View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5971_low_1 (Length: 688)

Name: NF5971_low_1
Description: NF5971
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5971_low_1
NF5971_low_1
[»] chr7 (44 HSPs)
chr7 (18-290)||(42138190-42138462)
chr7 (291-469)||(8080305-8080483)
chr7 (291-469)||(7389389-7389566)
chr7 (291-469)||(19329842-19330020)
chr7 (286-469)||(38837212-38837395)
chr7 (291-469)||(4999436-4999614)
chr7 (291-474)||(38044197-38044380)
chr7 (291-477)||(22343361-22343547)
chr7 (294-451)||(3783998-3784155)
chr7 (291-464)||(19436114-19436287)
chr7 (291-473)||(8238212-8238395)
chr7 (291-417)||(38267040-38267166)
chr7 (291-469)||(40957707-40957885)
chr7 (296-473)||(35522881-35523058)
chr7 (291-443)||(35137533-35137685)
chr7 (291-471)||(41915741-41915921)
chr7 (292-469)||(32951415-32951592)
chr7 (291-400)||(36361904-36362013)
chr7 (291-473)||(21234401-21234583)
chr7 (291-400)||(36362026-36362135)
chr7 (291-474)||(35468772-35468955)
chr7 (291-471)||(7727906-7728086)
chr7 (291-473)||(31735884-31736059)
chr7 (291-475)||(46033717-46033901)
chr7 (291-469)||(3434562-3434730)
chr7 (294-444)||(3694370-3694520)
chr7 (291-473)||(32564344-32564526)
chr7 (291-419)||(36208173-36208301)
chr7 (291-474)||(26296644-26296827)
chr7 (291-473)||(40846031-40846213)
chr7 (286-471)||(18207175-18207359)
chr7 (291-469)||(11044188-11044356)
chr7 (291-419)||(10343535-10343663)
chr7 (332-472)||(16374743-16374883)
chr7 (325-473)||(27744227-27744375)
chr7 (291-471)||(39255844-39256023)
chr7 (377-470)||(1766702-1766795)
chr7 (291-474)||(12310906-12311087)
chr7 (291-473)||(41423682-41423864)
chr7 (291-471)||(45223042-45223222)
chr7 (314-472)||(2318160-2318320)
chr7 (312-472)||(32045858-32046018)
chr7 (289-385)||(46374808-46374904)
chr7 (408-473)||(46374742-46374807)
[»] chr2 (42 HSPs)
chr2 (481-672)||(31930862-31931061)
chr2 (294-469)||(19930742-19930917)
chr2 (291-475)||(20700815-20700999)
chr2 (294-469)||(28863458-28863633)
chr2 (291-462)||(33436029-33436200)
chr2 (291-469)||(7465657-7465835)
chr2 (291-469)||(13438343-13438521)
chr2 (291-469)||(17473020-17473198)
chr2 (291-451)||(9058480-9058640)
chr2 (291-469)||(10249304-10249482)
chr2 (291-469)||(28381577-28381755)
chr2 (291-469)||(32505570-32505748)
chr2 (291-473)||(40613820-40614002)
chr2 (291-469)||(40701478-40701656)
chr2 (291-450)||(30915463-30915622)
chr2 (297-473)||(3439985-3440161)
chr2 (291-473)||(38732354-38732536)
chr2 (309-470)||(2997408-2997569)
chr2 (291-474)||(38273060-38273242)
chr2 (291-469)||(38882733-38882913)
chr2 (291-474)||(43490121-43490304)
chr2 (291-469)||(4060685-4060863)
chr2 (291-473)||(2533124-2533305)
chr2 (291-473)||(42257193-42257375)
chr2 (291-400)||(5574479-5574588)
chr2 (291-480)||(36168836-36169025)
chr2 (307-473)||(13365369-13365535)
chr2 (334-475)||(3737986-3738127)
chr2 (291-473)||(17823784-17823970)
chr2 (291-396)||(27864704-27864809)
chr2 (291-431)||(33436211-33436351)
chr2 (291-434)||(17819961-17820104)
chr2 (291-477)||(26891418-26891604)
chr2 (292-417)||(41575138-41575264)
chr2 (381-471)||(41758677-41758767)
chr2 (296-472)||(44151928-44152108)
chr2 (291-473)||(45097653-45097835)
chr2 (341-474)||(3034900-3035033)
chr2 (291-469)||(15428663-15428840)
chr2 (304-471)||(21301420-21301587)
chr2 (568-628)||(31927336-31927394)
chr2 (341-412)||(3154193-3154264)
[»] chr8 (38 HSPs)
chr8 (291-470)||(40423864-40424043)
chr8 (291-469)||(15197333-15197511)
chr8 (291-469)||(14547922-14548100)
chr8 (292-477)||(5957831-5958016)
chr8 (291-473)||(10284549-10284731)
chr8 (291-469)||(12831047-12831225)
chr8 (291-474)||(37038479-37038662)
chr8 (290-451)||(1179880-1180041)
chr8 (291-469)||(504043-504221)
chr8 (310-475)||(8841348-8841513)
chr8 (291-469)||(23122519-23122697)
chr8 (291-469)||(34012218-34012396)
chr8 (291-473)||(43414499-43414681)
chr8 (291-469)||(44507010-44507187)
chr8 (291-469)||(34307216-34307394)
chr8 (291-473)||(15048099-15048281)
chr8 (291-477)||(17443825-17444011)
chr8 (296-476)||(10621012-10621182)
chr8 (291-469)||(24307715-24307893)
chr8 (291-469)||(30479396-30479574)
chr8 (291-473)||(42221515-42221697)
chr8 (291-475)||(4854779-4854963)
chr8 (291-474)||(32032725-32032907)
chr8 (291-473)||(20074870-20075034)
chr8 (291-435)||(16383377-16383521)
chr8 (291-470)||(16056322-16056501)
chr8 (292-469)||(9122196-9122363)
chr8 (291-473)||(15258847-15259029)
chr8 (376-475)||(40467785-40467884)
chr8 (290-461)||(14055522-14055693)
chr8 (345-473)||(42354506-42354634)
chr8 (367-474)||(32707920-32708029)
chr8 (291-473)||(30183794-30183975)
chr8 (384-469)||(42710216-42710301)
chr8 (291-354)||(24307629-24307692)
chr8 (311-472)||(25838217-25838370)
chr8 (307-406)||(38229445-38229543)
chr8 (317-357)||(30912496-30912535)
[»] chr4 (39 HSPs)
chr4 (291-473)||(50052346-50052528)
chr4 (291-473)||(29239886-29240068)
chr4 (290-469)||(41236346-41236525)
chr4 (291-469)||(6034044-6034222)
chr4 (291-469)||(11511385-11511562)
chr4 (291-473)||(31910192-31910374)
chr4 (291-469)||(48182971-48183149)
chr4 (286-419)||(3481649-3481782)
chr4 (291-469)||(42044289-42044467)
chr4 (291-451)||(54473473-54473633)
chr4 (291-450)||(480388-480547)
chr4 (291-469)||(23608235-23608413)
chr4 (291-473)||(50526089-50526271)
chr4 (291-483)||(55475191-55475383)
chr4 (291-482)||(29977885-29978076)
chr4 (291-471)||(40574779-40574959)
chr4 (291-473)||(19670634-19670816)
chr4 (291-469)||(24995029-24995207)
chr4 (299-473)||(28480186-28480360)
chr4 (299-473)||(28481061-28481235)
chr4 (299-473)||(28481936-28482110)
chr4 (291-477)||(50813806-50813992)
chr4 (309-470)||(17983664-17983825)
chr4 (291-417)||(29234219-29234345)
chr4 (330-476)||(41823921-41824067)
chr4 (291-473)||(44536664-44536845)
chr4 (291-470)||(47104544-47104723)
chr4 (291-473)||(29547877-29548059)
chr4 (307-473)||(29589658-29589823)
chr4 (291-473)||(47986208-47986389)
chr4 (296-418)||(53352539-53352660)
chr4 (291-473)||(32766958-32767140)
chr4 (309-473)||(18924413-18924577)
chr4 (291-417)||(55079687-55079814)
chr4 (331-470)||(56300086-56300225)
chr4 (335-472)||(48647645-48647782)
chr4 (335-443)||(18768996-18769103)
chr4 (335-435)||(18769153-18769252)
chr4 (290-417)||(8343137-8343264)
[»] chr5 (34 HSPs)
chr5 (291-471)||(35943812-35943992)
chr5 (291-461)||(36732872-36733042)
chr5 (294-469)||(18520806-18520981)
chr5 (291-469)||(2740274-2740452)
chr5 (291-469)||(14831814-14831992)
chr5 (291-469)||(40145407-40145585)
chr5 (291-464)||(13811652-13811825)
chr5 (291-473)||(15409528-15409710)
chr5 (291-469)||(33149560-33149738)
chr5 (291-469)||(35785199-35785377)
chr5 (291-473)||(3921183-3921365)
chr5 (291-473)||(2252086-2252268)
chr5 (291-473)||(31008988-31009170)
chr5 (286-417)||(42414276-42414407)
chr5 (291-472)||(6679698-6679879)
chr5 (291-472)||(33825243-33825424)
chr5 (291-430)||(28177775-28177914)
chr5 (291-473)||(26720516-26720698)
chr5 (291-473)||(26990265-26990447)
chr5 (292-470)||(36875537-36875702)
chr5 (291-471)||(9603813-9603993)
chr5 (291-473)||(6259919-6260101)
chr5 (356-473)||(2177429-2177546)
chr5 (290-473)||(20073434-20073617)
chr5 (291-473)||(39688815-39688997)
chr5 (314-476)||(39557429-39557594)
chr5 (335-473)||(21370048-21370186)
chr5 (311-431)||(16327921-16328041)
chr5 (340-413)||(25831334-25831407)
chr5 (291-431)||(38296203-38296343)
chr5 (296-354)||(10356639-10356698)
chr5 (291-382)||(41470425-41470516)
chr5 (339-401)||(31132392-31132454)
chr5 (317-357)||(33801596-33801635)
[»] chr3 (45 HSPs)
chr3 (285-469)||(49607408-49607592)
chr3 (291-469)||(53982011-53982189)
chr3 (290-473)||(8076392-8076575)
chr3 (295-473)||(30801651-30801829)
chr3 (291-469)||(33644200-33644378)
chr3 (292-469)||(31456690-31456867)
chr3 (291-473)||(14623757-14623939)
chr3 (291-473)||(26141448-26141632)
chr3 (291-469)||(54868817-54868995)
chr3 (291-469)||(17470405-17470583)
chr3 (304-473)||(26754708-26754877)
chr3 (296-469)||(52629305-52629478)
chr3 (291-473)||(33118768-33118951)
chr3 (291-473)||(20764833-20765015)
chr3 (291-473)||(24699873-24700054)
chr3 (291-473)||(35536626-35536808)
chr3 (291-469)||(36707350-36707524)
chr3 (288-478)||(51419273-51419463)
chr3 (291-473)||(11347840-11348022)
chr3 (292-471)||(13897975-13898154)
chr3 (291-394)||(27714888-27714991)
chr3 (291-476)||(8956762-8956947)
chr3 (291-473)||(41189682-41189864)
chr3 (291-473)||(35965700-35965874)
chr3 (291-471)||(48375626-48375806)
chr3 (290-473)||(47531864-47532047)
chr3 (291-473)||(45058471-45058652)
chr3 (313-473)||(36331247-36331407)
chr3 (291-400)||(11095346-11095453)
chr3 (296-473)||(42823116-42823293)
chr3 (288-420)||(41080706-41080836)
chr3 (291-469)||(9562999-9563177)
chr3 (295-401)||(48587081-48587187)
chr3 (291-473)||(21746106-21746283)
chr3 (291-406)||(11907371-11907486)
chr3 (296-469)||(25395256-25395428)
chr3 (332-471)||(1758379-1758515)
chr3 (298-474)||(35093592-35093768)
chr3 (294-475)||(25407063-25407245)
chr3 (374-471)||(43746422-43746519)
chr3 (312-417)||(32605888-32605993)
chr3 (299-468)||(39670019-39670188)
chr3 (306-406)||(45320385-45320485)
chr3 (369-431)||(11140993-11141055)
chr3 (291-353)||(36331416-36331478)
[»] chr6 (22 HSPs)
chr6 (291-469)||(32869678-32869856)
chr6 (294-469)||(22880580-22880755)
chr6 (291-469)||(17598554-17598732)
chr6 (291-475)||(31976248-31976432)
chr6 (291-473)||(15507942-15508124)
chr6 (291-469)||(11427616-11427796)
chr6 (291-474)||(15989959-15990142)
chr6 (291-473)||(30341278-30341460)
chr6 (291-473)||(31952948-31953130)
chr6 (291-469)||(6209388-6209565)
chr6 (291-469)||(29857827-29858005)
chr6 (294-452)||(23128066-23128224)
chr6 (313-474)||(4231570-4231731)
chr6 (291-417)||(31109374-31109500)
chr6 (291-473)||(31110679-31110859)
chr6 (291-473)||(12732482-12732663)
chr6 (295-471)||(28536408-28536582)
chr6 (292-469)||(946377-946554)
chr6 (286-469)||(15832572-15832755)
chr6 (296-443)||(9379660-9379807)
chr6 (367-471)||(30870090-30870193)
chr6 (427-474)||(22421996-22422043)
[»] chr1 (34 HSPs)
chr1 (291-476)||(32813247-32813432)
chr1 (286-469)||(47452242-47452425)
chr1 (291-469)||(2581915-2582093)
chr1 (291-474)||(51898600-51898783)
chr1 (291-469)||(9474798-9474976)
chr1 (291-469)||(27564657-27564835)
chr1 (290-450)||(3000318-3000478)
chr1 (291-469)||(48716204-48716382)
chr1 (291-450)||(38595154-38595313)
chr1 (291-451)||(38632261-38632421)
chr1 (291-469)||(37649198-37649376)
chr1 (292-473)||(11152296-11152476)
chr1 (291-462)||(50630458-50630629)
chr1 (291-473)||(5958918-5959100)
chr1 (291-469)||(41758805-41758983)
chr1 (291-475)||(50590916-50591100)
chr1 (291-471)||(49811447-49811627)
chr1 (291-451)||(8346327-8346488)
chr1 (291-471)||(23597011-23597191)
chr1 (294-417)||(44548350-44548473)
chr1 (291-475)||(41608409-41608593)
chr1 (291-469)||(43132-43310)
chr1 (291-473)||(3302451-3302633)
chr1 (311-473)||(45044478-45044640)
chr1 (294-469)||(26274435-26274607)
chr1 (291-475)||(37926354-37926538)
chr1 (291-473)||(47748443-47748624)
chr1 (321-417)||(13414791-13414887)
chr1 (311-474)||(6260890-6261053)
chr1 (296-417)||(44453984-44454105)
chr1 (332-477)||(44332285-44332430)
chr1 (304-401)||(26440747-26440844)
chr1 (334-423)||(48489343-48489432)
chr1 (291-416)||(7740733-7740858)
[»] scaffold1268 (1 HSPs)
scaffold1268 (291-472)||(848-1029)
[»] scaffold1267 (1 HSPs)
scaffold1267 (291-472)||(848-1029)
[»] scaffold0110 (1 HSPs)
scaffold0110 (291-473)||(8781-8963)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (291-469)||(4029-4207)
[»] scaffold0321 (1 HSPs)
scaffold0321 (291-469)||(10031-10209)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (307-472)||(152514-152679)
[»] scaffold0316 (2 HSPs)
scaffold0316 (387-473)||(17199-17285)
scaffold0316 (334-405)||(17097-17168)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 273; Significance: 1e-152; HSPs: 44)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 18 - 290
Target Start/End: Original strand, 42138190 - 42138462
Alignment:
Q  18 atgtaatgtactcaagtttgtaatgagagaaggtgatggttatgtgtaatgtttatgtgtcatatatatagcattgtttctaaatagagggttgttttct 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42138190 atgtaatgtactcaagtttgtaatgagagaaggtgatggttatgtgtaatgtttatgtgtcatatatatagcattgtttctaaatagagggttgttttct 42138289  T
Q  118 tttatgtcaaattaagagcattccttttattcaacaactgtttgaccggtgctttgggaattggaagcttgactaaaaagtagtcaaaattatatactac 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42138290 tttatgtcaaattaagagcattccttttattcaacaactgtttgaccggtgctttgggaattggaagcttgactaaaaagtagtcaaaattatatactac 42138389  T
Q  218 cttttcattttatacctaagatagatataaatgtatttttaatattgaatgtacgtagagaagtcacacaaac 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42138390 cttttcattttatacctaagatagatataaatgtatttttaatattgaatgtacgtagagaagtcacacaaac 42138462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 291 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 8080483 - 8080305
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  8080483 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacctacataaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 8080384  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacatt 469  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| |  ||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  8080383 tcttttctctcctcttctctcttcctattgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 8080305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 291 - 469
Target Start/End: Original strand, 7389389 - 7389566
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  7389389 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 7389488  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacatt 469  Q
    ||||| |||||||  | |||||||||| || ||| ||||||| ||| ||||||||||||||   |||||||||| ||||    
T  7389489 tcttttctctcctactctctcttcctaatacatggggtgtac-agggtgtatgggaataaaggatgtctatgtatcatt 7389566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 291 - 469
Target Start/End: Original strand, 19329842 - 19330020
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  19329842 gagtaatgatacatagacatccttaggtggcaatacaccttttgacacccacacaaaaatctgacacgtaatcacgtggaccccgcacaagcacactttc 19329941  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacatt 469  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| |  ||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  19329942 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 19330020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 286 - 469
Target Start/End: Original strand, 38837212 - 38837395
Alignment:
Q  286 caaacgagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcaca 385  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  38837212 caaaagagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacacccttgtacacctacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcaca 38837311  T
Q  386 ctttctctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacatt 469  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||| |  ||| | ||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||| ||||    
T  38837312 ctttctcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtatggaaataaagggtgtctatgtatcatt 38837395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 291 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 4999614 - 4999436
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||||| |||||||||    
T  4999614 gagtaatgatacatagacacccttagatggcaatacaccttttgacacccacacaaaaatctgatacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacactttc 4999515  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacatt 469  Q
    |||||  ||||||||| |||||||||| |  ||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  4999514 tcttttatctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgagaataaaaggtgtctatgtatcatt 4999436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 291 - 474
Target Start/End: Original strand, 38044197 - 38044380
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  38044197 gagttatgatacataaacacccttaggtggcaatacaccccttgacatccacacaaaaatctgacatgtagccatatggaccccgcacaagtacactttc 38044296  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttcca 474  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  38044297 tctttcttcttctcttttctcttcctaatacatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcca 38044380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 291 - 477
Target Start/End: Original strand, 22343361 - 22343547
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  |   ||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  22343361 gagttatgatacataaacacccttaggtggcaatacaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtgaccatatggaccccgcacaagtacactttc 22343460  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttccataa 477  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||||| || ||||||||||||||| ||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22343461 tctttcttcttctcttctctcttcctaatacatgaggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttccataa 22343547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 294 - 451
Target Start/End: Original strand, 3783998 - 3784155
Alignment:
Q  294 taatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttctct 393  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  3783998 taatgatacatagacacccttaggtggcaatacatcttttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggatcccgcacaagcacactttctct 3784097  T
Q  394 ttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaa 451  Q
    || |||||||||| |||||||||| |  ||| |||||||||| ||||||| |||||||    
T  3784098 tttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagaatgtatgtgaataaa 3784155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 291 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 19436287 - 19436114
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| || ||||||||||||    
T  19436287 gagtaatgatacatagacatccttaggtgacaatacaccttttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggatcccgcataagcacactttc 19436188  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgta 464  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||| |  ||| ||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||    
T  19436187 tcttttctcttctcttttctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgagaataaatggtgtctatgta 19436114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 291 - 473
Target Start/End: Original strand, 8238212 - 8238395
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacaccct-taggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacacttt 389  Q
    |||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  8238212 gagttatgatacataaacaccctgtaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacatgtagtcatatggaccccgcacaagtacacttt 8238311  T
Q  390 ctctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttcc 473  Q
    ||||||| ||| ||||| |||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||  | ||||| | ||||||||||||||||||    
T  8238312 ctctttcttcttctcttctctcttcctaatacatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggcgtctatgtaacattttcc 8238395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 291 - 417
Target Start/End: Original strand, 38267040 - 38267166
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  38267040 gagtaatgatacatagacacccttatgtgacaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 38267139  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttccta 417  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  38267140 tcttttctctcctcttctctcttccta 38267166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 291 - 469
Target Start/End: Original strand, 40957707 - 40957885
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||  ||||||||||||||    
T  40957707 gagtaatgatacatagacactcttaggtggcaatacactctttgatacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggatcccgtacaagcacactttc 40957806  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacatt 469  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||| |  ||| ||||||||||| ||||||  |||||   ||||||||||| ||||    
T  40957807 tcttttctctcatcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgaaaataatgggtgtctatgtatcatt 40957885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 296 - 473
Target Start/End: Original strand, 35522881 - 35523058
Alignment:
Q  296 atgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttctcttt 395  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| | | ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  35522881 atgatacatagacatccttaagtggcaatacaccatttaacacccacacaaaaatctgacacgtggccatatggatcccgcacaagcacactttctcttt 35522980  T
Q  396 cctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttcc 473  Q
     ||||| |||| |||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  35522981 tctctcttcttctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtttatgtaacattttcc 35523058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 291 - 443
Target Start/End: Original strand, 35137533 - 35137685
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||| |||||||||    
T  35137533 gagtaatgataaatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctaacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacactttc 35137632  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatg 443  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| |  ||| | ||||||||| ||||||    
T  35137633 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtatg 35137685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 291 - 471
Target Start/End: Original strand, 41915741 - 41915921
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||  | | ||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  41915741 gagttatgatacataaacacccttaggtggcaatacaccccttgacacctacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcacaagtacactttc 41915840  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacatttt 471  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||  | ||||| ||||||||||||||||||    
T  41915841 tctttcttcttctcttctctcttcctaatatatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacatttt 41915921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 292 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 32951592 - 32951415
Alignment:
Q  292 agtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttct 391  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||  |||| ||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  32951592 agtaatgatacatagacactcttagatgacaatacatcctttaacatccacacaaaaatctaacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 32951493  T
Q  392 ctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacatt 469  Q
    |||| |||||||||| |||||||||| || ||| ||||||||||| |||||| ||||||   ||||||||||| ||||    
T  32951492 cttttctctcctcttctctcttcctaatacatggggtgtacaagggtgtatgagaataaggggtgtctatgtatcatt 32951415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 291 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 36362013 - 36361904
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36362013 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacatcctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccacacaagcacactttc 36361914  T
Q  391 tctttcctct 400  Q
    ||||| ||||    
T  36361913 tcttttctct 36361904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 291 - 473
Target Start/End: Original strand, 21234401 - 21234583
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||  || ||||| |||||||||| ||||    
T  21234401 gagttatgatacatagacatccttaggtgacaatacaccctttgacactcacacaaaaatttgacacgtagccacatgtaccccgcacaagcacattttc 21234500  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttcc 473  Q
    |||| |||||||| |  |||||||||| | |||| ||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21234501 tcttacctctcctttcctctcttcctaatgtatggggtgtacaatggtgtatgagaataaaaggtgtctatgtaacattttcc 21234583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 291 - 400
Target Start/End: Original strand, 36362026 - 36362135
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36362026 gagtaatgatacatagacacccttaggtggtaatacatcctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccacacaagcacactttc 36362125  T
Q  391 tctttcctct 400  Q
    ||||| ||||    
T  36362126 tcttttctct 36362135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 291 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 35468955 - 35468772
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||   ||||||||||||| |||||||| | |  |   |||||||||||  ||||| |||||||||    
T  35468955 gagtaatgatacatagacatccttagatggcaatacatcatttgacacccacataaaaatctaatatgtgaccatgtggaccctgcacaaacacactttc 35468856  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttcca 474  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  35468855 tctttcctatcctcttctctcttcctagttcatgagatgtataaggatgtatgagaataaaaggtgtatatgtaacattttcca 35468772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 291 - 471
Target Start/End: Original strand, 7727906 - 7728086
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||| ||||||| || |||||||||||||| |||||||   ||||||  |||| ||||||||||||  | ||||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  7727906 gagttatgatacataaacacccttaggtggtaatacacctcttgacattcacataaaaatctgacatgtggtcatatggaccccgcacaagtacactttc 7728005  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacatttt 471  Q
    | |||| ||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||    
T  7728006 tgtttcttcttctcttctctcttcctaatatatggggtgtacaaggatgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacatttt 7728086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 291 - 473
