View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6029_low_12 (Length: 338)

Name: NF6029_low_12
Description: NF6029
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6029_low_12
NF6029_low_12
[»] scaffold0440 (1 HSPs)
scaffold0440 (1-317)||(1251-1567)
[»] chr5 (27 HSPs)
chr5 (1-316)||(12686236-12686551)
chr5 (1-316)||(12692338-12692653)
chr5 (1-316)||(28525443-28525758)
chr5 (1-316)||(28531539-28531854)
chr5 (1-316)||(7389605-7389920)
chr5 (1-314)||(41297068-41297379)
chr5 (87-316)||(32097165-32097395)
chr5 (5-291)||(30772094-30772381)
chr5 (1-316)||(19059821-19060143)
chr5 (87-316)||(32094364-32094594)
chr5 (10-313)||(20499928-20500231)
chr5 (1-316)||(30384435-30384756)
chr5 (1-313)||(19066164-19066481)
chr5 (131-316)||(14609957-14610141)
chr5 (1-125)||(32094217-32094340)
chr5 (1-101)||(24054336-24054437)
chr5 (1-122)||(32097018-32097138)
chr5 (1-79)||(16215231-16215309)
chr5 (5-72)||(28542269-28542336)
chr5 (9-68)||(14610184-14610243)
chr5 (176-284)||(26318492-26318599)
chr5 (54-197)||(8706532-8706672)
chr5 (11-69)||(37896365-37896423)
chr5 (1-279)||(26509674-26509952)
chr5 (190-316)||(33753481-33753606)
chr5 (5-74)||(26316853-26316922)
chr5 (190-316)||(33849115-33849240)
[»] chr7 (28 HSPs)
chr7 (1-316)||(28421016-28421331)
chr7 (1-316)||(3817368-3817683)
chr7 (1-316)||(3811226-3811541)
chr7 (1-315)||(351575-351888)
chr7 (1-291)||(20238762-20239053)
chr7 (1-315)||(339169-339473)
chr7 (1-314)||(5979231-5979546)
chr7 (62-316)||(15843733-15843988)
chr7 (62-316)||(15860842-15861097)
chr7 (1-314)||(35148061-35148379)
chr7 (5-316)||(43539764-43540083)
chr7 (4-316)||(5849317-5849624)
chr7 (7-316)||(22741988-22742302)
chr7 (1-150)||(42767352-42767501)
chr7 (1-126)||(26383603-26383728)
chr7 (1-136)||(30219303-30219438)
chr7 (164-312)||(26380876-26381023)
chr7 (141-268)||(35150736-35150865)
chr7 (4-209)||(12803893-12804099)
chr7 (203-315)||(26383457-26383569)
chr7 (73-239)||(7608306-7608475)
chr7 (1-71)||(18666553-18666622)
chr7 (163-239)||(3677889-3677965)
chr7 (174-279)||(18656883-18656988)
chr7 (264-316)||(35152849-35152901)
chr7 (47-126)||(26381056-26381134)
chr7 (244-316)||(42767505-42767574)
chr7 (164-197)||(24690848-24690881)
[»] chr6 (22 HSPs)
chr6 (1-316)||(8650860-8651176)
chr6 (1-315)||(4580378-4580693)
chr6 (1-316)||(21190923-21191242)
chr6 (1-316)||(25353998-25354313)
chr6 (1-316)||(25343412-25343726)
chr6 (5-315)||(31756276-31756591)
chr6 (1-146)||(32035343-32035488)
chr6 (1-132)||(21782810-21782941)
chr6 (1-316)||(21770615-21770938)
chr6 (1-316)||(21197078-21197413)
chr6 (1-316)||(17581423-17581728)
chr6 (1-316)||(21783366-21783698)
chr6 (1-316)||(21789589-21789921)
chr6 (1-85)||(8662838-8662922)
chr6 (1-122)||(18778564-18778685)
chr6 (187-314)||(30905825-30905951)
chr6 (1-71)||(34603387-34603457)
chr6 (1-71)||(34724664-34724734)
chr6 (167-316)||(28728071-28728218)
chr6 (3-85)||(6097999-6098077)
chr6 (163-229)||(20745431-20745497)
chr6 (23-87)||(1106229-1106294)
[»] chr3 (33 HSPs)
chr3 (1-316)||(11839782-11840098)
chr3 (1-316)||(10244391-10244707)
chr3 (1-316)||(38455607-38455923)
chr3 (5-316)||(10760711-10761023)
chr3 (1-316)||(38449120-38449436)
chr3 (1-316)||(8331574-8331889)
chr3 (1-316)||(17055850-17056165)
chr3 (1-316)||(49151399-49151714)
chr3 (1-316)||(49157466-49157781)
chr3 (1-316)||(10238269-10238585)
chr3 (1-316)||(42191277-42191593)
chr3 (1-316)||(42197219-42197535)
chr3 (1-316)||(30051159-30051473)
chr3 (5-291)||(55003473-55003756)
chr3 (108-316)||(10769133-10769342)
chr3 (1-220)||(11846120-11846340)
chr3 (20-313)||(13444847-13445144)
chr3 (1-143)||(17593339-17593481)
chr3 (1-316)||(48128104-48128412)
chr3 (166-316)||(26429639-26429790)
chr3 (1-111)||(10766928-10767038)
chr3 (1-314)||(53069111-53069421)
chr3 (1-316)||(28964667-28964970)
chr3 (1-245)||(34300348-34300599)
chr3 (145-243)||(13837534-13837632)
chr3 (5-146)||(46656638-46656782)
chr3 (4-286)||(12108728-12109008)
chr3 (203-304)||(2982484-2982585)
chr3 (220-316)||(13367114-13367209)
chr3 (211-272)||(52222573-52222634)
chr3 (220-315)||(9760506-9760600)
chr3 (164-206)||(24643773-24643815)
chr3 (167-316)||(46656467-46656610)
[»] chr8 (19 HSPs)
chr8 (1-316)||(5542217-5542533)
chr8 (1-316)||(32890675-32890991)
chr8 (1-316)||(32896799-32897115)
chr8 (1-316)||(36818759-36819073)
chr8 (1-281)||(14417763-14418043)
chr8 (1-316)||(42993061-42993373)
chr8 (1-316)||(9935070-9935381)
chr8 (5-316)||(10699816-10700127)
chr8 (17-316)||(10705625-10705923)
chr8 (5-316)||(22219778-22220100)
chr8 (5-245)||(39735613-39735849)
chr8 (1-280)||(39727377-39727645)
chr8 (164-316)||(42033588-42033740)
chr8 (1-134)||(7771202-7771334)
chr8 (1-93)||(14799473-14799564)
chr8 (1-128)||(1882809-1882939)
chr8 (164-276)||(1883039-1883151)
chr8 (34-200)||(1171249-1171414)
chr8 (214-247)||(1171216-1171249)
[»] chr1 (17 HSPs)
chr1 (1-315)||(25387561-25387876)
chr1 (1-316)||(34739773-34740088)
chr1 (1-315)||(25381592-25381907)
chr1 (1-316)||(50305984-50306291)
chr1 (1-316)||(31051331-31051646)
chr1 (5-316)||(8092907-8093218)
chr1 (1-316)||(31057831-31058146)
chr1 (1-316)||(44409787-44410112)
chr1 (139-316)||(1078031-1078209)
chr1 (4-316)||(24926814-24927133)
chr1 (23-316)||(38152048-38152335)
chr1 (1-247)||(24963759-24964012)
chr1 (1-315)||(27954951-27955263)
chr1 (1-99)||(1078228-1078326)
chr1 (1-101)||(12183641-12183740)
chr1 (171-222)||(12183816-12183867)
chr1 (189-240)||(23254013-23254063)
[»] chr2 (21 HSPs)
chr2 (1-316)||(13455886-13456202)
chr2 (1-316)||(13461827-13462143)
chr2 (1-316)||(28683002-28683317)
chr2 (1-316)||(36750201-36750517)
chr2 (5-316)||(44716866-44717178)
chr2 (1-316)||(30965114-30965430)
chr2 (1-316)||(31002163-31002479)
chr2 (1-316)||(31008141-31008457)
chr2 (1-316)||(13149743-13150062)
chr2 (1-316)||(35090706-35091025)
chr2 (1-316)||(35084733-35085052)
chr2 (1-316)||(11048610-11048927)
chr2 (1-306)||(23343351-23343663)
chr2 (5-253)||(35438770-35439014)
chr2 (166-283)||(19879418-19879536)
chr2 (244-316)||(35439671-35439743)
chr2 (5-226)||(29833079-29833306)
chr2 (165-227)||(29034697-29034759)
chr2 (74-323)||(28765362-28765610)
chr2 (5-44)||(31651664-31651703)
chr2 (264-316)||(23284732-23284784)
[»] scaffold0208 (2 HSPs)
scaffold0208 (1-316)||(6309-6625)
scaffold0208 (5-316)||(12182-12494)
[»] chr4 (31 HSPs)
chr4 (1-316)||(10739396-10739709)
chr4 (1-316)||(10953165-10953478)
chr4 (1-316)||(24287774-24288089)
chr4 (1-316)||(6257262-6257577)
chr4 (1-313)||(33458324-33458636)
chr4 (1-316)||(48160746-48161061)
chr4 (1-316)||(48166965-48167280)
chr4 (1-312)||(33461450-33461760)
chr4 (5-197)||(10733307-10733499)
chr4 (5-197)||(10947076-10947268)
chr4 (96-316)||(10733504-10733722)
chr4 (96-316)||(10947273-10947491)
chr4 (9-316)||(44831677-44831987)
chr4 (1-313)||(49976382-49976689)
chr4 (1-313)||(50168385-50168695)
chr4 (164-316)||(26957023-26957176)
chr4 (12-292)||(4632192-4632482)
chr4 (1-123)||(26963398-26963518)
chr4 (1-239)||(3769434-3769669)
chr4 (1-313)||(19686385-19686687)
chr4 (132-234)||(35177666-35177770)
chr4 (213-316)||(26971824-26971927)
chr4 (14-291)||(50155770-50156046)
chr4 (4-115)||(50427356-50427474)
chr4 (1-64)||(9237402-9237465)
chr4 (166-239)||(17627002-17627075)
chr4 (163-241)||(32284542-32284620)
chr4 (163-241)||(33045107-33045185)
chr4 (179-222)||(50427238-50427281)
chr4 (38-127)||(31986745-31986833)
chr4 (5-61)||(28704553-28704609)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (1-316)||(172947-173262)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (1-281)||(676-956)
[»] scaffold0236 (1 HSPs)
scaffold0236 (1-173)||(5465-5637)
[»] scaffold1114 (1 HSPs)
scaffold1114 (17-314)||(852-1174)
[»] scaffold0085 (2 HSPs)
scaffold0085 (1-99)||(38434-38530)
scaffold0085 (187-240)||(38290-38343)
[»] scaffold0185 (3 HSPs)
scaffold0185 (1-82)||(5945-6025)
scaffold0185 (159-222)||(5826-5889)
scaffold0185 (250-314)||(5758-5821)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (259-316)||(14060-14117)


Alignment Details
Target: scaffold0440 (Bit Score: 293; Significance: 1e-164; HSPs: 1)
Name: scaffold0440
Description:

Target: scaffold0440; HSP #1
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 317
Target Start/End: Original strand, 1251 - 1567
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1251 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgatatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 1350  T
Q  101 aaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggta 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1351 aaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcgactgatttggtttttcctcaaccggta 1450  T
Q  201 catttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatttgatgggcattagg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  1451 catttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagg 1550  T
Q  301 atttcccattattccgg 317  Q
    |||| ||||||||||||    
T  1551 attttccattattccgg 1567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 272; Significance: 1e-152; HSPs: 27)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 12686236 - 12686551
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12686236 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattaggctattaggaatacctggataaagctttc 12686335  T
Q  101 aaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggta 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12686336 aaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggta 12686435  T
Q  201 catttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatttgatgggcattagg 300  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12686436 cctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatatttgatggccattagg 12686535  T
Q  301 atttcccattattccg 316  Q
     |||||||||||||||    
T  12686536 gtttcccattattccg 12686551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 12692338 - 12692653
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12692338 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattaggctattaggaatacctggataaagctttc 12692437  T
Q  101 aaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggta 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12692438 aaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggta 12692537  T
Q  201 catttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatttgatgggcattagg 300  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12692538 cctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatatttgatggccattagg 12692637  T
Q  301 atttcccattattccg 316  Q
     |||||||||||||||    
T  12692638 gtttcccattattccg 12692653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 248; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 28525443 - 28525758
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28525443 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttattaaggatattaagaattagggtattatgaatacctggataaagctttc 28525542  T
Q  101 aaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggta 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  28525543 aaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagtcagcggtggctgatttgattcttcctcaaccggta 28525642  T
Q  201 catttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatttgatgggcattagg 300  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  28525643 cctttatgcctcacgttctcttcagatggggagaagagagagtttgccatgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagg 28525742  T
Q  301 atttcccattattccg 316  Q
     |||||||||||||||    
T  28525743 gtttcccattattccg 28525758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 28531539 - 28531854
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28531539 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttattaaggatattaagaattagggtattatgaatacctggataaagctttc 28531638  T
Q  101 aaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggta 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| || |||||||||| |||    
T  28531639 aaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagtcagcggtggctgatttgattcttcctcaaccagta 28531738  T
Q  201 catttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatttgatgggcattagg 300  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  28531739 cctttatgcctcacgttctcttcagatggggagaagagagagtttgccatgtacggtatattggagaccatagcctcttttatattggatggccattagg 28531838  T
Q  301 atttcccattattccg 316  Q
     |||||||||||||||    
T  28531839 gtttcccattattccg 28531854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 7389605 - 7389920
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  7389605 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatccacgacatgtttgatttatcaag-atattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttt 7389703  T
Q  101 aaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggta 200  Q
       ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  7389704 gtagccgctctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcgactgatttggttcttcctcaaccggta 7389803  T
Q  201 catttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagag-tttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatttgatgggcattag 299  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||   ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  7389804 cctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagttttgccgtgtacagtatattgggaaccatagcctcttttatattggatggccattag 7389903  T
Q  300 gatttcccattattccg 316  Q
      |||||||||||||||    
T  7389904 agtttcccattattccg 7389920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 41297379 - 41297068
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      |||||    
T  41297379 aaacaaaacattgaacataattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatataaagaattagggtattaggaatacctgg------ctttc 41297286  T
Q  101 aaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggta 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41297285 aaggcaaccctctcatcaacaacgataaccaaggagaggaggtgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggta 41297186  T
Q  201 catttatgcctca---agttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatttgatgggcat 296  Q
    | |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||    
T  41297185 cctttatgcctcaagtagttctcttcagatggggagaagagagagtattgtcgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatgaccat 41297086  T
Q  297 taggatttcccattattc 314  Q
    |||| |||||||||||||    
T  41297085 tagggtttcccattattc 41297068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 87 - 316
Target Start/End: Original strand, 32097165 - 32097395
Alignment:
Q  87 tggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggttt 186  Q
    |||||||||||||||  ||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||     
T  32097165 tggataaagctttcatagcagccctttaatcaacaacgataaccaaagagatgagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttagttc 32097264  T
Q  187 ttcctcaaccggtacatttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatat 285  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | ||||| | | |||||||||||||||||||||||||||    
T  32097265 ttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaatagagagtatttccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatat 32097364  T
Q  286 ttgatgggcattaggatttcccattattccg 316  Q
    | ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  32097365 tggatggccattagggtttcccattattccg 32097395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 5 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 30772381 - 30772094
Alignment:
Q  5 aaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcaagg 104  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||    
T  30772381 aaaacaatgaacatgattatgatcggatcgacaacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggattacctggataaagtttttatgg 30772282  T
Q  105 catccctctcatcaacaacgataaccaa-agagag-gagatgatctgaaacagacaatagag--ttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggta 200  Q
    || |||||||| ||||||   ||| ||| |||  | | |||||||||||||| |||| | ||  |||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  30772281 cagccctctcaacaacaa---taaacaagagaaggtgtgatgatctgaaacacacaacaaagggttagcggcggctgatttgattcttcctcaaccggta 30772185  T
Q  201 catttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatttgatg 291  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  30772184 cctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgtcgtgtctgatatattgtggaccatagtctcttctatattggatg 30772094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 19059821 - 19060143
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggata--aagctt 98  Q
    |||||||| ||| ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||    
T  19059821 aaacaaaatattaaacatgaatataaacggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattagaaatacctggagatgaagctt 19059920  T
Q  99 tcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagaca---------atagagttagcggcggctgatttggtttttc 189  Q
    |   |||| |||||||  ||||||||||||    |||||| || |||||||||||| |||         | |  |||||||||||||||||||||| |||    
T  19059921 tggtggcagccctctcgacaacaacgataa----agagagaaggtgatctgaaacaaacatccacatcaacacggttagcggcggctgatttggttcttc 19060016  T
Q  190 ctcaaccggtacatttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatttga 289  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19060017 ctcaactggtacttttatgcctcaagttctcttcatatcgggagaagagagagtttgtcgtgtctgatgtattggggaccatagcctcttttatattgga 19060116  T
Q  290 tgggcattaggatttcccattattccg 316  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  19060117 tggccattagggtttcccattattccg 19060143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 87 - 316
Target Start/End: Original strand, 32094364 - 32094594
Alignment:
Q  87 tggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggttt 186  Q
    ||||||||| |||||  ||| |||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  32094364 tggataaaggtttcatagcagccctttaatcaacaacaataaccaaagagagaagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctaatttggttc 32094463  T
Q  187 ttcctcaaccggtacatttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatat 285  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  32094464 ttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgtcgtgtacggtgtatttgggaccatagcctcttttatat 32094563  T
Q  286 ttgatgggcattaggatttcccattattccg 316  Q
    | ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  32094564 tagatggccattagggtttcccattattccg 32094594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 10 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 20500231 - 20499928
Alignment:
Q  10 attgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcaaggcatcc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| | |||| ||    
T  20500231 attgaacatgattatgatcggatctacgacatacttgatttatcaaggatactaagaattagagtattagaaatacctggataaaacttttatggcagcc 20500132  T
Q  110 ctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggtacatttatgc 209  Q
    |||||| || ||||||||| || |||||  ||  ||||||||||| |||| |  |||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  20500131 ctctcaacatcaacgataaacagagaga-aaggcgatctgaaacaaacaagaaggttagcagcggttgatttggttcttccttaaccggtacatttatgc 20500033  T
Q  210 ctcaagttctcttcagatggggagaagagagag-tttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatttgatgggcattaggatttccca 308  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||| ||||| | | ||||||||||||||||||||| | |||| ||||  ||||||| ||| |||    
T  20500032 ctcaagttctcttcaaatggagagaacagagagttttgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttatttattggatgaccattagggttttcca 20499933  T
Q  309 ttatt 313  Q
    |||||    
T  20499932 ttatt 20499928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 30384435 - 30384756
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  30384435 aaacaaaacattgaacacgattatgatcggatcta-gacatgtctgatttatcaaggatattaagaataagggtattaagaatacctggatgaagctttc 30384533  T
Q  101 aaggcatccctctcatcaacaacgat---aaccaaagagaggagatg-----atctgaaacagacaatagag-ttagcggcggctgatttggtttttcct 191  Q
      | || | |||||  || |||||||   || ||| |||||||||||     |||||||||| |||| | || ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  30384534 gtgacaactctctcgccatcaacgatctaaaacaaggagaggagatgatctaatctgaaacacacaacatagcttagcggcgactgatttggttcttcct 30384633  T
Q  192 caaccggtacatttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatttgatg 291  Q
    |||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| | | |||| |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  30384634 caaccggtacctttatacctcgagttctcttcagatggggagaagagaatgtttgccgtgtacggtgtatt-gggaccatagtctcttttatattggatg 30384732  T
Q  292 ggcattaggatttcccattattccg 316  Q
       |||| ||||| |||||||||||    
T  30384733 actatta-gattttccattattccg 30384756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 19066164 - 19066481
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggata--aagctt 98  Q
    |||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |  ||||||    
T  19066164 aaacaaaacattaagcatgaatatgaacggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattatggtattaggaataccaggagatgaagctt 19066263  T
Q  99 tcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagac-------aatagagttagcggcggctgatttggtttttcct 191  Q
