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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF6071_low_10 (Length: 228)
Name: NF6071_low_10
Description: NF6071
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF6071_low_10 |
 | |
|
| [»] chr8 (8 HSPs) |
| |
|
| [»] chr4 (8 HSPs) |
| |
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| [»] chr3 (5 HSPs) |
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| [»] chr2 (7 HSPs) |
| |
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| [»] chr1 (11 HSPs) |
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| [»] chr6 (3 HSPs) |
| |
|
| [»] chr5 (7 HSPs) |
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|
Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 228; Significance: 1e-126; HSPs: 8)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 30982815 - 30983042
Alignment:
| Q |
1 |
ttacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgt |
100 |
Q |
| |
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|
|
| T |
30982815 |
ttacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgt |
30982914 |
T |
|
| Q |
101 |
attatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgcggattatgtttcgaacgcgatc |
200 |
Q |
| |
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|
| T |
30982915 |
attatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgcggattatgtttcgaacgcgatc |
30983014 |
T |
|
| Q |
201 |
catctctgacgacgaaactacatttaaa |
228 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
30983015 |
catctctgacgacgaaactacatttaaa |
30983042 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 34774034 - 34774261
Alignment:
| Q |
1 |
ttacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgt |
100 |
Q |
| |
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| T |
34774034 |
ttacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgt |
34774133 |
T |
|
| Q |
101 |
attatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgcggattatgtttcgaacgcgatc |
200 |
Q |
| |
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|
|
| T |
34774134 |
attatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgcggattatgtttcgaacgcgatc |
34774233 |
T |
|
| Q |
201 |
catctctgacgacgaaactacatttaaa |
228 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34774234 |
catctctgacgacgaaactacatttaaa |
34774261 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 30211075 - 30210848
Alignment:
| Q |
1 |
ttacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgt |
100 |
Q |
| |
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|
|
| T |
30211075 |
ttacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgt |
30210976 |
T |
|
| Q |
101 |
attatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgcggattatgtttcgaacgcgatc |
200 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
30210975 |
attatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgcggattatgtttcaaacgcgatc |
30210876 |
T |
|
| Q |
201 |
catctctgacgacgaaactacatttaaa |
228 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30210875 |
catctctgacgacgaaactacatttaaa |
30210848 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 193877 - 193651
Alignment:
| Q |
1 |
ttacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgt |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
193877 |
ttacaatactaacatcatgaaaataaaa-ttacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattatcacaaaactaacataatgtgt |
193779 |
T |
|
| Q |
101 |
attatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgcggattatgtttcgaacgcgatc |
200 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
193778 |
attatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcatgtgctcaataatttcattgcggattatgtttcgaacgcgatc |
193679 |
T |
|
| Q |
201 |
catctctgacgacgaaactacatttaaa |
228 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
193678 |
catctctgacgacgaaactacatttaaa |
193651 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 721481 - 721255
Alignment:
| Q |
1 |
ttacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgt |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
721481 |
ttacaatactaacatcatgaaaataaaa-ttacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattatcacaaaactaacataatgtgt |
721383 |
T |
|
| Q |
101 |
attatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgcggattatgtttcgaacgcgatc |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
721382 |
attatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcatgtgctcaataatttcattgcggattatgtttcgaacgcgatc |
721283 |
T |
|
| Q |
201 |
catctctgacgacgaaactacatttaaa |
228 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
721282 |
catctctgacgacgaaactacatttaaa |
721255 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 882588 - 882362
Alignment:
| Q |
1 |
ttacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgt |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
882588 |
ttacaatactaacatcatgaaaataaaa-ttacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattatcacaaaactaacataatgtgt |
882490 |
T |
|
| Q |
101 |
attatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgcggattatgtttcgaacgcgatc |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
882489 |
attatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcatgtgctcaataatttcattgcggattatgtttcgaacgcgatc |
882390 |
T |
|
| Q |
201 |
catctctgacgacgaaactacatttaaa |
228 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
882389 |
catctctgacgacgaaactacatttaaa |
882362 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 44240611 - 44240386
Alignment:
| Q |
1 |
ttacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgt |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||| ||||||||||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
44240611 |
ttacaatactaatagcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaattgcaacaaagtactaa--tattattacaaaactaatttaaagtgt |
44240514 |
T |
|
| Q |
101 |
attatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgcggattatgtttcgaacgcgatc |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44240513 |
attatagtactaaaatattgatataataatttaaagaacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgcggattatgtttcgaacgcgatc |
44240414 |
T |
|
| Q |
201 |
catctctgacgacgaaactacatttaaa |
228 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
44240413 |
catctctgatgacgaaactatatttaaa |
