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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF6041_low_2 (Length: 593)
Name: NF6041_low_2
Description: NF6041
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF6041_low_2 |
 | |
|
| [»] scaffold0390 (2 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0203 (2 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0657 (3 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold1679 (2 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0234 (7 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0008 (2 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0705 (1 HSPs) |
| | |
|
Alignment Details
Target: scaffold0390 (Bit Score: 411; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0390
Description:
Target: scaffold0390; HSP #1
Raw Score: 411; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 12098 - 11676
Alignment:
| Q |
14 |
agatccggttgtccatactgaacaaacaattgttaaaactattgatgtttgattgtcgtattagggtacctaactatacaagagttgtattattatggtt |
113 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12098 |
agatccggttgtccatactgaacaaacaattgttaaaactattgatgtttgattgtcgtattagggtacctaactatacaagagttgtattattatggtt |
11999 |
T |
|
| Q |
114 |
gatcaattgttttcaagaagattgttatgactttgaacaattcgtgagattgagcttcgatatccgaatctggtgaagcatcaaagatccggttgttcat |
213 |
Q |
| |
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|
|
| T |
11998 |
gatcaattgttttcaagaagattgttgtgactttgaacaattcgtgagattgagcttcgatatccgaatctggtaaagcatcaaagatccggttgttcat |
11899 |
T |
|
| Q |
214 |
gctaaacaaacaattctagaaactatttatgtttaattaatttattcaattggagaaaggtagtaaatttaaaatatgatgattttgaaagagtttcaat |
313 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
11898 |
gctaaacaaacaatcctagaaactatttatgtttaattaatttattcaattggagaaaggtagtaaatttaaaatatgatgattttgaaagagtttcaat |
11799 |
T |
|
| Q |
314 |
atcatatatgattttgaatttagtaataaaatatttgcttaattttggcaccataatttgttttggaaacaaattggtcacccaaataatgcatatttaa |
413 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
11798 |
atcatatatgattttgaatttagtaataaaatatttgcttaattttggcaccataatttgttttggaaacaaattggtcacccaaataatgcatatttaa |
11699 |
T |
|
| Q |
414 |
ttataataattattgagtgtcaa |
436 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
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| T |
11698 |
ttataataattattgagtgtcaa |
11676 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0390; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 150 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 12154 - 12049
Alignment:
| Q |
150 |
acaattcgtgagattgagcttcgatatccgaat--------ctggtgaagcatcaaagatccggttgttcatgctaaacaaacaattctagaaactattt |
241 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
12154 |
acaattcgtgagattgagcttcgatatccgaatatccgattctggtgaagcatcaaagatccggttgtccatactgaacaaacaattgttaaaactattg |
12055 |
T |
|
| Q |
242 |
atgttt |
247 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
12054 |
atgttt |
12049 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3 (Bit Score: 411; Significance: 0; HSPs: 6)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 411; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 436
Target Start/End: Original strand, 13243683 - 13244105
Alignment:
| Q |
14 |
agatccggttgtccatactgaacaaacaattgttaaaactattgatgtttgattgtcgtattagggtacctaactatacaagagttgtattattatggtt |
113 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13243683 |
agatccggttgtccatactgaacaaacaattgttaaaactattgatgtttgattgtcgtattagggtacctaactatacaagagttgtattattatggtt |
13243782 |
T |
|
| Q |
114 |
gatcaattgttttcaagaagattgttatgactttgaacaattcgtgagattgagcttcgatatccgaatctggtgaagcatcaaagatccggttgttcat |
213 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13243783 |
gatcaattgttttcaagaagattgttgtgactttgaacaattcgtgagattgagcttcgatatccgaatctggtgaaacatcaaagatccggttgttcat |
13243882 |
T |
|
| Q |
214 |
gctaaacaaacaattctagaaactatttatgtttaattaatttattcaattggagaaaggtagtaaatttaaaatatgatgattttgaaagagtttcaat |
313 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13243883 |
gctaaacaaacaatcctagaaactatttatgtttaattaatttattcaattggagaaaggtagtaaatttaaaatatgatgattttgaaagagtttcaat |
13243982 |
T |
|
| Q |
314 |
atcatatatgattttgaatttagtaataaaatatttgcttaattttggcaccataatttgttttggaaacaaattggtcacccaaataatgcatatttaa |
413 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13243983 |
atcatatatgattttgaatttagtaataaaatatttgcttaattttggcaccataatttgttttggaaacaaattggtcacccaaataatgcatatttaa |
13244082 |
T |
|
| Q |
414 |
ttataataattattgagtgtcaa |
436 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13244083 |
ttataataattattgagtgtcaa |
13244105 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 10577607 - 10577183
Alignment:
| Q |
14 |
agatccggttgtccatactgaacaaacaattgttaaaactattgatgtttgattgtcgtattagggtacctaactatacaagagttgtattattatggtt |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10577607 |
agatccggttgtccatactgaacaaacaattgttaaaactattaatgtttgattgtcgtattagggtacctaactatacaagagttgtattattatggtt |
10577508 |
T |
|
| Q |
114 |
gatcaattgttttcaagaagattgttatgactttgaacaattcgtgagattgagcttcgatatccgaatctggtgaagcatcaaagatccggttgttcat |
213 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10577507 |
gatcaattgttttcaagaagactgttgtgactttgaacaattcgtgagattgagcttcgatatccgaatctggtgaagcatcaaagatccggttgttcat |
10577408 |
T |
|
| Q |
214 |
gctaaacaaacaattctagaaactatttatgtttaattaatttattcaattggagaaaggtagtaaatttaaaatatgatgattttgaaagagtttcaat |
313 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10577407 |
gctaaacaaacaatccttgaaactatttatgtttaatttatttatttaattggagaaaggtagtaaatttaaaagatcatgattttgaaagagtttcaac |
10577308 |
T |
|
| Q |
314 |
atcatatatga--ttttgaatttagtaataaaatatttgcttaattttggcaccataatttgttttggaaacaaattggtcacccaaataatgcatattt |
411 |
Q |
| |
|
|||| || ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| |
|
|
| T |
10577307 |
atcagatgtgactttttgaatttggtaataaattatttgcttaattttagcactgtaatttgttttggaaacaaattggtcgtctaaataaagcatattt |
10577208 |
T |
|
| Q |
412 |
aattataataattattgagtgtcaa |
436 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
10577207 |
aattataataattgttgagtgtcaa |
10577183 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 433 - 574
Target Start/End: Complemental strand, 15356201 - 15356060
Alignment:
| Q |
433 |
tcaaattttgaattcgatctatgtattgactttttgtatgggaacgtgatcttttgtgtgattatttgatgaatgaaaagcttgagtactgagtaattcc |
532 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15356201 |
tcaaattttgaattcgatctatgtattgactttttgtatgggaacgtgatcttttgtgtgattatttgatgaatgaaaagcttgagtactgagtaattcc |
15356102 |
T |
|
| Q |
533 |
caaaaggttcatacgatcacgatacagtacaggaccaattct |
574 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15356101 |
caaaaggttcatacgatcacgatacagtacaggaccaattct |
15356060 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 173 - 247
