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Alignment Overview

Query: NF5975-Insertion-17 (Length: 340)

Name: NF5975-Insertion-17
Description: NF5975
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5975-Insertion-17
NF5975-Insertion-17
[»] chr8 (51 HSPs)
chr8 (88-338)||(12587812-12588062)
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chr8 (39-282)||(4132452-4132695)
chr8 (39-291)||(30654340-30654592)
chr8 (40-284)||(7890721-7890965)
chr8 (39-250)||(27082636-27082847)
chr8 (39-284)||(1205108-1205353)
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chr8 (51-280)||(44869690-44869919)
chr8 (40-250)||(23854229-23854439)
chr8 (39-284)||(38644159-38644404)
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chr8 (39-282)||(5299712-5299955)
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chr8 (44-268)||(35459491-35459715)
chr8 (87-282)||(35859163-35859358)
chr8 (61-282)||(33906415-33906634)
chr8 (39-250)||(6098311-6098527)
chr8 (40-254)||(40862601-40862816)
chr8 (45-243)||(16223050-16223248)
chr8 (87-276)||(466061-466250)
chr8 (39-257)||(12876290-12876509)
chr8 (87-257)||(34951848-34952018)
chr8 (61-281)||(31933653-31933873)
chr8 (39-278)||(39098889-39099128)
chr8 (39-219)||(9864329-9864509)
chr8 (47-254)||(10554998-10555203)
chr8 (37-248)||(24823194-24823397)
chr8 (113-254)||(33198057-33198198)
chr8 (99-254)||(18259320-18259475)
chr8 (52-212)||(1149756-1149912)
chr8 (159-281)||(41362723-41362845)
chr8 (39-172)||(13307804-13307936)
chr8 (7-95)||(12585265-12585353)
chr8 (39-128)||(43025883-43025972)
chr8 (39-142)||(41910895-41910997)
chr8 (158-282)||(43025974-43026099)
chr8 (88-179)||(34463704-34463792)
chr8 (61-144)||(7998481-7998563)
chr8 (220-281)||(9864533-9864594)
chr8 (210-254)||(13307931-13307975)
chr8 (7-40)||(8910654-8910687)
chr8 (7-40)||(33878412-33878445)
chr8 (211-254)||(41910852-41910895)
chr8 (7-40)||(22175065-22175098)
chr8 (7-40)||(23944992-23945025)
[»] chr7 (57 HSPs)
chr7 (39-282)||(10358975-10359218)
chr7 (61-282)||(31520502-31520723)
chr7 (39-284)||(35353265-35353510)
chr7 (39-257)||(9355612-9355830)
chr7 (39-254)||(37703287-37703502)
chr7 (40-257)||(18797485-18797702)
chr7 (40-289)||(24211899-24212149)
chr7 (39-281)||(32432609-32432851)
chr7 (39-283)||(15612519-15612763)
chr7 (40-280)||(31578827-31579067)
chr7 (40-283)||(37110032-37110275)
chr7 (40-284)||(17842343-17842587)
chr7 (39-257)||(23111349-23111567)
chr7 (39-257)||(37347179-37347396)
chr7 (65-282)||(29173706-29173922)
chr7 (39-283)||(6546676-6546920)
chr7 (39-283)||(41764838-41765082)
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chr7 (39-250)||(32820846-32821057)
chr7 (39-268)||(15672534-15672766)
chr7 (40-282)||(30055685-30055927)
chr7 (40-257)||(10481763-10481980)
chr7 (61-282)||(26980485-26980706)
chr7 (39-282)||(8861442-8861685)
chr7 (40-281)||(27283902-27284145)
chr7 (39-286)||(5657237-5657485)
chr7 (39-294)||(21991793-21992039)
chr7 (39-285)||(48928055-48928301)
chr7 (40-284)||(7334952-7335195)
chr7 (39-254)||(4583076-4583291)
chr7 (39-257)||(26587878-26588088)
chr7 (61-283)||(12390409-12390629)
chr7 (39-250)||(25691337-25691548)
chr7 (39-282)||(44598823-44599066)
chr7 (39-237)||(11071363-11071558)
chr7 (74-268)||(44411315-44411509)
chr7 (39-250)||(22687396-22687599)
chr7 (61-254)||(32592996-32593188)
chr7 (87-268)||(37704387-37704568)
chr7 (67-246)||(43925286-43925459)
chr7 (78-213)||(12165939-12166074)
chr7 (95-252)||(34361967-34362126)
chr7 (39-188)||(33688117-33688266)
chr7 (39-172)||(43686197-43686330)
chr7 (170-285)||(38258867-38258982)
chr7 (40-149)||(38258703-38258812)
chr7 (61-172)||(38053640-38053751)
chr7 (39-112)||(37704314-37704387)
chr7 (39-134)||(48928473-48928568)
chr7 (208-283)||(12166215-12166290)
chr7 (39-110)||(27421313-27421384)
chr7 (7-37)||(20595691-20595721)
chr7 (7-36)||(4544724-4544753)
chr7 (7-36)||(22256248-22256277)
chr7 (7-40)||(45288312-45288345)
chr7 (125-189)||(27421219-27421283)
chr7 (217-257)||(33688078-33688118)
[»] chr6 (21 HSPs)
chr6 (39-276)||(3879704-3879941)
chr6 (39-282)||(6090941-6091185)
chr6 (40-281)||(1946017-1946260)
chr6 (46-282)||(5627580-5627817)
chr6 (39-283)||(20768264-20768508)
chr6 (39-283)||(7234790-7235037)
chr6 (39-257)||(29182345-29182561)
chr6 (39-282)||(4318575-4318824)
chr6 (39-243)||(21016916-21017114)
chr6 (46-274)||(8513417-8513638)
chr6 (78-276)||(33892777-33892975)
chr6 (63-247)||(6089109-6089286)
chr6 (65-254)||(33619033-33619230)
chr6 (118-257)||(7054556-7054696)
chr6 (39-143)||(30353256-30353360)
chr6 (40-117)||(7055139-7055216)
chr6 (39-126)||(15491797-15491884)
chr6 (183-238)||(33724062-33724117)
chr6 (7-40)||(23379988-23380021)
chr6 (7-40)||(25456400-25456433)
chr6 (6-34)||(24409319-24409347)
[»] chr5 (56 HSPs)
chr5 (41-282)||(38527987-38528228)
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chr5 (39-282)||(22980975-22981218)
chr5 (39-257)||(31786421-31786639)
chr5 (61-257)||(24886291-24886487)
chr5 (42-257)||(15992315-15992530)
chr5 (41-283)||(23115979-23116213)
chr5 (41-282)||(35511232-35511468)
chr5 (39-275)||(33908415-33908650)
chr5 (61-276)||(2888201-2888416)
chr5 (39-282)||(19120041-19120284)
chr5 (40-279)||(22973835-22974074)
chr5 (40-283)||(31705361-31705604)
chr5 (39-282)||(35934078-35934321)
chr5 (39-257)||(5837737-5837955)
chr5 (40-282)||(22255365-22255607)
chr5 (40-254)||(35504548-35504762)
chr5 (39-250)||(35826268-35826477)
chr5 (48-275)||(8437156-8437383)
chr5 (40-283)||(17157780-17158023)
chr5 (39-282)||(40133567-40133810)
chr5 (39-281)||(12910537-12910779)
chr5 (39-283)||(27318237-27318480)
chr5 (40-248)||(5830075-5830284)
chr5 (39-283)||(25500675-25500919)
chr5 (45-276)||(7208620-7208851)
chr5 (39-253)||(8741664-8741879)
chr5 (39-282)||(27330486-27330729)
chr5 (78-283)||(42342942-42343147)
chr5 (39-282)||(36866944-36867187)
chr5 (78-276)||(25669797-25669995)
chr5 (39-276)||(36860606-36860843)
chr5 (39-281)||(39573001-39573235)
chr5 (71-282)||(25889584-25889795)
chr5 (78-276)||(22019844-22020042)
chr5 (68-282)||(14409091-14409305)
chr5 (78-276)||(32563361-32563559)
chr5 (92-257)||(7693456-7693621)
chr5 (87-268)||(43308424-43308605)
chr5 (41-276)||(13956120-13956353)
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chr5 (39-250)||(30969106-30969317)
chr5 (39-250)||(15724670-15724881)
chr5 (39-282)||(23954552-23954782)
chr5 (61-196)||(1428998-1429133)
chr5 (113-282)||(28416301-28416470)
chr5 (39-267)||(21088533-21088759)
chr5 (59-257)||(8466929-8467126)
chr5 (40-257)||(14919314-14919520)
chr5 (122-282)||(26269074-26269234)
chr5 (156-283)||(43254154-43254281)
chr5 (39-184)||(6824329-6824472)
chr5 (39-126)||(26268256-26268343)
chr5 (51-98)||(11898148-11898195)
chr5 (7-40)||(22938229-22938262)
chr5 (239-283)||(11898197-11898241)
[»] chr1 (56 HSPs)
chr1 (36-283)||(46931584-46931832)
chr1 (41-276)||(2959928-2960163)
chr1 (39-276)||(4330459-4330696)
chr1 (40-283)||(19899522-19899766)
chr1 (39-282)||(32216233-32216476)
chr1 (46-282)||(23999532-23999769)
chr1 (39-283)||(47682248-47682492)
chr1 (42-249)||(27266988-27267195)
chr1 (39-257)||(16415824-16416042)
chr1 (40-282)||(37451464-37451706)
chr1 (41-254)||(9902837-9903050)
chr1 (39-276)||(15168274-15168511)
chr1 (61-281)||(30254623-30254843)
chr1 (69-282)||(14758240-14758453)
chr1 (39-283)||(7078817-7079061)
chr1 (39-279)||(38823392-38823632)
chr1 (40-282)||(8222307-8222549)
chr1 (39-249)||(27227273-27227483)
chr1 (41-283)||(34012136-34012373)
chr1 (39-283)||(10181761-10182006)
chr1 (61-282)||(11742123-11742344)
chr1 (39-288)||(27532731-27532979)
chr1 (61-282)||(48353743-48353963)
chr1 (40-276)||(51129038-51129272)
chr1 (44-283)||(22170894-22171133)
chr1 (61-289)||(28564534-28564757)
chr1 (40-282)||(10922906-10923148)
chr1 (40-282)||(32267213-32267455)
chr1 (40-280)||(27763067-27763308)
chr1 (39-250)||(238300-238511)
chr1 (51-250)||(28769843-28770042)
chr1 (40-282)||(15383112-15383355)
chr1 (39-280)||(27563662-27563903)
chr1 (40-243)||(25160811-25161015)
chr1 (39-250)||(47279367-47279578)
chr1 (39-282)||(1547457-1547692)
chr1 (87-282)||(3535149-3535344)
chr1 (39-281)||(39393562-39393804)
chr1 (61-245)||(3309353-3309538)
chr1 (40-237)||(30326751-30326949)
chr1 (39-283)||(15752207-15752451)
chr1 (61-232)||(1359740-1359911)
chr1 (39-250)||(42721217-42721425)
chr1 (90-257)||(21289829-21289996)
chr1 (65-257)||(31621328-31621526)
chr1 (100-282)||(31962855-31963038)
chr1 (45-223)||(18422835-18423006)
chr1 (82-257)||(41926378-41926552)
chr1 (61-254)||(40885013-40885207)
chr1 (39-282)||(33725366-33725598)
chr1 (82-237)||(37618705-37618856)
chr1 (39-174)||(38759711-38759846)
chr1 (188-282)||(48620916-48621010)
chr1 (217-257)||(38759846-38759886)
chr1 (235-276)||(47555092-47555133)
chr1 (78-139)||(48620845-48620906)
[»] chr3 (66 HSPs)
chr3 (39-289)||(1089866-1090116)
chr3 (39-282)||(52040682-52040925)
chr3 (39-282)||(46297522-46297765)
chr3 (41-282)||(22622478-22622719)
chr3 (61-276)||(11357147-11357362)
chr3 (39-282)||(53228912-53229155)
chr3 (41-281)||(39282827-39283067)
chr3 (39-282)||(3362428-3362671)
chr3 (61-283)||(21009560-21009783)
chr3 (39-284)||(33378543-33378788)
chr3 (39-276)||(33698326-33698563)
chr3 (39-284)||(4015633-4015877)
chr3 (42-280)||(7327242-7327482)
chr3 (40-276)||(42505841-42506077)
chr3 (44-284)||(48355119-48355359)
chr3 (40-282)||(40552019-40552261)
chr3 (39-257)||(44891670-44891888)
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[»] chr2 (53 HSPs)
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[»] chr4 (61 HSPs)
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chr4 (7-40)||(15430940-15430973)
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chr4 (7-40)||(56197822-56197855)
chr4 (8-40)||(49637672-49637704)
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[»] scaffold0318 (1 HSPs)
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[»] scaffold0291 (1 HSPs)
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[»] scaffold0022 (1 HSPs)
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[»] scaffold0061 (1 HSPs)
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[»] scaffold0017 (1 HSPs)
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[»] scaffold0002 (4 HSPs)
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[»] scaffold0008 (1 HSPs)
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[»] scaffold0214 (2 HSPs)
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[»] scaffold0009 (2 HSPs)
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[»] scaffold0270 (1 HSPs)
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[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (7-40)||(96102-96135)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 223; Significance: 1e-123; HSPs: 51)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 88 - 338
Target Start/End: Original strand, 12587812 - 12588062
Alignment:
Q  88 tcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcatta 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12587812 tcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcatta 12587911  T
Q  188 atcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactcccaataa 287  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | | |||||||| |||||||    
T  12587912 atcagtaattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaattttttcaaaaaagtcagttctctaactgaaccatagaaacttccaataa 12588011  T
Q  288 aataatagactcttgattactagctccactaggaaaagtggtgggtctcct 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12588012 aataatagactcttgattactagctccactaggaaaagtggtgggtctcct 12588062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 39 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 1953998 - 1953756
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaaca-ccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctg 137  Q
    |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1953998 ttaagtgtaacatccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctgtttgcatgttaaagttgtcaacgataaaatagtacctg 1953899  T
Q  138 taagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaa 237  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1953898 taaatccaagattttgcaagcattattagatgaattactattgatcattaatcaataatcaacaattttaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaa 1953799  T
Q  238 ctttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactc 280  Q
     |||||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||    
T  1953798 ttttttcaaaaaaatcagtttcctgactgcaccgtagaaactc 1953756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 41 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 16446882 - 16446641
Alignment:
Q  41 aagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaa 140  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  16446882 aagtgtaacaccccacaaagcgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaatctgtttgcatgttaaagatgccaatgataaaatagtacctgtaa 16446783  T
Q  141 gtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactt 240  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  16446782 gtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatctaacattaaaatcaaaattaactt 16446683  T
Q  241 tttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactccc 282  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||    
T  16446682 tttcaaaaaagtcagtttcctgactgcaccgtagaagctccc 16446641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 40 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 1149640 - 1149398
Alignment:
Q  40 taagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgta 139  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  1149640 taagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatattatcaactttgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgta 1149541  T
Q  140 agtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaact 239  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  1149540 agtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcggtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaatt 1149441  T
Q  240 ttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactccc 282  Q
    ||||||||||||||| || ||| |||||| ||||||| |||||    
T  1149440 ttttcaaaaaagtcaatttcctgactgcaccgtagaagctccc 1149398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 40 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 37970527 - 37970285
Alignment:
Q  40 taagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgta 139  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    || |||||||||||||||||    
T  37970527 taagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatccttacaataaaatagtacctgta 37970428  T
Q  140 agtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaact 239  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37970427 agtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactgttgatcattaatcagaaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaact 37970328  T
Q  240 ttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactccc 282  Q
    ||||||||||||||| || ||| |||||| | ||||| |||||    
T  37970327 ttttcaaaaaagtcactttcctgactgcaccatagaagctccc 37970285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 40 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 8803825 - 8803573
Alignment:
Q  40 taagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgta 139  Q
    |||| ||||||||| | | | |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  8803825 taagcgtaacaccctaaaaagtgtaacacttaatactatcacataatatcatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgta 8803726  T
Q  140 agtcaaagattttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8803725 agtccaagatgttgcaagcattaccagatgaatatactattgatcattaatcagtaatgaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaac 8803626  T
Q  239 tttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactcccaataaaata 291  Q
    |||||||||||||||| || ||| |||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  8803625 tttttcaaaaaagtcaatttcctgactgcaccgtaaaaactcccaaaaaaata 8803573  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 39 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 4132695 - 4132452
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4132695 ttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacataagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgt 4132596  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  4132595 aagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatttgtaatcaacaatttaaaaatgaattacacattaagatcaaaattaac 4132496  T
Q  239 tttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactccc 282  Q
    |||| ||||||||||||||  || |||||| | ||||| |||||    
T  4132495 ttttccaaaaaagtcagtttgctgactgcaccatagaagctccc 4132452  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 39 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 30654592 - 30654340
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    ||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  30654592 ttaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctatttgcatgttaaaaatttcaacgataaaatagtacctgt 30654493  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaa 237  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  30654492 aagtccaagatgttgcaagcattactaaatgaatatattattgatcattaatcagtaattaacaattt-aaaatgaatcaaatattaaaatcaaaattaa 30654394  T
Q  238 ctttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactcccaataaaata 291  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| |||||| ||||||||||||| | ||||||    
T  30654393 ctttttcaaaaaaatcagtttcctgactgcaccgtagaaactccctaaaaaata 30654340  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 40 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 7890965 - 7890721
Alignment:
Q  40 taagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgta 139  Q
    |||| |||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  7890965 taagcgtaacaccccacaacgtgtaacacttaagattatcacataatatcatcaactctggttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgta 7890866  T
Q  140 agtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaact 239  Q
    |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7890865 agtctaaaatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaatattaagatcaaaattaact 7890766  T
Q  240 ttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactcccaa 284  Q
    |||||||||||||||||| | | || ||| ||||||| |||||||    
T  7890765 ttttcaaaaaagtcagtttcatgaccgcaccgtagaagctcccaa 7890721  T

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Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 39 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 27082847 - 27082636
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    |||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27082847 ttaagtctaacaccccgcaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgt 27082748  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27082747 aagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactacttatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaagatcaaaattaac 27082648  T
Q  239 tttttcaaaaaa 250  Q
    ||||||||||||    
T  27082647 tttttcaaaaaa 27082636  T

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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 39 - 284
Target Start/End: Original strand, 1205108 - 1205353
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  1205108 ttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcgcataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgt 1205207  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  1205208 aagtccaagatgttgcaagtattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcagcaatttaaaaatgaatcaaacaacaagatcaaaattaac 1205307  T
Q  239 tttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactcccaa 284  Q
    ||||| |||||||||| ||  || ||| || ||||||| |||||||    
T  1205308 ttttttaaaaaagtcaattttctgactacaccgtagaagctcccaa 1205353  T

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Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 40 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 43643603 - 43643361
Alignment:
Q  40 taagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgta 139  Q
    |||| |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||  | || |||||||||||| ||||    
T  43643603 taagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatattatcaactctgtttgcatgttaaaaattccgacaataaaatagtacatgta 43643504  T
Q  140 agtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaact 239  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43643503 agtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcgacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaact 43643404  T
Q  240 ttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactccc 282  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||| | ||||| |||||    
T  43643403 ttttcaaaaaagtcagttttctgactgcaccatagaagctccc 43643361  T

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Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 41 - 282
Target Start/End: Original strand, 34895150 - 34895386
Alignment:
Q  41 aagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaa 140  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||     |||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  34895150 aagtgtaacaccccacaaaatgtaacac-----actatcacataatatcatcaaatctgtttgcatgttaaagatgccaacgaaaaaatagtacatgtaa 34895244  T
Q  141 gtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactt 240  Q
    ||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34895245 gttcaagatgttgcaagcattactatatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactt 34895344  T
Q  241 tttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactccc 282  Q
    ||| |||||||||| || |||||||||| ||||||| |||||    
T  34895345 ttttaaaaaagtcaatttcctaactgcaccgtagaagctccc 34895386  T

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Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 51 - 280
Target Start/End: Original strand, 44869690 - 44869919
Alignment:
Q  51 ccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaagatt 150  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||| || | |||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||     
T  44869690 ccccacaaagtgtaacacttaagactatcaaatgatatcagcaactttgtttccatgttaaagatgtcaacgataaaatagtaccgataagtccaagata 44869789  T
Q  151 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  44869790 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaaccaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaactttttcaaaaaa 44869889  T
Q  251 gtcagttccctaactgcagcgtagaaactc 280  Q
    ||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  44869890 gtcagtttcataactgcatcgtagaaactc 44869919  T

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Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 40 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 23854439 - 23854229
Alignment:
Q  40 taagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgta 139  Q
    ||||||||||||| || | | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||  | || |||||||||||||||||    
T  23854439 taagtgtaacaccgcataaagtgtaacacttaagacaatcacataatatcatcaactctgcttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgta 23854340  T
Q  140 agtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaact 239  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23854339 agtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagaaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaact 23854240  T
Q  240 ttttcaaaaaa 250  Q
    |||||||||||    
T  23854239 ttttcaaaaaa 23854229  T

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Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 39 - 284
Target Start/End: Original strand, 38644159 - 38644404
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    ||||||||||||| ||| | | ||||||||| |||||||||| || | |||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  38644159 ttaagtgtaacactccataaagtgtaacactcaagactatcatatgatatcagcaactctgtttgcaagttaaagatgtcaatgataaaatagtacatgt 38644258  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  38644259 aagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaaaaatttaaaaataaatcaaacattaagattaaaattaac 38644358  T
Q  239 tttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactcccaa 284  Q
    ||||||||||||||||||| | | |||||| |||| || |||||||    
T  38644359 tttttcaaaaaagtcagtttcatgactgcaccgtaaaagctcccaa 38644404  T

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Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 39 - 282
Target Start/End: Original strand, 11727205 - 11727449
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |||    
T  11727205 ttaagtgtaacaccccacaaaatgtaacacttaagactatcacatgatatcaacaactttgtttgaatgttaaagatgccaacgataaaatagtatatgt 11727304  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  11727305 aagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaattattaagattaaaattaac 11727404  T
Q  239 tttttcaaaaaa-gtcagttccctaactgcagcgtagaaactccc 282  Q
    ||||| |||||| |||| || | | |||||| ||||||| |||||    
T  11727405 ttttttaaaaaatgtcaatttcatgactgcaccgtagaagctccc 11727449  T

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Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 39 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 5299955 - 5299712
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| || | |||| ||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||    
T  5299955 ttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagattatcaaatgatatcagcaattttgtttgcatgttaaagataacaacgataaaatagtacatgt 5299856  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  5299855 aagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattaatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaagattaaaattaac 5299756  T
Q  239 tttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactccc 282  Q
    ||||||||||||||||||| | | |||||| | ||||| |||||    
T  5299755 tttttcaaaaaagtcagtttcatgactgcaccatagaagctccc 5299712  T

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Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 39 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 36694975 - 36694732
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  36694975 ttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgt 36694876  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    || || ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| | |||| || ||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||||    
T  36694875 aaatccaagatgttgcaagcatcactagatgaattactatttatcatgaataagtaatcaataatttaaaaataaatcaaacattaaaattaaaagtaac 36694776  T
Q  239 tttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactccc 282  Q
    |||||||||||| |||||| | | |||||| ||||||| |||||    
T  36694775 tttttcaaaaaaatcagtttcttcactgcatcgtagaagctccc 36694732  T

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Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 44 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 35459715 - 35459491
Alignment:
Q  44 tgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtc 143  Q
    ||||||| |||||| | | |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||| ||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||    
T  35459715 tgtaacatcccacagattataacacttaagactattacataatatcatcaattctgtttgtatgttaaagatttcgacaataaaatagtatctgtaagtc 35459616  T
Q  144 aaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttt 243  Q
     || || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35459615 caaaatgttgcaaacattactagatgaattactattgatcattaatcagaaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttt 35459516  T
Q  244 caaaaaagtcagttccctaactgca 268  Q
    ||||||||||||||  |||||||||    
T  35459515 caaaaaagtcagttttctaactgca 35459491  T

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Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 87 - 282
Target Start/End: Original strand, 35859163 - 35859358
Alignment:
Q  87 atcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcatt 186  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35859163 atcatcaaatctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacttgtaagttcgagatgttgcaagcattactagatgaattaatattgatcatt 35859262  T
Q  187 aatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactccc 282  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  35859263 aatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcctgactgcaccgtagaaactccc 35859358  T

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Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 61 - 282
Target Start/End: Original strand, 33906415 - 33906634
Alignment:
Q  61 tgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaagattttgcaagcat 160  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  33906415 tgtaacacttaagactatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcat 33906514  T
Q  161 tactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttccc 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |  |||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  33906515 tactagatgaattactattgatcattaatcagcaatca--aatttaaaaatgaatcgaatagtaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttttc 33906612  T
Q  261 taactgcagcgtagaaactccc 282  Q
    | ||||||  |||||| |||||    
T  33906613 tgactgcactgtagaagctccc 33906634  T

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Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 39 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 6098527 - 6098311
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaata-----gta 133  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||     |||    
T  6098527 ttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgatacaatacaatagta 6098428  T
Q  134 cctgtaagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaa 233  Q
    | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  6098427 cttgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcatga 6098328  T
Q  234 ttaactttttcaaaaaa 250  Q
    ||||||||  |||||||    
T  6098327 ttaactttcccaaaaaa 6098311  T

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Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 40 - 254
Target Start/End: Original strand, 40862601 - 40862816
Alignment:
Q  40 taagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgta 139  Q
    |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40862601 taagtgtaacactccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatattatcaactatgtttgtatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgta 40862700  T
Q  140 agtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaattt-aaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  40862701 agtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactatttgtcataaatcagtaatcgacaatttaaaaaatgaatcaaacattaagattaaaagtaac 40862800  T
Q  239 tttttcaaaaaagtca 254  Q
    ||||||||||||||||    
T  40862801 tttttcaaaaaagtca 40862816  T

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Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Original strand, 16223050 - 16223248
Alignment:
Q  45 gtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtca 144  Q
    ||||||||||| | | |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||     
T  16223050 gtaacaccccaaaaagtgtaacacttaagagtatcacataatatcatcaactttgtttgcattttaaagattccaatgataaaatagtacatgtaagtct 16223149  T
Q  145 aagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttt 243  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  16223150 aagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaatttttt 16223248  T

