View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6132_low_42 (Length: 236)

Name: NF6132_low_42
Description: NF6132
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6132_low_42
NF6132_low_42
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (1-224)||(995-1218)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (1-224)||(6103-6326)
[»] chr7 (46 HSPs)
chr7 (1-224)||(18253874-18254098)
chr7 (1-222)||(16211768-16211990)
chr7 (5-224)||(36052667-36052884)
chr7 (1-213)||(11580778-11580991)
chr7 (2-224)||(16478990-16479213)
chr7 (2-224)||(47481071-47481294)
chr7 (2-224)||(2437457-2437681)
chr7 (1-213)||(13037053-13037266)
chr7 (2-224)||(10989410-10989633)
chr7 (2-217)||(13572683-13572900)
chr7 (1-213)||(3059977-3060190)
chr7 (2-224)||(13911052-13911277)
chr7 (1-217)||(25292377-25292594)
chr7 (2-188)||(13321050-13321239)
chr7 (1-224)||(7293017-7293240)
chr7 (1-109)||(11516343-11516451)
chr7 (1-109)||(15441603-15441711)
chr7 (1-109)||(30262168-30262276)
chr7 (2-156)||(296006-296162)
chr7 (12-111)||(15950833-15950933)
chr7 (1-124)||(28722210-28722334)
chr7 (1-62)||(16914951-16915013)
chr7 (12-62)||(48622708-48622758)
chr7 (12-87)||(13758507-13758584)
chr7 (12-87)||(15927705-15927782)
chr7 (12-87)||(18980063-18980140)
chr7 (1-86)||(14935497-14935584)
chr7 (1-86)||(15358934-15359021)
chr7 (1-86)||(15363090-15363177)
chr7 (1-62)||(9611470-9611532)
chr7 (1-62)||(9839041-9839103)
chr7 (1-77)||(14271922-14272000)
chr7 (1-62)||(48356806-48356868)
chr7 (18-124)||(4438883-4438989)
chr7 (16-111)||(7822842-7822938)
chr7 (16-111)||(7830153-7830249)
chr7 (2-62)||(13377691-13377752)
chr7 (18-86)||(13448868-13448937)
chr7 (12-87)||(14250940-14251017)
chr7 (12-87)||(15760156-15760233)
chr7 (16-111)||(27101683-27101779)
chr7 (16-111)||(27109031-27109127)
chr7 (16-111)||(27176547-27176643)
chr7 (16-111)||(38783775-38783871)
chr7 (14-120)||(10000413-10000520)
chr7 (3-62)||(49047699-49047759)
[»] chr5 (39 HSPs)
chr5 (1-224)||(23506965-23507189)
chr5 (1-224)||(27182586-27182810)
chr5 (2-175)||(29188312-29188486)
chr5 (1-224)||(18531106-18531330)
chr5 (1-224)||(22053872-22054096)
chr5 (2-224)||(43443423-43443647)
chr5 (2-217)||(27009848-27010065)
chr5 (2-224)||(18778020-18778244)
chr5 (2-224)||(22366509-22366733)
chr5 (2-224)||(25426628-25426852)
chr5 (2-224)||(12374-12598)
chr5 (2-213)||(34939289-34939500)
chr5 (2-224)||(19499899-19500123)
chr5 (2-224)||(21073623-21073847)
chr5 (2-224)||(4200013-4200237)
chr5 (1-109)||(20623085-20623193)
chr5 (1-109)||(21233567-21233675)
chr5 (1-108)||(25900445-25900552)
chr5 (1-109)||(16536313-16536421)
chr5 (1-109)||(37052860-37052968)
chr5 (12-111)||(10778012-10778112)
chr5 (12-111)||(1219562-1219662)
chr5 (12-87)||(23514698-23514775)
chr5 (15-156)||(32950761-32950905)
chr5 (1-156)||(24084144-24084301)
chr5 (12-156)||(35791140-35791287)
chr5 (12-156)||(11212107-11212253)
chr5 (1-74)||(23981539-23981614)
chr5 (1-124)||(26559838-26559962)
chr5 (12-58)||(17471630-17471676)
chr5 (1-62)||(19862371-19862433)
chr5 (1-62)||(21310732-21310794)
chr5 (2-62)||(5450867-5450928)
chr5 (16-111)||(21932427-21932523)
chr5 (16-111)||(21938597-21938693)
chr5 (16-111)||(35582150-35582246)
chr5 (16-111)||(36989816-36989912)
chr5 (1-60)||(22885806-22885866)
chr5 (1-60)||(29918129-29918189)
[»] chr3 (39 HSPs)
chr3 (1-224)||(15936666-15936890)
chr3 (1-224)||(14842600-14842824)
chr3 (1-217)||(15938508-15938725)
chr3 (1-213)||(51158057-51158270)
chr3 (1-224)||(15859063-15859287)
chr3 (1-224)||(12030186-12030410)
chr3 (1-224)||(2049810-2050034)
chr3 (6-213)||(15614845-15615053)
chr3 (1-213)||(13838905-13839118)
chr3 (2-224)||(16821139-16821363)
chr3 (2-224)||(55316219-55316443)
chr3 (2-224)||(41270075-41270299)
chr3 (1-224)||(17912521-17912744)
chr3 (7-217)||(13954934-13955146)
chr3 (7-217)||(13975766-13975978)
chr3 (7-217)||(45860812-45861024)
chr3 (1-224)||(16744154-16744377)
chr3 (1-109)||(2449277-2449385)
chr3 (12-124)||(54651558-54651671)
chr3 (12-124)||(11986216-11986329)
chr3 (12-111)||(25058853-25058953)
chr3 (12-111)||(49232550-49232650)
chr3 (12-156)||(12264834-12264981)
chr3 (1-124)||(14814788-14814912)
chr3 (110-224)||(47984650-47984765)
chr3 (110-224)||(48003224-48003339)
chr3 (1-86)||(4145837-4145923)
chr3 (1-123)||(6228648-6228771)
chr3 (12-87)||(12902132-12902209)
chr3 (12-87)||(18911130-18911207)
chr3 (12-81)||(5228456-5228527)
chr3 (110-224)||(47993937-47994052)
chr3 (110-224)||(48012510-48012625)
chr3 (12-58)||(15468382-15468428)
chr3 (12-58)||(22275377-22275423)
chr3 (1-62)||(34560061-34560123)
chr3 (1-62)||(47784789-47784851)
chr3 (16-111)||(1467785-1467881)
chr3 (1-61)||(3576461-3576522)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (1-222)||(3621-3843)
scaffold0266 (1-224)||(1124-1348)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (1-224)||(48187-48411)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (1-224)||(107747-107971)
scaffold0026 (19-217)||(64573-64773)
[»] chr8 (36 HSPs)
chr8 (5-224)||(43373511-43373731)
chr8 (1-213)||(16193755-16193968)
chr8 (2-213)||(24548993-24549205)
chr8 (2-213)||(6774286-6774498)
chr8 (2-217)||(21844600-21844817)
chr8 (2-217)||(21851993-21852210)
chr8 (1-213)||(24928830-24929043)
chr8 (1-224)||(16405014-16405235)
chr8 (2-224)||(30120722-30120946)
chr8 (2-213)||(17345581-17345792)
chr8 (2-224)||(16674420-16674644)
chr8 (37-224)||(222754-222943)
chr8 (37-224)||(736377-736566)
chr8 (37-224)||(860272-860461)
chr8 (1-224)||(22907253-22907476)
chr8 (1-109)||(5238203-5238311)
chr8 (1-109)||(24661287-24661395)
chr8 (1-109)||(43685662-43685770)
chr8 (37-95)||(691909-691967)
chr8 (12-111)||(22006300-22006400)
chr8 (1-124)||(33172328-33172452)
chr8 (1-62)||(26011656-26011718)
chr8 (12-87)||(13720970-13721047)
chr8 (12-87)||(16873093-16873170)
chr8 (18-128)||(24552611-24552721)
chr8 (12-156)||(16195298-16195445)
chr8 (1-124)||(22742864-22742988)
chr8 (24-124)||(45558984-45559084)
chr8 (12-111)||(13662307-13662407)
chr8 (1-62)||(15933460-15933522)
chr8 (16-111)||(271406-271502)
chr8 (16-111)||(644418-644514)
chr8 (16-111)||(830153-830249)
chr8 (18-124)||(18261512-18261618)
chr8 (16-111)||(22088840-22088936)
chr8 (4-86)||(37653642-37653726)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (2-224)||(8878-9101)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (1-224)||(12115-12337)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (1-224)||(148721-148945)
scaffold0025 (1-224)||(8849-9073)
scaffold0025 (1-62)||(53508-53570)
[»] chr1 (20 HSPs)
chr1 (12-224)||(22227809-22228022)
chr1 (12-224)||(22232506-22232719)
chr1 (1-224)||(20931345-20931569)
chr1 (2-213)||(2116265-2116478)
chr1 (1-224)||(20913037-20913254)
chr1 (1-224)||(41394222-41394446)
chr1 (1-212)||(20893665-20893877)
chr1 (1-213)||(20445690-20445903)
chr1 (1-213)||(20531455-20531668)
chr1 (1-213)||(37844489-37844703)
chr1 (5-158)||(45051489-45051643)
chr1 (2-224)||(18601146-18601370)
chr1 (2-224)||(5072416-5072640)
chr1 (1-109)||(51452608-51452716)
chr1 (12-87)||(17148704-17148781)
chr1 (12-111)||(18059800-18059900)
chr1 (1-124)||(21195114-21195238)
chr1 (18-128)||(5768210-5768320)
chr1 (16-111)||(17004752-17004848)
chr1 (16-111)||(38055137-38055233)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (2-213)||(9377-9589)
scaffold0215 (2-213)||(16275-16487)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (1-224)||(128208-128431)
scaffold0008 (2-224)||(31703-31928)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (12-224)||(5254-5466)
[»] chr2 (34 HSPs)
chr2 (1-213)||(462749-462962)
chr2 (1-213)||(8891253-8891466)
chr2 (1-224)||(19794743-19794967)
chr2 (1-213)||(20627352-20627565)
chr2 (1-224)||(24341428-24341652)
chr2 (1-224)||(36982480-36982704)
chr2 (1-224)||(43642996-43643220)
chr2 (12-224)||(7507894-7508107)
chr2 (2-224)||(19886689-19886913)
chr2 (7-217)||(17396697-17396909)
chr2 (2-224)||(25265430-25265653)
chr2 (1-109)||(19689440-19689548)
chr2 (1-109)||(23820187-23820295)
chr2 (1-109)||(14906479-14906587)
chr2 (1-109)||(20015127-20015235)
chr2 (12-87)||(3798645-3798722)
chr2 (12-87)||(12635910-12635987)
chr2 (12-87)||(12728529-12728606)
chr2 (12-87)||(34824612-34824689)
chr2 (1-124)||(9636845-9636969)
chr2 (1-59)||(19669132-19669191)
chr2 (10-87)||(23778085-23778164)
chr2 (1-62)||(24884848-24884910)
chr2 (2-62)||(68154-68215)
chr2 (12-87)||(8943983-8944060)
chr2 (16-111)||(11231384-11231480)
chr2 (12-87)||(12641684-12641761)
chr2 (12-87)||(16935730-16935807)
chr2 (12-87)||(17006390-17006467)
chr2 (16-111)||(22513231-22513327)
chr2 (16-111)||(24685827-24685923)
chr2 (16-111)||(28775853-28775949)
chr2 (12-87)||(42178011-42178088)
chr2 (1-60)||(19660044-19660104)
[»] scaffold0195 (2 HSPs)
scaffold0195 (1-224)||(19206-19430)
scaffold0195 (1-224)||(21290-21514)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (12-224)||(3722-3936)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (1-213)||(5100-5313)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (1-213)||(123203-123416)
[»] chr4 (29 HSPs)
chr4 (1-213)||(13246441-13246654)
chr4 (1-224)||(15675128-15675352)
chr4 (1-224)||(54118283-54118507)
chr4 (2-224)||(10644219-10644443)
chr4 (1-224)||(31115629-31115853)
chr4 (1-156)||(10104289-10104445)
chr4 (1-216)||(13048260-13048477)
chr4 (1-125)||(121989-122113)
chr4 (2-224)||(47357654-47357878)
chr4 (1-224)||(26680201-26680424)
chr4 (2-156)||(40885594-40885749)
chr4 (1-109)||(10488678-10488786)
chr4 (1-109)||(16327965-16328073)
chr4 (126-213)||(111406-111493)
chr4 (2-133)||(7850090-7850223)
chr4 (14-156)||(17145701-17145845)
chr4 (12-156)||(8374576-8374722)
chr4 (12-104)||(22738390-22738483)
chr4 (12-111)||(18169084-18169184)
chr4 (1-124)||(18238180-18238304)
chr4 (12-87)||(7132107-7132184)
chr4 (12-87)||(19020623-19020700)
chr4 (2-156)||(15044895-15045051)
chr4 (1-124)||(38764809-38764933)
chr4 (1-35)||(33240890-33240924)
chr4 (18-124)||(15013323-15013429)
chr4 (2-62)||(15109373-15109434)
chr4 (12-87)||(20000860-20000937)
chr4 (18-124)||(41256410-41256516)
[»] scaffold0023 (3 HSPs)
scaffold0023 (1-224)||(48598-48822)
scaffold0023 (2-224)||(36093-36317)
scaffold0023 (12-111)||(154049-154149)
[»] chr6 (29 HSPs)
chr6 (2-213)||(14626158-14626370)
chr6 (1-213)||(23153458-23153671)
chr6 (5-213)||(1650136-1650345)
chr6 (2-224)||(25175563-25175787)
chr6 (2-224)||(27654011-27654235)
chr6 (2-213)||(1657788-1657999)
chr6 (5-224)||(35009482-35009702)
chr6 (2-213)||(15862484-15862694)
chr6 (2-224)||(16825780-16826006)
chr6 (10-156)||(29665941-29666089)
chr6 (43-155)||(27740907-27741021)
chr6 (2-47)||(27751603-27751648)
chr6 (1-124)||(29605550-29605673)
chr6 (1-62)||(18629631-18629693)
chr6 (12-87)||(1556142-1556219)
chr6 (12-87)||(16232029-16232106)
chr6 (1-77)||(17083221-17083298)
chr6 (12-87)||(18086865-18086942)
chr6 (12-111)||(22225780-22225880)
chr6 (12-87)||(23977906-23977983)
chr6 (1-62)||(16887815-16887877)
chr6 (1-62)||(25651399-25651461)
chr6 (16-111)||(10488813-10488909)
chr6 (12-87)||(13620836-13620913)
chr6 (16-111)||(16376419-16376515)
chr6 (16-111)||(16383743-16383839)
chr6 (16-111)||(16556185-16556281)
chr6 (16-111)||(16632741-16632837)
chr6 (18-124)||(22848115-22848221)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (2-224)||(21144-21367)
scaffold0139 (2-224)||(14089-14312)
[»] scaffold0076 (2 HSPs)
scaffold0076 (2-224)||(42997-43221)
scaffold0076 (16-111)||(39217-39313)
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (1-209)||(26454-26663)
scaffold0162 (2-122)||(8220-8340)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (1-224)||(36952-37176)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (1-213)||(247481-247694)
scaffold0012 (12-146)||(34200-34336)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (2-213)||(46-259)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (1-213)||(171916-172129)
scaffold0001 (1-213)||(177619-177832)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (2-213)||(2973-3186)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (1-213)||(41740-41953)
[»] scaffold1542 (1 HSPs)
scaffold1542 (1-211)||(573-784)
[»] scaffold0772 (1 HSPs)
scaffold0772 (2-197)||(5555-5752)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (1-213)||(272036-272249)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (2-128)||(13353-13479)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (2-213)||(13517-13729)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (2-224)||(34500-34724)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (2-224)||(41648-41871)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (1-108)||(51221-51328)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (1-126)||(89493-89618)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (1-224)||(37105-37328)
[»] scaffold1711 (1 HSPs)
scaffold1711 (2-109)||(1332-1439)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (119-224)||(48514-48620)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (1-109)||(22656-22764)
scaffold0141 (1-109)||(26911-27019)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (1-109)||(1621-1729)
[»] scaffold1560 (1 HSPs)
scaffold1560 (119-224)||(9-115)
[»] scaffold0066 (2 HSPs)
scaffold0066 (12-156)||(45098-45244)
scaffold0066 (12-156)||(54484-54630)
[»] scaffold0361 (1 HSPs)
scaffold0361 (5-124)||(3290-3410)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (12-124)||(56149-56262)
[»] scaffold0622 (1 HSPs)
scaffold0622 (126-224)||(9382-9480)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (1-124)||(22452-22576)
[»] scaffold0892 (1 HSPs)
scaffold0892 (14-87)||(3551-3625)
[»] scaffold0151 (1 HSPs)
scaffold0151 (1-169)||(22445-22615)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (12-87)||(54012-54088)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (1-62)||(8172-8234)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (12-87)||(1617-1694)
[»] scaffold0670 (1 HSPs)
scaffold0670 (18-124)||(7716-7822)
[»] scaffold0467 (1 HSPs)
scaffold0467 (12-87)||(10381-10458)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (1-124)||(3351-3475)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (1-86)||(4742-4829)
[»] scaffold1666 (1 HSPs)
scaffold1666 (12-58)||(38-84)
[»] scaffold0700 (1 HSPs)
scaffold0700 (1-62)||(2687-2749)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (1-62)||(6823-6885)
[»] scaffold0409 (2 HSPs)
scaffold0409 (1-77)||(1371-1449)
scaffold0409 (1-77)||(9626-9704)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (1-62)||(76870-76932)
[»] scaffold1500 (1 HSPs)
scaffold1500 (12-87)||(1556-1633)
[»] scaffold1272 (1 HSPs)
scaffold1272 (2-62)||(456-517)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (2-62)||(2340-2401)
[»] scaffold0107 (2 HSPs)
scaffold0107 (16-111)||(31423-31519)
scaffold0107 (12-87)||(39783-39860)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (2-62)||(43822-43883)


Alignment Details
Target: scaffold0175 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 995 - 1218
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  995 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaatt 1094  T
Q  101 gatgaattttgctaagttgttgttaattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgttt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  1095 gatgaattttgctaagttgttgttaattgagattttattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgggt 1194  T
Q  201 atgcatattcatggatttatgatg 224  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  1195 atgcatattcatggattgatgatg 1218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 6103 - 6326
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  6103 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtaaaaattgtgctgaatt 6202  T
Q  101 gatgaattttgctaagttgttgttaattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgttt 200  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |    
T  6203 ggtgaattttgctaagttgttgttaattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttttgttatgattgatgaataattgcttgggt 6302  T
Q  201 atgcatattcatggatttatgatg 224  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  6303 atgcatattcatggattgatgatg 6326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 181; Significance: 6e-98; HSPs: 46)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 18253874 - 18254098
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18253874 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 18253973  T
Q  101 gatgaattttgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtt 199  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||      
T  18253974 ggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttgtgattgatgaataattgcctgag 18254073  T
Q  200 tatgcatattcatggatttatgatg 224  Q
    |||||||||||||||||| ||||||    
T  18254074 tatgcatattcatggattgatgatg 18254098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 16211990 - 16211768
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16211990 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgtttgtgaaattgcatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 16211891  T
Q  101 gatgaattttgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtt 199  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||| | ||||||||      
T  16211890 ggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttaaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgattcattgcttggg 16211791  T
Q  200 tatgcatattcatggatttatga 222  Q
    |||||||||||||| ||| ||||    
T  16211790 tatgcatattcatgaattaatga 16211768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 5 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 36052884 - 36052667
Alignment:
Q  5 gtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattgatg 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  36052884 gtttgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttggtaaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtg 36052785  T
Q  105 aattttgctaagttgttgttaattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtttatgc 204  Q
    ||||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||  |||||    
T  36052784 aattttgctaagttgt--taatttgagatttgattcttgttcaattgatgttgtggttgttaattgatgttgtggttgatgaataattgcttgggtatgc 36052687  T
Q  205 atattcatggatttatgatg 224  Q
    ||||||||| ||| ||||||    
T  36052686 atattcatgaattgatgatg 36052667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 11580778 - 11580991
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11580778 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 11580877  T
Q  101 gatgaattttgctaagttgttgtta-attgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtt 199  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||      
T  11580878 ggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 11580977  T
Q  200 tatgcatattcatg 213  Q
    ||| ||||||||||    
T  11580978 tatacatattcatg 11580991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 2 - 224
Target Start/End: Original strand, 16478990 - 16479213
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16478990 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattg 16479089  T
Q  102 atgaattttgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgttt 200  Q
     ||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||| || ||||| |  ||||||||| | ||||||  |    
T  16479090 gtgaattttgttaagttatttttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggt 16479189  T
Q  201 atgcatattcatggatttatgatg 224  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  16479190 atgcatattcatggattgatgatg 16479213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 2 - 224
Target Start/End: Original strand, 47481071 - 47481294
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  47481071 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgttcaattg 47481170  T
Q  102 atgaattttgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgttt 200  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||||| | | |||||| ||||| |  ||||||||| ||||||||  |    
T  47481171 gtgaattttgctaagttgttgttgaattgagttatgattcttgttcaattgatgttatcgctcttaattgatgtttttgttgatgaatcattgcttgggt 47481270  T
Q  201 atgcatattcatggatttatgatg 224  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||    
T  47481271 atgcatattcatgaattgatgatg 47481294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 2437681 - 2437457
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||||    
T  2437681 tatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgttcaattg 2437582  T
Q  102 atgaa-ttttgctaagttgttgttaat-tgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtt 199  Q
     |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||||      
T  2437581 gtgaatttttcctaagttgttgttaatatgagatttgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgag 2437482  T
Q  200 tatgcatattcatggatttatgatg 224  Q
    | |||||||||||||||| ||||||    
T  2437481 tttgcatattcatggattgatgatg 2437457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 13037053 - 13037266
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13037053 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttgatgaaattgcatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 13037152  T
Q  101 gatgaattttgctaagttgttgtta-attgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtt 199  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| | |||||||| || |||||| ||||| || ||||||||| ||||||||      
T  13037153 ggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattaatgttatgaatattaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 13037252  T
Q  200 tatgcatattcatg 213  Q
    ||||||||||||||    
T  13037253 tatgcatattcatg 13037266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 2 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 10989633 - 10989410
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  10989633 tatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattg 10989534  T
Q  102 atgaattt-tgctaagttgttgttaattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgttt 200  Q
     ||||||| | |||||||||||| | ||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||||  |    
T  10989533 gtgaatttctcctaagttgttgtaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggt 10989434  T
Q  201 atgcatattcatggatttatgatg 224  Q
     |||||||||||||||| ||||||    
T  10989433 ttgcatattcatggattgatgatg 10989410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 13572900 - 13572683
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  13572900 tatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtgtgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattg 13572801  T
Q  102 atgaattt-tgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtt 199  Q
     ||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||| || || |||||||| |||||||||||||||      
T  13572800 gtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattaatgaataattgcttggg 13572701  T
Q  200 tatgcatattcatggatt 217  Q
    | ||||||||||||||||    
T  13572700 tttgcatattcatggatt 13572683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 3060190 - 3059977
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |    
T  3060190 atatatttgtatgcattaattgatgataattgtaatactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataaattgtgaaaattatgctcaaat 3060091  T
Q  101 gatgaattttgctaagttgttgtta-attgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtt 199  Q
    | ||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||      
T  3060090 ggtgaattttgttaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatgactgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 3059991  T
Q  200 tatgcatattcatg 213  Q
    ||||||||||||||    
T  3059990 tatgcatattcatg 3059977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 2 - 224
Target Start/End: Original strand, 13911052 - 13911277
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  13911052 tatgtttgtatgcatgaattgatgttaattgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgctcaattg 13911151  T
Q  102 atgaattt-tgct-aagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgt 198  Q
     ||||||| | || ||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||| || || ||||||||||||||||||| ||||     
T  13911152 gtgaatttctcctaaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataatttcttgg 13911251  T
Q  199 ttatgcatattcatggatttatgatg 224  Q
     | |||||||||||||||| ||||||    
T  13911252 gtttgcatattcatggattgatgatg 13911277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 25292377 - 25292594
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 100  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||||||    
T  25292377 atatgtttgtatgtatgaattgttgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaaggataagctatgaatattgtgctcaatt 25292476  T