Target Start/End: Original strand, 13243658 - 13243732
Alignment:
| Q |
173 |
atatccgaatctggtgaagcatcaaagatccggttgttcatgctaaacaaacaattctagaaactatttatgttt |
247 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| | |||||||| |||||| |
|
|
| T |
13243658 |
atatccgattctggtgaagcatcaaagatccggttgtccatactgaacaaacaattgttaaaactattgatgttt |
13243732 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 150 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 10577663 - 10577558
Alignment:
| Q |
150 |
acaattcgtgagattgagcttcgatatccgaat--------ctggtgaagcatcaaagatccggttgttcatgctaaacaaacaattctagaaactattt |
241 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
10577663 |
acaactcgtgagattgagtttcgatatccgaatatctgattctggtgaagcatcaaagatccggttgtccatactgaacaaacaattgttaaaactatta |
10577564 |
T |
|
| Q |
242 |
atgttt |
247 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
10577563 |
atgttt |
10577558 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 292 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 10577075 - 10577042
Alignment:
| Q |
292 |
atgattttgaaagagtttcaatatcatatatgat |
325 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10577075 |
atgattttgaaaaagtttcaatatcatatatgat |
10577042 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6 (Bit Score: 403; Significance: 0; HSPs: 9)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 403; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 17689640 - 17689218
Alignment:
| Q |
14 |
agatccggttgtccatactgaacaaacaattgttaaaactattgatgtttgattgtcgtattagggtacctaactatacaagagttgtattattatggtt |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
17689640 |
agatccggttgtccatactgaacgaacaattgttaaaactattgatgtttgattgtcgtattaggttacctaactatacaagagttgtattatcatggtt |
17689541 |
T |
|
| Q |
114 |
gatcaattgttttcaagaagattgttatgactttgaacaattcgtgagattgagcttcgatatccgaatctggtgaagcatcaaagatccggttgttcat |
213 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17689540 |
gatcaattgttttcaagaagattgttgtgactttgaacaattcgtgagattgagcttcgatatccgaatctggtgaagcatcaaagatccggttgttcat |
17689441 |
T |
|
| Q |
214 |
gctaaacaaacaattctagaaactatttatgtttaattaatttattcaattggagaaaggtagtaaatttaaaatatgatgattttgaaagagtttcaat |
313 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17689440 |
gctaaacaaacaatcctagaaactatttatgtttaattaatttattcaattggagaaaggtagtaaatttaaaatatgatgattttgaaagagtttcaat |
17689341 |
T |
|
| Q |
314 |
atcatatatgattttgaatttagtaataaaatatttgcttaattttggcaccataatttgttttggaaacaaattggtcacccaaataatgcatatttaa |
413 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17689340 |
atcatatatgattttgaatttagtaataaaatatttgcttaattttggcaccataatttgttttggaaacaaattggtcacccaaataatgcatatttaa |
17689241 |
T |
|
| Q |
414 |
ttataataattattgagtgtcaa |
436 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17689240 |
ttataataattattgagtgtcaa |
17689218 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 395; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 436
Target Start/End: Original strand, 27298666 - 27299087
Alignment:
| Q |
14 |
agatccggttgtccatactgaacaaacaattgttaaaactattgatgtttgattgtcgtattagggtacctaactatacaagagttgtattattatggtt |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
27298666 |
agatccggttgtccatactgaacgaacaattgttaaaactattgatgtttgattgtcgtattaggttacctaactatacaagagttgtattatcatggtt |
27298765 |
T |
|
| Q |
114 |
gatcaattgttttcaagaagattgttatgactttgaacaattcgtgagattgagcttcgatatccgaatctggtgaagcatcaaagatccggttgttcat |
213 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27298766 |
gatcaattgttttcaagaagattgttgtgactttgaacaattcgtgagattgagcttcgatatccgaatctggtgaagcatcaaagatccggttgttcat |
27298865 |
T |
|
| Q |
214 |
gctaaacaaacaattctagaaactatttatgtttaattaatttattcaattggagaaaggtagtaaatttaaaatatgatgattttgaaagagtttcaat |
313 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27298866 |
gctaaacaaacaatcctagaaactatttatgtttaattaatttattcaattggagaaaggtagtaaatttaaaatatgatgattttgaaagagtttcaat |
27298965 |
T |
|
| Q |
314 |
atcatatatgattttgaatttagtaataaaatatttgcttaattttggcaccataatttgttttggaaacaaattggtcacccaaataatgcatatttaa |
413 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27298966 |
atcatatatgattttgaatttagtaataaaatatttgcttaattttggcaccataatttgtttt-gaaacaaattggtcacccaaataatgcatatttaa |
27299064 |
T |
|
| Q |
414 |
ttataataattattgagtgtcaa |
436 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27299065 |
ttataataattattgagtgtcaa |
27299087 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 386; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 31 - 436
Target Start/End: Original strand, 27273807 - 27274212
Alignment:
| Q |
31 |
ctgaacaaacaattgttaaaactattgatgtttgattgtcgtattagggtacctaactatacaagagttgtattattatggttgatcaattgttttcaag |
130 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27273807 |
ctgaacgaacaattgttaaaactattgatgtttgattgtcgtattaggttacctaactatacaagagttgtattatcatggttgatcaattgttttcaag |
27273906 |
T |
|
| Q |
131 |
aagattgttatgactttgaacaattcgtgagattgagcttcgatatccgaatctggtgaagcatcaaagatccggttgttcatgctaaacaaacaattct |
230 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
27273907 |
aagattgttgtgactttgaacaattcgtgagattgagcttcgatatccgaatctggtgaagcatcaaagatccggttgttcatgctaaacaaacaatcct |
27274006 |
T |
|
| Q |
231 |
agaaactatttatgtttaattaatttattcaattggagaaaggtagtaaatttaaaatatgatgattttgaaagagtttcaatatcatatatgattttga |
330 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27274007 |
agaaactatttatgtttaattaatttattcaattggagaaaggtagtaaatttaaaatatgatgattttgaaagagtttcaatatcatatatgattttga |
27274106 |
T |
|
| Q |
331 |
atttagtaataaaatatttgcttaattttggcaccataatttgttttggaaacaaattggtcacccaaataatgcatatttaattataataattattgag |
430 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27274107 |
atttagtaataaaatatttgcttaattttggcaccataatttgttttggaaacaaattggtcacccaaataatgcatatttaattataataattattgag |
27274206 |
T |
|
| Q |
431 |
tgtcaa |
436 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
27274207 |
tgtcaa |
27274212 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 436
Target Start/End: Original strand, 29310941 - 29311363
Alignment:
| Q |
14 |
agatccggttgtccatactgaacaaacaattgttaaaactattgatgtttgattgtcgtattagggtacctaactatacaagagttgtattattatggtt |
113 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29310941 |
agatccgattgtccatactgaacaaacaattgttaaaactattgatgtttgattgttgtattagggtacctaactatacaagagttgtattattatggtt |
29311040 |
T |
|
| Q |
114 |
gatcaattgttttcaagaagattgttatgactttgaacaattcgtgagattgagcttcgatatccgaatctggtgaagcatcaaagatccggttgttcat |
213 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29311041 |
gatcaattgttttcaagaagattgttgtgactttgaacaattcgtgagattgagcttcgatatccgaatctggtgaagcatcaaagatccggttgttcat |
29311140 |
T |
|
| Q |
214 |
gctaaacaaacaattctagaaactatttatgtttaattaatttattcaattggagaaaggtagtaaatttaaaatatgatgattttgaaagagtttcaat |
313 |
Q |