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Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 87 - 276
Target Start/End: Original strand, 466061 - 466250
Alignment:
Q  87 atcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcatt 186  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  466061 atcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaatgataaaataatacctgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcatt 466160  T
Q  187 aatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaa 276  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| | | |||||| |||||||    
T  466161 aatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttattcaaaaaaatcagtttcatgactgcaccgtagaa 466250  T

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Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 39 - 257
Target Start/End: Original strand, 12876290 - 12876509
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaa-gactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctg 137  Q
    ||||| ||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12876290 ttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatg 12876389  T
Q  138 taagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaa 237  Q
    |||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | |||| |||| ||| ||||| ||||||||||||| || |||| |||    
T  12876390 taagtccaagatgttacaggcattactagatgaattactatttatcatgaataagtaatcaacagtttgaaaataaatcaaacattaaaattaaaagtaa 12876489  T
Q  238 ctttttcaaaaaagtcagtt 257  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  12876490 cttttttaaaaaagtcagtt 12876509  T

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Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 87 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 34952018 - 34951848
Alignment:
Q  87 atcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcatt 186  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  34952018 atcagcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagtcttactacatgaattactattgatcatt 34951919  T
Q  187 aatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtt 257  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  34951918 aatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcagaaaagtcagtt 34951848  T

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Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 61 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 31933873 - 31933653
Alignment:
Q  61 tgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaagattttgcaagcat 160  Q
    |||||||||||| | |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||  |||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||||  |||    
T  31933873 tgtaacacttaaaattatcacataatatcatcaagtctgtttgcatgttaaggattccaacaataaaatagtacttgtaagtctaagatattgcagacat 31933774  T
Q  161 tactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttccc 260  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  31933773 tactagatgaattattattgatcattaatcagtaatcaacgatttaaaaatgaatcaaatattaagatcaaaattaattttttcaaaaaagtcagtttcc 31933674  T
Q  261 taactgcagcgtagaaactcc 281  Q
     ||||||| | ||||| ||||    
T  31933673 caactgcaccatagaagctcc 31933653  T

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Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 39 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 39099128 - 39098889
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    |||||||||||| |||||| | | | ||||||||||||||| ||| | |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||    
T  39099128 ttaagtgtaacatcccacaaagtatcacacttaagactatcgcatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaatatgtcaacgataaaatagtatatgt 39099029  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| |||||||||||| || ||||||||     
T  39099028 aagtccaaaatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaattaataatcaataatttaaaaatgcatcaaacattaaaattaaaattaat 39098929  T
Q  239 tttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaac 278  Q
    ||||| |||||| |||||| | | | |||| |||||||||    
T  39098928 ttttttaaaaaaatcagtttcatgattgcaccgtagaaac 39098889  T

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Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 39 - 219
Target Start/End: Original strand, 9864329 - 9864509
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9864329 ttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaattttgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgt 9864428  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaa 219  Q
    ||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||| | ||||| ||||  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  9864429 aagttcaagatgttgcaagcattactagatgaataactagtaatcatgaatcggtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaa 9864509  T

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Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 47 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 10555203 - 10554998
Alignment:
Q  47 aacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaa 146  Q
    |||||| |||| || |||||||||  ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||| ||    
T  10555203 aacacctcacaaaacgtaacactt--gactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaa 10555106  T
Q  147 gattttgcaagcattactagatgaatt--actattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaa-cttttt 243  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||   | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  10555105 gatattgcaagcattactagatgaattacactattgatcatta---agtaataaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaattttttt 10555009  T
Q  244 caaaaaagtca 254  Q
    |||||||||||    
T  10555008 caaaaaagtca 10554998  T

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Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 37 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 24823397 - 24823194
Alignment:
Q  37 tgttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacct 136  Q
    ||||||||||||||||||||| | | ||| ||| |||| |||||||| | |||| |||||||        |||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  24823397 tgttaagtgtaacaccccacaaagtataatactcaagattatcacatgatatcaacaactct--------gttaaagatgccaacgataaaatagtacat 24823306  T
Q  137 gtaagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaatta 236  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  24823305 gtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgttcattaatcagtaatcaacaatttaaaaataaatcaaacattaagattaaaatta 24823206  T
Q  237 actttttcaaaa 248  Q
    ||||||| ||||    
T  24823205 acttttttaaaa 24823194  T

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Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 113 - 254
Target Start/End: Original strand, 33198057 - 33198198
Alignment:
Q  113 gatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatg 212  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33198057 gatgccaacgataaaatagtacatgtaagtctaaaatgttgcaagcatcactagatgaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatg 33198156  T
Q  213 aatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtca 254  Q
    |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  33198157 aatcaatcattaagattaagattaactttttcaaaaaagtca 33198198  T

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Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 99 - 254
Target Start/End: Original strand, 18259320 - 18259475
Alignment:
Q  99 atttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataatta 198  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| | |||| |    
T  18259320 atttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattattgttgatcagtaatgagtaatca 18259419  T
Q  199 acaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtca 254  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| |||||||||||||||    
T  18259420 acaatttaaaaatgaatcaatcattaaaattaaaattaaccttttcaaaaaagtca 18259475  T

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Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 52 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 1149912 - 1149756
Alignment:
Q  52 cccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaagattt 151  Q
    |||||| | |||||||||||||||    |||||| |||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  1149912 cccacaaagtgtaacacttaagac----acataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacttgtaagtctaagatgt 1149817  T
Q  152 tgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatg 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  1149816 tgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatg 1149756  T

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Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 159 - 281
Target Start/End: Original strand, 41362723 - 41362845
Alignment:
Q  159 attactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttc 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  41362723 attactagatgaattactattgatcattaaccagtaatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaagatcaaaattaattttttcaaaaaagtcagttt 41362822  T
Q  259 cctaactgcagcgtagaaactcc 281  Q
    ||| |||||| | ||||| ||||    
T  41362823 cctgactgcaccatagaagctcc 41362845  T

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Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 39 - 172
Target Start/End: Original strand, 13307804 - 13307936
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    |||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  13307804 ttaaatgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcaacaactctgtttgcatgttaaa-atgtcaacgataaaatagtacccgt 13307902  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaat 172  Q
    ||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  13307903 aagttcaagatgttgcaagcattacaagatgaat 13307936  T

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Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 7 - 95
Target Start/End: Original strand, 12585265 - 12585353
Alignment:
Q  7 catgtcgactgtgtgtgaaccctttcatattgttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaac 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12585265 catgtcgactgtgtgtgaaccctttcatattgttaagtgtaacaccccacaaaatctaacacttaatactatcacataacatcatcaac 12585353  T

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Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 39 - 128
Target Start/End: Original strand, 43025883 - 43025972
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaa 128  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43025883 ttaactgtaacaccccacaaaatgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactctgattgcatgttaaagatgtcaacgataaaa 43025972  T

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Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 39 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 41910997 - 41910895
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  41910997 ttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaatactatcacatgatatcaccaactctgtttgcatgttaaagatg-caacgataaaatattacctgt 41910899  T
Q  139 aagt 142  Q
    ||||    
T  41910898 aagt 41910895  T

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Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 158 - 282
Target Start/End: Original strand, 43025974 - 43026099
Alignment:
Q  158 cattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac-tttttcaaaaaagtcagt 256  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| ||| |    
T  43025974 cattattagataaattactattgatcatgaatcagtgatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaacttttttcaaaaaaatcaat 43026073  T
Q  257 tccctaactgcagcgtagaaactccc 282  Q
    | |||||| ||||  ||||| |||||    
T  43026074 ttcctaaccgcagtttagaagctccc 43026099  T

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Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 88 - 179
Target Start/End: Original strand, 34463704 - 34463792
Alignment:
Q  88 tcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactatt 179  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    || ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34463704 tcatcaactttgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaataatacctataagtc---catgttgcaagcattactaaatgaattactatt 34463792  T

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Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 61 - 144
Target Start/End: Original strand, 7998481 - 7998563
Alignment:
Q  61 tgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtca 144  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| |||  || ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  7998481 tgtaacacttaatactatcacataatatcaacaactctgtttctatattaaagatgccaacgataaaatagtacc-gtaagtca 7998563  T

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Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 220 - 281
Target Start/End: Original strand, 9864533 - 9864594
Alignment:
Q  220 cattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactcc 281  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| ||||    
T  9864533 cattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcctaactgcaccttagaagctcc 9864594  T

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Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 210 - 254
Target Start/End: Original strand, 13307931 - 13307975
Alignment:
Q  210 atgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtca 254  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  13307931 atgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaatagtca 13307975  T

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Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 40
Target Start/End: Original strand, 8910654 - 8910687
Alignment:
Q  7 catgtcgactgtgtgtgaaccctttcatattgtt 40  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8910654 catgtcgactgtgtgtgaaccctttcatattgtt 8910687  T

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Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 40
Target Start/End: Complemental strand, 33878445 - 33878412
Alignment:
Q  7 catgtcgactgtgtgtgaaccctttcatattgtt 40  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33878445 catgtcgactgtgtgtgaaccctttcatattgtt 33878412  T

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Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 211 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 41910895 - 41910852
Alignment:
Q  211 tgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtca 254  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  41910895 tgaatcaaacattcagattaaaattaacttttttaaaaaagtca 41910852  T

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Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 40
Target Start/End: Complemental strand, 22175098 - 22175065
Alignment:
Q  7 catgtcgactgtgtgtgaaccctttcatattgtt 40  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22175098 catgtcgattgtgtgtgaaccctttcatattgtt 22175065  T

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Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 40
Target Start/End: Complemental strand, 23945025 - 23944992
Alignment:
Q  7 catgtcgactgtgtgtgaaccctttcatattgtt 40  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23945025 catgtcgactctgtgtgaaccctttcatattgtt 23944992  T

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Target: chr7 (Bit Score: 180; Significance: 4e-97; HSPs: 57)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 39 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 10359218 - 10358975
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  10359218 ttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacaacatcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaattagtacttgt 10359119  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10359118 aagtccaagattttgcaagcattactaaatgatttactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattatgatcaaaattaac 10359019  T
Q  239 tttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactccc 282  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||| ||||||| |||||    
T  10359018 tttttcaaaaaagttagtttcttaactgcaccgtagaagctccc 10358975  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 61 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 31520723 - 31520502
Alignment:
Q  61 tgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaagattttgcaagcat 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  31520723 tgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctatttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatgttgcaagcat 31520624  T
Q  161 tactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttccc 260  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31520623 tactcgatgaattactattgatcattaatccgtaattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcataattaactttttcaaaaaagtcagtttcc 31520524  T
Q  261 taactgcagcgtagaaactccc 282  Q
    |||||||| | ||||| |||||    
T  31520523 taactgcaccatagaagctccc 31520502  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 39 - 284
Target Start/End: Original strand, 35353265 - 35353510
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  35353265 ttaagtgtaacaccccagaaaatgtaacacttaagactatctcataatatcatcaactatatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacattt 35353364  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35353365 aagtccaagatgttgcaagcattactagatgaatcactattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaatcgaacattaagatcaaaattaac 35353464  T
Q  239 tttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactcccaa 284  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| |||||||    
T  35353465 tttttcaaaaaagtcagtttcctgactgcaccttagaagctcccaa 35353510  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 39 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 9355830 - 9355612
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  9355830 ttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacttgt 9355731  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9355730 aagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattgctattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaac 9355631  T
Q  239 tttttcaaaaaagtcagtt 257  Q
    |||||||||||||||||||    
T  9355630 tttttcaaaaaagtcagtt 9355612  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 39 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 37703502 - 37703287
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    |||||||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37703502 ttaagtgtaacatcccacaaagtgtaccacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtatctgt 37703403  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37703402 aagtccaagatgttgcaaacattactagatgaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaagatcaaaattaac 37703303  T
Q  239 tttttcaaaaaagtca 254  Q
    ||||||||||||||||    
T  37703302 tttttcaaaaaagtca 37703287  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 40 - 257
Target Start/End: Original strand, 18797485 - 18797702
Alignment:
Q  40 taagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgta 139  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||    
T  18797485 taagtgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgta 18797584  T
Q  140 agtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaact 239  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18797585 agtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaact 18797684  T
Q  240 ttttcaaaaaagtcagtt 257  Q
    |||| |||||||||||||    
T  18797685 tttttaaaaaagtcagtt 18797702  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 40 - 289
Target Start/End: Original strand, 24211899 - 24212149
Alignment:
Q  40 taagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgta 139  Q
    ||||||||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||    
T  24211899 taagtgtaacatcctacaaagtgtaacacctaagactatcacataatatcatcaactttatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctata 24211998  T
Q  140 agtcaaagattttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24211999 agtccaagatgttgcaagcattactagatgaatatactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaac 24212098  T
Q  239 tttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactcccaataaaa 289  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||| || |||||    
T  24212099 tttttcaaaaaagtcagtttcctgactgcaccgtagaagctctcattaaaa 24212149  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 39 - 281
Target Start/End: Original strand, 32432609 - 32432851
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  32432609 ttaagtgtaacaccccacaaaatgtaacacttaagactatcacataatatcatcaacactgtttgcatattaaagatgccaacgataaaatagtacatgt 32432708  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  32432709 aagtccaaggtgttgcaagcattactagatgaattattattaatcatgaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaagtaac 32432808  T
Q  239 tttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactcc 281  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||    
T  32432809 ttttttaaaaaagtcagtttcctgactgcaccgtagaagctcc 32432851  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 39 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 15612763 - 15612519
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  15612763 ttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaatgataaaatagtacctgt 15612664  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  15612663 aagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattattgttgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaatcattaagattaaaattaac 15612564  T
Q  239 tttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactccca 283  Q
    ||||| ||||||||||||| | | |||||| ||||||| ||||||    
T  15612563 tttttaaaaaaagtcagtttcatgactgcaccgtagaagctccca 15612519  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 40 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 31579067 - 31578827
Alignment:
Q  40 taagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgta 139  Q
    ||||| |||||||| | | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||    
T  31579067 taagtataacaccctataaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttatttgcatgttaaagattccaacgataaaataatacatgta 31578968  T
Q  140 agtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaact 239  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  31578967 agtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataatcaataatttaaaaatgaatcaaacaataaaatcaaaattaact 31578868  T
Q  240 ttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactc 280  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||| | |||||||||    
T  31578867 ttttcaaaaaagtcagtttcctgactgcaccatagaaactc 31578827  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 40 - 283
Target Start/End: Original strand, 37110032 - 37110275
Alignment:
Q  40 taagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgta 139  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  37110032 taagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactaccacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacatgta 37110131  T
Q  140 agtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaact 239  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  37110132 agtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaact 37110231  T
Q  240 ttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactccca 283  Q
    ||| ||||||| ||| || | | |||||| ||||||| ||||||    
T  37110232 tttccaaaaaaatcaatttcttgactgcaccgtagaagctccca 37110275  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 40 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 17842587 - 17842343
Alignment:
Q  40 taagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgta 139  Q
    |||| |||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  17842587 taagcgtaacatcccacaaagtgtaacacttaagactaccacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacatgta 17842488  T
Q  140 agtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaact 239  Q
    |||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  17842487 agtccaagatgttgcaagcattattagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaact 17842388  T
Q  240 ttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactcccaa 284  Q
    ||| ||||||||||| || | | |||||| ||||||| |||||||    
T  17842387 tttccaaaaaagtcaatttcttgactgcaccgtagaagctcccaa 17842343  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 39 - 257
Target Start/End: Original strand, 23111349 - 23111567
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||    
T  23111349 ttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagataacaacgataaaatagtacatgt 23111448  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    || |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23111449 aaatcaaagatgttgaaagcattactagaagaattactattgatcataaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaagttaac 23111548  T
Q  239 tttttcaaaaaagtcagtt 257  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  23111549 ttttttaaaaaagtcagtt 23111567  T

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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 39 - 257
Target Start/End: Original strand, 37347179 - 37347396
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    |||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  37347179 ttaagtgtaa-actccacaaagtgtaacacttaagactaccacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgccaatgataaaatagtatctgt 37347277  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37347278 aagtccaagatattgcaagcattactcgatgaattactattgatcattaatccgtaattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcataattaac 37347377  T
Q  239 tttttcaaaaaagtcagtt 257  Q
    |||||||||||||||||||    
T  37347378 tttttcaaaaaagtcagtt 37347396  T

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Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 65 - 282
Target Start/End: Original strand, 29173706 - 29173922
Alignment:
Q  65 acacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaagattttgcaagcattact 164  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  29173706 acacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaa-atgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatgttgcaagcattact 29173804  T
Q  165 agatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttccctaac 264  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || ||    
T  29173805 agatgaattactattgatcatgaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcagttttctgac 29173904  T
Q  265 tgcagcgtagaaactccc 282  Q
    |||| ||||||| |||||    
T  29173905 tgcatcgtagaagctccc 29173922  T

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Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 39 - 283
Target Start/End: Original strand, 6546676 - 6546920
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    ||||||||||||||||||| | | |||||||||| | |||||||| | |||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6546676 ttaagtgtaacaccccacaaagtataacacttaatattatcacatgatatcagcaactctgtttgtatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgt 6546775  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    ||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  6546776 aagtctaagatgaggcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaatcattaagattaaaattaac 6546875  T
Q  239 tttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactccca 283  Q
    ||||||||||||||||||| | | |||||| ||||||| ||||||    
T  6546876 tttttcaaaaaagtcagtttcatgactgcaccgtagaagctccca 6546920  T

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Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 39 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 41765082 - 41764838
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||    
T  41765082 ttaagtgtaacaccccagaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtacatgt 41764983  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  41764982 aagtccaagattttgcaagcattactggatgaattattattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaac 41764883  T
Q  239 tttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactccca 283  Q
     ||||||||||||||| || ||  ||| || ||||||||||||||    
T  41764882 cttttcaaaaaagtcaatttcccgactccaccgtagaaactccca 41764838  T

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Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 39 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 46481133 - 46480905
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    |||||||||||| | || | | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  46481133 ttaagtgtaacatctcataaagtgtaacacttaagactatcacataatatcattaactttgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgt 46481034  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||    
T  46481033 aagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaataaataaaacattaagatcataattaac 46480934  T
Q  239 tttttcaaaaaagtcagttccctaactgc 267  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  46480933 tttttcaaaaaagtcagtttcctgactgc 46480905  T

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Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 39 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 32821057 - 32820846
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    ||||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||    
T  32821057 ttaagcgtaacaccccataaagtgtaacacttaagactatcgcataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgt 32820958  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32820957 aagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattactattaatcattcatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 32820858  T
Q  239 tttttcaaaaaa 250  Q
    ||||| ||||||    
T  32820857 tttttaaaaaaa 32820846  T

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Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 39 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 15672766 - 15672534
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaata---gtacc 135  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||   |||||    
T  15672766 ttaagtgtaacactccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctatttgaatgttaaagatgccaacgataaaataatagtacc 15672667  T
Q  136 tgtaagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaatt 235  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||    
T  15672666 tgtaagtccaaaatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcatgcatcaataatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaaggttaaaatt 15672567  T
Q  236 aactttttcaaaaaagtcagttccctaactgca 268  Q
    || ||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  15672566 aattttttcaaaaaagtcagtttcctgactgca 15672534  T

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Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 40 - 282
Target Start/End: Original strand, 30055685 - 30055927
Alignment:
Q  40 taagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgta 139  Q
    |||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  30055685 taagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaacgttgttcgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgta 30055784  T
Q  140 agtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaact 239  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||    
T  30055785 agtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaatcgttaaaatcaaaattaact 30055884  T
Q  240 ttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactccc 282  Q
    || |||||||||||| || ||| |||||| ||||||| |||||    
T  30055885 ttatcaaaaaagtcaatttcctgactgcaccgtagaagctccc 30055927  T

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Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 40 - 257
Target Start/End: Original strand, 10481763 - 10481980
Alignment:
Q  40 taagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgta 139  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||  |||| ||||||||||| | |||    
T  10481763 taagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctctttgcatgtcaaagattccaacaataaaatagtatccgta 10481862  T
Q  140 agtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaact 239  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  10481863 agtccaagatgttgcaagtattactagatgaattactattgatcgttaatcagtaattaacaatttaaaaataaattaaatattaagatcaaaattaact 10481962  T
Q  240 ttttcaaaaaagtcagtt 257  Q
    ||||||||||||||||||    
T  10481963 ttttcaaaaaagtcagtt 10481980  T

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Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 61 - 282
Target Start/End: Original strand, 26980485 - 26980706
Alignment:
Q  61 tgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaagattttgcaagcat 160  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||    
T  26980485 tgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtatctgtaagtctaagatgttgcaagtat 26980584  T
Q  161 tactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttccc 260  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |     
T  26980585 tactagatgaattattgttgatcattaatcggtaatcaacaatttaaaaatgaatcaatcattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttca 26980684  T
Q  261 taactgcagcgtagaaactccc 282  Q
    | |||||| | ||||| |||||    
T  26980685 tgactgcaccttagaagctccc 26980706  T

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Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 39 - 282
Target Start/End: Original strand, 8861442 - 8861685
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    |||||||||||||||| || | ||||||||| ||||| ||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||    
T  8861442 ttaagtgtaacaccccgcaaagtgtaacactcaagaccatcacatgatatcagcaactctctttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacatgt 8861541  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  8861542 aagtctaagatgttgcatgcattactagatgaaatactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacactaagattaaaattaac 8861641  T
Q  239 tttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactccc 282  Q
    ||||||||||||||||||| | | |||||| ||| ||| |||||    
T  8861642 tttttcaaaaaagtcagtttcatcactgcaccgttgaagctccc 8861685  T

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Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 40 - 281
Target Start/End: Original strand, 27283902 - 27284145
Alignment:
Q  40 taagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgta 139  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| || ||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  27283902 taagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatattatcaactatgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgta 27284001  T
Q  140 agtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaat-gaatcaaacattaagatcaaaattaa- 237  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||     
T  27284002 agtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaataatttaaaaataaaatcaaacattaaaatcaaaattaat 27284101  T
Q  238 ctttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactcc 281  Q
    |||||  |||||||||| || ||| |||||| ||||||| ||||    
T  27284102 cttttcaaaaaaagtcaatttcctgactgcaccgtagaagctcc 27284145  T

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Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 39 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 5657485 - 5657237
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||| ||| | |||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  5657485 ttaagtgtaacagcccacaaagtgtaatacttaagactatcgcatgatatcagcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgt 5657386  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacatt-aagatcaaaattaa 237  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||||    
T  5657385 aagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatgagtaatcaaaaatttaaaaatgaataaatcattaaagattaaaattaa 5657286  T
Q  238 ctttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactcccaata 286  Q
    |||||||||||| ||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||    
T  5657285 ctttttcaaaaatgtcagtttcataactgcattgtagaagctcccaata 5657237  T

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Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 39 - 294
Target Start/End: Original strand, 21991793 - 21992039
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21991793 ttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactttgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 21991892  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    ||||| ||||| |||||||||     |||||||||||||||||||    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21991893 aagtccaagatgttgcaagca-----agatgaattactattgatc----atcattaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaac 21991983  T
Q  239 tttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactcccaataaaataata 294  Q
     |||||||||||||||||| | | | | || ||||||| ||||| |||| ||||||    
T  21991984 cttttcaaaaaagtcagtttcatgattacaccgtagaagctccctataatataata 21992039  T

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Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 39 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 48928301 - 48928055
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    |||||||||||||| || | | |||||  |||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||    
T  48928301 ttaagtgtaacacctcagaaagtgtaatgcttaagactatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaaaaatgccaacgatgaaatagtacatgt 48928202  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||     
T  48928201 aagtccaagatgttgcaaacattactagatgaattactattgatcattaatcaacaatcaacaatttaaaaataaatcgaacatttagatcaaaattaat 48928102  T
Q  239 tttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactcccaat 285  Q
    ||||| |||||||||| ||  ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  48928101 ttttttaaaaaagtcaattttctaactgcaccgtagaagctcccaat 48928055  T

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Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 40 - 284
Target Start/End: Original strand, 7334952 - 7335195
Alignment:
Q  40 taagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgta 139  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||   |||| |||||||||||  | || |||||||||||||||||    
T  7334952 taagtgtaacaccccacagagtgtaacacttaagattatcagataatatcatcaactag-tttgaatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgta 7335050  T
Q  140 agtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaact 239  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7335051 aatccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattaatcattaatcagaaatcaataatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaatt 7335150  T
Q  240 ttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactcccaa 284  Q
    ||||||||||||||| || ||| |||||| | ||||| |||||||    
T  7335151 ttttcaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctcccaa 7335195  T

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Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 39 - 254
Target Start/End: Original strand, 4583076 - 4583291
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||  |||    
T  4583076 ttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactatgtttgtatgttaaagatgtcaacgatcaaataatatttgt 4583175  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    ||||  ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  4583176 aagttcaagatgttgcaagcattactggatgaattactattaatcatgaatcagtcatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaagattaaaattaac 4583275  T
Q  239 tttttcaaaaaagtca 254  Q
    ||||||||||||||||    
T  4583276 tttttcaaaaaagtca 4583291  T

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Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 39 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 26588088 - 26587878
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||        |||||||||| ||||||||||||| ||| |||    
T  26588088 ttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaagactatcacatgatatcaacaactct--------gttaaagatgccaacgataaaataatacatgt 26587997  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  26587996 aagtccaagatgttgcaggcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaataaatcaaacattaagattaaaattaac 26587897  T
Q  239 tttttcaaaaaagtcagtt 257  Q
    |||||||||||||||||||    
T  26587896 tttttcaaaaaagtcagtt 26587878  T

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Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 61 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 12390629 - 12390409
Alignment:
Q  61 tgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaagattttgcaagcat 160  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||   |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||    
T  12390629 tgtaacacttaagact--cacataatatcatcaactcagcttgcatgttaaagatgccaatgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaaccat 12390532  T
Q  161 tactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttccc 260  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||    
T  12390531 tactagatgaattactatttatcattaatcagtaattgacaatttaaaaatgaaataaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcaatttcc 12390432  T
Q  261 taactgcagcgtagaaactccca 283  Q
    | ||| || ||||||| ||||||    
T  12390431 tgacttcaccgtagaagctccca 12390409  T

