View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6076_high_8 (Length: 634)

Name: NF6076_high_8
Description: NF6076
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6076_high_8
NF6076_high_8
[»] chr4 (49 HSPs)
chr4 (18-371)||(34480554-34480917)
chr4 (409-624)||(14905904-14906119)
chr4 (409-624)||(17245887-17246102)
chr4 (409-624)||(16852225-16852440)
chr4 (420-621)||(10662770-10662971)
chr4 (420-621)||(10876915-10877116)
chr4 (481-616)||(18065183-18065318)
chr4 (409-616)||(5021263-5021479)
chr4 (409-616)||(16315854-16316070)
chr4 (481-616)||(24649539-24649674)
chr4 (481-616)||(27665781-27665916)
chr4 (409-616)||(4989307-4989523)
chr4 (409-616)||(18754002-18754218)
chr4 (481-616)||(459771-459906)
chr4 (409-616)||(10742110-10742326)
chr4 (409-616)||(10955879-10956095)
chr4 (481-616)||(14837620-14837755)
chr4 (481-616)||(17927307-17927442)
chr4 (481-616)||(18131761-18131896)
chr4 (409-616)||(19945850-19946066)
chr4 (481-616)||(22005625-22005760)
chr4 (409-616)||(30928005-30928221)
chr4 (481-616)||(36027499-36027634)
chr4 (481-616)||(49516745-49516880)
chr4 (409-616)||(55746764-55746980)
chr4 (409-616)||(40455872-40456088)
chr4 (409-616)||(14712335-14712542)
chr4 (481-616)||(16265073-16265208)
chr4 (486-616)||(15195437-15195567)
chr4 (486-616)||(27175287-27175417)
chr4 (409-616)||(27816458-27816674)
chr4 (481-616)||(3380710-3380845)
chr4 (41-103)||(34482856-34482918)
chr4 (409-452)||(459690-459733)
chr4 (409-452)||(3380629-3380672)
chr4 (409-452)||(14837793-14837836)
chr4 (409-452)||(15198489-15198532)
chr4 (409-452)||(16264992-16265035)
chr4 (409-452)||(17927226-17927269)
chr4 (409-452)||(18065102-18065145)
chr4 (409-452)||(18131934-18131977)
chr4 (409-452)||(22005544-22005587)
chr4 (409-452)||(24649458-24649501)
chr4 (409-452)||(27175200-27175243)
chr4 (409-452)||(27665700-27665743)
chr4 (409-452)||(36027418-36027461)
chr4 (409-452)||(49516664-49516707)
chr4 (520-622)||(13694685-13694787)
chr4 (409-452)||(10299799-10299842)
[»] chr8 (50 HSPs)
chr8 (409-624)||(15976653-15976868)
chr8 (409-624)||(17287786-17288001)
chr8 (409-613)||(17014873-17015077)
chr8 (409-613)||(17542124-17542328)
chr8 (410-622)||(21603723-21603935)
chr8 (409-624)||(25164582-25164797)
chr8 (409-623)||(20257189-20257403)
chr8 (409-624)||(19940409-19940624)
chr8 (409-624)||(22672100-22672315)
chr8 (409-622)||(19941542-19941755)
chr8 (420-624)||(18152638-18152842)
chr8 (409-592)||(20260483-20260666)
chr8 (409-592)||(21047113-21047296)
chr8 (409-616)||(19233892-19234108)
chr8 (409-616)||(13690113-13690329)
chr8 (509-622)||(22463084-22463197)
chr8 (409-616)||(19427436-19427652)
chr8 (409-616)||(3350178-3350394)
chr8 (409-616)||(3842052-3842259)
chr8 (481-616)||(9366889-9367024)
chr8 (481-616)||(26119505-26119640)
chr8 (481-616)||(29085586-29085721)
chr8 (481-616)||(32079239-32079374)
chr8 (481-616)||(36087117-36087252)
chr8 (481-616)||(36302121-36302256)
chr8 (481-616)||(44490309-44490444)
chr8 (409-616)||(15782254-15782470)
chr8 (481-616)||(19137875-19138010)
chr8 (481-616)||(29075335-29075470)
chr8 (409-616)||(30316268-30316484)
chr8 (409-610)||(23791755-23791956)
chr8 (481-616)||(251003-251138)
chr8 (481-616)||(814104-814239)
chr8 (409-622)||(21297246-21297459)
chr8 (481-616)||(16745596-16745731)
chr8 (409-616)||(22149148-22149355)
chr8 (481-622)||(45569571-45569712)
chr8 (409-452)||(250922-250965)
chr8 (409-452)||(814023-814066)
chr8 (409-452)||(9366808-9366851)
chr8 (409-452)||(16745515-16745558)
chr8 (409-452)||(19137794-19137837)
chr8 (409-452)||(26119424-26119467)
chr8 (409-452)||(29075254-29075297)
chr8 (409-452)||(29085505-29085548)
chr8 (409-452)||(32079412-32079455)
chr8 (409-452)||(36087036-36087079)
chr8 (409-452)||(44490228-44490271)
chr8 (539-622)||(24666877-24666960)
chr8 (409-452)||(36302040-36302083)
[»] chr3 (84 HSPs)
chr3 (409-624)||(2559512-2559727)
chr3 (409-624)||(18123279-18123494)
chr3 (409-622)||(16029328-16029541)
chr3 (409-624)||(11188313-11188528)
chr3 (409-622)||(14908303-14908513)
chr3 (409-624)||(17244813-17245028)
chr3 (435-622)||(19886712-19886897)
chr3 (414-616)||(14078951-14079153)
chr3 (409-619)||(17016297-17016507)
chr3 (409-616)||(16397528-16397744)
chr3 (536-624)||(5211122-5211210)
chr3 (409-616)||(9382172-9382388)
chr3 (409-616)||(9983396-9983612)
chr3 (409-616)||(10628456-10628672)
chr3 (409-616)||(6183474-6183690)
chr3 (409-616)||(11273893-11274109)
chr3 (409-616)||(13374176-13374392)
chr3 (409-616)||(13384770-13384986)
chr3 (481-616)||(28315746-28315881)
chr3 (409-616)||(29935071-29935278)
chr3 (409-616)||(29984225-29984432)
chr3 (481-616)||(38203846-38203981)
chr3 (481-616)||(4752913-4753048)
chr3 (481-616)||(5538529-5538664)
chr3 (481-616)||(5581141-5581276)
chr3 (481-616)||(5867204-5867339)
chr3 (481-616)||(6491854-6491989)
chr3 (481-616)||(8783857-8783992)
chr3 (481-616)||(8997459-8997594)
chr3 (481-616)||(14474815-14474950)
chr3 (481-616)||(16392556-16392691)
chr3 (481-616)||(19787616-19787751)
chr3 (481-616)||(24669064-24669199)
chr3 (481-616)||(29462726-29462861)
chr3 (481-616)||(39381278-39381413)
chr3 (481-616)||(41692843-41692978)
chr3 (409-616)||(12288488-12288704)
chr3 (409-616)||(505678-505894)
chr3 (481-616)||(5519462-5519597)
chr3 (481-616)||(11207603-11207738)
chr3 (481-616)||(12239126-12239261)
chr3 (481-616)||(13130864-13130999)
chr3 (409-616)||(20674705-20674921)
chr3 (481-616)||(23766488-23766623)
chr3 (409-616)||(24385026-24385242)
chr3 (538-624)||(53058347-53058433)
chr3 (481-616)||(7796129-7796264)
chr3 (481-616)||(13263181-13263316)
chr3 (481-616)||(14312920-14313055)
chr3 (481-616)||(37875655-37875790)
chr3 (481-616)||(37884173-37884308)
chr3 (409-616)||(1062657-1062864)
chr3 (481-616)||(1785585-1785720)
chr3 (481-616)||(4432354-4432489)
chr3 (481-619)||(12754290-12754428)
chr3 (464-610)||(15652623-15652769)
chr3 (481-619)||(15847488-15847626)
chr3 (409-476)||(5211053-5211120)
chr3 (540-622)||(16306630-16306712)
chr3 (409-452)||(4432273-4432316)
chr3 (409-452)||(4752832-4752875)
chr3 (409-452)||(5519381-5519424)
chr3 (409-452)||(5538702-5538745)
chr3 (409-452)||(5581314-5581357)
chr3 (409-452)||(5867377-5867420)
chr3 (409-452)||(8783776-8783819)
chr3 (409-452)||(13130783-13130826)
chr3 (409-452)||(14474734-14474777)
chr3 (409-452)||(16392729-16392772)
chr3 (409-452)||(19787535-19787578)
chr3 (409-452)||(24668983-24669026)
chr3 (409-452)||(37875574-37875617)
chr3 (409-452)||(37884092-37884135)
chr3 (409-452)||(38203765-38203808)
chr3 (409-452)||(39381197-39381240)
chr3 (409-452)||(41692762-41692805)
chr3 (522-612)||(18696534-18696624)
chr3 (409-452)||(7796302-7796345)
chr3 (409-452)||(8997632-8997675)
chr3 (409-452)||(11207776-11207819)
chr3 (409-452)||(12239299-12239342)
chr3 (409-452)||(13263354-13263397)
chr3 (409-452)||(23766407-23766450)
chr3 (409-452)||(28315919-28315962)
[»] chr7 (53 HSPs)
chr7 (409-620)||(13878454-13878665)
chr7 (409-623)||(16547628-16547842)
chr7 (409-623)||(16617820-16618034)
chr7 (409-624)||(13680658-13680873)
chr7 (409-622)||(13173846-13174059)
chr7 (409-624)||(14171975-14172190)
chr7 (419-622)||(13028559-13028762)
chr7 (409-624)||(16311609-16311823)
chr7 (409-622)||(16669765-16669993)
chr7 (409-622)||(17644133-17644361)
chr7 (409-624)||(4413597-4413821)
chr7 (409-619)||(13176082-13176291)
chr7 (409-616)||(6868822-6869038)
chr7 (481-616)||(11014364-11014499)
chr7 (409-616)||(9168676-9168892)
chr7 (481-616)||(176066-176201)
chr7 (481-616)||(1996732-1996867)
chr7 (409-616)||(2707205-2707421)
chr7 (481-616)||(4221184-4221319)
chr7 (409-616)||(8003658-8003874)
chr7 (481-616)||(8626521-8626656)
chr7 (481-616)||(9093563-9093698)
chr7 (481-616)||(9442439-9442574)
chr7 (481-616)||(11003755-11003890)
chr7 (481-616)||(20988233-20988368)
chr7 (481-616)||(22098317-22098452)
chr7 (481-616)||(24743277-24743412)
chr7 (409-616)||(26391686-26391902)
chr7 (409-616)||(40043696-40043912)
chr7 (481-616)||(42875024-42875159)
chr7 (467-616)||(15879414-15879563)
chr7 (409-616)||(458578-458794)
chr7 (481-616)||(17951706-17951841)
chr7 (409-616)||(26654928-26655144)
chr7 (540-622)||(21212214-21212296)
chr7 (409-616)||(18439699-18439906)
chr7 (509-616)||(16309336-16309443)
chr7 (566-622)||(16106650-16106706)
chr7 (409-452)||(175985-176028)
chr7 (409-452)||(1996651-1996694)
chr7 (409-452)||(4221103-4221146)
chr7 (409-452)||(8626440-8626483)
chr7 (409-452)||(9093482-9093525)
chr7 (409-452)||(9442358-9442401)
chr7 (409-452)||(11003674-11003717)
chr7 (409-452)||(11014283-11014326)
chr7 (409-452)||(15879587-15879630)
chr7 (409-452)||(17951879-17951922)
chr7 (409-452)||(20988152-20988195)
chr7 (409-452)||(22098236-22098279)
chr7 (409-452)||(24743196-24743239)
chr7 (409-452)||(42874943-42874986)
chr7 (540-622)||(16408238-16408323)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (409-624)||(7264-7479)
[»] chr6 (49 HSPs)
chr6 (411-612)||(26940718-26940919)
chr6 (409-622)||(19450386-19450596)
chr6 (409-622)||(19448392-19448602)
chr6 (409-612)||(17926098-17926301)
chr6 (409-616)||(28253086-28253302)
chr6 (409-616)||(28331835-28332051)
chr6 (409-616)||(22307269-22307476)
chr6 (481-616)||(27502852-27502987)
chr6 (481-616)||(9114011-9114146)
chr6 (409-624)||(14054904-14055119)
chr6 (481-616)||(27383285-27383420)
chr6 (481-616)||(27473669-27473804)
chr6 (481-616)||(3670592-3670727)
chr6 (409-616)||(17610112-17610319)
chr6 (481-616)||(25984625-25984760)
chr6 (481-616)||(26034568-26034703)
chr6 (481-616)||(26042743-26042878)
chr6 (481-616)||(26873950-26874085)
chr6 (481-616)||(27350893-27351028)
chr6 (481-616)||(27411633-27411768)
chr6 (409-616)||(32302564-32302780)
chr6 (409-616)||(32963464-32963680)
chr6 (409-616)||(34808680-34808896)
chr6 (409-612)||(20031443-20031655)
chr6 (409-616)||(12718354-12718570)
chr6 (481-616)||(12864079-12864214)
chr6 (481-616)||(16958156-16958291)
chr6 (481-614)||(25804216-25804349)
chr6 (409-619)||(11204439-11204650)
chr6 (411-616)||(18553768-18553972)
chr6 (420-616)||(17062708-17062904)
chr6 (481-619)||(22385156-22385294)
chr6 (411-616)||(17447272-17447477)
chr6 (531-614)||(13138005-13138088)
chr6 (409-526)||(17056529-17056646)
chr6 (409-517)||(25723353-25723461)
chr6 (409-452)||(3670511-3670554)
chr6 (409-452)||(12863998-12864041)
chr6 (409-452)||(16958075-16958118)
chr6 (409-452)||(25984544-25984587)
chr6 (409-452)||(26034487-26034530)
chr6 (409-452)||(26042662-26042705)
chr6 (409-452)||(26873869-26873912)
chr6 (409-452)||(27350812-27350855)
chr6 (409-452)||(27383204-27383247)
chr6 (409-452)||(27411552-27411595)
chr6 (409-452)||(27473588-27473631)
chr6 (509-586)||(19874319-19874396)
chr6 (409-452)||(27502771-27502814)
[»] scaffold0022 (5 HSPs)
scaffold0022 (409-624)||(35748-35963)
scaffold0022 (409-624)||(133808-134023)
scaffold0022 (412-622)||(157456-157663)
scaffold0022 (481-616)||(45306-45441)
scaffold0022 (409-446)||(45520-45557)
[»] chr5 (74 HSPs)
chr5 (409-624)||(26782737-26782952)
chr5 (409-624)||(26763774-26763988)
chr5 (421-622)||(21200627-21200828)
chr5 (409-616)||(23394040-23394256)
chr5 (409-619)||(23486917-23487127)
chr5 (409-616)||(24981824-24982040)
chr5 (481-616)||(39354127-39354262)
chr5 (409-616)||(31420296-31420512)
chr5 (409-616)||(34053591-34053807)
chr5 (481-616)||(5299637-5299772)
chr5 (481-616)||(6977437-6977572)
chr5 (481-616)||(9337585-9337720)
chr5 (409-616)||(14031673-14031889)
chr5 (409-616)||(14456026-14456242)
chr5 (481-616)||(14567148-14567283)
chr5 (409-616)||(15741600-15741816)
chr5 (481-616)||(16002391-16002526)
chr5 (409-616)||(17608693-17608909)
chr5 (409-616)||(17720549-17720765)
chr5 (481-616)||(22148147-22148282)
chr5 (481-616)||(22677747-22677882)
chr5 (481-616)||(23297908-23298043)
chr5 (481-616)||(23363727-23363862)
chr5 (481-616)||(23698411-23698546)
chr5 (409-616)||(24568719-24568935)
chr5 (481-616)||(27051332-27051467)
chr5 (481-616)||(30236521-30236656)
chr5 (481-616)||(31350165-31350300)
chr5 (409-616)||(31835111-31835327)
chr5 (409-616)||(34773540-34773756)
chr5 (409-616)||(35217134-35217350)
chr5 (481-616)||(36591612-36591747)
chr5 (409-616)||(36689329-36689545)
chr5 (481-616)||(37739062-37739197)
chr5 (481-616)||(39499982-39500117)
chr5 (409-616)||(40391989-40392205)
chr5 (481-616)||(42044411-42044546)
chr5 (409-616)||(43620308-43620524)
chr5 (409-616)||(24809547-24809763)
chr5 (481-616)||(24825970-24826105)
chr5 (409-616)||(27461793-27462009)
chr5 (481-616)||(27621267-27621402)
chr5 (487-616)||(1120403-1120532)
chr5 (487-622)||(11209620-11209755)
chr5 (481-616)||(19465603-19465738)
chr5 (409-616)||(20553446-20553662)
chr5 (409-610)||(21704378-21704588)
chr5 (481-616)||(17455808-17455943)
chr5 (481-619)||(25113526-25113664)
chr5 (481-619)||(25172617-25172755)
chr5 (409-610)||(13532291-13532492)
chr5 (409-452)||(1120316-1120359)
chr5 (409-452)||(5299556-5299599)
chr5 (409-452)||(6977610-6977653)
chr5 (409-452)||(9337758-9337801)
chr5 (409-452)||(14567067-14567110)
chr5 (409-452)||(17455727-17455770)
chr5 (409-452)||(22148320-22148363)
chr5 (409-452)||(22677920-22677963)
chr5 (409-452)||(23298081-23298124)
chr5 (409-452)||(23363900-23363943)
chr5 (409-452)||(23698584-23698627)
chr5 (409-452)||(24825889-24825932)
chr5 (409-452)||(27051251-27051294)
chr5 (409-452)||(27621186-27621229)
chr5 (409-452)||(30236440-30236483)
chr5 (409-452)||(31350338-31350381)
chr5 (409-452)||(37738981-37739024)
chr5 (409-452)||(39499901-39499944)
chr5 (409-452)||(42044584-42044627)
chr5 (409-452)||(16002310-16002353)
chr5 (409-452)||(19465776-19465819)
chr5 (409-452)||(36591531-36591574)
chr5 (409-452)||(39354300-39354343)
[»] chr2 (49 HSPs)
chr2 (409-624)||(22253913-22254128)
chr2 (409-624)||(28702792-28703007)
chr2 (409-622)||(22783199-22783412)
chr2 (409-622)||(24723688-24723897)
chr2 (409-573)||(23185816-23185977)
chr2 (409-573)||(23597079-23597240)
chr2 (422-622)||(24842516-24842716)
chr2 (525-624)||(21137530-21137629)
chr2 (409-616)||(24329277-24329493)
chr2 (409-616)||(21163475-21163691)
chr2 (481-616)||(27230588-27230723)
chr2 (481-616)||(35262153-35262288)
chr2 (481-616)||(35272778-35272913)
chr2 (467-616)||(24416554-24416703)
chr2 (481-616)||(4219045-4219180)
chr2 (409-616)||(9899101-9899317)
chr2 (481-616)||(10276136-10276271)
chr2 (409-616)||(11396700-11396916)
chr2 (409-616)||(19303956-19304163)
chr2 (481-616)||(22916388-22916523)
chr2 (481-616)||(39171622-39171757)
chr2 (481-616)||(40249758-40249893)
chr2 (409-616)||(9764291-9764507)
chr2 (409-616)||(34791745-34791961)
chr2 (481-616)||(43091828-43091963)
chr2 (481-616)||(43353579-43353714)
chr2 (409-619)||(24803176-24803386)
chr2 (409-616)||(19301507-19301714)
chr2 (413-616)||(24303627-24303830)
chr2 (481-616)||(26876117-26876252)
chr2 (481-616)||(29253369-29253504)
chr2 (522-614)||(10900079-10900171)
chr2 (487-612)||(28722850-28722975)
chr2 (569-624)||(24574502-24574557)
chr2 (409-452)||(4218964-4219007)
chr2 (409-452)||(10276055-10276098)
chr2 (409-452)||(26876036-26876079)
chr2 (409-452)||(27230507-27230550)
chr2 (409-452)||(28723019-28723062)
chr2 (409-452)||(29253288-29253331)
chr2 (409-452)||(35262072-35262115)
chr2 (409-452)||(35272697-35272740)
chr2 (409-452)||(39171795-39171838)
chr2 (409-452)||(40249677-40249720)
chr2 (409-452)||(43353498-43353541)
chr2 (518-611)||(21919643-21919736)
chr2 (409-452)||(22916561-22916604)
chr2 (409-452)||(24416727-24416770)
chr2 (409-452)||(43091747-43091790)
[»] scaffold0317 (1 HSPs)
scaffold0317 (409-610)||(2551-2752)
[»] chr1 (41 HSPs)
chr1 (413-615)||(17720192-17720391)
chr1 (409-622)||(18613480-18613693)
chr1 (409-624)||(25449822-25450037)
chr1 (409-622)||(21196259-21196469)
chr1 (410-576)||(22444931-22445097)
chr1 (410-576)||(22450165-22450331)
chr1 (409-624)||(21125928-21126143)
chr1 (409-624)||(21207377-21207592)
chr1 (409-622)||(23023181-23023394)
chr1 (413-600)||(20943079-20943272)
chr1 (409-619)||(22017627-22017837)
chr1 (409-616)||(7691021-7691237)
chr1 (409-616)||(35639589-35639805)
chr1 (481-616)||(3180737-3180872)
chr1 (481-616)||(4176438-4176573)
chr1 (481-616)||(5842340-5842475)
chr1 (481-616)||(7516410-7516545)
chr1 (481-616)||(12615873-12616008)
chr1 (481-616)||(12739664-12739799)
chr1 (481-616)||(21876284-21876419)
chr1 (481-616)||(36237980-36238115)
chr1 (409-616)||(47609486-47609702)
chr1 (481-616)||(51630742-51630877)
chr1 (481-616)||(19186341-19186476)
chr1 (409-616)||(20874779-20874986)
chr1 (409-616)||(38104140-38104356)
chr1 (508-616)||(38093622-38093730)
chr1 (409-616)||(5641260-5641483)
chr1 (572-624)||(22431528-22431580)
chr1 (509-612)||(9345191-9345294)
chr1 (409-452)||(3180656-3180699)
chr1 (409-452)||(4176357-4176400)
chr1 (409-452)||(5842259-5842302)
chr1 (409-452)||(7516329-7516372)
chr1 (409-452)||(12616046-12616089)
chr1 (409-452)||(21876203-21876246)
chr1 (409-452)||(36238153-36238196)
chr1 (409-452)||(51630915-51630958)
chr1 (409-452)||(19186260-19186303)
chr1 (410-452)||(12739584-12739626)
chr1 (539-600)||(23976030-23976091)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (421-624)||(47641-47843)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (409-624)||(27228-27443)
[»] scaffold0389 (1 HSPs)
scaffold0389 (409-616)||(12268-12472)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (409-624)||(209718-209933)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (411-624)||(66960-67173)
scaffold0011 (409-622)||(166247-166460)
[»] scaffold0047 (3 HSPs)
scaffold0047 (409-622)||(6972-7182)
scaffold0047 (481-616)||(34454-34589)
scaffold0047 (409-452)||(34627-34670)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (409-624)||(111179-111394)
[»] scaffold0083 (1 HSPs)
scaffold0083 (409-595)||(43324-43510)
[»] scaffold0161 (2 HSPs)
scaffold0161 (409-622)||(11651-11864)
scaffold0161 (409-622)||(16324-16537)
[»] scaffold0315 (1 HSPs)
scaffold0315 (409-622)||(6984-7193)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (409-612)||(1782-1985)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (409-582)||(25711-25883)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (409-619)||(3057-3267)
[»] scaffold0217 (2 HSPs)
scaffold0217 (523-624)||(17546-17647)
scaffold0217 (409-465)||(14586-14642)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (409-616)||(75576-75784)
[»] scaffold1507 (1 HSPs)
scaffold1507 (409-616)||(931-1138)
[»] scaffold0105 (2 HSPs)
scaffold0105 (481-616)||(38506-38641)
scaffold0105 (409-452)||(38679-38722)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (409-616)||(3796-4003)
[»] scaffold0017 (2 HSPs)
scaffold0017 (409-619)||(44735-44945)
scaffold0017 (409-619)||(55038-55248)
[»] scaffold0272 (1 HSPs)
scaffold0272 (409-616)||(23737-23953)
[»] scaffold1820 (1 HSPs)
scaffold1820 (471-622)||(3-154)
[»] scaffold0211 (2 HSPs)
scaffold0211 (409-622)||(1235-1448)
scaffold0211 (551-622)||(1089-1160)
[»] scaffold0630 (1 HSPs)
scaffold0630 (409-504)||(3840-3935)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (409-610)||(9322-9532)
[»] scaffold0382 (1 HSPs)
scaffold0382 (409-619)||(2838-3049)
[»] scaffold0185 (1 HSPs)
scaffold0185 (409-619)||(31600-31810)
[»] scaffold0925 (1 HSPs)
scaffold0925 (481-619)||(3775-3913)
[»] scaffold0892 (1 HSPs)
scaffold0892 (409-573)||(1-165)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (521-616)||(53286-53381)
[»] scaffold0758 (1 HSPs)
scaffold0758 (518-619)||(2774-2875)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (411-516)||(20150-20255)
[»] scaffold0443 (1 HSPs)
scaffold0443 (570-624)||(2555-2609)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 321; Significance: 0; HSPs: 49)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 371
Target Start/End: Original strand, 34480554 - 34480917
Alignment:
Q  18 caaacaagaggagaagaatgtgctttgttgaaacatctacctcttcatgcagccatgcatcttgttcatgctaagggcgaccattttgaggtgttgtatt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34480554 caaacaagaggagaagaatgtgctttgttgaaacatctacctcttcatgcagccatgcatcttgttcatgctaagggcgaccattttgaggtgttgtatt 34480653  T
Q  118 tctacaaatctggatttttcaaaggtataagaatactaaaaatggcttatgtgaaagctgctattagtgtatgtgtgtaacagttggaaatttgtttc-- 215  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  34480654 tctacaaatctgaatttttcaaaggtataagaatactaaaaatggcttatgtgaaagctgctattagtgtatgtgtgtaacagttggaaatttgtttcat 34480753  T
Q  216 --------attttattttatttgcgtgtaacattattaaaacaaggaataacttgtatgcttaatgcttgagtgtgttttgtttgtctgagtgcgtgctg 307  Q
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34480754 tttattttattttattttatttgcgtgtaacattattaaaacaaggaataacttgtatgcttaatgcttgagtgtgttttgtttgtctgagtgcgtgctg 34480853  T
Q  308 tcaaaacaaggaataacaacaaaaatgcgttttggaaccttcgtcaaaattgagcatttgtgta 371  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34480854 tcaaaacaaggaataataacaaaaatgcgttttggaaccttcgtcaaaattgagcatttgtgta 34480917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 409 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 14906119 - 14905904
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttact 508  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  14906119 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcaacaactttaacagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttact 14906020  T
Q  509 cttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctca 608  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||    
T  14906019 cttcctagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagaacttcaacacttaaagtgttcaaatctttaccttccgca 14905920  T
Q  609 atagcagtcacctttg 624  Q
    ||||||||||||||||    
T  14905919 atagcagtcacctttg 14905904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 409 - 624
Target Start/End: Original strand, 17245887 - 17246102
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttact 508  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17245887 gatcttcatcagaatctccatcatgtgattcttcttcagattcaacaactttaagaaattttgatgacttccctttttatggtagagcaatggatttact 17245986  T
Q  509 cttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctca 608  Q
    ||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| |||||||    
T  17245987 ctttttggaaggttcatattcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctca 17246086  T
Q  609 atagcagtcacctttg 624  Q
    ||||||||||||||||    
T  17246087 atagcagtcacctttg 17246102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 409 - 624
Target Start/End: Original strand, 16852225 - 16852440
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttact 508  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||    
T  16852225 gatcctcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattccacaactttgagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttgct 16852324  T
Q  509 cttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctca 608  Q
     |||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  16852325 tttcttagatgactcatgttcattaagactaatctcatgaacttttagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgttcaaatctttagcttcctca 16852424  T
Q  609 atagcagtcacctttg 624  Q
    ||||||||||||||||    
T  16852425 atagcagtcacctttg 16852440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 420 - 621
Target Start/End: Complemental strand, 10662971 - 10662770
Alignment:
Q  420 gaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaag 519  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||  |||| ||||| || ||||| |||||| ||||||| ||||    
T  10662971 gaatctccatcatgtgactcttcttcagattcaataactttaagagctttagatgactttcctttagatgggagcgcaatagatttattcttctttgaag 10662872  T
Q  520 gttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagtcac 619  Q
      ||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||    
T  10662871 actcatgctcatttaggctcatttcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagcttcctccatagcagtaac 10662772  T
Q  620 ct 621  Q
    ||    
T  10662771 ct 10662770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 420 - 621
Target Start/End: Complemental strand, 10877116 - 10876915
Alignment:
Q  420 gaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaag 519  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||  |||| ||||| || ||||| |||||| ||||||| ||||    
T  10877116 gaatctccatcatgtgactcttcttcagattcaataactttaagagctttagatgactttcctttagatgggagcgcaatagatttattcttctttgaag 10877017  T
Q  520 gttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagtcac 619  Q
      ||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||    
T  10877016 actcatgctcatttaggctcatttcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagcttcctccatagcagtaac 10876917  T
Q  620 ct 621  Q
    ||    
T  10876916 ct 10876915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Original strand, 18065183 - 18065318
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  18065183 ctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggattcatgctcatttagactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacact 18065282  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  18065283 taaagtgtttagatccttagcttcctcaatagcagt 18065318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 409 - 616
Target Start/End: Original strand, 5021263 - 5021479
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaac---------gactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaat 499  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||           | |||||  || |||||| | |||  |||| ||||||| ||||||    
T  5021263 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactagctttataggctttagaagattttgaagtctttcctttagatggtaaagcaat 5021362  T
Q  500 ggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatcttta 599  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  5021363 ggatttactcttcttagaggattcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatcctta 5021462  T
Q  600 gtttcctcaatagcagt 616  Q
    | |||||||||||||||    
T  5021463 gcttcctcaatagcagt 5021479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 409 - 616
Target Start/End: Original strand, 16315854 - 16316070
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgac---------tttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaat 499  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |         ||||  || ||| || |||||  |||| ||||||||||||||    
T  16315854 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttagaagatttggaagactttcctttagatggtagagcaat 16315953  T
Q  500 ggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatcttta 599  Q
     ||||||||||||||||| |  ||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  16315954 agatttactcttcttagaggactcatgctcatttagactcatttcatgcactttgagggaactgacaagatcttcaacactcaaagtgtttaaatcctta 16316053  T
Q  600 gtttcctcaatagcagt 616  Q
    | |||||||||||||||    
T  16316054 gcttcctcaatagcagt 16316070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Original strand, 24649539 - 24649674
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  24649539 ctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttagactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacact 24649638  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    |||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  24649639 taaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagt 24649674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Original strand, 27665781 - 27665916
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  27665781 ctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttagactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacact 27665880  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    |||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  27665881 taaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagt 27665916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 409 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 4989523 - 4989307
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaac---------gactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaat 499  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||           | |||||  || |||||| | |||  |||| ||||||| ||||||    
T  4989523 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactagctttataggctttagaagattttgaagtctttcctttagatggtaaagcaat 4989424  T
Q  500 ggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatcttta 599  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  4989423 ggatttactcttcttagaggattcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatcctta 4989324  T
Q  600 gtttcctcaatagcagt 616  Q
    | |||| ||||||||||    
T  4989323 gcttccccaatagcagt 4989307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 409 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 18754218 - 18754002
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca---------acgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaat 499  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||         | | |||||  || |||||| | |||  |||| ||||||| ||||||    
T  18754218 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcacttgctttaaaggctttagaagattttgaagtctttcctttagatggtaaagcaat 18754119  T
Q  500 ggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatcttta 599  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| || || | ||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||    
T  18754118 ggatttactcttcttagaggattcatgctcgtttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcctcaacacttaaagtgtttagatcctta 18754019  T
Q  600 gtttcctcaatagcagt 616  Q
    | |||||||||||||||    
T  18754018 gcttcctcaatagcagt 18754002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Original strand, 459771 - 459906
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  459771 ctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacact 459870  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    |||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  459871 taaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagt 459906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 409 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 10742326 - 10742110
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgact------tct---cttttgatggtagagcaat 499  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||    ||||| || ||||      |||   |||| ||||||| ||||||    
T  10742326 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttggaagactttgaggtctttcctttagatggtaaagcaat 10742227  T
Q  500 ggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatcttta 599  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  10742226 ggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacacttaaagtatttagatcctta 10742127  T
Q  600 gtttcctcaatagcagt 616  Q
    | |||||||||||||||    
T  10742126 gcttcctcaatagcagt 10742110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 409 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 10956095 - 10955879
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgact------tct---cttttgatggtagagcaat 499  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||    ||||| || ||||      |||   |||| ||||||| ||||||    
T  10956095 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttggaagactttgaggtctttcctttagatggtaaagcaat 10955996  T
Q  500 ggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatcttta 599  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  10955995 ggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacacttaaagtatttagatcctta 10955896  T
Q  600 gtttcctcaatagcagt 616  Q
    | |||||||||||||||    
T  10955895 gcttcctcaatagcagt 10955879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 14837755 - 14837620
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||| | ||| || ||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  14837755 ctttagatggtagagcaatggatttactcttcttagaggactcatgctcatttaaactcatttcatgcaccttgagggaactgacaagatcttcaacact 14837656  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  14837655 taaagtgtttagatccttagcttcctcaatagcagt 14837620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Original strand, 17927307 - 17927442
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  17927307 ctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacact 17927406  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    |||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  17927407 taaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagt 17927442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 18131896 - 18131761
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  18131896 ctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacact 18131797  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    |||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  18131796 taaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagt 18131761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 409 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 19946066 - 19945850
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgacttt-aag--------agcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaat 499  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||  ||        || |||||| | |||  |||| ||||||||||||||    
T  19946066 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttggaagattttgaagtctttcctttagatggtagagcaat 19945967  T
Q  500 ggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatcttta 599  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  19945966 ggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcgtgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacacttaaagtatttagatcctta 19945867  T
Q  600 gtttcctcaatagcagt 616  Q
    | |||||||||||||||    
T  19945866 gcttcctcaatagcagt 19945850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Original strand, 22005625 - 22005760
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  22005625 ctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacact 22005724  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    |||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  22005725 taaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagt 22005760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 409 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 30928221 - 30928005
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgacttt-aag--------agcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaat 499  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||  ||        || |||||| | |||  |||| ||||||| ||||||    
T  30928221 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttggaagattttgaggtctttcctttagatggtaaagcaat 30928122  T
Q  500 ggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatcttta 599  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  30928121 ggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacacttaaagtatttagatcctta 30928022  T
Q  600 gtttcctcaatagcagt 616  Q
    | |||||||||||||||    
T  30928021 gcttcctcaatagcagt 30928005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Original strand, 36027499 - 36027634
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  36027499 ctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacact 36027598  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    |||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  36027599 taaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagt 36027634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Original strand, 49516745 - 49516880
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  49516745 ctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacact 49516844  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    |||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  49516845 taaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagt 49516880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 409 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 55746980 - 55746764
