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 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6107_low_2 (Length: 356)

Name: NF6107_low_2
Description: NF6107
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6107_low_2
NF6107_low_2
[»] chr8 (4 HSPs)
chr8 (1-353)||(12930597-12930947)
chr8 (1-353)||(12935343-12935693)
chr8 (45-115)||(26504985-26505055)
chr8 (1-113)||(15588948-15589060)
[»] chr1 (1 HSPs)
chr1 (1-353)||(34907060-34907410)
[»] chr4 (9 HSPs)
chr4 (1-324)||(14178641-14178962)
chr4 (1-324)||(14173887-14174208)
chr4 (1-318)||(28611662-28611977)
chr4 (3-318)||(28606902-28607215)
chr4 (1-318)||(44161543-44161855)
chr4 (1-348)||(11104397-11104738)
chr4 (2-212)||(48826793-48827000)
chr4 (6-107)||(48708155-48708256)
chr4 (22-115)||(24726288-24726381)
[»] chr7 (6 HSPs)
chr7 (1-319)||(37040520-37040836)
chr7 (1-316)||(15290195-15290499)
chr7 (8-353)||(12098925-12099263)
chr7 (58-356)||(12081935-12082227)
chr7 (258-318)||(15302900-15302960)
chr7 (3-115)||(2757307-2757418)
[»] chr5 (3 HSPs)
chr5 (1-318)||(42911084-42911399)
chr5 (1-318)||(29106969-29107282)
chr5 (2-92)||(38997230-38997320)
[»] chr2 (1 HSPs)
chr2 (1-318)||(8539139-8539456)
[»] chr3 (2 HSPs)
chr3 (129-317)||(51302118-51302306)
chr3 (1-37)||(51302308-51302344)
[»] chr6 (2 HSPs)
chr6 (1-92)||(2100291-2100379)
chr6 (85-115)||(2100723-2100753)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 284; Significance: 1e-159; HSPs: 4)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 12930947 - 12930597
Alignment:
Q  1 tgaacaccaatatttaacgtggaaaaccctctaatactgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12930947 tgaacaccaatatttaacgtggaaaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaata 12930848  T
Q  101 ttctctccactctctnnnnnnnnnnnnagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattatattatagcacctagaagtt 200  Q
    |||||||||||||||            |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12930847 ttctctccactctctcacacacaca--agagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttttattctaatgctattattttatagcacctagaagtt 12930750  T
Q  201 atagagatgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttctacacacacagaagttttg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12930749 atagagatgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttctacacacacagaagctttg 12930650  T
Q  301 tattttcacttctgcttcattgatgaagcttgtattttctttgagcttcggat 353  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12930649 tattttcacttctgcttcaatactgaagcttgtattttctttgagcttcggat 12930597  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 12935693 - 12935343
Alignment:
Q  1 tgaacaccaatatttaacgtggaaaaccctctaatactgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12935693 tgaacaccaatatttaacgtggaaaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaata 12935594  T
Q  101 ttctctccactctctnnnnnnnnnnnnagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattatattatagcacctagaagtt 200  Q
    |||||||||||||||            |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12935593 ttctctccactctctcacacacaca--agagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttttactctaatgctattattttatagcacctagaagtt 12935496  T
Q  201 atagagatgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttctacacacacagaagttttg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12935495 atagagatgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttctacacacacagaagctttg 12935396  T
Q  301 tattttcacttctgcttcattgatgaagcttgtattttctttgagcttcggat 353  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12935395 tattttcacttctgcttcaatactgaagcttgtattttctttgagcttcggat 12935343  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 45 - 115
Target Start/End: Original strand, 26504985 - 26505055
Alignment:
Q  45 aaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctccactctct 115  Q
    |||||||| | ||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| || |||||||    
T  26504985 aaaaccacagtacaaactccaaaaaatattcaactataataaaaaatattacaatattctttcaactctct 26505055  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 15589060 - 15588948
Alignment:
Q  1 tgaacaccaatatttaacgtggaaaaccctctaatactgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaata 100  Q
    |||||| |||||||||   || ||||||||||| || |||| |||||| || | |||||||||  ||||||||| |||| ||| ||| |||||||||| |    
T  15589060 tgaacatcaatatttattttgaaaaaccctctattaatgagagaaaaatcaagtgacaaactctaaaaaatatttcactttatcaaacaatattacaaca 15588961  T
Q  101 ttctctccactct 113  Q
    || ||||||||||    
T  15588960 ttttctccactct 15588948  T