    |   |||| | |||||  ||||||||||||    |||||| |  |||||||||||| ||       || |  ||||||||| ||||||||| || |||||    
T  19066264 tggtggcagctctctcgacaacaacgataa----agagagaaagtgatctgaaacaaacccacatcaacacggttagcggcagctgatttgattcttcct 19066359  T
Q  192 caaccggtacatttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatttgatg 291  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  | | |||||||||||| | ||| ||||||||| ||||    
T  19066360 caaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgtcgtgtccggtgtattggggaccacaacctattttatattggatg 19066459  T
Q  292 ggcattaggatttcccattatt 313  Q
    | ||||||| ||| ||||||||    
T  19066460 gtcattagggttttccattatt 19066481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 131 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 14610141 - 14609957
Alignment:
Q  131 aaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggtacatttatgcctcaagttctcttcagatggg 230  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14610141 aaagagaggagatgatctgaaacaaacaaaagggttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacttttatgcctaaagttctcttcagatggg 14610042  T
Q  231 gagaagagagagtttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatttgatgggcattaggatttcccattattccg 316  Q
    ||||| ||| ||||||| ||||  | | |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||  ||||||| ||| |||||||||||    
T  14610041 gagaaaagaaagtttgccgtgttcggtgtattggggaccataacctcttttacattagatgaccattagggttt-ccattattccg 14609957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Original strand, 32094217 - 32094340
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32094217 aaacaaaacattgaacatgattatgataggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaatta-ggtattaggaatacctgaataaagctttc 32094315  T
Q  101 aaggcatccctctcatcaacaacga 125  Q
    |  ||| |||||||| |||||||||    
T  32094316 atagcagccctctcaacaacaacga 32094340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 24054437 - 24054336
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattaggg-tattaggaatacctggataaagcttt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24054437 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaatttgggatattaggaatacctggataaagcttt 24054338  T
Q  100 ca 101  Q
    ||    
T  24054337 ca 24054336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Original strand, 32097018 - 32097138
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||    
T  32097018 aaacaaaacattgaacatgattatgataggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaatta-ggtattaggattacctgaataaagctttc 32097116  T
Q  101 aaggcatccctctcatcaacaa 122  Q
    |  |||  ||||||| ||||||    
T  32097117 atagcagtcctctcaacaacaa 32097138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 79
Target Start/End: Original strand, 16215231 - 16215309
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattag 79  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16215231 aaacaaaacatttaacatgattatgattggatctacgaaatgtttgatttatcaaggatattaaaaattagggtattag 16215309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 5 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 28542336 - 28542269
Alignment:
Q  5 aaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagg 72  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28542336 aaaacattgaacatgattatgatcgaaactacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagg 28542269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 9 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 14610243 - 14610184
Alignment:
Q  9 cattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaat 68  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14610243 cattgaacatgattatgatcggatttacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaat 14610184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 176 - 284
Target Start/End: Original strand, 26318492 - 26318599
Alignment:
Q  176 tgatttggtttttcctcaaccggtacatttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgcggtgtatgatatattggggaccatagcc 275  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || |  ||||||||||||| |||||||    
T  26318492 tgatttggttctttctcaaccggtacatttataccataagttctcttcagat-gggagaagagagagtttgtcgtttccgatatattggggatcatagcc 26318590  T
Q  276 tcttttata 284  Q
    |||| ||||    
T  26318591 tcttatata 26318599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 54 - 197
Target Start/End: Original strand, 8706532 - 8706672
Alignment:
Q  54 aaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaac 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| | || || ||||| || ||||    || |||||||||||||||||||||||    
T  8706532 aaggatattaagaattagggtattaggaatacctgaattatgctttcatgacaaccatctcaacagcaac----acgaaagagaggagatgatctgaaac 8706627  T
Q  154 aga-caatagagttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccg 197  Q
    | |   |  | ||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  8706628 aaattgaaggggttagcgacggctgatttggttcttcctcaaccg 8706672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 69
Target Start/End: Original strand, 37896365 - 37896423
Alignment:
Q  11 ttgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaatt 69  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  37896365 ttgaacatgattatgatcggatctacgacatgattgatttatcaagaatattaataatt 37896423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 26509952 - 26509674
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||   | ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||  || || |||||||     
T  26509952 aaacaaaacattgaacataattatgatataaactacgacatatttgattcatcaa-gatattaagaatta-ggtattaggaatatatgaatgaagctttg 26509855  T
Q  101 aaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagat---gatctgaaacagaca--atagagttagcggcggctgatttggtttttcctcaac 195  Q
    | | ||  ||||||| || |||||||    ||||||  || ||   ||||||||| | |||  |||||||  | ||||||||||||| |  ||||||||     
T  26509854 atgacagtcctctcaacatcaacgat-ctgaaagaggagaaatcgcgatctgaaatacacaacatagagtcggtggcggctgatttgatacttcctcaat 26509756  T
Q  196 cggtacatttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctctt 279  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| ||||||  ||| ||| |||||||| | ||||| | ||||| | |||||||| ||||||    
T  26509755 cggtacctttatgcctctagttctcatcagat--ggaaaagggagagtttaccgtgtacggtatatcgtggaccataacctctt 26509674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 190 - 316
Target Start/End: Original strand, 33753481 - 33753606
Alignment:
Q  190 ctcaaccggtacatttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatttga 289  Q
    ||||| |||||  |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||  ||||| | | || || ||| ||||| |||||||| || |||    
T  33753481 ctcaaacggtatttttatgcctcaagttctccttggatggggagaagagagagtatggtgtgtacggtgtactgaggaacataggctctttta-atatga 33753579  T
Q  290 tgggcattaggatttcccattattccg 316  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  33753580 tggtcattagggtttcccattattccg 33753606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 74
Target Start/End: Original strand, 26316853 - 26316922
Alignment:
Q  5 aaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggt 74  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||    
T  26316853 aaaacattgaacattaatatgattggatctaggacatgtttgatttatctacggtattaataattagggt 26316922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 190 - 316
Target Start/End: Original strand, 33849115 - 33849240
Alignment:
Q  190 ctcaaccggtacatttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatttga 289  Q
    ||||| |||||  |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||  |||||   | || || ||| ||||| |||||||| || |||    
T  33849115 ctcaaacggtatttttatgcctcaagttctccttggatggggagaagagagagtatggtgtgtacagtgtactgaggaacataggctctttta-atatga 33849213  T
Q  290 tgggcattaggatttcccattattccg 316  Q
    | | ||||||| |||||||||||||||    
T  33849214 tagtcattagggtttcccattattccg 33849240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 268; Significance: 1e-149; HSPs: 28)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 28421016 - 28421331
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28421016 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattaggctattaggaatacctggataaagctttc 28421115  T
Q  101 aaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggta 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28421116 aaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggta 28421215  T
Q  201 catttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatttgatgggcattagg 300  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  28421216 cctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagg 28421315  T
Q  301 atttcccattattccg 316  Q
     |||||||||||||||    
T  28421316 gtttcccattattccg 28421331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 3817368 - 3817683
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3817368 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 3817467  T
Q  101 aaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggta 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  3817468 aaggcaaccctctcatcaacaacgataaccaaagagagaagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccagta 3817567  T
Q  201 catttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatttgatgggcattagg 300  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||    
T  3817568 cctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatgaccattagg 3817667  T
Q  301 atttcccattattccg 316  Q
     |||||||||||||||    
T  3817668 gtttcccattattccg 3817683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 3811226 - 3811541
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3811226 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 3811325  T
Q  101 aaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggta 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  3811326 aaggcaaccctctcatcaacaacgataacaaaagagagaagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccagta 3811425  T
Q  201 catttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatttgatgggcattagg 300  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||    
T  3811426 cctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatgaccattagg 3811525  T
Q  301 atttcccattattccg 316  Q
     |||||||||||||||    
T  3811526 gtttcccattattccg 3811541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 351888 - 351575
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  351888 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattaggctattaggaatacctggataaagctttc 351789  T
Q  101 aaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggta 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  351788 aaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaa-agaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttgattcttcctcaaccggta 351690  T
Q  201 catttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatttgatgggcattagg 300  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  351689 cctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagg 351590  T
Q  301 atttcccattattcc 315  Q
     ||||||||||||||    
T  351589 gtttcccattattcc 351575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 20239053 - 20238762
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20239053 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 20238954  T
Q  101 aaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggta 200  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20238953 aaggcagccctctcatcaacaacaataaccaaagagatgagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggta 20238854  T
Q  201 catttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatttgatg 291  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20238853 cctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatg 20238762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 339473 - 339169
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||       
T  339473 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattaggctattaggaatacctggataaagct--- 339377  T
Q  101 aaggcatccctctcatcaacaac---gataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccg 197  Q
             ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  339376 ---------ctctcatcaacaacaatgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttgattcttcctcaaccg 339286  T
Q  198 gtacatttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatttgatgggcatt 297  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||    
T  339285 gtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgtcgtgtacggtatattggggaccatgacctcttttatattggatggccatt 339186  T
Q  298 aggatttcccattattcc 315  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  339185 agg-tttcccattattcc 339169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Original strand, 5979231 - 5979546
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 100  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5979231 aaacaaactattgaacatgattatgattggatctacgacatgtttgatttattaaggatgttaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttt 5979330  T
Q  101 aaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggta 200  Q
       ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  5979331 gtagcagctctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcgactaatttggttcttcctcaaccggta 5979430  T
Q  201 catttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctctttta-tatttgatgggcatta 298  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| | | |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||||    
T  5979431 cttttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgtcgtgtacggtgtattggggaccataacctcttttattattggatgaccatta 5979530  T
Q  299 ggatttcccattattc 314  Q
    |  |||||||||||||    
T  5979531 gactttcccattattc 5979546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 62 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 15843988 - 15843733
Alignment:
Q  62 taagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaata 161  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  15843988 taagaattagggtattaggaatacctggatcaagctttcatagcagccctctaatcaacaacaataaccaaagagaggagatgatcggaaacacacaata 15843889  T
Q  162 gagttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggtacatttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgcggtgta-tgatata 260  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  | | ||    
T  15843888 gagttagcggcggctgatttggttcttcctcaactggtacatttatgcctcaagttctcttcagatggggagaatagagagtttgccgtgtaccggtgta 15843789  T
Q  261 ttggggaccatagcctcttttatatttgatgggcattaggatttcccattattccg 316  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||  |||||||||||||||    
T  15843788 ttggagaccataacctcttttatattggatgaccattagagtttcccattattccg 15843733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 62 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 15861097 - 15860842
Alignment:
Q  62 taagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaata 161  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  15861097 taagaattagggtattaggaatacctggatcaagctttcatagcagccctctaatcaacaacaataaccaaagagaggagatgatcggaaacacacaata 15860998  T
Q  162 gagttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggtacatttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgcggtgta-tgatata 260  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  | | ||    
T  15860997 gagttagcggcggctgatttggttcttcctcaactggtacatttatgcctcaagttctcttcagatggggagaatagagagtttgccgtgtaccggtgta 15860898  T
Q  261 ttggggaccatagcctcttttatatttgatgggcattaggatttcccattattccg 316  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||  |||||||||||||||    
T  15860897 ttggagaccataacctcttttatattggatgaccattagagtttcccattattccg 15860842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Original strand, 35148061 - 35148379
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattaggg-tattaggaatacctggataaagcttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  35148061 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacacgtttgatttatcaaggatattaagaattaggggtattaggaatacctggataaagcttt 35148160  T
Q  100 caaggcatccctctcatcaacaacgataacca--aagagaggagatgatctgaaacagacaataga--gttagcggcggctgatttggtttttcctcaac 195  Q
    || || | |||||  | ||||||| | ||  |  |  ||  | |||||||||||||| |||| | |  || ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  35148161 catggtagccctcgtaacaacaacaacaaatatgagaaggtgggatgatctgaaacacacaaaatatggtcagcagcggctgatttggttcttcctcaac 35148260  T
Q  196 cggtacatttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatttgatgggca 295  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||    
T  35148261 cggtacctttatgcctcaaattctcttcagatggggagaagagagagtttgccatgtacggtgtattggggatcatagcctcttttatattggatggcca 35148360  T
Q  296 ttaggatttcccattattc 314  Q
    ||||  |||||||||||||    
T  35148361 ttagagtttcccattattc 35148379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 5 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 43540083 - 43539764
Alignment:
Q  5 aaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcaagg 104  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |       
T  43540083 aaaatattgaacatgattatgatcggatctacaacatgtttgatttatcaagaatattaaaaattagggtattatgaatacctggatgaagctttgataa 43539984  T
Q  105 catccctctcatcaacaacgataaccaaagagagga---gatgatctgaaacagac--aatagagttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggt 199  Q
    ||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||| ||  ||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||    
T  43539983 caatcctctcaacaacaacgataaacaaagagaggaggtgatgatctgaaacacacaaaatatggttagcggcgactgatttggttcttcctcaaccagt 43539884  T
Q  200 acatttatgcctcaagttctcttcagatgg---ggagaagagagagtttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatttgatgggcat 296  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||  |||    
T  43539883 acctttatgcctaaagttctcttcagatgggaaggagaagagagagtttgccgtgcacggtatattggggaccataacctcttttatattgggtgaccat 43539784  T
Q  297 taggatttcccattattccg 316  Q
    |||| ||| || ||||||||    
T  43539783 tagggttttccgttattccg 43539764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 4 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 5849624 - 5849317
Alignment:
Q  4 caaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcaag 103  Q
    ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | |    
T  5849624 caaaacattgaacataaatatgaacggatctacgacatgtttgatttatcaaggatatcaagaattaggatattaggaatacctggatgaagctttaatg 5849525  T
Q  104 gcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaataga-gttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggtaca 202  Q
     || | |||||| ||||||||||       ||||    ||||||||||| | |||| | | |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||     
T  5849524 acagctctctcaacaacaacgatg------gagaaactatgatctgaaatacacaacatatgttagcggcgtctgatttggttcttcctcaaccggtacc 5849431  T
Q  203 tttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatttgatgggcattaggat 302  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  ||||| | |    
T  5849430 tttatgcctcaagttatcttcagatggggagaaaagagagtttgccgtgtacggtatattgaggaccatagcctcttttatattggatgaccattaaggt 5849331  T
Q  303 ttcccattattccg 316  Q
    ||| ||||||||||    
T  5849330 ttctcattattccg 5849317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 7 - 316
Target Start/End: Original strand, 22741988 - 22742302
Alignment:
Q  7 aacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcaaggca 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||| ||||| |   ||||    
T  22741988 aacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaag-atattgaggattagg-tattaggaatacctggatgaagctatggtggca 22742085  T
Q  107 tccctctcatcaa-caacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacaga---------caatagagttagcggcggctgatttggtttttcctcaacc 196  Q
     ||||||   ||| |||||||||    |||||||||||||||||||||| |         ||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  22742086 gccctcttgacaaacaacgataa----agagaggagatgatctgaaacaaatatcaacatcaacacggttagcggcggctgatttggtttttcatcaact 22742181  T
Q  197 ggtacatttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagag-tttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatttgatgggca 295  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||| | |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| ||    
T  22742182 ggtacctttatgcctcaagttctcttcagattgggagaagagagagttttgccatgtacggtatattggagaccatagtctcttttatattggatggcca 22742281  T
Q  296 ttaggatttcccattattccg 316  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  22742282 ttagggtttcccattattccg 22742302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 42767352 - 42767501
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  42767352 aaacaaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatatttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttt 42767451  T
Q  101 aaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctga 150  Q
       ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  42767452 gtagcagccctctcatcaacaacgataatcaaagagagaagatgatctga 42767501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 26383728 - 26383603
