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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF5975-Insertion-11 (Length: 545)
Name: NF5975-Insertion-11
Description: NF5975
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF5975-Insertion-11 |
 | |
|
| [»] chr5 (8 HSPs) |
| |
|
Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 462; Significance: 0; HSPs: 8)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 462; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 68 - 545
Target Start/End: Original strand, 38456248 - 38456725
Alignment:
| Q |
68 |
gttgatcatgtcattaatttgtattcagttaccgggaagaagcgataatgacatcaagaacttttggaatgcgagaaaaagaaaacttgaaaagcgtggc |
167 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
38456248 |
gttgatcatgtcattaatttgtattcagttaccgggaagaagcgataatgacatcaagaacttttggaatgcgagaaaaagaaaacttgaaaagctcggc |
38456347 |
T |
|
| Q |
168 |
ttgtcacccttccccgacaacatggaacctgatcatgagttgaatagtagccaacaagttgaggattcacaagaagatgaatttaatataccacaattga |
267 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38456348 |
ttgtcacccttccccgacaacatggaaccggatcataagttgaatagtagccaacaagttgaggattcacaagaagatgaatttaatataccacaattga |
38456447 |
T |
|
| Q |
268 |
aatttagaaaatatccatcaatttttgatgagataaatgaaaaacttttagatgttccaaacatgttctacaataatgtgggaagtacttcaacattgat |
367 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
38456448 |
aatttagaaaatatccatcaatttttgatgagataaatgaaaaacttttagatgttccaaacatgttctacaataatgtgggaagtacttcaacattgat |
38456547 |
T |
|
| Q |
368 |
tgataggtgagtagattatgtaattccattttcttttatatgttaaaattgtttatatgagtgtgttaaatttacagttactttcatcaatttcaggggt |
467 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38456548 |
tgataggtgagtagattatgtaattccattttcttttatatgttaaaattgtttatatgagtgtgttaaatttacagttactttcatcaatttcaggggt |
38456647 |
T |
|
| Q |
468 |
agcagcattattggaacttctcatattcatatacctatagctctaccctcaccatgttcataccttccacttccttca |
545 |
Q |
| |
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|
|
| T |
38456648 |
agcagcattattggaacttctcatattcatatacctatagctctaccctcaccatgttcataccttccacttccttca |
38456725 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 446; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 68 - 545
Target Start/End: Original strand, 38180888 - 38181364
Alignment:
| Q |
68 |
gttgatcatgtcattaatttgtattcagttaccgggaagaagcgataatgacatcaagaacttttggaatgcgagaaaaagaaaacttgaaaagcgtggc |
167 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
38180888 |
gttgatcatgtcattaatttgtattcagttaccgggaagaagcgataatgacatcaagaacttttggaatgcgagaaaaagaaaacttgaaaagctcggc |
38180987 |
T |
|
| Q |
168 |
ttgtcacccttccccgacaacatggaacctgatcatgagttgaatagtagccaacaagttgaggattcacaagaagatgaatttaatataccacaattga |
267 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38180988 |
ttgtcacccttccccgacaacatggaaccggatcataagttgaatagtagccaacaagttgaggattcacaagaagatgaatttaatataccacaattga |
38181087 |
T |
|
| Q |
268 |
aatttagaaaatatccatcaatttttgatgagataaatgaaaaacttttagatgttccaaacatgttctacaataatgtgggaagtacttcaacattgat |
367 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38181088 |
aatttagaaaatatccatcaatttttgatgagataaatgaaaaacttttagatgttccaaacatgttctacaataatgtgggaagtacttcaacattgat |
38181187 |
T |
|
| Q |
368 |
tgataggtgagtagattatgtaattccattttcttttatatgttaaaattgtttatatgagtgtgttaaatttacagttactttcatcaatttcaggggt |
467 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
38181188 |
tgataggtgagtagattatgtaattccattttcttttatatgttaaaattgtttatatgag-gtgttatatttacagttactttcatcaatttcagggtt |
38181286 |
T |
|
| Q |
468 |
agcagcattattggaacttctcatattcatatacctatagctctaccctcaccatgttcataccttccacttccttca |
545 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38181287 |
agcagcattattggaacttctcatattcatatacctatagctctaccctcaccatgttcataccttccacttccttca |
