View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5961_low_42 (Length: 255)

Name: NF5961_low_42
Description: NF5961
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5961_low_42
NF5961_low_42
[»] chr7 (60 HSPs)
chr7 (13-241)||(36939702-36939930)
chr7 (45-196)||(11845197-11845348)
chr7 (45-210)||(23378-23543)
chr7 (45-210)||(1085617-1085782)
chr7 (45-195)||(37533012-37533161)
chr7 (45-195)||(37533365-37533515)
chr7 (53-210)||(7517572-7517729)
chr7 (47-195)||(29157572-29157720)
chr7 (76-210)||(7554017-7554151)
chr7 (45-195)||(30244277-30244427)
chr7 (45-210)||(40094775-40094940)
chr7 (45-192)||(6054570-6054717)
chr7 (45-216)||(45433227-45433398)
chr7 (45-192)||(45434646-45434793)
chr7 (45-195)||(47129102-47129252)
chr7 (45-194)||(24177443-24177592)
chr7 (54-194)||(19122740-19122879)
chr7 (45-195)||(22567040-22567189)
chr7 (46-195)||(34218036-34218185)
chr7 (45-195)||(30245084-30245230)
chr7 (55-195)||(45754723-45754862)
chr7 (85-192)||(14681520-14681627)
chr7 (93-195)||(22566711-22566813)
chr7 (46-195)||(9901652-9901799)
chr7 (48-192)||(40230295-40230439)
chr7 (76-187)||(1085280-1085391)
chr7 (45-195)||(30032574-30032724)
chr7 (44-195)||(36622967-36623118)
chr7 (82-195)||(16569203-16569316)
chr7 (82-195)||(16596346-16596459)
chr7 (45-210)||(118300-118467)
chr7 (45-209)||(8128442-8128606)
chr7 (46-143)||(37167840-37167937)
chr7 (45-194)||(41854643-41854791)
chr7 (67-192)||(24838724-24838850)
chr7 (45-121)||(47129450-47129526)
chr7 (77-195)||(20599321-20599441)
chr7 (45-160)||(30253534-30253645)
chr7 (93-190)||(36534833-36534930)
chr7 (129-210)||(30245486-30245567)
chr7 (129-210)||(30255331-30255412)
chr7 (81-210)||(43241487-43241616)
chr7 (46-114)||(37532753-37532821)
chr7 (107-195)||(41910657-41910745)
chr7 (46-156)||(28300255-28300366)
chr7 (114-209)||(28301613-28301708)
chr7 (44-119)||(28300568-28300644)
chr7 (135-210)||(30244693-30244768)
chr7 (135-210)||(36109008-36109083)
chr7 (85-135)||(23569043-23569093)
chr7 (84-133)||(21416181-21416230)
chr7 (97-195)||(44361517-44361614)
chr7 (37-101)||(30245256-30245320)
chr7 (90-133)||(21619091-21619134)
chr7 (88-133)||(27391813-27391858)
chr7 (84-148)||(4124128-4124192)
chr7 (37-101)||(30244453-30244517)
chr7 (60-107)||(4719312-4719359)
chr7 (94-160)||(37345960-37346026)
chr7 (152-209)||(40094502-40094559)
[»] chr4 (86 HSPs)
chr4 (43-210)||(1731644-1731811)
chr4 (47-210)||(25483328-25483491)
chr4 (25-195)||(36629244-36629414)
chr4 (45-195)||(55933123-55933273)
chr4 (46-195)||(50630755-50630904)
chr4 (45-195)||(41370364-41370514)
chr4 (45-193)||(44621011-44621159)
chr4 (47-195)||(54017596-54017744)
chr4 (45-193)||(44620362-44620510)
chr4 (54-187)||(54108928-54109060)
chr4 (27-195)||(20825843-20826011)
chr4 (54-209)||(52884688-52884844)
chr4 (45-195)||(50002433-50002583)
chr4 (61-210)||(4955332-4955481)
chr4 (42-195)||(50459728-50459881)
chr4 (47-195)||(3340814-3340962)
chr4 (45-195)||(39404405-39404555)
chr4 (45-210)||(10245912-10246076)
chr4 (45-210)||(22183263-22183428)
chr4 (46-195)||(39792860-39793009)
chr4 (45-195)||(49302911-49303063)
chr4 (45-208)||(44620654-44620816)
chr4 (45-195)||(36572026-36572176)
chr4 (37-210)||(22027952-22028125)
chr4 (45-210)||(36608660-36608825)
chr4 (45-192)||(54343007-54343147)
chr4 (45-190)||(22028368-22028515)
chr4 (51-195)||(32941128-32941272)
chr4 (43-195)||(34646646-34646798)
chr4 (45-208)||(49076830-49076992)
chr4 (84-210)||(52884879-52885006)
chr4 (45-195)||(39404025-39404175)
chr4 (82-195)||(49880167-49880280)
chr4 (45-177)||(18932748-18932880)
chr4 (45-183)||(54936215-54936352)
chr4 (47-210)||(4390102-4390265)
chr4 (76-187)||(45496820-45496931)
chr4 (53-187)||(54108551-54108686)
chr4 (49-195)||(20826224-20826370)
chr4 (43-195)||(16889533-16889685)
chr4 (45-209)||(2740693-2740855)
chr4 (93-195)||(2741078-2741180)
chr4 (45-195)||(16888815-16888965)
chr4 (74-195)||(6975484-6975605)
chr4 (53-209)||(3244458-3244614)
chr4 (45-148)||(23817680-23817783)
chr4 (84-195)||(41707503-41707613)
chr4 (45-210)||(49076450-49076612)
chr4 (47-195)||(34004586-34004732)
chr4 (94-189)||(54017750-54017845)
chr4 (113-191)||(10246358-10246436)
chr4 (50-149)||(31691205-31691306)
chr4 (45-162)||(43827480-43827596)
chr4 (47-210)||(51768061-51768224)
chr4 (43-209)||(54741177-54741341)
chr4 (60-194)||(19504713-19504838)
chr4 (94-210)||(3341120-3341236)
chr4 (46-156)||(18879852-18879962)
chr4 (48-195)||(43174513-43174661)
chr4 (43-195)||(45489329-45489480)
chr4 (45-176)||(48111697-48111828)
chr4 (47-210)||(3700357-3700512)
chr4 (136-194)||(44620304-44620362)
chr4 (94-148)||(3271841-3271895)
chr4 (84-133)||(11197295-11197344)
chr4 (84-209)||(28034222-28034347)
chr4 (46-179)||(39698944-39699079)
chr4 (84-195)||(760196-760306)
chr4 (61-160)||(15841383-15841482)
chr4 (65-195)||(40067050-40067181)
chr4 (151-192)||(50788088-50788129)
chr4 (95-195)||(15841034-15841133)
chr4 (136-195)||(44620951-44621011)
chr4 (136-208)||(44621420-44621492)
chr4 (88-131)||(51681609-51681652)
chr4 (95-133)||(1868120-1868158)
chr4 (61-139)||(11783568-11783646)
chr4 (84-133)||(10396200-10396249)
chr4 (92-133)||(10396485-10396526)
chr4 (76-177)||(23556896-23556997)
chr4 (92-148)||(34544160-34544217)
chr4 (45-110)||(43174233-43174298)
chr4 (114-210)||(11348396-11348492)
chr4 (83-133)||(922487-922537)
chr4 (45-91)||(11702298-11702344)
chr4 (93-130)||(11706591-11706628)
[»] chr6 (47 HSPs)
chr6 (45-195)||(29518510-29518660)
chr6 (45-195)||(29518927-29519077)
chr6 (45-195)||(32741186-32741336)
chr6 (45-195)||(35210211-35210361)
chr6 (54-195)||(3409266-3409407)
chr6 (45-195)||(2378133-2378283)
chr6 (45-195)||(3409667-3409817)
chr6 (45-210)||(2579873-2580038)
chr6 (45-195)||(2578444-2578593)
chr6 (45-195)||(16454914-16455064)
chr6 (45-187)||(1846763-1846905)
chr6 (45-195)||(2377761-2377911)
chr6 (45-195)||(3415465-3415617)
chr6 (45-195)||(14748343-14748489)
chr6 (54-195)||(26544056-26544197)
chr6 (45-192)||(3058236-3058383)
chr6 (53-195)||(16107685-16107827)
chr6 (45-195)||(16454582-16454732)
chr6 (45-209)||(10073992-10074156)
chr6 (45-195)||(2843561-2843712)
chr6 (52-209)||(10074371-10074528)
chr6 (52-195)||(2579500-2579643)
chr6 (94-195)||(32460630-32460731)
chr6 (53-195)||(1127367-1127509)
chr6 (60-195)||(1950201-1950336)
chr6 (45-192)||(5832028-5832174)
chr6 (77-195)||(9062383-9062500)
chr6 (45-195)||(593708-593860)
chr6 (37-209)||(10073609-10073779)
chr6 (47-195)||(6999799-6999947)
chr6 (45-195)||(2578836-2578985)
chr6 (45-192)||(2579110-2579253)
chr6 (48-195)||(10911572-10911720)
chr6 (43-195)||(16108070-16108210)
chr6 (82-210)||(5958641-5958769)
chr6 (77-210)||(6071124-6071257)
chr6 (84-209)||(12092522-12092647)
chr6 (83-210)||(8481919-8482045)
chr6 (45-131)||(12071692-12071778)
chr6 (47-189)||(31714683-31714823)
chr6 (88-133)||(22605299-22605344)
chr6 (47-131)||(12085037-12085121)
chr6 (88-133)||(21130101-21130146)
chr6 (83-133)||(11637760-11637810)
chr6 (129-182)||(35210498-35210551)
chr6 (51-98)||(3409405-3409452)
chr6 (119-165)||(14789279-14789325)
[»] chr2 (68 HSPs)
chr2 (46-195)||(37106195-37106344)
chr2 (45-195)||(36178606-36178756)
chr2 (45-195)||(5542626-5542776)
chr2 (45-195)||(6421392-6421542)
chr2 (45-195)||(37105931-37106081)
chr2 (37-195)||(41283468-41283626)
chr2 (50-195)||(15880270-15880415)
chr2 (45-195)||(14745668-14745818)
chr2 (48-195)||(5543002-5543149)
chr2 (47-195)||(962605-962753)
chr2 (45-210)||(15511496-15511659)
chr2 (45-195)||(42514656-42514806)
chr2 (45-184)||(36178172-36178311)
chr2 (45-195)||(35580725-35580874)
chr2 (47-209)||(40679632-40679794)
chr2 (45-186)||(6422126-6422267)
chr2 (63-195)||(28254258-28254388)
chr2 (46-195)||(33731655-33731804)
chr2 (51-195)||(36005887-36006030)
chr2 (45-195)||(6712983-6713134)
chr2 (46-209)||(28531316-28531479)
chr2 (42-195)||(14745291-14745445)
chr2 (43-210)||(38796617-38796786)
chr2 (44-209)||(37632597-37632762)
chr2 (47-189)||(23346250-23346391)
chr2 (60-189)||(5367468-5367597)
chr2 (94-210)||(31468800-31468912)
chr2 (45-195)||(40733524-40733674)
chr2 (95-195)||(36178320-36178420)
chr2 (45-195)||(40733890-40734039)
chr2 (54-195)||(1769899-1770040)
chr2 (42-210)||(29676895-29677068)
chr2 (55-191)||(40163383-40163520)
chr2 (95-210)||(16542441-16542556)
chr2 (45-195)||(7598235-7598385)
chr2 (86-194)||(37895103-37895211)
chr2 (45-140)||(6421793-6421888)
chr2 (49-195)||(7598616-7598754)
chr2 (54-195)||(12529038-12529179)
chr2 (114-195)||(31899496-31899577)
chr2 (45-194)||(29676543-29676686)
chr2 (92-177)||(31259664-31259749)
chr2 (51-209)||(16590881-16591034)
chr2 (45-148)||(3673122-3673225)
chr2 (48-130)||(3672773-3672855)
chr2 (84-210)||(30313170-30313295)
chr2 (124-210)||(38796298-38796384)
chr2 (93-210)||(30323456-30323573)
chr2 (94-209)||(33561501-33561616)
chr2 (93-191)||(29874072-29874170)
chr2 (45-194)||(9231257-9231406)
chr2 (145-210)||(36785664-36785729)
chr2 (48-140)||(6421688-6421780)
chr2 (94-210)||(29873587-29873703)
chr2 (84-195)||(37894732-37894843)
chr2 (97-186)||(28254165-28254254)
chr2 (76-149)||(36784292-36784365)
chr2 (94-209)||(33953821-33953936)
chr2 (90-160)||(31385779-31385849)
chr2 (98-138)||(35580494-35580534)
chr2 (95-194)||(12910236-12910335)
chr2 (45-112)||(31899103-31899170)
chr2 (154-192)||(6421314-6421352)
chr2 (42-132)||(8904498-8904587)
chr2 (90-148)||(25390314-25390372)
chr2 (84-133)||(22062834-22062883)
chr2 (84-133)||(28226406-28226455)
chr2 (95-148)||(41678419-41678471)
[»] chr1 (64 HSPs)
chr1 (45-195)||(44290825-44290976)
chr1 (45-195)||(44290459-44290609)
chr1 (45-192)||(3537600-3537747)
chr1 (45-194)||(14318875-14319024)
chr1 (47-195)||(17294584-17294733)
chr1 (42-210)||(41157367-41157535)
chr1 (45-195)||(41142379-41142530)
chr1 (52-210)||(34364917-34365075)
chr1 (45-210)||(41156983-41157148)
chr1 (53-195)||(37556118-37556260)
chr1 (45-195)||(26661523-26661673)
chr1 (45-195)||(41759490-41759640)
chr1 (48-195)||(3550727-3550871)
chr1 (47-195)||(48588491-48588639)
chr1 (52-210)||(34364499-34364657)
chr1 (45-195)||(50052025-50052174)
chr1 (52-195)||(40082414-40082556)
chr1 (48-210)||(66476-66638)
chr1 (45-195)||(5319966-5320116)
chr1 (45-195)||(11977287-11977437)
chr1 (69-195)||(32594741-32594867)
chr1 (45-210)||(31767162-31767327)
chr1 (46-210)||(3875333-3875497)
chr1 (60-195)||(38804371-38804506)
chr1 (45-195)||(29798206-29798356)
chr1 (45-195)||(34649445-34649595)
chr1 (45-195)||(9955914-9956066)
chr1 (67-195)||(26661921-26662049)
chr1 (51-209)||(24600321-24600479)
chr1 (45-210)||(37850601-37850766)
chr1 (45-209)||(22077496-22077660)
chr1 (45-175)||(32168699-32168823)
chr1 (45-195)||(45084389-45084533)
chr1 (45-190)||(45493975-45494124)
chr1 (53-195)||(37555737-37555878)
chr1 (108-210)||(41184489-41184591)
chr1 (61-210)||(39066217-39066366)
chr1 (52-192)||(5528762-5528902)
chr1 (45-179)||(22077111-22077245)
chr1 (46-195)||(22077831-22077979)
chr1 (123-195)||(3537226-3537298)
chr1 (52-210)||(5575098-5575252)
chr1 (82-168)||(44043810-44043896)
chr1 (93-186)||(66136-66230)
chr1 (45-131)||(11977015-11977101)
chr1 (50-195)||(22793285-22793431)
chr1 (50-195)||(24131994-24132136)
chr1 (121-210)||(21378118-21378207)
chr1 (54-194)||(45839635-45839779)
chr1 (94-209)||(44685449-44685564)
chr1 (96-195)||(30630690-30630789)
chr1 (84-209)||(1188628-1188753)
chr1 (61-209)||(19283472-19283620)
chr1 (75-175)||(4956218-4956320)
chr1 (45-132)||(50051690-50051776)
chr1 (136-209)||(4878796-4878869)
chr1 (90-147)||(35154049-35154106)
chr1 (125-210)||(35154127-35154205)
chr1 (45-103)||(21378060-21378118)
chr1 (84-160)||(10351202-10351278)
chr1 (108-148)||(41184152-41184192)
chr1 (94-131)||(47380217-47380254)
chr1 (84-120)||(12466365-12466401)
chr1 (89-121)||(25293630-25293662)
[»] chr5 (71 HSPs)
chr5 (45-195)||(40296316-40296466)
chr5 (45-195)||(41170641-41170791)
chr5 (45-195)||(6500458-6500607)
chr5 (45-210)||(15370091-15370256)
chr5 (48-195)||(18603124-18603271)
chr5 (60-209)||(13415776-13415925)
chr5 (43-195)||(36492216-36492368)
chr5 (45-195)||(25327942-25328092)
chr5 (45-195)||(32487401-32487550)
chr5 (45-214)||(3295346-3295513)
chr5 (45-195)||(42405599-42405747)
chr5 (45-195)||(6500830-6500979)
chr5 (45-210)||(11416978-11417141)
chr5 (45-195)||(27502037-27502187)
chr5 (45-189)||(3295016-3295160)
chr5 (48-192)||(34753029-34753173)
chr5 (45-209)||(41632775-41632939)
chr5 (45-195)||(6224203-6224353)
chr5 (45-195)||(9498656-9498805)
chr5 (45-210)||(12662653-12662818)
chr5 (48-195)||(624203-624350)
chr5 (84-195)||(26074619-26074730)
chr5 (45-195)||(299496-299646)
chr5 (45-195)||(1028518-1028668)
chr5 (37-176)||(15370428-15370567)
chr5 (43-190)||(33747783-33747930)
chr5 (45-195)||(35150014-35150163)
chr5 (84-209)||(26074186-26074311)
chr5 (51-195)||(26075168-26075313)
chr5 (45-209)||(36568570-36568732)
chr5 (45-195)||(623825-623975)
chr5 (52-195)||(38427555-38427697)
chr5 (42-195)||(24489204-24489355)
chr5 (79-195)||(29549290-29549406)
chr5 (81-195)||(26074818-26074933)
chr5 (64-195)||(5723811-5723942)
chr5 (45-194)||(35914857-35915006)
chr5 (107-195)||(42508619-42508707)
chr5 (76-191)||(300970-301077)
chr5 (52-165)||(26590918-26591031)
chr5 (95-195)||(2411014-2411114)
chr5 (75-195)||(36522268-36522388)
chr5 (45-116)||(26900018-26900089)
chr5 (94-195)||(36521946-36522047)
chr5 (45-194)||(35167839-35167988)
chr5 (84-133)||(13042608-13042657)
chr5 (122-195)||(26074325-26074398)
chr5 (66-118)||(795254-795306)
chr5 (127-195)||(7768857-7768925)
chr5 (45-115)||(38427306-38427376)
chr5 (42-194)||(41635189-41635341)
chr5 (90-133)||(13112606-13112649)
chr5 (107-210)||(31509615-31509718)
chr5 (45-130)||(13785633-13785718)
chr5 (84-133)||(36389016-36389065)
chr5 (121-194)||(39309692-39309764)
chr5 (88-120)||(5963765-5963797)
chr5 (60-100)||(24489583-24489623)
chr5 (84-144)||(32445943-32446003)
chr5 (107-195)||(42524724-42524811)
chr5 (64-131)||(9498343-9498410)
chr5 (93-188)||(19275543-19275637)
chr5 (88-131)||(34103625-34103668)
chr5 (84-122)||(13042784-13042822)
chr5 (84-122)||(13112782-13112820)
chr5 (48-112)||(5660340-5660405)
chr5 (84-177)||(13786041-13786133)
chr5 (84-145)||(36527135-36527196)
chr5 (88-133)||(41341524-41341569)
chr5 (142-194)||(6225052-6225104)
chr5 (167-195)||(13785732-13785760)
[»] chr3 (78 HSPs)
chr3 (45-195)||(35946529-35946679)
chr3 (46-195)||(43346793-43346942)
chr3 (45-195)||(22304576-22304726)
chr3 (45-210)||(42342389-42342554)
chr3 (45-195)||(37990640-37990790)
chr3 (37-195)||(37990970-37991128)
chr3 (45-210)||(29644903-29645068)
chr3 (45-209)||(33803253-33803417)
chr3 (45-210)||(12114563-12114728)
chr3 (46-195)||(15772861-15773010)
chr3 (45-210)||(25739426-25739591)
chr3 (61-195)||(52634683-52634816)
chr3 (45-210)||(32589696-32589860)
chr3 (45-195)||(29644582-29644732)
chr3 (61-195)||(39389077-39389211)
chr3 (47-195)||(32462903-32463052)
chr3 (52-193)||(39934963-39935104)
chr3 (45-210)||(54017817-54017982)
chr3 (45-183)||(41359766-41359904)
chr3 (45-195)||(54018199-54018349)
chr3 (46-210)||(42342092-42342256)
chr3 (70-196)||(3135099-3135225)
chr3 (50-210)||(15773184-15773346)
chr3 (52-195)||(22303963-22304099)
chr3 (45-210)||(53577356-53577521)
chr3 (45-209)||(8327897-8328065)
chr3 (45-195)||(21832346-21832494)
chr3 (45-195)||(25755401-25755551)
chr3 (47-144)||(22303662-22303759)
chr3 (45-210)||(31190009-31190166)
chr3 (45-216)||(3135455-3135633)
chr3 (47-210)||(45395656-45395819)
chr3 (61-195)||(4823662-4823796)
chr3 (52-195)||(49336694-49336838)
chr3 (55-210)||(39914244-39914399)
chr3 (49-192)||(42584829-42584970)
chr3 (45-217)||(53117976-53118147)
chr3 (45-195)||(45901720-45901871)
chr3 (45-195)||(50612448-50612603)
chr3 (45-195)||(1634316-1634466)
chr3 (45-195)||(37726511-37726653)
chr3 (49-195)||(32462563-32462710)
chr3 (45-128)||(41359492-41359575)
chr3 (45-192)||(44160548-44160692)
chr3 (45-195)||(11661958-11662108)
chr3 (51-209)||(9240142-9240300)
chr3 (78-176)||(33362327-33362425)
chr3 (118-195)||(51886568-51886645)
chr3 (132-195)||(11661542-11661605)
chr3 (94-195)||(33175711-33175815)
chr3 (84-209)||(47964558-47964683)
chr3 (84-209)||(47964955-47965080)
chr3 (95-195)||(3384317-3384417)
chr3 (110-194)||(7767380-7767464)
chr3 (45-132)||(54017549-54017636)
chr3 (86-160)||(46546367-46546441)
chr3 (92-149)||(52634993-52635050)
chr3 (89-133)||(17731949-17731993)
chr3 (89-133)||(19033180-19033224)
chr3 (151-195)||(22304253-22304297)
chr3 (146-210)||(43346642-43346706)
chr3 (76-123)||(39336002-39336049)
chr3 (84-133)||(53596029-53596078)
chr3 (84-133)||(53596344-53596393)
chr3 (45-93)||(22304302-22304350)
chr3 (95-195)||(39336280-39336380)
chr3 (45-98)||(8328374-8328427)
chr3 (88-133)||(16871003-16871048)
chr3 (88-133)||(17735035-17735080)
chr3 (88-133)||(19036304-19036349)
chr3 (84-133)||(53596544-53596593)
chr3 (84-119)||(11661603-11661638)
chr3 (93-160)||(12749211-12749278)
chr3 (88-131)||(16869841-16869884)
chr3 (92-195)||(25991410-25991513)
chr3 (90-133)||(48127861-48127904)
chr3 (89-133)||(16143507-16143551)
chr3 (88-132)||(16868427-16868471)
[»] chr8 (72 HSPs)
chr8 (45-195)||(3669694-3669844)
chr8 (48-195)||(3670067-3670214)
chr8 (51-195)||(30441088-30441236)
chr8 (46-195)||(3038292-3038441)
chr8 (43-194)||(33113366-33113517)
chr8 (45-195)||(34835216-34835366)
chr8 (48-180)||(9483191-9483323)
chr8 (52-195)||(34834883-34835026)
chr8 (47-196)||(70277-70426)
chr8 (48-196)||(9482608-9482756)
chr8 (48-192)||(18371998-18372142)
chr8 (52-195)||(30359278-30359421)
chr8 (45-210)||(6876863-6877029)
chr8 (46-195)||(40518589-40518738)
chr8 (54-195)||(45122067-45122208)
chr8 (63-195)||(147458-147590)
chr8 (49-209)||(9608738-9608898)
chr8 (46-189)||(20870575-20870718)
chr8 (45-195)||(37544491-37544641)
chr8 (45-177)||(45122649-45122781)
chr8 (52-195)||(1014253-1014396)
chr8 (45-195)||(34835481-34835632)
chr8 (45-195)||(34835747-34835898)
chr8 (45-194)||(1513916-1514065)
chr8 (45-195)||(40518076-40518228)
chr8 (52-195)||(1013879-1014022)
chr8 (45-210)||(9309347-9309511)
chr8 (45-195)||(25561816-25561967)
chr8 (37-195)||(40579499-40579657)
chr8 (54-210)||(147821-147968)
chr8 (46-190)||(5420663-5420807)
chr8 (45-141)||(5915928-5916024)
chr8 (48-196)||(18371665-18371808)
chr8 (45-195)||(18380020-18380168)
chr8 (48-195)||(30359616-30359763)
chr8 (47-209)||(41972151-41972316)
chr8 (45-195)||(45121911-45122061)
chr8 (45-210)||(8918765-8918930)
chr8 (45-196)||(6651509-6651651)
chr8 (52-195)||(6731911-6732045)
chr8 (45-176)||(32305503-32305634)
chr8 (45-209)||(9308970-9309138)
chr8 (45-195)||(45123013-45123163)
chr8 (51-185)||(45121663-45121797)
chr8 (54-195)||(32640542-32640678)
chr8 (90-195)||(43274825-43274930)
chr8 (65-165)||(9609122-9609222)
chr8 (45-127)||(40579270-40579352)
chr8 (124-196)||(41416251-41416323)
chr8 (84-195)||(8794118-8794229)
chr8 (94-195)||(18372656-18372753)
chr8 (93-165)||(9507819-9507891)
chr8 (98-195)||(18372988-18373082)
chr8 (130-195)||(18372785-18372850)
chr8 (93-209)||(4154715-4154831)
chr8 (45-120)||(8919145-8919220)
chr8 (53-195)||(43398077-43398222)
chr8 (137-195)||(18372349-18372407)
chr8 (112-189)||(3037776-3037853)
chr8 (136-192)||(25561736-25561792)
chr8 (53-192)||(12283883-12284021)
chr8 (45-124)||(41129066-41129145)
chr8 (84-210)||(4154321-4154446)
chr8 (97-195)||(20130456-20130553)
chr8 (88-131)||(12156702-12156745)
chr8 (158-195)||(18372485-18372522)
chr8 (84-125)||(20995456-20995497)
chr8 (110-166)||(18373236-18373292)
chr8 (45-108)||(43274636-43274699)
chr8 (107-209)||(9620739-9620841)
chr8 (76-121)||(16524446-16524491)
chr8 (103-160)||(40991795-40991852)
[»] scaffold0702 (2 HSPs)
scaffold0702 (45-195)||(515-665)
scaffold0702 (45-195)||(148-293)
[»] scaffold0734 (2 HSPs)
scaffold0734 (53-210)||(5388-5546)
scaffold0734 (67-210)||(5769-5917)
[»] scaffold0391 (3 HSPs)
scaffold0391 (48-195)||(1110-1257)
scaffold0391 (84-155)||(1731-1802)
scaffold0391 (150-210)||(3091-3151)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (82-210)||(5349-5477)
scaffold0078 (51-210)||(4974-5133)
[»] scaffold0027 (1 HSPs)
scaffold0027 (45-195)||(47367-47517)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (90-210)||(17500-17622)
[»] scaffold0504 (1 HSPs)
scaffold0504 (125-195)||(10192-10262)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 60)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 13 - 241
Target Start/End: Original strand, 36939702 - 36939930
Alignment:
Q  13 aatattctgctaggtcattgaagtgagcatgagggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaacc 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  || ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36939702 aatattctgctaggtcattgaagggagcatggggacccatccacatcgaggctagaacaaccgcataagcaagagaaacaccacacttttacccaaaacc 36939801  T
Q  113 ttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcactaatgcacacaacaaga 212  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||| |||||      
T  36939802 ttaaggcaatggatttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacttttactattttatacgatttgggacatataactcacacttgcacagaacaacg 36939901  T
Q  213 tattcgaattctgacttatagatatatct 241  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36939902 tattcgaattatgacttatagatatatct 36939930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 45 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 11845348 - 11845197
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  11845348 gggaccgtctacatcgaggctagaacaactgcacaagcaagagagacaccacactcttatccaaaaccttaaggcaatggatttatgggtcctcttactt 11845249  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcact 196  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  11845248 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggaacatataactcact 11845197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 45 - 210
Target Start/End: Original strand, 23378 - 23543
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  23378 gggaccgtccaaatcgaggctagaacaaccgcacatgcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatgggtcctcttactt 23477  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcactaatgcacacaacaa 210  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  23478 ataaggtgttcaacctttactattgtatccgatgtggaacatataactcacaattgcacacaacaa 23543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 45 - 210
Target Start/End: Original strand, 1085617 - 1085782
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1085617 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagtaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 1085716  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcactaatgcacacaacaa 210  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  1085717 ataaagtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaa 1085782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 45 - 195
Target Start/End: Original strand, 37533012 - 37533161
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  37533012 gggaccgtccacatcgaggttagaacaagcgcacaagcaagagagacaccacact-ttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttactt 37533110  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  37533111 ataaggtgttcaacctttactattttatccaatgtgggacatataactcac 37533161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 45 - 195
Target Start/End: Original strand, 37533365 - 37533515
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  37533365 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggatttatgggtcctcttactt 37533464  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| | || | | |||||||||||||    
T  37533465 ataaggtgttcaacctttactattttattcaatgtagaacatataactcac 37533515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 53 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 7517729 - 7517572
Alignment:
Q  53 ccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatg 152  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  7517729 ccacatcgaggctagaacaaccacacaagtgagacagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtg 7517630  T
Q  153 ttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcactaatgcacacaacaa 210  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  7517629 ttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaa 7517572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 47 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 29157720 - 29157572
Alignment:
Q  47 gaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttat 146  Q
    ||||||||||||  || ||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||    
T  29157720 gaccgtccacatcaagactagagcaactacacgagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggatttatgggtcgtcttacttat 29157621  T
Q  147 aagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  29157620 aaggtgttcaacctttactattttatccggtgtgggacatataactcac 29157572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 76 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 7554151 - 7554017
Alignment:
Q  76 cacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccg 175  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7554151 cacaagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttatggatcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccg 7554052  T
Q  176 atttgggacatataactcactaatgcacacaacaa 210  Q
    || |||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  7554051 atgtgggacatataactcacacttgcacacaacaa 7554017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 45 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 30244427 - 30244277
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||||||  ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  30244427 gggaccatccacatcgaggcttgaacaaccacacaagtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttactt 30244328  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||||| | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30244327 ataaggtcttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcac 30244277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 45 - 210
Target Start/End: Original strand, 40094775 - 40094940
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  40094775 gggaccgaccacatcgaggctagaacaacctcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaagacgatgggtttatgggtcctcttactt 40094874  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcactaatgcacacaacaa 210  Q
    ||||| |||| |||||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||   ||||||||||||    
T  40094875 ataaggtgttgaacctttactcttttattcgatgtgagacatataactcacacttgcacacaacaa 40094940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 45 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 6054717 - 6054570
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||   ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  6054717 gggaccgtccacatcaaggctagaacaaccatacaagtaggagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgtgtttatgggtcctcttactt 6054618  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataact 192  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  6054617 ataaggtgttcaacatttactattttatccgatgtgagacatataact 6054570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 45 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 45433398 - 45433227
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |  |||||||||    
T  45433398 gggaccgaccacatcgaggctagaacaaccccacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaataggtttatgagttctcttactt 45433299  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcactaatgcacacaacaagatatt 216  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||   || ||||||||| |||||    
T  45433298 ataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtggatcatataactcacacttgtacacaacaacatatt 45433227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 45 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 45434793 - 45434646
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||    
T  45434793 gggaccgatcacatcgaggctagaacaactccacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaaggcagtaagtttatgggtcctcttactt 45434694  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataact 192  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  45434693 ataaggtgttcaacctttacttttttatccgatgtgggacatataact 45434646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 45 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 47129252 - 47129102
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  |||  |  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||    
T  47129252 gggaccgtctacattgaggctagaacaaccacacttgtgagagagacaccacactcctacccaaaaccttaaagcgatgggtttatgggtcctcttactt 47129153  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  47129152 ataagaggttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcac 47129102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 45 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 24177592 - 24177443
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    |||||||||||| | |||||||  ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  24177592 gggaccgtccacgtcgaggctaagacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttaccaaaaactttaaggcaatgggtttatgggtccgcttactt 24177493  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactca 194  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24177492 ataaggtgttcagcctttactcttttatccgatgtgggacatataactca 24177443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 54 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 19122879 - 19122740
Alignment:
Q  54 cacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgt 153  Q
    ||||| ||| ||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||    
T  19122879 cacatcgagactagaacaaccacacaagcaagatagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggatttatgagtcctcttacttataaggtgt 19122780  T
Q  154 tcaacctttactattttatccgatttgggacatataactca 194  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  19122779 tcaacctttactattttatccgatgt-ggacatataactca 19122740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 45 - 195
Target Start/End: Original strand, 22567040 - 22567189
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    |||||| ||||||| |||||  |||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  22567040 gggaccatccacatcgaggcccgaacaaccccacaagcaagagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttactt 22567139  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  22567140 ataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgt-ggacatattactcac 22567189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 46 - 195
Target Start/End: Original strand, 34218036 - 34218185
Alignment:
Q  46 ggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactta 145  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||   |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||    
T  34218036 ggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcactta 34218135  T
Q  146 taagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    |||| |||||||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  34218136 taaggtgttcaacatttacttttttatccgatgtgagacatataactcac 34218185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 45 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 30245230 - 30245084
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||||||  ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  30245230 gggaccatccacatcgaggcttgaacaac--caca--caagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcgtcttactt 30245135  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  30245134 ataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtggaacatataactcac 30245084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 55 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 45754862 - 45754723
Alignment:
Q  55 acattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgtt 154  Q
    |||| |||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||||||| ||||    
T  45754862 acatcgaggcttgaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttatgagtcatcttacttataaggtgtt 45754763  T
Q  155 caacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    |||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  45754762 caacatttactattttatccgatgt-ggacatataactcac 45754723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 85 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 14681627 - 14681520
Alignment:
Q  85 gagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggac 184  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  14681627 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggccctcttacttacaaggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggac 14681528  T
Q  185 atataact 192  Q
    ||||||||    
T  14681527 atataact 14681520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 93 - 195
Target Start/End: Original strand, 22566711 - 22566813
Alignment:
Q  93 ccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataact 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||    
T  22566711 ccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatattact 22566810  T
Q  193 cac 195  Q
    |||    
T  22566811 cac 22566813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 46 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 9901799 - 9901652
Alignment:
Q  46 ggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactta 145  Q
    |||| |||||||  |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||| ||| ||    
T  9901799 ggacagtccacaccgaggctagaacaaccgcactagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgagtttatggatcctc-tacgta 9901701  T
Q  146 taagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  9901700 taagatgttcaacctttactgttttatccgatgt-ggacatataactcac 9901652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 48 - 192
Target Start/End: Original strand, 40230295 - 40230439
Alignment:
Q  48 accgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttata 147  Q
    ||||||||||| |||| ||||| |||| |||  |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||    
T  40230295 accgtccacatagaggttagaataactacacttgcaagagagacaccagacttttacccaaaaccttaagactatgggtttatgggtcctcttacttata 40230394  T
Q  148 agatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataact 192  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||||||||    
T  40230395 agatgttcaacttttacttttttattcgatgtgggacatataact 40230439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 76 - 187
Target Start/End: Original strand, 1085280 - 1085391
Alignment:
Q  76 cacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccg 175  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  1085280 cacaaggaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttacttatgagttgttcaacttttactattttatccg 1085379  T
Q  176 atttgggacata 187  Q
    || |||||||||    
T  1085380 atatgggacata 1085391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 45 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 30032724 - 30032574
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||   |||||||||    
T  30032724 gggaccgtccacatcgaggatagaacaaccgcacaagcaagagagatgtcacactcttacccaaaaccttaaggctataggtttatggatactcttactt 30032625  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||||| ||||||||  ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||    
T  30032624 ataaggtgttcaacacttactcttttattcgatgtgggacatataactcac 30032574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 44 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 36623118 - 36622967
Alignment:
Q  44 agggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttact 143  Q
    |||||||||||||||  |||  |||||||   |||||| ||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||    
T  36623118 agggaccgtccacatcaaggtcagaacaatcacacaagtaagagaggcaccatactcctacccaaaaccttaaggcaatggatttatggatcctcctact 36623019  T
Q  144 tataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36623018 tataaaatgtttaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcac 36622967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 82 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 16569316 - 16569203
Alignment:
Q  82 caagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatttgg 181  Q
    ||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| || |||||||| ||     
T  16569316 caagagagacaccgcactcttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtattcaacctttactgttctatccgatgtga 16569217  T
Q  182 gacatataactcac 195  Q
    ||||||||||||||    
T  16569216 gacatataactcac 16569203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 82 - 195
Target Start/End: Original strand, 16596346 - 16596459
Alignment:
Q  82 caagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatttgg 181  Q
    ||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| || |||||||| ||     
T  16596346 caagagagacaccgcactcttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtattcaacctttactgttctatccgatgtga 16596445  T
Q  182 gacatataactcac 195  Q
    ||||||||||||||    
T  16596446 gacatataactcac 16596459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 45 - 210
Target Start/End: Original strand, 118300 - 118467
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacac--cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttac 142  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||||  ||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||    
T  118300 gggaccgtccacatcaaagctagaacaaccacacaagcaagagatagacgccacactcttacccaaaaccttacggtaatgggtttatggatcctcttac 118399  T
Q  143 ttataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcactaatgcacacaacaa 210  Q
    |||| || ||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||| ||   ||||||||||||    
T  118400 ttattaggtgttcaacctttacttttctatctgatgtgggacatataacttacacttgcacacaacaa 118467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 45 - 209
Target Start/End: Original strand, 8128442 - 8128606
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    ||||| || ||||| || |||||||||||  || |||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |    
T  8128442 gggactgttcacatcgatgctagaacaaccacataagcgagagtgacaccacactcttaaccaaaaccttaaggttatgggtttatgggtcctcttacat 8128541  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcactaatgcacacaaca 209  Q
    ||||| ||||||||||||| | || |||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||    
T  8128542 ataaggtgttcaacctttatttttctatccgatatgggacatataactcacacttgcacacaaca 8128606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 46 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 37167937 - 37167840