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| T |
29311141 |
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29311239 |
T |
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314 |
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412 |
Q |
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| T |
29311240 |
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29311339 |
T |
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| Q |
413 |
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436 |
Q |
| |
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| T |
29311340 |
aatataataattattgagtgtcaa |
29311363 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 37 - 227
Target Start/End: Original strand, 28174150 - 28174348
Alignment:
| Q |
37 |
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127 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| |||| |
|
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| T |
28174150 |
aaacaattgttaaaactatcgatgtttgattgttgcattagggtacctaactatacaagagttgtattgtcatggttgtttcatacaatcaattgctttc |
28174249 |
T |
|
| Q |
128 |
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227 |
Q |
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| T |
28174250 |
aa-aagattattgtgaatttgaacaattcatgagaattaacttcgaaatctgaatatggtgaaacattaaagattcggtatttcatactaaacaaacaat |
28174348 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 151 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 17689695 - 17689591
Alignment:
| Q |
151 |
caattcgtgagattgagcttcgatatccgaat--------ctggtgaagcatcaaagatccggttgttcatgctaaacaaacaattctagaaactattta |
242 |
Q |
| |
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| T |
17689695 |
caattcgtgagattgagcttcgatatccgaatatctgattctggtgaagcatcaaagatccggttgtccatactgaacgaacaattgttaaaactattga |
17689596 |
T |
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| Q |
243 |
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247 |
Q |
| |
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||||| |
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| T |
17689595 |
tgttt |
17689591 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 151 - 247
Target Start/End: Original strand, 27298611 - 27298715
Alignment:
| Q |
151 |
caattcgtgagattgagcttcgatatccgaat--------ctggtgaagcatcaaagatccggttgttcatgctaaacaaacaattctagaaactattta |
242 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||| | |||||||| | |
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| T |
27298611 |
caattcgtgagattgagcttcgatatccgaatatctgattctggtgaagcatcaaagatccggttgtccatactgaacgaacaattgttaaaactattga |
27298710 |
T |
|
| Q |
243 |
tgttt |
247 |
Q |
| |
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||||| |
|
|
| T |
27298711 |
tgttt |
27298715 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 151 - 247
Target Start/End: Original strand, 29310886 - 29310990
Alignment:
| Q |
151 |
caattcgtgagattgagcttcgatatccgaat--------ctggtgaagcatcaaagatccggttgttcatgctaaacaaacaattctagaaactattta |
242 |
Q |
| |
|
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| T |
29310886 |
caattcgtgagattgagcttcgatatccgaatatccgattctggtgaagcatcaaagatccgattgtccatactgaacaaacaattgttaaaactattga |
29310985 |
T |
|
| Q |
243 |
tgttt |
247 |
Q |
| |
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||||| |
|
|
| T |
29310986 |
tgttt |
29310990 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 150 - 202
Target Start/End: Original strand, 28174079 - 28174131
Alignment:
| Q |
150 |
acaattcgtgagattgagcttcgatatccgaatctggtgaagcatcaaagatc |
202 |
Q |
| |
|
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| T |
28174079 |
acaattcgtgagattgagctttgatatctgattctggtaaaacatcaaagatc |
28174131 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4 (Bit Score: 399; Significance: 0; HSPs: 15)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 399; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 436
Target Start/End: Original strand, 26965512 - 26965934
Alignment:
| Q |
14 |
agatccggttgtccatactgaacaaacaattgttaaaactattgatgtttgattgtcgtattagggtacctaactatacaagagttgtattattatggtt |
113 |
Q |
| |
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| T |
26965512 |
agatccggttgtccatactgaacaaacaattgttaaaactattgatgtttgattgtcgtattagggtacctaactatacaagcgttgtattattatggtt |
26965611 |
T |
|
| Q |
114 |
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213 |
Q |
| |
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| T |
26965612 |
gatcaattgttttcaagaagattgttgtgactttgaacaattcgtgagattgagcttcgatatccgaatctggtgaagcatcaaagatccggttgttcat |
26965711 |
T |
|
| Q |
214 |
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313 |
Q |
| |
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| T |
26965712 |
gctaaacaaacaatcctagaaactatttatgtttaattaatttattcaattggagaaatgtagtaaatttaaaatatgatgattttgaaagagtttcaat |
26965811 |
T |
|
| Q |
314 |
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413 |
Q |
| |
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| T |
26965812 |
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26965911 |
T |
|
| Q |
414 |
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436 |
Q |
| |
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||||||||||||||||| ||||| |
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| T |
26965912 |
ttataataattattgagggtcaa |
26965934 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 19924870 - 19924448
Alignment:
| Q |
14 |
agatccggttgtccatactgaacaaacaattgttaaaactattgatgtttgattgtcgtattagggtacctaactatacaagagttgtattattatggtt |
113 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
19924870 |
agatccggttgtccatactgaacaaacaattgttaaaattattgatgtttgattgtcgtattagggtacctaactatacaagagttgtattattatggtt |
19924771 |
T |
|
| Q |
114 |
gatcaattgttttcaagaagattgttatgactttgaacaattcgtgagattgagcttcgatatccgaatctggtgaagcatcaaagatccggttgttcat |
213 |
Q |
| |
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| T |
19924770 |
gatcaattgttttcaagaagattgttgtgactttgaacaattcgtgagatcgagcttcgatatccgaatctggtgaagcatcaaagatccggttgttcat |
19924671 |
T |
|
| Q |
214 |
gctaaacaaacaattctagaaactatttatgtttaattaatttattcaattggagaaaggtagtaaatttaaaatatgatgattttgaaagagtttcaat |
313 |
Q |
| |
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| T |
19924670 |
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19924572 |
T |
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| Q |
314 |
atcatatatga-ttttgaatttagtaataaaatatttgcttaattttggcaccataatttgttttggaaacaaattggtcacccaaataatgcatattta |
412 |
Q |
| |
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| T |
19924571 |
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19924472 |
T |
|
| Q |
413 |
attataataattattgagtgtcaa |
436 |
Q |
| |
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| T |
19924471 |