38181364 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 446; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 68 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 38190243 - 38189767
Alignment:
| Q |
68 |
gttgatcatgtcattaatttgtattcagttaccgggaagaagcgataatgacatcaagaacttttggaatgcgagaaaaagaaaacttgaaaagcgtggc |
167 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
38190243 |
gttgatcatgtcattaatttgtattcagttaccgggaagaagcgataatgacatcaagaacttttggaatgcgagaaaaagaaaacttgaaaagctcggc |
38190144 |
T |
|
| Q |
168 |
ttgtcacccttccccgacaacatggaacctgatcatgagttgaatagtagccaacaagttgaggattcacaagaagatgaatttaatataccacaattga |
267 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38190143 |
ttgtcacccttccccgacaacatggaaccggatcataagttgaatagtagccaacaagttgaggattcacaagaagatgaatttaatataccacaattga |
38190044 |
T |
|
| Q |
268 |
aatttagaaaatatccatcaatttttgatgagataaatgaaaaacttttagatgttccaaacatgttctacaataatgtgggaagtacttcaacattgat |
367 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38190043 |
aatttagaaaatatccatcaatttttgatgagataaatgaaaaacttttagatgttccaaacatgttctacaataatgtgggaagtacttcaacattgat |
38189944 |
T |
|
| Q |
368 |
tgataggtgagtagattatgtaattccattttcttttatatgttaaaattgtttatatgagtgtgttaaatttacagttactttcatcaatttcaggggt |
467 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
38189943 |
tgataggtgagtagattatgtaattccattttcttttatatgttaaaattgtttatatgag-gtgttatatttacagttactttcatcaatttcagggtt |
38189845 |
T |
|
| Q |
468 |
agcagcattattggaacttctcatattcatatacctatagctctaccctcaccatgttcataccttccacttccttca |
545 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38189844 |
agcagcattattggaacttctcatattcatatacctatagctctaccctcaccatgttcataccttccacttccttca |
38189767 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 446; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 68 - 545
Target Start/End: Original strand, 38208112 - 38208588
Alignment:
| Q |
68 |
gttgatcatgtcattaatttgtattcagttaccgggaagaagcgataatgacatcaagaacttttggaatgcgagaaaaagaaaacttgaaaagcgtggc |
167 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
38208112 |
gttgatcatgtcattaatttgtattcagttaccgggaagaagcgataatgacatcaagaacttttggaatgcgagaaaaagaaaacttgaaaagctcggc |
38208211 |
T |
|
| Q |
168 |
ttgtcacccttccccgacaacatggaacctgatcatgagttgaatagtagccaacaagttgaggattcacaagaagatgaatttaatataccacaattga |
267 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38208212 |
ttgtcacccttccccgacaacatggaaccggatcataagttgaatagtagccaacaagttgaggattcacaagaagatgaatttaatataccacaattga |
38208311 |
T |
|
| Q |
268 |
aatttagaaaatatccatcaatttttgatgagataaatgaaaaacttttagatgttccaaacatgttctacaataatgtgggaagtacttcaacattgat |
367 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38208312 |
aatttagaaaatatccatcaatttttgatgagataaatgaaaaacttttagatgttccaaacatgttctacaataatgtgggaagtacttcaacattgat |
38208411 |
T |
|
| Q |
368 |
tgataggtgagtagattatgtaattccattttcttttatatgttaaaattgtttatatgagtgtgttaaatttacagttactttcatcaatttcaggggt |
467 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
38208412 |
tgataggtgagtagattatgtaattccattttcttttatatgttaaaattgtttatatgag-gtgttatatttacagttactttcatcaatttcagggtt |
38208510 |
T |
|
| Q |
468 |
agcagcattattggaacttctcatattcatatacctatagctctaccctcaccatgttcataccttccacttccttca |
545 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38208511 |
agcagcattattggaacttctcatattcatatacctatagctctaccctcaccatgttcataccttccacttccttca |
38208588 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 446; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 68 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 38217468 - 38216992
Alignment:
| Q |
68 |
gttgatcatgtcattaatttgtattcagttaccgggaagaagcgataatgacatcaagaacttttggaatgcgagaaaaagaaaacttgaaaagcgtggc |
167 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
38217468 |