44240386 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 31778752 - 31778710
Alignment:
| Q |
42 |
aatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaa |
84 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
31778752 |
aatagaatttaaagttcaatatagtactaaaatattattacaa |
31778710 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4 (Bit Score: 228; Significance: 1e-126; HSPs: 8)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 24035806 - 24036033
Alignment:
| Q |
1 |
ttacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgt |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24035806 |
ttacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgt |
24035905 |
T |
|
| Q |
101 |
attatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgcggattatgtttcgaacgcgatc |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24035906 |
attatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgcggattatgtttcgaacgcgatc |
24036005 |
T |
|
| Q |
201 |
catctctgacgacgaaactacatttaaa |
228 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24036006 |
catctctgacgacgaaactacatttaaa |
24036033 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 24247038 - 24246811
Alignment:
| Q |
1 |
ttacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgt |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24247038 |
ttacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgt |
24246939 |
T |
|
| Q |
101 |
attatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgcggattatgtttcgaacgcgatc |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24246938 |
attatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgcggattatgtttcgaacgcgatc |
24246839 |
T |
|
| Q |
201 |
catctctgacgacgaaactacatttaaa |
228 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
24246838 |
catctctgacgatgaaactacatttaaa |
24246811 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 56560997 - 56560772
Alignment:
| Q |
1 |
ttacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgt |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||| ||||||||||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
56560997 |
ttacaatactaatagcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaattgcaacaaagtactaa--tattattacaaaactaatttaaagtgt |
56560900 |
T |
|
| Q |
101 |
attatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgcggattatgtttcgaacgcgatc |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
56560899 |
attatagtactaaaatattgatataataatttaaagaacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgcggattatgtttcgaacgcgatc |
56560800 |
T |
|
| Q |
201 |
catctctgacgacgaaactacatttaaa |
228 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
56560799 |
catctctgacgacgaaactacatttaaa |
56560772 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 49128149 - 49128013
Alignment:
| Q |
1 |
ttacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgt |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
49128149 |
ttacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgt |
49128050 |
T |
|
| Q |
101 |
attatagtactaaaatattgatataataatttaaagt |
137 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
49128049 |
attatagtactaaaatattgatataataatttaaagt |
49128013 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 228
Target Start/End: Original strand, 52056607 - 52056812
Alignment:
| Q |
21 |
aaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgtattatagtactaaaatattg |
120 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
52056607 |
aaataaaaattacaaatagataatagaatttaaattgcaacaaagtactaa--tattattacaaaactaatttaaagtgtattatggtattaaaatattg |
52056704 |
T |
|
| Q |
121 |
atataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgcggattatgtttcgaacgcgatccatctctgacgacgaaacta |
220 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
52056705 |
atataataatttaaagaacaatattaattattttgcatgtgctcaataatttgattgcagattatgtttcgaacgtgatccatctctgacgaggaaacta |
52056804 |
T |
|
| Q |
221 |
catttaaa |
228 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
52056805 |
catttaaa |
52056812 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Original strand, 39382624 - 39382748
Alignment:
| Q |
1 |
ttacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgt |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39382624 |
ttacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgt |
39382723 |
T |
|
| Q |
101 |
attatagtactaaaatattgatata |
125 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39382724 |
attatagtactaaaatattgatata |
39382748 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 51833974 - 51834116
Alignment:
| Q |
1 |
ttacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgt |
100 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
51833974 |
ttacaatattaacagcaagaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaacagagtattaaaatataattacaaaactaatttaatgtgt |
51834073 |
T |
|
| Q |
101 |
attatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaata |
143 |
Q |
| |
|
|| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
51834074 |
atcataatactaaaatattgatataataatttaaagtaaaata |
51834116 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 190 - 227
Target Start/End: Original strand, 31430944 - 31430981
Alignment:
| Q |
190 |
cgaacgcgatccatctctgacgacgaaactacatttaa |
227 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31430944 |
cgaacgcgatccatctctgacgacgaaactacatttaa |
31430981 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3 (Bit Score: 228; Significance: 1e-126; HSPs: 5)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 51124975 - 51125202
Alignment:
| Q |
1 |
ttacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgt |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
51124975 |
ttacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgt |
51125074 |
T |
|
| Q |
101 |
attatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgcggattatgtttcgaacgcgatc |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
51125075 |
attatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgcggattatgtttcgaacgcgatc |
51125174 |
T |
|
| Q |
201 |
catctctgacgacgaaactacatttaaa |
228 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
51125175 |
catctctgacgacgaaactacatttaaa |
51125202 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 52693033 - 52692806
Alignment:
| Q |
1 |
ttacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgt |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
52693033 |
ttacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgt |
52692934 |
T |
|
| Q |
101 |
attatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgcggattatgtttcgaacgcgatc |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
52692933 |
attatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgcggattatgtttcgaacgcgatc |
52692834 |
T |
|
| Q |
201 |
catctctgacgacgaaactacatttaaa |
228 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
52692833 |
catctctgacgacgaaactacatttaaa |
52692806 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 38469674 - 38469447
Alignment:
| Q |
1 |
ttacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgt |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38469674 |
ttacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgt |
38469575 |
T |
|
| Q |
101 |
attatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgcggattatgtttcgaacgcgatc |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
38469574 |
attatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgcggattatgttttgaacgcgatc |
38469475 |
T |
|
| Q |
201 |
catctctgacgacgaaactacatttaaa |
228 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38469474 |
catctctgacgacgaaactacatttaaa |
38469447 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 1527999 - 1527826
Alignment:
| Q |
1 |
ttacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgt |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1527999 |
ttacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgt |
1527900 |
T |
|
| Q |
101 |
attatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttca |
174 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1527899 |
attatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttca |
1527826 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 47140955 - 47141080
Alignment:
| Q |
1 |
ttacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgt |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47140955 |
ttacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgt |
47141054 |
T |
|
| Q |
101 |
attatagtactaaaatattgatataa |
126 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47141055 |
attatagtactaaaatattgatataa |
47141080 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2 (Bit Score: 228; Significance: 1e-126; HSPs: 7)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 14380598 - 14380371
Alignment:
| Q |
1 |
ttacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgt |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14380598 |
ttacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgt |
14380499 |
T |
|
| Q |
101 |
attatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgcggattatgtttcgaacgcgatc |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14380498 |
attatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgcggattatgtttcgaacgcgatc |
14380399 |
T |
|
| Q |
201 |
catctctgacgacgaaactacatttaaa |
228 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14380398 |
catctctgacgacgaaactacatttaaa |
14380371 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 31686525 - 31686752
Alignment:
| Q |
1 |
ttacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgt |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31686525 |
ttacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgt |
31686624 |
T |
|
| Q |
101 |
attatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgcggattatgtttcgaacgcgatc |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31686625 |
attatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgcggattatgtttcgaacgcgatc |
31686724 |
T |
|
| Q |
201 |
catctctgacgacgaaactacatttaaa |
228 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31686725 |
catctctgacgacgaaactacatttaaa |
31686752 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 31787141 - 31786924
Alignment:
| Q |
1 |
ttacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgt |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31787141 |
ttacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgt |
31787042 |
T |
|
| Q |
101 |
attatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgcggattatgtttcgaacgcgatc |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31787041 |
attatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgcggattatgtttcgaacgcgatc |
31786942 |
T |
|
| Q |
201 |
catctctgacgacgaaac |
218 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31786941 |
catctctgacgacgaaac |
31786924 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 40255001 - 40254824
Alignment:
| Q |
1 |
ttacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgt |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40255001 |
ttacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgt |
40254902 |
T |
|
| Q |
101 |
attatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgc |
178 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40254901 |
attatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgc |
40254824 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 19 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 13896470 - 13896263
Alignment:
| Q |
19 |
gaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgtattatagtactaaaatat |
118 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13896470 |
gaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaattgcaacaaagtactaa--tattattacaaaactaatttaaagtgtattatagtactaaaatat |
13896373 |
T |
|
| Q |
119 |
tgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgcggattatgtttcgaacgcgatccatctctgacgacgaaac |
218 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13896372 |
tgatataataatttaaagaacaatactaattattttgtctgtgctcaataattttattgcggattatgtttcgaacgcgatccatctctgacgacgaaac |
13896273 |
T |
|
| Q |
219 |
tacatttaaa |
228 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
13896272 |
tacatttaaa |
13896263 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 19 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 14037087 - 14036880
Alignment:
| Q |
19 |
gaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgtattatagtactaaaatat |
118 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14037087 |
gaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaattgcaacaaagtactaa--tattattacaaaactaatttaaagtgtattatagtactaaaatat |