Q  101 gatgaattttgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtt 199  Q
    | |||||| | ||| ||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||| || || |||||| | |||||||||||||||      
T  25292477 ggtgaattctcctaggttgtcgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgactaatgaataattgcttggg 25292576  T
Q  200 tatgcatattcatggatt 217  Q
    | ||||||||||||||||    
T  25292577 tttgcatattcatggatt 25292594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 13321239 - 13321050
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||  ||||| || ||||||||||||||    
T  13321239 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgtcaagttatg-aaattgtgctcaat 13321141  T
Q  100 tgatgaattttgctaagttg-ttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaat 188  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| | |||||||| ||||| |  |||||||||    
T  13321140 tggtgaattttgctaagttgattgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttgttgttgatgaat 13321050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 7293240 - 7293017
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||  |||     
T  7293240 atatgtttgtatgcatgaattaataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatg 7293141  T
Q  101 gatgaattttgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtt 199  Q
    |||||| ||||  | ||||||||| ||||||| | |||||||||| ||| ||||||| | |||| ||||  ||||| |  ||||||||| ||||||||      
T  7293140 gatgaa-tttgacatgttgttgttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcattgcttggg 7293042  T
Q  200 tatgcatattcatggatttatgatg 224  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||    
T  7293041 tatacatattcatggattgatgatg 7293017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 11516451 - 11516343
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||  |||     
T  11516451 atatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatg 11516352  T
Q  101 gatgaattt 109  Q
    |||||||||    
T  11516351 gatgaattt 11516343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Original strand, 15441603 - 15441711
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||  |||     
T  15441603 atatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatg 15441702  T
Q  101 gatgaattt 109  Q
    |||||||||    
T  15441703 gatgaattt 15441711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Original strand, 30262168 - 30262276
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||  |||     
T  30262168 atatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatg 30262267  T
Q  101 gatgaattt 109  Q
    |||||||||    
T  30262268 gatgaattt 30262276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 156
Target Start/End: Original strand, 296006 - 296162
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattg 101  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| ||||| | |||||| |   ||| ||    
T  296006 tatgtttgtgtgcatgaatcgatgataatgttatgattgttggtgaaatttcatgttgaattatgtaaaaatgagaagttataaaaattatatccaaatg 296105  T
Q  102 atgaattttgctaagttgttgtt--aattgagatttgattcttgttcaagtgatgtt 156  Q
     ||||||||||||| ||| ||||  ||||| | | |||||| ||||||| |||||||    
T  296106 gtgaattttgctaaattgatgtttgaattgtgttgtgattcatgttcaattgatgtt 296162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 111
Target Start/End: Original strand, 15950833 - 15950933
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattt 109  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| || ||||| |||| |||||||||| ||    
T  15950833 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatgaaatt 15950931  T
Q  110 tg 111  Q
    ||    
T  15950932 tg 15950933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 28722334 - 28722210
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctc-a 97  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||  |||||  |||| ||||| |    
T  28722334 atatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtg--aattatgctcaa 28722237  T
Q  98 attgatgaattttgctaagttgttgtt 124  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||||    
T  28722236 attgttgaattgtgctatgttgttgtt 28722210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Original strand, 16914951 - 16915013
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 62  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  16914951 atatgtttgaatgcatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaa 16915013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 12 - 62
Target Start/End: Original strand, 48622708 - 48622758
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 62  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  48622708 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgttcaaa 48622758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 13758584 - 13758507
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 87  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  13758584 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 13758507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 15927782 - 15927705
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 87  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  15927782 tgcatgaattgatgattatggtatgcttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 15927705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 87
Target Start/End: Original strand, 18980063 - 18980140
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 87  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  18980063 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 18980140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 14935584 - 14935497
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaatgataagttgtgaa 86  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||  |||||||    
T  14935584 atatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaa 14935497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 15359021 - 15358934
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaatgataagttgtgaa 86  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||  |||||||    
T  15359021 atatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaa 15358934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 15363177 - 15363090
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaatgataagttgtgaa 86  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||  |||||||    
T  15363177 atatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaa 15363090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 9611532 - 9611470
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 62  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  9611532 atatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaa 9611470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 9839103 - 9839041
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 62  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  9839103 atatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaa 9839041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Original strand, 14271922 - 14272000
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgata 77  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  ||  |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  14271922 atatgtttgaatgcatgaaattgttgataattcaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtatgtgaaaatgata 14272000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 48356868 - 48356806
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 62  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  48356868 atatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaa 48356806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 18 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 4438989 - 4438883
Alignment:
Q  18 aattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgct-caattgatgaattttgctaa 115  Q
    ||||| ||||||||| ||  || ||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||  |||||  ||||||||| |||||| |||||| |||||     
T  4438989 aattggtgataattgaattgttattggtgaaattgcatgttcatagtatgttaaaatgatatattgtg--aattgtgctccaattgttgaattgtgctat 4438892  T
Q  116 gttgttgtt 124  Q
    |||||||||    
T  4438891 gttgttgtt 4438883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 16 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 7822938 - 7822842
Alignment:
Q  16 tgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttg 111  Q
    |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| || ||||| |||| |||||||||| ||||    
T  7822938 tgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatgaaatttg 7822842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 16 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 7830249 - 7830153
Alignment:
Q  16 tgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttg 111  Q
    |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| || ||||| |||| |||||||||| ||||    
T  7830249 tgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatgaaatttg 7830153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 13377752 - 13377691
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 62  Q
    |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  13377752 tatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 13377691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 18 - 86
Target Start/End: Original strand, 13448868 - 13448937
Alignment:
Q  18 aattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaatgataagttgtgaa 86  Q
    ||||| ||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||  |||||||    
T  13448868 aattggtgataattgaattattgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaa 13448937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 12 - 87
Target Start/End: Original strand, 14250940 - 14251017
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 87  Q
    |||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  14250940 tgcatgaattgatgattatggtatgtttttgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 14251017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 12 - 87
Target Start/End: Original strand, 15760156 - 15760233
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 87  Q
    |||||||||||||||| ||  |||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  15760156 tgcatgaattgatgattatgatatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 15760233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 16 - 111
Target Start/End: Original strand, 27101683 - 27101779
Alignment:
Q  16 tgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttg 111  Q
    |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| || ||||| |||| |||||||||| ||||    
T  27101683 tgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatgaaatttg 27101779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 16 - 111
Target Start/End: Original strand, 27109031 - 27109127
Alignment:
Q  16 tgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttg 111  Q
    |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| || ||||| |||| |||||||||| ||||    
T  27109031 tgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatgaaatttg 27109127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 16 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 27176643 - 27176547
Alignment:
Q  16 tgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttg 111  Q
    |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| || ||||| |||| |||||||||| ||||    
T  27176643 tgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatgaaatttg 27176547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 16 - 111
Target Start/End: Original strand, 38783775 - 38783871
Alignment:
Q  16 tgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttg 111  Q
    |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| || ||||| |||| |||||||||| ||||    
T  38783775 tgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatgaaatttg 38783871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 120
Target Start/End: Original strand, 10000413 - 10000520
Alignment:
Q  14 catgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacat-gttcaa-atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttg 111  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||| | ||||||||||| ||||||  |||||| |||||  |||||||| ||||| |||| ||||||||| || ||    
T  10000413 catgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aaattttgcttaattgatgatttgtg 10000511  T
Q  112 ctaagttgt 120  Q
     ||||||||    
T  10000512 ataagttgt 10000520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 62
Target Start/End: Original strand, 49047699 - 49047759
Alignment:
Q  3 atgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 62  Q
    ||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  49047699 atgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 49047759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 39)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 23507189 - 23506965
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23507189 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 23507090  T
Q  101 gatgaattttgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtt 199  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||      
T  23507089 ggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaataattgcttggg 23506990  T
Q  200 tatgcatattcatggatttatgatg 224  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||    
T  23506989 tatgcatattcatgaattgatgatg 23506965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 27182586 - 27182810
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27182586 atatgtttgtatgcatgaactgatgataattgtatgattgttgatgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 27182685  T
Q  101 gatgaattttgctaagttgttgtta-attgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtt 199  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||      
T  27182686 ggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgag 27182785  T
Q  200 tatgcatattcatggatttatgatg 224  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||    
T  27182786 tatgcatattcatgaattgatgatg 27182810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 2 - 175
Target Start/End: Original strand, 29188312 - 29188486
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29188312 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgctcaattg 29188411  T
Q  102 atgaattttgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgtt 175  Q
     |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  29188412 gtgaattttgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgatgtt 29188486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 18531106 - 18531330
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  18531106 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgttcaatt 18531205  T
Q  101 gatgaattttgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtt 199  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| | |||||||| ||||| |  ||||||||| |||||| |      
T  18531206 ggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgaatcattgctcggg 18531305  T
Q  200 tatgcatattcatggatttatgatg 224  Q
    ||| |||||||||| ||| ||||||    
T  18531306 tatacatattcatgaattgatgatg 18531330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 22053872 - 22054096
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  22053872 atatgtttgtatgtatgaattgatgatagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaatt 22053971  T
Q  101 gatgaattttgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtt 199  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| | |||||||| ||||| |  ||||||||| ||||||||      
T  22053972 ggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgaatcattgcttggg 22054071  T
Q  200 tatgcatattcatggatttatgatg 224  Q
    | | |||||||||| ||| ||||||    
T  22054072 tctacatattcatgaattgatgatg 22054096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 224
Target Start/End: Original strand, 43443423 - 43443647
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  43443423 tatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattg 43443522  T
Q  102 atgaattt-tgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtt 199  Q
     ||||||| | ||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||| |||||||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||||      
T  43443523 gtgaatttcttctaagttgttgttgatttgagatgtgagtcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttggg 43443622  T
Q  200 tatgcatattcatggatttatgatg 224  Q
    | |||||||||||||||| ||||||    
T  43443623 tttgcatattcatggattgatgatg 43443647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 27010065 - 27009848
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||    
T  27010065 tatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgagtgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtactcaattg 27009966  T
Q  102 atgaattt-tgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtt 199  Q
     ||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||| || || |||||||| |||||||||||||||      
T  27009965 gtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattaatgaataattgcttggg 27009866  T
Q  200 tatgcatattcatggatt 217  Q
    | ||||||||||||||||    
T  27009865 tttgcatattcatggatt 27009848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 2 - 224
Target Start/End: Original strand, 18778020 - 18778244
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  18778020 tatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattg 18778119  T
Q  102 atgaattt-tgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtt 199  Q
     ||||||| | ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||| || ||| || || ||||||||||||||||||||||||      
T  18778120 gtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatattatttgatattatgattgatgaataattgcttggg 18778219  T
Q  200 tatgcatattcatggatttatgatg 224  Q
    |||||||||||||||||| ||||||    
T  18778220 tatgcatattcatggattgatgatg 18778244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 2 - 224
Target Start/End: Original strand, 22366509 - 22366733
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  22366509 tatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattg 22366608  T
Q  102 atgaattt-tgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtt 199  Q
     ||||||| | ||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||| |||||||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||||      
T  22366609 gtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttggg 22366708  T
Q  200 tatgcatattcatggatttatgatg 224  Q
    |||||||||||||||||| ||||||    
T  22366709 tatgcatattcatggattgatgatg 22366733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 2 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 25426852 - 25426628
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||||| || ||    
T  25426852 tatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaagtg 25426753  T
Q  102 atgaattt-tgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtt 199  Q
     ||||||| | ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||||      
T  25426752 gtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttggg 25426653  T
Q  200 tatgcatattcatggatttatgatg 224  Q
    |||||||||||||||||| ||||||    
T  25426652 tatgcatattcatggattgatgatg 25426628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 12598 - 12374
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||| |||||||| || ||    
T  12598 tatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtg 12499  T
Q  102 atgaattt-tgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtt 199  Q
     ||||||| | ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||||      
T  12498 gtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttggg 12399  T
Q  200 tatgcatattcatggatttatgatg 224  Q
    |||||||||||||||||| ||||||    
T  12398 tatgcatattcatggattgatgatg 12374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 2 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 34939500 - 34939289
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  34939500 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattg 34939401  T
Q  102 atgaattttgctaagttgttgttaattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgttta 201  Q
    ||| ||||||||||||  |||| ||||||| | |||||||||||||  ||||||||| | |||||||| ||||| |  ||||||||| | ||||||  ||    
T  34939400 atggattttgctaagtcattgtgaattgagttatgattcttgttcagttgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggta 34939301  T
Q  202 tgcatattcatg 213  Q
    ||||||||||||    
T  34939300 tgcatattcatg 34939289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 2 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 19500123 - 19499899
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||||| || ||    
T  19500123 tatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaagtg 19500024  T
Q  102 atgaattt-tgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtt 199  Q
     ||||||| | ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| || || ||||||||||| |||||||||||       
T  19500023 gtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgattaataattgctttgg 19499924  T
Q  200 tatgcatattcatggatttatgatg 224  Q
    |||||||||||||||||| ||||||    
T  19499923 tatgcatattcatggattgatgatg 19499899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 2 - 224
Target Start/End: Original strand, 21073623 - 21073847
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattg 101  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||||| || ||    
T  21073623 tatgtttgtatgcatgaatggatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaagtg 21073722  T
Q  102 atgaattt-tgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtt 199  Q
     ||||||| | ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||  |||||| || || ||||||||||||||||||||||||      
T  21073723 gtgaatttcttctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatcaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttggg 21073822  T
Q  200 tatgcatattcatggatttatgatg 224  Q
    |||||||||||||||||| ||||||    
T  21073823 tatgcatattcatggattgatgatg 21073847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 2 - 224
Target Start/End: Original strand, 4200013 - 4200237
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||| |||| |||||    
T  4200013 tatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgctaaattg 4200112  T
Q  102 atgaattt-tgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtt 199  Q
     ||||||| |  || ||||||||| | ||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||| || || ||||||||||||||| ||||||||      
T  4200113 gtgaatttctcttatgttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaatgattgcttggg 4200212  T
Q  200 tatgcatattcatggatttatgatg 224  Q
    | ||||||||||||| || ||||||    
T  4200213 tttgcatattcatgggttgatgatg 4200237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 20623193 - 20623085
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||  |||     
T  20623193 atatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatg 20623094  T
Q  101 gatgaattt 109  Q
    |||||||||    
T  20623093 gatgaattt 20623085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Original strand, 21233567 - 21233675
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||  |||     
T  21233567 atatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatg 21233666  T
Q  101 gatgaattt 109  Q
    |||||||||    
T  21233667 gatgaattt 21233675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 25900445 - 25900552
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||  |||     
T  25900445 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggttaaattatatgtttgaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatg 25900544  T
Q  101 gatgaatt 108  Q
    ||||||||    
T  25900545 gatgaatt 25900552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 16536421 - 16536313
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||  |||     
T  16536421 atatgtttgtatgcatgaatttataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatg 16536322  T
Q  101 gatgaattt 109  Q
    |||||||||    
T  16536321 gatgaattt 16536313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 37052968 - 37052860
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||  |||     
T  37052968 atatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtggaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatg 37052869  T
Q  101 gatgaattt 109  Q
    |||||||||    
T  37052868 gatgaattt 37052860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 111
Target Start/End: Original strand, 10778012 - 10778112
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattt 109  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| || ||||| |||| |||||||||| ||    