gttgatcatgtcattaatttgtattcagttaccgggaagaagcgataatgacatcaagaacttttggaatgcgagaaaaagaaaacttgaaaagctcggc |
38217369 |
T |
|
| Q |
168 |
ttgtcacccttccccgacaacatggaacctgatcatgagttgaatagtagccaacaagttgaggattcacaagaagatgaatttaatataccacaattga |
267 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38217368 |
ttgtcacccttccccgacaacatggaaccggatcataagttgaatagtagccaacaagttgaggattcacaagaagatgaatttaatataccacaattga |
38217269 |
T |
|
| Q |
268 |
aatttagaaaatatccatcaatttttgatgagataaatgaaaaacttttagatgttccaaacatgttctacaataatgtgggaagtacttcaacattgat |
367 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38217268 |
aatttagaaaatatccatcaatttttgatgagataaatgaaaaacttttagatgttccaaacatgttctacaataatgtgggaagtacttcaacattgat |
38217169 |
T |
|
| Q |
368 |
tgataggtgagtagattatgtaattccattttcttttatatgttaaaattgtttatatgagtgtgttaaatttacagttactttcatcaatttcaggggt |
467 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
38217168 |
tgataggtgagtagattatgtaattccattttcttttatatgttaaaattgtttatatgag-gtgttatatttacagttactttcatcaatttcagggtt |
38217070 |
T |
|
| Q |
468 |
agcagcattattggaacttctcatattcatatacctatagctctaccctcaccatgttcataccttccacttccttca |
545 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38217069 |
agcagcattattggaacttctcatattcatatacctatagctctaccctcaccatgttcataccttccacttccttca |
38216992 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 92 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 26033324 - 26032886
Alignment:
| Q |
92 |
tcagttaccgggaagaagcgataatgacatcaagaacttttggaatgcgagaaaaagaaaacttgaaaagcgtggcttgtcacccttccccgacaacatg |
191 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
26033324 |
tcagttaccgggaagaagcgataatgacatcaagaacttttggaacgcgagaaaaagaaaacttgaaaggcgtggcttgtcacccttccctgacaacatg |
26033225 |
T |
|
| Q |
192 |
gaacctgatcatgagttgaatagtagccaacaagttgaggattcacaagaagatgaatttaatataccacaattgaaatttagaaaatatccatcaattt |
291 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26033224 |
gaactggatgatgagctgaatagtagccaacaaattgaggattcacaagaagatgaatttcatataccacaattgaaatttagaaaatatccatcaattt |
26033125 |
T |
|
| Q |
292 |
ttgatgagataaatgaaaaacttttagatgttccaaacatgttctacaataa---tgtgggaagtacttcaacattgattgataggtgagtagattatgt |
388 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26033124 |
ttgatgagataaatgaaaaacttttagatgtcccaaacatgttctacaataatattgtgggaagtacttcaacattgattgataggtgagtagattatgt |
26033025 |
T |
|
| Q |
389 |
aattccattttcttttatatgttaaaattgtttatatgagtgtgttaaatttacagttactttcatcaatttcaggggtagcagcattattggaacttct |
488 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26033024 |
aattccattttcttttatatgttaaaattgtttatacgag-gtgttaaatttactgttactttcattaatttcaggg---gaagcattattggaacttc- |
26032930 |
T |
|
| Q |
489 |
catattcatatacctatagctctaccctcaccatgttcataccttccac |
537 |
Q |
| |
|
| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26032929 |
-----ttatatacctatggctccacccccaccatgttcataccttccac |
26032886 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 93 - 212
Target Start/End: Original strand, 38447447 - 38447566
Alignment:
| Q |
93 |
cagttaccgggaagaagcgataatgacatcaagaacttttggaatgcgagaaaaagaaaacttgaaaagcgtggcttgtcacccttccccgacaacatgg |
192 |
Q |
| |
|
||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
38447447 |
cagttgcctggaagaaccgataatgacatcaagaacttttggaatgcgagaaagagaaaacataaaaagtgtggcttgtcacccttccctgacaacatgg |
38447546 |
T |
|
| Q |
193 |
aacctgatcatgagttgaat |
212 |
Q |
| |
|
||| ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
38447547 |
aactggatgatgagttgaat |
38447566 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 325 - 358
Target Start/End: Original strand, 38447655 - 38447688
Alignment:
| Q |
325 |
caaacatgttctacaataatgtgggaagtacttc |
358 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38447655 |
caaatatgttctacaataatgtgggaagtacttc |