Target Start/End: Original strand, 31735884 - 31736059
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||       ||| | | ||  |||| ||| |||||||||||||||    
T  31735884 gagttatgatacatagacatccttaggtggcaatacactctttaacacccacacaaa-------cacgtggccacatggatcccgcacaagcacactttc 31735976  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttcc 473  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  31735977 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaaaggtatctatctaacattttcc 31736059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 291 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 46033901 - 46033717
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||  || || || |||||||| | ||||    
T  46033901 gagttatgatacatagatattcttaggtggcaatacaccctttaacacccacataaaaatctgacacgtggtcacatgaactccgcacaagcatattttc 46033802  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttccat 475  Q
    ||||| |||||||||| ||| |||||| | |||| ||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  46033801 tcttttctctcctcttctctattcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgagaataaatggtgtctatgtaacattttccat 46033717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 291 - 469
Target Start/End: Original strand, 3434562 - 3434730
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||| |||||||||||||||    
T  3434562 gagtaatgatacatagacatccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaaactgacacgtagtcacgtggatcccgcacaagcacactttc 3434661  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacatt 469  Q
    ||||          || |||||||||| |  ||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  3434662 tctt----------ttctctcttcctaatgcatggggtgtacaaggctgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 3434730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 294 - 444
Target Start/End: Original strand, 3694370 - 3694520
Alignment:
Q  294 taatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttctct 393  Q
    ||||||||  || ||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  3694370 taatgatatatacacacccttaggtgacaatacaccttttaacacccacacaaaaatctgacacgtagtcatgtggatcccgcacaagcacactttctct 3694469  T
Q  394 ttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgg 444  Q
    || |||||||||| |||||||| | |  ||| ||||||||||  |||||||    
T  3694470 tttctctcctcttctctcttcccaatgcatggggtgtacaagagtgtatgg 3694520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 291 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 32564526 - 32564344
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||| ||||||| || |||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  | |  || |||||||| |||||  ||||||||    
T  32564526 gagttatgatacataaacattcttaggtggcaatacaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggctatatggaccccgcacaaatacactttc 32564427  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttcc 473  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||||| || ||||||||||||||| ||||||  | |||||| |||||||||||||| ||||    
T  32564426 tctttcttcttctcttctctcttcctaatacatgaggtgtacaagggtgtatgcaattaaaatatgtctatgtaacatcttcc 32564344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 291 - 419
Target Start/End: Original strand, 36208173 - 36208301
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||| ||||||  | |||| ||||||||  |||||||||| ||||    
T  36208173 gagttatgatacatagacacccttaggtggtaatacattcattgacacccacacaaaaagctgacatgtggtcacgtggaccctgcacaagcacattttc 36208272  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagt 419  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36208273 tctttcctctcctcttctctcttcctagt 36208301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 291 - 474
Target Start/End: Original strand, 26296644 - 26296827
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||| || |||| ||| ||||| |||||||||| || | | ||| |||||||| ||||||| || ||||    
T  26296644 gagttatgatacatagacatccttaggtgacaatataccctttaacatccacataaaaatctgatacgtggccatatggaccccgcacaagcgcattttc 26296743  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttcca 474  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| || | |||||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||||| |||||||||||||    
T  26296744 tcttttctctcctcttctctcttcttaatgtatgaggtgtacaagggtgtatggaaatatatggtgtctacgtaacattttcca 26296827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 291 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 40846213 - 40846031
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||| ||||||| || ||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||  |||| || |||||||| |||||  ||||||||    
T  40846213 gagttatgatacataaacatccttaggtggcaatacaccccttgacatccacacaaaaatctaacatgtagttatatggaccccgcacaaatacactttc 40846114  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttcc 473  Q
    |||||| ||| ||||| ||||||||||  | ||||| ||||||||| ||||||  | ||||| || |||||||||||||||||    
T  40846113 tctttcttcttctcttctctcttcctaaaagatgagatgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtatctatgtaacattttcc 40846031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 286 - 471
Target Start/End: Original strand, 18207175 - 18207359
Alignment:
Q  286 caaacgagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcaca 385  Q
    |||| |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||| |||| | | || ||| ||||||||||||||||    
T  18207175 caaaagagttatgatacatagacaaccttaggtggcaatacacctcttgacacccatacaaaaatctaacacgtgg-cacgtgaaccccacacaagcaca 18207273  T
Q  386 ctttctctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacatttt 471  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||   |||||||||| ||||||  ||||||  || ||||| |||||||||    
T  18207274 ctttctctttcatctcctcttctctcttcctagtggatagagtgtacaagggtgtatgataataaagggtatctatctaacatttt 18207359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 291 - 469
Target Start/End: Original strand, 11044188 - 11044356
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||          ||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  11044188 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacatcctttgacaccc----------ctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagtacactttc 11044277  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacatt 469  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||| |  ||||||||||||| | ||||||  ||||||  ||||||||||| ||||    
T  11044278 tctttcctctcatcttctctcttcctaatgcatgaggtgtacaaaggtgtatgaaaataaagagtgtctatgtatcatt 11044356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 291 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 10343663 - 10343535
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |   |||||| |  || | ||||||||||    
T  10343663 gagtaatgatacatagacacccttaggtggaaatacacatcttgacacccacacaaaaatctgacacatgtttccgtggactctgcagacgcacactttc 10343564  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagt 419  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10343563 tctttcctctcctcttctctcttcctagt 10343535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 332 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 16374883 - 16374743
Alignment:
Q  332 ttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttctctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgta 431  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | |||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||| | || |||||||||| | ||||  |||||    
T  16374883 ttgacatccacacaaaaatctgacacgtggtcacgtggatctcacacaagcacacattctctttcatctctttttctctcttcctaatgtatggagtgta 16374784  T
Q  432 caaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttc 472  Q
    ||| | |||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  16374783 caaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttc 16374743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 325 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 27744375 - 27744227
Alignment:
Q  325 acactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttctctttcctctcctcttttctcttcctagtatatg 424  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||  | | || ||||| ||| || ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||    
T  27744375 acaccctttgatacccacacaaaaatctgacatgtggccacgtggatccctcataagcacattttctctatcctctcctcttctctcttcctagtgcatg 27744276  T
Q  425 aggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttcc 473  Q
     | ||||||||||| ||||||||||||  |||| ||| |||||||||||    
T  27744275 ggatgtacaaggatatatgggaataaatggtgtttatataacattttcc 27744227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 291 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 39256023 - 39255844
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||   |||| ||||| ||||||||||||||| | | || |||||| ||||||||| ||||||||    
T  39256023 gagttatgatacatagacaaccttaggtggcaatacaccacttgatacccatacaaaaatctgacacgt-ggcacgtggactccacacaagaacactttc 39255925  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacatttt 471  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||  ||  ||    ||||||||| ||||||  ||||||  ||||||||||||||||||    
T  39255924 tctttcatctcctcttctctcttcccggtggatagaatgtacaagggtgtatgataataaagggtgtctatgtaacatttt 39255844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 377 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 1766795 - 1766702
Alignment:
Q  377 acaagcacactttctctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattt 470  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||  | |||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  1766795 acaagcacactttctctttcctctcctcttctctcttcgtagtatatgaggtatacaagagtatatgagaacaaagtgtgtctatgtaacattt 1766702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 291 - 474
Target Start/End: Original strand, 12310906 - 12311087
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||  || | ||| ||||||||||||||  | |||| ||||| ||   ||||||||| |||     
T  12310906 gagttatgatacatagacacccttaggtggaaatata-tctg-gatatccatacaaaaatctgacatgtggtcacgtggatcctgaacaagcacatttta 12311003  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttcca 474  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||  || ||||||| | ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  12311004 tctttcctttcctcttctctcttcctagtatacaagatgtacaaaggtgtatggaaataaagggtgtctatgtaacattttcca 12311087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 291 - 473
Target Start/End: Original strand, 41423682 - 41423864
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||| ||||||| |||||| | |||| ||| |||||||   |||||||  ||||||||||||||||  | |||| || || |||  ||||||| | ||||    
T  41423682 gagttatgatacatagacatcattagatggtaatacacctcttgacacttacacaaaaatctgacatgtggtcacgtagatcccgtacaagcatattttc 41423781  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttcc 473  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||| | |||||| |||||||  |||| |||||||||||||||    
T  41423782 tctttcatctcctcttctctcttcctagtgcatggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtttatgtaacattttcc 41423864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 291 - 471
Target Start/End: Original strand, 45223042 - 45223222
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||||||||||  || ||| ||||||||||||||||| ||||  ||| | ||||||||||||||||| || |||| |  ||| || |||||| || ||||    
T  45223042 gagtaatgatatatatacatccttaggtggcaatacattcttgaacatctacacaaaaatctgacacgtaatcatattaacctcatacaagcgcattttc 45223141  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacatttt 471  Q
    |||||| |||| |||| |||||| | | |||||| ||||||||| ||||||||  ||||||   ||||||||| |||||||    
T  45223142 tctttcatctcatcttctctctttcaaatatatggggtgtacaaagatgtatgtaaataaaggatgtctatgtgacatttt 45223222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 314 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 2318320 - 2318160
Alignment:
Q  314 taggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttctctttcctctcctcttttctct- 412  Q
    |||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||   | |||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||| |||| |||| |||||     
T  2318320 taggtggcaagacacctcttgacacccacacaaaaatctgacgtgtggtcacgtggacccgacataagcatactttctctttcatctcatcttctctctc 2318221  T
Q  413 tc-ctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttc 472  Q
    || ||| |  |||  |||||||| | ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  2318220 tctctaatgcatggagtgtacaaaggtgtatggaaataaagtgtgtctatgtaacattttc 2318160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 312 - 472
Target Start/End: Original strand, 32045858 - 32046018
Alignment:
Q  312 cttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttctctttcctctcctcttttctc 411  Q
    |||||||||||||| | |  | |||||||||| ||||||||||||| ||  ||| | ||||||| || |||| ||||||| |||| |||| |||| ||||    
T  32045858 cttaggtggcaatatattactggacacccacataaaaatctgacacgtaaccatatagaccccatactagcatactttctttttcatctcatcttctctc 32045957  T
Q  412 ttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttc 472  Q
    || | | |||||||| ||||||||| ||||||  ||||||   ||||||||||||||||||    
T  32045958 tttcaaatatatgagatgtacaagggtgtatgtaaataaagaatgtctatgtaacattttc 32046018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 289 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 46374904 - 46374808
Alignment:
Q  289 acgagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcaca 385  Q
    |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| | | ||  |||||||| ||||||||||    
T  46374904 acgagttatgatacatagacatccttaggtggcaacacaccctttaacacccacacaaaaatctgacacgtggccacatggaccccgcacaagcaca 46374808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 408 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 46374807 - 46374742
Alignment:
Q  408 tctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttcc 473  Q
    |||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  46374807 tctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtaacattttcc 46374742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 144; Significance: 2e-75; HSPs: 42)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 481 - 672
Target Start/End: Complemental strand, 31931061 - 31930862
Alignment:
Q  481 aaatatatgattatggaagatgtcatgtattaa-----tactaataattgatagtaacataacataaacattcattgacaccaaaaacaatataacattt 575  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31931061 aaatatatgattatggaagatgtcatgtattagattagtactaataatttatagtaacacaacataa-cattcattgacaccaaaaacaatataacattt 31930963  T
Q  576 acaacaagcttcctgcaatcaaataatagactcagccaagtgaaaggaaaaa----atattcactttttaacattgaaaggaatgaacaagcagtagaat 671  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31930962 acaacaagcttcctgcaatcaaataatagactcagccaagtgaaaggaaaaaatatatattcactttttaacattgaaaggaatgaacaagcagtagaat 31930863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 294 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 19930917 - 19930742
Alignment:
Q  294 taatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttctct 393  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  19930917 taatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacatccacacaaaaatctgacacgtagtcatgtggaccccgcacaaacacactttctct 19930818  T
Q  394 ttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacatt 469  Q
    || |||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  19930817 tttctctcctcttctctcttcctaatgcatgaggtgtacaagggtgtatgggaataaaaggtgtctatgtatcatt 19930742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 291 - 475
Target Start/End: Original strand, 20700815 - 20700999
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  20700815 gagtaatgatacatagacatccttatgtggcaatacaccctttgactcctacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcataagcacactttc 20700914  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttccat 475  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  20700915 tctttcctctcctcttctctcttcctagtgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtaacattttccat 20700999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 294 - 469
Target Start/End: Original strand, 28863458 - 28863633
Alignment:
Q  294 taatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttctct 393  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28863458 taatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctct 28863557  T
Q  394 ttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacatt 469  Q
    ||  ||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  28863558 tttatctcctcttctctcttcctaatgcatgaggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 28863633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 291 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 33436200 - 33436029
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  33436200 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctaacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 33436101  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatg 462  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||| |  ||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||    
T  33436100 tctttcctctcatcttctctcttcctaatgcatgaggtgtacaagggtgtatgagaataaaaggtgtctatg 33436029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 291 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 7465835 - 7465657
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7465835 gagtaatgatacatagacacccttagatggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccacacaagcacactttc 7465736  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacatt 469  Q
    |||||  |||| |||| |||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  7465735 tcttttatctcttcttctctcttcctaatgcatgaggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 7465657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 291 - 469
Target Start/End: Original strand, 13438343 - 13438521
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  13438343 gagtaatgatacatagacacccttaggtgacaatacatcctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 13438442  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacatt 469  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  13438443 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaaggatgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 13438521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 291 - 469
Target Start/End: Original strand, 17473020 - 17473198
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| |||||||||||||||    
T  17473020 gagtaatgatacatagacacccttagatggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggatcccgcacaagcacactttc 17473119  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacatt 469  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  17473120 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatgaggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 17473198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 291 - 451
Target Start/End: Original strand, 9058480 - 9058640
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9058480 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcatgtggaccccgcacaagcacactttc 9058579  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaa 451  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| |  ||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  9058580 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagagtgtatgggaataaa 9058640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 291 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 10249482 - 10249304
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  10249482 gagtaatgatacatagacacccttaggtgacaatacaccttttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 10249383  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacatt 469  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||| ||||    
T  10249382 tcttttctctcctcttttctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgagaataaagggtgtctatgtatcatt 10249304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 291 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 28381755 - 28381577
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| || |||||||||||||||    
T  28381755 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacacctttcgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacatggactccgcacaagcacactttc 28381656  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacatt 469  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  28381655 tcttttctctcatcttctctcttcctaatatatggggtgtacaaggatgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 28381577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 291 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 32505748 - 32505570
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  32505748 gagtaatgatacatagacacccttaggtgacaatacaccttttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 32505649  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacatt 469  Q
    | ||| |||||||||| ||||||| || |  ||| ||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||| ||||    
T  32505648 tattttctctcctcttctctcttcttaatgcatggggtgtacaagggtgtatgagaataaagagtgtctatgtatcatt 32505570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 291 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 40614002 - 40613820
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | | ||  |||||||| |||||||||||||||    
T  40614002 gagttatgatacatagacatccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtggccacatggaccccgcacaagcacactttc 40613903  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttcc 473  Q
    ||||| ||||||| || | ||||| || | |||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  40613902 tcttttctctcctattctttcttcataatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtaacattttcc 40613820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 291 - 469
Target Start/End: Original strand, 40701478 - 40701656
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| ||||| |||||||||    
T  40701478 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccttttgacacccacacaaaaatctgacacgtagttacgtggaccccgcacaatcacactttc 40701577  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacatt 469  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||| |  ||  ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  40701578 tcttttctctcatcttctctcttcctaatgcatcgggtgtacaagggtgtatggaaataaaaggtgtctatgtatcatt 40701656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 291 - 450
Target Start/End: Original strand, 30915463 - 30915622
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  30915463 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacccccacataaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgtacaagcacactttc 30915562  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataa 450  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  30915563 tcttttctctcatcttctctcttcctaatacatggggtgtacaagggtgtatggaaataa 30915622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 297 - 473
Target Start/End: Original strand, 3439985 - 3440161
Alignment:
Q  297 tgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttctctttc 396  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||  |  | | ||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  3439985 tgatacgtagacacccttaggtggcaatacactcctggacacccacacaaaaatctaacatgtgattacgtggaccccgcacaagcacattttctctttc 3440084  T
Q  397 ctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttcc 473  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||  ||||||||| | ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  3440085 ctctcctcttctctctttctagaatatagggtgtacaaaggtgtatggaaataaagggtgtctatgtaacattttcc 3440161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 291 - 473
Target Start/End: Original strand, 38732354 - 38732536
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||| ||||||| || ||||||||| ||| |||||||  | |||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  38732354 gagttatgatacataaacacccttatgtgacaatacatcccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggtcatatggaccccgcacaagtacactttc 38732453  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttcc 473  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||||| || ||||| ||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  38732454 tctttcttcttctcttctctcttcctaatacatgagatgtacaaggatgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcc 38732536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 309 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 2997569 - 2997408
Alignment:
Q  309 acccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttctctttcctctcctctttt 408  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  | | ||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||| |    
T  2997569 acccttaggtggcaatacaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcacaagtacactttctctttcttcttctcttct 2997470  T
Q  409 ctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattt 470  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||| ||||||  | ||||| |||||||||||||||||    
T  2997469 ctcttcctaatacatgaggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaagtgtctatgtaacattt 2997408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 291 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 38273242 - 38273060
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||| ||||||| ||||||  ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||| ||| |||||||||||    
T  38273242 gagttatgatacatagacattcttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatctgacacgtagccacatggaccccgcactagcacactttc 38273143  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttcca 474  Q
    ||||| ||||||| || |||||||||| | |||| ||||||||| |||||||| |||||||  |||| ||||||| ||||||||    
T  38273142 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaa-gatgtatgagaataaatggtgtttatgtaatattttcca 38273060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 291 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 38882913 - 38882733
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccac---acaagcacact 387  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |   |||||| ||||    
T  38882913 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaata-accctttgacatccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggacccccccgcacaagcgcact 38882815  T
Q  388 ttctctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacatt 469  Q
    |||||||| ||||  |||| |||||||||| |  ||| ||||||||||| ||||||||||||||  || |||||||| ||||    
T  38882814 ttctcttttctcttatcttatctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtctctatgtatcatt 38882733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 291 - 474
Target Start/End: Original strand, 43490121 - 43490304
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||| ||||||| || ||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||  | | ||| |||||||| |||||| |||||||     
T  43490121 gagttatgatacataaacacccttaggtgacaatacaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcacaagtacacttta 43490220  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttcca 474  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||||| || ||  ||||||||||| ||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  43490221 tctttcttcttctcttctctcttcctaatacatagggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcca 43490304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 291 - 469
Target Start/End: Original strand, 4060685 - 4060863
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| |||| | ||||| ||| || ||||||||||||    
T  4060685 gagtaatgatacatagacacccttaggtgacaatacaccttttgacatccacacaaaaatctgacacgtagttacgtggatcccgcataagcacactttc 4060784  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacatt 469  Q
    | ||| ||||| |||| |||||||||| |  ||| ||||||||||| ||||||| |||||||  ||| |||||| ||||    
T  4060785 ttttttctctcatcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatggaaataaaagatgtttatgtatcatt 4060863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 291 - 473
Target Start/End: Original strand, 2533124 - 2533305
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||  | |||||| ||||||||||||||     
T  2533124 gagttatgatacatagacatccttaagtggcaatacatcctttgacacc-acacaaaaatctgacacgtagccacatagaccccgcacaagcacactttt 2533222  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttcc 473  Q
    |||||  ||||||||| |||||||| | | |||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||    
T  2533223 tcttttatctcctcttctctcttcccaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtatatataacattttcc 2533305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 291 - 473
Target Start/End: Original strand, 42257193 - 42257375
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||| | | ||  |||||||| |||||||||||||||    
T  42257193 gagttatgatacatagacatctttaggtggcaatacatcatttgacacccacataaaaatctgacacgtggccacatggaccccgcacaagcacactttc 42257292  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttcc 473  Q
    ||||| |||||||||| | |||||||| | |||| ||||||||||  ||||| | ||||||  |||||||||||| |||||||    
T  42257293 tcttttctctcctcttctttcttcctaatgtatggggtgtacaagagtgtatagaaataaagggtgtctatgtaatattttcc 42257375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 291 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 5574588 - 5574479
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||| |||||||||||||||    
T  5574588 gagtaatgatacatagacactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacataaaaatctgacacgtagtcacgtggatcccgcacaagcacactttc 5574489  T
Q  391 tctttcctct 400  Q
    ||||| ||||    
T  5574488 tcttttctct 5574479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 291 - 480
Target Start/End: Original strand, 36168836 - 36169025
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||| ||||||| |||||| |||||| || |||||||  |||| || ||||||||||||| |||||| | | ||  |||||||| |||||||| ||||||    
T  36168836 gagttatgatacatagacatccttagatgacaatacatcctttaactcccacacaaaaatttgacacgtggccacatggaccccgcacaagcatactttc 36168935  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttccataacat 480  Q
    ||||| ||||||| || |||||||||| | |||| ||||||||||  |||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  36168936 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagagtgtatgagaataaagggtgtttatgtaacattttccataacat 36169025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 307 - 473
Target Start/End: Original strand, 13365369 - 13365535
Alignment:
Q  307 acacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttctctttcctctcctctt 406  Q
    |||||||||| |||||||| || | |||||||||||||||||||||||||  |   ||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  13365369 acacccttagatggcaatataccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtgaccatatggaccccgcacaagtacactttctctttcttcttctctt 13365468  T
Q  407 ttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttcc 473  Q
     |||||||||| || ||| ||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  13365469 ctctcttcctaatacatggggtgtacaagggtgaatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcc 13365535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 334 - 475
Target Start/End: Original strand, 3737986 - 3738127
Alignment:
Q  334 gacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttctctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtaca 433  Q
    |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||  ||||||||    
T  3737986 gacacccacacaaaaatctgacatgtggtcatgtggaccccgcacaagcacattttctttttcctctcctcttctttcttcctagaatatagggtgtaca 3738085  T
Q  434 aggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttccat 475  Q
    | | ||||||  |||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  3738086 aaggtgtatgaaaatatagggtgtctatgtaacattttccat 3738127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 291 - 473
Target Start/End: Original strand, 17823784 - 17823970
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgt----ggaccccacacaagcacac 386  Q
    |||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||| ||   || |    |||||||| ||||||||||    
T  17823784 gagtaatgatacatatacatccttaggtggcaatacattcctgaacacccacacaaaaatctgacacgtaactatatatatggaccccatacaagcacac 17823883  T
Q  387 tttctctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttcc 473  Q
    |||||||||| |||| |||| |||||||| | |||||| ||||||||||| ||||||  ||||||   |||||||||||||||||||    
T  17823884 tttctctttcatctcatcttctctcttccaaatatatggggtgtacaagggtgtatgtaaataaaggatgtctatgtaacattttcc 17823970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 291 - 396
Target Start/End: Original strand, 27864704 - 27864809
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  27864704 gagtaatgatacatagacacccttatgtggcaatacaccctttgacatccacacaaaaatctgacacgtaatcacgtggaccccgcaaaagcacactttc 27864803  T
Q  391 tctttc 396  Q
    ||||||    
T  27864804 tctttc 27864809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 291 - 431
Target Start/End: Original strand, 33436211 - 33436351
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |   |||||||||    |||||||||||||||    
T  33436211 gagtaatgatacatagacatccttagatggcaatacaccttttgacacccacataaaaatctgacacgtgaccatgtggactttgcacaagcacactttc 33436310  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgta 431  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  33436311 tctttcctatcctcttctctcttcctagttcatgaggtgta 33436351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 291 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 17820104 - 17819961
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||| ||||||| |||||| |  ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  | || | ||||||||||||||| |||| ||||    
T  17820104 gagttatgatacatagacaactataggtggcaatacaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggttacgtggaccccacacaaacacattttc 17820005  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaa 434  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||    
T  17820004 tctttcatctcctcttctctcttcctaatgcatgaggtgtacaa 17819961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 291 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 26891604 - 26891418
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||  | |||| ||||||| |  ||||||||| ||||    
T  26891604 gagttatgatacatagccacccttaggtggcaatacacccctagacacccacacaaaaatctgacatgtggtcacgtggacctcgaacaagcacattttc 26891505  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttccataa 477  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| ||||   |||||| ||   ||||||  ||| ||  |||| |||||||||||||||||||    
T  26891504 tctttcctcttctcttctctcttcctaatatacagggtgtaaaaatgtgtatgaaaattaagggtgtatatgtaacattttccataa 26891418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 292 - 417
Target Start/End: Original strand, 41575138 - 41575264
Alignment:
Q  292 agtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggacccc-acacaagcacactttc 390  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41575138 agtaatgatacatagacatccttagatggtaatacaccctttgacattcacacaaaaatttgacatgtggtcatgtggacccctacacaagcacactttc 41575237  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttccta 417  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||||    
T  41575238 tctttcatctcctcttctctcgtccta 41575264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 381 - 471
Target Start/End: Original strand, 41758677 - 41758767
Alignment:
Q  381 gcacactttctctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacatttt 471  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41758677 gcacattttctcttttatctcctcttctctcttcctaatatatggggtgtacaaggatgtatgagaataaaatgtgtctatgtaacatttt 41758767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 296 - 472
Target Start/End: Original strand, 44151928 - 44152108
Alignment:
Q  296 atgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaa-tctgacacatagtcatgtgg---accccacacaagcacactttct 391  Q
    ||||||| |||||| |  |||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||| |||||||| | || |||| |   | ||||||||||||||||||||    
T  44151928 atgatacatagacaactataggtgacaatacactctttaacacctacaaaaaaaatctgacacgtggttatgtagtgaatcccacacaagcacactttct 44152027  T
Q  392 ctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttc 472  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| |  ||||| | ||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||    
T  44152028 ctttcatctcctcttctctcttcctaatgcatgagatatacaagggtgtatgcgaataaaaggtgtttatgtaacattttc 44152108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 291 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 45097835 - 45097653
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||| ||||||| || ||| |||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||  | | ||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  45097835 gagttatgatacataaacatccttaggtggcaatacatcccttgacacccatacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcacaagtacactttc 45097736  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttcc 473  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||||| || ||  | ||||||||  ||||||  | |||||  ||| |||||||||||||||    
T  45097735 tctttcttcttctcttctctcttcctaatacatcggatgtacaagagtgtatgcaattaaaagatgtttatgtaacattttcc 45097653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 341 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 3035033 - 3034900
Alignment:
Q  341 acacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttctctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgt 440  Q
    ||||||||||||||||  | ||||| |||||||| |||||| | |||||||||||| ||| ||||| |||||||||| || ||||||||||| | | |||    
T  3035033 acacaaaaatctgacatgtggtcatatggaccccgcacaagtatactttctctttcttcttctcttctctcttcctaatacatgaggtgtaccaaggtgt 3034934  T
Q  441 atgggaataaaatgtgtctatgtaacattttcca 474  Q
    |||  | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  3034933 atgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcca 3034900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 291 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 15428840 - 15428663
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||| ||||||| || ||| ||||| ||||| |||||| | || |||| |||||||||||||||||  | | |||||  ||||||| ||| |||| ||||    
T  15428840 gagttatgatacataaacatccttatgtggccatacaccccttaacactcacacaaaaatctgacatgtggccatgtaaaccccacgcaaacacattttc 15428741  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacatt 469  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||| |  ||||   |||||||||||||||    
T  15428740 tctttcatctcctcttttctctttctagtacatg-ggtgtacaagggtgtatgagggtaaatgatgtctatgtaacatt 15428663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 304 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 21301587 - 21301420
Alignment:
Q  304 tagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttctctttcctctcct 403  Q
    |||||| | ||| ||||||||| |||| | || || |||||||||||| || || |  |||||||||| | |||||| ||||||||||||||  ||| ||    
T  21301587 tagacatctttaagtggcaatatactcctcgatactcacacaaaaatcagatacgtgatcatgtggactctacacaaacacactttctcttttatcttct 21301488  T
Q  404 cttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacatttt 471  Q
    ||| | ||||||||||  |||||||||||| |  ||||||| ||||||  |||| ||| |||||||||    
T  21301487 cttctttcttcctagtgcatgaggtgtacatgagtgtatggaaataaagggtgtgtatctaacatttt 21301420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 568 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 31927394 - 31927336
Alignment:
Q  568 taacatttacaacaagcttcctgcaatcaaataatagactcagccaagtgaaaggaaaaaa 628  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||    
T  31927394 taacatttacaacaagcttcctacaatcaaat--tatactcagccaagtgaaaggacaaaa 31927336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 341 - 412
Target Start/End: Original strand, 3154193 - 3154264
Alignment:
Q  341 acacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttctctttcctctcctcttttctct 412  Q
    ||||||||||||||||| | ||||  |||| ||| | ||| |||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  3154193 acacaaaaatctgacacgtggtcacatggatcccgcccaaacacagtttctctttcatctcctcttttctct 3154264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 128; Significance: 8e-66; HSPs: 38)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 291 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 40424043 - 40423864
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40424043 gagtaatgatacatagatacccttaggtggcaatacaccctttgacatccacacaaaaatctgacacgtagtcatgtggaccccgcacaagcacactttc 40423944  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattt 470  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  40423943 tcttttctctcctcttctctcttcctaatacatgaggtgtacaagggtgtatgggaataaaaggtgtctatgtatcattt 40423864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 291 - 469
Target Start/End: Original strand, 15197333 - 15197511
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  15197333 gagtaatgatacatagacactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 15197432  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacatt 469  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  15197433 tcttttctctcctcttttctcttccaaatgcatgaggtgtacaagggtgtatgggaataaaaagtgtctatgtatcatt 15197511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 291 - 469
Target Start/End: Original strand, 14547922 - 14548100
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  14547922 gagtaaagatacatagacacccttaggtggcaatacaccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 14548021  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacatt 469  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  14548022 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaaggatgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 14548100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 292 - 477
Target Start/End: Original strand, 5957831 - 5958016
Alignment:
Q  292 agtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttct 391  Q
    ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  5957831 agtaatgatacatagacattcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggatcccgcacaatcacactttct 5957930  T
Q  392 ctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttccataa 477  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||| |||||||||||||| ||||    
T  5957931 ctttcctctcctcttctctcttcctagtgcatgaggtgtacaagggtgtatgagaataaagggtgtttatgtaacattttctataa 5958016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 291 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 10284731 - 10284549
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  10284731 gagttatgatacatagacacccttaagtgacaatacactctttgacacccacacaaaaatttgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 10284632  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttcc 473  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10284631 tctttcctttcatcttctctcttcctagtgcatggggtgtacaaggttgtataagaataaaaggtgtctatgtaacattttcc 10284549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 291 - 469
Target Start/End: Original strand, 12831047 - 12831225
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  12831047 gagtaatgatacatagacacccttaggtgacaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 12831146  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacatt 469  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| |  ||| ||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||| ||||    
T  12831147 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgagaataaatggtgtctatgtatcatt 12831225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 291 - 474
Target Start/End: Original strand, 37038479 - 37038662
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| |||||||||||||||    
T  37038479 gagtaatgatacatagacatctttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggatcccgcacaagcacactttc 37038578  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttcca 474  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||| | ||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  37038579 tatttcctctcctcttctctcttcctagtgcatggggtgtacaagggtgtatagaaataaagggtgtttatgtaacattttcca 37038662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 290 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 1180041 - 1179880
Alignment:
Q  290 cgagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacacttt 389  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  1180041 cgagtaatgatacatagacacccttaggtggtaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcatgtggattccgcacaagcacacttt 1179942  T
Q  390 ctctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaa 451  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  1179941 ctcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaaggatatatgggaataaa 1179880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 291 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 504221 - 504043
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| |||    
T  504221 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccttttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacacattc 504122  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacatt 469  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||| |  ||| ||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||| ||||    
T  504121 tcttttctctcatcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgagaataaagggtgtctatgtatcatt 504043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 310 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 8841513 - 8841348
Alignment:
Q  310 cccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttctctttcctctcctcttttc 409  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8841513 cccttaggtggcagtacaccctttgacacccacacaaaaatctaacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctctttcctctcctcttctc 8841414  T
Q  410 tcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttccat 475  Q
    | ||||||||  ||| ||||||||||  |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  8841413 ttttcctagtgcatggggtgtacaagagtgtatgagaataaatggtgtctatgtaacattttccat 8841348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 291 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 23122697 - 23122519
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  23122697 gagtaatgatacatagacacccttaagtggcaatacaccttttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcataagcacactttc 23122598  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacatt 469  Q
    ||||| ||||||| || |||||||||| |  ||| ||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||| ||||    
T  23122597 tcttttctctcctgttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgagaataaagggtgtctatgtatcatt 23122519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 291 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 34012396 - 34012218
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||| |||||||||||||||    
T  34012396 gagtaatgatacatagacacccttaggtggtaatacaccctttgacacccacacaaaaatttgacacgtagtcacgtggatcccgcacaagcacactttc 34012297  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacatt 469  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| |  ||| ||||||||||| |||| | |||||||  ||||||||||| ||||    
T  34012296 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtacgagaataaagggtgtctatgtatcatt 34012218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 291 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 43414681 - 43414499
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||| ||||||| |||||| |||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||  |||| ||| |||||||||||||||    
T  43414681 gagttatgatacatagacatccttagatggcaacacaccctttgacacccacacaaaaatctaacacgtggtcacatggatcccgcacaagcacactttc 43414582  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttcc 473  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  43414581 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatggcaataaagggtgtctatgtaacattttcc 43414499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 291 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 44507187 - 44507010
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||||| ||||||    
T  44507187 gagtaatgatacatagacacccttaggtggtaatacactctttaacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgtacaagcatactttc 44507088  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacatt 469  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||| |  ||| ||||||||||| |||||| |||| |||| |||||||||| ||||    
T  44507087 tcttttctctcatcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgagaat-aaatatgtctatgtatcatt 44507010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 291 - 469
Target Start/End: Original strand, 34307216 - 34307394
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  | | ||| || ||||| |||||| ||||||||    
T  34307216 gagttatgatacataaacacccttaggtggcaatacaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggacatatgaaccccgcacaagtacactttc 34307315  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacatt 469  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||  | ||||| ||||||||||||||||    
T  34307316 tctttcttcttctcttctctcttcctaatatatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacatt 34307394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 291 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 15048281 - 15048099
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||  |||||||| |||||||||||||||    
T  15048281 gagttatgatacatagacatccttaggtggcaatacaccctttgacacc-acacaaaaatctgacacgtagccacatggaccccgcacaagcacactttc 15048183  T
Q  391 tc-tttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttcc 473  Q
    || |||  ||||||||| |||||||||| | |||| | ||||||||| ||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  15048182 tctttttatctcctcttctctcttcctaatgtatgggatgtacaagggtgtatcggaataaagggtgtctatataacattttcc 15048099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 291 - 477
Target Start/End: Original strand, 17443825 - 17444011
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||  || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  17443825 gagttatgatacatagacaaccttaggtgacaatacacttcttaacactcacacaaaaatctgacatgtagtcatgtggaccccacacaaagacactttc 17443924  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttccataa 477  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||| |||  ||||| |||||||||||||||    |||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  17443925 tctttcatcttctcttctctcttcccagtgcatgagttgtacaaggatgtattcttataaagggtgtctatgtaacatttttcataa 17444011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 296 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 10621182 - 10621012
Alignment:
Q  296 atgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttctcttt 395  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  | || ||| ||||||||||||||||||||    
