View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6109_high_3 (Length: 473)

Name: NF6109_high_3
Description: NF6109
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6109_high_3
NF6109_high_3
[»] chr3 (18 HSPs)
chr3 (1-457)||(5482588-5483044)
chr3 (7-457)||(5488022-5488471)
chr3 (7-457)||(5500839-5501286)
chr3 (3-457)||(5523703-5524158)
chr3 (276-457)||(5452996-5453177)
chr3 (272-457)||(5855848-5856033)
chr3 (268-457)||(5804123-5804312)
chr3 (276-457)||(5444472-5444653)
chr3 (275-457)||(5850659-5850841)
chr3 (286-457)||(20341797-20341968)
chr3 (300-457)||(5829879-5830036)
chr3 (2-145)||(20341621-20341760)
chr3 (5-202)||(5452748-5452941)
chr3 (3-74)||(5856077-5856148)
chr3 (1-76)||(5830221-5830296)
chr3 (35-91)||(5804461-5804517)
chr3 (3-91)||(5851024-5851112)
chr3 (3-75)||(5444350-5444422)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 428; Significance: 0; HSPs: 18)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 428; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 5482588 - 5483044
Alignment:
Q  1 cgatatgtcagctattaactccagtgtccttccttcaatccatagtctccatgcctaaaatgacatcaaagttacaacaagagaaagctcatcaatcagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5482588 cgatatgtcagctattaactccagtgtccttccttcaatccatagtctccatgcctaaaatgacatcaaagttacaacaagagaaagctcatcaatcact 5482687  T
Q  101 tataaagtggattttgattgattgatttattttgtgtgtaggtatgtgtggagttcactttaaactattttcatcatatgaattagttttcattttgaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5482688 tataaagtggattttgattgattgatttattttgtgtgtaggtatgtgtggagttcactttaaactattttcatcatatgaattagttttcattttgaat 5482787  T
Q  201 ttcctcccatacatgattcattgagacnnnnnnngggatatatggaaagcaactaaaataaatacagtgtatcacaagatagagaaacatatacacttca 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5482788 ttcctcccatacatgattcattgagacaaaaaaagggatatatggaaagcaactaaaataaatacagtgtatcacaagatagagaaacatatacacttca 5482887  T
Q  301 aaacttacatggccaagaaggtttaaatgatgccgagggtcacaaaatccgcgattctttctaccgctaattatctcaagtacaacgactccaaagctaa 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5482888 aaacttacatggccaagaaggtttaaatgatgtcgagggtcacaaaatccgcgattctttctaccgctaattatctcaagtacaacgactccaaagctaa 5482987  T
Q  401 aaacatcagattttattgagaaagacccatgcactgcatattctggaggcatatatc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5482988 aaacatcagattttattgagaaagacccatgcactgcatattctggaggcatatatc 5483044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 7 - 457
Target Start/End: Original strand, 5488022 - 5488471
Alignment:
Q  7 gtcagctattaactccagtgtccttccttcaatccatagtctccatgcctaaaatgacatcaaagttacaacaagagaaagctcatcaatcagttataaa 106  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |    |||||     
T  5488022 gtcagctattaactccagtggtctttcttcaatccatagtttccatgcctaaaatgacatcaaagttacaacatgagtaagctcaacact----tataat 5488117  T
Q  107 gtggattttgattgattgatttattttgtgtgtaggtatgtgtggagttcactttaaactattttcatcatatgaattagttttcattttgaatttcctc 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| || | |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  5488118 gtggattttgattgattgatttattttgtgtgttggtaagtgtggagttcattttaaattagtatcatcatatgaattagttttcattttgagtttcttc 5488217  T
Q  207 ccatacat--gattcattgagacnnnnnnn-gggatatatggaaagcaactaaaataaatacagtgtatcacaagatagagaaacatatacacttcaaaa 303  Q
    |||| ||   |||| ||||||||        |||||||||||||||||||||||| | | | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5488218 ccatgcagtagatttattgagacccaaaaaagggatatatggaaagcaactaaaaaataaatagtgtgtcacaagatagagaaacatatacacttcaaaa 5488317  T
Q  304 cttacatggccaagaaggtttaaatgatgccgagggtcacaaaatccgcgattctttctaccgctaattatctcaagtacaacgactccaaagctaaaaa 403  Q
    |||||||| ||||||||||| | | ||||  ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  5488318 cttacatgaccaagaaggttaagacgatgtagagggtcacgaaatccatgattctttctaccgctaattatctcaagtagaacaactccaaagctgaaaa 5488417  T
Q  404 catcagattttattgagaaagacccatgcactgcatattctggaggcatatatc 457  Q