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgact------tct---cttttgatggtagagcaat 499  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||    ||||| || ||||      |||   |||| ||||||| ||||||    
T  55746980 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttggaagactttgaggtctttcctttagatggtaaagcaat 55746881  T
Q  500 ggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatcttta 599  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  55746880 ggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttagactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacacttaaagtatttagatcctta 55746781  T
Q  600 gtttcctcaatagcagt 616  Q
    | ||||||||| |||||    
T  55746780 gcttcctcaatggcagt 55746764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 409 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 40456088 - 40455872
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgacttt---------aagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaat 499  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||         |  || |||||| |||||  |||| ||||| | ||||||    
T  40456088 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttagaagattttgaagactttcctttagatggcaaagcaat 40455989  T
Q  500 ggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatcttta 599  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||    
T  40455988 ggatttactcttcttagaggattcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgaactaacaagatcttcaacacttaacgtgtttagatcctta 40455889  T
Q  600 gtttcctcaatagcagt 616  Q
    | |||||||||||||||    
T  40455888 gcttcctcaatagcagt 40455872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 409 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 14712542 - 14712335
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttact 508  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||  | | ||   |||||| ||||||||  |||| |||||||||||||| ||| || |    
T  14712542 gatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttggatgactttcctttagatggtagagcaatagatctatt 14712443  T
Q  509 cttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctca 608  Q
    ||||||  | | |||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| | ||| |||| |||||||    
T  14712442 cttctttaaggattcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacatgatcttcaacacttaaagtgttaagatccttagcttcctca 14712343  T
Q  609 atagcagt 616  Q
    || |||||    
T  14712342 atggcagt 14712335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Original strand, 16265073 - 16265208
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||| | |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  16265073 ctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcacgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacact 16265172  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    |||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  16265173 taaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagt 16265208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 486 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 15195567 - 15195437
Alignment:
Q  486 gatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaag 585  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  15195567 gatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaagatcttcaacactcaaag 15195468  T
Q  586 tgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    |||||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  15195467 tgtttagatccttagcttcctcaatagcagt 15195437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 486 - 616
Target Start/End: Original strand, 27175287 - 27175417
Alignment:
Q  486 gatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaag 585  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27175287 gatggtaaagcaatggatttactcttcttagagatttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacacttaaag 27175386  T
Q  586 tgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    | |||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  27175387 tatttagatccttagcttcctcaatagcagt 27175417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 409 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 27816674 - 27816458
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgacttt-aag--------agcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaat 499  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||  ||        || |||||| | |||  |||| ||||||| ||||||    
T  27816674 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttggaagattttgaagtctttcctttagatggtaaagcaat 27816575  T
Q  500 ggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatcttta 599  Q
    ||||||| |||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  27816574 ggatttattcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaagaagatcttcaacacttaaagtatttagatcctta 27816475  T
Q  600 gtttcctcaatagcagt 616  Q
    | |||||||||||||||    
T  27816474 gcttcctcaatagcagt 27816458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Original strand, 3380710 - 3380845
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||| |  || || ||||| ||||| || ||||| || |||||  | ||||||||||||||||||||    
T  3380710 ctttagatggtagagcaatagatttactccttttagaggactcgtgctcattcagactcatttcatgtaccttgaggaaactgacaagatcttcaacact 3380809  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
     || ||||||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  3380810 caaggtgtttagatccttagcttcctcaatagcagt 3380845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 41 - 103
Target Start/End: Original strand, 34482856 - 34482918
Alignment:
Q  41 tttgttgaaacatctacctcttcatgcagccatgcatcttgttcatgctaagggcgaccattt 103  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34482856 tttgttgaaacatctacttcctcatgcaaccatggatcttgttcatgctaagggtgaccattt 34482918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Original strand, 459690 - 459733
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  459690 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 459733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Original strand, 3380629 - 3380672
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3380629 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 3380672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 14837836 - 14837793
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14837836 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 14837793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 15198532 - 15198489
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15198532 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 15198489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Original strand, 16264992 - 16265035
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16264992 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 16265035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Original strand, 17927226 - 17927269
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17927226 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 17927269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Original strand, 18065102 - 18065145
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18065102 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 18065145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 18131977 - 18131934
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18131977 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 18131934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Original strand, 22005544 - 22005587
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22005544 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 22005587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Original strand, 24649458 - 24649501
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24649458 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 24649501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Original strand, 27175200 - 27175243
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27175200 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 27175243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Original strand, 27665700 - 27665743
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27665700 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 27665743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Original strand, 36027418 - 36027461
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36027418 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 36027461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Original strand, 49516664 - 49516707
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  49516664 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 49516707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 520 - 622
Target Start/End: Original strand, 13694685 - 13694787
Alignment:
Q  520 gttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagtcac 619  Q
    |||| |||| |||||| | ||||||||||  ||| |||||||| | ||||||||||| ||||| |||  ||| |||||||| |||||||||||  |||||    
T  13694685 gttcttgtttattaagccatatctcatgacatttaagagagcttataagatcttcaagacttagagtacttagatctttagcttcctcaatagttgtcac 13694784  T
Q  620 ctt 622  Q
    |||    
T  13694785 ctt 13694787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Original strand, 10299799 - 10299842
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  10299799 gatcttcatcagaatcttcatctggtgattcttcttcaaattca 10299842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 180; Significance: 7e-97; HSPs: 50)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 7e-97
Query Start/End: Original strand, 409 - 624
Target Start/End: Original strand, 15976653 - 15976868
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttact 508  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||    
T  15976653 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagtaatgtatttact 15976752  T
Q  509 cttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctca 608  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15976753 cttcctagaaggtttatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagcttcctca 15976852  T
Q  609 atagcagtcacctttg 624  Q
    ||||||||||||||||    
T  15976853 atagcagtcacctttg 15976868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 7e-97
Query Start/End: Original strand, 409 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 17288001 - 17287786
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttact 508  Q
    |||||||||| | |||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17288001 gatcttcatcaggatcttcatcgggtgattcttcttcatattcaacaactttaagagcttttgatgacttcccttttgatggtagagcaatggatttact 17287902  T
Q  509 cttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctca 608  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17287901 ctttttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagcttcctca 17287802  T
Q  609 atagcagtcacctttg 624  Q
    ||||||||||||||||    
T  17287801 atagcagtcacctttg 17287786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 409 - 613
Target Start/End: Original strand, 17014873 - 17015077
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttact 508  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  17014873 gatcttcatcagaatcttcatcaggtgattcctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatgatagagcaatagatttact 17014972  T
Q  509 cttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctca 608  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17014973 cttcctagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagcttcctca 17015072  T
Q  609 atagc 613  Q
    |||||    
T  17015073 atagc 17015077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 409 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 17542328 - 17542124
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttact 508  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  17542328 gatcttcatcagaatcttcatcaggtgattcctcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatgatagagcaatagatttact 17542229  T
Q  509 cttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctca 608  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17542228 cttcctagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagcttcctca 17542129  T
Q  609 atagc 613  Q
    |||||    
T  17542128 atagc 17542124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 410 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 21603935 - 21603723
Alignment:
Q  410 atcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttactc 509  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||    
T  21603935 atcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatagatttactc 21603836  T
Q  510 ttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctcaa 609  Q
    ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21603835 ttcttagcagactcatgttcattaagacttatctcatggactttgagagagctaacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaa 21603736  T
Q  610 tagcagtcacctt 622  Q
    ||||||| |||||    
T  21603735 tagcagtaacctt 21603723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 409 - 624
Target Start/End: Original strand, 25164582 - 25164797
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttact 508  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  25164582 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagatcaatagatttact 25164681  T
Q  509 cttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctca 608  Q
    ||  |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  25164682 ctctttaacaggttcatgttcattaagacttatttcatgaactttgagagagctgacaagatcttcagcacttaaaatgtttaaatctttagttttctca 25164781  T
Q  609 atagcagtcacctttg 624  Q
    |||||||| |||||||    
T  25164782 atagcagtaacctttg 25164797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 409 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 20257403 - 20257189
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttact 508  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||| | |||| ||||||||    
T  20257403 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcaacaactttaagagtttttgatgaattccctttagatggtatatcaatagatttact 20257304  T
Q  509 cttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctca 608  Q
    |||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20257303 cttcttaccagactcatgttcattaagacttatctcatgaacttttagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagcttcctca 20257204  T
Q  609 atagcagtcaccttt 623  Q
    |||||||||||||||    
T  20257203 atagcagtcaccttt 20257189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 409 - 624
Target Start/End: Original strand, 19940409 - 19940624
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttact 508  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19940409 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattccacaactttaagagcttttgatgacttcccttttgatggtagagcaatggatttgct 19940508  T
Q  509 cttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctca 608  Q
     |||||||  |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  19940509 tttcttagtcgactcatgttcattaagactaatctcatgaactttgagaacgctgacaagatcttcaacacttaaagtgttcaaatctttagcttcctca 19940608  T
Q  609 atagcagtcacctttg 624  Q
    ||| ||||||||||||    
T  19940609 atatcagtcacctttg 19940624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 409 - 624
Target Start/End: Original strand, 22672100 - 22672315
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttact 508  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| |||| || || || | |||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||| ||    
T  22672100 gatcttcatcaaaatccccatcaggtgattcttcttcagattccacaacctttaaagcttttgatgactttcctcttgatggtagagcaatggatttgct 22672199  T
Q  509 cttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctca 608  Q
     ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22672200 tttcttggaagattcatgttcattaatacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcctcaacacttaaagtgtttaaatctttagcttcctca 22672299  T
Q  609 atagcagtcacctttg 624  Q
    ||||||||||||||||    
T  22672300 atagcagtcacctttg 22672315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 409 - 622
Target Start/End: Original strand, 19941542 - 19941755
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttact 508  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19941542 gatcttcatcagagtctccatcaggtgactcttcttcaaatttaataactttaagagattttgatgacttcccttttgatggtagagcaatagatttact 19941641  T
Q  509 cttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctca 608  Q
    ||| |||| | | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19941642 cttgttagcatgctcatgttcatttagacttatctcatgaaccttgaaagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagcttcctca 19941741  T
Q  609 atagcagtcacctt 622  Q
    |||| ||| |||||    
T  19941742 atagtagtaacctt 19941755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 420 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 18152842 - 18152638
Alignment:
Q  420 gaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaag 519  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || || | |||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  18152842 gaatccccatcaggtgattcttcttcagattccacaacctttaaagcttttgatgactttcctcttgatggtagagcaatggatttgcttttcttggaag 18152743  T
Q  520 gttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagtcac 619  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18152742 attcatgttcattaagacttatctcatgaaatttgagagagctcaccagatcctcaacacttagagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagtcac 18152643  T
Q  620 ctttg 624  Q
    |||||    
T  18152642 ctttg 18152638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 409 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 20260666 - 20260483
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttact 508  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| | ||||||    
T  20260666 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcaaaaactttaagagctttagatgacttccctttagatggtagagcaataggtttact 20260567  T
Q  509 cttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaa 592  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20260566 cttcttagcaggttcatgttcattaagacttatctcatgaacgttgagatagttgacaagatcttcaacacttaaagtgcttaa 20260483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 409 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 21047296 - 21047113
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttact 508  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| | ||||||    
T  21047296 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcaaaaactttaagagctttagatgacttccctttagatggtagagcaataggtttact 21047197  T
Q  509 cttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaa 592  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21047196 cttcttagcaggttcatgttcattaagacttatctcatgaacgttgagatagttgacaagatcttcaacacttaaagtgcttaa 21047113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 409 - 616
Target Start/End: Original strand, 19233892 - 19234108
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgacttt---------aagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaat 499  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||         |  || ||||||||||||  |||| ||||||| ||||||    
T  19233892 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttagaagattttgatgactttcctttagatggtaaagcaat 19233991  T
Q  500 ggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatcttta 599  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  19233992 ggatctactcttcttagaggattcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgaactaacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatcctta 19234091  T
Q  600 gtttcctcaatagcagt 616  Q
    | |||||||||||||||    
T  19234092 gcttcctcaatagcagt 19234108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 409 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 13690329 - 13690113
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgacttt-aag--------agcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaat 499  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||  ||        || |||||| | |||  |||| ||||||| ||||||    
T  13690329 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttggaagattttgaggtctttcctttagatggtaaagcaat 13690230  T
Q  500 ggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatcttta 599  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  13690229 ggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttagactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacacttaaagtatttagatcctta 13690130  T
Q  600 gtttcctcaatagcagt 616  Q
    | |||||||||||||||    
T  13690129 gcttcctcaatagcagt 13690113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 509 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 22463197 - 22463084
Alignment:
Q  509 cttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctca 608  Q
    ||||||||  || ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  22463197 cttcttagttggctcatgttcatttaggcttatctcatgaaccttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagagtttaaatttttagcttcctca 22463098  T
Q  609 atagcagtcacctt 622  Q
    |||||||| |||||    
T  22463097 atagcagtaacctt 22463084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 409 - 616
Target Start/End: Original strand, 19427436 - 19427652
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttt---------tgatgacttctcttttgatggtagagcaat 499  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||    |||||         ||| |||||  |||| ||||||| ||||||    
T  19427436 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcattggctttgtaggctttggaagatcttgaagactttcctttagatggtaaagcaat 19427535  T
Q  500 ggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatcttta 599  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  19427536 ggatttactcttcttagaggattcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgaactaacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatcctta 19427635  T
Q  600 gtttcctcaatagcagt 616  Q
    | |||||||||||||||    
T  19427636 gcttcctcaatagcagt 19427652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 409 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 3350394 - 3350178
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgact------tct---cttttgatggtagagcaat 499  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||    ||||| || ||||      |||   |||| ||||||| ||||||    
T  3350394 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttggaagactttgaggtctttcctttagatggtaaagcaat 3350295  T
Q  500 ggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatcttta 599  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  3350294 ggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacacttaaagtatttagatcctta 3350195  T
Q  600 gtttcctcaatagcagt 616  Q
    | |||||||||||||||    
T  3350194 gcttcctcaatagcagt 3350178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 409 - 616
Target Start/End: Original strand, 3842052 - 3842259
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttact 508  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||  | | ||   |||||| || |||||  |||| |||||||||||||| ||| || |    
T  3842052 gatcttcatcagaatctccatctggtgactcttcttcagattcactggccttgtaagctttggaagactttcctttagatggtagagcaatagatctatt 3842151  T
Q  509 cttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctca 608  Q
    ||||||||| | |||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| |||||||    
T  3842152 cttcttagaggattcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaagatcttcaacactcaaagtgtttagatccttagcttcctca 3842251  T
Q  609 atagcagt 616  Q
    || |||||    
T  3842252 atggcagt 3842259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Original strand, 9366889 - 9367024
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  9366889 ctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacact 9366988  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    |||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  9366989 taaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagt 9367024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Original strand, 26119505 - 26119640
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  26119505 ctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacact 26119604  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    |||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  26119605 taaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagt 26119640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Original strand, 29085586 - 29085721
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  29085586 ctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacact 29085685  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    |||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  29085686 taaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagt 29085721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 32079374 - 32079239
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  32079374 ctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacact 32079275  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    |||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  32079274 taaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagt 32079239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Original strand, 36087117 - 36087252
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  36087117 ctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacact 36087216  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    |||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  36087217 taaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagt 36087252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Original strand, 36302121 - 36302256
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  36302121 ctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacact 36302220  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    |||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  36302221 taaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagt 36302256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Original strand, 44490309 - 44490444
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  44490309 ctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacact 44490408  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    |||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  44490409 taaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagt 44490444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 409 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 15782470 - 15782254
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgacttt-aag--------agcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaat 499  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||  ||        || |||||| | |||  |||| ||||||| ||||||    
T  15782470 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttggaagattttgaggtctttcctttagatggtaaagcaat 15782371  T
Q  500 ggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatcttta 599  Q
    ||||||||||||||||||   |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  15782370 ggatttactcttcttagagatttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacacttaaagtatttagatcctta 15782271  T
Q  600 gtttcctcaatagcagt 616  Q
    | |||||||||||||||    
T  15782270 gcttcctcaatagcagt 15782254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Original strand, 19137875 - 19138010
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  19137875 ctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacact 19137974  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    ||| || |||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  19137975 taacgtatttagatccttagcttcctcaatagcagt 19138010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Original strand, 29075335 - 29075470
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  29075335 ctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacact 29075434  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    | |||| |||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  29075435 tcaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagt 29075470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 409 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 30316484 - 30316268
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgacttt-aag--------agcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaat 499  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||  ||        || |||||| | |||  |||| ||||||| ||||||    
T  30316484 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttggaagattttgaagtctttcctttagatggtaaagcaat 30316385  T
Q  500 ggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatcttta 599  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||  |||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  30316384 ggatttactcttcttagaggtttcatgcacatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacacttaaagtatttagatcctta 30316285  T
Q  600 gtttcctcaatagcagt 616  Q
    | |||||||||||||||    
T  30316284 gcttcctcaatagcagt 30316268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 409 - 610
Target Start/End: Original strand, 23791755 - 23791956
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttact 508  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||  | | ||   ||| || || |||||  |||| |||||||||||||| ||| || |    
T  23791755 gatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagcattggaagactttcctttagatggtagagcaatagatctatt 23791854  T
Q  509 cttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctca 608  Q
    ||||||||| | |||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||| |||||||    
T  23791855 cttcttagaggattcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaagatcctcaacactcaaagtgtttagatccttagcttcctca 23791954  T
Q  609 at 610  Q
    ||    
T  23791955 at 23791956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Original strand, 251003 - 251138
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| | | |||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  251003 ctttagatggtaaagcaacggatttactcttcttagaggttccatgctcatttagactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacact 251102  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    || ||| |||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  251103 tagagtatttagatccttagcttcctcaatagcagt 251138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Original strand, 814104 - 814239
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| | | |||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  814104 ctttagatggtaaagcaacggatttactcttcttagaggttccatgctcatttagactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacact 814203  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    || ||| |||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  814204 tagagtatttagatccttagcttcctcaatagcagt 814239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 409 - 622
Target Start/End: Original strand, 21297246 - 21297459
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttact 508  Q
    |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||    | ||    ||||| ||||||||  |||| |||||||||||||| |||||| |    
T  21297246 gatcttgatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactagccttgtatgctttagatgactttcctttagatggtagagcaatagatttatt 21297345  T
Q  509 cttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctca 608  Q
    |||| | || |  ||||| ||||| || || || |||||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| |||||||    
T  21297346 cttccttgaggactcatgctcattcaggctcatttcatgaaccttgagggaactaacaagatcttcaacactcaaagtgtttagatccttagcttcctca 21297445  T
Q  609 atagcagtcacctt 622  Q
    || |||||||||||    
T  21297446 atggcagtcacctt 21297459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Original strand, 16745596 - 16745731
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||| |  ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  16745596 ctttagatggtagagcaatagatttactccttttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaagatcttcaacact 16745695  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
     |||||||||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  16745696 caaagtgtttagatccttagcttcctcaatagcagt 16745731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 409 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 22149355 - 22149148
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttact 508  Q
    |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||  |   ||   |||||| || |||||  |||| |||||||||||||| ||| || |    
T  22149355 gatcttcattagaatctccatctggtgactcttcttcagattcactggtcttgtaagctttggaagactttcctttagatggtagagcaatagatatatt 22149256  T
Q  509 cttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctca 608  Q
    ||||||||| | |||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||| |||| ||    
T  22149255 cttcttagaggattcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaagatcttcaacactcaaggtgtttagatccttagcttccaca 22149156  T
Q  609 atagcagt 616  Q
    || |||||    
T  22149155 atggcagt 22149148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 481 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 45569712 - 45569571
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| ||||||| || |  ||||| ||||| || || || |||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  45569712 ctttagatggtagagcaatagatttattcttctttgaggactcatgctcattcaggctcatttcatgaaccttgagggaactgacaaaatcttcaacact 45569613  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagtcacctt 622  Q
     || ||||||| ||| |||| ||| ||||| ||||| |||||    
T  45569612 caatgtgtttagatccttagcttcttcaatggcagtaacctt 45569571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Original strand, 250922 - 250965
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  250922 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 250965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Original strand, 814023 - 814066
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  814023 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 814066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Original strand, 9366808 - 9366851
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9366808 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 9366851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Original strand, 16745515 - 16745558
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16745515 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 16745558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Original strand, 19137794 - 19137837
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19137794 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 19137837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Original strand, 26119424 - 26119467
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26119424 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 26119467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Original strand, 29075254 - 29075297
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29075254 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 29075297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Original strand, 29085505 - 29085548