T  10621182 atgatacatagacatccttaggtggtaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagccacatcgatcccgcacaagcacactttctcttt 10621083  T
Q  396 cctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttccata 476  Q
     |||||||||| |||||||||| ||||||          ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  10621082 tctctcctcttctctcttcctaatatatg----------ggatgtatgggaataaaagatgtctatgtaacattttccata 10621012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 291 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 24307893 - 24307715
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||| ||||||| || |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |  | | ||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  24307893 gagttatgatacataaacacccttaggtggcaatacatcccttgacacccacacaaaaatctgatatgtggccatatggaccccgcacaagtacactttc 24307794  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacatt 469  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||  | ||||| ||||||||||||||||    
T  24307793 tctttcttcttctcttctctcttcctaatacatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacatt 24307715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 291 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 30479574 - 30479396
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||  | |  || |||||| | |||||| ||||||||    
T  30479574 gagttatgatacataaacacccttaggtggcaatacaccctttgacatccacataaaaatctgacatgtggctatatggacctcgcacaagtacactttc 30479475  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacatt 469  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||||| || ||||||||||||||| ||||||  | ||||| ||||||||||||||||    
T  30479474 tctttcttcttctcttctctcttcctaatacatgaggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacatt 30479396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 291 - 473
Target Start/End: Original strand, 42221515 - 42221697
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||||||||||| || ||| ||||||||| ||||||| || | |||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  42221515 gagtaatgatacatatacatccttaggtgacaatacattcctggacacccacacaaaaatctgacacgtaatcatatggaccccatacaagcacactttc 42221614  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttcc 473  Q
    |||||| |||| |||| |||||||| | |||||  ||||||||||| ||||||  ||||||   ||| ||| |||||||||||    
T  42221615 tctttcatctcatcttctctcttccaaatatatagggtgtacaagggtgtatgtaaataaaggatgtttatataacattttcc 42221697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 291 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 4854963 - 4854779
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| ||| |||||||||| |  | | ||  |||||||  |||||||||||||||    
T  4854963 gagtaatgatacatagacatccttaggtggcaatacaccctttaacacctacataaaaatctgatatgtggccacatggaccctgcacaagcacactttc 4854864  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttccat 475  Q
    ||||| |||||||||| |||||| ||| | |||| | ||||||||| | |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  4854863 tcttttctctcctcttctctcttactaatgtatgggatgtacaagggtatatgagaataaagagtgtctatgtaacattttccat 4854779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 291 - 474
Target Start/End: Original strand, 32032725 - 32032907
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||  | | ||| |||| ||  |||||| ||||||||    
T  32032725 gagttatgatacataaacacccttaggtggcaataca-tccttgacatccacacaaaaatctgacatgtggccatatggatcctgcacaagtacactttc 32032823  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttcca 474  Q
    ||||||  || ||||| |||||||||| || ||||||||||||||| ||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  32032824 tctttctccttctcttctctcttcctaatacatgaggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcca 32032907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 291 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 20075034 - 20074870
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||        ||||||||  |||||||||||||||    
T  20075034 gagtaatgatacatagacatccttaggtggcaatacactctttgacacccacataaaaatgtgacac--------gtggaccctgcacaagcacactttc 20074943  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttcc 473  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||          |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20074942 tctttcctcttctcttctctcttcctagttcatgagg----------tgtatgagaataaaatgtgtctatgtaacattttcc 20074870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 291 - 435
Target Start/End: Original strand, 16383377 - 16383521
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  | | ||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  16383377 gagttatgatacataaacacccttaggtggcaatacaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcacaagtacactttc 16383476  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaag 435  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||||| || ||| ||||||||||    
T  16383477 tctttcttcttctcttctctcttcctaatacatggggtgtacaag 16383521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 291 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 16056501 - 16056322
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||| ||||||| || ||| ||||| ||| |||||||  | |||||||||||||||||||||||||  | | ||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  16056501 gagttatgatacataaacatccttatgtgacaatacatcccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcacaagtacactttc 16056402  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattt 470  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||  | ||||| |||||||||||||||||    
T  16056401 tctttcttcttctcttctctcttcctaatacatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattt 16056322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 292 - 469
Target Start/End: Original strand, 9122196 - 9122363
Alignment:
Q  292 agtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttct 391  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||    
T  9122196 agtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacac----------ccacacaaaaatctgacatgtagtcacgtggatcccgcacaagcacactttct 9122285  T
Q  392 ctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacatt 469  Q
    |||| |||||||||| |||||||||| |  ||| ||||||||||  ||||||||||||||   |||||||||| ||||    
T  9122286 cttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagagtgtatgggaataaagaatgtctatgtatcatt 9122363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 291 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 15259029 - 15258847
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||| ||||||| |||| || ||||| ||||||||||  | | |||| ||||| ||||||||||||  | |||| ||||||||  |||||||||| ||||    
T  15259029 gagttatgatacatagatactcttagatggcaatacatccctggacatccacataaaaatctgacatgtggtcacgtggaccctgcacaagcacattttc 15258930  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttcc 473  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||  | |||||||   ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  15258929 tctttcctctcctcttctctcttcctagaatataggatgtacaaaagtgtatggaaataaagggtgtctatgtaacattttcc 15258847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 376 - 475
Target Start/End: Original strand, 40467785 - 40467884
Alignment:
Q  376 cacaagcacactttctctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttccat 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||  || |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40467785 cacaagcacactttctctttcctctcatcttctctcttcctagtctatggggtgtacaaaaatttatggggataaaaggtgtctatgtaacattttccat 40467884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 290 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 14055693 - 14055522
Alignment:
Q  290 cgagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggacccc-acacaagcacactt 388  Q
    ||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||  |||||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  14055693 cgagttatgatacattgacacccttaggtgacaatacactccttgacatccacacaaaaatcttacatgtagtcacgtggacccctacacaagc-cactt 14055595  T
Q  389 tctctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctat 461  Q
    | ||||||||||  |||| ||||||| || |  ||||||| ||||| | |||||| |||||||  ||||||||    
T  14055594 tttctttcctctgatcttctctcttcttaatgaatgaggtatacaaaggtgtatgagaataaatagtgtctat 14055522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 345 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 42354634 - 42354506
Alignment:
Q  345 aaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttctctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgg 444  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||| | |||| |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||  ||| |||||| |||| ||||||     
T  42354634 aaaaatctgacacgtgttcatgtggatctcacataagcacactttctctttcatcttctcttctctcttcctagtgcatggggtgtagaagggtgtatga 42354535  T
Q  445 gaataaaatgtgtctatgtaacattttcc 473  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  42354534 gaataaatggtgtctatgtaacattttcc 42354506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 367 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 32708029 - 32707920
Alignment:
Q  367 tggaccccacacaag--cacactttctctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgta 464  Q
    |||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||  | ||||| |||||||||||    
T  32708029 tggaccccgcacaagtacacactttctctttcttcttctcttctctcttcctaatacatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgta 32707930  T
Q  465 acattttcca 474  Q
    ||||||||||    
T  32707929 acattttcca 32707920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 291 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 30183975 - 30183794
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| || | ||||| || |||||||||||| || || |||| |||||  || | ||||||||||||    
T  30183975 gagtaatgatacatatacatccttacgtggcaatacattcctggacactcatacaaaaatctgatacgtaatcatatggacttcatataagcacactttc 30183876  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttcc 473  Q
    |||||| | || |||| | |||||| | |||||| ||||||||||  ||||||  ||||||   ||||||| |||||||||||    
T  30183875 tctttcat-tcatcttctttcttccaaatatatggggtgtacaagagtgtatgtaaataaaggatgtctatctaacattttcc 30183794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 384 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 42710301 - 42710216
Alignment:
Q  384 cactttctctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacatt 469  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||| ||||    
T  42710301 cactttctcttttctctcctcttctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtctgtgtatcatt 42710216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 291 - 354
Target Start/End: Original strand, 24307629 - 24307692
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctga 354  Q
    |||| ||||||| || |||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  24307629 gagttatgatacataaacacccttaggtggcaatacatccattgacacccacacaaaaatctga 24307692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 311 - 472
Target Start/End: Original strand, 25838217 - 25838370
Alignment:
Q  311 ccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttctctttcctctcctcttttct 410  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||        ||| | ||||  ||||| ||  ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||    
T  25838217 ccttaggtggcaatacactttttgacatccacacaa--------cacgttgtcacatggactccgtacaagcacactttttcttttctctcctcttctct 25838308  T
Q  411 cttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttc 472  Q
     || ||| | |||  ||||||||||| ||||||| ||||||   | ||||||||||||||||    
T  25838309 tttgctaatgtatagggtgtacaaggttgtatggcaataaaggatatctatgtaacattttc 25838370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 307 - 406
Target Start/End: Original strand, 38229445 - 38229543
Alignment:
Q  307 acacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttctctttcctctcctctt 406  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||  |   ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  38229445 acactcttaggtggcaatacgctcct-gacacccacacaaaaatctgacatgtggtcacgtggattctgtacaagcacattttctctttcctcttctctt 38229543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 317 - 357
Target Start/End: Original strand, 30912496 - 30912535
Alignment:
Q  317 gtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacac 357  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  30912496 gtggcaatacactcttt-acacccacacaaaattctgacac 30912535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 127; Significance: 3e-65; HSPs: 39)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 291 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 50052528 - 50052346
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  50052528 gagtaatgatacatagacatccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 50052429  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttcc 473  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||  || |||||||||| | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  50052428 tctttcctctcctcttctctcttcctagtgcataaggtgtacaaaggtgtatgggaataaagggtgtctatgtaacattttcc 50052346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 291 - 473
Target Start/End: Original strand, 29239886 - 29240068
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29239886 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccatttgacatccacacaaaaatctaacacgtagtcacgtggaccccacacaagcacactttc 29239985  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttcc 473  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  29239986 tctttcctctcctcttctctcttcctagtgcatggggtgtacaagagtgtatgggaataaagggtgtctatgtaacattttcc 29240068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 290 - 469
Target Start/End: Original strand, 41236346 - 41236525
Alignment:
Q  290 cgagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacacttt 389  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  41236346 cgagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccttttgacatccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacacttt 41236445  T
Q  390 ctctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacatt 469  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |  ||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  41236446 ctcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 41236525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 291 - 469
Target Start/End: Original strand, 6034044 - 6034222
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||| |||||||||||||||    
T  6034044 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacatgtagtcacgtggatcccgcacaagcacactttc 6034143  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacatt 469  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| |  ||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  6034144 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgagaataaaaggtgtctatgtatcatt 6034222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 291 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 11511562 - 11511385
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  11511562 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacataaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 11511463  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacatt 469  Q
    ||||| |||| ||||| ||||||| || |  ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  11511462 tcttttctcttctcttctctcttcttaatgcatgaggtgtacaagggtgtatggaaat-aaatgtgtctatgtatcatt 11511385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 291 - 473
Target Start/End: Original strand, 31910192 - 31910374
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||    
T  31910192 gagttatgatacatagacatccttaggtgacaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagccacatggaccccgcacaagcacactttc 31910291  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttcc 473  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||| | |||| | ||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  31910292 tcttttctctcatcttctctcttcctaatgtatgggatgtacaagagtgtatgggaataaatggtgtctatgtaacattttcc 31910374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 291 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 48183149 - 48182971
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  48183149 gagtaatgatacatagacacccttacgtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 48183050  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacatt 469  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| || |  ||| ||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||| ||||    
T  48183049 tcttttctctcctcttctctcttcttaatgcatggggtgtacaagggtgtatgagaataaagggtgtctatgtatcatt 48182971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 286 - 419
Target Start/End: Original strand, 3481649 - 3481782
Alignment:
Q  286 caaacgagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcaca 385  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3481649 caaatgagtaatgatacatagacacctttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccacacaagcaca 3481748  T
Q  386 ctttctctttcctctcctcttttctcttcctagt 419  Q
    |||||||||||||| | |||| |||||| |||||    
T  3481749 ctttctctttcctcccatcttctctctttctagt 3481782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 291 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 42044467 - 42044289
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  42044467 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacatccttgtacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 42044368  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacatt 469  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| |  ||| | ||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||| ||||    
T  42044367 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtatggaaataaagggtgtctatgtatcatt 42044289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 291 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 54473633 - 54473473
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||     
T  54473633 gagtaatgatacatagacacccttaggtgacaatacaccatttgacacccacacaaaaatctaacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacacttta 54473534  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaa 451  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| || |||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  54473533 tcttttctctcctcttctctcttcctaatacatggagtgtacaagggtgtatgggaataaa 54473473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 291 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 480547 - 480388
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  480547 gagtaatgatacatagacacccttaggtgacaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgtacaagcacactttc 480448  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataa 450  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| |  ||| ||||||||| | ||||||| |||||    
T  480447 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaaaggtgtatggaaataa 480388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 291 - 469
Target Start/End: Original strand, 23608235 - 23608413
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || ||||||||||||||||||    
T  23608235 gagtaatgatatatagacacccttagatgacaatacaccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtgaactccacacaagcacactttc 23608334  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacatt 469  Q
    |||||  ||||||||| |||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||| ||||    
T  23608335 tcttttatctcctcttctctcttcctaatgcatgaggtgtacagggatgtatgggaataaaggatgtctatgtatcatt 23608413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 291 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 50526271 - 50526089
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||  || ||||||||| |||||    
T  50526271 gagtaatgatacatagacatctttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtggtcacgtggattccgcacaagcacgctttc 50526172  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttcc 473  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||| | ||||||  |||| |||||||||||||||    
T  50526171 tatttcctctcctcttctctcttcctagtgcatggggtgtacaagggtgtatagaaataaagggtgtttatgtaacattttcc 50526089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 291 - 483
Target Start/End: Original strand, 55475191 - 55475383
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||| ||||||| || ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | | ||| |||||||  || ||| ||||||||    
T  55475191 gagttatgatacataaacatccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccctgcataagtacactttc 55475290  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttccataacataaa 483  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55475291 tctttcttcttctcttctctcttcctaatacatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttccataacataaa 55475383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 291 - 482
Target Start/End: Original strand, 29977885 - 29978076
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||||||||||| || | | || ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29977885 gagtaatgatacatacagaaccataggtggcaatacaccccttaacacccacacaaaaatctgacacgtagtcatatggaccccacacaagcacactttc 29977984  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttccataacataa 482  Q
    |||||| ||| |||||||||||  ||| | |||| ||||||||||  ||||| |||||||||  | ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  29977985 tctttcatcttctcttttctctcactaatgtatggggtgtacaagtgtgtataggaataaaagatatctatgtaacatttttcataaaataa 29978076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 291 - 471
Target Start/End: Original strand, 40574779 - 40574959
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |  |  |||| |||  ||||||||||||||    
T  40574779 gagttatgatacatagacatccttaggtggtaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgctgctacatggatcccgaacaagcacactttc 40574878  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacatttt 471  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||    
T  40574879 tcttttctctcctcttctctcttcctaatatatggggtgtacaagggtgtatgagaataaaaggtgtctatctaacatttt 40574959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 291 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 19670816 - 19670634
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||  | | ||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  19670816 gagttatgatacataaacacccttaggtggcaatacaccccttgacactcacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcacaagtacactttc 19670717  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttcc 473  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  19670716 tctttcttcttctcttctctcttcctaatacatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcc 19670634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 291 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 24995207 - 24995029
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||| |||||| ||||||||| |||||||||| ||||    
T  24995207 gagtaatgatatatggacacccttagatggcaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacattttc 24995108  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacatt 469  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| || |  ||| ||||||||| | ||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  24995107 tcttttctctcctcttctctcttcttaatgcatggggtgtacaatggtgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 24995029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 299 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 28480360 - 28480186
Alignment:
Q  299 atacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttctctttcct 398  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||||||||  || |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |    
T  28480360 atacatagacaaccttaggtgacaatacacttcttaacactcacacaaaaatctgacatgtagtcatgtggaccccacacaaacacactttctccttcat 28480261  T
Q  399 ctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttcc 473  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||    |||||  ||||||||||||||||||||    
T  28480260 ctcctcttctctcttcctagtgcatgagttgtacaaggatgtattcttataaagggtgtctatgtaacattttcc 28480186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 299 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 28481235 - 28481061
Alignment:
Q  299 atacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttctctttcct 398  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||||||||  || |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |    
T  28481235 atacatagacaaccttaggtgacaatacacttcttaacactcacacaaaaatctgacatgtagtcatgtggaccccacacaaacacactttctccttcat 28481136  T
Q  399 ctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttcc 473  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||    |||||  ||||||||||||||||||||    
T  28481135 ctcctcttctctcttcctagtgcatgagttgtacaaggatgtattcttataaagggtgtctatgtaacattttcc 28481061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 299 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 28482110 - 28481936
Alignment:
Q  299 atacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttctctttcct 398  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||||||||  || |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |    
T  28482110 atacatagacaaccttaggtgacaatacacttcttaacactcacacaaaaatctgacatgtagtcatgtggaccccacacaaacacactttctccttcat 28482011  T