T  10778012 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatgaaatt 10778110  T
Q  110 tg 111  Q
    ||    
T  10778111 tg 10778112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 111
Target Start/End: Original strand, 1219562 - 1219662
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattt 109  Q
    ||||| |||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| || ||||| |||| |||||||||| ||    
T  1219562 tgcattaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatgaaatt 1219660  T
Q  110 tg 111  Q
    ||    
T  1219661 tg 1219662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 23514775 - 23514698
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 87  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  23514775 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 23514698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 32950905 - 32950761
Alignment:
Q  15 atgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatg-ataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttg 111  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||| ||| |   ||||| || ||||||||||||| || ||||||||     
T  32950905 atgatttgatgataattgtatgattgtggttgaaattacatgtttcaaagtatgtataaaggtcaaagttatg-aaattgtgctcaaatggtgaatttta 32950807  T
Q  112 ctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgtt 156  Q
    ||| ||||||||| ||  ||||| |||||| ||||| | |||||||    
T  32950806 ctatgttgttgttgaaaagagatgtgattcatgttccattgatgtt 32950761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 24084301 - 24084144
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctc-a 97  Q
    ||||||||| || |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||  |||||  |||||||||| |    
T  24084301 atatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtaaaattacatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtg--aattgtgctcta 24084204  T
Q  98 attgatgaattttgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgtt 156  Q
    | || |||||| ||||| ||||||||| ||||| ||| ||| || |||| || |||||||    
T  24084203 aatgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgtgaatcatgtttaattgatgtt 24084144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 156
Target Start/End: Original strand, 35791140 - 35791287
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattgatg-aatt 108  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||  ||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| || | ||| | || |||||||| ||||    
T  35791140 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgagtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatg-agattatacttaattgatgaaatt 35791238  T
Q  109 ttgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgtt 156  Q
    ||| || ||||||||| || |||||| |||||| ||||| | |||||||    
T  35791239 ttgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgtt 35791287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 12 - 156
Target Start/End: Original strand, 11212107 - 11212253
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattt 109  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| | |||| ||||| |||||| || ||||| | ||||| |  |||||||    
T  11212107 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtgtgtataaatgttaagttatg-aaattatactcaagtagtgaattt 11212205  T
Q  110 tgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgtt 156  Q
    |  || ||||||||| || |||||| |||||| ||||| | |||||||    
T  11212206 taatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgtt 11212253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 74
Target Start/End: Original strand, 23981539 - 23981614
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatg 74  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||  ||||||||||| || |||||||||| |||||| |||||    
T  23981539 atatgtttgtatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaatttgcatgttcaaagtatgtataaatg 23981614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 26559838 - 26559962
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctc-a 97  Q
    ||||||||| || |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||  |||||  |||||||||| |    
T  26559838 atatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtg--aattgtgctcta 26559935  T
Q  98 attgatgaattttgctaagttgttgtt 124  Q
    | || |||||| ||||| |||||||||    
T  26559936 aatgttgaattgtgctatgttgttgtt 26559962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 58
Target Start/End: Original strand, 17471630 - 17471676
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 58  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  17471630 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 17471676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 19862433 - 19862371
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 62  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  19862433 atatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 19862371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Original strand, 21310732 - 21310794
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 62  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  21310732 atatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaa 21310794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 62
Target Start/End: Original strand, 5450867 - 5450928
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 62  Q
    |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  5450867 tatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 5450928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 16 - 111
Target Start/End: Original strand, 21932427 - 21932523
Alignment:
Q  16 tgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttg 111  Q
    |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| || ||||| |||| |||||||||| ||||    
T  21932427 tgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatgaaatttg 21932523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 16 - 111
Target Start/End: Original strand, 21938597 - 21938693
Alignment:
Q  16 tgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttg 111  Q
    |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| || ||||| |||| |||||||||| ||||    
T  21938597 tgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatgaaatttg 21938693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 16 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 35582246 - 35582150
Alignment:
Q  16 tgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttg 111  Q
    |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| || ||||| |||| |||||||||| ||||    
T  35582246 tgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatgaaatttg 35582150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 16 - 111
Target Start/End: Original strand, 36989816 - 36989912
Alignment:
Q  16 tgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttg 111  Q
    |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| || ||||| |||| |||||||||| ||||    
T  36989816 tgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatgaaatttg 36989912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 22885866 - 22885806
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca 60  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  22885866 atatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttca 22885806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 29918189 - 29918129
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca 60  Q
    ||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  29918189 atatgtttgaatacatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttca 29918129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 39)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 15936666 - 15936890
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15936666 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 15936765  T
Q  101 gatgaattttgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtt 199  Q
    | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||      
T  15936766 ggtgaattttgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttgtgattgatgaataattgcctgag 15936865  T
Q  200 tatgcatattcatggatttatgatg 224  Q
    |||||||||||||||||| ||||||    
T  15936866 tatgcatattcatggattgatgatg 15936890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 14842600 - 14842824
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14842600 atatgtttgtatgcatgaattgaagataattgtatgattgttggtgaaattgcatgttcaaatgtgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgctcaatt 14842699  T
Q  101 gatgaattttgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtt 199  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||      
T  14842700 ggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttatgattgatgaataattgattggg 14842799  T
Q  200 tatgcatattcatggatttatgatg 224  Q
    | |||||||||||||||| ||||||    
T  14842800 tttgcatattcatggattgatgatg 14842824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 15938508 - 15938725
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 100  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15938508 atatgtttgtaatcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 15938607  T
Q  101 gatgaattttgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtt 199  Q
    | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||      
T  15938608 ggtgaattttgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttgtgattgatgaataattgcctgag 15938707  T
Q  200 tatgcatattcatggatt 217  Q
    ||||||||||||||||||    
T  15938708 tatgcatattcatggatt 15938725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 51158057 - 51158270
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51158057 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 51158156  T
Q  101 gatgaattttgctaagttgttgtta-attgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtt 199  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||      
T  51158157 ggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 51158256  T
Q  200 tatgcatattcatg 213  Q
    ||||||||||||||    
T  51158257 tatgcatattcatg 51158270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 15859063 - 15859287
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15859063 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 15859162  T
Q  101 gatgaattttgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtt 199  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||      
T  15859163 ggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 15859262  T
Q  200 tatgcatattcatggatttatgatg 224  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||    
T  15859263 tatgcatattcatgaattgatgatg 15859287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 12030186 - 12030410
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12030186 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaagtgataagttgtgaaagttgtgctcaatt 12030285  T
Q  101 gatgaattttgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtt 199  Q
    | |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||      
T  12030286 ggtgaattttgctaagttattgttaatttgatatttgattcttgttcaattgatgctatggttgttaattgatgttatggttgatgaatcattgcttggg 12030385  T
Q  200 tatgcatattcatggatttatgatg 224  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||    
T  12030386 tatgcatattcatgaattgatgatg 12030410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 2050034 - 2049810
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2050034 atatgtttgtatgcctgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaacatgataacttgtgaaaattgtgctcaatt 2049935  T
Q  101 gatgaattttgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtt 199  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||      
T  2049934 ggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgatttttgttcaattgatgctatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 2049835  T
Q  200 tatgcatattcatggatttatgatg 224  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||    
T  2049834 tatgcatattcatgaattgatgatg 2049810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 6 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 15615053 - 15614845
Alignment:
Q  6 tttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattgatga 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  15615053 tttgtatgcatgaattgatgataattgtaggattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaatatggtgctcaattggtga 15614954  T
Q  106 attttgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtttatgc 204  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||| |  ||||||||| ||||||||  |||||    
T  15614953 attttgctaagttattgttaatttgggatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatgc 15614854  T
Q  205 atattcatg 213  Q
    |||||||||    
T  15614853 atattcatg 15614845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 13839118 - 13838905
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13839118 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 13839019  T
Q  101 gatgaattttgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtt 199  Q
    | |||||||||||||||||| |||  |||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||| |||| |||      
T  13839018 ggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgtttggg 13838919  T
Q  200 tatgcatattcatg 213  Q
    ||||||||||||||    
T  13838918 tatgcatattcatg 13838905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 2 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 16821363 - 16821139
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattg 101  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||  |||||||| |||||    
T  16821363 tatgtttgtatgcataaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagctatgagtattgtgctaaattg 16821264  T
Q  102 atgaattt-tgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtt 199  Q
     ||||||| | ||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||||      
T  16821263 gtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttggg 16821164  T
Q  200 tatgcatattcatggatttatgatg 224  Q
    | |||||||||||||||| ||||||    
T  16821163 tttgcatattcatggattaatgatg 16821139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 2 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 55316443 - 55316219
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  55316443 tatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattg 55316344  T
Q  102 atgaattt-tgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtt 199  Q
     ||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||| || ||  ||||||| |||||||||||||||      
T  55316343 gtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgataatatgattaatgaataattgcttggg 55316244  T
Q  200 tatgcatattcatggatttatgatg 224  Q
    | |||||||||||||||| ||||||    
T  55316243 tttgcatattcatggattgatgatg 55316219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 41270299 - 41270075
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  41270299 tatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtggaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattg 41270200  T
Q  102 atgaattt-tgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtt 199  Q
     ||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||| || ||  ||||||| |||||||||||||||      
T  41270199 gtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgataatatgattaatgaataattgcttggg 41270100  T
Q  200 tatgcatattcatggatttatgatg 224  Q
    | |||||||||||||||| ||||||    
T  41270099 tttgcatattcatggattgatgatg 41270075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 17912521 - 17912744
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||    
T  17912521 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatt 17912620  T
Q  101 gatgaattttgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtt 199  Q
    |||||| |||| || ||||| ||| ||||||| | |||||| |||||||  |||||||| | |||||||| ||||| |  ||||||||| | ||||||      
T  17912621 gatgaa-tttgatatgttgtagttgaattgagctatgattcatgttcaatcgatgttattgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcactgcttggg 17912719  T
Q  200 tatgcatattcatggatttatgatg 224  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||    
T  17912720 tatgcatattcatgaattgatgatg 17912744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 7 - 217
Target Start/End: Original strand, 13954934 - 13955146
Alignment:
Q  7 ttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaa 106  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||    
T  13954934 ttgtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaaataagtaaaaatgatcagttatgaatattgtgctcaattgatgaa 13955033  T
Q  107 ttt-tgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtttatgc 204  Q
    ||| | |||||||||  |||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||| || ||  ||||||| |||||||||||||||  | |||    
T  13955034 tttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgataatatgattaatgaataattgcttgggtttgc 13955133  T
Q  205 atattcatggatt 217  Q
    |||||||||||||    
T  13955134 atattcatggatt 13955146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 7 - 217
Target Start/End: Original strand, 13975766 - 13975978
Alignment:
Q  7 ttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaa 106  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  13975766 ttgtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaaataagtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaa 13975865  T
Q  107 ttt-tgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtttatgc 204  Q
    ||| | |||||||||  |||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||| || ||  ||||||| |||||||||||||||  | |||    
T  13975866 tttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgataatatgattaatgaataattgcttgggtttgc 13975965  T
Q  205 atattcatggatt 217  Q
    |||||||||||||    
T  13975966 atattcatggatt 13975978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 7 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 45861024 - 45860812
Alignment:
Q  7 ttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaa 106  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  45861024 ttgtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaaataagtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaa 45860925  T
Q  107 ttt-tgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtttatgc 204  Q
    ||| | |||||||||  |||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||| || ||  ||||||| |||||||||||||||  | |||    
T  45860924 tttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgataatatgattaatgaataattgcttgggtttgc 45860825  T
Q  205 atattcatggatt 217  Q
    |||||||||||||    
T  45860824 atattcatggatt 45860812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 16744154 - 16744377
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||  |||     
T  16744154 atatgtttgtatccatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatg 16744253  T
Q  101 gatgaattttgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtt 199  Q
    |||||| ||||  | ||| | ||| ||||||| | |||||||||| ||| ||||||| | |||| ||||  ||||| |  ||||||||| ||||||||      
T  16744254 gatgaa-tttgacatgttatagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataaatgttgtagttgatgaatcattgcttggg 16744352  T
Q  200 tatgcatattcatggatttatgatg 224  Q
    ||| ||| |||||||||| ||||||    
T  16744353 tatacatgttcatggattgatgatg 16744377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Original strand, 2449277 - 2449385
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||  |||     
T  2449277 atatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatg 2449376  T
Q  101 gatgaattt 109  Q
    |||||||||    
T  2449377 gatgaattt 2449385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 54651671 - 54651558
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt-caaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| |||| |||||| ||||| |||||| || ||||| | |||||||| |||||||    
T  54651671 tgcatgaattgatgataattgtatgattgtgagtgaaattgcatgttgcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaattatactcaattggtgaattt 54651573  T
Q  110 tgctaagttgttgtt 124  Q
    || || |||||||||    
T  54651572 tgatatgttgttgtt 54651558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 12 - 124
Target Start/End: Original strand, 11986216 - 11986329
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg--ttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattt 109  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||| | ||||||||||||  || || ||||||  ||||  ||||| || ||||||||||||| |  |||||||    
T  11986216 tgcatgatttaatgataattgtatgattgtggttgaaattacatgttttaaagtatgtattaatgtcaagttatg-aaattgtgctcaaatagtgaattt 11986314  T
Q  110 tgctaagttgttgtt 124  Q
    |||||||||||||||    
T  11986315 tgctaagttgttgtt 11986329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 25058953 - 25058853
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattt 109  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| || ||||| |||| |||||||||| ||    
T  25058953 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatgaaatt 25058855  T
Q  110 tg 111  Q
    ||    
T  25058854 tg 25058853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 49232650 - 49232550
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattt 109  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| || ||||| |||| |||||||||| ||    
T  49232650 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatgaaatt 49232552  T
Q  110 tg 111  Q
    ||    
T  49232551 tg 49232550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 12 - 156
Target Start/End: Original strand, 12264834 - 12264981
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattgatg-aatt 108  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| || | ||| | || |||||||| ||||    
T  12264834 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatg-agattatacttaattgatgaaatt 12264932  T
Q  109 ttgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgtt 156  Q
    ||| || ||||||||| || |||||| |||||| ||||| | |||||||    
T  12264933 ttgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgtt 12264981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 14814788 - 14814912
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctc-a 97  Q
    ||||||||| || |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||  |||||  |||||||||| |    
T  14814788 atatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtg--aattgtgctcaa 14814885  T
Q  98 attgatgaattttgctaagttgttgtt 124  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||||    
T  14814886 attgttgaattgtgctatgttgttgtt 14814912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 110 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 47984765 - 47984650
Alignment:
Q  110 tgctaagttgttgtta-attgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtttatgcatat 208  Q
    |||||||||||||||  |||||||| |||||| ||||||| ||||||| | | |||||||| ||||| |  ||||||||| ||  ||||  |||||||||    
T  47984765 tgctaagttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatat 47984666  T
Q  209 tcatggatttatgatg 224  Q
    ||||| ||| ||||||    
T  47984665 tcatgaattgatgatg 47984650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 110 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 48003339 - 48003224
Alignment:
Q  110 tgctaagttgttgtta-attgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtttatgcatat 208  Q
    |||||||||||||||  |||||||| |||||| ||||||| ||||||| | | |||||||| ||||| |  ||||||||| ||  ||||  |||||||||    
T  48003339 tgctaagttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatat 48003240  T
Q  209 tcatggatttatgatg 224  Q
    ||||| ||| ||||||    
T  48003239 tcatgaattgatgatg 48003224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 86
Target Start/End: Original strand, 4145837 - 4145923
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaatgataagttgtgaa 86  Q
    ||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||  |||||||    
T  4145837 atatgtttgaatacatgaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattacatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaa 4145923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Original strand, 6228648 - 6228771
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctc-a 97  Q
    ||||||||| || |||||| ||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||  |||||  |||||||||| |    
T  6228648 atatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattacatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtg--aattgtgctcta 6228745  T
Q  98 attgatgaattttgctaagttgttgt 123  Q
    | || |||||| ||||| ||||||||    
T  6228746 aatgttgaattgtgctatgttgttgt 6228771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 87