Alignment:
Q  46 ggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttact 143  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||  |||||||||    
T  37167937 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaactttaagtcaatggatttatggatcctcttact 37167840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 45 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 41854791 - 41854643
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||| |   ||||| || | |||| |||    
T  41854791 gggaccgtctacattgaggctagaacaaccgcacaagtaagaaagacgtcacactcttacccaaaaccttaaggcattatatttataggtcatcttgctt 41854692  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactca 194  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  41854691 ataaggtgttcaacctttactctttta-ctgatgtgggacatataactca 41854643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 67 - 192
Target Start/End: Original strand, 24838724 - 24838850
Alignment:
Q  67 gaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgg-gccctcttacttataagatgttcaacctttact 165  Q
    |||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24838724 gaacaaccacacaagcaagagagacgtcacactcttacccaaaaccttaagacaacgggtttatggatccttcttacttataaggtgttcaacctttact 24838823  T
Q  166 attttatccgatttgggacatataact 192  Q
     |||||| |||| || |||||||||||    
T  24838824 cttttattcgatgtgagacatataact 24838850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 45 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 47129526 - 47129450
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 121  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47129526 gggaccgtccacatcgaggctagatcaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 47129450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 77 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 20599441 - 20599321
Alignment:
Q  77 acaagcaagagaaacaccacactct--tacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacctttactattttatcc 174  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||  | ||||||| ||||||  |||| | |||||||| ||||||||    
T  20599441 acaagcaagagagacaccacactctcttacccaaaacgttaaggcaatgagtttatatgtcctcttatttataaagtgtttatcctttacttttttatcc 20599342  T
Q  175 gatttgggacatataactcac 195  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  20599341 gatatgggacatataactcac 20599321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 45 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 30253645 - 30253534
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||||||  ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  30253645 gggaccatccacatcgaggcttgaacaac--caca--caagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttactt 30253550  T
Q  145 ataagatgttcaacct 160  Q
    ||||| | ||||||||    
T  30253549 ataaggtcttcaacct 30253534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 93 - 190
Target Start/End: Original strand, 36534833 - 36534930
Alignment:
Q  93 ccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataa 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  36534833 ccacactcttacccaaaaccttaagactttaggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctctactgttttatccgaggtgggacatataa 36534930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 129 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 30245567 - 30245486
Alignment:
Q  129 atgggccctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcactaatgcacacaacaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  30245567 atgggccctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatctgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaa 30245486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 129 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 30255412 - 30255331
Alignment:
Q  129 atgggccctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcactaatgcacacaacaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||   ||||||||||||    
T  30255412 atgggccctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataacgcacacttgcacacaacaa 30255331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 81 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 43241616 - 43241487
Alignment:
Q  81 gcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatttg 180  Q
    |||||||| ||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||  ||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||    
T  43241616 gcaagagagacatcatacttttacctaaaaccttaagtcaataagtttatgagtccttttacttataaggtgttcaacctttatttttttatccgatgtg 43241517  T
Q  181 ggacatataactcactaatgcacacaacaa 210  Q
    | |||||||||||||   ||||||||||||    
T  43241516 gaacatataactcacacttgcacacaacaa 43241487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 46 - 114
Target Start/End: Original strand, 37532753 - 37532821
Alignment:
Q  46 ggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaacctt 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37532753 ggaccgtccacatcgaggctagaacaacagcacaagctagagagacaccacactcttacccaaaacctt 37532821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 107 - 195
Target Start/End: Original strand, 41910657 - 41910745
Alignment:
Q  107 aaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41910657 aaaatcttaagccaatgggtttatgggtcctctcagttataaggtattcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcac 41910745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 46 - 156
Target Start/End: Original strand, 28300255 - 28300366
Alignment:
Q  46 ggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat-gggccctcttactt 144  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||  |||  |||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||||    
T  28300255 ggaccgtccacatcgaggcccgaacaaccacacttgcaagagagacgccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggtttatggggttctcttactt 28300354  T
Q  145 ataagatgttca 156  Q
    ||||| ||||||    
T  28300355 ataaggtgttca 28300366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 114 - 209
Target Start/End: Original strand, 28301613 - 28301708
Alignment:
Q  114 taaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcactaatgcacacaaca 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | |||||| || |||||||| || ||||||||||||||   |||||||||||    
T  28301613 taaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcagcttttacttttctatccgatgtgagacatataactcacacttgcacacaaca 28301708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 44 - 119
Target Start/End: Original strand, 28300568 - 28300644
Alignment:
Q  44 agggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactctta-cccaaaaccttaaggc 119  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28300568 agggatcgtccacatcgaggctagaataaccacacaagcaagagagacaccacactcttaccccaaaaccttaaggc 28300644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 135 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 30244768 - 30244693
Alignment:
Q  135 cctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcactaatgcacacaacaa 210  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  30244768 cctcttatttataaggtgttcaacctttactcttttatccaatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaa 30244693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 135 - 210
Target Start/End: Original strand, 36109008 - 36109083
Alignment:
Q  135 cctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcactaatgcacacaacaa 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||   ||||||||||||    
T  36109008 cctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgagaaatataactcacacttgcacacaacaa 36109083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 135
Target Start/End: Original strand, 23569043 - 23569093
Alignment:
Q  85 gagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggcc 135  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23569043 gagagacatcacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggcc 23569093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 84 - 133
Target Start/End: Original strand, 21416181 - 21416230
Alignment:
Q  84 agagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 133  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21416181 agagagacaccacactcttacccaaaaccctaaggcaatgggtttatggg 21416230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 195
Target Start/End: Original strand, 44361517 - 44361614
Alignment:
Q  97 actcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||  | ||||||||| ||| |||||||| |||||| ||||||||||| || |||||||| |||||    
T  44361517 actcttacctaaaaccgtaaggttatgggtttatggatcatcttactta-aaggtgttcaacttttactcttttatccgatgtgagacatatatctcac 44361614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 37 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 30245320 - 30245256
Alignment:
Q  37 gagcatgagggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactct 101  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||  ||||| ||||||||||||    
T  30245320 gagcatgggggaccgtccacattgaggcttgaacaaccacacaagtgagagagacaccacactct 30245256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 90 - 133
Target Start/End: Original strand, 21619091 - 21619134
Alignment:
Q  90 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 133  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21619091 acaccacacttttacccaaaaccttaagacaatgggtttatggg 21619134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 88 - 133
Target Start/End: Original strand, 27391813 - 27391858
Alignment:
Q  88 aaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 133  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  27391813 aaacaccacactcttacctaaaaccttaaggcagtggatttatggg 27391858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 148
Target Start/End: Original strand, 4124128 - 4124192
Alignment:
Q  84 agagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataa 148  Q
    ||||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||| || ||||| ||||||||    
T  4124128 agagagacaccacacttttatccaaaaccttaatgcaatgagtttattggtcctctcacttataa 4124192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 30244517 - 30244453
Alignment:
Q  37 gagcatgagggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactct 101  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||  ||||| ||||||||||||    
T  30244517 gagcctgagggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccacacaagtgagagagacaccacactct 30244453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 60 - 107
Target Start/End: Original strand, 4719312 - 4719359
Alignment:
Q  60 gaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttaccca 107  Q
    ||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  4719312 gaggctagagcaaccgcacaaacaagagaaataccacactcttaccca 4719359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 37346026 - 37345960
Alignment:
Q  94 cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacct 160  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||| | ||| |||||||| ||||| |||||    
T  37346026 cacactcttactcaaaactttaaggcaatatgtttatgggtcttctcacttataaaatgtttaacct 37345960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 152 - 209
Target Start/End: Original strand, 40094502 - 40094559
Alignment:
Q  152 gttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcactaatgcacacaaca 209  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||   |||||||||||    
T  40094502 gttcaacctttactcttttatctgatgttggacatataactcacacttgcacacaaca 40094559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 124; Significance: 7e-64; HSPs: 86)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 43 - 210
Target Start/End: Original strand, 1731644 - 1731811
Alignment:
Q  43 gagggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttac 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||     
T  1731644 gagggaccgtccacattgaggctagaacaaccacacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaattggtttatgggtcctcttat 1731743  T
Q  143 ttataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcactaatgcacacaacaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  1731744 ttataagatgttcaacctttactgttttatctgatgtgggacatataactcacatttgcacacaacaa 1731811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 47 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 25483491 - 25483328
Alignment:
Q  47 gaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttat 146  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  25483491 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggatcctcttacttat 25483392  T
Q  147 aagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcactaatgcacacaacaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||   ||||||||||||    
T  25483391 aagatgttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacacttgcacacaacaa 25483328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 25 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 36629414 - 36629244
Alignment:
Q  25 ggtcattgaagtgagcatgagggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgg 124  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  36629414 ggtcattgaggggagcatgtgggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatga 36629315  T
Q  125 gtttatgggccctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  36629314 gtttatgggtcctcttacttataaggtgtttaacttttacttttctatccgatgtgggacatataactcac 36629244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 45 - 195
Target Start/End: Original strand, 55933123 - 55933273
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  55933123 gggaccgtccacatcgaggctagaacaactgtacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaactttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 55933222  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  55933223 ataaggtgttcaacccttactattttatccgatgtaggacatataactcac 55933273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 46 - 195
Target Start/End: Original strand, 50630755 - 50630904
Alignment:
Q  46 ggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactta 145  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  50630755 ggaccgcccacatcgaggctaaaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta 50630854  T
Q  146 taagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  50630855 taatgtgttcaacctttactattttatccgatgtaggacatataactcac 50630904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 45 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 41370514 - 41370364
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41370514 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacactacactcttacccaaaactttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 41370415  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41370414 ataaggttttcaacatttactattttatccgatttgggacatataactcac 41370364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 45 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 44621159 - 44621011
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  44621159 gggaccgtccacatcgaggctagaataaccgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgagtttatgtgccctcttactt 44621060  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactc 193  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||    
T  44621059 ataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtgggtcatacaactc 44621011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 47 - 195
Target Start/End: Original strand, 54017596 - 54017744
Alignment:
Q  47 gaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttat 146  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  || |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  54017596 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccacataagcaagagagacatcacactcttacctaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttat 54017695  T
Q  147 aagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  54017696 aagatgttcaacctttactattttatctgacgtgggacatataactcac 54017744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 45 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 44620510 - 44620362
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  44620510 gggaccgtccacatcaaggttagaacaaccacacaagcaagagaaacatcacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggctctcttattt 44620411  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactc 193  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  44620410 ataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtggaacatataactc 44620362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 54 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 54109060 - 54108928
Alignment:
Q  54 cacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgt 153  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  54109060 cacatcgaagctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaac-ttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgt 54108962  T
Q  154 tcaacctttactattttatccgatttgggacata 187  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  54108961 tcaacctttactattttatccgatgtgggacata 54108928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 27 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 20826011 - 20825843
Alignment:
Q  27 tcattgaagtgagcatgagggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggt 126  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  20826011 tcattgaagggagcatgggggactgtccacatcaaggctagaacaaccgcataaggaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggctaaaggt 20825912  T
Q  127 ttatgggccctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    |||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  20825911 ttatgggtgctcttatttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtggaacatataactcac 20825843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 54 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 52884844 - 52884688
Alignment:
Q  54 cacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttaccc-aaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatg 152  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||| ||    
T  52884844 cacatcgaggctagatcaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttaccccaaaaccttaaggcaatgggtttatcgatcatcttacttataaggtg 52884745  T
Q  153 ttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcactaatgcacacaaca 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||    
T  52884744 ttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaaca 52884688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 45 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 50002583 - 50002433
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  50002583 gggaccgcccacatcgaggctagaacaaccgcacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatggatttatgggtcctcttactt 50002484  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    | ||  ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  50002483 aaaaagtgttcaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcac 50002433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 61 - 210
Target Start/End: Original strand, 4955332 - 4955481
Alignment:
Q  61 aggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacct 160  Q
    |||||||| |||| ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  4955332 aggctagagcaaccgcacaagtaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacct 4955431  T
Q  161 ttactattttatccgatttgggacatataactcactaatgcacacaacaa 210  Q
    | ||||||||||||||| || ||||||||||||||   ||||||||||||    
T  4955432 taactattttatccgatatgagacatataactcacacttgcacacaacaa 4955481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 42 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 50459881 - 50459728
Alignment:
Q  42 tgagggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctctta 141  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||| | |||||||    
T  50459881 tgagggaccgtgcacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacgctcttacctaaaaccttaagataatgggtttatgagtcctctta 50459782  T
Q  142 cttataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||    
T  50459781 cttataagatgttcaacctttactcttttaaccgatgtggaacatataactcac 50459728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 47 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 3340962 - 3340814
Alignment:
Q  47 gaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttat 146  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  3340962 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccccacaagcaagaaagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcagtgggtttatgggtcctcttacttat 3340863  T
Q  147 aagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||| || |||||||||||| ||| ||| |||  ||||||||||||||||    
T  3340862 aaggtgctcaacctttactctttcatctgatgcgggacatataactcac 3340814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 45 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 39404555 - 39404405
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||    
T  39404555 gggaccgttcacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacattcttgcccaaaaccttaaggctataggtttatgggtcctcttactt 39404456  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  39404455 ataaggtgttccacctttactcttttatctgatgtgggacatataactcac 39404405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 45 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 10246076 - 10245912
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||    
T  10246076 gggagcgtccacatcgaggctagaacaaccagacaagcaagggagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctttgggtttat-ggtcctcttactt 10245978  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcactaatgcacacaacaa 210  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||   ||||||||||||    
T  10245977 ataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtggggcatataactcacacttgcacacaacaa 10245912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 45 - 210
Target Start/End: Original strand, 22183263 - 22183428
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| | |||||  ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  22183263 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgtacaagtgagagagacgccacactcttatccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtccttttactt 22183362  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcactaatgcacacaacaa 210  Q
    ||||  |||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||   ||||||||||||    
T  22183363 ataaattgttcaacatttactcttttatccgatgtgggatatataactcacacttgcacacaacaa 22183428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 46 - 195
Target Start/End: Original strand, 39792860 - 39793009
Alignment:
Q  46 ggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactta 145  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||| ||||    
T  39792860 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttacggttcctctttctta 39792959  T
Q  146 taagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    |||| |||||||| |||||| || |||| ||| |||||||||||||||||    
T  39792960 taaggtgttcaacatttacttttctatctgatgtgggacatataactcac 39793009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 45 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 49303063 - 49302911
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttac-- 142  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||  ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||      
T  49303063 gggatcgtccacatcgaggatagaacaatcgcataagtaagagatacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 49302964  T
Q  143 ttataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  49302963 ttataagatgttcaacctttacttttttatttgatgtgggacatataactcac 49302911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 44620816 - 44620654
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    |||||||||||||| |||| || |||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||    
T  44620816 gggaccgtccacatcgaggatataacaaccgcacaagcaagagagaaaccacactcttacccaaaaccttaaggttat-ggtttatgggtcctcttactt 44620718  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcactaatgcacacaac 208  Q
    ||||  |||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||    
T  44620717 ataaagtgttcaacctctactatttcatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaac 44620654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 45 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 36572176 - 36572026
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    |||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||    
T  36572176 gggaccgttcacatcgaggcttgaacaaccgcacaagcgagagagacaccatactctaacccaaaaccttaaggcaatggatttatgggtcttcttactt 36572077  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||    
T  36572076 ataaggtgttcaacatttactcttttattcgatgtgggacatataactcac 36572026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 37 - 210
Target Start/End: Original strand, 22027952 - 22028125
Alignment:
Q  37 gagcatgagggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccc 136  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||| ||| ||||||  || |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  22027952 gagcctgagggactgtccacatcgagactaaaacaaccacataagcgagagagacaccacattcttacccaaaaccttaaggcaatatgtttatgggtcc 22028051  T
Q  137 tcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcactaatgcacacaacaa 210  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||   ||||||||||||    
T  22028052 tcttacttataaggtgttcaacctttcgtattttatccgatgtgggacatataagtcacacttgcacacaacaa 22028125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 45 - 210
Target Start/End: Original strand, 36608660 - 36608825
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||    
T  36608660 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacactagtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatggatttatggatcctcttactt 36608759  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcactaatgcacacaacaa 210  Q
    || || |||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||   ||||||||||||    
T  36608760 atgaggtgttcaacttttactcttttatccgatgttggacatataactcacacttgcacacaacaa 36608825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 45 - 192
Target Start/End: Original strand, 54343007 - 54343147
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||| ||||||||||    
T  54343007 gggaccatccacatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatg-------gggtcctcttactt 54343099  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataact 192  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  54343100 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataact 54343147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 45 - 190
Target Start/End: Original strand, 22028368 - 22028515
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||     
T  22028368 gggaccgtccacattgaggctagaacaacctcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacattaagacaatgagtttatgggtcctcttacta 22028467  T
Q  145 ataagatgttcaaccttta--ctattttatccgatttgggacatataa 190  Q
    ||||| |||||||||||||   | ||||||||||| | ||||||||||    
T  22028468 ataaggtgttcaacctttatttttttttatccgatgtaggacatataa 22028515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 51 - 195
Target Start/End: Original strand, 32941128 - 32941272
Alignment:
Q  51 gtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataaga 150  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||     
T  32941128 gtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgtcacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgagccctcttatttataagg 32941227  T
Q  151 tgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||||||||||||||| || | |||||| |  ||||||||||||||    
T  32941228 tgttcaacctttactgttctttccgatgtaagacatataactcac 32941272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 43 - 195
Target Start/End: Original strand, 34646646 - 34646798
Alignment:
Q  43 gagggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttac 142  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||  ||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||     
T  34646646 gagggaccgtccacaacaaggctagaacaaccacacagaccagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgagtcctcttag 34646745  T
Q  143 ttataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34646746 ttataaggtgttcaacatttactgttttatccgatgtgggacatataactcac 34646798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Original strand, 49076830 - 49076992
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||| |    
T  49076830 gggacagtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagaaagacaccacactctaacccaaaaccttaaggttatgggtttatgggttctcttac-t 49076928  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcactaatgcacacaac 208  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||   ||||||||||    
T  49076929 ataaggtgttcaacctttactattttagccaatatggaacatataactcacacttgcacacaac 49076992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 84 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 52885006 - 52884879
Alignment:
Q  84 agagaaacaccacactcttaccc-aaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatttggg 182  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  52885006 agagagacaccacattcttaccccaaaaccttaaggcaatgggtttatggatcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggg 52884907  T
Q  183 acatataactcactaatgcacacaacaa 210  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||    
T  52884906 acatataactcacacttgcacacaacaa 52884879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 45 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 39404175 - 39404025
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| | ||||||||||    
T  39404175 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaatgctatgagtttatgagtcctcttactt 39404076  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||||| | || | |||||||||||||||    
T  39404075 ataaagtgttcaacctttactcttttattcaatgtaggacatataactcac 39404025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 82 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 49880280 - 49880167
Alignment:
Q  82 caagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatttgg 181  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | || |||    
T  49880280 caagagagacaccacgctcttacccaaaaccttaaggcagtgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttattcaatgtgg 49880181  T
Q  182 gacatataactcac 195  Q
    ||||||||||||||    
T  49880180 gacatataactcac 49880167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 45 - 177
Target Start/End: Original strand, 18932748 - 18932880
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    |||||||| ||||| ||||||| ||||||  | |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  18932748 gggaccgtacacatcgaggctataacaaccactcaagtaagagagacaccacactcttacctaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttattt 18932847  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgat 177  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  18932848 ataaggtattcaacctttactattttatccgat 18932880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 45 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 54936352 - 54936215
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcaca-agcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttact 143  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||  |||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  54936352 gggactgtccacatcgaggctagaacaac--cacatagtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 54936255  T
Q  144 tataagatgttcaacctttactattttatccgatttggga 183  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  54936254 tacaaggtgttcaacctttactattttatctgatgtggga 54936215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 47 - 210
Target Start/End: Original strand, 4390102 - 4390265
Alignment:
Q  47 gaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttat 146  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||| | | | ||  ||||||||||||    
T  4390102 gaccgtccgcatcgaggctagaacaactgcacaagcaagagagacgtcacactcttacccaaaaccttaacgcaatgtgctaaaggatcctcttacttat 4390201  T
Q  147 aagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcactaatgcacacaacaa 210  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| || ||||||||   ||||||||||||    
T  4390202 aaggtgttcaacctttactcttttatctgatgtgggatatgtaactcacacttgcacacaacaa 4390265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 76 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 45496931 - 45496820
Alignment:
Q  76 cacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccg 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  45496931 cacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgagtttataggtcctcttacttataaggtgttcaacctttacgattttatccg 45496832  T
Q  176 atttgggacata 187  Q
    || |||||||||    
T  45496831 atgtgggacata 45496820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 53 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 54108686 - 54108551
Alignment:
Q  53 ccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatg-ggtttatgggccctcttacttataagat 151  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||| ||| ||||||||||| |    
T  54108686 ccacattgaggctagaacaaccacacaagcaagatagacaccacactcttagccaaaaccttaaggcaatgaattttatgggtccttttacttataaggt 54108587  T
Q  152 gttcaacctttactattttatccgatttgggacata 187  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  54108586 gttcaacctttactattttatcctatatgggacata 54108551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 49 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 20826370 - 20826224
Alignment:
Q  49 ccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataa 148  Q
    |||||||||| |||||||||||||  ||| ||| |||||| ||| |||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  20826370 ccgtccacatcgaggctagaacaatcgcataaggaagagagacatcacactcttacctaaaatgttaaggctatgggtttatgggttctcttacttataa 20826271  T
Q  149 gatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
      |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20826270 cgtgttcaacttttactattttatccgatgtgggacatataactcac 20826224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 43 - 195
Target Start/End: Original strand, 16889533 - 16889685
Alignment:
Q  43 gagggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttac 142  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||   |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||||   ||||||||    
T  16889533 gagggaccgtccacatcgaggttagaacaatcacacaaggaagagagacaccatactcttacccaaaactttaaggcagtaggtttatgaatcctcttac 16889632  T
Q  143 ttataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||||||| | ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  16889633 ttataaggtattcaacctttacttttctatccgatttgagacatataactcac 16889685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 45 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 2740855 - 2740693
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||||  ||||||  ||||| || ||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||    
T  2740855 gggaccatccatatcgaggctagaacaac--cacaagtgagagagacgccacactcttacgtaaaaccttaaggctctgggtttataggtcctcttactt 2740758  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcactaatgcacacaaca 209  Q
    ||||| ||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||    
T  2740757 ataaggtgttcaacctttactgttctatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaaca 2740693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 93 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 2741180 - 2741078
Alignment:
Q  93 ccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataact 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  2741180 ccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggagttatgggtcctcttacttataaggtattcaacctttactattctatctgatgtgggacatataact 2741081  T
Q  193 cac 195  Q
    |||    
T  2741080 cac 2741078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 45 - 195
Target Start/End: Original strand, 16888815 - 16888965
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    ||||||||| |||| ||  |||||||||  |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||  |||||||||    
T  16888815 gggaccgtctacatcgaaactagaacaatcgcacaaacaagagagacatcacactcttacccaaaaccgtaagacaatgagtttataggttctcttactt 16888914  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||||| | ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  16888915 ataaggtattcaacctttacttttctatccgatgtgggacatataactcac 16888965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 74 - 195
Target Start/End: Original strand, 6975484 - 6975605
Alignment:
Q  74 tgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacctttactattttatc 173  Q
    |||| |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6975484 tgcataagcaagagagacgccacactcttacccaaaatcttaagataatggatttatgagtcctcttacttataagatattcaacctttactattttatc 6975583  T
Q  174 cgatttgggacatataactcac 195  Q
     ||| || ||||||||||||||    
T  6975584 ggatgtgagacatataactcac 6975605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 53 - 209
Target Start/End: Original strand, 3244458 - 3244614
Alignment:
Q  53 ccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatg 152  Q
    |||||| |||||| |||||||   |||||  ||||| ||  |||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3244458 ccacatcgaggctggaacaaccatacaagtgagagagacgacacattcttacccaaaactttaagacaatgagtttatgggtcctcttacttataagatg 3244557  T
Q  153 ttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcactaatgcacacaaca 209  Q
    ||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||   |||||||||||    
T  3244558 ttcaacctttacttttctatccgatgtgagacatataactcacacttgcacacaaca 3244614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 45 - 148
Target Start/End: Original strand, 23817680 - 23817783
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||    
T  23817680 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacactagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgaatcctcttactt 23817779  T
Q  145 ataa 148  Q
    ||||    
T  23817780 ataa 23817783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 84 - 195
Target Start/End: Original strand, 41707503 - 41707613
Alignment:
Q  84 agagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatttggga 183  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||  || ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  41707503 agagagacaccacactcttacc-aaaaccttaagacaatgagtttatgggttcttttacttatatggtgttcaacctttactcttttatccgatgtggga 41707601  T