Q  399 ctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttcc 473  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||    |||||  ||||||||||||||||||||    
T  28482010 ctcctcttctctcttcctagtgcatgagttgtacaaggatgtattcttataaagggtgtctatgtaacattttcc 28481936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 291 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 50813992 - 50813806
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||| ||||||| || |||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||  | ||||| || ||||| |||||| ||||||||    
T  50813992 gagttatgatacataaacactcttaggtggtaatacaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggtcatatgaaccccgcacaagtacactttc 50813893  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttccataa 477  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||||| || ||||| ||||||||| ||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  50813892 tctttcttcttctcttctctcttcctaatacatgagatgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttccataa 50813806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 309 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 17983825 - 17983664
Alignment:
Q  309 acccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttctctttcctctcctctttt 408  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  | | ||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||| |    
T  17983825 acccttaggtggcaatacaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcacaagtacactttctctttcttcttctcttct 17983726  T
Q  409 ctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattt 470  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||| ||||||  | ||||| |||||||||||||||||    
T  17983725 ctcttcctaatacatgaggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaagtgtctatgtaacattt 17983664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 291 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 29234345 - 29234219
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  29234345 gagtaatgatacatagacacccttagatggcaatacaccctttgataccttcacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 29234246  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttccta 417  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  29234245 tcttttctctcctcttctctcttccta 29234219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 330 - 476
Target Start/End: Original strand, 41823921 - 41824067
Alignment:
Q  330 ctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttctctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtg 429  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| |  ||||||||    
T  41823921 ctttaacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacatggaccccgcacaagcacactttctcttttctctcttcttctctcttcctaatgcatgaggtg 41824020  T
Q  430 tacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttccata 476  Q
    ||||| | |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  41824021 tacaaaggtgtatgagaataaatggtgtctatgtaacattttccata 41824067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 291 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 44536845 - 44536664
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||| ||||||| || ||||  |||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||  | ||||| | ||||||||| ||| ||||||||    
T  44536845 gagttatgatacataaacacttttaggtggcaatacaccctt-gacatccacacaaaaatctgacatgtggtcatatagaccccacataagtacactttc 44536747  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttcc 473  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||||| || ||  |||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  44536746 tctttcttcttctcttctctcttcctaatacatagggtgtacaagaatgtatgcaattaaaatgtgtctatgtaacattttcc 44536664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 291 - 470
Target Start/End: Original strand, 47104544 - 47104723
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||||||||||  ||||||  ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| | ||  | | |||||||||||| |||||||||    
T  47104544 gagtaatgatatatagacattcttagatgacaatacactctctgacacccacacaaaaatttgacacgtggttttattgaccccacacaaacacactttc 47104643  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattt 470  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| || |  ||||||||||| || ||||| | |||||||| ||||||| |||||||||    
T  47104644 tctttcatctcctcttctctcttcttaatgcatgaggtgtactagaatgtacgagaataaaaagtgtctacgtaacattt 47104723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 291 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 29548059 - 29547877
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||| ||||||| || ||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||  | | ||| |||| ||| || ||| |||||||     
T  29548059 gagttatgatacataaacatccttaggtggcaatacatcccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggccatatggatcccgcataagtacactttt 29547960  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttcc 473  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  29547959 tctttcttcttctcttctctcttcctaatacatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcc 29547877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 307 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 29589823 - 29589658
Alignment:
Q  307 acacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttctctttcctctcctctt 406  Q
    |||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |  | | ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  29589823 acacccttagttg-caatacaccccttgacacccacacaaaaatctgatatgtggccatatggaccccacacaagtacactttctctttcttcttctctt 29589725  T
Q  407 ttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttcc 473  Q
     |||||||||| || ||||||||||||||  ||||||  | ||||| |||||||||||| |||||||    
T  29589724 ctctcttcctaatacatgaggtgtacaagagtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaatattttcc 29589658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 291 - 473
Target Start/End: Original strand, 47986208 - 47986389
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||| ||||||| || |||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||  | | ||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  47986208 gagttatgatacataaacacccttaggtggcaatacatcccttgacatccacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcacaagtacactttc 47986307  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttcc 473  Q
    |||||| | | ||||| |||||||||| || ||| | ||||||||| ||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  47986308 tctttcttattctcttctctcttcctaatacatgggatgtacaagggtgtat-gcaattaaaggtgtctatgtaacattttcc 47986389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 296 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 53352660 - 53352539
Alignment:
Q  296 atgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttctcttt 395  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  53352660 atgatacatagacacccttaggtg-caatacattctttaacacctacacaaaaatctgacacgtagttaagtggaccccgcacaagcatactttctcttt 53352562  T
Q  396 cctctcctcttttctcttcctag 418  Q
     |||||||||| |||||||||||    
T  53352561 tctctcctcttctctcttcctag 53352539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 291 - 473
Target Start/End: Original strand, 32766958 - 32767140
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||| ||||||| || |||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||  | | ||| |||||||  |||||| ||||||||    
T  32766958 gagttatgatacataaacactcttaggtggcaatacaccccttgacacccatacaaaaatctgacatgtggccatatggaccctgcacaagtacactttc 32767057  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttcc 473  Q
    |||||| ||| ||| | |||||| ||| || ||   |||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  32767058 tctttcttcttctcctctctctttctaatacatagagtgtacaagggtgtatgcaattaaaatgtgtctatgtaacattttcc 32767140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 309 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 18924577 - 18924413
Alignment:
Q  309 acccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttctctttcctctcctctttt 408  Q
    |||||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||  | |  || || || || |||||| |||||||||||||| ||| ||||| |    
T  18924577 acccttaggtggcaatacaccccttgatatccacacaaaaatctgacatgtggcaatatgaactccgcacaagtacactttctctttcttcttctcttct 18924478  T
Q  409 ctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttcc 473  Q
    ||||||||| || |||||||||| |||| ||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  18924477 ctcttcctaatacatgaggtgtaaaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcc 18924413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 291 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 55079814 - 55079687
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtgga-ccccacacaagcacacttt 389  Q
    |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||  | | ||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  55079814 gagttatgatacataaacacccttaggtggcaatacacctcttgacacccatacaaaaatctgacatgtggccatatggacccccacacaagtacacttt 55079715  T
Q  390 ctctttcctctcctcttttctcttccta 417  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  55079714 ctctttcttcttctcttctctcttccta 55079687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 331 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 56300225 - 56300086
Alignment:
Q  331 tttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttctctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgt 430  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  | ||||| || | ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||| |||    
T  56300225 tttgacatccacacaaaaatctgacatgtggtcatatgaatcctgcacaaacacactttctctttcctctcctcttctctctttctaatgtatgagatgt 56300126  T
Q  431 acaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattt 470  Q
    |||||  |||||| |||||||   |||||| |||||||||    
T  56300125 acaagattgtatgagaataaagaatgtctacgtaacattt 56300086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 335 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 48647782 - 48647645
Alignment:
Q  335 acacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttctctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaa 434  Q
    ||||||||| |||||||| |||| | |||| |||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||    |||||||    
T  48647782 acacccacataaaaatctaacacgtggtcacgtggactccgcacaagcacaatttctctttcctctcctcttctctcttcctagtgcatagaatgtacaa 48647683  T
Q  435 ggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttc 472  Q
     |||||||   ||||||   ||||||||||||||||||    
T  48647682 agatgtataaaaataaatgatgtctatgtaacattttc 48647645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 335 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 18769103 - 18768996
Alignment:
Q  335 acacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttctctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaa 434  Q
    ||||||||||||||||||||||  | |||||||  | ||||||||| |||| |||||||||| |||| | ||||||||||||| || ||| |||||||||    
T  18769103 acacccacacaaaaatctgacatgtggtcatgtaaatcccacacaaacacattttctctttcatctcattttttctcttcctaatacatg-ggtgtacaa 18769005  T
Q  435 ggatgtatg 443  Q
    |||||||||    
T  18769004 ggatgtatg 18768996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 335 - 435
Target Start/End: Original strand, 18769153 - 18769252
Alignment:
Q  335 acacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttctctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaa 434  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||  ||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| |||||||||    
T  18769153 acacccacacaaaaatctgacacgtggtcatgtaaaccccacacaaatacattttctctttcatctccttttttctctttctagtacatg-ggtgtacaa 18769251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 290 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 8343264 - 8343137
Alignment:
Q  290 cgagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacacttt 389  Q
    ||||| ||||||| || ||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||  | | ||| |||||||| || ||| | |||||    
T  8343264 cgagttatgatacataaacatccttaggtggcaatacatcctttgacacctacataaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcataagtatacttt 8343165  T
Q  390 ctctttcctctcctcttttctcttccta 417  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  8343164 ctctttcttcttctcttctctcttccta 8343137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 125; Significance: 5e-64; HSPs: 34)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 291 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 35943992 - 35943812
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||||    
T  35943992 gagttatgatacatagacacccttaggtggcaatacatcatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagttacgtggatcccacacaagcacactttc 35943893  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacatttt 471  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  35943892 tctttcctctcctcttttctcttcctagtgcatggggtgtacaagggtgtatggaaataaaatgtgtctatgtaacatttt 35943812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 291 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 36733042 - 36732872
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  36733042 gagtaatgatacatagacacccttaggtagcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 36732943  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctat 461  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  36732942 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatgaggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtctat 36732872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 294 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 18520981 - 18520806
Alignment:
Q  294 taatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttctct 393  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18520981 taatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctct 18520882  T
Q  394 ttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacatt 469  Q
    ||  ||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||  ||||||  ||||||||||| ||||    
T  18520881 tttatctcctcttctctcttcctaatgcatgaggtgtacaagggtgtatgaaaataaagggtgtctatgtatcatt 18520806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 291 - 469
Target Start/End: Original strand, 2740274 - 2740452
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| |||||||||||||||    
T  2740274 gagtaatgatacatagacatccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggatcccgcacaagcacactttc 2740373  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacatt 469  Q
    ||||| |||||| ||| |||||||||| |  ||| | ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  2740374 tcttttctctccccttctctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 2740452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 291 - 469
Target Start/End: Original strand, 14831814 - 14831992
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||| |||||||||||||||    
T  14831814 gagtaatgatacatagacactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacataaaaatctgacacgtagtcacgtggatcccgcacaagcacactttc 14831913  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacatt 469  Q
    | |||  ||||||||| |||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  14831914 ttttttttctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaaggatgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 14831992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 291 - 469
Target Start/End: Original strand, 40145407 - 40145585
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  40145407 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttaacatccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 40145506  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacatt 469  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| |  | ||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||||||| ||||    
T  40145507 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgcacgaggtgtacaagggtatatgagaataaagggtgtctatgtatcatt 40145585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 291 - 464
Target Start/End: Original strand, 13811652 - 13811825
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  13811652 gagtaaagatacatagacacccttaggtggcaatacatcatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 13811751  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgta 464  Q
    ||||  |||||||||| |||||||||| |  ||| | ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  13811752 tcttctctctcctcttctctcttcctaatgcatgggatgtacaaggatgtatgggaataaatggtgtctatgta 13811825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 291 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 15409710 - 15409528
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||| |||||||||||| ||    
T  15409710 gagttatgatacatagacatccttaggtgacaatacattctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagccacatggaccccgcacaagcacactctc 15409611  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttcc 473  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||||| |||||| |||||||  |||| |||||||||||||||    
T  15409610 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgcgaataaagggtgtttatgtaacattttcc 15409528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 291 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 33149738 - 33149560
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||| |||||||||||||||    
T  33149738 gagtaatgatacatagacacccttaggtggtaatacaccctttgacacccacacaaaaatttgacacgtagtcacgtggatcccgcacaagcacactttc 33149639  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacatt 469  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| |  ||| ||||||||||| |||| | |||||||  ||||||||||| ||||    
T  33149638 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtacgagaataaagggtgtctatgtatcatt 33149560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 291 - 469
Target Start/End: Original strand, 35785199 - 35785377
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| ||| ||||| |||||||||    
T  35785199 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccttttgacacccacacaaaaatctgacacgtagttacgtggatcccgcacaatcacactttc 35785298  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacatt 469  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||| |  ||| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  35785299 tcttttctctcatcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatggaaataaaaggtgtctatgtatcatt 35785377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 291 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 3921365 - 3921183
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  | | ||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  3921365 gagttatgatacataaacacccttaggtggcaatacaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcacaagtacactttc 3921266  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttcc 473  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  3921265 tctttcttcttctcttctctcttcctaatatatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcc 3921183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 291 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 2252268 - 2252086
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||| ||||||| || ||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  | | ||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  2252268 gagttatgatacataaacatccttaggtggcaatacaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcacaagtacactttc 2252169  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttcc 473  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  2252168 tctttcttcttctcttctctcttcctaatatatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcc 2252086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 291 - 473
Target Start/End: Original strand, 31008988 - 31009170
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||| ||||||| || ||| ||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| |||||||||||||||    
T  31008988 gagttatgatacataaacatccttaggtgacaatacattcttccacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggatcccgcacaagcacactttc 31009087  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttcc 473  Q
    | |||||||| ||||| ||||||||||||  ||| ||||||||| | |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  31009088 tatttcctcttctcttctctcttcctagtgcatggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttcc 31009170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 286 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 42414407 - 42414276
Alignment:
Q  286 caaacgagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcaca 385  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  42414407 caaatgagtaatgatacatagacaccagtaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcatgtggaccccgcacaagcaca 42414308  T
Q  386 ctttctctttcctctcctcttttctcttccta 417  Q
    |||| ||||| || ||||||| ||||||||||    
T  42414307 ctttatcttttctttcctcttctctcttccta 42414276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 291 - 472
Target Start/End: Original strand, 6679698 - 6679879
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||| ||||| |||| ||||    
T  6679698 gagttatgatacatagacatctttaggtggcaatacaccttttgacacccacacaaaaatctgacacgtggtcacatggaccccgcacaaacacattttc 6679797  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttc 472  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| | |||  ||||||||||| ||||||  ||||||   ||||||||||||||||||    
T  6679798 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgtatagggtgtacaagggtgtatgacaataaatgatgtctatgtaacattttc 6679879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 291 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 33825424 - 33825243
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  33825424 gagtaatgatgcatagacattcttaggtggcaatacactccttgacacccacataaaaatctgacacgtgttcatgtgaaccttacacaagcacactttc 33825325  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttc 472  Q
    |||||  ||| ||||| ||||||||||||  ||| |||||| |||| |||||| |||||||  ||||| |||||||||||||    
T  33825324 tcttttatcttctcttctctcttcctagtgcatggggtgtagaaggctgtatgagaataaatggtgtcaatgtaacattttc 33825243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 291 - 430
Target Start/End: Original strand, 28177775 - 28177914
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||| ||||| |||||||||    
T  28177775 gagttatgatacatagacatccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtggtcacatggaccccgcacaaacacactttc 28177874  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgt 430  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||| | |||| |||||    
T  28177875 tcttttctctcctcttccctcttcctaatgtatggggtgt 28177914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 291 - 473
Target Start/End: Original strand, 26720516 - 26720698
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||| | | ||  |||| ||| |||||||||||||||    
T  26720516 gagttatgatacatagacatccttaggtggcaatacaccctttaacacctacaaaaaaatctgacacgtggccacatggatcccgcacaagcacactttc 26720615  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttcc 473  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||||| | |||| ||||||| ||| |||||| |||||||   ||||||| |||||||||||    
T  26720616 tcttttctcttctcttctctcttcctaatgtatggggtgtactagggtgtatgagaataaatgatgtctatataacattttcc 26720698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 291 - 473
Target Start/End: Original strand, 26990265 - 26990447
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||| | | ||  |||| ||| |||||||||||||||    
T  26990265 gagttatgatacatagacatccttaggtggcaatacaccctttaacacctacaaaaaaatctgacacgtggccacatggatcccgcacaagcacactttc 26990364  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttcc 473  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||||| | |||| ||||||| ||| |||||| |||||||   ||||||| |||||||||||    
T  26990365 tcttttctcttctcttctctcttcctaatgtatggggtgtactagggtgtatgagaataaatgatgtctatataacattttcc 26990447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 292 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 36875702 - 36875537
Alignment:
Q  292 agtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttct 391  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||    
T  36875702 agtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaa---------atagtcacgtggatcccgcacaagcacactttct 36875612  T
Q  392 ctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattt 470  Q
    ||||  ||||||||| |||||||||| || ||| |||||||||||     ||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  36875611 cttttttctcctcttctctcttcctaatacatggggtgtacaagg----gtggaaataaatggtgtctatgtaacattt 36875537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 291 - 471
Target Start/End: Original strand, 9603813 - 9603993
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||||||||||| || ||| |||||||||  ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  9603813 gagtaatgatacatatacatccttaggtgataatacactcattcacacctacacaaaaatctgacacatggtcatatggaccccatacaatcacactttc 9603912  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacatttt 471  Q
    |||||| | || |||| ||||||| ||||   || | ||||||| | |||||| |||||||  ||||||| ||||||||||    
T  9603913 tctttcatttcgtcttctctcttcttagtgcttgggatgtacaaaggtgtatgagaataaatggtgtctacgtaacatttt 9603993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 291 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 6260101 - 6259919
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||||||||||| || ||| || |||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||  |||||| |||| ||||||||||||    