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29085505 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 29085548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 32079455 - 32079412
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32079455 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 32079412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Original strand, 36087036 - 36087079
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36087036 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 36087079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Original strand, 44490228 - 44490271
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44490228 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 44490271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 539 - 622
Target Start/End: Original strand, 24666877 - 24666960
Alignment:
Q  539 tatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagtcacctt 622  Q
    ||||||||||  |||||||||||| | |  |||||||||||||| ||| |||| || ||||| |||||||||||  ||||||||    
T  24666877 tatctcatgacatttgagagagcttataccatcttcaacacttagagtatttagatttttagcttcctcaatagatgtcacctt 24666960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Original strand, 36302040 - 36302083
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  36302040 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttgttcagattca 36302083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 180; Significance: 7e-97; HSPs: 84)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 7e-97
Query Start/End: Original strand, 409 - 624
Target Start/End: Original strand, 2559512 - 2559727
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttact 508  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  2559512 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcaacaactttaagagtttttgatgacttcccttttgatggtagagcaatgaatttact 2559611  T
Q  509 cttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctca 608  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  2559612 cttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagttgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatcattagcttcctca 2559711  T
Q  609 atagcagtcacctttg 624  Q
    ||||||||||||||||    
T  2559712 atagcagtcacctttg 2559727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 409 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 18123494 - 18123279
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttact 508  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18123494 gatcttcatcagaatctccatcagatgattcttcttcagattcaataactttaagagcttttgatgacttcccttttgatggtagagcaatagatttact 18123395  T
Q  509 cttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctca 608  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18123394 cttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagttaacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagcttcctca 18123295  T
Q  609 atagcagtcacctttg 624  Q
    ||||||||||||||||    
T  18123294 atagcagtcacctttg 18123279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 409 - 622
Target Start/End: Original strand, 16029328 - 16029541
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttact 508  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  16029328 gatcttcatcagaatctccatcaggtgactcttcttcagattcaataactttaagcgcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttact 16029427  T
Q  509 cttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctca 608  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  16029428 cttcttagcaggttcatgttcatttagacttacctcatgaatcttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagcttcatca 16029527  T
Q  609 atagcagtcacctt 622  Q
    |||||||| |||||    
T  16029528 atagcagtaacctt 16029541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 409 - 624
Target Start/End: Original strand, 11188313 - 11188528
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttact 508  Q
    ||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||    
T  11188313 gatcttcttcagaatcttcatcatgtgattcttcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatgaatttact 11188412  T
Q  509 cttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctca 608  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||    
T  11188413 cttcttagaaggttcatattcattaaaacttatctcataaactttgagagagctatcaagatcttcaacatttgaagtgtttaaatctttagcttcctca 11188512  T
Q  609 atagcagtcacctttg 624  Q
    ||||||||||||||||    
T  11188513 atagcagtcacctttg 11188528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 409 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 14908513 - 14908303
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttact 508  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    |||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  14908513 gatcttcatctgaatctccatcaggtgaatcttcttcagattcaaca---ttaagagcttttgaagacttccctttagatggtagagcaattgatttact 14908417  T
Q  509 cttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctca 608  Q
    |||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  14908416 cttcttagcagaatcatgttcatttagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgttaaaatctttagcttcctca 14908317  T
Q  609 atagcagtcacctt 622  Q
    |||||||| |||||    
T  14908316 atagcagtaacctt 14908303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 409 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 17245028 - 17244813
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttact 508  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||  |||||||    
T  17245028 gatcttcatcagaatctccattaggtgattcttctttagattcaacaactttaagagtttttgatgacttccctttagatggtagaacaataaatttact 17244929  T
Q  509 cttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctca 608  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  17244928 cttcttagcaggctcatgttcattaagacttatctcatgaacttttagagagcttacaagatcttcaacacgtaaagtgtttaaatctttagcttcctca 17244829  T
Q  609 atagcagtcacctttg 624  Q
    ||| |||| |||||||    
T  17244828 ataacagtaacctttg 17244813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 435 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 19886897 - 19886712
Alignment:
Q  435 gattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaa 534  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| |   |||||||||||||    
T  19886897 gattcttcttaagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaat--atttactcttcttagcatactcatgttcattaa 19886800  T
Q  535 gacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagtcacctt 622  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||    
T  19886799 gacttatctcatgaactttgagagagctgacaatatcttcaacacttgaagtgtttaaatctctaggttcctcaatagcagtaacctt 19886712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 414 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 14079153 - 14078951
Alignment:
Q  414 tcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttactcttct 513  Q
    ||||| || |||||||| ||  ||||||||| | | |||| |||||| |||||||||||  ||||  |||| |||||||||||||| |||||| ||||||    
T  14079153 tcatcagagtctccatctgggaattcttctttagactcaatgactttgagagcttttgagaactttcctttagatggtagagcaatagatttagtcttct 14079054  T
Q  514 tagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagc 613  Q
    ||| ||  ||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  14079053 tagcagaatcatgctcattaagactaatcttatgaaccttgagagagctcataagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaataac 14078954  T
Q  614 agt 616  Q
    |||    
T  14078953 agt 14078951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 409 - 619
Target Start/End: Original strand, 17016297 - 17016507
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttact 508  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||  | | ||   |||||| || |||||  |||| |||||||||||||| ||| ||||    
T  17016297 gatcttcatcagaatctccatctggtgaatcttcttcagattcactggccttgtaagctttggaagactttcctttagatggtagagcaatagatctact 17016396  T
Q  509 cttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctca 608  Q
    |||||| || | |||||| ||||| ||||| || ||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  17016397 cttctttgaggattcatgctcattcagactcatttcatgaactctgagggaactgacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctca 17016496  T
Q  609 atagcagtcac 619  Q
    || ||||||||    
T  17016497 atggcagtcac 17016507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 409 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 16397744 - 16397528
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacg---------actttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaat 499  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  |         ||||||  || |||||| | |||  |||| ||||||| ||||||    
T  16397744 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtagactttagaagattttgaagtctttcctttagatggtaaagcaat 16397645  T
Q  500 ggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatcttta 599  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  16397644 ggatttactcttcttagaggattcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatcctta 16397545  T
Q  600 gtttcctcaatagcagt 616  Q
    | |||||||||||||||    
T  16397544 gcttcctcaatagcagt 16397528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 536 - 624
Target Start/End: Original strand, 5211122 - 5211210
Alignment:
Q  536 acttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagtcacctttg 624  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5211122 acttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcctcagcacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagcagtcacctttg 5211210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 409 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 9382388 - 9382172
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatga---------cttctcttttgatggtagagcaat 499  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  | | |||  |||||| || ||         |||| |||| ||||||||||||||    
T  9382388 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggccttataagctttagaagatttggaggacttccctttagatggtagagcaat 9382289  T
Q  500 ggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatcttta 599  Q
     ||||||||||||||||| |  ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  9382288 agatttactcttcttagaggactcatgctcatttagactcatttcatgcactttgaggaaactgacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatcctta 9382189  T
Q  600 gtttcctcaatagcagt 616  Q
    | |||||||||||||||    
T  9382188 gcttcctcaatagcagt 9382172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 409 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 9983612 - 9983396
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaac---------gactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaat 499  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||           | |||||  || |||||| | |||  |||| ||||||| ||||||    
T  9983612 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactagctttataggctttagaagattttgaagtctttcctttagatggtaaagcaat 9983513  T
Q  500 ggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatcttta 599  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  9983512 ggatttactcttcttagaggattcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatcatta 9983413  T
Q  600 gtttcctcaatagcagt 616  Q
    | |||||||||||||||    
T  9983412 gcttcctcaatagcagt 9983396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 409 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 10628672 - 10628456
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatga---------cttctcttttgatggtagagcaat 499  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||    |||||||| ||         |||  |||| ||||||| ||||||    
T  10628672 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggcttttgaagattttgaagtctttcctttagatggtaaagcaat 10628573  T
Q  500 ggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatcttta 599  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  10628572 ggatttactcttcttagaggattcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatcctta 10628473  T
Q  600 gtttcctcaatagcagt 616  Q
    | |||||||||||||||    
T  10628472 gcttcctcaatagcagt 10628456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 409 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 6183690 - 6183474
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgacttt-aag--------agcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaat 499  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||  ||        || |||||| | |||  |||| ||||||| ||||||    
T  6183690 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttggaagattttgaagtctttcctttagatggtaaagcaat 6183591  T
Q  500 ggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatcttta 599  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  6183590 ggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacacttaaagtatttaaatcctta 6183491  T
Q  600 gtttcctcaatagcagt 616  Q
    | |||||||||||||||    
T  6183490 gcttcctcaatagcagt 6183474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 409 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 11274109 - 11273893
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgacttt-aag--------agcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaat 499  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||  ||        || |||||| | |||  |||| ||||||| ||||||    
T  11274109 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttggaagattttgaggtctttcctttagatggtaaagcaat 11274010  T
Q  500 ggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatcttta 599  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  11274009 ggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttagactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacacttaaagtatttagatcctta 11273910  T
Q  600 gtttcctcaatagcagt 616  Q
    | |||||||||||||||    
T  11273909 gcttcctcaatagcagt 11273893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 409 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 13374392 - 13374176
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgacttt-aag--------agcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaat 499  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||  ||        || |||||| | |||  |||| ||||||| ||||||    
T  13374392 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttggaagattttgaggtctttcctttagatggtaaagcaat 13374293  T
Q  500 ggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatcttta 599  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  13374292 ggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacacttaaagtatttagatcttta 13374193  T
Q  600 gtttcctcaatagcagt 616  Q
    | |||||||||||||||    
T  13374192 gcttcctcaatagcagt 13374176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 409 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 13384986 - 13384770
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgacttt-aag--------agcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaat 499  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||  ||        || |||||| | |||  |||| ||||||| ||||||    
T  13384986 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttggaagattttgaggtctttcctttagatggtaaagcaat 13384887  T
Q  500 ggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatcttta 599  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  13384886 ggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacacttaaagtatttagatcttta 13384787  T
Q  600 gtttcctcaatagcagt 616  Q
    | |||||||||||||||    
T  13384786 gcttcctcaatagcagt 13384770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 28315881 - 28315746
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  28315881 ctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttagactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacact 28315782  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    |||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  28315781 taaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagt 28315746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 409 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 29935278 - 29935071
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttact 508  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  | | ||   |||||| || |||||  |||| |||||||||||||| ||| || |    
T  29935278 gatcttcatcaaaatctccatcaggtgattcttcttcagattcattggccttgtaagctttggaagactttcctttagatggtagagcaatagatctatt 29935179  T
Q  509 cttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctca 608  Q
    ||||||||| | |||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| |||||||    
T  29935178 cttcttagaggattcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaagatcttcaacactcaaagtgtttagatccttagcttcctca 29935079  T
Q  609 atagcagt 616  Q
    || |||||    
T  29935078 atggcagt 29935071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 409 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 29984432 - 29984225
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttact 508  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  | | ||   |||||| || |||||  |||| |||||||||||||| ||| || |    
T  29984432 gatcttcatcaaaatctccatcaggtgattcttcttcagattcattggccttgtaagctttggaagactttcctttagatggtagagcaatagatctatt 29984333  T
Q  509 cttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctca 608  Q
    ||||||||| | |||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| |||||||    
T  29984332 cttcttagaggattcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaagatcttcaacactcaaagtgtttagatccttagcttcctca 29984233  T
Q  609 atagcagt 616  Q
    || |||||    
T  29984232 atggcagt 29984225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Original strand, 38203846 - 38203981
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  38203846 ctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttagactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacact 38203945  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    |||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  38203946 taaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagt 38203981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Original strand, 4752913 - 4753048
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  4752913 ctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacact 4753012  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    |||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  4753013 taaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagt 4753048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 5538664 - 5538529
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  5538664 ctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacact 5538565  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    |||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  5538564 taaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagt 5538529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 5581276 - 5581141
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  5581276 ctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacact 5581177  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    |||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  5581176 taaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagt 5581141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 5867339 - 5867204
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  5867339 ctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacact 5867240  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    |||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  5867239 taaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagt 5867204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 6491989 - 6491854
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  6491989 ctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggattcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcctcaacact 6491890  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  6491889 taaagtgtttagatccttagcttcctcaatagcagt 6491854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Original strand, 8783857 - 8783992
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  8783857 ctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttagactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacact 8783956  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    |||||| |||| ||| |||| ||||||||| |||||    
T  8783957 taaagtatttagatccttagcttcctcaatggcagt 8783992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 8997594 - 8997459
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| | |||||| ||||||||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  8997594 ctttagatggtagagcaatagatttattcttcttagaggattcatgctcattaagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaagatcttcaacact 8997495  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||||||| |||||    
T  8997494 taaagtgtttagatccttagcttcctcaatggcagt 8997459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Original strand, 14474815 - 14474950
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  14474815 ctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacact 14474914  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    |||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  14474915 taaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagt 14474950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 16392691 - 16392556
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  16392691 ctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacact 16392592  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    |||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  16392591 taaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagt 16392556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Original strand, 19787616 - 19787751
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  19787616 ctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacact 19787715  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    |||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  19787716 taaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagt 19787751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Original strand, 24669064 - 24669199
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  24669064 ctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacact 24669163  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    |||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  24669164 taaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagt 24669199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 29462861 - 29462726
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  29462861 ctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacact 29462762  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    |||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  29462761 taaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagt 29462726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Original strand, 39381278 - 39381413
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  39381278 ctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacact 39381377  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    |||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  39381378 taaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagt 39381413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Original strand, 41692843 - 41692978
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  41692843 ctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacact 41692942  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    |||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  41692943 taaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagt 41692978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 409 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 12288704 - 12288488
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaac---------gactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaat 499  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||           | |||||  || |||||| | |||  |||| ||||||| ||||||    
T  12288704 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactagctttataggctttagaagattttgaagtctttcctttagatggtaaagcaat 12288605  T
Q  500 ggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatcttta 599  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| || || | ||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||    
T  12288604 ggatttactcttcttagaggattcatgctcgtttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcctcaacacttaaagtgtttagatcctta 12288505  T
Q  600 gtttcctcaatagcagt 616  Q
    | |||||||||||||||    
T  12288504 gcttcctcaatagcagt 12288488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 409 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 505894 - 505678
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgact------tct---cttttgatggtagagcaat 499  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||    ||||| || ||||      |||   |||| ||||||| ||||||    
T  505894 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttggaagactttgaggtctttcctttagatggtaaagcaat 505795  T
Q  500 ggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatcttta 599  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  505794 ggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttaagtgagctaacaagatcttcaacacttaaagtatttagatcctta 505695  T
Q  600 gtttcctcaatagcagt 616  Q
    | |||||||||||||||    
T  505694 gcttcctcaatagcagt 505678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Original strand, 5519462 - 5519597
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  5519462 ctttagatggtaaagcaacggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttagactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacact 5519561  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    || ||| |||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  5519562 tagagtatttagatccttagcttcctcaatagcagt 5519597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 11207738 - 11207603
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |  ||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  11207738 ctttagatggtagaacaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgcactttgagggaactgacaagatcttcaacact 11207639  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
     |||||||||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  11207638 caaagtgtttagatccttagcttcctcaatagcagt 11207603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 12239261 - 12239126
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||  ||||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  12239261 ctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggattcatgctcatttaaactcatttcatatactttgagtaagctaacaagatcttcaacact 12239162  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  12239161 taaagtgtttagatccttagcttcctcaatagcagt 12239126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Original strand, 13130864 - 13130999
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  13130864 ctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacact 13130963  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    |||||| |||| ||| |||| ||||| |||||||||    
T  13130964 taaagtatttagatccttagcttccttaatagcagt 13130999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 409 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 20674921 - 20674705
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgacttt-aag--------agcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaat 499  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||  ||        || |||||| | |||  |||| ||||||| ||||||    
T  20674921 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttggaagattttgaggtctttcctttagatggtaaagcaat 20674822  T
Q  500 ggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatcttta 599  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  20674821 ggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgaactaacaagatcttcaacacttaaagtatttagatcctta 20674722  T
Q  600 gtttcctcaatagcagt 616  Q
    | |||||||||||||||    
T  20674721 gcttcctcaatagcagt 20674705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Original strand, 23766488 - 23766623
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  23766488 ctttagatggtaaagcgatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacact 23766587  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    |||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  23766588 taaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagt 23766623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 409 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 24385242 - 24385026
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgact------tct---cttttgatggtagagcaat 499  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||    ||||| || ||||      |||   |||| ||||||| ||||||    
T  24385242 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttggaagactttgaggtctttcctttagatggtaaagcaat 24385143  T
Q  500 ggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatcttta 599  Q
    |||||||||||||||||| | |||| | ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  24385142 ggatttactcttcttagaggtttcaagctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacacttaaagtatttagatcctta 24385043  T
Q  600 gtttcctcaatagcagt 616  Q
    | |||||||||||||||    
T  24385042 gcttcctcaatagcagt 24385026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 538 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 53058433 - 53058347
Alignment:
Q  538 ttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagtcacctttg 624  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  53058433 ttatctcatgaactttgagagagctgacaagattttcaacactcaaagtttttaaatctttagcttcctcaatagcagttacctttg 53058347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 7796264 - 7796129
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  7796264 ctttagatggtagagcaatagatttactcttgttagaggtctcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgaactgacaagatcttcaacact 7796165  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||||||| |||||    
T  7796164 taaagtgtttagatccttagcttcctcaatggcagt 7796129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 13263316 - 13263181
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  13263316 ctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggatttgacaagatcttcaacact 13263217  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||||||| |||||    
T  13263216 taaagtgtttagatccttagcttcctcaatggcagt 13263181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 14313055 - 14312920
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||| ||||| ||||| || ||||| |  ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  14313055 ctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcatttagactcatttcatgtatcttgagggaactgacaagatcttcaacact 14312956  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||||||| |||||    
T  14312955 taaagtgtttagatccttagcttcctcaatggcagt 14312920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Original strand, 37875655 - 37875790
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || |||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  37875655 ctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgccctttgagtgagctaacaagatcttcaacact 37875754  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    |||||| |||| ||| |||| ||||||||| |||||    
T  37875755 taaagtatttagatccttagcttcctcaatggcagt 37875790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Original strand, 37884173 - 37884308
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || |||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  37884173 ctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgccctttgagtgagctaacaagatcttcaacact 37884272  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    |||||| |||| ||| |||| ||||||||| |||||    
T  37884273 taaagtatttagatccttagcttcctcaatggcagt 37884308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 409 - 616
Target Start/End: Original strand, 1062657 - 1062864
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttact 508  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| |||||  | | ||   |||||| || |||||  |||| |||||||||||||| ||| || |    
T  1062657 gatcttcatcagattctccatctggtgactcttcttcagattcactggccttgtaagctttggaagactttcctttagatggtagagcaatagatctatt 1062756  T
Q  509 cttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctca 608  Q
    ||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||| |||||||    
T  1062757 cttcttagaggattcatgctcattcatactcatttcatgtaccttgagggaactgacaagatcttcaacactcaaggtgtttagatccttagcttcctca 1062856  T
Q  609 atagcagt 616  Q
    || |||||    
T  1062857 atggcagt 1062864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 1785720 - 1785585
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||| |  ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  1785720 ctttagatggtagagcaatagatttactccttttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaagatcttcaacact 1785621  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
     |||||||||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  1785620 caaagtgtttagatccttagcttcctcaatagcagt 1785585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Original strand, 4432354 - 4432489
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||| |  ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  4432354 ctttagatggtagagcaatagatttactccttttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaagatcttcaacact 4432453  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
     |||||||||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  4432454 caaagtgtttagatccttagcttcctcaatagcagt 4432489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 481 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 12754428 - 12754290
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| ||||||| || |  ||||| ||||| || || || |||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  12754428 ctttagatggtagagcaatagatttattcttctttgaggactcatgctcattcaggctcatttcatgaaccttgagggaattgacaagatcttcaacact 12754329  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagtcac 619  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  12754328 taaagtgtttagatccttagcttcctcaatggcagtcac 12754290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 464 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 15652769 - 15652623
Alignment:
Q  464 agcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctg 563  Q
    |||||| || |||||  |||| |||||||||||||| ||| || |||||||||| | |||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||    
T  15652769 agctttggaagactttcctttagatggtagagcaatagatctattcttcttagaggattcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactg 15652670  T
Q  564 acaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctcaat 610  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| |||||||||    
T  15652669 ataagatcttcaacactcaaagtgtttagatccttagcttcctcaat 15652623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 481 - 619
Target Start/End: Original strand, 15847488 - 15847626
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| ||||||  || |  ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || || |||||||||||||||||    