Q  184 catataactcac 195  Q
    ||||||||||||    
T  41707602 catataactcac 41707613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 45 - 210
Target Start/End: Original strand, 49076450 - 49076612
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||  ||| |||| ||| | ||||  | | ||||||| |||| ||||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  49076450 gggaccgtccacatcgaggctataacaatcgcataagcgagacagacac--cgcccttaccc-aaactttaagacaatgggtttataggtcctcttactt 49076546  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcactaatgcacacaacaa 210  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||   ||||||||||||    
T  49076547 ataaggtgttcaacctttactgttttatccgatatggtacatataactcacacttgcacacaacaa 49076612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 47 - 195
Target Start/End: Original strand, 34004586 - 34004732
Alignment:
Q  47 gaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttat 146  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||  ||||| ||  |||||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  34004586 gaccgttcacatcgaggctagaacaaccgcacaagggagagagacggcacactcttatcgaaaaccttaagg-aatgagtttatgggtcctcttacttat 34004684  T
Q  147 aagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||| ||||||||||||| | |||||||  || || ||||||||||||||    
T  34004685 aagttgttcaacctttagt-ttttatcatatgtgtgacatataactcac 34004732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 94 - 189
Target Start/End: Original strand, 54017750 - 54017845
Alignment:
Q  94 cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatata 189  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  54017750 cacactcttacctaaaaccttaagacaatgggaatatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtgggatatata 54017845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 113 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 10246436 - 10246358
Alignment:
Q  113 ttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataac 191  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  10246436 ttaaggctatgggtttatgggtcctctaacttataagatgttcaacctttactcttttatccgatttgagacatataac 10246358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 50 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 31691306 - 31691205
Alignment:
Q  50 cgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacac--cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttata 147  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  31691306 cgtccacatcgaggctagaacaatcgtacaagcaagagatagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttata 31691207  T
Q  148 ag 149  Q
    ||    
T  31691206 ag 31691205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 45 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 43827596 - 43827480
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||    
T  43827596 gggaccgtccacatcgaggttagaacaaccgcacaagtaagagagacaccacactcttatcc-aaaccttaaggcaatgaatttatgggtcctcttattt 43827498  T
Q  145 ataagatgttcaaccttt 162  Q
    |||||  |||||| ||||    
T  43827497 ataaggagttcaatcttt 43827480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 47 - 210
Target Start/End: Original strand, 51768061 - 51768224
Alignment:
Q  47 gaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttat 146  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||   || ||| |||||| ||| |  ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||| ||||    
T  51768061 gaccgtccacatcgaggttagaacaatcccataagtaagagagacatcgtacttttacccaaaaccttaagacaatgagtttatgagtcctcttatttat 51768160  T
Q  147 aagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcactaatgcacacaacaa 210  Q
    ||| |||||||| |||||| || ||| |||| | |||||||||||||||   ||||||||||||    
T  51768161 aaggtgttcaacatttactcttatattcgatataggacatataactcacatttgcacacaacaa 51768224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 43 - 209
Target Start/End: Original strand, 54741177 - 54741341
Alignment:
Q  43 gagggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttac 142  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||  |||  |  ||||| | || ||||||||| ||||||||||||| ||||  || |||||| ||||||||    
T  54741177 gagggaccatctacactgaggctagaacaacaacacgtg--agagagagactacactcttatccaaaaccttaagacaatctgtgtatgggtcctcttac 54741274  T
Q  143 ttataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcactaatgcacacaaca 209  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||| ||||   |||||||||||    
T  54741275 ttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgagacatataattcacacttgcacacaaca 54741341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 60 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 19504838 - 19504713
Alignment:
Q  60 gaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacc 159  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| | || ||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| ||||||          ||||||||     
T  19504838 gaggctagaacaaccacacaagcaagatagacgccacactcttacccaaaactttaaggcaatagatttatgggtcctctt---------gtgttcaact 19504748  T
Q  160 tttactattttatccgatttgggacatataactca 194  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19504747 tttactattttatccgatatgggacatataactca 19504713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 94 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 3341236 - 3341120
Alignment:
Q  94 cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactc 193  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||||   ||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  3341236 cacactcttacccaaaatcttaaaacaatgatgttatgggtcctcttacttataaagtgtttaacctttactcttttatccaatgtgggacatataactc 3341137  T
Q  194 actaatgcacacaacaa 210  Q
    ||   ||||||||||||    
T  3341136 acacttgcacacaacaa 3341120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 46 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 18879962 - 18879852
Alignment:
Q  46 ggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactta 145  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||  ||||| ||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || | |||||||||    
T  18879962 ggaccgtccacatcgaagctagaacaaccacacaaccaaaagagacgtcacactcttacccaaaaccttaaggaaataggtttataggtcatcttactta 18879863  T
Q  146 taagatgttca 156  Q
    |||| ||||||    
T  18879862 taaggtgttca 18879852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 48 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 43174661 - 43174513
Alignment:
Q  48 accgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttata 147  Q
    |||||||||||  |||||| ||||||   | || ||||||| || |||||||||||||||| || ||||||  || |||||||| | |||||||||||||    
T  43174661 accgtccacatcaaggctacaacaaccatataaacaagagagacgccacactcttacccaacactttaaggtcataggtttatgtgtcctcttacttata 43174562  T
Q  148 agatgttcaacctttact-attttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    || |||||||||||||||  ||||||| ||| || | ||||||||||||    
T  43174561 aggtgttcaacctttactctttttatctgatgtgtggcatataactcac 43174513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 43 - 195
Target Start/End: Original strand, 45489329 - 45489480
Alignment:
Q  43 gagggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttac 142  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||   ||| ||||| ||| ||| |||||||||||| |||| |||||  || | |||||| | |  |||||||    
T  45489329 gagggaccatccacatcgaggctagaacaatcacactagcaaaagagacatcacactcttaccaaaaatcttaaa-cagtaggtttaagagttctcttac 45489427  T
Q  143 ttataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  45489428 ttatatggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgagacatataattcac 45489480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 45 - 176
Target Start/End: Original strand, 48111697 - 48111828
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||  ||   |  ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||  | ||| ||||||    
T  48111697 gggaccgtccacattgaggttagaaaaaccacatttgtgagagagacaccacactcatacctaaaaccttaaggtaatggatttataagtccttttactt 48111796  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccga 176  Q
    ||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  48111797 ataatgtgttcaacctttactcttttatccga 48111828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 47 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 3700512 - 3700357
Alignment:
Q  47 gaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttat 146  Q
    |||||||||||| |||||| ||| |||  |||||   ||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||        ||| ||||||||    
T  3700512 gaccgtccacatcgaggcttgaataaccacacaaatgagagagacatcatactcttatccaaaaccttaaggcaatgagt--------ccttttacttat 3700421  T
Q  147 aagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcactaatgcacacaacaa 210  Q
    ||| |||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||   ||||||||||||    
T  3700420 aaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtaggacatataactcacacttgcacacaacaa 3700357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 136 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 44620362 - 44620304
Alignment:
Q  136 ctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactca 194  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  44620362 ctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatcccatgtgggacatataactca 44620304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 3271895 - 3271841
Alignment:
Q  94 cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataa 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  3271895 cacactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatgggttctcttacttataa 3271841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 84 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 11197344 - 11197295
Alignment:
Q  84 agagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 133  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11197344 agagagacaccacactcttacccaaaaccctaaggcaatgggtttatggg 11197295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 84 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 28034347 - 28034222
Alignment:
Q  84 agagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatttggga 183  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||  |||| ||||||||  ||||||||||  ||| || ||||||||  ||||    
T  28034347 agagagacgccacactcttacctaaaaccttaaagcaataagtttatgggttctctcacttataaagtgttcaacctccacttttctatccgatgcggga 28034248  T
Q  184 catataactcactaatgcacacaaca 209  Q
    ||||||| ||||   |||||||||||    
T  28034247 catataattcacacttgcacacaaca 28034222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 179
Target Start/End: Original strand, 39698944 - 39699079
Alignment:
Q  46 ggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaacctt--aaggcaatgggtttatgggccctcttact 143  Q
    |||| |||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||| |  | |||||||||| |||||||||  || |  | || |||||||  |||||||||    
T  39698944 ggactgtccacatcgagactagaataaccgcacaagcaagagagatgctacactcttactcaaaaccttaaaacgacacggatttatggatcctcttact 39699043  T
Q  144 tataagatgttcaacctttactattttatccgattt 179  Q
    || || |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  39699044 tagaatatgttcaacctttacttttatatccgattt 39699079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 84 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 760306 - 760196
Alignment:
Q  84 agagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatttggga 183  Q
    ||||| |||||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||  |  |||||||| | | || ||| |||| |||||    
T  760306 agagagacaccacacttttacc-aaaatcttaaggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagttctcaaccttcatttttctattcgatgtggga 760208  T
Q  184 catataactcac 195  Q
    ||||||||||||    
T  760207 catataactcac 760196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 61 - 160
Target Start/End: Original strand, 15841383 - 15841482
Alignment:
Q  61 aggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacct 160  Q
    |||||||| ||||  ||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||| ||||| ||  ||||||||||    
T  15841383 aggctagagcaaccacacaagtgagagagacatcacactcttacccaaaaccttaaggcaatgtgtttatgaatcctctcacttacaaagtgttcaacct 15841482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 65 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 40067181 - 40067050
Alignment:
Q  65 tagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaac-cttta 163  Q
    |||||||||  || |||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||| | ||| | |||| | ||||||||||||||  ||||||||  ||||    
T  40067181 tagaacaaccacataagcaagagagacatcacacttttacccaaaatcttaaggtagtggatctatgtgtcctcttacttataatgtgttcaacttttta 40067082  T
Q  164 ctattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    |  ||||||||||| | | |||||||||||||    
T  40067081 cacttttatccgatgtagaacatataactcac 40067050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 192
Target Start/End: Original strand, 50788088 - 50788129
Alignment:
Q  151 tgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataact 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  50788088 tgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataact 50788129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 95 - 195
Target Start/End: Original strand, 15841034 - 15841133
Alignment:
Q  95 acactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactca 194  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |  ||||| |||||||| ||||||| |||  ||| || |||| ||| |||||||||||| |||    
T  15841034 acactcttacccaaaac-ttaaagcaatgggtttatagatcctctcacttataaaatgttcagcctccacttttctatctgatatgggacatataattca 15841132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 136 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 44621011 - 44620951
Alignment:
Q  136 ctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgat-ttgggacatataactcac 195  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  44621011 ctcttacttataaggtgttcaacctttacagttttatccgatgttgggacatctaactcac 44620951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 136 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 44621492 - 44621420
Alignment:
Q  136 ctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcactaatgcacacaac 208  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| || | |||||||||||||||   ||||||||||    
T  44621492 ctcttacttataaggtgtttaacctttactgttttatcccatgttggacatataactcacacttgcacacaac 44621420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 88 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 51681652 - 51681609
Alignment:
Q  88 aaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  51681652 aaacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggtatatg 51681609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 95 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 1868158 - 1868120
Alignment:
Q  95 acactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 133  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1868158 acactcttacccaaaactttaaggcaatgggtttatggg 1868120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 61 - 139
Target Start/End: Original strand, 11783568 - 11783646
Alignment:
Q  61 aggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctct 139  Q
    |||||||| |||||  |||||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||| |||||    
T  11783568 aggctagagcaactatacaagcgagagaaacgacacactcttacccaaaactttatggcaataggtgtatgggtcctct 11783646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 84 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 10396249 - 10396200
Alignment:
Q  84 agagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 133  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  10396249 agagagacaccaccctcttacctaaaaccctaaggcaatgggtttatggg 10396200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 92 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 10396526 - 10396485
Alignment:
Q  92 accacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 133  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10396526 accacactcttatccaaaaccctaaggcaatgggtttatggg 10396485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 76 - 177
Target Start/End: Original strand, 23556896 - 23556997
Alignment:
Q  76 cacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccg 175  Q
    |||||| |||||| ||  |||||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||   |||||| |||||| |||||||||||  ||| || ||||||    
T  23556896 cacaagtaagagagacgtcacactcttatccaaaactttaaggcaatgattttatggattctcttatttataaaatgttcaacctccacttttctatccg 23556995  T
Q  176 at 177  Q
    ||    
T  23556996 at 23556997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 92 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 34544217 - 34544160
Alignment:
Q  92 accacactcttacccaaaa-ccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataa 148  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||    
T  34544217 accacactcttacccaaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctctcatttataa 34544160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 45 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 43174298 - 43174233
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaa 110  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||  ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  43174298 gggaccgtccacatcaaggcttgaacaaccacacaagtgagagagacaccacactcttacccaaaa 43174233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 210
Target Start/End: Original strand, 11348396 - 11348492
Alignment:
Q  114 taaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcactaatgcacacaacaa 210  Q
    ||||||||||  | |||||  ||||| ||||||||  ||||||||||  ||||||||||| ||| | | ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  11348396 taaggcaatgaatatatggatcctctcacttataaagtgttcaacctccactattttatctgatgtagaacatataactcacaattgcacacaacaa 11348492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 922537 - 922487
Alignment:
Q  83 aagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 133  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||    
T  922537 aagagagacaccacactcttatccaaacccctaagacaatgggtttatggg 922487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 91
Target Start/End: Original strand, 11702298 - 11702344
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaac 91  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11702298 gggactgttcacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagaaac 11702344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 93 - 130
Target Start/End: Original strand, 11706591 - 11706628
Alignment:
Q  93 ccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  11706591 ccacactcttacccaaaaccttaaagcaatgagtttat 11706628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 47)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 45 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 29518660 - 29518510
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  29518660 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgggtttatgggtcctcttactt 29518561  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29518560 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcac 29518510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 45 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 29519077 - 29518927
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  29519077 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgggtttatgggtcctcttactt 29518978  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29518977 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcac 29518927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 45 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 32741336 - 32741186
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  32741336 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgggtttatgggtcctcttactt 32741237  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32741236 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcac 32741186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 45 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 35210361 - 35210211
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  35210361 gggaccgtccacatcgaggctagagcaaccgcacaagcaaaagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggttttatgggtcctcttactt 35210262  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  35210261 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcac 35210211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 54 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 3409407 - 3409266
Alignment:
Q  54 cacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgt 153  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  3409407 cacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgt 3409308  T
Q  154 tcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  3409307 tcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcac 3409266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 45 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 2378283 - 2378133
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  2378283 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacattcttacctaaaaccttaaggtaatgggtttatgggtcctcttactt 2378184  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2378183 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcac 2378133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 45 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 3409817 - 3409667
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3409817 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaaataaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 3409718  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  3409717 ataagatgttcaacttttactattttatctgatgtggtacatataactcac 3409667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 45 - 210
Target Start/End: Original strand, 2579873 - 2580038
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  2579873 gggaccttccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacattcttacccaaaaccttaaggctgtgggtttatgggtcctcttactt 2579972  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcactaatgcacacaacaa 210  Q
    ||||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  2579973 ataatgtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaa 2580038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 45 - 195
Target Start/End: Original strand, 2578444 - 2578593
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  2578444 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttatgggtcctcttactt 2578543  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||||  ||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||    
T  2578544 ataaagtgttcaacctttactcttttatccg-tgtgggacatataactcac 2578593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 45 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 16455064 - 16454914
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  16455064 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatgggtcctattactt 16454965  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  16454964 ataaggtgttcaacctttactcttttatctgatgtgggacacataactcac 16454914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 45 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 1846905 - 1846763
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||    
T  1846905 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttatccaaaaccttaaggcaatggatttatgggtgctcttactt 1846806  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacata 187  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  1846805 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgagacata 1846763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 45 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 2377911 - 2377761
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| |||  | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2377911 gggaccttccacatcgaggctagaaaaaccactcaagcaagaaagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 2377812  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  2377811 ataaggtgttcaacctttactcttttaaccgatgtgggacatataactcac 2377761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 45 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 3415617 - 3415465
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctaga--acaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttac 142  Q
    |||||| ||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3415617 gggaccttccacatcgaggctagagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 3415518  T
Q  143 ttataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  3415517 ttatatggtgttcaacctttactattttatgtgatgtgggacatataactcac 3415465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 45 - 195
Target Start/End: Original strand, 14748343 - 14748489
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||    
T  14748343 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagaga----ccacactcttacccaaaaccttaacgcaatgagtttatgggtcctcttattt 14748438  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14748439 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcac 14748489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 54 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 26544197 - 26544056
Alignment:
Q  54 cacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgt 153  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||  |||    
T  26544197 cacattgaggctagaacaatcgcacaagcaagagagacatcacactcttactcaaaaccttaaggcggtgggtttatgggtcctcttacttataacgtgt 26544098  T
Q  154 tcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26544097 tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcac 26544056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 45 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 3058383 - 3058236
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    ||||| |||||||| |||| |||||| ||   |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||    
T  3058383 gggacggtccacatcgaggttagaaccaccctacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggatcctcatactt 3058284  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataact 192  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3058283 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataact 3058236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 53 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 16107827 - 16107685
Alignment:
Q  53 ccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatg 152  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||    
T  16107827 ccacatcgaggctagagcaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtg 16107728  T
Q  153 ttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    || |||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  16107727 tttaacctttacttttttatccgatgtgacacatataactcac 16107685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 45 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 16454732 - 16454582
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16454732 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttatccaaaatcttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 16454633  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||||| |||||||| |||| | ||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  16454632 ataaggtgttcaacttttattcttttatctgatgtgggacacataactcac 16454582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 45 - 209
Target Start/End: Original strand, 10073992 - 10074156
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||   | |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10073992 gggaccgtccacgtcgaggctagaacaaccaaataagcgagagagacaccacacttttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 10074091  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcactaatgcacacaaca 209  Q
    ||||| |||||||| |||||| || |||||||| ||||| |||||||||||   |||||||||||    
T  10074092 ataaggtgttcaacgtttacttttctatccgatgtgggatatataactcacccttgcacacaaca 10074156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 45 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 2843712 - 2843561
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat-gggccctcttact 143  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||    
T  2843712 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagataccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatggggtcctcttact 2843613  T
Q  144 tataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    |||||| |||||||| |||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  2843612 tataaggtgttcaacttttattattttatccgatgtgaaacatataactcac 2843561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 52 - 209
Target Start/End: Original strand, 10074371 - 10074528
Alignment:
Q  52 tccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagat 151  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |    
T  10074371 tccacatcgaggctagaacaaccacactagtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggt 10074470  T
Q  152 gttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcactaatgcacacaaca 209  Q
    |||||||||||||| || |||||||| |||||| | ||||||||   |||||||||||    
T  10074471 gttcaacctttacttttctatccgatgtgggacctctaactcacacttgcacacaaca 10074528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 52 - 195
Target Start/End: Original strand, 2579500 - 2579643
Alignment:
Q  52 tccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagat 151  Q
    ||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  2579500 tccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacaccatacttttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggccctcttacttataaggt 2579599  T
Q  152 gttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
     | | ||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  2579600 atccgacctttacttttttgtccgatgtgggacatataactcac 2579643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 94 - 195
Target Start/End: Original strand, 32460630 - 32460731
Alignment:
Q  94 cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactc 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  32460630 cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatacgatgtgggacatataactc 32460729  T
Q  194 ac 195  Q
    ||    
T  32460730 ac 32460731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 53 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 1127509 - 1127367
Alignment:
Q  53 ccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatg 152  Q
    |||||| |||| |||| ||||  || ||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| ||    
T  1127509 ccacatcgaggttagagcaaccacataagtaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtg 1127410  T
Q  153 ttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  1127409 ttcaacctttactattttacccgatgtgggatatataactcac 1127367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 60 - 195
Target Start/End: Original strand, 1950201 - 1950336
Alignment:
Q  60 gaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacc 159  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||| | | |||||||  |||||||||| |||| |||||||||    
T  1950201 gaggctagaacaaccgcacaagtaagagagacgtcacactcttactcaaaaccttaaggcattagatttatggctcctcttacttgtaaggtgttcaacc 1950300  T
Q  160 tttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1950301 tttactcttttatccgatgtgggacatataactcac 1950336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 45 - 192
Target Start/End: Original strand, 5832028 - 5832174
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||   ||| |||||||| ||||||||||    
T  5832028 gggaccgtctacatcgaggctagaacaaccacacaagtaagagagacaccacacttttacccaaaatcttaagggg-tggctttatgggtcctcttactt 5832126  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataact 192  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  5832127 ataaggtgttcaacctttactcttttatccaatgtgggacatataact 5832174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 77 - 195
Target Start/End: Original strand, 9062383 - 9062500
Alignment:
Q  77 acaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccga 176  Q
    ||||| |||||| | |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9062383 acaagtaagagagataccacacttttacccaaaac-ttaagacaatgagtttatgagtcctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccga 9062481  T
Q  177 tttgggacatataactcac 195  Q
    | |||||||||||||||||    
T  9062482 tgtgggacatataactcac 9062500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 45 - 195
Target Start/End: Original strand, 593708 - 593860
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaaca--ccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttac 142  Q
    ||||||||| |||| ||| |||||||||| | ||||| |||||| | |  ||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||    
T  593708 gggaccgtcaacatcgagcctagaacaaccgtacaagtaagagagagataccacactattacccaaaaccttaaggcagtcggtttatgagtcctcttac 593807  T
Q  143 ttataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  593808 ttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatacaactcac 593860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 37 - 209
Target Start/End: Original strand, 10073609 - 10073779
Alignment:
Q  37 gagcatgagggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccc 136  Q
    |||| ||| ||||||||||||| || |||||||||||  ||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||  ||    
T  10073609 gagcctgaaggaccgtccacatcgatgctagaacaaccacactagtgagagagacaccacactcttacccaaaatcttaagccaatgagtttatggatcc 10073708  T
Q  137 tcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcactaatgcacacaaca 209  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||| |||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  10073709 tcttacttataaggtgttcaacctttac--ttttctccgatgtgggacatataactaacacttgcacacaaca 10073779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 47 - 195
Target Start/End: Original strand, 6999799 - 6999947
Alignment:
Q  47 gaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttat 146  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||  ||  ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||  |||||||| |||    
T  6999799 gaccgtccacatcgagactagaacaaccacattagcaagagagacgccacactcttatccaaaaccttaaggcagtgagtttatggatcctcttacatat 6999898  T
Q  147 aagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||| |||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  6999899 aaggtgttcaacttttacttttttatccgatgtaggacatataactcac 6999947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 45 - 195
Target Start/End: Original strand, 2578836 - 2578985
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||| ||    
T  2578836 gggaccgtccacatcgaggtcagaacaaccacacaagcaaaagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgagtttatggatcctcttattt 2578935  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||||| | |||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  2578936 ataaggtattcaacatttact-ttttatccgatgagggacatataaatcac 2578985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 45 - 192
Target Start/End: Original strand, 2579110 - 2579253
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| |  ||||||||||||  |||    |||    
T  2579110 gggaccgtgcacatcgaggctagaacaaccacacgagcaagagagacaccacactcttagccaaagccttaaagttatgggtttatggttcct----ctt 2579205  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataact 192  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  2579206 ataaggtgttcaacttttactcttttatccgatgtgggacatataact 2579253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 48 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 10911720 - 10911572
Alignment:
Q  48 accgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttata 147  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||  ||  || |||||| ||| ||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  10911720 accgtccacatcgaggcttgaacaacaacattagtaagagagacatcacactcttattcaaaactttaaggcaatgagtttatgagtcctcttacttata 10911621  T
Q  148 agatgttcaacctttac-tattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    || |||||||||||||| | ||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  10911620 aggtgttcaacctttactttttttatctgatgtaggacatataactcac 10911572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 43 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 16108210 - 16108070
Alignment:
Q  43 gagggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttac 142  Q
    |||||||||||||||| |||| || ||||||  ||||||||||||| |||||||||            ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16108210 gagggaccgtccacatcgaggttataacaaccccacaagcaagagagacaccacac------------ccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 16108123  T
Q  143 ttataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  16108122 ttataaggtgttcaacatttactcttttatctgatgtggaacatataactcac 16108070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 82 - 210
Target Start/End: Original strand, 5958641 - 5958769
Alignment:
Q  82 caagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatttgg 181  Q
    ||||||| ||| ||||||||  |||||||| ||||| ||||| ||||||| |  |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |      
T  5958641 caagagagacatcacactctatcccaaaactttaagacaatgagtttatgagttctcttatttataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtaa 5958740  T
Q  182 gacatataactcactaatgcacacaacaa 210  Q
     ||||||||||||| | ||||||| ||||    
T  5958741 cacatataactcacaattgcacaccacaa 5958769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 77 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 6071257 - 6071124
Alignment:
Q  77 acaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccga 176  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||  | ||| ||||||||  ||||||||||  ||| || ||| | |    
T  6071257 acaagcgagagagacgccacactcttatccaaaatcttaaggcaatgagtttatggatcatctcacttataaagtgttcaacctccacttttctattcaa 6071158  T
Q  177 tttgggacatataactcactaatgcacacaacaa 210  Q
    | |||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  6071157 tgtgggacatataactcacacttgcacacaacaa 6071124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 84 - 209
Target Start/End: Original strand, 12092522 - 12092647
Alignment:
Q  84 agagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatttggga 183  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||  || |||||||  ||| || |||||||| |||||    
