822-29514853)
chr2 (788-885)||(39675059-39675157)
chr2 (835-891)||(7569853-7569910)
chr2 (735-776)||(13564523-13564564)
[»] chr8 (86 HSPs)
chr8 (708-889)||(28709268-28709451)
chr8 (708-889)||(28716625-28716808)
chr8 (710-889)||(10618770-10618950)
chr8 (710-889)||(36681449-36681629)
chr8 (712-894)||(1893838-1894023)
chr8 (713-889)||(16422796-16422973)
chr8 (710-889)||(17081617-17081798)
chr8 (713-889)||(45141457-45141634)
chr8 (712-889)||(25023271-25023450)
chr8 (732-889)||(31581680-31581838)
chr8 (729-885)||(17115521-17115678)
chr8 (707-889)||(39702266-39702450)
chr8 (712-889)||(31478041-31478220)
chr8 (712-889)||(38171429-38171608)
chr8 (731-889)||(44827319-44827478)
chr8 (713-889)||(6338284-6338462)
chr8 (716-889)||(39871235-39871408)
chr8 (713-894)||(32099502-32099686)
chr8 (739-894)||(43276768-43276924)
chr8 (716-889)||(32541192-32541367)
chr8 (712-889)||(23676836-23677016)
chr8 (712-889)||(8270869-8271050)
chr8 (711-894)||(41313347-41313524)
chr8 (713-889)||(42142737-42142915)
chr8 (711-889)||(22877927-22878107)
chr8 (713-894)||(37587715-37587899)
chr8 (712-893)||(9210952-9211134)
chr8 (753-894)||(31688047-31688189)
chr8 (746-889)||(27781102-27781246)
chr8 (713-893)||(34395344-34395528)
chr8 (712-889)||(37560531-37560710)
chr8 (713-889)||(40223086-40223263)
chr8 (746-885)||(39320072-39320212)
chr8 (713-889)||(41693908-41694081)
chr8 (789-894)||(36112838-36112944)
chr8 (712-889)||(11298043-11298222)
chr8 (713-889)||(24652234-24652411)
chr8 (746-893)||(3427619-3427767)
chr8 (716-876)||(36590105-36590267)
chr8 (789-889)||(44157240-44157341)
chr8 (787-889)||(2642420-2642523)
chr8 (731-889)||(11741105-11741254)
chr8 (751-889)||(38780666-38780805)
chr8 (753-889)||(13969982-13970119)
chr8 (556-713)||(20539801-20539953)
chr8 (758-889)||(39746941-39747073)
chr8 (753-889)||(43849209-43849346)
chr8 (555-654)||(26240230-26240329)
chr8 (746-889)||(29189728-29189872)
chr8 (556-654)||(45534730-45534828)
chr8 (805-889)||(35243354-35243439)
chr8 (811-889)||(3511283-3511362)
chr8 (787-889)||(7378889-7378992)
chr8 (556-654)||(21969080-21969178)
chr8 (556-654)||(27007974-27008072)
chr8 (556-654)||(27015117-27015215)
chr8 (556-654)||(28498240-28498338)
chr8 (713-894)||(16831500-16831675)
chr8 (556-702)||(36970023-36970164)
chr8 (810-889)||(2855146-2855226)
chr8 (556-654)||(2963391-2963489)
chr8 (556-654)||(8371710-8371808)
chr8 (556-654)||(22131066-22131164)
chr8 (798-872)||(22957361-22957435)
chr8 (556-654)||(27880945-27881043)
chr8 (556-654)||(28021126-28021224)
chr8 (789-889)||(1363794-1363895)
chr8 (832-894)||(42203400-42203463)
chr8 (556-654)||(12561870-12561968)
chr8 (793-886)||(40551856-40551949)
chr8 (555-712)||(8782215-8782366)
chr8 (753-889)||(8436526-8436663)
chr8 (831-889)||(13888326-13888385)
chr8 (556-639)||(21914310-21914393)
chr8 (576-654)||(22659951-22660029)
chr8 (826-889)||(9370318-9370382)
chr8 (556-636)||(21862147-21862227)
chr8 (556-654)||(6430692-6430791)
chr8 (827-889)||(44263388-44263451)
chr8 (832-889)||(39677442-39677500)
chr8 (790-889)||(40045444-40045544)
chr8 (816-876)||(26293837-26293897)
chr8 (816-876)||(26307094-26307154)
chr8 (556-654)||(25610941-25611039)
chr8 (556-620)||(12642210-12642274)
chr8 (579-657)||(18835124-18835202)
[»] chr5 (90 HSPs)
chr5 (712-889)||(12774541-12774720)
chr5 (712-894)||(4221461-4221644)
chr5 (711-889)||(5591553-5591732)
chr5 (712-889)||(12713277-12713456)
chr5 (711-889)||(39744535-39744714)
chr5 (713-889)||(2236509-2236687)
chr5 (712-889)||(14647350-14647528)
chr5 (711-889)||(30412605-30412785)
chr5 (708-889)||(36685777-36685960)
chr5 (713-889)||(13228466-13228643)
chr5 (713-889)||(32382815-32382993)
chr5 (712-889)||(1711196-1711375)
chr5 (708-889)||(35639902-35640084)
chr5 (711-889)||(24793936-24794116)
chr5 (712-892)||(2671379-2671561)
chr5 (732-889)||(8023977-8024135)
chr5 (732-889)||(30299684-30299842)
chr5 (709-889)||(39275386-39275567)
chr5 (732-894)||(9587174-9587338)
chr5 (712-889)||(1174749-1174928)
chr5 (708-889)||(30774185-30774368)
chr5 (713-889)||(19956301-19956477)
chr5 (729-889)||(32381667-32381828)
chr5 (713-889)||(31168980-31169158)
chr5 (714-889)||(35236660-35236838)
chr5 (710-889)||(10697232-10697413)
chr5 (710-889)||(19525712-19525893)
chr5 (711-889)||(6603903-6604083)
chr5 (708-889)||(5997887-5998063)
chr5 (712-889)||(12363605-12363784)
chr5 (728-893)||(6893368-6893533)
chr5 (746-894)||(39246825-39246973)
chr5 (710-889)||(9160685-9160859)
chr5 (712-894)||(29392095-29392280)
chr5 (713-894)||(13156874-13157057)
chr5 (713-889)||(3037418-3037596)
chr5 (713-889)||(15443422-15443600)
chr5 (712-889)||(35235720-35235892)
chr5 (746-889)||(27130333-27130477)
chr5 (732-889)||(3670264-3670422)
chr5 (753-889)||(15530442-15530579)
chr5 (732-894)||(3669527-3669690)
chr5 (732-889)||(11663884-11664042)
chr5 (744-889)||(26699099-26699245)
chr5 (744-889)||(26968832-26968978)
chr5 (753-889)||(43402451-43402588)
chr5 (744-889)||(5381937-5382082)
chr5 (753-889)||(648538-648675)
chr5 (746-889)||(19347705-19347850)
chr5 (788-889)||(2178802-2178904)
chr5 (753-889)||(5521305-5521442)
chr5 (762-889)||(7651656-7651784)
chr5 (744-886)||(11062903-11063047)
chr5 (787-889)||(22977198-22977301)
chr5 (788-885)||(4379300-4379398)
chr5 (753-885)||(36027988-36028121)
chr5 (746-889)||(11100755-11100899)
chr5 (558-713)||(20100644-20100793)
chr5 (559-691)||(31652211-31652338)
chr5 (791-885)||(9627151-9627246)
chr5 (555-654)||(24933763-24933862)
chr5 (556-706)||(26130101-26130249)
chr5 (556-654)||(31646-31744)
chr5 (746-889)||(16474771-16474915)
chr5 (712-823)||(25872268-25872380)
chr5 (556-654)||(12790120-12790218)
chr5 (710-872)||(23920421-23920583)
chr5 (556-654)||(25805842-25805940)
chr5 (556-654)||(31096563-31096661)
chr5 (787-894)||(13936233-13936341)
chr5 (788-889)||(6280448-6280550)
chr5 (556-654)||(22940997-22941095)
chr5 (753-885)||(2497570-2497703)
chr5 (559-654)||(9812192-9812287)
chr5 (559-654)||(12704333-12704428)
chr5 (559-654)||(12765449-12765544)
chr5 (556-654)||(20940774-20940872)
chr5 (556-654)||(23545669-23545767)
chr5 (555-713)||(39535210-39535365)
chr5 (556-653)||(7865890-7865987)
chr5 (583-703)||(5097426-5097542)
chr5 (832-889)||(6349426-6349484)
chr5 (804-876)||(13921783-13921855)
chr5 (555-702)||(26244849-26244992)
chr5 (847-894)||(25872216-25872264)
chr5 (804-876)||(31407980-31408052)
chr5 (832-889)||(4657594-4657652)
chr5 (804-889)||(42323600-42323686)
chr5 (818-889)||(27005847-27005919)
chr5 (815-889)||(32321655-32321730)
[»] chr4 (131 HSPs)
chr4 (708-889)||(28307213-28307396)
chr4 (712-889)||(18582807-18582985)
chr4 (706-894)||(37115281-37115470)
chr4 (713-889)||(56372399-56372576)
chr4 (707-889)||(8829818-8830002)
chr4 (708-889)||(7706330-7706513)
chr4 (712-889)||(42116858-42117037)
chr4 (713-894)||(55495878-55496061)
chr4 (708-889)||(19513885-19514067)
chr4 (713-889)||(53407153-53407330)
chr4 (706-889)||(8941861-8942045)
chr4 (713-894)||(35777384-35777567)
chr4 (714-889)||(46895246-46895424)
chr4 (710-889)||(12233970-12234151)
chr4 (711-894)||(47417473-47417658)
chr4 (710-894)||(43225675-43225861)
chr4 (710-893)||(55828964-55829149)
chr4 (704-889)||(4392729-4392915)
chr4 (712-889)||(4517194-4517373)
chr4 (713-889)||(11600646-11600824)
chr4 (706-889)||(9043613-9043798)
chr4 (710-889)||(55764520-55764700)
chr4 (716-889)||(45906105-45906280)
chr4 (709-889)||(22038360-22038542)
chr4 (712-889)||(39087561-39087739)
chr4 (732-889)||(22892511-22892669)
chr4 (732-889)||(22944175-22944333)
chr4 (712-889)||(11151942-11152113)
chr4 (739-889)||(52669984-52670135)
chr4 (733-889)||(27397769-27397927)
chr4 (749-894)||(31678969-31679115)
chr4 (711-889)||(29413500-29413672)
chr4 (746-894)||(29663926-29664075)
chr4 (746-889)||(25440487-25440631)
chr4 (715-889)||(35822302-35822478)
chr4 (732-893)||(35580944-35581106)
chr4 (710-889)||(51011068-51011249)
chr4 (728-876)||(15635921-15636069)
chr4 (746-889)||(23867872-23868016)
chr4 (713-889)||(37970258-37970435)
chr4 (727-889)||(55856530-55856690)
chr4 (235-418)||(34791684-34791868)
chr4 (713-869)||(53273081-53273238)
chr4 (710-889)||(3009679-3009852)
chr4 (712-889)||(4939389-4939560)
chr4 (759-889)||(21369890-21370021)
chr4 (788-889)||(55358341-55358443)
chr4 (714-889)||(44442046-44442222)
chr4 (787-889)||(9031998-9032101)
chr4 (746-885)||(35468012-35468152)
chr4 (751-894)||(37831924-37832068)
chr4 (712-885)||(4355599-4355767)
chr4 (753-889)||(56270094-56270231)
chr4 (787-889)||(5465413-5465516)
chr4 (751-889)||(22430637-22430776)
chr4 (788-889)||(26826560-26826662)
chr4 (789-889)||(30366149-30366250)
chr4 (709-889)||(31338503-31338687)
chr4 (753-889)||(33114979-33115116)
chr4 (787-893)||(11050355-11050462)
chr4 (798-889)||(27185635-27185728)
chr4 (789-873)||(23162641-23162725)
chr4 (753-889)||(52708002-52708138)
chr4 (743-866)||(29656720-29656843)
chr4 (713-889)||(36196837-36197015)
chr4 (751-876)||(23113493-23113618)
chr4 (713-889)||(25235108-25235286)
chr4 (713-834)||(29656597-29656719)
chr4 (746-843)||(33005178-33005275)
chr4 (746-889)||(4391711-4391855)
chr4 (788-885)||(20511448-20511546)
chr4 (713-823)||(45780807-45780918)
chr4 (729-823)||(25199366-25199460)
chr4 (556-702)||(30040886-30041028)
chr4 (806-894)||(44525694-44525783)
chr4 (810-889)||(21633819-21633899)
chr4 (815-894)||(33005106-33005186)
chr4 (811-885)||(20148809-20148884)
chr4 (575-706)||(5528887-5529014)
chr4 (556-706)||(9537710-9537855)
chr4 (556-654)||(20243684-20243782)
chr4 (816-893)||(40497395-40497473)
chr4 (813-889)||(4465474-4465551)
chr4 (710-889)||(55684663-55684836)
chr4 (554-654)||(11420762-11420862)
chr4 (247-370)||(31818711-31818837)
chr4 (746-889)||(35190619-35190763)
chr4 (803-889)||(42085725-42085812)
chr4 (556-654)||(2676760-2676858)
chr4 (556-654)||(3369480-3369578)
chr4 (556-654)||(11484374-11484472)
chr4 (556-654)||(15461244-15461342)
chr4 (556-654)||(18162909-18163007)
chr4 (804-889)||(43078199-43078285)
chr4 (789-889)||(37047069-37047170)
chr4 (558-654)||(9487301-9487397)
chr4 (555-654)||(4676440-4676539)
chr4 (555-654)||(34975297-34975396)
chr4 (556-654)||(1941472-1941570)
chr4 (556-654)||(15814768-15814866)
chr4 (556-654)||(17300416-17300514)
chr4 (556-654)||(18111500-18111598)
chr4 (556-654)||(26531360-26531458)
chr4 (746-829)||(36008069-36008152)
chr4 (556-654)||(38816460-38816558)
chr4 (810-889)||(32101738-32101818)
chr4 (835-894)||(45780755-45780815)
chr4 (790-889)||(48056609-48056709)
chr4 (556-646)||(4545860-4545950)
chr4 (819-884)||(50502310-50502376)
chr4 (789-889)||(36486388-36486489)
chr4 (831-894)||(53224309-53224373)
chr4 (553-648)||(5870156-5870251)
chr4 (622-713)||(19362230-19362317)
chr4 (832-889)||(24954224-24954282)
chr4 (792-850)||(35842638-35842696)
chr4 (832-889)||(42124682-42124740)
chr4 (730-779)||(19169164-19169213)
chr4 (815-876)||(31435072-31435133)
chr4 (818-894)||(31953224-31953301)
chr4 (555-712)||(39422541-39422695)
chr4 (242-303)||(50375365-50375426)
chr4 (788-886)||(32948189-32948289)
chr4 (791-889)||(38048880-38048979)
chr4 (832-889)||(17715647-17715705)
chr4 (820-893)||(41864079-41864153)
chr4 (730-776)||(45520089-45520135)
chr4 (832-873)||(40119903-40119944)
chr4 (713-779)||(26443288-26443355)
chr4 (744-778)||(17715579-17715613)
chr4 (849-889)||(36008021-36008062)
[»] chr7 (97 HSPs)
chr7 (712-889)||(42587393-42587571)
chr7 (705-894)||(42375788-42375977)
chr7 (712-889)||(45686926-45687104)
chr7 (712-889)||(43254069-43254248)
chr7 (713-885)||(10312043-10312217)
chr7 (716-889)||(36246386-36246560)
chr7 (712-889)||(47470972-47471150)
chr7 (714-894)||(47587110-47587290)
chr7 (712-889)||(40637170-40637349)
chr7 (710-889)||(482992-483172)
chr7 (712-889)||(40258823-40259002)
chr7 (712-885)||(43134371-43134545)
chr7 (712-889)||(21254707-21254885)
chr7 (710-894)||(36436118-36436303)
chr7 (733-889)||(21374621-21374778)
chr7 (730-889)||(9487392-9487552)
chr7 (711-894)||(21313794-21313981)
chr7 (746-889)||(35587580-35587724)
chr7 (728-889)||(44743700-44743862)
chr7 (746-889)||(27089666-27089810)
chr7 (746-889)||(27188491-27188635)
chr7 (746-889)||(31511301-31511445)
chr7 (712-889)||(48832063-48832234)
chr7 (708-894)||(17192447-17192634)
chr7 (712-889)||(21741937-21742117)
chr7 (711-889)||(48313434-48313613)
chr7 (712-889)||(36407194-36407373)
chr7 (753-894)||(19831995-19832137)
chr7 (732-889)||(44596597-44596755)
chr7 (746-886)||(40106018-40106159)
chr7 (738-889)||(27655683-27655835)
chr7 (705-889)||(45222083-45222262)
chr7 (787-889)||(33026918-33027021)
chr7 (712-850)||(32168799-32168938)
chr7 (712-885)||(33203682-33203856)
chr7 (738-889)||(11466049-11466201)
chr7 (746-889)||(34709234-34709378)
chr7 (763-889)||(48590732-48590859)
chr7 (732-886)||(49148319-49148474)
chr7 (746-889)||(23029790-23029935)
chr7 (751-894)||(38481286-38481430)
chr7 (745-889)||(17844544-17844689)
chr7 (787-889)||(12345077-12345180)
chr7 (788-889)||(9485759-9485861)
chr7 (754-873)||(21316611-21316730)
chr7 (744-889)||(28425621-28425767)
chr7 (569-712)||(25846302-25846445)
chr7 (746-889)||(1342777-1342921)
chr7 (556-654)||(18259580-18259678)
chr7 (788-889)||(38531193-38531294)
chr7 (555-654)||(15729497-15729596)
chr7 (730-889)||(19757526-19757686)
chr7 (712-889)||(46879534-46879714)
chr7 (555-654)||(48808953-48809052)
chr7 (555-686)||(3587656-3587783)
chr7 (556-654)||(34128322-34128420)
chr7 (556-713)||(24443921-24444074)
chr7 (806-889)||(35000773-35000857)
chr7 (735-876)||(48620448-48620588)
chr7 (746-889)||(791343-791487)
chr7 (555-654)||(18399850-18399949)
chr7 (787-889)||(46757752-46757855)
chr7 (556-654)||(18406835-18406933)
chr7 (556-654)||(19858869-19858967)
chr7 (556-654)||(10669358-10669456)
chr7 (556-654)||(30253885-30253983)
chr7 (556-654)||(47167315-47167413)
chr7 (789-889)||(22642261-22642362)
chr7 (810-889)||(40893437-40893517)
chr7 (556-654)||(2204298-2204396)
chr7 (556-654)||(8464746-8464844)
chr7 (561-713)||(14585913-14586067)
chr7 (556-654)||(18139797-18139895)
chr7 (556-654)||(19230634-19230732)
chr7 (556-654)||(22994055-22994153)
chr7 (571-703)||(19393835-19393963)
chr7 (791-889)||(36612121-36612220)
chr7 (559-713)||(15170432-15170581)
chr7 (804-857)||(24170803-24170856)
chr7 (817-889)||(27869572-27869645)
chr7 (555-682)||(42150499-42150627)
chr7 (836-894)||(39698930-39698989)
chr7 (610-701)||(14073105-14073192)
chr7 (610-701)||(14383133-14383220)
chr7 (556-654)||(28130309-28130407)
chr7 (556-630)||(48813749-48813823)
chr7 (556-605)||(31190951-31191000)
chr7 (558-633)||(5983248-5983324)
chr7 (789-889)||(7884693-7884790)
chr7 (838-893)||(47584185-47584241)
chr7 (663-713)||(5983112-5983162)
chr7 (712-760)||(34709206-34709255)
chr7 (818-853)||(21358657-21358692)
chr7 (787-858)||(21740187-21740258)
chr7 (556-713)||(22968697-22968851)
chr7 (857-894)||(32168931-32168969)
chr7 (826-886)||(45672375-45672436)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (706-889)||(12719-12904)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (712-889)||(126762-126940)
scaffold0031 (556-713)||(40389-40542)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (709-889)||(22557-22739)
[»] scaffold1632 (1 HSPs)
scaffold1632 (712-889)||(39-218)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (712-868)||(27158-27316)
[»] scaffold0197 (2 HSPs)
scaffold0197 (711-889)||(28078-28267)
scaffold0197 (746-894)||(30174-30323)
[»] scaffold0246 (1 HSPs)
scaffold0246 (713-889)||(7024-7201)
[»] scaffold0087 (1 HSPs)
scaffold0087 (787-894)||(53018-53126)
[»] scaffold0002 (2 HSPs)
scaffold0002 (753-889)||(431265-431402)
scaffold0002 (798-889)||(119241-119333)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (746-889)||(192013-192157)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (789-889)||(63887-63988)
[»] scaffold0016 (3 HSPs)
scaffold0016 (753-889)||(93388-93525)
scaffold0016 (815-885)||(84325-84396)
scaffold0016 (710-750)||(93514-93554)
[»] scaffold0027 (2 HSPs)
scaffold0027 (712-823)||(41814-41925)
scaffold0027 (835-889)||(41767-41822)
[»] scaffold0362 (1 HSPs)
scaffold0362 (788-894)||(5451-5557)
[»] scaffold0418 (1 HSPs)
scaffold0418 (816-893)||(4562-4640)
[»] scaffold0378 (1 HSPs)
scaffold0378 (553-654)||(8049-8150)
[»] scaffold0343 (1 HSPs)
scaffold0343 (810-889)||(9294-9374)
[»] scaffold0061 (1 HSPs)
scaffold0061 (555-654)||(76306-76405)
[»] scaffold1948 (1 HSPs)
scaffold1948 (556-654)||(1071-1169)
[»] scaffold0264 (2 HSPs)
scaffold0264 (556-654)||(4132-4230)
scaffold0264 (556-654)||(10987-11085)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (556-654)||(18871-18969)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (556-654)||(119477-119575)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (556-654)||(130681-130779)
scaffold0001 (601-654)||(138592-138645)
[»] scaffold0393 (1 HSPs)
scaffold0393 (558-654)||(15280-15376)
[»] scaffold0059 (1 HSPs)
scaffold0059 (554-654)||(33962-34062)
[»] scaffold0376 (1 HSPs)
scaffold0376 (556-654)||(11985-12083)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (556-654)||(40151-40249)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (556-654)||(67830-67928)
[»] scaffold0466 (1 HSPs)
scaffold0466 (571-701)||(13363-13489)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (555-654)||(8846-8947)
[»] scaffold0041 (1 HSPs)
scaffold0041 (810-889)||(72767-72847)
[»] scaffold2089 (1 HSPs)
scaffold2089 (556-654)||(175-273)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (556-654)||(13740-13838)
[»] scaffold0166 (1 HSPs)
scaffold0166 (711-778)||(36319-36387)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (816-876)||(10833-10893)
[»] scaffold0611 (1 HSPs)
scaffold0611 (556-654)||(9516-9614)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (556-654)||(19291-19389)
[»] scaffold0086 (1 HSPs)
scaffold0086 (555-648)||(53520-53613)
[»] scaffold0063 (1 HSPs)
scaffold0063 (556-654)||(45404-45502)
[»] scaffold0111 (1 HSPs)
scaffold0111 (615-702)||(26413-26496)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (739-857)||(8997-9115)
[»] scaffold0783 (1 HSPs)
scaffold0783 (556-613)||(6227-6284)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 586; Significance: 0; HSPs: 62)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 586; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 713
Target Start/End: Original strand, 4072772 - 4073477
Alignment:
Q  9 aaataatatatcaacttttatccccgagctaggtttcgaagattaggaattgcactcgggccatccaatctccagcaatttcaagtgaggataatcattg 108  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4072772 aaataatatatcaacttttctccccgagccaggtttcgaagattaggaattgcactcgggccatccaatctccagcaatttcaagtgaggataatcattg 4072871  T
Q  109 gtcc-tgacaatcgtgatagctgtcatgatttgccgataaaaaatgttgcatttgttctttatcatgtctt-gctgaaacggatacctcttcacgtcttc 206  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4072872 gtccctaacaatcgtgatagctgtcatgatttgccgataaaaaatgttgcatttgttctttatcaggtttttgctgaaacggatacctcctcacgtcttc 4072971  T
Q  207 annnnnnnaatgagcgttgctatagataaagaaggtttccttcgtgaaacttcccaatgccaacatgttgtatttgcaaagcaagggaaaacttgcaatt 306  Q
    |       ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4072972 atttttttaatgagcgttgctatagatcaagaaggtttccttcgtgaaacttcccaatgccaacatgttgtatttgcaaagcaagggaaaacttgcaatt 4073071  T
Q  307 cttatttaaaggaaaacatgggtgggtcaaggtatgactatccaatgaaaataaatcgtaaaatgcttgggatgtaacctctcacgacattaatcatttc 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4073072 cttatttaaaggaaaacatgggtgggtcaaggtttgactatccaatgaaaataaatcgtaaaatgcttgg-atgtaacctctcacgacattaatcatttc 4073170  T
Q  407 tgttttttaatctacacttccatgtaaaatttcattaactcgggacccactattttctgaataagcttgagaatcaagaggcactaaatgcctatttgaa 506  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4073171 tgttttttaatctacacttccatgtaaaatttcattaactcgggacccactattttctgaataagcttgagaatcaagaggcactaaatgcctatttgaa 4073270  T
Q  507 taaacaaatttctctttccggtccttagaataagaagaagatttaattatgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgt 606  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4073271 taaacaaatttctctttcaggtccttataataagaagaagacttaattatgttggtgtaagtcttagatgccaataatttatgttaaacttatgttatgt 4073370  T
Q  607 attatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatatttgtttgttgtaagattaataaagtccctagaattgatacttcatgtaatggaa 706  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  4073371 atcatgatttttatcattaaataaaatatggcattctttattacatttgtttgttgtaagattaataaagtccatagaattgatagttcatataatggaa 4073470  T
Q  707 cattaag 713  Q
    |||||||    
T  4073471 cattaag 4073477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 710 - 894
Target Start/End: Complemental strand, 31100198 - 31100012
Alignment:
Q  710 taagggtctgtttgggaaacccaaaa-aagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacacttttt 808  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| |||||||||||    
T  31100198 taaggctctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacacttttt 31100099  T
Q  809 caccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagcttctcac 894  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31100098 caccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttctcac 31100012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 710 - 889
Target Start/End: Original strand, 2442388 - 2442569
Alignment:
Q  710 taagggtctgtttgggaaacccaaaaaa-gagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacacttttt 808  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| |||||||||||    
T  2442388 taagggtctgtttgggaaactaaaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacacttttt 2442487  T
Q  809 caccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2442488 caccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 2442569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 716 - 889
Target Start/End: Original strand, 20804960 - 20805134
Alignment:
Q  716 tctgtttgggaaacccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatg 815  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||        | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  20804960 tctgtttgggaaaccaaaaaaagagcttttagtttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaacactttttcaccatg 20805059  T
Q  816 agcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20805060 agcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 20805134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 708 - 889
Target Start/End: Original strand, 12297326 - 12297509
Alignment:
Q  708 attaagggtctgtttgggaaaccc-aaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacacttt 806  Q
    |||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| |||||||||    
T  12297326 attatgggtctgtttggttaaccccaaaaaagagcttttaccttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacacttt 12297425  T
Q  807 ttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12297426 ttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 12297509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 708 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 30811334 - 30811151
Alignment:
Q  708 attaagggtctgtttgggaaacccaaaaaa-gagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacacttt 806  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||        |||||||||| ||| |||||    
T  30811334 attatgggtctgtttgggaaacccaaaaaaagagtttttagcttttagcttatagcttataagttcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaatacttt 30811235  T
Q  807 ttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30811234 ttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 30811151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 713 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 14227715 - 14227538
Alignment:
Q  713 gggtctgtttgggaaaccc-aaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcac 811  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||| |||||| ||||||||||||||    
T  14227715 gggtctgtttggttaaccccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgataaaaaa-gctttgtttggtaacactttttcac 14227617  T
Q  812 catgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14227616 catgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 14227538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 729 - 889
Target Start/End: Original strand, 32731742 - 32731903
Alignment:
Q  729 cccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagctta 828  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32731742 cccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagctta 32731841  T
Q  829 tttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32731842 tttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 32731903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 732 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 34233075 - 34232917
Alignment:
Q  732 aaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttattt 831  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34233075 aaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttattt 34232976  T
Q  832 cacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  34232975 cacgagcttataagctatttttcagaagctatttcaagtagcgtttgagcttatagctt 34232917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 713 - 894
Target Start/End: Complemental strand, 31452134 - 31451952
Alignment:
Q  713 gggtctgtttgggaaacccaaaaaa-gagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcac 811  Q
    |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| ||||||||||||||    
T  31452134 gggtctgtttgggaaaacaaaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcac 31452035  T
Q  812 catgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagcttctcac 894  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  31452034 catgagcttatagcttatttcacgagcttataagctgtttttcagaagctattccaagtagtgtttgagctta-agcttctcac 31451952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 746 - 894
Target Start/End: Original strand, 10856133 - 10856282
Alignment:
Q  746 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaa 845  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  10856133 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 10856232  T
Q  846 ctatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagcttctcac 894  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10856233 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttctcac 10856282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 705 - 889
Target Start/End: Original strand, 558326 - 558505
Alignment:
Q  705 aacattaagggtctgtttgggaaacccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnn-gctctgtttgataacac 803  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||       |||||||||||||||||||||         |||||||||| ||||||    
T  558326 aacactaagggtctgtttgggaaacccaaaaaaaagcttttagctt-------atagcttataagctcgtttgacaaaaaaaagctctgtttggtaacac 558418  T
Q  804 tttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  558419 tttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 558505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 713 - 864
Target Start/End: Complemental strand, 1806494 - 1806343
Alignment:
Q  713 gggtctgtttgggaaacccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcacc 812  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||         ||||||||| |||||||||||||||    
T  1806494 gggtctgtttggttaacccaaaaaagagcttttagcttatagcttatagcttataagctcgtttgactaaaaaatctctgtttggtaacactttttcacc 1806395  T
Q  813 atgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctatt 864  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1806394 atgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctatt 1806343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 95; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 712 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 6709870 - 6709698
Alignment:
Q  712 agggtctgtttgggaaacccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcac 811  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||      ||||||||||||||||| ||||||||          |||||||| ||||||||||||||    
T  6709870 agggtctgtttgggaaaccaaaaaaagagctttta------agcttatagcttataagttcgtttgacaaaaaaaattctgtttggtaacactttttcac 6709777  T
Q  812 catgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6709776 catgagcttatagcttatttcacgaaattataaactatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 6709698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 95; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 744 - 894
Target Start/End: Original strand, 33453734 - 33453885
Alignment:
Q  744 ttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttata 843  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||        |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33453734 ttagcttatagcttatagtttataagttcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttata 33453833  T
Q  844 aactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagcttctcac 894  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33453834 agctatttttcagaagttattccaagtagcgtttgagcttatagcttctcac 33453885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 746 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 34685161 - 34685018
Alignment:
Q  746 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaa 845  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  34685161 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacacattttcac-atgagcttatagcttatttcacgagcttataag 34685063  T
Q  846 ctatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34685062 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 34685018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 716 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 7317788 - 7317613
Alignment:
Q  716 tctgtttgggaaacccaaaaaa-gagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccat 814  Q
    ||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| |        |||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  7317788 tctgtttggtaaactcaaaaaaagagcttttagctcttaacttatagcttataagttcgtttcacagaaaaagctctgtttggtaacattttttgaccat 7317689  T
Q  815 gagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  7317688 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaaatagcgtttgagcttatagctt 7317613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 753 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 12432760 - 12432623
Alignment:
Q  753 agcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 852  Q
    ||||||||||||||||||||||||||         ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12432760 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaatctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 12432661  T
Q  853 tcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12432660 tcagaagccattccaagtagcgtttgagcttatagctt 12432623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 753 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 33540865 - 33540728
Alignment:
Q  753 agcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 852  Q
    ||||||||||||||||||||||||||         ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33540865 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaactctgtttggtaacactttttcaccataagcttatagcttatttcacgagcttataatctatttt 33540766  T
Q  853 tcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33540765 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 33540728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 731 - 894
Target Start/End: Complemental strand, 3636801 - 3636638
Alignment:
Q  731 caaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatt 830  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||          |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3636801 caaaaaagagcttttagctcttaacttatagcttataagcttgtttgacaaaaaaat-tctgtttggtaacactttttcaccataagcttatagcttatt 3636703  T
Q  831 tcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtag-cgttgagcttatagcttctcac 894  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||    
T  3636702 tcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcctttgaacttatagcttctcac 3636638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 711 - 889
Target Start/End: Original strand, 34903924 - 34904091
Alignment:
Q  711 aagggtctgtttgggaaac-ccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttc 809  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| ||||||||||||    
T  34903924 aagggtctgtttgggaaactccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttc 34904023  T
Q  810 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||||             ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34904024 accatgagcttat-------------agcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 34904091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 789 - 889
Target Start/End: Original strand, 5943035 - 5943136
Alignment:
Q  789 tctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagc 887  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  5943035 tctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagtgtttgagcttatagc 5943134  T
Q  888 tt 889  Q
    ||    
T  5943135 tt 5943136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 746 - 889
Target Start/End: Original strand, 34439683 - 34439827
Alignment:
Q  746 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaa 845  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||         ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  34439683 agcttatagcttatagcttataagctcgtctgacaaaaaaaactctgtttggtaatactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 34439782  T
Q  846 ctatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  34439783 ctatttttcagaagctattccaagtaacgtttgagcttatagctt 34439827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 787 - 885
Target Start/End: Original strand, 5681561 - 5681660
Alignment:
Q  787 gctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttata 885  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5681561 gctctgtttggcaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttata 5681660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 746 - 889
Target Start/End: Original strand, 28076423 - 28076567
Alignment:
Q  746 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaa 845  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||        |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28076423 agcttatagcttatagcttataaactcgtctgacaaaaaaagctctgtttggtaatacttttttaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 28076522  T
Q  846 ctatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28076523 ctatttttgagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 28076567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 746 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 3108153 - 3108008
Alignment:
Q  746 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagctta-tttcacgagcttataa 844  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||        ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  3108153 agcttatagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctatttggtaacactttttcaccatgagcttataacttaatttcacgagcttataa 3108054  T
Q  845 actatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
     ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||    
T  3108053 gctatttttcagaagctatttcaaatagcgtttgagcttatagctt 3108008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 556 - 713
Target Start/End: Original strand, 19218179 - 19218332
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatatttg 655  Q
    ||||||||||| || || |  |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||        
T  19218179 tgttggtgtaacccctatagtccaatagtttatgttaaatttatgctatgtatcatgacttttattattaaataatatatggcattctttattata---- 19218274  T
Q  656 tttgttgtaagattaataaagtccctagaattgatacttcatgtaatggaacattaag 713  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||| ||| ||||||    
T  19218275 tttgttgtaagattaataaagtctctagaatagatagttcgtgtaatagaatattaag 19218332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 793 - 889
Target Start/End: Original strand, 2970722 - 2970819
Alignment:
Q  793 tttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2970722 tttggtaacacttttttaccatgagtttatagcttatttcacgagcttataatctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 2970819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 752 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 29823176 - 29823038
Alignment:
Q  752 tagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactattt 851  Q
    |||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||  |||||    
T  29823176 tagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttgataacattttttcaccatgagctaatagcttattttgcgagcttataagttattt 29823077  T
Q  852 ttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  29823076 ttcaaaagctattcaaagtagcgtttgagcttatagctt 29823038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 753 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 5301741 - 5301604
Alignment:
Q  753 agcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 852  Q
    |||||||||||||||||||||| |||        | |||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5301741 agcttatagcttataagctcgtatgacaaaaaaagttctgtttggtaatgttttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 5301642  T
Q  853 tcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  5301641 tcagaagctattccaagtagcgtttaagcttatagctt 5301604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 746 - 889
Target Start/End: Original strand, 11015590 - 11015734
Alignment:
Q  746 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaa 845  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||         ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||     
T  11015590 agcttatagcttatagcttataagctcgtctgacaaaaaaaactctgtttggtaatactttttcaccatgagcttataacttatttcacgagcttacaag 11015689  T
Q  846 ctatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  11015690 ctatttttgagaagctattctaagtagcgtttgagcttatagctt 11015734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 791 - 889
Target Start/End: Original strand, 31049379 - 31049478
Alignment:
Q  791 tgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  31049379 tgtttggtaatactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttgagaagctattccaaatagtgtttgagcttatagctt 31049478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 710 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 29415094 - 29414926
Alignment:
Q  710 taagggtctgtttgggaa-acccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacacttttt 808  Q
    ||||||||||||||| || ||| ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| |||||||||||    
T  29415094 taagggtctgtttggtaacacctaaaaaagagtttatagctcttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacacttttt 29414995  T
Q  809 caccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||||             ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  29414994 caccatgagcttat-------------agcttataagctatttttcagaagctattccaagtagtgtttgagcttatagctt 29414926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 803 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 12140968 - 12140881
Alignment:
Q  803 ctttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  12140968 ctttttcaccatgagcttatagtttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctatttcaagtagcgtttgaacttatagctt 12140881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 787 - 889
Target Start/End: Original strand, 20563435 - 20563538
Alignment:
Q  787 gctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcgt-tgagcttata 885  Q
    ||||||||||||||  || | | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||    
T  20563435 gctctgtttgataatgctctcttaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctatttcaagtagcatctgagcttata 20563534  T
Q  886 gctt 889  Q
    ||||    
T  20563535 gctt 20563538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 805 - 889
Target Start/End: Original strand, 21894311 - 21894396
Alignment:
Q  805 ttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21894311 ttttcaccacgagattatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagacgctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 21894396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 753 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 7292688 - 7292551
Alignment:
Q  753 agcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 852  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||       ||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  7292688 agcttatagcttataagctcgtcggataaaaaaagctctgtttgataacgcttttttacaatgagcttatagcttatttcagaagcttataagctatttt 7292589  T
Q  853 tcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||| |||||| | |||||| || |||||||||||||||    
T  7292588 tcataagctacttcaagtaacgtttgagcttatagctt 7292551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 556 - 713
Target Start/End: Complemental strand, 20736882 - 20736729
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatatttg 655  Q
    |||||||||| ||| |||| |||||||  |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||      
T  20736882 tgttggtgtatgccctagaggccaataggttatgttaatcttatgttatgtatcatgacttttattattaaataatatatgccactctttattatatt-- 20736785  T
Q  656 tttgttgtaagattaataaagtccctagaattgatacttcatgtaatggaacattaag 713  Q
      ||||||||  |||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||| | ||||||    
T  20736784 --tgttgtaatgttaataaagttcctagaatagatagttcgtgtaatggtatattaag 20736729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 753 - 889
Target Start/End: Original strand, 23648201 - 23648338
Alignment:
Q  753 agcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 852  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||        |||||||||| |||  || | | |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23648201 agcttatagcttataagcttgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaatgctctcttaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 23648300  T
Q  853 tcagaagctattccaagtagcgt-tgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  23648301 tcagaagctatttcaagtagcttctgagcttatagctt 23648338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 555 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 1586664 - 1586565
Alignment:
Q  555 atgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  1586664 atgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaatctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 1586565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 791 - 885
Target Start/End: Complemental strand, 15591252 - 15591157
Alignment:
Q  791 tgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttata 885  Q
    |||||||||||  ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  15591252 tgtttgataacggttttttacaacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctacttcaagtagcgtttgagcttata 15591157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 556 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 5759034 - 5758936
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||  | ||||||||||||||    
T  5759034 tgttggtgtaagccctagaggccaataatttatgttaaacttatcttatgtatgatgacttttattattgaataatatatgatactctttattatattt 5758936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 556 - 654
Target Start/End: Original strand, 16788818 - 16788916
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  16788818 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 16788916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 556 - 653
Target Start/End: Complemental strand, 18020396 - 18020299
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatatt 653  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  18020396 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatt 18020299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 806 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 6104757 - 6104673
Alignment:
Q  806 tttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  6104757 tttcaccacgagcttatagcttatttcgcgagcttataagctatttttcagatactatttcaagtagcgtttgagcttatagctt 6104673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 789 - 886
Target Start/End: Original strand, 1225475 - 1225573
Alignment:
Q  789 tctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatag 886  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||| || |||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  1225475 tctgtttgataacactttttcatcaagagcttatattttatttcacaagtttataagctattttttagaagttatttcaagtagcgtttgagcttatag 1225573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 556 - 654
Target Start/End: Original strand, 14074227 - 14074325
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||  ||| |||||||| |||||| |||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  14074227 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaaaatatcttatgtatcatgactattattattgaataatatatggcactctttattatattt 14074325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 556 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 22860443 - 22860345
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||| |||  |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  22860443 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattggataatatatggcactctttattatattt 22860345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 556 - 653
Target Start/End: Original strand, 8612664 - 8612761
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatatt 653  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||| |||||| ||| ||||| ||||| || |||||||||||||    
T  8612664 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaataatatatgacactctttattatatt 8612761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 554 - 654
Target Start/End: Original strand, 13947499 - 13947600
Alignment:
Q  554 tatgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcatt-aaataaaatatggcattctttattatat 652  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||| |||  ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  13947499 tatgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgtaataatatatggcactctttattatat 13947598  T
Q  653 tt 654  Q
    ||    
T  13947599 tt 13947600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 555 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 13995499 - 13995400
Alignment:
Q  555 atgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    |||||||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  13995499 atgttggtataagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatgacactctttattatattt 13995400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 556 - 654
Target Start/End: Original strand, 14996859 - 14996957
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    ||||||||||||   |||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  14996859 tgttggtgtaagatctagaggccaatattttatgttaaacttatcttatgtattatgactttaattattgaataatatatgacactctttattatattt 14996957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 557 - 713
Target Start/End: Complemental strand, 10359588 - 10359436
Alignment:
Q  557 gttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatatttgt 656  Q
    |||||||||||  ||||| | ||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||| ||||| |||         
T  10359588 gttggtgtaagttttagaggtcaatagtttatgttaaacttatcgtatgtattatgatttttaatattaaataaaatatgacattatttatcata----a 10359493  T
Q  657 ttgttgtaagattaataaagtccctagaattgatacttcatgtaatggaacattaag 713  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||| |||  ||| || |||| |||||| ||||||    
T  10359492 ttgttataagattaataaagtctctataatatatagttgatgtgatggaatattaag 10359436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 556 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 27508903 - 27508804
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcatt-aaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||| |||  ||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  27508903 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctattttatgtatcatgacttttattattgtaataatatatgacactctttattatattt 27508804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 806 - 876
Target Start/End: Original strand, 9896766 - 9896836
Alignment:
Q  806 tttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcgtt 876  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||| | |||| |||||||||||    
T  9896766 tttcaccacgagcttatagtttatttcacaagcttataagctatttttcagacgttatttcaagtagcgtt 9896836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 556 - 713
Target Start/End: Complemental strand, 22560740 - 22560587
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatatttg 655  Q
    |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| |||||   ||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||| || | |||||||||        
T  22560740 tgttggtgtaagccctagaagccgatagtttatgttaaaattatgcagtgtatcatgacttctattattaaataatatatgacactttttattata---- 22560645  T
Q  656 tttgttgtaagattaataaagtccctagaattgatacttcatgtaatggaacattaag 713  Q
    ||| ||| || |||||||| |||| |||||| |||| ||| |||||||| | ||||||    
T  22560644 tttattgcaatattaataaggtccttagaatagatagttcgtgtaatgggatattaag 22560587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 556 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 27528489 - 27528390
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcatt-aaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    |||||||||||||| || | ||||||| |||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||| |||  ||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  27528489 tgttggtgtaagccctaaaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgtaataatatatgacactctttattatattt 27528390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 556 - 630
Target Start/End: Original strand, 21993711 - 21993784
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataa 630  Q
    |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  21993711 tgttggtgtaagccctata-gccaataatttatgttaaacctatgatatgtatcatgacttttattattaaataa 21993784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 805 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 5893981 - 5893896
Alignment:
Q  805 ttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||  ||||| |||||||||| || |||||||||  |||||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  5893981 ttttcaccacaagcttttagcttattttactagcttataacttattttccagacgctatttcaagtagcgtttgagcttatagctt 5893896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 602 - 713
Target Start/End: Complemental strand, 23846879 - 23846772
Alignment:
Q  602 tatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatatttgtttgttgtaagattaataaagtccctagaattgatacttcatgtaa 701  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||||||||||  | ||||||||| |||    |||||||||||||||||||| | |  ||||| ||||  |||||| |    
T  23846879 tatgtatcatgacttttaatattaaataaaataatgtattctttatcata----tttgttgtaagattaataaaattcaaagaatagatagctcatgtga 23846784  T
Q  702 tggaacattaag 713  Q
    ||||||||||||    
T  23846783 tggaacattaag 23846772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 815 - 876
Target Start/End: Original strand, 26561419 - 26561480
Alignment:
Q  815 gagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcgtt 876  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  26561419 gagcttatagtttatttcaggagcttataacttatttttcaaacgctatttcaagtagcgtt 26561480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 556 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 17121002 - 17120905
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagcct-tagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    ||||||||||||||  |||| | ||||| ||||||||||| | || |||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||  | ||||||||||||||    
T  17121002 tgttggtgtaagcccctagaggtcaatagtttatgttaaactcatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatg--actctttattatattt 17120905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 136; Significance: 2e-70; HSPs: 102)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 706 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 31150596 - 31150412
Alignment:
Q  706 acattaagggtctgtttgggaaacccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactt 805  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||| | ||||||||    
T  31150596 acattaagggtctgtttgggaaacccaaaaaaaagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgttgggtaacactt 31150497  T
Q  806 tttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31150496 tttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 31150412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 707 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 42064487 - 42064304
Alignment:
Q  707 cattaagggtctgtttgggaaacccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacacttt 806  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| |||||||||    
T  42064487 cattaagggtctgtttgggaaactaaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacacttt 42064388  T
Q  807 ttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42064387 ttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 42064304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 708 - 894
Target Start/End: Complemental strand, 13121753 - 13121566
Alignment:
Q  708 attaagggtctgtttgggaaacccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttt 807  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| ||||||||||    
T  13121753 attaagggtctgtttggttaaccccaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttt 13121654  T
Q  808 tcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagcttctcac 894  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  13121653 tcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatcac 13121566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 717 - 889
Target Start/End: Original strand, 26204249 - 26204422
Alignment:
Q  717 ctgtttgggaaacccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatga 816  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26204249 ctgtttggttaacccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgataaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatga 26204348  T
Q  817 gcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26204349 gcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 26204422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 710 - 889
Target Start/End: Original strand, 29586126 - 29586306
Alignment:
Q  710 taagggtctgtttgggaaacccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttc 809  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| |||||||||||     
T  29586126 taagggtctgtttgggaaactaaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttt 29586225  T
Q  810 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29586226 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 29586306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 716 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 36301265 - 36301092
Alignment:
Q  716 tctgtttgggaaacccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatg 815  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36301265 tctgtttggttaacccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttga-caaaaaagctctgtttgataacactttttcaccatg 36301167  T
Q  816 agcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36301166 agcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 36301092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 711 - 894
Target Start/End: Complemental strand, 7711121 - 7710936
Alignment:
Q  711 aagggtctgtttgggaaacccaaaaaa-gagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttc 809  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||         ||||||||| ||||||||||||    
T  7711121 aagggtctgtttgggaaacccaaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagttcgtttgacaaaaaaaactctgtttggtaacactttttc 7711022  T
Q  810 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagcttctcac 894  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7711021 atcatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttctcac 7710936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 708 - 894
Target Start/End: Original strand, 17046694 - 17046882
Alignment:
Q  708 attaagggtctgtttgggaaaccc-aaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacacttt 806  Q
    |||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||| |||||| |||||||||    
T  17046694 attatgggtctgtttggttaaccccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctttgtttggtaacacttt 17046793  T
Q  807 ttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagcttctcac 894  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17046794 ttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttctcac 17046882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 708 - 894
Target Start/End: Original strand, 39826565 - 39826753
Alignment:
Q  708 attaagggtctgtttgggaaacccaa-aaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacacttt 806  Q
    |||||||||||| ||||  ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| |||||||||    
T  39826565 attaagggtctgattggttaaccccataaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacacttt 39826664  T
Q  807 ttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagcttctcac 894  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39826665 ttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttctcac 39826753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 713 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 36838860 - 36838682
Alignment:
Q  713 gggtctgtttgggaaacccaaaaaa-gagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcac 811  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        | |||||||| |||||||||||| |    
T  36838860 gggtctgtttgggaaacccaaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaacactttttctc 36838761  T
Q  812 catgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36838760 catgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 36838682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 713 - 889
Target Start/End: Original strand, 44909811 - 44909988
Alignment:
Q  713 gggtctgtttgggaaacccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcacc 812  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||        |||||||||| |||||||||||||||    
T  44909811 gggtctgtttggttaaccccaaaaagagcttttagcttttaacttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcacc 44909910  T
Q  813 atgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44909911 atgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 44909988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 711 - 894
Target Start/End: Complemental strand, 47134697 - 47134513
Alignment:
Q  711 aagggtctgtttgggaaacccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttca 810  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||        |||||||||| |||||||||||||    
T  47134697 aagggtctgtttggttaacccaaaaaagagcttttagcttttaccttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttca 47134598  T
Q  811 ccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagcttctcac 894  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  47134597 ccatgagcttatagcttatttcatgagcttataagctatttttcagaagctattctaagtagcgtttgagcttatagcttatcac 47134513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 713 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 30721789 - 30721610
Alignment:
Q  713 gggtctgtttgggaaacccaaaaaa-gagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnn-gctctgtttgataacactttttca 810  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||| |||||||||||||    
T  30721789 gggtctgtttgggaaacccaaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaagctctgtttggtaacactttttca 30721690  T
Q  811 ccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30721689 ccatgaacttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 30721610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 713 - 886
Target Start/End: Original strand, 33524498 - 33524673
Alignment:
Q  713 gggtctgtttgggaaaccc-aaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcac 811  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||       |||||||||| ||||||||||||||    
T  33524498 gggtctgtttggttaaccccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagcttgtttgataaaaaaagctctgtttggtaacactttttcac 33524597  T
Q  812 catgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatag 886  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33524598 catgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatag 33524673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 716 - 889
Target Start/End: Original strand, 1917999 - 1918173
Alignment:
Q  716 tctgtttgggaaacccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatg 815  Q
    |||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1917999 tctgtttggttaacccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatg 1918098  T
Q  816 agcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1918099 agcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 1918173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 729 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 19899056 - 19898895
Alignment:
Q  729 cccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagctta 828  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||        | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19899056 cccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagttcgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagctta 19898957  T
Q  829 tttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19898956 tttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 19898895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 713 - 889
Target Start/End: Original strand, 30774056 - 30774229
Alignment:
Q  713 gggtctgtttgggaaacccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcacc 812  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||       |||||||||| |||||||||||||||    
T  30774056 gggtctgtttggttaacccaaaaaagagcttttagcttttaacttatagcttataagttcgtttgataaa----gctctgtttggtaacactttttcacc 30774151  T
Q  813 atgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30774152 ataagtttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 30774229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 713 - 889
Target Start/End: Original strand, 15313214 - 15313391
Alignment:
Q  713 gggtctgtttgggaaacccaaaaaa-gagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcac 811  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||       |||||||||| |||||||||| |||    
T  15313214 gggtctgtttgggaaacccaaaaaaagaacttttagcttttaacttatagcttataagttcgtttgataaaaaaagctctgtttggtaacactttt-cac 15313312  T
Q  812 catgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15313313 catgagcttatagcttatttcacaagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 15313391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 732 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 17500030 - 17499872
Alignment:
Q  732 aaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttattt 831  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||        |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17500030 aaaaaagagcttttagcttttagtttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttattt 17499931  T
Q  832 cacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  17499930 cacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttaagcttatagctt 17499872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 709 - 889
Target Start/End: Original strand, 26843717 - 26843899
Alignment:
Q  709 ttaagggtctgtttgggaaacccaaaaaag-agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttt 807  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||| |||||||| ||||||    
T  26843717 ttaagggtctgtttggaaaatccaaaaaaatagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctatttgataatactttt 26843816  T
Q  808 tcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||    
T  26843817 tcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctatttcaagtagcgtttgagtttatagctt 26843899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 709 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 32368508 - 32368326
Alignment:
Q  709 ttaagggtctgtttgggaaaccc-aaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttt 807  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||        |||||||||| ||||||||||    
T  32368508 ttaagggtctgtttggttaaccctaaaaaagagcttttaacttttagcttatagcttataagcttgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttt 32368409  T
Q  808 tcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32368408 tcaccatgagcttataacttatttcacgagcttatatgctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 32368326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 709 - 894
Target Start/End: Complemental strand, 38967624 - 38967446
Alignment:
Q  709 ttaagggtctgtttgggaaacccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacacttttt 808  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||        |||||||||| |||||||||||    
T  38967624 ttaagggtctgtttgggaaaacaaaaaaagagcttttagctt-------atagcttataagctcgtttga-caaaaaagctctgtttggtaacacttttt 38967533  T
Q  809 caccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagcttctcac 894  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38967532 caccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttctcac 38967446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 712 - 889
Target Start/End: Original strand, 2497891 - 2498070
Alignment:
Q  712 agggtctgtttgggaaacccaaaaa-agagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttca 810  Q
    ||||||||||| |  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        |||||||||| |||||| ||||||    
T  2497891 agggtctgtttagttaaccctaaaatagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacaccttttca 2497990  T
Q  811 ccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2497991 ccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 2498070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 716 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 29704246 - 29704071
Alignment:
Q  716 tctgtttgggaaacccaaaa-aagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccat 814  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||        |||||||||| |||||||||||||||||    
T  29704246 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttaatttttagcttatagcttataagcttgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccat 29704147  T
Q  815 gagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29704146 gagcttataacttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 29704071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 713 - 889
Target Start/End: Original strand, 34319359 - 34319537
Alignment:
Q  713 gggtctgtttgggaaacccaaaaaa-gagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcac 811  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |        | |||||||| ||||||||||| ||    
T  34319359 gggtctgtttggtaaacccaaaaaaagagcttttagctcttagcttatagcttataagctcgtttcacaaaaaaagttctgtttggtaacactttttgac 34319458  T
Q  812 catgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34319459 catgaccttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 34319537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 716 - 889
Target Start/End: Original strand, 38676463 - 38676637
Alignment:
Q  716 tctgtttgggaaacccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatg 815  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||        |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38676463 tctgattgggaaaccccaaaaaaagcttttagcttttaacttatagtttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatg 38676562  T
Q  816 agcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  38676563 agcttatagcttatttcacgaacttataagctatttttcagaagctatttcaagtagcgtttgagcttatagctt 38676637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 730 - 886
Target Start/End: Original strand, 15348812 - 15348969
Alignment:
Q  730 ccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttat 829  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||        || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15348812 ccaaaaaagagcttttagctctttgcttatagcttataagctcgtttgataaaaaaaactatgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttat 15348911  T
Q  830 ttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatag 886  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15348912 ttcacgagcttataaattatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatag 15348969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 727 - 894
Target Start/End: Original strand, 25601971 - 25602139
Alignment:
Q  727 aacccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagct 826  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||        |||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||    
T  25601971 aacccaaaaaagagcttttagctcttagcttataggttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtatcacttttttaccatgaccttatagct 25602070  T
Q  827 tatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagcttctcac 894  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25602071 tatttcacgagcttataagctatttttcagaagctatttcaagtagcgtttgagcttatagcttctcac 25602139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 713 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 1507909 - 1507730
Alignment:
Q  713 gggtctgtttgggaa-acccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnn-gctctgtttgataacactttttca 810  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||| |||||||||||||    
T  1507909 gggtctgtttggtaacacccaaaaaagagtttttagctcttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaagaagctctgtttggtaacactttttca 1507810  T
Q  811 ccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  1507809 ccattagtttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaaatagcgtttgagcttatagctt 1507730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 705 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 51423158 - 51422971
Alignment:
Q  705 aacattaagggtctgtttgggaa-acccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnn-gctctgtttgataaca 802  Q
    ||||||| |||||||||||| || |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||        | ||||||||||||||    
T  51423158 aacattaggggtctgtttggtaacattcaaaaaagagcttttaacttttagcttatagcttataagtttgtttgataaaaaaaagttctgtttgataaca 51423059  T
Q  803 ctttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  51423058 ctttttcaccatgaacttatagcttatttcacgagtttataaactattttttagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 51422971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 98; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 728 - 889
Target Start/End: Original strand, 3660931 - 3661093
Alignment:
Q  728 acccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagctt 827  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||        | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3660931 acccaaaaaagagcttttagttcttagcttatagcttataagctcatttgacaacaaaagttctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatatctt 3661030  T
Q  828 atttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3661031 atttcacgagcttataagctatttttcaaaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 3661093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 746 - 889
Target Start/End: Original strand, 322869 - 323013
Alignment:
Q  746 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaa 845  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||        | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  322869 agcttttagcttatagcttataagcttgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaacacttttttaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaa 322968  T
Q  846 ctatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  322969 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 323013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 746 - 889
Target Start/End: Original strand, 50351036 - 50351180
Alignment:
Q  746 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaa 845  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  50351036 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttaaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 50351135  T
Q  846 ctatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  50351136 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgaggttatagctt 50351180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 93; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 713 - 889
Target Start/End: Original strand, 3270636 - 3270806
Alignment:
Q  713 gggtctgtttgggaaacccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcacc 812  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||     |||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||| |||||||||||||||    
T  3270636 gggtctgtttgggaaacccaaaaaa-ag-----agcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaa-tctgtttggtaacactttttcacc 3270728  T
Q  813 atgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  3270729 atgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctatttcaagtagcgtttgagcttatagctt 3270806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 711 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 33562062 - 33561922
Alignment:
Q  711 aagggtctgtttgggaaacccaaaaaa-gagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttc 809  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| ||||||||||||    
T  33562062 aagggtctgtttgggaaactaaaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttc 33561963  T
Q  810 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatt 850  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33561962 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatt 33561922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 712 - 850
Target Start/End: Original strand, 2479130 - 2479268
Alignment:
Q  712 agggtctgtttgggaaacccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcac 811  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| ||||||||||| |     
T  2479130 agggtctgtttgggaaaccaaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacacttttttat 2479229  T
Q  812 catgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatt 850  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2479230 catgagtttatagcttatttcacgagcttataagctatt 2479268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 745 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 49220605 - 49220460
Alignment:
Q  745 tagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataa 844  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  49220605 tagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaactctgtttggtaacactttttcaccgtgagcttacagcttatttcacgagcttataa 49220506  T
Q  845 actatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  49220505 gctatttttcagaagctatttcaagtagcgtttgagcttatagctt 49220460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 738 - 889
Target Start/End: Original strand, 29374326 - 29374478
Alignment:
Q  738 gagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgag 837  Q
    |||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||       |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  29374326 gagcttatagcttatagcttttagcttataagctcgtttgataaaaaaagctctgtttggtaatacttttttaccatgagcttatagcttatttcaagag 29374425  T
Q  838 cttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  29374426 cttataagctatttttcagaagctattccaagtagagtttgagcttatagctt 29374478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 746 - 889
Target Start/End: Original strand, 34086970 - 34087114
Alignment:
Q  746 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaa 845  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||        |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  34086970 agcttatagcttatagcttataagctcgtctgacaaaaaaagctctgtttggtaatactttttcaccatgagcttatagctaatttcacgagcttataag 34087069  T
Q  846 ctatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  34087070 ctatttttgagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagctt 34087114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 708 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 36043471 - 36043287
Alignment:
Q  708 attaagggtctgtttgggaa-acccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngct-ctgtttgataacactt 805  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||          | ||||||| ||||| ||    
T  36043471 attaacggtctgtttggtaacacccaaaaaagagcttatagctcttagcttatagcatataagttcgtttgacaaaaaaaaattctgtttggtaacagtt 36043372  T
Q  806 tttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  36043371 tttcaccatgagcttatagtttatttcacgagcttataagctatttttcagatgctattctaagtagcgtttgagcttatagctt 36043287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 788 - 885
Target Start/End: Original strand, 37703716 - 37703814
Alignment:
Q  788 ctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttata 885  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  37703716 ctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtaacgtttgagcttata 37703814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 739 - 893
Target Start/End: Original strand, 50540769 - 50540924
Alignment:
Q  739 agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagc 838  Q
    ||||| || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||       | |||||||| ||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||     
T  50540769 agcttataacttatagcttatagcttataaactcgtttgataaaaaaagttctgtttggtaatactttttcaccataaacttatagcttatttcacgagt 50540868  T
Q  839 ttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagcttctca 893  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  50540869 ttataagctatttttcagaagctattacaagtagcgtttgagcttatagcttctca 50540924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 789 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 49185273 - 49185172
Alignment:
Q  789 tctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagc 887  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  49185273 tctgtttggtaacactttttcaccataagcttatagcttatttcacaagcttataaactatttttcagaagctattccaagtaacgtttgagcttatagc 49185174  T
Q  888 tt 889  Q
    ||    
T  49185173 tt 49185172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 713 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 50171462 - 50171284
Alignment:
Q  713 gggtctgtttgggaaaccc-aaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcac 811  Q
    |||||||||||||||||   |||||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||||          |||||||| |||||| |||| ||    
T  50171462 gggtctgtttgggaaactttaaaaaaaagcttttcgcttttaatttatagcttataagcttgtttgacaaaaaaaattctgtttggtaacacctttttac 50171363  T
Q  812 catgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagc-gttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  50171362 catgagcttatagcttatttcacaagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcatttgagcttatagctt 50171284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 746 - 889
Target Start/End: Original strand, 46369809 - 46369952
Alignment:
Q  746 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnng--ctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttata 843  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||    
T  46369809 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaaaactctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagc---ta 46369905  T
Q  844 aactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  46369906 agctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 46369952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 746 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 7781295 - 7781151
Alignment:
Q  746 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaa 845  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||| ||     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  7781295 agcttatagcttatagcttataagctcgtttgataaaaaaagctctgtttggtactgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataag 7781196  T
Q  846 ctatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  7781195 ctatttttcagaagctattccaagtagtgtttgagcttatagctt 7781151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 788 - 885
Target Start/End: Complemental strand, 37672439 - 37672341
Alignment:
Q  788 ctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttata 885  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  37672439 ctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagtttataagctatttttcagaagctattccaagtaacgtttgagcttata 37672341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 744 - 889
Target Start/End: Original strand, 3391122 - 3391268
Alignment:
Q  744 ttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttata 843  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||| | |||||||       |||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  3391122 ttagcttatagtctatagcttataagtttgtttgataaaaaaagctctgtttggtaatactttttcaccatgaacttatagtttatttcacgagcttata 3391221  T
Q  844 aactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||    
T  3391222 aactatttttcagaagctattccaagtaacgtttaagcttatagctt 3391268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 789 - 889
Target Start/End: Original strand, 22098965 - 22099066
Alignment:
Q  789 tctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagc 887  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22098965 tctgtttggtaacattttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagtttataagctattttttagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagc 22099064  T
Q  888 tt 889  Q
    ||    
T  22099065 tt 22099066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 792 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 9770058 - 9769958
Alignment:
Q  792 gtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagcttc 890  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| ||||    
T  9770058 gtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcaaaagctattccaaataacgtttgagcttataacttc 9769959  T
Q  891 t 891  Q
    |    
T  9769958 t 9769958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 798 - 889
Target Start/End: Original strand, 43727077 - 43727169
Alignment:
Q  798 taacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  43727077 taacactttttcaccatgagcttatagcttatttcatgagcttataaactatttttcagaagttattccaagtagcgtttgaacttatagctt 43727169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 746 - 876
Target Start/End: Original strand, 39583100 - 39583230
Alignment:
Q  746 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaa 845  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||          |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||     
T  39583100 agcttttagcttatagcttataagtttgtttgacaaaaaaaattctgtttggtaacactttttcaccatgagcttataacttatttaacgagtttataag 39583199  T
Q  846 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtt 876  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39583200 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtt 39583230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 790 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 42614222 - 42614122
Alignment:
Q  790 ctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagct 888  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  42614222 ctgtttggtaacattttttcaccatgagcttctagcttatttcacaagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgaggttatagct 42614123  T
Q  889 t 889  Q
    |    
T  42614122 t 42614122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 802 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 49822242 - 49822154
Alignment:
Q  802 actttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  49822242 actttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactattttttagaagttatttcaagtagcgtttgagcttatagctt 49822154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 753 - 893
Target Start/End: Complemental strand, 49240405 - 49240264
Alignment:
Q  753 agcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 852  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||        |||||||||| |||  ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  49240405 agcttatagcttataagttcgtatgacaaaaaaagctctgtttggtaatgctttttcactatgaacttatagcttatttcatgagcttataagctatttt 49240306  T
Q  853 tcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagcttctca 893  Q
    |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  49240305 tcagaagctatttcaaatagcgtttgagcttatagcttctca 49240264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 789 - 860
Target Start/End: Original strand, 28429076 - 28429147
Alignment:
Q  789 tctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagc 860  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28429076 tctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagc 28429147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 788 - 885
Target Start/End: Original strand, 5697523 - 5697621
Alignment:
Q  788 ctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttata 885  Q
    |||| |||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  5697523 ctctatttggtaacagttttttacaatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagacgctattccaagtagcgtttgagcttata 5697621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 728 - 894
Target Start/End: Complemental strand, 18347564 - 18347398
Alignment:
Q  728 acccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagctt 827  Q
    ||||||||  |||||| |||||| |||||||||||||||||| | ||||||        |||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||    
T  18347564 acccaaaagtgagcttatagcttatagcttatagcttataagtttgtttga-caaaaaagctctgtttggtaatgtcttttcaccacgagcttatagctt 18347466  T
Q  828 atttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagcttctcac 894  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  18347465 atttcacaagcttataagctatttttcagacactattccaagtagtgtttgagcttatagcttctcac 18347398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 751 - 889
Target Start/End: Original strand, 34318415 - 34318554
Alignment:
Q  751 ttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatt 850  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||        |||||||||| |||   |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  34318415 ttagcttatagcttataagcttgttcgacaaaaaaagctctgtttggtaatggtttttcaccacgagcttatagcttattttacgagcttataagctatt 34318514  T
Q  851 tttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  34318515 tttcagatgctattccaagtagtgtttgagcttatagctt 34318554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 790 - 894
Target Start/End: Complemental strand, 30495282 - 30495177
Alignment:
Q  790 ctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagct 888  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||    
T  30495282 ctgtttggtaatactttttgaccatgagcttatagcttatttctagagtttataagctatttttcagaagctatttcaagtagcgtttcagcttatagct 30495183  T
Q  889 tctcac 894  Q
    ||||||    
T  30495182 tctcac 30495177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 556 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 22235029 - 22234931
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  22235029 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaatctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 22234931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 816 - 889
Target Start/End: Original strand, 40887949 - 40888023
Alignment:
Q  816 agcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40887949 agcttatagcttattttacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 40888023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 805 - 894
Target Start/End: Complemental strand, 44719043 - 44718953
Alignment:
Q  805 ttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagcttctcac 894  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  44719043 ttttcaccacgagcttatagcttattttacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtagcgtttaagcttataacttctcac 44718953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 752 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 52703236 - 52703098
Alignment:
Q  752 tagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactattt 851  Q
    |||||||||||||||||||||||||||          |||||||| |||  || | | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  52703236 tagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaattctgtttggtaatgctctcttaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataagttattt 52703137  T
Q  852 ttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  52703136 ttcagaagctatttcaagtagcgtttgagcttatagctt 52703098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 554 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 42817546 - 42817446
Alignment:
Q  554 tatgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatatt 653  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  42817546 tatgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatt 42817447  T
Q  654 t 654  Q
    |    
T  42817446 t 42817446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 556 - 654
Target Start/End: Original strand, 9455863 - 9455961
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  9455863 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 9455961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 556 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 20780200 - 20780102
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||  |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  20780200 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttatatttatcttatgtatcatgacttttattattgtataatatatggcactctttattatattt 20780102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 789 - 894
Target Start/End: Original strand, 25134895 - 25135001
Alignment:
Q  789 tctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagc 887  Q
    |||||||| ||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | |||||||||||||    
T  25134895 tctgtttggtaacagttttttacaacgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagacgctattttaagtagtgtttgagcttatagc 25134994  T
Q  888 ttctcac 894  Q
    || ||||    
T  25134995 ttatcac 25135001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 556 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 28135278 - 28135180
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  28135278 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 28135180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 556 - 654
Target Start/End: Original strand, 35930329 - 35930427
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  35930329 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacttatcttatgtataatgacttttattattgaataatatatgacactctttattatattt 35930427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 556 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 47668029 - 47667931
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  47668029 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 47667931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 822 - 894
Target Start/End: Original strand, 40719554 - 40719627
Alignment:
Q  822 tagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagcttctcac 894  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  40719554 tagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagttatttcaagtagcgtttgagtttatagcttctcac 40719627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 739 - 876
Target Start/End: Complemental strand, 8221373 - 8221236
Alignment:
Q  739 agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagc 838  Q
    ||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||| |||        |||||||||| ||||  ||||| || | ||||||||||||||||||||||||    
T  8221373 agcttatagcttatagcggatagcttataagctcgtctgacaaaaaaagctctgtttggtaacggttttttacaacgagcttatagcttatttcacgagc 8221274  T
Q  839 ttataaactatttttcagaagctattccaagtagcgtt 876  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||||| |||||||    
T  8221273 ttataagctatttttcaaaaactattccaaatagcgtt 8221236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 556 - 654
Target Start/End: Original strand, 22612234 - 22612333
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcatt-aaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  22612234 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaaataatatatggcactctttattatattt 22612333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 791 - 889
Target Start/End: Original strand, 42963877 - 42963976
Alignment:
Q  791 tgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||  |||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||    
T  42963877 tgtttgataatactttttcactatgagcttataatttattttacgagtttataagctatttttgagaagctatttcaagtagcgtttgagcttacagctt 42963976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 556 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 19706994 - 19706896
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  19706994 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatgtcactctttattatattt 19706896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 556 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 22670812 - 22670714
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||| |||  |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  22670812 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattggataatatatggcactctttattatattt 22670714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 796 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 36379227 - 36379133
Alignment:
Q  796 gataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||| ||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36379227 gataacacttttttacgatgagtttatagtttatttcatgagtttataagttatttttcaaaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 36379133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 708 - 813
Target Start/End: Original strand, 9169043 - 9169149
Alignment:
Q  708 attaagggtctgtttgggaaaccc-aaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacacttt 806  Q
    |||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||        |||||||||| |||||||||    
T  9169043 attaggggtctgtttggttaaccccaaaaaagagcttttaacttttagcttatagcttataagttcgtttgaaaaaaaaagctctgtttggtaacacttt 9169142  T
Q  807 ttcacca 813  Q
    |||||||    
T  9169143 ttcacca 9169149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 789 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 16085699 - 16085598
Alignment:
Q  789 tctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagc 887  Q
    ||||||||||||   |||||||||| || |||||||  ||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  16085699 tctgtttgataatgttttttcaccacgatcttatagtctattttacgagcttataagctatttttcagatgctatttcaagtagcgtttgagcttatagc 16085600  T
Q  888 tt 889  Q
    ||    
T  16085599 tt 16085598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 789 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 46929072 - 46928971
Alignment:
Q  789 tctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagc 887  Q
    ||||||| ||| || |||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||||||    
T  46929072 tctgtttaatatcattttttcactaagaacttatagcttattttacgagcttataagctatttttcagaagctattctaattagcgtttgtgcttatagc 46928973  T
Q  888 tt 889  Q
    ||    
T  46928972 tt 46928971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 835 - 894
Target Start/End: Original strand, 7024916 - 7024976
Alignment:
Q  835 gagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagcttctcac 894  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7024916 gagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttctcac 7024976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 815 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 13570855 - 13570780
Alignment:
Q  815 gagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  13570855 gagcttatagcttatttcacgaacttataagctatttttcagacgctattccaaatagcgtttgaacttatagctt 13570780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 739 - 871
Target Start/End: Complemental strand, 46088138 - 46088006
Alignment:
Q  739 agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagc 838  Q
    ||||| |||||| ||||  |||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||   |||||| ||| ||||||||| |||||||||||||     
T  46088138 agcttatagcttatagcagatagtttataagctcgtttgactagaaaagctctgtttgataatgttttttcgccacgagcttataacttatttcacgagt 46088039  T
Q  839 ttataaactatttttcagaagctattccaagta 871  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  46088038 ttataagctatttttcagacgttattccaagta 46088006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 556 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 20391794 - 20391696
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| ||||||  |||  ||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  20391794 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgagaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 20391696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 556 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 43802920 - 43802822
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  43802920 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacatatcttatgtatcatgacttttaatattgaataatatatgacactctttattatattt 43802822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 804 - 885
Target Start/End: Original strand, 44956340 - 44956422
Alignment:
Q  804 tttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttata 885  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||    
T  44956340 ttttttaccatgagcttatagcttatttaacgagattataagttatttttcagatgctattccaagtagagtttgagcttata 44956422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 829 - 892
Target Start/End: Original strand, 9169142 - 9169206
Alignment:
Q  829 tttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagcttctc 892  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9169142 tttcaccaacttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttctc 9169206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 712 - 779
Target Start/End: Complemental strand, 22099754 - 22099687
Alignment:
Q  712 agggtctgtttgggaaacccaaaaaa-gagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgat 779  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22099754 agggtctgtttgggaaactaaaaaaaagagcttttag-ttttagcttatagcttataagctcgtttgat 22099687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 712 - 823
Target Start/End: Original strand, 7024812 - 7024924
Alignment:
Q  712 agggtctgtttgggaa-acccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttca 810  Q
    ||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||          ||| |||||||||| |||||||    
T  7024812 agggtctgtttggtaacacctaaaaaagagcttttagctcttagcatatagcttataagttcgtttgacaaaaaaaattctatttgataacattttttca 7024911  T
Q  811 ccatgagcttata 823  Q
    |||||||||||||    
T  7024912 ccatgagcttata 7024924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 804 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 46056499 - 46056413
Alignment:
Q  804 tttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagc-gttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||  || ||||||||||||    
T  46056499 tttttcaccacgaacttatagtttatttcacgagcttataagatatttttcagacgctatttcaagtagcatttaagcttatagctt 46056413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 823 - 876
Target Start/End: Original strand, 33151975 - 33152028
Alignment:
Q  823 agcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcgtt 876  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  33151975 agcttatttcacgagcttataagctatttttaagaagctatttcaagtagcgtt 33152028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 813 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 41005057 - 41004980
Alignment:
Q  813 atgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  41005057 atgagtttatagcttatttcatgagcttataagttatttttaagaagctatttcaagtagcgtttgaacttatagctt 41004980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 628 - 713
Target Start/End: Original strand, 29096544 - 29096625
Alignment:
Q  628 taaaatatggcattctttattatatttgtttgttgtaagattaataaagtccctagaattgatacttcatgtaatggaacattaag 713  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||     |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||    
T  29096544 taaaatatgacattctttattataattgttc----taagattaataaagtccctagaatagatagttcatgtgatggaatattaag 29096625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 839 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 40935945 - 40935894
Alignment:
Q  839 ttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40935945 ttataaactatttttcagaaactattccaagtagcgtttgagcttatagctt 40935894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 816 - 876
Target Start/End: Complemental strand, 2029037 - 2028977
Alignment:
Q  816 agcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcgtt 876  Q
    ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||    
T  2029037 agcttatagtttatttaacgagtttataaactatttttcagacgctatttcaagtaccgtt 2028977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 726 - 778
Target Start/End: Original strand, 40719482 - 40719534
Alignment:
Q  726 aaacccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttga 778  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||    
T  40719482 aaactcaaaaaagagcttttagctttgagtttatagtttataagctcgtttga 40719534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 819 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 28869069 - 28868998
Alignment:
Q  819 ttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||  |||| |||||| || |||||||||||||||    
T  28869069 ttatagtttatttcacgagcttataaattatttttaagaaattatttcaagtaacgtttgagcttatagctt 28868998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 836 - 886
Target Start/End: Original strand, 9894931 - 9894982
Alignment:
Q  836 agcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatag 886  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  9894931 agcttataagctatttttcagacgctattcaaagtagcgtttgagcttatag 9894982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 556 - 713
Target Start/End: Complemental strand, 21881931 - 21881777
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatat--ggcattctttattatatt 653  Q
    |||||||||||||  || | | ||||| ||||| ||||| || || || |||| ||||||||||| ||| ||||| ||||  |||||| |||||||||||    
T  21881931 tgttggtgtaagctctataggtcaatagtttatcttaaacttttgctacgtatcatgacttttattattgaataatatatatggcatt-tttattatatt 21881833  T
Q  654 tgtttgttgtaagattaataaagtccctagaattgatacttcatgtaatggaacattaag 713  Q
    ||||    ||||||| ||||||||||  ||||| |||| ||| ||| |||||| ||||||    
T  21881832 tgtt----gtaagataaataaagtccagagaatagatagttcgtgtgatggaatattaag 21881777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 835 - 884
Target Start/End: Original strand, 33632331 - 33632381
Alignment:
Q  835 gagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttat 884  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  33632331 gagcttataagctatttttcagaagctattccaaacagcgtttgagcttat 33632381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 585 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 26923871 - 26923803
Alignment:
Q  585 ttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatatttgt 656  Q
    |||||||||| |||| |||||||| |   ||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  26923871 ttatgttaaacttatcttatgtatca---cttttattattaaataatatatgacactctttattatatttgt 26923803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 135; Significance: 8e-70; HSPs: 107)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 708 - 894
Target Start/End: Complemental strand, 46248153 - 46247966
Alignment:
Q  708 attaagggtctgtttgggaaacccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttt 807  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| ||||||||||    
T  46248153 attaagggtttgtttgggaaacccaaaaaagagcttttagtttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttt 46248054  T
Q  808 tcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagcttctcac 894  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  46248053 tcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtaacgtttgagcttatagcttctcac 46247966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 712 - 894
Target Start/End: Complemental strand, 44748971 - 44748788
Alignment:
Q  712 agggtctgtttgggaaacccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcac 811  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||        |||||||||| ||||||||||||||    
T  44748971 agggtctgtttgggaaaccaaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataaacttgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcac 44748872  T
Q  812 catgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagcttctcac 894  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44748871 catgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttctcac 44748788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 712 - 889
Target Start/End: Original strand, 35499568 - 35499746
Alignment:
Q  712 agggtctgtttgggaaacccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcac 811  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||| ||||||||||||||    
T  35499568 agggtctgtttgggaaacccaaaaaaaagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaatctctgtttggtaacactttttcac 35499667  T
Q  812 catgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35499668 catgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 35499746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 713 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 28677075 - 28676897
Alignment:
Q  713 gggtctgtttgggaaaccc-aaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcac 811  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| ||||||||||||||    
T  28677075 gggtatgtttgggaaaccctaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgaaaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcac 28676976  T
Q  812 catgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28676975 catgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 28676897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 712 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 45345193 - 45345015
Alignment:
Q  712 agggtctgtttgggaaacccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcac 811  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| ||||||||||||||    
T  45345193 agggtctgtttgggaaaccaaaaaaagagtttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcac 45345094  T
Q  812 catgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45345093 catgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagttattccaagtagcgtttgagcttatagctt 45345015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 710 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 37528911 - 37528730
Alignment:
Q  710 taagggtctgtttgggaaacccaaaaaaga-gcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacacttttt 808  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| |||||||||||    
T  37528911 taagggtctgtttgggaaacccaaaaaaaaagcttttaacttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacacttttt 37528812  T
Q  809 caccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37528811 caccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 37528730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 713 - 894
Target Start/End: Original strand, 8872840 - 8873023
Alignment:
Q  713 gggtctgtttgggaaacccaaaaaa-gagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcac 811  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||| |||||| ||| ||||||||||    
T  8872840 gggtctgtttgggaaacccaaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctatgtttggtaatactttttcac 8872939  T
Q  812 catgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagcttctcac 894  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8872940 catgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctatttcaagtagcgtttgagcttatagcttctcac 8873023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 712 - 889
Target Start/End: Original strand, 37088250 - 37088429
Alignment:
Q  712 agggtctgtttgggaaacccaaaaaa-gagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttca 810  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| ||| |||||||||    
T  37088250 agggtctttttgggaaacccaaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaatactttttca 37088349  T
Q  811 ccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37088350 ccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 37088429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 709 - 889
Target Start/End: Original strand, 26540923 - 26541105
Alignment:
Q  709 ttaagggtctgtttgggaaaccc-aaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttt 807  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| ||||||||||    
T  26540923 ttaagggtctgtttggttaaccccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttt 26541022  T
Q  808 tcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  26541023 tcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttacagctt 26541105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 729 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 16127307 - 16127146
Alignment:
Q  729 cccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagctta 828  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16127307 cccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagctta 16127208  T
Q  829 tttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16127207 tttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 16127146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 729 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 29081449 - 29081288
Alignment:
Q  729 cccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagctta 828  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29081449 cccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagctta 29081350  T
Q  829 tttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29081349 tttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 29081288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 713 - 889
Target Start/End: Original strand, 38185738 - 38185915
Alignment:
Q  713 gggtctgtttgggaaacccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcacc 812  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| |||||||||||||||    
T  38185738 gggtctgtttggttaacctaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcacc 38185837  T
Q  813 atgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  38185838 atgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgaacttatagctt 38185915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 120; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 711 - 889
Target Start/End: Original strand, 44845589 - 44845769
Alignment:
Q  711 aagggtctgtttgggaaacc-caaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttc 809  Q
    ||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| ||||||||||||    
T  44845589 aagggtctgtttggttaacctcaaaaaagagtttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttc 44845688  T
Q  810 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44845689 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 44845769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 120; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 728 - 894
Target Start/End: Complemental strand, 46318929 - 46318761
Alignment:
Q  728 acccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnn-gctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagct 826  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46318929 acccaaaaaagagcttttatctcttagcttatagcttataagctcgtttgataaaaaaaagctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagct 46318830  T
Q  827 tatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagcttctcac 894  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  46318829 tatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttctcac 46318761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 708 - 889
Target Start/End: Original strand, 50499725 - 50499907
Alignment:
Q  708 attaagggtctgtttgggaaacccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttt 807  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||       | | |||||| ||||||||||    
T  50499725 attaagggtctgtttggttaacccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgataaaaaaagttttgtttggtaacactttt 50499824  T
Q  808 tcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  50499825 tcaccataagcttatagtttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 50499907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 714 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 24536738 - 24536561
Alignment:
Q  714 ggtctgtttgggaaac-ccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcacc 812  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||        |||||||||| |||||||||||||||    
T  24536738 ggtctgtttcggaaactccaaaaaagagcttttagctcttagcttagagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcacc 24536639  T
Q  813 atgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24536638 atgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 24536561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 115; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 708 - 885
Target Start/End: Complemental strand, 54672369 - 54672191
Alignment:
Q  708 attaagggtctgtttgggaaacccaaaaaa-gagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacacttt 806  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||    
T  54672369 attatgggtctgtttgggaaactaaaaaaaagagcttttagcttttagtttatagcttataagctcgtttga-gaaaaaagctctgtttgataacacttt 54672271  T
Q  807 ttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttata 885  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  54672270 ttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttata 54672191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 713 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 2580112 - 2579934
Alignment:
Q  713 gggtctgtttgggaaaccc-aaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcac 811  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||        |||||||||| ||||||||||||||    
T  2580112 gggtctgtttggttaaccctaaaaaagagcttttagcttttagtttatagcttataagttcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcac 2580013  T
Q  812 catgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2580012 catgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 2579934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 713 - 889
Target Start/End: Original strand, 25570346 - 25570524
Alignment:
Q  713 gggtctgtttgggaaacccaaaaaa-gagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcac 811  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| ||||||||||||||    
T  25570346 gggtctgtttgggaaactaaaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcac 25570445  T
Q  812 catgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25570446 catgagcttatagcttatttcacaagcttataagctattttttagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 25570524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 710 - 894
Target Start/End: Complemental strand, 40480209 - 40480023
Alignment:
Q  710 taagggtctgtttgggaaacc-caaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacacttttt 808  Q
    ||||| ||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        | |||||||| |||||||||||    
T  40480209 taaggctctgtttggtacacctcaaaaatgagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaacacttttt 40480110  T
Q  809 caccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagcttctcac 894  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40480109 caccatgagcttatagcttattttacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttctcac 40480023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 729 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 40563531 - 40563370
Alignment:
Q  729 cccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagctta 828  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40563531 cccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagctta 40563432  T
Q  829 tttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40563431 tttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 40563370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 712 - 889
Target Start/End: Original strand, 4240252 - 4240423
Alignment:
Q  712 agggtctgtttgggaaacccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcac 811  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||| ||||||||||||||||||       |||||||||| ||||||||||||||    
T  4240252 agggtctgtttgggaaacccaaaaaagagcttttagctt-------ataacttataagctcgtttgataaaaaaagctctgtttggtaacactttttcac 4240344  T
Q  812 catgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4240345 catgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 4240423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 712 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 19948504 - 19948325
Alignment:
Q  712 agggtctgtttgggaaaccc-aaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttca 810  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||        |||||||||| ||||||||||| |    
T  19948504 agggtctgtttggttaaccccaaaaaagagcttttagcttctagcttatagtttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttta 19948405  T
Q  811 ccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19948404 ccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 19948325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 708 - 894
Target Start/End: Complemental strand, 37714148 - 37713967
Alignment:
Q  708 attaagggtctgtttgggaaacccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttt 807  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| ||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||| ||||||||||    
T  37714148 attaagggtctgtttgggaaactaaaaaaa-ag-----agcttttagcttatagcttataagctcgtttgataaaaaaagctctgtttggtaacactttt 37714055  T
Q  808 tcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagcttctcac 894  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37714054 tcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagttattccaagtagcgtttgagcttatagcttctcac 37713967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 708 - 889
Target Start/End: Original strand, 52857858 - 52858041
Alignment:
Q  708 attaagggtctgtttgggaaacccaaaaaa-gagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacacttt 806  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |        |||||||||| |||||||||    
T  52857858 attaagggtctgtttggtaaacccaaaaaaagagcttttagctcttagtttatagcttataagctcgttttacaaaaaaagctctgtttggtaacacttt 52857957  T
Q  807 ttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  52857958 ttgaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtatcgtttgagcttatagctt 52858041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 729 - 894
Target Start/End: Original strand, 21707135 - 21707301
Alignment:
Q  729 cccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagctta 828  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |        | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21707135 cccaaaaaagagcttttagcttttaacttatagcttataagctcgtttaacaaaaaaagttctgtttggtaacactttttcaccatgagattatagctta 21707234  T
Q  829 tttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagc-gttgagcttatagcttctcac 894  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  21707235 tttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcttttgagcttatagcttctcac 21707301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 712 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 29718386 - 29718208
Alignment:
Q  712 agggtctgtttgggaaacccaaaaaaga-gcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttca 810  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||        |||||||||| |||||||||| ||    
T  29718386 agggtctgtttgggaaaccaaaaaaaaaagcttttagtttttagtttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttt-ca 29718288  T
Q  811 ccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29718287 tcatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 29718208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 712 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 52166276 - 52166097
Alignment:
Q  712 agggtctgtttgggaaacccaaaaaa-gagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttca 810  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |         |||||||||  |||||||||| |    
T  52166276 agggtctgtttggtaaacccaaaaaaagagcttttagctcttagcttatagcttataagctcgtttcacaaaaaaatctctgtttggcaacactttttga 52166177  T
Q  811 ccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagc-gttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  52166176 ccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcatttgagcttatagctt 52166097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 744 - 893
Target Start/End: Original strand, 42217662 - 42217812
Alignment:
Q  744 ttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttata 843  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42217662 ttagcttatagcttatagcttataagctcgtttgataaaaaaagctctgtttggtaatactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttata 42217761  T
Q  844 aactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagcttctca 893  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  42217762 agctatttttcagaagctattccaagtaacgtttgagcttatagcttctca 42217812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 710 - 894
Target Start/End: Original strand, 48942962 - 48943139
Alignment:
Q  710 taagggtctgtttgggaaacccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttc 809  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||     |||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||| |||||||||||     
T  48942962 taagggtctgtttgggaaacccaaaaaa-ag-----agcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaa--tctgtttggtaacactttttt 48943053  T
Q  810 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagcttctcac 894  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  48943054 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttctcac 48943139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 713 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 38892170 - 38891993
Alignment:
Q  713 gggtctgtttgggaaacccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcacc 812  Q
    ||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        |||||||||| ||||| |||||||||    
T  38892170 gggtctgtttggttaatctaaaaaagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacattttttcacc 38892071  T
Q  813 atgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagc-gttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  38892070 atgagcttatagcttatttcacgagcctataagctatttttcagaaactattccaagtagcatttgagcttatagctt 38891993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 746 - 894
Target Start/End: Original strand, 43525744 - 43525893
Alignment:
Q  746 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaa 845  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||        |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  43525744 agcttttagcttatagcttataagctcatttgacaaaaaaagctctgtttggtaacattttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 43525843  T
Q  846 ctatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagcttctcac 894  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43525844 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttctcac 43525893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 711 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 47897793 - 47897613
Alignment:
Q  711 aagggtctgtttgggaaacc-caaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttc 809  Q
    |||||| |||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||        |||||||||  ||||||||||||    
T  47897793 aagggtatgtttggttaaccgcaaaaaagagcttttaccttttagtttatagcttataaactcatttgacaaaaaaagctctgtttagtaacactttttc 47897694  T
Q  810 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  47897693 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 47897613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 746 - 889
Target Start/End: Original strand, 52794896 - 52795040
Alignment:
Q  746 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaa 845  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  52794896 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttccccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 52794995  T
Q  846 ctatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  52794996 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 52795040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 98; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 712 - 889
Target Start/End: Original strand, 30864394 - 30864571
Alignment:
Q  712 agggtctgtttgggaaacccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcac 811  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||          |||||||| ||||||||||||||    
T  30864394 agggtctgtttaggaaatcaaaaaaagagcttttaacttttagtttatagcttataagct-gtttgacaaaaaaaattctgtttggtaacactttttcac 30864492  T
Q  812 catgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30864493 cattagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 30864571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 98; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 753 - 894
Target Start/End: Original strand, 39876622 - 39876764
Alignment:
Q  753 agcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 852  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||        |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39876622 agcttatagcttataagttcgtttgactaaaaaagctctgtttgataacactttttcatcatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 39876721  T
Q  853 tcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagcttctcac 894  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39876722 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttctcac 39876764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 98; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 708 - 889
Target Start/End: Original strand, 53779000 - 53779176
Alignment:
Q  708 attaagggtctgtttgggaaacccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttt 807  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||     |||||||||||| ||||||||||||||||||||        | |||||||| ||||||||||    
T  53779000 attaagggtctgtttgggaaacctaaaaaa-ag-----agcttttagcttttagcttataagctcgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaacactttt 53779093  T
Q  808 tcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  53779094 tcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagtgtttgagcttatagctt 53779176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 710 - 850
Target Start/End: Original strand, 44545195 - 44545335
Alignment:
Q  710 taagggtctgtttgggaaacccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttc 809  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        | |||||||| ||||||||||||    
T  44545195 taagggtctgtttgggaaaccaaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaacactttttc 44545294  T
Q  810 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatt 850  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44545295 accatgaacttatagcttatttcacgagcttataagctatt 44545335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 708 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 50317211 - 50317036
Alignment:
Q  708 attaagggtctgtttgggaaacccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttt 807  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||       ||||||||||||||||||||||       | ||||||||  |||||||||    
T  50317211 attaagggtctgtttggttaacccaaaaaagagcttttaactt-------atagcttataagctcgtttgataaaaaaagttctgtttggcaacactttt 50317119  T
Q  808 tcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  50317118 tcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctattttttagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 50317036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 746 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 55305260 - 55305116
Alignment:
Q  746 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaa 845  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||        | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  55305260 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 55305161  T
Q  846 ctatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  55305160 ctatttttcagaaactattccaagtagcgtttgagcttatagctt 55305116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 713 - 889
Target Start/End: Original strand, 46972000 - 46972178
Alignment:
Q  713 gggtctgtttgggaaacccaaaaaa-gagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcac 811  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |          | |||||| ||||||||||| ||    
T  46972000 gggtctgtttggtaaactcaaaaaaagagcttttagctcttagcttatagcttataagctcgtttcacaaaaaaatttatgtttggtaacactttttgac 46972099  T
Q  812 catgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  46972100 catgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctatttcaagtagcgtttgagcttatagctt 46972178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 732 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 49853208 - 49853050
Alignment:
Q  732 aaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttattt 831  Q
    ||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||        ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49853208 aaaaaagagcttttaactcttaccttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaggctatctttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttattt 49853109  T
Q  832 cacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  49853108 cacgagcttataagctatttttcagaagctatttcaagtagcgtttgagcttatagctt 49853050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 787 - 889
Target Start/End: Original strand, 2121869 - 2121972
Alignment:
Q  787 gctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttata 885  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2121869 gctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttata 2121968  T
Q  886 gctt 889  Q
    ||||    
T  2121969 gctt 2121972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 712 - 885
Target Start/End: Original strand, 33391869 - 33392044
Alignment:
Q  712 agggtctgtttgggaa-acccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttca 810  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||| ||| |||| |||||||||| ||||||||        | |||||||| |||||||||||||    
T  33391869 agggtctgtttggtaacacccaaaaaagagtttttagctcttaacttagagcttataagttcgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaacactttttca 33391968  T
Q  811 ccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttata 885  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33391969 ccatgagcttatagtttatttcatgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttata 33392044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 753 - 894
Target Start/End: Original strand, 41246257 - 41246399
Alignment:
Q  753 agcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 852  Q
    |||||||||||||||| |||||||||        | ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41246257 agcttatagcttataaactcgtttgacaaaaaaagttctatttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 41246356  T
Q  853 tcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagcttctcac 894  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41246357 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttctcac 41246399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 732 - 865
Target Start/End: Original strand, 47173555 - 47173688
Alignment:
Q  732 aaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttattt 831  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||       | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47173555 aaaaaagagcttatagctcttagcttataggttataagctcgtttgataaaaaaagttctgtttgataacgctttttcaccatgagcttatagcttattt 47173654  T
Q  832 cacgagcttataaactatttttcagaagctattc 865  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47173655 cacgagcttataagctatttttcagaagctattc 47173688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 712 - 890
Target Start/End: Original strand, 48378192 - 48378372
Alignment:
Q  712 agggtctgtttgggaa-acccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttca 810  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||          |||||||| ||||| |||||||    
T  48378192 agggtctctttggtaacacccaaaaaagagcttttacctcttagcttatagcttataagctcatttgacaaaaaaaaatctgtttggtaacattttttca 48378291  T
Q  811 ccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagcttc 890  Q
    ||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48378292 ccacgagtctatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttc 48378372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 713 - 885
Target Start/End: Complemental strand, 12063913 - 12063739
Alignment:
Q  713 gggtctgtttgggaaac-ccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcac 811  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| || ||||||          |||||||| ||||||||||| ||    
T  12063913 gggtctgtttggtaaactccaaaaaagagcttttagctcttagtttatagcttataaacttgtttgacaaaaaaaattctgtttggtaacactttttgac 12063814  T
Q  812 catgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttata 885  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  12063813 cataagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaaactattccaagtagcgtttgagcttata 12063739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 746 - 894
Target Start/End: Complemental strand, 54542086 - 54541937
Alignment:
Q  746 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaa 845  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||        | | |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  54542086 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagttttgtttggtaacattttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 54541987  T
Q  846 ctatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagcttctcac 894  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  54541986 ctatttttcagaagttattccaagtagcgtttgagcttataatttctcac 54541937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 789 - 889
Target Start/End: Original strand, 2851861 - 2851962
Alignment:
Q  789 tctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagc 887  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2851861 tctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcatgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagc 2851960  T
Q  888 tt 889  Q
    ||    
T  2851961 tt 2851962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 751 - 871
Target Start/End: Complemental strand, 24628345 - 24628225
Alignment:
Q  751 ttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatt 850  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  24628345 ttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacattttttcaccatgagcttatagcttatttcatgagcttataagctatt 24628246  T
Q  851 tttcagaagctattccaagta 871  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  24628245 tttcagaagctattccaagta 24628225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 712 - 843
Target Start/End: Original strand, 41785775 - 41785907
Alignment:
Q  712 agggtctgtttgggaaaccc-aaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttca 810  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||| |||||||||    
T  41785775 agggtctgtttggttaaccccaaaaaagagcttttagcttttaacttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttgataatactttttca 41785874  T
Q  811 ccatgagcttatagcttatttcacgagcttata 843  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41785875 ccatgagcttatagcttatttcatgagcttata 41785907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 746 - 889
Target Start/End: Original strand, 52225286 - 52225430
Alignment:
Q  746 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaa 845  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||        | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  52225286 agcttatagctcatagcttataagctcgtttgacaacaaaagttctgtttggtaacacttttttaccatgagcttatagcttatttcacgagtttataag 52225385  T
Q  846 ctatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  52225386 ctatttttcagaagctattcaaagtagcgtttgagcttatagctt 52225430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 793 - 889
Target Start/End: Original strand, 21603846 - 21603943
Alignment:
Q  793 tttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21603846 tttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctacttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 21603943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 789 - 889
Target Start/End: Original strand, 51709055 - 51709156
Alignment:
Q  789 tctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagc 887  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  51709055 tctgtttggtaacactttttcaccatgagcttataacttatttcacgagcttataagctatttttcagaaactattccaagtagcgtttgagcttatagc 51709154  T
Q  888 tt 889  Q
    ||    
T  51709155 tt 51709156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 556 - 713
Target Start/End: Original strand, 14146769 - 14146922
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatatttg 655  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  14146769 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacttatgttatgtatcatgacttttattattaaataatatatggcactctttattatatttg 14146868  T
Q  656 tttgttgtaagattaataaagtccctagaattgatacttcatgtaatggaacattaag 713  Q
    ||     |||||||||||  |||| |||||| |||| ||| |||||||||| ||||||    
T  14146869 tta----taagattaatacggtccatagaatagatagttcgtgtaatggaatattaag 14146922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 710 - 889
Target Start/End: Original strand, 45368574 - 45368755
Alignment:
Q  710 taagggtctgtttgggaa-acccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacacttttt 808  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||        |||||||||| |||| ||||||    
T  45368574 taagggtctgtttggtaacacccaaaaaggagcttatagcttatagctgatagcttataagctcgtctgacaaaaaaagctctgtttggtaacgcttttt 45368673  T
Q  809 caccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
     || |  |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  45368674 tacaacaagcttatagcttatttcaggagcttataagctatttttcagaagctacttcaagtagcgtttgagcttatagctt 45368755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 791 - 889
Target Start/End: Original strand, 30548790 - 30548889
Alignment:
Q  791 tgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30548790 tgtttggtaacacttttttaccatgagcttatagcttatttcacgagtttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 30548889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 751 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 46627644 - 46627504
Alignment:
Q  751 ttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnn-gctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactat 849  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||         | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||     
T  46627644 ttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaagttctgtttggtaatactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgaggttataagctaa 46627545  T
Q  850 ttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  46627544 ttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 46627504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 712 - 889
Target Start/End: Original strand, 41518327 - 41518506
Alignment:
Q  712 agggtctgtttgggaa-acccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttca 810  Q
    ||||||||||||  || ||| |||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||       ||| | |||| |||| |||||| |    
T  41518327 agggtctgtttgataacacctaaaaaagagcttatagtttatagctgatagcttataagctcgtctgataaaaaaagctttctttggtaacgctttttta 41518426  T
Q  811 ccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  41518427 caatgagcttatagcttatttcaagagcttataaactatttttcagaagctacttcaagtagcgtttgagcttatagctt 41518506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 797 - 889
Target Start/End: Original strand, 42497046 - 42497139
Alignment:
Q  797 ataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42497046 ataacactttttcatcatgagcttataacttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 42497139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 746 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 44947352 - 44947208
Alignment:
Q  746 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaa 845  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||| ||     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  44947352 agcttatagcttatagcttataagctcgtttgataaaaaaagctctgtttggtactgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataag 44947253  T
Q  846 ctatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||    
T  44947252 ctatttttcagaagctattccaagcagtgtttgagcttatagctt 44947208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 728 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 42465196 - 42465034
Alignment:
Q  728 acccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagctt 827  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||          | |||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  42465196 acccaaaaaagagcttatagctcttaacttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaattatgtttggtaacattttttcggcatgagcttatagctt 42465097  T
Q  828 atttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  42465096 atttcacaagtttataagctatttttcagaagctattctaagtagcgtttgagattatagctt 42465034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 746 - 889
Target Start/End: Original strand, 193398 - 193542
Alignment:
Q  746 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaa 845  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| ||||| ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||||||     
T  193398 agcttatagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaatagctctgtttggtaacaattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataag 193497  T
Q  846 ctatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  193498 ctatttttcagatgctattacaagtagcgtttgagcttatagctt 193542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 744 - 876
Target Start/End: Complemental strand, 30814403 - 30814271
Alignment:
Q  744 ttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttata 843  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||        | | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30814403 ttagcttatagcttatagcttttaagctcgtttgacaaaaaaagttttgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagtttata 30814304  T
Q  844 aactatttttcagaagctattccaagtagcgtt 876  Q
    |  |||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  30814303 agatatttttcggaaactattccaagtagcgtt 30814271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 746 - 850
Target Start/End: Original strand, 39469914 - 39470018
Alignment:
Q  746 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaa 845  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  39469914 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacaagcttataag 39470013  T
Q  846 ctatt 850  Q
    |||||    
T  39470014 ctatt 39470018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 739 - 893
Target Start/End: Complemental strand, 37490082 - 37489927
Alignment:
Q  739 agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagc 838  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||        ||||| |||| |||   |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37490082 agcttatagcttatagctgatagcttataagcttgtttgacaaaaaaagctctatttgttaaagattttccaccacgagcttatagcttatttcacgagc 37489983  T
Q  839 ttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagcttctca 893  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37489982 ttataagctatttttcagacactattccaagtagcgtttgagcttatagcttctca 37489927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 556 - 716
Target Start/End: Original strand, 15526503 - 15526658
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatatttg 655  Q
    |||||||||||||| || | |||| |||||||||||||| ||| | || |||| ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||        
T  15526503 tgttggtgtaagccctataggccattaatttatgttaaacttaagctacgtatcatgacttttattattaaataatatatgacattctttattata---- 15526598  T
Q  656 tttgttgtaagattaataaagtccctagaattgatacttcatgtaatggaacattaagggt 716  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||| ||| |||||||||| |||||||||    
T  15526599 tttgttataagattaataaa-tccctagaatatatagttcgtgtaatggaatattaagggt 15526658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 728 - 889
Target Start/End: Original strand, 35100171 - 35100326
Alignment:
Q  728 acccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnn--gctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagc 825  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||         | | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35100171 acccaaaaaa-agcttttagttcttagcttatagcttataagctcgtttgataaaaaaaaagttttgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagc 35100269  T
Q  826 ttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||        | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35100270 ttatttcacgag--------ccatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 35100326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 751 - 885
Target Start/End: Complemental strand, 32026555 - 32026420
Alignment:
Q  751 ttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatt 850  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||        ||||||||||||||   |||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||    
T  32026555 ttagcttatagcttataagttcgttcgacaaaaaaagctctgtttgataatggtttttcaccacgagcttatagtttatttcacaagcttataagctatt 32026456  T
Q  851 tttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttata 885  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  32026455 tttcagatgctattccaagtagcgtttgagcttata 32026420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 804 - 893
Target Start/End: Complemental strand, 52595427 - 52595337
Alignment:
Q  804 tttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcgtt-gagcttatagcttctca 893  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  52595427 tttttcaccatgagtttatagcttatttcacaagattataagctatttttcagaagctattccaagtagcgttggagcttataacttctca 52595337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 805 - 889
Target Start/End: Original strand, 51003307 - 51003392
Alignment:
Q  805 ttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  51003307 ttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagacgttatttcaagtagcgtttgagcttatagctt 51003392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 818 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 45693465 - 45693393
Alignment:
Q  818 cttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45693465 cttatagcttatttcacgaacttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 45693393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 758 - 885
Target Start/End: Original strand, 2598608 - 2598736
Alignment:
Q  758 atagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcaga 857  Q
    ||||||||||||||||||||||        ||||||||| |||   ||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  2598608 atagcttataagctcgtttgatcaaaaaaactctgtttggtaatgttttttcaccacaaacttatagcttatttcacaagcttataagctatttttcaga 2598707  T
Q  858 agctattccaagtagcg-ttgagcttata 885  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||    
T  2598708 agttattccaagtagcgtttgagcttata 2598736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 555 - 654
Target Start/End: Original strand, 21398538 - 21398637
Alignment:
Q  555 atgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  21398538 atgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacttatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatgacactctttattatattt 21398637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 760 - 876
Target Start/End: Complemental strand, 33898030 - 33897914
Alignment:
Q  760 agcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaag 859  Q
    ||||||||||||||||||||       |||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |    
T  33898030 agcttataagctcgtttgataaaaaaagctctgtttggtaatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacaagcttataagctatttttcagacg 33897931  T
Q  860 ctattccaagtagcgtt 876  Q
    ||||||||| |||||||    
T  33897930 ctattccaaatagcgtt 33897914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 556 - 654
Target Start/End: Original strand, 21033985 - 21034083
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  21033985 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 21034083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 556 - 654
Target Start/End: Original strand, 55426768 - 55426866
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  55426768 tgttggtgtaagccctagagaccaatagtttatgttaaatctatcttatgtattatgacttttattattgaataatatatgacactctttattatattt 55426866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 716 - 876
Target Start/End: Original strand, 20450428 - 20450589
Alignment:
Q  716 tctgtttgggaaacccaaaaaa-gagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccat 814  Q
    ||||||||| || ||||||||| |||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||| |||        |||||||||| ||||| ||||| || |     
T  20450428 tctgtttggcaagcccaaaaaacgagcttatagcttatagcggatagcttataagctcgtctgacaaaaaaagctctgtttggtaacagttttttacaac 20450527  T
Q  815 gagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcgtt 876  Q
     || ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  20450528 aagtttataacttatttcacgagcttataagttatttttcagacgctattgcaagtagcgtt 20450589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 810 - 885
Target Start/End: Complemental strand, 52868266 - 52868190
Alignment:
Q  810 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttata 885  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  52868266 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttgagaagctatttcaagtagtgtttgagcttata 52868190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 789 - 876
Target Start/End: Original strand, 7041105 - 7041192
Alignment:
Q  789 tctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcgtt 876  Q
    |||||||| |||| |||||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  7041105 tctgtttggtaacgcttttttacaacgagcttatagcttatttcaggagcttataagctatttttcagaagctacttcaagtagcgtt 7041192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 556 - 654
Target Start/End: Original strand, 14890138 - 14890236
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  14890138 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatgacactctttattatattt 14890236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 556 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 15847091 - 15846993
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||| |||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  15847091 tgttggtgtaagcgctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 15846993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 556 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 20148110 - 20148012
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||| |||  |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  20148110 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattggataatatatggcactctttattatattt 20148012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 556 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 25979282 - 25979184
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    |||||||||||| | |||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  25979282 tgttggtgtaagtcctagaggccaatagtttatgttaaacttatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatgacactctttattatattt 25979184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 788 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 29203136 - 29203034
Alignment:
Q  788 ctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagc-gttgagcttatag 886  Q
    ||||||||| ||||  ||||| || | |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  29203136 ctctgtttggtaacggttttttacaacgagcttatagtttatttcacgagcttataagctatttttcagacgctatttcaagtagcatttgagcttatag 29203037  T
Q  887 ctt 889  Q
    |||    
T  29203036 ctt 29203034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 718 - 778
Target Start/End: Complemental strand, 24536869 - 24536808
Alignment:
Q  718 tgtttgggaaac-ccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttga 778  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24536869 tgtttgggaaactccaaaaaagagcttttagctcttagcttatagcttataagctcgtttga 24536808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 752 - 889
Target Start/End: Original strand, 39719361 - 39719498
Alignment:
Q  752 tagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactattt 851  Q
    |||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||  ||||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||     
T  39719361 tagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttgataacgtttttt-acaacaagcttatagcttatttcacgagcttataagttatta 39719459  T
Q  852 ttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |  |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  39719460 tgaagaagctattccaaatagcgtttgagtttatagctt 39719498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 558 - 654
Target Start/End: Original strand, 28087967 - 28088063
Alignment:
Q  558 ttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    ||||||||| || || | ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  28087967 ttggtgtaatccctaaaggccaatagtttatgttaaacttatcttatgtatcatgacttttattattaaataatatatgacactctttattatattt 28088063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 712 - 778
Target Start/End: Original strand, 52363008 - 52363075
Alignment:
Q  712 agggtctgtttgggaaacccaaaa-aagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttga 778  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  52363008 agggtctgtttgggaaactaaaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagcttgtttga 52363075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 712 - 769
Target Start/End: Original strand, 889679 - 889736
Alignment:
Q  712 agggtctgtttgggaaacccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataag 769  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  889679 agggtctgtttggttaaccctaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataag 889736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 791 - 875
Target Start/End: Original strand, 27446473 - 27446557
Alignment:
Q  791 tgtttgataacactttttcaccatgagctt-atagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcgt 875  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  27446473 tgtttggtaacactttttcac-atgagctttatagcttatttcacgagtttatatgctatttttcagaagctatttcaaatagcgt 27446557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 753 - 885
Target Start/End: Complemental strand, 37713285 - 37713151
Alignment:
Q  753 agcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttga-taacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactattt 851  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||        ||||||||||| ||||  ||||| || | |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  37713285 agcttatggcttataaactcgtttgacaaaaaaagctctgtttgagtaacggttttttacaacgagcttatagtttattttacgagcttataaactattt 37713186  T
Q  852 ttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttata 885  Q
    || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  37713185 ttaagaagttattctaagtagcgtttgagcttata 37713151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 556 - 696
Target Start/End: Original strand, 14225954 - 14226091
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataattt-atgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    |||||||||||||  ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||  || || |||||||||       
T  14225954 tgttggtgtaagctctagagaccaatatttttatgttaaatttatgttatgtatcatgacttttattattaaataagataacgcgttttttattata--- 14226050  T
Q  655 gtttgttgtaagattaataaagtccctagaattgatacttca 696  Q
     ||   |||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  14226051 -ttaactgtaagattaataaagtccctaaaatagatagttca 14226091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 791 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 43740384 - 43740325
Alignment:
Q  791 tgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatt 850  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43740384 tgtttggtaacagtttttcaccatgagtttatagcttatttcacgagcttataagctatt 43740325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 556 - 654
Target Start/End: Original strand, 12299658 - 12299756
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    ||||| |||||| | |||| ||||||| |||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  12299658 tgttgatgtaagtcctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcgctctttattatattt 12299756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 732 - 843
Target Start/End: Complemental strand, 45693571 - 45693460
Alignment:
Q  732 aaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttattt 831  Q
    ||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||         || | |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45693571 aaaaaagagtttatagttcttagcttatagcttataagttcgtttgacaaaaaaaactttatttggtaacactttttcaccatgagcttatagtttattt 45693472  T
Q  832 cacgagcttata 843  Q
    ||||| ||||||    
T  45693471 cacgaacttata 45693460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 729 - 778
Target Start/End: Complemental strand, 28394222 - 28394173
Alignment:
Q  729 cccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttga 778  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  28394222 cccaaaaaagagcttttagcttttaccttataacttataagctcgtttga 28394173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 804 - 876
Target Start/End: Complemental strand, 24350358 - 24350286
Alignment:
Q  804 tttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcgtt 876  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| || ||| |||||||    
T  24350358 tttttcaccacgagcttatagtttatttcacgagtttataaattatttttcagacgctgtttcaattagcgtt 24350286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 712 - 816
Target Start/End: Original strand, 51950322 - 51950427
Alignment:
Q  712 agggtctgtttgggaa-acccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttca 810  Q
    ||||||||||||| || ||| ||||||||| || | ||| |||||||||| |||||||||||||||||        |||||||||| |||||||||||||    
T  51950322 agggtctgtttggtaatacctaaaaaagagtttatcgctcttagcttataacttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttca 51950421  T
Q  811 ccatga 816  Q
    ||||||    
T  51950422 ccatga 51950427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 731 - 894
Target Start/End: Complemental strand, 52931299 - 52931147
Alignment:
Q  731 caaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnng-ctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttat 829  Q
    |||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||          ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52931299 caaaaaagagtttttaacttttaacttatagtttataaactcgtttgacaaaaaaaaactctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttat 52931200  T
Q  830 ttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagcttctcac 894  Q
                 ||  |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  52931199 -------------aagttatttttcagaagctattccaagtagcgtttaagcttatagcttctcac 52931147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 820 - 889
Target Start/End: Original strand, 5506704 - 5506774
Alignment:
Q  820 tatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  5506704 tatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 5506774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 791 - 894
Target Start/End: Complemental strand, 32983011 - 32982914
Alignment:
Q  791 tgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||       || |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |    
T  32983011 tgtttggtaacactttttcaccatgagcttat-------tttacgagcttataagctatttttcggaagctatttcaagtaatgcttgagcttatagcgt 32982919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 711 - 760
Target Start/End: Original strand, 52788648 - 52788698
Alignment:
Q  711 aagggtctgtttgggaaaccc-aaaaaagagcttttagcttttagcttata 760  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  52788648 aagggtctctttgggaaaccccaaaaaagagcttttagcttatagcttata 52788698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 746 - 778
Target Start/End: Original strand, 52788677 - 52788709
Alignment:
Q  746 agcttttagcttatagcttataagctcgtttga 778  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52788677 agcttttagcttatagcttataagctcgtttga 52788709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 584 - 633
Target Start/End: Original strand, 27432334 - 27432383
Alignment:
Q  584 tttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaat 633  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  27432334 tttatgttaaacttatattatgtattatgaattttattattcaataaaat 27432383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 710 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 54542116 - 54542075
Alignment:
Q  710 taagggtctgtttgggaaaccc-aaaaaagagcttttagctt 750  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  54542116 taagggtttgtttgggaaaccctaaaaaagagcttttagctt 54542075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 132; Significance: 5e-68; HSPs: 86)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 712 - 894
Target Start/End: Original strand, 5039738 - 5039922
Alignment:
Q  712 agggtctgtttgggaaaccc-aaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttca 810  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| |||||||||||||    
T  5039738 agggtctgtttgggaaaccccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttca 5039837  T
Q  811 ccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagcttctcac 894  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5039838 ccgtgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttctcac 5039922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 712 - 889
Target Start/End: Original strand, 16486846 - 16487024
Alignment:
Q  712 agggtctgtttgggaaacccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcac 811  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| ||||||||||||||    
T  16486846 agggtctgtttggttaacccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcac 16486945  T
Q  812 catgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16486946 catgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 16487024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 713 - 889
Target Start/End: Original strand, 3377357 - 3377534
Alignment:
Q  713 gggtctgtttgggaaacccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcacc 812  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| |||||||||||||||    
T  3377357 gggtctgtttggttaacccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcacc 3377456  T
Q  813 atgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3377457 atgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 3377534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 709 - 885
Target Start/End: Original strand, 36999450 - 36999627
Alignment:
Q  709 ttaagggtctgtttgggaaacccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacacttttt 808  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||        |||||||||| |||||||||||    
T  36999450 ttaagggtctgtttgggaaaccaaaaaaagagcttttagcttttagtttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacacttttt 36999549  T
Q  809 caccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttata 885  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36999550 caccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttata 36999627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 127; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 728 - 894
Target Start/End: Original strand, 43135597 - 43135764
Alignment:
Q  728 acccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagctt 827  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||       |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43135597 acccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagttcgtttgataaaaaaagctctgtttgataacactttttcatcatgagcttatagctt 43135696  T
Q  828 atttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagcttctcac 894  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43135697 atttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttctcac 43135764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 711 - 894
Target Start/End: Complemental strand, 4038518 - 4038334
Alignment:
Q  711 aagggtctgtttgggaaacccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttca 810  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||       | |||||||| |||||||||||||    
T  4038518 aagggtttgtttggttaacccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttacaagctcgtttgataaaaaaagttctgtttggtaacactttttca 4038419  T
Q  811 ccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagcttctcac 894  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4038418 ccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagttatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttctcac 4038334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 712 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 2266329 - 2266151
Alignment:
Q  712 agggtctgtttgggaaacccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcac 811  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||         ||||||||| ||||||||||||||    
T  2266329 agggtctgtttgggaaacccaaaaaaaaacttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgacaaaaaaaactctgtttggtaacactttttcac 2266230  T
Q  812 catgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2266229 catgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 2266151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 709 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 40025123 - 40024941
Alignment:
Q  709 ttaagggtctgtttgggaaac-ccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttt 807  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||        | |||||||| ||||||||||    
T  40025123 ttaagggtctgtttgggaaactccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcatataagctcgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaacactttt 40025024  T
Q  808 tcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtag-cgttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  40025023 tcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcctttgagcttatagctt 40024941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 713 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 8689138 - 8688961
Alignment:
Q  713 gggtctgtttgggaaacccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcacc 812  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||        |||||||||| |||||||||||||||    
T  8689138 gggtctgtttggttaaccccaaaaagagcttttagcttttagtttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcacc 8689039  T
Q  813 atgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8689038 atgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 8688961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 120; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 706 - 889
Target Start/End: Original strand, 9886950 - 9887134
Alignment:
Q  706 acattaagggtctgtttgggaaacccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactt 805  Q
    ||||| |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| ||||||||    
T  9886950 acatttagggtctgtttggttaacctaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactt 9887049  T
Q  806 tttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  9887050 tttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcataagctatttcaagtagcgtttgagcttatagctt 9887134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 713 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 13111920 - 13111741
Alignment:
Q  713 gggtctgtttgggaaaccc-aaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgttt-gataacactttttca 810  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||| | |||||||||||||    
T  13111920 gggtctgtttgggaaaccccaaaaaatagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgttttggtaacactttttca 13111821  T
Q  811 ccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13111820 ccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 13111741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 708 - 889
Target Start/End: Original strand, 37356128 - 37356311
Alignment:
Q  708 attaagggtctgtttgggaaacccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnn-gctctgtttgataacacttt 806  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||| |||||||||    
T  37356128 attacgggtctgtttgggaaactaaaaaaagagtttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaaagctctgtttggtaacacttt 37356227  T
Q  807 ttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37356228 ttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 37356311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 732 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 36712693 - 36712535
Alignment:
Q  732 aaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttattt 831  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36712693 aaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttattt 36712594  T
Q  832 cacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36712593 cacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 36712535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 710 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 2546504 - 2546323
Alignment:
Q  710 taagggtctgtttgggaaaccc-aaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacacttttt 808  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| |||||  ||||    
T  2546504 taagggtctgtttgagaaaccccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacaaatttt 2546405  T
Q  809 caccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2546404 aaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 2546323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 729 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 4453683 - 4453522
Alignment:
Q  729 cccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagctta 828  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4453683 cccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagctta 4453584  T
Q  829 tttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  4453583 tttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagtgtttgagcttatagctt 4453522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 710 - 889
Target Start/End: Original strand, 41322717 - 41322898
Alignment:
Q  710 taagggtctgtttgggaaacccaaaaaa-gagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacacttttt 808  Q
    |||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||        |||||||||| |||||||||||    
T  41322717 taagggtctgtttgggaaataaaaaaaaagagcttttagcttttatcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacacttttt 41322816  T
Q  809 caccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41322817 caccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 41322898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 710 - 889
Target Start/End: Original strand, 8815175 - 8815355
Alignment:
Q  710 taagggtctgtttgggaaacccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttc 809  Q
    ||||||||| |||||  ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||        |||||||||| ||||||||||||    
T  8815175 taagggtctatttggttaactcaaaaaagagcctttagcttttaacttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttc 8815274  T
Q  810 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8815275 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 8815355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 115; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 716 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 28382854 - 28382679
Alignment:
Q  716 tctgtttgggaaacccaaaaaag-agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccat 814  Q
    |||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| |||||||||||||||||    
T  28382854 tctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccat 28382755  T
Q  815 gagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28382754 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 28382679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 115; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 716 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 38579182 - 38579007
Alignment:
Q  716 tctgtttgggaaaccc-aaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccat 814  Q
    |||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| |||||||||||||||||    
T  38579182 tctgtttggttaaccctaaaaaagaacttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccat 38579083  T
Q  815 gagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38579082 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 38579007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 713 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 650956 - 650779
Alignment:
Q  713 gggtctgtttgggaaaccc-aaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcac 811  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| ||||||||||||||    
T  650956 gggtctgtttggttaaccccaaaaaagagcttttagcttt-agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcac 650858  T
Q  812 catgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  650857 catgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 650779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 709 - 893
Target Start/End: Complemental strand, 41796923 - 41796737
Alignment:
Q  709 ttaagggtctgtttgggaaaccca-aaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttt 807  Q
    |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||       |||||||||  ||||||||||    
T  41796923 ttaagggtctgtttggtaaaccaataaaaagagcttttagctcttagcttatagtttataagctcgttttataaaaaaagctctgtttcgtaacactttt 41796824  T
Q  808 tcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagcttctca 893  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41796823 tgaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttctca 41796737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 713 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 10839756 - 10839579
Alignment:
Q  713 gggtctgtttgggaaacccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcacc 812  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||| |||||||||||||||    
T  10839756 gggtctgtttgggaaaccaaaaaaagaacttttagcttttagcttatagcttataaactcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcacc 10839657  T
Q  813 atgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10839656 atgagcttatatcttatttcactagcttataagctatttttcaaaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 10839579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 712 - 893
Target Start/End: Complemental strand, 6760782 - 6760599
Alignment:
Q  712 agggtctgtttgggaaacccaaaaaa-gagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttca 810  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |        |||||||||| ||||||||||| |    
T  6760782 agggtctgtttggtaaactcaaaaaaagagcttttagctcttagcttatagcttataagctcgtttcacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttga 6760683  T
Q  811 ccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagcttctca 893  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6760682 ccatgagcttatagcttatttcacaagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttctca 6760599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 713 - 889
Target Start/End: Original strand, 21865210 - 21865389
Alignment:
Q  713 gggtctgtttgggaaaccc-aaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnn-gctctgtttgataacactttttca 810  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||| |||||||||||||    
T  21865210 gggtctgtttggttaaccccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaagctctgtttggtaacactttttca 21865309  T
Q  811 ccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21865310 ccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagttattccaagtagcgtttgagcttatagctt 21865389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 710 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 24402225 - 24402051
Alignment:
Q  710 taagggtctgtttgggaaacccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttc 809  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||     |||||||||||| ||||||||||||||||||||        |||||||||| ||||||||||||    
T  24402225 taagggtctgtttgggaaacccaaaaaa-ag-----agcttttagcttttagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttc 24402132  T
Q  810 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24402131 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 24402051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 739 - 889
Target Start/End: Original strand, 15521470 - 15521621
Alignment:
Q  739 agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagc 838  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15521470 agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaaaactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagc 15521569  T
Q  839 ttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15521570 ttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 15521621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 712 - 885
Target Start/End: Original strand, 26911475 - 26911649
Alignment:
Q  712 agggtctgtttgggaa-acccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttca 810  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||         |||| |||| |||||||||||||    
T  26911475 agggtctgtttggtaacacccaaaaaagagcttttagctcttaacttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaa-ctctctttggtaacactttttca 26911573  T
Q  811 ccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttata 885  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26911574 ccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttata 26911649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 713 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 43507732 - 43507561
Alignment:
Q  713 gggtctgtttgggaaacccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcacc 812  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||     |||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| ||||| |||||||||    
T  43507732 gggtctgtttgggaaaccctaaaaa-ag-----agcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacattttttcacc 43507639  T
Q  813 atgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43507638 atgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 43507561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 735 - 894
Target Start/End: Complemental strand, 4385679 - 4385519
Alignment:
Q  735 aaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcac 834  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||        | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4385679 aaagagcttttagctcttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaacactttttcaccatgagtttatagcttatttcac 4385580  T
Q  835 gagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagcttctcac 894  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4385579 gagcttataagctatttttcagaaactatttcaagtagcgtttgagcttatagcttctcac 4385519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 747 - 894
Target Start/End: Complemental strand, 31616528 - 31616380
Alignment:
Q  747 gcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaac 846  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||        ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31616528 gcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctttgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagc 31616429  T
Q  847 tatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagcttctcac 894  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  31616428 tatttttcagaagctattccaaatagcgtttgagcttatagcttctcac 31616380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 753 - 889
Target Start/End: Original strand, 39167756 - 39167893
Alignment:
Q  753 agcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 852  Q
    ||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39167756 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 39167855  T
Q  853 tcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39167856 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 39167893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 744 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 10393180 - 10393034
Alignment:
Q  744 ttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttata 843  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10393180 ttagcttatagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcatgagcttata 10393081  T
Q  844 aactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  10393080 agctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagtttatagctt 10393034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 746 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 17263896 - 17263752
Alignment:
Q  746 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaa 845  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||        |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17263896 agcttttagcttttagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacatgttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 17263797  T
Q  846 ctatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17263796 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 17263752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 746 - 889
Target Start/End: Original strand, 29514832 - 29514975
Alignment:
Q  746 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaa 845  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||        |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  29514832 agcttttagcttttagcttataagctcgtttga-caaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccaagagcttatagcttatttcacgagcttataag 29514930  T
Q  846 ctatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29514931 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 29514975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 731 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 6232438 - 6232279
Alignment:
Q  731 caaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatt 830  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||          |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6232438 caaaaaagagcttttagctcttagcttataacttataagctcgtttgacaaaaaatattctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagtttatt 6232339  T
Q  831 tcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  6232338 tcacgagcttataagctatttttcagaagatatttcaagtagcgtttgagcttatagctt 6232279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 751 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 7400529 - 7400390
Alignment:
Q  751 ttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatt 850  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||        |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7400529 ttagtttatagcttataagttcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatt 7400430  T
Q  851 tttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7400429 tttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 7400390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 744 - 893
Target Start/End: Complemental strand, 40869504 - 40869354
Alignment:
Q  744 ttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttata 843  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| |||||        | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40869504 ttagcttatagcttatagtttataagctcatttgacaaaaaaagttctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcatgagcttata 40869405  T
Q  844 aactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagcttctca 893  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40869404 agctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttctca 40869354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 732 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 38880940 - 38880781
Alignment:
Q  732 aaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnn-gctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatt 830  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |         | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38880940 aaaaaagagcttttaactcttagcttatagcttataagctcgtttcacaaaaaaaagttctgtttggtaacactttttgaccatgagcttatagcttatt 38880841  T
Q  831 tcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38880840 tcacgagtttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 38880781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 730 - 885
Target Start/End: Original strand, 10727812 - 10727968
Alignment:
Q  730 ccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttat 829  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||       | |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  10727812 ccaaaaaagagtttttaacttttagcttatagcttattagcccgtttgataaaaaaagttctgtttgataacactttttcatcataagcttatagcttat 10727911  T
Q  830 ttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttata 885  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||    
T  10727912 ttcacgaacttataagctatttttcaaaaactattccaagtagcgtttgagcttata 10727968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 712 - 851
Target Start/End: Original strand, 18212083 - 18212223
Alignment:
Q  712 agggtctgtttgggaaacccaaaaaag-agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttca 810  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||        |||||||||| |||||||||||||    
T  18212083 agggtctgtttggttaaccccaaaaaggagcttttagcttttaccttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttca 18212182  T
Q  811 ccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactattt 851  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18212183 ccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctattt 18212223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 759 - 876
Target Start/End: Complemental strand, 7213791 - 7213674
Alignment:
Q  759 tagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaa 858  Q
    |||||||||||||||||||||        ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7213791 tagcttataagctcgtttgataaaaaaaactctgtttgataatactttttgaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaa 7213692  T
Q  859 gctattccaagtagcgtt 876  Q
    ||||||||||||||||||    
T  7213691 gctattccaagtagcgtt 7213674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 787 - 894
Target Start/End: Original strand, 43285657 - 43285765
Alignment:
Q  787 gctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttata 885  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  43285657 gctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcatgagtttataagctatttttcagaagctattccaaatagcgtttgagcttata 43285756  T
Q  886 gcttctcac 894  Q
    |||||||||    
T  43285757 gcttctcac 43285765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 751 - 889
Target Start/End: Original strand, 38842838 - 38842977
Alignment:
Q  751 ttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatt 850  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||        ||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38842838 ttagcttatagtttataagttcgtttgataaaaaaaactctgtttggtaatactttttcaccatgagtttatagcttatttcacgagcttataaactatt 38842937  T
Q  851 tttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  38842938 tttcagaagctatttcaagtagcgtttgaacttatagctt 38842977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 789 - 894
Target Start/End: Original strand, 42132708 - 42132814
Alignment:
Q  789 tctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagc 887  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  42132708 tctgtttggtaacaccttttcatcatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaaatagcgtttgagcttatagc 42132807  T
Q  888 ttctcac 894  Q
    |||||||    
T  42132808 ttctcac 42132814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 716 - 889
Target Start/End: Original strand, 44275630 - 44275804
Alignment:
Q  716 tctgtttgggaaacccaaaaaa-gagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccat 814  Q
    ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |          | |||||| ||||||||||| ||||     
T  44275630 tctgtttggtaaacctaaaaaaagagcttttagctcttagcttatagcttataagctcgtttcacaaaaaaat-tatgtttggtaacactttttgaccac 44275728  T
Q  815 gagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  44275729 gagcttatagcttatttcacgagcttataatctatttttcagaagttattccaattagcgtttgagcttatagctt 44275804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 713 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 13528079 - 13527903
Alignment:
Q  713 gggtctgtttgggaaacccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcacc 812  Q
    ||||||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||        |||||||| | |||||| ||||||||    
T  13528079 gggtctgtttggttaaccaaaaaaa-agcttttagcttttaacttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgttcggtaacaccttttcacc 13527981  T
Q  813 atgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||| ||||| |||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||    
T  13527980 atgagtttataacttatttcacaagtttataagctatttttcagaagctatttcaagtaacgtttgaacttatagctt 13527903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 555 - 713
Target Start/End: Original strand, 21626428 - 21626582
Alignment:
Q  555 atgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||| || ||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21626428 atgttggtgtaagtcctagatgtcaatagtttatgttaaacttatgatatgcatcatgacatttattattgaataaaataaggcattctttattatattt 21626527  T
Q  655 gtttgttgtaagattaataaagtccctagaattgatacttcatgtaatggaacattaag 713  Q
    |||     ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  21626528 gtta----taagattaataaagtccctcgaatagatagttcatgtgatggaacattaag 21626582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 791 - 886
Target Start/End: Complemental strand, 8070718 - 8070622
Alignment:
Q  791 tgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatag 886  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  8070718 tgtttggtaacactttttcaccatgagcttataacttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattctaagtagcgtttgagcttatag 8070622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 732 - 889
Target Start/End: Original strand, 8339963 - 8340121
Alignment:
Q  732 aaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttattt 831  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||        | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  8339963 aaaaaagagcttttagctcttaacttatagtttataagttcgtttgacgaaaaaagttctgtttggtaacactttttcatcatgagcttatagtttattt 8340062  T
Q  832 cacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
     ||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  8340063 tacgaatttataagctatttttcaaaagctattccaagtagcgtttgagcttaaagctt 8340121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 710 - 823
Target Start/End: Original strand, 18710152 - 18710265
Alignment:
Q  710 taagggtctgtttgggaaacccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttc 809  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||        |||||||||| |||||||||||     
T  18710152 taagggtctgtttgggaaactaaaaaaagagcttttagcttttaacttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttt 18710251  T
Q  810 accatgagcttata 823  Q
    ||||||||||||||    
T  18710252 accatgagcttata 18710265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 810 - 889
Target Start/End: Original strand, 24019948 - 24020028
Alignment:
Q  810 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24019948 accacgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 24020028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 793 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 9053226 - 9053129
Alignment:
Q  793 tttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||| |||||||| |||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  9053226 tttggtaacacttattcaccatgaactaatagtttatttcacgagcttataaactattcttcagaagctatttcaagtagcgtttgagcttatagctt 9053129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 556 - 704
Target Start/End: Original strand, 29800175 - 29800319
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatatttg 655  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||| ||||  || |||| ||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||        
T  29800175 tgttggtgtaagccctagaggacaatattttatgttaaacttatactacgtatcatgacttttattattgaataatatatgtcattctttattata---- 29800270  T
Q  656 tttgttgtaagattaataaagtccctagaattgatacttcatgtaatgg 704  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||    
T  29800271 attattgtaagattaataaagtccctagaatagatagttcgtgtaatgg 29800319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 556 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 24250587 - 24250489
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24250587 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataaaatatggcactctttattatattt 24250489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 810 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 23357063 - 23356983
Alignment:
Q  810 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcgt-tgagcttatagctt 889  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  23357063 accacgagcttatagcttatttcacgagcttatatgctatttttcagaagctatttcaagtagcgtctgagcttatagctt 23356983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 553 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 24764114 - 24763969
Alignment:
Q  553 ttatgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatat 652  Q
    |||||||  |||||||| | || ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||| | ||||||||||||    
T  24764114 ttatgtttttgtaagccctggaggccaatagtttatgttaaacttatgttatgtataatgacttttattattaaataatacatggaaatctttattatat 24764015  T
Q  653 ttgtttgttgtaagattaataaagtccctagaattgatacttcatgtaat 702  Q
    |||||     |||  ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  24764014 ttgtta----taatgttaataaagtcccaagaatagatagttcatgtaat 24763969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 565 - 713
Target Start/End: Complemental strand, 15342548 - 15342404
Alignment:
Q  565 aagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatatttgtttgttgta 664  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||  |||||||| ||||| ||||| ||||||||     || |||||    
T  15342548 aagccttagaggccaatagtttatgttaaacttatattatgtatcatgacttttattgttaaataatatatgacattcgttattata----attcttgta 15342453  T
Q  665 agattaataaagtccctagaattgatacttcatgtaatggaacattaag 713  Q
     ||||||||||||||||| ||| |||  ||| |||||||||| ||||||    
T  15342452 tgattaataaagtccctaaaatagatggttcgtgtaatggaatattaag 15342404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 815 - 889
Target Start/End: Original strand, 16669119 - 16669194
Alignment:
Q  815 gagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16669119 gagcttatagcttatttcaggagcttataagctatttttcagacgctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 16669194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 815 - 889
Target Start/End: Original strand, 25071437 - 25071512
Alignment:
Q  815 gagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25071437 gagcttatagtttatttcacgagcttataagctatttttcagaaactattccaagtagcgtttgagcttatagctt 25071512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 789 - 886
Target Start/End: Original strand, 15250146 - 15250244
Alignment:
Q  789 tctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatag 886  Q
    ||||||||||||   | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15250146 tctgtttgataatggtctttcaccacgagcttatagcttatttctcgagcttataagttatttttcagacgctattccaagtagcgtttgagcttatag 15250244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 556 - 654
Target Start/End: Original strand, 30174124 - 30174222
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  30174124 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 30174222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 797 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 2047412 - 2047320
Alignment:
Q  797 ataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  2047412 ataacactttttcac-atgagtttatagcttatttcatgagtttataagctatttttcagaagttattctaagtagcgtttgagcttatagctt 2047320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 556 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 24229770 - 24229672
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  24229770 tgttggtgtaagccctagaggccaatggtttatgttaaacttatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatgacactctttattatattt 24229672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 713 - 893
Target Start/End: Complemental strand, 6153625 - 6153457
Alignment:
Q  713 gggtctgtttgggaa-acccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcac 811  Q
    |||||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||        | | |||||| ||| ||||||| ||    
T  6153625 gggtctgtttggtaacatccaaaaaagagcttttagctcttagcttatagcttataagctcgtttga-caaaaaagttttgtttggtaaaacttttttac 6153527  T
Q  812 catgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagcttctca 893  Q
    |||||||||||             ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  6153526 catgagcttat-------------agcttataagctatttttcagaagttattccaagtagtgtttgagcttatagcttctca 6153457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 805 - 876
Target Start/End: Original strand, 2221446 - 2221517
Alignment:
Q  805 ttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcgtt 876  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  2221446 ttttcaccatgagtttatagtttatttcacgagcttctaagctatttttcagacgctattccaagtaacgtt 2221517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 788 - 893
Target Start/End: Original strand, 34884850 - 34884956
Alignment:
Q  788 ctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatag 886  Q
    |||||||||||||   |||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||| | || |||||||||    
T  34884850 ctctgtttgataaaggttttccaccacgagtttatagtttatttcacgagcttatagcctatttttcagactctattccaagtagtgtttcagcttatag 34884949  T
Q  887 cttctca 893  Q
    |||||||    
T  34884950 cttctca 34884956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 809 - 889
Target Start/End: Original strand, 4055951 - 4056032
Alignment:
Q  809 caccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  4055951 caccacgagcttatagcttatttcacgagcttattagctatttttcagacactattccaaatagcgtttgaacttatagctt 4056032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 830 - 889
Target Start/End: Original strand, 41877821 - 41877881
Alignment:
Q  830 ttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||    
T  41877821 ttcacgagcttataaactatttttcagaagctatttcaagtagtgtttgagcttatagctt 41877881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 815 - 885
Target Start/End: Original strand, 2758898 - 2758969
Alignment:
Q  815 gagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttata 885  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  2758898 gagcttataacttatttcatgagcttataagctattttttagacgctattccaagtagcgtttgagcttata 2758969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 815 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 7823621 - 7823546
Alignment:
Q  815 gagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  7823621 gagcttgtagcttatttcacgagcttataagctattttttataagctacttcaagtagcgtttgagcttatagctt 7823546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 820 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 6222708 - 6222638
Alignment:
Q  820 tatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagc-gttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||  |||| ||||||||||    
T  6222708 tatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctatttcaagcagcatttgaacttatagctt 6222638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 746 - 887
Target Start/End: Complemental strand, 5520211 - 5520069
Alignment:
Q  746 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaa 845  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||          ||||||||  ||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||| ||||||     
T  5520211 agcttatagcttatagcttataagctcgtttgtaaaaaaaaactctgtttagtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagtttataag 5520112  T
Q  846 ctatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagc 887  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||    
T  5520111 ctatttttcagatgctattacaaatagcgtttgagcttatagc 5520069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 826 - 894
Target Start/End: Original strand, 37674497 - 37674566
Alignment:
Q  826 ttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagcttctcac 894  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  37674497 ttatttcacgagcttgtaaactatattttagacgctattccaagtagcgtttgagtttatagcttctcac 37674566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 788 - 886
Target Start/End: Original strand, 598931 - 599030
Alignment:
Q  788 ctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatag 886  Q
    ||||| ||| |||| |||||| || | ||| |||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  598931 ctctgcttggtaacgcttttttacaacgagtttatagtttatttcaaaagcttataagctatttttcagaagctacttcaagtagcgtttgagcttatag 599030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 578 - 703
Target Start/End: Original strand, 19616205 - 19616327
Alignment:
Q  578 caataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatatttgtttgttgtaagattaataaagt 677  Q
    ||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||| || ||||  |||||  | ||||||||||  ||||||||||    
T  19616205 caatagtttatgttaaacttatattatgtatcatgatttttattattaaataatatatgacactctt--ttata-atatttgttgtaatgttaataaagt 19616301  T
Q  678 ccctagaattgatacttcatgtaatg 703  Q
     |||||||| |||| ||| |||||||    
T  19616302 tcctagaatagatagttcgtgtaatg 19616327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 846 - 894
Target Start/End: Original strand, 18710268 - 18710317
Alignment:
Q  846 ctatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagcttctcac 894  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18710268 ctattttttagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttctcac 18710317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 556 - 713
Target Start/End: Complemental strand, 18852337 - 18852183
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataattt-atgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    |||||||||||||| || |  |||||||||| | |||||| ||||||| | ||| ||||||||||| | ||||||| |   ||||||||||||||||       
T  18852337 tgttggtgtaagccataaaaaccaataattttaagttaaacttatgttttctatcatgacttttattaataaataatacgaggcattctttattata--- 18852241  T
Q  655 gtttgttgtaagattaataaagtccctagaattgatacttcatgtaatggaacattaag 713  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || ||| |||| |||  |||||| ||| |||||    
T  18852240 -ttttttgtaagattaataaagtccatataatagatagttcgagtaatgaaacgttaag 18852183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 731 - 823
Target Start/End: Original strand, 7569768 - 7569861
Alignment:
Q  731 caaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgat-nnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttata 823  Q
    |||||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||        | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  7569768 caaaaatgagcttttaactctcagcttatagcttataagctcgtttgataaaaaaaagttctgtttggtaacacttttttaccatgagcttata 7569861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 602 - 713
Target Start/End: Complemental strand, 28719304 - 28719196
Alignment:
Q  602 tatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattcttt-attatatttgtttgttgtaagattaataaagtccctagaattgatacttcatgta 700  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||||| | |||||||| |||||| || ||    |||| ||||||||||||| ||||||  ||| |||||||     
T  28719304 tatgtatcatgacttttattattaaacaaaataagacattcttttattatacttatt----gtaaaattaataaagtccttagaatatatagttcatgtg 28719209  T
Q  701 atggaacattaag 713  Q
    |||||||||||||    
T  28719208 atggaacattaag 28719196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 588 - 676
Target Start/End: Complemental strand, 28741478 - 28741394
Alignment:
Q  588 tgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatatttgtttgttgtaagattaataaag 676  Q
    ||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||||||||     ||||||||||||||||||||    
T  28741478 tgttaaacttatgatatatatcatgacttttattattaaataaaataaggtattcattattata----cttgttgtaagattaataaag 28741394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 844 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 13351649 - 13351601
Alignment:
Q  844 aactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagcttct 891  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  13351649 aactatttttcagacgctatttcaagtagcgtttgagcttatagcttct 13351601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 832 - 889
Target Start/End: Original strand, 13761842 - 13761898
Alignment:
Q  832 cacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  13761842 cacgagcttataagctatttttcagaagtta--ccaagtagcgtttgagcttatagctt 13761898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 729 - 760
Target Start/End: Original strand, 29514822 - 29514853
Alignment:
Q  729 cccaaaaaagagcttttagcttttagcttata 760  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29514822 cccaaaaaagagcttttagcttttagcttata 29514853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 788 - 885
Target Start/End: Original strand, 39675059 - 39675157
Alignment:
Q  788 ctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttata 885  Q
    |||| |||| ||| ||||||| || |||| |||||| ||||||||| ||| ||||||  ||||||||| |||||  | ||||||||| |||||||||||    
T  39675059 ctctatttggtaaaacttttttacaatgaacttataacttatttcaagagtttataagatatttttcaaaagctgcttcaagtagcgtttgagcttata 39675157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 835 - 891
Target Start/End: Original strand, 7569853 - 7569910
Alignment:
Q  835 gagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagcttct 891  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||| || |||||||||||||||||    
T  7569853 gagcttataagctatttttcagaagttattttaagtaacgtttgagcttatagcttct 7569910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 735 - 776
Target Start/End: Complemental strand, 13564564 - 13564523
Alignment:
Q  735 aaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgttt 776  Q
    |||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||    
T  13564564 aaagagcttttaactcttaacttatagcttataagctcgttt 13564523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 131; Significance: 2e-67; HSPs: 86)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 708 - 889
Target Start/End: Original strand, 28709268 - 28709451
Alignment:
Q  708 attaagggtctgtttgggaaa-cccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacacttt 806  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||        |||||||||| |||||||||    
T  28709268 attaagggtctgtttgggaaaacccaaaaaagagcttttagcttttaacttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacacttt 28709367  T
Q  807 ttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28709368 ttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 28709451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 708 - 889
Target Start/End: Original strand, 28716625 - 28716808
Alignment:
Q  708 attaagggtctgtttgggaaa-cccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacacttt 806  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||        |||||||||| |||||||||    
T  28716625 attaagggtctgtttgggaaaacccaaaaaagagcttttagcttttaacttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacacttt 28716724  T
Q  807 ttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28716725 ttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 28716808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 710 - 889
Target Start/End: Original strand, 10618770 - 10618950
Alignment:
Q  710 taagggtctgtttgggaaacccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttc 809  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||       | | |||||| ||||||||||||    
T  10618770 taagggtctgtttgggaaaccaaaaaaagagcttttagtttttagcttatagcttataagctcgtttgataaaaaaagttttgtttggtaacactttttc 10618869  T
Q  810 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10618870 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 10618950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 710 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 36681629 - 36681449
Alignment:
Q  710 taagggtctgtttgggaaacccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttc 809  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| ||||||||||||    
T  36681629 taagggtctgtttgggaaactaaaaaaagagcttttaacttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttc 36681530  T
Q  810 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36681529 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 36681449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 712 - 894
Target Start/End: Complemental strand, 1894023 - 1893838
Alignment:
Q  712 agggtctgtttgggaaacccaaaaaa-gagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnn-gctctgtttgataacactttttc 809  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        | |||||||| ||||||||||||    
T  1894023 agggtctgtttgggaaacccaaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgataaaaaaaagttctgtttggtaacactttttc 1893924  T