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Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 39 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 25691548 - 25691337
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||  || |||    
T  25691548 ttaagtgtaacaccccacaaagtgtcacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcacgttaaagatgttaacgataaaataacacatgt 25691449  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    ||||  || || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  25691448 aagttcaaaatgttgcaaacattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaaa 25691349  T
Q  239 tttttcaaaaaa 250  Q
    ||||| ||||||    
T  25691348 ttttttaaaaaa 25691337  T

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Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 39 - 282
Target Start/End: Original strand, 44598823 - 44599066
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||    
T  44598823 ttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacctaagactatcacatgatatcaacaactctgtttgcatgttaaagatgacaacgataaaataatacatgt 44598922  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatc---aataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaatt 235  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||   |||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||| ||||||    
T  44598923 aagtctaagatgttacaagcattactagatgaa--actattgatcattaatcaataataatcaacaattt-aaaatgaatcaatcgttaagattaaaatt 44599019  T
Q  236 aactttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactccc 282  Q
    || |||||||||||| |||||| | | |||||| |||||||||||||    
T  44599020 aattttttcaaaaaaatcagtttcatgactgcaccgtagaaactccc 44599066  T

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Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 39 - 237
Target Start/End: Original strand, 11071363 - 11071558
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    |||||||||| |||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | || ||||||||||||   ||||||||||||| |||||||    
T  11071363 ttaagtgtaataccccacaaagtgtaacacttaagattatcacataatatcatcaactttgttcgcatgttaaaga---caacgataaaataatacctgt 11071459  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaa 237  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  11071460 aagtccaagatgttgcaaacattactagatgaattactattgatcattaatcattaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaa 11071558  T

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Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 74 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 44411509 - 44411315
Alignment:
Q  74 actatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaagattttgcaagcattactagatgaatt 173  Q
    |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44411509 actatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatattatctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaatt 44411410  T
Q  174 actattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttccctaactgca 268  Q
    | |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||| ||| ||||||    
T  44411409 aatattgaccattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatgaaacattaagatcataattaacctttccaaaaaagttagtttcctgactgca 44411315  T

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Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 39 - 250
Target Start/End: Original strand, 22687396 - 22687599
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||| | |||| |||||||        ||||| |||| ||||||||||||||||| |||    
T  22687396 ttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaagactatctcatgatatcaacaactct--------gttaaggatgccaacgataaaatagtacatgt 22687487  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  22687488 aagtccaagatgttgcaagcattaatagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcatacattaagattaaaattaac 22687587  T
Q  239 tttttcaaaaaa 250  Q
    ||||||||||||    
T  22687588 tttttcaaaaaa 22687599  T

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Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 61 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 32593188 - 32592996
Alignment:
Q  61 tgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaagattttgcaagcat 160  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || |||  ||    
T  32593188 tgtaacacttaagactatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgttaaaatagtacatgtaagtccaagatgttacaaatat 32593089  T
Q  161 tactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtca 254  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32593088 tactagataaattactatggatcattaatcagcaatcaacaattt-aaaatgaattgaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtca 32592996  T

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Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 87 - 268
Target Start/End: Original strand, 37704387 - 37704568
Alignment:
Q  87 atcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcatt 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37704387 atcatcaactctatttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatgttgcaagcattaccagatgaattactattgatcatt 37704486  T
Q  187 aatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttccctaactgca 268  Q
    ||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||  |||| ||||||||||| || ||| ||||||    
T  37704487 aattagtaatcaacaatttacaaatgaatcaaacattaaaatcaagattagtttttccaaaaaagtcaatttcctgactgca 37704568  T

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Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 67 - 246
Target Start/End: Original strand, 43925286 - 43925459
Alignment:
Q  67 acttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaagattttgcaagcattactag 166  Q
    |||||| || ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||      ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  43925286 acttaatacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaataatac------gtccaagatgttgcaagcattactag 43925379  T
Q  167 atgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaa 246  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43925380 atgaattactattaatcatgaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaa 43925459  T

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Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 78 - 213
Target Start/End: Original strand, 12165939 - 12166074
Alignment:
Q  78 tcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattacta 177  Q
    |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12165939 tcacataatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgacaacgataaaatagtatctgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattacta 12166038  T
Q  178 ttgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatga 213  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  12166039 ttgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatga 12166074  T

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Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 95 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 34362126 - 34361967
Alignment:
Q  95 ctctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaata 194  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |     
T  34362126 ctctgtttgcatgttaaaaatatcaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatattgcaaacattactagatgaattacttttgatcattaatcagtc 34362027  T
Q  195 attaacaatttaaaaatgaatcaaacatt-aaga-tcaaaattaactttttcaaaaaagt 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  34362026 attaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaagatttaaaattaactttttcaaaaaagt 34361967  T

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Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 39 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 33688266 - 33688117
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    ||||||||||||| ||| | | ||||||| | |||||||||| || | |||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  33688266 ttaagtgtaacactccataaagtgtaacattcaagactatcatatgatatcagcaactctgtttgcaagttaaagatgtcaatgataaaatagtacatgt 33688167  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaa 188  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33688166 aagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattgctattgatcattaa 33688117  T

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Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 39 - 172
Target Start/End: Original strand, 43686197 - 43686330
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  43686197 ttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactatgtttgtatgttaaagatgtcaacgataaaataatatttgt 43686296  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaat 172  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  43686297 aagtccaagatgttgcaagcattactggatgaat 43686330  T

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Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 170 - 285
Target Start/End: Original strand, 38258867 - 38258982
Alignment:
Q  170 aattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttccctaactgcag 269  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||     
T  38258867 aattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaaatcagttttctgactgcac 38258966  T
Q  270 cgtagaaactcccaat 285  Q
    ||||||| ||||||||    
T  38258967 cgtagaagctcccaat 38258982  T

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Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 40 - 149
Target Start/End: Original strand, 38258703 - 38258812
Alignment:
Q  40 taagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgta 139  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  38258703 taagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgta 38258802  T
Q  140 agtcaaagat 149  Q
    |||| |||||    
T  38258803 agtccaagat 38258812  T

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Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 61 - 172
Target Start/End: Original strand, 38053640 - 38053751
Alignment:
Q  61 tgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaagattttgcaagcat 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||    
T  38053640 tgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctatttggatgttaaagattccaacaataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaaacat 38053739  T
Q  161 tactagatgaat 172  Q
    || | |||||||    
T  38053740 tatttgatgaat 38053751  T

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Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 39 - 112
Target Start/End: Original strand, 37704314 - 37704387
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  37704314 ttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcatataatatcatcaactctgtttgcatgttaaa 37704387  T

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Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 39 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 48928568 - 48928473
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtac 134  Q
    |||||||||||||| || | | |||||  |||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  48928568 ttaagtgtaacacctcagaaagtgtaatgcttaagactatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaaaaatgccaacgataaaatagtac 48928473  T

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Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 208 - 283
Target Start/End: Original strand, 12166215 - 12166290
Alignment:
Q  208 aaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactccca 283  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | | ||||||| |||||| ||||||    
T  12166215 aaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttttagaaaagtcagtttcatgactgcagtgtagaagctccca 12166290  T

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Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 27421384 - 27421313
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgtta 110  Q
    |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||  || | |||| ||||||| |||||||||||    
T  27421384 ttaagtgtaacatcccacaaagtgtaacacttaagactatcgtatgatatcagcaactctgtttgcatgtta 27421313  T

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Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 37
Target Start/End: Original strand, 20595691 - 20595721
Alignment:
Q  7 catgtcgactgtgtgtgaaccctttcatatt 37  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20595691 catgtcgactgtgtgtgaaccctttcatatt 20595721  T

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Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 36
Target Start/End: Original strand, 4544724 - 4544753
Alignment:
Q  7 catgtcgactgtgtgtgaaccctttcatat 36  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4544724 catgtcgactgtgtgtgaaccctttcatat 4544753  T

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Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 36
Target Start/End: Original strand, 22256248 - 22256277
Alignment:
Q  7 catgtcgactgtgtgtgaaccctttcatat 36  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22256248 catgtcgactgtgtgtgaaccctttcatat 22256277  T

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Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 40
Target Start/End: Complemental strand, 45288345 - 45288312
Alignment:
Q  7 catgtcgactgtgtgtgaaccctttcatattgtt 40  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45288345 catgtcgattgtgtgtgaaccctttcatattgtt 45288312  T

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Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 125 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 27421283 - 27421219
Alignment:
Q  125 aaaatagtacctgtaagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 189  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| ||||||   |||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  27421283 aaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaaatgttacaagatgaaataatattgatcattaat 27421219  T

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Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 217 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 33688118 - 33688078
Alignment:
Q  217 aaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtt 257  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||    
T  33688118 aaacattaaaattaaaattaacttttttaaaaaagtcagtt 33688078  T

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Target: chr6 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 21)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 39 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 3879941 - 3879704
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    |||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3879941 ttaaatgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacttgt 3879842  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3879841 aagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcatgaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaac 3879742  T
Q  239 tttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaa 276  Q
    |||||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||    
T  3879741 tttttcaaaaaaatcagtttcctgactgcaccgtagaa 3879704  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 39 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 6091185 - 6090941
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaa-gactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctg 137  Q
    ||||| ||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||    
T  6091185 ttaagcgtaacacccaacaaagtgtaacacttaaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatattaaagattcaaacgataaaatagtacctg 6091086  T
Q  138 taagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaa 237  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6091085 taagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaa 6090986  T
Q  238 ctttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactccc 282  Q
    |||||| |||||||| ||||  || |||||| ||||||| |||||    
T  6090985 cttttttaaaaaagtaagttttctgactgcaccgtagaagctccc 6090941  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 40 - 281
Target Start/End: Original strand, 1946017 - 1946260
Alignment:
Q  40 taagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgta 139  Q
    |||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  1946017 taagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgta 1946116  T
Q  140 agtcaaagattttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    |||| ||||| || ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1946117 agtccaagatgttacaagcattattagatgaatatactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaac 1946216  T
Q  239 -tttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactcc 281  Q
     ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||    
T  1946217 ttttttcaaaaaagtcagtttcctgactgcaccgtagaagctcc 1946260  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 46 - 282
Target Start/End: Original strand, 5627580 - 5627817
Alignment:
Q  46 taacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaa 145  Q
    |||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5627580 taacaccctacaaagtgtaatacttaagactatcacataatatcatcaactctatttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacctgtaagtcca 5627679  T
Q  146 agattttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttc 244  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||     
T  5627680 agatgttgcaagcattactaggtgaatatactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaatattaaaatcaaaattaattttttt 5627779  T
Q  245 aaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactccc 282  Q
    |||||| |||||| ||| |||||| ||||||| |||||    
T  5627780 aaaaaaatcagtttcctgactgcaccgtagaagctccc 5627817  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 39 - 283
Target Start/End: Original strand, 20768264 - 20768508
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    |||||||||||| |||| | | ||||||||||||||  ||| ||||| |||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20768264 ttaagtgtaacatcccataaagtgtaacacttaagatcatcgcataatatcatcaattatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgt 20768363  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  20768364 aagtccaaggtgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaattgaacattaagatcaaaattaac 20768463  T
Q  239 tttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactccca 283  Q
    |||||||||||| ||| || ||| |||||| ||||||| ||||||    
T  20768464 tttttcaaaaaaatcaatttcctgactgcaccgtagaagctccca 20768508  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 39 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 7235037 - 7234790
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    ||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||    
T  7235037 ttaagtgtaacaccccagaaagtgtaacgcttaagactatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaaaaatgccaacgataaaatagtacatgt 7234938  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat---caataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaatt 235  Q
    ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  7234937 aagtccaagatgttgcaaacattactagatgaattactattgatcattaatcaacaacaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaatt 7234838  T
Q  236 aactttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactccca 283  Q
    ||||||||||||||| ||| || ||| ||| || |||| || ||||||    
T  7234837 aactttttcaaaaaaatcattttcctgactacaccgtaaaagctccca 7234790  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 39 - 257
Target Start/End: Original strand, 29182345 - 29182561
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataa--tgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacct 136  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  29182345 ttaagtgtaacacccc-cataaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctatttgcaggttaaagatgccaacgataaaatagtactt 29182443  T
Q  137 gtaagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaatta 236  Q
    ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||    
T  29182444 gtaagtctaagatgttgcaagtattactagatgaattac---tgatcattaatcaacaatcaacaatttaaaaatgaatcaatcattaagactaaaatta 29182540  T
Q  237 actttttcaaaaaagtcagtt 257  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  29182541 actttttcaaaaaagttagtt 29182561  T

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Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 39 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 4318824 - 4318575
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    ||||||||||||||| | | | ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  |     
T  4318824 ttaagtgtaacaccctataaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgttttcatgttaaagatgtcaacgatgaaatagtacggga 4318725  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaaca------ttaagatcaaa 232  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||      |||| || |||    
T  4318724 aagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcattaatcaacaatttaaaaataaatcaaacattaaaattaaaattaaa 4318625  T
Q  233 attaactttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactccc 282  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||| |||||    
T  4318624 attaactttttcaaaaaaatcagtttcataactgcaccgtagaagctccc 4318575  T

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Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 39 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 21017114 - 21016916
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||        
T  21017114 ttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgtcaacgataaaatagtac---- 21017019  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
      ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  21017018 --gtctaagatgttgcaagcattactagatgaattactattaatcatgaatcagtaatcaacaatttataaatgaatcaaatattaagattaaaattaac 21016921  T

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Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 46 - 274
Target Start/End: Original strand, 8513417 - 8513638
Alignment:
Q  46 taacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaa 145  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| |    
T  8513417 taacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttccatgttaaagatgccaatgataaaatagtaccggtaagtcca 8513516  T
Q  146 agattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttca 245  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  8513517 aaatcttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatc-------aacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaactttttca 8513609  T
Q  246 aaaaagtcagttccctaactgcagcgtag 274  Q
    |||||||||||| | | |||||| |||||    
T  8513610 aaaaagtcagtttcatgactgcaccgtag 8513638  T

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Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 78 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 33892975 - 33892777
Alignment:
Q  78 tcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattacta 177  Q
    |||||| | |||| ||||||  ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  33892975 tcacatgatatcagcaactcagtttgcatgttaaagatgccaacaataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaaacattactaaatgaattacta 33892876  T
Q  178 ttgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaa 276  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||| |||||||    
T  33892875 ttgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaggttaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcataattgcaccgtagaa 33892777  T

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Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 63 - 247
Target Start/End: Original strand, 6089109 - 6089286
Alignment:
Q  63 taacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaagattttgcaagcatta 162  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||    
T  6089109 taacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttccatgttaaagatgccaacgataaaatagtaccagtaagtccaaaatgttgcaagcatta 6089208  T
Q  163 ctagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaa 247  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  6089209 ctatatgaattactattgatcattaatc-------aacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaattttttcaaa 6089286  T

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Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 65 - 254
Target Start/End: Original strand, 33619033 - 33619230
Alignment:
Q  65 acacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaa-----agatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaagattttgcaagca 159  Q
    |||||||||| |||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||     ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||    
T  33619033 acacttaagagtatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaagttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaatatgttgcaagca 33619132  T
Q  160 ttactagatgaattactattgatcatta---atcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtca 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   ||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  33619133 ttactagatgaattactattgatcattaatgatcagcaatcaacaatttaaaaatgaatcgaacattaagattaaaattaactttttaaaaaaagtca 33619230  T

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Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 118 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 7054696 - 7054556
Alignment:
Q  118 caacgataaaatagtacctgtaagtcaaagattttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatc 216  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  7054696 caacgataaaatagtaactgtaagtccaagatgttgcaaacattactaaatgaatatactattgatcattaatcattaatcaacaatttaaagatgaatc 7054597  T
Q  217 aaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtt 257  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7054596 aaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtt 7054556  T

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Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 39 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 30353360 - 30353256
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  30353360 ttaagtgtaacatcccacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgt 30353261  T
Q  139 aagtc 143  Q
    |||||    
T  30353260 aagtc 30353256  T

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Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 40 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 7055216 - 7055139
Alignment:
Q  40 taagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgt 117  Q
    |||||||||||| | ||| | |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7055216 taagtgtaacacgctacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactctatttggatgttaaagatgt 7055139  T

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Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 39 - 126
Target Start/End: Original strand, 15491797 - 15491884
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataa 126  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| | |||| ||| ||| |||| ||||||||||||  ||||||||    
T  15491797 ttaagtgtaacaccccacaaaatgtaacacttaaaaatatcacatgatatcagcaattctgtttggatgttaaagatgctaacgataa 15491884  T

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Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 183 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 33724117 - 33724062
Alignment:
Q  183 cattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33724117 cattaatcattaagcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 33724062  T

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Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 40
Target Start/End: Complemental strand, 23380021 - 23379988
Alignment:
Q  7 catgtcgactgtgtgtgaaccctttcatattgtt 40  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23380021 catgtcgactgtgtgtgaaccctttcatattgtt 23379988  T

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Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 40
Target Start/End: Original strand, 25456400 - 25456433
Alignment:
Q  7 catgtcgactgtgtgtgaaccctttcatattgtt 40  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25456400 catgtcgactgtgtgtgaaccctttcatattgtt 25456433  T

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Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 34
Target Start/End: Original strand, 24409319 - 24409347
Alignment:
Q  6 tcatgtcgactgtgtgtgaaccctttcat 34  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24409319 tcatgtcgactgtgtgtgaaccctttcat 24409347  T

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Target: chr5 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 56)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 41 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 38528228 - 38527987
Alignment:
Q  41 aagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaa 140  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  38528228 aagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaatctatttacatgttaaagatatcaacgataaaatagtacttgtaa 38528129  T
Q  141 gtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactt 240  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38528128 gtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactt 38528029  T
Q  241 tttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactccc 282  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||||| ||||||| |||||    
T  38528028 tttcaaaaaaatcagtttcctgactgcaccgtagaagctccc 38527987  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 39 - 268
Target Start/End: Original strand, 699332 - 699561
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  699332 ttaagtgtaacactccacaaagtgtaatacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatctgt 699431  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  699432 aagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 699531  T
Q  239 tttttcaaaaaagtcagttccctaactgca 268  Q
    |||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  699532 ttttccaaaaaagtcagtttcctgactgca 699561  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 39 - 282
Target Start/End: Original strand, 22980975 - 22981218
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||    
T  22980975 ttaagtgtaacacctcacaaaatgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatatgt 22981074  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22981075 aagtccaagatgttgcaatcattactagatgaattattattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 22981174  T
Q  239 tttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactccc 282  Q
    |||||  |||||||||||| ||| |||||| | ||||| |||||    
T  22981175 tttttttaaaaagtcagtttcctgactgcaccatagaagctccc 22981218  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 39 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 31786639 - 31786421
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31786639 ttaagtgtaacaccctacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactctgattgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgt 31786540  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31786539 aaatccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgttcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaatatcaaaattaac 31786440  T
Q  239 tttttcaaaaaagtcagtt 257  Q
    |||||||||||||||||||    
T  31786439 tttttcaaaaaagtcagtt 31786421  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 61 - 257
Target Start/End: Original strand, 24886291 - 24886487
Alignment:
Q  61 tgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaagattttgcaagcat 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  24886291 tgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacaataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcat 24886390  T
Q  161 tactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtt 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24886391 tactagatgaattactattgatcattaatcagaaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtt 24886487  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 42 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 15992530 - 15992315
Alignment:
Q  42 agtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaag 141  Q
    |||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||| | ||||  |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  15992530 agtgcaacaccccacaaagtgtcacacttaagactatcgcatgatatcaggaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtaccggtaag 15992431  T
Q  142 tcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttt 241  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15992430 tccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttt 15992331  T
Q  242 ttcaaaaaagtcagtt 257  Q
    ||||||||||||||||    
T  15992330 ttcaaaaaagtcagtt 15992315  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 41 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 23116213 - 23115979
Alignment:
Q  41 aagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaa 140  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23116213 aagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaatctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaa 23116114  T
Q  141 gtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactt 240  Q
    ||| ||||| |||||||||||||        | |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23116113 gtccaagatgttgcaagcattac--------tgactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactt 23116022  T
Q  241 tttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactccca 283  Q
    |||||||||||||| || ||| ||| || ||||||||||||||    
T  23116021 tttcaaaaaagtcattttcctgacttcaccgtagaaactccca 23115979  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 41 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 35511468 - 35511232
Alignment:
Q  41 aagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaa 140  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||     |||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  35511468 aagtgtaacaccccacaaaatgtaacac-----actatcacataatatcatcaaatctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaa 35511374  T
Q  141 gtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactt 240  Q
    ||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35511373 gttcaagatgttgcaagcattactatatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactt 35511274  T
Q  241 tttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactccc 282  Q
    ||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||    
T  35511273 ttttaaaaaagtcagtttcctgactgcaccgtagaagctccc 35511232  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 39 - 275
Target Start/End: Original strand, 33908415 - 33908650
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    |||| |||||||||||| | | ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  33908415 ttaaatgtaacaccccagaaagtgtaacacttaagactatcgcataatatcgtcaactatgtttgtatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgt 33908514  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33908515 aagtccaagatgttgcaagcattactagat-aattactattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 33908613  T
Q  239 tttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtaga 275  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  33908614 tttttcaaaaaagtcagttttctaactgcaccgtaga 33908650  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 61 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 2888416 - 2888201
Alignment:
Q  61 tgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaagattttgcaagcat 160  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||    
T  2888416 tgtaacacttaagactatcagataatatcatcaaatatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttacaagcat 2888317  T
Q  161 tactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttccc 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||  |    
T  2888316 tactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaactttttcaaaaaagtcaattttc 2888217  T
Q  261 taactgcagcgtagaa 276  Q
    | |||||| |||||||    
T  2888216 tgactgcaccgtagaa 2888201  T

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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 39 - 282
Target Start/End: Original strand, 19120041 - 19120284
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||      
T  19120041 ttaagtataacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactccgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctca 19120140  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  19120141 aagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtgatcaacaatttaaaaatgaatcaatcattaagattaaaattaac 19120240  T
Q  239 tttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactccc 282  Q
    ||||||||||||||||||| | | |||||| | ||||| |||||    
T  19120241 tttttcaaaaaagtcagtttcatgactgcaccttagaagctccc 19120284  T

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Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 40 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 22974074 - 22973835
Alignment:
Q  40 taagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgta 139  Q
    |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| |||||||||||||||| || || |||||||||||| ||||    
T  22974074 taagcgtaacacctcacaaaatgtaacacttaagactattacataatattatcaactctgtttgcatgttaaagatttcgacaataaaatagtacatgta 22973975  T
Q  140 agtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaact 239  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22973974 agtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaact 22973875  T
Q  240 ttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaact 279  Q
    |||| |||||| ||||||  || |||||| | ||||||||    
T  22973874 ttttaaaaaaaatcagttttctgactgcaccatagaaact 22973835  T

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Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 40 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 31705604 - 31705361
Alignment:
Q  40 taagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgta 139  Q
    |||| |||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| | ||    
T  31705604 taagcgtaacatctcacaaaatgtaacacttaagaccatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaaagataaaatagtacatata 31705505  T
Q  140 agtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaact 239  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  31705504 agtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaataaaaattaact 31705405  T
Q  240 ttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactccca 283  Q
    ||||||||||||||| || | | |||||| ||||||| ||||||    
T  31705404 ttttcaaaaaagtcaatttcttgactgcaccgtagaatctccca 31705361  T

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Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 39 - 282
Target Start/End: Original strand, 35934078 - 35934321
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| | ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  35934078 ttaagtgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactttgtttccatgttaaagatgtcaacaataaaatagtaccggt 35934177  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  35934178 aagtccaagatgttgcaagcattactagttgaattattattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgattcaaacattaaaattaaaattaac 35934277  T
Q  239 tttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactccc 282  Q
    |||||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  35934278 tttttcaaaaaaatcagtttcataactgcaccgtagaaactccc 35934321  T

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Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 39 - 257
Target Start/End: Original strand, 5837737 - 5837955
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||     
T  5837737 ttaagtgtaataccccacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctctttgcatgttaaagatgacaacgacaaaatagtacctgc 5837836  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||    
T  5837837 aagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactgttgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaatcattaaaattaaaattaac 5837936  T
Q  239 tttttcaaaaaagtcagtt 257  Q
     ||||||||||||||||||    
T  5837937 cttttcaaaaaagtcagtt 5837955  T

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Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 40 - 282
Target Start/End: Original strand, 22255365 - 22255607
Alignment:
Q  40 taagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgta 139  Q
    |||| |||||||| |||| | |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||    
T  22255365 taagcgtaacaccacacaaagtgtaacacttaaaactattacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaatattccaacgataaaatagtacctgta 22255464  T
Q  140 agtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaact 239  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22255465 agtccaagatgttgcaagccttactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaact 22255564  T
Q  240 ttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactccc 282  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||| | ||||||| |||||    
T  22255565 ttttaaaaaaagtcagtttcctgactgtaccgtagaagctccc 22255607  T

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Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 40 - 254
Target Start/End: Original strand, 35504548 - 35504762
Alignment:
Q  40 taagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgta 139  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  35504548 taagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatattatcaaatctgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacatgta 35504647  T
Q  140 agtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaact 239  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  35504648 agtccaagatgttgcaagtattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattgact 35504747  T
Q  240 ttttcaaaaaagtca 254  Q
    |||||||||||||||    
T  35504748 ttttcaaaaaagtca 35504762  T

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Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 39 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 35826477 - 35826268
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    ||||| ||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  35826477 ttaagcgtaacactccacaaagtgtaacccttaagattatca--taatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacatgt 35826380  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35826379 aagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 35826280  T
Q  239 tttttcaaaaaa 250  Q
    ||||| ||||||    
T  35826279 tttttaaaaaaa 35826268  T

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Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 48 - 275
Target Start/End: Original strand, 8437156 - 8437383
Alignment:
Q  48 acaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaag 147  Q
    ||||||||||   |||||||||||||| |||||||||| || ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8437156 acaccccacaatgtgtaacacttaagattatcacataatatgatcaactctgtttgaatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaagtccaag 8437255  T
Q  148 attttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaa 247  Q
    || ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  8437256 atgttgaaaacattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaattaaatattaaaatcaaaattaactttttcaaa 8437355  T
Q  248 aaagtcagttccctaactgcagcgtaga 275  Q
    |||||||||| ||| |||||| ||||||    
T  8437356 aaagtcagtttcctgactgcatcgtaga 8437383  T