T  6260101 gagtaatgatacatacacaaccataggtgacaatacaccctttaacacccacgcaaaaatctaacacatggtcacatggacctcacagaagcacactttc 6260002  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttcc 473  Q
    |||||| ||||||||| |||||  ||| | |||| | ||||||||  ||||| ||||||||   | |||||||||||||||||    
T  6260001 tctttcatctcctcttctctctcactaatgtatgggatgtacaagtgtgtataggaataaaggatatctatgtaacattttcc 6259919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 356 - 473
Target Start/End: Original strand, 2177429 - 2177546
Alignment:
Q  356 acatagtcatgtggaccccacacaagcacactttctctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgt 455  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||  | ||||||||| |||||| |||||||||||    
T  2177429 acatagacacgtggatcccacacaagcacattttctctttcctctcctcttctctcttcctagtgcattggatgtacaagggtgtatgagaataaaatgt 2177528  T
Q  456 gtctatgtaacattttcc 473  Q
    |||| |||||||||||||    
T  2177529 gtctctgtaacattttcc 2177546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 290 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 20073617 - 20073434
Alignment:
Q  290 cgagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacacttt 389  Q
    ||||||||||||  |||||| | |||| || |||||||| ||||||||| |||| ||||||||  ||| |   || ||||||||  ||||||||||||||    
T  20073617 cgagtaatgatatatagacatcattagatgacaatacaccctttgacactcacataaaaatcttgcacgtgaccacgtggaccctgcacaagcacacttt 20073518  T
Q  390 ctctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttcc 473  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||  ||||| | ||||| | |||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  20073517 ctatttcctctcctcttctctcttcctagttcatgagatttacaaaggtgtatgagaataaaaaatgtctatctaacattttcc 20073434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 291 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 39688997 - 39688815
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||| ||||||| || ||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |  | ||||| || ||||| || ||| ||||||||    
T  39688997 gagttatgatacataaacacccttaagtggcaatacatcccttgacacccacacaaaaatctgatatgtggtcatatgaaccccgcataagtacactttc 39688898  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttcc 473  Q
    |||||| |||  |||| |||||||||| || ||  ||||||||| | ||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  39688897 tctttcttcttttcttctctcttcctaatacatagggtgtacaaaggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcc 39688815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 314 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 39557594 - 39557429
Alignment:
Q  314 taggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttctctttcctctcctcttttctctt 413  Q
    ||||||| |||||||   || ||| ||||||||||||||||||| |  |||  ||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  39557594 taggtggtaatacacctcttaacatccacacaaaaatctgacacgtgatcacatggaccccatacaatcacactttctcttttatctcctcttctctctt 39557495  T
Q  414 cctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaa---tgtgtctatgtaacattttccata 476  Q
    |||| || |||||||||||| |||| |||| ||||||||   ||| |||||| |||||||||||||    
T  39557494 cctaatacatgaggtgtacatggatctatgagaataaaagggtgtatctatgaaacattttccata 39557429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 335 - 473
Target Start/End: Original strand, 21370048 - 21370186
Alignment:
Q  335 acacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttctctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaa 434  Q
    |||||||| |||||||||||||  | |||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| || |||||||    
T  21370048 acacccactcaaaaatctgacatgtggtcacgtggaccccgcacaaacacattttctctttcctctcatcttctttcttcctagtatataagatgtacaa 21370147  T
Q  435 ggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttcc 473  Q
     | ||||||  ||||||  |||| |||||||||||||||    
T  21370148 aggtgtatgaaaataaagggtgtttatgtaacattttcc 21370186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 311 - 431
Target Start/End: Original strand, 16327921 - 16328041
Alignment:
Q  311 ccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttctctttcctctcctcttttct 410  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| | | ||||| |||    
T  16327921 ccttaggtggcaatacatccattgacacccacataaaaatctgacacgtgttcatgtgcacctcacacaagcacactttttctttcattttctcttctct 16328020  T
Q  411 cttcctagtatatgaggtgta 431  Q
    || |||| |||||| ||||||    
T  16328021 ctccctaatatatggggtgta 16328041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 340 - 413
Target Start/End: Original strand, 25831334 - 25831407
Alignment:
Q  340 cacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttctctttcctctcctcttttctctt 413  Q
    |||| |||||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||| ||||    
T  25831334 cacaaaaaaatctaacacgtggtcatgtggaccccacacaaacacattttctctttcatatcctcttttttctt 25831407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 291 - 431
Target Start/End: Original strand, 38296203 - 38296343
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||| ||||||| |||||   |||||||| ||||||||   || | ||||||||||||||| ||||| |||  | ||||| || ||||||||||||||||    
T  38296203 gagttatgatacatagactatcttaggtgtcaatacacctcttaatacccacacaaaaatcagacacgtagctacgtggatccaacacaagcacactttc 38296302  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgta 431  Q
    || ||| ||||||||| | ||||| || || ||| ||||||    
T  38296303 tcattcatctcctcttctttcttcttactacatggggtgta 38296343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 296 - 354
Target Start/End: Original strand, 10356639 - 10356698
Alignment:
Q  296 atgatacttagacacccttaggtggcaataca-ctctttgacacccacacaaaaatctga 354  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||    
T  10356639 atgatacatagacatccttaggtggcaatacatcccattgacacccacacaaaaatctga 10356698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 291 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 41470516 - 41470425
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagc 382  Q
    ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||  |||| | |  || | ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  41470516 gagtaataatacatagacacctttaggtggcaatacatcctttaaaattcatataaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagc 41470425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 339 - 401
Target Start/End: Original strand, 31132392 - 31132454
Alignment:
Q  339 ccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttctctttcctctc 401  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  31132392 ccacacaaaaatctgacaagtagtcacgtggaccccgcacaagcatactttttcttttctctc 31132454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 317 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 33801635 - 33801596
Alignment:
Q  317 gtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacac 357  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  33801635 gtggcaatacactcttt-acacccacacaaaattctgacac 33801596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 125; Significance: 5e-64; HSPs: 45)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 285 - 469
Target Start/End: Original strand, 49607408 - 49607592
Alignment:
Q  285 acaaacgagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcac 384  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  49607408 acaaaagagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggatcccacacaagcac 49607507  T
Q  385 actttctctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacatt 469  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  49607508 actttctcttttctctcctcttttctcttcctaatgcatgacgtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 49607592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 291 - 469
Target Start/End: Original strand, 53982011 - 53982189
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  53982011 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 53982110  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacatt 469  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| |  ||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  53982111 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaaggttgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 53982189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 290 - 473
Target Start/End: Original strand, 8076392 - 8076575
Alignment:
Q  290 cgagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacacttt 389  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  8076392 cgagtaatgatacataaacacccttaggtggcagtacaccctttgacacccacacaaaaatctaacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacacttt 8076491  T
Q  390 ctctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttcc 473  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||   |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  8076492 ctctttcctctcctcttctctcttcctagtgcatggggtgtacaaaagtgtatgagaataaatggtgtctatgtaacattttcc 8076575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 295 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 30801829 - 30801651
Alignment:
Q  295 aatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttctctt 394  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30801829 aatgatacatagacacccttaggtgataatacaccctttgatacccacacaaaaatatgacatgtagtcatatggaccccacacaagcacattttctctt 30801730  T
Q  395 tcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttcc 473  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30801729 tcctctcatcttctctcttcctagtacatggggtgtacaagggtgtatgagaataaaaggtgtctatgtaacattttcc 30801651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 291 - 469
Target Start/End: Original strand, 33644200 - 33644378
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  33644200 gagtaatgatacatagacacccttgggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 33644299  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacatt 469  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| |  ||| |||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  33644300 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtataagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 33644378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 292 - 469
Target Start/End: Original strand, 31456690 - 31456867
Alignment:
Q  292 agtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttct 391  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31456690 agtaatgatacatagacacccataggcggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcatgtggaccccgcacaagcacactttct 31456789  T
Q  392 ctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacatt 469  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||| || |||||||||||  |||| |||||| ||||    
T  31456790 cttttctctcctcttttctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgcatgggaataaagggtgtttatgtatcatt 31456867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 291 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 14623939 - 14623757
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||  |  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14623939 gagtaatgatacatagacatccttaggtggcaatacaccccttgacacccacataaaaatctgacatgtgttcatgtggacctcacacaagcacactttc 14623840  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttcc 473  Q
    |||||| ||| ||||| |||||| |||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  14623839 tctttcatcttctcttctctctttctagtgcatgaggtgtagaaggatgtatgagaataaatggtgtctatgtaacattttcc 14623757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 291 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 26141632 - 26141448
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  26141632 gagttatgatacatagacatccttaggtggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatctgacacgtggtcacatggaccccacacaagcacactttc 26141533  T
Q  391 tctttcctctcctct--tttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttcc 473  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||| | |||| ||||||||||  ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  26141532 tcttttctctcctcttctttctcttcctaatgtatggggtgtacaagagtgtatggaaataaagggtgtctatgtaacattttcc 26141448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 291 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 54868995 - 54868817
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| ||||| |||||||||    
T  54868995 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccttttgacacccacacaaaaatctgacacgtagttacgtggaccccgcacaatcacactttc 54868896  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacatt 469  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||| |  ||  ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  54868895 tcttttctctcatcttctctcttcctaatgcatagggtgtacaagggtgtatggaaataaaaggtgtctatgtatcatt 54868817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 291 - 469
Target Start/End: Original strand, 17470405 - 17470583
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17470405 gagtaatgatacatagacacctttaggtggcaatacaccttttaacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccacacaagcacactttc 17470504  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacatt 469  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||| |  ||| | |||||||  ||||||| |||||||  ||||||||||| ||||    
T  17470505 tcttttctctcatcttctctcttcctaatgcatgggatgtacaaatatgtatgagaataaatggtgtctatgtatcatt 17470583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 304 - 473
Target Start/End: Original strand, 26754708 - 26754877
Alignment:
Q  304 tagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttctctttcctctcct 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||  | ||||  |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  26754708 tagacacccttaggtggcaatacacccttggacatccacacaaaaatctgacatgtggtcacatggaccccgcacaagcacattttctctttcctctcct 26754807  T
Q  404 cttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttcc 473  Q
    ||| ||||||||||| ||||  ||||||||| | ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  26754808 cttctctcttcctagaatatagggtgtacaaaggtgtatggaaataaagagtgtctatgtaacattttcc 26754877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 296 - 469
Target Start/End: Original strand, 52629305 - 52629478
Alignment:
Q  296 atgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttctcttt 395  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  52629305 atgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgtacaagcacactttctcttt 52629404  T
Q  396 cctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacatt 469  Q
     ||||| |||| |||||||||| |  ||| | ||||||||| ||||||| |||||   ||||||||||| ||||    
T  52629405 tctctcatcttctctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtatggaaataatgggtgtctatgtatcatt 52629478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 291 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 33118951 - 33118768
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||| || || |||||||||    
T  33118951 gagttatgatacatagacacccttaggtgacaatacaccctttgacacccacacaaaaatttgacacgtagtcacgtggatccctcagaaacacactttc 33118852  T
Q  391 tctttcctctcct-cttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttcc 473  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| ||||||  ||| ||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  33118851 tctttcctctcctccttctctctccctagtgcatggggtgtacaagggtgtatggaaataaagggtgtctacgtaacattttcc 33118768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 291 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 20765015 - 20764833
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||| |||| || |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||  ||||||||  ||||||||||||||    
T  20765015 gagttatgagacatagacatccttaggtggtaatacactctttaacacccacacaaaaatctgacacgtggccacatggaccccgtacaagcacactttc 20764916  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttcc 473  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||| | |||| ||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  20764915 tcttttctctcatcttctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgagaataaatggtgtctatgtaacattttcc 20764833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 291 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 24700054 - 24699873
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||| | | || ||||||||   |||| |||||||||    
T  24700054 gagtaatgatacatagacatccttagttggcaatacaccttttgacacccacataaaaatctggcacgtggccacgtggaccctgtacaaacacactttc 24699955  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttcc 473  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  24699954 tctttcctctcctcttctctcttcctagtttatgaggtgtataa-gatgtatgagaataaaagatgtctatgtaacattttcc 24699873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 291 - 473
Target Start/End: Original strand, 35536626 - 35536808
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||| | ||||||||||||  |||||||||||||| |    
T  35536626 gagtaatgatacatagacatccttatgtggcaatacaccatttgacacccacataaaaatgtgacacgtggtcatgtggaccttacacaagcacacttcc 35536725  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttcc 473  Q
    |||||| ||| ||||| ||||||||||||  ||| |||||| |||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  35536726 tctttcatcttctcttctctcttcctagtgcatggggtgtagaagggtgtatgagaataaatggtgtctatgtaacattttcc 35536808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 291 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 36707524 - 36707350
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||| | ||||| ||| |    ||||||||||    
T  36707524 gagtaatgatacatagatacccttaggtgacaatacaccctttgacatccacacaaaaatctgacacgtagttacgtggatcccgc----gcacactttc 36707429  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacatt 469  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  36707428 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatgaggtgtacaagaatgtatgggaataaaaggtgtctatgtatcatt 36707350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 288 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 51419463 - 51419273
Alignment:
Q  288 aacgagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacact 387  Q
    ||||||| ||||||| |||||| |||||| || |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| | | ||  | |||||| ||||||||||||    
T  51419463 aacgagttatgatacatagacatccttagatgacaatacatcctttaacacccacacaaaaatctgacacgtggccacatagaccccgcacaagcacact 51419364  T
Q  388 ttctctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttccataac 478  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||    
T  51419363 ttctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatggaaataaaaggtgtttatgtaacattttccttaac 51419273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 291 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 11348022 - 11347840
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| | | ||  |||||||  || ||||||||||||    
T  11348022 gagttatgatacatagacatccttaggtgacaatacatcctttgacatccacacaaaaatctgacacgtggccacatggaccctgcataagcacactttc 11347923  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttcc 473  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| | |||| |||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  11347922 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgtatggggtgtataagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtaccattttcc 11347840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 292 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 13898154 - 13897975
Alignment:
Q  292 agtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttct 391  Q
    ||||||||||  || ||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13898154 agtaatgatagataaacatccttaggtggcaatacaccccttgacacccacataaaaatctgacacgtgttcatgtggacctcacacaagcacactttct 13898055  T
Q  392 ctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacatttt 471  Q
    ||||| ||| ||||| ||||| |||||| |||| |||||| ||   |||||| |||||||  |||||||| |||||||||    
T  13898054 ctttcatcttctcttctctctccctagtgtatggggtgtagaaaagtgtatgagaataaatggtgtctatctaacatttt 13897975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 291 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 27714991 - 27714888
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27714991 gagtaatgatacatagacacctttaggtggtaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcatgtggaccccgcacaagcacactttc 27714892  T
Q  391 tctt 394  Q
    ||||    
T  27714891 tctt 27714888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 291 - 476
Target Start/End: Original strand, 8956762 - 8956947
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||||| |  |||||||||||  |||||||||||||| |    
T  8956762 gagtaatgatacatagacatccttatgtggcaatacatcctttgacacccacataaaaatgtgacacgtgttcatgtggaccttacacaagcacacttcc 8956861  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttccata 476  Q
    |||||| ||| ||||| ||||||||||||  |   |||||| |||| |||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  8956862 tctttcatcttctcttctctcttcctagtgcacagggtgtagaagggtgtatgagaataaatgctgtctatgtaacattttccata 8956947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 291 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 41189864 - 41189682
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||| ||||||| || ||| |||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||| |||||| | | ||  |||||||| |||||||||||||||    
T  41189864 gagttatgatacatatacatccttaggtggcaatacatcatttgacacccacataaaaatttgacacgtggccacatggaccccgcacaagcacactttc 41189765  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttcc 473  Q
    ||||| |||||||||| | |||||||| | ||||  |||||||||  ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  41189764 tcttttctctcctcttctttcttcctaatgtatggagtgtacaagagtgtatggaaataaagggtgtctatgtaacattttcc 41189682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 291 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 35965874 - 35965700
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||||||||||| || ||| ||||| |||  ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||        ||||| ||  |||||||||||||||    
T  35965874 gagtaatgatacatatacatccttaagtgataatacatcctttgacacccacataaaaatctgacac--------gtggatcctgcacaagcacactttc 35965783  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttcc 473  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || |  ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35965782 tctttcctctcctcttttcttttcttaattcatgaggtgtacaagggtgtatgagaataaaaggtgtctatgtaacattttcc 35965700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 291 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 48375806 - 48375626
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||||| |||||||| | |  | | ||| |||||||||||||   | ||||  |||||||| |||||||||| ||||    
T  48375806 gagttatgattcatagacacccttaggtgacaatacacccctgaaaatccatacaaaaatctgacgtgtggtcacatggaccccgcacaagcacattttc 48375707  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacatttt 471  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  48375706 tctttcctctcctcttctctcttcctagaatatagggtgtacaaagatgtatggaaataaagggtgtctatgtaacatttt 48375626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 290 - 473
Target Start/End: Original strand, 47531864 - 47532047
Alignment:
Q  290 cgagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacacttt 389  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||||| |||||||||||  ||| ||| |||||||| |||||||||| | | ||| || ||||| ||||||||||||||    
T  47531864 cgagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccttttaacatccacacaagaatctgacacgtggccatatgaaccccgcacaagcacacttt 47531963  T
Q  390 ctctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttcc 473  Q
    |||||| ||||||| || |||||||||| | ||||   ||||||||  ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  47531964 ctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggaatgtacaagtgtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 47532047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 291 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 45058652 - 45058471
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||  |   ||| |||||||| |||||| | ||||||    
T  45058652 gagttatgatacataaacacccttaggtggcaatacaccctt-gacacccacataaaaatctgacatgtgaccatatggaccccgcacaagtatactttc 45058554  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttcc 473  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||||| || ||| ||||||||| | ||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  45058553 tctttcttcttctcttctctcttcctaatacatggggtgtacaatggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcc 45058471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 313 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 36331407 - 36331247
Alignment:
Q  313 ttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttctctttcctctcctcttttctct 412  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||  | | ||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||    
T  36331407 ttaggtggcaatgcaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcacaagtacactttctctttcttcttctcttctctct 36331308  T
Q  413 tcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttcc 473  Q
    ||||| || ||| ||||||||||| ||||||  | |||||  ||| |||||||||||||||    
T  36331307 tcctaatacatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaagatgtatatgtaacattttcc 36331247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 291 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 11095453 - 11095346