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Target: chr1 (Bit Score: 284; Significance: 1e-159; HSPs: 1)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 34907410 - 34907060
Alignment:
Q  1 tgaacaccaatatttaacgtggaaaaccctctaatactgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34907410 tgaacaccaatatttaacgtggaaaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaata 34907311  T
Q  101 ttctctccactctctnnnnnnnnnnnnagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattatattatagcacctagaagtt 200  Q
    |||||||||||||||            |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34907310 ttctctccactctctcacacacaca--agagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttttattctaatgctattattttatagcacctagaagtt 34907213  T
Q  201 atagagatgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttctacacacacagaagttttg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34907212 atagagatgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttctacacacacagaagctttg 34907113  T
Q  301 tattttcacttctgcttcattgatgaagcttgtattttctttgagcttcggat 353  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34907112 tattttcacttctgcttcaatactgaagcttgtattttctttgagcttcggat 34907060  T

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Target: chr4 (Bit Score: 271; Significance: 1e-151; HSPs: 9)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 14178962 - 14178641
Alignment:
Q  1 tgaacaccaatatttaacgtggaaaaccctctaatactgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14178962 tgaacaccaatatttaacgtggaaaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaata 14178863  T
Q  101 ttctctccactctctnnnnnnnnnnnnagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattatattatagcacctagaagtt 200  Q
    |||||||||||||||            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14178862 ttctctccactctctcacacacaca--agagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagtt 14178765  T
Q  201 atagagatgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttctacacacacagaagttttg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14178764 atagagatgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttctacacacacagaagctttg 14178665  T
Q  301 tattttcacttctgcttcattgat 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  14178664 tattttcacttctgcttcattgat 14178641  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 14174208 - 14173887
Alignment:
Q  1 tgaacaccaatatttaacgtggaaaaccctctaatactgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14174208 tgaacaccaatatttaacgtggaaaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaata 14174109  T
Q  101 ttctctccactctctnnnnnnnnnnnnagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattatattatagcacctagaagtt 200  Q
    |||||||||||||||            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14174108 ttctctccactctctcacacacaca--agagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagtt 14174011  T
Q  201 atagagatgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttctacacacacagaagttttg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  14174010 atagagatgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttctacacacacagaaactttg 14173911  T
Q  301 tattttcacttctgcttcattgat 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  14173910 tattttcacttctgcttcattgat 14173887  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Original strand, 28611662 - 28611977
Alignment:
Q  1 tgaacaccaatatttaacgtggaaaaccctctaatactgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28611662 tgaacaccaatatttaacgtgaaaaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaata 28611761  T
Q  101 ttctctccactctctnnnnnnnnnnnnagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattatattatagcacctagaagtt 200  Q
    |||||||||||||||            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28611762 ttctctccactctctcacacacaca--agagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagtt 28611859  T
Q  201 atagagatgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttctacacacacagaagttttg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28611860 atagagatgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttctacacacacagaagctttg 28611959  T
Q  301 tattttcacttctgcttc 318  Q
    ||||||||||||||||||    
T  28611960 tattttcacttctgcttc 28611977  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 3 - 318
Target Start/End: Original strand, 28606902 - 28607215
Alignment:
Q  3 aacaccaatatttaacgtggaaaaccctctaatactgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatatt 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28606902 aacaccaatatttaacgtgaaaaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatatt 28607001  T
Q  103 ctctccactctctnnnnnnnnnnnnagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattatattatagcacctagaagttat 202  Q
    |||||||||||||            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28607002 ctctccactctctcacacacaca--agagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttat 28607099  T
Q  203 agagatgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttctacacacacagaagttttgta 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28607100 agagatgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttctacacacacagaagctttgta 28607199  T
Q  303 ttttcacttctgcttc 318  Q
    ||||||||||||||||    
T  28607200 ttttcacttctgcttc 28607215  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 44161855 - 44161543
Alignment:
Q  1 tgaacaccaatatttaacgtggaaaaccctctaatactgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  44161855 tgaacaccaatatttaacgtggaaaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaat- 44161757  T
Q  101 ttctctccactctctnnnnnnnnnnnnagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattatattatagcacctagaagtt 200  Q
     ||||||||||||||            ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44161756 -tctctccactctcttacacacaca--agagatacaatatagtgtttcccgtaagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagtt 44161660  T
Q  201 atagagatgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttctacacacacagaagttttg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||    
T  44161659 atagagatgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctattattcctctcacacacctct--acacacagaagctttg 44161562  T
Q  301 t-attttcacttctgcttc 318  Q
    |  ||||||||||||||||    
T  44161561 tgtttttcacttctgcttc 44161543  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 11104738 - 11104397
Alignment:
Q  1 tgaacaccaatatttaacgtggaaaaccctctaatactgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaata 100  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  11104738 tgaacaccaatatttaacatagaaaatcctctaatatcgagggtaaa-ccacgggacaaactccgaaaaatattccaccatatctaagaatattacaata 11104640  T
Q  101 ttctctccactctctnnnnnnnnnnnnagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattatattatagcacctagaagtt 200  Q
    |||||||||||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  11104639 ttctctccactctcttacacacaa---agagatacaatatagtgtttcccgtgagacccactcctattcaaatgctattattttataacacctagaagtt 11104543  T
Q  201 atagagatgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttctacacacacagaagttttg 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||| ||||    
T  11104542 atagagatgatatccacccggtgtatttttcctacactctctggatttactcaacactctattttttctctcacacacttcta--cacatagaagctttg 11104445  T
Q  301 tattttcacttctgcttcattgatgaagc-ttgtattttctttgagctt 348  Q
    || ||| |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||    
T  11104444 ta-tttgacttctgcttcaatgttgaagctttgtattttctttgagctt 11104397  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 2 - 212
Target Start/End: Original strand, 48826793 - 48827000
Alignment:
Q  2 gaacaccaatatttaacgtggaaaaccctctaatactgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48826793 gaacaccaatatttaacgtggaaaatcctctaataccgagggaaaaatcacgggacaa-ctccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatat 48826891  T
Q  102 tctctccactctctnnnnnnnnnnnnagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattatattatagcacctagaagtta 201  Q
    ||||| | ||||||            |||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  48826892 tctcttcgctctct--tacacacacaagagatacaatatagtgtttcccgtgagattcactcctatttgaatgctattattttatagcacctagaagtta 48826989  T
Q  202 tagagatgata 212  Q
    |||||||||||    
T  48826990 tagagatgata 48827000  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 6 - 107
Target Start/End: Original strand, 48708155 - 48708256
Alignment:
Q  6 accaatatttaacgtggaaaaccctctaatactgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctc 105  Q
    ||||||||||||| || ||||| || ||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||    
T  48708155 accaatatttaacatgaaaaactctataatactaagagaaaaaccacgtgacaaactccaaaaaatatttcattatattaaaaaatattacaatattctc 48708254  T
Q  106 tc 107  Q
    ||    
T  48708255 tc 48708256  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 22 - 115
Target Start/End: Original strand, 24726288 - 24726381
Alignment:
Q  22 gaaaaccctctaatactgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctccactctct 115  Q
    ||||||| |||||||   |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||||| |||||    
T  24726288 gaaaaccatctaatatcaagggaaaagccacgagacaaactctgaaaaatattccattatattaaagaacataataatattctctccattctct 24726381  T

