View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6092_low_1 (Length: 604)

Name: NF6092_low_1
Description: NF6092
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6092_low_1
NF6092_low_1
[»] chr8 (11 HSPs)
chr8 (7-593)||(14892199-14892785)
chr8 (7-592)||(21211417-21212002)
chr8 (9-519)||(22832121-22832631)
chr8 (75-500)||(33600415-33600840)
chr8 (145-500)||(25035933-25036288)
chr8 (145-500)||(25049970-25050325)
chr8 (145-500)||(18233759-18234114)
chr8 (145-500)||(18243210-18243565)
chr8 (145-500)||(12916388-12916743)
chr8 (280-492)||(23749913-23750125)
chr8 (287-410)||(45497837-45497960)
[»] chr4 (9 HSPs)
chr4 (7-591)||(16254548-16255127)
chr4 (7-592)||(6693527-6694112)
chr4 (7-590)||(17150684-17151267)
chr4 (22-590)||(520375-520943)
chr4 (7-590)||(7844905-7845488)
chr4 (100-499)||(54698311-54698710)
chr4 (145-491)||(26813342-26813688)
chr4 (555-590)||(13791747-13791782)
chr4 (508-546)||(13791715-13791753)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (7-592)||(52979-53562)
[»] chr7 (16 HSPs)
chr7 (7-592)||(9543687-9544272)
chr7 (7-592)||(5389618-5390203)
chr7 (7-592)||(16140631-16141216)
chr7 (7-592)||(26304865-26305450)
chr7 (7-592)||(26361368-26361953)
chr7 (7-592)||(32099689-32100274)
chr7 (7-592)||(46498423-46499008)
chr7 (7-592)||(6535793-6536378)
chr7 (7-592)||(8502358-8502943)
chr7 (7-592)||(44898608-44899193)
chr7 (7-562)||(13283877-13284432)
chr7 (22-394)||(42596865-42597237)
chr7 (425-590)||(42596698-42596863)
chr7 (100-499)||(7582477-7582876)
chr7 (145-499)||(15175386-15175740)
chr7 (59-500)||(14643279-14643720)
[»] chr6 (10 HSPs)
chr6 (7-592)||(18161374-18161959)
chr6 (7-592)||(31358870-31359455)
chr6 (7-592)||(16899255-16899840)
chr6 (22-590)||(34766667-34767235)
chr6 (7-590)||(18710425-18711008)
chr6 (7-590)||(18704490-18705073)
chr6 (201-592)||(29541756-29542147)
chr6 (7-206)||(29561121-29561320)
chr6 (145-232)||(25895804-25895891)
chr6 (317-410)||(11375039-11375132)
[»] chr5 (19 HSPs)
chr5 (7-592)||(18362586-18363171)
chr5 (7-592)||(26200772-26201357)
chr5 (7-592)||(27413457-27414042)
chr5 (7-592)||(33940629-33941214)
chr5 (22-590)||(20949166-20949734)
chr5 (23-590)||(23375368-23375927)
chr5 (151-500)||(5601579-5601928)
chr5 (100-499)||(30453136-30453535)
chr5 (100-499)||(30458214-30458613)
chr5 (100-499)||(24413672-24414071)
chr5 (75-338)||(22456358-22456621)
chr5 (145-500)||(24299175-24299530)
chr5 (517-590)||(19781874-19781947)
chr5 (280-500)||(21083013-21083233)
chr5 (59-340)||(20037245-20037526)
chr5 (428-500)||(24289951-24290023)
chr5 (287-410)||(15329389-15329512)
chr5 (287-410)||(18709247-18709370)
chr5 (427-500)||(22456710-22456783)
[»] chr2 (6 HSPs)
chr2 (7-585)||(45015669-45016247)
chr2 (7-592)||(18652527-18653112)
chr2 (7-592)||(9512211-9512796)
chr2 (22-590)||(27168448-27169016)
chr2 (7-590)||(22903455-22904033)
chr2 (151-500)||(1791955-1792304)
[»] chr3 (10 HSPs)
chr3 (7-592)||(8974155-8974740)
chr3 (7-592)||(9538444-9539029)
chr3 (7-592)||(6423616-6424201)
chr3 (86-592)||(12387297-12387802)
chr3 (151-500)||(48979673-48980022)
chr3 (145-491)||(28366656-28367002)
chr3 (193-500)||(4384222-4384529)
chr3 (441-491)||(28374773-28374823)
chr3 (441-491)||(28382595-28382645)
chr3 (534-590)||(11461136-11461192)
[»] chr1 (3 HSPs)
chr1 (7-592)||(16156192-16156777)
chr1 (22-590)||(1987651-1988219)
chr1 (37-532)||(22959697-22960190)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (7-592)||(148017-148602)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (22-590)||(6030-6598)
[»] scaffold0313 (2 HSPs)
scaffold0313 (22-590)||(7080-7648)
scaffold0313 (22-590)||(10862-11430)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (23-590)||(16538-17097)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (170-592)||(20084-20506)
scaffold0141 (7-176)||(27670-27839)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (136-425)||(1-290)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (37-532)||(189005-189498)
[»] scaffold0611 (1 HSPs)
scaffold0611 (9-218)||(1-210)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (7-176)||(86973-87142)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (100-499)||(102825-103224)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (145-500)||(257898-258253)
[»] scaffold0500 (1 HSPs)
scaffold0500 (289-368)||(5117-5196)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 523; Significance: 0; HSPs: 11)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 523; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 593
Target Start/End: Original strand, 14892199 - 14892785
Alignment:
Q  7 acatcatcatcaacaactgatgaactttgctgagatgctttcaaggcaagtgtttttaccttcttcactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgag 106  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14892199 acatcatcatcagctactgatgagctttgctgagatgctttcaaggcaagtgttttcaccttcttcactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgag 14892298  T
Q  107 ctctcagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtgtccacatacttggaagacatct 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14892299 ctctcagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatcttctgcctgagtaattgcagtgaccataggtctccacatacttggaagacatct 14892398  T
Q  207 cagtatttttctaattctatcatgagtagaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtt 306  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14892399 caatatttttctaattctatcatgagtagaatataccttttcaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatagtt 14892498  T
Q  307 tcattttcactcatttcaaagacttcaaattttctgactccaatgtcaattctggtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtat 406  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14892499 tcattttcactcatttcaaagacttcaaattttctgactccaatgtcaattctggtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtatttttaaggtat 14892598  T
Q  407 cccatacctctttagcattcttacattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagaatttaacaatac 506  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14892599 cccatacctctttatcattcttacattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagaatttaacaatac 14892698  T
Q  507 ctgagctttttcatctgttgaccatgcactcttttctttgacagctccttctttggttgttggaacaaagtctccatctgtgatgat 593  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14892699 ctgagctttttcatctgttgaccatgcacttttttctttgacagctccttctttggttgttggaacaaagtctccatatgtgatgat 14892785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 486; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 592
Target Start/End: Original strand, 21211417 - 21212002
Alignment:
Q  7 acatcatcatcaacaactgatgaactttgctgagatgctttcaaggcaagtgtttttaccttcttcactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgag 106  Q
    ||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21211417 acatcttcatcatcaactgatgaggtttgctgagatgctttcaaggcaagtgttcttaccttcttcactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgag 21211516  T
Q  107 ctctcagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtgtccacatacttggaagacatct 206  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21211517 ctcttagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtctccacatacttggaagacatct 21211616  T
Q  207 cagtatttttctaattctatcatgagtagaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtt 306  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21211617 cagaatttttctaattctatcatgagtggaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatcttgcatacatctcatcaatggtt 21211716  T
Q  307 tcattttcactcatttcaaagacttcaaattttctgactccaatgtcaattctggtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtat 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||    
T  21211717 tcattttcactcatttcaaagacttcaaattttctgactccaatgtcaattctagtttctttgacatgagaagtaccctcatgatgtattttcagagtat 21211816  T
Q  407 cccatacctctttagcattcttacattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagaatttaacaatac 506  Q
    |||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||    
T  21211817 cccatactcctttagcatttgtacattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttagtaatac 21211916  T
Q  507 ctgagctttttcatctgttgaccatgcactcttttctttgacagctccttctttggttgttggaacaaagtctccatctgtgatga 592  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21211917 ctgagctttttcatctgttgaccatgcactttttgctttgacagctccttctttgtttgttggaacaaagtctccatttgtgatga 21212002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 22832631 - 22832121
Alignment:
Q  9 atcatcatcaacaactgatgaactttgctgagatgctttcaaggcaagtgtttttaccttcttcactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgagct 108  Q
    |||||||||| | ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  22832631 atcatcatcagctactgatgaggtttgctgagaggctttcaaggcaagtgattttaccttcttcactggtttgtctccttgaagtactacttcaggagct 22832532  T
Q  109 ctcagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtgtccacatacttggaagacatctca 208  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||     
T  22832531 ctcagtgaaccaatgagatcttcaaggttcatagatttcaaatctttggcctgagtgattgcagtgacgataggtctccacataattggaagacatctcg 22832432  T
Q  209 gtatttttctaattctatcatgagtagaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtttc 308  Q
    | || ||||  ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22832431 gaatctttccgattctttcatgagtggaatatgccttttcaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcataaatggtttc 22832332  T
Q  309 attttcactcatttcaaagacttcaaattttctgactccaatgtcaattctggtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtatcc 408  Q
    ||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| | |||| || |||    
T  22832331 attctcactcatttcaaagaccttaaactttctgactccattatcaattctagtttctttgatatgagatgtaccttcatgatgtactctcaaagtgtcc 22832232  T
Q  409 catacctctttagcattcttacattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagaatttaacaatacct 508  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||    
T  22832231 catacctctttggcatttttacactcatcaactctttcactttctttcatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttagtaatacct 22832132  T
Q  509 gagctttttca 519  Q
    |||||||||||    
T  22832131 gagctttttca 22832121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 75 - 500
Target Start/End: Original strand, 33600415 - 33600840
Alignment:
Q  75 tggtttgtctccttgaagtacaacttcatgagctctcagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtg 174  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||| |    ||  || ||||| |||||||  ||||||||||| ||     
T  33600415 tggtttgtcttcttgaagcaaaacttcatgggctcttagtgttccaatgagatcttctaaagccaaggaatttaagtctttggattgagtgattgctgta 33600514  T
Q  175 accataggtgtccacatacttggaagacatctcagtatttttctaattctatcatgagtagaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattg 274  Q
    ||||||||| |||| ||  | ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||| ||| |||   ||||| |  || || | |||||||||||| |    
T  33600515 accataggtctccatattttaggaagacatctgaggatttttctgattctgtcatgaggagagtatatttttcccaatgaccttaattcatttactatag 33600614  T
Q  275 tagtaaatctagcatacatctcatcaatggtttcattttcactcatttcaaagacttcaaattttctgactccaatgtcaattctggtttctttgacatg 374  Q
      |||||||| | |||||| ||||||||| |||| | |||| ||||||| || | |||||||||||  || ||||| || || |  |||||||| |||||    
T  33600615 aggtaaatctggaatacatttcatcaatgttttcttcttcattcatttcgaaaatttcaaattttcgtacgccaatatctatccgtgtttctttaacatg 33600714  T
Q  375 agatgtaccctcatgatgtattttcaaggtatcccatacctctttagcattcttacattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgat 474  Q
        || || |||||||| ||||| || || ||||| |  ||||| ||| |  ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| || ||||  |    
T  33600715 gctagttccttcatgatgaatttttaatgtgtcccaaatttcttttgcagtactacattcataaatcctttcactttcttccatggttaatgaacattgt 33600814  T
Q  475 agaaagagtctagctttagaatttaa 500  Q
    |||||||||  |||||| ||||||||    
T  33600815 agaaagagttgagctttggaatttaa 33600840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 145 - 500
Target Start/End: Original strand, 25035933 - 25036288
Alignment:
Q  145 tttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtgtccacatacttggaagacatctcagtatttttctaattctatcatgagtagaatatgcct 244  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||  |  |||| | |||||| | ||||||||| ||||| ||||||| |||||||   |    
T  25035933 tttaagtctttggcttgagtgattgccgtaaccataggtctccatgtgtttgggaaacatcttaatatttttctgattctgtcatgaggagaatatattt 25036032  T
Q  245 ttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtttcattttcactcatttcaaagacttcaaattttctgac 344  Q
    |||| |  || || |  ||||||||||| |  || ||||  | |||||| ||||||||| |||| | |||||||||||| || | |||||||||||  ||    
T  25036033 ttcccaatgaccttaactcatttactatagaggtgaatcgtgaatacatttcatcaatgttttcttcttcactcatttcgaaaatttcaaattttcgtac 25036132  T
Q  345 tccaatgtcaattctggtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtatcccatacctctttagcattcttacattcatcaactctt 444  Q
     |||||||| || || ||||||||||||||    || || |||||||||||||| || |||||||| |  ||||| ||  |  | ||||||| || ||||    
T  25036133 gccaatgtctatccttgtttctttgacatggctagttccttcatgatgtatttttaatgtatcccaaatttcttttgccgtggtgcattcataaattctt 25036232  T
Q  445 tcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagaatttaa 500  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||  ||||||||| |||||    
T  25036233 tcactttcttccatggttagtgaacattgtaaaaagagttgagctttagagtttaa 25036288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 145 - 500
Target Start/End: Original strand, 25049970 - 25050325
Alignment:
Q  145 tttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtgtccacatacttggaagacatctcagtatttttctaattctatcatgagtagaatatgcct 244  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||  |  |||| | |||||| | ||||||||| ||||| ||||||| |||||||   |    
T  25049970 tttaagtctttggcttgagtgattgccgtaaccataggtctccatgtgtttgggaaacatcttaatatttttctgattctgtcatgaggagaatatattt 25050069  T
Q  245 ttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtttcattttcactcatttcaaagacttcaaattttctgac 344  Q
    |||| |  || || |  ||||||||||| |  || ||||  | |||||| ||||||||| |||| | |||||||||||| || | |||||||||||  ||    
T  25050070 ttcccaatgaccttaactcatttactatagaggtgaatcgtgaatacatttcatcaatgttttcttcttcactcatttcgaaaatttcaaattttcgtac 25050169  T
Q  345 tccaatgtcaattctggtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtatcccatacctctttagcattcttacattcatcaactctt 444  Q
     |||||||| || || ||||||||||||||    || || |||||||||||||| || |||||||| |  ||||| ||  |  | ||||||| || ||||    
T  25050170 gccaatgtctatccttgtttctttgacatggctagttccttcatgatgtatttttaatgtatcccaaatttcttttgccgtggtgcattcataaattctt 25050269  T
Q  445 tcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagaatttaa 500  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||  ||||||||| |||||    
T  25050270 tcactttcttccatggttagtgaacattgtaaaaagagttgagctttagagtttaa 25050325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 145 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 18234114 - 18233759
Alignment:
Q  145 tttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtgtccacatacttggaagacatctcagtatttttctaattctatcatgagtagaatatgcct 244  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||  || |||| |||||||| | ||||||||| ||||| |||||||  ||||||   |    
T  18234114 tttaagtctttggcttgagtgattgctgtaaccataggtctccatgtatttgggagacatcttaatatttttctgattctgtcatgaggggaatatattt 18234015  T
Q  245 ttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtttcattttcactcatttcaaagacttcaaattttctgac 344  Q
    |||| |  ||||| |  ||||| ||||| | ||| ||||  | |||||| ||||||||  |||| | |||||||||||| || | ||| |||||||  ||    
T  18234014 ttcccaatgatcttaactcattcactatagaagtgaatcgtgaatacatttcatcaatattttcttcttcactcatttcgaaaatttcgaattttcgtac 18233915  T
Q  345 tccaatgtcaattctggtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtatcccatacctctttagcattcttacattcatcaactctt 444  Q
     ||||| || || || |||||||| |||||    || || |||||||| ||||| || |||||||| |  ||||| ||  |  ||||||||| || ||||    
T  18233914 gccaatatctatccttgtttctttaacatggctagttccttcatgatgaatttttaacgtatcccaaatttcttttgccgtagtacattcataaattctt 18233815  T
Q  445 tcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagaatttaa 500  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||  ||||||||| |||||    
T  18233814 tcactttcttccatggttagtgaacattgtaaaaagagttgagctttagagtttaa 18233759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 145 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 18243565 - 18243210
Alignment:
Q  145 tttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtgtccacatacttggaagacatctcagtatttttctaattctatcatgagtagaatatgcct 244  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||  || |||| |||||||| | ||||||||| ||||| |||||||  ||||||   |    
T  18243565 tttaagtctttggcttgagtgattgctgtaaccataggtctccatgtatttgggagacatcttaatatttttctgattctgtcatgaggggaatatattt 18243466  T
Q  245 ttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtttcattttcactcatttcaaagacttcaaattttctgac 344  Q
    |||| |  ||||| |  ||||| ||||| | ||| ||||  | |||||| ||||||||  |||| | |||||||||||| || | ||| |||||||  ||    
T  18243465 ttcccaatgatcttaactcattcactatagaagtgaatcgtgaatacatttcatcaatattttcttcttcactcatttcgaaaatttcgaattttcgtac 18243366  T
Q  345 tccaatgtcaattctggtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtatcccatacctctttagcattcttacattcatcaactctt 444  Q
     ||||| || || || |||||||| |||||    || || |||||||| ||||| || |||||||| |  ||||| ||  |  ||||||||| || ||||    
T  18243365 gccaatatctatccttgtttctttaacatggctagttccttcatgatgaatttttaacgtatcccaaatttcttttgccgtagtacattcataaattctt 18243266  T
Q  445 tcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagaatttaa 500  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||  ||||||||| |||||    
T  18243265 tcactttcttccatggttagtgaacattgtaaaaagagttgagctttagagtttaa 18243210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 145 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 12916743 - 12916388
Alignment:
Q  145 tttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtgtccacatacttggaagacatctcagtatttttctaattctatcatgagtagaatatgcct 244  Q
    |||| ||||||| | ||||||||||| || ||||||||| ||||  |  |||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||||  || |||   |    
T  12916743 tttagatctttgtcttgagtgattgctgtaaccataggtctccatgtgtttgggagacatcttaatatttttctaattctgtcatgagaggagtatattt 12916644  T
Q  245 ttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtttcattttcactcatttcaaagacttcaaattttctgac 344  Q
    |||| |  || || |  ||||| ||||| | ||| ||||  | |||||| ||||||||| |||| |  ||||||||||| || | |||||||||||  ||    
T  12916643 ttcccaatgaccttaactcattcactatagaagtgaatcgtgaatacatttcatcaatgttttcttcatcactcatttctaaaatttcaaattttcgtac 12916544  T
Q  345 tccaatgtcaattctggtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtatcccatacctctttagcattcttacattcatcaactctt 444  Q
     ||||| || || || |||||||| |||||    || || |||||||| ||||| || |||||||| |  ||||| ||  |  | ||||||| || ||||    
T  12916543 gccaatatctatccttgtttctttaacatggctggttccttcatgatgaatttttaacgtatcccaaatttcttttgccgtagtgcattcataaattctt 12916444  T
Q  445 tcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagaatttaa 500  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||  ||||||||| |||||    
T  12916443 tcactttcttccatggttagtgaacattgtaaaaagagttgagctttagagtttaa 12916388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 280 - 492
Target Start/End: Original strand, 23749913 - 23750125
Alignment:
Q  280 aatctagcatacatctcatcaatggtttcattttcactcatttcaaagacttcaaattttctgactccaatgtcaattctggtttctttgacatgagatg 379  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||  |||| || |||  |||||||||  | ||||| ||||| |||||   ||| |||||||||  ||    
T  23749913 aatcttgcaaacatctcatcaatggtttcactttctttcatctcgaaggtttcaaatttcttaactcccatgtctattctttcttccttgacatgacttg 23750012  T
Q  380 taccctcatgatgtattttcaaggtatcccatacctctttagcattcttacattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaa 479  Q
    | || |||||||| ||||| ||||  ||||||| |||||||||| |  ||||||| || ||||| |||  ||||||| || |||  ||||||| ||||||    
T  23750013 ttccttcatgatgaatttttaaggcttcccatatctctttagcagttgtacattcttctactctatcatattcttccctgcttaaagcacatgttagaaa 23750112  T
Q  480 gagtctagcttta 492  Q
     |||  |||||||    
T  23750113 aagttgagcttta 23750125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 410
Target Start/End: Original strand, 45497837 - 45497960
Alignment:
Q  287 catacatctcatcaatggtttcattttcactcatttcaaagacttcaaattttctgactccaatgtcaattctggtttctttgacatgagatgtaccctc 386  Q
    ||||||| ||||| ||||||||  ||||  ||||||| || | |||| ||||||  || || ||||||||||| |||||||| || |||   ||||| ||    
T  45497837 catacatttcatctatggtttcggtttccttcatttcgaatagttcatattttcgtacaccgatgtcaattcttgtttctttcacgtgactggtaccttc 45497936  T
Q  387 atgatgtattttcaaggtatccca 410  Q
    ||||||||||||||| | ||||||    
T  45497937 atgatgtattttcaaagcatccca 45497960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 509; Significance: 0; HSPs: 9)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 509; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 591
Target Start/End: Complemental strand, 16255127 - 16254548
Alignment:
Q  7 acatcatcatcaacaactgatgaactttgctgagatgctttcaaggcaagtgtttttaccttcttcactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgag 106  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16255127 acatcatcatcagcaactgatgaactttgctgagatgctttcaaggcaagtgtttttaccttcttcactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgag 16255028  T
Q  107 ctctcagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtgtccacatacttggaagacatct 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16255027 ctctcagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctaagtaattacagtgaccataggtctccacatacttggaagacatct 16254928  T
Q  207 cagtatttttctaattctatcatgagtagaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtt 306  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16254927 caatatttttctgattctatcatgagtagaatatgcctttccaagagatctcatatcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtt 16254828  T
Q  307 tcattttcactcatttcaaagacttcaaattttctgactccaatgtcaattctggtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtat 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16254827 tcattttcactcatttcaaagacttcaaattttctgactccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtat 16254728  T
Q  407 cccatacctctttagcattcttacattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagaatttaacaatac 506  Q
    |     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16254727 c-----cctctttagcattcttacattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttaacaatac 16254633  T
Q  507 ctgagctttttcatctgttgaccatgcactcttttctttgacagctccttctttggttgttggaacaaagtctccatctgtgatg 591  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16254632 ttgagctttttcatctgttgaccatgtactcttttctgtgacaactccttctttggttgttggaacaaagtctccatctgtgatg 16254548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 490; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 6694112 - 6693527
Alignment:
Q  7 acatcatcatcaacaactgatgaactttgctgagatgctttcaaggcaagtgtttttaccttcttcactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgag 106  Q
    ||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6694112 acatcttcatcagcaactgatgaggtttgctgagatgctttcaaggcaagtgttcttaccttcttcactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgag 6694013  T
Q  107 ctctcagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtgtccacatacttggaagacatct 206  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6694012 ctcttagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtctccacatacttggaagacatct 6693913  T
Q  207 cagtatttttctaattctatcatgagtagaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtt 306  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6693912 cagaatttttctaattctatcatgagtggaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatcttgcatacatctcatcaatggtt 6693813  T
Q  307 tcattttcactcatttcaaagacttcaaattttctgactccaatgtcaattctggtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtat 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  6693812 tcattttcactcatttcaaagacttcaaattttctgactccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcagagtat 6693713  T
Q  407 cccatacctctttagcattcttacattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagaatttaacaatac 506  Q
    |||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||    
T  6693712 cccatactcctttagcatttgtacattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttagtaatac 6693613  T
Q  507 ctgagctttttcatctgttgaccatgcactcttttctttgacagctccttctttggttgttggaacaaagtctccatctgtgatga 592  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6693612 ctgagctttttcatctgttgaccatgcactttttgctttgacagctccttctttgtttgttggaacaaagtctccatttgtgatga 6693527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 480; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 17151267 - 17150684
Alignment:
Q  7 acatcatcatcaacaactgatgaactttgctgagatgctttcaaggcaagtgtttttaccttcttcactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgag 106  Q
    |||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17151267 acatcatcatcagctactgatgaggtttgctgagatgctttcaaggcaagtgtttttaccttcttcactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgag 17151168  T
Q  107 ctctcagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtgtccacatacttggaagacatct 206  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||    
T  17151167 ctcttagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagattataaatctttggcctgagtaattgcattgaccataggtctccaaacacttggaagacatct 17151068  T
Q  207 cagtatttttctaattctatcatgagtagaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtt 306  Q
     | |||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17151067 taatatttttctaattcaaacatgagtagaatatgccttttcaagatatctcatttaatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtt 17150968  T
Q  307 tcattttcactcatttcaaagacttcaaattttctgactccaatgtcaattctggtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtat 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17150967 tcattttcactcatttcaaagacttcaaattttctaactccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtat 17150868  T
Q  407 cccatacctctttagcattcttacattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagaatttaacaatac 506  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  17150867 cccatacctctttagcattcttacattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcaaatgatagaaagagtctagctttaaagtttaacaatac 17150768  T
Q  507 ctgagctttttcatctgttgaccatgcactcttttctttgacagctccttctttggttgttggaacaaagtctccatctgtgat 590  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17150767 ctgagcattttcatctgttgaccatgcactcttttctttgacagttccttcgttggttgttggaacaaagtctccatctgtgat 17150684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 441; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 590
Target Start/End: Original strand, 520375 - 520943
Alignment:
Q  22 actgatgaactttgctgagatgctttcaaggcaagtgtttttaccttcttcactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgagctctcagtgaaccaa 121  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  520375 actgatgaggtttgctgagaggctttcaaggcaagtgactttaccttctttactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgagctctcagtgaaccaa 520474  T
Q  122 tgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtgtccacatacttggaagacatctcagtatttttctaat 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  520475 tgagatcttccaggttcatagatttcaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtctccacatacttggaagacatctcaatatttttctgat 520574  T
Q  222 tctatcatgagtagaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtttcattttcactcatt 321  Q
    ||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  520575 tctctcatgagtggaatatgtttttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctggcatacatctcatcaatggtttcattttcactcatt 520674  T
Q  322 tcaaagacttcaaattttctgactccaatgtcaattctggtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtatcccatacctctttag 421  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  520675 tcaaagacttcaaactttctgactccaatgtcaattctggtttctttgacatgagatgtaccttcatgatgtactttcaaggtatcccatacctctttag 520774  T
Q  422 cattcttacattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagaatttaacaatacctgagctttttcatc 521  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||    
T  520775 catttttgcattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttagcaatacctgagccttttcatc 520874  T
Q  522 tgttgaccatgcactcttttctttgacagctccttctttggttgttggaacaaagtctccatctgtgat 590  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||     ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  520875 tgttgaccatgcactcttaactttgatgatcccttctttggttagtggaacaaagtctccatctgtgat 520943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 416; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 590
Target Start/End: Original strand, 7844905 - 7845488
Alignment:
Q  7 acatcatcatcaacaactgatgaactttgctgagatgctttcaaggcaagtgtttttaccttcttcactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgag 106  Q
    |||||||||||| | ||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7844905 acatcatcatcagctactaatgagctttgttgagatgctttcaatgcaagtgtctttaccttcttcactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgag 7845004  T
Q  107 ctctcagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtgtccacatacttggaagacatct 206  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||    
T  7845005 ctctcaatgagccaatgagatcttctagattcatagattttaaatctttggcctgagtaattgcagtgaccataggtctccatacacttggaagacatct 7845104  T
Q  207 cagtatttttctaattctatcatgagtagaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtt 306  Q
     | ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7845105 taatatttttctgattctatcataagtagaataagcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtt 7845204  T
Q  307 tcattttcactcatttcaaagacttcaaattttctgactccaatgtcaattctggtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtat 406  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |    
T  7845205 tcattttcactcatttcaaaaacttcaaattttctgactccaatatcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatatattttcagagtgt 7845304  T
Q  407 cccatacctctttagcattcttacattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagaatttaacaatac 506  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||    
T  7845305 cccatacctctttggcatttttacactcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaaaagtctagctttagagtttagtaatac 7845404  T
Q  507 ctgagctttttcatctgttgaccatgcactcttttctttgacagctccttctttggttgttggaacaaagtctccatctgtgat 590  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| || | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7845405 atgagccttttcatctgttgaccatgccttcttttcctttatagctccttctttgtttgttggaacaaagtctccatctgtgat 7845488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 100 - 499
Target Start/End: Original strand, 54698311 - 54698710
Alignment:
Q  100 tcatgagctctcagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtgtccacatacttggaa 199  Q
    ||||||||| | | ||| |||||||||||||| ||    | ||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||| ||||  | |||||||    
T  54698311 tcatgagcttttaatgacccaatgagatcttcaagagctaaagagtttaagtctttagcttgtgtgattgcagttaccatgggtctccatgtgcttggaa 54698410  T
Q  200 gacatctcagtatttttctaattctatcatgagtagaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatc 299  Q
    ||||||| |  |||||||| || | ||||||||| | ||| |  |||||||| ||||| | |||||| || || |  || ||||| |  ||||| |||||    
T  54698411 gacatcttaagatttttcttatccgatcatgagtggtataagtttttccaagtgatcttaattcattcacaatagatgtgaatctggagtacatttcatc 54698510  T
Q  300 aatggtttcattttcactcatttcaaagacttcaaattttctgactccaatgtcaattctggtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttc 399  Q
    |||| | |||| |||  |||||||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||    || || |||||||| |||||     
T  54698511 aatgttctcatcttcgttcatttcaaagatttcaaattttcttacgccaatgtctattcttgtttcttttacatggctagttccttcatgatgaattttt 54698610  T
Q  400 aaggtatcccatacctctttagcattcttacattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagaattta 499  Q
    |  || ||||| || ||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  54698611 agagtgtcccacacttcttttgcagtcacacattcatcaactctttcactttcttccatgcttagtgcgcatgatagaaagagtcgagctttagagttta 54698710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 145 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 26813688 - 26813342
Alignment:
Q  145 tttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtgtccacatacttggaagacatctcagtatttttctaattctatcatgagtagaatatgcct 244  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||| ||||  | |||||||||||||| |  |||||||| |||| ||||||||| | ||| |  |    
T  26813688 tttaagtctttagcttgtgtgattgcagttaccatgggtctccatgtgcttggaagacatcttaaaatttttcttattcgatcatgagtggtataagttt 26813589  T
Q  245 ttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtttcattttcactcatttcaaagacttcaaattttctgac 344  Q
    |||| || ||||| | |||||| || || |  || ||||| |  ||||| ||||||||| | |||| |||  ||||||| |||| |||||||||||| ||    
T  26813588 ttcccagtgatcttaattcattcacaatagatgtgaatctggagtacatttcatcaatgttctcatcttcgttcatttcgaagatttcaaattttcttac 26813489  T
Q  345 tccaatgtcaattctggtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtatcccatacctctttagcattcttacattcatcaactctt 444  Q
     ||||| || ||||| |||||||| || ||    || ||||||||||| ||||| |  || ||||| || ||||| ||| |   ||||||||||||||||    
T  26813488 gccaatatctattcttgtttcttttacgtggctagttccctcatgatgaatttttagagtgtcccaaacttcttttgcagtaacacattcatcaactctt 26813389  T
Q  445 tcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagcttt 491  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  26813388 tcactttcttccatgcttagtgcgcatgatagaaagagtcgagcttt 26813342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 555 - 590
Target Start/End: Original strand, 13791747 - 13791782
Alignment:
Q  555 ttctttggttgttggaacaaagtctccatctgtgat 590  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13791747 ttctttggttgttggaacaaagtctccatctttgat 13791782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 508 - 546
Target Start/End: Original strand, 13791715 - 13791753
Alignment:
Q  508 tgagctttttcatctgttgaccatgcactcttttctttg 546  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13791715 tgagctttgtcatttgttgaccatgcactcttttctttg 13791753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 503; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 503; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 592
Target Start/End: Original strand, 52979 - 53562
Alignment:
Q  7 acatcatcatcaacaactgatgaactttgctgagatgctttcaaggcaagtgtttttaccttcttcactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgag 106  Q
    |||||||||||| | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  52979 acatcatcatcagctactgatgagctttgatgagatgctttcaaggcaagtgttttcaccttcttcactagtttgtctccttgaagtataacttcatgag 53078  T
Q  107 ctctcagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtgtccacatacttggaagacatct 206  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  53079 ctctcagtgatccaatgagatcttcgaggttcatagattttaaatctttggcctgagtaattgcagtgaccataggtctccatatacttggaagacatct 53178  T
Q  207 cagtatttttctaattctatcatgagtagaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtt 306  Q
    |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53179 c--tatttttctgattctatcatgagtagaatatgcctttccaagagatctcatatcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtt 53276  T
Q  307 tcattttcactcatttcaaagacttcaaattttctgactccaatgtcaattctggtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtat 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  53277 tcattttcactcatttcaaagacttcaaattttctgactccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtatttttaaggtat 53376  T
Q  407 cccatacctctttagcattcttacattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagaatttaacaatac 506  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53377 cccatacctctttagcattcttacattcatcaactctttcactttcttccatggttaatgcacatgatagaaagagtctagctttagaatttaacaatac 53476  T
Q  507 ctgagctttttcatctgttgaccatgcactcttttctttgacagctccttctttggttgttggaacaaagtctccatctgtgatga 592  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53477 ctgagctttttcatctattgaccatgcactcttttctttgacagctccttctttggttgttggaacaaagtctccatctgtgatga 53562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 502; Significance: 0; HSPs: 16)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 502; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 592
Target Start/End: Original strand, 9543687 - 9544272
Alignment:
Q  7 acatcatcatcaacaactgatgaactttgctgagatgctttcaaggcaagtgtttttaccttcttcactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgag 106  Q
    |||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9543687 acatcatcttcagcagctgatgagctttgctgagatgcttttaaggcaagtgtttttaccttcttcactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgag 9543786  T
Q  107 ctctcagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtgtccacatacttggaagacatct 206  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9543787 ctctcagtgaaccaataagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctgggtgattgcagtgaccataggtctccacatacttggaagacatct 9543886  T
Q  207 cagtatttttctaattctatcatgagtagaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtt 306  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9543887 tagtatttttctaattctatcatgagtagaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctggcatacatctcatcaatggtt 9543986  T
Q  307 tcattttcactcatttcaaagacttcaaattttctgactccaatgtcaattctggtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtat 406  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9543987 tcattttcactcatttcaaaaacttcaaattttctgactccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcagggtat 9544086  T
Q  407 cccatacctctttagcattcttacattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagaatttaacaatac 506  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||    
T  9544087 cccatacttctttagcatttgtacattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttagtaatac 9544186  T
Q  507 ctgagctttttcatctgttgaccatgcactcttttctttgacagctccttctttggttgttggaacaaagtctccatctgtgatga 592  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9544187 ctgagctttttcatctgttgaccatgcactttttgctttgacagctccttctttggttgttggaacaaagtctccatctgtgatga 9544272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 494; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 592
Target Start/End: Original strand, 5389618 - 5390203
Alignment:
Q  7 acatcatcatcaacaactgatgaactttgctgagatgctttcaaggcaagtgtttttaccttcttcactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgag 106  Q
