View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6013_high_7 (Length: 415)

Name: NF6013_high_7
Description: NF6013
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6013_high_7
NF6013_high_7
[»] chr3 (11 HSPs)
chr3 (10-415)||(2749367-2749772)
chr3 (24-409)||(2837975-2838360)
chr3 (45-409)||(2855206-2855570)
chr3 (17-409)||(5413264-5413656)
chr3 (10-409)||(2818935-2819334)
chr3 (10-409)||(2759592-2759991)
chr3 (21-409)||(2807645-2808033)
chr3 (10-409)||(2769447-2769846)
chr3 (47-409)||(2790698-2791060)
chr3 (45-409)||(2797739-2798103)
chr3 (249-355)||(3201376-3201482)
[»] scaffold0691 (1 HSPs)
scaffold0691 (10-409)||(5513-5912)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 398; Significance: 0; HSPs: 11)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 398; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 2749772 - 2749367
Alignment:
Q  10 catcatcactaagtgatagaatctttactagacacgttaaatgggcattacgtcctaattccagactcagattttcactcaccttttgccattcaatcat 109  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2749772 catcataactaagtgatagaatctttactagacacgttaaatgggcattacgtcctaattccagactcagattttcactcaccttttgccattcaatcat 2749673  T
Q  110 tgttttagattttgttgaaagtaaaccaccaatggctacaattgctagaggtagctgcctgcacttttgaacaatttcttttgacacagcctcaagttct 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2749672 tgttttagattttgttgaaagtaaaccaccaatagctacaattgctagaggtagctgcctgcacttttgaacaatttcttttgacacagcctcaagttct 2749573  T
Q  210 gatggacaatgtccaccaagctcatatctaaatactctcttgcagaaaagttcccatgctttgtttggaggcaaaagttgcaggttgtgaatatgagtta 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2749572 gatggacaatgtccaccaagctcatatctaaatactctcttgcagaaaagttcccatgctttgtttggaggcaaaagttgcaggttgtgaatatgagtta 2749473  T
Q  310 gaaaggattttttgaaaaaatctgcaacatacatcattctagtggtgatgataatcctactacctttattgttatttggcatggcaaattgaacctggtc 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2749472 gaaaggattttttgaaaaaatctgcaacatacatcattctagtggtgatgataatcctactacctttattgttatttggcatggcaaattgaacctggtc 2749373  T
Q  410 cgcaaa 415  Q
    ||||||    
T  2749372 cgcaaa 2749367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 24 - 409
Target Start/End: Original strand, 2837975 - 2838360
Alignment:
Q  24 gatagaatctttactagacacgttaaatgggcattacgtcctaattccagactcagattttcactcaccttttgccattcaatcattgttttagattttg 123  Q
    |||| |||||||  |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2837975 gataaaatctttgttagactagttaaatgggcattacgtcccaattccagtctcatattttcactcacgttttgccattcaatcattgttttagattttg 2838074  T
Q  124 ttgaaagtaaaccaccaatggctacaattgctagaggtagctgcctgcacttttgaacaatttcttttgacacagcctcaagttctgatggacaatgtcc 223  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||    
T  2838075 ttgaaagtagaccaccaatggctacaattgccagaggtagctgcttgcatttttgaacaatttcttttgacacagccttaagctctggtggacaatgccc 2838174  T
Q  224 accaagctcatatctaaatactctcttgcagaaaagttcccatgctttgtttggaggcaaaagttgcaggttgtgaatatgagttagaaaggattttttg 323  Q
    |||| | ||| ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  2838175 accaggttcaaatctaaatactttcttacagaagagttcccatgctttgtttggaggcaaaagttgcaggttatgaatatgagttagaaaggatttcttg 2838274  T
Q  324 aaaaaatctgcaacatacatcattctagtggtgatgataatcctactacctttattgttatttggcatggcaaattgaacctggtc 409  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  2838275 aaaaattctgcaacatgcatcattctagtagtgattatgatcctactacctttattgttattaggcatggcaaattcaatctggtc 2838360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 45 - 409