38447688 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3 (Bit Score: 91; Significance: 8e-44; HSPs: 1)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 240 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 6067860 - 6067743
Alignment:
| Q |
240 |
gaagatgaatttaatataccacaattgaaatttagaaaatatccatcaatttttgatgagataaatgaaaaacttttagatgttccaaacatgttctaca |
339 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
6067860 |
gaagatgaattta-tataccacaattgaaatttagaaaatatccataaattttttatgagataaatgaaacacttttagatgtcccaaacatgttctaca |
6067762 |
T |
|
| Q |
340 |
ataatgtgggaagtacttc |
358 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
6067761 |
ataacgtgggaagtacttc |
6067743 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 1)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 102 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 53351429 - 53351249
Alignment:
| Q |
102 |
ggaagaagcgataatgacatcaagaacttttggaatgcgagaaaaagaaaacttgaaaagcgtggcttgtcacccttccccgacaacatggaacctgatc |
201 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||| || |
|
|
| T |
53351429 |
ggaagaagcgataatgacatcaagaatttttggaatgcaagaaaaagaaaacttgaaaagcgt---atgtcaccctttcctgacaagatggaactgaatg |
53351333 |
T |
|
| Q |
202 |
atgagttgaat------------agtagccaacaagttgaggattcacaagaagatgaatttaatataccacaattgaaattta |
273 |
Q |
| |
|
||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
53351332 |
atgagttgaataaaagtggttcaaatagccaacaagttaaggattcacaagatgatgaatttaatataccgcaagtgaaattta |
53351249 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 4)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 102 - 189
Target Start/End: Original strand, 38342739 - 38342826
Alignment:
| Q |
102 |
ggaagaagcgataatgacatcaagaacttttggaatgcgagaaaaagaaaacttgaaaagcgtggcttgtcacccttccccgacaaca |
189 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| | ||| | | |||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
38342739 |
ggaagaaccgataatgacatcaagaacttttggaacgcaagaaaaagaaaacatcaaagacattgcttgtcacccttccctgacaaca |
38342826 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 102 - 189
Target Start/End: Original strand, 38446932 - 38447019
Alignment:
| Q |
102 |
ggaagaagcgataatgacatcaagaacttttggaatgcgagaaaaagaaaacttgaaaagcgtggcttgtcacccttccccgacaaca |
189 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| | ||| | | |||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
38446932 |
ggaagaaccgataatgacatcaagaacttttggaacgcaagaaaaagaaaacatcaaagacattgcttgtcacccttccctgacaaca |
38447019 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 353 - 408
Target Start/End: Original strand, 38343008 - 38343063
Alignment:
| Q |
353 |
tacttcaacattgattgataggtgagtagattatgtaattccattttcttttatat |
408 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||| |
|
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| T |
38343008 |
tacttctacattgattgataggtgagttgattatgcaatgccattctcttttatat |
38343063 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 353 - 408
Target Start/End: Original strand, 38447201 - 38447256
Alignment:
| Q |
353 |
tacttcaacattgattgataggtgagtagattatgtaattccattttcttttatat |
408 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
38447201 |
tacttctacattgattgataggtgagttgattatgcaatgccattctcttttatat |
38447256 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 111 - 177
Target Start/End: Original strand, 4121643 - 4121709
Alignment:
| Q |
111 |
gataatgacatcaagaacttttggaatgcgagaaaaagaaaacttgaaaagcgtggcttgtcaccct |
177 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||| | ||||||| |
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| T |
4121643 |
gataatgctatcaagaacttttggaatgcaagaaaaagaaaatataaaaagagtggcctatcaccct |
4121709 |
T |
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