14036990 |
T |
|
| Q |
119 |
tgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgcggattatgtttcgaacgcgatccatctctgacgacgaaac |
218 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14036989 |
tgatataataatttaaagaacaatactaattattttgtctgtgctcaataattttattgcggattatgtttcgaacgcgatccatctctgacgacgaaac |
14036890 |
T |
|
| Q |
219 |
tacatttaaa |
228 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
14036889 |
tacatttaaa |
14036880 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 2443137 - 2443280
Alignment:
| Q |
1 |
ttacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgt |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
2443137 |
ttacaatactaacaacatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaatatattattacaaaactaatttaatgtgt |
2443236 |
T |
|
| Q |
101 |
attatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatact |
145 |
Q |
| |
|
|| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2443237 |
atcataatactaaaatattgatataa-aatttaaagtacaatact |
2443280 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1 (Bit Score: 228; Significance: 1e-126; HSPs: 11)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 5271211 - 5271438
Alignment:
| Q |
1 |
ttacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgt |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5271211 |
ttacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgt |
5271310 |
T |
|
| Q |
101 |
attatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgcggattatgtttcgaacgcgatc |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5271311 |
attatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgcggattatgtttcgaacgcgatc |
5271410 |
T |
|
| Q |
201 |
catctctgacgacgaaactacatttaaa |
228 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5271411 |
catctctgacgacgaaactacatttaaa |
5271438 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 50978531 - 50978758
Alignment:
| Q |
1 |
ttacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgt |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
50978531 |
ttacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgt |
50978630 |
T |
|
| Q |
101 |
attatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgcggattatgtttcgaacgcgatc |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
50978631 |
attatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgcggattatgtttcgaacgcgatc |
50978730 |
T |
|
| Q |
201 |
catctctgacgacgaaactacatttaaa |
228 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
50978731 |
catctctgacgacgaaactacatttaaa |
50978758 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 51488080 - 51488307
Alignment:
| Q |
1 |
ttacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgt |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
51488080 |
ttacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgt |
51488179 |
T |
|
| Q |
101 |
attatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgcggattatgtttcgaacgcgatc |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
51488180 |
attatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcatgtgctcaataatttcattgcggattatgtttcgaacgcgatc |
51488279 |
T |
|
| Q |
201 |
catctctgacgacgaaactacatttaaa |
228 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
51488280 |
catctctgacgatgaaactacatttaaa |
51488307 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 7592910 - 7593122
Alignment:
| Q |
1 |
ttacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgt |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7592910 |
ttacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtacaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgt |
7593009 |
T |
|
| Q |
101 |
attatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgcggattatgtttcgaacgcgatc |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7593010 |
attatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgcggattatgtttcgaacgcgatc |
7593109 |
T |
|
| Q |
201 |
catctctgacgac |
213 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
| T |
7593110 |
catctctgacgac |
7593122 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 38843808 - 38843631
Alignment:
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1 |
ttacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgt |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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ttacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgt |
38843709 |
T |
|
| Q |
101 |
attatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgc |
178 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38843708 |
attatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgc |
38843631 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 46407977 - 46407752
Alignment:
| Q |
1 |
ttacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgt |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||| ||||||||||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
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ttacaatactaatagcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaattgcaacaaagtactaa--tattattacaaaactaatttaaagtgt |
46407880 |
T |
|
| Q |
101 |
attatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgcggattatgtttcgaacgcgatc |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46407879 |
attatagtactaaaatattgatataataatttaaagaacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgcggattatgtttcgaacgcgatc |
46407780 |
T |
|
| Q |
201 |
catctctgacgacgaaactacatttaaa |
228 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46407779 |
catctctgacgacgaaactacatttaaa |
46407752 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 35606819 - 35606594
Alignment:
| Q |
1 |
ttacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgt |
100 |
Q |
| |
|
||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||| ||||||||||||||||| ||| |||| |
|
|
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35606819 |
ttacaatacaaatagcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaattgcaacaaagtactaa--tattattacaaaactaatttaaagtgt |
35606722 |
T |
|
| Q |
101 |
attatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgcggattatgtttcgaacgcgatc |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||| |
|
|
| T |
35606721 |
attatagtactaaaatattgatataataatttaaagaacaatactaattattttgcatgtgctcaataatttgattgcgggttatgtttcgaatgtgatc |