T  12092522 agagagacaccacagtcttactcaaaaccttaaggcaatgagtttatggatcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatccgatgtggga 12092621  T
Q  184 catataactcactaatgcacacaaca 209  Q
    ||| |||| |||   |||||||||||    
T  12092622 catctaacacacccttgcacacaaca 12092647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 83 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 8482045 - 8481919
Alignment:
Q  83 aagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatttggg 182  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | | ||| | ||||||  ||||||||||  ||| || |||| ||| | ||    
T  8482045 aagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgagtcatctcatttataaagtgttcaacctccacttttatatctgatgt-gg 8481947  T
Q  183 acatataactcactaatgcacacaacaa 210  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||    
T  8481946 acatataactcacacttgcacacaacaa 8481919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 131
Target Start/End: Original strand, 12071692 - 12071778
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 131  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  12071692 gggaccgttcacatcgaggctagaacaaccacacaagtgagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggtcataggtttatg 12071778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 31714823 - 31714683
Alignment:
Q  47 gaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttat 146  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||| | | |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| | ||||    
T  31714823 gaccgtccacatcgaggctagagcaaccacacaagcgaaa-aaacgccacactcttactcaaaaccttaaggcaatgagttaatgggtcctctca-ttat 31714726  T
Q  147 aagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatata 189  Q
    |  | |||||||||  ||| || |||||||| | |||||||||    
T  31714725 ataacgttcaacctccacttttctatccgatgtaggacatata 31714683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 88 - 133
Target Start/End: Original strand, 22605299 - 22605344
Alignment:
Q  88 aaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 133  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22605299 aaacaccacattcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 22605344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 131
Target Start/End: Original strand, 12085037 - 12085121
Alignment:
Q  47 gaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 131  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||||  ||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  12085037 gaccgttcgcatcgaggctagaacaaccacacaagtgagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggccatggttttatg 12085121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 133
Target Start/End: Original strand, 21130101 - 21130146
Alignment:
Q  88 aaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 133  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21130101 aaacaccacactcttatccaaaaccttaaggcaatggatttatggg 21130146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 83 - 133
Target Start/End: Original strand, 11637760 - 11637810
Alignment:
Q  83 aagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 133  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||    
T  11637760 aagagagacaccacactcttatccaaaatcttaagacaatgggtttatggg 11637810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 129 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 35210551 - 35210498
Alignment:
Q  129 atgggccctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatttggg 182  Q
    ||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35210551 atgggtcctcttacttacaaggtattcaacctttactattttatccgatgtggg 35210498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 51 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 3409452 - 3409405
Alignment:
Q  51 gtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacac 98  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||    
T  3409452 gtccacatcgaggctagaacaaccgcataagcaagagagacaccacac 3409405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 119 - 165
Target Start/End: Original strand, 14789279 - 14789325
Alignment:
Q  119 caatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacctttact 165  Q
    |||| |||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  14789279 caattggtttatgggtcctcttacttgtaaggtgttcaacctttact 14789325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 68)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 46 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 37106344 - 37106195
Alignment:
Q  46 ggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactta 145  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  37106344 ggaccgtccacatcgaggctagaacaatcgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggaaatgggtttatgggtcctcttactta 37106245  T
Q  146 taagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37106244 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcac 37106195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 45 - 195
Target Start/End: Original strand, 36178606 - 36178756
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36178606 gggatcgtccacatagaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 36178705  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36178706 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcac 36178756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 45 - 195
Target Start/End: Original strand, 5542626 - 5542776
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  5542626 gggaccgtccacatcgagacttgaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaataggtttatgggtcctcttactt 5542725  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  5542726 ataaggtgttcaacctttactattttattcgatatgggacatataactcac 5542776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 45 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 6421542 - 6421392
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  6421542 gggaccgtccacatcgagactagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacctcaaggcaatgagtttatgagtcctcttactt 6421443  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6421442 ataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcac 6421392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 45 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 37106081 - 37105931
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || |||||||    
T  37106081 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgtacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgggtccccttactt 37105982  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  37105981 ataaggtgttcaacctttactattttattcgatgtgggacatataactcac 37105931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 37 - 195
Target Start/End: Original strand, 41283468 - 41283626
Alignment:
Q  37 gagcatgagggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccc 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||  ||||| ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  41283468 gagcatgggggaccgtccacatcaaggctagaacaaccacacaaacaagagagacgccacactcttacctaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcc 41283567  T
Q  137 tcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41283568 tcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatatgggacatataactcac 41283626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 50 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 15880415 - 15880270
Alignment:
Q  50 cgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataag 149  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15880415 cgtccacatcgaggctaaaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataag 15880316  T
Q  150 atgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  15880315 gtgttcaacctttactcttttatccgatgtggaacatataactcac 15880270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 45 - 195
Target Start/End: Original strand, 14745668 - 14745818
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||  |||  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14745668 gggactgtccacatcgaggctagaacaaccacacttgcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 14745767  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  14745768 ataaggtgttcaacctttactattttatccaatgtgggacatataactcac 14745818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 48 - 195
Target Start/End: Original strand, 5543002 - 5543149
Alignment:
Q  48 accgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttata 147  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  5543002 accgtccacatcgaggcttgaacaaccgcacaagcaatagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaataggtttatggatcctcttacttata 5543101  T
Q  148 agatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  5543102 aggtgttcaacctttactattttatcggatgtgggacatataactcac 5543149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 47 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 962753 - 962605
Alignment:
Q  47 gaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttat 146  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  962753 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagtgacaacacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggtcctctcacttat 962654  T
Q  147 aagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||| ||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  962653 aaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgggacatataactcac 962605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 45 - 210
Target Start/End: Original strand, 15511496 - 15511659
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    |||| ||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  15511496 gggatcgtccacatcgagactagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaagacaatgggtttatgggtcctcttactt 15511595  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcactaatgcacacaacaa 210  Q
    ||||  ||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||  ||||||||||||    
T  15511596 ataacgtgttcaacctttactcttttatccgttgtgtgacatataactcact--tgcacacaacaa 15511659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 45 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 42514806 - 42514656
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||| || |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  42514806 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccccacaagtaagagagacgccacactcttacccaaaatcttaaggcgatgggtttatgggtcctcttactt 42514707  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||||| ||||||||||||||| || |||| ||| | |||||||||||||||    
T  42514706 ataaggtgttcaacctttacttttctatctgatgtaggacatataactcac 42514656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 45 - 184
Target Start/End: Original strand, 36178172 - 36178311
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    ||||||||| |||| ||||||| ||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | |||||||    
T  36178172 gggaccgtctacatcgaggctataacaaccacacaagcaagagaggcaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggtttatgggttcccttactt 36178271  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggac 184  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36178272 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggac 36178311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 45 - 195
Target Start/End: Original strand, 35580725 - 35580874
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  35580725 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccccacaaacaagagagacgccgcactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat-ggtcctctcactt 35580823  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||||| |||||||| |||| | ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35580824 ataaggtgttcaacatttattgttttatccgatgtgggacatataactcac 35580874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 47 - 209
Target Start/End: Original strand, 40679632 - 40679794
Alignment:
Q  47 gaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttat 146  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||  |||||| |||||| || |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  40679632 gaccgtccacatcgagactagaacaaccccacaagtaagagagacgccacactcttacccaaaatcttaaggcgatgggtttatgggttctcttacttat 40679731  T
Q  147 aagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcactaatgcacacaaca 209  Q
    ||| ||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||    
T  40679732 aaggtgttcaacccttacttttctatccgatatgggacatataactcacatttgcacacaaca 40679794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 45 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 6422267 - 6422126
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||    
T  6422267 gggacagtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacctaaaaccttaaggctatgggtttatgggtcctcttaatt 6422168  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacat 186  Q
    ||||  ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||    
T  6422167 ataatgtgttcaacctttacttttttatctgatgtgggacat 6422126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 63 - 195
Target Start/End: Original strand, 28254258 - 28254388
Alignment:
Q  63 gctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaaccttt 162  Q
    |||||||||||  ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28254258 gctagaacaaccccacaag--agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataagatgttcaaccttt 28254355  T
Q  163 actattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||| || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  28254356 acttttctatccgatgtgggacatataagtcac 28254388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 46 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 33731804 - 33731655
Alignment:
Q  46 ggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactta 145  Q
    |||||||  |||| |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  33731804 ggaccgtttacatcgaggctagaacaaccgcataagcaagagagacaccatactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatggatcctcttactta 33731705  T
Q  146 taagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    |||| || |||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||    
T  33731704 taaggtgctcaacctttactcttttatccgatgtgagatatataactcac 33731655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 51 - 195
Target Start/End: Original strand, 36005887 - 36006030
Alignment:
Q  51 gtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataaga 150  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||     
T  36005887 gtccacatcgaggctagaacaaccccacaagcaagagagacgccacacttttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataagg 36005986  T
Q  151 tgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    |||||||| |||||| || ||| |||| |||||||||||||||||    
T  36005987 tgttcaacttttact-ttctattcgatgtgggacatataactcac 36006030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 45 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 6713134 - 6712983
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaa-ccttaaggcaatgggtttatgggccctcttact 143  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||   || |||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    
T  6713134 gggaccgtccacatcgaggctagaacaatcccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaaccttaaagcaataggtttatgggtcctcttact 6713035  T
Q  144 tataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  6713034 tataaggtgttcaacatttactgttttatccgatgtgagacatataactcac 6712983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 46 - 209
Target Start/End: Original strand, 28531316 - 28531479
Alignment:
Q  46 ggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactta 145  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||   |||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  28531316 ggaccatccacatcgaggctagagcaactgcataactgagagagtcaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgggacctcttactta 28531415  T
Q  146 taagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcactaatgcacacaaca 209  Q
    |||| |||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||    
T  28531416 taaggtgttcaacctttgcttttctatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaaca 28531479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 42 - 195
Target Start/End: Original strand, 14745291 - 14745445
Alignment:
Q  42 tgagggaccgtccacattgaggctagaacaactgc-acaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctctt 140  Q
    |||||||  |||||||| ||||||||||||||  | ||   ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  14745291 tgagggattgtccacatcgaggctagaacaaccaccacttacaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcat 14745390  T
Q  141 acttataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  14745391 acttacaagatgttcaaccattactattttattcgatgtgggacatataactcac 14745445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 43 - 210
Target Start/End: Original strand, 38796617 - 38796786
Alignment:
Q  43 gagggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccaca--ctcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctctt 140  Q
    ||||||||||| |||| |||||| |||||||  ||||||||| ||| || |||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||    
T  38796617 gagggaccgtcgacatcgaggcttgaacaaccacacaagcaatagagacgccacatactcttacccaaaaccttaaggcattaggtttatgggtcctctt 38796716  T
Q  141 acttataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcactaatgcacacaacaa 210  Q
    ||||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  38796717 acttataaggtgttcaacctttattgttttatcagatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaa 38796786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 44 - 209
Target Start/End: Original strand, 37632597 - 37632762
Alignment:
Q  44 agggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttact 143  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||   |||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||    
T  37632597 aggggccgtccacatcgaggctagaacaatcacacttgtaagagatacaccacactcttacccaaaaccttaaagttatgggtttatgggtcctcttact 37632696  T
Q  144 tataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcactaatgcacacaaca 209  Q
    ||||| ||||  |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||   |||||||||||    
T  37632697 tataaaatgtcaaacctttactattttatccgatgtaggacatataactcacacttgcacacaaca 37632762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 47 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 23346391 - 23346250
Alignment:
Q  47 gaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttat 146  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  23346391 gaccgtccacatctaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacatcacactcttaccgaaaaccttaaggctatgggtttatgggccctctta-ttat 23346293  T
Q  147 aagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatata 189  Q
    ||| |||| |||||||||| || ||| |||| || ||||||||    
T  23346292 aaggtgtttaacctttacttttctatacgatgtgagacatata 23346250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 60 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 5367597 - 5367468
Alignment:
Q  60 gaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacc 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||  | ||||||||||||| |||||||||    
T  5367597 gaggctagaacaactgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggttatgtgttcatggatcatcttacttataaggtgttcaacc 5367498  T
Q  160 tttactattttatccgatttgggacatata 189  Q
    ||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  5367497 tttgctcttttatccgatctgggacatata 5367468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 94 - 210
Target Start/End: Original strand, 31468800 - 31468912
Alignment:
Q  94 cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactc 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31468800 cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctctta----taagatattcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactc 31468895  T
Q  194 actaatgcacacaacaa 210  Q
    ||   ||||||||||||    
T  31468896 acacttgcacacaacaa 31468912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 45 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 40733674 - 40733524
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    |||||| ||||||| ||| || |||| ||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||   | |||||||||| ||||||||||    
T  40733674 gggaccatccacatcgagacttgaactaccacacaagcgagagagacaccacactcttacccaaaactttaaggttgtaggtttatgggtcctcttactt 40733575  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  40733574 ataaggtgttcaacatttacttttttatctgatgtgggacatataactcac 40733524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 95 - 195
Target Start/End: Original strand, 36178320 - 36178420
Alignment:
Q  95 acactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactca 194  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  36178320 acactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtccccttacttataaggtgttccacctttactattttatccgaagtgggacatataactca 36178419  T
Q  195 c 195  Q
    |    
T  36178420 c 36178420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 45 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 40734039 - 40733890
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||||  ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| |||||||  | |||| ||| ||||||||||||    
T  40734039 gggaccgtccacatcgagacttgaacaaccacacaagcgagacagacaccacactcttacccaaaactttaaggctgtaggtt-atgagccctcttactt 40733941  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||||| |||| || ||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||    
T  40733940 ataaggtgttaaatctttactcttttattcgatgtgggacatataactcac 40733890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 54 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 1770040 - 1769899
Alignment:
Q  54 cacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgt 153  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||  |||| | | || || ||| ||||||| | ||||||||||||||| |||    
T  1770040 cacatcgaggctagaacaacctcacaagcaagagagacaccacactcttattcaaagcttcaaagctatgagtttatgagtcctcttacttataaggtgt 1769941  T
Q  154 tcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  1769940 tcaacttttactcttttatccgatgtgtgacatataactcac 1769899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 42 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 29677068 - 29676895
Alignment:
Q  42 tgagggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg-----ccc 136  Q
    ||||||||| ||||||| |||| | |||||||  |||||  |||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||      ||    
T  29677068 tgagggaccatccacatcgaggttggaacaaccccacaattaagagagacaccacactcttacttaaagccttaaggcaatgggtttatgggtcttctcc 29676969  T
Q  137 tcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcactaatgcacacaacaa 210  Q
    ||| || |||||| |||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  29676968 tctcacctataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacctgcacacaacaa 29676895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 55 - 191
Target Start/End: Original strand, 40163383 - 40163520
Alignment:
Q  55 acattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaagg-caatgggtttatgggccctcttacttataagatgt 153  Q
    |||| |||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | || | |||| ||||| | ||||||||||||| |||    
T  40163383 acatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacaccacacttttacccaaaaccttaaagacactaggttaatgggtcatcttacttataaggtgt 40163482  T
Q  154 tcaacctttactattttatccgatttgggacatataac 191  Q
    |||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  40163483 tcaacctttacttttctatccgatgtgggacatataac 40163520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 95 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 16542556 - 16542441
Alignment:
Q  95 acactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactca 194  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||  | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  16542556 acactcttactcaaaatcttaaggcaatgagtttataagtcctcttatttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacttataactca 16542457  T
Q  195 ctaatgcacacaacaa 210  Q
    |   ||||||||||||    
T  16542456 cacttgcacacaacaa 16542441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 45 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 7598385 - 7598235
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    |||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||  ||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||    
T  7598385 gggaccgttcacatcgaggcttgaacaaccgcacaagtgagagagacaccatattcttacccaaaaccttaaggctatgagtttatgggtcctcttattt 7598286  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||||| |||| |||||||||| || ||| |||| | | |||||||| ||||    
T  7598285 ataaggtgttgaacctttacttttctattcgatgtagaacatataattcac 7598235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 86 - 194
Target Start/End: Original strand, 37895103 - 37895211
Alignment:
Q  86 agaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggaca 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||||| |||| | |||||| |||| | || |||||||| |||||||    
T  37895103 agaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgtgttcttttacttttaaggttttcaacttttatttttctatccgatgtgggaca 37895202  T
Q  186 tataactca 194  Q
    |||||||||    
T  37895203 tataactca 37895211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 45 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 6421888 - 6421793
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctctt 140  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  6421888 gggaccgtccacatcgaggccagaacaaccacacaagttagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatgggtcctctt 6421793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 49 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 7598754 - 7598616
Alignment:
Q  49 ccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataa 148  Q
    |||||||||| || ||| |||||||  ||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||        ||||||| ||||||||||||||    
T  7598754 ccgtccacatcgatgcttgaacaaccacacaagtgagagagacaccacactcttaccaaaaacgttaagg--------ttatgggtcctcttacttataa 7598663  T
Q  149 gatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    | ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  7598662 ggtgttcaacctttacttttttatctgatgtgggacatataactcac 7598616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 54 - 195
Target Start/End: Original strand, 12529038 - 12529179
Alignment:
Q  54 cacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgt 153  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||| ||  ||||| | ||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| | |||    
T  12529038 cacattgaggttagaacaaccgcacaaacaagagagacactacgttcttatctaaaactttaaggcaatgagtttatgagtcctcttacttatacggtgt 12529137  T
Q  154 tcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    |||| ||||||| ||||||  ||| | |||||||||||||||    
T  12529138 tcaatctttactgttttatttgatgtaggacatataactcac 12529179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 114 - 195
Target Start/End: Original strand, 31899496 - 31899577
Alignment:
Q  114 taaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  31899496 taaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacatttactattttatccgatgtggaacatataactcac 31899577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 45 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 29676686 - 29676543
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    |||||||||||||| |||| | ||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||      ||||||||| |||||||||  |||| ||||    
T  29676686 gggaccgtccacatcgaggtttgaataaccccacaagcaagagagacaccacactcttacccaa------aaggcaatgagtttatgggttctctcactt 29676593  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactca 194  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||||||| || || |||||||||||||    
T  29676592 ataatgtgttcaatctttactcttttatccaatgtgagacatataactca 29676543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 92 - 177
Target Start/End: Original strand, 31259664 - 31259749
Alignment:
Q  92 accacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgat 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||    
T  31259664 accacactcttacccaaaaccttaaggtgataggtttatgggtcatcttacttataaggtgttgaacctttactcttttatccgat 31259749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 51 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 16591034 - 16590881
Alignment:
Q  51 gtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataaga 150  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| |||  | | ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||          
T  16591034 gtccacattgaggctagaacaaccccacaagtaagagagacattagattcttacttaaaaccttaaggcaatgtgtttatgggtcctcttactt------ 16590941  T
Q  151 tgttcaacctttac-tattttatccgatttgggacatataactcactaatgcacacaaca 209  Q
    |||||||||||||| | ||||||  ||| |||||||||||||||||   |||||||||||    
T  16590940 tgttcaacctttactttttttatttgatgtgggacatataactcacacttgcacacaaca 16590881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 45 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 3673225 - 3673122
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  ||| || |||||| ||| |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||  ||||||||||    
T  3673225 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacactagtaagagagacatcacactcttagccaaaatcttaaagcaatgagtttatggatcctcttactt 3673126  T
Q  145 ataa 148  Q
    ||||    
T  3673125 ataa 3673122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 48 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 3672855 - 3672773
Alignment:
Q  48 accgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat 130  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||  |||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3672855 accgtccacatcgagactagaacaaccacacaattaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggtttat 3672773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 84 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 30313295 - 30313170
Alignment:
Q  84 agagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatttggga 183  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| ||||| ||||||||| ||||||||||  ||| || |||||||| || ||    
T  30313295 agagagacgccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttttgggtcctctcacttataag-tgttcaacctccacttttctatccgatgtgaga 30313197  T
Q  184 catataactcactaatgcacacaacaa 210  Q
    |||||||| |||   ||||||||||||    
T  30313196 catataacacacgcttgcacacaacaa 30313170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 124 - 210
Target Start/End: Original strand, 38796298 - 38796384
Alignment:
Q  124 ggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcactaatgcacacaacaa 210  Q
    ||||||| || ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  38796298 ggtttataggtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaa 38796384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 93 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 30323573 - 30323456
Alignment:
Q  93 ccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataact 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||| |||  ||||||||||  | | || |||| |||||||||||||||||     
T  30323573 ccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttataggtcctctcacttctaaagtgttcaacctccaattttctatctgatttgggacatataaca 30323474  T
Q  193 cactaatgcacacaacaa 210  Q
    |||   ||||||||||||    
T  30323473 cacacttgcacacaacaa 30323456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 94 - 209
Target Start/End: Original strand, 33561501 - 33561616
Alignment:
Q  94 cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactc 193  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||||  |||| |||||  ||| || |||| ||| ||| |||||||||||    
T  33561501 cacactcttacccaaaaccttaagacaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgtttaacctccacttttctatctgatgtggaacatataactc 33561600  T
Q  194 actaatgcacacaaca 209  Q
    ||   |||||||||||    
T  33561601 acacttgcacacaaca 33561616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 93 - 191
Target Start/End: Original strand, 29874072 - 29874170
Alignment:
Q  93 ccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataac 191  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||||  ||||||||||  ||| || |||| ||| |||||||||||||    
T  29874072 ccacactcttatccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcccaattataaagtgttcaacctccacttttctatctgatgtgggacatataac 29874170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 45 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 9231406 - 9231257
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    |||| |||||||||  ||| ||||| ||| ||| |||  ||||| | || ||||||||| ||||||| |||||||  |||||| ||||  ||||||| ||    
T  9231406 gggatcgtccacatcaaggttagaataaccgcataagttagagagatactacactcttaaccaaaactttaaggcggtgggttgatggatcctcttattt 9231307  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactca 194  Q
    |||| |||||||||||||||| || |||| ||| || |||||||||||||    
T  9231306 ataatatgttcaacctttacttttctatctgatatgagacatataactca 9231257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 145 - 210
Target Start/End: Original strand, 36785664 - 36785729
Alignment:
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcactaatgcacacaacaa 210  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  36785664 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaa 36785729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 48 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 6421780 - 6421688
Alignment:
Q  48 accgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctctt 140  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||  ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||| ||||||    
T  6421780 accgtccacatcgaggccggaacaaccacacaagttagagagacaccacactcttacccaaaacctttagtcaataggtttatgggtcctctt 6421688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 94 - 210
Target Start/End: Original strand, 29873587 - 29873703
Alignment:
Q  94 cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactc 193  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||  |||||||| |||||||||||  ||| || |||| ||| |||||||| |||| |    
T  29873587 cacactcttactcaaaaccttaaggcaatgagtttatgagtcctcccacttataaaatgttcaacctccacttttctatctgatgtgggacatgtaacac 29873686  T
Q  194 actaatgcacacaacaa 210  Q
    ||   ||||||||||||    
T  29873687 acccttgcacacaacaa 29873703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 84 - 195
Target Start/End: Original strand, 37894732 - 37894843
Alignment:
Q  84 agagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatttggga 183  Q
    ||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||| | | ||||||||||||| | || | |||||||| || ||| | || |||||    
T  37894732 agagacacaccacacttttaaccaaaatcttaaggcaatggatttatgagtcttcttacttataaggtttttagcctttacttttctattcaatgtggga 37894831  T
Q  184 catataactcac 195  Q
    ||||||||||||    
T  37894832 catataactcac 37894843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 97 - 186
Target Start/End: Original strand, 28254165 - 28254254
Alignment:
Q  97 actcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacat 186  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| | ||||||| | ||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||| || |||||    
T  28254165 actcttaccctaaactttaaggcaaagtgtttatgagtcctcttacttataaagtgttcaacctttacttttctatccgatgtgagacat 28254254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 76 - 149
Target Start/End: Original strand, 36784292 - 36784365
Alignment:
Q  76 cacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataag 149  Q
    ||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||    
T  36784292 cacaagcaagagagacacaacacttttatccaaaaccttaagacaaagggtttatgggtcatcttacttataag 36784365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 94 - 209
Target Start/End: Original strand, 33953821 - 33953936
Alignment:
Q  94 cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactc 193  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||| ||||| |||||||   ||||||||||  ||| || |||| ||| |||||| ||||||||    
T  33953821 cacactcttacccaaaattttaaggcaacaggtttatgggtcctctcacttatatagtgttcaacctccacttttctatctgatgtgggacttataactc 33953920  T
Q  194 actaatgcacacaaca 209  Q
    ||   |||||||||||    
T  33953921 acatttgcacacaaca 33953936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 90 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 31385849 - 31385779
Alignment:
Q  90 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacct 160  Q
    ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| || |||||||    
T  31385849 acaccacacttattcccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctttcacttataaggtgctcaacct 31385779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 138
Target Start/End: Original strand, 35580494 - 35580534
Alignment:
Q  98 ctcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctc 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  35580494 ctcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctc 35580534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 95 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 12910335 - 12910236
Alignment:
Q  95 acactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactca 194  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||  | | | | |||||||||  ||||||||| |||| ||  ||||||| ||| ||||||||||||    
T  12910335 acactcttacccaaaaccttaagacaatgaatttataagtcatttcacttataaggggttcaacctgtacttttccatccgatgtggaacatataactca 12910236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 45 - 112
Target Start/End: Original strand, 31899103 - 31899170
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaacc 112  Q
    |||||||| ||||| |||| ||||| |||  ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  31899103 gggaccgttcacatcgaggttagaagaaccccacaagcaagagagatacctcactcttacccaaaacc 31899170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 6421352 - 6421314
Alignment:
Q  154 tcaacctttactattttatccgatttgggacatataact 192  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  6421352 tcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataact 6421314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 8904587 - 8904498
Alignment:
Q  42 tgagggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgg 132  Q