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||| || || |||||||||    
T  11095453 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgt--accccgcataaacacactttc 11095356  T
Q  391 tctttcctct 400  Q
    ||||| ||||    
T  11095355 tcttttctct 11095346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 296 - 473
Target Start/End: Original strand, 42823116 - 42823293
Alignment:
Q  296 atgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttctcttt 395  Q
    ||||||| || ||||| ||| |||| ||||||| | |||||||||||| |||||| |||||  | ||||| |||||||| || ||| | |||||||||||    
T  42823116 atgatacataaacaccattatgtggtaatacaccccttgacacccacaaaaaaatttgacatgtggtcatatggaccccgcataagtatactttctcttt 42823215  T
Q  396 cctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttcc 473  Q
    | | | ||||| |||||||||| || ||||||||||||||| ||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  42823216 cttattctcttctctcttcctaatacatgaggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcc 42823293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 288 - 420
Target Start/End: Original strand, 41080706 - 41080836
Alignment:
Q  288 aacgagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacact 387  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||| | |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| |  | ||||||||||||| ||||||||||| |    
T  41080706 aacgagtaatgatacatagacatccttag-tagcaaaacaccctttgacacccacgcaaaaatctgatatgtggtcatgtggaccc-acacaagcacatt 41080803  T
Q  388 ttctctttcctctcctcttttctcttcctagta 420  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  41080804 ttctctttcatctcctcttctctcttcctagta 41080836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 291 - 469
Target Start/End: Original strand, 9562999 - 9563177
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||||||||||| || ||||| |||| || |||||||  |||||||| ||| | ||||||||||||| |||||| ||||| ||  ||||| |||||||||    
T  9562999 gagtaatgatacataaacaccattagatgacaatacaacctttgacatccatataaaaatctgacacgtagtcacgtggatcctgcacaaacacactttc 9563098  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacatt 469  Q
    ||| | |||||||||| |||||||||| |  ||||| ||||||| | ||||||||||||||  || |||||||| ||||    
T  9563099 tctcttctctcctcttctctcttcctaatgcatgagttgtacaaaggtgtatgggaataaagggtatctatgtatcatt 9563177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 295 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 48587187 - 48587081
Alignment:
Q  295 aatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttctctt 394  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  48587187 aatgatacatagatacccttaggtggcaatacaccctttgacacctacataaaaatctgacacgtagtcacgtggatcccgcacaagtacactttctctt 48587088  T
Q  395 tcctctc 401  Q
    | |||||    
T  48587087 ttctctc 48587081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 291 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 21746283 - 21746106
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacaccc--acacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactt 388  Q
    |||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| || | |||||||  ||||||||||||||||| ||        ||||||| ||||||||||||    
T  21746283 gagtaatgatacatatacatccttaggtggcaatacattcctggacacccccacacaaaaatctgacacgtaa-------gaccccatacaagcacactt 21746191  T
Q  389 tctctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttcc 473  Q
    |||||||| |||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||  ||||||   |||| |||||| |||||||    
T  21746190 tctctttcatctcatcttctctcttccaaatatatgaggtgtacaagggtgtatgtaaataaatgatgtccatgtaatattttcc 21746106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 291 - 406
Target Start/End: Original strand, 11907371 - 11907486
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| | |  |||| |||||||||||||||||  | ||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  11907371 gagttatgatacatagacacccttaggtgacaatacacacctgaacactcacacaaaaatctgacatgtggtcatatggaccccgcacaagcacattttc 11907470  T
Q  391 tctttcctctcctctt 406  Q
    ||||| ||||||||||    
T  11907471 tcttttctctcctctt 11907486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 296 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 25395428 - 25395256
Alignment:
Q  296 atgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttctcttt 395  Q
    ||||||| || ||| ||||| ||||| |||||  | || | ||||||||||||||||||||  | |  || | |||||||||||| |||| |||||||||    
T  25395428 atgatacataaacatccttatgtggccatacatcccttaatacccacacaaaaatctgacatgtggctatatagaccccacacaaacacattttctcttt 25395329  T
Q  396 cctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacatt 469  Q
    | ||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||||| |||||||| | ||||||  |||||||||||||||    
T  25395328 catcttctcttttctctttctagtacatg-ggtgtacaaagatgtatgaggataaaagatgtctatgtaacatt 25395256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 332 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 1758515 - 1758379
Alignment:
Q  332 ttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttctctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgta 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || || | |||||| |||||||| |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |  ||| ||||||    
T  1758515 ttgacacccacacaaaaatctgacatatggttacgtggactccacacaaacacattttctctttcatctcctcttctctcttcctaatgcatg-ggtgta 1758417  T
Q  432 caaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacatttt 471  Q
    ||| | |||||  |||||||  |||| |||||||||||||    
T  1758416 caaaggtgtat--gaataaacagtgtttatgtaacatttt 1758379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 298 - 474
Target Start/End: Original strand, 35093592 - 35093768
Alignment:
Q  298 gatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttctctttcc 397  Q
    ||||| |||||| | ||||||| |||||||   ||||||| |||| |||||||||||||  | |||||||| || ||| |||||||||||||||||| |     
T  35093592 gatacatagacaactttaggtgacaatacaacatttgacatccacgcaaaaatctgacatgtggtcatgtgaactccatacaagcacactttctcttgca 35093691  T
Q  398 tctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttcca 474  Q
    |||  | || ||||||||||||  ||||| ||||||| | |||||| |||||||   |||||| |||||||||||||    
T  35093692 tctttttttctctcttcctagtgcatgagatgtacaaaggtgtatgagaataaatgatgtctaggtaacattttcca 35093768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 294 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 25407245 - 25407063
Alignment:
Q  294 taatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaa-tctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttctc 392  Q
    ||||||||| || ||| || |||||||||||| || | ||||||| |||||||||| |||||||| |  |||| |||| ||||||||| |||||||||||    
T  25407245 taatgatacatacacaaccataggtggcaatataccccttgacacacacacaaaaaatctgacacgtgatcatatggatcccacacaaacacactttctc 25407146  T
Q  393 tttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttccat 475  Q
    |||| ||||||||| |||||  ||| | ||| ||||||| ||  || |||  |||||||  ||| |||| |||||||||||||    
T  25407145 tttcatctcctcttctctctcactaatgtataaggtgtataaatatatataagaataaagggtgactatataacattttccat 25407063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 374 - 471
Target Start/End: Original strand, 43746422 - 43746519
Alignment:
Q  374 cacacaagcacactttctctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacatttt 471  Q
    ||||||| |||| |||||||||| ||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||  || |||  |||| |||||||||||||    
T  43746422 cacacaaacacaatttctctttcatctcctcttctttcttcctagtgcatgaggtgtacaagggtgtatgacaacaaagggtgtttatgtaacatttt 43746519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 312 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 32605993 - 32605888
Alignment:
Q  312 cttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttctctttcctctcctcttttctc 411  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||   || | ||||| |  |||| || ||||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||    
T  32605993 cttaggtggcaatacattctttgacattcacacaaaaaatagatatatagttacatggatccaacacaagcacactttttctttcatctcctcttctttc 32605894  T
Q  412 ttccta 417  Q
    ||||||    
T  32605893 ttccta 32605888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 299 - 468
Target Start/End: Original strand, 39670019 - 39670188
Alignment:
Q  299 atacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttctctttcct 398  Q
    |||| |||||| ||||| ||||||||| |  | |||||| | | | |||||| |||||| |  ||||||||||| |  ||| |||||||| |||||| ||    
T  39670019 atacatagacatccttatgtggcaatatatcccttgacatctatataaaaatttgacacgtgatcatgtggacctcgtacacgcacacttcctcttttct 39670118  T
Q  399 ctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacat 468  Q
    |||||||| ||||||| || | |||||| ||||||||| |||| || ||||||   ||||| ||||||||    
T  39670119 ctcctcttctctcttcttaatgtatgagatgtacaagggtgtacggaaataaatgatgtctgtgtaacat 39670188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 306 - 406
Target Start/End: Original strand, 45320385 - 45320485
Alignment:
Q  306 gacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttctctttcctctcctct 405  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||| || |||| ||||||||||||||| || |||| ||||||||  |||||||  ||| ||||| |||| ||||||||    
T  45320385 gacaaccttaagtgacaatacactcattaacactcacacaaaaatctgatacgtagttatgtggacttcacacaaatacattttctttttcatctcctct 45320484  T
Q  406 t 406  Q
    |    
T  45320485 t 45320485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 369 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 11141055 - 11140993
Alignment:
Q  369 gaccccacacaagcacactttctctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgta 431  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| || ||||||||||||| ||| ||||||    
T  11141055 gaccccacaaaagcatactttctctttcatctccttttctctcttcctagtacatggggtgta 11140993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 291 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 36331478 - 36331416
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctg 353  Q
    |||| ||||||| || |||||||||| ||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||    
T  36331478 gagttatgatacataaacacccttagatggcaatgcaccccttgacatccacacaaaaatctg 36331416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 119; Significance: 2e-60; HSPs: 22)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 291 - 469
Target Start/End: Original strand, 32869678 - 32869856
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  32869678 gagtaaagatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 32869777  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacatt 469  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  32869778 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaaggatgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 32869856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 294 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 22880755 - 22880580
Alignment:
Q  294 taatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttctct 393  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22880755 taatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaattctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctct 22880656  T
Q  394 ttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacatt 469  Q
    || |||||||||| |||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||| ||||    
T  22880655 tttctctcctcttctctcttcctaatacatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtatatgtatcatt 22880580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 291 - 469
Target Start/End: Original strand, 17598554 - 17598732
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  17598554 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacatcttttgacacccacacaaaaatctgacacgttgtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 17598653  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacatt 469  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| |  ||| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  17598654 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatggaaataaaaggtgtctatgtatcatt 17598732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 291 - 475
Target Start/End: Original strand, 31976248 - 31976432
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||  || ||||| |||||||||||||||    
T  31976248 gagttatgatacatagacatccttaggtggcaatataccctttaacacccacacaaaaatctgacacgtggtcacatgaaccccgcacaagcacactttc 31976347  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttccat 475  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  31976348 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgagaataaatggtgtctatgtaacattttccat 31976432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 291 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 15508124 - 15507942
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  | | ||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  15508124 gagttatgatacataaacacccttaggtggcaatacaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcacaagtacactttc 15508025  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttcc 473  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  15508024 tctttcttcttctcttctctcttcctaatatatggggtgtacaaggatgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcc 15507942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 291 - 469
Target Start/End: Original strand, 11427616 - 11427796
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacaccct--taggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactt 388  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| |||||||||||||    
T  11427616 gagtaatgatacatagacaccctcttaggtggcaatacatcctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggatcccgcacaagcacactt 11427715  T
Q  389 tctctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacatt 469  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| |  ||| ||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||| ||||    
T  11427716 tctcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgagaataaagggtgtctatgtatcatt 11427796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 291 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 15990142 - 15989959
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  | | ||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  15990142 gagttatgatacataaacacccttaggtggcaatacaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcacaagtacactttc 15990043  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttcca 474  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  15990042 tctttcttcttctcttctctcttcctaatatatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcca 15989959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 291 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 30341460 - 30341278
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  | | ||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  30341460 gagttatgatacataaacacccttaggtggcaatacaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcacaagtacactttc 30341361  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttcc 473  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  30341360 tctttcttcttctcttctctcttcctaatatatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcc 30341278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 291 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 31953130 - 31952948
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||  |  ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  31953130 gagtaatgatagatagacatccttaggtggcaatacaccccttgacacccacataaaaatctgacatgtgttcatgtggacctcacacaaacacactttc 31953031  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttcc 473  Q
    |||||| ||| ||||| ||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  31953030 tctttcatcttctcttctctcttcctagtgcatggggtgtagaaggatgtatgagaataaatggtgtctatgtaacattttcc 31952948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 291 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 6209565 - 6209388
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| ||| |||||||||||    
T  6209565 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacactatttgacactcacacaaaaatctgtcacgtagtcacgtggaccccgcactagcacactttc 6209466  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacatt 469  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| |  ||| | ||||||| |||||| |||||||||  || |||||||| ||||    
T  6209465 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatgggatgtacaaagatgta-gggaataaagggtatctatgtatcatt 6209388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 291 - 469
Target Start/End: Original strand, 29857827 - 29858005
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| ||| || ||||||||||||    
T  29857827 gagtaatgatacatagacacctttagatggcaatacaccttttaacacccacacaaaaatctgacacgtagttacgtggatcccgcataagcacactttc 29857926  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacatt 469  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||||| |  ||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  29857927 tcttttctcttctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatt 29858005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 294 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 23128224 - 23128066
Alignment:
Q  294 taatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttctct 393  Q
    ||||||||  |||||||| ||| |||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23128224 taatgatatatagacacctttatgtgataatacatcctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggatcccacacaagcacactttctct 23128125  T
Q  394 ttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaa 452  Q
    || ||||||||||||||||||||| |  ||| | ||||||||| ||||||| |||||||    
T  23128124 tttctctcctcttttctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtatggaaataaaa 23128066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 313 - 474
Target Start/End: Original strand, 4231570 - 4231731
Alignment:
Q  313 ttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttctctttcctctcctcttttctct 412  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||| | | ||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||    
T  4231570 ttaggtggcaatacaccccttgccacccacacaaaaatctgacacgtggccatatggaccccgcacaagtacactttctctttcttcttctcttctctct 4231669  T
Q  413 tcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttcca 474  Q
    ||||| || ||| ||||||||||| ||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  4231670 tcctaatacatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcca 4231731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 291 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 31109500 - 31109374
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||||| || ||| ||||||||    
T  31109500 gagtaatgattaatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacatccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtagaccccgcaaaagtacactttc 31109401  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttccta 417  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||    
T  31109400 tcttttctctcctcttttctcttccta 31109374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 291 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 31110859 - 31110679
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||| ||  ||  |||||||  |||||||||||||||    
T  31110859 gagttatgatacatagacatccttaggtggcaatacaccctttgacactcaca--aaaatctgacacgtaaccacatggaccctgcacaagcacactttc 31110762  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttcc 473  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||||| | |||| ||||||||| | ||||||| ||||||   |||||||||||||||||||    
T  31110761 tcttttctctactcttctctcttcctaatgtatggggtgtacaaaggtgtatggaaataaaggatgtctatgtaacattttcc 31110679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 291 - 473
Target Start/End: Original strand, 12732482 - 12732663
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||||||||||| ||||||  |||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||| |||||| ||||||| ||||    
T  12732482 gagtaatgatacatagacattcttaagtggcaatataatcattgacacccacacaaaaatctgacacgtggctatgtggatcccacataagcacattttc 12732581  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttcc 473  Q
    |||||| ||||||||| |||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  12732582 tctttcatctcctcttctctctttctagtacataaggtgcacaaaaatgtatggaaat-aaagatgtctatgtaacattttcc 12732663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 295 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 28536582 - 28536408
Alignment:
Q  295 aatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttctctt 394  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28536582 aatgatacataaacatccttaggtggcaatacaacccttgacacccacacaaaaatctgacacg--gtcatgtggaccccacacaagcacactttctctt 28536485  T
Q  395 tcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacatttt 471  Q
    |  ||| |||||  ||||||||| |  ||| ||||||||||| ||||||  ||||||   |||| ||||||||||||    
T  28536484 ttatcttctcttccctcttcctactgcatggggtgtacaagggtgtatgaaaataaatgatgtcgatgtaacatttt 28536408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 292 - 469
Target Start/End: Original strand, 946377 - 946554
Alignment:
Q  292 agtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttct 391  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| || |||||||||||||| |||||| ||  | ||| | | ||||||||||||    
T  946377 agtaacgatacatagacatccttaggtgataatacaccctttgacacctacccaaaaatctgacacctagtcacgtaaatcccgctctagcacactttct 946476  T
Q  392 ctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacatt 469  Q
    |||| |||||||||| |||||||||| |  ||||| |||||||| |||||||  ||||||| ||||| ||||| ||||    
T  946477 cttttctctcctcttctctcttcctaatgcatgagatgtacaagaatgtatgacaataaaaagtgtcaatgtatcatt 946554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 286 - 469
Target Start/End: Original strand, 15832572 - 15832755
Alignment:
Q  286 caaacgagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcaca 385  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| |   |||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||  |||||  |||    
T  15832572 caaaagagtaatgatacatagacacctttaggtgacaataaatcatttgacacccacacaaaaatttgacacgtagtcacgtggatcctgcacaaataca 15832671  T
Q  386 ctttctctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacatt 469  Q
     |||||||||  ||||||||| | |||||||| |  ||| ||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||| ||||    
T  15832672 ttttctcttttttctcctcttctatcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtattggaataaagggtgtctacgtatcatt 15832755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 296 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 9379807 - 9379660
Alignment:
Q  296 atgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttctcttt 395  Q
    ||||||| |||||| |||||| || |||||||  | |||||||||| |||||||| |||||| | | |||||||| | ||||||| |||| |||||||||    
T  9379807 atgatacatagacatccttagatgacaatacatcccttgacacccatacaaaaatttgacacgtggccatgtggatctcacacaaacacattttctcttt 9379708  T
Q  396 cctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatg 443  Q
    | ||| |||||||||||||||| |  || |||| ||||||||||||||    
T  9379707 catcttctcttttctcttcctaatgcataaggtatacaaggatgtatg 9379660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 367 - 471
Target Start/End: Original strand, 30870090 - 30870193
Alignment:
Q  367 tggaccccacacaagcacactttctctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaac 466  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||| | ||||||  ||||||  |||||||| ||||    
T  30870090 tggaccccgcacaagcacattttctctttcctctcctcttctctctttctagtatatagggtgtacaaaggtgtatgaaaataaagggtgtctat-taac 30870188  T
Q  467 atttt 471  Q
    |||||    
T  30870189 atttt 30870193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 427 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 22422043 - 22421996
Alignment:
Q  427 gtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttcca 474  Q
    |||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  22422043 gtgtacaagggtgtatgagaataaatggtgtctatgtaacattttcca 22421996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 114; Significance: 2e-57; HSPs: 34)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 291 - 476
Target Start/End: Original strand, 32813247 - 32813432
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  32813247 gagttatgatacatagacatccttaggtggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatctgacacgtggtcacatggaccccgcacaagcacactttc 32813346  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttccata 476  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  32813347 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtaacattttccata 32813432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 286 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 47452425 - 47452242
Alignment:
Q  286 caaacgagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcaca 385  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  47452425 caaatgagtaatgatacatagacacccttaggtggtaatacaccctttgacacccacacaaaaatctaacacgtagtcacgtggatcccgcacaagcaca 47452326  T
Q  386 ctttctctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacatt 469  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  47452325 ctttctcttttctctcctcttctctcttcctattgcatggggtgtacaaggatgtatgggaataaagagtgtctatgtatcatt 47452242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 291 - 469
Target Start/End: Original strand, 2581915 - 2582093