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 100  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||     
T  26383728 aaacaaaatattgaacatgatcatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaagcatactaagaattagggtattaggaataccttgatgaagctttg 26383629  T
Q  101 aaggcatccctctcatcaacaacgat 126  Q
    | |||| |||||||| ||||||||||    
T  26383628 atggcagccctctcaacaacaacgat 26383603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 30219303 - 30219438
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 100  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30219303 aaacaaaacgttgaacatgaatatgaacggatctacgacatgtttgatttattaaagatattaagaattatggtattaggaatatctggataaagctttc 30219402  T
Q  101 aaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagag 136  Q
    | | || || ||||| || ||||||||| |||||||    
T  30219403 atgacaaccatctcagcatcaacgataaacaaagag 30219438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 164 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 26381023 - 26380876
Alignment:
Q  164 gttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggtacatttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgcggtgtatgatatattg 263  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||| || ||    
T  26381023 gttagcggcggctgatttggttcttcctcaactgctacctttatgcctaaagttttcttcagatcgggagaagagagagtttgtcgtgtctgatgtactg 26380924  T
Q  264 gggaccatagcctcttttatatttgatgggcattaggatttcccattat 312  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||    
T  26380923 gggaccatag-ctcttttatattggatgaccattaagatttcccattat 26380876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 141 - 268
Target Start/End: Original strand, 35150736 - 35150865
Alignment:
Q  141 gatgatctgaaacagacaataga--gttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggtacatttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagag 238  Q
    |||||||||||||| |||| | |  |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35150736 gatgatctgaaacacacaaaatatggttagcggcggctgatttggttattcttcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagag 35150835  T
Q  239 agagtttgcggtgtatgatatattggggac 268  Q
    |||||||||  |||| | | ||||||||||    
T  35150836 agagtttgccatgtacggtgtattggggac 35150865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 12804099 - 12803893
Alignment:
Q  4 caaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacct--ggataaagctttca 101  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||      
T  12804099 caaaacattgaacatgaacatgaacggatctacgacatgtttgatttatcaagaatattaagaattagggtattaagaatacctggggatgaagctttgg 12804000  T
Q  102 aggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacaga---caatagagttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccgg 198  Q
      ||| |||||||  ||||||||||    ||||||||||| |||| ||||||| |   ||| |  ||||||| || |||||| |||| ||||||||||||    
T  12803999 tagcagccctctcgacaacaacgat----aaagagaggaggtgatttgaaacaaacatcaacatggttagcgacgactgattaggttcttcctcaaccgg 12803904  T
Q  199 tacatttatgc 209  Q
    ||| |||||||    
T  12803903 tacctttatgc 12803893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 203 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 26383569 - 26383457
Alignment:
Q  203 tttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatttgatgggcattaggat 302  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||  | | |||| ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |    
T  26383569 tttatgcctcaagttctcttcaaatagggagaagagagagtttgccgtgtccggtgtattagggaccatagcctcttttatattggatgaccattagggt 26383470  T
Q  303 ttcccattattcc 315  Q
    |||||||||||||    
T  26383469 ttcccattattcc 26383457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 73 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 7608475 - 7608306
Alignment:
Q  73 gtattaggaatacctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagag--ttagcg 170  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||| | | ||  | |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||  || |  ||||||    
T  7608475 gtattagaaatatctgaataaagctttgatgacagtcatctcatcaacaatgataaccaaagagatgagatgatctgaaacacacataagcggattagcg 7608376  T
Q  171 gcggctgatttggtttttcctcaaccggtacatttatgcctcaagttctcttcagat-ggggagaagaga 239  Q
    ||| ||||||||||  ||||| || |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  7608375 gcgactgatttggtacttcctaaatcggtacctttatgactcaagttctcttccgatgggggagaagaga 7608306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 71
Target Start/End: Original strand, 18666553 - 18666622
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattag 71  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||    
T  18666553 aaacaaaacattgaacttgattatgatcagat-tacgacatgtttgatttagcaatgatattaataattag 18666622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 3677965 - 3677889
Alignment:
Q  163 agttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggtacatttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagaga 239  Q
    ||||| |||| | ||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  3677965 agttaccggcagttgatttgtttcttcctcaaccgatacttttatgcctcaatttctcttcagatggagagaagaga 3677889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 279
Target Start/End: Original strand, 18656883 - 18656988
Alignment:
Q  174 gctgatttggtttttcctcaaccggtacatttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgcggtgtatgatatattggggaccatag 273  Q
    |||||||||||| ||||||||| | ||| |||||| ||  ||||||||||||| || ||||||||| ||||||  ||||||| |  ||||| ||| ||||    
T  18656883 gctgatttggttcttcctcaactgttacttttatgtctttagttctcttcagacggagagaagagaaagtttgtcgtgtatggtgcattggagacaatag 18656982  T
Q  274 cctctt 279  Q
    ||||||    
T  18656983 cctctt 18656988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 264 - 316
Target Start/End: Original strand, 35152849 - 35152901
Alignment:
Q  264 gggaccatagcctcttttatatttgatgggcattaggatttcccattattccg 316  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  35152849 gggaccatagcctcttttatattggatgaccattagggtttcccattattccg 35152901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 47 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 26381134 - 26381056
Alignment:
Q  47 atttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgat 126  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| | | || |||||||| ||||||||||    
T  26381134 atttatcaagcatgctaagaattagggtattaggagta-ctggatgaagctttgatgacaaccctctcaacaacaacgat 26381056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 316
Target Start/End: Original strand, 42767505 - 42767574
Alignment:
Q  244 ttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatttgatgggcattaggatttcccattattccg 316  Q
    |||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||   |||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  42767505 ttgccgtgtacggtatattcgggaccatagcctcttttatat---atggccattagggtttcctattattccg 42767574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 24690881 - 24690848
Alignment:
Q  164 gttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccg 197  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24690881 gttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccg 24690848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 265; Significance: 1e-148; HSPs: 22)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 8650860 - 8651176
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8650860 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 8650959  T
Q  101 aaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggta 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8650960 aaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggta 8651059  T
Q  201 catttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatttgatgggcattag 299  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||    
T  8651060 cctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatgaccattag 8651159  T
Q  300 gatttcccattattccg 316  Q
    | |||||||||||||||    
T  8651160 ggtttcccattattccg 8651176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Original strand, 4580378 - 4580693
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  4580378 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttaccaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttt 4580477  T
Q  101 aaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggta 200  Q
        || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4580478 gtaacaaccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacgcaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggta 4580577  T
Q  201 catttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatttgatgggcattag 299  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  4580578 cctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggccattag 4580677  T
Q  300 gatttcccattattcc 315  Q
    | ||||||||||||||    
T  4580678 ggtttcccattattcc 4580693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 21190923 - 21191242
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21190923 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgatatatttgatttatcaaagatattaagaattagggtattagaaatacctggataaagctttc 21191022  T
Q  101 aaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggta 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21191023 aaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatatgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggta 21191122  T
Q  201 catttatgcc---tcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatttgatgggcat 296  Q
    | ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  21191123 cctttatgcctcatcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtaaggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccat 21191222  T
Q  297 taggatttcccattattccg 316  Q
    || | |||| ||||||||||    
T  21191223 tatggtttcacattattccg 21191242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 25354313 - 25353998
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25354313 aaacaaagcattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaag-atattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttt 25354215  T
Q  101 aaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggta 200  Q
       ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25354214 gtagcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggta 25354115  T
Q  201 catttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatttgatgggcattag 299  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||    
T  25354114 cctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgtcgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattagatgaccattag 25354015  T
Q  300 gatttcccattattccg 316  Q
      |||||||||||||||    
T  25354014 agtttcccattattccg 25353998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 25343726 - 25343412
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||     
T  25343726 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatttttgatttatcaag-atattaagaattagagtattaggaatacctagataaagctttt 25343628  T
Q  101 aaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggta 200  Q
       ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25343627 gtagcagccctttcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggta 25343528  T
Q  201 catttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatttgatgggcattag 299  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| | | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||    
T  25343527 cctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgtcgtgtacggtgtattgggga-catagcctcttttatattggatgaccattag 25343429  T
Q  300 gatttcccattattccg 316  Q
    | |||||||||||||||    
T  25343428 ggtttcccattattccg 25343412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 5 - 315
Target Start/End: Original strand, 31756276 - 31756591
Alignment:
Q  5 aaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcaagg 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |     
T  31756276 aaaacattgaacatgattataatcggatctacgacatgtttgaattatcaaggatattaagaattagggtattatgaatatctggatagagctttcatga 31756375  T
Q  105 catccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggag---atgatctgaaacagacaatagag--ttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggt 199  Q
    || |||||||| || |||| |||  || |||||||||   ||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  31756376 cagccctctcaacagcaaccatacacagagagaggaggtgatgatctgaaacacacaatatagggttagcggcggctgatttggttcttcctcaacaggt 31756475  T
Q  200 acatttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatttgatgggcattag 299  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  31756476 acctttatacctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgtcgtgtttgatatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattag 31756575  T
Q  300 gatttcccattattcc 315  Q
    | ||||||||||||||    
T  31756576 ggtttcccattattcc 31756591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Original strand, 32035343 - 32035488
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32035343 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggttattaagaattagggtattaggaatacctggataaacctttc 32035442  T
Q  101 aaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgat 146  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32035443 aaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgat 32035488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 21782810 - 21782941
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21782810 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatagctggataaagctttc 21782909  T
Q  101 aaggcatccctctcatcaacaacgataaccaa 132  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21782910 aaggcagccctctcatcaacaacgataaccaa 21782941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 21770615 - 21770938
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 100  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||     
T  21770615 aaacaaaacattgaacataaatatgaacggatctacgacatgtttgatttatcaaggatatcaagaattag--tattaggaatatctgaataaagctttt 21770712  T
Q  101 aaggcatccctctcatcaacaac---gataaccaaagagaggagatgatctgaaacagaca--------ataga--gttagcggcggctgatttggtttt 187  Q
    | |||| |||||||| |||||||   |||||  |  || ||||| |||||||||||| |||        ||  |  |||||| ||||||||||||||| |    
T  21770713 atggcagccctctcaacaacaacaacgataagga--gataggaggtgatctgaaacaaacatcaacttcatcaacggttagcagcggctgatttggttct 21770810  T
Q  188 tcctcaaccggtacatttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagag-tttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatt 286  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||| | | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21770811 tcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagat--ggagaagagagagttttgccgtgtacggtgtattggggaccgtagcctcttttatatt 21770908  T
Q  287 tgatgggcattaggatttcccattattccg 316  Q
     | ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  21770909 ggttggccattagggtttcccattattccg 21770938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 21197078 - 21197413
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 100  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||     
T  21197078 aaacaaaacattgaacataagtatgaacggatctacaacatgtttgatttatcaaggatatcaagaatta--gtattatgaatacctggataaatctttt 21197175  T
Q  101 aaggcatccctct---catcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagaca--------at--agagttagcggcggctgatttggtttt 187  Q
    | |||| ||||||   || ||||||||||||    ||||||||| |||| || |||| |||        ||  |  |||||||||||||||||||||| |    
T  21197176 atggcagccctctcaacaacaacaacgataa--ggagagaggaggtgatatggaacaaacatcaacttcatcaacggttagcggcggctgatttggttct 21197273  T
Q  188 tcctcaaccggtacatttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-----------ttgcggtgtatgatatattggggaccatagcct 276  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||| ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  21197274 tcctcaaccggtatctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgagtattgccgtgtacggtatattggggaccatagcct 21197373  T
Q  277 cttttatatttgatgggcattaggatttcccattattccg 316  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  21197374 cttttatattggatggccattaggttttcccattattccg 21197413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 17581728 - 17581423
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17581728 aaacaaaacattgaacatgattattataggatctacgacatgtttgatttaccaag---------aattagggtattaggaatacctggataaagctttc 17581638  T
Q  101 aaggcatccctctcatcaacaacgataaccaa-agagaggagatgatctgaaacagacaatagag-ttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccgg 198  Q
    | | || |||||||| ||||||| |  || |  ||||||||| ||||||||| || |||  |  | |||| ||| |||||||||||| |||||||||  |    
T  17581637 atgacagccctctcaacaacaacaacgacaaggagagaggaggtgatctgaagcaaacatcaacggttagtggcagctgatttggttcttcctcaacttg 17581538  T
Q  199 tacatttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagag-tttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatttgatgggcatt 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||   | |  |||||||||||||||||||||||||| || ||  |||    
T  17581537 tacatttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagttttgtcgtgt---acagtttggggaccatagcctcttttatattggacggttatt 17581441  T
Q  298 aggatttcccattattccg 316  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  17581440 agg-tttcccattattccg 17581423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 21783366 - 21783698
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 100  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||     
T  21783366 aaacaaaacattgaacataaatatgaacggatctacgacatgtttgatttatcaaggatatcaagaatta--gtattaggaatacctgaataaagctttt 21783463  T
Q  101 aaggcatccctctcatcaacaac---gataaccaaagagaggagatgatctgaaacagaca--------at--agagttagcggcggctgatttggtttt 187  Q
    | |||| |||||||| |||||||   |||||    ||||||||| |||| ||||||| |||        ||  |  |||| | ||||||||||||||| |    
T  21783464 atggcacccctctcaacaacaacaaagataa--ggagagaggaggtgatttgaaacaaacatcaacttcatcaacggttaacagcggctgatttggttct 21783561  T
Q  188 tcctcaaccgg------tacatttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagag-tttgcggtgtatgatatattgggg--accatagcctct 278  Q
    |||||||||||      ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | | ||||||||  ||||||||||||    
T  21783562 tcctcaaccggcacctttacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagttttgccgtgtacggtgtattggggacaccatagcctct 21783661  T
Q  279 tttatatttgatgggcattaggatttcccattattccg 316  Q
    |||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  21783662 tttatattggat-gccattagggtttcccattattccg 21783698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 21789589 - 21789921
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 100  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||     
T  21789589 aaacaaaacattgaacataaatatgaacggatctacgacatgtttgatttatcaaggatatcaagaatta--gtattaggaatacctgaataaagctttt 21789686  T
Q  101 aaggcatccctctcatcaacaac---gataaccaaagagaggagatgatctgaaacagaca--------at--agagttagcggcggctgatttggtttt 187  Q
    | |||| |||||||| |||||||   |||||    ||||||||| |||| ||||||| |||        ||  |  |||| | ||||||||||||||| |    
T  21789687 atggcacccctctcaacaacaacaaagataa--ggagagaggaggtgatttgaaacaaacatcaacttcatcaacggttaacagcggctgatttggttct 21789784  T
Q  188 tcctcaaccgg------tacatttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagag-tttgcggtgtatgatatattgggg--accatagcctct 278  Q
    |||||||||||      ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | | ||||||||  ||||||||||||    
T  21789785 tcctcaaccggcacctttacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagttttgccgtgtacggtgtattggggacaccatagcctct 21789884  T
Q  279 tttatatttgatgggcattaggatttcccattattccg 316  Q
    |||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  21789885 tttatattggat-gccattagggtttcccattattccg 21789921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 85
Target Start/End: Original strand, 8662838 - 8662922
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatac 85  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8662838 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattaggctattaggaatac 8662922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 18778685 - 18778564
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaatta-gggtattaggaatacctggataaagcttt 99  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  18778685 aaacaaaacgttgaacataattatgatcggatctacgacgtatttgatttatcaa-tatattaagaattaggggttttaggaatacctggataaaacttt 18778587  T
Q  100 caaggcatccctctcatcaacaa 122  Q
    || |||| |||||| | ||||||    
T  18778586 catggcagccctcttaacaacaa 18778564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 187 - 314
Target Start/End: Original strand, 30905825 - 30905951
Alignment:
Q  187 ttcctcaaccggtacatttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatt 286  Q
    ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30905825 ttcctcaattggtatatttatgcctcaagttctcttcagatgggg-gaagagagagtttgtcgagtacggtgtattgggaaccatagcctcttttatatt 30905923  T
Q  287 tgatgggcattaggatttcccattattc 314  Q
     ||||  ||||| | |||||||||||||    
T  30905924 ggatgaccattatggtttcccattattc 30905951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 71