attaaaataattattgagtgtcaa |
19924448 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 436
Target Start/End: Original strand, 5709375 - 5709797
Alignment:
| Q |
14 |
agatccggttgtccatactgaacaaacaattgttaaaactattgatgtttgattgtcgtattagggtacctaactatacaagagttgtattattatggtt |
113 |
Q |
| |
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|
|
| T |
5709375 |
agatccggttgtccatactgaacaaacaattgttaaaactattgatgtttgattgtcgtattagggtacctaactatacaagagttgtattattatggtt |
5709474 |
T |
|
| Q |
114 |
gatcaattgttttcaagaagattgttatgactttgaacaattcgtgagattgagcttcgatatccgaatctggtgaagcatcaaagatccggttgttcat |
213 |
Q |
| |
|
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|
| T |
5709475 |
gatcaattgtttacaagaagattgttgtgactttgaacaattcgtgagattgagcttcgatatccgaatctggtgaagcatcaaagatccggttgttcat |
5709574 |
T |
|
| Q |
214 |
gctaaacaaacaattctagaaactatttatgtttaattaatttattcaattggagaaaggtagtaaatttaaaatatgatgattttgaaagagtttcaat |
313 |
Q |
| |
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| T |
5709575 |
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5709673 |
T |
|
| Q |
314 |
atcatatatga-ttttgaatttagtaataaaatatttgcttaattttggcaccataatttgttttggaaacaaattggtcacccaaataatgcatattta |
412 |
Q |
| |
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| T |
5709674 |
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5709773 |
T |
|
| Q |
413 |
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436 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5709774 |
attataataattattgagtgtcaa |
5709797 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 14 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 10626451 - 10626027
Alignment:
| Q |
14 |
agatccggttgtccatactgaacaaacaattgttaaaactattgatgtttgattgtcgtattagggtacctaactatacaagagttgtattattatggtt |
113 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
10626451 |
agatccggttgtccatactgaacaaacaattgttaagactattgatgtttgattgtcgtattagggtacctaactatacaagagttatattattatggtt |
10626352 |
T |
|
| Q |
114 |
gatcaattgttttcaagaagattgttatgactttgaacaattcgtgagattgagcttcgatatccgaatctggtgaagcatcaaagatccggttgttcat |
213 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10626351 |
gatcaattgttttcaagaagactgttgtgactttgaacaattcgtgagattgagcttcgatatccgaatctgatgaagcatcaaagatccggttgttcat |
10626252 |
T |
|
| Q |
214 |
gctaaacaaacaattctagaaactatttatgtttaattaatttattcaattggagaaaggtagtaaatttaaaatatgatgattttgaaagagtttcaat |
313 |
Q |
| |
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| T |
10626251 |
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10626152 |
T |
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| Q |
314 |
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411 |
Q |
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| T |
10626151 |
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10626052 |
T |
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436 |
Q |
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| T |
10626051 |
aattataataattgttgagtgtcaa |
10626027 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 14 - 328
Target Start/End: Original strand, 18264141 - 18264457
Alignment:
| Q |
14 |
agatccggttgtccatactgaacaaacaattgttaaaactattgatgtttgattgtcgtattagggtacctaactatacaagagttgtattattatggtt |
113 |
Q |
| |
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|
|
| T |
18264141 |
agatccggttgtccatactgaacaaacaattgttaaaactattgatgtttgattgtcgtattagggtacctaactattcaagagttgtattattatggtt |
18264240 |
T |
|
| Q |
114 |
gatcaattgttttcaagaagattgttatga--ctttgaacaattcgtgagattgagcttcgatatccgaatctggtgaagcatcaaagatccggttgttc |
211 |
Q |
| |
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|
| T |
18264241 |
gatcaattgttttcaagaatattgttgtgagactttgaacaattcgtgagattgagcttcgatatccgaatctggtgaagcatcaaagatccgattgttc |
18264340 |
T |
|
| Q |
212 |
atgctaaacaaacaattctagaaactatttatgtttaattaatttattcaattggagaaaggtagtaaatttaaaatatgatgattttgaaagagtttca |
311 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||| |
|
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| T |
18264341 |
atgctaaacaaacaattcttgaaattgtttatttttaattaatttattcaatttgtgaaaggtagtaaatttaaaagatcgtgattttgaaagggtttca |
18264440 |
T |
|
| Q |
312 |
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328 |
Q |
| |
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|||||| |||||||||| |
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| T |
18264441 |
atatcagatatgatttt |
18264457 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 292 - 436
Target Start/End: Original strand, 18264521 - 18264666
Alignment:
| Q |
292 |
atgattttgaaagagtttcaatatcatatatgatttt-gaatttagtaataaaatatttgcttaattttggcaccataatttgttttggaaacaaattgg |
390 |
Q |
| |
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| T |
18264521 |
atgattttgaaagagtttcaatattagatatgatttttgaatttgataataaaatattggcttagttatagtaccataatttgtttttgaaacaaattgg |
18264620 |
T |
|
| Q |
391 |
tcacccaaataatgcatatttaattataataattattgagtgtcaa |
436 |
Q |
| |
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| T |
18264621 |
tcgcccaaataaagcatatttaattataataattattgagtgtcaa |
18264666 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 151 - 247
Target Start/End: Original strand, 26965457 - 26965561
Alignment:
| Q |
151 |
caattcgtgagattgagcttcgatatccgaat--------ctggtgaagcatcaaagatccggttgttcatgctaaacaaacaattctagaaactattta |
242 |
Q |
| |
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| T |
26965457 |
caattcgtgagattgagcttcgatatccgaatatccgattctggtgaagcatcaaagatccggttgtccatactgaacaaacaattgttaaaactattga |
26965556 |
T |
|
| Q |
243 |
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247 |
Q |
| |
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|
| T |
26965557 |
tgttt |
26965561 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 150 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 19924926 - 19924840
Alignment:
| Q |
150 |
acaattcgtgagattgagcttcgatatccgaat--------ctggtgaagcatcaaagatccggttgttcatgctaaacaaacaatt |
228 |
Q |
| |
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|
|
| T |
19924926 |
acaattcgtgagattgagcttcgatatccgaatatctaattctggtgaagcatcaaagatccggttgtccatactgaacaaacaatt |
19924840 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 150 - 247
Target Start/End: Original strand, 18264085 - 18264190
Alignment:
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150 |
acaattcgtgagattgagcttcgatatccgaat--------ctggtgaagcatcaaagatccggttgttcatgctaaacaaacaattctagaaactattt |
241 |
Q |
| |
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|||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| | |||||||| |
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| T |
18264085 |
acaactcgtgagattgagcttcgatatccgaatatctgattctggtgaagcatcaaagatccggttgtccatactgaacaaacaattgttaaaactattg |
18264184 |
T |
|
| Q |
242 |
atgttt |
247 |
Q |