    ||||||||||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  5488418 catcagattttattgagaaggatccatccgctgcatattctggaggcatatatc 5488471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 7 - 457
Target Start/End: Original strand, 5500839 - 5501286
Alignment:
Q  7 gtcagctattaactccagtgtccttccttcaatccatagtctccatgcctaaaatgacatcaaagttacaacaagagaaagctcatcaatcagttataaa 106  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |    |||||     
T  5500839 gtcagctattaactccagtggtctttcttcaatccatagtctccatgcctaaaatgacatcaaagttacaacatgagtaagctcaacact----tataat 5500934  T
Q  107 gtggattttgattgattgatttattttgtgtgtaggtatgtgtggagttcactttaaactattttcatcatatgaattagttttcattttgaatttcctc 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||    
T  5500935 gtggattttgattgattgatttatt--gtgtgttagtatgtgtggagttcactttaaactatcatcatcatataaattagttttcattttgaattccttc 5501032  T
Q  207 ccat--acatgattcattgaga-cnnnnnnngggatatatggaaagcaactaaaataaatacagtgtatcacaagatagagaaacatatacacttcaaaa 303  Q
    ||||  | | |||| ||||||| |       |||||||| | |||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5501033 ccatgcagaagatttattgagaccaaaaaaagggatataagaaaagcaactaaaaaggatacagtgtgtcacaagatagagaaacatatacacttccaaa 5501132  T
Q  304 cttacatggccaagaaggtttaaatgatgccgagggtcacaaaatccgcgattctttctaccgctaattatctcaagtacaacgactccaaagctaaaaa 403  Q
    |||||||| ||||||||||| | | | ||  | ||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||    
T  5501133 cttacatgaccaagaaggttaagacggtgtagtgggtcgcgaaatccatgattctttctaccgctaattatctcaagtagaacaactccaaaactataaa 5501232  T
Q  404 catcagattttattgagaaagacccatgcactgcatattctggaggcatatatc 457  Q
    ||||||||||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  5501233 catcagattttattgagaaggatccatccgctgcatattctggaggcatatatc 5501286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 3 - 457
Target Start/End: Original strand, 5523703 - 5524158
Alignment:
Q  3 atatgtcagctattaactccagtgtccttccttcaatccatagtctccatgcctaaaatgacatcaaagttacaacaagagaaagctcatcaatcagtta 102  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||    || ||  ||    
T  5523703 atatgtctgctattaactccagtggtctttcttcaatccatagtttccatgccttaaatgacatcaaagttacaacatgagtaagct----aaacacata 5523798  T
Q  103 taaagtggattttgattgattgatttattttgtgtgtaggtatgtgtggagttcactttaaactattttcatcatatgaattagttttcattttgaattt 202  Q
    ||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  5523799 taatgtgaattttgattgattggtttattttgtgtgctggtatgtgtggagttcactttaaacaattatcatggtatgaattagttttcattttgaattt 5523898  T
Q  203 cctcccatacatga--ttcattgagacnnnnnnnggga-tatatggaaagcaactaaaa--taaatacagtgtatcacaagatagagaaacatatacact 297  Q
    | || ||| ||  |  || ||||||||        ||| ||||||||||||||||||||  |||||||| |||     ||||||||||||||||||||      
T  5523899 cttcacatgcagaacatttattgagactaaaaaaaggaatatatggaaagcaactaaaaaataaatacaatgtggtggaagatagagaaacatatacatg 5523998  T
Q  298 tcaaaacttacatggccaagaaggtttaaatgatgccgagggtcacaaaatccgcgattctttctaccgctaattatctcaagtacaacgactccaaagc 397  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | | ||||  ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5523999 tcaaaacttacatgaccaagaaggttaagacgatgtagagggtcacgaaatccatgattctttctaccgctaattatctcaagtacaacgactccaaagc 5524098  T
Q  398 taaaaacatcagattttattgagaaagacccatgcactgcatattctggaggcatatatc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  5524099 taaaaacatcagattttattgagaaagatccatgcgctgcatattctggaggcatgtatc 5524158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 276 - 457
Target Start/End: Original strand, 5452996 - 5453177
Alignment:
Q  276 aagatagagaaacatatacacttcaaaacttacatggccaagaaggtttaaatgatgccgagggtcacaaaatccgcgattctttctaccgctaattatc 375  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5452996 aagatagaaaaacatataaacttcaaaacttacatgaccaagaaggtttcgatgatgcagagggtcacaaaatccgcgattcttcctaccgctaattatc 5453095  T