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Target: chr7 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 6)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Original strand, 37040520 - 37040836
Alignment:
Q  1 tgaacaccaatatttaacgtggaaaaccctctaatactgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37040520 tgaacaccaatatttaacgtggaaaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaata 37040619  T
Q  101 ttctctccactctctnnnnnnnnnnnnagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattatattatagcacctagaagtt 200  Q
    || ||||||||||||            |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37040620 ttttctccactctctcacacacaca--agagatacaatatagtgttttccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagtt 37040717  T
Q  201 atagagatgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttctacacacacagaagttttg 300  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37040718 atagagatgatacccacccgatgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttctacacacacagaagctttg 37040817  T
Q  301 tattttcacttctgcttca 319  Q
    |||||||||||||||||||    
T  37040818 tattttcacttctgcttca 37040836  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 15290499 - 15290195
Alignment:
Q  1 tgaacaccaatatttaacgtggaaaaccctctaatactgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||    
T  15290499 tgaacaccaatatttaacgtggaaaaccctctaataccgaggtataaaccacgggacaaactccaaaagattttccactatatttaagaatattacaata 15290400  T
Q  101 ttctctccactctctnnnnnnnnnnnnagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattatattatagcacctagaagtt 200  Q
    |||||||||||||||            |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  15290399 ttctctccactctct--tacacacacaagagatacaatatagtgttt-ccgtgagacccactcctattcgaatgctat--tatttcagcacctagaagtt 15290305  T
Q  201 atagagatgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttctacacacacagaag---tt 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||      ||||||||||||||  |||||||||||   ||    
T  15290304 atagagatgatacccacccggtgtattttt-ccacactttctggatttagtcaacactctat------tctcacacacttct--acacacagaagctttt 15290214  T
Q  298 ttgtattttcacttctgct 316  Q
    |||||||||||||||||||    
T  15290213 ttgtattttcacttctgct 15290195  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 8 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 12099263 - 12098925
Alignment:
Q  8 caatatttaacgtggaaaaccctctaatactgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctc 107  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||   || |||||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12099263 caatattttacgtgaaaaaccctctaatgacgaaggaaaaaccaagggacaaactccgaaaaaatttcaactatattaaagaatattacaatattctctc 12099164  T
Q  108 cactctctnnnnnnnnnnnnagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattatattatagcacctagaagttatagaga 207  Q
    ||||||||            ||||| ||||||| |||||||  |||||||  ||| |||||| |||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  12099163 cactctct--tacacgcacaagagacacaatattgtgtttctagtgagactcactcctattcaaatgatattattttataacacctaaaagttatagaga 12099066  T
Q  208 tgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttctacacacacagaagttttgtattttc 307  Q
    |||||| ||| |  | ||||||  | | |  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||| ||  |||||| ||||    
T  12099065 tgatactcactcaatctatttt--cgaga--ctctgaatttactcaacactctatttttcctttcacatacttct--acacacaaaaactttgtagtttc 12098972  T
Q  308 acttctgcttcattgatgaagc-ttgtattttctttgagcttcggat 353  Q
    |||||| ||||| |     ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12098971 acttctacttcaatacccgagctttgtattttctttgagcttcggat 12098925  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 58 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 12082227 - 12081935
Alignment:
Q  58 aaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctccactctctnnnnnnnnnnnnagagatacaatatagtgtttcccgtgagac 157  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||            |||||||||||||||||||||   ||||||    
T  12082227 aaactccaaaaaatattccactatattaa-gaatattacaatattttctccactctcttacacggaaa--agagatacaatatagtgtttctaatgagac 12082131  T
Q  158 ctacttctattctaatgctattatattatagcacctagaagttatagagatgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacac 257  Q
       || |||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||| |  | ||||||||||| ||||||    
T  12082130 tcgctcctattcaaatgttattattttatagcgcctagaagttatagagataatacctacccgatatatttttccc-ctttttctggatttacccaacac 12082032  T
Q  258 tctatttttcctctcacacacttctacacacacagaagttttgtattttcacttctgcttcattgatgaagc-ttgtattttctttgagcttcggataat 356  Q
    |||| |||||   |||||||||||||||||   | ||  ||||||| ||||||| ||||||| |  | |||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  12082031 tctaattttctgatcacacacttctacaca---aaaaactttgtatcttcacttatgcttcaatactaaagctttgtattttctttgagctttggataat 12081935  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 258 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 15302960 - 15302900
Alignment:
Q  258 tctatttttcctctcacacacttctacacacacagaagttttgtattttcacttctgcttc 318  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  15302960 tctatttttgctctcacacacttctacacacacagaagctttgtattttcaattctgcttc 15302900  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 115
Target Start/End: Original strand, 2757307 - 2757418
Alignment:
Q  3 aacaccaatatttaacgtggaaaaccctctaatactgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatatt 102  Q
    |||||||||||||||  || ||| |||| |||| || | |||||||||| | |||||| |  ||||| |||||||||||||| || |||||| || ||||    
T  2757307 aacaccaatatttaatatgaaaacccctttaatgcttaaggaaaaaccatgagacaaattttgaaaa-tattccactatatttaaaaatattgcactatt 2757405  T
Q  103 ctctccactctct 115  Q
    |||||||||||||    
T  2757406 ctctccactctct 2757418  T