T  15847488 ctttagatggtagagcaatagatttattcttctatgaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaacttacaagatcttcaacact 15847587  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagtcac 619  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  15847588 taaagtgtttagatccttagcttcctcaatggcagtcac 15847626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 409 - 476
Target Start/End: Original strand, 5211053 - 5211120
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgac 476  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||    
T  5211053 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattccacaactttaagagctttcgatgac 5211120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 540 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 16306712 - 16306630
Alignment:
Q  540 atctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagtcacctt 622  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||| ||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  16306712 atctcatgacatttgagagagctgataagatcttcaacacttatagtacttagatccttagcttcctcaatagcagtctcctt 16306630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Original strand, 4432273 - 4432316
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4432273 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 4432316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Original strand, 4752832 - 4752875
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4752832 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 4752875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Original strand, 5519381 - 5519424
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5519381 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 5519424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 5538745 - 5538702
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5538745 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 5538702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 5581357 - 5581314
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5581357 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 5581314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 5867420 - 5867377
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5867420 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 5867377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Original strand, 8783776 - 8783819
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8783776 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 8783819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Original strand, 13130783 - 13130826
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13130783 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 13130826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Original strand, 14474734 - 14474777
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14474734 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 14474777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 16392772 - 16392729
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16392772 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 16392729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Original strand, 19787535 - 19787578
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19787535 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 19787578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Original strand, 24668983 - 24669026
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24668983 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 24669026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Original strand, 37875574 - 37875617
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37875574 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 37875617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Original strand, 37884092 - 37884135
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37884092 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 37884135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Original strand, 38203765 - 38203808
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38203765 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 38203808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Original strand, 39381197 - 39381240
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39381197 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 39381240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Original strand, 41692762 - 41692805
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41692762 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 41692805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 522 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 18696624 - 18696534
Alignment:
Q  522 tcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctcaatag 612  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |  | || ||||||||| | |||||||||||  |||| |||||||||||    
T  18696624 tcatgctcattaaaactaatctcatgaaccttgagagagcttatgaaatattcaacactcagagtgtttaaattcttagcttcctcaatag 18696534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 7796345 - 7796302
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7796345 gatcttcatcagattctccatcaggtgattcttcttcagattca 7796302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 8997675 - 8997632
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  8997675 gatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattca 8997632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 11207819 - 11207776
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  11207819 gatcttcatcagaatcttcatcaggtgattcttcttcagattca 11207776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 12239342 - 12239299
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  12239342 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcatcttcagattca 12239299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 13263397 - 13263354
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13263397 gatcttcatcataatctccatcaggtgattcttcttcagattca 13263354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Original strand, 23766407 - 23766450
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23766407 gatcttcattagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 23766450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 28315962 - 28315919
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  28315962 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttctacagattca 28315919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 176; Significance: 2e-94; HSPs: 53)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 409 - 620
Target Start/End: Original strand, 13878454 - 13878665
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttact 508  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  13878454 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttact 13878553  T
Q  509 cttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctca 608  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  13878554 cttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagatgacaagttcttcaacacttaatgtgtttaaatctttagcttcctca 13878653  T
Q  609 atagcagtcacc 620  Q
    |||| |||||||    
T  13878654 atagtagtcacc 13878665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 7e-94
Query Start/End: Original strand, 409 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 16547842 - 16547628
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttact 508  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16547842 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttcccttttgatggtagagcaatggatttact 16547743  T
Q  509 cttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctca 608  Q
    ||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16547742 ctttttggaaggttcatgtccattaagacttagctcatgaactttaagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagcttcctca 16547643  T
Q  609 atagcagtcaccttt 623  Q
    |||||||||||||||    
T  16547642 atagcagtcaccttt 16547628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 175; E-Value: 7e-94
Query Start/End: Original strand, 409 - 623
Target Start/End: Original strand, 16617820 - 16618034
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttact 508  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16617820 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttcccttttgatggtagagcaatggatttact 16617919  T
Q  509 cttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctca 608  Q
    ||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16617920 ctttttggaaggttcatgtccattaagacttagctcatgaactttaagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagcttcctca 16618019  T
Q  609 atagcagtcaccttt 623  Q
    |||||||||||||||    
T  16618020 atagcagtcaccttt 16618034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 409 - 624
Target Start/End: Original strand, 13680658 - 13680873
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttact 508  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||| |    
T  13680658 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagtaatggatttaat 13680757  T
Q  509 cttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctca 608  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  13680758 cttcctagaaggttcatgttcattaagacatatctcgtgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatatttagcttcctca 13680857  T
Q  609 atagcagtcacctttg 624  Q
    ||||||||||||||||    
T  13680858 atagcagtcacctttg 13680873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 409 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 13174059 - 13173846
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttact 508  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| || |||||    
T  13174059 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagattgtagagcaatagagttact 13173960  T
Q  509 cttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctca 608  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13173959 cttcttagcaggctcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagcttcctca 13173860  T
Q  609 atagcagtcacctt 622  Q
    ||| |||| |||||    
T  13173859 ataacagtaacctt 13173846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 409 - 624
Target Start/End: Original strand, 14171975 - 14172190
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttact 508  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  14171975 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagactcaacaactttaagaacttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttact 14172074  T
Q  509 cttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctca 608  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  14172075 cttcttagacgattcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcctcaacacttaaagtgttaaaatctttagcttcctca 14172174  T
Q  609 atagcagtcacctttg 624  Q
    |||| |||||||||||    
T  14172175 atagtagtcacctttg 14172190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 419 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 13028762 - 13028559
Alignment:
Q  419 ggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaa 518  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||| |    
T  13028762 ggaatctccatcaagtgattcttcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagtgcaatagatttactcttcctagca 13028663  T
Q  519 ggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagtca 618  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  13028662 ggctcatgttcattgagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctcgatagcagtaa 13028563  T
Q  619 cctt 622  Q
    ||||    
T  13028562 cctt 13028559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 409 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 16311823 - 16311609
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttact 508  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  16311823 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgaattccctttagatggtagagcaatagatttact 16311724  T
Q  509 cttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctca 608  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16311723 cttcttagtaggctcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagaattgac-agatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagcttcctca 16311625  T
Q  609 atagcagtcacctttg 624  Q
    || ||||| |||||||    
T  16311624 atggcagtaacctttg 16311609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 409 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 16669993 - 16669765
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttact 508  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||  |    
T  16669993 gatcttcatcagaatctccatcaagtgattcttcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggcagagcaatagatttgtt 16669894  T
Q  509 cttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatga---------------actttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaa 593  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |               || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16669893 cttcttagcaggctcatgttcatttagacttatctcataaaccttgagagagttgaccttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaa 16669794  T
Q  594 tctttagtttcctcaatagcagtcacctt 622  Q
    ||||||  |||||||||||| || |||||    
T  16669793 tctttaacttcctcaatagcggtaacctt 16669765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 409 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 17644361 - 17644133
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttact 508  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||  |    
T  17644361 gatcttcatcagaatctccatcaagtgattcttcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggcagagcaatagatttgtt 17644262  T
Q  509 cttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatga---------------actttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaa 593  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |               || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17644261 cttcttagcaggctcatgttcatttagacttatctcataaaccttgagagagttgaccttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaa 17644162  T
Q  594 tctttagtttcctcaatagcagtcacctt 622  Q
    ||||||  |||||||||||| || |||||    
T  17644161 tctttaacttcctcaatagcggtaacctt 17644133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 409 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 4413821 - 4413597
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgactt------ctct---tttgatggtagagcaat 499  Q
    |||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| |||| ||||| || |  |||||||| |||||      || |   || ||||| ||||||||    
T  4413821 gatcttcatcagaatctccatcaagtaattcttcttcagattccacgaccttcaatgcttttgaagactttgaagactttcccttagatggaagagcaat 4413722  T
Q  500 ggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatcttta 599  Q
    |||||| || |||||   || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4413721 ggatttgcttttcttgacagattcatgttcattgagactaatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacactcaaagtgtttaaatcttta 4413622  T
Q  600 gtttcctcaatagcagtcacctttg 624  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  4413621 gcttcctcaatagcagtcacctttg 4413597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 409 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 13176291 - 13176082
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttact 508  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||  | | ||   |||||| ||||||||  |||| ||| |||||||||| ||| ||||    
T  13176291 gatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttggatgactttcctttagattgtagagcaatagatctact 13176192  T
Q  509 cttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctca 608  Q
    |||||| || | |||||| ||||| | ||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||    
T  13176191 cttctttgaggattcatgctcattcaaactcatttcatgaactttgagggaactgacaagatcttcaacactt-aagtgtttagatccttagcttcctca 13176093  T
Q  609 atagcagtcac 619  Q
    || ||||||||    
T  13176092 atggcagtcac 13176082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 409 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 6869038 - 6868822
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgacttt-aag--------agcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaat 499  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||  ||        || |||||| | |||  |||| ||||||||||||||    
T  6869038 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttggaagattttgaagtctttcctttagatggtagagcaat 6868939  T
Q  500 ggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatcttta 599  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  6868938 ggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacacttaaagtatttagatcctta 6868839  T
Q  600 gtttcctcaatagcagt 616  Q
    | |||||||||||||||    
T  6868838 gcttcctcaatagcagt 6868822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Original strand, 11014364 - 11014499
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  11014364 ctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttagactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacact 11014463  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    |||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  11014464 taaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagt 11014499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 409 - 616
Target Start/End: Original strand, 9168676 - 9168892
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgac---------tttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaat 499  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |         ||||  || ||| || |||||  |||| ||||||||| ||||    
T  9168676 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttagaagatttggaagactttcctttagatggtagatcaat 9168775  T
Q  500 ggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatcttta 599  Q
     ||||||||||||||||| |  ||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  9168776 agatttactcttcttagaggactcatgctcatttagactcatttcatgcactttgagggaactgacaagatcttcaacactcaaagtgtttaaatcctta 9168875  T
Q  600 gtttcctcaatagcagt 616  Q
    | |||||||||||||||    
T  9168876 gcttcctcaatagcagt 9168892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Original strand, 176066 - 176201
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  176066 ctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacact 176165  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    |||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  176166 taaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagt 176201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Original strand, 1996732 - 1996867
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  1996732 ctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacact 1996831  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    |||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  1996832 taaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagt 1996867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 409 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 2707421 - 2707205
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgacttt-aag--------agcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaat 499  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||  ||        || |||||| | |||  |||| ||||||| ||||||    
T  2707421 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttggaagattttgaggtctttcctttagatggtaaagcaat 2707322  T
Q  500 ggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatcttta 599  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  2707321 ggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacacttaaagtatttagatcctta 2707222  T
Q  600 gtttcctcaatagcagt 616  Q
    | |||||||||||||||    
T  2707221 gcttcctcaatagcagt 2707205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Original strand, 4221184 - 4221319
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  4221184 ctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacact 4221283  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    |||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  4221284 taaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagt 4221319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 409 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 8003874 - 8003658
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgact------tct---cttttgatggtagagcaat 499  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||    ||||| || ||||      |||   |||| ||||||| ||||||    
T  8003874 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttggaagactttgaggtctttcctttagatggtaaagcaat 8003775  T
Q  500 ggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatcttta 599  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  8003774 ggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttagactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacacttaaagtatttagatcctta 8003675  T
Q  600 gtttcctcaatagcagt 616  Q
    | ||||||||| |||||    
T  8003674 gcttcctcaatggcagt 8003658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Original strand, 8626521 - 8626656
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  8626521 ctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacact 8626620  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    |||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  8626621 taaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagt 8626656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Original strand, 9093563 - 9093698
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  9093563 ctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttagactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacact 9093662  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    |||||| |||| ||| |||| ||||||||| |||||    
T  9093663 taaagtatttagatccttagcttcctcaatggcagt 9093698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Original strand, 9442439 - 9442574
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  9442439 ctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacact 9442538  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    |||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  9442539 taaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagt 9442574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Original strand, 11003755 - 11003890
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  11003755 ctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacact 11003854  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    |||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  11003855 taaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagt 11003890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Original strand, 20988233 - 20988368
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  20988233 ctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacact 20988332  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    |||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  20988333 taaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagt 20988368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Original strand, 22098317 - 22098452
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  22098317 ctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacact 22098416  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    |||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  22098417 taaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagt 22098452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Original strand, 24743277 - 24743412
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  24743277 ctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacact 24743376  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    |||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  24743377 taaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagt 24743412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 409 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 26391902 - 26391686
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgact------tct---cttttgatggtagagcaat 499  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||    ||||| || ||||      |||   |||| ||||||| ||||||    
T  26391902 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttggaagactttgaggtctttcctttagatggtaaagcaat 26391803  T
Q  500 ggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatcttta 599  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  26391802 ggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacacttaaagtatttagatcctta 26391703  T
Q  600 gtttcctcaatagcagt 616  Q
    | |||||||||||||||    
T  26391702 gcttcctcaatagcagt 26391686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 409 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 40043912 - 40043696
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgact------tct---cttttgatggtagagcaat 499  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||    ||||| || ||||      |||   |||| ||||||| ||||||    
T  40043912 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttggaagactttgaggtctttcctttagatggtaaagcaat 40043813  T
Q  500 ggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatcttta 599  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  40043812 ggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacacttaaagtatttagatcctta 40043713  T
Q  600 gtttcctcaatagcagt 616  Q
    | |||||||||||||||    
T  40043712 gcttcctcaatagcagt 40043696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Original strand, 42875024 - 42875159
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  42875024 ctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacact 42875123  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    |||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  42875124 taaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagt 42875159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 467 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 15879563 - 15879414
Alignment:
Q  467 ttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgaca 566  Q
    |||||| |||||  |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| || || |||    
T  15879563 ttttgaagactttcctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggattcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgaactaaca 15879464  T
Q  567 agatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  15879463 agatcttcaacacttaaaatgtttagatccttagcttcctcaatagcagt 15879414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 409 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 458794 - 458578
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgacttt-aag--------agcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaat 499  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||  ||        || |||||| | |||  |||| ||||||| ||| ||    
T  458794 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttggaagattttgaggtctttcctttagatggtaaagcgat 458695  T
Q  500 ggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatcttta 599  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  458694 ggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacacttaaagtatttagatcctta 458595  T
Q  600 gtttcctcaatagcagt 616  Q
    | |||||||||||||||    
T  458594 gcttcctcaatagcagt 458578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 17951841 - 17951706
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  17951841 ctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacact 17951742  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    |||||| |||| ||| |||| || ||||||||||||    
T  17951741 taaagtatttagatccttagctttctcaatagcagt 17951706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 409 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 26655144 - 26654928
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgact------tct---cttttgatggtagagcaat 499  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||    ||||| || ||||      |||   |||| ||||||| |||||     
T  26655144 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttggaagactttgaggtctttcctttagatggtaaagcaac 26655045  T
Q  500 ggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatcttta 599  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| ||| |||    
T  26655044 ggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttagactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacacttagagtatttagatcctta 26654945  T
Q  600 gtttcctcaatagcagt 616  Q
    | |||||||||||||||    
T  26654944 gcttcctcaatagcagt 26654928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 540 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 21212296 - 21212214
Alignment:
Q  540 atctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagtcacctt 622  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  21212296 atctaatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagcttcatcaatagcagtaacctt 21212214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 409 - 616
Target Start/End: Original strand, 18439699 - 18439906
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttact 508  Q
    |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||||    | ||   |||||| || |||||  |||| |||||||||||||| ||| || |    
T  18439699 gatcttcattagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactagccttgtaagctttggaagactttcctttagatggtagagcaatagatctatt 18439798  T
Q  509 cttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctca 608  Q
    ||||||||| | |||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| |||||||    
T  18439799 cttcttagaggattcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgataagatcttcaacactcaaagtgtttagatccttagcttcctca 18439898  T
Q  609 atagcagt 616  Q
    || |||||    
T  18439899 atggcagt 18439906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 509 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 16309443 - 16309336
Alignment:
Q  509 cttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctca 608  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||| | |||||| |||||| ||| ||| |||||||| |||| |||||||    
T  16309443 cttcttagaagattcatgttcatttagaccaatctcatgaaccttgagagagcttataagatcctcaacagttagagtttttaaatccttagcttcctca 16309344  T
Q  609 atagcagt 616  Q
    ||||||||    
T  16309343 atagcagt 16309336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 566 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 16106706 - 16106650
Alignment:
Q  566 aagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagtcacctt 622  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||    
T  16106706 aagatcttcaacacttagagtgtttaaatcattagcttcctcaattgcattcacctt 16106650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Original strand, 175985 - 176028
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  175985 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 176028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Original strand, 1996651 - 1996694
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1996651 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 1996694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Original strand, 4221103 - 4221146
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4221103 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 4221146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Original strand, 8626440 - 8626483
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8626440 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 8626483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Original strand, 9093482 - 9093525
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9093482 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 9093525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Original strand, 9442358 - 9442401
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9442358 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 9442401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Original strand, 11003674 - 11003717
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11003674 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 11003717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Original strand, 11014283 - 11014326
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11014283 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 11014326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 15879630 - 15879587
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15879630 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 15879587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 17951922 - 17951879
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17951922 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 17951879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Original strand, 20988152 - 20988195
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20988152 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 20988195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Original strand, 22098236 - 22098279
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22098236 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 22098279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Original strand, 24743196 - 24743239
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24743196 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 24743239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Original strand, 42874943 - 42874986
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42874943 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 42874986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 540 - 622
Target Start/End: Original strand, 16408238 - 16408323
Alignment:
Q  540 atctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaag---tgtttaaatctttagtttcctcaatagcagtcacctt 622  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| ||   ||||||||||  ||| |||||||| || ||| |||||    
T  16408238 atctcatgaaccttgagagagctcataagatcttcaacacttagagtactgtttaaatccctagcttcctcaaaagtagtaacctt 16408323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 172; Significance: 4e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 409 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 7479 - 7264
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttact 508  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  7479 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttact 7380  T
Q  509 cttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctca 608  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  7379 ctttctagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaagtttgagagagctgacaagattttcaacacttaaagtgtttaaatatttagcttcctca 7280  T
Q  609 atagcagtcacctttg 624  Q
    ||||||||||||||||    
T  7279 atagcagtcacctttg 7264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 158; Significance: 9e-84; HSPs: 49)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 411 - 612
Target Start/End: Original strand, 26940718 - 26940919
Alignment:
Q  411 tcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttactct 510  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  26940718 tcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaattgatttactct 26940817  T
Q  511 tcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctcaat 610  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26940818 tcttagtaggctcctgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacactcaaagtgtttaaatctttagcttcctcaat 26940917  T