Target Start/End: Original strand, 34603387 - 34603457
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattag 71  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34603387 aaacaaagcattgaacataattatgatcggatctatggcatgtttgatttatcaaggatattaacaattag 34603457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 71
Target Start/End: Original strand, 34724664 - 34724734
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattag 71  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34724664 aaacaaagcattgaacataattatgatcggatctatggcatgtttgatttatcaaggatattaacaattag 34724734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 167 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 28728218 - 28728071
Alignment:
Q  167 agcggcggctgatttggtttttcctcaaccggtacatttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgcggtgtatgatatattgggg 266  Q
    ||||||||||  || |||| ||||||||||||||| |  |||||  || | | ||||||||||||||||||| |  ||||| ||||| | ||||||||||    
T  28728218 agcggcggctagttaggttcttcctcaaccggtacctcgatgccctaa-tgcgcttcagatggggagaagagcggttttgctgtgtacggtatattgggg 28728120  T
Q  267 accatagcctcttttatatttgatgggcattaggatttcccattattccg 316  Q
    |||||||||||  ||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  28728119 accatagcctc-attatataggatggccattagggtttcccattattccg 28728071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 3 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 6098077 - 6097999
Alignment:
Q  3 acaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatac 85  Q
    ||||||||||||||||||    || |||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  6098077 acaaaacattgaacatgaa---gaacggatctacgacgtgtttgatttatcaag-atgttaagaattagggtattaggaatac 6097999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 163 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 20745497 - 20745431
Alignment:
Q  163 agttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggtacatttatgcctcaagttctcttcagatgg 229  Q
    ||||||||| | || ||||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||    
T  20745497 agttagcggtgactaatttggtttttcctcaatcggtacttttaagccccaagttctcttcagatgg 20745431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 1106294 - 1106229
Alignment:
Q  23 atgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaatt-agggtattaggaatacct 87  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  1106294 atgatcggatctacaacatgtttgattcatcaagaatattaataattcaaggtattaggaatacct 1106229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 265; Significance: 1e-148; HSPs: 33)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 11839782 - 11840098
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11839782 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 11839881  T
Q  101 aaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggta 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11839882 aaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggta 11839981  T
Q  201 catttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatttgatgggcattag 299  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  11839982 cctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggccattag 11840081  T
Q  300 gatttcccattattccg 316  Q
    | |||||||||||||||    
T  11840082 ggtttcccattattccg 11840098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 10244391 - 10244707
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10244391 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattaggctattaggaatacctggataaagctttc 10244490  T
Q  101 aaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggta 200  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10244491 aagacagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatatgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggta 10244590  T
Q  201 catttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatttgatgggcattag 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  10244591 catttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggccattag 10244690  T
Q  300 gatttcccattattccg 316  Q
    | |||||||||||||||    
T  10244691 ggtttcccattattccg 10244707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 38455607 - 38455923
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38455607 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacaacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 38455706  T
Q  101 aaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggta 200  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38455707 gaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggta 38455806  T
Q  201 catttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatttgatgggcattag 299  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||    
T  38455807 cctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatgaccattag 38455906  T
Q  300 gatttcccattattccg 316  Q
    | |||||||||||||||    
T  38455907 ggtttcccattattccg 38455923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 5 - 316
Target Start/End: Original strand, 10760711 - 10761023
Alignment:
Q  5 aaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcaagg 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10760711 aaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcaagg 10760810  T
Q  105 catccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggtacatt 204  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| ||    
T  10760811 cagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcgactgatttggttcttcctcaaccagtacctt 10760910  T
Q  205 tatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatttgatgggcattaggatt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||    
T  10760911 tatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggtcattagggtt 10761010  T
Q  304 tcccattattccg 316  Q
    |||||||||||||    
T  10761011 tcccattattccg 10761023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 38449120 - 38449436
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38449120 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacaacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaaactttc 38449219  T
Q  101 aaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggta 200  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38449220 gaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggta 38449319  T
Q  201 catttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatttgatgggcattag 299  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||    
T  38449320 cctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatgaccattag 38449419  T
Q  300 gatttcccattattccg 316  Q
    | |||||||||||||||    
T  38449420 ggtttcccattattccg 38449436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 8331889 - 8331574
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8331889 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattaggctattaggaatacctggataaagctttc 8331790  T
Q  101 aaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggta 200  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8331789 aaggcagccctctcgtcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctaaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggta 8331690  T
Q  201 catttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatttgatgggcattagg 300  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   | |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||    
T  8331689 cctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacagtgtattggggaccatagcctcttttatattggatgaccattagg 8331590  T
Q  301 atttcccattattccg 316  Q
     |||||||||||||||    
T  8331589 gtttcccattattccg 8331574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 17055850 - 17056165
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17055850 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 17055949  T
Q  101 aaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggta 200  Q
    |  ||| |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17055950 atagcagccctctaatcaacaacggtaaccaaagataggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggta 17056049  T
Q  201 catttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatttgatgggcattagg 300  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||    
T  17056050 cctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacgatgtattggggaccatagcctcttttatattggatgtccattagg 17056149  T
Q  301 atttcccattattccg 316  Q
     |||||||||||||||    
T  17056150 gtttcccattattccg 17056165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 49151714 - 49151399
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  49151714 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttattaaggatattaagaattagggtattatgaatacctggataaagctttc 49151615  T
Q  101 aaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggta 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  49151614 aaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggtggctgatttgattcttcctcaaccggta 49151515  T
Q  201 catttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatttgatgggcattagg 300  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  49151514 cctttatgcctcacgttctcttcagatggggagaagagagagtttgccatgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagg 49151415  T
Q  301 atttcccattattccg 316  Q
     |||||||||||||||    
T  49151414 gtttcccattattccg 49151399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 49157781 - 49157466
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  49157781 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttattaaggatattaagaattagggtattatgaatacctggataaagctttc 49157682  T
Q  101 aaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggta 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  49157681 aaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggtggctgatttgattcttcctcaaccggta 49157582  T
Q  201 catttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatttgatgggcattagg 300  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  49157581 cctttatgcctcacgttctcttcagatggggagaagagagagtttgccatgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagg 49157482  T
Q  301 atttcccattattccg 316  Q
     |||||||||||||||    
T  49157481 gtttcccattattccg 49157466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 10238269 - 10238585
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10238269 aaacaaaacattgaacatgattatgatcagatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattaggctattaggaatacctggataaagctttc 10238368  T
Q  101 aaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggta 200  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10238369 aagacagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggatatgatatgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggta 10238468  T
Q  201 catttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatttgatgggcattag 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  10238469 catttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggccattag 10238568  T
Q  300 gatttcccattattccg 316  Q
    | |||||||||||||||    
T  10238569 ggtttcccattattccg 10238585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 42191277 - 42191593
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42191277 aaacaaaacattgaacctgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaagggtattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 42191376  T
Q  101 aaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggta 200  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42191377 aaggcagccctctcatcaacaactataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggtggctgatttggttcttcctcaaccggta 42191476  T
Q  201 catttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatttgatgggcattag 299  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  42191477 cctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggccattag 42191576  T
Q  300 gatttcccattattccg 316  Q
    | |||||||||||||||    
T  42191577 ggtttcccattattccg 42191593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 42197219 - 42197535
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42197219 aaacaaaacattgaacctgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaagggtattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 42197318  T
Q  101 aaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggta 200  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42197319 aaggcagccctctcatcaacaactataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggtggctgatttggttcttcctcaaccggta 42197418  T
Q  201 catttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatttgatgggcattag 299  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  42197419 cctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggccattag 42197518  T
Q  300 gatttcccattattccg 316  Q
    | |||||||||||||||    
T  42197519 ggtttcccattattccg 42197535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 30051159 - 30051473
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30051159 aaacaaaatattgaacatgattataatcagatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 30051258  T
Q  101 aaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggta 200  Q
    |   || |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  30051259 attacagccctctaatcgacaacaataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcgacggctgatttgattcttcctcaaccggta 30051358  T
Q  201 catttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatttgatgggcattagg 300  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  30051359 cctttatgcctcaagttctcttcagatgggcagaagagagagtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagg 30051458  T
Q  301 atttcccattattccg 316  Q
     ||| |||||||||||    
T  30051459 gttt-ccattattccg 30051473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 5 - 291
Target Start/End: Original strand, 55003473 - 55003756
Alignment:
Q  5 aaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcaagg 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |    
T  55003473 aaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttaatttatcaagtatattaagaattagggtattagaaatatctggataaagctttcatag 55003572  T
Q  105 catccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggtacatt 204  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||| ||    
T  55003573 cagccctctaatcaacaacgataaccaaagagaaaagatgatctgaaatacacaatagagttagcggcggctgatttgg---ttcctcaatcggtacctt 55003669  T
Q  205 tatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatttgatg 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  55003670 tatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgtcgtgtacggtatattggggaccataacctcttttatattggatg 55003756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 108 - 316
Target Start/End: Original strand, 10769133 - 10769342
Alignment:
Q  108 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggtacatttat 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  10769133 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaatacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttat 10769232  T
Q  208 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatttgatgggcattaggatttcc 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  10769233 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcc 10769332  T
Q  307 cattattccg 316  Q
    ||||||||||    
T  10769333 cattattccg 10769342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 11846120 - 11846340
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  11846120 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaagtatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttt 11846219  T
Q  101 aaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctga-tttggtttttcctcaaccggt 199  Q
        || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||     
T  11846220 gtaacagccctctcatcaacaacgataaccaaagagagaagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgattttggttcttcctcaaccgga 11846319  T
Q  200 acatttatgcctcaagttctc 220  Q
    || |||||||| |||||||||    
T  11846320 acctttatgccgcaagttctc 11846340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 20 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 13445144 - 13444847
Alignment:
Q  20 attatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| | || | ||||||  ||    
T  13445144 attatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctagataaaacattcatgacagctctctcagtaa 13445045  T
Q  120 caacgataaccaaa---gagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggtacatttatgcctcaagt 216  Q
    |||| |||| ||||   |||| | ||||||||||| || | || || ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  13445044 caaccataaacaaagaggagatgtgatgatctgaaccacaaaacagggttagtggcggctgatttggttcttcctcaaccgatacttttatgcctcaagt 13444945  T
Q  217 tctcttcagatggggagaagagagagt-ttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatttgatgggcattaggatttcccattatt 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | | |  ||||| | | |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  13444944 tctcttcagatggggagaagagagaatatcgttgtgtacggtgtattggggaccataacctattttatattggatggccattagggtttcccattatt 13444847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 17593339 - 17593481
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17593339 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttaatttatcaagaatattaagaattagggtattaggaatacctggataaacctttc 17593438  T
Q  101 aaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagat 143  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17593439 gaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagat 17593481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 48128104 - 48128412
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtatta-ggaatacctggataaagcttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||    
T  48128104 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggttctacgacatgtttgatttattaagaatattaagaattagggtattttggaatacctg-ataaaacttt 48128202  T
Q  100 caaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggt 199  Q
    || |||| |  ||||| |||||||| |||  |||     ||| ||||||| |||| |||| |  |||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  48128203 catggcagc--tctca-caacaacggtaaaaaaat----gaggtgatctggaacaaacaacaatgttagcagcggctgatttggttcttcctcaactggt 48128295  T
Q  200 acatttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatttgatgggcattag 299  Q
    || |||||||||  |||||||||||||  |||||||||||  |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||     
T  48128296 acctttatgcctttagttctcttcagacagggagaagagaatgtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatgaccattaa 48128395  T
Q  300 gatttcccattattccg 316  Q
    | ||| |||||||||||    
T  48128396 ggttttccattattccg 48128412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 166 - 316
Target Start/End: Original strand, 26429639 - 26429790
Alignment:
Q  166 tagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggtacatttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgcggtgtatgatatattgg 264  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||    
T  26429639 tagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtatattgg 26429738  T
Q  265 ggaccatagcctcttttatatttgatgggcattaggatttcccattattccg 316  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  26429739 ggaccatagcctcttttatactggatgaccattagggtttcccattattccg 26429790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 111
Target Start/End: Original strand, 10766928 - 10767038
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10766928 aaacaaaacattgaacatgattatgaccggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 10767027  T
Q  101 aaggcatccct 111  Q
    |||||| ||||    
T  10767028 aaggcagccct 10767038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Original strand, 53069111 - 53069421
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaatta-gggtattaggaatacctggataaagcttt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  53069111 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctatgacatgtttgatttatcaaggatattaagaatcaggggtattaagaatacctggataaaacttt 53069210  T
Q  100 caaggcatccctctcatcaacaacgataacca--aagagaggagatgatctgaaacagac--aatagagttagcggcggctgatttggtttttcctcaac 195  Q
    || || |  | ||| | ||||||| | ||  |  |  ||  | |||||||||||||| ||  ||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  53069211 catggtagtcatcttaacaacaacaacaaagatgagaaggtgtgatgatctgaaacacacaaaatatggttagcggcggctgatttggttcttcctcaac 53069310  T
Q  196 cggtacatttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctc--ttttatatttgatggg 293  Q
    ||||||          | ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | | ||||| |||||||||||||  ||||||||| || |      
T  53069311 cggtac----------ctagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccatgtacggtgtattgaggaccatagcctcttttttatattggacgat 53069400  T
Q  294 cattaggatttcccattattc 314  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  53069401 cattagggtttcccattattc 53069421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 28964970 - 28964667
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggata-aagcttt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||   |||||||||||||||||  |||||||    