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Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 40 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 17158023 - 17157780
Alignment:
Q  40 taagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgta 139  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| | ||    
T  17158023 taagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagaccatcacataatattatcaactctgtttgcatgataaagatttcaacgataaaatagtactttta 17157924  T
Q  140 agtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaact 239  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||    
T  17157923 agtccaagatgttgcaagcattactagatgaattattattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaacttgact 17157824  T
Q  240 ttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactccca 283  Q
    ||||||||||||||| || | | |||| | ||||||| ||||||    
T  17157823 ttttcaaaaaagtcaatttcttgactgtaccgtagaagctccca 17157780  T

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Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 39 - 282
Target Start/End: Original strand, 40133567 - 40133810
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  40133567 ttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactatgtttgtatgttaaagatgtcaacgataaaataatatttgt 40133666  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  40133667 aagtccaagatgttgcaagcattactggatgaattactattaatcatgaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaagattaaaattaac 40133766  T
Q  239 tttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactccc 282  Q
    |||||||||||||||| ||  || |||||| ||||||| |||||    
T  40133767 tttttcaaaaaagtcaattttctgactgcaccgtagaagctccc 40133810  T

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Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 39 - 281
Target Start/End: Original strand, 12910537 - 12910779
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||| |||| ||| |||| ||| |||    
T  12910537 ttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacctaagactatcacataatatcatcaactctggttgtatgttaaagatgccaacaatacaataatacatgt 12910636  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12910637 aagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgaacattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcataattaac 12910736  T
Q  239 tttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactcc 281  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||    
T  12910737 ttttccaaaaaagtcagtttcctgactgcaccatagaagctcc 12910779  T

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Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 39 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 27318480 - 27318237
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |    
T  27318480 ttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtac--at 27318383  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaa-tttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaa 237  Q
    ||||  ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27318382 aagtttaagatgttgcaaacattactatatgaattactattgatcattaatcaaaaatcaacaattttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaa 27318283  T
Q  238 ctttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactccca 283  Q
    |||||| |||||||||||||  || |||||| | ||||||||||||    
T  27318282 cttttttaaaaaagtcagttttctgactgcaccatagaaactccca 27318237  T

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Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 40 - 248
Target Start/End: Original strand, 5830075 - 5830284
Alignment:
Q  40 taagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgta 139  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  5830075 taagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgta 5830174  T
Q  140 agtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatg-aatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  5830175 agtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaaatcaaacattaaaatcaaaattaac 5830274  T
Q  239 tttttcaaaa 248  Q
    |||| |||||    
T  5830275 ttttccaaaa 5830284  T

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Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 39 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 25500919 - 25500675
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| | |||| ||||| | |||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25500919 ttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagatcatcacatgatatcagcaactttctttagatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgt 25500820  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||    
T  25500819 aagtctaagatgttgcaagcattactagatgaaatactgttgatcattaatcagtaattaacaatttaaaaatgaatcaaatactaagattaaaattaac 25500720  T
Q  239 tttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactccca 283  Q
    |||||||||||| |||||| | | |||||| ||||||| ||||||    
T  25500719 tttttcaaaaaaatcagtttcatgactgcaccgtagaagctccca 25500675  T

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Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 45 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 7208851 - 7208620
Alignment:
Q  45 gtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtca 144  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||      
T  7208851 gtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatattttcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagttc 7208752  T
Q  145 aagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttc 244  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||     
T  7208751 aagatgttgcaagtattactagatgaattattattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaataaaaattaacttttta 7208652  T
Q  245 aaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaa 276  Q
    ||||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  7208651 aaaaaagtcagtttcttaactgcaacgtagaa 7208620  T

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Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 39 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 8741879 - 8741664
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataac-atcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctg 137  Q
    ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| |  || | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8741879 ttaagtgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacatgattatgagcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatg 8741780  T
Q  138 taagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaa 237  Q
    |||||| || || |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8741779 taagtccaaaatgttgcaagcatcactagatgaaatactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaa 8741680  T
Q  238 ctttttcaaaaaagtc 253  Q
    ||||||||||||||||    
T  8741679 ctttttcaaaaaagtc 8741664  T

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Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 39 - 282
Target Start/End: Original strand, 27330486 - 27330729
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    |||||||||||||||||   | ||| ||||||||||||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||    
T  27330486 ttaagtgtaacaccccatgaagtgtcacacttaagactatcgcatgatatcagcaactctatttgcatgttaaagatttcaacaataaaatggtacatgt 27330585  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27330586 aagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatgaacgatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaac 27330685  T
Q  239 tttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactccc 282  Q
    ||||||||| |||||| || | | |||||| ||||||| |||||    
T  27330686 tttttcaaacaagtcaatttcatgactgcaccgtagaagctccc 27330729  T

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Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 78 - 283
Target Start/End: Original strand, 42342942 - 42343147
Alignment:
Q  78 tcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattacta 177  Q
    |||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  42342942 tcacatgatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaataggacatgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattacca 42343041  T
Q  178 ttgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaa 277  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | | |||||| |||||||     
T  42343042 ttgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcagaaaagtcagtttcatgactgcaccgtagaag 42343141  T
Q  278 ctccca 283  Q
    ||||||    
T  42343142 ctccca 42343147  T

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Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 39 - 282
Target Start/End: Original strand, 36866944 - 36867187
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  36866944 ttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactatgtttgtatgttaaagatgtcaacgataaaataatatttgt 36867043  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    ||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  36867044 aagtccaagatgttgcaaacattactggatgaattactattaatcatgaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaagattaaaattaac 36867143  T
Q  239 tttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactccc 282  Q
    ||||| |||||||||| ||  || |||||| ||||||| |||||    
T  36867144 ttttttaaaaaagtcaattttctgactgcaccgtagaagctccc 36867187  T

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Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 78 - 276
Target Start/End: Original strand, 25669797 - 25669995
Alignment:
Q  78 tcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattacta 177  Q
    |||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||    
T  25669797 tcacatgatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaaaatgttgcaagcattactagatgaattacta 25669896  T
Q  178 ttgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaa 276  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| | | |||||| |||||||    
T  25669897 ttgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaactttttcaaaaaaatcagtttcatgactgcaccgtagaa 25669995  T

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Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 39 - 276
Target Start/End: Original strand, 36860606 - 36860843
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  36860606 ttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactatgtttgtatgttaaagatgtcaacgataaaataatatttgt 36860705  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  36860706 aagtccaagatgttgcaagcattactaaatgaattactattaatcatgaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaagcattaagattaaaattaac 36860805  T
Q  239 tttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaa 276  Q
    ||||| |||||||||| ||  || |||||| |||||||    
T  36860806 ttttttaaaaaagtcaattttctgactgcaccgtagaa 36860843  T

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Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 39 - 281
Target Start/End: Original strand, 39573001 - 39573235
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    |||||||||||| |||||| | |||||||||  |||||||||||| | |||| |||||||        |||||||||| ||| ||||||||||||| |||    
T  39573001 ttaagtgtaacatcccacaaagtgtaacactcgagactatcacatgatatcaacaactct--------gttaaagatgccaatgataaaatagtacatgt 39573092  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39573093 aagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaac 39573192  T
Q  239 tttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactcc 281  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| ||||    
T  39573193 tttttcaaaaaagtcagtttcataactgcaccgtagaagctcc 39573235  T

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Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 71 - 282
Target Start/End: Original strand, 25889584 - 25889795
Alignment:
Q  71 aagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaagattttgcaagcattactagatga 170  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||||||||||||    
T  25889584 aagattatgacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagataccaacaataaaatagtacctgtaaatccaagatgttgaaagcattactagatga 25889683  T
Q  171 attactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagc 270  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||| |    
T  25889684 attactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaagatcaaaattaacttttccagaaaagtcagtttcctgactgcatc 25889783  T
Q  271 gtagaaactccc 282  Q
    |||||| |||||    
T  25889784 gtagaagctccc 25889795  T

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Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 78 - 276
Target Start/End: Original strand, 22019844 - 22020042
Alignment:
Q  78 tcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattacta 177  Q
    |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  22019844 tcacatgatatcagcaactctatttgcatgttaaagatgccaacgataaaataatacttgtaagtctaagatgttgtaagcattactagatgaattacta 22019943  T
Q  178 ttgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaa 276  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| |||||||    
T  22019944 ttgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaatattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcatgactgcaccgtagaa 22020042  T

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Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 68 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 14409305 - 14409091
Alignment:
Q  68 cttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaagattttgcaagcattactaga 167  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||| |    
T  14409305 cttaagactatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacttgtaagtccaagatgttgcaaacattactaaa 14409206  T
Q  168 tgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttccctaactgc 267  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||| |||||| ||| |||||    
T  14409205 tgaattactattgatcattattcagcaatcaacaatttaaaaatgaatcgaacattaaaattaaaattaaatttttcaaaaaaatcagtttcctgactgc 14409106  T
Q  268 agcgtagaaactccc 282  Q
    | ||||||| |||||    
T  14409105 accgtagaagctccc 14409091  T

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Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 78 - 276
Target Start/End: Original strand, 32563361 - 32563559
Alignment:
Q  78 tcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattacta 177  Q
    |||||| | |||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||    
T  32563361 tcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttatagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagaattactagataaattatta 32563460  T
Q  178 ttgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaa 276  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  32563461 ttgatcattaatcagcaattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcataactgcaccgtagaa 32563559  T

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Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 92 - 257
Target Start/End: Original strand, 7693456 - 7693621
Alignment:
Q  92 caactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatca 191  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7693456 caactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaataatacttgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgttcattaatca 7693555  T
Q  192 ataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtt 257  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | |||||||||||    
T  7693556 gtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaacttttttagaaaagtcagtt 7693621  T

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Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 87 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 43308605 - 43308424
Alignment:
Q  87 atcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcatt 186  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43308605 atcatcaactcttcttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtcgaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcatt 43308506  T
Q  187 aatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttccctaactgca 268  Q
    |||||  ||| ||||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43308505 aatcagaaatcaacaatttaaaaacgaatcaaatactaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcctaactgca 43308424  T

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Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 41 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 13956353 - 13956120
Alignment:
Q  41 aagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaa 140  Q
    ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||| |||| |||||||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  13956353 aagtgtaacaccctacaaagcgtaacacttaagactatcatataatatcatcaaatttgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtta 13956254  T
Q  141 gtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactt 240  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  || |   ||||||||||| |||||||||||| |    
T  13956253 gtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaattt--aactttttcaaacattaaaatcaaaattaacat 13956156  T
Q  241 tttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaa 276  Q
    |||||||||| |||| |  || |||||| |||||||    
T  13956155 tttcaaaaaaatcagctttctgactgcaccgtagaa 13956120  T

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Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 78 - 281
Target Start/End: Original strand, 9200445 - 9200648
Alignment:
Q  78 tcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattacta 177  Q
    |||||| | |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9200445 tcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatctataagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattacta 9200544  T
Q  178 ttgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaa 277  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  |||| || |||||||| |||||||||||| |||||| | | |||||| |||||||     
T  9200545 ttgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaaatttaaaattaaaattaattttttcaaaaaaatcagtttcatgactgcaccgtagaag 9200644  T
Q  278 ctcc 281  Q
    ||||    
T  9200645 ctcc 9200648  T

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Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 39 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 30969317 - 30969106
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |    
T  30969317 ttaagtgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactttgtttgcatgttaaagatgtcaacaataaaatagtatctat 30969218  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    ||||  |||||  |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  30969217 aagttcaagatgctgcaagtattactagatgagttactattaatcattaatcagtaatccacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaac 30969118  T
Q  239 tttttcaaaaaa 250  Q
    ||||| ||||||    
T  30969117 ttttttaaaaaa 30969106  T

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Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 39 - 250
Target Start/End: Original strand, 15724670 - 15724881
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    |||||| |||||| || || | |||| || |||||||||||| || | |||| ||||| | ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  15724670 ttaagtataacacgccccaaagtgtatcaattaagactatcatatgatatcaacaactttgtttacatgttaaagatgtcaactataaaatagtacttgt 15724769  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    ||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  15724770 aagtccaaaatattgtaagcattactagatgaattactattaatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaagttaaaattaac 15724869  T
Q  239 tttttcaaaaaa 250  Q
    ||||||||||||    
T  15724870 tttttcaaaaaa 15724881  T

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Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 39 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 23954782 - 23954552
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||  |||    
T  23954782 ttaagtgtaacacctcacaaaatgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaa-atgccaacgataaaataatatttgt 23954684  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    ||||  |||||      | ||||||| |||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  23954683 aagtgcaagat-----gaacattacttgatgaattactattgatcattaatc-------aacaatttaaaaatgaattaaacattaagatcataattaac 23954596  T
Q  239 tttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactccc 282  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| |||||    
T  23954595 tttttcaaaaaagtcagtttcctgactgcaccatagaagctccc 23954552  T

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Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 61 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 1429133 - 1428998
Alignment:
Q  61 tgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaagattttgcaagcat 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  1429133 tgtaacacttaagactatcacataatatcataaactttatttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcat 1429034  T
Q  161 tactagatgaattactattgatcattaatcaataat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1429033 tactagatgaattactattgatcattaatcagtaat 1428998  T

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Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 113 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 28416470 - 28416301
Alignment:
Q  113 gatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatg 212  Q
    |||| ||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |    
T  28416470 gatgccaacgataaaatagtacttttaagtccaagatgttgcaagcattacttgatgaattactattgatcattaatcaacaatcaacaatttaaaaaag 28416371  T
Q  213 aatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactccc 282  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | | |||||| ||||||| |||||    
T  28416370 aatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcagcttcatgactgcaccgtagaagctccc 28416301  T

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Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 39 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 21088759 - 21088533
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    |||||||||||| |||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||||||  | ||||    
T  21088759 ttaagtgtaacatcccacaaagtgtaacacttaagattatcacataatatcatcaactatgtttgtatgttaaagatgccaacgataaaataacatctgt 21088660  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaa- 237  Q
    || || ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||     
T  21088659 aaatccaagatgttgtaagcattactagatgaattactattaatcatgaataaataat---caatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaagttaat 21088563  T
Q  238 ctttttcaaaaaagtcagttccctaactgc 267  Q
     |||||  ||||||||||||  ||||||||    
T  21088562 ttttttttaaaaagtcagttttctaactgc 21088533  T

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Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 59 - 257
Target Start/End: Original strand, 8466929 - 8467126
Alignment:
Q  59 aatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaagattttgcaagc 158  Q
    |||||||||||||||||||||| || | |||| ||||||| ||| ||| |||||| ||| |||||||||||| ||  |||||||| || || ||||||||    
T  8466929 aatgtaacacttaagactatcatatgatatcaccaactctgtttacatattaaaggtgt-aacgataaaatattatttgtaagtccaaaatgttgcaagc 8467027  T
Q  159 attactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtt 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||| ||||||    
T  8467028 attactagatgaattactattgatcattaattagtaatcaacagtttaaaaatgaatcaaacattaaaaataaaattaactttttaaaaaaaatcagtt 8467126  T

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Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 40 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 14919520 - 14919314
Alignment:
Q  40 taagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgta 139  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||||| |||    ||    
T  14919520 taagtgtaacacctcacaaattgtaatacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacaataaaattgta----ta 14919425  T
Q  140 agtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaact 239  Q
    |||| ||||| |||||| ||      |||||||||| |||||||||||||||  |||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14919424 agtccaagatattgcaatca------gatgaattac-attgatcattaatcagaaatctaaaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaatt 14919332  T
Q  240 ttttcaaaaaagtcagtt 257  Q
    ||||||||||||||||||    
T  14919331 ttttcaaaaaagtcagtt 14919314  T

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Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 122 - 282
Target Start/End: Original strand, 26269074 - 26269234
Alignment:
Q  122 gataaaatagtacctgtaagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaaca 221  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||    
T  26269074 gataaaatagtacctgtaagtttaagatgttgtaagcaatactagataaattactactgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaaccaatca 26269173  T
Q  222 ttaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactccc 282  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | | |||||| |||||||||||||    
T  26269174 ttaagattaaaattaactttttcataaaagtcagtttcatgactgcaccgtagaaactccc 26269234  T

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Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 156 - 283
Target Start/End: Original strand, 43254154 - 43254281
Alignment:
Q  156 agcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcag 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  43254154 agcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcaa 43254253  T
Q  256 ttccctaactgcagcgtagaaactccca 283  Q
    || ||| |||||| | ||||| ||||||    
T  43254254 tttcctgactgcaccatagaagctccca 43254281  T

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Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 39 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 6824472 - 6824329
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    |||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  | || | ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| |||    
T  6824472 ttaaatgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacaagatat-agcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaa-gataaaacaatacatgt 6824375  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatca 184  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  6824374 aagtctaagatgttgcaagcatcactagatgagatactattgatca 6824329  T

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Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 39 - 126
Target Start/End: Original strand, 26268256 - 26268343
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataa 126  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||    
T  26268256 ttaagtgtaacaccgcacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaaggataa 26268343  T

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Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 51 - 98
Target Start/End: Original strand, 11898148 - 11898195
Alignment:
Q  51 ccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactct 98  Q
    ||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11898148 ccccacaaagtgtaacccttaagaatatcacataacatcatcaactct 11898195  T

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Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 40
Target Start/End: Complemental strand, 22938262 - 22938229
Alignment:
Q  7 catgtcgactgtgtgtgaaccctttcatattgtt 40  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22938262 catgtcgactatgtgtgaaccctttcatattgtt 22938229  T

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Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 239 - 283
Target Start/End: Original strand, 11898197 - 11898241
Alignment:
Q  239 tttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactccca 283  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||    
T  11898197 tttttcaaaaaagtcagtttcctgactgcaccgtagaagctccca 11898241  T

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Target: chr1 (Bit Score: 173; Significance: 5e-93; HSPs: 56)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 36 - 283
Target Start/End: Original strand, 46931584 - 46931832
Alignment:
Q  36 ttgttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacc 135  Q
    ||||| || ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  46931584 ttgttcagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctatttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacc 46931683  T
Q  136 tgtaagtcaaagattttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaat 234  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  46931684 tgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaatatattattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaat 46931783  T
Q  235 taactttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactccca 283  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||    
T  46931784 taactttttcaaaaaagtcagtttccttactgcaccgtagaagctccca 46931832  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 41 - 276
Target Start/End: Original strand, 2959928 - 2960163
Alignment:
Q  41 aagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaa 140  Q
    |||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  2959928 aagtgtaacatcccacaaattgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaatatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatctgtaa 2960027  T
Q  141 gtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactt 240  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2960028 gtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactt 2960127  T
Q  241 tttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaa 276  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||    
T  2960128 tttcaaaaaaatcagtttcctgactgcaccgtagaa 2960163  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 39 - 276
Target Start/End: Original strand, 4330459 - 4330696
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  4330459 ttaagtgtaacaccccacaaaatgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctttttgcatgttaaagatgtcaaagataaaatagtacttgt 4330558  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    ||||| || || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  4330559 aagtccaatatgttgcaagcattactagatgaattacaattgatcattaatcagtaatcaacaatataaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaat 4330658  T
Q  239 tttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaa 276  Q
    |||| ||||||| ||||||  || |||||| |||||||    
T  4330659 ttttccaaaaaaatcagttgtctgactgcaccgtagaa 4330696  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 40 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 19899766 - 19899522
Alignment:
Q  40 taagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgta 139  Q
    |||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  19899766 taagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcaccaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgta 19899667  T
Q  140 agtcaaagattttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19899666 agtccaagatgttgcaagcattactagatgaatatactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaac 19899567  T
Q  239 tttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactccca 283  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||    
T  19899566 ttttccaaaaaagtcagtttcctaactgcactgtagaagctccca 19899522  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 39 - 282
Target Start/End: Original strand, 32216233 - 32216476
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||    
T  32216233 ttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaataatatttgt 32216332  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32216333 aagtccaagatgttgcaagcattattagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 32216432  T
Q  239 tttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactccc 282  Q
    ||||| |||||||||||||  || |||||| ||||||| |||||    
T  32216433 ttttttaaaaaagtcagttttctgactgcaccgtagaagctccc 32216476  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 46 - 282
Target Start/End: Original strand, 23999532 - 23999769
Alignment:
Q  46 taacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaa 145  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23999532 taacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctatttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacctgtaagtcca 23999631  T
Q  146 agattttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttc 244  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  23999632 agatgttgcaagcattactagatgaatatactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttt 23999731  T
Q  245 aaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactccc 282  Q
    ||||| |||| || ||| |||||| | ||||| |||||    
T  23999732 aaaaaggtcaatttcctgactgcaccatagaagctccc 23999769  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 39 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 47682492 - 47682248
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47682492 ttaagtgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcatataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 47682393  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    || || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||    
T  47682392 aaatccaagatgttgcaagcattactaaatgaattactattgatcattaatcagtaattaacaatttaaaaaagaattaaacattaagattaaaattaac 47682293  T
Q  239 tttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactccca 283  Q
    || ||||||||||||||||  || |||||| | ||||| ||||||    
T  47682292 ttgttcaaaaaagtcagtttactgactgcaccatagaagctccca 47682248  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 42 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 27267195 - 27266988
Alignment:
Q  42 agtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaag 141  Q
    |||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27267195 agtgtaacaccccacaaagtgcaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtatctgtaag 27267096  T
Q  142 tcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttt 241  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27267095 tctaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgataattaatcaataatcaataatttaaaaatgaattaaacattaagatcaaaattaacttt 27266996  T
Q  242 ttcaaaaa 249  Q
    | ||||||    
T  27266995 tccaaaaa 27266988  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 39 - 257
Target Start/End: Original strand, 16415824 - 16416042
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  16415824 ttaagtgtaataccccacatattgtaatacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgt 16415923  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16415924 aagtccaagatgttgcaagcattattagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaat 16416023  T
Q  239 tttttcaaaaaagtcagtt 257  Q
    ||||  |||||||| ||||    
T  16416024 ttttctaaaaaagttagtt 16416042  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 40 - 282
Target Start/End: Original strand, 37451464 - 37451706
Alignment:
Q  40 taagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgta 139  Q
    ||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  37451464 taagtgtaacacctcaaaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtatctgta 37451563  T
Q  140 agtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaact 239  Q
    |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  37451564 agtccaagatgttgcaaacattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaataaaaattaact 37451663  T
Q  240 ttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactccc 282  Q
    ||||||||||||||| || | | |||||| ||||||| |||||    
T  37451664 ttttcaaaaaagtcaatttcttcactgcaccgtagaatctccc 37451706  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 41 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 9903050 - 9902837
Alignment:
Q  41 aagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaa 140  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  9903050 aagtgtaacaccccacaaaatgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaatttgtttgcatgttaaagatgacaacgataaaatagtaccagtaa 9902951  T
Q  141 gtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactt 240  Q
    ||| |||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  9902950 gtccaagatgctgcaagcactactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaatattaaaatcaaaattaactt 9902851  T
Q  241 tttcaaaaaagtca 254  Q
    ||||||||||||||    
T  9902850 tttcaaaaaagtca 9902837  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 39 - 276
Target Start/End: Original strand, 15168274 - 15168511
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    |||||||||||||| || | | ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15168274 ttaagtgtaacacctcagaaagtgtaacacttaaggctatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgt 15168373  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    ||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15168374 aagtacaagatgttgcaagcattattagatgaattactattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaatcgaacattaagatcaaaattaac 15168473  T
Q  239 tttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaa 276  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  15168474 tttttcaaaaaaatcagtttcctaactgcaccgtagaa 15168511  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 61 - 281
Target Start/End: Original strand, 30254623 - 30254843
Alignment:
Q  61 tgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaagattttgcaagcat 160  Q
    |||||||||||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  30254623 tgtaacacttaagactgtcacataataacatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaataatacatgtaagtccaagatgttgcaagcat 30254722  T
Q  161 tactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttccc 260  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  30254723 tactagatgaattactattgattattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagtttcc 30254822  T
Q  261 taactgcagcgtagaaactcc 281  Q
    | |||||| ||||||||||||    
T  30254823 tgactgcaccgtagaaactcc 30254843  T

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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 69 - 282
Target Start/End: Original strand, 14758240 - 14758453
Alignment:
Q  69 ttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaagattttgcaagcattactagat 168  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  14758240 ttaagactatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagat 14758339  T
Q  169 gaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttccctaactgca 268  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||    
T  14758340 gaattactattgatcattaatcaacaatcaacaatttaaaaatgaatcgaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcgtgactgca 14758439  T
Q  269 gcgtagaaactccc 282  Q
     ||||||| |||||    
T  14758440 ccgtagaagctccc 14758453  T

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Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 39 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 7079061 - 7078817
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    ||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||    
T  7079061 ttaagtgtaacaccccacaaagtataagacttaagactatcacatgatatcaacaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatatgt 7078962  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  7078961 aagtctaagatattgcaaacattactagatgaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaatcattaagattaaaattaac 7078862  T
Q  239 tttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactccca 283  Q
    |||||||||||| |||||| | | |||| | |||| |||||||||    
T  7078861 tttttcaaaaaaatcagtttcatgactgtaccgtaaaaactccca 7078817  T

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Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 39 - 279
Target Start/End: Original strand, 38823392 - 38823632
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  38823392 ttaagtgtaacacccaacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttagagatgccaacgataaaataatacctgt 38823491  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  38823492 aagtctaaaatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaaacaaatattaagattaaaattaac 38823591  T
Q  239 tttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaact 279  Q
    ||||| ||||||||||||| | | |||||| ||||||||||    
T  38823592 ttttttaaaaaagtcagtttcatgactgcaccgtagaaact 38823632  T

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Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 40 - 282
Target Start/End: Original strand, 8222307 - 8222549
Alignment:
Q  40 taagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgta 139  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  8222307 taagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgta 8222406  T
Q  140 agtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatg-aatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  8222407 agtccaagatgttgcaagcattactagatgaatta-tattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaaatcaaacattaaaatcaaaattaac 8222505  T
Q  239 tttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactccc 282  Q
    |||||||||||||||||||  || |||| | ||||||| |||||    
T  8222506 tttttcaaaaaagtcagttttctgactgtaccgtagaagctccc 8222549  T

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Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 39 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 27227483 - 27227273
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| | |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27227483 ttaagtgtaacaccccacaaagtgcaacacttaagactatcacatgatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtatctgt 27227384  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  27227383 aagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaaccatttaaaaatgaattaaacattaatatcaaaattaac 27227284  T
Q  239 tttttcaaaaa 249  Q
    |||| ||||||    
T  27227283 ttttccaaaaa 27227273  T