    ||||||||| |||||||| |||| ||| |||  ||| |||  ||||| |||||||||| |||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  8904587 tgagggaccatccacatt-aggcaagagcaatagcataagtgagagagacaccacacttttacccaaaaccatatggcaattggtttatgg 8904498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 90 - 148
Target Start/End: Original strand, 25390314 - 25390372
Alignment:
Q  90 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataa 148  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||| | ||||| ||||||    
T  25390314 acaccacacttctacccaaaaccttaagacaataggtttatgggtcttcttagttataa 25390372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 84 - 133
Target Start/End: Original strand, 22062834 - 22062883
Alignment:
Q  84 agagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||  |||||||||    
T  22062834 agagaaacaccacactcttacccaaaaccataaaacaataagtttatggg 22062883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 84 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 28226455 - 28226406
Alignment:
Q  84 agagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 133  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||    
T  28226455 agagagacaccacactcttacctaaaaccctaagacaatgtgtttatggg 28226406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 95 - 148
Target Start/End: Original strand, 41678419 - 41678471
Alignment:
Q  95 acactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataa 148  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||    
T  41678419 acactcttactcaaaaccttaaggcaa-aggtttatgggtcctctcacttataa 41678471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 64)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 45 - 195
Target Start/End: Original strand, 44290825 - 44290976
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactctt-acccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttact 143  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44290825 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagatacaccacactctttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 44290924  T
Q  144 tataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44290925 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcac 44290976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 45 - 195
Target Start/End: Original strand, 44290459 - 44290609
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44290459 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgtacaagcaagaaagacaccatactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 44290558  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44290559 ataagatgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcac 44290609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 45 - 192
Target Start/End: Original strand, 3537600 - 3537747
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||     
T  3537600 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaagccaatgggtttataggtcctcttactc 3537699  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataact 192  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3537700 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataact 3537747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 45 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 14319024 - 14318875
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||    
T  14319024 gggaccgtccacattgaggctagaacaaccgcacaaataagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatagatttatgggtcttcttactt 14318925  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactca 194  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  14318924 ataaggtgttcaacctttactattttatccgacgtggaacatataactca 14318875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 47 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 17294733 - 17294584
Alignment:
Q  47 gaccgtccacattgaggctagaacaac-tgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactta 145  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17294733 gaccgtccacatcgaggctagagcaacctgcataagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta 17294634  T
Q  146 taagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    |||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17294633 taaagtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcac 17294584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 42 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 41157535 - 41157367
Alignment:
Q  42 tgagggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctctta 141  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  41157535 tgagggaccgcccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagacagacaccacactcttactcaaaacctaaaggcaatgggtttatgggtcctctta 41157436  T
Q  142 cttataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcactaatgcacacaacaa 210  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  41157435 cttataaggtgttcaacttttactcttttatctgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaa 41157367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 45 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 41142530 - 41142379
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactctt-acccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttact 143  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  41142530 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacgccacactctttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtccttttact 41142431  T
Q  144 tataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41142430 tataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtgggacatataactcac 41142379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 52 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 34365075 - 34364917
Alignment:
Q  52 tccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagat 151  Q
    ||||||| |||| |||| |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  34365075 tccacatcgaggttagagcaactgcataagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttatgggtcctcttacttataaggt 34364976  T
Q  152 gttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcactaatgcacacaacaa 210  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||   ||||||||||||    
T  34364975 gttcaacctttattattttatccgatgtgtgacatataactcacacttgcacacaacaa 34364917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 45 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 41157148 - 41156983
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  41157148 gggaccgcccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaatagagacaccacactcttacccaaaaccttaaagcaatgagtttatgggtcctcttactt 41157049  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcactaatgcacacaacaa 210  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||   ||||||||||||    
T  41157048 ataaggtgttcaacctttactcttttatccgttatgggacatataattcacacttgcacacaacaa 41156983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 53 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 37556260 - 37556118
Alignment:
Q  53 ccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatg 152  Q
    |||||| |||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  37556260 ccacatcgaggcttgaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttat-ggtcctcttacttataagatg 37556162  T
Q  153 ttcaacctttacta-ttttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37556161 ttcaacctttactatttttatccgatgtgggacatataactcac 37556118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 45 - 195
Target Start/End: Original strand, 26661523 - 26661673
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    ||||||||||| || |||||| |||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  26661523 gggaccgtccatatcgaggcttgaacaaccacacaagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctctcactt 26661622  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  26661623 ataaggtgttcaacctttactcttttacccgatgtgggacatataactcac 26661673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 45 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 41759640 - 41759490
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||||||    
T  41759640 gggaccgtccacatcaaggctagaacaaccacataagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggatttatggatcatcttactt 41759541  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  41759540 ataaggtgttcaacttttactattttatccgatgtgtgacatataactcac 41759490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 48 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 3550871 - 3550727
Alignment:
Q  48 accgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttata 147  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  3550871 accgtccacatcgaggctagaacaaccg---tagcaagagagacaccacactcttacccaaaactttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttata 3550775  T
Q  148 agatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  3550774 aggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcac 3550727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 47 - 195
Target Start/End: Original strand, 48588491 - 48588639
Alignment:
Q  47 gaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttat 146  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| | ||||||||||    
T  48588491 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagtaagagagacaccgcactcttacccaaaaccttaaggcaatgaatttacgggtcttcttacttat 48588590  T
Q  147 aagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||    
T  48588591 aaggtgttcaacctttactattttatccgatgtcggacatagaactcac 48588639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 52 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 34364657 - 34364499
Alignment:
Q  52 tccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagat 151  Q
    ||||||| ||||||||| |||| ||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||| |    
T  34364657 tccacatcgaggctagagcaaccgcataagcgagagagacatcacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttacggatcctcttacttataaggt 34364558  T
Q  152 gttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcactaatgcacacaacaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||   ||||||||||||    
T  34364557 gttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacacttgcacacaacaa 34364499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 45 - 195
Target Start/End: Original strand, 50052025 - 50052174
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    ||||| |||||||| |||| |||||||||  || || ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||| ||||||||||    
T  50052025 gggactgtccacatcgaggttagaacaaca-cataaacaagagagacaccacactcttacccaaaactttaagaaaataggtttatgggtcctcttactt 50052123  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50052124 ataagatgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcac 50052174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 52 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 40082556 - 40082414
Alignment:
Q  52 tccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagat 151  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |  ||||||||||||||| |    
T  40082556 tccacatcgaggctagaacaaacgcacaagcaagagagataccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgaatttat-gatcctcttacttataaggt 40082458  T
Q  152 gttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  40082457 gttcaacctttactattttatccgatgtaggacatataactcac 40082414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 48 - 210
Target Start/End: Original strand, 66476 - 66638
Alignment:
Q  48 accgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttata 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || | | ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||  |||||||||||||    
T  66476 accgtccacattgaggctagaacaaccgcacaagcgagagagacgctatactcttacccaaaaccttaaggccatatgtttatggatcctcttacttata 66575  T
Q  148 agatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcactaatgcacacaacaa 210  Q
    || ||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||||||||||   ||||||||||||    
T  66576 aggtgttcaacctttacttttctatccgatatggaacatataactcacacttgcacacaacaa 66638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 45 - 195
Target Start/End: Original strand, 5319966 - 5320116
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  || |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||    
T  5319966 gggaccgtctacattgaggctagaacaaccacataagcaagagagacactacactcttacccaaaaccttaaggctatgagtttatgggtcctctcactt 5320065  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||||| |||||||| |||||| || |||||||| ||| |||||||||||||    
T  5320066 ataaggtgttcaacttttacttttctatccgatgtggaacatataactcac 5320116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 45 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 11977437 - 11977287
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |  |||||||||    
T  11977437 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacttgcaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaaggcattaggtttatgagtgctcttactt 11977338  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  11977337 ataaggtgttcaacatttactgttttacccgatgtgggacatataactcac 11977287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 69 - 195
Target Start/End: Original strand, 32594741 - 32594867
Alignment:
Q  69 acaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacctttactatt 168  Q
    |||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32594741 acaattgcacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactatt 32594840  T
Q  169 ttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||||| ||| | |||||||||||||||    
T  32594841 ttatctgatgtaggacatataactcac 32594867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 45 - 210
Target Start/End: Original strand, 31767162 - 31767327
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||    
T  31767162 gggaccgtccacatcgagtctagaacaaccacacaagcaagatagacgtcacactcttacccaaaaccttaaggcattaggttaatgggtcctcttactt 31767261  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcactaatgcacacaacaa 210  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||   ||||||||||||    
T  31767262 ataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtggaacatataacccacacttgcacacaacaa 31767327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 46 - 210
Target Start/End: Original strand, 3875333 - 3875497
Alignment:
Q  46 ggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactta 145  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||  ||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  3875333 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacactagtgagagagactccacattcttacctaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttactta 3875432  T
Q  146 taagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcactaatgcacacaacaa 210  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  3875433 taaggtgtacaacctttacttttttatccgatgtgtgacatataactgactcttgcacacaacaa 3875497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 60 - 195
Target Start/End: Original strand, 38804371 - 38804506
Alignment:
Q  60 gaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacc 159  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||    
T  38804371 gaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacactacactcttacccaaaaccttaaggttatgggtttatggatcctcttacttataatgtgttcaacc 38804470  T
Q  160 tttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    |||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||    
T  38804471 tttactcttttattcgatgtgggacgtataactcac 38804506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 45 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 29798356 - 29798206
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    ||||||||| | || |||| |||||||||  |||  |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  29798356 gggaccgtctatatcgaggttagaacaaccacacttgcaagagagacaccacactcttatccaagaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttactt 29798257  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||    
T  29798256 ataaggtgttcaacctttactattttatccaatgtaggacatataactcac 29798206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 45 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 34649595 - 34649445
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||   ||||    
T  34649595 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacactagcaagagagacgcctcactcttacccaaaaccttaaggcattaggtttatgggttcttgcactt 34649496  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34649495 ataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcac 34649445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 45 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 9956066 - 9955914
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggttt-atgggccctcttact 143  Q
    |||||||  ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  9956066 gggaccgctcacatcgaggctagagcaaccgcacaagcaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaaggcaattggtttaatgggtcctcttact 9955967  T
Q  144 tataagatgttcaacctttac-tattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    |||||  |||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  9955966 tataatgtgttcaacctttactttttttatctgatgtgggacatataactcac 9955914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 67 - 195
Target Start/End: Original strand, 26661921 - 26662049
Alignment:
Q  67 gaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacctttacta 166  Q
    |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||     
T  26661921 gaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatcggtttatgggtcttctcacttataaggtgttcaacctttactc 26662020  T
Q  167 ttttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  26662021 ttttatctgatatgggatatataactcac 26662049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 51 - 209
Target Start/End: Original strand, 24600321 - 24600479
Alignment:
Q  51 gtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataaga 150  Q
    |||||||| ||||||||||||||   || ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |  ||||||||||||| |    
T  24600321 gtccacatcgaggctagaacaaccatactagcgagagagacaccacactcttacacaaaaccttaagacaatgagtttatgagttctcttacttataata 24600420  T
Q  151 tgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcactaatgcacacaaca 209  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||    
T  24600421 tgttcaacctttacttttctatccgatatgggacatataactcacacttgcacacaaca 24600479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 45 - 210
Target Start/End: Original strand, 37850601 - 37850766
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||  ||||| |||||||||||||| || |||||||||  || | ||||||||||  |||||||||    
T  37850601 gggaccgtccacatcgaggctagagcaaccgcacaagtgagagagacaccacactcttatccgaaaccttaaaacattaggtttatgggttctcttactt 37850700  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcactaatgcacacaacaa 210  Q
    ||||| |||||||||| |||| |||||| |||| |||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  37850701 ataaggtgttcaacctctactgttttatgcgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaa 37850766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 45 - 209
Target Start/End: Original strand, 22077496 - 22077660
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    ||||||||||| || || ||| ||||||| ||| |||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||||    
T  22077496 gggaccgtccatatcgatgcttgaacaaccgcataagtgagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggctacgagtttatgggtcctcttactt 22077595  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcactaatgcacacaaca 209  Q
    ||||| ||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||   |||||||||||    
T  22077596 ataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgagacatataactcacacttgcacacaaca 22077660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 45 - 175
Target Start/End: Original strand, 32168699 - 32168823
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||         
T  32168699 gggactgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaacctcaaggcaatgggtttatgggtcctct----- 32168793  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccg 175  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32168794 -taaggtgttcaacctttactattttatccg 32168823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 45 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 45084533 - 45084389
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    |||||||||| ||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |       ||||||| ||||||||||    
T  45084533 gggaccgtccgcatcgaggttagaacaaccgcacaagcaagagagacaccactctcttacccaaaaccttaagacg------ttatgggtcctcttactt 45084440  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  45084439 ataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtgggagatataactcac 45084389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 45 - 190
Target Start/End: Original strand, 45493975 - 45494124
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||  || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||    
T  45493975 gggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccacataaggaagagagacaccacactcttatccaaaactttaaggcaatgggtttatggatcatcttactt 45494074  T
Q  145 ataa----gatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataa 190  Q
    |||     | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45494075 atatatatggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataa 45494124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 53 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 37555878 - 37555737
Alignment:
Q  53 ccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatg 152  Q
    |||||| |||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||  || ||||||||||||||  |     
T  37555878 ccacatcgaggcttgaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctaaggattta-aggtcctcttacttataatgta 37555780  T
Q  153 ttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  37555779 ttcaaccttcactattttatccgatgtgggacttataactcac 37555737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 108 - 210
Target Start/End: Original strand, 41184489 - 41184591
Alignment:
Q  108 aaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcactaatgcacacaa 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||   |||||||||    
T  41184489 aaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaagtgttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacacttgcacacaa 41184588  T
Q  208 caa 210  Q
    |||    
T  41184589 caa 41184591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 61 - 210
Target Start/End: Original strand, 39066217 - 39066366
Alignment:
Q  61 aggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacct 160  Q
    |||||||||||||  || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||    
T  39066217 aggctagaacaaccacataagtaagagagacaccacactcttatccaaaaccttaagacaatgattttatgggtcatcttagttataaggtgttcaacct 39066316  T
Q  161 ttactattttatccgatttgggacatataactcactaatgcacacaacaa 210  Q
    ||||| || |||||||| ||| | |||||||||||   ||||||||||||    
T  39066317 ttacttttctatccgatgtggaatatataactcacacttgcacacaacaa 39066366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 52 - 192
Target Start/End: Original strand, 5528762 - 5528902
Alignment:
Q  52 tccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagat 151  Q
    ||||||| |||| ||||||||| ||| ||  |||||| || ||||||  |||||||||||||||||  |||| ||||||| | ||||||| |||||||||    
T  5528762 tccacatcgaggatagaacaaccgcataaagaagagagacgccacacatttacccaaaaccttaagaaaatgagtttatgagtcctcttatttataagat 5528861  T
Q  152 gttcaacctttactattttatccgatttgggacatataact 192  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  5528862 gttcaacctttactcttttatccgatgtgagacatataact 5528902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 45 - 179
Target Start/End: Original strand, 22077111 - 22077245
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||  || || ||  |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  22077111 gggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccgcataagtgagggagacgtcacactcttatccaaaaccttagggcaatgagtttatgggtcctcttactt 22077210  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgattt 179  Q
    ||||| | ||||||||||||| || ||||||||||    
T  22077211 ataaggtattcaacctttacttttctatccgattt 22077245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 46 - 195
Target Start/End: Original strand, 22077831 - 22077979
Alignment:
Q  46 ggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactta 145  Q
    ||||||||||||| || ||| ||||||| ||| |||  | ||| || |||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||    
T  22077831 ggaccgtccacatcgatgcttgaacaaccgcataagtgaaagagacgccacactcttaccccaaacctta-ggctatgagtttatgggtcctcttactta 22077929  T
Q  146 taagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    |||||||||||||||||| | || ||||||||||   |||||||||||||    
T  22077930 taagatgttcaacctttatttttctatccgatttaaaacatataactcac 22077979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 123 - 195
Target Start/End: Original strand, 3537226 - 3537298
Alignment:
Q  123 gggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3537226 gggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcac 3537298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 52 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 5575252 - 5575098
Alignment:
Q  52 tccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagat 151  Q
    ||||||| ||||||||||| ||  || |||  ||||| || ||||||||||| |||||||||||| || |||| ||||| || ||||||||||||||| |    
T  5575252 tccacatcgaggctagaactacctcataag--agagagacgccacactcttatccaaaaccttaaagctatggatttataggtcctcttacttataaggt 5575155  T
Q  152 gttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcactaatgcacacaacaa 210  Q
    |||||||||||||| || |||||||  |||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  5575154 gttcaacctttactcttctatccgacgtgggacatataattcac--atgcacacaacaa 5575098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 82 - 168
Target Start/End: Original strand, 44043810 - 44043896
Alignment:
Q  82 caagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacctttactatt 168  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  44043810 caagagagacaccacactcttacccaaaatcttaagacaatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacatttactatt 44043896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 93 - 186
Target Start/End: Original strand, 66136 - 66230
Alignment:
Q  93 ccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttc-aacctttactattttatccgatttgggacat 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| || |||||||| || |||||    
T  66136 ccacactcttacccaaaaccttaaggccataggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaaacctttacttttctatccgatgtgagacat 66230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 45 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 11977101 - 11977015
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 131  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  11977101 gggaccgtccacatcgaggctagaactaccgcacttgcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcattaggtttatg 11977015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 50 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 22793431 - 22793285
Alignment:
Q  50 cgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa-tgggtttatgggccctcttacttataa 148  Q
    |||||| |||||||| ||||||||  |||||| |||||| ||  ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||  ||||| ||||||||    
T  22793431 cgtccatattgaggccagaacaaccacacaagtaagagagacgtcacactcttactcaaaaccgtaaggcaaatgggtttatggatcctctcacttataa 22793332  T
Q  149 gatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
      | |||||||| |||| || ||| |||| |||||||||||||||||    
T  22793331 agttttcaacctctacttttctatacgatgtgggacatataactcac 22793285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 50 - 195
Target Start/End: Original strand, 24131994 - 24132136
Alignment:
Q  50 cgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataag 149  Q
    |||| |||| ||||||||||||||  ||| ||  ||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||  || |||| |||||||    
T  24131994 cgtctacatcgaggctagaacaaccacactagtgagagagacaccacact--tacccaaa-ccttaaggcaatgagtttatggatccccttatttataag 24132090  T
Q  150 atgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
     ||||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||    
T  24132091 gtgttcaacctttacttttctatccgatgagggacatataactcac 24132136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 121 - 210
Target Start/End: Original strand, 21378118 - 21378207
Alignment:
Q  121 atgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcactaatgcacacaacaa 210  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||   ||||||||||||    
T  21378118 atgggtttatgggtcctcttacttataagatattcaacctttactgttctatccgatctgggacatataactgacacttgcacacaacaa 21378207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 54 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 45839779 - 45839635
Alignment:
Q  54 cacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatg- 152  Q
    ||||| ||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |   |||||||| | ||||||||||||| ||     
T  45839779 cacatcgaggccagaacaatcccacaagcaagagagacaccacaatcttacccaaaaccttaaggcattacatttatgggtcttcttacttataaggtgt 45839680  T
Q  153 ----ttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactca 194  Q
        ||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||    
T  45839679 tcgattcaaccttta-ttttctatccgatgtgggacatataactca 45839635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 94 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 44685564 - 44685449
Alignment:
Q  94 cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaa-cctttactattttatccgatttgggacatataact 192  Q
    |||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| | ||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  44685564 cacactgttacccaaa-cattaaggcaatgagtttattggtcctcttacttataaggttttcaaacctttacttttctatccgatatgggacatataact 44685466  T
Q  193 cactaatgcacacaaca 209  Q
    |||   |||||||||||    
T  44685465 cacacttgcacacaaca 44685449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 96 - 195
Target Start/End: Original strand, 30630690 - 30630789
Alignment:
Q  96 cactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||  |||  |||||||| | ||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  30630690 cactcttacccaaaactttaaggcaatgtgtttatgggttctcttacttataaagtgtcaaacctttaattttttatccgatgtgagacatataaatcac 30630789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 84 - 209
Target Start/End: Original strand, 1188628 - 1188753
Alignment:
Q  84 agagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatttggga 183  Q
    ||||| || ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| | | ||| |||||||| || ||||||||  ||| || |||||||| ||| |    
T  1188628 agagagacgccacacttttacccaaaaccttaaagcaatgagtttatgagtcttctcacttataaaatattcaacctccacttttctatccgatatggaa 1188727  T
Q  184 catataactcactaatgcacacaaca 209  Q
    ||||||||||||   |||||||||||    
T  1188728 catataactcacacttgcacacaaca 1188753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 61 - 209
Target Start/End: Original strand, 19283472 - 19283620
Alignment:
Q  61 aggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacct 160  Q
    |||||||| |||| |||||||  ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||| | ||| ||  || |||||||    
T  19283472 aggctagagcaaccgcacaagtgagagagacgccacactcttatccaaaaccttaaggcgatgagtttatgtgtcctctcatttacaaagtgctcaacct 19283571  T
Q  161 ttactattttatccgatttgggacatataactcactaatgcacacaaca 209  Q
      ||| || |||||| | |||||||||||||||||   |||||||||||    
T  19283572 ccacttttctatccggtgtgggacatataactcacacttgcacacaaca 19283620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 75 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 4956320 - 4956218
Alignment:
Q  75 gcacaagcaagagaaacac--cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacctttactattttat 172  Q
    |||||||||||||| | ||  |||||| ||||| ||||| |||  |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  4956320 gcacaagcaagagatagacgtcacacttttacctaaaactttagagcaatgagtttatggatcctcttacttataagatgttcaacctttacttttctat 4956221  T
Q  173 ccg 175  Q
    |||    
T  4956220 ccg 4956218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 45 - 132
Target Start/End: Original strand, 50051690 - 50051776
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgg 132  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||  || || ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  50051690 gggaccgtccacatcgatgctagaacaaca-cataaacaagagagacaccacactcttacgcaaaaccttaagataatgggtttatgg 50051776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 136 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 4878869 - 4878796
Alignment:
Q  136 ctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcactaatgcacacaaca 209  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  4878869 ctctcacttataaaatgttcaagcttcactattttatccgatgtggaacatataactcacaattgcacacaaca 4878796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 147
Target Start/End: Original strand, 35154049 - 35154106
Alignment:
Q  90 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttata 147  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  35154049 acaccacactcttgccaaaaaccttaagacaatcagtttatgggccctcttacttata 35154106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 210
Target Start/End: Original strand, 35154127 - 35154205
Alignment:
Q  125 gtttatgggccctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcactaatgcacacaacaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||||       ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  35154127 gtttatgggccctcttacttata-------caacctttactcttttatctgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaa 35154205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 45 - 103
Target Start/End: Original strand, 21378060 - 21378118
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactctta 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | | || |||||||||||    
T  21378060 gggaccgtccacattgaggctagaacaaccacacaagcaatatagacgccacactctta 21378118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 10351278 - 10351202
Alignment:
Q  84 agagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacct 160  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||||  |||| ||||||||  ||||||||||    
T  10351278 agagagacgccacactcttacccaaaatcttaaagtaatgtgtttatgggttctctcacttataaagtgttcaacct 10351202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 148
Target Start/End: Original strand, 41184152 - 41184192
Alignment:
Q  108 aaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataa 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  41184152 aaaccttaaggcaatgggtttatggatcctcttacttataa 41184192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 94 - 131
Target Start/End: Original strand, 47380217 - 47380254
Alignment:
Q  94 cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 131  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  47380217 cacactcttacccaaaactttaaggcaatgagtttatg 47380254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 84 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 12466401 - 12466365
Alignment:
Q  84 agagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 120  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12466401 agagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggca 12466365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 121
Target Start/End: Original strand, 25293630 - 25293662
Alignment:
Q  89 aacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25293630 aacaccacactcttacccaaaaccttaaagcaa 25293662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 119; Significance: 7e-61; HSPs: 71)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 45 - 195
Target Start/End: Original strand, 40296316 - 40296466
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40296316 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacctcaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 40296415  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40296416 ataaggtgttcaaccttttctattttatccgatgtgggacatataactcac 40296466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 45 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 41170791 - 41170641
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41170791 gggaccgtctacaccgaggctagaacaaccacacaagcaagaaaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 41170692  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41170691 ataagatgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcac 41170641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 45 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 6500607 - 6500458
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  6500607 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttaaaggtcctcttactt 6500508  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  6500507 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgt-ggacatataactcac 6500458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 45 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 15370256 - 15370091
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||    
T  15370256 gggaccgtccacatcgaggctagaacaatcccacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctgtggatttatgggtcctcttactt 15370157  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcactaatgcacacaacaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  15370156 ataagatgttcaacctttactattttattcgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaa 15370091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 48 - 195
Target Start/End: Original strand, 18603124 - 18603271
Alignment:
Q  48 accgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttata 147  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18603124 accgtccacatcgaggctagaactaccacacaagcaagagagatgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 18603223  T
Q  148 agatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  18603224 aggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcac 18603271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 60 - 209
Target Start/End: Original strand, 13415776 - 13415925
Alignment:
Q  60 gaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacc 159  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  13415776 gaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggtaataggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacc 13415875  T