T  28964970 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatatcaatagttagaa-attaggaatacctggattgaagcttt 28964872  T
Q  100 caaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagaca-atagagttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccgg 198  Q
     | || | || |||||  | |||| || |  | ||| |||   |||||||||||| ||| | || ||||||||||||| |||||||| |||||||||||     
T  28964871 gatggaagcc-tctcaaaagcaac-atgaatagagaaagg---tgatctgaaacaaacataaagtgttagcggcggctaatttggttcttcctcaaccg- 28964778  T
Q  199 tacatttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatttgatgggcatta 298  Q
           ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||    
T  28964777 -------atgcctcgagttctcttcagatggggagaagagagagttttccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatgaccatta 28964685  T
Q  299 ggatttcccattattccg 316  Q
    || |||| ||||||||||    
T  28964684 gggtttctcattattccg 28964667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 34300599 - 34300348
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  34300599 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatatttgatttataaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgaattaagctttc 34300500  T
Q  101 aaggcatccctctcatcaacaacgataaccaa-agagaggagatgatctg------aaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcctca 193  Q
    | |||| |||||||| || ||||  | |  || | ||||||| |||| ||      ||||| |  |  | |||||||||| || |||||||| ||| |||    
T  34300499 atggcaaccctctcaacagcaacagtcagaaacacagaggaggtgatttgttatgaaaacacaagaacgggttagcggcgacttatttggttattcttca 34300400  T
Q  194 accggtacatttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagttt 245  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||    
T  34300399 accggtactttcatgcctcaagttctcttcatacgaggagatgagagagttt 34300348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 145 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 13837632 - 13837534
Alignment:
Q  145 atctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggtacatttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt 243  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13837632 atctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt 13837534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 5 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 46656782 - 46656638
Alignment:
Q  5 aaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcaagg 104  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||| || ||||||||| |     
T  46656782 aaaacattcaatataattatgatcggatctacgatatgtttgatttatcaatgatattgagaatgagggtattagaaatacctgaatgaagctttcatga 46656683  T
Q  105 catccctctcatcaacaacgat---aaccaaagagaggagatgat 146  Q
    || |||||||| ||||||||||   || ||| |||||||||||||    
T  46656682 caaccctctcaacaacaacgatctaaaacaaggagaggagatgat 46656638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 4 - 286
Target Start/End: Original strand, 12108728 - 12109008
Alignment:
Q  4 caaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcaag 103  Q
    |||||||||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| || ||||| | | |    
T  12108728 caaaacattgaatatgattatgatttgatctaagacatgtttgatttatcaaggatattaacaatta-ggtattaagaatacctgaatgaagctctaatg 12108826  T
Q  104 gcatccctctcatcaacaacgat---aaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaataga-gttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggt 199  Q
     || || ||| | ||  |||| |   || |  ||||| ||| |||| ||||||| |||| | | |||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||    
T  12108827 acaaccttctgaacatgaacggtctgaaacggagagatgaggtgatatgaaacacacaacataggttagcggcgactgatttggttcttctttaaccggt 12108926  T
Q  200 acatttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatt 286  Q
    || |||||||||||||     ||||||| || |||| ||| ||||||| ||||| ||| ||||| ||||| ||  ||||||||||||    
T  12108927 acctttatgcctcaag-----ttcagatcggaagaaaagatagtttgccgtgtacgatgtattgaggaccgtactctcttttatatt 12109008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 203 - 304
Target Start/End: Original strand, 2982484 - 2982585
Alignment:
Q  203 tttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatttgatgggcattaggat 302  Q
    |||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||| || || |||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  2982484 tttatgtcttaagttctcttcagatagggagaaaagagagttcgccgtatatggtatatttgggaccatgacctcttttatatttgttggtcattaggat 2982583  T
Q  303 tt 304  Q
    ||    
T  2982584 tt 2982585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 220 - 316
Target Start/End: Original strand, 13367114 - 13367209
Alignment:
Q  220 cttcagatggggagaagagagagtttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatttgatgggcattaggatttcccattattccg 316  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||||  |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  13367114 cttcagatggggagaagagcggttttgctatgtacggtatattggggaccatagcctc-tttatattggatggtcattagggtttcccattattccg 13367209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 211 - 272
Target Start/End: Original strand, 52222573 - 52222634
Alignment:
Q  211 tcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgcggtgtatgatatattggggaccata 272  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  52222573 tcaagctctcttcggatggggagaaaatagagtttgttgtgtatgatatattggagaccata 52222634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 220 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 9760600 - 9760506
Alignment:
Q  220 cttcagatggggagaagagagagtttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatttgatgggcattaggatttcccattattcc 315  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||| |  |||| | |||||||||||||||| |||| |||||||| ||||  ||||||| ||||| ||||||||    
T  9760600 cttcagatggggagaagagcggttttactatgtacggtatattggggaccatatcctc-tttatattggatgaccattagggtttcctattattcc 9760506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 164 - 206
Target Start/End: Original strand, 24643773 - 24643815
Alignment:
Q  164 gttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggtacattta 206  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||    
T  24643773 gttagcggcggctgatttggttctttctcaaccggtaccttta 24643815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 167 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 46656610 - 46656467
Alignment:
Q  167 agcggcggctgatttggtttttcctcaaccggtacatttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgcggtgtatgatatattgggg 266  Q
    |||||||  |||||||| | ||||| |||||| || |||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||  ||||      || | | |||||||     
T  46656610 agcggcgattgatttggctcttccttaaccggcacctttatgtctctaattctattcagatggggagaagagaatgttt------tacggtgtattggga 46656517  T
Q  267 accatagcctcttttatatttgatgggcattaggatttcccattattccg 316  Q
    |||||| ||||||||||||| |||   || |||| |||||||||||||||    
T  46656516 accataacctcttttatattggataaccaatagggtttcccattattccg 46656467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 19)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 5542217 - 5542533
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5542217 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctagataaagctttc 5542316  T
Q  101 aaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggta 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5542317 aaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagaggggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggta 5542416  T
Q  201 catttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatttgatgggcattag 299  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  5542417 cctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggccattag 5542516  T
Q  300 gatttcccattattccg 316  Q
    | |||||||||||||||    
T  5542517 ggtttcccattattccg 5542533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 32890991 - 32890675
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32890991 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttaccaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 32890892  T
Q  101 aaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggta 200  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32890891 aaggcaaccctctcatcaacaacaataaccaaagagatgagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggta 32890792  T
Q  201 catttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatttgatgggcattag 299  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  32890791 cctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattag 32890692  T
Q  300 gatttcccattattccg 316  Q
    | |||||||||||||||    
T  32890691 ggtttcccattattccg 32890675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 32897115 - 32896799
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32897115 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttaccaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 32897016  T
Q  101 aaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggta 200  Q
    ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32897015 aagacaaccctctcatcaacaacaataaccaaagagatgagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggta 32896916  T
Q  201 catttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatttgatgggcattag 299  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  32896915 cctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattag 32896816  T
Q  300 gatttcccattattccg 316  Q
    | |||||||||||||||    
T  32896815 ggtttcccattattccg 32896799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 36819073 - 36818759
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  36819073 aaacaaaacattgaatatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaag-atattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttt 36818975  T
Q  101 aaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggta 200  Q
       ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36818974 gtagccgccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggta 36818875  T
Q  201 catttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatttgatgggcattagg 300  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  36818874 cctttatgcctcaagttctcatcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatatttgatagccattagg 36818775  T
Q  301 atttcccattattccg 316  Q
     |||||||||||||||    
T  36818774 gtttcccattattccg 36818759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 14418043 - 14417763
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14418043 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 14417944  T
Q  101 aaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggta 200  Q
    |  ||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14417943 atagcagccctctaatcaacgacgataaccaaagagagaagatgatctgaaacacacaatagttttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggta 14417844  T
Q  201 catttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctctttt 281  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||||||||||||||||||    
T  14417843 cgtttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctctttt 14417763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 42993061 - 42993373
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  42993061 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaag-atattaagaattagggtattaggaataccttgataaagctttt 42993159  T
Q  101 aaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggta 200  Q
       ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42993160 gtagccaccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggta 42993259  T
Q  201 catttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatttgatgggcattag 299  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||| ||||  | |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||    
T  42993260 cctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaa---agagtattgccgtgttcggtatattggggaccataacctcttttatattggatggcgattag 42993356  T
Q  300 gatttcccattattccg 316  Q
    | |||||||||||||||    
T  42993357 ggtttcccattattccg 42993373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 9935381 - 9935070
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9935381 aaacaaaacattgaatatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaatctttc 9935282  T
Q  101 aaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggta 200  Q
    |  ||| |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  9935281 atagcagccctctaatcaacaacgttaaccaaagataggagatgatctgaaacacacaatagatttagcggcggctgatttggttcttcctcaatcggta 9935182  T
Q  201 catttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatttgatgggcattagg 300  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||| | | ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  9935181 cctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaag--agagtttgtcgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttat-ttggatggccattagg 9935085  T
Q  301 atttcccattattccg 316  Q
     |||||||||||||||    
T  9935084 -tttcccattattccg 9935070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 5 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 10700127 - 10699816
Alignment:
Q  5 aaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcaagg 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    |    
T  10700127 aaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaag-atattaagaattagggtattaggaatatctggataaaacttttgtag 10700029  T
Q  105 catccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggtacatt 204  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  10700028 cagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggaaatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctt 10699929  T
Q  205 tatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatttgatgggcattaggatt 303  Q
    ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||    
T  10699928 tatgcctcaagttttcgtcagatggagagaagagagagtattgccgtgtacggtatattggggaccatagtctcttttatatttgatgaccattagggtt 10699829  T
Q  304 tcccattattccg 316  Q
    |||||||| ||||    
T  10699828 tcccattactccg 10699816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 17 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 10705923 - 10705625
Alignment:
Q  17 atgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcaaggcatccctctcat 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    ||| |||||||||    
T  10705923 atgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaag-atattaagaattagggtattaggattacctggataaagcttttgtagcagccctctcat 10705825  T
Q  117 caacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggtacatttatgcctcaagt 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||| || ||||    
T  10705824 caacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttgattcttcctcaaccggtacctttatggcttaagt 10705725  T
Q  217 tctcttcagatggggagaagagagagt-ttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatttgatgggcattaggatttcccattattcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||| ||||||||||    
T  10705724 tctcttcagatggggagaagagagagtattgtcgtgtacggtatattggagaccatagcctcttttatatttgatgactattagggttt-ccattattcc 10705626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 5 - 316
Target Start/End: Original strand, 22219778 - 22220100
Alignment:
Q  5 aaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggata-aagctttcaag 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | |    
T  22219778 aaaactttgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggattgaagctttgatg 22219877  T
Q  104 gcatccctctcatcaacaac----------gataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcctca 193  Q
    ||| |||||||| |||||||          ||||| |||||| |  |  |||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  22219878 gcagccctctcaacaacaaccaacaacaacgataaacaaagaaaaaat-tgatctgaaacaaacaataaagttagtggcggctgatttggttcttcctca 22219976  T
Q  194 accggtacatttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatttgatgg 292  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  22219977 accggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatga 22220076  T
Q  293 gcattaggatttcccattattccg 316  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
T  22220077 ccattagggtttcccattattccg 22220100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 5 - 245
Target Start/End: Original strand, 39735613 - 39735849
Alignment:
Q  5 aaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcaagg 104  Q
    |||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||| ||    
T  39735613 aaaatattgaacatgattatgattgtatctacgacatgtttgatttatcaaagatattaagaactagggtataaggaatacctggataaa-atttcatgg 39735711  T
Q  105 catccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaa-tagagttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggtacat 203  Q
    || |||||||| |||||||| |    |||||||| || |||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||||    
T  39735712 caaccctctcaacaacaacggt----aaagagagaaggtgatctgaaacaaacaacaagggttagcggcggctgatttgattcttccttaactggtacat 39735807  T
Q  204 ttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagttt 245  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39735808 ttatgcctcaagtactcttcagatggggagaagagagagttt 39735849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 39727377 - 39727645
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| |||||    
T  39727377 aaacaaaacattgaacatgattatgatc---------acatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtataagaaatacctggaaaaaactttc 39727467  T
Q  101 aaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaata-gagttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggt 199  Q
      |||| |||||||| |||||||| |||    |||||| || |||||||||||| |||  | | ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  39727468 ttggcaaccctctcaacaacaacggtaa----agagagaaggtgatctgaaacaaacagcaagggttagcggctgctgatttggttcttcctcaaccggt 39727563  T
Q  200 acatttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagag-tttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttt 280  Q
    || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  39727564 acctttatgcctcaagtactcttgagatggggagaagagagagttttgttgtgtacggtatattggggaccatatcctcttt 39727645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 164 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 42033740 - 42033588
Alignment:
Q  164 gttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggtacatttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgcggtgtatgatatattg 263  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  || |||||    
T  42033740 gttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggagagaagagagagtttgccgtgtacaatgtattg 42033641  T
Q  264 gggaccatagcctcttttatatttgatgggcattaggatttcccattattccg 316  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  42033640 gggaccatagcctcctttatattggatgaccattagggtttcccattattccg 42033588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 7771334 - 7771202
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||     
T  7771334 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttaccaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggat-aagctttt 7771236  T
Q  101 aaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaag 134  Q
       ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7771235 gtagcaaccctctcatcaacaacgataaccaaag 7771202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 14799473 - 14799564
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataa 93  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14799473 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa-gatattaagaattagggtattaggaatacctggataa 14799564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 1882809 - 1882939
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctac-gacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctg--gataaagct 97  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||    
T  1882809 aaacaaaacattgaacatgaatatgaacggatctaatgacatgtttgatttatcaaggatgttaagaattagggtattaggaatacctggagatgaagct 1882908  T
Q  98 ttcaaggcatccctctcatcaacaacgataa 128  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||||||||    
T  1882909 ttcatggcagccctctcaacaacaacgataa 1882939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 164 - 276
Target Start/End: Original strand, 1883039 - 1883151
Alignment:
Q  164 gttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggtacatttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgcggtgtatgatatattg 263  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  | |||||    
T  1883039 gttagcggcggctaatttggttcttcctcaaccagtacctttatgtctcaagttctcttcagatggggagaagagaaagtttgccgtgtattgtgtattg 1883138  T
Q  264 gggaccatagcct 276  Q
    |||||||||||||    
T  1883139 gggaccatagcct 1883151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 34 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 1171414 - 1171249
Alignment:
Q  34 tacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaa 133  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |||| | |||||| || ||||  ||| || |    
T  1171414 tacgacatatttgatttatcaag-ataacaagaattagg-tattaggaatacctggttaaagcttttatggcagctctctcaacagcaacagtaaacaga 1171317  T