Q  611 ag 612  Q
    ||    
T  26940918 ag 26940919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 409 - 622
Target Start/End: Original strand, 19450386 - 19450596
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttact 508  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||   ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  19450386 gatcttcatctgaatctccatcaggtgattgttcttcagatttaac---tttaagagcttttgatgacttttctttagatggtagagcaatagatttact 19450482  T
Q  509 cttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctca 608  Q
    ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  19450483 cttattagcaggttcatgttcatttagacttatctcatgaactttgagagggctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagcttcctga 19450582  T
Q  609 atagcagtcacctt 622  Q
    |||||||| |||||    
T  19450583 atagcagtaacctt 19450596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 409 - 622
Target Start/End: Original strand, 19448392 - 19448602
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttact 508  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||   ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  19448392 gatcttcatctgaatctccatcaggtgattgttcttcagatttaac---tttaagagcttttgatgacttttctttagatggtagagcaatagatttact 19448488  T
Q  509 cttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctca 608  Q
    ||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  19448489 cttattagcaagttcatgttcatttagacttatctcatgaactttgagagggctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagcttcctga 19448588  T
Q  609 atagcagtcacctt 622  Q
    |||||||| |||||    
T  19448589 atagcagtaacctt 19448602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 409 - 612
Target Start/End: Original strand, 17926098 - 17926301
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttact 508  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||  |||||||  |||| |||   | |||||| |||||| |    
T  17926098 gatcttcatcagaatctccatcaggtgactcttcttcatattcaataactttaagagctttatatgactttactttagatttcatagcaatagatttatt 17926197  T
Q  509 cttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctca 608  Q
    |||||| |||| |||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | || ||||    
T  17926198 cttctttgaagattcatgctcatttagactcatttcatgaactttgagagagctaacaagatctttaacacttaaagtgtttacatctttcgctttctca 17926297  T
Q  609 atag 612  Q
    ||||    
T  17926298 atag 17926301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 409 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 28253302 - 28253086
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatga---------cttctcttttgatggtagagcaat 499  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||    |||||||| ||         |||  |||| ||||||||||||||    
T  28253302 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggcttttgaagattttgaagtctttcctttagatggtagagcaat 28253203  T
Q  500 ggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatcttta 599  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  28253202 ggatttactcttcttagaggattcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatcctta 28253103  T
Q  600 gtttcctcaatagcagt 616  Q
    | |||||||||||||||    
T  28253102 gcttcctcaatagcagt 28253086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 409 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 28332051 - 28331835
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatga---------cttctcttttgatggtagagcaat 499  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||    |||||||| ||         |||  |||| ||||||||||||||    
T  28332051 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggcttttgaagattttgaagtctttcctttagatggtagagcaat 28331952  T
Q  500 ggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatcttta 599  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  28331951 ggatttactcttcttagaggattcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatcctta 28331852  T
Q  600 gtttcctcaatagcagt 616  Q
    | |||||||||||||||    
T  28331851 gcttcctcaatagcagt 28331835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 409 - 616
Target Start/End: Original strand, 22307269 - 22307476
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttact 508  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||  | | |||  |||||| || |||||  |||| |||||||||||||| ||| || |    
T  22307269 gatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttataagctttggaagactttcctttagatggtagagcaatagatctatt 22307368  T
Q  509 cttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctca 608  Q
    ||||||||| | |||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| |||||||    
T  22307369 cttcttagaggattcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaagatcttcaacactcaaagtgtttagatccttagcttcctca 22307468  T
Q  609 atagcagt 616  Q
    || |||||    
T  22307469 atggcagt 22307476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Original strand, 27502852 - 27502987
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  27502852 ctttagatggtagagcaatggatttactcttcttagaggattcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacact 27502951  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  27502952 taaagtgtttagatccttagcttcctcaatagcagt 27502987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 9114146 - 9114011
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  9114146 ctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacact 9114047  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||    
T  9114046 taaagtatttagatctttagcttcctcaatagcagt 9114011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 409 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 14055119 - 14054904
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttact 508  Q
    |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||    | |||   ||||| |||| |||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  14055119 gatcttcatcagaatccccatctggtgattcttcttcagattcactagccttatatgctttagatggctttcctttagatggtagagcaatggatttact 14055020  T
Q  509 cttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctca 608  Q
    |||||| || | |||||| ||||| || || |  |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||| |||||||    
T  14055019 cttctttgaggattcatgctcatttaggctcaattcatgaaccttgagagaacttacaagatcttcaacactcaacgtgtttagatccttagcttcctca 14054920  T
Q  609 atagcagtcacctttg 624  Q
    |||||||| |||||||    
T  14054919 atagcagttacctttg 14054904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Original strand, 27383285 - 27383420
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  27383285 ctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggattcatgctcatttagactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacact 27383384  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    ||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||    
T  27383385 taaagtgtttagatccctagcttcctcaatagcagt 27383420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Original strand, 27473669 - 27473804
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  27473669 ctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggattcatgctcatttagactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacact 27473768  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    ||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||    
T  27473769 taaagtgtttagatccctagcttcctcaatagcagt 27473804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Original strand, 3670592 - 3670727
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  3670592 ctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacact 3670691  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    |||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  3670692 taaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagt 3670727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 409 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 17610319 - 17610112
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttact 508  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||  | | ||   |||||| || |||||  |||| |||||||||||||| ||| || |    
T  17610319 gatcttcatcagaatctccatctggtgactcttcttcagattcactggccttgtaagctttggaagactttcctttagatggtagagcaatagatctatt 17610220  T
Q  509 cttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctca 608  Q
    ||||||||| | |||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| |||||||    
T  17610219 cttcttagaggattcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaagatcttcaacactcaaagtgtttagatccttagcttcctca 17610120  T
Q  609 atagcagt 616  Q
    || |||||    
T  17610119 atggcagt 17610112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Original strand, 25984625 - 25984760
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  25984625 ctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacact 25984724  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    |||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  25984725 taaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagt 25984760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Original strand, 26034568 - 26034703
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  26034568 ctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacact 26034667  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    |||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  26034668 taaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagt 26034703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Original strand, 26042743 - 26042878
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| | |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  26042743 ctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggattcatgctcatttaaactcatttcatgcattttgagtgagctaacaagatcttcaacact 26042842  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  26042843 taaagtgtttagatccttagcttcctcaatagcagt 26042878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Original strand, 26873950 - 26874085
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  26873950 ctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacact 26874049  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    |||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  26874050 taaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagt 26874085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Original strand, 27350893 - 27351028
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  27350893 ctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacact 27350992  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    |||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  27350993 taaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagt 27351028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Original strand, 27411633 - 27411768
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  27411633 ctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacact 27411732  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    |||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  27411733 taaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagt 27411768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 409 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 32302780 - 32302564
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgact------tct---cttttgatggtagagcaat 499  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||    ||||| || ||||      |||   |||| ||||||| ||||||    
T  32302780 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttggaagactttgaggtctttcctttagatggtaaagcaat 32302681  T
Q  500 ggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatcttta 599  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  32302680 ggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacacttaaagtatttagatcctta 32302581  T
Q  600 gtttcctcaatagcagt 616  Q
    | |||||||||||||||    
T  32302580 gcttcctcaatagcagt 32302564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 409 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 32963680 - 32963464
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgacttt-aag--------agcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaat 499  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||  ||        || |||||| | |||  |||| ||||||| ||||||    
T  32963680 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttggaagattttgaggtctttcctttagatggtaaagcaat 32963581  T
Q  500 ggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatcttta 599  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  32963580 ggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacacttaaagtatttagatcctta 32963481  T
Q  600 gtttcctcaatagcagt 616  Q
    | |||||||||||||||    
T  32963480 gcttcctcaatagcagt 32963464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 409 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 34808896 - 34808680
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgacttt-aag--------agcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaat 499  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||  ||        || |||||| | |||  |||| ||||||| ||||||    
T  34808896 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttggaagattttgaggtctttcctttagatggtaaagcaat 34808797  T
Q  500 ggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatcttta 599  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  34808796 ggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacacttaaagtatttagatcctta 34808697  T
Q  600 gtttcctcaatagcagt 616  Q
    | |||||||||||||||    
T  34808696 ggttcctcaatagcagt 34808680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 409 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 20031655 - 20031443
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgacttt---------aagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaat 499  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||         |  || |||||| |||||  |||| ||||||| ||||||    
T  20031655 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttagaagattttgaagactttcctttagatggtaaagcaat 20031556  T
Q  500 ggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatcttta 599  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| | ||| | ||| || ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  20031555 ggatttactcttcttagaggattcatgctaatttaaactcatttcatgcactttgagtgaactaacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatcctta 20031456  T
Q  600 gtttcctcaatag 612  Q
    | |||||||||||    
T  20031455 gcttcctcaatag 20031443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 409 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 12718570 - 12718354
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactt--taag-------agcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaat 499  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||  | |||  ||||       || |||||| | |||  |||| ||||||| ||||||    
T  12718570 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagactcactggctttgtaagctttggaagattttgaggtctttcctttagatggtaaagcaat 12718471  T
Q  500 ggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatcttta 599  Q
     ||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  12718470 agatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacacttaaagtatttagatcctta 12718371  T
Q  600 gtttcctcaatagcagt 616  Q
    | |||||||||||||||    
T  12718370 gcttcctcaatagcagt 12718354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Original strand, 12864079 - 12864214
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |||    
T  12864079 ctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaaaact 12864178  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    |||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  12864179 taaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagt 12864214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Original strand, 16958156 - 16958291
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||| || |||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  16958156 ctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttagactcatttcatgccctttgagtgagctaacaagatcttcaacact 16958255  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    |||||| |||| ||| |||| ||||||||| |||||    
T  16958256 taaagtatttagatccttagcttcctcaatggcagt 16958291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 481 - 614
Target Start/End: Original strand, 25804216 - 25804349
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||| |  ||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  25804216 ctttagatggtagaacaataaatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgcactttgagggaactgacaagatcttcaacact 25804315  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagca 614  Q
     |||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  25804316 caaagtgtttagatccttagcttcctcaatagca 25804349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 409 - 619
Target Start/End: Original strand, 11204439 - 11204650
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttact 508  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||  | | ||   |||||| ||||||||  |||| ||| |||||||||| ||| || |    
T  11204439 gatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcatattcactggccttgtaagctttggatgactttgctttagatagtagagcaatagatctatt 11204538  T
Q  509 cttcttagaaggttcatgttcatta-agacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctc 607  Q
    |||||| || | |||||| |||||  ||||| || || || || ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||| ||||||    
T  11204539 cttctttgaggattcatgctcattcgagactcatttcgtgtaccttgagggaactgacaagatcttcaacactcaaagtgttcagatccttagcttcctc 11204638  T
Q  608 aatagcagtcac 619  Q
    ||| ||||||||    
T  11204639 aatggcagtcac 11204650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 411 - 616
Target Start/End: Original strand, 18553768 - 18553972
Alignment:
Q  411 tcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttactct 510  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||   | | ||   |||||| || |||||  |||| |||||||||||||| ||| || | |    
T  18553768 tcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcgctggccttgtaagctttggaagactttcctttagatggtagagcaatagatctatttt 18553867  T
Q  511 tcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctcaat 610  Q
    |||| || | ||| || ||||| ||||| || ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| |||||||||    
T  18553868 tctttgaggattc-tgctcattcagactcatttcatgtaccttgagagaactgacaagatcttcaacactcaaagtgtttagatccttagcttcctcaat 18553966  T
Q  611 agcagt 616  Q
     |||||    
T  18553967 ggcagt 18553972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 420 - 616
Target Start/End: Original strand, 17062708 - 17062904
Alignment:
Q  420 gaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaag 519  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| |||||  | ||||   |||||| || |||||  |||| |||||||||||||| ||| || |||||||||| |    
T  17062708 gaatctccatttggtgattcttcttcagattcactggctttgtaagctttggaagactttcctttagatggtagagcaatagatctattcttcttagagg 17062807  T
Q  520 gttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
     |||||| | ||| ||||| || ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||  || ||||||| ||| |||| ||||||||| |||||    
T  17062808 attcatgctaattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaagatcttcaacacacaaggtgtttagatccttagcttcctcaatggcagt 17062904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 481 - 619
Target Start/End: Original strand, 22385156 - 22385294
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| ||||||| || |  ||||| ||||| || || || |||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  22385156 ctttagatggtagagcaatagatttattcttctttgaggactcatgctcattcaggctcatttcatgaaccttgagggaaatgacaagatcttcaacact 22385255  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagtcac 619  Q
     |||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  22385256 caaagtgtttagatccttagcttcctcaatggcagtcac 22385294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 411 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 17447477 - 17447272
Alignment:
Q  411 tcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttactct 510  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |||    ||||||| |||| |||  |||||  ||| ||   ||| ||||| || ||   ||    
T  17447477 tcttcatcagaatctccatcaggtgactcttcttcagactcatttgctttaagggcttgtgactacttccttttggaatttagtgcaatagactttgact 17447378  T
Q  511 tcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctcaat 610  Q
    |||||| ||  ||||| ||||||||||| ||||||| ||  |||||||| || | ||||||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||    
T  17447377 tcttagcagaatcatgctcattaagactaatctcataaatcttgagagaactcataagatcttcaacacttagaatgtttaaatccttagcttcctcaat 17447278  T
Q  611 agcagt 616  Q
    ||||||    
T  17447277 agcagt 17447272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 531 - 614
Target Start/End: Complemental strand, 13138088 - 13138005
Alignment:
Q  531 ttaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagca 614  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| || | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  13138088 ttaagactaatctcatgaaccttgagagaacttataagatcttcaacaattagagtgtttaaatctttagattcttcaatagca 13138005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 409 - 526
Target Start/End: Original strand, 17056529 - 17056646
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttact 508  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||  | ||||   |||||| || |||||  |||| |||||||||||||| ||| || |    
T  17056529 gatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggctttgtaagctttggaagactttcctttagatggtagagcaatagatctatt 17056628  T
Q  509 cttcttagaaggttcatg 526  Q
    ||||||||| | ||||||    
T  17056629 cttcttagaggattcatg 17056646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 409 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 25723461 - 25723353
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttact 508  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||  | | ||   |||||| || |||||  |||| |||||||||||||| ||| || |    
T  25723461 gatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttagaagactttcctttagatggtagagcaatagatctatt 25723362  T
Q  509 cttcttaga 517  Q
    |||||||||    
T  25723361 cttcttaga 25723353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Original strand, 3670511 - 3670554
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3670511 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 3670554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Original strand, 12863998 - 12864041
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12863998 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 12864041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Original strand, 16958075 - 16958118
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16958075 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 16958118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Original strand, 25984544 - 25984587
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25984544 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 25984587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Original strand, 26034487 - 26034530
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26034487 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 26034530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Original strand, 26042662 - 26042705
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26042662 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 26042705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Original strand, 26873869 - 26873912
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26873869 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 26873912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Original strand, 27350812 - 27350855
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27350812 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 27350855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Original strand, 27383204 - 27383247
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27383204 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 27383247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Original strand, 27411552 - 27411595
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27411552 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 27411595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Original strand, 27473588 - 27473631
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27473588 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 27473631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 509 - 586
Target Start/End: Original strand, 19874319 - 19874396
Alignment:
Q  509 cttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagt 586  Q
    |||||||| ||  ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||| |||||    
T  19874319 cttcttagtagaatcatgataattaagactaatctcatgaaccttgagagagctcttaagatcttcaacactcaaagt 19874396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Original strand, 27502771 - 27502814
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  27502771 gatcttcatcagaatctcgatcaggtgattcttcttcagattca 27502814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 156; Significance: 1e-82; HSPs: 5)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 409 - 624
Target Start/End: Original strand, 35748 - 35963
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttact 508  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  35748 gatcttcatcagaatctccatcaagtgattcttcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttatatggtagagcaatggatttact 35847  T
Q  509 cttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctca 608  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35848 cttccaagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactctgagagagttgagtagatcttcaaaacttaaagtgtttaaatctttagcttcctca 35947  T
Q  609 atagcagtcacctttg 624  Q
    ||||||||||||||||    
T  35948 atagcagtcacctttg 35963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 409 - 624
Target Start/End: Original strand, 133808 - 134023
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttact 508  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  133808 gatcttcatcagaatctccatcaagtgattcttcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttatatggtagagcaatggatttact 133907  T
Q  509 cttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctca 608  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  133908 cttccaagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactctgagagagttgagtagatcttcaaaacttaaagtgtttaaatctttagcttcctca 134007  T
Q  609 atagcagtcacctttg 624  Q
    ||||||||||||||||    
T  134008 atagcagtcacctttg 134023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 412 - 622
Target Start/End: Original strand, 157456 - 157663
Alignment:
Q  412 cttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttactctt 511  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  157456 cttcatctgaatctccatcaggtgattcttcttcagattcaac---tttaaaagtttttgatgacttccctttagatggtagagcaattgatttactctt 157552  T
Q  512 cttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctcaata 611  Q
    ||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  157553 cttagcaggctcatgttcatttagatttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaata 157652  T
Q  612 gcagtcacctt 622  Q
    ||||| |||||    
T  157653 gcagtaacctt 157663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 45441 - 45306
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  45441 ctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacact 45342  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    |||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  45341 taaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagt 45306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 409 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 45557 - 45520
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttca 446  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  45557 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttca 45520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 156; Significance: 1e-82; HSPs: 74)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 409 - 624
Target Start/End: Original strand, 26782737 - 26782952
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttact 508  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  26782737 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatttact 26782836  T
Q  509 cttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctca 608  Q
    |||||||| ||| ||  |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |    
T  26782837 cttcttagcaggctccagttcattaagacttgtcttatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagcttccaaa 26782936  T
Q  609 atagcagtcacctttg 624  Q
    ||| ||||||||||||    
T  26782937 ataacagtcacctttg 26782952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 409 - 624
Target Start/End: Original strand, 26763774 - 26763988
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttact 508  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| |||    
T  26763774 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattccacaactttaagagcttttgatgacttcccttttgatggaagagcaatgaatt-act 26763872  T
Q  509 cttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctca 608  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26763873 tttcttagaagattcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagttgacaagatccttaacacttaaagtgtttaaatctttagcttcctca 26763972  T
Q  609 atagcagtcacctttg 624  Q
    |||||| |||||||||    
T  26763973 atagcaatcacctttg 26763988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 421 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 21200828 - 21200627
Alignment:
Q  421 aatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaagg 520  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21200828 aatctccatcaggtgattcttcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgaattccctttagatggtagagcaattgatttactcttcttagaagg 21200729  T
Q  521 ttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagtcacc 620  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||    
T  21200728 ctcatgttcatttagacttatctcatgaactttaagagagttgacaagatctttaacacttaaagtgtttagatgtttagcttcctcaatagcagtaacc 21200629  T
Q  621 tt 622  Q
    ||    
T  21200628 tt 21200627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 409 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 23394256 - 23394040
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgac---------tttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaat 499  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |         ||||  || |||||| |||||  |||| ||||||||||||||    
T  23394256 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttagaagattttgaagactttcctttagatggtagagcaat 23394157  T
Q  500 ggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatcttta 599  Q
    |||||||||||||||||| |  ||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23394156 ggatttactcttcttagaggactcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagggaactgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatcctta 23394057  T
Q  600 gtttcctcaatagcagt 616  Q
    | |||||||||||||||    
T  23394056 gcttcctcaatagcagt 23394040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 409 - 619
Target Start/End: Original strand, 23486917 - 23487127
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttact 508  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||    | ||   |||||| ||||||||  |||| |||||||||||||| ||| || |    
T  23486917 gatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactagccttgtaagctttagatgactttcctttagatggtagagcaatagatctatt 23487016  T
Q  509 cttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctca 608  Q
    |||||| || | |||||| ||||| ||||  || |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  23487017 cttctttgaggattcatgctcattcagacccatttcatgaactttgatggaactgacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctca 23487116  T
Q  609 atagcagtcac 619  Q
    || ||||||||    
T  23487117 atggcagtcac 23487127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 409 - 616
Target Start/End: Original strand, 24981824 - 24982040
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgac---------tttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaat 499  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |         ||||  || ||| || |||||  |||| ||||||||||||||    
T  24981824 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttagaagatttggaagactttcctttagatggtagagcaat 24981923  T
Q  500 ggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatcttta 599  Q
     ||||||||||||||||| |  ||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  24981924 agatttactcttcttagaggactcatgctcatttagactcatttcatgcactttgagggaactgacaagatcttcaacactcaaagtgtttaaatcctta 24982023  T
Q  600 gtttcctcaatagcagt 616  Q
    | |||||||||||||||    
T  24982024 gcttcctcaatagcagt 24982040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 39354262 - 39354127
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  39354262 ctttagatggtagagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacact 39354163  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    |||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  39354162 taaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagt 39354127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 409 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 31420512 - 31420296
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgacttt---------aagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaat 499  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||         |  || |||||| | |||  |||| ||||||| ||||||    
T  31420512 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttagaagattttgaagtctttcctttagatggtaaagcaat 31420413  T
Q  500 ggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatcttta 599  Q
    ||||||||||||||||||   |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  31420412 ggatttactcttcttagagaattcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatcctta 31420313  T
Q  600 gtttcctcaatagcagt 616  Q
    | |||||||||||||||    
T  31420312 gcttcctcaatagcagt 31420296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 409 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 34053807 - 34053591
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgac---------tttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaat 499  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |         ||||  || ||| || |||||  |||| ||||||||||||||    
T  34053807 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttagaagatttggaagactttcctttagatggtagagcaat 34053708  T
Q  500 ggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatcttta 599  Q
     ||||||||||||||||| |  ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||    
T  34053707 agatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgcactttgagagaactgacaagatcttcaacactcaaggtgtttagatcctta 34053608  T
Q  600 gtttcctcaatagcagt 616  Q
    | |||||||||||||||    
T  34053607 gcttcctcaatagcagt 34053591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Original strand, 5299637 - 5299772