    ||||| |||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5389618 acatcttcatcagcaactgatggggtttgctgagatgctttcaaggcaagtgttcttaccttcttcactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgag 5389717  T
Q  107 ctctcagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtgtccacatacttggaagacatct 206  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5389718 ctcttagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtctccacatacttggaagacatct 5389817  T
Q  207 cagtatttttctaattctatcatgagtagaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtt 306  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5389818 cagaatttttctaattctatcatgagtggaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatcttgcatacatctcatcaatggtt 5389917  T
Q  307 tcattttcactcatttcaaagacttcaaattttctgactccaatgtcaattctggtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtat 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  5389918 tcattttcactcatttcaaagacttcaaattttctgactccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcagagtat 5390017  T
Q  407 cccatacctctttagcattcttacattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagaatttaacaatac 506  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||    
T  5390018 cccatacttctttagcatttgtacattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttagtaatac 5390117  T
Q  507 ctgagctttttcatctgttgaccatgcactcttttctttgacagctccttctttggttgttggaacaaagtctccatctgtgatga 592  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5390118 ctgagctttttcatctgttgaccatgcactttttgctttgacagctccttctttggttgttggaacaaagtctccatttgtgatga 5390203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 494; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 592
Target Start/End: Original strand, 16140631 - 16141216
Alignment:
Q  7 acatcatcatcaacaactgatgaactttgctgagatgctttcaaggcaagtgtttttaccttcttcactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgag 106  Q
    ||||| |||||| |||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16140631 acatcttcatcagcaactgatggggtttgctgagatgcttttaaggcaagtgtttttaccttcttcactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgag 16140730  T
Q  107 ctctcagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtgtccacatacttggaagacatct 206  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  16140731 ctcttagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtctccacacacttggaagacatct 16140830  T
Q  207 cagtatttttctaattctatcatgagtagaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtt 306  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16140831 cagaatttttctaattctatcatgagtggaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatcttgcatacatctcatcaatggtt 16140930  T
Q  307 tcattttcactcatttcaaagacttcaaattttctgactccaatgtcaattctggtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtat 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  16140931 tcattttcactcatttcaaagacttcaaattttctgactccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcagagtat 16141030  T
Q  407 cccatacctctttagcattcttacattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagaatttaacaatac 506  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||    
T  16141031 cccatacttctttagcatttgtacattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttagtaatac 16141130  T
Q  507 ctgagctttttcatctgttgaccatgcactcttttctttgacagctccttctttggttgttggaacaaagtctccatctgtgatga 592  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16141131 ctgagctttttcatctgttgaccatgcactttttgctttgacagctccttctttggttgttggaacaaagtctccatctgtgatga 16141216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 494; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 26305450 - 26304865
Alignment:
Q  7 acatcatcatcaacaactgatgaactttgctgagatgctttcaaggcaagtgtttttaccttcttcactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgag 106  Q
    ||||| |||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26305450 acatcttcatcagcaactgatggggtttgctgagatgctttcaaggcaagtgttcttaccttcttcactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgag 26305351  T
Q  107 ctctcagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtgtccacatacttggaagacatct 206  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26305350 ctcttagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtctccacatacttggaagacatct 26305251  T
Q  207 cagtatttttctaattctatcatgagtagaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtt 306  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26305250 cagaatttttctaattctatcatgagtggaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatcttgcatacatctcatcaatggtt 26305151  T
Q  307 tcattttcactcatttcaaagacttcaaattttctgactccaatgtcaattctggtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtat 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  26305150 tcattttcactcatttcaaagacttcaaattttctgactccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcagagtat 26305051  T
Q  407 cccatacctctttagcattcttacattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagaatttaacaatac 506  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||    
T  26305050 cccatacttctttagcatttgtacattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttagtaatac 26304951  T
Q  507 ctgagctttttcatctgttgaccatgcactcttttctttgacagctccttctttggttgttggaacaaagtctccatctgtgatga 592  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26304950 ctgagctttttcatctgttgaccatgcactttttgctttgacagctccttctttggttgttggaacaaagtctccatttgtgatga 26304865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 494; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 592
Target Start/End: Original strand, 26361368 - 26361953
Alignment:
Q  7 acatcatcatcaacaactgatgaactttgctgagatgctttcaaggcaagtgtttttaccttcttcactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgag 106  Q
    ||||| |||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26361368 acatcttcatcagcaactgatggggtttgctgagatgctttcaaggcaagtgttcttaccttcttcactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgag 26361467  T
Q  107 ctctcagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtgtccacatacttggaagacatct 206  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26361468 ctcttagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtctccacatacttggaagacatct 26361567  T
Q  207 cagtatttttctaattctatcatgagtagaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtt 306  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26361568 cagaatttttctaattctatcatgagtggaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatcttgcatacatctcatcaatggtt 26361667  T
Q  307 tcattttcactcatttcaaagacttcaaattttctgactccaatgtcaattctggtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtat 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  26361668 tcattttcactcatttcaaagacttcaaattttctgactccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcagagtat 26361767  T
Q  407 cccatacctctttagcattcttacattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagaatttaacaatac 506  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||    
T  26361768 cccatacttctttagcatttgtacattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttagtaatac 26361867  T
Q  507 ctgagctttttcatctgttgaccatgcactcttttctttgacagctccttctttggttgttggaacaaagtctccatctgtgatga 592  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26361868 ctgagctttttcatctgttgaccatgcactttttgctttgacagctccttctttggttgttggaacaaagtctccatttgtgatga 26361953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 494; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 32100274 - 32099689
Alignment:
Q  7 acatcatcatcaacaactgatgaactttgctgagatgctttcaaggcaagtgtttttaccttcttcactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgag 106  Q
    ||||| |||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32100274 acatcttcatcagcaactgatggggtttgctgagatgctttcaaggcaagtgttcttaccttcttcactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgag 32100175  T
Q  107 ctctcagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtgtccacatacttggaagacatct 206  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32100174 ctcttagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtctccacatacttggaagacatct 32100075  T
Q  207 cagtatttttctaattctatcatgagtagaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtt 306  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32100074 cagaatttttctaattctatcatgagtggaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatcttgcatacatctcatcaatggtt 32099975  T
Q  307 tcattttcactcatttcaaagacttcaaattttctgactccaatgtcaattctggtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtat 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  32099974 tcattttcactcatttcaaagacttcaaattttctgactccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcagagtat 32099875  T
Q  407 cccatacctctttagcattcttacattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagaatttaacaatac 506  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  32099874 cccatacttctttagcatttgtacattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttaataatac 32099775  T
Q  507 ctgagctttttcatctgttgaccatgcactcttttctttgacagctccttctttggttgttggaacaaagtctccatctgtgatga 592  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  32099774 ctgagctttttcatctgttgaccatgcactttttgctttgacagctccttctttggttgttggaacaaaatctccatttgtgatga 32099689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 490; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 46499008 - 46498423
Alignment:
Q  7 acatcatcatcaacaactgatgaactttgctgagatgctttcaaggcaagtgtttttaccttcttcactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgag 106  Q
    ||||| |||||| ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  46499008 acatcttcatcagcaactgatggagtttgctgagatgcttttaaggcaagtgtttttaccttcttcactggtttgtctccttaaagtacaacttcatgag 46498909  T
Q  107 ctctcagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtgtccacatacttggaagacatct 206  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  46498908 ctcttagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtctccacacacttggaagacatct 46498809  T
Q  207 cagtatttttctaattctatcatgagtagaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtt 306  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  46498808 cagaatttttctaattctatcatgagtggaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatcttgcatacatctcatcaatggtt 46498709  T
Q  307 tcattttcactcatttcaaagacttcaaattttctgactccaatgtcaattctggtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtat 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  46498708 tcattttcactcatttcaaagacttcaaattttctgactccaatgtcaattctagtttctttgacatgaaatgtaccctcatgatgtattttcagagtat 46498609  T
Q  407 cccatacctctttagcattcttacattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagaatttaacaatac 506  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||    
T  46498608 cccatacttctttagcatttgtacattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttagtaatac 46498509  T
Q  507 ctgagctttttcatctgttgaccatgcactcttttctttgacagctccttctttggttgttggaacaaagtctccatctgtgatga 592  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46498508 ctgagctttttcatctgttgaccatgcactttttgctttgacagctccttctttggttgttggaacaaagtctccatctgtgatga 46498423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 486; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 6536378 - 6535793
Alignment:
Q  7 acatcatcatcaacaactgatgaactttgctgagatgctttcaaggcaagtgtttttaccttcttcactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgag 106  Q
    ||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6536378 acatcttcatcagcaactgatgaggtttgctgagatgctttcaaggcaagtgttcttaccttcttcactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgag 6536279  T
Q  107 ctctcagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtgtccacatacttggaagacatct 206  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6536278 ctcttagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtctccacatacttggaagacatct 6536179  T
Q  207 cagtatttttctaattctatcatgagtagaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtt 306  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6536178 cagaatttttctaattctatcatgagtggaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatcttgcatacatctcatcaatggtt 6536079  T
Q  307 tcattttcactcatttcaaagacttcaaattttctgactccaatgtcaattctggtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtat 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  6536078 tcattttcactcatttcaaagacttcaaattttctgactccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcagagtat 6535979  T
Q  407 cccatacctctttagcattcttacattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagaatttaacaatac 506  Q
    |||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||    
T  6535978 cccatactcctttagcatttgtacattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttagtaatac 6535879  T
Q  507 ctgagctttttcatctgttgaccatgcactcttttctttgacagctccttctttggttgttggaacaaagtctccatctgtgatga 592  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6535878 ctgagctttttcatctgctgaccatgcactttttgctttgacagctccttctttgtttgttggaacaaagtctccatttgtgatga 6535793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 482; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 8502943 - 8502358
Alignment:
Q  7 acatcatcatcaacaactgatgaactttgctgagatgctttcaaggcaagtgtttttaccttcttcactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgag 106  Q
    ||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8502943 acatcttcatcagcaactgatgaggtttgctgagatgctttcaaggcaagtgttcttaccttctttactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgag 8502844  T
Q  107 ctctcagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtgtccacatacttggaagacatct 206  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8502843 ctcttagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtctccacatacttggaagacatct 8502744  T
Q  207 cagtatttttctaattctatcatgagtagaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtt 306  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  8502743 cagaatttttctaattctatcatgagtggaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatcttgcatacatttcatcaatggtt 8502644  T
Q  307 tcattttcactcatttcaaagacttcaaattttctgactccaatgtcaattctggtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtat 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  8502643 tcattttcactcatttcaaagacttcaaattttctgactccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcagagtat 8502544  T
Q  407 cccatacctctttagcattcttacattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagaatttaacaatac 506  Q
    |||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||    
T  8502543 cccatactcctttagcatttgtacattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttagtaatac 8502444  T
Q  507 ctgagctttttcatctgttgaccatgcactcttttctttgacagctccttctttggttgttggaacaaagtctccatctgtgatga 592  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8502443 ctgagctttttcatctgttgaccatgcactttttgctttgacagctccttctttgtttgttggaacaaagtctccatttgtgatga 8502358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 482; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 44899193 - 44898608
Alignment:
Q  7 acatcatcatcaacaactgatgaactttgctgagatgctttcaaggcaagtgtttttaccttcttcactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgag 106  Q
    ||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44899193 acatcttcatcagcaactgatgaggtttgctgagatgctttcaaggcaagtgttcttaccttctttactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgag 44899094  T
Q  107 ctctcagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtgtccacatacttggaagacatct 206  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44899093 ctcttagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtctccacatacttggaagacatct 44898994  T
Q  207 cagtatttttctaattctatcatgagtagaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtt 306  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44898993 cagaatttttctaattctatcatgagtggaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatcttgcatacatctcatcaatggtt 44898894  T
Q  307 tcattttcactcatttcaaagacttcaaattttctgactccaatgtcaattctggtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtat 406  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  44898893 tcatttttactcatttcaaagacttcaaattttctgactccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcagagtat 44898794  T
Q  407 cccatacctctttagcattcttacattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagaatttaacaatac 506  Q
    |||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||    
T  44898793 cccatactcctttagcatttgtacattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttagtaatac 44898694  T
Q  507 ctgagctttttcatctgttgaccatgcactcttttctttgacagctccttctttggttgttggaacaaagtctccatctgtgatga 592  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44898693 ctgagctttttcatctgttgaccatgcactttttgctttgacagctccttctttgtttgttggaacaaagtctccatttgtgatga 44898608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 393; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 562
Target Start/End: Original strand, 13283877 - 13284432
Alignment:
Q  7 acatcatcatcaacaactgatgaactttgctgagatgctttcaaggcaagtgtttttaccttcttcactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgag 106  Q
    ||||||||||||   ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13283877 acatcatcatcagttactgatgaagtttactgagaggctttcaaggcaagtgactttaccttctttactagtttgtctccttgaagtacaacttcatgag 13283976  T
Q  107 ctctcagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtgtccacatacttggaagacatct 206  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  13283977 ctctaagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagatttcaaatctttggcctgagtgattgaagtgaccataggtctccacatacttggaaggcatct 13284076  T
Q  207 cagtatttttctaattctatcatgagtagaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtt 306  Q
     | ||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13284077 taatatttttctgattctctcatgagtggagtatgccttcccaagagatctcatttcatttactattgcagtaaatctggcatacatctcatcaatggtt 13284176  T
Q  307 tcattttcactcatttcaaagacttcaaattttctgactccaatgtcaattctggtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtat 406  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  13284177 tcattttcactcatttcaaaga-ttcaaactttttgactccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccttcatgatgtactttcaaagtat 13284275  T
Q  407 cccatacctctttagcattcttacattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagaatttaacaatac 506  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13284276 cccatacctctttagcattcttgcattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacataatagaaagagtctagctttagaatttaacaatac 13284375  T
Q  507 ctgagctttttcatctgttgac-catgcactcttttctttgacagctccttctttgg 562  Q
     |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  13284376 ttgagatttttcatctgttgacacatgcactcttttctttgatggttccttctttgg 13284432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 22 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 42597237 - 42596865
Alignment:
Q  22 actgatgaactttgctgagatgctttcaaggcaagtgtttttaccttcttcactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgagctctcagtgaaccaa 121  Q
    ||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42597237 actgatgaggtttgttgagaggctttcaaggcaagtgactttaccttcttcactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgagctctcagtgaacaaa 42597138  T
Q  122 tgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtgtccacatacttggaagacatctcagtatttttctaat 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||    