Target Start/End: Original strand, 12902132 - 12902209
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 87  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  12902132 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 12902209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 18911207 - 18911130
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 87  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  18911207 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 18911130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 5228527 - 5228456
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt--caaatatgtaaaaatgataagtt 81  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||   ||||||||| ||||| ||||||    
T  5228527 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaaatatgtataaatgttaagtt 5228456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 110 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 47994052 - 47993937
Alignment:
Q  110 tgctaagttgttgtta-attgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtttatgcatat 208  Q
    |||||||||||||||  |||||||| |||||| ||||||| ||||||| | | |||||||| || || |  ||||||||| ||  ||||  |||||||||    
T  47994052 tgctaagttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgattttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatat 47993953  T
Q  209 tcatggatttatgatg 224  Q
    ||||| ||| ||||||    
T  47993952 tcatgaattgatgatg 47993937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 110 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 48012625 - 48012510
Alignment:
Q  110 tgctaagttgttgtta-attgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtttatgcatat 208  Q
    |||||||||||||||  |||||||| |||||| ||||||| ||||||| | | |||||||| || || |  ||||||||| ||  ||||  |||||||||    
T  48012625 tgctaagttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgattttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatat 48012526  T
Q  209 tcatggatttatgatg 224  Q
    ||||| ||| ||||||    
T  48012525 tcatgaattgatgatg 48012510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 58
Target Start/End: Original strand, 15468382 - 15468428
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 58  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  15468382 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 15468428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 22275423 - 22275377
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 58  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  22275423 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 22275377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 34560123 - 34560061
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 62  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  34560123 atatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaa 34560061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Original strand, 47784789 - 47784851
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 62  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  47784789 atatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 47784851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 16 - 111
Target Start/End: Original strand, 1467785 - 1467881
Alignment:
Q  16 tgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttg 111  Q
    |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| || ||||| |||| |||||||||| ||||    
T  1467785 tgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatgaaatttg 1467881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Original strand, 3576461 - 3576522
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 61  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||    
T  3576461 atatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaa 3576522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 175; Significance: 2e-94; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 3621 - 3843
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3621 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 3720  T
Q  101 gatgaattttgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtt 199  Q
    | | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||      
T  3721 ggtaaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttgtgattgaggaataattgcttggg 3820  T
Q  200 tatgcatattcatggatttatga 222  Q
    |||||||||| ||||||| ||||    
T  3821 tatgcatattgatggattgatga 3843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 1348 - 1124
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1348 atatgttagtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 1249  T
Q  101 gatgaattttgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtt 199  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || || ||||||||||||||||||      
T  1248 ggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatattgtggttgatgaataattgcttggg 1149  T
Q  200 tatgcatattcatggatttatgatg 224  Q
    | |||||||||||| ||| ||||||    
T  1148 tgtgcatattcatgaattgatgatg 1124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 173; Significance: 4e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 48411 - 48187
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48411 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 48312  T
Q  101 gatgaattttgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtt 199  Q
    | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||      
T  48311 ggtgaattttgttaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatagatgttaattgatgttgtgattgatgaataattgcctggg 48212  T
Q  200 tatgcatattcatggatttatgatg 224  Q
    |||||||||||||||||| ||||||    
T  48211 tatgcatattcatggattgatgatg 48187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 169; Significance: 9e-91; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 107971 - 107747
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  107971 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgcaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaatt 107872  T
Q  101 gatgaattttgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtt 199  Q
    | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||      
T  107871 ggtgaattttgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttgtgattgatgaataattgcttggg 107772  T
Q  200 tatgcatattcatggatttatgatg 224  Q
    | |||||||||||||||| ||||||    
T  107771 tttgcatattcatggattgatgatg 107747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 19 - 217
Target Start/End: Original strand, 64573 - 64773
Alignment:
Q  19 attgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattt-tgctaagt 117  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  64573 attgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagt 64672  T
Q  118 tgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtttatgcatattcatggat 216  Q
    ||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||| || || |||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  64673 tgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggat 64772  T
Q  217 t 217  Q
    |    
T  64773 t 64773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 165; Significance: 2e-88; HSPs: 36)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 5 - 224
Target Start/End: Original strand, 43373511 - 43373731
Alignment:
Q  5 gtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattgatg 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  43373511 gtttgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtg 43373610  T
Q  105 aattttgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtttatg 203  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||  ||||    
T  43373611 aattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgctatggttgttaattgatgttgtggttgatgaataattgcttgggtatg 43373710  T
Q  204 catattcatggatttatgatg 224  Q
    |||||||||| ||| ||||||    
T  43373711 catattcatgaattgatgatg 43373731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 16193755 - 16193968
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16193755 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggggaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 16193854  T
Q  101 gatgaattttgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtt 199  Q
    | |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||      
T  16193855 ggtgaattttgccaaattgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 16193954  T
Q  200 tatgcatattcatg 213  Q
    ||||||||||||||    
T  16193955 tatgcatattcatg 16193968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 2 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 24549205 - 24548993
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24549205 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgctcaattg 24549106  T
Q  102 atgaattttgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgttt 200  Q
     |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||| |  ||||||||| ||||||||  |    
T  24549105 gtgaattttgctaagttattgttaatttgggatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgcttgggt 24549006  T
Q  201 atgcatattcatg 213  Q
    |||||||||||||    
T  24549005 atgcatattcatg 24548993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 2 - 213
Target Start/End: Original strand, 6774286 - 6774498
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6774286 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattg 6774385  T
Q  102 atgaattttgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgttt 200  Q
     |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||| || ||||| |  ||||||||| | ||||||  |    
T  6774386 gtgaattttgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggt 6774485  T
Q  201 atgcatattcatg 213  Q
    |||||||||||||    
T  6774486 atgcatattcatg 6774498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 2 - 217
Target Start/End: Original strand, 21844600 - 21844817
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  21844600 tatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattg 21844699  T
Q  102 atgaattt-tgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtt 199  Q
     ||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||||      
T  21844700 gtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatttttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttggg 21844799  T
Q  200 tatgcatattcatggatt 217  Q
    | ||||||||||| ||||    
T  21844800 tttgcatattcattgatt 21844817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 2 - 217
Target Start/End: Original strand, 21851993 - 21852210
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  21851993 tatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattaaatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattg 21852092  T
Q  102 atgaattt-tgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtt 199  Q
     ||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||||      
T  21852093 gtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttggg 21852192  T
Q  200 tatgcatattcatggatt 217  Q
    | ||||||||||| ||||    
T  21852193 tttgcatattcattgatt 21852210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 24928830 - 24929043
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24928830 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 24928929  T
Q  101 gatgaattttgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtt 199  Q
    | ||||||| |||||||||| |||  |||||| | ||  |||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||      
T  24928930 ggtgaatttcgctaagttgtggttggattgagttatgtctcttgttcaattgaggttatggttgttaattgatgttgtgattgatgaatcattgcttggg 24929029  T
Q  200 tatgcatattcatg 213  Q
    ||||||||||||||    
T  24929030 tatgcatattcatg 24929043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 16405014 - 16405235
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16405014 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgttaagttgtgaaaattgtgctcaatt 16405113  T
Q  101 gatgaattttgctaagttgttgttaattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgttt 200  Q
    | ||||||||||||||||||  | |||||| || |||||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||||| |  ||||||||| | ||||||  |    
T  16405114 ggtgaattttgctaagttgt--taaattgacatatgattcttgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttttagttgatgaatcactgcttgggt 16405211  T
Q  201 atgcatattcatggatttatgatg 224  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||    
T  16405212 atgcaaattcatgaattgatgatg 16405235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 2 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 30120946 - 30120722
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattg 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  30120946 tatgtttgtatgcatgaatttatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattg 30120847  T
Q  102 atgaattt-tgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtt 199  Q
     ||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||||      
T  30120846 gtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttggg 30120747  T
Q  200 tatgcatattcatggatttatgatg 224  Q
    | ||||||||||| |||| ||||||    
T  30120746 tttgcatattcatcgattgatgatg 30120722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 2 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 17345792 - 17345581
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattg 101  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  17345792 tatgtttatatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattg 17345693  T
Q  102 atgaattttgctaagttgttgttaattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgttta 201  Q
    ||| ||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||  |||| |||| | |||||||| ||||| |  ||||||||| | ||||||  ||    
T  17345692 atggattttgctaagttattgtgaattgagttatgattcttgttcagttgatattattgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggta 17345593  T
Q  202 tgcatattcatg 213  Q
    ||||||||||||    
T  17345592 tgcatattcatg 17345581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 2 - 224
Target Start/End: Original strand, 16674420 - 16674644
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattg 101  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  16674420 tatgtttttatgcatgaatttatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgcttaattg 16674519  T
Q  102 atgaattt-tgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtt 199  Q
     ||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||| || ||  ||||||| |||||||||||||||      
T  16674520 gtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgataatatgattaatgaataattgcttgag 16674619  T
Q  200 tatgcatattcatggatttatgatg 224  Q
    | |||||||||||||||| ||||||    
T  16674620 tttgcatattcatggattgatgatg 16674644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 37 - 224
Target Start/End: Original strand, 222754 - 222943
Alignment:
Q  37 attgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattt-tgctaagttgttgttaatt-gagatt 134  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||| |     
T  222754 attgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttg 222853  T
Q  135 tgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtttatgcatattcatggatttatgatg 224  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  222854 tgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 222943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 37 - 224
Target Start/End: Original strand, 736377 - 736566
Alignment:
Q  37 attgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattt-tgctaagttgttgttaatt-gagatt 134  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||| |     
T  736377 attgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttg 736476  T
Q  135 tgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtttatgcatattcatggatttatgatg 224  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  736477 tgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 736566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 37 - 224
Target Start/End: Original strand, 860272 - 860461
Alignment:
Q  37 attgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattt-tgctaagttgttgttaatt-gagatt 134  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||| |     
T  860272 attgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttg 860371  T
Q  135 tgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtttatgcatattcatggatttatgatg 224  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  860372 tgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 860461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 22907253 - 22907476
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||  |||     
T  22907253 atatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatg 22907352  T
Q  101 gatgaattttgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtt 199  Q
    |||||||||  | | ||||| ||| ||||||| | |||||||||| ||| ||||||| | |||| ||||  ||||| |  ||||||||| ||||||||      
T  22907353 gatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcattgcttggg 22907451  T
Q  200 tatgcatattcatggatttatgatg 224  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||    
T  22907452 tatacatattcatggattgatgatg 22907476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 5238311 - 5238203
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||  |||     
T  5238311 atatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatg 5238212  T
Q  101 gatgaattt 109  Q
    |||||||||    
T  5238211 gatgaattt 5238203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Original strand, 24661287 - 24661395
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||  |||     
T  24661287 atatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatg 24661386  T
Q  101 gatgaattt 109  Q
    |||||||||    
T  24661387 gatgaattt 24661395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 43685770 - 43685662
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||  |||     
T  43685770 atatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatg 43685671  T
Q  101 gatgaattt 109  Q
    |||||||||    
T  43685670 gatgaattt 43685662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 95
Target Start/End: Original strand, 691909 - 691967
Alignment:
Q  37 attgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgct 95  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  691909 attgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgct 691967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 111
Target Start/End: Original strand, 22006300 - 22006400
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattt 109  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| || ||||| |||| |||||||||| ||    
T  22006300 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatgaaatt 22006398  T
Q  110 tg 111  Q
    ||    
T  22006399 tg 22006400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 33172452 - 33172328
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctc-a 97  Q
    ||||||||| || |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||  |||||  |||||||||| |    
T  33172452 atatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtg--aattgtgctcta 33172355  T
Q  98 attgatgaattttgctaagttgttgtt 124  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||||    
T  33172354 attgttgaattgtgctatgttgttgtt 33172328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 26011718 - 26011656
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 62  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  26011718 atatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattacatgttcaaa 26011656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 87
Target Start/End: Original strand, 13720970 - 13721047
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 87  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  13720970 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 13721047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 87
Target Start/End: Original strand, 16873093 - 16873170
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 87  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  16873093 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 16873170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 128
Target Start/End: Original strand, 24552611 - 24552721
Alignment:
Q  18 aattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctc-aattgatgaattttgctaa 115  Q
    ||||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||  |||||  |||||||||| ||||| |||||| || ||     
T  24552611 aattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtg--aattgtgctctaattgttgaattgtgttat 24552708  T
Q  116 gttgttgttaatt 128  Q
    |||||||||||||    
T  24552709 gttgttgttaatt 24552721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 16195445 - 16195298
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattgatg-aatt 108  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| || | ||| | || |||| ||| ||||    
T  16195445 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatg-agattatacttaatttatgaaatt 16195347  T
Q  109 ttgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgtt 156  Q
    ||| || ||||||||| || |||||| |||||| ||||| | |||||||    
T  16195346 ttgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgtt 16195298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 22742988 - 22742864
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctc-a 97  Q
    |||||||||  |||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||  |||||  |||||||||| |    
T  22742988 atatgtttgagtgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtg--aattgtgctcta 22742891  T
Q  98 attgatgaattttgctaagttgttgtt 124  Q
    | || |||||| ||||| |||||||||    
T  22742890 aatgttgaattgtgctatgttgttgtt 22742864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 24 - 124
Target Start/End: Original strand, 45558984 - 45559084
Alignment:
Q  24 tgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctc-aattgatgaattttgctaagttgtt 121  Q
    ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||  |||||  |||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||    
T  45558984 tgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtg--aattgtgctctaattgttgaattgtgctatgttgtt 45559081  T
Q  122 gtt 124  Q
    |||    
T  45559082 gtt 45559084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 111
Target Start/End: Original strand, 13662307 - 13662407
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattt 109  Q
    |||||||||  ||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| || ||||| |||| |||||||||| ||    
T  13662307 tgcatgaatgnatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatgaaatt 13662405  T
Q  110 tg 111  Q
    ||    
T  13662406 tg 13662407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 15933522 - 15933460
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 62  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  15933522 atatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaa 15933460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 16 - 111
Target Start/End: Original strand, 271406 - 271502
Alignment:
Q  16 tgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttg 111  Q
    |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| || ||||| |||| |||||||||| ||||    
T  271406 tgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatgaaatttg 271502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 16 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 644514 - 644418
Alignment:
Q  16 tgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttg 111  Q
    |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| || ||||| |||| |||||||||| ||||    
T  644514 tgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatgaaatttg 644418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 16 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 830249 - 830153
Alignment:
Q  16 tgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttg 111  Q
    |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| || ||||| |||| |||||||||| ||||    
T  830249 tgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatgaaatttg 830153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 18 - 124
Target Start/End: Original strand, 18261512 - 18261618
Alignment:
Q  18 aattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctc-aattgatgaattttgctaa 115  Q
    ||||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||| |||| | ||||| |||||||||  |||||  |||||||||| ||||| |||||| |||||     
T  18261512 aattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatcttcatagtatgtgaaaatgatatattgtg--aattgtgctctaattgttgaattgtgctat 18261609  T
Q  116 gttgttgtt 124  Q