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  5299637 ctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacact 5299736  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    |||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  5299737 taaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagt 5299772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 6977572 - 6977437
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  6977572 ctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacact 6977473  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    |||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  6977472 taaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagt 6977437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 9337720 - 9337585
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  9337720 ctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacact 9337621  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    |||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  9337620 taaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagt 9337585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 409 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 14031889 - 14031673
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgact------tct---cttttgatggtagagcaat 499  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||    ||||| || ||||      |||   |||| ||||||| ||||||    
T  14031889 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttggaagactttgaggtctttcctttagatggtaaagcaat 14031790  T
Q  500 ggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatcttta 599  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  14031789 ggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacacttaaagtatttagatcctta 14031690  T
Q  600 gtttcctcaatagcagt 616  Q
    | |||||||||||||||    
T  14031689 gcttcctcaatagcagt 14031673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 409 - 616
Target Start/End: Original strand, 14456026 - 14456242
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgacttt--aag-------agcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaat 499  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||  |||       || |||||| | |||  |||| ||||||| ||||||    
T  14456026 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaagctttggaagattttgaggtctttcctttagatggtaaagcaat 14456125  T
Q  500 ggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatcttta 599  Q
     ||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  14456126 agatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacacttaaagtatttagatcctta 14456225  T
Q  600 gtttcctcaatagcagt 616  Q
    | |||||||||||||||    
T  14456226 gcttcctcaatagcagt 14456242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Original strand, 14567148 - 14567283
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  14567148 ctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacact 14567247  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    |||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  14567248 taaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagt 14567283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 409 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 15741816 - 15741600
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgact------tct---cttttgatggtagagcaat 499  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||    ||||| || ||||      |||   |||| ||||||| ||||||    
T  15741816 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttggaagactttgaggtctttcctttagatggtaaagcaat 15741717  T
Q  500 ggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatcttta 599  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  15741716 ggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacacttaaagtatttagatcctta 15741617  T
Q  600 gtttcctcaatagcagt 616  Q
    | |||||||||||||||    
T  15741616 gcttcctcaatagcagt 15741600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Original strand, 16002391 - 16002526
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  16002391 ctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacact 16002490  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    |||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  16002491 taaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagt 16002526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 409 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 17608909 - 17608693
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgact------tct---cttttgatggtagagcaat 499  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||    ||||| || ||||      |||   |||| ||||||| ||||||    
T  17608909 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttggaagactttgaggtctttcctttagatggtaaagcaat 17608810  T
Q  500 ggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatcttta 599  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  17608809 ggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacacttaaagtatttagatcctta 17608710  T
Q  600 gtttcctcaatagcagt 616  Q
    | |||||||||||||||    
T  17608709 gcttcctcaatagcagt 17608693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 409 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 17720765 - 17720549
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgact------tct---cttttgatggtagagcaat 499  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||    ||||| || ||||      |||   |||| ||||||| ||||||    
T  17720765 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttggaagactttgaggtctttcctttagatggtaaagcaat 17720666  T
Q  500 ggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatcttta 599  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  17720665 ggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacacttaaagtatttagatcctta 17720566  T
Q  600 gtttcctcaatagcagt 616  Q
    | |||||||||||||||    
T  17720565 gcttcctcaatagcagt 17720549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 22148282 - 22148147
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  22148282 ctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacact 22148183  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    |||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  22148182 taaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagt 22148147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 22677882 - 22677747
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  22677882 ctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacact 22677783  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    |||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  22677782 taaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagt 22677747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 23298043 - 23297908
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  23298043 ctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacact 23297944  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    |||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  23297943 taaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagt 23297908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 23363862 - 23363727
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  23363862 ctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacact 23363763  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    |||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  23363762 taaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagt 23363727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 23698546 - 23698411
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  23698546 ctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacact 23698447  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    |||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  23698446 taaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagt 23698411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 409 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 24568935 - 24568719
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgact------tct---cttttgatggtagagcaat 499  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||    ||||| || ||||      |||   |||| ||||||| ||||||    
T  24568935 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttggaagactttgaggtctttcctttagatggtaaagcaat 24568836  T
Q  500 ggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatcttta 599  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  24568835 ggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacacttaaagtatttagatcctta 24568736  T
Q  600 gtttcctcaatagcagt 616  Q
    | |||||||||||||||    
T  24568735 gcttcctcaatagcagt 24568719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Original strand, 27051332 - 27051467
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  27051332 ctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacact 27051431  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    |||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  27051432 taaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagt 27051467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Original strand, 30236521 - 30236656
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  30236521 ctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacact 30236620  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    |||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  30236621 taaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagt 30236656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 31350300 - 31350165
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  31350300 ctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacact 31350201  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    |||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  31350200 taaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagt 31350165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 409 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 31835327 - 31835111
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgacttt-aag--------agcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaat 499  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||  ||        || |||||| | |||  |||| ||||||| ||||||    
T  31835327 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttggaagattttgaggtctttcctttagatggtaaagcaat 31835228  T
Q  500 ggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatcttta 599  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  31835227 ggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacacttaaagtatttagatcctta 31835128  T
Q  600 gtttcctcaatagcagt 616  Q
    | |||||||||||||||    
T  31835127 gcttcctcaatagcagt 31835111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 409 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 34773756 - 34773540
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgacttt-aag--------agcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaat 499  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||  ||        || |||||| | |||  |||| ||||||| ||||||    
T  34773756 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttggaagattttgaagtctttcctttagatggtaaagcaat 34773657  T
Q  500 ggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatcttta 599  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  34773656 ggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacacttaaagtatttagatcctta 34773557  T
Q  600 gtttcctcaatagcagt 616  Q
    | |||||||||||||||    
T  34773556 gcttcctcaatagcagt 34773540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 409 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 35217350 - 35217134
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgact------tct---cttttgatggtagagcaat 499  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||    ||||| || ||||      |||   |||| ||||||| ||||||    
T  35217350 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttggaagactttgaggtctttcctttagatggtaaagcaat 35217251  T
Q  500 ggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatcttta 599  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  35217250 ggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacacttaaagtatttagatcctta 35217151  T
Q  600 gtttcctcaatagcagt 616  Q
    | |||||||||||||||    
T  35217150 gcttcctcaatagcagt 35217134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Original strand, 36591612 - 36591747
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  36591612 ctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacact 36591711  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    |||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  36591712 taaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagt 36591747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 409 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 36689545 - 36689329
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgact------tct---cttttgatggtagagcaat 499  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||    ||||| || ||||      |||   |||| ||||||| ||||||    
T  36689545 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttggaagactttgaggtctttcctttagatggtaaagcaat 36689446  T
Q  500 ggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatcttta 599  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  36689445 ggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacacttaaagtatttagatcctta 36689346  T
Q  600 gtttcctcaatagcagt 616  Q
    | |||||||||||||||    
T  36689345 gcttcctcaatagcagt 36689329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Original strand, 37739062 - 37739197
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  37739062 ctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttagactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacact 37739161  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    |||||| |||| ||| |||| ||||||||| |||||    
T  37739162 taaagtatttagatccttagcttcctcaatggcagt 37739197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Original strand, 39499982 - 39500117
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  39499982 ctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacact 39500081  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    |||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  39500082 taaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagt 39500117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 409 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 40392205 - 40391989
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgacttt-aag--------agcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaat 499  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||  ||        || |||||| | |||  |||| ||||||| ||||||    
T  40392205 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttggaagattttgaggtctttcctttagatggtaaagcaat 40392106  T
Q  500 ggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatcttta 599  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  40392105 ggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacacttaaagtatttagatcctta 40392006  T
Q  600 gtttcctcaatagcagt 616  Q
    | |||||||||||||||    
T  40392005 gcttcctcaatagcagt 40391989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 42044546 - 42044411
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  42044546 ctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacact 42044447  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    |||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  42044446 taaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagt 42044411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 409 - 616
Target Start/End: Original strand, 43620308 - 43620524
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgacttt---------aagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaat 499  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||         |  || |||||| |||||  |||| ||||||| ||||||    
T  43620308 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttagaagattttgaagactttcctttagatggtaaagcaat 43620407  T
Q  500 ggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatcttta 599  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| || || ||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  43620408 ggatttactcttcttagaggattcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgaactaacaggatcttcaacacttaaagtgtttagatcctta 43620507  T
Q  600 gtttcctcaatagcagt 616  Q
    | |||||| ||||||||    
T  43620508 gcttcctcgatagcagt 43620524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 409 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 24809763 - 24809547
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgact------tct---cttttgatggtagagcaat 499  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||    ||||| || ||||      |||   |||| ||||||| ||||||    
T  24809763 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttggaagactttgaggtctttcctttagatggtaaagcaat 24809664  T
Q  500 ggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatcttta 599  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  24809663 ggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttagactcatttcatgcactttaagtgagctaacaagatcttcaacacttaaagtatttagatcctta 24809564  T
Q  600 gtttcctcaatagcagt 616  Q
    | ||||||||| |||||    
T  24809563 gcttcctcaatggcagt 24809547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Original strand, 24825970 - 24826105
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  24825970 ctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagcgaacaagatcttcaacact 24826069  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    |||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  24826070 taaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagt 24826105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 409 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 27462009 - 27461793
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgact------tct---cttttgatggtagagcaat 499  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||    ||||| || ||||      |||   |||| ||||||| ||||||    
T  27462009 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttggaagactttgaggtctttcctttagatggtaaagcaat 27461910  T
Q  500 ggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatcttta 599  Q
    ||||||||||||||| || | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  27461909 ggatttactcttcttggaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacacttaaagtatttagatcctta 27461810  T
Q  600 gtttcctcaatagcagt 616  Q
    | |||||||||||||||    
T  27461809 gcttcctcaatagcagt 27461793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Original strand, 27621267 - 27621402
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  27621267 ctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacact 27621366  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    ||| || |||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  27621367 taacgtatttagatccttagcttcctcaatagcagt 27621402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 487 - 616
Target Start/End: Original strand, 1120403 - 1120532
Alignment:
Q  487 atggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagt 586  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1120403 atggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacacttaaagt 1120502  T
Q  587 gtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
     |||| | | |||| |||||||||||||||    
T  1120503 atttagacccttagcttcctcaatagcagt 1120532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 487 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 11209755 - 11209620
Alignment:
Q  487 atggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagt 586  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| || |  | ||| ||||| || || || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  11209755 atggtagagcaatagatttactcttctttgaggacttatgctcatttaggctcatttcatgaaccttgagagaactgacaagatcttcaacactcaaagt 11209656  T
Q  587 gtttaaatctttagtttcctcaatagcagtcacctt 622  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||| |||||||||||    
T  11209655 gtttagatccttagcttcctcaatggcagtcacctt 11209620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 19465738 - 19465603
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || || |||||||||||||||||    
T  19465738 ctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgcaccttgagggaactaacaagatcttcaacact 19465639  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||||||| |||||    
T  19465638 taaagtgtttagatccttagcttcctcaatggcagt 19465603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 409 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 20553662 - 20553446
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactt--taag-------agcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaat 499  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||  || |       || |||||| || ||  |||| ||||||||||||||    
T  20553662 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggcttggtaggctttggaagattttgaagattttcctttagatggtagagcaat 20553563  T
Q  500 ggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatcttta 599  Q
     ||||||||||| ||||| |  ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  20553562 agatttactctttttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactaacaagatcttcaacactcaaagtgtttagatcctta 20553463  T
Q  600 gtttcctcaatagcagt 616  Q
    | |||||||||||||||    
T  20553462 gcttcctcaatagcagt 20553446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 409 - 610
Target Start/End: Original strand, 21704378 - 21704588
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgac---------tttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaat 499  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |         ||||  || ||| || |||||  |||| ||||||||||||||    
T  21704378 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttagaagatttggaagactttcctttagatggtagagcaat 21704477  T
Q  500 ggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatcttta 599  Q
     ||||||||||||||||| |  ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  21704478 agatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaagatcttcaacactcaaagtgtttagatcctta 21704577  T
Q  600 gtttcctcaat 610  Q
    | |||||||||    
T  21704578 gcttcctcaat 21704588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Original strand, 17455808 - 17455943
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| |||||||||| ||| ||||||||| | ||||| |  ||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  17455808 ctttagatggtagagaaatagatttactccttttagaggactcatgttcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaagatcttcaacact 17455907  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
     |||||||||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  17455908 caaagtgtttagatccttagcttcctcaatagcagt 17455943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 481 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 25113664 - 25113526
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| ||||||| || | |||||| ||||| || || || |||||||| ||||| || |||||||||| |||||||||    
T  25113664 ctttagatggtagagcaatagatttattcttctttgaggattcatgctcattcaggctcatttcatgaaccttgagggaactgacaagatattcaacact 25113565  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagtcac 619  Q
     |||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  25113564 caaagtgtttagatccttagcttcctcaatggcagtcac 25113526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 481 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 25172755 - 25172617
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| ||||||| || | |||||| ||||| || || || |||||||| ||||| || |||||||||| |||||||||    
T  25172755 ctttagatggtagagcaatagatttattcttctttgaggattcatgctcattcaggctcatttcatgaaccttgagggaactgacaagatattcaacact 25172656  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagtcac 619  Q
     |||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  25172655 caaagtgtttagatccttagcttcctcaatggcagtcac 25172617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 409 - 610
Target Start/End: Original strand, 13532291 - 13532492
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttact 508  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||  | | ||   |||||| || |||||  |||| |||||||||||||| ||| || |    
T  13532291 gatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttggaagactttcctttagatggtagagcaatagatctatt 13532390  T
Q  509 cttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctca 608  Q
    ||||||||| | |||||| | ||| ||||  || ||||| |  ||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||| |||||||    
T  13532391 cttcttagaggattcatgcttattcagacccatttcatgtatcttgagggaactgacaagatcctcaacactcaaagtgtttagatccttagcttcctca 13532490  T
Q  609 at 610  Q
    ||    
T  13532491 at 13532492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Original strand, 1120316 - 1120359
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1120316 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 1120359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Original strand, 5299556 - 5299599
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5299556 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 5299599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 6977653 - 6977610
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6977653 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 6977610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 9337801 - 9337758
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9337801 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 9337758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Original strand, 14567067 - 14567110
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14567067 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 14567110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Original strand, 17455727 - 17455770
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17455727 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 17455770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 22148363 - 22148320
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22148363 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 22148320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 22677963 - 22677920
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22677963 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 22677920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 23298124 - 23298081
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23298124 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 23298081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 23363943 - 23363900
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23363943 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 23363900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 23698627 - 23698584
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23698627 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 23698584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Original strand, 24825889 - 24825932
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24825889 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 24825932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Original strand, 27051251 - 27051294
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27051251 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 27051294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Original strand, 27621186 - 27621229
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27621186 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 27621229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Original strand, 30236440 - 30236483
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30236440 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 30236483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 31350381 - 31350338
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31350381 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 31350338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Original strand, 37738981 - 37739024
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37738981 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 37739024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Original strand, 39499901 - 39499944
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39499901 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 39499944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 42044627 - 42044584
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42044627 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 42044584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Original strand, 16002310 - 16002353
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16002310 gatctttatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 16002353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 19465819 - 19465776
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  19465819 gatcttcatcagaatctccatcaggtgactcttcttcagattca 19465776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Original strand, 36591531 - 36591574
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36591531 gatcttcatcaaaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 36591574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 39354343 - 39354300
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39354343 gatcttcatcaaaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 39354300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 152; Significance: 4e-80; HSPs: 49)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 409 - 624
Target Start/End: Original strand, 22253913 - 22254128
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttact 508  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  22253913 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcctattcaacaactttaagagcttttgatgacttctctttagatggtagagtaatagatttact 22254012  T
Q  509 cttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctca 608  Q
    ||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||    
T  22254013 ctttttagtagactcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctaacaagatcatcaacacttaaagtgtttaaatctttggcttcccca 22254112  T
Q  609 atagcagtcacctttg 624  Q
    ||||||||||||||||    
T  22254113 atagcagtcacctttg 22254128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 409 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 28703007 - 28702792
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttact 508  Q
    ||||||| || ||||||||||||| | ||||||||||| | | |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  28703007 gatcttcgtcagaatctccatcagataattcttcttcatacttaacagctttaagagcttttgatgacttcccttttgatggtagagcaatgaatttact 28702908  T
Q  509 cttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctca 608  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||    
T  28702907 ctttttagaaggttcatgctcattaaggcttatctcatgaactttgagagagttgacaagatcttcaacactcaaagtgtttaaatctttaacttcctca 28702808  T
Q  609 atagcagtcacctttg 624  Q
    ||||||||||||||||    
T  28702807 atagcagtcacctttg 28702792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 409 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 22783412 - 22783199
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttact 508  Q
    ||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||| || | |||||||||||||||  || || ||||||| ||||||||||| ||    
T  22783412 gatcttcatcaaaatccccatcgggtgattcttcttcagattccacgaccttcaaagcttttgatgactttcctcttaatggtagggcaatggatttgct 22783313  T
Q  509 cttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctca 608  Q
     ||||| |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  22783312 tttcttggaagattcatgttcattgagacttatcttatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgcttaaatctttagcttcctca 22783213  T
Q  609 atagcagtcacctt 622  Q
    ||||||||||||||    
T  22783212 atagcagtcacctt 22783199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 409 - 622
Target Start/End: Original strand, 24723688 - 24723897
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttact 508  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||||||| ||||||||    
T  24723688 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttcactttagatagaagagcaatagatttact 24723787  T
Q  509 cttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctca 608  Q
    |||||||| | | ||||||||||| |||||||||||    ||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  24723788 cttcttagcaagctcatgttcatttagacttatctc----actttaagaaagttgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagcttactca 24723883  T
Q  609 atagcagtcacctt 622  Q
    |||||||| |||||    
T  24723884 atagcagtaacctt 24723897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 409 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 23185977 - 23185816
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttact 508  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||   ||||||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||| ||||||||    
T  23185977 gatcttcatctgaatctccatcaggtgaatcttcttcagattcaac---tttaagagcttttgaagacttcccttaggatggtagagcaattgatttact 23185881  T
Q  509 cttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatctt 573  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23185880 cttcctagcaggttcatgttcatttagacttatctcatgaactttgagagagctgacaatatctt 23185816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 409 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 23597240 - 23597079
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttact 508  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||   ||||||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||| ||||||||    
T  23597240 gatcttcatctgaatctccatcaggtgaatcttcttcagattcaac---tttaagagcttttgaagacttcccttaggatggtagagcaattgatttact 23597144  T
Q  509 cttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatctt 573  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23597143 cttcctagcaggttcatgttcatttagacttatctcatgaactttgagagagctgacaatatctt 23597079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 422 - 622
Target Start/End: Original strand, 24842516 - 24842716
Alignment:
Q  422 atctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggt 521  Q
    |||| ||||||| ||||||| |||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||  |||| ||||| ||||||||  ||||  ||||||||| ||      
T  24842516 atctgcatcaggggattctttttcagattcaatgactttgagagctttagatgactttcctttagatggcagagcaatatattttgtcttcttagtagag 24842615  T
Q  522 tcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagtcacct 621  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||| |||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  24842616 tcatgctcattgagactcatttcacgaaccttgatagaactcacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagcagtaacct 24842715  T
Q  622 t 622  Q
    |    
T  24842716 t 24842716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 525 - 624
Target Start/End: Original strand, 21137530 - 21137629
Alignment:
Q  525 tgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagtcacctttg 624  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21137530 tgttcattaaaacttatctcatgtacttttagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagcagtcacctttg 21137629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 409 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 24329493 - 24329277