Q  134 gagaggagatgatctgaaacagacaatagag-ttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggta 200  Q
    |||| ||  |||||||||||| |||| |  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1171316 gagatgatgtgatctgaaacaaacaacaacggttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggta 1171249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 214 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 1171249 - 1171216
Alignment:
Q  214 agttctcttcagatggggagaagagagagtttgc 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1171249 agttctcttcagatggggagaagagagagtttgc 1171216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 17)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Original strand, 25387561 - 25387876
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25387561 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagcttta 25387660  T
Q  101 aaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggta 200  Q
    ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25387661 aaaacagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggta 25387760  T
Q  201 catttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatttgatgggcattag 299  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  25387761 cctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattag 25387860  T
Q  300 gatttcccattattcc 315  Q
    | ||||||||||||||    
T  25387861 ggtttcccattattcc 25387876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 248; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 34740088 - 34739773
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  34740088 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgaataaacctttc 34739989  T
Q  101 aaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggta 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34739988 aaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagagaaaatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggta 34739889  T
Q  201 catttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatttgatgggcattagg 300  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  34739888 cctttatgcctcaagttctcttcagattgggagaagagagagtttgtcgtgtacggtatattggggaccacagcctcttttatattggatggccattagg 34739789  T
Q  301 atttcccattattccg 316  Q
     |||||||||||||||    
T  34739788 gtttcccattattccg 34739773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Original strand, 25381592 - 25381907
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25381592 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgaaatgtttgatttaccaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttt 25381691  T
Q  101 aaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggta 200  Q
        || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25381692 gtaacagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggta 25381791  T
Q  201 catttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatttgatgggcattag 299  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  25381792 cctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggccattag 25381891  T
Q  300 gatttcccattattcc 315  Q
    | ||||||||||||||    
T  25381892 ggtttcccattattcc 25381907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 50306291 - 50305984
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  50306291 aaacaaaacattgaacatgattataatcggatctacgacatgtttgatttatcaag-atattaagaattaggctattaggaatacctggataaagctttc 50306193  T
Q  101 aaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggta 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  50306192 aaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggta 50306093  T
Q  201 catttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatttgatgggcattagg 300  Q
           |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||    
T  50306092 -------gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagaatttgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatgaccattagg 50306000  T
Q  301 atttcccattattccg 316  Q
     |||||||||||||||    
T  50305999 gtttcccattattccg 50305984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 31051646 - 31051331
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||     
T  31051646 aaacaaaacattgaacatgattatgattggatctacgacatgtttgatttatcaag-atattaagaattagggtattaagaatacctggataaaactttt 31051548  T
Q  101 aaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggta 200  Q
       ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  31051547 gtagcaaccctttcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttccttaaccggta 31051448  T
Q  201 catttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatttgatgggcattag 299  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  31051447 cctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattag 31051348  T
Q  300 gatttcccattattccg 316  Q
    | |||||||||||||||    
T  31051347 ggtttcccattattccg 31051331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 5 - 316
Target Start/End: Original strand, 8092907 - 8093218
Alignment:
Q  5 aaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcaagg 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    |    
T  8092907 aaaacattgaacatgattatgatcggatctatgacatgtttgatttatcaaggatattaagaatttgggtatgaggaatacctggataaagcttttgtag 8093006  T
Q  105 catccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaa-tagagttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggtacat 203  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  8093007 cagtcctctcatcaacaacgataaccaaagagatgagatgatctgaaacaaacaactag-gttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacct 8093105  T
Q  204 ttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatttgatgggcattaggatt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||    
T  8093106 ttatgcctcaagttctcttcagatggggagaaaagagagtttgccgtgttcggtatattggggaccatagcctcttttatatttgatgatcgttagggtt 8093205  T
Q  304 tcccattattccg 316  Q
    |||||||||||||    
T  8093206 tcccattattccg 8093218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 31058146 - 31057831
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||     
T  31058146 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaag-atattaagaattagggtattaagaatacttggataaaactttt 31058048  T
Q  101 aaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggta 200  Q
       ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  31058047 gtagcaaccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctaaaacacacaatagagttagcggcgactgatttggttcttccttaaccggta 31057948  T
Q  201 catttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatttgatgggcattag 299  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  31057947 cctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggatcatagcctcttttatattgtatggccattag 31057848  T
Q  300 gatttcccattattccg 316  Q
    | |||||||||||||||    
T  31057847 ggtttcccattattccg 31057831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 44410112 - 44409787
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 100  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||     
T  44410112 aaacaaaacattgaacataaatatgaacggatctacgacatgtttgatttatcaaggatatcaagaattag--tattaggaatacctggataaagctttt 44410015  T
Q  101 aaggcatccctctcatcaacaac---gataaccaaagagaggagatgatctgaaacagaca--------ataga--gttagcggcggctgatttggtttt 187  Q
    | |||| |||||||| |||||||   |||||  |  |||||||| |||||||||||| |||        ||  |  |||||||||||||||||||||| |    
T  44410014 atggcagccctctcaacaacaacaacgataagga--gagaggaggtgatctgaaacaaacatcaacttcatcaacggttagcggcggctgatttggttct 44409917  T
Q  188 tcctcaaccggtacatttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagag-tttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatt 286  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||  | |||||||||||||| |||||||||||||    
T  44409916 tcctcaaccagtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagttttgtcgtgtatagtgtattggggaccataacctcttttatatt 44409817  T
Q  287 tgatgggcattaggatttcccattattccg 316  Q
     ||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  44409816 ggatggccattagggtttctcattattccg 44409787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 139 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 1078209 - 1078031
Alignment:
Q  139 gagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggtacatttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagag 238  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1078209 gagatgatctgaaacacacaatagagttagcggccgctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggtgagaagag 1078110  T
Q  239 agagt-ttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatttgatgggcattaggatttcccattattccg 316  Q
    ||||| |||| ||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  1078109 agagtattgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccg 1078031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 4 - 316
Target Start/End: Original strand, 24926814 - 24927133
Alignment:
Q  4 caaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctg--gataaagctttca 101  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||  ||| |||||||      
T  24926814 caaaacattgaacattaatatgaacggatctacgacatgtttgatttatcaagaatattaagaattaacgtattaggaatacctgaagatgaagctttgg 24926913  T
Q  102 aggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagaca---------atagagttagcggcggctgatttggtttttcctc 192  Q
     |||| | |||||  ||||||||||||    ||||||||| |||||||||||| |||         | |  ||||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  24926914 tggcagcactctcgacaacaacgataa----agagaggaggtgatctgaaacaaacatcaacatcaacacggttagtggcagctgatttggttcttcctc 24927009  T
Q  193 aaccggtacatttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatttgatgg 292  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||   ||||||| |||||||||||||||||||| ||||     
T  24927010 aaccggtacctatatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagttttccacgtatggagtattgggaaccatagcctcttttatattggatga 24927109  T
Q  293 gcattaggatttcccattattccg 316  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
T  24927110 ccattagggtttcccattattccg 24927133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 23 - 316
Target Start/End: Original strand, 38152048 - 38152335
Alignment:
Q  23 atgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaa 122  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||| | | ||  ||||||| ||||||    
T  38152048 atgatcagatctacgacatgtttgatttatcaaacatattaagaattagggtattaggaatacctgaatgaaactttgatgacaatcctctcaacaacaa 38152147  T
Q  123 cgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaataga-gttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggtacatttatgcctcaagttctct 221  Q
     |||       ||||    ||||||||||| | |||| | | ||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |||    
T  38152148 tgatg------gagaaaccatgatctgaaatacacaacatacgttagcggcagctaatttggttcttcttcaaccggtacctttatgcttcaagttttct 38152241  T
Q  222 tcagatggggagaagagagagtttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatttgatgggcattaggatttcccattattccg 316  Q
    | ||||||||||||||  |||||||  ||||| | | ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  38152242 ttagatggggagaagaacgagtttgtcgtgtacggtgtattgggaaccatagcctcttttatattggatggtcattagg-tttcccattattccg 38152335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Original strand, 24963759 - 24964012
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctg--gataaagctt 98  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||  ||| ||||||    
T  24963759 aaacaaaacattgaacatgaatatgaacggatctacgccatgtttgatttatcaagaatagtaagaattaaagtattaggaatacctgaagatgaagctt 24963858  T
Q  99 tcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacaga---------caatagagttagcggcggctgatttggtttttc 189  Q
    |   || | |||||||  ||||||||||    ||||||||||| |||||||||||| |         ||| |  ||||| ||   ||||||||||| |||    
T  24963859 tggtggtagccctctcgacaacaacgat----aaagagaggaggtgatctgaaacaaacatcaacatcaacacggttagtggaaactgatttggttcttc 24963954  T
Q  190 ctcaaccggtacatttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgc 247  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24963955 ctcaaccagtacatttatgcctcaagtcctcttcagatggggagaagagagagtttgc 24964012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 27955263 - 27954951
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     |||||||| || || || ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27955263 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacaacatgtttgat-----aaggatataaataa-taaggtattaggaagacctggataaagctttc 27955170  T
Q  101 aaggca--tccctctcatcaacaacgataaccaaagagagga---gatgatctgaaacagacaataga--gttagcggcggctgatttggtttttcctca 193  Q
    | |  |  || |||||| ||||||||||||  ||||||||||   |||||||||||||| |||| | |  |||| || || ||||||| ||| |||||||    
T  27955169 atgatagctctctctcaacaacaacgataaagaaagagaggatgtgatgatctgaaacacacaacaaaatgttaacgacgactgatttagttattcctca 27955070  T
Q  194 accggtacatttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatttgatgg 292  Q
    |||||||| |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||  || |||  |||| ||   ||||||||| |||| | ||||||||||| ||||     
T  27955069 accggtacctttatgtcttaagttctc-tcagatggggagaagagaatgtattgtcgtgtgtg---tattggggatcataacatcttttatattggatga 27954974  T
Q  293 gcattaggatttcccattattcc 315  Q
     ||||| ||||||||||||||||    
T  27954973 ccattatgatttcccattattcc 27954951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 1078326 - 1078228
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagcttt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1078326 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttaccaagaatattaagaattagggtattaagaatacctggataaagcttt 1078228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Original strand, 12183641 - 12183740
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 100  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||    
T  12183641 aaacaaaatattgaacataattatgattggatctacgacatgtttgatttatcaa-gatattaagaatttgagtattaggaatacctgaataaagctttc 12183739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 171 - 222
Target Start/End: Original strand, 12183816 - 12183867
Alignment:
Q  171 gcggctgatttggtttttcctcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 222  Q
    ||| ||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  12183816 gcgactgatttggttatttctcaaccgctacctttatgcctcaagttctctt 12183867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 189 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 23254063 - 23254013
Alignment:
Q  189 cctcaaccggtacatttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagag 240  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  23254063 cctcaaccg-tacatttatgcatcaagttcttttcatatggggagaagagag 23254013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 21)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 13456202 - 13455886
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13456202 aaacaaaacattgaacctgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaagggtattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 13456103  T
Q  101 aaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggta 200  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13456102 aaggcagccctctcatcaacaactataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggtggctgatttggttcttcctcaaccggta 13456003  T
Q  201 catttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatttgatgggcattag 299  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  13456002 cctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggccattag 13455903  T
Q  300 gatttcccattattccg 316  Q
    | |||||||||||||||    
T  13455902 ggtttcccattattccg 13455886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 13462143 - 13461827
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13462143 aaacaaaacattgaacctgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaagggtattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 13462044  T
Q  101 aaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggta 200  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13462043 aaggcagccctctcatcaacaactataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggtggctgatttggttcttcctcaaccggta 13461944  T
Q  201 catttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatttgatgggcattag 299  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  13461943 cctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggccattag 13461844  T
Q  300 gatttcccattattccg 316  Q
    | |||||||||||||||    
T  13461843 ggtttcccattattccg 13461827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 248; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 28683002 - 28683317
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28683002 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggttattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 28683101  T
Q  101 aaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggta 200  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28683102 aagacaaccctctcatcaacaacgataaccaaggagagtggatgatctgaaacacacaatagagttaacagcggctgatttggttcttcctcaaccggta 28683201  T
Q  201 catttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatttgatgggcattagg 300  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  28683202 cctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagg 28683301  T
Q  301 atttcccattattccg 316  Q
     |||||||||||||||    
T  28683302 gtttcccattattccg 28683317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 36750517 - 36750201
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36750517 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaaactttc 36750418  T
Q  101 aaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggta 200  Q
    |  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36750417 atagcagccctctaatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggta 36750318  T
Q  201 catttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatttgatgggcattag 299  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| | | |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  36750317 tctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgtcgtgtacggtgtattggagaccatagcctcttttatattggatggccattag 36750218  T
Q  300 gatttcccattattccg 316  Q
    | |||||||||||||||    
T  36750217 ggtttcccattattccg 36750201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 5 - 316
Target Start/End: Original strand, 44716866 - 44717178
Alignment:
Q  5 aaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcaagg 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |    
T  44716866 aaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttaccaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagcttttgtag 44716965  T
Q  105 catccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggtacatt 204  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  44716966 cagctctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctt 44717065  T
Q  205 tatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatttgatgggcattaggatt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||    
T  44717066 tatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagatagtattgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggtcattagggtt 44717165  T
Q  304 tcccattattccg 316  Q
    | |||||||||||    
T  44717166 ttccattattccg 44717178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 30965430 - 30965114
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||     
T  30965430 aaacaaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaattattttaagaattagggtattaggaatacctgtataaatctttt 30965331  T
Q  101 aaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggta 200  Q
       ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  30965330 gtagcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagatgagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcgactaatttggttcttcctcaaccggta 30965231  T
Q  201 catttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatttgatgggcattag 299  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  30965230 cctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggccattag 30965131  T
Q  300 gatttcccattattccg 316  Q
    |||||||||||||||||    
T  30965130 gatttcccattattccg 30965114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 31002479 - 31002163
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  31002479 aaacaaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaagaatatcaagaattagggtattaggaatacctgaataaagctttt 31002380  T
Q  101 aaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggta 200  Q
       ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  31002379 gtagcagccctctcatcaacaacgataaccaaaaagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcgactaatttggttcttcctcaaccggta 31002280  T
Q  201 catttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatttgatgggcattag 299  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||     
T  31002279 cctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgttgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattat 31002180  T
Q  300 gatttcccattattccg 316  Q
    | |||||||||||||||    
T  31002179 ggtttcccattattccg 31002163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 31008457 - 31008141