Target Start/End: Original strand, 2855206 - 2855570
Alignment:
Q  45 gttaaatgggcattacgtcctaattccagactcagattttcactcaccttttgccattcaatcattgttttagattttgttgaaagtaaaccaccaatgg 144  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2855206 gttaaatgggcattacgtcccaattccaatctcatattttcactcacgttttgccattcaatcattgttttagattttgttgaaagtagaccaccaatgg 2855305  T
Q  145 ctacaattgctagaggtagctgcctgcacttttgaacaatttcttttgacacagcctcaagttctgatggacaatgtccaccaagctcatatctaaatac 244  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| | ||| ||||||||||    
T  2855306 ctacaattgccagaggtagctgcttgcattttagaacaatttcttttgacacagcctcaagctctggtggacaatgcccaccaggttcaaatctaaatac 2855405  T
Q  245 tctcttgcagaaaagttcccatgctttgtttggaggcaaaagttgcaggttgtgaatatgagttagaaaggattttttgaaaaaatctgcaacatacatc 344  Q
    | |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  2855406 tttcttacagaagagttcccatgctttgtttggaggcaaaagttgcaggttatgaatatgagttagaaaggatttcttgaaaaattctgcaacatgcatc 2855505  T
Q  345 attctagtggtgatgataatcctactacctttattgttatttggcatggcaaattgaacctggtc 409  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  2855506 attctagtagtgattatgatcctactacctttattgttattaggcatggcaaattcaacctggtc 2855570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 17 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 5413656 - 5413264
Alignment:
Q  17 actaagtgatagaatctttactagacacgttaaatgggcattacgtcctaattccagactcagattttcactcaccttttgccattcaatcattgtttta 116  Q
    ||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5413656 actaagtgacagaatctttgttagactcgttaaatgggcattacgtcctaattccaggctcagattttgactcaccttttgccattcaataattgtttta 5413557  T
Q  117 gattttgttgaaagtaaaccaccaatggctacaattgctagaggtagctgcctgcacttttgaacaatttcttttgacacagcctcaagttctgatggac 216  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||| || ||| ||| ||| || |||||||    
T  5413556 gattttgttgaaagtagaccaccaatggctacaatttctagaggaagctgcttgcattttcgaacaatttctttcgatacatcctgaagctccgatggac 5413457  T
Q  217 aatgtccaccaagctcatatctaaatactctcttgcagaaaagttcccatgctttgtttggaggcaaaagttgcaggttgtgaatatgagttagaaagga 316  Q
    |||  |||||||| ||| ||| ||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||    
T  5413456 aattcccaccaagttcaaatccaaacaccttcttgcagtaaagttcccatgctttgtttggaggcaaaagttgcaggttgtgaacatatactagaaagga 5413357  T
Q  317 ttttttgaaaaaatctgcaacatacatcattctagtggtgatgataatcctactacctttattgttatttggcatggcaaattgaacctggtc 409  Q
    ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||    
T  5413356 ttttttgaaaaaatccgcaacttgcatcattctagtggtgattatgatcctactacctttattgtttttaggcatcgcaaattcaacctggtc 5413264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 10 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 2819334 - 2818935
Alignment:
Q  10 catcatcactaagtgatagaatctttactagacacgttaaatgggcattacgtcctaattccagactcagattttcactcaccttttgccattcaatcat 109  Q
    |||||| |||||| || | |||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | || ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  2819334 catcataactaagcgacaaaatctttgttagactcgttaaatgggcattacgttccaactccaggctcaaattttgactcaccttttgccattcgatcat 2819235  T
Q  110 tgttttagattttgttgaaagtaaaccaccaatggctacaattgctagaggtagctgcctgcacttttgaacaatttcttttgacacagcctcaagttct 209  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||  ||| || | ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||     