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Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 41 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 34012373 - 34012136
Alignment:
Q  41 aagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaa 140  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||     |||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||    
T  34012373 aagtgtaacaccccacaaaatgtaacac-----actatcacataatatcatcaaatctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatatgtaa 34012279  T
Q  141 gtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactt 240  Q
    ||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34012278 gttcaagatgttgcaagcattactatatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactt 34012179  T
Q  241 tttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactccca 283  Q
    ||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||    
T  34012178 ttttaaaaaagtcagtttcctgactgcaccgtagaagctccca 34012136  T

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Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 39 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 10182006 - 10181761
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacct-g 137  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||| |||| ||| |||||||||| |    
T  10182006 ttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctggttgtatgttaaagatgacaacaatacaatagtaccttg 10181907  T
Q  138 taagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaa 237  Q
    |||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10181906 taagtccaaaatgttgcaagcattactagatgaattactattgaacattaatcaacaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcataattaa 10181807  T
Q  238 ctttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactccca 283  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||| |||||| | ||||| ||||||    
T  10181806 cttttccaaaaaagttagtttcctgactgcaccatagaagctccca 10181761  T

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Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 61 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 11742344 - 11742123
Alignment:
Q  61 tgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaagattttgcaagcat 160  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  11742344 tgtaacaattaagactatcacatgatatcagcaactctctttgtatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcat 11742245  T
Q  161 tactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttccc 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |     
T  11742244 tactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaaatcagtttca 11742145  T
Q  261 taactgcagcgtagaaactccc 282  Q
    | |||||  | |||||||||||    
T  11742144 tgactgcgccatagaaactccc 11742123  T

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Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 39 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 27532979 - 27532731
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||| ||||||||||||| | |||| ||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  27532979 ttaagtgtaacacctcacaaagtgtaacactcaagactatcacatgatatcagcaattctgtttgcaagttaaagatgccaacgataaaatagtacatgt 27532880  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27532879 aagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaa-ttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaac 27532781  T
Q  239 tttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactcccaataaa 288  Q
    |||||||||||| |||||| | | |||||| ||||||| |||||| ||||    
T  27532780 tttttcaaaaaaatcagtttcatgactgcaccgtagaagctcccattaaa 27532731  T

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Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 61 - 282
Target Start/End: Original strand, 48353743 - 48353963
Alignment:
Q  61 tgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaagattttgcaagcat 160  Q
    ||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  48353743 tgtaacact-aagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatattgcaagcat 48353841  T
Q  161 tactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttccc 260  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |     
T  48353842 tactagatgaattattattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaaatcagtttca 48353941  T
Q  261 taactgcagcgtagaaactccc 282  Q
    | |||||| ||||||| |||||    
T  48353942 tgactgcaccgtagaagctccc 48353963  T

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Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 40 - 276
Target Start/End: Original strand, 51129038 - 51129272
Alignment:
Q  40 taagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgta 139  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  51129038 taagtgtaacaccccacaaagtgtaacaattaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacatgta 51129137  T
Q  140 agtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaact 239  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||  |||||||||    
T  51129138 agtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaagtattaaaat--aaattaact 51129235  T
Q  240 ttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaa 276  Q
    ||||||||||||||| || | ||||| || |||||||    
T  51129236 ttttcaaaaaagtcaatttcttaactacatcgtagaa 51129272  T

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Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Original strand, 22170894 - 22171133
Alignment:
Q  44 tgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtc 143  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||    
T  22170894 tgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaatctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaataattcttgtaagtc 22170993  T
Q  144 aaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttt 243  Q
     ||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22170994 taagatgttgcaaacattattagataaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaataaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttt 22171093  T
Q  244 caaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactccca 283  Q
    ||||||| ||||||  |||| |||| ||||||| ||||||    
T  22171094 caaaaaaatcagttttctaattgcaccgtagaagctccca 22171133  T

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Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 61 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 28564757 - 28564534
Alignment:
Q  61 tgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaagattttgcaagcat 160  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||| |||    
T  28564757 tgtaacacttaa--ctatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaataatacatgtaagtccaagatgttgcaaacat 28564660  T
Q  161 tactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttccc 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  28564659 tactagatgaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcaatttcc 28564560  T
Q  261 taactgcagcgtagaaactcccaataaaa 289  Q
    |   ||||   ||||||||||||||||||    
T  28564559 t---tgcaaactagaaactcccaataaaa 28564534  T

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Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 40 - 282
Target Start/End: Original strand, 10922906 - 10923148
Alignment:
Q  40 taagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgta 139  Q
    |||| |||||||| |||| | |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    || ||||||||||| |||||    
T  10922906 taagggtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactgtcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattctgacaataaaatagtatctgta 10923005  T
Q  140 agtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaact 239  Q
    |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10923006 agtccaaaatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaact 10923105  T
Q  240 ttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactccc 282  Q
    ||||||||| ||||||||  || |||||| | ||||| |||||    
T  10923106 ttttcaaaagagtcagttttctgactgcaccatagaagctccc 10923148  T

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Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 40 - 282
Target Start/End: Original strand, 32267213 - 32267455
Alignment:
Q  40 taagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgta 139  Q
    |||| ||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||    
T  32267213 taagcgtaacactccacaaagtgtaacactcaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaatattccaactataaaatagtacctgta 32267312  T
Q  140 agtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaact 239  Q
     ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  32267313 ggtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgaacattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaatt 32267412  T
Q  240 ttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactccc 282  Q
    ||||||||||||||| || ||| |||||| ||||||| |||||    
T  32267413 ttttcaaaaaagtcaatttcctgactgcaccgtagaagctccc 32267455  T

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Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 40 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 27763308 - 27763067
Alignment:
Q  40 taagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgta 139  Q
    |||| ||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  27763308 taagcgtaacaccctacaaagtgtaatacttaagactatcacataatataatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtatctgta 27763209  T
Q  140 agtcaaagattttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    |||  ||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27763208 agttcaagatgttgcaagcattactagataaatatactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaac 27763109  T
Q  239 tttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactc 280  Q
    ||||||||||| |||| || ||| |||| | |||||||||||    
T  27763108 tttttcaaaaatgtcaatttcctgactgtaccgtagaaactc 27763067  T

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Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 39 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 238511 - 238300
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||| || ||||    
T  238511 ttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgtatgttaaagatgccaacgataaaataatatctgt 238412  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  238411 aagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattaatcatgaatcagtaatccacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaatcaac 238312  T
Q  239 tttttcaaaaaa 250  Q
    ||||||||||||    
T  238311 tttttcaaaaaa 238300  T

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Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 51 - 250
Target Start/End: Original strand, 28769843 - 28770042
Alignment:
Q  51 ccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaagatt 150  Q
    ||||||| | |||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  28769843 ccccacaaagtgtaacgcttaagactatcacataatatcatcacctctgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatg 28769942  T
Q  151 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaa 250  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  28769943 ttgcaaacattgctagatgaattactattgatcattaattaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaactttttcaaaaaa 28770042  T

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Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 40 - 282
Target Start/End: Original strand, 15383112 - 15383355
Alignment:
Q  40 taagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgta 139  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| | | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  15383112 taagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactatgtatgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgta 15383211  T
Q  140 agtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatg-aatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  15383212 aatccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaatcaaacattaaaatcaaaattaac 15383311  T
Q  239 tttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactccc 282  Q
    |||||||||||| ||| || ||| |||| | ||||||| |||||    
T  15383312 tttttcaaaaaaatcaatttcctgactgaaccgtagaagctccc 15383355  T

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Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 39 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 27563903 - 27563662
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    |||||| ||| |||||||| |  | ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||    
T  27563903 ttaagtataataccccacaaagaggaacacttaagactatcatataatttcatcaactctgtttgcatgttaaagatgcaaacgataaaatagtatatgt 27563804  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  27563803 aagtccaagatgttgcaagtattactagatgaattaatattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaaagaatcaaacattaagatcataattaac 27563704  T
Q  239 tttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactc 280  Q
    |||| ||||||| |||||| ||| |||||| | |||||||||    
T  27563703 ttttccaaaaaaatcagtttcctgactgcaccatagaaactc 27563662  T

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Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 40 - 243
Target Start/End: Original strand, 25160811 - 25161015
Alignment:
Q  40 taagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgta 139  Q
    |||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  25160811 taagtgtaacaccccacaaagtataacacttaaaactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgta 25160910  T
Q  140 agtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatg-aatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  25160911 agtccaagatgttgcaagcattactatatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaaatcaaacattaaaatcaaaattaac 25161010  T
Q  239 ttttt 243  Q
     ||||    
T  25161011 ctttt 25161015  T

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Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 39 - 250
Target Start/End: Original strand, 47279367 - 47279578
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    |||| ||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| | ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  47279367 ttaattgtaacatcccataaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcaacaactatgtttgcatgttaaagatgccaacaataaaatagtatctgt 47279466  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    ||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  47279467 aagtccaagatgttgcaaacattattagatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaac 47279566  T
Q  239 tttttcaaaaaa 250  Q
    ||||||||||||    
T  47279567 tttttcaaaaaa 47279578  T

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Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 39 - 282
Target Start/End: Original strand, 1547457 - 1547692
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||| | |||| |||||||        |||||||||  ||||||||||||||||| |||    
T  1547457 ttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaactct--------gttaaagataccaacgataaaatagtacatgt 1547548  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  1547549 aagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattaccattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaat 1547648  T
Q  239 tttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactccc 282  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| || | |||||||||||||    
T  1547649 tttttcaaaaaagtcagtttcataattgtaccgtagaaactccc 1547692  T

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Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 87 - 282
Target Start/End: Original strand, 3535149 - 3535344
Alignment:
Q  87 atcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcatt 186  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3535149 atcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctttaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcatt 3535248  T
Q  187 aatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactccc 282  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| |||||| | | ||| || ||||||| |||||    
T  3535249 aatcaacaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaactaactttttaaaaaaaatcagtttcatgactacaccgtagaagctccc 3535344  T

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Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 39 - 281
Target Start/End: Original strand, 39393562 - 39393804
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    |||||||||||| || ||| | |||||||||||||||||||| || | || | ||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  39393562 ttaagtgtaacatcctacaaagtgtaacacttaagactatcatatgatattagcaactctgtttccatgttaaagatgccaatgataaaatagtaccggt 39393661  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    || || ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||    
T  39393662 aaatccaagatgttgcaaacattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaaaattaaaattaac 39393761  T
Q  239 tttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactcc 281  Q
    ||||| |||||||||| || | | ||||| |||||||| ||||    
T  39393762 ttttttaaaaaagtcaatttcatgactgccgcgtagaagctcc 39393804  T

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Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 61 - 245
Target Start/End: Original strand, 3309353 - 3309538
Alignment:
Q  61 tgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaagattttgcaagcat 160  Q
    |||||||||||||||||||| || | |||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  3309353 tgtaacacttaagactatcaaatgatatcagcaactctgtttgtatgttaaagatgccaacgataaaatagtacccgtaagtccaagatattgcaagcat 3309452  T
Q  161 tactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaga-tcaaaattaactttttca 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  3309453 tactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacatttagatttaaaattaactttttca 3309538  T

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Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 40 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 30326949 - 30326751
Alignment:
Q  40 taagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgta 139  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| | ||    
T  30326949 taagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagattccaacgataaaataatacattta 30326850  T
Q  140 agtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatg-aatcaaacattaagatcaaaattaa 237  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  30326849 agtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcatcaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaaatcaaatattaaaatcaaaattaa 30326751  T

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Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 39 - 283
Target Start/End: Original strand, 15752207 - 15752451
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    ||||| ||||||||||| | | |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||  |||||| |||||| ||| |||    
T  15752207 ttaagcgtaacaccccataaagtgtaacacttaagagtatcacataatatcattaactctgtttgcatgttaaaaattccaacgacaaaataatacatgt 15752306  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    ||||| ||||  ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  15752307 aagtccaagaagttgcaatttttactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaagatcaaaattaat 15752406  T
Q  239 tttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactccca 283  Q
    |||||  ||||| ||| ||  || |||||| ||||||| ||||||    
T  15752407 tttttttaaaaaatcaattttctgactgcaccgtagaagctccca 15752451  T

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Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 61 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 1359911 - 1359740
Alignment:
Q  61 tgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaagattttgcaagcat 160  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  || || ||||||||||    
T  1359911 tgtaacacttaagattatcatataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaagttcaaaatgttgcaagcat 1359812  T
Q  161 tactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaa 232  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1359811 tactggatgaattactatcgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaa 1359740  T

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Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 39 - 250
Target Start/End: Original strand, 42721217 - 42721425
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    |||||||||| |||||||| | | |||||||||||| |||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||   ||||||||||||| ||| |||    
T  42721217 ttaagtgtaataccccacaaagtataacacttaagattatcacgtaatatcatcaactttgtttgcatgttaaaga---caacgataaaatattacatgt 42721313  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    ||||| ||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  42721314 aagtccaagatgttgcaattattactagattaattactattgatcattaatgagtaatcaataatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaac 42721413  T
Q  239 tttttcaaaaaa 250  Q
    ||||| ||||||    
T  42721414 ttttttaaaaaa 42721425  T

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Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 90 - 257
Target Start/End: Original strand, 21289829 - 21289996
Alignment:
Q  90 atcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 189  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||  || | |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21289829 atcaactctgtttgcatattaaagatgccaacgataaaataacacttataagtccaagatgttgcaaacattactagatgaattattattgatcattaat 21289928  T
Q  190 caataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtt 257  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  21289929 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaatttttctaaaaaagtcagtt 21289996  T

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Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 65 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 31621526 - 31621328
Alignment:
Q  65 acacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaa-----agatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaagattttgcaagca 159  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||||| | ||||||||||||     ||||| ||||||||||||||||| |||||||  || || |||||||||    
T  31621526 acacttaagactatcgcataatatcaacaactatgtttgcatgttaagttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagttcaatatgttgcaagca 31621427  T
Q  160 ttactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaattta-aaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtt 257  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31621426 ttagtagatgaactactattgatcattaatcatcaatcaacaatttaaaaaatgaatcgaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtt 31621328  T

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Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 100 - 282
Target Start/End: Original strand, 31962855 - 31963038
Alignment:
Q  100 tttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaa 199  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| ||  |||||||  ||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||    
T  31962855 tttgcatgttaaagaaatcaacgataaaataatatatgtaagtttaagatgttgcaagcattattagatgaactactattgatcattaatcggtaatcaa 31962954  T
Q  200 caattt-aaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactccc 282  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| |||||    
T  31962955 caattttaaaaataaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcataactgcaccgtagaagctccc 31963038  T

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Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 45 - 223
Target Start/End: Original strand, 18422835 - 18423006
Alignment:
Q  45 gtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtca 144  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||  ||||||||||| || || ||||||||     
T  18422835 gtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcacctccgtttgcatgttaaagattccaacgataaaaaagcacatgtaagtcc 18422934  T
Q  145 aagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacatt 223  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||    
T  18422935 aagatgttgcaagcattgctagatgaattactattgatcattaatc-------aacaatttaaaaatgaatcaaacatt 18423006  T

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Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 82 - 257
Target Start/End: Original strand, 41926378 - 41926552
Alignment:
Q  82 ataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattga 181  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41926378 ataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacaataaaatagtacttgtaagtccaagatatt-caagcattactagatgaattactattga 41926476  T
Q  182 tcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtt 257  Q
    |||||||| |||||| ||  |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||||  |||||| ||||||    
T  41926477 tcattaattaataatcaatgatttaaaattgaatcaaacattaaaatcataattaatttttaaaaaaaaatcagtt 41926552  T

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Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 61 - 254
Target Start/End: Original strand, 40885013 - 40885207
Alignment:
Q  61 tgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaagattttgcaagcat 160  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| | | ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||    
T  40885013 tgtaacacttaagactatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccgatgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaaacat 40885112  T
Q  161 tactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaa-ttaactttttcaaaaaagtca 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| || |||| ||||||||||| || |||||| | |||| ||||| |||| ||||||||||    
T  40885113 tactagatgaattactattgatcattaattagcaatcaataattcaaaaatgaatcgaatattaaggttaaaagttaacatttttaaaaaagtca 40885207  T

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Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 39 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 33725598 - 33725366
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33725598 ttaagtgtaacaccccagaaagtgtaacatttaagactatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgt 33725499  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatt-taaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaa 237  Q
    ||| | || || |||||| |            |||||||||||||||||||||  ||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  33725498 aagaccaaaatgttgcaaac------------attactattgatcattaatcagcaatcaacaattaaaaaaatgaatcgaacattaagatcaaaataaa 33725411  T
Q  238 ctttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactccc 282  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| |||||| |||| || |||||    
T  33725410 ctttttcaaaaaaatcagtttcctgactgcaacgtataagctccc 33725366  T

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Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 82 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 37618856 - 37618705
Alignment:
Q  82 ataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattga 181  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37618856 ataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaataatacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattagtattga 37618757  T
Q  182 tcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaa 237  Q
     |||||||||||||| |||||||||||    | ||||||||||| |||||||||||    
T  37618756 ccattaatcaataatcaacaatttaaa----attcaaacattaaaatcaaaattaa 37618705  T

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Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 39 - 174
Target Start/End: Original strand, 38759711 - 38759846
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||| | |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||  |||    
T  38759711 ttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttgagactatcagataatatcaccaactatgtttgcatgttaaaggtgtcaactataaaataatatatgt 38759810  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaatta 174  Q
    || || ||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  38759811 aactccaagatgttgcaagcattactagattaatta 38759846  T

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Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 188 - 282
Target Start/End: Original strand, 48620916 - 48621010
Alignment:
Q  188 atcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactccc 282  Q
    |||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | | |||||| ||||||| |||||    
T  48620916 atcattaatcaacaattttaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcagaaaagtcagtttcatgactgcaccgtagaagctccc 48621010  T

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Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 257
Target Start/End: Original strand, 38759846 - 38759886
Alignment:
Q  217 aaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtt 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38759846 aaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtt 38759886  T

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Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 235 - 276
Target Start/End: Original strand, 47555092 - 47555133
Alignment:
Q  235 taactttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaa 276  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  47555092 taactttttcaaaaaagtcagtttcctaactgcaccgtagaa 47555133  T

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Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 78 - 139
Target Start/End: Original strand, 48620845 - 48620906
Alignment:
Q  78 tcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgta 139  Q
    |||||| | |||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  48620845 tcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgaataaatagtacctgta 48620906  T

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Target: chr3 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 66)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 39 - 289
Target Start/End: Original strand, 1089866 - 1090116
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaaca-ccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctg 137  Q
    |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |     
T  1089866 ttaagtgtaacatccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaacaactctatttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacat- 1089964  T
Q  138 taagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaa 237  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1089965 taaatccaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaa 1090064  T
Q  238 ctttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactcccaataaaa 289  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| ||| || ||||||  || |||||||||    
T  1090065 cttttttaaaaaagtcagtttcctgactacaccgtagatgcttccaataaaa 1090116  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 39 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 52040925 - 52040682
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  52040925 ttaagtgtaataccccacatagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgt 52040826  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52040825 aagtccaagatgttgcaaacattactagatgaatgattattgatcattaatgagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 52040726  T
Q  239 tttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactccc 282  Q
    |||| ||||||||||||||   | |||||||||||||| |||||    
T  52040725 ttttccaaaaaagtcagttgtatgactgcagcgtagaagctccc 52040682  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 39 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 46297765 - 46297522
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||    
T  46297765 ttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtatttgt 46297666  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46297665 aagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 46297566  T
Q  239 tttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactccc 282  Q
    ||||| |||||||||||||   | |||||| ||||||| |||||    
T  46297565 ttttttaaaaaagtcagttttttgactgcaccgtagaagctccc 46297522  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 41 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 22622719 - 22622478
Alignment:
Q  41 aagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaa 140  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22622719 aagtgtaacaccccacaaagcgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaatctgtttggatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaa 22622620  T
Q  141 gtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactt 240  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22622619 gtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaactatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactt 22622520  T
Q  241 tttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactccc 282  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||||| |||| || |||||    
T  22622519 tttcaaaaaaatcagtttcctgactgcaccgtaaaagctccc 22622478  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 61 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 11357362 - 11357147
Alignment:
Q  61 tgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaagattttgcaagcat 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  11357362 tgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacttgtaagtccaagatgttgcaagcat 11357263  T
Q  161 tactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttccc 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |    
T  11357262 tactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttgtc 11357163  T
Q  261 taactgcagcgtagaa 276  Q
    | |||||| |||||||    
T  11357162 tgactgcatcgtagaa 11357147  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 39 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 53229155 - 53228912
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||    
T  53229155 ttaagtgtaactccccacaaagtgtaacacttaagactatcacatagtatcatcaactttgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaataatacatgt 53229056  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53229055 aagttcaagatgttgcaagcattactagatgaattagtattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 53228956  T
Q  239 tttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactccc 282  Q
    |||| ||||||| |||||| ||| |||||| ||||||| |||||    
T  53228955 ttttccaaaaaaatcagttgcctgactgcaccgtagaagctccc 53228912  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 41 - 281
Target Start/End: Original strand, 39282827 - 39283067
Alignment:
Q  41 aagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaa 140  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  39282827 aagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaatatgtttgcctgttaaagatgtcaacaataaaatagtatctgtaa 39282926  T
Q  141 gtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactt 240  Q
     || || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39282927 atccaaaatgttgcaagcattactagatgaattactattaatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactt 39283026  T
Q  241 tttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactcc 281  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||    
T  39283027 tttcaaaaaagtcagtttcctgactgcaccgtagaagctcc 39283067  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 39 - 282
Target Start/End: Original strand, 3362428 - 3362671
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |      
T  3362428 ttaagtgaaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaattgtacttag 3362527  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    ||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3362528 aagtccaatatgttgcaagcattactggatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcataattaac 3362627  T
Q  239 tttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactccc 282  Q
    |||| ||||||||||| || ||| |||||| | ||||| |||||    
T  3362628 ttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccc 3362671  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 61 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 21009783 - 21009560
Alignment:
Q  61 tgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaagattttgcaagcat 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  21009783 tgtaacacttaagactatcacataatatcatcaacaatatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaagtctaagatgttgcaagcat 21009684  T
Q  161 tactagatgaat-tactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttcc 259  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |    
T  21009683 tactagatgaatatactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaatttttttaaaaaagtcagtttc 21009584  T
Q  260 ctaactgcagcgtagaaactccca 283  Q
    || |||||| ||||||||||||||    
T  21009583 ctgactgcaccgtagaaactccca 21009560  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 39 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 33378788 - 33378543
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    |||||||||||||||||   | ||||| ||||||||||||| |||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33378788 ttaagtgtaacaccccaagaagtgtaatacttaagactatcgcataatctcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgt 33378689  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    ||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  33378688 aagttcaagatgttgcaaacattactagatgaattactattgatcattaatcaataatcaacgatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaat 33378589  T
Q  239 tttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactcccaa 284  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||    
T  33378588 tttttcaaaaaagtcagtttcctgactgcaccgtagaagctcccaa 33378543  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 39 - 276
Target Start/End: Original strand, 33698326 - 33698563
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| | |||  ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33698326 ttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcgcatgatatcggcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgt 33698425  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  33698426 aagtctaagatattgcaagcattactagatgaattaatattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcagtcattaagattaaaattaac 33698525  T
Q  239 tttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaa 276  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| |||| |||||||    
T  33698526 tttttcaaaaaagtcagtttcataaatgcaccgtagaa 33698563  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 39 - 284
Target Start/End: Original strand, 4015633 - 4015877
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||   |||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||    
T  4015633 ttaagtgtaacaccccacaaagtgtcacacttaagactatcgcattgtatcaacaact-tgtttgcatgttaaagatgccaacggtaaaatagtacatgt 4015731  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4015732 aagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaac 4015831  T
Q  239 tttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactcccaa 284  Q
    ||||||||||||||||||| | | |||||| ||||||| |||||||    
T  4015832 tttttcaaaaaagtcagtttcatgactgcaccgtagaagctcccaa 4015877  T

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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 42 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 7327482 - 7327242
Alignment:
Q  42 agtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaag 141  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  7327482 agtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcaacaactctatttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacttgtaag 7327383  T
Q  142 tcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttt 241  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||    
T  7327382 tctaagatgttgcaagcattactagatgaattactattaatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaattattaagattaaaattaacttt 7327283  T
Q  242 tt--caaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactc 280  Q
    ||   |||||||||| || | |||||||| |||||||||||    
T  7327282 tttaaaaaaaagtcaatttcataactgcaccgtagaaactc 7327242  T

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Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 40 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 42506077 - 42505841
Alignment:
Q  40 taagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgta 139  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  42506077 taagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaacgttgttcgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgta 42505978  T
Q  140 agtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaact 239  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||    
T  42505977 agtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaatcgttaaaatcaaaattaact 42505878  T
Q  240 ttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaa 276  Q
    || |||||||||||| || ||| |||||| |||||||    
T  42505877 ttatcaaaaaagtcaatttcctgactgcaccgtagaa 42505841  T

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Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 44 - 284
Target Start/End: Original strand, 48355119 - 48355359
Alignment:
Q  44 tgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtc 143  Q
    |||||||  ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  | || ||||||||||| |||||||||    
T  48355119 tgtaacataccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtatctgtaagtc 48355218  T
Q  144 aaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttt 243  Q
     ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48355219 caagatgttgcaagtattactagatgaattattattgatcattaatcagtaagcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttt 48355318  T
Q  244 caaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactcccaa 284  Q
    ||||||||||| || |||||||||| | ||||| |||||||    
T  48355319 caaaaaagtcaatttcctaactgcaccatagaagctcccaa 48355359  T

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Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 40 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 40552261 - 40552019
Alignment:
Q  40 taagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgta 139  Q
    |||| |||||| ||||||   ||||||||||| || | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  40552261 taagcgtaacatcccacaacgtgtaacacttaggattgtcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgta 40552162  T
Q  140 agtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaact 239  Q
    |||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40552161 agtccatgatgttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaact 40552062  T
Q  240 ttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactccc 282  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||| |||||    
T  40552061 ttttcaaaaaagtcagtttccagactgcaccgtagaagctccc 40552019  T

