View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6076_high_4 (Length: 712)

Name: NF6076_high_4
Description: NF6076
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6076_high_4
NF6076_high_4
[»] chr3 (116 HSPs)
chr3 (4-712)||(38173902-38174610)
chr3 (4-426)||(45419659-45420078)
chr3 (4-427)||(53517657-53518079)
chr3 (4-425)||(29348275-29348692)
chr3 (4-426)||(44808713-44809135)
chr3 (4-425)||(40762476-40762895)
chr3 (4-427)||(27492313-27492736)
chr3 (4-425)||(23917328-23917739)
chr3 (11-319)||(23883372-23883678)
chr3 (14-430)||(11045412-11045828)
chr3 (4-364)||(37178941-37179300)
chr3 (4-425)||(25250016-25250435)
chr3 (4-421)||(11293800-11294208)
chr3 (4-364)||(45235278-45235641)
chr3 (27-426)||(45406698-45407081)
chr3 (4-250)||(21749566-21749811)
chr3 (4-280)||(32146996-32147271)
chr3 (4-364)||(32943000-32943348)
chr3 (4-354)||(50615027-50615366)
chr3 (4-304)||(19669699-19669999)
chr3 (4-354)||(117393-117729)
chr3 (11-425)||(46295058-46295474)
chr3 (4-251)||(53397095-53397343)
chr3 (11-383)||(39562462-39562838)
chr3 (4-422)||(19601549-19601968)
chr3 (6-422)||(54268732-54269138)
chr3 (37-427)||(34995564-34995952)
chr3 (107-339)||(44557540-44557771)
chr3 (1-190)||(28685303-28685487)
chr3 (109-422)||(9018125-9018438)
chr3 (152-383)||(23920993-23921220)
chr3 (4-364)||(53439324-53439652)
chr3 (168-427)||(53377430-53377688)
chr3 (44-248)||(25232695-25232900)
chr3 (6-185)||(44555919-44556098)
chr3 (11-248)||(52701168-52701404)
chr3 (41-158)||(45387449-45387566)
chr3 (6-161)||(15772002-15772157)
chr3 (6-185)||(33475471-33475650)
chr3 (267-432)||(15771771-15771936)
chr3 (11-248)||(33476241-33476477)
chr3 (6-101)||(3173707-3173802)
chr3 (328-430)||(14525111-14525213)
chr3 (334-424)||(23917212-23917302)
chr3 (42-186)||(26268683-26268826)
chr3 (346-427)||(38173782-38173863)
chr3 (11-185)||(41927953-41928126)
chr3 (11-116)||(53377329-53377436)
chr3 (133-427)||(44287642-44287933)
chr3 (4-101)||(37481253-37481351)
chr3 (336-418)||(44555806-44555888)
chr3 (334-432)||(44809159-44809257)
chr3 (334-427)||(34995419-34995512)
chr3 (357-429)||(29348154-29348226)
chr3 (334-418)||(52701982-52702066)
chr3 (11-248)||(8575953-8576191)
chr3 (344-426)||(11045283-11045365)
chr3 (344-422)||(28260540-28260618)
chr3 (11-196)||(31991074-31991259)
chr3 (344-425)||(25249897-25249978)
chr3 (4-60)||(116924-116980)
chr3 (344-428)||(3173809-3173893)
chr3 (261-436)||(20078100-20078276)
chr3 (362-422)||(23883683-23883743)
chr3 (107-248)||(41927360-41927501)
chr3 (334-418)||(41928160-41928244)
chr3 (4-60)||(44555364-44555420)
chr3 (4-60)||(50614546-50614602)
chr3 (335-425)||(44555245-44555336)
chr3 (344-431)||(45420115-45420201)
chr3 (335-425)||(116806-116896)
chr3 (335-425)||(44557892-44557982)
chr3 (335-425)||(45234599-45234689)
chr3 (335-425)||(50615394-50615484)
chr3 (356-426)||(53518128-53518198)
chr3 (335-425)||(54185639-54185729)
chr3 (349-422)||(33225673-33225746)
chr3 (335-424)||(45235669-45235758)
chr3 (334-418)||(8575193-8575277)
chr3 (334-418)||(8576225-8576309)
chr3 (334-418)||(52701050-52701134)
chr3 (344-424)||(54269177-54269256)
chr3 (335-422)||(53396980-53397067)
chr3 (335-425)||(117757-117847)
chr3 (344-426)||(27492195-27492277)
chr3 (312-367)||(32147283-32147340)
chr3 (356-422)||(33226763-33226829)
chr3 (335-424)||(1430226-1430315)
chr3 (334-431)||(39562872-39562969)
chr3 (334-431)||(46294927-46295024)
chr3 (335-432)||(53439199-53439296)
chr3 (204-293)||(8575377-8575466)
chr3 (342-418)||(25233191-25233267)
chr3 (334-418)||(25353279-25353363)
chr3 (397-441)||(29217583-29217627)
chr3 (334-418)||(31990956-31991040)
chr3 (335-383)||(32147923-32147971)
chr3 (334-418)||(33475359-33475443)
chr3 (335-423)||(37481379-37481467)
chr3 (397-436)||(31311364-31311403)
chr3 (34-93)||(44287969-44288028)
chr3 (11-62)||(52701897-52701947)
chr3 (133-196)||(55006177-55006240)
chr3 (397-431)||(16012891-16012925)
chr3 (334-424)||(19601432-19601522)
chr3 (397-431)||(21863682-21863716)
chr3 (397-431)||(26704181-26704215)
chr3 (336-422)||(27867960-27868046)
chr3 (262-300)||(40630699-40630737)
chr3 (335-425)||(45387321-45387411)
chr3 (397-435)||(46710223-46710261)
chr3 (84-185)||(53520018-53520120)
chr3 (397-430)||(26257327-26257360)
chr3 (397-430)||(43630689-43630722)
chr3 (312-364)||(53397387-53397440)
chr3 (132-189)||(53658029-53658086)
[»] chr6 (82 HSPs)
chr6 (4-437)||(15720925-15721360)
chr6 (4-430)||(8709836-8710264)
chr6 (4-430)||(5974178-5974604)
chr6 (4-426)||(30660778-30661199)
chr6 (4-426)||(26356528-26356952)
chr6 (4-426)||(10915301-10915727)
chr6 (11-426)||(17697263-17697674)
chr6 (4-424)||(5087068-5087485)
chr6 (5-422)||(29691790-29692205)
chr6 (4-431)||(1820983-1821403)
chr6 (4-383)||(22731914-22732293)
chr6 (4-427)||(844106-844532)
chr6 (4-422)||(861235-861655)
chr6 (67-422)||(30492773-30493126)
chr6 (4-364)||(5079442-5079802)
chr6 (11-373)||(33518294-33518644)
chr6 (67-428)||(20510542-20510889)
chr6 (5-304)||(938845-939143)
chr6 (109-430)||(20977467-20977789)
chr6 (11-424)||(33744537-33744951)
chr6 (4-331)||(12481765-12482081)
chr6 (4-229)||(2087438-2087661)
chr6 (4-340)||(14256111-14256440)
chr6 (141-354)||(17245717-17245929)
chr6 (261-427)||(16736525-16736691)
chr6 (4-304)||(18502988-18503274)
chr6 (4-320)||(28476167-28476486)
chr6 (165-383)||(20897728-20897947)
chr6 (109-325)||(20977101-20977317)
chr6 (160-328)||(34046542-34046710)
chr6 (205-369)||(30353055-30353220)
chr6 (11-424)||(3375297-3375708)
chr6 (204-427)||(24958758-24958978)
chr6 (4-196)||(11400171-11400364)
chr6 (11-196)||(289461-289647)
chr6 (11-194)||(21108172-21108355)
chr6 (265-419)||(2937237-2937392)
chr6 (4-173)||(20898115-20898275)
chr6 (11-185)||(289005-289178)
chr6 (344-427)||(15721397-15721480)
chr6 (344-426)||(30492603-30492685)
chr6 (334-426)||(2087320-2087412)
chr6 (334-418)||(3913148-3913232)
chr6 (334-426)||(20510373-20510465)
chr6 (344-428)||(26356407-26356491)
chr6 (321-383)||(2087660-2087722)
chr6 (341-426)||(22732327-22732411)
chr6 (11-248)||(3914474-3914709)
chr6 (334-430)||(11400391-11400487)
chr6 (344-431)||(861692-861779)
chr6 (4-73)||(17246307-17246376)
chr6 (349-422)||(18804125-18804198)
chr6 (334-418)||(3914742-3914826)
chr6 (334-418)||(5086743-5086827)
chr6 (334-426)||(12482110-12482202)
chr6 (4-88)||(17244540-17244624)
chr6 (334-429)||(30660657-30660752)
chr6 (346-424)||(1820868-1820945)
chr6 (335-425)||(5079830-5079920)
chr6 (335-425)||(18503302-18503392)
chr6 (334-418)||(288888-288971)
chr6 (349-425)||(939180-939256)
chr6 (335-422)||(17246404-17246491)
chr6 (356-423)||(33518701-33518768)
chr6 (344-426)||(843984-844066)
chr6 (335-424)||(8231087-8231176)
chr6 (397-438)||(14191012-14191053)
chr6 (345-426)||(14256478-14256559)
chr6 (334-426)||(938725-938817)
chr6 (335-423)||(3335490-3335578)
chr6 (344-425)||(3375170-3375253)
chr6 (285-380)||(30916628-30916724)
chr6 (133-196)||(15053930-15053993)
chr6 (397-436)||(16465204-16465243)
chr6 (336-418)||(289683-289765)
chr6 (6-60)||(5079000-5079054)
chr6 (397-431)||(7575670-7575704)
chr6 (348-426)||(16465259-16465337)
chr6 (335-425)||(22971778-22971868)
chr6 (335-425)||(23816530-23816620)
chr6 (397-430)||(33683997-33684030)
chr6 (397-430)||(33858745-33858778)
[»] chr7 (111 HSPs)
chr7 (4-430)||(43597354-43597779)
chr7 (4-426)||(22378332-22378753)
chr7 (4-424)||(38158948-38159371)
chr7 (4-431)||(7238445-7238871)
chr7 (4-426)||(47791838-47792267)
chr7 (4-380)||(4926372-4926750)
chr7 (87-424)||(6330978-6331315)
chr7 (4-424)||(1961897-1962317)
chr7 (4-371)||(18059006-18059368)
chr7 (11-422)||(14990426-14990834)
chr7 (11-422)||(15420037-15420445)
chr7 (4-338)||(6588687-6589020)
chr7 (35-426)||(10620394-10620785)
chr7 (44-426)||(27727099-27727485)
chr7 (4-308)||(35482051-35482351)
chr7 (11-367)||(46044225-46044580)
chr7 (4-427)||(4899738-4900158)
chr7 (5-435)||(11396824-11397252)
chr7 (4-435)||(43574239-43574667)
chr7 (4-364)||(44167730-44168074)
chr7 (3-354)||(3495655-3495992)
chr7 (6-448)||(15652653-15653085)
chr7 (4-275)||(46330799-46331069)
chr7 (4-196)||(21109449-21109642)
chr7 (4-364)||(43083788-43084137)
chr7 (4-339)||(38199062-38199382)
chr7 (4-383)||(1544393-1544769)
chr7 (4-363)||(29155900-29156260)
chr7 (4-429)||(44080958-44081371)
chr7 (11-424)||(38598974-38599389)
chr7 (69-425)||(37539849-37540206)
chr7 (77-251)||(36019811-36019985)
chr7 (4-364)||(33624788-33625144)
chr7 (211-364)||(45958663-45958815)
chr7 (4-137)||(4883775-4883908)
chr7 (211-435)||(28924698-28924923)
chr7 (153-364)||(15130859-15131061)
chr7 (10-373)||(16080703-16081056)
chr7 (6-372)||(9633096-9633461)
chr7 (4-146)||(45958811-45958953)
chr7 (96-426)||(10463170-10463497)
chr7 (11-185)||(1066517-1066691)
chr7 (344-431)||(6588563-6588650)
chr7 (11-248)||(8832715-8832952)
chr7 (11-248)||(12621625-12621861)
chr7 (4-89)||(36020005-36020090)
chr7 (344-426)||(27728090-27728172)
chr7 (6-59)||(27727998-27728051)
chr7 (358-427)||(38158829-38158898)
chr7 (334-426)||(22378781-22378872)
chr7 (317-373)||(36019720-36019776)
chr7 (334-418)||(38595316-38595400)
chr7 (342-418)||(40304521-40304597)
chr7 (335-426)||(10620831-10620922)
chr7 (334-424)||(1260023-1260113)
chr7 (344-426)||(7238909-7238991)
chr7 (344-426)||(14990878-14990960)
chr7 (344-426)||(15420489-15420571)
chr7 (334-424)||(37537369-37537459)
chr7 (335-425)||(38198944-38199034)
chr7 (334-423)||(4883936-4884025)
chr7 (11-104)||(8081814-8081906)
chr7 (3-60)||(38199807-38199864)
chr7 (206-304)||(47139732-47139830)
chr7 (334-426)||(6589279-6589370)
chr7 (334-418)||(8832597-8832681)
chr7 (344-427)||(18058886-18058969)
chr7 (83-242)||(1065769-1065928)
chr7 (335-425)||(3496506-3496596)
chr7 (344-422)||(12908565-12908643)
chr7 (336-418)||(37107568-37107650)
chr7 (11-89)||(38593281-38593358)
chr7 (13-242)||(42974165-42974394)
chr7 (356-428)||(15654429-15654501)
chr7 (334-418)||(18798829-18798913)
chr7 (335-423)||(33624672-33624760)
chr7 (11-160)||(37108538-37108686)
chr7 (334-418)||(38593164-38593247)
chr7 (4-59)||(3496423-3496478)
chr7 (345-424)||(29884225-29884304)
chr7 (84-248)||(38594592-38594756)
chr7 (356-418)||(8081698-8081760)
chr7 (336-418)||(12621897-12621979)
chr7 (344-426)||(21109680-21109762)
chr7 (335-425)||(38199891-38199981)
chr7 (335-425)||(45958981-45959071)
chr7 (335-425)||(46330681-46330771)
chr7 (356-425)||(1961779-1961848)
chr7 (356-425)||(35482400-35482469)
chr7 (335-424)||(44167024-44167113)
chr7 (335-424)||(45957988-45958077)
chr7 (334-426)||(47791718-47791808)
chr7 (335-423)||(15131652-15131740)
chr7 (6-62)||(37537487-37537542)
chr7 (334-418)||(40303988-40304072)
chr7 (334-418)||(42974605-42974689)
chr7 (334-426)||(43597805-43597897)
chr7 (11-62)||(8082536-8082586)
chr7 (356-427)||(11397295-11397366)
chr7 (4-55)||(15130711-15130762)
chr7 (335-418)||(25270502-25270585)
chr7 (336-423)||(33625730-33625817)
chr7 (335-422)||(46044615-46044702)
chr7 (397-432)||(47580304-47580339)
chr7 (344-430)||(4900195-4900281)
chr7 (397-435)||(33653976-33654014)
chr7 (344-426)||(43574120-43574202)
chr7 (397-430)||(11290585-11290618)
chr7 (4-60)||(43083327-43083384)
chr7 (397-430)||(43301956-43301989)
chr7 (397-430)||(48154025-48154058)
[»] chr4 (119 HSPs)
chr4 (4-428)||(33177293-33177716)
chr4 (4-431)||(47309434-47309860)
chr4 (4-426)||(53323774-53324196)
chr4 (4-383)||(30331195-30331573)
chr4 (4-429)||(22068097-22068522)
chr4 (6-422)||(28448268-28448677)
chr4 (4-424)||(51395489-51395907)
chr4 (11-383)||(55938075-55938447)
chr4 (11-354)||(31316547-31316889)
chr4 (38-430)||(1870140-1870530)
chr4 (4-424)||(10085485-10085902)
chr4 (4-364)||(10321695-10322055)
chr4 (4-426)||(19522712-19523134)
chr4 (4-293)||(43938001-43938291)
chr4 (4-363)||(33689232-33689588)
chr4 (4-373)||(4850094-4850463)
chr4 (4-338)||(53423525-53423859)
chr4 (43-424)||(7490732-7491110)
chr4 (76-421)||(47463436-47463780)
chr4 (4-242)||(20177934-20178170)
chr4 (4-364)||(25422067-25422422)
chr4 (4-354)||(51876007-51876350)
chr4 (204-425)||(7617293-7617514)
chr4 (4-425)||(47379053-47379471)
chr4 (77-318)||(3873134-3873374)
chr4 (4-196)||(13718078-13718271)
chr4 (4-239)||(38114273-38114507)
chr4 (260-412)||(38114125-38114277)
chr4 (11-421)||(23473360-23473766)
chr4 (204-429)||(3862360-3862585)
chr4 (204-429)||(3871117-3871342)
chr4 (108-367)||(11670210-11670469)
chr4 (49-306)||(42972728-42972983)
chr4 (4-328)||(53571514-53571824)
chr4 (11-426)||(48082450-48082866)
chr4 (4-325)||(44209470-44209777)
chr4 (11-426)||(44289684-44290088)
chr4 (4-251)||(35060875-35061120)
chr4 (4-193)||(37329487-37329678)
chr4 (259-426)||(13717868-13718035)
chr4 (259-424)||(45557893-45558058)
chr4 (317-429)||(3872916-3873028)
chr4 (6-426)||(52947636-52948054)
chr4 (5-403)||(48219785-48220180)
chr4 (44-422)||(38499327-38499705)
chr4 (261-373)||(20177772-20177885)
chr4 (11-250)||(35821131-35821357)
chr4 (6-372)||(13603785-13604150)
chr4 (137-383)||(20650421-20650666)
chr4 (11-194)||(34513123-34513305)
chr4 (11-422)||(55283115-55283525)
chr4 (4-80)||(7617535-7617611)
chr4 (344-432)||(19522586-19522674)
chr4 (11-248)||(44452093-44452328)
chr4 (4-75)||(3873397-3873468)
chr4 (334-424)||(38114534-38114624)
chr4 (344-425)||(52948093-52948174)
chr4 (346-426)||(7490577-7490657)
chr4 (334-426)||(23473803-23473894)
chr4 (261-383)||(35351552-35351672)
chr4 (360-430)||(3873519-3873589)
chr4 (334-432)||(4849968-4850066)
chr4 (336-430)||(6589096-6589190)
chr4 (344-402)||(35821030-35821088)
chr4 (11-248)||(28163777-28164010)
chr4 (344-424)||(28448718-28448799)
chr4 (4-60)||(11670873-11670929)
chr4 (334-418)||(13508756-13508840)
chr4 (334-418)||(48738397-48738481)
chr4 (344-431)||(14579061-14579148)
chr4 (347-422)||(53423895-53423970)
chr4 (334-425)||(53569036-53569127)
chr4 (346-424)||(33177754-33177832)
chr4 (142-229)||(35351735-35351822)
chr4 (335-425)||(53570890-53570980)
chr4 (335-425)||(53571852-53571942)
chr4 (334-418)||(28164045-28164128)
chr4 (345-422)||(30331611-30331690)
chr4 (334-422)||(47309319-47309407)
chr4 (334-426)||(47379498-47379590)
chr4 (11-127)||(47939750-47939865)
chr4 (4-91)||(11670119-11670206)
chr4 (335-422)||(31470847-31470934)
chr4 (360-423)||(51875879-51875942)
chr4 (344-426)||(7499081-7499163)
chr4 (344-426)||(10085367-10085449)
chr4 (335-425)||(11670001-11670091)
chr4 (335-425)||(11670957-11671047)
chr4 (334-432)||(48082318-48082416)
chr4 (345-426)||(20650727-20650808)
chr4 (335-424)||(33689616-33689705)
chr4 (345-422)||(42973016-42973093)
chr4 (334-427)||(44289557-44289650)
chr4 (49-185)||(44452920-44453056)
chr4 (334-431)||(47463292-47463389)
chr4 (335-423)||(25243925-25244013)
chr4 (133-196)||(16618865-16618928)
chr4 (349-424)||(27392496-27392571)
chr4 (397-432)||(29772012-29772047)
chr4 (397-436)||(33440005-33440044)
chr4 (397-432)||(39150596-39150631)
chr4 (325-380)||(42916275-42916330)
chr4 (11-105)||(6817994-6818087)
chr4 (335-425)||(31316423-31316512)
chr4 (335-381)||(33688602-33688648)
chr4 (336-418)||(44451975-44452057)
chr4 (5-75)||(50824411-50824481)
chr4 (397-430)||(479769-479802)
chr4 (397-434)||(6786450-6786487)
chr4 (261-302)||(6818048-6818089)
chr4 (358-427)||(7617662-7617731)
chr4 (397-430)||(8080069-8080102)
chr4 (397-430)||(19689444-19689477)
chr4 (397-430)||(22023716-22023749)
chr4 (336-425)||(25421949-25422038)
chr4 (335-424)||(44208758-44208847)
chr4 (334-383)||(44453499-44453548)
chr4 (4-60)||(53569155-53569212)
chr4 (4-60)||(53571008-53571065)
[»] scaffold0445 (2 HSPs)
scaffold0445 (11-426)||(5791-6205)
scaffold0445 (334-432)||(6241-6338)
[»] chr5 (128 HSPs)
chr5 (4-423)||(10463737-10464154)
chr5 (4-430)||(8313209-8313633)
chr5 (4-424)||(37103032-37103450)
chr5 (4-422)||(8336843-8337259)
chr5 (4-426)||(8404268-8404690)
chr5 (4-387)||(27307819-27308201)
chr5 (4-383)||(34785167-34785544)
chr5 (4-419)||(40158265-40158678)
chr5 (34-428)||(17742355-17742750)
chr5 (4-422)||(4426022-4426439)
chr5 (11-426)||(621501-621914)
chr5 (4-427)||(4462756-4463181)
chr5 (6-383)||(1683081-1683458)
chr5 (4-383)||(27335630-27336006)
chr5 (4-426)||(42877489-42877905)
chr5 (4-427)||(2003952-2004372)
chr5 (4-367)||(41139025-41139387)
chr5 (4-435)||(41192836-41193272)
chr5 (4-432)||(24636808-24637234)
chr5 (77-427)||(34009995-34010344)
chr5 (4-424)||(31211187-31211609)
chr5 (4-364)||(8217947-8218293)
chr5 (123-424)||(9687407-9687708)
chr5 (123-427)||(28456628-28456928)
chr5 (95-364)||(38693402-38693670)
chr5 (4-427)||(4461836-4462245)
chr5 (4-304)||(13920063-13920362)
chr5 (11-426)||(30394087-30394503)
chr5 (4-328)||(34527030-34527341)
chr5 (108-427)||(42852827-42853142)
chr5 (4-329)||(43440844-43441155)
chr5 (11-418)||(2005030-2005438)
chr5 (204-383)||(22023014-22023193)
chr5 (4-175)||(22023191-22023362)
chr5 (163-435)||(21837098-21837369)
chr5 (4-424)||(18261055-18261471)
chr5 (31-434)||(37446432-37446830)
chr5 (164-417)||(9924401-9924645)
chr5 (13-431)||(22166741-22167161)
chr5 (4-354)||(26865653-26865975)
chr5 (11-380)||(10674648-10675016)
chr5 (155-424)||(14049632-14049899)
chr5 (210-364)||(18950805-18950959)
chr5 (23-426)||(36875874-36876274)
chr5 (11-425)||(30698556-30698969)
chr5 (4-147)||(16965878-16966021)
chr5 (11-248)||(2262845-2263081)
chr5 (4-87)||(9687715-9687798)
chr5 (32-138)||(9924287-9924393)
chr5 (214-383)||(6365214-6365383)
chr5 (345-425)||(28237291-28237371)
chr5 (6-185)||(40272459-40272638)
chr5 (334-425)||(10463621-10463712)
chr5 (341-426)||(621955-622040)
chr5 (11-248)||(43210678-43210914)
chr5 (334-430)||(27307697-27307793)
chr5 (260-423)||(28615906-28616065)
chr5 (334-425)||(4425903-4425994)
chr5 (334-425)||(17742216-17742307)
chr5 (209-383)||(27280360-27280531)
chr5 (335-435)||(1683486-1683586)
chr5 (11-194)||(19332468-19332651)
chr5 (262-429)||(32510406-32510573)
chr5 (6-368)||(3548280-3548638)
chr5 (344-430)||(42877941-42878027)
chr5 (334-427)||(41193299-41193392)
chr5 (4-100)||(6365413-6365508)
chr5 (334-426)||(8313091-8313183)
chr5 (334-421)||(22023389-22023476)
chr5 (346-432)||(40158140-40158226)
chr5 (334-431)||(10674518-10674615)
chr5 (329-426)||(27280062-27280159)
chr5 (345-434)||(37102907-37102995)
chr5 (334-418)||(3407211-3407295)
chr5 (359-435)||(4462446-4462522)
chr5 (334-418)||(19332351-19332435)
chr5 (4-60)||(26865232-26865288)
chr5 (335-418)||(2263114-2263197)
chr5 (334-433)||(30403440-30403539)
chr5 (346-424)||(9687838-9687916)
chr5 (335-425)||(13919945-13920035)
chr5 (32-130)||(14049903-14050000)
chr5 (335-425)||(38693759-38693849)
chr5 (334-427)||(2004903-2004996)
chr5 (11-196)||(43209900-43210084)
chr5 (344-417)||(43538478-43538551)
chr5 (4-56)||(8217510-8217562)
chr5 (11-90)||(32537608-32537687)
chr5 (344-427)||(28456467-28456550)
chr5 (349-427)||(8404735-8404813)
chr5 (335-425)||(13920973-13921063)
chr5 (348-426)||(27335511-27335589)
chr5 (334-424)||(36875743-36875833)
chr5 (344-425)||(2003834-2003915)
chr5 (356-437)||(4462294-4462375)
chr5 (334-423)||(8218321-8218410)
chr5 (397-434)||(26020312-26020349)
chr5 (335-424)||(34526913-34527002)
chr5 (11-104)||(42645089-42645181)
chr5 (358-426)||(8336723-8336791)
chr5 (356-424)||(21837026-21837094)
chr5 (11-91)||(37812678-37812757)
chr5 (4-60)||(38693675-38693731)
chr5 (334-418)||(40272346-40272430)
chr5 (334-418)||(43210947-43211034)
chr5 (397-432)||(4000976-4001011)
chr5 (137-196)||(5597755-5597814)
chr5 (397-432)||(12331120-12331155)
chr5 (137-196)||(24334041-24334100)
chr5 (109-297)||(30733927-30734113)
chr5 (396-435)||(32538752-32538791)
chr5 (335-402)||(42645214-42645281)
chr5 (43-90)||(42852775-42852822)
chr5 (397-431)||(18907505-18907539)
chr5 (360-418)||(37812172-37812230)
chr5 (397-430)||(4590856-4590889)
chr5 (284-381)||(11154722-11154818)
chr5 (335-424)||(18950977-18951066)
chr5 (397-426)||(21063913-21063942)
chr5 (133-186)||(23425337-23425389)
chr5 (334-423)||(24637261-24637350)
chr5 (397-430)||(26910448-26910481)
chr5 (4-45)||(28456585-28456626)
chr5 (397-438)||(31124499-31124540)
chr5 (335-424)||(38691864-38691953)
chr5 (397-430)||(39412764-39412797)
chr5 (397-430)||(41960457-41960490)
chr5 (397-430)||(43211847-43211880)
[»] chr1 (120 HSPs)
chr1 (4-424)||(30719479-30719899)
chr1 (4-424)||(26805367-26805786)
chr1 (1-422)||(35530783-35531204)
chr1 (4-422)||(19791239-19791656)
chr1 (4-425)||(43504775-43505187)
chr1 (4-364)||(36367825-36368185)
chr1 (4-432)||(52493528-52493956)
chr1 (6-326)||(26020373-26020692)
chr1 (11-364)||(11999725-12000077)
chr1 (4-367)||(30982314-30982677)
chr1 (83-424)||(46517047-46517388)
chr1 (4-297)||(13501206-13501496)
chr1 (4-364)||(33708880-33709240)
chr1 (4-435)||(51561211-51561642)
chr1 (4-242)||(28700954-28701192)
chr1 (4-367)||(46596708-46597070)
chr1 (32-250)||(47008697-47008913)
chr1 (11-422)||(10041119-10041528)
chr1 (4-427)||(31400219-31400640)
chr1 (4-339)||(36248333-36248658)
chr1 (11-354)||(12368185-12368518)
chr1 (204-428)||(21794533-21794756)
chr1 (6-427)||(33707242-33707663)
chr1 (4-369)||(21091051-21091412)
chr1 (4-339)||(15053640-15053953)
chr1 (294-423)||(47008553-47008682)
chr1 (142-428)||(2059484-2059769)
chr1 (94-304)||(39681883-39682094)
chr1 (174-354)||(37986691-37986869)
chr1 (118-431)||(48410258-48410570)
chr1 (82-426)||(35188250-35188587)
chr1 (44-304)||(7565175-7565435)
chr1 (11-104)||(21794417-21794510)
chr1 (284-428)||(28701194-28701339)
chr1 (11-229)||(49767693-49767910)
chr1 (164-426)||(5430438-5430699)
chr1 (11-229)||(12251439-12251656)
chr1 (11-304)||(31024051-31024344)
chr1 (204-427)||(42972167-42972386)
chr1 (262-381)||(20357192-20357310)
chr1 (262-381)||(20562645-20562763)
chr1 (11-185)||(27550800-27550974)
chr1 (11-229)||(25351963-25352178)
chr1 (11-194)||(11397039-11397222)
chr1 (6-73)||(2059078-2059145)
chr1 (344-425)||(13501087-13501168)
chr1 (4-100)||(37986893-37986989)
chr1 (350-432)||(46517412-46517494)
chr1 (334-418)||(48218172-48218256)
chr1 (11-185)||(49768522-49768696)
chr1 (52-248)||(52882360-52882556)
chr1 (335-418)||(52882620-52882703)
chr1 (334-432)||(30719353-30719451)
chr1 (344-426)||(30742661-30742743)
chr1 (336-418)||(51338351-51338433)
chr1 (11-104)||(48218046-48218138)
chr1 (334-418)||(27550683-27550767)
chr1 (266-326)||(29231368-29231428)
chr1 (334-418)||(52010675-52010759)
chr1 (4-59)||(29231884-29231939)
chr1 (335-425)||(12367585-12367675)
chr1 (335-425)||(12368553-12368643)
chr1 (344-426)||(13501544-13501626)
chr1 (335-425)||(36368213-36368303)
chr1 (336-418)||(49767575-49767657)
chr1 (24-89)||(26207482-26207547)
chr1 (335-424)||(29231208-29231297)
chr1 (11-60)||(36249098-36249147)
chr1 (358-427)||(48410001-48410070)
chr1 (4-60)||(12367703-12367759)
chr1 (4-60)||(15054431-15054487)
chr1 (334-418)||(25352768-25352852)
chr1 (4-60)||(37986209-37986265)
chr1 (341-425)||(43504657-43504741)
chr1 (334-418)||(51339919-51340003)
chr1 (125-248)||(27551561-27551684)
chr1 (334-429)||(35530665-35530760)
chr1 (344-427)||(51561680-51561763)
chr1 (336-425)||(15053528-15053617)
chr1 (336-418)||(27551819-27551901)
chr1 (334-436)||(28700824-28700926)
chr1 (335-425)||(36249182-36249272)
chr1 (335-425)||(37986091-37986181)
chr1 (334-416)||(52881487-52881569)
chr1 (342-383)||(12896869-12896910)
chr1 (345-426)||(13083325-13083406)
chr1 (345-426)||(19791120-19791201)
chr1 (335-424)||(37987017-37987106)
chr1 (124-196)||(52881707-52881780)
chr1 (106-150)||(2059152-2059196)
chr1 (348-424)||(7565515-7565590)
chr1 (334-418)||(11396921-11397005)
chr1 (335-423)||(11999601-11999689)
chr1 (334-418)||(12897412-12897496)
chr1 (344-424)||(26805824-26805904)
chr1 (261-425)||(31024305-31024468)
chr1 (335-423)||(33708203-33708291)
chr1 (6-90)||(42971953-42972036)
chr1 (262-297)||(1297113-1297148)
chr1 (397-432)||(2969677-2969712)
chr1 (363-418)||(12251714-12251769)
chr1 (55-186)||(18996922-18997052)
chr1 (133-196)||(26507632-26507695)
chr1 (335-425)||(533936-534025)
chr1 (397-431)||(538484-538518)
chr1 (262-320)||(14411388-14411446)
chr1 (336-418)||(25351845-25351927)
chr1 (397-431)||(41885054-41885088)
chr1 (344-422)||(47008962-47009040)
chr1 (336-418)||(51840106-51840188)
chr1 (356-425)||(2058959-2059028)
chr1 (397-430)||(10556072-10556105)
chr1 (357-422)||(21090938-21091003)
chr1 (344-425)||(26020275-26020356)
chr1 (346-383)||(28480016-28480053)
chr1 (397-430)||(28868481-28868514)
chr1 (335-424)||(30981631-30981720)
chr1 (334-435)||(31400091-31400192)
chr1 (397-430)||(39711519-39711552)
chr1 (397-430)||(41411444-41411477)
[»] chr8 (124 HSPs)
chr8 (4-426)||(25101834-25102255)
chr8 (1-425)||(38706316-38706739)
chr8 (4-425)||(5250263-5250684)
chr8 (4-426)||(44265446-44265867)
chr8 (4-426)||(6590263-6590685)
chr8 (4-427)||(41590211-41590631)
chr8 (1-380)||(36470743-36471121)
chr8 (4-426)||(33322531-33322952)
chr8 (4-437)||(37967533-37967966)
chr8 (4-375)||(43622715-43623087)
chr8 (4-383)||(27875361-27875740)
chr8 (4-425)||(5695793-5696205)
chr8 (4-430)||(8784576-8785001)
chr8 (4-383)||(28015541-28015921)
chr8 (4-383)||(6018037-6018413)
chr8 (4-365)||(21135321-21135681)
chr8 (4-364)||(35863039-35863397)
chr8 (4-364)||(24451482-24451841)
chr8 (4-383)||(42499295-42499673)
chr8 (4-354)||(18839862-18840211)
chr8 (4-364)||(35369188-35369546)
chr8 (4-423)||(17842463-17842881)
chr8 (4-251)||(17498541-17498787)
chr8 (4-364)||(41281235-41281593)
chr8 (11-320)||(37706702-37707009)
chr8 (11-364)||(16472997-16473341)
chr8 (11-364)||(16477568-16477912)
chr8 (1-237)||(21159841-21160077)
chr8 (14-373)||(30968670-30969029)
chr8 (4-364)||(36063369-36063718)
chr8 (4-184)||(6413383-6413563)
chr8 (69-342)||(18304622-18304896)
chr8 (132-424)||(43936391-43936681)
chr8 (83-317)||(23483421-23483654)
chr8 (4-196)||(30658540-30658731)
chr8 (4-354)||(39336991-39337330)
chr8 (11-383)||(5765631-5766005)
chr8 (11-421)||(28755051-28755462)
chr8 (4-196)||(9252645-9252836)
chr8 (22-250)||(17062413-17062639)
chr8 (22-250)||(17585719-17585945)
chr8 (4-196)||(13323652-13323845)
chr8 (11-420)||(36018116-36018528)
chr8 (25-383)||(32513959-32514318)
chr8 (208-427)||(36126455-36126678)
chr8 (259-425)||(17062151-17062313)
chr8 (259-425)||(17586045-17586207)
chr8 (262-426)||(30658323-30658491)
chr8 (4-242)||(43988211-43988446)
chr8 (262-427)||(2827065-2827230)
chr8 (344-431)||(547339-547426)
chr8 (262-422)||(12469454-12469615)
chr8 (4-104)||(14121938-14122038)
chr8 (262-426)||(31185724-31185890)
chr8 (6-185)||(32244511-32244690)
chr8 (44-320)||(42024231-42024504)
chr8 (304-429)||(21159717-21159843)
chr8 (334-432)||(36471145-36471243)
chr8 (344-429)||(6590142-6590227)
chr8 (11-248)||(3865698-3865934)
chr8 (270-430)||(30806208-30806368)
chr8 (345-424)||(12469306-12469385)
chr8 (344-430)||(14121806-14121892)
chr8 (358-426)||(14122090-14122158)
chr8 (334-418)||(30133849-30133933)
chr8 (334-421)||(38706763-38706850)
chr8 (44-154)||(2826919-2827029)
chr8 (345-430)||(10409473-10409558)
chr8 (345-426)||(43988485-43988566)
chr8 (11-136)||(44894574-44894698)
chr8 (344-427)||(37967413-37967496)
chr8 (44-185)||(3866505-3866647)
chr8 (335-425)||(24451364-24451454)
chr8 (334-427)||(5250711-5250804)
chr8 (334-426)||(17498813-17498905)
chr8 (4-60)||(39337757-39337813)
chr8 (334-418)||(44893744-44893828)
chr8 (334-418)||(44894732-44894816)
chr8 (11-196)||(6243479-6243663)
chr8 (344-426)||(8784457-8784539)
chr8 (345-427)||(21160113-21160195)
chr8 (335-425)||(41281621-41281711)
chr8 (344-426)||(41590668-41590750)
chr8 (334-424)||(42950204-42950294)
chr8 (108-160)||(1663854-1663906)
chr8 (335-427)||(1680847-1680939)
chr8 (334-430)||(25102281-25102376)
chr8 (11-248)||(32243684-32243920)
chr8 (4-60)||(35369928-35369984)
chr8 (335-425)||(13323873-13323963)
chr8 (335-425)||(21135204-21135294)
chr8 (344-426)||(33322412-33322494)
chr8 (335-425)||(35862921-35863011)
chr8 (335-425)||(39337841-39337931)
chr8 (344-429)||(9252521-9252606)
chr8 (167-383)||(10410010-10410225)
chr8 (335-424)||(13323066-13323155)
chr8 (335-424)||(21136266-21136355)
chr8 (334-418)||(2821304-2821386)
chr8 (334-418)||(3866714-3866798)
chr8 (346-422)||(5696245-5696320)
chr8 (14-102)||(10409789-10409876)
chr8 (346-418)||(30658769-30658841)
chr8 (335-423)||(36063746-36063834)
chr8 (397-437)||(38508587-38508627)
chr8 (133-196)||(6244275-6244338)
chr8 (109-196)||(34050598-34050685)
chr8 (334-424)||(6413591-6413681)
chr8 (335-425)||(16472873-16472962)
chr8 (335-425)||(16477444-16477533)
chr8 (334-432)||(18840238-18840336)
chr8 (24-86)||(28701866-28701928)
chr8 (336-418)||(32243566-32243648)
chr8 (335-425)||(35370012-35370102)
chr8 (397-431)||(36091721-36091755)
chr8 (397-431)||(37120802-37120836)
chr8 (335-425)||(39336873-39336963)
chr8 (4-58)||(41255335-41255389)
chr8 (397-430)||(5925885-5925918)
chr8 (397-434)||(8841727-8841764)
chr8 (317-422)||(17498435-17498538)
chr8 (397-430)||(18150295-18150328)
chr8 (335-424)||(24452424-24452513)
chr8 (397-430)||(40714364-40714397)
[»] chr2 (109 HSPs)
chr2 (4-426)||(33831998-33832418)
chr2 (4-424)||(7439220-7439639)
chr2 (11-425)||(10357322-10357736)
chr2 (4-431)||(42274168-42274596)
chr2 (4-426)||(31771316-31771738)
chr2 (4-424)||(25100585-25101001)
chr2 (4-427)||(41120738-41121161)
chr2 (11-424)||(31436045-31436456)
chr2 (4-433)||(40364753-40365179)
chr2 (127-432)||(13371863-13372167)
chr2 (4-338)||(3043323-3043656)
chr2 (4-429)||(30784185-30784597)
chr2 (4-423)||(44286563-44286978)
chr2 (11-432)||(8737696-8738100)
chr2 (4-304)||(43932730-43933029)
chr2 (15-429)||(44879589-44879995)
chr2 (4-242)||(6457266-6457504)
chr2 (4-426)||(37592761-37593171)
chr2 (4-329)||(42487639-42487963)
chr2 (4-354)||(20721175-20721511)
chr2 (4-323)||(44492883-44493202)
chr2 (12-250)||(36512025-36512263)
chr2 (4-249)||(25666038-25666282)
chr2 (4-354)||(21439778-21440114)
chr2 (226-429)||(29809125-29809328)
chr2 (6-427)||(14200837-14201260)
chr2 (4-184)||(35498588-35498768)
chr2 (126-364)||(18672317-18672550)
chr2 (4-364)||(20719949-20720297)
chr2 (259-429)||(35498806-35498975)
chr2 (285-432)||(25666283-25666430)
chr2 (4-251)||(34073621-34073865)
chr2 (272-432)||(6458408-6458568)
chr2 (11-249)||(33000913-33001147)
chr2 (118-308)||(33031165-33031353)
chr2 (11-372)||(8392262-8392615)
chr2 (67-229)||(29809401-29809562)
chr2 (11-242)||(32319001-32319232)
chr2 (294-424)||(30749427-30749555)
chr2 (207-369)||(36881222-36881383)
chr2 (4-86)||(7654925-7655007)
chr2 (4-102)||(20719228-20719326)
chr2 (344-432)||(19176637-19176725)
chr2 (11-196)||(3117981-3118166)
chr2 (334-435)||(25100457-25100558)
chr2 (334-418)||(3118828-3118912)
chr2 (11-185)||(32318223-32318398)
chr2 (335-426)||(41120623-41120714)
chr2 (110-351)||(18917309-18917544)
chr2 (6-84)||(33031087-33031165)
chr2 (334-418)||(32318105-32318189)
chr2 (346-429)||(3043695-3043778)
chr2 (335-425)||(3104875-3104965)
chr2 (333-427)||(33031343-33031437)
chr2 (335-425)||(42487991-42488081)
chr2 (344-422)||(44287014-44287092)
chr2 (344-425)||(33030903-33030984)
chr2 (344-424)||(4327936-4328016)
chr2 (357-436)||(7655058-7655134)
chr2 (334-422)||(13027767-13027855)
chr2 (4-60)||(23787782-23787838)
chr2 (334-418)||(25665929-25666013)
chr2 (334-418)||(30982510-30982594)
chr2 (344-423)||(6457152-6457231)
chr2 (209-297)||(13027445-13027533)
chr2 (344-427)||(31771196-31771279)
chr2 (350-424)||(8738619-8738693)
chr2 (335-428)||(10287452-10287545)
chr2 (335-425)||(20719354-20719444)
chr2 (335-425)||(21440142-21440232)
chr2 (336-418)||(32319268-32319350)
chr2 (345-430)||(14201300-14201385)
chr2 (334-418)||(9111458-9111542)
chr2 (4-60)||(20701256-20701312)
chr2 (335-423)||(20719833-20719921)
chr2 (4-60)||(21439296-21439352)
chr2 (334-418)||(30982713-30982796)
chr2 (335-418)||(3117864-3117947)
chr2 (344-427)||(31435918-31436001)
chr2 (334-425)||(33001183-33001274)
chr2 (11-93)||(13027654-13027735)
chr2 (335-425)||(20701138-20701228)
chr2 (335-425)||(20721540-20721630)
chr2 (11-196)||(32319624-32319809)
chr2 (344-430)||(34073897-34073983)
chr2 (335-425)||(43933057-43933147)
chr2 (335-425)||(44492765-44492855)
chr2 (4-57)||(18672259-18672312)
chr2 (356-425)||(40365226-40365295)
chr2 (335-424)||(42486936-42487025)
chr2 (335-423)||(1373521-1373609)
chr2 (397-437)||(40443919-40443959)
chr2 (344-423)||(8392659-8392738)
chr2 (265-300)||(19058643-19058678)
chr2 (397-432)||(21108477-21108512)
chr2 (397-432)||(33809841-33809876)
chr2 (398-437)||(40505097-40505136)
chr2 (6-56)||(4327848-4327898)
chr2 (336-418)||(9111999-9112081)
chr2 (336-418)||(32319845-32319927)
chr2 (356-426)||(35498451-35498521)
chr2 (397-431)||(39120562-39120596)
chr2 (397-431)||(41312378-41312412)
chr2 (329-423)||(44610645-44610739)
chr2 (397-430)||(16064948-16064981)
chr2 (328-373)||(23497332-23497377)
chr2 (397-430)||(27278022-27278055)
chr2 (397-430)||(27306008-27306041)
chr2 (397-430)||(45070273-45070306)
[»] scaffold0036 (2 HSPs)
scaffold0036 (6-422)||(17255-17669)
scaffold0036 (334-427)||(17699-17792)
[»] scaffold0651 (2 HSPs)
scaffold0651 (11-354)||(6809-7151)
scaffold0651 (335-425)||(7186-7275)
[»] scaffold1191 (2 HSPs)
scaffold1191 (4-425)||(669-1087)
scaffold1191 (344-425)||(551-632)
[»] scaffold1190 (2 HSPs)
scaffold1190 (4-422)||(80-486)
scaffold1190 (346-429)||(525-608)
[»] scaffold0514 (2 HSPs)
scaffold0514 (4-422)||(6059-6470)
scaffold0514 (346-429)||(6509-6592)
[»] scaffold1160 (2 HSPs)
scaffold1160 (6-360)||(1159-1514)
scaffold1160 (345-427)||(1528-1609)
[»] scaffold0707 (2 HSPs)
scaffold0707 (11-373)||(6838-7188)
scaffold0707 (356-423)||(7245-7312)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (103-427)||(157902-158223)
[»] scaffold0148 (3 HSPs)
scaffold0148 (4-320)||(35273-35588)
scaffold0148 (4-60)||(38618-38674)
scaffold0148 (335-422)||(35160-35247)
[»] scaffold0097 (6 HSPs)
scaffold0097 (4-354)||(25003-25339)
scaffold0097 (4-364)||(23787-24135)
scaffold0097 (4-102)||(23066-23164)
scaffold0097 (335-425)||(23192-23282)
scaffold0097 (335-423)||(23671-23759)
scaffold0097 (335-425)||(25368-25458)
[»] scaffold0627 (1 HSPs)
scaffold0627 (4-383)||(6931-7309)
[»] scaffold0562 (4 HSPs)
scaffold0562 (77-318)||(3953-4193)
scaffold0562 (317-429)||(3735-3847)
scaffold0562 (4-75)||(4216-4287)
scaffold0562 (360-430)||(4338-4408)
[»] scaffold0640 (2 HSPs)
scaffold0640 (11-427)||(3764-4181)
scaffold0640 (334-434)||(4215-4315)
[»] scaffold0003 (4 HSPs)
scaffold0003 (4-364)||(239947-240294)
scaffold0003 (4-60)||(239492-239548)
scaffold0003 (335-422)||(240322-240409)
scaffold0003 (356-429)||(120628-120701)
[»] scaffold0571 (2 HSPs)
scaffold0571 (162-428)||(8610-8874)
scaffold0571 (4-150)||(8430-8575)
[»] scaffold0385 (4 HSPs)
scaffold0385 (4-354)||(9906-10245)
scaffold0385 (335-425)||(10273-10363)
scaffold0385 (335-425)||(9309-9396)
scaffold0385 (4-60)||(9424-9479)
[»] scaffold0125 (3 HSPs)
scaffold0125 (163-339)||(21711-21886)
scaffold0125 (356-427)||(21890-21961)
scaffold0125 (395-437)||(21621-21663)
[»] scaffold0024 (2 HSPs)
scaffold0024 (109-432)||(47719-48041)
scaffold0024 (261-368)||(32895-33002)
[»] scaffold0199 (3 HSPs)
scaffold0199 (4-101)||(6204-6301)
scaffold0199 (335-427)||(6084-6176)
scaffold0199 (118-160)||(6305-6347)
[»] scaffold0734 (3 HSPs)
scaffold0734 (210-424)||(2727-2941)
scaffold0734 (11-185)||(3260-3436)
scaffold0734 (334-432)||(3470-3568)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (262-372)||(158745-158854)
[»] scaffold0093 (2 HSPs)
scaffold0093 (4-90)||(48967-49053)
scaffold0093 (348-422)||(19974-20048)
[»] scaffold0005 (5 HSPs)
scaffold0005 (11-147)||(282940-283076)
scaffold0005 (11-229)||(283308-283525)
scaffold0005 (344-431)||(238227-238314)
scaffold0005 (334-418)||(282823-282906)
scaffold0005 (336-415)||(283561-283640)
[»] scaffold0809 (1 HSPs)
scaffold0809 (273-427)||(630-786)
[»] scaffold0014 (2 HSPs)
scaffold0014 (334-426)||(123460-123553)
scaffold0014 (133-186)||(123298-123351)
[»] scaffold0287 (1 HSPs)
scaffold0287 (335-425)||(47-137)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (397-434)||(65340-65377)
[»] scaffold0586 (1 HSPs)
scaffold0586 (335-427)||(5914-6006)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (167-304)||(52512-52649)
[»] scaffold0245 (1 HSPs)
scaffold0245 (262-297)||(25023-25058)
[»] scaffold0063 (1 HSPs)
scaffold0063 (397-431)||(52125-52159)
[»] scaffold0041 (1 HSPs)
scaffold0041 (397-430)||(28078-28111)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 524; Significance: 0; HSPs: 116)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 524; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 712
Target Start/End: Original strand, 38173902 - 38174610
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||    
T  38173902 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttgagtttttgaacaattttttacaggcgtgttaagaacattactaaaagttcctatacaaaaaat 38174001  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  38174002 tgtcgcaaaatttgatttctacgtctagattttgttaattttatctttaactttttctgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaaaa 38174101  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 303  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||       |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38174102 tt-taaattttagtatatgaacctttcatagtgttctaaacttgtttcaaaaaaatcgttcaataatttaagagtttaaagataattaaataaactttgt 38174200  T
Q  304 tgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatag 403  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  38174201 tataacagggactaaaattagaagtaatttttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaaggattaaacttaaaaggtccctattttatag 38174300  T
Q  404 tgaccaaaaacatatttaaccctaaaaaatatt-actaacttttaaaagcacttttgaataattgtaacttgggaaagtggtttgtttactctgaaattc 502  Q
      ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38174301 gaaccaaaaacatatttaatcctaaaaaatatttactaacttttaaaagcacttttgaataattgtaacttgggaaagtggtttgtttactctgaaattc 38174400  T
Q  503 acatttccttgggatgactttgttggtatgtgttgatcgggattgaaagtttatgctactatgttggagtatatttcccttgtgatattgggggagcaga 602  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38174401 acatttccttgggatgactttgtttgtatgtgttgatcgggattgaaagtttatgctactatgttggagtatatttcccttgtgatattgggggagcaga 38174500  T
Q  603 agatgtggacaaacctaagatccatcaaatcaaatttcaacgaaggtcagtcgtgtatttgtgtcgattttaaggctgtaaagtgtcgatcagagaggaa 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38174501 agatgtggacaaacctaagatccatcaaatcaaatttcaacgaaggtcagtcgtgtatttgtgtcgattttaaggctgtaaagtgtcgatcagagaggaa 38174600  T
Q  703 aggtagaaat 712  Q
    ||||||||||    
T  38174601 aggtagaaat 38174610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 4 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 45420078 - 45419659
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  45420078 tcaattcaaatttgttt--tttatgcttaaactcttgagtttttgaacaattttttgcatacgtgttaagaacattactaaaagttcctctgcaaaaaat 45419981  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
    ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||| || ||| |||||           
T  45419980 tgtcgcaaaatttgatttctacgtccagattttgttaattttatatttaacttttaccgttttaaaaaattcatatttaactcatttaatgtt-aaaaaa 45419882  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45419881 ttctaaattttagtaaatgaacctttcataatgttctaaacttgtctaaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 45419782  T
Q  304 tgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatag 403  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||   ||  |||| |||||||||    
T  45419781 tgtaacagggactaaaattagaagtaatttttttttgtagggactaaaaaacctattaaaattaagtaaggactaaactcagaagttcccaattttatag 45419682  T
Q  404 tgaccaaaaacatatttaaccct 426  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  45419681 ggaccaaaaacatatttaaccct 45419659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 4 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 53518079 - 53517657
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  53518079 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaacttttgagtttttgaacaatttttcgcagacgtgttaagaacattactaaaagttcatctacaaaaaat 53517980  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  53517979 tgtcgcaaaatttgatttctacgtccagaatttgttaaatttatctttaacttttgtctttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaat 53517881  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||         |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  53517880 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttataaacttatcataaaaaaatcgttcaaaaatttaaaagtttaaggataattaaacaaactttgt 53517781  T
Q  304 tgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatag 403  Q
     |||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||  || | |||||||||    
T  53517780 cgtaacaaggactaaaattagaagtattttttttttgtagggactaaaaaacctattaaaattaaataaggattaaacttaaaagttctcaattttatag 53517681  T
Q  404 tgaccaaaaacatatttaacccta 427  Q
     ||||||||||||| |||||||||    
T  53517680 ggaccaaaaacataattaacccta 53517657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 4 - 425
Target Start/End: Original strand, 29348275 - 29348692
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29348275 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaact--tgagtttttgaacaattttttgcagaagtgttaagaatattactaaaagttcctttgcaaaaaat 29348372  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||           
T  29348373 tgtcgcaaaatttgatttttacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgtcgttttaaaaaattcatatttagttcgttttatgtt-aaaaaa 29348471  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||        ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29348472 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttataaatttgtct-aaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaatataattaaacaaactttgt 29348570  T
Q  304 tgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatag 403  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||  ||   |||||||||    
T  29348571 tgtaacagggactaaaattagaagtaattttcttttgcagggactaaaaaacctattaaaattaagtaaggactaaacttagaagttcgtaattttatag 29348670  T
Q  404 tgaccaaaaacatatttaaccc 425  Q
     ||| || ||||||||||||||    
T  29348671 ggactaagaacatatttaaccc 29348692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 4 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 44809135 - 44808713
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  44809135 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactctggagtttttaaacaattttttgcacacgtgttaagaatattactaaaagttcctttgcaaaaagt 44809036  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||           
T  44809035 tgtcgcaaaatttgatttttacgtcaaaattttgttaattttatctttaacttttgtcgtttttaaaaattcatatttaattcattttatgtt-aaaaaa 44808937  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtct-cnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttg 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||         |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  44808936 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttataaacctgtctaaaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattgaacaaactttg 44808837  T
Q  303 ttgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttata 402  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||  ||   ||||||||    
T  44808836 ttgtaacatgaactaaaattagaagtaattttcttttgcatggactaaaaaacctattaaaattaagtaaggactaaacttagaagttcgtaattttata 44808737  T
Q  403 gtgaccaaaaacatatttaaccct 426  Q
    | ||  ||||||||||||||||||    
T  44808736 gggattaaaaacatatttaaccct 44808713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 4 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 40762895 - 40762476
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   | || ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||    
T  40762895 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttgagtttttgaacaatttttgatagacgtgttaagaacattactaaaagctcctctacaaaatat 40762796  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
    | | | |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||           
T  40762795 tatcgtaaaatttgatttctacgtcaagattttgttaatttcatctttaacttttgccgttttaaaaaattcatatttaattcatttcatgtt-aaaaaa 40762697  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 303  Q
    ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |        |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40762696 ttctagattttagtaattgaatctttcatagtgttctaaacttgtttaaaaaaaatcgttcaaaattttaagagtttaaggataattaaacaaactttgt 40762597  T
Q  304 tgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatag 403  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||| ||||||||     
T  40762596 tgtaacagggattaaaattagaagtaatt-ttttttctagggactaaaaaacctattaaaattaagtaaggactaaacttaaaaattcccaattttataa 40762498  T
Q  404 tgaccaaaaacatatttaaccc 425  Q
     ||| ||||| |||||||||||    
T  40762497 ggactaaaaatatatttaaccc 40762476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 4 - 427
Target Start/End: Original strand, 27492313 - 27492736
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  27492313 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaattcttaggtttttgaacaattttttgcatacatgtttaaaacattactaaaagtttctccgcaaaaaat 27492412  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgtta-attttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnn 202  Q
    | | |||||| ||||||| ||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||          
T  27492413 tatcgcaaaatttgatttctacatccaaattttgttactttttatctttaacttttttcgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-agaaa 27492511  T
Q  203 nttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttg 302  Q
     |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||       ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  27492512 attctaaattttaataaatgaacatttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaatatcgttcaaaaatttgggagtttaaggataattaaacaaactttg 27492611  T
Q  303 ttgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttata 402  Q
    || || ||||||||||||||| |||||| | ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| | || | |||||||  ||  || | ||||||||    
T  27492612 ttttagcatggactaaaattataagtaaattttttttgtagggaataaaaaagctattaaaattaattgaggactaaacttagaagttctcaattttata 27492711  T
Q  403 gtgaccaaaaacatatttaacccta 427  Q
    | || ||||||||||||||||||||    
T  27492712 gggatcaaaaacatatttaacccta 27492736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 175; E-Value: 8e-94
Query Start/End: Original strand, 4 - 425
Target Start/End: Original strand, 23917328 - 23917739
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  23917328 tcaattcaagtttgtttaatttatgcttaaactcttgagtttttgaacaattttttacaaacgtgttaagaacattactaaaagtttctctgcaaaaaat 23917427  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| |||   ||||||||||||||           
T  23917428 tgtcgcaaaatttgatttctacgtccaaattgtgttaattttatttttaacttttgtcgttttaagaaattcctat---attcgtttcatgttaaaaa-- 23917522  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 303  Q
        |||   |||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||       |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23917523 ----aaaaaatagttaatgaacctttcatagtattctaaatttgtctcaaaaaaatcgtacaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgt 23917618  T
Q  304 tgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggact-aaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttata 402  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  || ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||| || | ||||||||    
T  23917619 tgtaacagggactaaaattagatgt--tttttttttgtggggactaaaaaaacctattaaaattaagtaaggactaaacttagaaattctcaattttata 23917716  T
Q  403 gtgaccaaaaacatatttaaccc 425  Q
    | ||||||||| |||||||||||    
T  23917717 gggaccaaaaaaatatttaaccc 23917739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 170; E-Value: 7e-91
Query Start/End: Original strand, 11 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 23883678 - 23883372
Alignment:
Q  11 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 110  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23883678 aaatttgtttaatttatgcttaaactctggagtttttgaacaattttttgcatacgtgttaagaacattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttaca 23883579  T
Q  111 aaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaa 210  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||       || ||||    
T  23883578 aaatttgatttctacgtccagattttgttaattttatctttaagttttgccgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaattgtaaa 23883480  T
Q  211 ttttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaaca 310  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||        | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  23883479 tattagtaaatgaaccttttatagtgttctaaacttgtctaaaaaaaattgttctaaaatttaagagtttaagaataattaaacaaactttgttataaca 23883380  T
Q  311 tggactaaa 319  Q
     ||||||||    
T  23883379 -ggactaaa 23883372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 430
Target Start/End: Original strand, 11045412 - 11045828
Alignment:
Q  14 tttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatg---ttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 110  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| || |    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11045412 tttgtttaatttatgcttaaactcttgagtttttgaaca-ttctttgcacacgtcgtattaagaaaattgctaaaagttcctctgcaaaaaattgtcgca 11045510  T
Q  111 aaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaa 210  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |       |||||||    
T  11045511 aaatttgatttctacgtccagattttgttaattttatcttgaacttttgccgttttaaaaaattcatatttaattcgttttatggt-aaaaaattctaaa 11045609  T
Q  211 ttttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaaca 310  Q
    ||||||||||||||||||||  | | |||||| ||||||||       |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||| |    
T  11045610 ttttagtaaatgaacctttctcactattctaaacttgtctcaaaaaaatcgtacaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaacttgattgtaata 11045708  T
Q  311 tggactaaaattagaagta-attcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgacca 409  Q
     ||||||||||||||||||  || ||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||| |||||||  ||  |||| ||||||||| || ||    
T  11045709 gggactaaaattagaagtatttttttttttgtagggacttaaaaacttattaaaa-taagtaagaactaaacttagaagttcccaattttatagggatca 11045807  T
Q  410 aaaacatatttaaccctaaaa 430  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  11045808 aaaacatatttaacccaaaaa 11045828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 4 - 364
Target Start/End: Original strand, 37178941 - 37179300
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||| | ||||| |||||||||||  | || ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  37178941 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttaaattttttaacaattttttatagacgtgttaagaacattactaaaagttcatccgcaaaaaat 37179040  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
    | | |||||| |||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||           
T  37179041 tatcgcaaaatttgatttatatgtccagattttattacatttatctttaacttttatcgttttcaaaaattcatatttaattcgtttgatgttaaaaaaa 37179140  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 303  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||       |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  37179141 ttctaaattttagtaattgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaaatcgttcaaaattttaagaatttaaggataattaaacaaactttgt 37179240  T
Q  304 tgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaa 364  Q
    | || ||   ||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  37179241 tttagcagtaactaaaactagaattaatt-ttttttgtagggactgaaaaacctactaaaa 37179300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 4 - 425
Target Start/End: Original strand, 25250016 - 25250435
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||    
T  25250016 tcaattcaaatttgtttaatttatatttaaactcttgagtttttgaataattttttacagacgtgttaagaacattactaaaagtttctatgcaaaaaat 25250115  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  25250116 tgtcgcaaaatttgatttctacgtccaaattttgt--attttatttttaacttttgccgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaa 25250212  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||       || ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||       
T  25250213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaaatcattcaaaaatttaagagtttaaggataatttaacaaatttgaa 25250312  T
Q  304 tgtaacatggactaa-aattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttata 402  Q
    |  |  | ||||||| | | ||     ||| || | | || ||||||||| | | |||||| ||||||||| | |||| |||||| ||||||||||||||    
T  25250313 ttgaggagggactaatagtgagtgcagatttttatatttagggactaaaagaaccattaaagttaagtaaggactaaagttgaaagatccctattttata 25250412  T
Q  403 gtgaccaaaaacatatttaaccc 425  Q
    | |||||||||||||||||||||    
T  25250413 gggaccaaaaacatatttaaccc 25250435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 4 - 421
Target Start/End: Original strand, 11293800 - 11294208
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaaca---tgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaa 100  Q
    |||||| |||| |||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||    ||||||||| ||| |||          |||||||    
T  11293800 tcaattcaaatctgtttaatctatgcttaaactcttgaatttttgaacaattttttgcagacgacgtgttaagaacattccta----------tgcaaaa 11293889  T
Q  101 aattgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatcttt-aacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnn 199  Q
    ||||||||||||| || |||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||       
T  11293890 aattgttgcaaaattttatttctaagtccagattttgtttattttatcttttaacttttaccattttaaaaaattcatatttaattcgtttcatcttaaa 11293989  T
Q  200 nnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaact 299  Q
        |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |        |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11293990 aaa-ttctaaattttagtaaatgaacttttcatagtgttctaaacttgtgtaaaagaagtcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaact 11294088  T
Q  300 ttgttgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctatttt 399  Q
    ||||||||  | ||||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||  || | |||||    
T  11294089 ttgttgtactagggactaaaattagaaataat--ttttttttagggagtaaaaaacctattaaaattaagtaaagattaaacttagaagttctcaatttt 11294186  T
Q  400 atagtgaccaaaaacatattta 421  Q
    |||| ||||||||||| |||||    
T  11294187 atagagaccaaaaacaaattta 11294208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 4 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 45235641 - 45235278
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaa- 102  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||  | || ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||     
T  45235641 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagttttttaacaattttttatagacgtgttaagaacattattaaaagttcctccgcaaaaaat 45235542  T
Q  103 ttgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatcttt-aacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnn 201  Q
    || | |||||| || ||||||| ||||||||||  ||| || ||||||| || |||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||         
T  45235541 ttatcgcaaaattttatttatatgtccagatttaattacttgtatctttaaaattttatcgtttttaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaa 45235443  T
Q  202 nnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaacttt 301  Q
      |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||        |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  45235442 tattctaaattttagtaattgaacctttcaaagtgttctaaacttgtctcaataaaaccgttaaaaaatttaagagtttatggataattaaacaaacttt 45235343  T
Q  302 gttgtaacatggactaaaattagaagtaa--ttcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaa 364  Q
    ||| || ||||||||||| ||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  45235342 gttttagcatggactaaatttagaagtaatttttttttttgtagggactaaaaaacctactaaaa 45235278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 27 - 426
Target Start/End: Original strand, 45406698 - 45407081
Alignment:
Q  27 tgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacg 126  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||              ||||||| |||     
T  45406698 tgcttaaactcttaaatttttgaacaattttttgcagacatgtttagaacattactaaaagtttctccgcaaaat-------------ttgatttttaca 45406784  T
Q  127 tccagattttgttaatttta-tctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaac 225  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||       ||||||||||||||||||||||    
T  45406785 tccagattttgttacttttaatctttaacttttgtcgttttaaaaaattcatatttaattcgattcatgttagaaaa-ttctaaattttagtaaatgaac 45406883  T
Q  226 ctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaacatggactaaaattaga 325  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||        |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |    
T  45406884 ctttcatagtgttctaaacttttcttataaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaa-tttgttttagcatggactaaaattata 45406982  T
Q  326 agtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccc 425  Q
    ||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||| | || |  | | ||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  45406983 agtaatt-ttttttgtagggagtaaaaaagctattaaaattacgtaaggactaaactt-agaagtttccaatttatagggacaaaaaacatatttaaccc 45407080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 4 - 250
Target Start/End: Original strand, 21749566 - 21749811
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||    
T  21749566 tcaattcaaatttgtttaatttattcttaaactcttgagtttttgaacaattttttacgaacgtgttaagaacattactaaaagtttctatgcaaaaaat 21749665  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
    |||   |||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||           
T  21749666 tgtcttaaaatttaatttctacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgtcgttttaaaaaattcatttttaattcgtttcatatt-aaaaaa 21749764  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtct 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||    
T  21749765 ttctaaattttagtaaatgaacctttcacagtattctaaacttgtct 21749811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 4 - 280
Target Start/End: Original strand, 32146996 - 32147271
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  32146996 tcaattcaaatttgtctaatttatgcttaaactcttaagttttttaacaattttttgtagacgtgttaagaacattactaaaagttcctccgcaaaaaat 32147095  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
    | | |||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||           
T  32147096 tatcgcaaaatttgatttatatgtccatattttattactcttatctttaacttttatcgttttcaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaa 32147194  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagttt 280  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||       ||||||||||||||||||||||    
T  32147195 ttctaaattttagtaattgaacatttcatagtgttctaaacttgtctccaaaaaatcgttcaaaaatttaagagttt 32147271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 4 - 364
Target Start/End: Original strand, 32943000 - 32943348
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  32943000 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagttttttaacaattttttgtagacgtgttaagaacattactaaaagttcctccgcaaaaaat 32943099  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
    | | |||||| |||||||||| |||  |||||| |||             |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| || ||           
T  32943100 tatcgcaaaatttgatttatatgtcttgattttatta-------------cttttgttgtttcaaaaa-ttcatatttaattcttttaatattaaaaaa- 32943184  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 303  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||       |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32943185 ttctaaattttagtaattgaacctttcatagtgttcaaaacttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgt 32943284  T
Q  304 tgtaacatggactaaaattagaagtaa---ttcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaa 364  Q
    | ||  | |||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32943285 tttagtagggactaaaattagaagtaatattttttttttgtatggactaaaaaacctactaaaa 32943348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 4 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 50615366 - 50615027
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||| | ||||||       
T  50615366 tcaattcaaatttgtttaatttattcttaaactcttaagttttttaacaattttttgtagacgtgttaagaatattactaaaagttccgccgcaaaat-- 50615269  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
               |||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||           
T  50615268 -----------ttgatttatatgtccatattttattacttttatctttaacttttattgttttcaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaaa- 50615181  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 303  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||       |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  50615180 ttctaaatttttttaattgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaattcgttcaaaaatttaagagtttaaggaaaattaaacaaactttgt 50615081  T
Q  304 tgtaacatggactaaaattagaagtaa---ttcttttttgtatggactaaaaaa 354  Q
    | ||  | |||||||||||| ||||||   || ||||||||| |||||||||||    
T  50615080 tttagtagggactaaaattataagtaatattttttttttgtagggactaaaaaa 50615027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 4 - 304
Target Start/End: Original strand, 19669699 - 19669999
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttga-gtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaa 102  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||| | |||||| |||||||||||| | || ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||     
T  19669699 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactctttaagttttttaacaattttttgtagacgtgttaagaacattactaaatgttcctccgcaaaaag 19669798  T
Q  103 ttgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnn 202  Q
    || |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||          
T  19669799 ttattgcaaaatttgatttatatgtccagattttattacttttatctttaacttttatcgttttcaaaaattcgtatttaattcgtttcatgttaaaaaa 19669898  T
Q  203 nttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttg 302  Q
     |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||        ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| ||||    
T  19669899 attctaaattttagtaattgaacctttgatagtgttctaaacttgtct-aaaaaaatcgttcaaaaatttaagagttcaagaataattaaataaattttg 19669997  T
Q  303 tt 304  Q
    ||    
T  19669998 tt 19669999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 4 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 117729 - 117393
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||  | |  ||||||||| ||||||||||||||| | ||||||       
T  117729 tcaattcaaatttgtttaatttattcttaaactcttaagttttttaacaattttttttagatgtgttaagaacattactaaaagttccgccgcaaaat-- 117632  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
               |||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||           
T  117631 -----------ttgatttatatgtccatattttattacttttatctttaacttttattgttttcaaaaattcatttttaattcgtttcatgttaaaaaaa 117543  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 303  Q
    || ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||       || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  117542 tt-taaattttattaattgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaattcattcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgt 117444  T
Q  304 tgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaa 354  Q
    | ||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  117443 tttagtagggactaaaattagaagtaatttttttttgtagggcctaaaaaa 117393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 11 - 425
Target Start/End: Original strand, 46295058 - 46295474
Alignment:
Q  11 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 110  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||| || || |||||||||  ||| |||||| ||||| | |||||||  | |||    
T  46295058 aaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagtttttcaacaaatttttacagacgtgttaagaacgttattaaaaggtcctccgaaaaaaata-tcgca 46295156  T
Q  111 aaaatt-gatttatacgtccagatttt-gttaattttatctttaactttt-gttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttct 207  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||| |||| || |||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||       || |    
T  46295157 aaaatttgatttctacgtccatatttttgttacttatatcttaaactttttgtcgttttaaaaaattcatatttaatttatttaatgttaaaaaa-ttat 46295255  T
Q  208 aaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgta 307  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |        ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| || ||    
T  46295256 agattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtataaaaagaatcgttaaaaaatttaagagtttaaggataattaagcaaaatttatttta 46295355  T
Q  308 acatggactaaaattagaagtaa-ttcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtga 406  Q
      | |||||||||||| |||||| || ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||  || | ||||||||| ||    
T  46295356 ggagggactaaaattataagtaaatttttttttgtagggattaaaaaagctattaaaattaagtaaggattaaacttagaaggtcacaattttataggga 46295455  T
Q  407 ccaaaaacatatttaaccc 425  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  46295456 ccaaaaatatatttaaccc 46295474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 4 - 251
Target Start/End: Original strand, 53397095 - 53397343
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||   || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |    
T  53397095 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagttttttaacaattttttgtcgacgtgttaagaacattactaaaagttcctccgcaaaaatt 53397194  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatg-ttnnnnnn 202  Q
    | | |||||| |||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||          
T  53397195 tatcgcaaaatttgatttatatgtccagattttattacttctatctttaacttttatcgttttcaaaaattcatatttaatttgtttcatgttttaaaaa 53397294  T
Q  203 nttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctc 251  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  53397295 attctaaattttagtaattgaacctttcatagtgttctaaacttttctc 53397343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 11 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 39562838 - 39562462
Alignment:
Q  11 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 110  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| || || |||||||||  ||| |||||| ||||| | |||||| | | |||    
T  39562838 aaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagtttttcaacaattttttacagacgtgttaagaacgttattaaaaggtcctccg-aaaaaaatatcgca 39562740  T
Q  111 aaaa-ttgatttatacgtccaga-ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttcta 208  Q
    |||| ||||||| |||||||| | |||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||       || ||    
T  39562739 aaaatttgatttctacgtccatatttttgttagttatatcttaaacttttgtcgttttaaaaaattcatatttaatttatttcatgtt-aaaaaattata 39562641  T
Q  209 aattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaa 308  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |        | ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| || ||     
T  39562640 gattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtataaaaagaattgttaaaaaatttaagagtttaaggataattaagcaaaatttattttag 39562541  T
Q  309 catggactaaaattagaagtaa----ttcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaactt 383  Q
    || |||||||||||| ||||||    || ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  39562540 cagggactaaaattataagtaaattttttttttttgtagggattaaaaaagctattaaaattaagtaaggactaaactt 39562462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 4 - 422
Target Start/End: Original strand, 19601549 - 19601968
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||  |||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  19601549 tcaattcaaatttgtttaatt-atgtttaaactcttatgttttttaacattcttttgcaaacatgttaagaacattactaaaagttcctccacaaaaaat 19601647  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccaga-ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnn 202  Q
    | | |||||| || |||| ||| |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||||  |||| ||||          
T  19601648 tatcgcaaaatttaatttctacatccagatttttgttacttttatcttgaacttttgtcattttaaaacattcatatttaattaatttcgtgtt-aaaaa 19601746  T
Q  203 nttctaaattttagtaaatgaacctttc--atagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactt 300  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| | || ||        ||| | |||| |||||||||||||  |||||| || ||||||    
T  19601747 attctaaattttagcaaatgaacctttcatatagtgttctaaacgtgcctaaaaaagatcgatgaaaattttaagagtttaagtataatttaagaaactt 19601846  T
Q  301 tgttgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctatttta 400  Q
    ||||  | ||  ||||||||||| |||||| | ||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |  |||||||||  ||| | || ||||||    
T  19601847 tgtttcagcagtgactaaaattataagtaaatttttgttgtagggactaaaaaagctattaaatttaagtgaagattaaacttagaaatttccaatttta 19601946  T
Q  401 tagtgaccaaaaacatatttaa 422  Q
    ||  ||||||||||||||||||    
T  19601947 tatggaccaaaaacatatttaa 19601968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 6 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 54269138 - 54268732
Alignment:
Q  6 aattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattg 105  Q
    |||| ||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||     
T  54269138 aattcaaatttggttaatt-atgcttaaactcttaagtttttgaacaattttttgcatgcgtgttaagaacattactaaaagttcctctgtaaaaaatta 54269040  T
Q  106 ttgcaaaaattgatttatacgtccagatttt-gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnt 204  Q
    |  ||||| ||||||| || |||||  |||| |||  ||||||||| |  |||||| |||| |||||||| ||||||||||  |||||||||       |    
T  54269039 tctcaaaatttgatttctaagtccaattttttgttgcttttatcttgattttttgtcgtttaaaaaaatttatatttaatttatttcatgttaaaaaa-t 54268941  T
Q  205 tctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgtt 304  Q
    |||||||||||| |||||| | ||| | | |||||||| | |            |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  54268940 tctaaattttaggaaatgatcttttgaaa-tgttctaaacat--------aaaatcgttcaaaaatttaaaagtttaaggataattaaacaaactttgtt 54268850  T
Q  305 gtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagt 404  Q
     || || |||||||||||| | |||| | ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||  ||| |  | |||||||||     
T  54268849 ttagcagggactaaaattacatgtaaatattttttgtagggattaaaaaagctattaaaattaagtaaaaactaaacttataaattttcaattttatagg 54268750  T
Q  405 gaccaaaaacatatttaa 422  Q
    ||||||||||||||||||    
T  54268749 gaccaaaaacatatttaa 54268732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 37 - 427
Target Start/End: Original strand, 34995564 - 34995952
Alignment:
Q  37 cttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccagatttt 136  Q
    |||||||||||||||||||||||  | || |||| | || ||||||||||||| |||  | |||||||  | ||||||||||||| |||||||| |  ||    
T  34995564 cttgagtttttgaacaattttttatagacgtgttcaaaacattactaaaagttgctccacgaaaaattagttcaaaaattgatttctacgtcca-agctt 34995662  T
Q  137 gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtg 236  Q
    || | ||||||||| || ||||||  ||| |||||| ||||||||||||| | |||||||       |||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  34995663 gtgacttttatcttgaaattttgtcatttaaaaaaaatcatatttaattcatctcatgttaaaaaa-ttctaaattttagtaaatgaaccttttataatg 34995761  T
Q  237 ttctaaccttgtctcnnnnnnn-tcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaacatggactaaaattagaagtaattctt 335  Q
    ||||||   ||| ||        |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| || ||| || || |||||||||||| | |||||| ||    
T  34995762 ttctaaaagtgtttccaaaaaaatcgttctaaaatttaatagtttaaggataattaaacaaatttagttttagcagggactaaaattatatgtaatt-tt 34995860  T
Q  336 ttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaacccta 427  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||  |   |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34995861 ttttgtagggattaaaaaagctattaaaattaagtaaggactaaacttagatgttcccaattttatagggaccaaaaacatatttaacccta 34995952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 107 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 44557771 - 44557540
Alignment:
Q  107 tgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttc 206  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||        |     
T  44557771 tgcaaaatttgatttatatgtccatattttattacttttatctttaacttttattattttcaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaaaaat- 44557673  T
Q  207 taaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgt 306  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||       ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |    
T  44557672 taaattttattaattgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaattcgttcaaaaatttaagagattaaggataattaaacaaactttgtttt 44557573  T
Q  307 aacatggactaaaattagaagtaattctttttt 339  Q
    |  | |||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  44557572 agtagggacgaaaattataagtaattttttttt 44557540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 28685303 - 28685487
Alignment:
Q  1 tcatcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaa 100  Q
    ||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| | ||||    
T  28685303 tcatcaatttaaatgtgattaatttatgcttaaactcttaagtttttgaacaattatttgcagacgtgttaagaacattactaaaagttcctccgtaaaa 28685402  T
Q  101 aattgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgttt 190  Q
    |||     ||||| || ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28685403 aat-----caaaatttaatttatatgtccaaattttattaattttatctttaacttttaccgttttaaaaaattcatatttaattcgttt 28685487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 109 - 422
Target Start/End: Original strand, 9018125 - 9018438
Alignment:
Q  109 caaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttcta 208  Q
    ||||| ||||||| ||| |||| |||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||       |||||    
T  9018125 caaaatttgatttttacttccatatttttgttattttatctttaacttttgtcgttttaaaaaattcatattgaatttatttcatgttaaaaaa-ttcta 9018223  T
Q  209 aattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnn-tcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgta 307  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||| ||| || || |         |||  |||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||| ||    
T  9018224 aatttttgtaaatgaacctttcacagtgttataaactcgtgtaaaaaaaaatcgcacaaaaatttaagagtttaagtataattaaacaaatattgtttta 9018323  T
Q  308 acatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgac 407  Q
     ||  ||||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| |||| |  | ||||||||  |||    
T  9018324 gcagagactaaaattataagtattttttttttgtaaggactaaaaaatgtattaaaattaagtaaggactaaacttaaaaattatccattttataaggac 9018423  T
Q  408 caaaaacatatttaa 422  Q
    |||||||||||||||    
T  9018424 caaaaacatatttaa 9018438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 152 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 23921220 - 23920993
Alignment:
Q  152 aacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctc 251  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||       ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||| |||     
T  23921220 aacttttgtcgttttaaaaaattcatatttaattc-tttcatgttaaaaaa-ttctaaattttagaaaatgagcctttcatagtgttataaacttatct- 23921124  T
Q  252 nnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaa 351  Q
           |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||| || ||||| ||||||||| ||||||||    
T  23921123 aaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgctataacagagactaaaattaaaaataatt-ttttttgtagggactaaa 23921025  T
Q  352 aaacctattaaaattaagtaagaattaaactt 383  Q
    |||  ||||| |||||||||| || |||||||    
T  23921024 aaatttattagaattaagtaataactaaactt 23920993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 364
Target Start/End: Original strand, 53439324 - 53439652
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||    || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  |    
T  53439324 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttacgttttttaacaattttttttcgacgtgttaagaacattactaaaagttcctccgcaaaattt 53439423  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
    |             ||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||           
T  53439424 t-------------atttatatgtccaaattttattacttttatctttaacttttatcgttttcaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaa 53439509  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 303  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||             |||||||   ||  ||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  53439510 ttctaaa-tttagtaattgaacctttcatagtgttctaaacttttc-------------tcaaaaa---aatcgttcaaaaataatt-aacaaactttgt 53439591  T
Q  304 tgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaa 364  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  53439592 tttaacagggactaaaattagaagtaatttttttttgtagggactaaaaaacctactaaaa 53439652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 168 - 427
Target Start/End: Original strand, 53377430 - 53377688
Alignment:
Q  168 aaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnn-tcgttcaa 266  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||       |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||         |||||||     
T  53377430 aaaaattcatatttaattcgttccatgttagaaaa-ttctaaattttagtaaatgaacctttcagagtgttctaaatttgtctaaaaaaaaatcgttcat 53377528  T
Q  267 aaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaatt 366  Q
    ||||  || ||||||| |||||| ||||||||||| || || || ||| |||||||| |||||||| |||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  53377529 aaatccaaaagtttaatgataataaaacaaactttttt-tagcaaggattaaaattataagtaattattttttatagggactaaaaaaactattaaaatt 53377627  T
Q  367 aagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaacccta 427  Q
    ||||||| | |||||||  ||  |||  ||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  53377628 aagtaaggactaaacttagaagttcctaattttatagggactaaaaacatatttaacccta 53377688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 44 - 248
Target Start/End: Original strand, 25232695 - 25232900
Alignment:
Q  44 ttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccaga-ttttgttaat 142  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||| ||| ||| ||||||||| |  ||||| || |||||| |||||||| |||||||| |    
T  25232695 ttttgaacaattttttgcacaagtgttaagaacattacgaaaatttcatctacaaaaaattatctcaaaattttatttatgcgtccagatttttgttact 25232794  T
Q  143 tttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaa 242  Q
    ||||| || |||||||||  ||| |||||||||||||||||||  |||||||||       ||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||    
T  25232795 tttattttaaacttttgtcttttaaaaaaattcatatttaatttatttcatgttaaaaaatttctaaattttagtaaacgaaccttttctaatgttctaa 25232894  T
Q  243 ccttgt 248  Q
     |||||    
T  25232895 acttgt 25232900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 6 - 185
Target Start/End: Original strand, 44555919 - 44556098
Alignment:
Q  6 aattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattg 105  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||     
T  44555919 aatttaaatttgtttaatt-atgcttaaacttttaagattttgaacaattttttgcacaagtgttaagaacattacgaaaagttcatctgcaaaaaatta 44556017  T
Q  106 ttgcaaaaattgatttatacgtccag-attttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaatt 185  Q
    |  ||||| || |||| | ||||||| |||||||||||||||| || |||||||||   || ||||||| |||||||||||    
T  44556018 tctcaaaattttatttctgcgtccagaattttgttaattttattttgaacttttgtctattaaaaaaatccatatttaatt 44556098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 248
Target Start/End: Original strand, 52701168 - 52701404
Alignment:
Q  11 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 110  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||||| || |  ||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||| |  ||    
T  52701168 aaatttgtttaatt-atgcttaaacttttaagattttgaacaattttttacacaagtgttaagaacattacgaaaagttcatctccaaaaaattatctca 52701266  T
Q  111 aaaattgatttatacgtccaga-ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaa 209  Q
    ||| || |||||| |||| ||| |||||||| |||||| || |||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||||||| |       ||||||    
T  52701267 aaattttatttatgcgtctagatttttgttacttttattttgaacttttgtcctttaaaaaaattcatatttaatttatttcatgct-aaataattctaa 52701365  T
Q  210 attttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgt 248  Q
    ||||||||||| ||||||||  || |||||||| |||||    
T  52701366 attttagtaaacgaaccttttgtaatgttctaaacttgt 52701404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 41 - 158
Target Start/End: Original strand, 45387449 - 45387566
Alignment:
Q  41 agtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgtta 140  Q
    ||||||| |||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||| |||    
T  45387449 agttttttaacaattttttgtagacgtgttaagaacattactaaaagttcctacgcaaaaaattatcgcaaaatttgatttatatgtccagattttatta 45387548  T
Q  141 attttatctttaactttt 158  Q
     |||||||||| ||||||    
T  45387549 cttttatcttttactttt 45387566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 6 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 15772157 - 15772002
Alignment:
Q  6 aattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattg 105  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||| |||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||     
T  15772157 aattcaaatttgtttaatt-atgcttaaaatcttaagtttttaaacaattttttgtagacgtgttaagaacattactaaaagttcctccgcaaaaaatta 15772059  T
Q  106 ttgcaaaaattgatttatacgtccaga-ttttgttaattttatctttaacttttgtt 161  Q
    |  ||||| ||||||| |||||| | | |||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  15772058 tctcaaaatttgatttctacgtcgaaatttttgtttcttttatcttgaacttttgtt 15772002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 6 - 185
Target Start/End: Original strand, 33475471 - 33475650
Alignment:
Q  6 aattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattg 105  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||     
T  33475471 aatttaaatttgtttaatt-atgcttaaacttttaagattttgaacaattttttgcacaagtgttaagaacattacgaaaagttcatctacaaaaaatta 33475569  T
Q  106 ttgcaaaaattgatttatacgtccag-attttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaatt 185  Q
    |  ||||| || |||| ||||||||| ||||||||| |||||| || |||||||||   || ||||||| |||||||||||    
T  33475570 tcacaaaattttatttctacgtccagaattttgttacttttattttgaacttttgtctattaaaaaaatccatatttaatt 33475650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 267 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 15771936 - 15771771
Alignment:
Q  267 aaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaatt 366  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| || || || |||||| ||||| | |||| | ||||||||| || |||||| | |||||||||||    
T  15771936 aaatataagagtttaaggataattaaacaaactttattttagcagggactagaattacatgtaaatattttttgtagggtctaaaatagctattaaaatt 15771837  T
Q  367 aagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaaaa 432  Q
    ||||||| | ||||||| |||  | || ||||||| | | |||| ||||||||||||||| |||||    
T  15771836 aagtaaggactaaacttaaaagtttccaattttatggaggccaataacatatttaacccttaaaaa 15771771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 33476477 - 33476241
Alignment:
Q  11 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 110  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||| |  | ||||||| || || |||||||  ||||||||||||| |  ||    
T  33476477 aaatttgtttaatt-atgcttaaacttttaagattttgaacaattttttgcacaggtattaagaacatcacgaaaagtttatctgcaaaaaattatctca 33476379  T
Q  111 aaaattgatttatacgtccaga-ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaa 209  Q
    ||| || ||| || |||||||| |||| ||| |||||| || |||||||||  ||| |||||||| ||||||||||  |||||||||       ||||||    
T  33476378 aaattttattcatgcgtccagattttttttacttttattttgaacttttgtcttttaaaaaaatttatatttaatttatttcatgtt-aaaaaattctaa 33476280  T
Q  210 attttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgt 248  Q
    ||||||||||| ||||||||  || |||||||| |||||    
T  33476279 attttagtaaacgaacctttagtaatgttctaaacttgt 33476241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 6 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 3173802 - 3173707
Alignment:
Q  6 aattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaa 101  Q
    |||| |||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  3173802 aattcaaatttgtttaatttatgattaaattcttgaatttttgaacaattttttgcagacgcgttaagaacattactataagtttctctgcaaaaa 3173707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 328 - 430
Target Start/End: Original strand, 14525111 - 14525213
Alignment:
Q  328 taattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaacccta 427  Q
    ||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||| |||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  14525111 taatttttttatgtagggactaaaaaacctattaaaattaagtaaggactaaacttagaaattcccaaatttatagggacgaaaaacatatttaacccaa 14525210  T
Q  428 aaa 430  Q
    |||    
T  14525211 aaa 14525213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 334 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 23917302 - 23917212
Alignment:
Q  334 ttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaacc 424  Q
    ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23917302 ttttttgtaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaagatctcaattttatagagaccaaaaacatatttaacc 23917212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 42 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 26268826 - 26268683
Alignment:
Q  42 gtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccaga-ttttgtta 140  Q
    ||||| ||||||||||||| | || | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    ||||| ||||||| |||| ||| | |||| |||    
T  26268826 gttttcgaacaattttttgtagacgtattaagaacattactaaaagtttctctgcaaaaaattagctcaaaatttgatttctacgcccatatttttatta 26268727  T
Q  141 attttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattc 186  Q
     ||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  26268726 cttttatcttgaacttttgtcg--ttaaaaaattcatatttaattc 26268683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 346 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 38173863 - 38173782
Alignment:
Q  346 actaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaacccta 427  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38173863 actaaaagaactattaaaattaagtaaggactaaacttgaaagtttcctattttatagggaccaaaaacatatttaacccta 38173782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 41928126 - 41927953
Alignment:
Q  11 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgtt-aagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgc 109  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||| |  |||| ||||| ||||| |||||||| | ||||||||||| |  |    
T  41928126 aaatttgtttaatt-atgcttaaacttttaagattttgaacaattttttgcacaagtgttaaagaacattacgaaaagttcatatgcaaaaaattatatc 41928028  T
Q  110 aaaaattgatttatacgtccaga-ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaatt 185  Q
    |||| || |||| | |||||| | |||||||| |||||| || |||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  41928027 aaaattttatttctgcgtccaaatttttgttacttttattttgaacttttgt--ctttaaaaaattcatatttaatt 41927953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 116
Target Start/End: Original strand, 53377329 - 53377436
Alignment:
Q  11 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgtt--aagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttg 108  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| || ||||  ||||| |||| |||||||||||  || ||||||| | |    
T  53377329 aaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagtttttgaacaattgtttgcagacgtgttaaaagaacattaataaaagttccttcgcgaaaaattatcg 53377428  T
Q  109 caaaaatt 116  Q
    ||||||||    
T  53377429 caaaaatt 53377436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 133 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 44287933 - 44287642
Alignment:
Q  133 ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcat 232  Q
    |||||||| ||||||||| ||| || || |||| |||||||||||||||||||| |||||||||       ||||||||||||| ||||||||||| | |    
T  44287933 ttttgttacttttatcttaaaccttcgtcgtttaaaaaaattcatatttaattcatttcatgtt-aaaaaattctaaattttagcaaatgaaccttccgt 44287835  T
Q  233 agtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaacatggactaaaattagaagtaatt 332  Q
      | ||||||  ||| |||       ||||||||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||| || |   | ||| | |||| | | ||||||    
T  44287834 gatattctaaaattgactcaaaaaaatcgttcaaaaa-ttatgaatttaaggataattaaacaaacttt-ttttgttagggattgaaatcacatgtaatt 44287737  T
Q  333 cttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaacccta 427  Q
     ||||||||| ||||| | ||| | |||||||||||||||| ||| ||||| |||| | || |||||| ||  ||  ||||||||||||||||||    
T  44287736 tttttttgtagggacttataaagcaattaaaattaagtaaggattgaacttaaaaatttccaattttagagaaactcaaaacatatttaacccta 44287642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 37481351 - 37481253
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttga-gtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaa 101  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||||||  | |  ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  37481351 tcaatttaaatttgtttaatttatgcttaaactcttaatgttttttaacaattttttatagatgtgttaagaacattactaaaagttcctccgcaaaaa 37481253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 336 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 44555888 - 44555806
Alignment:
Q  336 ttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatat 418  Q
    |||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  44555888 ttttatatggactaaaaacactattataattaagtaaggactaaacttgaaagatcccaattttatagagaccaaaaacatat 44555806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 334 - 432
Target Start/End: Original strand, 44809159 - 44809257
Alignment:
Q  334 ttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaaaa 432  Q
    |||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||| |||  | || ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44809159 ttttttttagggactaaaagaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaaggttccaattttatagggaccaaaaacatatttaacccaaaaaaa 44809257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 334 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 34995512 - 34995419
Alignment:
Q  334 ttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaacccta 427  Q
    |||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||  || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34995512 ttttttatagggactagaaaacctattaaaattaagtaaggactaatcttaaaaggtctcaattttatagggaccaaaaacatatttaacccta 34995419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 357 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 29348226 - 29348154
Alignment:
Q  357 tattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaa 429  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| |||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29348226 tattaaaattaagtaaggactaaacttaaaaggtcccaattttatagggaccaaaaacatatttaaccctaaa 29348154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 334 - 418
Target Start/End: Original strand, 52701982 - 52702066
Alignment:
Q  334 ttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatat 418  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||||  |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  52701982 ttttttatatggactaaaaacactattaaaattaagtaaggactaaactaaaaaagtcccaattttatagggaccaaaaacatat 52702066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 8576191 - 8575953
Alignment:
Q  11 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatatt-actaaaagttcctctgcaaaaaattgttgc 109  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||| || || ||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||| |  |||||||| | ||||||||||| |  |    
T  8576191 aaatttgtttaatt-atgtttaaacttttaagattttgaacaattttttgcacaagtgttaagaacatttaggaaaagttcatatgcaaaaaattatctc 8576093  T
Q  110 aaaaattgatttatacgtccagatttt-gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaa-ttcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttct 207  Q
    |||| || |||| |  ||| ||||||| |||| |||||| || |||||||||  ||| |||||| |||||||||||||| |||||||||       ||||    
T  8576092 aaaattttatttctgtgtctagatttttgttacttttattttgaacttttgtcttttaaaaaaaattcatatttaattcatttcatgtt-aaaaaattct 8575994  T
Q  208 aaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgt 248  Q
    ||||||||||||| |||||| |  || |||||||| |||||    
T  8575993 aaattttagtaaacgaacctcttgtaatgttctaaacttgt 8575953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 344 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 11045365 - 11045283
Alignment:
Q  344 ggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccct 426  Q
    ||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||| |||  |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  11045365 ggactaaaagaactattcaaattaagtaaggattaaacttaaaaggtcccaattttatagggacctaaaacatatttaaccct 11045283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 344 - 422
Target Start/End: Original strand, 28260540 - 28260618
Alignment:
Q  344 ggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaa 422  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||  ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  28260540 ggactaaaaaaactattaaaattaagtaagaattatatttaaaatatccaaattttataaggaccaaaaacatatttaa 28260618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 196
Target Start/End: Original strand, 31991074 - 31991259
Alignment:
Q  11 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 110  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||| || || ||||||||||||||||||| |  |||||| || ||||| |||||||  | |||||||| || |  ||    
T  31991074 aaatttgtttaatt-atgtttaaacttttaagattttgaacaattttttgcacaagtgttaaaaacattacgaaaagtttatttgcaaaaacttatctca 31991172  T
Q  111 aaaattgatttatacgtccaga-ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt 196  Q
    ||| || |||| | |||||| | |||||||| |||||| || |||||||||  ||| ||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  31991173 aaattttatttctgcgtccaaatttttgttacttttattttgaacttttgtcttttaaaaaaattcttatttaatttatttcatgtt 31991259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 25249978 - 25249897
Alignment:
Q  344 ggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccc 425  Q
    ||||||||| | | ||||||||||| |||| | ||||||||||| | ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  25249978 ggactaaaagaaccattaaaattaattaaggactaaacttgaaagacccctattttatagggacaaaaaacatatttaaccc 25249897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 4 - 60
Target Start/End: Original strand, 116924 - 116980
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttg 60  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  116924 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagttttttaacaattttttg 116980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 344 - 428
Target Start/End: Original strand, 3173809 - 3173893
Alignment:
Q  344 ggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaa 428  Q
    ||||||||| | || ||||||||||||||| ||||||||| |||  |||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  3173809 ggactaaaagaactgttaaaattaagtaaggattaaacttaaaaggtcccaattgtatagggaccaaagacatatttaaccctaa 3173893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 261 - 436
Target Start/End: Original strand, 20078100 - 20078276
Alignment:
Q  261 gttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttt-tgtatggactaaaaaacctat 359  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||  || || | ||||||||||||  | |||||| | ||| |||| |||||| || | ||||    
T  20078100 gttcaaaaattgaagagtttaagaataattaaacaaagttacttttagcttggactaaaattgcatgtaattttctttctgtagggactacaatagctat 20078199  T
Q  360 taaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaaaatatt 436  Q
    || |  |||||||| |||||||||  ||| || | |||||||||  | |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  20078200 tacatataagtaaggattaaacttagaaattctcaattttataggaaacaaaaatatatttaaccctaaaatatatt 20078276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 362 - 422
Target Start/End: Original strand, 23883683 - 23883743
Alignment:
Q  362 aaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaa 422  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23883683 aaattaagtaaggactaaacttgaaaagtcccaattttatagggaccaaaaacatatttaa 23883743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 107 - 248
Target Start/End: Original strand, 41927360 - 41927501
Alignment:
Q  107 tgcaaaaattgatttatacgtccagatttt-gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnntt 205  Q
    |||||||||| |||| | |||||||||||| |||| |||||| || |||||||||  ||| |||||||||||||||||||  |||||||||       ||    
T  41927360 tgcaaaaatttatttctgcgtccagatttttgttacttttattttgaacttttgtcttttaaaaaaattcatatttaatttatttcatgtt-aaaaaatt 41927458  T
Q  206 ctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgt 248  Q
    |||||||| |||||| ||||||||  || |||||||| |||||    
T  41927459 ctaaatttcagtaaacgaaccttttgtaatgttctaaacttgt 41927501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 334 - 418
Target Start/End: Original strand, 41928160 - 41928244
Alignment:
Q  334 ttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatat 418  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||| | ||||||| |||  |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  41928160 ttttttatatggactaaaaacactattataattaagtaaggactaaacttaaaaggtcccaattttatagggaccaaaaacatat 41928244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 4 - 60
Target Start/End: Original strand, 44555364 - 44555420
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttg 60  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  44555364 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagttttttaacaattttttg 44555420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 4 - 60
Target Start/End: Original strand, 50614546 - 50614602
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttg 60  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  50614546 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagttttttaacaattttttg 50614602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 335 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 44555336 - 44555245
Alignment:
Q  335 tttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatcc-ctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccc 425  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||| ||||  || | ||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  44555336 tttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaactttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaacatatttaaccc 44555245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 344 - 431
Target Start/End: Original strand, 45420115 - 45420201
Alignment:
Q  344 ggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaaa 431  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||| |||  |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  45420115 ggactaaaagaactattaaaattaagtaagaac-aaacttaaaaggtcccaattttatagggaccaaaaacatattgaacccaaaaaa 45420201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 116896 - 116806
Alignment:
Q  335 tttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccc 425  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||| |||   | | ||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  116896 tttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctccattttatagggactaaaaacatatttaaccc 116806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 425
Target Start/End: Original strand, 44557892 - 44557982
Alignment:
Q  335 tttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccc 425  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||| |||   | | ||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  44557892 tttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaacatatttaaccc 44557982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 45234689 - 45234599
Alignment:
Q  335 tttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccc 425  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||| |||   | | ||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  45234689 tttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaacatatttaaccc 45234599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 425
Target Start/End: Original strand, 50615394 - 50615484
Alignment:
Q  335 tttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccc 425  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||| |||   | | ||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  50615394 tttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaacatatttaaccc 50615484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 356 - 426
Target Start/End: Original strand, 53518128 - 53518198
Alignment:
Q  356 ctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccct 426  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| |||  |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  53518128 ctattaaaattaagtaaggactaaacttaaaaggtcccaattttatagggactaaaaacatatttaaccct 53518198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 425
Target Start/End: Original strand, 54185639 - 54185729
Alignment:
Q  335 tttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccc 425  Q
    ||||||||  |||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||| |||  || | ||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  54185639 tttttgtaatgactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgtctcaattttatagggactaaaaacatatttaaccc 54185729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 349 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 33225746 - 33225673
Alignment:
Q  349 aaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaa 422  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||  || ||| | ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33225746 aaaaaaactattaaaattaagtaaggactaaacttagaagatctcaattttatagggaccaaaaacatatttaa 33225673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 335 - 424
Target Start/End: Original strand, 45235669 - 45235758
Alignment:
Q  335 tttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaacc 424  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||| |||   | | ||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  45235669 tttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaacatatttaacc 45235758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 334 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 8575277 - 8575193
Alignment:
Q  334 ttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatat 418  Q
    |||||| | |||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||||| ||| || || ||||||||| ||| ||||||||||    
T  8575277 ttttttatttggactaaaaacactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaagattccaattttatagggacaaaaaacatat 8575193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 334 - 418
Target Start/End: Original strand, 8576225 - 8576309
Alignment:
Q  334 ttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatat 418  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||||| |||  || | ||||||||| || |||||||||||    
T  8576225 ttttttatatggactaaaaacactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaaggtctcaattttatagggagcaaaaacatat 8576309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 334 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 52701134 - 52701050
Alignment:
Q  334 ttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatat 418  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||  | ||||||| |||  || | ||||||||| ||||||||||||||    
T  52701134 ttttttatatggactaaaaacactattaaaattaagtaaagactaaacttaaaaggtctcaattttatagggaccaaaaacatat 52701050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 424
Target Start/End: Original strand, 54269177 - 54269256
Alignment:
Q  344 ggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaacc 424  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||| | ||||| ||||| | | ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  54269177 ggactaaaaatactattaaaattaagtaagaact-aacttaaaaaaactcaattttatagggatcaaaaacatatttaacc 54269256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 335 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 53397067 - 53396980
Alignment:
Q  335 tttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaa 422  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||  ||  || | ||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  53397067 tttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttataatgtctcaattttatagggactaaaaacatatttaa 53396980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 335 - 425
Target Start/End: Original strand, 117757 - 117847
Alignment:
Q  335 tttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccc 425  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||| |||   | | |||||||||  || |||||||||||||||||    
T  117757 tttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaagcactaaacttaaaatgcctcaattttatagaaactaaaaacatatttaaccc 117847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 344 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 27492277 - 27492195
Alignment:
Q  344 ggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccct 426  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| ||| || ||||||| ||| ||||| ||||||||  ||  ||||||||||||||||||    
T  27492277 ggactaaaagaactattaaaattaaataaaaactaaacttaaaagatcccaattttatatagattaaaaacatatttaaccct 27492195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 312 - 367
Target Start/End: Original strand, 32147283 - 32147340
Alignment:
Q  312 ggactaaaattagaagtaattctttttt--gtatggactaaaaaacctattaaaatta 367  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  32147283 ggactaaaattagaagtaatttttttttttgtagggactaaaaaacctactaaaatta 32147340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 356 - 422
Target Start/End: Original strand, 33226763 - 33226829
Alignment:
Q  356 ctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaa 422  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  ||  || | ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33226763 ctattaaaattaagtaagaactaaacttagaaggtctcaattttatagggaccaaaaacatatttaa 33226829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 424
Target Start/End: Original strand, 1430226 - 1430315
Alignment:
Q  335 tttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaacc 424  Q
    |||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||   | | |||||| || ||| ||||||||||||||||    
T  1430226 tttttgaaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggattaaacttaaaatgcctcaattttacagggactaaaaacatatttaacc 1430315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 334 - 431
Target Start/End: Original strand, 39562872 - 39562969
Alignment:
Q  334 ttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaaa 431  Q
    ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||  ||  || | ||||| | | |||| |||||||| |||||||||||||    
T  39562872 ttttttgtaaggattaaaaaagctattaaaattaaataaggattaaacttacaaggtcacaattttgttgggaccgaaaacataattaaccctaaaaa 39562969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 334 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 46295024 - 46294927
Alignment:
Q  334 ttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaaa 431  Q
    ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||  || ||| | ||||| ||| |||| |||||||| |||||||| ||||    
T  46295024 ttttttgtaaggattaaaaaagctattaaaattaaataaggactaaacttacaagatcgcaattttgtagggaccgaaaacataattaacccttaaaa 46294927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 53439296 - 53439199
Alignment:
Q  335 tttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaaaa 432  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||  ||  || | |||||||||  || |||||||||||||| || ||||||    
T  53439296 tttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaagtactaaacttataatgtctcaattttataggaactaaaaacatatttaatccaaaaaaa 53439199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 293
Target Start/End: Original strand, 8575377 - 8575466
Alignment:
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaa 293  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||| ||||| ||       ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  8575377 ttctaaattttagtaaacgaaccttttgtaatgttctaaacttgtatcaaaaaattcgttaaaaaatttaagagtttaaggatagttaaa 8575466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 342 - 418
Target Start/End: Original strand, 25233191 - 25233267
Alignment:
Q  342 atggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatat 418  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||||| |||  |  | ||||||||| ||||||||||||||    
T  25233191 atggactaaaaacactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaaggttacaattttatagagaccaaaaacatat 25233267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 334 - 418
Target Start/End: Original strand, 25353279 - 25353363
Alignment:
Q  334 ttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatat 418  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||||| || |||| |||  | || ||||||||| ||| ||||||||||    
T  25353279 ttttttatatggactaaaaacactattataattaagtaagaactatacttaaaaggttccaattttatagggactaaaaacatat 25353363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 397 - 441
Target Start/End: Original strand, 29217583 - 29217627
Alignment:
Q  397 tttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaaaatattactaa 441  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  29217583 tttatagggaccaaaaacatatttaacccttaataatattactaa 29217627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 334 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 31991040 - 31990956
Alignment:
Q  334 ttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatat 418  Q
    |||||| ||||||| ||||   |||||||||||||||||  ||||||||| |||  || | ||||||||| ||||||||||||||    
T  31991040 ttttttatatggaccaaaatcactattaaaattaagtaaagattaaacttaaaaggtctcaattttatagggaccaaaaacatat 31990956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 335 - 383
Target Start/End: Original strand, 32147923 - 32147971
Alignment:
Q  335 tttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaactt 383  Q
    |||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32147923 tttttgtaaggaataaaacaactattaaaattaagtaagaattaaactt 32147971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 334 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 33475443 - 33475359
Alignment:
Q  334 ttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatat 418  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||| | ||||||| |||  | || ||||||||| ||| ||||||||||    
T  33475443 ttttttatatggactaaaaacactattataattaagtaaggactaaacttaaaaggttccaattttatagggacaaaaaacatat 33475359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 335 - 423
Target Start/End: Original strand, 37481379 - 37481467
Alignment:
Q  335 tttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaac 423  Q
    |||||||| | ||||||| | ||||||||||||| |||| ||||||||| |||   | | ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  37481379 tttttgtaagcactaaaacaactattaaaattaaataaggattaaacttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaacatatttaac 37481467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 436
Target Start/End: Original strand, 31311364 - 31311403
Alignment:
Q  397 tttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaaaatatt 436  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31311364 tttatagggaccaaaaacatatttaaccctaaaatatatt 31311403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 44288028 - 44287969
Alignment:
Q  34 actcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctc 93  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||  || || ||||||||| |||||||||||||||||    
T  44288028 actcttaagtttttgaacaacttttgacagacgtgttaagaacattactaaaagttcctc 44287969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 52701947 - 52701897
Alignment:
Q  11 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgca 62  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  52701947 aaatttgtttaatt-atgcttaaactcttaagattttgaacaattttttgca 52701897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 196
Target Start/End: Original strand, 55006177 - 55006240
Alignment:
Q  133 ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt 196  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||| | ||||||||||| || ||||||    
T  55006177 ttttgttagttttatcttgaatttttggtgttttaaaaaaattatatttaattcattacatgtt 55006240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 397 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 16012925 - 16012891
Alignment:
Q  397 tttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaaa 431  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16012925 tttatagggaccaaaaacatatttaaccctaaaaa 16012891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 334 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 19601522 - 19601432
Alignment:
Q  334 ttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaacc 424  Q
    |||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||  ||  || | ||||||||| || || ||||||||||||||    
T  19601522 ttttttataaggactaaaatatctattaaaattaagtaatgattaaacttagaaggtctcaattttatagggatcagaaacatatttaacc 19601432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 397 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 21863716 - 21863682
Alignment:
Q  397 tttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaaa 431  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21863716 tttatagggaccaaaaacatatttaaccctaaaaa 21863682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 397 - 431
Target Start/End: Original strand, 26704181 - 26704215
Alignment:
Q  397 tttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaaa 431  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26704181 tttatagggaccaaaaacatatttaaccctaaaaa 26704215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 336 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 27868046 - 27867960
Alignment:
Q  336 ttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaa 422  Q
    ||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||  | ||||||| |||  || | |||||| || ||| ||||||||||||||    
T  27868046 ttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaatgactaaacttaaaatgtctcaattttacagggactaaaaacatatttaa 27867960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 262 - 300
Target Start/End: Original strand, 40630699 - 40630737
Alignment:
Q  262 ttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactt 300  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40630699 ttcaaaaatctaaaagtttaaagataattaaacaaactt 40630737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 335 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 45387411 - 45387321
Alignment:
Q  335 tttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccc 425  Q
    ||||||||  |||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||| |||   | | ||||||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  45387411 tttttgtaaagactaaaacatctattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaacatattcaaccc 45387321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 397 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 46710261 - 46710223
Alignment:
Q  397 tttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaaaatat 435  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  46710261 tttatagggaccaaaaacatatttaacccttaaaaatat 46710223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 84 - 185
Target Start/End: Original strand, 53520018 - 53520120
Alignment:
Q  84 aaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccaga-ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatattta 182  Q
    |||||| || ||||||||||| |  ||||||||||||| || ||||| | |||| ||| ||| |||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||    
T  53520018 aaagtttctttgcaaaaaattatgtcaaaaattgatttttaggtccaaagttttattattttaatctttaattttttgtgtttagaaaaattcatattta 53520117  T
Q  183 att 185  Q
    |||    
T  53520118 att 53520120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 397 - 430
Target Start/End: Original strand, 26257327 - 26257360
Alignment:
Q  397 tttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaa 430  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26257327 tttatagggaccaaaaacatatttaaccctaaaa 26257360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 397 - 430
Target Start/End: Original strand, 43630689 - 43630722
Alignment:
Q  397 tttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaa 430  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43630689 tttatagggaccaaaaacatatttaaccctaaaa 43630722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 312 - 364
Target Start/End: Original strand, 53397387 - 53397440
Alignment:
Q  312 ggactaaaattagaagtaa-ttcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaa 364  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||| | ||||||||||||||| |||||    
T  53397387 ggactaaaattagaagtaattttttttttgcagggactaaaaaacctactaaaa 53397440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 132 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 53658086 - 53658029
Alignment:
Q  132 attttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtt 189  Q
    ||||||||| ||||||||| || |||||  ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  53658086 attttgttagttttatcttgaatttttggcgttttaaaaaaattatatttaattcgtt 53658029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 271; Significance: 1e-151; HSPs: 82)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 4 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 15721360 - 15720925
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  15721360 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttgagtttttgaacaattttttacagacgtgttaaaaactttactaaaagttcctatgcaaaaaat 15721261  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  15721260 tgtcgcaaaatttgatttctacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgtcgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaaaa 15721161  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctc--nnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaacttt 301  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||         |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15721160 ttctaaaatttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaacttt 15721061  T
Q  302 gttgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttat 401  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||    
T  15721060 gttgtaataaggactaaaattagaagtaattcttttttgtagggacttaaaaatctattaaaattaagtaaggattaaacttgaaaggtccctattttat 15720961  T
Q  402 agtgaccaaaaacatatttaaccctaaaaaatatta 437  Q
    || |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  15720960 agggaccaaaaacatatttaaccgttaaaaatatta 15720925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 4 - 430
Target Start/End: Original strand, 8709836 - 8710264
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8709836 tcaatttaaatttgtttaatttatgcttaaactcttgagtttt-gaacaattttttgcagacgtgttaagaatattactaaaagttcctctacaaaaaat 8709934  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  8709935 tgtcgcaaaatttgatttctacgtccaaattttgttaattttatctttaactttttccgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaa 8710033  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 303  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||        |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8710034 ttctaaattttagttaatgaacctttcatagtattctaaacttgtcttaaaaaaatcgtacaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgt 8710133  T
Q  304 tgtaacatggactaaaattagaagtaattctttt----ttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctatttt 399  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||  |||| |||||    
T  8710134 tgtaacagggactaaaattagaagtaattttttttttgttgtagggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaactaaacttagaagttcccaatttt 8710233  T
Q  400 atagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaa 430  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  8710234 atagggaccaaaaacatatttagccctaaaa 8710264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 4 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 5974604 - 5974178
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || |||||||||||||||||| ||||||||    
T  5974604 tcaatttaaatttgtttaatttatgcttaaactcttgagtttttgaacaattttttgcagacgtgttaaaaacattactaaaagttcctctacaaaaaat 5974505  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
    ||| |||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  5974504 tgtcgcaaaatttgatttctacatccaaattttgttaattttatctttaactttttccgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaaat 5974405  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 303  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||        |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5974404 tt-taaattttagttaatgaacctttcatagtattctaaacttgtctgaaaaaaatcgtacaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgt 5974306  T
Q  304 tgtaacatggactaaaattagaagtaa-ttcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttata 402  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||  || | ||||||||    
T  5974305 tgtaacagggactaaaattagaagtaattttttttttgtacggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaactaaacttagaagttctcaattttata 5974206  T
Q  403 gtgaccaaaaacatatttaaccctaaaa 430  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||    
T  5974205 gggaccaaaaacatatttaaccctaaaa 5974178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 4 - 426
Target Start/End: Original strand, 30660778 - 30661199
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30660778 tcaatttaaatttgtttaatttatgcttaaactcttgagtttttgaacaattttttgcagacatgttaagaatattactaaaagttcatctgcaaaaaat 30660877  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgtttt-aaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnn 202  Q
    ||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||          
T  30660878 tgtcgcaaaatttgatttctacatccagattttgttaattttatcattaacttttgtcgttttaaaaaaattcatatttaattcgttttatgtt-aaaaa 30660976  T
Q  203 nttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttg 302  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||       ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  30660977 attctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaagtataattaaacaaaatttg 30661076  T
Q  303 ttgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttata 402  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||  ||   ||||||||    
T  30661077 ttgtaacagggactaaaattagaagtaatt-ttttttgcaggaactaaaaaacctattaaaattaagtaaggactaaacttaaaagttcgtaattttata 30661175  T
Q  403 gtgaccaaaaacatatttaaccct 426  Q
    | ||| |  |||||||||||||||    
T  30661176 gagactatgaacatatttaaccct 30661199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 4 - 426
Target Start/End: Original strand, 26356528 - 26356952
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttg---caaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    ||  | ||||||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  26356528 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttgagtttttgaacaatttttttttacacgcgtgttaagaacattactaaaagtttctatgcaaaa 26356627  T
Q  101 aattgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnn 200  Q
    ||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||        
T  26356628 aattgtcacaaaatttgatttctacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgccgttttaaaaaattcatatttaattcatttcatgttaaaa 26356727  T
Q  201 nnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactt 300  Q
       || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||       |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26356728 aattt-taaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 26356826  T
Q  301 tgttgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctatt-aaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctatttt 399  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| ||| || ||||||||    
T  26356827 tgctgtaacagggactaaaattagaagtaattcttttttgtagagactaaaaaacttattaaaaattaagtaaggattaaacttaaaatat-cctatttt 26356925  T
Q  400 atagtgaccaaaaacatatttaaccct 426  Q
    |||| || |||||||||||||||||||    
T  26356926 atagggatcaaaaacatatttaaccct 26356952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 4 - 426
Target Start/End: Original strand, 10915301 - 10915727
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaatttttt--gcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaa 101  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||    
T  10915301 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttgagtttttgaacaattttttttgcagacgtgttaagaacattactaaaaggtcctttacaaaaa 10915400  T
Q  102 attgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnn 201  Q
    ||||| ||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||         
T  10915401 attgtcgcataatttgatttctacgtccatattttgttaattttatctttaacatttttcgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaa 10915500  T
Q  202 nnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaacttt 301  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||       ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10915501 a-ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaaatcgatcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaacttt 10915599  T
Q  302 gttgtaacatggactaaaattagaagtaattctttttt---gtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattt 398  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||  | || ||||    
T  10915600 gttgtaacagggactaaaattcgaagtattttttttttttagtagggactaaaaaacctattaaaattaagtaaggattaaacttagaagttgccaattt 10915699  T
Q  399 tatagtgaccaaaaacatatttaaccct 426  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10915700 tatagggaccaaaaacatatttaaccct 10915727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 11 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 17697674 - 17697263
Alignment:
Q  11 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 110  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | || ||||||||| ||||| ||||| |||| | || |||||||| | |    
T  17697674 aaatttgtttaatttatgcttaaactcgtgagtttttgaacaattttttgaagacgtgttaagaacattacaaaaagctccttttcataaaattgtcgta 17697575  T
Q  111 aaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaa 210  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||       |||||||    
T  17697574 aaatttgatttctacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgtcgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatctt-aataaattctaaa 17697476  T
Q  211 ttttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaaca 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||        |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  17697475 ttttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttttctaaaaaaaatcgttcaaaagtttaagagtttaaggataattaaacaaactttgttgtaata 17697376  T
Q  311 tggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaa 410  Q
      ||||||||||||||||||    ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| |||  || | ||||||||| ||||||    
T  17697375 aagactaaaattagaagtaa---atttttttagggactaaaaaacctattaaaattaagcaaggactaaacttaaaagttctcaattttatagggaccaa 17697279  T
Q  411 aaacatatttaaccct 426  Q
    ||||||||||||||||    
T  17697278 aaacatatttaaccct 17697263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 4 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 5087485 - 5087068
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5087485 tcaattcaaatatgtttaatttatgcttaaactcttgactttttgaacaattttttgtagacgtgttaagaacattactaaaagttcctctgcaaaaaat 5087386  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
    ||| ||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||           
T  5087385 tgtcgcaaaaattaatttttacattcagattttgttaattttatctttaacttttgccgttttaaaaaattcatatttaatttgtttcatgtt-aaaaaa 5087287  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 303  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||         |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5087286 ttctaaattttagtaaatgaacatttcatagtgttctaaacttgtctaaaaacaaccgttcaaaaagttaagagtttaaggataattaaacaaactttgt 5087187  T
Q  304 tgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatag 403  Q
    ||||  | |||||||||||| || ||||  |||||| || | | |||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||  | || |||||||||    
T  5087186 tgtagtagggactaaaattaaaaataat--ttttttttaggtagtaaaaaacctattaaaattaagtaaggactaaacttagaagtttccaattttatag 5087089  T
Q  404 tgaccaaaaacatatttaacc 424  Q
      |||||||||||||||||||    
T  5087088 gaaccaaaaacatatttaacc 5087068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 5 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 29692205 - 29691790
Alignment:
Q  5 caattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaatt 104  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29692205 caattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttgagtttttcaacaattttttgtagacgtgttaaacatattacaaaaagttcctctgcaaaaaatt 29692106  T
Q  105 gttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnt 204  Q
     |  ||||| |||||||  ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||       |    
T  29692105 ctcacaaaatttgatttcaacgtccatattttgttacttatatctttaacttttgtcgttttgaaaaattcatatttaattcttttcatgttaataaa-t 29692007  T
Q  205 tctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgtt 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||       |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29692006 tctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttttaagtttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgtt 29691907  T
Q  305 gtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagt 404  Q
    |||  | ||||||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||  ||  || | |||||||||     
T  29691906 gtagtagggactaaaattagaagtaatt-ttttttggagggcctaaaaaacctattaaaattatgtaaggactaaacttataagttctcaattttataga 29691808  T
Q  405 gaccaaaaacatatttaa 422  Q
    ||||||||||||||||||    
T  29691807 gaccaaaaacatatttaa 29691790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 4 - 431
Target Start/End: Original strand, 1820983 - 1821403
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  1820983 tcaattcaaatttgttt--tttatgcttaaactcttgagtttttgaacaattttttgcatacgtattaagaacattactaaaagttcctctgcaaaaagt 1821080  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
    |||  ||||| ||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| || ||| |||||           
T  1821081 tgtcacaaaatttgatttctacgtccaaattttgt--attttatctttaacttttaccgttttaaaaaattcatatttaactcatttaatgttaaaaaa- 1821177  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1821178 ttctaaattttagtaaatgaacctttcataatgttataaacttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 1821277  T
Q  304 tgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatag 403  Q
    ||||| | | ||||| ||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||   ||  |||| |||||||||    
T  1821278 tgtaataggaactaacattagaaatactt-ttttttgta-ggactaaaaaacctattaaaattaaataaggactaaactcagaatttcccaattttatag 1821375  T
Q  404 tgaccaaaaacatatttaaccctaaaaa 431  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||    
T  1821376 ggaccaaaaacatatttaacccttaaaa 1821403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 4 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 22732293 - 22731914
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||  || || | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22732293 tcaattcaaatttgtttaaactatgcttaaactcttgagtttttaaacaattttta-catacgtattaagaacattactaaaagttcctctgcaaaaaat 22732195  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
    ||| |||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  22732194 tgtcgcaaaatttgatttctacggccagactttgttaattttatctttaacatttgtcgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaaaa 22732095  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaa-atttaagagtttaaagataattaaacaaactttg 302  Q
     |||||||||| |||||||||| | | | |||||||||| |||||||        ||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  22732094 atctaaattttggtaaatgaacatattacagtgttctaaacttgtcttaaaaaattcgttcaaaatttttaagagtttaagaataattaaacaaactttg 22731995  T
Q  303 ttgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaactt 383  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22731994 ttgtaacagggactaaaattagaagtaatatttttttgtaaggactaaaaaacctattaaaattaagtaaggattaaactt 22731914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 4 - 427
Target Start/End: Original strand, 844106 - 844532
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| ||| ||| |||||||||| | |||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  844106 tcaattcaaacttgcttaatttatgtttaaactcttaagtttttgaacaactttttgcagacatatttagaacattactaaaagttcctctgcaaaaaat 844205  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgtta-attttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnn 202  Q
    | | |||||| ||||||| ||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||          
T  844206 tatcgcaaaatttgatttctacattcagattttgttactttttatctttaacttttgccattttaaaaaattcatatttaatttgtttcatgtt-aaaaa 844304  T
Q  203 nttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttg 302  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||       ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  844305 attctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaagaataattaaacaaactttg 844404  T
Q  303 ttgtaacatggactaaaattagaagtaa-ttcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagt--aagaattaaacttgaaaaatccctatttt 399  Q
    || || || ||||||||||||  ||||| || ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |  ||| | |||||||  ||  ||||||||||    
T  844405 ttttagcagggactaaaattatgagtaattttttttttgtagggactaaaaatgctattaaaattaaataaaaggactaaacttagaagttccctatttt 844504  T
Q  400 atagtgaccaaaaacatatttaacccta 427  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||    
T  844505 atagggatcaaaaacatatttaacccta 844532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 861655 - 861235
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgcta-aaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaa 102  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  861655 tcaattcaaatatgcttaatttatgctttaaactcttaagtttttgaacaattttttgcagacatatttagaacattactaaaagttcctcggcaaaaaa 861556  T
Q  103 ttgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgtta-attttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnn 201  Q
    || | |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||         
T  861555 ttatcgcaaaatttgatttctacatccagattttgttactttttatctttaacttttgtcgttttaaaaaattcatatttaatttgtttcatgtt-aaaa 861457  T
Q  202 nnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaacttt 301  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||       ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||    
T  861456 aattctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttcaaaacttttctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaaaataattaaacaagtttt 861357  T
Q  302 gttgtaacatggactaaaattagaagtaa-ttcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctatttta 400  Q
    ||| || || ||||||||||||  ||||| || |||||| ||  |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||||| |||  |||||||||||    
T  861356 gttttagcagggactaaaattatgagtaattttttttttatagagactaaaaatgctattaaaattaagtaaggactaaacttaaaagttccctatttta 861257  T
Q  401 tagtgaccaaaaacatatttaa 422  Q
    ||| ||  ||||||||||||||    
T  861256 tagggattaaaaacatatttaa 861235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 165; E-Value: 7e-88
Query Start/End: Original strand, 67 - 422
Target Start/End: Original strand, 30492773 - 30493126
Alignment:
Q  67 tgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgtttt 166  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||    
T  30492773 tgttaagaacattactaaaagttcctctgctaaaaattgtcgcaaaattt-atttctacgtccagattttgtttattttatctttaacttttttcatttt 30492871  T
Q  167 aaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaa 266  Q
    |||||| | |||||||| ||||||||||||       || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||        ||||||||    
T  30492872 aaaaaaattatatttaactcgtttcatgttaaaaaa-ttataaattttagtaaatgaacccttcatagtgttctaaacttgtctaaaaaaaatcgttcaa 30492970  T
Q  267 aaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaatt 366  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  |  |||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30492971 aaatttaagagtttaaggataattaaacaaacttagttgtagtagagactaaaattagagataatttttttttgtatggagtaaaaaacctattaaaatt 30493070  T
Q  367 aagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaa 422  Q
    ||||||  | ||||||| |||  |||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30493071 aagtaaagaataaacttaaaagttcccaattttatagggaccaaaaacatatttaa 30493126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 4 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 5079802 - 5079442
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |    
T  5079802 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagttttttaacaattttttgtagacgtgttaagaacattactaaaagttcctccgcaaaaagt 5079703  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
    | |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||           
T  5079702 tattgcaaaatttgatttatatgtccagattttattacttttatctttaacttttatcgttttcaaaaattcatatttaatttgtttcatgttaaaaaaa 5079603  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctc-nnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttg 302  Q
     | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||        ||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  5079602 at-taaattttagtaattgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaaaatcgtttaaaaatttaagactttaaggataatttaacaaactttg 5079504  T
Q  303 ttgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaa 364  Q
    || || || | ||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||| |||||    
T  5079503 ttttagcaggaactaaaattagaagtaatttttttttgtaggaactaaaaaatctactaaaa 5079442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 33518644 - 33518294
Alignment:
Q  11 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 110  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||  ||    
T  33518644 aaatttgtttaatgtatgcttatactcttgagtttttgaacaattttttgcagacgtgttaaaaacattactaaaagttcatctgcaaaaaattgtcaca 33518545  T
Q  111 aaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaa 210  Q
    ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||       |||||||    
T  33518544 aaatttgatttctacgtccaaattttgttaattttatctttaacttttgccgttttaaaaaattcatatttaattcattttaggtt--aaaaattctaaa 33518447  T
Q  211 ttttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaaca 310  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||       ||||||||||||       ||||| |||||||||| ||||  ||||||||||    
T  33518446 ttttagttaataaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaatcaaatcgttcaaaaat-------tttaaggataattaaataaac--tgttgtaaca 33518356  T
Q  311 tggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaag 373  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  33518355 aggactaaaattagaagtaatt-ttttttgtaaggactataaaacctattaaaatcaagtaag 33518294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 67 - 428
Target Start/End: Original strand, 20510542 - 20510889
Alignment:
Q  67 tgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgtttt 166  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20510542 tgttaagaacattactaaaagttcctctacaaaaaattgtcgtaaaatttaatttctacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgtcgtttt 20510641  T
Q  167 aaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaa 266  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||       |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||             ||    
T  20510642 aaaaaattcatatttaattcgattcatgtt-aaaaaattctaaattttagttaatgaacctttcatagtgttctaaatttgtctcaa-----------aa 20510729  T
Q  267 aaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaatt 366  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  20510730 aaatttaaggttttaaagataattaaacaaactttattgtaacagggactaaaactagaagtaatt-ttttttgtagggact-aaaaacctattaaaatt 20510827  T
Q  367 aagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaa 428  Q
    ||||||| | |||  ||  ||  | || ||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  20510828 aagtaaggactaagattagaagtttccaattttatagggaacaaaaacatatttaaccctaa 20510889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 5 - 304
Target Start/End: Original strand, 938845 - 939143
Alignment:
Q  5 caattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaatt 104  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||    
T  938845 caattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacgtgttaagaacattactaaaagttcctccgcaataaatt 938944  T
Q  105 gttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnt 204  Q
     | |||||| |||| || |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||       |    
T  938945 atcgcaaaatttgaattctacgtccagactttgttgcttttatctttaacttttgtcttttaaaaaaaatcatatttaattcatttcatgttaaaaaaat 939044  T
Q  205 tctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgtt 304  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||       |||||| |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  939045 t-taaattttagtaaatgaacctttcaaagtgttctaaacatgtctcaaaaaaatcgttcgaaaatttaggagtttgaggataattaaacaaactttgtt 939143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 109 - 430
Target Start/End: Original strand, 20977467 - 20977789
Alignment:
Q  109 caaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttat-ctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttct 207  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||       || |    
T  20977467 caaaatttgatttctacgtccagattttgttatttttattctttaatttttgtcgttttaaaaaattcacatttaattcttttcatgttaaatttttt-t 20977565  T
Q  208 aaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgta 307  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||        |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | ||    
T  20977566 aaatattagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtctaaaaaatatcgttcaaaaatttaagagtttaaggatagttaaacaaactttgcttta 20977665  T
Q  308 acatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagt-aagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtga 406  Q
     || ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| | |||||| |||  || | || |||||  ||    
T  20977666 gcagggactaaaattagaagtaatttttttttgtagggactaaaaaacctattataattaagtaaagactaaaacttaaaagttctcaatattataagga 20977765  T
Q  407 ccaaaaacatatttaaccctaaaa 430  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  20977766 ccaaaaacatatttaaccctaaaa 20977789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 11 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 33744951 - 33744537
Alignment:
Q  11 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 110  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||||||  ||| |||||| ||||| | |||||||  | |||    
T  33744951 aaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagtttttcaacaatgttttacagacgtgttaagaacgttattaaaaggtcctccgaaaaaaata-tcgca 33744853  T
Q  111 aaaatt-gatttatacgtccagattttg-ttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttcta 208  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||  ||| || |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||       || ||    
T  33744852 aaaatttgatttctacgtccatatttttattacttatatcttaaacttttgtcgttttaaaaaattcatatttaatttatttcatgttaaaaaa-ttata 33744754  T
Q  209 aattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaa 308  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |        ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| || ||     
T  33744753 gattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtataaaaaaaatcgttaaaaaatttaagagtttaaggataattaagcaaaatttattttag 33744654  T
Q  309 catggactaaaattagaagtaattctttttt-gtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgac 407  Q
    || |||||||||||| |||||||| |||||| ||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||  || | ||||||||| |||    
T  33744653 cagggactaaaattataagtaattttttttttgtagggattaaaaaagctattaaaattaagtaaggactaaacttaaaaggtcgcaattttatagggac 33744554  T
Q  408 caaaaacatatttaacc 424  Q
    |||||||||||||||||    
T  33744553 caaaaacatatttaacc 33744537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 4 - 331
Target Start/End: Original strand, 12481765 - 12482081
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||           |||||||||||| || ||||||| | | |||||||| |||| || ||||||||    
T  12481765 tcaattcaaatttgtttaatttatactaaaactctt-----------caattttttgcagacgtgttaagcacaatactaaaaattccgctacaaaaaat 12481853  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
    ||| |||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||| ||||||||||  ||| |||||           
T  12481854 tgtcgcaaaatttgatttctacgtcctgattttgttaattttatctttaacttctttcgttttaaaatatttatatttaatttattttatgttaaaaaaa 12481953  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 303  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||        |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  12481954 ttctaaattttagcaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtctaaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaattttgt 12482053  T
Q  304 tgtaacatggactaaaattagaagtaat 331  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  12482054 tgtaatagggactaaaattagaagtaat 12482081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Original strand, 2087438 - 2087661
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  2087438 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactctt-agtttttgaacaaatttttacagacatgttaagaacattactaaaagttcatctgcaaaaaat 2087536  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
    |||   |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  |||||||           
T  2087537 tgtcataaaatttgatttctacgtccagattttgttaattttatctttaacttttatcgttttaaaaaattcatatttaattcggctcatgtt-aaaaaa 2087635  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaaccttt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  2087636 ttctaaattttagtaaatgaaccttt 2087661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 4 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 14256440 - 14256111
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttg-aacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaa 102  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| | | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  14256440 tcaattcaaatttatttaatttatgcttaaactcttgagtttttttaacaatttttggtagacatgttaaaaacattactaaaagttcctctgcaaaaaa 14256341  T
Q  103 ttgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnn 202  Q
    |||| |||||| |||||||  ||||||| ||||||||| |      |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||          
T  14256340 ttgtcgcaaaatttgatttcaacgtccaaattttgttact------tttaacttttgtcgttttgaaaaattcatatttaattcttttcatgtt-aataa 14256248  T
Q  203 nttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttg 302  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |  ||||| |       | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||     
T  14256247 attctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgtttcgagtttgtcacaaaaaatt-gttcaaaaatttaagaatttaaggataattaaacaaactttt 14256149  T
Q  303 ttgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttg 340  Q
    ||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14256148 ttgttttatggactaaaattagaagtaatttttttttg 14256111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 141 - 354
Target Start/End: Original strand, 17245717 - 17245929
Alignment:
Q  141 attttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttct 240  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||       |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  17245717 attttatctttaacttttattgttttcaaaaattcatatttatttcgtttcatgttaaaaaa-ttctaaattttattaattgaacctttcatagtgttct 17245815  T
Q  241 aaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttg 340  Q
    || ||||||||       |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  | ||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  17245816 aaacttgtctcaaaaaattcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgttttagtagggattaaaattagaagtaatttttttttg 17245915  T
Q  341 tatggactaaaaaa 354  Q
    ||||||||||||||    
T  17245916 tatggactaaaaaa 17245929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 261 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 16736691 - 16736525
Alignment:
Q  261 gttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctatt 360  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16736691 gttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaattttgttttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtagggactaaaaaacctatt 16736592  T
Q  361 aaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaacccta 427  Q
    ||||||||||||| ||||||| | |||  ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||    
T  16736591 aaaattaagtaaggattaaacataaaaggtccctattttataggattcaaaaacatatttaacccta 16736525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 4 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 18503274 - 18502988
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||||| |||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||| | ||||||       
T  18503274 tcaattcaaatttctttaatttattcttaaactcttaagttttttaacaattttttgtagacgtgttaagaacattactaaaagttccgccgcaaaat-- 18503177  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
               |||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||           
T  18503176 -----------ttgatttatatgtccatattttattacttttatctttaacttttattgttttcaaaaattcatatgtaattcgtttcaggttaaaaaaa 18503088  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 303  Q
    || ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||       || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18503087 tt-taaattttattaattgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaattcattcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgt 18502989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 4 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 28476486 - 28476167
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaa-acatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaa 102  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||  | |  | ||||  ||||||||||| ||| ||||| ||||||    
T  28476486 tcaatttaaatttgtttaatttatgtttaaacttttgagtttttcaacaattttttggtagatgtattaaacatattactaaatgtttctctg-aaaaaa 28476388  T
Q  103 ttgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnn 202  Q
    ||||  ||||| |||||||  ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||          
T  28476387 ttgtcacaaaatttgatttcaacgtccatattttgttacttatatctttaacttttgtcgttttgaaaaatttatatttaattcttttcatgtt-aataa 28476289  T
Q  203 nttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaa----atttaagagtttaaagataattaaacaaac 298  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||       ||||||||||    |||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  28476288 attctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttttaagtttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaatttatttaagaatttaagaataattaaacaaac 28476189  T
Q  299 tttgttgtaacatggactaaaa 320  Q
    |||||||||  | |||||||||    
T  28476188 tttgttgtagtagggactaaaa 28476167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 165 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 20897947 - 20897728
Alignment:
Q  165 ttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnn-tcgtt 263  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||         |||||    
T  20897947 ttaaaaaattcatgtttaattcgtttcatgttaaaaaaattctaaattttagtaaatgaacctttcatagcgtcttaaacttgtctaaaaaataatcgtt 20897848  T
Q  264 caaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaacatggactaaaattagaagtaa-ttcttttttgtatggactaaaaaacctattaa 362  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  20897847 caaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgttttagtagggactaaaattaaaagtaattttttttttgta-ggactaaaaaaactattaa 20897749  T
Q  363 aattaagtaagaattaaactt 383  Q
    ||||||||||| | |||||||    
T  20897748 aattaagtaaggactaaactt 20897728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 109 - 325
Target Start/End: Original strand, 20977101 - 20977317
Alignment:
Q  109 caaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttat-ctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttct 207  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||       || |    
T  20977101 caaaatttgatttctacgtctagattttgttatttttattctttaatttttgtcgttttaaaaaattcatatttacttcttttcatgttaattgtttt-t 20977199  T
Q  208 aaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgta 307  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||        |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | ||    
T  20977200 aaatattagaaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtcttaaaacaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggatagttaaacaaactttgcttta 20977299  T
Q  308 acatggactaaaattaga 325  Q
     || ||||||||||||||    
T  20977300 gcagggactaaaattaga 20977317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 160 - 328
Target Start/End: Original strand, 34046542 - 34046710
Alignment:
Q  160 ttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnnt 259  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||       |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||       |    
T  34046542 ttgtttttaaaaattcatatttaatttgtttcatgttaaaaaaattctaaattttattaattgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaatt 34046641  T
Q  260 cgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaacatggactaaaattagaagt 328  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||    
T  34046642 cgttcaaaaatttaagaatttaaggataattaaacaaactttgttttagtagggactaaaattagaagt 34046710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 205 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 30353220 - 30353055
Alignment:
Q  205 tctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgtt 304  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||        ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  30353220 tctaaattttagtaagtgaacctttcataatgttctaaacttgtct-aaaaaaatcgttcaaaaatttaagtgtttaaagataattaaataaactttgat 30353122  T
Q  305 gtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaa--aaaacctattaaaattaag 369  Q
    |||| | |||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  30353121 gtaatagggactaaaattataagtaaattttttttgtaaggactaaaaaaaacctattaaaattaag 30353055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 11 - 424
Target Start/End: Original strand, 3375297 - 3375708
Alignment:
Q  11 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 110  Q
    |||||||||||||| || || ||| | || || |||||||  |||||||| |||  ||||||||| |||||| ||| |||  |||||||||||| |  ||    
T  3375297 aaatttgtttaatt-atacttaaaattttaagattttgaaggattttttgtaaaagtgttaagaacattacttaaatttcacctgcaaaaaattatctca 3375395  T
Q  111 aaaattgatttatacgtccagatttt-gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaa 209  Q
    ||| || |||| ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||       ||| ||    
T  3375396 aaattttatttctacgttcagatttttgataattttatcttgaacttttgtcgtttaaaaatattcatatttaattcattttatgtt-aaaaaattccaa 3375494  T
Q  210 attttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaac 309  Q
    ||||||||| | || | |||  || |||||||| ||||||||       |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||  |      
T  3375495 attttagtatacgagcattttgtaatgttctaaacttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattagagaaactttgtttcagt 3375594  T
Q  310 atggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgacca 409  Q
    | ||||||||| || | ||||    |||||||| | ||||||||| ||||||||||||| |||  | ||||||| |||  | |  ||||||||| |||||    
T  3375595 agggactaaaactacatgtaaagtatttttgtaggaactaaaaaagctattaaaattaaataatgactaaacttaaaagtttcaaattttatag-gacca 3375693  T
Q  410 aaaacatatttaacc 424  Q
    |||||||||| ||||    
T  3375694 aaaacatattcaacc 3375708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 204 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 24958978 - 24958758
Alignment:
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 303  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| |||||||  || |||||||        ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24958978 ttctaaattttagtaaataaatctttcgtagtgttacaaacttgtctaaaaaaaatcgtt-aaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaaatttgt 24958880  T
Q  304 tgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatag 403  Q
    | || || ||| ||  || | |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||  | || |||||| |     
T  24958879 tttagcagggattatgataataagtaatt-ttttttgtaaggactaaaaaa-ctattaaaattaagtaaggactaaacttaaaagttaccgattttacaa 24958782  T
Q  404 tgaccaaaaacatatttaacccta 427  Q
     ||||| |||||||||||||||||    
T  24958781 ggaccataaacatatttaacccta 24958758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 11400364 - 11400171
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaa-ttttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttc-ctctgcaaaaa 101  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||    |||||| || || || |||||| |||||||||| ||  || || |||||    
T  11400364 tcaattcaaatttgtttaatttatgattaaactcttgagttttttaaatggttttttacatacgtgctaagaacattactaaaaattatctttg-aaaaa 11400266  T
Q  102 attgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt 196  Q
    ||||| | |||  || ||||| | |||||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  11400265 attgtcgtaaacttttatttaaatgtccagattttgttaattttatatgtaacttttggcgttttaaaaaatttatatttaattagtttcatgtt 11400171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 289647 - 289461
Alignment:
Q  11 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 110  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||| |  ||||||||| || |  |||||||  ||||||||||||| |   |    
T  289647 aaatttgtttaatt-atgcttaaacttttaagattttgaacaattttttgcacaagtgttaagaacatcatgaaaagtttatctgcaaaaaattatctta 289549  T
Q  111 aaaattgatttatacgtccaga--ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt 196  Q
    ||| || |||| ||||||||||  |||||||| |||||| || |||||||||  ||| |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  289548 aaattttatttctacgtccagattttttgttacttttattttgaacttttgtcttttaaaaaaattcatatttaatttatttcatgtt 289461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 21108355 - 21108172
Alignment:
Q  11 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 110  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||| ||| ||| ||||||| | |  ||    
T  21108355 aaatttgtttaatt-atgcttaaacttttaagattttgaacaattttttgcacaagtgttaagaacattacgaaaatttcatctccaaaaaaatatctca 21108257  T
Q  111 aaaattgatttatacgtccaga-ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatg 194  Q
    ||| || |||| | |||||||| |||||||| |||||| || |||||||||  ||| |||||||||||||||||||  |||||||    
T  21108256 aaattttatttctgcgtccagatttttgttacttttattttgaacttttgtcttttaaaaaaattcatatttaatttatttcatg 21108172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 265 - 419
Target Start/End: Original strand, 2937237 - 2937392
Alignment:
Q  265 aaaaatttaagagtttaaa--gataattaaacaaactttgttgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaa 362  Q
    ||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||  |||| | ||  || |||||||| ||||||    
T  2937237 aaaaaattaagagtttataatgataattaaacaaactttgttgtaacaaggattaaacttagaagtaatctttttgtttagagattaaaaaacttattaa 2937336  T
Q  363 aattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatt 419  Q
    ||||||||||||| |||| ||  ||  |||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  2937337 aattaagtaagaactaaatttagaagttcccaattttata-agaccaaaaacatatt 2937392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 20898275 - 20898115
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  | || | ||||||| |||||||||| |||||| | ||||||     
T  20898275 tcaattcaaatttttttaatttatgcttaaactcttaagtttttgaacaatttttttaagacttcttaagaacattactaaaacttcctccgaaaaaaaa 20898176  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaat 173  Q
      |  ||||| ||||||| ||||||||         ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20898175 aatcacaaaatttgatttctacgtcca---------aattttatctttaacttttgtcgttttaaaaaat 20898115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 185
Target Start/End: Original strand, 289005 - 289178
Alignment:
Q  11 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 110  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||  || || ||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||| |  ||    
T  289005 aaatttgtttaatt-atgcttaaacatttaagattttgaacaattttttgcacaagtgttaagaacattacgaaaacttcatctgcaaaaaattatctca 289103  T
Q  111 aaaattgatttatacgtccaga-ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaatt 185  Q
    ||| || |||| | |||||||| |||||||| |||||| || |||||||| | | ||||||||| |||||||||||    
T  289104 aaattttatttctgcgtccagatttttgttacttttattttgaacttttg-tctattaaaaaatccatatttaatt 289178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 344 - 427
Target Start/End: Original strand, 15721397 - 15721480
Alignment:
Q  344 ggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaacccta 427  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  15721397 ggactaaaaaaaccattaaaattaagtaaggactaaacttgaaagacccctattttatagggaccaaaaacatattttacccta 15721480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 344 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 30492685 - 30492603
Alignment:
Q  344 ggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccct 426  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30492685 ggactaaaagaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaaagtcccaattttatagggaccaaaaacatatttaaccct 30492603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 334 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 2087412 - 2087320
Alignment:
Q  334 ttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccct 426  Q
    |||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||  |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  2087412 ttttttttagggactaaaagaactattaaaattaagtaaggactaaacttgaaaggtcccaattttatagggaccaaaaatatatttaaccct 2087320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 334 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 3913232 - 3913148
Alignment:
Q  334 ttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatat 418  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  3913232 ttttttatatggactaaaaacactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaagatcccaattttatagggaccaaaaacatat 3913148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 334 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 20510465 - 20510373
Alignment:
Q  334 ttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccct 426  Q
    |||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  20510465 ttttttttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggagtaaacttaaaagatcccaattttatagggaccaaacacatatttaaccct 20510373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 344 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 26356491 - 26356407
Alignment:
Q  344 ggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaa 428  Q
    ||||||||| | | |||||||||||||||| | |||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26356491 ggactaaaagaacaattaaaattaagtaaggactaaacttgaaaggtccctaatttatagggaccaaaaacatatttaaccctaa 26356407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 321 - 383
Target Start/End: Original strand, 2087660 - 2087722
Alignment:
Q  321 ttagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaactt 383  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  2087660 ttagaagtaattcttttttatagggactaaaaaacctattaaaattaagcaaggattaaactt 2087722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 341 - 426
Target Start/End: Original strand, 22732327 - 22732411
Alignment:
Q  341 tatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccct 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||  |||| ||||| ||| || |||||||||||||||||||    
T  22732327 tatggactaaaaaacctattaaaattaagtaaggactaaacttaaaaggtcccaattttgtaggga-caaaaacatatttaaccct 22732411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 3914709 - 3914474
Alignment:
Q  11 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 110  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||| || || ||||||| ||||||| ||| |  ||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||| |  ||    
T  3914709 aaatttgtttaatt-atgtttaaacttttaagattttgaataattttt-gcacaagtgttaagaacattacaaaatgttcatctgcaaaaaattatctca 3914612  T
Q  111 aaaattgatttatacgtccagattt-tgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaa 209  Q
    ||| || |||| |||||| |||||| ||||| |||||| || |||||||||  ||| ||||| ||||||| |||||  |||||||||       ||||||    
T  3914611 aaattttatttctacgtctagatttctgttagttttattttgaacttttgtcttttaaaaaatttcatatctaatttatttcatgtt-aaaaaattctaa 3914513  T
Q  210 attttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgt 248  Q
    ||||||||||| |||| |||  || |||||||| |||||    
T  3914512 attttagtaaacgaactttttgtaatgttctaaacttgt 3914474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 334 - 430
Target Start/End: Original strand, 11400391 - 11400487
Alignment:
Q  334 ttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaa 430  Q
    |||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||  |||||||||  |  ||||||||||||||||||||||    
T  11400391 ttttttatagggactaaaataactattaaaattaagtaaggactaaacttgaaagatccaaattttataggaataaaaaacatatttaaccctaaaa 11400487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 344 - 431
Target Start/End: Original strand, 861692 - 861779
Alignment:
Q  344 ggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaaa 431  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||| |||  || | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  861692 ggactaaaagaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaaggtcacaattttatagggactaaaaacatatttaaccctaaaaa 861779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 17246376 - 17246307
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaag 73  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| |||  |||||||    
T  17246376 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagttttttaacaattttttgtaaatgtgttaag 17246307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 349 - 422
Target Start/End: Original strand, 18804125 - 18804198
Alignment:
Q  349 aaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaa 422  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18804125 aaaaaaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatatctcaattttatagggaccaaaaacatatttaa 18804198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 334 - 418
Target Start/End: Original strand, 3914742 - 3914826
Alignment:
Q  334 ttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatat 418  Q
    |||||| ||||||||||||   | |||||||||||||||| | ||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  3914742 ttttttatatggactaaaagcacaattaaaattaagtaaggactaaacttaaaaagtcccaattttatagggaccaaaaacatat 3914826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 334 - 418
Target Start/End: Original strand, 5086743 - 5086827
Alignment:
Q  334 ttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatat 418  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||| | ||||||| |||  |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  5086743 ttttttatatggactaaaaacactattataattaagtaaggactaaacttaaaaggtcccaattttatagggaccaaaaacatat 5086827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 334 - 426
Target Start/End: Original strand, 12482110 - 12482202
Alignment:
Q  334 ttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccct 426  Q
    |||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| |||  |  ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  12482110 ttttttgtagagactaaaagacctattaaaattaagtaaggaataaacttaaaagttttctactttatagggactaaaaacatatttaaccct 12482202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 4 - 88
Target Start/End: Original strand, 17244540 - 17244624
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagt 88  Q
    |||||| |||| |||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||| | |  ||||||||| ||||||||||||    
T  17244540 tcaattcaaatatgtttaatttattcttaaactcttaagttttttaacaattttttgtagatgtgttaagaacattactaaaagt 17244624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 334 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 30660752 - 30660657
Alignment:
Q  334 ttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaa 429  Q
    |||||| || ||||||||| |  ||||||||||||| ||| | ||||||| |||| || | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  30660752 ttttttttagggactaaaagaattattaaaattaagcaaggactaaacttaaaaagtctcaattttatagggaccaaaaacatatttaatcctaaa 30660657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 346 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 1820945 - 1820868
Alignment:
Q  346 actaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaacc 424  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  1820945 actaaaagaactattaaaattaagtaagaactaaacttaaaaggtcccaattttatag-gaccaaaaatatatttaacc 1820868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 425
Target Start/End: Original strand, 5079830 - 5079920
Alignment:
Q  335 tttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccc 425  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||   | | |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  5079830 tttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggattaaacttaaaatgcctcaattttacagggactaaaaacatatttaaccc 5079920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 425
Target Start/End: Original strand, 18503302 - 18503392
Alignment:
Q  335 tttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccc 425  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||| |||   | | ||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  18503302 tttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaacatatttaaccc 18503392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 334 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 288971 - 288888
Alignment:
Q  334 ttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatat 418  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||||| ||||  | | ||||||||| ||||||||||||||    
T  288971 ttttttatatggactaaaaacactattaaaattaagtaaggactaaactt-aaaagacacaattttatagggaccaaaaacatat 288888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 349 - 425
Target Start/End: Original strand, 939180 - 939256
Alignment:
Q  349 aaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccc 425  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||  || | ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  939180 aaaaaaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaagttctcaattttatatggaccaaaaacatatttaaccc 939256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 335 - 422
Target Start/End: Original strand, 17246404 - 17246491
Alignment:
Q  335 tttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaa 422  Q
    |||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||| |||   | | ||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  17246404 tttttgtaaggactaaagcaactattaaaattaagtaagaactaaacttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaacatatttaa 17246491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 356 - 423
Target Start/End: Original strand, 33518701 - 33518768
Alignment:
Q  356 ctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaac 423  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||| ||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  33518701 ctattaaaattaagtaatgactaaacttaaaagatcccaattttatagagactaaaaacatatttaac 33518768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 344 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 844066 - 843984
Alignment:
Q  344 ggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccct 426  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||  || |  |||||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  844066 ggactaaaagaactattaaaattaagtaaggactaaacttgaaaggtcgcacttttatatggactaaaaacatatttaaccct 843984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 8231176 - 8231087
Alignment:
Q  335 tttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaacc 424  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||| ||||||| | ||||||| |||   | | ||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  8231176 tttttgtaaggactaaaacaactattaaaataaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaacatatttaacc 8231087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Original strand, 14191012 - 14191053
Alignment:
Q  397 tttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaaaatattac 438  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14191012 tttatagggaccaaaaacatatttaacccaaaaaaatattac 14191053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 426
Target Start/End: Original strand, 14256478 - 14256559
Alignment:
Q  345 gactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccct 426  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||| |||  |  | ||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  14256478 gactaaaagaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaagctttcaattttatagggaccaaaaacataattaaccct 14256559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 334 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 938817 - 938725