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgacttta-ag--------agcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaat 499  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||  ||        || |||||| | |||  |||| ||||||||||||||    
T  24329493 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcaccggctttgtaggctttggaagattttgaagtctttcctttagatggtagagcaat 24329394  T
Q  500 ggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatcttta 599  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  24329393 ggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacacttaaagtatttagatcctta 24329294  T
Q  600 gtttcctcaatagcagt 616  Q
    | |||||||||||||||    
T  24329293 gcttcctcaatagcagt 24329277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 409 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 21163691 - 21163475
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgacttt-aag--------agcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaat 499  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||  ||        || |||||| || ||  |||| ||||||||||||||    
T  21163691 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttggaagattttgaagattttcctttagatggtagagcaat 21163592  T
Q  500 ggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatcttta 599  Q
     ||||||||||||||||| |  ||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  21163591 agatttactcttcttagaggactcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatcctta 21163492  T
Q  600 gtttcctcaatagcagt 616  Q
    | |||||||||||||||    
T  21163491 gcttcctcaatagcagt 21163475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Original strand, 27230588 - 27230723
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  27230588 ctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttagactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacact 27230687  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    |||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  27230688 taaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagt 27230723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Original strand, 35262153 - 35262288
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  35262153 ctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttagactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacact 35262252  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    |||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  35262253 taaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagt 35262288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Original strand, 35272778 - 35272913
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  35272778 ctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttagactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacact 35272877  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    |||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  35272878 taaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagt 35272913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 467 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 24416703 - 24416554
Alignment:
Q  467 ttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgaca 566  Q
    |||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| | ||| || ||||| || ||||  || ||||||    
T  24416703 ttttgaagactttcctttagatggtagagcaatggatttactcttcttagaagactcatgctcatttaaactcatttcatgcaccttgaaggaactgaca 24416604  T
Q  567 agatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  24416603 agatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctcaatagcagt 24416554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Original strand, 4219045 - 4219180
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  4219045 ctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacact 4219144  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    |||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  4219145 taaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagt 4219180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 409 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 9899317 - 9899101
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgacttt-aag--------agcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaat 499  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||  ||        || |||||| | |||  |||| ||||||| ||||||    
T  9899317 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttggaagattttgaggtctttcctttagatggtaaagcaat 9899218  T
Q  500 ggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatcttta 599  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  9899217 ggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacacttaaagtatttagatcctta 9899118  T
Q  600 gtttcctcaatagcagt 616  Q
    | |||||||||||||||    
T  9899117 gcttcctcaatagcagt 9899101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Original strand, 10276136 - 10276271
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  10276136 ctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacact 10276235  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    |||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  10276236 taaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagt 10276271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 409 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 11396916 - 11396700
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgact------tct---cttttgatggtagagcaat 499  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||    ||||| || ||||      |||   |||| ||||||| ||||||    
T  11396916 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttggaagactttgaggtctttcctttagatggtaaagcaat 11396817  T
Q  500 ggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatcttta 599  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  11396816 ggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacacttaaagtatttagatcctta 11396717  T
Q  600 gtttcctcaatagcagt 616  Q
    | |||||||||||||||    
T  11396716 gcttcctcaatagcagt 11396700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 409 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 19304163 - 19303956
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttact 508  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||  | | ||   |||||| || |||||  |||| |||||||||||||| ||| || |    
T  19304163 gatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttggaagactttactttagatggtagagcaatagatctatt 19304064  T
Q  509 cttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctca 608  Q
    |||||| || | |||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| |||||||    
T  19304063 cttctttgaggattcatgctcattcagactcatttcatgtacgttgagggaactgacaagatcttcaacactcaaagtgtttagatccttagcttcctca 19303964  T
Q  609 atagcagt 616  Q
    || |||||    
T  19303963 atggcagt 19303956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 22916523 - 22916388
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  22916523 ctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacact 22916424  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    |||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  22916423 taaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagt 22916388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 39171757 - 39171622
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  39171757 ctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacact 39171658  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    |||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  39171657 taaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagt 39171622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Original strand, 40249758 - 40249893
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  40249758 ctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacact 40249857  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    |||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  40249858 taaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagt 40249893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 409 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 9764507 - 9764291
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgacttt-aag--------agcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaat 499  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||  ||        || |||||| | |||  |||| ||||||| ||||||    
T  9764507 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttggaagattttgaggtctttcctttagatggtaaagcaat 9764408  T
Q  500 ggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatcttta 599  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  9764407 ggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgcgtgagctaacaagatcttcaacacttaaagtatttagatcctta 9764308  T
Q  600 gtttcctcaatagcagt 616  Q
    | |||||||||||||||    
T  9764307 gcttcctcaatagcagt 9764291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 409 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 34791961 - 34791745
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgacttt-aag--------agcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaat 499  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||  ||        || |||||| | |||  |||| ||||||| ||||||    
T  34791961 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttggaagattttgaggtctttcctttagatggtaaagcaat 34791862  T
Q  500 ggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatcttta 599  Q
    ||||||||||||||||||   |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  34791861 ggatttactcttcttagagatttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacacttaaagtatttagatcctta 34791762  T
Q  600 gtttcctcaatagcagt 616  Q
    | |||||||||||||||    
T  34791761 gcttcctcaatagcagt 34791745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Original strand, 43091828 - 43091963
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  43091828 ctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgtgctaacaagatcttcaacact 43091927  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    |||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  43091928 taaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagt 43091963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Original strand, 43353579 - 43353714
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  43353579 ctttagatggtaaagcaacggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttagactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacact 43353678  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    || ||| |||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  43353679 tagagtatttagatccttagcttcctcaatagcagt 43353714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 409 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 24803386 - 24803176
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttact 508  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||  | | ||    ||||| ||||||||  |||| |||||||||||||| ||| || |    
T  24803386 gatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtatgctttagatgactttcctttagatggtagagcaatagatctatt 24803287  T
Q  509 cttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctca 608  Q
    |||||| || | |||||| ||||| ||||| || ||||| || || || || ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||    
T  24803286 cttctttgaggattcatgctcattcagactcatttcatgtaccttaagggaactgacaaaatcttcaacactcaaagtgtttaaatccttggcttcctca 24803187  T
Q  609 atagcagtcac 619  Q
    || ||||||||    
T  24803186 atggcagtcac 24803176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 409 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 19301714 - 19301507
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttact 508  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||  | | ||   |||||| || |||||  |||| |||||||||||||| ||| || |    
T  19301714 gatcttcatcagaatctccatcgggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttggaagactttactttagatggtagagcaatagatctatt 19301615  T
Q  509 cttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctca 608  Q
    |||||| || | |||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||| |||| ||    
T  19301614 cttctttgaggattcatgctcattcagactcatttcatgtacattgagggaactgacaagatattcaacactcaaagtgtttagatccttagattccaca 19301515  T
Q  609 atagcagt 616  Q
    || |||||    
T  19301514 atggcagt 19301507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 413 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 24303830 - 24303627
Alignment:
Q  413 ttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttactcttc 512  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||| | | |||| | |||| ||||||||||| ||||||  ||| ||||  ||||||||  | ||   ||||    
T  24303830 ttcatcagaatctccatcaggggattcttctttagactcaatggctttgagagcttttgaggacttccatttagatgtcagagcaataaactttggcttc 24303731  T
Q  513 ttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctcaatag 612  Q
    |||| || |||||| ||||| ||||  |||||||| || |||||||| || | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||     
T  24303730 ttagtagattcatgctcatttagaccaatctcatgtaccttgagagaacttataagatcttcaacacttagagtgtttaaatctttagcttcatcaataa 24303631  T
Q  613 cagt 616  Q
    ||||    
T  24303630 cagt 24303627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Original strand, 26876117 - 26876252
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  26876117 ctttagatggtagagcaatagatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaagatcttcaacact 26876216  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    ||||||||||| ||| |||| |||||| || |||||    
T  26876217 taaagtgtttagatccttagcttcctctatggcagt 26876252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Original strand, 29253369 - 29253504
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  29253369 ctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacact 29253468  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    ||| || |||| ||| |||  |||||||||||||||    
T  29253469 taacgtatttagatccttaacttcctcaatagcagt 29253504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 522 - 614
Target Start/End: Complemental strand, 10900171 - 10900079
Alignment:
Q  522 tcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagca 614  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10900171 tcatgctcattgagactgatctcatgaaccttgaaagagctcataagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctctagtttcctcaatagca 10900079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 487 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 28722975 - 28722850
Alignment:
Q  487 atggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagt 586  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| |||||    
T  28722975 atggtagagcaatagatttactctttttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaagatcttcaacactcaaagt 28722876  T
Q  587 gtttaaatctttagtttcctcaatag 612  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||||    
T  28722875 gtttagatccttagcttcctcaatag 28722850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 569 - 624
Target Start/End: Original strand, 24574502 - 24574557
Alignment:
Q  569 atcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagtcacctttg 624  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24574502 atcttgaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagtcacctttg 24574557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Original strand, 4218964 - 4219007
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4218964 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 4219007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Original strand, 10276055 - 10276098
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10276055 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 10276098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Original strand, 26876036 - 26876079
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26876036 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 26876079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Original strand, 27230507 - 27230550
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27230507 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 27230550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 28723062 - 28723019
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28723062 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 28723019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Original strand, 29253288 - 29253331
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29253288 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 29253331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Original strand, 35262072 - 35262115
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35262072 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 35262115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Original strand, 35272697 - 35272740
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35272697 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 35272740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 39171838 - 39171795
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39171838 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 39171795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Original strand, 40249677 - 40249720
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40249677 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 40249720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Original strand, 43353498 - 43353541
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43353498 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 43353541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 518 - 611
Target Start/End: Complemental strand, 21919736 - 21919643
Alignment:
Q  518 aggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctcaata 611  Q
    |||||| || ||||| ||||  || ||||||  |||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||  ||| ||||||||||    
T  21919736 aggttcttgctcattgagaccaatatcatgacatttgagagagcttataagatcttcaacacttagagtgtttagatccgtagcttcctcaata 21919643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 22916604 - 22916561
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22916604 gatcttcattagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 22916561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 24416770 - 24416727
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  24416770 gatcttcatcagaatctccatcaagtgattcttcttcagattca 24416727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Original strand, 43091747 - 43091790
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43091747 gatcctcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 43091790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 150; Significance: 6e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 409 - 610
Target Start/End: Original strand, 2551 - 2752
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttact 508  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||| |    
T  2551 gatcttcatcagaatatccatcaggtgattcttcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagtaatggatttaat 2650  T
Q  509 cttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctca 608  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  2651 cttcctagaaggttcatgttcattaagacatatctcgtgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatatttagcttcctca 2750  T
Q  609 at 610  Q
    ||    
T  2751 at 2752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 149; Significance: 2e-78; HSPs: 41)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 413 - 615
Target Start/End: Original strand, 17720192 - 17720391
Alignment:
Q  413 ttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttactcttc 512  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||||||| ||    
T  17720192 ttcatctgaatctccatcaggtgattcttcttcagattcaac---tttaagagcttttgatgactttcctttagatggtagagcaatagatttactcctc 17720288  T
Q  513 ttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctcaatag 612  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17720289 ttagcaggttcatgttcatttagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatag 17720388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 409 - 622
Target Start/End: Original strand, 18613480 - 18613693
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttact 508  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  18613480 gatcttcatcagaatctccatatggtgattcttcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgactcccctttagatggcagagcaatggatttact 18613579  T
Q  509 cttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctca 608  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18613580 cttcttagcaggctcatgttcatttaaacttatctcatgaacctttagagagcttacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagcttcctca 18613679  T
Q  609 atagcagtcacctt 622  Q
    |||||||| |||||    
T  18613680 atagcagtaacctt 18613693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 409 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 25450037 - 25449822
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttact 508  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| | ||  | ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25450037 gatcttcgtcagaatctccatcaggtgatttttcttcagactcggcaacttttagaacttttgatgacttcccttttgatggtagagcaatggatttact 25449938  T
Q  509 cttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctca 608  Q
    ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  25449937 ctttttggaaggttcatgctcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgataagatcttcaacactgaaagtgtttaaatctttagcttcctca 25449838  T
Q  609 atagcagtcacctttg 624  Q
    || |||||||| ||||    
T  25449837 atggcagtcacttttg 25449822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 409 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 21196469 - 21196259
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttact 508  Q
    |||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||| |||||||   ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  21196469 gatcttcatctgaacctccatctggtgaatcttcttcagattcaac---tttaagagcttttgaagacttccctttagatggtagatcaattgatttact 21196373  T
Q  509 cttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctca 608  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  21196372 cttcttagcaggctcatgttcatttagagttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgttcaaatctttagcttcctca 21196273  T
Q  609 atagcagtcacctt 622  Q
    |||||||| |||||    
T  21196272 atagcagtgacctt 21196259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 410 - 576
Target Start/End: Complemental strand, 22445097 - 22444931
Alignment:
Q  410 atcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttactc 509  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22445097 atcttcatcaaaatctccattaggtgattcttcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttcccttttgatggttgagcaatggatttactc 22444998  T
Q  510 ttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaa 576  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  22444997 ttcttagaggattcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctaataagatcttcaa 22444931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 410 - 576
Target Start/End: Complemental strand, 22450331 - 22450165
Alignment:
Q  410 atcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttactc 509  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22450331 atcttcatcaaaatctccattaggtgattcttcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttcccttttgatggttgagcaatggatttactc 22450232  T
Q  510 ttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaa 576  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  22450231 ttcttagaggattcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctaataagatcttcaa 22450165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 409 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 21126143 - 21125928
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttact 508  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||| || |  |||||||| |||||  |||||||| ||| |||||||||||| ||    
T  21126143 gatcctcatcagaatccccatcaggagattcttcttcagattccacgacctttaatgcttttgaagactttccttttgattgtatagcaatggatttgct 21126044  T
Q  509 cttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctca 608  Q
     |||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  21126043 tttcttgaaagattcatgttcattgagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacactcaaagtgtttaaatctttagcttcctca 21125944  T
Q  609 atagcagtcacctttg 624  Q
    |||||| |||||||||    
T  21125943 atagcaatcacctttg 21125928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 409 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 21207592 - 21207377
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttact 508  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||  |||||||| |||||  | |||||| ||| |||||||||||| ||    
T  21207592 gatcctcatcagaatccccatcaggagattcttcttcagattccacgaccttaaatgcttttgaagactttccatttgatagtaaagcaatggatttgct 21207493  T
Q  509 cttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctca 608  Q
     |||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  21207492 tttcttgaaagattcatgttcattgagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacactcaaagtgtttaaatctttagcttcctca 21207393  T
Q  609 atagcagtcacctttg 624  Q
    |||||| |||||||||    
T  21207392 atagcaatcacctttg 21207377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 409 - 622
Target Start/End: Original strand, 23023181 - 23023394
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttact 508  Q
    |||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||| | || || ||||| ||||| ||||||||| |  ||||  ||||||  ||||||||||| ||    
T  23023181 gatcctcatcagaatctccattcggtgattcttcttcagactccacaactttgagagcctttgatgaccttcctttgaatggtaaggcaatggattttct 23023280  T
Q  509 cttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctca 608  Q
     ||||| || |  ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  23023281 tttcttggatgactcatgttcattaagactaatctcatgaactttaagagagctgacaagatcttcaacacttagagtgttcaaatctttagcttcctca 23023380  T
Q  609 atagcagtcacctt 622  Q
    ||||||||||||||    
T  23023381 atagcagtcacctt 23023394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 413 - 600
Target Start/End: Original strand, 20943079 - 20943272
Alignment:
Q  413 ttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttactcttc 512  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||   |||||||||| || |||||||  |||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  20943079 ttcatctgaatctccattaggtgattcttcttcagattcaac---tttaagagctctttatgactttcctttagatggtagagcaattgatttactcttc 20943175  T
Q  513 ttagaaggttcatgttcattaa---------gacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttag 600  Q
    |||| ||  ||||||||||| |         |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20943176 ttagcagactcatgttcatttactcttctttgactaatctcatgaactttgatagacctgacaagatcttcaacacctaaagtgtttaaatctttag 20943272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 409 - 619
Target Start/End: Original strand, 22017627 - 22017837
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttact 508  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||  | | ||    ||||| ||||||||  |||| |||||||||||||| |||||| |    
T  22017627 gatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtatgctttggatgactttcctttagatggtagagcaatagatttatt 22017726  T
Q  509 cttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctca 608  Q
    |||||| || | |||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| || |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||| |||||||    
T  22017727 cttctttgaggattcatgctcattcagactcatttcatgtactttgagggaactgacaagattttcaacactcaaagtgtttagatccttagcttcctca 22017826  T
Q  609 atagcagtcac 619  Q
    || ||||||||    
T  22017827 atggcagtcac 22017837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 409 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 7691237 - 7691021
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgacttta-ag--------agcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaat 499  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||  ||        || |||||| |||||  |||| ||||||| ||||||    
T  7691237 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttggaagattttgaagactttcctttagatggtaaagcaat 7691138  T
Q  500 ggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatcttta 599  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  7691137 ggatttactcttcttagaggattcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgaactaacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatcctta 7691038  T
Q  600 gtttcctcaatagcagt 616  Q
    | |||||||||||||||    
T  7691037 gcttcctcaatagcagt 7691021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 409 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 35639805 - 35639589
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgacttt-aag--------agcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaat 499  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||  ||        || |||||| | |||  |||| ||||||| ||||||    
T  35639805 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttggaagattttgaggtctttcctttagatggtaaagcaat 35639706  T
Q  500 ggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatcttta 599  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  35639705 ggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttagactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacacttaaagtatttagatcctta 35639606  T
Q  600 gtttcctcaatagcagt 616  Q
    | |||||||||||||||    
T  35639605 gcttcctcaatagcagt 35639589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Original strand, 3180737 - 3180872
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  3180737 ctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacact 3180836  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    |||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  3180837 taaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagt 3180872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Original strand, 4176438 - 4176573
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  4176438 ctttagatggtagagcaatggatttactcttcttagaggttttatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacact 4176537  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    |||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  4176538 taaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagt 4176573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Original strand, 5842340 - 5842475
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  5842340 ctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacact 5842439  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    |||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  5842440 taaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagt 5842475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Original strand, 7516410 - 7516545
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  7516410 ctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacact 7516509  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    |||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  7516510 taaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagt 7516545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 12616008 - 12615873
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  12616008 ctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacact 12615909  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    |||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  12615908 taaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagt 12615873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Original strand, 12739664 - 12739799
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  12739664 ctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacact 12739763  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    |||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  12739764 taaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagt 12739799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Original strand, 21876284 - 21876419
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  21876284 ctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacact 21876383  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    |||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  21876384 taaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagt 21876419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 36238115 - 36237980
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  36238115 ctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacact 36238016  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    |||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  36238015 taaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagt 36237980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 409 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 47609702 - 47609486
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgacttt--aag-------agcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaat 499  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||  |||       || |||||| | |||  |||| ||||||| ||||||    
T  47609702 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaagctttggaagattttgaggtctttcctttagatggtaaagcaat 47609603  T
Q  500 ggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatcttta 599  Q
     ||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  47609602 agatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacacttaaagtatttagatcctta 47609503  T
Q  600 gtttcctcaatagcagt 616  Q
    | |||||||||||||||    
T  47609502 gcttcctcaatagcagt 47609486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 51630877 - 51630742
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  51630877 ctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacact 51630778  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    |||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  51630777 taaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagt 51630742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Original strand, 19186341 - 19186476
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  19186341 ctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacact 19186440  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    ||| || |||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  19186441 taacgtatttagatccttagcttcctcaatagcagt 19186476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 409 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 20874986 - 20874779
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttact 508  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||  | | ||   |||||| || |||||  |||| |||||||||||||| ||| || |    
T  20874986 gatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttggaagactttcctttagatggtagagcaatagatctatt 20874887  T
Q  509 cttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctca 608  Q
    ||||||||| | |||||  ||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||| |||    