    |||||||||    
T  18261610 gttgttgtt 18261618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 16 - 111
Target Start/End: Original strand, 22088840 - 22088936
Alignment:
Q  16 tgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttg 111  Q
    |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| || ||||| |||| |||||||||| ||||    
T  22088840 tgaattgatgattatggtatgtttataggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatgaaatttg 22088936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 86
Target Start/End: Original strand, 37653642 - 37653726
Alignment:
Q  4 tgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaatgataagttgtgaa 86  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||| ||||||| |||||||| | ||||| |||||||||  |||||||    
T  37653642 tgtttgtatgcatgaatttggtgataattgaattgttgttgctgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaa 37653726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 164; Significance: 9e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 2 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 9101 - 8878
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattg 101  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9101 tatgtttgtatgcatgaatcgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgttaagttgtgaaaattgtgctcaattg 9002  T
Q  102 atgaattttgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgttt 200  Q
     ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  |    
T  9001 gtgaattttgttaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttgtgattgatgaataattgcttgggt 8902  T
Q  201 atgcatattcatggatttatgatg 224  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||    
T  8901 atgcatattcatgtattgatgatg 8878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 164; Significance: 9e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 12337 - 12115
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12337 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaaatacatgtttaaatgtgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctaaatt 12238  T
Q  101 gatgaattttgctaagttgttgttaattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgttt 200  Q
    | ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |    
T  12237 ggtgaattttgttaagttgttg-taattgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttatgattcatgaataattgcttgggt 12139  T
Q  201 atgcatattcatggatttatgatg 224  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  12138 atgcatattcatggattgatgatg 12115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 161; Significance: 5e-86; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 148945 - 148721
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  148945 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 148846  T
Q  101 gatgaattttgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtt 199  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||| || ||||||||| ||||||||      
T  148845 ggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgaagttgtggttgatgaatcattgcttggg 148746  T
Q  200 tatgcatattcatggatttatgatg 224  Q
    |||| ||||||||| ||| ||||||    
T  148745 tatgtatattcatgaattgatgatg 148721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 9073 - 8849
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  9073 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaatt 8974  T
Q  101 gatgaattttgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtt 199  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||| ||||||||| | | |||||| ||||| |  ||||||||| ||||||||      
T  8973 ggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattaatgttcaattgatgttattgctattaattgatgttgttgttgatgaatcattgcttggg 8874  T
Q  200 tatgcatattcatggatttatgatg 224  Q
    ||| |||||||||| ||| ||||||    
T  8873 tatacatattcatgaattgatgatg 8849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 53570 - 53508
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatga-attgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 62  Q
    ||||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  53570 atatgtttgaatgcatgatattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaa 53508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 158; Significance: 3e-84; HSPs: 20)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 22228022 - 22227809
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| |||||||||    
T  22228022 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgtccaattgttgaattttg 22227923  T
Q  112 ctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtttatgcatattc 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  22227922 ctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattc 22227823  T
Q  211 atggatttatgatg 224  Q
    ||||||| ||||||    
T  22227822 atggattgatgatg 22227809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 22232719 - 22232506
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| |||||||||    
T  22232719 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgtccaattgttgaattttg 22232620  T
Q  112 ctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtttatgcatattc 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  22232619 ctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattc 22232520  T
Q  211 atggatttatgatg 224  Q
    ||||||| ||||||    
T  22232519 atggattgatgatg 22232506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 20931569 - 20931345
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  20931569 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcatatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgctaaatt 20931470  T
Q  101 gatgaattttgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtt 199  Q
    | ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||      
T  20931469 ggtgaattttgctaaattgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaataatttcttggg 20931370  T
Q  200 tatgcatattcatggatttatgatg 224  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||    
T  20931369 tatgcatattcatgaattaatgatg 20931345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 2116478 - 2116265
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2116478 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgctcaattg 2116379  T
Q  102 atgaattttgctaagttgttgttaa-ttgaga-tttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtt 199  Q
     |||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||| |  ||||||||| ||||||||      
T  2116378 gtgaattttgctaagttattgttaatttgatattttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgcttggg 2116279  T
Q  200 tatgcatattcatg 213  Q
    ||||||||||||||    
T  2116278 tatgcatattcatg 2116265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 20913254 - 20913037
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20913254 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcatatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgctcaatt 20913155  T
Q  101 gatgaattttgctaagttgttgttaattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgttt 200  Q
    | |||||||||| ||||||||||||      ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || || ||||||||||||||||||  |    
T  20913154 ggtgaattttgcaaagttgttgtta------atttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatcttgtggttgatgaataattgcttgggt 20913061  T
Q  201 atgcatattcatggatttatgatg 224  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||    
T  20913060 atgcatattcatgaattgatgatg 20913037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 41394446 - 41394222
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41394446 atatgtttgtatgcataaattgatgataattgtatgattgttggtgaagttacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 41394347  T
Q  101 gatgaattttgctaagttgttgtta-attgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtt 199  Q
    | |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||| || ||||| |  ||||||||| | || |||      
T  41394346 ggtgaattttgctaagttattgttatgttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactgattggg 41394247  T
Q  200 tatgcatattcatggatttatgatg 224  Q
    |||||||||||||||||| ||||||    
T  41394246 tatgcatattcatggattgatgatg 41394222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 20893665 - 20893877
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20893665 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttgttgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 20893764  T
Q  101 gatgaattttgctaagttgttgtta-attgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtt 199  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||| || ||||||||| |||| |||      
T  20893765 ggtgaattttgctaagttgttgttagattgatttatgattcttgttcaattgatgttatgactgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgtttggg 20893864  T
Q  200 tatgcatattcat 212  Q
    |||||||||||||    
T  20893865 tatgcatattcat 20893877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 20445903 - 20445690
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20445903 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaatgataagtggtgaaaattgtgctcaatt 20445804  T
Q  101 gatgaattttgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtt 199  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||| |  ||||||||| ||||||||      
T  20445803 ggtgaattttgctaagttgttgttgaattgtgttatgattcttgatcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgcttggg 20445704  T
Q  200 tatgcatattcatg 213  Q
    ||||||||||||||    
T  20445703 tatgcatattcatg 20445690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 20531668 - 20531455
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20531668 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaatgataagtggtgaaaattgtgctcaatt 20531569  T
Q  101 gatgaattttgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtt 199  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||| |  ||||||||| ||||||||      
T  20531568 ggtgaattttgctaagttgttgttgaattgtgttatgattcttgatcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgcttggg 20531469  T
Q  200 tatgcatattcatg 213  Q
    ||||||||||||||    
T  20531468 tatgcatattcatg 20531455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 37844489 - 37844703
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgat-aagttgtgaaaattgtgctcaat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | ||||||| || | ||||||||||||||||||    
T  37844489 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaatgataaaatagtgaaaattgtgctcaat 37844588  T
Q  100 tgatgaattttgctaagttgttgtta-attgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgt 198  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||| | ||||||||     
T  37844589 taatgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgagtcattgcttgg 37844688  T
Q  199 ttatgcatattcatg 213  Q
     ||||||||||||||    
T  37844689 gtatgcatattcatg 37844703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 5 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 45051643 - 45051489
Alignment:
Q  5 gtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattgatg 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  45051643 gtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtg 45051544  T
Q  105 aattttgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttat 158  Q
    |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  45051543 aattttgctaagttatggttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttat 45051489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 2 - 224
Target Start/End: Original strand, 18601146 - 18601370
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  18601146 tatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattg 18601245  T
Q  102 atgaattt-tgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtt 199  Q
     ||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||| || ||  ||||||| |||||||||||||||      
T  18601246 gtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgataatatgattaatgaataattgcttggg 18601345  T
Q  200 tatgcatattcatggatttatgatg 224  Q
    | |||||||||||||||| ||||||    
T  18601346 tttgcatattcatggattgatgatg 18601370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 224
Target Start/End: Original strand, 5072416 - 5072640
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattg 101  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  5072416 tatgtttatatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattg 5072515  T
Q  102 atgaattt-tgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtt 199  Q
     ||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||| || ||  ||||||| |||||||||||||||      
T  5072516 gtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgataatatgattaatgaataattgcttggg 5072615  T
Q  200 tatgcatattcatggatttatgatg 224  Q
    | |||||||||||||||| ||||||    
T  5072616 tttgcatattcatggattgatgatg 5072640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 51452716 - 51452608
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||  |||     
T  51452716 atatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatg 51452617  T
Q  101 gatgaattt 109  Q
    |||||||||    
T  51452616 gatgaattt 51452608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 17148781 - 17148704
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 87  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  17148781 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 17148704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 111
Target Start/End: Original strand, 18059800 - 18059900
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattt 109  Q
    |||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| || ||||| |||| |||||||||| ||    
T  18059800 tgcatgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatgaaatt 18059898  T
Q  110 tg 111  Q
    ||    
T  18059899 tg 18059900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 21195238 - 21195114
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctc-a 97  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  ||||||||||||||  ||||||| | ||||| |||||||||  |||||  |||| ||||| |    
T  21195238 atatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgtatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtg--aattatgctcaa 21195141  T
Q  98 attgatgaattttgctaagttgttgtt 124  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||||    
T  21195140 attgttgaattgtgctaggttgttgtt 21195114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 18 - 128
Target Start/End: Original strand, 5768210 - 5768320
Alignment:
Q  18 aattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctc-aattgatgaattttgctaa 115  Q
    ||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||  ||||||| | ||||| |||||||||  |||||  |||||||||| ||||| |||||| || ||     
T  5768210 aattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgtatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtg--aattgtgctctaattgttgaattgtgttat 5768307  T
Q  116 gttgttgttaatt 128  Q
    |||||||||||||    
T  5768308 gttgttgttaatt 5768320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 16 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 17004848 - 17004752
Alignment:
Q  16 tgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttg 111  Q
    |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| || ||||| |||| |||||||||| ||||    
T  17004848 tgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatgaaatttg 17004752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 16 - 111
Target Start/End: Original strand, 38055137 - 38055233
Alignment:
Q  16 tgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttg 111  Q
    |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| || ||||| |||| |||||||||| ||||    
T  38055137 tgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatgaaatttg 38055233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 153; Significance: 3e-81; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 2 - 213
Target Start/End: Original strand, 9377 - 9589
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9377 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgctcaattg 9476  T
Q  102 atgaattttgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgttt 200  Q
     |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||| |  ||||||||| ||||||||  |    
T  9477 gtgaattttgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaaatgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgcttgggt 9576  T
Q  201 atgcatattcatg 213  Q
    |||||||||||||    
T  9577 atgcatattcatg 9589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 2 - 213
Target Start/End: Original strand, 16275 - 16487
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16275 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgctcaattg 16374  T
Q  102 atgaattttgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgttt 200  Q
     |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||| |  ||||||||| ||||||||  |    
T  16375 gtgaattttgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaaatgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgcttgggt 16474  T
Q  201 atgcatattcatg 213  Q
    |||||||||||||    
T  16475 atgcatattcatg 16487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 128208 - 128431
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  128208 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaaggtgttaagttgtgaaaattgtgctcaatt 128307  T
Q  101 gatgaattttgctaagttgttgttaattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgttt 200  Q
    |  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||  |    
T  128308 ggcgaattttgttaggttgttgttaattgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaatggatgttgtgattgatgaataattgattgggt 128407  T
Q  201 atgcatattcatggatttatgatg 224  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||    
T  128408 atgcatattcatgaattgatgatg 128431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 2 - 224
Target Start/End: Original strand, 31703 - 31928
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattg 101  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  31703 tatgtttgaatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatattcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgctcaattg 31802  T
Q  102 atgaattt-tgct-aagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgt 198  Q
     ||||||| | || ||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||||     
T  31803 gtgaatttctcctaaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttaatattatgattgatgaataattgcttgg 31902  T
Q  199 ttatgcatattcatggatttatgatg 224  Q
     | |||||||||||||||| ||||||    
T  31903 gtttgcatattcatggattaatgatg 31928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 5254 - 5466
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttg 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  5254 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattggtgaattttg 5353  T
Q  112 ctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtttatgcatattc 210  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||  | |||||||||    
T  5354 ctgagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttgtgattaatgaataattgcttgggt-tgcatattc 5452  T
Q  211 atggatttatgatg 224  Q
    ||||||| ||||||    
T  5453 atggattgatgatg 5466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 34)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 462962 - 462749
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  462962 atatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgttcaatt 462863  T
Q  101 gatgaattttgctaagttgttgtta-attgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtt 199  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||| ||||||||      
T  462862 ggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgtcgtgattgatgaatcattgcttggg 462763  T
Q  200 tatgcatattcatg 213  Q
    ||||||||||||||    
T  462762 tatgcatattcatg 462749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 8891466 - 8891253
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8891466 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggcgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 8891367  T
Q  101 gatgaattttgctaagttgttgtta-attgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtt 199  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||||||||||| | |||||| ||||| || ||||||||| ||||||||      
T  8891366 ggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctattaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 8891267  T
Q  200 tatgcatattcatg 213  Q
    ||||||||||||||    
T  8891266 tatgcatattcatg 8891253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 19794743 - 19794967
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19794743 atatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 19794842  T
Q  101 gatgaattttgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtt 199  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||||    ||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||      
T  19794843 ggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagttatgattcttgttcaattgatgttatttccgttaattgatgttatagttgatgaatcattgcttggg 19794942  T
Q  200 tatgcatattcatggatttatgatg 224  Q
    |||||||||||||||||| ||||||    
T  19794943 tatgcatattcatggattgatgatg 19794967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 20627352 - 20627565
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20627352 atatgtttgtatgcacgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtccaaatatgtaaaaatgataacttgtgaaaattgtgctcaatt 20627451  T
Q  101 gatgaattttgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtt 199  Q
    | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||  |||| || ||||||||| ||||||||      
T  20627452 ggtgaattttgttaagttgttgttaatttgagatttaattcttgttcaattgattttatggttgttaattggtgttgtggttgatgaatcattgcttggg 20627551  T
Q  200 tatgcatattcatg 213  Q
    |||| |||||||||    
T  20627552 tatggatattcatg 20627565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 24341428 - 24341652
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  24341428 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattatatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaatt 24341527  T
Q  101 gatgaattttgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtt 199  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| | |||||||| |||||    ||||||||| ||||||||      
T  24341528 ggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttcctgttgatgaatcattgcttggg 24341627  T
Q  200 tatgcatattcatggatttatgatg 224  Q
    ||| |||||||||| ||| ||||||    
T  24341628 tatacatattcatgaattgatgatg 24341652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 36982480 - 36982704
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36982480 atatgtttgtattcatgaattgatgataattgtaagattgctggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 36982579  T
Q  101 gatgaattttgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtt 199  Q
    | |||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||| ||||||||| | |||||||| ||||| |  ||||||||| |||| |||      
T  36982580 ggtgaattttgccaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcattgtttggg 36982679  T
Q  200 tatgcatattcatggatttatgatg 224  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||    
T  36982680 tatgcatattcatgaattgatgatg 36982704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 43642996 - 43643220
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43642996 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgttaagttgtgaaaattgtgctcaatt 43643095  T
Q  101 gatgaattttgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtt 199  Q
    | |||||||| || ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||| | |||||||| ||||| |  ||||||||| | ||||||      
T  43643096 ggtgaatttttcttagttgttattaatttgagatatgattcttgttcaattgatgctattgctgttaattgatgttgtagttgatgaatcactgcttggg 43643195  T
Q  200 tatgcatattcatggatttatgatg 224  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||    
T  43643196 tatgcatattcatgaattgatgatg 43643220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 7507894 - 7508107
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttg 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |    
T  7507894 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttatgaaaattgtgttcaattggtgaatttgg 7507993  T
Q  112 ctaagttgttgttaattgagatttgattcttg-ttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtttatgcatattc 210  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| || || || ||||||||| | ||||| || ||||| |  ||||||||| | ||||||  |||||||||||    
T  7507994 ctaagttgttgttaattgagatatgattcatgttttaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattc 7508093  T
Q  211 atggatttatgatg 224  Q
    ||||||| ||||||    