T  42597137 tgagatcttccaggttcatagatttcaaatctttggcctcagtgattgcagtgaccataggtctctacatacttggaaggcatctcaatatttttctgat 42597038  T
Q  222 tctatcatgagtagaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtttcattttcactcatt 321  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  42597037 tctctcatgagtggaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctggcatacatctcatcaatggtttcattcacactcatt 42596938  T
Q  322 tcaaagacttcaaattttctgactccaatgtcaattctggtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgta 394  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42596937 tcaaagacttcaaactttctgactctaatgtcaattatagtttctttgacatgagatgtaccttcatgatgta 42596865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 425 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 42596863 - 42596698
Alignment:
Q  425 tcttacattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagaatttaacaatacctgagctttttcatctgt 524  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42596863 tcttgcattcatcacctctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttaacaatacctgagctttttcatctgt 42596764  T
Q  525 tgaccatgcactcttttctttgacagctccttctttggttgttggaacaaagtctccatctgtgat 590  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  42596763 tgaccatgcactcttttctttgatggttccttttttggtctttggaacaaagtctccatctgtgat 42596698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 100 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 7582876 - 7582477
Alignment:
Q  100 tcatgagctctcagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtgtccacatacttggaa 199  Q
    ||||||||| | | |||||||||||||||||| ||    | ||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||| ||||  | |||| ||    
T  7582876 tcatgagcttttaatgaaccaatgagatcttcaagagctaaagagtttaagtctttagcttgtgtgattgcagttaccatgggtatccatgtgcttgaaa 7582777  T
Q  200 gacatctcagtatttttctaattctatcatgagtagaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatc 299  Q
    ||||||| |  |||||||| || | | ||||||| | ||| |  ||| |||| ||||| | |||||| || || |  || |||||    ||||| |||||    
T  7582776 gacatcttaagatttttcttatccgaacatgagtggtataagtttttacaagtgatcttaattcattcacaatagatgtgaatctgaagtacatttcatc 7582677  T
Q  300 aatggtttcattttcactcatttcaaagacttcaaattttctgactccaatgtcaattctggtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttc 399  Q
    |||| | |||| |||  ||||||| |||| |||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| | |||    || || |||||||| |||||     
T  7582676 aatgttctcatcttcgttcatttcgaagatttcaaattttcttacgccaatgtctattcttgtttcttttaaatggctagttccttcatgatgaattttt 7582577  T
Q  400 aaggtatcccatacctctttagcattcttacattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagaattta 499  Q
    |  || ||||| || ||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7582576 agagtgtcccaaacttcttttgcagtcacacattcatcaactctttcactttcttccatgcttagtgcgcatgatagaaagagtcgagctttagaattta 7582477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 145 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 15175740 - 15175386
Alignment:
Q  145 tttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtgtccacatacttggaagacatctcagtatttttctaattctatcatgagtagaatatgcct 244  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||| ||||  | |||||||||||||| |  |||||||| || | ||||||||| | ||| |  |    
T  15175740 tttaagtctttagcttgtgtgattgcagttaccatgggtctccatgtgcttggaagacatcttaagatttttcttatccgatcatgagtggtataagttt 15175641  T
Q  245 ttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtttcattttcactcatttcaaagacttcaaattttctgac 344  Q
    ||||||| ||||| | |||||| || || |  || ||||| |  ||||| ||||||||| | |||| |||  ||||||| |||| |||||||||||| ||    
T  15175640 ttccaagtgatcttaattcattcacaatagatgtgaatctggagtacatttcatcaatgttctcatcttcgttcatttcgaagatttcaaattttcttac 15175541  T
Q  345 tccaatgtcaattctggtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtatcccatacctctttagcattcttacattcatcaactctt 444  Q
     ||||| || ||||| |||||||| |  ||    ||  | |||||||| ||||| |  || ||||| |||||||| ||  |   ||||||||||||||||    
T  15175540 gccaatatctattcttgtttcttttatgtggctagtttcttcatgatgaatttttagagtgtcccaaacctcttttgccgtaacacattcatcaactctt 15175441  T
Q  445 tcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagaattta 499  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  15175440 tcactttcttccatgcttagtgcgcatgatagaaaaagtcaagctttagagttta 15175386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 59 - 500
Target Start/End: Original strand, 14643279 - 14643720
Alignment:
Q  59 tttttaccttcttcactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgagctctcagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggc 158  Q
    ||||| |||| ||||| ||||| ||| |||| |||| || |||||||||||| || |  ||||| ||||| || |||  ||  || |||| |||||||||    
T  14643279 tttttccctttttcaccggtttatcttcttggagtagaatttcatgagctctaagcgttccaataagatcctctagggccaaggaatttagatctttggc 14643378  T
Q  159 ctgagtgattgcagtgaccataggtgtccacatacttggaagacatctcagtatttttctaattctatcatgagtagaatatgcctttccaagagatctc 258  Q
     ||||||||||| || ||||||||| ||||  |  |||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||||  || |||   ||||| |  || ||     
T  14643379 ttgagtgattgctgtaaccataggtctccatgtgtttgggagacatcttaatatttttctaattctgtcatgaggggagtatatttttcccaatgacctt 14643478  T
Q  259 atttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtttcattttcactcatttcaaagacttcaaattttctgactccaatgtcaattc 358  Q
    |  ||||||||||| | ||| ||||  | |||||| ||||||||| |||| |  ||||||||||| || | |||||||||||  || |||||||| || |    
T  14643479 aactcatttactatagaagtgaatcgtgaatacatttcatcaatgttttcttcatcactcatttcgaaaatttcaaattttcgtacgccaatgtctatcc 14643578  T
Q  359 tggtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtatcccatacctctttagcattcttacattcatcaactctttcactttcttccat 458  Q
    | |||||||| |||||    || || ||||| || ||||| || |||||||| |  ||||| ||  |  | |||||||  | |||||||||||| |||||    
T  14643579 ttgtttctttaacatggctggttccttcatggtgaatttttaacgtatcccaaatttcttttgccgtagtgcattcatagattctttcactttcctccat 14643678  T
Q  459 ggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagaatttaa 500  Q
     ||||||| ||||  || |||||||  ||||||||| |||||    
T  14643679 agttagtgaacattgtaaaaagagttgagctttagagtttaa 14643720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 494; Significance: 0; HSPs: 10)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 494; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 18161959 - 18161374
Alignment:
Q  7 acatcatcatcaacaactgatgaactttgctgagatgctttcaaggcaagtgtttttaccttcttcactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgag 106  Q
    ||||| |||||| |||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18161959 acatcttcatcagcaactgatggggtttgctgagatgcttttaaggcaagtgtttttaccttcttcactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgag 18161860  T
Q  107 ctctcagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtgtccacatacttggaagacatct 206  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  18161859 ctcttagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtctccacacacttggaagacatct 18161760  T
Q  207 cagtatttttctaattctatcatgagtagaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtt 306  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18161759 cagaatttttctaattctatcatgagtggaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatcttgcatacatctcatcaatggtt 18161660  T
Q  307 tcattttcactcatttcaaagacttcaaattttctgactccaatgtcaattctggtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtat 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  18161659 tcattttcactcatttcaaagacttcaaattttctgactccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcagagtat 18161560  T
Q  407 cccatacctctttagcattcttacattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagaatttaacaatac 506  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||    
T  18161559 cccatacttctttagcatttgtacattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttagtaatac 18161460  T
Q  507 ctgagctttttcatctgttgaccatgcactcttttctttgacagctccttctttggttgttggaacaaagtctccatctgtgatga 592  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18161459 ctgagctttttcatctgttgaccatgcactttttgctttgacagctccttctttggttgttggaacaaagtctccatctgtgatga 18161374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 490; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 31359455 - 31358870
Alignment:
Q  7 acatcatcatcaacaactgatgaactttgctgagatgctttcaaggcaagtgtttttaccttcttcactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgag 106  Q
    ||||| |||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31359455 acatcttcatcagcaactgatggggtttgctgagatgctttcaaggcaagtgttcttaccttcttcactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgag 31359356  T
Q  107 ctctcagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtgtccacatacttggaagacatct 206  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31359355 ctcttagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtctccacatacttggaagacatct 31359256  T
Q  207 cagtatttttctaattctatcatgagtagaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtt 306  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31359255 cagaatttttctaattctatcatgagtggaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatcttgcatacatctcatcaatggtt 31359156  T
Q  307 tcattttcactcatttcaaagacttcaaattttctgactccaatgtcaattctggtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtat 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  31359155 tcattttcactcatttcaaagacttcaaattttctgactccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcagagtat 31359056  T
Q  407 cccatacctctttagcattcttacattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagaatttaacaatac 506  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||    
T  31359055 cccatacttctttagcatttgtacattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttagtaatac 31358956  T
Q  507 ctgagctttttcatctgttgaccatgcactcttttctttgacagctccttctttggttgttggaacaaagtctccatctgtgatga 592  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  31358955 ctgagctttttcatctgttgaccatgcactttttgctttgacagctccttctttggttgttggaacaaagtcttcatttgtgatga 31358870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 486; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 16899840 - 16899255
Alignment:
Q  7 acatcatcatcaacaactgatgaactttgctgagatgctttcaaggcaagtgtttttaccttcttcactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgag 106  Q
    ||||| |||||| |||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16899840 acatcttcatcagcaactgatggggtttgctgagatgcttttaaggcaagtgtttttaccttcttcactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgag 16899741  T
Q  107 ctctcagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtgtccacatacttggaagacatct 206  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  16899740 ctcttagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtctccacacacttggaagacatct 16899641  T
Q  207 cagtatttttctaattctatcatgagtagaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtt 306  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16899640 cagaatttttctaattctatcatgagttgaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatcttgcatacatctcatcaatggtt 16899541  T
Q  307 tcattttcactcatttcaaagacttcaaattttctgactccaatgtcaattctggtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtat 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  16899540 tcattttcactcatttcaaagacttcaaattttctgactccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcagagtat 16899441  T
Q  407 cccatacctctttagcattcttacattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagaatttaacaatac 506  Q
    | ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||    
T  16899440 ctcatacttctttagcatttgtacattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttagtaatac 16899341  T
Q  507 ctgagctttttcatctgttgaccatgcactcttttctttgacagctccttctttggttgttggaacaaagtctccatctgtgatga 592  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16899340 ctgagctttttcatctgttgaccatgcactttttgctttgacagctccttctttggttgttggaacatagtctccatctgtgatga 16899255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 445; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 34767235 - 34766667
Alignment:
Q  22 actgatgaactttgctgagatgctttcaaggcaagtgtttttaccttcttcactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgagctctcagtgaaccaa 121  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34767235 actgatgaggtttgctgagaggctttcaaggcaagtgactttaccttctttactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgagctctcagtgaaccaa 34767136  T
Q  122 tgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtgtccacatacttggaagacatctcagtatttttctaat 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  34767135 tgagatcttccaggttcatagatttcaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtctccacatacttggaagacatctcaatatttttctgat 34767036  T
Q  222 tctatcatgagtagaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtttcattttcactcatt 321  Q
    ||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34767035 tctctcatgagtggaatatgcttttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctggcatacatctcatcaatggtttcattttcactcatt 34766936  T
Q  322 tcaaagacttcaaattttctgactccaatgtcaattctggtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtatcccatacctctttag 421  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34766935 tcaaagacttcaaactttctgactccaatgtcaattctggtttctttgacatgagatgtaccttcatgatgtactttcaaggtatcccatacctctttag 34766836  T
Q  422 cattcttacattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagaatttaacaatacctgagctttttcatc 521  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||    
T  34766835 catttttgcattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttagcaatacctgagccttttcatc 34766736  T
Q  522 tgttgaccatgcactcttttctttgacagctccttctttggttgttggaacaaagtctccatctgtgat 590  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||     ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  34766735 tgttgaccatgcactcttaactttgatgatcccttctttggttagtggaacaaagtctccatctgtgat 34766667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 420; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 590
Target Start/End: Original strand, 18710425 - 18711008
Alignment:
Q  7 acatcatcatcaacaactgatgaactttgctgagatgctttcaaggcaagtgtttttaccttcttcactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgag 106  Q
    |||||||||||| | ||| ||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18710425 acatcatcatcagctacttatgaggtttgctgagaagctttcaaggcaagtgattttaccttcttcactgggttgtctccttgaagtacaactgcatgag 18710524  T
Q  107 ctctcagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtgtccacatacttggaagacatct 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18710525 ctctcagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctgagtaattgcagtgaccataggtctccacatacttggaagacatct 18710624  T
Q  207 cagtatttttctaattctatcatgagtagaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtt 306  Q
     || || ||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18710625 tagaatctttctgattctctcatgagtggaatattcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtt 18710724  T
Q  307 tcattttcactcatttcaaagacttcaaattttctgactccaatgtcaattctggtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtat 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||  || |    
T  18710725 tcattttcactcatttcaaagacttcaaactttctgactccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccttcatgatgtactctcagagtgt 18710824  T
Q  407 cccatacctctttagcattcttacattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagaatttaacaatac 506  Q
    | ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||    
T  18710825 ctcatacctctttggcatttttacactcatcaactcttgcactttcttccatggtcagtgcacatgataaaaagagtctagctttagagtttagtaatac 18710924  T
Q  507 ctgagctttttcatctgttgaccatgcactcttttctttgacagctccttctttggttgttggaacaaagtctccatctgtgat 590  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18710925 atgagctttttcatctgttgaccatgcactcttttcctttacagctccttatttggttgttgcaacaaagtctccatctgtgat 18711008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 416; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 590
Target Start/End: Original strand, 18704490 - 18705073
Alignment:
Q  7 acatcatcatcaacaactgatgaactttgctgagatgctttcaaggcaagtgtttttaccttcttcactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgag 106  Q
    |||||||||||| | ||| ||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18704490 acatcatcatcagctacttatgaggtttgctgagaagctttcaaggcaagtgattttaccttcttcactgggttgtctccttgaagtacaactgcatgag 18704589  T
Q  107 ctctcagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtgtccacatacttggaagacatct 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18704590 ctctcagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctgagtaattgcagtgaccataggtctccacatacttggaagacatct 18704689  T
Q  207 cagtatttttctaattctatcatgagtagaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtt 306  Q
     || || ||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18704690 tagaatctttctgattctctcatgagtggaatattcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcataaatctcatcaatggtt 18704789  T
Q  307 tcattttcactcatttcaaagacttcaaattttctgactccaatgtcaattctggtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtat 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||  || |    
T  18704790 tcattttcactcatttcaaagacttcaaaatttctgactccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccttcatgatgtactctcagagtgt 18704889  T
Q  407 cccatacctctttagcattcttacattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagaatttaacaatac 506  Q
    | ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||    
T  18704890 ctcatacctctttggcatttttacactcatcaactcttgcactttcttccatggtcagtgcacatgataaaaagagtctagctttagagtttagtaatac 18704989  T
Q  507 ctgagctttttcatctgttgaccatgcactcttttctttgacagctccttctttggttgttggaacaaagtctccatctgtgat 590  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18704990 atgagctttttcatctgttgaccatgcactcttttcctttacagctccttatttggttgttgcaacaaagtctccatctgtgat 18705073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 201 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 29542147 - 29541756
Alignment:
Q  201 acatctcagtatttttctaattctatcatgagtagaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatca 300  Q
    |||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29542147 acatcttaatatttttctgattctatcatgagtggaatatgcctttccaagagatttcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatca 29542048  T
Q  301 atggtttcattttcactcatttcaaagacttcaaattttctgactccaatgtcaattctggtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttca 400  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  29542047 atggtttcattttcactcattttaaagacttcaaattttctaactccaatgtcaattctagtttctttgacatgagattgaccctcatgatgtattttca 29541948  T
Q  401 aggtatcccatacctctttagcattcttacattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagaatttaa 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29541947 aggtatcccatacctctttagcattcttacattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttaa 29541848  T
Q  501 caatacctgagctttttcatctgttgaccatgcactcttttctttgacagctccttctttggttgttggaacaaagtctccatctgtgatga 592  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29541847 caatacctgagccttttcatctgttgaccatgcactcttttctttgacagctccttctttggttgttggaacaaagtctccatctatgatga 29541756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 7 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 29561320 - 29561121