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Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 39 - 257
Target Start/End: Original strand, 44891670 - 44891888
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  44891670 ttaagtgtaacactccacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttgtatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctac 44891769  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  44891770 aagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattactgttgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaatcattaagattaaaattaac 44891869  T
Q  239 tttttcaaaaaagtcagtt 257  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  44891870 ttttttaaaaaagtcagtt 44891888  T

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Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 61 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 26941241 - 26941020
Alignment:
Q  61 tgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaagattttgcaagcat 160  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  26941241 tgtaacacttaaaactatcatataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcat 26941142  T
Q  161 tactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttccc 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  26941141 tactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaagcgttaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttttc 26941042  T
Q  261 taactgcagcgtagaaactccc 282  Q
    | |||||| ||||||| |||||    
T  26941041 tgactgcaccgtagaagctccc 26941020  T

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Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 42 - 282
Target Start/End: Original strand, 37203243 - 37203484
Alignment:
Q  42 agtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactcta-tttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaa 140  Q
    |||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |  |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37203243 agtgtatcaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaatattgtttgtatgttaaagatgtcaatgataaaatagtacctgtaa 37203342  T
Q  141 gtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactt 240  Q
    ||| || || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37203343 gtccaatatatcgcaagcattactagatgaattaccattgatcattaatgagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactt 37203442  T
Q  241 tttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactccc 282  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||    
T  37203443 tttcaaaaaagtcagtttcctgactgcaccgtagaagctccc 37203484  T

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Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 46 - 276
Target Start/End: Original strand, 47481702 - 47481933
Alignment:
Q  46 taacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaa 145  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||  |    
T  47481702 taacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctatttgcatattaaagatttcaacgataaaatagtacttgtaagttca 47481801  T
Q  146 agattttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttc 244  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  47481802 agatgttgcaagcattactagatgaatatactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttc 47481901  T
Q  245 aaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaa 276  Q
    |||||| ||| || ||| |||| | |||||||    
T  47481902 aaaaaaatcaatttcctgactgtaccgtagaa 47481933  T

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Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 41 - 282
Target Start/End: Original strand, 37157882 - 37158124
Alignment:
Q  41 aagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactcta-tttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgta 139  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |  |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  37157882 aagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaatattgtttgtatgttaaagatgccaatgataaaatagtacatgta 37157981  T
Q  140 agtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaact 239  Q
    |||| || || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37157982 agtccaatatgtcgcaagcattactagatgaattaccattgatcattaatgagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaact 37158081  T
Q  240 ttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactccc 282  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||    
T  37158082 ttttcaaaaaagtcagtttcctgactgcaccgtagaagctccc 37158124  T

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Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 61 - 276
Target Start/End: Original strand, 54506002 - 54506218
Alignment:
Q  61 tgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaagattttgcaagcat 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  | |||||| || || ||||||||||    
T  54506002 tgtaacacttaagactatcacataatatcatctactttatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtatttataagtccaaaatgttgcaagcat 54506101  T
Q  161 tactagatgaat-tactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttcc 259  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || |    
T  54506102 tactagatgaatatactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaaatcaatttc 54506201  T
Q  260 ctaactgcagcgtagaa 276  Q
    || |||||| |||||||    
T  54506202 ctgactgcaccgtagaa 54506218  T

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Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 41 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 24708116 - 24707907
Alignment:
Q  41 aagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaa 140  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||| |||||||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  24708116 aagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaaacaatcacataatatcatcaaatttgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaa 24708017  T
Q  141 gtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactt 240  Q
    ||| ||||  |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  24708016 gtccaagaagttgcaagcattattagataaattactattaatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaactt 24707917  T
Q  241 tttcaaaaaa 250  Q
    ||||||||||    
T  24707916 tttcaaaaaa 24707907  T

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Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 39 - 257
Target Start/End: Original strand, 2008106 - 2008330
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    ||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  2008106 ttaagtgta-cactccacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgacaacgataaaatagtacttgt 2008204  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcat-------taatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaa 231  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||       |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2008205 aagtccaagatgttgcaagcattactagatgaaataatattgatcattaatcagtaatcattaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaa 2008304  T
Q  232 aattaactttttcaaaaaagtcagtt 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  2008305 aattaactttttcaaaaaagtcagtt 2008330  T

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Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 39 - 257
Target Start/End: Original strand, 32373643 - 32373860
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    |||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  32373643 ttaagtgtaacatcccacaaagtgtgacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcatattaaagatgtcaacgataaaatagtacttgt 32373742  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||  | || |||||| |||||||||    
T  32373743 aagtctaagatgttgcaagcattactagatgaatttctattgatcattaatcagtaatcaacaattt-aaaatgaattcatcaataagattaaaattaac 32373841  T
Q  239 tttttcaaaaaagtcagtt 257  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  32373842 tttttcaaaaaattcagtt 32373860  T

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Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 42 - 282
Target Start/End: Original strand, 36012314 - 36012556
Alignment:
Q  42 agtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactcta-tttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaa 140  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || | |||| |||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||    
T  36012314 agtgtaacatcccacaaaatgtaacacttaagactatcaaatgatatcagcaactcttgtttccatgttaaagatgccaacgataaaatagtaccgataa 36012413  T
Q  141 gtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaa-ttaact 239  Q
    ||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||||||    
T  36012414 gtccaaaatgctgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaataaatcaaacattaaaattaaaatttaact 36012513  T
Q  240 ttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactccc 282  Q
    |||||||||||||||||| | | |||||| ||||||| |||||    
T  36012514 ttttcaaaaaagtcagtttcatgactgcaccgtagaagctccc 36012556  T

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Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 39 - 248
Target Start/End: Original strand, 22451141 - 22451350
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    |||||||||||||||||   | ||||||| |||| ||||||  |||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  22451141 ttaagtgtaacaccccagtaagtgtaacatttaacactatcgtataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacaataaaatagtacatgt 22451240  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22451241 aagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattattattgatcattaatcagcaatcaaaaatttaaaaatgaatcgaacattaagatcaaaattaac 22451340  T
Q  239 tttttcaaaa 248  Q
    ||||||||||    
T  22451341 tttttcaaaa 22451350  T

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Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 39 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 24488965 - 24488719
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    |||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  | ||    
T  24488965 ttaagtgtaacacctcacaaggtgtaacacttaagactatcacacaatatcatcaactctatttgcatgttaaagatgccaacaataaaatagtgtcagt 24488866  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    ||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  24488865 aagttcaagatgttgcaagcattactagatgcattactattaatcatgaatcaataatcaataatttaaaaatgaatcaaacattaatattaaaattaac 24488766  T
Q  239 tttttcaa-aaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactcccaa 284  Q
    ||||| || |||||||| || ||| | | || ||||||| |||||||    
T  24488765 tttttaaataaaagtcaatttcctcattacatcgtagaagctcccaa 24488719  T

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Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 63 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 22446044 - 22445839
Alignment:
Q  63 taacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaagattttgcaagcatta 162  Q
    ||||||| |||||||||| |||| |||||||||| | ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| || || ||||||| ||||    
T  22446044 taacactcaagactatcatataatatcatcaactatttttgcatattaaagataccaacgataaaatagtacctttaagtccaaaatgttgcaagtatta 22445945  T
Q  163 ctagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttcccta 262  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||     
T  22445944 ctggatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaatatgaatcaaacattaagatcataattaacttttccaaaaaagtcagtttcctg 22445845  T
Q  263 actgca 268  Q
    ||||||    
T  22445844 actgca 22445839  T

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Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 42 - 254
Target Start/End: Original strand, 25579915 - 25580127
Alignment:
Q  42 agtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaag 141  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| |||     
T  25579915 agtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactattacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaactgtacctataaa 25580014  T
Q  142 tcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttt 241  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||    
T  25580015 tctaagatattgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatccgcaatcaacaatttaaaaatgaaccaatcattaagattaagattaacttt 25580114  T
Q  242 ttcaaaaaagtca 254  Q
    || ||||||||||    
T  25580115 tttaaaaaagtca 25580127  T

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Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 39 - 219
Target Start/End: Original strand, 34133108 - 34133288
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34133108 ttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaattttgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgt 34133207  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaa 219  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  34133208 aagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactagtaatcatgaatcggtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaa 34133288  T

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Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 104 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 43975830 - 43975652
Alignment:
Q  104 catgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaat 203  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||    
T  43975830 catgttaaagatgccaacgataaaatagtacttgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaat 43975731  T
Q  204 ttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactccc 282  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||  || |||||| |||||||||||||    
T  43975730 ttaaaaatgaatcgaacattaagatcaagattaattttttcaaaagagtcagttttctgactgcaccgtagaaactccc 43975652  T

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Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 78 - 282
Target Start/End: Original strand, 29099558 - 29099763
Alignment:
Q  78 tcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattacta 177  Q
    |||||| | |||| ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  29099558 tcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgctaacgataaaatagtacctttaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattacca 29099657  T
Q  178 ttgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttc-aaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaa 276  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| | | |||||| |||||||    
T  29099658 ttgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaatattaaaattaactttttcaaaaaaagtcagtttcatgactgcaccgtagaa 29099757  T
Q  277 actccc 282  Q
     |||||    
T  29099758 gctccc 29099763  T

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Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 61 - 254
Target Start/End: Original strand, 40936168 - 40936361
Alignment:
Q  61 tgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaagattttgcaagcat 160  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || | ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||    
T  40936168 tgtaacacttaagactatcacatgatattagcaactccgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgcaagtctaagatgttgcaagcat 40936267  T
Q  161 tactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtca 254  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  40936268 tactagataaattactattgatcattaatcggtaatcaacaatttaaaaataaatcaatcattaagattgaaattaactttttcaaaaaagtca 40936361  T

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Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 74 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 44186485 - 44186309
Alignment:
Q  74 actatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaagattttgcaagcattactagatgaatt 173  Q
    |||||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  44186485 actatcacatgatatcaacaactctgtttgcatgttaaagatgccaatgataaaatagtacctctaagtctaagatgttgcaagcattactagataaatt 44186386  T
Q  174 actattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaa 250  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  44186385 actattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacattttcgaaaaa 44186309  T

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Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 70 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 51212743 - 51212535
Alignment:
Q  70 taagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaagattttgcaagcattactagatg 169  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  51212743 taaggctatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatg 51212644  T
Q  170 aattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttccctaactgcag 269  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||     
T  51212643 aattactattgatcattaattaaaaatcaacaatttaaaaatgaa------attaagatcaaaattaactttttcaaaaatgtcagttttctgactgcac 51212550  T
Q  270 cgtagaaactcccaa 284  Q
    | ||||| |||||||    
T  51212549 catagaagctcccaa 51212535  T

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Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 63 - 292
Target Start/End: Original strand, 21193803 - 21194032
Alignment:
Q  63 taacacttaa-gactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaagattttgcaagcatt 161  Q
    |||||||||| |||||||| || | |||| ||||||| ||||||||||||||||    |||||||||||||| | ||||||  ||||| |||||| ||||    
T  21193803 taacacttaaagactatcatatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagattctcacgataaaatagtagccgtaagttcaagatgttgcaaccatt 21193902  T
Q  162 actagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttccct 261  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  21193903 actaaatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcat 21194002  T
Q  262 aactgcagcgtagaaactcccaataaaataa 292  Q
     |||||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  21194003 gactgcaccgtagaagctccc-ataaaataa 21194032  T

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Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 63 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 4761627 - 4761438
Alignment:
Q  63 taacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaagattttgcaagcatta 162  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  | || |||||||||||||| |||||| || || |||||| |||||    
T  4761627 taacacttaagactatcacataatatcatcaactatatttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctataagtccaaaatgttgcaaacatta 4761528  T
Q  163 ctagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagt 252  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  4761527 ccagatgaattactattaatcattaatcagaaatcaacaatttgaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttaaaaaaagt 4761438  T

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Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 40 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 46994663 - 46994490
Alignment:
Q  40 taagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgta 139  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||||| |||||||  | || |||||||||||||||||    
T  46994663 taagtgtaacgccccacaaaatgtaacacttaagactatcacataatatcatcaattatgtttgcatgctaaagattccgacaataaaatagtacctgta 46994564  T
Q  140 agtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatga 213  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  46994563 agtccaagatattgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagaaatcaacaatttaaaaatga 46994490  T

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Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 87 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 14586634 - 14586465
Alignment:
Q  87 atcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcatt 186  Q
    |||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  14586634 atcaacaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacg-gtaagtccaagatgttgcaagcattactagataaattactactgatcatt 14586536  T
Q  187 aatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtt 257  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  14586535 aatcagtaatcaacaatttaaaaataaatcaaacattaagattaaaattaattttttcaaaaaagtcagtt 14586465  T

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Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 45 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 3655199 - 3654984
Alignment:
Q  45 gtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtca 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||||||  || ||||||||||  || | ||||||     
T  3655199 gtaacacaccacaaaatgtaacacttaaaactatcacatgatatcatcagctctgtttgcatgttaaagattccatcgataaaataacacatataagtcc 3655100  T
Q  145 aagattttgcaagcattactag--atgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaat-gaatcaaacattaagatcaaaattaacttt 241  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  3655099 aagatgttgcaagcattactagatatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaataaaatcaaacattaaaatcaaaattaacatt 3655000  T
Q  242 ttcaaaaaagtcagtt 257  Q
    ||||||||| ||||||    
T  3654999 ttcaaaaaaatcagtt 3654984  T

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Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 39 - 282
Target Start/End: Original strand, 11466997 - 11467226
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||  |||||| |||||||||||||     
T  11466997 ttaagtgtaataccccacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcaacaactctgtttgcatgtttaagataccaacgacaaaatagtacctgc 11467096  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    ||||| ||||| ||||||       |||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||    
T  11467097 aagtctaagatgttgcaa-------tagatgaattactattgatcattaatc-------aacaatttaaaaatgaatcaatcattaagaataaaattaac 11467182  T
Q  239 tttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactccc 282  Q
    |||||||||||||||||||   | |||||| ||||||| |||||    
T  11467183 tttttcaaaaaagtcagtttgatgactgcaccgtagaagctccc 11467226  T

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Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 52 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 11357140 - 11356925
Alignment:
Q  52 cccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaagattt 151  Q
    |||||| | ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||  ||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||  |||||||| ||||| |    
T  11357140 cccacaaagtgtaacactcaagactatcatataatatcatcaactctggttgtatgttaaatatgccaatgataaaatagtatttgtaagtccaagatgt 11357041  T
Q  152 tgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaag 251  Q
    |||||||||||        ||||||||| ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11357040 tgcaagcatta--------attactattcatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatccaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaag 11356949  T
Q  252 tcagttccctaactgcagcgtaga 275  Q
    ||||||  || |||||| ||||||    
T  11356948 tcagttgtctgactgcaccgtaga 11356925  T

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Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 41 - 219
Target Start/End: Original strand, 38591873 - 38592051
Alignment:
Q  41 aagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaa 140  Q
    |||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  |||||    
T  38591873 aagtgtaataccccacaaaacgtgacacttaagactatcacataatatcatcaaatctatttgcatgtcaaagatgacaacgataaaaaagtatttgtaa 38591972  T
Q  141 gtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaa 219  Q
     || ||||| |||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  38591973 atccaagatgttgcaagcattattaaacaaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaa 38592051  T

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Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 78 - 257
Target Start/End: Original strand, 29164021 - 29164193
Alignment:
Q  78 tcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattacta 177  Q
    |||||| | |||| ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  29164021 tcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgctaacgataaaatagtacttgtaagtctaagatgttacaagcattactagatgaattacta 29164120  T
Q  178 ttgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtt 257  Q
    |||||||||||||       |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||    
T  29164121 ttgatcattaatc-------aacaatttaaaaataaatcaaacattaagattaaaattaacttttttagaaaagtcagtt 29164193  T

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Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 61 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 20373225 - 20373037
Alignment:
Q  61 tgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaagattttgcaagcat 160  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||| |||||               
T  20373225 tgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatataagtccaagat----------- 20373137  T
Q  161 tactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttccc 260  Q
            ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20373136 --------gaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcc 20373045  T

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Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 76 - 247
Target Start/End: Original strand, 50475021 - 50475199
Alignment:
Q  76 tatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattac 175  Q
    ||||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  50475021 tatcatataatatcatcaaatctgtttgcatattaaagatgtcaaggataaaataatacttgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattag 50475120  T
Q  176 tattg-------atcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaa 247  Q
    |||||       ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  50475121 tattgatcattaatcattaatcagtaatcaataatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaaatttttcaaa 50475199  T

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Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 40 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 54828703 - 54828547
Alignment:
Q  40 taagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgta 139  Q
    ||||||||||| |||||| | |||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| | |||| |||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||    
T  54828703 taagtgtaacatcccacaaagtgtaacacttaaaactatcaaataatatcatcaactatgtttgtatgttaaaaattccaactataaaatagtacatgta 54828604  T
Q  140 agtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataat 196  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  54828603 agtccaagatgttgcaagcattactagataaattactattgatcattaatcagtaat 54828547  T

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Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 61 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 27480347 - 27480150
Alignment:
Q  61 tgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctat----ttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaagattttg--- 153  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || ||        
T  27480347 tgtaacacttaagactatcgcataatatcatcaactatatatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaaaatgttaatt 27480248  T
Q  154 -caagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaa 250  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||   || ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  ||||| ||||||    
T  27480247 acaaacattactagatgaattactattgattattaatcagcgatcaacaatttaaaaatgaatcgaacattaagaacaaaattatatttttaaaaaaa 27480150  T

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Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 39 - 172
Target Start/End: Original strand, 43348430 - 43348563
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    |||||||||||| |||| | | ||| ||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  43348430 ttaagtgtaacatcccataaagtgtgacacttaagactatcacatgatatcaacaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacttgt 43348529  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaat 172  Q
    ||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  43348530 aagtttaagatgttgcaagcattactaaatgaat 43348563  T

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Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 39 - 181
Target Start/End: Original strand, 45174679 - 45174821
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    ||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||| | || | |||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | ||    
T  45174679 ttaagtgtaacactctacaaagtgtaacacttaagactataatatgatatcagcaactctgtttccatgttaaagatgccaacgataaaatagtaacggt 45174778  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattga 181  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45174779 aagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattga 45174821  T

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Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 39 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 11835630 - 11835494
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    |||||||||||| || ||| | ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||      |||| |||||||||||||||  |||    
T  11835630 ttaagtgtaacaacctacaaagtgtaacaattaagactatcacatgatatcatcaactctatttgcatg------atgttaacgataaaatagtatttgt 11835537  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattga 181  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  11835536 aagtccaagatgttgcaaacattactaaatgaattactattga 11835494  T

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Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 71 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 53811701 - 53811597
Alignment:
Q  71 aagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaagattttgcaagcattactagatga 170  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||    |||||||||||||||  ||||||||||||| |||  ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  53811701 aagactatcacataatatcatcaact----ttgcatgttaaagataccaacgataaaataatactcgtaagtccaagatgttgcaggcattcctagatga 53811606  T
Q  171 attactatt 179  Q
    |||||||||    
T  53811605 attactatt 53811597  T

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Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 198 - 283
Target Start/End: Original strand, 35844579 - 35844664
Alignment:
Q  198 aacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactccca 283  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||| || ||||||    
T  35844579 aacaatttaaaaataaatcaaacattaaaattaaaattaactttttcaaaaaagtcaatttcataactgcaccgtaaaagctccca 35844664  T

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Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 220 - 281
Target Start/End: Original strand, 34133312 - 34133373
Alignment:
Q  220 cattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactcc 281  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| ||||    
T  34133312 cattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcctaactgcaccttagaagctcc 34133373  T

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Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 121
Target Start/End: Original strand, 35844500 - 35844581
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaac 121  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||| | ||||  |||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  35844500 ttaagtgtaacaccctacaaagtgtaacacttaaga-tatcacatgatatcagtaactttgtttccatgttaaagatgtcaac 35844581  T

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Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 208 - 250
Target Start/End: Original strand, 43348556 - 43348598
Alignment:
Q  208 aaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaa 250  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43348556 aaatgaatcaatcattaagattaaaattaactttttcaaaaaa 43348598  T

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Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 40
Target Start/End: Original strand, 2777808 - 2777841
Alignment:
Q  7 catgtcgactgtgtgtgaaccctttcatattgtt 40  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2777808 catgtcgactgtgtgtgaaccctttcatattgtt 2777841  T

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Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 40
Target Start/End: Complemental strand, 15196404 - 15196371
Alignment:
Q  7 catgtcgactgtgtgtgaaccctttcatattgtt 40  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15196404 catgtcgactgtgtgtgaaccctttcatattgtt 15196371  T

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Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 102
Target Start/End: Original strand, 53176234 - 53176290
Alignment:
Q  46 taacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctattt 102  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||    
T  53176234 taacactccacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctattt 53176290  T

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Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 227 - 282
Target Start/End: Original strand, 38592046 - 38592101
Alignment:
Q  227 atcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactccc 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||| ||| |||||    
T  38592046 atcaaaattaactttttcaaaaaagtcaatttcttaactgcaccgttgaagctccc 38592101  T

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Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 37
Target Start/End: Original strand, 9157301 - 9157331
Alignment:
Q  7 catgtcgactgtgtgtgaaccctttcatatt 37  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9157301 catgtcgactgtgtgtgaaccctttcatatt 9157331  T

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Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 211 - 257
Target Start/End: Original strand, 45174819 - 45174865
Alignment:
Q  211 tgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtt 257  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||    
T  45174819 tgaattaaacattaaaattaaaattaactttttcaaaaaagccagtt 45174865  T

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Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 40
Target Start/End: Original strand, 10883809 - 10883842
Alignment:
Q  7 catgtcgactgtgtgtgaaccctttcatattgtt 40  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10883809 catgtcgattgtgtgtgaaccctttcatattgtt 10883842  T

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Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 36
Target Start/End: Complemental strand, 36533906 - 36533877
Alignment:
Q  7 catgtcgactgtgtgtgaaccctttcatat 36  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36533906 catgtcgactgtgtgtgaaccctttcatat 36533877  T

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Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 40
Target Start/End: Original strand, 47053754 - 47053787
Alignment:
Q  7 catgtcgactgtgtgtgaaccctttcatattgtt 40  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47053754 catgtcgactatgtgtgaaccctttcatattgtt 47053787  T

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Target: chr2 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 53)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 41 - 284
Target Start/End: Original strand, 41961024 - 41961267
Alignment:
Q  41 aagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaa 140  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  41961024 aagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagattatcacataatatcatcaaatcggtttgcatgttaaagatgccaacgataaaataatacctgtaa 41961123  T
Q  141 gtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactt 240  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41961124 gtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactt 41961223  T
Q  241 tttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactcccaa 284  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||||| ||||||| |||||||    
T  41961224 tttcaaaaaattcagtttcctgactgcaccgtagaagctcccaa 41961267  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 44 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 19289339 - 19289099
Alignment:
Q  44 tgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtc 143  Q
    ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||  | || |||||||| ||||||||||||    
T  19289339 tgtaacatcccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtgtgcatgttaaagattccgacaataaaataatacctgtaagtc 19289240  T
Q  144 aaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttt 243  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19289239 caagatattgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagaaattaacaatttaaaaatgaattaaacattaagatcaaaattaacttttt 19289140  T
Q  244 caaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactcccaa 284  Q
    |||||||||||||| |||||||||| | ||||| |||||||    
T  19289139 caaaaaagtcagtttcctaactgcaccatagaagctcccaa 19289099  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 46 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 11366395 - 11366165
Alignment:
Q  46 taacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaa 145  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11366395 taacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctatttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacctgtaagtcca 11366296  T
Q  146 agattttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttc 244  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  11366295 agatgttgcaagcattactagatgaatatactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaactttttc 11366196  T
Q  245 aaaaaagtcagttccctaactgcagcgtaga 275  Q
    |||||| ||| ||  || |||||| ||||||    
T  11366195 aaaaaaatcaattttctgactgcaccgtaga 11366165  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 41 - 282
Target Start/End: Original strand, 4763815 - 4764057
Alignment:
Q  41 aagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaa 140  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  4763815 aagtgtagcaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaattctttttgcatgttaaagatgctaacgataaaatagtacctgtaa 4763914  T
Q  141 gtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac-t 239  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  4763915 gtccaagatattgcaagcattactagttgaattactattgatcattaatcagtaatcaataatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactt 4764014  T
Q  240 ttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactccc 282  Q
    ||||  |||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||    
T  4764015 ttttttaaaaagtcagtttccttactgcaccgtagaagctccc 4764057  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 40 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 43648265 - 43648024
Alignment:
Q  40 taagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgta 139  Q
    ||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||||| || ||||    
T  43648265 taagtgtaacaccacacaaagtataacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttccatgttaaagatttcaacgataaaatagcacttgta 43648166  T
Q  140 agtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaact 239  Q
    |||| ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43648165 agtccaagatgtcgcaaacattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaact 43648066  T
Q  240 ttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactcc 281  Q
    ||||||||||||||| || ||| |||||| ||||||| ||||    
T  43648065 ttttcaaaaaagtcaatttcctgactgcaccgtagaagctcc 43648024  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 39 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 2325399 - 2325156
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  2325399 ttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaatttgtttgcatgttaaagattacaacgataaaatagtacctgt 2325300  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2325299 aaatccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaataaatcaaacattaagatcaaaattaac 2325200  T
Q  239 tttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactccc 282  Q
    ||||| |||||| ||| ||  || |||||| ||||||| |||||    
T  2325199 tttttaaaaaaaatcaattttctgactgcaccgtagaagctccc 2325156  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 39 - 276
Target Start/End: Original strand, 3177121 - 3177358
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  3177121 ttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaactataaaatagtacatgt 3177220  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | |||| |||||||| ||||| ||||||||||||| || |||| ||||    
T  3177221 aagtccaagatattacaagcattactagatgaattactatttatcatgaataagtaatcaacaatttgaaaataaatcaaacattaaaattaaaagtaac 3177320  T
Q  239 tttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaa 276  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||    
T  3177321 tttttcaaaaaagtcagtttcctgactgcaccgtagaa 3177358  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 39 - 282
Target Start/End: Original strand, 4167104 - 4167347
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  4167104 ttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactatgtttgtatgttaaagatgtcaacgataaaataatatttgt 4167203  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  4167204 aagtccaagatgttgcaagcattactggatgaattactattaatcatgaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaagattaaaattaac 4167303  T
Q  239 tttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactccc 282  Q
    |||||||||||||||| ||  || |||||| ||||||| |||||    
T  4167304 tttttcaaaaaagtcaattttctgactgcaccgtagaagctccc 4167347  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 39 - 282
Target Start/End: Original strand, 41465683 - 41465926
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    |||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  41465683 ttaagtgtaacacctcagaaagtgtaacacttaagactatcgcataatatcatcaattatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgt 41465782  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  41465783 aagtccaagatgttgcaaacattactatatgaattactattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaattgaatcgaacattaagatcaaaattaac 41465882  T
Q  239 tttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactccc 282  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| | || ||||||||    
T  41465883 tttttcaaaaaagtcagttttctaactgcaccatataaactccc 41465926  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 41 - 282
Target Start/End: Original strand, 26357761 - 26358002
Alignment:
Q  41 aagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaa 140  Q
    |||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||||||||| || ||||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||    
T  26357761 aagtgtaacatcccacaaattgtaacacttaaaactatcacataatattatcaaatgtgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatttttaa 26357860  T
Q  141 gtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactt 240  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26357861 gtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactt 26357960  T
Q  241 tttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactccc 282  Q
    ||| |||||||||| ||  |||||||||  |||||| |||||    
T  26357961 ttttaaaaaagtcaattttctaactgcaatgtagaagctccc 26358002  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 39 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 33709253 - 33709036
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    ||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||| ||| | |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  33709253 ttaagtgtaacaccctacaaagtgtcacacttaagactatcgcatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaatgataaaatagtacttgt 33709154  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  33709153 aaatccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcattaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaac 33709054  T
Q  239 tttttcaaaaaagtcagt 256  Q
    |||||||||||| |||||    
T  33709053 tttttcaaaaaattcagt 33709036  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 40 - 254
Target Start/End: Original strand, 35959079 - 35959289
Alignment:
Q  40 taagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgta 139  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||     
T  35959079 taagcgtaacaccccacaaagtgtaacagttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacatgt- 35959177  T
Q  140 agtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaact 239  Q
       | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35959178 ---ccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaact 35959274  T
Q  240 ttttcaaaaaagtca 254  Q
    |||||||||||||||    
T  35959275 ttttcaaaaaagtca 35959289  T