T  7508094 atggattgatgatg 7508107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 224
Target Start/End: Original strand, 19886689 - 19886913
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||| |||||||| || ||    
T  19886689 tatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtg 19886788  T
Q  102 atgaattt-tgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtt 199  Q
     ||||||| | ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||||      
T  19886789 gtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttggg 19886888  T
Q  200 tatgcatattcatggatttatgatg 224  Q
    |||||||||||||||||| ||||||    
T  19886889 tatgcatattcatggattgatgatg 19886913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 7 - 217
Target Start/End: Original strand, 17396697 - 17396909
Alignment:
Q  7 ttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaa 106  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  17396697 ttgtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaataagtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaa 17396796  T
Q  107 ttt-tgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtttatgc 204  Q
    ||| | |||||||||  |||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||| || || |||||||| ||| |||||||||||  | |||    
T  17396797 tttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattaatggataattgcttgggtttgc 17396896  T
Q  205 atattcatggatt 217  Q
    |||||||||||||    
T  17396897 atattcatggatt 17396909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 2 - 224
Target Start/End: Original strand, 25265430 - 25265653
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  25265430 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattg 25265529  T
Q  102 atgaattttgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgttt 200  Q
     |||||||||||| ||||||||| ||||  |||  ||  | ||||||| ||||||| | | |||||||| ||||| |  || |||||| || |||||  |    
T  25265530 gtgaattttgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgttaattgatgttgttgtttatgaatcatggcttgggt 25265629  T
Q  201 atgcatattcatggatttatgatg 224  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||    
T  25265630 atgcatattcatgaattgatgatg 25265653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Original strand, 19689440 - 19689548
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||  |||     
T  19689440 atatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatg 19689539  T
Q  101 gatgaattt 109  Q
    |||||||||    
T  19689540 gatgaattt 19689548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 23820295 - 23820187
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||  |||     
T  23820295 atatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatg 23820196  T
Q  101 gatgaattt 109  Q
    |||||||||    
T  23820195 gatgaattt 23820187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Original strand, 14906479 - 14906587
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||  |||     
T  14906479 atatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatg 14906578  T
Q  101 gatgaattt 109  Q
    |||||||||    
T  14906579 gatgaattt 14906587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 20015235 - 20015127
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||  |||     
T  20015235 atatgtttgcatgcatgaattgataataattgtgtgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatg 20015136  T
Q  101 gatgaattt 109  Q
    |||||||||    
T  20015135 gatgaattt 20015127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 87
Target Start/End: Original strand, 3798645 - 3798722
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 87  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  3798645 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 3798722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 87
Target Start/End: Original strand, 12635910 - 12635987
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 87  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  12635910 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 12635987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 12728606 - 12728529
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 87  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  12728606 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 12728529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 34824689 - 34824612
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 87  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  34824689 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 34824612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 9636969 - 9636845
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctc-a 97  Q
    ||||||||| || |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||  |||||  |||| ||||| |    
T  9636969 atatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtg--aattatgctcta 9636872  T
Q  98 attgatgaattttgctaagttgttgtt 124  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||||    
T  9636871 attgttgaattgtgctatgttgttgtt 9636845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Original strand, 19669132 - 19669191
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttc 59  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |  |||||||||||||| |||||||    
T  19669132 atatgtttgtatgcatgaaattgatgataattgagttgttgttggtgaaattgcatgttc 19669191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 87
Target Start/End: Original strand, 23778085 - 23778164
Alignment:
Q  10 tatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 87  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| |||| | |||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  23778085 tatgcatgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 23778164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 24884910 - 24884848
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 62  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  24884910 atatgtttgaatgcatggaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaa 24884848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 68215 - 68154
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 62  Q
    |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  68215 tatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 68154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 12 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 8944060 - 8943983
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 87  Q
    |||||||||||||||| || ||||  |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  8944060 tgcatgaattgatgattatggtatatttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 8943983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 16 - 111
Target Start/End: Original strand, 11231384 - 11231480
Alignment:
Q  16 tgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttg 111  Q
    |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| || ||||| |||| |||||||||| ||||    
T  11231384 tgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatgaaatttg 11231480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 12 - 87
Target Start/End: Original strand, 12641684 - 12641761
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 87  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| | |||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  12641684 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtggctgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 12641761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 12 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 16935807 - 16935730
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 87  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||  ||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  16935807 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgcgtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 16935730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 12 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 17006467 - 17006390
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 87  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||  ||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  17006467 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgcgtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 17006390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 16 - 111
Target Start/End: Original strand, 22513231 - 22513327
Alignment:
Q  16 tgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttg 111  Q
    |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| || ||||| |||| |||||||||| ||||    
T  22513231 tgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatgaaatttg 22513327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 16 - 111
Target Start/End: Original strand, 24685827 - 24685923
Alignment:
Q  16 tgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttg 111  Q
    |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| || ||||| |||| |||||||||| ||||    
T  24685827 tgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatgaaatttg 24685923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 16 - 111
Target Start/End: Original strand, 28775853 - 28775949
Alignment:
Q  16 tgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttg 111  Q
    |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| || ||||| |||| |||||||||| ||||    
T  28775853 tgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatgaaatttg 28775949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 12 - 87
Target Start/End: Original strand, 42178011 - 42178088
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 87  Q
    |||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  42178011 tgcatgaattgatgattatggtatgtttttgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 42178088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 19660104 - 19660044
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca 60  Q
    ||||||| |||| |||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||    
T  19660104 atatgttcgtatacatgaaattggtgataattgaattattgttggtgaaattgcatgttca 19660044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 149; Significance: 8e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 19430 - 19206
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19430 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 19331  T
Q  101 gatgaattttgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtt 199  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||| ||||||||| | |||||||| ||||| |  ||||||||| ||||||||      
T  19330 ggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgaatcattgcttggg 19231  T
Q  200 tatgcatattcatggatttatgatg 224  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||    
T  19230 tatgcatattcatgaattgatgatg 19206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 21514 - 21290
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21514 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 21415  T
Q  101 gatgaattttgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtt 199  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||| ||||||||| | |||||||| ||||| |  ||||||||| ||||||||      
T  21414 ggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgaatcattgcttggg 21315  T
Q  200 tatgcatattcatggatttatgatg 224  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||    
T  21314 tatgcatattcatgaattgatgatg 21290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 3936 - 3722
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaa-tgataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaatttt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||  |||||| ||||||||    
T  3936 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaaatgataagttatggaaattgtgtccaattggtgaatttt 3837  T
Q  111 gctaagttgttgttaatt-gagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtttatgcatatt 209  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  | ||||||||    
T  3836 gctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttatgattgatgaataattacttgggtttgcatatt 3737  T
Q  210 catggatttatgatg 224  Q
    |||||||| ||||||    
T  3736 catggattgatgatg 3722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 146; Significance: 5e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 5100 - 5313
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5100 atatgtttgtatgcgtgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaagtacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 5199  T
Q  101 gatgaattttgctaagttgttgtta-attgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtt 199  Q
    | |||||||||| |||||||||||| | |||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||      
T  5200 ggtgaattttgcaaagttgttgttagaatgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtgattgatgaatcattgcttggg 5299  T
Q  200 tatgcatattcatg 213  Q
    ||||||||||||||    
T  5300 tatgcatattcatg 5313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 146; Significance: 5e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 123203 - 123416
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  123203 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 123302  T
Q  101 gatgaattttgctaagttgttgtta-attgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtt 199  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||| |||||      
T  123303 ggtgaattttgctaagttgttgttagattaagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaataatggcttggg 123402  T
Q  200 tatgcatattcatg 213  Q
    ||||||||||||||    
T  123403 tatgcatattcatg 123416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 146; Significance: 5e-77; HSPs: 29)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 13246654 - 13246441
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13246654 atatgtttgtatgcatgaattaatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 13246555  T
Q  101 gatgaattttgctaagttgttgtta-attgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtt 199  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||      
T  13246554 ggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 13246455  T
Q  200 tatgcatattcatg 213  Q
    ||||||||||||||    
T  13246454 tatgcatattcatg 13246441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 15675128 - 15675352
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  15675128 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaatt 15675227  T
Q  101 gatgaattttgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtt 199  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| | |||||||| ||||| |  ||||||||| ||||||||      
T  15675228 ggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcattgcttggg 15675327  T
Q  200 tatgcatattcatggatttatgatg 224  Q
    ||| |||||||||| ||| ||||||    
T  15675328 tatacatattcatgaattgatgatg 15675352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 54118283 - 54118507
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  54118283 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaattgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 54118382  T
Q  101 gatgaattttgctaagttgttgtta-attgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtt 199  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||      
T  54118383 ggtgaattttgctaagttgttgttagatttagttatgattcttgttcaattgatgttatagttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 54118482  T
Q  200 tatgcatattcatggatttatgatg 224  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||    
T  54118483 tatgcatattcatgaattgatgatg 54118507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 10644443 - 10644219
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  |||||||| |||||    
T  10644443 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattg 10644344  T
Q  102 atgaattt-tgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtt 199  Q
     ||||||| | ||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||||      
T  10644343 gtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttggg 10644244  T
Q  200 tatgcatattcatggatttatgatg 224  Q
    | |||||||||||||||| ||||||    
T  10644243 tttgcatattcatggattgatgatg 10644219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 31115853 - 31115629
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  31115853 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttccattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattatgctcaatt 31115754  T
Q  101 gatgaattttgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtt 199  Q
    | |||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| | |||||||| ||||| |  ||||||||| ||||||||      
T  31115753 ggtgaattttcctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcattgcttggg 31115654  T
Q  200 tatgcatattcatggatttatgatg 224  Q
    ||| |||||||||| ||| ||||||    
T  31115653 tatacatattcatgaattgatgatg 31115629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 10104289 - 10104445
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  10104289 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaatt 10104388  T
Q  101 gatgaattttgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgtt 156  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  10104389 ggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgtt 10104445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 13048260 - 13048477
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||    
T  13048260 atatgtttgtatgcatgatttgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaaggataagttatgaatattgtgctcaatt 13048359  T
Q  101 gatgaattt-tgctaagttgttgtta-attgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgt 198  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||| |  ||  ||||||| |||||||||||||||     
T  13048360 gatgaatttctcctaagttgttgttagtttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttattagataatatgattaatgaataattgcttgg 13048459  T
Q  199 ttatgcatattcatggat 216  Q
     | |||||||||||||||    
T  13048460 gtttgcatattcatggat 13048477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 122113 - 121989
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  122113 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 122014  T
Q  101 gatgaattttgctaagttgttgtta 125  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  122013 ggtgaattttgctaagttgttgtta 121989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 2 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 47357878 - 47357654
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattg 101  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  47357878 tatgtttgtatgcatggattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattg 47357779  T
Q  102 atgaattt-tgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtt 199  Q
     ||||||| | ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||| |||      
T  47357778 gtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgattggg 47357679  T
Q  200 tatgcatattcatggatttatgatg 224  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||    
T  47357678 tatgtatattcatggattgatgatg 47357654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 26680424 - 26680201
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||  |||     
T  26680424 atatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaata 26680325  T
Q  101 gatgaattttgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtt 199  Q
    |||||||||  | | ||||| ||| ||||||| | |||||||||| ||| ||||||| | |||| ||||  ||||| |  ||||||||| ||||||||      
T  26680324 gatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcattgcttggg 26680226  T
Q  200 tatgcatattcatggatttatgatg 224  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||    
T  26680225 tatacatattcatggattgatgatg 26680201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 156
Target Start/End: Original strand, 40885594 - 40885749
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||| || ||||| |||||||||    
T  40885594 tatgtttgtatgcatgaattggtgataattgaatgtttgttggtgaaattacatgttcaaagtatgtataaatgtcaagttatg-aaattatgctcaatt 40885692  T
Q  101 gatgaattttgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgtt 156  Q
    | |||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  40885693 ggtgaactttgctaagttattgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgtt 40885749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 10488786 - 10488678
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||  |||     
T  10488786 atatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatg 10488687  T
Q  101 gatgaattt 109  Q
    |||||||||    
T  10488686 gatgaattt 10488678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Original strand, 16327965 - 16328073
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||  |||     
T  16327965 atatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatg 16328064  T
Q  101 gatgaattt 109  Q
    |||||||||    
T  16328065 gatgaattt 16328073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 126 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 111493 - 111406
Alignment:
Q  126 attgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtttatgcatattcatg 213  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  111493 attgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatg 111406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 7850223 - 7850090
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattg 101  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||| || ||| |||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||| ||    
T  7850223 tatgtttgaatgaatgtattgatgaaaactgtgtgattgttggtggaattgtatgtccaattatgtgaaaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaagtg 7850124  T
Q  102 atg-aattttgctaagttgttgtt-aattgagat 133  Q
    ||| |||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  7850123 atgaaattttgctaagtgattgttgaattgagat 7850090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 156
Target Start/End: Original strand, 17145701 - 17145845
Alignment:
Q  14 catgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttg 111  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||  |||||||||    
T  17145701 catgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttgtg-aaattatactcaattagtgaattttg 17145799  T
Q  112 ctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgtt 156  Q
     || ||||||||| || |||||| |||||| ||||| | |||||||    
T  17145800 atatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgtt 17145845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 12 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 8374722 - 8374576
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattt 109  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| || ||||| | |||||||  |||||||    
T  8374722 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgcttcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaattatactcaattagtgaattt 8374624  T
Q  110 tgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgtt 156  Q
    |  || ||||||||| || |||||| |||||| ||||| | |||||||    
T  8374623 taatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgtt 8374576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 22738483 - 22738390
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattgatg 104  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  22738483 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttgtg-aaattatgcttaattgatg 22738390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 18169184 - 18169084
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattt 109  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| || ||||| |||| |||||||||| ||    
T  18169184 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatgaaatt 18169086  T
Q  110 tg 111  Q
    ||    
T  18169085 tg 18169084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 18238180 - 18238304
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatga-attgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctc-a 97  Q
    ||||||||| || ||||| |||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||  |||||  |||||||||| |    
T  18238180 atatgtttgaatacatgatattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtg--aattgtgctcta 18238277  T
Q  98 attgatgaattttgctaagttgttgtt 124  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||||    
T  18238278 attgttgaattgtgctatgttgttgtt 18238304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 87
Target Start/End: Original strand, 7132107 - 7132184
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 87  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  7132107 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 7132184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 19020700 - 19020623