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Target: chr5 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 3)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Original strand, 42911084 - 42911399
Alignment:
Q  1 tgaacaccaatatttaacgtggaaaaccctctaatactgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaata 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42911084 tgaacaccaatatttaacatggaaaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaa-tattccactatatttaagaatattacaata 42911182  T
Q  101 ttctctccactctctnnnnnnnnnnnnagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattatattatagcacctagaagtt 200  Q
    |||||||||||||||            | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  42911183 ttctctccactctctcacacacaca--aaagatacaatatagtgtttcccttgagacctacttctattctaatgctattattttatagcaccaagaagtt 42911280  T
Q  201 atagagatgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttctacacacacagaagttttg 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42911281 atagagatgatacccacccagtgtattttttccacactctctggatttactcaacactctattttttctctcacacacttctacacacacagaagctttg 42911380  T
Q  301 t-attttcacttctgcttc 318  Q
    |  ||||||||||||||||    
T  42911381 tgtttttcacttctgcttc 42911399  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Original strand, 29106969 - 29107282
Alignment:
Q  1 tgaacaccaatatttaacgtggaaaaccctctaatactgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29106969 tgaacaccaatatttaacgtggaaaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaata 29107068  T
Q  101 ttctctccactctctnnnnnnnnnnnnagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattatattatagcacctagaagtt 200  Q
    |||||||||||||||            |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  29107069 ttctctccactctcttacacacaca--agagatacaa-atagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttttagcacctagaagtt 29107165  T
Q  201 atagagatgata-cccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttctacacacacagaagtttt 299  Q
    ||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| |||    
T  29107166 ataaagatgataccccacccaatgtatttttcccacactctctggatttactcaaca--ctattttttctctcacacacttctacatacagagaagcttt 29107263  T
Q  300 gtattttcacttctgcttc 318  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  29107264 gtatttccacttctgcttc 29107282  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 2 - 92
Target Start/End: Original strand, 38997230 - 38997320
Alignment:
Q  2 gaacaccaatatttaacgtggaaaaccctctaatactgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaata 92  Q
    ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||  ||  ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||    
T  38997230 gaacagcaatattttacgtcgaaaaccctctaatatcgaacgaaaaactacgggacaaactccaaaaaataatccattatattaaagaata 38997320  T