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| T |
18264185 |
atgttt |
18264190 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 151 - 247
Target Start/End: Original strand, 5709320 - 5709424
Alignment:
| Q |
151 |
caattcgtgagattgagcttcgatatccgaat--------ctggtgaagcatcaaagatccggttgttcatgctaaacaaacaattctagaaactattta |
242 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| | |||||||| | |
|
|
| T |
5709320 |
caattcgtgagattgagcttcgatatccgaatatctgattctggtgaaacatcaaagatccggttgtccatactgaacaaacaattgttaaaactattga |
5709419 |
T |
|
| Q |
243 |
tgttt |
247 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
5709420 |
tgttt |
5709424 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 150 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 10626507 - 10626421
Alignment:
| Q |
150 |
acaattcgtgagattgagcttcgatatccgaat--------ctggtgaagcatcaaagatccggttgttcatgctaaacaaacaatt |
228 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
10626507 |
acaactcgtgagattgagcttcgatatccgaatatctgattctggttaagcatcaaagatccggttgtccatactgaacaaacaatt |
10626421 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
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Target Start/End: Original strand, 5709990 - 5710026
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| Q |
292 |
atgattttgaaagagtttcaatatcatatatgatttt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
5709990 |
atgattttgaaagagtttcaatatcagatatgatttt |
5710026 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 292 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 10625918 - 10625885
Alignment:
| Q |
292 |
atgattttgaaagagtttcaatatcatatatgat |
325 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10625918 |
atgattttgaaaaagtttcaatatcatatatgat |
10625885 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 292 - 325
Target Start/End: Original strand, 18264773 - 18264806
Alignment:
| Q |
292 |
atgattttgaaagagtttcaatatcatatatgat |
325 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18264773 |
atgattttgaaaaagtttcaatatcatatatgat |
18264806 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 292 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 19924263 - 19924230
Alignment:
| Q |
292 |
atgattttgaaagagtttcaatatcatatatgat |
325 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
19924263 |
atgattttgaaagagtttcaatatcagatatgat |
19924230 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0203 (Bit Score: 375; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0203
Description:
Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 28392 - 27970
Alignment:
| Q |
14 |
agatccggttgtccatactgaacaaacaattgttaaaactattgatgtttgattgtcgtattagggtacctaactatacaagagttgtattattatggtt |
113 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28392 |
agatccggttgtccatgccgaacaaacaattgttaaaactattgatgtttgattgtcgtattagggtacctaactatacaagtgttgtattattatggtt |
28293 |
T |
|
| Q |
114 |
gatcaattgttttcaagaagattgttatgactttgaacaattcgtgagattgagcttcgatatccgaatctggtgaagcatcaaagatccggttgttcat |
213 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28292 |
gatcaattgttttcaagaagatttttgtgactttgaacaattcgtgagattgagcttcgatatccgaatctggtgaagcatcaaagatccggttgttcat |
28193 |
T |
|
| Q |
214 |
gctaaacaaacaattctagaaactatttatgtttaattaatttattcaattggagaaaggtagtaaatttaaaatatgatgattttgaaagagtttcaat |
313 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
28192 |
gctaaacaaacaatccttgaaactatttatgtttaattaatttattcaatttgtgaaaggtagtaaatttaaaatatgatgattttgaaatagtttcaat |
28093 |
T |
|
| Q |
314 |
atcatatatgattttgaatttagtaataaaatatttgcttaattttggcaccataatttgttttggaaacaaattggtcacccaaataatgcatatttaa |
413 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28092 |
atcatatatgattttgaatttggtaataaaatatttgcttaattttagcaccataatttgttttggaaacaaattggtcacccaaataatgcatatttaa |
27993 |
T |
|
| Q |
414 |
ttataataattattgagtgtcaa |
436 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27992 |
ttataataattattgagtgtcaa |
27970 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0203; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 150 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 28448 - 28343
Alignment:
| Q |
150 |
acaattcgtgagattgagcttcgatatccgaat--------ctggtgaagcatcaaagatccggttgttcatgctaaacaaacaattctagaaactattt |
241 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
28448 |
acaattcgtgagattgagcttcgatatccgaatatacgattctggtgaagcatcaaagatccggttgtccatgccgaacaaacaattgttaaaactattg |
28349 |
T |
|
| Q |
242 |
atgttt |
247 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
28348 |
atgttt |
28343 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1 (Bit Score: 355; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 436
Target Start/End: Original strand, 18254015 - 18254440
Alignment:
| Q |
14 |
agatccggttgtccatactgaacaaacaattgttaaaactattgatgtttgattgtcgt--attagggtacctaactatacaagagttgtattattatgg |
111 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
18254015 |
agatccgattgtccatactgaacaaacaattgttaaaattattgatgtttgattgtcgtgtattagggtacctaactatacaagaattgtattattatgg |
18254114 |
T |
|
| Q |
112 |
ttgatcaattgttttcaagaagattgttatgactttgaacaattcgtgagattgagcttcgatatccgaatctggtgaagcatcaaagatccggttgttc |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
18254115 |
ttgatcaattgttttcaagaagattattgtgactttgaacaattcgtgagattgagcttcgatatccgaatctggtgaagcatcaaagatccgattgttc |
18254214 |
T |
|
| Q |
212 |
atgctaaacaaacaattctagaaactatttatgtttaattaatttattcaattggagaaaggtagtaaatttaaaatatgatgattttgaaaga-gtttc |
310 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |
|
|
| T |
18254215 |
atgctaaacaaacaatccttgaaactatttatgtttaattaatttattcaaatggagaaaggtagtaaatttaaaatatgatgattttgaaaaaggtttc |
18254314 |
T |
|
| Q |
311 |
aatatcatatatgattttgaatttagtaataaaatatttgcttaattttggcaccataatttgttttggaaacaaattggtcacccaaataatgcatatt |
410 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18254315 |
aatatcatatatgattttgaatttggtaataaaatatttgcttaattttagcatcataatttgttttggaaacaaattggtcacccaaataatgcatatt |
18254414 |
T |
|
| Q |
411 |
taattataataattattgagtgtcaa |
436 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18254415 |
taattataataattattgagtgtcaa |
18254440 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 151 - 228
Target Start/End: Original strand, 18253960 - 18254045
Alignment:
| Q |
151 |
caattcgtgagattgagcttcgatatccgaat--------ctggtgaagcatcaaagatccggttgttcatgctaaacaaacaatt |
228 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
18253960 |
caattcgtgagattgagcttcgatatccgaatatccgattctggtgaagcatcaaagatccgattgtccatactgaacaaacaatt |
18254045 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7 (Bit Score: 346; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 11541191 - 11540768
Alignment:
| Q |
14 |
agatccggttgtccatactgaacaaacaattgttaaaactattgatgtttgattgtcgt--attagggtacctaactatacaagagttgtattattatgg |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