T  2819234 ggttttagattttgttgaaagtagaccaccaatggctacgattgccaaaggtaattgcttgaatttttgaacaatttcttttgccacaacctcaagttcc 2819135  T
Q  210 gatggacaatgtccaccaagctcatatctaaatactctcttgcagaaaagttcccatgctttgtttggaggcaaaagttgcaggttgtgaatatgagtta 309  Q
    | ||||||| | |||||||||||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||  ||    
T  2819134 ggtggacaacgaccaccaagctcagacctaaatactttcttgcagaagagttcccatgctttgtttggagtcaaaagttgcaagttgtgaacatgaacta 2819035  T
Q  310 gaaaggattttttgaaaaaatctgcaacatacatcattctagtggtgatgataatcctactacctttattgttatttggcatggcaaattgaacctggtc 409  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  2819034 gaaatgatttcttgaaaaaatctgcaacttgcatcattcttgtggtgattatgatcctactacctttgttgttattgggcatggcaaattcaacctggtc 2818935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 10 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 2759991 - 2759592
Alignment:
Q  10 catcatcactaagtgatagaatctttactagacacgttaaatgggcattacgtcctaattccagactcagattttcactcaccttttgccattcaatcat 109  Q
    |||||| |||||| || | |||||||  ||||| ||||||||||| |||||  || || ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2759991 catcataactaagcgacaaaatctttgttagactcgttaaatgggtattacaccccaactccaggctcaaattttgactcaccttttgccattcaatcat 2759892  T
Q  110 tgttttagattttgttgaaagtaaaccaccaatggctacaattgctagaggtagctgcctgcacttttgaacaatttcttttgacacagcctcaagttct 209  Q
     |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||| |||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||     
T  2759891 ggttttagattttgttgaaagtagaccagcaacggccacaattgcaagaggtagttgcttgaacttttgcacaatttcttttgccacagcctcaagctcc 2759792  T
Q  210 gatggacaatgtccaccaagctcatatctaaatactctcttgcagaaaagttcccatgctttgtttggaggcaaaagttgcaggttgtgaatatgagtta 309  Q
    | ||||||| | || ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||  ||    
T  2759791 ggtggacaacgccctccaagatcatatctaaatactttcttgcagaagagttcccatgctttgtttggagtcaaaagttgcaagttgtgaacatgaacta 2759692  T
Q  310 gaaaggattttttgaaaaaatctgcaacatacatcattctagtggtgatgataatcctactacctttattgttatttggcatggcaaattgaacctggtc 409  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  2759691 gaaatgatttcttgaaaaaatctgcaacttgcataattctagtggtgattatgatcctactacctttgttgttattaggcatggcaaattcaacctggtc 2759592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 21 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 2808033 - 2807645
Alignment:
Q  21 agtgatagaatctttactagacacgttaaatgggcattacgtcctaattccagactcagattttcactcaccttttgccattcaatcattgttttagatt 120  Q
    ||||||| |||||||  |||||  |||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||||||| |||    
T  2808033 agtgataaaatctttgttagacttgttaaatgggcattacgtcccaactccaagctcagattttgactcaccttttcccattccattattgttttatatt 2807934  T
Q  121 ttgttgaaagtaaaccaccaatggctacaattgctagaggtagctgcctgcacttttgaacaatttcttttgacacagcctcaagttctgatggacaatg 220  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| | |||||||||| |||| ||| ||||||| ||| |||||| ||||||||| || | |||||| ||    
T  2807933 ttgttgaaagtagaccgccaatagctacaattgccaaaggtagctgcttgcattttcgaacaatatctattgacatagcctcaagctccggtggacagtg 2807834  T
Q  221 tccaccaagctcatatctaaatactctcttgcagaaaagttcccatgctttgtttggaggcaaaagttgcaggttgtgaatatgagttagaaaggatttt 320  Q
     ||| |||| ||  ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||     
T  2807833 cccatcaagatcgaatctaaatactttcttgcagaagagttcccatgctttgtttggagtcaaaagttgcaagttgtgaacatgaactagaaaggatttc 2807734  T