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  31008457 aaacaaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaagaatatcaagaattagggtattaggaatacctgaataaagctttt 31008358  T
Q  101 aaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggta 200  Q
       ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  31008357 gtagcagccctctcatcaacaacgataaccaaaaagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcgactaatttggttcttcctcaaccggta 31008258  T
Q  201 catttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatttgatgggcattag 299  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||     
T  31008257 cttttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgttgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattat 31008158  T
Q  300 gatttcccattattccg 316  Q
    | |||||||||||||||    
T  31008157 ggtttcccattattccg 31008141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 13149743 - 13150062
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||     
T  13149743 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaag-atattaagaattagggtattaagaatacctg-ataaaactttt 13149840  T
Q  101 aaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggta 200  Q
       ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13149841 gtagcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggta 13149940  T
Q  201 catttatgcctcaagttctcttcagatggg-----gagaagagagagt-ttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatttgatgggc 294  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |     ||||||||||| | |||| ||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  |    
T  13149941 cctttatgcctcaagttctcttcagatgagatgaggagaagagagaatattgccgtgtacggtatattggggaccataacctcttttatattagatgacc 13150040  T
Q  295 attaggatttcccattattccg 316  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  13150041 attagggtttcccattattccg 13150062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 35090706 - 35091025
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35090706 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaagaatattaacaattagtgtattaggaatacctggataaagctttc 35090805  T
Q  101 aaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaataga--------gttagcggcggctgatttggtttttcctc 192  Q
    | |||| |||||||| || |||| |||| ||  ||||||   |||||||||||| |||||| |        |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35090806 atggcagccctctcagcatcaacaataaaca--gagagg---tgatctgaaacaaacaataaataaatagggttagcggcggctgatttggttcttcctc 35090900  T
Q  193 aaccggtacatttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatttgatg 291  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  35090901 aaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggata 35091000  T
Q  292 ggcattaggatttcccattattccg 316  Q
    | ||||||| |||||||||||||||    
T  35091001 gccattagggtttcccattattccg 35091025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 35084733 - 35085052
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35084733 aaacaaaacattgaaaatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaagaatattaacaattagtgtattaggaatacctggataaagctttc 35084832  T
Q  101 aaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaataga--------gttagcggcggctgatttggtttttcctc 192  Q
    | |||| |||||||| || |||| |||| ||  ||||||   |||||||||||| |||||| |        |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35084833 atggcagccctctcagcatcaacaataaaca--gagagg---tgatctgaaacaaacaataaataaatagggttagcggcggctgatttggttcttcctc 35084927  T
Q  193 aaccggtacatttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatttgatg 291  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  35084928 aaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggata 35085027  T
Q  292 ggcattaggatttcccattattccg 316  Q
    | ||||||| |||||||||||||||    
T  35085028 gccattagggtttcccattattccg 35085052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 11048610 - 11048927
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||     
T  11048610 aaacaaaacattgaacatgattatgattggatatacgtcatgtttgatgtaccaaggatattaagaattagggcactaggaatacttggataaagctttt 11048709  T
Q  101 aaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacaga---caatagagttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccg 197  Q
    | | || |||||||  ||||||| || |    |||||| || |||||||||||| |   ||| | ||||| ||||| || |||||||| ||||||||| |    
T  11048710 atgacagccctctcgacaacaacaatca----agagagaaggtgatctgaaacaaatatcaacacagtta-cggcgactaatttggttcttcctcaactg 11048804  T
Q  198 gtacatttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagaga----gtttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatttgatggg 293  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |     
T  11048805 gtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagttggtttgccgtgtacgatgtattggggaccatagcctcttttatattggatcgc 11048904  T
Q  294 cattaggatttcccattattccg 316  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  11048905 cattagggtttcccattattccg 11048927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 23343663 - 23343351
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggata--aagctt 98  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| |  || |||    
T  23343663 aaacaaaacattgaacatgaatatgaacgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagagttggggtattaggaatacatggagatgaaactt 23343564  T
Q  99 tcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagaca---------atagagttagcggcggctgatttggtttttc 189  Q
    |   |||| |||||||  ||||||| ||||    | ||||||| |||||||||||| |||         | |  |||||| ||||||||||||||| |||    
T  23343563 tggtggcagccctctcgacaacaacaataa----atagaggaggtgatctgaaacaaacatcaacatcaacacggttagcagcggctgatttggttcttc 23343468  T
Q  190 ctcaaccggtacatttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatttga 289  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23343467 ctcaaccgatacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttcccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattgga 23343368  T
Q  290 tgggcattaggatttcc 306  Q
    ||| ||||||| |||||    
T  23343367 tggtcattagggtttcc 23343351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 5 - 253
Target Start/End: Original strand, 35438770 - 35439014
Alignment:
Q  5 aaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcaagg 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          || ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  35438770 aaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttac---------taggaaatagggtattaggaatacctgtataaagctttcatgg 35438860  T
Q  105 catccctctcatcaacaacgataaccaaa----gagaggagatgatctgaaacagacaatagag-ttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggt 199  Q
    || || ||||  ||||||| | ||| | |    |||||||| |||||||||||| |||  |  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35438861 cagccgtctcgacaacaacaacaacgataaggagagaggaggtgatctgaaacaaacatcaacggttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggt 35438960  T
Q  200 acatttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgcggtgta 253  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35438961 acctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgta 35439014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 166 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 19879536 - 19879418
Alignment:
Q  166 tagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggtacatttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagag-tttgcggtgtatgatatattgg 264  Q
    ||||||||||||||||| || ||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||    
T  19879536 tagcggcggctgatttgattcttcttcaatcggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagttttgccgtgtacgatgtattgg 19879437  T
Q  265 ggaccatagcctcttttat 283  Q
     ||||||| ||||||||||    
T  19879436 cgaccataacctcttttat 19879418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 244 - 316
Target Start/End: Original strand, 35439671 - 35439743
Alignment:
Q  244 ttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatttgatgggcattaggatttcccattattccg 316  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  35439671 ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccg 35439743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 5 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 29833306 - 29833079
Alignment:
Q  5 aaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcaagg 104  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||| | |     
T  29833306 aaaatattgaacataattatgatcggatcgacaacatgtttgatttatcaa-gataacaataatta-ggtattaagaatacctggatgaag-tttgatga 29833210  T
Q  105 catccctctcatcaacaacgat---aaccaaagagaggaga-----tgatctgaaacagaca--atagagttagcggcggct-gatttggtttttcctca 193  Q
    || |||||||| ||||||||||   || |  ||||||||||     ||||| |||| | |||  || | |||||||||||||  |||||||| |||||||    
T  29833209 caaccctctcaacaacaacgatctgaatc--agagaggagaaaccgtgatccgaaatacacaacatcgggttagcggcggctaaatttggttcttcctca 29833112  T
Q  194 accggtacatttatgcctcaagttctcttcaga 226  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  29833111 accgatacatttatccttcaagttctcttcaga 29833079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 165 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 29034759 - 29034697
Alignment:
Q  165 ttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggtacatttatgcctcaagttctcttcagat 227  Q
    ||||||| |||||||||| || ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  29034759 ttagcggtggctgatttgattcttcctcaactggtacctttatgtctcaagttctcttcagat 29034697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 28765610 - 28765362
Alignment:
Q  74 tattaggaatacctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcg 173  Q
    |||||||||||||||||| | | ||| | |||| | || ||| |||||| ||||| |||| || | ||||||||||||||| |||  |  ||||| || |    
T  28765610 tattaggaatacctggatgatgttttgatggcagctctatcaacaacaatgataaacaaatagtgaagatgatctgaaacaaacaccaaggttagaggag 28765511  T
Q  174 gctgatttggtttttcctcaaccggtacatttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgcggtgtatgatatattggggaccatag 273  Q
      |||||||||| ||||||||  ||||| || ||||||||| |||||||| ||  | ||||| | |  |||||  ||||||| | || | |||||||| |    
T  28765510 attgatttggttcttcctcaataggtaccttgatgcctcaaattctcttcggaatgagagaatataatgtttgtcgtgtatggtgtaat-gggaccattg 28765412  T
Q  274 cctcttttatatttgatgggcattaggatttcccattattccggtgatga 323  Q
    |||||||||||||  || | ||||||  ||| ||||||||||| ||||||    
T  28765411 cctcttttatattgaatcgccattagagttttccattattccgttgatga 28765362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 5 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 31651703 - 31651664
Alignment:
Q  5 aaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtt 44  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  31651703 aaaacattgaacatgattatgatcggatttatgacatgtt 31651664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 23284784 - 23284732
Alignment:
Q  264 gggaccatagcctcttttatatttgatgggcattaggatttcccattattccg 316  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||    
T  23284784 gggaccataacatcttttatatttgatggccattagagtttcacattattccg 23284732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0208 (Bit Score: 245; Significance: 1e-136; HSPs: 2)
Name: scaffold0208
Description:

Target: scaffold0208; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 6625 - 6309
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6625 aaacaaaacattgaacatgattatgactgaatctacaacatgtttgatttatcaaggatattaagaattaggctattaggaatacctggataaagctttc 6526  T
Q  101 aaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggta 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6525 aaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggta 6426  T
Q  201 catttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatttgatgggcattag 299  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  6425 cctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggccattag 6326  T
Q  300 gatttcccattattccg 316  Q
    | |||||||||||||||    
T  6325 ggtttcccattattccg 6309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0208; HSP #2
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 5 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 12494 - 12182
Alignment:
Q  5 aaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcaagg 104  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12494 aaaacattgaacataattatgatcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattaggctattaggaatatctggataaagctttcaagg 12395  T
Q  105 catccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggtacatt 204  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  12394 cagtcctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctt 12295  T
Q  205 tatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatttgatgggcattaggatt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||    
T  12294 tatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtt 12195  T
Q  304 tcccattattccg 316  Q
    |||||||||||||    
T  12194 tcccattattccg 12182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 31)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 10739396 - 10739709
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10739396 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaacctttc 10739495  T
Q  101 aaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggta 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  10739496 aaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatttgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccgata 10739595  T
Q  201 catttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatttgatgggcattagg 300  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | | |||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||    
T  10739596 cctttatgcctcaaattctcttcagatggggagaagagagagtttaccgtgtacggtgtattggggaccatagcctc--ttatattggatggccattagg 10739693  T
Q  301 atttcccattattccg 316  Q
     |||||||||||||||    
T  10739694 gtttcccattattccg 10739709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 10953165 - 10953478
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10953165 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaacctttc 10953264  T
Q  101 aaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggta 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  10953265 aaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatttgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccgata 10953364  T
Q  201 catttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatttgatgggcattagg 300  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | | |||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||    
T  10953365 cctttatgcctcaaattctcttcagatggggagaagagagagtttaccgtgtacggtgtattggggaccatagcctc--ttatattggatggccattagg 10953462  T
Q  301 atttcccattattccg 316  Q
     |||||||||||||||    
T  10953463 gtttcccattattccg 10953478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 24288089 - 24287774
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24288089 aaacaaaacattgaacatgattatgatcgtatctacgacatgtttgatttatcaaggttattaagaattagggtattaggaatacctggataaaactttc 24287990  T
Q  101 aaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggta 200  Q
    |  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24287989 atagcagccctctaatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggta 24287890  T
Q  201 catttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatttgatgggcattag 299  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||    
T  24287889 cctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtgtattgggga-catagcctcttttatattggatgaccattag 24287791  T
Q  300 gatttcccattattccg 316  Q
    | |||||||||||||||    
T  24287790 ggtttcccattattccg 24287774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 6257262 - 6257577
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6257262 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacaacatgtttgatttatcaaggatgttaagaattaggatattaggaatacctggataaagctttc 6257361  T
Q  101 aaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggta 200  Q
       ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6257362 gtagcagccctctcatcaacaacgataaccaaagtgaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggta 6257461  T
Q  201 catttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatttgatgggcattag 299  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||    
T  6257462 cctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatgaccattag 6257561  T
Q  300 gatttcccattattccg 316  Q
    | ||| |||||||||||    
T  6257562 ggttt-ccattattccg 6257577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 33458324 - 33458636
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33458324 aaacaaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 33458423  T
Q  101 aaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggta 200  Q
       ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||    
T  33458424 ttagcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagatgagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttctttctcaaccgata 33458523  T
Q  201 catttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatttgatgggcattagg 300  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | |||||    
T  33458524 cctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagaaagtttgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatgaccgttagg 33458623  T
Q  301 atttcccattatt 313  Q
     |||| |||||||    
T  33458624 gtttcgcattatt 33458636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 48161061 - 48160746
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  48161061 aaacaaaacattgaacataattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaag-atattaagaattagggtattaggaatacctgaataaagctttt 48160963  T
Q  101 aaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggta 200  Q
        || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| |||    
T  48160962 gtaacagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcgactaatttggttcttcctcaaccagta 48160863  T
Q  201 catttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatttgatgggcattag 299  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  48160862 cctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatatttgatggccattag 48160763  T
Q  300 gatttcccattattccg 316  Q
    | |||||||||||||||    
T  48160762 ggtttcccattattccg 48160746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 48167280 - 48166965
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  48167280 aaacaaaacattgaacataattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaag-atattaagaattagggtattaggaatacctgaataaagctttt 48167182  T
Q  101 aaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggta 200  Q
        || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| |||    
T  48167181 gtaacagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcgactaatttggttcttcctcaaccagta 48167082  T
Q  201 catttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatttgatgggcattag 299  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  48167081 cctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattag 48166982  T
Q  300 gatttcccattattccg 316  Q
    | |||||||||||||||    
T  48166981 ggtttcccattattccg 48166965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Original strand, 33461450 - 33461760
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  33461450 aaacaaaacattgaacatgattatggtcggatttacgacatgtttgatttatcaag-atattaagaattagggtattaggaatatctggataaagctttt 33461548  T
Q  101 aaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggta 200  Q
       ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  33461549 gcagcagccctctcatcaacaacgataatcaaagagatgagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttgattcttcctcaaccggta 33461648  T
Q  201 catttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatttgatgggcattagg 300  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||    
T  33461649 cctttatgcctcaagttcttttcagatggggagaagagagagtttaccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatgatcatcagg 33461748  T
Q  301 atttcccattat 312  Q
     |||||||||||    
T  33461749 gtttcccattat 33461760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 5 - 197
Target Start/End: Original strand, 10733307 - 10733499
Alignment:
Q  5 aaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcaagg 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10733307 aaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaacctttcaagg 10733406  T
Q  105 catccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccg 197  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  10733407 cagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatttgaaacacacaatagagttagcgacggctgatttggttcttcctcaaccg 10733499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 5 - 197
Target Start/End: Original strand, 10947076 - 10947268
Alignment:
Q  5 aaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcaagg 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10947076 aaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaacctttcaagg 10947175  T