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Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 39 - 276
Target Start/End: Original strand, 44913845 - 44914086
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacacccc-acataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctg 137  Q
    |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  44913845 ttaagtgtaacacccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatg 44913944  T
Q  138 taagtcaaagattttgcaagcattactag---atgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaat 234  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| |||   ||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44913945 taagtccaagatgttgcaagcattattagaaaatgaattactattaatcatgaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaat 44914044  T
Q  235 taactttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaa 276  Q
    ||||||||||||||||  |||||  || |||||| |||||||    
T  44914045 taactttttcaaaaaaaccagtttgctgactgcaccgtagaa 44914086  T

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Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 61 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 7006937 - 7006744
Alignment:
Q  61 tgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaagattttgcaagcat 160  Q
    |||||||||||||| |||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  7006937 tgtaacacttaagaatatcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacttgtaagtccaagatgttgcaagcat 7006838  T
Q  161 tactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtca 254  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7006837 tactagatgaatttctattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattatgattaaaattaactttttcaaaaaagtca 7006744  T

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Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 39 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 31570755 - 31570518
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| | |||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  31570755 ttaagtgtaacaccccacaaaatgtaacacttaagactgtcacatgatatcaacaactctgtttacatgttaaagatgccaacgataaaatagtacttgt 31570656  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    ||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||    
T  31570655 aagtttaagatgttgcaagcattgctagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaaatatttaaaaatgaatcaatcattaaaatgaaaattaac 31570556  T
Q  239 tttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaa 276  Q
    ||||| ||||||||||||| | | ||||||| ||||||    
T  31570555 tttttaaaaaaagtcagtttcatgactgcagtgtagaa 31570518  T

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Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 65 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 18494276 - 18494084
Alignment:
Q  65 acacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaagattttgcaagcattact 164  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  18494276 acacttaagactatcacatgatatcaacgactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgtaagcattact 18494177  T
Q  165 agatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtt 257  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18494176 agatgaattgctattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcagtt 18494084  T

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Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 52 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 19500923 - 19500724
Alignment:
Q  52 cccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaagattt 151  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |  ||||| |    
T  19500923 cccacaaaatgtaacacttaagactatcacataatattatcaactctatttacatgttaaagatgttaacgataaaatagtacatgtaatttcaagatgt 19500824  T
Q  152 tgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaag 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  19500823 tgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaatattaagatcaaaatt-attttttcaaaaaag 19500725  T

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Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 87 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 33660350 - 33660155
Alignment:
Q  87 atcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcatt 186  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33660350 atcagcaactttgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtatctgtaagtctgagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcatt 33660251  T
Q  187 aatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactccc 282  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| | | |||||| ||||||| |||||    
T  33660250 aatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaactttttcagaaaagtcagtttcatgactgcaccgtagaagctccc 33660155  T

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Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 40 - 282
Target Start/End: Original strand, 31862035 - 31862277
Alignment:
Q  40 taagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgta 139  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||||||| | |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||  | || |||||||||||| ||||    
T  31862035 taagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaaattatcacataatatcatcaagtctgtttgcatgttaaggattccgacaataaaatagtacttgta 31862134  T
Q  140 agtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaact 239  Q
    |||| ||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31862135 agtccaagatattgtagacattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacgatttaaaaatgaatcaaatattaagatcaaaattaact 31862234  T
Q  240 ttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactccc 282  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||||| | ||||| |||||    
T  31862235 ttttcaaaaaagtcagtttcccgactgcaccatagaagctccc 31862277  T

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Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 39 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 29242159 - 29241923
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29242159 ttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacctaagactatcacataatatcatcaactctggttgtatgttaaagatgtcaacgatacaatagtacctgt 29242060  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    ||||| |||||       | ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29242059 aagtccaagat-------gaattactagatgaattactattgaacattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcataattaac 29241967  T
Q  239 tttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactccc 282  Q
    |||| ||||||  |||||| ||| |||||| | ||||| |||||    
T  29241966 ttttccaaaaagttcagtttcctgactgcaccatagaagctccc 29241923  T

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Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 74 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 39167355 - 39167172
Alignment:
Q  74 actatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaagattttgcaagcattactagatgaatt 173  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  | |||| ||||||||||||||||||    
T  39167355 actatcacataatatcatcaactctgtttgtatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaaattgttgctagcattactagatgaatt 39167256  T
Q  174 actattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtt 257  Q
    |||||| || || ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39167255 actattaattatgaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcagtt 39167172  T

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Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 39 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 19424649 - 19424414
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||||||              ||||||||     
T  19424649 ttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacatttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagat--------------agtacctgc 19424564  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  19424563 aagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaatcattaagattaaaattaac 19424464  T
Q  239 tttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactcccaataaa 288  Q
    |||||||||||||||||||   | |||||| ||||||| |||||| ||||    
T  19424463 tttttcaaaaaagtcagtttgatgactgcaccgtagaagctcccattaaa 19424414  T

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Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 100 - 257
Target Start/End: Original strand, 5881772 - 5881929
Alignment:
Q  100 tttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||    
T  5881772 tttgcatgttaaagatgtcaacaataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattattcagtaatcaa 5881871  T
Q  200 caatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtt 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  5881872 caatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcataaaaatcagtt 5881929  T

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Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 51 - 254
Target Start/End: Original strand, 37905904 - 37906108
Alignment:
Q  51 ccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaagatt 150  Q
    ||||||| | |||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||  || |||||||| |||||     
T  37905904 ccccacaaagtgtaacacttaaaactatcgcataatatcattaactctgtttgcatgttaaagattccaatgataaaataacacatgtaagtccaagatg 37906003  T
Q  151 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatg-aatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaa 249  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  37906004 ttgcaagaattactggatgaattactattgatcattaatcagtaattaacaatttaaaaatgaaatcaaacattaaaatcaaaattaattttttcaaaaa 37906103  T
Q  250 agtca 254  Q
    |||||    
T  37906104 agtca 37906108  T

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Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 78 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 43770830 - 43770651
Alignment:
Q  78 tcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattacta 177  Q
    |||||| | |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || |||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  43770830 tcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacaataaaatagtatctttaagttcaagatgttgcaagcattactagatgaatttcta 43770731  T
Q  178 ttgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtt 257  Q
    |||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43770730 ttgatcattaattagaaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcagtt 43770651  T

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Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 39 - 276
Target Start/End: Original strand, 13711641 - 13711878
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    ||||||||||||||||| | | | ||| | |||||||||| |||| | |||| ||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  13711641 ttaagtgtaacaccccataaagtataatagttaagactatgacatgatatcagcaactctgtatgcatgttaaagatgccagcgataaaatagtacctgt 13711740  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    ||||| ||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||| | || ||||||||     
T  13711741 aagtctaagatgttgcaaacaatactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacgatttaaaaatgaatcaatcatttaaattaaaattaat 13711840  T
Q  239 tttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaa 276  Q
    ||||||||||||| || ||   |||||||| |||||||    
T  13711841 tttttcaaaaaagacaattttataactgcaccgtagaa 13711878  T

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Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 39 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 33551007 - 33550800
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| |  |||| |||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||     
T  33551007 ttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagacta-cgtataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacttga 33550909  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattga----tcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaat 234  Q
    ||||| || || |||||||||||||||||||||| ||||||||    | ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33550908 aagtccaatatgttgcaagcattactagatgaataactattgattatttattaaccagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaat 33550809  T
Q  235 taacttttt 243  Q
    |||||||||    
T  33550808 taacttttt 33550800  T

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Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 93 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 27349915 - 27349731
Alignment:
Q  93 aactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaa 192  Q
    |||||| |||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27349915 aactctgtttgcaagttaaagattccaacgataaaatagtatctgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 27349816  T
Q  193 taattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactccc 282  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||     | |||||||||||||||| ||||||||||| | | ||||||  |||||| |||||    
T  27349815 taatcaacaatttaaaaatgaatcaaatat-----ttaaaattaactttttcagaaaagtcagtttcatgactgcactgtagaagctccc 27349731  T

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Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 39 - 191
Target Start/End: Original strand, 44286131 - 44286283
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| | ||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||    
T  44286131 ttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcaacaactttgtttgcatgttaaatatgctaacgataaaatagtatctgt 44286230  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatca 191  Q
    ||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44286231 aagtctaagatgttgcaagcattgttagatgaattactattgatcattaatca 44286283  T

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Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 39 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 4264098 - 4263926
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatca-cataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctg 137  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |     
T  4264098 ttaagtttaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcaacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacaataaaatagtacata 4263999  T
Q  138 taagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaa 210  Q
    |||||  ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||    
T  4263998 taagttcaagatgttgcaagcattactagatgaaataatattgatcattgatcagtaatcaacaatttaaaaa 4263926  T

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Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 61 - 209
Target Start/End: Original strand, 4478569 - 4478717
Alignment:
Q  61 tgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaagattttgcaagcat 160  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | |||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||    
T  4478569 tgtaacacttaagtctatcacatgatatcaccaactctgtttccatgttaaagatgccaatgataaaatagtatcggtaagtccaagatgttgcaagcat 4478668  T
Q  161 tactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaa 209  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  4478669 tactagatgaattgctattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaa 4478717  T

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Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 100 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 41051259 - 41051112
Alignment:
Q  100 tttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaa 199  Q
    ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||    
T  41051259 tttgcatgttaaa-atgccaaggataaaatagtacctgtaagttcaagatgttgtaagcattgctagatgaattgttattgatcattaatcaataatcaa 41051161  T
Q  200 caatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaa 248  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  41051160 caattcaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaattttttcaaaa 41051112  T

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Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 130 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 41463520 - 41463400
Alignment:
Q  130 agtacctgtaagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatc 229  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||     
T  41463520 agtacctctaagtctaagatgttgtaaacattaatagataaattactattgatcattaatcaataattaataatttaaaaatgaatcaatcattaagatt 41463421  T
Q  230 aaaattaactttttcaaaaaa 250  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  41463420 aaaattaactttttaaaaaaa 41463400  T

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Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 39 - 196
Target Start/End: Original strand, 19314033 - 19314186
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||       ||||||| | |||| ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  19314033 ttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacact-------atcacatgatatcagcaactatgtttgcatgttaaagatgtcagcgataaaatagtacatgt 19314125  T
Q  139 ---aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataat 196  Q
       ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19314126 tataagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaat 19314186  T

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Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 39 - 162
Target Start/End: Original strand, 45327902 - 45328025
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    |||||||||||||| || | | |||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  45327902 ttaagtgtaacacctcagaaagtgtaacacataagactatcgcataatatcataaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgt 45328001  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcatta 162  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||    
T  45328002 aagtccaagatgttgcaagcatta 45328025  T

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Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 39 - 162
Target Start/End: Original strand, 36642170 - 36642293
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| | | || ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  36642170 ttaagtgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacatgataccagcaactctgtttccatgttaaagatgccaacgataaaatagtaccggt 36642269  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcatta 162  Q
    ||||  ||||| ||||||||||||    
T  36642270 aagttcaagatgttgcaagcatta 36642293  T

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Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 39 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 17071758 - 17071648
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  17071758 ttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaatttgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgt 17071659  T
Q  139 aagtcaaagat 149  Q
    || || |||||    
T  17071658 aaatccaagat 17071648  T

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Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 145 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 18257453 - 18257316
Alignment:
Q  145 aagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttc 244  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||| ||  ||||| || |||||||||||||||    
T  18257453 aagatgttgcaagcattactagatgaattattatttatcattaatcagtaatcgacaattttaaaatgaataaattattaatattaaaattaactttttc 18257354  T
Q  245 aaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactccc 282  Q
    | |||||||||||   |||||||| |||| ||||||||    
T  18257353 acaaaagtcagtttgataactgcaccgtataaactccc 18257316  T

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Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 39 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 18258308 - 18258197
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||     
T  18258308 ttaagtgtaacaccccataaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctctttgcatgttaaagatcccaacgataaaatagtaactgc 18258209  T
Q  139 aagtcaaagatt 150  Q
    ||||| ||||||    
T  18258208 aagtctaagatt 18258197  T

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Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 160 - 250
Target Start/End: Original strand, 33902317 - 33902407
Alignment:
Q  160 ttactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaa 250  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33902317 ttactagatgaattattattgattattaatctgtaatcaacaatttaaaaataaatcaaacattaagatcaaaattaacttttttaaaaaa 33902407  T

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Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 41463871 - 41463779
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatag 131  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41463871 ttaattgtaacacctcacaaaatgtaacatttaagactatcacatgatatcaacaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatag 41463779  T

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Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 198 - 282
Target Start/End: Original strand, 45328031 - 45328114
Alignment:
Q  198 aacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactccc 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||| |||||    
T  45328031 aacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtt-tctgactgcaccgtagaagctccc 45328114  T

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Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 39 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 17054117 - 17054007
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    ||||| ||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||||||| | | |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  17054117 ttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaanactatcacataatatcatcaaatttgtttgcatgttaaaggttccaacgataaaatagtacctgt 17054018  T
Q  139 aagtcaaagat 149  Q
    || || |||||    
T  17054017 aaatccaagat 17054007  T

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Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 4263756 - 4263687
Alignment:
Q  213 aatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactccc 282  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||| | | |||| | |||||||||||||    
T  4263756 aatcaaacattaagattaaaattaactttttaaaaaaaatcagtttcatgactgtatcgtagaaactccc 4263687  T

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Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 40
Target Start/End: Complemental strand, 1504524 - 1504491
Alignment:
Q  7 catgtcgactgtgtgtgaaccctttcatattgtt 40  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1504524 catgtcgactgtgtgtgaaccctttcatattgtt 1504491  T

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Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 40
Target Start/End: Complemental strand, 9186550 - 9186517
Alignment:
Q  7 catgtcgactgtgtgtgaaccctttcatattgtt 40  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9186550 catgtcgactgtgtgtgaaccctttcatattgtt 9186517  T

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Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 186 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 17054005 - 17053960
Alignment:
Q  186 taatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaa 231  Q
    |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17054005 taatcagtaatcaacaatgtaaaaatgaatcaaacattaagatcaa 17053960  T

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Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 186 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 17071646 - 17071601
Alignment:
Q  186 taatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaa 231  Q
    |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17071646 taatcagtaatcaacaatgtaaaaatgaatcaaacattaagatcaa 17071601  T

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Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 40
Target Start/End: Complemental strand, 31428644 - 31428611
Alignment:
Q  7 catgtcgactgtgtgtgaaccctttcatattgtt 40  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31428644 catgtcgactgtgtgtgaaccctttcatattgtt 31428611  T

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Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 40
Target Start/End: Original strand, 45456094 - 45456126
Alignment:
Q  8 atgtcgactgtgtgtgaaccctttcatattgtt 40  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45456094 atgtcgactgtgtgtgaaccctttcatattgtt 45456126  T

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Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 39 - 110
Target Start/End: Original strand, 33902248 - 33902319
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgtta 110  Q
    ||||| ||| ||||||||| | |||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||    
T  33902248 ttaagggtagcaccccacaaagtgtaacacttaatagtatcacataatatcattaactctgtttccatgtta 33902319  T

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Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 36
Target Start/End: Original strand, 24237347 - 24237376
Alignment:
Q  7 catgtcgactgtgtgtgaaccctttcatat 36  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24237347 catgtcgactgtgtgtgaaccctttcatat 24237376  T

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Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 36
Target Start/End: Complemental strand, 25957570 - 25957541
Alignment:
Q  7 catgtcgactgtgtgtgaaccctttcatat 36  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25957570 catgtcgactgtgtgtgaaccctttcatat 25957541  T

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Target: chr4 (Bit Score: 170; Significance: 3e-91; HSPs: 61)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 39 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 25701086 - 25700841
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaaca-ccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctg 137  Q
    |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |    
T  25701086 ttaagtgtaacatccccacaaagtgtaacacttaagattatcacataacatcatcaactttgtttgcatgttaaagaagtcaacgataaaatagtatccg 25700987  T
Q  138 taagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaa 237  Q
    ||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25700986 taaatctaagattttgcaagcattgttagatgaattactattgatcattaatcaataatgtacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaa 25700887  T
Q  238 ctttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactccca 283  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||    
T  25700886 ctttttcaaaaaagtcaatttcctaactgcaccgtagaaactccca 25700841  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 39 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 28003015 - 28002772
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    ||||||||||||||||| | | |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28003015 ttaagtgtaacaccccagaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgt 28002916  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    ||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28002915 aagtccaagatgttgctaacattactagatgaattactattgatcattaatcaacaatcaacaatttaaaaatgaatcgaacattaagatcaaaattaac 28002816  T
Q  239 tttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactccc 282  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||    
T  28002815 tttttcaaaaaagtcagtttcctgactgcagtgtagaagctccc 28002772  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 63 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 7152209 - 7152015
Alignment:
Q  63 taacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaagattttgcaagcatta 162  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7152209 taacacttaatactatcacataacatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagattttgcaagcatta 7152110  T
Q  163 ctagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtt 257  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  7152109 ttagatgaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaaataactttttcaaaaaagtcagtt 7152015  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 41 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 33816543 - 33816302
Alignment:
Q  41 aagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaa 140  Q
    |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  33816543 aagtgtaataccccacaaagtgtaacacttaagactatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagttcatgtaa 33816444  T
Q  141 gtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactt 240  Q
    ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33816443 gtccaagatgttgcaaacattactagatgaattactattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaatcgaacattaagatcaaaattaactt 33816344  T
Q  241 tttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactccc 282  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||    
T  33816343 tttcaaaaaagtcagtttcctgactgcatcgtagaagctccc 33816302  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 39 - 282
Target Start/End: Original strand, 17167895 - 17168138
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  17167895 ttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctatttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgt 17167994  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||     
T  17167995 aagtctaagatgttgcaagcatcactagatgaattactatttatcattaattagtaatcaataatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaagtaat 17168094  T
Q  239 tttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactccc 282  Q
    ||||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||||||    
T  17168095 tttttcaaaaaagtcagtttctttactgcaccgtagaaactccc 17168138  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 40 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 32912608 - 32912365
Alignment:
Q  40 taagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgta 139  Q
    |||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32912608 taagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctatttgtatgttaaagatttcaacgataaaatagtacctgta 32912509  T
Q  140 agtcaaagattttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||     
T  32912508 agtccaagatgttgcaagcattactagatgaatatactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaatgaat 32912409  T
Q  239 tttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactccc 282  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| || |||||    
T  32912408 tttttcaaaaaagtcagtttcctgactgcaccgtaaaagctccc 32912365  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 40 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 34361520 - 34361277
Alignment:
Q  40 taagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgta 139  Q
    |||| ||||||||| ||| | ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||    
T  34361520 taagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaaagctatcacataatatcatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctata 34361421  T
Q  140 agtcaaagattttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34361420 agtccaagatgttgcaagcattactagatgaatatactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaac 34361321  T
Q  239 tttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactccc 282  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||    
T  34361320 tttttcaaaaaagtcagtttcctgactgcaccgtagaagctccc 34361277  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 40 - 289
Target Start/End: Original strand, 6864218 - 6864467
Alignment:
Q  40 taagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgta 139  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  ||||    
T  6864218 taagcgtaacaccccacaaagtgtaatacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattacaacgataaaataatatttgta 6864317  T
Q  140 agtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaact 239  Q
    |||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6864318 agttcaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaact 6864417  T
Q  240 ttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactcccaataaaa 289  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||| ||||||| ||||||| ||||    
T  6864418 ttttcaaaaaagtcagttttctgactgcaccgtagaagctcccaacaaaa 6864467  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 39 - 276
Target Start/End: Original strand, 7703691 - 7703928
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7703691 ttaagtgtaacactccacaaagtgtcacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcacgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgt 7703790  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7703791 aagtcgaagatgttgcaagcattactagatgaattactatttatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaac 7703890  T
Q  239 tttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaa 276  Q
    ||||||||||||||||||| | | |||||| |||||||    
T  7703891 tttttcaaaaaagtcagtttcatgactgcaccgtagaa 7703928  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 39 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 36493717 - 36493475
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    |||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  36493717 ttaagtgtaa-actccacaaagtgtaacacttaagactaccacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatctgt 36493619  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36493618 aagtctaagatattgcaagcattactcgatgaattactattgatcattaatccgtaattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcataattaac 36493519  T
Q  239 tttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactccc 282  Q
    |||||||||||||||| || ||| |||||| | ||||| |||||    
T  36493518 tttttcaaaaaagtcaatttcctgactgcaccatagaagctccc 36493475  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 39 - 249
Target Start/End: Original strand, 1815483 - 1815693
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  1815483 ttaagggtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgt 1815582  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    || || ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1815583 aaatccaagatgttgcaaacattactagatgaattacaattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 1815682  T
Q  239 tttttcaaaaa 249  Q
    ||||| |||||    
T  1815683 ttttttaaaaa 1815693  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 39 - 257
Target Start/End: Original strand, 47253922 - 47254140
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||     
T  47253922 ttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacaataaaatagtacatgc 47254021  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  47254022 aagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaatcattaagattaaaattaac 47254121  T
Q  239 tttttcaaaaaagtcagtt 257  Q
    |||||||||||||||||||    
T  47254122 tttttcaaaaaagtcagtt 47254140  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 39 - 256
Target Start/End: Original strand, 33341580 - 33341797
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33341580 ttaagtgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgt 33341679  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  33341680 aagtccaagatgttgtaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaat 33341779  T
Q  239 tttttcaaaaaagtcagt 256  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  33341780 ttttttaaaaaagtcagt 33341797  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 39 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 55241134 - 55240897
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  55241134 ttaagtgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatgtcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgt 55241035  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    ||||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  55241034 aagtccaagatgttgcaaacattactagataaattactattaatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaaa 55240935  T
Q  239 tttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaa 276  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  55240934 tttttcaaaaaagtcagtttcataactgcaccgtagaa 55240897  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 39 - 282
Target Start/End: Original strand, 17173472 - 17173715
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  17173472 ttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgt 17173571  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| | |||| || ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||     
T  17173572 aagtctaagatgttgcaagcatcactagatgaattactatttatcatgaataagtaatcaataatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaagtaat 17173671  T
Q  239 tttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactccc 282  Q
    ||||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||||||    
T  17173672 tttttcaaaaaagtcagtttcttgactgcaccgtagaaactccc 17173715  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 41 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 46888184 - 46887950
Alignment:
Q  41 aagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaa 140  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  46888184 aagtgtaacaccccacaaaacgtaacactta-gactatcacataatatcatcaaatcggtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaa 46888086  T
Q  141 gtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactt 240  Q
     || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  46888085 atccaagatgttacaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaatattaaaatcaaaattaactt 46887986  T
Q  241 tttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaa 276  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |||| |||||||    
T  46887985 tttcaaaaaagtcagtttcctgattgcaccgtagaa 46887950  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 45 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 19089476 - 19089238
Alignment:
Q  45 gtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtca 144  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  19089476 gtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaacgttgttcgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacctgtaagtcc 19089377  T
Q  145 aagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttc 244  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| ||    
T  19089376 aagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaatcgttaaaatcaaaattaactttatc 19089277  T
Q  245 aaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactccca 283  Q
    |||||||||| || ||| |||||| ||||||| ||||||    
T  19089276 aaaaaagtcaatttcctgactgcaccgtagaagctccca 19089238  T

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Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 40 - 281
Target Start/End: Original strand, 3042802 - 3043043
Alignment:
Q  40 taagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgta 139  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  3042802 taagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcttgttaaagatttcaacgataaaatagtacatgta 3042901  T
Q  140 agtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaact 239  Q
    |||| || || |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3042902 agtccaacatgttgcaagcattactagatgaattagtattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaact 3043001  T
Q  240 ttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactcc 281  Q
    ||||||||||||||| || | | |||||| ||||||| ||||    
T  3043002 ttttcaaaaaagtcaatttcttgactgcaccgtagaagctcc 3043043  T

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Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 39 - 283
Target Start/End: Original strand, 32579628 - 32579872
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    |||||||||| ||| || | | |||||| ||||||||||||  |||| |||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  32579628 ttaagtgtaagacctcagaaagtgtaactcttaagactatcttataatatcatcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgt 32579727  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  32579728 aagtccaagatgttgcaaacattactagatgaattactattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcaaacattaagatcaaaattaat 32579827  T
Q  239 tttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactccca 283  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  32579828 tttttcaaaaaagtcagttttctaactgcaccgtagaaactccca 32579872  T