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 87  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  19020700 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 19020623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 2 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 15045051 - 15044895
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctc-aa 98  Q
    |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||| ||||  ||| |||||  |  ||  |||| ||||| ||    
T  15045051 tatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttg--aattatgctcaaa 15044954  T
Q  99 ttgatgaattttgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgtt 156  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||  ||||| ||||||| |||||||    
T  15044953 ttgatgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgtt 15044895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 38764933 - 38764809
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctc-a 97  Q
    ||||||||| ||| ||||| ||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||  |||||  |||||||||| |    
T  38764933 atatgtttgaatgaatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattacatgttcatagtatgtgaaaatgttatattgtg--aattgtgctcaa 38764836  T
Q  98 attgatgaattttgctaagttgttgtt 124  Q
    |||| |||||| ||| | |||||||||    
T  38764835 attgttgaattatgcgatgttgttgtt 38764809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Complemental strand, 33240924 - 33240890
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtat 35  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33240924 atatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtat 33240890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 18 - 124
Target Start/End: Original strand, 15013323 - 15013429
Alignment:
Q  18 aattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctc-aattgatgaattttgctaa 115  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||| |  |||||  |||| ||||| ||||| |||||| |||||     
T  15013323 aattgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgacatattgtg--aattatgctcaaattgttgaattgtgctag 15013420  T
Q  116 gttgttgtt 124  Q
    |||||||||    
T  15013421 gttgttgtt 15013429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 62
Target Start/End: Original strand, 15109373 - 15109434
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 62  Q
    |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  15109373 tatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 15109434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 12 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 20000937 - 20000860
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 87  Q
    |||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  20000937 tgcatgaattgatgattatggtatgtttctgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 20000860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 18 - 124
Target Start/End: Original strand, 41256410 - 41256516
Alignment:
Q  18 aattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctc-aattgatgaattttgctaa 115  Q
    ||||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||  |||||  |||| ||||| ||||| |||||| |||||     
T  41256410 aattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtg--aattatgctcaaattgttgaattgtgctag 41256507  T
Q  116 gttgttgtt 124  Q
    |||||||||    
T  41256508 gttgttgtt 41256516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 3)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 48822 - 48598
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  48822 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcagtt 48723  T
Q  101 gatgaattttgctaagttgttgtta-attgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtt 199  Q
    | |||||||||||||||||||| || |||||| | |||||||||||||| ||||||||||| | |||||| ||||| || ||||||||| ||||||||      
T  48722 ggtgaattttgctaagttgttgctagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctattaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 48623  T
Q  200 tatgcatattcatggatttatgatg 224  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||    
T  48622 tatgcatattcatgaattgatgatg 48598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 2 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 36317 - 36093
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattg 101  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  36317 tatgtttgtatgtatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatattcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattg 36218  T
Q  102 atgaattt-tgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtt 199  Q
     ||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||  ||||||||| |||||| || ||  |||||||||||||||||||||||      
T  36217 gtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcatgttcaatagatgttatgaatgttatttgataatatgattgatgaataattgcttggg 36118  T
Q  200 tatgcatattcatggatttatgatg 224  Q
    | |||||||||||||||| ||||||    
T  36117 tttgcatattcatggattgatgatg 36093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 111
Target Start/End: Original strand, 154049 - 154149
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattt 109  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| || ||||| |||| |||||||||| ||    
T  154049 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaagttacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatgaaatt 154147  T
Q  110 tg 111  Q
    ||    
T  154148 tg 154149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 29)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 2 - 213
Target Start/End: Original strand, 14626158 - 14626370
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||    
T  14626158 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgtgcaattg 14626257  T
Q  102 atgaattttgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgttt 200  Q
     |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||| |  ||||||||| ||||||||  |    
T  14626258 gtgaattatgctaagttgttgttaacttgagatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgcttgggt 14626357  T
Q  201 atgcatattcatg 213  Q
    |||||||||||||    
T  14626358 atgcatattcatg 14626370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 23153671 - 23153458
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23153671 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 23153572  T
Q  101 gatgaattttgctaagttgttgtta-attgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtt 199  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||| || ||||||||| ||| ||||      
T  23153571 ggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatattatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattacttggg 23153472  T
Q  200 tatgcatattcatg 213  Q
    ||| ||||||||||    
T  23153471 tatacatattcatg 23153458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 5 - 213
Target Start/End: Original strand, 1650136 - 1650345
Alignment:
Q  5 gtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattgatg 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1650136 gtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaagaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtg 1650235  T
Q  105 aattttgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtttatg 203  Q
    |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||| || ||||| |  ||||||||| | ||||||  ||||    
T  1650236 aattttgctaagttatggttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatg 1650335  T
Q  204 catattcatg 213  Q
    ||||||||||    
T  1650336 catattcatg 1650345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 25175787 - 25175563
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  25175787 tatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattg 25175688  T
Q  102 atgaattt-tgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtt 199  Q
     ||||||| | ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||||      
T  25175687 gtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttggg 25175588  T
Q  200 tatgcatattcatggatttatgatg 224  Q
    |||||||||||||||||| ||||||    
T  25175587 tatgcatattcatggattgatgatg 25175563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 224
Target Start/End: Original strand, 27654011 - 27654235
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattg 101  Q
    |||| ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  27654011 tatgcttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattg 27654110  T
Q  102 atgaattt-tgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtt 199  Q
     ||||||| | ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| | |||||||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||||      
T  27654111 gtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttccaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttggg 27654210  T
Q  200 tatgcatattcatggatttatgatg 224  Q
    |||||||||||||||||| ||||||    
T  27654211 tatgcatattcatggattaatgatg 27654235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 2 - 213
Target Start/End: Original strand, 1657788 - 1657999
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattg 101  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  1657788 tatgtttggatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattg 1657887  T
Q  102 atgaattttgctaagttgttgttaattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgttta 201  Q
    ||| ||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||  ||||||||| | |||||||| ||||| |  ||||||||| | ||||||  ||    
T  1657888 atggattttgctaagttattgtgaattgagttatgattcttgttcagttgatgttattgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggta 1657987  T
Q  202 tgcatattcatg 213  Q
    ||||||||||||    
T  1657988 tgcatattcatg 1657999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 5 - 224
Target Start/End: Original strand, 35009482 - 35009702
Alignment:
Q  5 gtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattgatg 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  35009482 gtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttttgaaaattgtgctcaattggtg 35009581  T
Q  105 aattttgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtttatg 203  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||  |||  ||  | ||||||| ||||||| | | |||||||| ||||| |  ||||||||| ||||||||  ||||    
T  35009582 aattttgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatg 35009681  T
Q  204 catattcatggatttatgatg 224  Q
    |||||||||| ||| ||||||    
T  35009682 catattcatgaattgatgatg 35009702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 2 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 15862694 - 15862484
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  15862694 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaattatgtataaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattg 15862595  T
Q  102 atgaattttgctaagttgttgttaattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgttta 201  Q
    ||| ||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||| | | ||||||| | || ||||| ||||| |  ||||||||| | ||||||  ||    
T  15862594 atggattttgctaagttattgtgaattgagttatgattcttgttc-atttatgttattgctgataattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggta 15862496  T
Q  202 tgcatattcatg 213  Q
    ||||||||||||    
T  15862495 tgcatattcatg 15862484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 2 - 224
Target Start/End: Original strand, 16825780 - 16826006
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgta--tgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaat 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  16825780 tatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtaattaattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaat 16825879  T
Q  100 tgatgaattt-tgctaagttgttgttaatt-gagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttg 197  Q
    || || |||| | |||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||  | || |||||||||||||||||||||||     
T  16825880 tggtggatttctcctaatttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatctgatattatgattgatgaataattgcttt 16825979  T
Q  198 tttatgcatattcatggatttatgatg 224  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||    
T  16825980 gttatgcatattcatggattgatgatg 16826006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 29666089 - 29665941
Alignment:
Q  10 tatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaat 107  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| | |||||  ||||| || ||||||| |||||||| |||||    
T  29666089 tatgtatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgcataaatgtcaagttatg-aaattgtactcaattggtgaat 29665991  T
Q  108 tttgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgtt 156  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  29665990 tttgctaagttgttgttgaaatgagatatgattcatgttcaattgatgtt 29665941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 43 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 27741021 - 27740907
Alignment:
Q  43 ggtgaaattacatgttc--aaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgtt-aattgagatttgatt 139  Q
    ||||||||||||||||   || |||||| |||||  ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||    
T  27741021 ggtgaaattacatgtttcgaagtatgtataaatgtcaagttatgaaa-ttgtgctcaattggtgaattttgctaagtcgttgttgaattgagatatgatt 27740923  T
Q  140 cttgttcaagtgatgt 155  Q
    | ||||||| ||||||    
T  27740922 catgttcaattgatgt 27740907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 2 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 27751648 - 27751603
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtga 47  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27751648 tatgtttgtatgcatgaattgatgacaattgtatgattgttggtga 27751603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 29605673 - 29605550
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctc-aa 98  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| |  |||||  |||||||||| ||    
T  29605673 atatgtttgaatgcatgaattagtgataattgaattgttgttggtgaaattacatgttcatagtatgtgaaaatgaaatattgtg--aattgtgctcaaa 29605576  T
Q  99 ttgatgaattttgctaagttgttgtt 124  Q
     || |||||| ||||| |||||||||    
T  29605575 atgttgaattgtgctatgttgttgtt 29605550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Original strand, 18629631 - 18629693
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 62  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  18629631 atatgtttgaatgcatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaa 18629693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 1556219 - 1556142
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 87  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  1556219 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 1556142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 16232106 - 16232029
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 87  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  16232106 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 16232029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Original strand, 17083221 - 17083298
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaatgata 77  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||  ||||||| | ||||| |||||||||    
T  17083221 atatgtttgaatgcatgaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgtatgttcatagtatgtgaaaatgata 17083298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 87
Target Start/End: Original strand, 18086865 - 18086942
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 87  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  18086865 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 18086942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 111
Target Start/End: Original strand, 22225780 - 22225880
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattt 109  Q
    |||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| || ||||| |||| |||||||||| ||    
T  22225780 tgcatgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatgaaatt 22225878  T
Q  110 tg 111  Q
    ||    
T  22225879 tg 22225880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 23977983 - 23977906
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 87  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  23977983 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 23977906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Original strand, 16887815 - 16887877
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 62  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |   ||||||||||| || ||||||||||    
T  16887815 atatgtttgtatgcatgaaattgatgataattgaactgttgttggtgaatttgcatgttcaaa 16887877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 25651461 - 25651399
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 62  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  25651461 atatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaa 25651399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 16 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 10488909 - 10488813
Alignment:
Q  16 tgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttg 111  Q
    |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| || ||||| |||| |||||||||| ||||    
T  10488909 tgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatgaaatttg 10488813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 12 - 87
Target Start/End: Original strand, 13620836 - 13620913
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 87  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||| |||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  13620836 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattgcatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 13620913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 16 - 111
Target Start/End: Original strand, 16376419 - 16376515
Alignment:
Q  16 tgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttg 111  Q
    |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| || ||||| |||| |||||||||| ||||    
T  16376419 tgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatgaaatttg 16376515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 16 - 111
Target Start/End: Original strand, 16383743 - 16383839
Alignment:
Q  16 tgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttg 111  Q
    |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| || ||||| |||| |||||||||| ||||    
T  16383743 tgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatgaaatttg 16383839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 16 - 111
Target Start/End: Original strand, 16556185 - 16556281
Alignment:
Q  16 tgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttg 111  Q
    |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| || ||||| |||| |||||||||| ||||    
T  16556185 tgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatgaaatttg 16556281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 16 - 111
Target Start/End: Original strand, 16632741 - 16632837
Alignment:
Q  16 tgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttg 111  Q
    |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| || ||||| |||| |||||||||| ||||    
T  16632741 tgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatgaaatttg 16632837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 18 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 22848221 - 22848115
Alignment:
Q  18 aattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctc-aattgatgaattttgctaa 115  Q
    ||||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||| ||  |||||  |||||||||| ||||| |||||| |||||     
T  22848221 aattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcatagtatgtgaaaatgttatattgtg--aattgtgctcaaattgttgaattgtgctat 22848124  T
Q  116 gttgttgtt 124  Q
    |||||||||    
T  22848123 gttgttgtt 22848115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 144; Significance: 7e-76; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 2 - 224
Target Start/End: Original strand, 21144 - 21367
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattg 101  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  21144 tatgtttgtatccattaattgatgataattatatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaagattgagctcaattg 21243  T
Q  102 atgaattttgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgttt 200  Q
     |||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||  |    
T  21244 gtgaattttcctaagttgttgttaatttgagattggattcttgttcaattgatgttatgaatgttatttgatgttatgattgatgaataattgcttgagt 21343  T
Q  201 atgcatattcatggatttatgatg 224  Q
     |||||||||||||||| ||||||    
T  21344 ttgcatattcatggattaatgatg 21367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 224
Target Start/End: Original strand, 14089 - 14312
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattg 101  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  14089 tatgtctgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttagtgaaattacatgttgaaatatgtaaaaatgataagttatgaagattgtgctcaattg 14188  T
Q  102 atgaattttgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgttt 200  Q
     |||||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||  |    
T  14189 gtgaattttcctaagttgttgataatttgagattggattcttgttcaattaatgttatgaatgttgtttgatgttatgattgatgaataattgcttgagt 14288  T
Q  201 atgcatattcatggatttatgatg 224  Q
     |||||||||||||||| ||||||    
T  14289 ttgcatattcatggattgatgatg 14312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 141; Significance: 5e-74; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 43221 - 42997
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattg 101  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| |||||    
T  43221 tatgtttctatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgaagattgtgctaaattg 43122  T
Q  102 atgaattt-tgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtt 199  Q
     ||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||||      
T  43121 gtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcgtgttcaagtgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttggg 43022  T
Q  200 tatgcatattcatggatttatgatg 224  Q
    | |||||||||||||||| ||||||    
T  43021 tttgcatattcatggattgatgatg 42997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 16 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 39313 - 39217
Alignment:
Q  16 tgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttg 111  Q
    |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| || ||||| |||| |||||||||| ||||    
T  39313 tgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatgaaatttg 39217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 26454 - 26663
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26454 atatgtttgtatgcgtgaattgatgataattgtaagattattggtgaaagtacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgttctcaatt 26553  T
Q  101 gatgaattttgctaagttgttgtta-attgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtt 199  Q
    | ||||||||||||||||||||||| | |||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||      
T  26554 ggtgaattttgctaagttgttgttagaatgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtgattgatgaatcattgcttggg 26653  T
Q  200 tatgcatatt 209  Q
    ||||||||||    
T  26654 tatgcatatt 26663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 122
Target Start/End: Original strand, 8220 - 8340
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattg 101  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  8220 tatgtttgtatgcatgaattggtgataattgtatgattgttggtgaaattacaggttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattg 8319  T
Q  102 atgaattttgctaagttgttg 122  Q
     |||||||||||| |||||||    
T  8320 gtgaattttgctatgttgttg 8340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 36952 - 37176
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36952 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagcttgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctaaatt 37051  T
Q  101 gatgaattttgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtt 199  Q
    | |||||||||||||||||| |||  |||||| | ||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||      
T  37052 ggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgaatcttgttcaattgacgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 37151  T
Q  200 tatgcatattcatggatttatgatg 224  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||    
T  37152 tatgcatattcatgaattgatgatg 37176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 247481 - 247694
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  247481 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgagggtgaaatttcatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 247580  T