Alignment:
Q  7 acatcatcatcaacaactgatgaactttgctgagatgctttcaaggcaagtgtttttaccttcttcactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgag 106  Q
    |||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  29561320 acatcatcatcagctactgatgaggtttgctgagatgctttcaaagcaagtgtttttacattcttcactggtttatctccttgaagtacgacttcatgag 29561221  T
Q  107 ctctcagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtgtccacatacttggaagacatct 206  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||||| ||   |||| ||||| |||||||||    
T  29561220 ctcttagtgaaccaatgagatctttcaggttcatagattttaaatctttggcctaagtaattgttgtgaccatatgtcctcacacacttgaaagacatct 29561121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 145 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 25895891 - 25895804
Alignment:
Q  145 tttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtgtccacatacttggaagacatctcagtatttttctaattctatcatgag 232  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||  || |||| |||||||| | ||||||||| ||||| |||||||    
T  25895891 tttaagtctttggcttgagtgattgctgtaaccataggtctccatgtatttgggagacatcttaatatttttctgattctgtcatgag 25895804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 11375132 - 11375039
Alignment:
Q  317 tcatttcaaagacttcaaattttctgactccaatgtcaattctggtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtatccca 410  Q
    ||||||| || | |||||||||||  || || ||||||||||| |||||||| ||||||   || || |||||||||||||| || ||||||||    
T  11375132 tcatttcgaataattcaaattttcgtacacctatgtcaattcttgtttctttcacatgactagttccttcatgatgtatttttaatgtatccca 11375039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 494; Significance: 0; HSPs: 19)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 494; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 18363171 - 18362586
Alignment:
Q  7 acatcatcatcaacaactgatgaactttgctgagatgctttcaaggcaagtgtttttaccttcttcactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgag 106  Q
    ||||| |||||| |||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18363171 acatcttcatcagcaactgatggggtttgctgagatgcttttaaggcaagtgtttttaccttcttcactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgag 18363072  T
Q  107 ctctcagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtgtccacatacttggaagacatct 206  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  18363071 ctcttagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtctccacacacttggaagacatct 18362972  T
Q  207 cagtatttttctaattctatcatgagtagaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtt 306  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18362971 cagaatttttctaattctatcatgagtggaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatcttgcatacatctcatcaatggtt 18362872  T
Q  307 tcattttcactcatttcaaagacttcaaattttctgactccaatgtcaattctggtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtat 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  18362871 tcattttcactcatttcaaagacttcaaattttctgactccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcagagtat 18362772  T
Q  407 cccatacctctttagcattcttacattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagaatttaacaatac 506  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||    
T  18362771 cccatacttctttagcatttgtacattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttagtaatac 18362672  T
Q  507 ctgagctttttcatctgttgaccatgcactcttttctttgacagctccttctttggttgttggaacaaagtctccatctgtgatga 592  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18362671 ctgagctttttcatctgttgaccatgcactttttgctttgacagctccttctttggttgttggaacaaagtctccatctgtgatga 18362586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 494; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 592
Target Start/End: Original strand, 26200772 - 26201357
Alignment:
Q  7 acatcatcatcaacaactgatgaactttgctgagatgctttcaaggcaagtgtttttaccttcttcactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgag 106  Q
    ||||| |||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26200772 acatcttcatcagcaactgatggggtttgctgagatgctttcaaggcaagtgttcttaccttcttcactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgag 26200871  T
Q  107 ctctcagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtgtccacatacttggaagacatct 206  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26200872 ctcttagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtctccacatacttggaagacatct 26200971  T
Q  207 cagtatttttctaattctatcatgagtagaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtt 306  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26200972 cagaatttttctaattctatcatgagtggaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatcttgcatacatctcatcaatggtt 26201071  T
Q  307 tcattttcactcatttcaaagacttcaaattttctgactccaatgtcaattctggtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtat 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  26201072 tcattttcactcatttcaaagacttcaaattttctgactccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcagagtat 26201171  T
Q  407 cccatacctctttagcattcttacattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagaatttaacaatac 506  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||    
T  26201172 cccatacttctttagcatttgtacattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttagtaatac 26201271  T
Q  507 ctgagctttttcatctgttgaccatgcactcttttctttgacagctccttctttggttgttggaacaaagtctccatctgtgatga 592  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26201272 ctgagctttttcatctgttgaccatgcactttttgctttgacagctccttctttggttgttggaacaaagtctccatttgtgatga 26201357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 494; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 27414042 - 27413457
Alignment:
Q  7 acatcatcatcaacaactgatgaactttgctgagatgctttcaaggcaagtgtttttaccttcttcactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgag 106  Q
    ||||| |||||| |||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27414042 acatcttcatcagcaactgatggggtttgctgagatgctttcaaagcaagtgtttttaccttcttcactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgag 27413943  T
Q  107 ctctcagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtgtccacatacttggaagacatct 206  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  27413942 ctcttagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtctccacacacttggaagacatct 27413843  T
Q  207 cagtatttttctaattctatcatgagtagaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtt 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27413842 cagtatttttctaattctatcatgagtagaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctggcatacatctcatcaatggtt 27413743  T
Q  307 tcattttcactcatttcaaagacttcaaattttctgactccaatgtcaattctggtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtat 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  27413742 tcattttcactcatttcaaagacttcaaattttctaactccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcagagtat 27413643  T
Q  407 cccatacctctttagcattcttacattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagaatttaacaatac 506  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||    
T  27413642 cccatacttctttagcatttgtacattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttaaaatttagtaatac 27413543  T
Q  507 ctgagctttttcatctgttgaccatgcactcttttctttgacagctccttctttggttgttggaacaaagtctccatctgtgatga 592  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27413542 ctgacctttttcatctgttgaccatgcactttttgctttgacagctccttctttggttgttggaacaaagtctccatctgtgatga 27413457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 486; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 33941214 - 33940629
Alignment:
Q  7 acatcatcatcaacaactgatgaactttgctgagatgctttcaaggcaagtgtttttaccttcttcactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgag 106  Q
    ||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33941214 acatcttcatcagcaactgatgaggtttgctgagatgctttcaaggcaagtgttcttaccttctttactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgag 33941115  T
Q  107 ctctcagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtgtccacatacttggaagacatct 206  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33941114 ctcttagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtctccacatacttggaagacatct 33941015  T
Q  207 cagtatttttctaattctatcatgagtagaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtt 306  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33941014 cagaatttttctaattctatcatgagtggaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatcttgcatacatctcatcaatggtt 33940915  T
Q  307 tcattttcactcatttcaaagacttcaaattttctgactccaatgtcaattctggtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtat 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  33940914 tcattttcactcatttcaaagacttcaaattttctgactccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcagagtat 33940815  T
Q  407 cccatacctctttagcattcttacattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagaatttaacaatac 506  Q
    |||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||    
T  33940814 cccatactcctttagcatttgtacattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttagtaatac 33940715  T
Q  507 ctgagctttttcatctgttgaccatgcactcttttctttgacagctccttctttggttgttggaacaaagtctccatctgtgatga 592  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33940714 ctgagctttttcatctgttgaccatgcactttttgctttgacagctccttctttgtttgttggaacaaagtctccatttgtgatga 33940629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 441; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 20949734 - 20949166
Alignment:
Q  22 actgatgaactttgctgagatgctttcaaggcaagtgtttttaccttcttcactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgagctctcagtgaaccaa 121  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20949734 actgatgaggtttgctgagaggctttcaaggcaagtgactttaccttctttactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgagctctcagtgaaccaa 20949635  T
Q  122 tgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtgtccacatacttggaagacatctcagtatttttctaat 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  20949634 tgagatcttccaggttcatagatttcaaatccttggcctgagtgattgcagtgaccataggtctccacatacttggaagacatctcaatatttttctgat 20949535  T
Q  222 tctatcatgagtagaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtttcattttcactcatt 321  Q
    ||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20949534 tctctcatgagtggaatatgcttttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctggcatacatctcatcaatggtttcattttcactcatt 20949435  T
Q  322 tcaaagacttcaaattttctgactccaatgtcaattctggtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtatcccatacctctttag 421  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20949434 tcaaagacttcaaactttctgactccaatgtcaattctggtttctttgacatgagatgtaccttcatgatgtactttcaaggtatcccatacctctttag 20949335  T
Q  422 cattcttacattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagaatttaacaatacctgagctttttcatc 521  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||    
T  20949334 catttttgcattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttagcaatacctgagccttttcatc 20949235  T
Q  522 tgttgaccatgcactcttttctttgacagctccttctttggttgttggaacaaagtctccatctgtgat 590  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||     ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  20949234 tgttgaccatgcactcttaactttgatgatcccttctttggttagtggaacaaagtctccatctgtgat 20949166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 23 - 590
Target Start/End: Original strand, 23375368 - 23375927
Alignment:
Q  23 ctgatgaactttgctgagatgctttcaaggcaagtgtttttaccttcttcactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgagctctcagtgaaccaat 122  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23375368 ctgatgaagtttgttgagatgctttcaaggaaagtgattttacctttttcactggtttgtctttttgaagtacaacttcatgagctctcagtgaaccaat 23375467  T
Q  123 gagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtgtccacatacttggaagacatctcagtatttttctaatt 222  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    |||||||| ||||||||||||     ||||||| ||||||||| |||    
T  23375468 gagatcttcaaggttcatagattttaaatctttggcctgagtaattgca---tccataggtctccacatacttg-----catctcaatatttttctgatt 23375559  T
Q  223 ctatcatgagtagaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtttcattttcactcattt 322  Q
    || |||||||| |||||| | |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||    
T  23375560 ctttcatgagtggaatatacttttcgaagagacctcatctcatttactattgtagtaaatctaaaatacatttcatcaatagtttcattctcactcattt 23375659  T
Q  323 caaagacttcaaattttctgactccaatgtcaattctggtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtatcccatacctctttagc 422  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||  ||| | | ||  | |||||||||||||||||    
T  23375660 caaagacttcacactttctgactcctatgttaattctggtttccttgacatgagaggtaccttcatggcgtactcttaaaatttcccatacctctttagc 23375759  T
Q  423 attcttacattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagaatttaacaatacctgagctttttcatct 522  Q
    |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  23375760 attcttgcatttatcaactctttcattttcttccatggttagtgcacatgataaaaagagtctaggtttagagtttaacaatacatgagctttgtcatct 23375859  T
Q  523 gttgaccatgcactcttttctttgacagctccttctttggttgttggaacaaagtctccatctgtgat 590  Q
     |||||||||||||||||| |||||  | ||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  23375860 attgaccatgcactcttttgtttgatggttccttctttagtctttggaacaaagtctccatttgtgat 23375927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 151 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 5601928 - 5601579
Alignment:
Q  151 tctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtgtccacatacttggaagacatctcagtatttttctaattctatcatgagtagaatatgcctttccaa 250  Q
    ||||| || ||||||||||| || ||||| ||| ||||   | ||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||| |  |||||||    
T  5601928 tctttagcttgagtgattgccgtaaccatgggtctccattgagttggaagacatcttagtatttttcttattctgtcgtgggtagaataagtttttccaa 5601829  T
Q  251 gagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtttcattttcactcatttcaaagacttcaaattttctgactccaat 350  Q
    | ||||| | |||||||||||| |  || |||||||  ||||| ||||||||| |||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||| || |||||    
T  5601828 gtgatcttagttcatttactatagatgtgaatctagagtacatttcatcaatgttttcatcttcaatcatttcaaagatttcaaactttctcacaccaat 5601729  T
Q  351 gtcaattctggtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtatcccatacctctttagcattcttacattcatcaactctttcactt 450  Q
    ||||||||| |||||||| |||||   ||| || |||||||| | ||| |  |||||||| |||| ||| ||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  5601728 gtcaattcttgtttctttaacatggcttgttccttcatgatggactttgagagtatcccacaccttttttgcagtatcacattcatcaactctttcactt 5601629  T
Q  451 tcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagaatttaa 500  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5601628 tcttccatgcttagtgcacatgatagaaagagtcgagctttagaatttaa 5601579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 100 - 499
Target Start/End: Original strand, 30453136 - 30453535
Alignment:
Q  100 tcatgagctctcagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtgtccacatacttggaa 199  Q
    ||||||||| | | ||| |||||||||||||| ||    | ||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||| ||||  | |||||||    
T  30453136 tcatgagcttttaatgacccaatgagatcttcaagagctaaagagtttaagtctttagcttgtgtgattgcagttaccatgggtctccatgtgcttggaa 30453235  T
Q  200 gacatctcagtatttttctaattctatcatgagtagaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatc 299  Q
    ||||||| |  |||||||| || | ||||||||| | ||| |  |||||||| ||||| | |||||| || || |  || ||||| |  ||||| |||||    
T  30453236 gacatcttaagatttttcttatccgatcatgagtggtataagtttttccaagtgatcttaattcattcacaatagatgtgaatctggagtacatttcatc 30453335  T
Q  300 aatggtttcattttcactcatttcaaagacttcaaattttctgactccaatgtcaattctggtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttc 399  Q
    |||| | |||| |||  ||||||| |||| |||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||    || || |||||||| |||||     
T  30453336 aatgttctcatcttcgttcatttcgaagatttcaaattttcttacgccaatgtctattcttgtttcttttacatggctagttccttcatgatgaattttt 30453435  T
Q  400 aaggtatcccatacctctttagcattcttacattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagaattta 499  Q
    |  || ||||| || ||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  30453436 agagtgtcccacacttcttttgcagtcacacattcatcaactctttcactttcttccatgcttagtgcgcatgatagaaagagtcgagctttagagttta 30453535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 100 - 499
Target Start/End: Original strand, 30458214 - 30458613
Alignment:
Q  100 tcatgagctctcagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtgtccacatacttggaa 199  Q
    ||||||||| | | ||| |||||||||||||| ||    | ||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||| ||||  | |||||||    
T  30458214 tcatgagcttttaatgacccaatgagatcttcaagagctaaagagtttaagtctttagcttgtgtgattgcagttaccatgggtctccatgtgcttggaa 30458313  T
Q  200 gacatctcagtatttttctaattctatcatgagtagaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatc 299  Q
    ||||||| |  |||||||| || | ||||||||| | ||| |  |||||||| ||||| | |||||| || || |  || ||||| |  ||||| |||||    
T  30458314 gacatcttaagatttttcttatccgatcatgagtggtataagtttttccaagtgatcttaattcattcacaatagatgtgaatctggagtacatttcatc 30458413  T
Q  300 aatggtttcattttcactcatttcaaagacttcaaattttctgactccaatgtcaattctggtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttc 399  Q
    |||| | |||| |||  ||||||| |||| |||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||    || || |||||||| |||||     
T  30458414 aatgttctcatcttcgttcatttcgaagatttcaaattttcttacgccaatgtctattcttgtttcttttacatggctagttccttcatgatgaattttt 30458513  T
Q  400 aaggtatcccatacctctttagcattcttacattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagaattta 499  Q
    |  || ||||| || ||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  30458514 agagtgtcccacacttcttttgcagtcacacattcatcaactctttcactttcttccatgcttagtgcgcatgatagaaagagtcgagctttagagttta 30458613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 100 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 24414071 - 24413672
Alignment:
Q  100 tcatgagctctcagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtgtccacatacttggaa 199  Q
    ||||||||| | | ||| |||||||||||||| ||    | ||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||| ||||  | |||||||    
T  24414071 tcatgagcttttaatgacccaatgagatcttcaagagctaaagagtttaagtctttagcttgtgtgattgcagttaccatgggtctccatgtgcttggaa 24413972  T
Q  200 gacatctcagtatttttctaattctatcatgagtagaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatc 299  Q
    ||||||| |  |||||||| || | ||||||||| | ||| |  ||| |||| ||||| | |||||| || || |  || ||||| |  ||||| |||||    
T  24413971 gacatcttaagatttttcttatccgatcatgagtggtataagttttttcaagtgatcttaattcattcacaatagatgtgaatctggagtacatttcatc 24413872  T
Q  300 aatggtttcattttcactcatttcaaagacttcaaattttctgactccaatgtcaattctggtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttc 399  Q
    |||| | |||| |||  ||||||| |||| |||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||    || || |||||||| |||||     
T  24413871 aatgttctcatcttcgttcatttcgaagatttcaaattttcttacgccaatgtctattcttgtttcttttacatggctagttccttcatgatgaattttt 24413772  T
Q  400 aaggtatcccatacctctttagcattcttacattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagaattta 499  Q