Q  810 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagc-gttgagcttatagcttctcac 894  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  1893923 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcatttgagcttatagcttctcac 1893838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 713 - 889
Target Start/End: Original strand, 16422796 - 16422973
Alignment:
Q  713 gggtctgtttgggaaacccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcacc 812  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||       |||||||||  ||||||||||||| |    
T  16422796 gggtctgtttggttaacccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcctataagctcgtttgataaaaaaagctctgtttagtaacactttttcatc 16422895  T
Q  813 atgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16422896 atgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 16422973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 710 - 889
Target Start/End: Original strand, 17081617 - 17081798
Alignment:
Q  710 taagggtctgtttgggaaaccc-aaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacacttttt 808  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| |||||||||||    
T  17081617 taagggtctgtttggttaaccccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacacttttt 17081716  T
Q  809 caccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17081717 caccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 17081798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 713 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 45141634 - 45141457
Alignment:
Q  713 gggtctgtttgggaaacccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcacc 812  Q
    ||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| |||||||||||||||    
T  45141634 gggtctgtttggttaatccaaaaaagagtttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcacc 45141535  T
Q  813 atgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45141534 atgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 45141457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 712 - 889
Target Start/End: Original strand, 25023271 - 25023450
Alignment:
Q  712 agggtctgtttgggaaacccaaaaaa-gagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttca 810  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| |||||||||||||    
T  25023271 agggtctgtttgggaaactaaaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttca 25023370  T
Q  811 ccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25023371 ccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctattttttagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 25023450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 732 - 889
Target Start/End: Original strand, 31581680 - 31581838
Alignment:
Q  732 aaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttattt 831  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31581680 aaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttattt 31581779  T
Q  832 cacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31581780 cacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 31581838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 729 - 885
Target Start/End: Original strand, 17115521 - 17115678
Alignment:
Q  729 cccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagctta 828  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17115521 cccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgaaaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagctta 17115620  T
Q  829 tttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttata 885  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17115621 tttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttata 17115678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 707 - 889
Target Start/End: Original strand, 39702266 - 39702450
Alignment:
Q  707 cattaagggtctgtttgggaaacccaaaaaa-gagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactt 805  Q
    |||| ||||||||||||||||||  |||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| ||||||||    
T  39702266 catttagggtctgtttgggaaactaaaaaaaagaacttttaacttttagcttatagcttataagctcgtttgacataaaaagctctgtttggtaacactt 39702365  T
Q  806 tttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39702366 tttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 39702450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 115; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 712 - 889
Target Start/End: Original strand, 31478041 - 31478220
Alignment:
Q  712 agggtctgtttgggaaacccaaaaa-agagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttca 810  Q
    |||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| |||||||||||||    
T  31478041 agggtctgtttggttaaccccaaaagagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttca 31478140  T
Q  811 ccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31478141 ccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagttattccaagtagcgtttgagcttatagctt 31478220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 115; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 712 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 38171608 - 38171429
Alignment:
Q  712 agggtctgtttgggaaaccc-aaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttca 810  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||        |||||||||| |||||||| ||||    
T  38171608 agggtctgtttgggaaaccccaaaaaagagcttttagcttttagtttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacacttgttca 38171509  T
Q  811 ccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38171508 ccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagttgtttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 38171429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 115; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 731 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 44827478 - 44827319
Alignment:
Q  731 caaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatt 830  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44827478 caaaaaagagcttttagtttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatt 44827379  T
Q  831 tcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44827378 tcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 44827319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 713 - 889
Target Start/End: Original strand, 6338284 - 6338462
Alignment:
Q  713 gggtctgtttgggaaaccc-aaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcac 811  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||| ||||||||||| ||    
T  6338284 gggtctgtttggttaaccccaaaaaagagcttttagcttctagcttatagcttataagctcgtttgataaaaaaaactctgtttggtaacacttttttac 6338383  T
Q  812 catgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6338384 catgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 6338462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 716 - 889
Target Start/End: Original strand, 39871235 - 39871408
Alignment:
Q  716 tctgtttgggaaacccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatg 815  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  39871235 tctgtttgggaaactaaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttga-caaaaaagctctatttggtaacactttttcaccatg 39871333  T
Q  816 agcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagc-gttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  39871334 agcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcatttgagcttatagctt 39871408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 713 - 894
Target Start/End: Original strand, 32099502 - 32099686
Alignment:
Q  713 gggtctgtttgggaa-acccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnng-ctctgtttgataacactttttca 810  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||    
T  32099502 gggtctgtttggtaacacccaaaaaagagcttatagctcttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaatctctgtttgataacactttttca 32099601  T
Q  811 ccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagcttctcac 894  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32099602 ccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagttattccaagtagcgtttgagcttatagcttctcac 32099686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 739 - 894
Target Start/End: Complemental strand, 43276924 - 43276768
Alignment:
Q  739 agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagc 838  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43276924 agcttttagcttatagcttatagcttataagctcgtttgataaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagc 43276825  T
Q  839 ttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagcttctcac 894  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  43276824 ttataagctatttttcagaagctattccaagtaacgtttgagcttatagcttctcac 43276768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 716 - 889
Target Start/End: Original strand, 32541192 - 32541367
Alignment:
Q  716 tctgtttgggaaacccaaaaaag-agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccat 814  Q
    |||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| |||||||||||||||||    
T  32541192 tctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccat 32541291  T
Q  815 gagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32541292 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagttattccaagtagcgtttgagcttatagctt 32541367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 712 - 889
Target Start/End: Original strand, 23676836 - 23677016
Alignment:
Q  712 agggtctgtttgggaaaccc-aaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnn-gctctgtttgataacactttttc 809  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        | ||| |||| ||||||||||||    
T  23676836 agggtctgtttggttaaccccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgataaaaaaaagttctctttggtaacactttttc 23676935  T
Q  810 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23676936 accatgagcttatagcttatttcacgaacttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 23677016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 712 - 889
Target Start/End: Original strand, 8270869 - 8271050
Alignment:
Q  712 agggtctgtttgggaaacccaaaaaa---gagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacacttttt 808  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||   |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||        |||||||||| |||||||||||    
T  8270869 agggtctgtttgggaaactaaaaaaaaaagagcttttagtttttaccttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacacttttt 8270968  T
Q  809 caccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8270969 taccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 8271050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 711 - 894
Target Start/End: Original strand, 41313347 - 41313524
Alignment:
Q  711 aagggtctgtttgggaaacccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttca 810  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||       ||||||||||| |||||||||        |||||||||| |||||||||||||    
T  41313347 aagggtctgtttgggaaaccaaaaaaagagcttttagctt-------atagcttataaactcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttca 41313439  T
Q  811 ccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagcttctcac 894  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  41313440 ccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaaatagcgtttgagcttatagcttctcac 41313524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 713 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 42142915 - 42142737
Alignment:
Q  713 gggtctgtttgggaaacc-caaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcac 811  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||         ||||||||| ||||||||||||||    
T  42142915 gggtctgtttggttaacctcaaaaaagagcttttagcttttaacttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaactctgtttggtaacactttttcac 42142816  T
Q  812 catgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  42142815 catgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaaatagtgtttgagcttatagctt 42142737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 711 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 22878107 - 22877927
Alignment:
Q  711 aagggtctgtttgggaa-acccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttc 809  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||        |||||||||| ||||||||||||    
T  22878107 aagggtctgtttggtaacacccaaaaaagagcttatagctcttaacttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttc 22878008  T
Q  810 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  22878007 accatgaacttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattctcagtagcgtttgagcttatagctt 22877927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 713 - 894
Target Start/End: Complemental strand, 37587899 - 37587715
Alignment:
Q  713 gggtctgtttgggaa-acccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnn-gctctgtttgataacactttttca 810  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||        | |||||||| |||||||||||||    
T  37587899 gggtctgtttggtaacacccaaaaaagagtttttagctcttagcttatagcttataagctcgtttgataaaaaaaagttctgtttggtaacactttttca 37587800  T
Q  811 ccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagcttctcac 894  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  37587799 ccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagttatttttcagaagttattccaagtagcgtttgagcttttagcttctcac 37587715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 712 - 893
Target Start/End: Original strand, 9210952 - 9211134
Alignment:
Q  712 agggtctgtttgggaaacccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcac 811  Q
    ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| | ||||||        |||| ||||||||||||||||| ||    
T  9210952 agggtatgtttgataaacccaaaaaagagcttttaattcttagcttatagcttataagtttgtttgacaaaaaaagctccgtttgataacactttttgac 9211051  T
Q  812 catgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagcttctca 893  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9211052 catgagcttataacttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctatcccaagtagcgtttgagcttatagcttctca 9211134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 753 - 894
Target Start/End: Complemental strand, 31688189 - 31688047
Alignment:
Q  753 agcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 852  Q
    ||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31688189 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 31688090  T
Q  853 tcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagcttctcac 894  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31688089 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttctcac 31688047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 746 - 889
Target Start/End: Original strand, 27781102 - 27781246
Alignment:
Q  746 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaa 845  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27781102 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 27781201  T
Q  846 ctatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27781202 ctatttttcagaagttattccaagtagcgtttgagcttatagctt 27781246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 713 - 893
Target Start/End: Complemental strand, 34395528 - 34395344
Alignment:
Q  713 gggtctgtttgggaaaccc-aaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnng-ctctgtttgataacactttttca 810  Q
    |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||| |    
T  34395528 gggtctgtttggtaaaccttaaaaaagagcttttagcttttaacttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaaactctgtttgataacactttttga 34395429  T
Q  811 ccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaacta-tttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagcttctca 893  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||    
T  34395428 ccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctattttttcagaagctattcaaagtagcgtttgaacttatagcttctca 34395344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 95; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 712 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 37560710 - 37560531
Alignment:
Q  712 agggtctgtttgggaaacccaaaaaa-gagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttca 810  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |        | |||||||| ||||||||||| |    
T  37560710 agggtctgtttggtaaactcaaaaaaagagcttttagctcttaacttatagcttataagctcgtttcacaaaaaaagttctgtttggtaacactttttga 37560611  T
Q  811 ccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37560610 tcatgaacttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 37560531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 713 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 40223263 - 40223086
Alignment:
Q  713 gggtctgtttgggaa-acccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnn--gctctgtttgataacactttttc 809  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||          |||||||||| |||||||||  |    
T  40223263 gggtctgtttggtaacacccaaaaaagagcttttagctcttagcttatagcttataagcttgtttgacaaaaaaaaagctctgtttggtaacacttt--c 40223166  T
Q  810 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40223165 accatgagcttatagcttatttcacgagcttat-aactatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 40223086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 746 - 885
Target Start/End: Complemental strand, 39320212 - 39320072
Alignment:
Q  746 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaa 845  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||        |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  39320212 agcttttagcttatagcttataaattcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 39320113  T
Q  846 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtt-gagcttata 885  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39320112 ctatttttcagaagctattccaagtagcgttcgagcttata 39320072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 713 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 41694081 - 41693908
Alignment:
Q  713 gggtctgtttgggaaacccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnn---gctctgtttgataacactttttc 809  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||           |||||||||| ||||| ||||||    
T  41694081 gggtctgtttgggaaactcaaaaaagagcttttagctt-------atagcttataagctcgtttgacaaaatttttagctctgtttggtaacattttttc 41693989  T
Q  810 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41693988 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 41693908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 789 - 894
Target Start/End: Complemental strand, 36112944 - 36112838
Alignment:
Q  789 tctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagc 887  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36112944 tctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagc 36112845  T
Q  888 ttctcac 894  Q
    |||||||    
T  36112844 ttctcac 36112838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 712 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 11298222 - 11298043
Alignment:
Q  712 agggtctgtttgggaa-acccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttca 810  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||| ||||| |||||||    
T  11298222 agggtctgtttggtaacacccaaaaaagaggttatagctcttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaactctgtttggtaacattttttca 11298123  T
Q  811 ccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  11298122 tcatcagcttatagcttatttcacgagcttataagatatttttcagaagctattccaaataacgtttgagcttatagctt 11298043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 713 - 889
Target Start/End: Original strand, 24652234 - 24652411
Alignment:
Q  713 gggtctgtttgggaa-acccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcac 811  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||        | |||||||| |||||||||| |||    
T  24652234 gggtctgtttggtaacacccaaaaaagagcttttacctcttatcttatagcttataagctcgtttgacaaagaaagttctgtttggtaacactttt-cac 24652332  T
Q  812 catgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagc-gttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  24652333 catgagcttatagcttatttcacgagcttataagccattttttagaagctatttcaagtagcatttgagcttatagctt 24652411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 746 - 893
Target Start/End: Complemental strand, 3427767 - 3427619
Alignment:
Q  746 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaa 845  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| |||        |||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  3427767 agcttatagcttataggttataagctcgtctgacaaaaaaagctctgtttggtaatgctttttcaccatgaccttatagcttatttcacgagcttataag 3427668  T
Q  846 ctatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagcttctca 893  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3427667 ctattttttagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttctca 3427619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 716 - 876
Target Start/End: Original strand, 36590105 - 36590267
Alignment:
Q  716 tctgtttgggaa-acccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngct-ctgtttgataacactttttcacca 813  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||          | ||||||| ||||||||||| ||||    
T  36590105 tctgtttggtaacacccaaaaaagagcttttagctcttaatttatagcttataaactcgtttgacaaaaaaaaattctgtttggtaacacttttttacca 36590204  T
Q  814 tgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcgtt 876  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36590205 tgagcttataacttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtt 36590267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 789 - 889
Target Start/End: Original strand, 44157240 - 44157341
Alignment:
Q  789 tctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagc 887  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44157240 tctgtttggtaatactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttgagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagc 44157339  T
Q  888 tt 889  Q
    ||    
T  44157340 tt 44157341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 787 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 2642523 - 2642420
Alignment:
Q  787 gctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttata 885  Q
    |||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2642523 gctctgtttggtaatattttttgaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttata 2642424  T
Q  886 gctt 889  Q
    ||||    
T  2642423 gctt 2642420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 731 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 11741254 - 11741105
Alignment:
Q  731 caaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatt 830  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||        |          ||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11741254 caaaaaagagcttttagcttttagtttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaag----------taatacttttttaccatgagcttatagcttatt 11741165  T
Q  831 tcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11741164 tcacgagcttataagctatttttcagaatctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 11741105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 751 - 889
Target Start/End: Original strand, 38780666 - 38780805
Alignment:
Q  751 ttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatt 850  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||       | ||||||||| ||   |||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  38780666 ttagcttatagcttataagctcgtttgataaaaaaagttctgtttgacaatgatttttcaccacgaacttataacttattttacgagcttataaactatt 38780765  T
Q  851 tttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38780766 tttcagacgctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 38780805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 753 - 889
Target Start/End: Original strand, 13969982 - 13970119
Alignment:
Q  753 agcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 852  Q
    |||||||||||||||||||||||||||       |||||||||| ||     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13969982 agcttatagcttataagctcgtttgatcaaaaaagctctgtttggtactgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 13970081  T
Q  853 tcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  13970082 tcagacgctattcgaagtagcgtttgagcttatagctt 13970119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 556 - 713
Target Start/End: Complemental strand, 20539953 - 20539801
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatatttg 655  Q
    |||||||||||||| | ||  |||||| ||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||        
T  20539953 tgttggtgtaagccattgagaccaatagtttatgttaaacttgtgttatgtatcatgacttttattattaaataatatatgacattctttattata---- 20539858  T
Q  656 tttgttgtaagattaataaagtccctagaattgatacttcatgtaatggaacattaag 713  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||| ||||||    
T  20539857 attgttgtaagattaataaagtccatagaatagatagttcat-taatggaatattaag 20539801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 758 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 39747073 - 39746941
Alignment:
Q  758 atagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcaga 857  Q
    |||||||||||||||||||||        |||||||||| |||   |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39747073 atagcttataagctcgtttgaccaaaaaagctctgtttggtaatgttttttcaccacgagcttataacttatttcacgagcttataagctatttttcaga 39746974  T
Q  858 agctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39746973 tgctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 39746941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 753 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 43849346 - 43849209
Alignment:
Q  753 agcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 852  Q
    |||||||| |||||||||||||||||        |||||||||| ||||| ||||| || | ||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  43849346 agcttataacttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacaattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttt 43849247  T
Q  853 tcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  43849246 tcagatgctattacaagtagcgtttgagcttatagctt 43849209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 555 - 654
Target Start/End: Original strand, 26240230 - 26240329
Alignment:
Q  555 atgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  26240230 atgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacttatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 26240329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 746 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 29189872 - 29189728
Alignment:
Q  746 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaa 845  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||       |||||||||  ||||  ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||      
T  29189872 agcttatagcttatagcttataaactcgtttgataagaaaagctctgtttagtaacggttttttactacgagcttatagcttatttcacgagcttatatg 29189773  T
Q  846 ctatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  29189772 ttatttttaagaagctattccaagtagcgtttgagcttacagctt 29189728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 556 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 45534828 - 45534730
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  45534828 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaatctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 45534730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 805 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 35243439 - 35243354
Alignment:
Q  805 ttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35243439 ttttcaccacgagcttatatcttatttcacgagcttataagttatttttcagacgctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 35243354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 811 - 889
Target Start/End: Original strand, 3511283 - 3511362
Alignment:
Q  811 ccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  3511283 ccatgagcttgtagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctatttcaagtagcgtttgaacttatagctt 3511362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 787 - 889
Target Start/End: Original strand, 7378889 - 7378992
Alignment:
Q  787 gctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttata 885  Q
    |||||||||| |||| |||||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| | |||||||||||    
T  7378889 gctctgtttggtaacgcttttttacaacgagcttatagcttatttcatgagcttataagctatttttcagaagctacttcaagtagtgtttgagcttata 7378988  T
Q  886 gctt 889  Q
    ||||    
T  7378989 gctt 7378992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 556 - 654
Target Start/End: Original strand, 21969080 - 21969178
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  21969080 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 21969178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 556 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 27008072 - 27007974
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  27008072 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 27007974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 556 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 27015215 - 27015117
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  27015215 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 27015117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 556 - 654
Target Start/End: Original strand, 28498240 - 28498338
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  28498240 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 28498338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 713 - 894
Target Start/End: Original strand, 16831500 - 16831675
Alignment:
Q  713 gggtctgtttgggaa-acccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcac 811  Q
    |||||||||||| || ||| ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||        | || ||||| ||||||||||||||    
T  16831500 gggtctgtttggtaacaccaaaaaaagagtttttagctcttaacttatagcttataagttcgtttgacaaaaaaagttcagtttggtaacactttttcac 16831599  T
Q  812 catgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagcttctcac 894  Q
    |||||||||||||||        ||| |||||| |||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  16831600 catgagcttatagct--------gagtttataagctatttttcataagctattttaagtagcgtttgagcttataacttctcac 16831675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 556 - 702
Target Start/End: Original strand, 36970023 - 36970164
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatatttg 655  Q
    |||||||||||||| || | ||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||  | |||||||||||        
T  36970023 tgttggtgtaagcccta-aggccaatagtttatgttaaatttatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatgatactctttattata---- 36970117  T
Q  656 tttgttgtaagattaataaagtccctagaattgatacttcatgtaat 702  Q
    ||| | ||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  36970118 tttatagtaatgttaataaagtccctagaatagatagttcatgtaat 36970164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 810 - 889
Target Start/End: Original strand, 2855146 - 2855226
Alignment:
Q  810 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  2855146 accacgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcaaaagttatttcaagtagcgtttgagcttatagctt 2855226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 556 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 2963489 - 2963391
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||| |||||| ||| ||||| ||||| || | ||||||||||||    
T  2963489 tgttggtgtaagccctagatgccaatagtttatgttaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaataatatatgacactttttattatattt 2963391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 556 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 8371808 - 8371710
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||  |||| || ||||||||||||||    
T  8371808 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacttatcttatgtatcatgacttttattattgaataatgtatgacactctttattatattt 8371710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 556 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 22131164 - 22131066
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||  ||| ||||||||  |||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  22131164 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcgtgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 22131066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 798 - 872
Target Start/End: Original strand, 22957361 - 22957435
Alignment:
Q  798 taacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtag 872  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  22957361 taacatttttttaccatgagcttatagcttatttcacaagcttataagttatttttcagaagctattctaagtag 22957435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 556 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 27881043 - 27880945
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||| |||  |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  27881043 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattggataatatatggcactctttattatattt 27880945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 556 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 28021224 - 28021126
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||| |||  |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  28021224 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattggataatatatggcactctttattatattt 28021126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 789 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 1363895 - 1363794
Alignment:
Q  789 tctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagc 887  Q
    |||||||| ||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  1363895 tctgtttggtaatatttttttaccatgagcttataacttatttcacgagtttataagctattattcagacgctattctaagtagcgtttgaacttatagc 1363796  T
Q  888 tt 889  Q
    ||    
T  1363795 tt 1363794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 832 - 894
Target Start/End: Complemental strand, 42203463 - 42203400
Alignment:
Q  832 cacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagcttctcac 894  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42203463 cacgagcttataagctatttttcagaagctattctaagtagcgtttgagcttatagcttctcac 42203400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 556 - 654
Target Start/End: Original strand, 12561870 - 12561968
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    |||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  12561870 tgttggcgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatgacactctttattatattt 12561968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 793 - 886
Target Start/End: Original strand, 40551856 - 40551949
Alignment:
Q  793 tttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatag 886  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||    
T  40551856 tttggtaacattttttcaccatgagtttatagcttatttcatgagcttat-agctatttttcagaagctatttcagatagcgtttgagcttatag 40551949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 555 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 8782366 - 8782215
Alignment:
Q  555 atgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    ||||||||||||||| || | | ||||| ||||||||||| |||| |||||||| || |||||  |  || ||||||||||| ||||||||||||||       
T  8782366 atgttggtgtaagccctataggtcaatagtttatgttaaacttatattatgtatcattactttatt--tttaataaaatatgtcattctttattata--- 8782272  T
Q  655 gtttgttgtaagattaataaagtccctagaattgatacttcatgtaatggaacattaa 712  Q
      ||||||||||||||||||||||| || ||| |||| || |||| |||||| |||||    
T  8782271 -attgttgtaagattaataaagtccttaaaatagatagttaatgtgatggaatattaa 8782215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 753 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 8436663 - 8436526
Alignment:
Q  753 agcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 852  Q
    |||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||  ||||| || | || |||||||||||||| | ||||||||||  ||||||    
T  8436663 agcttatagcttataagctcgtttgataaaaaaaactctgtttgataacgattttttacaacgaacttatagcttattttatgagcttataagttatttt 8436564  T
Q  853 tcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||| |||||| ||| || || |||| ||||||||||    
T  8436563 tcagatgctattacaaatatcgtttgaacttatagctt 8436526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 831 - 889
Target Start/End: Original strand, 13888326 - 13888385
Alignment:
Q  831 tcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  13888326 tcacgagcttataaactatttttcagacgctattccaagtagcgtttaagcttatagctt 13888385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 556 - 639
Target Start/End: Original strand, 21914310 - 21914393
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggca 639  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  21914310 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggca 21914393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 576 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 22660029 - 22659951
Alignment:
Q  576 gccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  22660029 gccaatagtttatgttaaacttatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatgacactctttattatattt 22659951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 826 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 9370382 - 9370318
Alignment:
Q  826 ttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  9370382 ttatttcacgagcttataagctatttttcaaaagttatttcaagtagcgtttgagcttatagctt 9370318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 556 - 636
Target Start/End: Original strand, 21862147 - 21862227
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatg 636  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||    
T  21862147 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatg 21862227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 556 - 654
Target Start/End: Original strand, 6430692 - 6430791
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgactttta-tcattaaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    |||||||||||||  ||||  |||||| |||| ||||||||||| |||||||| || ||||||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  6430692 tgttggtgtaagctctagagaccaatagtttacgttaaatttatcttatgtatcataacttttatttattaaataatatatgacactctttattatattt 6430791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 827 - 889
Target Start/End: Original strand, 44263388 - 44263451
Alignment:
Q  827 tatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  44263388 tatttcaggagcttataagctatttttcagaagctacttcaagtagcgtttgagcttatagctt 44263451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 832 - 889
Target Start/End: Original strand, 39677442 - 39677500
Alignment:
Q  832 cacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  39677442 cacgagcttataagctatttttcaaaagctattccaagtagtgtttgagcttatagctt 39677500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 790 - 889
Target Start/End: Original strand, 40045444 - 40045544
Alignment:
Q  790 ctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaact-atttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagc 887  Q
    ||||||| ||||  ||||||| || ||||||||||||| ||| || ||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  40045444 ctgtttggtaactgtttttcatcaagagcttatagctttttt-actagcttataagcttatttttcagacgctatttcaagtagcgtttgagcttatagc 40045542  T
Q  888 tt 889  Q
    ||    
T  40045543 tt 40045544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 816 - 876
Target Start/End: Original strand, 26293837 - 26293897
Alignment:
Q  816 agcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcgtt 876  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  26293837 agcttatagcttatttcacaaatttataagctatttttcagacactattccaagtagcgtt 26293897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 816 - 876
Target Start/End: Original strand, 26307094 - 26307154
Alignment:
Q  816 agcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcgtt 876  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  26307094 agcttatagcttatttcacaaatttataagctatttttcagacactattccaagtagcgtt 26307154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 556 - 654
Target Start/End: Original strand, 25610941 - 25611039
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    |||| ||||||||| |||  || |||| |||||| ||||  ||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||| || |||||||||||    
T  25610941 tgtttgtgtaagccctaggggcaaatagtttatgataaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactccttattatattt 25611039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 556 - 620
Target Start/End: Original strand, 12642210 - 12642274
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttat 620  Q
    |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||    
T  12642210 tgttggtgtaagccctagaagcctatagtttatgttaaacttacgttgtgtatcatgacttttat 12642274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 579 - 657
Target Start/End: Original strand, 18835124 - 18835202
Alignment:
Q  579 aataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatatttgtt 657  Q
    |||| ||||||||||| |||| |||| ||| ||||||||| | ||||||||| ||||| || | ||| |||||||||||    
T  18835124 aatagtttatgttaaacttattttatttatcatgacttttgttattaaataatatatgacaatttttgttatatttgtt 18835202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 131; Significance: 2e-67; HSPs: 90)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 712 - 889
Target Start/End: Original strand, 12774541 - 12774720
Alignment:
Q  712 agggtctgtttgggaaaccc-aaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttca 810  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| |||||||||||||    
T  12774541 agggtctgtttgggaaaccccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttca 12774640  T
Q  811 ccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12774641 ccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 12774720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 712 - 894
Target Start/End: Complemental strand, 4221644 - 4221461
Alignment:
Q  712 agggtctgtttgggaaacccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcac 811  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        | |||||||| ||||||||||||||    
T  4221644 agggtctgtttggttaactcaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaacactttttcac 4221545  T
Q  812 catgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagcttctcac 894  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4221544 catgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttctcac 4221461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 127; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 711 - 889
Target Start/End: Original strand, 5591553 - 5591732
Alignment:
Q  711 aagggtctgtttgggaaacccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttca 810  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        | |||||||| |||||||||||||    
T  5591553 aagggtctgtttgggaaaccaaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaacactttttca 5591652  T
Q  811 ccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5591653 ccatgagcttatagcttatttcacgaacttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 5591732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 712 - 889
Target Start/End: Original strand, 12713277 - 12713456
Alignment:
Q  712 agggtctgtttgggaaaccc-aaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttca 810  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| |||||||||||||    
T  12713277 agggtctgtttgggaaaccccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttca 12713376  T
Q  811 ccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagc-gttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  12713377 ccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcatttgagcttatagctt 12713456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 127; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 711 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 39744714 - 39744535
Alignment:
Q  711 aagggtctgtttgggaaacccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttca 810  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||  ||||| |||||||    
T  39744714 aagggtctgtttgggaaaccaaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgttttgtaacattttttca 39744615  T
Q  811 ccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39744614 ccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 39744535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 713 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 2236687 - 2236509
Alignment:
Q  713 gggtctgtttgggaaacccaaaaaa-gagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcac 811  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||| ||||||||||||||    
T  2236687 gggtctgtttgggaaacccaaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaactctgtttggtaacactttttcac 2236588  T
Q  812 catgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2236587 catgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 2236509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 712 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 14647528 - 14647350
Alignment:
Q  712 agggtctgtttgggaaacccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcac 811  Q
    |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| ||||||||||||||    
T  14647528 agggtctgtttggttaacctaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcac 14647429  T
Q  812 catgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14647428 catgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 14647350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 711 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 30412785 - 30412605
Alignment:
Q  711 aagggtctgtttgggaaacccaaaaaaga-gcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttc 809  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| ||||||||||||    
T  30412785 aagggtctgtttgggaaacccaaaaaaaaagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttc 30412686  T
Q  810 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30412685 accatgagtttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 30412605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 708 - 889
Target Start/End: Original strand, 36685777 - 36685960
Alignment:
Q  708 attaagggtctgtttgggaaaccc-aaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacacttt 806  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||        |||||||||| |||||||||    
T  36685777 attaagggtctgtttggttaaccccaaaaaagagcttttagcttttaacttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacacttt 36685876  T
Q  807 ttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36685877 ttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 36685960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 713 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 13228643 - 13228466
Alignment:
Q  713 gggtctgtttgggaaac-ccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcac 811  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| ||||||||||| ||    
T  13228643 gggtctgtttgggaaactccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttga-caaaaaagctctgtttggtaacacttttttac 13228545  T
Q  812 catgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13228544 catgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 13228466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 713 - 889
Target Start/End: Original strand, 32382815 - 32382993
Alignment:
Q  713 gggtctgtttgggaaaccc-aaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcac 811  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       | |||||||| ||||||||||||||    
T  32382815 gggtctgtttggttaaccccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgataaaaaaagttctgtttggtaacactttttcac 32382914  T
Q  812 catgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32382915 catgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 32382993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 712 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 1711375 - 1711196
Alignment:
Q  712 agggtctgtttgggaaacccaaaaaa-gagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttca 810  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| |||||||||||||    
T  1711375 agggtctgtttgggaaacccaaaaaaagagcttttagcttatagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttca 1711276  T
Q  811 ccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1711275 ccatgagcttataacttatttcacaagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 1711196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 708 - 889
Target Start/End: Original strand, 35639902 - 35640084
Alignment:
Q  708 attaagggtctgtttgggaaacccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttt 807  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||       |||||||||||||| ||||||    
T  35639902 attaagggtcagtttgggaaaccaaaaaaagagcttttagtttttaacttataatttataagctcgtttgataaaaaaagctctgtttgataatactttt 35640001  T
Q  808 tcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35640002 tcaccatgagtttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 35640084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 711 - 889
Target Start/End: Original strand, 24793936 - 24794116
Alignment:
Q  711 aagggtctgtttgggaaacccaaaaaag-agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttc 809  Q
    |||| |||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| ||||||||||||    
T  24793936 aaggctctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttc 24794035  T
Q  810 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24794036 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 24794116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 712 - 892
Target Start/End: Original strand, 2671379 - 2671561
Alignment:
Q  712 agggtctgtttgggaaacccaaaaaagag-cttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttca 810  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| |||||||||||||    
T  2671379 agggtctgtttgggaaactaaaaaaaaaaacttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttca 2671478  T
Q  811 ccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagcttctc 892  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2671479 ccatgagcttatagcttatttcacaagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttctc 2671561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 732 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 8024135 - 8023977
Alignment:
Q  732 aaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttattt 831  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||        |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8024135 aaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagttcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttattt 8024036  T
Q  832 cacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8024035 cacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 8023977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 732 - 889
Target Start/End: Original strand, 30299684 - 30299842
Alignment:
Q  732 aaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttattt 831  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30299684 aaaaaagagtttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttattt 30299783  T
Q  832 cacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30299784 cacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 30299842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 709 - 889
Target Start/End: Original strand, 39275386 - 39275567
Alignment:
Q  709 ttaagggtctgtttgggaaacccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacacttttt 808  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||        | |||||||| |||||||||||    
T  39275386 ttaagggtctgtttgggaaactaaaaaaatagcttttagcttttaacttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaacacttttt 39275485  T
Q  809 caccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39275486 taccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctattttttagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 39275567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 732 - 894
Target Start/End: Complemental strand, 9587338 - 9587174
Alignment:
Q  732 aaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnn-gctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatt 830  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||         | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9587338 aaaaaagagcttttagcttatagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaagttctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatt 9587239  T
Q  831 tcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagcttctcac 894  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9587238 tcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttctcac 9587174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 712 - 889
Target Start/End: Original strand, 1174749 - 1174928
Alignment:
Q  712 agggtctgtttgggaaacccaaaaaa-gagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttca 810  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |        | |||||||| ||||||||||| |    
T  1174749 agggtctgtttggtaaacccaaaaaaagagcttttagctcttagcttatagcttataagctcgtttcacaaaaaaagttctgtttggtaacactttttga 1174848  T
Q  811 ccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1174849 ccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 1174928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 708 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 30774368 - 30774185
Alignment:
Q  708 attaagggtctgtttgggaaacccaaaaaa-gagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacacttt 806  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |        |||||||||| |||||||||    
T  30774368 attaagggtctctttggtaaacccaaaaaaagagcttttagctcttagcttatagcttataagctcgtttcacaaaaaaagctctgtttggtaacacttt 30774269  T
Q  807 ttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30774268 ttgaccataagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 30774185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 713 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 19956477 - 19956301
Alignment:
Q  713 gggtctgtttgggaaacccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcacc 812  Q
    |||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        |||||||||| |||||||||||||||    
T  19956477 gggtctctttggttaacctaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttaacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcacc 19956378  T
Q  813 atgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19956377 atgagcttatagcttatttcacgagcttataagcta-ttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 19956301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 729 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 32381828 - 32381667
Alignment:
Q  729 cccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagctta 828  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||         || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32381828 cccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagcttgtttgacaaaaaaaactatgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagctta 32381729  T
Q  829 tttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32381728 tttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 32381667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 713 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 31169158 - 31168980
Alignment:
Q  713 gggtctgtttgggaaacccaaaaaa-gagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcac 811  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  31169158 gggtctgtttgggaaactaaaaaaaagagtttttagcttttagtttatagtttataagttcgtttgacaaaaaaaactctgtttgataacactttttcac 31169059  T
Q  812 catgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31169058 catgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 31168980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 714 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 35236838 - 35236660
Alignment:
Q  714 ggtctgtttgggaaacccaaaaaa-gagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnn-gctctgtttgataacactttttcac 811  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||        |||||||||| ||||||||||| ||    
T  35236838 ggtctgtttggtaaaccaaaaaaaagagcttttagctcttagcttatagcttataagctcgtttcataaaaaaaagctctgtttggtaacactttttgac 35236739  T
Q  812 catgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35236738 catgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 35236660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 710 - 889
Target Start/End: Original strand, 10697232 - 10697413
Alignment:
Q  710 taagggtctgtttgggaaacccaaaaaa-gagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacacttttt 808  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |        |||||||||| |||||||||||    
T  10697232 taagggtttgtttggtaaacccaaaaaaagagcttttagctcttagcttatagcttataagctcatttcacaaaaaaagctctgtttggtaacacttttt 10697331  T
Q  809 caccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  10697332 gaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagtgtttgagcttatagctt 10697413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 710 - 889
Target Start/End: Original strand, 19525712 - 19525893
Alignment:
Q  710 taagggtctgtttgggaaaccc-aaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacacttttt 808  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||        |||||||||| |||||| ||||    
T  19525712 taagggtctgtttggttaaccctaaaaaagagcttttagcttttaccttatagtttataaactcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacacctttt 19525811  T
Q  809 caccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  19525812 caccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagcagcgtttgagcttatagctt 19525893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 711 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 6604083 - 6603903
Alignment:
Q  711 aagggtctgtttgggaaaccc-aaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttc 809  Q
    |||||||| | |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||        |||||||||| ||||| ||||||    
T  6604083 aagggtctatgtgggaaaccccaaaaaagagtttttagcttttagcttatagcttataagttcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacattttttc 6603984  T
Q  810 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  6603983 accgtgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctatttcaagtagcgtttgagcttatagctt 6603903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 708 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 5998063 - 5997887
Alignment:
Q  708 attaagggtctgtttgggaaacccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttt 807  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||      | |||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| ||||||||||    
T  5998063 attatgggtctgtttgggaaaccccaaaaa------tgagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttt 5997970  T
Q  808 tcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5997969 tcaccgtgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 5997887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 712 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 12363784 - 12363605
Alignment:
Q  712 agggtctgtttgggaaacccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnn-gctctgtttgataacactttttca 810  Q
    |||||||||||||  || ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||         | |||||||| |||||||||||||    
T  12363784 agggtctgtttggttaatccagaaaagagcttttaacttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaagttctgtttggtaacactttttca 12363685  T
Q  811 ccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12363684 ccatgagcttataacttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 12363605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 728 - 893
Target Start/End: Complemental strand, 6893533 - 6893368
Alignment:
Q  728 acccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagctt 827  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||        |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6893533 acccaaaaaagagctgttagctcttagcttatagtttataagctcgtttga-caaaaaagctctgtttggtaacacttttttaccatgagcttatagctt 6893435  T
Q  828 atttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagcttctca 893  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6893434 atttcacgagcttataaactagttttcagaagttattccaagtagcgtttgagcttatagcttctca 6893368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 746 - 894
Target Start/End: Complemental strand, 39246973 - 39246825
Alignment:
Q  746 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaa 845  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  39246973 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttt-caccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 39246875  T
Q  846 ctatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagcttctcac 894  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39246874 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttctcac 39246825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 710 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 9160859 - 9160685
Alignment:
Q  710 taagggtctgtttgggaaacccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttc 809  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||     |||||||||||| || |||||||||||||||||        |||||||||| ||||||||||||    
T  9160859 taagggtctgtttaggaaacccaaaaaa-ag-----agcttttagcttttaacttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttc 9160766  T
Q  810 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9160765 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 9160685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 712 - 894
Target Start/End: Complemental strand, 29392280 - 29392095
Alignment:
Q  712 agggtctgtttgggaaacccaaaaaa---gagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacacttttt 808  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        |||||||||| |||||||||||    
T  29392280 agggtctgtttgggaaaacaaaaaaaaaagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttga-caaaaaagctctgtttggtaacacttttt 29392182  T
Q  809 caccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagcttctcac 894  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  29392181 taccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctattttttaaaagctattccaaatagcgtttgagcttatagcttctcac 29392095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 713 - 894
Target Start/End: Complemental strand, 13157057 - 13156874
Alignment:
Q  713 gggtctgtttgggaaaccc-aaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcac 811  Q
    |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||        |||||||||| ||||||||||||||    
T  13157057 gggtctgtttgaaaaaccccaaaaaagagcttttagcttttaccttatagcttataagtttgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcac 13156958  T
Q  812 catgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagc-gttgagcttatagcttctcac 894  Q
    ||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  13156957 cattaacttatagcttatttcacgagtttataagctatttttcagaagctattccaagtagcttttgagcttatagcttctcac 13156874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 98; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 713 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 3037596 - 3037418
Alignment:
Q  713 gggtctgtttgggaaacccaaaaaa-gagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcac 811  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||       | | |||||| ||||||||||| ||    
T  3037596 gggtctgtttgggaaactaaaaaaaagagcttttagcttttaacttatagcttataagcttgtttgataaaaaaaggtatgtttggtaacacttttttac 3037497  T
Q  812 catgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3037496 catgagtttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcaaaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 3037418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 98; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 713 - 889
Target Start/End: Original strand, 15443422 - 15443600
Alignment:
Q  713 gggtctgtttgggaaacccaaaaaa-gagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcac 811  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||        | | || ||| ||||||||||||||    
T  15443422 gggtctgtctgggaaacccaaaaaaagagtttttaacttttagtttatagcttataagttcgtttgacaagtttagttttggttggtaacactttttcac 15443521  T
Q  812 catgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  15443522 catgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaaatagcgtttgagcttatagctt 15443600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 712 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 35235892 - 35235720
Alignment:
Q  712 agggtctgtttgggaaa-cccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttca 810  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||         ||||||||| |||||||||||||    
T  35235892 agggtctgtttggaaaatcccaaaaaagagcttttagcttttagcttata-------agctcgtttgacaaaaaaaactctgtttggtaacactttttca 35235800  T
Q  811 ccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35235799 ccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 35235720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 746 - 889
Target Start/End: Original strand, 27130333 - 27130477
Alignment:
Q  746 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaa 845  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||         ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27130333 agcttttagcttatagcttataagctcttttgacaaaaaaaactctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 27130432  T
Q  846 ctatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27130433 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 27130477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 732 - 889
Target Start/End: Original strand, 3670264 - 3670422
Alignment:
Q  732 aaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttattt 831  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |         ||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  3670264 aaaaaagagcttttagctcttagcttatagcttatgagctcgtttcacaaaaaaaactctgtttggtaacactttttgaccatgcgcttatagcttattt 3670363  T
Q  832 cacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3670364 cacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 3670422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 93; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 753 - 889
Target Start/End: Original strand, 15530442 - 15530579
Alignment:
Q  753 agcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 852  Q
    ||||||||||||||||||||||||||         || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15530442 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaactatgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 15530541  T
Q  853 tcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15530542 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 15530579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 732 - 894
Target Start/End: Original strand, 3669527 - 3669690
Alignment:
Q  732 aaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttattt 831  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||       |||||||||| ||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||    
T  3669527 aaaaaagagcttttagctcttagcttatagtttataagttcgtttgataaaaaaagctctgtttggtaacacttttttaccataaacttgtagcttattt 3669626  T
Q  832 cacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagcttctcac 894  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3669627 catgagcttataagctatttttcagaagctattcaaagtagcgtttgagcttatagcttctcac 3669690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 732 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 11664042 - 11663884
Alignment:
Q  732 aaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttattt 831  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |        |||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  11664042 aaaaaagagcttttagctcttagcttatagcttataagctcgtttcacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttgaccataagtttatagcttattt 11663943  T
Q  832 cacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  11663942 cacgagcttataagttatttttcagaagctattctaagtagcgtttgagcttatagctt 11663884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 744 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 26699245 - 26699099
Alignment:
Q  744 ttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttata 843  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||        |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26699245 ttagcttatagcttataggttataagctcgtttgacaaataaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcatgagcttata 26699146  T
Q  844 aactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26699145 agctatttttcagaggctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 26699099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 744 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 26968978 - 26968832
Alignment:
Q  744 ttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttata 843  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||        |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26968978 ttagcttatagcttataggttataagctcgtttgacaaataaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcatgagcttata 26968879  T
Q  844 aactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26968878 agctatttttcagaggctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 26968832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 753 - 889
Target Start/End: Original strand, 43402451 - 43402588
Alignment:
Q  753 agcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 852  Q
    ||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43402451 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 43402550  T
Q  853 tcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  43402551 tcaaaagctatttcaagtagcgtttgagcttatagctt 43402588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 744 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 5382082 - 5381937
Alignment:
Q  744 ttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttata 843  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  5382082 ttagcttatagcttatagcttataagctcgtttga-caaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccacgagcttataacttatttcatgagcttata 5381984  T
Q  844 aactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5381983 agctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 5381937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 753 - 889
Target Start/End: Original strand, 648538 - 648675
Alignment:
Q  753 agcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 852  Q
    |||||||||||||||||||||| |||        |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  648538 agcttatagcttataagctcgtctgacaaaaaaagctctgtttggtaatgctttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 648637  T
Q  853 tcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  648638 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 648675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 746 - 889
Target Start/End: Original strand, 19347705 - 19347850
Alignment:
Q  746 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnn-gctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataa 844  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||        |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19347705 agcttatagcttttagcttataagctcgtttgataaaaaaaagctctgtttggtaatacttttttaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataa 19347804  T
Q  845 actatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19347805 gctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 19347850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 788 - 889
Target Start/End: Original strand, 2178802 - 2178904
Alignment:
Q  788 ctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatag 886  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2178802 ctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagtttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatag 2178901  T
Q  887 ctt 889  Q
    |||    
T  2178902 ctt 2178904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 753 - 889
Target Start/End: Original strand, 5521305 - 5521442
Alignment:
Q  753 agcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 852  Q
    ||||||||||||||||||||||||||          |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5521305 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaattctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 5521404  T
Q  853 tcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  5521405 tcagaagctattctaagtagcgtttgagtttatagctt 5521442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 762 - 889
Target Start/End: Original strand, 7651656 - 7651784
Alignment:
Q  762 cttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagct 861  Q
    ||||||||||||||||||        ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7651656 cttataagctcgtttgataaaaaaaactctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataatctatttttcagaagct 7651755  T
Q  862 attccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||| ||||||| | |||||||||||||||    
T  7651756 atttcaagtagtgtttgagcttatagctt 7651784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 744 - 886
Target Start/End: Complemental strand, 11063047 - 11062903
Alignment:
Q  744 ttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnn-gctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttat 842  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||          |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  11063047 ttagcttatagcttatagcttataagctcgtttggcaaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttataacttatttcatgagcttat 11062948  T
Q  843 aaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatag 886  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11062947 aagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatag 11062903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 787 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 22977301 - 22977198
Alignment:
Q  787 gctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttata 885  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22977301 gctctgtttggtaacaccttttcaccatgagcttatagcttatttcatgagcttataaactatttttcataagctattccaagtagcgtttgagcttata 22977202  T
Q  886 gctt 889  Q
    ||||    
T  22977201 gctt 22977198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 788 - 885
Target Start/End: Original strand, 4379300 - 4379398
Alignment:
Q  788 ctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttata 885  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  4379300 ctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctatttcaagtagcgtttgagcttata 4379398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 753 - 885
Target Start/End: Complemental strand, 36028121 - 36027988
Alignment:
Q  753 agcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 852  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||         ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  36028121 agcttatagcttataagcttgtttgacaaaaaaaactctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttattttacgagcttataagctatttt 36028022  T
Q  853 tcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttata 885  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  36028021 tcagaagctatttcaagtagcgtttgagcttata 36027988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 746 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 11100899 - 11100755
Alignment:
Q  746 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaa 845  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||        |||||||||| ||||   |||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  11100899 agcttatagcttatagcttataagctcgtctgacaaaaaaagctctgtttggtaacgtctttttacaacgagcttatagcttatttcacgagcttataag 11100800  T
Q  846 ctatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11100799 ctatttttcagacgctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 11100755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 558 - 713
Target Start/End: Complemental strand, 20100793 - 20100644
Alignment:
Q  558 ttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatatttgtt 657  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| ||||||| | | ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  20100793 ttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtcagacttatgttatgtatcatgacttttattattcaataa--tatgacattctttattatatttgtt 20100696  T
Q  658 tgttgtaagattaataaagtccctagaattgatacttcatgtaatggaacattaag 713  Q
        |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||| ||||||    
T  20100695 ----gtaagattaataaagtccatagaatagatagttcatataatggaatattaag 20100644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 559 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 31652338 - 31652211
Alignment:
Q  559 tggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatatttgttt 658  Q
    |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||| | | ||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    |    
T  31652338 tggtgtaagccttaaaggccaata-tttatgttaaacttacgctttgtatcatgacttttattattaaataaaataaagcattctttattatatt----t 31652244  T
Q  659 gttgtaagattaataaagtccctagaattgata 691  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31652243 gttgtaagattaataaagtccctagaatagata 31652211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 791 - 885
Target Start/End: Complemental strand, 9627246 - 9627151
Alignment:
Q  791 tgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttata 885  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  9627246 tgtttgataacacttttttacaatgagcttatagcttatttcagaagcttataagctatttttcagaagctacttcaagtagcgtttgagcttata 9627151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 555 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 24933862 - 24933763
Alignment:
Q  555 atgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  24933862 atgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaatctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 24933763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 556 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 26130249 - 26130101
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatatttg 655  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||  |  |     
T  26130249 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgataaacttatgttatgtaacatgacttttattattaaataatatatgacactctttatttaa--ta 26130152  T
Q  656 tttgttgtaagattaataaagtccctagaattgatacttcatgtaatggaa 706  Q
     ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  26130151 cttgttgtaatattaataaagtctctagaatagatagttcgtgtaatggaa 26130101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 556 - 654
Target Start/End: Original strand, 31646 - 31744
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  31646 tgttggtgtaagccttagaggccaatagtttatgttaaacctattttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 31744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 746 - 889
Target Start/End: Original strand, 16474771 - 16474915
Alignment:
Q  746 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaa 845  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||| |||   | | | |||| |||||||||| |||||||||||| ||||||     
T  16474771 agcttatagcttatagcttataaactcgtttgacaaaaatagctctgtttggtaatggtctcttaccacgagcttatagtttatttcacgagattataag 16474870  T
Q  846 ctatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16474871 ctattttttagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 16474915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 712 - 823
Target Start/End: Complemental strand, 25872380 - 25872268
Alignment:
Q  712 agggtctgtttgggaa-acccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttca 810  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||        |||||||||| |||||||||||||    
T  25872380 agggtctgtttggtaacacccaaaaaagagcttttagctcgtagcttatagcttataagctcatttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttca 25872281  T
Q  811 ccatgagcttata 823  Q
    |||||| ||||||    
T  25872280 ccatgaacttata 25872268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 556 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 12790218 - 12790120
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    |||||||||||||| || | ||||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  12790218 tgttggtgtaagccctaaaggccaatagtttatgttaaatctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 12790120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 710 - 872
Target Start/End: Original strand, 23920421 - 23920583
Alignment:
Q  710 taagggtctgtttgggaa-acccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacacttttt 808  Q
    ||||||||||||||| || ||| |||||| |||||  ||||| ||||  |||||||||||| |||| |||        |||||||||| ||||  | |||    
T  23920421 taagggtctgtttggtaacacctaaaaaaaagctta-agcttatagcggatagcttataagttcgtatgacaaaaatagctctgtttggtaactatcttt 23920519  T
Q  809 caccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtag 872  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  23920520 caccaggagcttatagtttatttcacgagcttataagctatttttcagacgctattccaagtag 23920583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 556 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 25805940 - 25805842
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  25805940 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 25805842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 556 - 654
Target Start/End: Original strand, 31096563 - 31096661
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  31096563 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacttatcttatgtatcatgactcttattattgaataatatatggcactctttattatattt 31096661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 787 - 894
Target Start/End: Original strand, 13936233 - 13936341
Alignment:
Q  787 gctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagc-gttgagcttata 885  Q
    |||||||||| ||||  ||||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||    
T  13936233 gctctgtttggtaacggttttttacaacgagcttatagcttatttcatgagcttataagctatttttcagacgctatttcaagtagcatttgagcttata 13936332  T
Q  886 gcttctcac 894  Q
    |||| ||||    
T  13936333 gcttatcac 13936341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 788 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 6280550 - 6280448
Alignment:
Q  788 ctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagc-gttgagcttatag 886  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||  || |||||||||    
T  6280550 ctctgtttgatgacgctttttcatcatgagcttatagtttatttcacgggtttataaactatttttcataagttatttcaagtagcatttaagcttatag 6280451  T
Q  887 ctt 889  Q
    |||    
T  6280450 ctt 6280448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 556 - 654
Target Start/End: Original strand, 22940997 - 22941095
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  22940997 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatgacactctttattatattt 22941095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 753 - 885
Target Start/End: Original strand, 2497570 - 2497703
Alignment:
Q  753 agcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 852  Q
    |||||||||||||||||||||| | |        ||||| |||| |||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||    
T  2497570 agcttatagcttataagctcgtctaacaaaaaatgctctatttggtaatgctttttcaccatgagattataacttatttcacgagcttataagttatttt 2497669  T
Q  853 tcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttata 885  Q
    ||| ||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  2497670 tcaaaagctattctaaatagcgtttgagcttata 2497703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 559 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 9812287 - 9812192
Alignment:
Q  559 tggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||| |||||| ||| ||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  9812287 tggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaataatatatgacactctttattatattt 9812192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 559 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 12704428 - 12704333
Alignment:
Q  559 tggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||| |||||| ||| ||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  12704428 tggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaataatatatgacactctttattatattt 12704333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 559 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 12765544 - 12765449
Alignment:
Q  559 tggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||| |||||| ||| ||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  12765544 tggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaataatatatgacactctttattatattt 12765449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 556 - 654
Target Start/End: Original strand, 20940774 - 20940872
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    |||| ||||||||| || | ||||||| |||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  20940774 tgtttgtgtaagccctaaaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 20940872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 556 - 654
Target Start/End: Original strand, 23545669 - 23545767
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||| ||| | ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  23545669 tgttggtgtgagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgattaatatatggcactctttattatattt 23545767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 555 - 713
Target Start/End: Original strand, 39535210 - 39535365
Alignment:
Q  555 atgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatc-attaaataaaatatggcattctttattatatt 653  Q
    ||||||||||| ||| |||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |  ||||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  39535210 atgttggtgtatgccctagaggtcaatagtttatgttaaatttacgttatgtatcatgaattttttttattaaataatatatgacactctttattatatt 39535309  T
Q  654 tgtttgttgtaagattaataaagtccctagaattgatacttcatgtaatggaacattaag 713  Q
    ||||     |||  |||||||||||||| |||| |||| ||||| |||||| | ||||||    
T  39535310 tgtta----taatgttaataaagtccctggaatagatagttcatataatggtatattaag 39535365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 556 - 653
Target Start/End: Complemental strand, 7865987 - 7865890
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatatt 653  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||| |||||| ||| ||||| ||||| || |||||||||||||    
T  7865987 tgttggtttaagccctagaggccaatagtttatgttaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaataatatatgacactctttattatatt 7865890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 583 - 703
Target Start/End: Original strand, 5097426 - 5097542
Alignment:
Q  583 atttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatatttgtttgttgtaagattaataaagtcccta 682  Q
    |||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||||||||    ||| | ||||  ||||||||||||||     
T  5097426 atttatgttaaacttatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcaatttttattata----tttatagtaatgttaataaagtccctg 5097521  T
Q  683 gaattgatacttcatgtaatg 703  Q
    |||| |||| |||||||||||    
T  5097522 gaatagatagttcatgtaatg 5097542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 832 - 889
Target Start/End: Original strand, 6349426 - 6349484
Alignment:
Q  832 cacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  6349426 cacgagcttataaactatttttcagacgctattctaagtagcgtttgagcttatagctt 6349484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 804 - 876
Target Start/End: Original strand, 13921783 - 13921855
Alignment:
Q  804 tttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcgtt 876  Q
    ||||| |||| || |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  13921783 ttttttaccacgaacttataacttatttcacgagcttaaaagctatttttcagacgctatttcaagtagcgtt 13921855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 555 - 702
Target Start/End: Original strand, 26244849 - 26244992
Alignment:
Q  555 atgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    ||||||||||||||  | || ||||||| ||||||||||| |||| |||| ||| ||||||||||| ||| ||||| |||||  | ||||| |||||       
T  26244849 atgttggtgtaagctctggaggccaatagtttatgttaaacttatcttatatatcatgacttttattattgaataatatatgatactcttttttata--- 26244945  T
Q  655 gtttgttgtaagattaataaagtccctagaattgatacttcatgtaat 702  Q
     ||| | ||||  |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  26244946 -tttatagtaatgttaataaagtccctcgaatagatagttcatgtaat 26244992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 847 - 894
Target Start/End: Complemental strand, 25872264 - 25872216
Alignment:
Q  847 tatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagcttctcac 894  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  25872264 tatttttcagaagctattccaagtagagtttgagcttatagcttctcac 25872216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 804 - 876
Target Start/End: Original strand, 31407980 - 31408052
Alignment:
Q  804 tttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcgtt 876  Q
    ||||||| || ||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  31407980 tttttcagcacgagttaataacttatttcacgagcttataagctatttgtcagacgctattccaattagcgtt 31408052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 832 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 4657652 - 4657594
Alignment:
Q  832 cacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||    
T  4657652 cacgagcttataagctatttttcagaaactatttcaagtagagtttgagcttatagctt 4657594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 804 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 42323686 - 42323600
Alignment:
Q  804 tttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||| |||||| | |||||| | ||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||    
T  42323686 ttttgcaccataaccttataacatattttacgagtttataagctatttttcagacgctattctaagtagtgtttgagcttatagctt 42323600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 818 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 27005919 - 27005847
Alignment:
Q  818 cttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  |||||| || | |||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  27005919 cttatagcttatttcaagagcttataacttattttccaaacgctatttcaagtaacgtttgagcttatagctt 27005847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 815 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 32321730 - 32321655
Alignment:
Q  815 gagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||  ||||| ||| || || |||||||||||||||    
T  32321730 gagcttatagcttatttcacgaacttacaacttatttttcagactctatttcaaataacgtttgagcttatagctt 32321655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 131; Significance: 2e-67; HSPs: 131)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 708 - 889
Target Start/End: Original strand, 28307213 - 28307396
Alignment:
Q  708 attaagggtctgtttgggaaacccaaaaaa-gagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacacttt 806  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||| |||||||||||||||    
T  28307213 attatgggtctgtttgggaaacccaaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctcggtttgataacacttt 28307312  T
Q  807 ttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28307313 ttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 28307396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 712 - 889
Target Start/End: Original strand, 18582807 - 18582985
Alignment:
Q  712 agggtctgtttgggaaacccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcac 811  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| ||||||||||||||    
T  18582807 agggtctgtttgggaaaccaaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcac 18582906  T
Q  812 catgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18582907 catgagcttataacttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 18582985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 706 - 894
Target Start/End: Complemental strand, 37115470 - 37115281
Alignment:
Q  706 acattaagggtctgtttgggaaacccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactt 805  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||        | |||||||| ||||||||    
T  37115470 acatttagggtctgtttgggaaaccaaaaaaagagtttttagcttttagcttatagcatataagctcgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaacactt 37115371  T
Q  806 tttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagcttctcac 894  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37115370 tttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttctcac 37115281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 713 - 889
Target Start/End: Original strand, 56372399 - 56372576
Alignment:
Q  713 gggtctgtttgggaaacccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcacc 812  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| |||||||||||||||    
T  56372399 gggtctgtttgggaaaccaaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcacc 56372498  T
Q  813 atgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  56372499 atgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagcagcgtttgagcttatagctt 56372576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 707 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 8830002 - 8829818
Alignment:
Q  707 cattaagggtctgtttgggaaaccc-aaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactt 805  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| ||||||||    
T  8830002 catttagggtctgtttgggaaaccccaaaaaagagcttttagtttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactt 8829903  T
Q  806 tttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8829902 tttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 8829818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 708 - 889
Target Start/End: Original strand, 7706330 - 7706513
Alignment:
Q  708 attaagggtctgtttgggaaacccaa-aaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacacttt 806  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| |||||||||    
T  7706330 attaagggtctgtttgggaaaaccaagaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacacttt 7706429  T
Q  807 ttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7706430 ttcaccatgagtttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 7706513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 127; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 712 - 889
Target Start/End: Original strand, 42116858 - 42117037
Alignment:
Q  712 agggtctgtttgggaaacc-caaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttca 810  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| |||||||||||||    
T  42116858 agggtctgtttgggaaacctcaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttca 42116957  T
Q  811 ccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  42116958 ccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctatttcaagtagcgtttgagcttatagctt 42117037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 713 - 894
Target Start/End: Complemental strand, 55496061 - 55495878
Alignment:
Q  713 gggtctgtttgggaaacccaaaaaa-gagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcac 811  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| ||||||||||||||    
T  55496061 gggtctgtttgggaaactaaaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcac 55495962  T
Q  812 catgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagcttctcac 894  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  55495961 catgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttctcac 55495878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 708 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 19514067 - 19513885
Alignment:
Q  708 attaagggtctgtttgggaaacccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttt 807  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||        |||||||||| ||||||||||    
T  19514067 attatgggtctgtttgggaaaccaaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagttcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttt 19513968  T
Q  808 tcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  19513967 tcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgttttagcttatagctt 19513885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 713 - 889
Target Start/End: Original strand, 53407153 - 53407330
Alignment:
Q  713 gggtctgtttgggaaacccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcacc 812  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| |||||||||||||||    
T  53407153 gggtctgtttggttaaccccaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcacc 53407252  T
Q  813 atgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  53407253 atgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 53407330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 706 - 889
Target Start/End: Original strand, 8941861 - 8942045
Alignment:
Q  706 acattaagggtctgtttgggaaacccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactt 805  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||        |||||||||| ||||||||    
T  8941861 acattacgggtctgtttgggaaaccaaaaaaagagcttttaacttttaacttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactt 8941960  T
Q  806 tttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8941961 tttcaccatgagcttatagcttattttacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 8942045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 713 - 894
Target Start/End: Complemental strand, 35777567 - 35777384
Alignment:
Q  713 gggtctgtttgggaaaccc-aaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcac 811  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| ||||||||||||||    
T  35777567 gggtctgtttggttaaccccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcac 35777468  T
Q  812 catgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagcttctcac 894  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  35777467 catgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttataccttctcac 35777384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 714 - 889
Target Start/End: Original strand, 46895246 - 46895424
Alignment:
Q  714 ggtctgtttgggaaacccaaaaaa--gagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcac 811  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| ||| ||||||||||    
T  46895246 ggtctgtttgggaaacccaaaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaatactttttcac 46895345  T
Q  812 catgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  46895346 catgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 46895424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 710 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 12234151 - 12233970
Alignment:
Q  710 taagggtctgtttgggaaaccc-aaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacacttttt 808  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||        |||||||||| |||||||||||    
T  12234151 taagggtctgtttggttaaccccaaaaaagagcttttagcttttaacttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacacttttt 12234052  T
Q  809 caccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12234051 caccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 12233970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 711 - 894
Target Start/End: Complemental strand, 47417658 - 47417473
Alignment:
Q  711 aagggtctgtttgggaaaccc-aaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttc 809  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| ||||||||||||    
T  47417658 aagggtctgtttgggaaaccccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttc 47417559  T
Q  810 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagcttctcac 894  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||    
T  47417558 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatctttcataagctattccaagcagcgtttgagcttataacttctcac 47417473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 710 - 894
Target Start/End: Complemental strand, 43225861 - 43225675
Alignment:
Q  710 taagggtctgtttgggaaacccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnn-gctctgtttgataacacttttt 808  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||         |||||||||| |||||||||||    
T  43225861 taagggtctgtttgggaaaccaaaaaaagagcttttagtttttagcttatagcttataagtttgtttgacaaaaaaaagctctgtttggtaacacttttt 43225762  T
Q  809 caccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagcttctcac 894  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  43225761 caccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaaatagcgtttgagcttatagcttctcac 43225675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 710 - 893
Target Start/End: Original strand, 55828964 - 55829149
Alignment:
Q  710 taagggtctgtttgggaaacccaaaaaa-gagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacacttttt 808  Q
    |||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |        |||||||||| |||||||||||    
T  55828964 taagggtctgttcggtaaacccaaaaaaagagcttttagctcttagcttatagcttataagctcgtttcacaaaaaaagctctgtttggtaacacttttt 55829063  T
Q  809 caccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagcttctca 893  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  55829064 gaccatgagcttataacttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttctca 55829149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 115; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 704 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 4392915 - 4392729
Alignment:
Q  704 gaacattaagggtctgtttgggaaacc-caaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataaca 802  Q
    |||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||| |||||    
T  4392915 gaactttaagggtctgtttggttaacctcaaaaaagagcttttagtttttagcttatagcttataagctcgtttgataaaaaaagctctgtttggtaaca 4392816  T
Q  803 ctttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4392815 ctttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagcta-ttttcataagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 4392729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 115; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 712 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 4517373 - 4517194
Alignment:
Q  712 agggtctgtttgggaaa-cccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttca 810  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||        |||||||||| |||||| ||||||    
T  4517373 agggtctgtttggttaatcccaaaaaagagcttttagcttttaacttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacaccttttca 4517274  T
Q  811 ccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4517273 ccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 4517194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 713 - 889
Target Start/End: Original strand, 11600646 - 11600824
Alignment:
Q  713 gggtctgtttgggaaaccc-aaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcac 811  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||| |||||| ||||||||||||||    
T  11600646 gggtctgtttggttaaccccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctatgtttggtaacactttttcac 11600745  T
Q  812 catgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11600746 catgagcttatagcttatttcacaagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 11600824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 706 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 9043798 - 9043613
Alignment:
Q  706 acattaagggtctgtttgggaaacccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactt 805  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        | | |||||| ||||||||    
T  9043798 acattatgggtctgtttgggaaactcaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagttatgtttggtaacactt 9043699  T
Q  806 tttc-accatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  9043698 tttccaccatgagcttataacttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaaatagcgtttgagcttatagctt 9043613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 710 - 889
Target Start/End: Original strand, 55764520 - 55764700
Alignment:
Q  710 taagggtctgtttgggaaacccaaaaaa-gagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacacttttt 808  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |        |||||||||| |||||||||||    
T  55764520 taagggtctgtttggtaaacccaaaaaaagagcttttagctcttagcttatagcttataagctcgtttca-aaaaaaagctctgtttggtaacacttttt 55764618  T
Q  809 caccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  55764619 gaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 55764700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 716 - 889
Target Start/End: Original strand, 45906105 - 45906280
Alignment:
Q  716 tctgtttgggaaacccaaaaaag-agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccat 814  Q
    |||||||||  ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| |||||||||||||||||    
T  45906105 tctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttaccttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccat 45906204  T