Q  321 ttgaaaaaatctgcaacatacatcattctagtggtgatgataatcctactacctttattgttatttggcatggcaaattgaacctggtc 409  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||    
T  2807733 ttgaaaaaatctgcaacttgcatcattctagttgtgattatgatcctactacctttattgttgttaggcatagcaaattcaacctggtc 2807645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 10 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 2769846 - 2769447
Alignment:
Q  10 catcatcactaagtgatagaatctttactagacacgttaaatgggcattacgtcctaattccagactcagattttcactcaccttttgccattcaatcat 109  Q
    |||||| |||||| || | |||||||  |||||  | |||||||||||||||||| || |||||  | || |||| ||||||||||||||||||| |  |    
T  2769846 catcataactaagagacaaaatctttgttagactagataaatgggcattacgtcccaactccaggtttagcttttgactcaccttttgccattcagttct 2769747  T
Q  110 tgttttagattttgttgaaagtaaaccaccaatggctacaattgctagaggtagctgcctgcacttttgaacaatttcttttgacacagcctcaagttct 209  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||  | || ||| |||    
T  2769746 tgttttagattttgttgaaaatagaccaccaatggctacaattgccagaggtagctgcttgcattttcgaacaatttctttagacatggactgaagctct 2769647  T
Q  210 gatggacaatgtccaccaagctcatatctaaatactctcttgcagaaaagttcccatgctttgtttggaggcaaaagttgcaggttgtgaatatgagtta 309  Q
    | |||||| || ||| |||| ||| |||| ||| || |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||| ||||  ||    
T  2769646 ggtggacattgcccatcaagttcaaatctgaatgctttcttgcagaagagttcccatgctttgttaggaggcaaaagttgcatgttaagaacatgaacta 2769547  T
Q  310 gaaaggattttttgaaaaaatctgcaacatacatcattctagtggtgatgataatcctactacctttattgttatttggcatggcaaattgaacctggtc 409  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || || |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  2769546 gaaaggatttcttgaaaaaatctgcaacatgcatcattcttgtggttattatgatcctactacgtttattgttatttggcatggaaaattcaacctggtc 2769447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 47 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 2791060 - 2790698
Alignment:
Q  47 taaatgggcattacgtcctaattccagactcagattttcactcaccttttgccattcaatcattgttttagattttgttgaaagtaaaccaccaatggct 146  Q
    |||||||||||||||||| || |||||  |||| |||| ||||||| ||| ||||||| |||  ||||||| |||||||||||||| |||||  | ||||    
T  2791060 taaatgggcattacgtcccaactccaggttcaggttttgactcaccattttccattcagtcacggttttagcttttgttgaaagtagaccactgacggct 2790961  T
Q  147 acaattgctagaggtagctgcctgcacttttgaacaatttcttttgacacagcctcaagttctgatggacaatgtccaccaagctcatatctaaatactc 246  Q
    |||||||| || ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||    || ||| |||| ||||||||| |||||||||||| |||| ||| ||     
T  2790960 acaattgccaggggtagctgcttgcattttcgaacaatttcttttgacatgaacttaagctctggtggacaatgcccaccaagctcaaatctgaatgctt 2790861  T
Q  247 tcttgcagaaaagttcccatgctttgtttggaggcaaaagttgcaggttgtgaatatgagttagaaaggattttttgaaaaaatctgcaacatacatcat 346  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||    
T  2790860 tcttgcagaagagttcccatgctttgtttggtgtcaaaagttgcaagttgtgaacatgaactagaaaagatttcttgaaaaaatctgcaacttgcatcat 2790761  T
Q  347 tctagtggtgatgataatcctactacctttattgttatttggcatggcaaattgaacctggtc 409  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||    
T  2790760 tctagtggtgattatgatcctacaacctttattgttatttggaatggcaaattcaatctggtc 2790698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 45 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 2798103 - 2797739
Alignment:
Q  45 gttaaatgggcattacgtcctaattccagactcagattttcactcaccttttgccattcaatcattgttttagattttgttgaaagtaaaccaccaatgg 144  Q