    |  || ||||| || ||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  24413771 agagtgtcccacacttcttttgcagtcacacattcatcaactctttcactttcttccatgcttagtgcgcatgatagaaagagtcgagctttagagttta 24413672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 75 - 338
Target Start/End: Original strand, 22456358 - 22456621
Alignment:
Q  75 tggtttgtctccttgaagtacaacttcatgagctctcagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtg 174  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |    ||  || |||||||||||||| ||||||||| | ||     
T  22456358 tggtttgtcttcttgaagcaaaacttcatgagctcttagtgttccaatgagatcttctaaagccaaggaatttaaatctttggcttgagtgatttctgta 22456457  T
Q  175 accataggtgtccacatacttggaagacatctcagtatttttctaattctatcatgagtagaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattg 274  Q
    ||||||||| |||| ||| | ||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||| |||||||   ||||| |  || ||||  ||||||||| | |    
T  22456458 accataggtctccatatattaggaagacatcttaatatttttctgattctgtcatgaggagaatatatttttcccaatgacctcaactcatttactttag 22456557  T
Q  275 tagtaaatctagcatacatctcatcaatggtttcattttcactcatttcaaagacttcaaattt 338  Q
     |||||||||   |||||| ||||||||| |||| | |||| ||||||| |||| |||||||||    
T  22456558 aagtaaatctgaaatacatttcatcaatgttttcctcttcattcatttcgaagatttcaaattt 22456621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 145 - 500
Target Start/End: Original strand, 24299175 - 24299530
Alignment:
Q  145 tttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtgtccacatacttggaagacatctcagtatttttctaattctatcatgagtagaatatgcct 244  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||  || |||| |||||||| | ||||||||| ||||| |||||||  ||||||   |    
T  24299175 tttaagtctttggcttgagtgattgctgtaaccataggtctccatgtatttgggagacatcttaatatttttctgattctgtcatgaggggaatatattt 24299274  T
Q  245 ttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtttcattttcactcatttcaaagacttcaaattttctgac 344  Q
    |||| |  ||||| |  ||||| ||||| | ||| ||||  | |||||| ||||||||  |||| | |||||||||||| || | ||| |||||||  ||    
T  24299275 ttcccaatgatcttaactcattcactatagaagtgaatcatgaatacatttcatcaatattttcttcttcactcatttcgaaaatttcgaattttcgtac 24299374  T
Q  345 tccaatgtcaattctggtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtatcccatacctctttagcattcttacattcatcaactctt 444  Q
     ||||| || || || |||||||| |||||    || || |||||||| ||||| || |||||||| |  ||||| ||  |  ||||||||| || ||||    
T  24299375 gccaatatctatccttgtttctttaacatggctagttccttcatgatgaatttttaacgtatcccaaatttcttttgccgtagtacattcataaattctt 24299474  T
Q  445 tcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagaatttaa 500  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||  ||||||||| |||||    
T  24299475 tcactttcttccatggttagtgaacattgtaaaaagagttgagctttagagtttaa 24299530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 517 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 19781947 - 19781874
Alignment:
Q  517 tcatctgttgaccatgcactcttttctttgacagctccttctttggttgttggaacaaagtctccatctgtgat 590  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19781947 tcatctgtggaccatgcactattttcctttacaactccttctttggttgttggaacaaagtctccatctgtgat 19781874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 280 - 500
Target Start/End: Original strand, 21083013 - 21083233
Alignment:
Q  280 aatctagcatacatctcatcaatggtttcattttcactcatttcaaagacttcaaattttctgactccaatgtcaattctggtttctttgacatgagatg 379  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||  |||| || |||  |||||||||  | ||||| ||||| |||||   ||| |||||||||  ||    
T  21083013 aatcttgcaaacatctcatcaatggtttcactttctttcatctcgaaggtttcaaatttcttaactcccatgtctattctttcttccttgacatgacttg 21083112  T
Q  380 taccctcatgatgtattttcaaggtatcccatacctctttagcattcttacattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaa 479  Q
    | || |||||||| ||||| ||||  ||||||| |||||||||| |  ||||||| || ||||| |||  ||||||| || |||  ||||||| ||||||    
T  21083113 ttccttcatgatgaatttttaaggcttcccatatctctttagcagttgtacattcttctactctatcatattcttccctgcttaaagcacatgttagaaa 21083212  T
Q  480 gagtctagctttagaatttaa 500  Q
     |||  ||||||||| |||||    
T  21083213 aagttgagctttagagtttaa 21083233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 20037526 - 20037245
Alignment:
Q  59 tttttaccttcttcactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgagctctcagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggc 158  Q
    ||||| |||| ||||| ||||| ||| |||| |||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||| |    ||  || |||| ||| |||||    
T  20037526 tttttccctttttcaccggtttatcttcttggagtagaacttcatgagctctaagtgttccaatgagattttctaaagccaaggaatttagatcgttggc 20037427  T
Q  159 ctgagtgattgcagtgaccataggtgtccacatacttggaagacatctcagtatttttctaattctatcatgagtagaatatgcctttccaagagatctc 258  Q
     ||||||||||  || ||||||||| ||||| |  |||| |||||||| | ||||||||| ||||| |||||||  ||||||   ||||| |  || ||     
T  20037426 ttgagtgattgttgtaaccataggtctccacgtgtttgggagacatcttaatatttttctgattctgtcatgaggggaatatatttttcccaatgacctt 20037327  T
Q  259 atttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtttcattttcactcatttcaaagacttcaaattttc 340  Q
    |  ||||| ||||| | ||| ||||  | |||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||| |||||||    
T  20037326 aactcattcactatagaagtgaatcgtgaatacatttcatcaatgttttcttcttcactcatttcaaaaatttcgaattttc 20037245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 428 - 500
Target Start/End: Original strand, 24289951 - 24290023
Alignment:
Q  428 tacattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagaatttaa 500  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||  ||||||||| |||||    
T  24289951 tacattcataaattctttcactttcttccatggttagtgaacattgtaaaaagagttgagctttagagtttaa 24290023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 287 - 410
Target Start/End: Original strand, 15329389 - 15329512
Alignment:
Q  287 catacatctcatcaatggtttcattttcactcatttcaaagacttcaaattttctgactccaatgtcaattctggtttctttgacatgagatgtaccctc 386  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||  ||||||| || | |||| ||||||  || || ||||||||||| |||||||| || |||   ||||| ||    
T  15329389 catacatttcatcaatggtttcggtttccttcatttcgaatagttcatattttcgtacaccgatgtcaattcttgtttcttttacgtgactggtaccttc 15329488  T
Q  387 atgatgtattttcaaggtatccca 410  Q
    |||||||||||| |||| ||||||    
T  15329489 atgatgtatttttaaggaatccca 15329512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 287 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 18709370 - 18709247
Alignment:
Q  287 catacatctcatcaatggtttcattttcactcatttcaaagacttcaaattttctgactccaatgtcaattctggtttctttgacatgagatgtaccctc 386  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||  ||||||| || | |||| ||||||  || || ||||||||||| |||||||| || |||   ||||| ||    
T  18709370 catacatttcatcaatggtttcggtttccttcatttcgaatagttcatattttcgtacaccgatgtcaattcttgtttcttttacgtgactggtaccttc 18709271  T
Q  387 atgatgtattttcaaggtatccca 410  Q
    |||||||||||| |||| ||||||    
T  18709270 atgatgtatttttaaggaatccca 18709247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 427 - 500
Target Start/End: Original strand, 22456710 - 22456783
Alignment:
Q  427 ttacattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagaatttaa 500  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||  |||||| ||||||||    
T  22456710 ttacattcataaattctttcactttcttccatggttaatgaacattgtaaaaagagttgagctttggaatttaa 22456783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 491; Significance: 0; HSPs: 6)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 491; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 45016247 - 45015669
Alignment:
Q  7 acatcatcatcaacaactgatgaactttgctgagatgctttcaaggcaagtgtttttaccttcttcactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgag 106  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45016247 acatcatcatcagcaactgatgagcttgactgagatgcttttaaggcaagtgtttttaccttctttactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgag 45016148  T
Q  107 ctctcagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtgtccacatacttggaagacatct 206  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45016147 ctcttagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtctccacatacttggaagacatct 45016048  T
Q  207 cagtatttttctaattctatcatgagtagaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtt 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45016047 cagtatttttctaattctatcatgagtagaatatgcatttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtt 45015948  T
Q  307 tcattttcactcatttcaaagacttcaaattttctgactccaatgtcaattctggtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtat 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45015947 tcattttcactcatttcaaagacttcaaattttctgactccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtat 45015848  T
Q  407 cccatacctctttagcattcttacattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagaatttaacaatac 506  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||  |||||    
T  45015847 cccatacctctttagcatttgtacattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgataaaaagactctagctttagagtatagtaatac 45015748  T
Q  507 ctgagctttttcatctgttgaccatgcactcttttctttgacagctccttctttggttgttggaacaaagtctccatct 585  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  45015747 ctgagctttttcatctgttgaccatgcactttttgctttgacagctccttctttggttgttggaacaaaatcttcatct 45015669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 486; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 18653112 - 18652527
Alignment:
Q  7 acatcatcatcaacaactgatgaactttgctgagatgctttcaaggcaagtgtttttaccttcttcactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgag 106  Q
    ||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18653112 acatcttcatcagcaactgatgaggtttgctgagatgctttcaaggcaagtgttcttaccttctttactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgag 18653013  T
Q  107 ctctcagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtgtccacatacttggaagacatct 206  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18653012 ctcttagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtctccacatacttggaagacatct 18652913  T
Q  207 cagtatttttctaattctatcatgagtagaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtt 306  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18652912 cagaatttttctaattctatcatgagtggaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatcttgcatacatctcatcaatggtt 18652813  T
Q  307 tcattttcactcatttcaaagacttcaaattttctgactccaatgtcaattctggtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtat 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  18652812 tcattttcactcatttcaaagacttcaaattttctgactccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcagagtat 18652713  T
Q  407 cccatacctctttagcattcttacattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagaatttaacaatac 506  Q
    |||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||    
T  18652712 cccatactcctttagcatttgtacattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttagtaatac 18652613  T
Q  507 ctgagctttttcatctgttgaccatgcactcttttctttgacagctccttctttggttgttggaacaaagtctccatctgtgatga 592  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18652612 ctgagctttttcatctgttgaccatgcactttttgctttgacagctccttctttgtttgttggaacaaagtctccatttgtgatga 18652527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 478; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 592
Target Start/End: Original strand, 9512211 - 9512796
Alignment:
Q  7 acatcatcatcaacaactgatgaactttgctgagatgctttcaaggcaagtgtttttaccttcttcactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgag 106  Q
    ||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9512211 acatcttcatcagcaactgatgaggtttgctgagatgctttcaaggcaagtgttcttaccttctttactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgag 9512310  T
Q  107 ctctcagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtgtccacatacttggaagacatct 206  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9512311 ctcttagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtctccacatacttggaagacatct 9512410  T
Q  207 cagtatttttctaattctatcatgagtagaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtt 306  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9512411 cagaatttttctaattctatcatgagtggaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatcttgcatacatctcatcaatggtt 9512510  T
Q  307 tcattttcactcatttcaaagacttcaaattttctgactccaatgtcaattctggtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtat 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  9512511 tcattttcactcatttcaaagacttcaaattttctgactccaatgtcaattctagtttctctgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcagagtat 9512610  T
Q  407 cccatacctctttagcattcttacattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagaatttaacaatac 506  Q
    |||||||  ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||    
T  9512611 cccatactcctttagcatttgtacactcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttagtaatac 9512710  T
Q  507 ctgagctttttcatctgttgaccatgcactcttttctttgacagctccttctttggttgttggaacaaagtctccatctgtgatga 592  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9512711 ctgagctttttcatctgttgaccatgcactttttgctttgacagctccttctttgtttgttggaacaaagtctccatttgtgatga 9512796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 437; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 590
Target Start/End: Original strand, 27168448 - 27169016
Alignment:
Q  22 actgatgaactttgctgagatgctttcaaggcaagtgtttttaccttcttcactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgagctctcagtgaaccaa 121  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27168448 actgatgaggtttgctgagaggctttcaaggcaagtgactttactttctttactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgagctctcagtgaaccaa 27168547  T
Q  122 tgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtgtccacatacttggaagacatctcagtatttttctaat 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  27168548 tgagatcttccaggttcatagatttcaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtctccacatacttggaagacatctcaatatttttctgat 27168647  T
Q  222 tctatcatgagtagaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtttcattttcactcatt 321  Q
    ||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27168648 tctctcatgagtggaatatgcttttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctggcatacatctcatcaatggtttcattttcactcatt 27168747  T
Q  322 tcaaagacttcaaattttctgactccaatgtcaattctggtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtatcccatacctctttag 421  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27168748 tcaaagacttcaaactttctgactccaatgtcaattctggtctctttgacatgagatgtaccttcatgatgtactttcaaggtatcccatacctctttag 27168847  T
Q  422 cattcttacattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagaatttaacaatacctgagctttttcatc 521  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||    
T  27168848 catttttgcattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttagcaatacctgagccttttcatc 27168947  T
Q  522 tgttgaccatgcactcttttctttgacagctccttctttggttgttggaacaaagtctccatctgtgat 590  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||     ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  27168948 tgttgaccatgcactcttaactttgatgatcccttctttggttagtggaacaaagtctccatctgtgat 27169016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 384; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 22904033 - 22903455
Alignment:
Q  7 acatcatcatcaacaactgatgaactttgctgagatgctttcaaggcaagtgtttttaccttcttcactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgag 106  Q
    |||||||| ||| | ||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22904033 acatcatcttcagctactgatgaggtttgctgagaggcttttaaggcaagtgactttaccttcttcattggtttgtctccttgaagtacaacttcatgag 22903934  T
Q  107 ctctcagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtgtccacatacttggaagacatct 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || ||    
T  22903933 ctctcagtgaaccaatgagatcttccaagttcatagatttcaaatctttggcctgagtaattgcagttaccataggtctccacatacttggaaggcaact 22903834  T
Q  207 cagtatttttctaattctatcatgagtagaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtt 306  Q
    || ||||||||| ||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22903833 caatatttttctgattatctcatgagtgaaatatgtctttccaagagatctcatttcatttactattgtaataaatctggcatacatctcatcaatggtt 22903734  T
Q  307 tcattttcactcatttcaaagacttcaaattttctgactccaatgtcaattctggtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtat 406  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||  |||    
T  22903733 tcattctcactcatttcaaagacttgaaactttctaactccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccatcatgatgtaatatcaaaatat 22903634  T
Q  407 cccatacctctttagcattcttacattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagaatttaacaatac 506  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22903633 cccatacatctttagcattaatacattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttaacaatac 22903534  T
Q  507 ctgagctttttcatctgttgaccatgcactcttttctttgacagctccttctttggttgttggaacaaagtctccatctgtgat 590  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||     ||||||||||||||| |||||||||    
T  22903533 ctgagttttttcatctgttgaccatgcactcttttctttgatggttccttcttt-----ttggaacaaagtctctatctgtgat 22903455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 151 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 1792304 - 1791955
Alignment:
Q  151 tctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtgtccacatacttggaagacatctcagtatttttctaattctatcatgagtagaatatgcctttccaa 250  Q
    ||||| || ||||||||||| || ||||| ||| ||||   | ||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||| |  |||||||    
T  1792304 tctttagcttgagtgattgccgtaaccatgggtctccattgagttggaagacatcttagtatttttcttattctgtcgtgggtagaataagtttttccaa 1792205  T
Q  251 gagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtttcattttcactcatttcaaagacttcaaattttctgactccaat 350  Q
    | ||||| | |||||||||||| |  || |||||||  ||||| ||||||||| |||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||| || |||||    
T  1792204 gtgatcttagttcatttactatagatgtgaatctagagtacatttcatcaatgttttcatcttcaatcatttcaaagatttcaaactttctcacaccaat 1792105  T
Q  351 gtcaattctggtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtatcccatacctctttagcattcttacattcatcaactctttcactt 450  Q
    ||||||||| |||||||| |||||   ||| || |||||||| | ||| |  |||||||| |||| ||| ||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  1792104 gtcaattcttgtttctttaacatggcttgttccttcatgatggactttgagagtatcccacaccttttttgcagtatcacattcatcaactctttcactt 1792005  T
Q  451 tcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagaatttaa 500  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1792004 tcttccatgcttagtgcacatgatagaaagagtcgagctttagaatttaa 1791955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 490; Significance: 0; HSPs: 10)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 490; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 8974740 - 8974155
Alignment:
Q  7 acatcatcatcaacaactgatgaactttgctgagatgctttcaaggcaagtgtttttaccttcttcactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgag 106  Q
    ||||| |||||| |||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8974740 acatcttcatcagcaactgatggggtttgctgagatgcttttaaggcaagtgtctttaccttcttcactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgag 8974641  T