Alignment:
Q  334 ttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccct 426  Q
    ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||  ||| | ||||||| ||   |||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  938817 ttttttgtagggactaaaagaactattaaaattaaaaaagcactaaacttaaagggtcccaattttatagggatcaaaatcatatttaaccct 938725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 335 - 423
Target Start/End: Original strand, 3335490 - 3335578
Alignment:
Q  335 tttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaac 423  Q
    |||||||  ||| ||||| | |||||||||||||||||| | ||||||| |||  || | ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  3335490 tttttgtgaggattaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgtctcgattttatagggactaaaaacatatttaac 3335578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 344 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 3375253 - 3375170
Alignment:
Q  344 ggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgacca--aaaacatatttaaccc 425  Q
    ||||||||||   |||||||||||||| || ||||||||| ||||||| | ||||||||| ||| |  ||||||||||||||||    
T  3375253 ggactaaaaacattattaaaattaagtgaggattaaacttaaaaaatctcaattttatagggacaaataaaacatatttaaccc 3375170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 285 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 30916724 - 30916628
Alignment:
Q  285 ataattaaacaaactttgttgtaacatggactaaaattagaagtaattc-ttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaa 380  Q
    ||||||||||||| || |||  |||| |||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||  || |||||  ||||||| ||||||||||    
T  30916724 ataattaaacaaagttagtttcaacaaggactaaaattacatgtaatttgttttttgtatggactaagtaagctattctaattaagcaagaattaaa 30916628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 196
Target Start/End: Original strand, 15053930 - 15053993
Alignment:
Q  133 ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt 196  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||| | ||||||||||| || ||||||    
T  15053930 ttttgttagttttatcttgaatttttggtgttttaaaaaaattatatttaattcattacatgtt 15053993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 436
Target Start/End: Original strand, 16465204 - 16465243
Alignment:
Q  397 tttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaaaatatt 436  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16465204 tttatagggaccaaaaacatatttaaccctaaaatatatt 16465243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 336 - 418
Target Start/End: Original strand, 289683 - 289765
Alignment:
Q  336 ttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatat 418  Q
    |||| |||||||||||||  |||||| |||||||||| || ||||||| |||  |||| ||||||||  ||| ||||||||||    
T  289683 ttttatatggactaaaaacactattataattaagtaaaaactaaacttaaaaggtcccaattttataaggacaaaaaacatat 289765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 6 - 60
Target Start/End: Original strand, 5079000 - 5079054
Alignment:
Q  6 aattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttg 60  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |  |||| ||||||||||||    
T  5079000 aattcaaatttgtttaatttatgcttaaactctttaagtttttaacaattttttg 5079054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 397 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 7575704 - 7575670
Alignment:
Q  397 tttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaaa 431  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7575704 tttatagggaccaaaaacatatttaaccctaaaaa 7575670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 348 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 16465337 - 16465259
Alignment:
Q  348 taaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccct 426  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | |||| || |||  |  | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  16465337 taaaaaagctattaaaattaagtaagtactaaatttaaaagttttcaattttatagagaccaaaaaaatatttaaccct 16465259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 335 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 22971868 - 22971778
Alignment:
Q  335 tttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccc 425  Q
    |||||||| | ||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||| |||   | | |||||||||  || |||||||||||||||||    
T  22971868 tttttgtaagaactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttataggaactaaaaacatatttaaccc 22971778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 335 - 425
Target Start/End: Original strand, 23816530 - 23816620
Alignment:
Q  335 tttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccc 425  Q
    |||||||| | ||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||| |||   | | |||||||||  || |||||||||||||||||    
T  23816530 tttttgtaagaactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttataggaactaaaaacatatttaaccc 23816620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 397 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 33684030 - 33683997
Alignment:
Q  397 tttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaa 430  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33684030 tttatagggaccaaaaacatatttaaccctaaaa 33683997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 397 - 430
Target Start/End: Original strand, 33858745 - 33858778
Alignment:
Q  397 tttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaa 430  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33858745 tttatagggaccaaaaacatatttaaccctaaaa 33858778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 260; Significance: 1e-144; HSPs: 111)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 4 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 43597779 - 43597354
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  43597779 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttgagtttttgaacaattttttacagacgtgttaagaacattactaaaagttcctatgcaaaaaat 43597680  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
    | | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  43597679 tatcgcaaaatttgatttctacgtccagattttgttaattttatctttaactttttccgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaa 43597581  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||        ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43597580 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtctaaaataaatcgttaaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgt 43597481  T
Q  304 tgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatag 403  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  43597480 tgtaataaggactaaaattagaagtaattcttttttttagggactaaaaaatctattaaaattaagtaaagattaaacttgaaaggtccctattttatag 43597381  T
Q  404 tgaccaaaaacatatttaaccctaaaa 430  Q
     || |||||||||||||||||||||||    
T  43597380 ggatcaaaaacatatttaaccctaaaa 43597354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 4 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 22378753 - 22378332
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||     
T  22378753 tcaatttaaatttgtttaatttatacttaaactattgagtttttgaacagttttttacagacatgttaagaacgttactaaaagttcctatgcaaaaaaa 22378654  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  22378653 tgtcgcaaaatttgatttctacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgtcgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaaa- 22378555  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 303  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||       |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22378554 ttctaaattttagtaaatgtacctttcgtagtgttctaaacttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgt 22378455  T
Q  304 tgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatag 403  Q
    ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||     
T  22378454 tgtaataaggattaaaattagaagtaattcttttttgtaaggactaaaaaatctattaaaattaagtaaggattaaacttgaaagatccttattttataa 22378355  T
Q  404 tgaccaaaaacatatttaaccct 426  Q
     ||||||||| ||||||||||||    
T  22378354 ggaccaaaaaaatatttaaccct 22378332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 4 - 424
Target Start/End: Original strand, 38158948 - 38159371
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaa----ctcttgagtttttgaacaattttttg-caaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaa 98  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||    |||||||||||||||||||||||||  || || ||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  38158948 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaattaactcttgagtttttgaacaatttttttacagacgtgttaagaacattactaaaagttcctatgcaa 38159047  T
Q  99 aaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnn 198  Q
    |||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  38159048 aaaattgtcgcaaaatttgatttctacctccagattttgttaattt-atctttaacttttgtcgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaa 38159146  T
Q  199 nnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaac 298  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||       |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  38159147 aaaa-ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtgtaaggataattaaacaaac 38159245  T
Q  299 tttgttgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattt 398  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38159246 tttgttgtaatagggactaaaattagaagtaattcttttttgtaaggactaaatattttattaaaattaagtaaggattaaacttgaaaaatccctattt 38159345  T
Q  399 tatagtgaccaaaaacatatttaacc 424  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||    
T  38159346 tatagggaccaaaaacatatttaacc 38159371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 4 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 7238871 - 7238445
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||    
T  7238871 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttgaggttttgaacaattttttgcagacgtgttaagaacattattaaaaggtcctctacaaaaaat 7238772  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
    ||| ||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  7238771 tgtcgcataatttgatttctacgtccagattttgttaattttatctttaaactttttcgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaa 7238673  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||       ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7238672 ttctaaattttagtaaatgaacctttcataatgttctaaacttgtctcaaaaaaatcgatcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgt 7238573  T
Q  304 tgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatag 403  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||  | |  |||||||||    
T  7238572 tgtaacagggactaaaattcgaagtaatttttttttgtagggactaaaaaacctattaaaattaaataaggattaaacttagaagttgcaaattttatag 7238473  T
Q  404 tgaccaaaaacatatttaaccctaaaaa 431  Q
     |||||||||||||||||||||||||||    
T  7238472 ggaccaaaaacatatttaaccctaaaaa 7238445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 4 - 426
Target Start/End: Original strand, 47791838 - 47792267
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  47791838 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttgagtttttaaacaattttttgcagacgtgttaagaacattactaaaagttcctctgcaaaaaat 47791937  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  47791938 tgtcgcaaaatttgatttctacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgccgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaaaa 47792037  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaacttt-- 301  Q
     |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||        | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||      
T  47792038 -tctaaattttggtagatgaacctttcatagtgttctaaacttgtcttaaaaacattgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgt 47792136  T
Q  302 -----gttgtaacatggactaaaattagaagtaa-ttcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatcccta 395  Q
         ||||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||  |||| |    
T  47792137 tttaagttgtaacaggtactaaaattagaagtaattttttttttgtaaggactaaaaaacctattaaaattaagtaaggactaaacttagaagttcccaa 47792236  T
Q  396 ttttatagtgaccaaaaacatatttaaccct 426  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  47792237 ttttatagggaccaaaaacatatttaaccct 47792267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 4 - 380
Target Start/End: Original strand, 4926372 - 4926750
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctc---tgcaaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||    |||||||    
T  4926372 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttgagtttttaaacaattttttacagacgtgttaagaacattactaaaagttcctactatgcaaaa 4926471  T
Q  101 aattgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnn 200  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||        
T  4926472 aattgtcgcaaaatttgatttctacgttcagattttgttaattttatctttaacttgtgccgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaa 4926571  T
Q  201 nnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactt 300  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4926572 aa-ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttatctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactt 4926670  T
Q  301 tgttgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaa 380  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4926671 tgttgtaacagagactaaaattagaagtaatttttttttatatggactaaaaaacctattaaaattaagtaaggattaaa 4926750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 87 - 424
Target Start/End: Original strand, 6330978 - 6331315
Alignment:
Q  87 gttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccagatttt-gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaatt 185  Q
    |||||| ||||||||||||| | |||| ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  6330978 gttcctatgcaaaaaattgtcgtaaaatttgatttctatgtccagatttttgttaattttatctttaacttttgccgttttaaaaaattcatatttaatt 6331077  T
Q  186 cgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaaga 285  Q
    | |||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||       |||||||||||||||||||||||| ||    
T  6331078 catttcatgttaaaaaa-ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttttaaacttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaagga 6331176  T
Q  286 taattaaacaaactttgttgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttga 385  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6331177 taattaaacaaactttgttgtaataaggactaaaattagaagtaattcttttttgttgggactaaaaaatctattaaaattaagtaaggattaaacttga 6331276  T
Q  386 aaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaacc 424  Q
    ||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6331277 aaggtccctattttatagggaccaaaaacatatttaacc 6331315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 4 - 424
Target Start/End: Original strand, 1961897 - 1962317
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||  || || |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  1961897 tcaattcaaatttgtttcatttatgcttaaatttttgagtttttgaacaatttttcacagacgtgtttagaacattactaaaagttcatctgcaaaaaat 1961996  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaatt-catatttaattcgtttcatgttnnnnnn 202  Q
    ||| |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||          
T  1961997 tgtcgcaaaatttaatttctacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgtcgtttaaaaaaaatacatatttcattcgtttcatgttaaaaaa 1962096  T
Q  203 nttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttg 302  Q
     |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||  ||||||||       |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  1962097 -ttctaaattttaataaattgacctttcatagtgttctatacttgtctcaaaaatatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacgaactttg 1962195  T
Q  303 ttgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttata 402  Q
    |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||  || | ||||||||    
T  1962196 ttgtaataacgactaaaattagaagtaattcttttttgtaggaattaaaaaacctattaaaattaaataataattaaacttaaaagttctcaattttata 1962295  T
Q  403 gtgaccaaaaacatatttaacc 424  Q
    | ||| ||||||||||||||||    
T  1962296 gagacgaaaaacatatttaacc 1962317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 4 - 371
Target Start/End: Original strand, 18059006 - 18059368
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| |||||||| || |||||||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  18059006 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttgagttttcgaacaaatttttgcagacgtgttaagaaagttactaaaggttcctctgcaaaaaat 18059105  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
    ||| |||||| ||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  18059106 tgtcgcaaaatttgatttttatgtttagattttgttaattttatctttaatttttgtcgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaa 18059204  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||       |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  18059205 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttg--tccaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaa-tttgt 18059301  T
Q  304 tgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagta 371  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  18059302 tgtaacagggactaaaattagaagtaatt-ttttttgtagagactagaaaacctattaaaattaagta 18059368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 11 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 14990834 - 14990426
Alignment:
Q  11 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 110  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| | | |    
T  14990834 aaatttgtttaatttattcttaaactcttgagtttttgaacaattttttgcatacgtgttaggaacattactaaaagttcctctgcaaaaaattatcgta 14990735  T
Q  111 aaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaa 210  Q
    ||| ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||       || ||||    
T  14990734 aaatttgatttctacattcagattttgttaattttatctttaacttttg-ccttttaaaaaattcatatttaattcatttcatgtt-aaaaaattataaa 14990637  T
Q  211 ttttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaaca 310  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||       || |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14990636 ttttagt-aatgaacctttcatagtgttctaaacttctctcaaaaaaatcattcaaaaacttaagagtttaaggataattaaacaaactttgttgtaaca 14990538  T
Q  311 tggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaa 410  Q
     ||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||| |  | ||||||||  || |||    
T  14990537 aggactaaaattagaagtaattttattttgtagggactataaaacctattaaaattaaataaggactaaacttaaaaattatcaattttataaggatcaa 14990438  T
Q  411 aaacatatttaa 422  Q
    ||||||||||||    
T  14990437 aaacatatttaa 14990426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 11 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 15420445 - 15420037
Alignment:
Q  11 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 110  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| | | |    
T  15420445 aaatttgtttaatttattcttaaactcttgagtttttgaacaattttttgcatacgtgttaggaacattactaaaagttcctctgcaaaaaattatcgta 15420346  T
Q  111 aaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaa 210  Q
    ||| ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||       || ||||    
T  15420345 aaatttgatttctacattcagattttgttaattttatctttaacttttg-ccttttaaaaaattcatatttaattcatttcatgtt-aaaaaattataaa 15420248  T
Q  211 ttttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaaca 310  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||       || |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15420247 ttttagt-aatgaacctttcatagtgttctaaacttctctcaaaaaaatcattcaaaaacttaagagtttaaggataattaaacaaactttgttgtaaca 15420149  T
Q  311 tggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaa 410  Q
     ||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||| |  | ||||||||  || |||    
T  15420148 aggactaaaattagaagtaattttattttgtagggactataaaacctattaaaattaaataaggactaaacttaaaaattatcaattttataaggatcaa 15420049  T
Q  411 aaacatatttaa 422  Q
    ||||||||||||    
T  15420048 aaacatatttaa 15420037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 4 - 338
Target Start/End: Original strand, 6588687 - 6589020
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  6588687 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttgagtttttgaacaatttttcgcagacgtgttaagaacattactaaaagttcatctccaaaaaat 6588786  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||           
T  6588787 tgttgcaaaatttgatttctacgtccagaatttgttaattttatctttaacttttgtcattttaaaaaatttatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaa 6588885  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||         |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6588886 ttctaaattttagtaaatgaacctttcctagtgttataaacttgtcataaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgt 6588985  T
Q  304 tgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttt 338  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  6588986 cgtaacaaggactaaaattagaagtaatttttttt 6589020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 35 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 10620785 - 10620394
Alignment:
Q  35 ctcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaa-ttgttgcaaaaattgatttatacgtccagat 133  Q
    |||||||||||||| | ||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||    
T  10620785 ctcttgagtttttggataatattttgtatacatgttaagaacattactaaaagcttctctgcaaaaaaattgttacaaaatttgatttatacgtccatat 10620686  T
Q  134 tttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcata 233  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10620685 tttgttacttttatcattaacttttgtcgttttaaaaaaatcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaattctaaattttagtaaatgaacttttcata 10620587  T
Q  234 gtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaacatggactaaaattagaagtaattc 333  Q
    |||||| || |||||||        ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||||     
T  10620586 gtgttcaaaacttgtcttaatgaaatcgttcaaaaatttaagagtttaagaataattaaacaaactttattttagcaaggactaaaattagaagtaatta 10620487  T
Q  334 ttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccct 426  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||  |  | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  10620486 ttttttgtacggactaaaaaacctattaaaattaagtaaggactaaacttagaagttttcaattttatagggaccaaaaagatatttaaccct 10620394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 44 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 27727485 - 27727099
Alignment:
Q  44 ttttgaacaatttttt-gcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaa- 141  Q
    |||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||     
T  27727485 ttttgaacaatttttttgcacacgtgttaagaacattactaaaaattcctctacaaaaaattgtcgcaaaatttgatttctacgtccagattttgttaaa 27727386  T
Q  142 ttttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn-ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttct 240  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |        |||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||    
T  27727385 ttttatcttgaacttttgccgttttaaaaaattcatatttaattcgttttatggtaaaaaaaattctaaatttaagttaatgaacctttcttagtattct 27727286  T
Q  241 aaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaacatggactaaaattagaagtaa-ttctttttt 339  Q
    || ||||||||       |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || ||||||    
T  27727285 aaacttgtctcaaaaaaatcgtacaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaatagggactaaaattagaagtaatttttttttt 27727186  T
Q  340 gtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccct 426  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||  |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27727185 gtagggacttaaaaacctattaaaattaagtaaggagtaaacttagaagttcccaattttatagggaccaaaaacatatttaaccct 27727099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 4 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 35482351 - 35482051
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  35482351 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactattgagtttttgaacaattttttgcatacatgttaagaaaattattaaaagttcctctgcaaaaaat 35482252  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
    |||   |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||| ||| |||             
T  35482251 tgtcctaaaatttgatttctacgtccagattttgttaattttatctttaacttttagcg-tttaaaaaattcatatttaattcatttaatg---aaaaaa 35482156  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 303  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||       |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35482155 ttctaaattttagtaaatgaacatttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaacagtttaaagataattaaacaaactttgt 35482056  T
Q  304 tgtaa 308  Q
    |||||    
T  35482055 tgtaa 35482051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 46044580 - 46044225
Alignment:
Q  11 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgtt-gc 109  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| | || |||||| || ||||||||| |||| |||| ||||||||  | ||    
T  46044580 aaatttgtttaattaatgcttaaactcttaagttttttaacaattttttgtagacgtgttaaaaacattactaaatgttcatctgtaaaaaatttatcgc 46044481  T
Q  110 aaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaa 209  Q
    |||| || ||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||       ||||||    
T  46044480 aaaattttatttatatgtccaaattttattacttttatctttaacttttatcatttttaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaaa-ttctaa 46044382  T
Q  210 attttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaac 309  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||       |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || |    
T  46044381 attttagtaattgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaaaaaactttgttttagc 46044282  T
Q  310 atggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaatta 367  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  46044281 agggactaaaattagaagtaatt-ttttttgtagggactaaaaaacctactaaaatta 46044225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 4 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 4900158 - 4899738
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||| |||| |||| |||||||||||  || ||||||    
T  4900158 tcaattcaaatttgtttaatttatacttaaactcttaagttttt-aacaattttttgcagacttgtttagaacattaataaaagttccttcgcgaaaaat 4900060  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgtta-attttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnn 202  Q
    | | |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||          
T  4900059 tatcgcaaaatttgatttctacatccagattttgttactttttatctttaagttttgcggtttgaaaaaattcatatttaatttgtttcatgtt--agaa 4899962  T
Q  203 nttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttg 302  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||       || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  4899961 attctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttataaatttgtctcaaaaaaatcattcaaaaatttaagagtttaaggataattaaataaactttg 4899862  T
Q  303 ttgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttata 402  Q
    || ||||| | |||||||||   | ||||| |||| | || ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |  ||  |  | ||||||||    
T  4899861 ttttaacaggtactaaaattgtcactaatt-ttttatatagggattaaaaaaactattaaaattaagtaaggattaaacgtagaagttatcaattttata 4899763  T
Q  403 gtgaccaaaaacatatttaacccta 427  Q
    | || ||||||| ||||||||||||    
T  4899762 gggatcaaaaacctatttaacccta 4899738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 5 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 11397252 - 11396824
Alignment:
Q  5 caattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaatt 104  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||| || ||| |||||||||||| || |||||| |    
T  11397252 caattcaaatttgtttaatttatgttcaaactcttaagtttttgaacaatcttttgcatacgtgttaaaaacattgctaaaagttcctttgtaaaaaaat 11397153  T
Q  105 gttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnt 204  Q
     | | |||| ||||||| || ||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | |       |    
T  11397152 atcggaaaatttgatttctatgtttaga-tttgttacttttatctttaacttttgacgttttaaaaaattcatatttaatttgtttcacgctaaaaaaat 11397054  T
Q  205 tctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgtt 304  Q
    ||||||||||||||||||| || |||| |||||| ||| | |||||        |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  11397053 tctaaattttagtaaatgatccattcacagtgttataaacctgtcttacacaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttatt 11396954  T
Q  305 gtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagt 404  Q
     || || |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||  ||||| |||||||||||| | |||||||  ||| | || ||||||||      
T  11396953 ttagcagggactaaaattataagtaatt-ttttttgtagggattaaaaagactatttaaattaagtaaggactaaacttagaaatttccaattttataag 11396855  T
Q  405 gaccaaaaacatatttaaccctaaaaaatat 435  Q
    || |||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  11396854 gatcaaaaatatatttaacccttaaatatat 11396824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 4 - 435
Target Start/End: Original strand, 43574239 - 43574667
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||| ||  |||||||||    
T  43574239 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttaagtttttgaacaattttttgcagacatgtttagaacattactataagttacttcgcaaaaaat 43574338  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgtta-attttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnn 202  Q
    | | |||||| ||||||| ||| || | ||||| |||  |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| |||          
T  43574339 tatcgcaaaatttgatttctacatctaaattttattactttttatctttaacttttgtcattttaaaaaatttatatttaattcgtttcaagtt-agaaa 43574437  T
Q  203 nttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttg 302  Q
     |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |       ||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  43574438 attctaaattttaataaatgaacattttatagtgttctaaacttgtcacaaaaaaatcgttcaaacattttagagtttaagaataattaaacaaaatttg 43574537  T
Q  303 ttgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttata 402  Q
    || || || ||| |||||||| |||||| | ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| | ||||||| |||  |||  |||||| |    
T  43574538 ttttagcagggattaaaattataagtaaattttttttgta-ggact-aaaaacatattaaaattaagtaaggactaaacttaaaagttccaaattttaca 43574635  T
Q  403 gtgaccaaaaacatatttaaccctaaaaaatat 435  Q
    | |||| |||| ||||||||||| |||| ||||    
T  43574636 gggacc-aaaatatatttaacccaaaaatatat 43574667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 4 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 44168074 - 44167730
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |  | || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  44168074 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagttttttaacaattttgt--agacgtgttaagaacattactaaaagttcctccgcaaaaaat 44167977  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
    | | | |||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||             ||||||||||||||||||||||||| |||||||||           
T  44167976 tatcgtaaaatttgatttatatgtccagattttattacttttatc-------------gttttaaaaaattcatatttaattcatttcatgtt-aaaaaa 44167891  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 303  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||        |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44167890 ttctaaattttagtaattgaacctttcatagtgttataaacttgtctaaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgt 44167791  T
Q  304 tgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaa 364  Q
    | || ||  |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| || |||||    
T  44167790 tttagcagtgactaaaattagaagtaaattttttttgtagggactaaaaaacttactaaaa 44167730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 354
Target Start/End: Original strand, 3495655 - 3495992
Alignment:
Q  3 atcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaa 102  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||| |||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||| |  || ||||    
T  3495655 atcaattcaaatttgtttaatttattcttaaacgcttaagttttttaacaattttttgtagacgtgttaagaacattactaaaagttccgc--cacaaaa 3495752  T
Q  103 ttgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnn 202  Q
    ||           ||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||          
T  3495753 tt-----------tgatttatatgtccatattttattacttttatctttaacttttattgttttcaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaaa 3495841  T
Q  203 nttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttg 302  Q
     || ||||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||| |||| |||       || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3495842 att-taaattttattaattgaatctttcatagtgttttaaacttgcctcaaaaaattcattcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttg 3495940  T
Q  303 ttgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaa 354  Q
    || ||  | ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||    
T  3495941 ttttagtagggactaaaattagaagtgatttttttttgtagggactaaaaaa 3495992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 6 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 15653085 - 15652653
Alignment:
Q  6 aattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattg 105  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||     
T  15653085 aattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttaaatttttgaacaattttttacaaacgtgttaagaacattactaaaagttcctccacaaaaaatta 15652986  T
Q  106 ttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-nnnnnnnt 204  Q
    | | |||| ||||||| |||||||| ||||||||| |      ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||             
T  15652985 tcgtaaaatttgatttctacgtccaaattttgttact------tttaacttttgtcattttaaaaaattcatatttaatttgtttcatattaaaaaaaaa 15652892  T
Q  205 tctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgtt 304  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| | | ||||       ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  15652891 tctaaattttaataaataaacctttcatattgttctaaacgtatctcaaaaaaatcgttaaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaacttt-tt 15652793  T
Q  305 gtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagt 404  Q
     || || | | |||| ||| | |||    |||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| || | ||||||| |||  |  | |||||||||     
T  15652792 ttagcaggaattaaacttatatgta---tttttttgtacagactaaaaaaactattcaaattaagttaggactaaacttaaaagtttacaattttatag- 15652697  T
Q  405 gaccaaaaacatatttaaccctaaaaaatattactaacttttaa 448  Q
    || ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  15652696 gatcaaaaacatatttaacccttaaaattattactaaattttaa 15652653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Original strand, 46330799 - 46331069
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||| | ||  |||||||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  46330799 tcaattcaaatatgtttaatttatgcttaaactctcaagttttttaacaattttttgtagacgcgttaagaacattactaaaagttcatccgcaaaaaat 46330898  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
    | | |||||| |||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||           
T  46330899 tatcgcaaaatttgatttatatgtcgagattttattacttttatctttaacttttatcgttttcaaaaattcatatttaattcgttacatgtt-aaaaaa 46330997  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaag 275  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||       |||||||||||||||||    
T  46330998 ttctaaattttagtaattgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaag 46331069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 4 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 21109642 - 21109449
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21109642 tcaattcaaatttgtttcatttatgcttaaactcttaaatttttgaacaattttttgcatacgtgtttagaacattactaaaagttcctctgcaaaaaat 21109543  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgtta-attttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt 196  Q
    | | |||||| ||||||| ||| || |||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21109542 tatagcaaaatttgatttctacatcgagattttgttactttttatctttaatttttgtcgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt 21109449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 4 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 43084137 - 43083788
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||| || | ||||||       
T  43084137 tcaattcaaatttgtttaatttattcttaaactcttaagttttttaacaattttttgtagacgtgttaagaacattactaaaagtaccgccgcaaaat-- 43084040  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
               ||||||||||  | || ||||| ||| ||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||           
T  43084039 -----------ttgatttatattttcatattttattacttttatctttatctttaattgttttcaaaaattcatatttaatttttttcatgttaaaaaa- 43083952  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 303  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||       |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43083951 ttctaaattttattaattgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaattcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgt 43083852  T
Q  304 tgtaacatggactaaaattagaagtaa--ttcttttttgtatggact-aaaaaacctattaaaa 364  Q
    | ||  | |||||||||||||||||||  || ||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  43083851 tttagtagggactaaaattagaagtaatttttttttttgtagggactaaaaaaacctattaaaa 43083788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 4 - 339
Target Start/End: Original strand, 38199062 - 38199382
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||| | || ||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||       
T  38199062 tcaattcaaatttgtttaatttattcttaaactcttaagttttttaacaattttttgtagacgtgttaagaacattcctaaaagttccgccgcaaaat-- 38199159  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
               |||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||           
T  38199160 -----------ttgatttatatgtccatattttattacttttatctttaattttttttgttttcaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaaa- 38199247  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 303  Q
    |||||||||||| | | ||||||||||||||| |||||| ||||||||       |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  38199248 ttctaaattttattgattgaacctttcatagtattctaaacttgtctcaaaaaattcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaac-aactttgt 38199346  T
Q  304 tgtaacatggactaaaattagaagtaattctttttt 339  Q
    | ||  | ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38199347 tttagtagggactaaaattagaagtaattttttttt 38199382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 4 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 1544769 - 1544393
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |  |||| |||||||||||||  || || ||||||||| |||| |||||||| ||   |||||  |    
T  1544769 tcaattcaaatttgtttgatttatgcttaaactttaaagttgttgaacaatttttc-catacgtgttaagaacattattaaaagttacttcacaaaagct 1544671  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
    | | | |||| ||||||| ||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||           
T  1544670 tatcgtaaaatttgatttctacatcccgattttgttactttcatctttaacttttgtcgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcaagttaaaaaa- 1544572  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 303  Q
    ||| |||| |||| ||||||   |||||||||||||||| |||| |||       |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||    
T  1544571 ttcaaaatcttagcaaatgagtttttcatagtgttctaaacttgactcaaaaatatcgttcaaaaatttaaaagtttaaggataattaaacaaaatttgt 1544472  T
Q  304 tgtaacatggactaaaattagaagtaattctt-ttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaactt 383  Q
    | || || ||| |||||||  |||||||| || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||    
T  1544471 tttagcaaggattaaaattctaagtaatttttattttgtatggactaaaaa--ctattaaaattaagtaaggactaaactt 1544393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 4 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 29156260 - 29155900
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||| ||| |||| |||||| |||||  ||||||||    
T  29156260 tcaattcaaatttatataatttatgcttaaactcttaagtttttgaacaatttcttgtagacatgttatgaacatta-taaaaggtcctccacaaaaaat 29156162  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
    | | |||||| ||||||| || ||||||||| | ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||           
T  29156161 tatcgcaaaatttgatttctatgtccagattctattgcttttagctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcaaatt-aaaaaa 29156063  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttc----atagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaact 299  Q
    ||||||||||| |||||| |||| | |    ||| |||||||| ||||| |        | ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29156062 ttctaaatttttgtaaataaaccgtccatatataatgttctaaacttgtttaaaaaaaattgttcataaatttaagagtttaaggataattaaacaaact 29155963  T
Q  300 ttgttgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaa 363  Q
    ||||| ||| | ||||||||||||||||||  | |||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  29155962 ttgttctaatagggactaaaattagaagtacat-ttttttttagggactaaaaaaactattaaa 29155900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 4 - 429
Target Start/End: Original strand, 44080958 - 44081371
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||  ||||   |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||    
T  44080958 tcaattcaaacttgtttaatt-atgcttaaactcttaagttttcaaacatgcttttgcaaacgtgttaagaacaatactaaaagttcctccgcaaaaaat 44081056  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccaga-ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnn 202  Q
      | |||||| || |||| |||||||| | |||||||| ||||||||| |  ||| || ||||||||||||||||||||||||  |||||  ||          
T  44081057 gatcgcaaaatttaatttctacgtccatatttttgttacttttatcttgatgtttagtcgttttaaaaaattcatatttaattaatttca-attttaaaa 44081155  T
Q  203 nttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttg 302  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||        ||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  44081156 attttaaattttagtaaatgaacctttcatagtattctaaatttgtctaaaaaaattcgctcaaaaatttaagaatttaagtataattaaacaaactttg 44081255  T
Q  303 ttgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttata 402  Q
    |  ||||| |||||||||||| ||||||           || |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||  ||  |||| ||||||||    
T  44081256 tattaacaaggactaaaattataagtaa-----------attgactaaaaaagctattaaaattaaataaaaattaaacttagaagttcccaattttata 44081344  T
Q  403 gtgaccaaaaacatatttaaccctaaa 429  Q
    | ||||| |||||||||||||| ||||    
T  44081345 gggaccagaaacatatttaaccataaa 44081371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 424
Target Start/End: Original strand, 38598974 - 38599389
Alignment:
Q  11 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 110  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||  || || |||||||||  ||| |||| | |||||   |||||||  | |||    
T  38598974 aaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagtttttcaacaatttttcacagacgtgttaagaacgttattaaatggtcctccaaaaaaaata-tcgca 38599072  T
Q  111 aaaatt-gatttatacgtccagatttt-gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttcta 208  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||| |||| || |||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||       || ||    
T  38599073 aaaatttgatttctacgtccatatttttgttacttatatcttaaaattttgtcgttttaaaaaattcatatttaatttatttcatgttaaaaaa-ttata 38599171  T
Q  209 aattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaa 308  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |        ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||     
T  38599172 gattttagtaaatgaatctttcatagtgttctaaacttgtataaaaagaatcgttaaaaaatttaagagtttaaagataattaagcaaaatttattttag 38599271  T
Q  309 catggactaaaattagaagtaa--ttcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtga 406  Q
    ||  ||||||||||| ||||||  || ||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||  ||  ||   |||||||||  |    
T  38599272 cagtgactaaaattataagtaatttttttttttgtggggattaaaaaagctattaaaattaagtaaggactaaacttagaaggtcgtaattttataggaa 38599371  T
Q  407 ccaaaaacatatttaacc 424  Q
     |||||||||||||||||    
T  38599372 tcaaaaacatatttaacc 38599389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 69 - 425
Target Start/End: Original strand, 37539849 - 37540206
Alignment:
Q  69 ttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccagatttt-gttaattttatctttaacttttgttgtttta 167  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||| |||||||  | ||| |  |||| |||  ||||||||| ||||||||| |||| |    
T  37539849 ttaagaacattactaaaagttcctctgtaaaaaattatctcaaaatttgatttccaagtctaattttttgttgcttttatcttgaacttttgtcgtttaa 37539948  T
Q  168 aaaaa-ttcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaa 266  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||       ||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||   | ||||       ||||||||    
T  37539949 aaaaaattcatatttaattcatttcatgttaaaaaa-ttctaaattttagtaaatgaaccttttgaaatgttctaaatatatctcggaaaaatcgttcaa 37540047  T
Q  267 aaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaatt 366  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| | |||| | ||||||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  37540048 aaatttaaaagtttaaggataattaaacaaactttgttttagcagggactaaaattacatgtaaatattttttgtatggattaaaaagactattaaaatt 37540147  T
Q  367 aagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccc 425  Q
    ||||||| | |||||||  ||  |  | ||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  37540148 aagtaaggactaaacttataagttttcaattttatatggaccaaaaatatatttaaccc 37540206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 77 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 36019985 - 36019811
Alignment:
Q  77 attactaaaagttcctctgcaaaaaa-ttgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattc 175  Q
    ||||||||||||| || ||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  36019985 attactaaaagtttctatgcaaaaaaattgtcgcaaaatttgatttctacgtctagattttgttaattttatctttaacttttgccgttttaaaaaattc 36019886  T
Q  176 atatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctc 251  Q
    |||| ||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||    
T  36019885 atatctaattcgtttcatgtt-aaaaagttctaaattttagtaaatgaacatttcataatgttataaacttgtctc 36019811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 364
Target Start/End: Original strand, 33624788 - 33625144
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctg-------- 95  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| | | || ||||||||| |||||||||| ||| | ||            
T  33624788 tcaatttaaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagttttttaacaattttt-gtagacgtgttaagaacattactaaaaattcatatgtccaaatt 33624886  T
Q  96 -----caaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgttt 190  Q
         ||||||||| | |||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||             ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33624887 atccgcaaaaaattatcgcaaaatttgatttatatgtccaaattttattacttttatc-------------gttttcaaaaattcatatttaattcgttt 33624973  T
Q  191 catgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataatt 290  Q
    ||||||       |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |        ||  || ||||||||||||||||| |||||||    
T  33624974 catgttaaaaaa-ttctaaattttagtaattgaacctttcatagtgttctaaacttgtataaaaaaaatc--tctaaaatttaagagtttaaggataatt 33625070  T
Q  291 aaacaaactttgttgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaa 364  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||| |||||    
T  33625071 aaacaaactttgttttagcaaggactaaaattagaagtaaattttgtttgtagggactaaaaaacctactaaaa 33625144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 211 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 45958815 - 45958663
Alignment:
Q  211 ttttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaaca 310  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||       ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  45958815 ttttagtaattgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaaaataattaaacaaactttgttttagca 45958716  T
Q  311 tggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaa 364  Q
       ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  45958715 gaaactaaaattagaagtaatt-ttttttgtaaggactaaaaaacctactaaaa 45958663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 4 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 4883908 - 4883775
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  4883908 tcaatttaaatttgtttaatttatgtttaaactcttgagtttttgaataattttttacagacgtgttaagaacattactaaacgttcctatgcaaaaaat 4883809  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttg 137  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  4883808 tgtcgcaaaatttgatttctacgtccagattttg 4883775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 211 - 435
Target Start/End: Original strand, 28924698 - 28924923
Alignment:
Q  211 ttttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaaca 310  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| |||| ||| | ||||||       |||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| || |||   |||    
T  28924698 ttttagtaaatgaacattttataatgttttaaacatgtctccaaaaaatcgttcaaaactttaagaattcaaagataattaaacaaatttagtttataca 28924797  T
Q  311 tggactaaaattagaagtaattct-tttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgacca 409  Q
     |||||||||||| | |||||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||  |||| ||||||||| || ||    
T  28924798 aggactaaaattacatgtaattttctttttgtagggactaaaaaagctattaaaattaagtaaggattaaacttagaagttcccaattttatagggatca 28924897  T
Q  410 aaaacatatttaaccctaaaaaatat 435  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||    
T  28924898 aaaatatatttaaccctaaaatatat 28924923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 153 - 364
Target Start/End: Original strand, 15130859 - 15131061
Alignment:
Q  153 acttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcn 252  Q
    |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||       |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||      
T  15130859 acttttatcgttttcaaaaattcatatttaattcgtttaatatttaaaaa-ttctaaattttagtaattgaacctttcatagtgttctaaacttgtctaa 15130957  T
Q  253 nnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaa 352  Q
           ||||||||| |||||||        |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  15130958 aaaaaaacgttcaaaagtttaaga--------ataattaaacaaactttgttttagcaaggactaaaattagaagtaatttttttttgtagggactaaaa 15131049  T
Q  353 aacctattaaaa 364  Q
    |||||| |||||    
T  15131050 aacctactaaaa 15131061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 16081056 - 16080703
Alignment:
Q  10 gaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgc 109  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||| |||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |  |    
T  16081056 gaaatttgtttaatt-atgcttaaactcttaagttttcgaacaattatttgtatacatgttaaaaatattactaaaagttcctctgcaaaaaagtatctc 16080958  T
Q  110 aaaaattgatttatacgtccaga-ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-nnnnnnnttct 207  Q
    |||  ||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||               |||||||||||||||||  |||| |||||||||        || |    
T  16080957 aaattttgatttctacatccagatttttgttacttttatc--------------gtttaaaaaattcatattccattcatttcatgttaatttttttttt 16080872  T
Q  208 aaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgta 307  Q
    || ||||||||||||||| |||| || |||||||| ||| ||||       || |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  16080871 aagttttagtaaatgaacatttcttaatgttctaaacttttctcaaagaaatcataaaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgtttta 16080772  T
Q  308 acatggactaaaattagaagtaa---ttcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaag 373  Q
     ||| |||| |||||| | ||||   || |||||| || | ||||||||| |||||||| |||||||||    
T  16080771 gcatagactgaaattacatgtaattttttttttttataggtactaaaaaatctattaaatttaagtaag 16080703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 6 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 9633461 - 9633096
Alignment:
Q  6 aattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattg 105  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| | || ||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||     
T  9633461 aattcaaatttgtttaatt-atgcttaaactcttaagtttt-gaacaattttttgcagatattttatgaacattactaaaagttcctccgcaaaaattta 9633364  T
Q  106 ttgcaaaaattgatttatacgtccagatttt-gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnt 204  Q
    |  |||||  |||||| ||  |||| ||||| |||| ||||| ||||||    | | |||| ||| |||||||||||||||  ||||| |||       |    
T  9633363 tctcaaaatgtgatttttatatccaaatttttgttacttttaactttaaaaaatttcgtttaaaagaattcatatttaatttatttcaagttaaaaa--t 9633266  T
Q  205 tctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaa-tttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 303  Q
    | | ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| |||||||        || || ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9633265 tatgaattttagtaaatgaaccttttataatgttataaacttgtctaaaaaatatcattaaaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgt 9633166  T
Q  304 tgtaacatggactaaaattagaagt-aattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaa 372  Q
    | || || ||| |||||||| | || |||  ||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||    
T  9633165 tttagcagggattaaaattacatgtaaatatttttttgtagggactaaaaatgttattaaaattaagtaa 9633096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 45958953 - 45958811
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaatttttt-gcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaa 102  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||| ||||||||||| | | || |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  45958953 tcaattcaaatttgtttaatttctgcttaaactcttaagttttt-aacaatttttttgtagacgtgttaataacattactaaaagttcctccgcaaaaaa 45958855  T
Q  103 ttgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaatttta 146  Q
    || || ||||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  45958854 ttatttcaaaatttgatttatatgtccagattttattactttta 45958811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 96 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 10463497 - 10463170
Alignment:
Q  96 caaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccagatttt-gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatg 194  Q
    ||||||||| ||  ||||||| |||| |||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||||||     
T  10463497 caaaaaattatttgaaaaatttatttctacgtccagatttttgttacttttatcttaaatttttgtcttttaaaaaaattcatatttaattaatttcat- 10463399  T
Q  195 ttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaac 294  Q
    ||       |||||||||   ||||| ||||||||  || |||| ||| ||||||||       |||||||||||||||||||||||| |||||| | |     
T  10463398 tttaaaaaattctaaattg--gtaaacgaaccttttgtaatgttttaaacttgtctcaaaaagatcgttcaaaaatttaagagtttaa-gataatcagag 10463302  T
Q  295 aaactttgttgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccct 394  Q
    |||||||||| ||| |  |||||||| || | |||| |  ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||||  ||  | |      
T  10463301 aaactttgttttaatagtgactaaaactacatgtaaattatttttatagggactgaaaaagctattaaaattaagtaaggactaaacttagaagtttcaa 10463202  T
Q  395 attttatagtgaccaaaaacatatttaaccct 426  Q
    |||||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  10463201 attttacagagactaaaaacatatttaaccct 10463170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 1066691 - 1066517
Alignment:
Q  11 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 110  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||  |  ||    
T  1066691 aaatttgtttaatt-atgcttaaacttttaagattttgaacaattttttgcacaagtgttaagaacattacgaaaagttcatatgcaaaaaatgatctca 1066593  T
Q  111 aaaattgatttatacgtccag-attttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaatt 185  Q
    ||| || |||| ||||||||| ||||||||| |||||| || |||||||||   || ||||||| |||||||||||    
T  1066592 aaattttatttctacgtccagaattttgttacttttattttgaacttttgtctattaaaaaaatccatatttaatt 1066517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 344 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 6588650 - 6588563
Alignment:
Q  344 ggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaaa 431  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  6588650 ggactaaaagaactattaaaattaagtaagaactaaacttaaaaggtcccaattttatagggactaaaaacatatttaaccctaaaaa 6588563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 248
Target Start/End: Original strand, 8832715 - 8832952
Alignment:
Q  11 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaa-tattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgc 109  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || |||| |||||||||||||| |  ||| ||||| |||||| |||||||| ||| | || |||| |  |    
T  8832715 aaatttgtttaatt-atgcttaaacttttaagatttttaacaattttttgcacaagtgtcaagaactattacgaaaagttcatctccgaataattatctc 8832813  T
Q  110 aaaaattgatttatacgtccagatttt-gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttcta 208  Q
    |||| || |||| | |||||||||||| |||| |||||| || |||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||||||| |        ||||    
T  8832814 aaaattttatttctgcgtccagatttttgttacttttattttaaacttttgtcttttaaaaaaattcatatttaatttatttcatgctaaatagg-tcta 8832912  T
Q  209 aattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgt 248  Q
    |||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||    
T  8832913 aattttagtaaatgaaccttttgtaatgttctaaacttgt 8832952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 12621861 - 12621625
Alignment:
Q  11 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 110  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||| ||| |  | ||||||| || || |||||||  ||||||||||||| |  ||    
T  12621861 aaatttgtttaatt-atgcttaaacttttaagattttgaacaatttttagcacaagtattaagaacatcacgaaaagtttatctgcaaaaaattatctca 12621763  T
Q  111 aaaattgatttatacgtccagatttt-gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaa 209  Q
    ||| || |||  | |||||||||||| |||| |||||| || |||||| ||  ||| |||||||||||||||||||  |||||||||       || |||    
T  12621762 aaattttattcctgcgtccagatttttgttacttttattttgaactttcgtcttttaaaaaaattcatatttaatttatttcatgttaaaaaattt-taa 12621664  T
Q  210 attttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgt 248  Q
    ||||||||||| ||||||||  || |||||||| |||||    
T  12621663 attttagtaaacgaacctttagtaatgttctaaacttgt 12621625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 36020090 - 36020005
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagtt 89  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||| ||||| |||||||||||||    
T  36020090 tcaatttaaatttgtttaatttatacttaaactcttgagtttttaaacaattttttacaaatgtgtcaagaacattactaaaagtt 36020005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 344 - 426
Target Start/End: Original strand, 27728090 - 27728172
Alignment:
Q  344 ggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccct 426  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  27728090 ggactaaaagaactattaaaattaagtaaggattaaacttaaaacgtcccaattttatagggaccaaaaatatatttaaccct 27728172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 6 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 27728051 - 27727998
Alignment:
Q  6 aattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaatttttt 59  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27728051 aattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttgagtttttgaacaatttttt 27727998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 358 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 38158898 - 38158829
Alignment:
Q  358 attaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaacccta 427  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38158898 attaaaattaagtaaggactaaacttgaaaggcccctattttatagggaccaaaaacatatttaacccta 38158829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 334 - 426
Target Start/End: Original strand, 22378781 - 22378872
Alignment:
Q  334 ttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccct 426  Q
    |||||| || ||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| | | ||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  22378781 ttttttttagggattaaaagaactattaaaattaagtaaggattaaacttgaaagacctctattttataggga-caaaaacatatttaaccct 22378872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 317 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 36019776 - 36019720
Alignment:
Q  317 aaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaag 373  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36019776 aaaattagaagtaattattttttgtaggaactaaaaaacctattaaaattaagtaag 36019720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 334 - 418
Target Start/End: Original strand, 38595316 - 38595400
Alignment:
Q  334 ttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatat 418  Q
    |||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  38595316 ttttttatatggactaaaagcactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaaattcccaattttatagggaccaaaaacatat 38595400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 342 - 418
Target Start/End: Original strand, 40304521 - 40304597
Alignment:
Q  342 atggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatat 418  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  40304521 atggactaaaaacactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaagatcccaattttatagggaccaaaaacatat 40304597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 426
Target Start/End: Original strand, 10620831 - 10620922
Alignment:
Q  335 tttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccct 426  Q
    ||||| || |||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  10620831 tttttttagggactacaaaaactattaaaattaaataaggattaaacttcaaatatcacaattttataaggaccaaaaacatatttaaccct 10620922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 334 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 1260113 - 1260023
Alignment:
Q  334 ttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaacc 424  Q
    |||||| || ||||||||||| | |||||||||||| ||| | ||||||| ||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  1260113 ttttttatagggactaaaaaaacaattaaaattaagcaaggactaaacttaaaatatcccaattttatagggaacaaaaacatatttaacc 1260023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 344 - 426
Target Start/End: Original strand, 7238909 - 7238991
Alignment:
Q  344 ggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccct 426  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||| ||| || || |||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  7238909 ggactaaaagaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaagattccaattttataggaaccaaaaacatatttaaccct 7238991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 344 - 426
Target Start/End: Original strand, 14990878 - 14990960
Alignment:
Q  344 ggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccct 426  Q
    ||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||  ||  |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14990878 ggactaaaagaactattaaaattaggtaaggattaaacttagaaggtcccaattttatagggaccaaaaacatatttaaccct 14990960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 344 - 426
Target Start/End: Original strand, 15420489 - 15420571
Alignment:
Q  344 ggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccct 426  Q
    ||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||  ||  |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15420489 ggactaaaagaactattaaaattaggtaaggattaaacttagaaggtcccaattttatagggaccaaaaacatatttaaccct 15420571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 334 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 37537459 - 37537369
Alignment:
Q  334 ttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaacc 424  Q
    |||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||| | | ||||| ||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  37537459 ttttttttaaggactaaaaatactattaaaattaagtaaggactgaacttaaaaaatctcaattttataaggaccaaaaacatatttaacc 37537369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 335 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 38199034 - 38198944
Alignment:
Q  335 tttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccc 425  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| |||   | | ||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  38199034 tttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaagaactaaacttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaacatatttaaccc 38198944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 334 - 423
Target Start/End: Original strand, 4883936 - 4884025
Alignment:
Q  334 ttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaac 423  Q
    |||||| || ||||||||| | | |||||||||||||||| | |||||||||||  ||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  4883936 ttttttttagggactaaaagaaccattaaaattaagtaaggactaaacttgaaaggtccctattttataggaatcaaaaacatatttaac 4884025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 104
Target Start/End: Original strand, 8081814 - 8081906
Alignment:
Q  11 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaatt 104  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  8081814 aaatttgtttaatt-atgcttaaacttttaagattttgaacaattttttgcacaagtgttaagaacattacgaaaagttcatctccaaaaaatt 8081906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 38199864 - 38199807
Alignment:
Q  3 atcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttg 60  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  38199864 atcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagttttttaacaattttttg 38199807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 206 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 47139830 - 47139732
Alignment:
Q  206 ctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgtt 304  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||||||       || |||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  47139830 ctaaattttagtaaatgaaccttgcataatgttttaaacttgtctcaaaaaaatcattcaaaaatttaaatgtttaaggataattaaacaaaatttgtt 47139732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 334 - 426
Target Start/End: Original strand, 6589279 - 6589370
Alignment:
Q  334 ttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccct 426  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||  || | ||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  6589279 ttttttgta-ggactaaaaaacctattaaaattaagtaaggactaaacttagaagttctcaattttatatggaccaaaaacataattaaccct 6589370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 334 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 8832681 - 8832597
Alignment:
Q  334 ttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatat 418  Q
    |||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||| | ||||||| |||  |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  8832681 ttttttatatggaccaaaagaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaaggtcccaattttatagggaccaaaaacatat 8832597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 344 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 18058969 - 18058886
Alignment:
Q  344 ggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaacccta 427  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||| | | ||||| ||| |||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18058969 ggactaaaagaactattaaaattaagtaagcactgaacttaaaagatcttaattttatagggaccaaaaacatatttaacccta 18058886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 242
Target Start/End: Original strand, 1065769 - 1065928
Alignment:
Q  83 aaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccagatttt-gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatattt 181  Q
    |||||||  ||||||||||||| |  ||||| || |||  |||||| ||||||| |||| |||||| || |||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  1065769 aaaagtttatctgcaaaaaattatctcaaaattttattcctacgtctagatttttgttacttttattttgaacttttgtcttttaaaaaaattcatattt 1065868  T
Q  182 aattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaa 242  Q
    ||||  |||||||||       ||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||    
T  1065869 aatttatttcatgtt-aaaaaattctaaattttagtaaacgaacctttagtaatgttctaa 1065928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 425
Target Start/End: Original strand, 3496506 - 3496596
Alignment:
Q  335 tttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccc 425  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |  |||||| ||| | | | ||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  3496506 tttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggacaaaacttaaaatacctcaattttatagggactaaaaacatatttaaccc 3496596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 344 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 12908643 - 12908565
Alignment:
Q  344 ggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaa 422  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||  ||  || | ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12908643 ggactaaaaaaactattaaaattaagtaaggactaaacttagaaggtctcaattttatagggaccaaaaacatatttaa 12908565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 336 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 37107650 - 37107568
Alignment:
Q  336 ttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatat 418  Q
    |||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||| | ||||||| |||  |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  37107650 ttttatatggactaaaaacactattataattaagtaaggactaaacttaaaaggtcccaattttatagggaccaaaaacatat 37107568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 89
Target Start/End: Original strand, 38593281 - 38593358
Alignment:
Q  11 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagtt 89  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||    
T  38593281 aaatttgtttaatt-atgcttaaacttttaagattttgaacaattttttgcaaaagtgttaagaacattacgaaaagtt 38593358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 42974394 - 42974165
Alignment:
Q  13 atttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaa 112  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| || || |||| |||||||||||||| |  ||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||||| || |  ||||    
T  42974394 atttgtttaatt-atgcttaaacttttaagattttaaacaattttttgcacaagtgtcaagaacattacgaaaagttcatctccaaaaacttatctcaaa 42974296  T
Q  113 aattgatttatacgtccaga-ttttgttaattttatctttaacttttgt-tgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaa 210  Q
    | || |||| | |||||||| |||||||| |||||| |  ||||||||| | ||  |||||| ||||||||||||  || ||||||       |||||||    
T  42974295 attttatttctgcgtccagatttttgttacttttatttcaaacttttgtcttttaaaaaaaaatcatatttaatttattccatgtt-aaataattctaaa 42974197  T
Q  211 ttttagtaaatgaacctttcatagtgttctaa 242  Q
    |||||||||| ||||||||  || ||||||||    
T  42974196 ttttagtaaacgaaccttttgtaatgttctaa 42974165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 356 - 428
Target Start/End: Original strand, 15654429 - 15654501
Alignment:
Q  356 ctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaa 428  Q
    |||||||||||||||| | | ||||||| |||  |||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  15654429 ctattaaaattaagtatggaataaacttaaaaggtccctattttataaggaccaaaaacatatttaatcctaa 15654501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 334 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 18798913 - 18798829
Alignment:
Q  334 ttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatat 418  Q
    |||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||| |||||||||  ||  || | ||||||||| ||||||||||||||    
T  18798913 ttttttatatggaataaaaacactattaaaattaagtaaggattaaacttataaggtctcaattttatagggaccaaaaacatat 18798829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 335 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 33624760 - 33624672
Alignment:
Q  335 tttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaac 423  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||| |||   | | ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  33624760 tttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaacatatttaac 33624672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 37108686 - 37108538
Alignment:
Q  11 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 110  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||  ||| |  ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |  ||    
T  37108686 aaatttgcttaatt-atgcttaaacttttaagattttgaacaatttt--gcacaagtgttaagaacattacgaaaagttcatctgcaaaaaattatctca 37108590  T
Q  111 aaaa-ttgatttatacgtccag-attttgttaattttatctttaacttttgt 160  Q
    |||| || |||| | ||||||| ||||||||| |||||| || |||||||||    
T  37108589 aaaattttatttttccgtccagaattttgttacttttattttgaacttttgt 37108538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 334 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 38593247 - 38593164
Alignment:
Q  334 ttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatat 418  Q
    |||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||| | ||||||| |||  |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  38593247 ttttttatatggactcaaaacactattaaaattaagtaaggactaaactt-aaaggtcccaattttatagggaccaaaaacatat 38593164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 4 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 3496478 - 3496423
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaatttttt 59  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  3496478 tcaatttaaatttgtttaattcatgcttaaactcttaagttttttaacaatttttt 3496423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 345 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 29884304 - 29884225
Alignment:
Q  345 gactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaacc 424  Q
    |||||||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||  | ||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  29884304 gactaaaacaactattaaaattaaataagaatgaaacttagaaaattacaattttgtagagaccaaaaacatatttaacc 29884225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 84 - 248
Target Start/End: Original strand, 38594592 - 38594756
Alignment:
Q  84 aaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccagatttt-gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatattta 182  Q
    ||||||| ||| ||||||||| |  ||||| || |||||| |||| ||||||| |||| |||||| || |||||||||  ||| |||||||||||||||     
T  38594592 aaagttcatctccaaaaaattatctcaaaatttaatttatgcgtctagatttttgttacttttattttgaacttttgtcttttaaaaaaattcatatttg 38594691  T
Q  183 attcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgt 248  Q
    |||  ||||||| |       ||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||| |||||    
T  38594692 atttatttcatgct-aaataattctaaattttagtaaacgaaccttttgtaatgttctaaacttgt 38594756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 356 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 8081760 - 8081698
Alignment:
Q  356 ctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatat 418  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  8081760 ctattaaaattaagtaaggactaaacttaaaagatcccaattttataggtaccaaaaacatat 8081698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 336 - 418
Target Start/End: Original strand, 12621897 - 12621979
Alignment:
Q  336 ttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatat 418  Q
    |||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||| | ||||||| |||  |||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  12621897 ttttatatggactaaaaatactattataattaagtaaggactaaacttaaaaggtcccaaatttatagggaccaaaaacatat 12621979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 344 - 426
Target Start/End: Original strand, 21109680 - 21109762
Alignment:
Q  344 ggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccct 426  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||| |||  |||| |||||| |  ||| ||||||||||||||||||    
T  21109680 ggactaaaagaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaaggtcccaattttacaaggactaaaaacatatttaaccct 21109762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 335 - 425
Target Start/End: Original strand, 38199891 - 38199981
Alignment:
Q  335 tttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccc 425  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||| |||   | | ||||||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  38199891 tttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaatatatttaaccc 38199981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 335 - 425
Target Start/End: Original strand, 45958981 - 45959071
Alignment:
Q  335 tttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccc 425  Q
    ||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||| |||   ||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  45958981 tttttctaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggaataaacttaaaatgccccaattttatatagactaaaaacatatttaaccc 45959071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 335 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 46330771 - 46330681
Alignment:
Q  335 tttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccc 425  Q
    ||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||| |||   | | ||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  46330771 tttttataaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaacatatttaaccc 46330681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 356 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 1961848 - 1961779
Alignment:
Q  356 ctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccc 425  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||   || ||||| |||||||||||    
T  1961848 ctattaaaattaagtaaggattaaacttaaaaaattccaattttataagaacgaaaaatatatttaaccc 1961779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 356 - 425
Target Start/End: Original strand, 35482400 - 35482469
Alignment:
Q  356 ctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccc 425  Q
    |||||||||||||||||  | |||| || ||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35482400 ctattaaaattaagtaatgactaaatttaaaatatcctaattttatagggaccaaaaacatatttaaccc 35482469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 44167113 - 44167024
Alignment:
Q  335 tttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaacc 424  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||| |||   | | |||||| || ||| ||||||||||||||||    
T  44167113 tttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttacagggactaaaaacatatttaacc 44167024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 45958077 - 45957988
Alignment:
Q  335 tttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaacc 424  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||| |||   | | |||||| || ||| ||||||||||||||||    
T  45958077 tttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaagcactaaacttaaaatgcctcaattttacagggactaaaaacatatttaacc 45957988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 334 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 47791808 - 47791718
Alignment:
Q  334 ttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccct 426  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||||| |||  |||| ||||||||| ||||   |||||||||||||||    
T  47791808 ttttttttaaggactaaaaaaactattaaaattaagtaaggactgaacttaaaaggtcccaattttatagggacc--gaacatatttaaccct 47791718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 335 - 423
Target Start/End: Original strand, 15131652 - 15131740
Alignment:
Q  335 tttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaac 423  Q
    |||||||| ||||||||| | | |||||||||||||||| | ||||||| |||   | | ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  15131652 tttttgtaaggactaaaacaacgattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaacatatttaac 15131740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 6 - 62
Target Start/End: Original strand, 37537487 - 37537542
Alignment:
Q  6 aattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgca 62  Q
    |||| ||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37537487 aattcaaatttggttaatt-atgcttaaactcttaagtttttgaacaattttttgca 37537542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 334 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 40304072 - 40303988
Alignment:
Q  334 ttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatat 418  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||||| |||  ||   ||||||| | ||||||||||||||    
T  40304072 ttttttatatggactaaaaacactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgtcataattttattgagaccaaaaacatat 40303988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 334 - 418
Target Start/End: Original strand, 42974605 - 42974689
Alignment:
Q  334 ttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatat 418  Q
    |||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||| | ||||||| |||  |||| ||||||||| ||  ||||||||||    
T  42974605 ttttttatatgaactaaaaacactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaaggtcccaattttatagggataaaaaacatat 42974689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 334 - 426
Target Start/End: Original strand, 43597805 - 43597897
Alignment:
Q  334 ttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccct 426  Q
    |||||| || ||||||||| | | |||||||||||||||| | || ||||||||   ||| ||||| ||| || |||||||||||||||||||    
T  43597805 ttttttttagggactaaaagaaccattaaaattaagtaaggactagacttgaaaggccccgattttttagggatcaaaaacatatttaaccct 43597897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 8082586 - 8082536
Alignment:
Q  11 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgca 62  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  8082586 aaatttgtttaatt-atgcttaaacttttgagattttgaacaattttttgca 8082536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 356 - 427
Target Start/End: Original strand, 11397295 - 11397366
Alignment:
Q  356 ctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaacccta 427  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||| |||  |||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  11397295 ctatttaaattaagtaaggactaaacttaaaaggtcccaattttattggcaccaaaaacatatttaacccta 11397366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 55
Target Start/End: Original strand, 15130711 - 15130762
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaatt 55  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  15130711 tcaatttaaatttggttaatttatgcttaaactcttaagttttttaacaatt 15130762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 335 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 25270585 - 25270502
Alignment:
Q  335 tttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatat 418  Q
    ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||  | ||||||||| | | ||||||||||    
T  25270585 tttttatatggactaaaaacactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatatttcaattttatagggtctaaaaacatat 25270502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 336 - 423
Target Start/End: Original strand, 33625730 - 33625817
Alignment:
Q  336 ttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaac 423  Q
    ||||||| ||||||||| | | |||||||||||||||| | ||||||| |||   | | ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  33625730 ttttgtaaggactaaaacaacgattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaacatatttaac 33625817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 335 - 422
Target Start/End: Original strand, 46044615 - 46044702
Alignment:
Q  335 tttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaa 422  Q
    ||||| || ||||| ||| | |||||||||||||||||| | ||||||| ||| | | | ||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  46044615 tttttataaggactgaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatacctcaattttatagggactaaaaacatatttaa 46044702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 432
Target Start/End: Original strand, 47580304 - 47580339
Alignment:
Q  397 tttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaaaa 432  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47580304 tttatagagaccaaaaacatatttaaccctaaaaaa 47580339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 344 - 430
Target Start/End: Original strand, 4900195 - 4900281
Alignment:
Q  344 ggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaa 430  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |||  || | |||||| || ||| ||| | ||||||||| ||||||    
T  4900195 ggactaaaagacctattaaaattaagtatggattaaacttaaaaggtctcaattttacagggactaaatatatatttaactctaaaa 4900281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 397 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 33654014 - 33653976
Alignment:
Q  397 tttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaaaatat 435  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33654014 tttatagggaccaaaaacatatttaaccctaaacaatat 33653976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 344 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 43574202 - 43574120
Alignment:
Q  344 ggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccct 426  Q
    ||||||||| | ||||||||| |||||||| |||| |||| |||  || | | ||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  43574202 ggactaaaagaactattaaaactaagtaaggattatacttaaaaggtctcaactttatagggactaaaaacatatttaaccct 43574120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 397 - 430
Target Start/End: Original strand, 11290585 - 11290618
Alignment:
Q  397 tttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaa 430  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11290585 tttatagggaccaaaaacatatttaaccctaaaa 11290618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 60
Target Start/End: Original strand, 43083327 - 43083384
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgag-tttttgaacaattttttg 60  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||||    
T  43083327 tcaattcaaatttgtttaatttatacttaaactcttaagtttttttaacaattttttg 43083384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 397 - 430
Target Start/End: Original strand, 43301956 - 43301989
Alignment:
Q  397 tttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaa 430  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43301956 tttatagggaccaaaaacatatttaaccctaaaa 43301989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 397 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 48154058 - 48154025
Alignment:
Q  397 tttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaa 430  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  48154058 tttatagggaccaaaaacatatttaaccctaaaa 48154025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 258; Significance: 1e-143; HSPs: 119)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 4 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 33177716 - 33177293
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  33177716 tcaatttaaatttgtttaatttatgtttaaactcttgagtttttgaacaattttttacagacgtgttaagaacattactaaaagctcctatgcaaaaaat 33177617  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
    |||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  33177616 tgtctcaaaatttgatttctacgtccagattttgttaattttatctttaacgtttgccgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaaa- 33177518  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 303  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||       |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33177517 ttctaaattttagtaaatgaacttttcatagtattctaaacttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgt 33177418  T
Q  304 tgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatag 403  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  33177417 tgtaatagggactaaaattagaagtaattcttttttgtagggactaaaaaatctattaaaattaagtatggattaaacttgaaaggtccctattttatag 33177318  T
Q  404 tgaccaaaaacatatttaaccctaa 428  Q
     || |||||||||||||||||||||    
T  33177317 ggatcaaaaacatatttaaccctaa 33177293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 4 - 431
Target Start/End: Original strand, 47309434 - 47309860
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  47309434 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttgagtttttgaacaattatttacagacatgttaagaacattaataaaagttcctatgcaaaaaat 47309533  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
    ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  47309534 tgtagcaaaatttgatttatacgtcaagattttgttaattttatctttaacttttgccattttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaaa- 47309632  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||       ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47309633 ttctaaattttagtaaatgaacctttcacagtgttctaaacttgtctcaaaaaaatcgtttaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgt 47309732  T
Q  304 tgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatag 403  Q
    || || | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  47309733 tgcaataaggactaaaattagaagtaattcttttttgtagggactaaaaaatatattaaaattaagtaaggattaaacttgaaaggtccctattttatag 47309832  T
Q  404 tgaccaaaaacatatttaaccctaaaaa 431  Q
     ||||||||| |||||||||||| ||||    
T  47309833 ggaccaaaaatatatttaacccttaaaa 47309860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 4 - 426
Target Start/End: Original strand, 53323774 - 53324196
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttg-caaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaa 102  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  || || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  53323774 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttgagtttttgaacaatttttttacatacgtgttaagaacattactaaaagttcctatgcaaaaaa 53323873  T
Q  103 ttgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnn 202  Q
    ||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||          
T  53323874 ttgtcacaaaatttgatttctacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgtcgttttaaaaaattcatatttaattcatttcatgttaaaaaa 53323973  T
Q  203 nttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttg 302  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||       |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  53323974 -ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttg 53324072  T
Q  303 ttgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttata 402  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  53324073 ttgtaatagggactaaaattagaagtaattcttttttgtaaggactaaaatttttattaaaattaagtaaagattaaacttgaaagatccctattttata 53324172  T
Q  403 gtgaccaaaaacatatttaaccct 426  Q
    | |||||||||||||||| |||||    
T  53324173 gggaccaaaaacatattttaccct 53324196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 4 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 30331573 - 30331195
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  30331573 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttgagtttttgaacaattttttacaggcgtgttaagaacattactaaaagttcctatgcaaaaaat 30331474  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||           
T  30331473 tgtcgcaaaatttgatttctacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgccgttttaaaaaattcatatttaattcgttttatgtt-aaaaaa 30331375  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||       ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  30331374 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtttcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaagaataattaaacaaactttgt 30331275  T
Q  304 tgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaactt 383  Q
    ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||  |||||||||    
T  30331274 tgtaacagggactaattttagaagtaattcttttttgtagggactaaaaaaactattaaagttaaataaagattaaactt 30331195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 4 - 429
Target Start/End: Original strand, 22068097 - 22068522
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | |||| |||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22068097 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttgagtttttgaatagttttctgcagacgtgttaagaacattactaaaagttcctctgcaaaaaat 22068196  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
    ||| |||||| |||| || |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  22068197 tgtcgcaaaatttgacttttacgtcccaattttgttaatttaatctttaacttttgccgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaaaa 22068296  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 303  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | | ||||       |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22068297 -tctaaattttagaaaatgaacctttcatagtgttctaaacatatctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgt 22068395  T
Q  304 tgtaacatggactaaaattagaagtaa-ttcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttata 402  Q
    | ||| | ||||||||||| ||||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||  ||  | || ||||||||    
T  22068396 tttaaaagggactaaaatttgaagtaattttttttttgtagggactaaaaaatctattaaaattaagtaaggactaaacttagaagtttccaattttata 22068495  T
Q  403 gtgaccaaaaacatatttaaccctaaa 429  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||    
T  22068496 gggaccagaaacatatttaaccctaaa 22068522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 6 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 28448677 - 28448268
Alignment:
Q  6 aattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattg 105  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28448677 aattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaa-cgtgttgagaacattactaaaagttcctatgcaaaaaattg 28448579  T
Q  106 ttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnntt 205  Q
    | |||||| ||||||| |||||      |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||       ||    
T  28448578 tcgcaaaatttgatttctacgt------tttgttaattttatctttaagttttgtcgttttgaaaaattcatattcaatttgtttcatgttaaaaaa-tt 28448486  T
Q  206 ctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttg 305  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||       || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28448485 gtaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaaatcattcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgttg 28448386  T
Q  306 taacatggactaaaattagaagtaattctttttt-gtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagt 404  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||  |||| |||||||||     
T  28448385 taagagggactaaaattagaagtaatttttttttggtagggactaaaaaacctattaaaattaagtaaggactaaacttagaagttcccaattttatagg 28448286  T
Q  405 gaccaaaaacatatttaa 422  Q
    | ||||||||||||||||    
T  28448285 gtccaaaaacatatttaa 28448268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 4 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 51395907 - 51395489
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||| || ||||||  | |||||||||||||||| | ||||| ||    
T  51395907 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcatgagtttttgaataatttcttgcagacgtgttaaacacattactaaaagttcctgtacaaaatat 51395808  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
    ||| |||||| || |||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||           
T  51395807 tgtcgcaaaatttaattactacatcctgattttgttaattttatctttaacttttttcgttttgaaatattcatatttaatttgtttcatgttaaaaaaa 51395708  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 303  Q
    ||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||| |||||||        |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  51395707 ttctaaattttagtaaatgaatcactcatagtgtt-taaacttgtctaaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgt 51395609  T
Q  304 tgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatag 403  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||  ||  ||||||||||||||    
T  51395608 tgtaacagggactaaaattagaagtaatt-ttttttgtagggactaaaaaacttattaaaattaagtaaggactaaacttagaagttccctattttatag 51395510  T
Q  404 tgaccaaaaacatatttaacc 424  Q
      |||||||||||||||||||    
T  51395509 gaaccaaaaacatatttaacc 51395489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 11 - 383
Target Start/End: Original strand, 55938075 - 55938447
Alignment:
Q  11 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 110  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||    
T  55938075 aaatttgtttaatttatgcttaaactcttgagtttttgaacaattttttgcagacgtgttaagaatattactaaaagtacctctgtgaaaaattgtcgca 55938174  T
Q  111 aaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaa 210  Q
    ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||       |||||||    
T  55938175 aaatttgatttctacgtgcagattttgttaattttatctttaacatttgttgttttaaaaaattcagatttaattcgttttatgtt-aaaaaattctaaa 55938273  T
Q  211 ttttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaaca 310  Q
    || ||||||| | ||||||| ||||||||||| ||| | ||       ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  55938274 ttctagtaaacg-acctttcgtagtgttctaaacttatttcaaaaaaatcgtttaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgttgtaata 55938372  T
Q  311 tggactaaaattagaagtaa--ttcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaactt 383  Q
     |||||||||||| ||||||  || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  55938373 gggactaaaattataagtaatttttttttttgtaaggactaaaaaatctattaaaattaagtaaggactaaactt 55938447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 11 - 354
Target Start/End: Original strand, 31316547 - 31316889
Alignment:
Q  11 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 110  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| || |||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  31316547 aaatttgtttaatttatgcttaaactcttgagttttttaacaattttttgtagacgtgttaaaaacattactaaaagttcctctgcaaaaaattatcgca 31316646  T
Q  111 aaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaa 210  Q
    ||| |||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||       |||||||    
T  31316647 aaatttgatttatatgtccaaattttattatttttatctttaatttttatcgttttcaaaaattcatatttaatttgtttcatgttaaaaaaattctaaa 31316746  T
Q  211 ttttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaaca 310  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||       ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||    
T  31316747 ttttagtaattgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaaatcgttcagaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgttttagca 31316846  T
Q  311 tggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaa 354  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  31316847 -ggactaaaattagaagtaatttttttttgtaaggactaaaaaa 31316889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 38 - 430
Target Start/End: Original strand, 1870140 - 1870530
Alignment:
Q  38 ttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttg 137  Q
    ||||||||||  ||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  1870140 ttgagtttttcgacaattttttgtagacatgttaaaaacattactaaaagtttctcggcaaaaaattgtcacaaaatttgatttatacgtccatattttg 1870239  T
Q  138 ttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgt 237  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||       |||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  1870240 ttacttttatctttaacttttgtcgttttaaaaaattcatatttaattcgttttatgtt-aaaaaattctaaattttagtaaatgaacattttatagtgt 1870338  T
Q  238 tctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaacatggactaaaattagaagtaattctttt 337  Q
    ||||| |||||||        |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| || || || ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  1870339 tctaaacttgtct-taaaaaatcgttcaaaaatttaatagtttaaggatagttaaacaaactttattttagcagggactaaaattagaaataattttttt 1870437  T
Q  338 ttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaa 430  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | |||  |||| ||||||||| || |||  | ||||||||||||||||    
T  1870438 ttgtaggtactaaaaaacctattaaaattaagtaaggactaaacataaaagttcccaattttatagggatcaatcaaatatttaaccctaaaa 1870530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 4 - 424
Target Start/End: Original strand, 10085485 - 10085902
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  10085485 tcaattcaaatttgtttaatttatgctaaaactcttaagtttgtgaataattttttgcagacatgtttagaacattactaaaagttcctccgcaaaaaat 10085584  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgtta-attttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnn 202  Q
    | | |||||| ||||||| ||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||          
T  10085585 tatcgcaaaatttgatttctatatcctgattttgttactttttatctttaacttttgtcgttttaaaaaattta-atttaatttgtttcatgtt--aaaa 10085681  T
Q  203 nttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttg 302  Q
     |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||| |        ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||    
T  10085682 attctaaattttagtaaatgaagatttcatagtgttctaaatttgtcacaaaaaaaccgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaaaaaaaattg 10085781  T
Q  303 ttgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttata 402  Q
    || || || |||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||| |||  |||| ||||||||    
T  10085782 ttttagcagggactaaaattataagt-atttttttttgtagggactaaaaaagctattaaaattatgtaaggactaaactttaaagttcccaattttata 10085880  T
Q  403 gtgaccaaaaacatatttaacc 424  Q
      ||||||||||||||||||||    
T  10085881 aggaccaaaaacatatttaacc 10085902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 4 - 364
Target Start/End: Original strand, 10321695 - 10322055
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  10321695 tcaattaaaatttgtttaatttatacttaaactcttaagttttttaacaattttttgtagacgtgttaagaacattactaaaagtccctccgcaaaaaat 10321794  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
    | | |||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |           
T  10321795 tatcgcaaaatttgatttatatgtccagattttattacttttatctttaacttttatcgttttcaaaaattcatatttaattcttttcatgat-aaaata 10321893  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 303  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| ||       | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10321894 ttctaaattttagtaattgaacctttcacagtgttctaaacttgtgtcaaaaaaattgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaacttttt 10321993  T
Q  304 tgtaacatggactaaaattagaagtaa-ttcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaa 364  Q
    | || || ||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  10321994 tttagcagggactaaaattagaagtaattttttttttgtagggactaaaaaacctactaaaa 10322055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 4 - 426
Target Start/End: Original strand, 19522712 - 19523134
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||  |||| ||||||||||    
T  19522712 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttgagtttttgaacaattttttacagacgtgttaagaacattactaaaaagtcctatgcaaaaaat 19522811  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
    ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||           
T  19522812 tgtcgcaaaatttgatttctacgtccagattttgttaattttatttttaacttttgccgttttaaaaaattcatatttaatttgtttcatgtt-aaaaaa 19522910  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||        ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||       
T  19522911 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtctaaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaagaataattaaacaaatttgaa 19523010  T
Q  304 tgtaacatggactaa-aattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttata 402  Q
    |  |  | || |||| | | ||     ||| || ||| || ||||||||| | | |||||||||||||||| | |||||||||||  |||||||||||||    
T  19523011 ttgaggaggggctaatagtgagtgcagatttttatttttagggactaaaagaaccattaaaattaagtaaggactaaacttgaaaggtccctattttata 19523110  T
Q  403 gtgaccaaaaacatatttaaccct 426  Q
    | ||||||||||||||||||||||    
T  19523111 gggaccaaaaacatatttaaccct 19523134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 165; E-Value: 7e-88
Query Start/End: Original strand, 4 - 293
Target Start/End: Original strand, 43938001 - 43938291
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgc-aaaaaa 102  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  43938001 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttgagtttttgaacaattttttgtagacatgttaagaacattactaaaagttcctctgcaaaaaaa 43938100  T
Q  103 ttgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnn 202  Q
    |||| |||||| || |||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| || | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||          
T  43938101 ttgtcgcaaaattttatttatacgttcagattttgttaattttttcttgaactattttcgttttaaaattttcatatttaattcgtttcatgttaaaaaa 43938200  T
Q  203 nttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaa 293  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||       ||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  43938201 attctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaagcttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagttaaaggataattaaa 43938291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 4 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 33689588 - 33689232
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| | |  ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||    
T  33689588 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagttttttaacaattttttgtagatgtgttaagaacattactaaaaattcctccgcaaaaaat 33689489  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
    | | |||||| ||| |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||           
T  33689488 tatcgcaaaatttggtttatatgtccagattttattacttttatctttaacttttatcgtttttaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaa 33689390  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 303  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||       ||||| |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  33689389 ttctaaattttagtaattgaacctttcatagtgctctaaacttgtctcaaaaaaatcgtttaaaaatttaagaatttaagaataattaaacaaactttgt 33689290  T
Q  304 tgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaa 363  Q
    | || || ||| ||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  33689289 tttagcagggattaaaattagaagta--ttttttttgtagggactaaaaaacctactaaa 33689232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 160; E-Value: 7e-85
Query Start/End: Original strand, 4 - 373
Target Start/End: Original strand, 4850094 - 4850463
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||    
T  4850094 tcaattcaaatatgtttaatttatgcttaaactcttaagtttttgaacaattttttgcatacgtgttaagaatgttactaaaaatttctccgcaaaaaat 4850193  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
    | | |||||| ||||||| |||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||           
T  4850194 tatcgcaaaatttgatttctacgtctaagttttgttatttttatctttaacttttgtcgttttaaaaaattcatattaaattcgtttcatgtt-gaaaaa 4850292  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 303  Q
    |||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||||||   ||||||       ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  4850293 ttctaaatattactaaatgaatctttcatattgttctaaatgtgtctcaataaaatcgttcaaaaattcaagagtttaagaataattaaacaaactttgt 4850392  T
Q  304 tgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggact-aaaaaacctattaaaattaagtaag 373  Q
    | || || | |||||||||| ||||||||  |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  4850393 tttagcaagaactaaaattataagtaatttatttttgtaaggactaaaaaaaactattaaaattaagtaag 4850463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 53423859 - 53423525
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  53423859 tcaattcaaatttgtttaatttatactaaa-ctcttgagtttttggacaattttttgcagacatgttaagaacattactaaaagttcctccgcaaaaaat 53423761  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-nnnnnn 202  Q
    ||| |||||| ||| || | ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||           
T  53423760 tgtcgcaaaatttgtttcacacgtccatattttgttacttttatctataacttttgccgttttaaaaaattcatatttaatttatttcatgttaaaaaaa 53423661  T
Q  203 nttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttg 302  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||        | ||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||     
T  53423660 attctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtcttaaaagaattgttaaaaaatttaagagtttaaggatagttaaacaaacttta 53423561  T
Q  303 ttgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttt 338  Q
    || || ||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  53423560 ttttagcagagactaaaattagaaataattcttttt 53423525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 43 - 424
Target Start/End: Original strand, 7490732 - 7491110
Alignment:
Q  43 tttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaat 142  Q
    ||||||||||||||||  || || ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||  ||| |  ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  7490732 tttttgaacaatttttcacagacgtgttaagcacattactaaaa-ttcctctgcaaaaaattgacgcatattttgatttctacgtccaaattttgttaat 7490830  T
Q  143 tttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaa 242  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||       | ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  7490831 tttatctttaacttttgccgttttaaaatattcatatttaattcgtttcatcttaaaaaaat-ctaaactttagtaattgaaccttttatagtgttctaa 7490929  T
Q  243 ccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaattt-aagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgt 341  Q
     |||||||        | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  7490930 acttgtctaaaaaaagttgttcaaaaattttaagagtttaaggataattaaacaaactttgttgtaacagggactaaaattaaaagtaat--ttttttgt 7491027  T
Q  342 atggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaacc 424  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||  ||| ||   ||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  7491028 aaggactaaaaaacctattaaaattaagtaaagaataaactttgaaattcttaattttatagggactaaaaacatatttaacc 7491110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 76 - 421
Target Start/End: Original strand, 47463436 - 47463780
Alignment:
Q  76 tattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattc 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  47463436 tattactaaaagttcctctgcaaaaaattatcacaaaatttgatttctacgtccatattttgttaattttatctttaatttttactgttttaaaaaattc 47463535  T
Q  176 atatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgtt---ctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaattt 272  Q
    |||||||||| |||| |||||        | ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||       ||||| ||||||||    
T  47463536 atatttaatttgtttaatgttaaaaaaaat-taaattttagtaaatgaacctttcatagtgttgttctaaacttgtctcaaaaaa-tcgttaaaaaattt 47463633  T
Q  273 aagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaa 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||  ||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47463634 aagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaacaaaaactaaaattagaagtaat--tttttttaagggattaaaaaacctattaaaattaagtaa 47463731  T
Q  373 gaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatattta 421  Q
    | | |||||| | ||  |||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  47463732 ggactaaactcggaagttcccaattttataaggaccaaaaacatattta 47463780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 20178170 - 20177934
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  20178170 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaattcttgggttattgaacaattttttacatacatgttaagaacattactaaaagttcctctacaaaaaat 20178071  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||           
T  20178070 tgtcgcaaaatttgatttatacgtccagattttgttacttttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcttgttaaaaaat 20177971  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaa 242  Q
    |  |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  20177970 t--taaattttagtaaatgaaccttccatattgttctaa 20177934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 4 - 364
Target Start/End: Original strand, 25422067 - 25422422
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| |||| ||||||| | || ||||||||| ||||||||||| || || |||||||||    
T  25422067 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttaagttttttaacatttttttgtagacgtgttaagaacattactaaaagatcatccgcaaaaaat 25422166  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
    | | |||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||           
T  25422167 tatcgcaaaatttgatttatatgtccagatttt-ttacttttatctttaacatttatcgttttcaaaaattcatatttaattcgttttatgtt-aaaaaa 25422264  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 303  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||       ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25422265 ttctaaattttagtaattgaacctttgatagtgttctaaacttgtctcaaaaaaatcgtttaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgt 25422364  T
Q  304 tgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaa 364  Q
    | || || ||||||||| || ||||||    ||||| || ||||||||||||||| |||||    
T  25422365 tttagcagggactaaaaataaaagtaa---atttttttagggactaaaaaacctactaaaa 25422422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 4 - 354
Target Start/End: Original strand, 51876007 - 51876350
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  51876007 tcaatttaaatttgtttaatttatgcttaaactcttgagtttttgaacaattttttagagacgtgttaagaacattactaaaagttcctctgcaaaaaat 51876106  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatc-tttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnn 202  Q
    | |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||          
T  51876107 tatcacaaaatttgatttatacgtccagattttgttaattttatcttttaacttttaccgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaac 51876206  T
Q  203 nt-tctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaacttt 301  Q
     | ||||||||||| ||||||||| ||||| | |||| ||| |||||||        |||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||        
T  51876207 ttgtctaaattttaataaatgaacatttcacattgttataaacttgtctaaaaaaattcgttcaaaagtttaagagtttaagaataattaatcaaa---- 51876302  T
Q  302 gttgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaa 354  Q
         | ||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  51876303 -----accagagactaaaattagaagtaatttttttttgtagggactaaaaaa 51876350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 204 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 7617514 - 7617293
Alignment:
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||        |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7617514 ttctaaattttagtaaatgaacctttcataatgttttaaacttgtcttaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgt 7617415  T
Q  304 tgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatag 403  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||     
T  7617414 tgtaataaggactaaaattagaagtaattcttttttgtagggactaaaaaatctattaaaattaagtaaggattaaacttgaaatatctctattttatat 7617315  T
Q  404 tgaccaaaaacatatttaaccc 425  Q
     || ||||||||||||||||||    
T  7617314 ggatcaaaaacatatttaaccc 7617293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 4 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 47379471 - 47379053
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| | |||||| |||||| ||| |   ||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||    
T  47379471 tcaattcaaatttgtttaatt-atgcttatactcttaagttttcgaaaatgcttttgcagacgtgttaagaacaatactaaaagttcctccgcaaaaaat 47379373  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagatttt-gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnn 202  Q
    | | |||||| ||||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||| |  ||||||  ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||          
T  47379372 tatcgcaaaatttgatttctacgtccatatttttgttacttttatcttgacgttttgtcattttaaaaaatacatatttaattcatttcat-ttttaaaa 47379274  T
Q  203 nttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttg 302  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||       ||| |||||| ||  |||||||||  |||||||||||||||| |    
T  47379273 attctaaattttagtaaatgaacctttcatagtattctaaacttgtctcaaaatattcgctcaaaattt--agagtttaagtataattaaacaaacttcg 47379176  T
Q  303 ttgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttata 402  Q
    |  || ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||  ||  ||||  |||||||    
T  47379175 tattagcatggactaaaattataagtaattttttttggtagggactaaaaaaactattaaaattaagtaaggactaaacttagaagttcccagttttata 47379076  T
Q  403 gtgaccaaaaacatatttaaccc 425  Q
    | ||||| |||||||||||||||    
T  47379075 gggaccagaaacatatttaaccc 47379053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 77 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 3873374 - 3873134
Alignment:
Q  77 attactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattca 176  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  3873374 attactaaaagttcctatgcaaaaaattgtcgcaaaatttgatttctacgtacaggttttgttaattttatctttaactttttccgttttaaaaaattca 3873275  T
Q  177 tatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaaga 276  Q
    ||||||||| ||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||       |||||||||||| |||||    
T  3873274 tatttaatttgtttcatgtt-aaaaaattctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaatgtaaga 3873176  T
Q  277 gtttaaagataattaaacaaactttgttgtaacatggactaa 318  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  3873175 gtttaaggataattaaacaaattttgttgtaacaaggactaa 3873134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 4 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 13718271 - 13718078
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaa-acatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaa 102  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13718271 tcaatttaaatttgtttaatttatgcttaaactcttgagttttttaacaatttttttccagacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaa 13718172  T
Q  103 ttgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt 196  Q
    |||| |||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13718171 ttgtcgcaaaatttgatttctacgtcctgattttgttaattttatcttgatcttttgtcgttttaaaaaattcatatttaatgcgtttcatgtt 13718078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 4 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 38114507 - 38114273
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  38114507 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttgagttttttaacaaatttttacagacgtgttaagaacattactaaaagttcctatgcaaaaaat 38114408  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
    |||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  38114407 tgtcacaaaatttgatttatatgtccagattttgttaattttatctttaacttttgccgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaaat 38114308  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttc 239  Q
    || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||    
T  38114307 tt-taaattttagtaaatgaacatttcctagcgttc 38114273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 260 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 38114277 - 38114125
Alignment:
Q  260 cgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctat 359  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38114277 cgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgttgtaacagggactaaaattagaagtaattcttttttgtatgaactaaaaaacctat 38114178  T
Q  360 taaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaa 412  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  38114177 taaaattaagtaaggattaaacttgaaaggtccctattttatagggaccaaaa 38114125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 23473766 - 23473360
Alignment:
Q  11 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaatttttt-gcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgc 109  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| |||||||| | | || ||| |||||  |||| |||||||||||||||||||||| | ||    
T  23473766 aaatttgtttaatttatgcttaaagtcttaagtttttgaataatttttttgtagacgtgtcaagaacgttaccaaaagttcctctgcaaaaaattatcgc 23473667  T
Q  110 aaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaa 209  Q
    |||| ||||||  || ||||||||||| ||| || ||||||||| |||||  || || ||||| |||||||||||| ||||||||||       || |||    
T  23473666 aaaatttgattcttatgtccagattttattacttatatctttaatttttgacgtatttaaaaactcatatttaatttgtttcatgttaaaaaattt-taa 23473568  T
Q  210 attttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaac 309  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||       |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || |    
T  23473567 attttagt-aatgaacctttcacagtgttctaaacttatctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaccgataattaaacaaactttgttttagc 23473469  T
Q  310 atggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgacca 409  Q
    | |||||||||||| |||||||| |||| |  |   |||||||||  |||||||||||| |||  | ||||||| |||  |||| ||||||||  ||| |    
T  23473468 agggactaaaattaaaagtaatttttttataaa---actaaaaaaattattaaaattaaataaatactaaacttaaaagttcccaattttataaagacta 23473372  T
Q  410 aaaacatattta 421  Q
    ||||||||||||    
T  23473371 aaaacatattta 23473360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 204 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 3862585 - 3862360
Alignment:
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnn-tcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttg 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||        ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  3862585 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatcgcattctaaacttgtctcaaaaaaaatcgttaaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaattttg 3862486  T
Q  303 ttgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttata 402  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||  || ||||||||||    
T  3862485 ttgtaacagggactaaaattagaagtaattcttttttgtagggactaaaaaa-ctattaaaattaagtaaggattaaacttaaaaggtctctattttata 3862387  T
Q  403 gtgaccaaaaacatatttaaccctaaa 429  Q
      ||| ||||||||||||||| |||||    
T  3862386 aggacaaaaaacatatttaactctaaa 3862360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 204 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 3871342 - 3871117
Alignment:
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnn-tcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttg 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||        ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  3871342 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatcgcattctaaacttgtctcaaaaaaaatcgttaaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaattttg 3871243  T
Q  303 ttgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttata 402  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||  || ||||||||||    
T  3871242 ttgtaacagggactaaaattagaagtaattcttttttgtagggactaaaaaa-ctattaaaattaagtaaggattaaacttaaaaggtctctattttata 3871144  T
Q  403 gtgaccaaaaacatatttaaccctaaa 429  Q
      ||| ||||||||||||||| |||||    
T  3871143 aggacaaaaaacatatttaactctaaa 3871117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 108 - 367
Target Start/End: Original strand, 11670210 - 11670469
Alignment:
Q  108 gcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttct 207  Q
    |||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||       ||||    
T  11670210 gcaaaatttgatttatatgtccatattttattacttttatctttaacttttattgttttcaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaaa-ttct 11670308  T
Q  208 aaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgta 307  Q
    |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||       |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  11670309 aaattttattaattgaacctttcgtagtgttctaaacttgtctcaaaaaattcgttcaaaattttaagagtttaaggataattaaacaaactttgtttta 11670408  T
Q  308 acatggactaaaattagaagtaattct-tttttgtatggactaaaaaacctattaaaatta 367  Q
      | ||||||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||||| ||| ||||||||    
T  11670409 gtagggactaaaattagaagtaattttgtctttgtagggactaaaaaaactactaaaatta 11670469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 49 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 42972983 - 42972728
Alignment:
Q  49 aacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatc 148  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||| | |||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  42972983 aacaattttttgcagacgtgttaagaacattgctaaa-gttccactgcaaaaaattgtcgtaaaatttgatttctacgtccaaattttgttaattttatc 42972885  T
Q  149 tttaacttttgttgttttaa-aaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttg 247  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||       || |   ||||  ||||||||||||||||||| |||||| || |    
T  42972884 tttaacttttgttgttttaacaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaaaatttt--tttttgataaatgaacctttcatagtattctaaactcg 42972787  T
Q  248 tctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgt 306  Q
    |||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42972786 tcttaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgt 42972728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 4 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 53571824 - 53571514
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||| | || ||||||||| |||| |||||||||| | ||||||       
T  53571824 tcaattcaaatttgtttaatttattcttaaactcttaagttttttaacaattttttgtagacgtgttaagaacattattaaaagttccgccgcaaaat-- 53571727  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
               |||||||||| || || ||||| ||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||| |||||||||||||||||||||           
T  53571726 -----------ttgatttatatgtacatattttattacttttatctttaacttttattattttcaaaaatttatatttaattcgtttcatgttaaaaaa- 53571639  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 303  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||       |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  53571638 ttctaaattttattaattgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaattcgttcaaaaatttaagagtttaaggatgattaaacaaactttgt 53571539  T
Q  304 tgtaacatggactaaaattagaagt 328  Q
    | ||  | |||||||||||||||||    
T  53571538 tttagtagggactaaaattagaagt 53571514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 11 - 426
Target Start/End: Original strand, 48082450 - 48082866
Alignment:
Q  11 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 110  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| || || |||||||||  ||| |||||| || || | |||||| | | |||    
T  48082450 aaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagtttttcaacaattttttacagacgtgttaagaacgttattaaaaggtcatccg-aaaaaaatatcgca 48082548  T
Q  111 aaaa-ttgatttatacgtccaga-ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttcta 208  Q
    |||| ||||||| |||||||| | |||||||| || |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||||       || ||    
T  48082549 aaaatttgatttctacgtccatatttttgttatttatatcttaaacttttgtcgttttataaaattcatatttaatttatttcatgtt-aaaaaattata 48082647  T
Q  209 aattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaa 308  Q
     ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |        ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| || ||     
T  48082648 gatttttgtaaatgaaccgttcatagtgttctaaacttgtataaaaagaatcgttaaaaaatttaagagtttaaggataattaagcaaaatttattttag 48082747  T
Q  309 catggactaaaattagaagt-aattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgac 407  Q
    ||  ||||||||||| |||| |||| ||| ||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| | | |||||  ||  || | ||||||||| |||    
T  48082748 cagagactaaaattataagtaaattttttcttgtagggattaaaagagctattaaaattaagtaaggacttaacttagaaggtcgcaattttatagggac 48082847  T
Q  408 caaaaacatatttaaccct 426  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  48082848 caaaaacataattaaccct 48082866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 4 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 44209777 - 44209470
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| || ||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||    
T  44209777 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttaagttttttaataattttttgtagacgtgttaagaacattactaaaagttcgtacgcaaaaaat 44209678  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
    | | |||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||             || |||||| |||||||||||| |||| ||||           
T  44209677 tatcgcaaaatttgatttatatgtccagattttattacttttatcctt-------------ttcaaaaatacatatttaattcttttcgtgttaaaaga- 44209592  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 303  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||       |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44209591 ttctaaattttagtaattgaatctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgt 44209492  T
Q  304 tgtaacatggactaaaattaga 325  Q
    | |  || ||||||||||||||    
T  44209491 tttcgcaaggactaaaattaga 44209470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 426
Target Start/End: Original strand, 44289684 - 44290088
Alignment:
Q  11 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 110  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| || || |||||||||  ||| |||||| || || | |||||| | | |||    
T  44289684 aaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagtttttcaacaattttttacagacgtgttaagaacgttattaaaaggtcatccg-aaaaaaatatcgca 44289782  T
Q  111 aaaa-ttgatttatacgtccaga-ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttcta 208  Q
    |||| ||||||| |||||||| | |||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||       || ||    
T  44289783 aaaatttgatttctacgtccatatttttgttacttatatcttaaacttttgtcgttttaaaaaattcatatttaatttatttcatgtt-aaaaaattata 44289881  T
Q  209 aattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaa 308  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |        ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| || |      
T  44289882 gattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtataaaaagaatcgttaaaaaatttaagagtttaaggataattaagcaaaatttatttt-- 44289979  T
Q  309 catggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaactt-gaaaaatccctattttatagtgac 407  Q
              | ||| |||||| | ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||   || | ||||||||| |||    
T  44289980 ----------agttataagtaaattttttttgtagggattaaaaaagctattaaaattaagtaaggactaaacttagaagggtcgcaattttatagggac 44290069  T
Q  408 caaaaacatatttaaccct 426  Q
    |||||||||||||||||||    
T  44290070 caaaaacatatttaaccct 44290088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 4 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 35061120 - 35060875
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||| | || ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||    
T  35061120 tcaattcaaatttgtttaatttattctaaaactcttaagatttt-aacaattttttgtagacgtgttaagaacattattaaaagttcctccgcaaaaaat 35061022  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
    | | |||||| ||||||||||  |||||||||| ||| |||||| |||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||           
T  35061021 tatcgcaaaatttgatttatatatccagattttattacttttatttttaacttttatcgttttcaaaaaatcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaa 35060923  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctc 251  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||| |||| ||||| ||||||||    
T  35060922 ttctaaattttagtaattgaatatttcaaagtgctctaaacttgtctc 35060875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 4 - 193
Target Start/End: Original strand, 37329487 - 37329678
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||| | ||||| |||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  37329487 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttaaattttttaacaattttttgtagacgtgttaagaacattactaaaagttcatccgcaaaaaat 37329586  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatt--tatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcat 193  Q
    | |||||||| || |||  ||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37329587 tattgcaaaatttaatttatatatatccagattttattacttttatctttaacttttatcgttttcaaaaattcatatttaattcgtttcat 37329678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 259 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 13718035 - 13717868
Alignment:
Q  259 tcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaaccta 358  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||| ||    
T  13718035 tcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaacttttttgtaacatggactaaaattagaagtaaatcttttttgtagggattaaataacgta 13717936  T
Q  359 ttaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccct 426  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||  ||  |||| ||||||||   || ||||| ||||||||||||    
T  13717935 ttaaaattaagtaaggattaaatttagaagttcccaattttataagaacaaaaaatatatttaaccct 13717868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 259 - 424
Target Start/End: Original strand, 45557893 - 45558058
Alignment:
Q  259 tcgttcaaaaattt-aagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacct 357  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||   ||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45557893 tcgttcaaaaattttaagagtttaaggataattaaacaaatgctgtagtaacaagcactaaaattagtagtaattcttttttgtatggact-aaaaacct 45557991  T
Q  358 attaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaacc 424  Q
    |||||||||||||| |  |||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45557992 attaaaattaagtagggtttaaacttaaaaactcccaattttatagggaccaaaaacatatttaacc 45558058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 317 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 3873028 - 3872916
Alignment:
Q  317 aaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacat 416  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  3873028 aaaattagaagtaattcttttttgtagggactaaaaaacctattaaaattaagtaaggattaaacttaaaaggtccctattttatagggaccaaaaacat 3872929  T
Q  417 atttaaccctaaa 429  Q
    |||||||||||||    
T  3872928 atttaaccctaaa 3872916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 6 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 52948054 - 52947636
Alignment:
Q  6 aattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattg 105  Q
    |||| |||||||||||||| ||| | |||||||||| |||||||||||||||||  | |  |||| | || ||||||||||||| |||  | |||||||     
T  52948054 aattcaaatttgtttaatt-atgtttaaactcttgaatttttgaacaattttttatatatgtgttcaaaacattactaaaagttgctccccgaaaaatta 52947956  T
Q  106 ttgcaaaaattgatttatacgtccaga-ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnt 204  Q
     | ||||||||||||| |||| ||| | |||||| | ||||||||| || ||||||  ||| |||||||||||||||||||  | |||||||       |    
T  52947955 gttcaaaaattgatttctacgaccaaacttttgtgacttttatcttgaaattttgtcattt-aaaaaattcatatttaatttatctcatgttaaaaaaat 52947857  T
Q  205 tctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtct-cnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 303  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||   ||||| |       |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||  |    
T  52947856 tctaaattttagtaaatgaactttttataatgttctaaaagtgtctccaaaaaaatcgttctaaaatttaacagtttaaggataattaaataaatttaat 52947757  T
Q  304 tgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatag 403  Q
    | || || |||||||||||| | |||||  |||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||  |   | || |||||||||    
T  52947756 tttagcagggactaaaattatatgtaat--ttttttatagggattaaaaaagctattaaaattaagtaaggactaaacttagatgtttccaattttatag 52947659  T
Q  404 tgaccaaaaacatatttaaccct 426  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  52947658 ggaccaaaaacatatttaaccct 52947636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 5 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 48220180 - 48219785
Alignment:
Q  5 caattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaatt 104  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||| |||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||    
T  48220180 caattcaaatttgtttaatt-atgcttaaactcttatgttttttaacattcttttgcagatatgttaagaacattactaaaaattcctccgcaaaaaatt 48220082  T
Q  105 gttgcaaaaattgatttatacgtccagatttt-gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
     ||| |||| || |||| ||| |||| ||||| |||| |||||| || || ||||||  |||||||| ||||||||||||||  |||| ||||           
T  48220081 attgtaaaatttaatttctacatccaaatttttgttacttttatattgaa-ttttgtcattttaaaacattcatatttaattaatttcttgtt-aaaaaa 48219984  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 303  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| | ||  |        ||||| |||| ||||||||||| |  |||||| || |||||||||    
T  48219983 ttctaaattttaacaaatgaacctttcataatgttctaaacgtgcttaaaaaagatcgttgaaaattttaagagttt-agtataatttaagaaactttgt 48219885  T
Q  304 tgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatag 403  Q
    | || || |||||||||||| || ||| | ||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||| || | ||||||| |||| |||| |||||||||    
T  48219884 tttagcagggactaaaattataaataaatttttgttgtaaggactaaaaaagctattaaatttaagtgaggactaaacttaaaaattcccaattttatag 48219785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 44 - 422
Target Start/End: Original strand, 38499327 - 38499705
Alignment:
Q  44 ttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaatt 143  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  |  ||||| || |||| || ||||||||||| ||| ||    
T  38499327 ttttgaacaattttttgcagaagtgttaagaacattactaaaagttcatctgcaaaaaataatctcaaaattttatttctatgtccagatttttttactt 38499426  T
Q  144 ttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaac 243  Q
    ||||||| ||||  |||  ||| |||| ||||||||||||||| |||||||||        | |||||||||||||| ||||||||  || | || |||     
T  38499427 ttatcttgaactcatgtcttttaaaaatattcatatttaattcatttcatgttaaaaaaaatttaaattttagtaaacgaaccttttgtaatattataaa 38499526  T
Q  244 cttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtat 343  Q
    ||||| |        |||||  || |||||| ||||||| |||||||| | |||||||||| ||| | |||||||||  | | |||| |  ||||| ||     
T  38499527 cttgtttaaaaaaaatcgttttaagatttaatagtttaaggataattagagaaactttgttttaatagggactaaaacaacatgtaaattatttttatag 38499626  T
Q  344 ggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaa 422  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||  ||  |||  ||||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  38499627 ggactaaaaaaactattaaaattaagtaaggactaaacttagaagttccaaattttatagggaccacaaatatatttaa 38499705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 261 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 20177885 - 20177772
Alignment:
Q  261 gttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaacatggactaaaattagaagtaattcttt-tttgtatggactaaaaaacctat 359  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||    
T  20177885 gttcaaaaatttaagagattaagaataattaaacaaattttgttgtaacagtgactaaaattagaagtaattttttgtttgtagggactaaaaaacctat 20177786  T
Q  360 taaaattaagtaag 373  Q
    ||||||||||||||    
T  20177785 taaaattaagtaag 20177772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 35821131 - 35821357
Alignment:
Q  11 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 110  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| | |||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||           |    
T  35821131 aaatttgtttaatttatacttaaactcttaaatttt-gaacaattttttgcagacgtgttaagaacattactaaaagttcctctgcaa-----------a 35821218  T
Q  111 aaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaa 210  Q
    |||||| ||   |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||| |||  ||||||||||       || ||||    
T  35821219 aaaatt-atcgctacgtccagattttattaattttatttttaagttttgtcgttttataaaattcatattcaataagtttcatgttaaaaaaattgtaaa 35821317  T
Q  211 ttttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtct 250  Q
    || ||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||    
T  35821318 ttctagtatatgaacctttcatgatgttctaaacttgtct 35821357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 6 - 372
Target Start/End: Original strand, 13603785 - 13604150
Alignment:
Q  6 aattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattg 105  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| | || ||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||     
T  13603785 aattcaaatttgtttaatt-atgcttaaactcttaagtttt-gaacaattttttgcagatattttatgaacattactaaaagttcctccgcaaaaattta 13603882  T
Q  106 ttgcaaaaattgatttatacgtccagatttt-gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnt 204  Q
    |  |||||  |||||| ||  |||| ||||| |||| ||||| ||||||    | | |||| ||| |||||||||||||||  ||||| |||       |    
T  13603883 tctcaaaatgtgatttttatatccaaatttttgttacttttaactttaaaaaatttcgtttaaaagaattcatatttaatttatttcaagttaaaaa--t 13603980  T
Q  205 tctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaa-atttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 303  Q
    | | ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| |||||||        || || |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13603981 tatgaattttagtaaatgaaccttttataatgttataaacttgtctaaaaaatatcattaaaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgt 13604080  T
Q  304 tgtaacatggactaaaattagaagt-aattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaa 372  Q
    | || || ||| |||||||| | || |||  ||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||    
T  13604081 tttagcagggattaaaattacatgtaaatatttttttgtagggactaaaaatgttattaaaattaagtaa 13604150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 137 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 20650666 - 20650421
Alignment:
Q  137 gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtg 236  Q
    |||| ||||||||| |||||||||   || ||| |||||||||||||||| |||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||| |  ||    
T  20650666 gttacttttatcttgaacttttgtctattaaaataattcatatttaattcatttcatgttaaaaaa-ttctaaattttagtaaatgaatctttcgtgatg 20650568  T
Q  237 ttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaacatggactaaaattagaagtaattcttt 336  Q
    ||| || |||||| |       ||| | |||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | ||||||  ||    
T  20650567 ttccaaacttgtcccaagaaaatcgctaaaacttttaagattttaaagataattaaacaaactttgttttagtagggactaaaattacatgtaatttgtt 20650468  T
Q  337 tttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaactt 383  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||| |||| || | |||||||    
T  20650467 tttgtagggactaaaaaagctattaaaataaagtgaggactaaactt 20650421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 34513305 - 34513123
Alignment:
Q  11 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 110  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||| |  ||| ||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||| |  ||    
T  34513305 aaatttgtttaatt-atgcttaaacttttaagattttgaacaattttttgcacaagtgtcaagaacattacgaaaagttcatctccaaaaaattatctca 34513207  T
Q  111 aaaattgatttatacgtccaga-ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatg 194  Q
    ||| || |||| | |||||||| |||||||| |||||| || |||||||||  ||| |||||||||||||||||||  |||||||    
T  34513206 aaattttatttctgcgtccagatttttgttacttttat-ttaaacttttgtcttttaaaaaaattcatatttaatttatttcatg 34513123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 422
Target Start/End: Original strand, 55283115 - 55283525
Alignment:
Q  11 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 110  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||| |||||| ||||| | || | ||||||| ||||| |||||| ||||| ||||| |||    ||    
T  55283115 aaatttgtttaatt-atgcttaaattcttgaatttttaaacaatcttttgtacacctattaagaacattacgaaaagtccctctacaaaatattaactca 55283213  T
Q  111 aaaattgatttatacgtccagatttt-gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaa 209  Q
    ||| ||||||| ||||| |||||||| |||| | || |||| ||||||||| |||| ||||||| ||||||||| || | || | ||       | |||     
T  55283214 aaatttgatttctacgttcagatttttgttactcttttcttgaacttttgtcgtttaaaaaaat-catatttaaatcttctcctattaaaaaaat-ctat 55283311  T
Q  210 attttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaac 309  Q
     |||||| |||||||| ||| ||| |||||||| | ||||||       |||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||| || ||| | |     
T  55283312 tttttagcaaatgaacattttataatgttctaaacatgtctcctaaaaatcgttcaaaaatttaagaattcaagaataattaaacaaatttagtttttag 55283411  T
Q  310 atggactaaaattagaagtaattct-tttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgacc 408  Q
    | |||||||||||| | || ||| | |||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||  | |||||||  ||  | || ||||||||  ||||    
T  55283412 aaggactaaaattacatgttattttatttttgtagggactaaaaatattattaaaattaagtaaagactaaacttagaagtttccaattttatacggacc 55283511  T
Q  409 aaaaacatatttaa 422  Q
    ||||||||||||||    
T  55283512 aaaaacatatttaa 55283525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 7617611 - 7617535
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatatta 80  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||    
T  7617611 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttgagtttttgaacaattttttacagacatgttaagaacatta 7617535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 344 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 19522674 - 19522586
Alignment:
Q  344 ggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaaaa 432  Q
    ||||||||| | | |||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19522674 ggactaaaagaaccattaaaattaagtaaggactaaacttgaaaaacctctattttatagggaccaaaaacatatttaacccaaaaaaa 19522586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 248
Target Start/End: Original strand, 44452093 - 44452328
Alignment:
Q  11 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 110  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||| |  | ||||||| || || |||||||  |||||||||| || |  ||    
T  44452093 aaatttgtttaatt-atgcttaaacttttaagattttgaacaattttttgcacaagtattaagaacatcacgaaaagtttatctgcaaaaa-ttatctca 44452190  T
Q  111 aaaattgatttatacgtccagatttt-gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaa 209  Q
    ||| || |||  | |||||||||||| |||| |||||| || |||||||||  ||| |||||||||||||||||||  |||||||||       ||||||    
T  44452191 aaattttattcctgcgtccagatttttgttacttttattttgaacttttgtcttttaaaaaaattcatatttaatttatttcatgtt-aaaaaattctaa 44452289  T
Q  210 attttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgt 248  Q
    ||||||||||| ||||||||  || |||||||| |||||    
T  44452290 attttagtaaacgaacctttagtaatgttctaaacttgt 44452328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 3873468 - 3873397
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaa 75  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  3873468 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttgagtttttgaacaattttttacaggcatgttaagaa 3873397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 334 - 424
Target Start/End: Original strand, 38114534 - 38114624
Alignment:
Q  334 ttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaacc 424  Q
    |||||| || ||||||||| | | |||||||||||||||  |||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38114534 ttttttttagggactaaaagaaccattaaaattaagtaatgattaaacttgaaaggtccttattttatagggaccaaaaacatatttaacc 38114624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 344 - 425
Target Start/End: Original strand, 52948093 - 52948174
Alignment:
Q  344 ggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccc 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||| |||   ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  52948093 ggactaaaaaacctattaaaattaagtaaggactaatcttaaaagatcttaattttatagggaccaaaaacatatttaaccc 52948174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 346 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 7490657 - 7490577
Alignment:
Q  346 actaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccct 426  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| || |||||| || |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7490657 actaaaagaactattaaaattaagtaaggataaaacttaaagaatccaaattttatagggaccaaaaacatatttaaccct 7490577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 334 - 426
Target Start/End: Original strand, 23473803 - 23473894
Alignment:
Q  334 ttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccct 426  Q
    ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||| |||| || | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  23473803 ttttttgtagggactaaagaac-tattaaaattaagtaaggactaaacttcaaaagtctcgattttatagggactaaaaacatatttaaccct 23473894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 261 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 35351672 - 35351552
Alignment:
Q  261 gttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctatt 360  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||  ||| |||||||||| ||||| || ||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||||||  | ||    
T  35351672 gttcaaaaatttaagactttaagaataa--aaaaaaactttgttttaacaagggctaaaattacatgtaatttttttttgtaaggactaaaaaaaatgtt 35351575  T
Q  361 aaaattaagtaagaattaaactt 383  Q
    ||||||||| ||| | |||||||    
T  35351574 aaaattaagcaaggactaaactt 35351552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 360 - 430
Target Start/End: Original strand, 3873519 - 3873589
Alignment:
Q  360 taaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaa 430  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3873519 taaaattaagtaaaaactaaacttaaaaggtccatattttatagggaccaaaaacatatttaaccctaaaa 3873589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 334 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 4850066 - 4849968
Alignment:
Q  334 ttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaaaa 432  Q
    |||||| || ||||||||| | ||||| |||||||| ||| ||||||||| |||  || | ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  4850066 ttttttttagggactaaaagaactatttaaattaagcaaggattaaacttaaaaggtctcaattttatagggatcaaaaacatatttaaccctaaaaaa 4849968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 336 - 430
Target Start/End: Original strand, 6589096 - 6589190
Alignment:
Q  336 ttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaa 430  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||||  |  ||||| ||||| | | ||||||||||||||||||||||||||    
T  6589096 ttttgtagggactgaaaaagctattaaaattaagtaaggactaaacttagaggatcccaattttgtcgggaccaaaaacatatttaaccctaaaa 6589190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 344 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 35821088 - 35821030
Alignment:
Q  344 ggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttata 402  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  35821088 ggactaaaaaaactattaaaattaagtatgaattaaacttgaaagatcccaattttata 35821030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 28164010 - 28163777
Alignment:
Q  11 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 110  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || |  ||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||| |  |     
T  28164010 aaatttgtttaatt-atgcttaaacttttaaaattttgaacaattttttgcaca-gtgttaagaacattacgaaaagttcatctccaaaaaattat--ct 28163915  T
Q  111 aaaattgatttatacgtccaga-ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaa 209  Q
     || || |||| | | |||||| |||||||| |||||| || |||||||||  ||| |||||||||||||| ||||  ||||||| |       ||||||    
T  28163914 caattttatttctgcttccagatttttgttacttttattttcaacttttgtcttttaaaaaaattcatattaaatttatttcatgct-aaataattctaa 28163816  T
Q  210 attttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgt 248  Q
    ||||||||||| ||||||||  || |||||||| |||||    
T  28163815 attttagtaaacgaaccttttgtaatgttctaaacttgt 28163777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 424
Target Start/End: Original strand, 28448718 - 28448799
Alignment:
Q  344 ggactaaaaaacctatt-aaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaacc 424  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| | |||||||||||  |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  28448718 ggactaaaaaaactatttaaaattaagtaaggactaaacttgaaaggtcccaattttatagggacaaaaaacatatttaacc 28448799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 4 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 11670929 - 11670873
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttg 60  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  11670929 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagttttttaacaattttttg 11670873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 334 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 13508840 - 13508756
Alignment:
Q  334 ttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatat 418  Q
    |||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||| | ||||||| |||  |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  13508840 ttttttatatggactaaaagcactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaaggtcccaattttatagggaccaaaaacatat 13508756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 334 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 48738481 - 48738397
Alignment:
Q  334 ttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatat 418  Q
    |||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  48738481 ttttttatatggactaaaagcactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaagatctcaattttatagggaccaaaaacatat 48738397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 344 - 431
Target Start/End: Original strand, 14579061 - 14579148
Alignment:
Q  344 ggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaaa 431  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||  ||   ||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||    
T  14579061 ggactaaaaaagctattaaaattaagtaaggactaaacttagaagtacccaattttatagagatcaaaaacatatttaaccttaaaaa 14579148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 347 - 422
Target Start/End: Original strand, 53423895 - 53423970
Alignment:
Q  347 ctaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaa 422  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  53423895 ctaaaataactattaaaattaagtaagaactaaacataaaatatctcaattttatagagaccaaaaacatatttaa 53423970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 334 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 53569127 - 53569036
Alignment:
Q  334 ttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccc 425  Q
    ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||| |||  || | |||||||||  || |||||||||||||||||    
T  53569127 ttttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgtctcaattttataggaactaaaaacatatttaaccc 53569036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 346 - 424
Target Start/End: Original strand, 33177754 - 33177832
Alignment:
Q  346 actaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaacc 424  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |||| | |||| || |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33177754 actaaaaaaaccattaaaattaaataaggactaaatttaaaaaactcctattttatagggaccaaaaacatatttaacc 33177832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 35351822 - 35351735
Alignment:
Q  142 ttttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaaccttt 229  Q
    ||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||| || ||||||       || |||||||||||||||||||||||    
T  35351822 ttttatcttgaacttttgttgatgaaaaaaattcatatttaattcattacatgttacaaaaattttaaattttagtaaatgaaccttt 35351735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 53570980 - 53570890
Alignment:
Q  335 tttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccc 425  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||| |||   | | ||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  53570980 tttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaacatatttaaccc 53570890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 425
Target Start/End: Original strand, 53571852 - 53571942
Alignment:
Q  335 tttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccc 425  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||| |||   | | ||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  53571852 tttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaacatatttaaccc 53571942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 334 - 418
Target Start/End: Original strand, 28164045 - 28164128
Alignment:
Q  334 ttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatat 418  Q
    |||||| ||||||||||||   ||||||||||||||| || | ||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  28164045 ttttttatatggactaaaagcactattaaaattaagttaggactaaactt-aaaagtcccaattttatagggaccaaaaacatat 28164128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 422
Target Start/End: Original strand, 30331611 - 30331690
Alignment:
Q  345 gactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctatttt--atagtgaccaaaaacatatttaa 422  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| | | ||||| |||  ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  30331611 gactaaaaaaactattaaaattaagtaaggactgaacttaaaaggtccctattttaaatagggaccaaaaacatatttaa 30331690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 334 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 47309407 - 47309319
Alignment:
Q  334 ttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaa 422  Q
    |||||| || ||||||||| | | |||||||||||||||| | ||||||||||| | || |||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  47309407 ttttttttagggactaaaagaaccattaaaattaagtaaggactaaacttgaaagacccttattttatagggacaaaatacatatttaa 47309319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 334 - 426
Target Start/End: Original strand, 47379498 - 47379590
Alignment:
Q  334 ttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccct 426  Q
    |||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||   |||||||  ||  |||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  47379498 ttttttataggggctaaaaaaactattaaaattaagtaagggctaaacttagaaggtcccgattttattgggaccaaaaacatatttaaccct 47379590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 47939865 - 47939750
Alignment:
Q  11 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 110  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||   ||||| | |||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||| |  ||    
T  47939865 aaatttgtttaatt-atgcttaaacttttagctttttaagcaattttttgtagacatgttaagaacattactaaaagtttttccgcaaaaaattatctca 47939767  T
Q  111 aaaattgatttatacgt 127  Q
    ||| ||||||| |||||    
T  47939766 aaatttgatttctacgt 47939750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 4 - 91
Target Start/End: Original strand, 11670119 - 11670206
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcc 91  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||| |||||||||||| | |  ||||| ||| |||| ||||||||||    
T  11670119 tcaattcaaatttgtttaatttattcttaaacgcttaagttttttaacaattttttgtagatgtgttaggaacattattaaaagttcc 11670206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 335 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 31470934 - 31470847
Alignment:
Q  335 tttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaa 422  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||  | ||||||| |||  || | ||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  31470934 tttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaatgactaaacttaaaatgtctcaattttatagggactaaaaacatatttaa 31470847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 360 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 51875942 - 51875879
Alignment:
Q  360 taaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaac 423  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||| || |||| |||||||||||    
T  51875942 taaaattaagtaagaactaaacttgaaagattccaattttatagggatcaaagacatatttaac 51875879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 344 - 426
Target Start/End: Original strand, 7499081 - 7499163
Alignment:
Q  344 ggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccct 426  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||  ||  || | ||||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  7499081 ggactaaaaaacctattaaaattaagtaaagaataaacttagaagttctcaattttataaggaccaaaaacatatttcaccct 7499163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 344 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 10085449 - 10085367
Alignment:
Q  344 ggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccct 426  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||  || | ||||||||| ||| |||| ||||| |||||||    
T  10085449 ggactaaaaaaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaaggtctcaattttatagggactaaaatcatatataaccct 10085367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 335 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 11670091 - 11670001
Alignment:
Q  335 tttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccc 425  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||| |||   | | ||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  11670091 tttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttatagggattaaaaacatatttaaccc 11670001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 335 - 425
Target Start/End: Original strand, 11670957 - 11671047
Alignment:
Q  335 tttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccct--attttatagtgaccaaaaacatatttaaccc 425  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||  ||||| |||  ||||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  11670957 tttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaactt--aaaatgccttaattttatagggactaaaaacaaatttaaccc 11671047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 334 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 48082416 - 48082318
Alignment:
Q  334 ttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaaaa 432  Q
    ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||  || ||| | ||||| ||| |||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  48082416 ttttttgtaaggattaaaaaagctattaaaattaaataaggactaaacttacaagatcacaattttgtagagaccgaaaatataattaaccctaaaaaa 48082318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 426
Target Start/End: Original strand, 20650727 - 20650808
Alignment:
Q  345 gactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccct 426  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||  |  | ||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  20650727 gactaaaaaaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgtttcaattttatagggtacaaaaacatatttaaccct 20650808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 424
Target Start/End: Original strand, 33689616 - 33689705
Alignment:
Q  335 tttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaacc 424  Q
    |||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||   | | |||||| || ||| ||||||||||||||||    
T  33689616 tttttgtaaggattaaaacaactattaaaattaagtaaggattaaacttaaaatgcctcaattttacagggactaaaaacatatttaacc 33689705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 422
Target Start/End: Original strand, 42973016 - 42973093
Alignment:
Q  345 gactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaa 422  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||| |  |||||| |||||| || ||||||||| || |||||| ||||||||    
T  42973016 gactaaacaaactattaaaattaagtaaggaccaaacttaaaaaataccaattttatagggatcaaaaatatatttaa 42973093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 334 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 44289650 - 44289557
Alignment:
Q  334 ttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaacccta 427  Q
    ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||  || ||| | ||||| ||| |||| |||||||| |||||||||    
T  44289650 ttttttgtaaggattaaaaaagctattaaaattaaataaggactaaacttacaagatcacaattttgtagggaccgaaaacataattaacccta 44289557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 44453056 - 44452920
Alignment:
Q  49 aacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccag-attttgttaattttat 147  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |  |||   ||  ||| | ||||||| |||||| || ||||||    
T  44453056 aacaattttttgcacaagtgttaagaacattacgaaaagttcatctgcaaaaaattatctcaattttttttttctgcgtccagaattttgctacttttat 44452957  T
Q  148 ctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaatt 185  Q
     || |||||||| | | |||||||||||||||||||||    
T  44452956 tttgaacttttg-tctattaaaaaattcatatttaatt 44452920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 334 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 47463389 - 47463292
Alignment:
Q  334 ttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaaa 431  Q
    |||||| || ||||||||| | ||||||||||||| |||| | ||||||| |||  ||   ||||||||| || |||||||||||| |||||||||||    
T  47463389 ttttttttagggactaaaagaactattaaaattaaataaggactaaacttaaaatgtcttaattttatagggatcaaaaacatattaaaccctaaaaa 47463292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 335 - 423
Target Start/End: Original strand, 25243925 - 25244013
Alignment:
Q  335 tttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaac 423  Q
    |||||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||| | ||||||| |||   | | ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  25243925 tttttgtaaggacaaaaaaaactaataaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaacatatttaac 25244013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 16618928 - 16618865
Alignment:
Q  133 ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt 196  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||| | ||||||||||| || ||||||    
T  16618928 ttttgttagttttatcttgaatttttggtgttttaaaaaaattatatttaattcattacatgtt 16618865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 349 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 27392571 - 27392496
Alignment:
Q  349 aaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaacc 424  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||||||  |||||||   ||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  27392571 aaaaaaactattaaaattaagtaaggactaaactaaaaaaatcttaattttatatagactaaaaacatatttaacc 27392496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 432
Target Start/End: Original strand, 29772012 - 29772047
Alignment:
Q  397 tttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaaaa 432  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29772012 tttatagggaccaaaaacatatttaaccctaaaaaa 29772047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 436
Target Start/End: Original strand, 33440005 - 33440044
Alignment:
Q  397 tttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaaaatatt 436  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33440005 tttatagggaccaaaaacatatttaacccaaaaaaatatt 33440044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 39150631 - 39150596
Alignment:
Q  397 tttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaaaa 432  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39150631 tttatagggaccaaaaacatatttaaccctaaaaaa 39150596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 325 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 42916330 - 42916275
Alignment:
Q  325 aagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaa 380  Q
    |||||| | ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  42916330 aagtaaattttttttgtagggactaaaaaagatattaaaattaagtaaggattaaa 42916275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 6818087 - 6817994
Alignment:
Q  11 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattg 105  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||||   |||||||||||||||||| | || | ||||||| || | | |||||||||| |||||||||||    
T  6818087 aaatttgtttaatt-atgtttaaactcttacatttttgaacaattttttgtatacgttttaagaacataaattaaagttcctccgcaaaaaattg 6817994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 335 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 31316512 - 31316423
Alignment:
Q  335 tttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccc 425  Q
    |||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||| | ||||||| |||   | | ||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  31316512 tttttgtaaggactaaaacaattattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttatag-gactaaaaacatatttaaccc 31316423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 335 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 33688648 - 33688602
Alignment:
Q  335 tttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaac 381  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||    
T  33688648 tttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggattaaac 33688602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 336 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 44452057 - 44451975
Alignment:
Q  336 ttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatat 418  Q
    |||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||| | |||||||  ||  || | ||||||||| ||||||||||||||    
T  44452057 ttttatatggactaaaaacactattataattaagtaaggactaaacttataaggtcacaattttatagggaccaaaaacatat 44451975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 5 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 50824481 - 50824411
Alignment:
Q  5 caattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaa 75  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||   ||| |||||||||||||| |||| || || |||||||||    
T  50824481 caattcaaatttgtttaatttatgcttaatagcttaagtttttgaacaatatttttcagacgtgttaagaa 50824411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 397 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 479802 - 479769
Alignment:
Q  397 tttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaa 430  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  479802 tttatagggaccaaaaacatatttaaccctaaaa 479769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 397 - 434
Target Start/End: Original strand, 6786450 - 6786487
Alignment:
Q  397 tttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaaaata 434  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6786450 tttatagggaccaaaaacatatttaaccctaaataata 6786487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 261 - 302
Target Start/End: Original strand, 6818048 - 6818089
Alignment:
Q  261 gttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttg 302  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  6818048 gttcaaaaatgtaagagtttaaacataattaaacaaattttg 6818089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 358 - 427
Target Start/End: Original strand, 7617662 - 7617731
Alignment:
Q  358 attaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaacccta 427  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| |||   || |||||||||| || |||||| |||||||||||||    
T  7617662 attaaaattaagtaaggactaaacttaaaaggcccatattttatagggatcaaaaatatatttaacccta 7617731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 397 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 8080102 - 8080069
Alignment:
Q  397 tttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaa 430  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8080102 tttatagggaccaaaaacatatttaaccctaaaa 8080069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 397 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 19689477 - 19689444
Alignment:
Q  397 tttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaa 430  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19689477 tttatagggaccaaaaacatatttaaccctaaaa 19689444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 397 - 430
Target Start/End: Original strand, 22023716 - 22023749
Alignment:
Q  397 tttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaa 430  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22023716 tttatagggaccaaaaacatatttaaccctaaaa 22023749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 336 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 25422038 - 25421949
Alignment:
Q  336 ttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccc 425  Q
    ||||||| ||||| ||| | || ||||||||||||||| | ||||||| |||   | | ||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  25422038 ttttgtaaggactgaaacaactgttaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaacatatttaaccc 25421949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 335 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 44208847 - 44208758
Alignment:
Q  335 tttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaacc 424  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||| | ||||||| |||   | | |||||| || ||| ||||||||||||||||    
T  44208847 tttttgtaaggactaaaacaactattaaaaataagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttacagggactaaaaacatatttaacc 44208758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 334 - 383
Target Start/End: Original strand, 44453499 - 44453548
Alignment:
Q  334 ttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaactt 383  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  44453499 ttttttgtatggactaaaaacactattataattatgtaaggattaaactt 44453548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 60
Target Start/End: Original strand, 53569155 - 53569212
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgag-tttttgaacaattttttg 60  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||||    
T  53569155 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactgttaagtttttttaacaattttttg 53569212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 60
Target Start/End: Original strand, 53571008 - 53571065
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgag-tttttgaacaattttttg 60  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||||    
T  53571008 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactgttaagtttttttaacaattttttg 53571065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0445 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 2)
Name: scaffold0445
Description:

Target: scaffold0445; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 11 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 6205 - 5791
Alignment:
Q  11 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 110  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| |||    
T  6205 aaatttgtttaatttatgtttaaactcttgagtttttgaacaattttttacaaacgtgttaagaacattactaaaagttactatgcaaaaaattgtcgca 6106  T
Q  111 aaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaa 210  Q
    ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||       |||||||    
T  6105 aaatttgatttctacgttcagattttgttaattttatctttaactttttccgttttaaaaaattcatatttaattcgtttgatgttaaaaaa-ttctaaa 6007  T
Q  211 ttttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaaca 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||       ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  6006 ttttagtaaatgaacctttcatagtgttccaaacttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaaatcaagagtttaaggataattaaacaaactttgttgtaata 5907  T
Q  311 tggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaa 410  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  5906 gggactaaaattagaagtaattcttttttgtagggactaaaaaatctattaaaattaagtaaggattaaacttgaaaggtccctattttatagggaccaa 5807  T
Q  411 aaacatatttaaccct 426  Q
    ||||||||||||||||    
T  5806 aaacatatttaaccct 5791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0445; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 334 - 432
Target Start/End: Original strand, 6241 - 6338
Alignment:
Q  334 ttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaaaa 432  Q
    |||||| || ||||||||| | | |||||||||||||||| | ||||||| |||   ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  6241 ttttttttagggactaaaagaaccattaaaattaagtaaggactaaacttaaaaggcccctattttgtaggg-ccaaaaacatatttaaccctaaaaaa 6338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 128)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 4 - 423
Target Start/End: Original strand, 10463737 - 10464154
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  10463737 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttgagtttttgaacaattttttacagacgtgttaagaacattactaaaagttcctatgcaaaaaat 10463836  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  10463837 tgtcgcaaaatttgatttctacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgtcgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaa 10463935  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||       |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  10463936 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttat 10464035  T
Q  304 tgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatag 403  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| |    
T  10464036 tgtaatagggactaaaattagaagtaattcttttttgta-agactaaaatttttattaaaattaagtaaggattaaacttgaaaggtccctattttatgg 10464134  T
Q  404 tgaccaaaaacatatttaac 423  Q
     |||||||||||||||||||    
T  10464135 ggaccaaaaacatatttaac 10464154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 4 - 430
Target Start/End: Original strand, 8313209 - 8313633
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||    
T  8313209 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttgagtttttgaacaattttttacatacgtgttaagaacattattaaaagttcttatgcaaaaaat 8313308  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  8313309 tgtcgcaaaatttgatttctacgtccatattttgttaattttatttttaacttttgtcgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaa-- 8313406  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 303  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||       |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  8313407 ttctgaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgcctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttct 8313506  T
Q  304 tgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatag 403  Q
    | ||| | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  8313507 tataatagggactaaaattagaagtaattcttatttgtagggattaaaaaatcaattaaaattaagtaaggattaaacttgaaaggtccctattttatag 8313606  T
Q  404 tgaccaaaaacatatttaaccctaaaa 430  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||    
T  8313607 ggaccaaaaacatatttaacccaaaaa 8313633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 4 - 424
Target Start/End: Original strand, 37103032 - 37103450
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37103032 tcaattcaaatttgtttaatttatgcataaactcttgaatttttgaataattttttacaaacgtgttaagaacattactaaaagttcctctgcaaaaaat 37103131  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
    | |  ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||           
T  37103132 tatctcaaaatttaatttctacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgtcgttttaaaaaattcatttttaattcgtttcatgtt-agaaaa 37103230  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||        |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  37103231 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtctaaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaataaactttgt 37103330  T
Q  304 tgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatag 403  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||  | || |||||||||    
T  37103331 tgtaacaaggactaaaattagaagtagtt-ttttttgtagggactaaaaaacctattaaaattaagtaaggattaaacttagaagtttccaattttatag 37103429  T
Q  404 tgaccaaaaacatatttaacc 424  Q
      | |||||||||||||||||    
T  37103430 gaatcaaaaacatatttaacc 37103450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 4 - 422
Target Start/End: Original strand, 8336843 - 8337259
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  8336843 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttgagtttttgaacaattttttactgacgtgttaagaacattactaaaagttcctatgcaaaaaat 8336942  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  8336943 tgtcgcaaaatttgatttctacgtctagattttgttaattttatctttaacttttgcagttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaa 8337041  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||       || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8337042 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtctc-aaaaaatcattcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgt 8337140  T
Q  304 tgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatag 403  Q
    ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||| |||  ||||||||| |||| ||||||| ||||||    
T  8337141 tgtaatagggactaaaattaaaagtaattcttttttgtaaggactaaacaatttattaaaattaaataaagattaaacttaaaaagtccctatcttatag 8337240  T
Q  404 tgaccaaaaacatatttaa 422  Q
     ||| |||||| |||||||    
T  8337241 ggactaaaaacctatttaa 8337259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 4 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 8404690 - 8404268
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |    
T  8404690 tcaattcaagtttgtttaatttatgcttaaactcttgaatttttaaacaattttttgcagacgtgttaagaacattactaaaaattcatctgcaaaaagt 8404591  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
    ||| |||||| ||||||| || || || ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  8404590 tgtcgcaaaatttgatttttaagttcaaattttattaattttatctttaacttttgccgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaaaa 8404491  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 303  Q
     |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||        |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8404490 atctaaattttggtaaatgaaccttttttagtgttctaaacttgtcttaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgt 8404391  T
Q  304 tgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatag 403  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||  |||  |||||||||    
T  8404390 tgtaacagggactaaaattagaagtaatttttttttgtaaggactaaaaaacctattaaaattaagtaaggactaaacttaaaagttcctaattttatag 8404291  T
Q  404 tgaccaaaaacatatttaaccct 426  Q
     || |||||||||||||||||||    
T  8404290 ggatcaaaaacatatttaaccct 8404268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 4 - 387
Target Start/End: Original strand, 27307819 - 27308201
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| || |||||| |||||| || ||||||||||    
T  27307819 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttgagtttttgaacaattttttacagacgtgttaaaaacattactgaaagtttctatgcaaaaaat 27307918  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||           
T  27307919 tgtcgcaaaatttgatttctacgtcaagattttgttaattttatctttaacttttgccgttttaaaaaattcatatttaatttgtttcatgtt-aaaaaa 27308017  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 303  Q
    ||||||||| | ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||       |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27308018 ttctaaattgtggtaaatgaatctttcatagttttctaaacttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgt 27308117  T
Q  304 tgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaa 387  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27308118 tgtaataaggactaaaattagaagtaattcttttttataggaactaaaaaatctattaaaattaagtaaggattaaacttgaaa 27308201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 4 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 34785544 - 34785167
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34785544 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaacttttgagtttttgtacaatttttt-cagacgtgttaagaatattactaaaagttcctttgcaaaaaat 34785446  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||           
T  34785445 tgtcgcaaaatttgatttttacgtccaaattttgttaattttatctttaacttttgtcgttttaaaaaatttatatttaattcgttttatgttaaaaaaa 34785346  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 303  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||        ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  34785345 tt-taaattttagtaaatgaacctttcatagtgttataaacttgtctaaaaaaaatcgttaaaaaatttaagaatttaaggataattaaacaaactttgt 34785247  T
Q  304 tgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaactt 383  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  34785246 tgtaacagggactaaaattagaagtaattttcttttgcaggaactaaaaaacctattaaaattaagtaaggactaaactt 34785167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 4 - 419
Target Start/End: Original strand, 40158265 - 40158678
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||     
T  40158265 tcaatttaaatttgtttaatttatgcttaaactcttgagtttttgaacaatttttcgcatacgtgttaagaacattacaaaaagttcctctacaaaaaaa 40158364  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
    | | |||||| ||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  40158365 tttcgcaaaatttgatatctacgtccataatttgttaattttatctttaacttttgtcattttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaa 40158463  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||         |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  40158464 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatag-gttataaacttgtcataaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttct 40158562  T
Q  304 tgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatag 403  Q
     |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||  ||  |||| |||||||||    
T  40158563 cgtaacaaggactaaaataagaagtaatttttttttgtagggagtaaaaaacctattaaaattaactaaggactaaacttagaagttcccaattttatag 40158662  T
Q  404 tgaccaaaaacatatt 419  Q
     |||||||||||||||    
T  40158663 ggaccaaaaacatatt 40158678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 34 - 428
Target Start/End: Original strand, 17742355 - 17742750
Alignment:
Q  34 actcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccagat 133  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||    
T  17742355 actcttgagtttttaaacgattttttgcagacgtgttaagaacattactaaaagttcctctgtaaaatattgtcgcaaaatttgatttctacgtccagat 17742454  T
Q  134 tttgttaattttatctttaacttttgttgtttt-aaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcat 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||        ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  17742455 tttgttaattttatctttaacttttgccgttttaaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaaaa-tctaagttttggtaaatgaacctttcat 17742553  T
Q  233 agtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaacatggactaaaattagaagtaa-t 331  Q
    |||||||||| ||| |||        |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |    
T  17742554 agtgttctaaacttatcttaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgttgtaacggggactaaaattagaagtaatt 17742653  T
Q  332 tcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaa 428  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||  ||  |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  17742654 ttttttttgtaaggactaaaaaacctattaaaattaagtaaagactaaacttagaagttcccaattttataggaaccaaaaacatatttaaccctaa 17742750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 4 - 422
Target Start/End: Original strand, 4426022 - 4426439
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| || ||||||||||||||| | |||||  |||||||||||| |||||||| || || | ||||||| |||||||||||||||| |||  |||||    
T  4426022 tcaattcaattttgtttaatttatgtttaaacttctgagtttttgaataattttttacatacgtcttaagaacattactaaaagttcctatgcgcaaaat 4426121  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
    |||||||||| || |||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  4426122 tgttgcaaaatttaatttttacgtctagatttagttaaatttatctttaacttttgccgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaaa- 4426220  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 303  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||       |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4426221 ttctaaattttagtaaatgaatatttcatagtgttctaaacttatctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgt 4426320  T
Q  304 tgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatag 403  Q
    ||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||    
T  4426321 tgtaataaggactaaaattaaaagtatttcttttttgtagggactaaaagaaccattaaaattaagtaaggattaaacttgaaagatctctattttgtag 4426420  T
Q  404 tgaccaaaaacatatttaa 422  Q
      | |||||||||||||||    
T  4426421 gaatcaaaaacatatttaa 4426439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 11 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 621914 - 621501
Alignment:
Q  11 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 110  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| || |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  621914 aaatttctttaatttatgcttaaacttttgagtttttgaacaatttttggcagacgtgttaaaaacattactaaaagttcctctgcaaaaaattgtcgca 621815  T
Q  111 aaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaa 210  Q
    |||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||       || ||||    
T  621814 aaatgtgatttctacatccagattttgttaattttatctttaagttttgccgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaattgtaaa 621716  T
Q  211 ttttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaaca 310  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||       |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  621715 ttctagtaaatgaaccttttatagtgttctaaatctgtctcataaaaatcgttctaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgttgtaata 621616  T
Q  311 tggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaa 410  Q
      |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||  |||||||||||| |||| | |||||||| ||  |||| ||||||||| ||  ||    
T  621615 gagactaaaattagaagtaact-ttttttgtagggactaaaaaatttattaaaattaattaaggactaaacttggaagttcccaattttatagggataaa 621517  T
Q  411 aaacatatttaaccct 426  Q
    ||||||||||||||||    
T  621516 aaacatatttaaccct 621501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 4 - 427
Target Start/End: Original strand, 4462756 - 4463181
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| |||| ||| ||| ||||| ||||||||    
T  4462756 tcaattcaaatttgtttcatttatgctttaactcttgagtttttgaacaattatttgcagacgtgttaagaacattattaatagtccctctacaaaaaat 4462855  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||           
T  4462856 tgttgcaaaatttgatttctacatcctgattttgttaattttatctttaacttttgccgtttttaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aacaaa 4462954  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 303  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||| ||||||||       |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4462955 ttctaaattttagtcaatgaatctttcatagtactctaaacttgtctcgaaaaaatcgtacaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgt 4463054  T
Q  304 tgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgt---atggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctatttta 400  Q
    ||||  | ||||||||||||||||| ||| |||||| |   | ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||  |||| ||||||    
T  4463055 tgtacgagggactaaaattagaagtgatttttttttttgtaagggactgaaaaacctattaaaattaagtaaggactaaacttagaagttcccaatttta 4463154  T
Q  401 tagtgaccaaaaacatatttaacccta 427  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  4463155 tagggactaaaaacatatttaacccta 4463181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 6 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 1683458 - 1683081
Alignment:
Q  6 aattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattg 105  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  1683458 aattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttgagtttttggataattttttgcagacatgttaacaacattactaaaagctcctatgcaaaaaattg 1683359  T
Q  106 ttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnntt 205  Q
    |  ||||| |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||    
T  1683358 tcacaaaatttgatttatacgtccatattttattacttttatcattaacttttgtcgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaatt 1683260  T
Q  206 ctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttg 305  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||        |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||     
T  1683259 ctaaattttagtaaatgaacttttcatagtgttctaaacttgtcttaaagaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggatagttaaacaaactttattt 1683160  T
Q  306 taacatggactaaaattagaagtaa-ttcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaactt 383  Q
    ||  | ||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| | |||||||    
T  1683159 tagtagggactaaaattagaagtaattttttttttgtagggactaaaaaacctattaaaactaaataaggactaaactt 1683081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 4 - 383
Target Start/End: Original strand, 27335630 - 27336006
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  27335630 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttgagtttttaaacaattttttgcatatgtgttaagaacattactaaaagttcctctgtaaaaaat 27335729  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
    ||| |||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  27335730 tgtcgcaaaatttgatttttacgcccatattttgttaattttatctttaacttttgtcgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaaaa 27335829  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 303  Q
     | |||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||        | |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  27335830 -tataaattttggtaaatgaacctttcataatgttttaaacttgtcttaaaaaaattgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaataaactttgt 27335928  T
Q  304 tgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaactt 383  Q
    ||||||| | |||||||||| |||||||  ||||||||| | ||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  27335929 tgtaacaggaactaaaattaaaagtaat--ttttttgtaagaactaaaatacctgttaaaattaaataaggattaaactt 27336006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 4 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 42877905 - 42877489
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| | | || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42877905 tcaattcaaatttgtttaattcatgcttaaactcttgagtttttaaacaattttt-gtagacgtgttaagaacattactaaaagttcctctgcaaaaaat 42877807  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
    ||| |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||           
T  42877806 tgtcgcaaaattttatttctacgtccagattttgttaattttatctttatcttttgtcgtttt-aaaaattcatatttaattcgtttcatcttaaaaaaa 42877708  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 303  Q
     | |||||||| ||||||||||||||||| |  |||||| |||||||        || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  42877707 at-taaattttggtaaatgaacctttcatggcattctaaacttgtcttaaaaatatccttcaaaaatttaagagtttaagaataattaaacaaactttgt 42877609  T
Q  304 tgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatag 403  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||  ||  | || ||||||| |    
T  42877608 tgtaacagggactaaaattagaagtaatt-ttttttgtaaggactaaaaaatctattaaaattaagtaatgactaaactt--aattttccaattttattg 42877512  T
Q  404 tgaccaaaaacatatttaaccct 426  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  42877511 ggaccaaaaacatatttaaccct 42877489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 4 - 427
Target Start/End: Original strand, 2003952 - 2004372
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  2003952 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttgagtttttgaacaactttttgcgtacgtgttaagaacattactaaaagttcatctgcaaaaaat 2004051  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
    ||| |||||| ||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  2004052 tgtcgcaaaatttgatttttatgtccagattttgttaactttatctttaacttttgccgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-taacaa 2004150  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 303  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||       |||        | ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2004151 ttctaaattgtagaaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgcctcaaataaatcg--------tataagagtttaaggataattaaacaaactttgt 2004242  T
Q  304 tgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttt---tgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaa---aaatccctatt 397  Q
    |||| || |||||||||||||| |||||| |||||   |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| ||   |  |||| |||    
T  2004243 tgtagcagggactaaaattagacgtaattttttttttgtgtagggactaaaacacctattaaaattaagtaaggactaaacttaaaattagttcccaatt 2004342  T
Q  398 ttatagtgaccaaaaacatatttaacccta 427  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  2004343 ttatagggaccaaaaacatatttatcccta 2004372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Original strand, 41139025 - 41139387
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  41139025 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaatctcttaagttttttaacaattttttgtagacatgttaagaacattactaaaagttcctccgcaaaaaat 41139124  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
    | | |||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |           
T  41139125 tatcgcaaaatttgatttatatgtccagattttattacttttatctttaacttttatcgttttcaaaaattcatatttaattcatttcatgataaaaaaa 41139224  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 303  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| ||||||||       |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| |    
T  41139225 ttctaaattttagtaattgaacctttcacaatgttctaaacttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaaaagtttaaggataattaaacaaatttttt 41139324  T
Q  304 tgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaatta 367  Q
    | || ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  41139325 tttagcatagactaaaattagaagtaatt-tttgttgtagggactaaaaaacctactaaaatta 41139387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 175; E-Value: 8e-94
Query Start/End: Original strand, 4 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 41193272 - 41192836
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaa-ttttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaa 102  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||| ||  | |||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  41193272 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaacttttgattttttgaacaacttttttacagccgtgttaagaatgttgctaaaagttcctctgcaaaaaa 41193173  T
Q  103 ttgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnn 202  Q
    || | |||||| |||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||          
T  41193172 ttatcgcaaaatttgaattctacgtccagatttagttaattttatctttaacttttaccgttttaaaaaattcatattcaattcgttttatgtt-aaaaa 41193074  T
Q  203 nttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttg 302  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||        | |||||||| |||||||| |||| |||| ||||| |||  |||    
T  41193073 attctaaatttttgtaaatgaacctttgatagtgttctaaacttgtctaacaaaaatagttcaaaagtttaagagcttaaggatagttaaaaaaaaattg 41192974  T
Q  303 ttgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttata 402  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |   ||  |||| ||||||||    
T  41192973 ttgtaacagggattaaaattagaagtaatttttttttgtagggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattatattcagaagttcccaattttata 41192874  T
Q  403 gt-----gaccaaaaacatatttaaccctaaaaaatat 435  Q
    ||      ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41192873 gtatagaaaccaaaaacatatttaaccctgaaaaatat 41192836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 4 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 24637234 - 24636808
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  24637234 tcaattcaaatttgattaatttatgcttaaactcttaagttttttaacaattttttgtagacgtgttaagaacattactaaaagttcctccgcaaaaaat 24637135  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
    | | |||||| ||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  24637134 tatcgcaaaatttgatttctacttccagattttattacttttatctttaagttttgccattttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaa 24637036  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtct-cnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttg 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24637035 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctaaaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttg 24636936  T
Q  303 ttgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttata 402  Q
    || ||  | ||||||| ||||||||||| |  ||||||||  |||   |||| |||||||||||||||||| || ||||||  ||  | || ||||||||    
T  24636935 ttttaggagggactaatattagaagtaaatgatttttgtaacgacggcaaaa-ctattaaaattaagtaaggatcaaacttagaagtttccaattttata 24636837  T
Q  403 gtgaccaaaaacatatttaaccctaaaaaa 432  Q
      |||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  24636836 aggacc-aaaacataattaacccaaaaaaa 24636808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 160; E-Value: 7e-85
Query Start/End: Original strand, 77 - 427
Target Start/End: Original strand, 34009995 - 34010344
Alignment:
Q  77 attactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattca 176  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  34009995 attactaaaagttcctctccaaaaaattgacgcaaaatttgatttctacgttcagattttgttaattttatcttaaacttttgccgttttaaaaaattca 34010094  T
Q  177 tatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaaga 276  Q
    ||||||||| |||| ||| |       |||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||       | || |||||||||||||    
T  34010095 tatttaatttgttttatggtaaaaaa-ttctaaattttagttaatgaacctttcttagtattctaaacttgtctcaaaaaaatagtacaaaaatttaaga 34010193  T
Q  277 gtttaaagataattaaacaaactttgttgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaat 376  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||| | ||||||||||||| ||| |     
T  34010194 gtttaaggataattaaacaaactttgttgtaatagggactaaaattaaaagtaatttttttttgtagggacttaaaaccatattaaaattaagcaaggac 34010293  T
Q  377 taaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaacccta 427  Q
    |||||||  ||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34010294 taaacttagaagttcccaattttatagggaccaaaaacatatttaacccta 34010344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 424
Target Start/End: Original strand, 31211187 - 31211609
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaatttttt-gcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaa 102  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||| | | |   |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  31211187 tcaatttaaatttgtttaatttatacttaaattcttaagtttttgaacaatttttttgtagattagttaagaacattactaaaagttcctctgcataaaa 31211286  T
Q  103 ttgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnn 202  Q
    || |||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||| || ||||||||||||||| |||||||||||| || |||| |||||||||||| ||          
T  31211287 ttattgcaaaatttgatttctacgtcccgattttattacttatatctttaacttttgctgttttaaaaaactcctattgaattcgtttcatattaaaaaa 31211386  T
Q  203 nttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtct-cnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaacttt 301  Q
      |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |         |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31211387 a-tctaaatttttgtaaataaacctttcatattgttctaaacttgtttaaaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaacttt 31211485  T
Q  302 gttgtaacatggactaaaattagaagtaattcttt-tttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctatttta 400  Q
    ||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||| || |||  || | ||||||    
T  31211486 gttttaagagggactaaaattagaagtaattttttatttgtagtgactaaaaaaactattaaaattaagttagaaccaaatttaaaagttctcaatttta 31211585  T
Q  401 tagtgaccaaaaacatatttaacc 424  Q
    || |||||||||||||||||||||    
T  31211586 taatgaccaaaaacatatttaacc 31211609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 4 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 8218293 - 8217947
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  8218293 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagttttttaacaattttttgtagacgtgttaagaacattactaaaagttcctccgcaaaaaat 8218194  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
    | |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||             |||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  8218193 tattgcaaaatttgatttatatgtccagattttattacttttatc-------------gttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaa 8218108  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 303  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||       |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |    
T  8218107 ttctaaattttagtaattgaacctttcatagtgttctaaacttatctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagactttaaggataattaaacaaactttat 8218008  T
Q  304 tgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaa 364  Q
    | || ||  ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  8218007 tttagcagagactaaaattagaagtattttttttttgtagggactaaaaaatctactaaaa 8217947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 123 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 9687708 - 9687407
Alignment:
Q  123 tacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgtt-gttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaat 221  Q
    |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||     
T  9687708 tacgtcaaaattttattaattttatctttaactttttttcgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaaa-ttctaaattttagtaaac 9687610  T
Q  222 gaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaacatggactaaaat 321  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| | ||       ||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9687609 gaaccttttatagtgttctaaacttatatcaaaaaaatcgattaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgttgtaacagggactaaaat 9687510  T
Q  322 tagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatattta 421  Q
    |  |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||  | || ||||||||| |||||||||||||||||    
T  9687509 tcaaagtaatttttttttgtagggactaaaaaacctattaaaattaagtaaggattaaacttagaagttgccaattttatagggaccaaaaacatattta 9687410  T
Q  422 acc 424  Q
    |||    
T  9687409 acc 9687407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 123 - 427
Target Start/End: Original strand, 28456628 - 28456928
Alignment:
Q  123 tacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatg 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||          ||||||||||| ||||    
T  28456628 tacgtccagattttgttaattttatctttaacttttttcgttt-aaaaaattcatatttaattagtttcatgttaaaaaaaag-taaattttagttaatg 28456725  T
Q  223 aacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaacatggactaaaatt 322  Q
    ||| ||||||||| |||||| ||||||||       |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28456726 aacttttcatagtattctaaacttgtctcacaaaaatcgtacaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgttgtaacattgactaaaatt 28456825  T
Q  323 agaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaa 422  Q
    |||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| ||  ||| |||| ||||||||  ||  ||||||||||||||    
T  28456826 agaagtaatgtttttttgtagggactaaaaaatctattaaaattaagtaaggaataaatttagaaattcccaattttata--gattaaaaacatatttaa 28456923  T
Q  423 cccta 427  Q
    |||||    
T  28456924 cccta 28456928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 95 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 38693670 - 38693402
Alignment:
Q  95 gcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatg 194  Q
    |||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  38693670 gcaaaaaattatcgcaaaatttgatttatatgtccagattttattacttttatctttaacttttatcattttcaaaaattcatatttaattcgtttcatg 38693571  T
Q  195 ttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaac 294  Q
    ||       || ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||       |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38693570 ttaaaaaa-ttataaattttagtaattgaacctttcatagtattctaaacttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaac 38693472  T
Q  295 aaactttgttgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaa 364  Q
    |||||||||| || || ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  38693471 aaactttgttttagcagggactaatattagaagtaattgttttttgtagggactaaaaaacctactaaaa 38693402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 4 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 4462245 - 4461836
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaaca--tgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaa 101  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| | |  |||| |||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  4462245 tcaattcaaatgtgtttaatttatgcttaaactcttaagtttttgaacaattttttgcatatacgtgtttagaacattactaaaagttcctccgcaaaaa 4462146  T
Q  102 attgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnn 201  Q
     || | | |||| | ||||| ||| |||||||||||||  |||              || |||||||||||||||||||||||||||||||||||         
T  4462145 cttatcgtaaaattagatttctacatccagattttgttgcttt--------------gtcgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttagaaa 4462060  T
Q  202 nnttctaaattttagtaaatgaacctttc-atagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactt 300  Q
      ||||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||| ||||||||       |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4462059 g-ttctaaattttagtaaatgaacctttttatagtgtattaaacttgtctcaaaaaa-tcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 4461962  T
Q  301 tgttgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctatttta 400  Q
     ||| || || |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||| |  ||  |||| ||||||    
T  4461961 cgttttagcagggactaaaattataagtaatt-ttttttgtagggactaaaaaagctattaatattaagtaaggactaaacatagaagttcccaatttta 4461863  T
Q  401 tagtgaccaaaaacatatttaacccta 427  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||    
T  4461862 tagggaccaaaaacatatttaacccta 4461836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 4 - 304
Target Start/End: Original strand, 13920063 - 13920362
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||| | || ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||    
T  13920063 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactattaagttttttaacaattttttgtagacgtgttaagaacattaataaaagttcctccgcaaaaaat 13920162  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
    | | |||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| |  |||| ||| ||||||||||||||  |||||||||           
T  13920163 tatcgcaaaatttgatttatatgtccaaattttattacttttatctttaacttttatcattttcaaatattcatatttaattaatttcatgtt-aaaaaa 13920261  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 303  Q
    |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||       ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13920262 ttctaaattttaataattgaacatttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaattgaagagtttaaggataattaaacaaactttgt 13920361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 426
Target Start/End: Original strand, 30394087 - 30394503
Alignment:
Q  11 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 110  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| || || |||||||||  ||| |||||| ||||| | |||||| | | |||    
T  30394087 aaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagtttttcaacaattttttacagacgtgttaagaacgttattaaaaggtcctccg-aaaaaaatatcgca 30394185  T
Q  111 aaaa-ttgatttatacgtccaga-ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttcta 208  Q
    |||| ||||||| |||||||| | |||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||       || ||    
T  30394186 aaaatttgatttctacgtccatatttttgttacttatatcttaaacttttgtcgttttaaaaaattcatatttaatttatttcatgtt-aaaaaattata 30394284  T
Q  209 aattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaa 308  Q
     ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||| |        ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| |||| ||| || ||     
T  30394285 gattttagcaaatgaacc-ttcatagtgttataaacttgtataaaaagaatcgttaaaaaagttaagagtttaaggataattaagcaaaatttattttag 30394383  T
Q  309 catggactaaaattagaagtaattcttttt--tgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtga 406  Q
    || |||||||||||| |||||||| |||||  |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||  ||  || | ||||||||| ||    
T  30394384 cagggactaaaattataagtaatttttttttgtgtagggattaaaaaagctattaaaattaagtaaggactaaacttagaatgtcgcaattttatagaga 30394483  T
Q  407 ccaaaaacatatttaaccct 426  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  30394484 ccaaaaacatatttaaccct 30394503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 4 - 328
Target Start/End: Original strand, 34527030 - 34527341
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || | |||||| |||| || |||||||||||| | || ||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||       
T  34527030 tcaattcaaatttgtttaatttattcttatactcttaagttgtttaacaattttttgtagacgtgttaagaacattactaaatgttccgccgcaaaat-- 34527127  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
               |||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||           
T  34527128 -----------ttgatttatatgtccatattttattacttttatctttaacttttattgtttttaaaaattcatatttaatttgtttcatgttaaaaaaa 34527216  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 303  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||       |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  34527217 ttctaaattttattaattgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaattcgttcaaaaatttaagaatttaaggataattaaacaaactttgt 34527316  T
Q  304 tgtaacatggactaaaattagaagt 328  Q
    | ||  | |||||||||||||||||    
T  34527317 tttagtagggactaaaattagaagt 34527341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 108 - 427
Target Start/End: Original strand, 42852827 - 42853142
Alignment:
Q  108 gcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttct 207  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || |||||||||||||||| || ||||||||||| |||       || |    
T  42852827 gcaaaatttgatttctacgtccagattttgttacttttatttttaactttagtcgttttaaaaaattcattttaaattcgtttcacgttgaaaaattt-t 42852925  T
Q  208 aaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgta 307  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||        |||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||| || ||    
T  42852926 aaattttagtaaatgaatctttcatattgttctaaacttatctcataaaaaacgttcaaaaattcaagaatttaagaataattaaacaaactttctttta 42853025  T
Q  308 acatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgac 407  Q
     || |||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| | ||| ||| | |||||| || ||     
T  42853026 gcaaggactaaaattataagtaatt--tttttgta-ggactaaaaaaactattaaaattaagtaaggactaaacctaaaagatctcaattttacagggat 42853122  T
Q  408 caaaaacatatttaacccta 427  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  42853123 caaaaacatatttaacccta 42853142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 4 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 43441155 - 43440844
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| | |  ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||    
T  43441155 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagttttttaacaattttttgtagatgtgttaagaacattattaaaagttcctccgcaaaaaat 43441056  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
    | | |||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||             ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||           
T  43441055 tatcgcaaaatttgatttatatgtccatattttattacttttatc-------------gttttcaaaaattcatattgaattcgtttcatgtt-aaaaaa 43440970  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 303  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||       || ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||    
T  43440969 ttataaattttagtaattgaacctttcatagtgttctaaacttatctcaaaaaaatcattcaaaaatttaagaatttaaggataatcaaacaaactttgt 43440870  T
Q  304 tgtaacatggactaaaattagaagta 329  Q
    | || |||||||||||||||||||||    
T  43440869 tttagcatggactaaaattagaagta 43440844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 11 - 418
Target Start/End: Original strand, 2005030 - 2005438
Alignment:
Q  11 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 110  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| || || |||||||||  ||| | |||| ||||| | |||||| | | |||    
T  2005030 aaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagtttttcaacaattttttacagacgtgttaagaacgttatttaaaggtcctccg-aaaaaaatatcgca 2005128  T
Q  111 aaaa-ttgatttatacgtccaga-ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttcta 208  Q
    |||| ||||||| |||||||| | |||| ||| || |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||       || ||    
T  2005129 aaaatttgatttctacgtccatatttttcttacttatatcttaaacttttgtcgttttaaaaaattcatatttaatttatttcatgtt-aaaaaattata 2005227  T
Q  209 aattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaa 308  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |        || || |||||||||||||||||||||||||||| ||||  || || ||     
T  2005228 gattttagtaaatgaacctttcatagtgttataatcttgtataaaaagaatctttaaaaaatttaagagtttaaagataattaagcaaaaattattttag 2005327  T
Q  309 catggactaaaattagaagtaa-ttcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgac 407  Q
    || |||||||||||| |||||| || |||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||  | |||||||  ||  || | ||||||||| |||    
T  2005328 cagggactaaaattataagtaattttttttttttagggattaaaaaagctattaaaattaagtaacgactaaacttagaaggtcacaattttatagggac 2005427  T
Q  408 caaaaacatat 418  Q
    |||||||||||    
T  2005428 caaaaacatat 2005438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 204 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 22023193 - 22023014
Alignment:
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||       |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22023193 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatggtgttttaaacttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgt 22023094  T
Q  304 tgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaactt 383  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||    
T  22023093 tgtaacagggactaaaattagaaataatttttttttgtagtgactaaaaagcctattaaaattaagtaaggactaaactt 22023014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 4 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 22023362 - 22023191
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||    
T  22023362 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttgaatttttgaacaattttttgtagacgtgttaagaacattactaaaagttcctcggtaaaaaat 22023263  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattc 175  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  22023262 tgtcgcaaaatttgatttctacgtccgaattttgttaattttagctttaacttttttcgttttaaaaaattc 22023191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 163 - 435
Target Start/End: Original strand, 21837098 - 21837369
Alignment:
Q  163 ttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgt 262  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||       || |    
T  21837098 ttttaagaaattcatatttaattcgtttcatgttagaaaa-ttctaaattttagtaaatgaaccttttatagtgttctaaacttgtatcgaaaaaatcat 21837196  T
Q  263 tcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggact-aaaaaacctatta 361  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| || ||||| ||||||||| || || |||||| ||||||    
T  21837197 tcaaaaatttaaaagtttaaggataattaaacaaaatttgttttagcatggactaaaattataaataatt-ttttttgtaggggctaaaaaaagctatta 21837295  T
Q  362 aaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaaaatat 435  Q
    |||||||||||| | |||| ||  ||  ||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21837296 aaattaagtaaggactaaatttagaagttctatattctatagggaccaaaaacatatttaaccctataaaatat 21837369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 4 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 18261471 - 18261055
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaa--aaa 101  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||  |||| | |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||    
T  18261471 tcaattcaaatttgtttaatt-atgcttaaattcttaagttttcaaacattcttttacaaacgtgttaagaacattactaaaagttcctctgcaaaaaaa 18261373  T
Q  102 attgttgcaaaaattgatttatacgtccaga-ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnn 200  Q
    ||| | |||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||||    | | ||| ||| |||||||||        
T  18261372 attatcgcaaaatttgatttctacgtccagatttttgttagttttatcttgaacttttgtcgtttaaaaaa----aaaattagttcatttcatgtt-aaa 18261278  T
Q  201 nnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactt 300  Q
       ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| |        | | | |||||||||| ||| |||  |||||| |||||||||    
T  18261277 aaattctaaattttagtaaatggacctttcatagtgttataaacttgtttacattaaattgctaaaaaatttaaaagtgtaagtataatttaacaaactt 18261178  T
Q  301 tgttgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaatt-aaacttgaaaaatccctatttt 399  Q
    || | || || |||||||||||| |||||||  |||||| || | ||||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||  ||| || | |||||    
T  18261177 tgctttagcagggactaaaattataagtaat--ttttttttaggaactaaaaaagctattaaatttaagtaaggattaaaacttcgaaattctcaatttt 18261080  T
Q  400 atagtgaccaaaaacatatttaacc 424  Q
    |||||||| |||||||| |||||||    
T  18261079 atagtgactaaaaacatgtttaacc 18261055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 31 - 434
Target Start/End: Original strand, 37446432 - 37446830
Alignment:
Q  31 aaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtcca 130  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||||  |||||   || |||||||| ||||||| | | | ||    
T  37446432 aaaactcttaagtttttgaacaattttttacagacatgttaagaacgttactaaaagttccttcgcaaagttttattgcaaaatttgatttctgcataca 37446531  T
Q  131 gattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttc 230  Q
    ||     ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||       |||||||||||||||| |||||| ||     
T  37446532 ga-----ttacttttatctttaacttttgtcgttttaaaaaatttatatttaattcgtttcacattaaaaaaattctaaattttagtaagtgaaccattt 37446626  T
Q  231 atagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaacatggactaaaattagaagtaa 330  Q
    |||  ||||||| ||||| |        || ||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| | ||| | |||||||||||| || |||    
T  37446627 atatggttctaaacttgt-tttaaaaaatctttcaacaatttaagagttcaaggataattaaacaaactttgctttaatagggactaaaattataattaa 37446725  T
Q  331 ttcttttttgtatggact-aaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaa 429  Q
     | | ||||  |  |||| |||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||  || | |||||| |  |  ||||||||||||||||||||||    
T  37446726 atttcttttaaaaagactaaaaaaaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaagttcacaattttaaaagggtcaaaaacatatttaaccctaaa 37446825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 164 - 417
Target Start/End: Original strand, 9924401 - 9924645
Alignment:
Q  164 tttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgtt 263  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||        |||||    
T  9924401 tttaaaaatttcatatttaatttgtttcat-tttaaaaaattctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtct-aaaaaaatcgtt 9924498  T
Q  264 caaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggact-aaaaaacctattaa 362  Q
     |||||||||||        |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||    
T  9924499 taaaaatttaag--------gataattaaacaaattttgttgtaacagggactaaaattataagtaattcttttttttagggattaaaaaaacctattaa 9924590  T
Q  363 aattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacata 417  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||  |||  ||||||||| |||||||||||||    
T  9924591 aattaagtaaggattaaacttagaagttcctaattttatagggaccaaaaacata 9924645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 13 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 22167161 - 22166741
Alignment:
Q  13 atttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaa 112  Q
    |||||||||||| ||| | ||||||||  | ||||||||||||||||| | || | ||||||| |||||||||||||| || | |||||||| || ||||    
T  22167161 atttgtttaatt-atgtttaaactcttatgcttttgaacaattttttgtagacgtattaagaacattactaaaagttcatccgtaaaaaattatttcaaa 22167063  T
Q  113 aattgatttatacgtccagatttt-gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaa-ttcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaa 210  Q
    | ||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || |||| |  ||| |||||| |||||||| || || |||| ||||       |||||||    
T  22167062 atttgatttctatgtccatatttttgttaattttatcttgaaattttttcatttaaaaaaaattcatattaaactcatttcttgttaaaaaa-ttctaaa 22166964  T
Q  211 ttttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaat-ttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaac 309  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||||||       ||||| |||||  ||||| |||| |||||||||| ||||| |||||| || |    
T  22166963 ttttactaaatgaacctttcgtagtgttctaaatttgtctcataaaaatcgttaaaaaaagttaagtgtttgaagataattatacaaaatttgttttagc 22166864  T
Q  310 atggactaaaattagaagtaa-ttcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgacc 408  Q
      |||||| ||||| |||||| || ||||||||| ||| ||| ||| ||||||||||| |||||| | ||||||| ||   |||  ||||||||| ||||    
T  22166863 ggggactataattataagtaactttttttttgtagggattaataaaactattaaaatttagtaaggactaaacttaaagcttccggattttatagggacc 22166764  T
Q  409 aaaaacatatttaaccctaaaaa 431  Q
    ||||||||||||| |||| ||||    
T  22166763 aaaaacatatttaccccttaaaa 22166741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 4 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 26865975 - 26865653
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||                
T  26865975 tcaattcaaatttgtttaatttattcttaaactcttaagttttttaacaattttttgtagacgtgttaagaacattactaaaagttcc------------ 26865888  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
     |  |||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| |||||             ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||           
T  26865887 -gccgcaaaatttgatttatatgtccatattttattactttta-------------ttgttttcaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaaaa 26865802  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 303  Q
    || ||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| |||||||        || |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  26865801 tt-taaattttattaattggacctttcatagtgttctaaacttgtctaaaaaaattcattcaaaaatttaagagcttaaggataattaaacaaactttgt 26865703  T
Q  304 tgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaa 354  Q
    | ||  | |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  26865702 tttagtagggactaaaattataagtaatt-ttttttgtagggactaaaaaa 26865653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 11 - 380
Target Start/End: Original strand, 10674648 - 10675016
Alignment:
Q  11 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 110  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||||| ||||  |||||| || |||||||||||||| | | ||||||||  |  ||    
T  10674648 aaatttgtataatt-atgcttaaacttttaagattttgaacaattttttacaaaagtgttaaaaacattactaaaagttcatatacaaaaaatcatctca 10674746  T
Q  111 aaaattgatttatacgtccagatttt-gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaa 209  Q
    ||| ||  ||| |||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||| ||  ||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||       ||||||    
T  10674747 aaattttgtttctacgtccatatttttgttacttttatcttgaactttggtattttaaaaatattcatatttaattcattttatgttaataaa-ttctaa 10674845  T
Q  210 attttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaac 309  Q
    ||||||||||| ||||||||  | ||||||||| ||||||||       ||||| ||| |||||| ||||||| |||||||| | |||||||||| ||      
T  10674846 attttagtaaacgaaccttttgtggtgttctaaacttgtctcaaaaaaatcgtttaaagatttaaaagtttaaggataattagagaaactttgttttagt 10674945  T
Q  310 atggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaa 380  Q
    | ||||||||| || | | || |  ||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  10674946 agggactaaaactacatgcaaattatttttatagggattaaaaaagctattaaaattaagtaagaactaaa 10675016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 155 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 14049899 - 14049632
Alignment:
Q  155 ttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnn 254  Q
    |||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||       || ||||| ||||||||||||| |||| || |||||||| | ||| |        
T  14049899 ttttgtcgtttaaaaaaatttatatttaattcatttgatgttaaaaaattt-taaatattagtaaatgaacttttcgtaatgttctaaacgtgtattaag 14049801  T
Q  255 nnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggact-aaaaa 353  Q
        |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || || || |||||||||||| | |||||  ||||||||| | ||| |||||    
T  14049800 aaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggatgattaaacaaactttattttagcagggactaaaattatatgtaat--ttttttgtaggaactaaaaaa 14049703  T
Q  354 acctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaacc 424  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| |||| |  | |||||||||   ||||||||||||||||||    
T  14049702 aactattaaaattaagtaagaattaaacttaaaaattttcaattttataggatccaaaaacatatttaacc 14049632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 210 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 18950959 - 18950805
Alignment:
Q  210 attttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaac 309  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||        ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |    
T  18950959 attttagtaattgaacctttcatagtgttctaaacttgtctaaaaaaaatcgttcagaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgttttatc 18950860  T
Q  310 atggactaaaattagaagtaa-ttcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaa 364  Q
    | | |||||| |||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  18950859 a-gaactaaatttagaagtaattttttttttgtaaggactaaaaaacctactaaaa 18950805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 23 - 426
Target Start/End: Original strand, 36875874 - 36876274
Alignment:
Q  23 tttatgctaaaactcttgagtttttgaacaatttttt-gcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgattt 121  Q
    |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||| | ||||||||||||| |  ||||||||  |  ||||| |||||||    
T  36875874 tttatggttaaactcttaagtttttgaacaatttttttgcagatgtgttaagaacactactaaaagttccaccacaaaaaatcatctcaaaatttgattt 36875973  T
Q  122 atacgtccagat-tttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaa 220  Q
     ||| |||| || ||||||| ||||| ||| || |||| |||||| |||| ||| ||||||||||  |||||||||       |||| ||||||||||||    
T  36875974 -tacatccaaatatttgttacttttaacttaaattttt-ttgtttaaaaagatt-atatttaatttatttcatgttaaaaaa-ttctgaattttagtaaa 36876069  T
Q  221 tgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaacatggactaaaa 320  Q
    | ||||||| ||| ||||| || |||||||        || || |||||||||||||||| | |||||| | ||||| || ||  || || |||||||||    
T  36876070 taaacctttaataatgttccaaacttgtct-aaaaaaatcattaaaaaatttaagagtttgaggataataacacaaatttggtcttagcagggactaaaa 36876168  T
Q  321 ttagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatattt 420  Q
    ||| | |||| | ||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||  ||  | || ||||||||| ||||||||||||||||    
T  36876169 ttacatgtaaatattttttgtagggactcaaaatgctattaaaattaagtaagaactaaacttagaagtttccaattttatagggaccaaaaacatattt 36876268  T
Q  421 aaccct 426  Q
    ||||||    
T  36876269 aaccct 36876274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 30698969 - 30698556
Alignment:
Q  11 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 110  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||| |||||| ||||| | || | ||||||| |||||  ||||| ||||| ||||| |||    ||    
T  30698969 aaatttgtttaatt-atgcttaaattcttgaatttttaaacaatcttttgtacacctattaagaacattacggaaagtccctctacaaaatattaactca 30698871  T
Q  111 aaaattgatttatacgtccagattttgt-taattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaa 209  Q
    ||| ||||||| ||||| ||||||||   || | || |||| || |||||| |||| |||||||||||||||||||| | || ||||       || ||     
T  30698870 aaatttgatttctacgttcagatttttactactcttttcttgaatttttgtcgttt-aaaaaattcatatttaattcttctcctgttaaaaaa-ttatat 30698773  T
Q  210 attttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaac 309  Q
     ||||||||||||||| ||| ||| |||||||| | ||||||       |||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||| || ||| | |     
T  30698772 tttttagtaaatgaacattttataatgttctaaacatgtctccaaaaaatcgttcaaaaatttaagaattcaagaataattaaacaaatttagtttttag 30698673  T
Q  310 atggactaaaattagaagtaattct-tttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgacc 408  Q
    | |||||||||||| | |||||| | |||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||| | |||||||  ||  | || ||||||||| ||||    
T  30698672 aaggactaaaattacatgtaattttatttttgtagggactaaaaatgttattaaaattaagtaaggactaaacttagaagtttccaattttatagggacc 30698573  T
Q  409 aaaaacatatttaaccc 425  Q
    |||||||||||||||||    
T  30698572 aaaaacatatttaaccc 30698556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 16966021 - 16965878
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||| ||||  |||||| |||||| ||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  16966021 tcaatttaaatttgtttaatttatgtttaaagtcttacgttttttaacaatattttgtagacgtgttaagaacattactaaaagttcctccgcaaaaaat 16965922  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttat 147  Q
    | | |||||| ||||||| || ||||||||||| ||| ||||||    
T  16965921 tatcgcaaaatttgatttttatgtccagattttattacttttat 16965878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 2263081 - 2262845
Alignment:
Q  11 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 110  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || |  ||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |  ||    
T  2263081 aaatttgtttaatt-atgcttaaacttttaaaattttgaacaattttttgcacaagtgttaagaacattacaaaaagttcatctgcaaaaaattatctca 2262983  T
Q  111 aaaattgatttatacgtccaga-ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaa 209  Q
    ||| || |||||| ||| |||| |||||||| |||||| || |||||||||  ||| |||||||| ||||||||||  |||||| ||       ||||||    
T  2262982 aaattttatttatgcgtacagatttttgttacttttattttgaacttttgtcttttaaaaaaatttatatttaatttatttcatatt-aaaaaattctaa 2262884  T
Q  210 attttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgt 248  Q
    ||||||||||| |||  ||| ||| |||||||| |||||    
T  2262883 attttagtaaacgaagtttttataatgttctaaacttgt 2262845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 9687798 - 9687715
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaag 87  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||    
T  9687798 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagtttttgaacaattttttgcagacgtgttaagaacattactaaaag 9687715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 32 - 138
Target Start/End: Original strand, 9924287 - 9924393
Alignment:
Q  32 aaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccag 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||| |||| || |||||| ||    
T  9924287 aaactcttgagtttttgaacaattttttacagacttgttaagaacattacttaaagttcctctgcaaaatattgtcacaaaatttgaattctacgtctag 9924386  T
Q  132 attttgt 138  Q
    |||||||    
T  9924387 attttgt 9924393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 214 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 6365383 - 6365214
Alignment:
Q  214 tagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaacatgg 313  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||        || || | ||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||  |  | ||    
T  6365383 tagtaaatgaacatttcatagttttctaaacttgtcttaaataaatctttaacaaattcaagagtttaaggataattatacaaactttgtttcagtaagg 6365284  T
Q  314 actaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaactt 383  Q
    | |||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  6365283 attaaaattataagtaatttttttttgtaggaactaaaaaaactattaaaattaagtaaggactaaactt 6365214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 345 - 425
Target Start/End: Original strand, 28237291 - 28237371
Alignment:
Q  345 gactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccc 425  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  28237291 gactaaaagaactattaaaattaagtaaggattaaacttgaaagatccctattttattgagaccaaaaacatatttaaccc 28237371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 6 - 185
Target Start/End: Original strand, 40272459 - 40272638
Alignment:
Q  6 aattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattg 105  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||     
T  40272459 aatttaaatttgtttaatt-atgcttaaacttttaagattttgaacaattttttgcacaagtgttaagaacattacgaaaagttcatctacaaaaaatta 40272557  T
Q  106 ttgcaaaaattgatttatacgtccag-attttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaatt 185  Q
    |  ||||| || |||| | ||||||| ||||||||| |||||| || |||||||||   || ||||||| |||||||||||    
T  40272558 tctcaaaattttatttctgcgtccagaattttgttacttttattttaaacttttgtctattaaaaaaatccatatttaatt 40272638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 334 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 10463712 - 10463621
Alignment:
Q  334 ttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccc 425  Q
    |||||| || ||||||||| | | |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10463712 ttttttttagggactaaaagaaccattaaaattaagtaaggactaaacttgaaaaacccctattttatagggaccaaaaacatatttaaccc 10463621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 341 - 426
Target Start/End: Original strand, 621955 - 622040
Alignment:
Q  341 tatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccct 426  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  621955 tatggactaaaagaactattaaaattaagtaagtattaaacttgaaaggtcccaattttatagagaccagaaacatatttaaccct 622040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 43210914 - 43210678
Alignment:
Q  11 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 110  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| | |  ||||||||| ||||  |||||||| | ||||||||||| |  ||    
T  43210914 aaatttgtttaatt-atgcttaaacttttaagattttgaacaattttttgtacaagtgttaagaacattaagaaaagttcttatgcaaaaaattatctca 43210816  T
Q  111 aaaattgatttatacgtccaga-ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaa 209  Q
    ||| || |||| | |||||||| |||||||| |||||| || |||||||||   ||  ||||||||||||||||||  |||||||||       || |||    
T  43210815 aaattttatttcttcgtccagatttttgttacttttattttgaacttttgtctcttagaaaaattcatatttaatttatttcatgttaaaaaattt-taa 43210717  T
Q  210 attttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgt 248  Q
    ||||||||||| ||||||||  || |||||||| |||||    
T  43210716 attttagtaaacgaaccttttgtaatgttctaaacttgt 43210678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 334 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 27307793 - 27307697
Alignment:
Q  334 ttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaa 430  Q
    |||||| || ||||||||| | | |||||||||||||||| | |||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27307793 ttttttttagggactaaaagaaccattaaaattaagtaaggactaaacttgaaaggcccctattttatagggaccaaaaacatatttaaccctaaaa 27307697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 260 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 28616065 - 28615906
Alignment:
Q  260 cgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctat 359  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |  |||| ||| |||||| | |||||  |||||||||  |||||||||| ||||    
T  28616065 cgttcaaagatttaagagtttaaggataataaaacaaactttgttttggcatgaact-aaattacatgtaat--ttttttgtagagactaaaaaaactat 28615969  T
Q  360 taaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaac 423  Q
    |||||||||||||| |  ||||||  ||| || | ||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  28615968 taaaattaagtaag-acaaaacttagaaattctcaattttatagagaccaaaaatatatttaac 28615906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 334 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 4425994 - 4425903
Alignment:
Q  334 ttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccc 425  Q
    |||||| || ||||||||| | | |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  4425994 ttttttttagggactaaaagaaccattaaaattaagtaaggactaaacttgaaagatccctattttatagggacgaaaaacatatttaaccc 4425903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 334 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 17742307 - 17742216
Alignment:
Q  334 ttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccc 425  Q
    |||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17742307 ttttttttaaggaataaaaaaactattaaaattaagtaagaactaaacttaaaaggtcccaattttatagggaccaaaaacatatttaaccc 17742216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 209 - 383
Target Start/End: Original strand, 27280360 - 27280531
Alignment:
Q  209 aattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaa 308  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||        |   | |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||     
T  27280360 aattttagtaaatgaacctttaataatgttctaaacttgtctaaaaaaaat---ttaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaaatttgttttag 27280456  T
Q  309 catggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaactt 383  Q
    || | |||||||||| | || | | ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||| | |||||||    
T  27280457 caggtactaaaattacatgtcaatattttttgtagggactaaaaatgctattaaaattaaataaggactaaactt 27280531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 335 - 435
Target Start/End: Original strand, 1683486 - 1683586
Alignment:
Q  335 tttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaaaata 434  Q
    ||||| || ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||  || |||||||||||||||||||||| ||||    
T  1683486 tttttttagggactaaaagaactattgaaattaagtaagaattaaacttaaaagatctcaattttataaggatcaaaaacatatttaaccctaaagaata 1683585  T
Q  435 t 435  Q
    |    
T  1683586 t 1683586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 194
Target Start/End: Original strand, 19332468 - 19332651
Alignment:
Q  11 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 110  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||| ||||||||| | |  ||||||||| ||||| |||||||| |||  |||||||| |  ||    
T  19332468 aaatttgtttaatt-atgcttaaacttttaagattttgaataattttttgtacaagtgttaagaacattacgaaaagttcatctcgaaaaaattatctca 19332566  T
Q  111 aaaattgatttatacgtccaga-ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatg 194  Q
    ||| || |||| | |||||||| |||| ||| |||||| || |||||||||  ||| |||||||||||||||||||  |||||||    
T  19332567 aaattttatttctgcgtccagattttttttacttttattttgaacttttgtcttttaaaaaaattcatatttaatttatttcatg 19332651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 262 - 429
Target Start/End: Original strand, 32510406 - 32510573
Alignment:
Q  262 ttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctatta 361  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||| | |||||||||| ||  | | ||| ||| || | ||||    ||||| || ||||||||||| ||||||    
T  32510406 ttcaaaaatttaagagtttaagattaattagagaaactttgttttattaggaactcaaactacatgtaaactatttttataaggactaaaaaaactatta 32510505  T
Q  362 aaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaa 429  Q
    |||||||||||| ||||||| |  ||  |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32510506 aaattaagtaaggattaaacatagaagttccaaattttatagggaccaaaaacatatttaaccctaaa 32510573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 6 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 3548638 - 3548280
Alignment:
Q  6 aattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattg 105  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| ||||| || | ||||||||||||| |||| | |  ||| ||||| |||| ||||| ||||||  ||| |||||     
T  3548638 aattaaaatttgtttaatt-atgcttaaacttttaactttttgaacaattatttgtagaagtgtcaagaacattattaaaaattcctcgacaagaaatta 3548540  T
Q  106 ttgcaaaaattgatttatacgtccagattttg-ttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnt 204  Q
    |  ||||| || |||| || |  || | |||| ||| ||||||||| ||||||||   ||| |||||||||||||||||||| |||||  ||       |    
T  3548539 tctcaaaatttaatttctatgcacaaaatttggttacttttatcttgaacttttggcattt-aaaaaattcatatttaattcatttcacattaaataatt 3548441  T
Q  205 tctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgtt 304  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||        |||||||||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||    
T  3548440 t--aaattttagtaaatgaacctttcataatgttctaaatttgtctaaaataaatcgttcaaatgtttaagtgtttaaggataattaaacaaa-tttttt 3548344  T
Q  305 gtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaa 368  Q
     ||| | ||| |||||||| | |||| || |||||||   ||||||||||  ||||||||||||    
T  3548343 ttaatagggattaaaattacatgtaaatcatttttgtggagactaaaaaagttattaaaattaa 3548280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 344 - 430
Target Start/End: Original strand, 42877941 - 42878027
Alignment:
Q  344 ggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaa 430  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||  || | ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  42877941 ggactaaaaaaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaaggtctcaattttatagggaccaaaaacatatttaacccaaaaa 42878027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 334 - 427
Target Start/End: Original strand, 41193299 - 41193392
Alignment:
Q  334 ttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaacccta 427  Q
    |||||| || ||||||||| | ||||||||||||| |||  | ||||||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  41193299 ttttttttagggactaaaagaactattaaaattaaataacgaataaacttgaaatatcccaattttatagggatcaaaaacatatttaacccta 41193392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 6365508 - 6365413
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||| ||| |   |||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  6365508 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactattaagtttttgaac-atttttcgcagatgcgttaagaacattagtaaaagttcctctgcaaaa 6365413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 334 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 8313183 - 8313091
Alignment:
Q  334 ttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccct 426  Q
    |||||| || ||||||||| | | |||||||||||||||| | ||||||||||| | | ||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  8313183 ttttttttagggactaaaagaaccattaaaattaagtaaggactaaacttgaaagacctctattttatagggatcaaaaacatatttaaccct 8313091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 334 - 421
Target Start/End: Original strand, 22023389 - 22023476
Alignment:
Q  334 ttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatattta 421  Q
    |||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||| |||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  22023389 ttttttctagggactaaaagaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaaggtcccaattttatagggaccaaaaacatattta 22023476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 346 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 40158226 - 40158140
Alignment:
Q  346 actaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaaaa 432  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||| |||  |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||    
T  40158226 actaaaagaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaaggtcccaattttatagggactaaaaacatatttaacccttaaaaa 40158140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 334 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 10674615 - 10674518
Alignment:
Q  334 ttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaaa 431  Q
    |||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||  | |||||||  ||  |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  10674615 ttttttataaggactaaaagaactattaaaattaagtaaagactaaacttataaggtcccaattttatagggaccaaaaacatatttaacccaaaaaa 10674518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 329 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 27280159 - 27280062
Alignment:
Q  329 aattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccct 426  Q
    |||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||| ||| |||   ||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  27280159 aatttttttttatagggactaaaaaacctattaaaattaagggaggactaaactttaaatatcttaattttatagagaccaaaaaaatatttaaccct 27280062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 37102995 - 37102907
Alignment:
Q  345 gactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaaaata 434  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||| |||||||||  | |||||||||||||||| ||||||||||    
T  37102995 gactaaaataactataaaaattaagtaaggattaaacttgaaaggtcccaattttatag-aatcaaaaacatatttaactctaaaaaata 37102907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 334 - 418
Target Start/End: Original strand, 3407211 - 3407295
Alignment:
Q  334 ttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatat 418  Q
    |||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||| | ||||||| |||  |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  3407211 ttttttatatggactaaaagcactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaaggtcccaattttatagggaccaaaaacatat 3407295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 359 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 4462522 - 4462446
Alignment:
Q  359 ttaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaaaatat 435  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| |||  |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  4462522 ttaaaattaagtaaggactaaacttaaaaggtcccaattttatagggaccaaaaacatatttaacccaaaaatatat 4462446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 334 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 19332435 - 19332351
Alignment:
Q  334 ttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatat 418  Q
    |||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||| | ||||||| |||  |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  19332435 ttttttatatggactaaaaacattattaaaattaagtaaggactaaacttaaaaggtcccaattttatagggaccaaaaacatat 19332351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 4 - 60
Target Start/End: Original strand, 26865232 - 26865288
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttg 60  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  26865232 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagttttttaacaattttttg 26865288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 335 - 418
Target Start/End: Original strand, 2263114 - 2263197
Alignment:
Q  335 tttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatat 418  Q
    ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||  | ||||||| | | ||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  2263114 tttttatatggactaaaaacactattaaaattaagtaaagactaaacttaagagatcccaattttatagggaccaaaaacatat 2263197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 334 - 433
Target Start/End: Original strand, 30403440 - 30403539
Alignment:
Q  334 ttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaaaat 433  Q
    |||||| || || |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||  |||  || | |||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30403440 ttttttatagggtctaaaaaaactattataattaagtaagaactaaactgaaaaggtcgcaattttacagggaccaaaaacatatttaacccaaaaaaat 30403539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 346 - 424
Target Start/End: Original strand, 9687838 - 9687916
Alignment:
Q  346 actaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaacc 424  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||  | || ||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  9687838 actaaaagaactattaaaattaagtaagtattaaacttaaaaggttccaattttatagggaccaaaatcatatttaacc 9687916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 13920035 - 13919945
Alignment:
Q  335 tttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccc 425  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||| |||   | | ||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  13920035 tttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaacatatttaaccc 13919945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 14050000 - 14049903
Alignment:
Q  32 aaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtcca 130  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||| ||||||||||||| |||  | ||||||| |  ||||| ||||||| ||||||||    
T  14050000 aaactcttaagtttttgaacaatttttggaacacatgttaagaacattactaaaagtttctccac-aaaaattatctcaaaatttgatttctacgtcca 14049903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 425
Target Start/End: Original strand, 38693759 - 38693849
Alignment:
Q  335 tttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccc 425  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||| |||   | | ||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  38693759 tttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaacatatttaaccc 38693849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 334 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 2004996 - 2004903
Alignment:
Q  334 ttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaacccta 427  Q
    ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||  || ||| | ||||| ||| |||| |||||||| |||||||||    
T  2004996 ttttttgtaaggattaaaaaagctattaaaattaaataagaactaaacttacaagatcgcaattttgtagggaccgaaaacataattaacccta 2004903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 196
Target Start/End: Original strand, 43209900 - 43210084
Alignment:
Q  11 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 110  Q
    |||| ||||||||| |||||  |||| || || ||||||||||||||||||| |  | ||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||| |  ||    
T  43209900 aaatctgtttaatt-atgcttgaacttttaagattttgaacaattttttgcacaagtattaagaacattaccaaaagttcttatgcaaaaaattatctca 43209998  T
Q  111 aaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt 196  Q
    ||| || |||| | ||||||||||||  | | ||| | |  |||||||||  ||| |||||| ||||||||||||  |||||||||    
T  43209999 aaattttatttcttcgtccagatttttcttactttttttcgaacttttgtcttttaaaaaaaatcatatttaatttatttcatgtt 43210084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 344 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 43538551 - 43538478
Alignment:
Q  344 ggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacata 417  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| |||  | || ||||||||| |||||||||||||    
T  43538551 ggactaaaagaactattaaaattaagtaataattaaacttaaaatgttccaattttatagggaccaaaaacata 43538478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 56
Target Start/End: Original strand, 8217510 - 8217562
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattt 56  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||    
T  8217510 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagttttttaacaattt 8217562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 32537687 - 32537608
Alignment:
Q  11 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgtt-aagaatattactaaaagttc 90  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||    
T  32537687 aaatttgtttaatt-atgcttaaacttttgagattttgaacaatgttttgcaaaagtgttaaagaacattactaaaagttc 32537608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 344 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 28456550 - 28456467
Alignment:
Q  344 ggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaacccta 427  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||   | ||||||| |||  |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28456550 ggactaaaataactattaaaattaagtattgactaaacttaaaaggtcctaattttatagggaccaaaaacatatttaacccta 28456467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 349 - 427
Target Start/End: Original strand, 8404735 - 8404813
Alignment:
Q  349 aaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaacccta 427  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||  || | |||||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  8404735 aaaaaaactattaaaattaagtaaagattaaacttaaaaggtctcaattttataggaatcaaaaacatatttaacccta 8404813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 335 - 425
Target Start/End: Original strand, 13920973 - 13921063
Alignment:
Q  335 tttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccc 425  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||| |||   | | |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  13920973 tttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttaaagggactaaaaacatatttaaccc 13921063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 348 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 27335589 - 27335511
Alignment:
Q  348 taaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccct 426  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||| |||  |||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27335589 taaaaaaactaataaaattaaggaagaactaaacttaaaaggtccgaaatttatagggaccaaaaacatatttaaccct 27335511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 334 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 36875833 - 36875743
Alignment:
Q  334 ttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaacc 424  Q
    |||||| || |||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||  ||| ||   |||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  36875833 ttttttataaggactaaaaagcctattaaaattaagtgaggattaaccttagaaagtcataatttaatagggaccaaaaacatatttaacc 36875743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 344 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 2003915 - 2003834
Alignment:
Q  344 ggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccc 425  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||||||| |||  |||| |||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  2003915 ggactaaaaaaactattaaaattaaataagatctaaacttaaaaggtcccaattttataggaaccaaaaaaataattaaccc 2003834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 356 - 437
Target Start/End: Original strand, 4462294 - 4462375
Alignment:
Q  356 ctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaaaatatta 437  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||| ||   |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||    
T  4462294 ctattaaaattaattaaggactaaacttaaatggtcccaattttatagggactaaaaacatatttaaccctagaatatatta 4462375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 334 - 423
Target Start/End: Original strand, 8218321 - 8218410
Alignment:
Q  334 ttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaac 423  Q
    ||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||| | ||||||| |||   | | ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  8218321 ttttttgtaaggactaaaaccactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaacatatttaac 8218410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 397 - 434
Target Start/End: Original strand, 26020312 - 26020349
Alignment:
Q  397 tttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaaaata 434  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26020312 tttatagggaccaaaaacatatttaaccctaaaaaata 26020349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 34527002 - 34526913
Alignment:
Q  335 tttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaacc 424  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||| |||   | | ||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  34527002 tttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatggctcaattttataaggactaaaaacatatttaacc 34526913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 42645181 - 42645089
Alignment:
Q  11 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaatt 104  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||| | || ||||||| ||||  |||| ||| | |||||||||||    
T  42645181 aaatttgtttaatt-atgcttaaacttttaagattttgaacaattttttgcacaaatattaagaacattaaaaaaatttcatatgcaaaaaatt 42645089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 358 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 8336791 - 8336723
Alignment:
Q  358 attaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccct 426  Q
    ||||||||||| |||| | ||||||| |||   ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  8336791 attaaaattaaataaggactaaacttaaaaggcccctattttataaggaccaaaaacatatttaaccct 8336723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 356 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 21837094 - 21837026
Alignment:
Q  356 ctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaacc 424  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| |||  || | ||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  21837094 ctattaaaattaagtaaggactaaacttaaaaggtctcaattttatagggactaaaaacatatttaacc 21837026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 91
Target Start/End: Original strand, 37812678 - 37812757
Alignment:
Q  11 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcc 91  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||| ||||    
T  37812678 aaatttgtttaatt-atgcttaaacttttaagattttgaacaattttttgcacaagtgttaagaacattacgaaaatttcc 37812757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 38693731 - 38693675
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttg 60  Q
    |||||| | ||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  38693731 tcaattcatatttgtttaatttatacttaaactcttaagttttttaacaattttttg 38693675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 334 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 40272430 - 40272346
Alignment:
Q  334 ttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatat 418  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||| | |||| || |||  |||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  40272430 ttttttatatggactaaaaacactattataattaagtaaggactaaatttaaaaggtcccaattttatagggacaaaaaacatat 40272346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 334 - 418
Target Start/End: Original strand, 43210947 - 43211034
Alignment:
Q  334 ttttttgtatggactaaaaa-ac--ctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatat 418  Q
    |||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| | ||||||| |||  |||| ||||||||| || |||||||||||    
T  43210947 ttttttatatggactaaaaacacgtctattaaaattaagtaaggactaaacttaaaaggtcccaattttatagggatcaaaaacatat 43211034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 432
Target Start/End: Original strand, 4000976 - 4001011
Alignment:
Q  397 tttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaaaa 432  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4000976 tttatagggaccaaaaacatatttaaccctaaaaaa 4001011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 5597814 - 5597755
Alignment:
Q  137 gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt 196  Q
    |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| | ||||||||||| || ||||||    
T  5597814 gttaattttatcttgaacttttggcgttttaaaaaaattatatttaattcattacatgtt 5597755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 12331155 - 12331120
Alignment:
Q  397 tttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaaaa 432  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12331155 tttatagggaccaaaaacatatttaaccctaaaaaa 12331120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 196
Target Start/End: Original strand, 24334041 - 24334100
Alignment:
Q  137 gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt 196  Q
    |||| ||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  24334041 gttagttttatcttgaatttttggcgttttaaaaaattcatatttaattcattacatgtt 24334100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 30734113 - 30733927
Alignment:
Q  109 caaaaattgatttatacgtccagatttt-gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttct 207  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||| |||| | || |||| ||||||||  ||||  ||||||||||||||||||| | |||||||       ||||    
T  30734113 caaaatttgatttctacgtccagatttttgttactcttttcttgaacttttgacgttt--aaaaattcatatttaattcttgtcatgtt-aaaaaattct 30734017  T
Q  208 aaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaa 297  Q
    |  ||||||||||||||| ||| ||| |||||||| | ||||||       | |||||||||||||||| || ||   ||||||||||||    
T  30734016 attttttagtaaatgaacattttataatgttctaaacatgtctccaaaaaattgttcaaaaatttaagaattcaagagtaattaaacaaa 30733927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 396 - 435
Target Start/End: Original strand, 32538752 - 32538791
Alignment:
Q  396 ttttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaaaatat 435  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32538752 ttttatagggaccaaaaacatatttaatcctaaaaaatat 32538791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 335 - 402
Target Start/End: Original strand, 42645214 - 42645281
Alignment:
Q  335 tttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttata 402  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||  ||||||||    
T  42645214 tttttatatggattaaaaacactattaaaattaagtaaggattaaacttaaaagatccaaattttata 42645281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 90
Target Start/End: Original strand, 42852775 - 42852822
Alignment:
Q  43 tttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttc 90  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||  |||||||||||||    
T  42852775 tttttgaacaattttttgcatacgtgttaagaacgttactaaaagttc 42852822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 397 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 18907539 - 18907505
Alignment:
Q  397 tttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaaa 431  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18907539 tttatagggaccaaaaacatatttaaccctaaaaa 18907505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 360 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 37812230 - 37812172
Alignment:
Q  360 taaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatat 418  Q
    |||||||||||||| | ||||||| |||  |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  37812230 taaaattaagtaaggactaaacttaaaaggtcccaattttatagggaccaaaaacatat 37812172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 397 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 4590889 - 4590856
Alignment:
Q  397 tttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaa 430  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4590889 tttatagggaccaaaaacatatttaaccctaaaa 4590856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 284 - 381
Target Start/End: Original strand, 11154722 - 11154818
Alignment:
Q  284 gataattaaacaaactttgttgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaac 381  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | ||| | |||||| |  ||| | |||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||    
T  11154722 gataattaaacaaactttgttttaatagggattgaaattacatataaatattttttata-ggactaaaaatgctattaaaattaagtaaagattaaac 11154818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 335 - 424
Target Start/End: Original strand, 18950977 - 18951066
Alignment:
Q  335 tttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaacc 424  Q
    |||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| | ||||||| |||   | | |||||| || ||| ||||||||||||||||    
T  18950977 tttttgtaaggattaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttacagggactaaaaacatatttaacc 18951066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 397 - 426
Target Start/End: Original strand, 21063913 - 21063942
Alignment:
Q  397 tttatagtgaccaaaaacatatttaaccct 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21063913 tttatagtgaccaaaaacatatttaaccct 21063942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 133 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 23425389 - 23425337
Alignment:
Q  133 ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattc 186  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||   |||| |||||||||||||||||||    
T  23425389 ttttgttaattttatcttgaacttttgcaatttt-aaaaattcatatttaattc 23425337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #121
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 334 - 423
Target Start/End: Original strand, 24637261 - 24637350
Alignment:
Q  334 ttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaac 423  Q
    ||||||||| ||||||||| | | |||||||||||||||| |||||| || |||  || | ||||||||  ||| |||| ||||||||||    
T  24637261 ttttttgtagggactaaaagaaccattaaaattaagtaaggattaaaattaaaaggtctccattttataaggactaaaatcatatttaac 24637350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #122
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 397 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 26910481 - 26910448
Alignment:
Q  397 tttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaa 430  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26910481 tttatagggaccaaaaacatatttaaccctaaaa 26910448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #123
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 45
Target Start/End: Original strand, 28456585 - 28456626
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagttt 45  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  28456585 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttgagttt 28456626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #124
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 31124540 - 31124499
Alignment:
Q  397 tttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaaaatattac 438  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  31124540 tttatagggaccaaaaacatatttaaccctagaatatattac 31124499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #125
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 335 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 38691953 - 38691864
Alignment:
Q  335 tttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaacc 424  Q
    ||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||| |||  || | |||||| ||  || ||||||||||||||||    
T  38691953 tttttataaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgtctcaattttacaggaactaaaaacatatttaacc 38691864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #126
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 397 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 39412797 - 39412764
Alignment:
Q  397 tttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaa 430  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39412797 tttatagggaccaaaaacatatttaaccctaaaa 39412764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #127
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 397 - 430
Target Start/End: Original strand, 41960457 - 41960490
Alignment:
Q  397 tttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaa 430  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41960457 tttatagggaccaaaaacatatttaaccctaaaa 41960490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #128
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 397 - 430
Target Start/End: Original strand, 43211847 - 43211880
Alignment:
Q  397 tttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaa 430  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43211847 tttatagggaccaaaaacatatttaaccctaaaa 43211880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 120)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 4 - 424
Target Start/End: Original strand, 30719479 - 30719899
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaa-acatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaa 102  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||||||||||| || |||||||||    
T  30719479 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttgagtttttgaacaattttttacaagacgtgttaagaacattactaaaagtttctatgcaaaaaa 30719578  T
Q  103 ttgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnn 202  Q
    |||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||          
T  30719579 ttgtcgcaaaatttgatttctacgtccaaattttgttaattttatctttaacttttgccgttttaaaaaattcatatttaattcgattcatgttaaaaaa 30719678  T
Q  203 nttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttg 302  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||       |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30719679 -ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttg 30719777  T
Q  303 ttgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttata 402  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| |||||||||  |||||||||||||    
T  30719778 ttgtaatagggactaaaattagaagtaattcttttttgtagggactaaaaaatctattaaaattaaataaggattgaacttgaaaggtccctattttata 30719877  T
Q  403 gtgaccaaaaacatatttaacc 424  Q
    | || ||||| |||||||||||    
T  30719878 gggatcaaaatcatatttaacc 30719899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 4 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 26805786 - 26805367
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26805786 tcaattcaaatttgtttaatt-atgcttaaactcttgaatttttaaacaattttttgtagacgtgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaaa 26805688  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
      |  ||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  26805687 attcacaaaatttgatttttacgttcagattttgttaattttatctttaacttttgtcgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaaaa 26805588  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 303  Q
     | |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||        | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26805587 atataaattttggtaaatgaacatttcttagtgttctaaacttgtcttaaaaaaatagttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgt 26805488  T
Q  304 tgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatag 403  Q
    ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||  |||| |||||||||    
T  26805487 tgtaatagggattaaaattagaagtaattcttttttgtaaggattaaaaaacctattaaaattaagtaaggactaaacttagaagttcccaattttatag 26805388  T
Q  404 tgaccaaaaacatatttaacc 424  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  26805387 ggaccaaaaacatatttaacc 26805367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Original strand, 35530783 - 35531204
Alignment:
Q  1 tcatcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaa 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||| | || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  35530783 tcatcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttgagcttttaaacaatcttttgtagacgtgttaagaacattactaaaagttcccctgcaaaa 35530882  T
Q  101 aattgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnn 200  Q
    || |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| | |||||||||||||||| ||||        
T  35530883 aaatgttgcaaaatttgatttctacgtccagattttgttaattttatctttaacttttatcattttaaaaaaattatatttaattcgtttcttgttaaaa 35530982  T
Q  201 nnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactt 300  Q
        |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||        |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35530983 aaaatctaaattttggtaaatgaacatttcatagtgttctaaatttgtct-taaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 35531081  T
Q  301 tgttgtaacatggactaaaattagaagtaa-ttcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctatttt 399  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||  ||  |||| |||||    
T  35531082 tgttgtaacagggactaaaattagaagtaattttttttttctaaggactaaaaaacttattaaaattaagtaaggactaaacttagaagttcccaatttt 35531181  T
Q  400 atagtgaccaaaaacatatttaa 422  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  35531182 atagggaccaaaaacatatttaa 35531204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 4 - 422
Target Start/End: Original strand, 19791239 - 19791656
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  19791239 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttgagtttttgaacaatttttcgcagacgtgttaagaacattactaaaagttcatctacaaaaaat 19791338  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
    ||| |||||| ||||||| ||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||           
T  19791339 tgtcgcaaaatttgatttctacctccaaaatttgttaattttatctttaacttttgtcgttataaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaa 19791437  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 303  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| |         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19791438 ttctaaattttagtaaatgaacatttcatagtgttataaacttg-cataaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 19791536  T
Q  304 tgtaacatggactaaaattagaagtaa-ttcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttata 402  Q
     |||||| |||||||| |||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| |||| | |||| ||  ||  || | ||||||||    
T  19791537 cgtaacaaggactaaacttagaagtaattttttttttgtagggactaaataacctataaaaattaaataaggactaaatttagaagttctcaattttata 19791636  T
Q  403 gtgaccaaaaacatatttaa 422  Q
    | ||||||||||||| ||||    
T  19791637 gggaccaaaaacataattaa 19791656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 4 - 425
Target Start/End: Original strand, 43504775 - 43505187
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  || |  ||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||| |    
T  43504775 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaacttttgagtttttgaacaatttttaacagaagtgttaagaacattacgaaaagttcatctacaaaaagt 43504874  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
    ||||| |||  ||||||| ||||||||||||||||||||||       ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||           
T  43504875 tgttgtaaat-ttgatttttacgtccagattttgttaattt-------aacttttgtcgttctaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaaa- 43504965  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 303  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||          |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  43504966 ttccaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtctaaaaaaaacagttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaattttgt 43505065  T
Q  304 tgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatag 403  Q
    ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| | || ||||||||     
T  43505066 tgtaagaaggactaaaatttgaagtaattcttttttgtagagactaaaaaacctattaaaattaagtaaggatcaaacttaaaaatttccaattttataa 43505165  T
Q  404 tgaccaaaaacatatttaaccc 425  Q
     ||||| |||||||||||||||    
T  43505166 ggaccagaaacatatttaaccc 43505187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 36368185 - 36367825
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  36368185 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagttttttaacaattttttgtagacgtgttaagaacattactaaaagtttctccgcaaaaaat 36368086  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
    | | |||||| || ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||           
T  36368085 tatcgcaaaatttaatttatatgtccagattttattacttttatctttaaattttatcgttttcaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaa 36367987  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 303  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||       ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36367986 ttctaaattttagtaattaaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaatttatgagtttaaaaataattaaacaaactttgt 36367887  T
Q  304 tgtaacatggactaaaattagaagtaa-ttcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaa 364  Q
    | || || ||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  36367886 tttagcagggactaaaattagaagtaattttttttttgtagggactaaaaaacctactaaaa 36367825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 432
Target Start/End: Original strand, 52493528 - 52493956
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  52493528 tcaattcaaatttgattaatttatgcttaaactcttaagttttttaacaattttttgtagacgtgttaagaacattactaaaagttcctccgcaaaaaat 52493627  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
    | | |||||| ||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  52493628 tatcgcaaaatttgatttctacttccagattttattacttttatctttaagttttgccattttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaa 52493726  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtct-cnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttg 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  52493727 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctaaaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttg 52493826  T
Q  303 ttgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttata 402  Q
    || ||  | ||||||| ||||||||||| |  ||||||||  |||   |||| |||||||||||||||||| || ||||||  ||  | || ||||||||    
T  52493827 ttttaggagggactaatattagaagtaaatgatttttgtaacgacggcaaaaactattaaaattaagtaaggatcaaacttagaagtttccaattttata 52493926  T
Q  403 gtgaccaaaaacatatttaaccctaaaaaa 432  Q
      ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  52493927 aggaccaaaaacataattaacccaaaaaaa 52493956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 6 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 26020692 - 26020373
Alignment:
Q  6 aattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattg 105  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||    
T  26020692 aattcaaatttgtttaatttatgcttaaaatcttgagtttttgaacaattttttgcagacgtgttaagaacattactaaaagctcctctacataaaattg 26020593  T
Q  106 ttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnntt 205  Q
    | |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||       ||    
T  26020592 tcgcaaaatttgatttctacgttcagattttgttaattttatctttaaattttgccgttttaaaaaattcatatttaattcatttaatgtt-aaaaaatt 26020494  T
Q  206 ctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttg 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |       ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26020493 ctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttataaacttgtcacaaaaaaatcgttcaaaaattcaagagtttaatgataattaaacaaactttgttg 26020394  T
Q  306 taacatggactaaaattagaa 326  Q
    |||||  ||||||||||||||    
T  26020393 taacagagactaaaattagaa 26020373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 364
Target Start/End: Original strand, 11999725 - 12000077
Alignment:
Q  11 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 110  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||| || |||||||| | || ||    
T  11999725 aaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagttttttaataattttttgtagacgtgttaagaacattactaaaagttcatccgcaaaaaaatatttca 11999824  T
Q  111 aaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaa 210  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||  || |||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||       |||||||    
T  11999825 aaatttgatttatatgtccagattttagtacttttatctttaatttttatcgtttttaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaattctaaa 11999923  T
Q  211 ttttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaaca 310  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||| | ||||||       |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || ||    
T  11999924 ttttagtaattgaacatttcatagtgttctaaacatgtctcaaaataatcgttcaaaaatttaagactttaaggataattaaacaaactttgttttagca 12000023  T
Q  311 tggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaa 364  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  12000024 gggactaaaattagaagtaatttttttttgtagggactaaaaaatctactaaaa 12000077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 30982677 - 30982314
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| | || |||||||||  |||||||||||||||| || ||||||    
T  30982677 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagttttttaacaattttttgtagacgtgttaagaactttactaaaagttcctccgctaaaaat 30982578  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
    | |  ||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||           
T  30982577 tatcacaaaatttgatttatatgtccagattttattacttttatctttaacttttatcgttttcaaaaattcatatttaattcgcttcatgtt-aaaaaa 30982479  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 303  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||       |||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||    
T  30982478 ttctaaattttagtaattgaacctttcatattgttctaaacttgtctcgaaaaaatcgttcaaaaatttaagattttaaggatatttaaacaaactttgt 30982379  T
Q  304 tgtaacatggactaaaattagaagtaa-ttcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaatta 367  Q
    | || || ||||||| ||| ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  30982378 tttagcagggactaatatttgaagtaattttttttttgtagggactaaaaaacctactaaaatta 30982314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 165; E-Value: 7e-88
Query Start/End: Original strand, 83 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 46517388 - 46517047
Alignment:
Q  83 aaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatattta 182  Q
    ||||| |||||| |||||||||||  || || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  46517388 aaaaggtcctctacaaaaaattgtcacataatttgatttctacgtccagattttgttaattttatctttaacttttttcgttttaaaaaattcatattta 46517289  T
Q  183 attcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaa 282  Q
    ||||||||||||||       | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |       ||| |||||| |||||||||||||    
T  46517288 attcgtttcatgttaaaaaagt-ctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtcccaaaaaaatcgatcaaaattttaagagtttaa 46517190  T
Q  283 agataattaaacaaactttgttgtaacatggactaaaattagaagtaa-ttcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaac 381  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||    
T  46517189 ggataattaaacaaactttgttgtaagatggactaaaattcgaagtaattttttttttgtagggactaaaatatctattaaaattaagtaaggattaaac 46517090  T
Q  382 ttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaacc 424  Q
    ||  ||  | |  || |||||| ||||||||||||||||||||    
T  46517089 ttagaagttgctaatcttatagggaccaaaaacatatttaacc 46517047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 4 - 297
Target Start/End: Original strand, 13501206 - 13501496
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  13501206 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttgagtttttgaacaattttttacagacgtgttaataacattactaaaagttcctatgcaaaaaat 13501305  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
    ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  13501306 tgtcgcaaaatttgatttctacgtccagattttgttaattttatttttaacttttgccgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaa 13501404  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaa 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||       | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13501405 ttctaaattttagtaaatgaacctttc--agtgttctaaacttgtctcaaaaaaattgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaa 13501496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 4 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 33709240 - 33708880
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||| || |||| |||||||||||| | || ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  33709240 tcaattcaaatttgtttaatttatacttaaactcttaagatttttaacaattttttgtagacgtgttaagaacattcctaaaagttcctccgcaaaaaat 33709141  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
    | | |||||| |||||||||| ||| | ||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||           
T  33709140 tatcgcaaaatttgatttatatgtctaaattttattacttttatctttaacttttatcgttttcaaaaattcatatttaattcttttcatatt-aaaaaa 33709042  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 303  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||       |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33709041 ttctaaattttagtaattgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgt 33708942  T
Q  304 tgtaacatggactaaaattagaagtaattc-ttttttgtatggactaaaaaacctattaaaa 364  Q
    | ||  | |||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||| |||||    
T  33708941 tttagaagggactaaaattagaagtaatactttttttttagggactaaaaaacctactaaaa 33708880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 4 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 51561642 - 51561211
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  51561642 tcaattcaaatttgtttactttatgtttaaactcttgagtttttgaacaattttttacagacgtgttaagaacattactaaaagttcctatgcaaaaaat 51561543  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
    ||| |||||| ||||||| ||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  51561542 tgtcgcaaaatttgatttctacgttcaaattttgtttattttatttttaacttttgccattttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaa 51561444  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||       |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||       
T  51561443 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatttaacaaatttgaa 51561344  T
Q  304 tgtaacatggactaa-aattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttata 402  Q
    |  |  | ||||||| | | ||     ||| || | | || ||||||||| | | |||||||||||| ||| | |||| ||||||  |||||||||||||    
T  51561343 ttgaggagggactaatagtgagtgcatatttttatatttagggactaaaagaaccattaaaattaagcaaggactaaagttgaaaggtccctattttata 51561244  T
Q  403 gtgaccaaaaacatatttaaccctaaaaaatat 435  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  51561243 gggaccaaaaacatatttaaccctaaataatat 51561211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 242
Target Start/End: Original strand, 28700954 - 28701192
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaatttt-ttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaa 102  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28700954 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttgagtttttgaacaatttttttgcaaatgtgttaagaatattactaaaagttcctctgcgaaaaa 28701053  T
Q  103 ttgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnn 202  Q
    |||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||          
T  28701054 ttgtagcaaaatttgatttccacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgtcgttttaaaaaattcatatttaattcgttttatgtt-aaaaa 28701152  T
Q  203 nttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaa 242  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28701153 gttctaaattttagtaaatgaacctctcatagtgttctaa 28701192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 46597070 - 46596708
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  46597070 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagttttttaacaattttttgtagacgtgttaagaacattactaaaagttcatccgcaaaaaat 46596971  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
    | | |||||| ||  || ||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||           
T  46596970 tatcgcaaaatttagttgatatgtccaga-tttattacttttatctttaacttttatcgttttcaaaaattcatatttaattcgttttatgttaaaaaaa 46596872  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 303  Q
     ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| |||||||         |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  46596871 -tctaaattttaataattgaacctttcacagtgttctaaacttgtctaaaaaaaaccgttcaaaaatttaagagtttaagaataattaaacaaactttgt 46596773  T
Q  304 tgtaacatggactaaaattagaagtaa-ttcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaatta 367  Q
    | || ||| |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||    
T  46596772 tttagcatagactaaaattagaagtaattttttttttgtagggactaaaaaatctactaaaatta 46596708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 32 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 47008913 - 47008697
Alignment:
Q  32 aaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccag 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||     
T  47008913 aaactcttgagtttttgaacaattttttacagacgtgttaagaacattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaatttaatttctacgtccac 47008814  T
Q  132 attttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttca 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||       |||||||||||||||||| |||||||||    
T  47008813 attttgttaattttatctttaacttttgtcgttttaaaaaattcatatttaattcgttttatgtt--aaaaattctaaattttagtaaataaacctttca 47008716  T
Q  232 tagtgttctaaccttgtct 250  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  47008715 tagtgttctaaacttgtct 47008697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 10041528 - 10041119
Alignment:
Q  11 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 110  Q
    |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||  |    ||||||  | |||||||||||||||||| | ||||||||| |||    
T  10041528 aaatttgtttaatttatgtttaaattcttgagtttttaaacaattttttataggtgtgttaaacacattactaaaagttcctcttcgaaaaattgtcgca 10041429  T
Q  111 aaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaa 210  Q
    ||| || |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||| | |||||       || ||||    
T  10041428 aaatttaatttctacgttcagattttattaattttatctttaacttttgccgttttagaaaatttatatttaattcgtataatgttaaaaaaatt-taaa 10041330  T
Q  211 ttttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaaca 310  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||        ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  10041329 ttttggtaaatgaacctttcatggtgttctaaacttttcttaaaaaaatcgttaaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttaatgtaaca 10041230  T
Q  311 tggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggact-aaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgacca 409  Q
     |||||||||||||| |||||  |||  |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| | |||||||  ||  || | | ||||||  |||||    
T  10041229 gggactaaaattagatgtaat--tttcatgtaaggactaaaaaaacatattaaaattaagtaaggactaaacttagaagttctcaactttataaggacca 10041132  T
Q  410 aaaacatatttaa 422  Q
    |||||||||||||    
T  10041131 aaaacatatttaa 10041119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 4 - 427
Target Start/End: Original strand, 31400219 - 31400640
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| ||||||||||| || || |||||||||  ||| |||||| ||||| | ||||||     
T  31400219 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttaagtttttcaacaattttttacagacgtgttaagaacgttattaaaaggtcctccg-aaaaaaa 31400317  T
Q  104 tgttgcaaaaa-ttgatttatacgtccaga-ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnn 201  Q
    | | ||||||| ||||||| |||||||| | |||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |         
T  31400318 tatcgcaaaaatttgatttctacgtccatatttttgttacttatatcttaaacttttgtcgttttaaaaaattcatatttaatttatttcatgat-aaaa 31400416  T
Q  202 nnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaacttt 301  Q
      || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |        ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||| |||    
T  31400417 aattatagattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtataaaaagaatcgttaaaatatttaagagtttaaggataattaagcaaaattt 31400516  T
Q  302 gttgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttat 401  Q
     || || || |||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||  || ||| | |||||||    
T  31400517 attttagcagggactaaaattataagt-atttttttttgtagggattaaaaaagctattaaaattaagtaaggactaaacttagaagatcgcaattttat 31400615  T
Q  402 agtgaccaaaaacatatttaacccta 427  Q
    || || | ||||||||||||||||||    
T  31400616 ag-gaaccaaaacatatttaacccta 31400640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 4 - 339
Target Start/End: Original strand, 36248333 - 36248658
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||                
T  36248333 tcaattcaaatttgtttaatttattcttaaactcttaagttttttaacaatttcttgtagacatgttaagaatattactaaaagttcc------------ 36248420  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattt----tatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnn 199  Q
     || |||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| |||    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||       
T  36248421 -gtcgcaaaatttgatttatatgtccatattttattactttaatttatctttaacttttattgttttcaaaaattcatatttaatttgtttcatgttaaa 36248519  T
Q  200 nnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaact 299  Q
        || ||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||       || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36248520 aaattt-taaattttattaattgaacctttcatagtgttttaaacttgtctcaaaaaattcattcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaact 36248618  T
Q  300 ttgttgtaacatggactaaaattagaagtaattctttttt 339  Q
    ||||| ||  | ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36248619 ttgttttagtagggactaaaattagaagtaattttttttt 36248658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 12368518 - 12368185
Alignment:
Q  11 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 110  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||| | || ||||||||| |||| |||||||||| | ||||||              
T  12368518 aaatttgtttaatttattcttaaactcttaagttttttaacaattttttgtagacgtgttaagaacattattaaaagttccgccgcaaaat--------- 12368428  T
Q  111 aaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaa 210  Q
        |||||||||| || || ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||       |||||||    
T  12368427 ----ttgatttatatgttcatattttattacttttatctttaacttttattgttttcaaaaattaatatttaatacgtttcatgttaaaaaa-ttctaaa 12368333  T
Q  211 ttttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaaca 310  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||       |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  |    
T  12368332 ttttattaattgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaattcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgttttagta 12368233  T
Q  311 tggactaaaattagaagtaat----tcttttttgtatggactaaaaaa 354  Q
     ||||||||||||||||||||    | ||||||||| |||||||||||    
T  12368232 gggactaaaattagaagtaattttattttttttgtagggactaaaaaa 12368185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 204 - 428
Target Start/End: Original strand, 21794533 - 21794756
Alignment:
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 303  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| || | |||||| ||||||||       |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  21794533 ttctaaattttagttaatgaacctttcttaatattctaaacttgtctcaaaaaattcgtacaaaaatttaagagtttaaggataattaagcaaactttgt 21794632  T
Q  304 tgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatag 403  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||  |||| |||||||||    
T  21794633 tgtaatagggactaatattagaagtaatt-ttttttgtaaggacttaaaaacctattaaaattaagtaaggactaaacttataagttcccaattttatag 21794731  T
Q  404 tgaccaaaaacatatttaaccctaa 428  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  21794732 ggaccaaaaacatatttaaccctaa 21794756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 6 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 33707663 - 33707242
Alignment:
Q  6 aattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattg 105  Q
    |||| |||||||||||||| || || |||||||| | |||||||||||| ||||||| || |||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||     
T  33707663 aatttaaatttgtttaatt-attcttaaactcttaattttttgaacaatcttttgcagacgtgttgagaacattactaaaagttccttcgcaaaaaatta 33707565  T
Q  106 ttgcaaaaattgatttatacgtccagatttt-gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnt 204  Q
    |  ||||| ||||||| ||||| || ||||| |||  ||||||||| ||||||| | |||| |||||||| ||||||||| | |||||| ||       |    
T  33707564 tctcaaaatttgatttctacgttcaaatttttgttgcttttatcttgaacttttatcgtttgaaaaaatttatatttaatacatttcatattaaaaaaat 33707465  T
Q  205 tctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaattta-agagtttaaagataattaaacaaactttgt 303  Q
    | |||||||||||||||||| ||||  || |||| ||| ||||||||        | |||||   |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33707464 t-taaattttagtaaatgaaacttttgtaatgttttaaacttgtctcagaaaatactttcaattttttttagagtttaaggataattaaacaaactttgt 33707366  T
Q  304 tgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatag 403  Q
    | |||||||||||||||||| | |||| | |||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||  |  | |||||||||    
T  33707365 tttaacatggactaaaattacatgtaaatattttttctaaggactgaaaaaactattaaaattaagtaaggattaaacttaaaagttttcaattttatag 33707266  T
Q  404 tgaccaaaaacatatttaacccta 427  Q
      ||||||||||||||||||||||    
T  33707265 gaaccaaaaacatatttaacccta 33707242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 4 - 369
Target Start/End: Original strand, 21091051 - 21091412
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||  |||||||||||| | || ||||| ||| |||||  ||||||| ||  ||| ||||    
T  21091051 tcaattcaaatttgtttagtttatgtttaaactcttaagtttta-aacaattttttgtagacgtgttacgaacattacataaagttcatccacaataaat 21091149  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
    | |  ||||| |||||||||| || |||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||  |||           
T  21091150 tatctcaaaatttgatttatatgttcagattttattactttaatctttaacttttgatgtttt-aaaaattcatatttaattcatttcgcgtt-aaaaaa 21091247  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 303  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||        |||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| ||||    
T  21091248 ttataaattttaataaatgaacctttcacagtgttctaaacttgtctaaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttgaggataatcaaacaaacattgt 21091347  T
Q  304 tgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaag 369  Q
      || || |||||||||||| |||||||| | |||| || ||||||||||  ||||||||||||||    
T  21091348 cttagcagggactaaaattataagtaatt-tattttttagggactaaaaagactattaaaattaag 21091412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 339
Target Start/End: Original strand, 15053640 - 15053953
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||| |  || |||||    
T  15053640 tcaattcaaatttgtttaatttattcttaaactcttaagttttttaacaattttttgtagacgtgttaagaacattactaaaagttccgc--cacaaaat 15053737  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
    |           ||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||           
T  15053738 t-----------tgatttatatgtccatattttattacttttatctttaacttttattgttttcaaaaatttatatttaattcgtttcatgtt-aaaaca 15053825  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 303  Q
    |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||| ||||||||       | |||||||||||||||        ||||||||||||||||||||    
T  15053826 ttctaaattttattgattgagcctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaatttgttcaaaaatttaag--------gataattaaacaaactttgt 15053917  T
Q  304 tgtaacatggactaaaattagaagtaattctttttt 339  Q
    | ||  | ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15053918 tttagtagggactaaaattagaagtaattttttttt 15053953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 294 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 47008682 - 47008553
Alignment:
Q  294 caaactttgttgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccc 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||  ||||    
T  47008682 caaactttgttgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtagggactaaaaaacctattaaaattaagtaaggattgaacttagaagttccc 47008583  T
Q  394 tattttatagtgaccaaaaacatatttaac 423  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  47008582 aattttatagggaccaaaaacatatttaac 47008553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 142 - 428
Target Start/End: Original strand, 2059484 - 2059769
Alignment:
Q  142 ttttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttcta 241  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||       |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  2059484 ttttatctttaactttt-tcgttttaaaatattcatatttaatttgtttcatgttaacaaa-ttctaaattttagtaaatgaaccttttataatgttcta 2059581  T
Q  242 accttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaacatggactaaaattagaagtaattct--ttttt 339  Q
    | ||| |||        |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |  |||||||||||| ||||| |  |||||    
T  2059582 aacttatct-aaaaaaatcgttcaaaaatttaaaagtttaaggataattaaacaaattttgttttaacaggatctaaaattagaaataatttttgttttt 2059680  T
Q  340 gtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaa 428  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||  ||  || ||||||||||  ||| |||| |||||| ||| ||||    
T  2059681 gtagggactaaaaatcctattaaaattaagtaaagattaaacttagaagttctctattttataaggactaaaatcatattcaactctaa 2059769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 94 - 304
Target Start/End: Original strand, 39681883 - 39682094
Alignment:
Q  94 tgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcg-tttca 192  Q
    ||||||||||| | |||||| ||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||||| || |||||    
T  39681883 tgcaaaaaattatcgcaaaatttgatttctacatccagattttattacttttatctttaacttttatcgttttaaaaaaatcctatttaatccgttttca 39681982  T
Q  193 tgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaa 292  Q
    ||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||        | ||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  39681983 tgttaaaaaaattctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttttaaacttgtcttaaaaaaattgttcataaacttaagagtttaaggataattaa 39682082  T
Q  293 acaaactttgtt 304  Q
    ||||| ||||||    
T  39682083 acaaattttgtt 39682094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 174 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 37986869 - 37986691
Alignment:
Q  174 tcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaattta 273  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||       |||||||||||||||    
T  37986869 tcatatttaattcgtttcatgttaaacaa-ttctaaattttattaattgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaattcgttcaaaaattta 37986771  T
Q  274 agagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaa 354  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||| | || || ||||||||| |||||||||||    
T  37986770 agagtttaaggataattaaacaaactttgttttagtagggactaaaattag-actattttttttttgtagggactaaaaaa 37986691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 118 - 431
Target Start/End: Original strand, 48410258 - 48410570
Alignment:
Q  118 atttatacgtccagatttt-gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttag 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||  ||| |||||||| ||||||||| | |||||||||       |||||||||||||    
T  48410258 atttatacgtccagatttttgttacttttatcttgaacttttgtcttttaaaaaaatt-atatttaatccatttcatgttaaaaaa-ttctaaattttag 48410355  T
Q  217 taaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaacatggact 316  Q
    | |  ||||||||  || | || ||| ||||||||         |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||| ||| |  ||||    
T  48410356 tgaccgaaccttttgtaattttttaaacttgtctcaaaaagactgttcaaaaatttaagagtttaaggataattagagaaactttgttttaataatgact 48410455  T
Q  317 aaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacat 416  Q
    |||| || | |||| |  ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||  | |  ||||||||| ||||||||||||    
T  48410456 aaaactacatgtaaattatttttatagggactaaaaaagctattaaaattaagtaaggactaaacttaaaagtttcaaattttatagggaccaaaaacat 48410555  T
Q  417 atttaaccctaaaaa 431  Q
    |||||| ||||||||    
T  48410556 atttaatcctaaaaa 48410570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 82 - 426
Target Start/End: Original strand, 35188250 - 35188587
Alignment:
Q  82 taaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaatt-gatttatacgtccagatttt-gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatat 179  Q
    |||||||||||| |||||||| | | ||||||||| ||||| ||| |  | ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||||    
T  35188250 taaaagttcctcagcaaaaaaatatcgcaaaaatttgatttctacatttatatttttgttacttttatcttaaacttttgttgtttaaaaaaaat-atat 35188348  T
Q  180 ttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtt 279  Q
    ||||||  |||||||||       ||||| ||||||||| ||||| |||||| || ||| ||| ||||||||       ||||| |||||||||     |    
T  35188349 ttaatttatttcatgttaaaaaa-ttctatattttagtatatgaatctttcagagagttttaaacttgtctcaaaaaaatcgttaaaaaattta-----t 35188442  T
Q  280 taaagataattaaacaaactttgttgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaa 379  Q
    ||| || | |||||||||||||||| || || |||||||||||| |||||||  |||||| || ||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  35188443 taaggacagttaaacaaactttgttttagcagggactaaaattataagtaat--ttttttttagggattaaaaaagctactaaaattaagtaaggattaa 35188540  T
Q  380 acttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccct 426  Q
    ||||  ||  || | ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35188541 acttataagttctcgattttatagggaccaaaaacatatttaaccct 35188587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 44 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 7565435 - 7565175
Alignment:
Q  44 ttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccagatttt-gttaat 142  Q
    ||||||||||||| ||| | || |||||| || |||| ||||| ||| || | |||||||| |  ||||| ||||||| || ||||| ||||| ||||||    
T  7565435 ttttgaacaatttcttgtagacgtgttaaaaacattaataaaaattcatccgtaaaaaattatctcaaaatttgatttctatgtccatatttttgttaat 7565336  T
Q  143 tttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaa 242  Q
    |||||||| ||||||| | |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||       ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  7565335 tttatcttgaacttttctcgtttaaaaaaattcatattaaattcatttcatgtt-aaaaaattctaaattttagtaaatgtacctttcgtaatgttctaa 7565237  T
Q  243 ccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgtt 304  Q
     ||||||||       ||||| ||||| |||||||||| |||||||||  ||||| ||||||    
T  7565236 acttgtctcataaaaatcgttaaaaaagttaagagtttgaagataattgtacaaaatttgtt 7565175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 104
Target Start/End: Original strand, 21794417 - 21794510
Alignment:
Q  11 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaatt 104  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  21794417 aaatttgtttaatttatgcttaaactcttgagtttttgaacaattttttgcacacgtgttaagaacattaataaaagttcctctacaaaaaatt 21794510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 284 - 428
Target Start/End: Original strand, 28701194 - 28701339
Alignment:
Q  284 gataattaaacaaactttgttgtaacatggactaaaattagaagtaa-ttcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaact 382  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  28701194 gatagttaaacaaactttgttgtaacagggactaaaattagaagtaatttattttttgcagggactaaaaaacctattaaaattaagtaaggactaaact 28701293  T
Q  383 tgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaa 428  Q
    | |||  ||   ||||||||| | | || |||||||||||||||||    
T  28701294 taaaagttcgtaattttatagagtctaagaacatatttaaccctaa 28701339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 11 - 229
Target Start/End: Original strand, 49767693 - 49767910
Alignment:
Q  11 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 110  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||| |  | ||||||| || || |||||||  ||||||||||||| |  ||    
T  49767693 aaatttgtttaatt-atgcttaaacttttaagattttgaacaattttttgcacaagtattaagaacatcacgaaaagtttatctgcaaaaaattatctca 49767791  T
Q  111 aaaattgatttatacgtccaga-ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaa 209  Q
    |||||| |||| | |||||||| |||||||| |||||| || |||||||||  ||| |||||||||||||||||||  |||||||||       ||||||    
T  49767792 aaaatttatttctgcgtccagatttttgttacttttattttaaacttttgtcttttaaaaaaattcatatttaatttatttcatgtt-aaaaaattctaa 49767890  T
Q  210 attttagtaaatgaaccttt 229  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  49767891 attttagtaaacgaaccttt 49767910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 164 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 5430699 - 5430438
Alignment:
Q  164 tttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgtt 263  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||       |||||||||| |||||||||| ||||  || |||| ||| |||||||         ||||    
T  5430699 tttaaaaaaatcatatttaattcattttatgttaaaaaa-ttctaaatttcagtaaatgaatcttttgtaatgttataaacttgtcttagaaaaaccgtt 5430601  T
Q  264 caaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaa 363  Q
    ||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||||| || || || |||||||||   |||| | ||||||| | |||||||||||  |||||||    
T  5430600 caaaaatttacaagtttaaggataattaaacaaaatttgttttagcaggggctaaaattacgtgtaaatattttttgcaaggactaaaaaaattattaaa 5430501  T
Q  364 attaagtaagaattaaacttgaaaaatc-cctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccct 426  Q
    |||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||    
T  5430500 attaagtaagaattaaactt-aaaagtctccaattttatagagactaaaaatatatttaaccct 5430438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 12251656 - 12251439
Alignment:
Q  11 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 110  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |  ||    
T  12251656 aaatttgtttaatt-atgcttaaacttttaagattttgaacaattttttgcacaagtgttaagaacattacgaaaagttcatctgcaaaaaattatctca 12251558  T
Q  111 aaaattgatttatacgtccag-attttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaa 209  Q
    ||| || |||| | ||||||| ||||||||| |||||| || |||||||||   || ||||||| |||||||||||  |||||| ||       ||||||    
T  12251557 aaattttatttctgcgtccagaattttgttacttttattttgaacttttgtctattaaaaaaatccatatttaatttatttcatatt-aaaaaattctaa 12251459  T
Q  210 attttagtaaatgaaccttt 229  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  12251458 attttagtaaacgaaccttt 12251439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 31024344 - 31024051
Alignment:
Q  11 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 110  Q
    ||||||||| |||| ||| | ||||||||  ||||||||||||||| ||| | || ||||||||  |||||||||||||| || | || ||||| |   |    
T  31024344 aaatttgttcaatt-atgtttaaactcttatgtttttgaacaatttcttgtagacgtgttaagaccattactaaaagttcatccgtaacaaattatctta 31024246  T
Q  111 aaaattgatttatacgtccaga-ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaa 209  Q
    ||| ||||||| || || || | |||||||||||||||||| ||||||| | |||| |||||||||||||| ||| | |||||||||       | |||     
T  31024245 aaatttgatttctatgttcatatttttgttaattttatcttgaacttttttcgtttaaaaaaattcatattaaatacatttcatgttaaaaaaatcctag 31024146  T
Q  210 attttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgtt 304  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |       ||||| ||||| ||||||| || | |||||||| ||||| ||||||    
T  31024145 attttagtaaatgaacctttcgtagtgttctaaacttatcccataaaaatcgttaaaaaagttaagagcttgaggataattatacaaaatttgtt 31024051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 204 - 427
Target Start/End: Original strand, 42972167 - 42972386
Alignment:
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||   ||||||       ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||  | ||    
T  42972167 ttctaaattttagtaaatgaaccttttataatcttctaaaagtgtctccgaaaaatcgttaaaaaatttaagagtttaaggataattaaaaaaa--tagt 42972264  T
Q  304 tgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatag 403  Q
    | || ||  ||||||||||  | |||||| ||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| |||  || | |||||||||    
T  42972265 tttagcaaagactaaaattgcatgtaatt-ttttttgta-ggaataaaaaatatattaaaattaagtaaggactaaacttaaaagttctcaattttatag 42972362  T
Q  404 tgaccaaaaacatatttaacccta 427  Q
     ||||||||||||| |||||||||    
T  42972363 ggaccaaaaacataattaacccta 42972386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 262 - 381
Target Start/End: Original strand, 20357192 - 20357310
Alignment:
Q  262 ttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctatta 361  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | || ||| || || |||||||||||| | |||||| |||||| || ||||||||||| ||||||    
T  20357192 ttcaaaaatttaagattttgaagataattaaacagatttagttttagcagggactaaaattacatgtaatt-ttttttatagggactaaaaaaactatta 20357290  T
Q  362 aaattaagtaagaattaaac 381  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  20357291 aaattaagtaagaaataaac 20357310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 262 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 20562763 - 20562645
Alignment:
Q  262 ttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctatta 361  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | || ||| || || |||||||||||| | |||||| |||||| || ||||||||||| ||||||    
T  20562763 ttcaaaaatttaagattttgaagataattaaacagatttagttttagcagggactaaaattacatgtaatt-ttttttatagggactaaaaaaactatta 20562665  T
Q  362 aaattaagtaagaattaaac 381  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  20562664 aaattaagtaagaaataaac 20562645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 185
Target Start/End: Original strand, 27550800 - 27550974
Alignment:
Q  11 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 110  Q
    |||||||||||||| || || ||||| || || ||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |  ||    
T  27550800 aaatttgtttaatt-atacttaaacttttaagattttgaacaattttttgcacaagtgttaagaacattacgaaaagttcatctgcaaaaaattatctca 27550898  T
Q  111 aaaattgatttatacgtccag-attttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaatt 185  Q
    ||| || |||| | ||||||| ||||||||| |||||| || |||||||||   || ||||||| |||||||||||    
T  27550899 aaattttatttctgcgtccagaattttgttacttttattttgaacttttgtctattaaaaaaatccatatttaatt 27550974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 229
Target Start/End: Original strand, 25351963 - 25352178
Alignment:
Q  11 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 110  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||| |  |||||| || ||||| |||||||| ||| ||||||||| |  |     
T  25351963 aaatttgtttaatt-atgcttaaacttttaagattttgaacaattttttgcacaagtgttaaaaacattacgaaaagttcatctccaaaaaattat--ct 25352059  T
Q  111 aaaattgatttatacgtccaga-ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaa 209  Q
     || || |||||| |||||||| |||||||| |||||| || |||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||||||| |       ||||||    
T  25352060 caattttatttatgcgtccagatttttgttacttttattttcaacttttgtcttttaaaaaaattcatatttaatttatttcatgct-aaataattctaa 25352158  T
Q  210 attttagtaaatgaaccttt 229  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  25352159 attttagtaaacgaaccttt 25352178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 194
Target Start/End: Original strand, 11397039 - 11397222
Alignment:
Q  11 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 110  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||  || || ||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||| |  ||    
T  11397039 aaatttgtttaatt-atgcttaaacatttaagattttgaacaattttttgcacaagtgttaagaacattacgaaaagttcatctccaaaaaattatctca 11397137  T
Q  111 aaaattgatttatacgtccaga-ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatg 194  Q
    ||| || |||| | |||||| | |||||||| |||||| ||  ||||||||  ||| |||||||||||||||||||  |||||||    
T  11397138 aaattttatttctgcgtccatatttttgttacttttattttgcacttttgtcttttaaaaaaattcatatttaatttatttcatg 11397222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 6 - 73
Target Start/End: Original strand, 2059078 - 2059145
Alignment:
Q  6 aattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaag 73  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  2059078 aattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttgagtttttgaacaattttttgcatacgtgttaag 2059145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 344 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 13501168 - 13501087
Alignment:
Q  344 ggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccc 425  Q
    ||||||||| | | |||||||||||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13501168 ggactaaaagaaccattaaaattaagtaaggactaaacttgaaagacccctattttatagggaccaaaaacatatttaaccc 13501087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 37986989 - 37986893
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaa 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||| | ||||| |||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  37986989 tcaattcaaatttgtttaatttattcttaaactcttaaattttttaacaattttttgtagacgtgttaagaacattactaaaagttccgccgcaaaa 37986893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 350 - 432
Target Start/End: Original strand, 46517412 - 46517494
Alignment:
Q  350 aaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaaaa 432  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||  |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  46517412 aaaaaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgtcccaattttatagggacgaaaaacatatttaaccctaaaaaa 46517494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 334 - 418
Target Start/End: Original strand, 48218172 - 48218256
Alignment:
Q  334 ttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatat 418  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  48218172 ttttttatatggactaaaaacactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaagatcccaattttttagggaccaaaaacatat 48218256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 49768696 - 49768522
Alignment:
Q  11 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 110  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||   ||||||| | |  ||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||| |  ||    
T  49768696 aaatttgtttaatt-atgcttaaacttttaagattttgaaattttttttggacaagtgttaagaacattacgaaaagttcatttgcaaaaaattatctca 49768598  T
Q  111 aaaattgatttatacgtccag-attttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaatt 185  Q
    ||| || |||| ||||||||| ||||| ||| |||||| || |||||||||   || |||||||||||||||||||    
T  49768597 aaattttatttctacgtccagaattttattacttttattttgaacttttgtctattaaaaaaattcatatttaatt 49768522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 52882556 - 52882360
Alignment:
Q  52 aattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccagatttt-gttaattttatctt 150  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||| |  ||||| || |||| | | |||||||||| |||| |||||| ||    
T  52882556 aattttttgcacaagtgttaagaatattaagaaaagttcatctccaacaaattatctcaaaattttatttctgcctccagatttttgttacttttatttt 52882457  T
Q  151 taacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgt 248  Q
     || ||||||  ||| |||||||||||||||||||  |||||||||       ||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||| |||||    
T  52882456 gaaattttgtcttttaaaaaaattcatatttaattaatttcatgtt-aaaaaattctaaattttagtaaacgaaccttttgtaatgttctaaacttgt 52882360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 418
Target Start/End: Original strand, 52882620 - 52882703
Alignment:
Q  335 tttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatat 418  Q
    ||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  52882620 tttttatatggactaaatacactattaaaattaagtaaggattaaacttaaaagatcccaattttatagggacaaaaaacatat 52882703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 334 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 30719451 - 30719353
Alignment:
Q  334 ttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaaaa 432  Q
    |||||| || ||||||||| | | ||||||||||| | || | ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  30719451 ttttttttaaggactaaaagaaccattaaaattaaattaggactaaacttgaaaaacccctatattatagggaccaaaaacatatttaactcaaaaaaa 30719353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 344 - 426
Target Start/End: Original strand, 30742661 - 30742743
Alignment:
Q  344 ggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccct 426  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||| || | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  30742661 ggacttaaaaaactattaaaattaagtaaggattaaacttagaaactctcaattttatagggactaaaaacatatttaaccct 30742743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 336 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 51338433 - 51338351
Alignment:
Q  336 ttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatat 418  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||||| ||| || || ||||||||| ||||||||||||||    
T  51338433 ttttatatggactaaaaacactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatattccaattttatagggaccaaaaacatat 51338351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 48218138 - 48218046
Alignment:
Q  11 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaatt 104  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |  || ||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  48218138 aaatttgtttaatt-atgcttaaactttaaagattttgaacaattttttgcacaagtgttaagaacattacaaaaagttcatctgcaaaaaatt 48218046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 334 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 27550767 - 27550683
Alignment:
Q  334 ttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatat 418  Q
    |||||| ||||| |||||||  |||||| ||||||||||| | ||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  27550767 ttttttatatgggctaaaaatactattataattaagtaaggactaaacttaaaaaatcctaattttatagggaccaaaaacatat 27550683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 266 - 326
Target Start/End: Original strand, 29231368 - 29231428
Alignment:
Q  266 aaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaacatggactaaaattagaa 326  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||    
T  29231368 aaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgttttagtagggactaaaattagaa 29231428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 334 - 418
Target Start/End: Original strand, 52010675 - 52010759
Alignment:
Q  334 ttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatat 418  Q
    |||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||||| | ||||||| |||  |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  52010675 ttttttatatggactaaaaacactattgaaattaagtaaggaataaacttaaaaggtcccaattttatagggaccaaaaacatat 52010759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 29231939 - 29231884
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaatttttt 59  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  29231939 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagttttttaacaatttttt 29231884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 12367675 - 12367585
Alignment:
Q  335 tttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccc 425  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||| |||   | | ||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  12367675 tttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaacatatttaaccc 12367585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 425
Target Start/End: Original strand, 12368553 - 12368643
Alignment:
Q  335 tttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccc 425  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||| |||   | | ||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  12368553 tttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaacatatttaaccc 12368643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 344 - 426
Target Start/End: Original strand, 13501544 - 13501626
Alignment:
Q  344 ggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccct 426  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||| | |||||||||||  | | |||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  13501544 ggactaaaaaaaccattaaaattaagtaaggactaaacttgaaaggtacttattttatatggaccaaaaaaatatttaaccct 13501626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 425
Target Start/End: Original strand, 36368213 - 36368303
Alignment:
Q  335 tttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccc 425  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||| |||   | | ||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  36368213 tttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaacatatttaaccc 36368303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 336 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 49767657 - 49767575
Alignment:
Q  336 ttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatat 418  Q
    |||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||| | ||||||| |||  |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  49767657 ttttatatggactaaaaacactattataattaagtaaggactaaacttaaaaggtcccaattttatagggaccaaaaacatat 49767575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 24 - 89
Target Start/End: Original strand, 26207482 - 26207547
Alignment:
Q  24 ttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagtt 89  Q
    ||||||| | |||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||    
T  26207482 ttatgcttagactcttaagttttagaacaattttttcgaaacatgttaagaacattactaaaagtt 26207547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 335 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 29231297 - 29231208
Alignment:
Q  335 tttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaacc 424  Q
    ||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||| |||  || | ||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  29231297 tttttataaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgtctcaattttatagggactaaaaacatatttaacc 29231208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 36249147 - 36249098
Alignment:
Q  11 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttg 60  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  36249147 aaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagttttttaacaattttttg 36249098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 358 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 48410070 - 48410001
Alignment:
Q  358 attaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaacccta 427  Q
    |||||||||||||||| |  |||||| |||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  48410070 attaaaattaagtaaggacaaaacttaaaatgtcccaattttatagggaccaaaaacatatttaacccta 48410001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 60
Target Start/End: Original strand, 12367703 - 12367759
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttg 60  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  12367703 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttaagttttttaacaattttttg 12367759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 15054487 - 15054431
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttg 60  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  15054487 tcaattcaaatttatttaatttatgcttaaactcttaagttttttaacaattttttg 15054431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 334 - 418
Target Start/End: Original strand, 25352768 - 25352852
Alignment:
Q  334 ttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatat 418  Q
    |||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||| | ||||||| |||  || | ||||||||| ||||||||||||||    
T  25352768 ttttttatatggactaaaagcactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaagctcacaattttatagggaccaaaaacatat 25352852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 60
Target Start/End: Original strand, 37986209 - 37986265
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttg 60  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  37986209 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttaaattttttaacaattttttg 37986265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 341 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 43504741 - 43504657
Alignment:
Q  341 tatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccc 425  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||| ||| || |  ||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  43504741 tatggactaaaaaaacttataaaattaagtaaggattaaacttaaaagattctaattttataagaaccaaaaacatatttaaccc 43504657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 334 - 418
Target Start/End: Original strand, 51339919 - 51340003
Alignment:
Q  334 ttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatat 418  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||  | ||||||||  ||||||||||||||    
T  51339919 ttttttatatggactaaaaacactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaagatttcaattttataaggaccaaaaacatat 51340003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 125 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 27551684 - 27551561
Alignment:
Q  125 cgtccagatttt-gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatga 223  Q
    |||||||||||| |||| |||||| || |||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||||||| |       ||||||||||||||||| ||    
T  27551684 cgtccagatttttgttacttttattttgaacttttgtcttttaaaaaaattcatatttaatttatttcatg-taaaaaaattctaaattttagtaaacga 27551586  T
Q  224 acctttcatagtgttctaaccttgt 248  Q
    ||||||  || |||||||| |||||    
T  27551585 acctttagtaatgttctaaacttgt 27551561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 334 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 35530760 - 35530665
Alignment:
Q  334 ttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaa 429  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||  |||| ||||  |||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  35530760 ttttttttaaggactaaaaaaactattaaaattaagtaatgactaaacttaaaaggtcccaatttcgtaggaacctaaaacatatttaaccctaaa 35530665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 344 - 427
Target Start/End: Original strand, 51561680 - 51561763
Alignment:
Q  344 ggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaacccta 427  Q
    ||||||||| | | ||||||||||| |||| | ||||||||||| | || |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||    
T  51561680 ggactaaaagaaccattaaaattaattaaggactaaacttgaaagacccttattttatagggactaaaaacataattaacccta 51561763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 336 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 15053617 - 15053528
Alignment:
Q  336 ttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatcc-ctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccc 425  Q
    ||||||| |||| |||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||  || | ||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  15053617 ttttgtaaggacaaaaacaactattaaaattaagtaagaactaaac-tgaaaatgcctcaattttatagggactaaaaacatatttaaccc 15053528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 336 - 418
Target Start/End: Original strand, 27551819 - 27551901
Alignment:
Q  336 ttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatat 418  Q
    |||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||| | ||||||| |||  || | ||||||||| ||||||||||||||    
T  27551819 ttttatatggactaaaaacactattataattaagtaaggactaaacttaaaaggtctcaattttatagggaccaaaaacatat 27551901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 334 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 28700926 - 28700824
Alignment:
Q  334 ttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaaaat 433  Q
    |||||| ||||||| |||| | ||||||||||| |||||| | |||| || |||  |||| |||| |||| || |||||||||||||||||||| ||| |    
T  28700926 ttttttttatggaccaaaagaactattaaaatttagtaaggactaaaattaaaagttcccaatttaatagggatcaaaaacatatttaaccctataaatt 28700827  T
Q  434 att 436  Q
    |||    
T  28700826 att 28700824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 335 - 425
Target Start/End: Original strand, 36249182 - 36249272
Alignment:
Q  335 tttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccc 425  Q
    |||||||| |||||| || | |||||||||||||||||| | ||||||| |||   | | ||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  36249182 tttttgtaaggactacaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaacatatttaaccc 36249272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 335 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 37986181 - 37986091
Alignment:
Q  335 tttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccc 425  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||| |||   | | ||||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  37986181 tttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttatagggactgaaaacatatttaaccc 37986091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 334 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 52881569 - 52881487
Alignment:
Q  334 ttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacat 416  Q
    |||||| ||| ||||||||   |||||||||||||||||| | ||||||| |||  |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  52881569 ttttttatatagactaaaagcactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaaggtcccaattttatagggaccaaaaacat 52881487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 12896910 - 12896869
Alignment:
Q  342 atggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaactt 383  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12896910 atggactaaaaacactattaaaattaagtaagaattaaactt 12896869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 13083406 - 13083325
Alignment:
Q  345 gactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccct 426  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || | |||||||  ||| |||  ||||||| | || |||||||||||||||||||    
T  13083406 gactaaaaaaactattaaaattaagtgaggactaaactttgaaagtcctaattttatggcgatcaaaaacatatttaaccct 13083325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 19791201 - 19791120
Alignment:
Q  345 gactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccct 426  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||| |||  |||| |||||||||  |  ||||||||||||||||||    
T  19791201 gactaaaagaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaaggtcccaattttataggaaataaaaacatatttaaccct 19791120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 424
Target Start/End: Original strand, 37987017 - 37987106
Alignment:
Q  335 tttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaacc 424  Q
    |||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| |||   | | |||||| || ||| ||||||||||||||||    
T  37987017 tttttgcaaggactaaaacaactattaaaattaagtaagaactaaacttaaaatgcctcaattttacagggactaaaaacatatttaacc 37987106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 196
Target Start/End: Original strand, 52881707 - 52881780
Alignment:
Q  124 acgtccagatttt-gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt 196  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||  ||| |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  52881707 acgtccagatttttgttacttttattttgaacttttgtcttttaaaaaaattcatatttaatttatttcatgtt 52881780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 106 - 150
Target Start/End: Original strand, 2059152 - 2059196
Alignment:
Q  106 ttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctt 150  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2059152 ttgcaaaatttgatttctacgtcctgattttgttaattttatctt 2059196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 348 - 424
Target Start/End: Original strand, 7565515 - 7565590
Alignment:
Q  348 taaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaacc 424  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  | ||||| | ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7565515 taaaaaaactattaaaattaagcaaagaataaacattaaaaatctcaattttatag-gaccaaaaacatatttaacc 7565590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 334 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 11397005 - 11396921
Alignment:
Q  334 ttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatat 418  Q
    |||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||| | ||||||| |||  || | ||| ||||| ||||||||||||||    
T  11397005 ttttttatatggactaaaagcactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaaggtctcaattgtatagggaccaaaaacatat 11396921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 335 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 11999689 - 11999601
Alignment:
Q  335 tttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaac 423  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||| | ||||||| |||   | | ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  11999689 tttttgtaaggactaaaacaactattaaaattacgtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaacatatttaac 11999601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 334 - 418
Target Start/End: Original strand, 12897412 - 12897496
Alignment:
Q  334 ttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatat 418  Q
    |||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||| | ||||||| |||  | || ||||||||| |||| |||||||||    
T  12897412 ttttttatatggactaaaattactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaaggttccaattttatagggaccgaaaacatat 12897496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 344 - 424
Target Start/End: Original strand, 26805824 - 26805904
Alignment:
Q  344 ggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaacc 424  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||   ||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  26805824 ggactaaaaatactattaaaattaagtaagaactaaacttaaaaggtctgaattttatagggataaaaaacatatttaacc 26805904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 261 - 425
Target Start/End: Original strand, 31024305 - 31024468
Alignment:
Q  261 gttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctatt 360  Q
    |||||||||  |||||||||||| |||||| |||||| || | | ||  ||||||||||||| ||    ||  |||||| || ||| ||||||| |||||    
T  31024305 gttcaaaaacataagagtttaaacataattgaacaaatttggatttagtatggactaaaatt-gagtgcataattttttttagggattaaaaaaactatt 31024403  T
Q  361 aaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccc 425  Q
    ||||||||||||| | ||||| |  ||| |||| |||| |||  || ||||||||||||||||||    
T  31024404 aaaattaagtaaggactaaacattgaaagtcccaatttgataaggatcaaaaacatatttaaccc 31024468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 335 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 33708291 - 33708203
Alignment:
Q  335 tttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaac 423  Q
    ||||||||  |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||   | | |||||| || ||| |||||||||||||||    
T  33708291 tttttgtaaagactaaaacaactattaaaattaagtaaggattaaacttaaaatgcctcaattttacagggactaaaaacatatttaac 33708203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 6 - 90
Target Start/End: Original strand, 42971953 - 42972036
Alignment:
Q  6 aattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttc 90  Q
    |||| |||| ||||||||| ||| | |||||||| |||||| ||| ||| ||||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  42971953 aattcaaatctgtttaatt-atgtttaaactcttaagttttagaaaaatcttttgtagacgtgttaagaatattactaaaagttc 42972036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 262 - 297
Target Start/End: Original strand, 1297113 - 1297148
Alignment:
Q  262 ttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaa 297  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1297113 ttcaaaaatttaagagtttaaacataattaaacaaa 1297148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 2969712 - 2969677
Alignment:
Q  397 tttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaaaa 432  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2969712 tttatagggaccaaaaacatatttaaccctaaaaaa 2969677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 363 - 418
Target Start/End: Original strand, 12251714 - 12251769
Alignment:
Q  363 aattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatat 418  Q
    ||||||||||| | ||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  12251714 aattaagtaaggactaaacttaaaagatcccaattttatagagaccaaaaacatat 12251769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 186
Target Start/End: Original strand, 18996922 - 18997052
Alignment:
Q  55 tttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaac 154  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||  |||||||  || |||||||||   |  |||| || |||| || ||||| |||||||||  |||||||| |||    
T  18996922 tttttgcatacatgtttagaatattataaaaagtttatccgcaaaaaataagtttaaaattttatttttaggtccaaattttgttacatttatcttgaac 18997021  T
Q  155 ttttgttgttttaaaaaattcatatttaattc 186  Q
    |||||   || |||||||||||||||||||||    
T  18997022 ttttggc-ttctaaaaaattcatatttaattc 18997052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 196
Target Start/End: Original strand, 26507632 - 26507695
Alignment:
Q  133 ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt 196  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||| | ||||||||||| || ||||||    
T  26507632 ttttgttagttttatcttgaatttttggtgttttaaaaaaattatatttaattcattacatgtt 26507695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 335 - 425
Target Start/End: Original strand, 533936 - 534025
Alignment:
Q  335 tttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccc 425  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||| |||   | | |||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  533936 tttttgtaaggactaaaataactattaaaattaagtaagggttaaacttaaaatgcctcaattttata-tgattaaaaacatatttaaccc 534025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 397 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 538518 - 538484
Alignment:
Q  397 tttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaaa 431  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  538518 tttatagggaccaaaaacatatttaaccctaaaaa 538484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 262 - 320
Target Start/End: Original strand, 14411388 - 14411446
Alignment:
Q  262 ttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaacatggactaaaa 320  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||  | ||||| |||||||||    
T  14411388 ttcaaaaatttaaaagtttaaacataattaaacaaattttaatttaacagggactaaaa 14411446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 336 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 25351927 - 25351845
Alignment:
Q  336 ttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatat 418  Q
    |||| ||||||||||||   |||||||||||||||||| | ||||||| |||  || | ||||||||| || |||||||||||    
T  25351927 ttttatatggactaaaagcactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaaggtctcaattttatagggatcaaaaacatat 25351845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 397 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 41885088 - 41885054
Alignment:
Q  397 tttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaaa 431  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41885088 tttatagggaccaaaaacatatttaaccctaaaaa 41885054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 344 - 422
Target Start/End: Original strand, 47008962 - 47009040
Alignment:
Q  344 ggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaa 422  Q
    ||||||||| | ||||||||| |||||||| |  |||||| |||  |||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  47008962 ggactaaaagaactattaaaagtaagtaaggacaaaacttaaaaggtcctaattttatagggaccaaaaacatatttaa 47009040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 336 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 51840188 - 51840106
Alignment:
Q  336 ttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatat 418  Q
    |||| ||||||||||||   |||||||||||||||||| | ||||||| |||  |  | ||||||||| ||||||||||||||    
T  51840188 ttttatatggactaaaatcactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgtttcaattttatagggaccaaaaacatat 51840106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 356 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 2059028 - 2058959
Alignment:
Q  356 ctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccc 425  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||| |||  |||| |||| |||| ||| |||||||||||||||||    
T  2059028 ctattaaaattaaataaggactaaacttaaaaggtcccaatttcatagggactaaaaacatatttaaccc 2058959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 397 - 430
Target Start/End: Original strand, 10556072 - 10556105
Alignment:
Q  397 tttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaa 430  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10556072 tttatagggaccaaaaacatatttaaccctaaaa 10556105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 357 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 21091003 - 21090938
Alignment:
Q  357 tattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaa 422  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| |||  | || ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  21091003 tattaaaattaagtaaggactaaacttaaaattttccaattttataaggaccaaaaacatatttaa 21090938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 344 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 26020356 - 26020275
Alignment:
Q  344 ggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccc 425  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||  | || ||||||||   || |||||||||||||||||    
T  26020356 ggactacaaaacctattaaaattaagtaaggactaaacttagaagtttccaattttataaaaactaaaaacatatttaaccc 26020275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 346 - 383
Target Start/End: Original strand, 28480016 - 28480053
Alignment:
Q  346 actaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaactt 383  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28480016 actaaaaaagctattaaaattaaataagaattaaactt 28480053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 397 - 430
Target Start/End: Original strand, 28868481 - 28868514
Alignment:
Q  397 tttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaa 430  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28868481 tttatagggaccaaaaacatatttaaccctaaaa 28868514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 335 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 30981720 - 30981631
Alignment:
Q  335 tttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaacc 424  Q
    |||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||| | ||||||| |||   | | |||||| || ||| ||||||||||||||||    
T  30981720 tttttgtaaggactaaaacaattattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttacagggactaaaaacatatttaacc 30981631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 334 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 31400192 - 31400091
Alignment:
Q  334 ttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaaaat 433  Q
    ||||||||| | | ||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||  ||  || | ||||| ||| |||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  31400192 ttttttgtaagaattaaaaaagctattaaaattaaataaggactaaacttacaaggtcgcaattttgtagggaccgaaaacataattaaccctataaaat 31400093  T
Q  434 at 435  Q
    ||    
T  31400092 at 31400091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 397 - 430
Target Start/End: Original strand, 39711519 - 39711552
Alignment:
Q  397 tttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaa 430  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39711519 tttatagggaccaaaaacatatttaaccctaaaa 39711552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 397 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 41411477 - 41411444
Alignment:
Q  397 tttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaa 430  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41411477 tttatagggaccaaaaacatatttaaccctaaaa 41411444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 236; Significance: 1e-130; HSPs: 124)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 4 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 25102255 - 25101834
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  25102255 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactctcgagtttttgaacaattttttacagacgtgttaagaacattactaaaagttcctatgcaaaaaat 25102156  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
    |||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||           
T  25102155 tgtcacaaaatttgatttctacgtccagattttgttaattttatttttaacttttgccgttttgaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaa 25102057  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 303  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||       | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25102056 ttctaaattttagtaagtgaacctttcatagtgttttaaacttgtctcaaaaaaattgttcaaaagtttaagagtttaaggataattaaacaaactttgt 25101957  T
Q  304 tgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatag 403  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||     
T  25101956 tgtaatagggactaaaattagaagtaattcttttttgtagggactaaaaaatctattaaaattaagtaaggattaaacttgaaaggtctctattttataa 25101857  T
Q  404 tgaccaaaaacatatttaaccct 426  Q
      |||||||| ||||||||||||    
T  25101856 gaaccaaaaatatatttaaccct 25101834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 38706739 - 38706316
Alignment:
Q  1 tcatcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaa 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||  ||||||||||| | | |||||||    
T  38706739 tcatcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttgagtttttgaacaattttttacagacgtgttaagaacgttactaaaagtgcttgtgcaaaa 38706640  T
Q  101 aattgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnn 200  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||        
T  38706639 aattgtcgcaaaatttgatttctacgtccaaattttgttaattttatctttaacttttgtcgttttaaaaaattcatatctaatttgtttcatgttaaaa 38706540  T
Q  201 nnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactt 300  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||       ||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  38706539 aa-ttctaaattttagtaaatgaacctttcatattgttctaaacttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaattgaagtgtttaagaataattaaacaaactt 38706441  T
Q  301 tgttgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctatttta 400  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  38706440 tgttgtaacagggtctaaaattagaagtaatttttttttgtaaaaactaaaaaacctattaaaaataagtaatgattaaacttaaaagatccctatttta 38706341  T
Q  401 tagtgaccaaaaacatatttaaccc 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||    
T  38706340 tagggaccaaaaacatatttaaccc 38706316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 4 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 5250684 - 5250263
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||    
T  5250684 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttgagtttttgaacaattttttactgacgtgttaagaacattactaaaagttcctatgccaaaaat 5250585  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaactttt-gttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnn 202  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||          
T  5250584 tgtcgcaaaatttgatttctacgtttagattttgttaattttatctttaactttttgccgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaaa 5250485  T
Q  203 nttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttg 302  Q
     |||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |  |||||||       |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5250484 -ttctaaattttagtaaatgaacctttcgcagcgttctgaatttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttg 5250386  T
Q  303 ttgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttata 402  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  5250385 ttgtaagagggactaaaattagaagtaatttttttttatagggactaaaaaacctattaaaattaagtaaggattaaacttgaaaggtccctattttata 5250286  T
Q  403 gtgaccaaaaacatatttaaccc 425  Q
      |||||||||||||||||||||    
T  5250285 aggaccaaaaacatatttaaccc 5250263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 4 - 426
Target Start/End: Original strand, 44265446 - 44265867
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  44265446 tcaatttaaatttgtttaatttatgtttaaactcttgagtttttgaacaattttttgcagacgtgttaagaacattactaaaagttcctctgcaaaaaat 44265545  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
    |||||||||| ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||           
T  44265546 tgttgcaaaatttgatttctaagtccagattttgttgattttatctttaatttttggcgttttaaaaaactcatatttaattcttttcatgtt-aaaaaa 44265644  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 303  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||       ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44265645 ttctaaattttagcaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcgaaaaaatcgtttaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgt 44265744  T
Q  304 tgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatag 403  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||  ||  | || ||||||||     
T  44265745 tgtaacagggagtaaaattagaagtaattttcttttgtaaggactaaaaaacttattaaaattaagtaaagactaaacttagaagtttccaattttataa 44265844  T
Q  404 tgaccaaaaacatatttaaccct 426  Q
     ||| ||||||||||||||||||    
T  44265845 ggacaaaaaacatatttaaccct 44265867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 4 - 426
Target Start/End: Original strand, 6590263 - 6590685
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6590263 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttgagtttttgaacaattttttggagacgtgttaagaacattactaaaagttcctctgcaaaaaat 6590362  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
    ||| |||||| ||||||| || |  ||||||||||||||||||| ||| | |||| | ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||           
T  6590363 tgtcgcaaaatttgatttctaggctcagattttgttaattttatattttatttttctcgttttaaaaaaatcatatttaatttttttcatgttaaaaaaa 6590462  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 303  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||       | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  6590463 atctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaaatggttcaaaaatttaagagtttaagaataattaaacaaactttgt 6590562  T
Q  304 tgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatag 403  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||  |||| |||||||||    
T  6590563 tgtaacaaggactaaaattagaagtaattttcttttgtaaggactaaaaaacctattaaaattaagtaaggactaaacttagaagttcccaattttatag 6590662  T
Q  404 tgaccaaaaacatatttaaccct 426  Q
     ||| ||||| ||||||| ||||    
T  6590663 ggacaaaaaatatatttacccct 6590685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 4 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 41590631 - 41590211
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  41590631 tcaattcaaatttgtttaatttgtgcttaaactcttgagcttttgaacaatttttcgcatacgtgttaagaacattactaaaagttcctctacaaaaaat 41590532  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
    ||| |||||| ||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  41590531 tgtcgcaaaatttgatttctacttccagaatttgttaaatttatctttaacttttgtcattttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaa 41590433  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 303  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||         | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41590432 ttctaaattttagt-aatgaacctttcatagtgttataaacttgtcataaaaaaattgttcaaaaatttaaaagtttaaggataattaaacaaactttgt 41590334  T
Q  304 tgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatag 403  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||  || | |||||||||    
T  41590333 cgtaacaaggactaaaattagaagtaatt-ttttttgtagggactaaaaaacctattaaaattaagtaaggactaaacttaaaagttctcaattttatag 41590235  T
Q  404 tgaccaaaaacatatttaacccta 427  Q
     ||||||||||||| |||||||||    
T  41590234 ggaccaaaaacataattaacccta 41590211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 36471121 - 36470743
Alignment:
Q  1 tcatcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaa 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || |  | |||||||  |||| |||||||||| || ||||    
T  36471121 tcatcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttgagtttttgaacaattttttacagatgtattaagaacgttaccaaaagttcctatgtaaaa 36471022  T
Q  101 aattgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnn 200  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        
T  36471021 aattgtcgcaaaatttgatttctacgtccaaattttgttaattttatctttaactttcgctgttttaaaaaattcatatctaattcgtttcatgtt-aaa 36470923  T
Q  201 nnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactt 300  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||        ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  36470922 aaattctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttatcttaaaaaaatcgttcaaaaattgaagagtttaaggataattaaacaaactt 36470823  T
Q  301 tgttgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaa 380  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36470822 tgttgtaacagggcctaaaattagaagtaatttttttttgtagggactaaaaaacctattaaaattaagtaaggattaaa 36470743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 4 - 426
Target Start/End: Original strand, 33322531 - 33322952
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||  |||||||||||||| || |||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  33322531 tcaattcaaatttgtttaatttatacttaaactcatgagttttcaaacaattttttgcagacgtgttaaaaacattactaaaagttcctctgcaaaaaat 33322630  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||           
T  33322631 tgtcgcaaaatttgatttttacgtctagattttgttaattttatctttaacttttttcgttttaaaaaatttatatttaattcgtttcatgttaaaaaaa 33322730  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 303  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |        |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  33322731 -tctaaattttggtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtattgaaaaaatcgttcaaaattttaagagtttaaagataattaaacaaactttac 33322829  T
Q  304 tgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatag 403  Q
    | ||||| | |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||  ||  | || |||||||||    
T  33322830 tataacaggaactaaaattaaaagtaatttttttttgtaaggactaaaaaacctattaaaattaaataaggactaaacttagaagtttccaattttatag 33322929  T
Q  404 tgaccaaaaacatatttaaccct 426  Q
     |||||||||||||||| |||||    
T  33322930 agaccaaaaacatattttaccct 33322952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 4 - 437
Target Start/End: Original strand, 37967533 - 37967966
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||| ||| || ||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||    
T  37967533 tcaattcaaatttgtttaatttatgcataaactcttgagcttttaaacaatttttcgcagacgtgtaaagaacattactaaaacttcctccgcaaaaaat 37967632  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgt-tgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnn 202  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||          
T  37967633 tgtcgcaaaatttgatttctacgtccatattttgttaattttatctttaacttttttccattttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaat 37967732  T
Q  203 nttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtc-tcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaacttt 301  Q
      |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |        |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  37967733 a-tctaaattttggtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtcttaaaaaaaatcgttcaaaactttaagagtttaaggatgattaaacaaacttt 37967831  T
Q  302 gttgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttat 401  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||  ||  |||  |||||||    
T  37967832 gttgtaacagggactaaaattagaagtaa-tattttttgtaaggactaaaaaaactattaaaattaagtaaggactaaacttagaagttcctaattttat 37967930  T
Q  402 agtgaccaaaaacatatttaaccctaaaaaatatta 437  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37967931 agggaccaaaaacatatttaacccttaaaaatatta 37967966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 4 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 43623087 - 43622715
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| || |||||||||||||||||| ||||||||    
T  43623087 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttgagtttttgaacaatttttcgcagacgtgttaaaaacattactaaaagttcctcttcaaaaaat 43622988  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttg-ttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnn 202  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||          
T  43622987 tgtcgcaaaatttgatttctacgtccataatttgtttaattttatctttaacttttgtcattttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaaa 43622888  T
Q  203 nttctaaatttt-agtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaacttt 301  Q
     ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||         ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43622887 attctaaattttaagtaaatgcacctttcatagtgttataaacttgtcataaaaaaatcgtttaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaacttt 43622788  T
Q  302 gttgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaa 375  Q
    || |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43622787 gtcgtaacaagaactaaaattagaagtaatt-ttttttgtaaggactaaaaaacctactaaaattaagtaagaa 43622715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 4 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 27875740 - 27875361
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  27875740 tcaattcaaatttgtttattttatgcttaaactcttgagcttttgaacaattttttacaaacgtgttaaaaacattactaaaagttcctctgcaaaaaat 27875641  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
    ||| | |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| |||||           
T  27875640 tgtcgtaaaatttgatttctacgtccagattttgtttattttatctttaacttttgtcgtgttaaaaaattcatatttaattcatttaatgtt-aaaaaa 27875542  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||        |||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  27875541 ttctaaattttagtaaatgaacctttaatagtgttctaaacttgtctaaaaaaaatcgtccaaaaatttaagagtttataaataattaaacaaactttgt 27875442  T
Q  304 tgtaacatggactaaaattagaagtaa-ttcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaactt 383  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  27875441 tgtaagagggactaaaattagaagtaattttttttttgtggggactaaaaaatctattaaaattaagtaaggattacactt 27875361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 4 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 5696205 - 5695793
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||    
T  5696205 tcaattcaaatttgtttaatttatgattaaactcttcagtttttgaacaattttttgcagacgtgttaagatcattattgaaagttcctctgcaaaaaat 5696106  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
    |||  ||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | |||| ||           
T  5696105 tgtcacaaaatttgattttta-gttcagattttgttaattttatctttaacttttgccgttttaaaaaattcatatttaattcatctcatattaaaaaa- 5696008  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||       || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5696007 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttttaaacttgtctcgaaaaaatcattcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgt 5695908  T
Q  304 tgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatag 403  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||| | |||| || |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||        ||||||||    
T  5695907 tgtaacagagactaaaattagaagtaattttcttttttaaggactaaaaaccctattaaaattaagtaaggattaaacttaaaa-------gttttatag 5695815  T
Q  404 tgaccaaaaacatatttaaccc 425  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  5695814 ggaccaaaaacatatttaaccc 5695793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 4 - 430
Target Start/End: Original strand, 8784576 - 8785001
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||  || ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  8784576 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttgagtttttaaacaagtttttgctgacgtgttaagaacattactaaaagtttctctgcaaaaaat 8784675  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
    ||| |||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||           
T  8784676 tgtcgcaaaatttgatttctacgttcagattttattaattttatctttaacttcagccgttttaaaaaattcatatttaattctttttatgttaaaaaat 8784775  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 303  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||       | |||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  8784776 tt-taaattttagtaaatgaaccttttatagtgttctaaacttatgtcaaaaaaattgttcgaaaatttgagagtttacggataattaaacaaactttgt 8784874  T
Q  304 tgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatag 403  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||| |||  |||||| ||    
T  8784875 tgtaacaagaactaaaattagaagtaacttttttttgtagggactaaaaaacctattaaaattaagtaaggactaaacttagaaattcctaattttagag 8784974  T
Q  404 tgaccaaaaacatatttaaccctaaaa 430  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||    
T  8784975 ggaccaaaaacatatttaacccaaaaa 8785001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 4 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 28015921 - 28015541
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  28015921 tcaattcaaatttgtttattttatgcttaaactcttgagcttttgaacaattttttacaaacgtgttaaaaacattactaaaagttcctctgcaaaaaat 28015822  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
    ||| | |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| |||||           
T  28015821 tgtcgtaaaatttgatttctacgtccagattttgtttattttatctttaacttttgtcgtgttaaaaaattcatatttaattcatttaatgtt-aaaaaa 28015723  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||        |||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  28015722 ttctaaattttagtaaatgaacctttaatagtgttctaaacttgtctaaaaaaaatcgtccaaaaatttaagagtttataaataattaaacaaactttgt 28015623  T
Q  304 tgtaacatggactaaaattagaagtaa--ttcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaactt 383  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||  || ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  28015622 tgtaagagggactaaaattagaagtaatttttttttttgtggggactaaaaaatctattaaaattaagtaaggattacactt 28015541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 4 - 383
Target Start/End: Original strand, 6018037 - 6018413
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  6018037 tcaattcaaatttgtttaatttatgcataaactcttgagtttttgaacagttttttgcagacatgttaaaaacattactaaaagttcctctgcaaaaaat 6018136  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
    ||| |||||| || |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||           
T  6018137 tgtcgcaaaatttaatttttacgttcagattttgttagttttatctttatcttttgttgttttaataaattcatatttaatttgtttcatgtt-aaaaaa 6018235  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 303  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||       | |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  6018236 ttataaattttagtaaatgaacctttcataatgttctaaacttgtctcataaaaattgttcaaaaatttaaaagtttaagaataattaaacaaactttgt 6018335  T
Q  304 tgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaactt 383  Q
    ||||| | ||||||||||||||||| | | |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  6018336 tgtaata-ggactaaaattagaagtga-tattttttttagggactaaaaaacctattaaaattaagtaaggactaaactt 6018413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 4 - 365
Target Start/End: Original strand, 21135321 - 21135681
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  21135321 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttaagttttttaacaattttttgtagacgtgttaagaacattactaaaagttcctccgcaaaaaat 21135420  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
    | | |||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||           
T  21135421 tatcgcaaaatttgatttatatgtccagattttattacttttatctttaacttttatcgttttcaaaaattcatatttaattcgtttcat-tttaaaaaa 21135519  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 303  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||       |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21135520 ttctaaattttagtaattgaacctttcataatgttctaaatttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgt 21135619  T
Q  304 tgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaat 365  Q
    | |  || ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  21135620 tttggcagggactaaaattagaattaatttttttttgtagggactaaaaaacctactaaaat 21135681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 4 - 364
Target Start/End: Original strand, 35863039 - 35863397
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||    
T  35863039 tcaattcaaatttatttaatttatgcttaaactcttaagttttttaacaattttttgtagacgtgttaagaacattactaaaagattctccgcaaaaaat 35863138  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||           
T  35863139 tgttgcaaaatttgatttatatgtccagattttattacttttatctttaacttttatagttttcaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaaat 35863238  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 303  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||       | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35863239 tt-taaattttagtaattgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaatattgttcaaaagtttaagagtttaaggataattaaacaaactttgt 35863337  T
Q  304 tgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaa 364  Q
    | || || ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  35863338 tttagcagggactaatattagaagtaatt-ttttttgtagggactaaaaaacctactaaaa 35863397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 4 - 364
Target Start/End: Original strand, 24451482 - 24451841
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| || | || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  24451482 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagttttttaacaattttgtgtagacgtgttaagaacattactaaaagttcctccgcaaaaaat 24451581  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
    | | |||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||           
T  24451582 tatcgcaaaatttgatttatatgtccagattttattacttttatctttaacttttatcgttttcaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaa 24451680  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 303  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||       || ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| |    
T  24451681 ttctaaattttagtaattgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaaatcattcaaaattttaagagtttaagaataattaaacaaactttat 24451780  T
Q  304 tgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaa 364  Q
    | || || |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  24451781 tttagcagggactaaaattagaagtattttttttttgtagggactaaaaaacctactaaaa 24451841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 42499673 - 42499295
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| || ||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||| || | ||||||| ||||||||||| |  | ||||||||||    
T  42499673 tcaattcaattttgtttaatttatgcataaactattaagtttttgaacaattttttgcagacgtattaagaacattactaaaagcttatatgcaaaaaat 42499574  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
    ||| |||||| || |||| |||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||           
T  42499573 tgtcgcaaaatttaatttttacgtccatattgttttaattgtatctttaacttttgtcgtttttaaaaattcatatttaattcgttttatgtt-aaaaaa 42499475  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||       ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |    
T  42499474 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtctc-aaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaagaataattaaacaaactttat 42499376  T
Q  304 tgtaacatggactaaaattagaagtaa-ttcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaactt 383  Q
    ||||||| | ||||||| | ||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  42499375 tgtaacaagaactaaaacttgaagtaattttttttttgtaaggtctaaaaaacctattaaaattaagtaaggattaaactt 42499295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 4 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 18840211 - 18839862
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||| | |  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  18840211 tcaattcaaatttgtttaatttatacttaaactctcaagtttttgaacaattttttgtacatgtgttaagaacattactagaagttcctctgcaaaaaat 18840112  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
    | | |||||| ||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  18840111 tatcgcaaaatttgatttctatgtccagattttattacttttatctttaactcttttcgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaa 18840013  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 303  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||         |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18840012 ttctaagttttagtagatgaacctttcatagtgttctaaacatatccaaaaaaaatcgttcgaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgt 18839913  T
Q  304 tgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaa 354  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  18839912 tttaacatggactaaaattagaagtaaattttttttgtagggactaaaaaa 18839862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 4 - 364
Target Start/End: Original strand, 35369188 - 35369546
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||| | || |||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  35369188 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttcaactcttaagttttttaacaattttttgtagacgtgttaacaacattactaaaagttactccgcaaaaaat 35369287  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
    | |||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||           
T  35369288 tattgcaaaatttgatttatatgtccaaattttattacttttatctttaacttttatcgttttcaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaa 35369386  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 303  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| ||||       |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  35369387 ttctaaattttagcaattgaacctttcatagtgttctaaacttatctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagactttaaggataattaaacaaactttgt 35369486  T
Q  304 tgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaa 364  Q
    | || || |||||||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  35369487 tttagcagggactaaaattagaag-attttttttttgtagggactaaaaaatctactaaaa 35369546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 4 - 423
Target Start/End: Original strand, 17842463 - 17842881
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||| || ||||||| |||| | || |||||||||    
T  17842463 tcaattcaaatttgtttaatttatacttaaactcttaagtttttcaacaattttttgtatacatgttaaaaacattactagaagtacatcagcaaaaaat 17842562  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
      | |||||  ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  17842563 a-tcgcaaattttgatttctacgtccagattttattacttttatctttaacttttgtcgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaa 17842660  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 303  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||| |       |||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17842661 ttctaaattttagtaaatgaactttttatagtgttctaaacatgtc-ccaaaaaatcgtttggaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgt 17842759  T
Q  304 tgtaacatggactaaaattagaagtaa--ttcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttat 401  Q
    | ||  | ||||||||| ||||| |||  || ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||||| |||  |  | |||||||    
T  17842760 tttagtagggactaaaaatagaaataatttttttttttgtaaggactaaaaatactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaagttttcaattttat 17842859  T
Q  402 agtgaccaaaaacatatttaac 423  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  17842860 agggaccaaaaacatatttaac 17842881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 4 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 17498787 - 17498541
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17498787 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaacttttgagtttttgaacaattttttgcagacatataaagaaaattactaaaagttcctctgcaaaaaat 17498688  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
    ||| |||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||           
T  17498687 tgtcgcaaaatttgatttctacgttcaaattttgttaattttatctttaacttttgtcgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatatt-aaaaaa 17498589  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctc 251  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||    
T  17498588 ttctaaattttagtaaatgaatcttttatagtgttctaaacttgtctc 17498541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 4 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 41281593 - 41281235
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||| | ||||| |||||||||| | | || | ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  41281593 tcaatttaaatttgtttaatttatgtttaaactcttaatttttt-aacaattttt-gtagacgtcttaagaacattactaaaagttcctcagcaaaaaat 41281496  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
    | | |||||| ||||||||||  |||||||||  ||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||           
T  41281495 tatcgcaaaatttgatttatatatccagatttcattacttttatctttaacttttatcgttttcaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaa 41281397  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 303  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||        ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41281396 ttctaaactttagtaattgaacctttcatagtgttctaaacttgtctaaaaaaaatcgtttaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgt 41281297  T
Q  304 tgtaacatggactaaaattagaagtaa-ttcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaa 364  Q
    | || || |||||||| |||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  41281296 tttagcaaggactaaatttagaagtaattttttttttgtagggactaaaaaacctactaaaa 41281235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 37707009 - 37706702
Alignment:
Q  11 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 110  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||| | || | || |||| ||||||||||||||||| |||||||||| | |||    
T  37707009 aaatttgtgtaatttatgcttaaactcttatgttttttaacaattttttgtagacgtattgagaacattactaaaagttcctccgcaaaaaattatcgca 37706910  T
Q  111 aaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaa 210  Q
    ||| |||||||||| || |||||||| | | ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||       |||||||    
T  37706909 aaatttgatttatatgttcagattttatcacttttatctttaacttttatcgtttttaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-agaaaattctaaa 37706811  T
Q  211 ttttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaaca 310  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||        |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||    
T  37706810 ttttaataattgaacctttcatagtgttctaatcttgtct-aaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgttttagca 37706712  T
Q  311 tggactaaaa 320  Q
     |||||||||    
T  37706711 gggactaaaa 37706702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 364
Target Start/End: Original strand, 16472997 - 16473341
Alignment:
Q  11 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 110  Q
    |||||||||||||||||||| ||||      |||||| ||| |||||||| | || |||||||| |||||   ||||||||||||||||||||| | |||    
T  16472997 aaatttgtttaatttatgcttaaac------gttttttaaccattttttgtagacgtgttaagattatta---aaagttcctctgcaaaaaattatcgca 16473087  T
Q  111 aaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaa 210  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||          ||||    
T  16473088 aaatttgatttatatgtccagatttt-ttacttttatctttaacttttatcgttttcaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaaaaaaataaa 16473186  T
Q  211 ttttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaaca 310  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||       || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||    
T  16473187 ttttagtaattgaacctttcatagtgttctaaatttgtctcaaaaaaatcattcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgttttagca 16473286  T
Q  311 tggactaaaattagaagtaa-ttcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaa 364  Q
     ||||||| |||| || ||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  16473287 gggactaatattataaataattttttttttgtagggactaaaaaacctactaaaa 16473341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 364
Target Start/End: Original strand, 16477568 - 16477912
Alignment:
Q  11 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 110  Q
    |||||||||||||||||||| ||||      |||||| ||| |||||||| | || |||||||| |||||   ||||||||||||||||||||| | |||    
T  16477568 aaatttgtttaatttatgcttaaac------gttttttaaccattttttgtagacgtgttaagattatta---aaagttcctctgcaaaaaattatcgca 16477658  T
Q  111 aaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaa 210  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||          ||||    
T  16477659 aaatttgatttatatgtccagatttt-ttacttttatctttaacttttatcgttttcaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaaaaaaataaa 16477757  T
Q  211 ttttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaaca 310  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||       || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||    
T  16477758 ttttagtaattgaacctttcatagtgttctaaatttgtctcaaaaaaatcattcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgttttagca 16477857  T
Q  311 tggactaaaattagaagtaa-ttcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaa 364  Q
     ||||||| |||| || ||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  16477858 gggactaatattataaataattttttttttgtagggactaaaaaacctactaaaa 16477912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 21160077 - 21159841
Alignment:
Q  1 tcatcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaa 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||    
T  21160077 tcatcaattcaaatttgtttaatttatgcttatacttttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaacatcactaaaagttcatccgcaaaa 21159978  T
Q  101 aattgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnn 200  Q
    | |||| ||| || ||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||        
T  21159977 agttgtcgcacaatttgatttctacatctagattttgttaactttatctttaacttttgccattttaaaaaatttatatttaatccgtttcatattaaaa 21159878  T
Q  201 nnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgt 237  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21159877 aaattctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgt 21159841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 373
Target Start/End: Original strand, 30968670 - 30969029
Alignment:
Q  14 tttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaatt-ttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||| ||||||| || |||| | || ||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||    
T  30968670 tttgtttaatttatgcataaactcttaagtttttaaacaattattttgcatacgtgtttataacattactaaaagtttctctacaaaaaattatcgcaaa 30968769  T
Q  113 aattgatttatacgtccagattttgttaatttt-atctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaat 211  Q
    |  |||||| ||| | |||||||||||  |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||| ||       ||||||||    
T  30968770 atatgatttctacattcagattttgttgctttttatcattaacttttgtcgttttaaaaaattcatatttaatttattacatatt-aaaaaattctaaat 30968868  T
Q  212 tttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaacat 311  Q
    ||||||||| |||| ||||||| |||||||| |||||||         |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |     
T  30968869 tttagtaaacgaacatttcatattgttctaaacttgtctaaaaaaaaccgtttaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgttttaagag 30968968  T
Q  312 ggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaag 373  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30968969 ggactaaaattataagtaaat-ttttttgtagggactaaaaaaactattaaaattaagtaag 30969029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 4 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 36063718 - 36063369
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaatttttt--gcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaa 101  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||| |||| ||||||| |||||||||||  | | || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  36063718 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaattcttaagttttttaacaattttttttgtagacgtgttaagaacattactaaaagttcctccgcaaaaa 36063619  T
Q  102 attgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnn 201  Q
    ||| | |||||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||             ||||| |||||||||||||||||||||||||||||         
T  36063618 attatcgcaaaatttgatttatatgtccagattttattacttttatc-------------gtttttaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaa 36063532  T
Q  202 nnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaacttt 301  Q
      |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||       |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36063531 a-ttctaaattttagtaattgaacctttcataatgttctaaacttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaacttt 36063433  T
Q  302 gttgtaacatggactaaaattaga-agtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaa 364  Q
    ||| || || | ||||||||||||   |  || ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  36063432 gttttagcaggaactaaaattagatttttttttttttttgtagggactaaaaaacctactaaaa 36063369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 4 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 6413563 - 6413383
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||    
T  6413563 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttgagtttttgaacaattttttgcagacgtgttaagaacatcactaaaagttcctcttcaaaaaat 6413464  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaat 184  Q
    ||| |||||| ||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  6413463 tgtcgcaaaatttgattcctacatccaaattttgttaattttatctttaacttttgccgttttaaaaaattcatatttaat 6413383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 69 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 18304896 - 18304622
Alignment:
Q  69 ttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaa 168  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||    
T  18304896 ttaagaacattactaaaagttcctctgcaaaaaattgtcgcaaaatttgatttctacgtccaaattttgttgattttatctttaaattttgtcgttttaa 18304797  T
Q  169 aaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtct--cnnnnnnntcgttcaa 266  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||        |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||||          || |||||    
T  18304796 aaaattcatatttaattcgtttgaagttacaaaaa-tctaaattttggaaaatgaacctttcatagtgttctaaacatgtcttaaaaaaaaatcattcaa 18304698  T
Q  267 aaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgta 342  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||| || || |||||||||    
T  18304697 aaatttaagagtttaaggataattaatcaaactttgttgtaagagggactaatattagaaatagtttttttttgta 18304622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 132 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 43936681 - 43936391
Alignment:
Q  132 attttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttca 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||        | |||||||| |||||| || ||||||    
T  43936681 attttgttaattttatctttaacttttgccgttttaaaaaatttatttttaattcgtttcatgttaaaaaaaat-taaattttggtaaataaatctttca 43936583  T
Q  232 tagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaacatggactaaaattagaagtaat 331  Q
    ||| |||| || |||||||        |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  43936582 tagcgttcaaaacttgtcttaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaacttttttgtaacg-ggactaaaattagaagtaat 43936484  T
Q  332 tcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaacc 424  Q
    | ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||  ||  |||| ||||||| |  |||||||| ||||||||||    
T  43936483 ttttttttgtaaggactaaaagacctattaaaattaagcaaggattaaacttagaagttcccaattttattggaaccaaaaatatatttaacc 43936391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 83 - 317
Target Start/End: Original strand, 23483421 - 23483654
Alignment:
Q  83 aaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatattta 182  Q
    |||||||| ||| ||||||||| | | |||| ||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  23483421 aaaagttcttctacaaaaaattatcgtaaaatttgatttctacgtccacatttggttaatttgatctttaacttttgcaattttaaaaaattcatattta 23483520  T
Q  183 attcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaa 282  Q
    ||||||||||||||        ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||       | ||||||||||||||||||||||    
T  23483521 attcgtttcatgttaaaaaac-tctaaattttaataaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaaattgttcaaaaatttaagagtttaa 23483619  T
Q  283 agataattaaacaaactttgttgtaacatggacta 317  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23483620 ggataattaaacaaactttgttgtaacatggacta 23483654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 4 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 30658731 - 30658540
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||| |||||||||||||||||| |||||||     
T  30658731 tcaattcaaatttgtttaatt-atgcttaa-ctcttgagtttttaaacaattttttgcagacgtattaagaacattactaaaagttcctcttcaaaaaaa 30658634  T
Q  104 -tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt 196  Q
     |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  30658633 atgttgcaaaatttgatttctacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgtcgttttaaaaaattcataattaatttgtttcatgtt 30658540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 4 - 354
Target Start/End: Original strand, 39336991 - 39337330
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||||||   || ||||||||| ||||||||||||||| | ||||||       
T  39336991 tcaattcaaatttgtttaatttattcttaaactcttaagttttttaacaattttttgttgacgtgttaagaacattactaaaagttccgccgcaaaat-- 39337088  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
               |||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||           
T  39337089 -----------ttgatttatatgtccatattttattacttttatctttaacttctattgttttcaaaaattcatatttaattcgtttaatgttaaaaaaa 39337177  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 303  Q
    || ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||       || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39337178 tt-taaattttattaattgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaagattcattcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgt 39337276  T
Q  304 tgtaacatggactaaaattagaagtaattctttttt---gtatggactaaaaaa 354  Q
      ||  ||||||||||||||||||| ||| ||||||   ||| |||||||||||    
T  39337277 cttagtatggactaaaattagaagtgattttttttttttgtagggactaaaaaa 39337330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 5766005 - 5765631
Alignment:
Q  11 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttg--caaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttg 108  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||   || || |||||||||  ||| |||||| ||||  | |||||||  | |    
T  5766005 aaatttgtttaatttatgcttaaactctgaagtttttcaacaattttttttacagacgtgttaagaacgttattaaaaggtccttcgaaaaaaata-tcg 5765907  T
Q  109 caaaaatt-gatttatacgtccagatttt-gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttc 206  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||| || |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||       ||     
T  5765906 caaaaatttgatttctacgtccatatttttgttacttatatcttaaacttttgtcgttttaaaaaattcatatttaatttatttcatgtt-aaaaaatta 5765808  T
Q  207 taaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgt 306  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |        ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |    
T  5765807 tagattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtataaaaagaatcgttaaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaaatttatttt 5765708  T
Q  307 aacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaactt 383  Q
    | || |||||||||||| |||| | | |||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  5765707 agcagggactaaaattataagttaattttttttatagggattaaaaaagctattaaaattaagtaaggactaaactt 5765631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 28755462 - 28755051
Alignment:
Q  11 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 110  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| || || |||||||||  ||| |||||| ||||| | |||||| | | |||    
T  28755462 aaatttgtttaatttatgcttaaattcttaagtttttcaacaattttttacagacgtgttaagaacgttattaaaaggtcctccg-aaaaaaatatcgca 28755364  T
Q  111 aaaa-ttgatttatacgtccaga-ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttcta 208  Q
    |||| ||||||| ||||| || | |||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||       || ||    
T  28755363 aaaatttgatttctacgttcatatttttgttacttatatcttaaacttttgtcgttttaaaaaattcatatttaatttatttcatgtt-aaaaaattata 28755265  T
Q  209 aattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaa 308  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |        ||||| ||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||| || ||     
T  28755264 gattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtataaaaagaatcgttaaaaaatttaagagtttaacaataattaagcaaaatttattttag 28755165  T
Q  309 catggactaaaattagaagtaa-ttcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgac 407  Q
    || |||||||||||| |||||| || ||||||||| |||  |||||  |||||||||||||| ||  | |||||||  || ||| | ||||||||| |||    
T  28755164 cagggactaaaattataagtaattttttttttgtagggatcaaaaagactattaaaattaagcaaagactaaacttagaagatcgcaattttatagggac 28755065  T
Q  408 caaaaacatattta 421  Q
    |||||| |||||||    
T  28755064 caaaaatatattta 28755051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 4 - 196
Target Start/End: Original strand, 9252645 - 9252836
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  9252645 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttgagtttttgaacaatttttcgcagacgtgttaagaacattactaaaagttcctttgcaaaaaat 9252744  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt 196  Q
    ||  |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||  |||||| |||||||||| |||| |||||    
T  9252745 tgccgcaaaatttgatttctacttccagattttgttaattttatctttaacttttaccgtttt-caaaatttatatttaatttgttttatgtt 9252836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 22 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 17062639 - 17062413
Alignment:
Q  22 atttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgattt 121  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |  | || ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||| |||||| |||||||    
T  17062639 atttatgcttaaacttttgagtttttgaacaattttgtatagacgtgttaagaacattattaaaagttcttctgcaaaaa-ttgtcgcaaaatttgattt 17062541  T
Q  122 atacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaat 221  Q
     || |||||||||||||||||||  |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||       ||||||||||||||||||    
T  17062540 ctatgtccagattttgttaatttcgtctttaacttttctcattttaaaaaattcatatttaattcgtttgatgtt-aaaaaattctaaattttagtaaat 17062442  T
Q  222 gaacctttcatagtgttctaaccttgtct 250  Q
    |||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  17062441 gaacatttcatagtgttttaaacttgtct 17062413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 22 - 250
Target Start/End: Original strand, 17585719 - 17585945
Alignment:
Q  22 atttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgattt 121  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |  | || ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||| |||||| |||||||    
T  17585719 atttatgcttaaacttttgagtttttgaacaattttgtatagacgtgttaagaacattattaaaagttcttctgcaaaaa-ttgtcgcaaaatttgattt 17585817  T
Q  122 atacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaat 221  Q
     || |||||||||||||||||||  |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||       ||||||||||||||||||    
T  17585818 ctatgtccagattttgttaatttcgtctttaacttttctcattttaaaaaattcatatttaattcgtttgatgtt-aaaaaattctaaattttagtaaat 17585916  T
Q  222 gaacctttcatagtgttctaaccttgtct 250  Q
    |||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  17585917 gaacatttcatagtgttttaaacttgtct 17585945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 4 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 13323845 - 13323652
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaa-gttcctctgcaaaaaa 102  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| | || ||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||    
T  13323845 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagttttttaacaattttttgtagacgtgttaagaacattactaaaaagttcctccacaaaaaa 13323746  T
Q  103 ttgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt 196  Q
    || | |||||| |||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13323745 ttatcgcaaaatttgatttatatgttcagattttattacttttatctttaacttttatcattttcaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt 13323652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 11 - 420
Target Start/End: Original strand, 36018116 - 36018528
Alignment:
Q  11 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaa-attgttgc 109  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||  | || |||||||||   || |||||||| ||| ||||||| ||| | ||    
T  36018116 aaatttgtttcatttatgcttaaactcttaagtttttcaacaattttttt-agacgtgttaagaacgctattaaaagtttctccgcaaaaacattatcgc 36018214  T
Q  110 aaaaatt-gatttatacgtccagatttt-gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttct 207  Q
    ||||||| ||||| ||| | || ||||| |||| ||||||||| ||||||| | |||| ||||||| ||||||| |||  |||||||||       | ||    
T  36018215 aaaaatttgatttctacattcatatttttgttacttttatcttaaacttttttggtttaaaaaaatacatattttatttatttcatgttaaaaaaat-ct 36018313  T
Q  208 aaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgta 307  Q
    | |||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||       | ||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||    
T  36018314 agattttaataaatgaaccttttatagtgttcaaaacttgtctcaaaaaaattgttaagaaatttaagagtttaagaataattaaacaaactttgtttta 36018413  T
Q  308 acatggactaaaattagaagtaattc--ttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtg 405  Q
     || |||||||||||| |||| |||   ||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||  ||||||||| |    
T  36018414 gcagggactaaaattacaagtgattgatttttttgtagggattaaaaatgctattaaaattaattaaggattaaacttaaaaattccaaattttataggg 36018513  T
Q  406 accaaaaacatattt 420  Q
    |||||||| ||||||    
T  36018514 accaaaaaaatattt 36018528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 25 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 32514318 - 32513959
Alignment:
Q  25 tatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttata 124  Q
    |||||| ||||| || || |||| ||||||||||| || |  ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |   |||| || || | ||    
T  32514318 tatgcttaaacttttaagattttaaacaattttttacagaagtgttaagaacattactaatagttcatctgcaaaaaattatctgaaaattttatatcta 32514219  T
Q  125 cgtccaga-ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatga 223  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |  |||  ||||||| ||||||||||| |||||||||        |||||||||||||||| ||    
T  32514218 cgtccagaattttgttacttttatctttaacttttttcctttacaaaaatttatatttaattcatttcatgttaaaaaaaatctaaattttagtaaacga 32514119  T
Q  224 acctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaacatggactaaaatta 323  Q
    ||||||  ||  ||||||| ||||||||       ||||| |||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||| ||  | ||||||||| ||    
T  32514118 accttttgtaacgttctaaacttgtctcaaaataatcgtttaaaaatttaagagtttaaggataattagagaaactttgttttagtagggactaaaacta 32514019  T
Q  324 gaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaactt 383  Q
     | |||| |  ||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||    
T  32514018 catgtaaattatttttataaggactaaaaagactattaaaattaagtaaggattaaactt 32513959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 208 - 427
Target Start/End: Original strand, 36126455 - 36126678
Alignment:
Q  208 aaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaa-tttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgt 306  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||        ||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||| || |    
T  36126455 aaattttagtaaatgaaccttttatagtgttttaaacttgtcttaaaaaaatcgttcaaaaaatttaatagtttaaggatagttaaacaaactttatttt 36126554  T
Q  307 aacatggactaaaattagaagtaattctttttt---gtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatag 403  Q
    | || ||||||||||||||||||||| ||||||   ||| | | |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||  || | |||||||||    
T  36126555 agcagggactaaaattagaagtaattttttttttttgtaggtattaaaaaacctattaaaattaagtaaggactaaacttaaaagttctcaattttatag 36126654  T
Q  404 tgaccaaaaacatatttaacccta 427  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
T  36126655 ggaccaaacacatatttaacccta 36126678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 259 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 17062313 - 17062151
Alignment:
Q  259 tcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaaccta 358  Q
    |||||||||||||||| ||||    |||| |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  17062313 tcgttcaaaaatttaaaagtt----gatagttaaacaaactttgttgtaacgggaactaaaattagaagtaattcttttttgtagggactaaaagaccta 17062218  T
Q  359 ttaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccc 425  Q
     |||||||||||| | |||||||||  ||  |||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  17062217 ctaaaattaagtacggattaaacttagaagttcccaattttatagcgaccaaaaatatatttaaccc 17062151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 259 - 425
Target Start/End: Original strand, 17586045 - 17586207
Alignment:
Q  259 tcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaaccta 358  Q
    |||||||||||||||| ||||    |||| |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  17586045 tcgttcaaaaatttaaaagtt----gatagttaaacaaactttgttgtaacgggaactaaaattagaagtaattcttttttgtagggactaaaagaccta 17586140  T
Q  359 ttaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccc 425  Q
     |||||||||||| | |||||||||  ||  |||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  17586141 ctaaaattaagtacggattaaacttagaagttcccaattttatagcgaccaaaaatatatttaaccc 17586207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 262 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 30658491 - 30658323
Alignment:
Q  262 ttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaacatggactaaaattagaagta-attcttttttgtatggact---aaaaaacct 357  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||  ||||   |||||| ||    
T  30658491 ttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgttgtaacagggactaaaattagaagtatttttttttttgtaaagactaaaaaaaaatct 30658392  T
Q  358 attaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccct 426  Q
    |||||||||||||||| | |||||||  ||  || | ||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  30658391 attaaaattaagtaaggactaaacttagaagttcacaattttatagggaccaaaaacatatttgaccct 30658323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 43988446 - 43988211
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||| | |||||||    |||| ||||  ||||||| || |||||  ||||| ||    
T  43988446 tcaattcaaatttgtttaatt-atgcttaaactcttaagttttcgaacattattttgcatg--tgtttagaacgttactaatagctcctccacaaaatat 43988350  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagatttt-gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnn 202  Q
    | | |||||| ||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||          
T  43988349 tatcgcaaaatttgatttttacatccagatttttgttacttttatctttaacttttgctgttttaaaaaattcatatttaactcattttatgtt-aaaaa 43988251  T
Q  203 nttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaa 242  Q
     ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  43988250 attctaaattttagtatataaacctttcatagtgttctaa 43988211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 262 - 427
Target Start/End: Original strand, 2827065 - 2827230
Alignment:
Q  262 ttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctatta 361  Q
    |||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| ||||  || ||  ||||||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||  ||||||    
T  2827065 ttcaaaaaattaagagtttgaggataattaaacaaacattgtcttagcagagactaaaattataagtaacttttttttgtagggactaaaaagactatta 2827164  T
Q  362 aaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaacccta 427  Q
    |||||||||||| | ||||||| |||  | |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2827165 aaattaagtaaggactaaacttaaaagcttcaaattttatagggaccaaaaacatatttaacccta 2827230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 344 - 431
Target Start/End: Original strand, 547339 - 547426
Alignment:
Q  344 ggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaaa 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  547339 ggactaaaaaacctattaaaattaagtaaggattaaacttgaaaggtccctattttatagagaccaaaaacatatttaacccaaaaaa 547426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 262 - 422
Target Start/End: Original strand, 12469454 - 12469615
Alignment:
Q  262 ttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggact-aaaaaacctatt 360  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||| || | ||| |||||| |||||    
T  12469454 ttcaaaaatttaggagtttaaggataattaaacaaactttgttgtaatagggactaaaattaaaagtaatt-ttttttttaagaactaaaaaaatctatt 12469552  T
Q  361 aaaattaagtaaga-attaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaa 422  Q
    |||||||||||| | | |||||||  ||  |||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12469553 aaaattaagtaaaagactaaacttagaagttcctaattttatagggaccaaaaacatatttaa 12469615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 14122038 - 14121938
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||    
T  14122038 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttgagtttttgaacaattttttacagacgtgttaagaacattactaaaagttcctatgcaacaaat 14121939  T
Q  104 t 104  Q
    |    
T  14121938 t 14121938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 262 - 426
Target Start/End: Original strand, 31185724 - 31185890
Alignment:
Q  262 ttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaacatggactaaaattagaagtaa--ttcttttttgtatggactaaaaaacctat 359  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| || || || |||||||||||| ||||||  || ||||||||| | | ||||||| ||||    
T  31185724 ttcaaaaatttaagagtttaaggataattaagcaaaatttattttagcagggactaaaattataagtaaattttttttttgtaggaattaaaaaaactat 31185823  T
Q  360 taaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccct 426  Q
    |||||||||||||| | |||||||  ||  || | ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  31185824 taaaattaagtaaggactaaacttataaggtcgcaattttatagggatcaaaaacatatttaaccct 31185890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 6 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 32244690 - 32244511
Alignment:
Q  6 aattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattg 105  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||     
T  32244690 aatttaaatttgtttaatt-atgcttaaacttttaagattttgaacaattttttgcacaagtgttaagaacattacgaaaagttcatctacaaaaaatta 32244592  T
Q  106 ttgcaaaaattgatttatacgtccag-attttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaatt 185  Q
    |  ||||| || |||||| ||||||| ||||||||| |||||| || |||||||||    | ||||||| |||||||||||    
T  32244591 tctcaaaattttatttatgcgtccagaattttgttacttttattttgaacttttgtctactaaaaaaatccatatttaatt 32244511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 44 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 42024504 - 42024231
Alignment:
Q  44 ttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaa-aaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccagatttt-gttaa 141  Q
    |||| |||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||| | |  ||||| || |||| |||||| ||||||| ||||     
T  42024504 ttttaaacaattttttgcagaagtgttaagaacattactaaaatttcatctgcaagaaaaatct--caaaattttatttctacgtcgagatttttgttac 42024407  T
Q  142 ttttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttcta 241  Q
    ||||||||| |||||||||  ||  |||||||||||||||||  | ||||||| |       |||||||||||||||||  ||| |||  || |||||||    
T  42024406 ttttatcttgaacttttgtctttcaaaaaaattcatatttaacccatttcatggtataaaa-ttctaaattttagtaaacaaacttttggtaatgttcta 42024308  T
Q  242 accttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaacatggactaaaa 320  Q
    | |||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || || |||||||||    
T  42024307 aacttgtct--aaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattagagaaactttgttttagcagggactaaaa 42024231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 304 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 21159843 - 21159717
Alignment:
Q  304 tgtaacatggactaaaattagaagtaattctttttt-gtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttata 402  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| || |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||  || | ||||||||    
T  21159843 tgtaacagggactaaaattagaagtatttatttttttgttgggactaaaaaacctattaaaattaagtaaggactaaacttagaagttctcaattttata 21159744  T
Q  403 gtgaccaaaaacatatttaaccctaaa 429  Q
    | ||||||||| |||||||| ||||||    
T  21159743 gggaccaaaaatatatttaatcctaaa 21159717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 334 - 432
Target Start/End: Original strand, 36471145 - 36471243
Alignment:
Q  334 ttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaaaa 432  Q
    |||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||    
T  36471145 ttttttttagggactaaaagaactattaaaattaagtaaggactaaacttgaaagatctctattttatagggaccaaaatcatatttaacccaaaaaaa 36471243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 344 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 6590227 - 6590142
Alignment:
Q  344 ggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaa 429  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6590227 ggactaaaagaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaagatcccaattttatagggaccaaaaacatatttaaccctaaa 6590142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 248
Target Start/End: Original strand, 3865698 - 3865934
Alignment:
Q  11 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 110  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||| |  | ||||||| || || |||||||  ||| ||||||||| |  ||    
T  3865698 aaatttgtttaatt-atgcttaaacttttaagattttgaacaattttttgcacaagtattaagaacatcacgaaaagtttatctccaaaaaattatctca 3865796  T
Q  111 aaaattgatttatacgtccagatttt-gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaa 209  Q
    ||| || |||  | |||||||||||| |||| |||||| || |||||||||  ||| |||||||||||||||||||  |||||||||       ||||||    
T  3865797 aaattttattcctgcgtccagatttttgttacttttattttgaacttttgtcttttaaaaaaattcatatttaatttatttcatgtt-aaaaaattctaa 3865895  T
Q  210 attttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgt 248  Q
    | ||||||||| ||||||||  || |||||||| |||||    
T  3865896 agtttagtaaacgaacctttagtaatgttctaaacttgt 3865934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 270 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 30806368 - 30806208
Alignment:
Q  270 tttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaag 369  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||  | |||||  ||||| | |||| | ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  30806368 tttaagagtttaaggacaattaaacaaactttgttttagtaaggactggaattacatgtaaatattttttgtagggattaaaaaaactattaaaattaag 30806269  T
Q  370 taagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaa 430  Q
    |||  | ||||||| |||  | || |||||||||  |||||||| |||||||||| |||||    
T  30806268 taaatactaaacttaaaagtttccaattttataggaaccaaaaatatatttaaccttaaaa 30806208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 345 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 12469385 - 12469306
Alignment:
Q  345 gactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaacc 424  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  12469385 gactaaaaaaactattaaaatcaagtaagaattaaacttaaaaaatctcaattttatagagatcaaaaacatatttaacc 12469306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 344 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 14121892 - 14121806
Alignment:
Q  344 ggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaa 430  Q
    ||||||||| | | |||||||||||||||| | |||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  14121892 ggactaaaagaaccattaaaattaagtaaggactaaacttgaaaggtccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccctaaaa 14121806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 358 - 426
Target Start/End: Original strand, 14122090 - 14122158
Alignment:
Q  358 attaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccct 426  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14122090 attaaaattaagtaaggactaaacttgaaagacccctattttatagggaccaaaaacatatttaaccct 14122158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 334 - 418
Target Start/End: Original strand, 30133849 - 30133933
Alignment:
Q  334 ttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatat 418  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  30133849 ttttttatatggactaaaaacactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaaaatctcaattttatagggaccaaaaacatat 30133933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 334 - 421
Target Start/End: Original strand, 38706763 - 38706850
Alignment:
Q  334 ttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatattta 421  Q
    |||||| || ||||||||| | ||||||||||||| |||  | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38706763 ttttttttagggactaaaataactattaaaattaaataaagactaaacttgaaagatccctattttatagggaccaaaaacatattta 38706850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 44 - 154
Target Start/End: Original strand, 2826919 - 2827029
Alignment:
Q  44 ttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaatt 143  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||| || |||||||||||||| ||  ||||||||  | |||||| ||||||| ||  | |||||||||||| ||    
T  2826919 ttttgaacaattttttgcagacgtgttaaaaacattactaaaagttcatccacaaaaaatcatcgcaaaatttgatttctatattcagattttgttactt 2827018  T
Q  144 ttatctttaac 154  Q
    |||||||||||    
T  2827019 ttatctttaac 2827029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 345 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 10409558 - 10409473
Alignment:
Q  345 gactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaa 430  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||||| |||  |||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  10409558 gactaaaaacactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaaggtcccaattttacagggaccaaaaacatatttaaccctaaaa 10409473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 345 - 426
Target Start/End: Original strand, 43988485 - 43988566
Alignment:
Q  345 gactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccct 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  || | | | ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43988485 gactaaaaaacctattaaaattaagtaaggactaaacttagaagacctcaattttatagggaccaaaaacatatttaaccct 43988566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 44894698 - 44894574
Alignment:
Q  11 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 110  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||| |  ||    
T  44894698 aaatttgtttaatt-atgcttaaacttttaagattttgaacaattttttgcacaagtgttaagaacattacgaaaagttcatctccaaaaaattatctca 44894600  T
Q  111 aaaattgatttatacgtccagatttt 136  Q
    ||| || |||| | ||||||||||||    
T  44894599 aaattttatttctgcgtccagatttt 44894574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 344 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 37967496 - 37967413
Alignment:
Q  344 ggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaacccta 427  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||| ||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  37967496 ggactaaaaaaactattaaaattaagtaaagactaaacttaaaagatctcaattttatagggacgaaaaacatatttaacccta 37967413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 44 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 3866647 - 3866505
Alignment:
Q  44 ttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccag-attttgttaat 142  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| |  ||||| || |||| |  || ||| ||||||||| |    
T  3866647 ttttgaacaattttttgcacaagtgttaagaatattacgaaaagttcatatgcaaaaaattatctcaaaattttatttctgtgttcagaattttgttact 3866548  T
Q  143 tttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaatt 185  Q
    ||||| || |||||||||   || ||||||| |||||||||||    
T  3866547 tttattttgaacttttgtctattaaaaaaatccatatttaatt 3866505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 335 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 24451454 - 24451364
Alignment:
Q  335 tttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccc 425  Q
    |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||  || | ||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  24451454 tttttgtaagaactaaaaaaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgtctcaattttatagggactaaaaacatatttaaccc 24451364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 334 - 427
Target Start/End: Original strand, 5250711 - 5250804
Alignment:
Q  334 ttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaacccta 427  Q
    |||||| || ||||||||| | | ||||||||||| |||| | |||||||||||  ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5250711 ttttttttagggactaaaagaaccattaaaattaaataaggactaaacttgaaaggtctttattttatagggaccaaaaacatatttaacccta 5250804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 334 - 426
Target Start/End: Original strand, 17498813 - 17498905
Alignment:
Q  334 ttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccct 426  Q
    |||||| || ||||||||||  |||||| ||||||||||| | ||||||| |||| || | ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  17498813 ttttttttagggactaaaaatactattagaattaagtaaggactaaacttaaaaagtcacaattttatagagaacaaaaacatatttaaccct 17498905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 4 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 39337813 - 39337757
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttg 60  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  39337813 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagttttttaacaattttttg 39337757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 334 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 44893828 - 44893744
Alignment:
Q  334 ttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatat 418  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| | |||| || |||  |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  44893828 ttttttatatggactaaaaacactattaaaattaagtaaggactaaatttaaaaggtcccaattttatagggaccaaaaacatat 44893744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 334 - 418
Target Start/End: Original strand, 44894732 - 44894816
Alignment:
Q  334 ttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatat 418  Q
    |||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||   ||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  44894732 ttttttatatggactaaaagcactattaaaattaagtaagggctaaacttaaaagatcccaattttatagggaccaaaaacatat 44894816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 196
Target Start/End: Original strand, 6243479 - 6243663
Alignment:
Q  11 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 110  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || | |||| |||||| |||||||| |  |||||  || ||||| |||||||| || |||||||||| |  ||    
T  6243479 aaatttgtttaatt-atgcttaaacttttaaatttt-gaacaaatttttgcacaagtgttagtaacattacgaaaagttcatccgcaaaaaattatctca 6243576  T
Q  111 aaaattgatttatacgtccagatttt-gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt 196  Q
    ||| || |||| | | |||| ||||| |||| |||||| || ||||||| |  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6243577 aaatttaatttctgcatccatatttttgttacttttattttgaacttttatcttttaaaaaaattcatatttaatttgtttcatgtt 6243663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 344 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 8784539 - 8784457
Alignment:
Q  344 ggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccct 426  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||   ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  8784539 ggactaaaagaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatatctgaattttatagggatcaaaaacatatttaaccct 8784457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 427
Target Start/End: Original strand, 21160113 - 21160195
Alignment:
Q  345 gactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaacccta 427  Q
    |||||||| | ||||||||| ||| |||| ||||||||| |||  |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  21160113 gactaaaagaactattaaaactaaataaggattaaacttaaaatgtcccaattttatagggacaaaaaacatatttaacccta 21160195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 425
Target Start/End: Original strand, 41281621 - 41281711
Alignment:
Q  335 tttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccc 425  Q
    |||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||| |||   | | ||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  41281621 tttttgtaaggactaaaacaattattaaaattaagtaaggattaaacttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaacatatttaaccc 41281711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 344 - 426
Target Start/End: Original strand, 41590668 - 41590750
Alignment:
Q  344 ggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccct 426  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||| |||  |||| |||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  41590668 ggactaaaagaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaaggtcccaattttataggaactaaaaacatatttaaccct 41590750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 334 - 424
Target Start/End: Original strand, 42950204 - 42950294
Alignment:
Q  334 ttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaacc 424  Q
    |||||| || |||||||||   |||||||||||||||||| | ||||||| |||| |  | ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42950204 ttttttttagggactaaaagcactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaaagtaacaattttatagggaccaaaaacatatttaacc 42950294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 160
Target Start/End: Original strand, 1663854 - 1663906
Alignment:
Q  108 gcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgt 160  Q
    ||||||||| |||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1663854 gcaaaaatttatttctatgtccagattttgttacttttatctttaacttttgt 1663906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 335 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 1680939 - 1680847
Alignment:
Q  335 tttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaacccta 427  Q
    ||||| || ||||| ||| | |||||||||||||||||| | ||||||| | |  |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  1680939 tttttttagggactcaaagaactattaaaattaagtaaggactaaacttaagaggtcccaattttttagggaccaaaaacatatttaacccta 1680847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 334 - 430
Target Start/End: Original strand, 25102281 - 25102376
Alignment:
Q  334 ttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaa 430  Q
    |||||| || ||||||||| | | |||||||||||||||  | ||||||||||| | ||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  25102281 ttttttttaaggactaaaagaaccattaaaattaagtaaagactaaacttgaaagacccc-attttatagggatcaaaaacatatttaacccaaaaa 25102376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 248
Target Start/End: Original strand, 32243684 - 32243920
Alignment:
Q  11 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 110  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||| |  | ||||||| || || |||||||  ||||||||||||| |  ||    
T  32243684 aaatttgtttaatt-atgcttaaacttttaagattttgaacaattttttgcacaagtattaagaacatcacgaaaagtttatctgcaaaaaattatctca 32243782  T
Q  111 aaaattgatttatacgtccaga-ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaa 209  Q
    ||| || |||  | |||| ||| |||| ||| |||||| || |||||||||  ||| |||||| | |||||||| |  |||||||||       || |||    
T  32243783 aaattttattcctgcgtctagattttttttacttttattttgaacttttgtcttttaaaaaaaattatatttaaattatttcatgtt-aaaaaattataa 32243881  T
Q  210 attttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgt 248  Q
    ||||||||||| ||||||||  || |||||||| |||||    
T  32243882 attttagtaaacgaacctttagtaatgttctaaacttgt 32243920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 35369984 - 35369928
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttg 60  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||    
T  35369984 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagttttttaataattttttg 35369928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 335 - 425
Target Start/End: Original strand, 13323873 - 13323963
Alignment:
Q  335 tttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccc 425  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||| |||   | | ||||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  13323873 tttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttataaggactaaaaacatatttaaccc 13323963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 335 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 21135294 - 21135204
Alignment:
Q  335 tttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccc 425  Q
    |||||||| ||||||||| |  ||| ||||||||||||| | ||||||| |||  || | ||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  21135294 tttttgtaaggactaaaacaattatgaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgtctcaattttatagggactaaaaacatatttaaccc 21135204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 344 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 33322494 - 33322412
Alignment:
Q  344 ggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccct 426  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||  || | |||||||||  | |||||| ||||||||||||    
T  33322494 ggactaaaaaaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaaggtctcaattttatagaaatcaaaaagatatttaaccct 33322412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 335 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 35863011 - 35862921
Alignment:
Q  335 tttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccc 425  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||| |||   | | ||||||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  35863011 tttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaacgtatttaaccc 35862921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 335 - 425
Target Start/End: Original strand, 39337841 - 39337931
Alignment:
Q  335 tttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccc 425  Q
    ||||||||  |||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||| |||   | | ||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  39337841 tttttgtaacgactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaacatatttaaccc 39337931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 344 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 9252606 - 9252521
Alignment:
Q  344 ggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaa 429  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||| | ||| ||  | ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||    
T  9252606 ggactaaaagaactattaaaattaagtaaggactaaacataaaatatttcaattttatagggactaaaaaaatatttaaccctaaa 9252521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 383
Target Start/End: Original strand, 10410010 - 10410225
Alignment:
Q  167 aaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaa 266  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||       ||||||||||| ||||||||| ||||  || |||| ||| ||| |||        ||||||||    
T  10410010 aaaaaaatcatatttaattcatttcatgttaaaaaa-ttctaaattttggtaaatgaatcttttgtaatgttttaaacttatcttaaaaaaatcgttcaa 10410108  T
Q  267 aaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaatt 366  Q
    |||||||||| | ||| |||||||| | |||||||||| ||| |  |||||||| |  | |||| || ||||| || | | |||||||  ||||||||||    
T  10410109 aaatttaagactctaaggataattagagaaactttgttttaatagagactaaaacttcatgtaaatcatttttataggaattaaaaaagttattaaaatt 10410208  T
Q  367 aagtaagaattaaactt 383  Q
    ||||||| | |||||||    
T  10410209 aagtaaggactaaactt 10410225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 13323155 - 13323066
Alignment:
Q  335 tttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaacc 424  Q
    |||||||  ||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||| |||  || | |||||| || ||| ||||||||||||||||    
T  13323155 tttttgttaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgtctcaattttacagggactaaaaacatatttaacc 13323066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 424
Target Start/End: Original strand, 21136266 - 21136355
Alignment:
Q  335 tttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaacc 424  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||| |||   | | |||||| || ||| ||||||||||||||||    
T  21136266 tttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttacagggactaaaaacatatttaacc 21136355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 334 - 418
Target Start/End: Original strand, 2821304 - 2821386
Alignment:
Q  334 ttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatat 418  Q
    |||||| || |||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||  | || ||||||||||||| ||||||||||    
T  2821304 ttttttatagggactaaaaaac-tattaaaattaagtatgaactaaacttaaaaggttcc-attttatagtgacaaaaaacatat 2821386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 334 - 418
Target Start/End: Original strand, 3866714 - 3866798
Alignment:
Q  334 ttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatat 418  Q
    |||||| |||| ||||||||  |||||| ||||||||||| |  |||||| ||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  3866714 ttttttatatgaactaaaaacactattataattaagtaaggacaaaacttaaaagatcctaattttatagggaccaaaaacatat 3866798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 346 - 422
Target Start/End: Original strand, 5696245 - 5696320
Alignment:
Q  346 actaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaa 422  Q
    ||||||||| | |||| ||||||||||| | ||||||| ||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||    
T  5696245 actaaaaaaacaattataattaagtaaggactaaactt-aaaaatctcaattttatagggatcaaaaacatatttaa 5696320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 14 - 102
Target Start/End: Original strand, 10409789 - 10409876
Alignment:
Q  14 tttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaa 102  Q
    ||||||||||| ||| | ||||| || || ||||||||||||| ||||  |  ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  10409789 tttgtttaatt-atgtttaaacttttaagattttgaacaatttcttgcggaagtgttaagaacattactaaaagttcatctgcaaaaaa 10409876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 346 - 418
Target Start/End: Original strand, 30658769 - 30658841
Alignment:
Q  346 actaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatat 418  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||  |||| ||||| ||| ||||| ||| ||||    
T  30658769 actaaaaaaactattaaaattaagtaagaattaaatttaaaaggtcccaattttgtagggaccagaaatatat 30658841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 335 - 423
Target Start/End: Original strand, 36063746 - 36063834
Alignment:
Q  335 tttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaac 423  Q
    |||||||| |||| |||| | |||||||||||||||||| | ||||||| |||   | | ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  36063746 tttttgtaaggacaaaaacagctattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaacatatttaac 36063834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 397 - 437
Target Start/End: Original strand, 38508587 - 38508627
Alignment:
Q  397 tttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaaaatatta 437  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38508587 tttatagggaccaaaaacatatttaaccctaaaaactatta 38508627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 6244338 - 6244275
Alignment:
Q  133 ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt 196  Q
    |||||||| |||||| || |||||||||  ||| |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  6244338 ttttgttacttttattttgaacttttgtcttttaaaaaaattcatatttaatttatttcatgtt 6244275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 34050685 - 34050598
Alignment:
Q  109 caaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt 196  Q
    ||||| || |||| || ||||| ||||||||| ||||||||| || |||||  ||||||||||| | ||||||||||| || ||||||    
T  34050685 caaaattttatttttaggtccaaattttgttagttttatcttgaatttttggcgttttaaaaaaattatatttaattcattacatgtt 34050598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 334 - 424
Target Start/End: Original strand, 6413591 - 6413681
Alignment:
Q  334 ttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaacc 424  Q
    |||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||  | ||||||  ||||| ||| ||||||||||    
T  6413591 ttttttttagggattaaaaaaactattaaaattaagtaagaaataaacttaaaaggtcctaactttataaggaccataaatatatttaacc 6413681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 335 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 16472962 - 16472873
Alignment:
Q  335 tttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccc 425  Q
    ||||||||  |||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||| ||||  ||  | ||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  16472962 tttttgtaacgactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaactt-aaaacgcctcaatttatagggactaaaaacatatttaaccc 16472873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 335 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 16477533 - 16477444
Alignment:
Q  335 tttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccc 425  Q
    ||||||||  |||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||| ||||  ||  | ||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  16477533 tttttgtaacgactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaactt-aaaacgcctcaatttatagggactaaaaacatatttaaccc 16477444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 334 - 432
Target Start/End: Original strand, 18840238 - 18840336
Alignment:
Q  334 ttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaaaa 432  Q
    ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||  | | ||||| |||| |  | ||||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||    
T  18840238 ttttttgtagggactaaaagaactattaaaattaagtaaagacttaactttaaaagtttcaattttatagggactaaaactatatttaaccctataaaa 18840336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #112
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 24 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 28701928 - 28701866
Alignment:
Q  24 ttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaa 86  Q
    ||||||| ||||| || || ||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||    
T  28701928 ttatgcttaaacttttaagattttgaacaattttttgtagaagtgttaagaatattactaaaa 28701866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #113
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 336 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 32243648 - 32243566
Alignment:
Q  336 ttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatat 418  Q
    |||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||| | ||||||| |||  || | ||||||||| |||| |||||||||    
T  32243648 ttttatatggactaaaaacactattataattaagtaaggactaaacttaaaatgtctcaattttatagggacctaaaacatat 32243566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #114
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 335 - 425
Target Start/End: Original strand, 35370012 - 35370102
Alignment:
Q  335 tttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccc 425  Q
    |||||||  ||||||||| | |||||||||||||||||  | ||||||| |||  |  | ||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  35370012 tttttgtgaggactaaaacaactattaaaattaagtaaagactaaacttaaaatgtttcgattttatagggactaaaaacatatttaaccc 35370102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #115
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 397 - 431
Target Start/End: Original strand, 36091721 - 36091755
Alignment:
Q  397 tttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaaa 431  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36091721 tttatagggaccaaaaacatatttaaccctaaaaa 36091755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #116
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 397 - 431
Target Start/End: Original strand, 37120802 - 37120836
Alignment:
Q  397 tttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaaa 431  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37120802 tttatagggaccaaaaacatatttaaccctaaaaa 37120836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #117
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 335 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 39336963 - 39336873
Alignment:
Q  335 tttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccc 425  Q
    ||||| || ||||||||| |  ||||||||||||||||| | ||||||| |||   | | ||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  39336963 tttttctaaggactaaaacaattattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaacatatttaaccc 39336873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #118
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 4 - 58
Target Start/End: Original strand, 41255335 - 41255389
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttt 58  Q
    |||||| ||||||||||||||  || | || ||||||||||||||||||||||||    
T  41255335 tcaattcaaatttgtttaattagtgtttaatctcttgagtttttgaacaattttt 41255389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #119
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 397 - 430
Target Start/End: Original strand, 5925885 - 5925918
Alignment:
Q  397 tttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaa 430  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5925885 tttatagggaccaaaaacatatttaaccctaaaa 5925918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #120
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 397 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 8841764 - 8841727
Alignment:
Q  397 tttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaaaata 434  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8841764 tttatagggaccaaaaacatatttaacccaaaaaaata 8841727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #121
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 317 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 17498538 - 17498435
Alignment:
Q  317 aaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacat 416  Q
    ||||||||||| | || ||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||||| | |||||||  ||| | || ||||||||| || ||| |||||    
T  17498538 aaaattagaagaactt-ttttttgtatgaactaaaaatc-tattaagattaagtaaggactaaacttataaatttccaattttatagggatcaataacat 17498441  T
Q  417 atttaa 422  Q
    ||||||    
T  17498440 atttaa 17498435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #122
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 397 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 18150328 - 18150295
Alignment:
Q  397 tttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaa 430  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18150328 tttatagggaccaaaaacatatttaaccctaaaa 18150295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #123
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 335 - 424
Target Start/End: Original strand, 24452424 - 24452513
Alignment:
Q  335 tttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaacc 424  Q
    |||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||| | ||||||| |||   | | |||||| || ||| ||||||||||||||||    
T  24452424 tttttgtaaggactaaaacaattattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttacagggactaaaaacatatttaacc 24452513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #124
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 397 - 430
Target Start/End: Original strand, 40714364 - 40714397
Alignment:
Q  397 tttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaa 430  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40714364 tttatagggaccaaaaacatatttaaccctaaaa 40714397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 230; Significance: 1e-126; HSPs: 109)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 4 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 33832418 - 33831998
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | || ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  33832418 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttgagtttttgaacaatttttcgtagacgtgttaagaacattactaaaagttcctctacaaaaaat 33832319  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  ||           
T  33832318 tgtcgcaaaatttgatttgtacgtccagaatttgttaattttatcttatacttttgtcattttaaaaaattcatatttaattcgtttca--tttaaaaaa 33832221  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||         ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  33832220 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttataaacttgtcataaaaaaatcgtttaaaaatttaagagtttaaggataattaaacagactttgt 33832121  T
Q  304 tgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatag 403  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||  |||| |||||||||    
T  33832120 cgtaacaaggactaaaattagaagtaatttttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaaggactaaacttagaagttcccaattttatag 33832021  T
Q  404 tgaccaaaaacatatttaaccct 426  Q
     ||||||||||||| ||||||||    
T  33832020 agaccaaaaacataattaaccct 33831998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 4 - 424
Target Start/End: Original strand, 7439220 - 7439639
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |  || ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  7439220 tcaattcaattttttttaatttatgcttaaactcttgtgtttttgaacaattttttactgacgtgtcaagaacattactaaaagttcctctacaaaaaat 7439319  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
    ||| |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  7439320 tgtcgcaaaatttaatttctacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgtcgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaa 7439418  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 303  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||       ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  7439419 ttctaaattttactaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaaatcgtttaaaaatttaagagtttaagaataattaaacaaactttgt 7439518  T
Q  304 tgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatag 403  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||  | || |||||||||    
T  7439519 tgtaacagagactaaaattagaagtaattattttttgtagggattaaaaaacctatttaaattaagtaaggattaaacttataagtttccaattttatag 7439618  T
Q  404 tgaccaaaaacatatttaacc 424  Q
     ||||||||||| ||||||||    
T  7439619 ggaccaaaaacaaatttaacc 7439639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 11 - 425
Target Start/End: Original strand, 10357322 - 10357736
Alignment:
Q  11 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 110  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  10357322 aaatttgtttaatttatgcttaaactcttgagtttttgaacaattttttgcagacgtgttaagaacattactaaaagttcctctgcaaaaaattgtcgaa 10357421  T
Q  111 aaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaa 210  Q
    ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| | |||       |||||||    
T  10357422 aaatttgatttctacgcccagattttgttaattttatctttaacttttaccgttttaaaaaattcatatttaattcgtttaaggtt-aaaaaattctaaa 10357520  T
Q  211 ttttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaaca 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10357521 ttttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtctaaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaata 10357620  T
Q  311 tggactaaaattagaagtaa-ttcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgacca 409  Q
     ||| ||||||||||||||| || |||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||| | |||||||  ||  | || ||||||||| ||| |    
T  10357621 gggattaaaattagaagtaattttttttttataaggactaaaaaatctattaaaatcaagtaaggactaaacttagaagtttccaattttatagggacaa 10357720  T
Q  410 aaaacatatttaaccc 425  Q
    ||||||||||||||||    
T  10357721 aaaacatatttaaccc 10357736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 4 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 42274596 - 42274168
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||| |||||||| || |||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  42274596 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcatgagttttcaaacaaatttttgcagacgtgttaaaaacattactaaaagttcctctgcaaaaaat 42274497  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
    ||| |||||| ||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||           
T  42274496 tgtcgcaaaatttgatttctatgtctagattttgttaattttatctttaacttttgccgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatattaaaaaaa 42274397  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 303  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||        |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  42274396 -tctaaattttggtaaatgaacctttcataatgttctaaacttgtcttaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaattttgt 42274298  T
Q  304 tgtaacatggactaaaattagaagtaa---ttcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctatttta 400  Q
    ||||||  ||||||||| |||||||||   || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  ||  |||  ||||||    
T  42274297 tgtaactgggactaaaactagaagtaattttttttttttgtaaggactaaaaaacctatt-aaattaagtaaggactaaacttagaagttcctaatttta 42274199  T
Q  401 tagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaaa 431  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42274198 tagggaccaaaaacatatttaaccctaaaaa 42274168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 4 - 426
Target Start/End: Original strand, 31771316 - 31771738
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  31771316 tcaattcaaatttgtttaattgatgcataaactcttaagtttttgaacaattttttgtaaacgtgttaagaacattactaaaagttcctccgcaaaaaat 31771415  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
    | |||||||| || |||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||           
T  31771416 tattgcaaaatttaatttctacatccagattttattacttttatctttaacttttgtcgttttcaaaaattcatatttaattcatttcatgttaaaaaat 31771515  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 303  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||       |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31771516 tt-taaattttagtaaatgaaactttcatagtgttctaaacttgtgtcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgt 31771614  T
Q  304 tgtaaca-tggactaaaattagaagt-aattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttat 401  Q
    | |||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||  ||  |||   ||||||    
T  31771615 tttaacaggggactaaaattagaagtaaatttttttttgtatggactaaaaaaactattaaaattaa-taaggactaaacttagaagttcctcgttttat 31771713  T
Q  402 agtgaccaaaaacatatttaaccct 426  Q
    || |||| |||||||||||||||||    
T  31771714 agggaccgaaaacatatttaaccct 31771738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 4 - 424
Target Start/End: Original strand, 25100585 - 25101001
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||  |||  ||||| |||||||||||||| |||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25100585 tcaattcaaatttgtttaatttattgtaat-ctcttaagtttttgaacaatattttacagacgtgttaagaacattactaaaagttcctctgcaaaaaat 25100683  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
    ||| || ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |           
T  25100684 tgtcgctaaatttgatttttacgttcagattttgttaattttagctttaacttttgccgttttaaaagattcatatttatttcgtttcatgctaaaaaaa 25100783  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 303  Q
       ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||       |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25100784 aattaaattttagtaagtgaacctttcatagtgttctaaacttgtctc-aaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgt 25100882  T
Q  304 tgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatag 403  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| | |  |||||| ||    
T  25100883 tgtaacagggactgaaattagaagtaattcttgtttgtaaggactaaaaaacct-taaaaattaagtaagaattaaacttaaaaatttcaaatttta-ag 25100980  T
Q  404 tgaccaaaaacatatttaacc 424  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  25100981 ggaccaaaaacatatttaacc 25101001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 4 - 427
Target Start/End: Original strand, 41120738 - 41121161
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41120738 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaacttttgagtttttaaacaattttttgcagacgtgttaagaacattactaaaagttcctctgcaaaaaat 41120837  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
    ||| |  ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||| ||||||||||||||||||||           
T  41120838 tgtcgtgaaatttgatttctacgtccatattttgttaattttatctttaatttttgccg-tttaaaaaattcttatttaattcgtttcatgttaaaaaag 41120936  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 303  Q
     |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||        |||||||||||||||||||||||| | | || |||  ||||||||    
T  41120937 -tctaaattttggtaaatgaacttttcatagtgttctaaacttgtcttaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaagggttatgaaaacaactttgt 41121035  T
Q  304 tgtaacatggactaaaattagaagtaa--ttcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttat 401  Q
    ||||| | ||||||||| |||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||  |||| | |||||    
T  41121036 tgtaatagggactaaaactagaagtaatttttttttttgtaaggactaaaaaacctattaaaattaagtaaggactaaacttagaagttcccaactttat 41121135  T
Q  402 agtgaccaaaaacatatttaacccta 427  Q
    || |||||||||||||||||||||||    
T  41121136 agggaccaaaaacatatttaacccta 41121161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 11 - 424
Target Start/End: Original strand, 31436045 - 31436456
Alignment:
Q  11 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 110  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || |  |||||| | |||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  31436045 aaatttgtttaatttatgcttaaactcttgagtttttgaacaatttttcgcagacgtactaagaacaatactaaaagttcatctacaaaaaattgttgca 31436144  T
Q  111 aaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaa 210  Q
    ||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||    
T  31436145 aaatttgatttctacgttcagaatttgttaattttatctttaacttttg-tcatttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaattctaaa 31436242  T
Q  211 ttttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaaca 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||         ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  |||||    
T  31436243 ttttagtaaatgaacctttcatagtgttataaacttgtcataaaaaaatcgttcaaaaatttaagtgtttaaggataattaaacaaactttgtcataaca 31436342  T
Q  311 tggactaaaattagaagtaa-ttcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgacca 409  Q
     ||||||||||||||||||| || |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |  |||| |||||||   |||||    
T  31436343 aggactaaaattagaagtaattttttttttatagggaccaaaaaacctattaaaattaagtaaggattaaactt-agagttcccaattttatttggacca 31436441  T
Q  410 aaaacatatttaacc 424  Q
    |||||||| ||||||    
T  31436442 aaaacataattaacc 31436456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 4 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 40365179 - 40364753
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgct-aaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaa 102  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| || |||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  40365179 tcaatttaaatttgtttaatttatgtttaaaacccttgagttttgga-caattttttgcttatatgttaagaacattactaaaagttcatcggcaaaaaa 40365081  T
Q  103 ttgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnn 202  Q
    ||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||          
T  40365080 ttgtcacaaaatttgatttatacgtccatattttgttacttttatctttaacttttgtcgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaa 40364982  T
Q  203 nttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttg 302  Q
     |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||        |||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||     
T  40364981 attctaaattttagtaaatgaaccttcaatagtgttctaaacttgtcttaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttgaggatagttaaacaaacttta 40364882  T
Q  303 ttgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttata 402  Q
    || || |||||| ||||||||||||||||  ||||||  | | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | |||  | || ||||||||    
T  40364881 ttttagcatggattaaaattagaagtaat--tttttttcaagtactaaaaaacctattaaaattaagtaaggactaaacctaaaagtttccaattttata 40364784  T
Q  403 gtgaccaaaaacatatttaaccctaaaaaat 433  Q
    | |||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  40364783 gggaccaaaagcatatttaacccttaaaaat 40364753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 127 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 13372167 - 13371863
Alignment:
Q  127 tccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacc 226  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||    
T  13372167 tccagattttgtttattttatctttaacttttgtcgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaat-ttctaaattttagtaaatgaacc 13372069  T
Q  227 tttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaacatggactaaaattagaa 326  Q
    |||||||||||||||| |||||||        |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||    
T  13372068 tttcatagtgttctaaacttgtctaaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttagtgttacagggactaaaattagaa 13371969  T
Q  327 gtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccct 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  | || ||||||||| |||||||||||||| ||||||     
T  13371968 gtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaaggattaaacttaaaagtttccaattttatagggaccaaaaacatatataaccca 13371869  T
Q  427 aaaaaa 432  Q
    ||||||    
T  13371868 aaaaaa 13371863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 4 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 3043656 - 3043323
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||| || ||||||||||| | |||||||||||||    
T  3043656 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttgaattattgaacaattttttgcagacgtgttaaaaacattactaaaagctactctgcaaaaaat 3043557  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||           
T  3043556 tgtggcaaaatttgatttctacgtccaaattttgttaattttatctttaacttttgtcgttttaaaaaattcatatttaattagttttatgtt-aaaata 3043458  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 303  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||       ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3043457 ttctgaattttagtaaatgaacctttcatattgttctaaacttgtctcaaaaaattcgttaaaaaatttatgagtttaaggataattaaacaaactttgt 3043358  T
Q  304 tgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttt 338  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  3043357 tgtaacaggaactaaaattagaagtaatttttttt 3043323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 4 - 429
Target Start/End: Original strand, 30784185 - 30784597
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||    
T  30784185 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagttttagaacaattttttgcagacgtgttaagaacattactaaaagctcatctgcaaataat 30784284  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  30784285 tgtcgcaaaatttgatttctacgtccata-tttgttaattttatctttaacttttgtcgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaa 30784382  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||        ||||||||| ||||||||       | |||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  30784383 ttctaaattttagtaaatgaac--------gtgttctaaacttgtctcaaaaatattgttc-aaaatttaagaattttaggataattaaacaaactttgt 30784473  T
Q  304 tgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatag 403  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | | ||||| |||| | |  | |||||||    
T  30784474 tgtaacatggactaaaattagaag-attttttttttgtagggattaaaaaacctattaaaattaagtaaagactgaactt-aaaagttctcaatttatag 30784571  T
Q  404 tgaccaaaaacatatttaaccctaaa 429  Q
     |||||||||||||||||||||||||    
T  30784572 ggaccaaaaacatatttaaccctaaa 30784597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 170; E-Value: 7e-91
Query Start/End: Original strand, 4 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 44286978 - 44286563
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgcta---aaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||   ||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| | |||||||||||||| | |  ||||    
T  44286978 tcaattcaaatttgtttaatttataatacttaaactcttgagtttttgaacaattttttgcggacgtgttaagcacattactaaaagttcatttaaaaaa 44286879  T
Q  101 aattgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnn 200  Q
    |||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||    ||||||||||||||        
T  44286878 aattgtcgctaaatttgatttctacgttcagattttgttaattttatctttaagttttggcgttttaaaaaattcata----attcgtttcatgttaaaa 44286783  T
Q  201 nnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactt 300  Q
       || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||       |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44286782 aa-ttgtaaattttagtaaatgaatctttcatagtgttctaaatttgtctcaaaaaaatcgttcaaaagtttaagagtttaaggataattaaacaaactt 44286684  T
Q  301 tgttgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctatttta 400  Q
    |||||||| | |||||||||||| |||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||  |||  ||||||    
T  44286683 tgttgtaatagggactaaaattataagtaat--ttttttgtagggattaaaaaacctattaaaattaattaagaactaaacttaaaagttcctaatttta 44286586  T
Q  401 tagtgaccaaaaacatatttaac 423  Q
    ||  || ||||||||||||||||    
T  44286585 taaggatcaaaaacatatttaac 44286563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 8738100 - 8737696
Alignment:
Q  11 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaa-ttgttgc 109  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | || || |||||| || ||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||    
T  8738100 aaatttgtttaatttatgcttaaattcttgagtttttgaacaattttatacagacgtgttaaaaacattacgaaaagtttctctgcaaaaaaattgtcgc 8738001  T
Q  110 aaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaa 209  Q
    |||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||       || |||    
T  8738000 aaaatttgatttctacgtccaaattttgttaattttatctttaacttttgctgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaaaatt-taa 8737902  T
Q  210 attttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaac 309  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||         ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  8737901 attttagtaaacgaacctttcatagtgttctaaacttttctaaaaaaaaccgttcaaaaatttaagattttaaggataattaaataaactttgttgtaac 8737802  T
Q  310 atggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgacca 409  Q
    |  |||||||||||                ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||  |||| ||||||||| |||||    
T  8737801 aatgactaaaatta----------------gtagggactaaaaaacctattaaaattaagtaaggattaaacttagaagttcccaattttatag-gacca 8737719  T
Q  410 aaaacatatttaaccctaaaaaa 432  Q
    ||||| |||||||||| ||||||    
T  8737718 aaaacttatttaacccaaaaaaa 8737696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 4 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 43933029 - 43932730
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  43933029 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagttttttaataattttttgtagacgtgttaagaacattactaaaagttcctccgcaaaaaat 43932930  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
    | | |||||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||           
T  43932929 tatcgcaaaatttgatttatatgtccagattttattacttttatctttcacttttatcgttttcaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaa 43932831  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 303  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||||       |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43932830 ttctaaattttaataattgaacctttcatattgttctaaacttctctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgt 43932731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 15 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 44879995 - 44879589
Alignment:
Q  15 ttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaa 114  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||||||  | |||||||| |||| ||||||     
T  44879995 ttgtttaatttatgcttaaacttttgagtttttaaacaattttttgcagatgtgttaagatcattactaaaagtttatgtgcaaaaatttgtcgcaaaat 44879896  T
Q  115 ttgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaatttt 214  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||       | |||||||||    
T  44879895 ttgattt-tatgtccagattttcttaactttatctctaacttttga------aaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaaaat-ctaaatttt 44879804  T
Q  215 agtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaacatgga 314  Q
      ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||        ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44879803 gttaaatgaacttttcatagtgttctaaatttgtcttaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttagagatagttaaacaaactttgttgtaacatgga 44879704  T
Q  315 ctaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaac 414  Q
     |||||||| |||||| | ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||| | |  |  | ||||||||  ||||||||||    
T  44879703 ttaaaattataagtaaattttttttgtaaggactaaaaaacatactaaaattaagtatggattaaacttaacagttttcaattttatacggaccaaaaac 44879604  T
Q  415 atatttaaccctaaa 429  Q
    |||||||||| ||||    
T  44879603 atatttaaccataaa 44879589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 4 - 242
Target Start/End: Original strand, 6457266 - 6457504
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| | || |||| |||| |||| |||||| ||||||||||||||     
T  6457266 tcaattcaaatttgtttaatttatggttaaactcttgagtttttgaacaattttttgaagacgtgttgagaacattaataaaagctcctctgcaaaaaaa 6457365  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
      | | |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  6457366 attcgtaaaatttgatttctacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaaaa 6457465  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaa 242  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6457466 ttctaagttttagtaaatgaacctttcatagtgttctaa 6457504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 4 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 37593171 - 37592761
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37593171 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaattcctgagtttttgaacaattttttgcagctgtgttaagaatattactaaaagttcctttgcaaaaaat 37593072  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
    ||  |||||| |||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||   ||||||||||||||| |||||||||||           
T  37593071 tgccgcaaaatttgacttttacgttcaaattttgttaattttatctttaacttttgtcatttt---aaattcatatttaatccgtttcatgtt-aaaaaa 37592976  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaa---ctt 300  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  |||||             | |||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||    
T  37592975 ttctaaattttagtaaatgaacttttcatggtgttctaaatttgtc-------------taaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaacgtctt 37592889  T
Q  301 tgttgtaacatggactaaaattagaagtaa-ttcttttttgtatggact-aaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattt 398  Q
    || ||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||| | || || ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||  |  | ||||    
T  37592888 tgatgtaactaggactaaaattagaagtaattttttttttgcaggggctaaaaaaacctattaaaattaagtaaggactaaacttaaaagttttcaattt 37592789  T
Q  399 tatagtgaccaaaaacatatttaaccct 426  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  37592788 tatagagaccagaaacatatttaaccct 37592761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 4 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 42487963 - 42487639
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||| | |  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  42487963 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttaatttttt-aacaattttttgtagatgtgttaagaacattattaaaagttcctctgcaaaaaat 42487865  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
      | |||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||           
T  42487864 aatcgcaaaatttgatttatatgtccatattttattacttttatctttaacttttatcgttttaaaaaattcatattgaattcatttcatgttaaaaaaa 42487765  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 303  Q
     | ||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| ||||||||       || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42487764 atttaaattttagtaattgaacctttcatagcgttttaaacttgtctcaaaaaaatcattcaaaaatttaagagtttaaagataatcaaacaaactttgt 42487665  T
Q  304 tgtaacatggactaaaattagaagta 329  Q
    | || || ||||||||||||||||||    
T  42487664 tttagcagggactaaaattagaagta 42487639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 4 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 20721511 - 20721175
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||| |  || |||||    
T  20721511 tcaattcaaatttgtttaatttattcttaaactcttaagttttttaacaattttttgtagacgtgttaagaacattactaaaagttccgc--cacaaaat 20721414  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
    |           ||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||           
T  20721413 t-----------tgatttatatgtccatattttattacttttatctttaacttttattgttttcaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaaa- 20721326  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 303  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||       |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20721325 ttctaaattttattaattgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaattcgttcaaaaatttaagagtttaacgataattaaacaaactttgt 20721226  T
Q  304 tgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaa 354  Q
    | ||  | ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  20721225 tttagtagggactaaaattagaagtaatttttttttgcagggactaaaaaa 20721175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 4 - 323
Target Start/End: Original strand, 44492883 - 44493202
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  44492883 tcaattcaaatttgtttaagttatgttgaaactcttaagttttttaacaattttttgtagacgtgttaagaacattactaaaagtttccctgcaaaaaat 44492982  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgtt-gttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnn 202  Q
    | | |||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||          
T  44492983 tatcgcaaaatttgatttatatgtccagattttattacttttatctttaactttttttcgttttcaaaaattcatatttaattcgtttgatgtt-aaaat 44493081  T
Q  203 nttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttg 302  Q
     || ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||||       |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  44493082 attataaattttagtaattgaacctttcatagagttctaaacttatctcaataaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaacttta 44493181  T
Q  303 ttgtaacatggactaaaatta 323  Q
    || |  || ||||||||||||    
T  44493182 tttttgcagggactaaaatta 44493202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 12 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 36512263 - 36512025
Alignment:
Q  12 aatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaa-acatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 110  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||    
T  36512263 aatttgtttaatttatgcttaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaggacgtgttaagaatattactaaaagtttctctgtaaaaaattgtcgca 36512164  T
Q  111 aaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaa 210  Q
    ||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||       |||||||    
T  36512163 aaatttgatttttacatccagattttattaattttatctttaacatttgtcgttttaaaaaatccatatttaatttgttttatgtt-acaaaattctaaa 36512065  T
Q  211 ttttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtct 250  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||| |||||||    
T  36512064 ttttagaaaataaacatttcatagtgttctaaacttgtct 36512025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 4 - 249
Target Start/End: Original strand, 25666038 - 25666282
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| || || | ||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||    
T  25666038 tcaattcaaatttatttaatttatatttaaactcttgagtttttgaacaattttttacagacgtattaagaacattactaaaagttcctatgcgaaaaat 25666137  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
    ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  25666138 tgtcgcaaaatttgatttctacgtccagattttgttaattttacttttaatttttgccgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaaaa 25666237  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtc 249  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25666238 at-taaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtc 25666282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 4 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 21440114 - 21439778
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||||| |  || |||||    
T  21440114 tcaattcaaatttgtttaatttattcttaaactcttaagtttttaaacaattttttgtaatcgtgttaagaacattactaaaagttccgc--cataaaat 21440017  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
    |           ||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||           
T  21440016 t-----------tgatttatatgtccatattttattacttttatctttaacttttattgtttttaaaaatttatatttaattcgtttcaagttaaaaaaa 21439928  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 303  Q
    || ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||       || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21439927 tt-taaattttattaattgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaattcattcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgt 21439829  T
Q  304 tgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaa 354  Q
    | ||  | ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||    
T  21439828 tttagtagggactaaaattagaagtgatttttttttgtagggactaaaaaa 21439778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 226 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 29809328 - 29809125
Alignment:
Q  226 ctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaacatggactaaaattaga 325  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||       |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29809328 ctttcatagtgttttaaacttgtctcaaaaaaatcgttccaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgttgtaacatggactaaaattaga 29809229  T
Q  326 agtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccc 425  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  29809228 agtaattcttttctgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaaggattaaacttagtcattcccaattttatagggaccaaaaacatatttaacca 29809129  T
Q  426 taaa 429  Q
    ||||    
T  29809128 taaa 29809125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 6 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 14201260 - 14200837
Alignment:
Q  6 aattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaa--t 103  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||| |  | ||||||||| |||||||||||||| || | ||||||  |    
T  14201260 aattcaaatttgtttaatt-atgcttaaactcttaagtttgtgaataattttttgtagccgtgttaagaacattactaaaagttcatccgtaaaaaaaat 14201162  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaa-ttttatctttaacttttgttgttttaaaaaattc-atatttaattcgtttcatgttnnnnn 201  Q
    | |  ||||| ||||||| ||||||||  |||| ||   ||||||||| |||||||||  ||| |||||| || ||||||||||| |||||||||         
T  14201161 tatctcaaaatttgatttctacgtccaatttttttttgcttttatcttgaacttttgtcatttaaaaaaaatccatatttaattcatttcatgttaaaaa 14201062  T
Q  202 nnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaacttt 301  Q
      |||||||||||| |||||||||||||  || |||||||| ||||||||       | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14201061 a-ttctaaattttattaaatgaaccttttgtaatgttctaagcttgtctcagaaaaattgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaacttt 14200963  T
Q  302 gttgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttat 401  Q
    ||| || ||  |||||||||||   |||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||  | |||||||    
T  14200962 gttttagcagagactaaaattacctgtaaatattttttgtagggactaaaaaagctattaaaattaagtaaggactaaacttaaaagatgtcaattttat 14200863  T
Q  402 agtgaccaaaaacatatttaacccta 427  Q
    || ||||||| |||||||||||||||    
T  14200862 agggaccaaatacatatttaacccta 14200837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 4 - 184
Target Start/End: Original strand, 35498588 - 35498768
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||    
T  35498588 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttgagttgttgaacaatttttcgcagacgtgttaagaacattactaaaagtttctctacaaaaaat 35498687  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaat 184  Q
    ||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  35498688 tgtcgcgaaatttgatttctacgtccagaatttgttaattttatctttaacttttgtcatttttaaaaattcatatttaat 35498768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 126 - 364
Target Start/End: Original strand, 18672317 - 18672550
Alignment:
Q  126 gtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaac 225  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||    ||| | || || |||||||||||||||||||||||||||||       || ||||||||||||| |||||    
T  18672317 gtccagattttattacttttatcttt----tttatcgtcttcaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaaa-ttataaattttagtaattgaac 18672411  T
Q  226 ctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaacatggactaaaattaga 325  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||       |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||    
T  18672412 ctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgttttagcagtgactaaaattaga 18672511  T
Q  326 agtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaa 364  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  18672512 agtaatttttttttgtagggactaaaaaacctactaaaa 18672550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 4 - 364
Target Start/End: Original strand, 20719949 - 20720297
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaa-acatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaa 102  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||    ||||||| |||||||||||   | || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  20719949 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaacta---agttttttaacaatttttttatagacgtgttaagaacattactaaaagttcctccgcaaaaaa 20720045  T
Q  103 ttgtt-gcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnn 201  Q
     |  | |||||| |||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||         
T  20720046 ataatcgcaaaatttgatttatatgttcagattttattacttttatctttaacttttatcgttttcaaaaattcatatttaattcatttcaaatt-aaaa 20720144  T
Q  202 nnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaacttt 301  Q
      |||||||||||||||| ||||||       ||||||||| ||||||||       ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20720145 aattctaaattttagtaattgaacc-------gtgttctaaacttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaaaataattaaacaaacttt 20720237  T
Q  302 gttgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaa 364  Q
    ||| ||  | ||||||||||||||||||    |||||| || ||||||||||||||| |||||    
T  20720238 gttttagaagggactaaaattagaagta---tttttttttagggactaaaaaacctactaaaa 20720297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 259 - 429
Target Start/End: Original strand, 35498806 - 35498975
Alignment:
Q  259 tcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaaccta 358  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  35498806 tcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgtcgtaacaaggactaaaattagaagtaatt-ttttttgtagggactaaaaaaccta 35498904  T
Q  359 ttaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaa 429  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| |||  || | ||||||||| || |||||||||| |||||| ||||    
T  35498905 ttaaaattaagtaaggactaaacttaaaagttctcaattttatagggatcaaaaacataattaaccttaaa 35498975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 285 - 432
Target Start/End: Original strand, 25666283 - 25666430
Alignment:
Q  285 ataattaaacaaactttgttgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttg 384  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||     
T  25666283 ataattaaacaaactttgttgtaatagagactaaaattagaagtaattcttttttgtagggactaaaaaatctattaaaattaaataaggattaaactta 25666382  T
Q  385 aaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaaaa 432  Q
    |||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25666383 aaaggtccctattttacagggaccaaaaacatatttaaccctaaaaaa 25666430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 4 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 34073865 - 34073621
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||   |||||||    
T  34073865 tcaatttaaatttgttta-tttatgcctaaactcttg--tttttcaacaattttttgcagacatgtttagaacattactaaaagttcctccataaaaaat 34073769  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaatttt-atctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnn 202  Q
    | | |||||| || |||| ||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||          
T  34073768 tatcgcaaaatttaatttctacatccatattttgttactttttatctttaacttttgtagttttaaaaaattcatatttaattcgtttcttgtt-agaaa 34073670  T
Q  203 nttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctc 251  Q
     |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  34073669 attctaaattttattaaatgaatctttcttagtgttctaaacttgtctc 34073621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 272 - 432
Target Start/End: Original strand, 6458408 - 6458568
Alignment:
Q  272 taagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagta 371  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6458408 taagtgtttaaggataattaaacaaactttgttgtaacatggactaaaattagaagtatttttttcttgtagggactaaaaaacctattaaaattaagta 6458507  T
Q  372 agaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaaaa 432  Q
    ||||||||||||  ||  |||| | ||||||  || |||||||||||||||||| ||||||    
T  6458508 agaattaaacttagaagttcccaaatttataaggatcaaaaacatatttaacccaaaaaaa 6458568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 33001147 - 33000913
Alignment:
Q  11 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 110  Q
    |||||| |||||||||| |  |||||||| ||||||| |||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| | |||    
T  33001147 aaatttctttaatttatac--aaactcttaagttttttaacaattttttgtagacgtgttaagaacattactaaaagttactccgcaaaaaattatcgca 33001050  T
Q  111 aaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaa 210  Q
    ||| |||| ||||| ||||||| |||  || |||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||       |||||||    
T  33001049 aaatttga-ttatatgtccaga-tttaatacttttctctttaacttttatcgttttcaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaaaattctaaa 33000952  T
Q  211 ttttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtc 249  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  33000951 ttttagtaattgaacatttcatattgttctaaacttgtc 33000913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 118 - 308
Target Start/End: Original strand, 33031165 - 33031353
Alignment:
Q  118 atttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagt 217  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||        |||||||||| ||    
T  33031165 atttttacgtccagattttgttaattttatctttaactttttccgttttaaaaaattcata-ttaattcgtttcatgttaaaaaaa-tctaaattttggt 33031262  T
Q  218 aaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaa 308  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||        |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  33031263 aaatgaaccttttatagtgttctaaacttgtcttaaaaaaatcgttcaaaaatttaagaatttaaggataattaaacaaacttttttgtaa 33031353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 11 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 8392615 - 8392262
Alignment:
Q  11 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 110  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||| |||   |||| | | |   |    
T  8392615 aaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagtttttcaacaattttttacaaacgtgttaagaatgttattaaaagtttctccataaaagaatatcata 8392516  T
Q  111 aaaa-ttgatttatacgtccagattttg-ttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttcta 208  Q
    |||| ||||||| || ||  | |||||| ||| ||||||||  ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||  ||||| |||       |||||    
T  8392515 aaaaattgatttctatgtgtacattttggttacttttatctgaaacttttgtcgtttacaaaaattcatatttaatttatttcacgttaaaaaa-ttcta 8392417  T
Q  209 aattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaac-cttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgta 307  Q
     |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||          ||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||    
T  8392416 gattttattaaatgaaccttttatattgttctaaaacttgtct----------gttgaaaagtttaagagtttaaggataattaaacaaattttgtttta 8392327  T
Q  308 acatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaa 372  Q
     || |||||||||||| |||||| | ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  8392326 gcagggactaaaattataagtaaattttttttgtagggattaaaaaaactattaaaattaagtaa 8392262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 67 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 29809562 - 29809401
Alignment:
Q  67 tgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgtttt 166  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||  |||||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  29809562 tgttaagaacattactaaaagttcatctacaaaaaattatcgcaaaatctgatttctacatccaaattttgttaattttatcattaacttttgtcgtttt 29809463  T
Q  167 aaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaaccttt 229  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||       ||||||||||||||||||||||||||    
T  29809462 aaaaaaatcatatttaattcctttcatgtt-aaaaaattctaaattttagtaaatgaaccttt 29809401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 32319232 - 32319001
Alignment:
Q  11 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 110  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||| |  ||||||||| || |  |||||||  ||||||||||||| |  ||    
T  32319232 aaatttgtttaatt-atgcttaaacttttaagattttgaacaattttttgcacaagtgttaagaacatcatgaaaagtttatctgcaaaaaattatctca 32319134  T
Q  111 aaaattgatttatacgtccaga-ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaa 209  Q
    |||||| |||  | |||||||| |||||||| |||||| || |||||||||  ||| |||||||||||||||||||  |||||||||       ||||||    
T  32319133 aaaatttattcctgcgtccagatttttgttacttttattttgaacttttgtcttttaaaaaaattcatatttaatttatttcatgttaaaaaaattctaa 32319034  T
Q  210 attttagtaaatgaacctttcatagtgttctaa 242  Q
    | ||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  32319033 aatttagtaaatgaacctttagtaatgttctaa 32319001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 294 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 30749555 - 30749427
Alignment:
Q  294 caaactttgttgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccc 393  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||  ||| | | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | ||    
T  30749555 caaactttgttgtaacagggcttaaaattagaagcaattctttt--gtaggaattaaaaaacctattaaaattaagtaaggattaaacttgaaaggttcc 30749458  T
Q  394 tattttatagtgaccaaaaacatatttaacc 424  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  30749457 tattttataaggactaaaaacatatttaacc 30749427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 207 - 369
Target Start/End: Original strand, 36881222 - 36881383
Alignment:
Q  207 taaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgt 306  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||         || ||||||| ||| ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  36881222 taaattttagttattgaacctttcatagcgttctaaacttgtcaaaaaaaaatcattcaaaatttttagagtttaaggataattaaataaattttgttgt 36881321  T
Q  307 aacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaag 369  Q
    ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||    |||||||||||||||||||||||    
T  36881322 aacagagactaaaattagaagtaatt-ttttttgtagaagctaaaaaacctattaaaattaag 36881383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 4 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 7655007 - 7654925
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaa 86  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  7655007 tcaatttaaatttgtttaatttatggttaaactcttgagtttttgaatagttttttgcaaacatattaagaacattactaaaa 7654925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 4 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 20719326 - 20719228
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaa 102  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||   || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  20719326 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagttttctaacaattttttgttgacgtgttaagaacattactaaaagttcctccgcaaaaaa 20719228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 344 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 19176725 - 19176637
Alignment:
Q  344 ggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaaaa 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| | || |||| ||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19176725 ggactaaaaaacctattaaaattaagtaataactaaacttaagaattcccaattctatagggactaaaaacatatttaaccctaaaaaa 19176637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 196
Target Start/End: Original strand, 3117981 - 3118166
Alignment:
Q  11 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 110  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||| || || |||||||||| || ||||| | |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||  |  ||    
T  3117981 aaatttgtttaatt-atgtttaaacttttaagattttgaacaaattattgcacaaatgttaagaacattacgaaaagttcatctgcaaaaaataatctca 3118079  T
Q  111 aaaattgatttatacgtccaga-ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt 196  Q
    ||| || |||| | |||| ||| |||| ||| |||||| || |||||||||  ||| |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  3118080 aaattttatttctgcgtctagattttttttacttttattttgaacttttgtcttttaaaaaaattcatatttaatttatttcatgtt 3118166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 334 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 25100558 - 25100457
Alignment:
Q  334 ttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaaaat 433  Q
    |||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||| | || ||||||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||    
T  25100558 ttttttttagggactaaaatagctattaaaattaagtaaggactagacttgaaaggtcccaattttatagggaccaaaaacatatttaacccttgaaaat 25100459  T
Q  434 at 435  Q
    ||    
T  25100458 at 25100457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 334 - 418
Target Start/End: Original strand, 3118828 - 3118912
Alignment:
Q  334 ttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatat 418  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  3118828 ttttttatatggactaaaaacactattaaaattaagtaaggattaaacttaaaagatcccaattttatagggaccaaaaagatat 3118912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 185
Target Start/End: Original strand, 32318223 - 32318398
Alignment:
Q  11 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaatttttt-gcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgc 109  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||||| ||| |  ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||  ||| |  |    
T  32318223 aaatttgtttaatt-atgcttaaacttttaagattttgaacaatttttttgcacaagtgttaagaacattacgaaaagttcatctgcaaatgattatctc 32318321  T
Q  110 aaaaattgatttatacgtccagatttt-gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaatt 185  Q
    |||| || |||| | |||||||||||| |||| |||||| || |||||||||   || |||||||||||||||||||    
T  32318322 aaaattttatttctgcgtccagatttttgttacttttattttgaacttttgtctattaaaaaaattcatatttaatt 32318398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 335 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 41120714 - 41120623
Alignment:
Q  335 tttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccct 426  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||  |||| ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  41120714 tttttttaaggactaaaaaaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaaggtcccaattttatagggatcaaaaacatatttaaccct 41120623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 110 - 351
Target Start/End: Original strand, 18917309 - 18917544
Alignment:
Q  110 aaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaa 209  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||  | | | |||||| |||| |  ||| |||||| |||||||||||| ||||||||||           ||    
T  18917309 aaaaattgatttttacgttcagattttgtttctataacctttaaattttctcatttaaaaaaaatcatatttaatttgtttcatgttaaaaa------aa 18917402  T
Q  210 attttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaac 309  Q
    |  |||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||       || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  18917403 aaattagcaaatgaacctttcatagtgttctaaatatgtctcaaaaaaatcattcgaaaatttaagaatttaaagataattaaacaaactttgttttagc 18917502  T
Q  310 atggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaa 351  Q
    |  ||||||| ||| |||||| |  ||||| || ||||||||    
T  18917503 agagactaaacttacaagtaaattatttttatagggactaaa 18917544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 6 - 84
Target Start/End: Original strand, 33031087 - 33031165
Alignment:
Q  6 aattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaa 84  Q
    |||| |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||    
T  33031087 aattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttgaatttttaaacaattttttgcagacgtgttaagaacattactaa 33031165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 334 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 32318189 - 32318105
Alignment:
Q  334 ttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatat 418  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||| | ||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  32318189 ttttttatatggactaaaaacactattataattaagtaaggactaaacttaaaagatcccaattttatagggaccaaaaacatat 32318105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 346 - 429
Target Start/End: Original strand, 3043695 - 3043778
Alignment:
Q  346 actaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaa 429  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||  |||||||| |||||||||| ||||    
T  3043695 actaaaagaactattaaaattaaataagaattaaacttaaaagatcccaattttataggaaccaaaaatatatttaaccttaaa 3043778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 335 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 3104965 - 3104875
Alignment:
Q  335 tttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccc 425  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| |||   | | ||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  3104965 tttttgtaaggactaaaataactattaaaattaagtaagaactaaacttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaacatatttaaccc 3104875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 333 - 427
Target Start/End: Original strand, 33031343 - 33031437
Alignment:
Q  333 cttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaacccta 427  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||  ||  |||  |||||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  33031343 cttttttgtaaggactaaaaaacctattaaaattaagtaatgactaaacttagaagttcctaattttataggtatcaaaaacatatttaacccta 33031437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 335 - 425
Target Start/End: Original strand, 42487991 - 42488081
Alignment:
Q  335 tttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccc 425  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||   | | ||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  42487991 tttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggattaaacttaaaatgcctcaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 42488081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 344 - 422
Target Start/End: Original strand, 44287014 - 44287092
Alignment:
Q  344 ggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaa 422  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||   ||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44287014 ggactaaaagaactattaaaattaagtaaggactaaacttgaaagtccccaattttatagggaccaaaaacatatttaa 44287092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 33030984 - 33030903
Alignment:
Q  344 ggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccc 425  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||  | ||||||| ||| ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  33030984 ggactaaaaaaactattaaaattaaataaagactaaacttaaaagatcccaattttatagagatcaaaaacatatttaaccc 33030903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 344 - 424
Target Start/End: Original strand, 4327936 - 4328016
Alignment:
Q  344 ggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaacc 424  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||  |||| |||||| || ||| ||||||||||||||||    
T  4327936 ggactaaaaaaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaaggtcccaattttacagggactaaaaacatatttaacc 4328016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 357 - 436
Target Start/End: Original strand, 7655058 - 7655134
Alignment:
Q  357 tattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaaaatatt 436  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||| ||| |||||||||  |||||||||||||||||    
T  7655058 tattaaaattaagtaagaactaaactt-aaaagtcccaattttatagggacaaaaaacata--taaccctaaaaaatatt 7655134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 334 - 422
Target Start/End: Original strand, 13027767 - 13027855
Alignment:
Q  334 ttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaa 422  Q
    |||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||| | ||||||| |||  || | ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13027767 ttttttatagggactaaaaaaacaattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgtctcaattttatagggaccaaaaacatatttaa 13027855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 4 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 23787838 - 23787782
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttg 60  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  23787838 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagttttttaacaattttttg 23787782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 334 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 25666013 - 25665929
Alignment:
Q  334 ttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatat 418  Q
    |||||| || ||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||| | | |||||||| || ||||||||||||||    
T  25666013 ttttttttaaggactaaaagaaccattaaaattaagtaaggattaaacttgaaagacctctattttacagggaccaaaaacatat 25665929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 334 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 30982594 - 30982510
Alignment:
Q  334 ttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatat 418  Q
    |||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||| |||  || | ||||||||| ||||||||||||||    
T  30982594 ttttttatatggactaaaagcactattaaaattaagtaaggattaaacttaaaaggtctcaattttatagggaccaaaaacatat 30982510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 344 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 6457231 - 6457152
Alignment:
Q  344 ggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaac 423  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||  ||||||||| | |||||||||||||||||    
T  6457231 ggactaaaagaactattaaaattaagtaagaactaaacttaaaaggtccaaattttataggggccaaaaacatatttaac 6457152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 209 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 13027533 - 13027445
Alignment:
Q  209 aattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaa 297  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| |||||||| | ||||||       | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13027533 aattttagtaaacgaaccttttataatgttctaaacgtgtctccgaaaaattgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaa 13027445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 344 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 31771279 - 31771196
Alignment:
Q  344 ggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaacccta 427  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||| | ||| ||| |||  || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31771279 ggactaaaataactattaaaattaagtaaggactaagcttaaaaggtctcaattttatagggaccaaaaacatatttaacccta 31771196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 350 - 424
Target Start/End: Original strand, 8738619 - 8738693
Alignment:
Q  350 aaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaacc 424  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||||| || |||||||    
T  8738619 aaaaaactattaaaattaagtaaagattaaacttgaaaggtcccaattttatagggaccaaaaatatttttaacc 8738693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 428
Target Start/End: Original strand, 10287452 - 10287545
Alignment:
Q  335 tttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaa-ttaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaa 428  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||  |||  |||||||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  10287452 tttttgtagggactaaaaaac-tattaaaattaagtaaaaaattaaacttaaaacttccgaattttatagtggtcaaaaacatattcaaccctaa 10287545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 425
Target Start/End: Original strand, 20719354 - 20719444
Alignment:
Q  335 tttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccc 425  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||| |||   | | ||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  20719354 tttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaacatatttaaccc 20719444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 425
Target Start/End: Original strand, 21440142 - 21440232
Alignment:
Q  335 tttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccc 425  Q
    |||||||| | ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||  || | ||||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  21440142 tttttgtaagaactaaaataactattaaaattaagtaaggattaaacttaaaatgtcacaattttataaagactaaaaacatatttaaccc 21440232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 336 - 418
Target Start/End: Original strand, 32319268 - 32319350
Alignment:
Q  336 ttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatat 418  Q
    |||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||| |||  |||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  32319268 ttttatatggactaaaaacactattataattaagtaagaactaaacttaaaaggtcccaattttatagggacaaaaaacatat 32319350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 345 - 430
Target Start/End: Original strand, 14201300 - 14201385
Alignment:
Q  345 gactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaa 430  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||  ||| |||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  14201300 gactaaaaaacctattaaaattaagcaaggactaaaattagaaagtcctgattttatagggactaaaaacatatttaactctaaaa 14201385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 334 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 9111542 - 9111458
Alignment:
Q  334 ttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatat 418  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||| | ||||||| |||  |||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  9111542 ttttttatatggactaaaaacactattataattaagtaaggactaaacttaaaaggtcccaattttatagggacaaaaaacatat 9111458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 60
Target Start/End: Original strand, 20701256 - 20701312
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttg 60  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  20701256 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaacttttaagttttttaacaattttttg 20701312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 335 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 20719921 - 20719833
Alignment:
Q  335 tttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaac 423  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||   | | |||||| || ||| |||||||||||||||    
T  20719921 tttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggattaaacttaaaatgcctcaattttaaagggactaaaaacatatttaac 20719833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 60
Target Start/End: Original strand, 21439296 - 21439352
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttg 60  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  21439296 tcaattcaaatttatttaatttatgcttaaactcttaagttttttaacaattttttg 21439352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 334 - 418
Target Start/End: Original strand, 30982713 - 30982796
Alignment:
Q  334 ttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatat 418  Q
    |||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||| | ||||||| |||  |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  30982713 ttttttatatggactaaaagcactattaaaattaagtaaggactaaactt-aaaggtcccaattttatagggaccaaaaacatat 30982796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 335 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 3117947 - 3117864
Alignment:
Q  335 tttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatat 418  Q
    ||||| |||| |||||||   |||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  3117947 tttttatatgaactaaaagcactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaagatctcaattttatagggaccaaaaacatat 3117864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 344 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 31436001 - 31435918
Alignment:
Q  344 ggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaacccta 427  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||  | ||||||| |||  || | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  31436001 ggactaaaagaactattaaaattaagtaaagactaaacttaaaaggtctcaattttatagggactaaaaacatatttaacccta 31435918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 334 - 425
Target Start/End: Original strand, 33001183 - 33001274
Alignment:
Q  334 ttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccc 425  Q
    ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| | | ||||| ||||  | | ||||||||| ||| ||||||||| |||||||    
T  33001183 ttttttgtaaggactaaaataactattaaaattaagtaaggaatgaacttaaaaagcctcaattttatagggactaaaaacatagttaaccc 33001274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 13027735 - 13027654
Alignment:
Q  11 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctc 93  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||  | |  ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  13027735 aaatttgtttaatt-atgcttaaacacttaagtttttgaacaattttttatacatttgttaagaacattactataagttcctc 13027654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 335 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 20701228 - 20701138
Alignment:
Q  335 tttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccc 425  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||| |||   | | ||||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  20701228 tttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaagcactaaacttaaaatgcctcaattttatagggactaaaatcatatttaaccc 20701138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 335 - 425
Target Start/End: Original strand, 20721540 - 20721630
Alignment:
Q  335 tttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccc 425  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||| |||   | | ||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  20721540 tttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttataggggctaaaaacatatttaaccc 20721630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 32319809 - 32319624
Alignment:
Q  11 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 110  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||| ||  | ||||||||||||||||||| |  ||||||||| || |  |||||||  ||||||||||||| |  ||    
T  32319809 aaatttgtttaatt-atgtttaaacttttatgattttgaacaattttttgcacaagtgttaagaacatcatgaaaagtttatctgcaaaaaattatctca 32319711  T
Q  111 aaaattgatttatacgtccaga-ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt 196  Q
    ||| || |||  | |||||||| |||||||| |||||| || |||||||    ||| |||||| ||||||||||||  |||||||||    
T  32319710 aaattttattcctgcgtccagatttttgttacttttattttgaacttttcacttttaaaaaaaatcatatttaatttatttcatgtt 32319624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 344 - 430
Target Start/End: Original strand, 34073897 - 34073983
Alignment:
Q  344 ggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaa 430  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||| | |||| || |||  | || ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  34073897 ggactaaaagaactattaaaattaagtaaggactaaatttaaaaggttccaattttatagggactaaaaatatatttaaccctaaaa 34073983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 335 - 425
Target Start/End: Original strand, 43933057 - 43933147
Alignment:
Q  335 tttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccc 425  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||| |||   | | ||||||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  43933057 tttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaatatatttaaccc 43933147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 335 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 44492855 - 44492765
Alignment:
Q  335 tttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccc 425  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||| |||   | | ||||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  44492855 tttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaccatatttaaccc 44492765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 57
Target Start/End: Original strand, 18672259 - 18672312
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaatttt 57  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||    
T  18672259 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttgaactcttaagttttttaacaatttt 18672312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 356 - 425
Target Start/End: Original strand, 40365226 - 40365295
Alignment:
Q  356 ctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccc 425  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||  ||||||||| || |||||| |||||||||||    
T  40365226 ctattaaaattaagtaaggagtaaacttaaaagatccaaattttatagggatcaaaaatatatttaaccc 40365295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 42487025 - 42486936
Alignment:
Q  335 tttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccct--attttatagtgaccaaaaacatatttaacc 424  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||  ||||| |||  |||||| || ||| ||||||||||||||||    
T  42487025 tttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaactt--aaaatgccttaattttacagggactaaaaacatatttaacc 42486936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 335 - 423
Target Start/End: Original strand, 1373521 - 1373609
Alignment:
Q  335 tttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaac 423  Q
    ||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||| |||   | | ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  1373521 tttttttaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaacatatttaac 1373609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 397 - 437
Target Start/End: Original strand, 40443919 - 40443959
Alignment:
Q  397 tttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaaaatatta 437  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40443919 tttatagagaccaaaaacatatttaacccttaaaaatatta 40443959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 423
Target Start/End: Original strand, 8392659 - 8392738
Alignment:
Q  344 ggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaac 423  Q
    ||||||||| | | |||||||||||||||| | |||| ||  ||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8392659 ggactaaaacaaccattaaaattaagtaaggactaaatttagaaggtcccaattttatagggaccaaaaacatatttaac 8392738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 265 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 19058678 - 19058643
Alignment:
Q  265 aaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactt 300  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19058678 aaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 19058643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 21108512 - 21108477
Alignment:
Q  397 tttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaaaa 432  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21108512 tttatagggaccaaaaacatatttaaccctaaaaaa 21108477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 33809876 - 33809841
Alignment:
Q  397 tttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaaaa 432  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33809876 tttatagggaccaaaaacatatttaaccctaaaaaa 33809841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 398 - 437
Target Start/End: Original strand, 40505097 - 40505136
Alignment:
Q  398 ttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaaaatatta 437  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40505097 ttatagggaccaaaaacatatttaacccttaaaaatatta 40505136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 6 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 4327898 - 4327848
Alignment:
Q  6 aattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattt 56  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||    
T  4327898 aattcaaatttgtttaatttatgcttaaactattaagcttttgaacaattt 4327848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 336 - 418
Target Start/End: Original strand, 9111999 - 9112081
Alignment:
Q  336 ttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatat 418  Q
    |||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||| | ||||||| |||  || | ||||||||| |||| |||||||||    
T  9111999 ttttatatggactaaaaacactattataattaagtaaggactaaacttaaaaggtctcaattttatagggacctaaaacatat 9112081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 336 - 418
Target Start/End: Original strand, 32319845 - 32319927
Alignment:
Q  336 ttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatat 418  Q
    |||| ||||||||||||   |||||| |||||||||||||  |||||| |||  |||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  32319845 ttttatatggactaaaatcactattataattaagtaagaacaaaacttaaaatgtcccaattttatagagacaaaaaacatat 32319927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 356 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 35498521 - 35498451
Alignment:
Q  356 ctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccct 426  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||| |||  |||| |||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  35498521 ctattaaaattaagtaaagactaaacttaaaaggtcccaattttataggaactaaaaacatatttaaccct 35498451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 397 - 431
Target Start/End: Original strand, 39120562 - 39120596
Alignment:
Q  397 tttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaaa 431  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39120562 tttatagggaccaaaaacatatttaaccctaaaaa 39120596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 397 - 431
Target Start/End: Original strand, 41312378 - 41312412
Alignment:
Q  397 tttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaaa 431  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41312378 tttatagagaccaaaaacatatttaaccctaaaaa 41312412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 329 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 44610739 - 44610645
Alignment:
Q  329 aattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaac 423  Q
    |||| ||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||| || | |||||||  ||  |||| ||||| ||| ||||| |||||||||||||    
T  44610739 aattttttcttgtagggacaaaaaaaactattaaaattaagttaggaataaacttagaaggtcccaattttttagggaccagaaacatatttaac 44610645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 397 - 430
Target Start/End: Original strand, 16064948 - 16064981
Alignment:
Q  397 tttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaa 430  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16064948 tttatagggaccaaaaacatatttaaccctaaaa 16064981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 328 - 373
Target Start/End: Original strand, 23497332 - 23497377
Alignment:
Q  328 taattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaag 373  Q
    ||||| ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  23497332 taatttttttttgtaaggattaaaaaagctattaaaattaagtaag 23497377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 397 - 430
Target Start/End: Original strand, 27278022 - 27278055
Alignment:
Q  397 tttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaa 430  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27278022 tttatagggaccaaaaacatatttaaccctaaaa 27278055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 397 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 27306041 - 27306008
Alignment:
Q  397 tttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaa 430  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27306041 tttatagggaccaaaaacatatttaaccctaaaa 27306008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 397 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 45070306 - 45070273
Alignment:
Q  397 tttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaa 430  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  45070306 tttatagggaccaaaaacatatttaaccctaaaa 45070273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 2)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 6 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 17669 - 17255
Alignment:
Q  6 aattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattg 105  Q
    |||| |||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||     
T  17669 aattcaaatttgtttaatttatagttaaactcttaagtttttgaacaattttttgtagacgtgttaagaacattactaaaagttcctccgtaaaaaatta 17570  T
Q  106 ttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnntt 205  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       ||    
T  17569 ttgcaaaatttgatttttaagtccagattttattacttttatctttaacttttgttgttttaaaaaaatcatatttaattcgtttcatgtt--aaaaatt 17472  T
Q  206 ctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttg 305  Q
    ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||||       || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||     
T  17471 ctaaattttagtaaatgaatctatcatggtgttctaaacttgtctcaaaaaaatctttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttattt 17372  T
Q  306 taacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtg 405  Q
    ||  | |||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||| || | ||||||||| |    
T  17371 tagtagggactaaaattaaaagtaatttatttttgtagggactaaaaaaactattaaaattaagtaaggattaaacttagaaattctcaattttataggg 17272  T
Q  406 accaaaaacatatttaa 422  Q
    |||||||||||||||||    
T  17271 accaaaaacatatttaa 17255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 334 - 427
Target Start/End: Original strand, 17699 - 17792
Alignment:
Q  334 ttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaacccta 427  Q
    ||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||  | ||||||| |||  || | ||||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  17699 ttttttgtagggattaaaagaactattaaaattaagtaaagactaaacttaaaagctctcaattttataaggactaaaaacatatttaacccta 17792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0651 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 2)
Name: scaffold0651
Description:

Target: scaffold0651; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 11 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 7151 - 6809
Alignment:
Q  11 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 110  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| || |||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  7151 aaatttgtttaatttatgcttaaactcttgagttttttaacaattttttgtagacgtgttaaaaacattactaaaagttcctctgcaaaaaattatcgca 7052  T
Q  111 aaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaa 210  Q
    ||| |||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||       |||||||    
T  7051 aaatttgatttatatgtccaaattttattatttttatctttaatttttatcgttttcaaaaattcatatttaatttgtttcatgttaaaaaaattctaaa 6952  T
Q  211 ttttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaaca 310  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||       ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||    
T  6951 ttttagtaattgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaaatcgttcagaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgttttagca 6852  T
Q  311 tggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaa 354  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  6851 -ggactaaaattagaagtaatttttttttgtaaggactaaaaaa 6809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0651; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 335 - 425
Target Start/End: Original strand, 7186 - 7275
Alignment:
Q  335 tttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccc 425  Q
    |||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||| | ||||||| |||   | | ||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  7186 tttttgtaaggactaaaacaattattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttatag-gactaaaaacatatttaaccc 7275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1191 (Bit Score: 184; Significance: 3e-99; HSPs: 2)
Name: scaffold1191
Description:

Target: scaffold1191; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 4 - 425
Target Start/End: Original strand, 669 - 1087
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||| ||||| | ||||    
T  669 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttgagtttttgaacaattttttgcagacgtgataagaacattactaaaagttcatctgc-acaaat 767  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
    ||| |||||| ||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||           
T  768 tgtcgcaaaatttgatttttgagtccagaatttgttaattttatctttaacttttttcattttaaaaaattcatatttaattcgtttcatctt-aaaaaa 866  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtct-cnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttg 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||         ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||     
T  867 ttctaaattttagtaaatgaaccttttatagtgttctaaacttatctaaaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaagaataatcaaacaaactttt 966  T
Q  303 ttgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttata 402  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||| | || ||||||||    
T  967 ttgtaagagggactaaaattagaagtaact-ttttttgtagggactaaaaaa-ctattaaaattaagtaaggactaaacttaaaaatttccaattttata 1064  T
Q  403 gtgaccaaaaacatatttaaccc 425  Q
    | ||||| ||||||| |||||||    
T  1065 gggaccagaaacatagttaaccc 1087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1191; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 344 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 632 - 551
Alignment:
Q  344 ggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccc 425  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||   |||| || ||| ||| | ||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  632 ggactaaaagaactattaaaattaagtaaggtctaaattttaaagatctcaattttatatagatcaaaaacatatttaaccc 551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1190 (Bit Score: 173; Significance: 1e-92; HSPs: 2)
Name: scaffold1190
Description:

Target: scaffold1190; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 486 - 80
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  486 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaacacatgagtttttgaacaattttttggagacgtgttaagaacattactaaaagttcctctgcaaaaaat 387  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgttt-catgttnnnnnn 202  Q
    |||  ||||| ||||||| || | ||||||||||||||||||            ||| ||||| ||||| | ||||||||||  ||| ||| ||          
T  386 tgtcacaaaatttgatttctaggcccagattttgttaatttt------------tgtcgttttcaaaaaattatatttaattttttttcat-tttaaaaa 300  T
Q  203 nttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttg 302  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||       |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  299 attctaaattttagtaaatgaacctttcgtagtgttctgaacttgtctcgaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttg 200  T
Q  303 ttgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttata 402  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||  |||| ||||||||    
T  199 ttgtaacaaggactaaaattagaagtaattttcttttgtaaggactaaaaaacctattaaaattaagtaaggactaaacttagaagttcccaattttata 100  T
Q  403 gtgaccaaaaacatatttaa 422  Q
    ||||| ||||| ||||||||    
T  99 gtgacaaaaaatatatttaa 80  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1190; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 346 - 429
Target Start/End: Original strand, 525 - 608
Alignment:
Q  346 actaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaa 429  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||   ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  525 actaaaagaactattaaaattaagtaagaactaaacttaaaatgtctaaattttatagggaccaaaaacatatttaaccttaaa 608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0514 (Bit Score: 173; Significance: 1e-92; HSPs: 2)
Name: scaffold0514
Description:

Target: scaffold0514; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 6470 - 6059
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  6470 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttgagtttttcaacaattttttggagacgtgttaagaacattactaaaagttcatctacaaaaaat 6371  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaa--ttcgtttcatgttnnnnn 201  Q
    ||| |||||| ||||||| || | ||| | |||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||  ||  |||||||||         
T  6370 tgtcgcaaaatttgatttctaggcccaaactttgttaa-tttatctttaatttttctggttttaaaaaaatcatatttaatttttttttcatgtt-aaaa 6273  T
Q  202 nnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaacttt 301  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||       |||||||||||||||||       |||||||||||||||||||    
T  6272 aattctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgcctcgaaaaaatcgttcaaaaatttaag-------agataattaaacaaacttt 6180  T
Q  302 gttgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttat 401  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||  |||| |||||||    
T  6179 gttgtaacaaggactaaaattagaagtaattttcttttgtaaggactaaaaaacctattaaaattaagtaaggactaaacttagaagttcccaattttat 6080  T
Q  402 agtgaccaaaaacatatttaa 422  Q
    || ||| || || ||||||||    
T  6079 agggacaaagaatatatttaa 6059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0514; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 346 - 429
Target Start/End: Original strand, 6509 - 6592
Alignment:
Q  346 actaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaa 429  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||| |||  || | ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  6509 actaaaagaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgtctcaattttatagggaccaaaaacatatttaaccttaaa 6592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1160 (Bit Score: 169; Significance: 3e-90; HSPs: 2)
Name: scaffold1160
Description:

Target: scaffold1160; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 6 - 360
Target Start/End: Original strand, 1159 - 1514
Alignment:
Q  6 aattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattg 105  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||| |||||| || ||||||||||||    
T  1159 aattcaaatttgttttatttatgcttaaactcatgagtttttgaacaattttttgcagacgtgttaagaacattacttaaagtttctttgcaaaaaattg 1258  T
Q  106 ttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttt---taaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnn 202  Q
    | |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    |||    |||||| |||||||||||||||||||||||          
T  1259 tcgcaaaatttgatttctacgtccagattttgttaattttatctttagcttttaccatttaaaaaaaaaaatcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaa 1357  T
Q  203 nttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttg 302  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||       |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1358 attctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgcctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttg 1457  T
Q  303 ttgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctatt 360  Q
    |||||| | ||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||| |||||| ||||    
T  1458 ttgtaatagggactaaaa-tagaagtaattttcttttgtaaggacttaaaaacttatt 1514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1160; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 427
Target Start/End: Original strand, 1528 - 1609
Alignment:
Q  345 gactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaacccta 427  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||  ||  |||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  1528 gactaaaaaac-tattaaaattaagtaagaactaaatttagaagttcccaattttatagggaccaaaaatatatttaacccta 1609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0707 (Bit Score: 163; Significance: 1e-86; HSPs: 2)
Name: scaffold0707
Description:

Target: scaffold0707; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 7188 - 6838
Alignment:
Q  11 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 110  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||  ||    
T  7188 aaatttgtttaatgtatgcttatactcttgagtttttgaacaattttttgcagacgtgttaaaaacattactaaaagttcatctgcaaaaaattgtcaca 7089  T
Q  111 aaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaa 210  Q
    ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||       |||||||    
T  7088 aaatttgatttctacgtccaaattttgttaattttatctttaacttttgccgttttaaaaaattcatatttaattcattttaggtt--aaaaattctaaa 6991  T
Q  211 ttttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaaca 310  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||       ||||||||||||       ||||| |||||||||| ||||  ||||||||||    
T  6990 ttttagttaataaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaatcaaatcgttcaaaaat-------tttaaggataattaaataaac--tgttgtaaca 6900  T
Q  311 tggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaag 373  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  6899 aggactaaaattagaagtaatt-ttttttgtaaggactataaaacctattaaaatcaagtaag 6838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0707; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 356 - 423
Target Start/End: Original strand, 7245 - 7312
Alignment:
Q  356 ctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaac 423  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||| ||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  7245 ctattaaaattaagtaatgactaaacttaaaagatcccaattttatagagactaaaaacatatttaac 7312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 153; Significance: 1e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 103 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 158223 - 157902
Alignment:
Q  103 ttgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnn 202  Q
    |||| |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |          
T  158223 ttgtcgcaaaatttaatttctacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgccgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatggtaaaaaa 158124  T
Q  203 nttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttg 302  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||       ||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||    
T  158123 -ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaa-tcgttcaaaaattgaagagtttaaggagaattaaacaaactttg 158026  T
Q  303 ttgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttata 402  Q
    |||||||| | | |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | |||||||  ||  || | ||||||||    
T  158025 ttgtaacaggtagtaaaattagaagcaattattttttgtatggactaaaagacctattaaaattaagtgaggactaaacttagaagttctcaattttata 157926  T
Q  403 gtgaccaaaaacatatttaacccta 427  Q
    | ||  |||||||||||||||||||    
T  157925 g-gattaaaaacatatttaacccta 157902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 150; Significance: 6e-79; HSPs: 3)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 4 - 320
Target Start/End: Original strand, 35273 - 35588
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| | || ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||    
T  35273 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagttttttaacaattttttgtagacgtgttaagaacattagtaaaagttcctccgcaaaaaat 35372  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
    | |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||           
T  35373 tattgcaaaatttgatttatatgtccagattttattacttttatctttaacttttatcgttttcaaaaatttatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaa 35471  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 303  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||||| ||||| ||       |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  35472 ttctaaattttagtaattgaacctttcataataatctaaacttgtttcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagactttaaggataattaaacaaactttgt 35571  T
Q  304 tgtaacatggactaaaa 320  Q
    | || || |||||||||    
T  35572 tttagcagggactaaaa 35588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 38674 - 38618
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttg 60  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  38674 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttgaactcttaagttttttaacaattttttg 38618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 335 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 35247 - 35160
Alignment:
Q  335 tttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaa 422  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| |||   | | ||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  35247 tttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaagaactaaacttaaaatgcctcaattttatagggattaaaaacatatttaa 35160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0097 (Bit Score: 143; Significance: 9e-75; HSPs: 6)
Name: scaffold0097
Description:

Target: scaffold0097; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 4 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 25339 - 25003
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||| |  || |||||    
T  25339 tcaattcaaatttgtttaatttattcttaaactcttaagttttttaacaattttttgtagacgtgttaagaacattactaaaagttccgc--cacaaaat 25242  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
    |           ||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||           
T  25241 t-----------tgatttatatgtccatattttattacttttatctttaacttttattgttttcaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaaa- 25154  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 303  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||       |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25153 ttctaaattttattaattgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaattcgttcaaaaatttaagagtttaacgataattaaacaaactttgt 25054  T
Q  304 tgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaa 354  Q
    | ||  | ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  25053 tttagtagggactaaaattagaagtaatttttttttgcagggactaaaaaa 25003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0097; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 4 - 364
Target Start/End: Original strand, 23787 - 24135
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaa-acatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaa 102  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||    ||||||| |||||||||||   | || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  23787 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaacta---agttttttaacaatttttttatagacgtgttaagaacattactaaaagttcctccgcaaaaaa 23883  T
Q  103 ttgtt-gcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnn 201  Q
     |  | |||||| |||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||         
T  23884 ataatcgcaaaatttgatttatatgttcagattttattacttttatctttaacttttatcgttttcaaaaattcatatttaattcatttcaaatt-aaaa 23982  T
Q  202 nnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaacttt 301  Q
      |||||||||||||||| ||||||       ||||||||| ||||||||       ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23983 aattctaaattttagtaattgaacc-------gtgttctaaacttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaaaataattaaacaaacttt 24075  T
Q  302 gttgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaa 364  Q
    ||| ||  | ||||||||||||||||||    |||||| || ||||||||||||||| |||||    
T  24076 gttttagaagggactaaaattagaagta---tttttttttagggactaaaaaacctactaaaa 24135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0097; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 4 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 23164 - 23066
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaa 102  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||   || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  23164 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagttttctaacaattttttgttgacgtgttaagaacattactaaaagttcctccgcaaaaaa 23066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0097; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 425
Target Start/End: Original strand, 23192 - 23282
Alignment:
Q  335 tttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccc 425  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||| |||   | | ||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  23192 tttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaacatatttaaccc 23282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0097; HSP #5
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 335 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 23759 - 23671
Alignment:
Q  335 tttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaac 423  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||   | | |||||| || ||| |||||||||||||||    
T  23759 tttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggattaaacttaaaatgcctcaattttaaagggactaaaaacatatttaac 23671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0097; HSP #6
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 335 - 425
Target Start/End: Original strand, 25368 - 25458
Alignment:
Q  335 tttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccc 425  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||| |||   | | ||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  25368 tttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttataggggctaaaaacatatttaaccc 25458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0627 (Bit Score: 142; Significance: 4e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0627
Description:

Target: scaffold0627; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 4 - 383
Target Start/End: Original strand, 6931 - 7309
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| | ||||| || | ||||||||   |||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  6931 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaattcttaaattttttaatagttttttgctggcatgtttagaacattactaaaagtttctccgcaaaaaat 7030  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaa-ttttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnn 202  Q
    | | |||||| ||||||| ||| |||| |||||||||| |||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||          
T  7031 tatagcaaaatttgatttctacatccaaattttgttaatttttatatttaacttttatctttttaaaaaattcatatttaatttgtttcgtgtt-agaaa 7129  T
Q  203 nttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttg 302  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||       || || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7130 attctaaattttagtaaatgaacttttcatattgttctaaacttgtctcaaaaaaatcattaaaaaatttaagagtttaatgataattaaacaaactttg 7229  T
Q  303 ttgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaactt 383  Q
    || || ||  ||||||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||| |||||||||    
T  7230 ttttagcagagactaaaattataagtaaat-ttttttgtagggactaaaaaagctattaaagttaaataaggattaaactt 7309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0562 (Bit Score: 135; Significance: 6e-70; HSPs: 4)
Name: scaffold0562
Description:

Target: scaffold0562; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 77 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 4193 - 3953
Alignment:
Q  77 attactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattca 176  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  4193 attactaaaagttcctatgcaaaaaattgtcgcaaaatttgatttctacgtacaggttttgttaattttatctttaactttttccgttttaaaaaattca 4094  T
Q  177 tatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaaga 276  Q
    ||||||||| ||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||       |||||||||||| |||||    
T  4093 tatttaatttgtttcatgtt-aaaaaattctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaatgtaaga 3995  T
Q  277 gtttaaagataattaaacaaactttgttgtaacatggactaa 318  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  3994 gtttaaggataattaaacaaattttgttgtaacaaggactaa 3953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0562; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 317 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 3847 - 3735
Alignment:
Q  317 aaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacat 416  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  3847 aaaattagaagtaattcttttttgtagggactaaaaaacctattaaaattaagtaaggattaaacttaaaaggtccctattttatagggaccaaaaacat 3748  T
Q  417 atttaaccctaaa 429  Q
    |||||||||||||    
T  3747 atttaaccctaaa 3735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0562; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 4287 - 4216
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaa 75  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  4287 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttgagtttttgaacaattttttacaggcatgttaagaa 4216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0562; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 360 - 430
Target Start/End: Original strand, 4338 - 4408
Alignment:
Q  360 taaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaa 430  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4338 taaaattaagtaaaaactaaacttaaaaggtccatattttatagggaccaaaaacatatttaaccctaaaa 4408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0640 (Bit Score: 129; Significance: 2e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold0640
Description:

Target: scaffold0640; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 11 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 4181 - 3764
Alignment:
Q  11 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 110  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||  ||| |||||  |||||   |||||||  |  ||    
T  4181 aaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagtttttcaacaattttttacagacatgttaagaacgttattaaaacgtcctccaaaaaaaata-tcaca 4083  T
Q  111 aaaatt-gatttatacgtccagatttt-gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttcta 208  Q
    |||||| ||||| ||||| || ||||| |||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||       || ||    
T  4082 aaaatttgatttctacgttcatatttttgttacttatatcttaaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaatttatttcatgttaaaaaa-ttata 3984  T
Q  209 aattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaa 308  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |        ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| || ||     
T  3983 gattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtataaaaagaatcgttaaaaaatttaagagtttaaggataattaagcaaaatttattttag 3884  T
Q  309 catggactaaaattagaagtaa-ttcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgac 407  Q
    || |||||| ||||| |||||| || ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||  ||  || | ||||||| | |||    
T  3883 cagggactataattataagtaagtttttttttgtagggattaaaaaaactattaaaattaagtaaggactaaacttagaaggtcgcaattttattgggac 3784  T
Q  408 caaaaacatatttaacccta 427  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  3783 caaaaacatatttaacccta 3764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0640; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 334 - 434
Target Start/End: Original strand, 4215 - 4315
Alignment:
Q  334 ttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaaaat 433  Q
    ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||  ||  || | ||||| ||  |||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  4215 ttttttgtaaggattaaaaaagctattaaaattaaataagaactaaacttacaaggtcgcaattttgtatggaccgaaaacataattaaccctaataaat 4314  T
Q  434 a 434  Q
    |    
T  4315 a 4315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 127; Significance: 3e-65; HSPs: 4)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 4 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 240294 - 239947
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||  | |  ||||||||| ||||||||||||||| | ||||||       
T  240294 tcaattcaaatttgtttaatttattcttaaactcttaagttttttaacaattttttttagatgtgttaagaacattactaaaagttccgccgcaaaat-- 240197  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 203  Q
               ||||| |||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||           
T  240196 -----------ttgatctatatgtccatattttattacttttatctttaacttttattgttttcaaatattcatatttaattcgtttcatgttaaaaaa- 240109  T
Q  204 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 303  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||       |||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  240108 ttctaaattttattaattgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaagtcgttcaaaaatttaacagttgaaggataattaaacaaactttgt 240009  T
Q  304 tgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaa-aaaacctattaaaa 364  Q
    | ||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  240008 tttagtagggactaaaattagaagtaatttttttttgtagggactaaaaaaacctattaaaa 239947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 4 - 60
Target Start/End: Original strand, 239492 - 239548
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttg 60  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  239492 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagttttttaacaattttttg 239548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 335 - 422
Target Start/End: Original strand, 240322 - 240409
Alignment:
Q  335 tttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaa 422  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| |||   | | ||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  240322 tttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaagaactaaacttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaacatatttaa 240409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 356 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 120701 - 120628
Alignment:
Q  356 ctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaa 429  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||| | ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  120701 ctattaaaattaattaaggactaaacttgaaagatctcaattttatacagacaaaaaacatatttaaccctaaa 120628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0571 (Bit Score: 117; Significance: 3e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0571
Description:

Target: scaffold0571; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 162 - 428
Target Start/End: Original strand, 8610 - 8874
Alignment:
Q  162 gttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaaccttt-catagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntc 260  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||       |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||        ||    
T  8610 gttttaagaaattcatatttaattcgtttcatcttaaaaaa-ttctaaattttagtaaatgaaccttttcatagtgttctaaccttatctaaaaaaaatc 8708  T
Q  261 gttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctatt 360  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  8709 gttcaaaaatttaagaatttaagaataatcaaacaaactttgttgtaagagggactaaaattagaagtaatt-ttttttgtagggactaaaaaa-ctatt 8806  T
Q  361 aaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaa 428  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||  |  | ||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  8807 aaaattaagtaaggattaaacttaaaagttttcaattttatagggaccaaaaacatatttaatcctaa 8874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0571; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 150
Target Start/End: Original strand, 8430 - 8575
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| || ||| |||||||||| ||||| | ||||    
T  8430 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttgagtttttgaacaattttttgtagacatggtaacaacattgctaaaagttcatctgc-acaaat 8528  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctt 150  Q
    ||| |||||| ||||||| | |||||| |||||||||||||||||||    
T  8529 tgtcgcaaaatttgatttttgcgtccaaattttgttaattttatctt 8575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0385 (Bit Score: 99; Significance: 2e-48; HSPs: 4)
Name: scaffold0385
Description:

Target: scaffold0385; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 4 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 10245 - 9906
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||  ||||||||||| | || ||||||||| |||| |||||||||| | ||||||       
T  10245 tcaattcaaatttgtttaatttattcttaaactcttaagtttttttacaattttttgtagacgtgttaagaacattattaaaagttccgccgcaaaat-- 10148  T
Q  104 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-nnnnnn 202  Q
               |||||||||| ||||| ||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||           
T  10147 -----------ttgatttatatgtccatattttattgtttttatctttaacttttattgttttcaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaaaa 10059  T
Q  203 nttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctc-nnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaacttt 301  Q
        ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||        || || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  10058 aaattaaattttattaattgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaaattcattaaaaaatttaagagtttaagaataattaaacaaacttt 9959  T
Q  302 gttgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaa 354  Q
    ||| ||  | ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||    
T  9958 gttttagtagggactaaaattagaagtgatttttttttgtagggactaaaaaa 9906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0385; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 335 - 425
Target Start/End: Original strand, 10273 - 10363
Alignment:
Q  335 tttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccc 425  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| |||   | | ||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  10273 tttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaagaactaaacttaaaatgactcaattttatagggactaaaaacatatttaaccc 10363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0385; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 335 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 9396 - 9309
Alignment:
Q  335 tttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccc 425  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||   ||||||||||| ||||||||| ||| | | | ||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  9396 tttttgtaaggactaaaacaactat---aattaagtaaggattaaacttaaaatacctcaattttatagggactaaaaacatatttaaccc 9309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0385; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 60
Target Start/End: Original strand, 9424 - 9479
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttg 60  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  9424 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaact-ttaagttttttaacaattttttg 9479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 90; Significance: 4e-43; HSPs: 3)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 163 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 21886 - 21711
Alignment:
Q  163 ttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgt 262  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||       ||||    
T  21886 ttttaagaaattcaaatttaattcgtttcatgttagaaaa-ttctaaattttagtaaatgaaccttttatagtgttctaaacttgtctcgaaaaaatcgt 21788  T
Q  263 tcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaacatggactaaaattagaagtaattctttttt 339  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  21787 tcaaaaatttaaaagtttaaggataattaaacaaactttgttttagcatggactaaaattataagtaattttttttt 21711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 356 - 427
Target Start/End: Original strand, 21890 - 21961
Alignment:
Q  356 ctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaacccta 427  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  21890 ctattaaaattaagtaaggactaaacttaaaagatctcaattttatagggactaaaaacatatttaacccta 21961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 395 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 21663 - 21621
Alignment:
Q  395 attttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaaaatatta 437  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21663 attttatagggaccaaaaacatatttaaccctataaaatatta 21621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024 (Bit Score: 70; Significance: 3e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0024
Description:

Target: scaffold0024; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 109 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 48041 - 47719
Alignment:
Q  109 caaaaattgatttatacgtccagat-tttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttct 207  Q
    ||||| || |||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| |||||||||       ||||    
T  48041 caaaattttatttctacgtccggatatttgttacttttatcttgaacttttgtcgttt-aaaaaatttatatttaattcatttcatgttaaaaaa-ttct 47944  T
Q  208 aaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgta 307  Q
    ||||||||| ||| |||||| |  || |||||||| ||||||||       | |||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||| |     
T  47943 aaattttagaaaacgaacctcttgtaatgttctaaacttgtctcaagaaaattgttcaaaaatttaagagtttaaggataattagaaaaagtttgttttc 47844  T
Q  308 acatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgac 407  Q
      | ||||||||| || | |||| |  ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||  ||  | |  | ||||||| ||     
T  47843 gtagggactaaaactacatgtaaattatttttatagggactaaaaaagctattaaaattaagtaaggactaaacttataagtttcaaaatttatagggat 47744  T
Q  408 caaaaacatatttaaccctaaaaaa 432  Q
    ||||||||||||||||||| |||||    
T  47743 caaaaacatatttaacccttaaaaa 47719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 261 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 33002 - 32895
Alignment:
Q  261 gttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctatt 360  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| | |||||||||| ||  | |||||||||| | | ||||    ||||| || |||||||||||  ||||    
T  33002 gttcaaaaatttaagagttcaaggataattagaaaaactttgttttagtagggactaaaatcacatgtaaactgtttttatagggactaaaaaagttatt 32903  T
Q  361 aaaattaa 368  Q
    ||||||||    
T  32902 aaaattaa 32895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199 (Bit Score: 66; Significance: 8e-29; HSPs: 3)
Name: scaffold0199
Description:

Target: scaffold0199; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 4 - 101
Target Start/End: Original strand, 6204 - 6301
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaa 101  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  6204 tcaattcaaatatgtttaatttatgcttaaacttttaagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaacgttactaaaagttcctcagcaaaaa 6301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 335 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 6176 - 6084
Alignment:
Q  335 tttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaacccta 427  Q
    ||||| || ||||| ||| | |||||||||||||||||| | ||||||| | |  |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  6176 tttttttagggactcaaagaactattaaaattaagtaaggactaaacttaagaggtcccaattttttagggaccaaaaacatatttaacccta 6084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 118 - 160
Target Start/End: Original strand, 6305 - 6347
Alignment:
Q  118 atttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgt 160  Q
    |||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6305 atttctatgtccagattttgttacttttatctttaacttttgt 6347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0734 (Bit Score: 63; Significance: 5e-27; HSPs: 3)
Name: scaffold0734
Description:

Target: scaffold0734; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 210 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 2941 - 2727
Alignment:
Q  210 attttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaac 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |        ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || || |    
T  2941 attttagtaaatgaacctttcatagtgtgctaaacttgtataaaaagaatcgttaaaaaatttaagagtttaacgataattaaacaaaatttattttagc 2842  T
Q  310 atggactaaaattagaagt-aattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgacc 408  Q
    | |||||||||||| |||| ||||  |||||||| |||  |||||  |||||||||||||||||| | |||||||  ||  |  | ||||||||| ||||    
T  2841 a-ggactaaaattataagtaaatttatttttgtagggatcaaaaaggctattaaaattaagtaaggactaaacttagaaggttgcaattttatagggacc 2743  T
Q  409 aaaaacatatttaacc 424  Q
    ||||| ||||||||||    
T  2742 aaaaatatatttaacc 2727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0734; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 3436 - 3260
Alignment:
Q  11 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttg-caaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgc 109  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||  || || |||||||||  ||| |||||| ||||| | |||||||  | ||    
T  3436 aaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagtttttcaacaatttttttacagacgtgttaagaacgttattaaaagatcctccgaaaaaaata-tcgc 3338  T
Q  110 aaaaatt-gatttatacgtccagatttt-gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaatt 185  Q
    ||||||| ||||| ||| |||| ||||| |||| || |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3337 aaaaatttgatttctacatccatatttttgttacttatatcttaaacttttgtcgttttaaaaaattcatatttaatt 3260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0734; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 334 - 432
Target Start/End: Original strand, 3470 - 3568
Alignment:
Q  334 ttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaaaa 432  Q
    ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||  ||  || | ||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  3470 ttttttgtaaggattaaaaaagctattaaaattaaataaggactaaacttataaggtcacaattttgtagggaccgaaaacataattaaccctaaaaaa 3568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 55; Significance: 3e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 262 - 372
Target Start/End: Original strand, 158745 - 158854
Alignment:
Q  262 ttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtatggactaaaaaacctatta 361  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | || ||| || || |||||||||||| | |||||| |||||| || ||||||||||| ||||||    
T  158745 ttcaaaaatttaagagtttgaagataattaaacagatttagttttagcagggactaaaattacatgtaatt-ttttttatagggactaaaaaaactatta 158843  T
Q  362 aaattaagtaa 372  Q
    |||||||||||    
T  158844 aaattaagtaa 158854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 51; Significance: 7e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 49053 - 48967
Alignment:
Q  4 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttc 90  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||    
T  49053 tcaattcaaatttgtttaatttattcttaaactcttaagttttttaacaattttttgtagacgtgttaagaacattactaaaagttc 48967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 348 - 422
Target Start/End: Original strand, 19974 - 20048
Alignment:
Q  348 taaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaa 422  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| |||||| || |||  |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  19974 taaaaaaactattaaaattaaataagtattaaatttaaaaggtccgaattttatagagaccaaaaatatatttaa 20048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 50; Significance: 3e-19; HSPs: 5)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 147
Target Start/End: Original strand, 282940 - 283076
Alignment:
Q  11 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 110  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |  ||    
T  282940 aaatttgtttaatt-atgcttaaacttttaagattttgaacaattttttgcacaagtgttaagaacattacgaaaagttcatctgcaaaaaattatctca 283038  T
Q  111 aaaattgatttatacgtccag-attttgttaattttat 147  Q
    ||| || |||| | ||||||| ||||||||| ||||||    
T  283039 aaattttatttctgcgtccagaattttgttacttttat 283076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 283525 - 283308
Alignment:
Q  11 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 110  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||| |  | ||||||| || || |||| ||  ||||||||||||| |  ||    
T  283525 aaatttgtttaatt-atgcttaaacttttaagattttgaacaattttttgcacaagtattaagaacatcacgaaaattttatctgcaaaaaattatctca 283427  T
Q  111 aaaattgatttatacgtccagatttt-gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaa 209  Q
    ||| |  |||  | |||||||||||| |||| |||||| || |||||||||  ||| |||||||||||||||||||  |||||||||       ||||||    
T  283426 aaattgtattcctgcgtccagatttttgttacttttattttgaacttttgtcttttaaaaaaattcatatttaatttatttcatgtt-aaaaaattctaa 283328  T
Q  210 attttagtaaatgaaccttt 229  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  283327 attttagtaaacgaaccttt 283308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 344 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 238314 - 238227
Alignment:
Q  344 ggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaaa 431  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||  ||   ||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||    
T  238314 ggactaaaaaagctattaaaattaagtaaggactaaacttagaagtacccaattttatagagatcaaaaacatatttaaccttaaaaa 238227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 334 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 282906 - 282823
Alignment:
Q  334 ttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatat 418  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||| | ||||||| ||| ||||| | ||||||| |||||| |||||||    
T  282906 ttttttatatggactaaaaacactattataattaagtaaggactaaacttaaaatatccc-aatttatagggaccaataacatat 282823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 336 - 415
Target Start/End: Original strand, 283561 - 283640
Alignment:
Q  336 ttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaaca 415  Q
    |||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||| |||||  ||| || | ||||||||| |||||||||||    
T  283561 ttttatatggactaaaaacactattataattaagtaaggatttaacttacaaagtctcaattttatagggaccaaaaaca 283640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0809 (Bit Score: 48; Significance: 5e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0809
Description:

Target: scaffold0809; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 273 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 786 - 630
Alignment:
Q  273 aagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaacatggactaaaattagaagtaa---ttcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaag 369  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |  | |||| |||||||||||||||||   || ||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  786 aagagtttaaggataattaaacaaactttggttgagcatgaactaaaattagaagtaactttttttttttgtagggaataaaaaa-ctactaaaattaag 688  T
Q  370 taagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaacccta 427  Q
    |||  | |||||||  ||  |  | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  687 taaagactaaacttagaagtttacaattttatagggaccaaaaacatatttgacccta 630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 334 - 426
Target Start/End: Original strand, 123460 - 123553
Alignment:
Q  334 ttttttgtat--ggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccct 426  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||  | || ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  123460 ttttttgtataaggactaaaaaacctattaaaat-aagtaaggactaaacttaaaaggttccaattttatagggaccaaaaacatatttaaccct 123553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 133 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 123351 - 123298
Alignment:
Q  133 ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattc 186  Q
    |||||||| ||||||||| ||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  123351 ttttgttacttttatcttaaacatttgctgtttgaaaaaatttatatttaattc 123298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0287 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0287
Description:

Target: scaffold0287; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 425
Target Start/End: Original strand, 47 - 137
Alignment:
Q  335 tttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaaccc 425  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |  |||||| ||| | | | ||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  47 tttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggacaaaacttaaaatacctcaattttatagggactaaaaacatatttaaccc 137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 397 - 434
Target Start/End: Original strand, 65340 - 65377
Alignment:
Q  397 tttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaaaata 434  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  65340 tttatagggaccaaaaacatatttaaccctaaaaaata 65377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0586 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0586
Description:

Target: scaffold0586; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 335 - 427
Target Start/End: Original strand, 5914 - 6006
Alignment:
Q  335 tttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttgaaaaatccctattttatagtgaccaaaaacatatttaacccta 427  Q
    ||||| || ||||| ||||| | ||||||||||| |||||| |||||||  ||  || | ||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  5914 tttttttagggacttaaaaaaccattaaaattaattaagaactaaacttacaagttctcaattttatagggatcaaaaacatatttaacccta 6006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 167 - 304
Target Start/End: Original strand, 52512 - 52649
Alignment:
Q  167 aaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtc-tcnnnnnnntcgttca 265  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||       | |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| || |         |||||     
T  52512 aaaaaattcatatttaattcatttcaagttaaaaaaat-ctaaattttagtaaatgaaccttttataatgttctaaacttatcttagaaaaaaccgttcc 52610  T
Q  266 aaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgtt 304  Q
    |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  52611 aaaatttacgagtctaaggataattaaacaaactttgtt 52649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0245 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0245
Description:

Target: scaffold0245; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 262 - 297
Target Start/End: Original strand, 25023 - 25058
Alignment:
Q  262 ttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaa 297  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25023 ttcaaaaatttaagagtttaaacataattaaacaaa 25058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 397 - 431
Target Start/End: Original strand, 52125 - 52159
Alignment:
Q  397 tttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaaa 431  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  52125 tttatagggaccaaaaacatatttaaccctaaaaa 52159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 397 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 28111 - 28078
Alignment:
Q  397 tttatagtgaccaaaaacatatttaaccctaaaa 430  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28111 tttatagggaccaaaaacatatttaaccctaaaa 28078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University