11541191 |
agatccggttgtccatactgaacaaacaattgttaaaattattgatgtttgattgtcgtgtattagggtacctaactatacaagaattgtattattatgg |
11541092 |
T |
|
| Q |
112 |
ttgatcaattgttttcaagaagattgttatgactttgaacaattcgtgagattgagcttcgatatccgaatctggtgaagcatcaaagatccggttgttc |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11541091 |
ttgatcaattgttttcaagaagattattgtgactttgaacaattcgtgagattgagcttcgatatccgaatctggtgaatcatcaaagatccggttgttc |
11540992 |
T |
|
| Q |
212 |
atgctaaacaaacaattctagaaactatttatgtttaattaatttattcaattggagaaaggtagtaaatttaaaatatgatgattttgaaagagtttca |
311 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
11540991 |
atgctaaacaaacaatccttgaaactatt-atgtttaattaatttattcaattgaagaaaggtagtaaatttaaaatatgatgattttgaaaaggtttca |
11540893 |
T |
|
| Q |
312 |
atatcatatatgattttgaatttagtaataaaatatttgcttaattttggcaccataatttgttttggaaacaaattggtcacccaaataatgcatattt |
411 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
11540892 |
atatcatatatgattttgaatttggtaataaaatatttgcttaattttagcaccataatttgttttggaaacaaattggtcacacaaataaagcagattt |
11540793 |
T |
|
| Q |
412 |
aattataataattattgagtgtcaa |
436 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11540792 |
aattataataattattgagtgtcaa |
11540768 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 11541247 - 11541161
Alignment:
| Q |
150 |
acaattcgtgagattgagcttcgatatccgaat--------ctggtgaagcatcaaagatccggttgttcatgctaaacaaacaatt |
228 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
11541247 |
acaactcgtgagattgagcttcgatatccgaatatctgattctggtgaagcatcaaagatccggttgtccatactgaacaaacaatt |
11541161 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 279 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 11540590 - 11540543
Alignment:
| Q |
279 |
aatttaaaat-atgatgattttgaaagagtttcaatatcatatatgat |
325 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
11540590 |
aatttaaaatgatcatgattttgaaagagtttcaatatcagatatgat |
11540543 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 274 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 11540680 - 11540618
Alignment:
| Q |
274 |
tagtaaatttaaaatatgatgattttgaaagagtttcaatatcatatatg--attttgaattta |
335 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
11540680 |
tagtaaatttaaaatatcatga-tttgaaatagtttcaaggtcatatatgatattttgaattta |
11540618 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8 (Bit Score: 316; Significance: 1e-178; HSPs: 3)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 22 - 436
Target Start/End: Original strand, 24637688 - 24638102
Alignment:
| Q |
22 |
ttgtccatactgaacaaacaattgttaaaactattgatgtttgattgtcgtattagggtacctaactatacaagagttgtattattatggttgatcaatt |
121 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
24637688 |
ttgtccatacggaacaaacaattgttaaaactattaatgtttgattgtcagattaggatacataactatacaagagttgtattactatggttgatcaatt |
24637787 |
T |
|
| Q |
122 |
gttttcaagaagattgttatgactttgaacaattcgtgagattgagcttcgatatccgaatctggtgaagcatcaaagatccggttgttcatgctaaaca |
221 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24637788 |
gttttcaagaagattgttgtgactttgaacaattcgtgagattgagcttcgatatccgaatctggttaatcatcaaagatccggttgttcatgctaaaca |
24637887 |
T |
|
| Q |
222 |
aacaattctagaaactatttatgtttaattaatttattcaattggagaaaggtagtaaatttaaaatatgatgattttgaaagagtttcaatatcatata |
321 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24637888 |
aacaattcttgaaattatttat-tttaattaatttattcaattggtgaaaggtagtaaatttaaaagatcatgattttgaaagagtttcaatatcatata |
24637986 |
T |
|
| Q |
322 |
tga-ttttgaatttagtaataaaatatttgcttaattttggcaccataatttgttttggaaacaaattggtcacccaaataatgcatatttaattataat |
420 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24637987 |
tgatttttgaatttggtaataaaatatttgcttaattttagtaccataatttattttggaaacaaattggtcgcctaaataatgcatatttaattataat |
24638086 |
T |
|
| Q |
421 |
aattattgagtgtcaa |
436 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |
|
|
| T |
24638087 |
aattattgagtgtcaa |
24638102 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 83 - 328
Target Start/End: Original strand, 22107898 - 22108142
Alignment:
| Q |
83 |
ctaactatacaagagttgtattattatggttgatcaattgttttcaagaagattgttatgactttgaacaattcgtgagattgagcttcgatatccgaat |
182 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22107898 |
ctaactatacaagagttgtattattatggttgatcaattgtttttaagaatattgttgtgactttgaacaattcgtgagattgagcttcgatatccgaat |
22107997 |
T |
|
| Q |
183 |
ctggtgaagcatcaaagatccggttgttcatgctaaacaaacaattctagaaactatttatgtttaattaatttattcaattggagaaaggtagtaaatt |
282 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
22107998 |
ctggtgaagcatcaaagatccggttgttcatgctaaacaagcaattcttgaaattatttat-tttaattaatttattcaattggtgaaaggtagtaaatt |
22108096 |
T |
|
| Q |
283 |
taaaatatgatgattttgaaagagtttcaatatcatatatgatttt |
328 |
Q |
| |
|
||||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
22108097 |
taaaagatcgtgattttgaaagggtttcaatatcagatatgatttt |
22108142 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 292 - 436
Target Start/End: Original strand, 22108206 - 22108351
Alignment:
| Q |
292 |
atgattttgaaagagtttcaatatcatatatgatttt-gaatttagtaataaaatatttgcttaattttggcaccataatttgttttggaaacaaattgg |
390 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| || | | ||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
22108206 |
atgattttgaaaaagtttcaatattagatatgatttttgaatttggtaataaaatattggcttagttatagtaccataatttgtttttgaaacaaattgg |
22108305 |
T |
|
| Q |
391 |
tcacccaaataatgcatatttaattataataattattgagtgtcaa |
436 |
Q |
| |
|
|| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22108306 |
tcgcccaaataaagcagatttaattataataattattgagtgtcaa |
22108351 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0657 (Bit Score: 314; Significance: 1e-177; HSPs: 3)
Name: scaffold0657
Description:
Target: scaffold0657; HSP #1
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 14 - 436
Target Start/End: Original strand, 4748 - 5172
Alignment:
| Q |
14 |
agatccggttgtccatactgaacaaacaattgttaaaactattgatgtttgattgtcgtattagggtacctaactatacaagagttgtattattatggtt |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4748 |
agatccggttgtccatactgaacaaacaattattaaaaatattgatgtttgattgtcgtattagggtacctaactatacaagagttgtattattatggtt |
4847 |
T |
|
| Q |
114 |
gatcaattgttttcaagaagattgttatgactttgaacaattcgtgagattgagcttcgatatccgaatctggtgaagcatcaaagatccggttgttcat |
213 |
Q |
| |
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|
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| T |
4848 |
gatcaattgttttcaagaagattgttgtgactttgaacaattcgtgagattgagtttcaatatccgaatctggtgaagcattaaagatctggttgttcat |
4947 |
T |
|
| Q |
214 |
gctaaacaaacaattctagaaactatttatgtttaattaatttattcaattggagaaaggtagtaaatttaaaatatgatgattttgaaagagtttcaat |
313 |
Q |
| |
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|
|
| T |
4948 |