Q  160 tttactattttatccgatttgggacatataactcactaatgcacacaaca 209  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||    
T  13415876 tttactaatttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaaca 13415925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 43 - 195
Target Start/End: Original strand, 36492216 - 36492368
Alignment:
Q  43 gagggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttac 142  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||| || ||||||||    
T  36492216 gagggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttatccaaaacctaaaggtaatgtgtttattggtcctcttac 36492315  T
Q  143 ttataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36492316 ttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcac 36492368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 45 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 25328092 - 25327942
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  25328092 gggaccgtccacattgaggctagaacaaccacacttgcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcattaggtttatgggtcctcttactt 25327993  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  25327992 ataaggtgttcaacttttactgttttatccgatgtaggacatataactcac 25327942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 45 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 32487550 - 32487401
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||  || |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32487550 gggaccatccacatcgaggctagaacaaccacataagcaagagatacgtcacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 32487451  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32487450 at-aggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcac 32487401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 45 - 214
Target Start/End: Original strand, 3295346 - 3295513
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  3295346 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaacacactcttacc-aaaaccttaaggcaattggtttatgggtcctcttactt 3295444  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcactaatgcacacaacaagata 214  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||   | ||||||||||||||    
T  3295445 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggaacatat-actcacacttccacacaacaagata 3295513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 45 - 195
Target Start/End: Original strand, 42405599 - 42405747
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | ||| ||||||    
T  42405599 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagaga--caccacactcttacccaaaaccttaaggcattaggtttatgagtccttttactt 42405696  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  42405697 gtaaggtgttcaacctttactattttatccgatgttggacatataactcac 42405747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 45 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 6500979 - 6500830
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| ||    
T  6500979 gggaccgtccacatcgaggctagaataaccgcacaagtaagagagacaccacactcttatccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtccttttattt 6500880  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  6500879 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgt-ggacatataactcac 6500830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 45 - 210
Target Start/End: Original strand, 11416978 - 11417141
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    |||||| ||||||| || ||||||||||   ||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  11416978 gggaccatccacatcgaagctagaacaatcccacaagcaagagagagatcacactcttacacaaaaccttaaggcaatgggtttatggatcctcttactt 11417077  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcactaatgcacacaacaa 210  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  11417078 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggaacatataactcact--tgcacacaacaa 11417141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 45 - 195
Target Start/End: Original strand, 27502037 - 27502187
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  27502037 gggaccgtccacatcgaggatagaacaaccacacaagcaagagagacaccacacttttaccaaaaatcttaaggcaataggtttatgggtcctcttactt 27502136  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  27502137 ataaggtgtttaacctttactattttatccaatgtgggacatataactcac 27502187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 45 - 189
Target Start/End: Original strand, 3295016 - 3295160
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    ||||| |||||||| ||||||| ||||||  ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  3295016 gggactgtccacatcgaggctacaacaaccacacaaccaagagagacaccacactcatacccaaaacctcaaggcaatgggtttatgggtcttcttactt 3295115  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatata 189  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3295116 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatata 3295160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 48 - 192
Target Start/End: Original strand, 34753029 - 34753173
Alignment:
Q  48 accgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttata 147  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||    
T  34753029 accgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatcggtttatgggtcttcttacttata 34753128  T
Q  148 agatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataact 192  Q
    || |||||||| |||||| || ||||| || ||||||||||||||    
T  34753129 aggtgttcaacttttacttttctatccaatgtgggacatataact 34753173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 45 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 41632939 - 41632775
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    |||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||    
T  41632939 gggaccgtccacatcgagactaaaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaagcattgggtttatgggtcctcttactt 41632840  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcactaatgcacacaaca 209  Q
    ||||| ||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||   |||||||||||    
T  41632839 ataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgagacatataacttacacttgcacacaaca 41632775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 45 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 6224353 - 6224203
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||  ||  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||    
T  6224353 gggaccgtccatattgaggctagaccaaccgcacaagcaactgaggcaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgagtttatgggtcctcttactt 6224254  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  6224253 ataaggtgttcaacctttactcttttatccgaagtgggacatataactcac 6224203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 45 - 195
Target Start/End: Original strand, 9498656 - 9498805
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |  || || ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9498656 gggaccgtccacattgaggctagaccagca-cataaacaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 9498754  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||||    
T  9498755 ataaggtgttcaacctttactattctatctgatgtgagacatataactcac 9498805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 45 - 210
Target Start/End: Original strand, 12662653 - 12662818
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| |||  ||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||   ||||||||    
T  12662653 gggaccgaccacatcgaggctagaagaaccccacaagcaagaaaggcaccacactcttacccaaaaacttaagacaatggatttatgggttttcttactt 12662752  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcactaatgcacacaacaa 210  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  12662753 ataaaatgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaa 12662818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 48 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 624350 - 624203
Alignment:
Q  48 accgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttata 147  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  624350 accgtccacatcgaggctagaacaaccccacaagtgagagagacaccacactcttacccaaaacctcaaggctatgggtttatgggtcatcttacttata 624251  T
Q  148 agatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    |  |||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||    
T  624250 acgtgttcaacctttactattttatacaatgtgggacatataactcac 624203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 84 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 26074730 - 26074619
Alignment:
Q  84 agagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatttggga 183  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |    
T  26074730 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatatggaa 26074631  T
Q  184 catataactcac 195  Q
    ||||||||||||    
T  26074630 catataactcac 26074619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 45 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 299646 - 299496
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||| | |||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||    
T  299646 gggactgtccacatcgatgctagaacaaccgtacaagcaatagagacgccacactcttacacaaaaccttaaggctatgagtttatgggtcatcttactt 299547  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  299546 ataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtgggacatataactcac 299496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 45 - 195
Target Start/End: Original strand, 1028518 - 1028668
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||    
T  1028518 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagtgagagagacgccacactcttaccaaaaaccttaaggttataggtttatgggtcctcttactt 1028617  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||||  |||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  1028618 ataaagtgttcatcctttacttttctatccgatgtgggacatataactcac 1028668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 37 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 15370567 - 15370428
Alignment:
Q  37 gagcatgagggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccc 136  Q
    |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||| || |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  15370567 gagcatggaggaccgtccacatcgaggctagaacaaccccacaaacaagagagacgccacactcttacgcaaaaccttaaggctatgggtttatgggtcc 15370468  T
Q  137 tcttacttataagatgttcaacctttactattttatccga 176  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||    
T  15370467 tcttacttataaggtgttcaacatttactgtttcatccga 15370428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 43 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 33747930 - 33747783
Alignment:
Q  43 gagggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttac 142  Q
    |||| |||||||||||  ||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  33747930 gaggaaccgtccacatcaaggctagaacaaccgcataaggaagagagacaccacactcttatccaaaatcttaaggcaatgagtttatggatcctcttac 33747831  T
Q  143 ttataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataa 190  Q
    ||||||  | || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33747830 ttataaagtatttaacctttactattttatccgatgtgggacatataa 33747783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 45 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 35150163 - 35150014
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||  ||| ||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||    
T  35150163 gggacggtccacattgaggttagaacaaccacactagtgagagagacaccacacttttacccaaaaccttaagacaatggatttatggg-tctcttactt 35150065  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35150064 ataaggtgttcaaccttgactcttttatccgatgtgggacatataactcac 35150014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 84 - 209
Target Start/End: Original strand, 26074186 - 26074311
Alignment:
Q  84 agagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatttggga 183  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||||| || ||    
T  26074186 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggttcatgggtcctcttacatatgaggtgttcaacctttacttttttatccgatgtgtga 26074285  T
Q  184 catataactcactaatgcacacaaca 209  Q
    ||||||||||||   |||||||||||    
T  26074286 catataactcacacttgcacacaaca 26074311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 51 - 195
Target Start/End: Original strand, 26075168 - 26075313
Alignment:
Q  51 gtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactctt-acccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataag 149  Q
    |||||||| ||||||| ||||||  |||  |||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26075168 gtccacatcgaggctaaaacaaccacacttgcaagagagacgacacactctttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataag 26075267  T
Q  150 atgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  26075268 gtgttcaacctttactcttttatccgatgtgagacatataaatcac 26075313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 45 - 209
Target Start/End: Original strand, 36568570 - 36568732
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    |||||| ||||||| |||| |||||||||  ||||||  ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||||    
T  36568570 gggaccttccacatcgaggatagaacaaccacacaag--agagagacgccacactcttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttacgggtcatctcactt 36568667  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcactaatgcacacaaca 209  Q
    ||||| |||||||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||    
T  36568668 ataaggtgttcaacttttacttttctatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaaca 36568732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 45 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 623975 - 623825
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||  |  |||||||    
T  623975 gggaccgtctacattgaggctagaacaaccccacaagtgagagagacaccacactcttactcaaaaccttaaggctataagtttatggctcaacttactt 623876  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
     |||  |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  623875 gtaaagtgttcaacctttactattatatccgatgtgagacatataactcac 623825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 52 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 38427697 - 38427555
Alignment:
Q  52 tccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagat 151  Q
    ||||||| |||| ||||||||| |||||||  ||||| ||  ||||||||||| |||||||||||| |||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  38427697 tccacatcgaggttagaacaaccgcacaagtgagagagacgtcacactcttacacaaaaccttaagacaatggattaatgggtcctct-acttataagat 38427599  T
Q  152 gttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    |||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||    
T  38427598 gttcaacctttacttttctatccaatgtgggacatataactcac 38427555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 42 - 195
Target Start/End: Original strand, 24489204 - 24489355
Alignment:
Q  42 tgagggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctctta 141  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||| || ||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||   |||||    
T  24489204 tgagggaccgcccacatcgagactagaacaaccgcacaagtaaaagagacgccacactcttacgcaaaatcttaaggcaatgggtttatggg--ttctta 24489301  T
Q  142 cttataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    || ||||| |||| ||||||| || || |||| ||| |||||||||||||||||    
T  24489302 ctaataaggtgtttaaccttttcttttctatctgatgtgggacatataactcac 24489355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 79 - 195
Target Start/End: Original strand, 29549290 - 29549406
Alignment:
Q  79 aagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatt 178  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |||     
T  29549290 aagcaagagagacgccacactcttatccaaaaccttaaggtaatgtgtttatgggtcttcttacttatatggtgttcatcctttactattttatctgata 29549389  T
Q  179 tgggacatataactcac 195  Q
    ||| |||||||||||||    
T  29549390 tggaacatataactcac 29549406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 81 - 195
Target Start/End: Original strand, 26074818 - 26074933
Alignment:
Q  81 gcaagagaaacaccacactctt-acccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgattt 179  Q
    |||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  26074818 gcaagagagacgccacactctttacccaaaaccttaagacaataggtttatgggtcctcctacttatattgtgttcaacctttactcttttatccgatgt 26074917  T
Q  180 gggacatataactcac 195  Q
    ||||||||||||||||    
T  26074918 gggacatataactcac 26074933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 64 - 195
Target Start/End: Original strand, 5723811 - 5723942
Alignment:
Q  64 ctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaaccttta 163  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||| | |||||| |||||||||||||| ||||   || |||||  ||||||| |||||  |||||||| ||||    
T  5723811 ctagaacaaccgcacaagcaagagagacactatactctttcccaaaaccttaagacaataaattaatgggttctcttacatataatgtgttcaactttta 5723910  T
Q  164 ctattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5723911 ttattttatccgatgtgggacatataactcac 5723942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 45 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 35915006 - 35914857
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    ||||||||||||||||||| | || |||    | |||||||||| | |||||| ||||| |||| |  ||| |||||||| |||| ||| | ||||||||    
T  35915006 gggaccgtccacattgaggtttgaccaatcatataagcaagagagataccacattcttatccaataatttagggcaatggatttacgggtcttcttactt 35914907  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactca 194  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||    
T  35914906 ataaaatgttcaacctttactcttttatccgatgtgtgacatataactca 35914857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 107 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 42508707 - 42508619
Alignment:
Q  107 aaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||||| || |||||||| ||||| |||||| ||||    
T  42508707 aaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttattagatgtttaacctttacttttctatccgatgtgggatatataattcac 42508619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 76 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 301077 - 300970
Alignment:
Q  76 cacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccg 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||        |||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| |    
T  301077 cacaagcaagagagacaccacactcttaccaaaaatcttaaggcaatggatt--------ctcttacttataaggtattcaacctttactgttttatctg 300986  T
Q  176 atttgggacatataac 191  Q
    || |||||||||||||    
T  300985 atgtgggacatataac 300970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 52 - 165
Target Start/End: Original strand, 26590918 - 26591031
Alignment:
Q  52 tccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagat 151  Q
    ||||||| |||| |||||||||  ||| ||  ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||  ||||||||||||||| |    
T  26590918 tccacatcgaggttagaacaaccacactagtgagagagacgccacactcttactcaaaaccttaaggcattgaatttatggatcctcttacttataaggt 26591017  T
Q  152 gttcaacctttact 165  Q
    ||||||||||||||    
T  26591018 gttcaacctttact 26591031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 95 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 2411114 - 2411014
Alignment:
Q  95 acactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactca 194  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||  | ||||| || | ||||||||||||||    
T  2411114 acactcttactcaaaaccttaaggcaataagtttatgggttctcttacttacaagatgttcaacttttacttctctatccaatgtaggacatataactca 2411015  T
Q  195 c 195  Q
    |    
T  2411014 c 2411014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 75 - 195
Target Start/End: Original strand, 36522268 - 36522388
Alignment:
Q  75 gcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacctttactattttatcc 174  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||| |  | | || |||||    
T  36522268 gcacaagtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagataatgggtttattggtcctctcacttataaaatgttcaacttccatttttctatcc 36522367  T
Q  175 gatttgggacatataactcac 195  Q
     || || ||||||||||||||    
T  36522368 aatgtgagacatataactcac 36522388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 45 - 116
Target Start/End: Original strand, 26900018 - 26900089
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaa 116  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26900018 gggaccgtccacatcaaggctagaacaaacccacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaa 26900089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 94 - 195
Target Start/End: Original strand, 36521946 - 36522047
Alignment:
Q  94 cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataaga-tgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataact 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||| |||| ||||||||||  ||| || |||| ||| ||||||||||||||    
T  36521946 cacactcttacccaaaaccttaaggcaattggtttatgggtcctctcattta-aagagtgttcaacctcaacttttctatctgatgtgggacatataact 36522044  T
Q  193 cac 195  Q
    |||    
T  36522045 cac 36522047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 45 - 194
Target Start/End: Original strand, 35167839 - 35167988
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||  ||| ||   |||| ||| |||||||||||| ||||| | |||||||| | |||||||| | || |||||    
T  35167839 gggacagtccacatcgatgctagaacaaccacactagtgtgagagacatcacactcttaccaaaaacatcaaggcaatagatttatgggtcatcctactt 35167938  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactca 194  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| || || | ||||||||    
T  35167939 ataaggtgttcaacctttactcttttatctgatgtgagatacataactca 35167988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 84 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 13042657 - 13042608
Alignment:
Q  84 agagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 133  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13042657 agagagacaccacactcttatccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 13042608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 122 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 26074398 - 26074325
Alignment:
Q  122 tgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| | || |||| ||| |||||||||||||||||    
T  26074398 tgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaatctttagttttctatctgatgtgggacatataactcac 26074325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 118
Target Start/End: Original strand, 795254 - 795306
Alignment:
Q  66 agaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaagg 118  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  795254 agaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacctaaaaccttaagg 795306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 7768925 - 7768857
Alignment:
Q  127 ttatgggccctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  7768925 ttatgggtccttttacttataaggtgttcaacctttattattttatccgatgtaggatatataactcac 7768857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 45 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 38427376 - 38427306
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaacctta 115  Q
    ||||||| | |||| |||| ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  38427376 gggaccgccaacatcgaggttagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaatctta 38427306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 42 - 194
Target Start/End: Original strand, 41635189 - 41635341
Alignment:
Q  42 tgagggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctctta 141  Q
    |||||||| ||||||||| | | |||| ||||   ||||| || ||| | || ||||||||||| ||||  ||||| |||||| |||||||  |||||||    
T  41635189 tgagggacagtccacattaaagatagagcaaccatacaagtaaaagagatactacactcttacctaaaattttaagacaatggatttatggatcctctta 41635288  T
Q  142 cttataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactca 194  Q
     ||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||  |  ||||||||||||    
T  41635289 tttataaggtgttcaacatttactcttttatctgatgggaaacatataactca 41635341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 90 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 13112649 - 13112606
Alignment:
Q  90 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 133  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13112649 acaccacactcttatccaaaaccttaagacaatgggtttatggg 13112606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 31509718 - 31509615
Alignment:
Q  107 aaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcactaatgcacaca 206  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||  || |||||||  ||| || |||||||| || ||||||||||||||   ||||||||    
T  31509718 aaaacctcaaggcaatgagtttatgagtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatccgatgtgagacatataactcacacttgcacaca 31509619  T
Q  207 acaa 210  Q
    ||||    
T  31509618 acaa 31509615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 45 - 130
Target Start/End: Original strand, 13785633 - 13785718
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat 130  Q
    |||||||||||||| || | |||||||||   |||| | |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||  ||||||||||    
T  13785633 gggaccgtccacatcgaagttagaacaaccatacaaacgagagaaacaccacacttttacttaaaaccttaaggttatgggtttat 13785718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 84 - 133
Target Start/End: Original strand, 36389016 - 36389065
Alignment:
Q  84 agagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 133  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  36389016 agagaaacaccacactctgacccaaaaccctaaggcactgagtttatggg 36389065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 121 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 39309764 - 39309692
Alignment:
Q  121 atgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactca 194  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||||  |||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39309764 atgggtttatggtcc-tcttatttataatgtgttcaacatttacccttttatccgatgtgggacatataactca 39309692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 5963797 - 5963765
Alignment:
Q  88 aaacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5963797 aaacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 5963765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 24489623 - 24489583
Alignment:
Q  60 gaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactc 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24489623 gaggttagaacaactgcacaagcaagagagacaccacactc 24489583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 32446003 - 32445943
Alignment:
Q  84 agagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    ||||| |||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||    
T  32446003 agagagacaccacactttaacccaaaaccttaaggcgttgggtttatgggtcctctcactt 32445943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 42524811 - 42524724
Alignment:
Q  107 aaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    |||||||| || |||||| |||||| | ||||||| | ||||||||||||| ||||||| || |||||||| || ||||||||| ||||    
T  42524811 aaaaccttcagacaatggatttatgagtcctcttattcataagatgttcaa-ctttacttttctatccgatgtgagacatataattcac 42524724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 64 - 131
Target Start/End: Original strand, 9498343 - 9498410
Alignment:
Q  64 ctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 131  Q
    ||||||||||  |||  |||||||| || |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  9498343 ctagaacaaccacacttgcaagagagacgccacactcttactcaaatgcttaaggcaatgggtttatg 9498410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 93 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 19275637 - 19275543
Alignment:
Q  93 ccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatat 188  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| |||||  |||||||| | |||| |||||||| |||||||||| |||| || |||| |||||  |||||||    
T  19275637 ccacaatcttacccaaaatcttaagacaatgaatttatgggtcttcttccttataag-tgttcaacctctacttttctatctgatttaagacatat 19275543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 88 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 34103668 - 34103625
Alignment:
Q  88 aaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 131  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||    
T  34103668 aaacaccacactcttattcaaaaccttaaggcaatgagtttatg 34103625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 84 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 13042822 - 13042784
Alignment:
Q  84 agagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaat 122  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13042822 agagagacaccacattcttacccaaaaccttaaggcaat 13042784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 84 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 13112820 - 13112782
Alignment:
Q  84 agagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaat 122  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13112820 agagagacaccacattcttacccaaaaccttaaggcaat 13112782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 48 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 5660405 - 5660340
Alignment:
Q  48 accgtccacatt-gaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaacc 112  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||| ||| ||| ||||||||    
T  5660405 accgtccacatttgaggctagaacaaccacacaaacaagaaaaacaccatacttttatccaaaacc 5660340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 84 - 177
Target Start/End: Original strand, 13786041 - 13786133
Alignment:
Q  84 agagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgat 177  Q
    ||||| ||| |||||||||| |||||| |||||| |||| | |||| ||| | ||||||||||||  ||||||||| | ||| |||||||||||    
T  13786041 agagagacatcacactcttatccaaaatcttaagacaatagatttacgggtcatcttacttataaagtgttcaaccatcact-ttttatccgat 13786133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 84 - 145
Target Start/End: Original strand, 36527135 - 36527196
Alignment:
Q  84 agagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactta 145  Q
    ||||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||  ||||| |||||    
T  36527135 agagagacagcacactcttatccaaaatcttaaggcaatgcgtttatggatcctctcactta 36527196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 88 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 41341569 - 41341524
Alignment:
Q  88 aaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 133  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||    
T  41341569 aaacaccacattcttaccaaaaaccttaaggcaatgagtgtatggg 41341524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 6225104 - 6225052
Alignment:
Q  142 cttataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactca 194  Q
    |||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  6225104 cttataaggtgttcaacctttattcttttatctgatgtgggatatataactca 6225052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 167 - 195
Target Start/End: Original strand, 13785732 - 13785760
Alignment:
Q  167 ttttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13785732 ttttatccgatttgggacatataactcac 13785760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 78)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 45 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 35946679 - 35946529
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  35946679 gggaccgtccacatcgaggctagaacaattgcacaagcaagagagacaccacacttttacccaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttactt 35946580  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35946579 ataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtgggacatataactcac 35946529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 46 - 195
Target Start/End: Original strand, 43346793 - 43346942
Alignment:
Q  46 ggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactta 145  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  43346793 ggaccgtccacatagaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttactta 43346892  T
Q  146 taagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  43346893 taaggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcac 43346942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 45 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 22304726 - 22304576
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  22304726 gggactgtccacatcgagactagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgtgtttatgggtcctcttactt 22304627  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  22304626 ataaggtattcaacctttactattttatccgatgtgggacatatagctcac 22304576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 45 - 210
Target Start/End: Original strand, 42342389 - 42342554
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  42342389 gggaccgtccacattgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgtcacactcttacccaaaaccttaagacaatggatttatgggtcctcttactt 42342488  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcactaatgcacacaacaa 210  Q
    ||||| |||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  42342489 ataaggtgttgaacctttactcttttatcggatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaa 42342554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 45 - 195
Target Start/End: Original strand, 37990640 - 37990790
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  37990640 gggaccgtccacatcgaggctagaacaatcacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgagtcctcttactt 37990739  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  37990740 ataaggtgttcaacatttactattttatccgatgtggaacatataactcac 37990790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 37 - 195
Target Start/End: Original strand, 37990970 - 37991128
Alignment:
Q  37 gagcatgagggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccc 136  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| || ||    
T  37990970 gagcctgagggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacataagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcgatgagtttataggtcc 37991069  T
Q  137 tcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  37991070 tcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccaatgtgagacatataactcac 37991128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 45 - 210
Target Start/End: Original strand, 29644903 - 29645068
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  29644903 gggaccgtccacatcgaggctaaaacaaccgcataagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggtcctcttactt 29645002  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcactaatgcacacaacaa 210  Q
    ||||| |||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||   ||||||||||||    
T  29645003 ataaggtgtttaacctttactcttttatccgatgtgggacatataacttacacttgcacacaacaa 29645068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 45 - 209
Target Start/End: Original strand, 33803253 - 33803417
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||  || || || |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  33803253 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagagagggagacgccacactcttacccaataccttaatgcaatgggtttatgggtcctcttactt 33803352  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcactaatgcacacaaca 209  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  33803353 atatggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacaattgcacacaaca 33803417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 45 - 210
Target Start/End: Original strand, 12114563 - 12114728
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    ||||||| |||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  12114563 gggaccgaccacatcgtggctagaacaaccgcacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggtcctcttactt 12114662  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcactaatgcacacaacaa 210  Q
    ||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||   ||||||||||||    
T  12114663 ataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgggatatataacttacacttgcacacaacaa 12114728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 46 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 15773010 - 15772861
Alignment:
Q  46 ggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactta 145  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||    
T  15773010 ggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttatccaaaaccttaaagcaatgagtttatgggtcctcttactta 15772911  T
Q  146 taagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    |||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15772910 taaggtgttcaacatttactcttttatccgatatgggacatataactcac 15772861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 45 - 210
Target Start/End: Original strand, 25739426 - 25739591
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  25739426 gggaccgtccacatcgaggctagaactaccgcacaagctagagagacgtcacactcttacccaaaacctaaaagcaatgagtttatgggtcctcttactt 25739525  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcactaatgcacacaacaa 210  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  25739526 atatgatgttcaacttttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaa 25739591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 61 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 52634816 - 52634683
Alignment:
Q  61 aggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacct 160  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||    
T  52634816 aggctagaacaactgcacaagcaagagagacgtcacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg-tctcttacttataaggcgttcaacct 52634718  T
Q  161 ttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  52634717 ttactgttttatccgatgtgggacatataactcac 52634683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 45 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 32589860 - 32589696
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32589860 gggaccgtccacatcgagcctagaacaaccacacaagcaagagagacatcgcactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 32589761  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcactaatgcacacaacaa 210  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||  || |||||||||| ||||||   ||||||||||||    
T  32589760 ataaggtgttcaacctttattattttatcttatgtgggacatat-actcacacttgcacacaacaa 32589696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 45 - 195
Target Start/End: Original strand, 29644582 - 29644732