    |||||||||||||| ||||| || |||||  ||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||  ||||||| |||||| |||| || |||||||||||    
T  2798103 gttaaatgggcattgcgtcccaactccaggttcagattttgactcaccattttccattcagtcacagttttagcttttgtcgaaaatagaccaccaatgg 2798004  T
Q  145 ctacaattgctagaggtagctgcctgcacttttgaacaatttcttttgacacagcctcaagttctgatggacaatgtccaccaagctcatatctaaatac 244  Q
    |||||||||| || ||||||||| |||| ||| |||| |||||| ||||||  |  | ||| |||| ||||||||| ||||||| |||| |||| ||| |    
T  2798003 ctacaattgccaggggtagctgcttgcattttcgaactatttctattgacatggagttaagctctggtggacaatgcccaccaacctcaaatctgaatgc 2797904  T
Q  245 tctcttgcagaaaagttcccatgctttgtttggaggcaaaagttgcaggttgtgaatatgagttagaaaggattttttgaaaaaatctgcaacatacatc 344  Q
    | |||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||  | |||||||||| ||||||||||||||||| | ||||    
T  2797903 tttcttgcagaagagttcccatgatttgtttggtgtcaaaagttgcaagttgtgaacatgaacttgaaaggatttcttgaaaaaatctgcaacttgcatc 2797804  T
Q  345 attctagtggtgatgataatcctactacctttattgttatttggcatggcaaattgaacctggtc 409  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| |  |||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  2797803 attctcgtggtgatgatgatcctatttgctttgttgttattaggcatggcaaattcaacctggtc 2797739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 249 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 3201482 - 3201376
Alignment:
Q  249 ttgcagaaaagttcccatgctttgtttggaggcaaaagttgcaggttgtgaatatgagttagaaaggattttttgaaaaaatctgcaacatacatcattc 348  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||   ||||| ||||| || ||| | || || |||| ||||||||    
T  3201482 ttgcaaaacagttcccacgctttgtttggaggcaaaggttgtaggtggtgaatatgaacaagaaaagatttcttaaaatattcagctacatgcatcattc 3201383  T
Q  349 tagtggt 355  Q
    || ||||    
T  3201382 tactggt 3201376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0691 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 1)
Name: scaffold0691
Description:

Target: scaffold0691; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 10 - 409
Target Start/End: Original strand, 5513 - 5912
Alignment:
Q  10 catcatcactaagtgatagaatctttactagacacgttaaatgggcattacgtcctaattccagactcagattttcactcaccttttgccattcaatcat 109  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | || || || |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  5513 catcataactaagtgacaaaatctttgttagactcgttaaatgggcattacgttccaactctaggctcaaattttgactcaccttttgccattcaaccat 5612  T
Q  110 tgttttagattttgttgaaagtaaaccaccaatggctacaattgctagaggtagctgcctgcacttttgaacaatttcttttgacacagcctcaagttct 209  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||     
T  5613 tgttttagattttgttgaaagtagaccaccaatggctacaattgcaagaggtagctgcttgcattttttaacaatttcttttgatacagcctcaagctca 5712  T
Q  210 gatggacaatgtccaccaagctcatatctaaatactctcttgcagaaaagttcccatgctttgtttggaggcaaaagttgcaggttgtgaatatgagtta 309  Q
      ||||||||| |||||| | ||| ||||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||  ||    
T  5713 agtggacaatgcccaccaggttcaaatctaaatacttttttgcagaagagttcccatactttgtttggaggcaagagttgcagtttgtgaacatgaacta 5812  T
Q  310 gaaaggattttttgaaaaaatctgcaacatacatcattctagtggtgatgataatcctactacctttattgttatttggcatggcaaattgaacctggtc 409  Q
     ||||||||| |||||||| || ||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  5813 taaaggatttcttgaaaaattcggcaacaagcatcattcttgtggtgattataatcctactacctttattgttattaggcatggcaaattcaacctggtc 5912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University