Q  815 gagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45906205 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 45906280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 709 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 22038542 - 22038360
Alignment:
Q  709 ttaagggtctgtttgggaaacccaa-aaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttt 807  Q
    ||||||||||||||||  ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| ||||||||||    
T  22038542 ttaagggtctgtttggttaaccccataaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttt 22038443  T
Q  808 tcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  22038442 tcaccatgagcttatagcttatttctcgagcttataggctatttttcagaagctattccaagtaacgtttgagcttatagctt 22038360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 712 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 39087739 - 39087561
Alignment:
Q  712 agggtctgtttgggaaacccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcac 811  Q
    ||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| ||||||||||||||    
T  39087739 agggtttgtttggttaacctaaaaaagagcttttagcttctagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcac 39087640  T
Q  812 catgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39087639 catgagcttatagcttatttcacgagtttataagctatttttcagaagttattccaagtagcgtttgagcttatagctt 39087561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 732 - 889
Target Start/End: Original strand, 22892511 - 22892669
Alignment:
Q  732 aaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttattt 831  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |        |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22892511 aaaaaagagcttttagctcttagcttatagcttataagctcgtttcacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttgaccatgagcttatagcttattt 22892610  T
Q  832 cacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22892611 cacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 22892669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 732 - 889
Target Start/End: Original strand, 22944175 - 22944333
Alignment:
Q  732 aaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttattt 831  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |        |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22944175 aaaaaagagcttttagctcttagcttatagcttataagctcgtttcacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttgaccatgagcttatagcttattt 22944274  T
Q  832 cacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22944275 cacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 22944333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 712 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 11152113 - 11151942
Alignment:
Q  712 agggtctgtttgggaaacccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcac 811  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||        |||||||||| ||||||||||||||    
T  11152113 agggtctgtttgggaaactaaaaaaagagctttta-------gcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcac 11152021  T
Q  812 catgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11152020 catgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 11151942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 739 - 889
Target Start/End: Original strand, 52669984 - 52670135
Alignment:
Q  739 agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagc 838  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||         ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52669984 agcttttagcttttagcttatagcttataagcttgtttgacaaaaaaaactctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagc 52670083  T
Q  839 ttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  52670084 ttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 52670135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 733 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 27397927 - 27397769
Alignment:
Q  733 aaaaagagctttta-gcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttattt 831  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27397927 aaaaagagcttataagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttattt 27397828  T
Q  832 cacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27397827 cacgagcttataagctatttttcataagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 27397769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 749 - 894
Target Start/End: Original strand, 31678969 - 31679115
Alignment:
Q  749 ttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaacta 848  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31678969 ttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagcta 31679068  T
Q  849 tttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagcttctcac 894  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31679069 tttttcaaaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttctcac 31679115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 711 - 889
Target Start/End: Original strand, 29413500 - 29413672
Alignment:
Q  711 aagggtctgtttgggaaacccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttca 810  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||        | |||||||| |||||||||||||    
T  29413500 aagggtctgtttgggaaatccaaaaaagagcttttagctt-------atagcttataagctcgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaacactttttca 29413592  T
Q  811 ccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29413593 ccatgaacttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 29413672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 746 - 894
Target Start/End: Original strand, 29663926 - 29664075
Alignment:
Q  746 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaa 845  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  29663926 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacaagcttataag 29664025  T
Q  846 ctatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagcttctcac 894  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  29664026 ctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttctcac 29664075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 746 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 25440631 - 25440487
Alignment:
Q  746 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaa 845  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||       | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25440631 agcttttagcttttagcttataagctcgtttgataaaaaaagttctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 25440532  T
Q  846 ctatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25440531 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 25440487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 715 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 35822478 - 35822302
Alignment:
Q  715 gtctgtttgggaaacc-caaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcacca 813  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||         ||||||||| ||||||||||||||||    
T  35822478 gtctgtttggttaacctcaaaaaagagcttttagcttttagcttataacttataagctcgtttgacaaaaaaaactctgtttggtaacactttttcacca 35822379  T
Q  814 tgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35822378 tgagcttacaacttatttcacgagattataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 35822302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 98; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 732 - 893
Target Start/End: Complemental strand, 35581106 - 35580944
Alignment:
Q  732 aaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttattt 831  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |        |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  35581106 aaaaaagagcttttaacttttagcttatagcttataagttcgtttcacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttgaccatgagcttatagtttattt 35581007  T
Q  832 cacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagcttctca 893  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35581006 cacgagcttataaactatttttcagaggctatttcaagtagcgtttgagcttatagcttctca 35580944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 710 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 51011249 - 51011068
Alignment:
Q  710 taagggtctgtttgggaaacccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnn-gctctgtttgataacacttttt 808  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||        | ||| ||||  ||||||||||    
T  51011249 taagggtctgtttggttaactcaaaaaagagcttttagcttctagcttataacttataagctcgtttgataaaaaaaagttctatttggcaacacttttt 51011150  T
Q  809 caccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  51011149 caccataagcttatagcttatttcacaagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 51011068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 728 - 876
Target Start/End: Original strand, 15635921 - 15636069
Alignment:
Q  728 acccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagctt 827  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || |||||||       ||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  15635921 acccaaaaaagagcttttacctcttagcttatagcttataaacttgtttgataaaaaaagctttgtttggtaacactttttcactatgagtttatagctt 15636020  T
Q  828 atttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcgtt 876  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15636021 atttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcgtt 15636069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 746 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 23868016 - 23867872
Alignment:
Q  746 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaa 845  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||        |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23868016 agcttttagcttatagcttataagctcttttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 23867917  T
Q  846 ctatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23867916 ctattttttagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 23867872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 713 - 889
Target Start/End: Original strand, 37970258 - 37970435
Alignment:
Q  713 gggtctgtttgggaaacccaaaaaa-gagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcac 811  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |         ||||||||| ||||||||||| ||    
T  37970258 gggtctgtttggtaaaccaaaaaaatgagcttttagctcttagcttatagcttataagttcgtttcacaaaaaaa-ctctgtttggtaacactttttgac 37970356  T
Q  812 catgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37970357 catgagcttatagcttatttcatgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 37970435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 727 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 55856690 - 55856530
Alignment:
Q  727 aacccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagct 826  Q
    |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||       |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  55856690 aacctaaaaaggagcttttaacttttagcttatagcttataagtttgtttgataaaa---gctctgtttggtaacacttttttaccatgagcttatagct 55856594  T
Q  827 tatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  55856593 tatttcacgagcttataagctattttttagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 55856530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 93; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 235 - 418
Target Start/End: Original strand, 34791684 - 34791868
Alignment:
Q  235 aagaaggtttccttcgtgaaacttcccaatgccaacatgttgtatttgcaaagcaagggaaaacttgcaattctt-atttaaaggaaaacatgggtgggt 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| |||| ||||||||||||||    
T  34791684 aagaaggtttccttcgtgaaacttctcgatgcctgcgagttgtatttgcaaagcaagggaaaacttgcaattccggatttcaagggaaacatgggtgggt 34791783  T
Q  334 caaggtatgactatccaatgaaaataaatcgtaaaatgcttgggatgtaacctctcacgacattaatcatttctgttttttaatc 418  Q
    |||||  |||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| |||||  ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  34791784 caaggattgactaaccaatgaaaataaatcgtgaaatgtttggtatgtattctctcgcgacattaagcatttctgttatttaatc 34791868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 93; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 713 - 869
Target Start/End: Original strand, 53273081 - 53273238
Alignment:
Q  713 gggtctgtttgggaaacc-caaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcac 811  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        | ||| |||| ||||||||||||||    
T  53273081 gggtctgtttggttaacctcaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagttctatttggtaacactttttcac 53273180  T
Q  812 catgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaag 869  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  53273181 catgaacttataacttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaag 53273238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 710 - 889
Target Start/End: Original strand, 3009679 - 3009852
Alignment:
Q  710 taagggtctgtttgggaaacccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttc 809  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||       ||||||||||| |||||||||        |||||||||| ||||| |||||     
T  3009679 taagggtctgtttggaaaaccaaaaaaagagcttttagctt-------atagcttataaactcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacattttttt 3009771  T
Q  810 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3009772 accttgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 3009852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 712 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 4939560 - 4939389
Alignment:
Q  712 agggtctgtttgggaaacccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcac 811  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||     |||||||||||||||| ||||||||||||||||        | |||||||| ||||||||||| ||    
T  4939560 agggtctgtttgggaaaccctaaaaa-ag-----agcttttagcttatagtttataagctcgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaacacttttt-ac 4939468  T
Q  812 catgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4939467 catgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 4939389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 759 - 889
Target Start/End: Original strand, 21369890 - 21370021
Alignment:
Q  759 tagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaa 858  Q
    ||||||||||||||||||||        |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21369890 tagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaatactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaa 21369989  T
Q  859 gctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21369990 gctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 21370021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 788 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 55358443 - 55358341
Alignment:
Q  788 ctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatag 886  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  55358443 ctctgtttgataacactttttcaccatgagcttataacttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatag 55358344  T
Q  887 ctt 889  Q
    |||    
T  55358343 ctt 55358341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 714 - 889
Target Start/End: Original strand, 44442046 - 44442222
Alignment:
Q  714 ggtctgtttgggaaac-ccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcacc 812  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||          |||||||| |||||||||||||||    
T  44442046 ggtctgtttgagaaactccaaaaaagagcttttaacttttagcttataatttataagttcgtttgacaaaaaaaattctgtttggtaacactttttcacc 44442145  T
Q  813 atgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  44442146 atgagcttattgcttatctcacgagctta-aaactatttttcagaagctatttcaagtagcgtttgagcttatagctt 44442222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 787 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 9032101 - 9031998
Alignment:
Q  787 gctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttata 885  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  9032101 gctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagtgtttgagcttata 9032002  T
Q  886 gctt 889  Q
    ||||    
T  9032001 gctt 9031998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 746 - 885
Target Start/End: Original strand, 35468012 - 35468152
Alignment:
Q  746 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaa 845  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||          |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  35468012 agcttttaacttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaaatctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 35468111  T
Q  846 ctatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttata 885  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  35468112 ctatttttcagaagctattccaaatagcgtttgagcttata 35468152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 751 - 894
Target Start/End: Original strand, 37831924 - 37832068
Alignment:
Q  751 ttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatt 850  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37831924 ttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaactctgtttggtaacacttttttaccatgagtttatagcttatttcacgagcttataagctatt 37832023  T
Q  851 tttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagcttctcac 894  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  37832024 tttcagaagctattccaagtagcgtttgaggttatagtttctcac 37832068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 712 - 885
Target Start/End: Complemental strand, 4355767 - 4355599
Alignment:
Q  712 agggtctgtttgggaaacccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcac 811  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||     |||||||||||||||||||||||  ||||||||        | |||||||| ||| ||||||||||    
T  4355767 agggtctgtttggtaaacccaaaaaa-ag-----agcttttagcttatagcttataaattcgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaatactttttcac 4355674  T
Q  812 catgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttata 885  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  4355673 catgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctatttcaagtagcgtttgagcttata 4355599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 753 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 56270231 - 56270094
Alignment:
Q  753 agcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 852  Q
    |||||||||||||||||||||||| |         ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56270231 agcttatagcttataagctcgtttcacaaaaaaaactctgtttggtaacattttttgaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 56270132  T
Q  853 tcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  56270131 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttttagctt 56270094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 787 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 5465516 - 5465413
Alignment:
Q  787 gctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttata 885  Q
    |||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5465516 gctctgtttggtaatacttttttaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttata 5465417  T
Q  886 gctt 889  Q
    ||||    
T  5465416 gctt 5465413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 751 - 889
Target Start/End: Original strand, 22430637 - 22430776
Alignment:
Q  751 ttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatt 850  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||       ||||| ||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22430637 ttagcttatagcttataagctcgttcgataaaaaaagctctatttgataatggtttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatt 22430736  T
Q  851 tttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22430737 tttcagatgctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 22430776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 788 - 889
Target Start/End: Original strand, 26826560 - 26826662
Alignment:
Q  788 ctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatag 886  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26826560 ctctgtttggtaacactttttcacgatgagcttataacttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatag 26826659  T
Q  887 ctt 889  Q
    |||    
T  26826660 ctt 26826662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 789 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 30366250 - 30366149
Alignment:
Q  789 tctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagc 887  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  30366250 tctgtttggtaacactttttcatcatgagcttatatcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattctaagtagcgtttgagcttatagc 30366151  T
Q  888 tt 889  Q
    ||    
T  30366150 tt 30366149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 709 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 31338687 - 31338503
Alignment:
Q  709 ttaagggtctgtttgggaa-acccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttt 807  Q
    |||||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||| ||||||||        |||||||||  ||||| ||||    
T  31338687 ttaagggtctatttggtaacactcaaaaaagagcttatagctcttaactgatagcttataagttcgtttgacaaaaaaagctctgtttagtaacattttt 31338588  T
Q  808 t--caccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  31338587 tttcaccatgagcttatagcttatttcacgggcttataagctatttttcagaagctatttcaagtagcgtttgagcttatagctt 31338503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 753 - 889
Target Start/End: Original strand, 33114979 - 33115116
Alignment:
Q  753 agcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 852  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||        |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33114979 agcttttagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacacttttttaccgtgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 33115078  T
Q  853 tcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  33115079 tcagaagctatttcaagtatcgtttgagcttatagctt 33115116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 787 - 893
Target Start/End: Original strand, 11050355 - 11050462
Alignment:
Q  787 gctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttata 885  Q
    |||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  11050355 gctctgtttggtaatgctttttcaccatgaacttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctatttcaagtagcgtttgagcttata 11050454  T
Q  886 gcttctca 893  Q
    ||||||||    
T  11050455 gcttctca 11050462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 798 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 27185728 - 27185635
Alignment:
Q  798 taacactttttc-accatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27185728 taacactttttctaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 27185635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 789 - 873
Target Start/End: Original strand, 23162641 - 23162725
Alignment:
Q  789 tctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagc 873  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23162641 tctgtttggtaacactttttccccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagc 23162725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 753 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 52708138 - 52708002
Alignment:
Q  753 agcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 852  Q
    |||||||||||||||||||||||||||        ||||||||| ||||  ||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52708138 agcttatagcttataagctcgtttgatagaaaaaactctgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 52708039  T
Q  853 tcagaagctattccaagtagcgttgagcttatagctt 889  Q
    ||||| | |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  52708038 tcagatgttattacaagtaacgttgagcttatagctt 52708002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 743 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 29656843 - 29656720
Alignment:
Q  743 tttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttat 842  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||        | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29656843 tttagctcttagcttatagcttataagctcgtttgacagaaaaagttctgtttgttaacactttttcgccatgagcttatagcttatttcacgagctaat 29656744  T
Q  843 aaactatttttcagaagctattcc 866  Q
    ||  ||||||||||||||||||||    
T  29656743 aatttatttttcagaagctattcc 29656720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 713 - 889
Target Start/End: Original strand, 36196837 - 36197015
Alignment:
Q  713 gggtctgtttgggaaacccaaaaaa-gagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcac 811  Q
    |||||||||||| || ||||  ||| |||||| ||| || |||||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||   | | | ||    
T  36196837 gggtctgtttggtaagcccattaaatgagcttatagtttatagcttatagtttataagctcgtttgacaaaaatagctctgtttgataattgtctcttac 36196936  T
Q  812 catgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||    
T  36196937 cacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattctaagtagtgtttgagcttatagctt 36197015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 751 - 876
Target Start/End: Complemental strand, 23113618 - 23113493
Alignment:
Q  751 ttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatt 850  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||        || || ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23113618 ttagcttatagtttataagctcgtttgataaaaaaaactttgattggtaatactttttcgccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatt 23113519  T
Q  851 tttcagaagctattccaagtagcgtt 876  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||    
T  23113518 tttcagaagttattccaagtagcgtt 23113493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 713 - 889
Target Start/End: Original strand, 25235108 - 25235286
Alignment:
Q  713 gggtctgtttgggaa-acccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcac 811  Q
    |||||||||||| || || |||||| |||||| ||| || ||||| |||||||||||| |||| |||        |||||||||| |||| |||||| ||    
T  25235108 gggtctgtttggtaacacacaaaaaggagcttatagtttatagctgatagcttataagttcgtctgacaaaaaaagctctgtttggtaacgcttttttac 25235207  T
Q  812 catgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
     | ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  25235208 aacgagcttatagcttatttcaggagcttataagctatttttcagaagctacttcaagtagcgtttgagcttatagctt 25235286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 713 - 834
Target Start/End: Complemental strand, 29656719 - 29656597
Alignment:
Q  713 gggtctgtttgggaa-acccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcac 811  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||        |||||||||| ||||||||||||||    
T  29656719 gggtctgtttggtaacacccaaaaaagagcttttagctcttaccttatagcttttaagctcgtttgacaagaaaagctctgtttggtaacactttttcac 29656620  T
Q  812 catgagcttatagcttatttcac 834  Q
    || ||||||||||||||||||||    
T  29656619 cacgagcttatagcttatttcac 29656597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 746 - 843
Target Start/End: Complemental strand, 33005275 - 33005178
Alignment:
Q  746 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttata 843  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33005275 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacacttttttaccatgagcttatagcttatttcacgagcttata 33005178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 746 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 4391855 - 4391711
Alignment:
Q  746 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaa 845  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||        |||||||||| |||| |||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  4391855 agcttatagctgatagcttataagctcgtctgacaaaaaaagctctgtttggtaacgcttttttacaacgagcttatagcttatttcaggagcttataag 4391756  T
Q  846 ctatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  4391755 ctatttttcagaagctacttcaagtagcgtttgagcttatagctt 4391711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 788 - 885
Target Start/End: Original strand, 20511448 - 20511546
Alignment:
Q  788 ctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttata 885  Q
    ||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  20511448 ctctgtttgataacagttttttacaacgagcttatagcttatttcatgagcttataagctatttttcagacgctattccaagtagcgtttgagcttata 20511546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 713 - 823
Target Start/End: Complemental strand, 45780918 - 45780807
Alignment:
Q  713 gggtctgtttgggaaaccc-aaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcac 811  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||| |||| ||||||||||||||    
T  45780918 gggtctgtttggttaaccctaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctatttggtaacactttttcac 45780819  T
Q  812 catgagcttata 823  Q
    ||||||||||||    
T  45780818 catgagcttata 45780807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 729 - 823
Target Start/End: Complemental strand, 25199460 - 25199366
Alignment:
Q  729 cccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttata 823  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25199460 cccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttata 25199366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 556 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 30041028 - 30040886
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatatttg 655  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || || ||| |||||  | |||||||||||||      
T  30041028 tgttggtgtaagccctagaggccaataatttatgttaaacttatgttatgtatcatgacttttattatcaattaatatatgatactctttattatatt-- 30040931  T
Q  656 tttgttgtaagattaataaagtccctagaattgatacttcatgtaat 702  Q
      ||||||||  |||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||    
T  30040930 --tgttgtaatgttaataaagttcctagaatagatagttcgtgtaat 30040886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 806 - 894
Target Start/End: Original strand, 44525694 - 44525783
Alignment:
Q  806 tttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagcttctcac 894  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44525694 tttcactatgagtttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaaactatttcaagtagcgtttgagcttatagcttctcac 44525783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 810 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 21633899 - 21633819
Alignment:
Q  810 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  21633899 accacgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaaatagcgtttgagcttatagctt 21633819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 815 - 894
Target Start/End: Complemental strand, 33005186 - 33005106
Alignment:
Q  815 gagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagcttctcac 894  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  33005186 gagcttatagcttatttcacgagtttataagctatttttcagaagctattccaagtaacgtttgagcttatagcttctcac 33005106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 811 - 885
Target Start/End: Complemental strand, 20148884 - 20148809
Alignment:
Q  811 ccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttata 885  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  20148884 ccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctatttcaagtagcgtttgagcttata 20148809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 575 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 5529014 - 5528887
Alignment:
Q  575 tgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatatttgtttgttgtaagattaataa 674  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||| |||| |||||||||     ||||||||||||||||||    
T  5529014 tgccaatagtttatgttaaacttatgttatgtatcatgacatttattattaaatataatatgacattttttattata----attgttgtaagattaataa 5528919  T
Q  675 agtccctagaattgatacttcatgtaatggaa 706  Q
    | |||||||||| |||| | ||||| ||||||    
T  5528918 aatccctagaatagatagtgcatgtgatggaa 5528887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 556 - 706
Target Start/End: Original strand, 9537710 - 9537855
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatatttg 655  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||||        
T  9537710 tgttggtgtaagccccagaggccaatagtttatgttaaatttatgttatgtatcatgac-tttattattaaataatatatgtcatt-tttattata---- 9537803  T
Q  656 tttgttgtaagattaataaagt-ccctagaattgatacttcatgtaatggaa 706  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| || |||||||    
T  9537804 attgttgtaagattaataaagtcccctagaatagatagttcgtgcaatggaa 9537855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 556 - 654
Target Start/End: Original strand, 20243684 - 20243782
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  20243684 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaatctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 20243782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 816 - 893
Target Start/End: Complemental strand, 40497473 - 40497395
Alignment:
Q  816 agcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagcttctca 893  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40497473 agcttataacttatttcacgagcttataagctatttttcagaagttattccaagtagcgtttgagcttatagcttctca 40497395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 813 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 4465551 - 4465474
Alignment:
Q  813 atgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| ||||||    
T  4465551 atgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctgttccaagtagcgtttgagcttgtagctt 4465474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 710 - 889
Target Start/End: Original strand, 55684663 - 55684836
Alignment:
Q  710 taagggtctgtttgggaaacccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttc 809  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||        ||||||||||||||||| |||        ||| |||||| |||  ||||||     
T  55684663 taagggtctgtttggtaaacccaaaaaagagcttatagctg-------atagcttataagctcgtctgacaaaaaaagctttgtttggtaatgctttttt 55684755  T
Q  810 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    || | |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  55684756 acaacgagcttctagcttatttcaggagcttataagctatttttcagaagctacttcaagtagcgtttgagcttatagctt 55684836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 554 - 654
Target Start/End: Original strand, 11420762 - 11420862
Alignment:
Q  554 tatgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatatt 653  Q
    ||||| |||| ||||| |||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  11420762 tatgtcggtggaagccctagaggccaatggtttatgttaaacttatgttatgtatcatgacttttattattaaataatatatggcactctttattatatt 11420861  T
Q  654 t 654  Q
    |    
T  11420862 t 11420862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 247 - 370
Target Start/End: Original strand, 31818711 - 31818837
Alignment:
Q  247 ttcgtgaaacttcccaatgccaacatgttgtatttgcaaagcaagggaaaacttgcaattc---ttatttaaaggaaaacatgggtgggtcaaggtatga 343  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    | | ||| |||||||||||| || ||||||| |||    
T  31818711 ttcgtgaaacttcccaatgccggtatgttgtatttgcaaaacaagggaaaatttgcaattccggatttctaagggaaaacatgggcggatcaaggtttga 31818810  T
Q  344 ctatccaatgaaaataaatcgtaaaat 370  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||    
T  31818811 ctagccaatgaaaataaatcgtgaaat 31818837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 746 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 35190763 - 35190619
Alignment:
Q  746 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaa 845  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||         ||||||||| |||| |||||| || | ||| || |||||||||||| ||||||||||     
T  35190763 agcttatagcttatagcttataagctcgtctgacaaaaaaaactctgtttggtaacgcttttttacaacgagtttgtagcttatttcaggagcttataag 35190664  T
Q  846 ctatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  35190663 ctatttttcagaagctacttcaagtagcgtttgagcttatagctt 35190619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 803 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 42085812 - 42085725
Alignment:
Q  803 ctttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  42085812 ctttttcaccacgaacttatagcttatttcacgagcttataagctttttttcagacgctatttcaagtagcgtttgagcttatagctt 42085725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 556 - 654
Target Start/End: Original strand, 2676760 - 2676858
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  2676760 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 2676858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 556 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 3369578 - 3369480
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  3369578 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 3369480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 556 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 11484472 - 11484374
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  11484472 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 11484374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 556 - 654
Target Start/End: Original strand, 15461244 - 15461342
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  15461244 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 15461342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 556 - 654
Target Start/End: Original strand, 18162909 - 18163007
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  18162909 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaatctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattacattt 18163007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 804 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 43078285 - 43078199
Alignment:
Q  804 tttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagc-gttgagcttatagctt 889  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  43078285 tttttcgccacgagcttataacttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtagcatttgagcttatagctt 43078199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 789 - 889
Target Start/End: Original strand, 37047069 - 37047170
Alignment:
Q  789 tctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagc 887  Q
    ||||||||||||| |||||| || | ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||    
T  37047069 tctgtttgataacgcttttttacaacgagcttatagcttattttaggagcttataagctatttttcagaagctacttcaaatagcgtttgagcttatagc 37047168  T
Q  888 tt 889  Q
    ||    
T  37047169 tt 37047170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 558 - 654
Target Start/End: Original strand, 9487301 - 9487397
Alignment:
Q  558 ttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  9487301 ttggtgtaagccctaggggccaataatttatgttaaacttatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatgacactctttattatattt 9487397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 555 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 4676539 - 4676440
Alignment:
Q  555 atgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  4676539 atgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaatctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatgacactctttataatattt 4676440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 555 - 654
Target Start/End: Original strand, 34975297 - 34975396
Alignment:
Q  555 atgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||| | ||| ||||| || ||||||||||||||    
T  34975297 atgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacttatcttatgtatcatgacttttattattgattaatatatgacactctttattatattt 34975396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 556 - 654
Target Start/End: Original strand, 1941472 - 1941570
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  1941472 tgttggtgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaacttattttatgtatcatgacttttattattgaataatatatgacactctttattatattt 1941570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 556 - 654
Target Start/End: Original strand, 15814768 - 15814866
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    |||||||||||| | |||| ||||||| |||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  15814768 tgttggtgtaagtcctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 15814866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 556 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 17300514 - 17300416
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||  ||| ||||||||  |||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  17300514 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcttgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 17300416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 556 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 18111598 - 18111500
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||| ||  ||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  18111598 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttgaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 18111500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 556 - 654
Target Start/End: Original strand, 26531360 - 26531458
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||  ||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  26531360 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatattaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 26531458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 746 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 36008152 - 36008069
Alignment:
Q  746 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttat 829  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36008152 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaactctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttat 36008069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 556 - 654
Target Start/End: Original strand, 38816460 - 38816558
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||| |||  |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  38816460 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattggataatatatggcactctttattatattt 38816558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 810 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 32101818 - 32101738
Alignment:
Q  810 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32101818 accacgagcttataacttatttcacgagcttataaactatttctaagacgttattccaagtagcgtttgagcttatagctt 32101738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 835 - 894
Target Start/End: Complemental strand, 45780815 - 45780755
Alignment:
Q  835 gagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagcttctcac 894  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45780815 gagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttctcac 45780755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 790 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 48056709 - 48056609
Alignment:
Q  790 ctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagct 888  Q
    ||||||| ||||| ||||| || | || ||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  48056709 ctgtttggtaacaattttttacaacgaacttatagtttatttcacgaacttataagttatttttcagacgctattccaagtagcgtttgagcttatagct 48056610  T
Q  889 t 889  Q
    |    
T  48056609 t 48056609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 556 - 646
Target Start/End: Original strand, 4545860 - 4545950
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattcttta 646  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||| || ||||||    
T  4545860 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacttatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatgacactcttta 4545950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 819 - 884
Target Start/End: Original strand, 50502310 - 50502376
Alignment:
Q  819 ttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttat 884  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||    
T  50502310 ttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagacgctattccaagtagtgtttgagcttat 50502376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 789 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 36486489 - 36486388
Alignment:
Q  789 tctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagc 887  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||  |||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| || |||| ||||||||    
T  36486489 tctgtttggtaatactttttcaccatgaatttatagtttattttatgagcttataaactatttttcataagctattttaagtaacgtttgaacttatagc 36486390  T
Q  888 tt 889  Q
    ||    
T  36486389 tt 36486388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 831 - 894
Target Start/End: Original strand, 53224309 - 53224373
Alignment:
Q  831 tcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagcttctcac 894  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  53224309 tcacgagtttataagctatttttcaaaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttctcac 53224373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 553 - 648
Target Start/End: Original strand, 5870156 - 5870251
Alignment:
Q  553 ttatgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttatt 648  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||  ||| |||||||| ||||| ||||| ||| ||||| ||||| || ||||||||    
T  5870156 ttatgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacctttattattgaataatatatgacactctttatt 5870251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 622 - 713
Target Start/End: Original strand, 19362230 - 19362317
Alignment:
Q  622 attaaataaaatatggcattctttattatatttgtttgttgtaagattaataaagtccctagaattgatacttcatgtaatggaacattaag 713  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    ||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||||||| || ||||||    
T  19362230 attaaataatatatgacattctttattatatttg----ttgtaagatcaataaagttcctagaatagatagttcatgtaatgtaatattaag 19362317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 832 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 24954282 - 24954224
Alignment:
Q  832 cacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24954282 cacgagcttataagctatttttcagacgctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 24954224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 792 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 35842696 - 35842638
Alignment:
Q  792 gtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatt 850  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||    
T  35842696 gtttggtaacactttttcaccatgagcttatagattatttcgcgagcttataagctatt 35842638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 832 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 42124740 - 42124682
Alignment:
Q  832 cacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42124740 cacgagcttataaactatctttcagacgctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 42124682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 730 - 779
Target Start/End: Complemental strand, 19169213 - 19169164
Alignment:
Q  730 ccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgat 779  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19169213 ccaaaaaagagcttttagctcttaacttatagcttataagctcgtttgat 19169164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 815 - 876
Target Start/End: Original strand, 31435072 - 31435133
Alignment:
Q  815 gagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcgtt 876  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  31435072 gagcttatagcttatttcacgagtttataagttatttttcatacgctattccaagtagcgtt 31435133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 818 - 894
Target Start/End: Original strand, 31953224 - 31953301
Alignment:
Q  818 cttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagcttctcac 894  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||   |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31953224 cttatagcttatttcacgactttataaactattttttagacattatttcaagtagcgtttgagcttatagcttctcac 31953301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 555 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 39422695 - 39422541
Alignment:
Q  555 atgttggtgtaagccttagatgccaataattt-atgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatatt 653  Q
    ||||||||||||| | |||| | ||||| ||| |||||||| ||||||||  ||| |||| | |||| ||||||||||||   ||| | |||||||||||    
T  39422695 atgttggtgtaagtcgtagaggtcaatagttttatgttaaacttatgttacatatcatgattgttattattaaataaaatgacgcactatttattatatt 39422596  T
Q  654 tgtttgttgtaagattaataaagtccctagaattgatacttcatgtaatggaacattaa 712  Q
    ||||    ||||||||||||| ||||||| |||  ||| |||||||||||||| |||||    
T  39422595 tgtt----gtaagattaataatgtccctaaaataaatagttcatgtaatggaaaattaa 39422541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 242 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 50375426 - 50375365
Alignment:
Q  242 tttccttcgtgaaacttcccaatgccaacatgttgtatttgcaaagcaagggaaaacttgca 303  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50375426 tttccttcgtgaaattttacaatgccgacgtgttgtatttgcaaagcaagggaaaacttgca 50375365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 788 - 886
Target Start/End: Complemental strand, 32948289 - 32948189
Alignment:
Q  788 ctctgtttgataaca-ctttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttata 885  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||| | ||  ||||||| ||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||    
T  32948289 ctctgtttgataacaactttttcatcatgagtttatatcttattttatgatattataaagtatttttcagacgctattctaaatagcgtttgagcttata 32948190  T
Q  886 g 886  Q
    |    
T  32948189 g 32948189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 791 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 38048979 - 38048880
Alignment:
Q  791 tgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagc-gttgagcttatagctt 889  Q
    |||||| ||||  ||||||| || || ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||| |||||||||    
T  38048979 tgtttgttaacgttttttcatcacgaacttataatttatttcacgagtttataaactatttttcagacgctattccaaatagcatttgagtttatagctt 38048880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 832 - 889
Target Start/End: Original strand, 17715647 - 17715705
Alignment:
Q  832 cacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  17715647 cacgagcttataagctatttttcagacgctattccaagtagcgtttgagattatagctt 17715705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 820 - 893
Target Start/End: Complemental strand, 41864153 - 41864079
Alignment:
Q  820 tatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagcttctca 893  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||    
T  41864153 tatagcttattttacgaacttataagctatttttaagaagctattccaaatagcgtttaagtttatagcttctca 41864079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 730 - 776
Target Start/End: Original strand, 45520089 - 45520135
Alignment:
Q  730 ccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgttt 776  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  45520089 ccaaaaaagagtttttagctcttagcttatagcttataagctcgttt 45520135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 832 - 873
Target Start/End: Original strand, 40119903 - 40119944
Alignment:
Q  832 cacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagc 873  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40119903 cacgagcttataaactatttttcagacgctattccaagtagc 40119944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 713 - 779
Target Start/End: Original strand, 26443288 - 26443355
Alignment:
Q  713 gggtctgtttgggaa-acccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgat 779  Q
    |||||||||||| || | |||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  26443288 gggtctgtttggtaacatccaaaaaagagcttatagcttatagcagatagcttataagctcgtttgat 26443355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 744 - 778
Target Start/End: Original strand, 17715579 - 17715613
Alignment:
Q  744 ttagcttttagcttatagcttataagctcgtttga 778  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17715579 ttagcttatagcttatagcttataagctcgtttga 17715613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 849 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 36008062 - 36008021
Alignment:
Q  849 tttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  36008062 tttttcagaagctattccaagtagcgtttgagtttatagctt 36008021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 130; Significance: 7e-67; HSPs: 97)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 712 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 42587571 - 42587393
Alignment:
Q  712 agggtctgtttgggaaacccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcac 811  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| ||||||||||||||    
T  42587571 agggtctgtttgagaaaccaaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcac 42587472  T
Q  812 catgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42587471 catgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 42587393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 705 - 894
Target Start/End: Complemental strand, 42375977 - 42375788
Alignment:
Q  705 aacattaagggtctgtttgggaaacccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacact 804  Q
    |||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||| |||||||    
T  42375977 aacatttagggtatgtttggttaacccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaa-ctctgtttggtaacact 42375879  T
Q  805 ttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagcttctcac 894  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42375878 ttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttctcac 42375788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 712 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 45687104 - 45686926
Alignment:
Q  712 agggtctgtttgggaaacccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcac 811  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| ||||||||||||||    
T  45687104 agggtctatttgggaaactaaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcac 45687005  T
Q  812 catgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45687004 catgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 45686926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 712 - 889
Target Start/End: Original strand, 43254069 - 43254248
Alignment:
Q  712 agggtctgtttgggaaacccaaaaaa-gagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttca 810  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| |||||||||||||    
T  43254069 agggtctgtttgggaaactaaaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttca 43254168  T
Q  811 ccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43254169 ccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 43254248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 713 - 885
Target Start/End: Complemental strand, 10312217 - 10312043
Alignment:
Q  713 gggtctgtttgggaaacccaaaaaa-gagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcac 811  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| ||||||||||||||    
T  10312217 gggtctgtttgggaaactaaaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcac 10312118  T
Q  812 catgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttata 885  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10312117 catgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttata 10312043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 716 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 36246560 - 36246386
Alignment:
Q  716 tctgtttgggaaacccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatg 815  Q
    |||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36246560 tctgtttggttaacccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatg 36246461  T
Q  816 agcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36246460 agcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 36246386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 712 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 47471150 - 47470972
Alignment:
Q  712 agggtctgtttgggaaacccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcac 811  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||        | |||||||| ||| ||||||||||    
T  47471150 agggtctgtttggttaacccaaaaaagagcgtttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaatactttttcac 47471051  T
Q  812 catgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  47471050 catgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagttattccaagtagcgtttgagcttatagctt 47470972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 714 - 894
Target Start/End: Complemental strand, 47587290 - 47587110
Alignment:
Q  714 ggtctgtttgggaaacccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcacca 813  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||        ||||||||| |||||||||| |||||    
T  47587290 ggtctgtttgagaaacccaaaaaagagattttagcttttagcttatagcttataaactcgtctgataaaaaaaactctgtttggtaacactttt-cacca 47587192  T
Q  814 tgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagcttctcac 894  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47587191 tgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttctcac 47587110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 115; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 712 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 40637349 - 40637170
Alignment:
Q  712 agggtctgtttgggaaacc-caaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttca 810  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||  ||||||||||||    
T  40637349 agggtctgtttggttaacctcaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaactctgtttggcaacactttttca 40637250  T
Q  811 ccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40637249 ccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 40637170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 710 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 483172 - 482992
Alignment:
Q  710 taagggtctgtttgggaaacccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttc 809  Q
    ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |        ||| |||||| |||||||||||     
T  483172 taagggtctgtttggtaaacttaaaaaagagcttttagctcttagcttatagcttataagctcgtttcacaaaaaaagctttgtttggtaacactttttg 483073  T
Q  810 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  483072 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 482992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 712 - 889
Target Start/End: Original strand, 40258823 - 40259002
Alignment:
Q  712 agggtctgtttgggaa-acccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttca 810  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||        ||| |||||| |||||||||||||    
T  40258823 agggtctgtttggtaacacccaaaaaagagcttttagctcttagcttatagcttataagcttgtttgacagaaaaagctatgtttggtaacactttttca 40258922  T
Q  811 ccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40258923 ccatgagcttataacttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 40259002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 712 - 885
Target Start/End: Original strand, 43134371 - 43134545
Alignment:
Q  712 agggtctgtttgggaaacccaaaaaa-gagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttca 810  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        |||||||||| ||||||||||| |    
T  43134371 agggtctgtttggtaaacccaaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttca-caaaaaagctctgtttggtaacactttttga 43134469  T
Q  811 ccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttata 885  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43134470 ccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttata 43134545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 712 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 21254885 - 21254707
Alignment:
Q  712 agggtctgtttgggaaacccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcac 811  Q
    |||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||        |||||||||| ||||||||||||||    
T  21254885 agggtctgtttggttaacttaaaaaagagcttttagcttttaacttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcac 21254786  T
Q  812 catgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  21254785 tatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctatttcaagtagcgtttgagcttatagctt 21254707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 710 - 894
Target Start/End: Original strand, 36436118 - 36436303
Alignment:
Q  710 taagggtctgtttgggaaaccc-aaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacacttttt 808  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||        ||| |||||| |||||||||||    
T  36436118 taagggtctgtttggttaaccccaaaaaagagcttttagcttttagcttatatcttataagctcgtttga-caaaaaagctatgtttggtaacacttttt 36436216  T
Q  809 caccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagcttctcac 894  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  36436217 caccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaaatagcgtttgagcttataacttctcac 36436303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 733 - 889
Target Start/End: Original strand, 21374621 - 21374778
Alignment:
Q  733 aaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttc 832  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||          |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21374621 aaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagcttgtttgacaaaaaaaattctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttc 21374720  T
Q  833 acgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21374721 acgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 21374778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 730 - 889
Target Start/End: Original strand, 9487392 - 9487552
Alignment:
Q  730 ccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttat 829  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||        | |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  9487392 ccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtctgacaaaaaaagttctgtttggtaacacttttttactatgagcttatagcttat 9487491  T
Q  830 ttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9487492 ttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 9487552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 711 - 894
Target Start/End: Complemental strand, 21313981 - 21313794
Alignment:
Q  711 aagggtctgtttgggaa-acccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnn--gctctgtttgataacactttt 807  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||          |||||||||| ||||||||||    
T  21313981 aagggtctgtttggtaatacccaaaaaagaacttttagctcttaacttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaaagctctgtttggtaacactttt 21313882  T
Q  808 tcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagcttctcac 894  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21313881 tcaccatgagcttatagcttatttcacaagcttataagctatttttcaaaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttctcac 21313794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 746 - 889
Target Start/End: Original strand, 35587580 - 35587724
Alignment:
Q  746 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaa 845  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  35587580 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaactctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 35587679  T
Q  846 ctatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35587680 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 35587724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 728 - 889
Target Start/End: Original strand, 44743700 - 44743862
Alignment:
Q  728 acccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagctt 827  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||        |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44743700 acccaaaaaaaagcttttagctcttagcttatagtttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagctt 44743799  T
Q  828 atttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagc-gttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  44743800 atttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcatttgagtttatagctt 44743862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 746 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 27089810 - 27089666
Alignment:
Q  746 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaa 845  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27089810 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 27089711  T
Q  846 ctatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  27089710 ctatttttcagaagctattccaaatagcgtttgagcttatagctt 27089666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 746 - 889
Target Start/End: Original strand, 27188491 - 27188635
Alignment:
Q  746 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaa 845  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27188491 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 27188590  T
Q  846 ctatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  27188591 ctatttttcagaagctattccaaatagcgtttgagcttatagctt 27188635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 746 - 889
Target Start/End: Original strand, 31511301 - 31511445
Alignment:
Q  746 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaa 845  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  31511301 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaactctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 31511400  T
Q  846 ctatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31511401 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 31511445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 712 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 48832234 - 48832063
Alignment:
Q  712 agggtctgtttgggaaacccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcac 811  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||        |||||||||| ||||||||||||||    
T  48832234 agggtctgtttgggaatcccaaaaaagagcttttagcttttagcttata-------agctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcac 48832142  T
Q  812 catgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  48832141 cgtgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcaaaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 48832063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 708 - 894
Target Start/End: Complemental strand, 17192634 - 17192447
Alignment:
Q  708 attaagggtctgtttgggaa-acccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacacttt 806  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||        |||||||||| |||||||||    
T  17192634 attatgggtctgtttggtaacacccaaaaaagagtttttagctcttaacttatagtttataagttcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacacttt 17192535  T
Q  807 ttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagcttctcac 894  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17192534 t-caccatgagtttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctatttcaagtagcgtttgagcttatagcttctcac 17192447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 712 - 889
Target Start/End: Original strand, 21741937 - 21742117
Alignment:
Q  712 agggtctgtttgggaaaccc-aaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngct-ctgtttgataacactttttc 809  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||          | ||||||| |||||| |||||    
T  21741937 agggtctgtttggttaaccccaaaaaagagcttttagattttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaaattctgtttggtaacaccttttc 21742036  T
Q  810 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21742037 accatgagcttatagcttatttcacgagcttaaaagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 21742117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 711 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 48313613 - 48313434
Alignment:
Q  711 aagggtctgtttgggaaaccc-aaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttc 809  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||        |||||| ||| ||||||||||||    
T  48313613 aagggtctgtttggttaaccccaaaaaagagcttttagcttttaggttatagtttataagttcgtttga-caaaaaagctctgattggtaacactttttc 48313515  T
Q  810 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagc-gttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  48313514 accatgagcttatagcttatttcacaagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcttttgagcttatagctt 48313434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 95; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 712 - 889
Target Start/End: Original strand, 36407194 - 36407373
Alignment:
Q  712 agggtctgtttgggaaacccaaaaaa-gagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttca 810  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| |        | |||||||| ||||||||||| |    
T  36407194 agggtatgtttggtaaacccaaaaaaagagcttttaactcttagcttatagcttataagttcgtttcacaaaaaaagttctgtttggtaacactttttga 36407293  T
Q  811 ccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36407294 ccatgagcttataacttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 36407373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 753 - 894
Target Start/End: Complemental strand, 19832137 - 19831995
Alignment:
Q  753 agcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 852  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||       |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19832137 agcttttagcttataagctcgtttgataaaaaaagctctgtttggtaacattttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 19832038  T
Q  853 tcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagcttctcac 894  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19832037 tcaaaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttctcac 19831995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 732 - 889
Target Start/End: Original strand, 44596597 - 44596755
Alignment:
Q  732 aaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttattt 831  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |          |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44596597 aaaaaagagcttttagctcttagcttatagtttataagctcgtttcacaaaaaaaattctgtttggtaacacttttttaccatgagcttatagcttattt 44596696  T
Q  832 cacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44596697 cacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 44596755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 93; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 746 - 886
Target Start/End: Complemental strand, 40106159 - 40106018
Alignment:
Q  746 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaa 845  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||        |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40106159 agcttttagctcttagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaa 40106060  T
Q  846 ctatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatag 886  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  40106059 ctatttttcagaagctattccaagtaacgtttgagcttatag 40106018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 738 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 27655835 - 27655683
Alignment:
Q  738 gagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgag 837  Q
    |||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||       |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  27655835 gagcttatagcttatagcttttagcttataagctcgtttgataaaaaaagctctgtttggtaatacttttttaccatgagcttatagcttatttcaagag 27655736  T
Q  838 cttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27655735 cttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 27655683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 705 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 45222262 - 45222083
Alignment:
Q  705 aacattaagggtctgtttgggaaacccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacact 804  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||     |||||||||||||||| ||||||||||||||||        | |||||||| ||||||     
T  45222262 aacattaagggtctgtttggttaaccccaaaaa-ag-----agcttttagcttatagtttataagctcgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaacacc 45222169  T
Q  805 ttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  45222168 ttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttttagctt 45222083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 787 - 889
Target Start/End: Original strand, 33026918 - 33027021
Alignment:
Q  787 gctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttata 885  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33026918 gctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttata 33027017  T
Q  886 gctt 889  Q
    ||||    
T  33027018 gctt 33027021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 712 - 850
Target Start/End: Original strand, 32168799 - 32168938
Alignment:
Q  712 agggtctgtttgggaaa-cccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttca 810  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| |||||||||||||    
T  32168799 agggtctgtttggtaacgcccaaaaaagagcttttagctcttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttca 32168898  T
Q  811 ccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatt 850  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32168899 ccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatt 32168938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 712 - 885
Target Start/End: Complemental strand, 33203856 - 33203682
Alignment:
Q  712 agggtctgtttgggaaacccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcac 811  Q
    ||||||| |||||||||   |||||| |  ||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||        |||||||||| ||||||||||||||    
T  33203856 agggtctatttgggaaataaaaaaaaaaaattttagcttttagtttatagtttataagttcctttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcac 33203757  T
Q  812 catgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttata 885  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  33203756 catgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctatttcaagtagcgtttgagcttata 33203682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 738 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 11466201 - 11466049
Alignment:
Q  738 gagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgag 837  Q
    |||||| ||| || |||||| |||||||||||||||||||||       |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  11466201 gagcttatagtttatagcttttagcttataagctcgtttgataaaaaaagctctgtttggtaatactttttaaccatgagcttatagcttatttcacgaa 11466102  T
Q  838 cttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11466101 cttataagctattttttagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 11466049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 746 - 889
Target Start/End: Original strand, 34709234 - 34709378
Alignment:
Q  746 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaa 845  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | ||||||        ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  34709234 agcttttagcttttagcttataagtttgtttgactaaaaaagctctgtctggtaacactttttcaccatgagcttatagtttatttcacgagcttataag 34709333  T
Q  846 ctatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34709334 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 34709378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 763 - 889
Target Start/End: Original strand, 48590732 - 48590859
Alignment:
Q  763 ttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagcta 862  Q
    |||||||||||||||||       |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  48590732 ttataagctcgtttgataaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagttatttttcaaaagcta 48590831  T
Q  863 ttccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  48590832 ttcaaagtagcgtttgagcttatagctt 48590859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 732 - 886
Target Start/End: Original strand, 49148319 - 49148474
Alignment:
Q  732 aaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttattt 831  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||        |||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  49148319 aaaaaaaagcttttagctcttagctaatagcttataagcttttttgacaaaaaaagctctgtttagtaacacttttccaccatgagcttatagcttattt 49148418  T
Q  832 cacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatag 886  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  49148419 cacgagcttatgagctatttttcagaagctattccaagcagcgtttgagcttatag 49148474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 746 - 889
Target Start/End: Original strand, 23029790 - 23029935
Alignment:
Q  746 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnn-gctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataa 844  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||         ||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23029790 agcttatagcttatagcttataagctcgtctgacgaaaattagctttgtttggtaatgctttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataa 23029889  T
Q  845 actatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23029890 actattattcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 23029935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 751 - 894
Target Start/End: Original strand, 38481286 - 38481430
Alignment:
Q  751 ttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatt 850  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||        |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  38481286 ttagcttatagcttataagttcgtttgacaaaaacagctctgtttggtaacactttttcaccatgaatttatagcttatttcacgagtctataagctatt 38481385  T
Q  851 tttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagcttctcac 894  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  38481386 tttcaaaagctattccaagtagcgtttgagcttataacttctcac 38481430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 745 - 889
Target Start/End: Original strand, 17844544 - 17844689
Alignment:
Q  745 tagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataa 844  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||| |||        |||||||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17844544 tagcttatagtttatagtttataagctcgtctgacaaaaaaagctctgtttggtaatgctatttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataa 17844643  T
Q  845 actatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  17844644 gctatttttcagaagctattctaagtagcgtttgagcttatagctt 17844689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 787 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 12345180 - 12345077
Alignment:
Q  787 gctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagc-gttgagcttata 885  Q
    |||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  12345180 gctctgtttggtaacactttttcacgaagagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctatttcaagtagcatttgagcttata 12345081  T
Q  886 gctt 889  Q
    ||||    
T  12345080 gctt 12345077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 788 - 889
Target Start/End: Original strand, 9485759 - 9485861
Alignment:
Q  788 ctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagc-gttgagcttatag 886  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| |  ||||||||||||    
T  9485759 ctctctttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcaaaagctatttcaagtatcatttgagcttatag 9485858  T
Q  887 ctt 889  Q
    |||    
T  9485859 ctt 9485861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 754 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 21316730 - 21316611
Alignment:
Q  754 gcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactattttt 853  Q
    |||||||||||||||||||||||||         ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  21316730 gcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaaactctgtttggtaacactttttcactatgagcttatagcttatttcataagcttataagctattttt 21316631  T
Q  854 cagaagctattccaagtagc 873  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  21316630 cagaagctattccaagtagc 21316611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 744 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 28425767 - 28425621
Alignment:
Q  744 ttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttata 843  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||        | | |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28425767 ttagcttatagcttatagcttataaactcgtttgacaaaaaatgttttgtttggtaactttttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttata 28425668  T
Q  844 aactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |  ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  28425667 agttatttttcataagctattccaagtagtgtttgagcttatagctt 28425621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 569 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 25846445 - 25846302
Alignment:
Q  569 cttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaa----atatggcattctttattatatttgtttgttgta 664  Q
    |||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||    ||||| ||||||||||||    |||||||||||    
T  25846445 cttagaggtcaatattttatgttaaatttatgctatgtatcatgacttttattattaaataaaatatatatgacattctttatta----tgtttgttgta 25846350  T
Q  665 agattaataaagtccctagaattgatacttcatgtaatggaacattaa 712  Q
    ||||||||||| || ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  25846349 agattaataaaatctctaaaatagatagttcatgtaatggaacattaa 25846302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 746 - 889
Target Start/End: Original strand, 1342777 - 1342921
Alignment:
Q  746 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaa 845  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||        |||||||||| |||| |||||| || | |||||||||||||||||||  |||||||||     
T  1342777 agcttatagcttatagcttataagctcgtctgacaaaaaaagctctgtttggtaacgcttttttacaacgagcttatagcttatttcagaagcttataag 1342876  T
Q  846 ctatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  1342877 ctatttttcagaagctacttcaagtagcgtttgagcttatagctt 1342921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 556 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 18259678 - 18259580
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  18259678 tgttggtgtaagccctagaggccaataatttatgttaaacttatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 18259580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 788 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 38531294 - 38531193
Alignment:
Q  788 ctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatag 886  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  38531294 ctctgtttggtaacactttttcaccatgatctaatagcttattttacgagcttataagctatttttcagaagttatt-caagtagcgtttgagcttatag 38531196  T
Q  887 ctt 889  Q
    |||    
T  38531195 ctt 38531193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 555 - 654
Target Start/End: Original strand, 15729497 - 15729596
Alignment:
Q  555 atgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  15729497 atgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaatctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 15729596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 730 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 19757686 - 19757526
Alignment:
Q  730 ccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttat 829  Q
    |||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||| |||         || ||||||||||| |||||| || | ||||||||||||||     
T  19757686 ccaaaaaagagcttataacttatagctaatagcttataagctcgtctgacaaaaaaaactatgtttgataacgcttttttacaacgagcttatagcttaa 19757587  T
Q  830 ttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||| |||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  19757586 ttcaggagcttataagctatttttcaaaagctacttcaagtagcgtttgagcttatagctt 19757526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 712 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 46879714 - 46879534
Alignment:
Q  712 agggtctgtttgggaa-acccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnn-gctctgtttgataacactttttc 809  Q
    ||||||||||||| || || |||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||| |||| |||         ||||||| || |||| ||||||     
T  46879714 agggtctgtttggtaacacacaaaaaggagcttatagcttatagctgatagcttataagttcgtctgacaaaaaaaagctctgtctggtaacgctttttt 46879615  T
Q  810 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    || | ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  46879614 acaacgagcttatagcttatttcaggagcttataagctatttttcagaagctacttcaagtagcgtttgagcttatagctt 46879534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 555 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 48809052 - 48808953
Alignment:
Q  555 atgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  48809052 atgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaatctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 48808953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 555 - 686
Target Start/End: Original strand, 3587656 - 3587783
Alignment:
Q  555 atgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    ||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||       
T  3587656 atgttggtgtaagccctaaatgtcaatagtttatgtgaaacttatgctatgtatcatgacttttattattaaataacatatgcaattctttattata--- 3587752  T
Q  655 gtttgttgtaagattaataaagtccctagaat 686  Q
      ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3587753 -attgttgtaagattaataaagtccatagaat 3587783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 556 - 654
Target Start/End: Original strand, 34128322 - 34128420
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  34128322 tgttggtgtaagccctagaggccaataatttatgttaaacttatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatgacactctttattatattt 34128420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 556 - 713
Target Start/End: Complemental strand, 24444074 - 24443921
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatatttg 655  Q
    |||||||||||| |||||| | |||||  |||||||||| ||||||||| ||| |||| |||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  24444074 tgttggtgtaagtcttagaggtcaatagcttatgttaaacttatgttatctatcatgatttttattattgaataatatattgcattctttattatatttg 24443975  T
Q  656 tttgttgtaagattaataaagtccctagaattgatacttcatgtaatggaacattaag 713  Q
    ||     ||||||||||||| | | |||||| |||| ||| |||||||||| ||||||    
T  24443974 tta----taagattaataaaattcatagaatagatagttcgtgtaatggaatattaag 24443921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 806 - 889
Target Start/End: Original strand, 35000773 - 35000857
Alignment:
Q  806 tttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35000773 tttcatcaggagcttatagcttatttcacaagtttataaactatttttcagatgctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 35000857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 735 - 876
Target Start/End: Original strand, 48620448 - 48620588
Alignment:
Q  735 aaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcac 834  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| |||||| || ||||||         || |||||| |||||||||| || |||||| |||||| |||||||||    
T  48620448 aaagagtttttagctcttagcttatagtttataaacttgtttgacggaaaaaactttgtttggtaacactttt-catcatgagtttatagtttatttcac 48620546  T
Q  835 gagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcgtt 876  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  48620547 gagcttataaactatttttcagaaactatttcaagtagcgtt 48620588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 746 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 791487 - 791343
Alignment:
Q  746 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaa 845  Q
    ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||       |||||||||||||||  ||||| || | || |||||||||||||| | ||||||||||     
T  791487 agcttatagtttatagtttataagctcgtttgataaaaaaagctctgtttgataacgattttttacaacgaacttatagcttattttatgagcttataag 791388  T
Q  846 ctatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  791387 ctatttttcagatgctattacaagtagcgtttgaacttatagctt 791343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 555 - 654
Target Start/End: Original strand, 18399850 - 18399949
Alignment:
Q  555 atgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  18399850 atgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 18399949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 787 - 889
Target Start/End: Original strand, 46757752 - 46757855
Alignment:
Q  787 gctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttata 885  Q
    |||||||||| |||| |||||| || | ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  46757752 gctctgtttggtaacgcttttttacaacgagcttataacttatttcatgagcttataagctatttttcagaagctacttcaagtagcgtttgagcttata 46757851  T
Q  886 gctt 889  Q
    ||||    
T  46757852 gctt 46757855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 556 - 654
Target Start/End: Original strand, 18406835 - 18406933
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  18406835 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 18406933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 556 - 654
Target Start/End: Original strand, 19858869 - 19858967
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  19858869 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 19858967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 556 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 10669456 - 10669358
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  10669456 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatgacactctttattatattt 10669358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 556 - 654
Target Start/End: Original strand, 30253885 - 30253983
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  30253885 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttataatattt 30253983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 556 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 47167413 - 47167315
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||| || || || ||||||||||||||    
T  47167413 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacttatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatgtgacactctttattatattt 47167315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 789 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 22642362 - 22642261
Alignment:
Q  789 tctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagc-gttgagcttatagc 887  Q
    |||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | | ||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  22642362 tctgtttggtaacggtttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagtttataagctattttttaaacgctattctaagtagcatttgagcttatagc 22642263  T
Q  888 tt 889  Q
    ||    
T  22642262 tt 22642261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 810 - 889
Target Start/End: Original strand, 40893437 - 40893517
Alignment:
Q  810 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  40893437 accacgagcttatagcttatttcacaagcttataagctattttttagaacctatttcaagtagcgtttgagcttatagctt 40893517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 556 - 654
Target Start/End: Original strand, 2204298 - 2204396
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||| |||  |||| ||||| || ||||||||||||||    
T  2204298 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattggataatatatgacactctttattatattt 2204396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 556 - 654
Target Start/End: Original strand, 8464746 - 8464844
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    |||||||||||| | |||| ||||||| |||||||||||  ||| ||||| || ||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  8464746 tgttggtgtaagtcctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgaatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 8464844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 561 - 713
Target Start/End: Original strand, 14585913 - 14586067
Alignment:
Q  561 gtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttt------tatcattaaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    ||||||||| || ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||      ||| ||||||||| ||||| || |||||||||||       
T  14585913 gtgtaagccgtaaatgccaatagtttaagttaaatttatgttatgtatcatgacttttattactattattaaataatatatgtcactctttattata--- 14586009  T
Q  655 gtttgttgtaagattaataaagtccctagaattgatacttcatgtaatggaacattaag 713  Q
     ||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||| ||| | |||||| | ||||||    
T  14586010 -tttgttgtaatgttaataaagtccctaaaatagatagttcgtataatggtatattaag 14586067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 556 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 18139895 - 18139797
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||  ||| |||||||| ||||| ||||| ||| ||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  18139895 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacctttattattgaataatatatgacactctttattatattt 18139797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 556 - 654
Target Start/End: Original strand, 19230634 - 19230732
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    |||||||||| ||| |||| ||||||| || |||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  19230634 tgttggtgtacgccctagaggccaatagttaatgttaaacttatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatgacactctttattatattt 19230732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 556 - 654
Target Start/End: Original strand, 22994055 - 22994153
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||| |||||| ||| ||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  22994055 tgttggtgtaagccctagagaccaatagtttatgttaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaataatatatgacactctttattatattt 22994153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 571 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 19393963 - 19393835
Alignment:
Q  571 tagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatatttgtttgttgtaagatta 670  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||  | |||||||||||    | ||| ||||  |||    
T  19393963 tagaggccaatagtttatgttaaacttatcttatgtatcatgacttttattattaaataatatatgatactctttattata----tctgtagtaatgtta 19393868  T
Q  671 ataaagtccctagaattgatacttcatgtaatg 703  Q
    |||||||| ||| ||| |||| |||||||||||    
T  19393867 ataaagtctctataatagatagttcatgtaatg 19393835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 791 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 36612220 - 36612121
Alignment:
Q  791 tgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||| |||| |||||| || | |||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  36612220 tgtttggtaacgcttttttacaacgagcttttagcttatttcaggagtttataagctattttttagaagctacttcaagtagcgtttgagcttatagctt 36612121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 559 - 713
Target Start/End: Complemental strand, 15170581 - 15170432
Alignment:
Q  559 tggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatatttgttt 658  Q
    |||||||||||||  | || |||| ||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||  ||||||||| ||| | ||||||||||||||     ||    
T  15170581 tggtgtaagccttgaaggctaatagtttatgttaaatttattctatgtatcgtgagttttaatattaaataatatacgacattctttattata----att 15170486  T
Q  659 gttgtaagattaataaagtccctagaattgatacttcatgtaatggaacattaag 713  Q
    ||||||| ||||||||||||| || ||| |||  |||||||||||||| ||||||    
T  15170485 gttgtaaaattaataaagtccataaaatagat-gttcatgtaatggaatattaag 15170432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 804 - 857
Target Start/End: Original strand, 24170803 - 24170856
Alignment:
Q  804 tttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcaga 857  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  24170803 tttttcaccatgagtttatagcttatttcatgagcttataagctatttttcaga 24170856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 817 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 27869645 - 27869572
Alignment:
Q  817 gcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  27869645 gcttataacttatttcacgagcttataagctatttttcggacgttattccaagtagcgtttgagtttatagctt 27869572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 555 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 42150627 - 42150499
Alignment:
Q  555 atgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttat-gttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatatt 653  Q
    |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||  |||||||||| ||| ||||| ||||| || ||||| |||||||    
T  42150627 atgttggtataagccctagaggccaatagtttatgttaaacttatctttatgtatcgtgacttttattattgaataatatatgacactctttgttatatt 42150528  T
Q  654 tgtttgttgtaagattaataaagtcccta 682  Q
    |||  || ||||  ||||||||| |||||    
T  42150527 tgtaggtagtaatgttaataaagccccta 42150499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 836 - 894
Target Start/End: Original strand, 39698930 - 39698989
Alignment:
Q  836 agcttataaactatttttcagaagctattccaagtagc-gttgagcttatagcttctcac 894  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  39698930 agcttacaagctatttttcagaagctattccaagtagcatttgagcttatagcttctcac 39698989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 610 - 701
Target Start/End: Complemental strand, 14073192 - 14073105
Alignment:
Q  610 atgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatatttgtttgttgtaagattaataaagtccctagaattgatacttcatgtaa 701  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||     ||||||||| |||||||||||| || |||| |||| |||||||||    
T  14073192 atgacttttaatattaaataaaataaggcattctttattata----cttgttgtaatattaataaagtctcttgaatagatagttcatgtaa 14073105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 610 - 701
Target Start/End: Complemental strand, 14383220 - 14383133
Alignment:
Q  610 atgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatatttgtttgttgtaagattaataaagtccctagaattgatacttcatgtaa 701  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||     ||||||||| |||||||||||| || |||| |||| |||||||||    
T  14383220 atgacttttaatattaaataaaataaggcattctttattata----cttgttgtaatattaataaagtctcttgaatagatagttcatgtaa 14383133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 556 - 654
Target Start/End: Original strand, 28130309 - 28130407
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| |||||||| || |||| |||||||| || |||||||| ||| ||||  || || || ||||||||||||||    
T  28130309 tgttggtgtaagccctatatgccaatagtttatgttgaacttatcttatgtatcataacttttattattgaatagtatgtgacactctttattatattt 28130407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 556 - 630
Target Start/End: Original strand, 48813749 - 48813823
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataa 630  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  48813749 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataa 48813823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 556 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 31191000 - 31190951
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatg 605  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  31191000 tgttggtgtaagccttagaggccaataatttatgttaaacttatgctatg 31190951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 558 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 5983324 - 5983248
Alignment:
Q  558 ttggtgtaagccttagatgccaataattt-atgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaat 633  Q
    |||||||||||| | ||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||||    
T  5983324 ttggtgtaagccctggatgccattaattttatgttaaacttatgatatgtatcatgacttttattactaaataaaat 5983248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 789 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 7884790 - 7884693
Alignment:
Q  789 tctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagc 887  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||    ||  |||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  7884790 tctgtttgttaatactttttcaccatgaacttatagcgtattttacgagc----aagttatttttgtgaagctattctaagtagcgtttgagcttatagc 7884695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 838 - 893
Target Start/End: Original strand, 47584185 - 47584241
Alignment:
Q  838 cttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagcttctca 893  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  47584185 cttataaactatttttcagaagttattccaaatagcgtttgagtttatagcttctca 47584241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 663 - 713
Target Start/End: Complemental strand, 5983162 - 5983112
Alignment:
Q  663 taagattaataaagtccctagaattgatacttcatgtaatggaacattaag 713  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  5983162 taagattaataaagttcctagaattgatatttcaagtaatgaaacattaag 5983112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 712 - 760
Target Start/End: Original strand, 34709206 - 34709255
Alignment:
Q  712 agggtctgtttgggaaaccc-aaaaaagagcttttagcttttagcttata 760  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34709206 agggtctgtttggttaaccccaaaaaagagcttttagcttttagcttata 34709255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 818 - 853
Target Start/End: Original strand, 21358657 - 21358692
Alignment:
Q  818 cttatagcttatttcacgagcttataaactattttt 853  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21358657 cttatagcttatttcacgagtttataaactattttt 21358692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 787 - 858
Target Start/End: Complemental strand, 21740258 - 21740187
Alignment:
Q  787 gctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaa 858  Q
    |||||||||| |||| |||||| || |  ||||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||    
T  21740258 gctctgtttggtaacgcttttttacaacaagcttatagcttatttcagaagtttataagctatttttcagaa 21740187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 556 - 713
Target Start/End: Original strand, 22968697 - 22968851
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatat--ggcattctttattatatt 653  Q
    |||||||||||||  || | | ||||| ||||| ||||| || || || |||| ||||||||||| ||| ||||| ||||  |||||| |||||||||||    
T  22968697 tgttggtgtaagctctataggtcaatagtttatcttaaacttttgctacgtatcatgacttttattattgaataatatatatggcatt-tttattatatt 22968795  T
Q  654 tgtttgttgtaagattaataaagtccctagaattgatacttcatgtaatggaacattaag 713  Q
    ||    ||||||||| ||||||||||  ||||| |||| ||| ||| |||||| ||||||    
T  22968796 tg----ttgtaagataaataaagtccagagaatagatagttcgtgtgatggaatattaag 22968851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 857 - 894
Target Start/End: Original strand, 32168931 - 32168969
Alignment:
Q  857 aagctattccaagtagcg-ttgagcttatagcttctcac 894  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32168931 aagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttctcac 32168969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 826 - 886
Target Start/End: Original strand, 45672375 - 45672436
Alignment:
Q  826 ttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatag 886  Q
    |||||| |||| ||||||| |||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  45672375 ttattttacgaacttataagctatttttcagacgttatttcaagtagcgtttgagcttatag 45672436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 129; Significance: 3e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 706 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 12904 - 12719
Alignment:
Q  706 acattaagggtctgtttgggaaacccaaaaaa-gagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacact 804  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||| |||||||    
T  12904 acataaagggtctgtttgggaaacccaaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgataaaaaaagctctgtttggtaacact 12805  T
Q  805 ttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  12804 ttttcaccatgagcttatagcttatttgacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgaggttatagctt 12719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 126; Significance: 2e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 712 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 126940 - 126762
Alignment:
Q  712 agggtctgtttgggaaacccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcac 811  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| ||||||||||||||    
T  126940 agggtctgtttggttaacccaagaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcac 126841  T
Q  812 catgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  126840 catgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgcttgagcttatagctt 126762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 556 - 713
Target Start/End: Complemental strand, 40542 - 40389
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatatttg 655  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||        
T  40542 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacttatgctatgtagcatgacttttattattaaataatatatgacactctttattata---- 40447  T
Q  656 tttgttgtaagattaataaagtccctagaattgatacttcatgtaatggaacattaag 713  Q
    ||| |||||| |||||||||||| || |||| |||| |||||||||||| | ||||||    
T  40446 ttttttgtaatattaataaagtctctggaatagataattcatgtaatggtatattaag 40389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 122; Significance: 4e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 709 - 889
Target Start/End: Original strand, 22557 - 22739
Alignment:
Q  709 ttaagggtctgtttgggaaaccc-aaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttt 807  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| ||||||||||    
T  22557 ttaagggtctgtttggttaacccgaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttt 22656  T
Q  808 tcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22657 tcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagttatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 22739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1632 (Bit Score: 111; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold1632
Description:

Target: scaffold1632; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 712 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 218 - 39
Alignment:
Q  712 agggtctgtttgggaaacccaaaaaa-gagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttca 810  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |        |||||||||| ||||||||||| |    
T  218 agggtctgtttggtaaactcaaaaaaagagcttttagctcttagcttatagcttataagctcgtttcacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttga 119  T
Q  811 ccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  118 ccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 39  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 98; Significance: 9e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 712 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 27316 - 27158
Alignment:
Q  712 agggtctgtttgggaaaccc-aaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnn-gctctgtttgataacactttttc 809  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||| |||||| ||||||||||||    
T  27316 agggtctgtttggttaaccccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaataaagctatgtttggtaacactttttc 27217  T
Q  810 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaa 868  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27216 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaa 27158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 97; Significance: 4e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 711 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 28267 - 28078
Alignment:
Q  711 aagggtctgtttgggaa-acccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttc 809  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||    
T  28267 aagggtctgtttggtaacactcaaaaaagagcttttagctcttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttgataacactttttc 28168  T
Q  810 accatgagcttatagctta---------tttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||||||||||         |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28167 accatgagcttatagcttataagctatttttcacaagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 28078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 746 - 894
Target Start/End: Complemental strand, 30323 - 30174
Alignment:
Q  746 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaa 845  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||         ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  30323 agcttttagtttatagtttataagctcgtttgacaaaaaaaactctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagtttataag 30224  T
Q  846 ctatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagcttctcac 894  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30223 ctatttttcagaagttattccaagtagcgtttgagcttatagcttctcac 30174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0246 (Bit Score: 93; Significance: 9e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0246
Description:

Target: scaffold0246; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 713 - 889
Target Start/End: Original strand, 7024 - 7201
Alignment:
Q  713 gggtctgtttgggaaacccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcacc 812  Q
    ||||||||||||  ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||        | |||||||| ||||||||||| |||    
T  7024 gggtctgtttggttaacctcaaaaagagcttttagtttttagcttatagcttttaagttcgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaacacttttttacc 7123  T
Q  813 atgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  7124 atgagcttatagcttatttcacgagcttataagctattttttagaagctattccaagtagtgtttgagcttatagctt 7201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087 (Bit Score: 89; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0087
Description:

Target: scaffold0087; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 787 - 894
Target Start/End: Complemental strand, 53126 - 53018
Alignment:
Q  787 gctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttata 885  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  53126 gctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcctatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttata 53027  T
Q  886 gcttctcac 894  Q
    |||||||||    
T  53026 gcttctcac 53018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 85; Significance: 5e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 753 - 889
Target Start/End: Original strand, 431265 - 431402
Alignment:
Q  753 agcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 852  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||        |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  431265 agcttttagcttataagttcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 431364  T
Q  853 tcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  431365 tcagaagctattccaaatagcgtttgagcttatagctt 431402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 798 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 119333 - 119241
Alignment:
Q  798 taacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  119333 taacagttttttacaacgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagatcctattccaagtagagtttgagcttatagctt 119241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 84; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 746 - 889
Target Start/End: Original strand, 192013 - 192157
Alignment:
Q  746 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaa 845  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||        |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  192013 agcttatagcttatagcttataagctcgtatgacaaaaaaagctctgtttggtaatactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 192112  T
Q  846 ctatttttcagaagctattccaagtagc-gttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  192113 ctatttttgagaagctattccaagtagcttttgagcttatagctt 192157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 82; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 789 - 889
Target Start/End: Original strand, 63887 - 63988
Alignment:
Q  789 tctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagc 887  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  63887 tctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattctaagtagcgtttgagcttatagc 63986  T
Q  888 tt 889  Q
    ||    
T  63987 tt 63988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 81; Significance: 1e-37; HSPs: 3)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 753 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 93525 - 93388
Alignment:
Q  753 agcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 852  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  93525 agcttttagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttgataacactttaaaaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 93426  T
Q  853 tcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  93425 tcataagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 93388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 815 - 885
Target Start/End: Original strand, 84325 - 84396
Alignment:
Q  815 gagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttata 885  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  84325 gagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctatttcaagtagcgtttgagcttata 84396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 710 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 93554 - 93514
Alignment:
Q  710 taagggtctgtttgggaaacccaaaaaagagcttttagctt 750  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  93554 taagggtctgtttggttaacccaaaaaagagcttttagctt 93514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 79; Significance: 2e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 712 - 823
Target Start/End: Complemental strand, 41925 - 41814
Alignment:
Q  712 agggtctgtttgggaaacccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcac 811  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| ||||||||||||||    
T  41925 agggtctgtttgggaaaccaaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcac 41826  T
Q  812 catgagcttata 823  Q
    ||||||||||||    
T  41825 catgagcttata 41814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 835 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 41822 - 41767
Alignment:
Q  835 gagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41822 gagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 41767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0362 (Bit Score: 76; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0362
Description:

Target: scaffold0362; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 788 - 894
Target Start/End: Original strand, 5451 - 5557
Alignment:
Q  788 ctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatag 886  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5451 ctctgtttggtaacacttttttaccatgagcttata-cttatttcacgagcttataagttatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatag 5549  T
Q  887 cttctcac 894  Q
    ||||||||    
T  5550 cttctcac 5557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 59; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 816 - 893
Target Start/End: Original strand, 4562 - 4640
Alignment:
Q  816 agcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagcttctca 893  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4562 agcttataacttatttcacgagcttataagctatttttcagaagttattccaagtagcgtttgagcttatagcttctca 4640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0378 (Bit Score: 58; Significance: 7e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0378
Description:

Target: scaffold0378; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 553 - 654
Target Start/End: Original strand, 8049 - 8150
Alignment:
Q  553 ttatgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatat 652  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  8049 ttatgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatat 8148  T
Q  653 tt 654  Q
    ||    
T  8149 tt 8150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0343 (Bit Score: 57; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0343
Description:

Target: scaffold0343; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 810 - 889
Target Start/End: Original strand, 9294 - 9374
Alignment:
Q  810 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||    
T  9294 accacgagctcatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctatttcaagtagtgtttgagcttatagctt 9374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 56; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 555 - 654
Target Start/End: Original strand, 76306 - 76405
Alignment:
Q  555 atgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  76306 atgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacttatcttatgtatcatgacttttaatattgaataaaatatgacactctttattatattt 76405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1948 (Bit Score: 55; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold1948
Description:

Target: scaffold1948; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 556 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 1169 - 1071
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  1169 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 1071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0264 (Bit Score: 55; Significance: 4e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0264
Description:

Target: scaffold0264; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 556 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 4230 - 4132
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  4230 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 4132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0264; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 556 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 11085 - 10987
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  11085 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 10987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 55; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 556 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 18969 - 18871
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  18969 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 18871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 55; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 556 - 654
Target Start/End: Original strand, 119477 - 119575
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  119477 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 119575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 55; Significance: 4e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 556 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 130779 - 130681
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  130779 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 130681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 601 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 138645 - 138592
Alignment:
Q  601 ttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  138645 ttatgtatcatgacttttattattgaataatatatgtcactctttattatattt 138592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0393 (Bit Score: 53; Significance: 7e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0393
Description:

Target: scaffold0393; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 558 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 15376 - 15280
Alignment:
Q  558 ttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  15376 ttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 15280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059 (Bit Score: 53; Significance: 7e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0059
Description:

Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 554 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 34062 - 33962
Alignment:
Q  554 tatgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatatt 653  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||| || ||||| |||||||||||||    
T  34062 tatgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatgtggcactctttattatatt 33963  T
Q  654 t 654  Q
    |    
T  33962 t 33962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0376 (Bit Score: 51; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0376
Description:

Target: scaffold0376; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 556 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 12083 - 11985
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||| |||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  12083 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaataatatatgacattctttattgtattt 11985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 51; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 556 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 40249 - 40151
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  40249 tgttggtgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 40151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 51; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 556 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 67928 - 67830
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  67928 tgttggtgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaacttattttatgtatcatgacttttattattgaataatatatgacactctttattatattt 67830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466 (Bit Score: 50; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 571 - 701
Target Start/End: Complemental strand, 13489 - 13363
Alignment:
Q  571 tagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatatttgtttgttgtaagatta 670  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||  |||| |||||||    |||| ||||   ||    
T  13489 tagaggccaatagtttatgttaaatttatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggctctcttaattatat----ttgtagtaatgcta 13394  T
Q  671 ataaagtccctagaattgatacttcatgtaa 701  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  13393 ataaagtccctagaatagatagttcatgtaa 13363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 50; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 555 - 654
Target Start/End: Original strand, 8846 - 8947
Alignment:
Q  555 atgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatg-acttttatcatta-aataaaatatggcattctttattatat 652  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  8846 atgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaatctatcttatgtatcatgtacttttattattagaataatatatggcactctttattatat 8945  T
Q  653 tt 654  Q
    ||    
T  8946 tt 8947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041 (Bit Score: 49; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 810 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 72847 - 72767
Alignment:
Q  810 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcg-ttgagcttatagctt 889  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  72847 accacgagcttatagcttatttcacaagcttataagctattttttagaacctatttcaagtagcgtttgagcttatagctt 72767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2089 (Bit Score: 47; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold2089
Description:

Target: scaffold2089; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 556 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 273 - 175
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||  ||| |||||||| ||||| ||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  273 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttttgttaaacctatcttatgtatcatgacctttattattgaataatatatggcactctttattatattt 175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 47; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 556 - 654
Target Start/End: Original strand, 13740 - 13838
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||| |||||| ||| ||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  13740 tgttggtgtaagccctagagaccaatagtttatgttaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaataatatatgacactctttattatattt 13838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0166 (Bit Score: 45; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0166
Description:

Target: scaffold0166; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 711 - 778
Target Start/End: Original strand, 36319 - 36387
Alignment:
Q  711 aagggtctgtttgggaaacccaaaaaag-agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttga 778  Q
    |||| |||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36319 aaggctctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttga 36387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 45; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 816 - 876
Target Start/End: Original strand, 10833 - 10893
Alignment:
Q  816 agcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcgtt 876  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  10833 agcttatagcttatttcacgagtttataagctatttttcagacgctattccaaatagcgtt 10893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0611 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0611
Description:

Target: scaffold0611; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 556 - 654
Target Start/End: Original strand, 9516 - 9614
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||| || ||||| ||||||| ||||||    
T  9516 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattatggaataatatgtggcactctttataatattt 9614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 556 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 19389 - 19291
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| |||||   |||  ||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  19389 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttataaaaaaaatatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 19291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0086
Description:

Target: scaffold0086; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 555 - 648
Target Start/End: Original strand, 53520 - 53613
Alignment:
Q  555 atgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttatt 648  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||| |||| |||| ||| ||||||||||| ||| ||||| ||||| || ||||||||    
T  53520 atgttggtgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaacttatcttatatatcatgacttttattattgaataatatatgacactctttatt 53613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 556 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 45502 - 45404
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatgacttttatcattaaataaaatatggcattctttattatattt 654  Q
    ||||||||||||||  | | ||||||| ||| ||||||| |||| ||||| || ||||||||||| ||| ||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  45502 tgttggtgtaagcccaaaaggccaatagtttctgttaaacttatcttatgcatcatgacttttattattgaataatatatgacactctttattatattt 45404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 615 - 702
Target Start/End: Original strand, 26413 - 26496
Alignment:
Q  615 ttttatcattaaataaaatatggcattctttattatatttgtttgttgtaagattaataaagtccctagaattgatacttcatgtaat 702  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||    || |||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||    
T  26413 ttttattattaaataatatatggcactctttattata----ttcgttgtaatgttaataaagtccctagaatagatagttcgtgtaat 26496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 739 - 857
Target Start/End: Complemental strand, 9115 - 8997
Alignment:
Q  739 agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagc 838  Q
    ||||| |||||| ||||  ||||||||||||||  ||||||       |||||||||| |||    ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||     
T  9115 agcttatagcttatagcggatagcttataagcttatttgatcaaaaaagctctgtttggtaatgggttttcaccacgagcttatagtttatttcacaagt 9016  T
Q  839 ttataaactatttttcaga 857  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  9015 ttataagctatttttcaga 8997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0783 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0783
Description:

Target: scaffold0783; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 556 - 613
Target Start/End: Original strand, 6227 - 6284
Alignment:
Q  556 tgttggtgtaagccttagatgccaataatttatgttaaatttatgttatgtattatga 613  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||  ||| |||||||| ||||    
T  6227 tgttggtgtaagccctagaagccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatga 6284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University