Q  107 ctctcagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtgtccacatacttggaagacatct 206  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  8974640 ctcttagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtctccacacacttggaagacatct 8974541  T
Q  207 cagtatttttctaattctatcatgagtagaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtt 306  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8974540 cagaatttttctaattctatcatgagtggaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatcttgcatacatctcatcaatggtt 8974441  T
Q  307 tcattttcactcatttcaaagacttcaaattttctgactccaatgtcaattctggtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtat 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  8974440 tcattttcactcatttcaaagacttcaaattttctgactccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcagagtat 8974341  T
Q  407 cccatacctctttagcattcttacattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagaatttaacaatac 506  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||    
T  8974340 cccatacttctttagcatttgtacattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttagtaatac 8974241  T
Q  507 ctgagctttttcatctgttgaccatgcactcttttctttgacagctccttctttggttgttggaacaaagtctccatctgtgatga 592  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8974240 ctgagctttttcatctgttgaccatgcactttttgctttgacagctccttctttggttgttggaacaaagtctccatctgtgatga 8974155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 490; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 9539029 - 9538444
Alignment:
Q  7 acatcatcatcaacaactgatgaactttgctgagatgctttcaaggcaagtgtttttaccttcttcactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgag 106  Q
    ||||| |||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9539029 acatcttcatcagcaactgatggggtttgctgagatgctttcaaggcaagtgttcttaccttcttcactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgag 9538930  T
Q  107 ctctcagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtgtccacatacttggaagacatct 206  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9538929 ctcttagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtctccacatacttggaagacatct 9538830  T
Q  207 cagtatttttctaattctatcatgagtagaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtt 306  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9538829 cagaatttttctaattctatcatgagtggaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatcttgcatacatctcatcaatggtt 9538730  T
Q  307 tcattttcactcatttcaaagacttcaaattttctgactccaatgtcaattctggtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtat 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  9538729 tcattttcactcatttcaaagacttcaaattttctgactccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcagagtat 9538630  T
Q  407 cccatacctctttagcattcttacattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagaatttaacaatac 506  Q
    ||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||    
T  9538629 cccatacttgtttagcatttgtacattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttagtaatac 9538530  T
Q  507 ctgagctttttcatctgttgaccatgcactcttttctttgacagctccttctttggttgttggaacaaagtctccatctgtgatga 592  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9538529 ctgagctttttcatctgttgaccatgcactttttgctttgacagctccttctttggttgttggaacaaagtctccatttgtgatga 9538444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 486; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 6424201 - 6423616
Alignment:
Q  7 acatcatcatcaacaactgatgaactttgctgagatgctttcaaggcaagtgtttttaccttcttcactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgag 106  Q
    ||||| |||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6424201 acatcttcatcagcaactgatggggtttgctgagatgctttcaaggcaagtgtttttaccttcttcactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgag 6424102  T
Q  107 ctctcagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtgtccacatacttggaagacatct 206  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||    
T  6424101 ctcttagtgaaccaatgagatcttccaggtttatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtctccacacacttggaagacacct 6424002  T
Q  207 cagtatttttctaattctatcatgagtagaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtt 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6424001 cagtatttttctaattctatcatgagtagaatatgcatttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctggcatacatctcatcaatggtt 6423902  T
Q  307 tcattttcactcatttcaaagacttcaaattttctgactccaatgtcaattctggtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtat 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  6423901 tcattttcactcatttcaaagacttcaaattttctgactccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcagagtat 6423802  T
Q  407 cccatacctctttagcattcttacattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagaatttaacaatac 506  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||    
T  6423801 cccatacttctttagcatttgtacattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacacgatagaaagagtctagctttagagtttagtaatac 6423702  T
Q  507 ctgagctttttcatctgttgaccatgcactcttttctttgacagctccttctttggttgttggaacaaagtctccatctgtgatga 592  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6423701 ctgagctttttcatctgttgaccatgcattttttgctttgacagctccttctttggttgttggaacaaagtctccatctgtgatga 6423616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 86 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 12387802 - 12387297
Alignment:
Q  86 cttgaagtacaacttcatgagctctcagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtgt 185  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| |    
T  12387802 cttgaagtacaacttcatgagctatcagtgaatcaatgagatcttccaagttcatatattgtaaatatttagcctgagtaattgcagtgaccataggtct 12387703  T
Q  186 ccacatacttggaagacatctcagtatttttctaattctatcatgagtagaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatcta 285  Q
     | |||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||| |||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12387702 tcgcatacttggaaggcatctcaatatttttctgactctctcataagtggaatatgcctttccaaaagatcttatttcatttactattgtagtaaatcta 12387603  T
Q  286 gcatacatctcatcaatggtttcattttcactcatttcaaagacttcaaattttctgactccaatgtcaattctggtttctttgacatgagatgtaccct 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |    
T  12387602 gcatacatctcatcaatggtttcattttcactcatttcaaagacttccaactttatgacttcaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaactt 12387503  T
Q  386 catgatgtattttcaaggtatcccatacctctttagcattcttacattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtct 485  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12387502 catgatgtactatcaaggtatcccatacctcttt-gcattcttaaattcataaactctttcagtttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtct 12387404  T
Q  486 agctttagaatttaacaatacctgagctttttcatctgttgaccatgcactcttttctttgacagctccttctttggttgttggaacaaagtctccatct 585  Q
    ||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12387403 agctttagagtttattaatacttgagctttttcatttgttgaccatgcacttttttctttgacagttccttctttggtttttggaacaaagtctccatct 12387304  T
Q  586 gtgatga 592  Q
    |||||||    
T  12387303 gtgatga 12387297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 151 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 48980022 - 48979673
Alignment:
Q  151 tctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtgtccacatacttggaagacatctcagtatttttctaattctatcatgagtagaatatgcctttccaa 250  Q
    ||||| || ||||||||||| || ||||| ||| ||||   | ||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||| |  |||||||    
T  48980022 tctttagcttgagtgattgccgtaaccatgggtctccattgagttggaagacatcttagtatttttcttattctgtcgtgggtagaataagtttttccaa 48979923  T
Q  251 gagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtttcattttcactcatttcaaagacttcaaattttctgactccaat 350  Q
    | ||||| | |||||||||||| |  || |||||||  ||||| ||||||||| |||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||| || |||||    
T  48979922 gtgatcttagttcatttactatagatgtgaatctagagtacatttcatcaatgttttcatcttcaatcatttcaaagatttcaaactttctcacaccaat 48979823  T
Q  351 gtcaattctggtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtatcccatacctctttagcattcttacattcatcaactctttcactt 450  Q
    ||||||||| |||||||| |||||   ||| || |||||||| | ||| |  |||||||| |||| ||| ||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  48979822 gtcaattcttgtttctttaacatggcttgttccttcatgatggactttgagagtatcccacaccttttttgcagtatcacattcatcaactctttcactt 48979723  T
Q  451 tcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagaatttaa 500  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  48979722 tcttccatgcttagtgcacatgatagaaagagtcgagctttagaatttaa 48979673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 145 - 491
Target Start/End: Original strand, 28366656 - 28367002
Alignment:
Q  145 tttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtgtccacatacttggaagacatctcagtatttttctaattctatcatgagtagaatatgcct 244  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||| ||||  | |||||||||||||| |  |||||||| || | ||||||||| | ||| |  |    
T  28366656 tttaagtctttagcttgtgtgattgcagttaccatgggtctccatgtgcttggaagacatcttaaaatttttcttatccgatcatgagtggtataagttt 28366755  T
Q  245 ttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtttcattttcactcatttcaaagacttcaaattttctgac 344  Q
    |||| || ||||| | |||||| || || |  || ||||| |  ||||| ||||||||| | |||| |||  ||||||| |||| |||||||||||| ||    
T  28366756 ttcccagtgatcttaattcattcacaatagatgtgaatctggagtacatttcatcaatgttctcatcttcgttcatttcgaagatttcaaattttcttac 28366855  T
Q  345 tccaatgtcaattctggtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtatcccatacctctttagcattcttacattcatcaactctt 444  Q
     ||||| || ||||| |||||||| || ||    || ||||||||||| ||||| |  || ||||| || ||||| ||| |   ||||||||||||||||    
T  28366856 gccaatatctattcttgtttcttttacgtggctagttccctcatgatgaatttttagagtgtcccaaacttcttttgcagtgacacattcatcaactctt 28366955  T
Q  445 tcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagcttt 491  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  28366956 tcactttcttccatgcttagtgcgcatgatagaaagagtcgagcttt 28367002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 193 - 500
Target Start/End: Original strand, 4384222 - 4384529
Alignment:
Q  193 cttggaagacatctcagtatttttctaattctatcatgagtagaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcataca 292  Q
    |||||||||||| | | ||||||| ||||| | ||||  | |||||| |  || ||||| ||||| | |||||||||||| |  || |||||||  ||||    
T  4384222 cttggaagacattttaatatttttttaattatgtcatcggcagaataagttttcccaagtgatcttaattcatttactatagatgtgaatctagagtaca 4384321  T
Q  293 tctcatcaatggtttcattttcactcatttcaaagacttcaaattttctgactccaatgtcaattctggtttctttgacatgagatgtaccctcatgatg 392  Q
    | ||||||||| | |  | |||| ||||||| |||| |||||||||||| || || || || ||||| |||||||| || ||   ||| || |||||||     
T  4384322 tttcatcaatgttattttattcattcatttcgaagatttcaaattttcttacaccgatatctattcttgtttcttttacgtgccttgttccttcatgatt 4384421  T
Q  393 tattttcaaggtatcccatacctctttagcattcttacattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagcttta 492  Q
     ||||| || ||||| || |||| ||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |   ||||||||| ||| || |||||||    
T  4384422 gatttttaaagtatctcaaaccttttttgcagtatcacattcatcaactctttcactttcttccatgcttaatctgcatgatagatagactcgagcttta 4384521  T
Q  493 gaatttaa 500  Q
    ||||||||    
T  4384522 gaatttaa 4384529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 441 - 491
Target Start/End: Original strand, 28374773 - 28374823
Alignment:
Q  441 tctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagcttt 491  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  28374773 tctttcactttcttccatgcttagtgcgcatgatagaaagagtcgagcttt 28374823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 441 - 491
Target Start/End: Original strand, 28382595 - 28382645
Alignment:
Q  441 tctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagcttt 491  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  28382595 tctttcactttcttccatgcttagtgcgcatgatagaaagagtcgagcttt 28382645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 534 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 11461192 - 11461136
Alignment:
Q  534 actcttttctttgacagctccttctttggttgttggaacaaagtctccatctgtgat 590  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||    
T  11461192 actcttttatttgacaactccttctttggttatttgaacaaaatctccatatgtgat 11461136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 486; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 486; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 16156777 - 16156192
Alignment:
Q  7 acatcatcatcaacaactgatgaactttgctgagatgctttcaaggcaagtgtttttaccttcttcactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgag 106  Q
    ||||| |||||| |||||||||   ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16156777 acatcttcatcagcaactgatggggtttgctgagatgctttcaaagcaggtgtttttaccttcttcactggtttgtctcgttgaagtacaacttcatgag 16156678  T
Q  107 ctctcagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtgtccacatacttggaagacatct 206  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  16156677 ctcttagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatcttttgcctgagtgattgcagtgaccataggtctccacacacttggaagacatct 16156578  T
Q  207 cagtatttttctaattctatcatgagtagaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtt 306  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16156577 cagtatttttctaattttatcatgagtagaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctggcatacatctcatcaatggtt 16156478  T
Q  307 tcattttcactcatttcaaagacttcaaattttctgactccaatgtcaattctggtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtat 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  16156477 tcattttcactcatttcaaagacttcaaattttctgactccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcagagtat 16156378  T
Q  407 cccatacctctttagcattcttacattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagaatttaacaatac 506  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||    
T  16156377 cccatacttctttagcatttgtacattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttagtaatac 16156278  T
Q  507 ctgagctttttcatctgttgaccatgcactcttttctttgacagctccttctttggttgttggaacaaagtctccatctgtgatga 592  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16156277 ctgagctttttcatctgttgaccatgcactttttgctttgacagctccttctttggttgttggaacaaagtctccatctgtgatga 16156192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 433; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 590
Target Start/End: Original strand, 1987651 - 1988219
Alignment:
Q  22 actgatgaactttgctgagatgctttcaaggcaagtgtttttaccttcttcactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgagctctcagtgaaccaa 121  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1987651 actgatgagatttgctgagaggctttcaaggcaagtgactttaccttctttactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgagctcttagtgaaccaa 1987750  T
Q  122 tgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtgtccacatacttggaagacatctcagtatttttctaat 221  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||    
T  1987751 tgagatcttccagattcatagatttcaaatctttggcctgagtgatttcagtgaccataggtctccacatacttggaagtcatctcaatatttttctgat 1987850  T
Q  222 tctatcatgagtagaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtttcattttcactcatt 321  Q
    ||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1987851 tctctcatgagtggaatatgcttttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctggcatacatctcatcaatggtttcattttcactcatt 1987950  T
Q  322 tcaaagacttcaaattttctgactccaatgtcaattctggtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtatcccatacctctttag 421  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1987951 tcaaagacttcaaactttctgactccaatgtcaattctggtttctttgacatgagatgtaccttcatgatgtactttcaaggtatcccatacctctttag 1988050  T
Q  422 cattcttacattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagaatttaacaatacctgagctttttcatc 521  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||    
T  1988051 catttttgcattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttagcaatacctgagccttttcatc 1988150  T
Q  522 tgttgaccatgcactcttttctttgacagctccttctttggttgttggaacaaagtctccatctgtgat 590  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  1988151 tgttgaccatgcactcttaactttgatgattccttctttggttaatggaacaaagtctccatctgtgat 1988219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 37 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 22960190 - 22959697
Alignment:
Q  37 tgagatgctttcaaggcaagtgtttttaccttcttcactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgagctctcagtgaaccaatgagatcttccaggt 136  Q
    ||||| ||||| |||| ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||       
T  22960190 tgagaagcttttaaggtaagtgattttaccttcctcactggtttatctccttaaagtataacttcatgagctcttagtgaacca-tgagttcttccaaag 22960092  T
Q  137 tcatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtgtccacatacttggaagacatctcagtatttttctaattctatcatgagtaga 236  Q
    ||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| |     
T  22960091 tcaaagagtttaaatctttggcttgagtaattgcagtgaccataggtctccatatacttggaagacatcttagtatcttcctgattctatcatgagtggt 22959992  T
Q  237 atatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtttcattttcactcatttcaaagacttcaaat 336  Q
    |||| | || || ||| ||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||     
T  22959991 atatactttgcccagatatctcatttcattcactattgttgtgaatctatcatacatttcatcaatggtttcattttcactcatttcaaagatttc-aac 22959893  T
Q  337 tttctgactccaatgtcaattctggtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtatcccatacctctttagcattcttacattcat 436  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  || || |||||||||| ||| || || ||||| || ||||| |||||  |||||||||    
T  22959892 tttctgactccaatgtcaattcttgtttcttcgacatgagtggttccttcatgatgtacttttaaagtgtcccacacttctttggcatttgtacattcat 22959793  T
Q  437 caactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagaatttaacaatacctgagctttttcatctgttgaccatg 532  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |  ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||    
T  22959792 caaccctttcactttcttccaaggttaatgcacatgataaaaataagctaactttagaatttaacaataccttatctttttcatcagttgtccatg 22959697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 474; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 474; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 148602 - 148017
Alignment:
Q  7 acatcatcatcaacaactgatgaactttgctgagatgctttcaaggcaagtgtttttaccttcttcactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgag 106  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  148602 acatcatcatcagctactgatgagctttgctgagatgctttcaaggtaagtgtttttactttcttcactggtttgtctccttgaagtacaacgtcatgag 148503  T
Q  107 ctctcagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtgtccacatacttggaagacatct 206  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  148502 ctctcagtgaaccaatgagatcctctaggttcatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtctccacacacttggaagacatct 148403  T
Q  207 cagtatttttctaattctatcatgagtagaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtt 306  Q
     | ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  148402 taatatttttctgattctatcatgagtataatatgccttttcaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatagtt 148303  T
Q  307 tcattttcactcatttcaaagacttcaaattttctgactccaatgtcaattctggtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtat 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  148302 tcattttcactcatttcaaagacttcaaattttctgactccaatgtcaattctagtttctttgacatgagaagtaccctcatgatgtatttttaaggtat 148203  T
Q  407 cccatacctctttagcattcttacattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagaatttaacaatac 506  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||    
T  148202 cacatacctctttagcattcttacattcatcaactctttcactttcttccatggtaagtgcacatgatagaaagagtctagcttaagagtttagtaatac 148103  T
Q  507 ctgagctttttcatctgttgaccatgcactcttttctttgacagctccttctttggttgttggaacaaagtctccatctgtgatga 592  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  148102 ctgagctttttcatttgttgaccatgcactcttttcctttacagctccttctttggttgttggaacaaagtctccatctgtgatga 148017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 449; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 449; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 590
Target Start/End: Original strand, 6030 - 6598
Alignment:
Q  22 actgatgaactttgctgagatgctttcaaggcaagtgtttttaccttcttcactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgagctctcagtgaaccaa 121  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6030 actgatgaggtttgctgagaggctttcaaggcaagtgactttaccttctttactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgagctctcagtgaaccaa 6129  T
Q  122 tgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtgtccacatacttggaagacatctcagtatttttctaat 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  6130 tgagatcttccaggttcatagatttcaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtctccacatacttggaagacatctcaatatttttctgat 6229  T
Q  222 tctatcatgagtagaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtttcattttcactcatt 321  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6230 tctctcatgagtggaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctggcatacatctcatcaatggtttcattttcactcatt 6329  T
Q  322 tcaaagacttcaaattttctgactccaatgtcaattctggtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtatcccatacctctttag 421  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6330 tcaaagacttcaaactttctgactccaatgtcaattctggtttctttgacatgagatgtaccttcatgatgtactttcaaggtatcccatacctctttag 6429  T
Q  422 cattcttacattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagaatttaacaatacctgagctttttcatc 521  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||    
T  6430 catttttgcattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttagcaatacctgagccttttcatc 6529  T
Q  522 tgttgaccatgcactcttttctttgacagctccttctttggttgttggaacaaagtctccatctgtgat 590  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||     ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  6530 tgttgaccatgcactcttaactttgatgatcccttctttggttagtggaacaaagtctccatctgtgat 6598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0313 (Bit Score: 445; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0313
Description:

Target: scaffold0313; HSP #1
Raw Score: 445; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 7648 - 7080
Alignment:
Q  22 actgatgaactttgctgagatgctttcaaggcaagtgtttttaccttcttcactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgagctctcagtgaaccaa 121  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7648 actgatgaggtttgctgagaggctttcaaggcaagtgactttaccttctttactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgagctctcagtgaaccaa 7549  T
Q  122 tgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtgtccacatacttggaagacatctcagtatttttctaat 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  7548 tgagatcttccaggttcatagatttcaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtctccacatacttggaagacatctcaatatttttctgat 7449  T
Q  222 tctatcatgagtagaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtttcattttcactcatt 321  Q
    ||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7448 tctctcatgagtggaatatgcttttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctggcatacatctcatcaatggtttcattttcactcatt 7349  T
Q  322 tcaaagacttcaaattttctgactccaatgtcaattctggtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtatcccatacctctttag 421  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7348 tcaaagacttcaaactttctgactccaatgtcaattctggtttctttgacatgagatgtaccttcatgatgtactttcaaggtatcccatacctctttag 7249  T
Q  422 cattcttacattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagaatttaacaatacctgagctttttcatc 521  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||    
T  7248 catttttgcattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttagcaatacctgagccttttcatc 7149  T
Q  522 tgttgaccatgcactcttttctttgacagctccttctttggttgttggaacaaagtctccatctgtgat 590  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||     ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  7148 tgttgaccatgcactcttaactttgatgatcccttctttggttagtggaacaaagtctccatctgtgat 7080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0313; HSP #2
Raw Score: 445; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 11430 - 10862
Alignment:
Q  22 actgatgaactttgctgagatgctttcaaggcaagtgtttttaccttcttcactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgagctctcagtgaaccaa 121  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11430 actgatgaggtttgctgagaggctttcaaggcaagtgactttaccttctttactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgagctctcagtgaaccaa 11331  T
Q  122 tgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtgtccacatacttggaagacatctcagtatttttctaat 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  11330 tgagatcttccaggttcatagatttcaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtctccacatacttggaagacatctcaatatttttctgat 11231  T
Q  222 tctatcatgagtagaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtttcattttcactcatt 321  Q
    ||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11230 tctctcatgagtggaatatgcttttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctggcatacatctcatcaatggtttcattttcactcatt 11131  T
Q  322 tcaaagacttcaaattttctgactccaatgtcaattctggtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtatcccatacctctttag 421  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11130 tcaaagacttcaaactttctgactccaatgtcaattctggtttctttgacatgagatgtaccttcatgatgtactttcaaggtatcccatacctctttag 11031  T
Q  422 cattcttacattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagaatttaacaatacctgagctttttcatc 521  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||    
T  11030 catttttgcattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttagcaatacctgagccttttcatc 10931  T
Q  522 tgttgaccatgcactcttttctttgacagctccttctttggttgttggaacaaagtctccatctgtgat 590  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||     ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  10930 tgttgaccatgcactcttaactttgatgatcccttctttggttagtggaacaaagtctccatctgtgat 10862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 306; Significance: 1e-172; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 23 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 17097 - 16538
Alignment:
Q  23 ctgatgaactttgctgagatgctttcaaggcaagtgtttttaccttcttcactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgagctctcagtgaaccaat 122  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17097 ctgatgaagtttgttgagatgctttcaaggaaagtgattttacctttttcactggtttgtctttttgaagtacaacttcatgagctctcagtgaaccaat 16998  T
Q  123 gagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtgtccacatacttggaagacatctcagtatttttctaatt 222  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    |||||||| ||||||||||||     ||||||| ||||||||| |||    
T  16997 gagatcttcaaggttcatagattttaaatctttggcctgagtaattgca---tccataggtctccacatacttg-----catctcaatatttttctgatt 16906  T
Q  223 ctatcatgagtagaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtttcattttcactcattt 322  Q
    || |||||||| |||||| | |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||    
T  16905 ctttcatgagtggaatatacttttcgaagagacctcatctcatttactattgtagtaaatctaaaatacatttcatcaatagtttcattctcactcattt 16806  T
Q  323 caaagacttcaaattttctgactccaatgtcaattctggtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtatcccatacctctttagc 422  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||  ||| | | ||  | |||||||||||||||||    
T  16805 caaagacttcacactttctgactcctatgttaattctggtttccttgacatgagaggtaccttcatggcgtactcttaaaatttcccatacctctttagc 16706  T
Q  423 attcttacattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagaatttaacaatacctgagctttttcatct 522  Q
    |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  16705 attcttgcatttatcaactctttcattttcttccatggttagtgcacatgataaaaagagtctaggtttagagtttaacaatacatgagctttgtcatct 16606  T
Q  523 gttgaccatgcactcttttctttgacagctccttctttggttgttggaacaaagtctccatctgtgat 590  Q
     |||||||||||||||||| |||||  | ||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  16605 attgaccatgcactcttttgtttgatggttccttctttagtctttggaacaaagtctccatttgtgat 16538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 287; Significance: 1e-161; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 170 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 20506 - 20084
Alignment:
Q  170 cagtgaccataggtgtccacatacttggaagacatctcagtatttttctaattctatcatgagtagaatatgcctttccaagagatctcatttcatttac 269  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20506 cagtgaccataggtctccacattcttggaagacatcttagaatctttctgattctctcatgagtggaatatgcctttccaagagatctcatttcatttac 20407  T
Q  270 tattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtttcattttcactcatttcaaagacttcaaattttctgactccaatgtcaattctggtttctttg 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  20406 tattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtttcattttcactcatttcaaagagttcaaactttctgactccaatgtcaattctagttcctttg 20307  T
Q  370 acatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtatcccatacctctttagcattcttacattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcac 469  Q
    |||||||||||||| | |||||||| | |||  || |||||||| ||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| | || |||||||    
T  20306 acatgagatgtacctttatgatgtactctcagagtgtcccatacatctttggcatttttacacacatcaactctttcactttcttccctagtcagtgcac 20207  T
Q  470 atgatagaaagagtctagctttagaatttaacaatacctgagctttttcatctgttgaccatgcactcttttctttgacagctccttctttggttgttgg 569  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20206 atgatagaaagagtctagctttggagtttagtaatacctgagatttttcatctgttgaccatgcacttttttcttttacagctccttctttggttgttgg 20107  T
Q  570 aacaaagtctccatctgtgatga 592  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  20106 aacaaagtctccatctgtgatga 20084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 27839 - 27670
Alignment:
Q  7 acatcatcatcaacaactgatgaactttgctgagatgctttcaaggcaagtgtttttaccttcttcactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgag 106  Q
    |||||||||||| | ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27839 acatcatcatcagctactgatgaggtttgctgagaagctttcaaggcaagtgattttaccttcttcactggtttgtctccttgaagtataacttcatgag 27740  T
Q  107 ctctcagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtgac 176  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||    
T  27739 ctctcaatgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatctttgatctgagtaattgtagtgac 27670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 136 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 290 - 1
Alignment:
Q  136 ttcatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtgtccacatacttggaagacatctcagtatttttctaattctatcatgagtag 235  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |    
T  290 ttcatagatttcaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtctccacatacttggaagacatctcattatttttcttattctttcatgagtgg 191  T
Q  236 aatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtttcattttcactcatttcaaagacttcaaa 335  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  190 aatatgcttttctaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctttcatacatctcatcaatggtttcattttcactcatttcaaagacttcaaa 91  T
Q  336 ttttctgactccaatgtcaattctggtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtatcccatacctctttagcatt 425  Q
     ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  90 ctttctaactccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccttcatgatgtactttcaaagtatcccatacctctttagcatt 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 37 - 532
Target Start/End: Original strand, 189005 - 189498
Alignment:
Q  37 tgagatgctttcaaggcaagtgtttttaccttcttcactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgagctctcagtgaaccaatgagatcttccaggt 136  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |||||||||  ||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||       
T  189005 tgagaagcttttaaggcaagtgattttacctttctcattggtttatctccttaaagtataacttcatgagctcttagtgaacca-tgagtacttccaaag 189103  T
Q  137 tcatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtgtccacatacttggaagacatctcagtatttttctaattctatcatgagtaga 236  Q
    ||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||       
T  189104 tcaaagagtttaaatctttggcttgagtaattgcagtgaccataggcctccatgtacttggaagacatcttagtatcttcctaattctatcatgagtgct 189203  T
Q  237 atatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtttcattttcactcatttcaaagacttcaaat 336  Q
    |||| | || || ||| ||||||||||||| |||||||| || |||||| |||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  189204 atatactttgcccagatatctcatttcattcactattgttgtgaatctatcatatattttatcaatggtttcattttcactcatttcaaagatttcaact 189303  T
Q  337 tttctgactccaatgtcaattctggtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtatcccatacctctttagcattcttacattcat 436  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || || |||||||||| ||| || || ||||| || ||||| |||||  |||||||||    
T  189304 tt-ctgactccaatgtcaattcttgtttcttcgacatgagaggttccttcatgatgtacttttaaagtgtcccacacttctttggcatttgtacattcat 189402  T
Q  437 caactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagaatttaacaatacctgagctttttcatctgttgaccatg 532  Q
    |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| |  ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||    
T  189403 caaccctttcaatttcttccaaggttagtgcacatgataaaaataagctaactttagaatttaacaataccttatctttttcatcagttgtccatg 189498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0611 (Bit Score: 182; Significance: 4e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0611
Description:

Target: scaffold0611; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 9 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 210 - 1
Alignment:
Q  9 atcatcatcaacaactgatgaactttgctgagatgctttcaaggcaagtgtttttaccttcttcactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgagct 108  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  210 atcatcatcagcaactgatgaactttgctgagatgctttcaaggaaagtgtttttaccttcttcactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgagct 111  T
Q  109 ctcagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtgtccacatacttggaagacatctca 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  110 ctcagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctaagtaattgcagtgaccataggtctccaaatacttggaagacatctca 11  T
Q  209 gtatttttct 218  Q
     |||||||||    
T  10 atatttttct 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 122; Significance: 3e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 176
Target Start/End: Original strand, 86973 - 87142
Alignment:
Q  7 acatcatcatcaacaactgatgaactttgctgagatgctttcaaggcaagtgtttttaccttcttcactggtttgtctccttgaagtacaacttcatgag 106  Q
    |||||||||||| | ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  86973 acatcatcatcagctactgatgaggtttgctgagaagctttcaaggcaagtgattttaccttcttcactggtttgtctccttgaagtataacttcatgag 87072  T
Q  107 ctctcagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtgac 176  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||    
T  87073 ctctcaatgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatctttgatctgagtaattgtagtgac 87142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 100 - 499
Target Start/End: Original strand, 102825 - 103224
Alignment:
Q  100 tcatgagctctcagtgaaccaatgagatcttccaggttcatagattttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtgtccacatacttggaa 199  Q
    ||||||||| | | ||| |||||||||||||| ||    | ||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||| ||||  | |||||||    
T  102825 tcatgagcttttaatgacccaatgagatcttcaagagctaaagagtttaagtctttagcttgtgtgattgcagttaccatgggtctccatgtgcttggaa 102924  T
Q  200 gacatctcagtatttttctaattctatcatgagtagaatatgcctttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatc 299  Q
    ||||||| |  |||||||| || | ||||||||| | ||| |  |||||||| ||||| | |||||| || || |  || ||||| |  ||||| |||||    
T  102925 gacatcttaagatttttcttatccgatcatgagtggtataagtttttccaagtgatcttaattcattcacaatagatgtgaatctggagtacatttcatc 103024  T
Q  300 aatggtttcattttcactcatttcaaagacttcaaattttctgactccaatgtcaattctggtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttc 399  Q
    |||| | |||| |||  |||||||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||    || || |||||||| |||||     
T  103025 aatgttctcatcttcgttcatttcaaagatttcaaattttcttacgccaatgtctattcttgtttcttttacatggctagttccttcatgatgaattttt 103124  T
Q  400 aaggtatcccatacctctttagcattcttacattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagaattta 499  Q
    |  || ||||| || ||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  103125 agagtgtcccacacttcttttgcagtcacacattcatcaactctttcactttcttccatgcttagtgcgcatgatagaaagagtcgagctttagagttta 103224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 60; Significance: 3e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 145 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 258253 - 257898
Alignment:
Q  145 tttaaatctttggcctgagtgattgcagtgaccataggtgtccacatacttggaagacatctcagtatttttctaattctatcatgagtagaatatgcct 244  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||  |  |||| |||||||| | ||||||||| ||||| |||||||  ||||||   |    
T  258253 tttaagtctttggcttgagtgattgctgtaaccataggtctccatgtttttgggagacatcttaatatttttctgattctgtcatgaggggaatatattt 258154  T
Q  245 ttccaagagatctcatttcatttactattgtagtaaatctagcatacatctcatcaatggtttcattttcactcatttcaaagacttcaaattttctgac 344  Q
    |||| |  ||||| |  ||||| ||||| | ||| ||||  | |||||| ||||||||  |||| | |||||||||||| || | ||| |||||||  ||    
T  258153 ttcccaatgatcttaactcattcactatagaagtgaatcgtgaatacatttcatcaatattttcttcttcactcatttcgaaaatttcgaattttcgtac 258054  T
Q  345 tccaatgtcaattctggtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtatcccatacctctttagcattcttacattcatcaactctt 444  Q
     ||||| || || || |||||||| |||||    || || |||||||| ||||| || ||||||||||  ||||| ||  |  ||||||||| || ||||    
T  258053 gccaatatctatccttgtttctttaacatggctagttccttcatgatgaatttttaacgtatcccatatttcttttgccgtagtacattcataaattctt 257954  T
Q  445 tcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagaatttaa 500  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||  ||||||||| |||||    
T  257953 tcactttcttccatggttagtgaacattgtaaaaagagttgagctttagagtttaa 257898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0500 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0500
Description:

Target: scaffold0500; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 289 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 5196 - 5117
Alignment:
Q  289 tacatctcatcaatggtttcattttcactcatttcaaagacttcaaattttctgactccaatgtcaattctggtttcttt 368  Q
    ||||| ||||| ||||||||  ||||  |||||||||| | |||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||    
T  5196 tacatttcatctatggtttcggtttctttcatttcaaatagttcaaattttcgaacaccaatgtcaattcttgtttcttt 5117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University