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Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 40 - 282
Target Start/End: Original strand, 25184296 - 25184538
Alignment:
Q  40 taagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgta 139  Q
    |||| |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||  | || |||||||||||| ||||    
T  25184296 taagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatattatcaactctgtttgcatgttaaaaattccgacaataaaatagtacatgta 25184395  T
Q  140 agtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaact 239  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25184396 agtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcgacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaact 25184495  T
Q  240 ttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactccc 282  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||| | ||||| |||||    
T  25184496 ttttcaaaaaagtcagttttctgactgcaccatagaagctccc 25184538  T

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Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 48 - 282
Target Start/End: Original strand, 49376158 - 49376392
Alignment:
Q  48 acaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaag 147  Q
    ||||||||||   |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  49376158 acaccccacaatgtgtaacacttaagattatcacataatatcatcaactttgtttggatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaag 49376257  T
Q  148 attttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaa 247  Q
    |  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49376258 aagttgaaagcattactaaatgaattactattgatcattaatcagtaatcaagaatttaaaaatgaattaaacattaagatcaaaattaactttttcaaa 49376357  T
Q  248 aaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactccc 282  Q
    |||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||    
T  49376358 aaagtcagtttcctgactgcaccgtagaagctccc 49376392  T

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Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 40 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 19440676 - 19440433
Alignment:
Q  40 taagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgta 139  Q
    |||| |||||||||||||   |||||| ||||||  ||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||    
T  19440676 taagcgtaacaccccacaacgtgtaacccttaagtttataacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaatgataaaatagtacatgta 19440577  T
Q  140 agtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaact 239  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19440576 agtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaataatttaaaaattaatcaaacattaagatcaaaattaact 19440477  T
Q  240 ttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactccca 283  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||    
T  19440476 tttttaaaaaagtcagtttcctgactgcaccgtagaagctccca 19440433  T

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Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 40 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 55477919 - 55477716
Alignment:
Q  40 taagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgta 139  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||    
T  55477919 taagtgtaacaccccacaacgtgtaacactgaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacattta 55477820  T
Q  140 agtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaact 239  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  55477819 agtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattaatcattaatcagtaattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaatt 55477720  T
Q  240 tttt 243  Q
    ||||    
T  55477719 tttt 55477716  T

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Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 39 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 35021064 - 35020817
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  35021064 ttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtatctgt 35020965  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattac----tattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaat 234  Q
    ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35020964 aagtccaagatattgcaaacattactagatgaattactatatattgatcattaatcggtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaat 35020865  T
Q  235 taactttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactccc 282  Q
    ||||||||| |||| ||||||||  || ||| || ||||||| |||||    
T  35020864 taacttttttaaaagagtcagttttctgactacaccgtagaagctccc 35020817  T

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Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 40 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 37663769 - 37663527
Alignment:
Q  40 taagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgta 139  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  37663769 taagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaacgttgttcgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgta 37663670  T
Q  140 agtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaact 239  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||    
T  37663669 agtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaatcgttaaaatcaaaattaact 37663570  T
Q  240 ttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactccc 282  Q
    || | |||||||||| || ||| |||| | ||||||| |||||    
T  37663569 ttattaaaaaagtcaatttcctgactgtaccgtagaagctccc 37663527  T

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Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 78 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 30002631 - 30002426
Alignment:
Q  78 tcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattacta 177  Q
    |||||| | |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30002631 tcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatttaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattacta 30002532  T
Q  178 ttgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaa 277  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || | |||||||| |||||||     
T  30002531 ttgatcattaatcagtaataaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcagaaaagtcaatttcataactgcaccgtagaag 30002432  T
Q  278 ctccca 283  Q
    ||||||    
T  30002431 ctccca 30002426  T

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Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 39 - 282
Target Start/End: Original strand, 17272146 - 17272389
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    |||||||||||||||||   | ||| ||||||||||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||    
T  17272146 ttaagtgtaacaccccatgaagtgtcacacttaagactatcgcatgatatcagcaactctatttgcatattaaagatttcaacaataaaatagtacatgt 17272245  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17272246 aagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcggtaatgaacgatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaac 17272345  T
Q  239 tttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactccc 282  Q
    ||||||||| |||||| || | | |||||| ||||||| |||||    
T  17272346 tttttcaaataagtcaatttcatgactgcaccgtagaagctccc 17272389  T

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Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 39 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 29584229 - 29583986
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    |||||||| ||||||||   | ||| ||||||||||||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||    
T  29584229 ttaagtgttacaccccatgaagtgtcacacttaagactatcgcatgatatcagcaactctatttgcatgttaaagatttcaacaataaaatggtacatgt 29584130  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29584129 aagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatgaacgatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaac 29584030  T
Q  239 tttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactccc 282  Q
    ||||||||| |||||| || | | |||||| ||||||| |||||    
T  29584029 tttttcaaacaagtcaatttcatgactgcaccgtagaagctccc 29583986  T

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Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 40 - 257
Target Start/End: Original strand, 50697424 - 50697642
Alignment:
Q  40 taagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgca-tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    |||| |||||||| |||| | || |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  50697424 taagcgtaacaccacacaaagtgcaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcaatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgt 50697523  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    || || ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||     
T  50697524 aattccaagatgttgtaagcattactagatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaataaaaattaat 50697623  T
Q  239 tttttcaaaaaagtcagtt 257  Q
    |||||||||||||||||||    
T  50697624 tttttcaaaaaagtcagtt 50697642  T

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Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 40 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 879576 - 879359
Alignment:
Q  40 taagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgta 139  Q
    |||| |||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||    || |||||||||||||||||    
T  879576 taagcgtaacacctcacaaagtgtaacatttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattctgacaataaaatagtacctgta 879477  T
Q  140 agtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaact 239  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  879476 agtccaagatgttgcaagcattactagatgaattattattgatcattaataagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaact 879377  T
Q  240 ttttcaaaaaagtcagtt 257  Q
    ||||  ||||||||||||    
T  879376 ttttttaaaaagtcagtt 879359  T

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Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 43 - 252
Target Start/End: Original strand, 50764906 - 50765115
Alignment:
Q  43 gtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagt 142  Q
    ||||||||||||||| | || |||||| || | |||||||| | |||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  50764906 gtgtaacaccccacaaagtgaaacactcaatattatcacatgatatcagcaactatgtttgcaagttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagt 50765005  T
Q  143 caaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttt 242  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  50765006 ctaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttt 50765105  T
Q  243 tcaaaaaagt 252  Q
    | ||||||||    
T  50765106 ttaaaaaagt 50765115  T

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Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 39 - 257
Target Start/End: Original strand, 23761253 - 23761471
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    |||||||||||||| || | | ||| ||| ||||||||||| ||| | |||| ||||||| |||||| |||||||||  |||||||||||| |||||| |    
T  23761253 ttaagtgtaacacctcataaagtgtcacatttaagactatcgcatgatatcagcaactctgtttgcacgttaaagataccaacgataaaattgtacctat 23761352  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23761353 aagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattattattgatcattaatcagtaatcaataatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaac 23761452  T
Q  239 tttttcaaaaaagtcagtt 257  Q
    |||||||||||||||||||    
T  23761453 tttttcaaaaaagtcagtt 23761471  T

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Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 39 - 254
Target Start/End: Original strand, 37287909 - 37288126
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacacccc-acataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctg 137  Q
    ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||    
T  37287909 ttaagtgtaacgcccccacaaaatgtaacacttaagactagcacatgatatcagcaactttgtttgcatgttgaagatgccaacgataaaatagtacatg 37288008  T
Q  138 taagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaga-tcaaaatta 236  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  37288009 taagtccaagatgttgcaagcattattagatgaattactattgagcattaatcagtaatcaataatttaaaaatgaatcaaacattaagatttaaaatta 37288108  T
Q  237 actttttcaaaaaagtca 254  Q
    ||||||||||||||||||    
T  37288109 actttttcaaaaaagtca 37288126  T

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Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 41 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 34948124 - 34947923
Alignment:
Q  41 aagtgtaacaccccacataatgtaac--acttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    ||||| ||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||    
T  34948124 aagtgcaacaccccacaaagtgtaacgtacttaagactatcacatgatatcaacaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaataatacatgt 34948025  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34948024 aagtccaagatgttgcaagcattactagatgaaatactattgatcgttaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaac 34947925  T
Q  239 tt 240  Q
    ||    
T  34947924 tt 34947923  T

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Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 59 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 5047975 - 5047750
Alignment:
Q  59 aatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaagattttgcaagc 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| | ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||     
T  5047975 aatgtaacacttaagactatcacatgatatcataaactatgtttgcatgttaaagatgccaacaataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagt 5047876  T
Q  159 attactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttc 258  Q
     ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||     
T  5047875 tttactagataaattattattgatcagtaatcaacaataaacaatttaaaaatgaatcgaacattaaaatcaaaattaattttttcaaaaaagtctgttt 5047776  T
Q  259 cctaactgcagcgtagaaactcccaa 284  Q
    ||| |||||| |||| || |||||||    
T  5047775 cctgactgcaccgtaaaagctcccaa 5047750  T

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Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 100 - 280
Target Start/End: Original strand, 32592327 - 32592507
Alignment:
Q  100 tttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaa 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  32592327 tttgcatgttaaagatgtctacgataaaatagtacctgtaagttcaagatgttgaaagcattactaaatgaattactattgatcgttaatcaataatcaa 32592426  T
Q  200 caatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactc 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||   | |||||| |||||||||||    
T  32592427 caatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcaattttatgactgcaccgtagaaactc 32592507  T

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Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 87 - 279
Target Start/End: Original strand, 39400238 - 39400430
Alignment:
Q  87 atcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcatt 186  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39400238 atcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatggtacctttaagttcaagatgttgcaagcattactagatgaatgactattgatcatt 39400337  T
Q  187 aatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaact 279  Q
    |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | | |||| | ||||||||||    
T  39400338 aatcagcaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcatgactggaccgtagaaact 39400430  T

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Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 78 - 281
Target Start/End: Original strand, 37775879 - 37776082
Alignment:
Q  78 tcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattacta 177  Q
    |||||| | |||| ||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37775879 tcacatgatatcagcaactttgtttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattacta 37775978  T
Q  178 ttgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaa 277  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| || | | |||||| |||||||     
T  37775979 ttgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattgaaattaacttttttaaaaaagtcaatttcatgactgcaccgtagaag 37776078  T
Q  278 ctcc 281  Q
    ||||    
T  37776079 ctcc 37776082  T

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Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 61 - 276
Target Start/End: Original strand, 26896291 - 26896507
Alignment:
Q  61 tgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtca-aagattttgcaagca 159  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||  || || |||||| ||    
T  26896291 tgtaacacttaagactatcgcataatatgatcaagtctatttgcatgttaaa-atttcaacgataaaatagtacttgtaagtccgaaaatgttgcaaaca 26896389  T
Q  160 ttactagatgaat-tactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttc 258  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||     
T  26896390 ttactagatgaatatactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcgaacattaaaatcaaaattaacttttttaaaaaagtcaattt 26896489  T
Q  259 cctaactgcagcgtagaa 276  Q
    ||| |||||| |||||||    
T  26896490 cctgactgcaccgtagaa 26896507  T

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Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 46 - 287
Target Start/End: Original strand, 42199918 - 42200160
Alignment:
Q  46 taacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacc-tgtaagtca 144  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||     
T  42199918 taacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaataataccttgtaagtcc 42200017  T
Q  145 aagattttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttt 243  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| || ||| |||||||||||||    
T  42200018 aagatgttgcaagcattactagatgaatatactactgttcattaatcagtaatcaataatttaaaaattaatcaaacatcaaaatc-aaattaacttttt 42200116  T
Q  244 caaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactcccaataa 287  Q
    |||||| |||| || ||| | |||| ||||||| ||||| ||||    
T  42200117 caaaaaggtcaatttcctgattgcaccgtagaagctccctataa 42200160  T

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Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 89 - 282
Target Start/End: Original strand, 4205216 - 4205409
Alignment:
Q  89 catcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaa 188  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||    
T  4205216 catcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcatcactagatgaattactatttatcatgaa 4205315  T
Q  189 tcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactccc 282  Q
    | | |||| || ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||| | | |||||| ||||||| |||||    
T  4205316 taagtaatcaataatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaagtaactttttcaaaaaagtcagtttcttgactgcaccgtagaagctccc 4205409  T

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Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 39 - 257
Target Start/End: Original strand, 27396798 - 27397014
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    |||||||||||| |||| | | ||| ||||||||||| ||| ||| | |||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |    
T  27396798 ttaagtgtaacatcccataaagtgtcacacttaagaccatcgcatgatatcagcaacgctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaagtggtacctat 27396897  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27396898 aagtccaaaatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat--gtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaac 27396995  T
Q  239 tttttcaaaaaagtcagtt 257  Q
    |||||  ||||| ||||||    
T  27396996 tttttttaaaaaatcagtt 27397014  T

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Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 93 - 268
Target Start/End: Original strand, 9139465 - 9139638
Alignment:
Q  93 aactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaa 192  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9139465 aactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataacgtagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagacgaattactattgatcattaatcaa 9139564  T
Q  193 taattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttccctaactgca 268  Q
    ||||    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  9139565 taat--ctaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcataattaacttttccaaaaaagtcagtttcctcactgca 9139638  T

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Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 78 - 283
Target Start/End: Original strand, 4598203 - 4598408
Alignment:
Q  78 tcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattacta 177  Q
    |||||| | |||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| || ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  4598203 tcacatgatatcagcaactctgttttcatgttaaagatgccaacgataaaataatacatttaaatccaagatgttgcaagcattattagattaattacta 4598302  T
Q  178 ttgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaa 277  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||| | | |||||| |||||||     
T  4598303 ttgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacattttacaaaaagtcagtttcatgactgcaccgtagaag 4598402  T
Q  278 ctccca 283  Q
    ||||||    
T  4598403 ctccca 4598408  T

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Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 119 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 35025515 - 35025379
Alignment:
Q  119 aacgataaaatagtacctgtaagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaa 218  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  35025515 aacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaatcaa 35025416  T
Q  219 acattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagt 256  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35025415 acattaa-atcaaaattaactttttcataaaagtcagt 35025379  T

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Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 128 - 282
Target Start/End: Original strand, 23431826 - 23431980
Alignment:
Q  128 atagtacctgtaagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaga 227  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  23431826 atagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattagtagatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgcatcaaacattaaaa 23431925  T
Q  228 tcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactccc 282  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||  |||||| |||||    
T  23431926 ttaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcatgactgcactgtagaagctccc 23431980  T

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Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 54 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 46884123 - 46883932
Alignment:
Q  54 cacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaagattttg 153  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||| || | | ||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||  ||||||||   ||| |||    
T  46884123 cacaaaatgtaacacttaa-actatcacataatatcataaattttgtttgcatgttaaaaattccaaagataaaatagta--tgtaagtcc--gatgttg 46884029  T
Q  154 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaa 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  46884028 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaataaatcaaacattaaaataaaaattaattttttcaaaaaa 46883932  T

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Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 47 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 4934223 - 4934023
Alignment:
Q  47 aacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaa 146  Q
    |||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||              
T  4934223 aacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcatataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgacaacgataaaatagtacct---------- 4934134  T
Q  147 gattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaattt-aaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttca 245  Q
     || ||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||| || ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4934133 -atgttgcacgcattaatagatgaatttctattaatcattaatcagtaatcaaaaattttaaaaataaattaaacattaagatcaaaattaacttgttca 4934035  T
Q  246 aaaaagtcagtt 257  Q
    ||||||||||||    
T  4934034 aaaaagtcagtt 4934023  T

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Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 163 - 268
Target Start/End: Original strand, 38012568 - 38012673
Alignment:
Q  163 ctagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttcccta 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||     
T  38012568 ctagatgaattactattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaaattagtttcctg 38012667  T
Q  263 actgca 268  Q
    ||||||    
T  38012668 actgca 38012673  T

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Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 39 - 172
Target Start/End: Original strand, 38012036 - 38012169
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    |||||||||||| |||| | | |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||||| ||| |||| |||||||||||| |||    
T  38012036 ttaagtgtaacatcccagaaagtgtaacgcttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcacgttaaaaatgccaacaataaaatagtacatgt 38012135  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaat 172  Q
    ||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  38012136 aagtccaagatgttgcaaatattactagatgaat 38012169  T

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Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 39 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 35025625 - 35025530
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtac 134  Q
    |||||||| |||||||| | | ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35025625 ttaagtgtcacaccccagaaagtgtaacacttaagactatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtac 35025530  T

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Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 100 - 161
Target Start/End: Original strand, 56050173 - 56050234
Alignment:
Q  100 tttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaagattttgcaagcatt 161  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  56050173 tttgcatgttaaagacttcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcatt 56050234  T

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Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 40
Target Start/End: Complemental strand, 15430973 - 15430940
Alignment:
Q  7 catgtcgactgtgtgtgaaccctttcatattgtt 40  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15430973 catgtcgactgtgtgtgaaccctttcatattgtt 15430940  T

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Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 40
Target Start/End: Complemental strand, 15437587 - 15437554
Alignment:
Q  7 catgtcgactgtgtgtgaaccctttcatattgtt 40  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15437587 catgtcgactgtgtgtgaaccctttcatattgtt 15437554  T

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Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 39 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 54499266 - 54499166
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    ||||||||||||||| ||| | ||||||  ||||||||||||||| | || |  |||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||    
T  54499266 ttaagtgtaacaccctacaaagtgtaacttttaagactatcacatgatattagtaactctgtttccatgttaaa-atgccaacgataaaatggtaccggt 54499168  T
Q  139 aa 140  Q
    ||    
T  54499167 aa 54499166  T

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Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 40
Target Start/End: Original strand, 56197822 - 56197855
Alignment:
Q  7 catgtcgactgtgtgtgaaccctttcatattgtt 40  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56197822 catgtcgactgtgtgtgaaccctttcatattgtt 56197855  T

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Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 40
Target Start/End: Complemental strand, 49637704 - 49637672
Alignment:
Q  8 atgtcgactgtgtgtgaaccctttcatattgtt 40  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49637704 atgtcgactgtgtgtgaaccctttcatattgtt 49637672  T

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Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 37
Target Start/End: Complemental strand, 33411169 - 33411139
Alignment:
Q  7 catgtcgactgtgtgtgaaccctttcatatt 37  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33411169 catgtcgactgtgtgtgaaccctttcatatt 33411139  T

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Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 40
Target Start/End: Original strand, 19826494 - 19826527
Alignment:
Q  7 catgtcgactgtgtgtgaaccctttcatattgtt 40  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19826494 catgtcaactgtgtgtgaaccctttcatattgtt 19826527  T

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Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 40
Target Start/End: Complemental strand, 19861494 - 19861461
Alignment:
Q  7 catgtcgactgtgtgtgaaccctttcatattgtt 40  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19861494 catgtcgactgtgtgtgaacccttttatattgtt 19861461  T

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Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 36
Target Start/End: Complemental strand, 27678173 - 27678144
Alignment:
Q  7 catgtcgactgtgtgtgaaccctttcatat 36  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27678173 catgtcgactgtgtgtgaaccctttcatat 27678144  T

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Target: scaffold0318 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0318
Description:

Target: scaffold0318; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 39 - 281
Target Start/End: Original strand, 12091 - 12332
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||| | |||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  12091 ttaagtgtaacaccccacaaagtgtcacacttaagactatcgcatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgt 12190  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  12191 aagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaat-aatcaaacattaagattaaaattaac 12289  T
Q  239 tttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactcc 281  Q
    ||||| |||||||| |||| | | |||||| ||||||| ||||    
T  12290 ttttttaaaaaagtaagtttcatgactgcaccgtagaagctcc 12332  T

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Target: scaffold0291 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0291
Description:

Target: scaffold0291; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 40 - 282
Target Start/End: Original strand, 8070 - 8312
Alignment:
Q  40 taagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgta 139  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  8070 taagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaacgttgttcgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgta 8169  T
Q  140 agtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaact 239  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||    
T  8170 agtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaatcgttaaaatcaaaattaact 8269  T
Q  240 ttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactccc 282  Q
    || |||||||||||| || ||| |||||| ||||||| |||||    
T  8270 ttatcaaaaaagtcaatttcctgactgcaccgtagaagctccc 8312  T

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Target: scaffold0022 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 46 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 146012 - 145775
Alignment:
Q  46 taacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaa 145  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||| |    
T  146012 taacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtgtctgtaagtcca 145913  T
Q  146 agattttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttc 244  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  145912 agatgttgcaagcattactaaatgaatatacaattgatcattaatcagtaataaaaaatttaaaaatgaattaaacattaaaatcaaaattaactttttc 145813  T
Q  245 aaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactccc 282  Q
    |||||||||| || ||| |||||| ||||||| |||||    
T  145812 aaaaaagtcaatttcctgactgcaccgtagaagctccc 145775  T

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Target: scaffold0061 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 46 - 282
Target Start/End: Original strand, 44146 - 44381
Alignment:
Q  46 taacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaa 145  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |    
T  44146 taacaccccacaaagtgtaacacttaag-ctatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacatgtaagtcca 44244  T
Q  146 agattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttca 245  Q
    || | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  44245 agttgttgcaagcattactgaatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaaaatcaaaatcaactttttca 44344  T
Q  246 aaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactccc 282  Q
    ||||||||||||   | |||||| ||||||| |||||    
T  44345 aaaaagtcagtttgttgactgcatcgtagaagctccc 44381  T

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Target: scaffold0017 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 46 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 154641 - 154406
Alignment:
Q  46 taacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaa 145  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |    
T  154641 taacaccccacaaagtgtaacacttaag-ctatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacatgtaagtcca 154543  T
Q  146 agattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttca 245  Q
    || | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  154542 agttgttgcaagcattactgaatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaaaatcaaaatcaactttttca 154443  T
Q  246 aaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactccc 282  Q
    ||||||||||||   | |||||| ||||||| |||||    
T  154442 aaaaagtcagtttgttgactgcatcgtagaagctccc 154406  T

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Target: scaffold0002 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 4)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 40 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 408431 - 408223
Alignment:
Q  40 taagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgta 139  Q
    |||| |||||||| |||| | || ||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  408431 taagcgtaacacctcacaaagtggaacacttaagactatcacacaatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgta 408332  T
Q  140 agtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaact 239  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |    
T  408331 agtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaataaaaattaatt 408232  T
Q  240 ttttcaaaa 248  Q
    |||||||||    
T  408231 ttttcaaaa 408223  T

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Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 39 - 246
Target Start/End: Original strand, 316 - 517
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgt 138  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||        
T  316 ttaagtgtaacaccccataaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtac---- 411  T
Q  139 aagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 238  Q
      ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  412 --gtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattaatcatgaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaac 509  T
Q  239 tttttcaa 246  Q
    ||||||||    
T  510 tttttcaa 517  T

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Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 87 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 94055 - 93859
Alignment:
Q  87 atcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcatt 186  Q
    |||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  94055 atcatcaaatttgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacttgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattgctattgatcatt 93956  T
Q  187 aatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactcccaa 284  Q
    ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||| |||||| |||| ||||||||||    
T  93955 aatcactaatcaacaattt-aaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttttaaaaaggtccgtttccttactgcaccgtaaaaactcccaa 93859  T

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Target: scaffold0002; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 94384 - 94331
Alignment:
Q  41 aagtgtaacaccccacataatgtaacacttaagactatcacataacatcatcaa 94  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  94384 aagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactattacataatatcatcaa 94331  T

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Target: scaffold0008 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 39 - 283
Target Start/End: Original strand, 267466 - 267702
Alignment:
Q  39 ttaagtgtaacaccccacataatgtaacacttaa-gactatcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctg 137  Q
    |||| ||||||| |||||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||    
T  267466 ttaaatgtaacatcccacaaagtgtaacacttaaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaataatacatg 267565  T
Q  138 taagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaa 237  Q
    |||||| |||||  |||||| ||||||||||||||||         |  ||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  267566 taagtccaagatgctgcaagaattactagatgaatta---------accaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaatattaagatcaaaattaa 267656  T
Q  238 ctttttcaaaaaagtcagttccctaactgcagcgtagaaactccca 283  Q
     ||||||||||||||||||| | | |||||| | ||||| ||||||    
T  267657 ttttttcaaaaaagtcagtttcttgactgcaccatagaatctccca 267702  T

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Target: scaffold0214 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0214
Description:

Target: scaffold0214; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 40
Target Start/End: Original strand, 12478 - 12510
Alignment:
Q  8 atgtcgactgtgtgtgaaccctttcatattgtt 40  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12478 atgtcgactgtgtgtgaaccctttcatattgtt 12510  T

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Target: scaffold0214; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 40
Target Start/End: Original strand, 26494 - 26526
Alignment:
Q  8 atgtcgactgtgtgtgaaccctttcatattgtt 40  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26494 atgtcgactgtgtgtgaaccctttcatattgtt 26526  T

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Target: scaffold0009 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 202
Target Start/End: Original strand, 100948 - 101058
Alignment:
Q  78 tcacataacatcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattacta 177  Q
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T  100948 tcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgat------------gtaagtccaagatgttgcaagcattactaaatgcattacta 101035  T
Q  178 ttgatcattaatcaataattaacaa 202  Q
      |||||||||||| |||| |||||    
T  101036 --gatcattaatcagtaatcaacaa 101058  T

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Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 227 - 284
Target Start/End: Original strand, 101060 - 101118
Alignment:
Q  227 atcaaaattaactttttcaaaaaagtc-agttccctaactgcagcgtagaaactcccaa 284  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||  || |||||| |||||||||||||||    
T  101060 atcaaaattaacttttttaaaaaagtcaagttttcttactgcaccgtagaaactcccaa 101118  T

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Target: scaffold0270 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 40
Target Start/End: Complemental strand, 1271 - 1238
Alignment:
Q  7 catgtcgactgtgtgtgaaccctttcatattgtt 40  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1271 catgtcgactgtgtgtgaaacctttcatattgtt 1238  T

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Target: scaffold0037 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 40
Target Start/End: Complemental strand, 96135 - 96102
Alignment:
Q  7 catgtcgactgtgtgtgaaccctttcatattgtt 40  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  96135 catgtcgactgtgtgtgaaccctttcttattgtt 96102  T

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