gctaaacaaacaatccttcaaactatttatgtttaattaatttattcaattggagataggtagtaaatttaaaagatcatgattttgaaagagtttcaat |
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T |
|
| Q |
314 |
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411 |
Q |
| |
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| T |
5048 |
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5147 |
T |
|
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412 |
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436 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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aattataataattattgagtgtcaa |
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T |
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Target: scaffold0657; HSP #2
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228 |
Q |
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|
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4778 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0657; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
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Target Start/End: Original strand, 5279 - 5312
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292 |
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325 |
Q |
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|||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
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atgattttgaaaaagtttcaatatcatatatgat |
5312 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5 (Bit Score: 314; Significance: 1e-177; HSPs: 3)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
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Q |
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|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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T |
|
| Q |
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213 |
Q |
| |
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|
|
| T |
19712272 |
gatcaattgttttcaagaaaattgttgtgactttgaacaattcgtgagattgagtttcgatatccgaatctggtgaagcatcaaagatctggctgttcat |
19712173 |
T |
|
| Q |
214 |
gctaaacaaacaattctagaaactatttatgtttaattaatttattcaattggagaaaggtagtaaatttaaaatatgatgattttgaaagagtttcaat |
313 |
Q |
| |
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| T |
19712172 |
gctaaacaaacaatttttgaaattatttatttttaattaatttattcaattggagaaaggtaataaaattaaaagatcatgattttgaaagggtttcaat |
19712073 |
T |
|
| Q |
314 |
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411 |
Q |
| |
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| T |
19712072 |
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19711974 |
T |
|
| Q |
412 |
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436 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
19711973 |
aattataataattattgagtgtcaa |
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T |
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Target: chr5; HSP #2
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108 |
Q |
| |
|
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|
|
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T |
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Target: chr5; HSP #3
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Query Start/End: Original strand, 150 - 247
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241 |
Q |
| |
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|||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| | |||||||| |
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| T |
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19712329 |
T |
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| Q |
242 |
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247 |
Q |
| |
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|||||| |
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19712328 |
atgttt |
19712323 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1679 (Bit Score: 306; Significance: 1e-172; HSPs: 2)
Name: scaffold1679
Description:
Target: scaffold1679; HSP #1
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Q |
| |
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| T |
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712 |
T |
|
| Q |
114 |
gatcaattgttttcaagaagattgttatgactttgaacaattcgtgagattgagcttcgatatccgaatctggtgaagcatcaaagatccggttgttcat |
213 |
Q |
| |
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| T |
713 |
gatcaattgttttcaagatggttgttgtgactttgaacaattcgtgagattaagcttcgatatacgaatctggtgaagcatcaaagatccggttgttcat |
812 |
T |
|
| Q |
214 |
gctaaacaaacaattctagaaactatttatgtttaattaatttattcaattggagaaaggtagtaaatttaaaatatgatgattttgaaagagtttcaat |
313 |
Q |
| |
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| T |
813 |
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911 |
T |
|
| Q |
314 |
atcatatatga--ttttgaatttagtaataaaatatttgcttaattttggcaccataatttgttttggaaacaaattggtcacccaaataatgcatattt |
411 |
Q |
| |
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| T |
912 |
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1011 |
T |
|
| Q |
412 |
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436 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||||| |
|
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| T |
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aattataataattattgagtgtcaa |
1036 |
T |
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Target: scaffold1679; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 150 - 247
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241 |
Q |
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|
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T |
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| Q |
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247 |
Q |
| |
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|||||| |
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|
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657 |
atgttt |
662 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0234 (Bit Score: 250; Significance: 1e-138; HSPs: 7)
Name: scaffold0234
Description:
Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
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Target Start/End: Complemental strand, 9491 - 9175
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113 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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9392 |
T |
|
| Q |
114 |
gatcaattgttttcaagaagattgttatga--ctttgaacaattcgtgagattgagcttcgatatccgaatctggtgaagcatcaaagatccggttgttc |
211 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
9391 |
gatcaattgttttcaagaatattgttgtgagactttgaacaattcgtgagattgagcttcgatatccgaatctggtgaagcatcaaagatccgattgttc |