T  20874886 cttcttagaggattcattctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaagatcttcaacactcaaagtgtttagatccttagcttcatca 20874787  T
Q  609 atagcagt 616  Q
    || |||||    
T  20874786 atggcagt 20874779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 409 - 616
Target Start/End: Original strand, 38104140 - 38104356
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgacttt--aag-------agcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaat 499  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||  |||       || |||||| | |||  |||| ||||||| | ||||    
T  38104140 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaagctttggaagattttgaggtctttcctttagatggtaaaccaat 38104239  T
Q  500 ggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatcttta 599  Q
     ||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  38104240 agatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacacttaaagtatttagatcctta 38104339  T
Q  600 gtttcctcaatagcagt 616  Q
    | |||||||||||||||    
T  38104340 gcttcctcaatagcagt 38104356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 508 - 616
Target Start/End: Original strand, 38093622 - 38093730
Alignment:
Q  508 tcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctc 607  Q
    |||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||||||    
T  38093622 tcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacacttaaagtatttagatccttagcttcctc 38093721  T
Q  608 aatagcagt 616  Q
    |||||||||    
T  38093722 aatagcagt 38093730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 409 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 5641483 - 5641260
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgacttt-aag--------agcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaat 499  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||  ||        || |||||| | |||  |||| ||||||||||||||    
T  5641483 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggctttgtaggctttggaagattttgaagtctttcctttagatggtagagcaat 5641384  T
Q  500 ggatttactctt-------cttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaa 592  Q
    |||||||||| |        ||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||     
T  5641383 ggatttactccttttagggtttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacacttaaagtatttag 5641284  T
Q  593 atctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    ||| |||| |||||||||||||||    
T  5641283 atccttagcttcctcaatagcagt 5641260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 572 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 22431580 - 22431528
Alignment:
Q  572 ttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagtcacctttg 624  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22431580 ttcaacacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagcagtcacctttg 22431528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 509 - 612
Target Start/End: Original strand, 9345191 - 9345294
Alignment:
Q  509 cttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctca 608  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||   || ||||| |||||||| | |||||||||| |||  |||||||    
T  9345191 cttcttagcagattcatgttcattaagaccaatctcatgaaccttgagagagcttctaatatctttaacacttagaatgtttaaatccttaacttcctca 9345290  T
Q  609 atag 612  Q
    ||||    
T  9345291 atag 9345294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Original strand, 3180656 - 3180699
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3180656 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 3180699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Original strand, 4176357 - 4176400
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4176357 gatcttcatctgaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 4176400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Original strand, 5842259 - 5842302
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5842259 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 5842302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Original strand, 7516329 - 7516372
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7516329 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 7516372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 12616089 - 12616046
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12616089 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 12616046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Original strand, 21876203 - 21876246
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21876203 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 21876246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 36238196 - 36238153
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36238196 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 36238153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 51630958 - 51630915
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  51630958 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 51630915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Original strand, 19186260 - 19186303
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19186260 gatcctcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 19186303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 410 - 452
Target Start/End: Original strand, 12739584 - 12739626
Alignment:
Q  410 atcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  12739584 atcttcatcagaatctccatcgggtgattcttcttcagattca 12739626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 539 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 23976091 - 23976030
Alignment:
Q  539 tatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttag 600  Q
    ||||||||||  |||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||    
T  23976091 tatctcatgacatttgagagagcttataagatcttcaagacttagagtgtttagatatttag 23976030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 144; Significance: 2e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 421 - 624
Target Start/End: Original strand, 47641 - 47843
Alignment:
Q  421 aatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaagg 520  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||    
T  47641 aatctccatcaggtgattcttcttcagattcaacaactttaagagcttttgatgacttccctttagatggcagagcaatggatttactcttcctaaaagg 47740  T
Q  521 ttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagtcacc 620  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  47741 ttcatgttcattaagacttctctcatgaactttgagagagctaacatgatcatcaacac-taatgtgtttaaatctttagcttcctcaatagcagtcacc 47839  T
Q  621 tttg 624  Q
    ||||    
T  47840 tttg 47843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 144; Significance: 2e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 409 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 27443 - 27228
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttact 508  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| || | |||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||| ||    
T  27443 gatcttcatcagaatccccatcaggtgattcttcttcagattccacgaccttcaaagcttttgatgactttcctcttgatggtagagcaatggatttgct 27344  T
Q  509 cttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctca 608  Q
     ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27343 tttcttggaagattcatgttcattgagacttatctcatgaactttgagagagccgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagcttcctca 27244  T
Q  609 atagcagtcacctttg 624  Q
    |||| |||||||||||    
T  27243 atagtagtcacctttg 27228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0389 (Bit Score: 138; Significance: 8e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0389
Description:

Target: scaffold0389; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 409 - 616
Target Start/End: Original strand, 12268 - 12472
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttact 508  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  12268 gatcttcatctgaatctccatcaggtgattcttcttcagattcaac---tttaagagctcttgatgactttcctttagatggtagagcaattgatttact 12364  T
Q  509 cttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctca 608  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||     
T  12365 cttcttagcaggctcatgttcattgagacttatctcatgaacattgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaagtctttagcttcctct 12464  T
Q  609 atagcagt 616  Q
    ||||||||    
T  12465 atagcagt 12472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 136; Significance: 1e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 409 - 624
Target Start/End: Original strand, 209718 - 209933
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttact 508  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || || || | ||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||||| ||    
T  209718 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattccacaacctttaaagcttttaatgactttcctcttgatggtagagcaatggatttgct 209817  T
Q  509 cttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctca 608  Q
     |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  209818 tttcttgaaagattcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcctcaacacttaaagtgtttaaatctttagcttaatca 209917  T
Q  609 atagcagtcacctttg 624  Q
    ||||||||||||||||    
T  209918 atagcagtcacctttg 209933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 134; Significance: 2e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 411 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 67173 - 66960
Alignment:
Q  411 tcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttactct 510  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| || | | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || |    
T  67173 tcttcatcagaatccccatcaggtgattcttcttcagattccacgacctttaaaacttttgatgactttccttttgatggtagagcaatggattttcttt 67074  T
Q  511 tcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctcaat 610  Q
    ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  67073 tcttgaaagattcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcctcaacacttaaggtgtttaaatctctagcttcctcaat 66974  T
Q  611 agcagtcacctttg 624  Q
    |||| |||||||||    
T  66973 agcaatcacctttg 66960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 409 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 166460 - 166247
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttact 508  Q
    |||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||    | ||    ||||| |||| |||  |||| |||||||||||||| |||||| |    
T  166460 gatcttcatcagaacctccatctggtgattcttcttcagattcactagccttgtatgctttagatggctttcctttagatggtagagcaatagatttatt 166361  T
Q  509 cttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctca 608  Q
    |||||| || | |||||| ||||| || || || |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||| |||    
T  166360 cttctttgaggattcatgctcattcaggctcatttcatgaaccttgagggaactgacaagatcttcaacactcaaagtgtttagatccttagcttcttca 166261  T
Q  609 atagcagtcacctt 622  Q
    || ||||| |||||    
T  166260 atggcagtaacctt 166247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 132; Significance: 3e-68; HSPs: 3)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 409 - 622
Target Start/End: Original strand, 6972 - 7182
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttact 508  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||   ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  6972 gatcttcacctgaatctccatcaggtgaatcttcttcagattcaac---tttaagagcttttgaagacttccctttagatggtagagtaattgatttact 7068  T
Q  509 cttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctca 608  Q
    |||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  7069 cttcttagcaagctcatgttcatttagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgttcaaatatttagcttcctca 7168  T
Q  609 atagcagtcacctt 622  Q
    |||||||| |||||    
T  7169 atagcagtaacctt 7182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 34589 - 34454
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||| | ||| || ||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  34589 ctttagatggtagagcaatggatttactcttcttagaggactcatgctcatttaaactcatttcatgcaccttgagggaactgacaagatcttcaacact 34490  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  34489 taaagtgtttagatccttagcttcctcaatagcagt 34454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 34670 - 34627
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34670 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 34627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 132; Significance: 3e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 409 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 111394 - 111179
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttact 508  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || || | | |||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||    
T  111394 gatcttcgtcagaatccccatcaggtgattcttcttcagattccacaacctttaaaacttttgatgactttcctcttgatggtagagcaatgtatttact 111295  T
Q  509 cttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctca 608  Q
     |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  111294 tttcttgaaagattcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaatatcctcaacacttaaagtgtttaaatctttaggttcctca 111195  T
Q  609 atagcagtcacctttg 624  Q
    ||||||||||||||||    
T  111194 atagcagtcacctttg 111179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 127; Significance: 3e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 409 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 43510 - 43324
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttact 508  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  43510 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcaacaactttcaaagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatagatttact 43411  T
Q  509 cttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatc 595  Q
    | | |||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43410 ccttttagtagactcatgttcattgagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttaaacacttaaagtgtttaaatc 43324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 122; Significance: 3e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 409 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 11864 - 11651
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttact 508  Q
    |||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||  ||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||    
T  11864 gatcttcatcagagtctccatcaagtgactcttcttctgatttaataactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaataaatttact 11765  T
Q  509 cttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctca 608  Q
     ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||    
T  11764 tttcttagcaggctcatgttcatttagacttatctcatgaaccttgagaaagctgacaagatcttcaacacttcaagtttttaaatctttagcttcctca 11665  T
Q  609 atagcagtcacctt 622  Q
    |||||||| |||||    
T  11664 atagcagtaacctt 11651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 409 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 16537 - 16324
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttact 508  Q
    |||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||  ||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||    
T  16537 gatcttcatcagagtctccatcaagtgactcttcttctgatttaataactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaataaatttact 16438  T
Q  509 cttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctca 608  Q
     ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||    
T  16437 tttcttagcaggctcatgttcatttagacttatctcatgaaccttgagaaagctgacaagatcttcaacacttcaagtttttaaatctttagcttcctca 16338  T
Q  609 atagcagtcacctt 622  Q
    |||||||| |||||    
T  16337 atagcagtaacctt 16324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315 (Bit Score: 113; Significance: 7e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0315
Description:

Target: scaffold0315; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 409 - 622
Target Start/End: Original strand, 6984 - 7193
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttact 508  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||    ||||||||| ||||||||||  |||| ||||  ||  | || ||||||||    
T  6984 gatcttcatctgactctccatcaggtgattcttcttcagattcaac----ttaagagctcttgatgactttcctttagatgacagcacgattgatttact 7079  T
Q  509 cttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctca 608  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  7080 cttcttagtaggctcatgttcattgagactaatctcatgaactttgagagagctgacaagatcatcaacacttaaattgtttaaatctttagcttcctca 7179  T
Q  609 atagcagtcacctt 622  Q
    |||||||| |||||    
T  7180 atagcagtaacctt 7193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 112; Significance: 3e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 409 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 1985 - 1782
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttact 508  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||  |||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||  |    
T  1985 gatctttatcagaatctccatcaggtgactcttcttcagatttaataactttaagagttttagatgacttcactttagatggaagagcaatagattttgt 1886  T
Q  509 cttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctca 608  Q
    |||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  1885 cttcttagtaggctcatgtttatttagacttatctcatgaaccttgagagagttgacaagatcttcaacacttaaaatgtttaaatctttagcttcctca 1786  T
Q  609 atag 612  Q
    ||||    
T  1785 atag 1782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 98; Significance: 6e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 409 - 582
Target Start/End: Complemental strand, 25883 - 25711
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttact 508  Q
    ||||||||||  | |||||||||||||| |||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  25883 gatcttcatcaaagtctccatcaggtgactctt-ttcagattcaataactttaagagcttttgatgacttccctttagatggtagagcaatagatttact 25785  T
Q  509 cttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacactta 582  Q
    |||||||| |||  |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25784 cttcttagcaggcgcatgttcatttagacttatttcatgaaccttgagagagctaacaagatcttcaacactta 25711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 91; Significance: 9e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 409 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 3267 - 3057
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttact 508  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||  | | ||   |||||| ||||||||  |||| |||||||||||||| || |||||    
T  3267 gatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttggatgactttcctttagatggtagagcaatagacttact 3168  T
Q  509 cttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctca 608  Q
    |||||| || |  ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  3167 cttctttgaggactcatgctcattcagactcatttcatgaactttgagggaactgacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctca 3068  T
Q  609 atagcagtcac 619  Q
    || ||||||||    
T  3067 atggcagtcac 3057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 86; Significance: 9e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 523 - 624
Target Start/End: Original strand, 17546 - 17647
Alignment:
Q  523 catgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagtcacctt 622  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  17546 catgttcattgagacttatctcatgaacttttagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagcttcctcaatagaagtcacctt 17645  T
Q  623 tg 624  Q
    ||    
T  17646 tg 17647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 409 - 465
Target Start/End: Original strand, 14586 - 14642
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagag 465  Q
    ||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  14586 gatcttcatcaaaatcttcatcaagtgattcttcttcagattcaacggctttaagag 14642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 81; Significance: 8e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 409 - 616
Target Start/End: Original strand, 75576 - 75784
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttact 508  Q
    |||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| ||| ||||  |||| ||||| |||||||| |||||  |    
T  75576 gatcttcatcagaatctccatcagaggattcttcttcagattcaacgactttgagatctttagataactttcctttagatggaagagcaatagatttttt 75675  T
Q  509 cttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact-taaagtgtttaaatctttagtttcctc 607  Q
    |||||||| |   ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| |     
T  75676 cttcttagcaaactcatgctcattgagacttatttcatgaaccttgaaatagcttacaagatcttcaacactcaaaagtgtttaaatctttagcttcttt 75775  T
Q  608 aatagcagt 616  Q
    |||||||||    
T  75776 aatagcagt 75784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1507 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold1507
Description:

Target: scaffold1507; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 409 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 1138 - 931
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttact 508  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||  | | ||    ||||| ||||||||  |||| |||||||||||||| ||| || |    
T  1138 gatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtatgctttagatgactttcctttagatggtagagcaatagatctatt 1039  T
Q  509 cttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctca 608  Q
    |||||| || | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||  |||||||    
T  1038 cttctttgaggattcatgctcattcaaactcatttcatgtactttgagggaactgacaagatcttcaacactcaaagtgtttagatccttaacttcctca 939  T
Q  609 atagcagt 616  Q
    ||||||||    
T  938 atagcagt 931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0105 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0105
Description:

Target: scaffold0105; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 481 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 38641 - 38506
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  38641 ctttagatggtaaagcaatggatttactcttcttagaggtttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacact 38542  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    |||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  38541 taaagtatttagatccttagcttcctcaatagcagt 38506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0105; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 38722 - 38679
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca 452  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38722 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattca 38679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 409 - 616
Target Start/End: Original strand, 3796 - 4003
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttact 508  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||  | | ||   |||||| || |||||  |||| |||||||||||||| ||| || |    
T  3796 gatcttcatcagaatctccatctggtgactcttcttcagattcactggccttgtaagctttggaagactttcctttagatggtagagcaatagatctatt 3895  T
Q  509 cttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctca 608  Q
    ||||||||| | |||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| |||||||    
T  3896 cttcttagaggattcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaagatcttcaacactcaaagtgtttagatccttagcttcctca 3995  T
Q  609 atagcagt 616  Q
    || |||||    
T  3996 atggcagt 4003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 71; Significance: 8e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 409 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 44945 - 44735
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttact 508  Q
    |||||||||| ||||||||||| || ||||||| |||| |||||  | | ||   |||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||  | |||||    
T  44945 gatcttcatcagaatctccatctggcgattcttgttcagattcactggccttgtaagctttggatgactttcctttagatggtagagcaataaacttact 44846  T
Q  509 cttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctca 608  Q
    |||||| || |   |||| ||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| |    
T  44845 cttctttgaggacgcatgctcattcagactcatttcatgaactttgagggaactgacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctta 44746  T
Q  609 atagcagtcac 619  Q
    || ||||||||    
T  44745 atggcagtcac 44735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 409 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 55248 - 55038
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttact 508  Q
    |||||||||| ||||||||||| || ||||||| |||| |||||  | | ||   |||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||  | |||||    
T  55248 gatcttcatcagaatctccatctggcgattcttgttcagattcactggccttgtaagctttggatgactttcctttagatggtagagcaataaacttact 55149  T
Q  509 cttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctca 608  Q
    |||||| || |   |||| ||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| |    
T  55148 cttctttgaggacgcatgctcattcagactcatttcatgaactttgagggaactgacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctta 55049  T
Q  609 atagcagtcac 619  Q
    || ||||||||    
T  55048 atggcagtcac 55038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0272 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0272
Description:

Target: scaffold0272; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 409 - 616
Target Start/End: Original strand, 23737 - 23953
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatga---------cttctcttttgatggtagagcaat 499  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  | | |||  |||||| || ||         |||| |||| ||||||||||||||    
T  23737 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggccttataagctttagaagatttggaggacttccctttagatggtagagcaat 23836  T
Q  500 ggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatcttta 599  Q
     ||||||||||||||||| |  ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||    
T  23837 agatttactcttcttagaggactcatgctcatttagactcatttcatgcactttgaggaaactgacaagatcttcaacactaaaagtatttagatcctta 23936  T
Q  600 gtttcctcaatagcagt 616  Q
    | |||||||||||||||    
T  23937 gcttcctcaatagcagt 23953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1820 (Bit Score: 68; Significance: 5e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold1820
Description:

Target: scaffold1820; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 471 - 622
Target Start/End: Original strand, 3 - 154
Alignment:
Q  471 gatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagat 570  Q
    ||||||||  |||| |||||||||||||| |||||| ||||||| || | |||||| ||||| || || || |||||||| ||||| || ||||||||||    
T  3 gatgactttcctttagatggtagagcaatagatttattcttctttgaggattcatgctcattcaggctcatttcatgaaccttgagggaactgacaagat 102  T
Q  571 cttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagtcacctt 622  Q
    |||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||| |||||||||||    
T  103 cttcaacactcaaagtgtttagatccttagcttcctcaatggcagtcacctt 154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 66; Significance: 7e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 409 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 1448 - 1235
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttact 508  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| |||||    | ||    ||||| |||| |||  |||| |||||||||||||| |||||| |    
T  1448 gatcttcatcagaatcttcatctggtgattcttcttcagattcactagccttgtatgctttagatggctttcctttagatggtagagcaatagatttatt 1349  T
Q  509 cttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctca 608  Q
    |||||| ||||  ||||| ||||| || || || |||||||| ||||| || |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||| |||||||    
T  1348 cttctttgaagactcatgctcatttaggctcatttcatgaaccttgagggaactgacaagattttcaacactcaaagtgtttagatccttagcttcctca 1249  T
Q  609 atagcagtcacctt 622  Q
    || |||||||||||    
T  1248 atggcagtcacctt 1235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 551 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 1160 - 1089
Alignment:
Q  551 tttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagtcacctt 622  Q
    |||||| || |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||| |||||||||||    
T  1160 tttgagggaactgacaagattttcaacactcaaagtgtttagatccttagcttcctcaatggcagtcacctt 1089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0630 (Bit Score: 64; Significance: 1e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0630
Description:

Target: scaffold0630; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 409 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 3935 - 3840
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatt 504  Q
    |||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  3935 gatcttcaccagagtctccatcaggtgattcttcttcagattcaacaactttaagagattttgatgacttccctttagatggtagagcaatggatt 3840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 63; Significance: 5e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 409 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 9532 - 9322
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgac---------tttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaat 499  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |         ||||  || ||| || |||||  |||| ||||||||||||||    
T  9532 gatcttcatcagaatctccatcaggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttagaagatttggaagactttcctttagatggtagagcaat 9433  T
Q  500 ggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatcttta 599  Q
     ||||||||||||||||| |  ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  9432 agatttactcttcttagaggactcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaagatcttcaacactcaaagtgtttagatcctta 9333  T
Q  600 gtttcctcaat 610  Q
    | |||||||||    
T  9332 gcttcctcaat 9322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0382 (Bit Score: 61; Significance: 7e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0382
Description:

Target: scaffold0382; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 409 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 3049 - 2838
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattca-acgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttac 507  Q
    |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||| | | |||  |  ||||| |||| |||  ||||  ||||||||||||| |||||||    
T  3049 gatcttcatcagaatctccatctggcgattcttcttcagattcacaagccttgtat-gctttagatggctttcctttatatggtagagcaatagatttac 2951  T
Q  508 tcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtg-tttaaatctttagtttcct 606  Q
    ||||||| || |  ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||| |||||    
T  2950 tcttctttgaggactcatgctcattcagactcatttcatgaaccttgagggaactgacaagatcttcaacactcaaagtgttttagatccttagattcct 2851  T
Q  607 caatagcagtcac 619  Q
    |||| ||||||||    
T  2850 caatggcagtcac 2838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0185 (Bit Score: 59; Significance: 1e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0185
Description:

Target: scaffold0185; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 409 - 619
Target Start/End: Original strand, 31600 - 31810
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttact 508  Q
    |||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||  | | ||   |||||| ||||||||  | || |||||||||||||| ||| || |    
T  31600 gatcttaatcagaatctccatctggtgactcttcttcagattcactggccttgtaagctttggatgactttccattagatggtagagcaatagatctatt 31699  T
Q  509 cttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctca 608  Q
    |||||| || | |||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||  |||||||    
T  31700 cttctttgaggattcatgctcattcagactcatttcatgtaccttgaaggaactgacaagatcttcaacacttaaagtgttaagatccttaacttcctca 31799  T
Q  609 atagcagtcac 619  Q
    || ||||||||    
T  31800 atggcagtcac 31810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0925 (Bit Score: 55; Significance: 3e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0925
Description:

Target: scaffold0925; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 481 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 3913 - 3775
Alignment:
Q  481 cttttgatggtagagcaatggatttactcttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacact 580  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| ||||||| || |  ||||| ||||| || || || |||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  3913 ctttagatggtagagcaatagatttattcttctttgaggactcatgctcattcaggctcatttcatgaaccttgagggaaatgacaagatcttcaacact 3814  T
Q  581 taaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagtcac 619  Q
     |||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  3813 caaagtgtttagatccttagcttcctcaatggcagtcac 3775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0892 (Bit Score: 53; Significance: 4e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0892
Description:

Target: scaffold0892; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 409 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 165 - 1
Alignment:
Q  409 gatcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttact 508  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||  | | ||   |||||| ||||||||  |||| |||||||||||||| ||| || |    
T  165 gatcttcatcagaatctccatctggtgattcttcttcagattcactggccttgtaagctttggatgactttcctttagatggtagagcaatagatctatt 66  T
Q  509 cttcttagaaggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatctt 573  Q
    ||||||||| | |||||| | ||| ||||| || ||||| || ||||| || |||||||||||||    
T  65 cttcttagaggattcatgcttattcagactcatttcatgtaccttgagggaactgacaagatctt 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 52; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 521 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 53381 - 53286
Alignment:
Q  521 ttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagt 616  Q
    |||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  53381 ttcatgctcatttaaactcatttcatgcactttgagtgagctaacaagatcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctcaatagcagt 53286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0758 (Bit Score: 46; Significance: 6e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0758
Description:

Target: scaffold0758; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 518 - 619
Target Start/End: Original strand, 2774 - 2875
Alignment:
Q  518 aggttcatgttcattaagacttatctcatgaactttgagagagctgacaagatcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagtc 617  Q
    |||||| |||||| ||||||  |||||||||  |||||||||||| |  |||||||| ||||||| |||||||| ||| |||| ||||||||||||||||    
T  2774 aggttcttgttcaataagaccaatctcatgacatttgagagagcttatgagatcttcgacacttagagtgtttagatccttagcttcctcaatagcagtc 2873  T
Q  618 ac 619  Q
    ||    
T  2874 ac 2875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 46; Significance: 6e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 411 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 20255 - 20150
Alignment:
Q  411 tcttcatcggaatctccatcaggtgattcttcttcaaattcaacgactttaagagcttttgatgacttctcttttgatggtagagcaatggatttactct 510  Q
    |||||||  ||||||| |||||| |||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||  |||| ||||| |||||||| |||||  |||    
T  20255 tcttcattagaatctcgatcaggggattcttcttcagattcaatgactttgagagctttagatgactttcctttagatggcagagcaatagattttgtct 20156  T
Q  511 tcttag 516  Q
    ||||||    
T  20155 tcttag 20150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0443
Description:

Target: scaffold0443; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 570 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 2609 - 2555
Alignment:
Q  570 tcttcaacacttaaagtgtttaaatctttagtttcctcaatagcagtcacctttg 624  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  2609 tcttcaacacttaaagtgtttagatccttagcttcctcaatggcagtcacttttg 2555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University