Q  101 gatgaattttgctaagttgttgtta-attgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtt 199  Q
    | | ||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||      
T  247581 ggtaaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatgactgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 247680  T
Q  200 tatgcatattcatg 213  Q
    ||||||||||||||    
T  247681 tatgcatattcatg 247694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 146
Target Start/End: Original strand, 34200 - 34336
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattt 109  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| || || || | || |||||||||||||    
T  34200 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aagttatacttaattgatgaattt 34298  T
Q  110 tgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttc 146  Q
     | || ||||||||| || |||||| |||||| |||||    
T  34299 ggatatgttgttgttgaaatgagatatgattcatgttc 34336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 126; Significance: 4e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 259 - 46
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||    
T  259 tatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgtatattgtgctcaattg 160  T
Q  102 atgaattt-tgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtt 199  Q
     ||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||| || || |||||||| |||||||||||||||      
T  159 gtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattaatgaataattgcttggg 60  T
Q  200 tatgcatattcatg 213  Q
    | ||||||||||||    
T  59 tttgcatattcatg 46  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 126; Significance: 4e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 172129 - 171916
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  172129 atatgtttgtatggatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctaaatt 172030  T
Q  101 gatgaattttgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtt 199  Q
    | |||||||||||||||||| ||| ||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||| |||||||       
T  172029 ggtgaattttgctaagttgtggttgaattgagttacgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttagg 171930  T
Q  200 tatgcatattcatg 213  Q
    ||||||||||||||    
T  171929 tatgcatattcatg 171916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 177832 - 177619
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  177832 atatgtttgtatggatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctaaatt 177733  T
Q  101 gatgaattttgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtt 199  Q
    | |||||||||||||||||| ||| ||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||| |||||||       
T  177732 ggtgaattttgctaagttgtggttgaattgagttacgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttagg 177633  T
Q  200 tatgcatattcatg 213  Q
    ||||||||||||||    
T  177632 tatgcatattcatg 177619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 3186 - 2973
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattg 101  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  3186 tatgtttgtatccatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattg 3087  T
Q  102 atgaattttgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttg-ttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtt 199  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || || || ||||||||| | ||||| || ||||| |  ||||||||| | |||||||     
T  3086 gtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttttaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactgcttgtg 2987  T
Q  200 tatgcatattcatg 213  Q
    ||||||||||||||    
T  2986 tatgcatattcatg 2973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 41953 - 41740
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41953 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtcatattgttggtgaaattacatgctcaaatatgtaaaaatgataatttgtgaaaattgtgctcaatt 41854  T
Q  101 gatgaattttgctaagttgttgtta-attgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtt 199  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||  |||| |   |||||||| |||| |||      
T  41853 ggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgctatggctgttaattgttgttgtagatgatgaatcattggttggg 41754  T
Q  200 tatgcatattcatg 213  Q
    ||||||||||||||    
T  41753 tatgcatattcatg 41740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1542 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold1542
Description:

Target: scaffold1542; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Original strand, 573 - 784
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  573 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgatgagttgtgaaaattgtactcaatt 672  T
Q  101 gatgaattttgctaagttgttgtta-attgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtt 199  Q
    | ||||||||||||||||  ||||| ||| || | ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||| ||||||||      
T  673 ggtgaattttgctaagttactgttagattaagttatgattcttgtttaattgatgttatggctgctaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 772  T
Q  200 tatgcatattca 211  Q
    ||||||||||||    
T  773 tatgcatattca 784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 118; Significance: 2e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 2 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 5752 - 5555
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  5752 tatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagtcatgaatattgtgctcaattg 5653  T
Q  102 atgaattt-tgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttg 197  Q
     ||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||| || ||  ||||||| |||||||||||||||    
T  5652 gtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgataatatgattaatgaataattgcttg 5555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 118; Significance: 2e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 272249 - 272036
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  272249 atatgtttgtatgaatgaattgatgataattgtatgattgatggagaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctaaatt 272150  T
Q  101 gatgaattttgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtt 199  Q
    | |||||||||||||||||| |||  |||||| | |||||||||||||| || |||||| | |||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||      
T  272149 ggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattggtgttatagctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 272050  T
Q  200 tatgcatattcatg 213  Q
    ||||||||||||||    
T  272049 tatgcatattcatg 272036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 2 - 128
Target Start/End: Original strand, 13353 - 13479
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13353 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgctcaattg 13452  T
Q  102 atgaattttgctaagttgttgttaatt 128  Q
     |||||||||||||||| |||||||||    
T  13453 gtgaattttgctaagttattgttaatt 13479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 109; Significance: 6e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 2 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 13729 - 13517
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  13729 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattg 13630  T
Q  102 atgaattttgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgttt 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||  |||  ||  | ||||||| ||||||| | | |||||||| ||||| |  ||||||||| ||  ||||  |    
T  13629 atgaattttgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggt 13530  T
Q  201 atgcatattcatg 213  Q
    |||||||||||||    
T  13529 atgcatattcatg 13517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 109; Significance: 6e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 2 - 224
Target Start/End: Original strand, 34500 - 34724
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||   |||||||||||||||| |||||| |    
T  34500 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattgtgtaaaaatatgaagttgtgaaaattgttctcaatag 34599  T
Q  102 atgaattttgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttg-ttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtt 199  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || || || ||||||||| | ||||| || ||||| |  ||||||||| | | ||||      
T  34600 gtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttttaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactacttggg 34699  T
Q  200 tatgcatattcatggatttatgatg 224  Q
    |||||||||||||||||| ||||||    
T  34700 tatgcatattcatggattgatgatg 34724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 108; Significance: 2e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 2 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 41871 - 41648
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  41871 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgttcaattg 41772  T
Q  102 atgaattttgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgttt 200  Q
     |||||||||||| ||||||||| ||||  |||  ||  | ||||||| ||||||| | | |||||| | ||||| |  ||||||||| ||||||||  |    
T  41771 gtgaattttgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgttaaatgatgttgttgttgatgaatcattgcttgggt 41672  T
Q  201 atgcatattcatggatttatgatg 224  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||    
T  41671 atgcatattcatgaattgatgatg 41648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 92; Significance: 8e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 51221 - 51328
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51221 atatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaataggtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 51320  T
Q  101 gatgaatt 108  Q
    | ||||||    
T  51321 ggtgaatt 51328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 89493 - 89618
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  89493 atatatttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaattataagttgtgaaaattgtgctcaatt 89592  T
Q  101 gatgaattttgctaagttgttgttaa 126  Q
    | |||||| ||||  |||||||||||    
T  89593 ggtgaattatgctttgttgttgttaa 89618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 37105 - 37328
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||  |||     
T  37105 atatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatg 37204  T
Q  101 gatgaattttgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtt 199  Q
    |||||| ||||  | ||||| |||  |||||| | |||||||||| ||| ||||||| | |||| ||||  ||||| |  ||||||||| ||||||||      
T  37205 gatgaa-tttgacatgttgtagttggattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcattgcttggg 37303  T
Q  200 tatgcatattcatggatttatgatg 224  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||    
T  37304 tatacatattcatggattgatgatg 37328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1711 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold1711
Description:

Target: scaffold1711; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 109
Target Start/End: Original strand, 1332 - 1439
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  1332 tatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattg 1431  T
Q  102 atgaattt 109  Q
     |||||||    
T  1432 gtgaattt 1439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 119 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 48620 - 48514
Alignment:
Q  119 gttgttaatt-gagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtttatgcatattcatggatt 217  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  48620 gttgttaatttgagatttgattcttgttcacttgatgttatggatgttaattgatgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggatt 48521  T
Q  218 tatgatg 224  Q
     ||||||    
T  48520 gatgatg 48514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 22764 - 22656
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||  |||     
T  22764 atatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatg 22665  T
Q  101 gatgaattt 109  Q
    |||||||||    
T  22664 gatgaattt 22656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 27019 - 26911
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||  |||     
T  27019 atatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatg 26920  T
Q  101 gatgaattt 109  Q
    |||||||||    
T  26919 gatgaattt 26911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Original strand, 1621 - 1729
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||  |||     
T  1621 atatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatg 1720  T
Q  101 gatgaattt 109  Q
    |||||||||    
T  1721 gatgaattt 1729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1560 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold1560
Description:

Target: scaffold1560; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 119 - 224
Target Start/End: Original strand, 9 - 115
Alignment:
Q  119 gttgttaatt-gagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtttatgcatattcatggatt 217  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  9 gttgttaatttgatatttgattcttgttcaaatgatattatgaatgttaattgatgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggatt 108  T
Q  218 tatgatg 224  Q
     ||||||    
T  109 gatgatg 115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 12 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 45244 - 45098
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattt 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||| |||||  ||||| || ||||||| |||||||| |||||||    
T  45244 tgcatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgtcaagttttg-aaattgtactcaattggtgaattt 45146  T
Q  110 tgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgtt 156  Q
    || || ||||||||| || |||||| |||||| ||||| | |||||||    
T  45145 tgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgtt 45098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 12 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 54630 - 54484
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattt 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| |||||| |||||  ||||| || ||||||| |||||||| |||||||    
T  54630 tgcatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattgcatgtttcaaagtatgtataaatgtcaagttatg-aaattgtactcaattggtgaattt 54532  T
Q  110 tgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgtt 156  Q
    || || ||||||||| || |||||| |||||| ||||| | |||||||    
T  54531 tgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgtt 54484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0361
Description:

Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 5 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 3410 - 3290
Alignment:
Q  5 gtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacat-gttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattga 102  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||   ||||| || ||||||| ||||| ||     
T  3410 gtttgtatgcatgaattaatgatatttgtatgattgttggtgaaattacatatttcaaagtatgtataaatatcaagttatg-aaattgtactcaaatgg 3312  T
Q  103 tgaattttgctaagttgttgtt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  3311 tgaattttgctaagttgttgtt 3290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 12 - 124
Target Start/End: Original strand, 56149 - 56262
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg--ttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattt 109  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  || || |||||| |||||  ||||| || ||||||||||||| || |||||||    
T  56149 tgcatgatttgatgataattgtatgattgtggctgaaattacatgttttaaagtatgtataaatgtcaagttatg-aaattgtgctcaaatggtgaattt 56247  T
Q  110 tgctaagttgttgtt 124  Q
    |||||||||||||||    
T  56248 tgctaagttgttgtt 56262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 126 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 9480 - 9382
Alignment:
Q  126 attgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgtttatgcatattcatggatttatgatg 224  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||    
T  9480 attgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 9382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 22452 - 22576
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||| || |||||||||| | |||| || || ||| |||||  |||| |||||||    
T  22452 atatgtttgtatgcatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaatttgcatgttcaaagtgtgtataagtgttaacttgtg--aattatgctcaa 22549  T
Q  99 tt-gatgaattttgctaagttgttgtt 124  Q
    || | |||||| |||||||||||||||    
T  22550 ttgggtgaattatgctaagttgttgtt 22576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0892 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0892
Description:

Target: scaffold0892; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 3625 - 3551
Alignment:
Q  14 catgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 87  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| || || ||||||||||||    
T  3625 catgaattgatgattatggtatgattgtgggtgaaattacatgttcaaagcatgtataattgttaagttgtgaaa 3551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Original strand, 22445 - 22615
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttc-aaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctc-a 97  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||| ||| || ||  |||| ||||| |    
T  22445 atatgtttgtatgcatgaaattgatgataatttaattgttgttggtgaatttgcatgttcaaaatatgtataaatgctaacttatg--aattatgctcaa 22542  T
Q  98 attgatgaattttgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatt 169  Q
    |||  |||||| ||||| ||||||||| ||||||||| ||| || |||| || ||||||| | | ||||||||    
T  22543 attattgaattgtgctatgttgttgttgaattgagatgtgaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaatt 22615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 12 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 54088 - 54012
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 87  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||||| || || ||||||||||||    
T  54088 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgttcaaagcatgtataattgttaagttgtgaaa 54012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 8234 - 8172
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 62  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||| || ||||||||||    
T  8234 atatgtttgtatgcatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaatttgcatgttcaaa 8172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 87
Target Start/End: Original strand, 1617 - 1694
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 87  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  1617 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 1694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0670 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0670
Description:

Target: scaffold0670; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 124
Target Start/End: Original strand, 7716 - 7822
Alignment:
Q  18 aattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctc-aattgatgaattttgctaa 115  Q
    ||||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||  |||||  |||||||||| ||||| |||||| |||||     
T  7716 aattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtg--aattgtgctctaattgttgaattgtgctat 7813  T
Q  116 gttgttgtt 124  Q
    |||||||||    
T  7814 gttgttgtt 7822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 87
Target Start/End: Original strand, 10381 - 10458
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 87  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  10381 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgctaagttatgaaa 10458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 3475 - 3351
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctc-a 97  Q
    ||||||||| || |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||  |||||  ||||| |||| |    
T  3475 atatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtg--aattgggctcta 3378  T
Q  98 attgatgaattttgctaagttgttgtt 124  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||||    
T  3377 attgttgaattgtgctatgttgttgtt 3351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 4829 - 4742
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaatgataagttgtgaa 86  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||  |||||||    
T  4829 atatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaa 4742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1666 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1666
Description:

Target: scaffold1666; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 58
Target Start/End: Original strand, 38 - 84
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 58  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  38 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 84  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0700 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0700
Description:

Target: scaffold0700; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 2749 - 2687
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 62  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  2749 atatgtttggatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaa 2687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 6885 - 6823
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 62  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  6885 atatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 6823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0409
Description:

Target: scaffold0409; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Original strand, 1371 - 1449
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgata 77  Q
    |||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||    
T  1371 atatgtttgtatgcataaaattggtgataattggattgttgttggtgaaattgcatggtcaaagtatgtgaaaatgata 1449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Original strand, 9626 - 9704
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgata 77  Q
    |||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||    
T  9626 atatgtttgtatgcataaaattggtgataattggattgttgttggtgaaattgcatggtcaaagtatgtgaaaatgata 9704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Original strand, 76870 - 76932
Alignment:
Q  1 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 62  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  76870 atatgtttgaatgcatgaaattgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 76932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1500 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold1500
Description:

Target: scaffold1500; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 12 - 87
Target Start/End: Original strand, 1556 - 1633
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 87  Q
    |||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  1556 tgcatgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 1633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1272 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold1272
Description:

Target: scaffold1272; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 517 - 456
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 62  Q
    |||||||| ||||||||| ||| |||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  517 tatgtttgaatgcatgaagttgttgataattatattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 62
Target Start/End: Original strand, 2340 - 2401
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 62  Q
    |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  2340 tatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 2401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 16 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 31519 - 31423
Alignment:
Q  16 tgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttg 111  Q
    |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| || ||||| |||| |||||||||| ||||    
T  31519 tgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatgaaatttg 31423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 12 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 39860 - 39783
Alignment:
Q  12 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 87  Q
    |||||||||||||||| || ||||  |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  39860 tgcatgaattgatgattatggtatttttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 39783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 62
Target Start/End: Original strand, 43822 - 43883
Alignment:
Q  2 tatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 62  Q
    |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  43822 tatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 43883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University