9292 |
T |
|
| Q |
212 |
atgctaaacaaacaattctagaaactatttatgtttaattaatttattcaattggagaaaggtagtaaatttaaaatatgatgattttgaaagagtttca |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
9291 |
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T |
|
| Q |
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Q |
| |
|
|||||| |||||||||| |
|
|
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atatcagatatgatttt |
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T |
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Target: scaffold0234; HSP #2
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Target Start/End: Complemental strand, 16209 - 16027
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ttgaacaattcgtgagattgagcttcgatatccgaatctggtgaagcatcaaagatccggttgttcatgctaaacaaacaattctagaaactatttatgt |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||| | |
|
|
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ttgaacaattcgtgagattgagctttgatatccgaatctggtgaagcatcaaaggtccggttgttcatgctaaacaagcaattcttgaaattgtttattt |
16110 |
T |
|
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ttaattaatttattcaattggagaaaggtagtaaatttaaaatatgatgattttgaaagagtttcaatatcatatatgatttt |
328 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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ttaattaatttattcaatttgtgaaaggtagtaaatttaaaatatcgtgattttgaaagggtttcaatatcatatatgatttt |
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T |
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Target: scaffold0234; HSP #3
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Target Start/End: Complemental strand, 9111 - 8966
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| || | | ||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
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9012 |
T |
|
| Q |
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Q |
| |
|
|| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9011 |
tcgcccaaataaagcatatttaattataataattattgagtgtcaa |
8966 |
T |
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Target: scaffold0234; HSP #4
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390 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| || | |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
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T |
|
| Q |
391 |
tcacccaaataatgcata-tttaattataataattattgagtgtcaa |
436 |
Q |
| |
|
|| |||||| || ||| | ||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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tcgcccaaagaaagcagattttgattataataattattgagtgtcaa |
15817 |
T |
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Target: scaffold0234; HSP #5
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Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
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T |
|
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atgttt |
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Q |
| |
|
|||||| |
|
|
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atgttt |
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T |
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Q |
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|
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0234; HSP #7
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Query Start/End: Original strand, 292 - 325
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atgattttgaaagagtttcaatatcatatatgat |
325 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
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atgattttgaaaaagtttcaatatcatatatgat |
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Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
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Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
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T |
|
| Q |
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gatcaattgttttcaagaagattgttatgactttgaacaattcgtgagattgagcttcgatatccgaatctggtgaagcatcaaagatccggttgttcat |
213 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
228511 |
gatcaattgtttacaaagagattgatgtgaatttgaacaattcgtgagattgagcttcgatatccgaatctggtgaagcatcaaagatccggttgttcat |
228412 |
T |
|
| Q |
214 |
gctaaacaaacaattctagaaactatttatgtttaattaatttattcaattggagaaaggtagtaaatttaaaatatgatgattttgaaagagtttcaat |
313 |
Q |
| |
|
||||| |||||||| || ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
228411 |
gctaagcaaacaatccttcaaattattaatgtttaattaatttattcaattggagaaatttagtaaatttaaaagatcatgattttgaaagagtttcaat |
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T |
|
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atcatatatga--ttttgaatttagtaataaaatatttgcttaattttggcaccataatttgttttggaaacaaattggtcacccaaataatgcatattt |
411 |
Q |
| |
|
|||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||| | | ||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| | |
|
|
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atcaaatgtgactttttgaatttggtaataaaatatttg----------------tcacttgttttgg-aacaaattggtcgcctaaataatgcatatgt |
228229 |
T |
|
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aattataataattattgagtgtcaa |
436 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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aattataataattattgagtgtcaa |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0008; HSP #2
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Target: scaffold0705; HSP #1
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Alignment:
| Q |
433 |
tcaaattttgaattcgatctatgtattgactttttgtatgggaacgtgatcttttgtgtgattatttgatgaatgaaaagcttgagtactgagtaattcc |
532 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7254 |
tcaaattttgaattcgatctatgtattgactttttgtatgggaacgtgatcttttgtgtgattatttgatgaatgaaaagcttgagtactgagtaattcc |
7155 |
T |
|
| Q |
533 |
caaaaggttcatacgatcacgatacagtacaggaccaattct |
574 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
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| T |
7154 |
caaaaggttcatacgatcacgatacagtacaggaccaattct |
7113 |
T |
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Target: chr2 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000004; HSPs: 1)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 22 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 25498014 - 25497925
Alignment:
| Q |
22 |
ttgtccatactgaacaaacaattgttaaaactattgatgtttgattgtcgtattagggtacctaactatacaagagttgtattattatgg |
111 |
Q |
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| T |
25498014 |
ttgttcatactgaatgaacaatccttgaaactattgatgtttgatcgtcgcattagggttcatacctataaaagagttgtattgttatgg |
25497925 |
T |
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