35606622 |
T |
|
| Q |
201 |
catctctgacgacgaaactacatttaaa |
228 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
35606621 |
catctctgacgacaaaactacatttaaa |
35606594 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Original strand, 26999996 - 27000141
Alignment:
| Q |
1 |
ttacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgt |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26999996 |
ttacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgt |
27000095 |
T |
|
| Q |
101 |
attatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatacta |
146 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27000096 |
attatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatacta |
27000141 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 27576337 - 27576188
Alignment:
| Q |
1 |
ttacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgt |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
27576337 |
ttacaatactaacagtatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaattttattacaaaactaatttaatgtgt |
27576238 |
T |
|
| Q |
101 |
attatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaatta |
150 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27576237 |
atcatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaatta |
27576188 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 15353651 - 15353534
Alignment:
| Q |
1 |
ttacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgt |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15353651 |
ttacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgt |
15353552 |
T |
|
| Q |
101 |
attatagtactaaaatat |
118 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15353551 |
attatagtactaaaatat |
15353534 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 26821828 - 26821785
Alignment:
| Q |
1 |
ttacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataat |
44 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
26821828 |
ttacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataat |
26821785 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 3)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 30019711 - 30019484
Alignment:
| Q |
1 |
ttacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgt |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30019711 |
ttacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgt |
30019612 |
T |
|
| Q |
101 |
attatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgcggattatgtttcgaacgcgatc |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30019611 |
attatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaataataattattttgcctgtgctcaataatttcattgcggattatgtttcgaacgcgatc |
30019512 |
T |
|
| Q |
201 |
catctctgacgacgaaactacatttaaa |
228 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30019511 |
catctctgacgacgaaactacatttaaa |
30019484 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 21515297 - 21515522
Alignment:
| Q |
1 |
ttacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgt |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||| ||||||||||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
21515297 |
ttacaatactaatagcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaattgcaacaaagtactaa--tattattacaaaactaatttaaagtgt |
21515394 |
T |
|
| Q |
101 |
attatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgcggattatgtttcgaacgcgatc |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21515395 |
attatagtactaaaatattgatataataatttaaaaaacaataataattatattgactgtgctcaataatttcattgcggattatgtttcgaacgcgatc |
21515494 |
T |
|
| Q |
201 |
catctctgacgacgaaactacatttaaa |
228 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21515495 |
catctctgacgacgaaactacatttaaa |
21515522 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 31745922 - 31746072
Alignment:
| Q |
1 |
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99 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
31745922 |
ttacaatactaacagcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattaccaaaactaatttaatgtg |
31746021 |
T |
|
| Q |
100 |
tattatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaatta |
150 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31746022 |
tatcatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaatta |
31746072 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 7)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 29542026 - 29542253
Alignment:
| Q |
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100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29542026 |
ttacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgt |
29542125 |
T |
|
| Q |
101 |
attatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgcggattatgtttcgaacgcgatc |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29542126 |
attatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgcggattatgtttcgaacgcgatc |
29542225 |
T |
|
| Q |
201 |
catctctgacgacgaaactacatttaaa |
228 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
29542226 |
catctctgacgatgaaactacatttaaa |
29542253 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 42663868 - 42663660
Alignment:
| Q |
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ttacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgt |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42663868 |
ttacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagattattaaaatattattacaaaactaacataatgtgt |
42663769 |
T |
|
| Q |
101 |
attatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgcggattatgtttcgaacgcgatc |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
42663768 |
attatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgcggattatgtttcgaacgcggtc |
42663669 |
T |
|
| Q |
201 |
catctctga |
209 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
42663668 |
catctctga |
42663660 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 3260542 - 3260725
Alignment:
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100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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ttacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgt |
3260641 |
T |
|
| Q |
101 |
attatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgcggatta |
184 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3260642 |
attatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgcggatta |
3260725 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 27738157 - 27738382
Alignment:
| Q |
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ttacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgt |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||| ||||||||||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
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ttacaatactaatagcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaattgcaacaaagtactaa--tattattacaaaactaatttaaagtgt |
27738254 |
T |
|
| Q |
101 |
attatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgcggattatgtttcgaacgcgatc |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27738255 |
attatagtactaaaatattgatataataatttaaagaacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgcggattatgtttcgaacgcgatc |
27738354 |
T |
|
| Q |
201 |
catctctgacgacgaaactacatttaaa |
228 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27738355 |
catctctgacgacgaaactacatttaaa |
27738382 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 33232946 - 33232721
Alignment:
| Q |
1 |
ttacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgt |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||| ||||||||||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
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33232849 |
T |
|
| Q |
101 |
attatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgcggattatgtttcgaacgcgatc |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33232848 |
attatagtactaaaatattgatataataatttaaaaaacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgcggattatgtttcgaacgcgatc |
33232749 |
T |
|
| Q |
201 |
catctctgacgacgaaactacatttaaa |
228 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33232748 |
catctctgacgacgaaactacatttaaa |
33232721 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 7071626 - 7071851
Alignment:
| Q |
1 |
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100 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||| ||||||||||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
7071626 |
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T |
|
| Q |
101 |
attatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgcggattatgtttcgaacgcgatc |
200 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
7071724 |
attatggtactaaaatattgatataataatttaaagaacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattccggattatgtttcgaacgtgatt |
7071823 |
T |
|
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201 |
catctctgacgacgaaactacatttaaa |
228 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7071824 |
catttctgacgacgaaactacatttaaa |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Original strand, 32728860 - 32728908
Alignment:
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49 |
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|
| T |
32728860 |
ttacaatactaataccagggaaataaaagttacaaatagataatagaat |
32728908 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7 (Bit Score: 177; Significance: 1e-95; HSPs: 6)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Original strand, 31012201 - 31012377
Alignment:
| Q |
1 |
ttacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgt |
100 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31012201 |
ttacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgt |
31012300 |
T |
|
| Q |
101 |
attatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattg |
177 |
Q |
| |
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|
|
| T |
31012301 |
attatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattg |
31012377 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 25341182 - 25341355
Alignment:
| Q |
1 |
ttacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgt |
100 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
25341182 |
ttacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgt |
25341281 |
T |
|
| Q |
101 |
attatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttca |
174 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25341282 |
attatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttca |
25341355 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 5 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 41064970 - 41064825
Alignment:
| Q |
5 |
aatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgtatta |
104 |
Q |
| |
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|
|
| T |
41064970 |
aatactaaaagcatgaaaataaaaattagaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaatttaatgtgtatca |
41064871 |
T |
|
| Q |
105 |
tagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaatta |
150 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
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|
| T |
41064870 |
tagtactaaaatattgatataataatttaaagtataatactaatta |
41064825 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 12910415 - 12910305
Alignment:
| Q |
1 |
ttacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgt |
100 |
Q |
| |
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|
| T |
12910415 |
ttacaatactaatagcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaattgcaacaaagtact--aatattattacaaaactaatttaaagtgt |
12910318 |
T |
|
| Q |
101 |
attatagtactaa |
113 |
Q |
| |
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||||||||||||| |
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| T |
12910317 |
attatagtactaa |
12910305 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Original strand, 47238758 - 47238805
Alignment:
| Q |
1 |
ttacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaa |
48 |
Q |
| |
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|||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
47238758 |
ttacaatactaataccatggaaataaaaattacaaatagataatagaa |
47238805 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 39 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 40725817 - 40725766
Alignment:
| Q |
39 |
gataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaa |
90 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| |||| |||| |||||||| ||||||||||||| |
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|
| T |
40725817 |
gataatagaatttatagtgtaatatagtactaaaatatcattacaaaactaa |
40725766 |
T |
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