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    |||||| ||||||| || |||| |||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  29644582 gggaccatccacatcgaagctaaaacaaccgcataagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggttctcttactt 29644681  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  29644682 ataaggtgttcaacctttactctttaatccgatgtgggacatataactcac 29644732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 61 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 39389211 - 39389077
Alignment:
Q  61 aggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacct 160  Q
    |||||||||||| |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||    
T  39389211 aggctagaacaattgcacaggcaaaagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggtcctcttagttttaaggtgttcaacct 39389112  T
Q  161 ttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  39389111 ttactattttatccgatgtaggacatataactcac 39389077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 47 - 195
Target Start/End: Original strand, 32462903 - 32463052
Alignment:
Q  47 gaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttat 146  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||    
T  32462903 gaccgtacacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttactcaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcttcttacttat 32463002  T
Q  147 aagatgttcaacc-tttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||| | ||||||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  32463003 aaggtattcaaccttttactcttctatccgatgtgggacatataactcac 32463052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 52 - 193
Target Start/End: Original strand, 39934963 - 39935104
Alignment:
Q  52 tccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagat 151  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |    
T  39934963 tccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacatcacactcttactcaaaactttaaggcaatgggtttatggatcctcttacttataaggt 39935062  T
Q  152 gttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactc 193  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||    
T  39935063 gttcaacctttactcttttatccgatgtaggacatataactc 39935104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 45 - 210
Target Start/End: Original strand, 54017817 - 54017982
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    ||||||| |||||| || |||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| | ||||||||||    
T  54017817 gggaccgcccacatcgaagctagaacaaccacacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcgttaggtttatgagtcctcttactt 54017916  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcactaatgcacacaacaa 210  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||   ||||||||||||    
T  54017917 ataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtaggacatataactcacacttgcacacaacaa 54017982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 45 - 183
Target Start/End: Original strand, 41359766 - 41359904
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41359766 gggaccgcccacatcgaggctagaacaaccacacaagcgagagagacgccacattcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 41359865  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttggga 183  Q
    ||||| | |||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  41359866 ataaggtattcaacctttactattgtatccgatgtggga 41359904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 45 - 195
Target Start/End: Original strand, 54018199 - 54018349
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||    
T  54018199 gggaccgcccacatcgaggctagaacaaccacacaagcatgagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcgttaggtttatgggtcctcttactt 54018298  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||   |||||||||||||||    
T  54018299 ataaggtgttcaatctttactcttttatccgatgcaggacatataactcac 54018349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 46 - 210
Target Start/End: Original strand, 42342092 - 42342256
Alignment:
Q  46 ggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactta 145  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  42342092 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgagtcctcttactta 42342191  T
Q  146 taagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcactaatgcacacaacaa 210  Q
    ||||   || ||| |||||| ||||||||||| ||| |||||| | ||||   ||||||||||||    
T  42342192 taaggcattgaacatttactcttttatccgatgtggaacatatgaatcacacttgcacacaacaa 42342256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 70 - 196
Target Start/End: Original strand, 3135099 - 3135225
Alignment:
Q  70 caactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacctttactattt 169  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||  || ||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  3135099 caaccgcacaagcaagagagacaccacactcttactcaaaaccttatggcagtgggtttatgggttcttttacttataaggtgttcaacatttactattt 3135198  T
Q  170 tatccgatttgggacatataactcact 196  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||    
T  3135199 tatccgatgtgggacatataactcact 3135225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 50 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 15773346 - 15773184
Alignment:
Q  50 cgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaag--agaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttata 147  Q
    ||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| | |||||||||||||    
T  15773346 cgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagcaagagacatcacactcttacccaaaactttaaggcaatgagcttatgagtcctcttacttata 15773247  T
Q  148 agatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcactaatgcacacaacaa 210  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  15773246 agatgttcaacttttactcttttattcgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaa 15773184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 52 - 195
Target Start/End: Original strand, 22303963 - 22304099
Alignment:
Q  52 tccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagat 151  Q
    ||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||      
T  22303963 tccacatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacactcttatccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtccgcttacttataag-- 22304060  T
Q  152 gttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
         ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  22304061 -----acctttactattttatctgatgtgggacatataactcac 22304099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 45 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 53577521 - 53577356
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||||||  |||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||  || |||| ||    
T  53577521 gggaccatccacaccgaggctagaacaaccacacttgcaagagagacaccacactcttacccaagaccttaaggcaatatgtttatggatccacttattt 53577422  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcactaatgcacacaacaa 210  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||   ||||||||||||    
T  53577421 ttaagatgttcaacctttactgttttatccgatgtgtgacatataactcacacttgcacacaacaa 53577356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 45 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 8328065 - 8327897
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagca----agagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctctt 140  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||   |     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||  |||||    
T  8328065 gggagcgtccacatcgaggctagaacaactgcactcacttgtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcattacgtttatgggttctctt 8327966  T
Q  141 acttataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcactaatgcacacaaca 209  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||    
T  8327965 acttataagatattcatcctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaaca 8327897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 45 - 195
Target Start/End: Original strand, 21832346 - 21832494
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||   |||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||||    
T  21832346 gggactgtccacatcgaggctagaacaaccagacaagcaagagagacgccac--tcttacccaaaaccttaaggctatgagtttatgagtcctcttactt 21832443  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||||| ||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||    
T  21832444 ataaggtgttcaacctttacttttctatccaatgtgggacatataactcac 21832494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 45 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 25755551 - 25755401
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||| ||| | |||||| |||||| | ||||||||||    
T  25755551 gggaccatccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacacttttacccacaactttaggacaatggatttatgagtcctcttactt 25755452  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||||| | ||||||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||    
T  25755451 ataaggtattcaacctttactcttttatctgatgtgagacatataactcac 25755401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 144
Target Start/End: Original strand, 22303662 - 22303759
Alignment:
Q  47 gaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22303662 gaccgtctacatcgaggctagaacaatcgcacaagtaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 22303759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 45 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 31190166 - 31190009
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    |||| |||||| || ||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||        |||||| ||||| ||||    
T  31190166 gggagcgtccaaatcgaggctagaacaacccgacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc--------tatgggtcctctaactt 31190075  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcactaatgcacacaacaa 210  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||   ||||||||||||    
T  31190074 ataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatatcactcacacttgcacacaacaa 31190009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 45 - 216
Target Start/End: Original strand, 3135455 - 3135633
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat--gggccctcttac 142  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  3135455 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttatctaaaaccttaaggcaatgggtttatgggggtcctcttac 3135554  T
Q  143 -----ttataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcactaatgcacacaacaagatatt 216  Q
         | ||||| |||||||| |||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||   || ||||||||| |||||    
T  3135555 taatataataaggtgttcaacttttactcttttatctgaggtgggacatataactcacacttgtacacaacaacatatt 3135633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 47 - 210
Target Start/End: Original strand, 45395656 - 45395819
Alignment:
Q  47 gaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttat 146  Q
    |||| ||||||| ||||||||| ||||  ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  45395656 gaccctccacatcgaggctagagcaaccccacaagtgagagagacaccacactcttacccaaaacattaagacaatgggtttatggatcctcttacttat 45395755  T
Q  147 aagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcactaatgcacacaacaa 210  Q
    ||  |||| |||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||| ||   ||||||||||||    
T  45395756 aacgtgtttaacctttactcttttattcgatgtgggatatataacttacacttgcacacaacaa 45395819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 61 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 4823796 - 4823662
Alignment:
Q  61 aggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacct 160  Q
    ||||||||||| | ||| |||||| | | ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||| ||| |    
T  4823796 aggctagaacatccgcataagcaaaaaagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgggtcctcctacttataaggtgtttaactt 4823697  T
Q  161 ttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  4823696 ttactattttatccgatgtgagacttataactcac 4823662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 52 - 195
Target Start/End: Original strand, 49336694 - 49336838
Alignment:
Q  52 tccacattgaggctagaacaactgcacaagcaa-gagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataaga 150  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||  || |||| |||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||     
T  49336694 tccacattgaggatagaacaaccgcacaaaaaaagagagacaccacactcttacccagaactttaagactatgggtttatgggtcctcttacttataagg 49336793  T
Q  151 tgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    || |||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||||||    
T  49336794 tggtcaacctttacttttctatccgatgtgagacatgtaactcac 49336838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 55 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 39914399 - 39914244
Alignment:
Q  55 acattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgtt 154  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||  ||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||| ||||    
T  39914399 acatcgaggctagaacaaccgcataagtgagagagacaccacactcttatccaaaatattaaggcattaggtttatgggtcctcttatttataaggtgtt 39914300  T
Q  155 caacctttactattttatccgatttgggacatataactcactaatgcacacaacaa 210  Q
    |||||| |||| ||||||| ||| || ||||||||||||||   ||||||||||||    
T  39914299 caacctctactgttttatctgatgtgagacatataactcacacttgcacacaacaa 39914244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 49 - 192
Target Start/End: Original strand, 42584829 - 42584970
Alignment:
Q  49 ccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataa 148  Q
    |||||||||||||  |||||||||| ||| ||| ||||||  |||||||||||| | ||||| |||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  42584829 ccgtccacattgaaactagaacaaccgcataagtaagaga--caccacactctttctcaaaatcttaagacaattggtttatggatcctcttacttataa 42584926  T
Q  149 gatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataact 192  Q
    | ||||||| ||||||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  42584927 ggtgttcaatctttactcttctatccgatgtgggacatataact 42584970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 45 - 217
Target Start/End: Original strand, 53117976 - 53118147
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||||  |||  |  ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||   ||||| ||||    
T  53117976 gggaccgttcacatcgatgctagaacaaccacacttgtgagagagacactacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggttt-tgaatcctctcactt 53118074  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcactaatgcacacaacaagatattc 217  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||   ||| |||||||| ||||||    
T  53118075 ataaggtgttcaacctttactcttttatccgatatggaacatataactcacacttgcccacaacaacatattc 53118147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 45 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 45901871 - 45901720
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    |||||||||||||| || | |||||||||   | ||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||| | ||||||||||    
T  45901871 gggaccgtccacatcgaagttagaacaaccctataagtaagagagacaccacactcttaccaaaaactttaaggccatgagtttatgcgtcctcttactt 45901772  T
Q  145 ataagatgttcaacc-tttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||||| ||||||||| |||  | ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45901771 ataaggtgttcaacctttttttcttttatccgatgtgggacatataactcac 45901720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 45 - 195
Target Start/End: Original strand, 50612448 - 50612603
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtt-----tatgggccctct 139  Q
    |||||||||||| | |||| | |||||||  | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||  |||     |||| | |||||    
T  50612448 gggaccgtccacgtcgaggatggaacaaccactcaagcaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagataatatgttagatttatgagtcctct 50612547  T
Q  140 tacttataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50612548 tacttataaggtgttcaatctttactattttatccgatgtgggacatataactcac 50612603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 45 - 195
Target Start/End: Original strand, 1634316 - 1634466
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcaca-agcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttact 143  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  || | ||  ||||| | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  1634316 gggaccgtccacatcgaggctagaacaac--catatagtgagagagataccgcactcttacccaaaaccttaagccaatgggtttatgggtcctcttact 1634413  T
Q  144 tataagatgttcaacc-tttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    |||||  |||| |||| |||| | || |||||||| |||||||||||||||||    
T  1634414 tataatgtgtttaaccttttatttttctatccgatgtgggacatataactcac 1634466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 45 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 37726653 - 37726511
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||| ||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||| |        ||||||||||    
T  37726653 gggaccgtccacatcgaggctagaacaactatacaagtaagataaacgtcacactcttatccaaaacctaaaggcaatggat--------cctcttactt 37726562  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||||| | |||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  37726561 ataaggtattcaacatttactattttatccgatgtgagacatataactcac 37726511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 49 - 195
Target Start/End: Original strand, 32462563 - 32462710
Alignment:
Q  49 ccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataa 148  Q
    ||||| |||| ||||||| |||||   ||||| ||||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||  | ||||||||||||    
T  32462563 ccgtctacatcgaggctaaaacaatcccacaaacaagagagaccccacactcttatccaaaaccttaaagcaataggtttatggatcatcttacttataa 32462662  T
Q  149 gatgttcaacc-tttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    | ||||||||| |||||| ||| || |||| |||||||||||||||||    
T  32462663 ggtgttcaaccttttactctttcattcgatgtgggacatataactcac 32462710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 45 - 128
Target Start/End: Original strand, 41359492 - 41359575
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggttt 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  41359492 gggaccgtccacattgaggctagaacaaccgcacaagcaaaagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggttatgggttt 41359575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 45 - 192
Target Start/End: Original strand, 44160548 - 44160692
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  |||  || |||||| || ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||    
T  44160548 gggaccgtccacatcgaggctagaacaatcgca--agtaagagagacgccacattcttacc-aaaaccttaagacaatgggtttatggatcctcttattt 44160644  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataact 192  Q
    ||||| ||||||||||||| | |||||||| || ||  ||||||||||    
T  44160645 ataaggtgttcaacctttattgttttatccaatatgaaacatataact 44160692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 45 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 11662108 - 11661958
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaa-ccttaaggcaatgggtttatgggccctcttact 143  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||||  |||||  | |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||| |||    
T  11662108 gggactgttcacatcgaggctagaacaaccacacaatga-gagagacacctcactcttacccaaaaaccttaaggcaattggtttatgaggcctctcact 11662010  T
Q  144 tataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    | |||| ||||||||||||||| |||||||| || |||| ||| ||||||||    
T  11662009 tttaaggtgttcaacctttactcttttatccaatgtggggcatttaactcac 11661958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 51 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 9240300 - 9240142
Alignment:
Q  51 gtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataaga 150  Q
    |||||||| |||||||||| ||| |||| |   ||||| |||||||| ||||| || ||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||     
T  9240300 gtccacatcgaggctagaataaccgcactattgagagagacaccacattcttatccgaaatcttaaggtaatggatttatgggtcctcttacttataagg 9240201  T
Q  151 tgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcactaatgcacacaaca 209  Q
    |||||| | ||||||  | |||||||| ||| |||||||||||||   |||||||||||    
T  9240200 tgttcagcttttacttctctatccgatgtggaacatataactcacacttgcacacaaca 9240142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 78 - 176
Target Start/End: Original strand, 33362327 - 33362425
Alignment:
Q  78 caagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccga 176  Q
    ||||||||||| | ||  ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||    
T  33362327 caagcaagagagagacgccacacttacccaaaatcttaaggaaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtattcaacctttattattttatccga 33362425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 118 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 51886645 - 51886568
Alignment:
Q  118 gcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||    
T  51886645 gcaatgagtttatgggtcctcttacttatatgatgttcaacctttactattttattcgatgtgagacatataactcac 51886568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 132 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 11661605 - 11661542
Alignment:
Q  132 ggccctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11661605 ggccctcttacttataagatgtttaaccgttactattttatccgatgtgggacatataactcac 11661542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 94 - 195
Target Start/End: Original strand, 33175711 - 33175815
Alignment:
Q  94 cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat---gggccctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataa 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||   |||  |||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| ||| || |||||||||    
T  33175711 cacactcttacccaaaaccttaaggctatgagtttattatgggttctcttacttataaggtgttcaacctttacttttctatctgatgtgagacatataa 33175810  T
Q  191 ctcac 195  Q
    |||||    
T  33175811 ctcac 33175815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 84 - 209
Target Start/End: Original strand, 47964558 - 47964683
Alignment:
Q  84 agagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatttggga 183  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||    |||||||||  ||  || ||||||||  ||||    
T  47964558 agagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatgggtcctctcacttatatagcgttcaacctccacatttctatccgatgcggga 47964657  T
Q  184 catataactcactaatgcacacaaca 209  Q
    |||| |||||||   |||||||||||    
T  47964658 catacaactcacacttgcacacaaca 47964683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 84 - 209
Target Start/End: Original strand, 47964955 - 47965080
Alignment:
Q  84 agagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatttggga 183  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||  ||||| |||||  ||| || |||||||| |   |    
T  47964955 agagagacgccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggcttatgagccctctcacttatataatgtttaacctccacttttctatccgatgtaaaa 47965054  T
Q  184 catataactcactaatgcacacaaca 209  Q
    ||||||||||||   |||||||||||    
T  47965055 catataactcacacttgcacacaaca 47965080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 95 - 195
Target Start/End: Original strand, 3384317 - 3384417
Alignment:
Q  95 acactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactca 194  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||| |||||| |||||||  |||| ||||| |||| |||||||  || ||||||||||||||||    
T  3384317 acactcttacccaaaactttaaggcattaagtttatgggtcctcttccttataaagtgtttaacctatactgttttatcatatgtgggacatataactca 3384416  T
Q  195 c 195  Q
    |    
T  3384417 c 3384417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 110 - 194
Target Start/End: Original strand, 7767380 - 7767464
Alignment:
Q  110 accttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactca 194  Q
    |||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||  ||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  7767380 accttaagacaatgggtttatgagtcctcttagttataaagtgtccaacctttacttttctatccgatgtgggacatataactca 7767464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 45 - 132
Target Start/End: Original strand, 54017549 - 54017636
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgg 132  Q
    ||||||| |||||| ||||| | |||||   || ||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54017549 gggaccgaccacatcgaggccaaaacaatcacataagtaatagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgg 54017636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 160
Target Start/End: Original strand, 46546367 - 46546441
Alignment:
Q  86 agaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacct 160  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||  ||||||||||    
T  46546367 agaaacatcacactcttacacaaaaccttaaggcaatgggtttatggattctctaacttataaagtgttcaacct 46546441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 92 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 52635050 - 52634993
Alignment:
Q  92 accacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataag 149  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||    
T  52635050 accacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgggtcctcttatttataag 52634993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 133
Target Start/End: Original strand, 17731949 - 17731993
Alignment:
Q  89 aacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 133  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17731949 aacaccacactcttactcaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 17731993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 133
Target Start/End: Original strand, 19033180 - 19033224
Alignment:
Q  89 aacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 133  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19033180 aacaccacactcttactcaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 19033224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 22304297 - 22304253
Alignment:
Q  151 tgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22304297 tgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcac 22304253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 43346706 - 43346642
Alignment:
Q  146 taagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcactaatgcacacaacaa 210  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||   ||||||||||||    
T  43346706 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatacaactcacacttgcacacaacaa 43346642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 76 - 123
Target Start/End: Original strand, 39336002 - 39336049
Alignment:
Q  76 cacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatg 123  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39336002 cacaagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatg 39336049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 53596078 - 53596029
Alignment:
Q  84 agagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 133  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  53596078 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggtaacgggtttatggg 53596029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 53596393 - 53596344
Alignment:
Q  84 agagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 133  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  53596393 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggtaacgggtttatggg 53596344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 45 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 22304350 - 22304302
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacac 93  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  22304350 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacac 22304302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 95 - 195
Target Start/End: Original strand, 39336280 - 39336380
Alignment:
Q  95 acactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactca 194  Q
    ||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||  ||||| ||||||||  ||||||||||  |   || |||||||| ||||||||||||||||    
T  39336280 acactattatccaaaaccttaaagcaatgagtttatggatcctctcacttataaagtgttcaacctccaactttctatccgatgtgggacatataactca 39336379  T
Q  195 c 195  Q
    |    
T  39336380 c 39336380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 45 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 8328427 - 8328374
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacac 98  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  8328427 gggaccgtccacatcgaggctaaaacaaccccacaagcaagagagacaccacac 8328374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 88 - 133
Target Start/End: Original strand, 16871003 - 16871048
Alignment:
Q  88 aaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 133  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  16871003 aaacacgacactcttacctaaaaccttaaggcaatgagtttatggg 16871048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 88 - 133
Target Start/End: Original strand, 17735035 - 17735080
Alignment:
Q  88 aaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 133  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  17735035 aaacaccgcactcttacccaaaaccttaagtcaatgagtttatggg 17735080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 88 - 133
Target Start/End: Original strand, 19036304 - 19036349
Alignment:
Q  88 aaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 133  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  19036304 aaacaccgcactcttacccaaaaccttaagtcaatgagtttatggg 19036349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 84 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 53596593 - 53596544
Alignment:
Q  84 agagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 133  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||    
T  53596593 agagagacaccacactcttacctaaaatcttaagtcaatgggtttatggg 53596544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 84 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 11661638 - 11661603
Alignment:
Q  84 agagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11661638 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 11661603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 93 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 12749278 - 12749211
Alignment:
Q  93 ccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacct 160  Q
    ||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||| ||||  ||||||||  ||||||||||    
T  12749278 ccacactcttatcaaaaaccttaatgcaattggtttatgggtcctcacacttataaagtgttcaacct 12749211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 88 - 131
Target Start/End: Original strand, 16869841 - 16869884
Alignment:
Q  88 aaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 131  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||    
T  16869841 aaacaccacactcttgctcaaaaccttaaggcaatgagtttatg 16869884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 92 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 25991513 - 25991410
Alignment:
Q  92 accacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataac 191  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||| ||  |||| |||||||| ||||| ||| || |||  |||||  ||| |||||||||| ||    
T  25991513 accacactttaacccaaaaccttaaggcattaggtttataggttctctcacttataaaatgtttaacattaacttgtttatttgatgtgggacatattac 25991414  T
Q  192 tcac 195  Q
    ||||    
T  25991413 tcac 25991410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 90 - 133
Target Start/End: Original strand, 48127861 - 48127904
Alignment:
Q  90 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 133  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  48127861 acaccacactcttatccaaaacattaaagcaatgggtttatggg 48127904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 16143551 - 16143507
Alignment:
Q  89 aacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 133  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  16143551 aacactacactcttacccaaaactttaaggcaatgagcttatggg 16143507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 88 - 132
Target Start/End: Original strand, 16868427 - 16868471
Alignment:
Q  88 aaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgg 132  Q
    ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  16868427 aaacatcacactcttatccaaaatcttaaggcaatgagtttatgg 16868471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 111; Significance: 4e-56; HSPs: 72)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 45 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 3669844 - 3669694
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  3669844 gggaccatccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgagtcctcttactt 3669745  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  3669744 ataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcac 3669694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 48 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 3670214 - 3670067
Alignment:
Q  48 accgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttata 147  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  3670214 accgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggaaataggtttatgggtcctcatacttata 3670115  T
Q  148 agatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3670114 aggtgttaaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcac 3670067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 51 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 30441236 - 30441088
Alignment:
Q  51 gtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactta----t 146  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |    
T  30441236 gtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataatt 30441137  T
Q  147 aagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  30441136 aaggtgttcaacctttactattttagccgatgtgggacatataactcac 30441088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 46 - 195
Target Start/End: Original strand, 3038292 - 3038441
Alignment:
Q  46 ggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactta 145  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  3038292 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagatgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtccttttactta 3038391  T
Q  146 taagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3038392 taaagtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcac 3038441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 43 - 194
Target Start/End: Original strand, 33113366 - 33113517
Alignment:
Q  43 gagggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttac 142  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  33113366 gagggaccgtccgcattgagcctagaacaaccacactagcaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgggtcctcttac 33113465  T
Q  143 ttataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactca 194  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  33113466 ttataagacgttcaacctttactattttatccgatgtaggacatataactca 33113517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 45 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 34835366 - 34835216
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| |||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  34835366 gggaccgtctacatcgaggctagaataaccacacaagcaagagtgacaccacactcttacccaaaactttaaggcaatgagtttatgggtcctcttactt 34835267  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  34835266 ataaggtgttcaacctttactattttatcggatgtgggacatataactcac 34835216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 48 - 180
Target Start/End: Original strand, 9483191 - 9483323
Alignment:
Q  48 accgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttata 147  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9483191 accgtccacatcgaggctagaacaaccgcacgagcaaaagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggtcctcttacttata 9483290  T
Q  148 agatgttcaacctttactattttatccgatttg 180  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9483291 aggtgttcaacctttactcttttatccgatttg 9483323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 52 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 34835026 - 34834883
Alignment:
Q  52 tccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagat 151  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||| |    
T  34835026 tccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgagtcatcttacttataaggt 34834927  T
Q  152 gttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  34834926 gtttaacctttactattttatccaatgtgggacatataactcac 34834883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 47 - 196
Target Start/End: Original strand, 70277 - 70426
Alignment:
Q  47 gaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttat 146  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||| | ||  |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  70277 gaccgtccgcattgaggttagaacaaccacacaagcaagatagacgtcacactcttacctaaaaccttaaggcagtgggtttatgggtcctcttacttat 70376  T
Q  147 aagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcact 196  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  70377 aagatgttcaacatttactcttttatccgatgtgggacatataactcact 70426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 48 - 196
Target Start/End: Original strand, 9482608 - 9482756
Alignment:
Q  48 accgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttata 147  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9482608 accgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagataccacactcttatacaaaatctttaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 9482707  T
Q  148 agatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcact 196  Q
    || ||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  9482708 aggtgttcaacctttactcttttatcccatgtggaacatataactcact 9482756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 48 - 192
Target Start/End: Original strand, 18371998 - 18372142
Alignment:
Q  48 accgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttata 147  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  18371998 accgttcacattgaggctagagcaaccgcacaagcgagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaagcaatgagtttatggatcctcttacttata 18372097  T
Q  148 agatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataact 192  Q
    || ||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||    
T  18372098 aggtgttcaacctttactattttattggatgtggtacatataact 18372142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 52 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 30359421 - 30359278
Alignment:
Q  52 tccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagat 151  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| |    