Q  376 tcaagtacaacgactccaaagctaaaaacatcagattttattgagaaagacccatgcactgcatattctggaggcatatatc 457  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5453096 tcaagtacaacgactccaaaactaaaaacatcagattttattgagaaagacccatgcaccgcatattctggaggcatatatc 5453177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 272 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 5856033 - 5855848
Alignment:
Q  272 tcacaagatagagaaacatatacacttcaaaacttacatggccaagaaggtttaaatgatgccgagggtcacaaaatccgcgattctttctaccgctaat 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | ||||  |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||    
T  5856033 tcacaagatagagaaacatatacactccaaaacttacatgcccaagaaggtttagacgatgttgagggtcacaaaatccgctattcttcttaccgctgat 5855934  T
Q  372 tatctcaagtacaacgactccaaagctaaaaacatcagattttattgagaaagacccatgcactgcatattctggaggcatatatc 457  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5855933 tatctcaagtacaacgactccgaagctaaaaacatcagattttattgagaaagatccatgcactgcatattctggaggcatatatc 5855848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 268 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 5804312 - 5804123
Alignment:
Q  268 tgtatcacaagatagagaaacatatacacttcaaaacttacatggccaagaaggtttaaatgatgccgagggtcacaaaatccgcgattctttctaccgc 367  Q
    ||||| ||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||||| |||||||    
T  5804312 tgtatgacaagatagaagaatatataaacttcaaaacttacatgaccaagaaggtttagatgatgctgaggatcagaaaatccgcgattcttcctaccgc 5804213  T
Q  368 taattatctcaagtacaacgactccaaagctaaaaacatcagattttattgagaaagacccatgcactgcatattctggaggcatatatc 457  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5804212 taattatctcaagtacaacgactccgaagctaaaaacatcagattttatagagaaagatccatgcactgcatattctggaggcatatatc 5804123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 276 - 457
Target Start/End: Original strand, 5444472 - 5444653
Alignment:
Q  276 aagatagagaaacatatacacttcaaaacttacatggccaagaaggtttaaatgatgccgagggtcacaaaatccgcgattctttctaccgctaattatc 375  Q
    |||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5444472 aagataaaaaaagatataaacttcaaaacttacatgaccaagaaggtttagacgatgaagagggtcacgaaatccgcgattcttcctaccgctaattatc 5444571  T
Q  376 tcaagtacaacgactccaaagctaaaaacatcagattttattgagaaagacccatgcactgcatattctggaggcatatatc 457  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5444572 tcaagtacaacgactccaaaactaaaaacatcagattttattgagaaagacccatgcaccgcatattctggaggcatatatc 5444653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 275 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 5850841 - 5850659
Alignment:
Q  275 caagatagagaaacatatacacttcaaaacttacatggccaagaaggtttaaatgatgccgagggtcacaaaatccgcgattctttctaccgctaattat 374  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||  ||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  5850841 caagatagaggaacatatacacttcataacttacatgaccaagaaggtttagattgtgcagagggtcagaaaatccacgattcttcctaccgctaattat 5850742  T
Q  375 ctcaagtacaacgactccaaagctaaaaacatcagattttattgagaaagacccatgcactgcatattctggaggcatatatc 457  Q
    ||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5850741 ctcaagtacgacgactccgaaactaaaaacatcagactttattgagaaagatccatgcacggcatattctggaggcatatatc 5850659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 286 - 457
Target Start/End: Original strand, 20341797 - 20341968
Alignment:
Q  286 aacatatacacttcaaaacttacatggccaagaaggtttaaatgatgccgagggtcacaaaatccgcgattctttctaccgctaattatctcaagtacaa 385  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||    
T  20341797 aacaaatacacttcaaaacttacataaccaaggaggtttagatgatgtagagggtcacaaaatccgcgattcttcctgccgctaattatttcaagcacaa 20341896  T
Q  386 cgactccaaagctaaaaacatcagattttattgagaaagacccatgcactgcatattctggaggcatatatc 457  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  20341897 cgactccaaaactaaaaacatcagattttattgagaatgatccatgcacagcatattctggaggcatgtatc 20341968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 300 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 5830036 - 5829879
Alignment:
Q  300 aaaacttacatggccaagaaggtttaaatgatgccgagggtcacaaaatccgcgattctttctaccgctaattatctcaagtacaacgactccaaagcta 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||  |||| ||||||||||| ||||||||  | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  5830036 aaaacttacatggccaagaaggtttagattatgttgaggatcacaaaatccacgattcttcgtgccgctaatgatctcaagtacaacaactccaaagcta 5829937  T
Q  400 aaaacatcagattttattgagaaagacccatgcactgcatattctggaggcatatatc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5829936 aaaacatcagattttattgagaaaaacccatgcactgcatactctggaggcatatatc 5829879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 2 - 145
Target Start/End: Original strand, 20341621 - 20341760
Alignment:
Q  2 gatatgtcagctattaactccagtgtccttccttcaatccatagtctccatgcctaaaatgacatcaaagttacaacaagagaaagctcatcaatcagtt 101  Q
    |||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| || |    |    
T  20341621 gatatgtcagctattaactcctttgccctttcttcaatccatagtctccatgcctaaaatgacatcaaggttacaaaaagagtaagctcaacatt----t 20341716  T
Q  102 ataaagtggattttgattgattgatttattttgtgtgtaggtat 145  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||    
T  20341717 atgaagtggattttgattgattggtttatttcttgtgtatgtat 20341760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 5 - 202
Target Start/End: Original strand, 5452748 - 5452941
Alignment:
Q  5 atgtcagctattaactccagtgtccttccttcaatccatagtctccatgcctaaaatgacatcaaagttacaacaagagaaagctcatcaatcagttata 104  Q
    ||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||| ||||   ||||||   ||||    
T  5452748 atgtcagctattaactcctctggcctgccttcaatccacagtctccatgcctaaaatgacatcaaggttacagacagagtaagc---tcaatc--ctata 5452842  T
Q  105 aagtggattttgattgattgatttattttgtgtgtaggtatgtgtggagttcactttaaactatt-ttcatcatatgaattagttttcattttgaattt 202  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| || |||| ||||| |||||||| | | ||| ||||||||||    
T  5452843 aagtggattttggttgattgatttatttttagtgtatgtatgtgtggagtctactttcaattattattcatgatatgaataaatattccttttgaattt 5452941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 3 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 5856148 - 5856077
Alignment:
Q  3 atatgtcagctattaactccagtgtccttccttcaatccatagtctccatgcctaaaatgacatcaaagtta 74  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5856148 atatgtctgctattaactctagtggtctttcttcaatccatagtctccatgcctaaaatgacatcaaagtta 5856077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 5830296 - 5830221
Alignment:
Q  1 cgatatgtcagctattaactccagtgtccttccttcaatccatagtctccatgcctaaaatgacatcaaagttaca 76  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| || |||||||||||   ||||||||||||||    
T  5830296 cgatatgtcagctatgaactccagtgacctttcttcaatccataatcgccatgcctaaagaaacatcaaagttaca 5830221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 5804517 - 5804461
Alignment:
Q  35 tcaatccatagtctccatgcctaaaatgacatcaaagttacaacaagagaaagctca 91  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||    
T  5804517 tcaatccatagtctccatgcctaaaatgacatcaaagttatagtaagagtaagctca 5804461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 3 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 5851112 - 5851024
Alignment:
Q  3 atatgtcagctattaactccagtgtccttccttcaatccatagtctccatgcctaaaatgacatcaaagttacaacaagagaaagctca 91  Q
    |||||| |||||| ||||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||  |||||||    
T  5851112 atatgttagctatgaactctagtggcctttcttcgatccatagtctccatgcctgaaatgacataaaatttacatcaagaataagctca 5851024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 75
Target Start/End: Original strand, 5444350 - 5444422
Alignment:
Q  3 atatgtcagctattaactccagtgtccttccttcaatccatagtctccatgcctaaaatgacatcaaagttac 75  Q
    |||||||||| |||||||||  || ||| ||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| |||||    
T  5444350 atatgtcagccattaactcctctggcctgccttcaatccacaatttccatgcctaaaatgacatcaaggttac 5444422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University