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Target: chr2 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 1)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 8539456 - 8539139
Alignment:
Q  1 tgaacaccaatatttaacgtggaaaaccctctaatactgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaata 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8539456 tgaacatcaatatttaacgtggaaaaccctctaataccgagggaaaaatcacgggacaaactccgaaagatattccactatatttaagaatattacaata 8539357  T
Q  101 ttctctccactctctnnnnnnnnnnnnagagatacaatat---agtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattatattatagcacctagaa 197  Q
    || ||||||||||||            |||||||||||||   ||||||||| |||||||| ||| |||||| | ||||||||| ||| |||||||| ||    
T  8539356 ttatctccactctcttacacacaca--agagatacaatattatagtgtttcc-gtgagacccactcctattcgattgctattattttacagcacctaaaa 8539260  T
Q  198 gttatagagatgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttctacacacacagaagtt 297  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8539259 gttatagagatgatacccatccgatgtatttttcccacactctctgaatttactgaacactatatttttcctctcacacacttctacacacacagaagct 8539160  T
Q  298 ttgtattttcacttctgcttc 318  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  8539159 ttgtattttcacttctgcttc 8539139  T

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Target: chr3 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 2)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 129 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 51302306 - 51302118
Alignment:
Q  129 gagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattatattatagcacctagaagttatagagatgatacccacccggtgtattt 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51302306 gagatacaatatagtgtttcccgtgagacccactcctattcgaatgcaattgttttatagcacctagaagttatagagatgattcccacccggtgtattt 51302207  T
Q  229 ttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttctacacacacagaagttttgtattttcacttctgctt 317  Q
    |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  51302206 tatccacactctctggatttactcaatactctatttttcctcacacacacttctacacacacagaagctttgtattttcacttatgctt 51302118  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Complemental strand, 51302344 - 51302308
Alignment:
Q  1 tgaacaccaatatttaacgtggaaaaccctctaatac 37  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51302344 tgaacaccaatatttaacgtggaaaaccctctaatac 51302308  T

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Target: chr6 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 2)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Original strand, 2100291 - 2100379
Alignment:
Q  1 tgaacaccaatatttaacgtggaaaaccctctaatactgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaata 92  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2100291 tgaacatcaatatttaaggtggaaaaccctttaataatgagcgaaaaac---ggggcaaactccgaaaaatattccactatattaaagaata 2100379  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 115
Target Start/End: Original strand, 2100723 - 2100753
Alignment:
Q  85 aaagaatattacaatattctctccactctct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2100723 aaagaatattacaatattctctccactctct 2100753  T

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