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  2581915 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 2582014  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacatt 469  Q
    | ||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||| |||||  |||||||  |||| |||||| ||||    
T  2582015 ttttttctctcctcttctctcttcctaatacatgaggtgtacaagggtgtattagaataaagggtgtttatgtatcatt 2582093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 291 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 51898783 - 51898600
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| |||||||||||||||    
T  51898783 gagtaatgatacatagacatctttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggatcccgcacaagcacactttc 51898684  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttcca 474  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||| | ||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  51898683 tatttcctctcctcttctctcttcctagtgcatggggtgtacaagggtgtatagaaataaagggtgtttatgtaacattttcca 51898600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 291 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 9474976 - 9474798
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| |||||||||    
T  9474976 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacactttc 9474877  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacatt 469  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| |  ||| | ||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||| ||||    
T  9474876 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtatgagaataaagagtgtctatgtatcatt 9474798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 291 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 27564835 - 27564657
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  27564835 gagtaatgatacatagacatccttaggtggcaatacaccttttgacacccacacaaaaatctgacacgtaatcacgtggaccccgcacaagcacactttc 27564736  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacatt 469  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| |  ||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  27564735 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 27564657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 290 - 450
Target Start/End: Original strand, 3000318 - 3000478
Alignment:
Q  290 cgagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacacttt 389  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  3000318 cgagtaatgatacataaacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgtacaagcacacttt 3000417  T
Q  390 ctctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataa 450  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  3000418 ctcttttctctcatcttctctcttcctaatatatggggtgtacaagggtgtatggaaataa 3000478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 291 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 48716382 - 48716204
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||     
T  48716382 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccatttgacatccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacacttta 48716283  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacatt 469  Q
    ||||| || ||||||| |||||||||| |  ||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  48716282 tcttttctttcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 48716204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 291 - 450
Target Start/End: Original strand, 38595154 - 38595313
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  38595154 gagtaatgatacataaacacctttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgtacaagcacactttc 38595253  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataa 450  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  38595254 tcttttctctcatcttctctcttcctaatatatggggtgtacaagggtgtatggaaataa 38595313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 291 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 38632421 - 38632261
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||     
T  38632421 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccttttaacatccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttt 38632322  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaa 451  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| |  ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  38632321 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaa 38632261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 291 - 469
Target Start/End: Original strand, 37649198 - 37649376
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| |  || |||||||||||||||    
T  37649198 gagtaatgatacatagacatctttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacgtggtcacgtgaattccgcacaagcacactttc 37649297  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacatt 469  Q
     |||| |||||||||| |||||||||| |  ||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  37649298 ccttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 37649376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 292 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 11152476 - 11152296
Alignment:
Q  292 agtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttct 391  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||    
T  11152476 agtaatgaaacatagacacc-ttaggtggcaatacacccttcgacatccacacaaaaatctgacacgtagtcatgtagaccccgcacaagcacgctttct 11152378  T
Q  392 ctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttcc 473  Q
     |||||||||||||| |||||||| |||  ||| |||||| ||||||||||| |||||||  |||||||| |||||||||||    
T  11152377 ttttcctctcctcttctctcttcccagtgcatggggtgtagaaggatgtatgagaataaatggtgtctatataacattttcc 11152296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 291 - 462
Target Start/End: Original strand, 50630458 - 50630629
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  50630458 gagtaatgatacatagatacccttaggtggcaatacatcctttgttacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 50630557  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatg 462  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| |  ||  ||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||    
T  50630558 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatagggtgtacaagggtgtatgagaataaatggtgtctatg 50630629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 291 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 5959100 - 5958918
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||| ||||||| || ||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  5959100 gagttatgatacataaacacccttaagtggcaatacacctcttgacacccacacaaaaatctgacatgtggtcatatggaccccgcacaagtacactttc 5959001  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttcc 473  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  5959000 tctttcttcttctcttctctcttcctaatacatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaatgtgtctatgtaacattttcc 5958918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 291 - 469
Target Start/End: Original strand, 41758805 - 41758983
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||||||||||| |||||||| |||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||| |||||||||    
T  41758805 gagtaatgatacatagacaccattaaatggcaatacaccctttgacaaccacacaaaaatctgacacgtagtcacatggaccccgcacaaacacactttc 41758904  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacatt 469  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| |  ||| ||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||| ||||    
T  41758905 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgagaataaagggtgtctatgtatcatt 41758983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 291 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 50591100 - 50590916
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  | | ||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  50591100 gagttatgatacataaacacccttaggtggcaatacaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcacaagtacactttc 50591001  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttccat 475  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||  | ||||| || |||||||||||||||||||    
T  50591000 tctttcttcttctcttctctcttcctaatacatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtatctatgtaacattttccat 50590916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 291 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 49811627 - 49811447
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||| ||||||  |||||| ||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| | ||| || |||||||||||||||    
T  49811627 gagttatgatagatagacatccttaggtgacaatacaccatttgacatccacacaaaaatctgacacgtagccatatagactccgcacaagcacactttc 49811528  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacatttt 471  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| | |||| |||| |||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  49811527 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgtatgtggtgcacaagggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatttt 49811447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 291 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 8346488 - 8346327
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  8346488 gagtaatgatacatagtcacctttaggtggcaatacaccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccctgcacaagcacactttc 8346389  T
Q  391 tctttcctctcctc-ttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaa 451  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| |  |||  |||||||| | |||||| |||||||    
T  8346388 tcttttctctcctctttttctcttcctaatgcatggagtgtacaaaggtgtatgagaataaa 8346327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 291 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 23597191 - 23597011
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | | || || ||||   ||||| ||||||||     
T  23597191 gagtaatgatacatagacatcattaggtggcaatacactctttgatacccacataaaaatctgacacgtggccacgttgaccttgcacaaacacacttta 23597092  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacatttt 471  Q
    ||||| ||||||| || ||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  23597091 tcttttctctcctattctctattcctagttcatgaggtgtccaaggatgtatgagaataaaaaatgtctatgtaacatttt 23597011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 294 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 44548473 - 44548350
Alignment:
Q  294 taatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttctct 393  Q
    ||||||||| |||||| | ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44548473 taatgatacatagacatctttaggtggcaatacaccatttgatacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctct 44548374  T
Q  394 ttcctctcctcttttctcttccta 417  Q
    || ||||| |||| ||||||||||    
T  44548373 tttctctcttcttctctcttccta 44548350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 291 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 41608593 - 41608409
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||| ||||||| || ||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||  | | ||| ||||||||  ||||| ||||||||    
T  41608593 gagttatgatacataaacatccttaggtggcaatacaccccttgacactcacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgtacaagtacactttc 41608494  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttccat 475  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||||| || ||  ||||||||||| ||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  41608493 tctttcttcttctcttctctcttcctaatacatagggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtttatgtaacattttccat 41608409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 291 - 469
Target Start/End: Original strand, 43132 - 43310
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||||||||||| ||||||  |||||| | |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  43132 gagtaatgatacatagacagtcttaggagacaatacatcctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggactccgcacaagcacactttc 43231  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacatt 469  Q
    ||||| |||||||| | |||||| ||| |  ||| ||||||||||  |||||  |||||||  || |||||||| ||||    
T  43232 tcttttctctcctcctctctctttctaatgcatggggtgtacaagagtgtataagaataaagggtatctatgtatcatt 43310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 291 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 3302633 - 3302451
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||||||||||| || ||| ||||||||| ||||| | || | |||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  3302633 gagtaatgatacatatacatccttaggtgacaatatattcctggacacccacacaaaaatctgacacgtaatcatatggaccccatacaagcacactttc 3302534  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttcc 473  Q
    | |||| |||| |||| |||||||| | |||||  ||||||||||| ||||||  ||||||   ||| ||| |||||||||||    
T  3302533 tttttcatctcatcttctctcttccaaatatatagggtgtacaagggtgtatgttaataaaggatgtttatataacattttcc 3302451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 311 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 45044640 - 45044478
Alignment:
Q  311 ccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttctctttcctctcctcttttct 410  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||  |||||||| ||||| |||| ||||||||| |||| ||||| |||    
T  45044640 ccttaggtggcaatacaccatttgacacccatacaaaaatctgacatgtagccacatggaccccgcacaaacacattttctcttttctcttctcttctct 45044541  T
Q  411 cttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttcc 473  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||| |||||| |||||||   |||||| ||||||||||||    
T  45044540 cttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgagaataaatgatgtctacgtaacattttcc 45044478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 294 - 469
Target Start/End: Original strand, 26274435 - 26274607
Alignment:
Q  294 taatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttctct 393  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||   ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||| ||||||| |||    
T  26274435 taatgatacatagacacccttatgtggcaatacatcatttgacatccacagaaaaatctgacacatagtcacgtggatcctgcacaagtacactttttct 26274534  T
Q  394 ttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacatt 469  Q
    || ||   ||||| |||||||||| |  ||||| || |||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  26274535 tttct---ctcttctctcttcctaatgcatgagatgcacaagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 26274607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 291 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 37926538 - 37926354
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||| ||||||| |||| | | |||||||||||||||   ||| ||||||||| ||||||||||||| | | ||  |||| |||  ||||| ||||||||    
T  37926538 gagttatgatacatagatatctttaggtggcaatacatcttttaacacccacataaaaatctgacacgtggccacatggatcccgtacaagtacactttc 37926439  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttccat 475  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||||| | |||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||| ||| |||||||||    
T  37926438 tcttttctcttctcttctctcttcctaatgtatggggtgtacaaggatgtatgtgaataaatggtgtctatataatattttccat 37926354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 291 - 473
Target Start/End: Original strand, 47748443 - 47748624
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||| ||||||| || | |||||||||||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||  | | ||| |||| ||| |||||| | ||||||    
T  47748443 gagttatgatacataaatacccttaggtggcaatacaccctt-gacacccatataaaaatctgacatgtggccatatggatcccgcacaagtatactttc 47748541  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttcc 473  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||||| || ||| ||||||||||  ||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  47748542 tctttcttcttctcttctctcttcctaatacatggggtgtacaagagtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcc 47748624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 321 - 417
Target Start/End: Original strand, 13414791 - 13414887
Alignment:
Q  321 caatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttctctttcctctcctcttttctcttccta 417  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || || |||| ||||||||||    
T  13414791 caatacaccctttgacacccacacaaaaatctaacacgtagtcacgtggaccccacacaagcacattttctcttttctatcatcttctctcttccta 13414887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 311 - 474
Target Start/End: Original strand, 6260890 - 6261053
Alignment:
Q  311 ccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttctctttcctctcctcttttct 410  Q
    |||||||||| ||||||| | |  ||||||||| |||||||| |||  | |||| ||||||||| || ||||||| ||||| |||| ||||||||| |||    
T  6260890 ccttaggtggtaatacacccctgaacacccacataaaaatctaacatgtggtcacgtggaccccgcataagcacattttctatttcttctcctcttctct 6260989  T
Q  411 cttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttcca 474  Q
    ||| |||||||||  ||||||||| | ||||||  ||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  6260990 ctttctagtatatagggtgtacaaaggtgtatgaaaataaatggtgtgtatgtaacattttcca 6261053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 296 - 417
Target Start/End: Original strand, 44453984 - 44454105
Alignment:
Q  296 atgatacttagacacccttaggtggcaatacactct-ttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttctctt 394  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||  | || | ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  44453984 atgatacatagacacctttaagtggcaataca-tctcttgatacccacacaaaaatctgacatgtggttacgtggatcccacacaagcacactttttctt 44454082  T
Q  395 tcctctcctcttttctcttccta 417  Q
    ||||||| |||| ||||||||||    
T  44454083 tcctctcatcttctctcttccta 44454105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 332 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 44332430 - 44332285
Alignment:
Q  332 ttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttctctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgta 431  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  | | | | |||||||| |||||| | |||||||||||| ||| ||||| |||||||||| || ||   |||||    
T  44332430 ttgacacccacataaaaatctgacatgtggccctatggaccccgcacaagtatactttctctttcttcttctcttctctcttcctaatacatagagtgta 44332331  T
Q  432 caaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttccataa 477  Q
    ||||| ||||||  | ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  44332330 caagggtgtatgcaattaaaaggtatctatgtaacattttccataa 44332285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 304 - 401
Target Start/End: Original strand, 26440747 - 26440844
Alignment:
Q  304 tagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttctctttcctctc 401  Q
    |||||| |||||| || |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | | ||  |||| ||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  26440747 tagacatccttagatgacaatacaccctttaacacccacacaaaaatctgacacgtggccacatggatcccgcataagcacactttctcttttctctc 26440844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 334 - 423
Target Start/End: Original strand, 48489343 - 48489432
Alignment:
Q  334 gacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttctctttcctctcctcttttctcttcctagtatat 423  Q
    |||| ||||||||||||||||||  | |||| ||||| ||| |||||||||| ||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||||    
T  48489343 gacatccacacaaaaatctgacatgtggtcacgtggatcccgcacaagcacattttctattttctcacctcttctctcttcctagtatat 48489432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 291 - 416
Target Start/End: Original strand, 7740733 - 7740858
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||| ||||||| | |||| ||||| ||| |||||||  | |||||||| ||| |||||| |||||| | |  |||||||||||||||||  | | ||||    
T  7740733 gagttatgatacattgacaaccttatgtgacaatacatccattgacacctacataaaaatatgacacgtggctatgtggaccccacacaaatatattttc 7740832  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcct 416  Q
    | |||| ||||||||| |||||||||    
T  7740833 tttttcatctcctcttctctcttcct 7740858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1268 (Bit Score: 98; Significance: 6e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold1268
Description:

Target: scaffold1268; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 291 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 1029 - 848
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||| | ||| |||||||||||||||    
T  1029 gagtaatgatacatagacatctttaggtggcaatacaccctttaacatccacacaaaaaactgacacgtagtcacgtgaatcccgcacaagcacactttc 930  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttc 472  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  929 tctttcctctcctcttctctcttcctagtgcatggggtgtacaagagtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttc 848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1267 (Bit Score: 98; Significance: 6e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold1267
Description:

Target: scaffold1267; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 291 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 1029 - 848
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||| | ||| |||||||||||||||    
T  1029 gagtaatgatacatagacatctttaggtggcaatacaccctttaacatccacacaaaaaactgacacgtagtcacgtgaatcccgcacaagcacactttc 930  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttc 472  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  929 tctttcctctcctcttctctcttcctagtgcatggggtgtacaagagtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttc 848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0110 (Bit Score: 95; Significance: 4e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0110
Description:

Target: scaffold0110; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 291 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 8963 - 8781
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||| ||||||  |||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  8963 gagttatgatatatagacatccttaagtgacaatacactatttgacatctacacaaaaatttgacacatagtcacgtggaccccacacaagtacattttc 8864  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttcc 473  Q
    ||||||||| | |||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8863 tctttcctcccatcttctctcttcctaatatatggggtgtacaagggtgtataagaataaaaggtgtctatgtaacattttcc 8781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 291 - 469
Target Start/End: Original strand, 4029 - 4207
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| ||| || ||||||||||||    
T  4029 gagtaatgatacatagacacctttagatggcaatacaccttttaacacccacacaaaaatctgacacgtagttacgtggatcccgcataagcacactttc 4128  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacatt 469  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||||| |  ||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  4129 tcttttctcttctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatt 4207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0321 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0321
Description:

Target: scaffold0321; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 291 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 10209 - 10031
Alignment:
Q  291 gagtaatgatacttagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttc 390  Q
    |||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| |  ||||||||||||||    
T  10209 gagttatgatacatagacacctttaggtggcaatacatcctttgacatccacataaaaatctgacacgtagtcacgtggaccgcgtacaagcacactttc 10110  T
Q  391 tctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacatt 469  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| |  ||  ||||||||||| ||||||| |||||   ||||||||||| ||||    
T  10109 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatagggtgtacaagggtgtatggaaataatgggtgtctatgtatcatt 10031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 70; Significance: 3e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 307 - 472
Target Start/End: Original strand, 152514 - 152679
Alignment:
Q  307 acacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttctctttcctctcctctt 406  Q
    |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||| ||| |||||  |||||||||||||| ||| |||||    
T  152514 acacccttgggtggcaatacaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggtcatatggatcccgcacaaatacactttctctttcttcttctctt 152613  T
Q  407 ttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttc 472  Q
     |||||| ||| || ||| | ||||||||| ||||||  | ||||| |||||||||||||||||||    
T  152614 ctctctttctaatacatgggatgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttc 152679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0316 (Bit Score: 55; Significance: 3e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0316
Description:

Target: scaffold0316; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 387 - 473
Target Start/End: Original strand, 17199 - 17285
Alignment:
Q  387 tttctctttcctctcctcttttctcttcctagtatatgaggtgtacaaggatgtatgggaataaaatgtgtctatgtaacattttcc 473  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  17199 tttctctttcctctcctcttctctcttcctagaatataaggtgtacaaaggtgtatggaaataaagggtgtctatgtaacattttcc 17285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0316; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 334 - 405
Target Start/End: Original strand, 17097 - 17168
Alignment:
Q  334 gacacccacacaaaaatctgacacatagtcatgtggaccccacacaagcacactttctctttcctctcctct 405  Q
    |||| ||||||||||||||||||  | ||||  |||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  17097 gacatccacacaaaaatctgacatgtggtcacatggaccccgcacaagcacattttctctttcctcttctct 17168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University