T  30359421 tccacattgaggctaaaacaacatcacaagaaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttatgggtcctcttgcttataaggt 30359322  T
Q  152 gttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  30359321 gttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcac 30359278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 45 - 210
Target Start/End: Original strand, 6876863 - 6877029
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||| | ||||| ||    
T  6876863 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaaacaagagaaacaccacactcttacccaaaaccctaagacaatgagtgtatgggtcatcttattt 6876962  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggac-atataactcactaatgcacacaacaa 210  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||   ||||||||||||    
T  6876963 ataaggtgttcaacctttacttttttatccgatgtgggactatataactcacacttgcacacaacaa 6877029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 46 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 40518738 - 40518589
Alignment:
Q  46 ggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactta 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| |||    
T  40518738 ggaccgtccacattgaggctagaacaaccacacaagcaagagtgacgtcacactcttacccaaaaccttaagtcattgggtttatgggtcctcttattta 40518639  T
Q  146 taagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    |||| ||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||||||    
T  40518638 taaggtgttcaacctttacttttctatctgatgtgggacatataactcac 40518589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 54 - 195
Target Start/End: Original strand, 45122067 - 45122208
Alignment:
Q  54 cacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgt 153  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||  |||||||||||||| |||    
T  45122067 cacatcgaggctagaacaaccccacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagaaaatgagtttatgggttctcttacttataaggtgt 45122166  T
Q  154 tcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  45122167 tcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcac 45122208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 63 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 147590 - 147458
Alignment:
Q  63 gctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaaccttt 162  Q
    |||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  147590 gctagaactaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaactttaaggcaataggtttatgggtcctcttatttataaggtgttcaaccttt 147491  T
Q  163 actattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  147490 actcttttatccgatgtgggacatataactcac 147458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 49 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 9608898 - 9608738
Alignment:
Q  49 ccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataa 148  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  9608898 ccgtccacatcgaggctagaacaacctcactagcaagagagacgccacactcatacccaaaaccttaaggtgatgggtttatgggtcatcttacttataa 9608799  T
Q  149 gatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcactaatgcacacaaca 209  Q
    | ||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||    
T  9608798 ggtgttcaacctttacttttctatccgatatgggacatataactcacacttgcacacaaca 9608738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 46 - 189
Target Start/End: Original strand, 20870575 - 20870718
Alignment:
Q  46 ggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactta 145  Q
    |||||||||| ||  ||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  20870575 ggaccgtccatatcaaggttagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttatccaaaatcttaaggcagtgggtttatgggtcctcttactta 20870674  T
Q  146 taagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatata 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||    
T  20870675 taagatgttcaacctttactattttatctgatgtggaacatata 20870718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 45 - 195
Target Start/End: Original strand, 37544491 - 37544641
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||| |||    
T  37544491 gggatcgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagtaagaaagacaccacactcttacccaaaaccttaaagtaatggatttatgggtcctctttctt 37544590  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  37544591 ataatgtgttcaacctttactattttatccgatgtgcgacttataactcac 37544641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 45 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 45122781 - 45122649
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  45122781 gggaccttccacatcgaggcttgaacaaccacacaagcaagagagacgccacactcatacccaaaaccttaagacaatgagtttatgggtcctcttactt 45122682  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgat 177  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  45122681 ataaggtgttcaacctttactattttatccgat 45122649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 52 - 195
Target Start/End: Original strand, 1014253 - 1014396
Alignment:
Q  52 tccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagat 151  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||| ||| ||||||||||||||| |    
T  1014253 tccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaggagagacaccacactcttacccaaaactttaaggtaacgagtttacgggtcctcttacttataaggt 1014352  T
Q  152 gttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||    
T  1014353 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactcac 1014396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 45 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 34835632 - 34835481
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| |||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  34835632 gggaccgtctacatcgaggctagaataaccacacaagcaagagtgacaccacactcttacccaaaactttaaggcaatgagtttatgggtcctcttactt 34835533  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatc-cgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||    
T  34835532 ataaggtgttaaacctttactattttatcgggacgtgggacatataactcac 34835481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 45 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 34835898 - 34835747
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| |||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  34835898 gggaccgtctacatcgaggctagaataaccacacaagcaagagtgacaccacactcttacccaaaactttaaggcaatgagtttatgggtcctcttactt 34835799  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatc-cgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||    
T  34835798 ataaggtgttaaacctttactattttatcgggacgtgggacatataactcac 34835747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 45 - 194
Target Start/End: Original strand, 1513916 - 1514065
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||  |||| | |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||    
T  1513916 gggaccgtccacatcgaggctagaataaccccacatgtaagagagataccacacttttacccaaaaccttaaggttatgggtttaagggtcctcttactt 1514015  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactca 194  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  1514016 ataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggatatataactca 1514065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 45 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 40518228 - 40518076
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||    
T  40518228 gggaccgtccacatcaaggctagaacaaccacacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcattgggtttatgggtccatttactt 40518129  T
Q  145 ataagatgttcaacctttac--tattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||||| ||||||||||||||  | |||||||| || ||| |||||||||||||    
T  40518128 ataaggtgttcaacctttacttttttttatccaatgtggaacatataactcac 40518076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 52 - 195
Target Start/End: Original strand, 1013879 - 1014022
Alignment:
Q  52 tccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagat 151  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||| || ||| ||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||| | |    
T  1013879 tccacatcgaggctagaacaaccgcacaagtaaaagagacaacacactcttactcaaaactctaaggcaatgggtttattggtcctcttacttatagggt 1013978  T
Q  152 gttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  1013979 gttcaacttttactattttatccgatgtggaacatataactcac 1014022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 45 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 9309511 - 9309347
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagca-agagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttact 143  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||  |  ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  9309511 gggaccgtccacatcgaggctagaacaac--cacatactgagagagacaccacactcttacccgacaccttaaggcaatgagtttaagggtcctcttact 9309414  T
Q  144 tataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcactaatgcacacaacaa 210  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  9309413 tataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaa 9309347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 45 - 195
Target Start/End: Original strand, 25561816 - 25561967
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttaccc-aaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttact 143  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||| |   ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||    
T  25561816 gggaccttccacatcgaggctagagcaaccacacaagcaagagagatgtcacactcttaccccaaaaccttaagacaatgagtttatgggtcctcttact 25561915  T
Q  144 tataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25561916 tataaggtgttcaacgtttactcttttatccgatgtgggacatataactcac 25561967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 37 - 195
Target Start/End: Original strand, 40579499 - 40579657
Alignment:
Q  37 gagcatgagggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccc 136  Q
    |||||||  ||| ||||||||| |||| ||||||||| | |||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||| ||    
T  40579499 gagcatggaggatcgtccacatcgaggatagaacaaccgtacaagcaatagagacaccacactcttacctaaaaccttaaagcaataagtttatgggtcc 40579598  T
Q  137 tcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||| ||||    
T  40579599 tcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccaatatgaaacatataattcac 40579657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 54 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 147968 - 147821
Alignment:
Q  54 cacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgt 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||         ||||| | |||    
T  147968 cacattgaggctagaacaactgcacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatggg---------ttatatgttgt 147878  T
Q  154 tcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcactaatgcacacaacaa 210  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  147877 tcaacatttacttttttatcagatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaa 147821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 46 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 5420807 - 5420663
Alignment:
Q  46 ggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactta 145  Q
    |||| |||||||| |||||| |||||||  ||||||  || || ||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  5420807 ggacggtccacatcgaggcttgaacaaccacacaagtgagggagacgtcacactcttacaaaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttactta 5420708  T
Q  146 taagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataa 190  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  5420707 taagatgttcaacctttactattctatccgatgtgggacatataa 5420663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 45 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 5916024 - 5915928
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctctta 141  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  5916024 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctctta 5915928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 48 - 196
Target Start/End: Original strand, 18371665 - 18371808
Alignment:
Q  48 accgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttata 147  Q
    ||||||||||| || |||||| |||| ||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||      
T  18371665 accgtccacatcgaagctagagcaaccgcacaaatgagagacacaccacactcttacccaaaaccttaaggc-atgggtttatgggtcttcttactta-- 18371761  T
Q  148 agatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcact 196  Q
      |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  18371762 --atgttcaacctttactattttatccgatgtgtgacatataactcact 18371808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 45 - 195
Target Start/End: Original strand, 18380020 - 18380168
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    ||||| |||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||    
T  18380020 gggactgtccacatcgaagctagaagaatcgcacaagcaagagg--caccacactcttactcaaaaccttaaggtagtgggtttataggcccccttactt 18380117  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  18380118 ataaggtgttcaacctttactattttattcgatgtgggatatataactcac 18380168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 48 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 30359763 - 30359616
Alignment:
Q  48 accgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttata 147  Q
    ||||||||||| || | ||||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| | |||||||||||||    
T  30359763 accgtccacatcgaagttagaacaaccgcataagtaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggttatgggtttatgagtcctcttacttata 30359664  T
Q  148 agatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    || |||||||| |||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||    
T  30359663 aggtgttcaacttttactcttttatctgatgtgagacatataactcac 30359616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 47 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 41972316 - 41972151
Alignment:
Q  47 gaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaa---aaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttact 143  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||  || ||||||||||||||||   ||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||    
T  41972316 gaccgtccatattgaggctggaacaaccacacaagcaagagtgacgccacactcttacccaacaaaactttatggcaatgggtttatgggtcctatcact 41972217  T
Q  144 tataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcactaatgcacacaaca 209  Q
    |||||| ||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||    
T  41972216 tataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaaca 41972151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 45 - 195
Target Start/End: Original strand, 45121911 - 45122061
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    |||||| ||||||| |||||| ||| |||  ||| ||||| ||| || ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  45121911 gggaccttccacatcgaggcttgaataaccacacgagcaaaagagacgccacactgttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgagtcctcttactt 45122010  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  45122011 ataaagtgttcaacctttactattttatgcgatgtgggacatataactcac 45122061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 45 - 210
Target Start/End: Original strand, 8918765 - 8918930
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    |||||||||||||| |||| || ||||||  |||| |||||| | ||  |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||    
T  8918765 gggaccgtccacatcgaggttaaaacaaccacacacgcaagaaagacgtcacactcttacccaaaaccttaagtcaataggtttatgggtcctcttactt 8918864  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcactaatgcacacaacaa 210  Q
    ||||  ||||||||||||||| |  |||| ||| |||||||| ||||||||   ||||||||||||    
T  8918865 ataaagtgttcaacctttactctgctatctgatgtgggacatgtaactcacacttgcacacaacaa 8918930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 45 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 6651651 - 6651509
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    |||||| ||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||        
T  6651651 gggaccatccacatcgaggttagaacaatcgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgaatttatgggttctctt---- 6651556  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcact 196  Q
         || ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  6651555 -----attttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcact 6651509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 52 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 6732045 - 6731911
Alignment:
Q  52 tccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagat 151  Q
    ||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||            
T  6732045 tccacatcgaggttagaacaaccgcataagcaagagagacaccacactcttactcaaaaccttaaggcaatgaatttatgggttctcttact-------- 6731954  T
Q  152 gttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6731953 -ttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcac 6731911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 45 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 32305634 - 32305503
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||| || | | || ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| || | ||||||||    
T  32305634 gggaccgtccacatcaaggttagaacaactgcataagtaataaagacgccacactcttatccaaaatcttaaggtaatgggtttataggtcttcttactt 32305535  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccga 176  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32305534 ataaggtgttcaacctttactattttatccga 32305503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 45 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 9309138 - 9308970
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcaca-agcaagagaaacaccacact---cttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctctt 140  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||  ||||| ||||||||||   ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  9309138 gggaccgtccacatcgaggctagaacaac--cacatagtgagagagacaccacactactcttgcccaaaacctttaggcaatgggtttatgggtcctctt 9309041  T
Q  141 acttataagatgttcaacctttactattttatccgatttg--ggacatataactcactaatgcacacaaca 209  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||| ||  |||||||||||||||   |||||||||||    
T  9309040 acttataacatgttcaacttttactcttttatctgatgtgtaggacatataactcacacttgcacacaaca 9308970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 45 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 45123163 - 45123013
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactct--tacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttac 142  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||  |||||  |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||  ||| |||||||||| | ||||||    
T  45123163 gggaccgtccacatcgagattagaacaaccccacaaataagagagacaccacactctcttacccaaaaccttaagaaaataggtttatgggtcatcttac 45123064  T
Q  143 ttataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    |||  || |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45123063 tta--aggtgtttaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcac 45123013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 51 - 185
Target Start/End: Original strand, 45121663 - 45121797
Alignment:
Q  51 gtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataaga 150  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || ||| |||||| | | ||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||  |||||||||||||||     
T  45121663 gtccacatcgaggctagaacaaccccataagtaagagagatatcacactcttactcaaaaccttaaggctgtaggtttatggatcctcttacttataagg 45121762  T
Q  151 tgttcaacctttactattttatccgatttgggaca 185  Q
    || |||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  45121763 tgatcaacctttactcttttatccgatgtgggaca 45121797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 54 - 195
Target Start/End: Original strand, 32640542 - 32640678
Alignment:
Q  54 cacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgt 153  Q
    ||||| |||||||||||||   || |||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |     ||||    
T  32640542 cacatcgaggctagaacaatcacaaaagcaagagagacgcaacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatcggtcctcttacct-----atgt 32640636  T
Q  154 tcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||    
T  32640637 tcaacctttactcttttatccgatgtgagacagataactcac 32640678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 90 - 195
Target Start/End: Original strand, 43274825 - 43274930
Alignment:
Q  90 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatata 189  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||| ||  |||||||    
T  43274825 acaccacactcttactcaaaaccttaagacaataggtttatgggtcctcttacttataatatattcaacctttactcttttatctgatgtgaaacatata 43274924  T
Q  190 actcac 195  Q
    ||||||    
T  43274925 actcac 43274930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 65 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 9609222 - 9609122
Alignment:
Q  65 tagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacctttac 164  Q
    |||||||||  ||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9609222 tagaacaaccacactagcaagagagacgccacactcttaccgaaaacattaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataagatgttcaacctttac 9609123  T
Q  165 t 165  Q
    |    
T  9609122 t 9609122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 45 - 127
Target Start/End: Original strand, 40579270 - 40579352
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtt 127  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  40579270 gggacagtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaatcctaaggcaatgggtt 40579352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 124 - 196
Target Start/End: Original strand, 41416251 - 41416323
Alignment:
Q  124 ggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcact 196  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41416251 ggtttatggatcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcact 41416323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 84 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 8794229 - 8794118
Alignment:
Q  84 agagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatttggga 183  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||  | | |||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| || ||    
T  8794229 agagagacaccgcactctcacccaaaaccttaagatattaggtttatgagtcctcttacttataagatgttcaacatttattcttttatccgatgtgaga 8794130  T
Q  184 catataactcac 195  Q
    ||||||||||||    
T  8794129 catataactcac 8794118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 94 - 195
Target Start/End: Original strand, 18372656 - 18372753
Alignment:
Q  94 cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactc 193  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| ||    
T  18372656 cacactcttacccaaaacct---ggcaatgggtttatgagtcctcttacttataag-tgttcaacctttactattttatccgaaatggaacatataaatc 18372751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 93 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 9507891 - 9507819
Alignment:
Q  93 ccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacctttact 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  9507891 ccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtattcaacctttact 9507819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 98 - 195
Target Start/End: Original strand, 18372988 - 18373082
Alignment:
Q  98 ctcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||||||||||||||||   ||||||| ||||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  18372988 ctcttacccaaaacct---ggcaatgagtttatgagtcctcttatttataaggtgttcaacctttactattttatccgaagtgggacatataaatcac 18373082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 130 - 195
Target Start/End: Original strand, 18372785 - 18372850
Alignment:
Q  130 tgggccctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  18372785 tgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgtgacatataactcac 18372850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 93 - 209
Target Start/End: Original strand, 4154715 - 4154831
Alignment:
Q  93 ccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataact 192  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||| | ||||||||  ||||||||||  ||| || |||| ||| ||||||||||||||    
T  4154715 ccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctttcacttataaagtgttcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataact 4154814  T
Q  193 cactaatgcacacaaca 209  Q
    |||   |||||||||||    
T  4154815 cacacttgcacacaaca 4154831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 45 - 120
Target Start/End: Original strand, 8919145 - 8919220
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 120  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8919145 gggaccgtccacatcgaagctagaacaaccacacaagcaaaagagacaccacactcttatccaaaaccttaaggca 8919220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 53 - 195
Target Start/End: Original strand, 43398077 - 43398222
Alignment:
Q  53 ccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctc---ttacttataag 149  Q
    |||||| |||| |||| |||| |||| || || |||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||  |||||||| ||||   ||| |||||||    
T  43398077 ccacatcgaggttagagcaaccgcactagtaaaagaaacgccacattcttatccaaaactttaaggcaatgaatttatgggtcctcctcttatttataag 43398176  T
Q  150 atgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
     ||||||||||||||| || |||||||| || || |||||||||||    
T  43398177 gtgttcaacctttacttttctatccgatatgagatatataactcac 43398222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 137 - 195
Target Start/End: Original strand, 18372349 - 18372407
Alignment:
Q  137 tcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  18372349 tcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcac 18372407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 112 - 189
Target Start/End: Original strand, 3037776 - 3037853
Alignment:
Q  112 cttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatata 189  Q
    |||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  3037776 cttaagacaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactatttcatccgatgtggaacatata 3037853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 136 - 192
Target Start/End: Original strand, 25561736 - 25561792
Alignment:
Q  136 ctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataact 192  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  25561736 ctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataact 25561792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 53 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 12284021 - 12283883
Alignment:
Q  53 ccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatg 152  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||  ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| |  || ||||||| | | | |||||| ||||||     
T  12284021 ccacatagaggctagaacaaccacacaagtgagagagacactacactcttatccaaaaccttaagac-ttgagtttatgtgtcattttacttttaagata 12283923  T
Q  153 ttcaacctttactattttatccgatttgggacatataact 192  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||    
T  12283922 ttcaacatttacttttttatctgacgtgggacatataact 12283883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 45 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 41129145 - 41129066
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgg 124  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||  |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  41129145 gggaccgtccacatcgaggtttgaacaaccacacaagtaagagagacaccacactcatacccaaaaccttaagacaatgg 41129066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 84 - 210
Target Start/End: Original strand, 4154321 - 4154446
Alignment:
Q  84 agagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatttggga 183  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||  ||||||||||  ||| || |||| ||| | |||    
T  4154321 agagagacatcacacacttacccaaaatattaaggcaatgagtttatggg-tctctcacttataaagtgttcaacctccacttttctatctgatgtagga 4154419  T
Q  184 catataactcactaatgcacacaacaa 210  Q
    ||||||||||||   ||||||||||||    
T  4154420 catataactcacatttgcacacaacaa 4154446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 20130553 - 20130456
Alignment:
Q  97 actcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||  | ||||||||| ||| |||||||| |||||| ||||||||||| || |||||||| |||||    
T  20130553 actcttacctaaaaccgtaaggttatgggtttatggatcatcttactta-aaggtgttcaacttttactcttttatccgatgtgagacatatatctcac 20130456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 88 - 131
Target Start/End: Original strand, 12156702 - 12156745
Alignment:
Q  88 aaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 131  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12156702 aaacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatg 12156745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 158 - 195
Target Start/End: Original strand, 18372485 - 18372522
Alignment:
Q  158 cctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18372485 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcac 18372522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 84 - 125
Target Start/End: Original strand, 20995456 - 20995497
Alignment:
Q  84 agagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggg 125  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20995456 agagagacaccacattcttacccaaaaccttaaggcaatggg 20995497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 166
Target Start/End: Original strand, 18373236 - 18373292
Alignment:
Q  110 accttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacctttacta 166  Q
    |||||||| ||||||||| ||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  18373236 accttaagacaatgggttaatggatcctcttatttataaggtgttcaacctttacta 18373292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 45 - 108
Target Start/End: Original strand, 43274636 - 43274699
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaa 108  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||  || ||| |||||| ||||||||||| |||||||    
T  43274636 gggaccgtccacatcgaggctggaacaaccccataagtaagagagacaccacactcatacccaa 43274699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 209
Target Start/End: Original strand, 9620739 - 9620841
Alignment:
Q  107 aaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcactaatgcacaca 206  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||  || ||||| | |||| || |||| | | || ||||||||||||||   ||||||||    
T  9620739 aaaatcttaaggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgatcaacttctacttttctatctgttgtgagacatataactcacacttgcacaca 9620838  T
Q  207 aca 209  Q
    |||    
T  9620839 aca 9620841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 76 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 16524491 - 16524446
Alignment:
Q  76 cacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 121  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  16524491 cacaagtaagagagacaccacactcttactcaaaaccttaaagcaa 16524446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 103 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 40991852 - 40991795
Alignment:
Q  103 acccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacct 160  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||| |  ||||||||||    
T  40991852 acccaaaaccttgaggcattgggtttatgggtcctctcacttatgaagtgttcaacct 40991795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0702 (Bit Score: 99; Significance: 6e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0702
Description:

Target: scaffold0702; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 45 - 195
Target Start/End: Original strand, 515 - 665
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| |||  | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  515 gggaccttccacatcgaggctagaaaaaccactcaagcaagaaagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 614  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  615 ataaggtgttcaacctttactcttttaaccgatgtgggacatataactcac 665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0702; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 45 - 195
Target Start/End: Original strand, 148 - 293
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||| |||   |||| ||||||| || ||||||||    
T  148 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacattcttacctaaa-cctaaagt--atgg-tttatggtcc-tcttactt 242  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  243 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcac 293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0734 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0734
Description:

Target: scaffold0734; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 53 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 5546 - 5388
Alignment:
Q  53 ccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaacctt-aaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagat 151  Q
    |||||| |||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| |    
T  5546 ccacatcgaggcttgaacaaccccacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaactttaagacaatatgtttatgggccctcttacttataaggt 5447  T
Q  152 gttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcactaatgcacacaacaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||   ||||||||||||    
T  5446 gttcaacctttactattttatccgatgtaggacatataactcacacttgcacacaacaa 5388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0734; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 67 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 5917 - 5769
Alignment:
Q  67 gaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaac-----cttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacctt 161  Q
    |||||||  |||||| || ||| ||||||||||||||| |||||      |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  5917 gaacaaccccacaagtaaaagagacaccacactcttactcaaaatttaatcttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctt 5818  T
Q  162 tactattttatccgatttgggacatataactcactaatgcacacaacaa 210  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||   ||||||||||||    
T  5817 tactattttatccgatgtgcgacatataactcacacttgcacacaacaa 5769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 3)
Name: scaffold0391
Description:

Target: scaffold0391; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 48 - 195
Target Start/End: Original strand, 1110 - 1257
Alignment:
Q  48 accgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttata 147  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  || || ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||||    
T  1110 accgtccacatcgaggctagaacaaccacataaacaagagagacaccatactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctttttcttata 1209  T
Q  148 agatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    || ||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||    
T  1210 aggtgttcaacctttactcttttatccaatgtgggacatataactcac 1257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 84 - 155
Target Start/End: Original strand, 1731 - 1802
Alignment:
Q  84 agagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttc 155  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  1731 agagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctcacttataaggtgttc 1802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 210
Target Start/End: Original strand, 3091 - 3151
Alignment:
Q  150 atgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcactaatgcacacaacaa 210  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  3091 atgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacctgcacacaacaa 3151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 82 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 5477 - 5349
Alignment:
Q  82 caagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatttgg 181  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| |||    
T  5477 caagagagacaccacactcttatccaaaatcttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactgttctatccgatgtgg 5378  T
Q  182 gacatataactcactaatgcacacaacaa 210  Q
     |||||||||||||   ||||||||||||    
T  5377 aacatataactcacacttgcacacaacaa 5349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 51 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 5133 - 4974
Alignment:
Q  51 gtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataaga 150  Q
    |||||||| ||||||||| |||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | | ||||||||||||    
T  5133 gtccacatcgaggctagagcaaccgcataagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccataaggcaatgagtttatgggtctttttacttataaga 5034  T
Q  151 tgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcactaatgcacacaacaa 210  Q
    | || |||||||||| || | |||||| || ||||||||| ||||   ||||||||||||    
T  5033 tattaaacctttactgttctctccgatgtgagacatataattcacacttgcacacaacaa 4974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 45 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 47517 - 47367
Alignment:
Q  45 gggaccgtccacattgaggctagaacaactgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttactt 144  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  47517 gggaccgtccacatcgaggttagaacaaccgcgcaagcaagagagacaccacatttttacccaaaactttaaggcaatgggtttatggattctcttactt 47418  T
Q  145 ataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| || ||||| ||| ||||    
T  47417 ataaggtgttcaaactttactattttatcggatgtgagacatttaattcac 47367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 90 - 210
Target Start/End: Original strand, 17500 - 17622
Alignment:
Q  90 acaccacactcttacccaaaa--ccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacata 187  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||    
T  17500 acaccatactcttacccaaaaaaccttaaggctatgggtttatgggtcctcttacttacaaggtgttcaacctttactattttatctgatgtgtgacata 17599  T
Q  188 taactcactaatgcacacaacaa 210  Q
    ||||||||   ||||||||||||    
T  17600 taactcacacttgcacacaacaa 17622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0504 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0504
Description:

Target: scaffold0504; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 125 - 195
Target Start/End: Original strand, 10192 - 10262
Alignment:
Q  125 gtttatgggccctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatttgggacatataactcac 195  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  10192 gtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacttttaccattttatccgatgtgagacatataactcac 10262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University