Q  105 catccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccg 197  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  10947176 cagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatttgaaacacacaatagagttagcgacggctgatttggttcttcctcaaccg 10947268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 96 - 316
Target Start/End: Original strand, 10733504 - 10733722
Alignment:
Q  96 ctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcctcaac 195  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  10733504 ctttcaaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatttgaaacacacaatagagttagcgacggctgatttggttcttcctcaac 10733603  T
Q  196 cggtacatttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatttgatgggca 295  Q
    || ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||    
T  10733604 cgatacctttatgcctcaaattctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctc--ttatattggatggcca 10733701  T
Q  296 ttaggatttcccattattccg 316  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  10733702 ttagggtttcccattattccg 10733722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 96 - 316
Target Start/End: Original strand, 10947273 - 10947491
Alignment:
Q  96 ctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcctcaac 195  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  10947273 ctttcaaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatttgaaacacacaatagagttagcgacggctgatttggttcttcctcaac 10947372  T
Q  196 cggtacatttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatttgatgggca 295  Q
    || ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||    
T  10947373 cgatacctttatgcctcaaattctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctc--ttatattggatggcca 10947470  T
Q  296 ttaggatttcccattattccg 316  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  10947471 ttagggtttcccattattccg 10947491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 9 - 316
Target Start/End: Original strand, 44831677 - 44831987
Alignment:
Q  9 cattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcaaggcatc 108  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||| |   || |    
T  44831677 cattgaacatgaatatgatcgaatctacgacatgtttaatttatcaaggatattaagaactagggtattaagaatacctagatgaagctttgataacaac 44831776  T
Q  109 cctctcatcaacaacgataaccaaagagag-----gagatgatctgaaacagacaa--tagagttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggtac 201  Q
    ||||||| |||||||||||| || ||||||     | |||||||||||||| ||||  ||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  44831777 cctctcaacaacaacgataaacagagagagagaaggtgatgatctgaaacacacaaaatagggttagcgacggctgatgtggttcttcctcaaccggtat 44831876  T
Q  202 atttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatttgatgggcattagga 301  Q
     ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||     
T  44831877 ttttatgcctcaagttctcttcggatgcggagaagagagagtt----gtgttcggtatattggggaccatagcctcttttatattggatgaccattaggg 44831972  T
Q  302 tttcccattattccg 316  Q
    ||||| |||||||||    
T  44831973 tttccaattattccg 44831987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 49976689 - 49976382
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||| |||||||||||||| | || |||||||     
T  49976689 aaacaaaacattgaatatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggataataa---ttagagtattaggaataccag-atgaagctttg 49976594  T
Q  101 aaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggag---atgatctgaaacagacaataga---gttagcggcggctgatttggtttttcctcaa 194  Q
    |   ||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||   ||||||| ||||| |||| | |   |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  49976593 ataacactcctctcaacaacaacgataaacaaagagaggaggtgatgatctcaaacacacaaaataagggttagcggcggctgatttggttcttcctcaa 49976494  T
Q  195 ccggtacatttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatttgatgggc 294  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |      ||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |    
T  49976493 c-ggtac-tttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacg-----gtggagaccataacctcttttatattggatggcc 49976401  T
Q  295 attaggatttcccattatt 313  Q
    |||||| ||| ||||||||    
T  49976400 attagggttttccattatt 49976382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 50168695 - 50168385
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||| | | ||||||    
T  50168695 aaacaaaacattgaacatgattatgatcgaatatacgacatgtttgatttatcaagaatattaacaattagg-tataaggaatacctggttgaggctttc 50168597  T
Q  101 aaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagag-ttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggt 199  Q
    | |||| ||  |||| ||||||| | || || ||||||||  |||||||||||| |||| |  | |||||||||| |||||| ||| ||||||||| |||    
T  50168596 atggcagcca-ctcaacaacaacaacaatcagagagaggatgtgatctgaaacaaacaacaaggattagcggcggttgatttagttcttcctcaac-ggt 50168499  T
Q  200 acatttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatttgatgggcattag 299  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||   ||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||    
T  50168498 acctttatgcctcaagttctcttcagatggagagaaaagagagttttgcgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattgaatgaccattag 50168399  T
Q  300 gatttcccattatt 313  Q
    | ||| ||||||||    
T  50168398 ggttttccattatt 50168385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 164 - 316
Target Start/End: Original strand, 26957023 - 26957176
Alignment:
Q  164 gttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggtacatttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgcggtgtatgatatatt 262  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||    
T  26957023 gttagcggcgactgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtatatt 26957122  T
Q  263 ggggaccatagcctcttttatatttgatgggcattaggatttcccattattccg 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  26957123 ggggaccatagcctcttttatatttgatggccattagggtttcccattattccg 26957176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 12 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 4632482 - 4632192
Alignment:
Q  12 tgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcaaggcatccct 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| | || ||||    
T  4632482 tgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa-gatattaagaattagggtatcagaaatacttggataaagctttcatgacaaccct 4632384  T
Q  112 ctcatcaacaacgataaccaaa---gagaggagatga-------tctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggtac 201  Q
     ||| ||||||| |||| ||||   |||| | |||||       ||||||||| | || | ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||     
T  4632383 ttcaacaacaaccataaacaaataggagatgtgatgatctgaattctgaaacacaaaacatagttagcggcttctgatttggttcttcctcaaccggtat 4632284  T
Q  202 atttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatttgatgg 292  Q
     |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||   ||||   |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  4632283 ctttatgcctcaagttctcttcagatgagaagaagagaaagtattgtcatgtactgtatattggggaccataacctcttttatattggatgg 4632192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Original strand, 26963398 - 26963518
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 100  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||     
T  26963398 aaacaaaacattgaacataagtatgaacggatctacgacatgtttgatttatcaaggatatcaagaatta--gtattaggaatacctggataaagctttt 26963495  T
Q  101 aaggcatccctctcatcaacaac 123  Q
    | || | |||||||| |||||||    
T  26963496 atggtagccctctcaacaacaac 26963518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 3769669 - 3769434
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || | |||||     
T  3769669 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttcattaatcaaggatattaataatta-ggtattaggaatacttgaatgaggctttg 3769571  T
Q  101 aaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggaga---tgatctgaaacagacaataga-gttagcggcggctgatttggtttttcctcaacc 196  Q
    | ||    ||||||| || |||||||   || ||||| || |   |||| ||||| | |||| | | ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  3769570 atgg---tcctctcaacagcaacgat---cacagagaagaaatcgtgatgtgaaatacacaacataggttagtggcggctgatttggttcttcctcaacc 3769477  T
Q  197 ggtacatttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagaga 239  Q
     ||| ||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||    
T  3769476 cgtatatttatgcctatagttcttttcagatagggagaagaga 3769434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 19686385 - 19686687
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 100  Q
    |||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||| | ||||||||     
T  19686385 aaacaaaatattgaacgtaattatcatcggatctacaacatgcttgattaatcaagcatattaagaattcgggtattatgaata-ctgaacaaagctttg 19686483  T
Q  101 aaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggta 200  Q
    | | ||  | | ||| || ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||      || | || ||||||||||||  | |||||||||||    
T  19686484 atgacagacatttcaacagcaatgatcaccaaagagagaagatgatctgaaacacacaa------tatcagcagctgatttggttcgttctcaaccggta 19686577  T
Q  201 catttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatttgatgggcattagg 300  Q
    |  ||||||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||  ||  |||| |||| | ||| |||| |||||||||||| ||||| || ||||    
T  19686578 ccattatgcctcaatttctcttgggatgaggagaagagagagtttgccttg--tgatgtatt-gagactatagtctcttttatattggatggtcagtagg 19686674  T
Q  301 atttcccattatt 313  Q
     |||| |||||||    
T  19686675 gtttctcattatt 19686687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 132 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 35177770 - 35177666
Alignment:
Q  132 aagagaggagatgatctgaaacagacaa--tagagttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggtacatttatgcctcaagttctcttcagatgg 229  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  35177770 aagagaggtgatgatctgaaacacacaacatagagttagcggcgcctgatttgattatttctcaaccgatacatttatgcctcaagttctcttcagatga 35177671  T
Q  230 ggaga 234  Q
    |||||    
T  35177670 ggaga 35177666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 213 - 316
Target Start/End: Original strand, 26971824 - 26971927
Alignment:
Q  213 aagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatttgatgggcattaggatttcccatta 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||    
T  26971824 aagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtatattggggaccatagtctcttttatattggatggccattagggttt-ccatta 26971922  T
Q  312 ttccg 316  Q
    |||||    
T  26971923 ttccg 26971927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 50156046 - 50155770
Alignment:
Q  14 aacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcaaggcatccctct 113  Q
    ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||| |||||||  ||| | | ||||||| || | ||  ||    
T  50156046 aacataattaagatcggatatacgacatgtttgatttatcaagaatattaacaattacg-tataaggaatatttggttgaggctttcatggaagcca-ct 50155949  T
Q  114 catcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggtacatttatgcctca 213  Q
    ||  | |||| | ||  | ||||||||  |||| ||||||| |||| |   |||||||||||||||||| || || ||| || ||||| ||||||||| |    
T  50155948 caatagcaacaacaattagagagaggatgtgatttgaaacaaacaacaatattagcggcggctgatttgattctttctcgactggtacctttatgcctta 50155849  T
Q  214 agttctcttcagatggggag-aagagagagtttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatttgatg 291  Q
    |||||| |||||||| |||| ||||||||||||   ||||| | | |||||||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  50155848 agttcttttcagatgaggagaaagagagagttttgcgtgtacggtgtattggggaccataacttcttttatattggatg 50155770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 50427474 - 50427356
Alignment:
Q  4 caaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttt--------gatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaag 95  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||        ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  50427474 caaaacattgaa-atgattatgatcggatgtacgacatgtttaatttattgatttatcaagaagattaagaattagggtattaggaatacctggatatag 50427376  T
Q  96 ctttcaaggcatccctctca 115  Q
    | |||| || | ||||||||    
T  50427375 cgttcatggaagccctctca 50427356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 9237465 - 9237402
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaa 64  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9237465 aaacagaacattgaatatgattatgctcggatttacgacatgtttgatttatcaagtatattaa 9237402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 166 - 239
Target Start/End: Original strand, 17627002 - 17627075
Alignment:
Q  166 tagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggtacatttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagaga 239  Q
    ||||| |||||  ||| ||| ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  17627002 tagcgacggctagttttgttcttcctcaaccggtacttttatgcttctagttctcttcagatggggagaagaga 17627075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 163 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 32284620 - 32284542
Alignment:
Q  163 agttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggtacatttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagaga 241  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||| | |||||| |||| |||||||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  32284620 agttagtggcgactgatttggttcttcctcgatcggtacctttaggcctcaagttttcttcagatgaggagaatagaga 32284542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 33045185 - 33045107
Alignment:
Q  163 agttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggtacatttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagaga 241  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||  |||||||||||||||   | ||||||||||||    
T  33045185 agttaacggcggctgatttagttctttctcaaccggtacttttatatctcaagttctcttcaatcgcggagaagagaga 33045107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 179 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 50427281 - 50427238
Alignment:
Q  179 tttggtttttcctcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 222  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  50427281 tttggttcttactcaaccggtacatttatgcctcaacttctctt 50427238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 127
Target Start/End: Original strand, 31986745 - 31986833
Alignment:
Q  38 acatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgata 127  Q
    |||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||| ||| || ||| ||| | |||  |||| ||| |||||||||||    
T  31986745 acatgtttgatttatcaaggataacaataatta-ggtattaggaatatctgaatgaagttttgatggcggccctttcaacaacaacgata 31986833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 28704609 - 28704553
Alignment:
Q  5 aaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatat 61  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| |||||    
T  28704609 aaaatattgagcatgaatatgatcagatctacaacatgtttgatgtatcaaagatat 28704553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 228; Significance: 1e-126; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 172947 - 173262
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  172947 aaacaaaacattgaaaatgattatgatcggatctacgacatgtttaatttatcaaggatattaagaattaggatattaggaatacatggataaagctttc 173046  T
Q  101 aaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggta 200  Q
    |||  | |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  173047 aagatagccctcttatcaacaacgataaccaaagagagaagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccagta 173146  T
Q  201 catttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatttgatgggcattagg 300  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||    
T  173147 cctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtatacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatgaccattagg 173246  T
Q  301 atttcccattattccg 316  Q
     |||||||||||||||    
T  173247 gtttcccattattccg 173262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 281
Target Start/End: Original strand, 676 - 956
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  676 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 775  T
Q  101 aaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggta 200  Q
    |  ||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  776 atagcagccctctaatcaacgacgataaccaaagagagaagatgatctgaaacacacaatagttttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggta 875  T
Q  201 catttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctctttt 281  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||||||||||||||||||    
T  876 cgtttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctctttt 956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0236 (Bit Score: 161; Significance: 8e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0236
Description:

Target: scaffold0236; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 5637 - 5465
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5637 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattaggctattaggaatacctggataaagctttc 5538  T
Q  101 aaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcg 173  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5537 aaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcg 5465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1114 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold1114
Description:

Target: scaffold1114; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 17 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 1174 - 852
Alignment:
Q  17 atgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcaaggcatccctctcat 116  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||| |||| | ||||||     
T  1174 atgattatgatcggatcaacgacatgtttgacttatcatgcatattaacaattagagtattagaaatatctggataaaactttcatggcagctctctcaa 1075  T
Q  117 caacaacgataaccaaagagagga---gatgatctgaaacagacaata-gagttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggtacatttatgcctc 212  Q
    || |||| ||||   |||||| |    ||||||| |||||| |||  | | ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||    
T  1074 catcaacaataaaacaagagaaggtgtgatgatcggaaacacacaccaagggttagtggcggctgatttggttcttcctcaaccgttatctttatgcctc 975  T
Q  213 aagttctcttcagatggggagaaga---------------------gagagtttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatttgatg 291  Q
    |||||||||||||||||||||||||                     |||||||||  |||||   | |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  974 aagttctcttcagatggggagaagatctcttcagatggggagaagagagagtttgtcgtgtacagtgtattggggaccatagcctcttttatattggatg 875  T
Q  292 ggcattaggatttcccattattc 314  Q
      ||||||| |||||||||||||    
T  874 accattagggtttcccattattc 852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0085 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0085
Description:

Target: scaffold0085; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 38530 - 38434
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagcttt 99  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  38530 aaacaaaacattgaacatagttatgatcggatctacaacatgtttg-tttatcaagaatattaataatta-ggtattaggaatacctggatgaagcttt 38434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0085; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 38343 - 38290
Alignment:
Q  187 ttcctcaaccggtacatttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagag 240  Q
    ||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  38343 ttcctcaactgatacctttatgtctcaagttctcttcagatgggaagaatagag 38290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0185 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 3)
Name: scaffold0185
Description:

Target: scaffold0185; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 6025 - 5945
Alignment:
Q  1 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaa 82  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||| |||||||||||    
T  6025 aaacaaaacattgaacatgaatatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaaaatattattaatta-ggtattaggaa 5945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0185; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 5889 - 5826
Alignment:
Q  159 atagagttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 222  Q
    |||| ||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5889 atagggttagcgacgactaatttggttcttcctcaaccggtacatttatgcctcaagttatctt 5826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0185; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 250 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 5821 - 5758
Alignment:
Q  250 tgtatgatatattggggaccatagcctcttttatatttgatgggcattaggatttcccattattc 314  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||  |||| | ||||| |||||||||||||    
T  5821 tgtacgatgtattgggaaccatagcctcttttatattgaatggccgttagg-tttcccattattc 5758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 259 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 14117 - 14060
Alignment:
Q  259 tattggggaccatagcctcttttatatttgatgggcattaggatttcccattattccg 316  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  14117 tattggggaccataacctcttttatattggatgaccattagggtttcccattattccg 14060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University